CN108559789A - 猫冠状病毒荧光ema检测引物组、试剂盒和检测方法 - Google Patents
猫冠状病毒荧光ema检测引物组、试剂盒和检测方法 Download PDFInfo
- Publication number
- CN108559789A CN108559789A CN201711497728.XA CN201711497728A CN108559789A CN 108559789 A CN108559789 A CN 108559789A CN 201711497728 A CN201711497728 A CN 201711497728A CN 108559789 A CN108559789 A CN 108559789A
- Authority
- CN
- China
- Prior art keywords
- primer
- fluorescence
- cat
- detection
- ema
- Prior art date
- Legal status (The legal status is an assumption and is not a legal conclusion. Google has not performed a legal analysis and makes no representation as to the accuracy of the status listed.)
- Pending
Links
Classifications
-
- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
- C12Q—MEASURING OR TESTING PROCESSES INVOLVING ENZYMES, NUCLEIC ACIDS OR MICROORGANISMS; COMPOSITIONS OR TEST PAPERS THEREFOR; PROCESSES OF PREPARING SUCH COMPOSITIONS; CONDITION-RESPONSIVE CONTROL IN MICROBIOLOGICAL OR ENZYMOLOGICAL PROCESSES
- C12Q1/00—Measuring or testing processes involving enzymes, nucleic acids or microorganisms; Compositions therefor; Processes of preparing such compositions
- C12Q1/70—Measuring or testing processes involving enzymes, nucleic acids or microorganisms; Compositions therefor; Processes of preparing such compositions involving virus or bacteriophage
- C12Q1/701—Specific hybridization probes
-
- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
- C12Q—MEASURING OR TESTING PROCESSES INVOLVING ENZYMES, NUCLEIC ACIDS OR MICROORGANISMS; COMPOSITIONS OR TEST PAPERS THEREFOR; PROCESSES OF PREPARING SUCH COMPOSITIONS; CONDITION-RESPONSIVE CONTROL IN MICROBIOLOGICAL OR ENZYMOLOGICAL PROCESSES
- C12Q1/00—Measuring or testing processes involving enzymes, nucleic acids or microorganisms; Compositions therefor; Processes of preparing such compositions
- C12Q1/68—Measuring or testing processes involving enzymes, nucleic acids or microorganisms; Compositions therefor; Processes of preparing such compositions involving nucleic acids
- C12Q1/6844—Nucleic acid amplification reactions
Landscapes
- Chemical & Material Sciences (AREA)
- Life Sciences & Earth Sciences (AREA)
- Organic Chemistry (AREA)
- Health & Medical Sciences (AREA)
- Engineering & Computer Science (AREA)
- Zoology (AREA)
