CN108467900B - 一种联合利用lncRNA及其靶基因筛选杨树生长性状的方法、试剂盒及应用 - Google Patents

Abstract

本发明提出了预测杨树生长性状的方法、杨树选育方法、用于预测杨树生长性状的试剂盒、用于预测杨树生长性状的设备、杨树选育系统以及预定位点的基因型在预测杨树生长性状中的用途。所述方法包括：(1)确定所述杨树下列预定位点的基因型：Lnc‑CK基因的第221位、Pto‑CKX6基因的第1490位和2153位；以及(2)基于所述预定位点的基因型，预测所述杨树的生长性状。利用本发明的方法能够预测出杨树的生长性状，选育出速生杨树，缩短育种周期。

Description

一种联合利用lncRNA及其靶基因筛选杨树生长性状的方法、 试剂盒及应用

技术领域

本发明涉及生物领域。具体地，本发明涉及一种联合利用lncRNA及其靶基因筛选杨树生长性状的方法、试剂盒及应用。更具体地，本发明涉及预测杨树生长性状的方法、杨树选育方法、用于预测杨树生长性状的试剂盒、用于预测杨树生长性状的设备、杨树选育系统以及预定位点的基因型在预测杨树生长性状中的用途。

背景技术

杨树是北半球地区广泛栽培的重要用材树种，具有广泛的工业与经济价值。并且杨树作为我国北方主要的造林及绿化树种，也具有非常重要的生态价值。随着杨树定向培育的发展，对杨树新品种也提出了相应要求。在杨树优良品种定向培育中，树高、胸径等生长指标，是杨树速生、丰产优异种质选育的主要考虑因素。随着现代育种技术的不断发展，分子标记辅助育种，即利用分子标记对育种材料进行选择，克服了传统杂交育种周期长、稳定性差等缺点，可以有效地提高育种效率。目前，通过对表型和基因型进行联合遗传学研究，利用功能性标记位点对林木优良种质资源进行选育，已经成为杨树新品种选育的另一重要途径。

由于林木生长周期长，杂合度高，基因组较为庞大且多数经济性状为复杂的数量性状，基于候选基因的SNP关联分析常被用来解析等位变异与表型性状之间的调控关系，以鉴定出与林木生长及材性相关的功能标记。

然而，目前利用功能SNP位点对杨树生长性状的选育方法仍有待开发。

发明内容

本发明旨在至少在一定程度上解决现有技术中存在的技术问题至少之一。

在本发明的一个方面，本发明提出了一种预测杨树生长性状的方法。根据本发明的实施例，所述方法包括：(1)确定所述杨树下列预定位点的基因型：Lnc-CK基因的第221位、Pto-CKX6基因的第1490位和2153位；以及(2)基于所述预定位点的基因型，预测所述杨树的生长性状，其中，所述Lnc-CK基因的第221位基因型为CC、Pto-CKX6基因的第1490位基因型为GG和第2153位基因型为AC，是所述杨树的生长性状优的指示；所述Lnc-CK基因的第221位基因型为CG、Pto-CKX6基因的第1490位基因型为GG和第2153位基因型为AA，是所述杨树的生长性状差的指示。发明人发现，Lnc-CK基因的第221位、Pto-CKX6基因的第1490位和2153位是与杨树生长性状显著关联的SNP位点，通过确定其基因型，能够预测出杨树的生长性状，选育出优质杨树，缩短育种周期。

根据本发明的实施例，所述预测杨树生长性状的方法还可以具有下列附加技术特征：

根据本发明的实施例，在步骤(1)中，确定所述预定位点的基因型是利用第一引物至第九引物进行的，其中，所述第一引物至第九引物分别具有SEQ ID NO：1～9所示的核苷酸序列。发明人发现，利用上述引物，能够确定Lnc-CK基因的第221位、Pto-CKX6基因的第1490位和2153位的基因型，从而预测出杨树的生长性状，选育出优质杨树，缩短育种周期。

根据本发明的实施例，所述生长性状包括胸径值。由此，根据本发明实施例的方法能够有效地预测出杨树的胸径值，选育出速生杨树，缩短育种周期。

根据本发明的实施例，所述杨树为毛白杨。由此，根据本发明实施例的方法能够有效地预测出毛白杨的生长性状，选育出优质毛白杨，缩短育种周期。

在本发明的另一方面，本发明提出了一种杨树选育方法。根据本发明的实施例，所述方法包括：(a)提供多个杨树候选株；(b)根据前面所描述的预测杨树生长性状的方法，预测所述杨树候选株的生长性状；和(c)基于步骤(b)的预测结果，选择并培育生长性状优的候选株。由此，根据本发明实施例的杨树选育的方法能够有效地选育出优质杨树，缩短育种周期。

在本发明的又一方面，本发明提出了一种用于预测杨树生长性状的试剂盒。根据本发明的实施例，所述试剂盒包括：适于确定所述杨树下列预定位点的基因型的试剂：Lnc-CK基因的第221位、Pto-CKX6基因的第1490位和2153位。由此，利用根据本发明实施例的用于预测杨树生长性状的试剂盒能够有效地预测杨树生长性状，从而实现选育出优质杨树，缩短育种周期。

根据本发明的实施例，根据本发明的实施例，所述试剂包括：第一引物至第九引物，其中，所述第一引物至第九引物分别具有SEQ ID NO：1～9所示的核苷酸序列。根据本发明的具体实施例，所述生长性状包括胸径值。根据本发明的另一具体实施例，所述杨树为毛白杨。由此，利用根据本发明实施例的用于预测杨树生长性状的试剂盒能够有效地预测杨树生长性状，从而实现选育出优质杨树，缩短育种周期。

在本发明的又一方面，本发明提出了一种用于预测杨树生长性状的设备。根据本发明的实施例，所述设备包括：基因型确定单元，所述基因型确定单元用于确定所述杨树下列预定位点的基因型：Lnc-CK基因的第221位、Pto-CKX6基因的第1490位和2153位；以及计算单元，所述计算单元与所述基因型确定单元相连，用于基于所述预定位点的基因型，预测所述杨树的生长性状，其中，所述Lnc-CK基因的第221位基因型为CC、Pto-CKX6基因的第1490位基因型为GG和第2153位基因型为AC，是所述杨树的生长性状优的指示，所述Lnc-CK基因的第221位基因型为CG、Pto-CKX6基因的第1490位基因型为GG和第2153位基因型为AA，是所述杨树的生长性状差的指示。由此，根据本发明实施例的设备能够有效地预测出杨树的生长性状，选育出优质杨树，缩短育种周期。

