CN107619833B - 用于构建布鲁氏菌突变株的质粒pZF17-30及其构建方法和应用 - Google Patents

用于构建布鲁氏菌突变株的质粒pZF17-30及其构建方法和应用 Download PDF

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Abstract

本发明提供了一种用于构建布鲁氏菌突变株的质粒pZF17‑30及其构建方法和应用,构建过程主要包括从商业化质粒pCMV‑BE3中扩增rAPOBEC1‑nCas9‑UGI片段,并将该片段与含有泛宿主复制子pBBR1‑MCS‑5和非特异性sgRNA的载体通过重组反应整合到一起,随后将ccdB基因与Chl抗性基因插入sgRNA中;利用限制性内切酶BsaI酶切质粒pZF17‑30,将特异性sgRNA与线性化pZF17‑30连接,构建的载体的序列如SEQ ID NO.3所示,该载体可用于构建布鲁氏菌突变株,将virB10基因CDS区478位碱基由C突变为T。

Description

用于构建布鲁氏菌突变株的质粒pZF17-30及其构建方法和 应用
技术领域
本发明属于基因工程技术领域,具体涉及一种用于构建布鲁氏菌突变株的质粒pZF17-30及其构建方法,可用于布鲁氏菌基因编码区终止突变,蛋白质翻译提前终止。
背景技术
布鲁氏菌病(brucellosis)是一种波及世界的重要的人畜共患病,对畜牧业造成了严重的经济损失,因为它人畜共患病的特点,也使其成为了人类健康和社会安全的一大威胁。然而,迄今为止,都未能研发出安全有效的疫苗。布鲁氏菌(Brucella),又称作布氏杆菌,是造成布鲁氏菌病的病原体,要研发出安全有效的疫苗,对该菌各类基因的功能研究是十分重要的。
目前,对布鲁氏菌基因的功能研究存在许多困难。一是布鲁氏菌生长缓慢,在实验室稳定的培养环境下,菌体需要生长36-48h才能在平板上长出肉眼可见的菌落,初次分离的野生菌株生长往往更加缓慢。二是布鲁氏菌病人畜共患的特征,使得对布鲁氏菌的操作变的相当繁琐和耗时。这些因素都使得对布鲁氏菌基因的研究变得格外困难。随着对布鲁氏菌致病机理的深入研究以及与其相关的分子生物学技术的发展,布鲁氏菌病基因工程疫苗的研究成为生命科学的一项重要课题,基因工程疫苗有望代替传统的弱毒活疫苗,成为安全有效新型布病疫苗。基因工程疫苗旨在解决传统布病疫苗存在的安全、保护力低、干扰血清学诊断等问题,主要包括基因工程弱毒活疫苗、活载体疫苗、DNA疫苗和亚单位疫苗。其中基因工程活疫苗是利用分子生物学技术将布鲁氏菌的某个毒力基因进行缺失或者过提高保护性抗原的表达,由于其具有安全性更高、可以利用血清学诊断区分疫苗接种和自然感染,是目前布鲁氏菌病疫苗的研究热点(景志刚等2016)。利用分子生物学技术在強毒株或分离株上将毒力基因进行缺失,研发基因缺失疫苗。例如LPS合成基因如pgm、wboA、per等基因缺失突变株;外膜蛋白基因如omP25、omP31、bp26等基因缺失突变株;代谢通路和转录调控因子必须基因如vrrB2、vjbR等基因缺失突变株。这些基因缺失突变株改善了传统布鲁氏菌病弱毒疫苗安全性差、干扰血清学免疫诊断等缺点。但是目前构建布鲁氏菌毒力基因缺失的技术大多使用传统的同源重组结合自杀质粒进行,但是传统的同源重组技术存在自身的弊端,例如,针对不同的靶基因需要重新构建复杂的打靶和筛选载体质粒使得操作繁琐、工作量大、耗时长、增加了实验成本,同时载体质粒的构建也受克隆载体及靶基因所在的基因组上的限制性酶切位点的限制,进行功能基因组学实验操作时,克隆载体可能无法承受大片段的DNA,此外传统的同源重组技术发生重组的概率低(Copeland et al 2001),限制了该项技术在实验室大规模应用,也使得布鲁氏菌毒力基因研究进展缓慢,因此这种传统的布鲁氏菌基因编辑技术有望得到改进。
发明内容
本发明的目的在于提供一种质粒pZF17-30,包含氯霉素抗性基因和毒性基因ccdB,两个酶切位点Bsa I,方便质粒重组筛选,可在大肠杆菌和布鲁氏菌等细菌中复制。
本发明的再一个目的在于提供由pZF17-30构建得到的载体在制备布鲁氏菌的单碱基突变株中的应用,仅需要插入特异性sgRNA,转化布鲁氏菌后即可实现对特定基因终止突变,获得细菌突变株。
为了实现上述目的,本发明采用以下技术方案:
质粒pZF17-30的构建方法,其步骤是:
1.将sgRNA插入质粒pBBR1-MCS-5,所述的sgRNA的序列为5′-GTTTTAGAGCTAGGCCAACATGAGGATCACCCATGTCTGCAGGGCCTAGCAAGTTAAAATAAGGCTAGTCCGTTATCAACTTGGCCAACATGAGGATCACCCATGTCTGCAGGGCCAAGTGGCACCGAGTCGGTGCTTTTT-3′,转化大肠杆菌TransT1感受态细胞,得到pZF17-26;
2.以质粒pCMV-BE3为模板,oWY-158(5′-AAGGAAGCTAAAATGCATATGAGCTCAGAGACTGGCCCAG-3′)、oWY-159(5′-TGGAGATCCTTACTCGAGAGGCTGATCAGCGGGTTTAAAC-3′)为引物,扩增rAPOBEC1-nCas9-ugi片段(5182bp);以pZF17-26为模板,oWY-156(5′-CTCGAGTAAGGATCTCCAGGCATCA-3′)、oWY-157(5′-ATGCATTTTAGCTTCCTTAGCTCCT-3′)为引物,扩增含有泛宿主复制子的线性化载体(pBBR1oriV-lac I)(9119bp);将上述扩增的线性化载体和插入基因(rAPOBEC1-nCas9-ugi片段)通过同源重组反应整合,转化大肠杆菌TransT1感受态细胞,得到pZF17-29质粒;
3.将pZF17-29用限制性内切酶Bsa I酶切线性化作为载体,以质粒pDONR221为模板,oWY-179(5′-CTGATGGAAGAGACCGACGTTGTAAAACGACGGCCAGT-3′)、oWY-180(5′-CTAAAACTGAGACCAAGCTGCCAGGAAACAGCTATGA-3′)为引物扩增Chl抗性基因和ccdB基因(2520bp),将PCR产物用限制性内切酶Bsa I酶切作为插入片段与载体进行酶连反应,转化大肠杆菌TransDB3.1感受态细胞,得到质粒pZF17-30,其序列如SEQ ID NO.1所示。
含有质粒pZF17-30的大肠杆菌(Escherichia coli)PZF17-30于2017年6月29日保藏于中国典型培养物保藏中心,地址:中国.武汉.武汉大学,其保藏编号为CCTCC No:M2017395。
由pZF17-30构建得到的载体的制备方法,其步骤是:
1.设计特异性sgRNA,具体序列如下:oWY-181(5′-TGGAACAGTCAAAAGAACACCAAGC-3′),oWY-182(5′-CAAAGCTTGGTGTTCTTTTGACTGT-3′);
2.线性化质粒载体的制备:利用限制性内切酶Bsa I酶切质粒pZF17-30,使其线性化,纯化后用作载体;
3.sgRNA的制备:将sgRNA引物做磷酸化处理,37℃反应30min后,将2条引物混合均匀,94℃反应5min,随后缓慢退火形成dimer;
4.载体与sgRNA的连接:将sgRNA dimer与线性化载体连接,即插入pZF17-30的两个Bsal位点之间,替换掉ccdB毒性基因和Chl抗性基因(插入位点123-143),转化大肠杆菌TransT1感受态细胞,挑取转化子,通过测序验证特异性sgRNA插入成功,序列如SEQ IDNO.3所示。
由pZF17-30构建得到的载体在制备布鲁氏菌的单碱基突变株中的应用:
将含有特异性sgRNA的载体转化布鲁氏菌,提取待检菌体的基因组DNA,随后利用PCR对靶基因(布鲁氏菌VirB10基因的CDS区序列)进行扩增(引物VirB10-F 5′-atgacacaggaaaacattccgg-3′,VirB10-R 5′-tcacttcggtttgacatcataca-3′),并对突变位点进行测序验证。结果显示,在挑取的21个转化子中有11个样品的VirB10基因的CDS区序列单碱基突变成功,突变株的测序结果如SEQ ID NO.4所示,突变后第478位的碱基C突变为T。
与现有技术相比,本发明具有以下优点及有益效果:相比现有传统技术利用单交换和双交换方法获得突变株存在的耗时长、重组率低和筛选工作量大的缺陷,本系统具有sgRNA设计简易、特异性强、效率高等优点,并且能够实现传统技术不具备的定点基因突变,而且由于sgRNA是特异的,所以每次的定点突变都只需设计相应的sgRNA,操作技术简单并且大大节约了时间成本,使其在基因的定点突变领域得到了广泛有效的利用。
附图说明
图1为质粒pZF17-30的图谱。
图2为质粒pZF17-30的构建流程图。
具体实施方式
各实施例中使用的生物材料来源如下:
质粒pBBR1-MCS-5:购自美国BioVector NTCC公司
质粒pCMV-BE3:购自美国Addgene公司
质粒pDONR221:购自美国BioVector NTCC公司
大肠杆菌TransT1感受态细胞:购自北京全式金生物(TransGen Biotech)
大肠杆菌TransDB3.1感受态细胞:购自北京全式金生物(TransGen Biotech)实施例1pZF17-30质粒构建
pZF17-30质粒的组成如图1所示,构建流程如图2所述,具体方法如下:
1.将sgRNA插入质粒pBBR1-MCS-5,所述的sgRNA的序列为5′-GTTTTAGAGCTAGGCCAACATGAGGATCACCCATGTCTGCAGGGCCTAGCAAGTTAAAATAAGGCTAGTCCGTTATCAACTTGGCCAACATGAGGATCACCCATGTCTGCAGGGCCAAGTGGCACCGAGTCGGTGCTTTTT-3′,转化大肠杆菌TransT1感受态细胞,得到pZF17-26;
2.以质粒pCMV-BE3为模板,oWY-158(5′-AAGGAAGCTAAAATGCATATGAGCTCAGAGACTGGCCCAG-3′)、oWY-159(5′-TGGAGATCCTTACTCGAGAGGCTGATCAGCGGGTTTAAAC-3′)为引物,扩增rAPOBEC1-nCas9-ugi片段(5182bp);以pZF17-26为模板,oWY-156(5′-CTCGAGTAAGGATCTCCAGGCATCA-3′)、oWY-157(5′-ATGCATTTTAGCTTCCTTAGCTCCT-3′)为引物,扩增含有泛宿主复制子的线性化载体(pBBR1oriV-lac I)(9119bp);将上述扩增的线性化载体和插入基因(rAPOBEC1-nCas9-ugi片段)通过同源重组反应整合,转化大肠杆菌TransT1感受态细胞,得到pZF17-29质粒;
3.将pZF17-29用限制性内切酶Bsa I酶切线性化作为载体,以质粒pDONR221为模板,oWY-179(5′-CTGATGGAAGAGACCGACGTTGTAAAACGACGGCCAGT-3′)、oWY-180(5′-CTAAAACTGAGACCAAGCTGCCAGGAAACAGCTATGA -3′)为引物扩增Chl抗性基因和ccdB基因(2520bp),将PCR产物用限制性内切酶Bsa I酶切作为插入片段与载体进行酶连反应,转化大肠杆菌TransDB3.1感受态细胞,得到质粒pZF17-30,其序列如SEQ ID NO.1所示。
质粒pZF17-30含有如下片段:ColE1复制子、庆大霉素抗性基因、pBBR1复制子、氯霉素抗性基因-ccdB自杀基因、sgRNA骨架、lacI基因、rAPOBEC1-nCas9-UGI融合基因,功能分别为:(1)作为大肠杆菌中质粒复制必要元件,承担质粒复制任务,高拷贝复制子,提高质粒提取效率;(2)提供庆大霉素抗性,用于筛选;(3)泛宿主复制子可于大肠杆菌和布鲁氏菌中复制,作为穿梭元件;(4)该片段两端有BsaI位点,可被切除,产生粘性末端,用于构建sgRNA seedregion区,自杀基因可有效提高重组质粒阳性率;(5)作为sgRNA骨架,在CRISPR系统工作时发挥引导Cas9的作用;(6)编码合成lacI抑制蛋白,负调控rAPOBEC1-nCas9-UGI基因表达;(7)编码融合蛋白,该蛋白具有切割dsDNA,造成其中一条链断裂,在切口附近将dCTP转化为dUTP,并且抑制细菌内源的UNG酶(尿嘧啶DNA糖基酶)活性。该质粒具有如下特性:(1)于大肠杆菌和布鲁氏菌等革兰阴性菌穿梭;(2)高效构建重组质粒;(3)特异性可诱导定向突变细菌基因组碱基。含有该质粒的大肠杆菌菌株(DB3.1)PZF17-30(Escherichiacoli)于2017年6月29日保藏在中国典型培养物保藏中心(CCTCC),地址:中国.武汉.武汉大学,其保藏编号:CCTCC No:M 2017395。
实施例2质粒pZF17-30在制备布鲁氏菌突变株中的应用
本实施例以pZF17-30作为出发质粒构建布鲁氏菌突变株,将布鲁氏菌VirB10基因的CDS区序列的第478位碱基C定向突变为T,布鲁氏菌virB10基因CDS区序列如SEQ ID NO.2所示。具体方法如下:
1.设计特异性sgRNA,具体序列如下:oWY-181(5′-TGGAACAGTCAAAAGAACACCAAGC-3′),oWY-182(5′-CAAAGCTTGGTGTTCTTTTGACTGT-3′),加粗表示sgRNA和靶基因的同源序列,下划线为待突变的终止密码子。
2.线性化质粒载体的制备:利用限制性内切酶Bsa I酶切质粒pZF17-30,使其线性化,用磁珠法微量DNA胶回收试剂盒(TAKARA)纯化后用作载体,酶切体系如下:
pZF17-30 2.5μL
Bsa I 2.5μL
10倍buffer 5μL
40μL
Total 50μL
3.sgRNA的制备:利用Thermo Fisher T4PNK将sgRNA引物做磷酸化处理,体系如下:
引物(100μM) 1μL
ATP(10mM) 1μL
10倍PNK buffer 1μL
T4PNK酶 1μL
6μL
Total 10μL
37℃,反应30min后,将2条引物混合均匀,94℃反应5min,随后缓慢退火形成dimer。
4.载体与sgRNA的连接:利用Thermo Fisher T4DNA ligase将sgRNA dimer与线性化载体连接,即插入pZF17-30的两个Bsal位点之间,替换掉ccdB毒性基因和Chl抗性基因(插入位点123-143),连接体系如下:
Vector 2μL
Insert 2μL
10倍T4DNA ligase buffer 1μL
T4DNA ligase 0.5μL
4.5μL
Total 10μL
22℃反应1h,转化大肠杆菌TransT1感受态细胞,挑取转化子,通过测序验证sgRNA插入成功,序列如SEQ ID NO.3所示。
5.含有特异性sgRNA的质粒转化布鲁氏菌:
(1)从-80℃冰箱中取出需要的布鲁氏菌感受态细胞,置于冰上待其溶化,同时将电转杯放在冰上预冷;
(2)在生物安全柜中,小心地打开装有布鲁氏菌感受态细胞的离心管,用移液器吸取5μL质粒DNA加入感受态细胞中,轻轻吹打混匀,置于冰上;
(3)调节电转仪电转电压2.5kV,将电转杯用干燥的纱布擦净,并在纱布上轻轻撞击电转杯底部,使电转杯中无气泡;
(4)将电转杯放置在电转仪的电击槽位中,按Pulse键,听到电击结束提示后迅速拿出电转杯,使用移液器加入1mL不含抗生素的TSB培养基,适度吹打,使感受态细胞均匀分布;
(5)吸取全部1mL菌液至20mL一次性的细菌瓶中,使用浸有75%酒精的纱布仔细擦拭细菌瓶进行消毒,最后将细菌瓶装在自封袋中,于37℃,180rpm的条件下复苏4-6h;