- Wood Science & Technology (AREA)
- Proteomics, Peptides & Aminoacids (AREA)
- Immunology (AREA)
- General Engineering & Computer Science (AREA)
- Bioinformatics & Cheminformatics (AREA)
- Microbiology (AREA)
- Molecular Biology (AREA)
- Analytical Chemistry (AREA)
- Physics & Mathematics (AREA)
- Biophysics (AREA)
- Genetics & Genomics (AREA)
- General Health & Medical Sciences (AREA)
- Biotechnology (AREA)
- Biochemistry (AREA)
- Chemical Kinetics & Catalysis (AREA)
- Virology (AREA)
- Measuring Or Testing Involving Enzymes Or Micro-Organisms (AREA)
Abstract
本发明涉及一种猫冠状病毒(FCoV)荧光EMA检测引物组、试剂盒和检测方法,所述猫冠状病毒荧光EMA检测引物组包含上、下游引物和探针,所述试剂盒包括以下内容:复溶液、含引物的冻干酶管、阳性质控品、阴性质控品。所述检测包含使用所述试剂盒进行常温核酸扩增技术,通过M‑MLV逆转录酶、Rnase抑制剂、DNA解旋酶、单链DNA结合蛋白、DNA聚合酶等多个酶促反应,可在37‑45℃恒温条件下,10‑30分钟内使待检RNA逆转录成cDNA,并将cDNA扩增数百万倍,配合荧光检测技术,可以实现对待检RNA的快速检定。本发明操作简单、时间短、仪器要求低,适合用于宠物传染性疾病的快速诊断。
Description
技术领域
本发明涉及生物技术领域,具体涉及一种猫冠状病毒荧光EMA 检测引物组、试剂盒和检测方法。
背景技术
猫冠状病毒(Feline Coronavirus,FCoV):据统计,家庭饲养的 猫有25%~40%为冠状病毒阳性,而在大型猫舍或是繁殖猫舍中,阳 性率达到80%~100%。虽然感染后可能完全没有临床症状,但是可 能会发生死亡率非常高的猫传染性腹膜炎,本病常发于四岁以下的年 轻成猫,尤其常发于群聚饲养的猫群。目前,对猫传染性腹膜炎无有 效的疫苗预防,也无有效的药物治疗。因此,对于FCoV的管理与控 制,准确的诊断是至关重要的。
目前,已有少数针对猫冠状病毒(FCoV)核酸的检测方法,主 要包括PCR技术和实时荧光定量PCR技术,对猫冠状病毒(FCoV) 核酸的检测灵敏度和特异性有了很大提升。但PCR技术和实时荧光 定量PCR技术均需要配备价格高昂的PCR仪或实时荧光定量PCR 仪,因此无法用于基层和现场检测,目前并未得到广泛应用。
因此,怎样能够满足基层检测用时少、技术和仪器要求低、操作 简单方便的需求,成为业内急需解决的问题。
发明内容
为解决以上技术问题,本发明提供一种猫冠状病毒荧光EMA检 测引物组、试剂盒及检测方法,特异性强、准确率高,操作简单、时 间短、仪器要求低,能够快速、准确、低成本地检测猫冠状病毒。
为达到上述目的,本发明的技术方案是:猫冠状病毒荧光EMA 检测引物组,所述猫冠状病毒荧光EMA检测引物组包含上、下游引 物和探针,所述上游引物序列是: 5’-TCAAGGTCTGGTTCTCAGTCTAG-3’;所述下游引物序列是: 5’-GTTTTCTTCCAGGTGTGTTTGT-3’;所述探针序列是 5’-TTTTCTTCCAGGTGTGTTTG/i6-FAMdT/T/idSp//iBHQ1dT/TAGG TGT-3’C3Spacer。其中:“i6-FAMdT”指6-FAM(6-羧基荧光素) 荧光标记的dT核苷酸,“idSp”指碱基缺失,“iBHQ1dT”指带有 BHQ1淬灭基团标记的dT核苷酸,“C3Spacer”指3’羟基封闭。
所述上、下游引物和探针是与权利要求1所述序列同源性大于 85%的序列;或者,所述上、下游引物和探针是与权利要求1所述序 列碱基互补的序列。
本发明还提供猫冠状病毒荧光EMA检测试剂盒,所述试剂盒包 括以下内容:
(1)复溶液;
(2)含引物的冻干酶管;所述引物包含上、下游引物和探针;
所述上游引物是:5’-TCAAGGTCTGGTTCTCAGTCTAG-3’;所 述下游引物是:5’-GTTTTCTTCCAGGTGTGTTTGT-3’;所述探针是5’-TTTTCTTCCAGGTGTGTTTG/i6-FAMdT/T/idSp//iBHQ1dT/TAGG TGT-3’C3Spacer;
(3)阳性对照品;
(4)阴性对照品。
其中,所述复溶液的成分如下:每30ml复溶液中含0.1-2M的 MgAc2840μL、0.1-2MpH8.0的Tris-Ac 3.00mL、0.1-2M的DTT 150μL、 无RNase水26.01ml。
优选的,所述复溶液的成分如下:每30ml复溶液中含1-2M的 MgAc2840μL、1-2MpH8.0的Tris-Ac 3.00mL、1-2M的DTT 150μL、 无RNase水26.01ml。
