CN108330173B - RT-qPCR检测猕猴ABCG2基因转录水平的方法 - Google Patents

RT-qPCR检测猕猴ABCG2基因转录水平的方法 Download PDF

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Abstract

本发明提供一种RT‑qPCR检测猕猴ABCG2基因转录水平的方法，以猕猴新鲜肾脏组织提取的总RNA逆转录合成得到的cDNA为模板，利用PCR引物组合进行实时荧光定量PCR扩增，获得ABCG2基因片段及内参基因GAPDH片段的Ct值及溶解峰、扩增效率，通过常规处理得均一化后的ABCG2基因倍数表达的ΔΔC(t)值，从而获得ABCG2基因转录水平相对表达值。为研究猕猴ABCG2功能以及相关药物对其影响提供了有效途径。本发明适用于实时定量PCR检测，其操作简单，可重复性高，检测成本低、灵敏性高、特异性强。

Description

RT-qPCR检测猕猴ABCG2基因转录水平的方法
技术领域
本发明涉及一种检测方法，尤其是一种用实时荧光定量RT-qPCR法检测猕猴三磷酸腺苷结合盒转运蛋白ABCG2基因转录水平的方法，属于分子生物技术领域。
背景技术
近年来，全基因组关联分析(Genome-wide association studies，GWAS)已检出多个导致高尿酸血症和痛风的易感位点及相关候选基因。其中SLC2A9、SLC22A11和SLC22A12基因功能缺失性突变可引起遗传性低尿酸血症，而过表达则会加强尿酸的重吸收。ABCG2、 SLC17A1和SLC17A3基因功能缺陷型变异会降低肾脏和肠道对尿酸的排泄量。ABCG2作为一种转运蛋白，定位于细胞膜，广泛分布在具有分泌及排泄功能的组织中，肾脏中的ABCG2位于肾近端小管上皮细胞膜刷状缘，介导细胞内尿酸分泌，是一种高能的尿酸转运蛋白。研究发现ABCG2的常见单核苷酸多态性rs2231142与尿酸水平和痛风显著相关，其突变使肠道和肾脏尿酸排泄受阻而导致高尿酸血症和痛风。ABCG2单核苷酸基因多态性分析研究及日本人群受试者数量性状遗传位点分析显示，该功能缺失能够阻碍尿酸排泄使血清尿酸浓度上升，引发高尿酸血症。以上研究证明ABCG2与尿酸排泄紧密相关。
近年来，随着人民生活水平的提高，饮食结构和生活习惯发生了改变，高尿酸血症（hyperuricemia，HUA）的患病率逐年增高，流行病学研究资料表明高尿酸血症和原发性痛风的发病呈上升趋势，在中国，已经有1.2亿的HUA人群，大约占总人口的10%，中老年及绝经后的妇女为高发人群，近年来发病年龄也呈年轻化的趋势。高尿酸血症与肥胖、高血压、高脂血症、冠状动脉粥样硬化性心脏病、胰岛素抵抗的发生密切相关，已成为识别代谢综合征的早期标志，治疗和控制高尿酸血症已成为代谢性疾病治疗的重要组成部分。无论是药物的筛选, 还是致病机制的研究, 都需要选择一种科学、合理的动物模型来开展高尿酸血症致病机理的研究及开发相关降血尿酸的药物。
猕猴(Macaca Malatta)，又名恒河猴（rhesus monkey），由于在形态学、生理生化代谢等方面与人类非常相似，是较为理想的实验动物，常用于许多重要的科学研究。其尿酸代谢途径与人类相似，是研究该病的最佳实验动物，为了利用亲缘关系与人类接近的实验动物—猕猴来开展高尿酸血症致病机理的研究及开发相关降血尿酸的药物，需要建立一种猕猴三磷酸腺苷结合盒转运蛋白ABCG2 mRNA 表达的相对定量方法，以研究药物作用猕猴体内ABCG2 mRNA基因的转录水平变化，进而为研究ABCG2功能及其对机体血清尿酸的影响因素打下基础。因此, 建立RT-qPCR检测猕猴三磷酸腺苷结合盒转运蛋白- ABCG2 mRNA基因转录水平的方法，可对于开展利用动物模型开展的HUA发病机制研究及新药筛选具有重要意义。
实时荧光定量PCR的基因扩增法已被广泛应用于基因转录水平的定量研究。该方法具有特异性强、灵敏度高、重复性好、定量准确、自动化程度高、全封闭反应等优点。目前国内外还未见利用猕猴进行ABCG2转录水平定量检测方法的研究。
