CN106687135A - 使用pd‑1轴结合拮抗剂和il‑17结合拮抗剂治疗癌症的方法 - Google Patents

使用pd‑1轴结合拮抗剂和il‑17结合拮抗剂治疗癌症的方法 Download PDF

Info

Publication number
CN106687135A
CN106687135A CN201580048941.5A CN201580048941A CN106687135A CN 106687135 A CN106687135 A CN 106687135A CN 201580048941 A CN201580048941 A CN 201580048941A CN 106687135 A CN106687135 A CN 106687135A
Authority
CN
China
Prior art keywords
antibody
binding antagonists
seq
cancer
sequences
Prior art date
Legal status (The legal status is an assumption and is not a legal conclusion. Google has not performed a legal analysis and makes no representation as to the accuracy of the status listed.)
Pending
Application number
CN201580048941.5A
Other languages
English (en)
Inventor
J·格罗根
Y·肖
P·卡普拉斯
S·连诺格罗
J·哈克尼
E·Y-C·蒋
Current Assignee (The listed assignees may be inaccurate. Google has not performed a legal analysis and makes no representation or warranty as to the accuracy of the list.)
F Hoffmann La Roche AG
Original Assignee
F Hoffmann La Roche AG
Priority date (The priority date is an assumption and is not a legal conclusion. Google has not performed a legal analysis and makes no representation as to the accuracy of the date listed.)
Filing date
Publication date
Application filed by F Hoffmann La Roche AG filed Critical F Hoffmann La Roche AG
Publication of CN106687135A publication Critical patent/CN106687135A/zh
Pending legal-status Critical Current

Links

Classifications

    • AHUMAN NECESSITIES
    • A61MEDICAL OR VETERINARY SCIENCE; HYGIENE
    • A61KPREPARATIONS FOR MEDICAL, DENTAL OR TOILETRY PURPOSES
    • A61K39/00Medicinal preparations containing antigens or antibodies
    • A61K39/395Antibodies; Immunoglobulins; Immune serum, e.g. antilymphocytic serum
    • A61K39/39533Antibodies; Immunoglobulins; Immune serum, e.g. antilymphocytic serum against materials from animals
    • A61K39/39558Antibodies; Immunoglobulins; Immune serum, e.g. antilymphocytic serum against materials from animals against tumor tissues, cells, antigens
    • CCHEMISTRY; METALLURGY
    • C07ORGANIC CHEMISTRY
    • C07KPEPTIDES
    • C07K16/00Immunoglobulins [IGs], e.g. monoclonal or polyclonal antibodies
    • C07K16/18Immunoglobulins [IGs], e.g. monoclonal or polyclonal antibodies against material from animals or humans
    • C07K16/24Immunoglobulins [IGs], e.g. monoclonal or polyclonal antibodies against material from animals or humans against cytokines, lymphokines or interferons
    • C07K16/244Interleukins [IL]
    • AHUMAN NECESSITIES
    • A61MEDICAL OR VETERINARY SCIENCE; HYGIENE
    • A61KPREPARATIONS FOR MEDICAL, DENTAL OR TOILETRY PURPOSES
    • A61K47/00Medicinal preparations characterised by the non-active ingredients used, e.g. carriers or inert additives; Targeting or modifying agents chemically bound to the active ingredient
    • A61K47/50Medicinal preparations characterised by the non-active ingredients used, e.g. carriers or inert additives; Targeting or modifying agents chemically bound to the active ingredient the non-active ingredient being chemically bound to the active ingredient, e.g. polymer-drug conjugates
    • A61K47/51Medicinal preparations characterised by the non-active ingredients used, e.g. carriers or inert additives; Targeting or modifying agents chemically bound to the active ingredient the non-active ingredient being chemically bound to the active ingredient, e.g. polymer-drug conjugates the non-active ingredient being a modifying agent
    • A61K47/62Medicinal preparations characterised by the non-active ingredients used, e.g. carriers or inert additives; Targeting or modifying agents chemically bound to the active ingredient the non-active ingredient being chemically bound to the active ingredient, e.g. polymer-drug conjugates the non-active ingredient being a modifying agent the modifying agent being a protein, peptide or polyamino acid
    • AHUMAN NECESSITIES
    • A61MEDICAL OR VETERINARY SCIENCE; HYGIENE
    • A61PSPECIFIC THERAPEUTIC ACTIVITY OF CHEMICAL COMPOUNDS OR MEDICINAL PREPARATIONS
    • A61P35/00Antineoplastic agents
    • AHUMAN NECESSITIES
    • A61MEDICAL OR VETERINARY SCIENCE; HYGIENE
    • A61PSPECIFIC THERAPEUTIC ACTIVITY OF CHEMICAL COMPOUNDS OR MEDICINAL PREPARATIONS
    • A61P43/00Drugs for specific purposes, not provided for in groups A61P1/00-A61P41/00
    • CCHEMISTRY; METALLURGY
    • C07ORGANIC CHEMISTRY
    • C07KPEPTIDES
    • C07K16/00Immunoglobulins [IGs], e.g. monoclonal or polyclonal antibodies
    • C07K16/18Immunoglobulins [IGs], e.g. monoclonal or polyclonal antibodies against material from animals or humans
    • C07K16/28Immunoglobulins [IGs], e.g. monoclonal or polyclonal antibodies against material from animals or humans against receptors, cell surface antigens or cell surface determinants
    • C07K16/2803Immunoglobulins [IGs], e.g. monoclonal or polyclonal antibodies against material from animals or humans against receptors, cell surface antigens or cell surface determinants against the immunoglobulin superfamily
    • C07K16/2827Immunoglobulins [IGs], e.g. monoclonal or polyclonal antibodies against material from animals or humans against receptors, cell surface antigens or cell surface determinants against the immunoglobulin superfamily against B7 molecules, e.g. CD80, CD86
    • CCHEMISTRY; METALLURGY
    • C07ORGANIC CHEMISTRY
    • C07KPEPTIDES
    • C07K16/00Immunoglobulins [IGs], e.g. monoclonal or polyclonal antibodies
    • C07K16/18Immunoglobulins [IGs], e.g. monoclonal or polyclonal antibodies against material from animals or humans
    • C07K16/28Immunoglobulins [IGs], e.g. monoclonal or polyclonal antibodies against material from animals or humans against receptors, cell surface antigens or cell surface determinants
    • C07K16/30Immunoglobulins [IGs], e.g. monoclonal or polyclonal antibodies against material from animals or humans against receptors, cell surface antigens or cell surface determinants from tumour cells
    • C07K16/3053Skin, nerves, brain
    • AHUMAN NECESSITIES
    • A61MEDICAL OR VETERINARY SCIENCE; HYGIENE
    • A61KPREPARATIONS FOR MEDICAL, DENTAL OR TOILETRY PURPOSES
    • A61K39/00Medicinal preparations containing antigens or antibodies
    • A61K2039/505Medicinal preparations containing antigens or antibodies comprising antibodies
    • AHUMAN NECESSITIES
    • A61MEDICAL OR VETERINARY SCIENCE; HYGIENE
    • A61KPREPARATIONS FOR MEDICAL, DENTAL OR TOILETRY PURPOSES
    • A61K39/00Medicinal preparations containing antigens or antibodies
    • A61K2039/505Medicinal preparations containing antigens or antibodies comprising antibodies
    • A61K2039/507Comprising a combination of two or more separate antibodies
    • AHUMAN NECESSITIES
    • A61MEDICAL OR VETERINARY SCIENCE; HYGIENE
    • A61KPREPARATIONS FOR MEDICAL, DENTAL OR TOILETRY PURPOSES
    • A61K2300/00Mixtures or combinations of active ingredients, wherein at least one active ingredient is fully defined in groups A61K31/00 - A61K41/00
    • CCHEMISTRY; METALLURGY
    • C07ORGANIC CHEMISTRY
    • C07KPEPTIDES
    • C07K2317/00Immunoglobulins specific features
    • C07K2317/30Immunoglobulins specific features characterized by aspects of specificity or valency
    • C07K2317/33Crossreactivity, e.g. for species or epitope, or lack of said crossreactivity

Landscapes

  • Health & Medical Sciences (AREA)
  • Chemical & Material Sciences (AREA)
  • Immunology (AREA)
  • Life Sciences & Earth Sciences (AREA)
  • Organic Chemistry (AREA)
  • Medicinal Chemistry (AREA)
  • General Health & Medical Sciences (AREA)
  • Proteomics, Peptides & Aminoacids (AREA)
  • Molecular Biology (AREA)
  • Genetics & Genomics (AREA)
  • Biochemistry (AREA)
  • Biophysics (AREA)
  • Engineering & Computer Science (AREA)
  • Pharmacology & Pharmacy (AREA)
  • Animal Behavior & Ethology (AREA)
  • Public Health (AREA)
  • Veterinary Medicine (AREA)
  • Bioinformatics & Cheminformatics (AREA)
  • Epidemiology (AREA)
  • Biomedical Technology (AREA)
  • Nuclear Medicine, Radiotherapy & Molecular Imaging (AREA)
  • General Chemical & Material Sciences (AREA)
  • Chemical Kinetics & Catalysis (AREA)
  • Neurology (AREA)
  • Cell Biology (AREA)
  • Oncology (AREA)
  • Microbiology (AREA)
  • Mycology (AREA)
  • Medicines That Contain Protein Lipid Enzymes And Other Medicines (AREA)
  • Medicines Containing Antibodies Or Antigens For Use As Internal Diagnostic Agents (AREA)
  • Peptides Or Proteins (AREA)

Abstract

本公开文本提供包括对个体施用有效量的PD‑1轴结合拮抗剂和IL‑17结合拮抗剂的方法。进一步提供的是包含PD‑1轴结合拮抗剂,IL‑17结合拮抗剂,或二者,以及其使用说明书的试剂盒。

