CN111154892A - 绵羊bmpr1b基因插入/缺失多态性检测用引物对、试剂盒、方法和应用 - Google Patents
绵羊bmpr1b基因插入/缺失多态性检测用引物对、试剂盒、方法和应用 Download PDFInfo
- Publication number
- CN111154892A CN111154892A CN202010085634.7A CN202010085634A CN111154892A CN 111154892 A CN111154892 A CN 111154892A CN 202010085634 A CN202010085634 A CN 202010085634A CN 111154892 A CN111154892 A CN 111154892A
- Authority
- CN
- China
- Prior art keywords
- sheep
- deletion
- polymorphism
- bmpr1b
- bmpr1b gene
- Prior art date
- Legal status (The legal status is an assumption and is not a legal conclusion. Google has not performed a legal analysis and makes no representation as to the accuracy of the status listed.)
- Granted
Links
- 241001494479 Pecora Species 0.000 title claims abstract description 109
- 238000003780 insertion Methods 0.000 title claims abstract description 88
- 230000037431 insertion Effects 0.000 title claims abstract description 88
- 238000012217 deletion Methods 0.000 title claims abstract description 86
- 230000037430 deletion Effects 0.000 title claims abstract description 86
- 101150100446 BMPR1B gene Proteins 0.000 title claims abstract description 62
- 238000000034 method Methods 0.000 title claims abstract description 30
- 238000003752 polymerase chain reaction Methods 0.000 claims abstract description 20
- 238000001962 electrophoresis Methods 0.000 claims abstract description 16
- 230000003321 amplification Effects 0.000 claims abstract description 14
- 238000003199 nucleic acid amplification method Methods 0.000 claims abstract description 14
- 239000012634 fragment Substances 0.000 claims abstract description 12
- 238000012408 PCR amplification Methods 0.000 claims description 13
- 238000000137 annealing Methods 0.000 claims description 12
- 238000006243 chemical reaction Methods 0.000 claims description 12
- 238000001514 detection method Methods 0.000 claims description 12
- 239000003550 marker Substances 0.000 claims description 10
- 239000003147 molecular marker Substances 0.000 claims description 10
- 238000009394 selective breeding Methods 0.000 claims description 7
- 238000011144 upstream manufacturing Methods 0.000 claims description 6
- 241000283903 Ovis aries Species 0.000 claims description 5
- 210000003754 fetus Anatomy 0.000 claims description 5
- 239000011543 agarose gel Substances 0.000 claims description 4
- 238000004925 denaturation Methods 0.000 claims description 4
- 230000036425 denaturation Effects 0.000 claims description 4
- 238000012257 pre-denaturation Methods 0.000 claims description 4
- 108020004414 DNA Proteins 0.000 description 29
- 108090000623 proteins and genes Proteins 0.000 description 15
- 238000009395 breeding Methods 0.000 description 10
- 230000001488 breeding effect Effects 0.000 description 10
- 238000000246 agarose gel electrophoresis Methods 0.000 description 9
- 239000000243 solution Substances 0.000 description 8
- 108700028369 Alleles Proteins 0.000 description 7
- 238000004458 analytical method Methods 0.000 description 6
- 238000010219 correlation analysis Methods 0.000 description 6
- 230000000694 effects Effects 0.000 description 6
- 230000002068 genetic effect Effects 0.000 description 5
- 102100027052 Bone morphogenetic protein receptor type-1B Human genes 0.000 description 4
- LFQSCWFLJHTTHZ-UHFFFAOYSA-N Ethanol Chemical compound CCO LFQSCWFLJHTTHZ-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 4
- 101000984546 Homo sapiens Bone morphogenetic protein receptor type-1B Proteins 0.000 description 4
- 235000019687 Lamb Nutrition 0.000 description 4
- FAPWRFPIFSIZLT-UHFFFAOYSA-M Sodium chloride Chemical compound [Na+].[Cl-] FAPWRFPIFSIZLT-UHFFFAOYSA-M 0.000 description 4
- 239000003153 chemical reaction reagent Substances 0.000 description 4
- 238000010369 molecular cloning Methods 0.000 description 4
- 230000035772 mutation Effects 0.000 description 4
- 102000004169 proteins and genes Human genes 0.000 description 4
- 238000011160 research Methods 0.000 description 4
- 239000000523 sample Substances 0.000 description 4
- 210000001519 tissue Anatomy 0.000 description 4
