CN106544330B - 一种特异性高的果糖基肽氧化酶及其编码基因和用途 - Google Patents

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Abstract

本发明涉及酶工程领域,公开了一种果糖基肽氧化酶及其编码基因,该果糖基肽氧化酶的氨基酸序列如SEQ ID NO:1所示。本发明还公开了具有所述基因的重组载体及含有该重组载体的转化子。本发明还公开了所述果糖基肽氧化酶、基因、重组载体或转化子在酶法检测糖化血红蛋白中的应用。此外,本发明公开了一种增强果糖基肽氧化酶的特异性的方法,包括将来源于土正青霉的果糖基肽氧化酶的第62位精氨酸置换为另一种氨基酸,所述另一种氨基酸为赖氨酸、丙氨酸、天冬酰胺、谷氨酰胺、苯丙氨酸、缬氨酸、异亮氨酸、组氨酸、亮氨酸、丝氨酸、甲硫氨酸或脯氨酸。通过上述技术方案,本发明获得了酶活特异性明显提高的果糖基肽氧化酶,使得该酶更具有商业应用价值。

Description

一种特异性高的果糖基肽氧化酶及其编码基因和用途
技术领域
本发明涉及酶工程领域,具体地,涉及一种果糖基肽氧化酶及其编码基因和用途。
背景技术
糖尿病在中国属于高发病率慢性疾病,平均10个人就有一人是糖尿病患者。目前中国已成为全球糖尿病患病人数最多,患病率最高的国家。糖尿病严重危害到患者的健康,影响其生活质量,因此对糖尿病的治疗和监测十分重要。
在人体红细胞120天生命周期内,血红蛋白可以持续被糖基化,而糖化血红蛋白形成的速率与血糖浓度成正比,因此糖化血红蛋白的含量反映了2-3个月血糖控制的情况。研究发现,与单纯的血糖水平相比,糖化血红蛋白的水平用于诊断糖尿病能更好地反映长期血糖控制和慢性并发症的风险,具有生物变异性较小、无需空腹采血等优点。临床上检测糖化血红蛋白的方法有很多,其中基于果糖基氨基酸氧化酶的酶法检测因具有操作简单、快速、价廉、精密度高等优点引起越来越多的关注。
果糖基氨基酸氧化酶作为酶法检测糖化血红蛋白涉及的关键酶,是一类能水解果糖基氨基酸的酶。有些以α-果糖基氨基酸(例如α-果糖基缬氨酸(Fructosyl-aN-valine),f-αVal)和ε-果糖基氨基酸(例如ε-果糖基赖氨酸(Fructosyl-εN-lysine),f-εLys)为底物的果糖基氨基酸氧化酶对糖基化二肽或糖基化六肽具有活性,这类果糖基氨基酸氧化酶又被称为果糖基肽氧化酶,其由于既可以果糖基氨基酸为底物又可以果糖基二肽为底物,对检测糖化血红蛋白的前期处理的要求低,应用范围更广。
然而,由于糖化白蛋白在蛋白酶的作用下分解释放出f-εLys,而f-εLys也可以作为果糖基肽氧化酶的底物,因此在全血检测糖化血红蛋白时,糖化白蛋白成为其最主要的干扰因素,这就要求用于糖化血红蛋白检测的果糖基肽氧化酶尽可能对f-εLys的酶活低。即,开发酶活特异性高(对f-αVal的专一性高且对f-αVal的比活力高于对f-εLys的比活力)的果糖基肽氧化酶更具有实际应用价值。
发明内容
本发明的目的是针对现有果糖基肽氧化酶特异性不高的缺点,提供一种特异性高的酶突变体及其编码基因和相关用途。
为了实现上述目的,本发明的发明人利用生物技术手段对来源于土正青霉(Eupenicillium terrenum)的果糖基肽氧化酶进行了改造,发现第62位精氨酸是该酶与底物相互作用的关键位点,突变(置换)其第62位精氨酸即可有效改变其特异性,因此,第一方面,本发明提供了一种果糖基肽氧化酶,该果糖基肽氧化酶的氨基酸序列如SEQ ID NO:1所示。
第二方面,本发明提供了编码第一方面所述的果糖基肽氧化酶的基因。
第三方面,本发明提供了具有第二方面所述的基因的重组载体。
