CN108441571B - 玉米分子标记在鉴定和调控玉米粗缩病抗性性状中的应用 - Google Patents

玉米分子标记在鉴定和调控玉米粗缩病抗性性状中的应用 Download PDF

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Abstract

本发明公开了玉米分子标记在鉴定和调控玉米粗缩病抗性性状中的应用。本发明所公开的玉米分子标记,为以玉米的基因组DNA为模板、采用引物对A1进行扩增得到的DNA分子;A1能以玉米基因组为模板扩增得到含有序列5的第7418‑9965位的DNA片段。实验证明,本发明的玉米分子标记与玉米粗缩病抗性性状显著相关,可用于鉴玉米粗缩病抗性性状定;不含有序列5的第7418‑9965位的ZmGDI2基因可显著提高玉米对粗缩病的感病性,含有序列5的第7418‑9965位的ZmGDI1基因可显著提高玉米对粗缩病的抗病性,可利用ZmGDI2基因和ZmGDI1基因调控玉米对粗缩病的抗病性。

Description

玉米分子标记在鉴定和调控玉米粗缩病抗性性状中的应用
技术领域
本发明涉及生物技术领域中,玉米分子标记在鉴定和调控玉米粗缩病抗性性状中的应用。
背景技术
玉米(Zea Mays L.)是我国的第一大粮食作物,在我国能源与粮食安全中占有举足轻重的位置。玉米粗缩病是一种世界性的病毒性病害,严重危害玉米的生产。自1954年在我国的新疆和甘肃地区发现以来,玉米粗缩病在我国各个产区,尤其是黄淮海地区,大面积爆发,引发大面积毁种或绝产,对玉米的生产造成严重威胁。2007年,山东省近5.33万hm2玉米因粗缩病绝产,2008年,山东省又遭受历史罕见的玉米粗缩病,全省发生面积达74万hm2
在世界范围内导致玉米粗缩病的病原病毒是一种球状病毒,属呼肠孤病毒科,斐济病毒属,由10条双链RNA构成,主要由灰飞虱以持久性方式传播。分为四种:玉米粗缩病毒(Maize rough dwarf virus),水稻黑条矮缩病毒(Rice black streaked dwarf virus),里奥夸尔托病毒(Mal de RioCuarto virus)和South rice streaked dwarf virus。在我国,导致玉米粗缩病的的病原主要是水稻灰条矮缩病病毒。玉米粗缩病病毒宿主范围较广,主要是单子叶禾本科植物,如玉米、小麦、水稻等作物,以及狗尾草、马唐等杂草。灰飞虱在田间杂草上越冬并获毒,第二年春天将病毒传播至小麦和玉米上。
玉米粗缩病抗性鉴定的方法目前主要分为田间自然接种鉴定和室内接种鉴定两种。玉米在3-6叶期与带毒灰飞虱相遇最易感病。玉米在玉米感染粗缩病后的典型症状是在叶背出现白色蜡泪状脉突、手感粗糙、叶色深绿、叶片变短;植株显著矮化、茎间缩短;严重时不能抽穗或雌穗极小、变形、雄花少或无花粉。
路银贵等人对从美国引进的78份以及国内选育的69份玉米自交系进行了粗缩病抗性鉴定,发现E13和E115表现高抗,在国内自交系中,X178、P138、901141、9138和沈137的抗性表现较好。杨兴飞等人研究结果表明塘四平头群和P群总体最好,Reid群较差,旅大红骨和Lancaster群抗感病表现相差不大,说明玉米种质(遗传基础)对粗缩病的抗性起重要作用。
目前,粗缩病的防治主要依赖于化学防治和调整播期两种手段:化学防治污染环境并且增加成本;调整播期有很大的局限性,不仅浪费光温资源,又容易遭受后期的自然灾害,降低产量。所以筛选高抗粗缩病的玉米自交系是抗病育种的基础,但是目前市场推广的品种大部分处于高感或者中感水平,抗性较好的品种较少,玉米粗缩病抗性来源比较单一,主要来源于美国杂交种P78599。因此培育和推广种植抗病品种是对玉米粗缩病进行控制的持续有效手段。
发明内容
本发明所要解决的技术问题是如何鉴定玉米的粗缩病抗性及如何调控玉米的粗缩病抗性。
为解决上述技术问题,本发明还提供了玉米分子标记或其多态性在鉴定或辅助鉴定玉米粗缩病抗性性状中的应用。
本发明所提供的玉米分子标记或其多态性在鉴定或辅助鉴定玉米粗缩病抗性性状中的应用中,所述玉米分子标记,为以玉米的基因组DNA为模板、采用引物对A1进行扩增得到的DNA分子或所述DNA分子的任意片段;所述A1能以玉米基因组为模板扩增得到序列5的第7418-9965位所示的DNA片段或其任意片段或含有序列5的第7418-9965位的DNA片段。
上述应用中,所述玉米分子标记可为序列表中序列5的第7036-10712位所示的DNA片段或序列6的第7033-8161位所示的DNA片段。
所述A1可由P1和P2组成;
所述P1为如下a1)至a4)中的任一种单链DNA:
a1)序列表中序列7所示的单链DNA;
a2)在a1)的5′端和/或3′端添加一个或几个核苷酸得到的单链DNA;
a3)与a1)或a2)限定的单链DNA具有85%以上的同一性的单链DNA;
a4)在严格条件下与a1)或a2)限定的单链DNA杂交的单链DNA;
所述P2为如下b1)至b4)中的任一种单链DNA:
b1)序列表中序列8所示的单链DNA;
b2)在b1)的5′端和/或3′端添加一个或几个核苷酸得到的单链DNA;
b3)与b1)或b2)限定的单链DNA具有85%以上的同一性的单链DNA;
b4)在严格条件下与b1)或b2)限定的单链DNA杂交的单链DNA。
a2)所述单链DNA可为在序列7所示的单链DNA的5′端和/或3′端添加一至十个核苷酸得到的单链DNA。b2)所述单链DNA可为在序列8所示的单链DNA的5′端和/或3′端添加一至十个核苷酸得到的单链DNA。
这里使用的术语“同一性”指与天然核酸序列的序列相似性。“同一性”包括与本发明的核苷酸序列具有85%或更高,或90%或更高,或95%或更高同一性的核苷酸序列。同一性可以用肉眼或计算机软件进行评价。使用计算机软件,两个或多个序列之间的同一性可以用百分比(%)表示,其可以用来评价相关序列之间的同一性。
所述严格条件是在2×SSC,0.1%SDS的溶液中,在68℃下杂交并洗膜2次,每次5min,又于0.5×SSC,0.1%SDS的溶液中,在68℃下杂交并洗膜2次,每次15min;或,0.1×SSPE(或0.1×SSC)、0.1%SDS的溶液中,65℃条件下杂交并洗膜。
上述85%以上同一性,可为85%、90%或95%以上的同一性。
上述应用中,所述玉米分子标记可为序列表中序列5所示的DNA分子或序列6所示的DNA分子。
为解决上述技术问题,本发明还提供了鉴定玉米基因型的方法,所述基因型为RR基因型、RS基因型和SS基因型。
本发明所提供的鉴定玉米基因型的方法包括如下Ⅰ或Ⅱ或Ⅲ或Ⅵ:
Ⅰ、检测待测玉米基因组DNA中对应于序列表中序列5所示的DNA片段,如所述待测玉米基因组中两条染色体均为下述g1)的染色体,所述待测玉米为RR基因型;如所述待测玉米基因组中两条染色体均为下述g2)的染色体,所述待测玉米为SS基因型;如所述待测玉米基因组中两条染色体中一条为下述g1)的染色体,另一条为下述g2)的染色体,所述待测玉米为RS基因型;
g1)对应于序列5所示的DNA片段含有序列5的第7418-9965位所示的DNA片段;
g2)对应于序列5所示的DNA片段不含序列5的第7418-9965位所示的DNA片段;
Ⅱ、如下K1)和K2):
K1)以待测玉米基因组DNA为模板,采用所述A1进行PCR扩增得到PCR产物;
K2)检测步骤K1)得到的PCR产物,根据所述PCR产物确定玉米基因型:
所述PCR产物含有B1且不含B2,所述待测玉米的基因型为RR基因型;所述PCR产物含有所述B1和所述B2,所述待测玉米的基因型为RS基因型;所述PCR产物含有所述B2且不含所述B1,所述待测玉米的基因型为SS基因型;
所述B1为一个含有b1的DNA分子,所述B2为一个不含有所述b1的DNA分子;所述b1为序列5的第7418-9965位所示的DNA片段或其任一片段;
Ⅲ、如下L1)和L2):
L1)以待测玉米基因组DNA为模板,采用所述A1进行PCR扩增得到PCR产物;
L2)下述L21)或L22):
L21)检测步骤L1)得到的PCR产物的大小,根据所述PCR产物的大小确定玉米基因型:
所述PCR产物含有1129bp和3677bp的DNA片段的所述待测玉米的基因型为RS基因型;所述PCR产物含有3677bp的DNA片段且不含有1129bp的DNA片段的所述待测玉米的基因型为RR基因型;所述PCR产物不含有3677bp的DNA片段且含有1129bp的DNA片段的所述待测玉米的基因型为SS基因型;
L22)检测步骤L1)得到的PCR产物的序列,根据所述PCR产物确定玉米基因型:
所述PCR产物含有序列5的第7036-10712位和序列6的第7033-8161位所示的DNA片段的所述待测玉米的基因型为RS基因型;所述PCR产物含有序列5的第7036-10712位所示的DNA片段、不含序列6的第7033-8161位所示的DNA片段,所述待测玉米的基因型为RR基因型;所述PCR产物含有序列6的第7033-8161位所示的DNA片段、不含序列5的第7036-10712位所示的DNA片段,所述待测玉米的基因型为SS基因型。
上述方法中,所述检测步骤K1)得到的PCR产物可为检测所述PCR产物的大小或序列,根据所述PCR产物确定玉米基因型为根据所述PCR产物的大小或序列进行确定。
上述方法中,采用所述A1进行PCR扩增的反应体系中所述P1和所述P2的浓度均可为0.4μM。
上述方法中,采用所述A1进行PCR扩增的退火温度可为60℃。采用所述A1进行PCR扩增的退火条件可为60℃15s。采用所述A1进行PCR扩增的变性、退火和延伸条件可为98℃10s,60℃15s,72℃2min。采用所述A1进行PCR扩增的变性、退火和延伸的循环数可为35。
为解决上述技术问题,本发明还提供了鉴定玉米粗缩病抗性性状的方法。
本发明所提供的鉴定玉米粗缩病抗性性状的方法,包括:利用所述鉴定玉米基因型的方法鉴定待测玉米的基因型,根据待测玉米的基因型确定所述待测玉米的粗缩病抗性性状:RR基因型待测玉米的粗缩病抗性高于或候选高于SS基因型待测玉米的粗缩病抗性,RR基因型待测玉米的粗缩病抗性高于或候选高于RS基因型待测玉米的粗缩病抗性。
为解决上述技术问题,本发明还提供了下述H1、H2、H3或H4的产品:
H1、所述玉米分子标记;
H2、所述玉米分子标记编码的蛋白质;
H3、所述蛋白质的编码基因;
H4、所述A1。
上述产品中,所述蛋白质为名称为ZmGDI1或ZmGDI2的蛋白质;所述ZmGDI1可为如下M11)或M12):
M11)氨基酸序列是序列3的蛋白质;
