CN109371162A - 与水稻耐盐性相关的snp分子标记及其应用 - Google Patents

与水稻耐盐性相关的snp分子标记及其应用 Download PDF

Info

Publication number
CN109371162A
CN109371162A CN201811531107.3A CN201811531107A CN109371162A CN 109371162 A CN109371162 A CN 109371162A CN 201811531107 A CN201811531107 A CN 201811531107A CN 109371162 A CN109371162 A CN 109371162A
Authority
CN
China
Prior art keywords
rice
salt
genotype
sequence
chromosome
Prior art date
Legal status (The legal status is an assumption and is not a legal conclusion. Google has not performed a legal analysis and makes no representation as to the accuracy of the status listed.)
Pending
Application number
CN201811531107.3A
Other languages
English (en)
Inventor
赵秀琴
王文生
穆罕默德·马布布尔·拉希德
傅彬英
王银晓
谢自艳
徐建龙
黎志康
Current Assignee (The listed assignees may be inaccurate. Google has not performed a legal analysis and makes no representation or warranty as to the accuracy of the list.)
Shenzhen Biology Breeding And Innovation Institute Chinese Academy Of Agricultural Sciences
Institute of Crop Sciences of Chinese Academy of Agricultural Sciences
Original Assignee
Shenzhen Biology Breeding And Innovation Institute Chinese Academy Of Agricultural Sciences
Institute of Crop Sciences of Chinese Academy of Agricultural Sciences
Priority date (The priority date is an assumption and is not a legal conclusion. Google has not performed a legal analysis and makes no representation as to the accuracy of the date listed.)
Filing date
Publication date
Application filed by Shenzhen Biology Breeding And Innovation Institute Chinese Academy Of Agricultural Sciences, Institute of Crop Sciences of Chinese Academy of Agricultural Sciences filed Critical Shenzhen Biology Breeding And Innovation Institute Chinese Academy Of Agricultural Sciences
Priority to CN201811531107.3A priority Critical patent/CN109371162A/zh
Publication of CN109371162A publication Critical patent/CN109371162A/zh
Pending legal-status Critical Current

Links

Classifications

    • C—CHEMISTRY; METALLURGY
    • C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
    • C12Q—MEASURING OR TESTING PROCESSES INVOLVING ENZYMES, NUCLEIC ACIDS OR MICROORGANISMS; COMPOSITIONS OR TEST PAPERS THEREFOR; PROCESSES OF PREPARING SUCH COMPOSITIONS; CONDITION-RESPONSIVE CONTROL IN MICROBIOLOGICAL OR ENZYMOLOGICAL PROCESSES
    • C12Q1/00—Measuring or testing processes involving enzymes, nucleic acids or microorganisms; Compositions therefor; Processes of preparing such compositions
    • C12Q1/68—Measuring or testing processes involving enzymes, nucleic acids or microorganisms; Compositions therefor; Processes of preparing such compositions involving nucleic acids
    • C12Q1/6876—Nucleic acid products used in the analysis of nucleic acids, e.g. primers or probes
    • C12Q1/6888—Nucleic acid products used in the analysis of nucleic acids, e.g. primers or probes for detection or identification of organisms
    • C12Q1/6895—Nucleic acid products used in the analysis of nucleic acids, e.g. primers or probes for detection or identification of organisms for plants, fungi or algae
    • C—CHEMISTRY; METALLURGY
    • C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
    • C12Q—MEASURING OR TESTING PROCESSES INVOLVING ENZYMES, NUCLEIC ACIDS OR MICROORGANISMS; COMPOSITIONS OR TEST PAPERS THEREFOR; PROCESSES OF PREPARING SUCH COMPOSITIONS; CONDITION-RESPONSIVE CONTROL IN MICROBIOLOGICAL OR ENZYMOLOGICAL PROCESSES
    • C12Q2600/00—Oligonucleotides characterized by their use
    • C12Q2600/13—Plant traits
    • C—CHEMISTRY; METALLURGY
    • C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
    • C12Q—MEASURING OR TESTING PROCESSES INVOLVING ENZYMES, NUCLEIC ACIDS OR MICROORGANISMS; COMPOSITIONS OR TEST PAPERS THEREFOR; PROCESSES OF PREPARING SUCH COMPOSITIONS; CONDITION-RESPONSIVE CONTROL IN MICROBIOLOGICAL OR ENZYMOLOGICAL PROCESSES
    • C12Q2600/00—Oligonucleotides characterized by their use
    • C12Q2600/156—Polymorphic or mutational markers

