CN111133006A - 抗cd166抗体及其用途 - Google Patents

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Abstract

本发明尤其提供结合或能够结合CD166的抗体或抗原结合多肽、包含其的组合物及其用途。在某些实施方案中，本发明的抗CD166抗体或抗原结合多肽结合或能够结合CD166的胞内结构域(“ICD”)的全部或一部分。本发明尤其还包括一种编码结合或能够结合CD166的抗体或抗原结合多肽的核酸分子。在各种实施方案中，抗CD166抗体或抗原结合多肽适用于检测或治疗病况或疾病的方法中。

Description

抗CD166抗体及其用途
相关申请
本申请要求于2017年7月14日提交的美国临时申请号62/532,889的权益，其内容通过引用整体并入本文。
背景技术
CD166，也称为活化的白细胞粘附分子(ALCAM)，是免疫球蛋白超家族的I型跨膜分子。它最初被描述为白细胞上的CD6配体。根据一些研究，CD166可以包括500个氨基酸的胞外结构域、22个氨基酸的跨膜结构域和34个氨基酸的短胞内结构域。根据一些研究，CD166可以具有105kDa的分子量(去糖基化后，69kDa)。CD166的胞外结构域可以包括五个免疫球蛋白样结构域。编码CD166的人类基因位于3号染色体(3q13.1q13.2)上，由16个外显子构成，并且其大小超过200kb。
发明内容
本发明尤其提供结合或能够结合CD166的抗体或抗原结合多肽、包含其的组合物及其用途。在某些实施方案中，本发明的抗CD166抗体或抗原结合多肽结合或能够结合CD166的胞内结构域(“ICD”)的全部或一部分。结合或能够结合CD166的胞内结构域的全部或一部分的本发明的抗体或抗原结合多肽可以被称为“抗CD166ICD抗体或抗原结合多肽”。其部分可以被相应地称为例如抗CD166ICD CDR。本发明尤其还包括一种编码结合或能够结合CD166的抗体或抗原结合多肽的核酸分子。在各种实施方案中，抗CD166抗体或抗原结合多肽适用于检测或治疗病况或疾病的方法中。
在一些实施方案中，抗体或抗原结合多肽包含重链可变结构域。在一些实施方案中，本公开提供一种包含重链可变结构域的抗体或抗原结合多肽，所述重链可变结构域包含以下区中的一种或多种：(i)重链互补决定区1(HCDR1)，其包含与SEQ ID NO:3或SEQ IDNO:23在5个氨基酸位置中的3、4或5个处相同的氨基酸序列，(ii)重链互补决定区2(HCDR2)，其包含与SEQ ID NO:4、SEQ ID NO:24、SEQ ID NO:43或SEQ ID NO:44在17个氨基酸位置中的12、13、14、15、16或17个处相同的氨基酸序列，和(iii)重链互补决定区3(HCDR3)，其包含与SEQ ID NO:5或SEQ ID NO:25在6个氨基酸位置中的4、5或6个处相同的氨基酸序列。
在一些实施方案中，重链可变结构域包含重链HCDR1，所述重链HCDR1包含以下氨基酸序列或由以下氨基酸序列组成：SEQ ID NO:3或SEQ ID NO:23。在一些实施方案中，重链可变结构域包含重链HCDR2，所述重链HCDR2包含以下氨基酸序列或由以下氨基酸序列组成：SEQ ID NO:4、SEQ ID NO:24、SEQ ID NO:43或SEQ ID NO:44。在一些实施方案中，重链可变结构域包含重链HCDR3，所述重链HCDR3包含以下氨基酸序列或由以下氨基酸序列组成：SEQ ID NO:5或SEQ ID NO:25。
在一些实施方案中，重链可变结构域包含与SEQ ID NO:2、SEQ ID NO:22或SEQ IDNO:41的氨基酸序列具有至少90％、至少95％、至少97％、至少98％或至少99％同一性的氨基酸序列。在一些实施方案中，重链可变结构域包含以下氨基酸序列或由以下氨基酸序列组成：SEQ ID NO:2、SEQ ID NO:22或SEQ ID NO:41。
在一些实施方案中，抗体或抗原结合多肽包含轻链可变结构域。在一些实施方案中，本公开提供一种包含轻链可变结构域的抗体或抗原结合多肽，所述轻链可变结构域包含以下区中的一种或多种：(i)轻链互补决定区1(LCDR1)，其包含与SEQ ID NO:13或SEQ IDNO:33在16个氨基酸位置中的12、13、14、15或16个处相同的氨基酸序列，(ii)轻链互补决定区2(LCDR2)，其包含与SEQ ID NO:14或SEQ ID NO:34在7个氨基酸位置中的5、6或7个处相同的氨基酸序列，和(iii)轻链互补决定区3(LCDR3)，其包含与SEQ ID NO:15、SEQ ID NO:35或SEQ ID NO:45在9个氨基酸位置中的7、8或9个处相同的氨基酸序列。
在一些实施方案中，轻链可变结构域包含轻链LCDR1，所述轻链LCDR1包含以下氨基酸序列或由以下氨基酸序列组成：SEQ ID NO:13、SEQ ID NO:33。在一些实施方案中，轻链可变结构域包含轻链LCDR2，所述轻链LCDR2包含以下氨基酸序列或由以下氨基酸序列组成：SEQ ID NO:14或SEQ ID NO:34。在一些实施方案中，轻链可变结构域包含轻链LCDR3，所述轻链LCDR3包含以下氨基酸序列或由以下氨基酸序列组成：SEQ ID NO:15、SEQ ID NO:35或SEQ ID NO:45。在一些实施方案中，轻链可变结构域包含与SEQ ID NO:12、SEQ ID NO:32或SEQ ID NO:42的氨基酸序列具有至少90％、至少95％、至少97％、至少98％或至少99％同一性的氨基酸序列。在一些实施方案中，轻链可变结构域包含以下氨基酸序列或由以下氨基酸序列组成：SEQ ID NO:12、SEQ ID NO:32或SEQ ID NO:42。
在一些实施方案中，抗体或抗原结合多肽特异性结合至CD166(例如，哺乳动物、灵长类动物或人CD166)的C-末端胞内结构域内的表位。
在一些实施方案中，抗体或抗原结合多肽特异性结合至SEQ ID NO:62、SEQ IDNO:64或SEQ ID NO:66内的表位。
在一些实施方案中，抗体或抗原结合多肽与包含重链可变结构域的抗体或抗原结合多肽特异性竞争结合至表位，所述重链可变结构域包含以下区中的一种或多种：(i)重链互补决定区1(HCDR1)，其包含与SEQ ID NO:3或SEQ ID NO:23在5个氨基酸位置中的3、4或5个处相同的氨基酸序列，(ii)重链互补决定区2(HCDR2)，其包含与SEQ ID NO:4、SEQ IDNO:24、SEQ ID NO:43或SEQ ID NO:44在17个氨基酸位置中的12、13、14、15、16或17个处相同的氨基酸序列，和(iii)重链互补决定区3(HCDR3)，其包含与SEQ ID NO:5或SEQ ID NO:25在6个氨基酸位置中的4、5或6个处相同的氨基酸序列。
在一些实施方案中，抗体或抗原结合多肽与包含轻链可变结构域的抗体或抗原结合多肽特异性竞争结合至表位，所述轻链可变结构域包含以下区中的一种或多种：(i)轻链互补决定区1(LCDR1)，其包含与SEQ ID NO:13或SEQ ID NO:33在16个氨基酸位置中的12、13、14、15或16个处相同的氨基酸序列，(ii)轻链互补决定区2(LCDR2)，其包含与SEQ IDNO:14或SEQ ID NO:34在7个氨基酸位置中的5、6或7个处相同的氨基酸序列，和(iii)轻链互补决定区3(LCDR3)，其包含与SEQ ID NO:15、SEQ ID NO:35或SEQ ID NO:45在9个氨基酸位置中的7、8或9个处相同的氨基酸序列。
在一些实施方案中，抗体或抗原结合多肽与包含以下的抗体或抗原结合多肽特异性竞争结合至表位：(I)重链可变结构域，所述重链可变结构域包含(i)重链互补决定区1(HCDR1)，其包含与SEQ ID NO:3或SEQ ID NO:23在5个氨基酸位置中的3、4或5个处相同的氨基酸序列，(ii)重链互补决定区2(HCDR2)，其包含与SEQ ID NO:4、SEQ ID NO:24、SEQ IDNO:43或SEQ ID NO:44在17个氨基酸位置中的12、13、14、15、16或17个处相同的氨基酸序列，以及(iii)重链互补决定区3(HCDR3)，其包含与SEQ ID NO:5或SEQ ID NO:25在6个氨基酸位置中的4、5或6个处相同的氨基酸序列，和(II)轻链可变结构域，所述轻链可变结构域包含(i)轻链互补决定区1(LCDR1)，其包含与SEQ ID NO:13或SEQ ID NO:33在16个氨基酸位置中的12、13、14、15或16个处相同的氨基酸序列，(ii)轻链互补决定区2(LCDR2)，其包含与SEQ ID NO:14或SEQ ID NO:34在7个氨基酸位置中的5、6或7个处相同的氨基酸序列，以及(iii)轻链互补决定区3(LCDR3)，其包含与SEQ ID NO:15、SEQ ID NO:35或SEQ ID NO:45在9个氨基酸位置中的7、8或9个处相同的氨基酸序列。
在一些实施方案中，抗体或抗原结合多肽以100nM至10pM、50nM至10pM、50nM至100pM、50nM至500pM、50nM至1nM、25nM至10pM、25nM至100pM、25nM至500pM、25nM至1nM、10nM至10pM、10nM至100pM、10nM至500pM、或10nM至1nM范围内的KD与CD166的C-末端胞内结构域内的表位结合。在一些实施方案中，抗体或抗原结合多肽以100nM至10pM、50nM至10pM、50nM至100pM、50nM至500pM、50nM至1nM、25nM至10pM、25nM至100pM、25nM至500pM、25nM至1nM、10nM至10pM、10nM至100pM、10nM至500pM、或10nM至1nM范围内的KD与SEQ ID NO:62、SEQ IDNO:64或SEQ ID NO:66内的表位结合。
在一些实施方案中，抗体或抗原结合多肽是IgA、IgG、IgM、IgE或IgD抗体。在一些实施方案中，IgG抗体是IgG1、IgG2、IgG3或IgG4抗体。
在一些实施方案中，抗体或抗原结合多肽是或包含融合蛋白。
在一些实施方案中，抗原结合多肽是或包含：Fab片段、Fab'片段、F(ab')2片段、Fd片段、Fd'片段、Fv片段、dAb片段、scFv、分离的HCDR区、分离的LCDR区、dsFv双抗体、scAb、单结构域重链抗体、单结构域轻链抗体或单链抗体。
在一些实施方案中，抗体或抗原结合多肽是小鼠抗体或抗原结合多肽、兔抗体或抗原结合多肽或者仓鼠抗体或抗原结合多肽。在一些实施方案中，抗体或抗原结合多肽是人或人源化抗体或抗原结合多肽。在一些实施方案中，抗体或抗原结合多肽是密码子优化的抗体或抗原结合多肽。
在一些实施方案中，抗体或抗原结合多肽是嵌合的或反向嵌合的。
在一些实施方案中，抗体或抗原结合多肽与试剂缀合。在一些实施方案中，试剂是或包含可检测部分或治疗性部分。
在一些实施方案中，可检测部分是或包含标记。在一些实施方案中，标记是或包括：生物素、酶报道分子、荧光标记、化学发光标记、体内成像剂或放射性标记。在一些实施方案中，标记是或包括选自过氧化物酶、碱性磷酸酶(AP)、葡萄糖氧化酶或β-半乳糖苷酶的酶报道分子。在一些实施方案中，标记是或包括放射性标记。放射性标记可以包括锆-89(89Zr)、碘-124(124I)、碘-131(131I)、碘-125(125I)、铋-212(212Bi)、铋-213(213Bi)、砹-221(221At)、铜-67(67Cu)、铜-64(64Cu)、铼-186(186Re)、铼-188(188Re)、磷-32(32P)、钐-153(153Sm)、镥-177(177Lu)、锝-99m(99mTc)、镓-67(67Ga)、铟-111(111In)或铊-201(201Tl)。
在一些实施方案中，治疗性部分是或包括药物(例如，细胞毒性剂、化疗剂、毒素或放射性核素)。
本公开尤其提供一种包含本文所述的抗体或抗原结合多肽的组合物。在一些实施方案中，组合物包含药学上可接受的载剂或赋形剂。
在一些实施方案中，组合物包含CD166(例如，哺乳动物CD166、灵长类动物CD166、人CD166)。在一些实施方案中，组合物包含与CD166结合的本公开的抗体或抗原结合多肽。
在一些实施方案中，组合物包含二抗，所述二抗的特征在于能够结合所述抗体或抗原结合多肽。在一些情况下，二抗与试剂例如可检测部分缀合。在一些实施方案中，可检测部分是或包括：生物素、酶报道分子、荧光标记、化学发光标记、体内成像剂或放射性标记。在一些实施方案中，可检测部分是或包括选自过氧化物酶、碱性磷酸酶(AP)、葡萄糖氧化酶或β-半乳糖苷酶的酶报道分子。在一些实施方案中，可检测部分是或包括放射性标记，所述放射性标记包括锆-89(89Zr)、碘-124(124I)、碘-131(131I)、碘-125(125I)、铋-212(212Bi)、铋-213(213Bi)、砹-221(221At)、铜-67(67Cu)、铜-64(64Cu)、铼-186(186Re)、铼-188(188Re)、磷-32(32P)、钐-153(153Sm)、镥-177(177Lu)、锝-99m(99mTc)、镓-67(67Ga)、铟-111(111In)或铊-201(201Tl)。
在一些实施方案中，组合物包含与抗体或抗原结合多肽结合的二抗。
本公开提供一种包含编码本公开的抗体或抗原结合多肽的重链可变结构域和/或轻链可变结构域的序列的核酸序列。本公开另外提供一种包含这样的核酸序列的载体。还提供了一种包含这样的核酸序列或载体的宿主细胞。如本文所述，产生抗体或抗原结合多肽的方法包括在允许宿主细胞表达所述抗体或抗原结合多肽的条件下培养所述宿主细胞，所述宿主细胞包含编码本公开的抗体或抗原结合多肽的重链可变结构域和/或轻链可变结构域的核酸序列或载体。在一些实施方案中，方法包括分离所述抗体或抗原结合多肽。
本公开提供一种包含本文所述的抗体或抗原结合多肽的试剂盒。
在一些实施方案中，试剂盒包含二抗，所述二抗的特征在于能够结合至所述抗体或抗原结合多肽。在一些实施方案中，二抗与试剂例如可检测部分缀合。在一些实施方案中，可检测部分是或包括：生物素、酶报道分子、荧光标记、化学发光标记、体内成像剂或放射性标记。在一些实施方案中，可检测部分是或包括选自过氧化物酶、碱性磷酸酶(AP)、葡萄糖氧化酶或β-半乳糖苷酶的酶报道分子。在一些实施方案中，可检测部分是或包括放射性标记，例如包括锆-89(89Zr)、碘-124(124I)、碘-131(131I)、碘-125(125I)、铋-212(212Bi)、铋-213(213Bi)、砹-221(221At)、铜-67(67Cu)、铜-64(64Cu)、铼-186(186Re)、铼-188(188Re)、磷-32(32P)、钐-153(153Sm)、镥-177(177Lu)、锝-99m(99mTc)、镓-67(67Ga)、铟-111(111In)或铊-201(201Tl)的放射性标记。
在一些实施方案中，试剂盒包含(i)细胞核染色试剂、(ii)封闭缓冲液、(iii)洗涤缓冲液和封固介质中的一种或多种。
在一些实施方案中，试剂盒包含治疗剂，例如治疗性抗体或抗原结合多肽。在一些实施方案中，治疗性抗体或抗原结合多肽特异性结合至免疫检查点蛋白(例如，PD-L1或PD-1)。
在一些实施方案中，治疗性抗体或抗原结合多肽特异性结合至CD166。在一些实施方案中，治疗性抗体或抗原结合多肽是治疗性抗CD166抗体或抗原结合多肽，其包含：
(i)重链可变结构域，其包含以下区中的一种或多种：
(a)重链HCDR1，其与SEQ ID NO:49在12个氨基酸位置中的12个、12个氨基酸位置中的11个或12个氨基酸位置中的10个处相同；
(b)重链HCDR2，其与SEQ ID NO:50在9个氨基酸位置中的9个、9个氨基酸位置中的8个或9个氨基酸位置中的7个处相同；以及
(c)重链HCDR3，其与SEQ ID NO:51在11个氨基酸位置中的11个、11个氨基酸位置中的10个或11个氨基酸位置中的9个处相同；和/或
(ii)包含轻链可变结构域，其包含以下区中的一种或多种：
(a)轻链LCDR1，其与SEQ ID NO:57或SEQ ID NO:58在16个氨基酸位置中的16个、16个氨基酸位置中的15个、16个氨基酸位置中的14个或16个氨基酸位置中的13个处相同；
(b)轻链LCDR2，其与SEQ ID NO:59或SEQ ID NO:60在7个氨基酸位置中的7个、7个氨基酸位置中的6个或7个氨基酸位置中的5个处相同；以及
(c)轻链LCDR3，其与SEQ ID NO:61在9个氨基酸位置中的9个、9个氨基酸位置中的8个或9个氨基酸位置中的7个处相同。
在一些实施方案中，治疗性抗体或抗原结合多肽包含重链可变结构域，所述重链可变结构域包含与SEQ ID NO:47或SEQ ID NO:48的氨基酸序列具有至少90％、至少95％、至少97％、至少98％或至少99％同一性的氨基酸序列。在一些实施方案中，治疗性抗体或抗原结合多肽包含重链可变结构域，所述重链可变结构域包含以下氨基酸序列或由以下氨基酸序列组成：SEQ ID NO:47或SEQ ID NO:48。
在一些实施方案中，治疗性抗体或抗原结合多肽包含轻链可变结构域，所述轻链可变结构域包含与SEQ ID NO:53、SEQ ID NO:54、SEQ ID NO:55或SEQ ID NO:56的氨基酸序列具有至少90％、至少95％、至少97％、至少98％或至少99％同一性的氨基酸序列。在一些实施方案中，治疗性抗体或抗原结合多肽包含轻链可变结构域，所述轻链可变结构域包含以下氨基酸序列或由以下氨基酸序列组成：SEQ ID NO:53、SEQ ID NO:54、SEQ ID NO:55或SEQ ID NO:56。
在一些实施方案中，治疗性抗体或抗原结合多肽是可活化的治疗性抗体或抗原结合多肽。
在一些实施方案中，治疗性抗体或抗原结合多肽与试剂(例如，治疗性部分)缀合。在一些实施方案中，治疗性部分是或包含药物(例如，细胞毒性剂、化疗剂、毒素或放射性核素)。
在本文提供的一个方面，检测样品中CD166的方法包括使所述样品与本公开的抗体或抗原结合多肽接触，以及检测是否存在与所述样品的一部分结合的抗体或抗原结合多肽，从而检测是否存在CD166(例如，哺乳动物CD166、灵长类动物CD166或人CD166)。
在本文提供的一个方面，检测组织样品中表达CD166的细胞的方法包括使所述组织样品与本公开的抗体或抗原结合多肽接触，以及检测所述组织样品中是否存在与至少一种细胞结合的抗体或抗原结合多肽，从而检测所述组织样品中是否存在表达CD166的细胞。在一些实施方案中，由表达CD166的细胞表达的CD166是哺乳动物CD166、灵长类动物CD166或人CD166。
在本文提供的一个方面，检测组织样品中的活化的淋巴细胞或活化的单核细胞(白细胞)的方法包括使所述组织样品与本公开的抗体或抗原结合多肽接触，以及检测所述样品中是否存在与至少一种细胞结合的抗体或抗原结合多肽，从而检测所述组织样品中是否存在活化的淋巴细胞或活化的单核细胞(白细胞)。
在一些实施方案中，样品包含来自肿瘤细胞系的细胞。在一些实施方案中，样品来自受试者。在一些实施方案中，样品包含癌细胞(例如，实体瘤细胞)。在一些实施方案中，癌细胞包括非小细胞肺癌细胞、乳腺癌细胞、卵巢癌细胞、子宫内膜癌细胞、胆管癌细胞、头颈癌细胞、或去势抗性前列腺癌细胞。在一些实施方案中，癌细胞包括H292细胞、HCC1806细胞、MDA-MB-231细胞、BXPC3细胞、HT29细胞或BT20细胞。
在一些实施方案中，样品是固定的。在一些实施方案中，样品包埋在介质中(例如，福尔马林固定的石蜡包埋的样品)。
在一些实施方案中，检测是否存在与样品的一部分结合的抗体或抗原结合多肽包括进行免疫组织化学、电泳、蛋白质印迹分析、免疫沉淀分析和/或显微镜检查。
在一些实施方案中，检测是否存在与样品的一部分结合的抗体或抗原结合多肽包括检测与样品的一部分结合的抗体或抗原结合多肽的水平，从而检测CD166的水平。
在一些实施方案中，方法包括将与样品的一部分结合的抗体或抗原结合多肽的水平与参考值相比较，或将CD166的水平与参考值相比较。
本公开提供了一种治疗疾病或病症的方法，其包括向处于所述疾病或病症的风险中或患有所述疾病或病症的受试者施用治疗性抗体或抗原结合多肽，其中在施用之前，在来自所述受试者的样品中检测到CD166的存在。在一些实施方案中，通过进行以下步骤检测来自受试者的样品中CD166的存在：使所述样品与本公开的抗体或抗原结合多肽接触，以及检测是否存在与所述样品的一部分结合的抗体或抗原结合多肽，从而检测是否存在CD166。
在一些实施方案中，检测是否存在与样品的一部分结合的抗体或抗原结合多肽包括进行免疫组织化学、电泳、蛋白质印迹分析、免疫沉淀分析和/或显微镜检查。
在一些实施方案中，方法包括，在施用后，检测来自受试者的样品中CD166的存在。在一些实施方案中，检测来自所述受试者的样品中CD166的存在包括进行以下步骤：使所述样品与本公开的抗体或抗原结合多肽接触，以及检测是否存在与所述样品的一部分结合的抗体或抗原结合多肽，从而检测是否存在CD166。
在一些实施方案中，检测是否存在与样品的一部分结合的抗体或抗原结合多肽包括进行免疫组织化学、电泳、蛋白质印迹分析、免疫沉淀分析和/或显微镜检查。
在一些实施方案中，治疗性抗体或抗原结合多肽特异性结合至免疫检查点蛋白(例如，PD-L1或PD-1)。
在一些实施方案中，治疗性抗CD166抗体或抗原结合多肽。
在一些实施方案中，治疗性抗体或抗原结合多肽是可活化的治疗性抗体或抗原结合多肽。
在一些实施方案中，治疗性抗体或抗原结合多肽与试剂(例如，治疗性部分)缀合。
在一些实施方案中，治疗性抗CD166抗体或抗原结合多肽包含：
(i)重链可变结构域，其包含以下区中的一种或多种：
(a)重链HCDR1，其与SEQ ID NO:49在12个氨基酸位置中的12个、12个氨基酸位置中的11个或12个氨基酸位置中的10个处相同；
(b)重链HCDR2，其与SEQ ID NO:50在9个氨基酸位置中的9个、9个氨基酸位置中的8个或9个氨基酸位置中的7个处相同；以及
(c)重链HCDR3，其与SEQ ID NO:51在11个氨基酸位置中的11个、11个氨基酸位置中的10个或11个氨基酸位置中的9个处相同；和/或
(ii)包含轻链可变结构域，其包含以下区中的一种或多种：
(a)轻链LCDR1，其与SEQ ID NO:57或SEQ ID NO:58在16个氨基酸位置中的16个、16个氨基酸位置中的15个、16个氨基酸位置中的14个或16个氨基酸位置中的13个处相同；
(b)轻链LCDR2，其与SEQ ID NO:59或SEQ ID NO:60在7个氨基酸位置中的7个、7个氨基酸位置中的6个或7个氨基酸位置中的5个处相同；以及
(c)轻链LCDR3，其与SEQ ID NO:61在9个氨基酸位置中的9个、9个氨基酸位置中的8个或9个氨基酸位置中的7个处相同。
在一些实施方案中，样品包含癌细胞。在一些实施方案中，样品包含非小细胞肺癌细胞、乳腺癌细胞、卵巢癌细胞、子宫内膜癌细胞、胆管癌细胞、头颈癌细胞、前列腺癌细胞、或去势抗性前列腺癌细胞。在一些实施方案中，样品包含癌细胞，所述癌细胞包括H292细胞、HCC1806细胞、MDA-MB-231细胞、BXPC3细胞、HT29细胞或BT20细胞。
在一些实施方案中，样品包含活化的淋巴细胞或活化的单核细胞(白细胞)。
在一些实施方案中，疾病或病症是癌症。在一些实施方案中，癌症是前列腺癌、鳞状细胞皮肤癌、乳腺癌、卵巢癌、肺腺癌、小细胞肺癌、非小细胞肺癌、食管小细胞癌、透明细胞肾癌、小肠癌、结肠腺癌、乳头状甲状腺癌、子宫内膜癌、直肠癌、鳞状细胞肺癌、喉癌、胰腺癌、鳞状细胞宫颈癌、鳞状细胞食管癌、肝癌、胃贲门癌、胃癌、腹腔癌、膀胱移行细胞癌、黑素瘤、乳腺癌、子宫内膜癌、胆管癌、或去势抗性前列腺癌。
本公开提供一种帮助为处于疾病或病症风险中或患有疾病或病症的受试者选择疗法的方法，其包括使来自所述受试者的样品与本公开的抗体或抗原结合多肽接触，检测是否存在与所述样品的一部分结合的抗体或抗原结合多肽，从而检测是否存在CD166，以及记录所述样品中是否存在CD166。
在一些实施方案中，方法包括如果检测到在所述样品中存在CD166，则将个体分类为可受益于施用治疗性抗CD166抗体或抗原结合多肽的个体。
在一些实施方案中，检测存在与所述样品的一部分结合的抗体或抗原结合多肽包括进行免疫组织化学、电泳、蛋白质印迹分析、免疫沉淀分析和/或显微镜检查。
在一些实施方案中，检测存在与所述样品的一部分结合的抗体或抗原结合多肽包括检测与所述样品的一部分结合的抗体或抗原结合多肽的水平，从而检测CD166的水平。
在一些实施方案中，方法包括将与所述样品的一部分结合的抗体或抗原结合多肽的水平或CD166的水平与参考值相比较。
在一些实施方案中，方法包括施用治疗性抗体或抗原结合多肽。在一些实施方案中，治疗性抗体或抗原结合多肽是治疗性抗CD166抗体或抗原结合多肽。在一些实施方案中，治疗性抗体或抗原结合多肽是可活化的抗CD166治疗性抗体或抗原结合多肽。
在一些实施方案中，抗体或抗原结合多肽与试剂(例如，可检测部分或治疗性部分)缀合。
在一些实施方案中，抗体或抗原结合多肽是治疗性抗CD166抗体或抗原结合多肽，其包含：
(i)重链可变结构域，其包含以下区中的一种或多种：
(a)重链HCDR1，其与SEQ ID NO:49在12个氨基酸位置中的12个、12个氨基酸位置中的11个或12个氨基酸位置中的10个处相同；
(b)重链HCDR2，其与SEQ ID NO:50在9个氨基酸位置中的9个、9个氨基酸位置中的8个或9个氨基酸位置中的7处相同；以及
(c)重链HCDR3，其与SEQ ID NO:51在11个氨基酸位置中的11个、11个氨基酸位置中的10个或11个氨基酸位置中的9个处相同；和/或
(ii)包含轻链可变结构域，其包含以下区中的一种或多种：
(a)轻链LCDR1，其与SEQ ID NO:57或SEQ ID NO:58在16个氨基酸位置中的16个、16个氨基酸位置中的15个、16个氨基酸位置中的14个或16个氨基酸位置中的13个处相同；
(b)轻链LCDR2，其与SEQ ID NO:59或SEQ ID NO:60在7个氨基酸位置中的7个、7个氨基酸位置中的6个或7个氨基酸位置中的5个处相同；以及
(c)轻链LCDR3，其与SEQ ID NO:61在9个氨基酸位置中的9个、9个氨基酸位置中的8个或9个氨基酸位置中的7个处相同。
在一些实施方案中，样品包含癌细胞。在一些实施方案中，样品包含非小细胞肺癌细胞、乳腺癌细胞、卵巢癌细胞、子宫内膜癌细胞、胆管癌细胞、头颈癌细胞、前列腺癌细胞或去势抗性前列腺癌细胞。在一些实施方案中，样品包含癌细胞，所述癌细胞包括H292细胞、HCC1806细胞、MDA-MB-231细胞、BXPC3细胞、HT29细胞或BT20细胞。
在一些实施方案中，疾病或病症是癌症。在一些实施方案中，癌症是前列腺癌、鳞状细胞皮肤癌、乳腺癌、卵巢癌、肺腺癌、小细胞肺癌、非小细胞肺癌、食管小细胞癌、透明细胞肾癌、小肠癌、结肠腺癌、乳头状甲状腺癌、子宫内膜癌、直肠癌、鳞状细胞肺癌、喉癌、胰腺癌、鳞状细胞宫颈癌、鳞状细胞食管癌、肝癌、胃贲门癌、胃癌、腹腔癌、膀胱移行细胞癌、黑素瘤、乳腺癌、子宫内膜癌、胆管癌、或去势抗性前列腺癌。
本公开提供了如本文所述的抗体或抗原结合多肽用于检测CD166的用途。
本公开提供了如本文所述的抗体或抗原结合多肽用于治疗疾病或病症的用途。
本公开还提供了如本文所述的抗体或抗原结合多肽用于为处于疾病或病症的风险之中或患有所述疾病或病症的受试者选择疗法的用途。在一些实施方案中，疾病或病症是癌症。
本公开提供了用于治疗疾病或病症的如本文所述的抗体或抗原结合多肽。
本公开提供了如本文所述的抗体或抗原结合多肽，其用于制造用于治疗疾病或病症的药物。在一些实施方案中，疾病或病症是癌症。
本公开所涵盖的这些和其他方面在下文和权利要求中更详细地描述。
定义
一个或一种：冠词“一个”和“一种”在本文中用来指代所述冠词的语法对象的一个/种或一个/种以上(即，“至少一个/种”)。举例而言，“一种要素”意指一种要素或多于一种要素。
亲和力：如本文所用，术语“亲和力”是指结合部分与靶标之间的结合相互作用的特征，并且指示结合相互作用的强度。在一些实施方案中，亲和力的量度表示为解离常数(KD)。在一些实施方案中，结合部分对靶标具有高亲和力(例如，KD小于约10-7M、小于约10-8M或小于约10-9M)。在一些实施方案中，结合部分对靶标具有低亲和力(例如，KD高于约10-7M、高于约10-6M、高于约10-5M或高于约10-4M)。
施用：如本文所用，术语“施用”是指将组合物施用到受试者或系统，例如人。本领域普通技术人员将意识到在适当的情况下可用于向受试者施用的多种途径。例如，在一些实施方案中，施用途径可以是眼、口、肠胃外、局部等。在一些实施方案中，施用可以是支气管的(例如，通过支气管滴注)、口颊、真皮(例如，局部至真皮、皮内、真皮间、经皮等)、肠内、动脉内、皮内、胃内、髓内、肌内、鼻内、腹膜内、鞘内、静脉内、心室内、在特定器官内(例如肝内)、粘膜、鼻、口、直肠、皮下、舌下、局部、气管(例如，通过气管内滴注)、阴道、玻璃体等。可以根据本文所述的或本领域已知的任何方案进行施用。
试剂：通常，如本文所用，术语“试剂”可指任何化学类别的化合物或实体，包括例如多肽、核酸、糖、脂质、小分子、金属或其组合或复合物。在适当的情况下，如本领域技术人员从上下文中将清楚的，所述术语可用于指代作为或包含细胞或生物体、或其级分、提取物或组分的实体。在一些实施方案中，试剂可以分离或纯的形式使用。在一些实施方案中，试剂可以粗制或不纯的形式使用。在一些实施方案中，试剂可作为集合或文库提供，例如可对其进行筛选以鉴定或表征它们中的活性试剂。在一些情况下，术语“试剂”可指代化合物或实体，所述化合物或实体是或包括聚合物或多种相同或不同的聚合物。
改善(Amelioration)：如本文所用，术语“改善”是指预防、减轻或缓解受试者的状态，或改善受试者的状态。改善包括但不要求疾病、病症或病况(例如，辐射损伤)的完全恢复或完全预防。
近似或约：如本文所用，术语“近似”或“约”在修饰一个或多个目标值时，是指与所述参考值类似的值。在某些实施方案中，术语“近似”或“约”是指在所述参考值的任一方向上的(大于或小于)25％、20％、19％、18％、17％、16％、15％、14％、13％、12％、11％、10％、9％、8％、7％、6％、5％、4％、3％、2％、1％或更小百分比内的值范围，除非另外说明或以另外的方式从上下文显而易见(除了在这样的数值将超过可能值的100％的情况下)。
抗体：如本文所用，术语“抗体”是指多肽，所述多肽包含至少一个免疫球蛋白可变区，例如提供免疫球蛋白可变结构域或免疫球蛋白可变结构域序列的氨基酸序列。例如，抗体可包括重(H)链可变区(本文缩写为VH)和轻(L)链可变区(本文缩写为VL)。在另一实例中，抗体包含两个重(H)链可变区和两个轻(L)链可变区。术语“抗体”包括IgA、IgG、IgE、IgD、IgM型的免疫球蛋白(以及其亚型)。免疫球蛋白的轻链可以是κ轻链或λ轻链。