根据本发明的实施例，所述基因型确定单元中设置有第一引物至第九引物，其中，所述第一引物至第九引物分别具有SEQ ID NO：1～9所示的核苷酸序列。由此，根据本发明实施例的设备能够有效地预测出杨树的生长性状，选育出优质杨树，缩短育种周期。

根据本发明的实施例，所述生长性状包括胸径值。由此，根据本发明实施例的设备能够有效地预测出杨树的胸径值，选育出速生杨树，缩短育种周期。

根据本发明的实施例，所述杨树为毛白杨。由此，根据本发明实施例的设备能够有效地预测出毛白杨的生长性状，选育出优质毛白杨，缩短育种周期。

在本发明的又一方面，本发明提出了一种杨树选育系统。根据本发明的实施例，所述系统包括：候选株获取设备，所述候选株获取设备用于提供多个杨树候选株；性状预测设备，所述性状预测设备与所述候选株获取设备相连，所述性状预测设备为前面所述的用于预测杨树生长性状的设备，并且用于预测所述杨树候选株的生长性状；和培育设备，所述培育设备与所述性状预测设备相连，所述培育设备用于基于所述性状预测设备的预测结果，选择并培育生长性状优的候选株。由此，根据本发明实施例的系统能够有效地预测出杨树的生长性状，选育出优质杨树，缩短育种周期。

根据本发明的实施例，所述生长性状包括胸径值。由此，根据本发明实施例的系统能够有效地预测出杨树的胸径值，选育出速生杨树，缩短育种周期。

根据本发明的实施例，所述杨树为毛白杨。由此，根据本发明实施例的系统能够有效地预测出毛白杨的生长性状，选育出优质毛白杨，缩短育种周期。

在本发明的又一方面，本发明提出了预定位点的基因型在预测杨树生长性状中的用途。根据本发明的实施例，所述预定位点包括：Lnc-CK基因的第221位、Pto-CKX6基因的第1490位和2153位。由此，通过确定上述预定位点的基因型，以便预测出杨树的生长性状，选育出优质杨树，缩短育种周期。

本发明的附加方面和优点将在下面的描述中部分给出，部分将从下面的描述中变得明显，或通过本发明的实践了解到。

附图说明

本发明的上述和/或附加的方面和优点从结合下面附图对实施例的描述中将变得明显和容易理解，其中：

图1显示了根据本发明一个实施例的预测杨树生长性状的方法的流程示意图；

图2显示了根据本发明一个实施例的用于预测杨树生长性状的设备的结构示意图；

图3显示了根据本发明一个实施例的杨树选育系统的结构示意图；以及

图4显示了根据本发明一个实施例的基因表达的分析示意图，其中，A为单SNP位点对表型性状(胸径)的基因型效应分析图；B为SNP位点组合对表型性状(胸径值)的基因型效应分析图。

具体实施方式

下面详细描述本发明的实施例。下面描述的实施例是示例性的，仅用于解释本发明，而不能理解为对本发明的限制。

需要说明的是，术语“第一”、“第二”仅用于描述目的，而不能理解为指示或暗示相对重要性或者隐含指明所指示的技术特征的数量。由此，限定有“第一”、“第二”的特征可以明示或者隐含地包括一个或者更多个该特征。进一步地，在本发明的描述中，除非另有说明，“多个”的含义是两个或两个以上。

本发明提出了预测杨树生长性状的方法、杨树选育方法、用于预测杨树生长性状的试剂盒、用于预测杨树生长性状的设备、杨树选育系统以及预定位点的基因型在预测杨树生长性状中的用途。下面将分别对其进行详细描述。

预测杨树生长性状的方法

在本发明的一个方面，本发明提出了一种预测杨树生长性状的方法。根据本发明的实施例，参见图1，该方法包括：

S100确定基因型

在该步骤中，确定杨树下列预定位点的基因型：Lnc-CK基因的第221位、Pto-CKX6基因的第1490位和2153位。

S200预测生长性状

在该步骤中，基于预定位点的基因型，预测杨树的生长性状。

长片段非编码RNA(lncRNA)作为一种重要的调控因子，可以在转录、转录后水平以及表观遗传学水平影响基因的表达，进而对表型变异产生影响。但是，由于树木具有高度杂合、周期长、异交体系等特点，导致转基因或者反向遗传学的方法难以在林木中开展转基因研究工作。

有鉴于此，发明人提出了下列构思：通过筛选lncRNA及其靶基因内与杨树重要性状显著关联的SNP标记位点，并分析基因型效应，从而可以预测杨树生长性状。进而，发明人发现，Lnc-CK基因(SEQ ID NO.10)以及Pto-CKX6基因(SEQ ID NO.11)显著影响生长性状。

SEQ ID NO.10所示核苷酸序列如下：

AAAAAAAAAATCATGGGTATTGCACAAATCCTTATGTAAAATTACTGAAACTGAGTGCAGGAAAAGGGGAAGTACTAAATTGCTCGGAGAAGCAAAATAGCGACCTATTTCACAGTGTTCTTGGAGGACTTGGTCAGTTTGGCATCATAACTCGGGCAAGAATATCCTTGGAACCAGCACCTCAGACGTCTCAATCCACTTTTACAGCAATCAGTCCACACCAATGACACGA

