CN110066815B - 海带α型碳酸酐酶基因Sjα-CA3及其编码蛋白和应用 - Google Patents

海带α型碳酸酐酶基因Sjα-CA3及其编码蛋白和应用 Download PDF

Info

Publication number
CN110066815B
CN110066815B CN201910421670.3A CN201910421670A CN110066815B CN 110066815 B CN110066815 B CN 110066815B CN 201910421670 A CN201910421670 A CN 201910421670A CN 110066815 B CN110066815 B CN 110066815B
Authority
CN
China
Prior art keywords
alpha
protein
gly
ala
gene
Prior art date
Legal status (The legal status is an assumption and is not a legal conclusion. Google has not performed a legal analysis and makes no representation as to the accuracy of the status listed.)
Expired - Fee Related
Application number
CN201910421670.3A
Other languages
English (en)
Other versions
CN110066815A (zh
Inventor
毕燕会
许玲
周志刚
Current Assignee (The listed assignees may be inaccurate. Google has not performed a legal analysis and makes no representation or warranty as to the accuracy of the list.)
Shanghai Ocean University
Original Assignee
Shanghai Ocean University
Priority date (The priority date is an assumption and is not a legal conclusion. Google has not performed a legal analysis and makes no representation as to the accuracy of the date listed.)
Filing date
Publication date
Application filed by Shanghai Ocean University filed Critical Shanghai Ocean University
Priority to CN201910421670.3A priority Critical patent/CN110066815B/zh
Publication of CN110066815A publication Critical patent/CN110066815A/zh
Application granted granted Critical
Publication of CN110066815B publication Critical patent/CN110066815B/zh
Expired - Fee Related legal-status Critical Current
Anticipated expiration legal-status Critical

Links

Images

Classifications

    • CCHEMISTRY; METALLURGY
    • C12BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
    • C12NMICROORGANISMS OR ENZYMES; COMPOSITIONS THEREOF; PROPAGATING, PRESERVING, OR MAINTAINING MICROORGANISMS; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING; CULTURE MEDIA
    • C12N9/00Enzymes; Proenzymes; Compositions thereof; Processes for preparing, activating, inhibiting, separating or purifying enzymes
    • C12N9/88Lyases (4.)
    • CCHEMISTRY; METALLURGY
    • C12BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
    • C12YENZYMES
    • C12Y402/00Carbon-oxygen lyases (4.2)
    • C12Y402/01Hydro-lyases (4.2.1)
    • C12Y402/01001Carbonate dehydratase (4.2.1.1), i.e. carbonic anhydrase

Landscapes

  • Chemical & Material Sciences (AREA)
  • Organic Chemistry (AREA)
  • Life Sciences & Earth Sciences (AREA)
  • Health & Medical Sciences (AREA)
  • Engineering & Computer Science (AREA)
  • Bioinformatics & Cheminformatics (AREA)
  • Zoology (AREA)
  • Wood Science & Technology (AREA)
  • Genetics & Genomics (AREA)
  • Biochemistry (AREA)
  • General Health & Medical Sciences (AREA)
  • General Engineering & Computer Science (AREA)
  • Medicinal Chemistry (AREA)
  • Molecular Biology (AREA)
  • Biomedical Technology (AREA)
  • Biotechnology (AREA)
  • Microbiology (AREA)
  • Enzymes And Modification Thereof (AREA)
  • Micro-Organisms Or Cultivation Processes Thereof (AREA)

Abstract

本发明公开了海带α型碳酸酐酶基因Sjα‑CA3及其编码蛋白和应用,基因Sjα‑CA3的cDNA序列如SEQ ID NO:1所示,其DNA序列如SEQ ID NO:2所示;上述基因Sjα‑CA3编码蛋白的氨基酸序列如SEQ ID NO:3所示,通过上述基因Sjα‑CA3和表达载体构建所获得的重组蛋白rSjα‑CA3的氨基酸序列如SEQ ID NO:4所示,且重组蛋白rSjα‑CA3具有CO2水合反应的酶活性和酯酶反应活性;本发明的基因上述Sjα‑CA3、其编码蛋白和重组蛋白rSjα‑CA3可应用于高产转基因海带作物的培育。