与……相关联：如果一个事件或实体的存在、水平和/或形式与另一事件或实体相关，则两个事件或实体彼此“相关联”，如本文中使用所述术语。例如，如果特定实体(例如，多肽、基因信号、代谢物、微生物等)的存在、水平和/或形式与疾病、病症或病况(例如，在相关人群中)的发生率和/或易感性相关，则认为所述特定实体与特定疾病、病症或病况相关联。在一些实施方案中，如果两个或更多个实体直接或间接相互作用，则它们在物理上彼此“相关联”，从而它们彼此是和/或保持在物理上邻近。在一些实施方案中，彼此物理上相关联的两个或更多个实体彼此共价连接。在一些实施方案中，彼此物理上相关联的两个或更多个实体彼此不共价连接，而是例如通过氢键、范德华相互作用、疏水相互作用、磁性及其组合非共价缔合。
结合：如本文所用，术语“结合”通常是指两个或更多个实体之间或之中的非共价缔合。“直接”结合涉及实体或部分之间的物理接触；间接结合涉及通过与一种或多种中间实体的物理接触实现的物理相互作用。通常可以在多种情况中的任一种下评估两个或更多个实体之间的结合，包括孤立地或在更复杂系统的情况下(例如，同时与载体实体共价或以其他方式缔合和/或在生物系统如细胞中)研究相互作用的实体或部分。
结合部分：如本文所用，“结合部分”是能够特异性结合靶标例如目标靶标的任何分子或分子的一部分。结合部分包括例如抗体及其抗原结合片段。如本文所用，“抗原结合多肽”是包含结合部分的任何多肽，在某些非限制性实例中，所述抗原结合多肽可以是抗体或其片段。“抗原结合多肽”可以是但不限于重链抗体、轻链抗体、基于LRR的抗体、具有抗体样性质的其他蛋白质支架或本领域已知的其他免疫结合部分中的任一种，所述免疫结合部分包括：例如，四链免疫球蛋白、免疫粘附素、双抗体、dsFv、双抗体、三链抗体、四链抗体、微型抗体、大型抗体、TandAb、单链抗体、重链抗体、单结构域重链抗体、特定的HCDR、特定的LCDR、重链可变结构域、轻链可变结构域、DVD、BiTe、scFv、scAb、Fab、Fab'、Fab2、Fab3、F(ab')2、Fd、Fd'、Fv等或其任何组合。
生物标志物：如本文所用，术语“生物标志物”在本文中与其在本领域中的使用一致，是指其存在、水平或形式与特定的生物学事件或目标状态相关的实体，从而使其被视为所述事件或状态的“标志物”。仅举几个例子，在一些实施方案中，生物标志物可以是或包括用于特定疾病状态或特定疾病、病症或病况可能发展、发生或复发的可能性的标志物。在一些实施方案中，生物标志物可以是或包括用于特定疾病或治疗结果或其可能性的标志物。因此，在一些实施方案中，生物标志物预测、预后和/或诊断相关的生物学事件或目标状态。生物标志物可以是任何化学类别的实体。例如，在一些实施方案中，生物标志物可以是或包括核酸、多肽、脂质、碳水化合物、小分子、无机试剂(例如，金属或离子)或其组合。在一些实施方案中，生物标志物是细胞表面标志物。在一些实施方案中，生物标志物是细胞内的。在一些实施方案中，在细胞外部发现生物标志物(例如，在细胞外部例如在体液如血液、尿液、泪液、唾液、脑脊液等中分泌或以其他方式产生或存在。
癌症：如本文所用，术语“癌症”、“恶性肿瘤”、“瘤”、“肿瘤”和“癌”是指表现出相对异常、不受控制和/或自主生长的细胞，从而它们表现出异常的生长表型，所述生长表型的特征在于明显丧失对细胞增殖的控制。在一些实施方案中，肿瘤可以是或包括癌前(例如，良性)、恶性、转移前、转移和/或非转移的细胞。本公开具体地鉴定其教导可能特别相关的某些癌症。在一些实施方案中，相关癌症可以实体肿瘤为特征。在一些实施方案中，相关癌症可以血液肿瘤为特征。通常，本领域已知不同类型癌症的实例。
载剂：如本文所用，是指与组合物一起施用的稀释剂、佐剂、赋形剂或媒介物。在一些示例性实施方案中，载剂可包括无菌液体，例如像水和油，包括石油、动物、植物或合成来源的油，例如像花生油、大豆油、矿物油、芝麻油等。在一些实施方案中，载剂是或包括一种或多种固体组分。
CDR移植性抗体：如本文所用，术语“CDR移植性抗体”是指如下抗体，其氨基酸序列包含第一物种的重链可变区序列和轻链可变区序列，但其中VH和/或VL的一个或多个CDR区的序列被另一物种的CDR序列替代，如(仅提供一个实例)具有鼠VH和VL区的抗体，其中一个或多个鼠CDR(例如，CDR3)已被人CDR序列替代。同样，“CDR移植性抗体”包括例如具有人VH和VL区的抗体，其中一个或多个人CDR(例如，CDR3)已被小鼠CDR序列替代。
恒定区：如本文所用，术语“恒定区”是指对应于或来源于抗体的一个或多个恒定区免疫球蛋白结构域的多肽。恒定区可包括以下免疫球蛋白结构域中的任一个或全部：CH1结构域、铰链区、CH2结构域、CH3结构域(来源于IgA、IgD、IgG、IgE或IgM)和CH4结构域(来源于IgE或IgM)。
剂型或单位剂型：如本文所用，术语“剂型”可用以指代施用到受试者的试剂(例如，治疗剂或诊断剂)的物理离散单位、等分试样或量。通常，每个这样的单位包含预定量的活性剂，例如，预定质量或摩尔数的试剂。
表位：如本文所用，术语“表位”包括被抗体或抗原结合多肽或其结合部分特异性识别的任何部分。在一些实施方案中，表位由抗原上的多个化学原子或基团构成。在一些实施方案和/或抗原构象中，这样的化学原子或基团在空间上在物理上彼此靠近。在各种实施方案中，表位应理解为由氨基酸序列表示。应当理解，在一些实施方案中，由氨基酸序列表示的表位可需要产生指定氨基酸的特定构象，例如当在特定蛋白质中和/或特定情况下存在时，由指定氨基酸所采用的构象。
赋形剂：如本文所用，术语“赋形剂”是指可包含在组合物中例如以提供或促成所需稠度或稳定效果的试剂。在一些实施方案中，合适的赋形剂可以是或包括例如淀粉、葡萄糖、乳糖、蔗糖、明胶、麦芽、大米、面粉、白垩、硅胶、硬脂酸钠、单硬脂酸甘油酯、滑石、氯化钠、脱脂乳粉、甘油、丙烯、乙二醇、水、乙醇等。赋形剂可以是包含抗体或抗原结合多肽的组合物或制剂的组分，所述赋形剂不是抗体或抗原结合多肽。
同源性：如本文所用，术语“同源性”是指聚合物分子之间，例如核酸分子(例如，DNA分子和/或RNA分子)之间和/或多肽分子之间的整体相关性。在一些实施方案中，如果聚合物分子的序列为至少25％、30％、35％、40％、45％、50％、55％、60％、65％、70％、75％、80％、85％、90％、95％或99％相同，则认为它们是彼此“同源的”。在一些实施方案中，如果聚合物分子的序列为至少25％、30％、35％、40％、45％、50％、55％、60％、65％、70％、75％、80％、85％、90％、95％或99％相似，则认为它们是彼此“同源的”。序列的比较或比对以及两个序列之间的同源性百分比的确定可使用数学算法如BLAST(基本局部比对搜索工具)完成。
人抗体：如本文所用，术语“人抗体”旨在包括具有从人免疫球蛋白序列产生、组装或得到的可变区和恒定区的抗体。在一些实施方案中，即使抗体(或抗体组分)的氨基酸序列例如在一个或多个CDR中包括不由人种系免疫球蛋白序列编码的残基或元件(例如，包括序列变异，例如可(最初)已通过体外随机或位点特异性诱变或通过体内体细胞突变引入)，所述抗体(或抗体组分)也可被认为是“人的”。
人源化：如本文所用，术语“人源化”可指的是具有氨基酸序列的抗体或抗原结合多肽，所述氨基酸序列包含来自非人物种(例如，小鼠)中产生的参考抗体的VH和VL区序列，但在那些序列中还包含相对于参考抗体的修饰，所述修饰旨在使它们更呈“人样”，即更类似于人种系可变序列。在一些实施方案中，“人源化”抗体或抗原结合多肽是如下抗体或抗原结合多肽：其免疫特异性结合至目标抗原并且具有实质上具有正如人抗体的氨基酸序列的氨基酸序列的框架(FR)区和实质上具有正如非人抗体的氨基酸序列的氨基酸序列的互补决定区(CDR)。人源化抗体或抗原结合多肽可以是如下抗体或抗原结合多肽，其中至少一个且通常两个可变结构域(Fab、Fab'、F(ab')2、FabC、Fv)中的实质上全部，其中全部或实质上全部的CDR区对应于非人免疫球蛋白(即，供体免疫球蛋白)的CDR区，并且全部或实质上全部的框架区是人免疫球蛋白共有序列的框架区。在一些实施方案中，人源化抗体或抗原结合多肽包含免疫球蛋白恒定区(Fc)的至少一部分，通常是人免疫球蛋白恒定区的至少一部分。在一些实施方案中，人源化抗体或抗原结合多肽含有轻链和至少重链的可变结构域两者。人源化抗体或抗原结合多肽可包括重链恒定区的CH1、铰链、CH2、CH3和任选的CH4区。在一些实施方案中，人源化抗体或抗原结合多肽仅包含人源化VL区。在一些实施方案中，人源化抗体或抗原结合多肽仅包含人源化VH区。在一些某些实施方案中，人源化抗体或抗原结合多肽包含人源化VH和VL区。
同一性：如本文所用，术语“同一性”是指聚合物分子之间，例如核酸分子(例如，DNA分子和/或RNA分子)之间和/或多肽分子之间的整体相关性。计算两个所提供的多肽序列之间的同一性百分比的方法是本领域已知的。计算两个核酸或多肽序列的同一性百分比例如出于最优比较目的可通过比对这两个序列来执行(例如，为了最优比对，可在第一序列和第二序列中的一个或两个中引入间隙并且出于比较目的可忽略非同一的序列)。然后比较相应位置处的核苷酸或氨基酸。当第一序列中的位置被与第二序列中的相应位置相同的残基(例如，核苷酸或氨基酸)占据时，则在此位置的分子是相同的。这两个序列之间的同一性百分比随着由序列共享的相同位置的数目而变化，任选地考虑到为了最优比对这两个序列而可能需要引入的间隙的数目和每个间隙的长度。序列的比较或比对以及两个序列之间的同一性百分比的确定可使用数学算法如BLAST(基本局部比对搜索工具)完成。
“改善”、“增加”或“减少”：如本文所用，这些术语或语法上可比较的比较术语指示相对于可比较的参考测量的值。例如，在一些实施方案中，用目标试剂获得的评估值相对于可比较的参考试剂获得的评估值可以是“改善”的。或者或另外，在一些实施方案中，在目标受试者或系统中实现的评估值相对于在不同条件下(例如，在诸施用目标试剂的事件之前或之后)在相同受试者或系统中获得的评估值或在不同的可比较的受试者中(例如，在存在目标特定疾病、病症或病况的一种或多种适应症的情况下或在暴露于条件或试剂之前等不同于目标受试者或系统的可比较的受试者或系统中)获得的评估值可以是“改善的”。在一些实施方案中，比较术语是指统计上相关的差异(例如，其普遍性和/或量级足以达到统计上的相关性)。在给定的上下文中，本领域技术人员将意识到或将能够容易地确定实现这种统计显著性所需或足够的差异的程度和/或普遍性。
体外：本文所用的术语“体外”是指在人工环境中发生的事件，例如，在试管、反应容器、细胞培养物等中，而不是在多细胞生物体内发生的事件。
体内：如本文所用，术语“体内”是指在多细胞生物体如人或非人动物内发生的事件。在基于细胞的系统的情况下，所述术语可用以指代在活细胞(与例如体外系统相反)内发生的事件。
分离的：如本文所用，是指以下物质，其(1)已经与至少一些组分分离，所述至少一些组分在较早的时间已与所述物质缔合或所述物质将以其他方式与所述至少一些组分缔合，和/或(2)存在于组合物中，所述组合物是或包含有限或限定量或浓度的一种或多种已知或未知的污染物。在一些实施方案中，分离的物质可与约10％、约20％、约30％、约40％、约50％、约60％、约70％、约80％、约90％、约91％、约92％、约93％、约94％、约95％、约96％、约97％、约98％、约99％或大于99％的其他非物质组分分离，所述其他非物质组分在较早的时间与所述物质缔合，例如，其他特定组分或污染物，所述其他特定组分或污染物先前已经或将以其他方式与所述物质缔合。在某些情况下，如果物质存在于包含有限或减少量或浓度的相同或相似类型的分子的组合物中，则所述物质是分离的。例如，在某些情况下，如果核酸、DNA或RNA物质存在于包含有限或减少量或浓度的非物质核酸、DNA或RNA分子的组合物中，则所述核酸、DNA或RNA物质是分离的。例如，在某些情况下，如果多肽物质存在于包含有限或减少量或浓度的非物质多肽分子的组合物中，则所述多肽物质是分离的。在某些实施方案中，量可以是例如相对于组合物中存在的所需物质的量测量的量。在某些实施方案中，有限量可以是不超过组合物中100％物质量的量，例如，不超过组合物中物质量的1％、5％、10％、20％、30％、40％、50％、60％、70％、80％、90％或95％。在某些情况下，组合物相对于特定物质是纯的或实质上纯的。在一些实施方案中，分离的物质是约80％、约85％、约90％、约91％、约92％、约93％、约94％、约95％、约96％、约97％、约98％、约99％或大于99％纯的。如本文所用，如果物质实质上不含其他组分或污染物，则它为“纯的”。在一些实施方案中，如本领域技术人员将理解的，在与某些其他组分例如像一种或多种载剂或赋形剂(例如，缓冲剂、溶剂、水等)组合后，物质仍可以被认为是“分离的”或甚至“纯的”；在此类实施方案中，在不包含此类载剂或赋形剂的情况下，计算物质的分离百分比或纯度。仅给出一个非限制性实例，在一些实施方案中，当a)由于天然存在的生物聚合物如多肽或多核苷酸的起源或衍生来源，而不与在自然界中以其天然状态下伴随所述生物聚合物的一些或所有组分缔合；b)其实质上不含与天然产生其的物种相同的物种的其他多肽或核酸；和/或c)由来自不是天然产生其的物种的细胞或其他表达系统的组分表达或以其他方式与其缔合时，认为所述天然存在的生物聚合物如多肽或多核苷酸是“分离的”。因此，例如，在一些实施方案中，化学合成的或在不同于天然产生其的细胞系统的细胞系统中合成的多肽被认为是“分离的”多肽。或者或另外，在一些实施方案中，已经受一种或多种纯化技术的多肽可被认为是“分离的”多肽，其分离程度是所述多肽已经与其他组分分离，a)所述多肽与所述其他组分自然缔合；和/或b)所述多肽在最初产生时与所述其他组分缔合。
Ka：如本文所用，“Ka”是指特定结合部分与靶标形成结合部分/靶标复合物的缔合速率。
Kd：如本文所用，“Kd”是指特定结合部分/靶标复合物的解离速率。
KD：如本文所用，“KD”是指解离常数，其是由Kd与Ka的比率(即，Kd/Ka)获得，并表示为摩尔浓度(M)。可使用本领域中已经确定的方法，例如通过使用表面等离子体共振，或使用生物传感器系统如
Figure BDA0002410652900000251
系统确定KD值。
部分：本领域技术人员将理解，“部分”是具有特定结构和/或活性的已定义的化学基团或实体，如本文所述。
参考：如本文所用，“参考“实体、系统、量、条件集等是如本文所述，测试实体、系统、量、条件集等与之比较的实体、系统、量、条件集等。例如，在一些实施方案中，“参考“抗体或抗原结合多肽是对照抗体或抗原结合多肽，例如，本文未描述的抗体或抗原结合多肽。
药学上可接受的：如本文所用，术语“药学上可接受的”是指分子或组合物对其接受者无害，或者对其接受者的益处超过了任何有害作用。对于用于配制如本文公开的组合物的载剂、稀释剂或赋形剂，药学上可接受的载剂、稀释剂或赋形剂必须与组合物的其他成分相容并且对其接受者无害，或者对其接受者的益处超过了任何有害作用。
药学上可接受的载剂：如本文所用，术语“药学上可接受的载剂”是指药学上可接受的材料、组合物或媒介物，如液体或固体填充剂、稀释剂、赋形剂或溶剂包封材料，其涉及从身体的一种器官或部分携带或运输主题组合物到身体的另一器官或部分。各载剂在可与制剂的其他成分相容并且对患者无伤害的意义上必须是“可接受的”。可充当药学上可接受的载剂的材料的一些实例包括：糖，如乳糖、葡萄糖和蔗糖；淀粉，如玉米淀粉和马铃薯淀粉；纤维素及其衍生物，如羧甲基纤维素钠、乙基纤维素和乙酸纤维素；粉状黄蓍胶；麦芽糖；明胶；滑石；赋形剂，如可可脂和栓剂蜡；油，如花生油、棉籽油、红花油、芝麻油、橄榄油、玉米油和大豆油；二醇类，如丙二醇；多元醇，如甘油、山梨糖醇、甘露糖醇和聚乙二醇；酯类，如油酸乙酯和月桂酸乙酯；琼脂；缓冲剂，如氢氧化镁和氢氧化铝；海藻酸；无热原水；等渗盐水；林格氏溶液(Ringer’s solution)；乙醇；pH缓冲溶液；聚酯、聚碳酸酯和/或聚酸酐；及其他用于药物制剂中的无毒可相容物质。
参考：如本文所用，术语“参考”描述了相对于其进行比较的标准或对照。例如，在一些实施方案中，将目标试剂、动物、个体、群体、样品、序列或值与参考或对照试剂、动物、个体、群体、样品、序列或值进行比较。在一些实施方案中，参考或对照与目标测试或测定实质上同时测试和/或测定。在一些实施方案中，参考或对照是任选地包含在有形介质中的历史参考或对照。通常，如本领域技术人员所理解的，在与评估条件或环境相当的条件或环境下确定或表征参考或对照。本领域技术人员将理解，何时存在足够的相似性以证明对特定的可能参考或对照的依赖和/或与之的比较。
风险：如本文所用，术语“风险”可指的是疾病、病症和/或病况的风险，意指特定个体将发展疾病、病症和/或病况的可能性。在一些实施方案中，风险表示为百分比。在一些实施方案中，风险是0％、1％、2％、3％、4％、5％、6％、7％、8％、9％、10％、20％、30％、40％、50％、60％、70％、80％、90％直至100％。在一些实施方案中，风险表示为相对于与参考样品或一组参考样品相关联的风险的风险。在一些实施方案中，参考样品或一组参考样品具有已知的疾病、病症、病况和/或事件的风险。在一些实施方案中，参考样品或一组参考样品是来自可与特定个体比较的个体。在一些实施方案中，相对风险被测量为倍数变化，例如，风险增加或降低0、1、2、3、4、5、6、7、8、9、10或更多倍。
选择性结合：如本文所用，就结合部分和靶标而言，“选择性结合”、“选择性地结合”、“特异性结合”或“特异性地结合”是指结合部分优先与靶标缔合，而不与不是靶标的实体缔合。在结合部分与非靶标之间可能发生一定程度的非特异性结合。在一些实施方案中，如果与相比较，结合部分与靶标之间的结合比结合部分与非靶标的结合大2倍、大5倍、大10倍或大100倍，则所述结合部分选择性地结合所述靶标。在一些实施方案中，如果结合亲和力小于约10-5M、小于约10-6M、小于约10-7M、小于约10-8M或小于约10-9M，则结合部分选择性地结合靶标。
受试者：如本文所用，术语“受试者”是指期望对其进行诊断、预后或治疗的任何受试者。例如，受试者可以是动物，例如哺乳动物，例如人或非人灵长类动物(如猿、猴、猩猩或黑猩猩)、犬、猫、豚鼠、兔、大鼠、小鼠、马、牛或奶牛。
靶标：如本文所用，“靶标”是被多特异性结合分子的结合部分特异性结合的任何分子。在一些实施方案中，靶标是本文所述的表位抗原。
治疗剂：如本文所用，短语“治疗剂”可指的是当施用到生物体时引起期望的药理作用的任何试剂。在一些实施方案中，如果试剂在整个合适的群体中表现出统计学上显著的效果，则所述试剂被认为是治疗剂。在一些实施方案中，合适的群体可以是模型生物体的群体。在一些实施方案中，合适的群体可通过各种标准，如特定的年龄组、性别、遗传背景、先前存在的临床状况、根据是否存在特定生物标志物等来限定。在一些实施方案中，治疗剂是可用于缓解、改善、减轻、抑制、预防、延迟疾病、病症和/或病况的一种或多种症状或特征的发作，降低其严重性和/或降低其发生率的物质。在一些实施方案中，治疗剂是在可被销售以向人施用之前已由或需要由政府机构批准的试剂。在一些实施方案中，治疗剂是需要药物处方才能对人施用的试剂。
治疗有效量：如本文所用，术语“治疗有效量”是指以适用于任何医学治疗的合理效益/风险比赋予所治疗受试者以治疗效果的治疗分子(例如，本文所述的治疗性抗体或抗原结合多肽)的量。治疗效果可以是客观的(即，可通过某种测试或标志物进行测量)或主观的(即，受试者给出效果的指示或感觉到效果)。具体说来，“治疗有效量”是指治疗分子或组合物有效治疗、改善或预防特定病况或疾病，或表现出可检测的治疗或预防效果的量，如通过改善与疾病相关联的症状；预防或延迟疾病的发作；和/或还减轻疾病症状的严重性或频率来实现。治疗有效量可以可包含多个单位剂量的给药方案来施用。对于任何特定的治疗分子，治疗有效量(和/或有效给药方案内的适当单位剂量)可例如根据施用途径、与其他药剂的组合而变化。此外，对于任何特定受试者的具体治疗有效量(和/或单位剂量)可取决于多种因素，所述因素包括所治疗的病症和病症的严重性；所用的具体药剂的活性；所用的具体组合物；受试者的年龄、体重、一般健康状况、性别和饮食；所用的具体治疗分子的施用时间、施用途径和/或排泄或代谢的速率；治疗的持续时间；以及医学领域熟知的类似因素。
治疗：如本文所用，术语“治疗”是指部分或完全地缓解、改善、减轻、抑制、延迟特定疾病、病症和/或病况的一种或多种症状或特征的发作、降低其严重性和/或降低其发生率的治疗分子(例如，本文所述的治疗性抗体或抗原结合多肽)的任何施用。这种治疗可用于未表现出相关疾病、病症和/或病况的体征的受试者，和/或仅表现出疾病、病症和/或病况的早期体征的受试者。或者或另外，这种治疗可用于表现出相关疾病、病症和/或病况的一种或多种已确立的体征的受试者。
治疗方案：本领域技术人员将理解，术语“治疗方案”可用于指代单剂量或两个或更多个单位剂量的组、时间表或系列，例如在一段时间内个别地施用到受试者，例如单独地施用到受试者。在一些实施方案中，给定的分子具有推荐的治疗方案，其可涉及一个或多个剂量。在一些实施方案中，治疗方案包括在时间上与其他剂量分隔开的多个剂量。在一些实施方案中，各个剂量彼此以相同长度的时间段分隔开；或者以至少两个不同长度的时间段分隔开。在一些实施方案中，治疗方案内的所有剂量均具有相同的单位剂量。在一些实施方案中，治疗方案内的不同剂量为不同量。
载体：如本文所用，术语“载体”是指经修饰以包括或掺入所提供的核酸序列的受体核酸分子。一种类型的载体是“质粒”，所述质粒是指可将额外的DNA区段连接到其中的环状双链DNA环。另一类型的载体是病毒载体，其中额外的DNA区段可连接到病毒基因组中。某些载体能够在它们被引入的宿主细胞中自主复制(例如，具有细菌复制起点的细菌载体和附加型哺乳动物载体)。其他载体(例如，非附加型哺乳动物载体)可在引入到宿主细胞中之后整合到宿主细胞的基因组中，且因此与宿主基因组一起复制。此外，某些载体能够指导它们所操作性地连接到的基因的表达。此类载体在本文中称为“表达载体”。标准技术可用于重组DNA、寡核苷酸合成和组织培养与转化(例如，电穿孔、脂质体转染)。酶反应和纯化技术可根据制造商的说明书或如本领域通常完成的或如本文所述执行。以上技术和程序通常可根据本领域中所熟知且如整篇本说明书中所引用并论述的各种一般参考文献和更具体的参考文献中所述的常规方法来进行。参见，例如Sambrook等，Molecular Cloning:ALaboratory Manual(第2版，Cold Spring Harbor Laboratory Press,Cold SpringHarbor,N.Y.(1989))，出于任何目的将其通过引用并入本文。
附图说明
图1是一组免疫组织化学(IHC)图像，示出了福尔马林固定的石蜡包埋(FFPE)的人肿瘤细胞系(HCC1806和BT20)，各细胞系已使用标准流程制备和封闭，然后与
Figure BDA0002410652900000301
EPR2759(2)/ab109215或表达指定的小鼠单克隆抗体(Ab3或Ab6)的杂交瘤的上清液一起孵育。
图2是一组IHC图像，示出了福尔马林固定的石蜡包埋(FFPE)的人肿瘤细胞系(HCC1806和BT20)，各细胞系已使用标准流程制备和封闭，然后与表达指定的小鼠单克隆抗体(Ab2、Ab1或Ab5)的杂交瘤的上清液一起孵育。
图3是一组IHC图像，示出了福尔马林固定的石蜡包埋(FFPE)的人肿瘤细胞系(HCC1806和BT20)，各细胞系已使用标准流程制备和封闭，然后与表达指定的小鼠单克隆抗体(Ab7、Ab4或Ab8)的杂交瘤的上清液一起孵育。
图4是一组IHC图像，示出了福尔马林固定的石蜡包埋(FFPE)的人肿瘤细胞系(HCC1806和BT20)，各细胞系已使用标准流程制备和封闭，然后与培养基(没有一抗)一起孵育。
图5是一组IHC图像，示出了福尔马林固定的石蜡包埋(FFPE)的人前列腺组织样品，所述样品已使用标准流程制备和封闭，然后与从本公开的杂交瘤上清液纯化的5μg/mL抗hCD166小鼠单克隆抗体(Ab2或Ab1)或
Figure BDA0002410652900000311
EPR2759(2)/ab109215一起孵育。
图6是一组IHC图像，示出了福尔马林固定的石蜡包埋(FFPE)的人胃组织样品，所述样品已使用标准流程制备和封闭，然后与从本公开的杂交瘤上清液纯化的5μg/mL抗hCD166小鼠单克隆抗体(Ab2或Ab1)或
Figure BDA0002410652900000312
EPR2759(2)/ab109215一起孵育。
图7是一组IHC图像，示出了福尔马林固定的石蜡包埋(FFPE)的人肝组织样品，所述样品已使用标准流程制备和封闭，然后与从本公开的杂交瘤上清液纯化的5μg/mL抗hCD166小鼠单克隆抗体(Ab2或Ab1)或
Figure BDA0002410652900000313
EPR2759(2)/ab109215一起孵育。
图8是一组IHC图像，示出了福尔马林固定的石蜡包埋(FFPE)的人脾组织样品，所述样品已使用标准流程制备和封闭，然后与从本公开的杂交瘤上清液纯化的5μg/mL抗hCD166小鼠单克隆抗体(Ab2或Ab1)或
Figure BDA0002410652900000314
EPR2759(2)/ab109215一起孵育。
图9是一组IHC图像，示出了福尔马林固定的石蜡包埋(FFPE)的人骨骼肌组织样品，所述样品已使用标准流程制备和封闭，然后与从本公开的杂交瘤上清液纯化的5μg/mL抗hCD166小鼠单克隆抗体(Ab2或Ab1)或
Figure BDA0002410652900000315
EPR2759(2)/ab109215一起孵育。
图10是一组IHC图像，示出了福尔马林固定的石蜡包埋(FFPE)的人脑组织样品，所述样品已使用标准流程制备和封闭，然后与从本公开的杂交瘤上清液纯化的5μg/mL抗hCD166小鼠单克隆抗体(Ab2或Ab1)或
Figure BDA0002410652900000316
EPR2759(2)/ab109215一起孵育。
图11是一组IHC图像，示出了福尔马林固定的石蜡包埋的人组织(hCD166阳性人前列腺组织或hCD166阴性人胎盘组织)，所述组织已使用标准流程制备和封闭，然后与1μg/mL本公开的纯化的重组Ab1抗hCD166小鼠单克隆抗体或5μg/mL可商购获得的抗hCD166兔单克隆抗体(
Figure BDA0002410652900000321
EPR2759(2)/ab109215)一起孵育。
图12是一组蛋白质印迹图像，示出了从所指示的人肿瘤细胞系分离的细胞裂解物，使用本文公开的Ab1抗hCD166小鼠单克隆抗体、
Figure BDA0002410652900000322
EPR2759(2)/ab109215抗hCD166兔单克隆抗体、BD Biosciences 3A6抗hCD166小鼠单克隆抗体(目录号559263)或抗肌动蛋白抗体对照进行分析。每个蛋白质印迹图像示出了六条泳道，分别代表以下细胞系：H292、HCC1806、MDA-MB-231、BXPC3、HT29和BT20。
图13是示出了在具有
Figure BDA0002410652900000323
EPR2759(2)/ab109215的多个患者来源的肿瘤组织微阵列(TMA)上的IHC染色结果的图。
具体实施方式
本发明尤其提供结合或能够结合CD166的抗体或抗原结合多肽、包含其的组合物及其用途。在某些实施方案中，本发明的抗CD166抗体或抗原结合多肽结合或能够结合CD166的胞内结构域(“ICD”)的全部或一部分。结合或能够结合CD166的胞内结构域的全部或一部分的本发明的抗体或抗原结合多肽可被称为“抗CD166 ICD抗体或抗原结合多肽”。其部分可相应地被称为例如抗CD166 ICD CDR。本发明尤其还包括编码结合或能够结合CD166的抗体或抗原结合多肽的核酸分子。
在各种实施方案中，抗CD166抗体或抗原结合多肽适用于检测或治疗病况或疾病的方法中。如本文公开的检测方法可以是体外的，例如，用来源于受试者的样品进行，或是体内的。在一些情况下，抗CD166抗体或抗原结合多肽适用于检测或治疗癌症的方法中。在一些情况下，抗CD166抗体或抗原结合多肽适用于检测或治疗以活化的淋巴细胞或活化的单核细胞(白细胞)为特征的病况或疾病的方法中。
抗体和抗原结合多肽
本文所述的抗体或抗原结合多肽可以是免疫球蛋白、重链抗体、轻链抗体、基于LRR的抗体、具有抗体样性质的其他蛋白质支架或本领域已知的其他免疫结合部分，包括：例如四链免疫球蛋白、免疫粘附素、双抗体、dsFv、双抗体、三链抗体、四链抗体、微型抗体、大型抗体、TandAb、单链抗体、重链抗体、单结构域重链抗体、特定的HCDR、特定的LCDR、DVD、BiTe、scFv、scAb、Fab、Fab'、Fab2、Fab3、F(ab')2、Fd、Fd'、Fv等或其任何组合。不同种类的抗体和抗原结合多肽的亚单位结构和三维构型是本领域已知的。
抗体可以是具有四条多肽链例如两条重链(H)和两条轻链(L)的免疫球蛋白分子。同样，抗原结合多肽可以是或包含重链、轻链、重链可变结构域、轻链可变结构域中的一个或多个，或其任何一个或多个部分，如本文所述或本领域已知的。重链可以包含重链可变结构域和重链恒定结构域。重链恒定结构域可以包括CH1、铰链、CH2、CH3，并且在一些情况下，包括CH4区。轻链可以包含轻链可变结构域和轻链恒定结构域。轻链恒定结构域可以包括CL。重链的重链可变结构域和轻链的轻链可变结构域通常可以进一步细分为可变性区域，称为互补决定区(CDR)，其间散布有更保守的区域，称为框架区(FR)。这样的重链和轻链可变结构域可以各自包含三个CDR和四个框架区，从氨基-末端到羧基-末端按以下顺序排列：FR1、CDR1、FR2、CDR2、FR3、CDR3、FR4，其中的一个或多个可具有如本文所述的序列。某些重链区可被指定为HFR1、HCDR1、HFR2、HCDR2、HFR3、HCDR3、HFR4。某些轻链区可被指定为LFR1、LCDR1、LFR2、LCDR2、LFR3、LCDR3、LFR4。
在本领域中已经确立了某些系统来限定CDR边界(例如，Kabat系统和Chothia系统)。本领域技术人员将意识到CDR鉴定系统(例如，Kabat系统或Chothia系统)的选择将影响所鉴定的CDR的氨基酸序列(及相应地CDR编码核酸的序列)。因此，本领域技术人员将理解，尽管本公开可根据特定系统鉴定CDR，但本公开涵盖如可由任何替代系统鉴定的那些CDR。
抗CD166 ICD重链互补决定区
在一些实施方案中，本文所述的抗CD166 ICD抗体或抗原结合多肽可以包含抗CD166 ICD HCDR1、抗CD166 ICD HCDR2和/或抗CD166 ICD HCDR3中的一种或多种。
抗CD166 ICD抗体或抗原结合多肽的抗CD166 ICD HCDR1可具有根据SEQ ID NO:3或SEQ ID NO:23的序列。
