CN106535891A - 组蛋白脱乙酰酶抑制剂及其组合物和使用方法 - Google Patents

组蛋白脱乙酰酶抑制剂及其组合物和使用方法 Download PDF

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Abstract

本申请提供一些具有式I的组蛋白脱乙酰酶(HDAC)抑制剂或其药用盐、其组合物及它们的使用方法。由HDAC介导的病症或障碍包括神经变性病理。因此，本申请还提供在需要所述治疗的受试者中治疗由HDAC介导的神经变性病理的方法，其包括向所述受试者给药治疗有效量的至少一种本申请所述化合物或其药用盐。

Description

组蛋白脱乙酰酶抑制剂及其组合物和使用方法
本申请要求2014年6月2日提交的美国申请62/006,534的优先权，出于所有目的将其引入到本申请中作为参考。
本申请提供一些组蛋白脱乙酰酶(HDAC)抑制剂、其组合物和它们的使用方法。
组蛋白脱乙酰酶(HDAC)是含有锌的酶，其催化乙酰基从簇生在核小体组蛋白的氨基末端附近的赖氨酸残基的ε-氨基末端中除去。存在11种已知的金属依赖性人组蛋白脱乙酰酶，根据其辅结构域的结构将其分成四类。第I类包括HDAC1、HDAC2、HDAC3及HDAC8并与酵母RPD3具有同源性。HDAC4、HDAC5、HDAC7及HDAC9属于第IIa类并与酵母HDAC1具有同源性。HDAC6及HDAC10含有两个催化位点且被归类为第IIb类，而HDAC11在其催化中心中具有保守性残基且有时候被置于第IV类中，所述保守性残基为第I类及第II类脱乙酰酶所共有。
本申请提供式I化合物或其药用盐：
其中：
R1选自-C(O)NH(OH)和-N(OH)C(O)R9；
R2选自芳基、杂芳基和杂环烷基，其各自任选取代有1至3个独立选自以下的取代基：卤素、烷基、环烷基、卤代烷基、羟基、烷氧基和腈基团；
A选自芳基和杂芳基；
R3和R4独立选自氢、烷基、卤素、NHSO2R10、C(O)NR11R12、NR11R12、腈基团、环烷基、杂环烷基、芳基、杂芳基、芳烷基和杂芳烷基，其各自任选取代有1至3个独立选自以下的取代基：卤素、烷基、环烷基、卤代烷基、羟基、烷氧基、芳基、杂芳基和腈基团，其中烷基和烷氧基任选取代有氨基、(烷基)氨基或二(烷基)氨基；
R5、R6、R7和R8在每次出现时独立选自氢和低级烷基；
R9选自氢和低级烷基；
R10选自低级烷基、环烷基、杂环烷基、芳基和杂芳基；
R11和R12独立选自氢、低级烷基、烷氧基、低级卤代烷基和环烷基，其中烷基和烷氧基任选取代有氨基、(烷基)氨基或二(烷基)氨基，且
m和m’独立选自0、1、2、3和4，条件是2≤(m+m’)≤4。
本申请还提供药物组合物，其包含本申请所述化合物或其药用盐和至少一种药用赋形剂。
本申请还提供在需要所述治疗的受试者中治疗由至少一种组蛋白脱乙酰酶介导的病症或障碍的方法，其包括向所述受试者给药治疗有效量的本申请所述化合物或其药用盐。
本说明书使用的以下词语、短语及符号通常旨在具有下述意义，除非它们在上下文中另有说明。
不是在两个字母或符号之间的破折号(“-”)用于表示取代基的连接点。例如，-CONH2通过碳原子来连接。
“任选的”或“任选地”是指随后描述的事件或情况可能发生或可能不发生且所述描述包括所述事件或情况发生的状态及所述事件或情况不发生的状态。例如，“任选取代的烷基”包括如下定义的“烷基”和“取代的烷基”。就含有一个或多个取代基的任意基团而言，本领域技术人员应该理解的是，所述基团没有预期引入在立体上不切实际的、在合成上不可行的和/或内在不稳定的任意取代或取代模式。
“烷基”包括具有例如所示碳原子数的直链和支链，通常为1-20个碳原子，例如1-8个碳原子，例如1-6个碳原子。例如，C1-C6烷基包括具有1-6个碳原子的直链和支链烷基。烷基的实例包括甲基、乙基、丙基、异丙基、正丁基、仲丁基、叔丁基、戊基、2-戊基、异戊基、新戊基、己基、2-己基、3-己基、3-甲基戊基等。亚烷基是烷基的另一个亚组，其是指与烷基相同的残基，但是具有两个连接点。亚烷基通常将具有2-20个碳原子，例如2-8个碳原子，例如2-6个碳原子。例如，C0亚烷基是指共价键且C1亚烷基为亚甲基。当提到具有具体碳数的烷基残基时，旨在包括具有该碳数的所有几何异构体；因此，例如“丁基”旨在包括正丁基、仲丁基、异丁基和叔丁基；“丙基”包括正丙基和异丙基。
“环烷基”表示具有例如所示碳原子数的非芳族的完全饱和的碳环，例如3-10个或3-8个或3-6个环碳原子。环烷基可为单环或多环的(例如二环的、三环的)。环烷基的实例包括环丙基、环丁基、环戊基、环戊烯基和环己基及桥接环基团和笼形环基团(例如降莰烷、二环[2.2.2]辛烷)。另外，多环环烷基中的一个环可为芳族的，条件是所述多环环烷基通过非芳族碳与母体结构连接。例如，1,2,3,4-四氢萘-1-基(其中所述部分通过非芳族碳原子与母体结构连接)为环烷基，而1,2,3,4-四氢萘-5-基(其中所述部分通过芳族碳原子与母体结构连接)不被认为是环烷基。
“环烯基”表示具有3至10个或3至8个或3至6个环碳原子及至少一个通过由相应的环烷基中两个相邻的碳原子除去一分子氢而得到的双键的非芳族的环。
“烷氧基”是指通过氧桥连接的具有例如所示碳原子数的烷基，例如甲氧基、乙氧基、丙氧基、异丙氧基、正丁氧基、仲丁氧基、叔丁氧基、戊氧基、2-戊基氧基、异戊氧基、新戊氧基、己氧基、2-己氧基、3-己氧基、3-甲基戊氧基等。烷氧基通常将具有通过氧桥连接的1-6个碳原子。
“芳基”是指具有例如所示碳原子数例如6-12个或6-10个碳原子的芳族的碳环。芳基可为单环或多环的(例如二环的、三环的)。在一些情况下，多环芳基中的两个环都为芳族的(例如萘基)。在其它情况下，多环芳基可包括与芳族环稠合的非芳族的环(例如环烷基、环烯基、杂环烷基、杂环烯基)，条件是所述多环芳基通过芳族环中的原子与母体结构连接。因此，1,2,3,4-四氢萘-5-基(其中所述部分通过芳族碳原子与母体结构连接)被认为是芳基，而1,2,3,4-四氢萘-1-基(其中所述部分通过非芳族碳原子与母体结构连接)不被认为是芳基。类似地，1,2,3,4-四氢喹啉-8-基(其中所述部分通过芳族碳原子与母体结构连接)被认为是芳基，而1,2,3,4-四氢喹啉-1-基(其中所述部分通过非芳族氮原子与母体结构连接)不被认为是芳基。然而，本申请定义的术语“芳基”不包括“杂芳基”或不与“杂芳基”重叠而不论连接点在哪里(例如喹啉-5-基和喹啉-2-基都是杂芳基)。在一些情况下，芳基为苯基或萘基。在一些情况下，芳基为苯基。
由取代的苯衍生物形成并在环原子处具有自由价的二价基团被命名为取代的亚苯基。由具有自由价的碳原子通过除去一个氢原子而衍生自其名称以“基”结尾的单价多环烃基的二价基团通过向相应单价基团的名称中加入“亚基”来命名，例如具有两个连接点的萘基被称为亚萘基。
术语“卤代”包括氟代、氯代、溴代和碘代且术语“卤素”包括氟、氯、溴和碘。
“杂芳基”是指含有例如所示原子数的芳族环(例如5-12元或5-10元杂芳基)，其含有一个或多个选自N、O和S的杂原子(例如1、2、3或4个杂原子)且其余环原子为碳。杂芳基不含有相邻的S和O原子。在一些实施方案中，杂芳基中S和O原子的总数不多于2个。在一些实施方案中，杂芳基中S和O原子的总数不多于1个。除非另有说明，在化合价允许的情况下，杂芳基可通过碳或氮原子与母体结构连接。例如，“吡啶基”包括2-吡啶基、3-吡啶基和4-吡啶基且“吡咯基”包括1-吡咯基、2-吡咯基和3-吡咯基。当氮存在于杂芳基环中时，在相邻原子和基团的性质允许的情况下，所述氮可按氧化态(即N+-O-)存在。另外，当硫存在于杂芳基环中时，在相邻原子和基团的性质允许的情况下，所述硫可按氧化态(即S+-O-或SO2)存在。杂芳基可为单环或多环的(例如二环的、三环的)。
在一些情况下，杂芳基为单环的。实例包括吡咯、吡唑、咪唑、三唑(例如1,2,3-三唑、1,2,4-三唑、1,3,4-三唑)、四唑、呋喃、异噁唑、噁唑、噁二唑(例如1,2,3-噁二唑、1,2,4-噁二唑、1,3,4-噁二唑)、噻吩、异噻唑、噻唑、噻二唑(例如1,2,3-噻二唑、1,2,4-噻二唑、1,3,4-噻二唑)、吡啶、哒嗪、嘧啶、吡嗪、三嗪(例如1,2,4-三嗪、1,3,5-三嗪)和四嗪。
在一些情况下，多环杂芳基中的两个环都为芳族的。实例包括吲哚、异吲哚、吲唑、苯并咪唑、苯并三唑、苯并呋喃、苯并噁唑、苯并异噁唑、苯并噁二唑、苯并噻吩、苯并噻唑、苯并异噻唑、苯并噻二唑、1H-吡咯并[2,3-b]吡啶、1H-吡唑并[3,4-b]吡啶、3H-咪唑并[4,5-b]吡啶、3H-[1,2,3]三唑并[4,5-b]吡啶、1H-吡咯并[3,2-b]吡啶、1H-吡唑并[4,3-b]吡啶、1H-咪唑并[4,5-b]吡啶、1H-[1,2,3]三唑并[4,5-b]吡啶、1H-吡咯并[2,3-c]吡啶、1H-吡唑并[3,4-c]吡啶、3H-咪唑并[4,5-c]吡啶、3H-[1,2,3]三唑并[4,5-c]吡啶、1H-吡咯并[3,2-c]吡啶、1H-吡唑并[4,3-c]吡啶、1H-咪唑并[4,5-c]吡啶、1H-[1,2,3]三唑并[4,5-c]吡啶、呋喃并[2,3-b]吡啶、噁唑并[5,4-b]吡啶、异噁唑并[5,4-b]吡啶、[1,2,3]噁二唑并[5,4-b]吡啶、呋喃并[3,2-b]吡啶、噁唑并[4,5-b]吡啶、异噁唑并[4,5-b]吡啶、[1,2,3]噁二唑并[4,5-b]吡啶、呋喃并[2,3-c]吡啶、噁唑并[5,4-c]吡啶、异噁唑并[5,4-c]吡啶、[1,2,3]噁二唑并[5,4-c]吡啶、呋喃并[3,2-c]吡啶、噁唑并[4,5-c]吡啶、异噁唑并[4,5-c]吡啶、[1,2,3]噁二唑并[4,5-c]吡啶、噻吩并[2,3-b]吡啶、噻唑并[5,4-b]吡啶、异噻唑并[5,4-b]吡啶、[1,2,3]噻二唑并[5,4-b]吡啶、噻吩并[3,2-b]吡啶、噻唑并[4,5-b]吡啶、异噻唑并[4,5-b]吡啶、[1,2,3]噻二唑并[4,5-b]吡啶、噻吩并[2,3-c]吡啶、噻唑并[5,4-c]吡啶、异噻唑并[5,4-c]吡啶、[1,2,3]噻二唑并[5,4-c]吡啶、噻吩并[3,2-c]吡啶、噻唑并[4,5-c]吡啶、异噻唑并[4,5-c]吡啶、[1,2,3]噻二唑并[4,5-c]吡啶、喹啉、异喹啉、噌啉、喹唑啉、喹喔啉、酞嗪、二氮杂萘(例如1,8-二氮杂萘、1,7-二氮杂萘、1,6-二氮杂萘、1,5-二氮杂萘、2,7-二氮杂萘、2,6-二氮杂萘)、咪唑并[1,2-a]吡啶、1H-吡唑并[3,4-d]噻唑、1H-吡唑并[4,3-d]噻唑和咪唑并[2,1-b]噻唑。
在其它情况下，多环杂芳基可包括与杂芳基环稠合的非芳族的环(例如环烷基、环烯基、杂环烷基、杂环烯基)，条件是所述多环杂芳基通过芳族环中的原子与母体结构连接。例如，4,5,6,7-四氢苯并[d]噻唑-2-基(其中所述部分通过芳族碳原子与母体结构连接)被认为是杂芳基，而4,5,6,7-四氢苯并[d]噻唑-5-基(其中所述部分通过非芳族碳原子与母体结构连接)不被认为是杂芳基。
“杂环烷基”是指具有例如所示原子数的非芳族的完全饱和的环(例如3-10元或3-7元杂环烷基)，其包含一个或多个选自N、O和S的杂原子(例如1、2、3或4个杂原子)且其余环原子为碳。杂环烷基可为单环或多环的(例如二环的、三环的)。
单环杂环烷基的实例包括环氧乙烷基、氮丙啶基、氮杂环丁烷基、吡咯烷基、咪唑烷基、吡唑烷基、哌啶基、哌嗪基、吗啉基和硫吗啉基。
当氮存在于杂环烷基环中时，在相邻原子和基团允许的情况下，所述氮可按氧化态(即N+-O-)存在。实例包括哌啶基N-氧化物和吗啉基N-氧化物。另外，当硫存在于杂环烷基环中时，在相邻原子和基团允许的情况下，所述硫可按氧化态(即S+-O-或-SO2-)存在。实例包括硫吗啉S-氧化物和硫吗啉S,S-二氧化物。
另外，多环杂环烷基中的一个环可为芳族的(例如芳基或杂芳基)，条件是所述多环杂环烷基通过非芳族碳或氮原子与母体结构连接。例如，1,2,3,4-四氢喹啉-1-基(其中所述部分通过非芳族氮原子与母体结构连接)被认为是杂环烷基，而1,2,3,4-四氢喹啉-8-基(其中所述部分通过芳族碳原子与母体结构连接)不被认为是杂环烷基。
“杂环烯基”是指具有例如所示原子数的非芳族的环(例如3-10元或3-7元杂环烯基)，其含有一个或多个选自N、O和S的杂原子(例如1、2、3或4个杂原子)且其余环原子为碳且具有至少一个通过由相应的杂环烷基中相邻的碳原子、相邻的氮原子或相邻的碳和氮原子除去一分子氢而得到的双键。杂环烯基可为单环或多环的(例如二环的、三环的)。当氮存在于杂环烯基环中时，在相邻原子和基团允许的情况下，所述氮可按氧化态(即N+-O-)存在。另外，当硫存在于杂环烯基环中时，在相邻原子和基团允许的情况下，所述硫可按氧化态(即S+-O-或-SO2-)存在。杂环烯基的实例包括二氢呋喃基(例如2,3-二氢呋喃基、2,5-二氢呋喃基)、二氢噻吩基(例如2,3-二氢噻吩基、2,5-二氢噻吩基)、二氢吡咯基(例如2,3-二氢-1H-吡咯基、2,5-二氢-1H-吡咯基)、二氢咪唑基(例如2,3-二氢-1H-咪唑基、4,5-二氢-1H-咪唑基)、吡喃基、二氢吡喃基(例如3,4-二氢-2H-吡喃基、3,6-二氢-2H-吡喃基)、四氢吡啶基(例如1,2,3,4-四氢吡啶基、1,2,3,6-四氢吡啶基)和二氢吡啶(例如1,2-二氢吡啶、1,4-二氢吡啶)。另外，多环杂环烯基中的一个环可为芳族的(例如芳基或杂芳基)，条件是所述多环杂环烯基通过非芳族碳或氮原子与母体结构连接。例如，1,2-二氢喹啉-1-基(其中所述部分通过非芳族氮原子与母体结构连接)被认为是杂环烯基，而1,2-二氢喹啉-8-基(其中所述部分通过芳族碳原子与母体结构连接)不被认为是杂环烯基。
本申请使用的术语“取代”是指所述原子或基团上的任意一个或多个氢用从指定组中选择的基团代替，条件是不超过所述原子的正常化合价。当取代基为氧代(即＝O)时，原子上的2个氢被代替。仅当取代基和/或变量的组合得到稳定的化合物或有用的合成中间体时，这样的组合才是允许的。稳定的化合物或稳定的结构预示化合物足够稳定以经历从反应混合物中分离和随后配制成具有至少一种实际用途的药物。除非另有说明，将取代基命名到核心结构中。例如，应该理解的是，当将(环烷基)烷基列为可能的取代基时，该取代基与核心结构的连接点在烷基部分中。
除非另有明确定义，术语“取代的”烷基(包括但不限于C1-C4烷基)、“取代的”环烷基、“取代的”芳基、“取代的”杂环烷基和“取代的”杂芳基分别是指其中一个或多个(例如最多5个且例如最多3个)氢原子被独立选自以下的取代基代替的烷基、环烷基、芳基、杂环烷基和杂芳基：
-Ra、-ORb、-O(C1-C2烷基)O-(例如亚甲二氧基-)、-SRb、胍基(-NHC(＝NH)NH2)、胍上的一个或多个氢用C1-C4烷基代替的胍基、-NRbRc、卤素、氰基、氧代(作为杂环烷基的取代基)、硝基、-CORb、-CO2Rb、-CONRbRc、-OCORb、-OCO2Ra、-OCONRbRc、-NRcCORb、-NRcCO2Ra、-NRcCONRbRc、-SORa、-SO2Ra、-SO2NRbRc和-NRcSO2Ra，
其中Ra选自C1-C6烷基、环烷基、芳基、杂环烷基和杂芳基；
Rb选自H、C1-C6烷基、芳基和杂芳基；且
Rc选自氢和C1-C4烷基；或
Rb和Rc与和它们所连接的氮形成杂环烷基；且
其中每个C1-C6烷基、环烷基、芳基、杂环烷基和杂芳基任选取代有一个或多个例如一个、两个或三个独立选自以下的取代基：C1-C4烷基、C3-C6环烷基、芳基、杂芳基、芳基-C1-C4烷基-、杂芳基-C1-C4烷基-、C1-C4卤代烷基-、-OC1-C4烷基、-OC1-C4烷基苯基、-C1-C4烷基-OH、-C1-C4烷基-O-C1-C4烷基、-OC1-C4卤代烷基、卤素、-OH、-NH2、-C1-C4烷基-NH2、-N(C1-C4烷基)(C1-C4烷基)、-NH(C1-C4烷基)、-N(C1-C4烷基)(C1-C4烷基苯基)、-NH(C1-C4烷基苯基)、氰基、硝基、氧代(作为杂芳基的取代基)、-CO2H、-C(O)OC1-C4烷基、-CON(C1-C4烷基)(C1-C4烷基)、-CONH(C1-C4烷基)、-CONH2、-NHC(O)(C1-C4烷基)、-NHC(O)(苯基)、-N(C1-C4烷基)C(O)(C1-C4烷基)、-N(C1-C4烷基)C(O)(苯基)、-C(O)C1-C4烷基、-C(O)C1-C4苯基、-C(O)C1-C4卤代烷基、-OC(O)C1-C4烷基、-SO2(C1-C4烷基)、-SO2(苯基)、-SO2(C1-C4卤代烷基)、-SO2NH2、-SO2NH(C1-C4烷基)、-SO2NH(苯基)、-NHSO2(C1-C4烷基)、-NHSO2(苯基)和-NHSO2(C1-C4卤代烷基)。
本申请所述化合物包括但不限于它们的光学异构体、外消旋体和它们的其它混合物。在这些情况下，单一的对映异构体或非对映异构体即光学活性形式可通过不对称合成或通过对外消旋体进行拆分来得到。外消旋体可例如通过常规方法(例如在拆分剂存在下进行结晶)或色谱法(使用例如手性高压液相色谱(HPLC)柱)来拆分。
当没有知晓单一对映异构体的绝对构型时，将构型表示为E1(对映异构体1)和E2(对映异构体2)且手性中心用星号标记。例如，E1-(abs)-5-(3-氟-2-甲基苯基)-N-羟基-1-苯基-4,5,6,7-四氢-1H-吲唑-5-甲酰胺和E2-(abs)-5-(3-氟-2-甲基苯基)-N-羟基-1-苯基-4,5,6,7-四氢-1H-吲唑-5-甲酰胺为单一的对映异构体，其在手性中心的绝对构型是没有知晓的。
另外，上述化合物包括具有碳-碳双键的化合物的Z-形式和E-形式(或顺式形式和反式形式)。当本申请所述化合物以多种互变异构形式存在时，术语“化合物”旨在包括所述化合物的所有互变异构形式。上述化合物还包括晶体形式，包括多晶型物和包合物。类似地，术语“盐”旨在包括所述化合物的所有互变异构形式和晶体形式。
“药用盐”包括但不限于与无机酸的盐，例如盐酸盐、磷酸盐、焦磷酸盐、氢溴酸盐、硫酸盐、亚硫酸盐、硝酸盐等；及与有机酸的盐，例如苹果酸盐、马来酸盐、富马酸盐、酒石酸盐、琥珀酸盐、枸橼酸盐、乙酸盐、乳酸盐、甲磺酸盐、对甲苯磺酸盐、2-羟基乙基磺酸盐、苯甲酸盐、水杨酸盐、硬脂酸盐、烷酸盐例如乙酸盐、HOOC-(CH2)n-COOH(其中n为0-4)盐等。类似地，药用阳离子包括但不限于钠、钾、钙、铝、锂和铵。
另外，若以酸加成盐形式得到本申请所述化合物，则游离碱可通过对所述酸加成盐的溶液进行碱化来得到。相反地，若产物为游离碱，则加成盐且特别是药用加成盐可如下得到：按照由碱化合物制备酸加成盐的常规操作将所述游离碱溶解在适当的有机溶剂中并用酸对溶液进行处理。本领域技术人员将认识到可用于制备无毒药用加成盐的各种合成方法学。
本申请使用的术语“基团”、“基”或“片段”为同义的并旨在表示分子中可与分子中的键或其它片段连接的官能团或片段。
术语“活性剂”用于表示具有生物学活性的化合物或其药用盐。在一些实施方案中，“活性剂”为具有药物用途的化合物或其药用盐。例如，活性剂可为抗神经变性治疗剂。
术语“治疗有效量”是指当给药于人类或非人类患者以有效提供治疗益处例如缓解症状、减缓疾病进展或预防疾病的量，例如治疗有效量可为以下量，其足以减少对抑制HDAC活性有响应的疾病的症状。
本申请使用的术语“组蛋白脱乙酰酶”和“HDAC”旨在表示以下酶的家族中的任意一员，所述酶从蛋白质(例如组蛋白或微管蛋白)的赖氨酸残基的ε-氨基中除去Nε-乙酰基。除非上下文另有说明，术语“组蛋白”旨在表示任意组蛋白蛋白质，包括来自任意物种的H1、H2A、H2B、H3、H4和H5。在一些实施方案中，所述组蛋白脱乙酰酶为人HDAC，包括但不限于HDAC4、HDAC5、HDAC6、HDAC7、HDAC9和HDAC10。在一些实施方案中，至少一种组蛋白脱乙酰酶选自HDAC4、HDAC5、HDAC7和HDAC9。在一些实施方案中，所述组蛋白脱乙酰酶为第IIa类HDAC。在一些实施方案中，所述组蛋白脱乙酰酶为HDAC4。在一些实施方案中，所述组蛋白脱乙酰酶为HDAC5。在一些实施方案中，所述组蛋白脱乙酰酶来自原生动物来源或真菌来源。
术语“组蛋白脱乙酰酶抑制剂”和“组蛋白脱乙酰酶的抑制剂”旨在表示本申请所述化合物或其药用盐，其能够与组蛋白脱乙酰酶相互作用并抑制其酶活性。
本申请使用的术语“由HDAC介导的病症或障碍”或“由组蛋白脱乙酰酶介导的病症或障碍”是指以下病症或障碍，其中HDAC和/或HDAC的作用例如对于该病症的发作、进展、表达等是重要或必需的，或是指已知可通过HDAC抑制剂(例如曲古抑菌素A)来治疗的病症。
术语“作用”描述了细胞表型或细胞增殖的变化或细胞表型或细胞增殖的不再变化。“作用”还可描述HDAC催化活性的变化或HDAC催化活性的不再变化。“作用”还可描述HDAC和天然结合配偶体之间相互作用的变化或HDAC和天然结合配偶体之间相互作用的不再变化。
术语“抑制组蛋白脱乙酰酶的酶活性”旨在表示降低组蛋白脱乙酰酶从蛋白质(例如但不限于组蛋白或微管蛋白)中除去乙酰基的能力。抑制剂使组蛋白脱乙酰酶的活性降至未受抑制的所述酶的活性的50％的浓度被确定为IC50值。在一些实施方案中，组蛋白脱乙酰酶活性的这种降低为至少50％，例如至少约75％，例如至少约90％。在一些实施方案中，组蛋白脱乙酰酶的活性被降低至少95％，例如被降低至少99％。在一些实施方案中，本申请所述化合物及其药用盐具有小于100nM的IC50值。在一些实施方案中，本申请所述化合物及其药用盐具有100nM至1μM的IC50值。在一些实施方案中，本申请所述化合物及其药用盐具有1至25μM的IC50值。
在一些实施方案中，上述抑制为特异性的，即所述组蛋白脱乙酰酶抑制剂当浓度低于产生另一种不相关的生物作用所需要的抑制剂浓度时使组蛋白脱乙酰酶从蛋白质中除去乙酰基的能力得以降低。在一些实施方案中，与产生不相关的生物作用所需要的浓度相比，组蛋白脱乙酰酶抑制活性所需要的抑制剂浓度低至少2倍，例如低至少5倍，例如低至少10倍，例如低至少20倍。
“治疗”是指在患者中对疾病状态进行的任意治疗，包括：
a)预防所述疾病，也就是说，使所述疾病的临床症状不再发展；
b)抑制所述疾病；
c)减缓或阻止临床症状的发展；和/或
d)缓解所述疾病，也就是说，使临床症状消退。
“受试者”或“患者”是指动物例如哺乳动物，其已为或将为治疗、观察或实验对象。本申请所述方法可用于人类疗法和兽医应用。在一些实施方案中，所述受试者为哺乳动物；且在一些实施方案中，所述受试者为人类。
本申请提供式I化合物或其药用盐：
其中：
R1选自-C(O)NH(OH)和-N(OH)C(O)R9；
R2选自芳基、杂芳基和杂环烷基，其各自任选取代有1至3个独立选自以下的取代基：卤素、烷基、环烷基、卤代烷基、羟基、烷氧基和腈基团；
A选自芳基和杂芳基；
R3和R4独立选自氢、烷基、卤素、NHSO2R10、C(O)NR11R12、NR11R12、腈基团、环烷基、杂环烷基、芳基、杂芳基、芳烷基和杂芳烷基，其各自任选取代有1至3个独立选自以下的取代基：卤素、烷基、环烷基、卤代烷基、羟基、烷氧基、芳基、杂芳基和腈基团，其中烷基和烷氧基任选取代有氨基、(烷基)氨基或二(烷基)氨基；
R5、R6、R7和R8在每次出现时独立选自氢和低级烷基；
R9选自氢和低级烷基；
R10选自低级烷基、环烷基、杂环烷基、芳基和杂芳基；
R11和R12独立选自氢、低级烷基、烷氧基、低级卤代烷基和环烷基，其中烷基和烷氧基任选取代有氨基、(烷基)氨基或二(烷基)氨基，且
m和m’独立选自0、1、2、3和4，条件是2≤(m+m’)≤4。
在一些实施方案中，所述式I化合物或其药用盐选自式II化合物或其药用盐：
在式II化合物或其药用盐的一些实施方案中，R3选自苯基，其任选取代有一个或两个独立选自以下的取代基：低级烷基、低级卤代烷基、低级烷氧基、低级卤代烷氧基和卤素。
在式II化合物或其药用盐的一些实施方案中，R3选自苯基、2-甲基苯基、3-甲基苯基、4-甲基苯基、2-氟苯基、3-氟苯基、4-氟苯基、2-氯苯基、3-氯苯基、4-氯苯基、3-氯-2-氟苯基、2,6-二氟苯基、2,5-二甲基苯基、2,6-二甲基苯基、2-氯-6-氟苯基、2-氟-6-甲基苯基、2,4-二氟苯基、4-(二氟甲氧基)苯基和3-氟-2-甲基苯基。
在式II化合物或其药用盐的一些实施方案中，R3选自吡啶-2-基、吡啶-4-基和吡嗪-2-基，其各自任选取代有一个或两个独立选自以下的取代基：低级烷基和卤素。
在式II化合物或其药用盐的一些实施方案中，R3选自5-氟吡啶-2-基、吡嗪-2-基和3-甲基吡啶-4-基。
在式II化合物或其药用盐的一些实施方案中，R3选自环丙基和环戊基，其各自任选取代有一个或两个独立选自以下的取代基：低级烷基和卤素。
在式II化合物或其药用盐的一些实施方案中，R3选自环丙基和环戊基。
在式II化合物或其药用盐的一些实施方案中，R3选自异丙基。
在式II化合物或其药用盐的一些实施方案中，R4为氢。
在一些实施方案中，所述式I化合物或其药用盐选自式III化合物或其药用盐：
在式III化合物或其药用盐的一些实施方案中，R3选自低级烷基、低级卤代烷基和任选取代有卤素的芳烷基。
在式III化合物或其药用盐的一些实施方案中，R3选自甲基、2,2,2,-三氟乙基和4-氟苄基。
在式III化合物或其药用盐的一些实施方案中，R3选自苯基，其任选取代有一个或两个独立选自以下的取代基：低级烷基、低级卤代烷基、低级烷氧基、低级卤代烷氧基和卤素。
在式III化合物或其药用盐的一些实施方案中，R3选自2-氟苯基、4-(二氟甲氧基)苯基、4-氟-2-甲基苯基和3-甲基苯基。
在式III化合物或其药用盐的一些实施方案中，R3选自吡啶-2-基和吡啶-4-基，其各自任选取代有一个或两个独立选自以下的取代基：低级烷基和卤素。
在式III化合物或其药用盐的一些实施方案中，R3选自3-甲基吡啶-4-基、3-氯吡啶-2-基和3-氟吡啶-2-基。
在式III化合物或其药用盐的一些实施方案中，R4选自氢、环丙基和任选取代有卤素的苯基。
在式III化合物或其药用盐的一些实施方案中，R4为氢。
在一些实施方案中，所述式I化合物或其药用盐选自式IV化合物或其药用盐：
在式IV化合物或其药用盐的一些实施方案中，R3为氢。
在式IV化合物或其药用盐的一些实施方案中，R4为环丙基。
在一些实施方案中，所述式I化合物或其药用盐选自式V化合物或其药用盐：
在式V化合物或其药用盐的一些实施方案中，R3选自：
氢，
环烷基，其任选取代有一个或两个独立选自以下的基团：卤素、低级烷基、低级卤代烷基和低级烷氧基，
杂芳基，其任选取代有一个或两个独立选自以下的基团：卤素、低级烷基、低级卤代烷基和低级烷氧基，
苯基，其任选取代有一个或两个独立选自以下的基团：卤素、低级烷基、低级卤代烷基和低级烷氧基，
苄基，其在芳族部分上任选取代有一个或两个独立选自以下的基团：卤素、低级烷基、低级卤代烷基和低级烷氧基，和
-NHS(O)2R10，其中R10选自苯基。
在式V化合物或其药用盐的一些实施方案中，R3选自氢、环丙基、任选取代有一个或两个独立选自氟和甲基的基团的苯基、嘧啶-5-基、任选取代有甲基的1H-吡唑-5-基、任选取代有甲基的1H-吡唑-4-基、任选取代有甲氧基的吡啶-2-基、在芳族部分上任选取代有三氟甲基的苄基和-NHS(O)2R10，其中R10选自苯基。
在一些实施方案中，所述式I化合物或其药用盐选自式VI化合物或其药用盐：
在式VI化合物或其药用盐的一些实施方案中，R3选自氢、低级烷基、低级卤代烷基、环烷基、任选取代有卤素的苯基和杂芳基。
在式VI化合物或其药用盐的一些实施方案中，R3选自氢、三氟甲基、环丙基、任选取代有卤素的苯基和吡啶-3-基。
在式VI化合物或其药用盐的一些实施方案中，R4为氢。
在一些实施方案中，所述式I化合物或其药用盐选自式VII化合物或其药用盐：
在式VII化合物或其药用盐的一些实施方案中，R3为氢。
在式VII化合物或其药用盐的一些实施方案中，R4为氢。
在一些实施方案中，所述式I化合物或其药用盐选自式VIII化合物或其药用盐：
在式VIII化合物或其药用盐的一些实施方案中，R3为苯基，其任选取代有1至3个独立选自以下的取代基：卤素、烷基、环烷基、卤代烷基、羟基和烷氧基。
在式VIII化合物或其药用盐的一些实施方案中，R3为苯基。
在式I-VIII化合物或其药用盐的一些实施方案中，R2选自芳基，其任选取代有1至3个独立选自以下的取代基：卤素、烷基、环烷基、卤代烷基、羟基、烷氧基和腈基团。
在式I-VIII化合物或其药用盐的一些实施方案中，R2选自苯基，其任选取代有1至3个独立选自以下的取代基：卤素、烷基、环烷基、卤代烷基、羟基、烷氧基和腈基团。
在式I-VIII化合物或其药用盐的一些实施方案中，R2选自苯基，其任选取代有1至3个独立选自以下的取代基：卤素和烷基。
在式I-VIII化合物或其药用盐的一些实施方案中，R2选自苯基和3-氟-2-甲基苯基。
在式I-VIII化合物或其药用盐的一些实施方案中，R2为3-氟-2-甲基苯基。
在式I-VIII化合物或其药用盐的一些实施方案中，m为1且m’为1。
在式I-VIII化合物或其药用盐的一些实施方案中，m为1且m’为2。
在式I-VIII化合物或其药用盐的一些实施方案中，m为0且m’为2。
在式I-VIII化合物或其药用盐的一些实施方案中，m为2且m’为2。
在式I-VIII化合物或其药用盐的一些实施方案中，R1为-N(OH)C(O)R9。在一些实施方案中，R9为低级烷基。
在式I-VIII化合物或其药用盐的一些实施方案中，R1选自-C(O)NH(OH)。
在式I-VIII化合物或其药用盐的一些实施方案中，R5、R6、R7和R8在每次出现时为氢。
本申请还提供选自以下的式I化合物或其药用盐：
(S)-5-(3-氟-2-甲基苯基)-N-羟基-1-苯基-1,4,5,6-四氢环戊并[c]吡唑-5-甲酰胺；
(S)-5-(3-氟-2-甲基苯基)-N-羟基-1-(邻甲苯基)-1,4,5,6-四氢环戊并[c]吡唑-5-甲酰胺；
(S)-5-(3-氟-2-甲基苯基)-1-(2-氟苯基)-N-羟基-1,4,5,6-四氢环戊并[c]吡唑-5-甲酰胺；
(S)-1-(3-氯苯基)-5-(3-氟-2-甲基苯基)-N-羟基-1,4,5,6-四氢环戊并[c]吡唑-5-甲酰胺；
(S)-5-(3-氟-2-甲基苯基)-1-(4-氟苯基)-N-羟基-1,4,5,6-四氢环戊并[c]吡唑-5-甲酰胺；
(S)-5-(3-氟-2-甲基苯基)-1-(3-氟苯基)-N-羟基-1,4,5,6-四氢环戊并[c]吡唑-5-甲酰胺；
(S)-1-(2-氯苯基)-5-(3-氟-2-甲基苯基)-N-羟基-1,4,5,6-四氢环戊并[c]吡唑-5-甲酰胺；
(S)-1-(4-氯苯基)-5-(3-氟-2-甲基苯基)-N-羟基-1,4,5,6-四氢环戊并[c]吡唑-5-甲酰胺；
(S)-5-(3-氟-2-甲基苯基)-N-羟基-1-(对甲苯基)-1,4,5,6-四氢环戊并[c]吡唑-5-甲酰胺；
(S)-1-(3-氯-2-氟苯基)-5-(3-氟-2-甲基苯基)-N-羟基-1,4,5,6-四氢环戊并[c]吡唑-5-甲酰胺；
(S)-1-(2,6-二氟苯基)-5-(3-氟-2-甲基苯基)-N-羟基-1,4,5,6-四氢环戊并[c]吡唑-5-甲酰胺；
(S)-1-(2,5-二甲基苯基)-5-(3-氟-2-甲基苯基)-N-羟基-1,4,5,6-四氢环戊并[c]吡唑-5-甲酰胺；
(S)-1-(2,6-二甲基苯基)-5-(3-氟-2-甲基苯基)-N-羟基-1,4,5,6-四氢环戊并[c]吡唑-5-甲酰胺；
(S)-1-(2-氯-6-氟苯基)-5-(3-氟-2-甲基苯基)-N-羟基-1,4,5,6-四氢环戊并[c]吡唑-5-甲酰胺；
(S)-5-(3-氟-2-甲基苯基)-1-(2-氟-6-甲基苯基)-N-羟基-1,4,5,6-四氢环戊并[c]吡唑-5-甲酰胺；
(S)-5-(3-氟-2-甲基苯基)-1-(5-氟吡啶-2-基)-N-羟基-1,4,5,6-四氢环戊并[c]吡唑-5-甲酰胺；
(S)-1-(2,4-二氟苯基)-5-(3-氟-2-甲基苯基)-N-羟基-1,4,5,6-四氢环戊并[c]吡唑-5-甲酰胺；
(S)-1-环戊基-5-(3-氟-2-甲基苯基)-N-羟基-1,4,5,6-四氢环戊并[c]吡唑-5-甲酰胺；
(S)-5-(3-氟-2-甲基苯基)-N-羟基-1-(吡嗪-2-基)-1,4,5,6-四氢环戊并[c]吡唑-5-甲酰胺；
(S)-1-(4-(二氟甲氧基)苯基)-5-(3-氟-2-甲基苯基)-N-羟基-1,4,5,6-四氢环戊并[c]吡唑-5-甲酰胺；
(S)-2-(4-(二氟甲氧基)苯基)-5-(3-氟-2-甲基苯基)-N-羟基-2,4,5,6-四氢环戊并[c]吡唑-5-甲酰胺；
(S)-5-(3-氟-2-甲基苯基)-1-(4-氟-2-甲基苯基)-N-羟基-1,4,5,6-四氢环戊并[c]吡唑-5-甲酰胺；
(S)-5-(3-氟-2-甲基苯基)-2-(4-氟-2-甲基苯基)-N-羟基-2,4,5,6-四氢环戊并[c]吡唑-5-甲酰胺；
(S)-5-(3-氟-2-甲基苯基)-N-羟基-1-(间甲苯基)-1,4,5,6-四氢环戊并[c]吡唑-5-甲酰胺；
(S)-5-(3-氟-2-甲基苯基)-N-羟基-2-(间甲苯基)-2,4,5,6-四氢环戊并[c]吡唑-5-甲酰胺；
(S)-5-(3-氟-2-甲基苯基)-N-羟基-1-(3-甲基吡啶-4-基)-1,4,5,6-四氢环戊并[c]吡唑-5-甲酰胺；
(S)-5-(3-氟-2-甲基苯基)-N-羟基-2-(3-甲基吡啶-4-基)-2,4,5,6-四氢环戊并[c]吡唑-5-甲酰胺；
(S)-2-(3-氯吡啶-2-基)-5-(3-氟-2-甲基苯基)-N-羟基-2,4,5,6-四氢环戊并[c]吡唑-5-甲酰胺；
(S)-5-(3-氟-2-甲基苯基)-2-(3-氟吡啶-2-基)-N-羟基-2,4,5,6-四氢环戊并[c]吡唑-5-甲酰胺；
(R)-5-(3-氟-2-甲基苯基)-N-羟基-1-苯基-1,4,5,6-四氢环戊并[c]吡唑-5-甲酰胺；
E1-(abs)-5-(3-氟-2-甲基苯基)-N-羟基-1-苯基-4,5,6,7-四氢-1H-吲唑-5-甲酰胺；
E2-(abs)-5-(3-氟-2-甲基苯基)-N-羟基-1-苯基-4,5,6,7-四氢-1H-吲唑-5-甲酰胺；
E1-(abs)-5-(3-氟-2-甲基苯基)-2-(2-氟苯基)-N-羟基-4,5,6,7-四氢-2H-吲唑-5-甲酰胺；
E2-(abs)-5-(3-氟-2-甲基苯基)-2-(2-氟苯基)-N-羟基-4,5,6,7-四氢-2H-吲唑-5-甲酰胺；
5-(3-氟-2-甲基苯基)-N-羟基-1-(2,2,2-三氟乙基)-4,5,6,7-四氢-1H-吲唑-5-甲酰胺和5-(3-氟-2-甲基苯基)-N-羟基-2-(2,2,2-三氟乙基)-4,5,6,7-四氢-2H-吲唑-5-甲酰胺；
5-(3-氟-2-甲基苯基)-1-(4-氟苄基)-N-羟基-4,5,6,7-四氢-1H-吲唑-5-甲酰胺和5-(3-氟-2-甲基苯基)-2-(4-氟苄基)-N-羟基-4,5,6,7-四氢-2H-吲唑-5-甲酰胺；
E1-(abs)-5-(3-氟-2-甲基苯基)-N-羟基-1-(邻甲苯基)-4,5,6,7-四氢-1H-吲唑-5-甲酰胺；
E2-(abs)-5-(3-氟-2-甲基苯基)-N-羟基-1-(邻甲苯基)-4,5,6,7-四氢-1H-吲唑-5-甲酰胺；
3-环丙基-5-(3-氟-2-甲基苯基)-N-羟基-2-(2,2,2-三氟乙基)-4,5,6,7-四氢-2H-吲唑-5-甲酰胺；
