CN109337882A - 一种α-1,2-岩藻糖基转移酶及制备人乳寡糖中的应用 - Google Patents

一种α-1,2-岩藻糖基转移酶及制备人乳寡糖中的应用 Download PDF

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Abstract

本发明公开了一种α‑1,2‑岩藻糖基转移酶及制备人乳寡糖中的应用,属于基因工程技术领域。本发明涉及来自原始介属密螺旋体Treponema primitia的核酸以及氨基酸序列,编码一种α‑1,2‑岩藻糖基转移酶TpFucT,分离获得的TpFucT构建表达载体,并转化大肠杆菌表达菌株BL21(DE3)中实现高效表达。本发明还提供了利用α‑1,2‑岩藻糖基转移酶生成岩藻糖基化寡糖、糖肽、糖蛋白和糖脂的方法,尤其是在合成人乳和人血型H抗原中的应用,在婴幼儿配方乳粉、食品与医药工业领域具有应用前景。

Description

一种α-1,2-岩藻糖基转移酶及制备人乳寡糖中的应用
技术领域
本发明涉及一种α-1,2-岩藻糖基转移酶及制备人乳寡糖中的应用,属于生物工程技术领域。
背景技术
人乳寡糖(Human milk oligosaccharides,HMOS)是一类存在于母乳中的天然低聚糖,是公认的在营养学和生物医学应用领域具有很高潜力的天然分子。近年来,HMOS一直是国际生物技术领域备受关注的方向,合成这类功能性寡糖的研究显著增多,这归因于其在人体中所具有的多种生物学作用的不断揭示,其生理功能包括调节肠道菌群、益生菌增殖、防御呼吸系统及泌尿系统的感染、调节免疫系统提高机体免疫力及促进婴儿大脑发育等。在过去20年间,已尝试通过有机化学合成以及酶促手段制备HMOS。
在生物系统中,Leloir型糖基转移酶(GT,EC2.4.1.-)和糖苷酶(亦称为糖苷水解酶; GH,EC3.2.1.-)构成了碳水化合物加工酶的两个主要类别,这两类酶的作用都是将糖基从供体转移到受体,结果是产生寡糖。但是,糖基转移酶在工业规模的合成中的应用,因所需酶的表达和溶解性问题而使其可获得性受到限制,并且还受到活化的供体糖的高成本的限制。这些核苷酸供体通常可以原位产生,但该过程需要额外的酶。
岩藻糖基转移酶(Fucosyltransferase)属于糖基转移酶家族中的一类己糖基转移酶,催化从核苷二磷酸岩藻糖将岩藻糖基转移至受体分子,通常是二磷酸鸟苷岩藻糖(GDP-岩藻糖)转移到包括寡糖、糖蛋白、以及糖脂的受体。基于岩藻糖的添加部位的不同,岩藻糖基转移酶被分类为:α-1,2-岩藻糖基转移酶、α-1,3/4-岩藻糖基转移酶、α-1,6-岩藻糖基转移酶、以及O-岩藻糖基转移酶。α-1,2-岩藻糖基转移酶广泛地存在于脊椎动物、无脊椎动物、植物、以及细菌中,但这些酶的大多不能在细菌系统中以活性形式表达,极大限制了寡糖的大规模合成制备。
值得注意的一点是,目前仅有来源于嗜热蓝绿藻(Thermosynechococcus elongatus)、幽门螺杆菌(Helicobacter pylori)和大肠杆菌(Escherichia coli)等的α-1,2-岩藻糖基转移酶基因能在细菌中活性表达。因此发现高效稳定且有特异性的新型α-1,2-岩藻糖基转移酶具有重要的现实意义。本发明利用PCR技术从密螺旋体T. primitia基因组DNA中获取α-1,2-岩藻糖基转移酶基因,并连接到pET15载体中,将重组表达载体导入大肠杆菌BL21(DE3)表达系统中对该新型基因进行高效表达,为岩藻糖基化寡糖的大量合成奠定基础。
发明内容
本发明目的在于提供一一种α-1,2-岩藻糖基转移酶及制备人乳寡糖中的应用,以达到能够高效合成岩藻糖基化系列寡糖的目的。本发明糖基转移酶来源的密螺旋体Treponema primitia菌株,扩增α-1,2-岩藻糖基转移酶基因后,构建同源重组表达载体,并实现了目的基因在大肠杆菌表达菌株BL21(DE3)中的高效表达,以实现α-1,2-岩藻糖基转移酶制剂大量化生产,以及制备岩藻糖基化寡糖及其衍生物的目的。
为实现上述目的,本发明采用如下技术方案:
一种α-1,2-岩藻糖基转移酶,所述α-1,2-岩藻糖基转移酶氨基酸序列如SEQ ID NO:2所示。
编码所述α-1,2-岩藻糖基转移酶的基因,核苷酸序列如SEQ ID NO:1所示。
所述的基因的制备方法:设计引物,上游引物为:CATATGATATTATTTTGGTC,下游引物为:GGATCCTTATTTATCAATAACGAAGG;然后以原始介属密螺旋体T. primitia基因组DNA为模板,利用聚合酶链式反应进行基因扩增,获得α-1,2-岩藻糖基转移酶基因序列。