Description

使用PD-1轴结合拮抗剂和IL-17结合拮抗剂治疗癌症的方法
对相关申请的交叉引用
本申请要求2014年9月15日提交的美国临时申请No.62/050,745的优先权,据此通过援引将其完整收录。
ASCII文本文件上的序列表的提交
通过援引将ASCII文本文件上的下述提交的内容完整收入本文:计算机可读形式(CRF)的序列表(文件名称:146392027140SeqList.txt,记录日期:2015年9月14日,大小:41KB)。
发明领域
本公开文本涉及通过施用PD-1轴结合拮抗剂和IL-17结合拮抗剂来治疗癌症的方法。
发明背景
对T细胞提供两种截然不同的信号是一种关于抗原呈递细胞(APC)对静息T淋巴细胞的淋巴细胞活化的广泛公认的模型。Lafferty等,Aust.J.Exp.Biol.Med.Sci.53:27-42(1975)。此模型进一步提供了自身与非自身的辨别和免疫耐受性。Bretscher等,Science169:1042-1049(1970);Bretscher,P.A.,P.N.A.S.USA 96:185-190(1999);Jenkins等,J.Exp.Med.165:302-319(1987)。在主要组织相容性复合体(MHC)的背景中呈递的外来抗原肽的识别后,第一信号,或抗原特异性信号经由T细胞受体(TCR)转导。第二或共刺激信号通过抗原呈递细胞(APC)上表达的共刺激分子投递至T细胞,并且诱导T细胞以促进克隆扩充,细胞因子分泌和效应器功能。Lenschow等,Ann.Rev.Immunol.14:233(1996)。在缺乏共刺激的情况中,T细胞能对抗原刺激变得不应,不发起有效的免疫应答,并且进一步可以导致对外来抗原的耐受性或耗竭。
在两信号模型中,T细胞接受正和负第二共刺激信号二者。此类正和负信号的调节对于在维持免疫耐受性和防止自身免疫的同时使宿主的保护性免疫应答最大化是至关重要的。负第二信号对于诱导T细胞耐受性似乎是必需的,而正信号促进T细胞活化。虽然简单的两信号模型仍然为未免疫淋巴细胞提供有效解释,但是宿主的免疫应答是一个动态过程,并且也可以对抗原暴露的T细胞提供共刺激信号。共刺激的机制是治疗学方面感兴趣的,因为已经显示了共刺激信号的操作提供增强或终止基于细胞的免疫应答的手段。最近,已经发现了T细胞功能障碍或无反应性与抑制性受体(编程性死亡1多肽(PD-1))的诱导且持续的表达并行发生。因此,PD-1和经由与PD-1的相互作用发信号的其它分子,诸如编程性死亡配体1(PD-Ll)和编程性死亡配体2(PD-L2)的治疗性靶向是强烈感兴趣的领域。
PDL1在许多癌症中过表达,并且经常与不良预后关联(Okazaki T等,Intern.Immun.2007,19(7):813;Thompson RH等,Cancer Res 2006,66(7):3381)。令人感兴趣地,与正常组织中的T淋巴细胞和外周血T淋巴细胞形成对比,大多数肿瘤浸润性T淋巴细胞主要表达PD-1,这指示肿瘤反应性T细胞上PD-1的上调可以促成受损的抗肿瘤免疫应答(Blood 2009 114(8):1537)。这可以是由于利用由与PD-1表达T细胞相互作用的PDL1表达肿瘤细胞介导的PD-L1信号传导以导致T细胞活化的减弱及逃避免疫监视(Sharpe等,NatRev 2002)(Keir ME等,2008Annu.Rev.Immunol.26:677)。因此,对PD-L1/PD-1相互作用的抑制可以增强CD8+T细胞介导的肿瘤杀伤。
IL-17是一种促炎性分子,其刺激上皮细胞、内皮细胞和成纤维细胞生成其它炎性细胞因子和趋化因子,包括IL-6、IL-8、G-CSF、及MCP-1[参见Yao,Z.等,J.Immunol.,122(12):5483-5486(1995);Yao,Z.等,Immunity,3(6):811-821(1995);Fossiez,F.等,J.Exp.Med.,183(6):2593-2603(1996);Kennedy,J.等,J.Interferon Cytokine Res.,16(8):611-7(1996);Cai,X.Y.等,Immunol.Lett,62(1):51-8(1998);Jovanovic,D.V.等,J.Immunol.,160(7):3513-21(1998);Laan,M.等,J.Immunol.,162(4):2347-52(1999);Linden,A.等,Eur Respir J,15(5):973-7(2000);及Aggarwal,S.和Gurney,A.L.,JLeukocBiol.71(1):1-8(2002)]。IL-17还与其它细胞因子(包括TNF-α和IL-1β)协同作用以进一步诱导趋化因子表达(Chabaud,M.等,J.Immunol.161(1):409-14(1998))。白介素17(IL-17)对多种类型的细胞展现多效生物学活性。IL-17还具有诱导ICAM-1表面表达、T细胞增殖、及CD34+人祖细胞生长并分化为嗜中性细胞的能力。
仍然需要用于治疗各种癌症,稳定化各种癌症,预防各种癌症,和/或延迟各种癌症形成的此类最佳疗法。
通过援引将本文中引用的所有参考文献(包括专利申请,专利公开文本,和UniProtKB/Swiss-Prot登录号)完整收入本文,就像明确且单独指出通过援引来收录每一篇个别参考文献。
发明概述
本公开文本描述包含有效量的PD-1轴结合拮抗剂和IL-17结合拮抗剂的组合治疗。
在某些方面,本公开文本提供一种用于在个体中治疗癌症或延迟癌症进展的方法,其包括对该个体施用有效量的PD-1轴结合拮抗剂和IL-17结合拮抗剂。在另一个方面,本公开文本提供一种在具有癌症的个体中增强免疫功能的方法,其包括施用有效量的PD-1轴结合拮抗剂和IL-17结合拮抗剂的组合。
在另一个方面,本公开文本提供一种用于为PD-1轴结合拮抗剂和IL-17结合拮抗剂的治疗鉴定具有癌症的个体的方法,该方法包括:(a)检测自该个体中的癌症获得的活检样品中IL-17的表达;并(b)如果该活检样品显示IL-17的表达的话,或如果该活检样品显示与参照或参照样品相比升高的IL-17的表达的话,对该个体施用有效量的PD-1轴结合拮抗剂和IL-17结合拮抗剂。在另一个方面,本公开文本提供一种用于为PD-1轴结合拮抗剂和IL-17结合拮抗剂的治疗鉴定具有癌症的个体的方法,该方法包括:(a)检测自该个体中的癌症获得的活检样品中IL-17基因签名(诸如一种或多种选自IL-17A,IL-17F,IL-8,CSF3,CXCL1,CXCL3,和CCL20的基因)的表达;并(b)如果该活检样品显示该IL-17基因签名的表达的话,或如果该活检样品显示与参照或参照样品相比升高的该IL-17基因签名的表达,对该个体施用有效量的PD-1轴结合拮抗剂和IL-17结合拮抗剂。在另一个方面,本公开文本提供一种用于为PD-1轴结合拮抗剂和IL-17结合拮抗剂的治疗鉴定具有癌症的个体的方法,该方法包括:(a)检测自该个体中的癌症获得的活检样品中IL-17基因签名(诸如一种或多种选自CD4,CD8a,IL17A,IL17B,IL17C,IL17D,IL17F,IL17RA,IL17RC,C3,CCL2,CCL20,CSF2,CSF3,CXCL1,CXCL2,CXCL3,CXCL5,CXCL10,CXCR1,CXCR2,ICAM1,IL6,IL8,MMP1,MMP2,MMP3,MMP8,MMP9,MMP13,MMP14,MMP25,NCF4,NFKBIZ,S100A8,S100A9,SAA2,SAA1,SAA3,SAA4,TIMP1,TIMP2,TIMP3,和TIMP4的基因)的表达;并(b)如果该活检样品显示该IL-17基因签名的表达的话,或如果该活检样品显示与参照或参照样品相比升高的该IL-17基因签名的表达的话,对该个体施用有效量的PD-1轴结合拮抗剂和IL-17结合拮抗剂。在另一个方面,本公开文本提供一种用于为PD-1轴结合拮抗剂和IL-17结合拮抗剂的治疗鉴定具有癌症的个体的方法,该方法包括检测自该个体中的癌症获得的活检样品中IL-17基因签名(诸如一种或多种选自CD4,CD8a,IL17A,IL17B,IL17C,IL17D,IL17F,IL17RA,IL17RC,C3,CCL2,CCL20,CSF2,CSF3,CXCL1,CXCL2,CXCL3,CXCL5,CXCL10,CXCR1,CXCR2,ICAM1,IL6,IL8,MMP1,MMP2,MMP3,MMP8,MMP9,MMP13,MMP14,MMP25,NCF4,NFKBIZ,S100A8,S100A9,SAA2,SAA1,SAA3,SAA4,TIMP1,TIMP2,TIMP3,和TIMP4的基因)的表达,其中如果该活检样品显示该IL-17基因签名的表达的话,或如果该活检样品显示与参照或参照样品相比升高的该IL-17基因签名的表达的话,为该治疗鉴定该个体。
在一些实施方案中,该PD-1轴结合拮抗剂选自由PD-1结合拮抗剂,PDL1结合拮抗剂和PDL2结合拮抗剂组成的组。
在一些实施方案中,该PD-1轴结合拮抗剂是PD-1结合拮抗剂。在一些实施方案中,该PD-1结合拮抗剂抑制PD-1对其配体结合配偶的结合。在一些实施方案中,该PD-1结合拮抗剂抑制PD-1对PDL1的结合。在一些实施方案中,该PD-1结合拮抗剂抑制PD-1对PDL2的结合。在一些实施方案中,该PD-1结合拮抗剂抑制PD-1对PDL1和PDL2二者的结合。在一些实施方案中,PD-1结合拮抗剂是抗体。在一些实施方案中,该抗PD-1抗体是单克隆抗体。在一些实施方案中,该抗PD-1抗体是选自由Fab,Fab’-SH,Fv,scFv,和(Fab’)2片段组成的组的抗体片段。在一些实施方案中,PD-1结合拮抗剂是nivolumab,pembrolizumab,CT-011,或AMP-224。
在一些实施方案中,该PD-1轴结合拮抗剂是PDL1结合拮抗剂。在一些实施方案中,该PDL1结合拮抗剂抑制PDL1对PD-1的结合。在一些实施方案中,该PDL1结合拮抗剂抑制PDL1对B7-1的结合。在一些实施方案中,该PDL1结合拮抗剂抑制PDL1对PD-1和B7-1二者的结合。在一些实施方案中,该PDL1结合拮抗剂是抗PDL1抗体。在一些实施方案中,该抗PDL1抗体是单克隆抗体。在一些实施方案中,该抗PDL1抗体是选自由Fab,Fab’-SH,Fv,scFv,和(Fab’)2片段组成的组的抗体片段。在一些实施方案中,该抗PDL1抗体是人源化抗体或人抗体。在一些实施方案中,该PDL1结合拮抗剂选自由YW243.55.S70,MPDL3280A,MDX-1105,和MEDI4736组成的组。
在一些实施方案中,该抗PDL1抗体包含包含SEQ ID NO:15的HVR-H1序列,SEQ IDNO:16的HVR-H2序列,和SEQ ID NO:3的HVR-H3序列的重链;和包含SEQ ID NO:17的HVR-L1序列,SEQ ID NO:18的HVR-L2序列,和SEQ ID NO:19的HVR-L3序列的轻链。在一些实施方案中,抗PDL1抗体包含包含SEQ ID NO:24或SEQ ID NO:28的氨基酸序列的重链可变区和包含SEQ ID NO:21的氨基酸序列的轻链可变区。在一些实施方案中,该抗PDL1抗体包含包括SEQID NO:26的氨基酸序列的重链和/或包含SEQ ID NO:27的氨基酸序列的轻链。
在一些实施方案中,该PD-1轴结合拮抗剂是PDL2结合拮抗剂。在一些实施方案中,PDL2结合拮抗剂是抗体。在一些实施方案中,该抗PDL2抗体是单克隆抗体。在一些实施方案中,该抗PDL2抗体是选自由Fab,Fab’-SH,Fv,scFv,和(Fab’)2片段组成的组的抗体片段。在一些实施方案中,PDL2结合拮抗剂是免疫粘附素。
在一些实施方案中,该IL-17结合拮抗剂抑制IL-17对IL-17受体的结合。在一些实施方案中,该IL-17结合拮抗剂是抗体。在一些实施方案中,该IL-17结合拮抗剂是单克隆抗体。在一些实施方案中,该IL-17结合拮抗剂是选自由Fab,Fab’-SH,Fv,scFv,和(Fab’)2片段组成的组的抗体片段。在一些实施方案中,该IL-17结合拮抗剂是人源化抗体或人抗体。
在一些实施方案中,该抗IL-17抗体包含包含SEQ ID NO:32的CDR-H1序列,SEQ IDNO:33的CDR-H2序列,和SEQ ID NO:34的CDR-H3序列的重链;和包含SEQ ID NO:35的CDR-L1序列,SEQ ID NO:36的CDR-L2序列,和SEQ ID NO:37的CDR-L3序列的轻链。在一些实施方案中,该抗IL-17抗体包含包含SEQ ID NO:30的氨基酸序列的重链可变区和包含SEQ ID NO:31的氨基酸序列的轻链可变区。
在一些实施方案中,该抗IL-17抗体包含包含SEQ ID NO:40的CDR-H1序列,SEQ IDNO:41的CDR-H2序列,和SEQ ID NO:42的CDR-H3序列的重链;和包含SEQ ID NO:43的CDR-L1序列,SEQ ID NO:44的CDR-L2序列,和SEQ ID NO:45的CDR-L3序列的轻链。在一些实施方案中,该抗IL-17抗体包含包含SEQ ID NO:38的氨基酸序列的重链可变区和包含SEQ ID NO:39的氨基酸序列的轻链可变区。
在一些实施方案中,该抗IL-17抗体包含包含SEQ ID NO:48的CDR-H1序列,SEQ IDNO:49的CDR-H2序列,和SEQ ID NO:50的CDR-H3序列的重链;和包含SEQ ID NO:51的CDR-L1序列,SEQ ID NO:52的CDR-L2序列,和SEQ ID NO:53的CDR-L3序列的轻链。在一些实施方案中,该抗IL-17抗体包含包含SEQ ID NO:46的氨基酸序列的重链可变区和包含SEQ ID NO:47的氨基酸序列的轻链可变区。
在一些实施方案中,该抗IL-17抗体包含包含SEQ ID NO:56的CDR-H1序列,SEQ IDNO:57的CDR-H2序列,和SEQ ID NO:58的CDR-H3序列的重链;和包含SEQ ID NO:59的CDR-L1序列,SEQ ID NO:60的CDR-L2序列,和SEQ ID NO:61的CDR-L3序列的轻链。在一些实施方案中,该抗IL-17抗体包含包含SEQ ID NO:54的氨基酸序列的重链可变区和包含SEQ ID NO:55的氨基酸序列的轻链可变区。
在一些实施方案中,该IL-17结合拮抗剂是抗IL-17抗体。在一些实施方案中,该抗IL-17抗体特异性结合IL-17A。在一些实施方案中,该抗IL-17抗体特异性结合IL-17F。在一些实施方案中,该抗IL-17抗体特异性结合IL-17A和IL-17F。在一些实施方案中,该抗IL-17抗体是ixekizumab,bimekizumab,或secukinumab。
在一些实施方案中,该IL-17结合拮抗剂是抗IL-17受体抗体。在一些实施方案中,该抗IL-17受体抗体是brodalumab。
在一些实施方案中,该IL-17结合拮抗剂是包含至少一个来自IL-17受体的外显子的可溶性多肽。在一些实施方案中,该可溶性多肽包含至少一个来自IL-17RA的外显子和至少一个来自IL-17RC的外显子。
在一些实施方案中,该方法进一步包括检测施用该PD-1轴结合拮抗剂和该IL-17结合拮抗剂之前或之后来自该个体的癌症的活检样品中生物标志物表达的步骤。在一些实施方案中,自该个体的癌症获得的活检样品显示IL-17的表达。在一些实施方案中,该IL-17的表达是IL-17mRNA的表达。在一些实施方案中,该IL-17的表达是IL-17蛋白质的表达。在一些实施方案中,该自癌症获得的活检样品显示与参照或参照样品相比升高的IL-17的表达。在一些实施方案中,自该个体的癌症获得的活检样品显示一种或多种选自由IL-17A,IL-17F,IL-8,CSF3,CXCL1,CXCL3,和CCL20组成的组的基因的表达。在一些实施方案中,该自癌症获得的活检样品显示与参照或参照样品相比升高的一种或多种选自由IL-17A,IL-17F,IL-8,CSF3,CXCL1,CXCL3,和CCL20组成的组的基因的表达。在一些实施方案中,该癌症选自由肾细胞癌,膀胱癌,非小细胞肺癌,鳞状非小细胞肺癌,非鳞状非小细胞肺癌,结直肠癌,黑素瘤,卵巢癌,乳腺癌,激素受体阳性乳腺癌,HER2阳性乳腺癌,和三重阴性乳腺癌组成的组。在一些实施方案中,自该个体的癌症获得的活检样品显示一种或多种选自由CD4,CD8a,IL17A,IL17B,IL17C,IL17D,IL17F,IL17RA,IL17RC,C3,CCL2,CCL20,CSF2,CSF3,CXCL1,CXCL2,CXCL3,CXCL5,CXCL10,CXCR1,CXCR2,ICAM1,IL6,IL8,MMP1,MMP2,MMP3,MMP8,MMP9,MMP13,MMP14,MMP25,NCF4,NFKBIZ,S100A8,S100A9,SAA2,SAA1,SAA3,SAA4,TIMP1,TIMP2,TIMP3,和TIMP4组成的组的基因的表达。在一些实施方案中,自该个体的癌症获得的活检样品显示至少1,至少2,至少3,至少4,至少5,至少6,至少7,至少8,至少9,至少10,至少11,至少12,至少13,至少14,至少15,至少16,至少17,至少18,至少19,至少20,至少21,至少22,至少23,至少24,至少25,至少26,至少27,至少28,至少29,至少30,至少31,至少32,至少33,至少34,至少35,至少36,至少37,至少38,至少39,至少40,至少41,至少42,至少43,或至少44种选自CD4,CD8a,IL17A,IL17B,IL17C,IL17D,IL17F,IL17RA,IL17RC,C3,CCL2,CCL20,CSF2,CSF3,CXCL1,CXCL2,CXCL3,CXCL5,CXCL10,CXCR1,CXCR2,ICAM1,IL6,IL8,MMP1,MMP2,MMP3,MMP8,MMP9,MMP13,MMP14,MMP25,NCF4,NFKBIZ,S100A8,S100A9,SAA2,SAA1,SAA3,SAA4,TIMP1,TIMP2,TIMP3,和TIMP4基因的表达。在一些实施方案中,该自癌症获得的活检样品显示与参照或参照样品相比升高的一种或多种选自由CD4,CD8a,IL17A,IL17B,IL17C,IL17D,IL17F,IL17RA,IL17RC,C3,CCL2,CCL20,CSF2,CSF3,CXCL1,CXCL2,CXCL3,CXCL5,CXCL10,CXCR1,CXCR2,ICAM1,IL6,IL8,MMP1,MMP2,MMP3,MMP8,MMP9,MMP13,MMP14,MMP25,NCF4,NFKBIZ,S100A8,S100A9,SAA2,SAA1,SAA3,SAA4,TIMP1,TIMP2,TIMP3,和TIMP4组成的组的基因的表达。在一些实施方案中,该自癌症获得的活检样品显示与参照或参照样品相比升高的至少1,至少2,至少3,至少4,至少5,至少6,至少7,至少8,至少9,至少10,至少11,至少12,至少13,至少14,至少15,至少16,至少17,至少18,至少19,至少20,至少21,至少22,至少23,至少24,至少25,至少26,至少27,至少28,至少29,至少30,至少31,至少32,至少33,至少34,至少35,至少36,至少37,至少38,至少39,至少40,至少41,至少42,至少43,或至少44种选自CD4,CD8a,IL17A,IL17B,IL17C,IL17D,IL17F,IL17RA,IL17RC,C3,CCL2,CCL20,CSF2,CSF3,CXCL1,CXCL2,CXCL3,CXCL5,CXCL10,CXCR1,CXCR2,ICAM1,IL6,IL8,MMP1,MMP2,MMP3,MMP8,MMP9,MMP13,MMP14,MMP25,NCF4,NFKBIZ,S100A8,S100A9,SAA2,SAA1,SAA3,SAA4,TIMP1,TIMP2,TIMP3,和TIMP4基因的表达。在一些实施方案中,自该个体的癌症获得的活检样品显示一种或多种选自由NFKBIZ,S100A8,和S100A9组成的组的基因的表达。在一些实施方案中,该自癌症获得的活检样品显示与参照或参照样品相比升高的一种或多种选自由NFKBIZ,S100A8,和S100A9组成的组的基因的表达。
在一些实施方案中,该治疗在该治疗停止后在该个体中导致持久响应。
在一些实施方案中,连续或间歇施用该IL-17结合拮抗剂和/或该PD-1轴结合拮抗剂。在一些实施方案中,在该PD-1轴结合拮抗剂之前施用该IL-17结合拮抗剂。在一些实施方案中,与该PD-1轴结合拮抗剂同时施用该IL-17结合拮抗剂。在一些实施方案中,在同一组合物中配制该IL-17结合拮抗剂和该PD-1轴结合拮抗剂。在一些实施方案中,在该PD-1轴结合拮抗剂之后施用该IL-17结合拮抗剂。在一些实施方案中,静脉内,肌肉内,皮下,表面,口服,经皮,腹膜内,眶内,通过植入,通过吸入,鞘内,室内,或鼻内施用该PD-1轴结合拮抗剂或该IL-17结合拮抗剂。
在另一个方面,本公开文本提供一种试剂盒,其包含PD-1轴结合拮抗剂和包装插页,该包装插页包含关于与IL-17结合拮抗剂组合使用该PD-1轴结合拮抗剂以在个体中治疗癌症或延迟癌症进展的用法说明书。在另一个方面,本公开文本提供一种试剂盒,其包含PD-1轴结合拮抗剂和IL-17结合拮抗剂及包装插页,该包装插页包含关于使用该PD-1轴结合拮抗剂和该IL-17结合拮抗剂以在个体中治疗癌症或延迟癌症进展的用法说明书。在一些实施方案中,在同一组合物中配制该PD-1轴结合拮抗剂和该IL-17结合拮抗剂。在另一个方面,本公开文本提供一种试剂盒,其包含IL-17结合拮抗剂和包装插页,该包装插页包含关于与PD-1轴结合拮抗剂组合使用该IL-17结合拮抗剂以在个体中治疗癌症或延迟癌症进展的用法说明书。在另一个方面,本公开文本提供一种试剂盒,其包含PD-1轴结合拮抗剂和包装插页,该包装插页包含关于与IL-17结合拮抗剂组合使用该PD-1轴结合拮抗剂以在具有癌症的个体中增强免疫功能的用法说明书。在另一个方面,本公开文本提供一种试剂盒,其包含PD-1轴结合拮抗剂和IL-17结合拮抗剂及包装插页,该包装插页包含关于使用该PD-1轴结合拮抗剂和该IL-17结合拮抗剂以在具有癌症的个体中增强免疫功能的用法说明书。在一些实施方案中,在同一组合物中配制该PD-1轴结合拮抗剂和该IL-17结合拮抗剂。在另一个方面,本公开文本提供一种试剂盒,其包含IL-17结合拮抗剂和包装插页,该包装插页包含关于与PD-1轴结合拮抗剂组合使用该IL-17结合拮抗剂以在具有癌症的个体中增强免疫功能的用法说明书。
在另一个方面,本公开文本提供一种用于在个体中治疗癌症或延迟癌症进展的方法,其包括对该个体施用有效量的多特异性(例如双特异性)抗体,其中该多特异性抗体包含:(a)针对PD-1,PDL1,和/或PDL2的第一结合特异性;和(b)针对IL-17和/或IL-17R的第二结合特异性。
要理解,可以组合上文和本文描述的各个实施方案的一个,一些,或所有特性以形成本发明的其它实施方案。本发明的这些和其它方面对本领域技术人员会变得显而易见。通过下面的详述进一步描述本发明的这些和其它实施方案。
附图简述
图1A-1D显示代表多种类型的癌症的样品中IL-17A和IL-17F的相对流行度。每幅图描绘一组样品中每种IL-17表达状态的相对流行度(作为100%或1.0的分数)(以及所使用的样品的数目,N)。IL-17表达状态为:IL-17A/IL-17F双重阴性(“A-F-“),IL-17F阳性且IL-17A阴性(“仅F+”),IL-17A阳性且IL-17F阴性(“仅A+”),和IL-17A/IL-17F双重阳性(“A+F+”)。显示的是结直肠癌(“CRC”,图1A),激素受体阳性乳腺癌(“HR+BC”,图1B),非鳞状非小细胞肺癌(“非鳞状NSCLC”,图1C),和鳞状非小细胞肺癌(“鳞状NSCLC”,图1D)中每种IL-17表达状态的流行度。
图2A-2D显示代表多种类型的癌症的样品中IL-17A和IL-17F的相对流行度。每幅图描绘一组样品中每种IL-17表达状态的相对流行度(作为100%或1.0的分数)(以及所使用的样品的数目,N)。IL-17表达状态为:IL-17A/IL-17F双重阴性(“A-F-“),IL-17F阳性且IL-17A阴性(“仅F+”),IL-17A阳性且IL-17F阴性(“仅A+”),和IL-17A/IL-17F双重阳性(“A+F+”)。显示的是三重阴性乳腺癌(“TNBC”,图2A),HER2阳性乳腺癌(“HER2+BC”,图2B),肾细胞癌(“RCC”,图2C),和黑素瘤(图2D)中每种IL-17状况的流行度。
图3A和3B显示代表多种类型的癌症的样品中IL-17A和IL-17F的相对流行度。每幅图描绘一组样品中每种IL-17表达状态的相对流行度(作为100%或1.0的分数)(以及所使用的样品的数目,N)。IL-17状况为:IL-17A/IL-17F双重阴性(“A-F-“),IL-17F阳性且IL-17A阴性(“仅F+”),IL-17A阳性且IL-17F阴性(“仅A+”),和IL-17A/IL-17F双重阳性(“A+F+”)。显示的是卵巢癌(图3A)和膀胱癌(图3B)中每种IL-17状况的流行度。
图4显示黑素瘤患者中IL-17表达和针对抗PDL1治疗的响应之间的关联。对于每种IL-17状况,描绘了显示存在IL-17(测定为具有少于30个循环的原始Ct)的样品的百分比和样品的数目(N)。IL-17状况为:ITT,意图治疗(所有功效患者);BP,生物标志物可得的患者;A+,存在IL-17A(IL-17F存在不可知);F+,存在IL-17F(IL-17A存在不可知);A+F+,存在IL-17A和IL-17F;和A-F-,IL-17A和IL-17F均不存在。
图5A-5D显示黑素瘤患者中针对抗PDL1治疗的响应和IL-17A表达(图5A),IL-17F表达(图5B),IL-8表达(图5C),和所有三种基因的平均表达(标准化至平均值为0且标准偏差为1)(图5D)之间的关联。
图6A-6D显示具有IHCIC得分2+的黑素瘤患者中针对抗PDL1治疗的响应和IL-17A表达(图6A),IL-17F表达(图6B),IL-8表达(图6C),和所有三种基因的平均表达(标准化至平均值为0且标准偏差为1)(图6D)之间的关联。
图7显示黑素瘤患者中IL-17基因表达和针对抗PDL1治疗的响应的ROC(接收器工作特征)分析,通过将灵敏度对1-特异性绘图进行。描绘了曲线下面积(AUC)值。蓝色实线描绘具有完全或部分响应的患者与具有稳定或进展疾病的患者的比较。黑色虚线描绘具有完全响应,部分响应,或稳定疾病的患者与具有进展疾病的患者的比较。对角的黑色实线显示无区别线。
图8显示肾细胞癌患者中IL-17表达和针对抗PDL1治疗的响应之间的关联。对于每种IL-17状况,描绘了显示存在IL-17(测定为具有少于30个循环的原始Ct)的样品的百分比和样品的数目(N)。IL-17状况如上文关于图4描述的。
图9A-9D显示肾细胞癌患者中针对抗PDL1治疗的响应和IL-17A表达(图9A),IL-17F表达(图9B),IL-8表达(图9C),和所有三种基因的平均表达(标准化至平均值为0且标准偏差为1)(图9D)之间的关联。
图10A-10D显示具有IHCIC得分2+的肾细胞癌患者中针对抗PDL1治疗的响应和IL-17A表达(图10A),IL-17F表达(图10B),IL-8表达(图10C),和所有三种基因的平均表达(标准化至平均值为0且标准偏差为1)(图10D)之间的关联。
图11显示肾细胞癌患者中IL-17基因表达和针对抗PDL1治疗的响应的ROC分析,通过将灵敏度对1-特异性绘图进行。描绘了曲线下面积(AUC)值。蓝色实线描绘具有完全或部分响应的患者与具有稳定或进展疾病的患者的比较。黑色虚线描绘具有完全响应,部分响应,或稳定疾病的患者与具有进展疾病的患者的比较。对角的黑色实线显示无区别线。
图12显示膀胱癌患者中IL-17表达和针对抗PDL1治疗的响应之间的关联。对于每种IL-17状况,描绘了显示存在IL-17(测定为具有少于30个循环的原始Ct)的样品的百分比和样品的数目(N)。IL-17状况如上文关于图4描述的。
图13A-13D显示膀胱癌症患者中针对抗PDL1治疗的响应和IL-17A表达(图13A),IL-17F表达(图13B),IL-8表达(图13C),和所有三种基因的平均表达(标准化至平均值为0且标准偏差为1)(图13D)之间的关联。
图14A-14D显示具有IHCIC得分2+的膀胱癌症患者中针对抗PDL1治疗的响应和IL-17A表达(图14A),IL-17F表达(图14B),IL-8表达(图14C),和所有三种基因的平均表达(标准化至平均值为0且标准偏差为1)(图14D)之间的关联。
图15显示膀胱癌患者中IL-17基因表达和针对抗PDL1治疗的响应的ROC分析,通过将灵敏度对1-特异性绘图进行。描绘了曲线下面积(AUC)值。蓝色实线描绘具有完全或部分响应的患者与具有稳定或进展疾病的患者的比较。黑色虚线描绘具有完全响应,部分响应,或稳定疾病的患者与具有进展疾病的患者的比较。对角的黑色实线显示无区别线。
图16显示非小细胞肺癌患者中IL-17表达和针对抗PDL1治疗的响应之间的关联。对于每种IL-17状况,描绘了显示存在IL-17(测定为具有少于30个循环的原始Ct)的样品的百分比和样品的数目(N)。IL-17状况如上文关于图4描述的。
图17A-17D显示非小细胞肺癌患者中针对抗PDL1治疗的响应和IL-17A表达(图17A),IL-17F表达(图17B),IL-8表达(图17C),和所有三种基因的平均表达(标准化至平均值为0且标准偏差为1)(图17D)之间的关联。
图18A-18D显示具有IHCIC得分2+的非小细胞肺癌患者中针对抗PDL1治疗的响应和IL-17A表达(图18A),IL-17F表达(图18B),IL-8表达(图18C),和所有三种基因的平均表达(标准化至平均值为0且标准偏差为1)(图18D)之间的关联。
图19显示非小细胞肺癌患者中IL-17基因表达和针对抗PDL1治疗的响应的ROC分析,通过将灵敏度对1-特异性绘图进行。描绘了曲线下面积(AUC)值。蓝色实线描绘具有完全或部分响应的患者与具有稳定或进展疾病的患者的比较。黑色虚线描绘具有完全响应,部分响应,或稳定疾病的患者与具有进展疾病的患者的比较。对角的黑色实线显示无区别线。
图20A-20H显示非小细胞肺癌患者中针对抗PDL1治疗的响应和IL-17A表达(图20A),IL-17F表达(图20B),IL-8表达(图20C),CSF3表达(图20D),CXCL1表达(图20E),CXCL3表达(图20F),CCL20表达(图20G),和基因签名中所有七种基因的平均表达(标准化至平均值为0且标准偏差为1)(图20H)之间的关联。
图21A-21H显示具有IHCIC得分2+的非小细胞肺癌患者中针对抗PDL1治疗的响应和IL-17A表达(图21A),IL-17F表达(图21B),IL-8表达(图21C),CSF3表达(图21D),CXCL1表达(图21E),CXCL3表达(图21F),CCL20表达(图21G),和基因签名中所有七种基因的平均表达(标准化至平均值为0且标准偏差为1)(图21H)之间的关联。
图22显示非小细胞肺癌患者中IL-17基因签名表达和针对抗PDL1治疗的响应的ROC分析,通过将灵敏度对1-特异性绘图进行。描绘了曲线下面积(AUC)值。蓝色实线描绘具有完全或部分响应的患者与具有稳定或进展疾病的患者的比较。黑色虚线描绘具有完全响应,部分响应,或稳定疾病的患者与具有进展疾病的患者的比较。对角的黑色实线显示无区别线。
图23A和23B显示所标注的多种癌症类型中Th17(图23A)和T效应(Teff)(图23B)基因签名的相对表达。Th17签名包括IL17A,IL17F和RORC的表达,而Teff签名包括CD8,IFNγ,粒酶A,粒酶B和穿孔蛋白(peforin)的表达。将循环阈(Ct)值标准化并通过减去在阵列上使用所有96种基因评估的中值基因表达转换成相对表达值(负ΔCt)。
图24A-24C显示所标注的多种癌症类型中IL-17A(图24A),IL-17F(图24B),和IL-17A和IL-17F(图24C)基因签名的相对表达。将循环阈(Ct)值标准化并通过减去在阵列上使用所有96种基因评估的中值基因表达转换成相对表达值(负ΔCt)。
图25显示针对抗PDL1治疗显示响应性(PR,部分响应;CR,完全响应)或非响应性(PD,进展疾病)的具有黑素瘤,膀胱癌,和肾癌的患者中IL-17A的相对表达。指示了每种癌症类型的样品的数目(N)。一式三份运行样品并通过自每种靶基因的均值减去五种参照基因(SP2,GUSB,TMEM55B,VPS33B和SDHA)的均值将循环阈(Ct)值转换成相对表达值(负ΔCt)。
图26A和26B显示如标注的那样具有肾细胞癌的响应患者(R)或不响应患者(nR)中PDL1(图26A)和IL-17F(图26B)的相对表达。这项研究包括8名响应者和5名不响应者。一式三份运行样品并通过自每种靶基因的均值减去五种参照基因(SP2,GUSB,TMEM55B,VPS33B和SDHA)的均值将循环阈(Ct)值转换成相对表达值(负ΔCt)。
图27A显示如标注的那样具有肾细胞癌的响应患者(PR/CR)或不响应患者(PD)中IL-17F的相对表达。这项研究包括2名响应者和5名不响应者。一式三份运行样品并通过自每种靶基因的均值减去五种参照基因(SP2,GUSB,TMEM55B,VPS33B和SDHA)的均值将循环阈(Ct)值转换成相对表达值(负ΔCt)。
图27B显示如标注的那样具有肾细胞癌,非小细胞肺癌,或黑素瘤的早期响应患者或晚期响应患者(大于6个月)中IL-17F的相对表达。这项研究包括14名早期响应者和11名晚期响应者。一式三份运行样品并通过自每种靶基因的均值减去五种参照基因(SP2,GUSB,TMEM55B,VPS33B和SDHA)的均值将循环阈(Ct)值转换成相对表达值(负ΔCt)。
图28A-28D显示非小细胞肺癌组织中的IL-17A蛋白质表达的数个例子。以比例尺指示每幅免疫组织化学图像的比例。
图29A-29C显示结直肠癌组织中的IL-17A蛋白质表达的数个例子。以比例尺指示每幅免疫组织化学图像的比例。
图30显示接受所标注的对照,抗PDL1,抗IL-17,或抗PDL1和抗IL-17处理的小鼠EMT6乳腺癌模型中随时间的肿瘤体积。
图31显示多种小鼠肿瘤中IL-17可诱导基因的累积基因表达。实施了RNA-Seq以测定每份肿瘤样品的基因表达。以读出/千碱基/106定位读出(RPKM)报告基因表达,并使用ExpressionPlot 3.7.0版以棒图将所有基因的RPKM值的和绘图进行数据分析。
图32A-32W和33A-33T显示Lewis肺癌和B16.F10黑素瘤同位肺肿瘤中构成IL-17可诱导基因签名的基因的相对表达。每幅图描绘所示基因相对于持家基因表达的表达。
图34A-34W和35A-35T显示用抗IL-17抗体处理的同基因小鼠中的Lewis肺癌同位肺肿瘤中构成IL-17可诱导基因签名的基因的相对表达。以实线棒指示与无实验(naive)小鼠相比未处理或抗IL-17处理的小鼠之间的统计学上显著的差异;以虚线棒指示未处理和抗IL17处理的小鼠之间的差异。指示了与条相关的p值。
发明详述
I.通用技术
本文中描述或提及的技术和规程是本领域技术人员一般充分了解且通常采用的,其使用常规方法,诸如例如广泛利用的方法进行,该方法记载于Sambrook等,MolecularCloning:A Laboratory Manual 3d edition(2001)Cold Spring Harbor LaboratoryPress,Cold Spring Harbor,N.Y.;Current Protocols in Molecular Biology(F.M.Ausubel等编,(2003));丛刊Methods in Enzymology(Academic Press,Inc.):PCR2:A Practical Approach(M.J.MacPherson,B.D.Hames and G.R.Taylor编(1995)),Harlow和Lane编(1988)Antibodies,A Laboratory Manual,and Animal Cell Culture(R.I.Freshney编(1987));Oligonucleotide Synthesis(M.J.Gait编,1984);Methods inMolecular Biology,Humana Press;Cell Biology:A Laboratory Notebook(J.E.Cellis编,1998)Academic Press;Animal Cell Culture(R.I.Freshney)编,1987);Introductionto Cell and Tissue Culture(J.P.Mather和P.E.Roberts,1998)Plenum Press;Cell andTissue Culture:Laboratory Procedures(A.Doyle,J.B.Griffiths,和D.G.Newell编,1993-8)J.Wiley and Sons;Handbook of Experimental Immunology(D.M.Weir和C.C.Blackwell编);Gene Transfer Vectors for Mammalian Cells(J.M.Miller和M.P.Calos编,1987);PCR:The Polymerase Chain Reaction,(Mullis等编,1994);CurrentProtocols in Immunology(J.E.Coligan等编,1991);Short Protocols in MolecularBiology(Wiley和Sons,1999);Immunobiology(C.A.Janeway和P.Travers,1997);Antibodies(P.Finch,1997);Antibodies:A Practical Approach(D.Catty.编,IRLPress,1988-1989);Monoclonal Antibodies:A Practical Approach(P.Shepherd和C.Dean编,Oxford University Press,2000);Using Antibodies:A Laboratory Manual(E.Harlow和D.Lane(Cold Spring Harbor Laboratory Press,1999);The Antibodies(M.Zanetti和J.D.Capra编,Harwood Academic Publishers,1995);及Cancer:Principlesand Practice of Oncology(V.T.DeVita等编,J.B.Lippincott Company,1993)。
II.定义
在详细描述本发明之前,应当理解本发明不限于特定组合物或生物学系统,它们当然可以有所变化。还应理解本文中所使用的术语仅出于描述特定实施方案的目的,并非意图对其进行限制。
如本文及所附权利要求书中使用的,单数形式“一个”,“一种”,和“该/所述”包括复数提及物,除非上下文明确另有规定。
本文中提及“约”某个数值或参数包括(并描述)涉及所述数值或参数本身的变化。例如,提及“约X”的描述包括“X”的描述。
理解的是,本文所述发明的各个方面和变化包括“由……组成”和/或“基本上由……组成”方面和变化。
术语“拮抗剂”以最广义使用,包括部分或完全阻断,抑制,或中和本文中所公开的天然多肽的生物学活性的任何分子。类似的,术语“激动剂”以最广义使用,包括模拟本文中所公开的天然多肽的生物学活性的任何分子。合适的激动剂或拮抗剂分子明确包括激动性或拮抗性抗体或抗体片段,天然多肽的片段或氨基酸序列变体,肽,反义寡核苷酸,有机小分子等。用于鉴定多肽的激动剂或拮抗剂的方法可包括使多肽接触候选激动剂或拮抗剂分子并测量通常与所述多肽有关的一种或多种生物学活性的可检测变化。
术语“适体”指能够结合靶分子(诸如多肽)的核酸分子。例如,本发明的适体能特异性结合IL-17或IL-17受体多肽。适体的生成和治疗用途是本领域已完善建立的。参见例如美国专利No.5,475,096,及(Eyetech,New York)用于治疗年龄相关黄斑变性的治疗功效。
如本文中使用的,术语“PD-1轴结合拮抗剂”指一种抑制PD-1轴结合配偶与一种或多种其结合配偶的相互作用,使得消除源自PD-1信号传导轴上的信号传导的T细胞功能障碍(结果是恢复或增强T细胞功能(例如增殖,细胞因子生成,靶细胞杀伤))的分子。如本文中使用的,PD-1轴结合拮抗剂包括PD-1结合拮抗剂,PD-L1结合拮抗剂和PD-L2结合拮抗剂。
如本文中使用的,术语“PD-1结合拮抗剂”指一种降低,阻断,抑制,消除或干扰源自PD-1与一种或多种其结合配偶,诸如PD-L1,PD-L2的相互作用的信号转导的分子。在一些实施方案中,PD-1结合拮抗剂是一种抑制PD-1与其结合配偶结合的分子。在一个具体的方面,PD-1结合拮抗剂抑制PD-1与PD-L1和/或PD-L2的结合。例如,PD-1结合拮抗剂包括降低,阻断,抑制,消除或干扰源自PD-1与PD-L1和/或PD-L2相互作用的信号转导的抗PD-1抗体,其抗原结合片段,免疫粘附素,融合蛋白,寡肽和其它分子。在一个实施方案中,PD-1结合拮抗剂降低负共刺激信号,从而使功能障碍T细胞不太有功能障碍(例如增强对抗原识别的效应器应答),所述负共刺激信号经由PD-1由或经由T淋巴细胞上表达的细胞表面蛋白介导的信号传导介导。在一些实施方案中,PD-1结合拮抗剂是抗PD-1抗体。在一个具体的方面,PD-1结合拮抗剂是本文中描述的nivolumab(也称作MDX-1106-04,MDX-1106,ONO-4538,BMS-936558,和)。在另一个具体的方面,PD-1结合拮抗剂是本文中描述的pembrolizumab(也称作MK-3475,Merck 3475,和SCH-900475)。在另一个具体的方面,PD-1结合拮抗剂是本文中描述的CT-011(也称作hBAT或hBAT-1)。在还有另一个具体的方面,PD-1结合拮抗剂是本文中描述的AMP-224(也称作B7-DCIg)。
如本文中使用的,术语“PD-L1结合拮抗剂”指一种降低,阻断,抑制,消除或干扰源自PD-L1与一种或多种其结合配偶,诸如PD-1,B7-1的相互作用的信号转导的分子。在一些实施方案中,PD-L1结合拮抗剂是抑制PD-L1与其结合配偶结合的分子。在一个具体的方面,PD-L1结合拮抗剂抑制PD-L1与PD-1和/或B7-1的结合。在一些实施方案中,PD-L1结合拮抗剂包括降低,阻断,抑制,消除或干扰源自PD-L1与一种或多种其结合配偶,诸如PD-1,B7-1的相互作用的信号转导的抗PDL1抗体,其抗原结合片段,免疫粘附素,融合蛋白,寡肽和其它分子。在一个实施方案中,PD-L1结合拮抗剂降低负共刺激信号,从而使功能障碍T细胞不太有功能障碍(例如增强对抗原识别的效应器应答),所述负共刺激信号经由PD-L1由或经由T淋巴细胞上表达的细胞表面蛋白介导的信号传导介导。在一些实施方案中,PD-L1结合拮抗剂是抗PDL1抗体。在一个具体的方面,抗PDL1抗体是本文中描述的YW243.55.S70。在另一个具体的方面,抗PDL1抗体是本文中描述的MDX-1105(也称作BMS-936559)。在又一个具体的方面,抗PDL1抗体是本文中描述的MPDL3280A。在仍有另一个具体的方面,抗PDL1抗体是本文中描述的MEDI4736。
如本文中使用的,术语“PD-L2结合拮抗剂”指一种降低,阻断,抑制,消除或干扰源自PD-L2与一种或多种其结合配偶,诸如PD-1的相互作用的信号转导的分子。在一些实施方案中,PD-L2结合拮抗剂是抑制PD-L2与其结合配偶结合的分子。在一个具体的方面,PD-L2结合拮抗剂抑制PD-L2与PD-1的结合。在一些实施方案中,PD-L2拮抗剂包括降低,阻断,抑制,消除或干扰源自PD-L2与一种或多种其结合配偶,诸如PD-1的相互作用的信号转导的抗PDL2抗体,其抗原结合片段,免疫粘附素,融合蛋白,寡肽和其它分子。在一个实施方案中,PD-L2结合拮抗剂降低负共刺激信号,从而使功能障碍T细胞不太有功能障碍(例如增强对抗原识别的效应器应答),所述负共刺激信号经由PD-L2由或经由T淋巴细胞上表达的细胞表面蛋白介导的信号传导介导。在一些实施方案中,PD-L2结合拮抗剂是免疫粘附素。
术语“功能障碍”在免疫功能障碍的背景中指降低的对抗原性刺激的免疫响应性的状态。该术语包括可以发生抗原识别,但是随后的免疫应答对于控制感染或肿瘤生长无效的耗竭和/或无反应性二者的共同要素。
如本文中使用的,术语“功能障碍”还包括对抗原识别的不感受或不响应,特别地,将抗原识别转化成下游T细胞效应器功能,诸如增殖,细胞因子生成(例如IL-2)和/或靶细胞杀伤的能力受损。
术语“无反应性”指源自经由T细胞受体投递的不完全或不充分信号(例如在缺乏ras活化的情况中胞内Ca+2增加)的对抗原刺激的无响应性状态。T细胞无反应性也可以在缺乏共刺激的情况中在用抗原刺激后发生,生成即使在共刺激的背景中对抗原的随后活化变得不感受的细胞。无响应性状态经常可以被白介素-2的存在超越。无反应性T细胞不经历克隆扩充和/或获得效应器功能。
术语“耗竭”指作为源自在许多慢性感染和癌症期间发生的持续TCR信号传导的T细胞功能障碍状态的T细胞耗竭。它与无反应性的区别在于它不经由不完全或缺乏的信号传导,而是由于持续信号传导而发生。它以较差的效应器功能,持续的抑制性受体表达和与功能性效应或记忆T细胞的转录状态不同的转录状态限定。耗竭阻止感染和肿瘤的最佳控制。耗竭可以源自外在负调节途径(例如免疫调节细胞因子)及细胞固有负调节(共刺激)途径二者。
“增强T细胞功能”意指诱导,引起或刺激T细胞具有持续或放大的生物学功能,或者恢复或再活化耗竭的或无活性的T细胞。增强T细胞功能的例子包括:相对于干预前的此类水平,升高的来自CD8+T细胞的γ-干扰素分泌,升高的增殖,升高的抗原响应性(例如病毒,病原体,或肿瘤清除)。在一个实施方案中,增强的水平是至少50%,或者60%,70%,80%,90%,100%,120%,150%,200%。测量此增强的方式是本领域普通技术人员已知的。
“T细胞功能障碍性病症”是以降低的对抗原性刺激(例如针对表达免疫原的肿瘤)的响应性为特征的T细胞病症或状况。在一些实施方案中,T细胞功能障碍性病症是如下的病症,其中T细胞是无反应性的或者具有降低的分泌细胞因子,增殖,或者执行细胞裂解活性的能力。在一个具体的方面,降低的响应性导致对表达免疫原的肿瘤的无效控制。以T细胞功能障碍为特征的T细胞功能障碍性病症的例子包括肿瘤免疫和癌症。
“肿瘤免疫”指肿瘤逃避免疫识别和清除的过程。如此,作为治疗概念,肿瘤免疫在此类逃避减弱时得到“治疗”,并且肿瘤被免疫系统识别并攻击。肿瘤识别的例子包括肿瘤结合,肿瘤收缩和肿瘤清除。
“免疫原性”指特定物质引发免疫应答的能力。肿瘤是免疫原性的,并且增强肿瘤免疫原性有助于通过免疫应答清除肿瘤细胞。增强肿瘤免疫原性的例子包括但不限于用抗PD-1轴拮抗剂和IL-17结合拮抗剂处理。
“持续应答”指在停止处理后对降低肿瘤生长的持续影响。例如,与施用阶段开始时的大小相比,肿瘤大小可以保持为相同或更小。在一些实施方案中,持续应答具有与处理持续时间至少相同的持续时间,处理持续时间的至少1.5倍,2.0倍,2.5倍,或3.0倍长度。
如本文中使用的,“癌症”和“癌性”指或描述哺乳动物中特征通常为细胞生长不受调控的生理疾患。此定义中包括良性和恶性癌症以及休眠肿瘤或微转移。癌症的例子包括但不限于癌,淋巴瘤,母细胞瘤,肉瘤,和白血病。此类癌症的更具体例子包括但不限于鳞状细胞癌,肺癌(包括小细胞肺癌,非小细胞肺癌,肺的腺癌,和肺的鳞癌),黑素瘤,肾细胞癌,腹膜癌,肝细胞癌,胃的癌或胃癌(包括胃肠癌),胰腺癌,成胶质细胞瘤,宫颈癌,卵巢癌,肝癌,膀胱癌,肝瘤,乳腺癌,结肠癌,结肠直肠癌,子宫内膜癌或子宫癌,唾液腺癌,肾癌或肾的癌,肝癌,前列腺癌,外阴癌,甲状腺癌,肝的癌及各种类型的头和颈癌,以及B细胞淋巴瘤(包括低级/滤泡性非何杰金氏淋巴瘤(NHL),小淋巴细胞性(SL)NHL,中级/滤泡性NHL,中级弥漫性NHL,高级成免疫细胞性NHL,高级成淋巴细胞性NHL,高级小无核裂细胞性NHL,贮积病(bulky disease)NHL,套细胞淋巴瘤,AIDS相关淋巴瘤,和瓦尔登斯特伦氏(Waldenstrom)巨球蛋白血症),慢性淋巴细胞性白血病(CLL),急性成淋巴细胞性白血病(ALL),毛细胞性白血病,慢性成髓细胞性白血病,和移植后淋巴增殖性病症(PTLD),以及与瘢痣病(phakomatoses),水肿(诸如与脑瘤有关的)和梅格斯氏(Meigs)综合征有关的异常血管增殖。癌症的例子可以包括任何上述类型癌症的原发性肿瘤或第二部位处自任何上述类型癌症衍生的转移性肿瘤。
如本文中使用的,“转移”指癌自其原发部位传播至身体中的其它位置。癌细胞能脱离原发性肿瘤,渗透入淋巴和血管,经由血流而循环,和在身体中其它地方的正常组织中的远端病灶(转移)中生长。转移可以是当地的或远端的。转移是一个连续过程,视肿瘤细胞自原发性肿瘤脱落、经由血流而传播、并在远端部位停止而定。在新的部位,该细胞建立血供且能生长至形成危及生命的团块。肿瘤细胞内的刺激性和抑制性分子途径均调节这种行为,而且肿瘤细胞与远端部位中的宿主细胞之间的相互作用也是重要的。
术语“抗体”包括单克隆抗体(包括具有免疫球蛋白Fc区的全长抗体),具有多表位特异性的抗体组合物,多特异性抗体(例如双特异性抗体),双抗体,和单链分子,及抗体片段(例如Fab,F(ab’)2,和Fv)。术语“免疫球蛋白”(Ig)在本文中与“抗体”可互换使用。
基本的4链抗体单元是由两条相同的轻链(L)和两条相同的重链(H)构成的异四聚体糖蛋白。IgM抗体由5个基本的异四聚体单元及称作J链的另外多肽组成,而且包含10个抗原结合位点,而IgA抗体包含与J链组合的2-5个能聚合而形成多价装配物的基本4链单元。在IgG的情况中,4链单元通常是约150,000道尔顿。每条轻链通过一个共价二硫键与重链相连,而两条重链通过一个或多个二硫键彼此相连,二硫键的数目取决于重链的同种型。每条重链和轻链还具有间隔规律的链内二硫桥。每条重链在N-末端具有一个可变域(VH),接着是三个(对于α和γ链)或四个(对于μ和ε同种型)恒定域(CH)。每条轻链在N-末端具有一个可变域(VL),接着是其另一端的一个恒定域(CL)。VL与VH排列在一起,而CL与重链第一恒定域(CH1)排列在一起。认为特定的氨基酸残基在轻链和重链可变域之间形成界面。一个VH和一个VL一起配对而形成一个抗原结合位点。关于不同类别抗体的结构和性质,参见例如Basicand Clinical Immunology,第8版,Daniel P.Sties,Abba I.Terr and TristramG.Parsolw(编),Appleton&Lange,Norwalk,CT,1994,第71页和第6章。根据其恒定域氨基酸序列,来自任何脊椎动物物种的L链可归入两种截然不同类型中的一种,称作卡帕(κ)和拉姆达(λ)。根据其重链恒定域(CH)氨基酸序列,免疫球蛋白可归入不同的类别或同种型。有五类免疫球蛋白:IgA,IgD,IgE,IgG和IgM,分别具有称作α,δ,ε,γ和μ的重链。根据CH序列和功能的较小差异,γ和α类可进一步分为亚类,例如人类表达下列亚类:IgG1,IgG2A,IgG2B,IgG3,IgG4,IgA1和IgA2。
抗体的“可变区”或“可变域”指抗体重链或轻链的氨基末端结构域。重链可变域和轻链可变域分别可以称为“VH”和“VL”。这些结构域一般是抗体的最易变部分(相对于同一类的其它抗体而言)且包含抗原结合位点。
术语“可变的”指可变域中的某些区段在抗体间序列差异广泛的实情。V结构域介导抗原结合且限定特定抗体对其特定抗原的特异性。然而,变异性并非均匀分布于可变域的整个跨度。而是,它集中于轻链和重链可变域二者中称作高变区(HVR)的三个区段。可变域中更加高度保守的部分称作框架区(FR)。天然重链和轻链的可变域各自包含四个FR区,它们大多采取β-折叠片构象,通过形成环状连接且在有些情况中形成β-折叠片结构一部分的三个HVR连接。每条链中的HVR通过FR区非常接近的保持在一起,并与另一条链的HVR一起促成抗体的抗原结合位点的形成(参见Kabat等,Sequences of Immunological Interest,第5版,National Institute of Health,Bethesda,MD.(1991))。恒定域不直接参与抗体与抗原的结合,但展现出多种效应器功能,诸如抗体在抗体依赖性细胞的细胞毒性中的参与。
术语“单克隆抗体”在用于本文时指从一群基本上同质的抗体获得的抗体,即构成群体的各个抗体相同,除了可能以极小量存在的可能的天然存在突变和/或翻译后修饰(例如异构化,酰胺化)外。单克隆抗体是高度特异性的,针对单一抗原性位点。与典型的包含针对不同决定簇(表位)的不同抗体的多克隆抗体制备物不同,每种单克隆抗体针对抗原上的单一决定簇。在它们的特异性以外,单克隆抗体的优势在于它们是由杂交瘤培养物合成的,未受到其它免疫球蛋白的污染。修饰语“单克隆”指示抗体从基本上同质的抗体群获得的特征,不应解释为要求通过任何特定方法来生成抗体。例如,有待依照本发明使用的单克隆抗体可通过多种技术来生成,包括例如杂交瘤法(例如Kohler and Milstein.,Nature,256:495-97(1975);Hongo等,Hybridoma,14(3):253-260(1995),Harlow等,Antibodies:ALaboratory Manual,(Cold Spring Harbor Laboratory Press,2nd ed.1988);Hammerling等,in:Monoclonal Antibodies and T-Cell Hybridomas 563-681(Elsevier,N.Y.,1981)),重组DNA法(参见例如美国专利No.4,816,567),噬菌体展示技术(参见例如Clackson等,Nature 352:624-628(1991);Marks等,J.Mol.Biol.222:581-597(1992);Sidhu等,J.Mol.Biol.338(2):299-310(2004);Lee等,J.Mol.Biol.340(5):1073-1093(2004);Fellouse,Proc.Nat.Acad.Sci.USA 101(34):12467-12472(2004);Lee等,J.Immunol.Methods 284(1-2):119-132(2004)),及用于在具有部分或整个人免疫球蛋白基因座或编码人免疫球蛋白序列的基因的动物中生成人或人样抗体的技术(参见例如WO1998/24893;WO 1996/34096;WO 1996/33735;WO 1991/10741;Jakobovits等,Proc.Natl.Acad.Sci.USA 90:2551(1993);Jakobovits等,Nature 362:255-258(1993);Bruggemann等,Year in Immunol.7:33(1993);美国专利No.5,545,807;5,545,806;5,569,825;5,625,126;5,633,425;和5,661,016;Marks等,Bio/Technology 10:779-783(1992);Lonberg等,Nature 368:856-859(1994);Morrison,Nature 368:812-813(1994);Fishwild等,Nature Biotechnol.14:845-851(1996);Neuberger,Nature Biotechnol.14:826(1996);Lonberg and Huszar,Intern.Rev.Immunol.13:65-93(1995))。
术语“裸抗体(裸露的抗体)”指未缀合细胞毒性模块或放射性标记物的抗体。
术语“全长抗体”,“完整抗体”和“全抗体”可互换使用,指基本上完整形式的抗体,与抗体片段不同。具体而言,完整抗体包括那些具有重链和轻链(包括Fc区)的。恒定域可以是天然序列恒定域(例如人天然序列恒定域)或其氨基酸序列变体。在有些情况中,完整抗体可具有一项或多项效应器功能。
“抗体片段”包含完整抗体的一部分,优选完整抗体的抗原结合和/或可变区。抗体片段的例子包括Fab,Fab’,F(ab’)2和Fv片段;双抗体;线性抗体(参见美国专利5,641,870,实施例2;Zapata等,Protein Eng.8(10):1057-1062(1995));单链抗体分子;及由抗体片段形成的多特异性抗体。用木瓜蛋白酶消化抗体产生两个相同的抗原结合片段,称作“Fab”片段,和一个残余“Fc”片段,其名称反映了它易于结晶的能力。Fab片段由完整L链及H链可变区域(VH)和重链第一恒定域(CH1)组成。每个Fab片段对于抗原结合是单价的,即它具有一个抗原结合位点。胃蛋白酶处理抗体产生一个较大F(ab’)2片段,它大体相当于两个通过二硫键相连的Fab片段,具有不同抗原结合活性且仍能够交联抗原。Fab’片段因在CH1结构域的羧基末端增加了少数残基而与Fab片段有所不同,包括来自抗体铰链区的一个或多个半胱氨酸。Fab’-SH是本文中对其中恒定域半胱氨酸残基携带游离硫醇基的Fab’的称谓。F(ab’)2抗体片段最初是作为成对Fab’片段生成的,在Fab’片段之间具有铰链半胱氨酸。还知道抗体片段的其它化学偶联。
Fc片段包含通过二硫键保持在一起的两条H链的羧基末端部分。抗体的效应器功能由Fc区中的序列来决定,该区域也受到在某些类型的细胞上找到的Fc受体(FcR)识别。
“Fv”是包含完整抗原识别和结合位点的最小抗体片段。此片段由紧密,非共价结合的一个重链可变区和一个轻链可变区的二聚体组成。从这两个结构域的折叠中生发出六个高变环(重链和轻链各3个环),贡献出抗原结合的氨基酸残基并赋予抗体以抗原结合特异性。然而,即使是单个可变域(或只包含对抗原特异的三个HVR的半个Fv)也具有识别和结合抗原的能力,尽管亲和力低于完整结合位点。
“单链Fv”,也缩写成“sFv”或“scFv”,是包含连接成一条多肽链的VH和VL抗体结构域的抗体片段。优选的是,sFv多肽在VH与VL结构域之间进一步包含多肽接头,其使得sFv能够形成结合抗原的期望结构。关于sFv的综述参见Pluckthun,于《The Pharmacology ofMonoclonal Antibodies》,第113卷,Rosenburg和Moore编,Springer-Verlag,New York,第269-315页,1994。
本发明抗体的“功能性片段”包含完整抗体的一部分,一般包括完整抗体的抗原结合或可变区或抗体的保留或具有改良FcR结合能力的Fc区。抗体片段的例子包括线性抗体,单链抗体分子和自抗体片段形成的多特异性抗体。
术语“双抗体”指通过在VH和VL结构域之间使用短接头(约5-10个残基)构建sFv片段(见上一段)而制备的小型抗体片段,由于接头短,使得V结构域实行链间而非链内配对,由此导致二价片段,即具有两个抗原结合位点的片段。双特异性双抗体是两个“交叉”sFv片段的异二聚体,其中两种抗体的VH和VL结构域存在于不同多肽链上。双抗体更详细的描述于例如EP 404,097;WO 93/11161;Hollinger等,Proc.Natl.Acad.Sci.USA,90:6444-6448(1993)。
单克隆抗体在本文中明确包括“嵌合”抗体(免疫球蛋白),其中重链和/或轻链的一部分与衍生自特定物种或属于特定抗体类别或亚类的抗体中的相应序列相同或同源,而链的剩余部分与衍生自另一物种或属于另一抗体类别或亚类的抗体中的相应序列相同或同源,以及此类抗体的片段,只要它们展现出期望的生物学活性(美国专利No.4,816,567;Morrison等,Proc.Natl.Acad.Sci.USA 81:6851-6855(1984))。本文中感兴趣的嵌合抗体包括“灵长类化”抗体,其中抗体的抗原结合区衍生自通过用例如感兴趣抗原免疫短尾猴(macaque monkey)而生成的抗体。如本文中所使用的,“人源化抗体”是“嵌合抗体”的一个子集。
非人(例如鼠)抗体的“人源化”形式指最低限度包含衍生自非人免疫球蛋白的序列的嵌合抗体。在一个实施方案中,人源化抗体指人免疫球蛋白(受体抗体)中的HVR残基(下文限定)用具有期望特异性,亲和力和/或能力的非人物种(供体抗体)(诸如小鼠,大鼠,家兔或非人灵长类动物)的HVR残基替换的人免疫球蛋白。在有些情况中,将人免疫球蛋白的框架(“FR”)残基用相应的非人残基替换。此外,人源化抗体可包含在受体抗体中或在供体抗体中没有找到的残基。进行这些修饰可以是为了进一步改进抗体的性能,诸如结合亲和力。一般而言,人源化抗体将包含至少一个,通常两个基本上整个如下的可变域,其中所有或基本上所有高变环对应于非人免疫球蛋白序列的高变环,且所有或基本上所有FR区是人免疫球蛋白序列的FR区,尽管FR区可包含一处或多处改进抗体性能(诸如结合亲和力,异构化,免疫原性等)的个别FR残基替代。FR中这些氨基酸替代的数目,H链中通常不超过6处,L链中通常不超过3处。人源化抗体任选还将包含至少部分免疫球蛋白恒定区(Fc),通常是人免疫球蛋白的恒定区。更多细节参见例如Jones等,Nature 321:522-525(1986);Riechmann等,Nature 332:323-329(1988);及Presta,Curr.Op.Struct.Biol.2:593-596(1992)。还可参见例如Vaswani and Hamilton,Ann.Allergy,Asthma&Immunol.1:105-115(1998);Harris,Biochem.Soc.Transactions 23:1035-1038(1995);Hurle and Gross,Curr.Op.Biotech.5:428-433(1994);及美国专利No.6,982,321和7,087,409。
“人抗体”指拥有与由人生成的抗体的氨基酸序列对应的氨基酸序列和/或使用本文所公开的用于生成人抗体的任何技术生成的抗体。人抗体的这种定义明确排除包含非人抗原结合残基的人源化抗体。人抗体可使用本领域已知的多种技术来生成,包括噬菌体展示文库(Hoogenboom and Winter,J.Mol.Biol.227:381(1991);Marks等,J.Mol.Biol.222:581(1991))。还可用于制备人单克隆抗体的是以下文献中记载的方法:Cole等,MonoclonalAntibodies and Cancer Therapy,Alan R.Liss,p.77(1985);Boerner等,J.Immunol.147(1):86-95(1991)。还可参见van Dijk and van de Winkel,Curr.Opin.Pharmacol.,5:368-74(2001)。可通过给已经修饰以应答抗原性刺激而生成人抗体但其内源基因座已经失去能力的转基因动物例如经过免疫的异种小鼠(xenomice)施用抗原来制备人抗体(参见例如美国专利No.6,075,181和6,150,584,关于XENOMOUSETM技术)。还可参见例如Li等,Proc.Natl.Ascad.Sci.USA,103:3557-3562(2006),关于经人B-细胞杂交瘤技术生成的人抗体。
术语“高变区”,“HVR”或“HV”在用于本文时指抗体可变域中序列上高度可变和/或形成结构上定义的环的区域。通常,抗体包含六个HVR:三个在VH中(H1,H2,H3),三个在VL中(L1,L2,L3)。在天然抗体中,H3和L3展示这六个HVR的最大多样性,而且认为特别是H3在赋予抗体以精密特异性中发挥独特作用。参见例如Xu等,Immunity 13:37-45(2000);Johnsonand Wu,于:Methods in Molecular Biology 248:1-25(Lo编,Human Press,Totowa,NJ,2003)。事实上,仅由重链组成的天然存在camelid抗体在缺乏轻链时是有功能的且稳定的。参见例如Hamers-Casterman等,Nature 363:446-448(1993);Sheriff等,NatureStruct.Biol.3:733-736(1996)。