在特定情况下，抗CD166 ICD抗体或抗原结合多肽的抗CD166ICD HCDR1可具有以下序列：在与根据SEQ ID NO:3的序列或根据SEQ ID NO:23的序列(其各自是5个氨基酸的序列)比对时，其与根据SEQ ID NO:3或SEQ ID NO:23的序列在5个氨基酸位置中的5个、5个氨基酸位置中的4个或5个氨基酸位置中的3个处相同。
在特定情况下，抗CD166 ICD抗体或抗原结合多肽的抗CD166ICD HCDR1可具有以下序列：在与根据SEQ ID NO:3的序列或根据SEQ ID NO:23的序列比对时，其与根据SEQ IDNO:3或SEQ ID NO:23的序列在1或2个氨基酸位置处不同。
抗CD166 ICD抗体或抗原结合多肽的抗CD166 ICD HCDR2可具有根据SEQ ID NO:4、SEQ ID NO:24、SEQ ID NO:43和/或SEQ ID NO:44的序列。
在特定情况下，抗CD166 ICD抗体或抗原结合多肽的抗CD166ICD HCDR2可具有以下序列：在与根据SEQ ID NO:4的序列、根据SEQ ID NO:24的序列、根据SEQ ID NO:43的序列或根据SEQ ID NO:44的序列(其各自是17个氨基酸的序列)比对时，其与根据SEQ ID NO:4、SEQ ID NO:24、SEQ ID NO:43或SEQ ID NO:44的序列在17个氨基酸位置中的17个、17个氨基酸位置中的16个、17个氨基酸位置中的15个、17个氨基酸位置中的14个、17个氨基酸位置中的13个或17个氨基酸位置中的12个处相同。
在特定情况下，抗CD166 ICD抗体或抗原结合多肽的抗CD166ICD HCDR2可具有以下序列：在与根据SEQ ID NO:4的序列、根据SEQ ID NO:24的序列、根据SEQ ID NO:43的序列或根据SEQ ID NO:44的序列比对时，其与根据SEQ ID NO:4、SEQ ID NO:24、SEQ ID NO:43或SEQ ID NO:44的序列在1、2、3、4或5个氨基酸位置处不同。
抗CD166 ICD抗体或抗原结合多肽的抗CD166 ICD HCDR3可具有根据SEQ ID NO:5或SEQ ID NO:25的序列。
在特定情况下，抗CD166 ICD抗体或抗原结合多肽的抗CD166ICD HCDR3可具有以下序列：在与根据SEQ ID NO:5的序列或根据SEQ ID NO:25的序列(其各自是6个氨基酸的序列)比对时，其与根据SEQ ID NO:5或SEQ ID NO:25的序列在6个氨基酸位置中的6个、6个氨基酸位置中的5个或6个氨基酸位置中的4个处相同。
在特定情况下，抗CD166 ICD抗体或抗原结合多肽的抗CD166ICD HCDR3可具有以下序列：在与根据SEQ ID NO:5的序列或根据SEQ ID NO:25的序列比对时，其与根据SEQ IDNO:5或SEQ ID NO:25的序列在1或2个氨基酸位置处不同。
在各种实施方案中，氨基酸位置的不同之处可在于对应于特定位置的氨基酸被取代或缺失。在各种实施方案中，氨基酸位置的不同之处可在于添加或插入了氨基酸。
如本领域技术人员将理解的，任何抗CD166 ICD HCDR序列可以容易地例如通过分子生物学技术与本文提供的或本领域中另外已知的任何其他抗体序列或结构域组合，所述抗体序列或结构域包括如本文公开的或本领域中另外已知的任何框架区、CDR、或恒定结构域、或其部分，如可能存在于如本文公开的或本领域中另外已知的任何形式的抗体或结合分子中。
抗CD166 ICD重链可变结构域
在一些实施方案中，本文所述的抗CD166 ICD抗体或抗原结合多肽可以包含抗CD166 ICD重链可变结构域。
本发明的抗CD166 ICD重链可变结构域可以包含抗CD166 ICD HCDR1、抗CD166ICD HCDR2和/或抗CD166 ICD HCDR3中的一种、任意两种或全部。本领域技术人员将理解，在各种情况下，可通过CDR或一组CDR的存在来鉴定、表征、区分或定义抗CD166ICD重链可变结构域，所述CDR任选地选自抗CD166 ICD HCDR1、抗CD166 ICD HCDR2和/或抗CD166 ICDHCDR3中的一种、任意两种或全部。在各种实施方案中，抗CD166 ICD重链可变结构域包含抗CD166 ICD HCDR1。在各种实施方案中，抗CD166 ICD重链可变结构域包含抗CD166 ICDHCDR2。在各种实施方案中，抗CD166 ICD重链可变结构域包含抗CD166 ICD HCDR3。在各种实施方案中，抗CD166 ICD重链可变结构域包含抗CD166 ICD HCDR1和抗CD166 ICD HCDR2。在各种实施方案中，抗CD166 ICD重链可变结构域包含抗CD166 ICD HCDR1和抗CD166 ICDHCDR3。在各种实施方案中，抗CD166 ICD重链可变结构域包含抗CD166 ICD HCDR2和抗CD166 ICD HCDR3。在各种实施方案中，抗CD166ICD重链可变结构域包含抗CD166 ICDHCDR1、抗CD166 ICD HCDR2和抗CD166 ICD HCDR3。
在一些实施方案中，本文所述的抗CD166 ICD抗体或抗原结合多肽可以包含根据SEQ ID NO:2、SEQ ID NO:22和/或SEQ ID NO:41的抗CD166 ICD重链可变结构域。
在特定情况下，抗CD166 ICD抗体或抗原结合多肽的抗CD166ICD重链可变结构域可具有与根据SEQ ID NO:2的序列、根据SEQ ID NO:22的序列或根据SEQ ID NO:41的序列至少75％同一的序列，例如，与根据SEQ ID NO:2的序列、根据SEQ ID NO:22的序列或根据SEQ ID NO:41的序列至少75％、至少80％、至少80％、至少90％、至少95％、至少96％、至少97％、至少98％或至少99％同一的序列。
在特定情况下，抗CD166 ICD抗体或抗原结合多肽的抗CD166ICD重链可变结构域可具有以下序列：在与根据SEQ ID NO:2的序列、根据SEQ ID NO:22的序列或根据SEQ IDNO:41的序列(其各自是115个氨基酸的序列)比对时，其与根据SEQ ID NO:2、SEQ ID NO:22或SEQ ID NO:41的序列在115个氨基酸位置中的115个至115个氨基酸位置中的至少90个(例如，115个氨基酸位置中的至少90、95、100、105、106、107、108、109、110、111、112、113或114个)处相同。
在特定情况下，抗CD166 ICD抗体或抗原结合多肽的抗CD166ICD重链可变结构域可具有以下序列：在与根据SEQ ID NO:2的序列、根据SEQ ID NO:22的序列或根据SEQ IDNO:41的序列比对时，其与根据SEQ ID NO:2、SEQ ID NO:22或SEQ ID NO:41的序列在不超过25个氨基酸位置(例如，不超过1、2、3、4、5、6、7、8、9、10、11、12、13、14、15、16、17、18、19、20或25个氨基酸位置)处不同。
抗CD166 ICD重链
在一些实施方案中，本文所述的抗CD166 ICD抗体或抗原结合多肽可以包含抗CD166 ICD重链。
本发明的抗CD166 ICD重链可以包含本文公开的任何抗CD166ICD重链可变结构域。
在各种实施方案中，抗CD166 ICD重链恒定结构域可以是任何类别(或亚类)。在各种实施方案中，重链恒定结构域可以包括但不限于IgG、IgM、IgA、IgD或IgE中的一种或多种中的任一种的氨基酸序列，包括但不限于亚类，诸如IgG1、IgG2、IgG3、IgG4、IgA1和IgA2。在各种情况下，恒定结构域可以包括免疫球蛋白重链恒定结构域的两个或更多个类别(或亚类)的混合。例如，抗体或抗原结合多肽可以包含恒定结构域的第一部分，所述第一部分具有选自IgG、IgM、IgA、IgD或IgE类恒定结构域的免疫球蛋白恒定结构域的序列；和恒定结构域的第二部分，所述第二部分具有与所述第一部分不同且选自IgG、IgM、IgA、IgD或IgE类恒定结构域的免疫球蛋白恒定结构域的序列。在一些情况下，恒定结构域可以包括特定类别的恒定结构域的两个或更多个亚类的混合，例如，恒定结构域的第一部分可以包括选自IgG1、IgG2、IgG3或IgG4亚类恒定结构域的免疫球蛋白恒定结构域的序列，并且恒定结构域的第二部分可以包括不同于所述第一部分且选自IgG1、IgG2、IgG3或IgG4亚类恒定结构域的免疫球蛋白恒定结构域的序列。在一些情况下，抗CD166ICD抗体或抗原结合多肽包含Fc区或Fc片段。重链可包含存在于参考重链如根据SEQ ID NO:1、SEQ ID NO:21和/或SEQ IDNO:67的重链中的恒定结构域。
在一些实施方案中，本文所述的抗CD166 ICD抗体或抗原结合多肽可以包含根据SEQ ID NO:1、SEQ ID NO:21和/或SEQ ID NO:67的抗CD166 ICD重链。
在特定情况下，抗CD166 ICD抗体或抗原结合多肽的抗CD166ICD重链可具有以下序列：其与根据SEQ ID NO:1的序列、根据SEQ ID NO:21的序列或根据SEQ ID NO:67的序列至少75％同一，例如，与根据SEQ ID NO:1的序列、根据SEQ ID NO:21的序列或根据SEQ IDNO:67的序列至少75％、至少80％、至少80％、至少90％、至少95％、至少96％、至少97％、至少98％或至少99％同一。
在特定情况下，抗CD166 ICD抗体或抗原结合多肽的抗CD166ICD重链可具有以下序列：在与根据SEQ ID NO:1的序列、根据SEQ ID NO:21的序列或根据SEQ ID NO:67的序列(其各自是439个氨基酸的序列)比对时，其与根据SEQ ID NO:1、SEQ ID NO:21或SEQ IDNO:67的序列在439个氨基酸位置中的439个至439个氨基酸位置中的至少350个(例如，至少360、370、380、390、400、410、420、425、430、431、432、433、434、435、436、437或438或439个氨基酸位置)处相同。
在特定情况下，抗CD166 ICD抗体或抗原结合多肽的抗CD166ICD重链可具有以下序列：在与根据SEQ ID NO:1的序列、根据SEQ ID NO:21的序列或根据SEQ ID NO:67的序列比对时，其与根据SEQ ID NO:1、SEQ ID NO:21或SEQ ID NO:67的序列在不超过80个氨基酸位置(例如，不超过1、2、3、4、5、6、7、8、9、10、11、12、13、14、15、16、17、18、19、20、30、40、50、70或80个氨基酸位置)处不同。
抗CD166 ICD轻链互补决定区
在一些实施方案中，本文所述的抗CD166 ICD抗体或抗原结合多肽可以包含抗CD166 ICD LCDR1、抗CD166 ICD LCDR2和/或抗CD166 ICD LCDR3中的一种或多种。
抗CD166 ICD抗体或抗原结合多肽的抗CD166 ICD LCDR1可具有根据SEQ ID NO:13或SEQ ID NO:33的序列。
在特定情况下，抗CD166 ICD抗体或抗原结合多肽的抗CD166ICD LCDR1可具有以下序列：在与根据SEQ ID NO:13的序列或根据SEQ ID NO:33的序列(其各自是16个氨基酸的序列)比对时，其与根据SEQ ID NO:13或SEQ ID NO:33的序列在16个氨基酸位置中的16个、16个氨基酸位置中的15个、16个氨基酸位置中的14个、16个氨基酸位置中的13个或16个氨基酸位置中的12个处相同。
在特定情况下，抗CD166 ICD抗体或抗原结合多肽的抗CD166ICD LCDR1可具有以下序列：在与根据SEQ ID NO:13的序列或根据SEQ ID NO:33的序列比对时，其与根据SEQID NO:13或SEQ ID NO:33的序列在1、2、3或4个氨基酸位置处不同。
抗CD166 ICD抗体或抗原结合多肽的抗CD166 ICD LCDR2可具有根据SEQ ID NO:14或SEQ ID NO:34的序列。
在特定情况下，抗CD166 ICD抗体或抗原结合多肽的抗CD166ICD LCDR2可具有以下序列：在与根据SEQ ID NO:14的序列或根据SEQ ID NO:34的序列(其各自是7个氨基酸的序列)比对时，其与根据SEQ ID NO:14或SEQ ID NO:34的序列在7个氨基酸位置中的7个、7个氨基酸位置中的6个或7个氨基酸位置中的5个处相同。
在特定情况下，抗CD166 ICD抗体或抗原结合多肽的抗CD166ICD LCDR2可具有以下序列：在与根据SEQ ID NO:14的序列或根据SEQ ID NO:34的序列比对时，其与根据SEQID NO:14或SEQ ID NO:34的序列在1或2个氨基酸位置处不同。
抗CD166 ICD抗体或抗原结合多肽的抗CD166 ICD LCDR3可具有根据SEQ ID NO:15、SEQ ID NO:35和/或SEQ ID NO:45的序列。
在特定情况下，抗CD166 ICD抗体或抗原结合多肽的抗CD166ICD LCDR3可具有以下序列：在与根据SEQ ID NO:15的序列、根据SEQ ID NO:35的序列或根据SEQ ID NO:45的序列(其各自是9个氨基酸的序列)比对时，其与根据SEQ ID NO:15、SEQ ID NO:35或SEQ IDNO:45的序列在9个氨基酸位置中的9个、9个氨基酸位置中的8个或9个氨基酸位置中的7个处相同。
在特定情况下，抗CD166 ICD抗体或抗原结合多肽的抗CD166ICD LCDR3可具有以下序列：在与根据SEQ ID NO:15的序列、根据SEQ ID NO:35的序列或根据SEQ ID NO:45的序列比对时，其与根据SEQ ID NO:15、SEQ ID NO:35或SEQ ID NO:45的序列在1或2个氨基酸位置处不同。
如本领域技术人员将理解的，任何抗CD166 ICD LCDR序列可以容易地例如通过分子生物学技术与本文提供的或本领域中另外已知的任何其他抗体序列或结构域组合，所述抗体序列或结构域包括如本文公开的或本领域中另外已知的任何框架区、CDR、或恒定结构域、或其部分，如可能存在于如本文公开的或本领域中另外已知的任何形式的抗体或结合分子中。
抗CD166 ICD轻链可变结构域
在一些实施方案中，本文所述的抗CD166 ICD抗体或抗原结合多肽可以包含抗CD166 ICD轻链可变结构域。
本发明的抗CD166 ICD轻链可变结构域可以包含抗CD166 ICD LCDR1、抗CD166ICD LCDR2和/或抗CD166 ICD LCDR3中的一种、任意两种或全部。本领域技术人员将理解，在各种情况下，可以通过CDR或一组CDR的存在来鉴定、表征、区分或定义抗CD166ICD轻链可变结构域，所述CDR任选地选自抗CD166 ICD LCDR1、抗CD166 ICD LCDR2和/或抗CD166 ICDLCDR3中的一种、任意两种或全部。在各种实施方案中，抗CD166 ICD轻链可变结构域包含抗CD166 ICD LCDR1。在各种实施方案中，抗CD166 ICD轻链可变结构域包含抗CD166 ICDLCDR2。在各种实施方案中，抗CD166ICD轻链可变结构域包含抗CD166 ICD LCDR3。在各种实施方案中，抗CD166 ICD轻链可变结构域包含抗CD166 ICD LCDR1和抗CD166 ICD LCDR2。在各种实施方案中，抗CD166 ICD轻链可变结构域包含抗CD166 ICD LCDR1和抗CD166 ICDLCDR3。在各种实施方案中，抗CD166 ICD轻链可变结构域包含抗CD166 ICD LCDR2和抗CD166 ICD LCDR3。在各种实施方案中，抗CD166 ICD轻链可变结构域包含抗CD166 ICDLCDR1、抗CD166 ICD LCDR2和抗CD166 ICD LCDR3。
在一些实施方案中，本文所述的抗CD166 ICD抗体或抗原结合多肽可以包含根据SEQ ID NO:12、SEQ ID NO:32和/或SEQ ID NO:42的抗CD166 ICD轻链可变结构域。
在特定情况下，抗CD166 ICD抗体或抗原结合多肽的抗CD166ICD轻链可变结构域可具有以下序列：其与根据SEQ ID NO:12的序列、根据SEQ ID NO:32的序列或根据SEQ IDNO:42的序列至少75％同一，例如，与根据SEQ ID NO:12的序列、根据SEQ ID NO:32的序列或根据SEQ ID NO:42的序列至少75％、至少80％、至少80％、至少90％、至少95％、至少96％、至少97％、至少98％或至少99％同一。
在特定情况下，抗CD166 ICD抗体或抗原结合多肽的抗CD166ICD轻链可变结构域可具有以下序列：在与根据SEQ ID NO:12的序列、根据SEQ ID NO:32的序列或根据SEQ IDNO:42的序列(其各自是112个氨基酸的序列)比对时，其与根据SEQ ID NO:12的序列、根据SEQ ID NO:32的序列或根据SEQ ID NO:42的序列在112个氨基酸位置中的112个至112个氨基酸位置的至少85个(例如，在112个氨基酸位置的至少85、90、95、100、105、106、107、108、109、110、111或112个)处相同。
在特定情况下，抗CD166 ICD抗体或抗原结合多肽的抗CD166ICD轻链可变结构域可具有以下序列：在与根据SEQ ID NO:12的序列、根据SEQ ID NO:32的序列或根据SEQ IDNO:42的序列比对时，其与根据SEQ ID NO:12、SEQ ID NO:32或SEQ ID NO:42的序列在不超过25个氨基酸位置(例如，不超过1、2、3、4、5、6、7、8、9、10、11、12、13、14、15、16、17、18、19、20或25个氨基酸位置)处不同。
抗CD166 ICD轻链
在一些实施方案中，本文所述的抗CD166 ICD抗体或抗原结合多肽可以包含抗CD166 ICD轻链。
本发明的抗CD166 ICD轻链可以包含本文公开的任何抗CD166ICD轻链可变结构域。
在一些实施方案中，抗CD166 ICD抗体或抗原结合多肽包含抗CD166 ICD轻链，所述抗CD166 ICD轻链包含任何轻链恒定结构域，例如本领域技术人员已知的轻链恒定结构域。如本领域技术人员将意识到的，轻链恒定结构域可以是κ轻链恒定结构域或λ轻链恒定结构域。在某些实施方案中，如本文公开的轻链的恒定结构域是κ轻链恒定结构域。在某些实施方案中，如本文公开的轻链的恒定结构域是λ轻链恒定结构域。轻链可以包含存在于参考轻链如根据SEQ ID NO:11、SEQ ID NO:31和/或SEQ ID NO:68的轻链中的恒定结构域。
在一些实施方案中，本文所述的抗CD166 ICD抗体或抗原结合多肽可以包含根据SEQ ID NO:11、SEQ ID NO:31和/或SEQ ID NO:68的抗CD166 ICD轻链。
在特定情况下，抗CD166 ICD抗体或抗原结合多肽的抗CD166ICD轻链可具有以下序列：其与根据SEQ ID NO:11的序列、根据SEQ ID NO:31的序列或根据SEQ ID NO:68的序列至少75％同一，例如，与根据SEQ ID NO:11的序列、根据SEQ ID NO:31的序列或根据SEQID NO:68的序列至少75％、至少80％、至少80％、至少90％、至少95％、至少96％、至少97％、至少98％或至少99％同一。
在特定情况下，抗CD166 ICD抗体或抗原结合多肽的抗CD166ICD轻链可具有以下序列：在与根据SEQ ID NO:11的序列、根据SEQ ID NO:31的序列或根据SEQ ID NO:68的序列(其各自是219个氨基酸的序列)比对时，其与根据SEQ ID NO:11、SEQ ID NO:31或SEQ IDNO:68的序列在219个氨基酸位置中的219个至219个氨基酸位置中的至少175个(例如，在219个氨基酸位置中的至少175、180、185、190、195、200、205、210、211、212、213、214、215、216、217、218或219个)处相同。
在特定情况下，抗CD166 ICD抗体或抗原结合多肽的抗CD166ICD轻链可具有以下序列：在与根据SEQ ID NO:11的序列、根据SEQ ID NO:31的序列或根据SEQ ID NO:68的序列比对时，其与根据SEQ ID NO:11的序列、根据SEQ ID NO:31的序列或根据SEQ ID NO:68的序列在不超过40个氨基酸位置(例如，不超过1、2、3、4、5、6、7、8、9、10、11、12、13、14、15、16、17、18、19、20、30或40个氨基酸位置)处不同。
抗CD166 ICD抗体或抗原结合多肽
在各种实施方案中，抗CD166 ICD抗体或抗原结合多肽可以包含如本文公开的抗CD166 ICD重链、抗CD166 ICD重链可变结构域、抗CD166 ICD HCDR1、抗CD166 ICD HCDR2和/或抗CD166 ICD HCDR3。抗CD166 ICD抗体或抗原结合多肽可以包含以任意组合的如本文公开的抗CD166 ICD重链、抗CD166 ICD重链可变结构域、抗CD166 ICD HCDR1、抗CD166ICD HCDR2和/或抗CD166 ICD HCDR3中的一种或多种。
在各种实施方案中，抗CD166 ICD抗体或抗原结合多肽可以包含如本文公开的抗CD166 ICD轻链、抗CD166 ICD轻链可变结构域、抗CD166 ICD LCDR1、抗CD166 ICD LCDR2和/或抗CD166 ICD LCDR3。抗CD166 ICD抗体或抗原结合多肽可以包含以任意组合的如本文公开的抗CD166 ICD轻链、抗CD166 ICD轻链可变结构域、抗CD166 ICD LCDR1、抗CD166ICD LCDR2和/或抗CD166 ICD LCDR3中的一种或多种。
在各种实施方案中，抗CD166 ICD抗体或抗原结合多肽可以包含如本文公开的抗CD166 ICD重链、抗CD166 ICD重链可变结构域、抗CD166 ICD HCDR1、抗CD166 ICD HCDR2和/或抗CD166 ICD HCDR3中的一种或多种或全部，以及如本文公开的抗CD166 ICD轻链、抗CD166 ICD轻链可变结构域、抗CD166 ICD LCDR1、抗CD166 ICD LCDR2和/或抗CD166 ICDLCDR3中的一种或多种或全部。
在某些实施方案中，抗CD166 ICD抗体或抗原结合多肽可以包含抗CD166 ICD重链可变结构域和抗CD166 ICD轻链可变结构域。
在某些实施方案中，抗CD166 ICD抗体或抗原结合多肽可以包含抗CD166 ICD重链和抗CD166 ICD轻链。
在某些实施方案中，抗CD166 ICD抗体和抗原结合可以包含一个或两个抗CD166ICD HCDR1区、一个或两个抗CD166 ICD HCDR2区和/或一个或两个抗CD166 ICD HCDR3区。在某些实施方案中，抗CD166 ICD抗体或抗原结合多肽可以包含以下区中的一种或多种：两个抗CD166 ICD HCDR1区、抗CD166 ICD HCDR2区或抗CD166 ICD HCDR3区，这两个区相同或不同。
在某些实施方案中，抗CD166 ICD抗体和抗原结合可以包含一个或两个抗CD166ICD LCDR1区、一个或两个抗CD166 ICD LCDR2区和/或一个或两个抗CD166 ICD LCDR3区。在某些实施方案中，抗CD166 ICD抗体或抗原结合多肽可以包含以下区中的一种或多种：两个抗CD166 ICD LCDR1区、抗CD166 ICD LCDR2区或抗CD166 ICD LCDR3区，这两个区相同或不同。
在某些实施方案中，抗CD166 ICD抗体和抗原结合可以包含一个或两个重链可变结构域和一个或两个轻链可变结构域。在某些实施方案中，抗CD166 ICD抗体或抗原结合多肽可以包含第一抗CD166 ICD重链可变结构域、与所述第一抗CD166 ICD重链可变结构域相同或不同的第二抗CD166 ICD重链可变结构域、及抗CD166ICD轻链可变结构域。在某些实施方案中，抗CD166 ICD抗体或抗原结合多肽可以包含第一抗CD166 ICD轻链可变结构域、与所述第一抗CD166 ICD轻链可变结构域相同或不同的第二抗CD166 ICD轻链可变结构域、及抗CD166 ICD重链可变结构域。在某些实施方案中，抗CD166 ICD抗体或抗原结合多肽可以包含第一抗CD166 ICD重链可变结构域、与所述第一抗CD166 ICD重链可变结构域相同或不同的第二抗CD166 ICD重链可变结构域、第一抗CD166 ICD轻链可变结构域、及与所述第一抗CD166 ICD轻链可变结构域相同或不同的第二抗CD166 ICD轻链可变结构域。
在某些实施方案中，抗CD166 ICD抗体和抗原结合可以包含一个或两个重链和一个或两个轻链。在某些实施方案中，抗CD166ICD抗体或抗原结合多肽可以包含第一抗CD166ICD重链、与所述第一抗CD166 ICD重链相同或不同的第二抗CD166 ICD重链、及抗CD166ICD轻链。在某些实施方案中，抗CD166 ICD抗体或抗原结合多肽可以包含第一抗CD166 ICD轻链、与所述第一抗CD166 ICD轻链相同或不同的第二抗CD166 ICD轻链、及抗CD166 ICD重链。在某些实施方案中，抗CD166 ICD抗体或抗原结合多肽可以包含第一抗CD166 ICD重链、与所述第一抗CD166 ICD重链相同或不同的第二抗CD166 ICD重链、第一抗CD166 ICD轻链、及与所述第一抗CD166 ICD轻链相同或不同的第二抗CD166 ICD轻链。
在某些特定的实施方案中，本发明的抗CD166 ICD抗体或抗原结合多肽包含至少一个根据SEQ ID NO:1的抗CD166 ICD重链和至少一个根据SEQ ID NO:11的抗CD166 ICD轻链。在某些特定的实施方案中，本发明的抗CD166 ICD抗体或抗原结合多肽包含两个根据SEQ ID NO:1的抗CD166 ICD重链和两个根据SEQ ID NO:11的抗CD166 ICD轻链。
在某些特定的实施方案中，本发明的抗CD166 ICD抗体或抗原结合多肽包含至少一个根据SEQ ID NO:2的抗CD166 ICD重链可变结构域和至少一个根据SEQ ID NO:12的抗CD166 ICD轻链可变结构域。在某些特定的实施方案中，本发明的抗CD166 ICD抗体或抗原结合多肽包含两个根据SEQ ID NO:2的抗CD166 ICD重链可变结构域和两个根据SEQ IDNO:12的抗CD166 ICD轻链可变结构域。
在某些特定的实施方案中，本发明的抗CD166 ICD抗体或抗原结合多肽包含以下区中的一个或多个或全部：(a)根据SEQ ID NO:3的抗CD166 ICD HCDR1；(b)根据SEQ IDNO:4的抗CD166 ICD HCDR2；和/或(c)根据SEQ ID NO:5的抗CD166 ICD HCDR3；以及以下区中的一个或多个或全部：(a)根据SEQ ID NO:13的抗CD166ICD LCDR1；(b)根据SEQ ID NO:14的抗CD166 ICD LCDR2；和/或(c)根据SEQ ID NO:15的抗CD166 ICD LCDR3。
在某些特定的实施方案中，本发明的抗CD166 ICD抗体或抗原结合多肽包含以下区中的一个或多个或全部：(a)两个根据SEQ ID NO:3的抗CD166 ICD HCDR1区；(b)两个根据SEQ ID NO:4的抗CD166 ICD HCDR2区；和/或(c)两个根据SEQ ID NO:5的抗CD166ICDHCDR3区；以及以下区中的一个或多个或全部：(a)两个根据SEQ ID NO:13的抗CD166 ICDLCDR1区；(b)两个根据SEQ ID NO:14的抗CD166 ICD LCDR2区；和/或(c)两个根据SEQ IDNO:15的抗CD166 ICD LCDR3区。
在某些特定的实施方案中，本发明的抗CD166 ICD抗体或抗原结合多肽包含至少一个根据SEQ ID NO:3的抗CD166 ICD HCDR1；至少一个根据SEQ ID NO:13的抗CD166 ICDLCDR1；至少一个根据SEQ ID NO:4的抗CD166 ICD HCDR2；至少一个根据SEQ ID NO:14的抗CD166 ICD LCDR2；至少一个根据SEQ ID NO:5的抗CD166 ICD HCDR3；和至少一个根据SEQID NO:15的抗CD166ICD LCDR3。
在某些特定的实施方案中，本发明的抗CD166 ICD抗体或抗原结合多肽包含两个根据SEQ ID NO:3的抗CD166 ICD HCDR1区；两个根据SEQ ID NO:13的抗CD166 ICD LCDR1区；两个根据SEQ ID NO:4的抗CD166 ICD HCDR2区；两个根据SEQ ID NO:14的抗CD166 ICDLCDR2区；两个根据SEQ ID NO:5的抗CD166 ICD HCDR3区；和两个根据SEQ ID NO:15的抗CD166 ICD LCDR3区。
在某些特定的实施方案中，本发明的抗CD166 ICD抗体或抗原结合多肽包含以下区中的一个或多个或全部：(a)根据SEQ ID NO:23的抗CD166 ICD HCDR1；(b)根据SEQ IDNO:24的抗CD166 ICD HCDR2；和/或(c)根据SEQ ID NO:25的抗CD166 ICD HCDR3；以及以下区中的一个或多个或全部：(a)根据SEQ ID NO:33的抗CD166ICD LCDR1；(b)根据SEQ IDNO:34的抗CD166 ICD LCDR2；和/或(c)根据SEQ ID NO:35的抗CD166 ICD LCDR3。
在某些特定的实施方案中，本发明的抗CD166 ICD抗体或抗原结合多肽包含以下区中的一个或多个或全部：(a)两个根据SEQ ID NO:23的抗CD166 ICD HCDR1区；(b)两个根据SEQ ID NO:24的抗CD166 ICD HCDR2区；和/或(c)两个根据SEQ ID NO:25的抗CD166 ICDHCDR3区；以及以下区中的一个或多个或全部：(a)两个根据SEQ ID NO:33的抗CD166 ICDLCDR1区；(b)两个根据SEQ ID NO:34的抗CD166 ICD LCDR2区；和/或(c)两个根据SEQ IDNO:35的抗CD166 ICD LCDR3区。