- XLYOFNOQVPJJNP-UHFFFAOYSA-N water Substances O XLYOFNOQVPJJNP-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 4
- QTBSBXVTEAMEQO-UHFFFAOYSA-N Acetic acid Chemical compound CC(O)=O QTBSBXVTEAMEQO-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 3
- 241001465754 Metazoa Species 0.000 description 3
- HEMHJVSKTPXQMS-UHFFFAOYSA-M Sodium hydroxide Chemical compound [OH-].[Na+] HEMHJVSKTPXQMS-UHFFFAOYSA-M 0.000 description 3
- KRKNYBCHXYNGOX-UHFFFAOYSA-N citric acid Chemical compound OC(=O)CC(O)(C(O)=O)CC(O)=O KRKNYBCHXYNGOX-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 3
- 238000000746 purification Methods 0.000 description 3
- 238000012163 sequencing technique Methods 0.000 description 3
- 108010040422 Bone Morphogenetic Protein Receptors Proteins 0.000 description 2
- 102000001893 Bone Morphogenetic Protein Receptors Human genes 0.000 description 2
- HEDRZPFGACZZDS-UHFFFAOYSA-N Chloroform Chemical compound ClC(Cl)Cl HEDRZPFGACZZDS-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- KCXVZYZYPLLWCC-UHFFFAOYSA-N EDTA Chemical compound OC(=O)CN(CC(O)=O)CCN(CC(O)=O)CC(O)=O KCXVZYZYPLLWCC-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- 101100377356 Homo sapiens ZNF395 gene Proteins 0.000 description 2
- ISWSIDIOOBJBQZ-UHFFFAOYSA-N Phenol Chemical compound OC1=CC=CC=C1 ISWSIDIOOBJBQZ-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- WCUXLLCKKVVCTQ-UHFFFAOYSA-M Potassium chloride Chemical compound [Cl-].[K+] WCUXLLCKKVVCTQ-UHFFFAOYSA-M 0.000 description 2
- DBMJMQXJHONAFJ-UHFFFAOYSA-M Sodium laurylsulphate Chemical compound [Na+].CCCCCCCCCCCCOS([O-])(=O)=O DBMJMQXJHONAFJ-UHFFFAOYSA-M 0.000 description 2
- CZMRCDWAGMRECN-UGDNZRGBSA-N Sucrose Chemical compound O[C@H]1[C@H](O)[C@@H](CO)O[C@@]1(CO)O[C@@H]1[C@H](O)[C@@H](O)[C@H](O)[C@@H](CO)O1 CZMRCDWAGMRECN-UGDNZRGBSA-N 0.000 description 2
- 229930006000 Sucrose Natural products 0.000 description 2
- 108010006785 Taq Polymerase Proteins 0.000 description 2
- 239000007983 Tris buffer Substances 0.000 description 2
- 101150023866 ZNF395 gene Proteins 0.000 description 2
- 238000000540 analysis of variance Methods 0.000 description 2
- UDSAIICHUKSCKT-UHFFFAOYSA-N bromophenol blue Chemical compound C1=C(Br)C(O)=C(Br)C=C1C1(C=2C=C(Br)C(O)=C(Br)C=2)C2=CC=CC=C2S(=O)(=O)O1 UDSAIICHUKSCKT-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- 238000004364 calculation method Methods 0.000 description 2
- 210000004027 cell Anatomy 0.000 description 2
- HVYWMOMLDIMFJA-DPAQBDIFSA-N cholesterol Chemical compound C1C=C2C[C@@H](O)CC[C@]2(C)[C@@H]2[C@@H]1[C@@H]1CC[C@H]([C@H](C)CCCC(C)C)[C@@]1(C)CC2 HVYWMOMLDIMFJA-DPAQBDIFSA-N 0.000 description 2
- 238000013461 design Methods 0.000 description 2
- 238000005516 engineering process Methods 0.000 description 2
- 229960005542 ethidium bromide Drugs 0.000 description 2
- ZMMJGEGLRURXTF-UHFFFAOYSA-N ethidium bromide Chemical compound [Br-].C12=CC(N)=CC=C2C2=CC=C(N)C=C2[N+](CC)=C1C1=CC=CC=C1 ZMMJGEGLRURXTF-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- 230000006870 function Effects 0.000 description 2
- 239000000499 gel Substances 0.000 description 2
- 230000007614 genetic variation Effects 0.000 description 2
- 238000003384 imaging method Methods 0.000 description 2
- PHTQWCKDNZKARW-UHFFFAOYSA-N isoamylol Chemical compound CC(C)CCO PHTQWCKDNZKARW-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- 238000004519 manufacturing process Methods 0.000 description 2
- 238000002360 preparation method Methods 0.000 description 2
- 239000011780 sodium chloride Substances 0.000 description 2
- 239000005720 sucrose Substances 0.000 description 2
- 108091032973 (ribonucleotides)n+m Proteins 0.000 description 1
- FWLJYHNRACJOJA-UHFFFAOYSA-N 1,2-xylene;cyanide Chemical compound N#[C-].CC1=CC=CC=C1C FWLJYHNRACJOJA-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- OSBLTNPMIGYQGY-UHFFFAOYSA-N 2-amino-2-(hydroxymethyl)propane-1,3-diol;2-[2-[bis(carboxymethyl)amino]ethyl-(carboxymethyl)amino]acetic acid;boric acid Chemical compound OB(O)O.OCC(N)(CO)CO.OC(=O)CN(CC(O)=O)CCN(CC(O)=O)CC(O)=O OSBLTNPMIGYQGY-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- QKNYBSVHEMOAJP-UHFFFAOYSA-N 2-amino-2-(hydroxymethyl)propane-1,3-diol;hydron;chloride Chemical compound Cl.OCC(N)(CO)CO QKNYBSVHEMOAJP-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 108020005345 3' Untranslated Regions Proteins 0.000 description 1