一种重组表达载体,包含所述的α-1,2-岩藻糖基转移酶基因的核苷酸序列。
一种基因工程菌,所述基因工程菌由所述的重组表达载体转化至宿主微生物中获得。
所述的岩藻糖基转移酶的制备方法,所述方法包括:将如所述的基因工程菌接种至新鲜培养基中,前期培养至OD600为0.6-0.8后,加入异丙基-β-D-硫代吡喃半乳糖苷为0.1-0.3 mmol/L,诱导温度16-24℃,转速160-200 rpm,培养20-24 h后收集菌体,采用镍亲和柱纯化制备。
所述的α-1,2-岩藻糖基转移酶在制备岩藻糖基化寡糖中的应用,
制备方法包括以下步骤:
(1)提供具有α-1,2-岩藻糖基转移酶活性的多肽,其氨基酸序列选自以下:(a) SEQ IDNO:2所示的氨基酸序列;(b) 将SEQ ID NO:2中氨基酸序列经过取代、缺失或添加一个或几个氨基酸得到的氨基酸序列;
(2)提供供体底物和受体底物,使得所述α-1,2-岩藻糖基转移酶的多肽催化岩藻糖残基从GDP-岩藻糖残基供体底物转移到受体底物,通过生物酶法合成体系合成人乳和人血型H抗原岩藻糖基化寡糖。
所述受体底物为以下的一种或几种组成:Lacto-N-tetraose、Lacto-N-neotetraose、Galβ1,3GalNAcαProN3、Galβ1,3GalNAcβProN3、Galβ1,3GlcNAcαProN3、Galβ1,3GlcNAcβProN3
本发明的优点在于:
1、本发明提供的α-1,2-岩藻糖基转移酶活性高,稳定性好(见实施例一(6)),用其制备人乳寡糖既可减少生产成本,又可达到规模化生产的目的。
2、本发明提供的α-1,2-岩藻糖基转移酶合成寡糖与化学法合成寡糖相比,在酶的专一性和高效性上占有重大优势。对于合成不同的糖,化学合成法需要对糖基供体进行严谨的设计保护基团及立体异构性的要求,而酶法合成仅需要通过供体与受体的构型选择合适的酶类即可。
附图说明
图1 重组质粒pET15b-Tpfuct物理图谱。
图2 重组质粒pET15b-Tpfuct双酶切鉴定的琼脂糖凝胶电泳图。泳道从左到右依次表示:重组质粒pET15b-Tpfuct、DNA marker。
图3 咪唑梯度洗脱纯化岩藻糖基转移酶SDS-PAGE分析,泳道从左到右依次表示:0%Elute Buffer洗脱状况、8%Elute Buffer洗脱状况、10%Elute Buffer洗脱状况、20%Elute Buffer洗脱状况、30%Elute Buffer洗脱状况、蛋白marker。
图4 以Galβ1,3GlcNAcβProN3为受体底物时反应活性分析。
具体实施方式
实施例 1
(1)根据NCBI数据库提供的Treponema primitia(NCBI Reference Sequence: NC_015578.1)的基因组DNA为模板,设计引物CATATGATATTATTTTGGTC和GGATCCTTATTTATCAATAACGAAGG,引物由上海生工合成后,进行PCR扩增,得到大小为897 bp的目的基因片段(图2)。
PCR扩增条件为:94℃预变性5min后开始以下循环:94℃变性1min,52℃退火40s,72℃延伸反应2.5min,进行30个循环,最后72℃反应5min,4℃保温。
PCR反应体系:10×Taq 酶 Buffer(5μL),模板DNA(1μL),上游引物(1μL),下游引物(1μL), dNTPs(1μL),ddH2O(40.5μL),Taq 酶(0.5μL)设计引物,上游引物为:CATATGATATTATTTTGGTC,下游引物为:GGATCCTTATTTATCAATAACGAAGG。
重组表达载体的构建参照《分子克隆实验指南》。将 PCR 产物进行琼脂糖凝胶电泳,并以凝胶回收试剂盒回收凝胶上的目的基因。将目的基因TpFuct与质粒 pET15b (购买于上海生工)均用两种限制性内切酶(NdeI 和 BamHI)酶切。酶切体系为:目的基因TpFuct与质粒 pET15b各 0.1 μL,NdeI 和BamHI 酶各0.5μL;酶切缓冲液(R buffer)2 μL,另加去离子水补足至20μL,在 37℃下进行酶切。产物进行琼脂糖凝胶电泳,再以试剂盒回收凝胶上的目的条带。将酶切过的目的基因与载体用 DNA 连接酶连接,反应于金属浴中进行,反应时间7h,获得重组表达载体TpFuct-PET15b (图1)。
