CN111233991A - 水稻OsNBARC1蛋白及其编码基因在调控水稻对白叶枯病抗性中的应用 - Google Patents

水稻OsNBARC1蛋白及其编码基因在调控水稻对白叶枯病抗性中的应用 Download PDF

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Abstract

本发明涉及水稻OsNBARC1蛋白及其编码基因在调控水稻对白叶枯病抗性中的应用。本发明公开了水稻OsNBARC1蛋白的氨基酸序列,以及其编码基因的序列和编码区序列,并利用基因互补和基因编辑技术进行了功能验证。实验结果证明,OsNBARC1互补转基因植株对白叶枯病的抗性显著提高,相较于野生型植株,病斑长度下降61.9%左右,OsNBARC1基因敲除植株对白叶枯病的抗性显著降低,相较于野生型植株,病斑长度增加2.8倍左右。这些实验结果表明水稻OsNBARC1蛋白具有正向调控水稻的抗病性的功能,可以用于改良水稻对白叶枯病的抗性,对于培育抗白叶枯病水稻新品种具有重要意义。

Description

水稻OsNBARC1蛋白及其编码基因在调控水稻对白叶枯病抗性 中的应用
技术领域
本发明属于生物技术领域,涉及一个水稻抗病相关基因的功能与应用,具体涉及水稻OsNBARC1蛋白及其编码基因在调控水稻对白叶枯病抗性中的应用。
背景技术
水稻白叶枯病是由黄单胞杆菌水稻致病变种(Xanthomonas oryz ae pv.oryzae,Xoo)引起的一种重要的细菌性病害,发病范围较广。一般年份可导致水稻减产10%左右,严重时减产50%-60%。利用抗性基因培育抗病品种是目前防治水稻白叶枯病最经济有效的措施。
迄今,现有技术已报道45个水稻白叶枯病抗性基因(http://www.shigen.nig.ac.jp/rice/oryzabase/gene/list)。然而,来源于野生稻的抗病基因难以利用,部分抗性基因仅具有成株期抗性,并且大多抗性基因的抗谱较窄。在已鉴定的水稻白叶枯病抗性基因中,仅Xa3、Xa4、Xa21和Xa23等基因在生产中得以广泛应用。由于水稻白叶枯病菌具有高度的变异性,携带单个主效基因的抗病品种大面积推广种植后,潜在的毒性小种变为优势小种或病菌变异出现新的毒性小种,极易导致品种抗性丧失。
因此,鉴定水稻抗病相关基因有助于进一步培育抗病品种,增强植物的抗病性,有利于控制和降低水稻白叶枯病的危害。
发明内容
为了解决现有技术存在的问题,本发明提供水稻OsNBARC1蛋白及其编码基因在调控水稻对白叶枯病抗性中的应用。
第一方面,本发明提供水稻OsNBARC1蛋白或其编码基因或水稻OsNBARC1蛋白编码基因的启动子驱动基因组全长序列在调控水稻对白叶枯病抗性中的应用。
本发明进一步提供水稻OsNBARC1蛋白或其编码基因或水稻OsNBARC1蛋白编码基因的启动子驱动基因组全长序列在水稻遗传育种或转基因水稻制备中的应用。
进一步地,通过提高所述水稻OsNBARC1蛋白编码基因的表达量,提高水稻的抗白叶枯病能力。
进一步地,所述提高所述水稻OsNBARC1蛋白编码基因的表达量为通过基因互补技术将所述水稻OsNBARC1蛋白编码基因的启动子驱动基因组全长序列转化至所述水稻中构建OsNBARC1互补转基因植株。
进一步地,所述水稻OsNBARC1蛋白具有如下任一种氨基酸序列:
i)如SEQ ID NO.1所示的氨基酸序列;
ii)如SEQ ID NO.1所示的氨基酸序列经取代、缺失和/或增加一个或多个氨基酸的替换、插入或缺失得到的具有相同功能蛋白的氨基酸序列;
iii)与如SEQ ID NO.1所示的氨基酸序列具有至少80%同源性的氨基酸序列;优选地,所述同源性至少90%;更优选为95%。
本发明的前期研究发现,对白叶枯病具有广谱抗性的水稻导入系FF329及其对PXO99A等菌株感病的轮回亲本黄华占(HHZ)接种后,OsNBARC1在FF329和HHZ之间差异表达,接种后24小时,OsNBARC1在FF329植株中显著上调表达,在HHZ植株中仅微量表达,推测该基因可能调控FF329对白叶枯病的抗病反应。本发明克隆了OsNBARC1基因,并通过基因互补和基因编辑技术进行了功能验证,发现水稻OsNBARC1基因在改良水稻对白叶枯病抗性方面具有重要意义。
第二方面,本发明提供水稻OsNBARC1蛋白编码基因的启动子驱动基因组全长序列,所述水稻OsNBARC1蛋白编码基因的启动子驱动基因组全长序列包括如SEQ ID NO.4所示核苷酸序列;
所述水稻OsNBARC1蛋白具有如下任一种氨基酸序列:
i)如SEQ ID NO.1所示的氨基酸序列;
ii)如SEQ ID NO.1所示的氨基酸序列经取代、缺失和/或增加一个或多个氨基酸的替换、插入或缺失得到的具有相同功能蛋白的氨基酸序列;
iii)与如SEQ ID NO.1所示的氨基酸序列具有至少80%同源性的氨基酸序列;优选地,所述同源性至少90%;更优选为95%。
本发明进一步提供包含所述水稻OsNBARC1蛋白编码基因的启动子驱动基因组全长序列的生物材料,所述生物材料包括表达盒、载体或转基因植物细胞。
第三方面,本发明提供一种调控水稻对白叶枯病抗性的方法,包括:
调控水稻中水稻OsNBARC1蛋白编码基因的表达量;
所述水稻OsNBARC1蛋白编码基因具有如下任一种核苷酸序列:
i)如SEQ ID NO.2所示的核苷酸序列;
ii)如SEQ ID NO.2所示的核苷酸序列经取代、缺失和/或增加一个或多个核苷酸的替换、插入或缺失得到的编码相同功能蛋白的核苷酸序列;
优选地,所述水稻OsNBARC1蛋白编码基因的编码区的核苷酸序列如SEQ ID NO.3所示。
进一步地,使用如下引物可以扩增得到所述水稻OsNBARC1基因的编码区:
OsNBARC1-CDS-F:5’-ATGGAGTTCGCCACAGGGGC-3’,
OsNBARC1-CDS-R:5’-TTACCTCCTATTGTCAAGGTATTCTC-3’;
进一步地,通过提高所述水稻中所述水稻OsNBARC1蛋白编码基因的表达量,提高水稻的抗白叶枯病能力;或者,通过将OsNBARC1互补转基因植株与其他株系杂交,培育抗白叶枯病株系。
进一步地,所述提高所述水稻中所述水稻OsNBARC1蛋白编码基因的表达量为通过基因互补技术将所述水稻OsNBARC1蛋白编码基因的启动子驱动基因组全长序列转化至所述水稻中构建OsNBARC1互补转基因植株。
本发明具有如下有益效果:
本发明公开了水稻OsNBARC1蛋白的氨基酸序列,以及其编码基因的序列和编码区序列,并利用基因互补和基因编辑技术进行了功能验证。实验结果证明,OsNBARC1互补转基因植株对白叶枯病的抗性显著提高,相较于野生型植株,病斑长度下降61.9%左右,OsNBARC1基因敲除植株对白叶枯病的抗性显著降低,相较于野生型植株,病斑长度增加2.8倍左右。本发明提供的水稻OsNBARC1基因有正向调控水稻的抗病性的功能,可以用于改良水稻对白叶枯病的抗性,对于培育抗白叶枯病水稻新品种具有重要意义。
附图说明
图1为本发明实施例4提供的水稻白叶枯病抗性基因OsNBARC1互补转基因植株的PCR鉴定结果;其中,M为DNA分子量标准(DL2000 DNA marker),1为阳性对照,2为阴性对照,3为OsNBARC1互补转基因株系CP-1,4为OsNBARC1互补转基因株系CP-2,5为OsNBARC1互补转基因株系CP-3;
图2为本发明实施例4提供的经过CRISPR/Cas9敲除的OsNBARC1基因敲除株系KO-1、KO-2和KO-3的测序峰图;
图3为本发明实施例4提供的经过CRISPR/Cas9敲除的OsNBARC1基因敲除株系KO-1、KO-2和KO-3与FF329的氨基酸序列比较;
图4为本发明实施例5提供的黄华占(HHZ)和OsNBARC1基因互补转基因株系CP-1、CP-2和CP-3的病斑长度对比;
图5为本发明实施例5提供的FF329和OsNBARC1基因敲除株系KO-1、KO-2和KO-3的病斑长度对比。
具体实施方式
以下实施例用于说明本发明,但不用来限制本发明的范围。
实施例1、水稻OsNBARC1基因的克隆
1.水稻OsNBARC1基因的基因组序列的获得
提取水稻品种FF329的叶片DNA,以此DNA为模板,利用:
正向引物OsNBARC1-F:5’-ACTCACTCCAAATCCTGAGTAGT-3’,
反向引物OsNBARC1-R:5’-AGCGGCCAATATGCTCGGAAT-3’;
用PrimeSTAR GXL DNA Polymerase(Code:R050A,Takara)进行PCR扩增,得到扩增产物,即序列表中的SEQ ID NO.2,OsNBARC1基因序列。