- IKHKJYWPWWBSFZ-UHFFFAOYSA-N 4-[[4-(diethylamino)phenyl]-(4-diethylazaniumylidenecyclohexa-2,5-dien-1-ylidene)methyl]benzene-1,3-disulfonate;hydron Chemical compound C1=CC(N(CC)CC)=CC=C1C(C=1C(=CC(=CC=1)S([O-])(=O)=O)S(O)(=O)=O)=C1C=CC(=[N+](CC)CC)C=C1 IKHKJYWPWWBSFZ-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 229920000936 Agarose Polymers 0.000 description 1
- 102100028727 Bone morphogenetic protein 15 Human genes 0.000 description 1
- 108010067770 Endopeptidase K Proteins 0.000 description 1
- 108700024394 Exon Proteins 0.000 description 1
- WQZGKKKJIJFFOK-GASJEMHNSA-N Glucose Natural products OC[C@H]1OC(O)[C@H](O)[C@@H](O)[C@@H]1O WQZGKKKJIJFFOK-GASJEMHNSA-N 0.000 description 1
- 101000695360 Homo sapiens Bone morphogenetic protein 15 Proteins 0.000 description 1
- 239000007836 KH2PO4 Substances 0.000 description 1
- 241000124008 Mammalia Species 0.000 description 1
- 108091092878 Microsatellite Proteins 0.000 description 1
- 101150051587 SIRT7 gene Proteins 0.000 description 1
- VMHLLURERBWHNL-UHFFFAOYSA-M Sodium acetate Chemical compound [Na+].CC([O-])=O VMHLLURERBWHNL-UHFFFAOYSA-M 0.000 description 1
- 239000008051 TBE buffer Substances 0.000 description 1
- 239000000980 acid dye Substances 0.000 description 1
- 150000001413 amino acids Chemical class 0.000 description 1
- 238000003975 animal breeding Methods 0.000 description 1
- 238000012098 association analyses Methods 0.000 description 1
- WQZGKKKJIJFFOK-VFUOTHLCSA-N beta-D-glucose Chemical compound OC[C@H]1O[C@@H](O)[C@H](O)[C@@H](O)[C@@H]1O WQZGKKKJIJFFOK-VFUOTHLCSA-N 0.000 description 1
- 230000008827 biological function Effects 0.000 description 1
- KGBXLFKZBHKPEV-UHFFFAOYSA-N boric acid Chemical compound OB(O)O KGBXLFKZBHKPEV-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 239000004327 boric acid Substances 0.000 description 1
- 239000000872 buffer Substances 0.000 description 1
- 239000007853 buffer solution Substances 0.000 description 1
- 210000000085 cashmere Anatomy 0.000 description 1
- 238000005119 centrifugation Methods 0.000 description 1
- 235000012000 cholesterol Nutrition 0.000 description 1
- 210000000349 chromosome Anatomy 0.000 description 1
- 238000010276 construction Methods 0.000 description 1
- 230000007547 defect Effects 0.000 description 1
- 239000008367 deionised water Substances 0.000 description 1
- 229910021641 deionized water Inorganic materials 0.000 description 1
- 238000010586 diagram Methods 0.000 description 1
- 230000004069 differentiation Effects 0.000 description 1
- 238000010790 dilution Methods 0.000 description 1
- 239000012895 dilution Substances 0.000 description 1
- BNIILDVGGAEEIG-UHFFFAOYSA-L disodium hydrogen phosphate Chemical compound [Na+].[Na+].OP([O-])([O-])=O BNIILDVGGAEEIG-UHFFFAOYSA-L 0.000 description 1
- 229910000397 disodium phosphate Inorganic materials 0.000 description 1
- 238000009826 distribution Methods 0.000 description 1
- 229940000406 drug candidate Drugs 0.000 description 1
- 238000004043 dyeing Methods 0.000 description 1
- 230000000550 effect on aging Effects 0.000 description 1
- 230000013020 embryo development Effects 0.000 description 1
- 235000019441 ethanol Nutrition 0.000 description 1
- 239000003777 experimental drug Substances 0.000 description 1
- 238000002474 experimental method Methods 0.000 description 1
- 238000000605 extraction Methods 0.000 description 1
- 230000035558 fertility Effects 0.000 description 1
- 230000001605 fetal effect Effects 0.000 description 1
- 238000012252 genetic analysis Methods 0.000 description 1
- 239000008103 glucose Substances 0.000 description 1
- 235000020251 goat milk Nutrition 0.000 description 1
- 210000002503 granulosa cell Anatomy 0.000 description 1
- 230000006872 improvement Effects 0.000 description 1
- 230000003993 interaction Effects 0.000 description 1
- 238000002955 isolation Methods 0.000 description 1