M12)将序列表中序列3所示的氨基酸序列经过一个或几个氨基酸残基的取代和/或缺失和/或添加且具有相同功能的蛋白质;
所述ZmGDI2可为如下M21)或M22):
M21)氨基酸序列是序列4的蛋白质;
M22)将序列表中序列4所示的氨基酸序列经过一个或几个氨基酸残基的取代和/或缺失和/或添加且具有相同功能的蛋白质。
上述M12)中的ZmGDI1蛋白质和上述M22)中的ZmGDI2蛋白质,所述一个或几个氨基酸残基的取代和/或缺失和/或添加均可为不超过10个氨基酸残基的取代和/或缺失和/或添加。
上述M12)中的ZmGDI1蛋白质和上述M22)中的ZmGDI2蛋白质可人工合成,也可先合成其编码基因,再进行生物表达得到。
上述M12)中的ZmGDI1蛋白质的编码基因可通过将序列1的第136-1428位所示的DNA序列中缺失一个或几个氨基酸残基的密码子,和/或进行一个或几个碱基对的错义突变,和/或在其5′端和/或3′端连上标签的编码序列得到。
上述M22)中的ZmGDI2蛋白质的编码基因可通过将序列2的第136-1473位所示的DNA序列中缺失一个或几个氨基酸残基的密码子,和/或进行一个或几个碱基对的错义突变,和/或在其5′端和/或3′端连上标签的编码序列得到。
所述ZmGDI1的编码基因可为如下m11)-m14)中任一种:
m11)核苷酸序列是序列表中序列1的第136-1428位核苷酸的cDNA分子或DNA分子;
m12)核苷酸序列是序列表中序列1的DNA分子cDNA分子或DNA分子;
m13)与m11)或m12)限定的核苷酸序列具有75%或75%以上同一性,且编码所述ZmGDI1的cDNA分子或基因组DNA分子;
m14)在严格条件下与m11)或m12)限定的核苷酸序列杂交,且编码所述ZmGDI1的cDNA分子或基因组DNA分子;
所述ZmGDI2的编码基因可为如下m21)-m24)中任一种:
m21)核苷酸序列是序列表中序列2的第136-1473位核苷酸的cDNA分子或DNA分子;
m22)核苷酸序列是序列表中序列2的DNA分子cDNA分子或DNA分子;
m23)与m21)或m22)限定的核苷酸序列具有75%或75%以上同一性,且编码所述ZmGDI2的cDNA分子或基因组DNA分子;
m24)在严格条件下与m21)或m22)限定的核苷酸序列杂交,且编码所述ZmGDI2的cDNA分子或基因组DNA分子。
其中,所述核酸分子可以是DNA,如cDNA、基因组DNA或重组DNA;所述核酸分子也可以是RNA,如mRNA或hnRNA等。
其中,序列1的第136-1428位所示的DNA分子编码序列3所示的ZmGDI1。序列2的第136-1473位所示的DNA分子编码序列4所示的ZmGDI2。
本领域普通技术人员可以很容易地采用已知的方法,例如定向进化和点突变的方法,对本发明的编码所述ZmGDI1或所述ZmGDI2的核苷酸序列进行突变。那些经过人工修饰的,具有与本发明分离得到的所述ZmGDI1或所述ZmGDI2的核苷酸序列75%或者更高同一性的核苷酸,只要编码所述ZmGDI1或所述ZmGDI2且具有所述ZmGDI1或所述ZmGDI2功能,均是衍生于本发明的核苷酸序列并且等同于本发明的序列。
上述75%以上同一性,可为75%、80%、85%、90%或95%以上的同一性。
为解决上述技术问题,本发明还提供了下述任一应用:
X1、所述玉米分子标记在玉米育种中的应用;
X2、所述鉴定玉米基因型的方法在鉴定玉米粗缩病抗性性状中的应用;
X3、所述鉴定玉米基因型的方法或所述鉴定玉米粗缩病抗性性状的方法在玉米育种中的应用;
X4、序列5所示的DNA分子或所述ZmGDI1或所述ZmGDI1的编码基因在培育粗缩病抗性植物中的应用;
X5、序列5所示的DNA分子或所述ZmGDI1或所述ZmGDI1的编码基因在制备提高植物粗缩病抗性产品中的应用;
X6、序列5所示的DNA分子或所述ZmGDI1或所述ZmGDI1的编码基因在提高植物粗缩病抗性中的应用;
X7、序列5所示的DNA分子或所述ZmGDI1或所述ZmGDI1的编码基因在调控植物粗缩病抗性中的应用;
X8、序列6所示的DNA分子或所述ZmGDI2或所述ZmGDI2的编码基因在培育粗缩病敏感植物中的应用
X9、序列6所示的DNA分子或所述ZmGDI2或所述ZmGDI2的编码基因在制备降低植物粗缩病抗性产品中的应用;
X10、序列6所示的DNA分子或所述ZmGDI2或所述ZmGDI2的编码基因在降低植物粗缩病抗性中的应用;
X11、序列6所示的DNA分子或所述ZmGDI2或所述ZmGDI2的编码基因在调控植物粗缩病抗性中的应用。
为解决上述技术问题,本发明还提供了下述L或M的方法:
L、玉米育种方法,按照所述鉴定玉米基因型的方法鉴定玉米的基因型,选择RR或RS基因型的玉米作为亲本进行育种;
M、培育转基因植物的方法,为下述M1或M2:
M1、培育粗缩病敏感转基因植物的方法,包括M1a或/和M1b:
M1a、增加目的植物中所述ZmGDI2的活性或增加目的植物中所述ZmGDI2的含量或促进所述ZmGDI2的编码基因的表达,得到转基因植物;所述转基因植物粗缩病抗性低于所述目的植物;
M1b、降低目的植物中所述ZmGDI1的活性、降低目的植物中所述ZmGDI1的含量、抑制目的植物中所述ZmGDI1的编码基因的表达或敲除目的植物中所述ZmGDI1的编码基因,得到转基因植物;所述转基因植物粗缩病抗性低于所述目的植物;
M2、培育抗粗缩病转基因植物的方法,包括M2a和/或M2b:
M2a、增加目的植物中所述ZmGDI1的活性或增加目的植物中所述ZmGDI1的含量或促进所述ZmGDI1的编码基因的表达,得到转基因植物;所述转基因植物粗缩病抗性高于所述目的植物;
M2b、降低目的植物中所述ZmGDI2的活性、降低目的植物中所述ZmGDI2的含量、抑制目的植物中所述ZmGDI2的编码基因的表达或敲除目的植物中所述ZmGDI2的编码基因,得到转基因植物;所述转基因植物粗缩病抗性低于所述目的植物。
所述增加目的植物中所述ZmGDI2的含量可通过向所述目的植物中导入所述ZmGDI2的编码基因或所述ZmGDI2基因实现。所述增加目的植物中所述ZmGDI1的含量可通过向所述目的植物中导入所述ZmGDI1的编码基因或所述ZmGDI1基因实现。
本发明中,所述植物可为R1或R2:R1、单子叶植物或双子叶植物;R2、玉米。
所述1129bp和3677bp的DNA片段可通过电泳和/或测序检测。在利用电泳进行检测时,所述1129bp的DNA片段具体可体现为在1000bp与2000bp间有一条带,所述3677bp的DNA片段具体可体现为在3000bp与5000bp间有一条带。
实验证明,利用本发明的玉米分子标记可以鉴定玉米的粗缩病抗性性状:与两条染色体都含有序列5的第7418-9965位的RR基因型(即两条染色体均含有ZmGDI1基因)玉米相比,两条染色体都不含有序列5的第第7418-9965位的SS基因型(即两条染色体均含有ZmGDI2基因)和两条染色体一条含有序列5的第第7418-9965位、一条不含有序列5的第第7418-9965位的RS基因型(即一条染色体含有ZmGDI1基因、一条染色体含有ZmGDI2基因)的粗缩病抗性均显著降低,SS基因型与RS基因型玉米的粗缩病抗性无显著差异,表明,本发明的玉米分子标记与玉米粗缩病抗性性状显著相关,可用于鉴玉米粗缩病抗性性状定。
将ZmGDI2的编码基因导入粗缩病感病玉米中后与抗病玉米杂交并将其子代与该抗病玉米回交得到的RR基因型的含有ZmGDI2的编码基因的玉米粗缩病抗性显著下降,说明,来源于粗缩病感病玉米的ZmGDI2基因可显著提高玉米对粗缩病的感病性,来源于粗缩病抗病玉米的ZmGDI1基因可显著提高玉米对粗缩病的抗病性。表明,可利用ZmGDI2基因和ZmGDI1基因调控玉米对粗缩病的抗病性。
附图说明
图1为不同基因型玉米的病情指数。
图2为感病自交系HuangC(SS)和抗病自交系X178(RR)组配的近等基因系后代中玉米分子标记与玉米粗缩病抗性性状的相关性分析。图中小写字母为差异显著性分析结果,相同字母间差异不显著,不同字母间差异显著。
图3为pBCXUN-ZmGDI2示意图。
图4为阳性BC2T2F1代材料的粗缩病抗性检测结果。
图5为阳性BC2T2F1代材料的ZmGDI2编码基因表达量的检测结果。
图6为成套引物1鉴定玉米基因型的结果。其中,1:
Figure BDA0001224931070000061
Plus DNA Marker(北京全式金生物技术有限公司);2:阴性对照(B73基因组DNA);3:阳性对照(X178基因组DNA);4-8:转基因植株,其中4-7是RR基因型的结果,8是RS类型RR基因型的结果。
具体实施方式
下面结合具体实施方式对本发明进行进一步的详细描述,给出的实施例仅为了阐明本发明,而不是为了限制本发明的范围。下述实施例中的实验方法,如无特殊说明,均为常规方法。下述实施例中所用的材料、试剂、仪器等,如无特殊说明,均可从商业途径得到。以下实施例中的定量试验,均设置三次重复实验,结果取平均值。
下述实施例中的pBCXUN载体是将pCXUN(Chen et al.;A Versatile ZeroBackground T-Vector System for Gene Cloning and Functional Genomics 2009,Plant Physol.150,1111-1121)载体的植物抗性基因HYG基因替换为PPT(BASTA)基因得到的载体。
其中,pCXUN载体中HYG基因的序列为:
tatttctttgccctcggacgagtgctggggcgtcggtttccactatcggcgagtacttctacacagccatcggtccagacggccgcgcttctgcgggcgatttgtgtacgcccgacagtcccggctccggatcggacgattgcgtcgcatcgaccctgcgcccaagctgcatcatcgaaattgccgtcaaccaagctctgatagagttggtcaagaccaatgcggagcatatacgcccggagtcgtggcgatcctgcaagctccggatgcctccgctcgaagtagcgcgtctgctgctccatacaagccaaccacggcct ccagaagaagatgttggcgacctcgtattgggaatccccgaacatcgcctcgctccagtcaatgaccgctgttatgcggccattgtccgtcaggacattgttggagccgaaatccgcgtgcacgaggtgccggacttcggggcagtcctcggcccaaagcatcagctcatcgagagcctgcgcgacggacgcactgacggtgtcgtccatcacagtttgccagtgatacacatggggatcagcaatcgcgcatatgaaatcacgccatgtagtgtattgaccgattccttgcggtccgaatgggccgaacccgctcgtctggctaagatcggccgcagcgatcgcatccatagcctccgcgaccggttgtagaacagcgggcagttcggtttcaggcaggtcttgcaacgtgacaccctgtgcacggcgggagatgcaataggtcaggctctcgctaaactccccaatgtcaagcacttccggaatcgggagcgcggccgatgcaaagtgccgataaacataacgatctttgtagaaaccatcggcgcagctatttacccgcaggacatatccacgccctcctacatcgaagctgaaagcacgagattcttcgccctccgagagctgcatcaggtcggagacgctgtcgaacttttcgatcagaaacttctcgacagacgtcgcggtgagttcaggctttttcat。
pBCXUN载体中PPT(BASTA)基因的序列为:
tcagatctcggtgacgggcaggaccggacggggcggaaccggcaggctgaagtccagctgccagaaacccacgtcatgccagttcccgtgcttgaagccggccgcccgcagcatgccgcggggggcatatccgagcgcctcgtgcatgcgcacgctcgggtcgttgggcagcccgatgacagcgaccacgctcttgaagccctgtgcctccagggacttcagcaggtgggtgtagagcgtggagcccagtcccgtccgctggtggcggggggagacgtacacggtagactcggccgtccagtcgtaggcgttgcgtgccttccaggggccagcgtaggcgatgccggcgacctcgccgtccacctcggcgacgagccagggatagcgctcccgcagacggacgaggtcgtccgtccactcctgcggttcctgcggctcggtacggaagttgaccgtgcttgtctcgatgtagtggttgacgatggtgcagaccgccggcatgtccgcctcggtggcacggcggatgtcggccgggcgtcgttctgggctcatagatccggtgcagattatttggattgagagtgaatatgagactctaattggataccgagg。
实施例1、玉米分子标记在鉴定玉米粗缩病抗性性状中的应用
本实施例提供的玉米分子标记为以引物对A1进行扩增得到的DNA分子;A1为由序列表中序列7和序列8所示的两条单链DNA(名称分别为P1和P2)组成的引物对。A1能以玉米基因组为模板扩增得到序列5的第7036-10712位所示的DNA片段或序列6的第7033-8161位所示的DNA片段。与序列5的第7036-10712位所示的DNA片段相比,序列6的第7033-8161位所示的DNA片段中缺少序列5的第7418-9965位。
1、现有自交系中玉米分子标记与玉米粗缩病抗性性状的相关性分析
1.1、待测玉米
检测对象为619份不同来源的玉米自交系(表1)。
1.2、基因型的鉴定
取幼苗期的玉米叶片提取基因组DNA,利用北京擎科新业生物技术有限公司的I-52X High-Fidelity Master Mix(货号:TP001)和引物对A1进行PCR扩增。
PCR反应体系:
Figure BDA0001224931070000071
PCR反应程序:
Figure BDA0001224931070000072
Figure BDA0001224931070000081
对得到的PCR产物进行电泳与测序,将PCR产物中含有序列5的第7036-10712位所示的DNA片段且不含有序列6的第7033-8161位所示的DNA片段的玉米定义为RR基因型;将PCR产物中含有序列6的第7033-8161位所示的DNA片段且不含有序列5的第7036-10712位所示的DNA片段的玉米定义为SS基因型;将PCR产物中含有序列5的第7036-10712位所示的DNA片段和序列6的第7033-8161位所示的DNA片段的玉米定义为RS基因型。各玉米的基因型如表1所示。在进行电泳时,利用北京全式金生物技术有限公司的Trans2K Plus DNA Marker(货号BM111-01)作为DNA分子量标准,序列5的第7036-10712位所示的DNA片段显示为在3000bp与5000bp间有一条带,序列6的第7033-8161位所示的DNA片段显示为在1000bp与2000bp间有一条带。
表1、各玉米自交系的基因型
Figure BDA0001224931070000082
Figure BDA0001224931070000091
Figure BDA0001224931070000101
1.3、抗性的鉴定
按照如下方法检测各玉米自交系的粗缩病抗性:
共对表1中183个玉米自交系进行了抗病性检测。其中,NT411,HuangC,X178记载在文献(Tao et al.,Identification and fine-mapping of a QTL,qMrdd1,that confersrecessive resistance to maize rough dwarf disease,BMC Plant Biology 2013,13:145)中,F7和FAP1360A记载在文献(Tao et al.,Combined linkage and associationmapping reveals candidates for Scmv1,a major locus involved in resistance tosugarcane mosaic virus(SCMV)in maize BMC Plant Biology 2013,13:162),177,268,501,1323,3411,5237,7381,9782,4F1,835a,A619,B11,B110,By4839,By4944,By813,By843,BZN,CIMBL102,CIMBL110,CIMBL111,CIMBL114,CIMBL117,CIMBL123,CIMBL124,CIMBL144,CIMBL148,CIMBL149,CIMBL16,CIMBL29,CIMBL31,CIMBL39,CIM BL5,CIMBL58,CIMBL65,CIMBL82,CIMBL88,CIMBL91,CIMBL93,CML113,CML148,CML162,CML165,CML166,CML170,CML20,CML228,CML286,CML304,CML305,CML31,CML428,CML471,CML493,CML50,CML51,D863F,Dan3130,Dan360,Dan599,DE.EX,DH29,FCD0602,GEMS11,GEMS12,GEMS13,GEMS14,GEMS15,GEMS16,GEMS17,GEMS18,GEMS20,GEMS21,GEMS23,GEMS28,GEMS41,GEMS47,GEMS48,G EMS50,GEMS51,GEMS52,GEMS55,GEMS57,GEMS59,GEMS6,GEMS62,GEMS65,GEMS9,GY1032,Gy386,IRF291,IRF314,J4112,JH59,Ji846,Liao138,Liao5114,LK11,P138,Qi319,Ry684,Ry729,Shen137,SW92E114,Sy1128,U8112,XZ698,Ye478,Yu374,ZaC546,ZH68,Zheng29,Zheng30,Zhi41,Zh ong69,ZZ01,ZZ03记载在文献(Yang et al.,Characterization of a global germplasm collection and its potentialutilization for analysis of complex quantitative traits in maize,Mol Breeding(2011)28:511–526)中,W22记载在文献(Hsiao-Yi Hunga et al.,ZmCCT and the geneticbasis of day-length adaptation underlying the postdomestication spread ofmaize,PNAS,Published online June 18,2012,E1913–E1921)中,BM,Tie7922,旱21记载在文献(刘志斋等,基于40个核心SSR标记揭示的820份中国玉米重要自交系的遗传多样性与群体结构,中国农业科学2012,45(11):2107-2138)中,邢抗36记载在文献(田志刚等,邢抗系列抗虫玉米品种(系)的特性鉴定及分析,河北农业科学,2004年12月,第8卷第4期)中,835,多黄29,海9-21,黄早4,金黄96B,品1p6co,齐318,中黄68记载在文献(史利玉等,玉米抗粗缩病毒SCAR分子标记的开发,中国农业科学,2011,44(9):1763—177)中,698-3,ca339,CL1165记载在文献(李新海,玉米抗粗缩病全基因组关联与连锁分析,中国农业科学院博士学位论文,2013年6月)中,旱23,黄野4记载在文献(路银贵等,国内及国外玉米自交系抗粗缩病性鉴定及分析,河北农业科学,2001,5(4):22-25.),青农105,中江玉703记载在文献(蒋飞.玉米抗粗缩病材料的鉴定与筛选,山东农业大学,2011)中。
抗病性检测利用的是人工培养的携带RBSDV的带毒灰飞虱,该带毒灰飞虱为河北省农科院植保所产品。将两叶一心期的玉米幼苗用防虫网罩住,将四龄的带毒灰飞虱接种于防虫网内,按7头/株的量接种。接种后四天除去防虫网,将玉米幼苗移栽到温室中。在成熟期观察玉米表型,按发病级别分为0,0.25,0.5,0.75和1共5个等级,统计粗缩病病级并计算病情指数。每个玉米自交系接种30株。每个玉米自交系均利用未接种带毒灰飞虱的同种玉米作为对照。粗缩病分级标准如表3,病情指数如表2所示。