(6)复苏结束后,用移液器小心吸取菌液至1.5mL离心管中,8000rpm离心3min;
(7)吸出900μL上清液,用移液器轻轻吹吸,重悬离心管中的菌体,小心转移到事先准备好带有所需抗性的TSB平板上,使用刮铲将菌液涂布均匀,待菌液干燥后,用浸有75%酒精的纱布仔细擦拭平板表面进行消毒,最后将平板装在自封袋中,倒置于37℃恒温培养箱中,培养约3-4d。
6.突变株的鉴定
挑取平板上的转化子(本实施例挑取20个),摇菌(5mL TSB,Gm终浓度50mg/mL)至菌体状态为平台期;利用酒精苯酚混合液(乙醇:苯酚的体积比95:5)对菌体灭活,收集菌液;利用天根细菌基因组提取试剂盒提取待检菌体的基因组,随后利用PCR对靶基因进行扩增(引物VirB10-F 5′-atgacacaggaaaacattccgg-3′,VirB10-R 5′-tcacttcggtttgacatcataca-3′),并对突变位点进行测序验证。结果显示,在挑取的21个转化子中有11个样品的单碱基突变成功,突变株的测序结果如SEQ ID NO.4所示,野生型对照(转化未加入特异性sgRNA的质粒pZF17-30,其他处理相同)的测序结果如SEQ ID NO.5所示,突变后第478位的碱基C突变为T。
SEQUENCE LISTING
<110> 华中农业大学
<120> 用于构建布鲁氏菌突变株的质粒pZF17-30及其构建方法和应用
<160> 5
<170> PatentIn version 3.1
<210> 1
<211> 14300
<212> DNA
<213> 人工序列
<400> 1
acggtcacgg atccgcgcgc cagggttttc ccagtcacga cctcgagaaa aaagccagac 60
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caagaaataa cgccggaaca ttagtgcagg cagcttccac agcaatggca tcctggtcat 3660
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tggaccccac attgagacgg cggatcgagc cccatgagtt tgaggtattc ttcgatccga 4320
gagagctccg caaggaaacc tgcctgcttt acgaaattaa ttgggggggc cggcactcca 4380
tttggcgaca tacatcacag aacactaaca agcacgtcga agtcaacttc atcgagaagt 4440
tcacgacaga aagatatttc tgtccgaaca caaggtgcag cattacctgg tttctcagct 4500
ggagcccatg cggcgaatgt agtagggcca tcactgaatt cctgtcaagg tatccccacg 4560
tcactctgtt tatttacatc gcaaggctgt accaccacgc tgacccccgc aatcgacaag 4620
gcctgcggga tttgatctct tcaggtgtga ctatccaaat tatgactgag caggagtcag 4680
gatactgctg gagaaacttt gtgaattata gcccgagtaa tgaagcccac tggcctaggt 4740
atccccatct gtgggtacga ctgtacgttc ttgaactgta ctgcatcata ctgggcctgc 4800
ctccttgtct caacattctg agaaggaagc agccacagct gacattcttt accatcgctc 4860
ttcagtcttg tcattaccag cgactgcccc cacacattct ctgggccacc gggttgaaaa 4920
gcggcagcga gactcccggg acctcagagt ccgccacacc cgaaagtgat aaaaagtatt 4980
ctattggttt agccatcggc actaattccg ttggatgggc tgtcataacc gatgaataca 5040
aagtaccttc aaagaaattt aaggtgttgg ggaacacaga ccgtcattcg attaaaaaga 5100
atcttatcgg tgccctccta ttcgatagtg gcgaaacggc agaggcgact cgcctgaaac 5160
gaaccgctcg gagaaggtat acacgtcgca agaaccgaat atgttactta caagaaattt 5220
ttagcaatga gatggccaaa gttgacgatt ctttctttca ccgtttggaa gagtccttcc 5280
ttgtcgaaga ggacaagaaa catgaacggc accccatctt tggaaacata gtagatgagg 5340
tggcatatca tgaaaagtac ccaacgattt atcacctcag aaaaaagcta gttgactcaa 5400
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ggcactttct cattgagggt gatctaaatc cggacaactc ggatgtcgac aaactgttca 5520
tccagttagt acaaacctat aatcagttgt ttgaagagaa ccctataaat gcaagtggcg 5580
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tcgcacaatt acccggagag aagaaaaatg ggttgttcgg taaccttata gcgctctcac 5700
taggcctgac accaaatttt aagtcgaact tcgacttagc tgaagatgcc aaattgcagc 5760
ttagtaagga cacgtacgat gacgatctcg acaatctact ggcacaaatt ggagatcagt 5820
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aatataagga aatattcttt gatcagtcga aaaacgggta cgcaggttat attgacggcg 6060
gagcgagtca agaggaattc tacaagttta tcaaacccat attagagaag atggatggga 6120
cggaagagtt gcttgtaaaa ctcaatcgcg aagatctact gcgaaagcag cggactttcg 6180
acaacggtag cattccacat caaatccact taggcgaatt gcatgctata cttagaaggc 6240
aggaggattt ttatccgttc ctcaaagaca atcgtgaaaa gattgagaaa atcctaacct 6300
ttcgcatacc ttactatgtg ggacccctgg cccgagggaa ctctcggttc gcatggatga 6360
caagaaagtc cgaagaaacg attactccat ggaattttga ggaagttgtc gataaaggtg 6420
cgtcagctca atcgttcatc gagaggatga ccaactttga caagaattta ccgaacgaaa 6480