发明内容
本发明的目的在于提供一种用实时荧光定量RT-qPCR法检测猕猴三磷酸腺苷结合盒转运蛋白- ABCG2 mRNA基因转录水平的方法，以在转录水平上对ABCG2基因进行定量检测。
为实现上述目的，本发明以样品总RNA反转录成的cDNA为模板，利用PCR引物组合进行实时荧光定量PCR扩增，根据反应体系中荧光的变化情况定量分析ABCG2基因转录水平的变化。具体如下：
一种RT-qPCR检测猕猴ABCG2基因转录水平的方法，包括下列步骤：
（1）设计下列引物：
猕猴ABCG2基因表达水平的特异性上、下游引物为：
ABCG2 F：5’- TTAGCTGCAAGGAAAGATCCAAG -3’
ABCG2 R：5’- GTCATAGTTGTTGGAAGCCGAAG -3’
作为内参基因的猕猴GAPDH基因的特异性上、下游引物为：
GAPDH F：5＇-AGCCCCATCACCATCTTCC-3＇
GAPDH R：5＇- AATGAGCCCCAGCCTTCTC -3＇；
（2）以猕猴新鲜肾脏组织提取的总RNA为模板，按常规逆转录合成得猕猴肾脏组织cDNA第一链；
（3）以步骤（2）的猕猴肾脏组织cDNA第一链为cDNA模板，以步骤（1）中的ABCG2 F和ABCG2 R上、下游引物以及GAPDH F和GAPDH R上、下游引物为特异性引物，分别在下列PCR扩增体系及反应条件下进行实时荧光定量PCR扩增，扩增结束后根据荧光信号的数据，分别获得ABCG2基因片段及内参基因GAPDH片段的Ct值及溶解峰；Real-time 荧光定量qPCR目的片段及内参基因特异性通过绘制出的溶解峰来证实；
所述PCR扩增体系及反应条件如下：
PCR扩增体系即25μL体系：
SYBR Premix Ex Taq II 酶 12.5μL，cDNA模板1μL，SLC22A12/URAT1 F和SLC22A12/URAT1 R上、下游引物各1μL，去离子水9.5μL；
SYBR Premix Ex Taq II 酶 12.5μL，cDNA模板1μL，GAPDH F和GAPDH R上、下游引物各1μL，去离子水9.5μL；
反应条件：94℃预变性30s，94℃变性5s、60℃退火30s、40个循环，59℃到94℃每5s采集一次荧光信号；
（4）将步骤（2）的猕猴肾脏组织cDNA第一链稀释为100、10-1、10-2、10-3、10-4倍浓度作为cDNA模板，以步骤（1）中的ABCG2 F和ABCG2 R上、下游引物以及GAPDH F和GAPDH R上、下游引物为特异性引物，分别按步骤（3）的PCR扩增体系及反应条件进行荧光定量PCR扩增，反应结束后根据荧光信号的数据，获得Ct值，通过qPCR仪器自带CFXManager 软件建立ABCG2基因及内参基因GAPDH的溶解曲线及标准曲线，得到ABCG2基因片段及内参基因GAPDH 片段的扩增效率、斜率及R2值；当ABCG2基因片段及内参基因GAPDH片段扩增效率分别在80%至120% 之间，同时R2接近1时，说明结果可信度较高，符合荧光定量PCR 要求，可进一步进行待检样品检测；
（5）在步骤（3）的PCR扩增体系及反应条件下，以步骤（2）的猕猴肾脏组织cDNA第一链作为待测样品cDNA模板，进行实时荧光定量PCR扩增，得到对应的Ct值，将该Ct值以及步骤（4）得到的ABCG2基因及内参基因GAPDH的扩增效率，通过qPCR仪器自带CFX Manager 软件处理，得出均一化后的ABCG2基因倍数表达的ΔΔC(t)值，从而获得ABCG2基因转录水平相对表达值。
所述步骤（3）获得的PCR扩增产物ABCG2基因片段及内参基因GAPDH片段分别经过下列验证：
1）通过商业生物公司测序分别得到：
所扩增的猕猴三磷酸腺苷结合盒转运蛋白ABCG2基因片段核苷酸序列为：
GTATTTTAGGATTTCTGAAGTTCTGATAATGGAGCACTGCGACCTACCAATTTCAAATGTAATTCAGGTTACGTGGTACAAGATGATGTCGTGATGGGCACTCTGACGGTGAGAGAAAACTTACAGTTCTCAGCAGCTCTTCGGCTTCCAACAACTATGAC