Description

海带α型碳酸酐酶基因Sjα-CA3及其编码蛋白和应用
技术领域
本发明属于基因工程技术领域,具体涉及海带α型碳酸酐酶基因Sjα-CA3及其编码蛋白和应用。
背景技术
海带(Saccharina japonica)对CO2的吸收有助于缓解温室气体及水体酸化,HCO3 -占海水总无机碳含量的90%左右,是海水无机碳的主要形式;而CO2所占的比例不足无机碳总量的1%,但海带等大型海藻的光合作用效率却远远高于陆地植物(Gao&McKinley,1994)。这是因为多数海藻存在一种无机碳浓缩机制(CCM),可以增加1,5-二磷酸核酮糖羧化酶/加氧酶(RuBisCO)周围的CO2浓度,使藻体能固定更多的CO2以提高其光合作用效率。在CCM中,碳酸酐酶(Carbonic anhydrase,CA)是一个不可缺少的组分,CA是一种含锌金属酶,能够有效地催化
Figure GDA0003819705140000011
与CO2之间的可逆反应,有助于将CO2运输到RuBisCO周围。到目前为止,已经报道的CA有8种亚型,它们分别是α-CA、β-CA、γ-CA、δ-CA、ε-CA、ζ-CA、η-CA和θ-CA,其中,前三者广泛分布在植物、动物、真细菌和古细菌中。
发明内容
本发明的主要目的在于提供海带α型碳酸酐酶基因Sjα-CA3。
本发明的另一目的在于提供上述基因Sjα-CA3的编码蛋白。
本发明的目的之三在于提供上述基因Sjα-CA3与表达载体构建获得的重组蛋白rSjα-CA3。
本发明的目的之四在于提供上述基因Sjα-CA3、和/或其编码蛋白、和/或其重组蛋白rSjα-CA3在培育高产转基因海带作物上的用途。
本发明在海带高通量测序得到一条长为774bp的contig序列基础上,利用cDNA末端快速扩增(rapid amplification of cDNA ends,RACE)等技术获得该基因的cDNA全长序列如SEQ ID NO:1所示,它长1496bp,包括332bp的5′-非翻译区(un-translated region,UTR),297bp且具有明显poly A尾的3′-UTR和840bp的开放阅读框(open reading frame,ORF);它编码一个由279个氨基酸组成的蛋白如SEQ ID NO:3所示,相对分子质量为31.19kD,等电点为4.85。经TMHMM和iPSORT预测,该蛋白在N端开始的第11Ile-33 Arg位氨基酸具有一段强疏水性的跨膜区,同时存在长度为33个氨基酸的信号肽,酶切后的成熟蛋白由246个氨基酸组成,相对分子质量为27.52kD,等电点为4.61。通过在NCBI网站中进行同源性搜索和比对,发现该蛋白属于α-CA家族,它与海带基因Sjα-CA1(GenBank登录号:AEF33616.1)所编码的蛋白序列具有47%的一致性,与基因Sjα-CA2的编码蛋白序列具有49%的一致性,基因Sjα-CA2的cDNA序列如SEQ ID NO:5所示,其DNA序列如SEQ ID NO:6所示,基因Sjα-CA2编码蛋白的氨基酸序列如SEQ ID NO:7所示,且基于34个CA的氨基酸序列所构建的邻接和最大似然聚类图也显示,该CA与其它物种的α-CA聚为一支,因此将该基因命名为Sjα-CA3。
将基因Sjα-CA3不含有信号肽的ORF序列连接至表达载体pET-32a中,然后导入大肠杆菌(Escherichia coli)表达菌株BL21中,经过诱导表达和亲和层析纯化,获得重组蛋白rSjα-CA3,其氨基酸序列如SEQ ID NO:4所示。用电极法和分光光度计法对重组蛋白rSjα-CA3进行检测,发现它具有将CO2水合成
Figure GDA0003819705140000021
以及将乙酸对硝基苯酯酯化成对硝基苯酚的功能,证明Sjα-CA3基因为α-CA基因家族的成员。
本发明的上述技术方案采用的主要操作包括:
1)在温度17±1℃、光照强度40μmol photons/(m2·s)和光周期16h/8h(光照/黑暗)的条件下培养海带配子体,收集海带配子体细胞,并提取总RNA和基因组DNA。
2)在海带高通量测序所得到一条长为774bp的contig序列的基础上设计引物,利用RACE技术获得该基因5′-和3′-末端的cDNA序列,经拼接和重新设计引物验证,获得该基因的cDNA全长序列。
3)将Sjα-CA3与搜索到的其他CA的氨基酸序列利用MEGA6软件进行聚类分析,它与其他的α-CA聚为一支。经序列比对,发现它与Sjα-CA1(GenBank登录号:AEF33616.1)所编码的蛋白只有47%的序列一致性,与基因Sjα-CA2的编码蛋白只有49%的序列一致性,故将其命名为Sjα-CA3。
4)根据Sjα-CA3全长的cDNA序列设计引物,利用海带配子体基因组DNA作为模板进行PCR扩增,经拼接和重新设计引物验证,得到Sjα-CA3的DNA全长序列如SEQ ID NO:2所示。
5)根据Sjα-CA3不含叶绿体转运肽的ORF序列和克隆质粒pMD19-T及表达质粒pET32a多克隆位点序列设计带酶切位点的引物,利用PCR方法构建携带目的基因的克隆质粒pMD19T/Sjα-CA3。
6)利用核酸内切酶EcoRI和XhoI分别对pMD19T/Sjα-CA3和pET32a进行双酶切,回收目的片段,再用T4连接酶连接得到含目的片段的重组质粒pET32a/Sjα-CA3。
7)将测序正确的重组表达质粒pET32a/Sjα-CA3利用热激法转化到大肠杆菌BL21感受态细胞中,筛选到含有目的基因的转基因菌株ET32a/Sjα-CA3。将该转基因菌株接种到LB液体培养基中进行放大培养,当菌液在600nm的光密度(OD600)值达到0.6~0.8时,加入1mM的异丙基-β-D-硫代半乳糖苷(IPTG)继续培养以诱导目的蛋白的表达。
8)收集菌体并破碎,利用Bio-ScaleTMMini ProfinityTMIMAC Cartridges蛋白亲和层析纯化预装柱纯化到目的基因Sjα-CA3的重组蛋白rSjα-CA3。
9)利用十二烷基硫酸钠(SDS)聚丙烯酰胺凝胶电泳(PAGE)电泳技术对目的重组蛋白进行电泳,然后从凝胶上分离出目的条带,使用胰蛋白酶(Trypsin)对蛋白质样品进行酶解,再使用液相色谱-质谱-质谱(nanoLC-QE)联用对酶解后的多肽样品进行分析,以鉴定重组蛋白的氨基酸序列。
10)利用纯化后并得到复性的rSjα-CA3分别构建体外的CO2水合反应和乙酸对硝基苯酯酯化反应体系,分别用电极法和分光光度计法测定rSjα-CA3的酶活性。结果表明rSjα-CA3既具有CO2的水合酶活性,也具有酯酶活性,进而从功能上鉴定Sjα-CA3基因的编码蛋白。
与现有技术相比,本发明的有益效果在于:
本发明首次从海带中分离得到海带α型碳酸酐酶基因Sjα-CA3,通过基因克隆获得Sjα-CA3的cDNA和DNA序列,然后利用原核表达获得它的重组蛋白rSjα-CA3,最后利用电极法和分光光度计法分别检测rSjα-CA3在CO2水合反应的酶活性和酯酶反应活性,证明增加Sjα-CA3的基因表达量有助于提高海带产量。
附图说明
图1是Sjα-CA3的cDNA及DNA扩增产物电泳图;M:D2000分子量标准;泳道1:α-CA基因片段扩增产物;泳道2:5′-RACE的PCR产物;泳道3:3′-RACE的PCR产物;泳道4~6:基因Sjα-CA3的DNA分段扩增产物;泳道7:空白对照。
图2是Sjα-CA3的基因结构示意图;灰色线是非翻译区,黑色线为内含子,黑色框为外显子。
图3是基于CA的氨基酸序列所构建的聚类图;箭号所指示的是本发明的基因;每个物种拉丁名后面的括号内信息表示该物种的CA蛋白序列号;在节点处斜杠前后的数据,分别为邻接法(NJ)和最大似然法(ML)的靴带值。
图4是重组表达质粒pET32a/Sjα-CA3构建过程中相关产物的电泳图;M1:D2000分子量标准;M2:Marker IV分子量标准;泳道1:带有酶切位点的引物扩增Sjα-CA3的PCR产物;泳道2:pMD19T/Sjα-CA3的双酶切产物;泳道3:pET32a的双酶切产物;泳道4:pET32a/Sjα-CA3的双酶切产物。
图5是重组蛋白诱导表达产物的电泳及Western印迹图谱;M:蛋白质分子量标准品;泳道1~8:分别为经IPTG诱导0h、1h、2h、3h、4h、5h、6h和7h的全菌蛋白;泳道9、11:空载对照;泳道10:经IPTG诱导4h的全菌蛋白。
图6是pET32a质粒图谱(上)及多克隆位点区域的序列(下)。
图7是rSjα-CA3一个肽段的质谱图(上)及这个肽段在Sjγ-CA3中的位置(下);下划线表示质谱检测到的肽段序列,其中,红色字母表示上述质谱图所检测到的且在Sjα-CA3中对应的氨基酸序列。
图8是Sjα-CA3重组表达及其纯化产物的电泳与Western印迹图谱;M:蛋白质分子量标准品;泳道1:空载对照;泳道2:沉淀蛋白;泳道3:上清蛋白;泳道4~6:分别对应于用含250mM、5mM、10mM咪唑的洗脱缓冲液洗脱的产物;泳道7:用含250mM咪唑的洗脱缓冲液洗脱的产物。
具体实施方式
下面结合附图和实施例对本发明进一步说明。
1、材料
海带配子体材料自制,在温度为17±1℃、光照强度为40μmol photons/(m2·s)和光/暗比为16h/8h的条件下培养。所用培养基为PES(Starr&Zeikus,1993),每两个星期换一次培养基。
大肠杆菌克隆菌株DH5α、表达菌株BL21(DE3)和增强型HRP-DAB底物显色试剂盒购自天根生化科技有限公司。
表达载体pET32a购自鼎国生物公司。
Taq DNA聚合酶、限制性核酸内切酶EcoRI和XhoI、T4 DNA连接酶、TA克隆载体pMD19-T购自TaKaRa公司。
Bio-ScaleTMMini ProfinityTMIMAC Cartridges蛋白亲和层析纯化预装柱购自Bio-Rad公司。
质粒提取试剂盒、胶回收试剂盒、十六烷基三甲基溴化铵(CTAB)法植物基因组DNA提取试剂盒均购自北京艾德莱生物科技有限公司。
预染的蛋白质分子量标准购自Thermo Scientific公司。
抗聚His标签抗体和辣根过氧化物酶(HRP)标记羊抗兔IgG购买于上海友科生物科技有限公司。
TRIzol试剂、SMARTTMRACE cDNA扩增试剂盒购自Clontech公司。
氨苄青霉素钠(Amp)、卡那霉素(Kan)、异丙基-β-D-硫代半乳糖苷(IPTG)、5-溴-4-氯-3-吲哚-β-D-半乳糖苷(X-gal)均购自上海生工生物公司。
2、方法
(1)将0.1g刚离心收集的新鲜藻细胞置预冷的研钵中,加入液氮充分研磨。
(2)按照试剂盒的说明,利用CTAB法提取基因组DNA,-80℃保存备用;利用TRIzol试剂法,按照试剂盒的说明,抽提总RNA,-20℃保存备用。
(3)利用反转录试剂盒对RNA进行反转录(RT)PCR反应合成cDNA。
①去除基因组DNA反应。PCR反应体系包含2μL的5×基因组DNA去除酶缓冲液、1μL的基因组DNA去除酶、总RNA的量最大为500ng,然后加无RNA酶的去离子H2O至10μL。PCR反应条件为42℃保持2min,冷却至4℃保存。
②cDNA合成。PCR反应体系包含10μL的上述PCR反应液、4μL无RNA酶去离子H2O、4μL的5×Prime Script缓冲液、1μL的Prime ScriptRTEnzyme Mix I及1μL的RT Primer Mix。PCR反应条件为37℃保持15min、85℃保持5s、冷却至4℃保存,即完成cDNA的合成反应。
(4)将在海带高通量测序所得到的一条长为774bp的contig序列,利用NCBI进行BlastX搜索,发现它与海带基因Sjα-CA1(GenBank登录号:AEF33616.1)所编码的蛋白具有47%的序列一致性,与基因Sjα-CA2所编码的蛋白具有49%的序列一致性。
根据该contig序列设计1对引物α774F(GTCGGAAGCGCACCAAGTTA)和α774R(GCCCAACGAGTCAACCATCAT),以上述合成的cDNA为模板进行PCR扩增,反应产物经琼脂糖凝胶电泳并纯化、克隆及测序,以验证该contig序列。PCR反应体系包含1μL的cDNA、12.5μL的2×Taq PCR Master Mix及上、下游引物各1μL,最后加去离子H2O至25μL。PCR反应条件为:94℃预变性5min;94℃变性45s,58.3℃退火45s,72℃延伸1min,运行35个循环;72℃延伸10min,10℃保存。PCR产物经胶回收后连接至pMD19-T载体,然后利用热激法转化大肠杆菌DH5α感受态细胞,蓝白斑筛选后挑取阳性克隆,进行菌落PCR验证,将验证后含有目的片段的阳性克隆菌液送至上海生工生物工程有限公司测序,以验证目的片段的序列。
(5)根据验证的contig序列设计基因特异引物,并利用RACE技术分别获得该基因的5′-和3′-末端的cDNA序列。
①使用SmartTMRACE cDNA扩增试剂盒先合成5′-RACE和3′-RACE的cDNA第一链。
5′-RACE的cDNA第一链合成。PCR合成体系包含1.75μL的无RNA酶去离子H2O,1μL总RNA,1μL的5′-RACE CDS Primer A。PCR反应条件为72℃保持3min,42℃反应2min后冷却至4℃保存。取出并短暂离心后加入2μL的5×第一链缓冲液,1μL的二硫苏糖醇(DTT)(20mM),1μL的dNTP(10mM),1μL的Smart Scribe反转录酶,1μL的SMARTer IIA,0.25μL的RNA酶抑制剂。PCR反应条件为42℃保持90min,72℃保持10min,冷却至4℃保存;取出后加入100μL的Tricine-EDTA溶液(10mM Tricine-NaOH,0.1mM EDTA,pH 8.0)进行稀释后,于-20℃冰箱保存备用。
3′-RACE的cDNA第一链合成。PCR合成体系包含2.75μL的无RNA酶的去离子H2O及1μL的3′-RACE CDS Primer A,其他的反应组成及反应条件与5′-RACE的cDNA第一链合成反应一致。反应后同样稀释、保存备用。
②5′-RACE与3′-RACE的PCR反应。
5′-RACE采用巢式PCR反应。第一轮的PCR反应体系包含12.5μL的2×Taq PCRMaster Mix,9.5μL的无RNA酶去离子H2O,1μL5′-RACE的cDNA第一链反应液作为模板,1μL的引物5GSP1(gcacgcacctccgttctcgtgctcgg),1μL的引物UPM(试剂盒自带)。反应条件为:94℃预变性5min;94℃变性45s、63.9℃退火45s及72℃延伸2min,最后72℃延伸10min;40个循环。第二轮PCR的反应包含1μL第一轮PCR产物作为模板,引物为5NGSP(gagaagttgagctcctcgctcgagcac)和试剂盒中的NUP,其他组分同第一轮反应。反应条件为94℃预变性5min;94℃变性45s、61.5℃退火45s和72℃延伸2min,最后72℃延伸10min;共40个循环。
3′-RACE也采用巢式PCR反应。第一轮的PCR反应体系基本与5′-RACE的第一轮PCR反应体系相同,只是模板为3′-RACE的cDNA第一链反应液,同时,基因特异性引物为3GSP1(tccgggagagcaccaatggatggtgaac)。反应条件为:94℃预变性5min;94℃变性45s、69.3℃退火45s及72℃延伸2min,最后72℃延伸10min;40个循环。第二轮PCR反应体系包含1μL第一轮PCR产物作为模板,引物为3NGSP(ccgagcacgagaacggaggtgcgtgc)和试剂盒中的NUP,其他组分同第一轮反应。反应条件为94℃预变性5min;94℃变性45s、66.4℃退火45s和72℃延伸2min,最后72℃延伸10min;共40个循环。
第二轮PCR反应后的产物经上述相同的胶回收、连接、转化、蓝白斑筛选和测序等过程,从而获得Sjα-CA3的5′-及3′-末端的cDNA序列。