Landscapes

  • Chemical & Material Sciences (AREA)
  • Life Sciences & Earth Sciences (AREA)
  • Analytical Chemistry (AREA)
  • Engineering & Computer Science (AREA)
  • Organic Chemistry (AREA)
  • Proteomics, Peptides & Aminoacids (AREA)
  • Health & Medical Sciences (AREA)
  • Biotechnology (AREA)
  • Zoology (AREA)
  • Wood Science & Technology (AREA)
  • Immunology (AREA)
  • Mycology (AREA)
  • Microbiology (AREA)
  • Molecular Biology (AREA)
  • Botany (AREA)
  • Biophysics (AREA)
  • Physics & Mathematics (AREA)
  • Biochemistry (AREA)
  • Bioinformatics & Cheminformatics (AREA)
  • General Engineering & Computer Science (AREA)
  • General Health & Medical Sciences (AREA)
  • Genetics & Genomics (AREA)
  • Measuring Or Testing Involving Enzymes Or Micro-Organisms (AREA)

Abstract

本发明公开了与水稻耐盐性相关的SNP分子标记及其应用。本发明提供的SNP分子标记位于水稻第7号染色体第10,979,736位，多态性为A或G。该SNP分子标记与水稻在盐胁迫条件下的幼苗存活指数显著相关，该位点基因型为AA的水稻品种在盐胁迫条件下的耐盐性显著强于基因型为GG的水稻品种。本发明还依据该SNP位点设计了PCR引物，引物的核苷酸序列如序列1和序列2所示。本发明提供的与水稻耐盐性相关的SNP分子标记在自然群体验证结果表明该标记可以有效预测水稻苗期耐盐性，从而可用于水稻耐盐分子标记辅助育种。

