CN108277268A - 用于诊断精神分裂症的外周血标志物-血浆游离dna - Google Patents
用于诊断精神分裂症的外周血标志物-血浆游离dna Download PDFInfo
- Publication number
- CN108277268A CN108277268A CN201710004688.4A CN201710004688A CN108277268A CN 108277268 A CN108277268 A CN 108277268A CN 201710004688 A CN201710004688 A CN 201710004688A CN 108277268 A CN108277268 A CN 108277268A
- Authority
- CN
- China
- Prior art keywords
- alu
- segments
- schizophrenia
- nucleic acid
- detection
- Prior art date
- Legal status (The legal status is an assumption and is not a legal conclusion. Google has not performed a legal analysis and makes no representation as to the accuracy of the status listed.)
- Granted
Links
Classifications
-
- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
- C12Q—MEASURING OR TESTING PROCESSES INVOLVING ENZYMES, NUCLEIC ACIDS OR MICROORGANISMS; COMPOSITIONS OR TEST PAPERS THEREFOR; PROCESSES OF PREPARING SUCH COMPOSITIONS; CONDITION-RESPONSIVE CONTROL IN MICROBIOLOGICAL OR ENZYMOLOGICAL PROCESSES
- C12Q1/00—Measuring or testing processes involving enzymes, nucleic acids or microorganisms; Compositions therefor; Processes of preparing such compositions
- C12Q1/68—Measuring or testing processes involving enzymes, nucleic acids or microorganisms; Compositions therefor; Processes of preparing such compositions involving nucleic acids
- C12Q1/6876—Nucleic acid products used in the analysis of nucleic acids, e.g. primers or probes
- C12Q1/6883—Nucleic acid products used in the analysis of nucleic acids, e.g. primers or probes for diseases caused by alterations of genetic material
-
- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
- C12Q—MEASURING OR TESTING PROCESSES INVOLVING ENZYMES, NUCLEIC ACIDS OR MICROORGANISMS; COMPOSITIONS OR TEST PAPERS THEREFOR; PROCESSES OF PREPARING SUCH COMPOSITIONS; CONDITION-RESPONSIVE CONTROL IN MICROBIOLOGICAL OR ENZYMOLOGICAL PROCESSES
- C12Q1/00—Measuring or testing processes involving enzymes, nucleic acids or microorganisms; Compositions therefor; Processes of preparing such compositions
- C12Q1/68—Measuring or testing processes involving enzymes, nucleic acids or microorganisms; Compositions therefor; Processes of preparing such compositions involving nucleic acids
- C12Q1/6844—Nucleic acid amplification reactions