SEQ ID NO.11所示核苷酸序列如下：

GGCATGCTTGGTGATTTGATTAGTGATTTTACATTAGCATGATCTTGGAAAGTGACATGGGAGCCACTCTAGCCGTCCTCTTGATTCTTGGATGACATTTGTTACGAGTGAAATTCAACAATTCTTGACTTGTAAAAAGAGCTTCTTGCTCTGCAAAAACGAAGCATCAATGGACATGAAGGCCCCTTGATACGTGTTTATGGCCTTCGTGGTGGCTCGCGTAATCATTATTAACCTATCTTAATTATGCTTTGTTTTCTTTATTAATGCTTCGGTCTCCTTCTAGAGTATTAATTAATTGCATGTAATCACAGATTAGGTTTTTCACCACAAATTAATACATGTCACACAACACATTCACACCGGCTATACTTCCACACCATATCCCACAACTAGAGGTACGTGTTCGACTGCAATTTCTACTCCAAAACCAAAAGACATCACATTATTATAACCCATCAAAACAAGACTCGAGTCCAGTCACGTTTTGGATTGTGGTATAAAATGGTTGTTTTATAAAATATTTTTGTTATTATTTTAAATTTATTTTTTATATCAGTATATCAAAACCATTCCAAATCATAAAAAAAAATAATTTAAAAATTTAAAAATAATTTTTATACACAAAAGCAAACATATATTCTGATCGAGATGCTACTCCGCTAGAGACAATGTTTACTTGTTTTATTAGAAGATGTTGTCAAAACCACCTCAAGGAAGCTGGAGTTAAAGGCGAGTCGGTAGTTGGATTTGTCAATGCAGTCTTTTTCATGTTGTTTTCCTTCTCGTATCGTTGCGTTATGTCATTTTCTCCCTCTTAAAGTTTGAACTTAAGTTCTATTCACTTTACCTAAACAACTCCTAGCAGTAAAAAGTACTAACCCCACCATTCCAGAATACATATACAAATACATTGTACGCATACGTGTATGCGCACGCTCTATATCAATAAAAGTCTCCTTTCTACTGTATTCATCTTTTTTAAAAATAAAAAACAAAACCCTAAAATAATCCAAATTAACCTTACAAGGTAACTAAGATTGATGTGCACTAAATTATTCCCTGTACAGGTACAAAAATGTTAATAGTTTGTACATGTTAACATTGAATGATGGAAAATTATTACACTACCTTTTTAAAGTATTTTTTATTTAAAAACACATCAAAATAATATTTTTTTATTTTTTAAAAATTATTTTTATATCAGCATATTAAAATAATCTAAATATACTAAAAAATATATTAATTTAAAAAAAATCAATTTTTTTTAAAATTATTTATAAAGTGCAAAAATAAAAAGCAAGATCAAATACAAGTACAGATGCCCATAAGCTGGCACTTCCATAGCACGTTGTTCCAAGCAAGTACACAAAGATTGTATTTCAAATCTAGGGTTGCAATTATCAAGATGCTGATTCCTTTCAGTTTTCATGAGAGTTGATTACCCTAGGCAGTCCAAACCAGCTTGAAAAAAAAACGAGTCCATTGCTCAAATCTGAGTGTTGTTTTTCCTTTCCTTTAACACAAGTGCTTACCCGGCATCCACTCTTCAGCAGGACAGAATTACAGACATAGCAAGTATATAATTTTTTTAATTTATTTTTAACATTAAGACATTAAAATGTTATAAAAACATATAAAAAAACATTGAAAAAGGAAAAAAACTAAATAAATTTTTTGAAAACCAGTGCATGGCGGCAAAGACAAACAGGCTTTTAAGAGAAGTGAAAGATGCTTCCCTCTGGAAGTGCAAATCTCAAACTAGAGGTGCTGTGATGCAACTAGTTTGCAAAAAAGTGAAAAGGGCAATAATTGAACTACTGTAATTTAATTGCACTTGCAAACAAATAAACAAGAGAATCCTCCAGACTTGTCACTTTGCTGGGAACTAAGGCTTCAAAACAAGAAACAATAGAGAGGTAGCAGAGGAGTCTTTCAGTGCTATCCCTCAAGCTGTCATCCCCATCCACAGTACTACTCTTCTTCTTACATATTCACACTGGCACACATGGATTAGCACTTCACGTGTCTTATGGACCCATAAAAAAGCCCCACCTGATCATCCCTCCCTTTCAAATAAATCAAAGGGAGGCCCCATAGTGCCTCTCATCTGATCTCAAAGCAGATTCGCGATGCTTACATTCCGACAGCCATAGATATGAGAAAAACATAATCTATAATAATTCATGTATGGGAGACAAAGGTATGGCATACCTGTCATCAGAGGCGGAGGGATACACAAACCGGCGAAGCCATTGAGTATCTCATTTTTCTAAATATAGACAAAGTTCCCTTCAACATGGTAAGAGAGATAAATTTCGAGGCATGTTTGTCTTTGGTGGAAAAGGTGAGATTGTGGTTGCAACTGTTGGGAAAAGGTGCAAAGATTTGTGAAATCTTTCTCTCCTGTGCCCTTCTCTCTTCAACTTGGCATCTGTGTTTGATGGCTTCTGTTAATAAATGAAAGAGCACAAAAAGAAGAACCAAAAGATAGTCATAACAAGTAGGCAGTCTTCATACGGATTCTTAAAAATGAATATTGGTTGACTCAGCCACCCAAAATCTTCACCTTTAAATTCCCCCCCCAACCCTTGGCTCCTCCATACCACTTCTTTTGCTCTTTTTGCATACAAACGTGAAAGAAAACCTGCTTAATCACCTTTCTTTCCTCAACTTTCCAACTGAAAAAATAAATGAGATATCCACCCGTGAGTATCCTCAAGCAAACCAATATGCTTTTCGTAAGAAGCTTCTTGATTTTGTTCCTGAGCTGCATGACCACAACAATAAACCTTTGTCTTTCCAGCAACCCTTCTTCGTTGGGAACCCTCTCCGTTGACGGGCATTTCAGCTTTGATGAAGTTCACCATGCAGCCAAAGACTTCGGCAACAGGTTTCATCTACTCCCTTTGGCAGTACTCTATCCAAAGTCAGTTTCTGATATTGCCACTACGATAAGGCATATTTGGCAGATGGGTCCTGATTCAGAGCTGACAGTTGCAGCCAGAGGCCACAGCCACTCACTCCAGGGTCAGGCACAAGCCCACCACGGAGTTGTAATCAATATGGAATCACTCCAAGTTCATAAAATGCATGTTTACAGTGGAAACTATCCATATGTGGATGCCTCTGGCGGTGAGTTGTGGATAGATATCCTGCGTGAATGCCTCAAGTATGGATTAGCACCAAAATCATGGACAGACTACTTACATTTAACTGTTGGCGGTACTTTGTCTAATGCTGGGGTTAGCGGGCAGGCGTTTCGGCAAGGCCCTCAGATCAGTAATGTCAATCAGCTGGAAGTTGTTACAGGTTCGTTTGAGTAAAATAGCGAAGAAAAGATTTTTCTTTTGTTTTTTTTTTTAAAAAAGAAGGGAGAAAAAACAAAAACACAGTAGGCAACACACATGGATAATTTGCATCTAGGCAAATGGGACCAGGGTCAAGTGAAGTATTCATGACATCGTCCTTGCTATGCATGCTGTGCTAGACCTTGCTTCCACAAAAGATAATTTCGACCATTGCCAATAATTTGATGTTCAAGTACAAAAATTAGAGTGTACGAGCACACACAAATATGCAACCATGGCATGAAAAAAATATCATGTGCATCTCACAAATCCTTCTGTAAGATAACTGAAACTCCGTGCAGGAAAGGGAGAAGTATTAAATTGCTCGGAGAAGCAGAATAGTGACCTGTTTCACGGCGTTCTTGGAGGACTTGGTCAGTTTGGCATCATAACACGGGCAAGAATATCCTTGGAACCTGCACCTGATATGGTAAAATTATAGCCATTGGGTCCACATAGAAGCTTTACTAAATCAAAGCAAGATAATGAAATGATGCCTCTAGCAGTAAGTTTCGTTTCTCACAGCTCAATTTCATATTTTGAATAGGTGAAATGGATTAGAGTTCTCTACTCGGACTTTACGACATTTGCCACAGACCAAGAGCTTTTAATAGGTGCAGAAAGCACATTCGACTACATTGAAGGATTTGTGATAATTAACAGGACTTCTCTCCTGAATAACTGGAGGTCATCTTTCGATCCTCAGGACCCGGTTCAAGCTAGCCAGTTTCAATCGGATGGAAGAACTCTGTACTGCTTAGAATTGGCCAAATACTTCAACCGAGACAGGATAGATGCACTAAATGAGGTGAGGCACATGGTCCTTTATCTTCTGGTTTTCATATATCAGCAAAAATAATTAGGAAATCATAAACTAATTAATAAAATGGCATTCACTCACAAATCCATTTTTTCTCATGCAGGAAGTTGGGAATTTGTTGTCTCAACTAAGATACATGGCATCAACACTTTTCCTAACAGAAGTTTCATACTTGGAATTCTTGGATAGAGTTCATGTGTCTGAGGTCAAGCTACGGTCTAAGGGCTTGTGGGAAGTTCCGCATCCATGGCTCAATCTTCTTATCCCCAAAAGCAAAATAAACGATTTTGCGGATGAAGTCTTTGGCAGCATCCTAACAGACACGAGCAACGGTCCAATCCTAATCTACCCAGTTAACAAATCAAAGTAACTGTTTGACAAAAGAATTAATTTCAATTTTGTGATTTCTCCGAGTTTTGTTGACTGATTGACTTGCTGTTTCTGATTTCAGATGGGACAACAGAACTTCTGCTGTTCTTCCAGAGGAAGATATTTTCTACTTGGTGGCTTTCCTTAACTCTGCAATGCCCTCGTCCATGGGAACTGATGGCTTAGAACATATCTTAACTCAGAATAAAAGAATTTTAGAATTTTGTGAAACAGCACGCCTTGGGATGAAGCAATATCTGCCCCACTACAATACACAGGGAGAATGGAGAGCCCACTTTGGCCCACGATGGGAAGTTTTTGCCCAGAGAAAATCTACTTACGACCCCCTGGCAATACTTGCTCCTGGCCAGAGAATTTTTCAAAAGGGAATATCTTTCTCATGA

