CN110132921B - 一种基于针尖纳米孔单分子检测技术的实时监控酶切反应的方法 - Google Patents
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Abstract
本发明涉及一种基于针尖纳米孔单分子检测技术的实时监控酶切反应的方法,属于荧光检测技术领域,该方法中利用针尖纳米孔将溶液分为纳米孔内和纳米孔外两个区域,在电泳驱动下使剪切酶和/或能够与荧光标记的基因特异性吸附的物质进入针尖纳米孔内,或者使负载有荧光标记的基因的纳米材料进入凹槽内(即针尖纳米孔外),通过观察电流信号和荧光信号的变化实现实时监控酶切反应。针尖纳米孔对检测区域的物理分离,以及电泳控制待检测分子的移动,避免了其他外界因素对反应的干扰,膜片钳和荧光显微镜技术的结合能实时观察到反应动态,为纳米材料对酶切保护机理的研究提供更直接的证明。
Description
技术领域
本发明属于荧光检测技术领域,具体涉及一种基于针尖纳米孔单分子检测技术的实时监控酶切反应的方法。
背景技术
纳米孔单分子检测技术是近年来广泛应用于DNA,RNA,蛋白质等生物大分子检测领域的新型技术,被认为是最有潜力的单分子检测技术。其中,针尖纳米孔技术是固态纳米孔中的一种,相对于传统的固体薄膜纳米孔,具有成本低廉、易于制造、性能稳定等显著优点。
无机纳米材料非病毒型基因载体因其良好的稳定性和生物相容性,在生物分析领域已引起广泛关注。但是,人们对此类基因载体在基因传递过程中的各种关键因素还缺乏深入的了解,由于外源基因在细胞内的酶切保护问题是影响基因转染成败的重要因素之一,石墨烯、金纳米、二氧化硅纳米颗粒作为新型的非病毒型基因载体,电泳技术和荧光偏振技术研究发现纳米材料与核酸分子的相互作用证明可以抵抗核酸酶的降解,但纳米材料保护基因的研究机理仍然有待探讨,因此需要一种能够实时监控酶切反应的方法,以便于更好的研究纳米材料保护基因的原理。
发明内容
有鉴于此,本发明的目的在于提供一种基于针尖纳米孔单分子检测技术的实时监控酶切反应的方法。
为达到上述目的,本发明提供如下技术方案:
一种基于针尖纳米孔单分子检测技术的实时监控酶切反应的方法,所述方法包括如下步骤:
首先向针尖纳米孔101内注入含纳米材料的电解质溶液,备用;所述纳米材料上负载有荧光标记的基因;然后取具有凹槽105的盖玻片102,向所述凹槽内注入含剪切酶和/或能够与所述荧光标记的基因特异性吸附的物质的电解质溶液,将所述针尖纳米孔固定在所述盖玻片上且所述针尖纳米孔的针尖位于凹槽内;接着连接膜片钳106,将所述膜片钳探头端引出的电极104插入所述针尖纳米孔内,另一端电极103置于所述凹槽内;最后将所述盖玻片置于倒置荧光显微镜107上,在所述膜片钳控制电泳驱动下使剪切酶和/或能够与所述荧光标记的基因特异性吸附的物质进入所述针尖纳米孔内,或者使纳米材料进入所述凹槽内,通过观察电流信号和荧光信号的变化实现实时监控酶切反应。
优选的,所述电解质溶液为浓度是200-500mM,pH=7-8的KCl溶液或NaCl溶液中的一种。
优选的,所述纳米材料具有荧光淬灭效果。
优选的,所述纳米材料为氧化石墨烯、金纳米或二氧化硅中的一种或至少两种形成的复合纳米材料。
优选的,所述凹槽的底部厚度为0.13-0.17mm。
优选的,所述膜片钳探头端引出的电极为Ag/AgCl电极或铂丝电极中的一种,另一端电极为Ag/AgCl电极或铂丝电极中的一种。
优选的,所述针尖纳米孔的针尖直径为5-500nm。
优选的,所述针尖纳米孔的制备方法如下:
