CN110016013A - 一种新型的c-Met/HDAC双靶点抑制剂及其合成方法与应用 - Google Patents

一种新型的c-Met/HDAC双靶点抑制剂及其合成方法与应用 Download PDF

Info

Publication number
CN110016013A
CN110016013A CN201910428395.8A CN201910428395A CN110016013A CN 110016013 A CN110016013 A CN 110016013A CN 201910428395 A CN201910428395 A CN 201910428395A CN 110016013 A CN110016013 A CN 110016013A
Authority
CN
China
Prior art keywords
met
hdac
bis
target spot
inhibitor
Prior art date
Legal status (The legal status is an assumption and is not a legal conclusion. Google has not performed a legal analysis and makes no representation as to the accuracy of the status listed.)
Granted
Application number
CN201910428395.8A
Other languages
English (en)
Other versions
CN110016013B (zh
Inventor
不公告发明人
Current Assignee (The listed assignees may be inaccurate. Google has not performed a legal analysis and makes no representation or warranty as to the accuracy of the list.)
Beijing Kaine Meg Pharmaceutical Technology Co Ltd
Original Assignee
Beijing Kaine Meg Pharmaceutical Technology Co Ltd
Priority date (The priority date is an assumption and is not a legal conclusion. Google has not performed a legal analysis and makes no representation as to the accuracy of the date listed.)
Filing date
Publication date
Application filed by Beijing Kaine Meg Pharmaceutical Technology Co Ltd filed Critical Beijing Kaine Meg Pharmaceutical Technology Co Ltd
Priority to CN201910428395.8A priority Critical patent/CN110016013B/zh
Publication of CN110016013A publication Critical patent/CN110016013A/zh
Application granted granted Critical
Publication of CN110016013B publication Critical patent/CN110016013B/zh
Active legal-status Critical Current
Anticipated expiration legal-status Critical

Links

Classifications

    • AHUMAN NECESSITIES
    • A61MEDICAL OR VETERINARY SCIENCE; HYGIENE
    • A61PSPECIFIC THERAPEUTIC ACTIVITY OF CHEMICAL COMPOUNDS OR MEDICINAL PREPARATIONS
    • A61P35/00Antineoplastic agents
    • CCHEMISTRY; METALLURGY
    • C07ORGANIC CHEMISTRY
    • C07DHETEROCYCLIC COMPOUNDS
    • C07D401/00Heterocyclic compounds containing two or more hetero rings, having nitrogen atoms as the only ring hetero atoms, at least one ring being a six-membered ring with only one nitrogen atom
    • C07D401/02Heterocyclic compounds containing two or more hetero rings, having nitrogen atoms as the only ring hetero atoms, at least one ring being a six-membered ring with only one nitrogen atom containing two hetero rings
    • C07D401/04Heterocyclic compounds containing two or more hetero rings, having nitrogen atoms as the only ring hetero atoms, at least one ring being a six-membered ring with only one nitrogen atom containing two hetero rings directly linked by a ring-member-to-ring-member bond

Landscapes

  • Chemical & Material Sciences (AREA)
  • Organic Chemistry (AREA)
  • Health & Medical Sciences (AREA)
  • General Chemical & Material Sciences (AREA)
  • Medicinal Chemistry (AREA)
  • Nuclear Medicine, Radiotherapy & Molecular Imaging (AREA)
  • Chemical Kinetics & Catalysis (AREA)
  • Pharmacology & Pharmacy (AREA)
  • Life Sciences & Earth Sciences (AREA)
  • Animal Behavior & Ethology (AREA)
  • General Health & Medical Sciences (AREA)
  • Public Health (AREA)
  • Veterinary Medicine (AREA)
  • Pharmaceuticals Containing Other Organic And Inorganic Compounds (AREA)

Abstract

本发明公开了一种新型的c‑Met/HDAC双靶点抑制剂及其合成方法与应用,本发明的抑制剂以c‑Met抑制剂克唑替尼和HDAC抑制剂伏立诺他为先导结构,设计出的一种单一结构的双靶点抑制剂,用克唑替尼除去哌啶环以外的结构作为HDAC抑制剂的帽状结构,代替伏立诺他结构中的苯胺酰基,保留伏立诺他中的羟肟酸结构作为金属锌离子的螯合基团,在两者之间通过引入不同结构的连接基团,利用药效团拼合的原理,设计单一结构双靶点抑制剂,得到的双靶点抑制剂对c‑Met与HDAC均具有良好的抑制作用,且能够协同抑制c‑Met与HDAC。