(2)将上述验证正确的重组质粒转化到大肠杆菌BL21(DE3)中,按如下步骤进行:取制备好的大肠杆菌BL21 (DE3)感受态细胞,置于冰上30min融化,吸取50μL感受态细胞与2μL的TpFuct-PET15b质粒(浓度100ng/mL)混合,置于42℃水浴中热激1.5min,随后立即冰浴2min冷却,加入700μL的新鲜LB培养基,于37℃、100rpm条件下复苏培养45min,之后取80μL菌液涂布于含有氨苄青霉素(100ug/ml)的LB平板,37℃恒温培养箱培养16h后挑取单菌落,PCR和双酶切鉴定重组子,证明重组表达载体TpFuct-PET15b构建成功。
(3)挑取上述平板上的阳性转化子,接种到LB液体培养基中,置于37℃、200 rpm摇床上振荡培养17h,得种子液;再以1%(v/v)的接种量将种子液接种到新鲜的LB培养基中,于37℃振荡培养至OD600为0.7,经异丙基-β-D-硫代吡喃半乳糖苷(IPTG)诱导,IPTG终浓度0.2mmol/L,于16-24℃诱导22 h,转速180 rpm。
(4)诱导表达后,将发酵液于4000r/min、4℃离心1h收集菌体。将菌体用10mMpH7.0 Trsi-HC1缓冲液重悬后,以plus on 2s / off 3s的频率下超声6min中以破碎菌体;将破碎后液体于10000r/min、4℃离心30h去除细胞碎片后收集上清液,利用Ni柱亲和层析法纯化得到可溶性岩藻糖基转移酶,用镍亲和柱纯化分离的过程如下:向镍亲和柱加入去离子水至柱顶端自然洗脱后用3倍体积的Binding buffer自然洗脱;再将经滤膜过滤的粗酶液上柱,慢流使样品与柱充分结合,待样品流干后分别用7倍柱体积的Washing buffer连续梯度洗脱去除杂蛋白,最后用5倍Elution buffer洗脱目的蛋白,收集洗脱液。SDS-PAGE分析目的蛋白表达情况(图3),基因工程菌经诱导后有明显的特异表达条带,条带分子量与预期大小分子量35.2 kD基本一致。获得的目的蛋白即为α-1,2-岩藻糖基转移酶TpFucT,其氨基酸氨基酸如SEQ ID NO.2所示,编码所述α-1,2-岩藻糖基转移酶的基因,核苷酸如SEQID NO.1所示。
(5)纯化后的α-1,2-岩藻糖基转移酶TpFucT,能够以LNT、LNnT、Galβ1,3GalNAcαProN3、Galβ1,3GalNAcβProN3、Galβ1,3GlcNAcαProN3、Galβ1,3GlcNAcβProN3寡糖为受体底物,以GDP-岩藻糖为供体底物,反应生成相对应的Fucα-1,2-LNT、Fucα-1,2-LNnT、Fucα-1,2Galβ1,3GalNAcαProN3、Fucα-1,2Galβ1,3GalNAcβProN3、Fucα-1,2Galβ1,3GlcNAcαProN3、Fucα-1,2Galβ1,3GlcNAcβProN3人乳和人血型H抗原岩藻糖基化寡糖。
(6)岩藻糖基转移酶活性中以Galβ1,3GlcNAcβProN3为受体时反应活性最高,产率高达98%。高分辨质谱对产物进行分析,在M/Z:635.2 (M-H)+有离子峰,反应合成岩藻糖基化寡糖Fucα-1,2Galβ1-3GlcNAcαProN3(图4)。
实施例2
α-1,2-岩藻糖基转移酶制备岩藻糖基化寡糖的反应为:
(1)GDP-fucose 的合成反应:将0.1 mol/L ATP 1.5 mL、0.1 mol/L GTP 1.5 mL,0.1mol/L MgCl2 1 mL,0.1 mol/L L-fucose 1mL,酶 FKP1mL,酶 PmPpA1mL,1mol/L Tris-HCl(pH8.0)1mL ,混匀,离心,置于37 ℃反应,待确定反应已基本完全,终止反应。加入等量乙醇,混匀,离心取上清,干燥,过凝胶柱初步纯化,冻干。
(2)寡糖的合成反应:取一洁净离心管,向其中加入适量 GDP-fucose 以及同等质量的Galβ1,3GlcNAcβProN3,以20mmol/L的MgCl2溶液溶解,并以Tris-HCl调节pH至7.0,再加入一定量的α-1,2-岩藻糖基转移酶TpFucT(根据反应情况补料添加),于40℃进行反应,以薄层层析法检验,待反应基本完全终止反应,反应生成岩藻糖基化寡糖Fucα-1,2Galβ1-3GlcNAcαProN3,用凝胶柱法对其进行纯化。
以上所述仅为本发明的较佳实施例,凡依本发明申请专利范围所做的均等变化与修饰,皆应属本发明的涵盖范围。
SEQUENCE LISTING
<110> 福建农林大学