2.水稻OsNBARC1基因的编码区序列的获得
取水稻品种FF329的叶片总RNA,采用FastKing gDNA Dispelling RT SuperMix(Code:KR118,TIANGEN)合成cDNA,以此cDNA为模板,利用引物:
OsNBARC1-CDS-F:5’-ATGGAGTTCGCCACAGGGGC-3’,
OsNBARC1-CDS-R:5’-TTACCTCCTATTGTCAAGGTATTCTC-3’;
用PrimeSTAR GXL DNA Polymerase(Code:R050A,Takara)进行PCR扩增,得到扩增产物,即序列表中的SEQ ID NO.3,OsNBARC1基因的编码区序列。序列分析发现,OsNBARC1基因含有1个RX-CC_like结构域和1个NB-ARC结构域,与水稻抗病蛋白RGA5、RGA4、Pik-6和Pik-2高度同源,可能在水稻中行使抗病防御功能。
实施例2、水稻OsNBARC1互补载体和基因编辑载体的构建
1.水稻OsNBARC1互补载体的构建
构建由OsNBARC1基因自身启动子驱动基因组全长序列的OsNBARC1基因互补载体pCAMBIA1300-OsNBARC1。操作步骤如下:
(1)提取水稻品种FF329的叶片DNA,以该DNA为模板,利用:
正向引物OsNBARC1-CP-F:5’-TTGGAAGAGCGAGAGACTTCG-3’,
反向引物OsNBARC1-CP-R:5’-AAAAGCAGCCACTCTTATCTCG-3’;
用PrimeSTAR GXL DNA Polymerase(Code:R050A,Takara)进行PCR扩增,得到扩增产物(即序列表中的SEQ ID NO.4,OsNBAR C1基因自身启动子驱动基因组全长序列),并进行切胶回收。
(2)将步骤(1)得到的扩增产物添加载体同源序列,具体步骤为:以步骤1的产物为模板,利用:
正向引物OsNBARC1-CP-BamHIF:5’-GAGCTCGGTACCCGGGGATCCTTGGAAGAGCGAGAGACTTCG-3’,
反向引物OsNBARC1-CP-HindIIIR:5’-ACGACGGCCAGTGCCAAGCTTAAAAGCAGCCACTCTTATCTCG-3’;
用PrimeSTAR GXL DNA Polymerase(Code:R050A,Takara)进行PCR扩增,得到扩增产物(即带载体接头的OsNBARC1基因自身启动子驱动基因组全长序列),并进行切胶回收。
(3)将步骤(2)得到的回收产物与经BamHI和HindIII酶切的载体pCAMBIA1300进行同源重组连接,得到含有SEQ ID NO.4所示的DNA片段的序列正确的重组载体,命名为pCAMBIA1300-OsNBARC1。
同源重组反应体系:经BamHI和HindIII酶切的载体pCAMBIA1300 50-100ng,步骤(2)的回收产物50-100ng,5×In-Fusion HD Enzyme Premix 2μL,加ddH2O补充至10μL。
同源重组反应条件:50℃孵育15min。
将反应产物转化大肠杆菌DH5α,筛选阳性克隆,得到正确的含有OsNBARC1基因自身启动子驱动基因组全长序列的表达载体pCAMBIA1300-OsNBARC1。pCAMBIA1300-OsNBARC1含有序列表中SEQ ID NO.4所示的OsNBARC1基因自身启动子驱动基因组全长序列。
2.水稻OsNBARC1基因编辑载体的构建
利用CRISPR/Cas9技术构建编辑OsNBARC1基因的重组载体,所用靶序列为靶序列1和靶序列2。
靶序列1:CACGCTCCTCCCCAAGCTGG(即序列表中SEQ ID NO.3的第27-46位);将CRISPR/Cas9方法中靶向靶序列1的sgRNA记为sgRNA1;
靶序列2:GAGCCAAGTCAGGGAGGTGA(即序列表中SEQ ID NO.3的第378-397位);将CRISPR/Cas9方法中靶向靶序列2的sgRNA记为sgRNA2。
sgRNA表达盒构建:
以pYLsgRNA-OsU6a载体为模板,使用引物:
U-F:5’-CTCCGTTTTACCTGTGGAATCG-3’,
U6a-OsNBARC1-R:5’-CCAGCTTGGGGAGGAGCGTGCGGCAGCCAAGCCAGCA-3’;
进行PCR扩增,将序列正确的DNA片段命名为U6a-OsNBARC1;以pYLsgRNA-OsU6a载体为模板,使用引物:
gR-OsNBARC1-1F:5’-CACGCTCCTCCCCAAGCTGGGTTTTAGAGCTAGAAAT-3’,
gR-R:5’-CGGAGGAAAATTCCATCCAC-3’;
进行PCR扩增,将序列正确的DNA片段命名为sgRNA-OsNBARC1-1。采用overlappingPCR方法将U6a-OsNBARC1和sgRNA-OsNBARC1-1连在一起,随后用引物:
Pps-GGL:5’-TTCAGAGGTCTCTCTCGACTAGTATGGAATCGGCAGCAAAGG-3’,
Pgs-GG2:5’-AGCGTGGGTCTCGTCAGGGTCCATCCACTCCAAGCTC-3’;
进行PCR扩增加上酶切接头,将得到的序列正确的DNA片段命名为U6a-sgRNA-OsNBARC1,U6a-sgRNA-OsNBARC1即为sgRNA1表达盒。U6a-sgRNA-OsNBARC1的序列为序列表中SEQ ID NO.5,SEQ ID NO.5的第44-490位为U6a启动子,第491-593位为sgRNA1的编码序列。U6a-sgRNA-OsNBARC1能编码sgRNA1,sgRNA1序列为序列表中SEQ ID NO.6。
以pYLsgRNA-OsU6b载体为模板,使用引物:
U-F:5’-CTCCGTTTTACCTGTGGAATCG-3’,
U6b-OsNBARC1-R:5’-TCACCTCCCTGACTTGGCTCAACACAAGCGGCAGC-3’;
进行PCR扩增,将序列正确的DNA片段命名为U6b-OsNBARC1;以pYLsgRNA-OsU6b载体为模板,使用引物:
gR-OsNBARC1-2F:5’-AGCCAAGTCAGGGAGGTGAGTTTTAGAGCTAGAAAT-3’,
gR-R:5’-CGGAGGAAAATTCCATCCAC-3’;
进行PCR扩增,将序列正确的DNA片段命名为sgRNA-OsNBARC1-2。采用overlappingPCR方法将U6b-OsNBARC1和sgRNA-OsNBARC1-2连在一起,随后用:
Pps-GG2:5’-TTCAGAGGTCTCTCTGACACTGGAATCGGCAGCAAAGG-3’,
Pgs-GGR:5’-AGCGTGGGTCTCGACCGACGCGTATCCATCCACTCCAAGCTC-3’;
扩增加上酶切接头,将得到的序列正确的DNA片段命名为U6b-sgRNA-OsNBARC1,U6b-sgRNA-OsNBARC1即为sgRNA2表达盒。U6b-sgRNA-OsNBARC1的序列为序列表中SEQ IDNO.7,SEQ ID NO.7的第40-372位为U6b启动子,第373-474位为sgRNA2的编码序列。U6b-sgRNA-OsNBARC1能编码sgRNA2,sgRNA2序列为序列表中SEQ ID NO.8。
重组载体的构建:
将上述U6a-sgRNA-OsNBARC1和U6b-sgRNA-OsNBARC1分别与pYLCRISPR/Cas9Pubi-H载体进行酶切-连接反应,得到OsNBARC1基因敲除载体CRISPR/Cas9-OsNBARC1。
酶切-连接反应体系:U6a-sgRNA-OsNBARC1(10-15ng),U6b-sgRNA-OsNBARC1(10-15ng),pYLCRISPR/Cas9Pubi-H载体(60-80ng),10×CutSmart Buffer 1.5μL,10mM ATP1.5μL,BsaI-HF10U,T4 DNA ligase 35U,加ddH2O补充至15μL。
酶切-连接反应体程序:37℃10min,10℃5min,20℃5min,进行3个循环;37℃3min,10℃5min,20℃5min,进行10个循环。
取反应产物10-15μL转化大肠杆菌DH5α,筛选阳性克隆,将得到的序列正确的重组载体命名为CRISPR/Cas9-OsNBARC1,CRISPR/Cas9-OsNBARC1含有sgRNA1表达盒和sgRNA2表达盒,能表达sgRNA1和sgRNA2以及Cas9。