发明人通过对众多杨树样品lncRNA基因Lnc-CK及其靶基因Pto-CKX6的基因序列进行克隆测序以及多重比对，确定Lnc-CK基因的第221位、Pto-CKX6基因的第1490位和2153位为与样品生长性状显著关联的SNP标记位点。

发明人发现，杨树lncRNA基因Lnc-CK的第221位为C或G，其靶基因Pto-CKX6的第1490位碱基为G或T，第2153位碱基为A或C。

需要说明的是，对于基因型的检测方法不作严格限定，可以采用本领域常规方法进行检测。根据本发明的实施例，采用锁核苷酸技术进行基因型检测。具体地，通过对待测位点设计引物，引物的设计要求是正向引物或反向引物的3’末端对应SNP功能位点，并将对应SNP位点的3’末端上的核苷酸进行修饰。进行扩增后，根据扩增产物中目的条带的有无确定SNP位点的基因型。

根据本发明的实施例，在步骤S100中，确定预定位点的基因型是利用第一引物至第九引物进行的，其中，第一引物至第九引物分别具有SEQ ID NO：1～9所示的核苷酸序列。具体参见表1。

需要说明的是，根据本发明的实施例，以Lnc-CK基因第221位为例，采用SEQ ID.2(简称引物2)与SEQ ID.3(简称引物3)分别与SEQ ID.1(简称引物1)组成引物对进行扩增，若引物1和2的扩增产物中出现目的条带，引物1和3的扩增产物中也出现目的条带，则可判断出SNP位点的基因型为CG；若引物1和2的扩增产物中出现目的条带，引物1和3的扩增产物中未出现目的条带，则可判断出SNP位点的基因型为CC；若引物1和2的扩增产物中未出现目的条带，引物1和3的扩增产物中出现目的条带，则可判断出SNP位点的基因型为GG。

表1引物序列

根据本发明的实施例，Lnc-CK基因的第221位基因型为CC、Pto-CKX6基因的第1490位基因型为GG和第2153位基因型为AC，是所述杨树的生长性状优的指示。Lnc-CK基因的第221位基因型为CG、Pto-CKX6基因的第1490位基因型为GG和第2153位基因型为AA，是所述杨树的生长性状差的指示。

发明人通过对SNP位点的基因型效应进行分析，发现Lnc-CK基因的第221位基因型为CC、Pto-CKX6基因的第1490位基因型为GG和第2153位基因型为AC时，对应的杨树生长性状(例如胸径值)最优。Lnc-CK基因的第221位基因型为CG、Pto-CKX6基因的第1490位基因型为GG和第2153位基因型为AA时，对应的杨树生长性状(例如胸径值)最差。可以理解的是，具有上述两种基因型的杨树，其生长性状属于两种较极端的情况(最优和最差)，其它的基因型组合，杨树的生长性状处于这两种情况之间。

需要说明的是，本发明所使用的术语“生长性状优”主要是相对于整体平均水平而言的，即Lnc-CK基因的第221位基因型为CC、Pto-CKX6基因的第1490位基因型为GG和第2153位基因型为AC的杨树生长性状显著高于整体平均水平，可以以该杨树作为选育林木，从而缩短了育种周期。

根据本发明的实施例，生长性状包括胸径值。发明人发现，以胸径值作为品控指标，当杨树的Lnc-CK基因的第221位基因型为CC、Pto-CKX6基因的第1490位基因型为GG和第2153位基因型为AC时，可以预测到杨树的胸径值较高，进而可以推断出其生长速度较快，从而选育出速生杨树；当杨树的Lnc-CK基因的第221位基因型为CG、Pto-CKX6基因的第1490位基因型为GG和第2153位基因型为AA时，可以预测到杨树的胸径值较低，生长速度较慢。由此，根据本发明实施例的方法能够有效地预测出杨树的胸径值，选育出速生杨树，缩短育种周期。

根据本发明的实施例，杨树为毛白杨。由此，根据本发明实施例的方法能够有效地预测出毛白杨的生长性状，选育出优质毛白杨，缩短育种周期。

杨树选育方法

在本发明的另一方面，本发明提出了一种杨树选育方法。根据本发明的实施例，方法包括：(a)提供多个杨树候选株；(b)根据前面所描述的预测杨树生长性状的方法，预测杨树候选株的生长性状；和(c)基于步骤(b)的预测结果，选择并培育生长性状优的候选株。