Description

与水稻耐盐性相关的SNP分子标记及其应用
技术领域
本发明涉及水稻育种和分子遗传学领域，具体涉及与水稻耐盐性相关的SNP分子标记及其应用，特别涉及水稻第7号染色体上的一个与水稻耐盐性状显著关联的SNP分子标记及其应用。
背景技术
水稻是世界上最重要的三大粮食作物之一，是世界2/3人口的主要食物来源。随着全球气候的不断变化和全国耕地面积的不断减少，盐害已成为影响我国水稻高产、稳产的重要限制因素之一。全世界盐碱地的面积为9.54亿公顷，我国约为9900万公顷，其中潜在盐碱土1700万公顷。水稻属于中度盐敏感作物，当土壤中可溶性盐浓度达到0.3％时即表现出受害症状，最终导致植株死亡并显著减产。同时，在耕地资源日益趋紧的情况下，如果能培育并推广耐高盐的水稻新品种，使海边大面积不长植物的盐碱地和滩涂成为耕地，对保障粮食安全意义重大。为了克服盐害对水稻生产的不利影响同时扩大水稻的种植面积，培育和种植耐盐新品种是最经济、最环保、最有效的方式。因此，发掘水稻耐盐相关基因，开发与耐盐性状紧密相关的分子标记，对于培育耐盐新品种具有重要意义。
水稻种质资源是新基因挖掘和分子育种的资源基础，种质资源中蕴藏着丰富的遗传变异。事实上，不论是遗传育种还是生产中，仅仅是极少数资源得到有效利用，因此优异种质的发掘、优异基因及其分子标记的鉴定是育种取得突破性进展的关键。随着全基因组测序技术的发展，使在全基因组水平上比较不同种质资源基因变异成为可能，同时结合表型鉴定数据，利用连锁分析和关联分析(GWAS)等分析方法，可以高效发掘种质资源中蕴含的新基因和有利等位基因。
单核苷酸多态性(Single Nucleotide Polymorphisms，SNP)主要是指由于单个核苷酸的变异而引起基因组水平上的DNA序列多态性，SNP在水稻基因组中的分布相当广泛，随着高通量测序技术的进步，SNP已经成为了新一代的分子标记。功能标记是根据功能基因内部引起表型性状变异的多态性基序开发出来的一种新型分子标记。由于来自基因内的功能性基序，此类标记不需要进一步验证就可以在不同的遗传背景下或者不同的水稻种质资源中确定目标等位基因的有无。
发明内容
本发明的一个目的是提供一种鉴定或辅助鉴定水稻耐盐性的方法。
本发明提供的鉴定或辅助鉴定水稻耐盐性的方法是检测待测水稻第7号染色体第10,979,736位的基因型是AA基因型还是GG基因型：AA基因型的待测水稻的耐盐性强于GG基因型的待测水稻；
所述AA基因型是水稻基因组第7号染色体第10,979,736位脱氧核糖核苷酸均为A的纯合体；所述GG基因型是水稻基因组第7号染色体第10,979,736位脱氧核糖核苷酸均为G的纯合体。
上述方法中，所述耐盐性为苗期耐盐性。
所述AA基因型的待测水稻的耐盐性强于GG基因型的待测水稻体现在AA基因型的待测水稻在盐胁迫下的幼苗存活率和/或幼苗存活指数高于GG基因型的待测水稻。所述盐胁迫具体为NaCl胁迫，所述NaCl的浓度具体为100mM。
所述幼苗存活率和所述幼苗存活指数的计算公式如下：
其中S10、S12、S15和S18分别代表在盐胁迫第10天、第12天、第15天和第18天后的幼苗存活率。
进一步的，所述检测待测水稻第7号染色体第10,979,736位的基因型是AA基因型还是GG基因型的方法为如下A)或B)：
A)直接测序；
B)测序含有水稻基因组第7号染色体第10,979,736位脱氧核糖核苷酸的PCR扩增产物。
更进一步的，所述PCR扩增产物所用的引物具体可为1)或2)：
1)由序列表中序列1所示的单链DNA分子和序列表中序列2所示的单链DNA分子组成的引物对A；
2)由序列A所示的单链DNA分子和序列B所示的单链DNA分子组成的引物对B；
所述序列A为将序列1删除或增加或改变一个或几个核苷酸，且与序列1具有相同功能的核苷酸；
所述序列B为将序列2删除或增加或改变一个或几个核苷酸，且与序列2具有相同功能的核苷酸。
本发明的另一个目的是提供检测水稻第7号染色体第10,979,736位的基因型的物质的新用途。
本发明提供了检测水稻第7号染色体第10,979,736位的基因型的物质在如下(a1)-(a8)中任一种中的应用：
(a1)鉴定或辅助鉴定待测水稻耐盐性；
(a2)制备鉴定或辅助鉴定待测水稻耐盐性的产品；
(a3)选育耐盐水稻品种；
(a4)制备选育耐盐水稻品种的产品；
(a5)改良水稻的耐盐性；
(a6)制备改良水稻的耐盐性的产品；
(a7)水稻分子育种；
(a8)制备水稻分子育种的产品。
本发明还有一个目的是提供一种鉴定或辅助鉴定待测水稻耐盐性的产品。
本发明提供的鉴定或辅助鉴定待测水稻耐盐性的产品为检测水稻第7号染色体第10,979,736位的基因型的物质。
上述产品具体可为如下(b1)-(b3)中任一种：
(b1)上述引物；
(b2)含有(b1)所述的引物的PCR试剂；
(b3)含有(b1)所述的引物或(b2)所述的PCR试剂的试剂盒。
上述产品在如下(c1)-(c4)中任一种应用也属于本发明的保护范围：
(c1)鉴定或辅助鉴定待测水稻耐盐性；
(c2)选育耐盐水稻品种；
(c3)改良的水稻耐盐性；
(c4)水稻分子育种。