Description

一种新型的c-Met/HDAC双靶点抑制剂及其合成方法与应用
技术领域
本发明属于医药技术领域,具体涉及一种新型的c-Met/HDAC双靶点抑制剂及其合成方法与应用。
背景技术
在HGF/MET信号通路中,HGF活化c-Met,激活下游的RAS–RAF–MEK–MAPK和PI3K–AKT信号通路,使原癌基因(c-Myc)和G1/S-特异性周期蛋白-D1(cyclin D1)表达升高,细胞周期检查蛋白p21和p27活性降低,促进细胞周期进程和生存。组蛋白去乙酰化酶(HDAC)也是细胞周期进程的关键调节子,抑制HDAC,能够促进细胞周期检查蛋白p21和p27的表达,阻滞细胞周期,降低cyclin D1的转录,加快c-Myc的降解。因此,c-Met抑制剂和HDAC抑制剂在对癌症的作用机制上存在一定协同作用。
c-Met与克唑替尼的复合物晶体结构如图1,从图中可以看出,化合物结构占据ATP结合口袋,2,6-二氯-3-氟-苯基与活化环上的残基Tyr1230形成较强的π-π相互作用,吡啶环和吡唑环结合在由残基Lys1110、Leu1157、Val1092、Ala1108、Ile1084和Tyr1159形成的疏水口袋中,吡啶环上的氨基与Pro1158形成氢键,连接在吡唑环上的哌啶环则伸展到疏水口袋的外部。伏立诺他是一种HDAC抑制剂,临床上治疗皮肤T淋巴细胞瘤,但伏立诺他对实体瘤无显著疗效。HDAC2与伏立诺他的复合物晶体结构如图2,从图中可以看出,链状的羟肟酸基团深入HDAC2的结合腔,与Zn2+螯合并与残基Asp268、His182、His142、His143和Tyr312形成氢键,而苯胺酰基则暴露在结合腔之外。
克唑替尼的分子式如式(II)所示,伏立诺他的结构式如式(III)所示。
多靶点抑制剂肿瘤信号转导是肿瘤治疗和药物开发的新方向,研究表明,多靶点单一实体药物的疗效效果优于单靶点药物且具有更小的副反应。同时具有c-Met和HDAC双靶点的抑制剂具有协同对抗癌症的作用,而现有技术中并没有针对具有这两种靶点的单项药物的研究。
鉴于以上原因,特提出本发明。
发明内容
为了解决现有技术存在的以上问题,本发明提供了一种新型的c-Met/HDAC双靶点抑制剂及其合成方法与应用,本发明的抑制剂采用药效团拼合的原理,合成了单一结构双靶点的抑制剂,可以同时抑制c-Met和HDAC。
为了实现上述目的,本发明采用如下技术方案:
一种新型的c-Met/HDAC双靶点抑制剂,所述的抑制剂的结构式如式(I)所示或式(I)在药学上可接受的盐:
其中,linker为直链结构、支链结构或芳香环结构。
进一步的,所述的直链结构为其中n为1-7任一自然数。
进一步的,所述的支链结构为
进一步的,所述的芳香环结构为
一种所述的新型的c-Met/HDAC双靶点抑制剂的合成方法,所述的方法包括如下步骤:
(1)首先合成中间体(a)反应方程式如下:
(2)中间体(b)的合成方程式如下:
(3)中间体(c)的合成方程式如下:
(4)中间体(d)的合成方程式如下:
(5)目标产物的合成方程式如下:
进一步的,步骤(1)中室温下搅拌反应22-26小时,加水、萃取、洗涤、干燥、过滤、浓缩,得到中间体(a),中间体(a)的产率为61-65%。
进一步的,步骤(2)中在氮气氛围下进行反应,反应物溶解在二甲亚砜中,加入碳酸钾,升温至78-82℃,加入[1,1'-双(二苯基膦)二茂铁]二氯化钯二氯甲烷络合物,反应18-22小时,分层、洗涤、干燥、过滤、蒸馏,得到中间体(b),中间体(b)的收率为63-67%。
进一步的,步骤(3)中室温反应3.5-4.5小时,浓缩,调节pH=5~6,过滤,洗涤,干燥,得到中间体(c),中间体(c)的产率为91-95%。
进一步的,步骤(4)中中间体(c)溶于DMF,加入HATU和DIPEA,水域搅拌10-20分钟,加入O-(四氢-2H-吡喃-2-基)羟胺,在室温下搅拌反应3.5-4.5小时,分层、洗涤、干燥、过滤、浓缩,得到中间体(d),中间体(d)产率为70-80%。
进一步的,步骤(5)中室温反应25-35分钟,浓缩,pH调节至中性,提纯,得到目标产物,目标产物的产率为50-54%。
一种所述的新型的c-Met/HDAC双靶点抑制剂在制备抗肿瘤药物中的应用。
与现有技术相比,本发明的有益效果为:
(1)本发明的抑制剂以c-Met抑制剂克唑替尼和HDAC抑制剂伏立诺他为先导结构,设计出的一种单一结构的双靶点抑制剂,用克唑替尼除去哌啶环以外的结构作为HDAC抑制剂的帽状结构,代替伏立诺他结构中的苯胺酰基,保留伏立诺他中的羟肟酸结构作为金属锌离子的螯合基团,在两者之间通过引入不同结构的连接基团,利用药效团拼合的原理,设计单一结构双靶点抑制剂,得到的双靶点抑制剂对c-Met与HDAC均具有良好的抑制作用,且能够协同抑制c-Met与HDAC;
(2)本发明的制备方法简单,条件温和,产率高,提供了一种新的药物研发思路,提高了治疗癌症的药物的利用效率和治疗效果,对于实体瘤的抑制具有显著的效果。
附图说明
为了更清楚地说明本发明实施例或现有技术中的技术方案,下面将对实施例或现有技术描述中所需要使用的附图作简单地介绍,显而易见地,下面描述中的附图仅仅是本发明的一些实施例,对于本领域普通技术人员来讲,在不付出创造性劳动的前提下,还可以根据这些附图获得其他的附图。