(6)Sjα-CA3的DNA全长序列获得
根据Sjα-CA3的cDNA序列设计3对引物,这些引物(对应的退火温度)分别为α1F(TGGCTGCGGATGCACGACATACAA)和α1R(ACGGTCCAGCTGGCGTCTCTC)(66.0℃)、α2F(GAGAGACGCCAGCTGGACCGT)和α2R(CACCATGTGGATCTCGGCGTCGT)(64.3℃)、α3F(ACGACGCCGAGATCCACATGGTG)和α3R(GCTCCACACACTCACACCAACTAACC)(64.3℃),以基因组DNA作为模板进行PCR反应。PCR反应体系包含1μL的cDNA、12.5μL的2×Taq PCR Master Mix及上、下游引物各1μL,最后加去离子H2O至25μL。PCR反应条件为:94℃预变性5min;94℃变性45s,在相应的退火温度退火45s,72℃延伸2min,运行35个循环;72℃延伸10min,10℃保存。反应产物经上述相同的胶回收、连接、转化、蓝白斑筛选和测序,拼接后获得Sjα-CA3的DNA全长序列。
(7)对获得的Sjα-CA3经TMHMM和iPSORT预测其跨膜区,经SignalP及ChloroP分别预测其信号肽、转运肽。运用NCBI中的BLAST Server(http://www.ncbi.nlm.nih.gov/BLAST)对已获得的序列进行同源性搜索。利用MEGA6软件中的最大似然法(ML)和邻接法(NJ)进行聚类分析。
(8)带酶切位点的目的基因开放阅读框(ORF)序列克隆
根据Sjα-CA3不含有叶绿体转运肽的ORF序列及克隆质粒pMD19-T和表达质粒pET32a多克隆位点的序列设计带酶切位点的引物EcoRI-αF(gaattcTCGTTTGCGAAAAAACATCACGA,小写字母为EcoRI酶切位点)和XhoI-αR(ctcgagTTATACGACTGATACGTAGTGG,小写字母为XhoI酶切位点),利用PCR技术扩增Sjα-CA3的去除转运肽的ORF片段。25μL的反应体系包括1μL的cDNA、12.5μL的2×Taq PCR MasterMix、9.5μL的去离子H2O、1μL的上游引物及1μL的下游引物。PCR反应条件为:94℃预变性5min;94℃变性45s,60.0℃退火45s,72℃延伸1min,运行35个循环;72℃延伸10min,10℃保存。PCR产物经过胶回收、TA克隆,以构建携带目的片段的克隆质粒pMD19T/Sjα-CA3,然后送上海生工生物工程公司测序确保目的片段序列的准确性。
(9)重组表达质粒pET32a/Sjα-CA3的构建
从测序正确的菌液中抽提质粒pMD19T/Sjα-CA3,用限制性内切酶EcoRI和XhoI分别对其及表达质粒pET32a进行双酶切反应,37℃反应4h。酶切反应体系包含2μL的10×H缓冲液(500mM Tris-HCl,100mM MgCl2,10mM DTT,1M NaCl,pH 7.5)、6μL的pMD19T/Sjα-CA3或pET32a、1μL的EcoRI、1μL的XhoI及10μL去离子H2O。胶回收酶切后的目的片段,并用T4DNA连接酶将酶切后的Sjα-CA3片段与pET32a片段连接得到重组表达载体pET32a/Sjα-CA3。连接反应体系为:3μL的目的基因片段、7.5μL的pET32a大片段、1μL的T4连接酶及2.5μL的T4缓冲液,然后加去离子H2O至25μL。将连接后的产物转化到大肠杆菌DH5α感受态细胞,按照上述方法进行菌落PCR验证和测序。
(10)重组表达质粒的提取与转化
利用质粒提取试剂盒从测序正确的菌液中抽提重组表达质粒pET32a/Sjα-CA3,经双酶切反应验证后,将pET32a/Sjα-CA3利用热激法转化至大肠杆菌BL21(DE3)感受态细胞。培养并吸取转化的菌液进行PCR验证,并将验证后携带目的基因的菌液送至上海生工生物工程公司测序。
(11)重组蛋白的诱导表达与检测
将测序正确的携带重组质粒pET32a/Sjα-CA3的表达菌株按1:1000(菌液:LB液体培养基)的比例接种于LB液体培养基,在37℃下、以180转/min(rpm)的转速活化培养10~12h。再按1:100(活化菌液:LB液体培养基)的比例,将活化的转基因菌液接种于LB液体培养基,放大培养至菌液的OD600值为0.6~0.8,加IPTG至终浓度为1mM,在37℃下、以180rpm的转速继续震荡培养,以诱导目的蛋白的表达。
取培养4h的菌液在4℃下、以7000rpm的转速离心5min,并将沉淀的菌体用1×磷酸缓冲液(PBS,含0.137M NaCl、2.7mM KCl、10mM Na2HPO4、2mM KH2PO4,pH 7.4)重悬。取50μL重悬全菌与2×蛋白上样缓冲液(100mM Tris-HCl,pH 6.8,200mM的DTT,4%SDS,20%甘油,0.2%溴酚蓝)以1:1的比例混合,沸水中煮10min留样备用。将重悬的样品在液氮中反复冻融3次并超声破碎至溶液透亮。在4℃下、以14000rpm的转速离心10min。收集上清并用1×PBS按10:1(菌液:1×PBS)的比例重悬沉淀,分别留样保存。利用十二烷基硫酸钠(SDS)聚丙烯酰胺凝胶电泳(PAGE)检测重组蛋白的诱导表达情况。
(12)重组蛋白rSjα-CA3的Western免疫印迹
在将蛋白样品进行SDS-PAGE电泳时,将事先剪好的与凝胶块大小一样的硝酸纤维素膜(NC)用去离子H2O浸泡1h,95%乙醇处理6s,然后放入转膜缓冲液(将30.2g的Tris和144g的Gly溶解于去离子H2O中并定容至1000mL)中至少平衡10min。待电泳结束后,在电转仪上,由下至上分别放入事先用转膜缓冲液平衡过的海绵垫、三层滤纸、电泳凝胶、NC膜、三层滤纸、海绵垫,使NC膜与正极相连。于4℃冰箱中在100V电压下转膜120min。转膜结束后,将NC膜取出用丽春红染色,观察蛋白是否成功转到膜上,然后用1×TBST(含0.137M的NaCl、2.7mM的KCl、0.025M的Tris和0.05%的Tween 20,pH 7.4)溶液在室温下用摇床洗3次,每次10min。清洗后,将NC膜立即浸入含5%脱脂奶粉的1×TBST封闭液中,室温下孵育60min。将抗聚His标签的商用抗体作为一抗,用封闭液按1:6000(一抗:封闭液)的比例稀释一抗。将标记好的NC膜放入,室温孵育60min后,用1×TBST在摇床上洗3次,每次10min。用1×TBST按1:8000的比例稀释HRP标记的羊抗兔IgG,室温下在摇床中孵育60min后,再用1×TBST洗3次,每次10min。用增强型HRP-DAB底物显色试剂盒在暗室中进行显色,并拍照记录。
(13)重组蛋白rSjα-CA3的分离与纯化
根据His标签能够与金属离子发生亲和作用的原理,利用Bio-ScaleTMMiniProfinityTMIMAC Cartridges蛋白亲和层析纯化预装柱来分离和纯化与组氨酸标签融合表达的重组蛋白rSjα-CA3。
①新的1mL预装层析柱分别用5倍(即5×)于层析柱柱床体积(column volume,CV)的超纯水、5×CV的20%的乙醇和5×CV的超纯水以2mL/min左右流速清洗层析柱。经过这样处理的层析柱即可用于后续的蛋白纯化。
②用至少5×CV的洗脱缓冲液1(6M尿素、5mM咪唑、50mM KH2PO4、300mM KCl,pH8.0)平衡层析柱,流速控制在1mL/min以内。
③将自转基因菌液中制备的包涵体先用20~30mL 1×PBS配制的2M尿素冰浴洗涤包涵体1h,在4℃下、以14000rpm的转速离心10min,洗去杂蛋白;再用1×PBS配制0.1%的Triton X-100,在冰浴条件下搅拌洗涤包涵体30min,在4℃下、以14000rpm的转速离心10min,去除脂类和膜蛋白;接着用10mL的8M尿素溶解包涵体,再用滤膜过滤一次,以防止堵塞柱子,然后以1mL/min的流速通过层析柱。
④再用16×CV的洗脱缓冲液1以1mL/min的流速清洗层析柱。
⑤然后,依次用16×CV的洗脱缓冲液2(含10mM咪唑,其他组分同缓冲液1,以下的洗脱缓冲液都如此,均省略)、洗脱缓冲液3(含250mM咪唑)以1mL/min的流速再次清洗层析柱,分别留样,4℃保存备用。
(14)重组蛋白rSjα-CA3的质谱鉴定与复性
吸取50μL每一梯度的洗脱液与2×蛋白上样缓冲液等体积混合后于沸水中煮10min,-20℃留样保存,利用SDS-PAGE进行电泳检测。从SDS-PAGE上分离出目的条带,使用胰蛋白酶(Trypsin)对蛋白质样品进行酶解,然后使用液相色谱-质谱-质谱(nanoLC-QE)联用对酶解后的多肽样品进行分析。采集多肽和多肽碎片的质量电荷比,通过搜索蛋白质质谱数据库解析氨基酸序列,并与目的基因所编码蛋白进行序列比对,以鉴定重组蛋白是否为目的蛋白。
将洗脱下来经过电泳检测的重组目的蛋白,用100×体积的缓冲液(0.05M Tris-HCl,150mM NaCl,1mM GSH,0.2mM GSSG,1mM EDTA,4M尿素,Arg 0.4M,5%甘油,pH 8.0)在4℃下透析24h;之后依次在尿素浓度为2M、1M、0M的透析缓冲液中透析12h以复性;在4℃下、以10000rpm的转速离心30min,取上清,测定蛋白浓度并浓缩,利用SDS-PAGE电泳检测,置4℃冰箱保存备用。
(15)重组蛋白rSjα-CA3的水合酶活性测定
①CO2饱和水溶液的制备:将CO2通入到0℃的去离子H2O中,持续通气1h。
②巴比妥混合液的配制:巴比妥0.184g,巴比妥钠1.030g,加去离子H2O至100mL,调pH至8.4,放在冰水混合物中备用。
③酶活性检测:将0.675mL纯化的rSjα-CA3(用50mM Tris-HCl,pH 8.0,将蛋白浓度调至0.743mg/mL)溶液加入到5mL巴比妥钠的缓冲液中,测定pH值;然后加入3mL的CO2饱和水,测定下降一个pH单位(即pH自8.4降至7.4)所需要的时间(min),整个过程要保持在冰水混合物中。
④酶活性计算:若1个酶活性单位(U)定义为(t0-t)/t(Haglund et al.,1992),其中,t0和t分别代表加入50mM的Tris-HCl和蛋白酶液后下降一个pH单位所用的时间(min),那么,rSjα-CA3的比活力即可用“(t0-t)/t/mg蛋白质”来计算。
(16)rSjα-CA3的酯酶活性测定
①对硝基苯酚(p-NP)标准曲线的绘制:先配制含10%乙腈的Tris缓冲液,然后用该缓冲液配制5μM、10μM、20μM、30μM、40μM、50μM、60μM、70μM、80μM、90μM、100μM、200μM、500μM等不同梯度浓度的p-NP溶液。
②3mM乙酸对硝基苯酯(p-NPA)配制(需现配现用):取0.0136g的p-NPA,用乙腈溶解并定容至25mL。
③操作步骤:0.839mL的重组蛋白用0.05mL的Tris-HCl稀释(空白对照组是直接加入0.839mL的Tris-HCl缓冲液),然后加入0.05mL的p-NPA迅速混合,用紫外分光光度计检测反应起始时405nm处的OD值,并每隔3min反应时间记录其OD405值,根据实验组和对照组的OD405变化情况来确定其酯酶活性。
④酶活性计算:若一个酶活性单位(U)定义为在0℃下、每min产生1μmol的p-NP(Bhakta et al.,2016),那么,rSjα-CA3的比活力即可用“(C-C0)×V/t/g蛋白质”来计算;其中,C、C0分别代表加酶液和不加酶液体系中p-NP的浓度(μM),V为总反应体积(mL),t为反应时间(min)。
3、结果
(1)根据一条长为774bp的contig序列设计引物α774F和α774R,以海带配子体的cDNA为模板,扩增得到一条大小为583bp的产物(图1泳道1)。利用RACE技术分别获得616bp长5′-RACE的PCR产物(图1泳道2)和770bp长3′-RACE的PCR产物(图1泳道3)。经与验证的583bp片段拼接,并重新设计引物扩增、克隆与测序后,可知Sjα-CA3的cDNA全长序列大小为1496bp(序列1),包括一个长为840bp的ORF区、332bp的5′-非翻译区(UTR)以及297bp的3′-UTR。
Sjα-CA3编码一个由279个氨基酸组成的前体蛋白,相对分子质量为31.19kD,等电点为4.85。经TMHMM和iPSORT预测,在N端开始的第10His-32 Val位氨基酸具有一段强疏水性的跨膜区。SignalP的预测结果显示,Sjα-CA3无信号肽;但经ChloroP预测,可知它具有由33个氨基酸构成的叶绿体转运肽。这样,酶切后的成熟蛋白由246个氨基酸组成,相对分子质量为27.52kD,等电点为4.61。
基于Sjα-CA3的全长cDNA序列设计3对引物(α1F和α1R、α2F和α2R以及α3F和α3R),以海带基因组DNA为模板进行PCR扩增,产物的大小在1400bp~2400bp之间(图1泳道4~6),经测序、拼接和验证,可知该基因的DNA全长序列大小为5485bp(序列2)。
将该DNA序列与其对应的cDNA序列进行比对,发现Sjα-CA3在其ORF中存在6个内含子,它们的大小自5′-端开始依次为1391bp、356bp、545bp、605bp、486bp、633bp,从而将该基因的ORF分隔成7个外显子(图2)。
(2)将自NCBI中同源搜索获得的33条不同物种CA的氨基酸序列与Sjα-CA3用邻接法(NJ)和最大似然法(ML)进行聚类分析。结果(图3)显示,34条序列明显地被聚成3大支,分别对应于α-CA(NJ和ML的靴带值分别99%/81%)、β-CA(NJ和ML的靴带值分别为100%/97%)和γ-CA(NJ和ML的靴带值分别为99%/87%)。本研究自海带中所克隆的CA基因在聚类图中位于α-CA分支,与海带α型碳酸酐酶基因Sjα-CA1和Sjα-CA2很接近,表明Sjα-CA3应属于α-CA家族。
(3)基于Sjα-CA3不含叶绿体转运肽的ORF序列和克隆质粒pMD19-T及表达质粒pET32a多克隆位点的序列,设计带酶切位点的引物EcoRI-αF/XhoI-αR,以海带配子体的cDNA为模板,扩增Sjα-CA3不带有叶绿体转运肽的ORF序列(图4泳道1),并连接至克隆质粒pMD19-T上构建pMD19T/Sjα-CA3;再用EcoRI和XhoI分别双酶切pMD19T/Sjα-CA3及表达质粒pET32a(图4泳道2和3),连接目的片段以构建含目的基因的重组表达质粒pET32a/Sjα-CA3。提取该表达质粒,经EcoRI和XhoI双酶切反应,其产物经电泳检测(图4泳道4)显示,该质粒是由目的基因(大小741bp)和载体序列(大小5866bp)的片段构成,表明已成功构建了pET32a/Sjα-CA3的重组表达质粒。
(4)将pET32a/Sjα-CA3转化大肠杆菌BL21的感受态细胞中,获得转基因细胞系ET32a/Sjα-CA3。经放大培养及添加IPTG进行不同时间的诱导培养,收集全菌,SDS-PAGE的电泳结果(图5泳道1~8)显示,与空载的菌体(图5泳道9)相比,转目的基因的菌体产物中出现大小约为60kD的新条带,且随着IPTG诱导时间的延长,该条带越来越明显,至诱导4h及以上时(图5泳道5、6和7),该条带相应产物的量相近。这些诱导表达产物的电泳结果表明,该条带可能就是目的基因的表达产物,但它的大小(约为60kD)比重组蛋白的理论分子量(包含27.52kD由目的基因编码的蛋白及17.60kD如图6所示由表达质粒pET32a中His标签、Trx标签等及多克隆位点碱基所编码的多肽)大了约15kD。
为了证明这条60kD是重组的目的蛋白,首先由于是运用表达质粒pET32a中的His标签融合表达目的蛋白,可利用商业提供的抗聚His标签的抗体,对自转基因细胞系中提取的总蛋白进行Western免疫印迹,以确定表达的是否目的蛋白。Western印迹结果(图5泳道10)显示在目的蛋白大小相近处只出现一条信号,而空载中无此信号(图5泳道11),说明该蛋白具有His标签且是融合表达的目的蛋白;印迹所对应的分子量大小约为60kD,与SDS-PAGE的电泳结果(图5泳道1~8)一致。