本发明的最后一个目的是提供一种选育耐盐水稻品种的方法。
本发明提供的选育耐盐水稻品种的方法包括选择AA基因型的水稻品种进行育种的步骤；所述AA基因型是水稻基因组第7号染色体第10,979,736位脱氧核糖核苷酸均为A的纯合体。
上述方法或应用或产品中，所述水稻第7号染色体第10,979,736位也即为序列3第266位。
上述方法或应用或产品中，所述耐盐性为苗期耐盐性。
本发明基于高密度SNP分子标记的关联分析方法快速、准确的检测到与水稻耐盐性状显著关联的SNP位点，其位于水稻第7号染色体第10,979,736位。通过实验证明：该SNP位点与盐胁迫条件下的幼苗存活指数显著相关，解释表型变异为11％。该SNP位点可以作为功能性分子标记，筛选耐盐的水稻资源和品种，在水稻耐盐分子育种中发挥重要作用。
具体实施方式
以下实施例进一步说明本发明的内容，但不应理解为对本发明的限制。在不背离本发明精神和实质的情况下，对本发明方法、步骤或条件的修改或者替换，均属于本发明的范围。若无特别指明，实施例中所用的技术手段为本领域技术人员所熟知的常规手段。若无特殊说明，实施例中所用的材料、试剂等均可从商业途径得到。
实施例1、与水稻耐盐性紧密连锁的SNP分子标记的获得与鉴定
一、与水稻耐盐性紧密连锁的SNP分子标记的获得
1、选取水稻微核心种质和全球水稻分子育种亲本共计480份，利用二代测序技术进行重测序，以日本晴为参考序列获得高密度的SNP数据。
2、在中国农业科学院作物科学研究所温室，考察480份种质资源在正常条件下和在盐胁迫条件下的幼苗存活指数。具体步骤如下：种子在50℃烘箱中烘3天打破休眠，用1％次氯酸钠溶液浸泡10分钟进行表面消毒，在37℃培育箱下浸种、催芽至露白。选发芽一致的种子播于底部带有尼龙网的泡沫板孔中，置于盛有20L水的塑料盆中，每个材料种植10粒种子，三次生物学重复。用pH为5.5的蒸馏水培养三天，之后用Yoshida营养液继续培养。播种后14天左右(两叶一心期)开始盐胁迫处理(NaCl处理)，NaCl处理浓度为100mM，NaCl处理方法为向Yoshida营养液中加入NaCl，调节NaCl浓度为100mM，用含有NaCl的Yoshida营养液进行培养。正常对照的处理方法为用未加入NaCl的Yoshida营养液进行培养。期间每天调pH至5.5左右，每7天换一次营养液。调查盐胁迫处理后第10天、12天、15天和18天的幼苗存活率S，并计算出幼苗存活指数，用于进行全基因组关联分析(GWAS)。幼苗存活率和幼苗存活指数的计算公式如下：
其中S10、S12、S15和S18分别代表在盐胁迫第10天、第12天、第15天和第18天后的幼苗存活率。水稻材料的幼苗存活指数越高，其耐盐性越强。
3、通过全基因组关联分析发掘一个与耐盐性显著相关的SNP位点，该SNP位点位于水稻基因组第7号染色体第10,979,736位，也即为序列3第266位。当该SNP为A时，编码赖氨酸(Lys)，幼苗存活指数较高，即苗期耐盐性较强，当该SNP为G时，编码精氨酸(Arg)，幼苗存活指数较低，即苗期耐盐性较差。
4、针对步骤3获得的SNP位点设计了引物，引物序列如表1所示。
表1、引物序列
引物名称 引物序列(5’-3’)
正向引物 5’-ACTAGGTGTGCTCTCTGATG-3’(序列1)
反向引物 5’-GAAGAAGAATCGACATGAAG-3’(序列2)
二、基于SNP分子标记鉴定水稻苗期耐盐性的方法
基于SNP分子标记鉴定苗期待测水稻耐盐性的方法是检测待测水稻中SNP位点(第7号染色体第10,979,736位)的基因型是AA基因型还是GG基因型：AA基因型水稻的耐盐性强于GG基因型水稻。AA基因型水稻是水稻基因组第7号染色体第10,979,736位脱氧核糖核苷酸为A的纯合体；GG基因型水稻是水稻基因组第7号染色体第10,979,736位脱氧核糖核苷酸为G的纯合体。
检测待测水稻中SNP位点(第7号染色体第10,979,736位)的基因型是AA基因型还是GG基因型具体步骤如下：提取水稻基因组DNA，以基因组DNA为模板，采用步骤一中设计的正向引物和反向引物进行PCR扩增，得到PCR扩增产物；将PCR扩增产物进行测序，根据测序结果确定待测水稻SNP位点(第7号染色体第10,979,736位)的基因型是AA基因型还是GG基因型。
实施例2、与水稻苗期耐盐性相关的SNP分子标记的应用
一、幼苗存活指数检测
从3000份水稻核心种质资源中随机选取30份材料作为实验材料(表2)，30份材料均记载于文献“Wang Wensheng et al.,Genomic variation in 3,010diverseaccessions of Asian cultivated rice.Nature,2018,557:43-49.”中，公众可从申请人处获得，该生物材料只为重复本发明的相关实验所用，不可作为其它用途使用。按照实施例1步骤一中的2的方法检测水稻幼苗存活率，并计算幼苗存活指数。结果如表2所示。
二、基因型检测
按照实施例1步骤二中的方法检测待测水稻的基因型。