- C12Q1/686—Polymerase chain reaction [PCR]
-
- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
- C12Q—MEASURING OR TESTING PROCESSES INVOLVING ENZYMES, NUCLEIC ACIDS OR MICROORGANISMS; COMPOSITIONS OR TEST PAPERS THEREFOR; PROCESSES OF PREPARING SUCH COMPOSITIONS; CONDITION-RESPONSIVE CONTROL IN MICROBIOLOGICAL OR ENZYMOLOGICAL PROCESSES
- C12Q2600/00—Oligonucleotides characterized by their use
- C12Q2600/118—Prognosis of disease development
Landscapes
- Chemical & Material Sciences (AREA)
- Life Sciences & Earth Sciences (AREA)
- Organic Chemistry (AREA)
- Health & Medical Sciences (AREA)
- Proteomics, Peptides & Aminoacids (AREA)
- Engineering & Computer Science (AREA)
- Zoology (AREA)
- Wood Science & Technology (AREA)
- Analytical Chemistry (AREA)
- Genetics & Genomics (AREA)
- Bioinformatics & Cheminformatics (AREA)
- Immunology (AREA)
- Microbiology (AREA)
- Molecular Biology (AREA)
- Physics & Mathematics (AREA)
- Biotechnology (AREA)
- Biochemistry (AREA)
- Biophysics (AREA)
- General Engineering & Computer Science (AREA)
- General Health & Medical Sciences (AREA)
- Chemical Kinetics & Catalysis (AREA)
- Pathology (AREA)
- Measuring Or Testing Involving Enzymes Or Micro-Organisms (AREA)
Abstract
本发明提供了用于诊断精神分裂症的外周血标志物‑血浆游离DNA。具体地,本发明提供一种核酸或其检测试剂的用途,所述核酸或其检测试剂选自:血液中总游离dsDNA;ALU‑115bp片段及其扩增引物;ALU‑247bp片段及其扩增引物;所述核酸或其检测试剂用于制备诊断精神分裂症和/或其预后的检测试剂或检测试剂盒。本发明还提供了用于诊断精神分裂症和/或其预后的检测试剂盒,核酸芯片或阵列及其用途,dsDNA含量检测试剂盒的用途,以及精神分裂症和/或其预后的诊断方法。
Description
技术领域
本发明涉及医学领域。具体地说,本发明涉及精神分裂症的生物标志物血浆游离DNA及其使用方法。
背景技术
精神分裂症(schizophrenia)是一种发病早,难治愈的复杂性精神疾病,临床表现包括幻觉、妄想、精神运动性不协调等阳性症状和(或)情感迟钝、情感淡漠、社交退缩、意志减退等阴性症状,严重影响患者的身体功能和生活质量。流行病学调查显示精神分裂症在世界范围内的终身患病率为1%左右,为家庭和社会带来了巨大的经济负担。
精神分裂症的临床症状复杂多样,个体差异较大,虽然国际上已有一些较为严格的诊断标准如DSM-5,ICD-10等,但目前临床诊断主要依赖于医生根据病人的详细病史与精神症状,再参考其发病年龄、病期、病程等来做综合判断,因此具有很强的主观性,缺乏客观的诊断指标。近年来,世界各地的科研工作者一直致力于寻找精神分裂症的生物标志物,建立有效的检测方法,以期提高诊断的一致性和准确度。
研究表明,血浆游离DNA主要来自于细胞凋亡,而精神分裂症患者由于细胞毒性、氧化压力、线粒体功能等的变化导致细胞凋亡高于正常人群,因此,将其应用于诊断精神分裂症就有了理论的可能。此外,血液是临床医学诊断中最常用的生物检测样本,具有取材方便、无创伤性、可连续体外检测的优点。因此,将血浆游离DNA作为分子标志用于精神分裂症的诊断具有重要的科研和临床应用前景。
发明内容
本发明的目的在于提供一种基于血浆游离DNA的核酸或其检测试剂的用途。
本发明的另一目的是提供一种用于诊断精神分裂症和/或精神分裂症预后的检测试剂盒。
在本发明的第一方面,提供了一种核酸或其检测试剂的用途,所述核酸或其检测试剂选自下组:
(a)血液中总游离dsDNA;
(b)ALU-115bp片段;
(c)用于检测ALU-115bp片段的引物和/或探针;
(d)ALU-247bp片段;
