CN107236738B - 色氨酸衰减子突变体及其应用以及解除色氨酸衰减子反馈阻遏的方法 - Google Patents

色氨酸衰减子突变体及其应用以及解除色氨酸衰减子反馈阻遏的方法 Download PDF

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Abstract

本发明公开了一种色氨酸衰减子突变体及其应用以及解除色氨酸衰减子反馈阻遏的方法。本发明提供的色氨酸衰减子突变体,为序列2第n1‑n2位核苷酸所示DNA分子;115≤n1≤122,135≤n2≤186。本发明还保护解除衰减调控的色氨酸操纵子基因,是将色氨酸操纵子基因中的色氨酸衰减子第1至n3位核苷酸去除后得到的DNA分子;114≤n3≤121。本发明还保护一种解除微生物中色氨酸操纵子反馈阻遏的方法,删除微生物的色氨酸操纵子基因中从色氨酸衰减子第1位开始计数的第1至n3位核苷酸。采用本发明提供的方案,可以显著提高色氨酸及其衍生物产量,对于色氨酸及其衍生物的生产领域具有极其重大的应用推广价值。

Description

色氨酸衰减子突变体及其应用以及解除色氨酸衰减子反馈阻 遏的方法
技术领域
本发明属于生物技术领域,具体涉及一种色氨酸衰减子突变体、基于该色氨酸衰减子突变体创制的工程菌和工程菌的应用,还涉及及高效解除色氨酸衰减子反馈阻遏的方法。
背景技术
L-色氨酸(L-Tryptophan)是含有吲哚基的芳香族氨基酸,是人和动物的必需氨基酸之一,广泛应用于食品、医药和饲料等行业。在医药行业,色氨酸可作为氨基酸注射液和药品,用于治疗抑郁症、提高睡眠质量、抗高血压及镇痛等。在食品行业,色氨酸作为添加剂可以提高机体对蛋白的利用效率。在饲料行业,色氨酸是安全型饲料添加剂,可以调节动物饲料的氨基酸的平衡,促进家禽家畜生长。L-色氨酸还可以衍生合成羟基色胺、烟酸、辅酶、吲哚乙酸、色素和生物碱等重要的生理活性物质,色氨酸衍生物具有广泛的应用市场。
生物合成氨基酸(如L-色氨酸、L-苏氨酸、L-苯丙氨酸、L-亮氨酸、L-异亮氨酸和L-组氨酸等)的操纵子存在衰减调节机制。当胞内特定氨基酸浓度较高时,氨基酸操纵子的转录提前终止。相反地,当胞内特定氨基酸缺乏时,RNA聚合酶转录氨基酸操纵子。
生物法生产L-色氨酸或其衍生物的过程中,胞内L-色氨酸逐步积累,通过上述衰减调控机制反馈阻遏色氨酸操纵子的表达,不利于L-色氨酸或其衍生物的生物合成。因此,高效解除色氨酸对色氨酸操纵子的衰减调控,是生物合成L-色氨酸及其衍生物的关键。
发明内容
本发明的目的是提供一种色氨酸衰减子突变体、基于该色氨酸衰减子突变体创制的工程菌和工程菌的应用,还涉及及高效解除色氨酸衰减子反馈阻遏的方法。
本发明首先保护DNA分子甲(色氨酸衰减子突变体),为如下(a1)、(a2)、(a3)、(a4)或(a5):
(a1)序列表的序列2第n1-n2位核苷酸所示的DNA分子;n1为115以上122以下的自然数(n1优选为115),n2为135以上186以下的自然数(n2具体可为135以上156以下的自然数或157以上186以下的自然数,更具体可为135、156或186);
(a2)将色氨酸衰减子的第1至n3位核苷酸去除后得到的DNA分子,n3为114以上121以下的自然数(n3优选为114);
(a3)将色氨酸衰减子相关序列的第1至n3位核苷酸去除后得到的DNA分子,n3为114以上121以下的自然数(n3优选为114);
(a4)在(a1)或(a2)或(a3)的末端连接标签序列得到的DNA分子;
(a5)在(a1)或(a2)或(a3)的末端连接连接序列得到的DNA分子。
色氨酸衰减子突变体为色氨酸衰减子截短体或色氨酸衰减子变体。色氨酸衰减子截短体如序列表的序列2第n1-135位核苷酸所示。色氨酸衰减子变体如序列表的序列2第n1-n4位核苷酸所示,n4为136以上186以下的自然数(n4具体可为136以上156以下的自然数或157以上186以下的自然数,更具体可为156或186)。
本发明还保护所述DNA分子甲在促进下游目的基因表达中的应用。所述应用中,所述DNA分子甲作为调控元件。所述应用中,所述DNA分子甲位于所述目的基因的启动子和所述目的基因的起始密码子之间。所述应用中,所述启动子具体可为序列表的序列1所示的启动子Pthr-trc。所述应用中,所述目的基因具体可为序列表的序列7所示的gfp基因。
本发明还保护DNA分子乙,自上游至下游依次包括:所述DNA分子甲和目的基因。所述目的基因具体可为序列表的序列7所示的gfp基因。
本发明还保护DNA分子丙,自上游至下游依次包括:启动子、所述DNA分子甲、目的基因和终止子。所述启动子具体可为序列表的序列1所示的启动子Pthr-trc。所述目的基因具体可为序列表的序列7所示的gfp基因。所述终止子具体可为CTAGCATAACCCCTTGGGGCCTCTAAACGGGTCTTGAGGGGTTTTTTG。
所述DNA分子甲或所述DNA分子乙或所述DNA分子丙中,不具有色氨酸衰减子的第1至n3位核苷酸,n3为114以上121以下的自然数(n3优选为114)。
所述DNA分子乙自上游至下游依次由如下元件组成:序列表的序列2第115至186位核苷酸,连接序列“GGTTCTGGTTCTGGTTCT”,序列表的序列7所示的gfp基因。
所述DNA分子乙自上游至下游依次由如下元件组成:序列表的序列2第122至186位核苷酸,连接序列“GGTTCTGGTTCTGGTTCT”,序列表的序列7所示的gfp基因。
所述DNA分子丙自上游至下游依次由如下元件组成:序列表的序列1所示的启动子Pthr-trc,限制性内切酶Hind III的酶切识别序列,序列表的序列2第115至186位核苷酸,连接序列“GGTTCTGGTTCTGGTTCT”,序列表的序列7所示的gfp基因,终止子序列“CTAGCATAACCCCTTGGGGCCTCTAAACGGGTCTTGAGGGGTTTTTTG”。
所述DNA分子丙自上游至下游依次由如下元件组成:序列表的序列1所示的启动子Pthr-trc,限制性内切酶Hind III的酶切识别序列,序列表的序列2第122至186位核苷酸,连接序列“GGTTCTGGTTCTGGTTCT”,序列表的序列7所示的gfp基因,终止子序列“CTAGCATAACCCCTTGGGGCCTCTAAACGGGTCTTGAGGGGTTTTTTG”。
本发明还保护DNA分子丁(解除衰减调控的色氨酸操纵子基因,又称色氨酸操纵子基因突变体),是将色氨酸操纵子基因中的色氨酸衰减子第1至n3位核苷酸去除后得到的DNA分子;n3为114以上121以下的自然数(n3优选为114)。
所述DNA分子丁具体可为序列表的序列2第115至6687位核苷酸所示的DNA分子。
本发明还保护DNA分子戊,自上游至下游依次包括如下元件:启动子和所述DNA分子丁。所述启动子可为序列表的序列8所示的启动子PJJ
所述DNA分子戊自上游至下游依次由如下元件组成:序列表的序列8所示的启动子PJJ、pACYC184质粒中Hind III和BamH I酶切位点之间的小片段、序列表的序列2第115至6687位核苷酸所示的DNA分子。
所述DNA分子戊自上游至下游依次由如下元件组成:序列表的序列8所示的启动子PJJ、pACYC184质粒中Hind III和BamH I酶切位点之间的小片段、序列表的序列2第115至6865位核苷酸所示的DNA分子。
含有所述DNA分子丁或所述DNA分子戊的重组载体也属于本发明的保护范围。
含有所述DNA分子丁或所述DNA分子戊的重组菌也属于本发明的保护范围。
所述重组载体可为所述DNA分子丁或所述DNA分子戊插入出发质粒得到的重组质粒。所述出发质粒为低拷贝、中拷贝或高拷贝数质粒,例如pSC101、pACYC184、pBR322或pTrc99a。
所述重组菌是将所述DNA分子丁或所述DNA分子戊导入出发菌得到的。所述出发菌可为埃希氏菌属细菌或棒杆菌属细菌。所述埃希氏菌属细菌具体可为大肠杆菌,更具体可为大肠杆菌K-12或其衍生菌株,更具体可为大肠杆菌K12MG1655或大肠杆菌AT。所述棒杆菌属细菌具体可为谷氨酸棒杆菌,例如谷氨酸棒杆菌13032等。
大肠杆菌AT是在大肠杆菌K12MG1655中导入编码3-脱氧-D-阿拉伯庚酮糖酸-7-磷酸合成酶(AroG蛋白或AroG*蛋白;AroG蛋白为野生型蛋白,AroG*蛋白为在AroG蛋白基础上进行突变得到的解除反馈抑制的蛋白)的基因和编码转酮酶A(TktA蛋白)的基因得到的重组菌。
AroG*蛋白为如下(b1)或(b2):
(b1)由序列表中序列4所示的氨基酸序列组成的蛋白质;
(b2)将序列的氨基酸序列4经过一个或几个氨基酸残基的取代和/或缺失和/或添加且具有相同功能的由序列4衍生的蛋白质。
TktA蛋白为如下(c1)或(c2):
(c1)由序列表中序列6所示的氨基酸序列组成的蛋白质;
(c2)将序列的氨基酸序列6经过一个或几个氨基酸残基的取代和/或缺失和/或添加且具有相同功能的由序列6衍生的蛋白质。
编码AroG*蛋白的基因具体可如序列表的序列3所示。
编码AroG*蛋白的基因的开放阅读框具体可为序列表的序列3第151-1203位核苷酸。
编码TktA蛋白的基因具体可如序列表的序列5所示。
编码TktA蛋白的基因的开放阅读框具体可为序列表的序列5第151-2142位核苷酸。
本发明还保护所述重组菌在制备色氨酸中的应用。
应用所述重组菌生产色氨酸时,采用发酵培养基培养所述重组菌。
所述发酵培养基可以是丰富培养基,也可以是无机盐培养基。培养基包含碳源、氮源、无机离子、抗生素和其它的营养因子。作为碳源,可以使用葡萄糖、乳糖、半乳糖等糖类;也可以是甘油、甘露醇等醇类;也可以使用葡萄糖酸、柠檬酸、丁二酸等有机酸类。作为氮源,可以使用氨水、硫酸铵、磷酸铵、氯化铵等无机氮源;也可以使用玉米浆、豆粕水解液、毛发粉、酵母提取物、蛋白胨等有机氮源。无机离子包含铁、钙、镁、锰、钼、钴、铜、钾等离子中的一种或多种。其它营养因子还包括生物素、维生素B1、吡哆醛等维生素。
所述发酵培养基中的碳源为葡萄糖。
所述发酵培养基具体可为:葡萄糖20.0g/L、硫酸铵15.0g/L、磷酸二氢钾2.0g/L、七水硫酸镁2.0g/L、酵母粉2.0g/L、碳酸钙15.0g/L、微量元素混合液5mL/L,余量为水。
微量元素混合液:FeSO4·7H2O 10g/L、CaCl2 1.35g/L、ZnSO4·7H2O 2.25g/L、MnSO4·4H2O 0.5g/L、CuSO4·5H2O 1g/L、(NH4)6Mo7O24·4H2O 0.106g/L、Na2B4O7·10H2O0.23g/L、CoCl2·6H2O 0.48g/L、35%HCl 10mL/L,余量为水。
所述培养的条件具体可为:37℃、220rpm震荡培养36h。
所述培养的条件具体可为:将种子液以3%的接种量接种至发酵培养基中,37℃、220rpm震荡培养36h。种子液的制备方法如下:将重组菌接种至含100mg/L氨苄青霉素和34mg/L氯霉素的液体LB培养基中,37℃、220rpm振荡培养8h,得到种子液。所述种子液的OD600nm值具体可为5.0。
所述培养的过程中进行如下过程控制:培养过程中,用氨水调节反应体系的pH值使其维持在6.8-7.0;培养过程中,每隔3-4h取样一次,检测葡萄糖含量,当体系中的葡萄糖含量低于5g/L时,补加葡萄糖并使体系中的葡萄糖浓度达到10g/L。
本发明还保护一种提高微生物生产色氨酸的能力的方法,包括如下步骤:删除微生物的色氨酸操纵子基因中从色氨酸衰减子第1位开始计数的第1至n3位核苷酸;n3为114以上121以下的自然数(n3优选为114)。所述微生物为具有色氨酸操纵子的微生物。所述微生物具体可为埃希氏菌属微生物。所述埃希氏菌属微生物具体可为大肠杆菌,更具体可为大肠杆菌K-12或其衍生菌株,更具体可为大肠杆菌K12MG1655或大肠杆菌AT。
本发明还保护一种解除微生物中色氨酸操纵子反馈阻遏的方法,包括如下步骤:删除微生物的色氨酸操纵子基因中从色氨酸衰减子第1位开始计数的第1至n3位核苷酸;n3为114以上121以下的自然数(n3优选为114)。所述微生物为具有色氨酸操纵子的微生物。所述微生物具体可为埃希氏菌属微生物。所述埃希氏菌属微生物具体可为大肠杆菌,更具体可为大肠杆菌K-12或其衍生菌株,更具体可为大肠杆菌K12MG1655或大肠杆菌AT。
以上任一所述色氨酸操纵子包括色氨酸衰减子、编码邻氨基苯甲酸合成酶(TrpE蛋白或TrpE*蛋白;TrpE蛋白为野生型蛋白,TrpE*蛋白为在TrpE蛋白基础上进行突变得到的解除反馈抑制的蛋白的基因)、编码磷酸核糖基邻氨基苯甲酸焦磷酸化酶(TrpD蛋白)的基因、编码邻氨基磷酸核糖苯甲酸异构酶(TrpC蛋白)的基因、编码色氨酸合酶β亚基(TrpB蛋白)和编码色氨酸合酶α亚基(TrpA蛋白)的基因。