所扩增的猕猴内参基因GAPDH片段核苷酸序列为：
GGCGCGCCTTTGCTGGCGCTGAGTACGTCGTGGAGTCCACTGGCGTCTTCACCACCACGGAGAAGGCTGGGGCTCATTA
2）再将上述测序所得核苷酸序列分别通过DNAMAN软件与NCBI所报道的猕猴的ABCG2基因及猕猴GAPDH基因的核苷酸序列进行同源性比对，结果显示：用本发明提供的引物、扩增体系及反应条件进行扩增后的猕猴肾脏组织ABCG2基因与NCBI猕猴GenBank：NM-001032919.1 GI：74136388的同源性为90.91%；用本发明提供的引物、扩增体系及反应条件进行扩增后的猕猴肾脏组织中GAPDH与NCBI猕猴GAPDH序列（NM--001195426.1）的同源性为91.14%，证明本发明所扩增出的目的片段分别为：猕猴ABCG2基因片段及GAPDH基因片段。
使用本发明的引物以及方法进行转录水平定量样品主要为肾脏组织，也适用于其他组织使用。
猕猴作为一种近年来开发的实验动物，以NCBI基因库中猕猴ABCG2基因的核苷酸序列作为参考，序列号：NM--001032919.1，用Primer premier 5.0软件设计多对引物，经过RT-PCR扩增，根据引物的特点摸索PCR扩增的最佳退火温度，筛选出上述所述的检测猕猴ABCG2基因表达的特异性上、下游引物组合及PCR扩增条件，获得了特异的ABCG2基因片段及内参基因GAPDH片段，并通过对所获得的的特异的ABCG2基因片段及内参基因GAPDH片段的测序及序列分析，进一步证实了所提供的PCR引物组合的特异性，可应用于实时荧光定量PCR法定量检测猕猴ABCG2基因转录水平。
本发明具有下列优点和效果：
1）采用上述方案，可较为容易地在转录水平上进行猕猴组织中ABCG2基因相对定量检测。
2）本发明所公开的引物是通过本领域技术人员公知的化学合成方法进行DNA 合成后得到的，用该引物序列可实现猕猴ABCG2基因及内参基因GAPDH的特异性扩增，对材料中非目的基因没有扩增信号，通过本发明的引物，可对猕猴ABCG2基因转录水平的变化状况实施定量检测，灵敏度高，方法简单，可重复性高。并且，本发明的引物特异性强，不会受到其他基因的干扰，特异性高，为研究猕猴ABCG2基因的功能及影响因素提供了有效的工具。
附图说明
图1为猕猴肾脏组织RNA完整性测定的琼脂糖凝胶电泳图；
图2为猕猴ABCG2基因溶解峰图；
图3为内参基因GAPDH溶解峰图；
图4为猕猴ABCG2基因的扩增曲线图；
图5为猕猴ABCG2基因的标准曲线图；
图6为猕猴GAPDH基因的扩增曲线图；
图7为猕猴GAPDH基因的标准曲线图；
图8为肌苷及别嘌醇对猕猴肾脏组织ABCG2 mRNA表达水平变化的影响图。
具体实施方式
下述实施例中所使用的试验方法，如无特殊说明，均为常规方法。
下述实施例中所使用的材料试剂等，如无特殊说明，均为商业途径得到。
下述实施例中所使用的实验动物：猕猴，雄性，6只，体重6-10kg。实验用猕猴由中国医学科学院医学生物学研究所提供，普通级别饲养。饲养环境温度20℃～25℃，湿度40%～70%，正常饲喂，自由饮水。
述实施例中的各种溶液配制原则及方法：Inosine配制：肌苷（Inosine，Sigma公司），批号：Lot # SLBP5740V，称取不同量的肌苷置于锥形瓶里面，以0.9%生理盐水作为溶剂，用水浴锅溶解，一般现配现用。（浓度，C=0.05mg/ml）；别嘌醇（allopurimol）配制，缩写为ALLO，溶液配制：称取不同量的ALLO置于锥形瓶里面，以0.9%生理盐水作为溶剂，用水浴锅溶解，一般现配现用。（浓度，C=1mg/ml）；