图1是c-Met与克唑替尼的复合物晶体结构;
图2是HDAC2与伏立诺他的复合物晶体结构;
图3是本发明提供的双靶点抑制剂的合成路径示意图。
具体实施方式
为使本发明的目的、技术方案和优点更加清楚,下面将对本发明的技术方案进行详细的描述。显然,所描述的实施例仅仅是本发明一部分实施例,而不是全部的实施例。基于本发明中的实施例,本领域普通技术人员在没有做出创造性劳动的前提下所得到的所有其它实施方式,都属于本发明所保护的范围。
实施例1
本实施例中的新型的c-Met/HDAC双靶点抑制剂的结构式如下:
其中,linker为n=2。
本实施例的新型的c-Met/HDAC双靶点抑制剂合成方法如下:
(1)首先合成中间体(a)反应方程式如下:
在室温条件下,将4-吡唑硼酸频哪醇酯(3.9g,20.0mmol)溶解于30.0mlDMF中,加入碳酸钾(5.5g,40.0mmol)及3-溴丙酸甲酯(4.0g,24.0mmol),室温搅拌24小时后,TLC监测(石油醚与乙酸乙酯体积比为2:1)反应原料仍有剩余。向反应混合液中加入30ml水,搅拌至清液,然后以乙酸乙酯(50ml×2)萃取,萃取液以饱和食盐水(50ml×2)洗涤,无水硫酸钠干燥,过滤,滤液减压浓缩,残留物以(石油醚与乙酸乙酯体积比5:1)分离得中间体(a)3.5g,收率63%;
(2)中间体(b)的合成反应方程式如下:
在氮气的保护下,将中间体(a)(1.8g,6.6mmol)和(R)-5-溴-3-(1-(2,6-二氯-3-氟苯基)乙醇)吡啶-2-胺(2.3g,6.0mmol)溶解于35ml二甲亚砜(DMSO)中,加入碳酸钾(2.8g,20.0mm ol),升温至80℃,加入[1,1'-双(二苯基膦)二茂铁]二氯化钯二氯甲烷络合物(Pd(dppf)Cl2·CH2Cl2)(80mg,0.1mmol),反应20小时。TLC检测(石油醚与乙酸乙酯的体积比1:1),原料仍有剩余。将反应混合物冷至室温,在砂芯漏斗上铺上一层硅藻土,然后将反应混合物过滤去不溶物。向滤液中加入乙酸乙酯(80.0ml)和水(60.0ml),充分搅拌后静置分液,分出乙酸乙酯层,饱和食盐水洗涤并以无水硫酸钠干燥。过滤,滤液减压蒸去溶剂,残留物以柱层析(石油醚与乙酸乙酯的体积比1∶1)分离得到棕色油状物中间体(b)1.8g,收率65.0%;
(3)中间体(c)的合成方程式如下:
将中间体(b)(1.4g,3.0mmol)溶解于甲醇(20.0ml)中,滴加2mol·L-1的氢氧化钠水溶液(10.0ml),室温搅拌4小时,TLC检测(乙酸乙酯)反应完全。减压浓缩,残留物用水溶清,以1mol·L-1的盐酸调节体系pH=5~6,伴随大量白色固体,过滤,并以冰水洗涤固体,干燥,分别得到白色固体中间体(c)1.2g,收率93%;
(4)中间体(d)的合成方程式如下:
将中间体(c)(878.5mg,2.0mmol)溶于30ml DMF中,然后加入HATU(912.5mg,2.4mmol)和DIPEA(517.0mg,4.0mmol),在冰浴条件下搅拌15分钟,然后加入NH2-O-THP(281.2mg,2.4mmol),在室温条件下搅拌4h,TLC监测(二氯甲烷与甲醇的体积比20:1)反应完全。加入30ml水和80ml乙酸乙酯,分层取有机相,饱和食盐水洗涤,无水硫酸钠干燥,过滤,减压浓缩。残留物柱层析(二氯甲烷与甲醇的体积比40:1)得类白色化合物中间体(d)807.6mg,收率75%;
(5)目标产物的合成方程式如下:
将中间体(d)(538.4mg,1mmol)溶于20ml 1,4-二氧六环和5ml甲醇,在5℃-10℃的冰浴条件下,滴加1N HCl/1,4-二氧六环(4ml),滴加完毕,室温反应30分钟。TLC监测(二氯甲烷与甲醇的体积比20:1)反应完全。减压浓缩反应液,残留物溶于水至清,用0.5N NaOH水溶液调节PH至中性,得固体粗品。柱层析(二氯甲烷:甲醇体积比10:1)得目标化合物(I-1)236.0mg,收率52%,1HNMR数据如下:
1H NMR(400MHz,DMSO-d6):ppm:10.49(s,1H),8.86(s,1H),7.82(s,1H),7.72(d,J=1.68Hz,1H),7.57(dd,J=5.04Hz,5.04Hz,1H),7.53(s,1H),7.44(t,J=8.68Hz,8.68Hz,1H),6.87(d,J=1.68Hz,1H),6.06-6.11(q,J=6.72Hz,6.76Hz,6.44Hz,1H),5.68(s,2H),4.29(t,J=6.72Hz,6.76Hz,2H),2.52(t,J=6.76Hz,6.72Hz,2H),1.79(d,J=6.72Hz,3H)。
实施例2
本实施例的c-Met/HDAC双靶点抑制剂结构式中,linker为n=3,按照实施例1的方法进行合成,将3-溴丙酸甲酯替换为4-溴丁酸甲酯,其他试验参数进行常规调整,得到目标产物(I-2),1HNMR数据如下:
1HNMR(400MHz,DMSO-d6):ppm:10.43(s,1H),7.88(s,1H),7.74(d,J=1.68Hz,1H),7.57(dd,J=4.76Hz,4.76Hz,1H),7.53(s,1H),7.45(t,J=8.68Hz,8.68Hz 1H),6.89(s,1H),6.06-6.11(q,J=6.72Hz,1H),5.68(s,2H),4.06(t,J=6.72Hz,5.92Hz,2H),1.92-1.99(m,4H),1.79(d,J=6.44Hz,3H)。