在某些特定的实施方案中，本发明的抗CD166 ICD抗体或抗原结合多肽包含至少一个根据SEQ ID NO:23的抗CD166 ICD HCDR1；至少一个根据SEQ ID NO:33的抗CD166 ICDLCDR1；至少一个根据SEQ ID NO:24的抗CD166 ICD HCDR2；至少一个根据SEQ ID NO:34的抗CD166 ICD LCDR2；至少一个根据SEQ ID NO:25的抗CD166 ICD HCDR3；和至少一个根据SEQ ID NO:35的抗CD166ICD LCDR3。
在某些特定的实施方案中，本发明的抗CD166 ICD抗体或抗原结合多肽包含两个根据SEQ ID NO:23的抗CD166 ICD HCDR1区；两个根据SEQ ID NO:33的抗CD166 ICD LCDR1区；两个根据SEQ ID NO:24的抗CD166 ICD HCDR2区；两个根据SEQ ID NO:34的抗CD166ICD LCDR2区；两个根据SEQ ID NO:25的抗CD166 ICD HCDR3区；和两个根据SEQ ID NO:35的抗CD166 ICD LCDR3区。
在某些特定的实施方案中，本发明的抗CD166 ICD抗体或抗原结合多肽包含至少一个根据SEQ ID NO:21的抗CD166 ICD重链和至少一个根据SEQ ID NO:31的抗CD166 ICD轻链。在某些特定的实施方案中，本发明的抗CD166 ICD抗体或抗原结合多肽包含两个根据SEQ ID NO:21的抗CD166 ICD重链和两个根据SEQ ID NO:31的抗CD166 ICD轻链。
在某些特定的实施方案中，本发明的抗CD166 ICD抗体或抗原结合多肽包含至少一个根据SEQ ID NO:22的抗CD166 ICD重链可变结构域和至少一个根据SEQ ID NO:32的抗CD166 ICD轻链可变结构域。在某些特定的实施方案中，本发明的抗CD166 ICD抗体或抗原结合多肽包含两个根据SEQ ID NO:22的抗CD166 ICD重链可变结构域和两个根据SEQ IDNO:32的抗CD166 ICD轻链可变结构域。
应当理解，当存在时，抗CD166 ICD抗体或抗原结合多肽的一个或多个框架区可以是本文公开的或本领域已知的任何框架区。如本领域技术人员将意识到，框架区通常不决定抗原结合。本发明的示例性重链框架区包括但不限于SEQ ID NO:1、SEQ ID NO:21和/或SEQ ID NO:67中存在的重链框架区。本发明的示例性轻链框架区包括但不限于SEQ ID NO:11、SEQ ID NO:31和/或SEQ ID NO:68中存在的轻链框架区。
在各种情况下，抗CD166 ICD抗体或抗原结合多肽是同型二聚单克隆抗体。在各种情况下，本文公开的抗体或抗原结合多肽是异型二聚抗体或抗原结合多肽。在各种情况下，抗CD166 ICD抗体或抗原结合多肽是人、非人灵长类动物、小鼠、大鼠、兔、仓鼠、山羊、鸡豚鼠、马或绵羊抗体或抗原结合。在各种情况下，抗CD166ICD抗体或抗原结合多肽来源于人、非人灵长类动物、小鼠、大鼠、兔、仓鼠、山羊、鸡豚鼠、马或绵羊抗体或抗原结合多肽。在各种情况下，抗CD166 ICD抗体或抗原结合多肽包括一种或多种特征，例如氨基酸序列特征，其特征在于人、非人灵长类动物、小鼠、大鼠、兔、仓鼠、山羊、鸡豚鼠、马或绵羊抗体或抗原结合。在各种情况下，抗CD166 ICD抗体或抗原结合多肽是人、人源化、灵长类化或嵌合的。
在各种情况下，抗体或抗原结合多肽(例如，抗CD166 ICD抗体或抗原结合多肽)是或包括例如四链免疫球蛋白、免疫粘附素、双抗体、dsFv、双抗体、三链抗体、四链抗体、微型抗体、大型抗体、TandAb、单链抗体、重链抗体、单结构域重链抗体、特定HCDR、特定LCDR、DVD、BiTe、scFv、scAb、Fab、Fab'、Fab2、Fab3、F(ab’)2、Fd、Fd'、Fv等，或其任何组合。在各种情况下，抗CD166ICD抗体或抗原结合多肽是融合抗体或抗原结合多肽或缀合的抗CD166ICD抗体或抗原结合多肽，例如包含抗体或抗原结合多肽和试剂的分子，所述试剂是例如可检测部分或治疗剂试剂。
抗体或片段可通过本领域已知的用于合成抗体的任何方法来产生(参见，例如，Harlow等，Antibodies:A Laboratory Manual,(Cold Spring Harbor Laboratory Press，第2版，1988)；Brinkman等，1995,J.Immunol.Methods 182:41-50；WO 92/22324；WO 98/46645)。嵌合抗体可使用在例如Morrison,1985,Science 229:1202中描述的方法产生，并且人源化抗体可使用在例如美国专利号6,180,370中描述的方法产生。
核苷酸序列
本公开包括编码如本文公开的抗CD166 ICD抗体或抗原结合多肽的全部或一部分的核苷酸序列。本公开包括编码本文公开的抗CD166 ICD HCDR1、抗CD166 ICD HCDR2、抗CD166 ICD HCDR3、抗CD166 ICD LCDR1、抗CD166 ICD LCDR2、抗CD166 ICD LCDR3、抗CD166ICD轻链可变结构域、抗CD166 ICD重链可变结构域、抗CD166 ICD重链和/或抗CD166 ICD轻链的全部或一部分的核苷酸序列。
本领域技术人员将认识到核碱基序列不同但编码相同氨基酸的密码子。本领域技术人员将认识到在生物系统如哺乳动物生物系统、细菌生物系统、真菌生物系统或体外系统的情况下，核碱基序列不同但编码相同氨基酸的密码子。因此，至少由于这个原因，本公开包括多种编码序列中的任一种，根据生物系统的密码子码，所述编码序列编码如本文公开的抗CD166 ICD抗体或抗原结合多肽的全部或一部分。
本公开尤其提供了一种核酸序列，所述核酸序列是或包括根据SEQ ID NO:6的核酸序列，所述SEQ ID NO.序列编码根据SEQ ID NO:1的抗CD166 ICD重链。
本公开尤其提供了一种核酸序列，所述核酸序列是或包括根据SEQ ID NO:7的核酸序列，所述SEQ ID NO.序列编码根据SEQ ID NO:2的抗CD166 ICD重链可变结构域。
本公开尤其提供了一种核酸序列，所述核酸序列是或包括根据SEQ ID NO:69的核酸序列，所述SEQ ID NO.序列编码根据SEQ ID NO:2的抗CD166 ICD重链可变结构域。
本公开尤其提供了一种核酸序列，所述核酸序列是或包括根据SEQ ID NO:8的核酸序列，所述SEQ ID NO.序列编码根据SEQ ID NO:3的抗CD166 ICD HCDR1。
本公开尤其提供了一种核酸序列，所述核酸序列是或包括根据SEQ ID NO:9的核酸序列，所述SEQ ID NO.序列编码根据SEQ ID NO:4的抗CD166 ICD HCDR2。
本公开尤其提供了一种核酸序列，所述核酸序列是或包括根据SEQ ID NO:10的核酸序列，所述SEQ ID NO.序列编码根据SEQ ID NO:5的抗CD166 ICD HCDR3。
本公开尤其提供了一种核酸序列，所述核酸序列是或包括根据SEQ ID NO:26的核酸序列，所述SEQ ID NO.序列编码根据SEQ ID NO:21的抗CD166 ICD重链。
本公开尤其提供了一种核酸序列，所述核酸序列是或包括根据SEQ ID NO:27的核酸序列，所述SEQ ID NO.序列编码根据SEQ ID NO:22的抗CD166 ICD重链可变结构域。
本公开尤其提供了一种核酸序列，所述核酸序列是或包括根据SEQ ID NO:71的核酸序列，所述SEQ ID NO.序列编码根据SEQ ID NO:22的抗CD166 ICD重链可变结构域。
本公开尤其提供了一种核酸序列，所述核酸序列是或包括根据SEQ ID NO:28的核酸序列，所述SEQ ID NO.序列编码根据SEQ ID NO:23的抗CD166 ICD HCDR1。
本公开尤其提供了一种核酸序列，所述核酸序列是或包括根据SEQ ID NO:29的核酸序列，所述SEQ ID NO.序列编码根据SEQ ID NO:24的抗CD166 ICD HCDR2。
本公开尤其提供了一种核酸序列，所述核酸序列是或包括根据SEQ ID NO:30的核酸序列，所述SEQ ID NO.序列编码根据SEQ ID NO:25的抗CD166 ICD HCDR3。
本公开尤其提供了一种根据SEQ ID NO:16的核酸序列，所述SEQ ID NO.序列编码根据SEQ ID NO:11的抗CD166 ICD轻链。
本公开尤其提供了一种根据SEQ ID NO:17的核酸序列，所述SEQ ID NO.序列编码根据SEQ ID NO:12的抗CD166 ICD轻链可变结构域。
本公开尤其提供了一种根据SEQ ID NO:70的核酸序列，所述SEQ ID NO.序列编码根据SEQ ID NO:12的抗CD166 ICD轻链可变结构域。
本公开尤其提供了一种根据SEQ ID NO:18的核酸序列，所述SEQ ID NO.序列编码根据SEQ ID NO:13的抗CD166 ICD LCDR1。
本公开尤其提供了一种根据SEQ ID NO:19的核酸序列，所述SEQ ID NO.序列编码根据SEQ ID NO:14的抗CD166 ICD LCDR2。
本公开尤其提供了一种根据SEQ ID NO:20的核酸序列，所述SEQ ID NO.序列编码根据SEQ ID NO:15的抗CD166 ICD LCDR3。
本公开尤其提供了一种核酸序列，所述核酸序列是或包括根据SEQ ID NO:36的核酸序列，所述SEQ ID NO.序列编码根据SEQ ID NO:31的抗CD166 ICD轻链。
本公开尤其提供了一种核酸序列，所述核酸序列是或包括根据SEQ ID NO:37的核酸序列，所述SEQ ID NO.序列编码根据SEQ ID NO:32的抗CD166 ICD轻链可变结构域。
本公开尤其提供了一种核酸序列，所述核酸序列是或包括根据SEQ ID NO:72的核酸序列，所述SEQ ID NO.序列编码根据SEQ ID NO:32的抗CD166 ICD轻链可变结构域。
本公开尤其提供了一种核酸序列，所述核酸序列是或包括根据SEQ ID NO:38的核酸序列，所述SEQ ID NO.序列编码根据SEQ ID NO:33的抗CD166 ICD LCDR1。
本公开尤其提供了一种核酸序列，所述核酸序列是或包括根据SEQ ID NO:39的核酸序列，所述SEQ ID NO.序列编码根据SEQ ID NO:34的抗CD166 ICD LCDR2。
本公开尤其提供了一种核酸序列，所述核酸序列是或包括根据SEQ ID NO:40的核酸序列，所述SEQ ID NO.序列编码根据SEQ ID NO:35的抗CD166 ICD LCDR3。
在各种情况下，本文公开的核苷酸序列可以是载体或质粒或者存在于载体或质粒中。在各种情况下，载体或质粒可存在于细胞中
在各种情况下，本文公开的核苷酸序列可存在于细胞的基因组中。在各种情况下，本文公开的核苷酸序列可存在于哺乳动物细胞、细菌细胞或真菌细胞的基因组中。在各种情况下，本文公开的核苷酸序列可存在于用于产生抗体的细胞例如用于产生抗体的哺乳动物细胞的基因组中。
可检测部分
在本发明的各种实施方案中，本发明的抗CD166 ICD抗体或抗原结合多肽与可检测部分缔合。在各种情况下，如本文公开的抗CD166 ICD抗体或抗原结合多肽可与可检测部分共价或非共价缔合。在各种情况下，如本文公开的抗CD166 ICD抗体或抗原结合多肽可与可检测部分直接或间接缔合。在各种情况下，如本文公开的抗CD166 ICD抗体或抗原结合多肽可通过接头与可检测部分缔合。在各种情况下，如本文公开的抗CD166 ICD抗体或抗原结合多肽可与可检测部分融合或缀合。在各种情况下，如本文公开的抗CD166 ICD抗体或抗原结合多肽通过抗CD166 ICD抗体或抗原结合多肽的多肽末端与可检测部分缔合。在各种情况下，如本文公开的抗CD166 ICD抗体或抗原结合多肽通过抗CD166 ICD抗体或抗原结合多肽的非末端残基与可检测部分缔合。在各种情况下，如本文公开的抗CD166 ICD抗体或抗原结合多肽通过将可检测部分并入抗CD166 ICD抗体或抗原结合多肽的分子结构中来与可检测部分缔合。在各种情况下，如本文公开的抗CD166 ICD抗体或抗原结合多肽可通过本文所公开或本领域中另外已知的任何机制与多个相同或不同的可检测部分缔合，所述相同或不同的可检测部分可通过如本文公开或本领域中另外已知的相同或不同的缔合机制与抗CD166 ICD抗体或抗原结合多肽缔合。
本发明的可检测部分包括但不限于产生、能够产生或能够有助于产生可通过本领域已知的任何手段检测的信号的部分。在特定的情况下，可检测部分产生、能够产生或能够有助于产生可通过但不限于以下方式检测的信号：可视化手段、光谱手段、光化学手段、生物化学手段、免疫化学手段、电磁手段、放射化学手段、化学手段、荧光、化学荧光、电化学发光或化学发光。在某些实施方案中，可检测部分是荧光部分、放射性部分、顺磁性部分、化学发光部分、生物发光部分、比色标记、多肽、酶和/或配体。
可检测部分包括但不限于绿色荧光蛋白(GFP)、红色荧光蛋白(RFP)、罗丹明、罗丹明衍生的可检测部分、荧光素、荧光素衍生的可检测部分、萘、萘衍生的可检测部分、香豆素、香豆素衍生的可检测部分、藻胆蛋白和衍生物如藻红蛋白和藻蓝蛋白、荧光素酶、β-半乳糖苷酶、生色团、酚酞、孔雀绿、硝基芳族化合物如硝基苯、重氮染料、二甲氨基偶氮苯甲酰(dabsyl)(4-二甲基氨基偶氮苯-4'-磺酰基)、His标签和生物素结合部分如链霉亲和素或抗生物素蛋白。可检测部分可以是放射性同位素或放射性标记(例如，3H、14C、32P、35S、125I、锆-89(89Zr)、碘-124(124I)、碘-131(131I)、碘-125(125I)、铋-212(212Bi)、铋-213(213Bi)、砹-221(221At)、铜-67(67Cu)、铜-64(64Cu)、铼-186(186Re)、铼-188(188Re)、磷-32(32P)、钐-153(153Sm)、镥-177(177Lu)、锝-99m(99mTc)、镓-67(67Ga)、铟-111(111In)或铊-201(201Tl)，或放射性标记的分子。可检测部分可以是小分子、荧光染料、或可通过x射线或电磁辐射检测的化合物。可检测部分可以是酶的催化底物，其中酶与底物的活性产生可检测信号。本发明的酶可检测部分包括但不限于过氧化物酶、碱性磷酸酶(AP)、葡萄糖氧化酶或β-半乳糖苷酶。
本领域技术人员将理解，本发明的抗CD166 ICD抗体或抗原结合多肽可例如通过免疫组织化学方法中的二抗检测。
治疗性部分
在本发明的各种实施方案中，本发明的抗CD166 ICD抗体或抗原结合多肽与治疗性部分缔合。在各种情况下，如本文公开的抗CD166 ICD抗体或抗原结合多肽可与治疗性部分共价或非共价缔合。在各种情况下，如本文公开的抗CD166 ICD抗体或抗原结合多肽可与治疗性部分直接或间接缔合。在各种情况下，如本文公开的抗CD166 ICD抗体或抗原结合多肽可通过接头与治疗性部分缔合。在各种情况下，如本文公开的抗CD166 ICD抗体或抗原结合多肽可与治疗性部分融合或缀合。在各种情况下，如本文公开的抗CD166 ICD抗体或抗原结合多肽通过抗CD166 ICD抗体或抗原结合多肽的多肽末端与治疗性部分缔合。在各种情况下，如本文公开的抗CD166 ICD抗体或抗原结合多肽通过抗CD166 ICD抗体或抗原结合多肽的非末端残基与治疗性部分缔合。在各种情况下，如本文公开的抗CD166 ICD抗体或抗原结合多肽通过将治疗性部分并入抗CD166 ICD抗体或抗原结合多肽的分子结构中而与治疗性部分缔合。在各种情况下，如本文公开的抗CD166 ICD抗体或抗原结合多肽可通过本文所公开或本领域中另外已知的任何机制与多个相同或不同的治疗性部分缔合，所述相同或不同的治疗性部分可通过如本文公开或本领域中另外已知的相同或不同的缔合机制与抗CD166 ICD抗体或抗原结合多肽缔合。
本发明的治疗性部分包括药物，例如用于治疗病况或疾病的药物。本发明的治疗性部分包括但不限于细胞毒性部分、化疗部分、毒素或放射性核素。
在各种实施方案中，化疗剂包括促凋亡剂、细胞抑制剂和/或细胞毒性剂，例如，具体地包括用于和/或推荐用于治疗一种或多种与不期望有的细胞增殖相关联的疾病、病症或病况的试剂。在某些实施方案中，化疗剂适用于治疗癌症。在一些实施方案中，化疗剂可以是或包括：一种或多种烷基化剂、一种或多种蒽环类药物、一种或多种细胞骨架破坏剂(例如，微管靶向剂，如紫杉烷类、美登素及其类似物)、一种或多种埃坡霉素、一种或多种组蛋白脱乙酰酶抑制剂HDAC)、一种或多种拓扑异构酶抑制剂(例如，拓扑异构酶I和/或拓扑异构酶II的抑制剂)、一种或多种激酶抑制剂、一种或多种核苷酸类似物或核苷酸前体类似物、一种或多种肽抗生素、一种或多种铂基试剂、一种或多种类视黄醇、一种或多种长春花生物碱、和/或一种或多种下列物质(即，共有相关的抗增殖活性的物质)的一种或多种类似物。在一些特定的实施方案中，化疗剂可以是或包括以下试剂中的一种或多种：放线菌素、全反式视黄酸、奥尼司他、阿扎胞苷、硫唑嘌呤、博来霉素、硼替佐米、卡铂、卡培他滨、顺铂、苯丁酸氮芥、环磷酰胺、姜黄素、阿糖胞苷、柔红霉素、多西他赛、阿霉素、多柔比星、表柔比星、埃坡霉素、依托泊苷、氟尿嘧啶、吉西他滨、羟基脲、伊达比星、伊马替尼、伊立替康、美登素和/或其类似物(例如，DM1)、甲氯雷他明、巯基嘌呤、甲氨蝶呤、米托蒽醌、美登木素生物碱(Maytansinoid)、奥沙利铂、紫杉醇、培美曲塞、替尼泊苷、替鸟苷、拓扑替康、戊柔比星、长春碱、长春新碱、长春地辛、长春瑞滨及其组合。在一些实施方案中，化疗剂可以在抗体-药物缀合物的情况下使用。在一些实施方案中，化疗剂是见于选自由以下组成的组的抗体-药物缀合物中的化疗剂：hLL1-阿霉素、hRS7-SN-38、hMN-14-SN-38、hLL2-SN-38、hA20-SN-38、hPA M4-SN-38、hLL1-SN-38、hRS7-Pro-2-P-Dox、hMN-14-Pro-2-P-Dox、hLL2-Pro-2-P-Dox、hA20-Pro-2-P-Dox、hPAM4-Pro-2-P-Dox、hLL1-Pro-2-P-Dox、P4/D10-阿霉素、吉妥单抗-奥佐米星(gemtuzumab ozogamicin)、本妥昔单抗-维多汀(brentuximab vedotin)、曲妥珠单抗-美坦新(trastuzumab emtansine)、奥英妥珠单抗(inotuzumab ozogamicin)、格巴妥莫单抗-维多汀(glembatumomab vedotin)、SAR3419、SAR566658、BIIB015、BT062、SGN-75、SGN-CD19A、AMG-172、AMG-595、BAY-94-9343、ASG-5ME、ASG-22ME、ASG-16M8F、MDX-1203、MLN-0264、抗PSMA ADC、RG-7450、RG-7458、RG-7593、RG-7596、RG-7598、RG-7599、RG-7600、RG-7636、ABT-414、IMGN-853、IMGN-529、vorsetuzumab mafodotin和莫-洛妥珠单抗(lorvotuzumab mertansine)。在一些实施方案中，化疗剂可以是或包括以下中的一种或多种：法尼基硫代水杨酸(FTS)、4-(4-氯-2-甲基苯氧基)-N-羟基丁酰胺(CMH)、雌二醇(E2)、四甲氧基芪(TMS)、δ-去甲基阿米酚、盐霉素或姜黄素组合疗法：如本文所用，术语“组合疗法”是指受试者同时暴露于两种或更多种治疗方案(例如，两种或更多种治疗剂)的那些情况。在一些实施方案中，可以同时施用两种或更多种试剂；在一些实施方案中，此类试剂可以顺序地施用；在一些实施方案中，此类试剂以重叠的给药方案施用。
在各种实施方案中，化疗剂包括促凋亡剂、细胞抑制剂和/或细胞毒性剂，例如，具体地包括用于和/或推荐用于治疗一种或多种与不期望有的细胞增殖相关联的疾病、病症或病况的试剂。在某些实施方案中，化疗剂适用于治疗癌症。在一些实施方案中，化疗剂可以是或包括：一种或多种烷基化剂、一种或多种蒽环类药物、一种或多种细胞骨架破坏剂(例如，微管靶向剂，如紫杉烷类、美登素及其类似物)、一种或多种埃坡霉素、一种或多种组蛋白脱乙酰酶抑制剂HDAC)、一种或多种拓扑异构酶抑制剂(例如，拓扑异构酶I和/或拓扑异构酶II的抑制剂)、一种或多种激酶抑制剂、一种或多种核苷酸类似物或核苷酸前体类似物、一种或多种肽抗生素、一种或多种铂基试剂、一种或多种类视黄醇、一种或多种长春花生物碱和/或一种或多种下列物质(即，共有相关的抗增殖活性的物质)的一种或多种类似物。在一些特定的实施方案中，化疗剂可以是或包括以下试剂中的一种或多种：放线菌素、全反式视黄酸、奥尼司他、阿扎胞苷、硫唑嘌呤、博来霉素、硼替佐米、卡铂、卡培他滨、顺铂、苯丁酸氮芥、环磷酰胺、姜黄素、阿糖胞苷、柔红霉素、多西他赛、阿霉素、多柔比星、表柔比星、埃坡霉素、依托泊苷、氟尿嘧啶、吉西他滨、羟基脲、伊达比星、伊马替尼、伊立替康、美登素和/或其类似物(例如，DM1)、甲氯雷他明、巯基嘌呤、甲氨蝶呤、米托蒽醌、美登木素生物碱、奥沙利铂、紫杉醇、培美曲塞、替尼泊苷、替鸟苷、拓扑替康、戊柔比星、长春碱、长春新碱、长春地辛、长春瑞滨及其组合。在一些实施方案中，化疗剂可以在抗体-药物缀合物的情况下使用。在一些实施方案中，化疗剂是见于选自由以下组成的组的抗体-药物缀合物中的化疗剂：hLL1-阿霉素、hRS7-SN-38、hMN-14-SN-38、hLL2-SN-38、hA20-SN-38、hPAM4-SN-38、hLL1-SN-38、hRS7-Pro-2-P-Dox、hMN-14-Pro-2-P-Dox、hLL2-Pro-2-P-Dox、hA20-Pro-2-P-Dox、hPAM4-Pro-2-P-Dox、hLL1-Pro-2-P-Dox、P4/D10-阿霉素、吉妥单抗-奥佐米星、本妥昔单抗-维多汀、曲妥珠单抗-美坦新、奥英妥珠单抗、格巴妥莫单抗-维多汀、SAR3419、SAR566658、BIIB015、BT062、SGN-75、SGN-CD19A、AMG-172、AMG-595、BAY-94-9343、ASG-5ME、ASG-22ME、ASG-16M8F、MDX-1203、MLN-0264、抗PSMA ADC、RG-7450、RG-7458、RG-7593、RG-7596、RG-7598、RG-7599、RG-7600、RG-7636、ABT-414、IMGN-853、IMGN-529、vorsetuzumabmafodotin和莫-洛妥珠单抗。在一些实施方案中，化疗剂可以是或包括以下中的一种或多种：法尼基硫代水杨酸(FTS)、4-(4-氯-2-甲基苯氧基)-N-羟基丁酰胺(CMH)、雌二醇(E2)、四甲氧基芪(TMS)、δ-去甲基阿米酚、盐霉素或姜黄素组合疗法：如本文所用，术语“组合疗法”是指受试者同时暴露于两种或更多种治疗方案(例如，两种或更多种治疗剂)的那些情况。在一些实施方案中，可以同时施用两种或更多种试剂；在一些实施方案中，此类试剂可以顺序地施用；在一些实施方案中，此类试剂以重叠的给药方案施用。
表位和结合
本发明的抗CD166 ICD抗体或抗原结合多肽可以结合表位，所述表位是或包括CD166的胞内结构域的氨基酸。在各种实施方案中，所述CD166是哺乳动物CD166。在各种实施方案中，所述CD166是小鼠或大鼠CD166。在各种实施方案中，所述CD166是灵长类动物CD166。在各种实施方案中，所述CD166是人CD166。
在某些实施方案中，本发明的抗CD166 ICD抗体或抗原结合多肽可以结合表位，所述表位是或包括CD166的胞内结构域中存在的氨基酸序列(SEQ ID NO:62)。在某些情况下，本文公开的抗CD166ICD抗体或抗原结合多肽结合SEQ ID NO:62的一部分中存在的CD166ICD表位，所述CD166 ICD表位是或包括例如从SEQ ID NO:62的序列内选择的2、3、4、5、6、7、8、9、10、11或12个氨基酸。在某些实施方案中，本文公开的抗CD166 ICD抗体或抗原结合多肽的表位是SEQ ID NO:63或其一部分(例如，包含从SEQ ID NO:63的序列内选择的2、3、4、5、6、7、8、9、10、11或12个氨基酸的部分)。在特定的实施方案中，本文公开的抗CD166 ICD抗体或抗原结合多肽的表位是SEQ ID NO:64或其一部分(例如，包含从SEQ ID NO:64的序列内选择的2、3、4、5、6、7、8、9、10、11或12个氨基酸的部分)。在某些实施方案中，本文公开的抗CD166ICD抗体或抗原结合多肽的表位是SEQ ID NO:65或其一部分(例如，包含从SEQ IDNO:65的序列内选择的2、3、4、5、6、7、8、9、10、11或12个氨基酸的部分)。在特定的实施方案中，本文公开的抗CD166 ICD抗体或抗原结合多肽的表位是SEQ ID NO:66或其一部分(例如，从SEQ ID NO:66的序列内选择的2、3、4、5、6、7、8、9、10、11或12个氨基酸)。
在各种实施方案中，本文公开的抗CD166 ICD抗体或抗原结合多肽是具有CD166表位的任何抗体或抗原结合多肽，所述表位是或包括SEQ ID NO:62或其一部分(例如，SEQ IDNO:62的1、2、3、4、5、6、7、8、9、10、11或12个氨基酸)。
在各种实施方案中，本文公开的抗CD166 ICD抗体或抗原结合多肽是具有CD166表位的任何抗体或抗原结合多肽，所述表位是或包括SEQ ID NO:63或其一部分(例如，SEQ IDNO:63的1、2、3、4、5、6、7、8、9、10、11或12个氨基酸)。
在各种实施方案中，本文公开的抗CD166 ICD抗体或抗原结合多肽是具有CD166表位的任何抗体或抗原结合多肽，所述表位是或包括SEQ ID NO:64或其一部分(例如，SEQ IDNO:64的1、2、3、4、5、6、7、8、9、10、11或12个氨基酸)。
在各种实施方案中，本文公开的抗CD166 ICD抗体或抗原结合多肽是具有CD166表位的任何抗体或抗原结合多肽，所述表位是或包括SEQ ID NO:65或其一部分(例如，SEQ IDNO:65的1、2、3、4、5、6、7、8、9、10、11或12个氨基酸)。
在各种实施方案中，本文公开的抗CD166 ICD抗体或抗原结合多肽是具有CD166表位的任何抗体或抗原结合多肽，所述表位是或包括SEQ ID NO:66或其一部分(例如，SEQ IDNO:66的1、2、3、4、5、6、7、8、9、10、11或12个氨基酸)。
表位的氨基酸可以是连续的、非连续的或其组合。
在各种实施方案中，表位包含CD166 ICD的多个连续氨基酸。在各种实施方案中，表位包含SEQ ID NO:62、SEQ ID NO:63、SEQ ID NO:64、SEQ ID NO:65和/或SEQ ID NO:66的多个连续氨基酸。在各种实施方案中，表位包含SEQ ID NO:62、SEQ ID NO:63、SEQ IDNO:64、SEQ ID NO:65和/或SEQ ID NO:66的多个非连续氨基酸。在各种实施方案中，表位包含SEQ ID NO:62、SEQ ID NO:63、SEQ ID NO:64、SEQ ID NO:65和/或SEQ ID NO:66的多个连续氨基酸以及SEQ ID NO:62、SEQ ID NO:63、SEQ ID NO:64、SEQ ID NO:65和/或SEQ IDNO:66的多个非连续氨基酸。
在各种实施方案中，本文公开的抗CD166 ICD抗体或抗原结合多肽结合SEQ IDNO:62。在各种实施方案中，本文公开的抗CD166ICD抗体或抗原结合多肽结合SEQ ID NO:63。在各种实施方案中，本文公开的抗CD166 ICD抗体或抗原结合多肽结合SEQ ID NO:64。在各种实施方案中，本文公开的抗CD166 ICD抗体或抗原结合多肽结合SEQ ID NO:65。在各种实施方案中，本文公开的抗CD166ICD抗体或抗原结合多肽结合SEQ ID NO:66。
在各种实施方案中，本文公开的抗CD166 ICD抗体或抗原结合多肽是结合SEQ IDNO:62的任何抗体或抗原结合多肽。在各种实施方案中，本文公开的抗CD166 ICD抗体或抗原结合多肽是结合SEQ ID NO:63的任何抗体或抗原结合多肽。在各种实施方案中，本文公开的抗CD166 ICD抗体或抗原结合多肽是结合SEQ ID NO:64的任何抗体或抗原结合多肽。在各种实施方案中，本文公开的抗CD166ICD抗体或抗原结合多肽是结合SEQ ID NO:65的任何抗体或抗原结合多肽。在各种实施方案中，本文公开的抗CD166 ICD抗体或抗原结合多肽是结合SEQ ID NO:66的任何抗体或抗原结合多肽。
在各种实施方案中，本文公开的抗CD166 ICD抗体或抗原结合多肽是具有CD166表位的任何抗体或抗原结合多肽，所述CD166表位与具有本文所述序列的抗CD166 ICD抗体或抗原结合多肽的CD166表位相同。
在各种实施方案中，本文公开的抗CD166 ICD抗体或抗原结合多肽是与具有本文所述序列的抗CD166 ICD抗体或抗原结合多肽(“竞争抗体”)竞争结合CD166或其表位的任何抗体或抗原结合多肽。根据本领域已知的任何测量、测定或预测方法，如果所提供的抗体或抗原结合多肽与抗原分子的结合阻断、抑制、干扰或以其他方式减少具有本文所述序列的抗CD166 ICD抗体或抗原结合多肽与相同抗原分子的结合，则所提供的抗体或抗原结合多肽与具有本文所述序列的抗CD166 ICD抗体或抗原结合多肽可理解为竞争。在某些这样的情况下，如果所提供的抗体或抗原结合多肽与抗原分子的结合通过空间抑制、具有本文所述序列的抗CD166 ICD抗体或抗原结合多肽的表位或结合位点被所提供的抗体或抗原结合多肽占据、或具有本文所述序列的抗CD166 ICD抗体或抗原结合多肽由于所提供的抗体或抗原结合多肽自表位或结合位点阻塞而阻断、抑制、干扰或以其他方式减少具有本文所述序列的抗CD166 ICD抗体或抗原结合多肽与相同抗原分子的结合，则所提供的抗体或抗原结合多肽与具有本文所述序列的抗CD166 ICD抗体或抗原结合多肽可理解为竞争。在各种实施方案中，本文公开的抗体或抗原结合多肽结合与具有本文所述序列的抗CD166 ICD抗体或抗原结合多肽的表位相同和/或重叠的CD166表位。在各种实施方案中，所提供的抗体与具有本文所述序列的抗CD166 ICD抗体或抗原结合多肽竞争的抗原或表位可以是细胞、组织、器官、样品或受试者中存在的以下中的任一种：完整CD166蛋白、CD166蛋白的一部分、分离的CD166蛋白、CD166蛋白的分离部分、或CD166蛋白的整体或一部分。在各种实施方案中，所提供的抗体与具有本文所述序列的抗CD166 ICD抗体或抗原结合多肽竞争的抗原或表位可存在于细胞中，存在于细胞膜中或从细胞膜中除去。在各种实施方案中，所提供的抗体与具有本文所述序列的抗CD166 ICD抗体或抗原结合多肽竞争的抗原或表位可存在于生物体中。在各种实施方案中，所提供的抗体与具有本文所述序列的抗CD166 ICD抗体或抗原结合多肽竞争的抗原或表位可以是由细胞、组织、器官或生物体产生的CD166蛋白或其部分。在各种实施方案中，所提供的抗体与具有本文所述序列的抗CD166ICD抗体或抗原结合多肽竞争的抗原或表位可以是合成的CD166蛋白或其一部分。在各种实施方案中，所提供的抗体与具有本文所述序列的抗CD166 ICD抗体或抗原结合多肽竞争的抗原或表位可以是CD166的ICD部分。在各种实施方案中，所提供的抗体与具有本文所述序列的抗CD166 ICD抗体或抗原结合多肽竞争的抗原或表位可以是根据SEQ ID NO:62、SEQ ID NO:63、SEQ IDNO:64、SEQ ID NO:65或SEQ ID NO:66的CD166的一部分。