表2、玉米基因型与粗缩病抗性
Figure BDA0001224931070000111
Figure BDA0001224931070000121
Figure BDA0001224931070000131
Figure BDA0001224931070000141
Figure BDA0001224931070000151
注:NA表示没有表型,原因是没有出苗。
表3、粗缩病分级标准
分级 节间缩短 株高 蜡突 雌穗 雄穗
0 正常 正常 没有 正常 正常
0.25 轻微 4/5 没有 正常 正常
0.5 明显 2/3 正常 正常
0.75 严重1 1/2 畸形 畸形
1 严重2 <1/2 没有 没有
表3中,“节间缩短”列中,“正常”是指与未接种带毒灰飞虱的同种玉米自交系的正常节间,“轻微”是指为“正常”节间的1~4/5(不包括1,包括4/5)的节间,“明显”是指为“正常”节间的4/5~2/3(不包括4/5,包括2/3)的节间,“严重1”是指为“正常”节间的2/3~1/2(不包括2/3,包括1/2)的节间,“严重2”是指小于等于“正常”节间的1/2的节间。
“株高”列中,“正常”是指与未接种带毒灰飞虱的同种玉米自交系的正常株高,“4/5”是指为“正常”株高的1~4/5(不包括1,包括4/5)的株高,“2/3”是指为“正常”株高的4/5~2/3(不包括4/5,包括2/3)的株高,“1/2”是指为“正常”株高的4/5~2/3(不包括4/5,包括2/3)的株高,“<1/2”是指小于等于“正常”株高的1/2的株高。
“雌穗”列中,“正常”是指与未接种带毒灰飞虱的同种玉米自交系表型相同,有相似大小的果穗和花丝。
“雄穗”列中,“正常”是指与未接种带毒灰飞虱的同种玉米自交系表型相同,能正常大量散粉。
病情指数计算:
病情指数(DSI)=∑(个体分级×各个分级的个体数)×100/(1×总株数)
计算具有病情指数的相同基因型玉米的平均病情指数,结果如表4和图1所示。
表4、各基因型的病情指数
年份、地点 RR基因型 SS基因型
2013年济宁 26.437±4.827 53.377±2.467
2014年济宁 6.760±1.219 10.267±0.795
2014年泰安 5.691±1.169 15.373±1.077
2015年开封 79.833±4.514 95.513±0.895
结果显示,RR基因型玉米的病情指数均显著低于SS基因型玉米,表明,本发明的玉米分子标记与玉米粗缩病抗性性状显著相关,可用于鉴玉米粗缩病抗性性状定。
2、感病自交系HuangC和抗病自交系X178组配的近等基因系后代中玉米分子标记与玉米粗缩病抗性性状的相关性分析
2.1感病自交系HuangC(SS)和抗病自交系X178(RR)组配的近等基因系后代
将感病自交系HuangC(SS基因型)和抗病自交系X178(RR基因型)杂交,得到F1,F1自交得到F2,之后利用单粒传法自交至F8,保证背景基本纯合后。利用实施例1中的引物对A1对F8的基因组DNA进行鉴定,筛选RS基因型植株。将RS基因型的单株进行自交,得到的后代可以分离出RR、SS和RS三种基因型,即HuangC和X178的近等基因系后代。
按照步骤1中的方法鉴定HuangC和X178的近等基因系后代的基因型,然后于2013年、2014年、2016年进行不同基因型的粗缩病抗性检测,抗病性检测利用的是人工培养的携带RBSDV的带毒灰飞虱,该带毒灰飞虱为河北省农科院植保所产品。将两叶一心期的玉米幼苗用防虫网罩住,将四龄的带毒灰飞虱接种于防虫网内,按7头/株的量接种。接种后四天除去防虫网,将玉米幼苗移栽到温室中。在成熟期观察玉米表型,按发病级别分为0,0.25,0.5,0.75和1共5个等级,统计粗缩病病级(表3)并计算病情指数。每种近等基因系均利用未接种带毒灰飞虱的同种玉米作为对照。
计算具有病情指数的相同基因型玉米的平均病情指数,结果如表5和图2所示。
表5、各基因型的病情指数
年份、地点 RR基因型 SS基因型 RS基因型
2013年 36.111±9.311 72.500±8.949 60.795±5.995
2014年 1.923±1.081 9.167±4.401 11.250±3.435
2016年 56.457±2.882 78.448±2.742 74.508±2.167
结果显示,RR基因型玉米的病情指数均显著低于SS基因型和RS基因型的玉米,SS基因型和RS基因型的玉米的病情指数没有显著差异。表明,本发明的玉米分子标记与玉米粗缩病抗性性状显著相关,可用于鉴玉米粗缩病抗性性状定。
实施例2、玉米分子标记在调控玉米粗缩病抗性性状中的应用
将来源于抗病玉米自交系X178的含有序列5的第7036-10712位所示的DNA片段的完整基因的基因组DNA命名为ZmGDI1基因,将ZmGDI1基因编码的蛋白质命名为ZmGDI1,将ZmGDI1基因中的CDS序列命名为ZmGDI1编码基因,ZmGDI1基因的序列为序列表中序列5,ZmGDI1的序列为序列表中序列3,ZmGDI1编码基因的序列为序列表中序列1的第136-1428位。从实施例1的结果可知,ZmGDI1基因为隐性粗缩病抗病基因。
将来源于感玉米粗缩病的玉米自交系B73的含有序列6的第7033-8161位所示的DNA片段的完整基因的基因组DNA命名为ZmGDI2基因,将ZmGDI2基因编码的蛋白质命名为ZmGDI2,将ZmGDI2基因中的CDS序列命名为ZmGDI2编码基因,ZmGDI2基因的序列为序列表中序列6,ZmGDI2的序列为序列表中序列4,ZmGDI2编码基因的序列为序列表中序列2的第136-1473位。从实施例1的结果可知,ZmGDI2基因为显性粗缩病感病基因。
对实施例中的部分抗病自交系进行检测,发现X178、7381、NT411、Shen137均含有序列5所示的ZmGDI1基因不含有序列6所示的ZmGDI2基因;对实施例中的部分感病自交系进行检测,发现HuangC、F7、FAP1360A、Zheng29均含有序列6所示的ZmGDI2基因不含有序列5所示的ZmGDI1基因。
1、转基因材料的制备
利用限制性内切酶XcmI在pBCXUN载体的XcmI的识别序列中插入序列2的第136-1473位所示的ZmGDI2编码基因,得到重组载体,将该重组载体命名为pBCXUN-ZmGDI2。
pBCXUN-ZmGDI2示意图如图2所示。pBCXUN-ZmGDI2能表达序列4所示的ZmGDI2蛋白质。
将pBCXUN-ZmGDI2导入农杆菌EH105中,得到重组菌,将该重组菌命名为EH105-pBCXUN-ZmGDI2;将pBCXUN载体导入农杆菌EH105中,得到重组菌,作为对照菌株。
利用农杆菌介导法将EH105-pBCXUN-ZmGDI2转化感玉米粗缩病的玉米材料B73(Yang X,Gao S,Xu S,et al.Characterization of a global germplasm collectionand its potential utilization for analysis of complex quantitative traits inmaize[J].Molecular Breeding,2011,28(4):511-526.)幼胚,利用除草剂抗性对转化阳性愈伤进行筛选,最后得到T0代-T2代转基因阳性植株。同时利用对照菌株设置转空载体对照。
将T2代转基因阳性植株与抗病自交系X178(刘志斋,吴迅,刘海利,等.基于40个核心SSR标记揭示的820份中国玉米重要自交系的遗传多样性与群体结构[J].中国农业科学,2012,45(11):2107-2138.)进行杂交,其子代为T2F1代。将利用成套引物1鉴定的RR基因型且BAR基因引物鉴定阳性的T2F1代的材料继续与X178回交,产生BC1T2F1代材料;利用成套引物1和BAR基因引物进行筛选,将RR基因型的BAR基因引物鉴定阳性的BC1T2F1代材料继续与X178回交,得到的BC2T2F1材料;利用成套引物1和BAR基因引物进行筛选,得到RR基因型的BAR基因引物鉴定阳性的BC2T2F1代材料,该材料含有ZmGDI1基因不含有ZmGDI2基因。
成套引物1用于检测玉米材料是否带有ZmGDI1基因和ZmGDI2基因,成套引物1由引物GDI-F(CCTGCTACAATACCTCTGTTGA)、引物GDI-R1(GTTCGGACTGTGGATTATCG)和引物GDI-R2(GTACCTGGACATCGTCGAAG)组成,2X Taq Mix为北京艾德莱生物科技有限公司产品。在利用成套引物1在按照如下反应体系和反应条件进行PCR扩增鉴定待测玉米材料时,如PCR扩增产物含有630bp的条带不含有413bp的条带,待测玉米为RR基因型,如PCR扩增产物含有413bp的条带不含有630bp的条带,待测玉米为SS基因型,如PCR扩增产物含有413bp的条带和630bp的条带,待测玉米为RS基因型(图6)。
PCR反应体系:
Figure BDA0001224931070000171
PCR反应条件:
Figure BDA0001224931070000172
Figure BDA0001224931070000181
利用BAR基因引物鉴定时,以ddH2O为空白对照,玉米材料B73基因组DNA为阴性对照,重组载体pBCXUN-ZmGDI2为阳性对照,得到351bp的材料为BAR基因引物鉴定阳性玉米。BAR基因引物序列为:BAR-F:5’-GGTGGACGGCGAGGTCGCCG-3’;BAR-R:5’-TCGGTGACGGGCAGGACCGG-3’。
2、粗缩病抗性检测
对以上RR基因型的BAR基因引物鉴定阳性的BC2T2F1代材料进行粗缩病抗性检测,以同代阴性植株(即BC2T2F1代中BAR基因引物未扩增出目的条带的RR基因型材料)作为阴性对照。抗病性检测利用的是人工培养的携带RBSDV的带毒灰飞虱,该带毒灰飞虱为河北省农科院植保所产品。将两叶一心期的玉米幼苗用防虫网罩住,将四龄的带毒灰飞虱接种于防虫网内,按7头/株的量接种。接种后四天除去防虫网,将玉米幼苗移栽到温室中。在成熟期观察玉米表型,按发病级别分为0,0.25,0.5,0.75和1共5个等级,统计粗缩病病级(表3)并计算病情指数。每个转基因事件接种60株,共接种两个转基因事件的玉米材料(OE-1和OE-2)。一个转基因事件是指得到一个T0代转基因阳性植株的外源基因的插入,每个T0代转基因及其后代属于同一个转基因事件。