实施例3
本实施例的c-Met/HDAC双靶点抑制剂结构式中,linker为n=4,按照实施例1的方法进行合成,将3-溴丙酸甲酯替换为5-溴戊酸甲酯,其他试验参数进行常规调整,得到目标产物(I-3),1HNMR数据如下:
1HNMR(400MHz,DMSO-d6):ppm:10.38(s,1H),8.78(s,1H),7.87(s,1H),7.73(d,J=1.68Hz,1H),7.57(dd,J=4.76Hz,5.04Hz,1H),7.52(s,1H),7.44(t,J=8.96Hz,8.86Hz,1H),6.88(d,J=1.44Hz,1H),6.06-6.11(q,J=6.88Hz,6.72Hz,6.72Hz,1H),5.68(s,2H),4.06(t,J=6.72Hz,7Hz,2H),1.97(t,J=7.32Hz,7.28Hz,2H),1.80(d,J=6.72Hz,3H),1.69-1.76(m,2H),1.40-1.47(m,2H)。
实施例4
本实施例的c-Met/HDAC双靶点抑制剂结构式中,linker为n=5,按照实施例1的方法进行合成,将3-溴丙酸甲酯替换为6-溴己酸甲酯,其他试验参数进行常规调整,得到目标产物(I-4),1HNMR数据如下:
1HNMR(400MHz,DMSO-d6):ppm:10.35(s,1H),8.70(s,1H),7.87(s,1H),7.74(d,J=1.68Hz,1H),7.57(dd,J=4.76Hz,5.04Hz,1H),7.51(s,1H),7.44(t,J=8.68Hz,1H),6.06-6.11(q,J=6.72Hz,1H),5.68(s,2H),4.04(t,J=7Hz,6.72Hz,2H),1.93(t,J=7.56Hz,7.32Hz,2H),1.80(d,J=6.72Hz,3H),1.71-1.77(m,2H),1.47-1.54(m,2H),1.15-1.23(m,2H)。
实施例5
本实施例的c-Met/HDAC双靶点抑制剂结构式中,linker为n=6,按照实施例1的方法进行合成,将3-溴丙酸甲酯替换为7-溴庚酸甲酯,其他试验参数进行常规调整,得到目标产物(I-5),1HNMR数据如下:
1HNMR(400MHz,DMSO-d6):ppm:10.35(s,1H),8.69(s,1H),7.87(s,1H),7.74(d,J=1.44Hz,1H),7.55-7.59(dd,J=5.04Hz,5.04Hz,1H),7.52(s,1H),7.44(t,J=8.68Hz,1H),6.88(d,J=1.68Hz,1H),6.06-6.11(q,J=6.76Hz,6.72Hz,6.44Hz,1H),5.68(s,2H),4.04(t,J=7Hz,6.72Hz,2H),1.92(t,J=7.56Hz,7Hz,2H),1.80(d,J=6.72Hz,3H),1.70-1.77(m,2H),1.43-1.50(m,2H),1.20-1.22(m,4H)。
实施例6
本实施例的c-Met/HDAC双靶点抑制剂结构式中,linker为n=6,按照实施例1的方法进行合成,将3-溴丙酸甲酯替换为8-溴辛酸甲酯,其他试验参数进行常规调整,得到目标产物(I-6),1HNMR数据如下:
1HNMR(400MHz,DMSO-d6):ppm:10.34(s,1H),8.67(s,1H),7.86(s,1H),7.73(s,1H),7.55-7.58(dd,J=5.04,5.04Hz,1H),7.51(s,1H),7.44(t,J=8.68Hz,8.4Hz,1H),6.87(s,1H),6.06-6.11(q,J=6.76Hz,6.72Hz,6.44Hz,1H),5.67(s,2H),4.04(t,J=7Hz,6.72Hz,2H),1.92(t,J=7.28Hz,2H),1.80(d,J=6.72Hz,3H),1.72-1.75(m,2H),1.40-1.47(m,2H),1.18-1.23(m,6H)。
实施例7
本实施例的c-Met/HDAC双靶点抑制剂结构式中,linker为按照实施例1的方法进行合成,将3-溴丙酸甲酯替换为linker为其他试验参数进行常规调整,得到目标产物(I-7),1HNMR数据如下:
1HNMR(400MHz,DMSO-d6):ppm:11.26(s,1H),9.12(s,1H),8.10(s,1H),7.45-7.78(m,8H),7.30(d,J=8.16Hz,2H),7.09(s,1H),6.23-6.27(q,J=6.44Hz,7Hz,6.16Hz,1H),5.39(s,2H),1.85(d,6.44Hz,3H)。
实施例8
本实施例的c-Met/HDAC双靶点抑制剂结构式中,linker为按照实施例1的方法进行合成,将3-溴丙酸甲酯替换为linker为其他试验参数进行常规调整,得到目标产物(I-8),1HNMR数据如下:
1HNMR(400MHz,DMSO-d6):ppm:11.26(s,1H),9.09(s,1H),7.99(s,1H),7.37-7.75(m,8H),6.89(s,1H),6.09-6.11(q,J=6.44Hz,6.72Hz,6.44Hz,1H),5.78(s,2H),5.35(s,2H),1.79(d,J=6.72Hz,3H)。
实施例9
本实施例的c-Met/HDAC双靶点抑制剂结构式中,linker为按照实施例1的方法进行合成,将3-溴丙酸甲酯替换为linker为其他试验参数进行常规调整,得到目标产物(I-9),1HNMR数据如下:
1HNMR(400MHz,DMSO-d6):ppm:10.80(s,1H),9.08(s,1H),8.01(s,1H),7.75(d,J=1.68Hz,1H),7.63(s,1H),7.54-7.58(m,3H),7.42-7.47(m,2H),7.27(d,7.4Hz,2H),6.9(d,J=1.4Hz,1H),6.58-6.66(m,2H),6.46(d,J=15.72Hz,1H),6.13-6.18(q,J=6.72Hz,1H),5.34(s,2H),1.80(d,J=6.44Hz,3H)。
实施例10
本实施例的c-Met/HDAC双靶点抑制剂结构式中,linker为按照实施例1的方法进行合成,将3-溴丙酸甲酯替换为linker为其他试验参数进行常规调整,得到目标产物(I-10)。
实施例11
将化合物(I-4)496mg(1mmol)溶于10ml二氯甲烷和甲醇的混合溶液(10:1),在冰水浴的条件下滴加0.5N HCl/1,4-二氧六环溶液4ml,有固体析出,搅拌4h,TLC检测,原料反应完全,停止反应,过滤得粗品,在冰浴条件下,在乙腈中搅拌3h,过滤得I-4-A 287mg,收率56%。
1HNMR数据如下:
1HNMR(400MHz,DMSO-d6):ppm:10.38(s,1H)8.03(s,1H),7.98(s,2H)
7.78(s,1H),7.60-7.63(m,2H),7.49(t,1H),7.13(s,1H),6.27-6.32(q,1H),4.08(t,2H),1.93(t,2H),1.86(d,3H),1.71-1.78(m,2H),1.46-1.54(m,2H),1.14-1.22(m,2H)。
实验例1
对实施例1-9制备的双靶点抑制剂化合物(I-1)~(I-9)分别进行如下评价:
1、生物活性评价:
按照Cisbio公司的试剂盒使用说明书,激酶TM-络氨酸激酶试验(KinEASETM-TK ASSAY)、HDAC2组蛋白去乙酰化试验(HDAC2HISTONE H3K4DEACETYLATION ASSAY)和HDAC1组蛋白去乙酰化试验(HDAC1HISTONE H3K9DEACETYLATION ASSAY)采用均相时间分辨荧光(HTRF)技术分别检测待测化合物对c-Met激酶活性及HDAC2和HDAC1脱乙酰化作用的抑制效应。实验过程分为三步:酶反应步骤、检测步骤和数据处理。
(1)酶反应步骤
在384孔板中分别按顺序加入化合物,底物-生物素(TK Substrate-biotin),酶等,将板子密封置于37℃孵箱中孵育进行酶反应。
(2)检测步骤
加入检测试剂链霉亲和素-XL665(Streptavidin-XL665)及酶对应的抗体,室温放置1小时后用酶标仪检测620nm和665nm荧光值。
(3)数据处理
每孔的检测值:Ratio=(665nm/620nm)×104,每个样品孔的特异性信号为样品孔的检测值与阴性对照孔检测值之差:Delta Ratio=Ratio(Sample)-Ratio(Negativecontrol),根据特异性信号计算每个化合物的抑制率:(Delta Ratio阳性对照-DeltaRatio化合物)/Delta Ratio阳性对照。根据化合物的浓度及对应的抑制率,求化合物的IC50。
2、对c-Met抑制活性的筛选
(1)材料准备
阳性对照化合物为克唑替尼。制备2×104uM的化合物为母液,储存在-80℃的冰箱里备用。将化合物稀释为200nM的浓度进行初筛。按照HTRFkinEASETM-TK分析试剂盒的说明配制试剂的浓度并进行稀释为工作液浓度:streptavidin-XL665(66.68×)、TKSubstrate-biotin(10×)、TK Antibody-Cryptate(1×)、Detection buffer(1×)、c-Met激酶(0.4ng/ul),DTT(100mM),ATP(5mM)和MgCl2(1M),Enzymatic buffer(5×Enzymaticbuffer,200×MgCl2,100×DTT,DDH2O)。
(2)酶反应步骤
阴性对照孔中加入6ul 1×kinase buffer,阳性对照孔中加入4ul 1×kinasebuffer,样品孔加入4ul化合物(200nM);然后每孔加入2ul TK Substrate-biotin(10×);除了阴性对照孔外,每孔再加入2ul的c-Met激酶(0.4ng/ul);最后每孔再加入2ul的ATP(5mM),在37℃的条件下孵育一个小时。
(3)检测步骤
每孔依次加入5ul的Streptavidin-XL665(66.68×)和5ul的TK Anti-body-Cryptate(1×),室温放置一小时后。酶标仪检测665nm和620nm的荧光值。
按照数据处理的方法,计算抑制率,结果见表1。