常规的杨树通常需要在其长至10年左右，观察外观或者检测特定指标，才能够筛选出生长较好的杨树，所以整体培育时间较长。发明人发现，利用根据本发明实施例的杨树选育方法，在杨树候选株的生长早期(例如幼苗期)即可采用前面所描述的预测杨树候选株生长性状的方法，预测其生长性状，对于生长性状优的杨树候选株即可作为培育对象，从而大大缩短了育种周期。

需要说明的是，本发明所使用的术语“候选株”应作广义理解，既可以指个体，例如幼苗；也可以指器官，例如叶子；还可以指细胞、组织等。

本领域技术人员能够理解的是，前面针对预测杨树生长性状的方法所描述的特征和优点，同样适用于该杨树选育方法，在此不再赘述。

用于预测杨树生长性状的试剂盒

在本发明的又一方面，本发明提出了一种用于预测杨树生长性状的试剂盒。根据本发明的实施例，该试剂盒包括：适于确定所述杨树下列预定位点的基因型的试剂：Lnc-CK基因的第221位、Pto-CKX6基因的第1490位和2153位。

发明人通过对众多杨树样品lncRNA基因Lnc-CK及其靶基因Pto-CKX6进行克隆测序以及多重比对、基因型分型及其与性状进行关联分析，确定Lnc-CK基因的第221位、Pto-CKX6基因的第1490位和2153位为显著影响杨树生长性状的SNP位点。进而，利用根据本发明试剂盒确定Lnc-CK基因的第221位、Pto-CKX6基因的第1490位和2153位的基因型，从而能够预测到杨树生长性状，选育出优质杨树，缩短育种周期。

根据本发明的实施例，试剂包括：第一引物至第九引物，其中，第一引物至第九引物分别具有SEQ ID NO：1～9所示的核苷酸序列。发明人发现，利用上述引物能够有效地判断出Lnc-CK基因的第221位、Pto-CKX6基因的第1490位和2153位的基因型，从而能够预测到杨树生长性状，选育出优质杨树，缩短育种周期。根据本发明的具体实施例，采用锁核苷酸技术进行基因型检测。具体地，通过对待测位点设计引物，引物的设计要求是正向引物或反向引物的3’末端对应SNP功能位点，并将对应SNP位点的3’末端上的核苷酸进行修饰。进行扩增后，根据扩增产物中目的条带的有无确定SNP位点的基因型。

根据本发明的实施例，杨树为毛白杨。由此，根据本发明实施例的试剂盒能够有效地预测出毛白杨的生长性状，选育出优质毛白杨，缩短育种周期。

根据本发明的实施例，生长性状包括胸径值。发明人发现，以胸径值作为品控指标，当杨树的Lnc-CK基因的第221位基因型为CC、Pto-CKX6基因的第1490位基因型为GG和第2153位基因型为AC时，可以预测到杨树的胸径值较高；当杨树的Lnc-CK基因的第221位基因型为CG、Pto-CKX6基因的第1490位基因型为GG和第2153位基因型为AA时，可以预测到杨树的胸径值较低。由此，根据本发明实施例的试剂盒能够有效地预测出杨树的胸径值，选育出速生杨树，缩短育种周期。

用于预测杨树生长性状的设备

在本发明的又一方面，本发明提出了一种用于预测杨树生长性状的设备。根据本发明的实施例，参见图2，该设备包括：基因型确定单元100以及计算单元200。下面将分别对其进行详细描述。

根据本发明的实施例，基因型确定单元用于确定杨树下列预定位点的基因型：Lnc-CK基因的第221位、Pto-CKX6基因的第1490位和2153位。发明人通过对众多杨树样品lncRNA基因Lnc-CK及其靶基因Pto-CKX6进行克隆测序以及多重比对、基因型分型及其与性状进行关联分析，确定Lnc-CK基因的第221位、Pto-CKX6基因的第1490位和2153位为显著影响杨树生长性状的SNP位点。进而，通过基因型确定单元100确定Lnc-CK基因的第221位、Pto-CKX6基因的第1490位和2153位的基因型，从而能够预测到杨树生长性状，选育出优质杨树，缩短育种周期。

根据本发明的实施例，计算单元200与基因型确定单元100相连，用于基于预定位点的基因型，预测杨树的生长性状，其中，Lnc-CK基因的第221位基因型为CC、Pto-CKX6基因的第1490位基因型为GG和第2153位基因型为AC，是所述杨树的生长性状优的指示；Lnc-CK基因的第221位基因型为CG、Pto-CKX6基因的第1490位基因型为GG和第2153位基因型为AA，是所述杨树的生长性状差的指示。

需要说明的是，本发明所使用的术语“生长性状优”主要是相对于整体平均水平而言的，即Lnc-CK基因的第221位基因型为CC、Pto-CKX6基因的第1490位基因型为GG和第2153位基因型为AC的杨树生长性状显著高于整体平均水平，可以以该杨树作为选育林木，从而缩短了育种周期。

根据本发明的实施例，基因型确定单元中设置有第一引物至第九引物，其中，第一引物至第九引物分别具有SEQ ID NO：1～9所示的核苷酸序列。发明人发现，利用上述引物能够有效地判断出Lnc-CK基因的第221位、Pto-CKX6基因的第1490位和2153位的基因型，从而能够预测到杨树生长性状，选育出优质杨树，缩短育种周期。根据本发明的具体实施例，采用锁核苷酸技术进行基因型检测。具体地，通过对待测位点设计引物，引物的设计要求是正向引物或反向引物的3’末端对应SNP功能位点，并将对应SNP位点的3’末端上的核苷酸进行修饰。进行扩增后，根据扩增产物中目的条带的有无确定SNP位点的基因型。

根据本发明的实施例，生长性状包括胸径值。发明人发现，以胸径值作为品控指标，当杨树的Lnc-CK基因的第221位基因型为CC、Pto-CKX6基因的第1490位基因型为GG和第2153位基因型为AC时，可以预测到杨树的胸径值较高；当杨树的Lnc-CK基因的第221位基因型为CG、Pto-CKX6基因的第1490位基因型为GG和第2153位基因型为AA时，可以预测到杨树的胸径值较低。由此，根据本发明实施例的设备能够有效地预测出杨树的胸径值，选育出速生杨树，缩短育种周期。

根据本发明的实施例，杨树为毛白杨。由此，根据本发明实施例的设备能够有效地预测出毛白杨的生长性状，选育出优质毛白杨，缩短育种周期。

杨树选育系统

在本发明的又一方面，本发明提出了一种杨树选育系统。根据本发明的实施例，参见图3，该系统包括：候选株获取设备1000、性状预测设备2000以及培育设备3000。下面将分别对其进行详细描述。