实施例3、转基因植株的获得
分别利用实施例2中的pCAMBIA1300-OsNBARC1与CRISPR/Cas9-OsNBARC1制备转基因水稻,并分别利用空白载体pCAMBIA1300和pYLCRISPR/Cas9Pubi-H作为对照。分别利用黄华占(HHZ)、FF329作为制备转基因水稻的受体植物,其中水稻品种黄华占(HHZ)对白叶枯病菌株PXO99A表现高感,水稻品种FF329对白叶枯病菌株PXO99A表现高抗。具体步骤如下:
(1)取出植物的成熟种子,去壳,挑取饱满光洁无菌斑的种子进行消毒。
(2)将消毒后的种子接种到诱导培养基上,28℃、暗培养14天左右,选取外观良好,生长力好的愈伤组织。
(3)取实施例2中构建的重组载体pCAMBIA1300-OsNBARC1电击转入根癌农杆菌EHA105,得到重组菌。
(4)取步骤(3)得到的重组菌,用侵染培养基重悬菌体,得到菌悬液。
(5)将步骤(2)的黄华占愈伤组织浸泡于步骤(4)制备的EHA105/pCAMBIA1300-OsNBARC1菌悬液中,侵染20min。侵染后将菌悬液倒掉,取愈伤组织,用无菌滤纸吸干水分,然后置于共培养培养基上,培养28℃暗培养50-55h。
(6)完成步骤(5)后,挑选表面没有明显农杆菌的愈伤组织移至抑菌培养基中,28℃暗培养3-4天。
(7)完成步骤(6)后,将愈伤组织移至筛选培养基上,28℃暗培养30天,每10天继代一次。
(8)完成步骤(7)后,取新鲜潮霉素抗性的愈伤组织,接于预再生培养基中,28℃暗培养7天,然后置于光照培养间(12h光照/12h黑暗)继续培养7天后转入再生培养基上,继续光照培养,直至生长出再生植株,得到转基因植株。
将利用重组载体pCAMBIA1300-OsNBARC1得到的转基因植株记为OsNBARC1基因互补转基因植株,将利用载体pCAMBIA1300得到的转基因植株记为转基因空载对照植株。
按照上述方法,将黄华占替换为FF329,将pCAMBIA1300-OsNBARC1替换为CRISPR/Cas9-OsNBARC1,其他步骤均不变,得到转基因植株。将利用重组载体CRISPR/Cas9-OsNBARC1得到的转基因植株记为OsNBARC1基因敲除植株,将利用pYLCRISPR/Cas9Pubi-H载体得到的转基因植株记为基因敲除空载对照植株。
遗传转化所用培养基及配方:
诱导培养基:CaCl2·2H2O 440mg,KH2PO4 170mg,MgSO4·7H2O 370mg,NH4NO31650mg,KNO3 1900mg,KI 0.83mg,CoCl2·6H2O 0.025mg,H3BO3 6.2mg,Na2MoO4·2H2O0.25mg,MnSO4·4H2O 22.3mg,CuSO4·5H2O 0.025mg,ZnSO4·7H2O 8.6mg,Na2-EDTA·2H2O37.3mg,FeSO4·7H2O 27.8mg,VB1 0.1mg,VB6 0.5mg,烟酸0.5mg,肌醇100mg,甘氨酸2mg,2,4-D 2mg,水解酪蛋白2g,麦芽糖30g,琼脂3g,去离子水加至1L。
侵染培养基:配制方法参见参考文献:Hiei Y,Ohta S,Komari T,etal.Efficient transformation of rice(Oryza sativa,L.)mediated byAgrobacterium,and sequence analysis of the boundaries of the T-DNA[J].PlantJournal,1994,6(2):271–282.。将参考文献中乙酰丁香酮的浓度替换为200μM。
共培养培养基:在诱导培养基中加入乙酰丁香酮和葡萄糖,使乙酰丁香酮在培养基中的终浓度为200μM,葡萄糖在培养基中的终浓度为10g/L。
抑菌培养基:在诱导培养基中头孢霉素,使头孢霉素在培养基中的终浓度为500mg/L。
筛选培养基:在诱导培养基中加入潮霉素和头孢霉素,使潮霉素在培养基中的终浓度为65mg/L,头孢霉素在培养基中的终浓度为500mg/L。
预再生培养基:CaCl2·2H2O 440mg,KH2PO4 170mg,MgSO4·7H2O 370mg,NH4NO31650mg,
KNO3 1900mg,KI 0.83mg,CoCl2·6H2O 0.025mg,H3BO3 6.2mg,Na2MoO4·2H2O0.25mg,
MnSO4·4H2O 22.3mg,CuSO4·5H2O 0.025mg,ZnSO4·7H2O 8.6mg,Na2-EDTA·2H2O37.3mg,FeSO4·7H2O 27.8mg,VB1 0.1mg,VB6 0.5mg,烟酸0.5mg,肌醇100mg,甘氨酸2mg,水解酪蛋白2g,麦芽糖30g,琼脂3g,激动素2mg,萘乙酸1mg,去离子水加至1L;倒平板之前加入潮霉素并使其浓度为50mg/L。
再生培养基:CaCl2·2H2O 440mg,KH2PO4 170mg,MgSO4·7H2O 370mg,NH4NO31650mg,KNO3 1900mg,KI 0.83mg,CoCl2·6H2O 0.025mg,H3BO3 6.2mg,Na2MoO4·2H2O0.25mg,MnSO4·4H2O 22.3mg,CuSO4·5H2O 0.025mg,ZnSO4·7H2O 8.6mg,Na2-EDTA·2H2O37.3mg,FeSO4·7H2O 27.8mg,VB1 0.1mg,VB6 0.5mg,烟酸0.5mg,肌醇100mg,甘氨酸2mg,水解酪蛋白2g,麦芽糖30g,琼脂6g,激动素2mg,萘乙酸1mg,去离子水加至1L;倒平板之前加入潮霉素并使其浓度为50mg/L。
实施例4、转基因植株的鉴定
1.OsNBARC1基因互补植株的鉴定
待测植株:受体品种黄华占(HHZ)以及实施例3得到的OsNBARC1基因互补植株、转基因空载对照植株。
提取待测植株基因组DNA,以基因组DNA为模板,利用引物:
p1300-VF:5’-CAGGAAACAGCTATGACC-3’,
OsNBARC1-CPR:5’-TGAATCGCGTCAAGATCTCA-3’;
进行PCR扩增,用pCAMBIA1300-OsNBARC1质粒作为阳性对照,用受体品种黄华占作为阴性对照。
将PCR扩增产物进行1%琼脂糖凝胶电泳,阳性对照和阳性OsNBARC1互补转基因植株均显示741bp的条带,转基因空载对照植株与阴性对照不能扩增出任何条带。部分样品的电泳图见图1。选取三个阳性OsNBARC1基因互补转基因株系分别记为CP-1、CP-2、CP-3。
2.OsNBARC1基因敲除植株的鉴定
待测植株:受体品种FF329以及实施例3得到的OsNBARC1基因敲除植株、基因敲除空载对照植株。
提取待测植株的基因组DNA,以基因组DNA为模板,使用引物:
OsNBARC1-TF:5’-CCCATCCTTCAATCCTTGACT-3’,
OsNBARC1-TR:5’-CCATCTTGAGCTTCTTGGGC-3’;
进行PCR扩增,以受体品种FF329为阴性对照。
将得到的PCR扩增产物进行1%琼脂糖凝胶电泳,阴性对照显示约751bp的条带。
将PCR扩增产物进行测序,将OsNBARC1基因敲除植株的PCR扩增产物序列与阴性对照进行比对,基因敲除空载对照植株中OsNBARC1基因未发生改变,3个独立的OsNBARC1基因敲除植株(分别为KO-1、KO-2和KO-3)均在OsNBARC1基因的靶点1处发生了5bp的缺失,在靶点2处发生了3bp的缺失。3个敲除株系的测序峰图如图1所示。将序列翻译成氨基酸序列,比较FF329和3个独立的敲除株系发现,OsNBARC1基因敲除后,原有的编码蛋白截短,其生物学功能可能被破坏。3个敲除株系的测序峰图如图2所示,氨基酸序列比较如图3所示。
实施例5、转基因株系的抗白叶枯病鉴定
待测植株为:黄华占(HHZ),阳性OsNBARC1基因互补转基因植株CP-1、CP-2、CP-3(T1代植株,均为纯合基因型),转基因空载对照植株;FF329,OsNBARC1基因基因敲除植株KO-1、KO-2和KO-3(T1代植株,均为纯合基因型),基因敲除空载对照植株。
1、将各待测植株在温室中培养约25天后移栽至网室中进行种植,单株种植,每种植株种植20株。
2、在步骤1水稻植株的分蘖盛期,用白叶枯病菌菌株PXO99A进行接种,采用剪叶法对水稻植株进行人工接种,每株接种5张叶片(菌液浓度为1×109cfu/mL),每个叶片的接种量均相等,均为40μL。
3、接菌约14天后测量各植株叶片的病斑长度,每个叶片沿叶脉有一个病斑,每个植株测量3张接种叶片的病斑长度,计算平均值。