(e)用于检测ALU-247bp片段的引物和/或探针;
并且,所述核酸或其检测试剂用于制备诊断精神分裂症和/或精神分裂症预后的检测试剂或检测试剂盒。
在另一优选例中,所述的检测试剂包括核酸芯片或阵列。
在另一优选例中,所述ALU-115bp片段和/或ALU-247bp片段为标准品。
在另一优选例中,所述的检测试剂包括用于检测ALU-115bp片段的引物。
在另一优选例中,所述的检测ALU-115bp片段的引物为序列如SEQ ID NO.:1和2所示的引物对。
本发明的第二方面,提供了一种用于诊断精神分裂症和/或精神分裂症预后的检测试剂盒,所述试剂盒包括:
(1)用于检测核酸的检测试剂;
(2)任选的标准品,所述标准品选自ALU-115bp片段、ALU-247bp片段、或其组合;和
(3)描述利用(1)所述检测试剂进行检测的使用说明书;
其中,所述核酸选自下组:
(a)血液中总游离dsDNA(双链DNA);
(b)血液中ALU-115bp片段;
(c)血液中ALU-247bp片段;
或其组合。
在另一优选例中,所述的说明书中记载以下内容:
当所述样本中总游离dsDNA的浓度高于16.65ng/mL时,则表明该患者患精神分裂症风险高于正常人群;和/或
当所述样本中ALU-115bp片段的相对浓度高于7.15×10-08时,则表明该患者患精神分裂症风险高于正常人群。
在另一优选例中,所述的试剂盒还有用于检测ALU-115bp片段的引物。
在另一优选例中,所述的检测ALU-115bp片段的引物为序列如SEQ ID NO.:1和2所示的引物对。
在另一优选例中,所述试剂盒包括:
(1)检测核酸的检测试剂;
(2)标准品,所述标准品选自ALU-115bp片段、ALU-247bp片段、或其组合;
(2)描述利用(1)所述检测试剂检测核酸的使用方法的使用说明书;
本发明的第三方面,提供了一种核酸芯片或阵列及其用途,所述芯片或阵列上具有检测选自下组中至少一种核酸的探针:
(a)血液中总游离dsDNA;
(b)ALU-115片段;
(c)ALU-247片段;
并且,所述核酸芯片或阵列用于制备诊断精神分裂症和/或精神分裂症预后的试剂盒。
本发明的第四方面,提供了一种血液中dsDNA含量检测试剂盒的用途,它被用于制备诊断精神分裂症和/或精神分裂症预后的试剂盒。
本发明的第五方面,提供了一种对精神分裂症的辅助诊断和/或预后的方法,所述方法包括步骤:
(1)提供样本;
(2)检测核酸浓度或含量;
(3)与标准值或标准曲线比较,从而进行助诊断和/或预后;
其中,所述的所述核酸选自下组:(a)血液中总游离dsDNA;(b)血液中ALU-115bp片段;(c)血液中ALU-247bp片段;或其组合。
在另一优选例中,在步骤(3)中,当所述样本中总游离dsDNA的浓度高于16.65ng/mL时,则表明该患者患精神分裂症风险高于正常人群;和/或
当所述样本中ALU-115bp片段的相对浓度高于7.15×10-08时,则表明该患者患精神分裂症风险高于正常人群。
应理解,在本发明范围内中,本发明的上述各技术特征和在下文(如实施例)中具体描述的各技术特征之间都可以互相组合,从而构成新的或优选的技术方案。限于篇幅,在此不再一一累述。
附图说明
图1是精神分裂症患者组、情感障碍患者组和正常对照组中血浆游离dsDNA的Qubit定量结果散点图。
图2是精神分裂症患者组、情感障碍患者组和正常对照组qPCR定量ALU-115bp片段结果散点图。
具体实施方式
本发明人经过广泛而深入的研究,通过对患者和正常人的血浆游离DNA进行绝对浓度和相对浓度的定量分析,首次发现精神分裂症患者的游离DNA浓度显著高于正常人,这种差异主要发生在短片段DNA中,而长片段DNA无此差异,表明精神分裂症患者的游离DNA片段与正常人相比趋于更短,此外,较高的游离DNA水平在精神疾病中可能是精神分裂症特异性的。因此,游离DNA(以及相应的ALU-115片段或ALU-247片段),不仅可作为区分精神分裂症与正常人的分子标志物,且可在临床运用过程中用于区分精神分裂症与其他症状相近的精神疾病,以降低临床误诊的几率。在此基础上完成了本发明。
术语
精神分裂症
精神分裂症是精神疾病的一种。其特征为患者出现异常的社会行为和不能理解什么是真实的。常见症状包括妄想、幻觉、思维混乱、幻听、社会参与和情绪表达的程度减少,以及缺乏动机等。临床诊断通常由临床医生依据DSM-5的诊断标准结合临床经验来判断。
血浆总游离DNA
正常条件下,人体组织和血液中的细胞在新陈代谢过程中会发生不同程度的细胞程序性死亡(凋亡),病理条件下可能会伴随细胞凋亡的异常甚至细胞坏死的现象。细胞在发生凋亡或坏死时会发生细胞核的皱缩和DNA的释放,这些释放出来的DNA通常呈片段化,并会随着血液循环进入血浆、尿液等体液中,我们将血浆中分离出来的DNA片段统称为血浆总游离DNA。
ALU-115片段
ALU序列是人类基因组中一组散在分布的重复序列,长约300bp。ALU-115是指通过特定引物以ALU序列为模板扩增出的一段长约115bp的dsDNA片段,由于该序列在基因组中散在分布,因此对血浆总游离DNA进行该片段的相对定量可代表总游离DNA的相对浓度,包括长片段和短片段的游离DNA。
ALU-247片段