其中,所述含引物的冻干酶管的成分如下:每4ml冻干酶管中含 有1000~3000ng/ul的单链DNA结合蛋白178μL、10-100ng/ul的ATP 再生蛋白75μL、200-2000ng/ul的DNA解旋酶259μL、100-1000ng/ul 的DNA聚合酶75μL、100-1000ng/ul的DNA限制性内切酶200μL、10-300ng/ul的辅助蛋白30μL、50-500ng/ul的M-MLV逆转录酶400 μL、500-5000ng/ul的RNase抑制剂10μL、10-100μM的上游引物5μL、 10-100μM的下游引物5μL、10-100μM的探针15.5μL、1-10M的磷 酸肌酸钠144μL、10-100mM的ATP 144μL、5-50mM的dNTP 62μL、 0.1-2MpH8.0的Tris-Ac 21.57ul、海藻糖0.14g、KAc 0.02g、纯化水 360μL。
优选的,所述含引物的冻干酶管的成分如下:每4ml冻干酶管中 含有1500-2500ng/ul单链DNA结合蛋白178μL、20-50ng/ul ATP再 生蛋白75μL、300-600ng/ul DNA解旋酶259μL、300-600ng/ul DNA 聚合酶75μL、300-600ng/ul DNA限制性内切酶200μL、50-100ng/ul辅 助蛋白30μL、100-200ng/ul M-MLV逆转录酶400μL、1000-2000ng/ul RNase抑制剂10μL、100μM上游引物5μL、100μM下游引物5μL、 10μM探针15.5μL、1M磷酸肌酸钠144μL、80-100mM ATP 144μL、 25mM dNTP 62μL、pH8.0的1-2M Tris-Ac 21.57ul、海藻糖0.14g、KAc 0.02g、纯化水360μL。
其中,所述阴性对照品为无RNase水空白对照。
其中,所述阳性对照品为猫冠状伪病毒,浓度是1μg/mL。
本发明还提供一种猫冠状病毒的检测方法,所述检测方法采用权 利要求3所述的猫冠状病毒荧光EMA检测试剂盒,所述检测方法不 以疾病的诊断和治疗为目的;所述检测方法包括以下步骤:
(1)提取样本中病毒RNA;
(2)使用权利要求3所述的检测试剂盒,取10μL复溶液及10μL 步骤(1)所得病毒RNA,加入到含引物的冻干酶管中,充分混匀;
(3)将复溶的冻干酶管放入核酸荧光检测仪中,37-45℃扩增 10-30分钟,每30秒扫描荧光一次,采集荧光数据,绘制时间-荧光 信号图;
(4)结果分析。
所述结果分析是:如果样本扫描荧光曲线为典型“S”型,则判 断为阳性结果;反之,则为阴性结果。
优选的,所述样本可取自猫鼻、咽拭子、粪便、直肠拭子;或 者,所述样本可取自猫胸、腹腔积液、脑脊液、房水、肾肉芽肿。
本发明使用常温核酸扩增技术,通过M-MLV逆转录酶、Rnase 抑制剂、DNA解旋酶、单链DNA结合蛋白、DNA聚合酶等多个酶 促反应,可在37-45℃恒温条件下,10-30分钟内使待检RNA逆转录 成eDNA,并将cDNA扩增数百万倍,配合荧光检测技术,可以实现 对待检RNA的快速检定。
本发明的引物序列是这样得到的:从NCBI中下载猫冠状病毒基 因组序列(序列号JQ408980.1),通过oligo7软件设计引物,以含 目的序列的质粒为模板,通过凝胶电泳筛选最适引物。筛选标准:引 物灵敏度至少到质粒6(10-4ng/μL)、副反应尽量少。筛选好引物后, 以上下游引物中间的序列设计一条探针。
本发明的引物和探针的筛选步骤如下:
1:先用在线软件分析猫冠状病毒RNA(JQ408980.1)的结构, http:// rna.tbi.univie.ac.at/cgi-bin/RNAWebSuite/RNAfold.cgi,根据二级 结构示意图,找出容易配对区域,见图3;
2:根据选取区域,按照以下规则进行引物设计,a)引物长度在20-30 碱基之间;b)引物GC%在40%-60%之间;c)避免G或C多次重复; 3:引物设计之后,进行扩增筛选,选取扩增特异性灵敏度最好的一 对;
4:根据以上所选引物,在以上扩增片段中,设计不同的探针,对比 不同探针,根据反应的灵敏度来筛选最好的一条探针;从而得到本发 明所含引物对及探针:
上游引物:5’-TCAAGGTCTGGTTCTCAGTCTAG-3’;
下游引物:5’-GTTTTCTTCCAGGTGTGTTTGT-3’;
探针: 5’-TTTTCTTCCAGGTGTGTTTG/i6-FAMdT/T/idSp//iBHQ1dT/TAGG TGT(3’C3Spacer)。
本发明的EMA(EnZymes Mediated Amplification,多酶介导的核 酸扩增技术,即常温扩增技术)体系(包括复溶液、含引物的冻干酶 管)通过比较酶加样量、引物浓度、反应温度、反应时间等确定最终 反应体系。
本发明的有益效果包括:
1、本发明中逆转录与DNA复制一步完成,核酸扩增条件为37℃ 到42℃,对温度要求低,对机器要求较低;
2、本发明的检测方法为一步法,反应时间短,可在30分钟内报 告结果;
3、本发明以猫冠状病毒的序列为目的基因,筛选最佳引物,并配 合以最适浓度及配比的酶和各种试剂,形成最优的实验反应体系,使 本发明试剂盒具有检测能力上的优势与特点,不仅检测简单易行,而 且具有较高的准确度、精密度、特异性以及可重复性。