第四方面,本发明提供了含有第三方面所述的重组载体的转化子。
第五方面,本发明提供了第一方面所述的果糖基肽氧化酶、第二方面所述的基因、第三方面所述的重组载体或第四方面所述的转化子在酶法检测糖化血红蛋白中的应用。
第六方面,本发明提供了一种增强果糖基肽氧化酶的特异性的方法,该方法包括将来源于土正青霉的果糖基肽氧化酶的第62位精氨酸置换为另一种氨基酸,所述另一种氨基酸为赖氨酸、丙氨酸、天冬酰胺、谷氨酰胺、苯丙氨酸、缬氨酸、异亮氨酸、组氨酸、亮氨酸、丝氨酸、甲硫氨酸或脯氨酸。
通过上述技术方案,本发明获得了酶活特异性明显提高的果糖基肽氧化酶,使得该酶更具有商业应用价值。
本发明的其它特征和优点将在随后的具体实施方式部分予以详细说明。
附图说明
附图是用来提供对本发明的进一步理解,并且构成说明书的一部分,与下面的具体实施方式一起用于解释本发明,但并不构成对本发明的限制。在附图中:
图1为野生型果糖基肽氧化酶及本发明获得的果糖基肽氧化酶经纯化后的SDS-PAGE电泳图;
图2为野生型果糖基肽氧化酶及本发明获得的果糖基肽氧化酶的特异性比较结果;
图3为野生型果糖基肽氧化酶及本发明获得的果糖基肽氧化酶的比活力测定结果。
具体实施方式
以下对本发明的具体实施方式进行详细说明。应当理解的是,此处所描述的具体实施方式仅用于说明和解释本发明,并不用于限制本发明。
在本发明中,在未作相反说明的情况下,使用的术语“酶活力”的大小即酶含量的多少,用酶活力单位表示,即酶单位(U),本发明中酶单位的定义是:在37℃、pH 8的条件下,每分钟产生1μmol氨基酸产物所需要的酶量定义为一个酶单位,即1U=1μmol/min;“酶的比活力”代表每单位质量蛋白质的催化能力,能够反应酶活性大小,其值越大,表明酶活性越高,比活力的计算公式为:比活力(U/mg)=总酶活力单位数/mg总蛋白;“特异性”是指果糖基肽氧化酶对某种底物(f-αVal或f-εLys)的专一性,特异性高主要指对f-αVal的专一性高且对f-αVal的比活力远高于对f-εLys的比活力;单位M=mol/L,相应地,mM=mmol/L,依此类推。
组成蛋白质的20种氨基酸,按照侧链极性可以分成四类:1、非极性的氨基酸:丙氨酸(Ala,A)、缬氨酸(Val,V)、亮氨酸(Leu,L)、异亮氨酸(Ile,I)、甲硫氨酸(Met,M)、苯丙氨酸(Phe,F)、色氨酸(Trp,W)和脯氨酸(Pro,P);2、极性不带电荷的氨基酸:甘氨酸(Gly,G)、丝氨酸(Ser,S)、苏氨酸(Thr,T)、半胱氨酸(Cys,C)、天冬酰胺(Asn,N)、谷氨酰胺(Gln,Q)和酪氨酸(Tyr,Y);3、带正电荷的氨基酸:精氨酸(Arg,R)、赖氨酸(Lys,K)和组氨酸(His,H);4、带负电荷的氨基酸:天冬氨酸(Asp,D)和谷氨酸(Glu,E)。本发明中使用的缩写“R62K”是指第62位的R残基突变为K残基,依此类推。
第一方面,本发明提供的果糖基肽氧化酶的氨基酸序列如下面的SEQ ID NO:1所示。
MAHSRASTKVVVVGGGGTIGSSTALHLIRSGYTPSNITVLDVYKTPSLQSAGHDLNKIMGIXLRNGPDLQLSLESLDMWQNDELFKPFFHQVGMIDCSSSKEGIENLRRKYQTLLDAGIGLEKTNVWLESEDEILAKAPNFTREQVKGWKGLFCTDGGWLAAAKAINAIGIFLQDKGVKFGFGGAGTFQQPLFAADGKTCIGLETTDGTKYFADKVVLAAGAWSPTLVDLEDQCVSKAWVFAHIQLTPKEADAYKNVPVVYDGEYGFFFEPNEYGVIKVCDEFPGFSRFKLHQPYGAASPKMISVPRSHAKHPTDTYPDASEVTIRKAIARFLPEFKDKELFNRTMCWCTDTADANLLICEHPKWKNFILATGDSGHSFKLLPNIGKHVVELLEGSLSQEMAGAWRWRPGGDALRSRRGAPAKDLAEMPGWKHDAHL(SEQ ID NO:1,其中X=K、A、N、Q、F、V、I、H、L、S、M或P)
