CN110467663A - Rspo3基因在母猪卵巢颗粒细胞中的应用 - Google Patents
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Abstract
本发明公开了RSPO3基因在母猪卵巢颗粒细胞中的应用。本发明以直径为3~5和7~10mm的两种卵泡为实验材料,采用测序技术研究H3K4me3与卵巢卵泡发育相关基因表达水平的关系。通过ChIP‑Seq发现,在不同大小卵泡中RSPO3基因启动子区的H3K4me3富集程度有显著差异;通过qRT‑PCR发现,在不同大小卵泡中RSPO3基因的表达量有显著差异;通过促进或抑制母猪卵巢颗粒细胞中H3K4me3的程度发现促进H3K4me3程度可促进RSPO3基因的转录,抑制H3K4me3程度可抑制RSPO3基因的转录;通过超表达或干扰RSPO3发现RSPO3可促进母猪卵巢颗粒细胞增殖,抑制细胞凋亡。
Description
技术领域
本发明属于细胞工程和基因工程技术领域,具体涉及RSPO3基因在母猪卵巢颗粒细胞中的应用。
背景技术
卵巢是母畜繁育的基础,其主要功能是产生并排出卵子,此外卵巢卵泡中的颗粒细胞能够分泌性激素,促进母畜性征的发育及维持,卵巢能否健康发育关系着母畜繁殖能力的强弱及利用年限的长短。表观遗传学是指在DNA双链序列未改变的情况下,基因的表达发生改变,即未改变基因型的前提下改变表型。其中组蛋白翻译后修饰发生在核小体八聚体的各个组份上,在表观遗传研究中H3K4me3(H3组蛋白上4号赖氨酸的3甲基化,Tri-methylation of Histone H3 lysine 4)是一个具有转录活性的典型染色质标记,Santos-Rosa等研究表明,H3的4号赖氨酸甲基化可以募集核小体重塑酶和组蛋白乙酰化酶,正向调节基因的转录,且H3K4me3结合在基因上的宽度与细胞识别种类相关,H3K4me3分布情况与基因的转录水平相关。
R-脊椎蛋白3(R-spondin 3,RSPO3)全长约2,390bp,有5个外显子,开放阅读框为816bp,编码272个氨基酸,是RSPO家族中第一个被发现的基因,主要分布在细胞的内质网和高尔基体上,能够通过经典的分泌途径分泌到胞外。Aoki、Kazanskaya等人研究发现,在小鼠胚胎发育过程中,胚胎血管可以与母体血管交换气体、营养和废物,敲低RSPO3基因会导致小鼠胎儿的血管渗透能力下降,并最终造成动物死亡。此外,RSPO3基因是RSPO家族蛋白的成员,Zhang等研究表明RSPO能够激活Wnt信号通路,在哺乳动物胚胎发育等较为重要的生物学进程中均发挥重要的。已有大量研究表明Wnt/β-catenin通路异常激活能够促进致癌细胞增殖、分化和迁移,且Wnt家族的大部分成员均能够在卵巢卵泡内表达,其中卷曲蛋白受体参与胚胎和卵泡的早期发育,低密度脂蛋白相关受体主要参与排卵和黄体的生成,但目前RSPO3基因与母猪卵巢颗粒细胞生长发育的联系仍未见报道。
发明内容
为了克服现有技术的缺点与不足,本发明的目的在于提供RSPO3基因在母猪卵巢颗粒细胞中的应用。
本发明的目的通过下述技术方案实现:RSPO3基因在母猪卵巢颗粒细胞中的应用,体外环境下,RSPO3基因调控母猪卵巢颗粒细胞的增殖和凋亡。
所述的RSPO3基因调控母猪卵巢颗粒细胞的增殖和凋亡为通过如下方式实现:增加RSPO3基因促进母猪卵巢颗粒细胞的增殖、抑制细胞的凋亡;或减少RSPO3基因抑制母猪卵巢颗粒细胞的增殖、促进细胞的凋亡。
所述的增加RSPO3基因促进母猪卵巢颗粒细胞的增殖、抑制细胞的凋亡为通过升高H3K4me3程度(升高H3K4me3程度能显著升高RSPO3的相对表达量),和/或增加外源性RSPO3基因的方式实现。
所述的升高H3K4me3程度为采用H3K4me3激动剂进行。
所述的H3K4me3激动剂为H3K4me3激动剂PBIT;优选为SIGMA公司的H3K4me3激动剂PBIT。
所述的H3K4me3激动剂PBIT的有效浓度为2~4μM;优选为2μM。
所述的增加外源性RSPO3基因通过如下方法实现:将RSPO3基因连接到pcDNA3.1载体上,构建含有RSPO3基因的超表达载体;然后将含有RSPO3基因的超表达载体转染到母猪卵巢颗粒细胞中。
所述的含有RSPO3基因的超表达载体优选为通过如下方法构建得到:
(1)以猪耳DNA为模板进行PCR扩增,得到扩增片段;然后将扩增片段连接到pMD18T载体上,得到重组质粒T-RSPO3;
(2)以重组质粒T-RSPO3为模板进行PCR扩增,得到目的片段;然后使用限制性内切酶BamHI和EcoRI酶切目的片段和pcDNA3.1载体,酶连,转化,菌液鉴定,测序鉴定,得到重组载体,即所述的含有RSPO3基因的超表达载体。