所述TrpE*蛋白为如下(d1)或(d2):
(d1)由序列表中序列9所示的氨基酸序列组成的蛋白质;
(d2)将序列的氨基酸序列9经过一个或几个氨基酸残基的取代和/或缺失和/或添加且具有邻氨基苯甲酸合成酶功能的由序列9衍生的蛋白质。
所述TrpD蛋白为如下(e1)或(e2):
(e1)由序列表中序列10所示的氨基酸序列组成的蛋白质;
(e2)将序列的氨基酸序列10经过一个或几个氨基酸残基的取代和/或缺失和/或添加且具有磷酸核糖基邻氨基苯甲酸焦磷酸化酶功能的由序列10衍生的蛋白质。
所述TrpC蛋白为如下(f1)或(f2):
(f1)由序列表中序列11所示的氨基酸序列组成的蛋白质;
(f2)将序列的氨基酸序列11经过一个或几个氨基酸残基的取代和/或缺失和/或添加且具有邻氨基磷酸核糖苯甲酸异构酶功能的由序列11衍生的蛋白质。
所述TrpB蛋白为如下(g1)或(g2):
(g1)由序列表中序列12所示的氨基酸序列组成的蛋白质;
(g2)将序列的氨基酸序列12经过一个或几个氨基酸残基的取代和/或缺失和/或添加且具有色氨酸合酶β亚基功能的由序列12衍生的蛋白质。
所述TrpA蛋白为如下(h1)或(h2):
(h1)由序列表中序列13所示的氨基酸序列组成的蛋白质;
(h2)将序列的氨基酸序列13经过一个或几个氨基酸残基的取代和/或缺失和/或添加且具有色氨酸合酶α亚基功能的由序列13衍生的蛋白质。
编码TrpE*蛋白的基因具体可如序列表的序列2第157-1719位核苷酸所示。
编码TrpD蛋白的基因具体可如序列表的序列2第1719-3314位核苷酸所示。
编码TrpC蛋白的基因具体可如序列表的序列2第3315-4676位核苷酸所示。
编码TrpB蛋白的基因具体可如序列表的序列2第4688-5881位核苷酸所示。
编码TrpA蛋白的基因具体可如序列表的序列2第5881-6687位核苷酸所示。
所述色氨酸衰减子具体如序列表的序列2第21至135位核苷酸所示。
所述色氨酸衰减子相关序列具体如序列表的序列2第21至186位核苷酸所示。
所述色氨酸操纵子基因具体如序列表的序列2第21至6687位核苷酸所示。
所述色氨酸操纵子基因具体如序列表的序列2第21至6865位核苷酸所示。
以上任一所述色氨酸具体可为L-色氨酸。
本发明公开了一种色氨酸衰减子的改造方法及其在色氨酸发酵生产中的应用。本发明通过逐步截短色氨酸衰减子功能序列,获得了显著提高基因翻译水平的色衰减子突变体。本发明通过删除衰减子中编码前导肽的基因trpL和终止子茎环结构中前段反向互补回文序列,可以显著提高后续基因的表达水平。显而易见,根据本专利的试验结果,本领域技术人员可轻易推论得到,在本发明保护的色氨酸衰减子突变体上同时保留上述衰减子终止子茎环结构中前段反向互补回文序列的部分序列,但尚未形成稳定的茎环结构,同样可能得到相似性能的色氨酸衰减子突变体和色氨酸操纵子基因突变体。因此,这种类似的改造色氨酸衰减子的方法也在本专利的保护范围之中。
本发明还保护含有具有所述色氨酸衰减子突变体的色氨酸操纵子基因的重组菌以及所述重组菌在生产色氨酸中的应用。应用本发明提供的色氨酸衰减子改造方法,显著提高了工程菌的色氨酸发酵性能。本发明在实践上可用于细菌发酵生产色氨酸。
本发明通过从5’端逐步截短色氨酸衰减子的序列,意外的获得了可以显著提高基因表达水平的色氨酸衰减子突变体。相应的,本发明获得了色氨酸操纵子基因突变体,过表达该色氨酸操纵子基因突变体的工程菌可以显著提高色氨酸及其衍生物产量。显而易见,本发明还可用于色氨酸代谢途径下游化合物的生物合成。如羟基色胺、烟酸、辅酶、吲哚乙酸、色素和生物碱等。显而易见,本发明解除大肠杆菌的色氨酸衰减子的方法,同样可应用于其它菌属的色氨酸衰减子。
采用本发明提供的方案,可以显著提高色氨酸及其衍生物产量,对于色氨酸及其衍生物的生产领域具有极其重大的应用推广价值。
具体实施方式
以下的实施例便于更好地理解本发明,但并不限定本发明。下述实施例中的实验方法,如无特殊说明,均为常规方法。下述实施例中所用的试验材料,如无特殊说明,均为自常规生化试剂商店购买得到的。以下实施例中的定量试验,均设置三次重复实验,结果取平均值。下述实施例中如未特别指明,实施例中所用的技术手段为本领域技术人员所熟知的常规手段和市售的常用仪器、试剂,可参见《分子克隆实验指南(第3版)》(科学出版社)、《微生物学实验(第4版)》(高等教育出版社)以及相应仪器和试剂的厂商说明书等参考。ATCC:https://www.atcc.org/
大肠杆菌K12MG1655:ATCC编号为700926。pACYC184质粒:NEB公司,产品目录号E4152S。pGFPuv载体:Clontech Laboratories,Inc.,Catalog No.632312。大肠杆菌EC135:记载于如下文献:Zhang et al,Plos Genetics,2012,8(9):e1002987。质粒pBR322:TaKaRa公司,产品目录号:D3050。
实施例1、衰减子突变体调控gfp基因的表达
一、构建重组质粒pACYC184-Pthr-trc
1、合成序列表的序列1所示的双链DNA分子(启动子Pthr-trc)。
2、以大肠杆菌K12MG1655的基因组DNA为模板,采用WY1947和WY1948组成的引物对进行PCR扩增,得到PCR扩增产物。
WY1947:CTAGTCTAGAGCTTTTCATTCTGACTGCAAC;
WY1948:CCCAAGCTT ACATTATACGAGCCGGATGATTAATTGTCAACTGTCTGTGCGCTATGCCT。
3、取步骤2得到的PCR扩增产物,用限制性内切酶Xba I和Hind III进行双酶切,回收酶切产物。
4、取pACYC184质粒,用限制性内切酶Xba I和Hind III进行双酶切,回收载体骨架(约4.1kb)。
5、将步骤3的酶切产物和步骤4的载体骨架连接,得到重组质粒pACYC184-Pthr-trc
二、构建各个重组质粒以及相应的重组菌
1、构建重组菌GFP3223
(1)以大肠杆菌K12MG1655的基因组DNA为模板,采用WY3223和WY3253组成的引物对进行PCR扩增,得到PCR扩增产物A1;以pGFPuv载体为模板,采用WY3105和WY1859组成的引物对进行PCR扩增,得到PCR扩增产物A2;将PCR扩增产物A1和PCR扩增产物A2混合后作为模板,采用WY3223和WY1859组成的引物对进行PCR扩增,得到PCR扩增产物A3。
WY3223:CCCAAGCTTACGTAAAAAGGGTATCGACA;
WY3253:AGTTCTTCTCCTTTACTCATAGAACCAGAACCAGAACCCAGTTCGAGAGTCGGTTTTTG;
WY3105:GGTTCTGGTTCTGGTTCTATGAGTAAAGGAGAAGAACTTTTCA;
WY1859:ACATGCATGC
CAAAAAACCCCTCAAGACCCGTTTAGAGGCCCCAAGGGGTTATGCTAGTTATTTGTAGAGCTCATCCATGCCA。
(2)取步骤(1)得到的PCR扩增产物A3,用限制性内切酶Hind III和Sph I双酶切,回收酶切产物。
(3)取重组质粒pACYC184-Pthr-trc,用限制性内切酶Hind III和Sph I双酶切,回收载体骨架(约4.0kb)。
(4)将步骤(2)的酶切产物和步骤(3)的载体骨架连接,化转至大肠杆菌EC135,并从转化子中提取质粒,得到重组质粒pACYC184-Pthr-trc-trpLE-gfp3223。根据测序结果,对重组质粒pACYC184-Pthr-trc-trpLE-gfp3223进行结构描述如下:在质粒pACYC184的Xba I和Sph I酶切位点之间插入了特异DNA分子;特异DNA分子自上游至下游依次由如下元件组成:序列表的序列1所示的启动子Pthr-trc,限制性内切酶Hind III的酶切识别序列,序列表的序列2第1至186位核苷酸,连接序列“GGTTCTGGTTCTGGTTCT”,序列表的序列7所示的gfp基因,终止子序列“CTAGCATAACCCCTTGGGGCCTCTAAACGGGTCTTGAGGGGTTTTTTG”。
含有重组质粒pACYC184-Pthr-trc-trpLE-gfp3223的大肠杆菌EC135命名为重组菌GFP3223。
2、构建重组菌GFP3224
(1)以大肠杆菌K12MG1655的基因组DNA为模板,采用WY3224和WY3253组成的引物对进行PCR扩增,得到PCR扩增产物A1;以pGFPuv载体为模板,采用WY3105和WY1859组成的引物对进行PCR扩增,得到PCR扩增产物A2;将PCR扩增产物A1和PCR扩增产物A2混合后作为模板,采用WY3224和WY1859组成的引物对进行PCR扩增,得到PCR扩增产物A3。
WY3224:CCCAAGCTTCTAATGAGCGGGCTTTTTTTTGAACA。
(2)取步骤(1)得到的PCR扩增产物A3,用限制性内切酶Hind III和Sph I双酶切,回收酶切产物。
(3)取重组质粒pACYC184-Pthr-trc,用限制性内切酶Hind III和Sph I双酶切,回收载体骨架(约4.0kb)。
(4)将步骤(2)的酶切产物和步骤(3)的载体骨架连接,化转至大肠杆菌EC135,并从转化子中提取质粒,得到重组质粒pACYC184-Pthr-trc-trpLE-gfp3224。根据测序结果,对重组质粒pACYC184-Pthr-trc-trpLE-gfp3224进行结构描述如下:在质粒pACYC184的Xba I和Sph I酶切位点之间插入了特异DNA分子;特异DNA分子自上游至下游依次由如下元件组成:序列表的序列1所示的启动子Pthr-trc,限制性内切酶Hind III的酶切识别序列,序列表的序列2第115至186位核苷酸,连接序列“GGTTCTGGTTCTGGTTCT”,序列表的序列7所示的gfp基因,终止子序列“CTAGCATAACCCCTTGGGGCCTCTAAACGGGTCTTGAGGGGTTTTTTG”。
含有重组质粒pACYC184-Pthr-trc-trpLE-gfp3224的大肠杆菌EC135命名为重组菌GFP3224。
3、构建重组菌GFP3225
(1)以大肠杆菌K12MG1655的基因组DNA为模板,采用WY3225和WY3253组成的引物对进行PCR扩增,得到PCR扩增产物A1;以pGFPuv载体为模板,采用WY3105和WY1859组成的引物对进行PCR扩增,得到PCR扩增产物A2;将PCR扩增产物A1和PCR扩增产物A2混合后作为模板,采用WY3225和WY1859组成的引物对进行PCR扩增,得到PCR扩增产物A3。
WY3225:CCCAAGCTT GCGGGCTTTTTTTTGAACAA。
(2)取步骤(1)得到的PCR扩增产物A3,用限制性内切酶Hind III和Sph I双酶切,回收酶切产物。
(3)取重组质粒pACYC184-Pthr-trc,用限制性内切酶Hind III和Sph I双酶切,回收载体骨架(约4.0kb)。
(4)将步骤(2)的酶切产物和步骤(3)的载体骨架连接,化转至大肠杆菌EC135,并从转化子中提取质粒,得到重组质粒pACYC184-Pthr-trc-trpLE-gfp3225。根据测序结果,对重组质粒pACYC184-Pthr-trc-trpLE-gfp3225进行结构描述如下:在质粒pACYC184的Xba I和Sph I酶切位点之间插入了特异DNA分子;特异DNA分子自上游至下游依次由如下元件组成:序列表的序列1所示的启动子Pthr-trc,限制性内切酶Hind III的酶切识别序列,序列表的序列2第122至186位核苷酸,连接序列“GGTTCTGGTTCTGGTTCT”,序列表的序列7所示的gfp基因,终止子序列“CTAGCATAACCCCTTGGGGCCTCTAAACGGGTCTTGAGGGGTTTTTTG”。
含有重组质粒pACYC184-Pthr-trc-trpLE-gfp3225的大肠杆菌EC135命名为重组菌GFP3225。
4、构建重组菌GFP3226
(1)以大肠杆菌K12MG1655的基因组DNA为模板,采用WY3226和WY3253组成的引物对进行PCR扩增,得到PCR扩增产物A1;以pGFPuv载体为模板,采用WY3105和WY1859组成的引物对进行PCR扩增,得到PCR扩增产物A2;将PCR扩增产物A1和PCR扩增产物A2混合后作为模板,采用WY3226和WY1859组成的引物对进行PCR扩增,得到PCR扩增产物A3。
WY3226:CCCAAGCTT AACAAAATTAGAGAATAACAATGCAAAC。