述实施例中的仪器与耗材：CFX 96TM Real-Time System C1000TM Thermal Cycler美国bio-rad公司产品，Sigma高速冷冻离心机，Sartoyius公司精密电子天平ME235S；美国bio-rad公司凝胶成像分析系统；美国bio-rad公司PCR仪：；美国bio-rad公司PowerPacBasic电泳仪；日本Tomy公司SS-325高压蒸气灭菌箱；美国DanoDrop公司ND-1000紫外分光光度计。1000ul、200ul、20ul、10ul、2ul的Gilson移液枪；2ml EP管、500ul EP管；1000ul吸头、200ul吸头、10ul吸头。
实施例
一种RT-qPCR检测猕猴ABCG2基因转录水平的方法，包括下列步骤：
（1）设计下列引物：
根据NCBI基因库中猕猴（macaca mulatta）猴的ABCG2核苷酸序列号： NM_001032919.1，猕猴（macaca mulatta）的GAPDH核苷酸序列号NM_001195426.1设计引物，以上引物均由上海生物工程有限公司合成：
猕猴ABCG2基因表达水平的特异性上、下游引物为：
ABCG2 F：5’- TTAGCTGCAAGGAAAGATCCAAG -3’
ABCG2 R：5’- GTCATAGTTGTTGGAAGCCGAAG -3’
作为内参基因的猕猴GAPDH基因的特异性上、下游引物为：
GAPDH F：5＇-AGCCCCATCACCATCTTCC-3＇
GAPDH R：5＇- AATGAGCCCCAGCCTTCTC -3＇；
猕猴ABCG2基因表达水平定量用引物序列及片段大小见表1：
表1 引物序列及片段大小（F上游，R下游）
Figure 562908DEST_PATH_IMAGE002
（2）以猕猴新鲜肾脏组织提取的总RNA为模板，按常规逆转录合成得猕猴肾脏组织cDNA第一链；具体如下：
（2.1）实验动物的分组及给药：挑选6只猕猴（体重10±4kg），随机分组，每组2只动物，分别第一组腹腔注射inosine 200mg/kg+ ALLO 2.5 mg/kg，第二组腹腔注射inosine100mg/kg + ALLO 1.85 mg/kg，第三组对照组腹腔注射生理盐水，给药0.5-1h进行B超介入的活体取材获得新鲜肾脏组织约20mg，用于猕猴ABCG2基因转录水平的检测；
（2.2）猕猴新鲜肾脏组织的活体取样：
按常规取右肾下脊实质，将所采集的新鲜肾脏组织置于RNA助溶剂（Tripure，Roche公司）用于猕猴ABCG2基因转录水平的检测；
（2.3）新鲜肝、肾组织总RNA的提取
取新鲜肝、肾组织20mg匀浆器中，加入1ml Tripure试剂在室温下充分匀浆，静置5min，再将其转移至1.5mlEP管中静置5min，加入200ul -20℃预冷的氯仿，漩涡震荡充分，静置15min后4℃、12000r/m离心25min，吸取上清液450ul于另一只1.5mlEP管中，等体积加入-20℃预冷的异丙醇，充分混匀静置10min，4℃、12000r/m离心10min，弃上清液，待管内壁稍干，加1ml-20℃预冷的75%乙醇洗涤沉淀，4℃、7500r/m离心5min，弃上清液，待管内壁稍干，加入30ulDEPC水溶解沉淀，65℃水浴10min，所提取的总RNA样品取1μl经Nanodrop-1000超微量核酸测定仪测定浓度及吸光度比值，测定浓度后加DEPC水稀释至1000ng/ul，放入-80℃冰箱备用；
（2.4）RNA完整性检测
随机取2.3步骤所提取的总RNA样品2μl进行1.5%琼脂糖凝胶电泳（120V，400mA）20min，在凝胶成像系统下观察28S，18S和5S条带亮度，分析RNA的完整性。结果可观察到28S，18S和5S三条带，见图1，说明所提取的RNA无降解，完整性好；
（2.5） cDNA的合成
按照逆转录试剂盒PrimeScript™RT reagent Kit说明操作，每10μl体系中依次加入5×PrimeScript Buffer 2μl，PrimeScript RT Enzyme Mix 0. 5μl，Oligo dTPrimer 0.5μl，Random 6 mers 0.5μl，总RNA( 浓度稀释为1000 ng /μl) 1μl，ＲNaseFree dH2O 5.5μl，逆转录条件为: 37℃，15min，85℃，5s，4℃，10min，得猕猴肾脏组织cDNA第一链；