优选地,SEQ ID NO:1中的X为A、N、Q、V、I、H、L、S或M。更优选地,SEQ ID NO:1中的X为N、Q、V、I、H、L或M。进一步优选地,SEQ ID NO:1中的X为V、I、L或M。
在特别优选的实施方式中,SEQ ID NO:1中的X为N、Q、V、I或M,此时能够在提高酶活性的前提下进一步提高特异性。
第二方面,本发明提供了编码第一方面所述的果糖基肽氧化酶的基因。本发明提供的基因的序列为SEQ ID NO:2的第184-186位碱基(CGA)分别置换为如下所示碱基的序列(可参照王镜岩等主编的《生物化学》第三版下册第511页的表37-5遗传密码字典获得)。
X为K:AAA或AAG
X为A:GCT、GCC、GCA或GCG
X为N:AAT或AAC
X为Q:CAA或CAG
X为F:TTT或TTC
X为V:GTT、GTC、GTA或GTG
X为I:ATT、ATC或ATA
X为H:CAT或CAC
X为L:TTA、TTG、CTT、CTC、CTA或CTG
X为S:TCT、TCC、TCA、TCG、AGT或AGC
X为M:ATG
X为P:CCT、CCC、CCA或CCG
ATGGCTCATTCGCGTGCAAGCACCAAAGTCGTCGTGGTTGGGGGAGGTGGTACGATCGGGTCTTCGACGGCTCTGCACTTAATCCGCTCTGGATATACCCCCTCAAATATCACCGTGCTTGACGTATACAAGACCCCTTCATTGCAATCTGCAGGACATGATTTGAACAAGATCATGGGCATTCGATTGCGCAACGGGCCTGACTTGCAGCTTTCGCTGGAATCACTCGACATGTGGCAAAACGATGAGTTGTTCAAGCCATTCTTTCACCAAGTGGGCATGATTGATTGTTCGTCATCCAAAGAGGGTATTGAAAATCTTCGACGAAAATACCAGACCCTCCTCGATGCGGGCATTGGGCTGGAGAAGACGAACGTTTGGCTGGAATCTGAAGATGAGATCCTCGCCAAAGCGCCGAATTTCACGCGTGAACAAGTCAAGGGGTGGAAAGGCTTATTTTGCACTGATGGAGGCTGGCTTGCTGCAGCCAAGGCTATCAATGCGATCGGAATTTTCCTCCAGGACAAAGGTGTCAAGTTTGGCTTTGGAGGTGCTGGAACATTTCAGCAACCTCTGTTCGCCGCTGATGGAAAAACTTGCATCGGACTTGAAACTACAGACGGAACCAAGTACTTTGCTGACAAGGTTGTCTTGGCTGCTGGTGCGTGGAGTCCCACCTTGGTGGATCTAGAAGATCAGTGTGTTTCAAAGGCCTGGGTTTTCGCTCATATTCAACTCACACCCAAAGAAGCGGACGCGTACAAGAATGTGCCTGTGGTCTATGATGGTGAATATGGGTTCTTTTTTGAGCCCAACGAGTATGGGGTGATCAAAGTCTGTGACGAGTTCCCTGGTTTCTCTCGCTTCAAACTGCATCAACCGTACGGGGCTGCATCTCCCAAGATGATATCCGTACCGCGATCACACGCCAAGCATCCCACAGATACCTACCCTGATGCCTCCGAAGTCACCATACGCAAAGCGATCGCAAGGTTCCTGCCAGAATTTAAAGACAAGGAGCTCTTCAACCGTACCATGTGCTGGTGTACAGATACGGCCGATGCTAACTTATTGATTTGCGAACACCCGAAGTGGAAGAATTTCATTCTGGCCACTGGAGATAGCGGACATTCCTTCAAGCTGTTGCCAAACATCGGGAAACACGTTGTTGAGCTTTTAGAGGGATCTCTATCGCAGGAAATGGCTGGTGCCTGGAGATGGAGACCCGGAGGTGATGCTCTTAGATCTAGACGCGGTGCTCCGGCAAAGGATCTTGCTGAGATGCCGGGATGGAAGCATGATGCACATTTGTGA(SEQ ID NO:2)
第三方面,本发明提供了具有第二方面所述的基因的重组载体。所述重组载体既可以为重组克隆载体,也可为重组表达载体。根据本发明的一种实施方式,所述重组载体可以为pET22b载体的多克隆位点(如BamHI和XhoI)或pET28a载体的多克隆位点(如NdeI和XhoI)间插入有所述基因的重组载体。
第四方面,本发明提供了含有第三方面所述的重组载体的转化子。所述转化子可以为含有本发明的重组载体的菌株,例如,可以通过将本发明的重组载体转入感受态菌株(如大肠杆菌感受态菌株Top10、TG1、DH5a或BL21(DE3))中而获得。
第五方面,本发明提供了第一方面所述的果糖基肽氧化酶、第二方面所述的基因、第三方面所述的重组载体或第四方面所述的转化子在酶法检测糖化血红蛋白中的应用。本发明的果糖基肽氧化酶对f-αVal的特异性高,从而能够用于更有效地检测糖化血红蛋白。
第六方面,本发明提供了一种增强果糖基肽氧化酶的特异性的方法,该方法包括将来源于土正青霉的果糖基肽氧化酶的第62位R置换为另一种氨基酸,所述另一种氨基酸为K、A、N、Q、F、V、I、H、L、S、M或P。置换后得到的酶的氨基酸序列如SEQ ID NO:1所示。
优选地,所述另一种氨基酸为A、N、Q、V、I、H、L、S或M。更优选地,所述另一种氨基酸为N、Q、V、I、H、L或M。进一步优选地,所述另一种氨基酸为V、I、L或M。
在特别优选的实施方式中,所述另一种氨基酸为N、Q、V、I或M,此时能够在提高酶活性的前提下进一步提高特异性。
以下将通过实施例对本发明进行详细描述。
以下实施例中,基因测序委托金唯智生物科技有限公司完成;引物合成委托生工生物工程股份有限公司完成;酶的纯度经SDS-聚丙烯酰胺凝胶电泳后通过Bandscan分析目的条带的灰度和Marker的灰度比后估算得到;酶的浓度通过BCA蛋白定量试剂盒(Sigma)测得;f-αVal和f-εLys委托中国科学院生物物理研究所合成得到,结构式分别为:
下述实施例中所使用的实验方法如无特殊说明,均为常规方法;所用的材料、试剂等如无特殊说明,均可从商业途径得到。
实施例1
本实施例用来说明表达果糖基肽氧化酶的编码基因和转化子的构建。
以BamHI和XhoI酶切位点之间携带有果糖基肽氧化酶的编码序列(SEQ ID NO:2)的pET22b载体质粒为模板,对其进行饱和突变,得到第184-186位碱基(CGA)分别置换为AAG、GCA、GAT、GAG、AAT、CAG、TTC、TAT、TGG、GGA、GTT、ATT、CAT、CTT、AGT、ACA、TGT、ATG和CCT的突变体R62K、R62A、R62D、R62E、R62N、R62Q、R62F、R62Y、R62W、R62G、R62V、R62I、R62H、R62L、R62S、R62T、R62C、R62M和R62P的编码基因。