- 244000144972 livestock Species 0.000 description 1
- 235000004213 low-fat Nutrition 0.000 description 1
- 102000006240 membrane receptors Human genes 0.000 description 1
- 108020004084 membrane receptors Proteins 0.000 description 1
- 230000004060 metabolic process Effects 0.000 description 1
- 230000004048 modification Effects 0.000 description 1
- 238000012986 modification Methods 0.000 description 1
- 229910000402 monopotassium phosphate Inorganic materials 0.000 description 1
- 108020004707 nucleic acids Proteins 0.000 description 1
- 102000039446 nucleic acids Human genes 0.000 description 1
- 150000007523 nucleic acids Chemical class 0.000 description 1
- 150000002989 phenols Chemical class 0.000 description 1
- 230000026731 phosphorylation Effects 0.000 description 1
- 238000006366 phosphorylation reaction Methods 0.000 description 1
- 230000035790 physiological processes and functions Effects 0.000 description 1
- 230000008092 positive effect Effects 0.000 description 1
- 239000001103 potassium chloride Substances 0.000 description 1
- 238000012545 processing Methods 0.000 description 1
- 239000002994 raw material Substances 0.000 description 1
- 239000011535 reaction buffer Substances 0.000 description 1
- 108020003175 receptors Proteins 0.000 description 1
- 102000005962 receptors Human genes 0.000 description 1
- 230000009467 reduction Effects 0.000 description 1
- 239000012723 sample buffer Substances 0.000 description 1
- 230000019491 signal transduction Effects 0.000 description 1
- 239000001632 sodium acetate Substances 0.000 description 1
- 235000017281 sodium acetate Nutrition 0.000 description 1
- 239000001509 sodium citrate Substances 0.000 description 1
- NLJMYIDDQXHKNR-UHFFFAOYSA-K sodium citrate Chemical compound O.O.[Na+].[Na+].[Na+].[O-]C(=O)CC(O)(CC([O-])=O)C([O-])=O NLJMYIDDQXHKNR-UHFFFAOYSA-K 0.000 description 1
- 235000019333 sodium laurylsulphate Nutrition 0.000 description 1
- 239000002904 solvent Substances 0.000 description 1
- 238000007619 statistical method Methods 0.000 description 1
- 238000006467 substitution reaction Methods 0.000 description 1
- ZRKFYGHZFMAOKI-QMGMOQQFSA-N tgfbeta Chemical compound C([C@H](NC(=O)[C@H](C(C)C)NC(=O)CNC(=O)[C@H](CCC(O)=O)NC(=O)[C@H](CCCNC(N)=N)NC(=O)[C@H](CC(N)=O)NC(=O)[C@H](CC(C)C)NC(=O)[C@H]([C@@H](C)O)NC(=O)[C@H](CCC(O)=O)NC(=O)[C@H]([C@@H](C)O)NC(=O)[C@H](CC(C)C)NC(=O)CNC(=O)[C@H](C)NC(=O)[C@H](CO)NC(=O)[C@H](CCC(N)=O)NC(=O)[C@@H](NC(=O)[C@H](C)NC(=O)[C@H](C)NC(=O)[C@@H](NC(=O)[C@H](CC(C)C)NC(=O)[C@@H](N)CCSC)C(C)C)[C@@H](C)CC)C(=O)N[C@@H]([C@@H](C)O)C(=O)N[C@@H](C(C)C)C(=O)N[C@@H](CC=1C=CC=CC=1)C(=O)N[C@@H](C)C(=O)N1[C@@H](CCC1)C(=O)N[C@@H]([C@@H](C)O)C(=O)N[C@@H](CC(N)=O)C(=O)N[C@@H](CCC(O)=O)C(=O)N[C@@H](C)C(=O)N[C@@H](CC=1C=CC=CC=1)C(=O)N[C@@H](CCCNC(N)=N)C(=O)N[C@@H](C)C(=O)N[C@@H](CC(C)C)C(=O)N1[C@@H](CCC1)C(=O)N1[C@@H](CCC1)C(=O)N[C@@H](CCCNC(N)=N)C(=O)N[C@@H](CCC(O)=O)C(=O)N[C@@H](CCCNC(N)=N)C(=O)N[C@@H](CO)C(=O)N[C@@H](CCCNC(N)=N)C(=O)N[C@@H](CC(C)C)C(=O)N[C@@H](CC(C)C)C(O)=O)C1=CC=C(O)C=C1 ZRKFYGHZFMAOKI-QMGMOQQFSA-N 0.000 description 1
- 238000013519 translation Methods 0.000 description 1
- LENZDBCJOHFCAS-UHFFFAOYSA-N tris Chemical compound OCC(N)(CO)CO LENZDBCJOHFCAS-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 229910021642 ultra pure water Inorganic materials 0.000 description 1
- 239000012498 ultrapure water Substances 0.000 description 1
- 238000004804 winding Methods 0.000 description 1
Images
Classifications
-
- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
- C12Q—MEASURING OR TESTING PROCESSES INVOLVING ENZYMES, NUCLEIC ACIDS OR MICROORGANISMS; COMPOSITIONS OR TEST PAPERS THEREFOR; PROCESSES OF PREPARING SUCH COMPOSITIONS; CONDITION-RESPONSIVE CONTROL IN MICROBIOLOGICAL OR ENZYMOLOGICAL PROCESSES
- C12Q1/00—Measuring or testing processes involving enzymes, nucleic acids or microorganisms; Compositions therefor; Processes of preparing such compositions
- C12Q1/68—Measuring or testing processes involving enzymes, nucleic acids or microorganisms; Compositions therefor; Processes of preparing such compositions involving nucleic acids