结果如表2所示。30个水稻材料中有15个材料在该SNP位点的基因型为AA，15个材料在该SNP位点的基因型为GG。同时发现该SNP位点基因型为AA的水稻材料的平均幼苗存活指数为0.590，基因型为GG的水稻材料的平均幼苗存活指数为0.288，两者间差异显著(p＝2.34E-11)。结果表明：该SNP位点基因型为AA的水稻材料的幼苗存活指数显著高于基因型为GG的水稻材料，说明该SNP位点基因型为AA的水稻材料的耐盐性显著强于基因型为GG的水稻材料。本发明进一步证明该SNP位点能够作为有效的遗传标记应用于水稻分子标记辅助选择，改良水稻的苗期耐盐性，加速耐盐水稻的育种进程。
表2、30份水稻种质资源在盐胁迫条件下的幼苗存活指数及SNP基因型统计
编号 品种名称 幼苗存活指数 SNP位点基因型
1 Bhavani 0.606 AA
2 C 894-21 0.512 AA
3 Cisanggarung 0.547 AA
4 FL478 0.693 AA
5 Gayabyeo 0.528 AA
6 Hei Mi Chan 0.620 AA
7 IR06G113 0.595 AA
8 IR77298-14-1-2 0.499 AA
9 L 301B 0.568 AA
10 OM997 0.557 AA
11 Y134 0.575 AA
12 ZALE 0.511 AA
13 万利籼 0.607 AA
14 镇籼232 0.799 AA
15 竹珍B 0.638 AA
16 80050YR72136-43 0.213 GG
17 BD007 0.260 GG
18 CAU2 0.281 GG
19 IAC165 0.281 GG
20 IAC47 0.315 GG
21 IRAT 36 0.195 GG
22 IRAT109 0.325 GG
23 ITA 221 0.296 GG
24 KinandangPatong 0.469 GG
25 Lemont 0.173 GG
26 MR19 0.397 GG
27 Nabated A Smar 0.303 GG
28 NAN-29-2 0.204 GG
29 YJ30 0.285 GG
30 红杂 0.319 GG
序列表
<110>中国农业科学院作物科学研究所 中国农业科学院深圳生物育种创新研究院
<120>与水稻耐盐性相关的SNP分子标记及其应用
<160>3
<170>PatentIn version 3.5
<210>1
<211>20
<212>DNA
<213>人工序列(Artificial Sequence)
<400>1
actaggtgtg ctctctgatg 20
<210>2
<211>20
<212>DNA
<213>人工序列(Artificial Sequence)
<400>2
gaagaagaat cgacatgaag 20
<210>3
<211>788
<212>DNA
<213>人工序列(Artificial Sequence)
<400>3
actaggtgtg ctctctgatg gcatatctca actccacctt ggaacaacat tttttcaggt 60
agtaaaaggc ttcatcaatg acaattcttc aatgctgtat ggatggtggc tattatcttg 120
atatgccttg tttttctcct gcagaaaatg attgctgtca acctgacaac ctcgattcga 180
acggtgaagg ttttggttct tgattcaaat ggccctaatc tggatgtagt tgttgacttc 240
ctcaaatgct tcccctgctt ggagaggctg tatgttgtag tgagtatttc cattttggtt 300
tctttcacta gattgattat aattttgtca agtattacat tgccaagtgc caaccggtta 360
gcaactgttt tgcgatggtc tcttctttcc ttttacagtc tcgcccacat aaggttatca 420
agaatataag gagctatgac ccactacatc caatagaatg catggagctc catctcagaa 480
aagtggtaat aagatattat gaaggcaaga ggccagatgt tgactttgcc aagttctttg 540
ttctgaatgc aaaagtgcta agagaaatgg atttctgtag ccctagcaat cgcaatctga 600
aatggcagga taaccaacac aggcgccttt cattggaaaa taaggcttct caagttgctc 660
aatttacatt taaaactacc tctaggacta ggaatgagtt gactaggaac aggcatacac 720
atgaattgtc aatgtctgat ccttttgatt tctcttcatg tctatgctct tcatgtcgat 780
tcttcttc 788