2-环丙基-6-(3-氟-2-甲基苯基)-N-羟基-4-氧代-3,4,5,6,7,8-六氢喹唑啉-6-甲酰胺；
6-(3-氟-2-甲基苯基)-N-羟基-2-(苯基磺酰氨基)-4,5,6,7-四氢苯并[d]噻唑-6-甲酰胺；
2-环丙基-6-(3-氟-2-甲基苯基)-N-羟基-4,5,6,7-四氢苯并[d]噻唑-6-甲酰胺；
6-(3-氟-2-甲基苯基)-N-羟基-2-(嘧啶-5-基)-4,5,6,7-四氢苯并[d]噻唑-6-甲酰胺；
6-(3-氟-2-甲基苯基)-N-羟基-4,5,6,7-四氢苯并[d]噻唑-6-甲酰胺；
6-(3-氟-2-甲基苯基)-N-羟基-5,6,7,8-四氢喹唑啉-6-甲酰胺；
2-环丙基-6-(3-氟-2-甲基苯基)-N-羟基-5,6,7,8-四氢喹唑啉-6-甲酰胺；
6-(3-氟-2-甲基苯基)-N-羟基-2-苯基-5,6,7,8-四氢喹唑啉-6-甲酰胺；
(S)-2-(2-氯苯基)-6-(3-氟-2-甲基苯基)-N-羟基-6,7-二氢-5H-环戊并[d]嘧啶-6-甲酰胺；
(R)-2-(2-氯苯基)-5-(3-氟-2-甲基苯基)-N-羟基-6,7-二氢-5H-环戊并[d]嘧啶-5-甲酰胺；
(R)-2-环丙基-6-(3-氟-2-甲基苯基)-N-羟基-6,7-二氢-5H-环戊并[d]嘧啶-6-甲酰胺；
(S)-2-环丙基-6-(3-氟-2-甲基苯基)-N-羟基-6,7-二氢-5H-环戊并[d]嘧啶-6-甲酰胺；
(S)-2-环丙基-5-(3-氟-2-甲基苯基)-N-羟基-6,7-二氢-5H-环戊并[d]嘧啶-5-甲酰胺；
(S)-5-(3-氟-2-甲基苯基)-N-羟基-1-异丙基-1,4,5,6-四氢环戊并[c]吡唑-5-甲酰胺；
(R)-4-(3-氟-2-甲基-苯基)-1-苯基-5,6-二氢环戊并[c]吡唑-4-异羟肟酸；
(S)-6-(3-氟-2-甲基-苯基)-2-(4-氟苯基)-5,7-二氢环戊并[d]嘧啶-6-异羟肟酸；
(S)-6-(3-氟-2-甲基苯基)-N-羟基-2-(三氟甲基)-6,7-二氢-5H-环戊并[d]嘧啶-6-甲酰胺；
(R)-2-环丙基-5-(3-氟-2-甲基苯基)-N-羟基-6,7-二氢-5H-环戊并[d]嘧啶-5-甲酰胺；
(S)-1-环丙基-5-(3-氟-2-甲基苯基)-N-羟基-1,4,5,6-四氢环戊并[c]吡唑-5-甲酰胺；
(R)-1-环丙基-4-(3-氟-2-甲基苯基)-N-羟基-1,4,5,6-四氢环戊并[c]吡唑-4-甲酰胺；
(S)-6-(3-氟-2-甲基苯基)-N-羟基-2-(吡啶-3-基)-6,7-二氢-5H-环戊并[d]嘧啶-6-甲酰胺；
E1-(abs)-5-(3-氟-2-甲基苯基)-2-(2-氟苯基)-N-羟基-5,6-二氢-4H-环戊并[d]噻唑-5-甲酰胺；
E2-(abs)-5-(3-氟-2-甲基苯基)-2-(2-氟苯基)-N-羟基-5,6-二氢-4H-环戊并[d]噻唑-5-甲酰胺；
5-(3-氟-2-甲基苯基)-N-羟基-2-(3-(三氟甲基)苄基)-5,6-二氢-4H-环戊并[d]噻唑-5-甲酰胺；
E1-(abs)-5-(3-氟-2-甲基苯基)-2-(3-氟苯基)-N-羟基-5,6-二氢-4H-环戊并[d]噻唑-5-甲酰胺；
E2-(abs)-5-(3-氟-2-甲基苯基)-2-(3-氟苯基)-N-羟基-5,6-二氢-4H-环戊并[d]噻唑-5-甲酰胺；
(R)-5-(3-氟-2-甲基苯基)-2-(4-氟苯基)-N-羟基-5,6-二氢-4H-环戊并[d]噻唑-5-甲酰胺；
(S)-5-(3-氟-2-甲基苯基)-2-(4-氟苯基)-N-羟基-5,6-二氢-4H-环戊并[d]噻唑-5-甲酰胺；
(S)-5-(3-氟-2-甲基苯基)-N-羟基-2-(1-甲基-1H-吡唑-5-基)-5,6-二氢-4H-环戊并[d]噻唑-5-甲酰胺；
(R)-5-(3-氟-2-甲基苯基)-N-羟基-2-(1-甲基-1H-吡唑-5-基)-5,6-二氢-4H-环戊并[d]噻唑-5-甲酰胺；
(R)-2-(1,3-二甲基-1H-吡唑-5-基)-5-(3-氟-2-甲基苯基)-N-羟基-5,6-二氢-4H-环戊并[d]噻唑-5-甲酰胺；
(R)-5-(3-氟-2-甲基苯基)-N-羟基-2-(5-甲氧基吡啶-2-基)-5,6-二氢-4H-环戊并[d]噻唑-5-甲酰胺；
(S)-2-环丙基-6-(3-氟-2-甲基苯基)-N-羟基-5,6-二氢-4H-环戊并[d]噻唑-6-甲酰胺；
(S)-6-(3-氟-2-甲基苯基)-N-羟基-2-(邻甲苯基)-5,6-二氢-4H-环戊并[d]噻唑-6-甲酰胺；
E1-(abs)-5-(3-氟-2-甲基苯基)-2-(4-氟-2-甲基苯基)-N-羟基-5,6-二氢-4H-环戊并[d]噻唑-5-甲酰胺；
E2-(abs)-5-(3-氟-2-甲基苯基)-2-(4-氟-2-甲基苯基)-N-羟基-5,6-二氢-4H-环戊并[d]噻唑-5-甲酰胺；
E1-(abs)-2-(1,5-二甲基-1H-吡唑-4-基)-5-(3-氟-2-甲基苯基)-N-羟基-5,6-二氢-4H-环戊并[d]噻唑-5-甲酰胺；
E2-(abs)-2-(1,5-二甲基-1H-吡唑-4-基)-5-(3-氟-2-甲基苯基)-N-羟基-5,6-二氢-4H-环戊并[d]噻唑-5-甲酰胺；
(S)-6-(3-氟-2-甲基苯基)-2-(4-氟苯基)-N-羟基-5,6-二氢-4H-环戊并[d]噻唑-6-甲酰胺；
(R)-5-(3-氟-2-甲基苯基)-3-(4-氟苯基)-N-羟基-2-甲基-2,4,5,6-四氢环戊并[c]吡唑-5-甲酰胺；
E1-(abs)-5-(3-氟-2-甲基苯基)-N-羟基-3-苯基-5,6-二氢-4H-环戊并[d]异噻唑-5-甲酰胺；
E2-(abs)-5-(3-氟-2-甲基苯基)-N-羟基-3-苯基-5,6-二氢-4H-环戊并[d]异噻唑-5-甲酰胺；
2-(3-氟-2-甲基苯基)-N-羟基-2,3-二氢-1H-茚-2-甲酰胺；
2-环丙基-7-(3-氟-2-甲基苯基)-N-羟基-6,7,8,9-四氢-5H-环庚并[d]嘧啶-7-甲酰胺；
E1-(abs)-6-(3-氟-2-甲基苯基)-N-羟基-2-(2,2,2-三氟乙基)-2,4,5,6,7,8-六氢环庚并[c]吡唑-6-甲酰胺；
E2-(abs)-6-(3-氟-2-甲基苯基)-N-羟基-2-(2,2,2-三氟乙基)-2,4,5,6,7,8-六氢环庚并[c]吡唑-6-甲酰胺；
N-羟基-6-苯基-2-(2,2,2-三氟乙基)-2,4,5,6,7,8-六氢环庚并[c]吡唑-6-甲酰胺；
E1-(abs)-N-羟基-1-苯基-2,3-二氢-1H-茚-1-甲酰胺；
E2-(abs)-N-羟基-1-苯基-2,3-二氢-1H-茚-1-甲酰胺；
N-羟基-2-苯基-2,3-二氢-1H-茚-2-甲酰胺；
(R)-4-(3-氟-2-甲基苯基)-2-(2-氟苄基)-N-羟基-2,4,5,四氢环戊并[c]吡唑-4-甲酰胺；
(S)-1-(2-氯-4-氟苯基)-5-(3-氟-2-甲基苯基)-N-羟基-1,4,5,6-四氢环戊并[c]吡唑-5-甲酰胺；
(S)-2-(4,6-二甲基嘧啶-2-基)-5-(3-氟-2-甲基苯基)-N-羟基-2,4,5,6-四氢环戊并[c]吡唑-5-甲酰胺；
(S)-1-苄基-5-(3-氟-2-甲基苯基)-N-羟基-1,4,5,6-四氢环戊并[c]吡唑-5-甲酰胺；
(R)-1-苄基-4-(3-氟-2-甲基苯基)-N-羟基-1,4,5,6-四氢环戊并[c]吡唑-4-甲酰胺；
(R)-2-苄基-4-(3-氟-2-甲基苯基)-N-羟基-2,4,5,6-四氢环戊并[c]吡唑-4-甲酰胺；和
(R)-2-苄基-4-(3-氟-2-甲基苯基)-N-羟基-2,4,5,6-四氢环戊并[c]吡唑-4-甲酰胺。
获得本申请所述化合物或其药用盐的方法对于本领域技术人员将是显而易见的，适当的操作参见例如以下实施例和本申请引用的参考文献。
本申请还提供抑制至少一种组蛋白脱乙酰酶的方法。在一些实施方案中，至少一种组蛋白脱乙酰酶为第IIa类HDAC。在一些实施方案中，至少一种组蛋白脱乙酰酶选自HDAC4、HDAC5、HDAC7和HDAC9。在一些实施方案中，所述抑制是在细胞中。在一些实施方案中，本申请所述化合物或其药用盐就抑制至少一种第II类组蛋白脱乙酰酶而言为选择性的。在一些实施方案中，本申请所述化合物或其药用盐为HDAC4和/或HDAC5的选择性抑制剂。
本申请还提供在需要所述治疗的受试者中治疗由HDAC介导的病症或障碍的方法，其包括向所述受试者给药治疗有效量的本申请所述至少一种化合物或其药用盐。
在一些实施方案中，由HDAC介导的病症或障碍包括神经变性病理。因此，本申请还提供在需要所述治疗的受试者中治疗由HDAC介导的神经变性病理的方法，其包括向所述受试者给药治疗有效量的本申请所述至少一种化合物或其药用盐。
在一些实施方案中，所述神经变性病理选自阿尔茨海默病(Alzheimer’sdisease)、帕金森病(Parkinson’s disease)、神经元核内包涵体病(NIID)、齿状核红核苍白球丘脑下核萎缩(DRPLA)、弗里德赖希共济失调(Friedreich’s ataxia)、Rubenstein-Taubi综合征和聚谷氨酰胺病例如亨廷顿病(Huntington’s disease)、脊髓小脑共济失调1(SCA 1)、脊髓小脑共济失调7(SCA 7)、癫痫发作、纹状体黑质变性、进行性核上性麻痹、变形性肌张力不全、痉挛性斜颈、运动障碍、家族性震颤、抽动秽语综合征(Gilles de laTourette syndrome)、弥散性卢伊体病、进行性核上性麻痹、匹克病(Pick’s disease)、原发性侧索硬化、进行性神经性肌萎缩、脊髓性肌萎缩、肥大性间质性多神经病、视网膜色素变性、遗传性视神经萎缩、遗传性痉挛性截瘫、夏-德综合征(Shy-Drager syndrome)、肯尼迪病(Kennedy’s disease)、与蛋白质聚集相关的神经变性、马-约病(Machado-Joseph’sdisease)、海绵状脑病、与阮病毒相关的疾病、多发性硬化症(MS)、进行性核上性麻痹(斯-理-奥病(Steel-Richardson-Olszewski disease))、哈-施病(Hallervorden-Spatzdisease)、进行性家族性肌阵挛性癫痫、小脑变性、运动神经元病、韦-霍病(Werdnig-Hoffman disease)、沃-库-韦病(Wohlfart-Kugelberg-Welander disease)、沙-马-图病(Charcot-Marie-Tooth disease)、德-索病(Dejerine-Sottas disease)、视网膜色素变性、莱伯病(Leber’s disease)、进行性全身性硬化症、皮肌炎和混合型结缔组织病。
在一些实施方案中，所述神经变性病理为眼部急性或慢性变性疾病。眼部急性或慢性变性疾病包括青光眼、干性年龄相关黄斑变性、视网膜色素变性和其它形式的遗传性变性视网膜病、视网膜脱落、黄斑皱褶、影响外部视网膜的缺血、与糖尿病性视网膜病和视网膜缺血相关的细胞损伤、与激光疗法相关的损伤、眼部新生血管、糖尿病性视网膜病、虹膜红变、葡萄膜炎、富克斯异色性虹膜睫状体炎(Fuch’s heterochromaticiridocyclitis)、新生血管性青光眼、角膜新血管形成、视网膜缺血、脉络膜血管功能不全、脉络膜性血栓症、颈动脉缺血、挫伤性眼外伤、早产儿视网膜病、视网膜静脉闭塞、增殖性玻璃体视网膜病、角膜血管发生、视网膜微血管病和视网膜水肿。
在一些实施方案中，由HDAC介导的病症或障碍包括纤维化疾病例如肝纤维化、囊性纤维化、肝硬化和纤维化皮肤病例如肥厚性瘢痕、瘢痕疙瘩和杜普伊特伦挛缩(Dupuytren’s contracture)。因此，本申请还提供在需要所述治疗的受试者中治疗由HDAC介导的纤维化疾病的方法，其包括向所述受试者给药治疗有效量的本申请所述至少一种化合物或其药用盐。
在一些实施方案中，由HDAC介导的病症或障碍包括心理障碍例如抑郁症、双相性精神障碍和痴呆。在一些实施方案中，由HDAC介导的病症或障碍包括抑郁症。因此，本申请还提供在需要所述治疗的受试者中治疗由HDAC介导的心理障碍例如抑郁症的方法，其包括向所述受试者给药治疗有效量的本申请所述至少一种化合物或其药用盐。在一些实施方案中，所述抑郁症选自重度抑郁性障碍和双相性精神障碍。
在一些实施方案中，由HDAC介导的病症或障碍包括焦虑症。因此，本申请还提供在需要所述治疗的受试者中治疗由HDAC介导的焦虑症的方法，其包括向所述受试者给药治疗有效量的本申请所述至少一种化合物或其药用盐。
在一些实施方案中，由HDAC介导的病症或障碍包括精神分裂症。因此，本申请还提供在需要所述治疗的受试者中治疗由HDAC介导的精神分裂症的方法，其包括向所述受试者给药治疗有效量的本申请所述至少一种化合物或其药用盐。
在一些实施方案中，由HDAC介导的病症或障碍包括运动神经元病、肌肉萎缩/肌肉消耗症或肌萎缩性侧索硬化(ALS)。因此，本申请还提供在需要所述治疗的受试者中治疗由HDAC介导的运动神经元病、肌肉萎缩/肌肉消耗症或肌萎缩性侧索硬化(ALS)的方法，其包括向所述受试者给药治疗有效量的本申请所述至少一种化合物或其药用盐。
在一些实施方案中，由HDAC介导的病症或障碍包括心血管病症。因此，本申请还提供在需要所述治疗的受试者中治疗由HDAC介导的心血管病症的方法，其包括向所述受试者给药治疗有效量的本申请所述至少一种化合物或其药用盐。在一些实施方案中，所述心血管病症选自心肌病、心脏肥大、心肌缺血、心力衰竭、心脏再狭窄和动脉硬化。
在一些实施方案中，由HDAC介导的病症或障碍包括癌症。因此，本申请还提供在需要所述治疗的受试者中治疗由HDAC介导的癌症的方法，其包括向所述受试者给药治疗有效量的本申请所述至少一种化合物或其药用盐。在一些实施方案中，所述癌症选自淋巴瘤、胰腺癌、结肠直肠癌、肝细胞癌、瓦尔登斯特伦巨球蛋白血症(Waldenstrommacroglobulinemia)、抗激素性前列腺癌和白血病、乳腺癌、肺癌、卵巢癌、前列腺癌、头颈癌、肾癌、胃癌、脑癌、B细胞淋巴瘤、外周T细胞淋巴瘤和皮肤T细胞淋巴瘤。在一些进一步的实施方案中，所述癌症选自以下癌症类型。心脏：肉瘤(血管肉瘤、纤维肉瘤、横纹肌肉瘤、脂肪肉瘤)、粘液瘤、横纹肌瘤、纤维瘤、脂肪瘤和畸胎瘤；肺：支气管癌(鳞状上皮细胞癌、未分化的小细胞癌、未分化的大细胞癌、腺癌)、肺泡(细支气管)癌、支气管腺瘤、肉瘤、淋巴瘤、软骨瘤性错构瘤、间皮瘤；胃肠：食道(鳞状上皮细胞癌、腺癌、平滑肌肉瘤、淋巴瘤)、胃(癌瘤、淋巴瘤、平滑肌肉瘤)、胰腺(导管腺癌、胰岛素瘤、胰高血糖素瘤、胃泌素瘤、类癌瘤、舒血管肠肽瘤)、小肠(腺癌、淋巴瘤、类癌瘤、卡波西肉瘤(Karposi’s sarcoma)、平滑肌瘤、血管瘤、脂肪瘤、神经纤维瘤、纤维瘤)、大肠(腺癌、管状腺瘤、绒毛状腺瘤、错构瘤、平滑肌瘤)；泌尿生殖道：肾脏(腺癌、威尔姆斯瘤(Wilm’s tumor)[肾胚细胞瘤]、淋巴瘤、白血病)、膀胱和尿道(鳞状上皮细胞癌、移行细胞癌、腺癌)、前列腺(腺癌、肉瘤)、睾丸(精原细胞瘤、畸胎瘤、胚胎性癌瘤、畸胎癌、绒毛膜癌、肉瘤、间质细胞癌、纤维瘤、纤维腺瘤、腺瘤样瘤、脂肪瘤)；肝脏：肝癌、胆管癌、肝毒细胞瘤、血管肉瘤、肝细胞腺瘤、血管瘤；骨：成骨肉瘤(骨肉瘤)、纤维肉瘤、恶性纤维组织细胞瘤、软骨肉瘤、尤因肉瘤(Ewing’s sarcoma)、恶性淋巴瘤(网状细胞肉瘤)、多发性骨髓瘤、恶性巨细胞瘤、脊索瘤、成软骨细胞瘤(骨软骨外生骨疣)、良性软骨瘤、成软骨细胞瘤、软骨粘液样纤维瘤、骨样骨瘤和巨细胞瘤；神经系统：颅骨(骨瘤、血管瘤、肉芽肿、黄色瘤、畸形性骨炎)、脑膜(脑膜瘤、脑膜肉瘤、神经胶质瘤)、脑(星形细胞瘤、髓母细胞瘤、神经胶质瘤、室管膜瘤、生殖细胞瘤[松果体瘤]、多型性胶质母细胞瘤、少突神经胶质瘤、神经鞘瘤、视网膜母细胞瘤、先天性肿瘤)、脊髓神经纤维瘤、脑膜瘤、神经胶质瘤、肉瘤)；妇科：子宫(子宫内膜癌)、宫颈(宫颈癌、瘤前宫颈非典型增生)、卵巢(卵巢癌[浆液性囊腺癌、粘液性囊腺癌、未分类的癌瘤]、粒层-泡膜细胞瘤、Sertoli-Leydig细胞瘤、无性细胞瘤、恶性畸胎瘤)、外阴(鳞状上皮细胞癌、上皮内癌瘤、腺癌、纤维肉瘤、黑素瘤)、阴道(透明细胞癌、鳞状上皮细胞癌、葡萄状肉瘤(胚胎横纹肌肉瘤)、输卵管(癌瘤)；血液学：血液(髓细胞性白血病[急性和慢性]、急性成淋巴细胞性白血病、慢性成淋巴细胞性白血病、骨髓增生性疾病、多发性骨髓瘤、骨髓增生异常综合征)、霍奇金病(Hodgkin’s disease)、非霍奇金淋巴瘤[恶性淋巴瘤]；皮肤：恶性黑素瘤、基底细胞癌、鳞状上皮细胞癌、卡波西肉瘤、moles dysplastic nevi、脂肪瘤、血管瘤、皮肤纤维瘤、瘢痕疙瘩、银屑病；和肾上腺：成神经细胞瘤；和通过在对肿瘤进行照射以治疗癌症前、在对肿瘤进行照射以治疗癌症期间或在对肿瘤进行照射以治疗癌症后给药本发明化合物来使肿瘤对放射疗法增敏。
在一些实施方案中，由HDAC介导的病症或障碍包括可通过免疫调节来治疗的病症或障碍。因此，本申请还提供在需要所述治疗的受试者中治疗由HDAC介导的可通过免疫调节来治疗的病症或障碍的方法，其包括向所述受试者给药治疗有效量的本申请所述至少一种化合物或其药用盐。在一些实施方案中，可通过免疫调节来治疗的病症或障碍选自哮喘、肠易激综合征、克罗恩病(Crohn’s disease)、溃疡性结肠炎、肠运动障碍、高血压、类风湿性关节炎、骨关节炎、青少年慢性关节炎、移植物抗宿主病、银屑病、脊椎关节病、炎症性肠病、酒精性肝炎、斯耶格伦综合征(Sjogren’s syndrome)、强直性脊柱炎、膜性肾小球病、椎间盘性疼痛、全身性红斑狼疮、变应性肠病、腹部疾病、支气管炎、囊性纤维化、类风湿性脊椎炎、骨关节炎、葡萄膜炎、虹膜炎和结膜炎、缺血性肠病、银屑病、湿疹、皮炎、脓毒性关节炎、痛风、假痛风、青少年关节炎、斯蒂尔病(Still’s disease)、亨-舍紫癜(Henoch-Schonlein purpura)、银屑病关节炎、肌痛、反应性关节炎(莱特综合征(Reiter’ssyndrome))、血色素沉着病、韦格肉芽肿病(Wegener’s granulomatosis)、家族性地中海热(FMF)、HBDS(高免疫球蛋白血症D和周期性发热综合征)、TRAPS(与TNF-α受体相关的周期性发热综合征)、慢性阻塞性肺病、在新生儿期发病的多系统炎症性疾病(NOMID)、与冷吡啉相关的周期性综合征(CAPS)和家族性寒冷性自身炎症性综合征(FCAS)。
在一些实施方案中，由HDAC介导的病症或障碍包括变应性疾病。因此，本申请还提供在需要所述治疗的受试者中治疗由HDAC介导的变应性疾病的方法，其包括向所述受试者给药治疗有效量的本申请所述至少一种化合物或其药用盐。变应性疾病包括但不限于呼吸系统变应性疾病例如变应性鼻炎、超敏性肺病、超敏性肺炎、嗜酸性粒细胞性肺炎、吕弗勒综合征(Loeffler’s syndrome)、慢性嗜酸性粒细胞性肺炎、迟发型超敏反应、间质性肺病(ILD)、特发性肺纤维化、多肌炎、皮肌炎、全身性过敏反应、药物变态反应(例如对青霉素或头孢菌素的变态反应)和昆虫叮咬性变态反应。
在一些实施方案中，由HDAC介导的病症或障碍包括感染性疾病例如真菌感染、细菌感染、病毒感染和原虫感染例如疟疾、贾第虫病、利什曼病、查加斯病(Chaga’sdisease)、痢疾、弓形体病和球虫病。在一些实施方案中，由HDAC介导的病症或障碍包括疟疾。因此，本申请还提供在需要所述治疗的受试者中治疗由HDAC介导的感染性疾病例如疟疾的方法，其包括向所述受试者给药治疗有效量的本申请所述至少一种化合物或其药用盐。
在一些实施方案中，由HDAC介导的病症或障碍包括自闭症或雷特综合征(Rettsyndrome)。因此，本申请还提供在需要所述治疗的受试者中治疗由HDAC介导的自闭症或雷特综合征的方法，其包括向所述受试者给药治疗有效量的本申请所述至少一种化合物或其药用盐。
在一些实施方案中，由HDAC介导的病症或障碍包括血液学障碍例如地中海贫血、贫血和镰状细胞贫血。因此，本申请还提供在需要所述治疗的受试者中治疗由HDAC介导的血液学障碍的方法，其包括向所述受试者给药治疗有效量的本申请所述至少一种化合物或其药用盐。
在一些实施方案中，由HDAC介导的病症或障碍包括代谢疾病例如前驱糖尿病或糖尿病(I型或II型)。因此，本申请还提供在需要所述治疗的受试者中治疗由HDAC介导的代谢疾病例如前驱糖尿病或糖尿病(I型或II型)的方法，其包括向所述受试者给药治疗有效量的本申请所述至少一种化合物或其药用盐。
在一些实施方案中，由HDAC介导的病症或障碍包括还可通过以祖细胞/干细胞为基础的疗法来治疗的障碍例如：与糖尿病相关的障碍(器官衰竭、肝硬化和肝炎)；与脑中祖细胞失调相关的中枢神经系统(CNS)障碍(例如创伤后应激障碍(PTSD)；肿瘤(例如视网膜母细胞瘤)；影响少突胶质细胞祖细胞的障碍(例如星形细胞瘤和室管膜细胞瘤)；多发性硬化症；脱髓鞘障碍，例如脑白质营养不良；与白质丢失相关的神经病；和小脑障碍，例如共济失调；和嗅觉祖细胞障碍(例如嗅觉缺失症)。因此，本申请还提供在需要所述治疗的受试者中治疗由HDAC介导的障碍的方法，其包括在用以祖细胞/干细胞为基础的疗法进行治疗前、在用以祖细胞/干细胞为基础的疗法进行治疗期间或在用以祖细胞/干细胞为基础的疗法进行治疗后向所述受试者给药治疗有效量的本申请所述至少一种化合物或其药用盐。
在一些实施方案中，由HDAC介导的病症或障碍包括与上皮细胞和间充质细胞的增殖相关的障碍(例如肿瘤、伤口愈合和外科手术)。因此，本申请还提供在需要所述治疗的受试者中治疗由HDAC介导的与上皮细胞和间充质细胞的增殖相关的障碍的方法，其包括向所述受试者给药治疗有效量的本申请所述至少一种化合物或其药用盐。
在一些实施方案中，由HDAC介导的病症或障碍包括与骨祖细胞(例如成骨细胞和破骨细胞)的增殖相关的障碍、与毛发祖细胞和表皮祖细胞相关的障碍(例如脱发、皮肤肿瘤、皮肤再生、烧伤和整形手术)和与绝经期间骨丢失相关的障碍。因此，本申请还提供在需要所述治疗的受试者中治疗由HDAC介导的与骨祖细胞的增殖相关的障碍、与毛发祖细胞和表皮祖细胞相关的障碍或与骨丢失相关的障碍的方法，其包括向所述受试者给药治疗有效量的本申请所述至少一种化合物或其药用盐。
在一些实施方案中，由HDAC介导的病症或障碍为病毒性障碍，对于所述病毒性障碍，血液细胞在由于向受试者给药治疗有效量的本申请所述至少一种化合物或其药用盐而抑制HDAC后变得对其它治疗敏感。
在一些实施方案中，由HDAC介导的病症或障碍为免疫障碍，所述免疫障碍在向受试者给药治疗有效量的本申请所述至少一种化合物或其药用盐后可用TNFα或其它免疫调节剂共同治疗。
在一些实施方案中，由HDAC介导的病症或障碍包括移植物排斥或移植排斥。因此，本申请还提供在需要所述治疗的受试者中治疗由HDAC介导的与移植物排斥或移植排斥相关的障碍的方法，其包括向所述受试者给药治疗有效量的本申请所述至少一种化合物或其药用盐。
在一些实施方案中，由HDAC介导的病症或障碍包括与氧化氮(NO)调节相关的血压障碍(例如高血压、勃起功能障碍、哮喘；和眼部障碍，例如青光眼)。因此，本申请还提供在需要所述治疗的受试者中治疗由HDAC介导的与氧化氮(NO)调节相关的血压障碍的方法，其包括向所述受试者给药治疗有效量的本申请所述至少一种化合物或其药用盐。在一些实施方案中，所述病症或障碍为心脏肥大障碍。因此，本申请还提供在需要所述治疗的受试者中治疗由HDAC介导的心脏肥大障碍的方法，其包括向所述受试者给药治疗有效量的本申请所述至少一种化合物或其药用盐。
本申请还提供其中将本申请所述至少一种化合物或其药用盐作为唯一活性剂给药于受试者的治疗方法且包括其中将本申请所述至少一种化合物或其药用盐与一种或多种其它活性剂联合给药于受试者的治疗方法。
通常，本申请所述化合物或其药用盐将以治疗有效量通过就具有类似用途的药物而言所接受的任意给药模式来给药。所述化合物即活性成分的实际量将取决于多种因素例如待治疗的疾病的严重程度、受试者的年龄和相对健康、所使用的化合物的效力、给药途径和给药形式及本领域技术人员已知的其它因素。药物可每天给药至少一次，例如每天给药一次或两次。
在一些实施方案中，本申请所述化合物或其药用盐以药物组合物形式给药。因此，本发明提供药物组合物，其包含本申请所述至少一种化合物或其药用盐及至少一种选自载体、辅料和赋形剂的药用媒介物。
药用媒介物必须具有足够高的纯度和足够低的毒性以使它们适于给药于所治疗的动物。媒介物可为惰性的或其可具有药学益处。为了在每个单位剂量中给药所述化合物或其药用盐，与所述化合物或其药用盐一起使用的媒介物的量足以提供实用量的物质。
示例性的药用载体或其组分为糖，例如乳糖、葡萄糖和蔗糖；淀粉，例如玉米淀粉和马铃薯淀粉；纤维素及其衍生物，例如羧甲基纤维素钠、乙基纤维素和甲基纤维素；西黄蓍胶粉；麦芽；明胶；滑石；固体润滑剂，例如硬脂酸和硬脂酸镁；硫酸钙；合成油；植物油，例如花生油、棉籽油、芝麻油、橄榄油和玉米油；多元醇，例如丙二醇、甘油、山梨醇、甘露醇和聚乙二醇；海藻酸；磷酸盐缓冲溶液；乳化剂，例如吐温；润湿剂，例如月桂基硫酸钠；着色剂；矫味剂；压片剂；稳定剂；抗氧化剂；防腐剂；无热原水；等渗盐水；和磷酸盐缓冲溶液。
任选的活性剂可包含在药物组合物中，所述任选的活性剂基本上不干扰本申请所述化合物或其药用盐的活性。
将有效浓度的本申请所述至少一种化合物或其药用盐与适当的药用媒介物混合。当所述化合物或其药用盐表现出不足的溶解度时，可使用使化合物增溶的方法。上述方法为本领域技术人员已知的且包括但不限于使用共溶剂例如二甲基亚砜(DMSO)、使用表面活性剂例如吐温或溶解在碳酸氢钠水溶液中。
当混合或加入本申请所述化合物或其药用盐时，所得混合物可为溶液、混悬液、乳液等。所得混合物的形式取决于多种因素，包括所预期的给药模式和所述化合物或其药用盐在所选媒介物中的溶解度。足以使所治疗的疾病的症状得以缓解的有效浓度可凭经验确定。
本申请所述化合物或其药用盐可如下以剂量单位制剂形式给药：口服、局部、胃肠外、静脉内、肌内注射、吸入或喷雾、舌下、透皮、含服、直肠、眼用溶液剂或其它方式。
可将药物组合物配制成用于口服，例如片剂、糖锭剂、锭剂、水性或油性混悬剂、可分散的粉末剂或颗粒剂、乳剂、硬胶囊剂或软胶囊剂、糖浆剂或酏剂。旨在用于口服的药物组合物可根据本领域已知的用于制备药物组合物的任意方法来制备且上述组合物可含有一种或多种物质例如甜味剂、矫味剂、着色剂和防腐剂以提供药学上美观和适口的制剂。在一些实施方案中，口服药物组合物含有0.1％至99％的本申请所述至少一种化合物或其药用盐。在一些实施方案中，口服药物组合物含有至少5％(重量％)的本申请所述至少一种化合物或其药用盐。一些实施方案含有25％至50％或5％至75％的本申请所述至少一种化合物或其药用盐。
口服给药的药物组合物还包括液体溶液剂、乳剂、混悬剂、粉末剂、颗粒剂、酏剂、酊剂、糖浆剂等。适于制备上述组合物的药用载体为本领域已知的。口服药物组合物可含有防腐剂、矫味剂、甜味剂(例如蔗糖或糖精)、掩味剂和着色剂。
用于糖浆剂、酏剂、乳剂和混悬剂的常见载体组分包括乙醇、甘油、丙二醇、聚乙二醇、液体蔗糖、山梨醇和水。糖浆剂和酏剂可用甜味剂例如甘油、丙二醇、山梨醇或蔗糖配制。上述药物组合物还可含有缓和剂。
例如，可将本申请所述化合物或其药用盐引入到口服液体制剂例如水性或油性混悬剂、溶液剂、乳剂、糖浆剂或酏剂中。另外，含有上述至少一种化合物或其药用盐的药物组合物可按干燥产品形式提供，其在使用前用水或其它适当的媒介物复溶。上述液体制剂可含有常规添加剂例如助悬剂(例如山梨醇糖浆、甲基纤维素、葡萄糖/糖、糖浆、明胶、羟乙基纤维素、羧甲基纤维素、硬脂酸铝凝胶和氢化食用脂)、乳化剂(例如卵磷脂、脱水山梨醇单油酸酯或阿拉伯胶)、非水性媒介物[其可包括食用油(例如杏仁油、分级椰子油、硅酯、丙二醇和乙醇)]和防腐剂(例如对羟基苯甲酸甲酯或对羟基苯甲酸丙酯和山梨酸)。
对于混悬剂，常见的助悬剂包括甲基纤维素、羧甲基纤维素钠、AVICELRC-591、西黄蓍胶和海藻酸钠；常见的润湿剂包括卵磷脂和聚山梨酯80；且常见的防腐剂包括对羟基苯甲酸甲酯和苯甲酸钠。
水性混悬剂含有活性物质(一种或多种)及适于制备水性混悬剂的赋形剂。上述赋形剂为助悬剂例如羧甲基纤维素钠、甲基纤维素、羟丙基甲基纤维素、海藻酸钠、聚乙烯基吡咯烷酮、西黄蓍胶和阿拉伯胶；分散剂或润湿剂；可为天然存在的磷脂例如卵磷脂或氧化烯与脂肪酸的缩合产物例如聚氧乙烯硬脂酸酯或氧化乙烯与长链脂肪醇的缩合产物例如十七乙烯氧基鲸蜡醇或氧化乙烯与衍生自脂肪酸和己糖醇的部分酯的缩合产物例如聚氧乙烯山梨醇代替物或氧化乙烯与衍生自脂肪酸和己糖醇酐的部分酯的缩合产物例如聚乙烯脱水山梨醇代替物。水性混悬剂还可含有一种或多种防腐剂例如对羟基苯甲酸乙酯或对羟基苯甲酸正丙酯。
油性混悬剂可如下配制：将活性成分混悬在植物油例如花生油、橄榄油、芝麻油或椰子油中或混悬在矿物油例如液体石蜡中。油性混悬剂可含有增稠剂例如蜂蜡、硬石蜡或鲸蜡醇。可加入甜味剂例如上述那些甜味剂和矫味剂以提供适口的口服制剂。这些药物组合物可通过加入抗氧化剂例如抗坏血酸来防腐。
药物组合物还可呈水包油型乳剂形式。油相可为植物油例如橄榄油或花生油或矿物油例如液体石蜡或这些油的混合物。适当的乳化剂可为天然存在的胶类例如阿拉伯胶或西黄蓍胶、天然存在的磷脂例如大豆磷脂或卵磷脂、衍生自脂肪酸和己糖醇或己糖醇酐的酯或部分酯例如脱水山梨醇单油酸酯和所述部分酯与氧化乙烯的缩合产物例如聚氧乙烯脱水山梨醇单油酸酯。
适于通过加入水来制备水性混悬剂的可分散的粉末剂和颗粒剂为活性成分与分散剂或润湿剂、助悬剂和一种或多种防腐剂的混合物。分散剂或润湿剂和助悬剂的适当实例如上所述。
片剂通常包含常规药用辅料例如惰性稀释剂，例如碳酸钙、碳酸钠、甘露醇、乳糖和纤维素；粘合剂，例如淀粉、明胶和蔗糖；崩解剂，例如淀粉、海藻酸和交联羧甲纤维素；润滑剂，例如硬脂酸镁、硬脂酸和滑石。助流剂例如二氧化硅可用于改善粉末混合物的流动性。为了美观，可加入着色剂例如FD&C染料。甜味剂和矫味剂例如阿司帕坦、糖精、薄荷醇、薄荷和水果香料可为用于咀嚼片的有用辅料。胶囊剂(包括定时释放和持续释放制剂)通常包含一种或多种上述固体稀释剂。对载体组分的选择通常取决于次级考虑因素例如味道、成本和贮存稳定性。
上述药物组合物还可通过常规方法通常用pH依赖性包衣或时间依赖性包衣来包衣，从而使所述化合物或其药用盐在胃肠道中在所期望的局部给药部位附近释放或使所述化合物或其药用盐在不同的时间释放以延长所期望的作用。上述剂型通常包含但不限于一种或多种乙酸邻苯二甲酸纤维素、聚乙烯基乙酸邻苯二甲酸酯、邻苯二甲酸羟丙基甲基纤维素、乙基纤维素、丙烯酸树脂包衣、蜡和虫胶。
口服药物组合物还可按硬明胶胶囊剂(其中将活性成分与惰性固体稀释剂例如碳酸钙、磷酸钙或高岭土混合)或软明胶胶囊剂(其中将活性成分与水或油性介质例如花生油、液体石蜡或橄榄油混合)形式提供。
药物组合物可呈无菌注射用水性或油性混悬剂形式。该混悬剂可根据已知技术使用上述那些适当的分散剂或润湿剂和助悬剂来配制。无菌注射剂还可为在胃肠外可接受的无毒媒介物中的无菌注射用溶液剂或混悬剂例如在1,3-丁二醇中的溶液剂。可使用且可接受的媒介物包括水、林格溶液和等渗氯化钠溶液。另外，通常使用无菌不挥发性油作为溶剂或混悬介质。出于该目的，可使用任意温和的不挥发性油，包括合成性甘油一酯或甘油二酯。另外，脂肪酸例如油酸可用于制备注射剂。
本申请所述化合物或其药用盐可在无菌介质中胃肠外给药。胃肠外给药包括皮下注射、静脉内注射、肌内注射、鞘内注射或输注技术。可将本申请所述化合物或其药用盐混悬或溶解在媒介物中，这取决于所使用的媒介物和浓度。有利地，可将辅料例如局部麻醉剂、防腐剂和缓冲剂溶解在媒介物中。在用于胃肠外给药的多种药物组合物中，载体占总组合物重量的至少90％。在一些实施方案中，用于胃肠外给药的载体选自丙二醇、油酸乙酯、吡咯烷酮、乙醇和芝麻油。
本申请所述化合物或其药用盐还可按用于药物直肠给药的栓剂形式给药。这些药物组合物可如下制备：将药物与适当的非刺激性赋形剂混合，所述赋形剂在常温为固体，但是在直肠温度为液体，因此将在直肠中融化以释放药物。上述物质包括可可脂和聚乙二醇。
可将本申请所述化合物或其药用盐配制成凝胶剂、乳膏剂和洗剂形式用于局部施用例如局部施用于皮肤和粘膜例如局部施用在眼中及用于施用于眼。局部用药物组合物可呈任意形式，包括例如溶液剂、乳膏剂、软膏剂、凝胶剂、洗剂、乳剂、清洁剂、增湿剂、喷雾剂、皮肤贴剂等。
可将上述溶液剂与适当的盐一起配制成浓度为0.01％-10％的等渗溶液(pH 5-7)。还可将本申请所述化合物或其药用盐配制成透皮贴剂用于透皮给药。
可将包含本申请所述至少一种化合物或其药用盐的局部用药物组合物与本领域已知的多种载体物质混合，所述载体物质为例如水、醇、芦荟凝胶、尿囊素、甘油、维生素A和E油、矿物油、丙二醇、PPG-2丙酸肉豆蔻酯等。
适于用在局部用载体中的其它物质包括例如润滑药、溶剂、保湿剂、增稠剂和粉末物质。这些类型的物质可单独使用或以一种或多种物质的混合物形式使用，所述物质的实例各自如下所述。
代表性润滑药包括硬脂醇、单蓖麻油酸甘油酯、单硬脂酸甘油酯、丙烷-1,2-二醇、丁烷-1,3-二醇、貂油、鲸蜡醇、异硬脂酸异丙酯、硬脂酸、棕榈酸异丁酯、硬脂酸异鲸蜡酯、油醇、月桂酸异丙酯、月桂酸己酯、油酸癸酯、十八烷-2-醇、异鲸蜡醇、棕榈酸鲸蜡酯、二甲基聚硅氧烷、癸二酸二正丁酯、肉豆蔻酸异丙酯、棕榈酸异丙酯、硬脂酸异丙酯、硬脂酸丁酯、聚乙二醇、三甘醇、羊毛脂、芝麻油、椰子油、花生油、蓖麻油、乙酰化羊毛脂醇、石油、矿物油、肉豆蔻酸丁酯、异硬脂酸、棕榈酸、亚油酸异丙酯、乳酸月桂酯、乳酸肉豆蔻酯、油酸癸酯和肉豆蔻酸肉豆蔻酯；推进剂，例如丙烷、丁烷、异丁烷、二甲醚、二氧化碳和一氧化二氮；溶剂，例如乙醇、二氯甲烷、异丙醇、蓖麻油、乙二醇单乙醚、二甘醇单丁醚、二甘醇单乙醚、二甲基亚砜、二甲基甲酰胺和四氢呋喃；保湿剂，例如甘油、山梨醇、吡咯烷-2-酮-5-甲酸钠、可溶性胶原、邻苯二甲酸二丁酯和明胶；和粉末物质，例如白垩、滑石、漂白土、高岭土、淀粉、胶类、胶体二氧化硅、聚丙烯酸钠、蒙脱石四烷基铵、蒙脱石三烷基芳基铵、经化学改性的硅酸镁铝、经有机改性的蒙脱石粘土、水合硅酸铝、烟雾硅胶、羧基乙烯基聚合物、羧甲基纤维素钠和乙二醇单硬脂酸酯。
本申请所述化合物或其药用盐还可按脂质体给药系统形式局部给药，所述脂质体给药系统为例如小单层囊泡、大单层囊泡和多层囊泡。脂质体可由多种磷脂例如胆固醇、硬脂胺或磷脂酰胆碱形成。
可用于实现全身给药所述化合物或其药用盐的其它药物组合物包括舌下、含服和经鼻剂型。上述药物组合物通常包含一种或多种可溶性填充剂物质(例如蔗糖、山梨醇和甘露醇)和粘合剂(例如阿拉伯胶、微晶纤维素、羧甲基纤维素和羟丙基甲基纤维素)。还可包含上述助流剂、润滑剂、甜味剂、着色剂、抗氧化剂和矫味剂。
用于吸入的药物组合物通常可按溶液剂、混悬剂或乳剂形式提供，其可按使用常规推进剂(例如二氯二氟甲烷或三氯氟甲烷)的干粉剂或气雾剂形式给药。
药物组合物还可任选包含活性促进剂。活性促进剂可选自很多种分子，所述分子以不同方式发挥作用以提高本申请所述化合物或其药用盐的治疗作用或独立于本申请所述化合物或其药用盐的治疗作用。具体类型的活性促进剂包括透皮促进剂和吸收促进剂。
药物组合物还可含有其它活性剂，所述其它活性剂可选自很多种分子，所述分子以不同方式发挥作用以提高本申请所述至少一种化合物或其药用盐的治疗作用。这些任选的其它活性剂当存在时通常以范围为0.01％至15％的水平用在药物组合物中。一些实施方案按组合物的重量计含有0.1％至10％的其它活性剂。其它实施方案按组合物的重量计含有0.5％至5％的其它活性剂。