步骤(1)中进行PCR扩增所用引物如下所示:
F:5′-ATGCACTTGCGACTGATTTCTTG-3′;
R:5′-CTAGTGTACAGTGCTGACTGATACC-3′。
步骤(2)中进行PCR扩增所用引物如下所示:
F:5′-GCTCGGATCCATGCACTTGCGACTGATTTCTTGGTTTTTTATC-3′;
R:5′-TGCAGAATTCCTAGTGTACAGTGCTGACTGATACCGATTTCTG-3′。
所述的减少RSPO3基因抑制母猪卵巢颗粒细胞的增殖、促进细胞的凋亡为通过降低H3K4me3程度(降低H3K4me3程度能显著降低RSPO3的相对表达量),和/或将抑制RSPO3基因表达的siRNA转染到母猪卵巢颗粒细胞的方式实现。
所述的降低H3K4me3程度为采用H3K4me3抑制剂进行。
所述的H3K4me3抑制剂为H3K4me3抑制剂BCl-121;优选为SIGMA公司的H3K4me3抑制剂BCl-121。
所述的H3K4me3抑制剂BCl-121的有效浓度为100~150μM;优选为150μM。
所述抑制RSPO3基因表达的siRNA,其靶向核苷酸序列选自如下任一序列:
RSPO3-siRNA1:5′-GCAACATGTTCAGATTACA-3′;
RSPO3-siRNA2:5′-ACAGTGCAAAGAAAGAAGT-3′;
RSPO3-siRNA3:5′-GCGAAAGGTCCAAGAGAAA-3′。
RSPO3基因作为母猪卵巢卵泡生长发育标志物的应用,测序结果显示:不同大小卵泡中RSPO3基因启动子区H3K4me3的富集程度具有显著差异,直径为3~5mm的母猪卵泡中,RSPO3基因启动子区H3K4me3的富集程度显著低于7~10mm的母猪卵泡;不同大小卵泡中RSPO3基因含量具有显著差异,3~5mm的母猪卵泡中RSPO3基因含量低于7~10mm的母猪卵泡,说明RSPO3基因参与卵泡生长发育,可以作为卵泡生长发育的标志。
所述的RSPO3基因启动子区H3K4me3的富集程度检测通过ChIP-Seq的方式实现。
所述的母猪卵泡中RSPO3基因含量检测通过qRT-PCR的方式实现。
RSPO3基因在制备调控母猪卵巢颗粒细胞的增殖和凋亡的药物中的应用。
所述的RSPO3基因调控母猪卵巢颗粒细胞的增殖和凋亡为通过如下方式实现:增加RSPO3基因促进母猪卵巢颗粒细胞的增殖、抑制细胞的凋亡;或减少RSPO3基因抑制母猪卵巢颗粒细胞的增殖、促进细胞的凋亡。
所述的增加RSPO3基因为通过升高H3K4me3程度(升高H3K4me3程度能显著升高RSPO3的相对表达量),和/或增加外源性RSPO3基因的方式实现。
所述的降低H3K4me3程度为采用H3K4me3抑制剂进行。
所述的H3K4me3抑制剂优选为H3K4me3抑制剂PBIT。
所述的H3K4me3抑制剂PBIT的有效浓度为2~4μM;优选为2μM。
所述的减少RSPO3基因抑制母猪卵巢颗粒细胞的增殖、促进细胞的凋亡为通过降低H3K4me3程度(降低H3K4me3程度能显著降低RSPO3的相对表达量),和/或将抑制RSPO3基因表达的siRNA转染到母猪卵巢颗粒细胞的方式实现。
所述的降低H3K4me3程度为采用H3K4me3抑制剂进行。
所述的H3K4me3抑制剂优选为H3K4me3抑制剂BCl-121。
所述的H3K4me3抑制剂BCl-121的有效浓度为100~150μM;优选为150μM。
所述抑制RSPO3基因表达的siRNA,其靶向核苷酸序列选自如下任一序列:
RSPO3-siRNA1:5′-GCAACATGTTCAGATTACA-3′;
RSPO3-siRNA2:5′-ACAGTGCAAAGAAAGAAGT-3′;
RSPO3-siRNA3:5′-GCGAAAGGTCCAAGAGAAA-3′。
本发明的验证结果如下:
1、直径为3~5和7~10mm的两种卵泡进行ChIP-Seq,发现直径为3~5的母猪卵泡中,RSPO3基因启动子区H3K4me3的富集程度显著低于7~10mm的母猪卵泡。
2、直径为3~5mm的卵泡中RSPO3相对表达量显著低于7~10mm的卵泡。
3、使用H3K4me3药物处理母猪卵巢颗粒细胞(BCl-121为H3K4me3抑制剂,DMSO-150为抑制剂对照;PBIT为H3K4me3激动剂,DMSO-2为激动剂对照),qRT-PCR检测RSPO3的相对表达量,降低H3K4me3程度能显著降低RSPO3的相对表达量,升高H3K4me3程度能显著升高RSPO3的相对表达量(图2)。