（3）以步骤（2）的猕猴肾脏组织cDNA第一链为cDNA模板，以步骤（1）中的ABCG2 F和ABCG2 R上、下游引物以及GAPDH F和GAPDH R上、下游引物为特异性引物，分别在下列PCR扩增体系及反应条件下进行实时荧光定量PCR扩增，扩增结束后根据荧光信号的数据，分别获得ABCG2基因片段及内参基因GAPDH片段的Ct值及溶解峰；Real-time 荧光定量qPCR目的片段及内参基因特异性通过绘制出的溶解峰来证实；
所述PCR扩增体系及反应条件如下：
PCR扩增体系即25μL体系：
SYBR Premix Ex Taq II 酶 12.5μL，cDNA模板1μL，SLC22A12/URAT1 F和SLC22A12/URAT1 R上、下游引物各1μL，去离子水9.5μL；
SYBR Premix Ex Taq II 酶 12.5μL，cDNA模板1μL，GAPDH F和GAPDH R上、下游引物各1μL，去离子水9.5μL；
反应条件：94℃预变性30s，94℃变性5s、60℃退火30s、40个循环，59℃到94℃每5s采集一次荧光信号；
SYBR Premix Ex TaqⅡ酶为TAKARA生物有限公司产品的荧光定量PCR试剂；
（4）将步骤（2）的猕猴肾脏组织cDNA第一链稀释为100、10-1、10-2、10-3、10-4倍浓度作为cDNA模板，以步骤（1）中的ABCG2 F和ABCG2 R上、下游引物以及GAPDH F和GAPDH R上、下游引物为特异性引物，分别按步骤（3）的PCR扩增体系及反应条件进行荧光定量PCR扩增，反应结束后根据荧光信号的数据，获得Ct值，通过qPCR仪器自带CFXManager 软件建立ABCG2基因及内参基因GAPDH的溶解曲线及标准曲线，得到ABCG2基因片段及内参基因GAPDH 片段的扩增效率、斜率及R2值；当ABCG2基因片段及内参基因GAPDH片段扩增效率分别在80%至120%之间，同时R2接近1时，说明结果可信度较高，符合荧光定量PCR 要求，可进一步进行待检样品检测；
（5）在步骤（3）的PCR扩增体系及反应条件下，以步骤（2）的猕猴肾脏组织cDNA第一链作为待测样品cDNA模板，进行实时荧光定量PCR扩增，得到对应的Ct值，将该Ct值以及步骤（4）得到的ABCG2基因及内参基因GAPDH的扩增效率，通过qPCR仪器自带CFX Manager 软件处理，得出均一化后的ABCG2基因倍数表达的ΔΔC(t)值，从而获得ABCG2基因转录水平相对表达值。
所述步骤（3）获得的PCR扩增产物ABCG2基因片段及内参基因GAPDH片段分别经过下列验证：
1）通过商业生物公司测序分别得到：
所扩增的猕猴三磷酸腺苷结合盒转运蛋白ABCG2基因片段核苷酸序列为：
GTATTTTAGGATTTCTGAAGTTCTGATAATGGAGCACTGCGACCTACCAATTTCAAATGTAATTCAGGTTACGTGGTACAAGATGATGTCGTGATGGGCACTCTGACGGTGAGAGAAAACTTACAGTTCTCAGCAGCTCTTCGGCTTCCAACAACTATGAC
所扩增的猕猴内参基因GAPDH片段核苷酸序列为：
GGCGCGCCTTTGCTGGCGCTGAGTACGTCGTGGAGTCCACTGGCGTCTTCACCACCACGGAGAAGGCTGGGGCTCATTA
2）再将上述测序所得核苷酸序列分别通过DNAMAN软件与NCBI所报道的猕猴的ABCG2基因及猕猴GAPDH基因的核苷酸序列进行同源性比对，结果显示：用本发明提供的引物、扩增体系及反应条件进行扩增后的猕猴肾脏组织ABCG2基因与NCBI猕猴GenBank：NM--001032919.1 GI：74136388的同源性为90.91%；用本发明提供的引物、扩增体系及反应条件进行扩增后的猕猴肾脏组织中GAPDH与NCBI猕猴GAPDH序列（NM--001195426.1）的同源性为91.14%，证明本发明所扩增出的目的片段分别为：猕猴ABCG2基因片段及GAPDH基因片段。