候选株获取设备1000

根据本发明的实施例，候选株获取设备用于提供多个杨树候选株。

性状预测设备2000

根据本发明的实施例，性状预测设备与候选株获取设备相连，性状预测设备为前面所描述的用于预测杨树生长性状的设备，并且用于预测杨树候选株的生长性状。

培育设备3000

根据本发明的实施例，培育设备与性状预测设备相连，培育设备用于基于性状预测设备的预测结果，选择并培育生长性状优的候选株。

发明人发现，利用根据本发明实施例的杨树选育系统，在杨树候选株的生长早期(如幼苗期)即可通过前面所描述的预测杨树候选株生长性状的方法，预测其生长性状，对于生长性状优的杨树候选株即可作为培育对象，从而大大缩短了育种周期。

根据本发明的实施例，生长性状包括胸径值。发明人发现，以胸径值作为品控指标，当杨树的Lnc-CK基因的第221位基因型为CC、Pto-CKX6基因的第1490位基因型为GG和第2153位基因型为AC时，可以预测到杨树的胸径值较高；当杨树的Lnc-CK基因的第221位基因型为CG、Pto-CKX6基因的第1490位基因型为GG和第2153位基因型为AA时，可以预测到杨树的胸径值较低。由此，根据本发明实施例的系统能够有效地预测出杨树的胸径值，选育出速生杨树，缩短育种周期。

根据本发明的实施例，杨树为毛白杨。由此，根据本发明实施例的系统能够有效地预测出毛白杨的生长性状，选育出优质毛白杨，缩短育种周期。

预定位点的基因型在预测杨树生长性状中的用途

在本发明的又一方面，本发明提出了预定位点的基因型在预测杨树生长性状中的用途。根据本发明的实施例，预定位点包括：Lnc-CK基因的第221位、Pto-CKX6基因的第1490位和2153位。由此，通过确定上述预定位点的基因型，从而预测出杨树的生长性状，选育出优质杨树，缩短育种周期。

下面将结合实施例对本发明的方案进行解释。本领域技术人员将会理解，下面的实施例仅用于说明本发明，而不应视为限定本发明的范围。实施例中未注明具体技术或条件的，按照本领域内的文献所描述的技术或条件或者按照产品说明书进行。所用试剂或仪器未注明生产厂商者，均为可以通过市购获得的常规产品。

实施例1

发明人通过下列步骤获得与杨树生长性状显著关联的3个功能性SNP标记位点及其基因型效应分析。

(1)DNA提取：从全国毛白杨种质资源库中选取435株个体作为关联群体，利用CTAB法提取每株个体的基因组DNA。

(2)表型性状测定：利用生长性状测定工具对关联群体的每株个体的胸径指标进行测定。

(3)SNP发现和基因分型：以最大程度地反映毛白杨自然分布区域的40个基因型个体的总DNA为模板，对毛白杨lncRNA基因Lnc-CK及其靶基因Pto-CKX6进行克隆测序，利用MEGA5.0对测序片段比对分析，发现基因内出现频率>10％的SNP位点。采用锁核酸(LNA)法将这些位点在关联群体中进行基因分型。

(4)利用MDR3.0.2软件对lncRNA基因Lnc-CK及其靶基因Pto-CKX6内具有遗传互作效应的位点进行检测，将检测出的位点组合与杨树生长性状(胸径)进行关联分析，并对结果进行FDR多重检测，最终检测到毛白杨lncRNA基因Lnc-CK内的第221位SNP位点及其靶基因Pto-CKX6内的第1490位和2153位SNP位点之间存在的遗传互作对毛白杨生长性状(胸径)具有显著的关联。

(5)根据个体基因型数据对实验样品进行分类，结果发现，当lncRNA基因Lnc-CK第221位基因型为CC、Pto-CKX6基因的第1490位基因型为GG和第2153位基因型为AC时，所述毛白杨的生长性状好，体现在胸径平均值与整体胸径平均值相比高11.873cm；当lncRNA基因Lnc-CK第221位基因型为CG、Pto-CKX6基因的第1490位基因型为GG和第2153位基因型为AA时，所述毛白杨的生长性状差，体现在胸径平均值与整体胸径平均值相比低10.223cm(图4)。

在本说明书的描述中，参考术语“一个实施例”、“一些实施例”、“示例”、“具体示例”、或“一些示例”等的描述意指结合该实施例或示例描述的具体特征、结构、材料或者特点包含于本发明的至少一个实施例或示例中。在本说明书中，对上述术语的示意性表述不必须针对的是相同的实施例或示例。而且，描述的具体特征、结构、材料或者特点可以在任一个或多个实施例或示例中以合适的方式结合。此外，在不相互矛盾的情况下，本领域的技术人员可以将本说明书中描述的不同实施例或示例以及不同实施例或示例的特征进行结合和组合。

尽管上面已经示出和描述了本发明的实施例，可以理解的是，上述实施例是示例性的，不能理解为对本发明的限制，本领域的普通技术人员在本发明的范围内可以对上述实施例进行变化、修改、替换和变型。