采用QuikChange定点突变试剂盒(Stratagene公司)进行PCR,具体突变和使用的引物如表1所示,PCR反应体系如下:
PCR条件如下:
预变性:98℃30sec;变性:98℃10sec,退火:60℃30sec,延伸:72℃4min,25个循环;最后延伸:72℃10min。
表1
向50μl的PCR产物中加入1μl的DpnI酶,37℃消化3小时。从消化后的混合液中取10μl直接转化大肠杆菌感受态细胞DH5a(购自天根生化科技有限公司)中,涂布LB氨苄平板,倒置于37℃培养箱培养12h。从平板上挑取单克隆,接种于5ml含100μg/ml氨苄青霉素的LB培养基中,37℃培养9h。采用Omega质粒小量提取试剂盒抽取质粒,经基因测序证实突变成功的质粒(R62K、R62A、R62D、R62E、R62N、R62Q、R62F、R62Y、R62W、R62G、R62V、R62I、R62H、R62L、R62S、R62T、R62C、R62M和R62P)分别转化大肠杆菌表达菌株BL21(DE3)(购自天根生化科技有限公司)。
实施例2
本实施例用来说明果糖基肽氧化酶的表达。
将实施例1中转化有正确突变基因的BL21菌株按照1:1000比例接种至100ml的LB培养基(100μg/ml氨苄青霉素)中,37℃培养过夜。然后将过夜培养的菌液按照1:100的比例接种至含800ml LB培养基(100μg/ml氨苄青霉素)的大瓶中,37℃、200rpm培养3小时,至OD值达0.8,向大瓶中加入诱导剂异丙基-β-d-硫代半乳糖苷(IPTG)至终浓度为0.5mM,16℃诱导表达18h,4℃、4000rpm离心30分钟收集菌体。
实施例3
本实施例用来说明果糖基肽氧化酶的纯化。
参照Ni-NTA产品使用说明书,采用镍离子金属鳌合亲和层析方法纯化酶:将实施例2收集的菌体用裂解缓冲液(Lysis buffer)重悬,超声破碎,破碎液离心后上清与Ni-NTABeads(购自QIAGEN公司)在4℃下结合1小时,经过不同浓度(10mM、50mM、100mM、300mM和500mM)的咪唑洗脱液洗脱,获得较纯的果糖基肽氧化酶,纯度大于95%,SDS-PAGE电泳图见图1。
裂解缓冲液成分:10mM的Tris-HCl,100mM的NaCl,pH 8。
实施例4
本实施例用来说明果糖基肽氧化酶的酶活性及特异性。
(1)测活试剂A的配制:
(2)酶液的稀释:用20mM磷酸钾缓冲液(pH 8)将实施例3中纯化的酶稀释到合适浓度,如0.05-0.1mg/ml。
(3)取792μl上述测活试剂A于1ml石英比色皿中,37℃孵育5min,加入8μl稀释后的酶液,迅速搅动混匀,于37℃下反应,开始计时3min并连续读取555nm吸光度的值,然后按照如下公式计算酶的比活力:
其中,ΔA/min:每分钟吸光度的变化值
Vt:反应液总体积
D:酶液稀释倍数
ε:生成的苯醌在555nm下的消光系数,取39.2(cm2/μmol)
Vs:加入反应体系的酶液体积
d:比色杯光径(1cm)
将野生型果糖基肽氧化酶(WT)和实施例4获得的各果糖基肽氧化酶对f-αVal的比活力与对f-εLys的比活力相比,比值定义为p值,对p值作直方图(见图2),可以直观地看出特异性提高的突变体有R62K、R62A、R62N、R62Q、R62F、R62V、R62I、R62H、R62L、R62S、R62M和R62P。