其次,从SDS-PAGE上分离约60kD的目的条带,经酶解上样至Trap柱,利用液相色谱-质谱-质谱联用,采集多肽和多肽碎片的质荷比,并搜索蛋白质谱数据库,检测到4个肽段(图7)共75个氨基酸,虽只占目的蛋白总长度(246个氨基酸)的30.49%,但每个肽段均与Sjα-CA3所编码蛋白的相应片段完全匹配。这个结果表明重组的就是目的基因Sjα-CA3所编码的蛋白。
(5)将添加IPTG诱导培养4h的ET32a/Sjα-CA3,反复冻融以破碎细胞,分别提取上清和沉淀中的蛋白,经SDS-PAGE电泳,发现重组蛋白可存于上清和沉淀(图8泳道2和3)中,但主要以包涵体的形式表达于沉淀(图8泳道2)中。利用Bio-ScaleTMMini ProfinityTMIMACCartridges蛋白亲和层析纯化预装柱,对自包涵体中提取的蛋白用含不同浓度咪唑的洗脱缓冲液进行纯化(图8泳道4、5和6)。其中,用含250mM咪唑的洗脱缓冲液洗脱下来的蛋白(图8泳道4),经SDS-PAGE电泳和染色,在目的蛋白大小处只显现一条带而无杂带;同时,利用抗聚His标签的抗体对纯化的rSjα-CA3进行Western印迹,结果在约60kD处只显现唯一印迹(图8泳道7)。结果表明,经过亲和层析,已纯化到重组蛋白rSjα-CA3。
(6)自包涵体中纯化的蛋白因构象折叠错误而无酶活性,因此在进行活性检测之前,必须对纯化的重组蛋白进行复性。将经过尿素梯度透析而复性的rSjα-CA3在体外构建CO2的水合反应(即
Figure GDA0003819705140000131
)体系,利用电极法测定可知,需要约1.5min的时间,反应体系中的pH就从8.4下降到7.4;而在不加rSjα-CA3的体系中,约需要2.1min的时间,pH才能下降到7.4。这个结果表明rSjα-CA3具有加速CO2的水合反应能力,从而使反应体系在指定的时间内形成更多的H+。通过计算可知,rSjα-CA3的水合反应比活力为0.82±0.087U/mg蛋白(3次重复试验的平均值±标准差)。
鉴于α-CA还具有酯酶活性,本发明还构建体外将p-NPA酯化成p-NP的反应体系,来检测rSjα-CA3的酯酶活性。在加入rSjα-CA3的实验组中,OD405值会随着时间的延长不断地增加,当反应时间到达60min时,OD405值就不再发生明显的变化,也就是说此时在这个体系中几乎不产生新的p-NP,表明加入的rSjα-CA3能使p-NPA逐渐酯化从而生成p-NP。通过计算可知,rSjα-CA3的酯酶比活力为2.157±0.007U/g蛋白(3次重复试验的平均值±标准差)。这样,通过重组蛋白的酶活性检测,鉴定了Sjα-CA3编码蛋白的功能。
Figure GDA0003819705140000141
Figure GDA0003819705140000151
Figure GDA0003819705140000161
Figure GDA0003819705140000171
Figure GDA0003819705140000181
Figure GDA0003819705140000191
Figure GDA0003819705140000201
Figure GDA0003819705140000211
Figure GDA0003819705140000221
Figure GDA0003819705140000231
Figure GDA0003819705140000241
Figure GDA0003819705140000251
Figure GDA0003819705140000261
Figure GDA0003819705140000271
Figure GDA0003819705140000281
序列表
<110> 上海海洋大学
<120> 海带α型碳酸酐酶基因Sjα-CA3及其编码蛋白和应用
<141> 2019-05-14
<160> 7
<170> SIPOSequenceListing 1.0
<210> 1
<211> 1496
<212> DNA
<213> 海带(Saccharina japonica)
<400> 1
tggctgcgga tgcacgacat acaacgcgtt cgcttatata ggtattctgc acgtctaaat 60
ctgactgatt tacgagtaca aggcatcgaa ctatactctc cttttactgc attgcaatct 120
agtgccggta tctcttgtgt cgtactgtat ttttgtgacc acagagcttg cttgtatccg 180
atctcaaaaa ttgacacgaa cactgggtgt gctggatgtc ggcgggtaga cacaaataaa 240
aataacggtt taatgtttgt ttttgctttt ttactactac tactactact actactacta 300
ctactactac tactactact actgtgctgt tcatgcatcc agctgttgta gatactcacc 360
acatatttgc ttccctttcc gttttccttg ttttctgttg cccctcgtcg ctcttgcatg 420
cgcgcgttcg ttcgtttgcg aaaaaacatc acgatatacc acaaaacagc gactgggggg 480
agtctttcga ggactgctac ggtgacatgc agagccccat caacttgtcg gaagcgcacc 540
aagttatcaa acacgccggc gagtacgatt tggaattcca cgcagaactg tgctcgagcg 600
aggagctcaa cttctctccg ggagagcacc aatggatggt gaacttcgcc gactgcacgg 660
acagatcatc tctgacgttt gacggcgacc actaccagct cctcaacgta cacatccact 720
ccgtttccga gcacgagaac ggaggtgcgt gccacgacgc cgagatccac atggtgcacg 780
tgcgcgaggg cacggacgac gaactcctcg ttgtaggcgt tcttctcgac gcgtcgatgt 840
tcggctacaa caatgagctg acgccgatgt gggaagttct cgcgaagggc gaggaggagg 900
gcgacgaaga acacgaattc tccttgtctc cctacgagat gctcccggcg agccgcgcgt 960
actcgcacta catgggctct ttgactaccc ctccgtgcac cgagggcgtt aagtggatcg 1020
tcatgaccga ccccacgctt cttggccttg gccagctcac caccttccgc gccgccgtcg 1080
gctctcacat gatggttgac tcgttgggca acacgaaccg acctgtgcag cctctcaacg 1140
gccgcgaggt ccactacgta tcagtcgtat aatcgaacgg aacgtccggg agatcgatcg 1200
ccaaccacca accacatcat taccaccaac cccccccccc gtgtgttttc ccgtaatttt 1260
ggggaaaccg acggcgcaga catataactt atggaggcgt gtttggggtg gggggtggtg 1320
taaaagtgtt gtatggcggt tcgatgaaat cttcagtacg tgagttattt ttgcatcatc 1380
ggaagggagg ttggttagtt ggtgtgagtg tgtggagcaa aaggaaaaag acccggccca 1440
caaacataaa aaaatacatt ttttttccga aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaa 1496
<210> 2
<211> 5485
<212> DNA
<213> 海带(Saccharina japonica)
<400> 2
tggctgcgga tgcacgacat acaacgcgtt cgcttatata ggtattctgc acgtctaaat 60
ctgactgatt tacgagtaca aggcatcgaa ctatactctc cttttactgc attgcaatct 120
agtgccggta tctcttgtgt cgtactgtat ttttgtgacc acagagcttg cttgtatccg 180
atctcaaaaa ttgacacgaa cactgggtgt gctggatgtc ggcgggtaga cacaaataaa 240
aataacggtt taatgtttgt ttttgctttt ttactactac tactactact actactacta 300
ctactactac tactactact actgtgctgt tcatgcatcc agctgttgta gatactcacc 360
acatatttgc ttccctttcc gttttccttg ttttctgttg cccctcgtcg ctcttgcatg 420
cgcgcgttcg ttcgtttgcg aaaaaacatc acgatatacc acaaaacagc gactgggggg 480
agtctttcga ggactgctac ggtgacatgc agagccccat caacttgtcg gaagcgcacc 540
aagttatcaa acacgtaagt ccttgcacca tcatgcatac acggtacatg attcgtgcgc 600
catactggtt cacccccatg gtataatata tgtccccctc atacgggatg tacatcctac 660
atgaggacat ataaaatccg taagtacgcg cgatcgaagt attacactca gctagcaaag 720
atgagcttcg acgaaatctt ttaatatacg atcgtctatg tatcgcatcg tcaaccgtac 780
cggggtatgt actaatataa gtacagtccg tatattaatt aagttatccg aatggtcctt 840
atatttcagg acaaagcggt gttgtatata cgtcactagc ctcctgctgc ggttgccctt 900
acatgcgcac gagtccccaa gtcttgtggc ccatatgtac gagtgcacac ctgatacacc 960
tggtgcatat cgcatctaat actacactgc tctactatcg ataggtgtac gttcatgtat 1020
atatgtatat atctgcatgc gtatatcgat acgtgaccag aaaaaaagtg aaaacacgaa 1080
agcatttttg accttgagaa acataccagg tacagcctac atgaatatga tttgttaaca 1140
atataccagg tacgaagcac gtggttctgt gctcgtatat atgaatatat atatacagat 1200
gtagacgaag acgaggtgct gcctgcgggt attgtgtact cttgtgtggt acatacataa 1260
aatttccaga tctcgacgtc ttcggccggt gtcatacaag tcgtacgtag ctgacatatt 1320
atatacctga tacctggtag ctgctggtat acgatatttt atcgtgagcg gattgtgcac 1380
ggtttgtgcg actatggcta tggctattat ggcctatgat ccccccaaaa acaactacgt 1440
acatacgata tacgagtact aagtattact acctgtcaaa agcccatagt tctgcgctgt 1500
acggcagtag aaggcagtca tattaatagt aacatcatag gtaaaaaaca taaaatcata 1560
accacatact cctatatact acgagagacg ccagctggac cgtgaaatgt attttttgcg 1620
tggttgcttt ctatggggta ttgacttttg tagagccatc ccccataggt tgcttctgct 1680
tcacccctcc agctgccccc ccatggtcat acgactacgg ccatgcatga aaataaaaga 1740
cccccccccc ttcccccctg cgagggtcct ggtcatacga ctacggccgt gcacgacatg 1800
agtaaccccc cccccccccc cggtcaagcc gcgaccatcg ctctaacgaa tctaccgcct 1860
cgtttgcttc tttcctcccc tcttctctac ttttgcctgt tttctctgtt gttttgtctg 1920
tcttgtctct gttgtctgat ctcaggccgg cgagtacgat ttggaattcc acgcagaact 1980
gtgctcgagc gaggagctca acttctctcc gggagagcac caatggatgg tgagcgcacg 2040
cacacctaca ggcagatcgc acgggtttcg agccattatt aatattttga cgagattatg 2100
ctatcgtaca catatcatat gtacaatgtg tataagctgt gtccgcattg aagtttgaag 2160
acctcgtttt gtgtcgcagg gtcaacgtca ggggaaatag tgtagtacca ggtattacag 2220
atgggtgctg caaactgctg tgcgtgccat acagccccac cgcaccgcgc ccgcccacac 2280
tgctgtccat tctgacctta ttatccgttt gctgattcgg caccccgccg tcgcccgtga 2340
tcgctgtttt ccgtgtgttt ttttgttcaa cgaactttta aataggtgaa cttcgccgac 2400
tgcacggaca gatcatctct gacgtttgac ggcgaccact accagctcct caacgtacac 2460
atccactccg tttccgagca cgaggtgagt tttcaatcgt tgtgcgagat cgcagtgtcg 2520
tctgatatat cacacagctt gcagaaaagc tgagtttcga cgattttctt cgcgacctcg 2580
cggctctggt gtcccgttta cgcaaatcac cccttccaaa acaaggagaa cgtgtacagt 2640