(2)取步骤(1)得到的PCR扩增产物A3,用限制性内切酶Hind III和Sph I双酶切,回收酶切产物。
(3)取重组质粒pACYC184-Pthr-trc,用限制性内切酶Hind III和Sph I双酶切,回收载体骨架(约4.0kb)。
(4)将步骤(2)的酶切产物和步骤(3)的载体骨架连接,化转至大肠杆菌EC135,并从转化子中提取质粒,得到重组质粒pACYC184-Pthr-trc-trpLE-gfp3226。根据测序结果,对重组质粒pACYC184-Pthr-trc-trpLE-gfp3226进行结构描述如下:在质粒pACYC184的Xba I和Sph I酶切位点之间插入了特异DNA分子;特异DNA分子自上游至下游依次由如下元件组成:序列表的序列1所示的启动子Pthr-trc,限制性内切酶Hind III的酶切识别序列,序列表的序列2第137至186位核苷酸,连接序列“GGTTCTGGTTCTGGTTCT”,序列表的序列7所示的gfp基因,终止子序列“CTAGCATAACCCCTTGGGGCCTCTAAACGGGTCTTGAGGGGTTTTTTG”。
含有重组质粒pACYC184-Pthr-trc-trpLE-gfp3226的大肠杆菌EC135命名为重组菌GFP3226。
5、构建GFP对照
将重组质粒pACYC184-Pthr-trc导入大肠杆菌EC135,得到的重组菌命名为GFP对照。
三、GFP荧光强度分析
试验菌株为:重组菌GFP3223、重组菌GFP3224、重组菌GFP3225或重组菌GFP3226。
设置GFP对照作为对照菌株。
1、将试验菌株或对照菌株接种至含34mg/L氯霉素的液体LB培养基中,37℃、220rpm振荡培养过夜。
2、取步骤1得到的菌液,按照1%接种量接种于含34mg/L氯霉素的液体LB培养基中,37℃、220rpm振荡培养12小时。
3、取150μL步骤2得到的菌液,加入黑边透底的96孔板中,使用高通量多功能酶标仪(INFINITE 200 PRO型,瑞士TECAN)同时检测细胞密度和GFP荧光信号。检测细胞密度的相关参数设置见表1。检测GFP荧光信号的相关参数设置见表2。
表1
吸光度(Absorbance)
波长(Wavelength) 600nm
带宽(Bandwidth) 9nm
闪光次数(Number of Flashes) 25
建立时间(Settle Time) 0ms
表2
荧光顶读(Fluorescence Top Reading)
激发波长(Excitation Wavelength) 400nm
发射波长(Emission Wavelength) 510nm
激发带宽(Excitation Bandwidth) 9nm
发射带宽(Emission Bandwidth) 20nm
收集(Gain) 100(手动,Manual)
闪光次数(Number of Flashes) 15
积分时间(Integration Time) 20μs
滞后时间(LagTime) 0μs
建立时间(Settle Time) 0ms
Z位置(Z-Position) 20000μm(手动,Manual)
各个试验菌株的荧光强度值=实测荧光值÷细胞密度-对照菌株的实测荧光值÷对照菌株的细胞密度。设置三次重复试验,相应的平均值和标准差结果见表3。
与重组菌GFP3223(完全保留色氨酸衰减子)相比,重组菌GFP3224的荧光强度提高了10.7倍。与重组菌GFP3226(完全去除色氨酸衰减子)相比,重组菌GFP3224的荧光强度提高了10.6倍。与重组菌GFP3223相比,重组菌GFP3225的荧光强度提高了3.6倍。与重组菌GFP3226相比,重组菌GFP3225的荧光强度提高了3.6倍。结果表明,位于启动子和目的基因之间的色氨酸衰减子截短体可以作为调控元件,促进目的基因的表达。
色氨酸衰减子突变体如序列表的序列2第n1-n2位核苷酸所示,n1为115以上122以下的自然数(n1优选为115),n2为135以上186以下的自然数(n2具体可为135以上156以下的自然数或157以上186以下的自然数,更具体可为135、156或186)。色氨酸衰减子突变体包括色氨酸衰减子截短体和色氨酸衰减子变体(全称为在色氨酸衰减子截短体下游连接其他核苷酸的变体)。色氨酸衰减子截短体如序列表的序列2第n1-135位核苷酸所示。色氨酸衰减子变体如序列表的序列2第n1-n4位核苷酸所示,n4为136以上186以下的自然数(n4具体可为136以上156以下的自然数或157以上186以下的自然数,更具体可为156或186)。
表3
荧光强度
重组菌GFP3223 2841.4±15.2
重组菌GFP3224 33141.9±283.2
重组菌GFP3225 13084.2±188.3
重组菌GFP3226 2865.1±76.5
实施例2、制备色氨酸
一、构建重组质粒pBR322-aroG*
1、以大肠杆菌K12MG1655的基因组为模板,采用WY4001和WY4002组成的引物对进行PCR扩增,得到PCR扩增产物。
2、以大肠杆菌K12MG1655的基因组为模板,采用WY4003和WY4004组成的引物对进行PCR扩增,得到PCR扩增产物。
3、将步骤1得到的PCR扩增产物和步骤2得到的PCR扩增产物混合后作为模板,采用WY4001和WY4004组成的引物对进行PCR扩增,得到PCR扩增产物。
经测序,步骤3得到的PCR扩增产物的NheI和BamH I酶切识别位点之间的核苷酸如序列表的序列3所示。序列表的序列3中,开放阅读框为第151-1203位核苷酸,编码序列表的序列4所示的AroG*蛋白。与AroG蛋白(野生蛋白)相比,AroG*蛋白只存在一个氨基酸残基的差异,即将AroG蛋白第150位氨基酸残基由脯氨酸突变为了亮氨酸。
WY4001:CTAGCTAGCATCTCGTTTTTCGCGACAATCT;
WY4002:CAGGTCAGCGAGATATTGTAGGGTGATCATATCGAGAAAC;
WY4003:GTTTCTCGATATGATCACCCTACAATATCTCGCTGACCTG;
WY4004:CGCGGATCC AGCGAAAGCAGCGGCGGTT。
4、取质粒pBR322,用限制性内切酶Nhe I和BamH I双酶切,回收载体骨架(约4.3kb)。
5、取步骤3得到的PCR扩增产物,用限制性内切酶Nhe I和BamH I双酶切,回收酶切产物。
6、将步骤4的载体骨架和步骤5的酶切产物连接,得到重组质粒pBR322-aroG*。
二、构建重组质粒pBR322-aroG*-tktA
1、以大肠杆菌K12MG1655的基因组为模板,采用WY4005和WY4006组成的引物对进行PCR扩增,得到PCR扩增产物。经测序,PCR扩增产物的BamHI和Eco 52I酶切识别位点之间的核苷酸如序列表的序列5所示。序列表的序列5中,开放阅读框为第151-2142位核苷酸,编码序列表的序列6所示的TktA蛋白。
WY4005:CGC GGATCC ATCCAGAGATTTCTGAAGCG;
WY4006:AAT CGGCCG TTAATTTCTTATATAACATTGAGTTATAGATATAACAAC。
2、取重组质粒pBR322-aroG*,用限制性内切酶BamH I和Eco 52I双酶切,回收载体骨架(约5.2kb)。
3、取步骤1得到的PCR扩增产物,用限制性内切酶BamH I和Eco 52I双酶切,回收酶切产物。
4、将步骤2的载体骨架和步骤3的酶切产物连接,得到重组质粒pBR322-aroG*-tktA。根据测序结果,对重组质粒pBR322-aroG*-tktA进行结构描述如下:在质粒pBR322的Nhe I和Eco52I之间插入了自上游至下游依次由如下元件组成的DNA分子:序列表的序列3所示的DMA分子、限制性内切酶BamHI的酶切识别序列、序列表的序列5所示的DMA分子。
三、构建重组质粒pACYC184-PJJ
1、合成序列表的序列8所示的双链DNA分子(启动子PJJ)。
2、以步骤1制备的双链DNA分子为模板,采用WY843和WY842组成的引物对进行PCR扩增,得到PCR扩增产物。
WY843:TGCTCTAGACAATTCCGACGTCTAAGAAA;
WY842:CCCAAGCTTGGTCAGTGCGTCCTGCTGAT。
3、取步骤2得到的PCR扩增产物,用限制性内切酶XbaI和Hind III进行双酶切,回收酶切产物。
4、取pACYC184质粒,用限制性内切酶XbaI和Hind III进行双酶切,回收载体骨架(约4.1kb)。
5、将步骤3的酶切产物和步骤4的载体骨架连接,得到重组质粒pACYC184-PJJ
四、构建重组质粒pACYC184-PJJ-trpL*E*DCBA
1、以大肠杆菌K12MG1655的基因组DNA为模板,采用WY4007和WY4010组成的引物对进行PCR扩增,得到PCR扩增产物A1;以大肠杆菌K12MG1655的基因组DNA为模板,采用WY4008和WY4010组成的引物对进行PCR扩增,得到PCR扩增产物A2;以大肠杆菌K12MG1655的基因组DNA为模板,采用WY4009和WY4010组成的引物对进行PCR扩增,得到PCR扩增产物A3;以大肠杆菌K12MG1655的基因组DNA为模板,采用WY4011和WY4012组成的引物对进行PCR扩增,得到PCR扩增产物A4。
WY4007:CGCggatccACGTAAAAAGGGTATCGACA;
WY4008:CGCggatccCTAATGAGCGGGCTTTTTTTTGAACA;
WY4009:CGCggatcc AACAAAATTAGAGAATAACAATGCAAAC;
WY4010:ATCCTGCATAAAAAACGTGTACGGGCTGGGATTACTC;
WY4011:GAGTAATCCCAGCCCGTACACGTTTTTTATGCAGGAT;
WY4012:ACATGCATGC GTTATGTTGCGGGATTAATTTGT。
通过引物WY4010和WY4011在trpE基因中引入一个点突变,突变后的基因编码序列表的序列9所示的TrpE*蛋白。与TrpE蛋白(野生蛋白)相比,TrpE*蛋白只存在一个氨基酸残基的差异,即将TrpE蛋白第293位氨基酸残基由蛋氨酸突变为了苏氨酸。
2、将PCR扩增产物A1和PCR扩增产物A4混合后作为模板,采用WY4007和WY4012组成的引物对进行PCR扩增,得到PCR扩增产物B1;将PCR扩增产物A2和PCR扩增产物A4混合后作为模板,采用WY4008和WY4012组成的引物对进行PCR扩增,得到PCR扩增产物B2;将PCR扩增产物A3和PCR扩增产物A4混合后作为模板,采用WY4009和WY4012组成的引物对进行PCR扩增,得到PCR扩增产物B3。
3、取重组质粒pACYC184-PJJ,用限制性内切酶BamH I和Sph I双酶切,回收载体骨架。
4、取步骤2得到的PCR扩增产物B1,用限制性内切酶BamH I和Sph I双酶切,回收酶切产物。
5、将步骤3的载体骨架和步骤4的酶切产物连接,得到重组质粒pACYC184-PJJ-trpL4007E*DCBA。根据测序结果,对重组质粒pACYC184-PJJ-trpL4007E*DCBA进行结构描述如下:以pACYC184质粒为出发载体,在XbaI和Hind III酶切位点之间插入了序列表的序列8所示的启动子PJJ,在BamH I和Sph I酶切位点之间插入了序列表的序列2所示的DNA分子。
6、取步骤2得到的PCR扩增产物B2,用限制性内切酶BamH I和Sph I双酶切,回收酶切产物。
7、将步骤3的载体骨架和步骤6的酶切产物连接,得到重组质粒pACYC184-PJJ-trpL4008E*DCBA。根据测序结果,对重组质粒pACYC184-PJJ-trpL4008E*DCBA进行结构描述如下:以pACYC184质粒为出发载体,在XbaI和Hind III酶切位点之间插入了序列表的序列8所示的启动子PJJ,在BamH I和Sph I酶切位点之间插入了序列表的序列2第115至6865位核苷酸所示的DNA分子。
8、取步骤2得到的PCR扩增产物B3,用限制性内切酶BamH I和Sph I双酶切,回收酶切产物。
9、将步骤3的载体骨架和步骤8的酶切产物连接,得到重组质粒pACYC184-PJJ-trpL4009E*DCBA。根据测序结果,对重组质粒pACYC184-PJJ-trpL4009E*DCBA进行结构描述如下:以pACYC184质粒为出发载体,在XbaI和Hind III酶切位点之间插入了序列表的序列8所示的启动子PJJ,在BamH I和Sph I酶切位点之间插入了序列表的序列2第137至6865位核苷酸所示的DNA分子。
五、构建重组菌