- C12Q1/6876—Nucleic acid products used in the analysis of nucleic acids, e.g. primers or probes
- C12Q1/6888—Nucleic acid products used in the analysis of nucleic acids, e.g. primers or probes for detection or identification of organisms
-
- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
- C12Q—MEASURING OR TESTING PROCESSES INVOLVING ENZYMES, NUCLEIC ACIDS OR MICROORGANISMS; COMPOSITIONS OR TEST PAPERS THEREFOR; PROCESSES OF PREPARING SUCH COMPOSITIONS; CONDITION-RESPONSIVE CONTROL IN MICROBIOLOGICAL OR ENZYMOLOGICAL PROCESSES
- C12Q1/00—Measuring or testing processes involving enzymes, nucleic acids or microorganisms; Compositions therefor; Processes of preparing such compositions
- C12Q1/68—Measuring or testing processes involving enzymes, nucleic acids or microorganisms; Compositions therefor; Processes of preparing such compositions involving nucleic acids
- C12Q1/6844—Nucleic acid amplification reactions
- C12Q1/6858—Allele-specific amplification
-
- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
- C12Q—MEASURING OR TESTING PROCESSES INVOLVING ENZYMES, NUCLEIC ACIDS OR MICROORGANISMS; COMPOSITIONS OR TEST PAPERS THEREFOR; PROCESSES OF PREPARING SUCH COMPOSITIONS; CONDITION-RESPONSIVE CONTROL IN MICROBIOLOGICAL OR ENZYMOLOGICAL PROCESSES
- C12Q2600/00—Oligonucleotides characterized by their use
- C12Q2600/124—Animal traits, i.e. production traits, including athletic performance or the like
-
- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
- C12Q—MEASURING OR TESTING PROCESSES INVOLVING ENZYMES, NUCLEIC ACIDS OR MICROORGANISMS; COMPOSITIONS OR TEST PAPERS THEREFOR; PROCESSES OF PREPARING SUCH COMPOSITIONS; CONDITION-RESPONSIVE CONTROL IN MICROBIOLOGICAL OR ENZYMOLOGICAL PROCESSES
- C12Q2600/00—Oligonucleotides characterized by their use
- C12Q2600/156—Polymorphic or mutational markers
-
- Y—GENERAL TAGGING OF NEW TECHNOLOGICAL DEVELOPMENTS; GENERAL TAGGING OF CROSS-SECTIONAL TECHNOLOGIES SPANNING OVER SEVERAL SECTIONS OF THE IPC; TECHNICAL SUBJECTS COVERED BY FORMER USPC CROSS-REFERENCE ART COLLECTIONS [XRACs] AND DIGESTS
- Y02—TECHNOLOGIES OR APPLICATIONS FOR MITIGATION OR ADAPTATION AGAINST CLIMATE CHANGE
- Y02P—CLIMATE CHANGE MITIGATION TECHNOLOGIES IN THE PRODUCTION OR PROCESSING OF GOODS
- Y02P60/00—Technologies relating to agriculture, livestock or agroalimentary industries
- Y02P60/80—Food processing, e.g. use of renewable energies or variable speed drives in handling, conveying or stacking
- Y02P60/87—Re-use of by-products of food processing for fodder production
Abstract
本发明涉及一种利用如上所述的引物对的绵羊BMPR1B基因插入/缺失多态性的检测方法,步骤如下:以待测绵羊基因组DNA为模板,以引物对为扩增引物,利用PCR扩增包含绵羊BMPR1B基因内含子区插入/缺失多态性位点的片段,对扩增产物进行电泳,根据电泳结果鉴定所述插入/缺失多态性位点的基因型。本发明方法根据绵羊BMPR1B基因内含子区插入/缺失多态性位点(参考序列NC_040257.1:g29373339_29373348)设计引物,以绵羊基因组DNA为模板,通过序列扩增、电泳鉴定,能够简单、快速、低成本、精确地检测所述插入/缺失多态性位点的基因型。
Description
技术领域
本发明属于生物技术与家畜育种技术领域,尤其是一种绵羊BMPR1B基因插入/缺失多态性检测用引物对、试剂盒、方法和应用。
背景技术
绵羊以其羊肉肉质鲜美、低脂肪、低胆固醇等特点深受消费者的喜爱,随着人们生活水平的提高,社会对羊肉、羊奶、羊绒等产品的需求越来越高。为了实现高产、优质和高效的绵羊育种目标,人们对绵羊的研究已在分子水平上,以DNA的多态性为标记对绵羊进行基因结构和功能的遗传分析和研究,通过筛查与绵羊产羔数性状密切相关的DNA标记位点并进行检测,并根据其基因多态性与产羔数性状的关联,从而可以加快建立优良产羔数性状绵羊种群,这类标记具有存在较为普遍、遗传稳定、准确度高等优点,因而被广泛应用于各个领域。
分子标记辅助选择(MAS)作为分子遗传标记的常用方法,通过对目标基因所连锁的分子标记的基因型分析从而进行育种,使用这种方法可以大幅度地缩短育种年限,针对某一性状专一选择,从而能够有效地提高育种效率。
近年来,随着测序技术的不断升级与测序成本的降低,插入/缺失(indel)突变作为一种重要的分子遗传标记而逐渐受到人们的重视。插入和缺失(InDels)构成自然突变库的重要组成部分,InDels是由于聚合酶滑移、转座子、不均等交叉等导致的在整个基因组中大量分布的结构,有时可能导致生物体功能的获得或丧失。InDels最常见的类别包括单碱基对插入和缺失,单体碱基对扩展和多碱基对扩展,然而在基因组中包含随机序列和转座子插入的InDel相对较少。由于可以简单地使用凝胶对InDels进行基因分型鉴定,使InDels更具价值。在以前的一些研究中,还发现InDels比微卫星标记更具多态性。如今,InDels已在多种应用中使用,包括种群遗传学,分类学诊断标记,遗传图谱构建和不同农作物中的关联图谱,在动物繁殖性状的选育方面的indel标记的研究和应用较少。在绵羊上已有的部分关于indels的报道显示:在生长方面,有报道在小尾寒羊SIRT7基因3’UTR存在一个17bp的indel可以显著地影响绵羊的胸深等生长性状(Xu et al.,2019);还有Erdenee等对绵羊ZNF395基因内含子3的一个indel位点进行了关联分析,发现ZNF395基因的该位点对小尾寒羊的胸宽和胸围有极显著影响,对湖羊的管围有极显著影响(Erdenee et al.,2019)。这些研究都表明InDels对动物分子育种具有重要的意义和参考价值。但是,目前InDels在绵羊繁殖育种上的研究较少。