4、设计目的基因RSPO3的引物:从NCBI上查找目的基因RSPO3(NCBI Gene ID:100155208)的序列,确定酶切位点(RSPO3基因的酶切位点是BamHI和EcoRI),使用PrimerPremier 5.0软件进行引物设计,通过PCR特异性扩增、纯化、酶切目的片段,然后与pcDNA3.1表达载体连接,最后成功构建目的基因RSPO3的超表达载体pcDNA3.1-RSPO3。后续通过在母猪卵巢颗粒细胞中转染不同浓度(50、100、250、500和1000ng/mL)的超表达载体,qRT-PCR检测RSPO3的表达量发现,转染pcDNA3.1-RSPO3超表达载体的浓度越高,转染效率越好,且均差异显著。后续研究选择250ng/mL为pcDNA3.1-RSPO3的转染浓度。
5、合成3对干扰RSPO3小片段/对照(RSPO3-siRNA/siRNA-NC),筛选并检测其干扰效率。由附图结果可知,转染基因干扰小片段到母猪卵巢颗粒细胞中,通过qRT-PCR手段,最终筛选干扰效果较好RSPO3-siRNA2小片段进行后续实验。
RSPO3-siRNA1:5′-GCAACATGTTCAGATTACA-3′;
RSPO3-siRNA2:5′-ACAGTGCAAAGAAAGAAGT-3′;
RSPO3-siRNA3:5′-GCGAAAGGTCCAAGAGAAA-3′。
6、分别转染pcDNA3.1-RSPO3或RSPO3-siRNA2到母猪卵巢颗粒细胞,利用AnnexinV-FITC法和Edu法分别检测RSPO3对母猪卵巢颗粒细胞凋亡和增殖的影响。结果显示pcDNA3.1-RSPO3组的凋亡率(早期凋亡+晚期凋亡)显著低于对照组pcDNA3.1,RSPO3-siRNA2组的凋亡率显著高于对照组siRNA-NC。另一部分结果显示pcDNA3.1-RSPO3组的增值率显著高于对照组pcDNA3.1,RSPO3-siRNA2组的增殖率显著低于对照组siRNA-NC。综上,RSPO3可能抑制母猪卵巢颗粒细胞的凋亡和促进增殖。
本发明相对于现有技术具有如下的优点及效果:
1、本发明以直径为3~5和7~10mm的两种卵泡为实验材料,采用测序技术研究H3K4me3与卵巢卵泡发育相关基因表达水平的关系:通过ChIP-Seq发现,在直径为3~5的母猪卵泡中,RSPO3基因启动子区H3K4me3的富集程度显著低于7~10mm的母猪卵泡;通过qRT-PCR发现,在不同大小卵泡中RSPO3基因的表达量有显著差异。
2、通过促进或抑制母猪卵巢颗粒细胞中H3K4me3的程度发现促进H3K4me3程度可促进RSPO3基因的转录,抑制H3K4me3程度可抑制RSPO3基因的转录。
3、本发明预测RSPO3基因的表达水平可能影响母猪卵巢颗粒细胞功能,并能够调控母猪卵巢颗粒细胞的增殖和凋亡,调控母猪卵巢卵泡的生长发育。因此,以RSPO3为研究对象,采用了分子和细胞生物学方法研究其在母猪卵巢颗粒细胞中的应用:通过超表达或干扰RSPO3发现RSPO3可促进母猪卵巢颗粒细胞增殖,抑制凋亡。对研究卵巢卵泡闭锁机制等具有很好的应用价值。
3、本发明技术方案设计周详,结果可靠。
附图说明
图1是不同大小卵泡中RSPO3相对表达量。
图2是H3K4me3对RSPO3相对表达量的影响图。
图3是pcDNA3.1-RSPO3重组质粒双酶切电泳图。
图4是超表达载体pcDNA3.1-RSPO3效率检测图。
图5是干扰片段RSPO3-siRNA效率检测图。
图6是Edu法检测超表达或干扰RSPO3对母猪卵巢颗粒细胞增殖的影响图;其中,a是Edu法检测超表达RSPO3对母猪卵巢颗粒细胞增殖的影响;b是Edu法检测干扰RSPO3对母猪卵巢颗粒细胞增殖的影响。
图7是Annexin V-FITC法检测超表达或干扰RSPO3对母猪卵巢颗粒细胞凋亡的影响图;其中a是Annexin V-FITC法超表达RSPO3对母猪卵巢颗粒细胞凋亡的影响;b是Annexin V-FITC法检测干扰RSPO3对母猪卵巢颗粒细胞凋亡的影响。
具体实施方式
下面结合实施例及附图对本发明作进一步详细的描述,但本发明的实施方式不限于此。下列实施例中未注明具体条件的实验方法,通常按照常规条件。除非特别说明,本发明所用试剂和原材料均可通过市售获得。
本发明中应用统计学方法,分析各实施例中3次独立实验的结果,分别计算“平均值±标准差”,使用单因素方差分析进行差异显著性分析(图中“*”表示P<0.05,“**”表示P<0.01)。
实施例1ChIP-Seq筛选差异基因RSPO3
(1)选择猪卵巢中直径为3~5和7~10mm的两种大小卵泡,甲醛交联整个组织,即将目标蛋白与染色质连结,分离基因组DNA,超声波将DNA打断;添加目标蛋白质的特异性抗体anti-H3K4me3(SANTA CRUZ),形成免疫沉淀复合体;去交联,纯化DNA即得到染色质免疫沉淀的DNA样本。