SEQUENCE LISTING

<110> 北京林业大学

<120> 一种联合利用lncRNA及其靶基因筛选杨树生长性状的方法、试剂盒及应用

<130> PIDC3168753

<160> 11

<170> PatentIn version 3.5

<210> 1

<211> 25

<212> DNA

<213> Artificial Sequence

<220>

<223> SEQ ID NO.1

<400> 1

gtgaaaatgt cgttagtcag gtgtg 25

<210> 2

<211> 26

<212> DNA

<213> Artificial Sequence

<220>

<223> SEQ ID NO.2

<400> 2

gacgatatac cgtagcacag taaccc 26

<210> 3

<211> 26

<212> DNA

<213> Artificial Sequence

<220>

<223> SEQ ID NO.3

<400> 3

gacgatatac cgtagcacag taaccg 26

<210> 4

<211> 25

<212> DNA

<213> Artificial Sequence

<220>

<223> SEQ ID NO.4

<400> 4

ttgaaaaaaa aacgagtcca ttgct 25

<210> 5

<211> 25

<212> DNA

<213> Artificial Sequence

<220>

<223> SEQ ID NO.5

<400> 5

ttgaaaaaaa aacgagtcca ttgcg 25

<210> 6

<211> 25

<212> DNA

<213> Artificial Sequence

<220>

<223> SEQ ID NO.6

<400> 6

ctgtcctgct gaagagtgga tgccg 25

<210> 7

<211> 25

<212> DNA

<213> Artificial Sequence

<220>

<223> SEQ ID NO.7

<400> 7

cgcgatgctt acattccgac agcca 25

<210> 8

<211> 25

<212> DNA

<213> Artificial Sequence

<220>

<223> SEQ ID NO.8

<400> 8

cgcgatgctt acattccgac agccc 25

<210> 9

<211> 25

<212> DNA

<213> Artificial Sequence

<220>

<223> SEQ ID NO.9

<400> 9

ctccgcctct gatgacaggt atgcc 25

<210> 10

<211> 232

<212> DNA

<213> Artificial Sequence

<220>

<223> SEQ ID NO.10

<400> 10

aaaaaaaaaa tcatgggtat tgcacaaatc cttatgtaaa attactgaaa ctgagtgcag 60

gaaaagggga agtactaaat tgctcggaga agcaaaatag cgacctattt cacagtgttc 120

ttggaggact tggtcagttt ggcatcataa ctcgggcaag aatatccttg gaaccagcac 180

ctcagacgtc tcaatccact tttacagcaa tcagtccaca ccaatgacac ga 232

<210> 11

<211> 4943

<212> DNA

<213> Artificial Sequence

<220>

<223> SEQ ID NO.11

<400> 11

ggcatgcttg gtgatttgat tagtgatttt acattagcat gatcttggaa agtgacatgg 60

gagccactct agccgtcctc ttgattcttg gatgacattt gttacgagtg aaattcaaca 120

attcttgact tgtaaaaaga gcttcttgct ctgcaaaaac gaagcatcaa tggacatgaa 180

ggccccttga tacgtgttta tggccttcgt ggtggctcgc gtaatcatta ttaacctatc 240

ttaattatgc tttgttttct ttattaatgc ttcggtctcc ttctagagta ttaattaatt 300

gcatgtaatc acagattagg tttttcacca caaattaata catgtcacac aacacattca 360

caccggctat acttccacac catatcccac aactagaggt acgtgttcga ctgcaatttc 420

tactccaaaa ccaaaagaca tcacattatt ataacccatc aaaacaagac tcgagtccag 480

tcacgttttg gattgtggta taaaatggtt gttttataaa atatttttgt tattatttta 540

aatttatttt ttatatcagt atatcaaaac cattccaaat cataaaaaaa aataatttaa 600

aaatttaaaa ataattttta tacacaaaag caaacatata ttctgatcga gatgctactc 660

cgctagagac aatgtttact tgttttatta gaagatgttg tcaaaaccac ctcaaggaag 720

ctggagttaa aggcgagtcg gtagttggat ttgtcaatgc agtctttttc atgttgtttt 780

ccttctcgta tcgttgcgtt atgtcatttt ctccctctta aagtttgaac ttaagttcta 840

ttcactttac ctaaacaact cctagcagta aaaagtacta accccaccat tccagaatac 900

atatacaaat acattgtacg catacgtgta tgcgcacgct ctatatcaat aaaagtctcc 960

tttctactgt attcatcttt tttaaaaata aaaaacaaaa ccctaaaata atccaaatta 1020

accttacaag gtaactaaga ttgatgtgca ctaaattatt ccctgtacag gtacaaaaat 1080

gttaatagtt tgtacatgtt aacattgaat gatggaaaat tattacacta cctttttaaa 1140

gtatttttta tttaaaaaca catcaaaata atattttttt attttttaaa aattattttt 1200

atatcagcat attaaaataa tctaaatata ctaaaaaata tattaattta aaaaaaatca 1260

atttttttta aaattattta taaagtgcaa aaataaaaag caagatcaaa tacaagtaca 1320

gatgcccata agctggcact tccatagcac gttgttccaa gcaagtacac aaagattgta 1380

tttcaaatct agggttgcaa ttatcaagat gctgattcct ttcagttttc atgagagttg 1440

attaccctag gcagtccaaa ccagcttgaa aaaaaaacga gtccattgct caaatctgag 1500

tgttgttttt cctttccttt aacacaagtg cttacccggc atccactctt cagcaggaca 1560

gaattacaga catagcaagt atataatttt tttaatttat ttttaacatt aagacattaa 1620

aatgttataa aaacatataa aaaaacattg aaaaaggaaa aaaactaaat aaattttttg 1680

aaaaccagtg catggcggca aagacaaaca ggcttttaag agaagtgaaa gatgcttccc 1740

tctggaagtg caaatctcaa actagaggtg ctgtgatgca actagtttgc aaaaaagtga 1800

aaagggcaat aattgaacta ctgtaattta attgcacttg caaacaaata aacaagagaa 1860

tcctccagac ttgtcacttt gctgggaact aaggcttcaa aacaagaaac aatagagagg 1920

tagcagagga gtctttcagt gctatccctc aagctgtcat ccccatccac agtactactc 1980

ttcttcttac atattcacac tggcacacat ggattagcac ttcacgtgtc ttatggaccc 2040

ataaaaaagc cccacctgat catccctccc tttcaaataa atcaaaggga ggccccatag 2100

tgcctctcat ctgatctcaa agcagattcg cgatgcttac attccgacag ccatagatat 2160

gagaaaaaca taatctataa taattcatgt atgggagaca aaggtatggc atacctgtca 2220

tcagaggcgg agggatacac aaaccggcga agccattgag tatctcattt ttctaaatat 2280

agacaaagtt cccttcaaca tggtaagaga gataaatttc gaggcatgtt tgtctttggt 2340

ggaaaaggtg agattgtggt tgcaactgtt gggaaaaggt gcaaagattt gtgaaatctt 2400