本申请还提供经包装的药物组合物。上述经包装的组合物含有包含本申请所述至少一种化合物或其药用盐的药物组合物和使用所述组合物对受试者(通常为人类患者)进行治疗的说明书。在一些实施方案中，所述说明书指出使用所述药物组合物对患有由HDAC介导的病症或障碍的受试者进行治疗。经包装的药物组合物可例如以经包装的药物组合物中的标签形式向患者或护理人员提供处方信息。处方信息可包括例如与所述药物组合物相关的效力、剂量、给药、禁忌症和副反应信息。
在所有上述内容中，所述化合物或其药用盐可单独给药或以与其它活性剂的混合物形式给药或与其它活性剂联合给药。
本申请所述方法包括治疗亨廷顿病的方法，包括治疗与亨廷顿病相关的记忆和/或认知缺损的方法，其包括向受试者同时或先后给药本申请所述至少一种化合物或其药用盐和一种或多种用于治疗亨廷顿病的其它药物，所述其它药物为例如但不限于阿米替林、丙咪嗪、地昔帕明、去甲替林、帕罗西汀、氟西汀、舍曲林、丁苯那嗪、氟哌啶醇、氯丙嗪、硫利达嗪、舒必利、喹硫平、氯氮平和利培酮。在使用同时给药的方法中，所述药物可存在于所组合的组合物中或可分开给药。因此，本申请还提供药物组合物，其包含本申请所述至少一种化合物或其药用盐和一种或多种用于治疗亨廷顿病的其它药物，所述其它药物为例如但不限于阿米替林、丙咪嗪、地昔帕明、去甲替林、帕罗西汀、氟西汀、舍曲林、丁苯那嗪、氟哌啶醇、氯丙嗪、硫利达嗪、舒必利、喹硫平、氯氮平和利培酮。类似地，本申请还提供经包装的药物组合物，其含有包含本申请所述至少一种化合物或其药用盐的药物组合物和包含一种或多种用于治疗亨廷顿病的其它药物的另一种组合物，所述其它药物为例如但不限于阿米替林、丙咪嗪、地昔帕明、去甲替林、帕罗西汀、氟西汀、舍曲林、丁苯那嗪、氟哌啶醇、氯丙嗪、硫利达嗪、舒必利、喹硫平、氯氮平和利培酮。
本申请还提供针对阿尔茨海默病(包括治疗与阿尔茨海默病相关的记忆和/或认知缺损)的方法，其包括向受试者同时或先后给药本申请所述至少一种化合物或其药用盐和一种或多种用于治疗阿尔茨海默病的其它药物，所述其它药物为例如但不限于加兰他敏、他克林、多奈哌齐、利凡斯的明、美金刚、新托平、司来吉兰、雌激素和氯碘喹啉。在使用同时给药的方法中，所述药物可存在于所组合的组合物中或可分开给药。本申请还提供药物组合物，其包含本申请所述至少一种化合物或其药用盐和一种或多种用于治疗阿尔茨海默病的其它药物，所述其它药物为例如但不限于加兰他敏、他克林、多奈哌齐、利凡斯的明、美金刚、新托平、司来吉兰、雌激素和氯碘喹啉。类似地，本申请还提供经包装的药物组合物，其含有包含本申请所述至少一种化合物或其药用盐的药物组合物和包含一种或多种用于治疗阿尔茨海默病的其它药物的另一种组合物，所述其它药物为例如但不限于加兰他敏、他克林、多奈哌齐、利凡斯的明、美金刚、新托平、司来吉兰、雌激素和氯碘喹啉。
本申请还提供治疗癌症的方法，其包括向受试者同时或先后给药本申请所述至少一种化合物或其药用盐和一种或多种用于治疗癌症的其它药物，所述其它药物为例如但不限于以下类别的抗肿瘤药：
(i)通过与本申请上述那些机理相同或不同的机理来发挥作用的其它细胞周期抑制剂，例如周期素依赖性激酶(CDK)抑制剂，特别是CDK2抑制剂；
(ii)细胞生长抑制剂，例如抗雌激素药(例如他莫昔芬、托瑞米芬、雷洛昔芬、屈洛昔芬、碘多昔芬)、孕激素(例如醋酸甲地孕酮)、芳香酶抑制剂(例如阿那曲唑、来曲唑、氟氯唑、依西美坦)、抗孕激素药、抗雄激素药(例如氟他胺、尼鲁米特、比卡鲁胺、醋酸环丙孕酮)、LHRH激动剂和拮抗剂(例如醋酸戈舍瑞林、亮丙瑞林)、睾酮5α-二氢还原酶抑制剂(例如非那雄胺)、抗侵入药(例如金属蛋白酶抑制剂例如马立马司他和尿激酶纤维蛋白溶解酶原激活剂受体功能抑制剂)和生长因子功能抑制剂(所述生长因子包括例如血管内皮生长因子、上皮生长因子、血小板源性生长因子和肝细胞生长因子且所述抑制剂包括生长因子抗体、生长因子受体抗体、酪氨酸激酶抑制剂和丝氨酸/苏氨酸激酶抑制剂)；
(iii)用在医学肿瘤学中的抗增殖/抗肿瘤药及其组合，例如抗代谢药(例如抗叶酸剂例如甲氨蝶呤、氟嘧啶例如5-氟尿嘧啶、嘌呤和腺苷类似物、阿糖胞苷)；抗肿瘤性抗生素(例如蒽环类抗生素例如多柔比星、柔红霉素、表柔比星和伊达比星、丝裂霉素C、放线菌素D、光辉霉素)；铂衍生物(例如顺铂、卡铂)；烷化剂(例如氮芥、美法仑、苯丁酸氮芥、白消安、环磷酰胺、异环磷酰胺、亚硝基脲、塞替派)；抗有丝分裂药(例如长春花生物碱类例如长春新碱和紫杉烷类例如紫杉醇、多西紫杉醇)；拓扑异构酶抑制剂(例如鬼臼乙叉甙类例如依托泊苷和替尼泊苷、安吖啶、托泊替康)；
(iv)通过与本申请上述那些机理不同的机理来发挥作用的抗血管生成剂(例如受体酪氨酸激酶例如Tie-2、整联蛋白α5β3功能抑制剂、血管紧张素、雷佐生、沙利度胺)且包括血管靶向药物；和
(v)分化剂(例如维A酸和维生素D)。
在使用同时给药的方法中，所述药物可存在于所组合的组合物中或可分开给药。因此，本申请还提供药物组合物，其包含本申请所述至少一种化合物或其药用盐和一种或多种本申请所述抗肿瘤药。类似地，本申请还提供经包装的药物组合物，其含有包含本申请所述至少一种化合物或其药用盐的药物组合物和包含一种或多种本申请所述抗肿瘤药的另一种组合物。当与一种或多种其它药物联用时，可在给药所述其它药物(一种或多种)前、与所述其它药物(一种或多种)同时或在给药所述其它药物(一种或多种)后给药本申请所述化合物或其药用盐。
在一些实施方案中，本申请所述化合物或其药用盐可与外科手术或放射疗法联用，任选与一种或多种用于治疗癌症的其它药物联用。
本申请所述化合物的剂量取决于多种因素，包括待治疗的具体症状、所述症状的严重程度、给药途径、剂量间隔频率、所使用的具体化合物、所述化合物的效力、毒理学分布和药物代谢动力学分布及是否存在任意有害的副作用等。
本申请所述化合物或其药用盐通常以就HDAC抑制剂而言常用的剂量水平和方式来给药。例如，所述化合物或其药用盐可按一剂或多剂来口服给药，其中剂量水平通常为0.001-100mg/kg/日，例如0.01-100mg/kg/日，例如0.1-70mg/kg/日，例如0.5-10mg/kg/日。单位剂量形式通常可含有0.01-1000mg本申请所述至少一种化合物或其药用盐，例如0.1-50mg本申请所述至少一种化合物或其药用盐。所述化合物可按一剂或多剂来静脉内给药，其中剂量水平为例如0.001-50mg/kg/日，例如0.001-10mg/kg/日，例如0.01-1mg/kg/日。单位剂量形式可含有例如0.1-10mg本申请所述至少一种化合物或其药用盐。
呈标记形式的本申请所述化合物或其药用盐可用作诊断剂以鉴别和/或得到具有本申请所述功能即调节HDAC活性的化合物。本申请所述化合物或其药用盐还可用于对生物学测定进行验证、优化和归一化。
本申请使用的“标记”是指化合物用能够提供可检测的信号的标记物进行直接或间接标记，所述标记物为例如放射性同位素、荧光标签、酶、抗体、粒子例如磁性粒子、化学发光标签或特异性结合分子等。特异性结合分子包括配对体例如生物素和链霉抗生物素、地高辛和抗地高辛等。对于特异性结合成员，互补成员通常可如上所述按照已知的方法用能够被检测的分子进行标记。标记物可直接或间接提供可检测的信号。
在实施本申请所述方法的过程中，应该理解的是，当提到具体的缓冲剂、介质、试剂、细胞、培养条件等时，不是旨在进行限制，而是使其能够被阅读以包括所有相关物质，本领域技术人员可认识到的是，这些相关物质在进行上述讨论的具体背景下是重要的或是有价值的。例如，一种缓冲剂系统或培养基通常可用另一种缓冲剂系统或培养基代替并仍实现类似(若不相同)的结果。本领域技术人员将具有就上述系统和方法学而言足够的知识以在不进行过度实验的情况下就能够进行上述代替，在使用本申请所述方法和操作中，这样的代替将最佳地用于其目的。
实施例
通过以下非限制性实施例来进一步说明本申请所述化合物或其药用盐、组合物和方法。
本申请使用的以下缩写具有以下含义。若缩写没有被定义，则其具有其公认的含义。
缩写
aq.：水溶液
DBU：1,8-二氮杂二环[5.4.0]十一碳-7-烯
DCM：二氯甲烷
DDQ：2,3-二氯-5,6-二氰基-1,4-苯醌
DME：二甲氧基乙烷
DIPEA：二异丙基乙基胺
DMAP：二甲基氨基吡啶
DMF：二甲基甲酰胺
DMSO：二甲基亚砜
ES+：电喷雾正离子化
ES-：电喷雾负离子化
Et2O：乙醚
EtOAc：乙酸乙酯
h：小时
HPLC：高效液相色谱
i-hex：异己烷
IPA：异丙醇
LCMS：液相色谱-质谱
LiHMDS：二(三甲基甲硅烷基)氨基锂
M：质量
MeCN：乙腈
MeOH：甲醇
min：分钟
MS：质谱
NBS：N-溴琥珀酰亚胺
NMR：核磁共振
RT：保留时间
r.t.：室温
sat.：饱和的
SFC：超临界流体色谱
TBAF：四丁基氟化铵
tBu：叔丁基
TFA：三氟乙酸
TFFH：氟-N,N,N’,N’-四甲基甲脒鎓六氟磷酸盐
THF：四氢呋喃
借助Cambridgesoft Chemistry Cartridge(v.9.0.0.182)软件对化合物进行命名。
涉及空气敏感性或湿气敏感性试剂的所有反应在氮气气氛下使用无水溶剂和玻璃器皿来进行。
分析条件
制备中间体1和2：(1S,4R)-4-(3-氟-2-甲基苯基)-2-氧杂二环[2.2.1]庚-3-酮和(R)-1-(3-氟-2-甲基苯基)-3-氧代环戊烷羧酸甲酯。
方法1
步骤1：(S)-1,4-二溴丁-2-醇
在0℃向(S)-丁-1,2,4-三醇(2g,18.9mmol)和三苯基膦(9.9g,37.7mmol)在DCM(100mL)中的搅拌溶液中分批加入NBS(6.7g,37.7mmol)。将混合物温热至室温并搅拌17h。将反应混合物用水(2×100mL)和饱和盐水溶液(100mL)洗涤并将有机相通过相分离器，然后真空浓缩。将残留物溶于DCM(10mL)并加到快速搅拌的Et2O(200mL)中。将所得固体通过真空过滤除去。在过滤期间额外的固体在滤液中析出，因此重复该操作若干次以除去残留的三苯基膦氧化物。浓缩滤液并将所得油状物经快速硅胶柱色谱纯化(梯度洗脱5％EtOAc/异己烷至10％EtOAc/异己烷)得到标题化合物，其为无色油状物(1.5g,35％)。1H NMRδ(ppm)(CHCl3-d):4.09-4.01(1H,m),3.61-3.50(3H,m),3.42(1H,dd,J＝10.4,6.7Hz),2.18(1H,dd,J＝5.4,0.8Hz),2.13-2.01(2H,m)。
步骤2：(S)-2-(3-氟-2-甲基苯基)乙酸1,4-二溴丁-2-基酯
向(S)-1,4-二溴丁-2-醇(1.43g,6.16mmol)在DCM(30mL)中的搅拌溶液中加入2-(3-氟-2-甲基苯基)乙酸(941mg,5.60mmol)、二环己基碳二亚胺(1.27g,6.16mmol)和DMAP(20mg,催化量)并将混合物在室温搅拌17h。将反应混合物过滤并将白色固体通过过滤除去并用DCM(3×25mL)洗涤。收集滤液并用1M HCl(aq)(30mL)、饱和盐水溶液(30mL)洗涤并将有机相通过相分离器且浓缩。经快速硅胶色谱纯化(梯度洗脱异己烷至20％EtOAc/异己烷)得到标题化合物，其为白色晶状固体(2.06g,96％)。1H NMRδ(ppm)(CHCl3-d):7.15-7.07(1H,m),7.02-6.93(2H,m),5.20-5.12(1H,m),3.70(2H,s),3.58(1H,dd,J＝11.1,4.7Hz),3.45(1H,dd,J＝11.1,4.3Hz),3.34(1H,ddd,J＝10.3,6.6,5.5Hz),3.25(1H,ddd,J＝10.3,8.4,6.1Hz),2.35-2.26(1H,m),2.24(3H,d,J＝2.7Hz),2.26-2.12(1H,m)。
步骤3：(1S,4R)-4-(3-氟-2-甲基苯基)-2-氧杂二环[2.2.1]庚-3-酮(中间体1)
在室温向(S)-2-(3-氟-2-甲基苯基)乙酸1,4-二溴丁-2-基酯(2.05g,5.37mmol)在1,4-二噁烷(50mL)中的搅拌溶液中以1mL/min的速率加入LiHMDS(11.8mL,11.8mmol,1M在THF中的溶液)。加完后，将混合物搅拌1h并用1M HCl水溶液(20mL)淬灭，然后在EtOAc(3×50mL)中萃取。将合并的有机相用水(50mL)和饱和盐水溶液(50mL)洗涤，分离，干燥(MgSO4)，过滤且浓缩。经快速硅胶色谱纯化(梯度洗脱异己烷至5％EtOAc/异己烷)得到标题化合物，其为白色晶状固体(890mg,75％)。MS(ES+)221(M+H)+；1H NMRδ(ppm)(CHCl3-d):7.17-7.08(1H,m),7.07-6.97(2H,m),5.00(1H,d,J＝2.10Hz),2.81(1H,dd,J＝10.4,2.4Hz),2.40-2.18(2H,m),2.30(3H,d,J＝2.3Hz),2.13-2.07(2H,m),1.93(1H,d,J＝10.3Hz)。
步骤4：(1R,3S)-1-(3-氟-2-甲基苯基)-3-羟基环戊烷羧酸甲酯
向(1R,4S)-4-(3-氟-2-甲基苯基)-2-氧杂二环[2.2.1]庚-3-酮(890mg,4.05mmol)在MeOH(30mL)中的搅拌溶液中加入4M HCl在二噁烷(1mL)中的溶液。将混合物加热至60℃且保持17h，然后浓缩。经快速硅胶色谱纯化(梯度洗脱异己烷至30％EtOAc/异己烷)得到标题化合物，其为白色晶状固体(766mg,75％[95％,基于回收的原料])。1H NMRδ(ppm)(CHCl3-d):7.18-7.06(2H,m),6.98-6.89(1H,m),4.42-4.37(1H,m),3.66(3H,s),2.74-2.69(1H,m),2.66-2.58(1H,m),2.55(1H,d,J＝7.85Hz),2.29-2.13(3H,m),2.13(3H,d,J＝2.7Hz),1.83-1.72(1H,m)。
步骤5：(R)-1-(3-氟-2-甲基苯基)-3-氧代环戊烷羧酸甲酯(中间体2)
向(1S,3R)-1-(3-氟-2-甲基苯基)-3-羟基环戊烷羧酸甲酯(766mg,3.04mmol)在无水DCM(20mL)中的溶液中加入戴斯-马丁(Dess-Martin)高碘剂(1.55g,3.64mmol)。将反应混合物在室温搅拌4h。将反应混合物用10％Na2S2O3和饱和NaHCO3溶液的混合物(1:1,50mL)淬灭，然后快速搅拌30min。将有机层用另外的DCM(2×50mL)萃取，然后干燥，过滤(相分离柱)并浓缩得到淡黄色油状物。将残留物经快速硅胶柱色谱纯化(梯度洗脱异己烷至20％EtOAc/异己烷)得到标题化合物，其为无色固体(656mg,86％)。MS(ES+)251(M+H)+；1HNMRδ(ppm)(CHCl3-d):7.28-7.19(1H,m),7.17-7.02(2H,m),3.76(3H,s),3.23(1H,d,J＝17.9Hz),2.88-2.79(1H,m),2.69-2.33(4H,m),2.19(3H,d,J＝2.7Hz)。SFC(分析性)(Chiralpak IA 5/95 IPA/CO2,5.0mL/min,120巴,40℃)RT 2.4min；手性HPLC(ChiralpakIC 10/90 IPA/MeOH(50/50/0.1％甲酸)/庚烷,1.0mL/min)RT 10.35min(95.7％ee)。由热的庚烷进行双重重结晶得到对映异构体富集的产物(1.5g,>99.5％ee)。
制备中间体3：(S)-1-(3-氟-2-甲基苯基)-3-氧代环戊烷羧酸甲酯
按照方法1起始于(S)-丁-1,2,4-三醇。
方法2
步骤1：二甲烷磺酸(S)-2-羟基丁-1,4-二基酯
将(S)-丁-1,2,4-三醇(20.0g,0.19mol)溶于无水吡啶(85mL)。将反应混合物快速搅拌，同时冷却至-10℃(NaCl/冰浴)。然后逐滴加入甲烷磺酰氯(44.3g,30mL,0.40mol)，同时保持内部烧瓶温度<4℃(～3h)。加完后，将反应混合物在室温再搅拌1h。然后将反应混合物冷却至4℃并历时20min加入2M HCl水溶液(200mL)。将所得溶液用EtOAc(300mL)分配，用另外的2M HCl水溶液(200mL)洗涤，干燥，过滤(相分离柱)并浓缩得到黄色油状物，其在静置时部分固化。将残留物溶于最少量的热的EtOAc并在-20℃静置16h。将析出的固体过滤并用冷的Et2O/异己烷(1:9,50mL)洗涤得到标题化合物，其为无色晶体(26.8g,55％)。[还可经快速硅胶柱色谱进行纯化(Et2O至EtOAc)—这得到保留时间接近的可在下一步容易分离的杂质]。Rf＝0.2(66％EtOAc/异己烷)；MS(ES+)263(M+H)+；1H NMRδ(ppm):(DMSO-d6):5.33(1H,s),4.35-4.23(2H,m),4.19-3.99(2H,m),3.89-3.81(1H,m),3.19(3H,s),3.18(3H,s),1.94-1.84(1H,m),1.77-1.66(1H,m)。
步骤2：二甲烷磺酸(S)-2-((叔丁基二苯基甲硅烷基)氧基)丁-1,4-二基酯
向二甲烷磺酸(S)-2-羟基丁-1,4-二基酯(23.2g,0.09mol)在无水DMF(75mL)中的4℃溶液中先后加入叔丁基氯二苯基甲硅烷(36.5g,34.5mL,0.11mol)和咪唑(10.0g,0.15mol)。将反应混合物在4℃搅拌1h，然后在室温再搅拌16h。使用冰水(200mL)将反应混合物淬灭，同时快速搅拌30min。将相应的溶液用EtOAc(300mL)分配，先后用水(2×200mL)和饱和NaCl溶液(250mL)洗涤。将合并的有机层干燥，过滤(相分离柱)并浓缩得到黄色油状物。经快速硅胶柱色谱纯化(梯度洗脱异己烷至50％EtOAc/异己烷)得到标题化合物，其为无色玻璃状物(42.0g,93％)。Rf＝0.55(66％EtOAc/异己烷)；MS(ES+)501(M+H)+；1H NMRδ(ppm)(DMSO-d6):7.67-7.63(4H,m),7.52-7.41(6H,m),4.31-4.16(2H,m),4.13-4.01(3H,m),3.08(3H,s),3.02(3H,s),1.92(2H,dd,J＝12.2,6.1Hz),1.02(9H,s)。
步骤3：(S)-叔丁基((1,4-二溴丁-2-基)氧基)二苯基甲硅烷
向二甲烷磺酸(S)-2-((叔丁基二苯基甲硅烷基)氧基)丁-1,4-二基酯(42.0g,0.08mol)在无水DMF(320mL)中的溶液中加入溴化锂(22.0g,0.25mol)。将反应混合物在105℃搅拌1.5h。将反应混合物冷却至室温并在EtOAc(500mL)和水(300mL)之间分配。将有机层用另外的水(2×300mL)和饱和NaCl溶液(400mL)洗涤。将合并的有机层干燥，过滤(相分离柱)并浓缩得到黄色油状物。经快速硅胶柱色谱纯化(梯度洗脱异己烷至10％EtOAc/异己烷)得到标题化合物，其为无色油状物，所述油状物在静置后颜色变深(30.0g,80％)。Rf＝0.80(60％EtOAc/异己烷)；MS(ES+)471(M+H)+；1H NMRδ(ppm)(DMSO-d6):7.69-7.63(4H,m),7.52-7.41(6H,m),4.07-3.99(1H,m),3.53-3.40(4H,m),2.10(2H,dd,J＝13.0,6.5Hz),1.04(9H,s)。
步骤4：(1S,3S)-1-(3-氟-2-甲基苯基)-3-羟基环戊烷羧酸甲酯
向(S)-叔丁基((1,4-二溴丁-2-基)氧基)二苯基甲硅烷(6.43g,0.014mol)和2-(3-氟-2-甲基苯基)乙酸甲酯(2.0g,0.011mol)在无水DMF(80mL)中的溶液中加入18-冠-6(0.2g,催化量)。将反应混合物在室温搅拌10min，然后历时1.5h分批加入氢化钠(60％在矿物油中的分散液,1.05g,0.03mol)。将反应混合物在室温再搅拌16h。将反应混合物冷却至4℃并通过逐滴加入5％NaH2PO4溶液(15mL)淬灭。然后将溶液在EtOAc(250mL)和水(200mL)之间分配。将有机层用另外的水(2×150mL)、饱和NaCl溶液(200mL)洗涤，然后干燥，过滤(相分离柱)并浓缩得到黄色油状物。将所得油状物溶于无水THF(80mL)并加入TBAF(1M在THF中,0.03mol,30mL)。然后将反应混合物在室温搅拌3h。然后将反应混合物减压浓缩并经快速硅胶柱色谱纯化(梯度洗脱异己烷至33％EtOAc/异己烷)得到标题化合物，其为无色油状物(2.10g,78％,异构体的5:1混合物)。Rf＝0.1(20％EtOAc/异己烷)；MS(ES+)253(M+H)+。
步骤5：(1S,4R)-4-(3-氟-2-甲基苯基)-2-氧杂二环[2.2.1]庚-3-酮
向(1S,3S)-1-(3-氟-2-甲基苯基)-3-羟基环戊烷羧酸甲酯(异构体的5:1(1S,3S):(1R:3S)混合物,2.10g,0.0086mol)在无水乙腈(100mL)中的溶液中加入DBU(1.44g,1.42mL,0.0095mol)。将反应混合物在80℃搅拌20h。将反应混合物冷却至室温并在DCM(125mL)和1M HCl(100mL)之间分配。将有机层萃取，用水(100mL)洗涤，然后干燥，过滤(相分离柱)并浓缩得到黄色油状物。将残留物经快速硅胶柱色谱纯化(梯度洗脱异己烷至40％EtOAc/异己烷)得到标题化合物(1S,4R)-4-(3-氟-2-甲基苯基)-2-氧杂二环[2.2.1]庚-3-酮，其为无色油状物(256mg)；Rf＝0.3(33％EtOAc/异己烷)；MS(ES+)221(M+H)+；1H NMRδ(ppm)(CHCl3-d):7.18-7.10(1H,m),7.09-6.98(2H,m),5.00(1H,d,J＝2.1Hz),2.81(1H,dd,J＝10.4,2.4Hz),2.39-2.32(1H,m),2.32(3H,d,J＝2.8Hz),2.30-2.21(1H,m),2.15-2.07(2H,m),1.93(1H,d,J＝10.3Hz)；19F NMR:-114.43；和未反应的原料(1S,3S)-1-(3-氟-2-甲基苯基)-3-羟基环戊烷羧酸甲酯，其为无色油状物(1.63g)；Rf＝0.15(33％EtOAc/异己烷)；MS(ES+)与目标(M+H)+一致；1H NMRδ(ppm)(CHCl3-d):7.24(1H,d,J＝8.03Hz),7.19-7.11(1H,m),6.97-6.90(1H,m),4.56-4.49(1H,m),3.62(3H,s),3.07(1H,dd,J＝13.8,6.6Hz),2.47-2.42(2H,m),2.11(3H,d,J＝2.8Hz),2.10-2.01(1H,m),1.92(1H,ddd,J＝13.9,4.5,1.1Hz),1.79-1.70(1H,m),1.38(1H,d,J＝4.2Hz)；19F NMR:-114.83。
步骤6：(S)-1-(3-氟-2-甲基苯基)-3-氧代环戊烷羧酸甲酯(中间体3)
向(1S,3S)-1-(3-氟-2-甲基苯基)-3-羟基环戊烷羧酸甲酯(1.60g,6.5mmol)在无水DCM(100mL)中的溶液中加入戴斯-马丁高碘剂(3.32g,7.8mmol)。将反应混合物在室温搅拌4h。将反应混合物用10％Na2S2O3和饱和NaHCO3溶液的混合物(1:1,100mL)淬灭，然后快速搅拌30min。将有机层用另外的DCM(2×50mL)萃取，然后干燥，过滤(相分离柱)并浓缩得到淡黄色油状物。将残留物经快速硅胶柱色谱纯化(梯度洗脱异己烷至20％EtOAc/异己烷)得到标题化合物，其为无色固体(1.42g,84％)。Rf＝0.25(33％EtOAc/异己烷)；1H NMRδ(ppm)(CHCl3-d):7.28-7.19(1H,m),7.17-7.02(2H,m),3.76(3H,s),3.28(1H,d,J＝17.9Hz),2.88-2.79(1H,m),2.69-2.33(4H,m),2.19(3H,d,J＝2.7Hz)；SFC(分析性)(Chiralpak IA5/95IPA/CO2,5.0mL/min,120巴,40℃)RT 2.1min(>99.5％ee)；手性HPLC(Chiralpak IC10/90 IPA/MeOH(50/50/0.1％甲酸)/庚烷,1.0mL/min)RT 9.48min。
制备中间体4-8：3’-氟-4-羟基-2’-甲基-1,2,5,6-四氢-[1,1’-联苯]-1,3-二羧酸3-叔丁基酯·1-甲基酯、1-(3-氟-2-甲基苯基)-4-氧代环己烷羧酸甲酯、1-(3-氟-2-甲基苯基)-3-甲酰基-4-氧代环己烷羧酸甲酯、2-氨基-6-(3-氟-2-甲基苯基)-4,5,6,7-四氢苯并[d]噻唑-6-羧酸甲酯和2-溴-6-(3-氟-2-甲基苯基)-4,5,6,7-四氢苯并[d]噻唑-6-羧酸甲酯。
步骤1：3’-氟-4-羟基-2’-甲基-1,2,5,6-四氢-[1,1’-联苯]-1,3-二羧酸3-叔丁基酯·1-甲基酯(中间体4)
在室温在氮气气氛下将2-(3-氟-2-甲基苯基)乙酸甲酯(3.13g,17.2mmol)、DMF(30mL)和丙烯酸叔丁酯(5.22mL,36.12mmol)混合。将反应混合物用冰浴冷却并分批加入NaH(60％在油中)(3.44g,86mmol)。将反应混合物在室温搅拌20h，然后在冰浴冷却下小心地用饱和NH4Cl水溶液淬灭。将反应混合物用EtOAc萃取，然后将其用水、盐水洗涤并在硅胶上蒸干，然后经快速色谱纯化得到3’-氟-4-羟基-2’-甲基-1,2,5,6-四氢-[1,1’-联苯]-1,3-二羧酸3-叔丁基酯·1-甲基酯，其为白色固体(2.14g,34％)。1H NMRδ(ppm)(CHCl3-d):7.20-7.05(1H,m),7.00-6.85(2H,m),3.70(3H,s),2.75(2H,m),2.4-2.15(3H,m),2.13(3H,d,J＝2.4Hz),1.85-1.70(1H,m),1.55(9H,s)。未观察到OH共振信号。
步骤2：1-(3-氟-2-甲基苯基)-4-氧代环己烷羧酸甲酯(中间体5)
将中间体4(2.14g,5.88mmol)和TFA(10mL)混合并在室温搅拌20h。然后将TFA经真空蒸发除去并将残留物与甲苯共沸。加入甲苯(100mL)、MeOH(10mL)和NaHCO3(200mg)并将混合物加热至105℃且保持20h。然后将反应混合物在硅胶上蒸干并经快速色谱纯化得到标题化合物，其为白色固体(799mg,52％)。LCMS(ES+)265(M+H)+；1H NMRδ(ppm)(CHCl3-d):7.22-7.15(2H,m),7.05-6.95(1H,m),3.72(3H,s),2.77-2.64(4H,m),2.46-2.41(2H,m),2.27-2.20(2H,m),2.21(3H,d,J＝2.4Hz)。
步骤3：1-(3-氟-2-甲基苯基)-3-甲酰基-4-氧代环己烷羧酸甲酯(中间体6)
在氮气气氛下将tBuOK(233mg,2.08mmol)和THF混合。将反应混合物用冰浴冷却并逐滴加入甲酸乙酯(0.61mL,7.56mmol)—注意：冒泡。20min后，逐滴加入中间体5(500mg,1.89mmol)在甲酸乙酯(2.5mL)中的溶液。在冰浴冷却下将反应混合物再搅拌1h，然后用EtOAc稀释并用1N HCl洗涤，干燥(MgSO4)并蒸干得到标题化合物，其为棕色胶状物(516mg,94％)。
LCMS(ES-)291(M-H)-。
步骤4：2-氨基-6-(3-氟-2-甲基苯基)-4,5,6,7-四氢苯并[d]噻唑-6-羧酸甲酯(中间体7)
将中间体5(550mg,2.08mmol)、硫脲(228mg,3mmol)和AcOH(10mL)在密封管中混合。加入溴(0.107mL,2.08mmol)并将混合物加热至65℃且保持18h。将反应混合物冷却并蒸干。将残留物在2N NaOH溶液和EtOAc之间分配。用EtOAc(2×)萃取，然后将有机相干燥(MgSO4)并蒸干得到标题化合物，其为褐色固体(641mg,96％)。LCMS(ES+)321(M+H)+。
步骤5：2-溴-6-(3-氟-2-甲基苯基)-4,5,6,7-四氢苯并[d]噻唑-6-羧酸甲酯(中间体8)
将中间体7(1.94g,6.06mmol)、CuBr2(1.49g,6.67mmol)和MeCN(100mL)混合。逐滴加入亚硝酸叔丁酯(0.94mL,7.88mmol)—注意：放热。搅拌2h后，将反应混合物用1N HCl淬灭并用EtOAc(2×)萃取，干燥(MgSO4)并蒸干得到标题化合物，其为棕色固体(2.08g,89％)。LCMS(ES+)384/386(M+H)+。
步骤6：1-(3-氟-2-甲基苯基)-5-氧代环庚烷-1,4-二羧酸4-乙基酯·1-甲基酯(中间体9)
将中间体5(1.0g,3.79mmol)溶于无水DCM(11mL)并在氮气气氛下冷却至0℃。一次性加入三乙基氧鎓四氟硼酸盐(4.6mL,4.55mmol,1.0M在DCM中)。历时10min逐滴加入重氮基乙酸乙酯(0.48mL,4.55mmol)，保持内部温度为0℃。将反应混合物在0℃搅拌3h，然后用饱和碳酸氢钠溶液淬灭。将反应混合物转移至分液漏斗中并用DCM(×2)萃取。将合并的有机萃取物用水洗涤，干燥(硫酸镁)，过滤并蒸干得到标题化合物，其为黄色油状物(1.47g,>100％)。NMR显示烯醇和酮形式的混合物。无需进一步纯化即用于下一步。
制备中间体10：(S)-2-溴-6-(3-氟-2-甲基苯基)-5,6-二氢-4H-环戊并[d]噻唑-6-羧酸甲酯
步骤1：(S)-2-氨基-6-(3-氟-2-甲基苯基)-5,6-二氢-4H-环戊并[d]噻唑-6-羧酸甲酯
将中间体3(0.75g,3.0mmol)、硫脲(0.25g,3.3mmol)和溴(0.52g,3.3mmol)加到乙酸(10mL)中并加热至100℃且保持16.5h。将反应混合物冷却，用EtOAc(50mL)稀释并先后用NaOH(2N,2×50mL)、水和盐水洗涤，然后真空浓缩得到标题化合物(0.66g)，其无需进一步纯化即用于下一步。
LCMS(ES+)307(M+H)+。
步骤2：(S)-2-溴-6-(3-氟-2-甲基苯基)-5,6-二氢-4H-环戊并[d]噻唑-6-羧酸甲酯
向(S)-2-氨基-6-(3-氟-2-甲基苯基)-5,6-二氢-4H-环戊并[d]噻唑-6-羧酸甲酯(0.54g,1.79mmol)和溴化铜(II)(0.44g,1.96mmol)在MeCN(10mL)中的溶液中逐滴加入亚硝酸叔丁酯并将反应混合物在20℃搅拌0.6h。将反应混合物用HCl(1N,50mL)淬灭，在DCM(75mL)中萃取并进行水性后处理。分离有机相并真空浓缩得到粗标题化合物(0.63g)，其无需进一步纯化即用于下一步。
LCMS(ES+)370/372(M+H)+。
制备中间体11和12：3-溴-1-(3-氟-2-甲基苯基)-4-氧代环戊烷羧酸甲酯和2-溴-5-(3-氟-2-甲基苯基)-5,6-二氢-4H-环戊并[d]噻唑-5-羧酸甲酯
步骤1：2-烯丙基-2-(3-氟-2-甲基苯基)戊-4-烯酸甲酯
将2-(3-氟-2-甲基苯基)乙酸甲酯(1.95g,10.7mmol)和烯丙基溴(0.96mL,10.7mmol)在无水DMF(20mL)中的溶液在室温在氮气下用NaH(60wt％在油中,448mg,10.7mmol)处理并搅拌2h。然后加入另外一当量烯丙基溴和NaH，1h后最后加入0.5当量烯丙基溴和NaH。最后加入后1h，将反应混合物用H2O(1mL)淬灭，用EtOAc(100mL)稀释并用水(4×20mL)和盐水(20mL)洗涤。将有机层干燥(Na2SO4)并浓缩得到2.96g黄色液体，其无需进一步纯化即使用。
步骤2：1-(3-氟-2-甲基苯基)环戊-3-烯羧酸甲酯
将2-烯丙基-2-(3-氟-2-甲基苯基)戊-4-烯酸甲酯(2.96g,来自上一步,～10.7mmol)和Grubbs第二代催化剂(210mg,0.25mmol)在DCM(300mL)中的溶液在氮气下在室温搅拌24h。将混合物在硅胶上浓缩并经快速硅胶色谱纯化(梯度洗脱0-50％EtOAc/异己烷)得到标题化合物(1.85g)，其为纯度为约80％的淡棕色液体。
步骤3：3-溴-1-(3-氟-2-甲基苯基)-4-羟基环戊烷羧酸甲酯
将1-(3-氟-2-甲基苯基)环戊-3-烯羧酸甲酯(1.66g,7.09mmol)、NBS(1.39g,7.81mmol)和乙酸铵(80.3mg,1.04mmol)在丙酮(25mL)和水(6mL)中的溶液在室温搅拌2h。蒸发溶剂后，将混合物在水(20mL)和DCM(40mL)之间分配并浓缩有机层。将残留物经快速硅胶色谱纯化(梯度洗脱0％至100％EtOAc/异己烷)得到标题化合物，其为无色液体(1.74g,5.25mmol,74％)，其为立体异构体的混合物。
步骤4：3-溴-1-(3-氟-2-甲基苯基)-4-氧代环戊烷羧酸甲酯(中间体11)
将3-溴-1-(3-氟-2-甲基苯基)-4-羟基环戊烷羧酸甲酯(1.74g,5.25mmol)和戴斯-马丁高碘剂(2.44g,5.75mmol)在DCM(50mL)中的混悬液在室温搅拌16h。将反应混合物在硅胶上浓缩并经快速硅胶色谱纯化(梯度洗脱0％至100％EtOAc/异己烷)得到标题化合物，其为无色液体(1.58g,4.80mmol,91％)且为立体异构体的混合物。
步骤5：1-(3-氟-2-甲基苯基)-3-氧代-4-氰硫基环戊烷羧酸甲酯
将中间体11(800mg,2.43mmol)和硫氰酸钾(500mg,5.15mmol)在无水乙腈(8mL)中的溶液在微波辐射下在100℃加热10min。冷却至室温后，将混合物与另外两批相同的反应混合物混合并在水(20mL)和DCM(60mL)之间分配，干燥(相分离器)且浓缩。经快速硅胶色谱纯化(梯度洗脱0-100％EtOAc/异己烷)得到标题化合物(2.07g,6.74mmol,93％)，其为白色棱晶状物且为非对映异构体的2:1混合物。
步骤6：2-溴-5-(3-氟-2-甲基苯基)-5,6-二氢-4H-环戊并[d]噻唑-5-羧酸甲酯(中间体12)
将1-(3-氟-2-甲基苯基)-3-氧代-4-氰硫基环戊烷羧酸甲酯(338mg,1.10mmol)在HBr(33wt％在AcOH中,1mL)和AcOH(3mL)中的溶液在微波辐射下在100℃加热10min。冷却至室温后，将混合物与另外三批相同的反应混合物混合并倒入水(30mL)中。加入DCM(50mL)并将混合物在室温剧烈搅拌5min。将DCM层用饱和NaHCO3水溶液(40mL)洗涤，干燥(相分离器)且浓缩。经快速硅胶色谱纯化(梯度洗脱0-50％EtOAc/异己烷)得到标题化合物(620mg,1.67mmol,51％)，其为无色液体。
制备中间体13-16：(1R)-3-溴-1-(3-氟-2-甲基苯基)-4-氧代环戊烷羧酸甲酯
步骤1：(1R)-3-溴-1-(3-氟-2-甲基苯基)-4-氧代环戊烷羧酸甲酯(中间体13)
在-78℃向中间体2(4.5g,18mmol)在DCM(100mL)中的冷却溶液中加入4M HCl在二噁烷中的溶液(0.45mL)。将其搅拌5min，然后逐滴加入溴(2.88g,18mmol)。将反应混合物在-78℃搅拌1h，然后由冰浴取出。在室温再保持1h后，将反应混合物用水(100mL)稀释并收集有机相。将水性部分再次用DCM(100mL)萃取并将合并的有机相通过相分离器且浓缩。经快速色谱纯化(10％EtOAc/异己烷)得到标题化合物，其为无色油状物，所述油状物在静置时结晶(2.37g,40％)。LCMS(ES+)329/331(M+H)+。