Claims (10)

1.一种鉴定或辅助鉴定水稻耐盐性的方法，是检测待测水稻第7号染色体第10,979,736位的基因型是AA基因型还是GG基因型：AA基因型的待测水稻的耐盐性强于GG基因型的待测水稻；
所述AA基因型是水稻基因组第7号染色体第10,979,736位脱氧核糖核苷酸均为A的纯合体；
所述GG基因型是水稻基因组第7号染色体第10,979,736位脱氧核糖核苷酸均为G的纯合体。
2.根据权利要求1所述的方法，其特征在于：所述耐盐性为苗期耐盐性。
3.根据权利要求1或2所述的方法，其特征在于：所述检测待测水稻第7号染色体第10,979,736位的基因型是AA基因型还是GG基因型的方法为如下A)或B)：
A)直接测序；
B)测序含有水稻基因组第7号染色体第10,979,736位脱氧核糖核苷酸的PCR扩增产物。
4.根据权利要求3所述的方法，其特征在于：所述PCR扩增产物所用的引物为1)或2)：
1)由序列表中序列1所示的单链DNA分子和序列表中序列2所示的单链DNA分子组成的引物对A；
2)由序列A所示的单链DNA分子和序列B所示的单链DNA分子组成的引物对B；
所述序列A为将序列1删除或增加或改变一个或几个核苷酸，且与序列1具有相同功能的核苷酸；
所述序列B为将序列2删除或增加或改变一个或几个核苷酸，且与序列2具有相同功能的核苷酸。
5.检测水稻第7号染色体第10,979,736位的基因型的物质在如下(a1)-(a8)中任一种中的应用：
(a1)鉴定或辅助鉴定待测水稻耐盐性；
(a2)制备鉴定或辅助鉴定待测水稻耐盐性的产品；
(a3)选育耐盐水稻品种；
(a4)制备选育耐盐水稻品种的产品；
(a5)改良水稻的耐盐性；
(a6)制备改良水稻的耐盐性的产品；
(a7)水稻分子育种；
(a8)制备水稻分子育种的产品。
6.一种鉴定或辅助鉴定待测水稻耐盐性的产品，为检测水稻第7号染色体第10,979,736位的基因型的物质。
7.根据权利要求6所述的产品，其特征在于：所述产品为如下(b1)-(b3)中任一种：
(b1)权利要求4中所述的引物；
(b2)含有(b1)所述的引物的PCR试剂；
(b3)含有(b1)所述的引物或(b2)所述的PCR试剂的试剂盒。
8.权利要求6或7所述的产品在如下(c1)-(c4)中任一种应用：
(c1)鉴定或辅助鉴定待测水稻耐盐性；
(c2)选育耐盐水稻品种；
(c3)改良水稻的耐盐性；
(c4)水稻分子育种。
9.一种选育耐盐水稻品种的方法，包括选择AA基因型的水稻品种进行育种的步骤；所述AA基因型是水稻基因组第7号染色体第10,979,736位脱氧核糖核苷酸均为A的纯合体。
10.根据权利要求5所述的应用或权利要求6或7所述产品或权利要求8所述的应用或权利要求9所述的方法，其特征在于：所述耐盐性为苗期耐盐性。
CN201811531107.3A 2018-12-14 2018-12-14 与水稻耐盐性相关的snp分子标记及其应用 Pending CN109371162A (zh)

Priority Applications (1)

Application Number Priority Date Filing Date Title
CN201811531107.3A CN109371162A (zh) 2018-12-14 2018-12-14 与水稻耐盐性相关的snp分子标记及其应用

Applications Claiming Priority (1)

Application Number Priority Date Filing Date Title
CN201811531107.3A CN109371162A (zh) 2018-12-14 2018-12-14 与水稻耐盐性相关的snp分子标记及其应用

Publications (1)

Publication Number Publication Date
CN109371162A true CN109371162A (zh) 2019-02-22

Family

ID=65373922

Family Applications (1)

Application Number Title Priority Date Filing Date
CN201811531107.3A Pending CN109371162A (zh) 2018-12-14 2018-12-14 与水稻耐盐性相关的snp分子标记及其应用

Country Status (1)

Country Link
CN (1) CN109371162A (zh)

Cited By (7)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Publication number Priority date Publication date Assignee Title
CN110628935A (zh) * 2019-10-24 2019-12-31 中国农业科学院作物科学研究所 水稻成株期耐盐基因LOC_Os02g49700的分子标记方法及应用
CN110628936A (zh) * 2019-10-24 2019-12-31 中国农业科学院作物科学研究所 水稻全生育期耐盐基因LOC_Os03g28300的分子标记方法及应用
CN111662928A (zh) * 2020-06-16 2020-09-15 中国科学院植物研究所 调控植物耐盐性的方法及耐盐相关蛋白
CN111733278A (zh) * 2020-07-21 2020-10-02 上海市农业科学院 水稻钠钾离子吸收qtl连锁的snp分子标记及其应用
CN112225790A (zh) * 2020-10-14 2021-01-15 厦门大学 水稻抗盐胁迫相关基因onac103及编码蛋白与应用
CN113462805A (zh) * 2021-08-05 2021-10-01 浙江大学中原研究院 一种与大麦耐盐性相关的snp分子标记及其应用
CN114317812A (zh) * 2022-03-03 2022-04-12 中国农业科学院生物技术研究所 一种水稻耐盐性相关的分子标记及其应用

Citations (2)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Publication number Priority date Publication date Assignee Title
CN106498058A (zh) * 2016-10-27 2017-03-15 中国农业科学院作物科学研究所 水稻耐盐基因及其紧密连锁分子标记的育种应用
CN108411028A (zh) * 2018-05-24 2018-08-17 湖北省农业科学院粮食作物研究所 水稻耐盐基因skc1基因内特异snp共显性分子标记引物及应用

Patent Citations (2)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Publication number Priority date Publication date Assignee Title
CN106498058A (zh) * 2016-10-27 2017-03-15 中国农业科学院作物科学研究所 水稻耐盐基因及其紧密连锁分子标记的育种应用
CN108411028A (zh) * 2018-05-24 2018-08-17 湖北省农业科学院粮食作物研究所 水稻耐盐基因skc1基因内特异snp共显性分子标记引物及应用

Non-Patent Citations (2)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Title
MUHAMMED MAHBUBUR RASHID: "水稻苗期耐盐性状的关联分析研究", 《万方》 *
SHEFALI MISHRA等: "Association of SNP Haplotypes of HKT Family Genes with Salt Tolerance in Indian Wild Rice Germplasm", 《RICE (N Y)》 *