各个果糖基肽氧化酶对f-αVal的比活力测定结果如图3所示,图3示出的是各个果糖基肽氧化酶的比活力与野生型果糖基肽氧化酶的比活力(定义为100%)之间的百分比(相对活性),百分比值越高,说明酶活性越强。
从图2和图3可以看出,突变体R62K、R62A、R62N、R62Q、R62V、R62I、R62H、R62L和R62M在保证酶活性(相对活性在68%以上)的前提下提高了特异性,特别是突变体R62N、R62Q、R62V、R62I和R62M,其酶活性和对f-αVal的特异性均得到了大幅度提高。
以上详细描述了本发明的优选实施方式,但是,本发明并不限于上述实施方式中的具体细节,在本发明的技术构思范围内,可以对本发明的技术方案进行多种简单变型,这些简单变型均属于本发明的保护范围。
另外需要说明的是,在上述具体实施方式中所描述的各个具体技术特征,在不矛盾的情况下,可以通过任何合适的方式进行组合,为了避免不必要的重复,本发明对各种可能的组合方式不再另行说明。
此外,本发明的各种不同的实施方式之间也可以进行任意组合,只要其不违背本发明的思想,其同样应当视为本发明所公开的内容。

Claims (9)

1.一种果糖基肽氧化酶,其特征在于,该果糖基肽氧化酶的氨基酸序列如SEQ ID NO:1所示。
2.编码权利要求1所述的果糖基肽氧化酶的基因。
3.一种重组载体,该重组载体具有权利要求2所述的基因。
4.一种转化子,该转化子含有权利要求3所述的重组载体。
5.权利要求1所述的果糖基肽氧化酶、权利要求2所述的基因、权利要求3所述的重组载体或权利要求4所述的转化子在制备酶法检测糖化血红蛋白的产品中的应用。
6.一种增强果糖基肽氧化酶的特异性的方法,其特征在于,该方法包括将来源于土正青霉(Eupenicillium terrenum)的果糖基肽氧化酶的第62位精氨酸置换为另一种氨基酸,所述另一种氨基酸为赖氨酸、丙氨酸、天冬酰胺、谷氨酰胺、苯丙氨酸、缬氨酸、异亮氨酸、组氨酸、亮氨酸、丝氨酸、甲硫氨酸或脯氨酸。
7.根据权利要求6所述的方法,其中,所述另一种氨基酸为丙氨酸、天冬酰胺、谷氨酰胺、缬氨酸、异亮氨酸、组氨酸、亮氨酸、丝氨酸或甲硫氨酸。
8.根据权利要求6所述的方法,其中,所述另一种氨基酸为天冬酰胺、谷氨酰胺、缬氨酸、异亮氨酸、组氨酸、亮氨酸或甲硫氨酸。
9.根据权利要求6-8中任意一项所述的方法,其中,所述另一种氨基酸为缬氨酸、异亮氨酸、亮氨酸或甲硫氨酸。
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Engineering fructosyl peptide oxidase to improve activity toward the fructosyl hexapeptide standard for HbA1c measurement;Stefano Ferri et al.;《Mol Biotechnol》;20130120;第53卷;第939-943页 *
Molecular cloning and expression of novel fructosyl peptide oxidases and their application for the measurement of glycated protein;Kozo Hirokawa et al.;《Biochemical and Biophysical Research Communications》;20031231;摘要,第105页右栏第3段-第106页左栏第3段,第106页右栏第1段 *

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