(2)DNA样品送上海康成生物工程有限公司进行基因测序。测序基本流程:
①样品质量评估,使用Quant-iTTM dsDNA High-Sensitivity(HS)Assay Kit(Invitrogen)测定DNA样品的纯度和浓度。
②序列库准备,使用TruSeq Nano DNA Sample Prep Kit(FC-121-4002,Illumina)对DNA样品进行端部修复、尾端连接和接头连接;使用AMPure XP beads筛选200~1500bp的DNA片段;使用Agilent 2100分析仪测定DNA的长度和浓度。
③使用HiSeq 3000/4000 PE Cluster Kit(PE-410-1001,Illumin)在测序芯片上生产DNA簇,测序。
④分析测序数据,使用Off-Line Basecaller(v1.8.0)分析图像,调用和排列碱基;并用Solexa CHASTITY进行质控,最后使用BOWTIE(v2.1.0)将读取数据匹配到猪的基因组(susscr3)。
⑤使用MACS(v1.4.2)读取测序数据的峰值,采用泊松比较寻找与蛋白差异富集的区域(P<0.05)。
⑥使用UCSC RefSeq数据库注释距离差异peak最近的基因,将转录起始位点(Transcription start site,TSS)-2~+2Kb定义为启动子区,并寻找位于启动子区的peak。
⑦使用GO和KEGG分析启动子区包含peak的基因,筛选出与繁殖性能相关的差异基因RSPO3。
实施例2RNA抽提、质量检测及反转录
(1)RNA抽提:
①样品消化:从组织样中抽提RNA,取50~100mg组织样于冰上快速剪碎或用匀浆机反复匀浆,加入Trizol(50~100mg/ml)。从细胞中抽提RNA,不需要对细胞进行消化,直接加入Trizol(10cm2/mL)。
②将组织或细胞样在冰上放置10~15min,4℃12000g离心5min,将含RNA的上清转移至新的RNase-free管。
③加入氯仿(氯仿:Trizol的体积比为1:5),激烈震荡,室温下放置5min,4℃12,000g离心15min,将上层水相小心移至新的RNase-free管。
④加入异丙醇(异丙醇:Trizol的体积比为1:2),轻微颠倒混匀,室温下放置10min,4℃12,000g离心15min,抽去上清。
⑤按照体积比1:1的75%乙醇-DEPC:Trizol的比例加入75%乙醇-DEPC(即75%乙醇溶液(用DEPC处理过的水配制)),轻柔吹打,清洗抽提的RNA,然后4℃12000g离心15min,抽去上清,重复此步骤2次。
⑥将RNA于室温干燥5~10min,使乙醇尽量挥发完全,同时也应防止RNA过度干燥。
⑦最后加入30μL的DEPC水溶解RNA沉淀。
(2)RNA质量检测:
①琼脂糖凝胶电泳检测RNA的完整程度:制备浓度为1%的琼脂糖凝胶,将2μL RNA样品与2μL Loading Buffer混匀,15V/cm电压电泳20min。
②电泳完成后,使用凝胶成像仪拍照,若RNA完整程度较好,观察条带可见28S、18S和5S小分子RNA条带。
③最后紫外分光光度计检测样品OD 260/OD 280的比值,-80℃保存RNA备用。
(3)RNA反转录,参照Takara PrimerScriptTM RT reagent kit说明书,反应体系见表1:
表1基因组RNA反转录体系
注:反应条件为37℃ 15min,85℃ 5s。
实施例3 qRT-PCR
本发明中基因的qRT-PCR检测采用Maxima SYBR Green qPCR Master Mix(2X)试剂盒(Thermo Scientific公司)。实验采用比较Ct值法检测样品基因的含量,具体计算公式如下:
基因相对表达量=2-{〈﹙实验组目的基因Ct值﹚-﹙实验组内参基因Ct值﹚〉-〈﹙对照组目的基因Ct值﹚-﹙对照组内参基因Ct值﹚〉}
检测基因用GAPDH做内参,本发明所用到的qRT-PCR引物为:
qRT-PCR-RSPO3 Forward:5′-CGTCAGTATTGTGCACTGTGA-3′;
Reverse:5′-GGTGGGAGGACACAGGTTAC-3′;
qRT-PCR-GAPDH Forward:5′-GGACTCATGACCACGGTCCAT-3′;
Reverse:5′-TCAGATCCACAACCGACACGT-3′。
实施例4构建RSPO3基因超表达载体
(1)利用Primer5设计引物,引物序列如下:
F:5′-ATGCACTTGCGACTGATTTCTTG-3′;
R:5′-CTAGTGTACAGTGCTGACTGATACC-3′。