由图4可以看出,黄华占(HHZ)的病斑长度为17.6cm,阳性OsNBARC1基因互补转基因植株CP-1、CP-2和CP-3株系的病斑长度分别为6.9cm、6.5cm和6.7cm,平均降低了约61.9%,均显著短于黄华占的病斑长度,表明OsNBARC1基因能显著提高水稻对白叶枯病的抗病性。由图5可以看出,CRISPR/Cas9敲除载体的受体植物FF329的病斑长度为0.5cm,阳性OsNBARC1基因敲除植株KO-1、KO-2和KO-3的病斑长度分别为2.3cm、1.8cm和1.6cm,平均超出了2.8倍,显著长于FF329的病斑长度,表明敲除OsNBARC1基因能够提高水稻对白叶枯病的感病性。
以上结果表明,OsNBARC1基因正向调控水稻对白叶枯病的抗性。
虽然,上文中已经用一般性说明及具体实施方案对本发明作了详尽的描述,但在本发明基础上,可以对之作一些修改或改进,这对本领域技术人员而言是显而易见的。因此,在不偏离本发明精神的基础上所做的这些修改或改进,均属于本发明要求保护的范围。
序列表
<110> 中国农业科学院作物科学研究所
<120> 水稻OsNBARC1蛋白及其编码基因在调控水稻对白叶枯病抗性中的应用
<130> KHP201110680.9
<160> 29
<170> SIPOSequenceListing 1.0
<210> 1
<211> 273
<212> PRT
<213> Oryza sativa
<400> 1
Met Glu Phe Ala Thr Gly Ala Met Gly Thr Leu Leu Pro Lys Leu Val
1 5 10 15
Glu Leu Leu Lys Glu Gln Tyr Asp Leu Gln Lys Ser Val Lys Glu Gly
20 25 30
Ile Thr Phe Leu Ile Ala Glu Leu Lys Ser Ile Gln Ala Ala Leu Glu
35 40 45
Lys Val Ser Lys Val Pro Leu Asp Gln Leu Asp Glu Gln Thr Lys Ile
50 55 60
Trp Ala Trp Asp Ile Arg Glu Leu Ser Tyr Asp Ile Glu Asp Asn Ile
65 70 75 80
Asp Thr Phe Met Ile Cys Val Asp Gly Leu Glu Pro Ala Lys Lys Gln
85 90 95
Asn Leu Thr Trp Leu Ile Asp Lys Cys His Lys Ser Leu Ser Lys Ile
100 105 110
Lys Ile Arg His Lys Ile Ala Asn Glu Ile Lys Asp Ile Lys Ser Gln
115 120 125
Val Arg Glu Val Met Glu Arg Arg Asp Arg Tyr Lys Ile Asp Asp Val
130 135 140
Ala Thr Ile Pro Pro Thr Phe Val Asp Pro Arg Ile Leu Thr Leu Tyr
145 150 155 160
Glu Asn Val Thr Lys Leu Val Gly Val Asp Lys Ala Ser Asp Asp Leu
165 170 175
Met Lys Arg Leu Ser Val Gly Asp Glu Ala Pro Lys Lys Leu Lys Met
180 185 190
Val Ser Val Val Gly Ile Gly Gly Leu Gly Lys Thr Thr Leu Ser Lys
195 200 205
Val Val Phe Asp Lys Leu Lys Leu Gln Phe Asp Cys Ala Ala Phe Val
210 215 220
Pro Val Gly Gln Asn Pro Glu Ile Lys Lys Val Leu Lys Asp Ile Leu
225 230 235 240
Val Glu Leu Asn Lys Asp Lys Tyr Met Ser Phe Asp Val Thr Thr Val
245 250 255
Asn Glu Arg His Met Ile Asn Glu Leu Arg Glu Tyr Leu Asp Asn Arg
260 265 270
Arg
<210> 2
<211> 5015
<212> DNA
<213> 水稻(Oryza sativa)
<400> 2
actcactcca aatcctgagt agtccatggc gactccaccc acctgagcag aaagatctcc 60
tccaccacca ccagcagcag cagcatcagc caagagcagc aagaagccaa gaacaagagc 120
ttggctctcc aattcttttg caaggtcagc tgcattcgat tcaagtgtac tcccccctct 180
actttgcggt tgcagtttgt aggtgaacac ttttctgtcc tgagttgtta ggcatctgca 240
aggacgtctg aaacatttgg agagaacaca acaattaatc tgggtagact gtgtttttat 300
tgtgtaaaac tgggaaggaa acaaatacta ccagatctga acaaactatg taggaactgg 360
tcatctgata gttgtgtctg tcagaagatt tggggattaa cggttactat tgacttagct 420
caaagagcat ataaatgtgt acaagataag agagaaatcc ataataccct caatactctt 480
atcagtgtct ggtgagagtt aaagttacag aggatgccac aatcatcttc tctttctgca 540
tttgaatgaa catctgaaac agctatatac aattgaagaa atttgtgctt tgttgtgact 600
ctatgagatc ttgacgcgat tcattcggat cctgaattat tgttgttagt ccttaacaaa 660
tactattgtt gttacttaca gatattgagt gagtttggct agcaaggata tagacctgac 720
tacctaataa ctgtattctg tcctctattt aatagcttca gcagtttcaa tgattattga 780
gtttcgcttt ctttcaaaac tctgccttta tgtgtaaaca tgcttcgcca gctcttttgc 840
caaaatttcc catccttcaa tccttgactg ctaacagatt tcttatatgc tttttcattc 900
cagcagtgct tctcaaaatg gtttcatgtg tgaaccgagg cagctgtctg gtggtgaaca 960
gcaccatata atcatcacaa taaacagaga ggaggggggt ggggcgtagt aaaccatcag 1020
gaatggagtt cgccacaggg gcaatgggca cgctcctccc caagctggtg gagctgctca 1080
aggaacaata tgatctgcag aagagtgtga aggaggggat aacattcctc atagctgagc 1140
tcaagagcat acaagcagca cttgagaagg tctcaaaggt gccgctagac caacttgacg 1200
agcaaaccaa gatctgggct tgggacatta gggagttgtc ttatgacatt gaggacaaca 1260
ttgatacctt catgatatgt gtggatggtc ttgagccagc caagaaacag aatttaacat 1320
ggttaattga caagtgccac aaatcgttgt ccaagataaa gatccgacac aaaatagcca 1380
atgaaatcaa agatatcaag agccaagtca gggaggtgat ggaacgacgt gataggtaca 1440