表1
根据初筛结果,选择和阳性化合物的抑制率相当的化合物,做进一步的筛选。复筛化合物分别选择六个浓度(200nM,100nM,20nM,10nM,2nM,0.2nM),实验过程同上,复筛化合物的IC50值见表2。
表2
3、对HDAC2抑制活性的筛选
(1)材料准备
阳性对照化合物为伏立诺他。制备2×104uM的化合物为母液,储存在-80℃的冰箱里备用。首先选择在20uM的浓度进行初步筛选。按照说明配制试剂的浓度并进行稀释为工作液浓度:H3K4me0-Eu(K)Ab(50×),streptavidin-XL665(83.35×),Detection buffer(1×),Histone H3(1-21)lysine 4acetylated biotinylated peptide(1000nM),HDAC2(2ng/ul),1×Enzymatic buffer(50mM Tris-HCl PH 8.0,1mM DTT,0.01%Tween20,0.01%BSA)。
(2)酶反应步骤
阴性对照孔中加入6ul 1×kinase buffer,阳性对照孔中加入4ul 1×kinasebuffer,检测孔加入4ul化合物(20uM);然后除了阴性对照孔外,每孔再加入2ul的HDAC2(2ng/ul);最后每孔加入4ul的底物Histone H3(1-21)lysine 4acetylated biotinylatedpeptide(1000nM),在37℃的条件下孵育2个小时。
(3)酶检测步骤
每孔都依次加入5ul的Streptavidin-XL665(83.35×)和5ul的H3K4me0-Eu(K)Ab(50×),室温放置一小时后。酶标仪检测665nm和620nm的荧光值。
(4)数据处理
按照实验方法中的数据处理方法,计算抑制率,实验数据见表3。
表3
根据初筛结果,选择和阳性化合物伏立诺他的抑制率相当的化合物,做进一步的筛选。复筛化合物分别选择六个浓度(20uM,10uM,2uM,200nM,20nM,2nM),实验过程同上,复筛化合物的IC50值见表4。
表4
4、对HDAC1抑制活性的筛选
(1)材料准备
阳性对照化合物为伏立诺他。制备2×104uM的化合物为母液,储存在-80℃的冰箱里备用。首先选择在2uM的浓度进行初步筛选。按照说明配制试剂的浓度并进行稀释为工作液浓度:H3K9me0-Eu(K)Ab(50×),streptavidin-XL665(416.5×),Detection buffer(1×),Histone H3(1-21)lysine 9acetylated biotinylated peptide(200nM),HDAC1(20ng/ul),1×Enzymatic buffer(50mM Tris-HCl PH 8.0,137mM NaCl,2.7mM KCl,1mMMgCl2,0.01%Tween20)。
(2)酶反应步骤
阴性对照孔中加入6ul 1×kinase buffer,阳性对照孔中加入4ul 1×kinasebuffer,检测孔加入4ul化合物(2uM);然后除了阴性对照孔外,每孔再加入2ul的HDAC1(20ng/ul);最后每孔加入4ul的底物Histone H3(1-21)lysine 9acetylatedbiotinylated peptide(200nM),在37℃的条件下孵育2个小时。
(3)检测步骤
每孔都依次加入5ul的Streptavidin-XL665(83.35×)和5ul的H3K9me0-Eu(K)Ab(50×),室温放置一小时后。酶标仪检测665nm和620nm的荧光值。
(4)数据处理
按照实验方法中的数据处理方法,计算抑制率,实验数据见表5。
表5
根据初筛结果,选择和阳性化合物伏立诺他的抑制率相当的化合物,做进一步的筛选。复筛化合物分别选择六个浓度(20uM,2uM,1uM,200nM,20nM,2nM),实验过程同上,复筛化合物的IC50值见表6。
表6
组别 IC<sub>50</sub>(nM)
伏立诺他 582.6
I-4 129.1
I-6 1310
I-3 443.2
I-5 82
I-7 49.8
综合以上数据分析,(1)化合物I-1、I-3、I-4、I-5、I-7、I-9对c-Met的抑制活性和阳性对照克唑替尼在同一水平;(2)化合物有I-3、I-4、I-5、I-6、I-7对HDAC2的抑制活性和阳性对照伏立诺他在同一水平,其中I-4、I-5稍优于伏立诺他;(3)化合物I-3、I-4、I-5、I-7对HDAC1的抑制活性和阳性对照伏立诺他在同一水平;(4)化合物有I-3、I-4、I-5、I-7对c-Met和HDAC均有较好抑制活性。由于,c-Met和HDAC双靶点的抑制剂具有协同对抗癌症的作用,因此分析此类化合物在抗肿瘤机理上存在一定的协同作用,本发明的化合物在体内的药效可能存在叠加的效应,有望降低药物的使用剂量和毒副作用。
本申请人对其他实施例制备的化合物也进行了上述的试验,结果基本一致,由于篇幅有限,不再一一列举。
以上所述,仅为本发明的具体实施方式,但本发明的保护范围并不局限于此,任何熟悉本技术领域的技术人员在本发明揭露的技术范围内,可轻易想到变化或替换,都应涵盖在本发明的保护范围之内。因此,本发明的保护范围应以所述权利要求的保护范围为准。