骨形态发生蛋白受体(BMPR1B)是转化生长因子β(TGFβ)超家族的一员。该家族都是多功能蛋白质,可在许多细胞类型中调节生长和分化,并在胚胎发育和哺乳动物的生育能力中发挥重要作用(Dutta et al.,2014)。BMPR1B主要在TGFβ通路中起信号转导作用,是一个重要的膜受体;BMPR1B被认为是绵羊,小鼠和大鼠颗粒细胞中BMP15下游的1型受体之一(Ahlawat et al.,2014;Ahlawat et al.,2016)。没有骨形态发生蛋白受体,BMPs不能发挥其生理功能(Dutta et al.,2014)。绵羊BMPR1B基因位于6号染色体上,含有15个外显子,基因全长225764bp。绵羊BMPR1B蛋白包含558个氨基酸,为细胞核合成蛋白,该蛋白翻译后修饰的主要方式是磷酸化,在细胞内主要行翻译和脂肪代谢作用。蛋白二级结构以无规卷曲为主,三级结构主要由α螺旋和无规卷曲缠绕折叠形成。有研究表明,山羊BMPR1B蛋白与绵羊的同源性最高。BMPR1B作为候选基因对绵羊的繁殖性状具有实质性影响(Ahlawat etal.,2015)。Booroola绵羊突变FecB是BMPR1B激酶结构域中的Q249R突变,从而提高了雌性的生育能力。BMPR1B无效小鼠是不育的并且具有卵丘扩张缺陷(Ahlawat et al.,2014;Ahlawat et al.,2016)。
通过检索,尚未发现与本专利申请相关的公开专利文献。
发明内容
本发明目的在于克服现有技术中的不足之处,提供一种绵羊BMPR1B基因插入/缺失多态性检测用引物对、试剂盒、方法和应用,能够简单、快速、低成本、精确地检测所述插入/缺失多态性位点的基因型。
本发明解决其技术问题所采用的技术方案是:
一种绵羊BMPR1B基因插入/缺失多态性检测用引物对,所述引物对能够通过PCR扩增包含绵羊BMPR1B基因内含子区插入/缺失多态性位点的片段。
而且,所述插入/缺失多态性位点为绵羊BMPR1B基因NC_040257.1:g29373339_29373348位10-bp插入/缺失多态性位点。
而且,所述引物对为:
上游引物:SEQ NO.1;
下游引物:SEQ NO.2。
如上所述的绵羊BMPR1B基因插入/缺失多态性检测用引物对在绵羊产羔数分子标记辅助选择育种方面中的应用。
包含如上所述的引物对的绵羊BMPR1B基因插入/缺失多态性的检测试剂盒。
一种利用如上所述的引物对的绵羊BMPR1B基因插入/缺失多态性的检测方法,步骤如下:
以待测绵羊基因组DNA为模板,以引物对为扩增引物,利用PCR扩增包含绵羊BMPR1B基因内含子区插入/缺失多态性位点的片段,对扩增产物进行电泳,根据电泳结果鉴定所述插入/缺失多态性位点的基因型。
而且,所述PCR扩增采用的反应程序为:95℃预变性5min;94℃变性30s,68℃退火30s,72℃延伸12~24s,18个循环,每循环后退火温度减1℃;50℃退火30s,72℃延伸12~24s,25~30个循环;72℃延伸10min;
或者,所述电泳时采用质量浓度为3.0~3.5%的琼脂糖凝胶。
而且,根据电泳结果,所述插入/缺失多态性位点的插入/插入基因型II表现为208bp一条带纹,插入/缺失基因型ID表现为208bp和198bp两条带纹,缺失/缺失基因型DD表现为198bp一条带纹。
一种如上所述的绵羊BMPR1B基因插入/缺失多态性的检测方法在绵羊产羔数分子标记辅助选择育种方面中的应用。
而且,所述应用为:所述检测方法得到的插入/缺失多态性位点的基因型作为提高绵羊第3胎产羔数的DNA标记方面中的应用。
本发明取得的优点和积极效果为:
1、本发明方法根据绵羊BMPR1B基因内含子区插入/缺失多态性位点(参考序列NC_040257.1:g29373339_29373348)设计引物,以绵羊基因组DNA为模板,通过序列扩增、电泳鉴定,能够简单、快速、低成本、精确地检测所述插入/缺失多态性位点的基因型。
2、本发明方法对绵羊(例如,澳洲白绵羊)BMPR1B基因插入/缺失多态性位点(参考序列NC_040257.1:g29373339_29373348)进行基因型和基因频率分析,对该插入/缺失多态性位点与绵羊生产性状进行关联分析,结果表明本发明检测的插入/缺失多态性位点能够作为绵羊产羔数的分子标记位点,从而加快建立产羔数性状优良的绵羊种群,提高良种选育速度。
3、本发明方法以待测绵羊全基因组DNA为模板,通过PCR扩增绵羊BMPR1B基因部分片段,再进行琼脂糖凝胶电泳,根据电泳结果鉴定绵羊BMPR1B基因NC_040257.1:g
29373339_29373348位10-bp插入/缺失多态性位点的基因型。该10-bp插入/缺失多态性位点的不同基因型与澳洲白绵羊的产羔数性状存在显著相关关系,存在提高绵羊第3胎产羔数性状的DNA标记。本发明提供的检测绵羊BMPR1B基因插入/缺失多态性的方法,可应用于绵羊分子标记辅助选择育种中,加快建立优良绵羊遗传资源群体。
附图说明
图1为本发明中绵羊BMPR1B基因扩增产物(引物对P1)的琼脂糖凝胶电泳结果;M1表示Marker;
图2为本发明中绵羊BMPR1B基因PCR扩增产物测序图,其中:黑色方框标出的部分表示10-bp插入序列:NC_040257.1:g29373339_29373348delGCAGACGAGG。
具体实施方式
下面详细叙述本发明的实施例,需要说明的是,本实施例是叙述性的,不是限定性的,不能以此限定本发明的保护范围。
本发明中所使用的原料,如无特殊说明,均为常规的市售产品;本发明中所使用的方法,如无特殊说明,均为本领域的常规方法。
一种绵羊BMPR1B基因插入/缺失多态性检测用引物对,所述引物对能够通过PCR扩增包含绵羊BMPR1B基因内含子区插入/缺失多态性位点的片段。
较优地,所述插入/缺失多态性位点为绵羊BMPR1B基因NC_040257.1:g29373339_29373348位10-bp插入/缺失多态性位点。
较优地,所述引物对为:
上游引物:SEQ NO.15'-CAACCTCATCTCTTGGCCCT-3'(20nt);
下游引物:SEQ NO.25'-AGCAAAGACAGCAGAAGGGA-3'(20nt)。
如上所述的绵羊BMPR1B基因插入/缺失多态性检测用引物对在绵羊产羔数分子标记辅助选择育种方面中的应用。
包含如上所述的引物对的绵羊BMPR1B基因插入/缺失多态性的检测试剂盒。
一种利用如上所述的引物对的绵羊BMPR1B基因插入/缺失多态性的检测方法,步骤如下:
以待测绵羊基因组DNA为模板,以引物对为扩增引物,利用PCR扩增包含绵羊BMPR1B基因内含子区插入/缺失多态性位点的片段,对扩增产物进行电泳,根据电泳结果鉴定所述插入/缺失多态性位点的基因型。
较优地,所述PCR扩增采用的反应程序为:95℃预变性5min;94℃变性30s,68℃退火30s,72℃延伸12~24s,18个循环,每循环后退火温度减1℃;50℃退火30s,72℃延伸12~24s,25~30个循环;72℃延伸10min;
或者,所述电泳时采用质量浓度为3.0~3.5%的琼脂糖凝胶。
较优地,根据电泳结果,所述插入/缺失多态性位点的插入/插入基因型II表现为208bp一条带纹,插入/缺失基因型ID表现为208bp和198bp两条带纹,缺失/缺失基因型DD表现为198bp一条带纹。
一种如上所述的绵羊BMPR1B基因插入/缺失多态性的检测方法在绵羊产羔数分子标记辅助选择育种方面中的应用。
较优地,所述应用为:所述检测方法得到的插入/缺失多态性位点的基因型作为提高绵羊第3胎产羔数的DNA标记方面中的应用。
更为具体地,相关制备步骤如下:
本发明利用PCR方法对所发现的绵羊BMPR1B基因g.29373339_29373348位点(参考序列:NC_040257.1)突变可能产生的插入/缺失多态性进行检测,并将其与绵羊产羔数性状进行关联分析,验证其是否存在可以作为绵羊分子育种中标记辅助选择的分子标记。
1.实验药品与试剂
1.1生化试剂与生物学试剂:①Taq DNA聚合酶(购自Fermantas即MBI公司);②蛋白酶K(购自华美生物工程公司);③MarkerI(购自天根生化科技(北京)有限公司)。
1.2普通试剂:柠檬酸、柠檬酸钠、葡萄糖、Tris、EDTA、NaCl、NaOH、KCl、Na2HPO4、KH2PO4、Tris饱和酚、氯仿、异戊醇、无水乙醇、醋酸钠、十二烷基磺酸钠(SDS)、溴化乙锭(EB)、溴酚蓝、二甲基苯氰FF、乙酸、蔗糖、硼酸、琼脂糖等,普通试剂从华美生物工程公司购买,为进口分装产品。
1.3溶液与缓冲液:所有溶液与缓冲液均采用去离子超纯水配制;高压灭菌条件为15bf/in(1.034×105Pa)、25min。试剂配制方法均参考Sambrook等编著的《分子克隆实验指南》;
1)提取组织样DNA所用溶液
①2mol/L NaCl:11.688g溶于水,定容至100mL,高压灭菌;
②组织DNA提取液(100mL):lmol/L Tris-HCl(pH8.0)lmL、0.5mol/L EDTA(pH8.0)20mL,及2mol/L NaCl5mL,定容至100mL。
2)琼脂糖凝胶电泳分析所用溶液
①0.5×TBE缓冲液:取10×TBE 50mL定容至1000mL;
②上样缓冲液:含质量终浓度0.25%溴酚蓝以及质量终浓度0.25%二甲苯青FF,溶剂为40.0%(w/v)蔗糖水溶液。
2.设计绵羊BMPR1B基因InDel位点扩增引物
在NCBI上检索绵羊BMPR1B基因的序列(NC_040257.1),并利用Primer5.0设计能够扩增BMPR1B基因多个候选InDel位点DNA片段的引物,其中能够扩增绵羊BMPR1B基因第12内含子区g.29373339_29373348InDel位点的PCR引物对为P1(引物设计完成时间2019年9月)。引物对P1序列见表1。
表1.绵羊BMPR1B基因InDel位点扩增引物表