将重组质粒pBR322-aroG*-tktA导入大肠杆菌K12MG1655,得到重组菌,将其命名为重组菌AT。
将重组质粒pACYC184-PJJ-trpL4007E*DCBA导入重组菌AT中,得到重组菌,将其命名为工程菌Trp4007。
将重组质粒pACYC184-PJJ-trpL4008E*DCBA导入重组菌AT中,得到重组菌,将其命名为工程菌Trp4008。
将重组质粒pACYC184-PJJ-trpL4009E*DCBA导入重组菌AT中,得到重组菌,将其命名为工程菌Trp4009。
六、色氨酸工程菌的摇瓶发酵试验
试验菌株为:工程菌Trp4007、工程菌Trp4008或工程菌Trp4009。
1、取试验菌株,划线接种于含100mg/L氨苄青霉素和34mg/L氯霉素的固体LB培养基平板,37℃静置培养12小时。
2、完成步骤2后,挑取平板上的菌苔,接种至含100mg/L氨苄青霉素和34mg/L氯霉素的液体LB培养基中,37℃、220rpm振荡培养8h,得到种子液(OD600nm值=5.0)。
3、完成步骤3后,将种子液按照3%的接种量接种至发酵培养基中,37℃、220rpm震荡培养。
发酵培养基:葡萄糖20.0g/L、硫酸铵15.0g/L、磷酸二氢钾2.0g/L、七水硫酸镁2.0g/L、酵母粉2.0g/L、碳酸钙15.0g/L、微量元素混合液5mL/L,余量为水。
微量元素混合液:FeSO4·7H2O 10g/L、CaCl2 1.35g/L、ZnSO4·7H2O 2.25g/L、MnSO4·4H2O 0.5g/L、CuSO4·5H2O 1g/L、(NH4)6Mo7O24·4H2O 0.106g/L、Na2B4O7·10H2O0.23g/L、CoCl2·6H2O 0.48g/L、35%HCl 10mL/L,余量为水。
培养过程中,用氨水调节反应体系的pH值使其维持在6.8-7.0。
培养过程中,每隔3-4h取样一次,使用生物传感分析仪SBA-40D检测葡萄糖含量,当体系中的葡萄糖含量低于5g/L时,补加葡萄糖并使体系中的葡萄糖浓度达到10g/L。
培养36h后取样,12000g离心2分钟,取上清液(即为发酵上清),检测L-色氨酸浓度。
结果见表4(三次重复试验的平均值±标准差)。工程菌Trp4008生产L-色氨酸的能力最高,发酵上清中的L-色氨酸浓度为1.20±0.15g/L。
表4
发酵上清中的L-色氨酸含量(g/L)
工程菌Trp4007 0.43±0.08
工程菌Trp4008 1.20±0.15
工程菌Trp4009 0.51±0.10
发酵上清中L-色氨酸浓度的检测方法:高效液相法,在参考文献(氨基酸和生物资源,2000,22,59-60)中氨基酸检测方法的基础上进行优化,具体方法如下(2,4-二硝基氟苯(FDBN)柱前衍生高效液相法):
取10μL上清液于2mL离心管中,加入200μL 0.5M NaHCO3水溶液和100μL 1%(体积比)FDBN-乙腈溶液,于60℃水浴中暗处恒温加热60min,然后冷却至室温,然后加入700μL0.04mol/L KH2PO4水溶液(pH=7.2±0.05,用40g/L KOH水溶液调整pH)并摇匀,静置15min,然后过滤并收集滤液。滤液用于上样,进样量为15μL。
色谱柱为C18柱(ZORBAX Eclipse XDB-C18,4.6*150mm,Agilent,USA);柱温:40℃;紫外检测波长:360nm;流动相A为0.04mol/L KH2PO4水溶液(pH=7.2±0.05,用40g/100mL KOH水溶液调整pH),流动相B为55%(体积比)乙腈水溶液,流动相总流量为1mL/min。
洗脱过程:洗脱起始时刻(0min)流动相A占流动相总流量的体积份数为86%、流动相B占流动相总流量的体积份数为14%;洗脱过程分为4个阶段,每个阶段中流动相A和流动相B占流动相总流量的体积份数均为线性变化;第1阶段(从起始时刻开始共进行2min)结束时流动相A占流动相总流量的体积份数为88%、流动相B占流动相总流量的体积份数为12%,第2阶段(从第1阶段结束时刻开始共进行2min)结束时流动相A占流动相总流量的体积份数为86%、流动相B占流动相总流量的体积份数为14%,第3阶段(从第2阶段结束时刻开始共进行6min)结束时流动相A占流动相总流量的体积份数为70%、流动相B占流动相总流量的体积份数为30%,第4阶段(从第3阶段结束时刻开始共进行10min)结束时流动相A占流动相总流量的体积份数为30%、流动相B占流动相总流量的体积份数为70%。
以市售L-色氨酸为标准品制作标准曲线,计算样品的色氨酸浓度。
最后应说明的是:显然,上述实施例仅仅是为清楚地说明本发明所作的举例,而并非对实施方式的限定。对于所属领域的普通技术人员来说,在上述说明的基础上还可以做出其它不同形式的变化或变动。这里无需也无法对所有的实施方式予以穷举。而由此所引申出的显而易见的变化或变动仍处于本发明的保护范围之中。
SEQUENCE LISTING
<110> 中国科学院微生物研究所
<120> 色氨酸衰减子突变体及其应用以及解除色氨酸衰减子反馈阻遏的方法
<130> GNCYX171072
<160> 13
<170> PatentIn version 3.5
<210> 1
<211> 192
<212> DNA
<213> 人工序列
<400> 1
gcttttcatt ctgactgcaa cgggcaatat gtctctgtgt ggattaaaaa aagagtgtct 60
gatagcagct tctgaactgg ttacctgccg tgagtaaatt aaaattttat tgacttaggt 120
cactaaatac tttaaccaat ataggcatag cgcacagaca gttgacaatt aatcatccgg 180
ctcgtataat gt 192
<210> 2
<211> 6865
<212> DNA
<213> 大肠杆菌
<400> 2
acgtaaaaag ggtatcgaca atgaaagcaa ttttcgtact gaaaggttgg tggcgcactt 60
cctgaaacgg gcagtgtatt caccatgcgt aaagcaatca gatacccagc ccgcctaatg 120
agcgggcttt tttttgaaca aaattagaga ataacaatgc aaacacaaaa accgactctc 180
gaactgctaa cctgcgaagg cgcttatcgc gacaatccca ccgcgctttt tcaccagttg 240
tgtggggatc gtccggcaac gctgctgctg gaatccgcag atatcgacag caaagatgat 300
ttaaaaagcc tgctgctggt agacagtgcg ctgcgcatta cagctttagg tgacactgtc 360
acaatccagg cactttccgg caacggcgaa gccctcctgg cactactgga taacgccctg 420
cctgcgggtg tggaaagtga acaatcacca aactgccgtg tgctgcgctt cccccctgtc 480
agtccactgc tggatgaaga cgcccgctta tgctcccttt cggtttttga cgctttccgt 540
ttattgcaga atctgttgaa tgtaccgaag gaagaacgag aagccatgtt cttcggcggc 600
ctgttctctt atgaccttgt ggcgggattt gaagatttac cgcaactgtc agcggaaaat 660
aactgccctg atttctgttt ttatctcgct gaaacgctga tggtgattga ccatcagaaa 720
aaaagcaccc gtattcaggc cagcctgttt gctccgaatg aagaagaaaa acaacgtctc 780
actgctcgcc tgaacgaact acgtcagcaa ctgaccgaag ccgcgccgcc gctgccagtg 840
gtttccgtgc cgcatatgcg ttgtgaatgt aatcagagcg atgaagagtt cggtggcgta 900
gtgcgtttgt tgcaaaaagc gattcgcgct ggagaaattt tccaggtggt gccatctcgc 960
cgtttctctc tgccctgccc gtcaccgctg gcggcctatt acgtgctgaa aaagagtaat 1020
cccagcccgt acacgttttt tatgcaggat aatgatttca ccctatttgg cgcgtcgccg 1080
gaaagctcgc tcaagtatga tgccaccagc cgccagattg agatctaccc gattgccgga 1140
acacgcccac gcggtcgtcg cgccgatggt tcactggaca gagatctcga cagccgtatt 1200
gaactggaaa tgcgtaccga tcataaagag ctgtctgaac atctgatgct ggttgatctc 1260
gcccgtaatg atctggcacg catttgcacc cccggcagcc gctacgtcgc cgatctcacc 1320
aaagttgacc gttattccta tgtgatgcac ctcgtctctc gcgtagtcgg cgaactgcgt 1380
cacgatcttg acgccctgca cgcttatcgc gcctgtatga atatggggac gttaagcggt 1440
gcgccgaaag tacgcgctat gcagttaatt gccgaggcgg aaggtcgtcg ccgcggcagc 1500
tacggcggcg cggtaggtta tttcaccgcg catggcgatc tcgacacctg cattgtgatc 1560
cgctcggcgc tggtggaaaa cggtatcgcc accgtgcaag cgggtgctgg tgtagtcctt 1620
gattctgttc cgcagtcgga agccgacgaa acccgtaaca aagcccgcgc tgtactgcgc 1680
gctattgcca ccgcgcatca tgcacaggag actttctgat ggctgacatt ctgctgctcg 1740
ataatatcga ctcttttacg tacaacctgg cagatcagtt gcgcagcaat gggcataacg 1800
tggtgattta ccgcaaccat attccggcgc aaaccttaat tgaacgcctg gcgaccatga 1860
gcaatccggt gctgatgctt tctcctggcc ccggtgtgcc gagcgaagcc ggttgtatgc 1920
cggaactcct cacccgcttg cgtggcaagc tgcccattat tggcatttgc ctcggacatc 1980
aggcgattgt cgaagcttac gggggctatg tcggtcaggc gggcgaaatt ctccacggta 2040
aagcctccag cattgaacat gacggtcagg cgatgtttgc cggattaaca aacccgctgc 2100
cggtggcgcg ttatcactcg ctggttggca gtaacattcc ggccggttta accatcaacg 2160
cccattttaa tggcatggtg atggcagtac gtcacgatgc ggatcgcgtt tgtggattcc 2220
agttccatcc ggaatccatt ctcaccaccc agggcgctcg cctgctggaa caaacgctgg 2280
cctgggcgca gcagaaacta gagccagcca acacgctgca accgattctg gaaaaactgt 2340
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acccgaacga gatcgccggg gcagcaaccg cgctactgga aaacgcagcg ccgttcccgc 2520