<120> 一种α-1,2-岩藻糖基转移酶及制备人乳寡糖中的应用
<130> 4
<160> 4
<170> PatentIn version 3.3
<210> 1
<211> 939
<212> DNA
<213> 人工序列
<400> 1
atgatattat tttggtcaga cggtggacta ggtaatcaat tttttcaata tgtttttatt 60
aaaacattgc agcaaaaaaa tgaaaatgtt ataatatttg gcaatgggtt taaagatata 120
gacgatattt ttgaaaaaat agaatttaca aaaattaaat acttttctaa aataatcagt 180
ttttgtatga atagaattgc taaatcattt atttgttatt tggcatacaa taatgtaatt 240
tcatatatat ttgtaaaaga agaatatata cttagtaaaa aatatcaaag ggaaggtgat 300
actgtttctt ttaaaaaagg attattcacg aatataaaat atatagaatc aaattttttt 360
cagtctgaaa tattctttaa taaagaaatt gtaggaaaaa ttaagctaaa acaaaaattt 420
ataattcaag ctgaaagatt tattcagatg ataccagtag gcgctaataa aatatttgtt 480
catatcagaa ggggagacta tgaaaatttt aaagtttgtg aaaaatcagt tatattaccg 540
tttgcttatt ttcatagttg tataaaatat tttcttgaag taatagaaaa tccatatttt 600
atatttttat ctgatgaaat aaacttaata aaaactgaat ttacttatct tgaaaatatg 660
attatttcag aaaatcagca ttacggtgtt gactttgcaa taatgacttt atgtaataat 720
gccatattga gcccaagttc atttagctgg tggggtagct atcttatgaa aaacaaagac 780
ataatattag ccccaaaata ctggatgggt tttgcaagca gaattgagtt tcaaaaaaat 840
ccattggcat catatatgaa aatagttgat gttgaaacat ttgtgattga taaataagac 900
acgcgtgatc tgtattgctc ggggtggact gtgctgtga 939
<210> 2
<211> 298
<212> PRT
<213> 人工序列
<400> 2
Met Ile Leu Phe Trp Ser Asp Gly Gly Leu Gly Asn Gln Phe Phe Gln
1 5 10 15
Tyr Val Phe Ile Lys Thr Leu Gln Gln Lys Asn Glu Asn Val Ile Ile
20 25 30
Phe Gly Asn Gly Phe Lys Asp Ile Asp Asp Ile Phe Glu Lys Ile Glu
35 40 45
Phe Thr Lys Ile Lys Tyr Phe Ser Lys Ile Ile Ser Phe Cys Met Asn
50 55 60
Arg Ile Ala Lys Ser Phe Ile Cys Tyr Leu Ala Tyr Asn Asn Val Ile
65 70 75 80
Ser Tyr Ile Phe Val Lys Glu Glu Tyr Ile Leu Ser Lys Lys Tyr Gln
85 90 95
Arg Glu Gly Asp Thr Val Ser Phe Lys Lys Gly Leu Phe Thr Asn Ile
100 105 110
Lys Tyr Ile Glu Ser Asn Phe Phe Gln Ser Glu Ile Phe Phe Asn Lys
115 120 125
Glu Ile Val Gly Lys Ile Lys Leu Lys Gln Lys Phe Ile Ile Gln Ala
130 135 140