agattgatga tgtcgctact attcctccaa catttgtgga tcctcgcatc ttgacattat 1500
atgagaatgt caccaagctt gttggggttg ataaggcaag tgatgatcta atgaagaggt 1560
tgtctgtggg ggatgaggcg cccaagaagc tcaagatggt ctctgttgtt ggaattggag 1620
gattgggcaa gacaactctt tccaaagtag tgtttgacaa gcttaaactg caatttgatt 1680
gtgctgcttt tgttcctgtc ggtcaaaacc ctgaaatcaa gaaagtcctg aaggacatcc 1740
tagttgaact taacaaggac aagtacatgt catttgatgt aacaacagta aatgaaaggc 1800
atatgattaa tgagcttcga gaataccttg acaataggag gtaagtgtgt agtaccctcc 1860
aatatttttg cttttcatga tgaacttatt ctcatggttg caatagttgt agacctttat 1920
ctgtattact ggtatatata actttttcta tatttcttta ataaaaaaag aatgaaaatg 1980
ttgcatagat caggaaaaca gaaaatgcaa cgaattctaa tgttaattgc agaacaggaa 2040
aaatatattt aactatctaa ctacattaat ccactcgttg ctagtgccag agaccaattt 2100
gatctaaaac cctttgattc aatagactta aataataaga tgagaattat gtttgcacac 2160
aaatgtcttg ggcactcata ttgcttcagt tttagaaaat agtaattaaa taatctctta 2220
tttatatatc agtacagttt atcatttcac taatccatga cccttctatt ctcatgggga 2280
taggtacttg attgttattg atgacgtatg ggagacatca aaatggaaca ttattaaatg 2340
tgctttgatt gatagtaatc gtggaagtag agtaatcata acaactcgta tttatcaagt 2400
tgctaatgaa gctgctgaag aatttggtgg tgtttacatg atggaaccac tttctgatga 2460
taactcaaaa aagttattct acaatagaat atttggtgtt gcctgcagta gttcaactgg 2520
taatcaatcg gttgaggcaa ccaaaaagat cttacataaa tgtggtggca taccactatc 2580
tataattgca atagctagtt tgttggttga taaaccaaca ggagactggt ctataattta 2640
tgactctata ggttttggga ctggagatcg aaatgaggcg gttcagaaca caaggaagat 2700
attgtctttt agctactatc acttaccctc atacctaaag acttgtatgt tgtacctaag 2760
catatatcca gaagatcatt tgattaaaaa ggatactttg atatggaagt gggtagctga 2820
aggctttgtc caagaggaac aagataaggc attatttgag gtcggcgaga ggtactttat 2880
tgagcttata aatagaagca tgatccagcc aatggagaat gatggtaaga tttctggctg 2940
ccacatacat gacatggtgt tagatcttat ccgaaacata atagccgaag aaaactttgt 3000
aaaagtattc gacaaactac atgaggtgca caggttgtct tcacagagga gtactgtccg 3060
taggatagca ctgcatgaga gttggaacca aggcaaaaac aatgaccttg ctgttggcat 3120
gacacaattg aggtcattca atgccatcaa gtgtactatt agcatgatgc cctcgcttct 3180
gagcttccag gttctacgcg tgctagagct acaaggctgt aatgtcacag gaggtttata 3240
cctcaagcat atcggaaagc tacgtcagtt gaggtaccta ggaatgagag gcacacgtgt 3300
tgctgagctt ccagtggaaa tagggaatct gatgcacctg cagacactag atgtccgata 3360
cacaggtctg aaggaactgc cgtcgaccat ttgtaagcta agcaagctga tgcggctgtg 3420
cgtcgctgga ggaacgggcg tgctgatggg tggttggaat ctgagttcac tgcaatacct 3480
aaagatgggc tatggttgca tcaaaagtaa caaagacttc gccatagaag tgggcaagct 3540
gatggagctg agaatcctca agatttatgt agagaacaag tttgacaagg gcacgaagaa 3600
cgctttgcta cagtctctgt gctgcttgcg tagactccag aacctgatga tagatttccc 3660
cttgccattt cagaatacga tgagcatctg ggatggctgg gacctctggg agccctcacc 3720
tcagctccgt gtgttccgta tatgcggcat tgagctgcct cggcttccag agtgggtgaa 3780
ctccatgtgc gtcccgtacc tatccgagct gcgacttgac gtggtagcca tggaagcacg 3840
ggacctggac atgcttgcaa ggatgccagc actccgcaca ctctgcctga gaacccaggc 3900
gagattttcg tggacagttg gtggtgccgg actgtttccg aacctgagat tctgtaggat 3960
ggacatagca ctcacatttc ttcaaggagc catgccgatg ctcatgaagc ttcaattatg 4020
gctgtgggcg tctgaatatt gtgccgccac tgacgttgga ttggggcacc tccctctgct 4080
caatcgcgtc gaagttatcc tccactgctg cgatgcgact accaggcagg tggaggaagc 4140
agaggcggcg tggaggcaca tggtgaattc tcacccgaac cgtcccgcca ttcgtgtgtc 4200
ccgacttgaa gaggtatggt tggtttggtt aatcatgatt aatcaattgg ttagttcaca 4260
ttcccctacc tacacgcacg cctccccact tctgactgcc ctccaaattc tgtaaccaat 4320
cagctttact tgttctcaat tgacgtattt cgttcctcag ttcatatcgc tctcgcactt 4380
tgtttttcag taccggatga aaggagatga agataatgat gatgaggaga tttcagctaa 4440
ggatcacgtt gacggaaatt gtgacgatgg gaattcagca tatacggacc aagaggtgct 4500
gcgcttgcgc ctgccatgca taactattcg atcctggttg catgattaat tacatgctct 4560