利用引物TS-R/TS-F(序列见表6)对RR基因型的BAR基因引物鉴定阳性的BC2T2F1代材料OE-1和OE-2的cDNA进行扩增,测序后发现阳性的BC2T2F1代材料OE-1和OE-2均可扩增出序列2的第383-1110位所示的ZmGDI2编码基因片段,而同代阴性对照则不能扩增出该DNA片段。
抗病性状检测结果如图3所示,可以看出,阳性BC2T2F1代材料OE-1和OE-2的病情指数均显著高于其同世代中不带有转ZmGDI2基因插入片段的同胞植株。这些结果表明ZmGDI2编码基因、ZmGDI2基因及ZmGDI2可以降低抗粗缩病玉米的粗缩病抗性,而ZmGDI1编码基因、ZmGDI1基因及ZmGDI1可以提高抗粗缩病玉米的粗缩病抗性,并且ZmGDI2基因为显性粗缩病感病基因,ZmGDI1基因为隐性粗缩病抗病基因。
3、ZmGDI2编码基因表达量的检测
分别提取阳性BC2T2F1代材料OE-1和OE-2的总RNA,反转录得到cDNA作为模板,用下表6的引物TS-F和TS-R进行RT-PCR扩增,以ZmGAPDH为内参,GAPDH2LP和GAPDH2RP为内参引物。以同世代中不带有转ZmGDI2基因插入片段的同胞植株作为阴性对照(CK),利用感病玉米HuangC作为阳性对照。
表6、RT-PCR所用引物与内参
Figure BDA0001224931070000182
结果如图4所示:与阴性对照相比,在阳性BC2T2F1代材料中ZmGDI2编码基因的表达量明显提高。图4中,L1与L2分别表示阳性BC2T2F1代材料OE-1和OE-2。
上述实验结果表明,来源于粗缩病感病玉米的ZmGDI2基因可显著提高玉米对粗缩病的感病性,来源于粗缩病抗病玉米的ZmGDI1基因可显著提高玉米对粗缩病的抗病性。
<110> 中国农业大学
<120> 玉米分子标记在鉴定和调控玉米粗缩病抗性性状中的应用
<160> 8
<170> PatentIn version 3.5
<210> 1
<211> 1687
<212> DNA
<213> 玉米
<400> 1
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atgcacgggt atgttttctg ttgctcatat acacataatg ttgcgccaaa agggaagttc 1140
attgcatttg tgtctgcgga agctgagacc gataatccac agtccgaact aaagcctgga 1200
attgatctac ttggtcaagt agatgaactg ttttttgata tgtatgacag atacaaacct 1260
gtcaatgaac catctcttga taattgcttt gtttcaatga gttatgatgc tactacacac 1320
tttgagacaa ctgtgacaga tgttctcagt atgtacacag caattactgg aaagaccgtt 1380
gatctcagtg tggacctgag cgctgccagc gcagctgaag aatactagag attttcctat 1440
tagagatacc atactctaaa gaagaacggt gttaacacag gccctgcctg gtggcttgcc 1500
aggtttagat ctatgctgca gctgcagcca attaaacgga cagaacatat caccctatag 1560
catttacatg gcgtttaaac acaagaccgt ttaggatgat ggtggtggtt cctttgttcc 1620
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115 120 125
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Leu Ser Ala Val Tyr Gly Gly Thr Tyr Met Leu Asn Lys Pro Glu Cys
245 250 255
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<213> 玉米
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atatatatat atatatatat atatatatat atatatatat atatatatat atatatatat 4440
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cggcagatcg gtaaaattgc tgtaatcgtc caattgtcaa taggcacatt tgttccaaat 8700
gagcttacta gctgaatttt acctgctatg tctgtttcgt gatgcttcta ctcgagactc 8760
tgtaactaca tgagcgttca ataattttcc acgatatggc gaagtgattt tattagagcg 8820
tgcaaataac ggtttacacg aacgaacgac gtccgcacga aacatcacgt aaataacgtg 8880
cggaccagac gcactcggta aaatatttgg cacgagacaa agatccaaat ttcggttgtg 8940
aatcaaatat ttgtaattgg aaaattagcg ccataaaaat agcctcgttt aaaatctgcc 9000
ttctaaaaaa taaaaatacg aactcaggac ctcgaatgat gttactcaga tcatcgcaac 9060
tcagactgct tgcatgtttt tttcacacgt cgcatggttt acaaattgaa acttcatctt 9120
tcttatagaa aacactccta atgcatgcac ggtctcgccc aaggaaacct catagtcatg 9180
actcgcccaa ggaaacctca tagtcacgac tctctcgatg ccaacctcgg gcgggagacg 9240
caatcacgct ttggccaaag ccatccttgg gtgagagaat gcattcacgc ctcgcccgag 9300
gccgccctca agcgggagaa cgcattcatg gctcgctcga ggccaccctc gggcgggaga 9360
catagtcacg actcacttga ggccatcccc aggcaggaga cgcagccatg gcttgcctga 9420
gaccatcctc gggcaggaga cgctgtcacg tctcgctcgt ggccgacctt tggcgggaga 9480
catagtcata gctcgcccga ggcaaccctc ggacgggaga cgcaatcacg cctcgccaga 9540
ggccaacctc gggcgggaga cgcaatcacg ccttgtccga ggccacactt gggcgagaga 9600
cgtagtcaca ctcgcccgag gccatcctcg cgcgggaaac gcagtcgcga cacgtttgag 9660
gccaccctcg ggcgggagac gcactcacgc tcgcccgagg ccaaccttgg gcgggagatg 9720
cagtcacggc tcgttcgtga cctccctcgg gtgggagacg caagttctta tgactgatat 9780
ttataaatgg cacttctttg caaacttaat gactgatatt ttgcagattc ttatgccgtg 9840
ggaattcagt agtttaaatg aggtaaccag tctaccacgc cgcttcaaga acatagatat 9900
gcacgggtaa taaactttta acgaatagtt tgtgttccgt tgcaacgcac gggcaccata 9960
ctagtatttc aaatagtttt catttgatga gtgccttaat tcagtttgta ctgcttggtt 10020
gtgtgtttgt aacatgtatt cttaaaatgt ttcttaggta tgttttctgt tgctcatata 10080
cacataatgt tgcgccaaaa gggaagttca ttgcatttgt gtctgcggaa gctgagaccg 10140
ataatccaca gtccgaacta aagcctggaa ttgatctact tggtcaagta gatgaactgt 10200
tttttgatat gtatgacaga tacaaacctg tcaatgaacc atctcttgat aattgctttg 10260
tttcaatggt aagtttagga ttatgtaata acaaagtgat tacaagtccc agatatctta 10320
gatgtttatg gaagttatct tctttgcaga gttatgatgc tactacacac tttgagacaa 10380
ctgtgacaga tgttctcagt atgtacacag caattactgg aaaggtaagg ttcatgtccc 10440
ttttttttgt ggtcatcaaa gcagatgtat caaatactaa tatctacaat gctgtattgg 10500
gcctagaaca ataacaacaa gcaagttgga taggctagag ttcaattcaa atccaacatg 10560
aaccacaagt taaagttaag gcatatggat agctgttttt catgcattcc tattcatggc 10620
taaatctttg ggtatatact atcttttcaa gtctcctaaa taaggggctg tcgacccatc 10680
tcttccccat tcaacactgt acctggttcc gatatgacac atccattaga gggttacgct 10740