Glu Arg Phe Ile Gln Met Ile Pro Val Gly Ala Asn Lys Ile Phe Val
145 150 155 160
His Ile Arg Arg Gly Asp Tyr Glu Asn Phe Lys Val Cys Glu Lys Ser
165 170 175
Val Ile Leu Pro Phe Ala Tyr Phe His Ser Cys Ile Lys Tyr Phe Leu
180 185 190
Glu Val Ile Glu Asn Pro Tyr Phe Ile Phe Leu Ser Asp Glu Ile Asn
195 200 205
Leu Ile Lys Thr Glu Phe Thr Tyr Leu Glu Asn Met Ile Ile Ser Glu
210 215 220
Asn Gln His Tyr Gly Val Asp Phe Ala Ile Met Thr Leu Cys Asn Asn
225 230 235 240
Ala Ile Leu Ser Pro Ser Ser Phe Ser Trp Trp Gly Ser Tyr Leu Met
245 250 255
Lys Asn Lys Asp Ile Ile Leu Ala Pro Lys Tyr Trp Met Gly Phe Ala
260 265 270
Ser Arg Ile Glu Phe Gln Lys Asn Pro Leu Ala Ser Tyr Met Lys Ile
275 280 285
Val Asp Val Glu Thr Phe Val Ile Asp Lys
290 295
<210> 3
<211> 20
<212> DNA
<213> 人工序列
<400> 3
catatgatat tattttggtc 20
<210> 4
<211> 26
<212> DNA
<213> 人工序列
<400> 4
ggatccttat ttatcaataa cgaagg 26

Claims (9)

1.一种α-1,2-岩藻糖基转移酶,其特征在于:所述α-1,2-岩藻糖基转移酶氨基酸序列如SEQ ID NO:2所示。
2.一种编码权利要求1所述α-1,2-岩藻糖基转移酶的基因,其特征在于,所述基因的核苷酸序列如SEQ ID NO:1所示。
3.如权利要求2所述的基因的制备方法,其特征在于,设计引物,上游引物为:CATATGATATTATTTTGGTC,下游引物为:GGATCCTTATTTATCAATAACGAAGG;然后以原始介属密螺旋体T. primitia基因组DNA为模板,利用聚合酶链式反应进行基因扩增,获得α-1,2-岩藻糖基转移酶基因序列。
4.一种重组表达载体,其特征在于,所述载体包含权利要求2所述的α-1,2-岩藻糖基转移酶基因的核苷酸序列。
5.一种基因工程菌,其特征在于,所述基因工程菌由权利要求4所述的重组表达载体转化至宿主微生物中获得。
6.一种如权利要求1所述的岩藻糖基转移酶的制备方法,其特征在于,所述方法包括:将如权利要求书5所述的基因工程菌接种至新鲜培养基中,前期培养至OD600为0.6-0.8后,加入异丙基-β-D-硫代吡喃半乳糖苷为0.1-0.3 mmol/L,诱导温度16-24℃,转速160-200rpm,培养20-24 h后收集菌体,采用镍亲和柱纯化制备。
7.如权利要求1所述的α-1,2-岩藻糖基转移酶在制备岩藻糖基化寡糖中的应用。
8.根据权利要求7所述的应用,其特征在于:制备方法包括以下步骤:
(1)提供具有α-1,2-岩藻糖基转移酶活性的多肽,其氨基酸序列选自以下:(a) SEQ IDNO:2所示的氨基酸序列;(b) 将SEQ ID NO:2中氨基酸序列经过取代、缺失或添加一个或几个氨基酸得到的氨基酸序列;
(2)提供供体底物和受体底物,使得所述α-1,2-岩藻糖基转移酶的多肽催化岩藻糖残基从GDP-岩藻糖残基供体底物转移到受体底物,通过生物酶法合成体系合成人乳和人血型H抗原岩藻糖基化寡糖。
9.根据权利要求8所述的应用,其特征在于:所述受体底物为以下的一种或几种组成:Lacto-N-tetraose、Lacto-N-neotetraose、Galβ1,3GalNAcαProN3、Galβ1,3GalNAcβProN3、Galβ1,3GlcNAcαProN3、Galβ1,3GlcNAcβProN3
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