步骤2：(S)-1-(3-氟-2-甲基苯基)-3-氧代-4-氰硫基环戊烷羧酸甲酯
将中间体13(800mg,2.43mmol)和硫氰酸钾(500mg,5.15mmol)在无水乙腈(8mL)中的溶液在微波辐射下在100℃加热10min。冷却至室温后，将混合物与另外两批相同的反应混合物混合并在水(20mL)和DCM(60mL)之间分配，干燥(相分离器)且浓缩。经快速硅胶色谱纯化(梯度洗脱0-100％EtOAc/异己烷)得到标题化合物(2.07g,6.74mmol,93％)，其为白色棱晶状物且为非对映异构体的2:1混合物。LCMS(ES+)308(M+H)+。
步骤3：(S)-2-溴-5-(3-氟-2-甲基苯基)-5,6-二氢-4H-环戊并[d]噻唑-5-羧酸甲酯(中间体14)
将(S)-1-(3-氟-2-甲基苯基)-3-氧代-4-氰硫基环戊烷羧酸甲酯(338mg,1.10mmol)在HBr(33wt％在AcOH中,1mL)和AcOH(3mL)中的溶液在微波辐射下在100℃加热10min。冷却至室温后，将混合物与另外三批相同的反应混合物混合并倒入水(30mL)中。加入DCM(50mL)并将混合物在室温剧烈搅拌5min。将DCM层用饱和NaHCO3水溶液(40mL)洗涤，干燥(相分离器)且浓缩。经快速硅胶色谱纯化(梯度洗脱0-50％EtOAc/异己烷)得到标题化合物(620mg,1.67mmol,51％)，其为无色液体。
可起始于中间体3进行步骤1-3得到中间体15和中间体16。
制备实施例
实施例1：(S)-5-(3-氟-2-甲基苯基)-N-羟基-1-苯基-1,4,5,6-四氢环戊并[c]吡唑-5-甲酰胺
步骤1：(1S)-1-(3-氟-2-甲基苯基)-3-甲酰基-4-氧代环戊烷羧酸甲酯
将tBuOK(247mg,2.2mmol)和THF(15mL)在氮气气氛下混合。将反应混合物用冰浴冷却并逐滴加入甲酸乙酯(0.64mL,8mmol)—注意：冒泡。15min后，逐滴加入中间体3(500mg,2mmol)在甲酸乙酯(2.5mL)中的溶液。在冰浴冷却下将反应混合物再搅拌1h，然后用EtOAc稀释并用1N HCl洗涤，干燥(MgSO4)并蒸干得到标题化合物，其为褐色油状物(569mg,100％)。
LCMS(ES+)279(M+H)+。
步骤2：(S)-5-(3-氟-2-甲基苯基)-1-苯基-1,4,5,6-四氢环戊并[c]吡唑-5-羧酸甲酯
将(1S)-1-(3-氟-2-甲基苯基)-3-甲酰基-4-氧代环戊烷羧酸甲酯(569mg,2mmol)、乙酸(10mL)和苯基肼(0.2mL,2mmol)在密封管中混合并加热至70℃且保持1h。然后将反应混合物在硅胶上蒸干并经快速色谱纯化得到标题化合物，其为棕色胶状物(451mg,64％)。LCMS(ES+)351(M+H)+。
步骤3：(S)-5-(3-氟-2-甲基苯基)-1-苯基-1,4,5,6-四氢环戊并[c]吡唑-5-羧酸
将(S)-5-(3-氟-2-甲基苯基)-1-苯基-1,4,5,6-四氢环戊并[c]吡唑-5-羧酸甲酯(451mg,1.29mmol)、MeOH(15mL)和15％NaOH水溶液(4mL)在密封管中混合并加热至70℃且保持1天。将反应混合物蒸干，用EtOAc稀释，用1N HCl洗涤并再次蒸干得到标题化合物，其为棕色胶状物(315mg,73％)。
LCMS(ES+)337(M+H)+。
步骤4：(S)-5-(3-氟-2-甲基苯基)-N-羟基-1-苯基-1,4,5,6-四氢环戊并[c]吡唑-5-甲酰胺
将(S)-5-(3-氟-2-甲基苯基)-1-苯基-1,4,5,6-四氢环戊并[c]吡唑-5-羧酸(315mg,0.94mmol)、TFFH(264mg,1mmol)、DMF(2mL)和三乙胺(0.5mL)混合并在室温搅拌1.5h。然后加入O-(四氢-2H-吡喃-2-基)羟胺(234mg,2mmol)并继续搅拌1天。将挥发性溶剂真空除去。加入MeOH(5mL)和2N HCl在Et2O(2mL)中的溶液并将反应混合物搅拌2h。将挥发性溶剂真空除去并将残留的粗物质经制备性HPLC纯化得到标题化合物，其为灰白色固体(256mg)。
LCMS(ES+)352(M+H)+,RT 3.52min(分析方法1)；1H NMRδ(ppm)(DMSO-d6):10.26(1H,s),8.80(1H,br s),7.70-7.60(2H,m),7.55-7.45(3H,m),7.30(1H,m),7.25-7.00(3H,m),4.12(1H,d),3.40(1H,d),3.25(1H,d),3.20(1H,d),2.20(3H,d,J＝2.4Hz)。
实施例2：(S)-5-(3-氟-2-甲基苯基)-N-羟基-1-(邻甲苯基)-1,4,5,6-四氢环戊并[c]吡唑-5-甲酰胺
按照如实施例1所述的方法制备。制备性HPLC得到标题化合物，其为褐色固体(64mg)。LCMS(ES+)366(M+H)+,RT 9.93min(分析方法2)；1H NMRδ(ppm)(DMSO-d6):10.23(1H,s),8.79(1H,br s),7.45-7.00(8H,m),3.76(1H,d,16Hz),3.45(1H,d,J＝15Hz),3.25(1H,d,J＝15Hz),2.51(1H,d,J＝16Hz),2.11(3H,d,J＝2.4Hz),2.01(3H,s)。
实施例3：(S)-5-(3-氟-2-甲基苯基)-1-(2-氟苯基)-N-羟基-1,4,5,6-四氢环戊并[c]吡唑-5-甲酰胺
按照如实施例1所述的方法制备。制备性HPLC得到标题化合物，其为白色固体(115mg)。LCMS(ES+)370(M+H)+,RT 3.43min(分析方法1)；1H NMRδ(ppm)(DMSO-d6):10.22(1H,s),8.81(1H,s),7.70-7.30(5H,m),7.25-6.95(3H,m),3.83(1H,d,J＝16Hz),3.45(1H,d,J＝15Hz),3.13(1H,d,J＝15Hz),3.03(1H,d,J＝16Hz),2.12(3H,d,J＝2.8Hz)。
实施例4：(S)-1-(3-氯苯基)-5-(3-氟-2-甲基苯基)-N-羟基-1,4,5,6-四氢环戊并[c]吡唑-5-甲酰胺
按照如实施例1所述的方法制备。制备性HPLC得到标题化合物，其为白色固体(85mg)。LCMS(ES+)386/388(M+H)+,RT 3.78min(分析方法1)；1H NMRδ(ppm)(DMSO-d6):10.27(1H,s),8.85(1H,s),7.75-7.45(5H,m),7.25-7.00(3H,m),4.11(1H,d,J＝16Hz),3.41(1H,d,J＝16Hz),3.33(1H,d,J＝16Hz),3.15(1H,d,J＝16Hz),2.17(3H,d,J＝2.4Hz)。
实施例5：(S)-5-(3-氟-2-甲基苯基)-1-(4-氟苯基)-N-羟基-1,4,5,6-四氢环戊并[c]吡唑-5-甲酰胺
按照如实施例1所述的方法制备。制备性HPLC得到标题化合物，其为灰白色固体(41mg)。LCMS(ES+)370(M+H)+,RT 3.65min(分析方法1)；1H NMRδ(ppm)(DMSO-d6):10.24(1H,s),8.81(1H,s),810(1H,s),7.78-7.74(2H,m),7.35-7.25(2H,m)7.25-7.00(3H,m),3.65(1H,d,J＝16Hz),3.50(1H,d,J＝16Hz),3.10(1H,d,J＝16Hz),3.05(1H,d,J＝16Hz),2.17(3H,d,J＝2.4Hz)。
实施例6：(S)-5-(3-氟-2-甲基苯基)-1-(3-氟苯基)-N-羟基-1,4,5,6-四氢环戊并[c]吡唑-5-甲酰胺
按照如实施例1所述的方法制备。制备性HPLC得到标题化合物，其为褐色固体(129mg)。LCMS(ES+)370(M+H)+,RT 3.67min(分析方法1)；1H NMRδ(ppm)(DMSO-d6):10.26(1H,s),8.83(1H,br s),7.60-7.45(4H,m),7.25-7.00(4H,m),4.13(1H,d,J＝16Hz),3.39(1H,d,J＝16Hz),3.31(1H,d,J＝16Hz),3.17(1H,d,J＝16Hz),2.18(3H,d,J＝2.4Hz)。
实施例7：(S)-1-(2-氯苯基)-5-(3-氟-2-甲基苯基)-N-羟基-1,4,5,6-四氢环戊并[c]吡唑-5-甲酰胺
按照如实施例1所述的方法制备。制备性HPLC得到标题化合物，其为灰白色固体(108mg)。LCMS(ES+)386/388(M+H)+,RT 3.37min(分析方法1)；1H NMRδ(ppm)(DMSO-d6):10.22(1H,s),8.80(1H,br s),7.75-7.45(5H,m),7.25-7.00(3H,m),3.7(1H,d,J＝16Hz),3.45(1H,d,J＝16Hz),3.5(1H,d,J＝15Hz),2.89(1H,d,J＝16Hz),2.11(3H,d,J＝2.8Hz)。
实施例8：(S)-1-(4-氯苯基)-5-(3-氟-2-甲基苯基)-N-羟基-1,4,5,6-四氢环戊并[c]吡唑-5-甲酰胺
按照如实施例1所述的方法制备。制备性HPLC得到标题化合物，其为灰白色固体(15mg)。LCMS(ES+)386/388(M+H)+,RT 3.52min(分析方法1)；1H NMRδ(ppm)(DMSO-d6):10.24(1H,s),8.81(1H,s),8.15(1H,s),7.80-7.70(2H,m),7.60-7.50(2H,m),7.25-7.00(3H,m),3.65(1H,d,J＝16Hz),3.50(1H,d,J＝16Hz),3.11(1H,d,J＝16Hz),3.06(1H,d,J＝16Hz),2.1(3H,d,J＝2.8Hz)。
实施例9：(S)-5-(3-氟-2-甲基苯基)-N-羟基-1-(对甲苯基)-1,4,5,6-四氢环戊并[c]吡唑-5-甲酰胺
按照如实施例1所述的方法制备。制备性HPLC得到标题化合物，其为棕色固体(60mg)。LCMS(ES+)366(M+H)+,RT 9.08min(分析方法3)；1H NMRδ(ppm)(DMSO-d6):10.26(1H,s),8.80(1H,br s),7.52(2H,d,J＝8.4Hz),7.43(1H,s),7.28(2H,d,J＝8Hz),7.25-7.20(3H,m),4.10(1H,d,J＝16Hz),3.40(1H,d,J＝16Hz),3.22(1H,d,J＝16Hz),3.15(1H,d,J＝16Hz),2.32(3H,s),2.17(3H,d,J＝2.8Hz)。
实施例10：(S)-1-(3-氯-2-氟苯基)-5-(3-氟-2-甲基苯基)-N-羟基-1,4,5,6-四氢环戊并[c]吡唑-5-甲酰胺
按照如实施例1所述的方法制备。制备性HPLC得到标题化合物，其为褐色固体(124mg)。LCMS(ES+)404/406(M+H)+,RT 9.05min(分析方法3)；1H NMRδ(ppm)(DMSO-d6):10.23(1H,s),8.80(1H,br s),7.70-7.60(2H,m),7.56(1H,s),7.40-7.30(1H,m),7.25-7.00(3H,m),3.84(1H,d,J＝15Hz),3.40(1H,d,J＝15Hz),3.15(1H,d,J＝15Hz),3.00(1H,d,J＝15Hz),2.12(3H,d,J＝2.8Hz)。
实施例11：(S)-1-(2,6-二氟苯基)-5-(3-氟-2-甲基苯基)-N-羟基-1,4,5,6-四氢环戊并[c]吡唑-5-甲酰胺
按照如实施例1所述的方法制备。制备性HPLC得到标题化合物，其为米色固体(131mg)。LCMS(ES+)388(M+H)+,RT 8.52min(分析方法3)；1H NMRδ(ppm)(DMSO-d6):10.21(1H,s),8.81(1H,br s),7.65-7.50(2H,m),7.45-7.30(2H,m),7.25-6.95(3H,m),3.73(1H,d,J＝16Hz),3.53(1H,d,J＝16Hz),3.15(1H,d,J＝16Hz),2.90(1H,d,J＝16Hz),2.10(3H,d,J＝2.8Hz)。
实施例12：(S)-1-(2,5-二甲基苯基)-5-(3-氟-2-甲基苯基)-N-羟基-1,4,5,6-四氢环戊并[c]吡唑-5-甲酰胺
按照如实施例1所述的方法制备。制备性HPLC得到标题化合物，其为灰色固体(108mg)。LCMS(ES+)380(M+H)+,RT 9.03min(分析方法3)；1H NMRδ(ppm)(DMSO-d6):10.22(1H,s),8.80(1H,br s),7.39(1H,s),7.30-7.00(6H,m),3.76(1H,d,J＝16Hz),3.44(1H,d,J＝16Hz),3.17(1H,d,J＝16Hz),2.79(1H,d,J＝16Hz),2.33(3H,s),2.10(3H,d,J＝2.8Hz),2.00(3H,s)。
实施例13：(S)-1-(2,6-二甲基苯基)-5-(3-氟-2-甲基苯基)-N-羟基-1,4,5,6-四氢环戊并[c]吡唑-5-甲酰胺
按照如实施例1所述的方法制备。制备性HPLC得到标题化合物，其为褐色固体(80mg)。LCMS(ES+)380(M+H)+,RT 3.50min(分析方法1)；1H NMRδ(ppm)(DMSO-d6):10.23(1H,s),8.80(1H,br s),7.43(1H,s),7.30-7.00(5H,m),3.66(1H,d,J＝15.6Hz),3.39(1H,d,J＝15.2Hz),3.27(1H,d,J＝15.2Hz),2.54(1H,d,J＝15.6Hz),2.08(3H,d,J＝32.4Hz),2.01(3H,s),1.63(1H,s)。
实施例14：(S)-1-(2-氯-6-氟苯基)-5-(3-氟-2-甲基苯基)-N-羟基-1,4,5,6-四氢环戊并[c]吡唑-5-甲酰胺
按照如实施例1所述的方法制备。制备性HPLC得到标题化合物，其为褐色固体(146mg)。LCMS(ES+)404/406(M+H)+,RT 9.86min(分析方法2)；1H NMRδ(ppm)(DMSO-d6):10.22(1H,s),8.80(1H,br s),7.65-7.40(4H,m),7.25-7.00(3H,m),3.69(1H,d,J＝16Hz),3.43(1H,d,J＝15.2Hz),3.17(1H,d,J＝15.2Hz),2.80(1H,d,J＝16Hz),2.09(3H,d,J＝3.6Hz)。
实施例15：(S)-5-(3-氟-2-甲基苯基)-1-(2-氟-6-甲基苯基)-N-羟基-1,4,5,6-四氢环戊并[c]吡唑-5-甲酰胺
按照如实施例1所述的方法制备。制备性HPLC得到标题化合物，其为褐色固体(157mg)。LCMS(ES+)384(M+H)+,RT 10.13min(分析方法2)；1H NMRδ(ppm)(DMSO-d6):10.22(1H,s),8.81(1H,br s),7.50-7.00(7H,m),3.81(1H,d,J＝16Hz),3.46(1H,d,J＝14.8Hz),3.12(1H,d,J＝15.2Hz),3.02(1H,d,J＝16Hz),2.32(3H,d,J＝2Hz),2.12(3H,d,J＝2.4Hz)。
实施例16：(S)-5-(3-氟-2-甲基苯基)-1-(5-氟吡啶-2-基)-N-羟基-1,4,5,6-四氢环戊并[c]吡唑-5-甲酰胺
按照如实施例1所述的方法制备。制备性HPLC得到标题化合物，其为灰白色固体(126mg)。LCMS(ES+)371(M+H)+,RT 3.55min(分析方法1)；1H NMRδ(ppm)(DMSO-d6):10.24(1H,s),8.80(1H,br s),8.46(1H,s),8.00-7.85(2H,m),7.52(1H,s),7.20-7.00(3H,m),4.03(1H,d,J＝16.8Hz),3.45(1H,d,J＝16.8Hz),3.42(1H,d,J＝15.6Hz),3.06(1H,d,J＝15.2Hz),2.15(3H,d,J＝2.8Hz)。
实施例17：(S)-1-(2,4-二氟苯基)-5-(3-氟-2-甲基苯基)-N-羟基-1,4,5,6-四氢环戊并[c]吡唑-5-甲酰胺
按照如实施例1所述的方法制备。制备性HPLC得到标题化合物，其为灰白色固体(118mg)。LCMS(ES+)388(M+H)+,RT 9.99min(分析方法2)；1H NMRδ(ppm)(DMSO-d6):10.22(1H,s),8.80(1H,br s),7.70-7.60(1H,m),7.60-7.50(2H,m),7.30-7.00(4H,m),3.82(1H,d,J＝15Hz),3.45(1H,d,J＝15Hz),3.14(1H,d,J＝15Hz),3.01(1H,d,J＝16Hz),2.12(3H,d,J＝2.8Hz)。
实施例18：(S)-1-环戊基-5-(3-氟-2-甲基苯基)-N-羟基-1,4,5,6-四氢环戊并[c]吡唑-5-甲酰胺
按照如实施例1所述的方法制备。制备性HPLC得到标题化合物，其为灰白色固体(41mg)。LCMS(ES+)344(M+H)+,RT 3.31min(分析方法1)；1H NMRδ(ppm)(DMSO-d6):10.18(1H,s),8.80(1H,br s),7.20-7.00(4H,m),4.60-4.50(1H,m),3.74(1H,d,J＝16Hz),3.37(1H,d,J＝16Hz),3.02(1H,d,J＝16Hz),2.98(1H,d,J＝16Hz),2.15(3H,d,J＝2.8Hz),2.10-1.90(2H,m),1.90-1.65(4H,m),1.65-1.52(2H,m)。
实施例19：(S)-5-(3-氟-2-甲基苯基)-N-羟基-1-(吡嗪-2-基)-1,4,5,6-四氢环戊并[c]吡唑-5-甲酰胺
按照如实施例1所述的方法制备。制备性HPLC得到标题化合物，其为棕色固体(43mg)。LCMS(ES+)354(M+H)+,RT 3.09min(分析方法1)；1H NMRδ(ppm)(DMSO-d6):10.25(1H,s),9.15(1H,s),8.82(1H,br s),8.56(1H,d,J＝2.8Hz),8.52(1H,m),7.64(1H,s),7.20-7.00(3H,m),4.06(1H,d,J＝16.8Hz),3.46(1H,d,J＝17.2Hz),3.43(1H,d,J＝15.2Hz),3.09(1H,d,J＝15.2Hz),2.18(3H,d,J＝2.8Hz)。
实施例20和21：(S)-1-(4-(二氟甲氧基)苯基)-5-(3-氟-2-甲基苯基)-N-羟基-1,4,5,6-四氢环戊并[c]吡唑-5-甲酰胺和(S)-2-(4-(二氟甲氧基)苯基)-5-(3-氟-2-甲基苯基)-N-羟基-2,4,5,6-四氢环戊并[c]吡唑-5-甲酰胺
按照如实施例1所述的方法制备。观察到两种区域异构体。制备性HPLC得到(S)-2-(4-(二氟甲氧基)苯基)-5-(3-氟-2-甲基苯基)-N-羟基-2,4,5,6-四氢环戊并[c]吡唑-5-甲酰胺，其为灰白色固体(21mg)；LCMS(ES+)418(M+H)+,RT 3.7min(分析方法1)；1H NMRδ(ppm)(DMSO-d6):10.25(1H,s),8.82(1H,s),8.13(1H,s),7.78(2H,d,J＝8.8Hz),7.26(2H,d,J＝9.2Hz),7.25(1H,t,J＝74Hz),7.20-7.05(2H,m),3.66(1H,d,J＝16Hz),3.52(1H,d,J＝16Hz),3.11(1H,d,J＝16Hz),3.06(1H,d,J＝16Hz),2.18(3H,d,J＝2.4Hz)；和(S)-1-(4-(二氟甲氧基)苯基)-5-(3-氟-2-甲基苯基)-N-羟基-1,4,5,6-四氢环戊并[c]吡唑-5-甲酰胺，其为灰白色固体(38mg)；LCMS(ES+)418(M+H)+,RT 10.55min(分析方法2)；1H NMRδ(ppm)(DMSO-d6):10.27(1H,s),8.82(1H,br s),7.69(2H,d,J＝10Hz),7.46(1H,s),7.29(2H,d,J＝10Hz),7.26(1H,t,J＝74Hz),7.20-7.00(2H,m),4.12(1H,d,J＝16Hz),3.38(1H,d,J＝16Hz),3.23(1H,d,J＝16Hz),3.19(1H,d,J＝16Hz),2.17(3H,d,J＝2.4Hz)。
实施例22和23：(S)-5-(3-氟-2-甲基苯基)-1-(4-氟-2-甲基苯基)-N-羟基-1,4,5,6-四氢环戊并[c]吡唑-5-甲酰胺和(S)-5-(3-氟-2-甲基苯基)-2-(4-氟-2-甲基苯基)-N-羟基-2,4,5,6-四氢环戊并[c]吡唑-5-甲酰胺
按照如实施例1所述的方法制备。观察到两种区域异构体。制备性HPLC得到(S)-5-(3-氟-2-甲基苯基)-2-(4-氟-2-甲基苯基)-N-羟基-2,4,5,6-四氢环戊并[c]吡唑-5-甲酰胺，其为灰白色固体(4mg)；LCMS(ES+)384(M+H)+,RT 10.09min(分析方法2)；1H NMRδ(ppm)(DMSO-d6):10.22(1H,s),8.80(1H,br s),7.62(1H,s),7.40-7.00(6H,m),3.64(1H,d,J＝16Hz),3.51(1H,d,J＝16Hz),3.08(1H,d,J＝16Hz),3.06(1H,d,J＝16Hz),2.18(6H,s)；和(S)-5-(3-氟-2-甲基苯基)-1-(4-氟-2-甲基苯基)-N-羟基-1,4,5,6-四氢环戊并[c]吡唑-5-甲酰胺，其为灰白色固体(44mg)；LCMS(ES+)384(M+H)+,RT 3.62min(分析方法1)；1H NMRδ(ppm)(DMSO-d6):10.23(1H,s),8.82(1H,br s),7.42(1H,s),7.38-7.00(6H,m),3.75(1H,d,J＝16Hz),3.43(1H,d,J＝16Hz),3.19(1H,d,J＝16Hz),2.79(1H,d,J＝16Hz),2.11(3H,d,J＝2.8Hz),2.04(3H,s)。
实施例24和25：(S)-5-(3-氟-2-甲基苯基)-N-羟基-1-(间甲苯基)-1,4,5,6-四氢环戊并[c]吡唑-5-甲酰胺和(S)-5-(3-氟-2-甲基苯基)-N-羟基-2-(间甲苯基)-2,4,5,6-四氢环戊并[c]吡唑-5-甲酰胺
按照如实施例1所述的方法制备。观察到两种区域异构体。制备性HPLC得到(S)-5-(3-氟-2-甲基苯基)-N-羟基-1-(间甲苯基)-1,4,5,6-四氢环戊并[c]吡唑-5-甲酰胺，其为灰白色固体(47mg)；LCMS(ES+)366(M+H)+,RT 3.62min(分析方法1)；1H NMRδ(ppm)(DMSO-d6):10.26(1H,s),8.80(1H,br s),7.50-7.30(4H,m),7.25-7.00(4H,m),4.09(1H,d,J＝16Hz),3.50(1H,d,J＝16Hz),3.25(1H,d,J＝16Hz),3.14(1H,d,J＝16Hz),2.37(3H,s),2.16(3H,d,J＝2.8Hz)；和(S)-5-(3-氟-2-甲基苯基)-N-羟基-2-(间甲苯基)-2,4,5,6-四氢环戊并[c]吡唑-5-甲酰胺，其为灰白色固体(39mg)；LCMS(ES+)366(M+H)+,RT 10.59min(分析方法2)；1H NMRδ(ppm)(DMSO-d6):10.24(1H,s),8.09(1H,s),7.58(1H,s),7.55-7.50(1H,m),7.35-7.25(1H,m),7.20-7.00(5H,m),3.64(1H,d,J＝16Hz),3.50(1H,d,J＝16Hz),3.09(1H,d,J＝16Hz),3.05(1H,d,J＝16Hz),2.35(3H,s),2.17(3H,d,J＝2.4Hz)。
实施例26和27：(S)-5-(3-氟-2-甲基苯基)-N-羟基-1-(3-甲基吡啶-4-基)-1,4,5,6-四氢环戊并[c]吡唑-5-甲酰胺和(S)-5-(3-氟-2-甲基苯基)-N-羟基-2-(3-甲基吡啶-4-基)-2,4,5,6-四氢环戊并[c]吡唑-5-甲酰胺
按照如实施例1所述的方法制备。在羧酸阶段经制备性HPLC分离两种吡唑区域异构体且两种异构体均进行至最后一步。制备性HPLC得到(S)-5-(3-氟-2-甲基苯基)-N-羟基-1-(3-甲基吡啶-4-基)-1,4,5,6-四氢环戊并[c]吡唑-5-甲酰胺，其为灰白色固体(27mg)；LCMS(ES+)367(M+H)+,RT 2.32min(分析方法1)；1H NMRδ(ppm)(DMSO-d6):10.25(1H,s),8.82(1H,br s),8.58(1H,s),8.51(1H,d,J＝5.2Hz),7.55(1H,s),7.37(1H,d,J＝5.2Hz),7.20-7.00(3H,m),3.94(1H,d,J＝16Hz),3.45(1H,d,J＝14.8Hz),3.20(1H,d,J＝13.6Hz),3.06(1H,d,J＝16Hz),2.31(3H,s),2.14(3H,d,J＝2.8Hz)。(S)-5-(3-氟-2-甲基苯基)-N-羟基-2-(3-甲基吡啶-4-基)-2,4,5,6-四氢环戊并[c]吡唑-5-甲酰胺，其为灰白色固体(29mg)。LCMS(ES+)367(M+H)+,RT 2.46min(分析方法1)；1H NMRδ(ppm)(DMSO-d6):10.25(1H,s),8.82(1H,br s),8.55(1H,s),8.47(1H,d,J＝5.2Hz),7.96(1H,s),7.48(1H,d,J＝5.2Hz),7.20-7.00(3H,m),3.68(1H,d,J＝16Hz),3.53(1H,d,J＝16Hz),3.14(1H,d,J＝16Hz),3.08(1H,d,J＝16Hz),2.42(3H,s),2.18(3H,d,J＝2.8Hz)。
实施例28：(S)-2-(3-氯吡啶-2-基)-5-(3-氟-2-甲基苯基)-N-羟基-2,4,5,6-四氢环戊并[c]吡唑-5-甲酰胺
按照如实施例1所述的方法制备。在羧酸阶段经制备性HPLC分离两种吡唑区域异构体且仅一种区域异构体继续进行。制备性HPLC得到标题化合物，其为灰白色固体(13mg)。LCMS(ES+)387/389(M+H)+,RT 3.25min(分析方法1)；1H NMRδ(ppm)(DMSO-d6):10.26(1H,s),8.80(1H,br s),8.46(1H,dd,J＝4.4和1.6Hz),8.15(1H,dd,J＝8和1.6Hz),7.95(1H,s),7.46(1H,dd,J＝8和4.4Hz),7.20-7.00(3H,m),3.69(1H,d,J＝16Hz),3.51(1H,d,J＝16Hz),3.14(1H,d,J＝16Hz),3.08(1H,d,J＝16Hz),2.18(3H,d,J＝2.4Hz)。
实施例29：(S)-5-(3-氟-2-甲基苯基)-2-(3-氟吡啶-2-基)-N-羟基-2,4,5,6-四氢环戊并[c]吡唑-5-甲酰胺
按照如实施例1所述的方法制备。在羧酸阶段及异羟肟酸阶段经制备性HPLC纯化得到标题化合物，其为灰白色固体(45mg)。LCMS(ES+)371(M+H)+,RT 3.12min(分析方法1)；1H NMRδ(ppm)(DMSO-d6):10.26(1H,s),8.82(1H,br s),8.32-8.28(1H,m),8.10(1H,s),7.98-7.90(1H,m),7.45-7.40(1H,m),7.20-7.00(3H,m),3.69(1H,d,J＝16Hz),3.51(1H,d,J＝16Hz),3.14(1H,d,J＝16Hz),3.08(1H,d,J＝16Hz),2.18(3H,d,J＝2.4Hz)。
实施例30：(R)-5-(3-氟-2-甲基苯基)-N-羟基-1-苯基-1,4,5,6-四氢环戊并[c]吡唑-5-甲酰胺
起始于中间体2按照如实施例1所述的方法制备。制备性HPLC得到标题化合物，其为褐色固体(12mg)。LCMS(ES+)352(M+H)+,RT 3.53min(分析方法1)；1H NMRδ(ppm)(DMSO-d6):10.26(1H,s),8.80(1H,br s),7.70-7.60(2H,m),7.55-7.45(3H,m),7.30(1H,m),7.25-7.00(3H,m),4.12(1H,d),3.40(1H,d),3.25(1h,d),3.20(1H,d),2.20(3H,d,J＝2.4Hz)。
实施例31和32：E1-(abs)-5-(3-氟-2-甲基苯基)-N-羟基-1-苯基-4,5,6,7-四氢-1H-吲唑-5-甲酰胺和E2-(abs)-5-(3-氟-2-甲基苯基)-N-羟基-1-苯基-4,5,6,7-四氢-1H-吲唑-5-甲酰胺
步骤1：5-(3-氟-2-甲基苯基)-1-苯基-4,5,6,7-四氢-1H-吲唑-5-羧酸甲酯
将中间体6(515mg,1.76mmol)、AcOH(10mL)和苯基肼(0.174mL,1.76mmol)在密封管中混合并加热至70℃且保持1h。然后将反应混合物在硅胶上蒸干并经快速色谱纯化得到标题化合物，其为黄色胶状物(288mg,45％)。LCMS(ES+)365(M+H)+；1H NMRδ(ppm)(CHCl3-d)7.58(1H,s),7.45-7.35(4H,m),7.35-7.25(1H,m),7.10-6.85(3H,m),3.73(3H,s),3.31(1H,d,J＝16.4Hz),3.12(1H,d,J＝16.4Hz),2.75-2.65(1H,m),2.55-2.30(2H,m),2.25-2.10(1H,m),2.20(3H,d,J＝2.4Hz)。
步骤2：5-(3-氟-2-甲基苯基)-1-苯基-4,5,6,7-四氢-1H-吲唑-5-羧酸
将5-(3-氟-2-甲基苯基)-1-苯基-4,5,6,7-四氢-1H-吲唑-5-羧酸甲酯(280mg)、MeOH(10mL)和15％NaOH水溶液(2mL)在密封管中混合并加热至70℃且保持5天。将反应混合物冷却并蒸干。将残留物在1N HCl和EtOAc之间分配。将有机相干燥(MgSO4)并蒸干得到标题化合物，其为褐色胶状物(225mg,84％)。LCMS(ES+)351(M+H)+。
步骤3：E1-(abs)-5-(3-氟-2-甲基苯基)-N-羟基-1-苯基-4,5,6,7-四氢-1H-吲唑-5-甲酰胺和E2-(abs)-5-(3-氟-2-甲基苯基)-N-羟基-1-苯基-4,5,6,7-四氢-1H-吲唑-5-甲酰胺
将5-(3-氟-2-甲基苯基)-1-苯基-4,5,6,7-四氢-1H-吲唑-5-羧酸(225mg,0.64mmol)、TFFH(185mg,0.7mmol)、DMF(2mL)和三乙胺(0.28mL)混合并搅拌1h。然后加入O-(四氢-2H-吡喃-2-基)羟胺(117mg,1mmol)并继续搅拌2天。将挥发性溶剂真空除去。加入MeOH(5mL)和2N HCl在Et2O(2mL)中的溶液并将反应混合物搅拌4h。将挥发性溶剂真空除去并将残留的粗物质经制备性HPLC纯化。手性制备性HPLC得到E1和E2对映异构体(ChiralpakIA,方法50/50THF(0.1％甲酸)/庚烷5.0mL/min,RT 5.4(E1-(abs))和10.1min(E2-(abs)))。得到E1-对映异构体，其为白色固体(22mg)。LCMS(ES+)366(M+H)+,RT 3.45min(分析方法1)；1H NMRδ(ppm)(DMSO-d6):10.21(1H,s),8.74(1H,s),7.58(1H,s),7.50-7.40(4H,m),7.33-7.27(1H,m),7.15-6.95(3H,m),3.15-2.98(2H,m),2.75-2.65(1H,m),2.45-2.10(3H,m),2.20(3H,d,J＝2.4Hz)。得到E2-对映异构体，其为白色固体(23mg)。LCMS(ES+)366(M+H)+,RT 3.39min(分析方法1)；1H NMRδ(ppm)(DMSO-d6):10.21(1H,s),8.74(1H,s),7.58(1H,s),7.50-7.40(4H,m),7.33-7.27(1H,m),7.15-6.95(3H,m),3.15-2.98(2H,m),2.75-2.65(1H,m),2.45-2.10(3H,m),2.20(3H,d,J＝2.4Hz)。
实施例33和34：E1-(abs)-5-(3-氟-2-甲基苯基)-2-(2-氟苯基)-N-羟基-4,5,6,7-四氢-2H-吲唑-5-甲酰胺和E2-(abs)-5-(3-氟-2-甲基苯基)-2-(2-氟苯基)-N-羟基-4,5,6,7-四氢-2H-吲唑-5-甲酰胺
按照如实施例31和32所述的方法制备。在羧酸酯阶段经快速色谱分离所观察到的两种吡唑区域异构体且仅一种区域异构体继续进行。先后经制备性HPLC和手性制备性HPLC纯化得到E1和E2对映异构体(Chiralpak IC,方法10/90EtOH(0.1％甲酸)/庚烷5.0mL/min,RT 21.0(E1-(abs))和15.6min(E2-(abs)))。得到E1-对映异构体，其为灰白色固体(8mg)。LCMS(ES+)384(M+H)+,RT 3.57(分析方法1)；1H NMRδ(ppm)(DMSO-d6):10.22(1H,br s),8.73(1H,s),8.01(1H,d,J＝2.8Hz),7.79-7.75(1H,m),7.50-7.40(1H,m),7.40-7.25(2H,m),7.20-7.00(3H,m),3.10(2H,s),2.70-2.60(1H,m),2.45-2.30(2H,m),2.20(3H,d,J＝2.8Hz),2.15-2.05(1H,m)。得到E2-对映异构体，其为灰白色固体(7mg)。LCMS(ES+)384(M+H)+,RT 3.55(分析方法1)；1H NMRδ(ppm)(DMSO-d6):10.22(1H,br s),8.73(1H,s),8.01(1H,d,J＝2.8Hz),7.79-7.75(1H,m),7.50-7.40(1H,m),7.40-7.25(2H,m),7.20-7.00(3H,m),3.10(2H,s),2.70-2.60(1H,m),2.45-2.30(2H,m),2.20(3H,d,J＝2.8Hz),2.15-2.05(1H,m)。
实施例35：5-(3-氟-2-甲基苯基)-N-羟基-1-(2,2,2-三氟乙基)-4,5,6,7-四氢-1H-吲唑-5-甲酰胺和5-(3-氟-2-甲基苯基)-N-羟基-2-(2,2,2-三氟乙基)-4,5,6,7-四氢-2H-吲唑-5-甲酰胺
按照如实施例31和32所述的方法制备。得到所观察到的两种吡唑区域异构体，其为不可分离的混合物。制备性HPLC得到标题化合物的区域异构体外消旋混合物，其为灰白色固体(105mg)。LCMS(ES+)372(M+H)+,RT 9.33(分析方法2).1H NMRδ(ppm)(DMSO-d6):10.18(0.5H,s),10.16(0.5H,s),8.73(1H,br s),7.59(0.5H,s),7.42(0.5H,s),7.15-6.80(3H,m),5.04-4.86(2H,m),3.15-2.85(2H,m),2.70-2.50(1H,m),2.40-2.15(2H,m),2.17(3H,d,J＝2.8Hz),2.00-1.75(1H,m)。