gcccggatta tctgtttgct gatatcgtcg gtactggcgg tgacggcagc aacagtatca 2580
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atcttgatat gaacgccgat aaatcgcgcc aggcgctgga tgagttaggt gtatgtttcc 2760
tctttgcgcc gaagtatcac accggattcc gccacgcgat gccggttcgc cagcaactga 2820
aaacccgcac cctgttcaat gtgctggggc cattgattaa cccggcgcat ccgccgctgg 2880
cgttaattgg tgtttatagt ccggaactgg tgctgccgat tgccgaaacc ttgcgcgtgc 2940
tggggtatca acgcgcggcg gtggtgcaca gcggcgggat ggatgaagtt tcattacacg 3000
cgccgacaat cgttgccgaa ctgcatgacg gcgaaattaa aagctatcag ctcaccgcag 3060
aagactttgg cctgacaccc taccaccagg agcaactggc aggcggaaca ccggaagaaa 3120
accgtgacat tttaacacgt ttgttacaag gtaaaggcga cgccgcccat gaagcagccg 3180
tcgctgcgaa cgtcgccatg ttaatgcgcc tgcatggcca tgaagatctg caagccaatg 3240
cgcaaaccgt tcttgaggta ctgcgcagtg gttccgctta cgacagagtc accgcactgg 3300
cggcacgagg gtaaatgatg caaaccgttt tagcgaaaat cgtcgcagac aaggcgattt 3360
gggtagaagc ccgcaaacag cagcaaccgc tggccagttt tcagaatgag gttcagccga 3420
gcacgcgaca tttttatgat gcgctacagg gtgcgcgcac ggcgtttatt ctggagtgca 3480
agaaagcgtc gccgtcaaaa ggcgtgatcc gtgatgattt cgatccagca cgcattgccg 3540
ccatttataa acattacgct tcggcaattt cggtgctgac tgatgagaaa tattttcagg 3600
ggagctttaa tttcctcccc atcgtcagcc aaatcgcccc gcagccgatt ttatgtaaag 3660
acttcattat cgacccttac cagatctatc tggcgcgcta ttaccaggcc gatgcctgct 3720
tattaatgct ttcagtactg gatgacgacc aatatcgcca gcttgccgcc gtcgctcaca 3780
gtctggagat gggggtgctg accgaagtca gtaatgaaga ggaacaggag cgcgccattg 3840
cattgggagc aaaggtcgtt ggcatcaaca accgcgatct gcgtgatttg tcgattgatc 3900
tcaaccgtac ccgcgagctt gcgccgaaac tggggcacaa cgtgacggta atcagcgaat 3960
ccggcatcaa tacttacgct caggtgcgcg agttaagcca cttcgctaac ggttttctga 4020
ttggttcggc gttgatggcc catgacgatt tgcacgccgc cgtgcgccgg gtgttgctgg 4080
gtgagaataa agtatgtggc ctgacgcgtg ggcaagatgc taaagcagct tatgacgcgg 4140
gcgcgattta cggtgggttg atttttgttg cgacatcacc gcgttgcgtc aacgttgaac 4200
aggcgcagga agtgatggct gcggcaccgt tgcagtatgt tggcgtgttc cgcaatcacg 4260
atattgccga tgtggtggac aaagctaagg tgttatcgct ggcggcagtg caactgcatg 4320
gtaatgaaga acagctgtat atcgatacgc tgcgtgaagc tctgccagca catgttgcca 4380
tctggaaagc attaagcgtc ggtgaaaccc tgcccgcccg cgagtttcag cacgttgata 4440
aatatgtttt agacaacggc cagggtggaa gcgggcaacg ttttgactgg tcactattaa 4500
atggtcaatc gcttggcaac gttctgctgg cggggggctt aggcgcagat aactgcgtgg 4560
aagcggcaca aaccggctgc gccggacttg attttaattc tgctgtagag tcgcaaccgg 4620
gcatcaaaga cgcacgtctt ttggcctcgg ttttccagac gctgcgcgca tattaaggaa 4680
aggaacaatg acaacattac ttaaccccta ttttggtgag tttggcggca tgtacgtgcc 4740
acaaatcctg atgcctgctc tgcgccagct ggaagaagct tttgtcagtg cgcaaaaaga 4800
tcctgaattt caggctcagt tcaacgacct gctgaaaaac tatgccgggc gtccaaccgc 4860
gctgaccaaa tgccagaaca ttacagccgg gacgaacacc acgctgtatc tcaagcgtga 4920
agatttgctg cacggcggcg cgcataaaac taaccaggtg ctggggcagg cgttgctggc 4980
gaagcggatg ggtaaaaccg aaatcatcgc cgaaaccggt gccggtcagc atggcgtggc 5040
gtcggccctt gccagcgccc tgctcggcct gaaatgccgt atttatatgg gtgccaaaga 5100
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gaccattgtg cgtgagtttc agcggatgat tggcgaagaa accaaagcgc agattctgga 5340
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cggcatgttt gctgatttca tcaatgaaac caacgtcggc ctgattggtg tggagccagg 5460
tggtcacggt atcgaaactg gcgagcacgg cgcaccgcta aaacatggtc gcgtgggtat 5520
ctatttcggt atgaaagcgc cgatgatgca aaccgaagac gggcagattg aagaatctta 5580
ctccatctcc gccggactgg atttcccgtc tgtcggccca caacacgcgt atcttaacag 5640
cactggacgc gctgattacg tgtctattac cgatgatgaa gcccttgaag ccttcaaaac 5700
gctgtgcctg cacgaaggga tcatcccggc gctggaatcc tcccacgccc tggcccatgc 5760
gttgaaaatg atgcgcgaaa acccggataa agagcagcta ctggtggtta acctttccgg 5820
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atggaacgct acgaatctct gtttgcccag ttgaaggagc gcaaagaagg cgcattcgtt 5940
cctttcgtca cgctcggtga tccgggcatt gagcagtcat tgaaaattat cgatacgcta 6000
attgaagccg gtgctgacgc gctggagtta ggtatcccct tctccgaccc actggcggat 6060
ggcccgacga ttcaaaacgc cactctgcgc gcctttgcgg caggtgtgac tccggcacaa 6120
tgttttgaaa tgctggcact gattcgccag aaacacccga ccattcccat tggcctgttg 6180
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aaagagtaca acgctgcacc tccattgcag ggatttggta tttccgcccc ggatcaggta 6540
aaagcagcga ttgatgcagg agctgcgggc gcgatttctg gttcggccat tgttaaaatc 6600
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aactttcttt aatgaagccg gaaaaatcct aaattcattt aatatttatc tttttaccgt 6780
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aaacaaatta atcccgcaac ataac 6865
<210> 3
<211> 1403
<212> DNA
<213> 大肠杆菌
<400> 3
atctcgtttt tcgcgacaat ctggcgtttt tcttgctaat tccaggatta atccgttcat 60
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aaagaaatca aagagttact tcctcctgtc gcattgctgg aaaaattccc cgctactgaa 240
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<211> 350
<212> PRT
<213> 大肠杆菌
<400> 4
Met Asn Tyr Gln Asn Asp Asp Leu Arg Ile Lys Glu Ile Lys Glu Leu
1 5 10 15
Leu Pro Pro Val Ala Leu Leu Glu Lys Phe Pro Ala Thr Glu Asn Ala
20 25 30
Ala Asn Thr Val Ala His Ala Arg Lys Ala Ile His Lys Ile Leu Lys
35 40 45
Gly Asn Asp Asp Arg Leu Leu Val Val Ile Gly Pro Cys Ser Ile His
50 55 60
Asp Pro Val Ala Ala Lys Glu Tyr Ala Thr Arg Leu Leu Ala Leu Arg
65 70 75 80
Glu Glu Leu Lys Asp Glu Leu Glu Ile Val Met Arg Val Tyr Phe Glu
85 90 95
Lys Pro Arg Thr Thr Val Gly Trp Lys Gly Leu Ile Asn Asp Pro His
100 105 110
Met Asp Asn Ser Phe Gln Ile Asn Asp Gly Leu Arg Ile Ala Arg Lys
115 120 125
Leu Leu Leu Asp Ile Asn Asp Ser Gly Leu Pro Ala Ala Gly Glu Phe