本文中使用且涵盖许多HVR的叙述。Kabat互补决定区(CDR)是以序列变异性为基础的,而且是最常用的(Kabat等,Sequences of Proteins of Immunological Interest,5th Ed.Public Health Service,National Institutes of Health,Bethesda,MD.(1991))。Chothia改为指结构环的位置(Chothia and Lesk J.Mol.Biol.196:901-917(1987))。AbM HVR代表Kabat HVR与Chothia结构环之间的折衷,而且得到OxfordMolecular的AbM抗体建模软件的使用。“接触”HVR是以对可获得的复合物晶体结构的分析为基础的。下文记录了这些HVR中每一个的残基。
HVR可包括如下“延伸的HVR”:VL中的24-36或24-34(L1),46-56或50-56(L2)和89-97或89-96(L3)及VH中的26-35(H1),50-65或49-65(H2)和93-102,94-102,或95-102(H3)。对于这些定义中的每一个,可变域残基是依照Kabat等,见上文编号的。
表述“依照Kabat的可变域残基编号方式”或“依照Kabat的氨基酸位置编号方式”及其变体指Kabat等,见上文中用于抗体重链可变域或轻链可变域编辑的编号系统。使用此编号系统,实际的线性氨基酸序列可包含较少或另外的氨基酸,对应于可变域FR或HVR的缩短或插入。例如,重链可变域可包含H2残基52后的单一氨基酸插入(依照Kabat为残基52a)及重链FR残基82后的插入残基(例如依照Kabat为残基82a,82b和82c等)。给定抗体的Kabat残基编号方式可通过将抗体序列与“标准”Kabat编号序列对比同源区来确定。
“框架”或“FR”残基指可变域中除本文中所定义的HVR残基外的那些残基。
“人共有框架”或“受体人框架”指代表人免疫球蛋白VL或VH框架序列选集中最常见的氨基酸残基的框架。通常,人免疫球蛋白VL或VH序列选集来自可变域序列亚组。通常,序列亚组是如Kabat等,Sequences of Proteins of Immunological Interest,第5版,Public Health Service,National Institutes of Health,Bethesda,MD(1991)中的亚组。例子包括对于VL,亚组可以是亚组κI,κII,κIII或κIV,如在Kabat等,见上文中的。另外,对于VH,亚组可以是亚组I,亚组II,或亚组III,如在Kabat等,见上文中的。或者,人共有框架可以自上述框架衍生,其中特定残基,诸如人框架残基通过比对供体框架序列与各种人框架序列的集合基于其与供体框架的同源性选择。自人免疫球蛋白框架“衍生”的受体人框架或人共有框架可以包含其相同的氨基酸序列,或者它可以含有先前存在的氨基酸序列变化。在一些实施方案中,先前存在的氨基酸变化的数目是10或更少,9或更少,8或更少,7或更少,6或更少,5或更少,4或更少,3或更少,或2或更少。
“VH亚组III共有框架”包含从Kabat等,见上文的可变重链亚型III中的氨基酸序列获得的共有序列。在一个实施方案中,VH亚型III共有框架氨基酸序列包含下列各序列中每一项的至少一部分或整个全部:EVQLVESGGGLVQPGGSLRLSCAAS(HC-FR1)(SEQ ID NO:4),WVRQAPGKGLEWV(HC-FR2),(SEQ ID NO:5),RFTISADTSKNTAYLQMNSLRAEDTAVYYCAR(HC-FR3,SEQ ID NO:6),WGQGTLVTVSA(HC-FR4),(SEQ ID NO:7)。
“VLκI共有框架”包含从Kabat等,见上文的可变轻链κ亚型I中的氨基酸序列获得的共有序列。在一个实施方案中,VL亚型I共有框架氨基酸序列包含下列各序列中每一项的至少一部分或整个:DIQMTQSPSSLSASVGDRVTITC(LC-FR1)(SEQ ID NO:11),WYQQKPGKAPKLLIY(LC-FR2)(SEQ ID NO:12),GVPSRFSGSGSGTDFTLTISSLQPEDFATYYC(LC-FR3)(SEQ ID NO:13),FGQGTKVEIKR(LC-FR4)(SEQ ID NO:14)。
指定位置(例如Fc区的)处的“氨基酸修饰”指指定残基的替代或删除,或指定残基附近至少一个氨基酸残基的插入。指定残基“附近”的插入意味着其一个至两个残基内的插入。插入可以在指定残基的N端或C端。本文中优选的氨基酸修饰是替代。
“亲和力成熟的”抗体指在抗体的一个或多个HVR中具有一处或多处改变,导致该抗体对抗原的亲和力与没有这些改变的亲本抗体相比有所改进的抗体。在一个实施方案,亲和力成熟的抗体具有纳摩尔或甚至皮摩尔量级的对靶抗原的亲和力。亲和力成熟的抗体可通过本领域已知规程来生成。例如,Marks等,Bio/Technology 10:779-783(1992)记载了通过VH和VL结构域改组进行的亲和力成熟。以下文献记载了HVR和/或框架残基的随机诱变:例如,Barbas等,Proc.Nat.Acad.Sci.USA 91:3809-3813(1994);Schier等,Gene 169:147-155(1995);Yelton等,J.Immunol.155:1994-2004(1995);Jackson等,J.Immunol.154(7):3310-9(1995);Hawkins等,J.Mol.Biol.226:889-896(1992)。
如本文中使用的,术语“特异性结合”或“对…特异性的”指可测量且可再现的相互作用,诸如靶物和抗体之间的结合,其确定在存在分子(包括生物学分子)的异质群体的情况中靶物的存在。例如,特异性结合靶物(其可以是表位)的抗体是以比其结合其它靶物更大的亲和力,亲合力,更容易,和/或以更大的持续时间结合此靶物的抗体。在一个实施方案中,抗体结合无关靶物的程度小于抗体结合靶物的约10%,如例如通过放射性免疫测定法(RIA)测量的。在某些实施方案中,特异性结合靶物的抗体具有≤1μM,≤100nM,≤10nM,≤1nM,或≤0.1nM的解离常数(Kd)。在某些实施方案中,抗体特异性结合蛋白质上在来自不同物种的蛋白质间保守的表位。在另一个实施方案中,特异性结合可以包括但不需要排他结合。
如本文中使用的,术语“免疫粘附素”指组合异源蛋白质(“粘附素”)的结合特异性与免疫球蛋白恒定域的效应器功能的抗体样分子。在结构上,免疫粘附素包含具有与抗体的抗原识别和结合位点不同的期望结合特异性的氨基酸序列(即,是“异源的”)和免疫球蛋白恒定域序列的融合物。免疫粘附素分子的粘附素部分通常是至少包含受体或配体的结合位点的连续氨基酸序列。免疫粘附素中的免疫球蛋白恒定域序列可以获自任何免疫球蛋白,诸如IgG-1,IgG-2(包括IgG2A和IgG2B),IgG-3,或IgG-4亚型,IgA(包括IgA-1和IgA-2),IgE,IgD或IgM。优选地,Ig融合物包含用本文中描述的多肽或抗体的域替换Ig分子内的至少一个可变区的取代。在一个特别优选的实施方案中,免疫球蛋白融合物包括IgG1分子的铰链,CH2和CH3,或铰链,CH1,CH2和CH3区。为了生成免疫球蛋白融合物,还可见1995年6月27日公告的美国专利No.5,428,130。Ig Fc和细胞表面受体ECD的免疫粘附素组合有时称作可溶性受体。
“融合蛋白”和“融合多肽”指具有两个共价连接在一起的部分的多肽,其中每个部分是具有不同特性的多肽。特性可以是生物学特性,诸如体外或体内活性。特性也可以是简单的化学或物理特性,诸如对靶分子的结合,反应的催化,等等。两个部分可以通过单一肽键直接连接,或者经由肽接头连接,但是为彼此以符合读码框的方式。
“PD-1寡肽”,“PDL1寡肽”,或“PDL2寡肽”是分别结合(优选特异性结合)PD-1,PDL1或PDL2负共刺激多肽的寡肽,分别包括受体,配体或信号传导组分,如本文中描述的。此类寡肽可以使用已知的寡肽合成技术化学合成或者可以使用重组技术制备并纯化。此类寡肽的长度通常是至少约5个氨基酸,或者长度为至少约6,7,8,9,10,11,12,13,14,15,16,17,18,19,20,21,22,23,24,25,26,27,28,29,30,31,32,33,34,35,36,37,38,39,40,41,42,43,44,45,46,47,48,49,50,51,52,53,54,55,56,57,58,59,60,61,62,63,64,65,66,67,68,69,70,71,72,73,74,75,76,77,78,79,80,81,82,83,84,85,86,87,88,89,90,91,92,93,94,95,96,97,98,99,或100个氨基酸或更多。可以使用公知的技术鉴定此类寡肽。在这点上,注意到用于对寡肽文库筛选能够特异性结合多肽靶物的寡肽的技术是本领域中公知的(见例如美国专利No.5,556,762,5,750,373,4,708,871,4,833,092,5,223,409,5,403,484,5,571,689,5,663,143;PCT公开文本No.WO 84/03506和WO84/03564;Geysen等,Proc.Natl.Acad.Sci.U.S.A.,81:3998-4002(1984);Geysen等,Proc.Natl.Acad.Sci.U.S.A.,82:178-182(1985);Geysen等,于Synthetic Peptides asAntigens,130-149(1986);Geysen等,J.Immunol.Meth.,102:259-274(1987);Schoofs等,J.Immunol.,140:611-616(1988),Cwirla,S.E.等,Proc.Natl.Acad.Sci.USA,87:6378(1990);Lowman,H.B.等,Biochemistry,30:10832(1991);Clackson,T.等,Nature,352:624(1991);Marks,J.D.等,J.Mol.Biol.,222:581(1991);Kang,A.S.等,Proc.Natl.Acad.Sci.USA,88:8363(1991),及Smith,G.P.,Current Opin.Biotechnol.,2:668(1991)。
“阻断性”抗体或“拮抗剂”抗体是抑制或降低其结合的抗原的生物学活性的抗体。在一些实施方案中,阻断性抗体或拮抗剂抗体实质性或完全抑制抗原的生物学活性。本发明的抗PDL1抗体阻断经由PD-1的信号传导,使得将T细胞的功能性应答(例如增殖,细胞因子生成,靶细胞杀伤)从功能障碍状态恢复至抗原刺激。
“激动剂”或活化性抗体是通过与其结合的抗原增强或启动信号传导的抗体。在一些实施方案中,激动剂抗体在不存在天然配体的情况中引起或激活信号传导。
术语“Fc区”在本文中用于定义免疫球蛋白重链的C端区,包括天然序列Fc区和变异Fc区。虽然免疫球蛋白重链Fc区的边界可以变化,但是人IgG重链Fc区通常定义为自其Cys226或Pro230位置的氨基酸残基至羧基末端的区段。Fc区的C-末端赖氨酸(残基447,依照EU编号系统)可以消除,例如在生产或纯化抗体的过程中,或者通过对编码抗体重链的核酸进行重组工程改造。因而,完整抗体的组合物可包括所有K447残基都被消除的抗体群,无一K447残基被消除的抗体群,或者混合了有和无K447残基的抗体的抗体群。对于在本发明的抗体中使用而言合适的天然序列Fc区包括人IgG1,IgG2(IgG2A,IgG2B),IgG3和IgG4。
“Fc受体”或“FcR”描述结合抗体Fc区的受体。优选的FcR是天然序列人FcR。此外,优选的FcR是结合IgG抗体的FcR(γ受体),包括FcγRI,FcγRII和FcγRIII亚类的受体,包括这些受体的等位变体和可变剪接形式。FcγRII受体包括FcγRIIA(“活化受体”)和FcγRIIB(“抑制受体”),它们具有相似的氨基酸序列,区别主要在其胞质结构域中。活化受体FcγRIIA在其胞质结构域中包含免疫受体基于酪氨酸的活化基序(ITAM)。抑制受体FcγRIIB在其胞质结构域中包含免疫受体基于酪氨酸的抑制基序(ITIM)(参见M.Annu.Rev.Immunol.15:203-234(1997))。FcR的综述参见Ravetch and Kinet,Annu.Rev.Immunol.9:457-492(1991);Capel等,Immunomethods 4:25-34(1994);de Haas等,J.Lab.Clin.Med.126:330-41(1995)。术语“FcR”在本文中涵盖其它FcR,包括那些未来将会鉴定的。
术语“Fc受体”或“FcR”还包括新生儿受体,FcRn,它负责将母体IgG转移给胎儿(Guyer等,J.Immunol.117:587(1976)和Kim等,J.Immunol.24:249(1994))。测量对FcRn的结合的方法是已知的(参见例如Ghetie and Ward,Immunol Today 18(12):592-8(1997);Ghetie等,Nature Biotechnology,15(7):637-40(1997);Hinton等,J.Biol.Chem 279(8):6213-6(2004);及WO2004/92219(Hinton等))。可测定人FcRn高亲和力结合多肽与FcRn的体内结合和血清半衰期,例如在表达人FcRn的转基因小鼠或经转染的人细胞系中,或者在施用了具有变异Fc区的多肽的灵长类动物中。WO2004/42072(Presta)记载了对FcR的结合得到改良或消除的抗体变体。还可参见例如Shields等,J.Biol.Chem.9(2):6591-6604(2001)。
短语“实质性降低”或“实质性不同”在用于本文时表示两个数值(通常一个与某分子有关而另一个与参照/比较分子有关)之间足够高的差异程度,以致本领域技术人员将认为在用所述数值(例如Kd值)所测量的生物学特性背景内两个数值之间的差异具有统计学显著性。作为参照/比较分子该数值的函数,所述两个数值之间的差异例如大于约10%,大于约20%,大于约30%,大于约40%,和/或大于约50%。
短语“基本上相似”或“基本上相同”在用于本文时表示两个数值(例如,一个涉及本发明的抗体而另一个涉及参照/比较抗体)之间足够高的相似程度,以致本领域技术人员将认为在用所述数值(例如Kd值)所测量的生物学特性背景内两个数值之间的差异具有很小的或没有生物学和/或统计学显著性。作为参照/比较值的函数,所述两个数值之间的差异例如小于约50%,小于约40%,小于约30%,小于约20%,和/或小于约10%。
“载体”在用于本文时包括药剂学可接受的载体,赋形剂或稳定剂,它们在所采用的剂量和浓度对暴露于其的细胞或哺乳动物是无毒的。通常,生理学可接受的载体是pH缓冲水溶液。生理学可接受载体的例子包括缓冲剂,诸如磷酸盐,柠檬酸盐和其它有机酸;抗氧化剂,包括抗坏血酸;低分子量(少于约10个残基)多肽;蛋白质,诸如血清清蛋白,明胶或免疫球蛋白;亲水性聚合物,诸如聚乙烯吡咯烷酮;氨基酸,诸如甘氨酸,谷氨酰胺,天冬酰胺,精氨酸或赖氨酸;单糖,二糖和其它碳水化合物,包括葡萄糖,甘露糖或糊精;螯合剂,诸如EDTA;糖醇,诸如甘露醇或山梨醇;成盐反荷离子,诸如钠;和/或非离子表面活性剂,诸如TWEENTM,聚乙二醇(PEG)和PLURONICSTM
“包装插页”指通常包括在药物的商业包装中的说明书,它们包含有关涉及此类药物应用的适应征,用法,剂量,施用,禁忌症,与该包装产品联合的其它药物和/或警告等的信息。
如本文中使用的,“治疗/处理”指设计用于改变临床病理学(例如癌症或肿瘤免疫)过程期间所治疗个体或细胞的自然进程的临床干预。治疗的期望效果包括降低疾病进展速率,改善或减轻疾病状态,和消退或改善的预后。例如,若一种或多种与癌症有关的症状是减轻或消除的,包括但不限于对癌性细胞的降低增殖(或破坏),减少源自疾病的症状,提高那些患有疾病的个体的生命质量,降低治疗疾病需要的其它药物的剂量,延迟疾病的进展,和/或延长个体存活,则个体得到成功“治疗”。
如本文中使用的,“延迟疾病的进展”意指推迟,阻碍,减缓,延迟,稳定,和/或延缓疾病(诸如癌症或肿瘤免疫)的形成。根据疾病史和/或治疗的个体,此延迟可以是不同时间长度的。如对于本领域技术人员明显的是,充分或显著的延迟实质上可以涵盖预防,因为个体不形成疾病。例如,可以延迟晚期阶段癌症,诸如转移的形成。
如本文中使用的,“降低或抑制癌症复发”意指降低或抑制肿瘤或癌症复发或肿瘤或癌症进展。如本文中使用的,癌症复发和/或癌症进展包括但不限于癌症转移。
“有效量”至少是实现特定病症的可测量改善或预防需要的最小浓度。本文中的有效量可以随诸如患者的疾病状态,年龄,性别,和重量,和抗体引发个体中期望的应答的能力等因素而变化。有效量也是治疗有益效果超过治疗的任何毒性或不利效果的量。为了预防性使用,有益或期望的结果包括如下的结果,诸如消除或降低风险,减轻严重性,或者延迟疾病的发作,包括疾病的生物化学,组织学和/或行为症状,其并发症和疾病形成期间呈现的中间病理学表型。为了治疗性使用,有益或期望的结果包括临床结果,诸如减少源自疾病的一种或多种症状,提高那些患有疾病的对象的生命质量,降低治疗疾病需要的其它药物的剂量,增强另一种药物的效果(诸如经由靶向),延迟疾病的进展,和/或延长存活。在癌症或肿瘤的情况中,药物的有效量在减少癌细胞的数目;降低肿瘤大小;抑制(即在一定程度上减缓或者期望地停止)癌细胞浸润入外周器官中;抑制(即在一定程度上减缓且期望地停止)肿瘤转移;在一定程度上抑制肿瘤生长;和/或在一定程度上减轻一种或多种与病症有关的症状中可以具有效果。可以在一次或多次施用中施用有效量。出于本发明的目的,药物,化合物,或药物组合物的有效量是足以直接或间接实现预防或治疗性处理的量。如在临床背景中理解的,药物,化合物,或药物组合物的有效量可以与或不与另一种药物,化合物,或药物组合物一起实现。如此,可以在施用一种或多种治疗剂的背景中考虑“有效量”,并且若与一种或多种其它药剂一起,可以实现或者实现期望的结果,则可以认为单一药剂以有效量给予。
如本文中使用的,“与……联合/一起”指在一种治疗形态外施用另一种治疗形态。因而,“与……联合/一起”指在对个体施用一种治疗形态之前,期间,或者之后施用另一种治疗形态。术语“与……组合”在本文中可以互换使用。
如本文中使用的,术语“个体”和“受试者”可互换使用且指哺乳动物,包括但不限于人或非人哺乳动物,诸如牛、马、犬、绵羊、或猫。优选地,个体或受试者指人。在本文中,患者也是个体或受试者。
如本文中使用的,“完全响应”或“CR”指所有靶损伤(例如人损伤)的消失;“部分响应”或“PR”指将基线SLD视为参照,靶损伤(例如人损伤)的最长直径和(SLD)的至少30%降低;且“稳定疾病”或“SD”指将治疗开始起的最小SLD视为参照,既没有足够的靶损伤(例如人损伤)收缩以符合PR,也没有足够的增加以符合PD。
如本文中使用的,“进行性疾病”或“PD”指将从治疗开始起记录的最小SLD视为参照,靶损伤(例如人损伤)的SLD的至少20%增加或一种或多种新损伤的存在。
如本文中使用的,“无进展存活”(PFS)指治疗期间和治疗后,所治疗疾病(例如癌症)不变坏的时间长度。无进展存活可以包括患者已经经历完全响应或部分响应的时间量,及患者已经经历稳定疾病的时间量。
如本文中使用的,“总体响应率”(ORR)指完全响应(CR)率和部分响应(PR)率的总和。
如本文中使用的,“总体存活”指组中在特定持续时间后有可能存活的个体的百分比。
如本文中使用的,“RECIST响应”指依照一套已发表的用于测定癌症患者中肿瘤状态(即响应,稳定,或进展)的指南测定的响应。关于这些指南的更加详细的讨论,参见Therasse,P.等,J.Natl.Cancer Inst.92:205-16(2000)。
术语“细胞增殖性病症”和“增殖性病症”指与一定程度的异常细胞增殖有关的病症。在一个实施方案中,细胞增殖性病症指癌症。在一个实施方案中,细胞增殖性病症是肿瘤。
如本文中使用的,“肿瘤”指所有赘生性(neoplastic)细胞生长和增殖,无论是恶性的还是良性的,及所有癌前(pre-cancerous)和癌性细胞和组织。术语“癌症”,“癌性”,“细胞增殖性病症”,“增殖性病症”和“肿瘤”在本文中提到时并不互相排斥。
“化疗剂”指可用于治疗癌症的化学化合物。化疗剂的非限制性实例包括烷化剂类(alkylating agents),诸如塞替派(thiotepa)和环磷酰胺(cyclophosphamide)磺酸烷基酯类(alkyl sulfonates),诸如白消安(busulfan),英丙舒凡(improsulfan)和哌泊舒凡(piposulfan);氮丙啶类(aziridines),诸如苯佐替派(benzodopa),卡波醌(carboquone),美妥替派(meturedopa)和乌瑞替派(uredopa);乙撑亚胺类(ethylenimines)和甲基蜜胺类(methylamelamines),包括六甲蜜胺(altretamine),三乙撑蜜胺(triethylenemelamine),三乙撑磷酰胺(trietylenephosphoramide),三乙撑硫代磷酰胺(triethiylenethiophosphoramide)和三羟甲蜜胺(trimethylolomelamine);番荔枝内酯类(acetogenin)(尤其是布拉他辛(bullatacin)和布拉他辛酮(bullatacinone));δ-9-四氢大麻酚(tetrahydrocannabinol)(屈大麻酚(dronabinol),);β-拉帕醌(lapachone);拉帕醇(lapachol);秋水仙素类(colchicines);白桦脂酸(betulinic acid);喜树碱(camptothecin)(包括合成类似物托泊替康(topotecan)(),CPT-11(伊立替康(irinotecan),),乙酰喜树碱,东莨菪亭(scopoletin)和9-氨基喜树碱);苔藓抑素(bryostatin);培美曲塞(pemetrexed);callystatin;CC-1065(包括其阿多来新(adozelesin),卡折来新(carzelesin)和比折来新(bizelesin)合成类似物);鬼臼毒素(podophyllotoxin);鬼臼酸(podophyllinic acid);替尼泊苷(teniposide);隐藻素类(cryptophycins)(特别是隐藻素1和隐藻素8);多拉司他汀(dolastatin);duocarmycin(包括合成类似物,KW-2189和CB1-TM1);艾榴塞洛素(eleutherobin);pancratistatin;TLK-286;CDP323,一种口服α-4整联蛋白抑制剂;sarcodictyin;海绵抑素(spongistatin);氮芥类(nitrogen mustards),诸如苯丁酸氮芥(chlorambucil),萘氮芥(chlornaphazine),胆磷酰胺(cholophosphamide),雌莫司汀(estramustine),异环磷酰胺(ifosfamide),双氯乙基甲胺(mechlorethamine),盐酸氧氮芥(mechlorethamine oxide hydrochloride),美法仑(melphalan),新氮芥(novembichin),苯芥胆甾醇(phenesterine),泼尼莫司汀(prednimustine),曲磷胺(trofosfamide),尿嘧啶氮芥(uracil mustard);亚硝脲类(nitrosoureas),诸如卡莫司汀(carmustine),氯脲菌素(chlorozotocin),福莫司汀(fotemustine),洛莫司汀(lomustine),尼莫司汀(nimustine)和雷莫司汀(ranimnustine);抗生素类,诸如烯二炔类抗生素(enediyne)(如加利车霉素(calicheamicin),尤其是加利车霉素γ1I和加利车霉素ωI1(参见例如Nicolaou等,Angew,Chem.Intl.Ed.Engl.33:183-186(1994));蒽环类抗生素(dynemicin),包括dynemicin A;埃斯波霉素(esperamicin);以及新制癌素(neocarzinostatin)发色团和相关色蛋白烯二炔类抗生素发色团),阿克拉霉素(aclacinomysin),放线菌素(actinomycin),氨茴霉素(authramycin),偶氮丝氨酸(azaserine),博来霉素(bleomycin),放线菌素C(cactinomycin),carabicin,洋红霉素(carminomycin),嗜癌霉素(carzinophilin),色霉素(chromomycinis),放线菌素D(dactinomycin),柔红霉素(daunorubicin),地托比星(detorubicin),6-二氮-5-氧-L-正亮氨酸,多柔比星(doxorubicin)(包括吗啉代多柔比星,氰基吗啉代多柔比星,2-吡咯代多柔比星,多柔比星盐酸脂质体注射液(和脱氧多柔比星),表柔比星(epirubicin),依索比星(esorubicin),伊达比星(idarubicin),麻西罗霉素(marcellomycin),丝裂霉素类(mitomycins)诸如丝裂霉素C,霉酚酸(mycophenolicacid),诺拉霉素(nogalamycin),橄榄霉素(olivomycin),培洛霉素(peplomycin),泊非霉素(potfiromycin),嘌呤霉素(puromycin),三铁阿霉素(quelamycin),罗多比星(rodorubicin),链黑菌素(streptonigrin),链佐星(streptozocin),杀结核菌素(tubercidin),乌苯美司(ubenimex),净司他丁(zinostatin),佐柔比星(zorubicin);抗代谢物类,诸如甲氨蝶呤,吉西他滨(gemcitabine)替加氟(tegafur)卡培他滨(capecitabine)埃坡霉素(epothilone);和5-氟尿嘧啶(5-FU);叶酸类似物,诸如二甲叶酸(denopterin),甲氨蝶呤,蝶酰三谷氨酸(pteropterin),三甲曲沙(trimetrexate);嘌呤类似物,诸如氟达拉滨(fludarabine),6-巯基嘌呤(mercaptopurine),硫咪嘌呤(thiamiprine),硫鸟嘌呤(thioguanine);嘧啶类似物,诸如安西他滨(ancitabine),阿扎胞苷(azacitidine),6-氮尿苷,卡莫氟(carmofur),阿糖胞苷(cytarabine),双脱氧尿苷(dideoxyuridine),去氧氟尿苷(doxifluridine),依诺他滨(enocitabine),氟尿苷(floxuridine),和imatinib(一种2-苯基氨基嘧啶衍生物),以及其它c-Kit抑制剂;抗肾上腺类,诸如氨鲁米特(aminoglutethimide),米托坦(mitotane),曲洛司坦(trilostane);叶酸补充剂,诸如亚叶酸(frolinic acid);醋葡醛内酯(aceglatone);醛磷酰胺糖苷(aldophosphamide glycoside);氨基乙酰丙酸(aminolevulinic acid);恩尿嘧啶(eniluracil);安吖啶(amsacrine);bestrabucil;比生群(bisantrene);依达曲沙(edatraxate);地磷酰胺(defofamine);地美可辛(demecolcine);地吖醌(diaziquone);elfornithine;依利醋铵(elliptinium acetate);依托格鲁(etoglucid);硝酸镓;羟脲(hydroxyurea);香菇多糖(lentinan);氯尼达明(lonidainine);美登木素生物碱类(maytansinoids),诸如美登素(maytansine)和安丝菌素(ansamitocin);米托胍腙(mitoguazone);米托蒽醌(mitoxantrone);莫哌达醇(mopidanmol);二胺硝吖啶(nitraerine);喷司他丁(pentostatin);蛋氨氮芥(phenamet);吡柔比星(pirarubicin);洛索蒽醌(losoxantrone);2-乙基酰肼(ethylhydrazide);丙卡巴肼(procarbazine);多糖复合物(JHS Natural Products,Eugene,OR);雷佐生(razoxane);根霉素(rhizoxin);西索菲兰(sizofiran);螺旋锗(spirogermanium);细交链孢菌酮酸(tenuazonic acid);三亚胺醌(triaziquone);2,2',2”-三氯三乙胺;单端孢菌素类(trichothecenes)(尤其是T-2毒素,疣孢菌素(verracurin)A,杆孢菌素(roridin)A和蛇行菌素(anguidine));乌拉坦(urethan);长春地辛(vindesine)( );达卡巴嗪(dacarbazine);甘露醇氮芥(mannomustine);二溴甘露醇(mitobronitol);二溴卫矛醇(mitolactol);哌泊溴烷(pipobroman);gacytosine;阿糖胞苷(arabinoside)(“Ara-C”);塞替派(thiotepa);类紫杉醇(taxoids),例如帕利他塞(paclitaxel)清蛋白改造的纳米颗粒剂型帕利他塞(ABRAXANETM),和多西他塞(doxetaxel)苯丁酸氮芥(chloranbucil);6-硫鸟嘌呤(thioguanine);巯基嘌呤(mercaptopurine);甲氨蝶呤(methotrexate);铂类似物,诸如顺铂(cisplatin)和卡铂(carboplatin);长春碱(vinblastine)铂;依托泊苷(etoposide)(VP-16);异环磷酰胺(ifosfamide);米托蒽醌(mitoxantrone);长春新碱(vincristine)奥沙利铂(oxaliplatin);亚叶酸(leucovovin);长春瑞滨(vinorelbine)能灭瘤(novantrone);依达曲沙(edatrexate);道诺霉素(daunomycin);氨基蝶呤(aminopterin);伊本膦酸盐(ibandronate);拓扑异构酶抑制剂RFS 2000;二氟甲基鸟氨酸(DMFO);类维A酸(retinoids),诸如维A酸(retinoic acid);任何上述物质的药学可接受盐,酸或衍生物;以及两种或更多种上述物质的组合,诸如CHOP(环磷酰胺,多柔比星,长春新碱和泼尼松龙联合疗法的缩写)和FOLFOX(奥沙利铂(ELOXATINTM)联合5-FU和亚叶酸的治疗方案的缩写)。
“化疗剂”还包括但不限于作用为调节,降低,阻断,或抑制可促进癌生长的激素效果的抗激素剂,且常常是系统或全身治疗的形式。它们自身可以是激素。非限制性实例包括抗雌激素类和选择性雌激素受体调节剂类(SERM),包括例如他莫昔芬(tamoxifen)(包括他莫昔芬),雷洛昔芬(raloxifene)屈洛昔芬(droloxifene),4-羟基他莫昔芬,曲沃昔芬(trioxifene),那洛昔芬(keoxifene),LY117018,奥那司酮(onapristone)和托瑞米芬(toremifene)抗孕酮类;雌激素受体下调剂类(ERD);雌激素受体拮抗剂,诸如氟维司群(fulvestrant)功能为抑制或关闭卵巢的药剂,例如促黄体生成激素释放激素(LHRH)激动剂,诸如醋酸亮丙瑞林(leuprolide acetate)(),醋酸戈舍瑞林(goserelin acetate),醋酸布舍瑞林(buserelin acetate)和曲普瑞林(tripterelin);抗雄激素类,诸如氟他米特(flutamide),尼鲁米特(nilutamide)和比卡米特(bicalutamide);及抑制在肾上腺中调节雌激素生成的芳香酶的芳香酶抑制剂,诸如例如4(5)-咪唑,氨鲁米特(aminoglutethimide),醋酸甲地孕酮(megestrol acetate)(),依西美坦(exemestane)(),福美坦(formestanie),法倔唑(fadrozole),伏罗唑(vorozole)(),来曲唑(letrozole)()和阿那曲唑(anastrozole)()。另外,化疗剂的这种定义包括二膦酸盐类(bisphosphonates),诸如氯膦酸盐(clodronate)(例如),依替膦酸钠(etidronate)(),NE-58095,唑来膦酸/唑来膦酸盐(zoledronicacid/zoledronate)(),阿伦膦酸盐(alendronate)(),帕米膦酸盐(pamidronate)(),替鲁膦酸盐(tiludronate)()或利塞膦酸盐(risedronate)();以及曲沙他滨(troxacitabine)(1,3-二氧戊环核苷胞嘧啶类似物);反义寡核苷酸,特别是抑制涉及异常(abherant)细胞增殖的信号途经中的基因表达的反义寡核苷酸,诸如例如PKC-α,Raf,H-Ras和表皮生长因子受体(EGF-R);疫苗,诸如疫苗和基因疗法疫苗,例如疫苗,疫苗和疫苗;拓扑异构酶1抑制剂(例如);抗雌激素,诸如氟维司群(fulvestrant);Kit抑制剂,诸如伊马替尼(imatinib)或EXEL-0862(一种酪氨酸激酶抑制剂);EGFR抑制剂,诸如erlotinib或西妥昔单抗(cetuximab);抗VEGF抑制剂,诸如贝伐单抗(bevacizumab);arinotecan;rmRH(例如);拉帕替尼(lapatinib)和二甲苯磺酸拉帕替尼(lapatinib ditosylate)(一种ErbB-2和EGFR双重酪氨酸激酶小分子抑制剂,也称作GW572016);17AAG(格尔德霉素(geldanamycin)衍生物,其是热休克蛋白(Hsp)90毒物);及任何上述物质的药学可接受盐,酸或衍生物。
“放射疗法”或“放疗”指使用定向伽马射线或贝塔射线来诱发对细胞的足够损伤,以限制细胞正常发挥功能的能力或全然破坏细胞。应当领会,本领域知道许多方式来确定治疗的剂量和持续时间。典型的治疗作为一次施用来给予,而典型的剂量范围为每天10-200个单位(戈瑞(Gray))。
如本文中使用的,术语“细胞因子”一般指由一种细胞群体释放的,作为细胞间介质对另一细胞起作用或者对生成该蛋白质的细胞具有自分泌影响的蛋白质。此类细胞因子的例子包括淋巴因子,单核因子;白介素(“IL”),诸如IL-1,IL-1α,IL-2,IL-3,IL-4,IL-5,IL-6,IL-7,IL-8,IL-9,IL-10,IL-11,IL-12,IL-13,IL-15,IL-17A-F,IL-18至IL-29(诸如IL-23),IL-31,包括rIL-2;肿瘤坏死因子,诸如TNF-α或TNF-β,TGF-β1-3;和其它多肽因子,包括白血病抑制因子(“LIF”),睫状节神经细胞营养因子(“CNTF”),CNTF样细胞因子(“CLC”),心肌营养蛋白(“CT”),和kit配体(“KL”)。
如本文中使用的,术语“趋化因子”指具有选择性诱导白细胞的趋化性和活化的能力的可溶性因子(例如细胞因子)。它们还触发血管发生,炎症,伤口愈合,和肿瘤发生的过程。趋化因子例子包括IL-8,即鼠角质形成细胞化学引诱物(KC)的人同系物。
如本文中使用的,“IL-17”指IL-17细胞因子家族。除非另有规定,提到IL-17可以指IL-17细胞因子家族的一个或多个成员,包括例如IL-17A,IL-17B,IL-17C,IL-17D,IL-17E,和IL-17F。另外,除非另有规定,IL-17可以指单一IL-17家族细胞因子多肽或IL-17家族细胞因子单体的二聚体(例如IL-17AA,IL-17FF,或IL-17AF)。
如本文中使用的,“IL-17受体(IL-17R)”指IL-17受体家族。除非另有规定,提到IL-17受体可以指IL-17受体家族的一个或多个成员,包括例如IL-17RA,IL-17RB,IL-17RC,IL-17RD,或IL-17RE。另外,除非另有规定,IL-17受体可以指单一IL-17受体多肽或IL-17受体单体的二聚体(例如受体复合物,诸如IL-17RA/IL-17RC或IL-17RA/IL-17RB)。
如本文中使用的,术语“IL-17结合拮抗剂”指一种降低,阻断,抑制,消除或干扰源自IL-17细胞因子与一种或多种IL-17受体的相互作用的信号转导的分子。IL-17结合拮抗剂的类型的例子可以包括结合IL-17家族细胞因子且抑制它与IL-17受体的相互作用的分子(例如特异性结合IL-17家族细胞因子的抗体或含有IL-17受体的至少一个外显子的可溶性多肽)和/或结合IL-17受体且抑制它与IL-17家族细胞因子的相互作用的分子(例如特异性结合IL-17受体的抗体)。在一些实施方案中,IL-17结合拮抗剂调控,阻断,抑制,降低,拮抗,中和或以其它方式干扰IL-17细胞因子(例如IL-17F,IL-17A,和/或IL-17A/IL-17F异二聚体复合物)的生物学活性。在一些实施方案中,IL-17结合拮抗剂调控,阻断,抑制,降低,拮抗,中和或以其它方式干扰IL-17受体(例如IL-17RA/IL-17RC受体复合物和/或IL-17RA/IL-17RB受体复合物)的生物学活性。在一些实施方案中,IL-17结合拮抗剂可以包括小分子。
如本文中使用的,短语“药学可接受盐”指本发明化合物的药学可接受的有机或无机盐。例示性的盐包括但不限于硫酸盐,柠檬酸盐,乙酸盐,草酸盐,氯化物,溴化物,碘化物,硝酸盐,硫酸氢盐,磷酸盐,酸式磷酸盐,异烟酸盐,乳酸盐,水杨酸盐,酸式柠檬酸盐,酒石酸盐,油酸盐,丹宁酸盐,泛酸盐,酒石酸氢盐,抗坏血酸盐,琥珀酸盐,马来酸盐,龙胆酸盐,富马酸盐,葡糖酸盐,葡糖醛酸盐,糖酸盐,甲酸盐,苯甲酸盐,谷氨酸盐,甲基磺酸盐(甲磺酸盐),乙磺酸盐,苯磺酸盐,对甲苯磺酸盐和扑酸盐(即1,1’-亚甲基-双(2-羟基-3-萘甲酸))盐,碱金属(例如钠和钾)盐,碱土金属(例如镁)盐,和铵盐。药学可接受盐可能牵涉包含另一种分子,诸如乙酸盐离子,琥珀酸盐离子或其它抗衡离子。抗衡离子可以是稳定母体化合物电荷的任何有机或无机模块。另外,药学可接受盐可以在其结构中具有超过一种带电荷原子。在多种带电荷原子作为药学可接受盐的组成部分的情况中可以具有多种抗衡离子。因此,药学可接受盐可具有一种或多种带电荷原子和/或一种或多种抗衡离子。
如果本发明的化合物是碱,那么期望的药学可接受的盐可以通过本领域可得的任何合适方法来制备,例如用无机酸(诸如氢氯酸,氢溴酸,硫酸,硝酸,甲磺酸,磷酸等等)或用有机酸(诸如乙酸,马来酸,琥珀酸,扁桃酸,富马酸/延胡索酸,丙二酸,丙酮酸,草酸,乙醇酸,水杨酸,吡喃糖苷酸(pyranosidyl acid)(诸如葡萄糖醛酸或半乳糖醛酸),α羟酸(诸如柠檬酸或酒石酸),氨基酸(诸如天冬氨酸或谷氨酸),芳香酸(诸如苯甲酸或肉桂酸),磺酸(诸如对甲苯磺酸或乙磺酸),等等)处理游离碱。
如果本发明的化合物是酸,那么期望的药学可接受的盐可以通过任何合适方法来制备,例如用无机或有机碱(诸如胺(伯,仲或叔)),碱金属氢氧化物或碱土金属氢氧化物,等等处理游离酸。合适的盐的例示性例子包括但不限于自氨基酸(诸如甘氨酸和精氨酸),铵,伯/仲/叔胺,和环胺(诸如哌啶,吗啉和哌嗪)衍生的有机盐,和自钠,钙,钾,镁,锰,铁,铜,锌,铝和锂衍生的无机盐。
短语“药学可接受的”指明该物质或组合物必须是在化学和/或毒理学方面与构成配制剂的其它成分和/或用它治疗的哺乳动物相容的。
术语“检测”包括任何检测手段,包括直接和间接检测。
如本文中使用的,术语“生物标志物”指可在样品中检测的指示物,例如预测性,诊断性和/或预后性的指示物。生物标志物可以充当由特定的分子,病理学,组织学和/或临床特征表征的特定疾病或病症(例如癌症)亚型的指示物。在一些实施方案中,生物标志物是一种基因。生物标志物包括但不限于,多核苷酸(例如DNA和/或RNA),多核苷酸拷贝数目改变(例如DNA拷贝数),多肽,多肽和多核苷酸修饰(例如翻译后修饰),碳水化合物和/或基于糖脂的分子标志物。
术语“生物标志物签名”,“签名”,“生物标志物表达签名”或“表达签名”在本文中可互换使用,指其表达为指示物,例如预测性,诊断性和/或预后性指示物的一种或一组生物标志物。生物标志物签名可以充当由特定的分子,病理学,组织学和/或临床特征表征的特定疾病或病症(例如癌症)亚型的指示物。在一些实施方案中,生物标志物签名是“基因签名”。术语“基因签名”与“基因表达签名”可互换使用,指其表达为指示物,例如预测性,诊断性和/或预后性指示物的一种或一组多核苷酸。在一些实施方案中,生物标志物签名是“蛋白质签名”。术语“蛋白质签名”与“蛋白质表达签名”可互换使用,指其表达为指示物,例如预测性,诊断性和/或预后性指示物的一种或一组多肽。
生物标志物与个体增加的临床益处有关的“量”或“水平”是生物学样品中的可检测水平。这些可通过本领域技术人员已知的及本文中公开的方法来测量。所评估的生物标志物的表达水平或量可用于确定对治疗的响应。
术语“表达的水平”或“表达水平”一般可互换使用,一般指生物学样品中生物标志物的量。“表达”一般指信息(例如基因编码和/或表观遗传)转化成细胞中存在并运行的结构的过程。因此,如本文中使用的,“表达”可以指转录成多核苷酸,翻译成多肽,或甚至多核苷酸和/或多肽修饰(例如多肽的翻译后修饰)。转录的多核苷酸的,翻译的多肽的,或多核苷酸和/或多肽修饰(例如多肽的翻译后修饰)的片段也应视为表达的,无论它们是源自通过可变剪接生成的转录物或经过降解的转录物,或者是源自多肽的翻译后加工(例如通过蛋白水解)。“表达的基因”包括转录成多核苷酸(如mRNA),然后翻译成多肽的基因,还有转录成RNA但不翻译成多肽的基因(例如转运和核糖体RNA)。
“升高的表达”,“升高的表达水平”或“升高的水平”指相对于对照如不患有疾病或病症(例如癌症)的个体或内部对照(例如持家型生物标志物),个体中生物标志物的增加的表达或增加的水平。
“降低的表达”,“降低的表达水平”或“降低的水平”指相对于对照诸如没有罹患疾病或病症(例如癌症)的个体或内部对照(例如持家型生物标志物),个体中生物标志物的降低的表达或降低的水平。在一些实施方案中,降低的表达是很少或不表达。
术语“持家型生物标志物”指通常相似地存在于所有细胞类型中的一种生物标志物或一组生物标志物(例如多核苷酸和/或多肽)。在一些实施方案中,持家型生物标志物是“持家基因”。“持家基因”在本文中指一种基因或一组基因,其编码活性对于细胞功能维持而言必要的蛋白质,且通常相似地存在于所有细胞类型中。
如本文中使用的,“扩增”一般指生成多拷贝的期望序列的过程。“多拷贝”指至少2个拷贝。“拷贝”不必然意味着与模板序列有完全的序列互补性或同一性。例如,拷贝可以包含核苷酸类似物诸如脱氧肌苷,有意的序列变化(诸如经由包含与模板可杂交但不互补的序列的引物引入的序列变化)和/或扩增期间发生的序列错误。
术语“多重PCR”指出于在单个反应中扩增两种或更多种DNA序列的目的,使用超过一套引物在自单一来源(例如个体)获得的核酸上进行的单个PCR反应。
杂交反应的“严格性”可以由本领域中的普通技术人员容易地确定,而且通常根据探针长度,洗涤温度和盐浓度凭经验计算。一般而言,较长的探针要求较高的温度以正确退火,而较短的探针需要较低的温度。杂交通常依赖于当互补链存在于低于其解链温度的环境中时变性DNA重新退火的能力。探针与可杂交序列之间的期望同源性程度越高,可使用的相对温度也越高。结果,可推出较高相对温度将趋向于使反应条件更为严格,而较低温度也就较不严格。关于杂交反应严格性的其它细节和解释,参见Ausubel et al.,CurrentProtocols in Molecular Biology,Wiley Interscience Publishers,(1995)。
如本文中所定义的,“严格条件”或“高严格条件”可由以下鉴定:(1)对于洗涤采用低离子强度和高温,例如0.015M氯化钠/0.0015M柠檬酸钠/0.1%十二烷基硫酸钠,50℃;(2)在杂交期间使用变性剂,诸如甲酰胺,例如50%(v/v)甲酰胺及0.1%牛血清清蛋白/0.1%Ficoll/0.1%聚乙烯吡咯烷酮/50mM磷酸钠缓冲液pH 6.5及750mM氯化钠,75mM柠檬酸钠,42℃;或(3)在使用50%甲酰胺,5x SSC(0.75M NaCl,0.075M柠檬酸钠),50mM磷酸钠(pH6.8),0.1%焦磷酸钠,5x登哈特(Denhardt)氏溶液,超声处理的鲑精DNA(50μg/ml),0.1%SDS和10%硫酸右旋糖苷的溶液中在42℃过夜杂交,在42℃于0.2x SSC(氯化钠/柠檬酸钠)洗涤10分钟,然后在55℃进行由含有EDTA的0.1x SSC组成的10分钟高严格洗涤。
“中等严格条件”可以如Sambrook et al.,Molecular Cloning:A LaboratoryManual,New York:Cold Spring Harbor Press,1989所描述的来定义,而且包括使用与上文所述那些相比较不太严格的洗涤溶液和杂交条件(例如温度,离子强度和%SDS)。中等严格条件的一个例子是在含:20%甲酰胺,5x SSC(150mM NaCl,15mM柠檬酸三钠),50mM磷酸钠(pH7.6),5x登哈特氏溶液,10%硫酸右旋糖苷和20mg/ml变性的剪切的鲑精DNA的溶液中于37℃温育过夜,然后于约37-50℃在1x SSC中洗涤滤膜。熟练技术人员会认识到如何根据适应诸如探针长度等因素的需要来调节温度,离子强度等。
“聚合酶链式反应”或“PCR”技术在用于本文时一般指其中如1987年7月28日公告的美国专利第4,683,195号中所记载的,扩增微量的核酸,RNA和/或DNA特定片段的流程。通常,需要获知目的区域末端或以外的序列信息,从而可设计寡核苷酸引物;这些引物在序列上将与待扩增模板的相对链相同或相似。两条引物的5’末端核苷酸可与所扩增物质的末端一致。PCR可用于从总基因组DNA和由总细胞RNA转录的cDNA,噬菌体或质粒序列等扩增特定RNA序列,特定DNA序列。一般参见Mullis等,Cold Spring Harbor Symp.Quant.Biol.51:263(1987);Erlich ed.,PCR Technology,Stockton Press,NY,1989。在用于本文时,PCR视为用于扩增核酸测试样品的核酸聚合酶反应方法的一个但非唯一的例子,包括使用已知核酸(DNA或RNA)作为引物并利用核酸聚合酶来扩增或生成特定核酸片段,或者扩增或生成与特定核酸互补的特定核酸片段。
“定量实时聚合酶链式反应”或“qRT-PCR”指PCR的一种形式,其中在PCR反应的每个步骤测量PCR产物的量。这种技术已经记载于多份出版物,包括Cronin等,Am.J.Pathol.164(1):35-42(2004);Ma等,Cancer Cell.5:607-616(2004)。
术语“微阵列”指可杂交阵列元素,优选多核苷酸探针在基片上的有序排列。
术语“寡核苷酸”指相对较短的多核苷酸,包括但不限于单链脱氧核糖核苷酸,单链或双链核糖核苷酸,RNA:DNA杂合物,及双链DNA。寡核苷酸,诸如单链DNA探针寡核苷酸,常常通过化学方法来合成,例如使用商品化的自动化寡核苷酸合成仪。然而,寡核苷酸可通过多种其它方法来制备,包括体外重组DNA介导的技术和通过DNA在细胞和生物体中的表达。
术语“多核苷酸”在以单数或复数使用时一般指任何多聚核糖核苷酸或多聚脱氧核糖核苷酸,可以是未经修饰的RNA或DNA或者是经过修饰的RNA或DNA。如此,例如,本文中所定义的多核苷酸包括但不限于单链和双链DNA,包含单链区和双链区的DNA,单链和双链RNA,及包含单链区和双链区的RNA,包含DNA和RNA的杂合分子,它可以是单链的,或者更典型的是双链的,或者包含单链区和双链区。另外,术语“多核苷酸”在用于本文时指包含RNA或DNA或RNA和DNA二者的三链区。此类区中的链可来自相同分子或来自不同分子。所述区可包含一种或多种分子的整个,但是更典型的是只包含有些分子的一个区。三股螺旋区的分子之一常常是寡核苷酸。术语“多核苷酸”明确包括cDNA。该术语包括包含一种或多种经修饰碱基的DNA(包括cDNA)和RNA。如此,主链为稳定性或其它原因而修饰的DNA或RNA也是“多核苷酸”该术语在本文中的意图所在。此外,包含罕见碱基诸如肌苷或经修饰碱基诸如氚化碱基的DNA或RNA也包括在本文中所定义的术语“多核苷酸”内。一般而言,术语“多核苷酸”涵盖未修饰多核苷酸的所有化学,酶学和/或代谢修饰形式,以及病毒和细胞,包括简单和复杂细胞的特征性的DNA和RNA的化学形式。
术语“诊断”在本文中用于指对分子或病理学状态,疾病或疾患(例如癌症)的鉴定或分类。例如,“诊断”可以指特定癌症类型的鉴定。“诊断”还可以指特定癌症亚型的分类,例如通过组织病理学标准或分子特征(例如由一种或一组生物标志物(例如特定基因或由所述基因编码的蛋白质)的表达表征的亚型)。
术语“帮助做出诊断”在本文中用于指帮助进行关于特定类型的疾病或病症(例如癌症)的症状或状况的存在或性质的临床确定的方法。例如,帮助做出疾病或状况(例如癌症)诊断的方法可以包括在来自个体的生物学样品中测量特定的生物标志物。
术语“样品”在用于本文时指获得自或衍生自感兴趣的受试者和/或个体的组合物,其包含有待根据例如物理,生化,化学和/或生理特点来表征和/或鉴定的细胞和/或其它分子实体。例如,短语“疾病样品”及其变体指得自感兴趣的受试者的任何样品,预计或已知其包含待表征的细胞和/或分子实体。样品包括但不限于,原代或培养的细胞或细胞系,细胞上清,细胞裂解物,血小板,血清,血浆,玻璃体液,淋巴液,滑液,滤泡液(follicularfluid),精液,羊水,乳,全血,血液衍生的细胞,尿液,脑脊髓液,唾液,痰,泪,汗液,粘液,肿瘤裂解物,和组织培养液(tissue culture medium),组织提取物如匀浆化的组织,肿瘤组织,细胞提取物,及其组合。
“组织样品”或“细胞样品”意指从受试者或个体的组织获得的相似细胞的集合。组织或细胞样品的来源可以是实体组织如来自新鲜,冷冻和/或保存的器官,组织样品,活组织检查和/或抽吸物;血液或任何血液成分如血浆;体液如脑脊髓液,羊水,腹膜液或间隙液(interstitial fluid);来自受试者的妊娠或发育中任意时间的细胞。组织样品还可以是原代或培养的细胞或细胞系。任选地,组织或细胞样品自患病的组织/器官获得。组织样品可以含有在自然界中不天然与组织混杂的化合物,如防腐剂,抗凝血剂,缓冲剂,固定剂,营养物,抗生素等。
为本发明目的,组织样品的“切片”意指一块或一片组织样品,例如从组织样品上切下来的一薄片组织或细胞。应当了解,可以制作多片组织样品切片并进行分析,只要理解可以将组织样品的同一切片用于形态学和分子两个水平的分析或者针对多肽和多核苷酸二者进行分析。
“关联”或“联系”意指以任何方式将第一分析或方案的性能和/或结果与第二分析或方案的性能和/或结果进行比较。例如,可以将第一分析或方案的结果用于实施第二方案,和/或,可以使用第一分析或方案的结果来决定是否应当实施第二分析或方案。就多肽分析或方案的实施方案而言,可以使用多肽表达分析或方案的结果来决定是否应当实施特定治疗方案。就多核苷酸分析或方案的实施方案而言,可以使用多核苷酸表达分析或方案的结果来决定是否应当实施特定治疗方案。
“个体响应”或“响应”可使用指示对个体益处的任何终点评估,包括但不限于:(1)一定程度地抑制疾病进展(例如癌症进展),包括减缓和完全阻滞;(2)缩小肿瘤尺寸;(3)抑制(即减轻、减缓或完全终止)癌细胞浸润入临近周围器官和/或组织;(4)抑制(即减轻、减缓或完全终止)转移;(5)一定程度地减轻与疾病或病症(例如癌症)有关的一种或多种症状;(6)存活(包括总体存活和无进展存活)的长度延长或扩展;和/或(9)治疗后给定时间点的死亡率降低。
患者对药物治疗的“有效响应”或“响应性”及类似用语指对处于疾病或病症(诸如癌症)风险或患有疾病或病症(诸如癌症)的患者给予的临床或治疗好处。在一个实施方案中,此类好处包括如下任何一项或多项:延长存活(包括总体存活和无进展存活);导致客观响应(包括完全响应或部分响应);或改善癌症体征或症状。在一个实施方案中,使用生物标志物(例如PD-L1表达,例如使用IHC测定的)来鉴定预测具有相对于不表达该生物标志物的患者升高的可能性响应药物(例如抗PDL1抗体)治疗的患者。在一个实施方案中,使用生物标志物(例如PD-L1表达,例如使用IHC测定的)来鉴定预测具有相对于不以相同水平表达该生物标志物的患者升高的可能性响应药物(例如抗PDL1抗体)治疗的患者。在一个实施方案中,使用生物标志物的存在来鉴定相对于不存在该生物标志物的患者更有可能响应药物治疗的患者。在另一个实施方案中,使用生物标志物的存在来确定患者会具有相对于不存在该生物标志物的患者升高的可能性受益于药物治疗。
“延长存活”意味着使接受治疗的患者的总体存活或无进展存活相对于未接受治疗的患者(即相对于未用药物治疗的患者),或相对于不以指定水平表达生物标志物的患者,和/或相对于用已获批准的抗肿瘤剂治疗的患者有延长。客观响应(objectiveresponse)指可测量的响应,包括完全响应(CR)或部分响应(PR)。
III.PD-1轴结合拮抗剂
本文中提供了用于在个体中治疗癌症或延迟癌症进展的方法,其包括对个体施用有效量的PD-1轴结合拮抗剂和IL-17结合拮抗剂。例如,PD-1轴结合拮抗剂包括PD-1结合拮抗剂,PDL1结合拮抗剂和PDL2结合拮抗剂。“PD-1”的备选名称包括CD279和SLEB2。“PDL1”的备选名称包括B7-H1,B7-4,CD274,和B7-H。“PDL2”的备选名称包括B7-DC,Btdc,和CD273。在一些实施方案中,PD-1,PDL1,和PDL2是人PD-1,PDL1,和PDL2。
在一些实施方案中,PD-1结合拮抗剂是抑制PD-1与其配体结合配偶结合的分子。在一个具体的方面,PD-1配体结合配偶是PDL1和/或PDL2。在另一个实施方案中,PDL1结合拮抗剂是抑制PDL1与其结合配偶结合的分子。在一个具体的方面,PDL1结合配偶是PD-1和/或B7-1。在另一个实施方案中,PDL2结合拮抗剂是抑制PDL2与其结合配偶结合的分子。在一个具体的方面,PDL2结合配偶是PD-1。拮抗剂可以是抗体,其抗原结合片段,免疫粘附素,融合蛋白,或寡肽。
在一些实施方案中,PD-1结合拮抗剂是抗PD-1抗体(例如人抗体,人源化抗体,或嵌合抗体)。在一些实施方案中,抗PD-1抗体选自下组:nivolumab,pembrolizumab,和CT-011。在一些实施方案中,抗PD-1抗体选自下组:nivolumab,pembrolizumab,CT-011,MEDI-0680(AMP-514),PDR001,REGN2810,BGB-108,和BGB-A317。在一些实施方案中,PD-1结合拮抗剂是免疫粘附素(例如包含融合至恒定区(例如免疫球蛋白序列的Fc区)的PDL1或PDL2的胞外或PD-1结合部分的免疫粘附素)。在一些实施方案中,PD-1结合拮抗剂是AMP-224。Nivolumab,也称作MDX-1106-04,MDX-1106,ONO-4538,BMS-936558,和是一种在WO2006/121168中描述的抗PD-1抗体。Pembrolizumab,也称作MK-3475,Merck 3475,lambrolizumab,和SCH-900475,是一种在WO2009/114335中描述的抗PD-1抗体。CT-011,也称作hBAT,hBAT-1和pidilizumab,是一种在WO2009/101611中描述的抗PD-1抗体。AMP-224,也称作B7-DCIg,是一种在WO2010/027827和WO2011/066342中描述的PDL2-Fc融合可溶性受体。
在一些实施方案中,抗PD-1抗体是nivolumab(CAS登记号:946414-94-4)。在仍有又一个实施方案中,提供一种分离的抗PD-1抗体,其包含包含来自SEQ ID NO:22的重链可变区氨基酸序列的重链可变区和/或包含来自SEQ ID NO:23的轻链可变区氨基酸序列的轻链可变区。在仍有又一个实施方案中,提供一种分离的抗PD-1抗体,其包含重链和/或轻链序列,其中:
(a)该重链序列与下述重链序列具有至少85%,至少90%,至少91%,至少92%,至少93%,至少94%,至少95%,至少96%,至少97%,至少98%,至少99%或100%序列同一性:
QVQLVESGGGVVQPGRSLRLDCKASGITFSNSGMHWVRQAPGKGLEWVAVIWYDGSKRYYADSVKGRFTISRDNSKNTLFLQMNSLRAEDTAVYYCATNDDYWGQGTLVTVSSASTKGPSVFPLAPCSRSTSESTAALGCLVKDYFPEPVTVSWNSGALTSGVHTFPAVLQSSGLYSLSSVVTVPSSSLGTKTYTCNVDHKPSNTKVDKRVESKYGPPCPPCPAPEFLGGPSVFLFPPKPKDTLMISRTPEVTCVVVDVSQEDPEVQFNWYVDGVEVHNAKTKPREEQFNSTYRVVSVLTVLHQDWLNGKEYKCKVSNKGLPSSIEKTISKAKGQPREPQVYTLPPSQEEMTKNQVSLTCLVKGFYPSDIAVEWESNGQPENNYKTTPPVLDSDGSFFLYSRLTVDKSRWQEGNVFSCSVMHEALHNHYTQKSLSLSLGK(SEQ ID NO:22),或
(b)该轻链序列与下述轻链序列具有至少85%,至少90%,至少91%,至少92%,至少93%,至少94%,至少95%,至少96%,至少97%,至少98%,至少99%或100%序列同一性:
EIVLTQSPATLSLSPGERATLSCRASQSVSSYLAWYQQKPGQAPRLLIYDASNRATGIPARFSGSGSGTDFTLTISSLEPEDFAVYYCQQSSNWPRTFGQGTKVEIKRTVAAPSVFIFPPSDEQLKSGTASVVCLLNNFYPREAKVQWKVDNALQSGNSQESVTEQDSKDSTYSLSSTLTLSKADYEKHKVYACEVTHQGLSSPVTKSFNRGEC(SEQ ID NO:23)。
在一些实施方案中,抗PD-1抗体是pembrolizumab(CAS登记号:1374853-91-4)。在仍有又一个实施方案中,提供一种分离的抗PD-1抗体,其包含包含来自SEQ ID NO:62的重链可变区氨基酸序列的重链可变区和/或包含来自SEQ ID NO:63的轻链可变区氨基酸序列的轻链可变区。在仍有又一个实施方案中,提供一种分离的抗PD-1抗体,其包含重链和/或轻链序列,其中:
(a)该重链序列与下述重链序列具有至少85%,至少90%,至少91%,至少92%,至少93%,至少94%,至少95%,至少96%,至少97%,至少98%,至少99%或100%序列同一性:
(b)该轻链序列与下述轻链序列具有至少85%,至少90%,至少91%,至少92%,至少93%,至少94%,至少95%,至少96%,至少97%,至少98%,至少99%或100%序列同一性:
在一些实施方案中,PDL1结合拮抗剂是抗PDL1抗体。在一些实施方案中,抗PDL1结合拮抗剂选自下组:YW243.55.S70,MPDL3280A,MDX-1105,和MEDI4736。在一些实施方案中,抗PDL1结合拮抗剂选自下组:YW243.55.S70,MPDL3280A(也称作atezolizumab),MDX-1105,MEDI4736(也称作durvalumab),和MSB0010718C(也称作avelumab)。MDX-1105,也称作BMS-936559,是一种在WO2007/005874中描述的抗PDL1抗体。抗体YW243.55.S70(重和轻链可变区序列分别显示于SEQ ID No.20和21)是一种在WO 2010/077634A1中描述的抗PDL1抗体。MEDI4736是一种在WO2011/066389和US2013/034559中描述的抗PDL1抗体。
可用于本发明方法的抗PDL1抗体及其生成方法的例子记载于PCT专利申请WO2010/077634 A1和美国专利No.8,217,149,其通过援引收入本文。
在一些实施方案中,PD-1轴结合拮抗剂是抗PDL1抗体。在一些实施方案中,抗PDL1抗体能够抑制PDL1和PD-1之间和/或PDL1和B7-1之间的结合。在一些实施方案中,抗PDL1抗体是单克隆抗体。在一些实施方案中,抗PDL1抗体是选自下组的抗体片段:Fab,Fab’-SH,Fv,scFv,和(Fab’)2片段。在一些实施方案中,抗PDL1抗体是人源化抗体。在一些实施方案中,抗PDL1抗体是人抗体。
可用于本发明的抗PDL1抗体(包括含有此类抗体的组合物),诸如那些记载于WO2010/077634A1的抗PDL1抗体可以与IL-17结合拮抗剂组合使用以治疗癌症。在一些实施方案中,抗PDL1抗体包含包含SEQ ID NO:20的氨基酸序列的重链可变区和包含SEQ ID NO:21的氨基酸序列的轻链可变区。
在一个实施方案中,抗PDL1抗体含有重链可变区多肽,其包含HVR-H1,HVR-H2和HVR-H3序列,其中:
(a)HVR-H1序列是GFTFSX1SWIH(SEQ ID NO:1);
(b)HVR-H2序列是AWIX2PYGGSX3YYADSVKG(SEQ ID NO:2);
(c)HVR-H3序列是RHWPGGFDY(SEQ ID NO:3);
进一步其中:X1是D或G;X2是S或L;X3是T或S。
在一个具体的方面,X1是D;X2是S且X3是T。在另一个方面,多肽进一步包含依照下式的HVR间并置的可变区重链框架序列:(HC-FR1)-(HVR-H1)-(HC-FR2)-(HVR-H2)-(HC-FR3)-(HVR-H3)-(HC-FR4)。在又一个方面,框架序列自人共有框架序列衍生。在另一个方面,框架序列是VH亚组III共有框架。在又一个方面,至少一个框架序列如下:
HC-FR1是EVQLVESGGGLVQPGGSLRLSCAAS(SEQ ID NO:4)
HC-FR2是WVRQAPGKGLEWV(SEQ ID NO:5)
HC-FR3是RFTISADTSKNTAYLQMNSLRAEDTAVYYCAR(SEQ ID NO:6)
HC-FR4是WGQGTLVTVSA(SEQ ID NO:7)。
在又一个方面,重链多肽与可变区轻链进一步组合,所述可变区轻链包含HVR-L1,HVR-L2和HVR-L3,其中:
(a)HVR-L1序列是RASQX4X5X6TX7X8A(SEQ ID NO:8);
(b)HVR-L2序列是SASX9LX10S(SEQ ID NO:9);
(c)HVR-L3序列是QQX11X12X13X14PX15T(SEQ ID NO:10);
进一步其中:X4是D或V;X5是V或I;X6是S或N;X7是A或F;X8是V或L;X9是F或T;X10是Y或A;X11是Y,G,F,或S;X12是L,Y,F或W;X13是Y,N,A,T,G,F或I;X14是H,V,P,T或I;X15是A,W,R,P或T。
在又一个方面,X4是D;X5是V;X6是S;X7是A;X8是V;X9是F;X10是Y;X11是Y;X12是L;X13是Y;X14是H;X15是A。在又一个方面,轻链进一步包含依照下式的HVR间并置的可变区轻链框架序列:(LC-FR1)-(HVR-L1)-(LC-FR2)-(HVR-L2)-(LC-FR3)-(HVR-L3)-(LC-FR4)。在又一个方面,框架序列自人共有框架序列衍生。在又一个方面,框架序列是VLκI共有框架。在又一个方面,至少一个框架序列如下:
LC-FR1是DIQMTQSPSSLSASVGDRVTITC(SEQ ID NO:11)
LC-FR2是WYQQKPGKAPKLLIY(SEQ ID NO:12)
LC-FR3是GVPSRFSGSGSGTDFTLTISSLQPEDFATYYC(SEQ ID NO:13)
LC-FR4是FGQGTKVEIKR(SEQ ID NO:14)。
在另一个实施方案中,提供了分离的抗PDL1抗体或抗原结合片段,其包含重链和轻链可变区序列,其中:
(a)重链包含HVR-H1,HVR-H2和HVR-H3,其中进一步:
(i)HVR-H1序列是GFTFSX1SWIH(SEQ ID NO:1),
(ii)HVR-H2序列是AWIX2PYGGSX3YYADSVKG(SEQ ID NO:2)
(iii)HVR-H3序列是RHWPGGFDY(SEQ ID NO:3),且