aagtattgcc taagcacagt ttactttacg agtatttcac agtgtacaat gaactcacga 6540
aagttaagta tgtcactgag ggcatgcgta aacccgcctt tctaagcgga gaacagaaga 6600
aagcaatagt agatctgtta ttcaagacca accgcaaagt gacagttaag caattgaaag 6660
aggactactt taagaaaatt gaatgcttcg attctgtcga gatctccggg gtagaagatc 6720
gatttaatgc gtcacttggt acgtatcatg acctcctaaa gataattaaa gataaggact 6780
tcctggataa cgaagagaat gaagatatct tagaagatat agtgttgact cttaccctct 6840
ttgaagatcg ggaaatgatt gaggaaagac taaaaacata cgctcacctg ttcgacgata 6900
aggttatgaa acagttaaag aggcgtcgct atacgggctg gggacgattg tcgcggaaac 6960
ttatcaacgg gataagagac aagcaaagtg gtaaaactat tctcgatttt ctaaagagcg 7020
acggcttcgc caataggaac tttatgcagc tgatccatga tgactcttta accttcaaag 7080
aggatataca aaaggcacag gtttccggac aaggggactc attgcacgaa catattgcga 7140
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agggtattaa agaactgggc agccagatct taaaggagca tcctgtggaa aatacccaat 7380
tgcagaacga gaaactttac ctctattacc tacaaaatgg aagggacatg tatgttgatc 7440
aggaactgga cataaaccgt ttatctgatt acgacgtcga tcacattgta ccccaatcct 7500
ttttgaagga cgattcaatc gacaataaag tgcttacacg ctcggataag aaccgaggga 7560
aaagtgacaa tgttccaagc gaggaagtcg taaagaaaat gaagaactat tggcggcagc 7620
tcctaaatgc gaaactgata acgcaaagaa agttcgataa cttaactaaa gctgagaggg 7680
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acgataagct gattcgggaa gtcaaagtaa tcactttaaa gtcaaaattg gtgtcggact 7860
tcagaaagga ttttcaattc tataaagtta gggagataaa taactaccac catgcgcacg 7920
acgcttatct taatgccgtc gtagggaccg cactcattaa gaaatacccg aagctagaaa 7980
gtgagtttgt gtatggtgat tacaaagttt atgacgtccg taagatgatc gcgaaaagcg 8040
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ttgtttgtcg gtgaacgctc tcctgagtag gacaaatccg ccgccctaga cctaggcgtt 9780
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cgaccacata cccaccggct ccaactgcgc ggcctgcggc cttgccccat caattttttt 12780
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attgcgcatg gtgccgcaac cgtgcggcac cctaccgcat ggagataagc atggccacgc 13380
agtccagaga aatcggcatt caagccaaga acaagcccgg tcactgggtg caaacggaac 13440
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tttccaagct catcggacgt tctttgcgga cggtccaata cgcagtcaag gacttggtgg 13620
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cagaataaat gatcatatcg tcaattatta cctccacggg gagagcctga gcaaactggc 14280
ctcaggcatt tgagaagcac 14300
<210> 2
<211> 1143
<212> DNA
<213> 布鲁氏菌
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atcggcatct atatcgcccg cgacctagat ttttcgagtg tgtatgatgt caaaccgaag 1140
tga 1143
<210> 3
<211> 11783
<212> DNA
<213> 人工序列
<400> 3
acggtcacgg atccgcgcgc cagggttttc ccagtcacga cctcgagaaa aaagccagac 60
aaacgtccgg cttttgaatt aaggcctccc ttgacaatta atcatccggc tcgtataatg 120
tgacagtcaa aagaacacca agcgttttag agctaggcca acatgaggat cacccatgtc 180
tgcagggcct agcaagttaa aataaggcta gtccgttatc aacttggcca acatgaggat 240
cacccatgtc tgcagggcca agtggcaccg agtcggtgct ttttctgcag gaggcatcaa 300
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ccatctgatc gttggcaacc agcatcgcag tgggaacgat gccctcattc agcatttgca 840
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acaaagtacc ttcaaagaaa tttaaggtgt tggggaacac agaccgtcat tcgattaaaa 2580
agaatcttat cggtgccctc ctattcgata gtggcgaaac ggcagaggcg actcgcctga 2640
aacgaaccgc tcggagaagg tatacacgtc gcaagaaccg aatatgttac ttacaagaaa 2700
tttttagcaa tgagatggcc aaagttgacg attctttctt tcaccgtttg gaagagtcct 2760