tactgtagta gtatatatac ttcgtaccac gtatatatta atgagtttcg acgaaatcct 2700
cgatctccca gctgctattt tcgtatgtaa gtacacctgg ttcacaccgc ctgctgtgta 2760
cagtagtaca tgtatggcca ggggagggga tgaacaagct agcagaacgg cgaacacctg 2820
atcgctaacg ataaacgtag ttttgaacat tcttgtatga gtttcgacga aatcttcgat 2880
ctcacagctc tgctttttgc tttttgtatg taagtacacc tgtaattcac actgctgctc 2940
cctgttgata ctaattgcat gtcccctcgc ccgatgcact tgccttgcct tgcttgcctc 3000
cttttgcttt gttttcgttt cttgttcaga acggaggtgc gtgccacgac gccgagatcc 3060
acatggtgca cgtgcgcgag ggcacggacg acgaactcct cgttgtaggc gttcttctcg 3120
acgcgtcgat gttcggctac aacaatgagg tacgtacgca tctcgtcatt attgtgtgtg 3180
tgtaccctgc tgtcgtgtac acagagggcg ggcgctttca ataaattcaa gtatccttaa 3240
cgttagcctt agcgagctat agcctaagcg ttgctagcct tagcgagata tacgtagcct 3300
ttagcgttgc tagccttaag cgagctatag ccttaacgtt gctagcttta gcgagctata 3360
gccttagcgt tgctagcctg agcaatggcc ttagcgagct acatgcttaa tgcttctagc 3420
ctttaacgct agctttagca ctgccacgct agcgctaacg ctgctagcct taacgctatg 3480
ccttagcgcc aagcctcaac atcgccttag cgctatatat agcccctcag cctgtccatt 3540
cgaacgacgc gtaggcagct ccagacatta ggcaagggcg acgccggccg aggccaggct 3600
aggctaggct agccggccgt aggctgacca tgataacaag acactcgcat tgacaaatac 3660
ataacgcccc ccccgccccc ctctgcacgc acaaaccccc acgccacacc tttttttaac 3720
aattccaccc accacacttg tttgtgcacc acagctgacg ccgatgtggg aagttctcgc 3780
gaagggcgag gaggagggcg acgaagaaca cgaattctcc ttgtctccct acgagatgct 3840
cccggcgagc cgcgcgtact cgcactacat gggctctttg actacccctc cgtgcaccga 3900
ggtgaggggc tattttatat ttcttgtttg tttttacctg ctgaactgtt tgaatggcga 3960
acgaacgaat gaatcgcggc cccaactaac tatcggatgg tatcgttttg aagttttaac 4020
ttttccgtgt gttgtgtgtg tttttttttg ggagcgctta atatagtgat ggaaggttga 4080
agctcatacg ctacacctca ttgctggatg gtcaggataa caaggatagt acgaagtgga 4140
caaaacgggc atgcagaggc tacaaacagt tacacaactt gtcaccgaac gatatcgcga 4200
aaacacacac acacatcacg tcggggaaca cacgcgtgtt ggcttcaatt caaagtgcaa 4260
gcaactcaca acaagtcttg tccctaagtc ttttgatcgt ttgaggtcaa gccgaggtag 4320
cagtatattt tgactcgata tttcccgccc ccttgtgtga cccgacgtcc gtttggctgt 4380
cttgcagggc gttaagtgga tcgtcatgac cgaccccacg cttcttggcc ttggccagct 4440
caccaccttc cgcgccgccg tcggctctca catgatggtg agtcagtcaa ccaacgaaaa 4500
tgtcgcgcgg ggtcttgggt ggttgtacgt acgtacatac atatgtgtat ttcttttggc 4560
cgacatggta cttgtcgtat ttgttactat tgcctgtcac ctgttactct tctgtcccaa 4620
aatagaaggg cagcaagggg gaaatcagaa aagaaagcct atcataccgc gagcacgaca 4680
taataagtcg taacttccca ttctccctgt atggtactct tgatcgaaac atgagggttt 4740
tgatcatgga taggtccagc cagcttcaca tcgatttact actacaccac tcgtgctgcc 4800
ctttttctcc tcccttctca ttcgagcaat gccttaaaag gctcgtgcct tgctaataat 4860
actcataacc gcttacaagc tcacttaagt gggtcaacct tgctcataaa ttactgagct 4920
cattaaaaaa aaagtgtgac gccttaccgt gggatgagtg tttcttaaac agcagtagct 4980
cctcctcctg cctccctata ccttatactc ctcagtccta agccgcgtcc tattttgtgt 5040
tccctcaccc tccccccccc cctgccgacg ccctcctccc tccgtccgtc tgtcccgtcg 5100
tgttgcttag gttgactcgt tgggcaacac gaaccgacct gtgcagcctc tcaacggccg 5160
cgaggtccac tacgtatcag tcgtataatc gaacggaacg tccgggagat cgatcgccaa 5220
ccaccaacca catcattacc accaaccccc ccccccgtgt gttttcccgt aattttgggg 5280
aaaccgacgg cgcagacata taacttatgg aggcgtgttt ggggtggggg gtggtgtaaa 5340
agtgttgtat ggcggttcga tgaaatcttc agtacgtgag ttatttttgc atcatcggaa 5400
gggaggttgg ttagttggtg tgagtgtgtg gagcaaaagg aaaaagaccc ggcccacaaa 5460
cataaaaaaa tacatttttt ttccg 5485
<210> 3
<211> 279
<212> PRT
<213> 海带(Saccharina japonica)
<400> 3
Met His Pro Ala Val Val Asp Thr His His Ile Phe Ala Ser Leu Ser
1 5 10 15
Val Phe Leu Val Phe Cys Cys Pro Ser Ser Leu Leu His Ala Arg Val
20 25 30
Arg Ser Phe Ala Lys Lys His His Asp Ile Pro Gln Asn Ser Asp Trp
35 40 45
Gly Glu Ser Phe Glu Asp Cys Tyr Gly Asp Met Gln Ser Pro Ile Asn
50 55 60
Leu Ser Glu Ala His Gln Val Ile Lys His Ala Gly Glu Tyr Asp Leu
65 70 75 80
Glu Phe His Ala Glu Leu Cys Ser Ser Glu Glu Leu Asn Phe Ser Pro
85 90 95
Gly Glu His Gln Trp Met Val Asn Phe Ala Asp Cys Thr Asp Arg Ser
100 105 110
Ser Leu Thr Phe Asp Gly Asp His Tyr Gln Leu Leu Asn Val His Ile
115 120 125
His Ser Val Ser Glu His Glu Asn Gly Gly Ala Cys His Asp Ala Glu
130 135 140
Ile His Met Val His Val Arg Glu Gly Thr Asp Asp Glu Leu Leu Val
145 150 155 160
Val Gly Val Leu Leu Asp Ala Ser Met Phe Gly Tyr Asn Asn Glu Leu
165 170 175
Thr Pro Met Trp Glu Val Leu Ala Lys Gly Glu Glu Glu Gly Asp Glu
180 185 190
Glu His Glu Phe Ser Leu Ser Pro Tyr Glu Met Leu Pro Ala Ser Arg
195 200 205
Ala Tyr Ser His Tyr Met Gly Ser Leu Thr Thr Pro Pro Cys Thr Glu
210 215 220
Gly Val Lys Trp Ile Val Met Thr Asp Pro Thr Leu Leu Gly Leu Gly
225 230 235 240
Gln Leu Thr Thr Phe Arg Ala Ala Val Gly Ser His Met Met Val Asp
245 250 255
Ser Leu Gly Asn Thr Asn Arg Pro Val Gln Pro Leu Asn Gly Arg Glu
260 265 270
Val His Tyr Val Ser Val Val
275
<210> 4
<211> 308
<212> PRT
<213> 海带(Saccharina japonica)
<400> 4
Met Ser Leu Ala Gly Ser Gly Ser Gly His Met His His His His His
1 5 10 15
His Ser Ser Gly Leu Val Pro Arg Gly Ser Gly Met Lys Glu Thr Ala
20 25 30
Ala Ala Lys Phe Glu Arg Gln His Met Asp Ser Pro Asp Leu Gly Thr
35 40 45
Asp Asp Asp Asp Lys Ala Met Ala Asp Ile Gly Ser Glu Phe Ser Phe
50 55 60
Ala Lys Lys His His Asp Ile Pro Gln Asn Ser Asp Trp Gly Glu Ser
65 70 75 80
Phe Glu Asp Cys Tyr Gly Asp Met Gln Ser Pro Ile Asn Leu Ser Glu
85 90 95
Ala His Gln Val Ile Lys His Ala Gly Glu Tyr Asp Leu Glu Phe His
100 105 110
Ala Glu Leu Cys Ser Ser Glu Glu Leu Asn Phe Ser Pro Gly Glu His
115 120 125
Gln Trp Met Val Asn Phe Ala Asp Cys Thr Asp Arg Ser Ser Leu Thr
130 135 140
Phe Asp Gly Asp His Tyr Gln Leu Leu Asn Val His Ile His Ser Val
145 150 155 160
Ser Glu His Glu Asn Gly Gly Ala Cys His Asp Ala Glu Ile His Met
165 170 175
Val His Val Arg Glu Gly Thr Asp Asp Glu Leu Leu Val Val Gly Val
180 185 190
Leu Leu Asp Ala Ser Met Phe Gly Tyr Asn Asn Glu Leu Thr Pro Met
195 200 205
Trp Glu Val Leu Ala Lys Gly Glu Glu Glu Gly Asp Glu Glu His Glu
210 215 220
Phe Ser Leu Ser Pro Tyr Glu Met Leu Pro Ala Ser Arg Ala Tyr Ser
225 230 235 240
His Tyr Met Gly Ser Leu Thr Thr Pro Pro Cys Thr Glu Gly Val Lys
245 250 255
Trp Ile Val Met Thr Asp Pro Thr Leu Leu Gly Leu Gly Gln Leu Thr
260 265 270
Thr Phe Arg Ala Ala Val Gly Ser His Met Met Val Asp Ser Leu Gly
275 280 285
Asn Thr Asn Arg Pro Val Gln Pro Leu Asn Gly Arg Glu Val His Tyr
290 295 300
Val Ser Val Val
305
<210> 5
<211> 1758
<212> DNA
<213> 海带(Saccharina japonica)
<400> 5
gtggggtgtc gcggcagcgt ccgtggtgtg ccgcgacatg tcgcgacacg tgccacgaaa 60
aagtccaata atgtattatt tgtgtccgtt tcacatatcg tttataacac gacagacaca 120
aaggcaccct cagctatccg gacaatgggc aaggtacctc tcacacttag attgtcctca 180
tcttcgcccc acggctgtac ccacttgtgt gttgtcgttt acttgtatcc gtttcacata 240
tcgtttataa cacgacagac actatggcac cctcagctat ccggacaatg ggcaaggtgc 300
tcttgtgctc tcttctcctg ccaagcttcc caggactggt cgccgcctca caacggcagc 360