(b)轻链包含HVR-L1,HVR-L2和HVR-L3,其中进一步:
(i)HVR-L1序列是RASQX4X5X6TX7X8A(SEQ ID NO:8),
(ii)HVR-L2序列是SASX9LX10S(SEQ ID NO:9),和
(iii)HVR-L3序列是QQX11X12X13X14PX15T(SEQ ID NO:10)
进一步其中:X1是D或G;X2是S或L;X3是T或S;X4是D或V;X5是V或I;X6是S或N;X7是A或F;X8是V或L;X9是F或T;X10是Y或A;X11是Y,G,F,或S;X12是L,Y,F或W;X13是Y,N,A,T,G,F或I;X14是H,V,P,T或I;X15是A,W,R,P或T。
在一个具体的方面,X1是D;X2是S且X3是T。在另一个方面,X4是D;X5是V;X6是S;X7是A;X8是V;X9是F;X10是Y;X11是Y;X12是L;X13是Y;X14是H;X15是A。在又一个方面,X1是D;X2是S且X3是T,X4是D;X5是V;X6是S;X7是A;X8是V;X9是F;X10是Y;X11是Y;X12是L;X13是Y;X14是H且X15是A。
在另一个方面,重链可变区包含如下的HVR间并置的一个或多个框架序列:(HC-FR1)-(HVR-H1)-(HC-FR2)-(HVR-H2)-(HC-FR3)-(HVR-H3)-(HC-FR4),并且轻链可变区包含如下的HVR间并置的一个或多个框架序列:(LC-FR1)-(HVR-L1)-(LC-FR2)-(HVR-L2)-(LC-FR3)-(HVR-L3)-(LC-FR4)。在又一个方面,框架序列自人共有框架序列衍生。在又一个方面,重链框架序列自Kabat亚组I,II,或III序列衍生。在又一个方面,重链框架序列是VH亚组III共有框架。在又一个方面,一个或多个重链框架序列如下:
HC-FR1 EVQLVESGGGLVQPGGSLRLSCAAS(SEQ ID NO:4)
HC-FR2 WVRQAPGKGLEWV(SEQ ID NO:5)
HC-FR3 RFTISADTSKNTAYLQMNSLRAEDTAVYYCAR(SEQ ID NO:6)
HC-FR4 WGQGTLVTVSA(SEQ ID NO:7)。
在又一个方面,轻链框架序列自KabatκI,II,II或IV亚组序列衍生。在又一个方面,轻链框架序列是VLκI共有框架。在又一个方面,一个或多个轻链框架序列如下:
LC-FR1 DIQMTQSPSSLSASVGDRVTITC(SEQ ID NO:11)
LC-FR2 WYQQKPGKAPKLLIY(SEQ ID NO:12)
LC-FR3 GVPSRFSGSGSGTDFTLTISSLQPEDFATYYC(SEQ ID NO:13)
LC-FR4 FGQGTKVEIKR(SEQ ID NO:14)。
在又一个具体的方面,抗体进一步包含人或鼠恒定区。在又一个方面,人恒定区选自下组:IgG1,IgG2,IgG2,IgG3,IgG4。在又一个具体的方面,人恒定区是IgG1。在又一个方面,鼠恒定区选自下组:IgG1,IgG2A,IgG2B,IgG3。在又一个方面,鼠恒定区是IgG2A。在又一个具体的方面,抗体具有降低的或最小的效应器功能。在又一个具体的方面,最小效应器功能源自“效应器较小(effector-less)的Fc突变”或无糖基化(aglycosylation)。在又一个实施方案中,效应器较小的Fc突变是恒定区中的N297A或D265A/N297A替代。
在又一个实施方案中,提供了抗PDL1抗体,其包含重链和轻链可变区序列,其中:
(a)重链进一步包含与GFTFSDSWIH(SEQ ID NO:15),AWISPYGGSTYYADSVKG(SEQ IDNO:16)和RHWPGGFDY(SEQ ID NO:3)分别具有至少85%序列同一性的HVR-H1,HVR-H2和HVR-H3序列,或
(b)轻链进一步包含与RASQDVSTAVA(SEQ ID NO:17),SASFLYS(SEQ ID NO:18)和QQYLYHPAT(SEQ ID NO:19)分别具有至少85%序列同一性的HVR-L1,HVR-L2和HVR-L3序列。
在一个具体的方面,序列同一性是86%,87%,88%,89%,90%,91%,92%,93%,94%,95%,96%,97%,98%,99%或100%。在另一个方面,重链可变区包含如下的HVR间并置的一个或多个框架序列:(HC-FR1)-(HVR-H1)-(HC-FR2)-(HVR-H2)-(HC-FR3)-(HVR-H3)-(HC-FR4),且轻链可变区包含如下的HVR间并置的一个或多个框架序列:(LC-FR1)-(HVR-L1)-(LC-FR2)-(HVR-L2)-(LC-FR3)-(HVR-L3)-(LC-FR4)。在又一个方面,框架序列自人共有框架序列衍生。在又一个方面,重链框架序列自Kabat亚组I,II,或III序列衍生。在又一个方面,重链框架序列是VH亚组III共有框架。在又一个方面,一个或多个重链框架序列如下:
HC-FR1 EVQLVESGGGLVQPGGSLRLSCAAS(SEQ ID NO:4)
HC-FR2 WVRQAPGKGLEWV(SEQ ID NO:5)
HC-FR3 RFTISADTSKNTAYLQMNSLRAEDTAVYYCAR(SEQ ID NO:6)
HC-FR4 WGQGTLVTVSA(SEQ ID NO:7)。
在又一个方面,轻链框架序列自KabatκI,II,II或IV亚组序列衍生。在又一个方面,轻链框架序列是VLκI共有框架。在又一个方面,一个或多个轻链框架序列如下:
LC-FR1 DIQMTQSPSSLSASVGDRVTITC(SEQ ID NO:11)
LC-FR2 WYQQKPGKAPKLLIY(SEQ ID NO:12)
LC-FR3 GVPSRFSGSGSGTDFTLTISSLQPEDFATYYC(SEQ ID NO:13)
LC-FR4 FGQGTKVEIKR(SEQ ID NO:14)。
在又一个具体的方面,抗体进一步包含人或鼠恒定区。在又一个方面,人恒定区选自下组:IgG1,IgG2,IgG2,IgG3,IgG4。在又一个具体的方面,人恒定区是IgG1。在又一个方面,鼠恒定区选自下组:IgG1,IgG2A,IgG2B,IgG3。在又一个方面,鼠恒定区是IgG2A。在又一个具体的方面,抗体具有降低的或最小的效应器功能。在又一个具体的方面,最小效应器功能源自“效应器较小的Fc突变”或无糖基化。在又一个实施方案中,效应器较小的Fc突变是恒定区中的N297A或D265A/N297A替代。
在又一个实施方案中,提供了分离的抗PDL1抗体,其包含重链和轻链可变区序列,其中:
(a)重链序列与下述重链序列具有至少85%序列同一性:
EVQLVESGGGLVQPGGSLRLSCAASGFTFSDSWIHWVRQAPGKGLEWVAWISPYGGSTYYADSVKGRFTISADTSKNTAYLQMNSLRAEDTAVYYCARRHWPGGFDYWGQGTLVTVSA(SEQ ID NO:20),或
(b)轻链序列与下述轻链序列具有至少85%序列同一性:
DIQMTQSPSSLSASVGDRVTITCRASQDVSTAVAWYQQKPGKAPKLLIYSASFLYSGVPSRFSGSGSGTDFTLTISSLQPEDFATYYCQQYLYHPATFGQGTKVEIKR(SEQ ID NO:21)。
在一个具体的方面,序列同一性是86%,87%,88%,89%,90%,91%,92%,93%,94%,95%,96%,97%,98%,99%或100%。在另一个方面,重链可变区包含如下的HVR间并置的一个或多个框架序列:(HC-FR1)-(HVR-H1)-(HC-FR2)-(HVR-H2)-(HC-FR3)-(HVR-H3)-(HC-FR4),且轻链可变区包含如下的HVR间并置的一个或多个框架序列:(LC-FR1)-(HVR-L1)-(LC-FR2)-(HVR-L2)-(LC-FR3)-(HVR-L3)-(LC-FR4)。在又一个方面,框架序列自人共有框架序列衍生。在又一个方面,重链框架序列自Kabat亚组I,II,或III序列衍生。在又一个方面,重链框架序列是VH亚组III共有框架。在又一个方面,一个或多个重链框架序列如下:
HC-FR1 EVQLVESGGGLVQPGGSLRLSCAAS(SEQ ID NO:4)
HC-FR2 WVRQAPGKGLEWV(SEQ ID NO:5)
HC-FR3 RFTISADTSKNTAYLQMNSLRAEDTAVYYCAR(SEQ ID NO:6)
HC-FR4 WGQGTLVTVSA(SEQ ID NO:7)。
在又一个方面,轻链框架序列自KabatκI,II,II或IV亚组序列衍生。在又一个方面,轻链框架序列是VLκI共有框架。在又一个方面,一个或多个轻链框架序列如下:
LC-FR1 DIQMTQSPSSLSASVGDRVTITC(SEQ ID NO:11)
LC-FR2 WYQQKPGKAPKLLIY(SEQ ID NO:12)
LC-FR3 GVPSRFSGSGSGTDFTLTISSLQPEDFATYYC(SEQ ID NO:13)
LC-FR4 FGQGTKVEIKR(SEQ ID NO:14)。
在又一个具体的方面,抗体进一步包含人或鼠恒定区。在又一个方面,人恒定区选自下组:IgG1,IgG2,IgG2,IgG3,IgG4。在又一个具体的方面,人恒定区是IgG1。在又一个方面,鼠恒定区选自下组:IgG1,IgG2A,IgG2B,IgG3。在又一个方面,鼠恒定区是IgG2A。在又一个具体的方面,抗体具有降低的或最小的效应器功能。在又一个具体的方面,最小的效应器功能源自原核细胞中的生成。在又一个具体的方面,最小的效应器功能源自“效应器较小的Fc突变”或无糖基化。在又一个实施方案中,效应器较小的Fc突变是恒定区中的N297A或D265A/N297A替代。
在另一个又一个实施方案中,提供一种分离的抗PDL1抗体,其包含重链和轻链可变区序列,其中:
(a)该重链序列与下述重链序列具有至少85%序列同一性:
EVQLVESGGGLVQPGGSLRLSCAASGFTFSDSWIHWVRQAPGKGLEWVAWISPYGGSTYYADSVKGRFTISADTSKNTAYLQMNSLRAEDTAVYYCARRHWPGGFDYWGQGTLVTVSS(SEQ ID NO:24),或
(b)该轻链序列与下述轻链序列具有至少85%序列同一性:
DIQMTQSPSSLSASVGDRVTITCRASQDVSTAVAWYQQKPGKAPKLLIYSASFLYSGVPSRFSGSGSGTDFTLTISSLQPEDFATYYCQQYLYHPATFGQGTKVEIKR(SEQ ID NO:21)。
在仍有又一个实施方案中,提供一种分离的抗PDL1抗体,其包含重链和轻链可变区序列,其中:
(a)该重链序列与下述重链序列具有至少85%序列同一性:
EVQLVESGGGLVQPGGSLRLSCAASGFTFSDSWIHWVRQAPGKGLEWVAWISPYGGSTYYADSVKGRFTISADTSKNTAYLQMNSLRAEDTAVYYCARRHWPGGFDYWGQGTLVTVSSASTK(SEQ ID NO:28),或
(b)该轻链序列与下述轻链序列具有至少85%序列同一性:
DIQMTQSPSSLSASVGDRVTITCRASQDVSTAVAWYQQKPGKAPKLLIYSASFLYSGVPSRFSGSGSGTDFTLTISSLQPEDFATYYCQQYLYHPATFGQGTKVEIKR(SEQ ID NO:29)。
在一个具体的方面,序列同一性是86%,87%,88%,89%,90%,91%,92%,93%,94%,95%,96%,97%,98%,99%或100%。在另一个方面,重链可变区包含如下的HVR间并置的一个或多个框架序列:(HC-FR1)-(HVR-H1)-(HC-FR2)-(HVR-H2)-(HC-FR3)-(HVR-H3)-(HC-FR4),且轻链可变区包含如下的HVR间并置的一个或多个框架序列:(LC-FR1)-(HVR-L1)-(LC-FR2)-(HVR-L2)-(LC-FR3)-(HVR-L3)-(LC-FR4)。在又一个方面,框架序列自人共有框架序列衍生。在另一个方面,重链框架序列自Kabat亚组I,II,或III序列衍生。在又一个方面,重链框架序列是VH亚组III共有框架。在又一个方面,一个或多个重链框架序列如下:
HC-FR1 EVQLVESGGGLVQPGGSLRLSCAAS(SEQ ID NO:4)
HC-FR2 WVRQAPGKGLEWV(SEQ ID NO:5)
HC-FR3 RFTISADTSKNTAYLQMNSLRAEDTAVYYCAR(SEQ ID NO:6)
HC-FR4 WGQGTLVTVSS(SEQ ID NO:25)。
在又一个方面,轻链框架序列自KabatκI,II,II或IV亚组序列衍生。在又一个方面,轻链框架序列是VLκI共有框架。在又一个方面,一个或多个轻链框架序列如下:
LC-FR1 DIQMTQSPSSLSASVGDRVTITC(SEQ ID NO:11)
LC-FR2 WYQQKPGKAPKLLIY(SEQ ID NO:12)
LC-FR3 GVPSRFSGSGSGTDFTLTISSLQPEDFATYYC(SEQ ID NO:13)
LC-FR4 FGQGTKVEIKR(SEQ ID NO:14)。
在又一个具体的方面,抗体进一步包含人或鼠恒定区。在又一个方面,人恒定区选自下组:IgG1,IgG2,IgG2,IgG3,IgG4。在又一个具体的方面,人恒定区是IgG1。在又一个方面,鼠恒定区选自下组:IgG1,IgG2A,IgG2B,IgG3。在又一个方面,鼠恒定区是IgG2A。在又一个具体的方面,抗体具有降低的或最小的效应器功能。在又一个具体的方面,最小的效应器功能源自原核细胞中的生成。在又一个具体的方面,最小的效应器功能源自“效应器较小的Fc突变”或无糖基化。在又一个实施方案中,效应器较小的Fc突变是恒定区中的N297A或D265A/N297A替代。
在又一个实施方案中,抗PDL1抗体是MPDL3280A(CAS登记号:1422185-06-5)。在又一个实施方案中,提供了分离的抗PDL1抗体,其包含包含来自SEQ ID NO:24或SEQ ID NO:28的重链可变区氨基酸序列的重链可变区和/或包含来自SEQ ID NO:21的轻链可变区氨基酸序列的轻链可变区。在又一个实施方案中,提供了分离的抗PDL1抗体,其包含重链和/或轻链序列,其中:
(a)重链序列与下述重链序列具有至少85%,至少90%,至少91%,至少92%,至少93%,至少94%,至少95%,至少96%,至少97%,至少98%,至少99%或100%序列同一性:
EVQLVESGGGLVQPGGSLRLSCAASGFTFSDSWIHWVRQAPGKGLEWVAWISPYGGSTYYADSVKGRFTISADTSKNTAYLQMNSLRAEDTAVYYCARRHWPGGFDYWGQGTLVTVSSASTKGPSVFPLAPSSKSTSGGTAALGCLVKDYFPEPVTVSWNSGALTSGVHTFPAVLQSSGLYSLSSVVTVPSSSLGTQTYICNVNHKPSNTKVDKKVEPKSCDKTHTCPPCPAPELLGGPSVFLFPPKPKDTLMISRTPEVTCVVVDVSHEDPEVKFNWYVDGVEVHNAKTKPREEQYASTYRVVSVLTVLHQDWLNGKEYKCKVSNKALPAPIEKTISKAKGQPREPQVYTLPPSREEMTKNQVSLTCLVKGFYPSDIAVEWESNGQPENNYKTTPPVLDSDGSFFLYSKLTVDKSRWQQGNVFSCSVMHEALHNHYTQKSLSLSPG(SEQ ID NO:26),或
(b)轻链序列与下述轻链序列具有至少85%,至少90%,至少91%,至少92%,至少93%,至少94%,至少95%,至少96%,至少97%,至少98%,至少99%或100%序列同一性:
DIQMTQSPSSLSASVGDRVTITCRASQDVSTAVAWYQQKPGKAPKLLIYSASFLYSGVPSRFSGSGSGTDFTLTISSLQPEDFATYYCQQYLYHPATFGQGTKVEIKRTVAAPSVFIFPPSDEQLKSGTASVVCLLNNFYPREAKVQWKVDNALQSGNSQESVTEQDSKDSTYSLSSTLTLSKADYEKHKVYACEVTHQGLSSPVTKSFNRGEC(SEQ ID NO:27)。
在又一个实施方案中,本发明提供了组合物,其包含与至少一种药学可接受载体组合的任一种上文描述的抗PDL1抗体。
在又一个实施方案中,提供了分离的核酸,其编码抗PDL1抗体的轻链或重链可变区序列,其中:
(a)重链进一步包含与GFTFSDSWIH(SEQ ID NO:15),AWISPYGGSTYYADSVKG(SEQ IDNO:16)和RHWPGGFDY(SEQ ID NO:3)分别具有至少85%序列同一性的HVR-H1,HVR-H2和HVR-H3序列,和
(b)轻链进一步包含与RASQDVSTAVA(SEQ ID NO:17),SASFLYS(SEQ ID NO:18)和QQYLYHPAT(SEQ ID NO:19)分别具有至少85%序列同一性的HVR-L1,HVR-L2和HVR-L3序列。
在一个具体的方面,序列同一性是86%,87%,88%,89%,90%,91%,92%,93%,94%,95%,96%,97%,98%,99%或100%。在各方面,重链可变区包含如下的HVR间并置的一个或多个框架序列:(HC-FR1)-(HVR-H1)-(HC-FR2)-(HVR-H2)-(HC-FR3)-(HVR-H3)-(HC-FR4),且轻链可变区包含如下的HVR间并置的一个或多个框架序列:(LC-FR1)-(HVR-L1)-(LC-FR2)-(HVR-L2)-(LC-FR3)-(HVR-L3)-(LC-FR4)。在又一个方面,框架序列自人共有框架序列衍生。在另一个方面,重链框架序列自Kabat亚组I,II,或III序列衍生。在又一个方面,重链框架序列是VH亚组III共有框架。在又一个方面,一个或多个重链框架序列如下:
HC-FR1 EVQLVESGGGLVQPGGSLRLSCAAS(SEQ ID NO:4)
HC-FR2 WVRQAPGKGLEWV(SEQ ID NO:5)
HC-FR3 RFTISADTSKNTAYLQMNSLRAEDTAVYYCAR(SEQ ID NO:6)
HC-FR4 WGQGTLVTVSA(SEQ ID NO:7)。
在又一个方面,轻链框架序列自KabatκI,II,II或IV亚组序列衍生。在又一个方面,轻链框架序列是VLκI共有框架。在又一个方面,一个或多个轻链框架序列如下:
LC-FR1 DIQMTQSPSSLSASVGDRVTITC(SEQ ID NO:11)
LC-FR2 WYQQKPGKAPKLLIY(SEQ ID NO:12)
LC-FR3 GVPSRFSGSGSGTDFTLTISSLQPEDFATYYC(SEQ ID NO:13)
LC-FR4 FGQGTKVEIKR(SEQ ID NO:14)。
在又一个具体的方面,本文中描述的抗体(诸如抗PD-1抗体,抗PDL1抗体,或抗PDL2抗体)进一步包含人或鼠恒定区。在又一个方面,人恒定区选自下组:IgG1,IgG2,IgG2,IgG3,IgG4。在又一个具体的方面,人恒定区是IgG1。在又一个方面,鼠恒定区选自下组:IgG1,IgG2A,IgG2B,IgG3。在又一个方面,鼠恒定区是IgG2A。在又一个具体的方面,抗体具有降低的或最小的效应器功能。在又一个具体的方面,最小的效应器功能源自原核细胞中的生成。在又一个具体的方面,最小的效应器功能源自“效应器较小的Fc突变”或无糖基化。在又一个方面,效应器较小的Fc突变是恒定区中的N297A或D265A/N297A替代。
在又一个方面,本文中提供了编码本文中描述的任何抗体的核酸。在一些实施方案中,核酸进一步包含适合于表达核酸的载体,所述核酸编码先前描述的抗PDL1,抗PD-1,或抗PDL2抗体之任一种。在又一个具体的方面,载体进一步包含适合于表达核酸的宿主细胞。在又一个具体的方面,宿主细胞是真核细胞或原核细胞。在又一个具体的方面,真核细胞是哺乳动物细胞,诸如中国仓鼠卵巢(CHO)。
可以使用本领域中已知的方法,例如通过如下的方法生成抗体或其抗原结合片段,所述方法包括在适合于生成此类抗体或片段的条件下培养含有核酸的宿主细胞,并回收抗体或片段,所述核酸编码适合于表达的形式的先前描述的抗PDL1,抗PD-1,或抗PDL2抗体或抗原结合片段之任一种。
在一些实施方案中,分离的抗PDL1抗体是无糖基化的。抗体的糖基化通常是N连接的或O连接的。N连接指碳水化合物模块附着至天冬酰胺残基的侧链。三肽序列天冬酰胺-X-丝氨酸和天冬酰胺-X-苏氨酸(其中X是除脯氨酸以外的任何氨基酸)是碳水化合物模块酶促附着至天冬酰胺侧链的识别序列。如此,这些三肽序列任一在多肽中的存在创建潜在的糖基化位点。O连接的糖基化指糖N-乙酰基半乳糖胺,半乳糖,或木糖之一附着至羟基氨基酸,最常见丝氨酸或苏氨酸,尽管也可以使用5-羟基脯氨酸或5-羟基赖氨酸。通过改变氨基酸序列,使得去除上文所述三肽序列(用于N连接的糖基化位点)之一,方便地实现自抗体去除糖基化位点。可以通过将糖基化位点内的天冬酰胺,丝氨酸或苏氨酸残基用另一种氨基酸残基(例如甘氨酸,丙氨酸或保守氨基酸替代)替代来进行改变。
在本文中的任何实施方案中,分离的抗PDL1抗体能结合人PDL1(例如UniProtKB/Swiss-Prot登录号Q9NZQ7.1中所示人PDL1)或其变体。
在又一个实施方案中,本发明提供了组合物,其包含如本文中提供的抗PDL1,抗PD-1,或抗PDL2抗体或其抗原结合片段和至少一种药学可接受载体。在一些实施方案中,对个体施用的抗PDL1,抗PD-1,或抗PDL2抗体或其抗原结合片段是包含一种或多种药学可接受载体的组合物。可以使用本文中描述的或本领域中已知的任何药学可接受载体。
在一些实施方案中,本文所述抗PDL1抗体在配制剂中,该配制剂包含量为约60mg/mL的抗体,浓度为约20mM的组氨酸乙酸酯,浓度为约120mM的蔗糖,和浓度为0.04%(w/v)的聚山梨酯(例如聚山梨酯20),而且该配制剂具有约5.8的pH。在一些实施方案中,本文所述抗PDL1抗体在配制剂中,该配制剂包含量为约125mg/mL的抗体,浓度为约20mM的组氨酸乙酸酯,浓度为约240mM的蔗糖,和浓度为0.02%(w/v)的聚山梨酯(例如聚山梨酯20),而且该配制剂具有约5.5的pH。
IV.IL-17结合拮抗剂
本文中提供的是用于在个体中治疗癌症或延迟癌症进展的方法,其包括对该个体施用有效量的PD-1轴结合拮抗剂和IL-17结合拮抗剂。
在一些实施方案中,IL-17结合拮抗剂抑制IL-17对IL-17受体的结合。已经证明IL-17活性是经由对它的独特细胞表面受体(IL-17R)的结合介导的(更加详细的描述参见美国申请公开文本No.20100055103)。IL-17和IL-17R的另外的描述可以见Gaffen,Nat.Rev.Immunol.,9:556-67(2009)。
如本文中描述的,术语“IL-17”涵盖IL-17细胞因子家族的一个或多个成员,诸如IL-17A和IL-17F(等等),以及单一IL-17家族细胞因子多肽或IL-17家族细胞因子单体的二聚体(例如IL-17AA,IL-17FF,或IL-17AF)。另外,术语“IL-17”还涵盖“全长”和未加工的IL-17以及源自细胞中加工的任何形式的IL-17(例如成熟蛋白质)。该术语还涵盖IL-17的天然发生变体和同等型,例如剪接变体或等位变体。www.uniprot.org/uniprot/Q16552和www.uniprot.org/uniprot/Q96PD4提供了例示性IL-17家族成员和序列的描述。
在一些实施方案中,IL-17结合拮抗剂抑制IL-17A同二聚体对IL-17受体的结合。在一些实施方案中,IL-17结合拮抗剂抑制IL-17F同二聚体对IL-17受体的结合。在一些实施方案中,IL-17结合拮抗剂抑制IL-17A/IL-17F异二聚体对IL-17受体的结合。
在一些实施方案中,该IL-17结合拮抗剂是抗体(例如人抗体,人源化抗体,或嵌合抗体)。在一些实施方案中,该IL-17结合拮抗剂是单克隆抗体。在一些实施方案中,该IL-17结合拮抗剂是选自由Fab,Fab’-SH,Fv,scFv,和(Fab’)2片段组成的组的抗体片段。在一些实施方案中,该IL-17结合拮抗剂是人源化抗体或人抗体。
在一些实施方案中,该IL-17结合拮抗剂是抗IL-17抗体。本领域知道多种抗IL-17抗体。下文提供了数种例示性抗IL-17抗体,序列,和更为详细地描述抗IL-17抗体的参考文献。在一些实施方案中,抗IL-17抗体结合一种或多种IL-17A同二聚体,IL-17F同二聚体,和IL-17A/IL-17F异二聚体。
在一些实施方案中,该抗IL-17抗体是美国专利No.8,771,697中描述的抗IL-17抗体。例如,在一些实施方案中,该抗IL-17抗体是美国专利No.8,771,697中描述的30D12BF或其变体。在一些实施方案中,IL-17抗体包含美国专利No.8,771,697中描述的抗体30D12BF的一个,两个,三个,四个,五个,或六个CDR。在一些实施方案中,IL-17抗体包含美国专利No.8,771,697中描述的抗体30D12BF的重链可变区和/或轻链可变区。在一些实施方案中,该抗IL-17抗体包含与氨基酸序列:
QVQLVQSGAEVKKPGASVKVSCKASGYTFTSYDINWVRQATGQGLEWMGWLNPDSGVIRYAQKFQGRVTMTRDTSISTAYMELSSLRSEDTAVYYCAREWFGELPSYYFYSGMDVWGQGTTVTVSS(SEQ ID NO:30)具有至少85%序列同一性的重链可变区(VH区),和/或与氨基酸序列:
EIVLTQSPATLSLSPGERATLSCRASQSVSSYLAWYQQKPGQAPRLLIYDASNRATGIPARFSGSGSGTDFTLTISSLEPEDFAVYYCQQRSNWPPTFGPGTKVDIK(SEQ ID NO:31)具有至少85%序列同一性的轻链可变区(VL区)。
在一个具体的方面,该序列同一性是86%,87%,88%,89%,90%,91%,92%,93%,94%,95%,96%,97%,98%,99%或100%。
在一个实施方案中,该抗IL-17抗体包含重链可变区多肽,其包含CDR-H1,CDR-H2和CDR-H3序列的,其中:
(a)CDR-H1序列是SYDIN(SEQ ID NO:32);
(b)CDR-H2序列是WLNPDSGVIRYAQKFQG(SEQ ID NO:33);且
(c)CDR-H3序列是EWFGELPSYYFYSGMDV(SEQ ID NO:34)。
在一个实施方案中,该抗IL-17抗体包含轻链可变区多肽,其包含CDR-L1,CDR-L2和CDR-L3序列,其中:
(a)CDR-L1序列是RASQSVSSYLA(SEQ ID NO:35);
(b)CDR-L2序列是DASNRAT(SEQ ID NO:36);且
(c)CDR-L3序列是QQRSNWPPT(SEQ ID NO:37)。
在一些实施方案中,该抗IL-17抗体是美国专利No.8,771,697中描述的29D8或其变体。在一些实施方案中,IL-17抗体包含美国专利No.8,771,697中描述的抗体29D8的一个,两个,三个,四个,五个,或六个CDR。在一些实施方案中,IL-17抗体包含美国专利No.8,771,697中描述的抗体29D8的重链可变区和/或轻链可变区。在一些实施方案中,该抗IL-17抗体包含与氨基酸序列:
QVQLVQSGAEVKKPGASVKVSCKAFAYTFSTYGISWVRQAPGQGLEWMGWISAYNSNTNYAQKVQGRITMTTDTSTRTAYMELRGLRSDDTAVYFCATFFGGHSGYHYGLDVWGQGTTVTVSS(SEQ ID NO:38)具有至少85%序列同一性的重链可变区(VH区),和/或与氨基酸序列:
EIVLXQSPATLSLSPGERATLSCRASQSVSSYLAWYQQKPGQAPRLLXYDASNRATGIPARFSGSGSGTDFTLTISSLEPEDFAVYYCQQRSNWPPYTFGQGTKLEIK(SEQ ID NO:39)具有至少85%序列同一性的轻链可变区(VL区)。
在一个具体的方面,该序列同一性是86%,87%,88%,89%,90%,91%,92%,93%,94%,95%,96%,97%,98%,99%或100%。
在一个实施方案中,该抗IL-17抗体包含重链可变区多肽,其包含CDR-H1,CDR-H2和CDR-H3序列,其中:
(a)CDR-H1序列是TYGIS(SEQ ID NO:40);
(b)CDR-H2序列是WISAYNSNTNYAQKVQG(SEQ ID NO:41);且
(c)CDR-H3序列是FFGGHSGYHYGLDV(SEQ ID NO:42)。
在一个实施方案中,该抗IL-17抗体包含轻链可变区多肽,其包含CDR-L1,CDR-L2和CDR-L3序列,其中:
(a)CDR-L1序列是RASQSVSSYLA(SEQ ID NO:43);
(b)CDR-L2序列是DASNRAT(SEQ ID NO:44);且
(c)CDR-L3序列是QQRSNWPPYT(SEQ ID NO:45)。
在一些实施方案中,该抗IL-17抗体是美国专利No.8,771,697中描述的15E6FK或其变体。在一些实施方案中,IL-17抗体包含美国专利No.8,771,697中描述的抗体15E6FK的一个,两个,三个,四个,五个,或六个CDR。在一些实施方案中,IL-17抗体包含美国专利No.8,771,697中描述的抗体15E6FK的重链可变区和/或轻链可变区。在一些实施方案中,该抗IL-17抗体包含与氨基酸序列:
EVQLVESGGGLVQPGRSLRLSCAASGFTFDDYAMHWVRQAPGKGLEWVSGINWSSGGIGYADSVKGRFTISRDNAKNSLYLQMNSLRAEDTALYYCARDIGGFGEFYWNFGLWGRGTLVTVSS(SEQ ID NO:46)具有至少85%序列同一性的重链可变区(VH区),和/或与氨基酸序列:
EIVLTQSPATLSLSPGERATLSCRASQSVRSYLAWYQQKPGQAPRLLIYDASNRATGIPARFSGSGSGTDFTLTISSLEPEDFAVYYCQQRSNWPPATFGGGTKVEIK(SEQ ID NO:47)具有至少85%序列同一性的轻链可变区(VL区)。
在一个具体的方面,该序列同一性是86%,87%,88%,89%,90%,91%,92%,93%,94%,95%,96%,97%,98%,99%或100%。
在一个实施方案中,该抗IL-17抗体包含重链可变区多肽,其包含CDR-H1,CDR-H2和CDR-H3序列,其中:
(a)CDR-H1序列是DYAMH(SEQ ID NO:48);
(b)CDR-H2序列是GINWSSGGIGYADSVKG(SEQ ID NO:49);且
(c)CDR-H3序列是DIGGFGEFYWNFGL(SEQ ID NO:50)。
在一个实施方案中,该抗IL-17抗体包含轻链可变区多肽,其包含CDR-L1,CDR-L2和CDR-L3序列,其中:
(a)CDR-L1序列isRASQSVRSYLA(SEQ ID NO:51);
(b)CDR-L2序列是DASNRAT(SEQ ID NO:52);且
(c)CDR-L3序列是QQRSNWPPAT(SEQ ID NO:53)。
在一些实施方案中,该抗IL-17抗体是美国专利No.8,771,697中描述的39F12A或其变体。在一些实施方案中,IL-17抗体包含美国专利No.8,771,697中描述的抗体39F12A的一个,两个,三个,四个,五个,或六个CDR。在一些实施方案中,IL-17抗体包含美国专利No.8,771,697中描述的抗体39F12A的重链可变区和/或轻链可变区。在一些实施方案中,该抗IL-17抗体包含与氨基酸序列:
QVQLVQSGAEVKKPGSSVKVSCKASGGTLSSYAFSWVRQAPGQGLEWMGGIIPFFGTTNYAQKFQGRVIITADESTNTAYMELSGLRSEDTAVYYCARDRDYYGLGSPFYYYGMDVWGQGTTVTVSS(SEQ ID NO:54)具有至少85%序列同一性的重链可变区(VH区),和/或与氨基酸序列:
EIVLTQSPDFQSVTPKEKVTITCRASQSIGSSLHWYQQKPDQSPKLLIKYASQSFSGVPSRFSGSGSGTDFTLTINSLEAEDAATYYCHQSSSLPWTFGQGTKVEIK(SEQ ID NO:55)具有至少85%序列同一性的轻链可变区(VL区)。
在一个具体的方面,该序列同一性是86%,87%,88%,89%,90%,91%,92%,93%,94%,95%,96%,97%,98%,99%或100%。
在一个实施方案中,该抗IL-17抗体包含重链可变区多肽,其包含CDR-H1,CDR-H2和CDR-H3序列,其中:
(a)CDR-H1序列是SYAFS(SEQ ID NO:56);
(b)CDR-H2序列是GIIPFFGTTNYAQKFQG(SEQ ID NO:57);且
(c)CDR-H3序列是DRDYYGLGSPFYYYGMDV(SEQ ID NO:58)。
在一个实施方案中,该抗IL-17抗体包含轻链可变区多肽,其包含CDR-L1,CDR-L2和CDR-L3序列,其中:
(a)CDR-L1序列是RASQSIGSSLH(SEQ ID NO:59);
(b)CDR-L2序列是YASQSFS(SEQ ID NO:60);且
(c)CDR-L3序列是HQSSSLPWT(SEQ ID NO:61)。
在一些实施方案中,该抗IL-17抗体特异性结合IL-17A。在一些实施方案中,该抗IL-17抗体特异性结合IL-17F。
在一些实施方案中,该抗IL-17抗体是美国专利No.7,807,155中描述的抗IL-17抗体(例如结合IL-17AA和IL-17AF的抗体)。在一个实施方案中,该抗IL-17抗体是secukinumab。
在一些实施方案中,该抗IL-17抗体是美国专利No.7,838,638中描述的抗IL-17抗体(例如结合IL-17AA和IL-17AF的抗体)。在一个实施方案中,该抗IL-17抗体是ixekizumab。
已经描述IL-17A/F(即包含IL-17A和IL-17F单体的异二聚体IL-17)成为治疗多种免疫介导的疾病的靶物(Chang and Dong,Cell Res.17(5):435-40(2007));已经显示由小鼠Th17细胞生成的IL-17A/F蛋白质诱导气道嗜中性粒细胞募集并因此具有气道嗜中性粒细胞中的体内功能(Liang et al.,J Immunol 179(11):7791-9(2007));且已经报告人IL-17A/F异二聚体细胞因子经由IL-17RA/IL-17RC受体复合物发信号(Wright et al.,JImmunol 181(4):2799-805(2008))。
在一些实施方案中,该抗IL-17抗体特异性结合IL-17A和IL-17F。此类抗体在本领域中称作交叉反应性抗体。“交叉反应性抗体”可以指识别多于一种抗原上的相同或相似表位的抗体。如此,本公开文本的交叉反应性抗体可以识别IL-17A和IL-17F二者上存在的相同或相似表位。在一个特定的实施方案中,该交叉反应性抗体利用相同或本质上相同的补位(paratope)来结合IL-17A和IL-17F二者(如本文中使用的,术语“补位”可以指抗体中结合靶抗原的部分)。优选地,本文中的交叉反应性抗体还阻断IL-17A和IL-17F二者功能(活性)。关于交叉反应性IL-17抗体的特性,和用于生成交叉反应性IL-17抗体的例示性方法的更多描述可以见例如美国专利公开文本No.US20100055103,通过援引将其收入本文。
在一些实施方案中,该抗IL-17抗体是PCT公开文本No.WO2007106769中描述的抗IL-17抗体(例如交叉反应性抗体),通过援引将其收入本文。
在一些实施方案中,该抗IL-17抗体是PCT公开文本No.WO2012095662中描述的抗IL-17抗体(例如交叉反应性抗体),通过援引将其收入本文。在一个实施方案中,该抗IL-17抗体是bimekizumab。
在一些实施方案中,该IL-17结合拮抗剂是抗IL-17受体抗体。在一些实施方案中,该抗IL-17受体抗体特异性结合与IL-17A和/或IL-17F(例如IL-17A同二聚体,IL-17F同二聚体,或IL-17A/IL-17F异二聚体)相互作用的IL-17受体。在一些实施方案中,抗IL-17受体抗体结合IL-17受体的胞外域上的表位。www.uniprot.org/uniprot/Q96F46和www.uniprot.org/uniprot/Q8NAC3提供了例示性IL-17受体和序列的描述。
在一些背景中,已知IL-17受体的异二聚体复合物介导IL-17信号传导(参见例如Wright et al.,J Immunol 181(4):2799-805(2008))。在一些实施方案中,抗IL-17受体抗体特异性结合IL-17受体复合物,诸如IL-17RA/IL-17RC受体复合物或IL-17RA/IL-17RB受体复合物。
本领域知道抗IL-17受体抗体。例如,在一些实施方案中,该抗IL-17受体抗体如美国专利No.7,767,206中描述的。在一个实施方案中,该抗IL-17受体抗体是brodalumab。
在一些实施方案中,该IL-17结合拮抗剂是包含至少一个来自IL-17受体的外显子的可溶性多肽。此类多肽可以与IL-17家族细胞因子相互作用并抑制它结合内源IL-17受体的能力。在一些实施方案中,该包含至少一个来自IL-17受体的外显子的可溶性多肽包含来自IL-17受体的胞外域的一部分。在一些实施方案中,该可溶性多肽包含至少一个来自IL-17RA的外显子和至少一个来自IL-17RC的外显子。在一些实施方案中,该包含至少一个来自IL-17受体的外显子的可溶性多肽是PCT公开文本No.WO2007038703中描述的可溶性多肽。
在一些实施方案中,分离的抗IL-17和/或抗IL-17受体抗体是无糖基化的。抗体的糖基化通常是N连接的或O连接的。N连接指碳水化合物模块附着至天冬酰胺残基的侧链。三肽序列天冬酰胺-X-丝氨酸和天冬酰胺-X-苏氨酸(其中X是除脯氨酸以外的任何氨基酸)是碳水化合物模块酶促附着至天冬酰胺侧链的识别序列。如此,这些三肽序列任一在多肽中的存在创建潜在的糖基化位点。O连接的糖基化指糖N-乙酰基半乳糖胺,半乳糖,或木糖之一附着至羟基氨基酸,最常见丝氨酸或苏氨酸,尽管也可以使用5-羟基脯氨酸或5-羟基赖氨酸。通过改变氨基酸序列,使得去除上文所述三肽序列(用于N连接的糖基化位点)之一,方便地实现自抗体去除糖基化位点。可以通过将糖基化位点内的天冬酰胺,丝氨酸或苏氨酸残基用另一种氨基酸残基(例如甘氨酸,丙氨酸或保守氨基酸替代)替代来进行改变。
在一些实施方案中,在包含一种或多种药学可接受载剂的组合物中对该个体施用本文中提供的抗IL-17抗体或其抗原结合片段,抗IL-17受体抗体或其抗原结合片段,和/或包含至少一个来自IL-17受体的外显子的可溶性多肽。可以使用本文中描述的或本领域知道的任何药学可接受载剂。
V.抗体制备
如上文描述的,在一些实施方案中,PD-1结合拮抗剂是抗体(例如抗PD-1抗体,抗PDL1抗体,或抗PDL2抗体)。在一些实施方案中,IL-17结合拮抗剂是抗体(例如抗IL-17抗体或抗IL-17受体抗体)。可以使用本领域用来生成抗体的可用技术来制备本文中描述的抗体,下面各节中更为详细地描述了其例示性方法。
抗体针对感兴趣抗原。例如抗体可以针对PD-1(诸如人PD-1),PDL1(诸如人PDL1),PDL2(诸如人PDL2),IL-17(诸如IL-17A和/或IL-17F,包括人IL-17A和/或人IL-17F),或IL-17受体(诸如IL-17RA和/或IL-17RC,包括人IL-17RA和/或人IL-17RC)。优选地,抗原是生物学上重要的多肽,而且对罹患病症的哺乳动物施用抗体能在该哺乳动物中导致治疗好处。
在某些实施方案中,本文中描述的抗体具有≤1μM,≤150nM,≤100nM,≤50nM,≤10nM,≤1nM,≤0.1nM,≤0.01nM,或≤0.001nM(例如10-8M或更少,例如10-8M至10-13M,例如10-9M至10-13M)的解离常数(Kd)。
在一个实施方案中,Kd是通过如下述测定法所述用Fab型式的感兴趣抗体及其抗原实施的放射性标记抗原结合测定法(RIA)测量的。通过在存在未标记抗原的滴定系列的情况中用最小浓度的(125I)标记抗原平衡Fab,然后用抗Fab抗体包被板捕捉结合的抗原来测量Fab对抗原的溶液结合亲和力(参见例如Chen et al.,J.Mol.Biol.293:865-881(1999))。为了建立测定法的条件,将多孔板(Thermo Scientific)用50mM碳酸钠(pH 9.6)中的5μg/ml捕捉用抗Fab抗体(Cappel Labs)包被过夜,随后用PBS中的2%(w/v)牛血清清蛋白于室温(大约23℃)封闭2-5小时。在非吸附板(Nunc#269620)中,将100pM或26pM[125I]-抗原与连续稀释的感兴趣Fab混合。然后将感兴趣Fab温育过夜;然而,温育可持续更长时段(例如约65个小时)以确保达到平衡。此后,将混合物转移至捕捉板,于室温温育(例如1小时)。然后除去溶液,并用PBS中的0.1%聚山梨酯20洗板8次。板干燥后,添加150μl/孔闪烁液(MICROSCINT-20TM;Packard),然后在TOPCOUNTTM伽马计数仪(Packard)上对板计数10分钟。选择各Fab给出小于或等于最大结合之20%的浓度用于竞争性结合测定法。
依照另一个实施方案,Kd是使用表面等离振子共振测定法使用-2000或-3000(BIAcore,Inc.,Piscataway,NJ)于25℃使用固定化抗原CM5芯片在约10个响应单位(RU)测量的。简言之,依照供应商的用法说明书用盐酸N-乙基-N’-(3-二甲基氨基丙基)-碳二亚胺(EDC)和N-羟基琥珀酰亚胺(NHS)活化羧甲基化右旋糖苷生物传感器芯片(CM5,BIACORE,Inc.)。将抗原用10mM乙酸钠pH 4.8稀释至5μg/ml(约0.2μM),然后以5μl/分钟的流速注射以获得大约10个响应单位(RU)的偶联蛋白质。注入抗原后,注入1M乙醇胺以封闭未反应基团。为了动力学测量,于25℃以大约25μl/分钟的流速注入在含0.05%聚山梨酯20(TWEEN-20TM)表面活性剂的PBS(PBST)中两倍连续稀释的Fab(0.78nM至500nM)。使用简单一对一朗格缪尔(Langmuir)结合模型(Evaluation软件版本3.2)通过同时拟合结合和解离传感图计算结合速率(kon)和解离速率(koff)。平衡解离常数(Kd)以比率koff/kon计算。参见例如Chen et al.,J.Mol.Biol.293:865-881(1999)。如果根据上文表面等离振子共振测定法,结合速率超过106M-1s-1,那么可使用荧光淬灭技术来测定结合速率,即根据分光计诸如配备了断流装置的分光光度计(Aviv Instruments)或8000系列SLM-AMINCOTM分光光度计(ThermoSpectronic)中用搅拌比色杯进行的测量,在存在浓度渐增的抗原的情况中,测量PBS pH 7.2中20nM抗抗原抗体(Fab形式)于25℃的荧光发射强度(激发=295nm;发射=340nm,16nm带通)的升高或降低。
在一些实施方案中,本文所述抗IL-17抗体展现至少100pM或更少的针对人IL-17A同二聚体的结合亲和力,至少300pM或更少的针对人IL-17F同二聚体的结合亲和力,至少400pM或更少的针对人IL-17A/IL-17F异二聚体复合物的结合亲和力,至少40nM或更少的针对人IL-17A同二聚体的中和能力,至少120nM或更少的针对人IL-17F同二聚体的中和能力,和至少31nM或更少的针对人IL-17A/IL-17F异二聚体复合物的中和能力。在这些实施方案中,可以如美国专利No.8,771,697中所述通过表面等离振子共振测量结合亲和力,而且可以如美国专利No.8,771,697中所述通过测量经人IL-17A同二聚体,人IL-17F同二聚体或人IL-17A/IL-17F异二聚体复合物刺激的小鼠或人胚胎成纤维细胞的IL-6分泌测定中和能力。
抗体片段
在某些实施方案中,本文中描述的抗体是抗体片段。抗体片段包括但不限于Fab,Fab’,Fab’-SH,F(ab’)2,Fv,和scFv片段,及下文所描述的其它片段。对于某些抗体片段的综述,参见Hudson等,Nat.Med.9:129-134(2003)。对于scFv片段的综述,参见例如Pluckthün,于The Pharmacology of Monoclonal Antibodies,vol.113,Rosenburg和Moore编,(Springer-Verlag,New York),pp.269-315(1994);亦参见WO 93/16185;和美国专利No.5,571,894和5,587,458。对包含补救受体结合表位残基且具有延长的体内半衰期的Fab和F(ab’)2片段的论述,参见美国专利No.5,869,046。
双抗体是具有两个抗原结合位点的抗体片段,其可以是二价或双特异性的。参见,例如EP 404,097;WO 1993/01161;Hudson等,Nat.Med.9:129-134(2003);和Hollinger等,Proc.Natl.Acad.Sci.USA 90:6444-6448(1993)。三抗体和四抗体也记载于Hudson等,Nat.Med.9:129-134(2003)。
单域抗体是包含抗体的整个或部分重链可变域,或整个或部分轻链可变域的抗体片段。在某些实施方案中,单域抗体是人单域抗体(Domantis,Inc.,Waltham,MA;参见例如美国专利No.6,248,516B1)。
可以通过各种技术来制备抗体片段,包括但不限于对完整抗体的蛋白水解消化以及通过重组宿主细胞(例如大肠杆菌或噬菌体)产生,如本文中描述的。
嵌合抗体和人源化抗体
在某些实施方案中,本文中描述的抗体是嵌合抗体。某些嵌合抗体记载于例如美国专利No.4,816,567;及Morrison et al.,Proc.Natl.Acad.Sci.USA 81:6851-6855(1984)。在一个例子中,嵌合抗体包含非人可变区(例如自小鼠,大鼠,仓鼠,家兔,或非人灵长类,诸如猴衍生的可变区)和人恒定区。在又一个例子中,嵌合抗体是“类转换的”抗体,其中类或亚类已经自亲本抗体的类或亚类改变。嵌合抗体包括其抗原结合片段。
在某些实施方案中,嵌合抗体是人源化抗体。通常,将非人抗体人源化以降低对人的免疫原性,同时保留亲本非人抗体的特异性和亲和力。一般地,人源化抗体包含一个或多个可变域,其中HVR,例如CDR(或其部分)自非人抗体衍生,而FR(或其部分)自人抗体序列衍生。任选地,人源化抗体还会至少包含人恒定区的一部分。在一些实施方案中,将人源化抗体中的一些FR残基用来自非人抗体(例如衍生HVR残基的抗体)的相应残基替代,例如为了恢复或改善抗体特异性或亲和力。
人源化抗体及其生成方法综述于例如Almagro and Fransson,Front.Biosci.13:1619-1633(2008),并且进一步记载于例如Riechmann et al.,Nature 332:323-329(1988);Queen et al.,Proc.Nat’l Acad.Sci.USA 86:10029-10033(1989);美国专利No.5,821,337,No.7,527,791,No.6,982,321,和No.7,087,409;Kashmiri et al.,Methods36:25-34(2005)(记载SDR(a-CDR)嫁接);Padlan,Mol.Immunol.28:489-498(1991)(记载“重修表面”);Dall’Acqua et al.,Methods 36:43-60(2005)(记载“FR改组”);及Osbournet al.,Methods 36:61-68(2005)及Klimka et al.,Br.J.Cancer 83:252-260(2000)(记载FR改组的“引导选择”办法)。
可以用于人源化的人框架区包括但不限于:使用“最佳拟合(best-fit)”方法选择的框架区(参见例如Sims et al.,J.Immunol.151:2296(1993));自轻或重链可变区的特定亚组的人抗体的共有序列衍生的框架区(参见例如Carter et al.,Proc.Natl.Acad.Sci.USA 89:4285(1992);及Presta et al.,J.Immunol.151:2623(1993));人成熟的(体细胞突变的)框架区或人种系框架区(参见例如Almagro andFransson,Front.Biosci.13:1619-1633(2008));和通过筛选FR文库衍生的框架区(参见例如Baca et al.,J.Biol.Chem.272:10678-10684(1997)及Rosok et al.,J.Biol.Chem.271:22611-22618(1996))。
人抗体
在某些实施方案中,本文中描述的抗体是人抗体。可以使用本领域中已知的多种技术来生成人抗体。一般地,人抗体记载于van Dijk and van de Winkel,Curr.Opin.Pharmacol.5:368-74(2001)及Lonberg,Curr.Opin.Immunol.20:450-459(2008)。
可以通过对转基因动物施用免疫原来制备人抗体,所述转基因动物已经修饰为响应抗原性攻击而生成完整人抗体或具有人可变区的完整抗体。此类动物通常含有整个或部分人免疫球蛋白基因座,其替换内源免疫球蛋白基因座,或者其在染色体外存在或随机整合入动物的染色体中。在此类转基因小鼠中,一般已经将内源免疫球蛋白基因座灭活。关于自转基因动物获得人抗体的方法的综述参见Lonberg,Nat.Biotech.23:1117-1125(2005)。还可参见例如美国专利No.6,075,181和No.6,150,584,其描述了XENOMOUSETM技术;美国专利No.5,770,429,其描述了技术;美国专利No.7,041,870,其描述了K-M技术,和美国专利申请公开文本No.US2007/0061900,其描述了技术。可以例如通过与不同人恒定区组合进一步修饰来自由此类动物生成的完整抗体的人可变区。
也可以通过基于杂交瘤的方法生成人抗体。已经描述了用于生成人单克隆抗体的人骨髓瘤和小鼠-人异源骨髓瘤细胞系(参见例如Kozbor,J.Immunol.133:3001(1984);Brodeur et al.,Monoclonal Antibody Production Techniques and Applications,pp.51-63(Marcel Dekker,Inc.,New York,1987);及Boerner et al.,J.Immunol.147:86(1991))。经由人B细胞杂交瘤技术生成的人抗体也记载于Li et al.,Proc.Natl.Acad.Sci.USA 103:3557-3562(2006)。其它方法包括那些记载于例如美国专利No.7,189,826(其描述了自杂交瘤细胞系生成单克隆人IgM抗体)及Ni,Xiandai Mianyixue26(4):265-268(2006)(其描述了人-人杂交瘤)的。人杂交瘤技术(Trioma技术)也记载于Vollmers and Brandlein,Histology and Histopathology 20(3):927-937(2005)及Vollmers and Brandlein,Methods and Findings in Experimental and ClinicalPharmacology 27(3):185-91(2005)。
也可以如下生成人抗体,即分离自人衍生的噬菌体展示文库选择的Fv克隆可变域序列。然后,可以将此类可变域序列与期望的人恒定域组合。下文描述了自抗体文库选择人抗体的技术。
文库衍生的抗体
可以通过对组合文库筛选具有期望的一种或多种活性的抗体来分离抗体。例如,用于生成噬菌体展示文库及对此类文库筛选拥有期望结合特征的抗体的多种方法是本领域中已知的。此类方法综述于例如Hoogenboom et al.,in Methods in MolecularBiology 178:1-37(O’Brien et al.,ed.,Human Press,Totowa,NJ,2001),并且进一步记载于例如McCafferty et al.,Nature 348:552-554;Clackson et al.,Nature 352:624-628(1991);Marks et al.,J.Mol.Biol.222:581-597(1992);Marks and Bradbury,inMethods in Molecular Biology 248:161-175(Lo,ed.,Human Press,Totowa,NJ,2003);Sidhu et al.,J.Mol.Biol.338(2):299-310(2004);Lee et al.,J.Mol.Biol.340(5):1073-1093(2004);Fellouse,Proc.Natl.Acad.Sci.USA 101(34):12467-12472(2004);及Lee et al.,J.Immunol.Methods 284(1-2):119-132(2004)。
在某些噬菌体展示方法中,将VH和VL基因的全集分别通过聚合酶链式反应(PCR)克隆,并在噬菌体文库中随机重组,然后可以对所述噬菌体文库筛选抗原结合噬菌体,如记载于Winter et al.,Ann.Rev.Immunol.12:433-455(1994)。噬菌体通常以单链Fv(scFv)片段或以Fab片段展示抗体片段。来自经免疫来源的文库提供针对免疫原的高亲和力抗体,而不需要构建杂交瘤。或者,可以(例如自人)克隆未免疫全集以在没有任何免疫的情况中提供针对一大批非自身和还有自身抗原的抗体的单一来源,如由Griffiths et al.,EMBO J,12:725-734(1993)描述的。最后,也可以通过自干细胞克隆未重排的V基因区段,并使用含有随机序列的PCR引物编码高度可变的CDR3区并在体外实现重排来合成生成未免疫文库,如由Hoogenboom and Winter,J.Mol.Biol.227:381-388(1992)所描述的。描述人抗体噬菌体文库的专利公开文本包括例如:美国专利No.5,750,373及美国专利公开文本No.2005/0079574,2005/0119455,2005/0266000,2007/0117126,2007/0160598,2007/0237764,2007/0292936和2009/0002360。
认为自人抗体文库分离的抗体或抗体片段是本文中的人抗体或人抗体片段。
多特异性抗体
在某些实施方案中,本文中描述的抗体是多特异性抗体,例如双特异性抗体。多特异性抗体是对至少两个不同位点具有结合特异性的单克隆抗体。在一些实施方案中,结合特异性之一针对PD-1轴成分(例如PD-1,PDL1,或PDL2),而另一种针对任何其它抗原。在一些实施方案中,结合特异性之一针对IL-17或IL-17R,而另一种针对任何其它抗原。在某些实施方案中,双特异性抗体可以结合PD-1轴成分(例如PD-1,PDL1,或PDL2),IL-17,或IL-17R的两个不同表位。双特异性抗体可以以全长抗体或抗体片段制备。
在一些实施方案中,结合特异性之一针对PD-1轴成分(例如PD-1,PDL1,或PDL2),而另一种针对IL-17或IL-17R。本文中提供的是用于在个体中治疗癌症或延迟癌症进展的方法,其包括对该个体施用有效量的多特异性抗体,其中该多特异性抗体包含针对PD-1轴成分(例如PD-1,PDL1,或PDL2)的第一结合特异性和针对IL-17或IL-17R的第二结合特异性。在一些实施方案中,可以通过本文和下文描述的任何技术来生成多特异性抗体。
在一些实施方案中,结合特异性之一针对IL-17A,而另一种针对IL-17F。本文中提供的是用于在个体中治疗癌症或延迟癌症进展的方法,其包括对该个体施用有效量的多特异性抗体,其中该多特异性抗体包含针对IL-17A的第一结合特异性和针对IL-17F的第二结合特异性。在一些实施方案中,结合特异性之一或二者是对IL-17A和IL-17F交叉反应性的。在一些实施方案中,可以通过本文和下文描述的任何技术来生成多特异性抗体。
用于生成多特异性抗体的技术包括但不限于具有不同特异性的两对免疫球蛋白重链-轻链对的重组共表达(参见Milstein和Cuello,Nature 305:537(1983)),WO 93/08829,和Traunecker等,EMBO J.10:3655(1991)),和“突起-入-空穴”工程化(参见例如美国专利No.5,731,168)。也可以通过用于生成抗体Fc-异二聚体分子的工程化静电操纵效应(WO 2009/089004A1);交联两个或更多个抗体或片段(参见例如美国专利No.4,676,980,及Brennan等,Science,229:81(1985));使用亮氨酸拉链来生成双特异性抗体(参见例如Kostelny等,J.Immunol.,148(5):1547-1553(1992));使用用于生成双特异性抗体片段的“双抗体”技术(参见例如Hollinger等,Proc.Natl.Acad.Sci.USA,90:6444-6448(1993));及使用单链Fv(sFv)二聚体(参见例如Gruber等,J.Immunol.,152:5368(1994));及如例如Tutt等,J.Immunol.147:60(1991)中所描述的,制备三特异性抗体来生成多特异性抗体。
本文中还包括具有三个或更多个功能性抗原结合位点的工程化改造抗体,包括“章鱼抗体”(参见例如US 2006/0025576A1)。
本文中的抗体或片段还包括包含结合PD-1轴成分(例如PD-1,PDL1,或PDL2),IL-17,或IL-17R及另一种不同抗原的抗原结合位点的“双重作用FAb”或“DAF”(参见例如US2008/0069820)。
抗体变体
在某些实施方案中,涵盖本文所述抗体的氨基酸序列变体。例如,可能希望改进抗体的结合亲和力和/或其它生物学特性。抗体的氨基酸序列变体可以是通过将适宜的修饰引入编码抗体的核苷酸序列或通过肽合成制备的。此类修饰包括例如抗体氨基酸序列内的残基删除和/或插入和/或替代。可进行任何删除,插入和替代组合以获得最终的构建物,倘若最终的构建物具有期望的特征,例如抗原结合。
替代,插入,和删除变体
在某些实施方案中,描述具有一处或多处氨基酸替代的抗体变体。替代诱变感兴趣的位点包括HVR和FR。保守替代在表1中在“保守的替代”的标题下显示。更实质的变化在表1中在“例示性替代”的标题下提供,并且如下文参照氨基酸侧链类别进一步描述的。可以将氨基酸替代引入感兴趣的抗体中,并且对产物筛选期望的活性,例如保留/改善的抗原结合,降低的免疫原性,或改善的ADCC或CDC。
表1
初始残基 例示性替代 优选的替代
Ala(A) Val;Leu;Ile Val
Arg(R) Lys;Gln;Asn Lys
Asn(N) Gln;His;Asp;Lys;Arg Gln
Asp(D) Glu;Asn Glu
Cys(C) Ser;Ala Ser
Gln(Q) Asn;Glu Asn
Glu(E) Asp;Gln Asp
Gly(G) Ala Ala
His(H) Asn;Gln;Lys;Arg Arg
Ile(I) Leu;Val;Met;Ala;Phe;正亮氨酸 Leu
Leu(L) 正亮氨酸;Ile;Val;Met;Ala;Phe Ile
Lys(K) Arg;Gln;Asn Arg
Met(M) Leu;Phe;Ile Leu
Phe(F) Trp;Leu;Val;Ile;Ala;Tyr Tyr
Pro(P) Ala Ala
Ser(S) Thr Thr
Thr(T) Val;Ser Ser
Trp(W) Tyr;Phe Tyr
Tyr(Y) Trp;Phe;Thr;Ser Phe
Val(V) Ile;Leu;Met;Phe;Ala;正亮氨酸 Leu
依照共同的侧链特性,氨基酸可以如下分组:
a.疏水性的:正亮氨酸,Met,Ala,Val,Leu,Ile;
b.中性,亲水性的:Cys,Ser,Thr,Asn,Gln;
c.酸性的:Asp,Glu;
d.碱性的:His,Lys,Arg;
e.影响链取向的残基:Gly,Pro;
f.芳香族的:Trp,Tyr,Phe。
非保守替代会需要用这些类别之一的成员替换另一个类别的。
一类替代变体牵涉替代亲本抗体(例如人源化或人抗体)的一个或多个高变区残基。一般地,为进一步研究选择的所得变体相对于亲本抗体会具有某些生物学特性的改变(例如改善)(例如升高的亲和力,降低的免疫原性)和/或会基本上保留亲本抗体的某些生物学特性。一种例示性替代变体是亲和力成熟抗体,其可以例如使用基于噬菌体展示的亲和力成熟技术诸如本文中所描述的那些技术来方便地生成。简言之,将一个或多个HVR残基突变,并将变体抗体在噬菌体上展示,并对其筛选特定的生物学活性(例如结合亲和力)。
可以在HVR中做出变化(例如替代),例如为了改善抗体亲和力。可以在HVR“热点”即由在体细胞成熟过程期间以高频率经历突变的密码子编码的残基(参见例如Chowdhury,Methods Mol.Biol.207:179-196(2008))和/或SDR(a-CDR)中做出此类变化,对所得变体VH或VL测试结合亲和力。通过次级文库的构建和再选择进行的亲和力成熟已经记载于例如Hoogenboom et al.,in Methods in Molecular Biology 178:1-37(O’Brien et al.,ed.,Human Press,Totowa,NJ,(2001))。在亲和力成熟的一些实施方案中,通过多种方法(例如易错PCR,链改组,或寡核苷酸指导的诱变)任一将多样性引入为成熟选择的可变基因。然后,创建次级文库。然后,筛选文库以鉴定具有期望亲和力的任何抗体变体。另一种引入多样性的方法牵涉HVR指导的办法,其中将数个HVR残基(例如一次4-6个残基)随机化。可以例如使用丙氨酸扫描诱变或建模来特异性鉴定牵涉抗原结合的HVR残基。特别地,经常靶向CDR-H3和CDR-L3。
在某些实施方案中,可以在一个或多个HVR内发生替代,插入,或删除,只要此类变化不实质性降低抗体结合抗原的能力。例如,可以在HVR中做出保守变化(例如保守替代,如本文中提供的),其没有实质性降低结合亲和力。此类变化可以在HVR“热点”或SDR以外。在上文提供的变体VH和VL序列的某些实施方案中,每个HVR或是未改变的,或是含有不多于1,2或3处氨基酸替代。
一种可用于鉴定抗体中可作为诱变靶位的残基或区域的方法称作“丙氨酸扫描诱变”,如记载于Cunningham and Wells,Science,244:1081-1085(1989)。在这种方法中,鉴定一个残基或一组靶残基(例如带电荷的残基,诸如arg,asp,his,lys,和glu),并用中性或带负电荷的氨基酸(例如丙氨酸或多丙氨酸)替换以测定抗体与抗原的相互作用是否受到影响。可以在对初始替代表明功能敏感性的氨基酸位置引入进一步的替代。或者/另外,利用抗原-抗体复合物的晶体结构来鉴定抗体与抗原之间的接触点。作为替代的候选,可以靶向或消除此类接触残基和邻近残基。可以筛选变体以确定它们是否含有期望特性。
氨基酸序列插入包括长度范围为1个残基至含有100或更多个残基的多肽的氨基和/或羧基末端融合,以及单个或多个氨基酸残基的序列内插入。末端插入的例子包括具有N端甲硫氨酰基残基的抗体。抗体分子的其它插入变体包括抗体的N或C端与酶(例如对于ADEPT)或延长抗体的血清半衰期的多肽的融合物。
糖基化变体
在某些实施方案中,改变本文中描述的抗体以提高或降低抗体糖基化的程度。可以通过改变氨基酸序列,使得创建或消除一个或多个糖基化位点来方便地实现对抗体添加或删除糖基化位点。