tccttgtcga agaggacaag aaacatgaac ggcaccccat ctttggaaac atagtagatg 2820
aggtggcata tcatgaaaag tacccaacga tttatcacct cagaaaaaag ctagttgact 2880
caactgataa agcggacctg aggttaatct acttggctct tgcccatatg ataaagttcc 2940
gtgggcactt tctcattgag ggtgatctaa atccggacaa ctcggatgtc gacaaactgt 3000
tcatccagtt agtacaaacc tataatcagt tgtttgaaga gaaccctata aatgcaagtg 3060
gcgtggatgc gaaggctatt cttagcgccc gcctctctaa atcccgacgg ctagaaaacc 3120
tgatcgcaca attacccgga gagaagaaaa atgggttgtt cggtaacctt atagcgctct 3180
cactaggcct gacaccaaat tttaagtcga acttcgactt agctgaagat gccaaattgc 3240
agcttagtaa ggacacgtac gatgacgatc tcgacaatct actggcacaa attggagatc 3300
agtatgcgga cttatttttg gctgccaaaa accttagcga tgcaatcctc ctatctgaca 3360
tactgagagt taatactgag attaccaagg cgccgttatc cgcttcaatg atcaaaaggt 3420
acgatgaaca tcaccaagac ttgacacttc tcaaggccct agtccgtcag caactgcctg 3480
agaaatataa ggaaatattc tttgatcagt cgaaaaacgg gtacgcaggt tatattgacg 3540
gcggagcgag tcaagaggaa ttctacaagt ttatcaaacc catattagag aagatggatg 3600
ggacggaaga gttgcttgta aaactcaatc gcgaagatct actgcgaaag cagcggactt 3660
tcgacaacgg tagcattcca catcaaatcc acttaggcga attgcatgct atacttagaa 3720
ggcaggagga tttttatccg ttcctcaaag acaatcgtga aaagattgag aaaatcctaa 3780
cctttcgcat accttactat gtgggacccc tggcccgagg gaactctcgg ttcgcatgga 3840
tgacaagaaa gtccgaagaa acgattactc catggaattt tgaggaagtt gtcgataaag 3900
gtgcgtcagc tcaatcgttc atcgagagga tgaccaactt tgacaagaat ttaccgaacg 3960
aaaaagtatt gcctaagcac agtttacttt acgagtattt cacagtgtac aatgaactca 4020
cgaaagttaa gtatgtcact gagggcatgc gtaaacccgc ctttctaagc ggagaacaga 4080
agaaagcaat agtagatctg ttattcaaga ccaaccgcaa agtgacagtt aagcaattga 4140
aagaggacta ctttaagaaa attgaatgct tcgattctgt cgagatctcc ggggtagaag 4200
atcgatttaa tgcgtcactt ggtacgtatc atgacctcct aaagataatt aaagataagg 4260
acttcctgga taacgaagag aatgaagata tcttagaaga tatagtgttg actcttaccc 4320
tctttgaaga tcgggaaatg attgaggaaa gactaaaaac atacgctcac ctgttcgacg 4380
ataaggttat gaaacagtta aagaggcgtc gctatacggg ctggggacga ttgtcgcgga 4440
aacttatcaa cgggataaga gacaagcaaa gtggtaaaac tattctcgat tttctaaaga 4500
gcgacggctt cgccaatagg aactttatgc agctgatcca tgatgactct ttaaccttca 4560
aagaggatat acaaaaggca caggtttccg gacaagggga ctcattgcac gaacatattg 4620
cgaatcttgc tggttcgcca gccatcaaaa agggcatact ccagacagtc aaagtagtgg 4680
atgagctagt taaggtcatg ggacgtcaca aaccggaaaa cattgtaatc gagatggcac 4740
gcgaaaatca aacgactcag aaggggcaaa aaaacagtcg agagcggatg aagagaatag 4800
aagagggtat taaagaactg ggcagccaga tcttaaagga gcatcctgtg gaaaataccc 4860
aattgcagaa cgagaaactt tacctctatt acctacaaaa tggaagggac atgtatgttg 4920
atcaggaact ggacataaac cgtttatctg attacgacgt cgatcacatt gtaccccaat 4980
cctttttgaa ggacgattca atcgacaata aagtgcttac acgctcggat aagaaccgag 5040
ggaaaagtga caatgttcca agcgaggaag tcgtaaagaa aatgaagaac tattggcggc 5100
agctcctaaa tgcgaaactg ataacgcaaa gaaagttcga taacttaact aaagctgaga 5160
ggggtggctt gtctgaactt gacaaggccg gatttattaa acgtcagctc gtggaaaccc 5220
gccaaatcac aaagcatgtt gcacagatac tagattcccg aatgaatacg aaatacgacg 5280
agaacgataa gctgattcgg gaagtcaaag taatcacttt aaagtcaaaa ttggtgtcgg 5340
acttcagaaa ggattttcaa ttctataaag ttagggagat aaataactac caccatgcgc 5400
acgacgctta tcttaatgcc gtcgtaggga ccgcactcat taagaaatac ccgaagctag 5460
aaagtgagtt tgtgtatggt gattacaaag tttatgacgt ccgtaagatg atcgcgaaaa 5520
gcgaacagga gataggcaag gctacagcca aatacttctt ttattctaac attatgaatt 5580