与ALU-115类似,ALU-247是指通过特定引物以ALU序列为模板扩增出的一段长约247bp的dsDNA片段,它可代表较长的游离DNA片段。
用于辅助性诊断精神分裂症和/或精神分裂症预后的检测试剂、试剂盒和方法
本发明提供了一种基于血浆游离DNA以及相应的ALU-115片段或ALU-247片段,诊断(尤其是辅助性诊断)诊断精神分裂症和/或精神分裂症预后的方法,以及相应的检测试剂、试剂盒。
可用于本发明方法和试剂盒的物质包括核酸或其检测试剂,其中,所述核酸或其检测试剂选自下组:
(a)血液中总游离dsDNA;
(b)ALU-115bp片段;
(c)用于检测ALU-115bp片段的引物和/或探针;
(d)ALU-247bp片段;
(e)用于检测ALU-247bp片段的引物和/或探针。
基于本发明的意外发现,所述核酸或其检测试剂可用于制备诊断精神分裂症和/或精神分裂症预后的检测试剂或检测试剂盒。
通常,所述的ALU-115片段或ALU-247片段可作为标准品,而相应的检测试剂可用于检测(尤其是定量检测)血浆游离DNA以及相应的ALU-115片段或ALU-247片段的数量,从而用于提供辅助诊断和预后的检测数据。
本发明的研究表明,当基于检测数据进行分析时,
当所述样本中总游离dsDNA的浓度高于16.65ng/mL时,则表明该患者患精神分裂症风险高于正常人群;
当所述样本中ALU-115bp片段的相对浓度高于7.15×10-08时,则表明该患者患精神分裂症风险高于正常人群;
当所述样本中总游离dsDNA的浓度高于31.3ng/mL时,则表明判别该患者有非常高的患有精神分裂症的风险;和/或
所述样本中DNA ALU-115bp序列的相对浓度高于1.01×10-07时,则表明该患者有非常高的患有精神分裂症的风险。
本发明的主要优点在于:
(1)本发明采用血液样本进行精神分裂症的诊断具有取材方便、无创伤性、可连续体外检测的优点。
(2)本发明采用多种检测方法评估游离DNA的浓度,诊断结果更加真实可靠。
(3)本发明不仅可用于区分精神分裂症与正常人,且可在临床运用过程中用于区分精神分裂症与其他症状相近的精神疾病,以降低临床误诊的几率。
下面结合具体实施例,进一步阐述本发明。应理解,这些实施例仅用于说明本发明而不用于限制本发明的范围。下列实施例中未注明具体条件的实验方法,通常按照常规条件如Sambrook等人,分子克隆:实验室手册(New York:Cold Spring Harbor LaboratoryPress,1989)中所述的条件,或按照制造厂商所建议的条件。除非另外说明,否则百分比和份数按重量计算。
本发明中所涉及的实验试剂和设备,如无特殊说明,均可从市售渠道获得。
材料
1.样本收集
从安徽省芜湖市第四人民医院筛选收集了通过DSM-IV诊断的首发或停药一年以上精神分裂症患者65例,情感障碍患者29例(包括18例重度抑郁和11例双相情感障碍)和正常对照62例,病例组与正常对照组间年龄、性别、BMI、吸烟饮酒习惯等均严格匹配。所有入组个体均无糖尿病、恶性肿瘤、发热、炎症等躯体疾病,且在入组前1个月内未服用其他任何药物,所有女性个体均未处于妊娠期。本发明的研究已通过芜湖市第四人民医院伦理委员会审查,实验方案符合道德原则,且通过书面方式正式告知所有入组人员。
2.游离DNA抽提
每位受试人员入组时采取5ml外周血于EDTA抗凝管中,室温下1600g离心10分钟初步分离血浆。再将分离出来的血浆在4℃条件下16000g离心10分钟,去除沉淀中残留的细胞碎片。取0.6ml上述血浆,用天根生物科技有限公司的微量DNA抽提试剂盒(TIANamp MicroDNA Kit)分离提取血浆游离DNA。具体操作步骤如下:
1)从-80℃冰箱中取出上述分离好的血浆,常温融化,取300uL血浆到2mL离心管中,再向管中加入30ul蛋白酶K,涡旋混匀;
2)向管中加入300uL GB和1.5uLCarrier RNA,颠倒混匀,置于56℃水浴锅中孵育10min,其间不时拿出颠倒混匀;简短离心去除内壁上的液滴;
3)向管中加入300ul乙醇(注意:若室温高于25℃,则将乙醇提前置于冰上预冷),颠倒混匀,静置5min,再简短离心;
4)将上一步所得的混合液加到一个CR2吸附柱中,常温,12000rpm,离心30s,倒出下管中的废液;
5)重新取300uL来自于同一样本的血浆,重复以上步骤1-3,并将混合液加上步骤4中的CR2吸附柱中,12000rpm,离心30s,倒出下管中的废液;
6)向吸附柱中加入500uL GD溶液,12000rpm,离心30s,倒出下管中的废液;
7)向吸附柱中加入600uL PW溶液,12000rpm,离心30s,倒出下管中的废液;
8)重复步骤7;
9)将吸附柱于12000rpm,常温条件下,空转2min,倒出下管中的废液,并将吸附柱置于室温敞口静置2-5min,以彻底晾干;
10)向吸附柱中的膜上加入30uL无RNA酶的双蒸水,常温放置2-5min,再在12000rpm、室温条件下离心2min,最后将下管中的游离DNA水溶液转移到新的1.5mL离心管中,缠绕封口膜,-80℃冰箱保存。
通用方法
1.用Qubit进行绝对浓度的定量和数据分析
采用赛默飞世尔科技公司的Qubit平台,依据其配套的高灵敏度dsDNA检测试剂盒(Quant-iTTM dsDNA High-Sensitivity Assay Kit)对65例精神分裂症、29例情感障碍和62例正常人的游离DNA进行荧光定量,并将测得的浓度换算成血浆中游离DNA的绝对浓度(ng/ml)。