tggttactga ccggaggtta attagtcgcc tgttctagcc ggacaatgat ttagccaaag 4620
aggaggaaga ggaggaggct acgaaccaat cttgaaccgg atctcttcac tcattcggtc 4680
atgctttcag gtacacatgt accaaagttg cacatcaaaa tcttcatgac attcttcaac 4740
tttaatcata cgcttatctc taacttttat tcccggctgt aattaaacag cggcagctgc 4800
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ttcgctgggc cttttttttt atttttttgt tgctgttggt tttctttccc tgttttttct 4920
caagaattta tatagtgtgg tttgtaataa tggttgtctc ggttacaata aggcccaagt 4980
aggctcagac agaaattccg agcatattgg ccgct 5015
<210> 3
<211> 822
<212> DNA
<213> 水稻(Oryza sativa)
<400> 3
atggagttcg ccacaggggc aatgggcacg ctcctcccca agctggtgga gctgctcaag 60
gaacaatatg atctgcagaa gagtgtgaag gaggggataa cattcctcat agctgagctc 120
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caaaccaaga tctgggcttg ggacattagg gagttgtctt atgacattga ggacaacatt 240
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ttaattgaca agtgccacaa atcgttgtcc aagataaaga tccgacacaa aatagccaat 360
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attgatgatg tcgctactat tcctccaaca tttgtggatc ctcgcatctt gacattatat 480
gagaatgtca ccaagcttgt tggggttgat aaggcaagtg atgatctaat gaagaggttg 540
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<211> 6309
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<213> 水稻(Oryza sativa)
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tagctcaaag agcatataaa tgtgtacaag ataagagaga aatccataat accctcaata 540
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ctgcatttga atgaacatct gaaacagcta tatacaattg aagaaatttg tgctttgttg 660
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cctccaatat ttttgctttt catgatgaac ttattctcat ggttgcaata gttgtagacc 1980
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ggcatgacac aattgaggtc attcaatgcc atcaagtgta ctattagcat gatgccctcg 3240
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tacctaaaga tgggctatgg ttgcatcaaa agtaacaaag acttcgccat agaagtgggc 3600
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gtgaactcca tgtgcgtccc gtacctatcc gagctgcgac ttgacgtggt agccatggaa 3900
gcacgggacc tggacatgct tgcaaggatg ccagcactcc gcacactctg cctgagaacc 3960
caggcgagat tttcgtggac agttggtggt gccggactgt ttccgaacct gagattctgt 4020
aggatggaca tagcactcac atttcttcaa ggagccatgc cgatgctcat gaagcttcaa 4080
ttatggctgt gggcgtctga atattgtgcc gccactgacg ttggattggg gcacctccct 4140
ctgctcaatc gcgtcgaagt tatcctccac tgctgcgatg cgactaccag gcaggtggag 4200
gaagcagagg cggcgtggag gcacatggtg aattctcacc cgaaccgtcc cgccattcgt 4260
gtgtcccgac ttgaagaggt atggttggtt tggttaatca tgattaatca attggttagt 4320
tcacattccc ctacctacac gcacgcctcc ccacttctga ctgccctcca aattctgtaa 4380
ccaatcagct ttacttgttc tcaattgacg tatttcgttc ctcagttcat atcgctctcg 4440
cactttgttt ttcagtaccg gatgaaagga gatgaagata atgatgatga ggagatttca 4500
gctaaggatc acgttgacgg aaattgtgac gatgggaatt cagcatatac ggaccaagag 4560
gtgctgcgct tgcgcctgcc atgcataact attcgatcct ggttgcatga ttaattacat 4620
gctcttggtt actgaccgga ggttaattag tcgcctgttc tagccggaca atgatttagc 4680
caaagaggag gaagaggagg aggctacgaa ccaatcttga accggatctc ttcactcatt 4740
cggtcatgct ttcaggtaca catgtaccaa agttgcacat caaaatcttc atgacattct 4800
tcaactttaa tcatacgctt atctctaact tttattcccg gctgtaatta aacagcggca 4860
gctgcagggc aagagaagaa taaaagggag aagagtagag cggaattgaa gagaaactca 4920
tctccttcgc tgggcctttt tttttatttt tttgttgctg ttggttttct ttccctgttt 4980
tttctcaaga atttatatag tgtggtttgt aataatggtt gtctcggtta caataaggcc 5040
caagtaggct cagacagaaa ttccgagcat attggccgct aaactgtcat gtgtgatttt 5100
tacactatgc ttgtttctca tgatcacctg ttttacttga ttcaaaggtt gttggttgga 5160
acatggaagc atttgtttca gatatgacga tcgtggtagt agcacctgaa ttctgaaagc 5220