gtggacccac gactgccgac gagcctgagg aatcctcctt tcccgactgg acctaccgcc 420
gcgcttccca cgaaggagaa aggccgtaca gccccagcga ttgggagatc ggctacccgg 480
actgtggcgg agactctcag agccccatca acttgtccgc caatgttgga acgctcgtcg 540
aggcaactga gttcaatctt gagcttttcg gagctgaatg tgcgtcgaaa gagttggact 600
tcgaggccaa cggacacgtc tgggagatcg actttagcga gtgtacctcc acctccaatc 660
tctccttcga cggcggcaag tacagcctgc tgcagatgca catccactcc ccttccgagc 720
acatggtcgc aggatcattg cacgatgccg agattcattt agtgcactcc cgtgacgatt 780
cggacggcac agaatctgag cttctcgtga taggcgtctt cctggatgcg aaagagcacg 840
gctggaatgt tgcgcttgag ccactgtggg atgttctggg ttctggggct aaacctaggg 900
gcgtcatcaa cccctacgag ctgataccgt ccgacatggc gtactcgcac tacatgggat 960
ctctcaccac ccctccctgc agcgagatag tgaggtgggt cgtcatgagc acaccaaccg 1020
taatcggcga tctacagctt gatatcttcc gcgactcggt cgccaccgct acgaactccc 1080
aggtggatga gcgctctaac acaaaccgcc cgggtcaggc gatcaacggg cgcgccgttt 1140
acatagtgtg agggcgcgac atgtgtccag cccgaggtgt agatgggggg ggtacactcg 1200
agcgagtacc tccttgacgc cacacaaaga catcgctcca agggatggag agactgtatc 1260
aatagcagta ctatagtcag ccgttacaag gctgtgtttg gtagggctag gtacaatagt 1320
tatatgggtg tatgtttcgg ccatacacaa aacagtgctg gtatggccac gagtatcttt 1380
cctccaactt agggttcgta atattctcga cgggtatagt attggggggc ggttataagg 1440
atacttaaaa agacccgttg gttatgttct accggggtca ataccctggg tccctcgatg 1500
taaataacgc atgcacagcg tgcagtagtt ttattgtatg atgtcgtggc gattccttcc 1560
tcgactgatc tggcatgtgc gggtacgtca cctagcgtca agggtttgca attgcattgg 1620
gggcggtagt attgggaata tatatacccg ttaggtacct cgaagtacgc aaccgtgtag 1680
ttttgaagtg tatatctgtc aaaacgatgt cgtcattcac gtttcctcaa aaaaaaaaaa 1740
aaaaaaaaaa aaaaaaaa 1758
<210> 6
<211> 8856
<212> DNA
<213> 海带(Saccharina japonica)
<400> 6
gtggggtgtc gcggcagcgt ccgtggtgtg ccgcgacatg tcgcgacacg tgccacgaaa 60
aagtccaata atgtattatt tgtgtccgtt tcacatatcg tttataacac gacagacaca 120
aaggcaccct cagctatccg gacaatgggc aaggtacctc tcacacttag attgtcctca 180
tcttcgcccc acggctgtac ccacttgtgt gttgtcgttt acttgtatcc gtttcacata 240
tcgtttataa cacgacagac actatggcac cctcagctat ccggacaatg ggcaaggtgc 300
tcttgtgctc tcttctcctg ccaagcttcc caggactggt cgccgcctca caacgggtaa 360
gccttccatt ttggcgtatg tatcgtactc gaatgcatgt accatgtaac gtaacccgtg 420
gctgctgaac ggcaaccggg gttgaacaca ggttagacta tatcatttgt tgatagttat 480
ccagtcaaca gtaattgtac cattaactac agtgtcgata gaatgtggtg ctattaataa 540
tagactataa tgtcatgccc tgttcgtatt ccacgcggag tgacaacggg cggtttgtac 600
gtgggagaca aacagatgtc ttccgcaaat agcggaccac ctggcaacaa gtaccggtag 660
gtattttagt atgttcgaag cagacattta gccattcact cgggctctgg ttgcgtaaag 720
gcaccgatgg cctcgctgtt gctattgtcg ccgattccct cctgcattta tcacacgtgt 780
gtactcattc atcatatcgt gtccttcgag ggtgaaaaca aattaatccc ttgaattaca 840
cagcagtatt tatagtatga cttaattaca aatatgtgct aaacgggggc cgaattcttc 900
cacgacctgg atggcagcaa cttaaacttc ttgctgttac gtacgtacgt acgtacgtac 960
gtacgctcaa acgaatcgat agtcattgct ctcgaacggg gcgttttttg tggtccatgc 1020
tcttcgccaa ttatattcca gacacgcgtg ttcagtgctc gcacatgttg cctgtttcaa 1080
tccaaccctt acgcgtgctt tcatggcccg ctgtcgctgt tgtcgccctc tgacgtgtga 1140
aatcaccttg gacaccacct gcgttcgtta aacccaccgg aaaactggat ggcaccttgg 1200
acaccacctg cgttcgttga acccaacgga aaactggatg gcatattgtg cccatggacg 1260
gcagcagcgt ggacccacga ctgccgacga gcctggtacg ctgaggacac taccgtaggt 1320
ttagctcctt tggacacgta ttttatgtgt caaggcatgt ggttcgttgt caactgagtg 1380
cctctaaact gcgaattgac gatgctatta tgtcttcgct tcacgttgat gtacatgcat 1440
acaaagttct caaggagctg caagcaacgt tttcggaggt aaatttcgtt tacttatggt 1500
agtgaaacat cctctttagg gaaataattg aaagctaccg gtatgtgctg ctgtatgtca 1560
agcccacaat tgaaatggat ggaagacgcc cgtcattctt accttttttc tccaatgggt 1620
ttgccctgtt ccggctgctg ttctgctcaa cagaggaatc ctcctttccc gactggacct 1680
accgccgcgc ttcccacgaa ggagaaaggc cgtacagccc caggtacgtg ttacagacag 1740
caccagcata acgacgtatt tttcggactg tccacgcacg ttccgtagcg agaccatttg 1800
ttgcacaggt ggccgagacc ccccttcagt tgcatcatgc gggaggaaca aataccgttg 1860
tgggcacgct gaacactgaa gcacacacat aggcgtatcg gatttagagg ttgtcgacac 1920
cttgtgggag ttgctgcacg gttcagctgt tgccgtgtct tcacaaagcg ttttggacgc 1980
ccacactgtg gaagggtgta ctgtagagtg aggccctgca gcaaatgtcg gcaaatcgaa 2040
atgtagccat gcaaaccctg aagagcgcgg cgaggctacc ccgcggatgg atgcgttttt 2100
ttttatatac ccctgtacca ggtagttctt gaaaaagtat gctgctctag cttgtgtatg 2160
tacgatcata aactttcgtc gagtcttacc atgcggtcct ttcttctctt tctccattat 2220
gttgagcctg cggtgggtta atcacgcact gcattggcat caaggtacaa cacctgactc 2280
gccttcgtat gggcgtatgc ctcgttcgct ggtgcacgta tctagacacg aacactaaaa 2340
cgttgaacga gtactcgtac ttcaactctg tttgattgta ctctacacat atatagttag 2400
accgggggtg tttgacgggt tctattgtag cttgtaatcc ttatagatgc gttatgggcc 2460
agatgtagag tttattaacc tgcgttcgga aaccgaagat cgttggtcaa cattataaca 2520
aatgccctgc attagtactc atgaccgctg cgccgccgcc tgtggaataa ttcgtggtcc 2580
tcacgccgta atctgacgac agcgattggg agatcggcta cccggactgt ggcggagact 2640
ctcagagccc catcaacttg tccgccaatg ttggaacgct cgtcgaggta cacactaaag 2700
tacggtggca gtagaaaata ccgaccagat gcgaggtgca cgcgggaaat ccaaagactg 2760
tgtcctcgtt gcttgctatt gtggttggtt ttacacggga gtcggggtgt gaataccact 2820
gtacctcgtt cccggttaac gaaatttaaa cggagcgcgt tggtgcgtct ggcaacgacg 2880
taacatgtca ggaacgaaac gcctgtactt acgattattt gtcggtagaa acgtcgtgaa 2940
catatatagg atagacggta ggtccgtgct cgtgtgtggg gctttataaa cgccattcat 3000
ggagctgata caaaacataa ttttggtgtc aacttgcgtg ttgttttttc tgacgatgta 3060
tagtgcgtgt aatctgtgca tgccgcgttt tctgtaattc agtgttggcc gcaagtttcc 3120
aagattggag ttggtagtag gccaacctat atatatcact tgtaattcag aactgatacc 3180
tgagatggca ccgacgtagt tacgacttat gttggcgaca ttgcagaccg tgcctgttat 3240
ccttttgacc aagctaggca atccagttaa gtctggaatt gttcgggccc atagcacgaa 3300
aagcctcatg acgatgattg gctgccgttt ctcatgtaag gtgacccact gcaatgctgc 3360
gcatgcctat atatcggctt gacgtgcctg tcgtttttct gacctaggca actgagttca 3420
atcttgagct tttcggagct gaatgtgcgt cgaaagagtt ggacttcgag gccaacggac 3480
acgtctggga ggtaagccgc tgcgtcggtt attttctgta atgccgtcat atgccttgga 3540
atgagagacc cgtgctcggt gataggaaac gcaaaatttc tccgttaact ctctatccca 3600
ctagagtgtg aggtattgac cagtggacag ctgcgtcccg tctgccgacc gtctgcatgc 3660
cgggtcaccc tgcatcattg ttctgttttg ttctgcgtac tgtgctctac tgtatggtgg 3720
caccagccgt ataattccac gtacgtgctg ggctgttcgg atctgcacgt acttttgcac 3780
catctctacc cttactccca cccggaccta atgctacccg gatctgatcc catttggcac 3840
cctgctccca cccacaaggt gcagaaatat aatcagccct ccgcaggagc cgccggaggc 3900
acacctggca cctcgatccc attttgtacc catgtaggcc atagatatct acaacaactc 3960
ctgctataca tttaaccgta ttgaatgtac gaattcgaat agcctggcac gtacgtgcac 4020
gttctccgga gccggtatgg tggtgtgtat tgtactcgac ggtactctgg acgagtgtta 4080
cggtagtacc aggtagctcc tactgctgta gtttcttcgg aagctcctca cttcaaaatc 4140
ttcctgccac aagcgaaata aacgcatata actaacgaac aacaaaatca aggtggataa 4200
tcccatggcc tgcggtaaaa accccacgaa tgatgctgta aaacacgaat ggggctccaa 4260
tattaaggct tgccttattg gctagttcct ccgttcaaga cagcgatcag caatttttat 4320