本发明操作简单、时间短、仪器要求低,非常适合用于宠物传染 性疾病的快速诊断。
附图说明
图1是阴、阳性样本测试结果示意图,其中,①具有典型“S”型, 为阳性结果,②为水平线,不具有典型“S”型特征,为阴性结果。
图2是实施例2临床样本的检测结果图。
图3是是猫冠状病毒RNA的容易配对区域。
具体实施方式
下面结合具体实施方式对本发明作进一步详细的说明,所选配方 为试剂盒的优选配方,但并不用来限制本发明的范围。
猫冠状病毒荧光EMA检测引物组,所述猫冠状病毒荧光EMA 检测引物组包含上、下游引物和探针,所述上游引物是: 5’-TCAAGGTCTGGTTCTCAGTCTAG-3’;所述下游引物是:5’-GTTTTCTTCCAGGTGTGTTTGT-3’;所述探针是 5’-TTTTCTTCCAGGTGTGTTTG/i6-FAMdT/T/idSp//iBHQ1dT/TAGG TGT-3’C3Spacer。其中:“i6-FAMdT”指6-FAM(6-羧基荧光素) 荧光标记的dT核苷酸,“idSp”指碱基缺失,“iBHQ1dT”指带有 BHQ1淬灭基团标记的dT核苷酸,“C3Spacer”指3’羟基封闭。
所述上、下游引物和探针可以是与权利要求1所述序列同源性大 于85%的序列;或者,所述上、下游引物和探针是与权利要求1所述 序列碱基互补的序列。
本发明还提供猫冠状病毒荧光EMA检测试剂盒,所述试剂盒包 括以下内容:
(1)复溶液;
(2)含引物的冻干酶管;所述引物包含上、下游引物和探针;
所述上游引物是:5’-TCAAGGTCTGGTTCTCAGTCTAG-3’;所 述下游引物是:5’-GTTTTCTTCCAGGTGTGTTTGT-3’;所述探针是 5’-TTTTCTTCCAGGTGTGTTTG/i6-FAMdT/T/idSp//iBHQ1dT/TAGG TGT-3’C3Spacer;
(3)阳性对照品;
(4)阴性对照品。
其中,所述复溶液的成分如下:每30ml复溶液中含0.1-2M的 MgAc2840μL、0.1-2MpH8.0的Tris-Ac 3.00mL、0.1-2M的DTT 150μL、 无RNase水26.01ml。
其中,所述含引物的冻干酶管的成分如下:每4ml冻干酶管中含 有1000~3000ng/ul的单链DNA结合蛋白178μL、10-100ng/ul的ATP 再生蛋白75μL、200-2000ng/ul的DNA解旋酶259μL、100-1000ng/ul 的DNA聚合酶75μL、100-1000ng/ul的DNA限制性内切酶200μL、10-300ng/ul的辅助蛋白30μL、50-500ng/ul的M-MLV逆转录酶400 μL、500-5000ng/ul的RNase抑制剂10μL、10-100μM的上游引物5μL、 10-100μM的下游引物5μL、10-100μM的探针15.5μL、1-10M的磷 酸肌酸钠144μL、10-100mM的ATP 144μL、5-50mM的dNTP 62μL、 0.1-2MpH8.0的Tris-Ac 21.57ul、海藻糖0.14g、KAc 0.02g、纯化水 360μL。
所述复溶液和含引物的冻干酶管具有以下的组分含量时,具有更 好的检测效果:
优选的,所述复溶液的成分如下:每30ml复溶液中含1-2M的 MgAc2840μL、1-2MpH8.0的Tris-Ac 3.00mL、1-2M的DTT 150μL、 无RNase水26.01ml。
优选的,所述含引物的冻干酶管的成分如下:每4ml冻干酶管中 含有1500-2500ng/ul单链DNA结合蛋白178μL、20-50ng/ul ATP再 生蛋白75μL、300-600ng/ul DNA解旋酶259μL、300-600ng/ul DNA 聚合酶75μL、300-600ng/ul DNA限制性内切酶200μL、50-100ng/ul辅 助蛋白30μL、100-200ng/ul M-MLV逆转录酶400μL、1000-2000ng/ul RNase抑制剂10μL、100μM上游引物5μL、100μM下游引物5μL、 10μM探针15.5μL、1M磷酸肌酸钠144μL、80-100mM ATP 144μL、 25mM dNTP 62μL、pH8.0的1-2M Tris-Ac 21.57ul、海藻糖0.14g、KAc 0.02g、纯化水360μL。
其中,所述阴性对照品为无RNase水空白对照。
其中,所述阳性对照品为猫冠状伪病毒,浓度是1μg/mL。
本发明还提供一种猫冠状病毒的检测方法,所述检测方法采用权 利要求3所述的猫冠状病毒荧光EMA检测试剂盒,所述检测方法不 以疾病的诊断和治疗为目的;所述检测方法包括以下步骤:
(1)提取样本中病毒RNA;
(2)使用权利要求3所述的检测试剂盒,取10μL复溶液及10μL 步骤(1)所得病毒RNA,加入到含引物的冻干酶管中,充分混匀;
(3)将复溶的冻干酶管放入核酸荧光检测仪中,37-45℃扩增 10-30分钟,每30秒扫描荧光一次,采集荧光数据,绘制时间-荧光 信号图;
(4)结果分析:如果样本扫描荧光曲线为典型“S”型,则判断为 阳性结果;反之,则为阴性结果。
其中,所述样本可取自猫鼻、咽拭子、粪便、直肠拭子;或者, 所述样本可取自猫胸、腹腔积液、脑脊液、房水、肾肉芽肿。