Qubit定量平台采用荧光染料检测特定目标分子的浓度。dsDNA High-Sensitivity Assay Kit中包含只与双链DNA结合后才发出荧光的Molecular染料,对双链DNA(dsDNA)有高度的选择性,可以定量浓度为10pg/μl到100ng/μl的样品。
试剂盒提供了浓缩的分析试剂,稀释缓冲液和预制的DNA标准品(包括0ng/ul和10ng/ul两个)。具体操作步骤如下:
1)先用缓冲液将分析试剂稀释200倍,配置适量体积的工作液。
2)将10ul标准品添加到190ul工作液中,1ul待测样品加入199ul工作液中,涡旋2-3秒充分混匀。
3)根据仪器操作流程,使用2.0荧光仪读取浓度。
先通过绘制箱线图,去除每组中3倍SD以外的异常值。由于数据分布不全服从正态分布,因此采用Wilcox-Mann-Whitney非参数检验来评估组间差异。检测到的P值可以表征游离DNA在组间是否存在显著差异,具体的差异表达量则用倍数比来表示。当P<0.05时,认为差异达到显著水平。
2.使用qRCR方法验证定量结果并探索游离DNA片段长度特征
人ALU重复序列散在分布于人基因组中,因此通过定量PCR的方法对ALU序列进行相对浓度的定量可代表游离DNA的相对浓度。此外,通过对一段较长的ALU序列(ALU-247bp)进行相对定量,可判断精神分裂症患者血浆游离DNA的片段长度特征。通过以下引物序列,扩增游离DNA中ALU序列的115bp和247bp片段。
引物名称 | 序列 | SEQ ID NO.: |
上游引物-115 | 5’CCTGAGGTCAGGAGTTCGAG-3’ | 1 |
下游引物-115 | 5’CCCGAGTAGCTGGGATTACA-3’ | 2 |
将抽提出来的游离DNA稀释50倍后进行qPCR反应,所有反应均在ViiATM7Real-TimePCR平台上进行,每次反应均设置了空白对照,且每个反应均重复三次取平均值。反应体系和程序如下:
在本实施例中,通过Ct值来表示检测结果,即每个反应内的荧光信号达到设定的阈值时所经历的循环数。
研究表明,每个模板的Ct值与该模板的起始拷贝数的对数存在线性关系,因此采用2-Ct作为该模板的相对定量值。数据分析过程与上述一致,同样是经过删除异常值后采用非参数检验的方法来评估组间差异。
实施例1精神分裂症患者血浆游离DNA浓度高于正常人,而情感障碍患者与正常人无异
对上述65例精神分裂症、29例情感障碍、62例正常人的血浆游离DNA采用Qubit平台进行总浓度的测定。样本统计学和临床信息见表1。定量结果见表2,精神分裂症患者的游离DNA平均浓度为21.1ng/mL,最低值为5.0ng/mL(此浓度为Qubit荧光定量仪检测的最低值),最高值为66.0ng/mL,正常人中cfDNA的平均浓度为12.68ng/mL,最低值为5.0ng/mL,最高值为31.3ng/mL,P值小于0.0001,而情感障碍组患者与正常人无显著差异,见图1,表3。
表1:人口统计学与临床信息
a:t检验;b:卡方检验;
表2精神分裂症组、情感障碍组和正常人组游离DNA荧光定量结果
平均值±标准差 | 最小值 | 最大值 | 中位数 | 上四分位数 | 下四分位数 | |
精神分裂症组 | 21.10±12.0 | 5.0 | 66.0 | 18.60 | 26 | 13.2 |
情感障碍组 | 12.15±5.38 | 5.0 | 25.2 | 10.50 | 14.2 | 8.4 |
正常人组 | 12.68±5.51 | 5.0 | 31.3 | 12.40 | 16.65 | 8.9 |
单位:ng/mL
表3精神分裂症组和情感障碍组与正常人组游离DNA荧光定量统计结果
非参数检验P值 | 倍数比 | |
精神分裂症组比正常人组 | 0.000027 | 1.67 |
情感障碍组比正常人组 | 0.5781 | 0.96 |
选取正常人中浓度的最大值31.3ng/mL和上四分位数16.65ng/mL作为诊断精神分裂症的两个阈值,其特异度和敏感度见表4。
当患者的血浆游离DNA总浓度高于31.3ng/mL时,可判别该患者患有精神分裂症,需要进行治疗;当患者的血浆游离DNA总浓度高于16.65ng/mL时,可认定该患者具有较高的精神分裂症风险,需结合其他方法进行进一步的确诊。
表4精神分裂症组和情感障碍组与正常人组游离DNA荧光定量统计结果
实施例2精神分裂症患者血浆游离DNA ALU-115bp序列的qPCR相对定量浓度高于正常人,而情感障碍患者与正常人无异。
通过对与上述方法中一致的人群进行ALU-115bp扩增序列的qPCR相对定量,见图2。具体定量结果和统计结果见表5,表6。
结果显示,精神分裂症患者的游离DNA相对浓度显著高于正常人,P值为0.0080,倍数比为1.6,而情感障碍患者无显著变化,P值为0.1632。
表5精神分裂症组、情感障碍组和正常人组游离DNA ALU-115bp片段qPCR相对定量结果
表6精神分裂症组和情感障碍组与正常人组游离DNA荧光定量统计结果
非参数检验P值 | 倍数比 | |
精神分裂症组比正常人组 | 0.0080 | 1.70 |