tctttaagac ggaaatcact ctggcaaacg gagagatacg caaacgacct ttaattgaaa 5640
ccaatgggga gacaggtgaa atcgtatggg ataagggccg ggacttcgcg acggtgagaa 5700
aagttttgtc catgccccaa gtcaacatag taaagaaaac tgaggtgcag accggagggt 5760
tttcaaagga atcgattctt ccaaaaagga atagtgataa gctcatcgct cgtaaaaagg 5820
actgggaccc gaaaaagtac ggtggcttcg atagccctac agttgcctat tctgtcctag 5880
tagtggcaaa agttgagaag ggaaaatcca agaaactgaa gtcagtcaaa gaattattgg 5940
ggataacgat tatggagcgc tcgtcttttg aaaagaaccc catcgacttc cttgaggcga 6000
aaggttacaa ggaagtaaaa aaggatctca taattaaact accaaagtat agtctgtttg 6060
agttagaaaa tggccgaaaa cggatgttgg ctagcgccgg agagcttcaa aaggggaacg 6120
aactcgcact accgtctaaa tacgtgaatt tcctgtattt agcgtcccat tacgagaagt 6180
tgaaaggttc acctgaagat aacgaacaga agcaactttt tgttgagcag cacaaacatt 6240
atctcgacga aatcatagag caaatttcgg aattcagtaa gagagtcatc ctagctgatg 6300
ccaatctgga caaagtatta agcgcataca acaagcacag ggataaaccc atacgtgagc 6360
aggcggaaaa tattatccat ttgtttactc ttaccaacct cggcgctcca gccgcattca 6420
agtattttga cacaacgata gatcgcaaac gatacacttc taccaaggag gtgctagacg 6480
cgacactgat tcaccaatcc atcacgggat tatatgaaac tcggatagat ttgtcacagc 6540
ttgggggtga ctctggtggt tctactaatc tgtcagatat tattgaaaag gaaaccggta 6600
agcaactggt tatccaggaa tccatcctca tgctcccaga ggaggtggaa gaagtcattg 6660
ggaacaagcc ggaaagcgat atactcgtgc acaccgccta cgacgagagc accgacgaga 6720
atgtcatgct tctgactagc gacgcccctg aatacaagcc ttgggctctg gtcatacagg 6780
atagcaacgg tgagaacaag attaagatgc tctctggtgg ttctcccaag aagaagagga 6840
aagtctaacc ggtcatcatc accatcacca ttgagtttaa acccgctgat cagcctctcg 6900
agtaaggatc tccaggcatc aaataaaacg aaaggctcag tcgaaagact gggcctttcg 6960
ttttatctgt tgtttgtcgg tgaacgctct ctactagagt cacactggct caccttcggg 7020
tgggcctttc tgcgtttata cctagctcta gaaattccgt cgcaaaaaac cccgcccctg 7080
acagggcggg gttttttcgc agtcatgcta gcctgtgtga aattgttatc cgctctgaac 7140
ctgcaggagg catcaaataa aacgaaaggc tcagtcgaaa gactgggcct ttcgttttat 7200
ctgttgtttg tcggtgaacg ctctcctgag taggacaaat ccgccgccct agacctaggc 7260
gttcggctgc ggcgagcggt atcagctcac tcaaaggcgg taatacggtt atccacagaa 7320
tcaggggata acgcaggaaa gaacatgtga gcaaaaggcc agcaaaaggc caggaaccgt 7380
aaaaaggccg cgttgctggc gtttttccat aggctccgcc cccctgacga gcatcacaaa 7440
aatcgacgct caagtcagag gtggcgaaac ccgacaggac tataaagata ccaggcgttt 7500
ccccctggaa gctccctcgt gcgctctcct gttccgaccc tgccgcttac cggatacctg 7560
tccgcctttc tcccttcggg aagcgtggcg ctttctcaat gctcacgctg taggtatctc 7620
agttcggtgt aggtcgttcg ctccaagctg ggctgtgtgc acgaaccccc cgttcagccc 7680
gaccgctgcg ccttatccgg taactatcgt cttgagtcca acccggtaag acacgactta 7740
tcgccactgg cagcagccac tggtaacagg attagcagag cgaggtatgt aggcggtgct 7800
acagagttct tgaagtggtg gcctaactac ggctacacta gaaggacagt atttggtatc 7860
tgcgctctgc tgaagccagt taccttcgga aaaagagttg gtagctcttg atccggcaaa 7920
caaaccaccg ctggtagcgg tggttttttt gtttgcaagc agcagattac gcgcagaaaa 7980
aaaggatctc aagaagatcc tttgatcttt tctacggggt ctgacgcccg gaattcaggc 8040
acgaacccag ttgacataag cctgttcggt tcgtaaactg taatgcaagt agcgtatgcg 8100
ctcacgcaac tggtccagaa ccttgaccga acgcagcggt ggtaacggcg cagtggcggt 8160
tttcatggct tgttatgact gtttttttgt acagtctatg cctcgggcat ccaagcagca 8220
agcgcgttac gccgtgggtc gatgtttgat gttatggagc agcaacgatg ttacgcagca 8280
gcaacgatgt tacgcagcag ggcagtcgcc ctaaaacaaa gttaggtggc tcaagtatgg 8340
gcatcattcg cacatgtagg ctcggccctg accaagtcaa atccatgcgg gctgctcttg 8400
atcttttcgg tcgtgagttc ggagacgtag ccacctactc ccaacatcag ccggactccg 8460