agccggcaga aacagcacac catactgatg ccttgaccca ggactacatg atatatgatg 5280
cacaggaatg tcggtacttt gttttccttt gcttttcaca cacatgtagc aaagcagaag 5340
atctgcagca agttcgcagc ggaaaatgta caccgtattc ctgtgtgtct gtgttcttgt 5400
ctgtgcgtgc ctgtgatcca ggagctgtgc ttgctctcct ggagtccggt gagcgaggaa 5460
caggaaatgg cgagcttcct tccattgacc tgctacaccg atagaattga gcatattgca 5520
aataaaaagt aagttcagac tcaaggcgga agacaaacca tgaaccatgt ggtgctcata 5580
attaagttca gcacgaaaaa aaccatagga ggaatccata ccaacgtgtt tggcacagag 5640
tctcggtttg gaaacatgct aaatgttata attcgaaatc ttaactgtcg cagaaaaaaa 5700
aattctccag tttggtagaa tacactaaaa attacatgtt ttcaaataga accctcatta 5760
acaaacaaat tcctgagttt aaagcagagc taagtgaact tcaagtttga tgagtaataa 5820
ttaatgtgat tccggtggga atcatgttag attaattcat gagttccaaa gtatcgaggg 5880
atatgtttga ctttgattcc ctccaaaatg cacgcgaact taaaatgaaa ggcctcttaa 5940
taaagtttac atttatacaa aagttgaaaa aaaaatgatc ttcattagca tataacaatg 6000
catactgtct tcattagcat aaaaatgcat actgcaggct aatgcagaat acaatatgaa 6060
acaaaataat ctaaatctca tggtgtattt atagcaaaaa gaaatgtcga tttaagtaca 6120
attaatctac cataatctaa aaaacatcat aagctgccat ccatacaaac gaaattaagc 6180
cgaggactaa tcacatgtgc ataatataca taagagctta cataagatta cactagctaa 6240
ttaatcaact agctagctta gtgaaggtga gagagtatta gtgtcgtcga gataagagtg 6300
gctgctttt 6309
<210> 5
<211> 633
<212> DNA
<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<400> 5
ttcagaggtc tctctcgact agtatggaat cggcagcaaa ggattttttc ctgtagtttt 60
cccacaacca ttttttacca tccgaatgat aggataggaa aaatatccaa gtgaacagta 120
ttcctataaa attcccgtaa aaagcctgca atccgaatga gccctgaagt ctgaactagc 180
cggtcacctg tacaggctat cgagatgcca tacaagagac ggtagtagga actaggaaga 240
cgatggttga ttcgtcaggc gaaatcgtcg tcctgcagtc gcatctatgg gcctggacgg 300
aataggggaa aaagttggcc ggataggagg gaaaggccca ggtgcttacg tgcgaggtag 360
gcctgggctc tcagcacttc gattcgttgg caccggggta ggatgcaata gagagcaacg 420
tttagtacca cctcgcttag ctagagcaaa ctggactgcc ttatatgcgc gggtgctggc 480
ttggctgccg cacgctcctc cccaagctgg gttttagagc tagaaatagc aagttaaaat 540
aaggctagtc cgttatcaac ttgaaaaagt ggcaccgagt cggtgctttt tttcaagagc 600
ttggagtgga tggaccctga cgagacccac gct 633
<210> 6
<211> 103
<212> DNA
<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<400> 6
cacgctcctc cccaagctgg gttttagagc tagaaatagc aagttaaaat aaggctagtc 60
cgttatcaac ttgaaaaagt ggcaccgagt cggtgctttt ttt 103
<210> 7
<211> 519
<212> DNA
<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<400> 7
ttcagaggtc tctctgacac tggaatcggc agcaaaggat gcaagaacga actaagccgg 60
acaaaaaaaa aaggagcaca tatacaaacc ggttttattc atgaatggtc acgatggatg 120
atggggctca gacttgagct acgaggccgc aggcgagaga agcctagtgt gctctctgct 180
tgtttgggcc gtaacggagg atacggccca cgagcgtgta ctaccgcgcg ggatgccgct 240
gggcgctgcg ggggccgttg gatggggatc ggtgggtcgc gggagcgttg aggggagaca 300
ggtttagtac cacctcgcct accgaacaat gaagaaccca ccttataacc ccgcgcgctg 360
ccgcttgtgt tgagccaagt cagggaggtg agttttagag ctagaaatag caagttaaaa 420
taaggctagt ccgttatcaa cttgaaaaag tggcaccgag tcggtgcttt ttttcaagag 480
cttggagtgg atggatacgc gtcggtcgag acccacgct 519
<210> 8
<211> 102
<212> DNA
<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<400> 8
agccaagtca gggaggtgag ttttagagct agaaatagca agttaaaata aggctagtcc 60
gttatcaact tgaaaaagtg gcaccgagtc ggtgcttttt tt 102
<210> 9
<211> 23
<212> DNA
<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<400> 9
actcactcca aatcctgagt agt 23
<210> 10
<211> 21
<212> DNA
<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<400> 10
agcggccaat atgctcggaa t 21
<210> 11
<211> 20
<212> DNA
<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<400> 11
atggagttcg ccacaggggc 20
<210> 12
<211> 26
<212> DNA
<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<400> 12
ttacctccta ttgtcaaggt attctc 26