在各种实施方案中，本文公开的抗CD166 ICD抗体或抗原结合多肽以如下KD结合本文公开的CD166 ICD表位：小于100nM、小于75nM、小于50nM、小于40nM、小于30nM、小于20nM、小于10nM、小于5nM、小于1nM、小于900pM、小于800pM、小于700pM、小于600pM、小于500pM、小于400pM、小于300pM、小于200pM、小于100pM、或小于50pM。在各种实施方案中，本文公开的抗CD166 ICD抗体或抗原结合多肽以如下KD结合本文公开的CD166 ICD表位：大于5pM、大于10pM、大于25pM、大于50pM、大于100pM、大于200pM、大于300pM、大于400pM、大于500pM、大于600pM、大于700pM、大于800pM、大于900pM、大于1nM、大于5nM、或大于10nM。在各种实施方案中，本文公开的抗CD166 ICD抗体或抗原结合多肽以如下KD结合本文公开的CD166 ICD表位：100nM至10pM、50nM至10pM、50nM至100pM、50nM至500pM、50nM至1nM、25nM至10pM、25nM至100pM、25nM至500pM、25nM至1nM、10nM至10pM、10nM至100pM、10nM至500pM、或10nM至1nM。
本文所述的抗体或抗原结合多肽的结合性质可通过本领域已知的技术来测量，所述技术包括但不限于以下任何技术：BIACORE分析、酶联免疫吸附测定(ELISA)、x-射线晶体学、序列分析和扫描诱变。可使用表面等离子体共振(SPR)分析抗体或抗原结合多肽的结合相互作用。SPR或生物分子相互作用分析(BIA)可以实时检测生物特异性相互作用，而无需标记任何相互作用物。
应用
本发明包括与本文公开的CD166和/或抗CD166 ICD抗体或抗原结合多肽相关的各种应用。在某些实施方案中，本文公开的抗CD166 ICD抗体或抗原结合多肽用于分析细胞、组织、器官、样品或受试者中的CD166浓度、量、水平、表达谱或定位。在各种实施方案中，分析是诊断分析。在各种实施方案中，分析是监测病况或疾病的进展或其治疗。
在某些实施方案中，本文公开的抗CD166 ICD抗体或抗原结合多肽用于检测或诊断病况或疾病。在某些情况下，抗CD166 ICD抗体或抗原结合多肽在检测或诊断病况或疾病中的用途包括确定细胞、组织、器官、样品或受试者是否包含或含有指示病况或疾病的浓度、量、水平、表达谱或定位的CD166。病况或疾病的检测可以包括确定细胞、组织、器官、样品或受试者包含或含有指示病况或疾病浓的度、量、水平、表达谱或定位的CD166。在各种情况下，确定细胞、组织、器官或样品包含或含有指示病况或疾病的浓度、量、水平、表达谱或定位的CD166包括将CD166的浓度、量、水平、表达谱或定位与参考进行比较。如果确定细胞、组织、器官、样品或受试者包含或已包含指示病况或疾病的浓度、量、水平、表达谱或定位的CD166，则可以诊断细胞、组织、器官、样品或受试者患有、正罹患或代表病况或疾病。应当理解，在一些情况下，确定细胞、组织、器官或样品包含或含有指示病况或疾病的浓度、量、水平、表达谱或定位的CD166可足以或相当于检测或诊断细胞、组织、器官或样品来源的受试者中的病况或疾病。
在某些实施方案中，本文公开的抗CD166 ICD抗体或抗原结合多肽用作在检测或诊断病况或疾病中考虑的因素(例如，两种或更多种因素中的一种，例如，一系列因素)。在某些情况下，病况或疾病的检测或诊断可以包括分级、联合、组合、加权、综合、布尔(Boolean)、客观、主观手段或累积考虑或分析两种或更多种因素的其他手段，所述因素中的至少一种可以是CD166的浓度、量、水平、表达谱或定位。因此，在某些情况下，通过累积考虑或分析多种因素来检测或诊断病况或疾病可以包括使用抗CD166 ICD抗体或抗原结合多肽来确定细胞、组织、器官、样品或受试者是否包含或含有有助于检测或诊断的浓度、量、水平、表达谱或定位的CD166。在各种情况下，确定细胞、组织、器官或样品包含或含有指示病况或疾病的浓度、量、水平、表达谱或定位的CD166包括将CD166的浓度、量、水平、表达谱或定位与参考进行比较。
在某些实施方案中，本文公开的抗CD166 ICD抗体或抗原结合多肽用于确定受试者患有或将患有病况或疾病的可能性或风险。在某些情况下，抗CD166 ICD抗体或抗原结合多肽在确定受试者患有或将患有病况或疾病的可能性或风险中的用途包括确定细胞、组织、器官、样品或受试者是否包含或含有指示病况或疾病的浓度、量、水平、表达谱或定位的CD166。确定受试者患有或将患有病况或疾病的可能性或风险可以包括确定细胞、组织、器官、样品或受试者包含或含有指示目前或未来病况或疾病的可能性或风险的浓度、量、水平、表达谱或定位的CD166。在各种情况下，确定细胞、组织、器官或样品包含或含有指示目前或未来病况或疾病的可能性或风险的浓度、量、水平、表达谱或定位的CD166包括将CD166的浓度、量、水平、表达谱或定位与参考进行比较。应当理解，在一些情况下，确定细胞、组织、器官或样品包含或含有指示目前或未来病况或疾病的可能性或风险的浓度、量、水平、表达谱或定位的CD166可以足以或相当于检测或诊断细胞、组织、器官或样品来源的受试者中的病况或疾病。
在某些实施方案中，本文公开的抗CD166 ICD抗体或抗原结合多肽用作确定受试者患有或将患有病况或疾病的可能性或风险所考虑的因素。在某些情况下，确定受试者患有或将患有病况或疾病的可能性或风险可以包括分级、联合、组合、加权、综合、布尔、客观、主观手段或累积考虑或分析两种或更多种因素的其他手段，所述因素中的至少一种可以是CD166的浓度、量、水平、表达谱或定位。因此，在某些情况下，确定受试者患有或将患有病况或疾病的可能性或风险包括累积考虑或分析多种因素，所述多种因素包括使用抗CD166ICD抗体或抗原结合多肽来测定细胞、组织、器官、样品或受试者中的CD166浓度、量、水平、表达谱或定位。在各种情况下，确定细胞、组织、器官或样品包含或含有指示受试者患有或将患有病况或疾病的可能性或风险的浓度、量、水平、表达谱或定位的CD166包括将CD166的浓度、量、水平、表达谱或定位与参考进行比较。
在某些实施方案中，本文公开的抗CD166 ICD抗体或抗原结合多肽用于确定是否施用用于治疗病况或疾病的治疗方案。如果完全或部分地基于CD166的测定的浓度、量、水平、表达谱或定位或其中的变化来确定受试者患有病况或疾病或处于患上病况或疾病的风险之中，则可以开始针对所述病况或疾病的治疗方案。如果完全或部分地基于CD166的测定的浓度、量、水平、表达谱或定位或其中的变化来确定受试者未患病况或疾病或并未处于患上病况或疾病的风险之中，则在某些情况下将不开始针对所述病况或疾病的治疗方案。
在某些实施方案中，本文公开的抗CD166 ICD抗体或抗原结合多肽用于选择或鉴定通过治疗方案治疗的受试者，和/或用于选择或鉴定不应通过治疗方案接受治疗的受试者。在某些实施方案中，本文公开的抗CD166 ICD抗体或抗原结合多肽用于在给受试者开处方或施用治疗方案之前或作为其先决条件的分析中。在各种实施方案中，如果确定受试者具有指示受试者患有病况或疾病或处于患上病况或疾病的风险之中的浓度、量、水平、表达谱或定位或其中的变化的CD166，则选择或鉴定受试者进行治疗。在各种实施方案中，如果完全或部分地基于CD166的浓度、量、水平、表达谱或定位或其中的变化确定受试者患有病况或疾病或处于患上病况或疾病的风险之中，则选择或鉴定受试者进行治疗。
在各种实施方案中，本文公开的抗CD166 ICD抗体或抗原结合多肽用于鉴定CD166作为生物标志物。在某些情况下，提供细胞、组织、器官、样品或受试者，已知、诊断或预期所述细胞、组织、器官、样品或受试者具有、代表病况或疾病、或处于病况或疾病的风险之中，或者所述细胞、组织、器官、样品或受试者来源于已知、诊断或预期患有、代表病况或疾病、或处于病况或疾病的风险之中的受试者。本发明可以包括测定CD166在测试细胞、组织、器官、样品或受试者中的浓度、量、水平、表达谱或定位，以及将测定的CD166浓度、量、水平、表达谱或定位与参考进行比较。在各种情况下，可以确定测试细胞、组织、器官、样品或受试者包含与参考不同的(例如，显著不同的)CD166浓度、量、水平、表达谱或定位，由此CD166是相关病况或疾病的生物标志物。在各种情况下，可以确定测试细胞、组织、器官、样品或受试者不包含与参考不同的(例如，显著不同的)CD166浓度、量、水平、表达谱或定位，由此CD166不是相关病况或疾病的生物标志物。
在某些实施方案中，本文公开的抗CD166 ICD抗体或抗原结合多肽用于监测病况或疾病。如本文所用，监测病况或疾病可以包括鉴定一段时间内的活性、严重性、阶段、特性或其他特征的变化。监测可以包括在多个时间点的测量，所述时间点包括但不限于第一时间点和第二时间点。在一些情况下，第一时间点是在治疗方案开始之前。在一些情况下，第一时间点是在治疗方案开始之后。在一些情况下，第二时间点是在治疗方案期间。在一些情况下，第二时间点是在治疗方案完成之后。在一些情况下，在第一时间点与第二时间点之间不存在治疗上的变化或没有治疗。如本文所用，在监测方案的时间点的测量可以包括测定CD166在细胞、组织、器官、样品或受试者中的浓度、量、水平、表达谱或定位。在各种实施方案中，CD166在细胞、组织、器官、样品或受试者中的浓度、量、水平、表达谱或定位的测定包括使用本文公开的抗CD166 ICD抗体或抗原结合多肽。在各种情况下，将测定的CD166浓度、量、水平、表达谱或定位与参考进行比较。在某些情况下，参考是从较早的时间点获得的测定结果。在某些情况下，参考是从稍后的时间点获得的测定结果。
在某些实施方案中，本文公开的抗CD166 ICD抗体或抗原结合多肽用于监测治疗，例如治疗的成功或失败。如本文所用，监测治疗可以包括鉴定一段时间内的活性、严重性、阶段、特性或其他特征的变化。监测可以包括在多个时间点的测量，所述时间点包括但不限于第一时间点和第二时间点。在一些情况下，第一时间点是在治疗方案开始之前。在一些情况下，第一时间点是在治疗方案开始之后。在一些情况下，第二时间点是在治疗方案期间。在一些情况下，第二时间点是在治疗方案完成之后。在一些情况下，在第一时间点与第二时间点之间不存在治疗上的变化。在一些情况下，在第一时间点与第二时间点之间存在治疗上的变化。如本文所用，在监测方案的时间点的测量可以包括测定CD166在细胞、组织、器官、样品或受试者中的浓度、量、水平、表达谱或定位。在各种实施方案中，CD166在细胞、组织、器官、样品或受试者中的浓度、量、水平、表达谱或定位的测定包括使用本文公开的抗CD166 ICD抗体或抗原结合多肽。在各种情况下，将测定的CD166浓度、量、水平、表达谱或定位与参考进行比较。在某些情况下，参考是从较早的时间点获得的测定结果。在某些情况下，参考是从稍后的时间点获得的测定结果。
在某些实施方案中，本文公开的抗CD166 ICD抗体或抗原结合多肽用于确定是否改变用于治疗病况或疾病的治疗方案。在某些情况下，如果对接受治疗的受试者的监测指示当前治疗方案尚未导致对病况或疾病的有效治疗，则可以将当前治疗方案修改为例如与当前方案不同或比其更严格的方案。在某些情况下，如果对接受治疗的受试者的监测指示当前治疗方案尚未导致病况或疾病的改善或实质改善，则可以将当前治疗方案修改为例如与当前方案不同或比其更严格的方案。在某些情况下，如果对接受治疗的受试者的监测指示当前治疗方案已经导致对病况或疾病的有效治疗，则可以将当前治疗方案修改为例如与当前方案不同或不如其严格的方案。在某些情况下，如果对接受治疗的受试者的监测指示当前治疗方案已经导致病况或疾病的改善，例如实质改善，则可以将当前治疗方案修改为例如与当前方案不同或不如其严格的方案。应当理解，治疗方案的改变最终由执业医生或施用或指导施用治疗方案的其他个体确定。
在某些实施方案中，本发明包括一种服务，其中对所提供的样品进行本文所述的方法、技术或分析。
参考可以是任何可比较的细胞、组织、器官、样品或受试者，所述细胞、组织、器官、样品或受试者是(a)已知、诊断或预期其具有、代表病况或疾病、或处于病况或疾病的风险之中，或(b)已知、诊断或预期其不具有、代表病况或疾病、或处于病况或疾病的风险之中。参考还可以是CD166在细胞、组织、器官、样品或受试者中的浓度、量、水平、表达谱或定位的任何标准的、接受的、选择的、设定的、实验确定的、任意确定的、系统确定的或相对的值。在特定情况下，参考是相同细胞类型、组织类型、样品类型或受试者的样品，所述样品对于一个或多个相关医学参数具有相同或相似的特征。在特定情况下，参考是相同细胞类型、组织类型、样品类型或受试者的样品，所述样品对于一个或多个相关医学参数具有相同或相似的特征，已知所述参考的健康之处在于所述受试者未知、未诊断出或未预期患有特定病况或疾病。参考可以来源于与测试细胞、组织、器官或样品相同的受试者。参考可以是来自与测试细胞、组织、器官或样品相同的受试者的健康组织。参考可以来自不同时间点例如较早时间点或较晚时间点的同一受试者。在一些情况下，参考时间点是在治疗方案开始之前，而测试时间点是在治疗方案开始之后。在一些情况下，参考时间点是在治疗方案开始之前，而测试时间点是在治疗方案期间或治疗方案完成之后。
本文所包括的各种实施方案包括使用本文公开的抗CD166 ICD抗体或抗原结合多肽测量或测定细胞、组织、器官、样品或受试者中的CD166浓度、量、水平、表达谱或定位。在各种实施方案中，测量或测定细胞、组织、器官、样品或受试者中的CD166浓度、量、水平、表达谱或定位包括使所述细胞、组织、器官、样品或受试者与本文公开的抗CD166 ICD抗体或抗原结合多肽接触的步骤。在各种实施方案中，测量或测定细胞、组织、器官、样品或受试者中的CD166浓度、量、水平、表达谱或定位包括允许本文公开的抗CD166 ICD抗体或抗原结合多肽结合暴露于本文公开的抗CD166 ICD抗体或抗原结合多肽的细胞、组织、器官、样品或受试者的CD166的步骤。在某些实施方案中，本发明包括以足以允许抗CD166 ICD抗体或抗原结合多肽与细胞、组织、器官、样品或受试者的CD166结合的方式，将所述细胞、组织、器官、样品或受试者与所述抗CD166 ICD抗体或抗原结合多肽一起孵育。在某些实施方案中，本发明包括例如通过洗涤暴露于抗CD166 ICD抗体或抗原结合多肽的细胞、组织、器官、样品或受试者除去未结合的抗CD166ICD抗体或抗原结合多肽的步骤。在某些实施方案中，本发明包括确定细胞、组织、器官、样品或受试者中CD166的存在、不存在、浓度、量、水平、表达谱或定位的步骤。
在包括确定细胞、组织、器官、样品或受试者中CD166的存在、不存在、浓度、量、水平、表达谱或定位的步骤的某些实施方案中，抗CD166 ICD抗体或抗原结合多肽不与可检测部分缔合。在某些情况下，CD166的检测包括通过提供二抗来标记被如本文所述的抗CD166ICD抗体或抗原结合多肽结合的CD166的步骤。在特定情况下，二抗是结合抗CD166 ICD抗体或抗原结合多肽的抗体。因此，在某些实施方案中，检测CD166包括使暴露于抗CD166 ICD抗体或抗原结合多肽或与之结合(或至少接触CD166结合的抗CD166 ICD抗体或抗原结合多肽)的细胞、组织、器官、样品或受试者与二抗接触。某些实施方案还包括允许二抗结合抗CD166 ICD抗体或抗原结合多肽的步骤。在某些实施方案中，本发明包括以足以允许二抗与抗CD166 ICD抗体或抗原结合多肽结合的方式将细胞、组织、器官、样品或受试者与二抗一起孵育。在某些实施方案中，本发明包括例如通过洗涤暴露于二抗的细胞、组织、器官、样品或受试者除去未结合的二抗的步骤。在某些情况下，二抗是结合抗CD166 ICD抗体或抗原结合多肽的抗体，所述二抗与可检测部分缔合。本领域技术人员将熟悉适用于检测本发明的可检测部分的方法。
在包括确定细胞、组织、器官、样品或受试者中CD166的存在、不存在、浓度、量、水平、表达谱或定位的步骤的某些实施方案中，抗CD166 ICD抗体或抗原结合多肽与被二抗结合的可检测部分缔合。在某些情况下，CD166的检测包括通过提供二抗来标记被如本文所述的抗CD166 ICD抗体或抗原结合多肽结合的CD166的步骤。在特定情况下，二抗是结合抗CD166 ICD抗体或抗原结合多肽的抗体。因此，在某些实施方案中，检测CD166包括使暴露于抗CD166 ICD抗体或抗原结合多肽或与之结合(或至少接触CD166结合的抗CD166 ICD抗体或抗原结合多肽)的细胞、组织、器官、样品或受试者与二抗接触。某些实施方案还包括允许二抗结合抗CD166 ICD抗体或抗原结合多肽的步骤。在某些实施方案中，本发明包括以足以允许二抗与抗CD166 ICD抗体或抗原结合多肽结合的方式将细胞、组织、器官、样品或受试者与二抗一起孵育。在某些实施方案中，本发明包括例如通过洗涤暴露于二抗的细胞、组织、器官、样品或受试者除去未结合的二抗的步骤。在某些情况下，二抗是结合抗CD166 ICD抗体或抗原结合多肽的抗体，所述二抗与可检测部分缔合。本领域技术人员将熟悉适用于检测二抗的本发明可检测部分的方法。
在包括确定细胞、组织、器官、样品或受试者中CD166的存在、不存在、浓度、量、水平、表达谱或定位的步骤的某些实施方案中，抗CD166 ICD抗体或抗原结合多肽与可检测部分缔合，其中与CD166结合的抗CD166 ICD抗体或抗原结合多肽在不使用二抗的情况下检测。在某些实施方案中，检测与抗CD166 ICD抗体或抗原结合多肽缔合(例如，直接缔合)的可检测部分。本领域技术人员将熟悉适用于检测二抗的本发明可检测部分的方法。
在各种实施方案中，在使细胞、组织、器官、样品或受试者与抗CD166 ICD抗体或抗原结合多肽接触之前，使所述细胞、组织、器官、样品或受试者与封闭剂或淬灭剂接触以减少、最小化或消除抗CD166 ICD抗体或抗原结合多肽与所述细胞、组织、器官、样品或受试者的非特异性结合。
在不受限制的情况下，检测可检测部分的手段可以包括但不限于免疫组织化学、电泳、蛋白质印迹分析、免疫沉淀分析和/或显微镜检查。本领域技术人员将熟悉适用于检测二抗的本发明可检测部分的方法。
本公开的病况或疾病可以是但不限于与CD166在细胞、组织、器官、样品或受试者中的水平、浓度、量、水平、表达谱或定位相关联的病况或疾病。在一些实施方案中，CD166在细胞、组织、器官、样品或受试者中的水平、浓度、量、水平、表达谱或定位可以与CD166在参考中的浓度、量、水平、表达谱或定位不同。在某些情况下，本公开的病况或疾病可以是但不限于癌症(例如，肿瘤，例如表达CD166的肿瘤)。在某些情况下，本公开的病况或疾病可以是但不限于以活化的淋巴细胞或活化的单核细胞(白细胞)(例如，表达CD166)为特征的病况或疾病。
在特定的实施方案中，本公开的病况或疾病可以是选自以下的癌症：前列腺癌、鳞状细胞皮肤癌、乳腺癌、卵巢癌、肺腺癌、小细胞肺癌、非小细胞肺癌、食管小细胞癌、透明细胞肾癌、小肠癌、结肠腺癌、乳头状甲状腺癌、子宫内膜癌、直肠癌、鳞状细胞肺癌、喉癌、胰腺癌、鳞状细胞宫颈癌、鳞状细胞食管癌、肝癌、胃贲门癌、胃癌、腹腔癌、膀胱移行细胞癌、黑素瘤、乳腺癌、子宫内膜癌、胆管癌、和去势抗性前列腺癌。
在特定的实施方案中，本公开的病况或疾病可以是存在活化的淋巴细胞和/或活化的单核细胞(白细胞)。在特定的实施方案中，本公开的病况或疾病可以是例如与参考相比，存在升高的活化的淋巴细胞和/或活化的单核细胞(白细胞)。
在特定的实施方案中，本公开的病况或疾病可以是以活化的淋巴细胞或活化的单核细胞(白细胞)为特征的炎性病况。在特定的实施方案中，本公开的病况或疾病可以是以活化的淋巴细胞或活化的单核细胞(白细胞)为特征的病况或疾病，其选自但不限于癌症、类风湿性关节炎、晕痣、骨髓增生异常综合征、狼疮、1型糖尿病、牙周炎、镰状细胞贫血、炎性肠病、和贝切特氏病。
本公开的样品可以是从目标来源如受试者获得或得到的任何材料。在一些实施方案中，目标来源是或包括生物组织或流体。在一些实施方案中，生物组织或流体可以是或包括羊水、房水、腹水、胆汁、骨髓、血液、母乳、脑脊液、耳垢、乳糜、食糜、射出精液、内淋巴液、渗出液、粪便、胃酸、胃液、淋巴液、粘液、心包液、外淋巴液、腹膜液、胸膜液、脓、发炎性分泌物、唾液、皮脂、精液、血清、阴垢、痰液、滑液、汗液、泪液、尿液、阴道分泌物、玻璃体液、呕吐物和/或其组合或组分。在一些实施方案中，生物流体可以是或包括细胞内液、细胞外液、血管内流体(血浆)、间质液、淋巴液和/或跨细胞液。在一些实施方案中，生物流体可以是或包括植物渗出物。在一些实施方案中，生物组织或样品可以例如通过抽吸、活组织检查(例如，细针或组织活组织检查)、拭子(例如，口、鼻、皮肤或阴道拭子)、刮擦、手术、洗涤或灌洗(例如，支气管肺泡(brocheoalvealar)、导管、鼻、眼、口、子宫、阴道或其他洗涤或灌洗)来获得。在一些实施方案中，生物样品是或包括从受试者获得的细胞。在一些实施方案中，样品是通过任何适当的手段从目标来源直接获得的“一级样品”。在一些实施方案中，样品是通过加工(例如，通过除去一种或多种组分和/或通过向其中添加一种或多种试剂)一级样品获得的制剂。这种“加工的样品”可以包括例如从一级样品中提取、获得或得到的细胞、核酸或蛋白质。
在特定情况下，样品可以是细胞或组织，如肿瘤或癌细胞或肿瘤或癌组织。在某些情况下，样品可以包括肿瘤或癌细胞系的细胞、从受试者获得或得到的肿瘤或癌细胞。在各种实施方案中，样品可以是或包括存在于培养基中的、固定的、福尔马林固定的和/或石蜡包埋的细胞或组织。在各种实施方案中，癌细胞可以包括选自H292、HCC1806、MDA-MB-231、BXPC3、HT29和BT20的细胞系的细胞。在各种实施方案中，癌细胞可以包括非小细胞肺癌细胞、乳腺癌细胞、卵巢癌细胞、子宫内膜癌细胞、胆管癌细胞、头颈癌细胞、或去势抗性前列腺癌细胞，或本文公开的任何肿瘤或癌症的细胞。在各种实施方案中，细胞、组织或样品可以是选自以下的癌症或肿瘤的细胞、组织或样品：前列腺癌、鳞状细胞皮肤癌、乳腺癌、卵巢癌、肺腺癌、小细胞肺癌、非小细胞肺癌、食管小细胞癌、透明细胞肾癌、小肠癌、结肠腺癌、乳头状甲状腺癌、子宫内膜癌、直肠癌、鳞状细胞肺癌、喉癌、胰腺癌、鳞状细胞宫颈癌、鳞状细胞食管癌、肝癌、胃贲门癌、胃癌、腹腔癌、膀胱移行细胞癌、黑素瘤、乳腺癌、子宫内膜癌、胆管癌、和去势抗性前列腺癌。
本发明的治疗方案可以包括但不限于向受试者施用癌症治疗剂(如化疗剂)和/或抗CD166抗体或抗原结合多肽(如不是抗CD166 ICD抗体或抗原结合多肽的抗CD166抗体或抗原结合多肽)。
在各种实施方案中，化疗剂包括促凋亡剂、细胞抑制剂和/或细胞毒性剂，例如，具体地包括用于和/或推荐用于治疗一种或多种与不期望有的细胞增殖相关联的疾病、病症或病况的试剂。在某些实施方案中，化疗剂适用于治疗癌症。在一些实施方案中，化疗剂可以是或包括：一种或多种烷基化剂、一种或多种蒽环类药物、一种或多种细胞骨架破坏剂(例如，微管靶向剂，如紫杉烷类、美登素及其类似物)、一种或多种埃坡霉素、一种或多种组蛋白脱乙酰酶抑制剂HDAC)、一种或多种拓扑异构酶抑制剂(例如，拓扑异构酶I和/或拓扑异构酶II的抑制剂)、一种或多种激酶抑制剂、一种或多种核苷酸类似物或核苷酸前体类似物、一种或多种肽抗生素、一种或多种铂基试剂、一种或多种类视黄醇、一种或多种长春花生物碱和/或一种或多种下列物质(即，共有相关的抗增殖活性的物质)的一种或多种类似物。在一些特定的实施方案中，化疗剂可以是或包括以下试剂中的一种或多种：放线菌素、全反式视黄酸、奥尼司他、阿扎胞苷、硫唑嘌呤、博来霉素、硼替佐米、卡铂、卡培他滨、顺铂、苯丁酸氮芥、环磷酰胺、姜黄素、阿糖胞苷、柔红霉素、多西他赛、阿霉素、多柔比星、表柔比星、埃坡霉素、依托泊苷、氟尿嘧啶、吉西他滨、羟基脲、伊达比星、伊马替尼、伊立替康、美登素和/或其类似物(例如，DM1)、甲氯雷他明、巯基嘌呤、甲氨蝶呤、米托蒽醌、美登木素生物碱、奥沙利铂、紫杉醇、培美曲塞、替尼泊苷、替鸟苷、拓扑替康、戊柔比星、长春碱、长春新碱、长春地辛、长春瑞滨及其组合。在一些实施方案中，化疗剂可以在抗体-药物缀合物的情况下使用。在一些实施方案中，化疗剂是见于选自由以下组成的组的抗体-药物缀合物中的化疗剂：hLL1-阿霉素、hRS7-SN-38、hMN-14-SN-38、hLL2-SN-38、hA20-SN-38、hPAM4-SN-38、hLL1-SN-38、hRS7-Pro-2-P-Dox、hMN-14-Pro-2-P-Dox、hLL2-Pro-2-P-Dox、hA20-Pro-2-P-Dox、hPAM4-Pro-2-P-Dox、hLL1-Pro-2-P-Dox、P4/D10-阿霉素、吉妥单抗-奥佐米星、本妥昔单抗-维多汀、曲妥珠单抗-美坦新、奥英妥珠单抗、格巴妥莫单抗-维多汀、SAR3419、SAR566658、BIIB015、BT062、SGN-75、SGN-CD19A、AMG-172、AMG-595、BAY-94-9343、ASG-5ME、ASG-22ME、ASG-16M8F、MDX-1203、MLN-0264、抗PSMA ADC、RG-7450、RG-7458、RG-7593、RG-7596、RG-7598、RG-7599、RG-7600、RG-7636、ABT-414、IMGN-853、IMGN-529、vorsetuzumabmafodotin和莫-洛妥珠单抗。在一些实施方案中，化疗剂可以是或包括以下中的一种或多种：法尼基硫代水杨酸(FTS)、4-(4-氯-2-甲基苯氧基)-N-羟基丁酰胺(CMH)、雌二醇(E2)、四甲氧基芪(TMS)、δ-去甲基阿米酚、盐霉素或姜黄素组合疗法：如本文所用，术语“组合疗法”是指受试者同时暴露于两种或更多种治疗方案(例如，两种或更多种治疗剂)的那些情况。在一些实施方案中，可以同时施用两种或更多种试剂；在一些实施方案中，此类试剂可以顺序地施用；在一些实施方案中，此类试剂以重叠的给药方案施用。
在各种实施方案中，抗CD166抗体或抗原结合多肽(如不是抗CD166 ICD抗体或抗原结合多肽的抗CD166抗体或抗原结合多肽)是治疗性抗体或抗原结合多肽，所述治疗性抗体或抗原结合多肽包含根据SEQ ID NO:46的重链和/或根据SEQ ID NO:52的轻链。在特定情况下，治疗性抗体或抗原结合多肽是以下抗体或抗原结合多肽，其包含根据SEQ ID NO:48或SEQ ID NO:49的重链可变结构域和/或根据SEQ ID NO:53、SEQ ID NO:54、SEQ ID NO:55或SEQ ID NO:56的轻链可变结构域。在特定情况下，治疗性抗体或抗原结合多肽是以下抗体或抗原结合多肽，其包含以下区中的一种或多种：(a)根据SEQ ID NO:49的HCDR1；(b)根据SEQ ID NO:50的HCDR2；(c)根据SEQ ID NO:51的HCDR3；(d)根据SEQ ID NO:57的LCDR1；(e)根据SEQ ID NO:58的LCDR1；(f)根据SEQ ID NO:59的LCDR2；(g)根据SEQ ID NO:60的LCDR2；和/或(h)根据SEQ ID NO:61的LCDR3。
在特定情况下，治疗性抗体或抗原结合多肽是以下抗体或抗原结合多肽，其包含根据SEQ ID NO:46的重链和根据SEQ ID NO:52的轻链。在特定情况下，治疗性抗体或抗原结合多肽是以下抗体或抗原结合多肽，其包含根据SEQ ID NO:46的第一重链、根据SEQ IDNO:46的第二重链、根据SEQ ID NO:52的第一轻链、和根据SEQ ID NO:52的第二轻链。
在特定情况下，治疗性抗体或抗原结合多肽是以下抗体或抗原结合多肽，其包含根据SEQ ID NO:48或SEQ ID NO:49的重链可变结构域和根据SEQ ID NO:53、SEQ ID NO:54、SEQ ID NO:55或SEQ ID NO:56的轻链可变结构域。在特定情况下，治疗性抗体或抗原结合多肽是以下抗体或抗原结合多肽，其包含根据SEQ ID NO:48或SEQ ID NO:49的第一重链可变结构域，根据SEQ ID NO:48或SEQ ID NO:49的第二重链可变结构域，根据SEQ ID NO:53、SEQ ID NO:54、SEQ ID NO:55或SEQ ID NO:56的第一轻链可变结构域，和根据SEQ IDNO:53、SEQ ID NO:54、SEQ ID NO:55或SEQ ID NO:56的第二轻链可变结构域。
在特定情况下，治疗性抗体或抗原结合多肽是以下抗体或抗原结合多肽，其包含(a)根据SEQ ID NO:49的HCDR1；(b)根据SEQ ID NO:50的HCDR2；(c)根据SEQ ID NO:51的HCDR3；(d)根据SEQ ID NO:57或SEQ ID NO:58的LCDR1；(e)根据SEQ ID NO:59或SEQ IDNO:60的LCDR2；和(f)根据SEQ ID NO:61的LCDR3。在特定情况下，治疗性抗体或抗原结合多肽是以下抗体或抗原结合多肽，其包含(a)根据SEQ ID NO:49的第一HCDR1；(b)根据SEQ IDNO:50的第一HCDR2；(c)根据SEQ ID NO:51的第一HCDR3；(d)根据SEQ ID NO:57或SEQ IDNO:58的第一LCDR1、(e)根据SEQ ID NO:59或SEQ ID NO:60的第一LCDR2；(f)根据SEQ IDNO:61的第一LCDR3；(g)根据SEQ ID NO:49的第二HCDR1；(h)根据SEQ ID NO:50的第二HCDR2；(i)根据SEQ ID NO:51的第二HCDR3；(j)根据SEQ ID NO:57或SEQ ID NO:58的第二LCDR1；(k)根据SEQ ID NO:59或SEQ ID NO:60的第二LCDR2；(l)根据SEQ ID NO:61的第二LCDR3。在一些情况下，治疗性抗体可以是单克隆的。
在某些情况下，治疗性抗体或抗原结合多肽是特异性结合至免疫检查点蛋白的治疗性抗体或抗原结合多肽。在某些情况下，治疗性抗体或抗原结合多肽是抗PD-1抗体或抗原结合多肽。在某些情况下，治疗性抗PD-1抗体或抗原结合多肽是可活化抗体或抗原结合多肽。在特定的实施方案中，治疗性抗PD-1抗体或抗原结合多肽是与治疗性部分缔合的抗PD-1抗体或抗原结合多肽(和/或抗PD-1可活化抗体或抗原结合多肽)。在某些情况下，治疗性抗体或抗原结合多肽是抗PD-L1抗体或抗原结合多肽。在某些情况下，治疗性抗PD-L1抗体或抗原结合多肽是可活化抗体或抗原结合多肽。在特定的实施方案中，治疗性抗PD-L1抗体或抗原结合多肽是与治疗性部分缔合的抗PD-L1抗体或抗原结合多肽(和/或抗PD-L1可活化抗体或抗原结合多肽)。