将毛细管浸泡于食人鱼刻蚀液中在25-80℃下处理15-120min,然后取出所述毛细管经清洗后烘干,最后利用模板法或拉直法制出针尖纳米孔。
所述毛细管的外部直径为1-2mm,内部直径为0.5-1.16mm。
优选的,所述食人鱼刻蚀液由质量分数为98%的浓硫酸和质量分数为30%的双氧水按体积比3:1混合而成。
优选的,所述烘干具体为用氮气吹干或真空烘干。
本发明的有益效果在于:本发明提供了一种基于针尖纳米孔单分子检测技术的实时监控酶切反应的方法,该方法中利用针尖纳米孔将溶液分为纳米孔内和纳米孔外两个区域,在电泳驱动下使剪切酶和/或能够与荧光标记的基因特异性吸附的物质进入针尖纳米孔内,或者使负载有荧光标记的基因的纳米材料进入凹槽内(即针尖纳米孔外),通过观察电流信号和荧光信号的变化实现实时监控酶切反应。针尖纳米孔对检测区域的物理分离,以及电泳控制待检测分子的移动,避免了其他外界因素对反应的干扰,膜片钳和荧光显微镜技术的结合能实时观察到反应动态,为纳米材料对酶切保护机理的研究提供更直接的证明。
本发明的其他优点、目标和特征在某种程度上将在随后的说明书中进行阐述,并且在某种程度上,基于对下文的考察研究对本领域技术人员而言将是显而易见的,或者可以从本发明的实践中得到教导。本发明的目标和其他优点可以通过下面的说明书来实现和获得。
附图说明
为了使本发明的目的、技术方案和优点更加清楚,下面将结合附图对本发明作优选的详细描述,其中:
图1为实施例1中制备的针尖纳米孔的扫描电镜图;
图2为本发明中构建的检测平台的示意图;
图3为实施例1中各阶段的荧光显微镜图;(图3中(a)为微囊藻毒素适配体负载到氧化石墨烯上的荧光显微镜图,图3中(b)为微囊藻毒素适配体离开氧化石墨烯表面后的荧光显微镜图,图3中(c)为在DNase1剪切酶的作用下的荧光显微镜图)
图4为实施例2中各阶段的荧光显微镜图。(图4中(a)为凝血酶适配体负载到金纳米上的荧光显微镜图,图4中(b)为凝血酶适配体离开金纳米表面后的荧光显微镜图,图4中(c)为在DNase1剪切酶的作用下的荧光显微镜图)
附图标记:针尖纳米孔101,盖玻片102,膜片钳另一端电极103,膜片钳探头端引出的电极104,凹槽105,膜片钳106,倒置荧光显微镜107。
具体实施方式
以下通过特定的具体实例说明本发明的实施方式,本领域技术人员可由本说明书所揭露的内容轻易地了解本发明的其他优点与功效。本发明还可以通过另外不同的具体实施方式加以实施或应用,本说明书中的各项细节也可以基于不同观点与应用,在没有背离本发明的精神下进行各种修饰或改变。
实施例1
(1)将外部直径为1mm,内部直径为0.7mm的毛细管浸泡于食人鱼刻蚀液(由质量分数为98%的浓硫酸和质量分数为30%的双氧水按体积比3:1混合而成)中在70℃下处理15min,然后取出毛细管经去离子水彻底清洗后用氮气吹干,最后利用拉直法拉制出针尖直径为300nm的针尖纳米孔,该针尖纳米孔的扫描电镜图如图1所示;
(2)首先向步骤(1)中拉制的针尖纳米孔内101注入含氧化石墨烯的浓度是500mM,pH=8的KCl溶液,该KCl溶液中氧化石墨烯的浓度为2.5μg/mL,备用,该氧化石墨烯上负载有荧光标记的微囊藻毒素适配体(F1:5‘-ggc gcc aaa cag gac cac cat gac aat taccca tac cac ctc att atg ccc cat ctc