<210> 13
<211> 21
<212> DNA
<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<400> 13
ttggaagagc gagagacttc g 21
<210> 14
<211> 22
<212> DNA
<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<400> 14
aaaagcagcc actcttatct cg 22
<210> 15
<211> 42
<212> DNA
<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<400> 15
gagctcggta cccggggatc cttggaagag cgagagactt cg 42
<210> 16
<211> 43
<212> DNA
<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<400> 16
acgacggcca gtgccaagct taaaagcagc cactcttatc tcg 43
<210> 17
<211> 22
<212> DNA
<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<400> 17
ctccgtttta cctgtggaat cg 22
<210> 18
<211> 37
<212> DNA
<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<400> 18
ccagcttggg gaggagcgtg cggcagccaa gccagca 37
<210> 19
<211> 37
<212> DNA
<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<400> 19
cacgctcctc cccaagctgg gttttagagc tagaaat 37
<210> 20
<211> 20
<212> DNA
<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<400> 20
cggaggaaaa ttccatccac 20
<210> 21
<211> 42
<212> DNA
<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<400> 21
ttcagaggtc tctctcgact agtatggaat cggcagcaaa gg 42
<210> 22
<211> 37
<212> DNA
<213> 人工序列(Artificial Sequence)
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agcgtgggtc tcgtcagggt ccatccactc caagctc 37
<210> 23
<211> 35
<212> DNA
<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<400> 23
tcacctccct gacttggctc aacacaagcg gcagc 35
<210> 24
<211> 36
<212> DNA
<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<400> 24
agccaagtca gggaggtgag ttttagagct agaaat 36
<210> 25
<211> 42
<212> DNA
<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<400> 25
agcgtgggtc tcgaccgacg cgtatccatc cactccaagc tc 42
<210> 26
<211> 18
<212> DNA
<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<400> 26
caggaaacag ctatgacc 18
<210> 27
<211> 20
<212> DNA
<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<400> 27
tgaatcgcgt caagatctca 20
<210> 28
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<212> DNA
<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<400> 28
cccatccttc aatccttgac t 21
<210> 29
<211> 20
<212> DNA
<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<400> 29
ccatcttgag cttcttgggc 20

Claims (10)

1.水稻OsNBARC1蛋白或其编码基因或水稻OsNBARC1蛋白编码基因的启动子驱动基因组全长序列在调控水稻对白叶枯病抗性中的应用。
2.水稻OsNBARC1蛋白或其编码基因或水稻OsNBARC1蛋白编码基因的启动子驱动基因组全长序列在水稻遗传育种或转基因水稻制备中的应用。
3.根据权利要求1或2所述的应用,其特征在于,通过提高所述水稻OsNBARC1蛋白编码基因的表达量,提高水稻的抗白叶枯病能力。
4.根据权利要求3所述的应用,其特征在于,所述提高所述水稻OsNBARC1蛋白编码基因的表达量为通过基因互补技术将所述水稻OsNBARC1蛋白编码基因的启动子驱动基因组全长序列转化至所述水稻中构建OsNBARC1互补转基因植株。
5.根据权利要求1-4任一项所述的应用,其特征在于,所述水稻OsNBARC1蛋白具有如下任一种氨基酸序列:
i)如SEQ ID NO.1所示的氨基酸序列;
ii)如SEQ ID NO.1所示的氨基酸序列经取代、缺失和/或增加一个或多个氨基酸的替换、插入或缺失得到的具有相同功能蛋白的氨基酸序列;
iii)与如SEQ ID NO.1所示的氨基酸序列具有至少80%同源性的氨基酸序列;优选地,所述同源性至少90%;更优选为95%。
6.水稻OsNBARC1蛋白编码基因的启动子驱动基因组全长序列,其特征在于,所述水稻OsNBARC1蛋白编码基因的启动子驱动基因组全长序列包括如SEQ ID NO.4所示核苷酸序列;
所述水稻OsNBARC1蛋白具有如下任一种氨基酸序列:
i)如SEQ ID NO.1所示的氨基酸序列;
ii)如SEQ ID NO.1所示的氨基酸序列经取代、缺失和/或增加一个或多个氨基酸的替换、插入或缺失得到的具有相同功能蛋白的氨基酸序列;
iii)与如SEQ ID NO.1所示的氨基酸序列具有至少80%同源性的氨基酸序列;优选地,所述同源性至少90%;更优选为95%。
7.一种生物材料,其特征在于,所述生物材料包括权利要求6所述水稻OsNBARC1蛋白编码基因的启动子驱动基因组全长序列,所述生物材料包括表达盒、载体或转基因植物细胞。
8.一种调控水稻对白叶枯病抗性的方法,其特征在于,包括:
调控水稻中水稻OsNBARC1蛋白编码基因的表达量;
所述水稻OsNBARC1蛋白编码基因具有如下任一种核苷酸序列:
i)如SEQ ID NO.2所示的核苷酸序列;
ii)如SEQ ID NO.2所示的核苷酸序列经取代、缺失和/或增加一个或多个核苷酸的替换、插入或缺失得到的编码相同功能蛋白的核苷酸序列;
优选地,所述水稻OsNBARC1蛋白编码基因的编码区的核苷酸序列如SEQ ID NO.3所示。
9.根据权利要求8所述的方法,其特征在于,通过提高所述水稻中所述水稻OsNBARC1蛋白编码基因的表达量,提高水稻的抗白叶枯病能力;或者,通过将OsNBARC1互补转基因植株与其他株系杂交,培育抗白叶枯病株系。
10.根据权利要求9所述的方法,其特征在于,所述提高所述水稻中所述水稻OsNBARC1蛋白编码基因的表达量为通过基因互补技术将权利要求6所述水稻OsNBARC1蛋白编码基因的启动子驱动基因组全长序列转化至所述水稻中构建OsNBARC1互补转基因植株。
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