实施例36：5-(3-氟-2-甲基苯基)-1-(4-氟苄基)-N-羟基-4,5,6,7-四氢-1H-吲唑-5-甲酰胺和5-(3-氟-2-甲基苯基)-2-(4-氟苄基)-N-羟基-4,5,6,7-四氢-2H-吲唑-5-甲酰胺
按照如实施例31和32所述的方法制备。得到所观察到的两种吡唑区域异构体，其为不可分离的混合物。经制备性HPLC纯化得到标题化合物的区域异构体外消旋混合物，其为白色固体(29mg)。LCMS(ES+)398(M+H)+,RT 3.36(分析方法1)；1H NMRδ(ppm)(DMSO-d6):10.17(0.5H,s),10.14(0.5H,s),8.70(1H,br s),7.57(0.5H,s),7.36(0.5H,s),7.30-6.80(6H,m),5.19(1H,s),5.14(1H,s),3.20-2.80(2H,m),2.65-2.40(1H,m),2.40-2.15(2H,m),2.16(1.5H,d,J＝2.8Hz),2.14(1.5H,d,J＝2.8Hz),1.90-1.80(1H,m),1.65-1.50(1H,m)。
实施例37和38：E1-(abs)-5-(3-氟-2-甲基苯基)-N-羟基-1-(邻甲苯基)-4,5,6,7-四氢-1H-吲唑-5-甲酰胺和E2-(abs)-5-(3-氟-2-甲基苯基)-N-羟基-1-(邻甲苯基)-4,5,6,7-四氢-1H-吲唑-5-甲酰胺
按照如实施例31和32所述的方法制备。先后经制备性HPLC和手性制备性HPLC纯化得到E1和E2对映异构体(Chiralpak IA,方法20/80EtOH(0.1％甲酸)/庚烷5.0mL/min,RT9.4(E1-(abs))和17.0min(E2-(abs)))。得到E1-对映异构体，其为灰白色固体(43mg)。LCMS(ES+)380(M+H)+,RT 3.49(分析方法1)；1H NMRδ(ppm)(DMSO-d6):10.19(1H,s),8.74(1H,s),7.54(1H,s),7.35-7.20(3H,m),7.15-7.00(3H,m),7.00-6.90(1H,m),3.21(1H,d,J＝16Hz),2.96(1H,d,J＝16Hz),2.40-2.20(3H,m),2.15(3H,d,J＝2.8Hz),1.79(3H,s),1.65-1.50(1H,m)。得到E2-对映异构体，其为灰白色固体(43mg)。LCMS(ES+)380(M+H)+,RT 3.49(分析方法1)；1H NMRδ(ppm)(DMSO-d6):10.19(1H,s),8.74(1H,s),7.54(1H,s),7.35-7.20(3H,m),7.15-7.00(3H,m),7.00-6.90(1H,m),3.21(1H,d,J＝16Hz),2.96(1H,d,J＝16Hz),2.40-2.20(3H,m),2.15(3H,d,J＝2.8Hz),1.79(3H,s),1.65-1.50(1H,m)。
实施例39：3-环丙基-5-(3-氟-2-甲基苯基)-N-羟基-2-(2,2,2-三氟乙基)-4,5,6,7-四氢-2H-吲唑-5-甲酰胺
步骤1：5-(3-氟-2-甲基苯基)-3-羟基-2-(2,2,2-三氟乙基)-4,5,6,7-四氢-2H-吲唑-5-羧酸甲酯和5-(3-氟-2-甲基苯基)-3-羟基-1-(2,2,2-三氟乙基)-4,5,6,7-四氢-1H-吲唑-5-羧酸甲酯
将中间体4(1.12g,3.07mmol)、乙酸(10mL)和2,2,2-三氟乙基肼(70％在水中)(0.5mL,3.1mmol)混合并加热至65℃且保持9h。将反应混合物在硅胶上蒸干并经快速色谱纯化得到标题化合物的混合物，其为澄清胶状物(1.04g,88％)。LCMS(ES+)387(M+H)+。
步骤2：5-(3-氟-2-甲基苯基)-1-(2,2,2-三氟乙基)-3-(((三氟甲基)磺酰基)氧基)-4,5,6,7-四氢-1H-吲唑-5-羧酸甲酯和5-(3-氟-2-甲基苯基)-2-(2,2,2-三氟乙基)-3-(((三氟甲基)磺酰基)氧基)-4,5,6,7-四氢-2H-吲唑-5-羧酸甲酯
在氮气下将来自上述反应的5-(3-氟-2-甲基苯基)-3-羟基-2-(2,2,2-三氟乙基)-4,5,6,7-四氢-2H-吲唑-5-羧酸甲酯和5-(3-氟-2-甲基苯基)-3-羟基-1-(2,2,2-三氟乙基)-4,5,6,7-四氢-1H-吲唑-5-羧酸甲酯的粗混合物(0.925mg,2.39mmol)与DCM(80mL)和三乙胺(0.5mL)合并。将反应混合物用冰浴冷却并逐滴加入三氟甲磺酸酐(0.4mL,2.4mmol)。将反应混合物搅拌，同时继续用冰浴冷却1h，然后在硅胶上真空蒸干并经快速色谱纯化得到5-(3-氟-2-甲基苯基)-1-(2,2,2-三氟乙基)-3-(((三氟甲基)磺酰基)氧基)-4,5,6,7-四氢-1H-吲唑-5-羧酸甲酯，其为澄清油状物(48mg)。LCMS(ES+)519(M+H)+；和5-(3-氟-2-甲基苯基)-2-(2,2,2-三氟乙基)-3-(((三氟甲基)磺酰基)氧基)-4,5,6,7-四氢-2H-吲唑-5-羧酸甲酯，其为澄清油状物(639mg)。LCMS(ES+)519(M+H)+。
步骤3：3-环丙基-5-(3-氟-2-甲基苯基)-2-(2,2,2-三氟乙基)-4,5,6,7-四氢-2H-吲唑-5-羧酸甲酯
在氮气气氛下将5-(3-氟-2-甲基苯基)-2-(2,2,2-三氟乙基)-3-(((三氟甲基)磺酰基)氧基)-4,5,6,7-四氢-2H-吲唑-5-羧酸甲酯(205mg,0.397mmol)、THF(10mL)、环丙基溴化锌(0.5N在THF中)(4mL,2mmol)和四三苯基膦钯(10mg)混合并加热至70℃且保持3天。然后将反应混合物用EtOAc稀释，用饱和NH4Cl水溶液洗涤并真空蒸干。将粗产物经制备性HPLC纯化得到标题化合物，其为褐色固体(17.9mg)。LCMS(ES+)411(M+H)+。
步骤4：3-环丙基-5-(3-氟-2-甲基苯基)-2-(2,2,2-三氟乙基)-4,5,6,7-四氢-2H-吲唑-5-羧酸
将3-环丙基-5-(3-氟-2-甲基苯基)-2-(2,2,2-三氟乙基)-4,5,6,7-四氢-2H-吲唑-5-羧酸甲酯(17.9mg)、MeOH(7mL)和15％NaOH溶液(0.5mmol)混合并加热至70℃且保持15天。然后将反应混合物真空蒸干，然后在EtOAc和1N HCl之间分配。将有机层干燥(MgSO4)并真空蒸干得到标题化合物(16mg)，其为澄清玻璃状物。LCMS(ES+)397(M+H)+。
步骤5：3-环丙基-5-(3-氟-2-甲基苯基)-N-羟基-2-(2,2,2-三氟乙基)-4,5,6,7-四氢-2H-吲唑-5-甲酰胺
将3-环丙基-5-(3-氟-2-甲基苯基)-2-(2,2,2-三氟乙基)-4,5,6,7-四氢-2H-吲唑-5-羧酸(16mg)、TFFH(100mg)、DMF(1mL)和三乙胺(0.5mL)混合并在室温搅拌1h。然后加入O-(四氢-2H-吡喃-2-基)羟胺(60mg,0.5mmol)并继续搅拌1天。将挥发性溶剂真空除去。加入MeOH(5mL)和2N HCl在Et2O(2mL)中的溶液并将反应混合物搅拌1h。将挥发性溶剂真空除去并将残留的粗物质经制备性HPLC纯化得到标题化合物，其为白色固体(4mg)。LCMS(ES+)412(M+H)+,RT 9.89(分析方法2)；1H NMRδ(ppm)(DMSO-d6):10.15(1H,s),8.75(1H,brs),7.15-6.95(2H,m),6.85-6.80(1H,m),5.05-4.85(2H,m),3.08(1H,d,J＝16Hz),2.86(1H,d,J＝16Hz),2.50-2.40(1H,m),2.35-2.25(1H,m),2.25-2.15(1H,m),2.17(3H,d,J＝2.8Hz),1.85-1.70(2H,m),1.05-0.90(2H,m),0.85-0.65(2H,m)。
实施例40：2-环丙基-6-(3-氟-2-甲基苯基)-N-羟基-4-氧代-3,4,5,6,7,8-六氢喹唑啉-6-甲酰胺
步骤1：2-环丙基-6-(3-氟-2-甲基苯基)-4-氧代-3,4,5,6,7,8-六氢喹唑啉-6-羧酸甲酯
将中间体4(1g,2.74mmol)、环丙基胍·HCl(361mg,3mmol)、MeOH(20mL)和DIPEA(1mL)在密封管中混合并加热至65℃且保持14天。然后将反应混合物在硅胶上真空蒸干并经快速色谱纯化得到标题化合物，其为澄清玻璃状物(99mg)。LCMS(ES+)357(M+H)+。
步骤2：2-环丙基-6-(3-氟-2-甲基苯基)-4-氧代-3,4,5,6,7,8-六氢喹唑啉-6-羧酸
将2-环丙基-6-(3-氟-2-甲基苯基)-4-氧代-3,4,5,6,7,8-六氢喹唑啉-6-羧酸甲酯(99mg)、MeOH(10mL)和15％NaOH水溶液(2mL)在密封管中混合并加热至65℃且保持19天。然后将反应混合物真空蒸干，然后在EtOAc和1N HCl之间分配。将有机层干燥(MgSO4)并真空蒸干得到标题化合物，其为澄清玻璃状物(25mg)。LCMS(ES+)343(M+H)+。
步骤3：2-环丙基-6-(3-氟-2-甲基苯基)-N-羟基-4-氧代-3,4,5,6,7,8-六氢喹唑啉-6-甲酰胺
将2-环丙基-6-(3-氟-2-甲基苯基)-4-氧代-3,4,5,6,7,8-六氢喹唑啉-6-羧酸(25mg)、TFFH(25mg)、DMF(1mL)和三乙胺(0.1mL)混合并在室温搅拌2h。然后加入O-(四氢-2H-吡喃-2-基)羟胺(30mg,0.25mmol)并继续搅拌2天。将挥发性溶剂真空除去。加入MeOH(2mL)和2N HCl在Et2O(2mL)中的溶液并将反应混合物搅拌1.5h。将挥发性溶剂真空除去并将残留的粗物质经制备性HPLC纯化得到标题化合物，其为灰白色固体(4mg)。LCMS(ES+)358(M+H)+,RT 2.65(分析方法1)；1H NMRδ(ppm)(DMSO-d6):12.44(1H,s),10.17(1H,s),8.71(1H,s),7.20-6.95(2H,m),6.90-6.80(1H,m),3.55-3.40(1H,m),2.70-2.60(1H,m0,2.40-2.30(1H,m),2.30-2.15(2H,m),2.17(3H,d,J＝2.8Hz),1.95-1.75(2H,m),1.00-0.85(4H,m)。
实施例41：6-(3-氟-2-甲基苯基)-N-羟基-2-(苯基磺酰氨基)-4,5,6,7-四氢苯并[d]噻唑-6-甲酰胺
步骤1：6-(3-氟-2-甲基苯基)-2-(苯基磺酰氨基)-4,5,6,7-四氢苯并[d]噻唑-6-羧酸甲酯
将中间体7(200mg,0.625mmol)、吡啶(5mL)和苯基磺酰氯(0.091mL,0.65mmol)混合并搅拌4天。然后将反应混合物用EtOAc稀释，用1N HCl(2×)洗涤，干燥(MgSO4)并蒸干得到标题化合物，其为褐色固体(234mg,81％)。LCMS(ES+)461(M+H)+。
步骤2：6-(3-氟-2-甲基苯基)-2-(苯基磺酰氨基)-4,5,6,7-四氢苯并[d]噻唑-6-羧酸
将6-(3-氟-2-甲基苯基)-2-(苯基磺酰氨基)-4,5,6,7-四氢苯并[d]噻唑-6-羧酸甲酯(230mg,0.5mmol)、MeOH(10mL)和15％NaOH水溶液(2mL)在密封管中混合并加热至70℃且保持5天。将反应混合物冷却并蒸干。将残留物在1N HCl和EtOAc之间分配。将有机相干燥(MgSO4)并蒸干得到标题化合物，其为黄色胶状物(181mg,81％)。LCMS(ES+)447(M+H)+。
步骤3：6-(3-氟-2-甲基苯基)-N-羟基-2-(苯基磺酰氨基)-4,5,6,7-四氢苯并[d]噻唑-6-甲酰胺
将6-(3-氟-2-甲基苯基)-2-(苯基磺酰氨基)-4,5,6,7-四氢苯并[d]噻唑-6-羧酸(181mg,0.4mmol)、TFFH(127mg,0.48mmol)、DMF(2mL)和三乙胺(0.5mL)混合并搅拌16h。然后加入O-(四氢-2H-吡喃-2-基)羟胺(117mg,1mmol)并继续搅拌2天。将挥发性溶剂真空除去。加入MeOH(5mL)和2N HCl在Et2O(2mL)中的溶液并将反应混合物搅拌2h。将挥发性溶剂真空除去并将残留的粗物质经制备性HPLC纯化得到标题化合物，其为灰白色固体(26mg)。LCMS(ES+)462(M+H)+,RT 9.49(分析方法2)；1H NMRδ(ppm)(DMSO-d6):12.45(1H,br s),10.22(1H,s),8.77(1H,s),7.82(2H,m),7.65-7.50(3H,m),7.25-7.10(1H,m),7.10-7.00(1H,m),6.95-6.85(1H,m),3.10-2.95(1H,m),2.85-2.75(1H,m),2.45-2.25(3H,m),2.15(3H,d,J＝2.4Hz),1.95-1.75(1H,m)。
实施例42：2-环丙基-6-(3-氟-2-甲基苯基)-N-羟基-4,5,6,7-四氢苯并[d]噻唑-6-甲酰胺
步骤1：2-环丙基-6-(3-氟-2-甲基苯基)-4,5,6,7-四氢苯并[d]噻唑-6-羧酸甲酯
在氮气气氛下将中间体8(300mg,0.78mmol)、THF(10mL)、四(三苯基膦)钯(0)(10mg)和环丙基溴化锌(0.5N在THF中)(3mL,1.5mmol)混合并加热至60℃且保持16h。加入另外的四(三苯基膦)钯(0)(20mg)和环丙基溴化锌(0.5N在THF中)(3mL,1.5mmol)并继续加热23h。将反应混合物在硅胶上蒸干并经快速色谱纯化得到标题化合物，其为褐色固体(177mg,66％)。
LCMS(ES+)346(M+H)+。
步骤2：2-环丙基-6-(3-氟-2-甲基苯基)-4,5,6,7-四氢苯并[d]噻唑-6-羧酸
将2-环丙基-6-(3-氟-2-甲基苯基)-4,5,6,7-四氢苯并[d]噻唑-6-羧酸甲酯(170mg,0.49mmol)、MeOH(10mL)和15％NaOH水溶液(1mL)在密封管中混合并加热至65℃且保持5天。将反应混合物冷却并蒸干。将残留物在1N HCl和EtOAc之间分配。将有机相干燥(MgSO4)并蒸干得到标题化合物，其为灰色固体(136mg,84％)。LCMS(ES+)332(M+H)+。
步骤3：2-环丙基-6-(3-氟-2-甲基苯基)-N-羟基-4,5,6,7-四氢苯并[d]噻唑-6-甲酰胺
将2-环丙基-6-(3-氟-2-甲基苯基)-4,5,6,7-四氢苯并[d]噻唑-6-羧酸(136mg,0.41mmol)、TFFH(132mg,0.5mmol)、DMF(2mL)和三乙胺(2mL)混合并搅拌1.5h。然后加入O-(四氢-2H-吡喃-2-基)羟胺(117mg,1mmol)并继续搅拌1天。将挥发性溶剂真空除去。加入MeOH(2mL)和2N HCl在Et2O(2mL)中的溶液并将反应混合物搅拌2h。将挥发性溶剂真空除去并将残留的粗物质经制备性HPLC纯化得到标题化合物，其为黄色玻璃状物(54mg)。
LCMS(ES+)347(M+H)+,RT 3.2(分析方法1)；1H NMRδ(ppm)(DMSO-d6):10.21(1H,s),8.80(1H,br s),7.15-7.05(2H,m),6.90(1H,m),3.30-3.05(2H,m),2.65-2.50(1H,m),2.40-2.25(3H,m),2.20(3H,d,J＝2.4Hz),2.10-2.00(1H,m),1.10-1.00(2H,m),1.90-1.80(2H,m)。
实施例43：6-(3-氟-2-甲基苯基)-N-羟基-2-(嘧啶-5-基)-4,5,6,7-四氢苯并[d]噻唑-6-甲酰胺
步骤1：6-(3-氟-2-甲基苯基)-2-(嘧啶-5-基)-4,5,6,7-四氢苯并[d]噻唑-6-羧酸甲酯
将中间体8(275mg,0.716mmol)、嘧啶-5-硼酸(99mg,0.8mmol)、CsF(150mg)、DME(15mL)、MeOH(2mL)和四(三苯基膦)钯(0)(10mg)在密封管中混合并用微波加热至120℃且保持2h。将反应混合物在硅胶上蒸干并经快速色谱纯化得到标题化合物，其为褐色玻璃状物(217mg,79％)。
LCMS(ES+)384(M+H)+。
步骤2：6-(3-氟-2-甲基苯基)-2-(嘧啶-5-基)-4,5,6,7-四氢苯并[d]噻唑-6-羧酸
将6-(3-氟-2-甲基苯基)-2-(嘧啶-5-基)-4,5,6,7-四氢苯并[d]噻唑-6-羧酸甲酯(200mg,0.52mmol)、MeOH(10mL)和15％NaOH水溶液(1mL)在密封管中混合并加热至65℃且保持2天。将反应混合物冷却并蒸干。将残留物在AcOH/H2O和EtOAc之间分配。将有机相干燥(MgSO4)并蒸干得到标题化合物，其为淡黄色玻璃状物(151mg)，所述玻璃状物以粗品形式用于下一步。
步骤3：6-(3-氟-2-甲基苯基)-N-羟基-2-(嘧啶-5-基)-4,5,6,7-四氢苯并[d]噻唑-6-甲酰胺
将6-(3-氟-2-甲基苯基)-2-(嘧啶-5-基)-4,5,6,7-四氢苯并[d]噻唑-6-羧酸(151mg,0.4mmol)、TFFH(132mg,0.5mmol)、DMF(2mL)和三乙胺(2mL)混合并搅拌1h。然后加入O-(四氢-2H-吡喃-2-基)羟胺(117mg,1mmol)并继续搅拌1天。将挥发性溶剂真空除去。加入MeOH(2mL)和2N HCl在Et2O(2mL)中的溶液并将反应混合物搅拌30min。将挥发性溶剂真空除去并将残留的粗物质经制备性HPLC纯化得到标题化合物，其为灰白色固体(11mg)。
LCMS(ES+)385(M+H)+,RT 9.03(分析方法2)；1H NMRδ(ppm)(DMSO-d6):10.30(1H,s),9.25(1H,s),9.24(2H,s),8.80(1H,s),7.20-6.95(3H,m),3.55-3.45(1H,m),3.30-3.15(1H,m),2.80-2.70(1H,m),2.60-2.40(2H,m),2.40-2.30(1H,m),2.20(3H,d,J＝2.4Hz)。
实施例44：6-(3-氟-2-甲基苯基)-N-羟基-4,5,6,7-四氢苯并[d]噻唑-6-甲酰胺
步骤1：6-(3-氟-2-甲基苯基)-4,5,6,7-四氢苯并[d]噻唑-6-羧酸甲酯
将中间体8(300mg,0.78mmol)、AcOH(10mL)和锌屑(300mg)混合并加热至65℃且保持1h。将锌残留物经硅藻土塞过滤除去，同时用EtOAc洗涤。然后将有机相蒸干得到标题化合物，其为褐色固体，所述固体以粗品形式用于下一步。LCMS(ES+)306(M+H)+。
步骤2：6-(3-氟-2-甲基苯基)-4,5,6,7-四氢苯并[d]噻唑-6-羧酸
将6-(3-氟-2-甲基苯基)-4,5,6,7-四氢苯并[d]噻唑-6-羧酸甲酯(0.78mmol)、MeOH(15mL)和15％NaOH水溶液(3mL)在密封管中混合并加热至65℃且保持19h。将反应混合物冷却并蒸干。将残留物在1N HCl和EtOAc之间分配。将有机相干燥(MgSO4)并蒸干得到标题化合物，其为褐色玻璃状物(191mg,84％,历经两步)。LCMS(ES+)292(M+H)+。
步骤3：6-(3-氟-2-甲基苯基)-N-羟基-4,5,6,7-四氢苯并[d]噻唑-6-甲酰胺
将6-(3-氟-2-甲基苯基)-4,5,6,7-四氢苯并[d]噻唑-6-羧酸(196mg,0.67mmol)、TFFH(264mg,1mmol)、DMF(2mL)和三乙胺(0.3mL)混合并搅拌1h。然后加入O-(四氢-2H-吡喃-2-基)羟胺(117mg,1mmol)并继续搅拌2天。将挥发性溶剂真空除去。加入MeOH(2mL)和2NHCl在Et2O(2mL)中的溶液并将反应混合物搅拌5h。将挥发性溶剂真空除去并将残留的粗物质经制备性HPLC纯化得到标题化合物，其为灰白色固体(43mg)。LCMS(ES+)307(M+H)+,RT2.87(分析方法1)；1H NMRδ(ppm)(DMSO-d6):10.24(1H,s),8.86(1H,s),8.77(1H,s),7.15-7.00(2H,m),6.90(1H,m),3.40-3.30(1H,m),3.25-3.15(1H,m),2.75-2.65(1H,m),2.60-2.50(1H,m),2.45-2.35(1H,m),2.25-2.10(1H,m),2.20(3H,d,J＝2.4Hz)。
实施例45：6-(3-氟-2-甲基苯基)-N-羟基-5,6,7,8-四氢喹唑啉-6-甲酰胺
步骤1：6-(3-氟-2-甲基苯基)-5,6,7,8-四氢喹唑啉-6-羧酸甲酯
将中间体6(516mg,1.77mmol)、甲脒·AcOH(198mg,1.9mmol)、MeOH(10mL)和DIPEA(2mL)在密封管中混合并加热至70℃且保持2.5h。然后将反应混合物在硅胶上蒸干并经快速色谱纯化得到标题化合物，其为澄清胶状物(264mg,50％)。LCMS(ES+)301(M+H)+。
步骤2：6-(3-氟-2-甲基苯基)-5,6,7,8-四氢喹唑啉-6-羧酸
将6-(3-氟-2-甲基苯基)-5,6,7,8-四氢喹唑啉-6-羧酸甲酯(264mg,0.88mmol)、MeOH(10mL)和15％NaOH水溶液(2mL)在密封管中混合并加热至70℃且保持4天。将反应混合物冷却并蒸干。将残留物在1N HCl和EtOAc之间分配。将有机相干燥(MgSO4)并蒸干得到标题化合物，其为淡黄色胶状物(194mg,77％)。LCMS(ES+)287(M+H)+。
步骤3：6-(3-氟-2-甲基苯基)-N-羟基-5,6,7,8-四氢喹唑啉-6-甲酰胺
将6-(3-氟-2-甲基苯基)-5,6,7,8-四氢喹唑啉-6-羧酸(194mg,0.68mmol)、TFFH(211mg,0.8mmol)、DMF(2mL)和三乙胺(0.28mL)混合并搅拌4h。然后加入O-(四氢-2H-吡喃-2-基)羟胺(117mg,1mmol)并继续搅拌16h。将挥发性溶剂真空除去。加入MeOH(5mL)和2NHCl在Et2O(2mL)中的溶液并将反应混合物搅拌2.5h。将挥发性溶剂真空除去并将残留的粗物质经制备性HPLC纯化得到标题化合物，其为白色固体(17mg)。LCMS(ES+)302(M+H)+,RT2.59(分析方法1)；1H NMRδ(ppm)(DMSO-d6):10.28(1H,s),8.85(1H,s),8.76(1H,s),8.57(1H,s),7.25-7.00(3H,m),3.50-3.35(1H,m),3.00-2.90(1H,m),2.80-2.70(1H,m),2.65-2.55(1H,m),2.50-2.40(2H,m),2.21(3H,d,J＝2.4Hz)。
实施例46：2-环丙基-6-(3-氟-2-甲基苯基)-N-羟基-5,6,7,8-四氢喹唑啉-6-甲酰胺
按照如实施例45所述的方法制备。制备性HPLC得到标题化合物，其为白色固体(90mg)。LCMS(ES+)342(M+H)+,RT 2.96(分析方法1)；1H NMRδ(ppm)(DMSO-d6):10.28(1H,s),8.75(1H,br s),8.39(1H,s),7.20-6.95(3H,m),3.40-3.30(2H,m),2.9(1H,m),2.75-2.65(1H,m),2.50-2.35(2H,m),2.21(3H,d,J＝2.4Hz),2.10(1H,m),1.00-0.85(4H,m)。
实施例47：6-(3-氟-2-甲基苯基)-N-羟基-2-苯基-5,6,7,8-四氢喹唑啉-6-甲酰胺
按照如实施例45所述的方法制备。制备性HPLC得到标题化合物，其为白色固体(53mg)。LCMS(ES+)378(M+H)+,RT 3.66(分析方法1)；1H NMRδ(ppm)(DMSO-d6):10.31(1H,s),8.78(1H,br s),8.68(1H,s),8.35(2H,m),7.55-7.45(3H,m),7.25-7.00(3H,m),3.50-3.40(2H,m),3.05-2.95(1H,m),2.90-2.80(1H,m),2.70-2.55(2H,m),2.24(3H,d,J＝2.4Hz)。
实施例48和49：(S)-2-(2-氯苯基)-6-(3-氟-2-甲基苯基)-N-羟基-6,7-二氢-5H-环戊并[d]嘧啶-6-甲酰胺和(R)-2-(2-氯苯基)-5-(3-氟-2-甲基苯基)-N-羟基-6,7-二氢-5H-环戊并[d]嘧啶-5-甲酰胺
步骤1：(S)-3-((二甲基氨基)亚甲基)-1-(3-氟-2-甲基苯基)-4-氧代环戊烷羧酸甲酯和(R)-2-(二甲基氨基亚甲基)-1-(3-氟-2-甲基-苯基)-3-氧代-环戊烷羧酸甲酯
将中间体3(2.5g,1.0mmol)溶于二甲基甲酰胺缩二甲醛(5.0mL)并加热至80℃且保持16h。将冷却的混合物在硅胶上浓缩并经快速硅胶柱色谱纯化(梯度洗脱异己烷至100％EtOAc/异己烷)得到标题化合物，其为淡黄色油状物(1.8g,58％)。LCMS(ES+)306(M+H)+。
步骤2：(6S)-2-(2-氯苯基)-6-(3-氟-2-甲基-苯基)-5,7-二氢环戊并[d]嘧啶-6-羧酸甲酯和(5R)-2-(2-氯苯基)-5-(3-氟-2-甲基-苯基)-6,7-二氢环戊并[d]嘧啶-5-羧酸甲酯
将(S)-3-((二甲基氨基)亚甲基)-1-(3-氟-2-甲基苯基)-4-氧代环戊烷羧酸甲酯和(R)-2-(二甲基氨基亚甲基)-1-(3-氟-2-甲基-苯基)-3-氧代-环戊烷羧酸甲酯(0.305g,1mmol)和2-氯苯甲脒盐酸盐(0.28g,1.5mmol)在甲醇(5mL)中的混合物加热至130℃且保持30min。将溶剂减压除去并将残留物在DCM(15mL)和水(15mL)之间分配。分离DCM层(相分离器)并减压蒸发得到油状物，将其经快速色谱纯化得到(S)-2-(2-氯苯基)-6-(3-氟-2-甲基苯基)-6,7-二氢-5H-环戊并[d]嘧啶-6-羧酸甲酯，其为无色油状物。LCMS(ES+)397(M+H)+；1H NMRδ(ppm)(CHCl3-d):8.68(1H,s),7.74-7.68(1H,m),7.53-7.47(1H,m),7.40-7.33(2H,m),7.19-7.06(1H,m),7.07-6.94(2H,m),4.07-3.94(2H,m),3.73(3H,s),3.63(1H,s),3.59-3.48(1H,m),2.23(3H,s)。得到(R)-2-(2-氯苯基)-5-(3-氟-2-甲基苯基)-6,7-二氢-5H-环戊并[d]嘧啶-5-羧酸甲酯，其为无色油状物。LCMS(ES+)398(M+H)+；1H NMRδ(ppm)(CHCl3-d):8.83(1H,s),7.81-7.75(1H,m),7.55-7.48(1H,m),7.48-7.26(2H,m),7.16-7.04(1H,m),7.01(1H,m),6.56(1H,m),3.79(3H,s),3.51(1H,m),3.30(1H,m),3.12(1H,m),2.27-2.18(4H,m)。
步骤3：(S)-2-(2-氯苯基)-6-(3-氟-2-甲基苯基)-N-羟基-6,7-二氢-5H-环戊并[d]嘧啶-6-甲酰胺
在氮气下将三甲基铝(1.56mL,2M在甲苯中,3.12mmol)加到羟胺盐酸盐(240mg,10.1mmol)在无水DCM(5mL)中的搅拌溶液中并将所得溶液在室温在氮气下搅拌30min。加入(6S)-2-(2-氯苯基)-6-(3-氟-2-甲基-苯基)-5,7-二氢环戊并[d]嘧啶-6-羧酸甲酯(0.234g,0.59mmol)在DCM(8mL)中的溶液并继续搅拌1h。先后加入饱和氯化铵溶液(1mL)和水(2.5mL)并将所得混合物蒸干，将残留物与甲醇(25mL)搅拌10min并过滤。将滤液减压蒸干并将残留物与EtOAc(30mL)搅拌并过滤。蒸发EtOAc并将所得油状物经制备性HPLC纯化得到标题化合物(78mg,33％)，其为无色固体。LCMS(ES+)398(M+H)+,RT 3.44(分析方法1)；1HNMRδ(ppm)(DMSO-d6):10.30(1H,br),8.86(1H,br),8.81-8.69(1H,m),7.73-7.65(1H,m),7.59-7.53(1H,m),7.51-7.42(2H,m),7.24-7.05(3H,m),3.98-3.93(1H,m),3.84-3.78(1H,m),3.53-3.47(1H,m),3.43-3.23(1H,m),2.27-2.19(3H,m)。
步骤4：(R)-2-(2-氯苯基)-5-(3-氟-2-甲基苯基)-N-羟基-6,7-二氢-5H-环戊并[d]嘧啶-5-甲酰胺
使用与步骤3相同的方法起始于(R)-2-(2-氯苯基)-5-(3-氟-2-甲基苯基)-6,7-二氢-5H-环戊并[d]嘧啶-5-羧酸甲酯。制备性HPLC得到标题化合物(14mg)，其为无色固体。LCMS(ES+)398(M+H)+,RT 8.91(分析方法3)；1H NMRδ(ppm)(DMSO-d6):8.95(1H,s),7.79-7.75(1H,m),7.63-7.58(1H,m),7.55-7.46(2H,m),7.21-7.11(2H,m),6.63(1H,s),3.5-3.30(1H,m),3.20-3.05(1H,m),3.05-2.96(1H,m),2.19(3H,d,J＝2Hz),2.07-1.98(1H,m),未观察到两个可交换的质子。
实施例50和51：(R)-2-环丙基-6-(3-氟-2-甲基苯基)-N-羟基-6,7-二氢-5H-环戊并[d]嘧啶-6-甲酰胺和(S)-2-环丙基-5-(3-氟-2-甲基苯基)-N-羟基-6,7-二氢-5H-环戊并[d]嘧啶-5-甲酰胺
步骤1：(R)-3-((二甲基氨基)亚甲基)-1-(3-氟-2-甲基苯基)-4-氧代环戊烷羧酸甲酯和(S)-2-(二甲基氨基亚甲基)-1-(3-氟-2-甲基-苯基)-3-氧代-环戊烷羧酸甲酯
将中间体2(2.5g,1.0mmol)溶于二甲基甲酰胺缩二甲醛(5.0mL)并加热至80℃且保持16h。在硅胶上浓缩并经快速硅胶柱色谱纯化(梯度洗脱异己烷至100％EtOAc/异己烷)得到标题化合物，其为淡黄色油状物(1.8g,58.8％)。
LCMS(ES+)306(M+H)+。
步骤2：(R)-2-环丙基-6-(3-氟-2-甲基苯基)-6,7-二氢-5H-环戊并[d]嘧啶-6-羧酸甲酯和(S)-2-环丙基-5-(3-氟-2-甲基苯基)-6,7-二氢-5H-环戊并[d]嘧啶-5-羧酸甲酯
向(R)-3-((二甲基氨基)亚甲基)-1-(3-氟-2-甲基苯基)-4-氧代环戊烷羧酸甲酯和(S)-2-(二甲基氨基亚甲基)-1-(3-氟-2-甲基-苯基)-3-氧代-环戊烷羧酸甲酯(0.23g,0.75mmol)在甲醇(10mL)中的溶液中加入环丙烷甲脒(91mg,0.755mmol)和NaOMe(41mg,0.755mmol)并将反应混合物在100℃搅拌过夜。将混合物在硅胶上浓缩并经快速硅胶柱色谱纯化(梯度洗脱异己烷至70％EtOAc/异己烷)得到(R)-2-环丙基-6-(3-氟-2-甲基苯基)-6,7-二氢-5H-环戊并[d]嘧啶-6-羧酸甲酯，其为黄色油状物(0.12g,50％)。
LCMS(ES+)327(M+H)+。得到(S)-2-环丙基-5-(3-氟-2-甲基苯基)-6,7-二氢-5H-环戊并[d]嘧啶-5-羧酸甲酯，其为黄色油状物(68mg,28％)。
LCMS(ES+)327(M+H)+。
步骤3：(R)-2-环丙基-6-(3-氟-2-甲基苯基)-6,7-二氢-5H-环戊并[d]嘧啶-6-羧酸
将(R)-2-环丙基-6-(3-氟-2-甲基苯基)-6,7-二氢-5H-环戊并[d]嘧啶-6-羧酸甲酯(68mg,0.19mmol)、MeOH(3mL)和15％NaOH水溶液(0.5mL)在密封管中混合并加热至70℃且保持4天。将反应混合物冷却并蒸干。将残留物在1N HCl和EtOAc之间分配。将有机相干燥(MgSO4)并蒸干得到标题化合物，其为灰白色固体。LCMS(ES+)313(M+H)+。
步骤4：(S)-2-环丙基-5-(3-氟-2-甲基苯基)-6,7-二氢-5H-环戊并[d]嘧啶-5-羧酸
按照与步骤3相同的方法。制备性HPLC得到标题化合物，其为白色固体。LCMS(ES+)313(M+H)+。
步骤5：(R)-2-环丙基-6-(3-氟-2-甲基苯基)-N-羟基-6,7-二氢-5H-环戊并[d]嘧啶-6-甲酰胺
将(R)-2-环丙基-6-(3-氟-2-甲基苯基)-6,7-二氢-5H-环戊并[d]嘧啶-6-羧酸(51mg,0.19mmol)、TFFH(58mg,0.22mmol)、DMF(1mL)和三乙胺(1mL)混合并搅拌1h。然后加入O-(四氢-2H-吡喃-2-基)羟胺(51mg,0.28mmol)并继续搅拌1天。将挥发性溶剂真空除去。加入MeOH(1mL)和2N HCl在Et2O(1mL)中的溶液并将反应混合物搅拌30min。将挥发性溶剂真空除去并将残留的粗物质经制备性HPLC纯化得到标题化合物，其为灰白色固体(29mg)。
LCMS(ES+)328(M+H)+,RT 2.90(分析方法1)；1H NMRδ(ppm)(CH3OH-d4):8.39(1H,s),7.19-7.10(1H,m),7.09-6.97(2H,m),3.90(1H,d,J＝17.2Hz),3.80(1H,d,J＝16.4Hz),3.44(1H,d,J＝16.4Hz),3.29(1H,d,J＝17.2Hz),2.26(3H,s),2.22-2.13(1H,m),1.12-1.04(4H,m),未观察到两个可交换的质子。
步骤6：(S)-2-环丙基-5-(3-氟-2-甲基苯基)-N-羟基-6,7-二氢-5H-环戊并[d]嘧啶-5-甲酰胺
按照与步骤5相同的方法。制备性HPLC得到标题化合物，其为白色固体(28mg)。LCMS(ES+)328(M+H)+,RT 9.15(分析方法2)。1H NMRδ(ppm)(CH3OH-d4):8.59(1H,s),7.16-7.08(1H,m),7.05(1H,t,J＝9.0Hz),6.54(1H,d,J＝7.78Hz),3.50(1H,ddd,J＝13.20,9.30,7.12Hz),3.16-3.05(1H,m),2.92(1H,ddd,J＝17.9,9.2,7.2Hz),2.32-2.23(4H,m),2.11(1H,ddd,J＝13.1,9.2,4.9Hz),1.22-1.10(4H,m),未观察到两个可交换的质子。
实施例52：(S)-2-环丙基-6-(3-氟-2-甲基苯基)-N-羟基-6,7-二氢-5H-环戊并[d]嘧啶-6-甲酰胺
按照如实施例50和51所述的方法由中间体3制备。经制备性HPLC纯化得到标题化合物，其为白色固体(12mg)。LCMS(ES+)328(M+H)+,RT 8.81(分析方法2)。1H NMRδ(ppm)(DMSO-d6):10.24(1H,s),8.81(1H,s),8.43(1H,s),7.19-7.12(1H,m),7.09-7.03(2H,m),3.81(1H,d,J＝17.1Hz),3.65(1H,d,J＝16.3Hz),3.38(1H,被水掩蔽),3.17(1H,d,J＝17.2Hz),2.18(3H,d,J＝2.8Hz),2.16-2.11(1H,m),1.00-0.92(4H,m)。