以抽提的猪耳DNA为模板扩增RSPO3基因CDS区,纯化回收扩增的片段,连接pMD18T载体(Takara),转化、筛选及测序鉴定正确后,抽提普通质粒,命名为T-RSPO3。
(2)BioEdit软件分析发现RSPO3基因CDS区序列无BamHI和EcoRI两种限制性内切酶酶切位点,而pcDNA3.1载体存在BamHI和EcoRI酶切位点。Primer5设计RSPO3基因CDS区引物,其上下游引物分别加上BamHI和EcoRI酶切位点序列。以T-RSPO3普通质粒为模版,PCR扩增;对目的片段回收纯化,双酶切目的片段和pcDNA3.1载体(Invitrogen,货号V79020),连接pcDNA3.1载体、转化、筛选并测序鉴定正确后抽提无内毒素质粒(Magen),命名为pcDNA3.1-RSPO3。
本发明用到的RSPO3基因超表达载体引物序列如下:
F:5′-GCTCGGATCCATGCACTTGCGACTGATTTCTTGGTTTTTTATC-3′;
R:5′-TGCAGAATTCCTAGTGTACAGTGCTGACTGATACCGATTTCTG-3′。
注:下划线为保护碱基,加粗部分为酶切位点。
实施例5母猪卵巢颗粒细胞的培养
(1)本发明母猪卵巢颗粒细胞的采集自嘉禾望岗屠宰场,采集屠宰母猪卵巢保存于含1%(w/w)双抗(青霉素和链霉素)的PBS缓冲液中,低温迅速带回实验室处理。
(2)用含1%(w/w)双抗的PBS清洗卵巢数次,转移样品至细胞房。
(3)提前将超净台紫外照射细胞房超净台20min,并用75%的酒精擦拭。
(4)镊子夹取卵巢,用1mL注射器吸取卵泡液于5mL DMEM培养基,每管吸取卵泡液至9mL,800rpm离心5min,弃上清,加入预热的PBS轻柔吹打沉淀细胞,清洗两次。
(5)在75mL细胞培养瓶中培养,先在培养瓶中加入10mL DMEM完全培养基(含10%(v/v)小牛血清和1%(w/w)双抗),再加入5mL细胞细胞悬液,轻柔地摇晃均匀。
(6)置于37℃,5% CO2培养箱,48h后观察母猪卵巢颗粒细胞生长状况。
(7)用含预热的含1%(w/w)双抗的PBS清洗两次,再培养24h后可进行后续实验。
实施例6 H3K4me3激动剂和抑制剂的药物处理母猪卵巢颗粒细胞
(1)用胰酶消化培养的母猪卵巢颗粒细胞,放入37℃,5% CO2培养箱3~5min,显微镜下观察到大部分细胞悬浮,立即加入等量DMEM完全培养基(同实施例5步骤(5))终止消化。
(2)收集细胞悬液800rpm离心5min,用预热的PBS清洗细胞两遍,用DMEM完全培养基重悬,将细胞悬液均匀加入6孔板中,轻柔地摇晃均匀,放入37℃,5% CO2培养箱培养24h。
(3)观察细胞状态,当细胞汇合度达到80%左右时,分别使用150μM的H3K4me3的抑制剂BCl-121(SIGMA,货号:SML1817)及2μM的H3K4me3激动剂PBIT(SIGMA,货号:SML1058)药物处理细胞。同时设置BCl-121组的对照是使用浓度为150μM的DMSO(二甲基亚砜)溶液(即DMSO-150),PBIT组的对照是使用浓度为2μM的DMSO溶液(即DMSO-2)。
(4)在显微镜下观察细胞状态,药物处理后的细胞置于37℃,5% CO2培养箱中继续培养。
实施例7母猪卵巢颗粒细胞铺板和转染
(1)用胰酶消化培养的母猪卵巢颗粒细胞,放入37℃,5% CO2培养箱3~5min,显微镜下观察到大部分细胞悬浮,立即加入等量DMEM完全培养基终止消化。
(2)收集细胞悬液800rpm离心5min,用预热的PBS清洗细胞两遍,用DMEM完全培养基重悬,将细胞悬液均匀加入6孔板中,轻柔地摇晃均匀,放入37℃,5% CO2培养箱培养24h。
(3)观察细胞状态,当细胞汇合度达到80%左右时,即可进行后续实验。
(4)转染方法按Invitrogen公司的3000试剂盒说明书进行,每组设置3个重复。
(5)转染后的细胞置于37℃,5% CO2培养箱中继续培养。
(6)根据实验目的在转染24或48h后收集细胞。
实施例8母猪卵巢颗粒细胞增殖检测
本发明使用EdU法检测细胞增殖,参照广州市锐博生物科技有限公司Cell-LightTMEdU Apollo 567 In vitro Kit检测试剂盒说明书,具体操作步骤如下:
(1)取母猪卵巢颗粒细胞接种于48孔板,培养细胞至融合度为50~80%。
(2)制备50μM EdU培养基,即为用细胞培养基稀释按照1000:1稀释EdU溶液,每孔加入200μL 50μM EdU培养基孵育2h,PBS清洗细胞,每次3~5min。
(3)细胞固定化:向每孔加入200μL细胞固定液(用PBS稀释至80%(v/v)的丙酮),室温孵育15~30min,PBS清洗细胞,每次3~5min。