在抗体包含Fc区的情况中,可以改变附着于Fc区的碳水化合物。由哺乳动物细胞生成的天然抗体通常包含分支的,双触角寡糖,其一般通过N连接附着于Fc区的CH2域的Asn297。参见例如Wright et al.,TIBTECH 15:26-32(1997)。寡糖可以包括各种碳水化合物,例如甘露糖,N-乙酰葡糖胺(GlcNAc),半乳糖,和唾液酸,以及附着于双触角寡糖结构“主干”中的GlcNAc的岩藻糖。在一些实施方案中,可以对本发明抗体中的寡糖进行修饰以创建具有某些改良特性的抗体变体。
在一个实施方案中,提供包含如下Fc区的抗体变体,其中附着于Fc区的碳水化合物结构具有减少的岩藻糖或缺乏岩藻糖,这可改善ADCC功能。具体而言,本文中涵盖如下的抗体,其具有相对于在野生型CHO细胞中生成的相同抗体上岩藻糖的量减少的岩藻糖。就是说,它们特征在于具有比如果由天然CHO细胞(例如生成天然糖基化样式的CHO细胞,诸如含有天然FUT8基因的CHO细胞)生成的话它们会具有的量降低的量的岩藻糖。在某些实施方案中,该抗体是如下的抗体,其上少于约50%,40%,30%,20%,10%,或5%的N连接的聚糖包含岩藻糖。例如,此类抗体中的岩藻糖的量可以是1%至80%,1%至65%,5%至65%或20%至40%。在某些实施方案中,该抗体是如下的抗体,其上无一N连接的聚糖包含岩藻糖,即其中该抗体完全没有岩藻糖,或者没有岩藻糖或是无岩藻糖基化的。通过相对于附着于Asn297的所有糖结构(例如复合的,杂合的和高甘露糖的结构)的总和,计算Asn297处糖链内岩藻糖的平均量来测定岩藻糖量,如通过MALDI-TOF质谱术测量的,例如如记载于WO2008/077546的。Asn297指位于Fc区中的约第297位(Fc区残基的Eu编号方式)的天冬酰胺残基;然而,Asn297也可以由于抗体中的微小序列变异而位于第297位上游或下游约±3个氨基酸,即在第294位和第300位之间。此类岩藻糖基化变体可具有改善的ADCC功能。参见例如美国专利公开文本No.US 2003/0157108(Presta,L.);US 2004/0093621(Kyowa HakkoKogyo Co.,Ltd)。涉及“脱岩藻糖基化的”或“岩藻糖缺乏的”抗体变体的出版物的例子包括:US 2003/0157108;WO 2000/61739;WO 2001/29246;US 2003/0115614;US 2002/0164328;US 2004/0093621;US 2004/0132140;US 2004/0110704;US 2004/0110282;US2004/0109865;WO 2003/085119;WO 2003/084570;WO 2005/035586;WO 2005/035778;WO2005/053742;WO 2002/031140;Okazaki et al.,J.Mol.Biol.336:1239-1249(2004);Yamane-Ohnuki et al.,Biotech.Bioeng.87:614(2004)。能够生成脱岩藻糖基化抗体的细胞系的例子包括蛋白质岩藻糖基化缺陷的Lec13CHO细胞(Ripka et al.,Arch.Biochem.Biophys.249:533-545(1986);美国专利申请No US 2003/0157108 A1,Presta,L;及WO 2004/056312A1,Adams等,尤其在实施例11),和敲除细胞系,诸如α-1,6-岩藻糖基转移酶基因FUT8敲除CHO细胞(参见例如Yamane-Ohnuki et al.,Biotech.Bioeng.87:614(2004);Kanda,Y.et al.,Biotechnol.Bioeng.94(4):680-688(2006);及WO 2003/085107)。
进一步提供具有两分型寡糖的抗体变体,例如其中附着于抗体Fc区的双触角寡糖是通过GlcNAc来两分的。此类抗体变体可具有降低的岩藻糖基化和/或改善的ADCC功能。此类抗体变体的例子记载于例如WO 2003/011878(Jean-Mairet等);美国专利No.6,602,684(Umana等);US 2005/0123546(Umana等);及Ferrara et al.,Biotechnology andBioengineering,93(5):851-861(2006)。还提供在附着于Fc区的寡糖中具有至少一个半乳糖残基的抗体变体。此类抗体变体可具有改善的CDC功能。此类抗体变体记载于例如WO1997/30087(Patel等);WO 1998/58964(Raju,S.);及WO 1999/22764(Raju,S.)。
在某些实施方案中,包含本文所述Fc区的抗体变体能够结合FcγRIII。在某些实施方案中,包含本文所述Fc区的抗体变体在人效应细胞存在下具有ADCC活性或在人效应细胞存在下具有与包含人野生型IgG1Fc区的其它方面相同的抗体相比升高的ADCC活性。
Fc区变体
在某些实施方案中,可以将一处或多处氨基酸修饰引入本文中描述的抗体的Fc区中,由此生成Fc区变体。Fc区变体可以包含在一个或多个氨基酸位置包含氨基酸修饰(例如替代)的人Fc区序列(例如人IgG1,IgG2,IgG3或IgG4Fc区)。
在某些实施方案中,本发明涵盖拥有一些但不是所有效应器功能的抗体变体,所述效应器功能使其成为如下应用的期望候选物,其中抗体的体内半衰期是重要的,而某些效应器功能(诸如补体和ADCC)是不必要的或有害的。可以进行体外和/或体内细胞毒性测定法以确认CDC和/或ADCC活性的降低/消减。例如,可以进行Fc受体(FcR)结合测定法以确保抗体缺乏FcγR结合(因此有可能缺乏ADCC活性),但是保留FcRn结合能力。介导ADCC的主要细胞NK细胞仅表达FcγRIII,而单核细胞表达FcγRI,FcγRII和FcγRIII。在Ravetchand Kinet,Annu.Rev.Immunol.9:457-492(1991)的第464页上的表3中汇总了造血细胞上的FcR表达。评估感兴趣分子的ADCC活性的体外测定法的非限制性例子记载于美国专利No.5,500,362(参见例如Hellstrom,I.et al.,Proc.Nat’l Acad.Sci.USA 83:7059-7063(1986))及Hellstrom,I.et al.,Proc.Nat’l Acad.Sci.USA 82:1499-1502(1985);5,821,337(参见Bruggemann,M.et al.,J.Exp.Med.166:1351-1361(1987))。或者,可以采用非放射性测定方法(参见例如用于流式细胞术的ACTITM非放射性细胞毒性测定法(CellTechnology,Inc.,Mountain View,CA;和非放射性细胞毒性测定法(Promega,Madison,WI))。对于此类测定法有用的效应细胞包括外周血单个核细胞(PBMC)和天然杀伤(NK)细胞。或者/另外,可以在体内评估感兴趣分子的ADCC活性,例如在动物模型中,诸如披露于Clynes et al.,Proc.Nat’l Acad.Sci.USA 95:652-656(1998)的。也可以实施C1q结合测定法以确认抗体不能结合C1q,并且因此缺乏CDC活性。参见例如WO 2006/029879和WO 2005/100402中的C1q和C3c结合ELISA。为了评估补体激活,可以实施CDC测定法(参见例如Gazzano-Santoro et al.,J.Immunol.Methods 202:163(1996);Cragg,M.S.et al.,Blood 101:1045-1052(2003);及Cragg,M.S.and M.J.Glennie,Blood 103:2738-2743(2004))。也可以使用本领域中已知的方法来实施FcRn结合和体内清除/半衰期测定(参见例如Petkova,S.B.et al.,Int’l.Immunol.18(12):1759-1769(2006))。
具有降低的效应器功能的抗体包括那些具有Fc区残基238,265,269,270,297,327和329中的一个或多个的替代的(美国专利No.6,737,056)。此类Fc突变体包括在氨基酸位置265,269,270,297和327中的两处或更多处具有替代的Fc突变体,包括残基265和297替代成丙氨酸的所谓的“DANA”Fc突变体(美国专利No.7,332,581)。
描述了具有改善的或降低的对FcR的结合的某些抗体变体(参见例如美国专利No.6,737,056;WO 2004/056312;及Shields et al.,J.Biol.Chem.9(2):6591-6604(2001))。
在一些实施方案中,在Fc区中做出改变,其导致改变的(即改善的或降低的)C1q结合和/或补体依赖性细胞毒性(CDC),例如,如记载于美国专利No.6,194,551;WO 99/51642;及Idusogie et al.,J.Immunol.164:4178-4184(2000)的。
具有延长的半衰期和改善的对新生儿Fc受体(FcRn)的结合的抗体记载于US2005/0014934A1(Hinton等),新生儿Fc受体(FcRn)负责将母体IgG转移至胎儿(Guyer etal.,J.Immunol.117:587(1976)及Kim et al.,J.Immunol.24:249(1994))。那些抗体包含具有改善Fc区对FcRn的结合的一处或多处替代的Fc区。此类Fc变体包括那些在Fc区残基238,256,265,272,286,303,305,307,311,312,317,340,356,360,362,376,378,380,382,413,424或434中的一处或多处具有替代(例如Fc区残基434的替代)的(美国专利No.7,371,826)。
还可参见Duncan and Winter,Nature 322:738-40(1988);美国专利No.5,648,260;美国专利No.5,624,821;及WO 94/29351,其关注Fc区变体的其它例子。
经半胱氨酸工程化改造的抗体变体
在某些实施方案中,可以期望创建经半胱氨酸工程化改造的抗体,例如,“thioMAb”,其中抗体的一个或多个残基用半胱氨酸残基替代。在具体的实施方案中,替代的残基存在于抗体的可接近位点。通过用半胱氨酸替代那些残基,反应性硫醇基团由此定位于抗体的可接近位点,并且可以用于将抗体与其它模块,诸如药物模块或接头-药物模块缀合,以创建免疫缀合物,如本文中进一步描述的。在某些实施方案中,可以用半胱氨酸替代下列残基之任一个或多个:轻链的V205(Kabat编号方式);重链的A118(EU编号方式);和重链Fc区的S400(EU编号方式)。可以如例如美国专利No.7,521,541所述生成经半胱氨酸工程化改造的抗体。
抗体衍生物
在某些实施方案中,可进一步修饰本文中描述的抗体以包含本领域知道的且易于获得的额外非蛋白质性质模块。适于抗体衍生化的模块包括但不限于水溶性聚合物。水溶性聚合物的非限制性例子包括但不限于聚乙二醇(PEG),乙二醇/丙二醇共聚物,羧甲基纤维素,右旋糖苷,聚乙烯醇,聚乙烯吡咯烷酮,聚-1,3-二氧戊环,聚-1,3,6-三烷,乙烯/马来酸酐共聚物,聚氨基酸(均聚物或随机共聚物),右旋糖苷或聚(n-乙烯吡咯烷酮)聚乙二醇,丙二醇均聚物,环氧丙烷/环氧乙烷共聚物,聚氧乙烯化多元醇(例如甘油),聚乙烯醇,及其混合物。由于其在水中的稳定性,聚乙二醇丙醛在生产中可能具有优势。聚合物可以是任何分子量,而且可以是分支的或不分支的。附着于抗体的聚合物数目可以变化,而且如果附着了超过一个聚合物,那么它们可以是相同或不同的分子。一般而言,可根据下列考虑来确定用于衍生化的聚合物的数目和/或类型,包括但不限于待改进抗体的具体特性或功能,抗体衍生物是否将用于指定条件下的治疗等。
在另一个实施方案中,提供了抗体和可以通过暴露于辐射选择性加热的非蛋白质性质模块的缀合物。在一个实施方案中,非蛋白质性质模块是碳纳米管(Kam等,Proc.Natl.Acad.Sci.USA 102:11600-11605(2005))。辐射可以是任何波长的,并且包括但不限于对普通细胞没有损害,但是将非蛋白质性质模块加热至抗体-非蛋白质性质模块附近的细胞被杀死的温度的波长。
重组方法和组合物
可以使用重组方法和组合物来生成抗体,例如,如记载于美国专利No.4,816,567的。分离的编码抗体的核酸可以编码包含抗体VL的氨基酸序列和/或包含VH的氨基酸序列(例如,抗体的轻和/或重链)。可以使用包含此类核酸的一种或多种载体(例如,表达载体)。提供了包含此类核酸的宿主细胞。在一个此类实施方案中,宿主细胞包含(例如,已经用下列载体转化):(1)包含核酸的载体,所述核酸编码包含抗体的VL的氨基酸序列和包含抗体的VH的氨基酸序列,或(2)第一载体和第二载体,所述第一载体包含编码包含抗体的VL的氨基酸序列的核酸,所述第二载体包含编码包含抗体的VH的氨基酸序列的核酸。在一个实施方案中,宿主细胞是真核的,例如中国仓鼠卵巢(CHO)细胞或淋巴样细胞(例如,Y0,NS0,Sp20细胞)。生成抗体的方法可以包括在适合于表达抗体的条件下培养包含编码抗体的核酸的宿主细胞,如上文提供的,并且任选地,自宿主细胞(或宿主细胞培养液)回收抗体。
对于抗体的重组生成,将编码抗体的核酸(例如如上文所描述的)分离,并插入一种或多种载体中,以在宿主细胞中进一步克隆和/或表达。可以使用常规规程将此类核酸容易地分离并测序(例如,通过使用寡核苷酸探针来进行,所述寡核苷酸探针能够特异性结合编码抗体的重和轻链的基因)。
适合于克隆或表达抗体编码载体的宿主细胞包括本文中所描述的原核或真核细胞。例如,可以在细菌中生成抗体,特别是在不需要糖基化和Fc效应器功能时。对于抗体片段和多肽在细菌中的表达,参见例如美国专利No.5,648,237,5,789,199和5,840,523(还可参见Charlton,Methods in Molecular Biology,第248卷(B.K.C.Lo编,Humana Press,Totowa,NJ,2003),第245-254页,其描述了抗体片段在大肠杆菌(E.coli.)中的表达)。表达后,可以将抗体在可溶性级分中自细菌细胞团糊分离,并可以进一步纯化。
在原核生物外,真核微生物诸如丝状真菌或酵母是适合于抗体编码载体的克隆或表达宿主,包括其糖基化途径已经“人源化”,导致生成具有部分或完全人的糖基化样式的抗体的真菌和酵母菌株。参见Gerngross,Nat.Biotech.22:1409-1414(2004),及Li等,Nat.Biotech.24:210-215(2006)。
适合于表达糖基化抗体的宿主细胞也自多细胞生物体(无脊椎动物和脊椎动物)衍生。无脊椎动物细胞的例子包括植物和昆虫细胞。已经鉴定出许多杆状病毒株,其可以与昆虫细胞一起使用,特别是用于转染草地夜蛾(Spodoptera frugiperda)细胞。
也可以利用植物细胞培养物作为宿主。参见例如美国专利No.5,959,177,6,040,498,6,420,548,7,125,978和6,417,429(其描述了用于在转基因植物中生成抗体的PLANTIBODIESTM技术)。
也可以使用脊椎动物细胞作为宿主。例如,适合于在悬浮液中生长的哺乳动物细胞系可以是有用的。有用的哺乳动物宿主细胞系的其它例子是经SV40转化的猴肾CV1系(COS-7);人胚肾系(293或293细胞,如记载于例如Graham等,J.Gen Virol.36:59(1977)的);幼年仓鼠肾细胞(BHK);小鼠塞托利(sertoli)细胞(TM4细胞,如记载于例如Mather,Biol.Reprod.23:243-251(1980)的);猴肾细胞(CV1);非洲绿猴肾细胞(VERO-76);人宫颈癌细胞(HELA);犬肾细胞(MDCK;牛鼠(buffalo rat)肝细胞(BRL 3A);人肺细胞(W138);人肝细胞(Hep G2);小鼠乳房肿瘤(MMT 060562);TRI细胞,如记载于例如Mather等,AnnalsN.Y.Acad.Sci.383:44-68(1982)的;MRC 5细胞;和FS4细胞。其它有用的哺乳动物宿主细胞系包括中国仓鼠卵巢(CHO)细胞,包括DHFR-CHO细胞(Urlaub等,Proc.Natl.Acad.Sci.USA77:4216(1980));和骨髓瘤细胞系诸如Y0,NS0和Sp2/0。关于适合于抗体生成的某些哺乳动物宿主细胞系的综述,参见例如Yazaki和Wu,Methods in Molecular Biology,第248卷(B.K.C.Lo编,Humana Press,Totowa,NJ),第255-268页(2003)。
测定法
可以通过本领域中已知的多种测定法对本文中描述的抗体鉴定,筛选,或表征其物理/化学特性和/或生物学活性。
一方面,可以对抗体测试其抗原结合活性,例如通过已知的方法诸如ELISA,Western印迹,等来进行。
另一方面,可使用竞争测定法来鉴定与特异性结合表位(例如自PD-1轴成分诸如PD-1,PDL1,或PDL2;IL-17;或IL-17R衍生的表位)的抗体竞争的抗体。在某些实施方案中,此类竞争性抗体结合与特异性结合表位(例如自PD-1轴成分诸如PD-1,PDL1,或PDL2;IL-17;或IL-17R衍生的表位)抗体所结合表位相同的表位(例如线性或构象表位)。用于定位抗体所结合表位的详细例示性方法参见Morris(1996)“Epitope Mapping Protocols”,Methods in Molecular Biology vol.66(Humana Press,Totowa,NJ)。
在一种例示性竞争测定法中,在包含第一经标记抗体(其特异性结合表位(例如自PD-1轴成分诸如PD-1,PDL1,或PDL2;IL-17;或IL-17R衍生的表位))和第二未标记抗体(其要测试与第一抗体竞争对表位的结合的能力)的溶液中温育固定化的特异性结合表位(例如自PD-1轴成分诸如PD-1,PDL1,或PDL2;IL-17;或IL-17R衍生的表位)的抗体或在其细胞表面上表达特异性结合表位(例如自PD-1轴成分诸如PD-1,PDL1,或PDL2;IL-17;或IL-17R衍生的表位)的抗体的细胞。第二抗体可存在于杂交瘤上清液中。作为对照,在包含第一经标记抗体但不包含第二未标记抗体的溶液中温育固定化的特异性结合表位(例如自PD-1轴成分诸如PD-1,PDL1,或PDL2;IL-17;或IL-17R衍生的表位)的抗体或表达特异性结合表位(例如自PD-1轴成分诸如PD-1,PDL1,或PDL2;IL-17;或IL-17R衍生的表位)的抗体的细胞。在允许第一抗体结合表位的条件下温育后,除去过量的未结合抗体,并测量与固定化的特异性结合表位的抗体或表达特异性结合表位的抗体的细胞联合的标记物的量。如果测试样品中与固定化的特异性结合表位的抗体或表达特异性结合表位的抗体的细胞联合的标记物的量与对照样品相比实质性降低,那么这指示第二抗体与第一抗体竞争对表位的结合。参见Harlow和Lane(1988)Antibodies:A Laboratory Manual ch.14(Cold Spring HarborLaboratory,Cold Spring Harbor,NY)。
活性测定法
可以对如上文所述生成的抗体进行一项或多项活性测定法以选择从治疗前景看具有有益特性的抗体或选择保留抗体的生物学活性的配制剂和条件。可以对抗体测试其结合抗原的能力(该抗体就是针对该抗原生成的)(例如如上文描述的)。例如,可以使用本领域已知的方法(诸如ELISA,WesternBlot,等)。
例如,可以在检测抗体特异性结合含有抗体表位的分子的能力的测定法中评估抗体的抗原结合特性。在一些实施方案中,例如,可以通过饱和结合;ELISA;和/或竞争测定法(例如RIA)来测定抗体的结合。还有,可以对抗体进行其它生物学活性测定法,例如为了评估其作为治疗剂的有效性。此类测定法是本领域已知的,而且依赖于靶抗原和抗体的预定用途。例如,可以在PD-1和/或IL-17信号传导的动物模型,细胞培养物模型,或体外模型中评估通过抗体阻断PD-1轴或阻断IL-17的生物学影响(关于PD-1,参见例如如美国专利8,217,149中描述的)。
为了筛选结合感兴趣抗原上特定表位的抗体,可以实施常规交叉阻断测定法,诸如Antibodies,A Laboratory Manual,Cold Spring Harbor Laboratory,Ed Harlow andDavid Lane(1988)中描述的。或者,可以实施表位作图来测定抗体是否结合感兴趣表位,例如如Champe et al.,J.Biol.Chem.270:1388-1394(1995)中描述的。
VI.方法
在一个方面,本文中提供的是用于在个体中治疗癌症或延迟癌症进展的方法,其包括对个体施用有效量的PD-1轴结合拮抗剂和IL-17结合拮抗剂。在另一个方面,本文中提供的是用于在具有癌症的个体中增强免疫功能的方法,其包括施用有效量的PD-1轴结合拮抗剂和IL-17结合拮抗剂的的组合。本公开文本的方法可以在治疗期望增强的免疫原性(诸如提高肿瘤免疫原性以治疗癌症或T细胞功能障碍性病症)的状况中得到应用。通过这些方法,可以治疗多种癌症,或者可以延迟其进展。
在一些实施方案中,要通过本公开文本的方法治疗的癌症包括但不限于结直肠癌,肾细胞癌(例如肾细胞癌瘤),黑素瘤,膀胱癌,卵巢癌,乳腺癌(例如三重阴性乳腺癌,HER2阳性乳腺癌,或激素受体阳性癌),或非小细胞肺癌(例如鳞状非小细胞肺癌或非鳞状非小细胞肺癌)。在一些实施方案中,要通过本公开文本的方法治疗的癌症包括但不限于癌,淋巴瘤,母细胞瘤,肉瘤,和白血病。在一些实施方案中,要通过本公开文本的方法治疗的癌症包括但不限于鳞状细胞癌,肺癌(包括小细胞肺癌,非小细胞肺癌,肺的腺癌,和肺的鳞癌),黑素瘤,肾细胞癌,腹膜癌,肝细胞癌,胃的癌或胃癌(包括胃肠癌),胰腺癌,成胶质细胞瘤,宫颈癌,卵巢癌,肝癌,膀胱癌,肝瘤,乳腺癌,结肠癌,结肠直肠癌,子宫内膜癌或子宫癌,唾液腺癌,肾癌或肾的癌,肝癌,前列腺癌,外阴癌,甲状腺癌,肝的癌及各种类型的头和颈癌,以及B细胞淋巴瘤(包括低级/滤泡性非何杰金氏淋巴瘤(NHL),小淋巴细胞性(SL)NHL,中级/滤泡性NHL,中级弥漫性NHL,高级成免疫细胞性NHL,高级成淋巴细胞性NHL,高级小无核裂细胞性NHL,贮积病(bulkydisease)NHL,套细胞淋巴瘤,AIDS相关淋巴瘤,和瓦尔登斯特伦氏(Waldenstrom)巨球蛋白血症),慢性淋巴细胞性白血病(CLL),急性成淋巴细胞性白血病(ALL),毛细胞性白血病,慢性成髓细胞性白血病,和移植后淋巴增殖性病症(PTLD),以及与瘢痣病(phakomatoses),水肿(诸如与脑瘤有关的)和梅格斯氏(Meigs)综合征有关的异常血管增殖。在一些实施方案中,该癌症可以是早期癌症或晚期癌症。在一些实施方案中,该癌症可以是原发性肿瘤。在一些实施方案中,该癌症可以是第二部位处自任何上述类型癌症衍生的转移性肿瘤。
在一些实施方案中,该个体具有癌症或有风险发生癌症。在一些实施方案中,该治疗在该治疗停止后在该个体中导致持久响应。在一些实施方案中,该个体具有可以处于早期或晚期的癌症。在一些实施方案中,该个体是是人。在一些实施方案中,该个体是哺乳动物,诸如驯养动物(例如牛,绵羊,猫,犬,和马),灵长类(例如人和非人灵长类诸如猴),家兔,和啮齿类(例如小鼠和大鼠)。
在一些实施方案中,本发明的组合疗法包括施用PD-1轴结合拮抗剂和IL-17结合拮抗剂。可以以本领域中已知的任何合适的方式施用PD-1轴结合拮抗剂和IL-17结合拮抗剂。例如,可以序贯(在不同时间)或并行(在相同时间)施用PD-1轴结合拮抗剂和IL-17结合拮抗剂。
在一些实施方案中,连续施用PD-1轴结合拮抗剂或IL-17结合拮抗剂。在一些实施方案中,间歇施用PD-1轴结合拮抗剂或IL-17结合拮抗剂。在一些实施方案中,在施用PD-1轴结合拮抗剂之前施用IL-17结合拮抗剂。在一些实施方案中,与施用PD-1轴结合拮抗剂同时施用IL-17结合拮抗剂(例如在同一组合物中配制)。在一些实施方案中,在施用PD-1轴结合拮抗剂之后施用IL-17结合拮抗剂。在一些实施方案中,与PD-1轴结合拮抗剂同一天施用IL-17结合拮抗剂。在一些实施方案中,在施用PD-1轴结合拮抗剂2天内,3天内,4天内,5天内,6天内,1周内,2周内,3周内,或1个月内施用IL-17结合拮抗剂。
在一些实施方案中,提供了用于在个体中治疗癌症或延迟癌症进展的方法,其包括对个体施用有效量的PD-1轴结合拮抗剂和IL-17结合拮抗剂,进一步包括施用别的疗法。别的疗法可以是放射疗法,手术(例如乳房肿瘤切除术和乳房切除术),化学疗法,基因疗法,DNA疗法,病毒疗法,RNA疗法,免疫疗法,骨髓移植,纳米疗法(nanotherapy),单克隆抗体疗法,或前述疗法的组合。别的疗法可以为辅助或新辅助疗法形式。在一些实施方案中,别的疗法是施用小分子酶促抑制剂或抗转移剂。在一些实施方案中,别的疗法是施用副作用限制剂(例如意图减轻治疗副作用的发生和/或严重性的药剂,诸如抗恶心剂等)。在一些实施方案中,别的疗法是放射疗法。在一些实施方案中,别的疗法是手术。在一些实施方案中,别的疗法是放射疗法和手术的组合。在一些实施方案中,别的疗法是γ照射。在一些实施方案中,别的疗法是靶向PI3K/AKT/mTOR途径的疗法,HSP90抑制剂,微管蛋白抑制剂,凋亡抑制剂,和/或化学预防剂。别的疗法可以是上文描述的一种或多种化疗剂。
可以通过相同施用路径或者通过不同施用路径施用PD-1轴结合拮抗剂和IL-17结合拮抗剂。在一些实施方案中,静脉内,肌肉内,皮下,表面,口服,经皮,腹膜内,眶内,通过植入,通过吸入,鞘内,室内,或鼻内施用PD-1轴结合拮抗剂。在一些实施方案中,静脉内,肌肉内,皮下,表面,口服,经皮,腹膜内,眶内,通过植入,通过吸入,鞘内,室内,或鼻内施用IL-17结合拮抗剂。可以施用有效量的PD-1轴结合拮抗剂和IL-17结合拮抗剂以预防或治疗疾病。PD-1轴结合拮抗剂和/或IL-17结合拮抗剂的合适剂量可以基于要治疗的疾病的类型,PD-1轴结合拮抗剂和IL-17结合拮抗剂的类型,疾病的严重性和过程,个体的临床状况,个体的临床史和对治疗的响应,和主治内科医生的判断确定。
在一些实施方案中,该治疗包括对该个体施用有效量的PD-1轴结合拮抗剂和IL-17结合拮抗剂(任选进一步包括施用上文所述别的疗法)在该治疗停止后在该个体中导致持久响应。
在一些实施方案中,首先依照当前用于要治疗的癌症的护理标准治疗个体,然后施用有效量的PD-1轴结合拮抗剂和IL-17结合拮抗剂(任选进一步包括施用别的疗法,如上文描述的)。用于本文所述任何癌症的护理标准是临床肿瘤学普通技术人员知道的。本文所述方法可以在治疗对当前护理标准不响应的患者中得到应用。
在一些实施方案中,自该个体的癌症获得的活检样品显示IL-17的表达。在一些实施方案中,自该个体的癌症获得的活检样品显示IL-17基因签名(例如,认为或预测其表达与IL-17信号传导在功能上相关或有关的一组基因或蛋白质,诸如一种或多种选自IL-17A,IL-17F,IL-8,CSF3,CXCL1,CXCL3,和CCL20的基因)的表达。在一些实施方案中,自该个体的癌症获得的活检样品显示IL-17基因签名(例如,认为或预测其表达与IL-17信号传导在功能上相关或有关的一组基因或蛋白质,诸如一种或多种选自CD4,CD8a,IL17A,IL17B,IL17C,IL17D,IL17F,IL17RA,IL17RC,C3,CCL2,CCL20,CSF2,CSF3,CXCL1,CXCL2,CXCL3,CXCL5,CXCL10,CXCR1,CXCR2,ICAM1,IL6,IL8,MMP1,MMP2,MMP3,MMP8,MMP9,MMP13,MMP14,MMP25,NCF4,NFKBIZ,S100A8,S100A9,SAA2,SAA1,SAA3,SAA4,TIMP1,TIMP2,TIMP3,和TIMP4的基因)的表达。在某些实施方案中,该IL-17基因签名包含一种或多种选自NFKBIZ,S100A8,和S100A9的基因,或其任意组合。在一些实施方案中,自该个体的癌症获得的活检样品显示至少1,至少2,至少3,至少4,至少5,至少6,至少7,至少8,至少9,至少10,至少11,至少12,至少13,至少14,至少15,至少16,至少17,至少18,至少19,至少20,至少21,至少22,至少23,至少24,至少25,至少26,至少27,至少28,至少29,至少30,至少31,至少32,至少33,至少34,至少35,至少36,至少37,至少38,至少39,至少40,至少41,至少42,至少43,或至少44种选自CD4,CD8a,IL17A,IL17B,IL17C,IL17D,IL17F,IL17RA,IL17RC,C3,CCL2,CCL20,CSF2,CSF3,CXCL1,CXCL2,CXCL3,CXCL5,CXCL10,CXCR1,CXCR2,ICAM1,IL6,IL8,MMP1,MMP2,MMP3,MMP8,MMP9,MMP13,MMP14,MMP25,NCF4,NFKBIZ,S100A8,S100A9,SAA2,SAA1,SAA3,SAA4,TIMP1,TIMP2,TIMP3,和TIMP4的基因的表达。在某些实施方案中,该IL-17基因签名包含一种或多种选自NFKBIZ,S100A8,和S100A9的基因,或其任意组合。例如,可以经由活检样品对个体测试癌症中IL-17和/或IL-17基因签名的表达。如果在该活检样品中检测到IL-17和/或IL-17基因签名的表达,那么可以通过本文所述任何方法治疗该个体。
本文中描述了用于测定样品中IL-17和/或IL-17基因签名的表达的例示性方法。例如,当该活检样品中IL-17或IL-17基因签名的量是通过特定测定法可检测时,或当该活检样品中IL-17或IL-17基因签名的量检测为在阈量以上时,活检样品可以显示IL-17或IL-17基因签名的表达。例如,阈量可以包括但不限于:如通过q-PCR测量的,对一种或多种基因检测的小于30的原始阈循环(Ct);如通过RNA-Seq测定的基因表达的原始量(例如阈RPKM值);和相对于一种或多种持家基因的表达的阈量(例如如下文实施例中描述的)。
来自癌症的活检样品,诸如肿瘤活检样品可以含有多种细胞类型。例如,活检样品可以含有肿瘤细胞,各种类型的免疫细胞和其它血细胞,肿瘤基质,等等。IL-17可以在一种或多种这些细胞类型中表达。因为IL-17是一种分泌型细胞因子,所以一旦自与肿瘤有关的细胞释放,IL-17就能够与表达IL-17受体的多种不同细胞类型相互作用。在一些实施方案中,IL-17由活检样品中的T细胞表达。在一些实施方案中,IL-17由活检样品中的嗜中性粒细胞表达。在一些实施方案中,IL-17由活检样品中的巨噬细胞表达。关于可表达IL-17的细胞类型及IL-17在肿瘤中的作用的进一步讨论可以见例如Fontao,L.,etal.Br.J.Dermatol.166:687-9(2012)和Chung,A.S.,et al.Nat.Med.19(9):1114-23(2013)。在一些实施方案中,活检样品可以是肿瘤样品的福尔马林固定,石蜡包埋(FFPE)切片。
在一些实施方案中,IL-17基因表达签名中的一种或多种基因由表达IL-17的细胞表达。在一些实施方案中,IL-17基因表达签名中的一种或多种基因由表达IL-17受体的细胞(例如其中IL-17信号传导通过IL-17和IL-17受体之间的相互作用而激活的细胞)表达。在一些实施方案中,IL-17基因表达签名含有至少两种基因,其中该IL-17基因表达签名中的一种或多种基因在表达IL-17的细胞中表达,且该IL-17基因表达签名中的一种或多种基因在表达IL-17受体的细胞中表达。
在一些实施方案中,IL-17的表达可以指编码IL-17的mRNA的表达。可以使用本领域已知的多种方法来测量活检样品中的IL-17mRNA,诸如但不限于定量PCR(例如qRT-PCR或Taqman qPCR),原位杂交,Northern印迹,半定量PCR,RNA微阵列,高通量RNA测序(例如RNA-Seq),NanoString测定法(参见例如Geiss,G.K.,et al.Nat.Biotechnol.26(3):317-25(2008)),等等。IL-17mRNA的水平可以以绝对量测量,或者针对一种或多种对照基因,诸如持家基因,rRNA,等的表达水平或自该活检样品分离的mRNA的总量标准化。
在一些实施方案中,IL-17的表达可以指IL-17蛋白质表达。可以使用本领域已知的多种方法来测量活检样品中的IL-17蛋白质,诸如但不限于Western印迹,质谱术,肽微阵列,免疫沉淀,免疫组织化学染色,等等。IL-17蛋白质的水平可以以绝对量测量,或者针对一种或多种多种蛋白质,诸如持家蛋白,核糖体蛋白质,等的表达水平或自该活检样品分离的蛋白质的总量标准化。
在一些实施方案中,该自癌症获得的活检样品显示与参照样品相比升高的IL-17的表达。如本文中使用的,“参照样品”,“参照细胞”,“参照组织”,“对照样品”,“对照细胞”,或“对照组织”指用于比较目的的样品,细胞,组织,标准,或水平。可以使用本领域知道的任何合适的参照样品。例如,参照样品可以指自没有癌症的个体取得的与该活检样品相同组织类型的样品。在其它实施方案中,参照样品可以指自已知或预测响应本文所述PD-1轴结合拮抗剂治疗的个体取得的与该活检样品相同肿瘤类型的样品。在另一个实施方案中,参照样品,参照细胞,参照组织,对照样品,对照细胞,或对照组织是自同一受试者或个体的健康和/或无疾病身体部位(例如组织或细胞)获得的。例如,临近于患病细胞或组织的健康和/或无疾病细胞或组织(例如临近肿瘤的细胞或组织)。在一些实施方案中,升高的基因或基因签名的表达可以指表达的绝对量。在一些实施方案中,升高的基因或基因签名的表达可以指平均值,均值,或中值表达水平(例如多种不同基因间的平均值/均值/中值表达水平,或多份不同样品间一种或多种基因的平均值/均值/中值表达水平)。
在一些实施方案中,自该个体的癌症获得的活检样品显示IL-17基因签名(例如一种或多种选自IL-17A,IL-17F,IL-8,CSF3,CXCL1,CXCL3,CCL20的基因或其任意组合)的表达。在一些实施方案中,自该个体的癌症获得的活检样品显示IL-17基因签名(例如一种或多种选自CD4,CD8a,IL17A,IL17B,IL17C,IL17D,IL17F,IL17RA,IL17RC,C3,CCL2,CCL20,CSF2,CSF3,CXCL1,CXCL2,CXCL3,CXCL5,CXCL10,CXCR1,CXCR2,ICAM1,IL6,IL8,MMP1,MMP2,MMP3,MMP8,MMP9,MMP13,MMP14,MMP25,NCF4,NFKBIZ,S100A8,S100A9,SAA2,SAA1,SAA3,SAA4,TIMP1,TIMP2,TIMP3,和TIMP4的基因,或其任意组合)的表达。在一些实施方案中,自该个体的癌症获得的活检样品显示至少1,至少2,至少3,至少4,至少5,至少6,至少7,至少8,至少9,至少10,至少11,至少12,至少13,至少14,至少15,至少16,至少17,至少18,至少19,至少20,至少21,至少22,至少23,至少24,至少25,至少26,至少27,至少28,至少29,至少30,至少31,至少32,至少33,至少34,至少35,至少36,至少37,至少38,至少39,至少40,至少41,至少42,至少43,或至少44种选自CD4,CD8a,IL17A,IL17B,IL17C,IL17D,IL17F,IL17RA,IL17RC,C3,CCL2,CCL20,CSF2,CSF3,CXCL1,CXCL2,CXCL3,CXCL5,CXCL10,CXCR1,CXCR2,ICAM1,IL6,IL8,MMP1,MMP2,MMP3,MMP8,MMP9,MMP13,MMP14,MMP25,NCF4,NFKBIZ,S100A8,S100A9,SAA2,SAA1,SAA3,SAA4,TIMP1,TIMP2,TIMP3,和TIMP4的基因的表达。在一些实施方案中,不是检测IL-17mRNA或蛋白质的表达,而是可以检测反映或关联IL-17信号传导的基因签名的表达。IL-17基因签名可以指认为或预测其表达与IL-17信号传导在功能上相关或有关的一组基因(或蛋白质)。例如,IL-17基因签名可以包括其表达可以受到IL-17信号传导(正或负)调节的一种或多种基因,或者它可以包括其表达可以与IL-17信号传导关联的一种或多种基因。此类基因签名可以包括IL-17(例如IL-17A和/或IL-17F)以及IL-17调节的或相关的基因(例如T细胞标志物CD4,CD8a;IL17受体IL17RA,IL17RC;和IL17可诱导基因C3,CCL2,CCL20,CSF2,CSF3,CXCL1,CXCL2,CXCL3,CXCL5,CXCL10,CXCR1,CXCR2,ICAM1,IL6,IL8,MMP1,MMP2,MMP3,MMP8,MMP9,MMP13,MMP14,MMP25,NCF4,NFKBIZ,S100A8,S100A9,SAA2,SAA1,SAA3,SAA4,TIMP1,TIMP2,TIMP3,和TIMP4;或其任意组合)的表达。在某些实施方案中,该IL-17基因签名包含一种或多种选自NFKBIZ,S100A8,和S100A9的基因,或其任意组合。在一些实施方案中,IL-17基因签名的表达可以指mRNA表达,如上文描述的。在一些实施方案中,IL-17基因签名的表达可以指蛋白质表达,如上文描述的。
在一些实施方案中,该自癌症获得的活检样品显示升高的IL-17基因签名(例如一种或多种选自IL-17A,IL-17F,IL-8,CSF3,CXCL1,CXCL3,CCL20的基因,或其任意组合)的表达。在一些实施方案中,该自癌症获得的活检样品显示升高的IL-17基因签名(例如一种或多种选自CD4,CD8a,IL17A,IL17B,IL17C,IL17D,IL17F,IL17RA,IL17RC,C3,CCL2,CCL20,CSF2,CSF3,CXCL1,CXCL2,CXCL3,CXCL5,CXCL10,CXCR1,CXCR2,ICAM1,IL6,IL8,MMP1,MMP2,MMP3,MMP8,MMP9,MMP13,MMP14,MMP25,NCF4,NFKBIZ,S100A8,S100A9,SAA2,SAA1,SAA3,SAA4,TIMP1,TIMP2,TIMP3,和TIMP4的基因,或其任意组合)的表达。在一些实施方案中,该自癌症获得的活检样品显示升高的至少1,至少2,至少3,至少4,至少5,至少6,至少7,至少8,至少9,至少10,至少11,至少12,至少13,至少14,至少15,至少16,至少17,至少18,至少19,至少20,至少21,至少22,至少23,至少24,至少25,至少26,至少27,至少28,至少29,至少30,至少31,至少32,至少33,至少34,至少35,至少36,至少37,至少38,至少39,至少40,至少41,至少42,至少43,或至少44种选自CD4,CD8a,IL17A,IL17B,IL17C,IL17D,IL17F,IL17RA,IL17RC,C3,CCL2,CCL20,CSF2,CSF3,CXCL1,CXCL2,CXCL3,CXCL5,CXCL10,CXCR1,CXCR2,ICAM1,IL6,IL8,MMP1,MMP2,MMP3,MMP8,MMP9,MMP13,MMP14,MMP25,NCF4,NFKBIZ,S100A8,S100A9,SAA2,SAA1,SAA3,SAA4,TIMP1,TIMP2,TIMP3,和TIMP4的基因的表达。在某些实施方案中,该IL-17基因签名包含一种或多种选自NFKBIZ,S100A8,和S100A9的基因,或其任意组合。检测IL-17基因签名可以涉及测量两种或更多种个别基因的表达(例如通过mRNA或蛋白质水平)及作为整体为该签名派生平均表达水平。此平均表达水平可以任选与上文所述参照样品比较。例如,可以比较一种或多种持家基因的表达或参照样品中mRNA/蛋白质的总量与该活检样品中测量的IL-17基因签名的表达。
可以在本领域已知的各种模型(诸如临床或临床前模型)中测试本文所述任何方法(例如包括施用有效量的PD-1轴结合拮抗剂和IL-17结合拮抗剂的组合的组合治疗)的功效。合适的临床前模型可包括但不限于ID8卵巢癌,GEM模型,B16黑素瘤,RENCA肾细胞癌,和Cloudman黑素瘤癌症模型。
可以在ID8卵巢癌模型中测试本文所述任何方法(例如包括施用有效量的PD-1轴结合拮抗剂和IL-17结合拮抗剂的组合的组合治疗)的功效。例如,将ID8细胞注射入小鼠以形成肿瘤。将小鼠随机募集入接受组合抗PDL1和抗IL-17处理或对照处理的处理组。在处理过程期间测量肿瘤尺寸(例如肿瘤体积),并且还监测总体存活率。关于ID8模型的进一步描述,参见例如Janat-Amsbury,M.M.,et al.Anticancer Res.26:3223-8(2006)。
可以在形成肿瘤的GEM模型(包括但不限于非小细胞肺癌,胰腺导管腺癌,或黑素瘤的GEM模型)中测试本文所述任何方法(例如包括施用有效量的PD-1轴结合拮抗剂和IL-17结合拮抗剂的组合的组合治疗)的功效。例如,可以使用如Jackson,E.L.,et al.(2001)Genes Dev.15(24):3243-8(描述KrasG12D)和Lee,C.L.,et al.(2012)Dis.Model Mech.5(3):397-402(FRT介导的p53缺无等位基因)中描述的,在腺病毒重组酶处理后之后在p53缺无背景中表达KrasG12D的小鼠作为非小细胞肺癌的临床前模型。又例如,可以使用如Jackson,E.L.,etal.(2001)Genes Dev.15(24):3243-8(描述KrasG12D)和Aguirre,A.J.,et al.(2003)Genes Dev.17(24):3112-26(p16/p19缺无等位基因)中描述的,在p16/p19缺无背景中表达KrasG12D的小鼠作为胰腺导管腺癌(PDAC)的临床前模型。再例如,可以使用如Dankort,D.,et al.(2007)Genes Dev.21(4):379-84(描述BrafV600E)和Trotman,L.C.,et al.(2003)PLoS Biol.1(3):E59(PTEN缺无等位基因)中描述的,具有在诱导型(例如4-OHT处理)重组酶处理之后在黑素细胞特异性PTEN缺无背景中表达BrafV600E的黑素细胞的小鼠作为黑素瘤的临床前模型。对于任何这些例示性模型,在形成肿瘤之后,将小鼠随机募集入接受组合抗PDL1和抗IL-17处理或对照处理的处理组。在处理过程期间测量肿瘤尺寸(例如肿瘤体积),并且还监测总体存活率。
可以在黑素瘤的小鼠模型,诸如Overwijk,W.W.and Restifo,N.P.(2001)Curr.Protoc.Immunol.Chapter 20:Unit 20.1中描述的基于B16细胞的皮下黑素瘤模型中测试本文所述任何方法(例如包括施用有效量的PD-1轴结合拮抗剂和IL-17结合拮抗剂的组合的组合治疗)的功效。在形成肿瘤之后,将小鼠随机募集入接受组合抗PDL1和抗IL-17处理或对照处理的处理组。在处理过程期间测量肿瘤尺寸(例如肿瘤体积),并且还监测总体存活率。
可以在肾癌症的小鼠模型,诸如Wiltrout,R.H.,et al.,pp.13-19inImmunotherapy of Renal Cell Carcinoma,Debruyne,F.M.J.,et al.,eds.,SpringerBerlin Heidelberg(1991)中描述的基于RENCA细胞的模型中测试本文所述任何方法(例如包括施用有效量的PD-1轴结合拮抗剂和IL-17结合拮抗剂的组合的组合治疗)的功效。在形成肿瘤之后,将小鼠随机募集入接受组合抗PDL1和抗IL-17处理或对照处理的处理组。在处理过程期间测量肿瘤尺寸(例如肿瘤体积),并且还监测总体存活率。
可以在黑素瘤的小鼠模型,诸如Nordlund,J.J.and Gershon,R.K.(1975).J.Immunol.114(5):1486-90中描述的基于Cloudman细胞的模型中测试本文所述任何方法(例如包括施用有效量的PD-1轴结合拮抗剂和IL-17结合拮抗剂的组合的组合治疗)的功效。在形成肿瘤之后,将小鼠随机募集入接受组合抗PDL1和抗IL-17处理或对照处理的处理组。在处理过程期间测量肿瘤尺寸(例如肿瘤体积),并且还监测总体存活率。
可以在IL-17信号传导受损或消除的小鼠模型中测试IL-17在肿瘤进展中的作用,例如测试IL-17信号传导对针对基于PD-1轴结合拮抗剂的疗法(例如抗PDL1抗体的治疗)的响应性的贡献。例如,可以使用缺乏一种或多种IL-17受体基因的敲除小鼠来为针对抗PDL1治疗的响应性建模,与具有正常IL-17功能的小鼠比较。在诱导形成肿瘤(例如通过注射肿瘤细胞系,如上文描述的)之后,IL-17受体敲除和野生型对照小鼠接受抗PDL1或对照处理。在处理过程期间对所有四种条件测量肿瘤尺寸(例如肿瘤体积),并且还监测总体存活率。
在另一个方面,本文中提供的是用于在具有癌症的个体中增强免疫功能的方法,其包括施用有效量的PD-1轴结合拮抗剂和IL-17结合拮抗剂的组合。
在本公开文本的方法的一些实施方案中,癌症具有升高水平的T细胞浸润。如本文中使用的,癌症的T细胞浸润可以指癌症组织内或其它相关部位存在T细胞,诸如肿瘤浸润性淋巴细胞(TIL)。本领域已知,T细胞浸润可能与某些癌症中改善的临床结局有关(参见例如Zhang et al.,N.Engl.J.Med.348(3):203-213(2003))。
然而,T细胞耗尽也是癌症的一项主要免疫学特征,其中许多肿瘤浸润性淋巴细胞(TIL)表达高水平的抑制性共受体且缺乏生成效应器细胞因子的能力(Wherry,E.J.Nature immunology 12:492-499(2011);Rabinovich,G.A.,etal.,Annual review of immunology25:267-296(2007))。在本公开文本的方法的一些实施方案中,个体具有T细胞功能障碍性病症。在本公开文本的方法的一些实施方案中,T细胞功能障碍性病症特征在于T细胞无反应性或分泌细胞因子,增殖或执行溶胞活性的能力降低。在本公开文本的方法的一些实施方案中,T细胞功能障碍性病症特征在于T细胞耗尽。在本公开文本的方法的一些实施方案中,T细胞是CD4+和CD8+T细胞。
在本公开文本的方法的一些实施方案中,个体中活化后的CD4和/或CD8T细胞特征在于相对于施用组合之前γ-IFN+生成CD4和/或CD8T细胞和/或增强的溶胞活性。可以通过本领域已知的任何手段来测量γ-IFN+,包括例如细胞内细胞因子染色(ICS),其牵涉细胞固定,透化,和用针对γ-IFN的抗体染色。可以通过本领域已知的任何手段来测量溶胞活性,例如使用用混合效应和靶细胞进行的细胞杀伤测定法。
在本公开文本的方法的一些实施方案中,CD4和/或CD8T细胞展现升高的选自下组的细胞因子的释放:IFN-γ,TNF-α和白介素。可以通过本领域已知的任何手段来测量细胞因子释放,例如使用Western印迹,ELISA,或免疫组织化学测定法检测含有CD4和/或CD8T细胞的样品中释放的细胞因子的存在。
在本公开文本的方法的一些实施方案中,CD4和/或CD8T细胞是效应记忆T细胞。在本公开文本的方法的一些实施方案中,CD4和/或CD8效应记忆T细胞特征在于具有CD44CD62L的表达。可以通过本领域已知的任何手段来检测CD44CD62L的表达,例如通过制备组织(例如癌症组织)的单细胞悬浮液并使用针对CD44和CD62L的商品化抗体实施表面染色和流式细胞术。
可以在本公开文本的方法中使用本领域已知的或本文中描述的任何PD-1轴结合拮抗剂和IL-17结合拮抗剂。
VI.试剂盒或制品
在另一个方面,本文中提供的是包含包装插页和PD-1轴结合拮抗剂和/或IL-17结合拮抗剂的试剂盒或制品。此类试剂盒或制品可用于在个体中治疗癌症或延迟癌症进展和/或在具有癌症的个体中增强免疫功能。在一些实施方案中,该包装插页包含关于使用该试剂盒或制品的用法说明书。
在一些实施方案中,本文中提供的是包含PD-1轴结合拮抗剂和包装插页的试剂盒,该包装插页包含关于与IL-17结合拮抗剂组合使用该PD-1轴结合拮抗剂以在个体中治疗癌症或延迟癌症进展的用法说明书。在一些实施方案中,本文中提供的是包含PD-1轴结合拮抗剂和IL-17结合拮抗剂及包装插页的试剂盒,该包装插页包含关于使用该PD-1轴结合拮抗剂和该IL-17结合拮抗剂以在个体中治疗癌症或延迟癌症进展的用法说明书。在一些实施方案中,本文中提供的是包含IL-17结合拮抗剂和包装插页的试剂盒,该包装插页包含关于与PD-1轴结合拮抗剂组合使用该IL-17结合拮抗剂以在个体中治疗癌症或延迟癌症进展的用法说明书。在一些实施方案中,本文中提供的是包含PD-1轴结合拮抗剂和包装插页的试剂盒,该包装插页包含关于与IL-17结合拮抗剂组合使用该PD-1轴结合拮抗剂以在具有癌症的个体中增强免疫功能的用法说明书。在一些实施方案中,本文中提供的是包含PD-1轴结合拮抗剂和IL-17结合拮抗剂及包装插页的试剂盒,该包装插页包含关于使用该PD-1轴结合拮抗剂和该IL-17结合拮抗剂以在具有癌症的个体中增强免疫功能的用法说明书。在一些实施方案中,本文中提供的是包含IL-17结合拮抗剂和包装插页的试剂盒,该包装插页包含关于与PD-1轴结合拮抗剂组合使用该IL-17结合拮抗剂以在具有癌症的个体中增强免疫功能的用法说明书。
在一些实施方案中,PD-1轴结合拮抗剂和IL-17结合拮抗剂在同一容器中或在分开的容器中。合适的容器包括例如瓶,管形瓶,袋和注射器。容器可用各种材料制成,诸如玻璃,塑料(诸如聚氯乙烯或聚烯烃),或金属合金(诸如不锈钢或hastelloy)。在一些实施方案中,容器装有配制剂,而且该容器上或关联的标签可指示使用说明。制品或试剂盒可进一步包括从商业和用户立场看想要的其它材料,包括其它缓冲剂,稀释剂,滤器,针头,注射器,和印有使用说明的包装插页。在一些实施方案中,制品进一步包括一种或多种别的药剂(例如化疗剂和抗肿瘤剂)。对于所述一种或多种别的药剂合适的容器包括例如瓶,管形瓶,袋和注射器。
在一些实施方案中,试剂盒包含含有本文中描述的一种或多种PD-1轴结合拮抗剂和IL-17结合拮抗剂的容器。合适的容器包括例如瓶,管形瓶(例如双室管形瓶),注射器(诸如单或双室注射器)和试管。容器可以由多种材料诸如玻璃或塑料形成。在一些实施方案中,试剂盒可以包含标签(例如在容器上或与容器联合)或包装插页。标签或包装插页可以指示其中含有的化合物可用于或意图用于在个体中治疗癌症或延迟癌症的进展或者在具有癌症的个体中增强免疫功能。试剂盒可以进一步包含从商业和用户观点看期望的其它材料,包括其它缓冲剂,稀释剂,滤器,针,和注射器。
认为本说明书足以使得本领域技术人员实施本发明。根据上述描述,在本文所示和所述之外对本发明的各种更改对本领域技术人员会变得显然,且落在所附权利要求的范围之内。通过述及将本文中引用的所有出版物,专利,和专利申请完整收入本文,用于所有目的。
实施例
本发明可以通过参考以下实施例进一步理解,所述实施例作为例示提供而并不意图为限制性的。
实施例1:在EMT6乳腺癌模型中测试使用抗PDL1和抗IL-17的组合治疗的功效
许多因素可能有助于癌症治疗(特别是那些靶向抗肿瘤免疫力的)的总体有效性。已经在特定患者分支中观察到IL-17F的表达与针对抗PDL1治疗的非响应性或晚期响应有关。因此,在EMT6同基因肿瘤模型中测试包括抗PDL1和抗IL-17的组合治疗的功效。
对90只BALB/c小鼠在左边第4个乳房脂肪垫中皮下接种100微升HBSS+matrigel(BD Biosciences)中的0.1x106个EMT6细胞。容许小鼠中肿瘤生长。当肿瘤达到大约150mm3的均值肿瘤体积时(第0天,接种之后大约10天),将动物募集入下文概述的处理组(对额外的动物处以安乐死)。
在第1天启动处理。如下文描述的,静脉内(IV)给予第一剂,并经由腹膜内(IP)注射施用剩余剂,一周三次,持续三周(即总共10剂,其中1剂是IV且剩余9剂是IP)。第1天开始gp120对照和抗IL-17处理的剂量给药。剂量体积为100μL。
将小鼠分成4个处理组,接受下面的剂量:(1)小鼠IgG1抗gp120 9338(20mg/kg)和小鼠IgG2a(10mg/kg),IV给药第一剂,然后IP给药,一周三次,持续三周;(2)识别IL-17A和IL-17F的抗IL17交叉反应性抗体(10mg/kg)和识别IL-17F的抗IL17抗体(10mg/kg),IV给药第一剂,然后IP给药,一周三次,持续三周;(3)抗PDL1(10mg/kg),IV给药第一剂,然后IP给药,一周三次,持续三周;和(4)抗PDL1(10mg/kg),识别IL-17A和IL-17F的抗IL17交叉反应性抗体(10mg/kg),和识别IL-17F的抗IL17抗体(10mg/kg),IV给药第一剂,然后IP给药一周三次,持续三周。
每周两次收集测量和重量。对展现重量减轻>15%的动物每天称重,而且如果它们体重减轻>20%的话,处以安乐死。对显示不利临床问题的动物更加频繁地观察,根据严重性直至每天,而且如果垂死的话,处以安乐死。如果肿瘤体积超过3,000mm3的话,对小鼠处以安乐死;或者,如果没有形成肿瘤的话,在3个月之后对小鼠处以安乐死。先前的研究已经显示,在8周之后,剩余肿瘤具有降低的生长速率且显著不太具攻击性。每周一次对这些剩余肿瘤测量和称重。对于在8周之后存在的任何大型或攻击性生长中的肿瘤,每周两次收集这些特定小鼠的测量和重量。贯穿整个研究,每周两次实施所有小鼠的临床观察。
如图30中显示的,单独的IL-17抗体的处理导致肿瘤尺寸与对照抗体的处理相比略微缩小。抗PDL1的处理导致肿瘤尺寸与抗IL-17抗体的处理相比略微更大的缩小。然而,抗PDL1抗体和抗IL-17抗体的组合处理导致肿瘤尺寸和肿瘤生长速率与任一单一处理或对照处理相比显著缩小/降低。这些结果指示包括PD-1轴结合拮抗剂(例如抗PDL1)和IL-17结合拮抗剂(例如抗IL-17)二者的组合处理在治疗癌症方面具有卓越的功效,特别是与对照处理和/或单独的每一种处理相比。
实施例2:抗PDL1处理期间IL-17表达和疾病进展的分析
先前的实施例证明包括PD-1轴结合拮抗剂和IL-17结合拮抗剂二者的组合处理在治疗癌症方面显示与单独的每一种处理相比卓越的功效。因此,有兴趣确定IL-17表达是否可以充当为PD-1轴结合拮抗剂和IL-17结合拮抗剂的治疗选择患者的生物标志物。此实施例分析多种癌症类型中IL-17家族细胞因子的表达和针对抗PDL1治疗的响应之间的关联。
材料和方法
基因表达分析
为所有样品制备苏木精-曙红(H&E)切片并由病理学家检查以确认诊断及评估肿瘤内容物。如Schleifman及其同事(Schleifman EB,et al.,(2014)PloS one 9(2):e88401)描述的那样实施RNA提取和基因表达分析。简言之,显微解剖FFPE切片以富集赘生组织,接着使用High Pure FFPE RNA Micro试剂盒(Roche Applied Sciences,Indianapolis,IN)提取RNA。然后使用Invitrogen Platinum Taq/逆转录酶酶混合物和合并的基因表达测定法(Life Technologies,Carlsbad,CA)对RNA进行一步cDNA合成/预扩增反应。然后使用BioMarkTM HD系统(Fluidigm Corporation,South SanFrancisco,CA)在Fluidigm 96.96动力学阵列上进行定量PCR(qPCR)。将循环阈(Ct)值标准化。如Geiss,G.K.,et al.Nat.Biotechnol.26(3):317-25(2008)中描述的那样对基因表达进行NanoString分析。
IHCIC指对免疫细胞中的PDL1表达特异性的免疫组织化学染色。将样品针对PDL1表达染色并基于具有阳性染色的肿瘤面积的百分比分级。用于评估染色的分级度量取决于肿瘤类型。例如,对于非小细胞肺癌症样品,IHCIC2+的级别指其中超过5%但不到10%的肿瘤面积被PDL1阳性染色的细胞占据的样品,而IHCIC 3+的级别指其中超过10%的肿瘤面积被PDL1阳性染色的细胞占据的样品。
抗PDL1处理和RECIST响应
用≥1-20mg/kg抗PDL1及基线肿瘤评估处理所有患者。通过RECIST v1.1评估客观响应率。对于黑素瘤,肾细胞癌,和非小细胞肺癌患者,使用经过确认的响应(BOCR)。对于膀胱癌患者,使用未经确认的响应(BURSP)。
对于基因表达签名与RECIST响应的关联,自响应作为结局和连续基因表达作为自变量的逻辑回归模型派生p值。针对IHCIC(分类的)和IHCTC,或肿瘤细胞中的免疫组织化学染色(≥50%;分类的)调整模型。黑色:IHCIC0;橙色:IHCIC1;品红色:IHCIC2;红色:IHCIC3。三角形符号描绘IHC TC≥50%。
ROC分析
通过以不同生物标志物截留将灵敏度对1-特异性绘图,生成ROC曲线。在具有完全或部分响应的患者与具有稳定或进展疾病的患者的比较中,灵敏度定义为具有完全或部分响应的得到如此正确鉴定的患者的百分比,而特异性定义为具有稳定或进展疾病的得到如此正确鉴定的患者的百分比。在具有完全响应,部分响应,或稳定疾病的患者与具有进展疾病的患者的比较中,灵敏度定义为具有完全或部分响应或稳定疾病的得到如此正确鉴定的患者的百分比,而特异性定义为具有进展疾病的得到如此正确鉴定的患者的百分比。
IL-17和Teff基因表达签名的分析
通过减去在阵列上使用所有96种基因评估的中值基因表达将标准化循环阈(Ct)值转换成相对表达值(负ΔCt)。通过组合IL-17A,IL-17F,和RORC的表达生成Th17签名,而且Teff签名含有CD8,IFNγ,粒酶A,粒酶B和穿孔蛋白(peforin)的表达。
免疫组织化学染色
对非小细胞肺癌(n=13)和结直肠癌(n=12)组织的福尔马林固定,石蜡包埋,销售商获取的肿瘤样品实施免疫组织化学染色。依照标准免疫组织化学染色方法以3μg/mL使用抗人IL-17A亲和纯化的山羊多克隆抗体进行检测(R&D Systems产品目录号AF-317)。
结果
为了研究IL-17细胞因子家族成员对抗肿瘤免疫力的潜在贡献,在来自多种癌症类型的肿瘤组织中测量IL-17A和IL-17F的表达。图1A-3B图解这两种细胞因子在多种肿瘤组织中的流行度。将来自每种类型的癌症组织的样品归类为显示无IL-17A或IL-17F表达,只IL-17F表达,只IL-17A表达,或表达IL-17A和IL-17F二者。如果基因产生少于30的原始阈循环(Ct)的话,认为样品显示表达。所研究的癌症组织的类型包括:结直肠癌(图1A),激素受体阳性乳腺癌(图1B),非鳞状非小细胞肺癌(图1C),鳞状非小细胞肺癌(图1D),三重阴性乳腺癌(图2A),HER2阳性乳腺癌(图2B),肾细胞癌(图2C),黑素瘤(图2D),卵巢癌(图3A),和膀胱癌(图3B)。
如图1A-3B中显示的,癌症中IL-17A和IL-17F的存在在癌症间有可观的变化。例如,超过60%的鳞状非小细胞肺癌和结直肠癌组织显示IL-17A和IL-17F二者表达,比较而言所测试的HER2阳性乳腺癌组织无一如此。在25-55%的大致范围中,非鳞状非小细胞肺癌,卵巢癌,膀胱癌,肾细胞癌,黑素瘤,和三重阴性乳腺癌也显示IL-17A和IL-17F表达的流行度。这些结果证明IL-17家族细胞因子表达在癌症间可变,但是存在于许多不同肿瘤类型中。
为了确定IL-17表达是否与针对抗PDL1治疗的响应有关联,在为了不同癌症类型接受抗PDL1治疗的患者分支中测量IL-17A和IL-17F的表达。对来自每个分支的样品测试多种因素:IL-17A/F(如本文中使用的,IL-17A/F可以统指IL-17A,IL-17F,IL-17A和IL-17F,及缺乏IL-17A和IL-17F的分析)表达和针对治疗的响应之间的关联,IL-17A/F和IL-8基因表达签名的分析,全部患者和具有IHCIC 2+级癌症的患者二者中IL-17A/F和IL-8表达和针对抗PDL1治疗的响应性之间的关联,RECIST响应和IL-17基因签名的关联,和与凭借抗PDL1治疗具有稳定或进展疾病的患者相比针对抗PDL1治疗具有完全或部分响应的患者中IL-17基因签名的ROC分析(或与凭借抗PDL1治疗具有进展疾病的患者相比凭借抗PDL1治疗具有完全响应,部分响应,或稳定疾病的患者中IL-17基因签名的ROC分析)。使用黑素瘤,肾细胞癌,膀胱癌,和非小细胞肺癌患者分支实施每项分析。
图4报告针对抗PDL1治疗显示完全或部分响应,针对抗PDL1治疗显示稳定疾病,和针对抗PDL1治疗显示进展疾病的患者中IL-17A/F基因表达的存在。如显示的,显示IL-17A和IL-17F表达二者缺失的患者趋向于升高的抗PDL1治疗临床好处(即完全或部分响应或稳定疾病)。
如图5A-5D中显示的,分析了IL-17A(图5A)和IL-17F(图5B)表达和针对抗PDL1治疗的RECIST响应之间的关联。还分析了针对抗PDL1治疗的RECIST响应和IL-17诱导的基因(IL-8)之间的关联(图5C)。最后,分析了IL-17基因表达签名和针对抗PDL1治疗的RECIST响应之间的关联(图5D)。此IL-17基因表达签名是自所有三种基因(IL-17A,IL-17F,和IL-8)的平均基因表达水平派生的。当分析所有患者时,在进展疾病患者中出现更大IL-17表达和IL-17基因签名流行度的总体趋势。
图6A-6D显示进展疾病和IL-17表达之间的这种关联在只分析IHCIC 2+患者时要清晰得多。IL-17A(图6A)和IL-17F(图6B)表达特别如此。
对于IL-17基因表达签名(如上文描述的)作为针对抗PDL1治疗的响应的预测器,ROC分析还预测临床好处(图7)。通过比较凭借PDL1治疗展现完全响应或部分响应的患者与凭借PDL1治疗展现稳定疾病或进展疾病的患者实施了ROC分析。还通过比较凭借PDL1治疗展现完全响应,部分响应,或稳定疾病的患者与凭借PDL1治疗展现进展疾病的患者实施了ROC分析。在这两种情况中,AUC值在0.5以上,对于IL-17基因表达签名指示临床好处。
对肾细胞癌患者重复这些分析。图8显示IL-17A和IL-17F表达呈阴性的患者中朝向更高响应性的趋势。图9A-9D显示更高的IL-17表达与接受抗PDL1治疗时具有稳定或进展疾病的患者有显著关联,特别是对于IL-17F表达(图9B)。另外,IL-17基因表达签名的分析显示统计学上极其显著的与针对抗PDL1治疗的稳定或进展疾病响应的关联(图9D)。
图10A-10D显示接受抗PDL1治疗时具有进展疾病的IHCIC 2+患者间朝向更高IL-17A和IL-17F表达的趋势。对于IL-17基因表达签名作为针对抗PDL1治疗的响应的预测器,响应性对不响应性患者的ROC分析也预测临床好处(图11),特别是在比较具有完全或部分响应的患者与具有稳定或进展疾病的患者时(AUC=0.88)。
对膀胱癌患者重复这些分析。图12显示IL-17A和IL-17F表达呈阴性的患者中针对抗PDL1治疗的完全或部分响应的更高相对流行度。图13A-13D显示接受抗PDL1治疗时具有稳定或进展疾病的患者中朝向更高IL-17A,IL-17F,IL-8,和IL-17基因签名表达的总体趋势。图14A-14D确认IHCIC 2+样品中的这种趋势。对于IL-17基因表达签名作为针对抗PDL1治疗的响应的预测器,ROC分析还预测临床好处(图15)。
对非小细胞肺癌患者重复这些分析。图16显示没有观察到IL-17A/F表达与针对抗PDL1治疗的响应的趋势。类似地,图17A-17D和18A-18D没有显示针对抗PDL1治疗的响应性和IL-17A/F表达之间清楚的关联。最后,对于IL-17基因表达签名作为针对抗PDL1治疗的响应的预测器,ROC分析没有预测清楚的临床好处,其中AUC值为0.45和0.56(图19)。
总之,这些结果证明IL-17A/F表达作为针对抗PDL1治疗的不响应性的预测器可能是有用的。具体而言,在许多癌症(诸如黑素瘤,膀胱癌,和肾细胞癌)中,肿瘤中缺乏IL-17A和IL-17F表达可预测比展示IL-17A/F表达的肿瘤更加正面的抗PDL1治疗的临床好处。
为了使用一种不同的方法确认这些结果及进一步调查非小细胞肺癌中IL-17A/F表达对抗PDL1治疗的影响,还使用NanoString分析检查了IL-17表达。这些分析包括一种更加广泛的IL-17基因表达签名,其并入有IL-17A和IL-17F的表达,连同IL-17诱导的基因IL-8,CSF3,CXCL1,CXCL3,和CCL20。