上述引物对P1对绵羊基因组扩增,能够扩增包含绵羊BMPR1B基因第12内含子区的候选InDel位点(NC_040257.1:g29373339_29373348)的片段。理论上,当g.29373339_29373348位之间的序列GCAGACGAGG插入时,利用引物对P1进行PCR扩增所得到的是208bp大小的带纹;当g.29373339_29373348位之间的序列GCAGACGAGG缺失时,利用引物对P1进行PCR扩增所得到的是198bp大小的带纹;当g.29373339_29373348位之间的序列GCAGACGAGG在一个等位基因上出现插入,在另一个等位基因上出现缺失时,利用引物对P1进行PCR扩增所得到的是大小分别为208bp和198bp的带纹。
3.以引物对P1 PCR扩增待测绵羊BMPR1B基因片段
3.1绵羊耳组织样品的采集
实验所用的动物共计521个样本,具体信息见表2。其中,140只绵羊的第三胎次产羔数性状数据由原种场工作人员测量,采取个体耳组织样品,样品用70%乙醇保存,冰盒低温带回实验室后置于-80℃冻存。
表2.采样信息
3.2组织样品基因组DNA的提取与分离
参考Sambrook等编著的《分子克隆实验指南》(2002)和以下文献:蓝贤勇.绵羊重要功能基因遗传变异及其与经济性状的关系[D.]西北农林科技大学博士学位论文,2007,陕西杨凌。
3.3琼脂糖凝胶电泳检测DNA
参考Sambrook等编著的《分子克隆实验指南》(2002)。
3.4DNA的纯化
参考Sambrook等编著的《分子克隆实验指南》(2002)。
3.5分光光度法检测DNA
用紫外光光度计测定DNA样品在260nm、280nm处的OD值。计算DNA含量和OD260/OD280的比值。如OD260/OD280比值小于1.6,说明样品中含有较多的蛋白质或酚,则应进行纯化;若比值大于1.8,则应该考虑去除RNA纯化。
DNA浓度(ng/μL)=50×OD260值×稀释倍数。
DNA检测完毕后,取出一定的量稀释至20ng/μL,存于-20℃备用,其余的存放于-80℃。
3.6PCR扩增
PCR反应体系采用混合加样法,即根据每一个反应体系所需的各种组分的数量和1次反应所需的PCR反应的个数,算出各种反应组分的总量,加入到1个1.5mL离心管中,充分混匀后瞬时离心,再分装到每个0.2mL EppendorfPCR管中,然后加入模板DNA(浓度为20ng/μL的绵羊基因组DNA),再瞬时离心后进行PCR扩增;PCR反应体系包括2×Taq PCR SuperMix(包括TaqDNA聚合酶、dNTPs和反应缓冲液,浓度为2×)6.5μL;上游引物0.25μL;下游引物0.25μL(上、下游引物浓度为10pmol/μL);基因组DNA 0.5μL;去离子水5.5μL;共13μL。
3.7PCR反应的程序
95℃预变性5min;94℃变性30s,68℃退火30s,72℃延伸12s,18个循环,每循环后退火温度减1℃;50℃退火30s,72℃延伸12s,25个循环;72℃延伸10min。
4.PCR扩增产物的琼脂糖凝胶电泳检测分析
琼脂糖凝胶电泳检测分3步:1)制作3.5%的琼脂糖凝胶,使用核酸染料染色,点样4.5μL,点样后120V电压电泳1.0~1.2h;2)待分子量不同的DNA片段分离清晰时,在BIO-RADGel Doc 2000凝胶成像系统成像;3)根据琼脂糖凝胶电泳结果分析InDel位点多态性;
对于澳洲白绵羊BMPR1B基因g.29373339_29373348位存在的10-bp插入/缺失多态性位点,其插入/缺失突变(InDel)在不同绵羊个体中的多态性分析结果参见图1,PCR的扩增产物(引物对P1)经琼脂糖凝胶电泳检测之后,所扩增的对应插入/缺失多态性位点的插入/插入基因型(II)表现为208bp一条带纹,插入/缺失基因型(ID)表现为208bp和198bp两条带纹,缺失/缺失基因型(DD)表现为198bp一条带纹。分析结果经测序进行了验证,见图2。
5.绵羊BMPR1B基因InDel位点的频率统计分析
1)基因和基因型频率
基因型频率是指一个群体中某一性状的某种基因型个体数占总个体数的比率。PYY=NYY/N,其中PYY代表某一位点的YY基因型频率;NYY表示群体中具有YY基因型的个体数;N为检测群体的总数量。
基因频率是指一个群体中某一基因数对其等位基因总数的相对比率。计算的公式可以写成:PY=(2NYY+NYa1+NYa2+NYa3+NYa4+……+NYan)/2N
式中,PY表示等位基因Y频率,NYY表示群体中具有YY基因型的个体数量,NYai表示群体中具有Yai基因型个体数量,a1~an为等位基因Y的n个互不相同的复等位基因。
2)统计结果
澳洲白绵羊样本BMPR1B基因g.29373339_29373348位10-bp插入/缺失多态性位点的基因型频率及等位基因频率如表3所示。
表3.澳洲白绵羊BMPR1B基因InDel位点基因频率分布表
6.绵羊BMPR1B基因InDel位点基因效应的关联分析
基因型数据:PCR扩增后琼脂糖凝胶电泳识别的基因型;
生产数据:澳洲白绵羊的每胎产羔数据。
关联分析模型:利用SPSS(25.0)软件来分析品种,不同因素与产羔数性状相关性。首先要对所得数据描述性的统计分析,来确定是不是存在离群值。然后根据数据的特性,利用方差分析、多元线性模型或者t分析进而来分析基因型的效应。在数据处理的过程中,考虑到个体的效应,基因之间的互作以及基因型的效应,采用固定的模型来进行相关分析。此外,根据实际条件来进行取舍,完整模型:Yijlm=μ+Si+HYSj+Gl+eijlm;其中,Yijlm:个体表型记录;μ:总体均值;Si:产仔年限效应;HYSj:绵羊群体均值;Gl:基因型的固定效应;eijlm:随机误差。第三胎次的结果使用方差分析,方差分析结果如表4所示。
表4.绵羊BMPR1B基因InDel位点与澳洲白绵羊产羔数性状方差分析
注:平均值肩上字母不同表示差异显著(P<0.05)。
由表4可以看出,BMPR1B基因10-bp InDel多态性对澳洲白绵羊第三胎有显著影响(P<0.05),ID基因型个体性状优于II和DD基因型个体。因此,绵羊BMPR1B基因10-bp插入/缺失多态性位点(NC_040257.1:g29373339_29373348)的ID基因型可作为绵羊产羔数的DNA分子标记。
总之,本发明利用PCR扩增方法检测绵羊BMPR1B基因10-bp插入/缺失多态性位点(NC_040257.1:g29373339_29373348)的基因型,并将其与澳洲白绵羊的第三胎产羔数进行关联分析,发现了可以作为绵羊产羔数分子育种中辅助选择的分子标记,从而加快良种选育速度。本发明所建立的绵羊BMPR1B基因插入/缺失多态性的检测方法,为利用InDel实现绵羊产羔数性状的标记辅助选择(MAS)提供了理论和实践依据。
本发明相关序列如下:
1、人工合成SEQ NO.1
caacctcatc tcttggccct 20
2、人工合成SEQ NO.2
agcaaagaca gcagaaggga 20
3、NC_040257.1:g29373339_29373348位插入序列
gcagacgagg 10
尽管为说明目的公开了本发明的实施例,但是本领域的技术人员可以理解:在不脱离本发明及所附权利要求的精神和范围内,各种替换、变化和修改都是可能的,因此,本发明的范围不局限于实施例所公开的内容。
序列表
<110> 天津奥群牧业有限公司
<120> 绵羊BMPR1B基因插入/缺失多态性检测用引物对、试剂盒、方法和应用
<160> 3
<170> SIPOSequenceListing 1.0
<210> 1
<211> 20
<212> DNA
<213> 上游引物(Unknown)
<400> 1
caacctcatc tcttggccct 20
<210> 2
<211> 20
<212> DNA
<213> 下游引物(Unknown)
<400> 2
agcaaagaca gcagaaggga 20
<210> 3
<211> 10
<212> DNA
<213> NC_040257.1:g29373339_29373348位插入序列(Unknown)
<400> 3
gcagacgagg 10
Claims (10)
1.一种绵羊BMPR1B基因插入/缺失多态性检测用引物对,其特征在于:所述引物对能够通过PCR扩增包含绵羊BMPR1B基因内含子区插入/缺失多态性位点的片段。
2.根据权利要求1所述的绵羊BMPR1B基因插入/缺失多态性检测用引物对,其特征在于:所述插入/缺失多态性位点为绵羊BMPR1B基因NC_040257.1:g29373339_29373348位10-bp插入/缺失多态性位点。
3.根据权利要求1或2所述的绵羊BMPR1B基因插入/缺失多态性检测用引物对,其特征在于:所述引物对为:
上游引物:SEQ NO.1;
下游引物:SEQ NO.2。
4.如权利要求1至3任一项所述的绵羊BMPR1B基因插入/缺失多态性检测用引物对在绵羊产羔数分子标记辅助选择育种方面中的应用。
5.包含如权利要求1至3任一项所述的引物对的绵羊BMPR1B基因插入/缺失多态性的检测试剂盒。
6.一种利用如权利要求1至3任一项所述的引物对的绵羊BMPR1B基因插入/缺失多态性的检测方法,其特征在于:步骤如下:
以待测绵羊基因组DNA为模板,以引物对为扩增引物,利用PCR扩增包含绵羊BMPR1B基因内含子区插入/缺失多态性位点的片段,对扩增产物进行电泳,根据电泳结果鉴定所述插入/缺失多态性位点的基因型。
7.根据权利要求6所述的绵羊BMPR1B基因插入/缺失多态性的检测方法,其特征在于:所述PCR扩增采用的反应程序为:95℃预变性5min;94℃变性30s,68℃退火30s,72℃延伸12~24s,18个循环,每循环后退火温度减1℃;50℃退火30s,72℃延伸12~24s,25~30个循环;72℃延伸10min;