attctactgt acctctatga tatcacgcgt cggtactgct cttgttctat attgccctgc 4380
attaaatttc ctcgccactt cccgcatgaa tttctgtgct gtgctgtact gtgtacggcc 4440
ttatatgact gttctctacc gcactcgtac cgtgctgtac tgtgctatgc tgtggtgcgc 4500
tgtgtccttt ccggtattgc gctgtatcat gtctattgca cacccggctg aactaatttg 4560
aggagcagat cgactttagc gagtgtacct ccacctccaa tctctccttc gacggcggca 4620
agtacagcct gctgcagatg cacatccact ccccttccga gcacatggtg agtgacagca 4680
tatatattat cgatagttat agtacacctg cgaaacgccg ctcaagagct tacatcgcaa 4740
agtcctgagt tttggtgaat ctccggtgca ataagcagcg gcacccaacg gagactaatg 4800
tccttcgttg gcaaaacggt agatattaac tcgtcctctg taatagcaag aaggccatgc 4860
cgttccacgg agcaaacaca ccaccaacaa tggatttggg actttttcta gacatcgtga 4920
acagtcgttt cctacgtcat attttccact cctataacct tgagagcgta ctgttctaaa 4980
gccattgcag cagcactcgt gcactatgca tcaatatctc agctgtgaac aaaaaagcga 5040
cgagtgttaa cctcgcgcgg ctgtgtttcc ccctcgtatg cgagcaggtc gcaggatcat 5100
tgcacgatgc cgagattcat ttagtgcact cccgtgacga ttcggacggc acagaatctg 5160
agcttctcgt gataggcgtc ttcctggatg cgaaagagca cggctggaat gttgcggtaa 5220
gtctgccgac gatggactac ggttcttaca actgctgtgt agaacaccga agtgctcacc 5280
atgcactctt agctattgtc tgcgtggttc tgcgaccatc atgttgtgaa ccaaacccac 5340
tattattgta actgcaatat gtctacacta ctacacatgg acaacgtccg aaaatcccga 5400
acataaaccg tcagatcccg gcatacatcg ctggggtccg cctctcactt tgccaagaaa 5460
cgcactgaac gactgactta cgcatacccc ctttcgcgct tcgttggcct gaatggatcg 5520
acagcttgag ccactgtggg atgttctggg ttctggggct aaacctaggg gcgtcatcaa 5580
cccctacgag ctgataccgt ccgacatggc gtactcgcac tacatgggat ctctcaccac 5640
ccctccctgc agcgaggtga tcagatgttt gaagcaatac acttccagtt cgttccccca 5700
cgtatgcggc aggttgttgc gcgcacttgt aggagaaacg gggtcgagtg gttttacact 5760
atcatatttg ccaaacacct gctatacgaa gcgtacgtgg taaaacaatt ttcaggtggg 5820
gtcttgctgg caagttaggt atatagactt acagtacacg gttcgcattt tttacttgaa 5880
tagtcgcgtt gccgtttgaa gtacattcat gatatggtct tcgcctgtgc cggccgctcg 5940
tagcttacgc acaacgcata tcatacaaaa tgttcggatg ccgactgaat gacgccgcgc 6000
agatagtgag gtgggtcgtc atgagcacac caaccgtaat cggcgatcta cagcttgata 6060
tcttccgcga ctcggtcgcc accgctacga actcccaggt aaaccgtaaa cacaatgacg 6120
agagtcgggc atgcatcact acggtacgag ttacctcgtt gctgttttgt gtgggtggtt 6180
tttggtgcgt ttttgtagaa tgtcagtgcg aagcaattaa gaacatggtt gtatgagatt 6240
cgttttatac tttttcctca agtgcacttc gcgagtttta ataaatatgc aactccaaag 6300
aaacgagtac tgtgccatga caagacgacc aataccaaga tttgggtatt ttttaatgtg 6360
aaaaaacgca tatatatata tgataatatg ttataacacc ggtcgccccg gtagactagt 6420
ggtcagcttc aaaggctact agcattggta cccaagttcg aataccaccg tgttgagatt 6480
ttcactttat ttgaaaaaat agaaggaacc aattgctgag agcgcctttg tgacgtgggt 6540
aggcggaatc cgacgcaagt tgacgaggga agaaagtgct gaaatcttgt cgcgataaaa 6600
atacaaggca cgtaccgtag tggggagggg ggagaagagc ctgcatagtt accccggatc 6660
tgagttacga ctaaagaggg agaaaagaag ggcgaacata acaatacaag aagggcgaag 6720
ataacaataa atgggatgga cggtgactac acaacagcca catcgagcct gtctgaaaag 6780
cggccaatat tactcaacag tcatattgta tgcttgaata gcgtcccatc aagcaacccc 6840
tttgcttcgg cgaggtattg tatacaaata tttcgatagt attggcgatg ccatcggccc 6900
gaccaaagac aactgctacg tacgagctgg gccagccata aaaggtttac acgtcggatt 6960
ggcgatgcga tgccccatca attttacgag tttggacttg atgtttggac actgtgtagt 7020
taaagcactc atcgatacat tgaccttcgg ccctatatat atatattctc aagagatatg 7080
accgatccaa caacccgaaa aaatacaaaa gcgaccaaaa cttgtaaaaa aaaacaaaaa 7140
aaaaataggg ccgacaagtg aatgcctttg aacgtgcgat tcaaatccgg ggttagacat 7200
ccagtgcaaa tttctcaaaa tagagcgggg cttgtagaaa tgccattttt ttcgtattga 7260
cttgacttgg tgtatggaat cggttttggt aacatctctt ggtgggtggc gaattgggta 7320
acgagagttt cgtcgctttt ttccttgtgt gtttcaccac tgactgtctc gcaccaagtt 7380
tcttgatgaa aacgacgttt tagttttcac gaatttggtg tagaaaagtt ggtgcttttt 7440
tgttttcgcg gatatctcgg cgagatcgag ccgaggaaag aaagagctac ataatgtttc 7500
atgtacgttt tgtttgcgta agcagtgatg tgtcagggtc attatcccca attttgtgta 7560
gcctgattag cagtggttca caagatacga cgttaggaag ctttctccgt tttatggctg 7620
gccccgctcg tagtcattag gagtgcattg cacgtttaca cgtcgccatc accgaaatgt 7680
atcatactga taattgatag ctagaaaatg ccgacggatt gttcaaagag ttgtgcctag 7740
gatttattat cgaatcgaac ggttcgtgcg agagtgagca tgtaaaatac acatatctac 7800
ggcataggct tgattgactg tatcaccgta aagtatcgat ggaggatgaa ctaaggtcct 7860
tgtcgacggc ggtcatcggg gcgtaccgga cgtcaatagc ttgcccgccc cgacgatctg 7920
ttgaatccaa attagggacg gtcggccatt ggggaggatg tgcctgtttt agtccatatt 7980
actgttgtat acctaccccc agcactgtgc ttcctgtgtt gcctgtttgc tttgctgcct 8040
tgttgtgccc atggaaccga aataccgatc acgtacaatc aacgacggtg gctgatacct 8100
ttgagcttgt aggcggctca ttggccgacg aacaaaaggc gacgccttta cagtccaact 8160
cataccaccg acctacttcc accccttgct cgtttatctc ggctatgcag gtggatgagc 8220
gctctaacac aaaccgcccg ggtcaggcga tcaacgggcg cgccgtttac atagtgtgag 8280
ggcgcgacat gtgtccagcc cgaggtgtag atgggggggg tacactcgag cgagtacctc 8340
cttgacgcca cacaaagaca tcgctccaag ggatggagag actgtatcaa tagcagtact 8400
atagtcagcc gttacaaggc tgtgtttggt agggctaggt acaatagtta tatgggtgta 8460
tgtttcggcc atacacaaaa cagtgctggt atggccacga gtatctttcc tccaacttag 8520
ggttcgtaat attctcgacg ggtatagtat tggggggcgg ttataaggat acttaaaaag 8580
acccgttggt tatgttctac cggggtcaat accctgggtc cctcgatgta aataacgcat 8640
gcacagcgtg cagtagtttt attgtatgat gtcgtggcga ttccttcctc gactgatctg 8700
gcatgtgcgg gtacgtcacc tagcgtcaag ggtttgcaat tgcattgggg gcggtagtat 8760
tgggaatata tatacccgtt aggtacctcg aagtacgcaa ccgtgtagtt ttgaagtgta 8820
tatctgtcaa aacgatgtcg tcattcacgt ttcctc 8856
<210> 7
<211> 295
<212> PRT
<213> 海带(Saccharina japonica)
<400> 7
Met Ala Pro Ser Ala Ile Ala Thr Met Gly Leu Val Leu Leu Cys Ser
1 5 10 15
Leu Leu Leu Pro Ser Pro Pro Gly Leu Val Ala Ala Ser Gly Ala Gly
20 25 30
Ala Gly Pro Thr Thr Ala Ala Gly Pro Gly Gly Ser Ser Pro Pro Ala
35 40 45
Thr Thr Thr Ala Ala Ala Ser His Gly Gly Gly Ala Pro Thr Ser Pro
50 55 60
Ser Ala Thr Gly Ile Gly Thr Pro Ala Cys Gly Gly Ala Ser Gly Ser
65 70 75 80
Pro Ile Ala Leu Ser Ala Ala Val Gly Thr Leu Val Gly Ala Thr Gly
85 90 95
Pro Ala Leu Gly Leu Pro Gly Ala Gly Cys Ala Ser Leu Gly Leu Ala
100 105 110
Pro Gly Ala Ala Gly His Val Thr Gly Ile Ala Pro Ser Gly Cys Thr
115 120 125
Ser Thr Ser Ala Leu Ser Pro Ala Gly Gly Leu Thr Ser Leu Leu Gly
130 135 140
Met His Ile His Ser Pro Ser Gly His Met Val Ala Gly Ser Leu His
145 150 155 160
Ala Ala Gly Ile His Leu Val His Ser Ala Ala Ala Ser Ala Gly Thr
165 170 175
Gly Ser Gly Leu Leu Val Ile Gly Val Pro Leu Ala Ala Leu Gly His
180 185 190
Gly Thr Ala Val Ala Leu Gly Pro Leu Thr Ala Val Leu Gly Ser Gly
195 200 205
Ala Leu Pro Ala Gly Val Ile Ala Pro Thr Gly Leu Ile Pro Ser Ala
210 215 220
Met Ala Thr Ser His Thr Met Gly Ser Leu Thr Thr Pro Pro Cys Ser
225 230 235 240
Gly Ile Val Ala Thr Val Val Met Ser Thr Pro Thr Val Ile Gly Ala
245 250 255
Leu Gly Leu Ala Ile Pro Ala Ala Ser Val Ala Thr Ala Thr Ala Ser
260 265 270
Gly Val Ala Gly Ala Ser Ala Thr Ala Ala Pro Gly Gly Ala Ile Ala
275 280 285
Gly Ala Ala Val Thr Ile Val
290 295