情感障碍组比正常人组 | 0.1632 | 1.49 |
基于以上结果,同样选取正常人游离DNA的相对浓度的最大值1.01×10-07和上四分位数7.15E-08作为诊断精神分裂症的两个阈值,其特异度和敏感度见表7。
当患者的血浆游离DNA相对浓度高于1.01×10-07时,可判别该患者患有精神分裂症,需要进行治疗;当患者的血浆游离DNA总浓度高于7.15E-08时,可判别该患者具有较高的精神分裂症风险,需结合其他方法进行进一步的确诊。
表7精神分裂症组和情感障碍组与正常人组游离DNA荧光定量统计结果
实施例4
用于辅助性诊断精神分裂症或用于精神分裂症预后的试剂盒
制备一用于辅助性诊断精神分裂症的试剂盒,所述试剂盒包括:
(a)容器,以及位于容器内的扩增ALU-115bp片段的引物(SEQ ID NO.:1和SEQ IDNO.:2);以及
(b)说明书,所述标签或说明书注明所述试剂盒用于辅助性诊断精神分裂症或用于精神分裂症预后。
用所述试剂盒对120个未知样本进行了ALU-115bp片段的相对浓度进行检测。
其中,有5个样本ALU-115bp片段的相对浓度高于7.15×10-08(其中2个样本中DNAALU-115bp序列的相对浓度高于1.01×10-07)。对相应个体进行精神分裂症常规诊断,确认有3个对象患精神分裂症,1个有精神分裂症倾向。
讨论
本发明的实验均提示:精神分裂症患者由于体内凋亡过程被激活,导致血浆游离DNA浓度升高。精神分裂症作为一种个体化差异很大的复杂疾病,通常很难由一到两种分子标志无对其进行精确的划分,需通过多种诊断指标结合医生的主观判断共同诊断。
基于该发明,游离DNA的总浓度定量和相对浓度定量均可筛选出一部分的精神分裂症患者,具有较高的特异性。当降低阈值,即检测值高于正常人群的上四分位数时,可筛选出较多患者,虽然特异性不高,但该指标具有较高的敏感度,可作为精神分裂症的一个高风险指标,为临诊断提供参考。
此外,由于这一结果仅在精神分裂症患者中被发现,在情感障碍组(包括双相情感障碍和重度抑郁)中并未出现,说明游离DNA这一指标的升高在精神疾病中很有可能是精神分裂症所特有的,在临床实践中,有利于医生将精神分裂症与其他精神疾病区分,有效降低误诊率。
综上,游离DNA不仅可作为区分精神分裂症与正常人的分子标志物,且可在临床运用过程中用于区分精神分裂症与其他症状相近的精神疾病,以降低临床误诊的几率。
在本发明提及的所有文献都在本申请中引用作为参考,就如同每一篇文献被单独引用作为参考那样。此外应理解,在阅读了本发明的上述讲授内容之后,本领域技术人员可以对本发明作各种改动或修改,这些等价形式同样落于本申请所附权利要求书所限定的范围。
序列表
<110> 上海添音生物科技有限公司
<120> 用于诊断精神分裂症的外周血标志物-血浆游离DNA
<130> P2016-1730
<160> 2
<170> PatentIn version 3.5
<210> 1
<211> 20
<212> DNA
<213> 人工序列
<400> 1
cctgaggtca ggagttcgag 20
<210> 2
<211> 20
<212> DNA
<213> 人工序列
<400> 2
cccgagtagc tgggattaca 20
Claims (10)
1.一种核酸或其检测试剂的用途,其特征在于,所述核酸或其检测试剂选自下组:
(a)血液中总游离dsDNA;
(b)ALU-115bp片段;
(c)用于检测ALU-115bp片段的引物和/或探针;
(d)ALU-247bp片段;
(e)用于检测ALU-247bp片段的引物和/或探针;
并且,所述核酸或其检测试剂用于制备诊断精神分裂症和/或精神分裂症预后的检测试剂或检测试剂盒。
2.如权利要求1所述的用途,其特征在于,所述的检测试剂包括用于检测ALU-115bp片段的引物。
3.如权利要求2所述的用途,其特征在于,所述的检测ALU-115bp片段的引物为序列如SEQ ID NO.:1和2所示的引物对。
4.一种用于诊断精神分裂症和/或精神分裂症预后的检测试剂盒,其特征在于,所述试剂盒包括:
(1)用于检测核酸的检测试剂;
(2)任选的标准品,所述标准品选自ALU-115bp片段、ALU-247bp片段、或其组合;和
(3)描述利用(1)所述检测试剂进行检测的使用说明书;
其中,所述核酸选自下组:
(a)血液中总游离dsDNA;
(b)血液中ALU-115bp片段;
(c)血液中ALU-247bp片段;
或其组合。
5.如权利要求4所述的试剂盒,其特征在于,所述的说明书中记载以下内容:
当所述样本中总游离dsDNA的浓度高于16.65ng/mL时,则表明该患者患精神分裂症风险高于正常人群;和/或
当所述样本中ALU-115bp片段的相对浓度高于7.15×10-08时,则表明该患者患精神分裂症风险高于正常人群。
6.如权利要求4所述的试剂盒,其特征在于,所述的试剂盒还有用于检测ALU-115bp片段的引物。
7.如权利要求6所述的试剂盒,其特征在于,所述的检测ALU-115bp片段的引物为序列如SEQ ID NO.:1和2所示的引物对。
8.一种核酸芯片或阵列的用途,其特征在于,所述芯片或阵列上具有检测选自下组中至少一种核酸的探针:
(a)血液中总游离dsDNA;