或者,所述电泳时采用质量浓度为3.0~3.5%的琼脂糖凝胶。
8.根据权利要求6或7所述的绵羊BMPR1B基因插入/缺失多态性的检测方法,其特征在于:
根据电泳结果,所述插入/缺失多态性位点的插入/插入基因型II表现为208bp一条带纹,插入/缺失基因型ID表现为208bp和198bp两条带纹,缺失/缺失基因型DD表现为198bp一条带纹。
9.一种如权利要求6至8任一项所述的绵羊BMPR1B基因插入/缺失多态性的检测方法在绵羊产羔数分子标记辅助选择育种方面中的应用。
10.根据权利要求9所述的应用:其特征在于:所述应用为:所述检测方法得到的插入/缺失多态性位点的基因型作为提高绵羊第3胎产羔数的DNA标记方面中的应用。
Priority Applications (1)
Application Number | Priority Date | Filing Date | Title |
---|---|---|---|
CN202010085634.7A CN111154892B (zh) | 2020-02-11 | 2020-02-11 | 绵羊bmpr1b基因插入/缺失多态性检测用引物对、试剂盒、方法和应用 |
Applications Claiming Priority (1)
Application Number | Priority Date | Filing Date | Title |
---|---|---|---|
CN202010085634.7A CN111154892B (zh) | 2020-02-11 | 2020-02-11 | 绵羊bmpr1b基因插入/缺失多态性检测用引物对、试剂盒、方法和应用 |
Publications (2)
Publication Number | Publication Date |
---|---|
CN111154892A true CN111154892A (zh) | 2020-05-15 |
CN111154892B CN111154892B (zh) | 2024-03-29 |
Family
ID=70565648
Family Applications (1)
Application Number | Title | Priority Date | Filing Date |
---|---|---|---|
CN202010085634.7A Active CN111154892B (zh) | 2020-02-11 | 2020-02-11 | 绵羊bmpr1b基因插入/缺失多态性检测用引物对、试剂盒、方法和应用 |
Country Status (1)
Country | Link |
---|---|
CN (1) | CN111154892B (zh) |
Cited By (2)
Publication number | Priority date | Publication date | Assignee | Title |
---|---|---|---|---|
CN111560441A (zh) * | 2020-05-28 | 2020-08-21 | 西北农林科技大学 | 一种利用绵羊结构变异区间快速鉴定FecB基因的方法 |
CN112980968A (zh) * | 2020-12-31 | 2021-06-18 | 河南省畜牧总站 | 一种检测黄牛klf5基因cnv标记的方法及其应用 |
Citations (1)
Publication number | Priority date | Publication date | Assignee | Title |
---|---|---|---|---|
CN110396546A (zh) * | 2018-04-24 | 2019-11-01 | 中国农业大学 | 一种与猪高繁殖性状相关的基因和snp分子标记及应用 |
-
2020
- 2020-02-11 CN CN202010085634.7A patent/CN111154892B/zh active Active
Patent Citations (1)
Publication number | Priority date | Publication date | Assignee | Title |
---|---|---|---|---|
CN110396546A (zh) * | 2018-04-24 | 2019-11-01 | 中国农业大学 | 一种与猪高繁殖性状相关的基因和snp分子标记及应用 |
Cited By (2)
Publication number | Priority date | Publication date | Assignee | Title |
---|---|---|---|---|
CN111560441A (zh) * | 2020-05-28 | 2020-08-21 | 西北农林科技大学 | 一种利用绵羊结构变异区间快速鉴定FecB基因的方法 |
CN112980968A (zh) * | 2020-12-31 | 2021-06-18 | 河南省畜牧总站 | 一种检测黄牛klf5基因cnv标记的方法及其应用 |
Also Published As
Publication number | Publication date |
---|---|
CN111154892B (zh) | 2024-03-29 |
Similar Documents
Publication | Publication Date | Title |
---|---|---|
CN110468218B (zh) | 一种山羊igf2bp1基因插入/缺失标记的检测方法 | |
CN109880890B (zh) | 一种山羊hiat1基因插入/缺失多态性的检测方法及其应用 | |
CN109957614B (zh) | 一种山羊cmtm2基因插入/缺失多态性的检测方法及其应用 | |
CN107164482B (zh) | 一种山羊csn1s1基因插入/缺失的检测方法及其应用 | |
CN111172295B (zh) | 一种检测黄牛vamp7基因cnv标记的方法及专用试剂盒 | |
CN111154892B (zh) | 绵羊bmpr1b基因插入/缺失多态性检测用引物对、试剂盒、方法和应用 | |
CN111088369B (zh) | 一种绵羊rora基因插入/缺失多态性的检测方法、引物对和应用 | |
CN110607373B (zh) | 一种山羊dnah1基因插入/缺失多态性的检测方法及其应用 | |
CN112921101A (zh) | 一种与绵羊剩余采食量相关的分子标记及其应用 | |
CN109182539B (zh) | 一种黄牛igf1r基因插入/缺失的检测方法及其应用 | |
CN111118179B (zh) | 一种检测鲁西黑公羊胸深性状的dna检测方法及其应用 | |
CN112553345B (zh) | 一种绵羊prnp基因插入/缺失在繁殖性状早期选择方面中的应用 | |
CN111154891B (zh) | 绵羊igf2bp1基因插入/缺失多态性的检测引物对、试剂盒、方法和应用 | |
CN112795668B (zh) | 一种山羊cfap43基因插入/缺失标记在性状早期选择中的应用 | |
CN111088373B (zh) | 绵羊prl基因插入/缺失多态性的检测引物对、试剂盒、方法和应用 | |
CN105543362B (zh) | 一种黄牛PPARβ基因单核苷酸多态性的检测方法及分子育种方法 | |
CN112795667B (zh) | 一种牛fras1基因插入/缺失突变的检测方法及其应用 | |
CN111154895B (zh) | 绵羊ghr基因插入/缺失多态性的检测引物对、试剂盒、方法和应用 | |
CN111118178A (zh) | 绵羊ghr基因插入/缺失多态性的检测引物对、试剂盒、方法和应用 | |
CN112852974B (zh) | 一种绵羊ahr基因插入/缺失作为繁殖性状早期选择的应用方法 | |
CN112941202B (zh) | 一种牛sept7基因插入/缺失突变的检测方法及其应用 | |
CN112609007B (zh) | 一种绵羊kdm3b基因插入/缺失作为繁殖性状早期选择的应用及方法 | |
CN111154894B (zh) | 一种检测鲁西黑头羊体重性状的dna检测方法及其应用 | |
CN111733261B (zh) | 一种山羊AKAP12基因InDel标记的检测方法及其应用 | |
CN111118148A (zh) | 绵羊csf1r基因插入/缺失多态性的检测引物对、试剂盒、方法和应用 |
Legal Events
Date | Code | Title | Description |
---|---|---|---|
PB01 | Publication | ||
PB01 | Publication | ||
SE01 | Entry into force of request for substantive examination | ||
SE01 | Entry into force of request for substantive examination | ||
GR01 | Patent grant | ||
GR01 | Patent grant |