cgc-FAM),该适配体的浓度为0.1μM;然后取具有凹槽105的盖玻片102,该凹槽105呈圆柱体形,直径为6mm,底部厚度为0.17mm,向该凹槽105内注入含有微囊藻毒素分子(MC-LR)和DNase1剪切酶的浓度是500mM,pH=8的KCl溶液,该KCl溶液中微囊藻毒素分子的浓度为1μg/mL,DNase1剪切酶的浓度为0.2unit/μL,将针尖纳米孔101固定在盖玻片102上且其针尖位于凹槽105内;接着连接微型膜片钳106,将该微型膜片钳106探头端引出的Ag/AgCl电极104插入针尖纳米孔101内,另一端Ag/AgCl电极103置于凹槽105内;最后将盖玻片102置于倒置荧光显微镜107上,构建出了检测平台,该平台的示意图如图2所示,在微型膜片钳探头端(即针尖纳米孔内部)施加正向电压(+380mV),驱动针尖纳米孔外部带负电的微囊藻毒素分子(MC-LR)向针尖纳米孔内部移动,倒置荧光显微镜记录荧光强度,由于氧化石墨烯具有荧光淬灭效果,当荧光标记的微囊藻毒素适配体负载到氧化石墨烯上后,其荧光就会被淬灭(如图3中(a)所示),而当微囊藻毒素分子(MC-LR)进入针尖纳米孔内,通过吸附作用使荧光标记的微囊藻毒素适配体离开氧化石墨烯表面,此时微囊藻毒素适配体上的荧光就会有所恢复(如图3中(b)所示),接着在DNase1剪切酶的作用下,其荧光得到进一步增强(如图3中(c)所示)。
实施例2
(1)将外部直径为1mm,内部直径为0.5mm的毛细管浸泡于食人鱼刻蚀液(由质量分数为98%的浓硫酸和质量分数为30%的双氧水按体积比3:1混合而成)中在50℃下处理30min,然后取出毛细管经去离子水彻底清洗后真空烘干,最后利用拉直法拉制出针尖直径为200nm的针尖纳米孔;
(2)首先向步骤(1)中拉制的针尖纳米孔101内注入含金纳米的浓度是200mM,pH=7的NaCl溶液,备用,该NaCl溶液中金纳米的浓度为1.2nM,该金纳米上负载有荧光标记的凝血酶适配体(TBF:5‘-ctc agt ccg tgg tag ggc agg ttg ggg tga ct-FAM),该适配体的浓度为0.1μM;然后取具有凹槽105的盖玻片102,该凹槽105呈圆柱体形,直径为6mm,底部厚度为0.17mm,向该凹槽105内注入含有凝血酶(TB)和DNase1剪切酶的浓度是200mM,pH=7的NaCl溶液,该NaCl溶液中凝血酶(TB)的浓度为0.1μM,DNase1剪切酶的浓度为0.1unit/μL,将针尖纳米孔101固定在盖玻片102上且其针尖位于凹槽105内;接着连接微型膜片钳106,将该微型膜片钳106探头端引出的铂丝电极104插入针尖纳米孔101内,另一端铂丝电极103置于凹槽105内;最后将盖玻片102置于倒置荧光显微镜107上,构建出了检测平台,该平台的示意图如图2所示,在微型膜片钳探头端(即针尖纳米孔内部)施加负向电压(-380mV),驱动针尖纳米孔内部带负电的负载有荧光标记的凝血酶适配体的金纳米向针尖纳米孔外部移动,倒置荧光显微镜记录荧光强度,由于金纳米具有荧光淬灭效果,当荧光标记的凝血酶适配体负载到金纳米上后,其荧光就会被淬灭(如图4中(a)所示),而当负载有荧光标记的凝血酶适配体的金纳米进入针尖纳米孔外,凹槽内的凝血酶(TB)通过吸附作用使荧光标记的凝血酶适配体离开金纳米表面,此时凝血酶适配体上的荧光就会有所恢复(如图4中(b)所示),接着在DNase1剪切酶的作用下,其荧光得到进一步增强(如图4中(c)所示)。
在所述膜片钳控制电泳驱动下使剪切酶和/或能够与所述荧光标记的基因特异性吸附的物质进入所述针尖纳米孔内,或者使纳米材料进入所述凹槽内,通过观察电流信号和荧光信号的变化实现实时监控酶切反应。