所述步骤（4）猕猴ABCG2基因及GAPDH基因的溶解曲线和标准曲线的建立：以Esidilution 梯度稀释逆转录合成的猕猴肾脏cDNA第一链，分别稀释为10-1、10-2、10-3、10-4倍浓度，以原始cDNA第一链及稀释后的cDNA为模板，各做2个平行样进行实时荧光定量检测，按步骤4.7荧光定量PCR体系进行实时荧光定量PCR，得到ABCG2基因和GAPDH基因的溶解曲线和标准曲线。
荧光定量PCR检测肌苷所致的高尿酸血症猕猴肾脏组织ABCG2mRNA表达水平的变化：
qPCR检测体系为防止混在RNA中的基因组DNA带来的假阳性，排除可能的污染，在实验中每个检测样品须做复空，同时设置以mRNA为模板对照及无模板对照，防止假阳性。利用CFX 96TM real-time system荧光定量PCR仪自带的CFX Manager软件对结果进行处理分析，以零点作为对照，以样品ct值软件分析测定均一化后对应得到目的基因的相对表达量。
结果
1、猕猴ABCG2基因荧光定量PCR反应的溶解峰
通过real-time RT-PCR实时荧光定量PCR反应，绘制出的ABCG2溶解峰如图2，GAPDH溶解峰如图3，显示ABCG2基因及内参基因GAPDH扩增特异性好，溶解峰单一。图4为ABCG2基因，图6为内参基因GAPDH，无模板对照无扩增，对照成立。
2、猕猴ABCG2基因和GAPDH基因的标准曲线
由图4-7可见，猕猴ABCG2基因和GAPDH基因的标准曲线R2均接近1，说明以此标准曲线进行相对定量较准确，由于荧光强度均较强，故能保证荧光强度的增加与PCR的扩增相对同步，能准确检测PCR的表达，以GAPDH为内源控制物，得到mRNA表达水平的变化。
反应结束后根据各稀释浓度的CT值，CFX Manager软件绘制出扩增曲线及标准曲线，见图4-图7，结果显示ABCG2基因扩增效率为扩增效率为118.1%，斜率-2.952，R2为0.983，GAPDH基因扩增效率为87.2.2%，斜率-3.671，R2为0.995，目的基因及内参基因扩增效率在80%至120之间，扩增效率理想，同时R2接近1，结果可信度较高，符合荧光定量PCR要求。
3、正常猕猴新鲜肝、肾组织ABCG2mRNA表达水平的变化的定量检测
将所获得的新鲜肝、肾组织所提取RNA，经荧光定量检测后，ABCG2mRNA主要在肾组织，肝组织中也有均具有表达，其中肾组织在的表达较肝脏组织多，表明机体的肝、肾是尿酸代谢的重要组织。
4、别嘌醇对肌苷所致的高尿酸血症猕猴肾脏组织ABCG2mRNA表达水平的变化的定量检测
以上各组所获得的新鲜肝、肾组织所提取RNA，经荧光定量检测后，软件分析模式测定均一化后的基因表达 normalized expression，相对表达值见图8。结果显示，Inosine药后0.5-1h后ABCG2与正常组相比较基因相对表达值下调约42.7倍，推测机体由于尿酸合成底物的大量增加，ABCG2基因mRNA表达活跃，Inosine+ALLO药后0.5-1h与肌苷组相比较ABCG2 mRNA表达水平变化不大，提示别嘌醇对ABCG2 mRNA表达水平影响不大。
5、肌苷(Inosine)，也称为次黄苷、次黄嘌呤核苷等。是由次黄嘌呤于核糖结合而成的核苷类化合物。本药为人体的正常成分，为腺嘌呤的前体，能直接透过细胞膜进入体细胞，参与体内核酸代谢、能量代谢和蛋白质的合成。在嘌呤的从头合成中，肌苷酸(IMP)可以作为合成腺苷酸(AMP)和鸟苷酸(GMP)的前体，Inosine是体内ATP、辅酶A、核糖核酸及脱氧核糖核酸等生命分子基本组成，在体内转变为肌苷酸及三磷酸腺苷，并继而转换为其他多种核苷酸，同时肌苷也是尿酸合成的底物。采用腹腔注射给猕猴一定剂量的尿酸合成底物-肌苷，导致次黄嘌呤在体内的蓄积，最终造成猕猴体内尿酸含量增加，造成高尿酸血症，用于上述实施例可显著下调ABCG2mRNA 表达；别嘌醇（ALLO）通过抑制黄嘌呤氧化酶的活性使尿酸生成减少,血中及尿中的尿酸含量降低到溶解度以下的水平，主要用于治疗痛风和防止痛风性肾病、继发性高尿酸血症以及重症癫痫的辅助治疗，用于上述实施例中Inosine+ALLO药后0.5-1h与肌苷组相比较ABCG2mRNA表达水平变化不大，提示别嘌醇对ABCG2mRNA表达水平影响不大。本发明可用于ABCG2mRNA 表达水平的检测，为研究猕猴ABCG2基因的功能及影响因素提供了有效工具，为高尿酸血症等疾病的研究提供可靠手段。