图20A-20H显示IL-17A(图20A),IL-17F(图20B),IL-8(图20C),CSF3(图20D),CXCL1(图20E),CXCL3(图20F),和CCL20(图20G)表达和针对抗PDL1治疗的响应性之间的关联,以及整个IL-17基因签名的平均值和针对抗PDL1治疗的响应性之间的关联(图20H)。图21A-21H对IHCIC 2+患者重复这些分析。如图20A-20H和21A-21H中显示的,没有观察到IL-17基因表达和针对抗PDL1治疗的响应性之间的关联的明确证据。该数据中的这种关联缺乏通过抗PDL1治疗中IL-17基因表达缺乏临床好处(如通过ROC分析预测的)得到确认(图22)。这些NanoString结果确认非小细胞肺癌缺乏IL-17基因表达和抗PDL1响应之间的关联,该发现符合先前的结果但将一种更加广泛的IL-17基因表达签名并入分析。
还在多种类型的癌症中测量IL-17和T效应(Teff)基因签名。这些结果证明清楚的IL-17基因签名升高和Teff基因签名降低,特别是在结直肠癌中(图23A和23B)。如图24A-24C中显示的,结直肠癌还显示IL-17A表达(图24A),IL-17F表达(图24B),和IL-17A/F表达(图24C)中值得注意的升高。这些发现可能提示这些细胞因子在抗肿瘤免疫力中的负调节作用,特别是在结直肠癌中。
图25进一步显示在黑素瘤,膀胱癌,和肾癌适应症间观察到的升高的IL-17A表达和进展疾病之间的关联。另外,肾细胞癌不响应抗PDL1治疗的患者显示朝向更高IL-17F表达的趋势。这在分析全部患者数据时是明显的(图26A和26B)。甚至更加清楚的是所观察到与针对抗PDL1治疗的正面响应(完全或部分响应)相比接受抗PDL1治疗时具有进展疾病的患者中更高IL-17F表达(图27A),及针对抗PDL1治疗的晚期响应者中更高IL-17F表达(大于6个月)(图27B)的趋势。
这些数据强调多种适应症中更高的IL-17表达和缺乏针对抗PDL1治疗的响应性之间的关联。例如,这些数据提示至少对于膀胱癌,黑素瘤,和肾细胞癌而言更高的IL-17表达与缺乏针对抗PDL1治疗的响应性有关联。这些数据进一步提示在其它类型的癌症(值得注意的是结直肠癌和卵巢癌)中也可能检测到升高的IL-17和/或IL-17基因表达签名的表达。
实施例3:肿瘤组织中IL-17表达的定位
先前的实施例证明IL-17表达与缺乏针对抗PDL1治疗的临床响应有关联。为了了解IL-17如何在不同肿瘤组织中表达,通过免疫组织化学染色来显现IL-17蛋白质表达。
如上文描述的那样对多种组织实施针对IL-17蛋白质的免疫组织化学染色。所使用的检测试剂为抗人IL-17A抗体AF-317。这种试剂已经广泛用于检测人组织中的IL-17。例如,这种抗体已经用于显现皮肤T-细胞淋巴瘤中表达IL-17A的细胞(Fontao,L.,etal.Br.J.Dermatol.166:687-9(2012))。Fontao等人证明IL-17染色与T细胞中的CD3染色有关联,但是另外也鉴定了显示无CD3表达的其它IL-17阳性细胞。发现这些细胞在形态上与嗜中性粒细胞相似且针对髓过氧化物酶(MPO)染色,提示嗜中性粒细胞也可能显示IL-17表达。
非小细胞肺癌症组织针对IL-17A染色。如图28A-28D中显示的,在单个核细胞中观察到与淋巴细胞和浸润肿瘤基质的其它小型,圆形细胞一致的IL-17A染色。还鉴定了具有IL-17A表达的嗜中性粒细胞的簇(参见例如图28C)。
还在结直肠癌中测定IL-17A染色。图29A-29C显示结肠腺癌样品中的IL-17A染色。正如在非小细胞肺癌中的,在诸如以更弱强度染色的嗜中性粒细胞等其它细胞类型以外,还在这些样品中观察到散布的IL-17A阳性单个核细胞。
总之,这些免疫组织化学染色数据清楚地证明多种肿瘤类型中IL-17A阳性单个核细胞以及其它IL-17A阳性细胞(诸如嗜中性粒细胞)的存在。
实施例4:小鼠肿瘤模型中的IL-17可诱导基因表达
IL-17诱导众多涉及促肿瘤发生途径的基因的表达。选择了一组基因作为IL-17可诱导基因签名以在小鼠肿瘤模型中调查IL-17途径的贡献。
对同基因小鼠皮下接种一组小鼠肿瘤细胞系(即对5-6只小鼠的分支皮下接种一种肿瘤细胞系)。一旦肿瘤建立并实现大约150-200mm3的肿瘤体积,就切出肿瘤并为RNA-Seq分析加工RNA。该分析中包括的肿瘤的类型是那些自肺(NSCLC 082A和NSCLC 095A,TC-1),乳腺(4T1,EMT6.luc,JC),结肠(51BLIM10,CT26,MC38),黑素瘤(克隆M-3,B16.F10,MEL-BR-1,SM1),和胰腺(KPR_3070,PAN 02X1)衍生的。
如图31中显示的,IL-17可诱导基因签名的相对强度在肿瘤中有变化。例如,B16.F10黑素瘤展现弱基因签名表达,而另一种黑素瘤(SM1)具有相对高的基因签名表达。IL-17可诱导基因签名内的个别基因成分表达也是可变的。例如,EMT6对总体基因签名具有相对高的S100A8和S100A9贡献,而JC(另一种乳腺肿瘤)具有相对高的MMP和TIMP贡献。正如对临床前肿瘤模型看到的,IL-17可诱导基因签名可以预测对作为单一药剂或与抗PDL1组合的IL-17结合拮抗剂响应的癌症。EMT6展示相对高的IL-17可诱导基因签名,而且PD-1轴结合拮抗剂和IL-17结合拮抗剂二者的组合的治疗在EMT6模型中显著缩小/降低肿瘤尺寸和生长速率,如实施例1中显示的。
接下来,为了建立同位肺肿瘤,对同基因B6(Cg)–Tyrc-2J/J小鼠经尾静脉注射i.v.接种100,000个Lewis肺癌(LLC)或B16.10黑素瘤细胞。在接种B16.F10之后24天或在LLC接种后第24天或第29天收获肺。
对于抗IL17抗体处理,对动物经尾静脉接种100微升体积HBSS中的1x106个LLC细胞。基于初始Micro CT扫描对所有接种小鼠分组。将肿瘤接种后第13天肺中具有可检测肿瘤的小鼠随机化分入两组。一组没有处理。第二组用识别IL-17A和IL-17F的抗IL-17交叉反应性抗体(10mg/kg)和识别IL-17F的抗IL-17抗体(10mg/kg)处理,IV给药第一剂,然后IP给药,一周三次。自接种后第14天启动处理。无实验(naive)小鼠既不接种LLC细胞,也不用抗IL-17抗体处理。
每周两次收集测量和重量。对展现重量减轻>15%的动物每天称重,而且如果它们体重减轻>20%的话,处以安乐死。对显示不利临床问题的动物更加频繁地观察,根据严重性直至每天,而且如果垂死的话,处以安乐死。在1周抗IL-17处理之后,在接种后第21天处死小鼠。在第20天实施Micro-CT扫描以评估肺组织体积。自携带肿瘤的肺纯化RNA并使用用于基因表达的Fluidigm动力学阵列芯片和BioMark实时PCR系统测定基因表达。
基因表达探针如下:持家基因ACTB,GAPDH,RPL19;T细胞标志物CD4,CD8a;IL17细胞因子IL17A,IL17B,IL17C,IL17D,IL17F;IL17受体IL17RA,IL17RC;IL17可诱导基因C3,CCL2,CCL20,CSF2,CSF3,CXCL1,CXCL2,CXCL3,CXCL5,CXCL10,CXCR1,CXCR2,ICAM1,IL6,MMP1,MMP2,MMP3,MMP8,MMP9,MMP13,MMP14,MMP25,NCF4,NFKBIZ,S100A8,S100A9,SAA1.2(即检测SAA1和SAA2二者的探针),SAA1,SAA3,SAA4,TIMP1,TIMP2,TIMP3,TIMP4。
如图32A-32W和33A-33T中显示的,个别基因(包括IL-17可诱导基因签名)的表达在同位B16.F10和LLC肺肿瘤之间有变化。总的说来,LLC肺肿瘤具有比B16.F10更高的IL-17可诱导基因签名成分的表达。而且,第29天LLC肺肿瘤中这些基因的相对表达水平与第24天相比升高,指示IL-17基因签名随肿瘤进展变得更加显著。这些数据证明IL-17基因签名可用于鉴定涉及IL-17途径且因此适用IL-17结合拮抗剂的癌症。
图34A-34W和35A-35T显示同位LLC肺肿瘤中抗IL-17治疗对IL-17可诱导基因的表达的影响。在1周治疗之后,对一些基因观察到基因表达抑制,值得注意的是NFKBIZ(图35J),S100A8(图35K)和S100A9(图35L)。这指示抗IL-17抗体治疗能调控有助于肿瘤进展的基因的表达。监测IL-17基因签名表达的变化可以充当用于在肿瘤学设置中评估IL-17结合拮抗剂的效果的生物标志物工具。
通过援引将本文中引用的所有专利,专利申请,文件,和论文完整收入本文。
序列表
<110> J·格罗根
Y·肖
P·卡普拉斯
S·连诺格罗
J·哈克尼
E·Y-C·蒋
<120> 使用PD-1轴结合拮抗剂和IL-17结合拮抗剂治疗癌症的方法
<130> 146392027140
<140> 未指派
<141> 随本文
<150> US 62/050,745
<151> 2014-09-15
<160> 63
<170> FastSEQ for Windows Version 4.0
<210> 1
<211> 10
<212> PRT
<213> 人工序列
<220>
<223> 合成构建物
<220>
<221> 变异
<222> 6
<223> Xaa = Asp 或 Gly
<400> 1
Gly Phe Thr Phe Ser Xaa Ser Trp Ile His
1 5 10
<210> 2
<211> 18
<212> PRT
<213> 人工序列
<220>
<223> 合成构建物
<220>
<221> 变异
<222> 4
<223> Xaa = Ser 或 Leu
<220>
<221> 变异
<222> 10
<223> Xaa = Thr 或 Ser
<400> 2
Ala Trp Ile Xaa Pro Tyr Gly Gly Ser Xaa Tyr Tyr Ala Asp Ser Val
1 5 10 15
Lys Gly
<210> 3
<211> 9
<212> PRT
<213> 人工序列
<220>
<223> 合成构建物
<400> 3
Arg His Trp Pro Gly Gly Phe Asp Tyr
1 5
<210> 4
<211> 25
<212> PRT
<213> 人工序列
<220>
<223> 合成构建物
<400> 4
Glu Val Gln Leu Val Glu Ser Gly Gly Gly Leu Val Gln Pro Gly Gly
1 5 10 15
Ser Leu Arg Leu Ser Cys Ala Ala Ser
20 25
<210> 5
<211> 13
<212> PRT
<213> 人工序列
<220>
<223> 合成构建物
<400> 5
Trp Val Arg Gln Ala Pro Gly Lys Gly Leu Glu Trp Val
1 5 10
<210> 6
<211> 32
<212> PRT
<213> 人工序列
<220>
<223> 合成构建物
<400> 6
Arg Phe Thr Ile Ser Ala Asp Thr Ser Lys Asn Thr Ala Tyr Leu Gln
1 5 10 15
Met Asn Ser Leu Arg Ala Glu Asp Thr Ala Val Tyr Tyr Cys Ala Arg
20 25 30
<210> 7
<211> 11
<212> PRT
<213> 人工序列
<220>
<223> 合成构建物
<400> 7
Trp Gly Gln Gly Thr Leu Val Thr Val Ser Ala
1 5 10
<210> 8
<211> 11
<212> PRT
<213> 人工序列
<220>
<223> 合成构建物
<220>
<221> 变异
<222> 5
<223> Xaa = Asp 或 Val
<220>
<221> 变异
<222> 6
<223> Xaa = Val 或 Ile
<220>
<221> 变异
<222> 7
<223> Xaa = Ser 或 Asn
<220>
<221> 变异
<222> 9
<223> Xaa = Ala 或 Phe
<220>
<221> 变异
<222> 10
<223> Xaa = Val 或 Leu
<400> 8
Arg Ala Ser Gln Xaa Xaa Xaa Thr Xaa Xaa Ala
1 5 10
<210> 9
<211> 7
<212> PRT
<213> 人工序列
<220>
<223> 合成构建物
<220>
<221> 变异
<222> 4
<223> Xaa = Phe 或 Thr
<220>
<221> 变异
<222> 6
<223> Xaa = Tyr 或 Ala
<400> 9
Ser Ala Ser Xaa Leu Xaa Ser
1 5
<210> 10
<211> 9
<212> PRT
<213> 人工序列
<220>
<223> 合成构建物
<220>
<221> 变异
<222> 3
<223> Xaa = Tyr, Gly, Phe, 或 Ser
<220>
<221> 变异
<222> 4
<223> Xaa = Leu, Tyr, Phe 或 Trp
<220>
<221> 变异
<222> 5
<223> Xaa = Tyr, Asn, Ala, Thr, Gly, Phe 或 Ile
<220>
<221> 变异
<222> 6
<223> Xaa = His, Val, Pro, Thr 或 Ile
<220>
<221> 变异
<222> 8
<223> Xaa = Ala, Trp, Arg, Pro 或 Thr
<400> 10
Gln Gln Xaa Xaa Xaa Xaa Pro Xaa Thr
1 5
<210> 11
<211> 23
<212> PRT
<213> 人工序列
<220>
<223> 合成构建物
<400> 11
Asp Ile Gln Met Thr Gln Ser Pro Ser Ser Leu Ser Ala Ser Val Gly
1 5 10 15
Asp Arg Val Thr Ile Thr Cys
20
<210> 12
<211> 15
<212> PRT
<213> 人工序列
<220>
<223> 合成构建物
<400> 12
Trp Tyr Gln Gln Lys Pro Gly Lys Ala Pro Lys Leu Leu Ile Tyr
1 5 10 15
<210> 13
<211> 32
<212> PRT
<213> 人工序列
<220>
<223> 合成构建物
<400> 13
Gly Val Pro Ser Arg Phe Ser Gly Ser Gly Ser Gly Thr Asp Phe Thr
1 5 10 15
Leu Thr Ile Ser Ser Leu Gln Pro Glu Asp Phe Ala Thr Tyr Tyr Cys
20 25 30
<210> 14
<211> 11
<212> PRT
<213> 人工序列
<220>
<223> 合成构建物
<400> 14
Phe Gly Gln Gly Thr Lys Val Glu Ile Lys Arg
1 5 10
<210> 15
<211> 10
<212> PRT
<213> 人工序列
<220>
<223> 合成构建物
<400> 15
Gly Phe Thr Phe Ser Asp Ser Trp Ile His
1 5 10
<210> 16
<211> 18
<212> PRT
<213> 人工序列
<220>
<223> 合成构建物
<400> 16
Ala Trp Ile Ser Pro Tyr Gly Gly Ser Thr Tyr Tyr Ala Asp Ser Val
1 5 10 15
Lys Gly
<210> 17
<211> 11
<212> PRT
<213> 人工序列
<220>
<223> 合成构建物
<400> 17
Arg Ala Ser Gln Asp Val Ser Thr Ala Val Ala
1 5 10
<210> 18
<211> 7
<212> PRT
<213> 人工序列
<220>
<223> 合成构建物
<400> 18
Ser Ala Ser Phe Leu Tyr Ser
1 5
<210> 19
<211> 9
<212> PRT
<213> 人工序列
<220>
<223> 合成构建物
<400> 19
Gln Gln Tyr Leu Tyr His Pro Ala Thr
1 5
<210> 20
<211> 118
<212> PRT
<213> 人工序列
<220>
<223> 合成构建物
<400> 20
Glu Val Gln Leu Val Glu Ser Gly Gly Gly Leu Val Gln Pro Gly Gly
1 5 10 15
Ser Leu Arg Leu Ser Cys Ala Ala Ser Gly Phe Thr Phe Ser Asp Ser
20 25 30
Trp Ile His Trp Val Arg Gln Ala Pro Gly Lys Gly Leu Glu Trp Val
35 40 45
Ala Trp Ile Ser Pro Tyr Gly Gly Ser Thr Tyr Tyr Ala Asp Ser Val
50 55 60
Lys Gly Arg Phe Thr Ile Ser Ala Asp Thr Ser Lys Asn Thr Ala Tyr
65 70 75 80
Leu Gln Met Asn Ser Leu Arg Ala Glu Asp Thr Ala Val Tyr Tyr Cys
85 90 95
Ala Arg Arg His Trp Pro Gly Gly Phe Asp Tyr Trp Gly Gln Gly Thr
100 105 110
Leu Val Thr Val Ser Ala
115
<210> 21
<211> 108
<212> PRT
<213> 人工序列
<220>
<223> 合成构建物
<400> 21
Asp Ile Gln Met Thr Gln Ser Pro Ser Ser Leu Ser Ala Ser Val Gly
1 5 10 15
Asp Arg Val Thr Ile Thr Cys Arg Ala Ser Gln Asp Val Ser Thr Ala
20 25 30
Val Ala Trp Tyr Gln Gln Lys Pro Gly Lys Ala Pro Lys Leu Leu Ile
35 40 45
Tyr Ser Ala Ser Phe Leu Tyr Ser Gly Val Pro Ser Arg Phe Ser Gly
50 55 60
Ser Gly Ser Gly Thr Asp Phe Thr Leu Thr Ile Ser Ser Leu Gln Pro
65 70 75 80
Glu Asp Phe Ala Thr Tyr Tyr Cys Gln Gln Tyr Leu Tyr His Pro Ala
85 90 95
Thr Phe Gly Gln Gly Thr Lys Val Glu Ile Lys Arg
100 105
<210> 22
<211> 440
<212> PRT
<213> 人工序列
<220>
<223> 合成构建物
<400> 22
Gln Val Gln Leu Val Glu Ser Gly Gly Gly Val Val Gln Pro Gly Arg
1 5 10 15
Ser Leu Arg Leu Asp Cys Lys Ala Ser Gly Ile Thr Phe Ser Asn Ser
20 25 30
Gly Met His Trp Val Arg Gln Ala Pro Gly Lys Gly Leu Glu Trp Val
35 40 45
Ala Val Ile Trp Tyr Asp Gly Ser Lys Arg Tyr Tyr Ala Asp Ser Val
50 55 60
Lys Gly Arg Phe Thr Ile Ser Arg Asp Asn Ser Lys Asn Thr Leu Phe
65 70 75 80
Leu Gln Met Asn Ser Leu Arg Ala Glu Asp Thr Ala Val Tyr Tyr Cys
85 90 95
Ala Thr Asn Asp Asp Tyr Trp Gly Gln Gly Thr Leu Val Thr Val Ser
100 105 110
Ser Ala Ser Thr Lys Gly Pro Ser Val Phe Pro Leu Ala Pro Cys Ser
115 120 125
Arg Ser Thr Ser Glu Ser Thr Ala Ala Leu Gly Cys Leu Val Lys Asp
130 135 140
Tyr Phe Pro Glu Pro Val Thr Val Ser Trp Asn Ser Gly Ala Leu Thr
145 150 155 160
Ser Gly Val His Thr Phe Pro Ala Val Leu Gln Ser Ser Gly Leu Tyr
165 170 175
Ser Leu Ser Ser Val Val Thr Val Pro Ser Ser Ser Leu Gly Thr Lys
180 185 190
Thr Tyr Thr Cys Asn Val Asp His Lys Pro Ser Asn Thr Lys Val Asp
195 200 205
Lys Arg Val Glu Ser Lys Tyr Gly Pro Pro Cys Pro Pro Cys Pro Ala
210 215 220
Pro Glu Phe Leu Gly Gly Pro Ser Val Phe Leu Phe Pro Pro Lys Pro
225 230 235 240
Lys Asp Thr Leu Met Ile Ser Arg Thr Pro Glu Val Thr Cys Val Val
245 250 255
Val Asp Val Ser Gln Glu Asp Pro Glu Val Gln Phe Asn Trp Tyr Val
260 265 270
Asp Gly Val Glu Val His Asn Ala Lys Thr Lys Pro Arg Glu Glu Gln
275 280 285
Phe Asn Ser Thr Tyr Arg Val Val Ser Val Leu Thr Val Leu His Gln
290 295 300
Asp Trp Leu Asn Gly Lys Glu Tyr Lys Cys Lys Val Ser Asn Lys Gly
305 310 315 320
Leu Pro Ser Ser Ile Glu Lys Thr Ile Ser Lys Ala Lys Gly Gln Pro
325 330 335
Arg Glu Pro Gln Val Tyr Thr Leu Pro Pro Ser Gln Glu Glu Met Thr
340 345 350
Lys Asn Gln Val Ser Leu Thr Cys Leu Val Lys Gly Phe Tyr Pro Ser
355 360 365
Asp Ile Ala Val Glu Trp Glu Ser Asn Gly Gln Pro Glu Asn Asn Tyr
370 375 380
Lys Thr Thr Pro Pro Val Leu Asp Ser Asp Gly Ser Phe Phe Leu Tyr
385 390 395 400
Ser Arg Leu Thr Val Asp Lys Ser Arg Trp Gln Glu Gly Asn Val Phe
405 410 415
Ser Cys Ser Val Met His Glu Ala Leu His Asn His Tyr Thr Gln Lys
420 425 430
Ser Leu Ser Leu Ser Leu Gly Lys
435 440
<210> 23
<211> 214
<212> PRT
<213> 人工序列
<220>
<223> 合成构建物
<400> 23
Glu Ile Val Leu Thr Gln Ser Pro Ala Thr Leu Ser Leu Ser Pro Gly
1 5 10 15
Glu Arg Ala Thr Leu Ser Cys Arg Ala Ser Gln Ser Val Ser Ser Tyr
20 25 30
Leu Ala Trp Tyr Gln Gln Lys Pro Gly Gln Ala Pro Arg Leu Leu Ile
35 40 45
Tyr Asp Ala Ser Asn Arg Ala Thr Gly Ile Pro Ala Arg Phe Ser Gly
50 55 60
Ser Gly Ser Gly Thr Asp Phe Thr Leu Thr Ile Ser Ser Leu Glu Pro
65 70 75 80
Glu Asp Phe Ala Val Tyr Tyr Cys Gln Gln Ser Ser Asn Trp Pro Arg
85 90 95
Thr Phe Gly Gln Gly Thr Lys Val Glu Ile Lys Arg Thr Val Ala Ala
100 105 110
Pro Ser Val Phe Ile Phe Pro Pro Ser Asp Glu Gln Leu Lys Ser Gly
115 120 125
Thr Ala Ser Val Val Cys Leu Leu Asn Asn Phe Tyr Pro Arg Glu Ala
130 135 140
Lys Val Gln Trp Lys Val Asp Asn Ala Leu Gln Ser Gly Asn Ser Gln
145 150 155 160
Glu Ser Val Thr Glu Gln Asp Ser Lys Asp Ser Thr Tyr Ser Leu Ser
165 170 175
Ser Thr Leu Thr Leu Ser Lys Ala Asp Tyr Glu Lys His Lys Val Tyr
180 185 190
Ala Cys Glu Val Thr His Gln Gly Leu Ser Ser Pro Val Thr Lys Ser
195 200 205
Phe Asn Arg Gly Glu Cys
210
<210> 24
<211> 118
<212> PRT
<213> 人工序列
<220>
<223> 合成构建物
<400> 24
Glu Val Gln Leu Val Glu Ser Gly Gly Gly Leu Val Gln Pro Gly Gly
1 5 10 15
Ser Leu Arg Leu Ser Cys Ala Ala Ser Gly Phe Thr Phe Ser Asp Ser
20 25 30
Trp Ile His Trp Val Arg Gln Ala Pro Gly Lys Gly Leu Glu Trp Val
35 40 45
Ala Trp Ile Ser Pro Tyr Gly Gly Ser Thr Tyr Tyr Ala Asp Ser Val
50 55 60
Lys Gly Arg Phe Thr Ile Ser Ala Asp Thr Ser Lys Asn Thr Ala Tyr
65 70 75 80
Leu Gln Met Asn Ser Leu Arg Ala Glu Asp Thr Ala Val Tyr Tyr Cys
85 90 95
Ala Arg Arg His Trp Pro Gly Gly Phe Asp Tyr Trp Gly Gln Gly Thr
100 105 110
Leu Val Thr Val Ser Ser
115
<210> 25
<211> 11
<212> PRT
<213> 人工序列
<220>
<223> 合成构建物
<400> 25
Trp Gly Gln Gly Thr Leu Val Thr Val Ser Ser
1 5 10
<210> 26
<211> 447
<212> PRT
<213> 人工序列
<220>
<223> 合成构建物
<400> 26
Glu Val Gln Leu Val Glu Ser Gly Gly Gly Leu Val Gln Pro Gly Gly
1 5 10 15
Ser Leu Arg Leu Ser Cys Ala Ala Ser Gly Phe Thr Phe Ser Asp Ser
20 25 30
Trp Ile His Trp Val Arg Gln Ala Pro Gly Lys Gly Leu Glu Trp Val
35 40 45
Ala Trp Ile Ser Pro Tyr Gly Gly Ser Thr Tyr Tyr Ala Asp Ser Val
50 55 60
Lys Gly Arg Phe Thr Ile Ser Ala Asp Thr Ser Lys Asn Thr Ala Tyr
65 70 75 80
Leu Gln Met Asn Ser Leu Arg Ala Glu Asp Thr Ala Val Tyr Tyr Cys
85 90 95
Ala Arg Arg His Trp Pro Gly Gly Phe Asp Tyr Trp Gly Gln Gly Thr
100 105 110
Leu Val Thr Val Ser Ser Ala Ser Thr Lys Gly Pro Ser Val Phe Pro
115 120 125
Leu Ala Pro Ser Ser Lys Ser Thr Ser Gly Gly Thr Ala Ala Leu Gly
130 135 140
Cys Leu Val Lys Asp Tyr Phe Pro Glu Pro Val Thr Val Ser Trp Asn
145 150 155 160
Ser Gly Ala Leu Thr Ser Gly Val His Thr Phe Pro Ala Val Leu Gln
165 170 175
Ser Ser Gly Leu Tyr Ser Leu Ser Ser Val Val Thr Val Pro Ser Ser
180 185 190
Ser Leu Gly Thr Gln Thr Tyr Ile Cys Asn Val Asn His Lys Pro Ser
195 200 205
Asn Thr Lys Val Asp Lys Lys Val Glu Pro Lys Ser Cys Asp Lys Thr
210 215 220
His Thr Cys Pro Pro Cys Pro Ala Pro Glu Leu Leu Gly Gly Pro Ser
225 230 235 240
Val Phe Leu Phe Pro Pro Lys Pro Lys Asp Thr Leu Met Ile Ser Arg
245 250 255
Thr Pro Glu Val Thr Cys Val Val Val Asp Val Ser His Glu Asp Pro
260 265 270
Glu Val Lys Phe Asn Trp Tyr Val Asp Gly Val Glu Val His Asn Ala
275 280 285
Lys Thr Lys Pro Arg Glu Glu Gln Tyr Ala Ser Thr Tyr Arg Val Val
290 295 300
Ser Val Leu Thr Val Leu His Gln Asp Trp Leu Asn Gly Lys Glu Tyr
305 310 315 320
Lys Cys Lys Val Ser Asn Lys Ala Leu Pro Ala Pro Ile Glu Lys Thr
325 330 335
Ile Ser Lys Ala Lys Gly Gln Pro Arg Glu Pro Gln Val Tyr Thr Leu
340 345 350
Pro Pro Ser Arg Glu Glu Met Thr Lys Asn Gln Val Ser Leu Thr Cys
355 360 365
Leu Val Lys Gly Phe Tyr Pro Ser Asp Ile Ala Val Glu Trp Glu Ser
370 375 380
Asn Gly Gln Pro Glu Asn Asn Tyr Lys Thr Thr Pro Pro Val Leu Asp
385 390 395 400
Ser Asp Gly Ser Phe Phe Leu Tyr Ser Lys Leu Thr Val Asp Lys Ser
405 410 415
Arg Trp Gln Gln Gly Asn Val Phe Ser Cys Ser Val Met His Glu Ala
420 425 430
Leu His Asn His Tyr Thr Gln Lys Ser Leu Ser Leu Ser Pro Gly
435 440 445
<210> 27
<211> 214
<212> PRT
<213> 人工序列
<220>
<223> 合成构建物
<400> 27
Asp Ile Gln Met Thr Gln Ser Pro Ser Ser Leu Ser Ala Ser Val Gly
1 5 10 15
Asp Arg Val Thr Ile Thr Cys Arg Ala Ser Gln Asp Val Ser Thr Ala
20 25 30
Val Ala Trp Tyr Gln Gln Lys Pro Gly Lys Ala Pro Lys Leu Leu Ile
35 40 45
Tyr Ser Ala Ser Phe Leu Tyr Ser Gly Val Pro Ser Arg Phe Ser Gly
50 55 60
Ser Gly Ser Gly Thr Asp Phe Thr Leu Thr Ile Ser Ser Leu Gln Pro
65 70 75 80
Glu Asp Phe Ala Thr Tyr Tyr Cys Gln Gln Tyr Leu Tyr His Pro Ala
85 90 95
Thr Phe Gly Gln Gly Thr Lys Val Glu Ile Lys Arg Thr Val Ala Ala
100 105 110
Pro Ser Val Phe Ile Phe Pro Pro Ser Asp Glu Gln Leu Lys Ser Gly
115 120 125
Thr Ala Ser Val Val Cys Leu Leu Asn Asn Phe Tyr Pro Arg Glu Ala
130 135 140
Lys Val Gln Trp Lys Val Asp Asn Ala Leu Gln Ser Gly Asn Ser Gln
145 150 155 160
Glu Ser Val Thr Glu Gln Asp Ser Lys Asp Ser Thr Tyr Ser Leu Ser
165 170 175
Ser Thr Leu Thr Leu Ser Lys Ala Asp Tyr Glu Lys His Lys Val Tyr
180 185 190
Ala Cys Glu Val Thr His Gln Gly Leu Ser Ser Pro Val Thr Lys Ser
195 200 205
Phe Asn Arg Gly Glu Cys
210
<210> 28
<211> 122
<212> PRT
<213> 人工序列
<220>
<223> 合成构建物
<400> 28
Glu Val Gln Leu Val Glu Ser Gly Gly Gly Leu Val Gln Pro Gly Gly
1 5 10 15
Ser Leu Arg Leu Ser Cys Ala Ala Ser Gly Phe Thr Phe Ser Asp Ser
20 25 30
Trp Ile His Trp Val Arg Gln Ala Pro Gly Lys Gly Leu Glu Trp Val
35 40 45
Ala Trp Ile Ser Pro Tyr Gly Gly Ser Thr Tyr Tyr Ala Asp Ser Val
50 55 60
Lys Gly Arg Phe Thr Ile Ser Ala Asp Thr Ser Lys Asn Thr Ala Tyr
65 70 75 80
Leu Gln Met Asn Ser Leu Arg Ala Glu Asp Thr Ala Val Tyr Tyr Cys
85 90 95
Ala Arg Arg His Trp Pro Gly Gly Phe Asp Tyr Trp Gly Gln Gly Thr
100 105 110
Leu Val Thr Val Ser Ser Ala Ser Thr Lys
115 120
<210> 29
<211> 108
<212> PRT
<213> 人工序列
<220>
<223> 合成构建物
<400> 29
Asp Ile Gln Met Thr Gln Ser Pro Ser Ser Leu Ser Ala Ser Val Gly
1 5 10 15
Asp Arg Val Thr Ile Thr Cys Arg Ala Ser Gln Asp Val Ser Thr Ala
20 25 30
Val Ala Trp Tyr Gln Gln Lys Pro Gly Lys Ala Pro Lys Leu Leu Ile
35 40 45
Tyr Ser Ala Ser Phe Leu Tyr Ser Gly Val Pro Ser Arg Phe Ser Gly
50 55 60
Ser Gly Ser Gly Thr Asp Phe Thr Leu Thr Ile Ser Ser Leu Gln Pro
65 70 75 80
Glu Asp Phe Ala Thr Tyr Tyr Cys Gln Gln Tyr Leu Tyr His Pro Ala
85 90 95
Thr Phe Gly Gln Gly Thr Lys Val Glu Ile Lys Arg
100 105
<210> 30
<211> 126
<212> PRT
<213> 人工序列
<220>
<223> 合成构建物
<400> 30
Gln Val Gln Leu Val Gln Ser Gly Ala Glu Val Lys Lys Pro Gly Ala
1 5 10 15
Ser Val Lys Val Ser Cys Lys Ala Ser Gly Tyr Thr Phe Thr Ser Tyr
20 25 30
Asp Ile Asn Trp Val Arg Gln Ala Thr Gly Gln Gly Leu Glu Trp Met
35 40 45
Gly Trp Leu Asn Pro Asp Ser Gly Val Ile Arg Tyr Ala Gln Lys Phe
50 55 60
Gln Gly Arg Val Thr Met Thr Arg Asp Thr Ser Ile Ser Thr Ala Tyr
65 70 75 80
Met Glu Leu Ser Ser Leu Arg Ser Glu Asp Thr Ala Val Tyr Tyr Cys
85 90 95
Ala Arg Glu Trp Phe Gly Glu Leu Pro Ser Tyr Tyr Phe Tyr Ser Gly
100 105 110
Met Asp Val Trp Gly Gln Gly Thr Thr Val Thr Val Ser Ser
115 120 125
<210> 31
<211> 107
<212> PRT
<213> 人工序列
<220>
<223> 合成构建物
<400> 31
Glu Ile Val Leu Thr Gln Ser Pro Ala Thr Leu Ser Leu Ser Pro Gly
1 5 10 15
Glu Arg Ala Thr Leu Ser Cys Arg Ala Ser Gln Ser Val Ser Ser Tyr
20 25 30
Leu Ala Trp Tyr Gln Gln Lys Pro Gly Gln Ala Pro Arg Leu Leu Ile
35 40 45
Tyr Asp Ala Ser Asn Arg Ala Thr Gly Ile Pro Ala Arg Phe Ser Gly
50 55 60
Ser Gly Ser Gly Thr Asp Phe Thr Leu Thr Ile Ser Ser Leu Glu Pro
65 70 75 80
Glu Asp Phe Ala Val Tyr Tyr Cys Gln Gln Arg Ser Asn Trp Pro Pro
85 90 95
Thr Phe Gly Pro Gly Thr Lys Val Asp Ile Lys
100 105
<210> 32
<211> 5
<212> PRT
<213> 人工序列
<220>
<223> 合成构建物
<400> 32
Ser Tyr Asp Ile Asn
1 5
<210> 33
<211> 17
<212> PRT
<213> 人工序列
<220>
<223> 合成构建物
<400> 33
Trp Leu Asn Pro Asp Ser Gly Val Ile Arg Tyr Ala Gln Lys Phe Gln
1 5 10 15
Gly
<210> 34
<211> 17
<212> PRT
<213> 人工序列
<220>
<223> 合成构建物
<400> 34
Glu Trp Phe Gly Glu Leu Pro Ser Tyr Tyr Phe Tyr Ser Gly Met Asp
1 5 10 15
Val
<210> 35
<211> 11
<212> PRT
<213> 人工序列
<220>
<223> 合成构建物
<400> 35
Arg Ala Ser Gln Ser Val Ser Ser Tyr Leu Ala
1 5 10
<210> 36
<211> 7
<212> PRT
<213> 人工序列
<220>
<223> 合成构建物
<400> 36
Asp Ala Ser Asn Arg Ala Thr
1 5
<210> 37
<211> 9
<212> PRT
<213> 人工序列
<220>
<223> 合成构建物
<400> 37
Gln Gln Arg Ser Asn Trp Pro Pro Thr
1 5
<210> 38
<211> 123
<212> PRT
<213> 人工序列
<220>
<223> 合成构建物
<400> 38
Gln Val Gln Leu Val Gln Ser Gly Ala Glu Val Lys Lys Pro Gly Ala
1 5 10 15
Ser Val Lys Val Ser Cys Lys Ala Phe Ala Tyr Thr Phe Ser Thr Tyr
20 25 30
Gly Ile Ser Trp Val Arg Gln Ala Pro Gly Gln Gly Leu Glu Trp Met
35 40 45
Gly Trp Ile Ser Ala Tyr Asn Ser Asn Thr Asn Tyr Ala Gln Lys Val
50 55 60
Gln Gly Arg Ile Thr Met Thr Thr Asp Thr Ser Thr Arg Thr Ala Tyr
65 70 75 80
Met Glu Leu Arg Gly Leu Arg Ser Asp Asp Thr Ala Val Tyr Phe Cys
85 90 95
Ala Thr Phe Phe Gly Gly His Ser Gly Tyr His Tyr Gly Leu Asp Val
100 105 110
Trp Gly Gln Gly Thr Thr Val Thr Val Ser Ser
115 120
<210> 39
<211> 108
<212> PRT
<213> 人工序列
<220>
<223> 合成构建物
<220>
<221> 变异
<222> 5, 48
<223> Xaa = 任何氨基酸
<400> 39
Glu Ile Val Leu Xaa Gln Ser Pro Ala Thr Leu Ser Leu Ser Pro Gly
1 5 10 15
Glu Arg Ala Thr Leu Ser Cys Arg Ala Ser Gln Ser Val Ser Ser Tyr
20 25 30
Leu Ala Trp Tyr Gln Gln Lys Pro Gly Gln Ala Pro Arg Leu Leu Xaa
35 40 45
Tyr Asp Ala Ser Asn Arg Ala Thr Gly Ile Pro Ala Arg Phe Ser Gly
50 55 60
Ser Gly Ser Gly Thr Asp Phe Thr Leu Thr Ile Ser Ser Leu Glu Pro
65 70 75 80
Glu Asp Phe Ala Val Tyr Tyr Cys Gln Gln Arg Ser Asn Trp Pro Pro
85 90 95
Tyr Thr Phe Gly Gln Gly Thr Lys Leu Glu Ile Lys
100 105
<210> 40
<211> 5
<212> PRT
<213> 人工序列
<220>
<223> 合成构建物
<400> 40
Thr Tyr Gly Ile Ser
1 5
<210> 41
<211> 17
<212> PRT
<213> 人工序列
<220>
<223> 合成构建物
<400> 41
Trp Ile Ser Ala Tyr Asn Ser Asn Thr Asn Tyr Ala Gln Lys Val Gln
1 5 10 15
Gly
<210> 42
<211> 14
<212> PRT
<213> 人工序列
<220>
<223> 合成构建物
<400> 42
Phe Phe Gly Gly His Ser Gly Tyr His Tyr Gly Leu Asp Val
1 5 10
<210> 43
<211> 11
<212> PRT
<213> 人工序列
<220>
<223> 合成构建物
<400> 43
Arg Ala Ser Gln Ser Val Ser Ser Tyr Leu Ala
1 5 10
<210> 44
<211> 7
<212> PRT
<213> 人工序列
<220>
<223> 合成构建物
<400> 44
Asp Ala Ser Asn Arg Ala Thr
1 5
<210> 45
<211> 10
<212> PRT
<213> 人工序列
<220>
<223> 合成构建物
<400> 45
Gln Gln Arg Ser Asn Trp Pro Pro Tyr Thr
1 5 10
<210> 46
<211> 123
<212> PRT
<213> 人工序列
<220>
<223> 合成构建物
<400> 46
Glu Val Gln Leu Val Glu Ser Gly Gly Gly Leu Val Gln Pro Gly Arg
1 5 10 15
Ser Leu Arg Leu Ser Cys Ala Ala Ser Gly Phe Thr Phe Asp Asp Tyr
20 25 30
Ala Met His Trp Val Arg Gln Ala Pro Gly Lys Gly Leu Glu Trp Val
35 40 45
Ser Gly Ile Asn Trp Ser Ser Gly Gly Ile Gly Tyr Ala Asp Ser Val
50 55 60
Lys Gly Arg Phe Thr Ile Ser Arg Asp Asn Ala Lys Asn Ser Leu Tyr
65 70 75 80
Leu Gln Met Asn Ser Leu Arg Ala Glu Asp Thr Ala Leu Tyr Tyr Cys
85 90 95
Ala Arg Asp Ile Gly Gly Phe Gly Glu Phe Tyr Trp Asn Phe Gly Leu
100 105 110
Trp Gly Arg Gly Thr Leu Val Thr Val Ser Ser
115 120
<210> 47
<211> 108
<212> PRT
<213> 人工序列
<220>
<223> 合成构建物
<400> 47
Glu Ile Val Leu Thr Gln Ser Pro Ala Thr Leu Ser Leu Ser Pro Gly
1 5 10 15
Glu Arg Ala Thr Leu Ser Cys Arg Ala Ser Gln Ser Val Arg Ser Tyr
20 25 30
Leu Ala Trp Tyr Gln Gln Lys Pro Gly Gln Ala Pro Arg Leu Leu Ile
35 40 45
Tyr Asp Ala Ser Asn Arg Ala Thr Gly Ile Pro Ala Arg Phe Ser Gly
50 55 60
Ser Gly Ser Gly Thr Asp Phe Thr Leu Thr Ile Ser Ser Leu Glu Pro
65 70 75 80
Glu Asp Phe Ala Val Tyr Tyr Cys Gln Gln Arg Ser Asn Trp Pro Pro
85 90 95
Ala Thr Phe Gly Gly Gly Thr Lys Val Glu Ile Lys
100 105
<210> 48
<211> 5
<212> PRT
<213> 人工序列
<220>
<223> 合成构建物
<400> 48
Asp Tyr Ala Met His
1 5
<210> 49
<211> 17
<212> PRT
<213> 人工序列
<220>
<223> 合成构建物
<400> 49
Gly Ile Asn Trp Ser Ser Gly Gly Ile Gly Tyr Ala Asp Ser Val Lys
1 5 10 15
Gly
<210> 50
<211> 14
<212> PRT
<213> 人工序列
<220>
<223> 合成构建物
<400> 50
Asp Ile Gly Gly Phe Gly Glu Phe Tyr Trp Asn Phe Gly Leu
1 5 10
<210> 51
<211> 11
<212> PRT
<213> 人工序列
<220>
<223> 合成构建物
<400> 51
Arg Ala Ser Gln Ser Val Arg Ser Tyr Leu Ala
1 5 10
<210> 52
<211> 7
<212> PRT
<213> 人工序列
<220>
<223> 合成构建物
<400> 52
Asp Ala Ser Asn Arg Ala Thr
1 5
<210> 53
<211> 10
<212> PRT
<213> 人工序列
<220>
<223> 合成构建物
<400> 53
Gln Gln Arg Ser Asn Trp Pro Pro Ala Thr
1 5 10
<210> 54
<211> 127
<212> PRT
<213> 人工序列
<220>
<223> 合成构建物
<400> 54
Gln Val Gln Leu Val Gln Ser Gly Ala Glu Val Lys Lys Pro Gly Ser
1 5 10 15
Ser Val Lys Val Ser Cys Lys Ala Ser Gly Gly Thr Leu Ser Ser Tyr
20 25 30
Ala Phe Ser Trp Val Arg Gln Ala Pro Gly Gln Gly Leu Glu Trp Met
35 40 45
Gly Gly Ile Ile Pro Phe Phe Gly Thr Thr Asn Tyr Ala Gln Lys Phe
50 55 60
Gln Gly Arg Val Ile Ile Thr Ala Asp Glu Ser Thr Asn Thr Ala Tyr
65 70 75 80
Met Glu Leu Ser Gly Leu Arg Ser Glu Asp Thr Ala Val Tyr Tyr Cys
85 90 95
Ala Arg Asp Arg Asp Tyr Tyr Gly Leu Gly Ser Pro Phe Tyr Tyr Tyr
100 105 110
Gly Met Asp Val Trp Gly Gln Gly Thr Thr Val Thr Val Ser Ser
115 120 125
<210> 55
<211> 107
<212> PRT
<213> 人工序列
<220>
<223> 合成构建物
<400> 55
Glu Ile Val Leu Thr Gln Ser Pro Asp Phe Gln Ser Val Thr Pro Lys
1 5 10 15
Glu Lys Val Thr Ile Thr Cys Arg Ala Ser Gln Ser Ile Gly Ser Ser
20 25 30
Leu His Trp Tyr Gln Gln Lys Pro Asp Gln Ser Pro Lys Leu Leu Ile
35 40 45
Lys Tyr Ala Ser Gln Ser Phe Ser Gly Val Pro Ser Arg Phe Ser Gly
50 55 60
Ser Gly Ser Gly Thr Asp Phe Thr Leu Thr Ile Asn Ser Leu Glu Ala
65 70 75 80
Glu Asp Ala Ala Thr Tyr Tyr Cys His Gln Ser Ser Ser Leu Pro Trp
85 90 95
Thr Phe Gly Gln Gly Thr Lys Val Glu Ile Lys
100 105
<210> 56
<211> 5
<212> PRT
<213> 人工序列
<220>
<223> 合成构建物
<400> 56
Ser Tyr Ala Phe Ser
1 5
<210> 57
<211> 17
<212> PRT
<213> 人工序列
<220>
<223> 合成构建物
<400> 57
Gly Ile Ile Pro Phe Phe Gly Thr Thr Asn Tyr Ala Gln Lys Phe Gln
1 5 10 15
Gly
<210> 58
<211> 18
<212> PRT
<213> 人工序列
<220>
<223> 合成构建物
<400> 58
Asp Arg Asp Tyr Tyr Gly Leu Gly Ser Pro Phe Tyr Tyr Tyr Gly Met
1 5 10 15
Asp Val
<210> 59
<211> 11
<212> PRT
<213> 人工序列
<220>
<223> 合成构建物
<400> 59
Arg Ala Ser Gln Ser Ile Gly Ser Ser Leu His
1 5 10
<210> 60
<211> 7
<212> PRT
<213> 人工序列
<220>
<223> 合成构建物
<400> 60
Tyr Ala Ser Gln Ser Phe Ser
1 5
<210> 61
<211> 9
<212> PRT
<213> 人工序列
<220>
<223> 合成构建物
<400> 61
His Gln Ser Ser Ser Leu Pro Trp Thr
1 5
<210> 62
<211> 447
<212> PRT
<213> 人工序列
<220>
<223> 合成构建物
<400> 62
Gln Val Gln Leu Val Gln Ser Gly Val Glu Val Lys Lys Pro Gly Ala
1 5 10 15
Ser Val Lys Val Ser Cys Lys Ala Ser Gly Tyr Thr Phe Thr Asn Tyr
20 25 30
Tyr Met Tyr Trp Val Arg Gln Ala Pro Gly Gln Gly Leu Glu Trp Met
35 40 45
Gly Gly Ile Asn Pro Ser Asn Gly Gly Thr Asn Phe Asn Glu Lys Phe
50 55 60
Lys Asn Arg Val Thr Leu Thr Thr Asp Ser Ser Thr Thr Thr Ala Tyr
65 70 75 80
Met Glu Leu Lys Ser Leu Gln Phe Asp Asp Thr Ala Val Tyr Tyr Cys
85 90 95
Ala Arg Arg Asp Tyr Arg Phe Asp Met Gly Phe Asp Tyr Trp Gly Gln
100 105 110
Gly Thr Thr Val Thr Val Ser Ser Ala Ser Thr Lys Gly Pro Ser Val
115 120 125
Phe Pro Leu Ala Pro Cys Ser Arg Ser Thr Ser Glu Ser Thr Ala Ala
130 135 140
Leu Gly Cys Leu Val Lys Asp Tyr Phe Pro Glu Pro Val Thr Val Ser
145 150 155 160
Trp Asn Ser Gly Ala Leu Thr Ser Gly Val His Thr Phe Pro Ala Val
165 170 175
Leu Gln Ser Ser Gly Leu Tyr Ser Leu Ser Ser Val Val Thr Val Pro
180 185 190
Ser Ser Ser Leu Gly Thr Lys Thr Tyr Thr Cys Asn Val Asp His Lys
195 200 205
Pro Ser Asn Thr Lys Val Asp Lys Arg Val Glu Ser Lys Tyr Gly Pro
210 215 220
Pro Cys Pro Pro Cys Pro Ala Pro Glu Phe Leu Gly Gly Pro Ser Val
225 230 235 240
Phe Leu Phe Pro Pro Lys Pro Lys Asp Thr Leu Met Ile Ser Arg Thr
245 250 255
Pro Glu Val Thr Cys Val Val Val Asp Val Ser Gln Glu Asp Pro Glu
260 265 270
Val Gln Phe Asn Trp Tyr Val Asp Gly Val Glu Val His Asn Ala Lys
275 280 285
Thr Lys Pro Arg Glu Glu Gln Phe Asn Ser Thr Tyr Arg Val Val Ser
290 295 300
Val Leu Thr Val Leu His Gln Asp Trp Leu Asn Gly Lys Glu Tyr Lys
305 310 315 320
Cys Lys Val Ser Asn Lys Gly Leu Pro Ser Ser Ile Glu Lys Thr Ile
325 330 335
Ser Lys Ala Lys Gly Gln Pro Arg Glu Pro Gln Val Tyr Thr Leu Pro
340 345 350
Pro Ser Gln Glu Glu Met Thr Lys Asn Gln Val Ser Leu Thr Cys Leu
355 360 365
Val Lys Gly Phe Tyr Pro Ser Asp Ile Ala Val Glu Trp Glu Ser Asn
370 375 380
Gly Gln Pro Glu Asn Asn Tyr Lys Thr Thr Pro Pro Val Leu Asp Ser
385 390 395 400
Asp Gly Ser Phe Phe Leu Tyr Ser Arg Leu Thr Val Asp Lys Ser Arg
405 410 415
Trp Gln Glu Gly Asn Val Phe Ser Cys Ser Val Met His Glu Ala Leu
420 425 430
His Asn His Tyr Thr Gln Lys Ser Leu Ser Leu Ser Leu Gly Lys
435 440 445
<210> 63
<211> 218
<212> PRT
<213> 人工序列
<220>
<223> 合成构建物
<400> 63
Glu Ile Val Leu Thr Gln Ser Pro Ala Thr Leu Ser Leu Ser Pro Gly
1 5 10 15
Glu Arg Ala Thr Leu Ser Cys Arg Ala Ser Lys Gly Val Ser Thr Ser
20 25 30
Gly Tyr Ser Tyr Leu His Trp Tyr Gln Gln Lys Pro Gly Gln Ala Pro
35 40 45
Arg Leu Leu Ile Tyr Leu Ala Ser Tyr Leu Glu Ser Gly Val Pro Ala
50 55 60
Arg Phe Ser Gly Ser Gly Ser Gly Thr Asp Phe Thr Leu Thr Ile Ser
65 70 75 80
Ser Leu Glu Pro Glu Asp Phe Ala Val Tyr Tyr Cys Gln His Ser Arg
85 90 95
Asp Leu Pro Leu Thr Phe Gly Gly Gly Thr Lys Val Glu Ile Lys Arg
100 105 110
Thr Val Ala Ala Pro Ser Val Phe Ile Phe Pro Pro Ser Asp Glu Gln
115 120 125
Leu Lys Ser Gly Thr Ala Ser Val Val Cys Leu Leu Asn Asn Phe Tyr
130 135 140
Pro Arg Glu Ala Lys Val Gln Trp Lys Val Asp Asn Ala Leu Gln Ser
145 150 155 160
Gly Asn Ser Gln Glu Ser Val Thr Glu Gln Asp Ser Lys Asp Ser Thr
165 170 175
Tyr Ser Leu Ser Ser Thr Leu Thr Leu Ser Lys Ala Asp Tyr Glu Lys
180 185 190
His Lys Val Tyr Ala Cys Glu Val Thr His Gln Gly Leu Ser Ser Pro
195 200 205
Val Thr Lys Ser Phe Asn Arg Gly Glu Cys
210 215