实施例1,猫冠状病毒荧光EMA检测
采用猫冠状病毒荧光EMA检测试剂盒进行猫冠状病毒的检测。 所述猫冠状病毒荧光EMA检测试剂盒包括:
1、复溶液500μl;
复溶液每30ml含有:
2、含引物的冻干酶管48头份;
每4mL冻干混合液包含以下各组分:
其中,引物对及探针的序列如下:
上游引物:5’-TCAAGGTCTGGTTCTCAGTCTAG-3’;
下游引物:5’-GTTTTCTTCCAGGTGTGTTTGT-3’;
探针:5’-TTTTCTTCCAGGTGTGTTTG/i6-FAMdT/T/idSp/
/iBHQ1dT/TAGGTGT-3’C3Spacer。
3、阴性对照品为无RNase水空白对照。
4、阳性对照品为猫冠状伪病毒,浓度是1μg/mL。
猫冠状病毒荧光EMA检测步骤如下:
(1)提取样本中病毒RNA;
(2)使用上述的检测试剂盒,取10μL复溶液及10μL步骤1提 取的病毒RNA,加入到含引物的冻干酶管中,充分混匀;
(3)将复溶的冻干酶管放入核酸荧光检测仪中,37-45℃扩增 10-30分钟,每30秒扫描荧光一次,采集荧光数据,绘制时间-荧光 信号图;
(4)结果分析:如果样本扫描荧光曲线为典型“S”型,则判断为 阳性结果;反之,则为阴性结果。
检测结果如图1所示,其中①具有典型“S”型,为阳性结果,② 为水平线,不具有典型“S”型特征,为阴性结果。
实施例2:临床样本的检测:
采用猫冠状病毒荧光EMA检测试剂盒进行猫冠状病毒临床样本 的检测。所述猫冠状病毒荧光EMA检测试剂盒包括:
1、复溶液500μl;
复溶液每30ml含有:
2、含引物的冻干酶管48头份;
每4mL冻干混合液包含以下各组分:
其中,引物对及探针的序列如下:
上游引物:5’-TCAAGGTCTGGTTCTCAGTCTAG-3’;
下游引物:5’-GTTTTCTTCCAGGTGTGTTTGT-3’;
探针:5’-TTTTCTTCCAGGTGTGTTTG/i6-FAMdT/T/idSp/
/iBHQ1dT/TAGGTGT-3’C3Spacer。
3、阴性对照品为无RNase水空白对照。
4、阳性对照品为猫冠状伪病毒,浓度是1μg/mL。
猫冠状病毒荧光EMA检测步骤如下:
(1)提取样本中病毒RNA;
(2)使用上述的检测试剂盒,取10μL复溶液及10μL步骤1提 取的病毒RNA,加入到含引物的冻干酶管中,充分混匀;
(3)将复溶的冻干酶管放入核酸恒温荧光检测仪中,37-45℃扩增 10-30分钟,每30秒扫描荧光一次,采集荧光数据,绘制时间-荧光 信号图;
(4)结果分析:如果样本扫描荧光曲线为典型“S”型,则判断为 阳性结果;反之,则为阴性结果。
取临床样本11例疑似病例猫粪便、咽拭子,样本来源于某动物医 院,采用猫冠状病毒荧光EMA检测试剂盒进行猫冠状病毒的检测, 结果见图2,图中7条曲线呈现典型“S”型曲线,判为阳性结果,而 呈水平线的样本可以判为阴性结果。因此检测和分析结果是:检出FCoV阳性样本7例、阴性样本4例。
同时用两个市售品牌的PCR法检测试剂盒做为对比例,本发明与 这两个市售品牌的PCR法检测试剂盒检验一致率均为100%。证实本 发明灵敏度与特异度与市售产品基本一致,但是在耗时及成本上,本 发明更具有优势,且本发明更适合于现场处置。
实施例3,交叉反应检测:
用猫杯状病毒、猫瘟热病毒、猫疱疹病毒、犬温热病毒、犬细 小病毒及狂犬疫苗核酸,以猫冠状病毒阳性样本为对照,进行本发明 特异性的检测,结果显示除猫冠状病毒阳性样本为阳性结果外,其他 样本均为阴性结果,证明本发明猫冠状病毒的检测与猫杯状病毒、猫 瘟热病毒、猫疱疹病毒、犬温热病毒、犬细小病毒及狂犬疫苗核酸没 有交叉反应。
本发明使用常温核酸扩增技术,通过M-MLV逆转录酶、Rnase 抑制剂、DNA解旋酶、单链DNA结合蛋白、DNA聚合酶等多个酶 促反应,可在37-45℃恒温条件下,10-30分钟内使待检RNA逆转录 成cDNA,并将cDNA扩增数百万倍,配合荧光检测技术,可以实现 对待检RNA的快速检定。
本发明以猫冠状病毒的序列为目的基因,筛选最佳引物,并配合 以最适浓度及配比的酶和各种试剂,形成最优的实验反应体系,使本 发明试剂盒具有检测能力上的优势与特点,不仅检测简单易行,而且 具有较高的准确度、精密度、特异性以及可重复性。本发明操作简单、 时间短、仪器要求低,非常适合用于宠物传染性疾病的快速诊断。
以上所述的仅是本发明的优选实施方式,应当指出,对于本领域 的普通技术人员来说,在不脱离本发明创造构思的前提下,还可以做 出若干变形和改进,这些都属于本发明的保护范围。
序列表
<110> 苏州点晶生物科技有限公司
<120> 猫冠状病毒荧光EMA检测引物组、试剂盒和检测方法
<130> 0
<160> 3
<170> SIPOSequenceListing 1.0
<210> 1
<211> 23
<212> DNA
<213> Feline coronavirus
<220>
<221> misc_feature
<222> (1)..(23)
<400> 1
tcaaggtctg gttctcagtc tag 23
<210> 2
<211> 22
<212> DNA
<213> Feline coronavirus
<220>