序列表
ABCG2基因特异性上游引物：
ABCG2 F：5’- TTAGCTGCAAGGAAAGATCCAAG -3’
ABCG2基因特异性下游引物：
ABCG2 R：5’- GTCATAGTTGTTGGAAGCCGAAG -3’
内参基因GAPDH特异性上游引物：
GAPDH F：5＇--AGCCCCATCACCATCTTCC -3＇
内参基因GAPDH特异性下游引物：
GAPDH R：5＇- AATGAGCCCCAGCCTTCTC -3＇
所扩增的猕猴ABCG2基因片段扩增序列为：
GTATTTTAGGATTTCTGAAGTTCTGATAATGGAGCACTGCGACCTACCAATTTCAAATGTAATTCAGGTTACGTGGTACAAGATGATGTCGTGATGGGCACTCTGACGGTGAGAGAAAACTTACAGTTCTCAGCAGCTCTTCGGCTTCCAACAACTATGAC
所扩增的猕猴内参基因GAPDH片段扩增序列为：
GGCGCGCCTT TGCTGGCGCT GAGTACGTCGTGGAGTCCACTGGCGTCTTC ACCACCACGGAGAAGGCTGG GGCTCATTA
序列表
<110> 中国医学科学院医学生物学研究所
<120> RT-qPCR检测猕猴ABCG2基因转录水平的方法
<160> 6
<170> SIPOSequenceListing 1.0
<210> 1
<211> 24
<212> DNA
<213> 猕猴(Macaca mulatta)
<400> 1
gttagctgca aggaaagatc caag 24
<210> 2
<211> 23
<212> DNA
<213> 猕猴(Macaca mulatta)
<400> 2
gtcatagttg ttggaagccg aag 23
<210> 3
<211> 19
<212> DNA
<213> 猕猴(Macaca mulatta)
<400> 3
agccccatca ccatcttcc 19
<210> 4
<211> 19
<212> DNA
<213> 猕猴(Macaca mulatta)
<400> 4
aatgagcccc agccttctc 19
<210> 5
<211> 161
<212> DNA
<213> 猕猴(Macaca mulatta)
<400> 5
gtattttagg atttctgaag ttctgataat ggagcactgc gacctaccaa tttcaaatgt 60
aattcaggtt acgtggtaca agatgatgtc gtgatgggca ctctgacggt gagagaaaac 120
ttacagttct cagcagctct tcggcttcca acaactatga c 161
<210> 6
<211> 79
<212> DNA
<213> 猕猴(Macaca mulatta)
<400> 6
ggcgcgcctt tgctggcgct gagtacgtcg tggagtccac tggcgtcttc accaccacgg 60
agaaggctgg ggctcatta 79

Claims (2)

1.一种非疾病诊断目的的RT-qPCR检测猕猴ABCG2基因转录水平的方法，其特征在于包括下列步骤：
(1)设计下列引物：
猕猴ABCG2基因表达水平的特异性上、下游引物为：
ABCG2 F：5’-TTAGCTGCAAGGAAAGATCCAAG-3’
ABCG2 R：5’-GTCATAGTTGTTGGAAGCCGAAG-3’
作为内参基因的猕猴GAPDH基因的特异性上、下游引物为：