在各种情况下，治疗性抗体或抗原结合多肽是可活化的。广泛地，如果抗体或抗原结合多肽与掩蔽部分(MM)偶联，则本文公开的抗体或抗原结合多肽是可活化的，当可活化抗体处于完整或未裂解状态时，所述掩蔽部分降低抗体或抗原结合多肽特异性结合至靶表位的能力。在一些情况下，MM通过可裂解部分(CM)偶联，所述可裂解部分包括蛋白酶的底物，例如在患病组织中有活性的蛋白酶和/或与受试者的治疗位点处的靶标共定位的蛋白酶。当可活化抗体或抗原结合多肽处于“活化”或裂解状态时，如当CM被蛋白酶裂解时，抗体或抗原结合多肽可以特异性结合至其靶表位。可活化抗体和抗原结合多肽以及产生它们的方法描述于例如国际公布号WO 2009/025846和国际公布号WO 2010/081173中，其各自通过引用整体并入本文。
在各种实施方案中，掩蔽部分是肽。在各种实施方案中，包含掩蔽部分的可活化抗体或抗原结合多肽包含“活化部分”。如本文所用，活化部分是介导可活化抗体或抗原结合多肽的非活化状态与活化状态之间的转变的部分。如本文所用，抗体或抗原结合多肽是“可活化的”，因为当处于“非活化“状态时，分子可以表现出与靶表位的第一“非活化”结合水平，并且当处于“活化”状态时，分子可以表现出第二更大的“活化”结合水平。可以根据本文所述的或本领域另外已知的任何结合标准进行处于非活化状态的可活化抗体或抗原结合多肽对表位的结合与可活化抗体或抗原结合多肽的活化形式对表位的结合的比较。结合的非限制性测量包括，例如，根据免疫吸附测定的测量，或如本文所述的测量结合的任何其他方法。尽管在某些特定的实施方案中情况可能是这样：处于非活化状态的可活化抗体或抗原结合多肽不结合或实质上不结合靶表位，但是应当理解，不需要完全或实质上完全消除在非活化状态下的结合。掩蔽部分及其用途描述于例如国际公布号WO 2009/025846和国际公布号WO 2010/081173中，其各自通过引用整体并入本文。
在各种实施方案中，抗体或抗原结合多肽和掩蔽部分通过接头接合。在各种实施方案中，接头是活化接头(即，是或包含活化部分的接头)。在各种实施方案中，抗体或抗原结合多肽和掩蔽部分通过活化接头接合，所述活化接头是或包含可裂解部分(CM)。在某些情况下，其中可活化抗体或抗原结合多肽包含通过活化接头与抗体或抗原结合多肽接合的掩蔽部分，所述活化接头是或包含可裂解部分(“可裂解接头”)，当可裂解接头处于未裂解状态时，掩蔽部分可抑制抗体或抗原结合多肽结合靶表位的能力，如果可裂解接头被裂解，则所述抑制被减轻。因此，在某些情况下，可裂解部分的裂解减轻掩蔽部分对抗体或抗原结合多肽结合靶表位的能力的抑制。接头及其用途描述在例如国际公布号WO 2009/025846和国际公布号WO 2010/081173中，其各自通过引用整体并入本文。
在各种实施方案中，非限制性地，掩蔽部分可以是结合可活化抗体或抗原结合多肽的结合部分的部分。在各种实施方案中，非限制性地，掩蔽部分可以在空间上抑制抗体或抗原结合多肽结合靶表位的能力。在各种实施方案中，非限制性地，掩蔽部分可以变构地抑制抗体或抗原结合多肽结合靶表位的能力。
在某些情况下，活化接头是或包含能够被酶、蛋白酶或肽酶特异性裂解的底物。在某些情况下，活化接头可被还原剂还原。在某些情况下，活化接头是光敏底物，其光解减轻了掩蔽部分对抗体或抗原结合多肽结合靶表位的能力的抑制。如本文所用，裂解可互换使用，表示被酶、还原剂或光解所活化。还预期可裂解接头和掩蔽部分可以在氨基酸序列中重叠，例如，使得可裂解接头包含在掩蔽部分内。可裂解接头及其用途描述在例如国际公布号WO 2009/025846和国际公布号WO 2010/081173中，其各自通过引用整体并入本文。
在各种实施方案中，可活化抗体或抗原结合多肽包含活化部分，所述活化部分通过经历、引起或促成掩蔽部分的构象变化或可活化抗体或抗原结合多肽的其他构象变化而介导可活化抗体或抗原结合多肽的非活化状态与活化状态之间的转变，所述转变减轻掩蔽部分对抗体或抗原结合多肽结合靶表位的能力的抑制。在各种实施方案中，在存在能够活化接头的酶/还原剂/光的情况下结合配偶体与功能性蛋白质的接近程度大于在不存在活化和/或这种酶/还原剂/光的情况下结合配偶体与功能性蛋白质的接近程度。活化部分及其用途描述于例如国际公布号WO 2009/025846和国际公布号WO 2010/081173中，其各自通过引用整体并入本文。
在某些实施方案中，可活化抗体或抗原结合多肽中包含的活化部分可基于蛋白酶的体内或体外定位(例如，在细胞、组织、器官或受试者内或之中)来选择，所述蛋白酶是用于裂解活化部分和/或活化可活化抗体或抗原结合多肽。例如，在某些组织(例如，癌组织)中表达的蛋白酶包括但不限于基质金属蛋白酶(MMP)、ADAM 17、BMP-1、半胱氨酸蛋白酶(例如，组织蛋白酶)、HtrA1、豆荚蛋白、蛋白裂解酶(MT-SP1)、嗜中性粒细胞弹性蛋白酶、TMPRSS(例如，TMPRSS3或TMPRSS4)、凝血酶或u型纤溶酶原活化物(uPA，也称为尿激酶)。因此，在特定情况下，活化部分可以是或包括选自以下的蛋白酶的底物：基质金属蛋白酶(MMP)、ADAM 17、BMP-1、半胱氨酸蛋白酶(例如，组织蛋白酶)、HtrA1、豆荚蛋白、蛋白裂解酶(MT-SP1)、嗜中性粒细胞弹性蛋白酶、TMPRSS(例如，TMPRSS3或TMPRSS4)、凝血酶或u型纤溶酶原活化物(uPA，也称为尿激酶)。在各种情况下，蛋白酶共有靶序列是本领域已知的。
可活化抗体或抗原结合多肽可以多种结构构型中的任一种提供。例如，预期抗体或抗原结合多肽、掩蔽部分、和可裂解接头可以从N-末端到C-末端的阅读顺序或从C-末端到N-末端的阅读顺序提供。
可活化抗体或抗原结合多肽的构型的非限制性实例包括(从N-末端至C-末端)：(a)[掩蔽部分]-[接头]-[抗体或抗原结合多肽]；(b)[抗体或抗原结合多肽]-[接头]-[掩蔽部分]；(c)[掩蔽部分]-[活化接头]-[抗体或抗原结合多肽]；和/或(d)[抗体或抗原结合多肽]-[活化接头]-[掩蔽部分]；(e)[掩蔽部分]-[抗体或抗原结合多肽]；(f)[抗体或抗原结合多肽]-[掩蔽部分]；
虽然掩蔽部分和接头在某些提供的构型中表示为不同的组分，但应理解，掩蔽部分的氨基酸序列与接头的氨基酸序列在至少一些情况下可以重叠，例如使得可裂解接头的序列完全或部分地在掩蔽部分的氨基酸序列内。还应理解，本文提供的构型也涵盖在C-末端至N-末端的取向中。可活化抗体和抗原结合多肽的构型描述于例如国际公布号WO 2009/025846和国际公布号WO 2010/081173中，其各自通过引用整体并入本文。
治疗性抗体或抗原结合多肽(如但不限于可活化抗体或抗原结合多肽)与治疗性部分缔合。
在本发明的各种实施方案中，本发明的治疗性抗体或抗原结合多肽与治疗性部分缔合。在各种情况下，如本文公开的治疗性抗体或抗原结合多肽可与治疗性部分共价或非共价缔合。在各种情况下，如本文公开的治疗性抗体或抗原结合多肽可直接或间接地与治疗性部分缔合。在各种情况下，如本文公开的治疗性抗体或抗原结合多肽可经由接头与治疗性部分缔合。在各种情况下，如本文公开的治疗性抗体或抗原结合多肽可与治疗性部分融合或缀合。在各种情况下，如本文公开的治疗性抗体或抗原结合多肽经由治疗性抗体或抗原结合多肽的多肽末端与治疗性部分缔合。在各种情况下，如本文公开的治疗性抗体或抗原结合多肽经由治疗性抗体或抗原结合多肽的非末端残基与治疗性部分缔合。在各种情况下，如本文公开的治疗性抗体或抗原结合多肽通过将治疗性部分并入治疗性抗体或抗原结合多肽的分子结构中而与治疗性部分缔合。在各种情况下，如本文公开的治疗性抗体或抗原结合多肽可通过本文所公开或本领域中另外已知的任何机制与多个相同或不同的治疗性部分缔合，所述相同或不同的治疗性部分可通过如本文公开或本领域中另外已知的相同或不同的缔合机制与治疗性抗体或抗原结合多肽缔合。
本发明的治疗性部分包括药物，例如用于治疗病况或疾病的药物。本发明的治疗性部分包括但不限于细胞毒性部分、化疗剂、毒素或放射性核素。
在各种实施方案中，化疗剂包括促凋亡剂、细胞抑制剂和/或细胞毒性剂，例如，具体地包括用于和/或推荐用于治疗一种或多种与不期望有的细胞增殖相关联的疾病、病症或病况的试剂。在某些实施方案中，化疗剂适用于治疗癌症。在一些实施方案中，化疗剂可以是或包括：一种或多种烷基化剂、一种或多种蒽环类药物、一种或多种细胞骨架破坏剂(例如，微管靶向剂，如紫杉烷类、美登素及其类似物)、一种或多种埃坡霉素、一种或多种组蛋白脱乙酰酶抑制剂HDAC)、一种或多种拓扑异构酶抑制剂(例如，拓扑异构酶I和/或拓扑异构酶II的抑制剂)、一种或多种激酶抑制剂、一种或多种核苷酸类似物或核苷酸前体类似物、一种或多种肽抗生素、一种或多种铂基试剂、一种或多种类视黄醇、一种或多种长春花生物碱和/或一种或多种下列物质(即，共有相关的抗增殖活性的物质)的一种或多种类似物。在一些特定的实施方案中，化疗剂可以是或包括以下试剂中的一种或多种：放线菌素、全反式视黄酸、奥尼司他、阿扎胞苷、硫唑嘌呤、博来霉素、硼替佐米、卡铂、卡培他滨、顺铂、苯丁酸氮芥、环磷酰胺、姜黄素、阿糖胞苷、柔红霉素、多西他赛、阿霉素、多柔比星、表柔比星、埃坡霉素、依托泊苷、氟尿嘧啶、吉西他滨、羟基脲、伊达比星、伊马替尼、伊立替康、美登素和/或其类似物(例如，DM1)、甲氯雷他明、巯基嘌呤、甲氨蝶呤、米托蒽醌、美登木素生物碱、奥沙利铂、紫杉醇、培美曲塞、替尼泊苷、替鸟苷、拓扑替康、戊柔比星、长春碱、长春新碱、长春地辛、长春瑞滨及其组合。在一些实施方案中，化疗剂可以在抗体-药物缀合物的情况下使用。在一些实施方案中，化疗剂是见于选自由以下组成的组的抗体-药物缀合物中的化疗剂：hLL1-阿霉素、hRS7-SN-38、hMN-14-SN-38、hLL2-SN-38、hA20-SN-38、hPAM4-SN-38、hLL1-SN-38、hRS7-Pro-2-P-Dox、hMN-14-Pro-2-P-Dox、hLL2-Pro-2-P-Dox、hA20-Pro-2-P-Dox、hPAM4-Pro-2-P-Dox、hLL1-Pro-2-P-Dox、P4/D10-阿霉素、吉妥单抗-奥佐米星、本妥昔单抗-维多汀、曲妥珠单抗-美坦新、奥英妥珠单抗、格巴妥莫单抗-维多汀、SAR3419、SAR566658、BIIB015、BT062、SGN-75、SGN-CD19A、AMG-172、AMG-595、BAY-94-9343、ASG-5ME、ASG-22ME、ASG-16M8F、MDX-1203、MLN-0264、抗PSMA ADC、RG-7450、RG-7458、RG-7593、RG-7596、RG-7598、RG-7599、RG-7600、RG-7636、ABT-414、IMGN-853、IMGN-529、vorsetuzumabmafodotin和莫-洛妥珠单抗。在一些实施方案中，化疗剂可以是或包括以下中的一种或多种：法尼基硫代水杨酸(FTS)、4-(4-氯-2-甲基苯氧基)-N-羟基丁酰胺(CMH)、雌二醇(E2)、四甲氧基芪(TMS)、δ-去甲基阿米酚、盐霉素或姜黄素组合疗法：如本文所用，术语“组合疗法”是指受试者同时暴露于两种或更多种治疗方案(例如，两种或更多种治疗剂)的那些情况。在一些实施方案中，可以同时施用两种或更多种试剂；在一些实施方案中，此类试剂可以顺序地施用；在一些实施方案中，此类试剂以重叠的给药方案施用。
本发明还包括一种产生本文公开的抗CD166 ICD抗体或抗原结合多肽的方法。产生如本文公开的抗CD166 ICD抗体或抗原结合多肽的方法可以包括产生包含编码如本文公开的抗CD166 ICD抗体或抗原结合多肽的核酸的细胞。所述核酸可以例如存在于细胞的基因组中和/或存在于用于表达抗体或抗原结合多肽的载体中。本发明的方法还可以包括在允许细胞生长和/或细胞分裂、产生如本文公开的抗CD166 ICD抗体或抗原结合多肽或两者的条件下培养包含编码如本文公开的抗CD166 ICD抗体或抗原结合多肽的核酸的细胞。本发明的方法还可以包括从细胞培养物中分离如本文公开的抗CD166 ICD抗体或抗原结合多肽。产生核酸、产生细胞、培养细胞以及从培养物中分离抗体的方法是本领域已知的。
抗CD166 ICD抗体或抗原结合多肽的配制
在各种实施方案中，本文所述的抗CD166 ICD抗体或抗原结合多肽可以是药物组合物或包含在药物组合物中。这样的药物组合物可适用于例如检测CD166、诊断与CD166相关的病况、治疗与CD166相关的病况、鉴定结合CD166或其部分(例如，其胞内部分或其胞外部分)的抗体或其他用途。包含抗CD166 ICD抗体或抗原结合多肽的组合物可通过本领域技术人员已知的方法(例如，根据Remington's Pharmaceutical Sciences，第17版，AlfonsoR Gennaro编，宾夕法尼亚州伊斯顿的Mack Publishing Company(1985)中描述的技术和/或制剂)配制。
在各种情况下，抗CD166 ICD抗体或抗原结合多肽组合物可被配制成包含可接受的载剂或赋形剂，例如，适于实验室使用的载剂或赋形剂、适于体外使用的载剂或赋形剂、或药学上可接受的载剂或赋形剂。载剂的实例包括但不限于生理上相容的任何和所有溶剂、分散介质、包衣、抗细菌和抗真菌剂、等渗剂和吸收延迟剂等。本发明的组合物可以包含盐，例如药学上可接受的盐，例如酸加成盐或碱加成盐。
任何特定形式的选择或使用可部分地取决于预期模式应用。在各种实施方案中，抗CD166 ICD抗体或抗原结合多肽可被配制为实验室试剂或体外使用的试剂，或以适合用作实验室试剂或体外使用的试剂的方式配制。在各种实施方案中，抗CD166 ICD抗体或抗原结合多肽将被配制成液体形式。
在各种实施方案中，可根据常规实践，例如使用蒸馏水作为载剂，配制包含如本文所述的抗体的组合物，例如无菌制剂。合适的载剂可以包括但不限于生理盐水或等渗溶液，其含有葡萄糖和其他补充剂，如D-山梨糖醇、D-甘露糖、D-甘露糖醇和氯化钠，任选地与以下试剂组合：合适的增溶剂，例如，醇如乙醇和多元醇如丙二醇或聚乙二醇，及非离子表面活性剂如聚山梨酯80TM、HCO-50等。
如本文所公开，抗CD166 ICD抗体或抗原结合多肽组合物可以呈本领域已知的任何形式。这样的形式包括，例如液体、半固体和固体剂型，如液体溶液(例如，可注射和可输注的溶液)、分散体或悬浮液、片剂、丸剂、粉剂、脂质体和栓剂。
在各种实施方案中，本发明的组合物可被配制成溶液、微乳液、分散体、脂质体、或适于在高浓度下稳定储存的其他有序结构。可通过以下操作来制备溶液：将所需量的本文所述的组合物与上文所列成分中的一种或其组合一起并入适当溶剂中，接着任选地过滤灭菌。通常，通过将本文所述的组合物并入含有基础分散介质和来自上文所列的那些的其他所需成分的无菌媒介物中来制备分散体。在粉末形式如无菌粉末的情况下，制备方法包括真空干燥和冷冻干燥，其产生本文所述的组合物加上任何另外的所需成分(例如，如本文所述)的粉末。在特定情况下，可例如通过使用包衣如卵磷脂、在分散体的情况下通过维持所需粒度以及通过使用表面活性剂来维持溶液的适当流动性。本文所述的组合物可以包含单硬脂酸盐或明胶。
抗CD166 ICD抗体或抗原结合多肽组合物可通过将抗CD166 ICD抗体或抗原结合多肽与一种或多种媒介物或介质如无菌水、生理盐水、植物油、乳化剂、悬浮剂、表面活性剂、稳定剂、调味赋形剂、稀释剂、媒介物、防腐剂、粘结剂任选地以适于预期用途的浓度适当地组合来配制。可以包含的其他项目是缓冲液如磷酸盐缓冲液或乙酸钠缓冲液，稳定剂如苄醇或苯酚，和抗氧化剂。
抗CD166 ICD抗体或抗原结合多肽组合物可被包装在合适的安瓿或其他合适的包装中，例如用于实验室用途。
在一些实施方案中，抗CD166 ICD抗体或抗原结合多肽组合物可被配制用于在低于0℃的温度(例如，-20℃或-80℃)下储存。在一些实施方案中，所述组合物可被配制用于在2-8℃(例如，4℃)下储存长达2年(例如，一个月、两个月、三个月、四个月、五个月、六个月、七个月、八个月、九个月、10个月、11个月、1年、11/2年或2年)。因此，在一些实施方案中，本文所述的组合物在2-8℃(例如，4℃)下稳定储存至少1年。
在特定情况下，抗CD166 ICD抗体或抗原结合多肽组合物可被配制为溶液。在一些实施方案中，组合物可被配制为例如合适的浓度且适于在2-8℃(例如4℃)下储存的缓冲溶液。
在各种实施方案中，如本文所述的抗CD166 ICD抗体或抗原结合多肽组合物还可以包含二抗。抗CD166 ICD抗体或抗原结合多肽的二抗可以存在于与抗CD166 ICD抗体或抗原结合多肽分开的二抗制剂中，所述二抗制剂可例如根据本文针对抗CD166 ICD抗体或抗原结合多肽组合物或制剂所述的方式制备。
在各种实施方案中，抗CD166 ICD抗体或抗原结合多肽在使抗CD166 ICD抗体或抗原结合多肽与抗CD166 ICD抗体或抗原结合多肽的CD166和/或CD166表位接触后，抗CD166ICD抗体或抗原结合多肽将结合CD166。本发明包括组合物，其中抗CD166 ICD抗体或抗原结合多肽例如通过抗CD166 ICD抗体或抗原结合多肽的CD166表位与CD166结合。在各种这样的情况下，CD166可以是哺乳动物CD166，例如灵长类动物CD166，例如人CD166。
在各种实施方案中，抗CD166 ICD抗体或抗原结合多肽与结合或能够结合抗CD166ICD抗体或抗原结合多肽的二抗接触。本发明包括组合物，其中抗CD166 ICD抗体或抗原结合多肽被二抗结合。本发明还包括特定的实施方案，其中抗CD166 ICD抗体或抗原结合多肽例如通过抗CD166 ICD抗体或抗原结合多肽的CD166表位与CD166结合，并且抗CD166 ICD抗体或抗原结合多肽被二抗结合。
本发明包括一种编码如本文公开的抗CD166 ICD抗体或抗原结合多肽的核酸。本文公开了编码抗CD166 ICD抗体或抗原结合多肽的核酸序列，其中的任一种可以存在或包括在本发明的组合物中。本发明的核酸分子可以是(单独或在其他编码元件之中)编码抗CD166 ICD抗体或抗原结合多肽的核酸分子。本发明的核酸分子可以是线性核酸、质粒或载体。在某些情况下，抗CD166 ICD抗体或抗原结合多肽组合物是溶液中的核酸，如溶液中的线性核酸、质粒或载体。用于储存核酸试剂的溶液是本领域已知的。本领域已知许多质粒和载体。例如，包含编码抗CD166 ICD抗体或抗原结合多肽的核酸序列的载体可以是表达载体，例如用于表达抗体或抗原结合多肽的载体。
根据本公开，可以使用本领域技术范围内的常规分子生物学、微生物学和重组DNA技术。这些技术描述于文献中(参见，例如，Sambrook，Fritsch&Maniatis，MolecularCloning：A Laboratory Manual，第二版(1989)Cold Spring Harbor Laboratory Press,Cold Spring Harbor,N.Y.；DNA Cloning:A Practical Approach，第I和II卷(D.N.Glover编，1985)；Oligonucleotide Synthesis(M.J.Gait编，1984)；Nucleic AcidHybridization(B.D.Hames和S.J.Higgins编，(1985))；Transcription And Translation(B.D.Hames&S.J.Higgins编，(1984))；Animal Cell Culture(R.I.Freshney编，(1986))；Immobilized Cells and Enzymes(IRL Press,(1986))；B.Perbal,A Practical Guide ToMolecular Cloning(1984)；F.M.Ausubel等(编),Current Protocols in MolecularBiology,John Wiley&Sons,Inc.(1994)。本领域已知多种用于构建含有编码抗体或多肽的核酸的表达载体的技术。已知的方法可用于构建含有抗体或多肽编码序列以及适当的转录和翻译控制信号的表达载体。这些方法包括，例如，体外重组DNA技术、合成技术和体内遗传重组。在某些实施方案中，表达载体可以通过常规技术转移到宿主细胞。包含表达载体的细胞可以通过常规技术培养以产生抗体或多肽。
本发明包括一种包含编码如本文公开的抗CD166 ICD抗体或抗原结合多肽的核酸分子的细胞。在各种实施方案中，所述细胞是真核细胞、哺乳动物细胞、真菌细胞或细菌细胞。在某些实施方案中，细胞是大肠杆菌细胞、酵母细胞、蝇细胞、灵长类动物细胞或人细胞。在各种实施方案中，细胞是用于表达抗CD166 ICD抗体或抗原结合多肽的细胞。在某些情况下，细胞是选自HEK293T、HEK293E、HEK293F、CHO、CHO DG44、CHO-K1和NSO的细胞系的细胞。本发明的细胞可以存在于本领域已知的任何培养基储存中。因此，本发明的细胞可以是例如培养中的活性细胞或冷冻细胞。
与抗CD166 ICD抗体或抗原结合多肽一起使用或包含的治疗剂的配制
在各种情况下，提供抗CD166 ICD抗体或抗原结合多肽以与治疗剂联合使用。例如，在特定的情况下，提供抗CD166 ICD抗体或抗原结合多肽以与治疗剂的施用或根据需要的任选施用联合用于诊断用途。
关于包含治疗剂的本发明的试剂盒，治疗剂可以药物组合物的形式提供。这样的药物治疗剂组合物可适用于例如预防和/或治疗病况或疾病。治疗剂组合物可通过本领域技术人员已知的方法(例如，如Remington’s Pharmaceutical Sciences，第17版，AlfonsoR.Gennaro编，宾夕法尼亚州伊斯顿的Mack Publishing Company(1985)中所述)来配制。
可基于待治疗的病况或疾病以及受试者的年龄和状况选择合适的施用手段。治疗剂组合物的单剂量可以在0.001至1000mg/kg体重的范围内选择，但不限于此。治疗剂组合物的单剂量可以在0.001至100000mg/kg体重的范围内选择，但不限于此。施用剂量和方法可以根据患者的体重、年龄、状况等改变，并且可以根据需要由本领域技术人员适当地选择。
在各种情况下，治疗剂组合物可被配制成包含药学上可接受的载剂或赋形剂。药学上可接受的载剂的实例包括但不限于生理上相容的任何和所有溶剂、分散介质、包衣、抗细菌和抗真菌剂、等渗剂和吸收延迟剂等。本发明的组合物可以包含药学上可接受的盐，例如酸加成盐或碱加成盐。
在各种实施方案中，可根据常规药学实践，使用注射用蒸馏水作为媒介物，配制包含如本文所述的治疗剂的组合物，例如注射用无菌制剂。例如，生理盐水或含有葡萄糖和其他补充剂如D-山梨糖醇、D-甘露糖、D-甘露糖醇和氯化钠的等渗溶液可以任选地与以下合适的增溶剂组合用作注射用水溶液：例如，醇如乙醇和多元醇如丙二醇或聚乙二醇，及非离子表面活性剂如聚山梨醇酯80TM、HCO-50等。
如本文所公开，治疗剂组合物可呈本领域已知的任何形式。这样的形式包括，例如液体、半固体和固体剂型，如液体溶液(例如，可注射和可输注的溶液)、分散体或悬浮液、片剂、丸剂、粉剂、脂质体和栓剂。
任何特定形式的选择或使用可部分地取决于预期施用模式和治疗应用。例如，含有预期用于全身或局部递送的组合物的组合物可呈可注射或可输注溶液的形式。因此，治疗剂组合物可被配制用于通过肠胃外模式(例如，静脉内、皮下、腹膜内或肌内注射)施用。如本文所用，肠胃外施用是指除了肠内和局部施用之外的施用模式，通常通过注射进行，并且包括但不限于静脉内、鼻内、眼内、肺部、肌内、动脉内、鞘内、囊内、眶内、心内、皮内、肺内、腹膜内、经气管、皮下、表皮下、关节内、囊下、蛛网膜下、脊柱内、硬膜外、脑内、颅内、颈动脉内和胸骨内注射和输注。
肠胃外施用途径可以是例如注射施用、经鼻施用、经肺施用或经皮施用。施用可以是全身的或局部的，通过静脉内注射、肌内注射、腹膜内注射、皮下注射进行。
在各种实施方案中，本发明的治疗剂组合物可被配制成溶液、微乳液、分散体、脂质体或适于在高浓度下稳定储存的其他有序结构。可通过以下操作来制备无菌可注射溶液：将所需量的本文所述的组合物与上文所列成分中的一种或其组合一起并入适当的溶剂中，随后根据需要进行过滤灭菌。通常，通过将本文所述的组合物并入含有基础分散介质和来自上文所列的那些的其他所需成分的无菌媒介物中来制备分散体。在无菌粉末用于制备无菌可注射溶液的情况下，制备方法包括真空干燥和冷冻干燥，产生本文所述的组合物加上来自其先前无菌-过滤溶液的任何另外所需成分(参见下文)的粉末。可例如通过使用包衣如卵磷脂、在分散体的情况下通过维持所需粒度以及通过使用表面活性剂来维持溶液的适当流动性。可注射组合物的延长吸收可通过在组合物中包含延迟吸收的试剂来实现，所述试剂例如为单硬脂酸盐和明胶。
治疗剂组合物可以可注射制剂的形式胃肠外施用，所述制剂包含在水或另一种药学上可接受的液体中的无菌溶液或悬浮液。例如，治疗剂组合物可通过以下操作来配制：将治疗分子与药学上可接受的媒介物或介质如无菌水和生理盐水、植物油、乳化剂、悬浮剂、表面活性剂、稳定剂、调味赋形剂、稀释剂、媒介物、防腐剂、粘合剂适当组合，然后以一般可接受的药学实践所需的单位剂型混合。药物制剂中包含的治疗剂的量使得提供指定范围内的合适剂量。油性液体的非限制性实例包括芝麻油和大豆油，并且其可以与苯甲酸苄酯或苄醇组合作为增溶剂。可以包含的其他项目是缓冲剂如磷酸盐缓冲剂或乙酸钠缓冲剂，安抚剂如盐酸普鲁卡因，稳定剂如苄醇或苯酚，和抗氧化剂。配制的注射剂可以包装在合适的安瓿中。
在一些实施方案中，治疗剂组合物可被配制用于在低于0℃的温度(例如，-20℃或-80℃)下储存。在一些实施方案中，所述组合物可被配制用于在2-8℃(例如，4℃)下储存长达2年(例如，一个月、两个月、三个月、四个月、五个月、六个月、七个月、八个月、九个月、10个月、11个月、1年、11/2年或2年)。因此，在一些实施方案中，本文所述的组合物在2-8℃(例如，4℃)下稳定储存至少1年。
在特定情况下，治疗剂组合物可被配制成溶液。在一些实施方案中，组合物可被配制为例如合适的浓度且适合在2-8℃(例如4℃)下储存的缓冲溶液。
包含如本文所述的治疗剂的组合物可被配制在免疫脂质体组合物中。这样的制剂可通过本领域已知的方法制备。具有增加的循环时间的脂质体公开在例如美国专利号5,013,556中。
在某些实施方案中，组合物可以用载剂配制，所述载剂将保护化合物不被快速释放，如控制释放制剂，其包括植入物和微囊包封的递送系统。可以使用可生物降解、生物相容的聚合物，如乙烯乙酸乙烯酯、聚酐、聚乙醇酸、胶原、聚原酸酯、和聚乳酸。制备这样的制剂的许多方法是本领域已知的。参见，例如J.R.Robinson(1978)“Sustained andControlled Release Drug Delivery Systems,”Marcel Dekker,Inc.,New York。
在一些实施方案中，组合物可被配制成适合对哺乳动物如人进行肺内施用(例如，用于通过吸入器或喷雾器施用)的组合物。配制这样的组合物的方法是本领域公知的。干粉吸入器制剂及适合施用所述制剂的系统也是本领域已知的。肺部施用可以是经口和/或经鼻。用于肺部递送的药物装置的实例包括定量吸入器、干粉吸入器(DPI)和喷雾器。例如，本文所述的组合物可以通过干粉吸入器的方式施用到受试者的肺部。这些吸入器是将可分散和稳定的干粉制剂递送到肺的无推进剂的装置。干粉吸入器在医药领域中是公知的，并且包括但不限于：
Figure BDA0002410652900000931
(AstraZeneca；英国伦敦)；
Figure BDA0002410652900000932
吸入器(
Figure BDA0002410652900000933
马萨诸塞州剑桥)；
Figure BDA0002410652900000934
(GlaxoS mithKline；英国伦敦)；和ECLIPSETM(Sanofi-Aventis；法国巴黎)。还参见例如PCT公布号WO 04/026380、WO 04/024156和WO 01/78693。DPI装置已经用于多肽如胰岛素和生长激素的肺部施用。在一些实施方案中，本文所述的组合物可以通过定量吸入器肺内施用。这些吸入器依靠推进剂将离散剂量的化合物递送到肺。另外的装置和肺内施用方法在例如美国专利申请公布号20050271660和20090110679中有所描述，其各自的公开内容通过引用整体并入本文。
在一些实施方案中，治疗剂组合物可被配制成例如以药学上可接受的溶液、悬浮液或软膏的形式递送至眼睛。用于治疗眼睛的制剂可呈无菌水溶液的形式，其含有例如另外的成分，如但不限于防腐剂、缓冲剂、张力剂、抗氧化剂和稳定剂、非离子润湿剂或澄清剂、和增粘剂。如本文所述的制剂可通过常规方法例如以滴剂的形式局部施用到需要治疗的受试者(例如，患有AMD的受试者)的眼睛，或通过将眼睛浸浴在含有一种或多种组合物的治疗溶液中来施用。
在某些实施方案中，用于将药物引入眼睛的玻璃体腔的多种装置可适于施用如本文所述的组合物。例如，美国公布号2002/0026176描述了一种含药的塞子，其可以通过巩膜插入，从而伸入玻璃体腔中以将药剂递送到玻璃体腔中。在另一实例中，美国专利号5,443,505描述了一种可植入装置，其用于引入脉络膜上腔或无血管区域中，以将药物持续释放到眼睛内部。美国专利号5,773,019和6,001,386各自公开了一种可连接到眼睛的巩膜表面的可植入药物递送装置。用于将治疗剂递送至眼睛的另外方法和装置(例如，经巩膜贴剂和经由接触镜递送)描述在例如Ambati和Adamis(2002)Prog Retin Eye Res 21(2):145-151；Ranta和Urtti(2006)Adv Drug Delivery Rev 58(11):1164-1181；Barocas和Balachandran(2008)Expert Opin Drug Delivery 5(1):1-10(10)；Gulsen和Chauhan(2004)Invest Opthalmol Vis Sci 45:2342-2347；Kim等(2007)Ophthalmic Res 39:244-254；以及PCT公布号WO 04/073551中，其公开内容通过引用整体并入本文。
在各种实施方案中，皮下施用可以借助于装置如注射器、预填充注射器、自动注射器(例如，一次性或可重复使用的)、笔式注射器、贴片注射器、可穿戴注射器、具有皮下输注套件的移动注射器输注泵或用于与抗体药物组合以进行皮下注射的其他装置完成。
在一些实施方案中，本文所述的治疗剂组合物可以通过局部施用的方式治疗性递送到受试者。如本文所用，“局部施用”或“局部递送”可指不依赖于治疗剂组合物或治疗剂通过血管系统输送到其预期靶组织或部位的递送。例如，治疗剂组合物可以通过注射或植入组合物或试剂或通过注射或植入含有所述组合物或试剂的装置来递送。在某些实施方案中，在靶组织或部位附近局部施用后，所述组合物或试剂或其一种或多种组分可以扩散到不是施用部位的预期靶组织或部位。