<221> misc_feature
<222> (1)..(22)
<400> 2
gttttcttcc aggtgtgttt gt 22
<210> 3
<211> 31
<212> DNA
<213> Feline coronavirus
<220>
<221> misc_feature
<222> (1)..(31)
<400> 3
ttttcttcca ggtgtgtttg ttgttaggtg t 31
Claims (9)
1.猫冠状病毒荧光EMA检测引物组,其特征在于,所述猫冠状病毒荧光EMA检测引物组包含上、下游引物和探针,所述上游引物序列是:5’-TCAAGGTCTGGTTCTCAGTCTAG-3’;所述下游引物序列是:5’-GTTTTCTTCCAGGTGTGTTTGT-3’;所述探针序列是5’-TTTTCTTCCAGGTGTGTTTG/i6-FAMdT/T/idSp//iBHQ1dT/TAGG TGT-3’C3 Spacer。
2.如权利要求1所述的猫冠状病毒荧光EMA检测引物组,其特征在于,所述上、下游引物和探针是与权利要求1所述序列同源性大于85%的序列;或者,所述上、下游引物和探针是与权利要求1所述序列碱基互补的序列。
3.猫冠状病毒荧光EMA检测试剂盒,其特征在于,所述试剂盒包括以下内容:
(1)复溶液;
(2)含引物的冻干酶管;所述引物包含上、下游引物和探针;
所述上游引物是:5’-TCAAGGTCTGGTTCTCAGTCTAG-3’;所述下游引物是:5’-GTTTTCTTCCAGGTGTGTTTGT-3’;所述探针是5’-TTTTCTTCCAGGTGTGTTTG/i6-FAMdT/T/idSp//iBHQ1dT/TAGG TGT-3’C3 Spacer;
(3)阳性对照品;
(4)阴性对照品。
4.如权利要求3所述的猫冠状病毒荧光EMA检测试剂盒,其特征在于,所述复溶液的成分如下:每30ml复溶液中含0.1-2M的MgAc2 840μL、0.1-2M pH8.0的Tris-Ac 3.00mL、0.1-2M的DTT 150μL、无RNase水26.01ml。
5.如权利要求3所述的猫冠状病毒荧光EMA检测试剂盒,其特征在于,所述含引物的冻干酶管的成分如下:每4ml冻干酶管中含有1000~3000ng/ul的单链DNA结合蛋白178μL、10-100ng/ul的ATP再生蛋白75μL、200-2000ng/ul的DNA解旋酶259μL、100-1000ng/ul的DNA聚合酶75μL、100-1000ng/ul的DNA限制性内切酶200μL、10-300ng/ul的辅助蛋白30μL、50-500ng/ul的M-MLV逆转录酶400μL、500-5000ng/ul的RNase抑制剂10μL、10-100μM的上游引物5μL、10-100μM的下游引物5μL、10-100μM的探针15.5μL、1-10M的磷酸肌酸钠144μL、10-100mM的ATP 144μL、5-50mM的dNTP 62μL、0.1-2M pH8.0的Tris-Ac 21.57ul、海藻糖0.14g、KAc 0.02g、纯化水360μL。
6.如权利要求3所述的猫冠状病毒荧光EMA检测试剂盒,其特征在于,所述阴性对照品为无RNase水空白对照。
7.如权利要求3所述的猫冠状病毒荧光EMA检测试剂盒,其特征在于,所述阳性对照品为猫冠状伪病毒,浓度是1μg/mL。
8.一种猫冠状病毒的检测方法,其特征在于,所述检测方法采用权利要求3所述的猫冠状病毒荧光EMA检测试剂盒,所述检测方法不以疾病的诊断和治疗为目的;所述检测方法包括以下步骤:
(1)提取样本中病毒RNA;
(2)使用权利要求3所述的检测试剂盒,取10μL复溶液及10μL步骤(1)所得病毒RNA,加入到含引物的冻干酶管中,充分混匀;
(3)将复溶的冻干酶管放入恒温荧光检测仪中,37-45℃扩增10-30分钟,每30秒扫描荧光一次,采集荧光数据,绘制时间-荧光信号图;
(4)结果分析。
9.如权利要求8所述的猫冠状病毒的检测方法,其特征在于,所述样本可取自猫鼻、咽拭子、粪便、直肠拭子;或者,所述样本可取自猫胸、腹腔积液、脑脊液、房水、肾肉芽肿。
Priority Applications (1)
Application Number | Priority Date | Filing Date | Title |
---|---|---|---|
CN201711497728.XA CN108559789A (zh) | 2017-12-29 | 2017-12-29 | 猫冠状病毒荧光ema检测引物组、试剂盒和检测方法 |
Applications Claiming Priority (1)
Application Number | Priority Date | Filing Date | Title |
---|---|---|---|
CN201711497728.XA CN108559789A (zh) | 2017-12-29 | 2017-12-29 | 猫冠状病毒荧光ema检测引物组、试剂盒和检测方法 |
Publications (1)
Publication Number | Publication Date |
---|---|
CN108559789A true CN108559789A (zh) | 2018-09-21 |