(4)细胞透化:每孔加入200μL渗透剂(含0.5% TritonX-100的PBS)透化细胞,透化孵育10min,PBS清洗细胞。
(5)EdU检测:每孔加入200μL的染色反应液(避光配置),避光在细胞培养中孵育30min,PBS清洗细胞。
(6)细胞再次透化:每孔加入200μL渗透剂(含0.5% TritonX-100的PBS)透化细胞,透化孵育10min,PBS清洗细胞。
(7)DNA染色:每孔加入200μL DAPI染色液,避光室温孵育30min;
(8)荧光显微镜镜检(每组三个重复)。
实施例9母猪卵巢颗粒细胞凋亡检测
本发明使用Annexin V-FITC技术检测细胞凋亡,参照参照BioVision公司AnnexinV-FITC Apoptosis Detection Kit试剂盒说明书,具体操作步骤如下:
(1)取母猪卵巢颗粒细胞接种于6孔板,培养细胞至融合度为50~80%,用PBS溶液清洗细胞。
(2)使用不含EDTA(乙二胺四乙酸)的胰酶消化细胞,用2mL PBS溶液清洗细胞。
(3)取0.5mL细胞悬液(约5×105个细胞),加入500μL 1×Binding Buffer。
(4)加入5μL Annexin V-FITC及室温5μL PI(Propidium Iodide,碘化丙啶),室温避光孵育5min。
(5)立即用流式细胞仪检测分析(每组3个重复)。
结果分析:
1、直径为3~5和7~10mm的两种大小卵泡进行ChIP-Seq,发现直径为3~5mm的母猪卵泡中,RSPO3基因启动子区H3K4me3的富集程度显著低于7~10mm的母猪卵泡(表2)。
表2 RSPO3基因在两个时期启动子区H3K4me3的富集程度
Refseq_name | NM_001315656 |
基因名 | RSPO3 |
正反义链 | - |
染色体位置 | chr1:39787701-39789000 |
差异富集区长度(bp) | 1300 |
3~5mm count | 8.1 |
7~10mm count | 18.9 |
差异倍数 | 2.3316893 |
P值 | 0.0059886 |
FDR | 0.064711 |
差异富集区域 | 启动子(promoter) |
注:a、表1中的ChIP-Seq结果,是将基因组DNA与H3K4me3蛋白结合,然后找出与H3K4me3蛋白结合的DNA,测序发现有很多片段的“count”在不同大小卵泡中有差异,也就是3~5mm卵泡中较少,7~10mm卵泡中较多。即表1中“3~5mm count”表示的是3~5mm卵泡中该片段与H3K4me3蛋白结合的DNA片段的数量;同理,“7~10mm count”表示的是7~10mm卵泡中该片段与H3K4me3蛋白结合的DNA片段的数量。
b、表1中P值<0.01,在直径为3~5和7~10mm的两种大小的卵泡中,该区域H3K4me3的富集程度具有显著差异。
2、抽取3~5和7~10mm直径卵泡的卵泡液,抽取卵泡液RNA检测RSPO3的相对表达量。结果如图1所示,直径为3~5mm的卵泡中RSPO3相对表达量显著低于直径为7~10mm的卵泡。
3、为探究H3K4me3对RSPO3基因的影响,使用药物处理母猪卵巢颗粒细胞,实验分为四组:150μM BCl-121(H3K4me3抑制剂组);150μM DMSO(抑制剂对照组,即DMSO-150);2μMPBIT(H3K4me3激动剂);2μM DMSO(激动剂对照组,即DMSO-2)。qRT-PCR检测RSPO3的相对表达量。结果显示降低H3K4me3程度能显著降低RSPO3的相对表达量,升高H3K4me3程度能显著升高RSPO3的相对表达量(图2)。
4、设计目的基因RSPO3的引物:从NCBI上查找目的基因RSPO3(NCBI Gene ID:100155208)的序列,确定酶切位点(RSPO3基因的酶切位点是BamHI和EcoRI),使用PrimerPremier 5.0软件进行引物设计,通过PCR特异性扩增、纯化、酶切目的片段,然后与pcDNA3.1表达载体连接,最后成功构建目的基因RSPO3的超表达载体pcDNA3.1-RSPO3(图3)。后续通过在母猪卵巢颗粒细胞中转染不同浓度(50、100、250、500和1000ng/mL)的过表达载体,qRT-PCR检测RSPO3的表达量发现,转染pcDNA3.1-RSPO3过表达载体的浓度越高,转染效率越好,且均差异显著(图4)。后续研究选择250ng/mL为pcDNA3.1-RSPO3的转染浓度。
所述的卵巢卵泡来源于广州市嘉禾望岗屠宰场的健康商品母猪(杜长大三元杂交猪,下同)。