在一些实施方案中，本文提供的组合物以单位剂型存在，所述单位剂型可适于自我施用。这种单位剂型可以提供在容器内，通常例如小瓶、药筒、预填充注射器或一次性笔内。还可以例如与如本文所述的注射系统一起使用给药器，如美国专利号6,302,855中描述的给药器装置。
本文所述的治疗剂组合物的合适剂量可以取决于多种因素，所述因素包括例如待治疗的受试者的年龄、性别和体重，待治疗的病况或疾病，及所用的特定治疗剂，所述剂量能够治疗或预防受试者的病症。影响向受试者施用的剂量的其他因素包括例如病况或疾病的类型或严重性。其他因素可以包括例如同时或之前影响受试者的其他医学病症、受试者的一般健康状况、受试者的遗传倾向、饮食、施用时间、排泄速率、药物组合、及施用于受试者的任何其他另外的治疗剂。还应理解，用于任何特定受试者的具体剂量和治疗方案也可以基于执业医生的判断来调整。
本文所述的治疗剂组合物可以固定剂量或毫克/千克(mg/kg)剂量施用。尽管不想以任何方式进行限制，抗体治疗剂的示例性剂量包括例如1-1000mg/kg、1-100mg/kg、0.5-50mg/kg、0.1-100mg/kg、0.5-25mg/kg、1-20mg/kg和1-10mg/kg。本文所述的组合物的示例性剂量包括但不限于0.1mg/kg、0.5mg/kg、1.0mg/kg、2.0mg/kg、4mg/kg、8mg/kg或20mg/kg。
治疗剂溶液可包含治疗有效量的本文所述的组合物。本领域普通技术人员可部分地基于所施用组合物的效果或组合物与一种或多种另外的活性剂(如果使用多于一种活性剂)的组合效果容易地确定这样的有效量。治疗有效量可以是治疗有益效果超过组合物的任何毒性或有害效果的量。
试剂盒
本发明包括一种试剂盒，其包含以下中的一种或多种：(a)抗CD166 ICD抗体或抗原结合多肽；(b)一种或多种用于能够检测抗CD166 ICD抗体或抗原结合多肽与CD166的结合的技术中的试剂；(c)治疗剂；(d)一种或多种用于施用治疗性抗体或抗原结合多肽的试剂(c)用于能够检测抗CD166 ICD抗体或抗原结合多肽与CD166的结合的技术的说明书；和/或(d)用于向受试者施用治疗性抗体或抗原结合多肽的说明书。
在各种实施方案中，本发明的试剂盒可以包含本文公开的任何抗CD166 ICD抗体或抗原结合多肽。在特定的实施方案中，抗CD166 ICD抗体或抗原结合多肽是与可检测部分缔合的抗CD166 ICD抗体或抗原结合多肽。在特定的实施方案中，抗CD166 ICD抗体或抗原结合多肽是与治疗性部分缔合的抗CD166 ICD抗体或抗原结合多肽。
在各种实施方案中，本发明的试剂盒可以包含一种或多种用于能够检测如本文公开或本领域已知的抗CD166 ICD抗体或抗原结合多肽与CD166的结合的技术中的试剂。在某些情况下，用于能够检测抗CD166 ICD抗体或抗原结合多肽与CD166的结合的技术的试剂是二抗。在某些非限制性实例中，抗CD166 ICD抗体或抗原结合多肽是人抗CD166 ICD抗体或抗原结合多肽，并且所述二抗是抗人二抗。在某些非限制性实例中，抗CD166 ICD抗体或抗原结合多肽是小鼠抗CD166 ICD抗体或抗原结合多肽，并且所述二抗是抗小鼠二抗。在某些非限制性实例中，抗CD166 ICD抗体或抗原结合多肽是兔抗CD166 ICD抗体或抗原结合多肽，并且所述二抗是抗兔二抗。在某些非限制性实例中，抗CD166 ICD抗体或抗原结合多肽是仓鼠抗CD166 ICD抗体或抗原结合多肽，并且所述二抗是抗仓鼠二抗。在某些非限制性实例中，抗CD166 ICD抗体或抗原结合多肽是山羊抗CD166 ICD抗体或抗原结合多肽，并且所述二抗是抗山羊二抗。在某些非限制性实例中，抗CD166 ICD抗体或抗原结合多肽是绵羊抗CD166 ICD抗体或抗原结合多肽，并且所述二抗是抗绵羊二抗。在某些非限制性实例中，抗CD166 ICD抗体或抗原结合多肽是马抗CD166 ICD抗体或抗原结合多肽，并且所述二抗是抗马二抗。在某些非限制性实例中，抗CD166 ICD抗体或抗原结合多肽是豚鼠抗CD166 ICD抗体或抗原结合多肽，并且所述二抗是抗豚鼠二抗。在某些非限制性实例中，抗CD166 ICD抗体或抗原结合多肽是鸡抗CD166 ICD抗体或抗原结合多肽，并且所述二抗是抗鸡二抗。
在某些情况下，用于能够检测抗CD166 ICD抗体或抗原结合多肽与CD166的结合的技术的试剂是核染色试剂。在某些情况下，用于能够检测抗CD166 ICD抗体或抗原结合多肽与CD166的结合的技术的试剂是封闭缓冲液。在某些情况下，用于能够检测抗CD166 ICD抗体或抗原结合多肽与CD166的结合的技术的试剂是洗涤缓冲液。在某些情况下，用于能够检测抗CD166 ICD抗体或抗原结合多肽与CD166的结合的技术的试剂是封固介质。在可检测部分是酶的各种情况下，本发明的试剂盒可以包含所述酶的底物作为用于能够检测抗CD166ICD抗体或抗原结合多肽与CD166的结合的技术中的试剂。在可检测部分是酶底物的各种情况下，本发明的试剂盒可以包含与所述底物相互作用的酶作为用于能够检测抗CD166 ICD抗体或抗原结合多肽与CD166的结合的技术中的试剂。
在各种实施方案中，本发明的试剂盒可以包含治疗剂，例如治疗性抗体或抗原结合多肽。在某些情况下，治疗性抗体或抗原结合多肽是可活化抗体或抗原结合多肽。在某些情况下，治疗性抗体或抗原结合多肽是与治疗性部分缔合的治疗性抗体或抗原结合多肽(例如，可活化抗体或抗原结合多肽)。
在某些情况下，治疗性抗体或抗原结合多肽是治疗性抗CD166抗体或抗原结合多肽。在某些情况下，治疗性抗CD166抗体或抗原结合多肽是可活化抗体或抗原结合多肽。在特定的实施方案中，治疗性抗CD166抗体或抗原结合多肽是与治疗性部分缔合的抗CD166抗体或抗原结合多肽(和/或抗CD166可活化抗体或抗原结合多肽)。
在某些情况下，治疗性抗体或抗原结合多肽是特异性结合至免疫检查点蛋白的治疗性抗体或抗原结合多肽。在某些情况下，治疗性抗体或抗原结合多肽是抗PD-1抗体或抗原结合多肽。在某些情况下，治疗性抗PD-1抗体或抗原结合多肽是可活化抗体或抗原结合多肽。在特定的实施方案中，治疗性抗PD-1抗体或抗原结合多肽是与治疗性部分缔合的抗PD-1抗体或抗原结合多肽(和/或抗PD-1可活化抗体或抗原结合多肽)。在某些情况下，治疗性抗体或抗原结合多肽是抗PD-L1抗体或抗原结合多肽。在某些情况下，治疗性抗PD-L1抗体或抗原结合多肽是可活化抗体或抗原结合多肽。在特定的实施方案中，治疗性抗PD-L1抗体或抗原结合多肽是与治疗性部分缔合的抗PD-L1抗体或抗原结合多肽(和/或抗PD-L1可活化抗体或抗原结合多肽)。
实施例
以下实施例尤其证明了如本文公开的某些抗CD166 ICD抗体或抗原结合多肽的鉴定、序列和应用。
实施例1：抗人CD166抗体的产生和表征
设计本文提供的研究以产生本公开的某些抗人CD166(hCD166)小鼠单克隆抗体。本文提供的抗hCD166抗体是在小鼠中针对人CD166而产生。本领域的普通技术人员理解在小鼠中产生抗hCD166抗体的难点。
本公开的抗hCD166小鼠单克隆抗体是使用小鼠杂交瘤技术获得。使用马来酰亚胺化学将来源于人CD166的C-末端胞内结构域的两种肽与钥孔戚血蓝素(KLH)缀合。这两种肽对应于人CD166的氨基酸残基550至569(YMKKSKTASKHVNKDLGNME；“肽A”；SEQ ID NO:64)和氨基酸残基565至583(LGNMEENKKLEENNHKTEA；“肽B”；SEQ ID NO:66)。每种肽还包含另外的N-末端半胱氨酸残基以允许马来酰亚胺缀合。在第一轮中，用两种肽分别免疫五只小鼠。随后在第二轮中用减少量的肽抗原免疫另外三只小鼠。
在第一轮中免疫的五只小鼠中，通过尾血筛选测定一只小鼠(1号小鼠)以确定其对两种靶肽的抗体效价。通过ELISA(100ng/孔的肽A或B，具有0.9mg/mL BSA)确定效价。1号小鼠的第一尾血的结果示于下表1中。
表1：1号小鼠第一尾血的ELISA
Figure BDA0002410652900000981
Figure BDA0002410652900000991
*阴性对照＝在1％乳/PBS中的初始血清(1:1,000)
在第二轮免疫的三只小鼠中，通过尾血筛选测定两只小鼠(2号小鼠和3号小鼠)以确定针对每种靶肽(SEQ ID NO:64和SEQ ID NO:66)的抗体效价。通过ELISA(200ng/孔的肽A或B，具有0.9mg/mL BSA)确定效价。这两只小鼠的第一尾血的结果示于下表2中。
表2：2号小鼠和3号小鼠第一尾血的ELISA
Figure BDA0002410652900000992
*阴性对照＝1％乳/PBS中的初始血清(1:1,000)
**阳性对照＝1％乳/PBS中的1号小鼠第一尾血血清(1:1,000)
用减少剂量的肽A和肽B加强1号小鼠以提高抗体的效价。对1号小鼠进行第二尾血测定，以确定其针对两种靶肽的抗体效价。通过ELISA(100ng/孔的肽A或B，具有0.9mg/mLBSA)确定效价。1号小鼠的第二尾血的结果示于下表3中。
表3：1号小鼠第二尾血的ELISA
Figure BDA0002410652900001001
*阴性对照＝3％乳/PBS中的初始血清(1:1,000)
**阳性对照＝3％乳/PBS中的1号小鼠第一尾血血清(1:1,000)
根据本领域已知的方法，将来自2号小鼠和3号小鼠各自的B细胞以组合方式融合以产生杂交瘤。克隆杂交瘤，并使用偶联至辣根过氧化物酶(HRP)的山羊抗IgGγ链特异性二抗(Millipore，目录号AP503P)，使用直接EIA形式，针对每种人CD166衍生的肽筛选约1100种克隆的上清液。在初始筛选后，选择136种克隆用于进一步的验证筛选，其中选择四十(40)种克隆用于扩增。在Octet RED96系统(Pall ForteBio)和ELISA(200ng/孔的肽A或肽B，具有0.9mg/mL BSA)中使用抗小鼠传感器测定扩增的克隆的小鼠IgG水平。候选物包括Ab1(本文也称为“示例抗CD166 ICD抗体1”)、Ab2(本文也称为“示例抗CD166 ICD抗体2”)、Ab3、Ab4、Ab5、Ab6、Ab7和Ab8。选择下表4中所示的五种候选物(Ab1、Ab2、Ab3、Ab4和Ab5)。
表4：扩增的杂交瘤克隆上清液的ELISA和IgG表达
Figure BDA0002410652900001002
Figure BDA0002410652900001011
*阴性对照＝1％乳/PBS中的生长培养基(1:1,000)
**阳性对照＝1％乳/PBS中的1号小鼠的心脏血清(1:1,000)
对两种候选抗体进行测序。代表性序列如下：
Ab2轻链；氨基酸序列(N-C)：SEQ ID NO:32
Ab2轻链；核苷酸序列(5’-3’)：SEQ ID NO:37
Ab2轻链；核苷酸序列(5’-3’)：SEQ ID NO:72
Ab2重链；氨基酸序列(N-C)：SEQ ID NO:22
Ab2重链；核苷酸序列(5’-3’)：SEQ ID NO:27
Ab2重链；核苷酸序列(5’-3’)：SEQ ID NO:71
Ab1轻链；氨基酸序列(N-C)：SEQ ID NO:12
Ab1轻链；核苷酸序列(5’-3’)：SEQ ID NO:17
Ab1轻链；核苷酸序列(5’-3’)：SEQ ID NO:70
Ab1重链；氨基酸序列(N-C)：SEQ ID NO:2
Ab1重链；核苷酸序列(5’-3’)：SEQ ID NO:7
Ab1重链；核苷酸序列(5’-3’)：SEQ ID NO:69
实施例2：抗hCD166杂交瘤上清液对肿瘤细胞系的筛选
本实施例显示，具有本公开的抗hCD166小鼠单克隆抗体的杂交瘤上清液可以使用免疫组织化学(IHC)染色检测人肿瘤细胞系中的人CD166。
如图1-4的示例性IHC图像所示，使用标准流程制备并封闭福尔马林固定的石蜡包埋(FFPE)的人肿瘤细胞系(三阴性乳腺癌源细胞系HCC 1806和乳腺导管癌源细胞系BT-20)，然后在室温下与所指示的杂交瘤上清液(本公开的Ab3、Ab6、Ab2、Ab1、Ab5、Ab7、Ab4或Ab8)在10μg/mL IgG下一起孵育60分钟。作为对照，FFPE样品也与5μg/mL的
Figure BDA0002410652900001021
EPR2759(2)/ab109215抗hCD166兔单克隆抗体一起孵育。结合的一抗的检测通过以下步骤进行：后续与生物素化-缀合的抗小鼠IgG抗体(对于杂交瘤上清液)或生物素化-缀合的抗兔IgG抗体(对于
Figure BDA0002410652900001022
抗体)一起孵育，然后添加抗生物素蛋白-辣根过氧化物酶(HRP)(Vectastain Elite ABC HRP试剂盒，Vector Laboratories)以形成抗生物素蛋白-生物素-HRP复合物，随后添加3,3'-二氨基联苯胺底物(DAB Plus，Dako)。用苏木精(FisherScientific)对组织进行复染。
图1-3中示出的所有杂交瘤上清液显示HCC1806细胞系的染色，已知HCC1806细胞系表达人CD166，信号强度至少与
Figure BDA0002410652900001023
EPR2759(2)/ab109215兔单克隆抗体相当。杂交瘤上清液没有显著染色BT-20，方式也以与
Figure BDA0002410652900001024
EPR2759(2)/ab109215抗体观察到的信号缺失相当。
实施例3：抗hCD166抗体与正常人组织的结合
本实施例显示，本公开的抗hCD166小鼠单克隆抗体可以使用免疫组织化学(IHC)染色检测多种正常人组织中的人CD166。
如图5-10的示例性IHC图像所示，使用标准流程制备并封闭福尔马林固定的石蜡包埋的人组织样品(FFPE)，然后与5μg/mL从本公开的杂交瘤上清液纯化的抗hCD166小鼠单克隆抗体(克隆Ab2或Ab1)或商购获得的抗hCD166兔单克隆抗体(
Figure BDA0002410652900001034
EPR2759(2)/ab109215)一起孵育。本公开的抗hCD166小鼠单克隆抗体的检测通过以下步骤进行：后续与5μg/mL生物素化-缀合的抗小鼠IgG抗体(生物素-SP缀合的AffinityPure驴抗小鼠IgG H+L链，Jackson Immunoresearch-)一起孵育，接着添加抗生物素蛋白-辣根过氧化物酶(HRP)(Vectastain Elite ABC HRP试剂盒，Vector Laboratories)以形成抗生物素蛋白-生物素-HRP复合物，随后添加3,3'-二氨基联苯胺底物(DAB Plus，Dako)。用苏木精(FisherScientific)对组织进行复染。
图5-10中所示的本公开的纯化的抗hCD166小鼠单克隆抗体(克隆Ab2或Ab1)显示，以与
Figure BDA0002410652900001035
EPR2759(2)/ab109215抗CD166兔单克隆抗体相似的分布对人组织染色。
实施例4：抗hCD166抗体与正常人组织的结合
本实施例显示，本公开的抗hCD166小鼠单克隆抗体可以使用免疫组织化学(IHC)染色，以比商购获得的抗hCD166抗体低的浓度检测正常人组织中的人CD166。
如图11的示例性IHC图像中所示，使用标准流程制备并封闭福尔马林固定的石蜡包埋的人前列腺组织(hCD166阳性)或胎盘组织(hCD166阴性)，然后与1μg/mL本公开的纯化的重组Ab1抗hCD166小鼠单克隆抗体或5μg/mL商购获得的抗hCD166兔单克隆抗体(
Figure BDA0002410652900001031
EPR2759(2)/ab109215)一起孵育。重组Ab1抗hCD166小鼠单克隆抗体或
Figure BDA0002410652900001032
的检测通过以下步骤进行：后续与生物素化-缀合的抗小鼠或抗兔IgG抗体一起孵育，然后添加抗生物素蛋白-辣根过氧化物酶(HRP)以形成抗生物素蛋白-生物素-HRP复合物，随后添加3,3'-二氨基联苯胺底物，使用EXPOSE小鼠和兔特异性HRP/DAB IHC试剂盒(
Figure BDA0002410652900001033
目录号ab80436)或Intellipath FLX Universal HRP检测试剂盒(BiocareMedical SKU IPK5011G80；“Biocare”)。用苏木精(Fisher Scientific)对组织进行复染。
图11显示与较高浓度(5μg/mL)的
Figure BDA0002410652900001042
EPR2759(2)/ab109215抗hCD166兔抗体相比，用较低浓度(1μg/mL)的本公开的重组Ab1抗hCD166小鼠单克隆抗体容易检测人CD166。
实施例5：通过抗hCD166抗体检测细胞裂解物中的人CD166
本实施例显示，本公开的抗hCD166小鼠单克隆抗体可以检测来源于人肿瘤细胞系的裂解物中的人CD166。
如图12的示例性蛋白质印迹图像中所示，使用蛋白质印迹分析，使用从本公开的杂交瘤上清液纯化的Ab1抗hCD166小鼠单克隆抗体、
Figure BDA0002410652900001041
EPR2759(2)/ab109215抗hCD166兔单克隆抗体、BD Biosciences 3A6抗hCD166小鼠单克隆抗体(目录号559263)或抗肌动蛋白抗体对照分析从所指示的人肿瘤细胞系分离的细胞裂解物。
图12显示通过本公开的Ab1抗hCD166单克隆抗体容易检测在人细胞裂解物中的人CD166。
实施例6：多个转移性癌样品中的CD166表达
本实施例显示，通过免疫组织化学(IHC)染色，使用抗CD166抗体证明CD166在大量和多种患者源转移性肿瘤中表达。
图13显示，使用商业购买的抗CD166抗体(
Figure BDA0002410652900001043
EPR2759(2)/ab109215)在多个患者源肿瘤组织微阵列(TMA)上的IHC染色证明人CD166在大量和多种患者源转移性肿瘤样品中有中等或高度表达。图13显示，TMA的CD166的IHC染色水平的汇总示出了来源于多个患者源转移性样品的大量核心显示出强CD166信号。
图13显示可以使用本公开的抗hCD166小鼠单克隆抗体测定大量和多种患者源转移性肿瘤样品中的CD166水平。
序列
应当理解，下述氨基酸序列中的“X”代表可以包括任何单个氨基酸的氨基酸位置。应当理解，下述氨基酸序列中的“X”在某些实施方案中代表可以包括天冬氨酸(D)残基或天冬酰胺(E)残基的氨基酸位置。应当理解，下述核酸序列中的“X”代表可以包括任何单个核酸的核酸位置。
SEQ ID NO:1
示例性抗CD166 ICD抗体序列1：
重链氨基酸序列(IgG1)
Figure BDA0002410652900001051
SEQ ID NO:2
示例性抗CD166 ICD抗体序列1：
重链可变结构域氨基酸序列
Figure BDA0002410652900001052
SEQ ID NO:3
示例性抗CD166 ICD抗体序列1：
重链CDR1氨基酸序列
DYYMH
SEQ ID NO:4
示例性抗CD166 ICD抗体序列1：
重链CDR2氨基酸序列
KIDPENGETKYAPKFQG
SEQ ID NO:5
示例性抗CD166 ICD抗体序列1：
重链CDR3氨基酸序列
EGFMDY
SEQ ID NO:6
示例性抗CD166 ICD抗体序列1：
重链DNA序列
Figure BDA0002410652900001071
SEQ ID NO:7
示例性抗CD166 ICD抗体序列1：
重链可变区DNA序列
Figure BDA0002410652900001081
SEQ ID NO:8
示例性抗CD166 ICD抗体序列1：
重链CDR1 DNA序列
GATTACTATATGCAT
SEQ ID NO:9
示例性抗CD166 ICD抗体序列1：
重链CDR2 DNA序列
AAAATTGACCCCGAAAATGGTGAAACAAAATACGCCCCGAAGTTTCAAGGA
SEQ ID NO:10
示例性抗CD166 ICD抗体序列1：
重链CDR3 DNA序列
GAAGGATTCATGGACTAC
SEQ ID NO:69
示例性抗CD166 ICD抗体序列1：
重链可变区DNA序列
Figure BDA0002410652900001091
SEQ ID NO:11
示例性抗CD166 ICD抗体序列1：
轻链氨基酸序列
Figure BDA0002410652900001092
SEQ ID NO:12
示例性抗CD166 ICD抗体序列1：
轻链可变结构域氨基酸序列
Figure BDA0002410652900001093
SEQ ID NO:13
示例性抗CD166 ICD抗体序列1：
轻链CDR1氨基酸序列
RSSQSLVHSNGNTYLH
SEQ ID NO:14
示例性抗CD166 ICD抗体序列1：
轻链CDR2氨基酸序列
KVSNRFS
SEQ ID NO:15
示例性抗CD166 ICD抗体序列1：
轻链CDR3氨基酸序列
SQSTFVPLT
SEQ ID NO:16
示例性抗CD166 ICD抗体序列1：
轻链DNA序列
Figure BDA0002410652900001101
SEQ ID NO:17
示例性抗CD166 ICD抗体序列1：
轻链可变区DNA序列
Figure BDA0002410652900001111
SEQ ID NO:18
示例性抗CD166 ICD抗体序列1：
轻链CDR1 DNA序列
CGGTCTAGTCAATCCCTCGTTCATTCCAACGGGAATACCTATTTGCAT
SEQ ID NO:19
示例性抗CD166 ICD抗体序列1：
轻链CDR2 DNA序列
AAAGTATCAAATCGATTTTCT
SEQ ID NO:20
示例性抗CD166 ICD抗体序列1：
轻链CDR3 DNA序列
AGCCAATCCACGTTTGTACCACTCACA
SEQ ID NO:70
示例性抗CD166 ICD抗体序列1：
轻链可变区DNA序列
Figure BDA0002410652900001121
SEQ ID NO:21
示例性抗CD166 ICD抗体序列2：
重链氨基酸序列(IgG1)
Figure BDA0002410652900001122
SEQ ID NO:22
示例性抗CD166 ICD抗体序列2：
重链可变结构域氨基酸序列
Figure BDA0002410652900001131
SEQ ID NO:23
示例性抗CD166 ICD抗体序列2：
重链CDR1氨基酸序列
DYYMH
SEQ ID NO:24
示例性抗CD166 ICD抗体序列2：
重链CDR2氨基酸序列
KIDPEDGETKYAPKFQG
SEQ ID NO:25
示例性抗CD166 ICD抗体序列2：
重链CDR3氨基酸序列
EGFMDY
SEQ ID NO:26
示例性抗CD166 ICD抗体序列2：
重链DNA序列
Figure BDA0002410652900001141
SEQ ID NO:27
示例性抗CD166 ICD抗体序列2：
重链可变区DNA序列
Figure BDA0002410652900001151
SEQ ID NO:28
示例性抗CD166 ICD抗体序列2：
重链CDR1 DNA序列
GACTACTATATGCAT
SEQ ID NO:29
示例性抗CD166 ICD抗体序列2：
重链CDR2 DNA序列
AAGATTGATCCAGAAGACGGTGAAACCAAATATGCCCCGAAATTTCAGGGT
SEQ ID NO:30
示例性抗CD166 ICD抗体序列2：
重链CDR3 DNA序列
GAGGGGTTCATGGACTAC
SEQ ID NO:71
示例性抗CD166 ICD抗体序列2：
重链可变区DNA序列
Figure BDA0002410652900001161
SEQ ID NO:31
示例性抗CD166 ICD抗体序列2：
轻链氨基酸序列
Figure BDA0002410652900001162
SEQ ID NO:32
示例性抗CD166 ICD抗体序列2：
轻链可变结构域氨基酸序列
Figure BDA0002410652900001163
SEQ ID NO:33
示例性抗CD166 ICD抗体序列2：
轻链CDR1氨基酸序列
RSSQSLVHSNGNTYLH
SEQ ID NO:34
示例性抗CD166 ICD抗体序列2：
轻链CDR2氨基酸序列
KVSNRFS
SEQ ID NO:35
示例性抗CD166 ICD抗体序列2：
轻链CDR3氨基酸序列
SQSTHVPLT
SEQ ID NO:36
示例性抗CD166 ICD抗体序列2：
轻链DNA序列
Figure BDA0002410652900001171
SEQ ID NO:37
示例性抗CD166 ICD抗体序列2：
轻链可变区DNA序列
Figure BDA0002410652900001181
SEQ ID NO:38
示例性抗CD166 ICD抗体序列2：
轻链CDR1 DNA序列
CGGAGTTCTCAGTCTCTTGTCCATAGTAATGGGAATACCTATCTGCAC
SEQ ID NO:39
示例性抗CD166 ICD抗体序列2：
轻链CDR2 DNA序列
AAAGTCTCAAACAGGTTTAGT
SEQ ID NO:40
示例性抗CD166 ICD抗体序列2：
轻链CDR3 DNA序列
TCTCAGAGTACGCATGTTCCGTTGACT
SEQ ID NO:72
示例性抗CD166 ICD抗体序列2：
轻链可变区DNA序列
Figure BDA0002410652900001191
SEQ ID NO:41
示例性抗CD166 ICD抗体1、2：
重链可变结构域共有氨基酸序列
Figure BDA0002410652900001192
SEQ ID NO:42
示例性抗CD166 ICD抗体1、2：
轻链可变结构域共有氨基酸序列
Figure BDA0002410652900001193
SEQ ID NO:43
示例性抗CD166 ICD抗体1、2：
HCDR2共有1
KIDPEXGETKYAPKFQG
SEQ ID NO:44
示例性抗CD166 ICD抗体1、2：
HCDR2共有2
KIDPE(Asx)GETKYAPKFQG
SEQ ID NO:45
示例性抗CD166 ICD抗体1、2：
LCDR3共有
SQSTXVPLT
SEQ ID NO:67
示例性抗CD166 ICD抗体1、2：
重链共有
Figure BDA0002410652900001201
SEQ ID NO:68
示例性抗CD166 ICD抗体1、2：
轻链共有
Figure BDA0002410652900001211
SEQ ID NO:46
示例性治疗性抗CD166 ICD序列：
重链氨基酸序列(IgG1)
Figure BDA0002410652900001212
SEQ ID NO:47
示例性治疗性抗CD166序列：
重链可变结构域氨基酸序列(1)
Figure BDA0002410652900001213
SEQ ID NO:48
示例性治疗性抗CD166序列：
重链可变结构域氨基酸序列(2)
Figure BDA0002410652900001221
SEQ ID NO:49
示例性治疗性抗CD166序列：
重链CDR1氨基酸序列
GFSLSTYGMGVG
SEQ ID NO:50
示例性治疗性抗CD166序列：
重链CDR2氨基酸序列
NIWWSEDKH
SEQ ID NO:51
示例性治疗性抗CD166序列：
重链CDR3氨基酸序列
IDYGNDY AFTY
SEQ ID NO:52
示例性治疗性抗CD166序列：
轻链氨基酸序列
Figure BDA0002410652900001231
SEQ ID NO:53
示例性治疗性抗CD166序列：
轻链可变结构域氨基酸序列(123)
Figure BDA0002410652900001232
SEQ ID NO:54
示例性治疗性抗CD166序列：
轻链可变结构域氨基酸序列(124)
Figure BDA0002410652900001233
SEQ ID NO:55
示例性治疗性抗CD166序列：
轻链可变结构域氨基酸序列(125)
Figure BDA0002410652900001234
SEQ ID NO:56
示例性治疗性抗CD166序列：
轻链可变结构域氨基酸序列(126)
Figure BDA0002410652900001241
SEQ ID NO:57
示例性治疗性抗CD166序列：
轻链CDR1氨基酸序列(1)
RSSKSLLHSNGITYLY
SEQ ID NO:58
示例性治疗性抗CD166序列：
轻链CDR1氨基酸序列(2)
RSSQSLLHSNGITYLY
SEQ ID NO:59
示例性治疗性抗CD166序列：
轻链CDR2氨基酸序列(1)
QMSNLAS
SEQ ID NO:60
示例性治疗性抗CD166序列：
轻链CDR2氨基酸序列(2)
QMSNRAS
SEQ ID NO:61
示例性治疗性抗CD166序列：
轻链CDR3氨基酸序列
AQNLELPYT
SEQ ID NO:62
CD166胞内结构域：
YMKKSKTASKHVNKDLGNMEENKKLEENNHKTEA
SEQ ID NO:63
CD166 ICD肽/表位1：
CYMKKSKTASKHVNKDLGNME
SEQ ID NO:64
CD166 ICD肽/表位2：
YMKKSKTASKHVNKDLGNME
SEQ ID NO:65
CD166 ICD肽/表位3：
CLGNMEENKKLEENNHKTEA
SEQ ID NO:66
CD166 ICD肽/表位4：
LGNMEENKKLEENNHKTEA
其他实施方案
虽然已经描述了本发明的许多实施方案，但是显然可以改变基本公开内容和实施例以提供利用本发明的化合物和方法的其他实施方案。因此，应当理解本发明的范围由所附的权利要求书限定，而不是由实施例所代表的具体实施方案限定。
本文引用的所有参考文献都通过引用并入本文。

Claims (151)

1.一种抗体或抗原结合多肽，其包含重链可变结构域，所述重链可变结构域包含以下区中的一种或多种：
(i)重链互补决定区1(HCDR1)，其包含与SEQ ID NO:3或SEQ ID NO:23在5个氨基酸位置中的5个、5个氨基酸位置中的4个、或5个氨基酸位置中的3个处相同的氨基酸序列；
(ii)重链互补决定区2(HCDR2)，其包含与SEQ ID NO:4、SEQ ID NO:24、SEQ ID NO:43或SEQ ID NO:44在17个氨基酸位置中的17个、17个氨基酸位置中的16个、17个氨基酸位置中的15个、17个氨基酸位置中的14个、17个氨基酸位置中的13个、或17个氨基酸位置中的12个处相同的氨基酸序列；以及