GAPDH F：5’-AGCCCCATCACCATCTTCC-3＇
GAPDH R：5’-AATGAGCCCCAGCCTTCTC-3＇；
(2)以猕猴新鲜肾脏组织提取的总RNA为模板，按常规逆转录合成得猕猴肾脏组织cDNA第一链；
(3)以步骤(2)的猕猴肾脏组织cDNA第一链为cDNA模板，以步骤(1)中的ABCG2 F和ABCG2 R上、下游引物以及GAPDH F和GAPDH R上、下游引物为特异性引物，分别在下列PCR扩增体系及反应条件下进行实时荧光定量PCR扩增，扩增结束后根据荧光信号的数据，分别获得ABCG2基因片段及内参基因GAPDH片段的Ct值及熔解峰；
所述PCR扩增体系及反应条件如下：
PCR扩增体系即25μL体系：
SYBR Premix Ex Taq II酶12.5μL，cDNA模板1μL，ABCG2 F和ABCG2 R上、下游引物各1μL，去离子水9.5μL；
SYBR Premix Ex Taq II酶12.5μL，cDNA模板1μL，GAPDH F和GAPDH R上、下游引物各1μL，去离子水9.5μL；
反应条件：94℃预变性30s，94℃变性5s、60℃退火30s、40个循环，59℃到94℃每5s采集一次荧光信号；
(4)将步骤(2)的猕猴肾脏组织cDNA第一链稀释为100、10-1、10-2、10-3、10-4倍浓度作为cDNA模板，以步骤(1)中的ABCG2 F和ABCG2 R上、下游引物以及GAPDH F和GAPDH R上、下游引物为特异性引物，分别按步骤(3)的PCR扩增体系及反应条件进行荧光定量PCR扩增，反应结束后根据荧光信号的数据，获得Ct值，通过qPCR仪器自带CFXManager软件建立ABCG2基因及内参基因GAPDH的标准曲线，得到ABCG2基因片段及内参基因GAPDH片段的扩增效率、斜率及R2值；
(5)在步骤(3)的PCR扩增体系及反应条件下，以步骤(2)的猕猴肾脏组织cDNA第一链作为待测样品cDNA模板，进行实时荧光定量PCR扩增，得到对应的Ct值，将该Ct值以及步骤(4)得到的ABCG2基因及内参基因GAPDH的扩增效率，通过qPCR仪器自带CFX Manager软件处理，得出均一化后的ABCG2基因倍数表达的ΔΔC(t)值，从而获得ABCG2基因转录水平相对表达值。
2.如权利要求1所述的非疾病诊断目的的RT-qPCR检测猕猴ABCG2基因转录水平的方法，其特征在于所述步骤(3)获得的PCR扩增产物ABCG2基因片段及内参基因GAPDH片段分别经过下列验证：
1)通过商业生物公司测序分别得到：
所扩增的猕猴三磷酸腺苷结合盒转运蛋白ABCG2基因片段核苷酸序列为：
GTATTTTAGGATTTCTGAAGTTCTGATAATGGAGCACTGCGACCTACCAATTTCAAATGTAATTCAGGTTACGTGGTACAAGATGATGTCGTGATGGGCACTCTGACGGTGAGAGAAAACTTACAGTTCTCAGCAGCTCTTCGGCTTCCAACAACTATGAC
所扩增的猕猴内参基因GAPDH片段核苷酸序列为：
GGCGCGCCTTTGCTGGCGCTGAGTACGTCGTGGAGTCCACTGGCGTCTTCACCACCACGGAGAAGGCTGGGGCTCATTA
2)再将上述测序所得核苷酸序列分别通过DNAMAN软件与NCBI所报道的猕猴的ABCG2基因及猕猴GAPDH基因的核苷酸序列进行同源性比对，结果显示：用本发明提供的引物、扩增体系及反应条件进行扩增后的猕猴肾脏组织ABCG2基因与NCBI报道的序列登录号为NM_001032919.1的猕猴ABCG2基因的同源性为90.91％；用本发明提供的引物、扩增体系及反应条件进行扩增后的猕猴肾脏组织中GAPDH与NCBI报道的序列登录号为NM_001195426.1的猕猴GAPDH基因的同源性为91.14％，证明本发明所扩增出的目的片段分别为：猕猴ABCG2基因片段及GAPDH基因片段。
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