130 135 140
Leu Asp Met Ile Thr Leu Gln Tyr Leu Ala Asp Leu Met Ser Trp Gly
145 150 155 160
Ala Ile Gly Ala Arg Thr Thr Glu Ser Gln Val His Arg Glu Leu Ala
165 170 175
Ser Gly Leu Ser Cys Pro Val Gly Phe Lys Asn Gly Thr Asp Gly Thr
180 185 190
Ile Lys Val Ala Ile Asp Ala Ile Asn Ala Ala Gly Ala Pro His Cys
195 200 205
Phe Leu Ser Val Thr Lys Trp Gly His Ser Ala Ile Val Asn Thr Ser
210 215 220
Gly Asn Gly Asp Cys His Ile Ile Leu Arg Gly Gly Lys Glu Pro Asn
225 230 235 240
Tyr Ser Ala Lys His Val Ala Glu Val Lys Glu Gly Leu Asn Lys Ala
245 250 255
Gly Leu Pro Ala Gln Val Met Ile Asp Phe Ser His Ala Asn Ser Ser
260 265 270
Lys Gln Phe Lys Lys Gln Met Asp Val Cys Ala Asp Val Cys Gln Gln
275 280 285
Ile Ala Gly Gly Glu Lys Ala Ile Ile Gly Val Met Val Glu Ser His
290 295 300
Leu Val Glu Gly Asn Gln Ser Leu Glu Ser Gly Glu Pro Leu Ala Tyr
305 310 315 320
Gly Lys Ser Ile Thr Asp Ala Cys Ile Gly Trp Glu Asp Thr Asp Ala
325 330 335
Leu Leu Arg Gln Leu Ala Asn Ala Val Lys Ala Arg Arg Gly
340 345 350
<210> 5
<211> 2342
<212> DNA
<213> 大肠杆菌
<400> 5
atccagagat ttctgaagcg gcaaaaggat gttccatgta catgacgcgc ggcttgcggt 60
aaattgttgg caaattttcc ggcgtagccc aaaacgcgct gtcgtcaagt cgttaagggc 120
gtgcccttca tcatccgatc tggagtcaaa atgtcctcac gtaaagagct tgccaatgct 180
attcgtgcgc tgagcatgga cgcagtacag aaagccaaat ccggtcaccc gggtgcccct 240
atgggtatgg ctgacattgc cgaagtcctg tggcgtgatt tcctgaaaca caacccgcag 300
aatccgtcct gggctgaccg tgaccgcttc gtgctgtcca acggccacgg ctccatgctg 360
atctacagcc tgctgcacct caccggttac gatctgccga tggaagaact gaaaaacttc 420
cgtcagctgc actctaaaac tccgggtcac ccggaagtgg gttacaccgc tggtgtggaa 480
accaccaccg gtccgctggg tcagggtatt gccaacgcag tcggtatggc gattgcagaa 540
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gccttcatgg gcgacggctg catgatggaa ggcatctccc acgaagtttg ctctctggcg 660
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tatgctcagt gggatgcgaa agaagcaggc caggcgaaag aatccgcatg gaacgagaaa 1080
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gaactgattt tcatcgctac cggttcagaa gttgaactgg ctgttgctgc ctacgaaaaa 1860
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taaggcgtgt tgtagatcac aaatatttat atgcaataaa tatcaattat gtaatatgca 2280
tcacgatatg cgtattgaca tttgttgtta tatctataac tcaatgttat ataagaaatt 2340
aa 2342
<210> 6
<211> 663
<212> PRT
<213> 大肠杆菌
<400> 6
Met Ser Ser Arg Lys Glu Leu Ala Asn Ala Ile Arg Ala Leu Ser Met
1 5 10 15
Asp Ala Val Gln Lys Ala Lys Ser Gly His Pro Gly Ala Pro Met Gly
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Met Ala Asp Ile Ala Glu Val Leu Trp Arg Asp Phe Leu Lys His Asn
35 40 45
Pro Gln Asn Pro Ser Trp Ala Asp Arg Asp Arg Phe Val Leu Ser Asn
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Gly His Gly Ser Met Leu Ile Tyr Ser Leu Leu His Leu Thr Gly Tyr
65 70 75 80
Asp Leu Pro Met Glu Glu Leu Lys Asn Phe Arg Gln Leu His Ser Lys
85 90 95
Thr Pro Gly His Pro Glu Val Gly Tyr Thr Ala Gly Val Glu Thr Thr
100 105 110
Thr Gly Pro Leu Gly Gln Gly Ile Ala Asn Ala Val Gly Met Ala Ile
115 120 125
Ala Glu Lys Thr Leu Ala Ala Gln Phe Asn Arg Pro Gly His Asp Ile
130 135 140
Val Asp His Tyr Thr Tyr Ala Phe Met Gly Asp Gly Cys Met Met Glu
145 150 155 160
Gly Ile Ser His Glu Val Cys Ser Leu Ala Gly Thr Leu Lys Leu Gly
165 170 175
Lys Leu Ile Ala Phe Tyr Asp Asp Asn Gly Ile Ser Ile Asp Gly His
180 185 190
Val Glu Gly Trp Phe Thr Asp Asp Thr Ala Met Arg Phe Glu Ala Tyr
195 200 205
Gly Trp His Val Ile Arg Asp Ile Asp Gly His Asp Ala Ala Ser Ile
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Lys Arg Ala Val Glu Glu Ala Arg Ala Val Thr Asp Lys Pro Ser Leu
225 230 235 240
Leu Met Cys Lys Thr Ile Ile Gly Phe Gly Ser Pro Asn Lys Ala Gly
245 250 255
Thr His Asp Ser His Gly Ala Pro Leu Gly Asp Ala Glu Ile Ala Leu
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Thr Arg Glu Gln Leu Gly Trp Lys Tyr Ala Pro Phe Glu Ile Pro Ser
275 280 285
Glu Ile Tyr Ala Gln Trp Asp Ala Lys Glu Ala Gly Gln Ala Lys Glu
290 295 300
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<212> DNA
<213> 人工序列
<400> 7
atgagtaaag gagaagaact tttcactgga gttgtcccaa ttcttgttga attagatggt 60
gatgttaatg ggcacaaatt ttctgtcagt ggagagggtg aaggtgatgc aacatacgga 120
aaacttaccc ttaaatttat ttgcactact ggaaaactac ctgttccatg gccaacactt 180
gtcactactt tctcttatgg tgttcaatgc ttttcccgtt atccggatca tatgaaacgg 240
catgactttt tcaagagtgc catgcccgaa ggttatgtac aggaacgcac tatatctttc 300
aaagatgacg ggaactacaa gacgcgtgct gaagtcaagt ttgaaggtga tacccttgtt 360
aatcgtatcg agttaaaagg tattgatttt aaagaagatg gaaacattct cggacacaaa 420
ctcgagtaca actataactc acacaatgta tacatcacgg cagacaaaca aaagaatgga 480
atcaaagcta acttcaaaat tcgccacaac attgaagatg gatccgttca actagcagac 540
cattatcaac aaaatactcc aattggcgat ggccctgtcc ttttaccaga caaccattac 600
ctgtcgacac aatctgccct ttcgaaagat cccaacgaaa agcgtgacca catggtcctt 660
cttgagtttg taactgctgc tgggattaca catggcatgg atgagctcta caaataa 717
<210> 8
<211> 162
<212> DNA
<213> 人工序列
<400> 8
caattccgac gtctaagaaa ccattattat catgacatta acctataaaa ataggcgtat 60
cacgaggccc tttcgtcttc acctcgagtc cctatcagtg atagagattg acctccctat 120
cagtgataga gatactgagc acatcagcag gacgcactga cc 162
<210> 9
<211> 520
<212> PRT
<213> 大肠杆菌
<400> 9
Met Gln Thr Gln Lys Pro Thr Leu Glu Leu Leu Thr Cys Glu Gly Ala
1 5 10 15
Tyr Arg Asp Asn Pro Thr Ala Leu Phe His Gln Leu Cys Gly Asp Arg
20 25 30
Pro Ala Thr Leu Leu Leu Glu Ser Ala Asp Ile Asp Ser Lys Asp Asp
35 40 45
Leu Lys Ser Leu Leu Leu Val Asp Ser Ala Leu Arg Ile Thr Ala Leu
50 55 60
Gly Asp Thr Val Thr Ile Gln Ala Leu Ser Gly Asn Gly Glu Ala Leu