(iii)重链互补决定区3(HCDR3)，其包含与SEQ ID NO:5或SEQ ID NO:25在6个氨基酸位置中的6个、6个氨基酸位置中的5个、或6个氨基酸位置中的4个处相同的氨基酸序列。
2.如权利要求1所述的抗体或抗原结合多肽，其中所述抗体或抗原结合多肽包含轻链可变结构域，所述轻链可变结构域包含以下区中的一种或多种：
(i)轻链互补决定区1(LCDR1)，其包含与SEQ ID NO:13或SEQ ID NO:33在16个氨基酸位置中的16个、16个氨基酸位置中的15个、16个氨基酸位置中的14个、16个氨基酸位置中的13个、或16个氨基酸位置中的12个处相同的氨基酸序列；
(ii)轻链互补决定区2(LCDR2)，其包含与SEQ ID NO:14或SEQ ID NO:34在7个氨基酸位置中的7个、7个氨基酸位置中的6个、或7个氨基酸位置中的5个处相同的氨基酸序列；以及
(iii)轻链互补决定区3(LCDR3)，其包含与SEQ ID NO:15、SEQ ID NO:35或SEQ ID NO:45在9个氨基酸位置中的9个、9个氨基酸位置中的8个、或9个氨基酸位置中的7个处相同的氨基酸序列。
3.一种抗体或抗原结合多肽，其包含轻链可变结构域，所述轻链可变结构域包含以下区中的一种或多种：
(i)轻链互补决定区1(LCDR1)，其包含与SEQ ID NO:13或SEQ ID NO:33在16个氨基酸位置中的16个、16个氨基酸位置中的15个、16个氨基酸位置中的14个、16个氨基酸位置中的13个、或16个氨基酸位置中的12个处相同的氨基酸序列；
(ii)轻链互补决定区2(LCDR2)，其包含与SEQ ID NO:14或SEQ ID NO:34在7个氨基酸位置中的7个、7个氨基酸位置中的6个、或7个氨基酸位置中的5个处相同的氨基酸序列；以及
(iii)轻链互补决定区3(LCDR3)，其包含与SEQ ID NO:15、SEQ ID NO:35或SEQ ID NO:45在9个氨基酸位置中的9个、9个氨基酸位置中的8个、或9个氨基酸位置中的7个处相同的氨基酸序列。
4.如权利要求3所述的抗体或抗原结合多肽，其包含重链可变结构域。
5.如权利要求1-4中任一项所述的抗体或抗原结合多肽，其中所述重链可变结构域包含重链HCDR1，所述重链HCDR1包含SEQ ID NO:3或SEQ ID NO:23的氨基酸序列。
6.如权利要求1-5中任一项所述的抗体或抗原结合多肽，其中所述重链可变结构域包含重链HCDR2，所述重链HCDR2包含SEQ ID NO:4、SEQ ID NO:24、SEQ ID NO:43或SEQ IDNO:44的氨基酸序列。
7.如权利要求1-6中任一项所述的抗体或抗原结合多肽，其中所述重链可变结构域包含重链HCDR3，所述重链HCDR3包含SEQ ID NO:5或SEQ ID NO:25的氨基酸序列。
8.如权利要求1-7中任一项所述的抗体或抗原结合多肽，其中所述重链可变结构域包含与SEQ ID NO:2、SEQ ID NO:22或SEQ ID NO:41的氨基酸序列具有至少90％同一性的氨基酸序列。
9.如权利要求1-8中任一项所述的抗体或抗原结合多肽，其中所述重链可变结构域包含SEQ ID NO:2、SEQ ID NO:22或SEQ ID NO:41的氨基酸序列。
10.如权利要求2-9中任一项所述的抗体或抗原结合多肽，其中所述轻链可变结构域包含轻链LCDR1，所述轻链LCDR1包含SEQ ID NO:13、SEQ ID NO:33的氨基酸序列。
11.如权利要求2-10中任一项所述的抗体或抗原结合多肽，其中所述轻链可变结构域包含轻链LCDR2，所述轻链LCDR2包含SEQ ID NO:14或SEQ ID NO:34的氨基酸序列。
12.如权利要求2-11中任一项所述的抗体或抗原结合多肽，其中所述轻链可变结构域包含轻链LCDR3，所述轻链LCDR3包含SEQ ID NO:15、SEQ ID NO:35或SEQ ID NO:45的氨基酸序列。
13.如权利要求2-12中任一项所述的抗体或抗原结合多肽，其中所述轻链可变结构域包含与SEQ ID NO:12、SEQ ID NO:32或SEQ ID NO:42的氨基酸序列具有至少90％同一性的氨基酸序列。
14.如权利要求2-13中任一项所述的抗体或抗原结合多肽，其中所述轻链可变结构域包含SEQ ID NO:12、SEQ ID NO:32或SEQ ID NO:42的氨基酸序列。
15.如权利要求1-14中任一项所述的抗体或抗原结合多肽，其中所述抗体或抗原结合多肽特异性结合至CD166的C-末端胞内结构域内的表位。
16.如权利要求15所述的抗体或抗原结合多肽，其中所述CD166是哺乳动物CD166。
17.如权利要求15所述的抗体或抗原结合多肽，其中所述CD166是灵长类动物CD166。
18.如权利要求15所述的抗体或抗原结合多肽，其中所述CD166是人CD166。
19.如权利要求15所述的抗体或抗原结合多肽，其中所述抗体或抗原结合多肽特异性结合至SEQ ID NO:62、SEQ ID NO:64或SEQ ID NO:66内的表位。
20.一种抗体或抗原结合多肽，其特异性结合至CD166的C-末端胞内结构域内的表位。
21.如权利要求20所述的抗体或抗原结合多肽，其中所述抗体或抗原结合多肽特异性结合至SEQ ID NO:62、SEQ ID NO:64或SEQ ID NO:66内的表位。
22.如权利要求20或21所述的抗体或抗原结合多肽，其中所述抗体或抗原结合多肽与如权利要求1-19中任一项所述的抗体或抗原结合多肽特异性竞争。
23.如权利要求20或22所述的抗体或抗原结合多肽，其中所述抗体或抗原结合多肽结合表位，所述表位也被如权利要求1-19中任一项所述的抗体或抗原结合多肽结合。
24.如权利要求15-23中任一项所述的抗体或抗原结合多肽，其中所述抗体或抗原结合多肽与CD166的C-末端胞内结构域内的表位的KD是100nM至10pM、50nM至10pM、50nM至100pM、50nM至500pM、50nM至1nM、25nM至10pM、25nM至100pM、25nM至500pM、25nM至1nM、10nM至10pM、10nM至100pM、10nM至500pM或10nM至1nM。
25.如权利要求15-24所述的抗体或抗原结合多肽，其中所述抗体或抗原结合多肽与SEQ ID NO:62、SEQ ID NO:64或SEQ ID NO:66内的表位的KD为100nM至10pM、50nM至10pM、50nM至100pM、50nM至500pM、50nM至1nM、25nM至10pM、25nM至100pM、25nM至500pM、25nM至1nM、10nM至10pM、10nM至100pM、10nM至500pM或10nM至1nM。
26.如权利要求1-25中任一项所述的抗体或抗原结合多肽，其中所述抗体或抗原结合多肽是IgA、IgG、IgM、IgE或IgD抗体。
27.如权利要求26所述的抗体或抗原结合多肽，其中所述抗体是IgG抗体。
28.如权利要求27所述的抗体或抗原结合多肽，其中所述IgG抗体是IgG1、IgG2、IgG3或IgG4抗体。
29.如权利要求1-28中任一项所述的抗体或抗原结合多肽，其中所述抗体或抗原结合多肽包括融合蛋白。
30.如权利要求1-25中任一项所述的抗体或抗原结合多肽，其中所述抗原结合多肽是或包括Fab片段、Fab'片段、F(ab')2片段、Fd片段、Fd'片段、Fv片段、dAb片段、scFv、分离的HCDR区、分离的LCDR区、dsFv双抗体、scAb、单结构域重链抗体、单结构域轻链抗体、或单链抗体。
31.如权利要求1-30中任一项所述的抗体或抗原结合多肽，其中所述抗体或抗原结合多肽是小鼠抗体或抗原结合多肽、兔抗体或抗原结合多肽、或仓鼠抗体或抗原结合多肽。
32.如权利要求1-30中任一项所述的抗体或抗原结合多肽，其中所述抗体或抗原结合多肽是人源化或密码子优化的抗体或抗原结合多肽。
33.如权利要求1-30中任一项所述的抗体或抗原结合多肽，其中所述抗体或抗原结合多肽是嵌合的。
34.如权利要求1-33中任一项所述的抗体或抗原结合多肽，其中所述抗体或抗原结合多肽与试剂缀合。
35.如权利要求34所述的抗体或抗原结合多肽，其中所述试剂是可检测部分或治疗性部分。
36.如权利要求35所述的抗体或抗原结合多肽，其中所述标记是或包括生物素、酶报道分子、荧光标记、化学发光标记、体内成像剂、或放射性标记。
37.如权利要求36所述的抗体或抗原结合多肽，其中所述标记是或包括选自以下的酶报道分子：过氧化物酶、碱性磷酸酶(AP)、葡萄糖氧化酶、或β-半乳糖苷酶。
38.如权利要求36所述的抗体或抗原结合多肽，其中所述标记是或包括放射性标记，所述放射性标记包括锆-89(89Zr)、碘-124(124I)、碘-131(131I)、碘-125(125I)、铋-212(212Bi)、铋-213(213Bi)、砹-221(221At)、铜-67(67Cu)、铜-64(64Cu)、铼-186(186Re)、铼-188(188Re)、磷-32(32P)、钐-153(153Sm)、镥-177(177Lu)、锝-99m(99mTc)、镓-67(67Ga)、铟-111(111In)、或铊-201(201Tl)。
39.如权利要求1-38中任一项所述的抗体或抗原结合多肽，其中所述抗体或抗原结合多肽与药物缀合。
40.如权利要求39所述的抗体或抗原结合多肽，其中所述药物是细胞毒性剂、化疗剂、毒素、放射性核素。
41.一种组合物，其包含如权利要求1-40中任一项所述的抗体或抗原结合多肽。
42.如权利要求41所述的组合物，其还包含药学上可接受的载剂或赋形剂。
43.如权利要求41或42所述的组合物，其还包含CD166。
44.如权利要求43所述的组合物，其中所述CD166是哺乳动物CD166。
45.如权利要求44所述的组合物，其中所述CD166是灵长类动物CD166。
46.如权利要求45所述的组合物，其中所述CD166是人CD166。
47.如权利要求43至46中任一项所述的组合物，其中所述抗体或抗原结合多肽结合至所述CD166。
48.如权利要求41至47所述的组合物，其还包含二抗，所述二抗的特征在于能够结合至所述抗体或抗原结合多肽。
49.如权利要求48所述的组合物，其中所述二抗与试剂缀合。
50.如权利要求49所述的组合物，其中所述试剂是可检测部分。
51.如权利要求50所述的组合物，其中所述可检测部分是或包括生物素、酶报道分子、荧光标记、化学发光标记、体内成像剂、或放射性标记。
52.如权利要求50所述的组合物，其中所述可检测部分是或包括选自以下的酶报道分子：过氧化物酶、碱性磷酸酶(AP)、葡萄糖氧化酶、或β-半乳糖苷酶。
53.如权利要求50所述的组合物，其中所述可检测部分是或包括放射性标记，所述放射性标记包括锆-89(89Zr)、碘-124(124I)、碘-131(131I)、碘-125(125I)、铋-212(212Bi)、铋-213(213Bi)、砹-221(221At)、铜-67(67Cu)、铜-64(64Cu)、铼-186(186Re)、铼-188(188Re)、磷-32(32P)、钐-153(153Sm)、镥-177(177Lu)、锝-99m(99mTc)、镓-67(67Ga)、铟-111(111In)、或铊-201(201Tl)。
54.如权利要求41-53中任一项所述的组合物，其中所述抗体或抗原结合多肽与药物缀合。
55.如权利要求54所述的组合物，其中所述药物是细胞毒性剂、化疗剂、毒素、放射性核素。
56.如权利要求48至55所述的组合物，其中所述二抗结合至所述抗体或抗原结合多肽。
57.一种核酸序列，其包含编码如权利要求1-40中任一项所述的抗体或抗原结合多肽的重链可变结构域和/或轻链可变结构域的序列。
58.一种载体，其包含如权利要求57所述的核酸序列。
59.一种宿主细胞，其包含如权利要求57所述的核酸序列或如权利要求58所述的载体。
60.一种产生抗体或抗原结合多肽的方法，其包括在允许如权利要求59所述的宿主细胞表达所述抗体或抗原结合多肽的条件下培养所述宿主细胞。
61.如权利要求60所述的方法，其还包括分离所述抗体或抗原结合多肽。
62.一种试剂盒，其包含如权利要求1-40中任一项所述的抗体或抗原结合多肽。
63.如权利要求62所述的试剂盒，其还包含二抗，所述二抗的特征在于能够结合至所述抗体或抗原结合多肽。
64.如权利要求63所述的试剂盒，其中所述二抗与试剂缀合。
65.如权利要求64所述的试剂盒，其中所述试剂是可检测部分。
66.如权利要求65所述的试剂盒，其中所述可检测部分是或包括生物素、酶报道分子、荧光标记、化学发光标记、体内成像剂、或放射性标记。
67.如权利要求65所述的试剂盒，其中所述可检测部分是或包含选自以下的酶报道分子：过氧化物酶、碱性磷酸酶(AP)、葡萄糖氧化酶或β-半乳糖苷酶。
68.如权利要求65所述的试剂盒，其中所述可检测部分是或包括放射性标记，所述放射性标记包括锆-89(89Zr)、碘-124(124I)、碘-131(131I)、碘-125(125I)、铋-212(212Bi)、铋-213(213Bi)、砹-221(221At)、铜-67(67Cu)、铜-64(64Cu)、铼-186(186Re)、铼-188(188Re)、磷-32(32P)、钐-153(153Sm)、镥-177(177Lu)、锝-99m(99mTc)、镓-67(67Ga)、铟-111(111In)、或铊-201(201Tl)。
69.如权利要求62-68中任一项所述的试剂盒，其中所述抗体或抗原结合多肽与药物缀合。
70.如权利要求69所述的试剂盒，其中所述药物是细胞毒性剂、化疗剂、毒素、放射性核素。
71.如权利要求62至70中任一项所述的试剂盒，其还包含以下中的一种或多种：
(i)核染色试剂；
(ii)封闭缓冲液；
(iii)洗涤缓冲液；以及
(iv)封固介质。
72.如权利要求62至71中任一项所述的试剂盒，其还包含治疗剂。
73.如权利要求62至72中任一项所述的试剂盒，其还包含治疗性抗体或抗原结合多肽。
74.如权利要求73所述的试剂盒，其中所述治疗性抗体或抗原结合多肽特异性结合至免疫检查点蛋白。
75.如权利要求73或74所述的试剂盒，其中所述治疗性抗体或抗原结合多肽是抗PD-L1抗体或抗原结合多肽。
76.如权利要求73或74所述的试剂盒，其中所述治疗性抗体或抗原结合多肽是抗PD-1抗体或抗原结合多肽。
77.如权利要求73所述的试剂盒，其中所述治疗性抗体或抗原结合多肽是治疗性抗CD166抗体或抗原结合多肽。
78.如权利要求72至77中任一项所述的试剂盒，其中所述治疗性抗体或抗原结合多肽与试剂缀合。
79.如权利要求78所述的试剂盒，其中所述试剂是治疗性部分。
80.如权利要求77至79中任一项所述的试剂盒，其中所述治疗性抗体或抗原结合多肽是治疗性抗CD166抗体或抗原结合多肽，所述治疗性抗CD166抗体或抗原结合多肽包含：
(i)重链可变结构域，其包含以下区中的一种或多种：
(a)重链HCDR1，其与SEQ ID NO:49在12个氨基酸位置中的12个、12个氨基酸位置中的11个、或12个氨基酸位置中的10个处相同；
(b)重链HCDR2，其与SEQ ID NO:50在9个氨基酸位置中的9个、9个氨基酸位置中的8个、或9个氨基酸位置中的7处相同；以及
(c)重链HCDR3，其与SEQ ID NO:51在11个氨基酸位置中的11个、11个氨基酸位置中的10个、或11个氨基酸位置中的9个处相同；和/或
(ii)包含轻链可变结构域，其包含以下区中的一种或多种：
(a)轻链LCDR1，其与SEQ ID NO:57或SEQ ID NO:58在16个氨基酸位置中的16个、16个氨基酸位置中的15个、16个氨基酸位置中的14个、或16个氨基酸位置中的13个处相同；
(b)轻链LCDR2，其与SEQ ID NO:59或SEQ ID NO:60在7个氨基酸位置中的7个、7个氨基酸位置中的6个、或7个氨基酸位置中的5个处相同；以及
(c)轻链LCDR3，其与SEQ ID NO:61在9个氨基酸位置中的9个、9个氨基酸位置中的8个、或9个氨基酸位置中的7个处相同。
81.如权利要求77-80中任一项所述的试剂盒，其中所述治疗性抗体或抗原结合多肽包含重链可变结构域，所述重链可变结构域包含与SEQ ID NO:47或SEQ ID NO:48的氨基酸序列具有至少90％同一性的氨基酸序列。
82.如权利要求77-81中任一项所述的试剂盒，其中所述治疗性抗体或抗原结合多肽包含重链可变结构域，所述重链可变结构域包含SEQ ID NO:47或SEQ ID NO:48的氨基酸序列。
83.如权利要求77-82中任一项所述的试剂盒，其中所述治疗性抗体或抗原结合多肽包含轻链可变结构域，所述轻链可变结构域包含与SEQ ID NO:53、SEQ ID NO:54、SEQ ID NO:55或SEQ ID NO:56的氨基酸序列具有至少90％同一性的氨基酸序列。
84.如权利要求77-83中任一项所述的试剂盒，其中所述治疗性抗体或抗原结合多肽包含轻链可变结构域，所述轻链可变结构域包含SEQ ID NO:53、SEQ ID NO:54、SEQ ID NO:55或SEQ ID NO:56的氨基酸序列。
85.如权利要求73-84中任一项所述的试剂盒，其中所述治疗性抗体或抗原结合多肽是可活化治疗性抗体或抗原结合多肽。
86.一种检测样品中的CD166的方法，其包括：
使所述样品与如权利要求1-40中任一项所述的抗体或抗原结合多肽接触；以及
检测是否存在与所述样品的一部分结合的抗体或抗原结合多肽，从而检测是否存在CD166。
87.如权利要求86所述的方法，其中所述CD166是哺乳动物CD166。
88.如权利要求87所述的方法，其中所述CD166是灵长类动物CD166。
89.如权利要求88所述的方法，其中所述CD166是人CD166。
90.一种检测组织样品中表达CD166的细胞的方法，其包括：
使所述组织样品与如权利要求1-40中任一项所述的抗体或抗原结合多肽接触；以及
检测是否存在与所述组织样品中的至少一种细胞结合的抗体或抗原结合多肽，从而检测所述组织样品中是否存在表达CD166的细胞。
91.如权利要求90所述的方法，其中所述CD166是哺乳动物CD166。
92.如权利要求91所述的方法，其中所述CD166是灵长类动物CD166。
93.如权利要求92所述的方法，其中所述CD166是人CD166。
94.一种检测组织样品中的活化的淋巴细胞或活化的单核细胞(白细胞)的方法，所述方法包括：
使所述组织样品与如权利要求1-40中任一项所述的抗体或抗原结合多肽接触；以及
检测是否存在与所述样品中的至少一种细胞结合的抗体或抗原结合多肽，从而检测所述组织样品中是否存在所述活化的淋巴细胞或所述活化的单核细胞(白细胞)。
95.如权利要求94所述的方法，其中所述抗体或抗原结合多肽是抗CD166抗体或抗原结合多肽。
96.如权利要求95所述的方法，其中所述抗CD166抗体或抗原结合多肽是抗哺乳动物CD166抗体或抗原结合多肽。
97.如权利要求96所述的方法，其中所述抗CD166抗体或抗原结合多肽是抗灵长类动物CD166抗体或抗原结合多肽或者抗人CD166抗体或抗原结合多肽。
98.如权利要求86-97中任一项所述的方法，其中所述样品包含来自肿瘤细胞系的细胞。
99.如权利要求86-98中任一项所述的方法，其中所述样品来自受试者。
100.如权利要求86-99中任一项所述的方法，其中所述样品包含癌细胞。
101.如权利要求100所述的方法，其中所述癌细胞是实体瘤细胞。
102.如权利要求86-101中任一项所述的方法，其中所述样品包埋在介质中。
103.如权利要求86-102中任一项所述的方法，其中所述样品是固定的。
104.如权利要求86-103所述的方法，其中所述样品是福尔马林固定的石蜡包埋的样品。
105.如权利要求86-104中任一项所述的方法，其中所述癌细胞包括非小细胞肺癌细胞、乳腺癌细胞、卵巢癌细胞、子宫内膜癌细胞、胆管癌细胞、头颈癌细胞、或去势抗性前列腺癌细胞。
106.如权利要求86-104中任一项所述的方法，其中所述癌细胞包括H292细胞、HCC1806细胞、MDA-MB-231细胞、BXPC3细胞、HT29细胞、或BT20细胞。
107.如权利要求86-106中任一项所述的方法，其中检测是否存在与所述样品的一部分结合的抗体或抗原结合多肽包括进行免疫组织化学、电泳、蛋白质印迹分析、免疫沉淀分析和/或显微镜检查。
108.如权利要求86-107中任一项所述的方法，其中检测是否存在与所述样品的一部分结合的抗体或抗原结合多肽包括检测与所述样品的一部分结合的抗体或抗原结合多肽的水平，从而检测CD166的水平。
109.如权利要求108所述的方法，其还包括将与所述样品的一部分结合的抗体或抗原结合多肽的水平与参考值相比较，或将CD166的水平与参考值相比较。
110.一种治疗疾病或病症的方法，其包括：
向处于所述疾病或病症的风险之中或患有所述疾病或病症的受试者施用治疗性抗体或抗原结合多肽，其中在施用之前，通过进行以下步骤检测在来自所述受试者的样品中CD166的存在：
使所述样品与如权利要求1-40中任一项所述的抗体或抗原结合多肽接触；以及
检测是否存在与所述样品的一部分结合的抗体或抗原结合多肽，从而检测是否存在CD166。
111.如权利要求110所述的方法，其中检测是否存在与所述样品的一部分结合的抗体或抗原结合多肽包括进行免疫组织化学、电泳、蛋白质印迹分析、免疫沉淀分析和/或显微镜检查。
112.如权利要求110或111中任一项所述的方法，其还包括在所述施用之后，通过进行以下步骤检测在来自所述受试者的样品中CD166的存在：
使所述样品与如权利要求1-44中任一项所述的抗体或抗原结合多肽接触；以及
检测是否存在与所述样品的一部分结合的抗体或抗原结合多肽，从而检测是否存在CD166。
113.如权利要求112所述的方法，其中检测是否存在与所述样品的一部分结合的抗体或抗原结合多肽包括进行免疫组织化学、电泳、蛋白质印迹分析、免疫沉淀分析和/或显微镜检查。
114.如权利要求110至113中任一项所述的方法，其中所述治疗性抗体或抗原结合多肽特异性结合至免疫检查点蛋白。
115.如权利要求110至114中任一项所述的方法，其中所述治疗性抗体或抗原结合多肽是抗PD-L1抗体或抗原结合多肽。
116.如权利要求110至114中任一项所述的方法，其中所述治疗性抗体或抗原结合多肽是抗PD-1抗体或抗原结合多肽
117.如权利要求110至113中任一项所述的方法，其中所述治疗性抗体或抗原结合多肽是抗CD166抗体或抗原结合多肽。
118.如权利要求110至117中任一项所述的方法，其中所述治疗性抗体或抗原结合多肽是可活化治疗性抗体或抗原结合多肽。
119.如权利要求118所述的方法，其中所述可活化治疗性抗体或抗原结合多肽与试剂缀合。
120.如权利要求119所述的方法，其中所述试剂是治疗性部分。
121.如权利要求117-120中任一项所述的方法，其中所述治疗性抗CD166抗体或抗原结合多肽包含：
(i)重链可变结构域，其包含以下区中的一种或多种：
(a)重链HCDR1，其与SEQ ID NO:49在12个氨基酸位置中的12个、12个氨基酸位置中的11个、或12个氨基酸位置中的10个处相同；
(b)重链HCDR2，其与SEQ ID NO:50在9个氨基酸位置中的9个、9个氨基酸位置中的8个、或9个氨基酸位置中的7处相同；以及
(c)重链HCDR3，其与SEQ ID NO:51在11个氨基酸位置中的11个、11个氨基酸位置中的10个、或11个氨基酸位置中的9个处相同；和/或
(ii)包含轻链可变结构域，其包含以下区中的一种或多种：
(a)轻链LCDR1，其与SEQ ID NO:57或SEQ ID NO:58在16个氨基酸位置中的16个、16个氨基酸位置中的15个、16个氨基酸位置中的14个、或16个氨基酸位置中的13个处相同；
(b)轻链LCDR2，其与SEQ ID NO:59或SEQ ID NO:60在7个氨基酸位置中的7个、7个氨基酸位置中的6个、或7个氨基酸位置中的5个处相同；以及
(c)轻链LCDR3，其与SEQ ID NO:61在9个氨基酸位置中的9个、9个氨基酸位置中的8个、或9个氨基酸位置中的7个处相同。
122.如权利要求110-121中任一项所述的方法，其中所述样品包含癌细胞。
123.如权利要求110-122中任一项所述的方法，其中所述样品包含活化的淋巴细胞或活化的单核细胞(白细胞)。
124.如权利要求110-123中任一项所述的方法，其中所述样品包含非小细胞肺癌细胞、乳腺癌细胞、卵巢癌细胞、子宫内膜癌细胞、胆管癌细胞、头颈癌细胞、前列腺癌细胞、或去势抗性前列腺癌细胞。
125.如权利要求110-123中任一项所述的方法，其中所述样品包含癌细胞，所述癌细胞包括H292细胞、HCC1806细胞、MDA-MB-231细胞、BXPC3细胞、HT29细胞、或BT20细胞。
126.如权利要求110-125中任一项所述的方法，其中所述疾病或病症是癌症。
127.如权利要求126所述的方法，其中所述癌症是非小细胞肺癌、乳腺癌、卵巢癌、子宫内膜癌、胆管癌、头颈癌、前列腺癌、或去势抗性前列腺癌。
128.如权利要求110-127中任一项所述的方法，其中所述癌症是前列腺癌、鳞状细胞皮肤癌、乳腺癌、卵巢癌、肺腺癌、小细胞肺癌、非小细胞肺癌、食管小细胞癌、透明细胞肾癌、小肠癌、结肠腺癌、乳头状甲状腺癌、子宫内膜癌、直肠癌、鳞状细胞肺癌、喉癌、胰腺癌、鳞状细胞宫颈癌、鳞状细胞食管癌、肝癌、胃贲门癌、胃癌、腹腔癌、膀胱移行细胞癌、黑素瘤、乳腺癌、子宫内膜癌、胆管癌、或去势抗性前列腺癌。
129.一种帮助为处于疾病或病症的风险之中或患有疾病或病症的受试者选择疗法的方法，所述方法包括：
使来自所述受试者的样品与如权利要求1-40中任一项所述的抗体或抗原结合多肽接触；
检测是否存在与所述样品的一部分结合的抗体或抗原结合多肽，从而检测是否存在CD166；以及
记录所述样品中是否存在CD166。
130.如权利要求129所述的方法，其还包括如果检测到在所述样品中存在CD166，则将个体分类为可受益于施用治疗性抗CD166抗体或抗原结合多肽的个体。
131.如权利要求129或130所述的方法，其中检测与所述样品的一部分结合的抗体或抗原结合多肽的存在包括进行免疫组织化学、电泳、蛋白质印迹分析、免疫沉淀分析和/或显微镜检查。
132.如权利要求129-131中任一项所述的方法，其中检测与所述样品的一部分结合的抗体或抗原结合多肽的存在包括检测与所述样品的一部分结合的抗体或抗原结合多肽的水平，从而检测CD166的水平。
133.如权利要求132所述的方法，其还包括将与所述样品的一部分结合的抗体或抗原结合多肽的水平或CD166的水平与参考值相比较。
134.如权利要求129至132中任一项所述的方法，其还包括施用治疗性抗体或抗原结合多肽。
135.如权利要求134所述的方法，其中所述治疗性抗体或抗原结合多肽是治疗性抗CD166抗体或抗原结合多肽，所述治疗性抗CD166抗体或抗原结合多肽是可活化治疗性抗体或抗原结合多肽。
136.如权利要求134或135所述的方法，其中所述抗体或抗原结合多肽与试剂缀合。
137.如权利要求135所述的方法，其中所述试剂是可检测部分或治疗性部分。
138.如权利要求134至137中任一项所述的方法，其中所述抗体或抗原结合多肽是治疗性抗CD166抗体或抗原结合多肽，所述治疗性抗CD166抗体或抗原结合多肽包含：
(i)重链可变结构域，其包含以下区中的一种或多种：
(a)重链HCDR1，其与SEQ ID NO:49在12个氨基酸位置中的12个、12个氨基酸位置中的11个、或12个氨基酸位置中的10个处相同；
(b)重链HCDR2，其与SEQ ID NO:50在9个氨基酸位置中的9个、9个氨基酸位置中的8个、或9个氨基酸位置中的7处相同；以及
(c)重链HCDR3，其与SEQ ID NO:51在11个氨基酸位置中的11个、11个氨基酸位置中的10个、或11个氨基酸位置中的9个处相同；和/或
(ii)包含轻链可变结构域，其包含以下区中的一种或多种：
(a)轻链LCDR1，其与SEQ ID NO:57或SEQ ID NO:58在16个氨基酸位置中的16个、16个氨基酸位置中的15个、16个氨基酸位置中的14个、或16个氨基酸位置中的13个处相同；
(b)轻链LCDR2，其与SEQ ID NO:59或SEQ ID NO:60在7个氨基酸位置中的7个、7个氨基酸位置中的6个、或7个氨基酸位置中的5个处相同；以及
(c)轻链LCDR3，其与SEQ ID NO:61在9个氨基酸位置中的9个、9个氨基酸位置中的8个、或9个氨基酸位置中的7个处相同。
139.如权利要求129-138中任一项所述的方法，其中所述样品包含癌细胞。
140.如权利要求129-139中任一项所述的方法，其中所述样品包含非小细胞肺癌细胞、乳腺癌细胞、卵巢癌细胞、子宫内膜癌细胞、胆管癌细胞、头颈癌细胞、前列腺癌细胞、或去势抗性前列腺癌细胞。
141.如权利要求129-139中任一项所述的方法，其中样品包含癌细胞，所述癌细胞包括H292细胞、HCC1806细胞、MDA-MB-231细胞、BXPC3细胞、HT29细胞、或BT20细胞。
142.如权利要求129-141中任一项所述的方法，其中所述疾病或病症是癌症。
143.如权利要求142所述的方法，其中所述癌症是非小细胞肺癌、乳腺癌、卵巢癌、子宫内膜癌、胆管癌、头颈癌、前列腺癌、或去势抗性前列腺癌。
144.如权利要求142或143中任一项所述的方法，其中所述癌症是前列腺癌、鳞状细胞皮肤癌、乳腺癌、卵巢癌、肺腺癌、小细胞肺癌、非小细胞肺癌、食管小细胞癌、透明细胞肾癌、小肠癌、结肠腺癌、乳头状甲状腺癌、子宫内膜癌、直肠癌、鳞状细胞肺癌、喉癌、胰腺癌、鳞状细胞宫颈癌、鳞状细胞食管癌、肝癌、胃贲门癌、胃癌、腹腔癌、膀胱移行细胞癌、黑素瘤、乳腺癌、子宫内膜癌、胆管癌、或去势抗性前列腺癌。
145.如权利要求1-40中任一项所述的抗体或抗原结合多肽用于检测CD166的用途。
146.如权利要求1-40中任一项所述的抗体或抗原结合多肽用于治疗疾病或病症的用途。
147.如权利要求1-40中任一项所述的抗体或抗原结合多肽用于为处于疾病或病症的风险之中或患有疾病或病症的受试者选择疗法的用途。
148.如权利要求146或147所述的用途，其中所述疾病或病症是癌症。
149.如权利要求1-40中任一项所述的抗体或抗原结合多肽，其用于治疗疾病或病症。
150.如权利要求1-40中任一项所述的抗体或抗原结合多肽，其用于制造用于治疗疾病或病症的药物。
151.如权利要求149或150所述的抗体或抗原结合多肽，其中所述疾病或病症是癌症。
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WD01 Invention patent application deemed withdrawn after publication

Application publication date: 20200508

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