实施例53：(S)-5-(3-氟-2-甲基苯基)-N-羟基-1-异丙基-1,4,5,6-四氢环戊并[c]吡唑-5-甲酰胺
起始于中间体3按照如实施例50和51所述的方法制备。仅分离了一种区域异构体。制备性HPLC得到标题化合物，其为白色固体(5mg)。LCMS(ES+)318(M+H)+,RT 8.89(分析方法2)；1H NMRδ(ppm)(DMSO-d6):10.18(1H,s),8.77(1H,br s),7.20-6.90(4H,m),4.40-4.30(1H,m),3.74(1H,d,J＝16Hz),3.30(1H,d,J＝16Hz),3.02(1H,d,J＝16Hz),2.98(1H,d,J＝16Hz),2.15(3H,d,J＝2.8Hz),1.35(6H,d,J＝6.8Hz)。
实施例54：(R)-4-(3-氟-2-甲基苯基)-N-羟基-1-苯基-1,4,5,6-四氢环戊并[c]吡唑-4-甲酰胺
按照如实施例48和49所述的方法制备。仅分离了一种区域异构体。制备性HPLC得到标题化合物，其为白色固体(11mg)。LCMS(ES+)352(M+H)+,RT 9.08(分析方法3)。1H NMRδ(ppm)(DMSO-d6):10.21(1H,s),8.80(1H,br s),8.78(1H,s),7.76-7.66(3H,m),7.55-7.47(2H,m),7.35-7.30(1H,m),7.22-7.14(1H,m),7.13-7.04(2H,m),3.95-3.80(1H,m),3.22-3.12(1H,m),3.11-3.02(1H,m),2.42-2.33(1H,m),2.15(3H,s)。
实施例55：(S)-6-(3-氟-2-甲基苯基)-2-(4-氟苯基)-N-羟基-6,7-二氢-5H-环戊并[d]嘧啶-6-甲酰胺
起始于中间体3按照如实施例50和51所述的方法制备。仅分离了一种区域异构体。制备性HPLC得到标题化合物，其为灰白色固体(23mg)。
LCMS(ES+)382(M+H)+,RT 10.55(分析方法2)；1H NMRδ(ppm)(DMSO-d6):10.30(1H,s),8.80(1H,br s),8.72(1H,s),8.44-8.37(2H,m),7.38-7.28(2H,m),7.21-7.04(3H,m),3.95(1H,d,J＝17.2Hz),3.76(1H,d,J＝16.8Hz),3.47(1H,d,16.8Hz),3.29(1H,d,J＝17.2Hz),2.26-2.20(3H,s)。
实施例56：(S)-6-(3-氟-2-甲基苯基)-N-羟基-2-(三氟甲基)-6,7-二氢-5H-环戊并[d]嘧啶-6-甲酰胺
起始于中间体3按照如实施例50和51所述的方法制备。仅分离了一种区域异构体。制备性HPLC得到标题化合物，其为无色固体(35mg)。
LCMS(ES+)356(M+H)+,RT 3.40(分析方法1)；1H NMRδ(ppm)(DMSO-d6):10.30(1H,s),8.87(2H,s),7.23-7.14(1H,m),7.14-7.05(2H,m),4.02-3.97(1H,m),3.85-3.80(1H,m),3.60-3.56(1H,m),3.46-3.42(1H,m),2.20(3H,s)。
实施例57：(R)-2-环丙基-5-(3-氟-2-甲基苯基)-N-羟基-6,7-二氢-5H-环戊并[d]嘧啶-5-甲酰胺
起始于中间体3按照如实施例50和51所述的方法制备。仅分离了一种区域异构体。制备性HPLC得到标题化合物，其为无色固体(21mg)。
LCMS(ES+)328(M+H)+,RT 3.17(分析方法1),1H NMRδ(ppm)(CH3OH-d4):8.59(1H,s),7.16-7.00(2H,m),6.54(1H,d,J＝7.8Hz),3.56-3.44(1H,m),3.18-3.06(1H,m),2.98-2.85(1H,m),2.32-2.23(4H,m),2.11-2.05(1H,m),1.22-1.09(4H,m),未观察到两个可交换的质子。
实施例58和59：(S)-1-环丙基-5-(3-氟-2-甲基苯基)-N-羟基-1,4,5,6-四氢环戊并[c]吡唑-5-甲酰胺和(R)-1-环丙基-4-(3-氟-2-甲基苯基)-N-羟基-1,4,5,6-四氢环戊并[c]吡唑-4-甲酰胺
起始于中间体3按照如实施例50和51所述的方法制备。制备性HPLC得到(S)-1-环丙基-5-(3-氟-2-甲基苯基)-N-羟基-1,4,5,6-四氢环戊并[c]吡唑-5-甲酰胺，其为白色固体(10mg)。LCMS(ES+)316(M+H)+,RT 7.86(分析方法3)。1H NMRδ(ppm)(DMSO-d6):10.19(1H,s),8.78(1H,s),7.20-7.01(4H,m),3.76(1H,d,J＝16Hz),3.53-3.45(1H,m),3.26(1H,d,J＝14.8Hz),3.05(1H,d,J＝16Hz),2.95(1H,d,J＝14.8Hz),2.18-2.11(3H,m),0.97-0.87(4H,m)。得到(R)-1-环丙基-4-(3-氟-2-甲基苯基)-N-羟基-1,4,5,6-四氢环戊并[c]吡唑-4-甲酰胺，其为白色固体(8mg)。LCMS(ES+)316(M+H)+,RT 8.22(分析方法3)。1H NMRδ(ppm)(DMSO-d6):10.07(1H,s),8.68(1H,s),7.39(1H,s),7.18-7.09(1H,m),7.09-7.02(2H,m),3.80(1H,ddd,J＝13.1,8.7,3.9Hz),3.56-3.48(1H,m),2.91-2.81(1H,m),2.77-2.67(1H,m),2.31-2.21(1H,m),2.10(3H,d,＝16Hz),1.04-0.90(4H,m)。
实施例60：(S)-6-(3-氟-2-甲基苯基)-N-羟基-2-(吡啶-3-基)-6,7-二氢-5H-环戊并[d]嘧啶-6-甲酰胺
起始于中间体3按照如实施例50和51所述的方法制备。仅分离了一种区域异构体。制备性HPLC得到标题化合物，其为白色固体(9mg)。
LCMS(ES+)365(M+H)+,RT 2.50(分析方法1)；1H NMRδ(ppm)(DMSO-d6):10.32(1H,s),9.5(1H,s),8.89(1H,s),8.8(1H,s),8.72-8.64(2H,m),8.64(1H,s),7.60-7.53(1H,m),7.21-7.06(2H,m),4.03-3.97(1H,m),3.84-3.76(1H,m),3.57-3.41(2H,m),2.24-2.19(3H,s)。
实施例61和62：E1-(abs)-5-(3-氟-2-甲基苯基)-2-(2-氟苯基)-N-羟基-5,6-二氢-4H-环戊并[d]噻唑-5-甲酰胺和E2-(abs)-5-(3-氟-2-甲基苯基)-2-(2-氟苯基)-N-羟基-5,6-二氢-4H-环戊并[d]噻唑-5-甲酰胺。
步骤1：(±)-5-(3-氟-2-甲基苯基)-2-(2-氟苯基)-5,6-二氢-4H-环戊并[d]噻唑-5-羧酸甲酯
向中间体11(500mg,1.52mmol)在乙醇(5mL)中的溶液中加入2-氟硫代苯甲酰胺(283mg,1.82mmol)。将反应混合物在微波辐射下加热至110℃且保持1h。将反应混合物浓缩得到黄色胶状物。将粗反应物质经快速硅胶色谱纯化(梯度洗脱0-40％EtOAc/异己烷)得到标题化合物，其为淡黄色胶状物(190mg,0.49mmol,32％)。LCMS(ES+)386(M+H)+；1H NMRδ(ppm)(400MHz,CDCl3):8.20(1H,dt,J＝7.9,7.5Hz),7.24-7.10(5H,m),7.00-6.96(1H,m),4.01(1H,d,J＝16.0Hz),3.85(1H,d,J＝16.0Hz),3.74(3H,s),3.49(1H,d,J＝16.0Hz),3.39(1H,d,J＝16.0Hz),2.20(3H,d,J＝2.7Hz)。
步骤2：(±)-5-(3-氟-2-甲基苯基)-2-(2-氟苯基)-5,6-二氢-4H-环戊并[d]噻唑-5-羧酸
将(±)-5-(3-氟-2-甲基苯基)-2-(2-氟苯基)-5,6-二氢-4H-环戊并[d]噻唑-5-羧酸甲酯(180mg,0.46mmol)、甲醇(5mL)和NaOH(3.75M在水中,1.25mL,4.69mmol)在密封管中混合并加热至65℃且保持18h。将黄色反应混合物真空浓缩。将残留物溶于H2O(20mL)并用1M HCl将溶液调节至pH 7。将水性混合物用EtOAc(2×20mL)萃取，将有机萃取物干燥(MgSO4)并真空浓缩。将残留物经快速硅胶色谱纯化(梯度洗脱0-100％EtOAc/异己烷)得到标题化合物，其为黄色胶状物(180mg,0.49mmol,98％)，所述胶状物无需进一步纯化即使用。
步骤3：E2-(abs)-5-(3-氟-2-甲基苯基)-2-(2-氟苯基)-N-羟基-5,6-二氢-4H-环戊并[d]噻唑-5-甲酰胺和E1-(abs)-5-(3-氟-2-甲基苯基)-2-(2-氟苯基)-N-羟基-5,6-二氢-4H-环戊并[d]噻唑-5-甲酰胺
将5-(3-氟-2-甲基苯基)-2-(2-氟苯基)-5,6-二氢-4H-环戊并[d]噻唑-5-羧酸(180mg,0.485mmol)、TFFH(148mg,0.56mmol)、DMF(2mL)和三乙胺(2mL)混合并搅拌1h。然后加入O-(四氢-2H-吡喃-2-基)羟胺(130mg,0.71mmol)并继续搅拌1天。将挥发性溶剂真空除去。加入MeOH(2mL)和2N HCl在Et2O(2mL)中的溶液并将反应混合物搅拌30min。将挥发性溶剂真空除去并将残留的粗物质经制备性HPLC和手性HPLC纯化得到标题化合物，其为灰白色固体(Chiralpak IA,方法50/50IPA/MeOH(50/50/0.1％甲酸)/庚烷1.0mL/min,RT5.55min(指定的E2-(abs)-对映异构体)和20.58min(指定的E1-(abs)-对映异构体)。E2-(abs)-5-(3-氟-2-甲基苯基)-2-(2-氟苯基)-N-羟基-5,6-二氢-4H-环戊并[d]噻唑-5-甲酰胺(27mg)。LCMS(ES+)387(M+H)+,RT 10.82min(分析方法2)；1H NMRδ(ppm)(400MHz,DMSO-d6):10.27(1H,s),8.82(1H,s),8.13(1H,td,J＝7.8,1.8Hz),7.51-7.44(1H,m),7.41-7.28(2H,m),7.19-7.02(3H,m),3.77(2H,dd,J＝16.0,11.9Hz),3.40(1H,d,J＝16.5Hz),3.21(1H,d,J＝16.0Hz),2.15(3H,d,J＝2.7Hz)；和E1-(abs)-5-(3-氟-2-甲基苯基)-2-(2-氟苯基)-N-羟基-5,6-二氢-4H-环戊并[d]噻唑-5-甲酰胺(32mg)。LCMS(ES+)387(M+H)+,RT 10.82min(分析方法2)；1H NMRδ(ppm)(400MHz,DMSO-d6):10.27(1H,s),8.82(1H,s),8.13(1H,td,J＝7.8,1.8Hz),7.51-7.44(1H,m),7.41-7.28(2H,m),7.19-7.02(3H,m),3.77(2H,dd,J＝16.0,11.9Hz),3.40(1H,d,J＝16.5Hz),3.21(1H,d,J＝16.0Hz),2.15(3H,d,J＝2.7Hz)。
实施例63：5-(3-氟-2-甲基苯基)-N-羟基-2-(3-(三氟甲基)苄基)-5,6-二氢-4H-环戊并[d]噻唑-5-甲酰胺
按照与实施例61和62相同的方法制备。经制备性HPLC纯化得到标题化合物，其为灰白色固体(12mg)。LCMS(ES+)451(M+H)+,RT 11.05min(分析方法2)；1H NMRδ(ppm)(DMSO-d6):10.22(1H,s),8.80(1H,s),7.72(1H,s),7.67-7.61(2H,m),7.61-7.54(1H,m),7.19-7.11(1H,m),7.11-7.01(2H,m),4.41(2H,s),3.65(2H,d,J＝15.6Hz),3.26(1H,d,J＝16.0Hz),3.09(1H,d,J＝15.6Hz),2.13(3H,d,J＝2.7Hz)。
实施例64和65：E1-(abs)-5-(3-氟-2-甲基苯基)-2-(3-氟苯基)-N-羟基-5,6-二氢-4H-环戊并[d]噻唑-5-甲酰胺和E2-(abs)-5-(3-氟-2-甲基苯基)-2-(3-氟苯基)-N-羟基-5,6-二氢-4H-环戊并[d]噻唑-5-甲酰胺
按照与实施例61和62相同的方法制备。经制备性HPLC和手性HPLC纯化得到标题化合物，其为灰白色固体(分别为30mg和24mg)(Chiralpak IA,方法50/50IPA/MeOH(50/50/0.1％甲酸)/庚烷1.0mL/min,RT 6.73min(指定的E2-(abs)-对映异构体)和17.40min(指定的E1-(abs)-对映异构体))；E2-(abs)-对映异构体:LCMS(ES+)387(M+H)+,RT 10.90min(分析方法2)；1H NMRδ(ppm)(DMSO-d6):10.27(1H,s),8.82(1H,s),7.71-7.61(2H,m),7.54-7.47(1H,m),7.28(1H,td,J＝8.5,2.7Hz),7.18-7.02(3H,m),3.75(2H,dd,J＝21.0,16.4Hz),3.31(1H,d,J＝16.4Hz),3.20(1H,d,J＝15.6Hz),2.15(3H,d,J＝2.7Hz)。E1-(abs)-对映异构体:LCMS(ES+)387(M+H)+,RT 10.90min(分析方法2)；1H NMRδ(ppm)(DMSO-d6):10.27(1H,s),8.82(1H,s),7.71-7.61(2H,m),7.54-7.47(1H,m),7.28(1H,td,J＝8.5,2.7Hz),7.18-7.02(3H,m),3.75(2H,dd,J＝21.0,16.4Hz),3.31(1H,d,J＝16.4Hz),3.20(1H,d,J＝15.6Hz),2.15(3H,d,J＝2.7Hz)。
实施例66：(R)-5-(3-氟-2-甲基苯基)-2-(4-氟苯基)-N-羟基-5,6-二氢-4H-环戊并[d]噻唑-5-甲酰胺
起始于中间体15按照与实施例61和62相同的方法制备。经制备性HPLC纯化得到标题化合物，其为白色固体(54mg)。LCMS(ES+)387(M+H)+,RT 10.85min(分析方法2)；1H NMRδ(ppm)(DMSO-d6):10.29(1H,s),8.84(1H,s),7.95-7.89(2H,m),7.32(2H,t,J＝8.8Hz),7.21-7.05(3H,m),3.76(2H,t,J＝17.7Hz),3.37(1H,d,J＝16.5Hz),3.20(1H,d,J＝15.5Hz),2.17(3H,d,J＝2.7Hz)。
实施例65和67：(R)-5-(3-氟-2-甲基苯基)-2-(4-氟苯基)-N-羟基-5,6-二氢-4H-环戊并[d]噻唑-5-甲酰胺和(S)-5-(3-氟-2-甲基苯基)-2-(4-氟苯基)-N-羟基-5,6-二氢-4H-环戊并[d]噻唑-5-甲酰胺
步骤1：5-(3-氟-2-甲基苯基)-2-(4-氟苯基)-5,6-二氢-4H-环戊并[d]噻唑-5-羧酸甲酯
将中间体12(50mg,0.14mmol)、4-氟苯基硼酸(20.6mg,0.15mmol)、四(三苯基膦)钯(0)(23.6mg,0.02mmol)和Cs2CO3(278mg,0.85mmol)在二噁烷(0.6mL)和水(0.1mL)中的混悬液用氮气净化并在100℃搅拌17h。将混合物经快速硅胶色谱纯化(梯度洗脱0％至100％EtOAc/异己烷)得到标题化合物，其为淡黄色液体(15mg,39μmol,29％)。
步骤2：5-(3-氟-2-甲基苯基)-2-(4-氟苯基)-5,6-二氢-4H-环戊并[d]噻唑-5-羧酸
将5-(3-氟-2-甲基苯基)-2-(4-氟苯基)-5,6-二氢-4H-环戊并[d]噻唑-5-羧酸甲酯(50mg,0.13mmol)和KOH(111mg,1.98mmol)在MeOH(1mL)中的混悬液在65℃搅拌16h。使用1M HCl将反应混合物酸化至pH 1，然后用DCM(20mL)萃取。将有机层通过相分离器干燥并浓缩得到40mg黄色液体，其无需进一步纯化即使用。
步骤3：(R)-5-(3-氟-2-甲基苯基)-2-(4-氟苯基)-N-羟基-5,6-二氢-4H-环戊并[d]噻唑-5-甲酰胺和(S)-5-(3-氟-2-甲基苯基)-2-(4-氟苯基)-N-羟基-5,6-二氢-4H-环戊并[d]噻唑-5-甲酰胺
在室温将5-(3-氟-2-甲基苯基)-2-(4-氟苯基)-5,6-二氢-4H-环戊并[d]噻唑-5-羧酸(～40mg来自上一步的混合物)在DCM(1mL)中的搅拌溶液用草酰氯(10μL,0.12mmol)和DMF(10μL)处理并搅拌30min直到不再冒泡。加入MeCN(1mL)和羟胺水溶液(50wt％羟胺,20μL,0.33mmol)并将反应混合物在微波辐射下加热至100℃且保持10min。将混合物浓缩并经制备性HPLC和手性制备性HPLC纯化得到标题化合物(分别为15mg和19mg)(Chiralpak IA,方法50/50IPA/MeOH(50/50/0.1％甲酸)/庚烷1.0mL/min,RT 6.1min((R)-对映异构体)和18.0min((S)-对映异构体)。(R)-对映异构体LCMS(ES+)387(M+H)+,RT 10.85min(分析方法2)；1H NMRδ(ppm)(DMSO-d6):10.29(1H,s),8.84(1H,s),7.95-7.89(2H,m),7.32(2H,t,J＝8.8Hz),7.21-7.05(3H,m),3.76(2H,t,J＝17.7Hz),3.37(1H,d,J＝16.5Hz),3.20(1H,d,J＝15.5Hz),2.17(3H,d,J＝2.7Hz)。(S)-对映异构体:LCMS(ES+)387(M+H)+,RT 10.85min(分析方法2)；1H NMRδ(ppm)(DMSO-d6):10.29(1H,s),8.84(1H,s),7.96-7.90(2H,m),7.32(2H,t,J＝8.8Hz),7.20-7.05(3H,m),3.76(2H,t,J＝17.7Hz),3.37(2H,d,J＝16.5Hz),3.20(1H,d,J＝15.5Hz),2.17(3H,d,J＝2.7Hz)。
实施例68：(S)-5-(3-氟-2-甲基苯基)-N-羟基-2-(1-甲基-1H-吡唑-5-基)-5,6-二氢-4H-环戊并[d]噻唑-5-甲酰胺
步骤1：(S)-5-(3-氟-2-甲基苯基)-2-(1-甲基-1H-吡唑-5-基)-5,6-二氢-4H-环戊并[d]噻唑-5-羧酸甲酯
将1-甲基-5-(4,4,5,5-四甲基-1,3,2-二氧杂硼杂环戊烷-2-基)-1H-吡唑(529mg,2.54mmol)、中间体14(620mg,1.67mmol)、四(三苯基膦)钯(0)(93mg,80μmol)和CsF(398mg,2.62mmol)在DME(11mL)和MeOH(2.7mL)中的混悬液用氮气净化并在微波反应器中在120℃搅拌10min。将混合物浓缩并经快速硅胶色谱纯化(梯度洗脱0％至100％EtOAc/异己烷)得到标题化合物，其为不纯的棕色油状物(548mg)，所述油状物无需进一步纯化即使用。
步骤2：(S)-5-(3-氟-2-甲基苯基)-2-(1-甲基-1H-吡唑-5-基)-5,6-二氢-4H-环戊并[d]噻唑-5-羧酸
将(S)-5-(3-氟-2-甲基苯基)-2-(1-甲基-1H-吡唑-5-基)-5,6-二氢-4H-环戊并[d]噻唑-5-羧酸甲酯(548mg,来自上一步)和KOH(876mg,15.6mmol)在MeOH(6mL)中的溶液在密封管中在70℃搅拌17h。使用10％HCl将混合物酸化至pH 0，用DCM(2×20mL)萃取，干燥(相分离器)且浓缩。得到标题化合物，其为不纯的棕色油状物(451mg)，所述油状物无需进一步纯化即使用。
步骤3：(S)-5-(3-氟-2-甲基苯基)-N-羟基-2-(1-甲基-1H-吡唑-5-基)-5,6-二氢-4H-环戊并[d]噻唑-5-甲酰胺
在0℃在氮气下将(S)-5-(3-氟-2-甲基苯基)-2-(1-甲基-1H-吡唑-5-基)-5,6-二氢-4H-环戊并[d]噻唑-5-羧酸(451mg,来自上一步)和三乙胺(0.53mL,3.80mmol)在无水DMF(12mL)中的搅拌溶液用TFFH(451mg,1.71mmol)处理。在室温搅拌40min后，将混合物冷却至0℃并加入O-(四氢-2H-吡喃-2-基)羟胺(240mg,2.05mmol)。将混合物在室温搅拌18h，然后用MeOH(15mL)稀释并用HCl(4M在二噁烷中的溶液,6mL)处理。在室温保持1.5h后，将反应混合物用EtOAc(30mL)稀释并用H2O(2×20mL)洗涤。将合并的水性洗涤液用EtOAc(2×20mL)萃取，将合并的有机层用H2O(20mL)洗涤，干燥(相分离器)且浓缩。LCMS分析显示靶标物质残留在水性洗涤液中，因此将其用盐水(30mL)处理并用EtOAc(3×20mL)萃取。对水层的LCMS分析显示靶标物质不再残留。将有机萃取物干燥(相分离器)，浓缩并与先前的有机残留物合并。将该混合物经制备性HPLC纯化得到标题化合物(140mg)，其为白色固体。LCMS(ES+)373(M+H)+,RT 9.75min(分析方法3)；1H NMRδ(ppm)(400MHz,DMSO-d6):10.30(1H,s),8.85(1H,s),7.50(1H,d,J＝2.1Hz),7.23-7.12(2H,m),7.10-7.05(1H,m),6.75(1H,d,J＝2.1Hz),4.12(3H,s),3.79(2H,d,J＝16.0Hz),3.41(1H,d,J＝16.6Hz),3.21(1H,d,J＝15.5Hz),2.18(3H,d,J＝2.7Hz)。
实施例69：(R)-5-(3-氟-2-甲基苯基)-N-羟基-2-(1-甲基-1H-吡唑-5-基)-5,6-二氢-4H-环戊并[d]噻唑-5-甲酰胺
起始于中间体16按照与实施例68相同的方法制备。制备性HPLC得到标题化合物，其为白色固体(133mg)。LCMS(ES+)373(M+H)+,RT 9.55min(分析方法2)；1H NMRδ(ppm)(400MHz,DMSO-d6):10.30(1H,s),8.85(1H,s),7.50(1H,d,J＝2.1Hz),7.23-7.12(2H,m),7.10-7.05(1H,m),6.75(1H,d,J＝2.1Hz),4.12(3H,s),3.79(2H,d,J＝16.0Hz),3.41(1H,d,J＝16.6Hz),3.21(1H,d,J＝15.5Hz),2.18(3H,d,J＝2.7Hz)。
实施例70：(R)-2-(1,3-二甲基-1H-吡唑-5-基)-5-(3-氟-2-甲基苯基)-N-羟基-5,6-二氢-4H-环戊并[d]噻唑-5-甲酰胺
起始于中间体16按照如实施例68所述的方法制备。制备性HPLC得到标题化合物(54mg)。LCMS(ES+)387(M+H)+,RT 9.35min(分析方法2)；1H NMRδ(ppm)(DMSO-d6):10.27(1H,s),8.82(1H,d,J＝1.6Hz),7.22-7.04(3H,m),6.48-6.44(1H,m),3.83-3.61(5H,m),3.28(1H,dd,J＝4.9,1.2Hz),3.18(1H,dd,J＝13.5,11.0Hz),2.49-2.14(3H,m),2.18-2.14(3H,m)。
实施例71：(R)-5-(3-氟-2-甲基苯基)-N-羟基-2-(5-甲氧基吡啶-2-基)-5,6-二氢-4H-环戊并[d]噻唑-5-甲酰胺
步骤1：(R)-5-(3-氟-2-甲基苯基)-2-(5-氟吡啶-2-基)-5-((甲基过氧基)甲基)-5,6-二氢-4H-环戊并[d]噻唑
向中间体15(500mg,1.52mmol)在乙醇(5mL)中的溶液中加入5-氟吡啶-2-硫代甲酰胺(356mg,2.28mmol)。将反应混合物在微波条件下加热至110℃且保持1h。将反应混合物浓缩得到暗红色胶状物。将粗反应物质经快速硅胶色谱纯化(梯度洗脱异己烷至40％EtOAc/异己烷)得到标题化合物，其为亮橙色胶状物(200mg,34％)。无需进一步纯化即继续。
步骤2：(R)-5-(3-氟-2-甲基苯基)-2-(5-甲氧基吡啶-2-基)-5,6-二氢-4H-环戊并[d]噻唑-5-羧酸
将(R)-5-(3-氟-2-甲基苯基)-2-(5-氟吡啶-2-基)-5-((甲基过氧基)甲基)-5,6-二氢-4H-环戊并[d]噻唑(160mg,0.41mmol)、甲醇(5mL)和15％NaOH水溶液(1.10mL,4.1mmol)在密封管中混合并加热至65℃且保持18h。将橙色反应混合物真空蒸发，然后用EtOAc和H2O稀释。将水层用1M HCl调节至pH 7并分离各层。将有机层干燥(MgSO4)并真空蒸发。将残留物经快速硅胶色谱纯化(梯度洗脱异己烷至100％EtOAc/异己烷)得到标题化合物，其为橙色固体(85mg,53％)。1H NMRδ(ppm)(CH3OH-d4):8.26(1H,dd,J＝20.1,2.9Hz),8.04(1H,dd,J＝20.1,8.8Hz),7.46(1H,dt,J＝8.8,3.0Hz),7.18-7.13(2H,m),7.01-6.94(1H,m),3.95-3.82(5H,m),3.53-3.42(1H,m),3.35(1H,d,J＝7.7Hz),2.27(3H,d,J＝2.7Hz)。未观察到酸OH。无需进一步纯化即以粗品形式使用。
步骤3：(R)-5-(3-氟-2-甲基苯基)-N-羟基-2-(5-甲氧基吡啶-2-基)-5,6-二氢-4H-环戊并[d]噻唑-5-甲酰胺
在0℃在氮气下将(R)-5-(3-氟-2-甲基苯基)-2-(5-甲氧基吡啶-2-基)-5,6-二氢-4H-环戊并[d]噻唑-5-羧酸(82mg,0.21mmol)和三乙胺(0.096mL,0.68mmol)在无水DMF(2mL)中的搅拌溶液用TFFH(81mg,0.31mmol)处理。在室温搅拌40min后，将混合物冷却至0℃并加入O-(四氢-2H-吡喃-2-基)羟胺(43mg,0.37mmol)。将混合物在室温搅拌18h，然后用MeOH(2mL)稀释并用HCl(4M在二噁烷中的溶液,1mL)处理。在室温保持1.5h后，将反应混合物用EtOAc(10mL)稀释并用H2O(2×10mL)洗涤。将合并的水性洗涤液用EtOAc(2×10mL)萃取，将合并的有机层用H2O(20mL)洗涤，干燥(相分离器)并浓缩。制备性HPLC得到标题化合物，其为灰白色固体(36mg)。
LCMS(ES+)400(M+H)+,RT 3.51min(分析方法1)。1H NMRδ(ppm)(DMSO-d6):10.26(1H,s),8.82(1H,s),8.30(1H,dd,J＝2.9,0.6Hz),7.97(1H,dd,J＝8.8,0.6Hz),7.50(1H,dd,J＝8.8,2.9Hz),7.21-7.03(3H,m),3.87(3H,s),3.73(2H,t,J＝15.6Hz),3.34(1H,d,J＝13.7Hz),3.18(1H,d,J＝15.6Hz),2.18-2.14(3H,m)。
实施例72：(S)-2-环丙基-6-(3-氟-2-甲基苯基)-N-羟基-5,6-二氢-4H-环戊并[d]噻唑-6-甲酰胺
步骤1：(S)-2-环丙基-6-(3-氟-2-甲基苯基)-5,6-二氢-4H-环戊并[d]噻唑-6-羧酸甲酯
将中间体10(0.114g,0.31mmol)、环丙基硼酸(0.029g,0.34mmol)、四(三苯基膦)钯(0.015g)和碳酸铯(0.5g,1.54mmol)在脱气的二噁烷/水混合物(9:1,10mL)中的混悬液在110℃搅拌16h。将反应混合物冷却至室温，用EtOAc(75mL)稀释并进行水性后处理。将有机层真空浓缩得到标题化合物，其为不纯的黄色油状物，所述油状物无需进一步纯化即用于下一步。
LCMS(ES+)332(M+H)+。
步骤2：(S)-2-环丙基-6-(3-氟-2-甲基苯基)-5,6-二氢-4H-环戊并[d]噻唑-6-羧酸
将(S)-2-环丙基-6-(3-氟-2-甲基苯基)-5,6-二氢-4H-环戊并[d]噻唑-6-羧酸甲酯(26mg,0.07mmol)、MeOH(2mL)和15％NaOH水溶液(0.5mL)在密封管中混合并加热至70℃且保持4天。将反应混合物冷却并蒸干。将残留物在1NHCl和EtOAc之间分配。将有机相干燥(MgSO4)并蒸干得到标题化合物，其为灰白色固体。LCMS(ES+)318(M+H)+。
步骤3：(S)-2-环丙基-6-(3-氟-2-甲基苯基)-N-羟基-5,6-二氢-4H-环戊并[d]噻唑-6-甲酰胺
将(S)-2-环丙基-6-(3-氟-2-甲基苯基)-5,6-二氢-4H-环戊并[d]噻唑-6-羧酸(53mg,0.16mmol)、TFFH(49mg,0.18mmol)、DMF(2mL)和三乙胺(0.12mL)混合并搅拌1h。然后加入O-(四氢-2H-吡喃-2-基)羟胺(22mg,0.184mmol)并继续搅拌1天。将挥发性溶剂真空除去。加入MeOH(1mL)和2N HCl在Et2O(1mL)中的溶液并将反应混合物搅拌30min。将挥发性溶剂真空除去并将残留的粗物质经制备性HPLC纯化得到(S)-2-环丙基-6-(3-氟-2-甲基苯基)-N-羟基-5,6-二氢-4H-环戊并[d]噻唑-6-甲酰胺(1mg)。LCMS(ES+)333(M+H)+,331(M-H)-,RT 9.68min(分析方法2)；1H NMR(400MHz,CHCl3-d)8.19(1H,s)7.03-6.86(3H,m),3.85-3.70(1H,m)3.05-2.95(1H,m)2.92-2.75(1H,m)2.50-2.38(1H,m),2.41-2.17(4H,m)1.20-0.90(4H,m)。未观察到OH共振信号。
实施例73：(S)-6-(3-氟-2-甲基苯基)-N-羟基-2-(邻甲苯基)-5,6-二氢-4H-环戊并[d]噻唑-6-甲酰胺
按照如实施例72所述的方法制备。制备性HPLC得到标题化合物，其为灰白色固体(4mg)。LCMS(ES+)383(M+H)+,RT 11.0min.(分析方法2)；1H NMRδ(ppm)(400MHz,DMSO-d6):10.55(1H,s),8.92(1H,s),7.76(1H,d,J＝7.4Hz),7.40-7.34(3H,m),7.21-7.09(2H,m),7.02(1H,dd,J＝7.8,7.8Hz),3.77-3.60(1H,m),3.06-2.83(2H,m),2.59(3H,s),2.43-2.31(1H,m),2.17(3H,d,J＝2.4Hz)。
实施例74和75：E1-(abs)-5-(3-氟-2-甲基苯基)-2-(4-氟-2-甲基苯基)-N-羟基-5,6-二氢-4H-环戊并[d]噻唑-5-甲酰胺和E2-(abs)-5-(3-氟-2-甲基苯基)-2-(4-氟-2-甲基苯基)-N-羟基-5,6-二氢-4H-环戊并[d]噻唑-5-甲酰胺
步骤1：5-(3-氟-2-甲基苯基)-2-(4-氟-2-甲基苯基)-5,6-二氢-4H-环戊并[d]噻唑-5-羧酸甲酯
将4-氟-2-甲基苯基硼酸(105mg,0.68mmol)、中间体12(188mg,0.51mmol)、四(三苯基膦)钯(0)(93mg,80μmol)和CsF(100mg,0.66mmol)在DME(3mL)和MeOH(0.75mL)中的混悬液用氮气净化并在微波反应器中在120℃搅拌10min。将混合物浓缩并经快速硅胶色谱纯化(梯度洗脱0％至100％EtOAc/异己烷)得到纯度为75％的标题化合物(79mg)，其为无色油状物，所述油状物无需进一步纯化即使用。
步骤2：5-(3-氟-2-甲基苯基)-2-(4-氟-2-甲基苯基)-5,6-二氢-4H-环戊并[d]噻唑-5-羧酸
向5-(3-氟-2-甲基苯基)-2-(4-氟-2-甲基苯基)-5,6-二氢-4H-环戊并[d]噻唑-5-羧酸甲酯(79mg来自上一步的混合物)在甲醇(2mL)中的溶液中加入KOH(122mg)。将反应混合物封盖并在70℃加热20h。然后将内容物冷却至室温并用10％HCl酸化至pH 0。将混合物用DCM(2×20mL)萃取，干燥(相分离柱)并浓缩得到纯度为85％的标题化合物(58mg)，其为棕色油状物，所述油状物无需进一步纯化即使用。
步骤3：E1-(abs)-5-(3-氟-2-甲基苯基)-2-(4-氟-2-甲基苯基)-N-羟基-5,6-二氢-4H-环戊并[d]噻唑-5-甲酰胺和E2-(abs)-5-(3-氟-2-甲基苯基)-2-(4-氟-2-甲基苯基)-N-羟基-5,6-二氢-4H-环戊并[d]噻唑-5-甲酰胺
在20℃将5-(3-氟-2-甲基苯基)-2-(4-氟-2-甲基苯基)-5,6-二氢-4H-环戊并[d]噻唑-5-羧酸(58mg来自上一步的混合物)在DCM(1mL)中的搅拌溶液先后用草酰氯(14μL)和DMF(10μL)处理。将混合物搅拌25min直到气体放出停止。加入MeCN(1mL)和羟胺(28μL)并将混合物在微波反应器中加热至100℃且保持10min。经制备性HPLC和手性制备性HPLC纯化得到随意指定的E1-(abs)和E2-(abs)-对映异构体(分别为1mg和2mg)(Chiralpak IA 50/50EtOH(0.1％甲酸)/庚烷,1.0mL/min,室温,RT 11.3min(E2-(abs))和6.1min(E1-(abs))。E2-(abs):LCMS(ES+)401(M+H)+,RT 4.06min(分析方法1)；1H NMRδ(ppm)(400MHz,DMSO-d6):10.31(1H,s),8.82(1H,s),7.76-7.71(1H,m),7.25(1H,dd,J＝2.4,10.0Hz),7.20-7.05(4H,m),3.90-3.76(2H,m),3.40-3.31(1H,m),3.26-3.17(1H,m),2.56(3H,s),2.21-2.18(3H,m)。E1-(abs):LCMS(ES+)401(M+H)+,RT 4.06min(分析方法1)；1H NMRδ(ppm)(400MHz,DMSO-d6):10.31(1H,s),8.82(1H,s),7.76-7.71(1H,m),7.25(1H,dd,J＝2.4,10.0Hz),7.20-7.05(4H,m),3.90-3.76(2H,m),3.40-3.31(1H,m),3.26-3.17(1H,m),2.56(3H,s),2.21-2.18(3H,m)。
实施例76和77：E1-(abs)-2-(1,5-二甲基-1H-吡唑-4-基)-5-(3-氟-2-甲基苯基)-N-羟基-5,6-二氢-4H-环戊并[d]噻唑-5-甲酰胺和E2-(abs)-2-(1,5-二甲基-1H-吡唑-4-基)-5-(3-氟-2-甲基苯基)-N-羟基-5,6-二氢-4H-环戊并[d]噻唑-5-甲酰胺