tctctcctgt gcccttctct cttcaacttg gcatctgtgt ttgatggctt ctgttaataa 2460

atgaaagagc acaaaaagaa gaaccaaaag atagtcataa caagtaggca gtcttcatac 2520

ggattcttaa aaatgaatat tggttgactc agccacccaa aatcttcacc tttaaattcc 2580

ccccccaacc cttggctcct ccataccact tcttttgctc tttttgcata caaacgtgaa 2640

agaaaacctg cttaatcacc tttctttcct caactttcca actgaaaaaa taaatgagat 2700

atccacccgt gagtatcctc aagcaaacca atatgctttt cgtaagaagc ttcttgattt 2760

tgttcctgag ctgcatgacc acaacaataa acctttgtct ttccagcaac ccttcttcgt 2820

tgggaaccct ctccgttgac gggcatttca gctttgatga agttcaccat gcagccaaag 2880

acttcggcaa caggtttcat ctactccctt tggcagtact ctatccaaag tcagtttctg 2940

atattgccac tacgataagg catatttggc agatgggtcc tgattcagag ctgacagttg 3000

cagccagagg ccacagccac tcactccagg gtcaggcaca agcccaccac ggagttgtaa 3060

tcaatatgga atcactccaa gttcataaaa tgcatgttta cagtggaaac tatccatatg 3120

tggatgcctc tggcggtgag ttgtggatag atatcctgcg tgaatgcctc aagtatggat 3180

tagcaccaaa atcatggaca gactacttac atttaactgt tggcggtact ttgtctaatg 3240

ctggggttag cgggcaggcg tttcggcaag gccctcagat cagtaatgtc aatcagctgg 3300

aagttgttac aggttcgttt gagtaaaata gcgaagaaaa gatttttctt ttgttttttt 3360

ttttaaaaaa gaagggagaa aaaacaaaaa cacagtaggc aacacacatg gataatttgc 3420

atctaggcaa atgggaccag ggtcaagtga agtattcatg acatcgtcct tgctatgcat 3480

gctgtgctag accttgcttc cacaaaagat aatttcgacc attgccaata atttgatgtt 3540

caagtacaaa aattagagtg tacgagcaca cacaaatatg caaccatggc atgaaaaaaa 3600

tatcatgtgc atctcacaaa tccttctgta agataactga aactccgtgc aggaaaggga 3660

gaagtattaa attgctcgga gaagcagaat agtgacctgt ttcacggcgt tcttggagga 3720

cttggtcagt ttggcatcat aacacgggca agaatatcct tggaacctgc acctgatatg 3780

gtaaaattat agccattggg tccacataga agctttacta aatcaaagca agataatgaa 3840

atgatgcctc tagcagtaag tttcgtttct cacagctcaa tttcatattt tgaataggtg 3900

aaatggatta gagttctcta ctcggacttt acgacatttg ccacagacca agagctttta 3960

ataggtgcag aaagcacatt cgactacatt gaaggatttg tgataattaa caggacttct 4020

ctcctgaata actggaggtc atctttcgat cctcaggacc cggttcaagc tagccagttt 4080

caatcggatg gaagaactct gtactgctta gaattggcca aatacttcaa ccgagacagg 4140

atagatgcac taaatgaggt gaggcacatg gtcctttatc ttctggtttt catatatcag 4200

caaaaataat taggaaatca taaactaatt aataaaatgg cattcactca caaatccatt 4260

ttttctcatg caggaagttg ggaatttgtt gtctcaacta agatacatgg catcaacact 4320

tttcctaaca gaagtttcat acttggaatt cttggataga gttcatgtgt ctgaggtcaa 4380

gctacggtct aagggcttgt gggaagttcc gcatccatgg ctcaatcttc ttatccccaa 4440

aagcaaaata aacgattttg cggatgaagt ctttggcagc atcctaacag acacgagcaa 4500

cggtccaatc ctaatctacc cagttaacaa atcaaagtaa ctgtttgaca aaagaattaa 4560

tttcaatttt gtgatttctc cgagttttgt tgactgattg acttgctgtt tctgatttca 4620

gatgggacaa cagaacttct gctgttcttc cagaggaaga tattttctac ttggtggctt 4680

tccttaactc tgcaatgccc tcgtccatgg gaactgatgg cttagaacat atcttaactc 4740

agaataaaag aattttagaa ttttgtgaaa cagcacgcct tgggatgaag caatatctgc 4800

cccactacaa tacacaggga gaatggagag cccactttgg cccacgatgg gaagtttttg 4860

cccagagaaa atctacttac gaccccctgg caatacttgc tcctggccag agaatttttc 4920

aaaagggaat atctttctca tga 4943

Claims (5)

1.一种预测杨树生长性状的方法，其特征在于，包括：

(1)确定所述杨树下列预定位点的基因型：Lnc-CK基因的第221位、Pto-CKX6基因的第1490位和2153位；以及

(2)基于所述预定位点的基因型，预测所述杨树的生长性状，

其中，所述Lnc-CK基因的第221位基因型为CC、Pto-CKX6基因的第1490位基因型为GG和第2153位基因型为AC，是所述杨树的生长性状优的指示；

所述Lnc-CK基因的第221位基因型为CG、Pto-CKX6基因的第1490位基因型为GG和第2153位基因型为AA，是所述杨树的生长性状差的指示；

其中所述Lnc-CK基因为SEQ ID NO:10所示序列，Pto-CKX6基因为SEQ ID NO:11所示序列；

所述生长性状为胸径值，所述杨树为毛白杨。

2.一种杨树选育方法，其特征在于，包括：

(a)提供多个杨树候选株；

(b)根据权利要求1所述的方法，预测所述杨树候选株的生长性状；和

(c)基于步骤(b)的预测结果，选择并培育生长性状优的候选株，

所述生长性状为胸径值，所述杨树为毛白杨。

3.一种用于预测杨树生长性状的设备，包括：

基因型确定单元，所述基因型确定单元用于确定所述杨树下列预定位点的基因型：Lnc-CK基因的第221位、Pto-CKX6基因的第1490位和2153位；以及

计算单元，所述计算单元与所述基因型确定单元相连，用于基于所述预定位点的基因型，预测所述杨树的生长性状，

其中，所述Lnc-CK基因的第221位基因型为CC、Pto-CKX6基因的第1490位基因型为GG和第2153位基因型为AC，是所述杨树的生长性状优的指示，

所述Lnc-CK基因的第221位基因型为CG、Pto-CKX6基因的第1490位基因型为GG和第2153位基因型为AA，是所述杨树的生长性状差的指示，

其中，所述Lnc-CK基因为SEQ ID NO:10所示序列，Pto-CKX6基因为SEQ ID NO:11所示序列；

所述生长性状为胸径值，所述杨树为毛白杨。

4.一种杨树选育系统，其特征在于，包括：

候选株获取设备，所述候选株获取设备用于提供多个杨树候选株；

性状预测设备，所述性状预测设备与所述候选株获取设备相连，所述性状预测设备为权利要求3所述的用于预测杨树生长性状的设备，并且用于预测所述杨树候选株的生长性状；和

培育设备，所述培育设备与所述性状预测设备相连，所述培育设备用于基于所述性状预测设备的预测结果，选择并培育生长性状优的候选株，

所述生长性状为胸径值，所述杨树为毛白杨。

5.预定位点的基因型在预测杨树生长性状中的用途，其特征在于，所述预定位点包括：Lnc-CK基因的第221位、Pto-CKX6基因的第1490位和2153位，其中所述Lnc-CK基因为SEQ IDNO:10所示序列，Pto-CKX6基因为SEQ ID NO:11所示序列；

其中所述Lnc-CK基因的第221位基因型为CC、Pto-CKX6基因的第1490位基因型为GG和第2153位基因型为AC，是所述杨树的生长性状优的指示；

所述Lnc-CK基因的第221位基因型为CG、Pto-CKX6基因的第1490位基因型为GG和第2153位基因型为AA，是所述杨树的生长性状差的指示；

所述生长性状为胸径值，所述杨树为毛白杨。

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