Claims (78)

1.一种用于在个体中治疗癌症或延迟癌症进展的方法,其包括施用对该个体有效量的PD-1轴结合拮抗剂和IL-17结合拮抗剂。
2.一种用于为PD-1轴结合拮抗剂和IL-17结合拮抗剂的治疗鉴定具有癌症的个体的方法,该方法包括:
(a)检测自该个体中的癌症获得的活检样品中IL-17的表达;并
(b)如果该活检样品显示IL-17的表达的话,或如果该活检样品显示与参照或参照样品相比升高的IL-17的表达的话,对该个体施用有效量的PD-1轴结合拮抗剂和IL-17结合拮抗剂。
3.一种用于为PD-1轴结合拮抗剂和IL-17结合拮抗剂的治疗鉴定具有癌症的个体的方法,该方法包括:
(a)检测自该个体中的癌症获得的活检样品中一种或多种选自由CD4,CD8a,IL17A,IL17B,IL17C,IL17D,IL17F,IL17RA,IL17RC,C3,CCL2,CCL20,CSF2,CSF3,CXCL1,CXCL2,CXCL3,CXCL5,CXCL10,CXCR1,CXCR2,ICAM1,IL6,IL8,MMP1,MMP2,MMP3,MMP8,MMP9,MMP13,MMP14,MMP25,NCF4,NFKBIZ,S100A8,S100A9,SAA2,SAA1,SAA3,SAA4,TIMP1,TIMP2,TIMP3,和TIMP4组成的组的基因的表达;并
(b)如果该活检样品显示一种或多种选自由CD4,CD8a,IL17A,IL17B,IL17C,IL17D,IL17F,IL17RA,IL17RC,C3,CCL2,CCL20,CSF2,CSF3,CXCL1,CXCL2,CXCL3,CXCL5,CXCL10,CXCR1,CXCR2,ICAM1,IL6,IL8,MMP1,MMP2,MMP3,MMP8,MMP9,MMP13,MMP14,MMP25,NCF4,NFKBIZ,S100A8,S100A9,SAA2,SAA1,SAA3,SAA4,TIMP1,TIMP2,TIMP3,和TIMP4组成的组的基因的表达的话,或如果该活检样品显示与参照或参照样品相比升高的一种或多种选自由CD4,CD8a,IL17A,IL17B,IL17C,IL17D,IL17F,IL17RA,IL17RC,C3,CCL2,CCL20,CSF2,CSF3,CXCL1,CXCL2,CXCL3,CXCL5,CXCL10,CXCR1,CXCR2,ICAM1,IL6,IL8,MMP1,MMP2,MMP3,MMP8,MMP9,MMP13,MMP14,MMP25,NCF4,NFKBIZ,S100A8,S100A9,SAA2,SAA1,SAA3,SAA4,TIMP1,TIMP2,TIMP3,和TIMP4组成的组的基因的表达的话,对该个体施用有效量的PD-1轴结合拮抗剂和IL-17结合拮抗剂。
4.权利要求1-3任一项的方法,其中该PD-1轴结合拮抗剂选自由PD-1结合拮抗剂,PDL1结合拮抗剂和PDL2结合拮抗剂组成的组。
5.权利要求4的方法,其中该PD-1轴结合拮抗剂是PD-1结合拮抗剂。
6.权利要求5的方法,其中该PD-1结合拮抗剂抑制PD-1对其配体结合配偶的结合。
7.权利要求6的方法,其中该PD-1结合拮抗剂抑制PD-1对PDL1的结合。
8.权利要求6的方法,其中该PD-1结合拮抗剂抑制PD-1对PDL2的结合。
9.权利要求6的方法,其中该PD-1结合拮抗剂抑制PD-1对PDL1和PDL2二者的结合。
10.权利要求6的方法,其中该PD-1结合拮抗剂是抗体。
11.权利要求10的方法,其中该PD-1结合拮抗剂是nivolumab。
12.权利要求10的方法,其中该PD-1结合拮抗剂是pembrolizumab。
13.权利要求10的方法,其中该PD-1结合拮抗剂是CT-011。
14.权利要求10的方法,其中该PD-1结合拮抗剂选自由MEDI-0680,PDR001,REGN2810,BGB-108,和BGB-A317组成的组。
15.权利要求6的方法,其中该PD-1结合拮抗剂是AMP-224。
16.权利要求4的方法,其中该PD-1轴结合拮抗剂是PDL1结合拮抗剂。
17.权利要求16的方法,其中该PDL1结合拮抗剂抑制PDL1对PD-1的结合。
18.权利要求16的方法,其中该PDL1结合拮抗剂抑制PDL1对B7-1的结合。
19.权利要求16的方法,其中该PDL1结合拮抗剂抑制PDL1对PD-1和B7-1二者的结合。
20.权利要求16的方法,其中该PDL1结合拮抗剂是抗PDL1抗体。
21.权利要求20的方法,其中该抗PDL1抗体是单克隆抗体。
22.权利要求20的方法,其中该抗PDL1抗体是选自由Fab,Fab’-SH,Fv,scFv,和(Fab’)2片段组成的组的抗体片段。
23.权利要求错误20-22任一项的方法,其中该抗PDL1抗体是人源化抗体或人抗体。
24.权利要求16的方法,其中该PDL1结合拮抗剂选自由YW243.55.S70,MPDL3280A,MDX-1105,MEDI4736,和avelumab组成的组。
25.权利要求20的方法,其中该抗体包含包含SEQ ID NO:15的HVR-H1序列,SEQ ID NO:16的HVR-H2序列,和SEQ ID NO:3的HVR-H3序列的重链;和包含SEQ ID NO:17的HVR-L1序列,SEQ ID NO:18的HVR-L2序列,和SEQ ID NO:19的HVR-L3序列的轻链。
26.权利要求20的方法,其中该抗体包含包括SEQ ID NO:24或SEQ ID NO:28的氨基酸序列的重链可变区和包括SEQ ID NO:21的氨基酸序列的轻链可变区。
27.权利要求4的方法,其中该PD-1轴结合拮抗剂是PDL2结合拮抗剂。
28.权利要求27的方法,其中该PDL2结合拮抗剂是抗体。
29.权利要求27的方法,其中该PDL2结合拮抗剂是免疫粘附素。
30.权利要求1-29任一项的方法,其中该IL-17结合拮抗剂抑制IL-17对IL-17受体的结合。
31.权利要求30的方法,其中该IL-17结合拮抗剂是抗体。
32.权利要求31的方法,其中该IL-17结合拮抗剂是单克隆抗体。
33.权利要求31的方法,其中该IL-17结合拮抗剂是选自由Fab,Fab’-SH,Fv,scFv,和(Fab’)2片段组成的组的抗体片段。
34.权利要求31-33任一项的方法,其中该IL-17结合拮抗剂是人源化抗体或人抗体。
35.权利要求31的方法,其中该抗体包含包含SEQ ID NO:32的CDR-H1序列,SEQ ID NO:33的CDR-H2序列,和SEQ ID NO:34的CDR-H3序列的重链;和包含SEQ ID NO:35的CDR-L1序列,SEQ ID NO:36的CDR-L2序列,和SEQ ID NO:37的CDR-L3序列的轻链。
36.权利要求31的方法,其中该抗体包含包含SEQ ID NO:30的氨基酸序列的重链可变区和包含SEQ ID NO:31的氨基酸序列的轻链可变区。
37.权利要求31的方法,其中该抗体包含包含SEQ ID NO:40的CDR-H1序列,SEQ ID NO:41的CDR-H2序列,和SEQ ID NO:42的CDR-H3序列的重链;和包含SEQ ID NO:43的CDR-L1序列,SEQ ID NO:44的CDR-L2序列,和SEQ ID NO:45的CDR-L3序列的轻链。
38.权利要求31的方法,其中该抗体包含包含SEQ ID NO:38的氨基酸序列的重链可变区和包含SEQ ID NO:39的氨基酸序列的轻链可变区。
39.权利要求31的方法,其中该抗体包含包含SEQ ID NO:48的CDR-H1序列,SEQ ID NO:49的CDR-H2序列,和SEQ ID NO:50的CDR-H3序列的重链;和包含SEQ ID NO:51的CDR-L1序列,SEQ ID NO:52的CDR-L2序列,和SEQ ID NO:53的CDR-L3序列的轻链。
40.权利要求31的方法,其中该抗体包含包含SEQ ID NO:46的氨基酸序列的重链可变区和包含SEQ ID NO:47的氨基酸序列的轻链可变区。
41.权利要求31的方法,其中该抗体包含包含SEQ ID NO:56的CDR-H1序列,SEQ ID NO:57的CDR-H2序列,和SEQ ID NO:58的CDR-H3序列的重链;和包含SEQ ID NO:59的CDR-L1序列,SEQ ID NO:60的CDR-L2序列,和SEQ ID NO:61的CDR-L3序列的轻链。
42.权利要求31的方法,其中该抗体包含包含SEQ ID NO:54的氨基酸序列的重链可变区和包含SEQ ID NO:55的氨基酸序列的轻链可变区。
43.权利要求31的方法,其中该IL-17结合拮抗剂是抗IL-17抗体。
44.权利要求43的方法,其中该抗IL-17抗体特异性结合IL-17A。
45.权利要求43的方法,其中该抗IL-17抗体特异性结合IL-17F。
46.权利要求43的方法,其中该抗IL-17抗体特异性结合IL-17A和IL-17F。
47.权利要求43的方法,其中该抗IL-17抗体是ixekizumab。
48.权利要求43的方法,其中该抗IL-17抗体是bimekizumab。
49.权利要求43的方法,其中该抗IL-17抗体是secukinumab。
50.权利要求31的方法,其中该IL-17结合拮抗剂是抗IL-17受体抗体。
51.权利要求50的方法,其中该抗IL-17受体抗体是brodalumab。
52.权利要求30的方法,其中该IL-17结合拮抗剂是包含至少一个来自IL-17受体的外显子的可溶性多肽。
53.权利要求52的方法,其中该可溶性多肽包含至少一个来自IL-17RA的外显子和至少一个来自IL-17RC的外显子。
54.权利要求1-53任一项的方法,其中自该个体的癌症获得的活检样品显示IL-17的表达。
55.权利要求54的方法,其中该IL-17的表达是IL-17mRNA的表达。
56.权利要求54的方法,其中该IL-17的表达是IL-17蛋白质的表达。
57.权利要求54-56任一项的方法,其中该自癌症获得的活检样品显示与参照样品相比升高的IL-17的表达。
58.权利要求1,2,和4-57任一项的方法,其中自该个体的癌症获得的活检样品显示一种或多种选自由CD4,CD8a,IL17A,IL17B,IL17C,IL17D,IL17F,IL17RA,IL17RC,C3,CCL2,CCL20,CSF2,CSF3,CXCL1,CXCL2,CXCL3,CXCL5,CXCL10,CXCR1,CXCR2,ICAM1,IL6,IL8,MMP1,MMP2,MMP3,MMP8,MMP9,MMP13,MMP14,MMP25,NCF4,NFKBIZ,S100A8,S100A9,SAA2,SAA1,SAA3,SAA4,TIMP1,TIMP2,TIMP3,和TIMP4组成的组的基因的表达。
59.权利要求57的方法,其中该自癌症获得的活检样品显示与参照样品相比升高的一种或多种选自由CD4,CD8a,IL17A,IL17B,IL17C,IL17D,IL17F,IL17RA,IL17RC,C3,CCL2,CCL20,CSF2,CSF3,CXCL1,CXCL2,CXCL3,CXCL5,CXCL10,CXCR1,CXCR2,ICAM1,IL6,IL8,MMP1,MMP2,MMP3,MMP8,MMP9,MMP13,MMP14,MMP25,NCF4,NFKBIZ,S100A8,S100A9,SAA2,SAA1,SAA3,SAA4,TIMP1,TIMP2,TIMP3,和TIMP4组成的组的基因的表达。
60.权利要求1-59任一项的方法,其中自该个体的癌症获得的活检样品显示一种或多种选自由NFKBIZ,S100A8,和S100A9组成的组的基因的表达。
61.权利要求60的方法,其中该自癌症获得的活检样品显示与参照样品相比升高的一种或多种选自由NFKBIZ,S100A8,和S100A9组成的组的基因的表达。
62.权利要求1-61任一项的方法,其中该癌选自由肾细胞癌,膀胱癌,非小细胞肺癌,鳞状非小细胞肺癌,非鳞状非小细胞肺癌,结直肠癌,黑素瘤,卵巢癌,乳腺癌,激素受体阳性乳腺癌,HER2阳性乳腺癌,和三重阴性乳腺癌组成的组。
63.权利要求1-62任一项的方法,其中该治疗在该治疗停止后在该个体中导致持久响应。
64.权利要求1-63任一项的方法,其中连续或间歇施用该IL-17结合拮抗剂或该PD-1轴结合拮抗剂。
65.权利要求1-64任一项的方法,其中在该PD-1轴结合拮抗剂之前施用该IL-17结合拮抗剂。
66.权利要求1-64任一项的方法,其中与该PD-1轴结合拮抗剂同时施用该IL-17结合拮抗剂。
67.权利要求66的方法,其中在同一组合物中配制该IL-17结合拮抗剂和该PD-1轴结合拮抗剂。
68.权利要求1-64任一项的方法,其中在该PD-1轴结合拮抗剂之后施用该IL-17结合拮抗剂。
69.一种在具有癌症的个体中增强免疫功能的方法,其包括施用有效量的PD-1轴结合拮抗剂和IL-17结合拮抗剂的组合。
70.权利要求1-69任一项的方法,其中静脉内,肌肉内,皮下,表面,口服,经皮,腹膜内,眶内,通过植入,通过吸入,鞘内,室内,或鼻内施用该PD-1轴结合拮抗剂或该IL-17结合拮抗剂。
71.一种试剂盒,其包含PD-1轴结合拮抗剂和包装插页,该包装插页包含关于与IL-17结合拮抗剂组合使用该PD-1轴结合拮抗剂以在个体中治疗癌症或延迟癌症进展的用法说明书。
72.一种试剂盒,其包含PD-1轴结合拮抗剂和IL-17结合拮抗剂及包装插页,该包装插页包含关于使用该PD-1轴结合拮抗剂和该IL-17结合拮抗剂以在个体中治疗癌症或延迟癌症进展的用法说明书。
73.权利要求72的试剂盒,其中在同一组合物中配制该PD-1轴结合拮抗剂和该IL-17结合拮抗剂。
74.一种试剂盒,其包含IL-17结合拮抗剂和包装插页,该包装插页包含关于与PD-1轴结合拮抗剂组合使用该IL-17结合拮抗剂以在个体中治疗癌症或延迟癌症进展的用法说明书。
75.一种试剂盒,其包含PD-1轴结合拮抗剂和包装插页,该包装插页包含关于与IL-17结合拮抗剂组合使用该PD-1轴结合拮抗剂以在具有癌症的个体中增强免疫功能的用法说明书。
76.一种试剂盒,其包含PD-1轴结合拮抗剂和IL-17结合拮抗剂及包装插页,该包装插页包含关于使用该PD-1轴结合拮抗剂和该IL-17结合拮抗剂以在具有癌症的个体中增强免疫功能的用法说明书。
77.权利要求76的试剂盒,其中在同一组合物中配制该PD-1轴结合拮抗剂和该IL-17结合拮抗剂。
78.一种试剂盒,其包含IL-17结合拮抗剂和包装插页,该包装插页包含关于与PD-1轴结合拮抗剂组合使用该IL-17结合拮抗剂以在具有癌症的个体中增强免疫功能的用法说明书。
CN201580048941.5A 2014-09-15 2015-09-14 使用pd‑1轴结合拮抗剂和il‑17结合拮抗剂治疗癌症的方法 Pending CN106687135A (zh)