按照与实施例74和75相同的方法制备。经制备性HPLC和手性HPLC纯化得到随意指定的E1-(abs)和E2-(abs)-对映异构体(分别为3mg和5mg)(Chiralpak IC 50/50EtOH(0.1％甲酸)/庚烷,1.0mL/min,RT 6.1min(E1-(abs))和11.6min(E2-(abs))。E1-(abs)-对映异构体:LCMS(ES+)387(M+H)+,RT 3.15min(分析方法1)；1H NMRδ(ppm)(400MHz,DMSO-d6):10.28(1H,s),8.82(1H,s),7.74(1H,s),7.19-7.05(3H,m),3.78(3H,s),3.77-3.67(2H,m),3.14(1H,d,J＝15.8Hz),2.53(3H,s),2.21-2.16(3H,m),1个H被水掩蔽。E2-(abs)-对映异构体:LCMS(ES+)387(M+H)+,RT 3.16min(分析方法1)；1H NMRδ(ppm)(400MHz,DMSO-d6):10.28(1H,s),8.82(1H,s),7.74(1H,s),7.19-7.05(3H,m),3.78(3H,s),3.77-3.67(2H,m),3.14(1H,d,J＝15.8Hz),2.53(3H,s),2.21-2.16(3H,m),1个H被水共振信号掩蔽。
实施例78：(S)-6-(3-氟-2-甲基苯基)-2-(4-氟苯基)-N-羟基-5,6-二氢-4H-环戊并[d]噻唑-6-甲酰胺
按照与实施例72相同的方法制备。制备性HPLC得到标题化合物，其为白色固体(8mg)。LCMS(ES+)387(M+H)+,RT 3.8min(分析方法1)；1H NMRδ(ppm)(400MHz,DMSO-d6):10.57(1H,d,J＝1.4Hz),8.93-8.91(1H,m),8.02-7.97(2H,m),7.38-7.33(2H,m),7.21-7.09(2H,m),6.98(1H,d,J＝7.5Hz),3.73-3.65(1H,m),3.02-2.94(1H,m),2.91-2.82(1H,m),2.40-2.32(1H,m),2.16(3H,d,J＝2.4Hz)(针对主要的旋转异构体报道的数据)。
实施例79：(R)-5-(3-氟-2-甲基苯基)-3-(4-氟苯基)-N-羟基-2-甲基-2,4,5,6-四氢环戊并[c]吡唑-5-甲酰胺
步骤1：(R)-3-((二甲基氨基)亚甲基)-1-(3-氟-2-甲基苯基)-4-氧代环戊烷羧酸甲酯
将tBuOK(124mg,1.1mmol)和THF(6mL)在氮气气氛下混合。将反应混合物用冰浴冷却并逐滴加入甲酸乙酯(0.24mL,4mmol)。15min后，逐滴加入中间体2(250mg,1mmol)在甲酸乙酯(2mL)中的溶液。在冰浴冷却下将反应混合物再搅拌1h，然后用EtOAc稀释，先后用1NHCl和盐水洗涤，干燥(相分离器)并蒸干得到粗醛，其为淡棕色油状物。将粗残留物溶于无水THF(6mL)并加入二甲胺(2mL,4mmol,2M在THF中的溶液)。然后将反应混合物再搅拌36h。然后将反应混合物减压浓缩并经快速硅胶柱色谱纯化(梯度洗脱异己烷至66％EtOAc/异己烷)得到标题化合物，其为淡黄色固体(0.25g,83％,历经2步)。LCMS(ES+)306(M+H)+。
步骤2：(R)-1-(3-氟-2-甲基苯基)-3-(4-氟亚苄基)-4-氧代环戊烷羧酸甲酯
将(R)-3-((二甲基氨基)亚甲基)-1-(3-氟-2-甲基苯基)-4-氧代环戊烷羧酸甲酯(250mg,0.8mmol)和THF(5mL)在氮气气氛下混合。将反应混合物用冰浴冷却并逐滴加入4-氟苯基溴化镁(2mL,2mmol,1M在THF中的溶液)。在冰浴冷却下将反应混合物搅拌1h，然后用NH4Cl水溶液(2mL)淬灭。然后将溶液用EtOAc稀释，先后用水和盐水洗涤，干燥(相分离器)并蒸干并经快速硅胶柱色谱纯化(梯度洗脱异己烷至20％EtOAc/异己烷)得到标题化合物，其为无色固体(0.28g,95％)。LCMS(ES+)357(M+H)+。
步骤3：(5R)-5-(3-氟-2-甲基苯基)-3-(4-氟苯基)-2-甲基-2,3,3a,4,5,6-六氢环戊并[c]吡唑-5-羧酸甲酯
将(R)-1-(3-氟-2-甲基苯基)-3-(4-氟亚苄基)-4-氧代环戊烷羧酸甲酯(130mg,0.4mmol)、氯化铟(20mg,0.15mmol)、甲基肼(25μL,0.44mmol)和乙醇(6mL)在氮气气氛下混合。然后将反应混合物回流2h。然后将反应混合物冷却至室温并通过硅胶垫(用50％EtOAc/异己烷洗脱)得到粗酰肼，其为顺/反异构体的3:1混合物。LCMS(ES+)385(M+H)+。
步骤4：(R)-5-(3-氟-2-甲基苯基)-3-(4-氟苯基)-2-甲基-2,4,5,6-四氢环戊并[c]吡唑-5-羧酸甲酯
将(5R)-5-(3-氟-2-甲基苯基)-3-(4-氟苯基)-2-甲基-2,3,3a,4,5,6-六氢环戊并[c]吡唑-5-羧酸甲酯(80mg,0.2mmol)、DDQ(52mg,0.23mmol)和无水二噁烷(3mL)在氮气气氛下混合。然后将反应混合物回流2h。然后将反应混合物冷却至室温，减压浓缩并经快速硅胶柱色谱纯化(梯度洗脱异己烷至60％EtOAc/异己烷)得到标题化合物，其为淡黄色油状物(53mg,66％)。
LCMS(ES+)383(M+H)+。
步骤5：(R)-5-(3-氟-2-甲基苯基)-3-(4-氟苯基)-2-甲基-2,4,5,6-四氢环戊并[c]吡唑-5-羧酸
向(R)-5-(3-氟-2-甲基苯基)-3-(4-氟苯基)-2-甲基-2,4,5,6-四氢环戊并[c]吡唑-5-羧酸甲酯(52mg,0.14mmol)在THF/甲醇/水(1:1:0.5,2.5mL)中的溶液中加入氢氧化锂水合物(0.03g,0.70mmol)。将反应混合物封盖并在65℃加热18h。然后将内容物冷却至室温并减压除去甲醇。将水性残留物在EtOAc(15mL)和1M HCl水溶液(15mL)之间分配。将有机层萃取，用盐水(20mL)洗涤，干燥，过滤(相分离柱)并浓缩得到标题化合物，其为淡黄色油状物，所述油状物直接使用(42mg,84％)。
步骤6：(R)-5-(3-氟-2-甲基苯基)-3-(4-氟苯基)-N-羟基-2-甲基-2,4,5,6-四氢环戊并[c]吡唑-5-甲酰胺
在0℃向(R)-5-(3-氟-2-甲基苯基)-3-(4-氟苯基)-2-甲基-2,4,5,6-四氢环戊并[c]吡唑-5-羧酸(0.40g,1.1mmol)和三乙胺(0.33g,468μL,3.3mmol)在无水DMF(10mL)中的溶液中加入TFFH(0.36g,1.42mmol)。将反应混合物在该温度搅拌15min，然后一次性加入O-(四氢-2H-吡喃-2-基)羟胺(0.2g,1.67mmol)。然后将反应混合物在室温搅拌24h。然后通过加入1M HCl溶液(5mL)淬灭反应混合物。将反应混合物在EtOAc(30mL)和1M HCl(15mL)之间分配。分离有机层，用盐水(40mL)洗涤，干燥，过滤(相分离柱)并浓缩得到粗的经THP保护的异羟肟酸，其为淡黄色油状物。向该油状物中加入无水甲醇(3mL)和4M HCl在二噁烷(2mL)中的溶液。将反应混合物在室温搅拌30min。然后减压除去溶剂得到粗异羟肟酸，将其经制备性HPLC纯化得到标题化合物，其为无色固体(20mg)。LCMS(ES+)384(M+H)+,RT 3.43min(分析方法1)；1H NMRδ(ppm)(DMSO-d6):10.19(1H,s),8.76(1H,s),7.58-7.53(2H,m),7.38-7.32(2H,m),7.14(1H,t,J＝7.3Hz),7.04(2H,t,J＝7.8Hz),3.78(3H,s),3.64-3.53(2H,m),3.02(1H,d,J＝7.2Hz),2.98(1H,d,J＝7.6Hz),2.16(3H,d,J＝2.7Hz)。
实施例80和81：E1-(abs)-5-(3-氟-2-甲基苯基)-N-羟基-3-苯基-5,6-二氢-4H-环戊并[d]异噻唑-5-甲酰胺和E2-(abs)-5-(3-氟-2-甲基苯基)-N-羟基-3-苯基-5，6-二氢-4H-环戊并[d]异噻唑-5-甲酰胺
步骤1：5-苯基-1,3,4-氧杂噻唑-2-酮
向酰胺(24.8mmol)在THF(50mL)中的搅拌溶液中加入氯羰基硫基氯(29.8mmol)。将溶液在室温搅拌17h，真空浓缩。经快速色谱纯化(5％EtOAc/异己烷)得到标题化合物，其为灰白色固体(3.9g,88％)。
LCMS(ES+)180(M+H)+
步骤2：3-苯基异噻唑-4,5-二羧酸二甲酯
将5-苯基-1,3,4-氧杂噻唑-2-酮(12.7mmol)和乙炔二羧酸二甲酯(38.1mmol)在CHCl3(10mL)中的溶液在微波中在160℃加热1h或直到气体放出停止。然后将混合物浓缩并经快速色谱纯化(5％EtOAc/异己烷)得到标题化合物，其为无色油状物(3.09g,88％)。LCMS(ES+)278(M+H)+
步骤3：(3-苯基异噻唑-4,5-二基)二甲醇
历时10min向3-苯基异噻唑-4,5-二羧酸二甲酯(10.7mmol)在THF(180mL)中的冷却溶液中加入Super-Hydride(53.3mmol)，然后将反应混合物在室温搅拌1.5h。将混合物用1M HCl(70mL)淬灭，体积减小至一半并在EtOAc中萃取。将水相再次用另外部分的EtOAc萃取并合并有机相，干燥(MgSO4)，过滤且浓缩。经快速色谱纯化(5％至15％MeOH/DCM梯度)得到标题化合物，其为无色油状物(2.36g,>99％)。LCMS(ES+)222(M+H)+
步骤4：4,5-二(溴甲基)-3-苯基异噻唑
向(3-苯基异噻唑-4,5-二基)二甲醇(13.6mmol)在DCM/Et2O(1:1,100mL)中的搅拌溶液中逐滴加入三溴化磷(27.2mmol)。将混合物加热至30℃且保持3h。将混合物用H2O(50mL)稀释并将挥发物浓缩，然后用DCM(2×50mL)萃取。将合并的有机相通过相分离器且浓缩。经快速色谱纯化(5％EtOAc/异己烷)得到标题化合物，其为无色油状物(3.02g,64％)。LCMS(ES+)348(M+H)+
步骤5：5-(3-氟-2-甲基苯基)-3-苯基-5,6-二氢-4H-环戊并[d]异噻唑-5-羧酸甲酯
向2-(3-氟-2-甲基苯基)乙酸甲酯(5.4mmol)在DMF(200mL)中的搅拌溶液中加入NaH(5.4mmol)。将其在不时的加热下搅拌1h直到不再观察到有氢气放出。然后在0℃将该溶液缓慢逐滴加到4,5-二(溴甲基)-3-苯基异噻唑(4.9mmol)在DMF(200mL)中的搅拌溶液中。加入另一份NaH(5.4mmol)并将反应混合物加热至60℃且保持1h。加入另一份NaH(5.4mmol)并继续搅拌1h。将反应混合物用H2O(在冰浴中)淬灭并将挥发物减压除去。将剩余的残留物在EtOAc和H2O之间分配。收集有机相，干燥(MgSO4)，过滤且浓缩。经快速色谱纯化(3％至5％EtOAc/异己烷)得到标题化合物(125mg,7％)。LCMS(ES+)367(M+H)+
步骤6：5-(3-氟-2-甲基苯基)-3-苯基-5,6-二氢-4H-环戊并[d]异噻唑-5-羧酸
向5-(3-氟-2-甲基苯基)-3-苯基-5,6-二氢-4H-环戊并[d]异噻唑-5-羧酸甲酯(97mg,0.26mmol)在THF/甲醇(1:1,2mL)中的溶液中加入氢氧化钠(2.0mL,2M水溶液)。将反应混合物封盖并在70℃加热18h。然后将内容物冷却至室温并减压除去甲醇。将水性残留物在EtOAc(15mL)和1M HCl水溶液(15mL)之间分配。将有机层萃取，用盐水(20mL)洗涤，干燥，过滤(相分离柱)并浓缩得到标题化合物，其为无色油状物，所述油状物直接用于下一步(60mg,65％)。
步骤7：E1-(abs)-5-(3-氟-2-甲基苯基)-N-羟基-3-苯基-5,6-二氢-4H-环戊并[d]异噻唑-5-甲酰胺和E2-(abs)-5-(3-氟-2-甲基苯基)-N-羟基-3-苯基-5,6-二氢-4H-环戊并[d]异噻唑-5-甲酰胺
在0℃向5-(3-氟-2-甲基苯基)-3-苯基-5,6-二氢-4H-环戊并[d]异噻唑-5-羧酸(60mg,来自上一步)、三乙胺(92μl,0.65mmol)在无水DMF(1mL)中的溶液中加入TFFH(49mg,0.19mmol)。将反应混合物在该温度搅拌15min，然后一次性加入O-(四氢-2H-吡喃-2-基)羟胺(39mg,0.34mmol)。然后将反应混合物在室温搅拌24h。然后通过加入1M HCl溶液(2mL)将反应混合物淬灭。将反应混合物在EtOAc(5mL)和1M HCl(5mL)之间分配。分离有机层，用盐水(10mL)洗涤，干燥，过滤(相分离柱)并浓缩得到粗的经THP保护的异羟肟酸，其为淡黄色油状物。向该油状物中加入无水甲醇(2mL)和4M HCl在二噁烷(1mL)中的溶液。将反应混合物在室温搅拌30min。然后将溶剂减压除去得到粗异羟肟酸，将其经制备性HPLC和手性HPLC纯化得到随意指定的E1-(abs)和E2-(abs)-对映异构体(分别为2mg和3mg)(Chiralpak IC40/60 IPA/MeOH(50/50/0.1％甲酸)/庚烷,1.0mL/min,RT 13.2min(E1-(abs))和4.9min(E2-(abs))。E1-(abs)：LCMS(ES+)369(M+H)+,RT 3.77min(分析方法1)；1H NMRδ(ppm)(DMSO-d6):10.3(1H,s),8.84(1H,s),7.90-7.85(2H,m),7.55-7.40(3H,m),7.20-7.00(3H,m),3.95(1H,d,J＝15.2Hz),3.92(1H,d,J＝17.2Hz),3.45(1H,d,J＝17.2Hz),3.42(1H,d,J＝15.2Hz),2.17(3H,d,J＝2.4Hz)。E2-(abs)：LCMS(ES+)369(M+H)+,RT 3.77min(分析方法1)；1H NMRδ(ppm)(DMSO-d6):10.3(1H,s),8.84(1H,s),7.90-7.85(2H,m),7.55-7.40(3H,m),7.20-7.00(3H,m),3.95(1H,d,J＝15.2Hz),3.92(1H,d,J＝17.2Hz),3.45(1H,d,J＝17.2Hz),3.42(1H,d,J＝15.2Hz),2.17(3H,d,J＝2.4Hz)。
实施例82：2-(3-氟-2-甲基苯基)-N-羟基-2,3-二氢-1H-茚-2-甲酰胺
步骤1：2-(3-氟-2-甲基苯基)-2,3-二氢-1H-茚-2-甲腈
向2-(3-氟-2-甲基苯基)乙腈(0.298g,2.0mmol)在DMF(30mL)中的溶液中加入在室温在氮气下搅拌30min的NaH(0.176g,4.4mmol)，加入α,α’-二溴-邻二甲苯(0.58g,2.2mmol)并将反应混合物在室温在氮气下搅拌92h。加入饱和NH4Cl溶液(30mL)，用EtOAc(3×30mL)萃取。将合并的有机相用盐水(20mL)萃取。然后干燥EtOAc层，过滤(相分离柱)并在硅胶上浓缩并经快速硅胶柱色谱纯化(梯度洗脱异己烷至100％EtOAc/异己烷)得到标题化合物，其为淡黄色油状物(0.098g,19％)。LCMS(ES+)252(M+H)+
步骤2：2-(3-氟-2-甲基苯基)-2,3-二氢-1H-茚-2-羧酸
将2-(3-氟-2-甲基苯基)-2,3-二氢-1H-茚-2-甲腈(98mg,0.39mmol)溶于二噁烷(2mL)并加入4M HCl在二噁烷(1mL)中的溶液。将混合物在120℃搅拌96h得到标题化合物，其为白色固体(63mg,97％)并以粗品形式用于下一步。LCMS(ES+)271(M+H)+。
步骤3：2-(3-氟-2-甲基苯基)-N-羟基-2,3-二氢-1H-茚-2-甲酰胺
在0℃向2-(3-氟-2-甲基苯基)-2,3-二氢-1H-茚-2-羧酸(63mg,来自上一步)和三乙胺(92μl,0.65mmol)在无水DMF(1mL)中的溶液中加入TFFH(49mg,0.19mmol)。将反应混合物在该温度搅拌15min，然后一次性加入O-(四氢-2H-吡喃-2-基)羟胺(39mg,0.34mmol)。然后将反应混合物在室温搅拌24h。然后通过加入1M HCl溶液(2mL)将反应混合物淬灭。将反应混合物在EtOAc(5mL)和1M HCl(5mL)之间分配。分离有机层，用盐水(10mL)洗涤，干燥，过滤(相分离柱)并浓缩得到粗的经THP保护的异羟肟酸，其为淡黄色油状物。向该油状物中加入无水甲醇(2mL)和4M HCl在二噁烷(1mL)中的溶液。将反应混合物在室温搅拌30min。然后将溶剂减压除去得到粗异羟肟酸，将其经制备性HPLC纯化得到标题化合物，其为无色固体(20mg)。LCMS(ES+)285(M+H)+,RT 3.58min(分析方法1)。1H NMRδ(ppm)(DMSO-d6):10.19(1H,s),8.74(1H,s),7.30-7.15(2H,m),7.15-6.95(5H,m),3.71(2H,d,J＝16.8Hz),3.20(2H,d,J＝16.8Hz),2.17(3H,d,J＝2.4Hz)。
实施例83：2-环丙基-7-(3-氟-2-甲基苯基)-N-羟基-6,7,8,9-四氢-5H-环庚并[d]嘧啶-7-甲酰胺
步骤1：2-环丙基-7-(3-氟-2-甲基苯基)-4-羟基-6,7,8,9-四氢-5H-环庚并[d]嘧啶-7-羧酸甲酯
将环丙烷甲脒盐酸盐(0.27g,2.2mmol)加到中间体9(0.77g,2.2mmol)在无水甲醇(15mL)中的溶液中。加入甲醇钠(0.24g,4.44mmol)并将反应混合物回流加热3.25h。加入额外的环丙烷甲脒盐酸盐(0.10g,0.83mmol)、甲醇钠(0.10g,1.85mmol)和甲醇(3mL)并将反应混合物回流加热3h。加入额外的环丙烷甲脒盐酸盐(0.05g,0.41mmol)、甲醇钠(0.06g,1.11mmol)和甲醇(10mL)并将反应混合物在室温搅拌。18h后，将反应混合物用饱和氯化铵溶液淬灭。将反应混合物浓缩为1/4体积，用DCM和水稀释并转移至分液漏斗中。将混合物用DCM(×3)萃取，干燥(相分离柱)并蒸干。将粗混合物经硅胶柱色谱纯化(25g SNAP柱)(用0-70％EtOAc/异己烷洗脱)得到标题化合物，其为固体(0.44g,54％)。1H NMRδ(ppm)(CHCl3-d):12.32(1H,br.s),7.23-7.14(2H,m),7.04-6.95(1H,m),3.71(3H,s),3.02(1H,dd,J＝17.2,10.3Hz),2.88-2.67(3H,m),2.64-2.53(2H,m),2.33-2.21(2H,m),2.16(3H,d,J＝3.1Hz),1.87-1.79(1H,m),1.20-1.14(2H,m),1.08-1.01(2H,m)。
步骤2：2-环丙基-7-(3-氟-2-甲基苯基)-4-(((三氟甲基)亚磺酰基)氧基)-6,7,8,9-四氢-5H-环庚并[d]嘧啶-7-羧酸甲酯
将2-环丙基-7-(3-氟-2-甲基苯基)-4-羟基-6,7,8,9-四氢-5H-环庚并[d]嘧啶-7-羧酸甲酯(0.44g,1.19mmol)溶于DCM(15mL)并冷却至0℃。加入吡啶(0.15mL,1.79mmol)，然后逐滴加入三氟甲磺酸酐(0.24mL,1.42mmol)。将反应混合物在0℃搅拌2h。将反应混合物用DCM转移至分液漏斗中并用水洗涤。将合并的有机萃取物干燥(相分离柱)并减压浓缩。经硅胶柱色谱纯化(用0-100％EtOAc/异己烷洗脱)得到标题化合物，其为黄色油状物(153mg,26％)。1H NMRδ(ppm)(CHCl3-d):7.23-7.12(2H,m),7.05-6.97(1H,m),3.75(3H,s),3.33(1H,dd,J＝16.6,10.8Hz),3.09-2.97(2H,m),2.92-2.83(1H,m),2.71-2.62(2H,m),2.29-2.10(5H,m),1.17-1.06(4H,m)。
步骤3：2-环丙基-7-(3-氟-2-甲基苯基)-6,7,8,9-四氢-5H-环庚并[d]嘧啶-7-羧酸甲酯
在室温将钯/炭(100mg)、三乙胺(0.06mL,0.43mmol)和分子筛加到2-环丙基-7-(3-氟-2-甲基苯基)-4-(((三氟甲基)亚磺酰基)氧基)-6,7,8,9-四氢-5H-环庚并[d]嘧啶-7-羧酸甲酯(153mg,0.30mmol)在EtOAc(10mL)中的溶液中。将反应混合物置于氢气气氛下并在室温搅拌21h。将反应混合物经硅藻土过滤，用EtOAc和甲醇洗涤。将滤液浓缩并将所得油状物在水和DCM之间分配。将混合物用DCM(×2)萃取并将合并的有机萃取物干燥(相分离柱)并蒸干得到标题化合物，其为黄色油状物(120mg,>100％)。无需进一步纯化即用于下一步。
步骤4：2-环丙基-7-(3-氟-2-甲基苯基)-6,7,8,9-四氢-5H-环庚并[d]嘧啶-7-羧酸
将2-环丙基-7-(3-氟-2-甲基苯基)-6,7,8,9-四氢-5H-环庚并[d]嘧啶-7-羧酸甲酯(0.30mmol)、氢氧化锂(100mg)、THF(2mL)、MeOH(2mL)和水(1mL)在密封管中在65℃混合15h。加入额外的LiOH(50mg)并再加热21h。将反应混合物冷却至室温并减压部分浓缩。加入水并将水性混合物用1N盐酸酸化。将所得白色析出物通过过滤收集并干燥。显示靶标物质存在于滤液中。将其浓缩，用DCM(×3)萃取，干燥(相分离柱)并蒸干。将其与过滤的固体合并且无需进一步纯化即用于下一步(58mg,57％)。
步骤5：2-环丙基-7-(3-氟-2-甲基苯基)-N-羟基-6,7,8,9-四氢-5H-环庚并[d]嘧啶-7-甲酰胺
将2-环丙基-7-(3-氟-2-甲基苯基)-6,7,8,9-四氢-5H-环庚并[d]嘧啶-7-羧酸(58mg,0.17mmol)、TFFH(68mg,0.26mmol)、DMF(1.5mL)和三乙胺(47μl)混合并在0℃搅拌0.5h。加入三乙胺(59μl,0.43mmol)和羟胺盐酸盐(24mg,0.34mmol)并将反应混合物在室温搅拌20h。将反应混合物用水(2-3滴)稀释，过滤并经制备性HPLC纯化得到标题化合物，其为白色固体(5mg)。
LCMS(ES+)356(M+H)+,RT 3.04min(分析方法1)；1H NMRδ(ppm)(CH3OH-d4):8.27(1H,s),7.20-7.18(1H,m),7.17-7.07(1H,m),6.96-6.87(1H,m),3.40-3.31(1H,m),3.12-2.99(1H,m),2.86(1H,dd,J＝16.7,8.7Hz),2.79-2.66(1H,m),2.60-2.47(2H,m),2.22-2.01(6H,m),1.08-1.00(4H,m)。
实施例84和85：E1-(abs)-6-(3-氟-2-甲基苯基)-N-羟基-2-(2,2,2-三氟乙基)-2,4,5,6,7,8-六氢环庚并[c]吡唑-6-甲酰胺和E2-(abs)-6-(3-氟-2-甲基苯基)-N-羟基-2-(2,2,2-三氟乙基)-2,4,5,6,7,8-六氢环庚并[c]吡唑-6-甲酰胺
步骤1：6-(3-氟-2-甲基苯基)-3-羟基-2-(2,2,2-三氟乙基)-2,4,5,6,7,8-六氢环庚并[c]吡唑-6-羧酸甲酯
在密封管中将2,2,2-三氟乙基肼(0.32mL,70％水溶液)加到中间体9(0.64g,1.8mmol)在无水乙醇(7mL)中的溶液中并在95℃加热16h。将反应混合物冷却至室温并减压浓缩。将所得胶状物在室温静置。历时2周出现部分重结晶。将固体先后用EtOAc和20％EtOAc/异己烷研磨。将所得固体通过过滤收集，用20％EtOAc/异己烷洗涤并在真空烘箱中干燥得到标题化合物，其为灰白色固体(360mg,50％)。1H NMRδ(ppm)(DMSO-d6):10.55(0.67H,s),10.39(0.33H,s),7.35(1H,d,J＝8.08Hz),7.23(1H,dd,J＝14.82,7.41Hz),7.13-7.04(1H,m),4.62(1.33H,dd,J＝18.38,9.19Hz),4.40(0.67H,d,J＝10.33Hz),3.64(3H,s),2.72-2.58(2H,m),2.50-2.32(4H,m),2.25-2.12(2H,m),2.06(3H,s)。NMR光谱与互变异构体的混合物一致。
步骤2：6-(3-氟-2-甲基苯基)-2-(2,2,2-三氟乙基)-3-(((三氟甲基)磺酰基)氧基)-2,4,5,6,7,8-六氢环庚并[c]吡唑-6-羧酸甲酯
将6-(3-氟-2-甲基苯基)-3-羟基-2-(2,2,2-三氟乙基)-2,4,5,6,7,8-六氢环庚并[c]吡唑-6-羧酸甲酯(0.36g,0.90mmol)溶于DCM(10mL)。在室温加入吡啶(0.11mL,1.35mmol)，然后逐滴加入三氟甲磺酸酐(0.06mL,0.36mmol)在DCM(1mL)中的溶液。将反应混合物冷却至0℃并逐滴加入三氟甲磺酸酐(0.12mL,0.72mmol)在DCM(3mL)中的溶液。1.5h后，将反应混合物用DCM转移至分液漏斗中并用水洗涤。将合并的有机萃取物干燥(相分离柱)并蒸干。将粗物质经硅胶柱色谱纯化(用0-70％EtOAc/异己烷洗脱)得到标题化合物，其为无色胶状物(380mg,80％)。1H NMRδ(ppm)(CHCl3-d):7.21-7.15(2H,m),7.03-6.95(1H,m),4.57(2H,dd,J＝16.20,8.10Hz),3.70(3H,s),3.01-2.92(1H,m),2.84-2.72(2H,m),2.66-2.49(3H,m),2.31-2.18(2H,m),2.15(3H,d,J＝3.13Hz)。
步骤3：6-(3-氟-2-甲基苯基)-2-(2,2,2-三氟乙基)-2,4,5,6,7,8-六氢环庚并[c]吡唑-6-羧酸甲酯
在室温将钯/炭(300mg)、三乙胺(0.14mL,1.00mmol)和分子筛加到6-(3-氟-2-甲基苯基)-2-(2,2,2-三氟乙基)-3-(((三氟甲基)磺酰基)氧基)-2,4,5,6,7,8-六氢环庚并[c]吡唑-6-羧酸甲酯(0.38g,0.70mmol)在EtOAc(20mL)中的溶液中。将反应混合物置于氢气气氛下并在室温搅拌20h。将反应混合物经硅藻土过滤，用甲醇洗涤。将滤液浓缩并将所得油状物在水和DCM之间分配。将混合物用DCM(×2)萃取并将合并的有机相干燥(相分离柱)，过滤并蒸干得到标题化合物，其为黄色油状物(331mg,>100％)。无需进一步纯化即用于下一步。1H NMRδ(ppm)(CHCl3-d):7.22-7.14(3H,m),7.02-6.95(1H,m),4.58(2H,dd,J＝16.98,8.49Hz),3.72(3H,s),2.94-2.91(1H,m),2.86-2.73(2H,m),2.67-2.56(3H,m),2.34-2.19(2H,m),2.18(3H,d,J＝3.13Hz)。
步骤4：6-(3-氟-2-甲基苯基)-2-(2,2,2-三氟乙基)-2,4,5,6,7,8-六氢环庚并[c]吡唑-6-羧酸
将6-(3-氟-2-甲基苯基)-2-(2,2,2-三氟乙基)-2,4,5,6,7,8-六氢环庚并[c]吡唑-6-羧酸甲酯(0.33g,0.86mmol)、氢氧化锂(180mg)、THF(2mL)、MeOH(2mL)和水(1mL)在密封管中在65℃混合18.5h。加入额外的LiOH(135mg)并再加热54h。将反应混合物冷却至室温并蒸干。将混合物在水和DCM之间分配，使用2N盐酸酸化至pH 1。将混合物用DCM(3次)萃取，干燥(相分离柱)并蒸干得到标题化合物，其为白色固体(250mg,79％)。1H NMRδ(ppm)(DMSO-d6):12.72(1H,s),7.50-7.46(1H,m),7.32(1H,d,J＝8.1Hz),7.25-7.17(1H,m),7.11-7.04(1H,m),4.94(2H,dd,J＝18.4,9.2Hz),2.81(1H,dd,J＝16.2,10.5Hz),2.71-2.58(3H,m),2.56-2.47(2H,m),2.48-2.37(2H,m),2.17(3H,d,J＝3.1Hz)。
步骤5：E1-(abs)-6-(3-氟-2-甲基苯基)-N-羟基-2-(2,2,2-三氟乙基)-2,4,5,6,7,8-六氢环庚并[c]吡唑-6-甲酰胺和E2-(abs)-6-(3-氟-2-甲基苯基)-N-羟基-2-(2,2,2-三氟乙基)-2,4,5,6,7,8-六氢环庚并[c]吡唑-6-甲酰胺
将6-(3-氟-2-甲基苯基)-2-(2,2,2-三氟乙基)-2,4,5,6,7,8-六氢环庚并[c]吡唑-6-羧酸(210mg,0.57mmol)混悬于无水DCM(4mL)中。在室温在搅拌下加入草酰氯(53μL,0.62mmol)和DMF(1滴)。2h后，加入MeCN(4mL)并将反应混合物转移至20mL微波管中。加入羟胺(200μL,50％水溶液)并将反应混合物在微波中在100℃加热10min。将反应混合物蒸干并混悬于甲醇中。将浆液用水研磨得到白色粉末，将其经硅胶柱色谱纯化(梯度洗脱0-5％MeOH/DCM)。手性制备性HPLC得到随意指定的E1-(abs)和E2-(abs)-对映异构体(ChiralpakIA,方法40/60EtOH(0.1％甲酸)/庚烷1.0mL/min,RT 6.3(E1-(abs))和17.3min(E2-(abs))。得到E1-(abs)-对映异构体，其为乳膏状固体(34mg)。LCMS(ES+)386(M+H)+,RT9.85(分析方法2)。1H NMRδ(ppm)(DMSO-d6):10.11(1H,s),8.68(1H,s),7.44(1H,s),7.36-7.30(1H,m),7.20(1H,q,J＝7.40Hz),7.10-7.03(1H,m),4.92(2H,q,J＝9.18Hz),2.82(1H,dd,J＝15.69,10.24Hz),2.70-2.39(7H,m),2.13(3H,d,J＝2.8Hz)。得到E2-(abs)-对映异构体，其为白色固体(31mg)。LCMS(ES+)386(M+H)+,RT 3.36min(分析方法1)。1H NMRδ(ppm)(DMSO-d6):10.11(1H,s),8.68(1H,s),7.44(1H,s),7.32(1H,d,J＝8.1Hz),7.20(1H,dd,J＝14.8,7.4Hz),7.10-7.03(1H,m),4.92(2H,dd,J＝18.4,9.2Hz),2.82(1H,dd,J＝15.7,10.2Hz),2.70-2.41(7H,m),2.13(3H,d,J＝3.2Hz)。
实施例86：N-羟基-6-苯基-2-(2,2,2-三氟乙基)-2,4,5,6,7,8-六氢环庚并[c]吡唑-6-甲酰胺
标题化合物根据实施例83和84制备，使用在实施例82步骤5中形成异羟肟酸的TFFH方法。制备性HPLC得到标题化合物，其为白色固体(38mg)。LCMS(ES+)354(M+H)+,RT9.44min(分析方法2)；1H NMRδ(ppm)(DMSO-d6):10.46(1H,s),8.75(1H,s),7.46(1H,s),7.39-7.28(4H,m),7.25-7.18(1H,m),4.92(2H,dd,J＝18.4,9.2Hz),2.78(1H,dd,J＝15.8,10.8Hz),2.72-2.55(3H,m),2.48-2.39(2H,m),2.02-1.87(2H,m)。
实施例87和88：E1-(abs)-N-羟基-1-苯基-2,3-二氢-1H-茚-1-甲酰胺和E2-(abs)-N-羟基-1-苯基-2,3-二氢-1H-茚-1-甲酰胺
步骤1：向2,3-二氢-1H-茚-1-羧酸甲酯(545mg,3.10mmol)在甲苯(3.8mL)中的溶液中先后加入二环己基胺(632μL,3.17mmol)和BuLi(2mL,3.2mmol,1.6M在己烷中)。在另一个烧瓶中先后混合Pd(OAc)2(8mg,0.037mmol)、P(tBu)3·HBF4(24mg,0.084mmol)、溴苯(163μL,1.55mmol)和甲苯(2mL)并加热至100℃且保持1min。然后将烯醇盐溶液经注射器加到反应混合物中。将合并的混合物在100℃加热1h。将混合物冷却至室温，然后加入水(8mL)和DCM(20mL)并将二相混合物通过相分离器。将有机相浓缩并经硅胶柱色谱纯化(10％EtOAc/异己烷)，得到标题化合物，其为黄色油状物(277mg,77％)。LCMS(ES+)253(M+H)+。
步骤2：1-苯基-2,3-二氢-1H-茚-1-羧酸
在0℃向tBuOK(813mg,7.25mmol)在无水乙醚(14mL)中的搅拌混悬液中加入H2O(33.5μL,1.86mmol)。向其中加入1-苯基-2,3-二氢-1H-茚-1-羧酸甲酯(211mg,0.84mmol)并将反应混合物温热至室温并搅拌96h。将混合物冷却(冰浴)并用2M HCl(4mL)酸化并用H2O(15mL)稀释。然后将反应混合物在EtOAc(2×50mL)中萃取并将合并的有机层干燥(MgSO4)，过滤并蒸干得到标题化合物，其为黄色油状物(213mg,80％)。
步骤3：E1-(abs)-N-羟基-1-苯基-2,3-二氢-1H-茚-1-甲酰胺和E2-(abs)-N-羟基-1-苯基-2,3-二氢-1H-茚-1-甲酰胺
向1-苯基-2,3-二氢-1H-茚-1-羧酸(210mg,0.88mmol)在DCM(7mL)中的溶液中加入草酰氯(149μL,1.76mmol)。将反应混合物在室温在氮气气氛下搅拌20h。将反应混合物浓缩至干并重新溶于DCM(8mL)。向其中加入羟胺水溶液(1.5mL,50％溶液)并将混合物在室温搅拌4h。将混合物冷却(冰浴)并用2MHCl(4mL)酸化并用H2O(15mL)稀释。然后将反应混合物在EtOAc(2×50mL)中萃取并将合并的有机相用盐水(10mL)洗涤，干燥(MgSO4)，过滤且浓缩。经制备性HPLC和手性HPLC纯化得到随意指定的E1-(abs)和E2-(abs)-对映异构体(分别为2mg和3mg)(Chiralpak IA 20/80 IPA/MeOH(50/50/0.1％甲酸)/庚烷,1.0mL/min,RT7.8min(E1-(abs))和10.9min(E2-(abs))。E1-(abs)：LCMS(ES+)254(M+H)+,RT 3.40min(分析方法1)；1H NMRδ(ppm)(DMSO-d6):10.36(1H,s),8.80(1H,s),7.55-7.51(1H,m),7.32-7.20(6H,m),7.11(2H,d,J＝7.3Hz),3.00-2.86(2H,m),2.80-2.67(1H,m),2.20-2.11(1H,m)。E2-(abs)：LCMS(ES+)254(M+H)+,RT 3.40min(分析方法1)；1H NMRδ(ppm)(DMSO-d6):10.38(1H,s),8.82(1H,s),7.54-7.51(1H,m),7.32-7.20(6H,m),7.11(2H,d,J＝7.2Hz),2.99-2.86(2H,m),2.80-2.67(1H,m),2.20-2.11(1H,m)。