Cited By (11)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Publication number Priority date Publication date Assignee Title
CN110628935A (zh) * 2019-10-24 2019-12-31 中国农业科学院作物科学研究所 水稻成株期耐盐基因LOC_Os02g49700的分子标记方法及应用
CN110628936A (zh) * 2019-10-24 2019-12-31 中国农业科学院作物科学研究所 水稻全生育期耐盐基因LOC_Os03g28300的分子标记方法及应用
CN110628935B (zh) * 2019-10-24 2022-05-10 中国农业科学院作物科学研究所 水稻成株期耐盐基因LOC_Os02g49700的分子标记方法及应用
CN111662928A (zh) * 2020-06-16 2020-09-15 中国科学院植物研究所 调控植物耐盐性的方法及耐盐相关蛋白
CN111662928B (zh) * 2020-06-16 2021-10-08 中国科学院植物研究所 调控植物耐盐性的方法及耐盐相关蛋白
CN111733278A (zh) * 2020-07-21 2020-10-02 上海市农业科学院 水稻钠钾离子吸收qtl连锁的snp分子标记及其应用
CN112225790A (zh) * 2020-10-14 2021-01-15 厦门大学 水稻抗盐胁迫相关基因onac103及编码蛋白与应用
CN113462805A (zh) * 2021-08-05 2021-10-01 浙江大学中原研究院 一种与大麦耐盐性相关的snp分子标记及其应用
CN113462805B (zh) * 2021-08-05 2023-12-29 浙江大学中原研究院 一种与大麦耐盐性相关的snp分子标记及其应用
CN114317812A (zh) * 2022-03-03 2022-04-12 中国农业科学院生物技术研究所 一种水稻耐盐性相关的分子标记及其应用
CN114317812B (zh) * 2022-03-03 2022-05-20 中国农业科学院生物技术研究所 一种水稻耐盐性相关的分子标记及其应用

Similar Documents

Publication Publication Date Title
CN109371162A (zh) 与水稻耐盐性相关的snp分子标记及其应用
Singh et al. From QTL to variety-harnessing the benefits of QTLs for drought, flood and salt tolerance in mega rice varieties of India through a multi-institutional network
JP6872307B2 (ja) ホウレンソウにおけるペロノスポラ耐性のための組成物及び方法
KR20160065887A (ko) 시금치에서 페르노스포라 저항성을 위한 조성물 및 방법
Sun et al. SSR genetic linkage map construction of pea (Pisum sativum L.) based on Chinese native varieties
Eleuch et al. Genetic diversity and association analysis for salinity tolerance, heading date and plant height of barley germplasm using simple sequence repeat markers
CN108411028A (zh) 水稻耐盐基因skc1基因内特异snp共显性分子标记引物及应用
CN110305978A (zh) 一种与辣椒果实朝向紧密关联的snp位点及其通用性分子标记、获取方法和应用
CN109371160A (zh) 与水稻耐盐性和耐低氧性相关的snp分子标记及其应用
CN107667180A (zh) 鉴定和选择对炭疽茎腐病具有抗性的玉蜀黍植物的方法
CN109688805A (zh) 产生灰叶斑病抗性玉蜀黍的方法
CN106755359A (zh) 一种筛选或辅助筛选不同株高小麦的方法及其专用试剂盒
CN106978494A (zh) 一种与大豆耐盐性相关的qtl、snp分子标记及应用
CN104711254B (zh) 玉米低磷响应基因ZmARF31的INDEL分子标记及其应用
Patil et al. Genetic analysis and molecular resistance to race 2 of Fusarium wilt in pigeonpea [Cajanus cajan (L.) Millsp.]
CN105624280A (zh) 鉴定苹果抗、感炭疽菌叶枯病的ssr分子标记及其应用
CN104762298B (zh) 一种水稻苗期耐盐基因qST11及其分子标记方法
CN109762928B (zh) 一种与甜瓜蔓长相关的分子标记及其在鉴定甜瓜蔓长性状中的应用
KR101699149B1 (ko) 수박의 과형 구별용 dna 마커
CN110527741A (zh) 一种与美洲南瓜抗白粉病生理小种2f基因紧密连锁的分子标记、引物及应用
CN110257546A (zh) 一个水稻苗期耐盐新基因簇qST12Pokkali及应用
CN104762299B (zh) 一种水稻苗期耐盐基因qST2及其分子标记方法
CN106755562B (zh) 一种与大豆根表面积相关的qtl、snp分子标记及应用
Singh et al. Chickpea
CN109371161A (zh) 与水稻耐低氧性相关的snp分子标记及其应用

Legal Events

Date Code Title Description
PB01 Publication
PB01 Publication
SE01 Entry into force of request for substantive examination
SE01 Entry into force of request for substantive examination
RJ01 Rejection of invention patent application after publication
RJ01 Rejection of invention patent application after publication

Application publication date: 20190222