(b)ALU-115片段;
(c)ALU-247片段;
并且,所述核酸芯片或阵列用于制备诊断精神分裂症和/或精神分裂症预后的试剂盒。
9.一种血液中dsDNA含量检测试剂盒的用途,其特征在于,用于制备诊断精神分裂症和/或精神分裂症预后的试剂盒。
10.一种对精神分裂症的辅助诊断和/或预后的方法,其特征在于,所述方法包括步骤:
(1)提供样本;
(2)检测核酸浓度或含量;
(3)与标准值或标准曲线比较,从而进行助诊断和/或预后;
其中,所述的核酸选自下组:(a)血液中总游离dsDNA;(b)血液中ALU-115bp片段;(c)血液中ALU-247bp片段;或其组合。
Priority Applications (1)
Application Number | Priority Date | Filing Date | Title |
---|---|---|---|
CN201710004688.4A CN108277268B (zh) | 2017-01-04 | 2017-01-04 | 用于诊断精神分裂症的外周血标志物-血浆游离dna |
Applications Claiming Priority (1)
Application Number | Priority Date | Filing Date | Title |
---|---|---|---|
CN201710004688.4A CN108277268B (zh) | 2017-01-04 | 2017-01-04 | 用于诊断精神分裂症的外周血标志物-血浆游离dna |
Publications (2)
Publication Number | Publication Date |
---|---|
CN108277268A true CN108277268A (zh) | 2018-07-13 |
CN108277268B CN108277268B (zh) | 2021-07-20 |
Family
ID=62800597
Family Applications (1)
Application Number | Title | Priority Date | Filing Date |
---|---|---|---|
CN201710004688.4A Active CN108277268B (zh) | 2017-01-04 | 2017-01-04 | 用于诊断精神分裂症的外周血标志物-血浆游离dna |
Country Status (1)
Country | Link |
---|---|
CN (1) | CN108277268B (zh) |
Citations (3)
Publication number | Priority date | Publication date | Assignee | Title |
---|---|---|---|---|
CN102146479A (zh) * | 2011-04-15 | 2011-08-10 | 上海交通大学 | 用于精神分裂症、双相情感障碍和重性抑郁症关联基因检测的引物、探针及其试剂盒及制备方法 |
US20140171413A1 (en) * | 2012-12-13 | 2014-06-19 | China Medical University | Compositions and methods for diagnosis of schizophrenia |
CN104120172A (zh) * | 2013-04-28 | 2014-10-29 | 上海交通大学 | 精神分裂症的基因标志物及其使用方法和应用 |
-
2017
- 2017-01-04 CN CN201710004688.4A patent/CN108277268B/zh active Active
Patent Citations (3)
Publication number | Priority date | Publication date | Assignee | Title |
---|---|---|---|---|
CN102146479A (zh) * | 2011-04-15 | 2011-08-10 | 上海交通大学 | 用于精神分裂症、双相情感障碍和重性抑郁症关联基因检测的引物、探针及其试剂盒及制备方法 |
US20140171413A1 (en) * | 2012-12-13 | 2014-06-19 | China Medical University | Compositions and methods for diagnosis of schizophrenia |
CN104120172A (zh) * | 2013-04-28 | 2014-10-29 | 上海交通大学 | 精神分裂症的基因标志物及其使用方法和应用 |
Non-Patent Citations (2)
Title |
---|
AO HUANG等: "Plasma Circulating Cell-free DNA Integrity as a Promising Biomarker for Diagnosis and Surveillance in Patients with Hepatocellular Carcinoma", 《JOURNAL OF CANCER》 * |