65 70 75 80
Leu Ala Leu Leu Asp Asn Ala Leu Pro Ala Gly Val Glu Ser Glu Gln
85 90 95
Ser Pro Asn Cys Arg Val Leu Arg Phe Pro Pro Val Ser Pro Leu Leu
100 105 110
Asp Glu Asp Ala Arg Leu Cys Ser Leu Ser Val Phe Asp Ala Phe Arg
115 120 125
Leu Leu Gln Asn Leu Leu Asn Val Pro Lys Glu Glu Arg Glu Ala Met
130 135 140
Phe Phe Gly Gly Leu Phe Ser Tyr Asp Leu Val Ala Gly Phe Glu Asp
145 150 155 160
Leu Pro Gln Leu Ser Ala Glu Asn Asn Cys Pro Asp Phe Cys Phe Tyr
165 170 175
Leu Ala Glu Thr Leu Met Val Ile Asp His Gln Lys Lys Ser Thr Arg
180 185 190
Ile Gln Ala Ser Leu Phe Ala Pro Asn Glu Glu Glu Lys Gln Arg Leu
195 200 205
Thr Ala Arg Leu Asn Glu Leu Arg Gln Gln Leu Thr Glu Ala Ala Pro
210 215 220
Pro Leu Pro Val Val Ser Val Pro His Met Arg Cys Glu Cys Asn Gln
225 230 235 240
Ser Asp Glu Glu Phe Gly Gly Val Val Arg Leu Leu Gln Lys Ala Ile
245 250 255
Arg Ala Gly Glu Ile Phe Gln Val Val Pro Ser Arg Arg Phe Ser Leu
260 265 270
Pro Cys Pro Ser Pro Leu Ala Ala Tyr Tyr Val Leu Lys Lys Ser Asn
275 280 285
Pro Ser Pro Tyr Thr Phe Phe Met Gln Asp Asn Asp Phe Thr Leu Phe
290 295 300
Gly Ala Ser Pro Glu Ser Ser Leu Lys Tyr Asp Ala Thr Ser Arg Gln
305 310 315 320
Ile Glu Ile Tyr Pro Ile Ala Gly Thr Arg Pro Arg Gly Arg Arg Ala
325 330 335
Asp Gly Ser Leu Asp Arg Asp Leu Asp Ser Arg Ile Glu Leu Glu Met
340 345 350
Arg Thr Asp His Lys Glu Leu Ser Glu His Leu Met Leu Val Asp Leu
355 360 365
Ala Arg Asn Asp Leu Ala Arg Ile Cys Thr Pro Gly Ser Arg Tyr Val
370 375 380
Ala Asp Leu Thr Lys Val Asp Arg Tyr Ser Tyr Val Met His Leu Val
385 390 395 400
Ser Arg Val Val Gly Glu Leu Arg His Asp Leu Asp Ala Leu His Ala
405 410 415
Tyr Arg Ala Cys Met Asn Met Gly Thr Leu Ser Gly Ala Pro Lys Val
420 425 430
Arg Ala Met Gln Leu Ile Ala Glu Ala Glu Gly Arg Arg Arg Gly Ser
435 440 445
Tyr Gly Gly Ala Val Gly Tyr Phe Thr Ala His Gly Asp Leu Asp Thr
450 455 460
Cys Ile Val Ile Arg Ser Ala Leu Val Glu Asn Gly Ile Ala Thr Val
465 470 475 480
Gln Ala Gly Ala Gly Val Val Leu Asp Ser Val Pro Gln Ser Glu Ala
485 490 495
Asp Glu Thr Arg Asn Lys Ala Arg Ala Val Leu Arg Ala Ile Ala Thr
500 505 510
Ala His His Ala Gln Glu Thr Phe
515 520
<210> 10
<211> 531
<212> PRT
<213> 大肠杆菌
<400> 10
Met Ala Asp Ile Leu Leu Leu Asp Asn Ile Asp Ser Phe Thr Tyr Asn
1 5 10 15
Leu Ala Asp Gln Leu Arg Ser Asn Gly His Asn Val Val Ile Tyr Arg
20 25 30
Asn His Ile Pro Ala Gln Thr Leu Ile Glu Arg Leu Ala Thr Met Ser
35 40 45
Asn Pro Val Leu Met Leu Ser Pro Gly Pro Gly Val Pro Ser Glu Ala
50 55 60
Gly Cys Met Pro Glu Leu Leu Thr Arg Leu Arg Gly Lys Leu Pro Ile
65 70 75 80
Ile Gly Ile Cys Leu Gly His Gln Ala Ile Val Glu Ala Tyr Gly Gly
85 90 95
Tyr Val Gly Gln Ala Gly Glu Ile Leu His Gly Lys Ala Ser Ser Ile
100 105 110
Glu His Asp Gly Gln Ala Met Phe Ala Gly Leu Thr Asn Pro Leu Pro
115 120 125
Val Ala Arg Tyr His Ser Leu Val Gly Ser Asn Ile Pro Ala Gly Leu
130 135 140
Thr Ile Asn Ala His Phe Asn Gly Met Val Met Ala Val Arg His Asp
145 150 155 160
Ala Asp Arg Val Cys Gly Phe Gln Phe His Pro Glu Ser Ile Leu Thr
165 170 175
Thr Gln Gly Ala Arg Leu Leu Glu Gln Thr Leu Ala Trp Ala Gln Gln
180 185 190
Lys Leu Glu Pro Ala Asn Thr Leu Gln Pro Ile Leu Glu Lys Leu Tyr
195 200 205
Gln Ala Gln Thr Leu Ser Gln Gln Glu Ser His Gln Leu Phe Ser Ala
210 215 220
Val Val Arg Gly Glu Leu Lys Pro Glu Gln Leu Ala Ala Ala Leu Val
225 230 235 240
Ser Met Lys Ile Arg Gly Glu His Pro Asn Glu Ile Ala Gly Ala Ala
245 250 255
Thr Ala Leu Leu Glu Asn Ala Ala Pro Phe Pro Arg Pro Asp Tyr Leu
260 265 270
Phe Ala Asp Ile Val Gly Thr Gly Gly Asp Gly Ser Asn Ser Ile Asn
275 280 285
Ile Ser Thr Ala Ser Ala Phe Val Ala Ala Ala Cys Gly Leu Lys Val
290 295 300
Ala Lys His Gly Asn Arg Ser Val Ser Ser Lys Ser Gly Ser Ser Asp
305 310 315 320
Leu Leu Ala Ala Phe Gly Ile Asn Leu Asp Met Asn Ala Asp Lys Ser
325 330 335
Arg Gln Ala Leu Asp Glu Leu Gly Val Cys Phe Leu Phe Ala Pro Lys
340 345 350
Tyr His Thr Gly Phe Arg His Ala Met Pro Val Arg Gln Gln Leu Lys
355 360 365
Thr Arg Thr Leu Phe Asn Val Leu Gly Pro Leu Ile Asn Pro Ala His
370 375 380
Pro Pro Leu Ala Leu Ile Gly Val Tyr Ser Pro Glu Leu Val Leu Pro
385 390 395 400
Ile Ala Glu Thr Leu Arg Val Leu Gly Tyr Gln Arg Ala Ala Val Val
405 410 415
His Ser Gly Gly Met Asp Glu Val Ser Leu His Ala Pro Thr Ile Val
420 425 430
Ala Glu Leu His Asp Gly Glu Ile Lys Ser Tyr Gln Leu Thr Ala Glu
435 440 445
Asp Phe Gly Leu Thr Pro Tyr His Gln Glu Gln Leu Ala Gly Gly Thr
450 455 460
Pro Glu Glu Asn Arg Asp Ile Leu Thr Arg Leu Leu Gln Gly Lys Gly
465 470 475 480
Asp Ala Ala His Glu Ala Ala Val Ala Ala Asn Val Ala Met Leu Met
485 490 495
Arg Leu His Gly His Glu Asp Leu Gln Ala Asn Ala Gln Thr Val Leu
500 505 510
Glu Val Leu Arg Ser Gly Ser Ala Tyr Asp Arg Val Thr Ala Leu Ala
515 520 525
Ala Arg Gly
530
<210> 11
<211> 453
<212> PRT
<213> 大肠杆菌
<400> 11
Met Met Gln Thr Val Leu Ala Lys Ile Val Ala Asp Lys Ala Ile Trp
1 5 10 15
Val Glu Ala Arg Lys Gln Gln Gln Pro Leu Ala Ser Phe Gln Asn Glu
20 25 30
Val Gln Pro Ser Thr Arg His Phe Tyr Asp Ala Leu Gln Gly Ala Arg
35 40 45
Thr Ala Phe Ile Leu Glu Cys Lys Lys Ala Ser Pro Ser Lys Gly Val
50 55 60
Ile Arg Asp Asp Phe Asp Pro Ala Arg Ile Ala Ala Ile Tyr Lys His
65 70 75 80
Tyr Ala Ser Ala Ile Ser Val Leu Thr Asp Glu Lys Tyr Phe Gln Gly
85 90 95
Ser Phe Asn Phe Leu Pro Ile Val Ser Gln Ile Ala Pro Gln Pro Ile
100 105 110
Leu Cys Lys Asp Phe Ile Ile Asp Pro Tyr Gln Ile Tyr Leu Ala Arg
115 120 125
Tyr Tyr Gln Ala Asp Ala Cys Leu Leu Met Leu Ser Val Leu Asp Asp