最后说明的是,以上实施例仅用以说明本发明的技术方案而非限制,尽管参照较佳实施例对本发明进行了详细说明,本领域的普通技术人员应当理解,可以对本发明的技术方案进行修改或者等同替换,而不脱离本技术方案的宗旨和范围,其均应涵盖在本发明的权利要求范围当中。
序列表
<110> 中国科学院重庆绿色智能技术研究院
<120> 一种基于针尖纳米孔单分子检测技术的实时监控酶切反应的方法
<160> 2
<170> SIPOSequenceListing 1.0
<210> 1
<211> 60
<212> DNA
<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<400> 1
ggcgccaaac aggaccacca tgacaattac ccataccacc tcattatgcc ccatctccgc 60
<210> 2
<211> 32
<212> DNA
<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<400> 2
ctcagtccgt ggtagggcag gttggggtga ct 32
Claims (9)
1.一种基于针尖纳米孔单分子检测技术的实时监控酶切反应的方法,其特征在于,所述方法包括如下步骤:
首先向针尖纳米孔(101)内注入含纳米材料的电解质溶液,备用;所述纳米材料上负载有荧光标记的基因;然后取具有凹槽(105)的盖玻片(102),向所述凹槽内注入含剪切酶和能够与所述荧光标记的基因特异性吸附的物质的电解质溶液,将所述针尖纳米孔固定在所述盖玻片上且所述针尖纳米孔的针尖位于凹槽内;接着连接膜片钳(106),将所述膜片钳探头端引出的电极(104)插入所述针尖纳米孔内,另一端电极(103)置于所述凹槽内;最后将所述盖玻片置于倒置荧光显微镜(107)上,在所述膜片钳控制电泳驱动下使剪切酶和能够与所述荧光标记的基因特异性吸附的物质进入所述针尖纳米孔内,或者使纳米材料进入所述凹槽内,通过观察电流信号和荧光信号的变化实现实时监控酶切反应;
所述纳米材料具有荧光淬灭效果。
2.如权利要求1所述的方法,其特征在于,所述电解质溶液为浓度是200-500 mM,pH=7-8的KCl 溶液或NaCl溶液中的一种。
3.如权利要求1所述的方法,其特征在于,所述纳米材料为氧化石墨烯、金纳米或二氧化硅中的一种或至少两种形成的复合纳米材料。
4.如权利要求1所述的方法,其特征在于,所述凹槽的底部厚度为0.13-0.17mm。
5.如权利要求1所述的方法,其特征在于,所述膜片钳探头端引出的电极为Ag/AgCl电极或铂丝电极中的一种,另一端电极为Ag/AgCl电极或铂丝电极中的一种。
6.如权利要求1-5任一项所述的方法,其特征在于,所述针尖纳米孔的针尖直径为5-500nm。
7.如权利要求6所述的方法,其特征在于,所述针尖纳米孔的制备方法如下:
将毛细管浸泡于食人鱼刻蚀液中在25-80℃下处理15-120min,然后取出所述毛细管经清洗后烘干,最后利用模板法或拉直法制出针尖纳米孔。
8.如权利要求7所述的方法,其特征在于,所述食人鱼刻蚀液由质量分数为98%的浓硫酸和质量分数为30%的双氧水按体积比3:1混合而成。
9.如权利要求7所述的方法,其特征在于,所述烘干具体为用氮气吹干或真空烘干。
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