ctaacggact actttgggtt tcatccttat tagaatggtt aggtttaaca tcggattggg 10800
acttgttatg ttgagaaaac ataggtggat ttcaatactg tattgggcct gagagatcaa 10860
aacctactac tctactagtg aaatttgcta gctttacagg gcatggtcaa ttgtttgtta 10920
accttctgtc agcaatagat gatttgcctc aaacaaaatt agtcccttac tagacatctc 10980
tctttattat tgatactctg atgacattac tattttatgt ttactgaccc aaagatggat 11040
cgcacatctt taaatctctc catgtctgtg tcgcagaccg ttgatctcag tgtggacctg 11100
agcgctgcca gcgcagctga agaatactag agattttcct attagagata ccatactcta 11160
aagaagaacg gtgttaacac aggccctgcc tggtggcttg ccaggtttag atctatgctg 11220
cagctgcagc caattaaacg gacagaacat atcaccctat agcatttaca tggcgtttaa 11280
acacaagacc gtttaggatg atggtggtgg ttcctttgtt ccttgcatta ttgatcggat 11340
ggttaacttt taactgtgct 11360
<210> 6
<211> 8809
<212> DNA
<213> 玉米
<400> 6
ctactaccct cccacctgcg agactgcaac gccgttgctt caactcgact ccagcatccc 60
tcgtccccgc atcaccgcgc cgccgacact ccgctcgctt tcgctcccga gacccgggcc 120
tgccgagccg ccgccatgga cgaggagtac gacgtgatcg ttctgggcac ggggctcaag 180
gagtgcatcc tcagcggtct cctctctgtc gacggcctca aggtgagcac cgaccacccg 240
cctcccggta acggcaatcg gacctcaccc cagtccccga gtccgatctg ccactctccc 300
ccgcacgtac ccggacgccg catgtggcct gcgcggtggg tctgccgcgg tgcgtcgtgg 360
tagtagatca ggcggtgctg gtccggcccc tgtctgatcc gggactggcg cgttcggatg 420
ggcgcttgtc taagctgtct acgcatctgg ctcctggcat tggtccgggg agttaaccag 480
ttgatgcaaa ccatcgtctg caaatgttgc cacaacttct tgcattctgt ggactgggaa 540
gatcagggca tggttagatt ctttaatgag gcaaactagt aacctggatt ctagggagat 600
tcactgcttc gaattttggt ctatcgtttg ttctttgttt ctgggatgta gaagtgttcc 660
catcctgtaa gacgatagat ggcatctata ttctgtcctc tgatatcact gcggcgagac 720
aggggtaact gaacggagag agaaagatgc ttaagttcaa tagtcagctt actgcgttaa 780
cttgaccgat gatggatttt ttaaattgat tttgaagaat tttgagtgac gcttttacag 840
gttctacaca tggatagaaa tgattactac ggaggagatt ccacctccct aaacctgaac 900
caggcaagaa gctataaatc tatgattttg gttctttttg aaactggaac atgtactgag 960
taatgtgttc cattttttgt gtgtgctggc aactcattct aatcccttta atcaccctta 1020
tctttttttt tggtgaacag ctctggaaga ggtttagggg ggaagacaag ccaccggcac 1080
atctaggtgc aagcagagat tacaatgtag acatggttcc aaaggtgtga taattcccga 1140
tcccaatgga ccgtacctag ctatgtgctt attgtttctt gccaaggcct catcatactt 1200
ggcaaatata ttgactaaaa acatatattt ccttatgctt gcacactcat tagttcctta 1260
cttgtcttat atatttgtta cactaccaga tacatcttcg gactggttag tctcatccag 1320
atagcattta caatcaatat actagctcag tgcccgtgcg ttgcaacggg atcatataat 1380
agctcgataa cttatatata caaatgtgtg ttatattgtt atgagattga ggacgacatc 1440
cacgagccgt ccaggatgac gttgaagaga aactcgggcc tgtgacgcac gaacactcac 1500
ctagtagtgt attatacaag atttaacaag acaatttaaa ggcaaaaatt caagaatgat 1560
ctttcataaa ctactgtaaa ttcatgacta aaagctcact gtaattgact tgcttgaaga 1620
acacaataat actactgtga atatgtgata caacttaatc acagtagtaa aattacatct 1680
gatgttgtat ttggtaaaaa aatatttttt cagagttcag agccaacaac taaactcagg 1740
tgttacaagg tacaacgaac cttactattc agattattat taatataaaa actcaagaca 1800
ggtgtaatcc tcaaacaatc ataagcaatg tgtataggaa ttttagacat aatggtgcct 1860
acaacatgct ttagtattca gattattaac acaaactcat gacataatga ccaaaaaata 1920
ttaacacaca aacatggata taatgttgtt taggaatttc agacatatat agaggtcaaa 1980
tagaggaatt ttagacaatg aacaactatc atcatcaata ggctagagtt caaattctta 2040
atatatgaac ttgacatata atagtgcctc tagcagtgtc gccttagttt aaaagcagta 2100
atatggcata aagaggagag gagagcagag aagagaggaa ataaacaaat atctattgct 2160
ttccatataa actcataaag ttatatatat tccaatccca tggagagatg aggggaggag 2220
agctacaaaa accaatcctg ttctgtttct cctttcaggc ctaaccctat gcagcagcat 2280
attcatctaa gaaaccaaca acctgtaaca tatcccttat tatcctaccc attacaaact 2340
tgtcattaaa attaaattca gtactaacta atattatctc gatcaatctt caaggacatc 2400
aagctcgatt ttgctatgct acagagaatg gtgcatgtgg acccttcttc cttatatgca 2460
tcaggtggtc taaagttggc tttaaccttt agcccacctt ttcattagag atttggacat 2520
caaaagaaag ctaaaacatt ctaaaccttt tagatctcta agtttagaag agggaggcaa 2580
acatgcccta gaatattgga gatcgcagtt gctgctatca ccaagtaaca cactaagata 2640
tcgaagacca caactgctgc tatcaccgtg cttttacttc taccttaaca actaagatct 2700
caatccatct taatttgtcc aaccgaactc tgaatgaaaa aaaggaatcg catttcagga 2760
atgattgacg agttagcaca atgcaggttt agaacctttg gttatttcta aaataaagac 2820
tcgcatgtat ggctataaca atttatactt ttaaaaatgg atacttattg agacctgata 2880
accacattta gctagcttag caggagggag catgctaact cataatgcct tgtaattact 2940
gaatactgat gaaccagcgg agccatacct cattaacatc ctcaagcagc tctgacaaac 3000
aaattagggg acatgacaaa taaattaggg gacactacct ctgcgtatct gcacaagggc 3060
ccaagagagg tggggcccgg ccataggaac ggagctctca gctcccacac cgtgcaccag 3120