Family
ID=63530694
Family Applications (1)
Application Number | Title | Priority Date | Filing Date |
---|---|---|---|
CN201711497728.XA Pending CN108559789A (zh) | 2017-12-29 | 2017-12-29 | 猫冠状病毒荧光ema检测引物组、试剂盒和检测方法 |
Country Status (1)
Country | Link |
---|---|
CN (1) | CN108559789A (zh) |
Cited By (3)
Publication number | Priority date | Publication date | Assignee | Title |
---|---|---|---|---|
CN111471797A (zh) * | 2020-04-16 | 2020-07-31 | 广东省实验动物监测所 | 用于检测猫冠状病毒的rt-rpa引物对、探针、试剂盒及检测方法 |
CN112557364A (zh) * | 2020-12-11 | 2021-03-26 | 天津市职业大学 | 一种智能室内空气质量病毒检测系统及检测方法 |
CN114891785A (zh) * | 2022-04-14 | 2022-08-12 | 深圳闪量科技有限公司 | 同时检测猫多种病原体的引物池及pcr快速检测试剂盒 |
Citations (3)
Publication number | Priority date | Publication date | Assignee | Title |
---|---|---|---|---|
CN102791886A (zh) * | 2010-01-18 | 2012-11-21 | 乌得勒支大学控股有限公司 | 区分fecv和fipv的工具和方法 |
US20150031018A1 (en) * | 2010-03-08 | 2015-01-29 | Gary Whittaker | Methods For Diagnosing Feline Coronavirus Infections |
CN106967843A (zh) * | 2017-04-06 | 2017-07-21 | 苏州点晶生物科技有限公司 | 犬细小病毒核酸快速检测试剂盒 |
-
2017
- 2017-12-29 CN CN201711497728.XA patent/CN108559789A/zh active Pending
Patent Citations (3)
Publication number | Priority date | Publication date | Assignee | Title |
---|---|---|---|---|
CN102791886A (zh) * | 2010-01-18 | 2012-11-21 | 乌得勒支大学控股有限公司 | 区分fecv和fipv的工具和方法 |
US20150031018A1 (en) * | 2010-03-08 | 2015-01-29 | Gary Whittaker | Methods For Diagnosing Feline Coronavirus Infections |
CN106967843A (zh) * | 2017-04-06 | 2017-07-21 | 苏州点晶生物科技有限公司 | 犬细小病毒核酸快速检测试剂盒 |
Non-Patent Citations (6)
Title |
---|
(美)JAMES H. JORGENSEN: "《临床微生物学手册》", 30 June 2017, 中华医学电子音像出版社 * |
R. PAUL SCHAUDIES: "《Biological Identifi cation:DNA Amplification and Sequencing, Optical Sensing, Lab-on-chip and Portable Systenms》", 31 December 2014, WOODHEAD PUBLISHING LIMITED * |
吕艳丽等: "猫传染性腹膜炎病毒的RT-PCR检测", 《中国畜牧兽医学会家畜传染病学分会第六届全国会员代表大会暨第11次学术研讨会论文集》 * |
夏邦顺等: "《临床分子诊断学》", 31 July 2012, 中山大学出版社 * |
徐建新: "《智慧即时检测》", 30 June 2016, 上海科学技术出版社 * |
高勤学: "《基因操作技术》", 31 May 2007, 中国环境科学出版社 * |
Cited By (5)
Publication number | Priority date | Publication date | Assignee | Title |
---|---|---|---|---|
CN111471797A (zh) * | 2020-04-16 | 2020-07-31 | 广东省实验动物监测所 | 用于检测猫冠状病毒的rt-rpa引物对、探针、试剂盒及检测方法 |