E S ERSHOVA等: "Quantification of cell-free DNA in blood plasma and DNA damage degree in lymphocytes to evaluate dysregulation of apoptosis in schizophrenia patients", 《JOURNAL OF PSYCHIATRIC RESEARCH》 * |
Also Published As
Publication number | Publication date |
---|---|
CN108277268B (zh) | 2021-07-20 |
Similar Documents
Publication | Publication Date | Title |
---|---|---|
CN106755491A (zh) | 基于宫颈癌特异性甲基化检测的引物对、试剂盒及方法 | |
CN105603101B (zh) | 检测8个miRNA表达量的系统在制备诊断或辅助诊断肝细胞癌产品中的应用 | |
CN108676878A (zh) | 基于ndrg4基因甲基化序列的结直肠癌早期检测方法 | |
WO2015069900A1 (en) | Methods for profiliing and quantitating cell-free rna | |
CN107460241A (zh) | 外泌体小分子rna在急性心肌梗死风险评估中的应用 | |
Mosca et al. | Cell-free DNA in the plasma of patients with systemic sclerosis | |
CN109735612A (zh) | 川崎病冠状动脉瘤并发症的生物分子标志物及其试剂盒 | |
CN110305953A (zh) | 检测miRNA表达量的系统在制备区分结核性脑膜炎和病毒性脑膜炎产品中的应用 | |
CN108277268A (zh) | 用于诊断精神分裂症的外周血标志物-血浆游离dna | |
CN116769892A (zh) | circRNA生物标志物在抑郁症诊断中的应用 | |
CN112779331B (zh) | 一种血管痴呆血清外泌体microRNAs标志物及其应用 | |
US20210087634A1 (en) | Determination of risk for development of cardiovascular disease by measuring urinary levels of podocin and nephrin messenger rna | |
CN111455037B (zh) | 基于血浆外泌体环状rna的冠心病分子诊断标志物及其应用 | |
CN108220416A (zh) | 一种用于检测阴虚上火体质血清特异性miRNA的试剂盒及其应用 | |
CN117025758B (zh) | 环状rna在制备诊断孤独症的生物标志物中的应用 | |
CN113528635B (zh) | 一种印记基因的甲基化作为心脑血管疾病早期诊断的标志物 | |
CN114381529B (zh) | Actr10与ca125联合在卵巢癌检测中的应用和试剂盒 | |
CN109295213A (zh) | 免疫性血小板减少症的miRNA标志物及试剂盒和应用 | |
CN107190073A (zh) | hsa_circRNA_104907在唐氏综合征的诊断、治疗及预后中的应用 | |
CN107190074A (zh) | hsa_circRNA_103127在唐氏综合征的诊断、治疗及预后中的应用 | |
US11377699B2 (en) | Methods for evaluating head and neck cancers | |
CN106544435A (zh) | 检测miR‑206所需逆转录引物对在制备预测试剂盒中的应用 | |
CN105368934A (zh) | MicroRNA-4454和MicroRNA-7975在制备检测银屑病试剂或试剂盒中的应用 | |
CN105779579A (zh) | 评估罹患结肠直肠癌风险的方法及标志物 | |
Kim et al. | Diagnostic performance of face masks for collection and detection of SARS-CoV-2 |
Legal Events
Date | Code | Title | Description |
---|---|---|---|
PB01 | Publication | ||
PB01 | Publication | ||
SE01 | Entry into force of request for substantive examination | ||
SE01 | Entry into force of request for substantive examination | ||
GR01 | Patent grant | ||
GR01 | Patent grant |