Claims (10)

1.一种新型的c-Met/HDAC双靶点抑制剂,其特征在于,所述的抑制剂的结构式如式(I)所示或式(I)在药学上可接受的盐:
其中,linker为直链结构、支链结构或芳香环结构。
2.根据权利要求1所述的新型的c-Met/HDAC双靶点抑制剂,其特征在于,所述的直链结构为其中n为1-7任一自然数。
3.根据权利要求1所述的新型的c-Met/HDAC双靶点抑制剂,其特征在于,所述的支链结构为
4.根据权利要求1所述的新型的c-Met/HDAC双靶点抑制剂,其特征在于,所述的芳香环结构为
5.一种权利要求1-4任意一项所述的新型的c-Met/HDAC双靶点抑制剂的合成方法,其特征在于,所述的方法包括如下步骤:
(1)首先合成中间体(a)反应方程式如下:
(2)中间体(b)的合成方程式如下:
(3)中间体(c)的合成方程式如下:
(4)中间体(d)的合成方程式如下:
(5)目标产物的合成方程式如下:
6.根据权利要求5所述的新型的c-Met/HDAC双靶点抑制剂的合成方法,其特征在于,步骤(1)中室温下搅拌反应22-26小时,加水、萃取、洗涤、干燥、过滤、浓缩,得到中间体(a),中间体(a)的产率为61-65%。
7.根据权利要求5所述的新型的c-Met/HDAC双靶点抑制剂的合成方法,其特征在于,步骤(2)中在氮气氛围下进行反应,反应物溶解在二甲亚砜中,加入碳酸钾,升温至78-82℃,加入[1,1'-双(二苯基膦)二茂铁]二氯化钯二氯甲烷络合物,反应18-22小时,分层、洗涤、干燥、过滤、蒸馏,得到中间体(b),中间体(b)的收率为63-67%。
8.根据权利要求5所述的新型的c-Met/HDAC双靶点抑制剂的合成方法,其特征在于,步骤(3)中室温反应3.5-4.5小时,浓缩,调节pH=5~6,过滤,洗涤,干燥,得到中间体(c),中间体(c)的产率为91-95%。
9.根据权利要求5所述的新型的c-Met/HDAC双靶点抑制剂的合成方法,其特征在于,步骤(4)中中间体(c)溶于DMF,加入HATU和DIPEA,水域搅拌10-20分钟,加入O-(四氢-2H-吡喃-2-基)羟胺,在室温下搅拌反应3.5-4.5小时,分层、洗涤、干燥、过滤、浓缩,得到中间体(d),中间体(d)产率为70-80%,优选的,步骤(5)中室温反应25-35分钟,浓缩,pH调节至中性,提纯,得到目标产物,目标产物的产率为50-54%。
10.一种权利要求1-4任意一项所述的新型的c-Met/HDAC双靶点抑制剂在制备抗肿瘤药物中的应用。
CN201910428395.8A 2019-05-22 2019-05-22 一种新型的c-Met/HDAC双靶点抑制剂及其合成方法与应用 Active CN110016013B (zh)