attacctcgg gaacttgctc cgtagtaaga cattcatcgc gcttgctgcc ttcgaccaag 8520
aagcggttgt tggcgctctc gcggcttacg ttctgcccag gtttgagcag ccgcgtagtg 8580
agatctatat ctatgatctc gcagtctccg gcgagcaccg gaggcagggc attgccaccg 8640
cgctcatcaa tctcctcaag catgaggcca acgcgcttgg tgcttatgtg atctacgtgc 8700
aagcagatta cggtgacgat cccgcagtgg ctctctatac aaagttgggc atacgggaag 8760
aagtgatgca ctttgatatc gacccaagta ccgccaccta acaattcgtt caagccgaga 8820
tcggcttccc ggccgcggag ttgttcggta aattgtcaca acgccgccag gtggcacttt 8880
tcggggaaat gtgcgcgccc gcgttcctgc tggcgctggg cctgtttctg gcgctggact 8940
tcccgctgtt ccgtcagcag cttttcgccc acggccttga tgatcgcggc ggccttggcc 9000
tgcatatccc gattcaacgg ccccagggcg tccagaacgg gcttcaggcg ctcccgaaga 9060
tctcgggccg tctcttgggc ttgatcggcc ttcttgcgca tctcacgcgc tcctgcggcg 9120
gcctgtaggg caggctcata cccctgccga accgcttttg tcagccggtc ggccacggct 9180
tccggcgtct caacgcgctt tgagattccc agcttttcgg ccaatccctg cggtgcatag 9240
gcgcgtggct cgaccgcttg cgggctgatg gtgacgtggc ccactggtgg ccgctccagg 9300
gcctcgtaga acgcctgaat gcgcgtgtga cgtgccttgc tgccctcgat gccccgttgc 9360
agccctagat cggccacagc ggccgcaaac gtggtctggt cgcgggtcat ctgcgctttg 9420
ttgccgatga actccttggc cgacagcctg ccgtcctgcg tcagcggcac cacgaacgcg 9480
gtcatgtgcg ggctggtttc gtcacggtgg atgctggccg tcacgatgcg atccgccccg 9540
tacttgtccg ccagccactt gtgcgccttc tcgaagaacg ccgcctgctg ttcttggctg 9600
gccgacttcc accattccgg gctggccgtc atgacgtact cgaccgccaa cacagcgtcc 9660
ttgcgccgct tctctggcag caactcgcgc agtcggccca tcgcttcatc ggtgctgctg 9720
gccgcccagt gctcgttctc tggcgtcctg ctggcgtcag cgttgggcgt ctcgcgctcg 9780
cggtaggcgt gcttgagact ggccgccacg ttgcccattt tcgccagctt cttgcatcgc 9840
atgatcgcgt atgccgccat gcctgcccct cccttttggt gtccaaccgg ctcgacgggg 9900
gcagcgcaag gcggtgcctc cggcgggcca ctcaatgctt gagtatactc actagacttt 9960
gcttcgcaaa gtcgtgaccg cctacggcgg ctgcggcgcc ctacgggctt gctctccggg 10020
cttcgccctg cgcggtcgct gcgctccctt gccagcccgt ggatatgtgg acgatggccg 10080
cgagcggcca ccggctggct cgcttcgctc ggcccgtgga caaccctgct ggacaagctg 10140
atggacaggc tgcgcctgcc cacgagcttg accacaggga ttgcccaccg gctacccagc 10200
cttcgaccac atacccaccg gctccaactg cgcggcctgc ggccttgccc catcaatttt 10260
tttaattttc tctggggaaa agcctccggc ctgcggcctg cgcgcttcgc ttgccggttg 10320
gacaccaagt ggaaggcggg tcaaggctcg cgcagcgacc gcgcagcggc ttggccttga 10380
cgcgcctgga acgacccaag cctatgcgag tgggggcagt cgaaggcgaa gcccgcccgc 10440
ctgccccccg agcctcacgg cggcgagtgc gggggttcca agggggcagc gccaccttgg 10500
gcaaggccga aggccgcgca gtcgatcaac aagccccgga ggggccactt tttgccggag 10560
ggggagccgc gccgaaggcg tgggggaacc ccgcaggggt gcccttcttt gggcaccaaa 10620
gaactagata tagggcgaaa tgcgaaagac ttaaaaatca acaacttaaa aaaggggggt 10680
acgcaacagc tcattgcggc accccccgca atagctcatt gcgtaggtta aagaaaatct 10740
gtaattgact gccactttta cgcaacgcat aattgttgtc gcgctgccga aaagttgcag 10800
ctgattgcgc atggtgccgc aaccgtgcgg caccctaccg catggagata agcatggcca 10860
cgcagtccag agaaatcggc attcaagcca agaacaagcc cggtcactgg gtgcaaacgg 10920
aacgcaaagc gcatgaggcg tgggccgggc ttattgcgag gaaacccacg gcggcaatgc 10980
tgctgcatca cctcgtggcg cagatgggcc accagaacgc cgtggtggtc agccagaaga 11040
cactttccaa gctcatcgga cgttctttgc ggacggtcca atacgcagtc aaggacttgg 11100
tggccgagcg ctggatctcc gtcgtgaagc tcaacggccc cggcaccgtg tcggcctacg 11160
tggtcaatga ccgcgtggcg tggggccagc cccgcgacca gttgcgcctg tcggtgttca 11220
gtgccgccgt ggtggttgat cacgacgacc aggacgaatc gctgttgggg catggcgacc 11280