CN111471797B (zh) * | 2020-04-16 | 2023-05-12 | 广东省实验动物监测所 | 用于检测猫冠状病毒的rt-rpa引物对、探针、试剂盒及检测方法 |
CN112557364A (zh) * | 2020-12-11 | 2021-03-26 | 天津市职业大学 | 一种智能室内空气质量病毒检测系统及检测方法 |
CN114891785A (zh) * | 2022-04-14 | 2022-08-12 | 深圳闪量科技有限公司 | 同时检测猫多种病原体的引物池及pcr快速检测试剂盒 |
CN114891785B (zh) * | 2022-04-14 | 2023-06-13 | 深圳闪量科技有限公司 | 同时检测猫多种病原体的引物池及pcr快速检测试剂盒 |
Similar Documents
Publication | Publication Date | Title |
---|---|---|
Wang et al. | Development of a novel quantitative real‐time PCR assay with lyophilized powder reagent to detect African swine fever virus in blood samples of domestic pigs in China | |
CN104342503B (zh) | 一种同时检测12种常见呼吸道病毒的方法 | |
JP2021517469A (ja) | 原核アルゴノートタンパク質に基づいた核酸検出方法およびその使用 | |
CN107916304A (zh) | 犬瘟热病毒荧光ema检测引物组、试剂盒和检测方法 | |
CN107988428A (zh) | 虾虹彩病毒(siv)的raa恒温荧光检测方法及试剂 | |
CN105112559B (zh) | 一种用于检测冠状病毒的试剂盒及其应用 | |
CN107916296A (zh) | 弓形虫核酸快速检测引物组、试剂盒和检测方法 | |
CN112538550B (zh) | 基于RT-RPA和CRISPR/Cas的DHAV-1和DHAV-3检测体系及应用 | |
EP3353320B1 (en) | Improved detection of short homopolymeric repeats | |
CN103074449B (zh) | 一种同步检测十三种腹泻病毒的试剂盒及其检测方法 | |
CN105861641A (zh) | 一种用于检测cho细胞dna残留的引物、试剂盒及检测方法 | |
WO2022257663A1 (zh) | 一种检测筛查新冠病毒n501y突变的方法及试剂盒 | |
CN108504775A (zh) | 一种基于微流控芯片的检测甲型、乙型流感病毒的试剂盒及其使用方法 | |
CN108559789A (zh) | 猫冠状病毒荧光ema检测引物组、试剂盒和检测方法 | |
CN103397107A (zh) | 牛病毒性腹泻病毒荧光定量rt-pcr检测试剂盒 | |
CN115029459A (zh) | 一种基于CRISPR-Cas12a可视化检测多杀性巴氏杆菌的试剂盒及应用 | |
CN113025726A (zh) | Lfd-rpa可视化快速检测日本血吸虫核酸的引物、探针、试剂盒及方法 | |
CN105886663A (zh) | 一种锁核酸增敏的猪伪狂犬病毒野毒株荧光定量pcr的检测试剂盒 | |
CN102876813B (zh) | 一种检测禽流感病毒的实时荧光rt-hda试剂盒及引物 | |
CN108841998A (zh) | 检测猫疱疹病毒i型核酸的引物探针组、快速检测试剂盒及方法 | |
CN105765080A (zh) | 用于检测核酸相邻性的方法 | |
CN112111609A (zh) | 一种肠道病毒通用型核酸检测试剂盒 | |
CN103397108A (zh) | 猪瘟兔化弱毒疫苗荧光定量rt-pcr检测试剂盒 | |
CN105112407A (zh) | 一种用于检测肠道病毒的试剂盒及其应用 | |
CN102912038A (zh) | 一种检测禽流感病毒的rt-hda试剂盒及引物 |
Legal Events
Date | Code | Title | Description |
---|---|---|---|
PB01 | Publication | ||
PB01 | Publication | ||
SE01 | Entry into force of request for substantive examination | ||
SE01 | Entry into force of request for substantive examination | ||
RJ01 | Rejection of invention patent application after publication |
Application publication date: 20180921 |
|
RJ01 | Rejection of invention patent application after publication |