Priority Applications (1)

Application Number Priority Date Filing Date Title
CN201910428395.8A CN110016013B (zh) 2019-05-22 2019-05-22 一种新型的c-Met/HDAC双靶点抑制剂及其合成方法与应用

Applications Claiming Priority (1)

Application Number Priority Date Filing Date Title
CN201910428395.8A CN110016013B (zh) 2019-05-22 2019-05-22 一种新型的c-Met/HDAC双靶点抑制剂及其合成方法与应用

Publications (2)

Publication Number Publication Date
CN110016013A true CN110016013A (zh) 2019-07-16
CN110016013B CN110016013B (zh) 2020-08-11

Family

ID=67194242

Family Applications (1)

Application Number Title Priority Date Filing Date
CN201910428395.8A Active CN110016013B (zh) 2019-05-22 2019-05-22 一种新型的c-Met/HDAC双靶点抑制剂及其合成方法与应用

Country Status (1)

Country Link
CN (1) CN110016013B (zh)

Cited By (1)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Publication number Priority date Publication date Assignee Title
CN113444069A (zh) * 2021-07-07 2021-09-28 新乡医学院 一类2-芳基-4-(1h-吡唑-3-基)吡啶类lsd1/hdac双靶点抑制剂

Citations (2)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Publication number Priority date Publication date Assignee Title
CN103304552A (zh) * 2012-03-09 2013-09-18 广东东阳光药业有限公司 取代的吡啶化合物及其使用方法和用途
WO2013138210A1 (en) * 2012-03-14 2013-09-19 Ning Xi Substituted cyclic compounds and methods of use

Patent Citations (2)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Publication number Priority date Publication date Assignee Title
CN103304552A (zh) * 2012-03-09 2013-09-18 广东东阳光药业有限公司 取代的吡啶化合物及其使用方法和用途
WO2013138210A1 (en) * 2012-03-14 2013-09-19 Ning Xi Substituted cyclic compounds and methods of use

Non-Patent Citations (1)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Title
TIMOFEEVSKI, SERGEI L等: "《Enzymatic Characterization of c-Met Receptor Tyrosine Kinase Oncogenic Mutants and Kinetic Studies with Aminopyridine and Triazolopyrazine Inhibitors》", 《BIOCHEMISTRY》 *

Cited By (1)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Publication number Priority date Publication date Assignee Title
CN113444069A (zh) * 2021-07-07 2021-09-28 新乡医学院 一类2-芳基-4-(1h-吡唑-3-基)吡啶类lsd1/hdac双靶点抑制剂

Also Published As

Publication number Publication date
CN110016013B (zh) 2020-08-11

Similar Documents

Publication Publication Date Title
Wang et al. Synthesis and in vitro antitumor activity of new butenolide-containing dithiocarbamates
CN105399757A (zh) 酸敏感型喜树碱-20位去甲斑蝥酸酯衍生物及其抗肿瘤应用
CN105017160A (zh) 一种嘧啶类egfrt790m抑制剂及其合成方法和应用
CN110016013A (zh) 一种新型的c-Met/HDAC双靶点抑制剂及其合成方法与应用
EP4110781B1 (en) 1,3,4-oxadiazole derivative compounds as histone deacetylase 6 inhibitor, and the pharmaceutical composition comprising the same
CN117924163A (zh) 一种艾沙康唑鎓硫酸盐的杂质化合物及其制备方法
CN110128411A (zh) 一种c-Met/HDAC双靶点抑制剂及其合成方法与应用
CN105646546B (zh) 酸敏感型的喜树碱‑20位酯衍生物及其抗肿瘤应用
CN102725288A (zh) 用于制造6-取代的1-甲基-1h-苯并咪唑衍生物的方法和所述方法的中间体
CN104592114B (zh) 取代喹啉类组蛋白去乙酰化酶抑制剂及制备方法和应用
CN110003181A (zh) 一种基于克唑替尼结构的c-Met/HDAC双靶点抑制剂及其合成方法与应用
CN106565713B (zh) 2′-吡唑-1H-咪唑[4,5-f][1,10]菲罗啉衍生物及其制备方法和应用
CN109400595A (zh) 一类含噻吩环的抗癌化合物
CN110172058B (zh) 7-氮杂螺[5.6]十二烷-10-酮类化合物及其制备方法与用途
CN108014113A (zh) 丁酰氨基二甲氧基苯并[d]氮杂*基喹唑啉类化合物在制备治疗宫颈癌药物中的应用
CN113292554A (zh) 二氢萘并[2,1-d]异噁唑酰胺类衍生物及其在抗肿瘤药物的应用
CN110054577B (zh) 一类含脲和硫脲结构的化合物、合成方法及其应用
CN103910734B (zh) 一种具有哌嗪结构的dpp-4抑制剂
CN113416171A (zh) 4,5-二氢萘并异噁唑类衍生物及其在抗肿瘤药物中的应用
CN103570619B (zh) 一种孟鲁司特钠衍生物的制备方法
CN101607938A (zh) 一种新型异喹啉类抗肿瘤化合物及其制备方法
CN114920663B (zh) 一种联苯类奥司他韦衍生物及其制备方法与应用
CN104098524A (zh) 1-间甲氧基苯甲酰基-3-苯基-1,4-二氢-1,2,4,5-四嗪及制备和应用
CN102875556B (zh) (4s)-1-取代-2,5-二氮杂双环[2,2,1]庚烷衍生物及制备方法
CN112225737B (zh) 具有hdac抑制活性的化合物、制备方法、组合物及用途

Legal Events

Date Code Title Description
PB01 Publication
PB01 Publication
SE01 Entry into force of request for substantive examination
SE01 Entry into force of request for substantive examination
GR01 Patent grant
GR01 Patent grant