tgcgccgcat cccgaccctg tatccgggcg agcagcaact accgaccggc cccggcgagg 11340
agccgcccag ccagcccggc attccgggca tggaaccaga cctgccagcc ttgaccgaaa 11400
cggaggaatg ggaacggcgc gggcagcagc gcctgccgat gcccgatgag ccgtgttttc 11460
tggacgatgg cgagccgttg gagccgccga cacgggtcac gctgccgcgc cggtagcact 11520
tgggttgcgc agcaacccgt aagtgcgctg ttccagacta tcggctgtag ccgcctcgcc 11580
gccctatacc ttgtctgcct ccccgcgttg cgtcgcggtg catggagccg ggccacctcg 11640
acctgaatgg aagccggcgg cacctcgcta acggattcac cgtttttatc aggctctggg 11700
aggcagaata aatgatcata tcgtcaatta ttacctccac ggggagagcc tgagcaaact 11760
ggcctcaggc atttgagaag cac 11783
<210> 4
<211> 939
<212> DNA
<213> 布鲁氏菌突变株
<400> 4
cggtgagcgt ggcctaccca ccgtgaacga aaacggctcc ggccgcaccc gcaaggtgtt 60
gctctttctc tttgtcgtgg gcttcatcgt cgtgctgctg ttgctgctcg tgtttcacat 120
gaggggcaat gcagagaata atcaccattc agacaagacg atggtgcaga ccagcacagt 180
tccgatgcga actttcaagc tgccaccccc gccacccccg ccaccaccag caccaccaga 240
accaccagcc ccgccaccgg ccccagccat gcccatcgcg gaacccgcag cggcggcgct 300
gagcctgcca ccattgccgg atgatacgcc ggcaaaggac gatgtactgg acaagtcggc 360
cagcgcgttg atggtcgtca ccaagtccag cggcgatacg aacgctcaaa cggccggtga 420
tacggtcgtt caaacgacca atgcgcgcat tcaagccctg ctcgacagtt aaaagaacac 480
caagcaggat gctggatcgc tgggtactct ccttcacggc acacaaacgg atgcacgcat 540
ggcgagcctt ctgcgcaacc gtgatttcct gctcgcgaag ggcagcatca tcaattgcgc 600
gctgcaaacc cgtctggatt cgacggtgcc gggcatggct gcctgcgtgg tcacacgcaa 660
catgtatagc gataacggca aggtgttgct gattgagcgc ggttcaacca tctcgggtga 720
atatgatgcc aacgtaaagc agggcatggc tcgcatttat gtcctgtgga cgcgcgtgaa 780
gacgccgaac ggtgtcgtga tcgatctcga ctctccaggc gccgaccccc tgggcggggc 840
aggcttgccc ggctacatcg actcccactt ctggaagcgc tttggcggcg ccttgatgtt 900
gagcacgatc gagaccctcg gccgctatgc aacccagaa 939
<210> 5
<211> 939
<212> DNA
<213> 布鲁氏菌野生型对照
<400> 5
cggtgagcgt ggcctaccca ccgtgaacga aaacggctcc ggccgcaccc gcaaggtgtt 60
gctctttctc tttgtcgtgg gcttcatcgt cgtgctgctg ttgctgctcg tgtttcacat 120
gaggggcaat gcagagaata atcaccattc agacaagacg atggtgcaga ccagcacagt 180
tccgatgcga actttcaagc tgccaccccc gccacccccg ccaccaccag caccaccaga 240
accaccagcc ccgccaccgg ccccagccat gcccatcgcg gaacccgcag cggcggcgct 300
gagcctgcca ccattgccgg atgatacgcc ggcaaaggac gatgtactgg acaagtcggc 360
cagcgcgttg atggtcgtca ccaagtccag cggcgatacg aacgctcaaa cggccggtga 420
tacggtcgtt caaacgacca atgcgcgcat tcaagccctg ctcgacagtc aaaagaacac 480
caagcaggat gctggatcgc tgggtactct ccttcacggc acacaaacgg atgcacgcat 540
ggcgagcctt ctgcgcaacc gtgatttcct gctcgcgaag ggcagcatca tcaattgcgc 600
gctgcaaacc cgtctggatt cgacggtgcc gggcatggct gcctgcgtgg tcacacgcaa 660
catgtatagc gataacggca aggtgttgct gattgagcgc ggttcaacca tctcgggtga 720
atatgatgcc aacgtaaagc agggcatggc tcgcatttat gtcctgtgga cgcgcgtgaa 780
gacgccgaac ggtgtcgtga tcgatctcga ctctccaggc gccgaccccc tgggcggggc 840
aggcttgccc ggctacatcg actcccactt ctggaagcgc tttggcggcg ccttgatgtt 900
gagcacgatc gagaccctcg gccgctatgc aacccagaa 939

Claims (4)

1.质粒pZF17-30,其特征在于,所述质粒pZF17-30的序列为SEQ ID NO.1所示。
2.利用权利要求1所述质粒pZF17-30构建得到的载体,其特征在于,所述载体的构建方法是:利用限制性内切酶Bsa I酶切质粒pZF17-30,将特异性sgRNA与线性化载体连接,所述的sgRNA为5′-TGGAACAGTCAAAAGAACACCAAGC-3′,5′-CAAAGCTTGGTGTTCTTTTGACTGT-3′,构建的载体的序列如SEQ ID NO.3所示。
3.权利要求2所述的载体在制备布鲁氏菌的单碱基突变株中的应用,其特征在于,所述的单碱基突变为virB10基因CDS区478位碱基由C突变为T。
4.含有权利要求1所述质粒pZF17-30的大肠杆菌,其特征在于,所述的大肠杆菌保藏于中国典型培养物保藏中心,其保藏编号为CCTCC No:M 2017395。
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