Applications Claiming Priority (3)

Application Number Priority Date Filing Date Title
US201462050745P 2014-09-15 2014-09-15
US62/050,745 2014-09-15
PCT/US2015/050051 WO2016044189A1 (en) 2014-09-15 2015-09-14 Methods of treating cancer using pd-1 axis binding antagonist and il-17 binding antagonists

Publications (1)

Publication Number Publication Date
CN106687135A true CN106687135A (zh) 2017-05-17

Family

ID=54325043

Family Applications (1)

Application Number Title Priority Date Filing Date
CN201580048941.5A Pending CN106687135A (zh) 2014-09-15 2015-09-14 使用pd‑1轴结合拮抗剂和il‑17结合拮抗剂治疗癌症的方法

Country Status (5)

Country Link
US (3) US20170274073A1 (zh)
EP (1) EP3194440A1 (zh)
JP (2) JP2017534577A (zh)
CN (1) CN106687135A (zh)
WO (1) WO2016044189A1 (zh)

Cited By (2)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Publication number Priority date Publication date Assignee Title
CN110621697A (zh) * 2017-05-25 2019-12-27 百时美施贵宝公司 拮抗性cd40单克隆抗体及其用途
WO2020057225A1 (zh) * 2018-09-17 2020-03-26 苏州泓迅生物科技股份有限公司 一种抗pd-l1抗体及其制备方法和应用

Families Citing this family (21)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Publication number Priority date Publication date Assignee Title
US10441654B2 (en) 2014-01-24 2019-10-15 Children's Hospital Of Eastern Ontario Research Institute Inc. SMC combination therapy for the treatment of cancer
AU2016350701B2 (en) 2015-11-02 2021-08-19 Five Prime Therapeutics, Inc. CD80 extracellular domain polypeptides and their use in cancer treatment
PL3400246T3 (pl) 2016-01-08 2021-03-08 F. Hoffmann-La Roche Ag Sposoby leczenia nowotworów z dodatnim markerem cea z wykorzystaniem antagonistów wiążących oś pd-1 oraz przeciwciał dwuswoistych anty-cea/anty-cd3
WO2017136497A1 (en) * 2016-02-03 2017-08-10 The Cleveland Clinic Foundation Detection and treatment of il-17 and il-13 related conditions
AU2017248061A1 (en) * 2016-04-08 2018-10-25 Centre Antoine Lacassagne Methods and kits for predicting the sensitivity of a subject suffering of renal cancer to cancer treatment
WO2018027524A1 (en) * 2016-08-09 2018-02-15 Innovent Biologics (Suzhou) Co., Ltd. Pd-1 antibody formulation
US20190270802A1 (en) * 2016-10-21 2019-09-05 Merck Sharp & Dohme Corp. Treating cancer with a combination of a pd-1 antagonist and an il-27 antagonist
WO2018201014A1 (en) 2017-04-28 2018-11-01 Five Prime Therapeutics, Inc. Methods of treatment with cd80 extracellular domain polypeptides
CA3065553A1 (en) 2017-06-18 2018-12-27 Kindred Biosciences, Inc. Il17a antibodies and antagonists for veterinary use
EP3483180A1 (en) * 2017-11-14 2019-05-15 Affilogic Multi specific molecules
AU2019207812A1 (en) * 2018-01-12 2020-07-23 Bristol-Myers Squibb Company Combination therapy with anti-IL-8 antibodies and anti-PD-1 antibodies for treating cancer
WO2019152344A1 (en) * 2018-01-30 2019-08-08 University Of Louisville Research Foundation, Inc. Compositions and methods for treating inflammation and cancer
CA3100200A1 (en) * 2018-05-21 2019-11-28 Nanostring Technologies, Inc. Molecular gene signatures and methods of using same
CN110563842B (zh) * 2018-06-06 2022-07-29 浙江博锐生物制药有限公司 针对程序性死亡配体(pd-l1)的抗体及其应用
KR102091637B1 (ko) * 2018-07-10 2020-03-20 연세대학교 산학협력단 면역 항암 요법의 치료 반응에 관한 정보 제공 방법 및 이를 이용한 키트
WO2020150208A1 (en) * 2019-01-14 2020-07-23 Board Of Regents, The University Of Texas System Compositions and methods for treating cancer using il-17 signaling inhibitors and immune checkpoint inhibitors
EP3946377A1 (en) * 2019-04-03 2022-02-09 Orega Biotech Combination therapies based on pd1 and il-17b inhibitors
WO2020218322A1 (ja) * 2019-04-23 2020-10-29 国立大学法人東北大学 血中ケモカインを用いた免疫チェックポイント阻害薬の治療効果予測
WO2021202959A1 (en) * 2020-04-03 2021-10-07 Genentech, Inc. Therapeutic and diagnostic methods for cancer
CN115735009A (zh) * 2020-04-30 2023-03-03 詹森药业有限公司 鉴定il-17途径的调节剂的方法
WO2024021059A1 (en) * 2022-07-29 2024-02-01 Jinfeng Laboratory Non-human mammalian model expressing il-8 and use thereof

Citations (5)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Publication number Priority date Publication date Assignee Title
CN102177179A (zh) * 2008-08-08 2011-09-07 葛兰素集团有限公司 自身免疫性和炎性疾病的治疗
WO2011141823A3 (en) * 2010-05-14 2012-01-05 Orega Biotech Methods of treating and/or preventing cell proliferation disorders with il-17 antagonists
WO2013019906A1 (en) * 2011-08-01 2013-02-07 Genentech, Inc. Methods of treating cancer using pd-1 axis binding antagonists and mek inhibitors
CN103890008A (zh) * 2011-08-17 2014-06-25 霍夫曼-拉罗奇有限公司 在顽固性肿瘤中抑制血管发生
WO2014109617A1 (ko) * 2013-01-14 2014-07-17 가톨릭대학교 산학협력단 HtrA2 단백질을 유효성분으로 포함하는 자가면역질환의 예방 또는 치료용 조성물

Patent Citations (6)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Publication number Priority date Publication date Assignee Title
CN102177179A (zh) * 2008-08-08 2011-09-07 葛兰素集团有限公司 自身免疫性和炎性疾病的治疗
WO2011141823A3 (en) * 2010-05-14 2012-01-05 Orega Biotech Methods of treating and/or preventing cell proliferation disorders with il-17 antagonists
WO2013019906A1 (en) * 2011-08-01 2013-02-07 Genentech, Inc. Methods of treating cancer using pd-1 axis binding antagonists and mek inhibitors
CN103842030A (zh) * 2011-08-01 2014-06-04 霍夫曼-拉罗奇有限公司 使用pd-1轴结合拮抗剂和mek抑制剂治疗癌症的方法
CN103890008A (zh) * 2011-08-17 2014-06-25 霍夫曼-拉罗奇有限公司 在顽固性肿瘤中抑制血管发生
WO2014109617A1 (ko) * 2013-01-14 2014-07-17 가톨릭대학교 산학협력단 HtrA2 단백질을 유효성분으로 포함하는 자가면역질환의 예방 또는 치료용 조성물

Non-Patent Citations (4)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Title
B.ELEWSKI ET AL.: "A randomized, placebo- and active-controlled, parallel-group, multicentre, investigator-blinded study of four treatment regimens of posaconazole in adults with toenail onychomycosis", 《BRITISH JOURNAL OF DERMATOLOGY》 *
GOPAL MURUGAIYAN ET AL: "Protumor vs antitumor functions of IL-17", 《THE JOURNAL OF IMMUNOLOGY》 *
JÉRÉMY BASTID ET AL.: "Lymphocyte-derived interleukin-17A adds another brick in the wall of inflammation-induced breast carcinogenesis", 《ONCOIMMUNOLOGY》 *
S.MUENST ET AL: "Expression of programmed death ligand 1 (PD-L1) is associated with poor prognosis in human breast cancer", 《BREAST CANCER RESEARCH AND TREATMENT》 *

Cited By (3)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Publication number Priority date Publication date Assignee Title
CN110621697A (zh) * 2017-05-25 2019-12-27 百时美施贵宝公司 拮抗性cd40单克隆抗体及其用途
CN110621697B (zh) * 2017-05-25 2023-06-27 百时美施贵宝公司 拮抗性cd40单克隆抗体及其用途
WO2020057225A1 (zh) * 2018-09-17 2020-03-26 苏州泓迅生物科技股份有限公司 一种抗pd-l1抗体及其制备方法和应用

Also Published As

Publication number Publication date
EP3194440A1 (en) 2017-07-26
JP2021001176A (ja) 2021-01-07
WO2016044189A1 (en) 2016-03-24
US20200405855A1 (en) 2020-12-31
US20170274073A1 (en) 2017-09-28
WO2016044189A9 (en) 2017-05-11
JP2017534577A (ja) 2017-11-24
WO2016044189A8 (en) 2017-03-23
US20200155676A1 (en) 2020-05-21

Similar Documents

Publication Publication Date Title
US20200405855A1 (en) Methods of treating cancer using pd-1 axis binding antagonists and il-17 binding antagonists
AU2021202413B9 (en) Methods of treating cancer using PD-1 axis binding antagonists and TIGIT inhibitors
CN107109484B (zh) 用于ox40激动剂治疗的功效预测和评估的方法和生物标志物
CN111213059B (zh) 用于癌症的诊断和治疗方法
CN106796235B (zh) 用于检测t细胞免疫子集的测定法及其使用方法
CN109154613A (zh) 用于监测和治疗癌症的方法
CN106999583A (zh) 包含ox40结合激动剂和pd‑1轴结合拮抗剂的组合疗法
CN106102774A (zh) 包含ox40结合激动剂和pd‑1轴结合拮抗剂的组合疗法
CN107750164A (zh) 使用抗ox40抗体和pd‑1轴结合拮抗剂治疗癌症的方法
CN107667119A (zh) 用于癌症的治疗和诊断方法
CN107532217A (zh) 用于癌症的治疗和诊断方法
CN107810011A (zh) 使用抗ox40抗体治疗癌症的方法
CN105934253A (zh) 使用pd-1轴结合拮抗剂和抗her2抗体治疗her2阳性癌症的方法
CN109154027A (zh) 用于监测和治疗癌症的方法
CN102498129A (zh) 使用bv8拮抗剂或g-csf拮抗剂抑制肿瘤转移
CN113396230A (zh) 癌症的诊断和治疗方法
WO2021202959A1 (en) Therapeutic and diagnostic methods for cancer
CN115885050A (zh) 用于非小细胞肺癌免疫疗法的方法和组合物
RU2825390C2 (ru) Способы лечения рака с использованием антагонистов, связывающих с осью pd-1, и ингибиторов tigit
NZ755387B2 (en) Methods of treating cancer using pd-1 axis binding antagonists and tigit inhibitors
NZ755389B2 (en) Methods of treating cancer using pd-1 axis binding antagonists and tigit inhibitors
NZ715444B2 (en) Methods of treating cancer using pd-1 axis binding antagonists and tigit inhibitors

Legal Events

Date Code Title Description
PB01 Publication
PB01 Publication
SE01 Entry into force of request for substantive examination
SE01 Entry into force of request for substantive examination
REG Reference to a national code

Ref country code: HK

Ref legal event code: DE

Ref document number: 1237659

Country of ref document: HK

WD01 Invention patent application deemed withdrawn after publication

Application publication date: 20170517

WD01 Invention patent application deemed withdrawn after publication
REG Reference to a national code

Ref country code: HK

Ref legal event code: WD

Ref document number: 1237659

Country of ref document: HK