tgaatgcgag cagctggtct ggccttccag taatccgatc tgcatacagt gtgatccagg 3180
attcacgtgg ataaggatga aatcaagaga gcgctagcta ggatcacacg ccaatagcac 3240
aaggaaggaa ggaatgagcg aacgaacctt gaggaaaaca tcgccgacgg gcttctttgt 3300
gtggctctct gtcgttggtc gcaacccccg ccactgccct cactcgtcgc acatcgcgtt 3360
gtggtcacgg tcggggctgc ccttccgtcc ggtcgaccgg ttgagcatgg ggcgatcaag 3420
caggactcga ggaggaggta gcggatttat ggcgacggat cggggtagcg gggccgagtg 3480
tgggttgttg gcttgttgcg cccgtgggcg tggcaggcgg ggggtggggg cgggcggagg 3540
gatcatgagc tagaggggga gatcgtggag ggagttggca gtttggagga agatcatggg 3600
ggattccttt gcgtgggcgt ctgggagtga gcgggtgctc ctaagatggc tgagatcgac 3660
gatgaacatg agagcacggg acggagacgg cgctagcagg aagggctaga gggcgagggc 3720
tcgctaggca gagaaagcaa gggagactga ccctaaagcc aagctgggtc agggtaagaa 3780
gcgtgcgggc ctcctagcag ctacttgggc cgcaccaaag aaacacagcc cacgcgacct 3840
atgtcgtcat cacggtttgc acatttttat gaccataccg gccagccaac atagcttcta 3900
ccagcttata agccttcctt ctttagagaa agcaatcatg gtcaaatgtt cctgctagtg 3960
tcaaattgag gcaacttttt gcgcgagcag acgtgggtcc ggtgtgtgca aaactaatgg 4020
tggctgtcac gtgggcgtcc gtagtctgca atgtgggccc aacgtccgga gtgtgtgatg 4080
gcttgcacga taggaatggc tgaatgggaa tgggggattt tgtcatatgg gaccggagtg 4140
ccccaagtca ggagttgctc gacgtccccg cgtcacagaa tgtgatggtt tgccggacaa 4200
cagcggtgga ggagccatta tggcttagtg tggcatcagc cataccttac ttttaataac 4260
tctcatatct tctactatac catcaaaatt cgatgtggtg tggtggatat gccgtctctc 4320
ctagatgttt tcatacccac ttgctgatat atatatatat atatatatat atatatatat 4380
atatatatat atatatatat atatatatat atatatatat atatatatat atatatatat 4440
atatatatat atagctgaat gcccgtgcgt tgcaacggaa atatataata cccgtatact 4500
acgataactt atatacaaaa tatgtgttat accgttatga gaaaatgttt cataatcaat 4560
ttgtgattct ggccatacat aaattttgtt atttataatc tatctatttc accactacat 4620
tgcaaccatc agtatcatgc agacttcgat atatgtcacg atttgcatgg cctcattatt 4680
ggagagcacg tttcacacat accggaagaa attcgctcgt acatcgttag tcatcggaca 4740
cgtaccacct tacacttttc cttaaacaaa aaggtaagtg tgtgtgtttg caagactaat 4800
ggtcaaacat tgtataacca taaagttaga atactatatt aatatattaa ataaattaat 4860
ccaatagaca tagattaact caattaacat aggataaata aatatctaat tataaaagta 4920
tgaaacatgg tataatcaat gttgttactg cgtagtaaat attcatacga gactaacaca 4980
actggaacgg ttcaatttag aattaaaatg gggaagttac gaatttccaa agtttctatg 5040
tatttaatat aggattaatt aggaaatcag ttttattgtt gttttcatga caaaacagag 5100
gtattatgtg ataaaaaata atattataga attatagaaa ttggaataaa ctcatttgga 5160
tttaatatga aatttccatg aattaaatga gtttctgcaa ttatttttaa actaaaaatt 5220
aatttctaaa ctccttttct ctattttctt tatttcctgg actgcgtccc aaattccaga 5280
aagatcaggg gccaagctat aaatgttttt ctagactcag tgagcataca gagtgaacga 5340
cgggttaaac acaaataaag tcttagttga agttgtacac aattcaatat gagtcacgtt 5400
ggttagaggg tggaaggcta gacattctac tcaatagatc taaggttcga tccctgagta 5460
gcacagttta attttttttc tgcgcccgga acgggggagg cagaacggca gactactctt 5520
accttcttaa taagtagtat agatgtttat gttaatttct tgatgataaa gtatgtgtat 5580
atcaaactct cctctctgac cagtttatga tggcaaacgg gactttggtt cgcactctca 5640
ttcacactga tgtgacaaaa tatttgtcat tcaaagctgt tgatggaagc tatgtcttca 5700
gcaaacggaa ggtaatttct taagtttaca ctcatccatc ctagttctat cttgtaagtt 5760
cagctttgct ggatttctca caagtggttt ctatattgta atcatgccgc cttattgcat 5820
tttcatcaga ttcacaaggt tcctgccacc gatatggagg ctctaaaatc tcctttgatg 5880
ggtctatttg agaaacgtag agcaaggaac ttttttgttt acgtccaaaa ttacaatgaa 5940
gctgatccag tgacacatca ggggttggac ctcacaagga ttacaactag agaattgatt 6000
ttgtgagtat cttgaccatc ctagcatcgt aatacttact ggcattgttg ttccttgttt 6060
gccatgttat tatgtgttgt atgattcttt gtatcactcc acctcatgtt gctgcatgga 6120
tgttgtatga ttcttcacct acttttgcct ctttctgctt tcgtatagta tgataatatt 6180
ttgtgcatca ataatgtaca caagttaatt gttgtaatgt tatattgatg aacagataaa 6240
caaaactgct ataaccgttc aacttctaaa tgacactttt tcttaaagct gtaaagagga 6300
tgtgtaatac ttggcatgtc ctccttttgc attataagta accttataag tcattttgtt 6360
ttcaggaaac atggattgag tgatgacact gtggatttta ttggccatgc actcgctctg 6420
cacagggatg atcgttacct aaatgaacct gcccttgata ctgtaaaaag gatgaaggta 6480
tgttttgagt gaagatgtgt taaactattg ttctttttca tattataatg taattttatc 6540
aaactacttc cttgcatatg tagccttttt tttatatatt ccagatttct aagtattctt 6600
ggatcgggaa catgatacaa ttttgttgtc tgtcttctct tagctttacg ctgagtctct 6660
tgcacgtttt caaggaggct cgccttatat ttatccatta tatgggttgg gtgagctgcc 6720
acaggtcagc tatttctcaa ttccttgcac caactctagt tgcttttatt attgcacttt 6780
gatgcttcta agaagcttcc atgctaagat gatgtcttat ggttcaggct tttgcacgtc 6840
taagtgctgt ttatggtggt acatatatgt taaataaacc agagtgcaag gtaatggctt 6900
gagctttttt tactcctaat tatcatagtc tgcgaaaaca gcttatcaaa tatgatcttt 6960