130 135 140
Asp Gln Tyr Arg Gln Leu Ala Ala Val Ala His Ser Leu Glu Met Gly
145 150 155 160
Val Leu Thr Glu Val Ser Asn Glu Glu Glu Gln Glu Arg Ala Ile Ala
165 170 175
Leu Gly Ala Lys Val Val Gly Ile Asn Asn Arg Asp Leu Arg Asp Leu
180 185 190
Ser Ile Asp Leu Asn Arg Thr Arg Glu Leu Ala Pro Lys Leu Gly His
195 200 205
Asn Val Thr Val Ile Ser Glu Ser Gly Ile Asn Thr Tyr Ala Gln Val
210 215 220
Arg Glu Leu Ser His Phe Ala Asn Gly Phe Leu Ile Gly Ser Ala Leu
225 230 235 240
Met Ala His Asp Asp Leu His Ala Ala Val Arg Arg Val Leu Leu Gly
245 250 255
Glu Asn Lys Val Cys Gly Leu Thr Arg Gly Gln Asp Ala Lys Ala Ala
260 265 270
Tyr Asp Ala Gly Ala Ile Tyr Gly Gly Leu Ile Phe Val Ala Thr Ser
275 280 285
Pro Arg Cys Val Asn Val Glu Gln Ala Gln Glu Val Met Ala Ala Ala
290 295 300
Pro Leu Gln Tyr Val Gly Val Phe Arg Asn His Asp Ile Ala Asp Val
305 310 315 320
Val Asp Lys Ala Lys Val Leu Ser Leu Ala Ala Val Gln Leu His Gly
325 330 335
Asn Glu Glu Gln Leu Tyr Ile Asp Thr Leu Arg Glu Ala Leu Pro Ala
340 345 350
His Val Ala Ile Trp Lys Ala Leu Ser Val Gly Glu Thr Leu Pro Ala
355 360 365
Arg Glu Phe Gln His Val Asp Lys Tyr Val Leu Asp Asn Gly Gln Gly
370 375 380
Gly Ser Gly Gln Arg Phe Asp Trp Ser Leu Leu Asn Gly Gln Ser Leu
385 390 395 400
Gly Asn Val Leu Leu Ala Gly Gly Leu Gly Ala Asp Asn Cys Val Glu
405 410 415
Ala Ala Gln Thr Gly Cys Ala Gly Leu Asp Phe Asn Ser Ala Val Glu
420 425 430
Ser Gln Pro Gly Ile Lys Asp Ala Arg Leu Leu Ala Ser Val Phe Gln
435 440 445
Thr Leu Arg Ala Tyr
450
<210> 12
<211> 397
<212> PRT
<213> 大肠杆菌
<400> 12
Met Thr Thr Leu Leu Asn Pro Tyr Phe Gly Glu Phe Gly Gly Met Tyr
1 5 10 15
Val Pro Gln Ile Leu Met Pro Ala Leu Arg Gln Leu Glu Glu Ala Phe
20 25 30
Val Ser Ala Gln Lys Asp Pro Glu Phe Gln Ala Gln Phe Asn Asp Leu
35 40 45
Leu Lys Asn Tyr Ala Gly Arg Pro Thr Ala Leu Thr Lys Cys Gln Asn
50 55 60
Ile Thr Ala Gly Thr Asn Thr Thr Leu Tyr Leu Lys Arg Glu Asp Leu
65 70 75 80
Leu His Gly Gly Ala His Lys Thr Asn Gln Val Leu Gly Gln Ala Leu
85 90 95
Leu Ala Lys Arg Met Gly Lys Thr Glu Ile Ile Ala Glu Thr Gly Ala
100 105 110
Gly Gln His Gly Val Ala Ser Ala Leu Ala Ser Ala Leu Leu Gly Leu
115 120 125
Lys Cys Arg Ile Tyr Met Gly Ala Lys Asp Val Glu Arg Gln Ser Pro
130 135 140
Asn Val Phe Arg Met Arg Leu Met Gly Ala Glu Val Ile Pro Val His
145 150 155 160
Ser Gly Ser Ala Thr Leu Lys Asp Ala Cys Asn Glu Ala Leu Arg Asp
165 170 175
Trp Ser Gly Ser Tyr Glu Thr Ala His Tyr Met Leu Gly Thr Ala Ala
180 185 190
Gly Pro His Pro Tyr Pro Thr Ile Val Arg Glu Phe Gln Arg Met Ile
195 200 205
Gly Glu Glu Thr Lys Ala Gln Ile Leu Glu Arg Glu Gly Arg Leu Pro
210 215 220
Asp Ala Val Ile Ala Cys Val Gly Gly Gly Ser Asn Ala Ile Gly Met
225 230 235 240
Phe Ala Asp Phe Ile Asn Glu Thr Asn Val Gly Leu Ile Gly Val Glu
245 250 255
Pro Gly Gly His Gly Ile Glu Thr Gly Glu His Gly Ala Pro Leu Lys
260 265 270
His Gly Arg Val Gly Ile Tyr Phe Gly Met Lys Ala Pro Met Met Gln
275 280 285
Thr Glu Asp Gly Gln Ile Glu Glu Ser Tyr Ser Ile Ser Ala Gly Leu
290 295 300
Asp Phe Pro Ser Val Gly Pro Gln His Ala Tyr Leu Asn Ser Thr Gly
305 310 315 320
Arg Ala Asp Tyr Val Ser Ile Thr Asp Asp Glu Ala Leu Glu Ala Phe
325 330 335
Lys Thr Leu Cys Leu His Glu Gly Ile Ile Pro Ala Leu Glu Ser Ser
340 345 350
His Ala Leu Ala His Ala Leu Lys Met Met Arg Glu Asn Pro Asp Lys
355 360 365
Glu Gln Leu Leu Val Val Asn Leu Ser Gly Arg Gly Asp Lys Asp Ile
370 375 380
Phe Thr Val His Asp Ile Leu Lys Ala Arg Gly Glu Ile
385 390 395
<210> 13
<211> 268
<212> PRT
<213> 大肠杆菌
<400> 13
Met Glu Arg Tyr Glu Ser Leu Phe Ala Gln Leu Lys Glu Arg Lys Glu
1 5 10 15
Gly Ala Phe Val Pro Phe Val Thr Leu Gly Asp Pro Gly Ile Glu Gln
20 25 30
Ser Leu Lys Ile Ile Asp Thr Leu Ile Glu Ala Gly Ala Asp Ala Leu
35 40 45
Glu Leu Gly Ile Pro Phe Ser Asp Pro Leu Ala Asp Gly Pro Thr Ile
50 55 60
Gln Asn Ala Thr Leu Arg Ala Phe Ala Ala Gly Val Thr Pro Ala Gln
65 70 75 80
Cys Phe Glu Met Leu Ala Leu Ile Arg Gln Lys His Pro Thr Ile Pro
85 90 95
Ile Gly Leu Leu Met Tyr Ala Asn Leu Val Phe Asn Lys Gly Ile Asp
100 105 110
Glu Phe Tyr Ala Gln Cys Glu Lys Val Gly Val Asp Ser Val Leu Val
115 120 125
Ala Asp Val Pro Val Glu Glu Ser Ala Pro Phe Arg Gln Ala Ala Leu
130 135 140
Arg His Asn Val Ala Pro Ile Phe Ile Cys Pro Pro Asn Ala Asp Asp
145 150 155 160
Asp Leu Leu Arg Gln Ile Ala Ser Tyr Gly Arg Gly Tyr Thr Tyr Leu
165 170 175
Leu Ser Arg Ala Gly Val Thr Gly Ala Glu Asn Arg Ala Ala Leu Pro
180 185 190
Leu Asn His Leu Val Ala Lys Leu Lys Glu Tyr Asn Ala Ala Pro Pro
195 200 205
Leu Gln Gly Phe Gly Ile Ser Ala Pro Asp Gln Val Lys Ala Ala Ile
210 215 220
Asp Ala Gly Ala Ala Gly Ala Ile Ser Gly Ser Ala Ile Val Lys Ile
225 230 235 240
Ile Glu Gln His Ile Asn Glu Pro Glu Lys Met Leu Ala Ala Leu Lys
245 250 255
Val Phe Val Gln Pro Met Lys Ala Ala Thr Arg Ser
260 265

Claims (10)

1.DNA分子甲,为如下(a1)、(a2)或(a3):
(a1)序列表的序列2第115-186位核苷酸所示的DNA分子;
(a2)在(a1)的末端连接标签序列得到的DNA分子;
(a3)在(a1)的末端连接连接序列得到的DNA分子。
2.权利要求1所述DNA分子甲在促进下游目的基因表达中的应用。
3.DNA分子乙,自上游至下游依次包括:权利要求1所述DNA分子甲和目的基因。
4.DNA分子丙,自上游至下游依次包括:启动子、权利要求1所述DNA分子甲、目的基因和终止子。
5.DNA分子丁,是将色氨酸操纵子基因中的色氨酸衰减子第1至114位核苷酸去除后得到的DNA分子;所述色氨酸操纵子基因如序列表的序列2第21至6687位核苷酸所示。
6.DNA分子戊,自上游至下游依次包括如下元件:启动子和权利要求5所述DNA分子丁。
7.含有权利要求5或6所述DNA分子的重组载体或重组菌。
8.权利要求7所述重组菌在制备色氨酸中的应用。
9.一种提高微生物生产色氨酸的能力的方法,包括如下步骤:删除微生物的色氨酸操纵子基因中从色氨酸衰减子第1位开始计数的第1至114位核苷酸;所述色氨酸操纵子基因如序列表的序列2第21至6687位核苷酸所示。
10.一种解除微生物中色氨酸操纵子反馈阻遏的方法,包括如下步骤:删除微生物的色氨酸操纵子基因中从色氨酸衰减子第1位开始计数的第1至114位核苷酸;所述色氨酸操纵子基因如序列表的序列2第21至6687位核苷酸所示。
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