Claims (4)

1.海带α型碳酸酐酶基因Sjα-CA3,其特征在于,其cDNA序列如SEQ ID NO:1所示。
2.权利要求1所述海带α型碳酸酐酶基因Sjα-CA3的编码蛋白,其特征在于,其氨基酸序列如SEQ ID NO:3所示。
3.重组蛋白rSjα-CA3,其特征在于,其氨基酸序列如SEQ ID NO:4所示,具有CO2水合反应的酶活性。
4.权利要求3所述的重组蛋白rSjα-CA3在加速CO2的水合反应能力上的应用。
CN201910421670.3A 2019-05-21 2019-05-21 海带α型碳酸酐酶基因Sjα-CA3及其编码蛋白和应用 Expired - Fee Related CN110066815B (zh)

Priority Applications (1)

Application Number Priority Date Filing Date Title
CN201910421670.3A CN110066815B (zh) 2019-05-21 2019-05-21 海带α型碳酸酐酶基因Sjα-CA3及其编码蛋白和应用

Applications Claiming Priority (1)

Application Number Priority Date Filing Date Title
CN201910421670.3A CN110066815B (zh) 2019-05-21 2019-05-21 海带α型碳酸酐酶基因Sjα-CA3及其编码蛋白和应用

Publications (2)

Publication Number Publication Date
CN110066815A CN110066815A (zh) 2019-07-30
CN110066815B true CN110066815B (zh) 2022-11-01

Family

ID=67371077

Family Applications (1)

Application Number Title Priority Date Filing Date
CN201910421670.3A Expired - Fee Related CN110066815B (zh) 2019-05-21 2019-05-21 海带α型碳酸酐酶基因Sjα-CA3及其编码蛋白和应用

Country Status (1)

Country Link
CN (1) CN110066815B (zh)

Families Citing this family (1)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Publication number Priority date Publication date Assignee Title
CN110066817B (zh) * 2019-05-21 2022-11-01 上海海洋大学 海带α型碳酸酐酶基因Sjα-CA2及其编码蛋白和应用

Citations (1)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Publication number Priority date Publication date Assignee Title
KR20130128885A (ko) * 2012-05-18 2013-11-27 고려대학교 산학협력단 신규 탄산탈수효소 및 이를 이용한 이산화탄소의 전환 또는 고정화 방법

Family Cites Families (5)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Publication number Priority date Publication date Assignee Title
WO2008095057A2 (en) * 2007-01-31 2008-08-07 Novozymes A/S Heat-stable carbonic anhydrases and their use
WO2013064195A1 (en) * 2011-11-04 2013-05-10 Enel Ingegneria E Ricerca S.P.A. A new heat-stable carbonic anhydrase and uses thereof
CN108374002B (zh) * 2018-02-11 2020-05-12 中国海洋大学 一种脆江蓠磷酸葡萄糖变位酶的蛋白及其编码基因和用途
CN110093338B (zh) * 2019-05-21 2022-05-27 上海海洋大学 海带γ型碳酸酐酶基因Sjγ-CA2及其编码蛋白和应用
CN110066817B (zh) * 2019-05-21 2022-11-01 上海海洋大学 海带α型碳酸酐酶基因Sjα-CA2及其编码蛋白和应用

Patent Citations (1)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Publication number Priority date Publication date Assignee Title
KR20130128885A (ko) * 2012-05-18 2013-11-27 고려대학교 산학협력단 신규 탄산탈수효소 및 이를 이용한 이산화탄소의 전환 또는 고정화 방법

Non-Patent Citations (3)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Title
Characterization of &alpha type carbonic anhydrase (CA) gene and subcellular localization of &alpha A in the gametophytes of Saccharina japonica;Ye, RX 等;《JOURNAL OF APPLIED PHYCOLOGY》;20140528;第26卷(第2期);881-890 *
Photosynthetic use of inorganic carbon in deep-water kelps from the Strait of Gibraltar;García-Sánchez MJ等;《Photosynth Res》;20150815;第127卷(第3期);295-305 *
缺刻缘绿藻碳酸酐酶(CA)基因的序列克隆及特征分析;梅守华等;《水产学报》;20150515(第05期);53-63 *

Also Published As

Publication number Publication date
CN110066815A (zh) 2019-07-30

Similar Documents

Publication Publication Date Title
CN110093338B (zh) 海带γ型碳酸酐酶基因Sjγ-CA2及其编码蛋白和应用
CN113429465B (zh) 一种桑黄MADS-box类转录因子PbMADS1及其编码基因与应用
CN110066815B (zh) 海带α型碳酸酐酶基因Sjα-CA3及其编码蛋白和应用
CN111793636A (zh) 一种调控不定根发育的苹果基因MdBT2及其应用
CN113403290B (zh) 热稳定性提高的葡萄糖氧化酶突变体及其编码基因和应用
CN110343691A (zh) 突变型肝素酶ⅰ及其编码核苷酸序列、包括该核苷酸序列的重组载体和宿主细胞以及应用
CN108795956B (zh) GmMDH12基因在促进大豆结瘤固氮能力方面的应用
CN110066817B (zh) 海带α型碳酸酐酶基因Sjα-CA2及其编码蛋白和应用
CN108034642B (zh) 葡萄糖氧化酶CnGOD19及其改良酶、基因和应用
CN110066816B (zh) 海带γ型碳酸酐酶基因Sjγ-CA及其编码蛋白和应用
CN110343154B (zh) 控制水稻库源流关键基因sem1的克隆及其应用
CN113667652A (zh) 一种提高sod3可溶性表达及酶活性的方法
CN113337537B (zh) OsCDKB1;1蛋白及其编码基因在水稻耐盐中的功能与应用
CN116555305A (zh) 海带磷酸烯醇式丙酮酸羧激酶SjPCK1基因及其编码蛋白和应用
Zhang et al. Cloning and prokaryotic expression of a salt-induced cDNA encoding a chloroplastic fructose-1, 6-diphosphate aldolase in Dunaliella salina (Chlorophyta)
CN111944833B (zh) 缺刻缘绿藻磷脂酶a2的基因序列及其编码蛋白和应用
CN111073868B (zh) 一种植物黄酮甲基转移酶蛋白及其编码基因与应用
EP0682117A1 (en) Dna coding for carbonic anhydrase
CN110791513B (zh) 一种密码子优化的玉足海参α-淀粉酶基因及其重组表达载体与应用
CN112920260B (zh) 葡萄耐热相关VvWRKY4蛋白及其编码基因与应用
CN111269923B (zh) 缺刻缘绿藻cdp-乙醇胺:二酰甘油乙醇胺磷酸转移酶的基因序列和应用
CN112063598B (zh) 香菇谷胱甘肽还原酶LeGR在提高微生物耐温度胁迫能力中的应用
CN108752444B (zh) 吊兰根系硝酸盐转运蛋白CcNPF8.3.2及其编码基因与应用
Dong et al. Nucleotide sequence analysis of a cDNA encoding chloroplastic fructose-1, 6-bisphosphatase from pea (Pisum sativum l.).
CN117821484A (zh) 一种HindIII限制性内切酶的制备方法及其应用

Legal Events

Date Code Title Description
PB01 Publication
PB01 Publication
SE01 Entry into force of request for substantive examination
SE01 Entry into force of request for substantive examination
GR01 Patent grant
GR01 Patent grant
CF01 Termination of patent right due to non-payment of annual fee
CF01 Termination of patent right due to non-payment of annual fee

Granted publication date: 20221101