ttgctgattt cactatataa tatgtttgta ggttgaattt gatatcgaag ggaaagtgtg 7020
tggtgttact tcagaaggtg aaacggcgaa atgcaaaaag gttgtctgtg atccttctta 7080
cttgcctagc aaggtaaatg ccactgcccg tataaaattg aactactctg tttattatag 7140
gaattcactg aaaccttgat atatttcaac caaatctact ggaatttaaa cttccctgct 7200
acaatacctc tgttgactaa tttcctatat ggtgctatct tgatttgggg ttcactttgt 7260
ggttgtcaat aggtaaggaa gattggaaaa gttgcacgtg caatcgctat tatgagccac 7320
ccaattccaa acacaaatga gtcccactcg attcagatta ttttgccgca gaagcaactt 7380
gggcgcaagt cagacatgtg ggtctcttac tcatatttca aatagttttc atttgatgag 7440
tgccttaatt cagtttgtac tgcttggttg tgtgtttgta acatgtattc ttaaaatgtt 7500
tcttaggtat gttttctgtt gctcatatac acataatgtt gcgccaaaag ggaagttcat 7560
tgcatttgtg tctgcggaag ctgagaccga taatccacag tccgaactaa agcctggaat 7620
tgatctactt ggtcaagtag atgaactgtt ttttgatatg tatgacagat acaaacctgt 7680
caatgaacca tctcttgata attgctttgt ttcaatggta agtttaggat tatgtaataa 7740
caaagtgatt acaagtccca gatatcttag atgtttatgg aagttatctt ctttgcagag 7800
ttatgatgct actacacact ttgagacaac tgtgacagat gttctcagta tgtacacagc 7860
aattactgga aaggtaaggt tcatgtccct tttttttgtg gtcatcaaag cagatgtatc 7920
aaatactaat atctacaatg ctgtattggg cctagaacaa taacaacaag caagttggat 7980
aggctagagt tcaattcaaa tccaacatga accacaagtt aaagttaagg catatggata 8040
gctgtttttc atgcattcct attcatggct aaatctttgg gtatatacta tcttttcaag 8100
tctcctaaat aaggggctgt cgacccatct cttccccatt caacactgta cctggttccg 8160
atatgacaca tccattagag ggttacgctc taacggacta ctttgggttt catccttatt 8220
agaatggtta ggtttaacat cggattggga cttgttatgt tgagaaaaca taggtggatt 8280
tcaatactgt attgggcctg agagatcaaa acctactact ctactagtga aatttgctag 8340
ctttacaggg catggtcaat tgtttgttaa ccttctgtca gcaatagatg atttgcctca 8400
aacaaaatta gtcccttact agacatctct ctttattatt gatactgtga tgacattact 8460
attttatgtt tactgaccca aagatggatc gcacatcttt aaatctctcc atgtctgtgt 8520
cgcagaccgt tgatctcagt gtggacctga gcgctgccag cgcagctgaa gaatactaga 8580
gattttccta ttagagatac catactctaa agaagaacgg tgttaacaca ggccctgcct 8640
ggtggcttgc caggtttaga tctatgctgc agctgcagcc aattaaacgg acagaacata 8700
tcaccctata gcatttacat ggcgtttaaa cacaagaccg tttaggatga tggtggtggt 8760
tcctttgttc cttgcattat tgatcggatg gttaactttt aactgtgct 8809
<210> 7
<211> 22
<212> DNA
<213> 人工序列
<220>
<223>
<400> 7
agaaggtgaa acggcgaaat gc 22
<210> 8
<211> 22
<212> DNA
<213> 人工序列
<220>
<223>
<400> 8
tcggaaccag gtacagtgtt ga 22

Claims (2)

1.下述任一应用:
X1、ZmGDI2或所述ZmGDI2的编码基因在培育粗缩病敏感玉米中的应用;
所述ZmGDI2的序列为序列表中序列4;
所述ZmGDI2的编码基因,为如下m21)或m22):
m21)核苷酸序列是序列表中序列2的第136-1473位核苷酸的cDNA分子或DNA分子;
m22)核苷酸序列是序列表中序列2的cDNA分子或DNA分子;
X2、所述ZmGDI2或所述ZmGDI2的编码基因在制备降低玉米粗缩病抗性产品中的应用;
X3、所述ZmGDI2或所述ZmGDI2的编码基因在降低玉米粗缩病抗性中的应用;
X4、所述ZmGDI2或所述ZmGDI2的编码基因在调控玉米粗缩病抗性中的应用。
2.培育粗缩病敏感转基因玉米的方法,包括:增加目的玉米中权利要求1中所述ZmGDI2的活性或增加目的玉米中权利要求1中所述ZmGDI2的含量或促进权利要求1中所述ZmGDI2的编码基因的表达,得到转基因玉米;所述转基因玉米粗缩病抗性低于所述目的玉米。
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Families Citing this family (4)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Publication number Priority date Publication date Assignee Title
CN110669860B (zh) * 2019-10-24 2021-03-23 中国农业大学 一种检测玉米茎秆强度的方法及其特异转座子
CN110862440B (zh) * 2019-12-12 2022-02-15 未米生物科技(江苏)有限公司 控制玉米株高基因zkm465及其应用
CN111073996A (zh) * 2020-02-12 2020-04-28 中国农业科学院作物科学研究所 与玉米抗粗缩病主效QtL紧密连锁的分子标记及其应用
CN114561425B (zh) * 2022-03-14 2022-10-11 东北农业大学 ZmHIR3蛋白或其编码基因在调控玉米抗粗缩病能力中的应用

Citations (2)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Publication number Priority date Publication date Assignee Title
WO2015066832A1 (zh) * 2013-11-08 2015-05-14 中国农业大学 与玉米粗缩病抗性相关的主效数量性状位点及其应用
CN105349684A (zh) * 2015-12-10 2016-02-24 中国农业科学院作物科学研究所 与玉米抗粗缩病主效qtl紧密连锁的分子标记

Patent Citations (2)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Publication number Priority date Publication date Assignee Title
WO2015066832A1 (zh) * 2013-11-08 2015-05-14 中国农业大学 与玉米粗缩病抗性相关的主效数量性状位点及其应用
CN105349684A (zh) * 2015-12-10 2016-02-24 中国农业科学院作物科学研究所 与玉米抗粗缩病主效qtl紧密连锁的分子标记

Non-Patent Citations (3)

* Cited by examiner, † Cited by third party
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A helitron induced RabGDIα variant causes quantitative recessive resistance to maize rough dwarf disease;Qingcai Liu, Mingliang Xu等;《NATURE COMMUNICATIONS》;20200124;第11卷(第495期);1-14 *
Fine mapping of a quantitative trait locus conferring resistance to maize rough dwarf disease;Changlin Liu,Xinhai Li等;《Theor. Appl. Genet.》;20160820;1-10 *
玉米抗粗缩病主效QTL的定位、克隆和应用;陶永富;《中国农业大学博士论文》;20180615;全文 *

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