5、合成3对干扰RSPO3小片段/对照(RSPO3-siRNA/siRNA-NC),筛选并检测其干扰效率。由附图结果可知(图5),转染基因干扰小片段到母猪卵巢颗粒细胞中,通过qRT-PCR手段,最终筛选干扰效果较好RSPO3-siRNA2小片段进行后续实验。
RSPO3-siRNA1:5′-GCAACATGTTCAGATTACA-3′;
RSPO3-siRNA2:5′-ACAGTGCAAAGAAAGAAGT-3′;
RSPO3-siRNA3:5′-GCGAAAGGTCCAAGAGAAA-3′。
上述小干扰RNA片段由广州市锐博生物科技有限公司合成;siRNA-NC对照组来自广州市锐博生物科技有限公司(siRNA-NC为该公司通用阴性对照产品)。
6、分别转染pcDNA3.1-RSPO3或RSPO3-siRNA2到母猪卵巢颗粒细胞,对应以pcDNA3.1或siRNA-NC为对照,利用Edu法和Annexin V-FITC法分别检测RSPO3对母猪卵巢颗粒细胞增殖和凋亡的影响。
结果显示pcDNA3.1-RSPO3组的增殖率显著高于对照组pcDNA3.1(图6a),RSPO3-siRNA2组的增殖率显著低于对照组siRNA-NC(图6b)。
另一部分结果显示,pcDNA3.1-RSPO3组的凋亡率(早期凋亡+晚期凋亡)显著低于对照组pcDNA3.1(图7a),RSPO3-siRNA2组的凋亡率显著高于对照组siRNA-NC(图7b)。
综上,RSPO3能够促进母猪卵巢颗粒细胞增殖,抑制细胞凋亡。
上述实施例为本发明较佳的实施方式,但本发明的实施方式并不受上述实施例的限制,其他的任何未背离本发明的精神实质与原理下所作的改变、修饰、替代、组合、简化,均应为等效的置换方式,都包含在本发明的保护范围之内。
序列表
<110> 华南农业大学
<120> RSPO3基因在母猪卵巢颗粒细胞中的应用
<160> 11
<170> SIPOSequenceListing 1.0
<210> 1
<211> 21
<212> DNA
<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<220>
<223> qRT-PCR- RSPO3 Forward
<400> 1
cgtcagtatt gtgcactgtg a 21
<210> 2
<211> 20
<212> DNA
<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<220>
<223> qRT-PCR- RSPO3 Reverse
<400> 2
ggtgggagga cacaggttac 20
<210> 3
<211> 21
<212> DNA
<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<220>
<223> qRT-PCR-GAPDH Forward
<400> 3
ggactcatga ccacggtcca t 21
<210> 4
<211> 21
<212> DNA
<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<220>
<223> qRT-PCR-GAPDH Reverse
<400> 4
tcagatccac aaccgacacg t 21
<210> 5
<211> 23
<212> DNA
<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<220>
<223> F
<400> 5
atgcacttgc gactgatttc ttg 23
<210> 6
<211> 25
<212> DNA
<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<220>
<223> R
<400> 6
ctagtgtaca gtgctgactg atacc 25
<210> 7
<211> 43
<212> DNA
<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<220>
<223> 上游引物F
<400> 7
gctcggatcc atgcacttgc gactgatttc ttggtttttt atc 43
<210> 8
<211> 43
<212> DNA
<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<220>
<223> 下游引物R
<400> 8
tgcagaattc ctagtgtaca gtgctgactg ataccgattt ctg 43
<210> 9
<211> 19
<212> DNA
<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<220>
<223> RSPO3-siRNA1
<400> 9
gcaacatgtt cagattaca 19
<210> 10
<211> 19
<212> DNA
<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<220>
<223> RSPO3-siRNA2
<400> 10
acagtgcaaa gaaagaagt 19
<210> 11
<211> 19
<212> DNA
<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<220>
<223> RSPO3-siRNA3
<400> 11
gcgaaaggtc caagagaaa 19
Claims (10)
1.RSPO3基因在母猪卵巢颗粒细胞中的应用,其特征在于:体外环境下,RSPO3基因调控母猪卵巢颗粒细胞的增殖和凋亡。
2.根据权利要求1所述的RSPO3基因在母猪卵巢颗粒细胞中的应用,其特征在于,所述的RSPO3基因调控母猪卵巢颗粒细胞的增殖和凋亡为通过如下方式实现:增加RSPO3基因促进母猪卵巢颗粒细胞的增殖、抑制细胞的凋亡;或减少RSPO3基因抑制母猪卵巢颗粒细胞的增殖、促进细胞的凋亡。
3.根据权利要求2所述的RSPO3基因在母猪卵巢颗粒细胞中的应用,其特征在于:
所述的增加RSPO3基因促进母猪卵巢颗粒细胞的增殖、抑制细胞的凋亡为通过升高H3K4me3程度,和/或增加外源性RSPO3基因的方式实现;
所述的减少RSPO3基因抑制母猪卵巢颗粒细胞的增殖、促进细胞的凋亡为通过降低H3K4me3程度,和/或将抑制RSPO3基因表达的siRNA转染到母猪卵巢颗粒细胞的方式实现。
4.根据权利要求3所述的RSPO3基因在母猪卵巢颗粒细胞中的应用,其特征在于:
所述的升高H3K4me3程度为采用H3K4me3激动剂进行;
所述的降低H3K4me3程度为采用H3K4me3抑制剂进行;
所述抑制RSPO3基因表达的siRNA,其靶向核苷酸序列选自如下任一序列:
RSPO3-siRNA1:5′-GCAACATGTTCAGATTACA-3′;
RSPO3-siRNA2:5′-ACAGTGCAAAGAAAGAAGT-3′;
RSPO3-siRNA3:5′-GCGAAAGGTCCAAGAGAAA-3′。
5.根据权利要求4所述的RSPO3基因在母猪卵巢颗粒细胞中的应用,其特征在于:
所述的H3K4me3激动剂为H3K4me3激动剂PBIT;
所述的H3K4me3激动剂PBIT的有效浓度为2~4μM;
所述的H3K4me3抑制剂为H3K4me3抑制剂BCl-121;
所述的H3K4me3抑制剂BCl-121的有效浓度为100~150μM。
6.RSPO3基因作为母猪卵巢卵泡生长发育标志物的应用。
7.RSPO3基因在制备调控母猪卵巢颗粒细胞的增殖和凋亡的药物中的应用。
8.根据权利要求7所述的应用,其特征在于,所述的RSPO3基因调控母猪卵巢颗粒细胞的增殖和凋亡通过如下方式实现:增加RSPO3基因促进母猪卵巢颗粒细胞的增殖、抑制细胞的凋亡;或减少RSPO3基因抑制母猪卵巢颗粒细胞的增殖、促进细胞的凋亡;
所述的增加RSPO3基因促进母猪卵巢颗粒细胞的增殖、抑制细胞的凋亡为通过升高H3K4me3程度,和/或增加外源性RSPO3基因的方式实现;
所述的减少RSPO3基因抑制母猪卵巢颗粒细胞的增殖、促进细胞的凋亡为通过降低H3K4me3程度,和/或将抑制RSPO3基因表达的siRNA转染到母猪卵巢颗粒细胞的方式实现。
9.根据权利要求8所述的应用,其特征在于:
所述的升高H3K4me3程度为采用H3K4me3激动剂进行;
所述的降低H3K4me3程度为采用H3K4me3抑制剂进行;
所述抑制RSPO3基因表达的siRNA,其靶向核苷酸序列选自如下任一序列:
RSPO3-siRNA1:5′-GCAACATGTTCAGATTACA-3′;
RSPO3-siRNA2:5′-ACAGTGCAAAGAAAGAAGT-3′;
RSPO3-siRNA3:5′-GCGAAAGGTCCAAGAGAAA-3′。
10.根据权利要求9所述的应用,其特征在于:
所述的H3K4me3激动剂为H3K4me3激动剂PBIT;
所述的H3K4me3激动剂PBIT的有效浓度为2~4μM;
所述的H3K4me3抑制剂为H3K4me3抑制剂BCl-121;
所述的H3K4me3抑制剂BCl-121的有效浓度为100~150μM。
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