实施例89：N-羟基-2-苯基-2,3-二氢-1H-茚-2-甲酰胺
步骤1：2-苯基-2,3-二氢-1H-茚-2-甲腈
将苄基氰(117mg,1.00mmol)、α,α’-二溴-邻二甲苯(396mg,1.50mmol)、NaOH(2mL,2M水溶液,4.00mmol)、苄基三乙基溴化铵(408mg,1.50mmol)和甲苯(10mL)混合并在室温搅拌8天。将反应混合物用H2O洗涤并将有机相浓缩。经快速色谱纯化(33％EtOAc/异己烷)得到标题化合物，其为澄清油状物(110mg,50％)。LCMS(ES+)220(M+H)+。
步骤2：2-苯基-2,3-二氢-1H-茚-2-羧酸
向2-苯基-2,3-二氢-1H-茚-2-甲腈(110mg,0.5mmol)在EtOH/H2O(5mL,3:2)中的搅拌溶液中加入NaOH(100mg,2.5mmol)并将混合物回流2天。将混合物用H2O稀释并用DCM洗涤。收集水性部分，用2M HCl酸化并在EtOAc中萃取。将有机相干燥(MgSO4)，过滤并浓缩得到标题化合物，其为白色固体(97mg,82mmol)。LCMS(ES+)239(M+H)+。
步骤3：2-苯基-2,3-二氢-1H-茚-2-羧酸乙酯
将2-苯基-2,3-二氢-1H-茚-2-羧酸(97mg,0.4mmol)和浓H2SO4(1滴)在EtOH(20mL)中的溶液在回流温度加热过夜。将反应混合物冷却至室温，用2M K2CO3水溶液稀释并在DCM中萃取。将有机相通过相分离器并浓缩得到标题化合物，其为白色固体(95mg,88％)。LCMS(ES+)267(M+H)+。
步骤4：N-羟基-2-苯基-2,3-二氢-1H-茚-2-甲酰胺
将2-苯基-2,3-二氢-1H-茚-2-羧酸乙酯(96mg,0.37mmol)、羟胺水溶液(2mL,50％溶液)和氢氧化钠(1mL,15％溶液)在MeOH(20mL)中的溶液在室温搅拌6h。将反应混合物用DCM萃取，通过相分离器并浓缩得到白色固体，然后将其用石油醚60-80/Et2O(1:1)研磨得到标题化合物，其为白色固体。
LCMS(ES+)254(M+H)+。1H NMRδ(ppm)(DMSO-d6):10.67(1H,s),8.69(1H,s),7.40(2H,d,J＝7.4Hz),7.36-7.29(2H,m),7.26-7.21(3H,m),7.14-7.10(2H,m),3.84(2H,d,J＝15.7Hz),3.18(2H,d,J＝15.7Hz)。
实施例90：(S)-1-(2-氯-4-氟苯基)-5-(3-氟-2-甲基苯基)-N-羟基-1,4,5,6-四氢环戊并[c]吡唑-5-甲酰胺
按照如实施例1所述的方法制备。制备性HPLC得到标题化合物，其为灰白色固体(23mg)。LCMS(ES+)404(M+H)+,RT 3.48min(分析方法1)；1H NMRδ(ppm)(DMSO-d6):10.25-10.18(1H,br s),8.83-8.77(1H,br s),7.68(1H,dd,J＝2.8,8.6Hz),7.58(1H,dd,J＝5.6,8.9Hz),7.47(1H,s),7.41-7.34(1H,m),7.20-7.13(1H,m),7.11-7.04(2H,m),3.77(1H,d,J＝15.9Hz),3.45(1H,d,J＝14.8Hz),3.19-3.13(1H,m),2.88(1H,d,J＝16.1Hz),2.11(3H,d,J＝2.6Hz)。
实施例91：(S)-2-(4,6-二甲基嘧啶-2-基)-5-(3-氟-2-甲基苯基)-N-羟基-2,4,5,6-四氢环戊并[c]吡唑-5-甲酰胺
按照如实施例1所述的方法制备。制备性HPLC得到标题化合物，其为灰白色固体(6mg)。LCMS(ES+)382(M+H)+,RT 3.16min(分析方法1)；1H NMRδ(ppm)(DMSO-d6):10.24(1H,s),8.85(1H,s),8.24(1H,s),7.14-7.03(4H,m),3.62(1H,d,J＝16.2Hz),3.49(1H,d,J＝16.7Hz),3.08(2H,dd,J＝6.4,16.1Hz),2.44(6H,s),2.17(3H,d,J＝2.6Hz)。
实施例92、93和94：(S)-1-苄基-5-(3-氟-2-甲基苯基)-N-羟基-1,4,5,6-四氢环戊并[c]吡唑-5-甲酰胺、(R)-1-苄基-4-(3-氟-2-甲基苯基)-N-羟基-1,4,5,6-四氢环戊并[c]吡唑-4-甲酰胺和(R)-2-苄基-4-(3-氟-2-甲基苯基)-N-羟基-2,4,5,6-四氢环戊并[c]吡唑-4-甲酰胺
步骤1：(S)-3-((二甲基氨基)亚甲基)-1-(3-氟-2-甲基苯基)-4-氧代环戊烷羧酸甲酯和(R)-2-(二甲基氨基亚甲基)-1-(3-氟-2-甲基-苯基)-3-氧代-环戊烷羧酸甲酯
将中间体3(2.5g,1.0mmol)溶于二甲基甲酰胺缩二甲醛(5.0mL)并加热至80℃且保持16h。将冷却的混合物在硅胶上浓缩并经快速硅胶柱色谱纯化(梯度洗脱异己烷至100％EtOAc/异己烷)得到标题化合物，其为淡黄色油状物(1.8g,58％)。LCMS(ES+)306(M+H)+。
步骤2：(S)-5-(3-氟-2-甲基苯基)-2,4,5,6-四氢环戊并[c]吡唑-5-羧酸甲酯和(R)-4-(3-氟-2-甲基苯基)-2,4,5,6-四氢环戊并[c]吡唑-4-羧酸甲酯
向(S)-3-((二甲基氨基)亚甲基)-1-(3-氟-2-甲基苯基)-4-氧代环戊烷羧酸甲酯和(R)-2-(二甲基氨基亚甲基)-1-(3-氟-2-甲基-苯基)-3-氧代-环戊烷羧酸甲酯(2.75g,9.02mmol)在乙酸(9mL)中的溶液中加入肼(9mL,9.00mmol,1M在THF中的溶液)并将混合物在室温搅拌15min，然后加热至55℃且保持3h。将溶剂真空除去并加入水，然后用DCM萃取。将有机相通过相分离器且浓缩。经快速硅胶色谱纯化(用Et2O洗脱)得到标题化合物(1.7g,68％)。
步骤3：(S)-1-苄基-5-(3-氟-2-甲基苯基)-1,4,5,6-四氢环戊并[c]吡唑-5-羧酸甲酯、(R)-1-苄基-4-(3-氟-2-甲基苯基)-1,4,5,6-四氢环戊并[c]吡唑-4-羧酸甲酯和(R)-2-苄基-4-(3-氟-2-甲基苯基)-2,4,5,6-四氢环戊并[c]吡唑-4-羧酸甲酯
向(S)-5-(3-氟-2-甲基苯基)-2,4,5,6-四氢环戊并[c]吡唑-5-羧酸甲酯和(R)-4-(3-氟-2-甲基苯基)-2,4,5,6-四氢环戊并[c]吡唑-4-羧酸甲酯(0.77g,2.8mmol)在DMF(5mL)中的搅拌混悬液中加入苄基氯(0.38g,3.0mmol)和碳酸铯(1.0g,3.1mmol)并将混合物在室温搅拌3天。然后将反应混合物用水稀释并在Et2O中萃取。将合并的有机相干燥(MgSO4)，过滤且浓缩。经快速硅胶色谱(用Et2O洗脱)和制备性HPLC纯化得到(S)-1-苄基-5-(3-氟-2-甲基苯基)-1,4,5,6-四氢环戊并[c]吡唑-5-羧酸甲酯(143mg,14％)、(R)-1-苄基-4-(3-氟-2-甲基苯基)-1,4,5,6-四氢环戊并[c]吡唑-4-羧酸甲酯(142mg,14％)和(R)-2-苄基-4-(3-氟-2-甲基苯基)-2,4,5,6-四氢环戊并[c]吡唑-4-羧酸甲酯(156mg,15％)，其为可分离的异构体混合物。LCMS(ES+)365(M+H)+。
步骤4：(S)-1-苄基-5-(3-氟-2-甲基苯基)-N-羟基-1,4,5,6-四氢环戊并[c]吡唑-5-甲酰胺
在氮气气氛下向羟胺盐酸盐(180mg,2.61mmol)在DCM(6mL)中的搅拌混悬液中加入三甲基铝(1.2mL,2.4mmol,2M THF溶液)。将混合物在室温搅拌20min，然后加入(S)-1-苄基-5-(3-氟-2-甲基苯基)-1,4,5,6-四氢环戊并[c]吡唑-5-羧酸甲酯(143mg,0.4mmol)在DCM(4mL)中的溶液并将混合物再搅拌1.5h。加入额外的羟胺盐酸盐(180mg,2.61mmol)和三甲基铝(1.2mL,2.4mmol,2M THF溶液)并继续搅拌2h。将反应混合物用2M HCl(3mL)淬灭，浓缩至干并在水和EtOAc之间分配。将有机相干燥(MgSO4)，过滤且浓缩。经制备性HPLC纯化得到标题化合物，其为无色固体(67mg)。LCMS(ES+)366(M+H)+,RT 3.29min(分析方法1)；1HNMRδ(ppm)(DMSO-d6):10.14(1H,s),8.76(1H,s),7.33-7.28(3H,m),7.15-7.11(3H,m),7.08-7.02(2H,m),6.87(1H,dd,J＝2.1,6.7Hz),5.27-5.20(2H,m),3.51(1H,d,J＝16Hz),3.34(1H,d,J＝16Hz),2.98(1H,d,J＝16Hz),2.83(1H,d,J＝16Hz),2.08(3H,d,J＝2.5Hz)。
步骤5：(R)-1-苄基-4-(3-氟-2-甲基苯基)-N-羟基-1,4,5,6-四氢环戊并[c]吡唑-4-甲酰胺
按照与步骤4相同的方法起始于(R)-1-苄基-4-(3-氟-2-甲基苯基)-1,4,5,6-四氢环戊并[c]吡唑-4-羧酸甲酯(142mg,0.39mmol)。经制备性HPLC纯化得到标题化合物，其为无色固体(99mg)。LCMS(ES+)366(M+H)+,RT 10.11min(分析方法2)；1H NMRδ(ppm)(DMSO-d6):10.09(1H,s),8.69(1H,s),7.46-7.45(1H,m),7.39-7.34(2H,m),7.33-7.27(1H,m),7.26-7.22(2H,m),7.17-7.10(1H,m),7.09-7.02(2H,m),5.23(2H,s),3.84-3.75(1H,m),2.78-2.68(1H,m),2.61-2.52(1H,m),2.30-2.20(1H,m),2.11(3H,s)。
步骤6：(R)-2-苄基-4-(3-氟-2-甲基苯基)-N-羟基-2,4,5,6-四氢环戊并[c]吡唑-4-甲酰胺
按照与步骤4相同的方法起始于(R)-2-苄基-4-(3-氟-2-甲基苯基)-2,4,5,6-四氢环戊并[c]吡唑-4-羧酸甲酯(156mg,0.43mmol)。经制备性HPLC纯化得到标题化合物，其为无色固体(104mg)。LCMS(ES+)366(M+H)+,RT 9.94min(分析方法2)；1H NMRδ(ppm)(DMSO-d6):10.11(1H,s),8.70(1H,d,J＝1.4Hz),7.68(1H,s),7.40-7.36(2H,m),7.33-7.28(3H,m),7.16-7.03(2H,m),6.99(1H,d,J＝7.5Hz),5.33(2H,s),3.67-3.58(1H,m),2.79-2.70(1H,m),2.60-2.56(1H,m),2.21-2.15(1H,m),2.14(3H,d,J＝2.4Hz)。
实施例95：(S)-1-苄基-5-(3-氟-2-甲基苯基)-N-羟基-1,4,5,6-四氢环戊并[c]吡唑-5-甲酰胺
使用2-氟苄基氯(432mg,3.0mmol)按照如实施例91所述的方法制备得到标题化合物，其为无色固体(89mg)。LCMS(ES+)384(M+H)+,RT 10.01min(分析方法2)；1H NMRδ(ppm)(DMSO-d6):10.11(1H,s),8.71(1H,s),7.69(1H,s),7.43-7.36(1H,m),7.32-7.27(1H,m),7.25-7.20(2H,m),7.16-7.04(2H,m),6.99(1H,d,J＝7.5Hz),5.39(2H,s),3.67-3.58(1H,m),2.77-2.69(1H,m),2.59-2.53(1H,m),2.20-2.15(1H,m),2.13(3H,d,J＝2.5Hz)。
实施例96：(R)-5-(3-氟-2-甲基苯基)-N-羟基-2-(5-氟吡啶-2-基)-5,6-二氢-4H-环戊并[d]噻唑-5-甲酰胺
步骤1：5-(3-氟-2-甲基苯基)-2-(5-氟吡啶-2-基)-5,6-二氢-4H-环戊并[d]噻唑-5-羧酸甲酯
向3-溴-1-(3-氟-2-甲基苯基)-4-氧代环戊烷羧酸甲酯(500mg,1.52mmol)在乙醇(5mL)中的溶液中加入5-氟吡啶-2-硫代甲酰胺(356mg,2.28mmol)。将反应混合物在微波条件下加热至110℃且保持1h。将反应混合物浓缩得到暗红色胶状物。将粗反应物质经快速硅胶色谱纯化(梯度洗脱异己烷至40％EtOAc/异己烷)得到标题化合物，其为亮橙色固体(226mg,34％)。无需进一步纯化即以粗品(45％纯)形式使用。
步骤2：5-(3-氟-2-甲基苯基)-2-(5-氟吡啶-2-基)-N-羟基-5,6-二氢-4H-环戊并[d]噻唑-5-甲酰胺
向羟胺盐酸盐(0.25g,3.68mmol)在DCM(10mL)中的溶液中加入三甲基铝在庚烷中的溶液(1.6mL,3.3mmol)。然后逐滴加入5-(3-氟-2-甲基苯基)-2-(5-氟吡啶-2-基)-5,6-二氢-4H-环戊并[d]噻唑-5-羧酸甲酯(226mg,0.58mmol)在DCM(7mL)中的溶液并搅拌1h。将反应混合物在冷却下用2NHCl(6mL)处理，然后加入MeOH(25mL)并用2N HCl调节pH至1。将溶剂蒸发留下水溶液，将其用NaHCO3调节至pH 5以使铝析出，将其经硅藻土滤出，用乙酸乙酯充分洗涤。分离各相并将有机相蒸发得到黄色固体，将其经制备性HPLC纯化得到标题化合物，其为灰白色固体(39mg)。
LCMS(ES+)388(M+H)+,RT 3.57min(分析方法1)；1H NMRδ(ppm)(DMSO-d6):10.29(1H,s),8.84(1H,s),8.62(1H,d,J＝2.9Hz),8.09(1H,dd,J＝4.5,8.9Hz),7.90-7.85(1H,m),7.19-7.06(3H,m),3.77(2H,dd,J＝15.6,15.6Hz),3.42-3.36(1H,m),3.22(1H,d,J＝15.8Hz),2.17(3H,d,J＝2.6Hz)。
实施例表格
生物学实施例
实施例A：分析化合物对HDAC4的抑制
通过使用荧光底物即Boc-Lys(Tfa)-AMC对组蛋白脱乙酰酶4(HDAC4)的催化域酶活性进行测量来量化化合物的效力。所述底物被HDAC4脱乙酰化为Boc-Lys-AMC。通过胰蛋白酶进行的裂解使荧光团AMC从脱乙酰化的底物中释放。样品的荧光与样品中组蛋白脱乙酰酶的活性直接相关。
连续稀释化合物.所测试的化合物和参照化合物(1-(5-(3-((4-(1,3,4-噁二唑-2-基)苯氧基)甲基)-1,2,4-噁二唑-5-基)噻吩-2-基)-2,2,2-三氟乙酮)的连续稀释液通过首先将冻干的化合物在100％二甲基亚砜(DMSO)中重新混悬至最终浓度为10mM来制备。制备原液即10mM化合物在DMSO中的60μL等分液并贮存在-20℃。根据表1使用125μL 16通道Matrix多通道移液管(Matrix Technologies Ltd)由待测试的每种化合物的一份原液等分液和参照化合物的一份原液等分液制备16点连续稀释液。
表1：对化合物的连续稀释
稀释液 孔 浓度(μM) 稀释比例 体积
浓度1 A 10000 - 60μL 10mM测试化合物/参照物
浓度2 B 5000 1:2 30μL A+30μL DMSO
浓度3 C 2500 1:2 30μL B+30μL DMSO
浓度4 D 1000 1:2.5 30μL C+45μL DMSO
浓度5 E 500 1:2 30μL D+30μL DMSO
浓度6 F 250 1:2 30μL E+30μL DMSO
浓度7 G 125 1:2 30μL F+30μL DMSO
浓度8 H 62.5 1:2 30μL G+30μL DMSO
浓度9 I 31.25 1:2 30μL H+30μL DMSO
浓度10 J 15.63 1:2 30μL I+30μL DMSO
浓度11 K 7.81 1:2 30μL J+30μL DMSO
浓度12 L 3.91 1:2 30μL K+30μL DMSO
浓度13 M 1.95 1:2 30μL L+30μL DMSO
浓度14 N 0.98 1:2 30μL M+30μL DMSO
浓度15 O 0.49 1:2 30μL N+30μL DMSO
浓度16 P 0.24 1:2 30μL O+30μL DMSO
使用Bravo(384孔头,Agilent)或12.5μL 16通道Matrix多通道移液管(MatrixTechnologies Ltd)将2μL(200×)每种稀释液和每种对照品(完全活性为单独的100％DMSO或完全抑制为1mM)按压到V形底聚丙烯384孔化合物板中。通过添加38μL测定缓冲液+DMSO(10.5％DMSO、45mM Tris-HCl、123mM NaCl、2.4mM KCl和0.9mM MgCl2(pH 8.0)并平衡至室温)将具有200×化合物溶液的每个孔以1:20稀释。
制备HDAC4催化域酶(0.2μg/mL).HDAC4催化域酶是由BioFocus生产的具有C-末端6×组氨酸标签的人催化域HDAC4蛋白(氨基酸648-1032)。酶的工作溶液由HDAC4催化域的500μg/mL原液等分液(在冰上解冻)制备，在即将将所述酶加到测定中前用测定缓冲液(50mM Tris-HCl、137mM NaCl、2.7mM KCl和1mM MgCl2(pH 8)并平衡至室温)将所述原液等分液稀释至0.2μg/mL。
制备5×(50μM)Boc-Lys(Tfa)-AMC底物.在即将加到测定中前制备5×(50μM)底物。1mM底物原液如下制备：通过将100mM Boc-Lys(Tfa)-AMC在DMSO中的溶液滴加到测定缓冲液(平衡至室温)中同时低速涡动以防止析出以1:100对100mM Boc-Lys(Tfa)-AMC在DMSO中的溶液进行稀释。5×底物如下制备：通过将1mM底物溶液滴加到测定缓冲液(平衡至室温)中同时低速涡动以防止析出以1:20对1mM底物溶液进行稀释。
制备3×(30μM)显色剂/终止溶液.3×(30μM)显色剂/终止溶液在即将加到板中前如下制备：在25mg/mL胰蛋白酶(PAA Laboratories Ltd.)(平衡至室温)中以1:333对10mM参照化合物的原液进行稀释。
测定.使用Bravo或Janus(384孔MDT头,Perkin Elmer)将5μL上述每种以1:20稀释的化合物的溶液转移到透明底黑色384孔测定板中。使用16通道Matrix多通道移液管将HDAC4催化域酶的35μL工作溶液(0.2μg/mL于测定缓冲液中)转移到测定板中。然后测定如下开始：使用Bravo、Janus或16通道Matrix多通道移液管将10μL 5×(50μM)底物加到测定板中。然后将测定板在定轨震摇器上以900rpm(每分钟转数)震摇两分钟。然后将板在37℃孵育15分钟。反应如下终止：使用Bravo、Janus或16通道Matrix多通道移液管向测定板中添加25μL 3×(30μM)显色剂/终止溶液。然后将测定板在定轨震摇器上以1200rpm震摇5分钟。然后将测定板在组织培养箱中在37℃孵育1小时。最后使用PerkinElmer EnVision以顶端读数模式对荧光进行测量(激发波长为355nm且发射波长为460nm)。
实施例B：分析化合物对HDAC5的抑制
通过使用荧光底物即Boc-Lys(Tfa)-AMC对组蛋白脱乙酰酶5(HDAC5)的酶活性进行测量来量化化合物的效力。所述底物被HDAC5脱乙酰化为Boc-Lys-AMC。通过胰蛋白酶进行的裂解使荧光团AMC从脱乙酰化的底物中释放。样品的荧光与样品中组蛋白脱乙酰酶的活性直接相关。
连续稀释化合物.所述化合物和参照化合物(1-(5-(3-((4-(1,3,4-噁二唑-2-基)苯氧基)甲基)-1,2,4-噁二唑-5-基)噻吩-2-基)-2,2,2-三氟乙酮)的连续稀释液通过首先将冻干的化合物在100％DMSO中重新混悬至最终浓度为10mM来制备。制备原液即10mM化合物在DMSO中的60μL等分液并贮存在-20℃。根据表1使用125μL 16通道Matrix多通道移液管由待测试的每种化合物的一份原液等分液和参照化合物的一份原液等分液制备16点连续稀释液。
使用Bravo、Janus或12.5μL 16通道Matrix多通道移液管将2μL(200×)每种稀释液和每种对照品(完全活性为单独的100％DMSO或完全抑制为1mM)按压到V形底聚丙烯384孔化合物板中。通过添加38μL测定缓冲液+DMSO(10.5％DMSO、45mM Tris-HCl、123mM NaCl、2.4mM KCl和0.9mM MgCl2(pH 8.0)并平衡至37℃)将具有所按压的2μL 200×化合物溶液的每个孔以1:20稀释。
制备HDAC5催化域酶(0.57μg/mL).HDAC5催化域酶为人HDAC5催化域(GenBank登记号为NM_001015053)即具有C-末端His标签的氨基酸657-1123且可得自BPS BioScience。所述蛋白质为51kDa且在杆状病毒表达系统中表达。酶的工作溶液由HDAC5催化域的1.65mg/mL原液等分液(在冰上解冻)制备，在即将将所述酶加到测定中前用测定缓冲液(50mMTris-HCl、137mM NaCl、2.7mM KCl和1mM MgCl2(pH 8)并平衡至37℃)将所述原液等分液稀释至0.57μg/mL。
制备5×(40μM)Boc-Lys(Tfa)-AMC底物.在即将加到测定中前制备5×(40μM)底物。5×底物如下制备：通过将100mM Boc-Lys(Tfa)-AMC在DMSO中的溶液滴加到测定缓冲液(平衡至37℃)中同时低速涡动以防止析出以1:2500对100mM Boc-Lys(Tfa)-AMC在DMSO中的溶液进行稀释。
制备3×(30μM)显色剂/终止溶液.3×(30μM)显色剂/终止溶液在即将加到板中前如下制备：在25mg/mL胰蛋白酶(平衡至37℃)中以1:333对10mM参照化合物的原液进行稀释。
测定.使用Bravo或Janus将5μL上述每种以1:20稀释的化合物和对照品的溶液转移到透明底黑色384孔测定板中。使用16通道Matrix多通道移液管将HDAC5催化域酶的35μL工作溶液(0.57μg/mL于测定缓冲液中)转移到测定板中。然后测定如下开始：使用Bravo、Janus或16通道Matrix多通道移液管将10μL 5×(40μM)底物加到测定板中。然后将测定板在定轨震摇器上以900rpm震摇一分钟。然后将板在37℃孵育15分钟。反应如下终止：使用Bravo、Janus或16通道Matrix多通道移液管向测定板中添加25μL3×(30μM)显色剂/终止溶液。然后将测定板在定轨震摇器上以900rpm震摇2分钟。然后将测定板在组织培养箱中在37℃孵育1小时，然后在定轨震摇器上以最大rpm震摇1分钟，然后用EnVision读数。最后使用PerkinElmer EnVision以顶端读数模式对荧光进行测量(激发波长为355nm且发射波长为460nm)。
实施例C：分析化合物对HDAC7的抑制
通过使用荧光底物即Boc-Lys(Tfa)-AMC对组蛋白脱乙酰酶7(HDAC7)的酶活性进行测量来量化化合物的效力。所述底物被HDAC7脱乙酰化为Boc-Lys-AMC。通过胰蛋白酶进行的裂解使荧光团AMC从脱乙酰化的底物中释放。样品的荧光与样品中组蛋白脱乙酰酶的活性直接相关。
连续稀释HDAC抑制剂化合物.待测试的化合物和参照化合物(1-(5-(3-((4-(1,3,4-噁二唑-2-基)苯氧基)甲基)-1,2,4-噁二唑-5-基)噻吩-2-基)-2,2,2-三氟乙酮)的连续稀释液通过首先将冻干的化合物在100％DMSO中重新混悬至最终浓度为10mM来制备。制备原液即10mM化合物在DMSO中的60μL等分液并贮存在-20℃。根据表1使用125μL 16通道Matrix多通道移液管由待测试的每种化合物的一份原液等分液和参照化合物的一份原液等分液制备16点连续稀释液。
使用Bravo、Janus或12.5μL 16通道Matrix多通道移液管将2μL(200×)每种稀释液和每种对照品(完全活性为单独的100％DMSO或完全抑制为1mM)按压到V形底聚丙烯384孔化合物板中。通过添加38μL测定缓冲液+DMSO(10.5％DMSO、45mM Tris-HCl、123mM NaCl、2.4mM KCl和0.9mM MgCl2(pH 8.0)并平衡至37℃)将具有200×化合物溶液的每个孔以1:20稀释。
制备HDAC7酶(71ng/mL).HDAC7酶为人HDAC7(GenBank登记号为AY302468)即具有N-末端谷胱甘肽S-转移酶(GST)标签的氨基酸518至末端且可得自BPS BioScience。所述蛋白质为78kDa且在杆状病毒表达系统中表达。酶的工作溶液由HDAC7的0.5mg/mL原液等分液(在冰上解冻)制备，在即将将所述酶加到测定中前用测定缓冲液(50mM Tris-HCl、137mMNaCl、2.7mM KCl和1mM MgCl2(pH 8)并平衡至37℃)将所述原液等分液稀释至71ng/mL。
制备5×(50μM)Boc-Lys(Tfa)-AMC底物.在即将加到测定中前制备5×(50μM)底物。5×底物如下制备：通过将100mM Boc-Lys(Tfa)-AMC在DMSO中的溶液滴加到测定缓冲液(平衡至37℃)中同时低速涡动以防止析出以1:2000对100mM Boc-Lys(Tfa)-AMC在DMSO中的溶液进行稀释。
制备3×(30μM)显色剂/终止溶液.3×(30μM)显色剂/终止溶液在即将加到板中前如下制备：在25mg/mL胰蛋白酶(平衡至37℃)中以1:333对10mM参照化合物的原液进行稀释。
测定.使用Bravo或Janus将5μL上述每种以1:20稀释的化合物的溶液转移到透明底黑色384孔测定板中。使用16通道Matrix多通道移液管将HDAC7酶的35μL工作溶液(71ng/mL于测定缓冲液中)转移到测定板中。然后测定如下开始：使用Bravo、Janus或16通道Matrix多通道移液管将10μL5×(50μM)底物加到测定板中。然后将测定板在定轨震摇器上以900rpm震摇一分钟。然后将板在37℃孵育15分钟。反应如下终止：使用Bravo、Janus或16通道Matrix多通道移液管向测定板中添加25μL 3×(30μM)显色剂/终止溶液。然后将测定板在定轨震摇器上以900rpm震摇2分钟。然后将测定板在组织培养箱中在37℃孵育1小时，然后在定轨震摇器上以最大rpm震摇1分钟。最后使用PerkinElmer EnVision以顶端读数模式对荧光进行测量(激发波长为355nm且发射波长为460nm)。
实施例D：分析化合物对HDAC9的抑制
通过使用荧光底物即Boc-Lys(Tfa)-AMC对组蛋白脱乙酰酶9(HDAC9)的酶活性进行测量来量化化合物的效力。所述底物被HDAC9脱乙酰化为Boc-Lys-AMC。通过胰蛋白酶进行的裂解使荧光团AMC从脱乙酰化的底物中释放。样品的荧光与样品中组蛋白脱乙酰酶的活性直接相关。
连续稀释化合物.所述化合物和参照化合物(1-(5-(3-((4-(1,3,4-噁二唑-2-基)苯氧基)甲基)-1,2,4-噁二唑-5-基)噻吩-2-基)-2,2,2-三氟乙酮)的连续稀释液通过首先将冻干的化合物在100％DMSO中重新混悬至最终浓度为10mM来制备。制备原液即10mM化合物在DMSO中的60μL等分液并贮存在-20℃。根据表1使用125μL 16通道Matrix多通道移液管由待测试的每种化合物的一份原液等分液和参照化合物的一份原液等分液制备16点连续稀释液。
使用Bravo、Janus或12.5μL 16通道Matrix多通道移液管将2μL(200×)每种稀释液和每种对照品(完全活性为单独的100％DMSO或完全抑制为1mM)按压到V形底聚丙烯384孔化合物板中。通过添加38μL测定缓冲液+DMSO(10.5％DMSO、45mM Tris-HCl、123mM NaCl、2.4mM KCl和0.9mM MgCl2(pH 8.0)并平衡至37℃)将具有所按压的200×化合物溶液的每个孔以1:20稀释。
制备HDAC9酶(0.57μg/mL).HDAC9酶为人HDAC9(GenBank登记号为NM_178423)即具有C-末端His标签的氨基酸604-1066且可得自BPS BioScience。所述蛋白质为50.7kDa且在杆状病毒表达系统中表达。酶的工作溶液由HDAC9的0.5mg/mL原液等分液(在冰上解冻)制备，在即将将所述酶加到测定中前用测定缓冲液(50mM Tris-HCl、137mM NaCl、2.7mM KCl和1mM MgCl2(pH 8)并平衡至37℃)将所述原液等分液稀释至0.57μg/mL。
制备5×(125μM)Boc-Lys(Tfa)-AMC底物.在即将加到测定中前制备5×(125μM)底物。5×底物如下制备：通过将100mM Boc-Lys(Tfa)-AMC在DMSO中的溶液滴加到测定缓冲液(平衡至37℃)中同时低速涡动以防止析出以1:800对100mM Boc-Lys(Tfa)-AMC在DMSO中的溶液进行稀释。
制备3×(30μM)显色剂/终止溶液.3×(30μM)显色剂/终止溶液在即将加到板中前如下制备：在25mg/mL胰蛋白酶(平衡至37℃)中以1:333对10mM参照化合物的原液进行稀释。
测定.使用Bravo或Janus将5μL上述每种以1:20稀释的化合物的溶液转移到透明底黑色384孔测定板中。使用16通道Matrix多通道移液管将HDAC9酶的35μL工作溶液(0.57μg/mL于测定缓冲液中)转移到测定板中。然后测定如下开始：使用Bravo、Janus或16通道Matrix多通道移液管将10μL5×(125μM)底物加到测定板中。然后将测定板在定轨震摇器上以900rpm震摇一分钟。然后将板在37℃孵育15分钟。反应如下终止：使用Bravo、Janus或16通道Matrix多通道移液管向测定板中添加25μL 3×显色剂/终止溶液。然后将测定板在定轨震摇器上以900rpm震摇2分钟。然后将测定板在组织培养箱中在37℃孵育1小时，然后在定轨震摇器上以最大rpm震摇1分钟，然后用EnVision读数。最后使用PerkinElmerEnVision以顶端读数模式对荧光进行测量(激发波长为355nm且发射波长为460nm)。
实施例E：分析化合物对细胞HDAC活性的抑制
通过使用荧光底物即Boc-Lys(Tfa)-AMC对细胞组蛋白脱乙酰酶的酶活性进行测量来量化化合物的效力。所述底物在渗入到Jurkat E6-1细胞中后被脱乙酰化为Boc-Lys-AMC。使细胞溶解且通过胰蛋白酶进行裂解后，荧光团AMC仅从脱乙酰化的底物中释放。样品的荧光与样品中组蛋白脱乙酰酶的活性直接相关。
Jurkat E6.1细胞的培养和铺板.按照标准细胞培养方案在Jurkat E6.1生长介质(不含有酚红的RPMI、10％FBS、10mM HEPES和1mM丙酮酸钠)中培养Jurkat E6.1细胞。使用Coulter计数器对Jurkat E6.1细胞进行计数并以75,000个细胞/35μL的浓度重新混悬在Jurkat E6.1生长介质中。将35μL或75,000个细胞接种到Greiner微滴定测定板中。然后将板在37℃和5％CO2的条件下孵育同时准备其它测定组分。
连续稀释化合物.待测试的化合物和参照化合物(1-(5-(3-((4-(1,3,4-噁二唑-2-基)苯氧基)甲基)-1,2,4-噁二唑-5-基)噻吩-2-基)-2,2,2-三氟乙酮)的连续稀释液通过首先将冻干的化合物在100％DMSO中重新混悬至最终浓度为10mM来制备。制备原液即10mM化合物在DMSO中的70μL等分液并贮存在-20℃。根据表1使用125μL 16通道Matrix多通道移液管由待测试的每种化合物的一份原液等分液和参照化合物的一份原液等分液制备16点连续稀释液。
使用Bravo、Janus或12.5μL 16通道Matrix多通道移液管将2μL(200×)每种稀释液和每种对照品(完全活性为单独的100％DMSO或完全抑制为1mM)按压到V形底聚丙烯384孔化合物板中。通过添加38μL Jurkat测定缓冲液+DMSO(9.5％DMSO、不含有酚红的RPMI、0.09％FBS、9mM Hepes和0.9mM丙酮酸钠(平衡至室温))将具有200×化合物溶液的每个孔以1:20稀释。
制备5×(500μM)Boc-Lys(Tfa)-AMC底物.在即将加到测定中前制备5×(500μM)底物。5×底物如下制备：通过将100mM Boc-Lys(Tfa)-AMC在DMSO中的溶液滴加到Jurkat测定介质(不含有酚红的RPMI、0.1％FBS、10mM Hepes和1mM丙酮酸钠(平衡至37℃))中同时低速涡动以防止析出以1:200对100mM Boc-Lys(Tfa)-AMC在DMSO中的溶液进行稀释。
制备3×溶胞缓冲液.10mL 3×溶胞缓冲液用8.8mL 3×原液溶胞缓冲液(50mMTris-HCl(pH 8.0)、137mM NaCl、2.7mM KCl、1mM MgCl2和1％Nonidet P40代替物(平衡至室温))和1.2mL 3mg/mL胰蛋白酶(平衡至室温)制备。
测定.使用Bravo将5μL上述每种以1:20稀释的化合物的溶液转移到含有75,000个细胞/孔的Greiner微滴定测定板中。然后将细胞在37℃和5％CO2的条件下孵育2小时。然后测定如下开始：使用Bravo或16通道Matrix多通道移液管将10μL 5×(500μM)底物加到测定板中。然后将细胞在37℃和5％CO2的条件下孵育3小时。然后使用125μL 16通道移液管或Bravo向每个孔中加入25μL 3×溶胞缓冲液。然后将测定板在37℃和5％CO2的条件下孵育过夜(15-16小时)。第二天将板在定轨震摇器上以900rpm震摇1分钟。最后使用PerkinElmerEnVision对顶部读数的荧光进行测量(激发波长为355nm且发射波长为460nm)。
实施例F
使用上述测定方案对由上述合成方法合成的以下化合物进行测试。
尽管已显示和描述了一些实施方案，但是可对这些实施方案进行各种修改和代替而不背离本发明主旨和范围。例如，出于构建权利要求的目的，本申请所述权利要求不应该被理解为比其字面语言窄，因此说明书中的示例性实施方案不应该被阅读到权利要求中。因此，应该理解的是，已说明性地描述了本发明，但是不限制权利要求的范围。

Claims (56)

1.式I化合物或其药用盐：
其中：
R1选自-C(O)NH(OH)和-N(OH)C(O)R9；
R2选自芳基、杂芳基和杂环烷基，其各自任选取代有1至3个独立选自以下的取代基：卤素、烷基、环烷基、卤代烷基、羟基、烷氧基和腈基团；
A选自芳基和杂芳基；
R3和R4独立选自氢、烷基、卤素、NHSO2R10、C(O)NR11R12、NR11R12、腈基团、环烷基、杂环烷基、芳基、杂芳基、芳烷基和杂芳烷基，其各自任选取代有1至3个独立选自以下的取代基：卤素、烷基、环烷基、卤代烷基、羟基、烷氧基、芳基、杂芳基和腈基团，其中烷基和烷氧基任选取代有氨基、(烷基)氨基或二(烷基)氨基；
R5、R6、R7和R8在每次出现时独立选自氢和低级烷基；
R9选自氢和低级烷基；
R10选自低级烷基、环烷基、杂环烷基、芳基和杂芳基；
R11和R12独立选自氢、低级烷基、烷氧基、低级卤代烷基和环烷基，其中烷基和烷氧基任选取代有氨基、(烷基)氨基或二(烷基)氨基，且
m和m’独立选自0、1、2、3和4，条件是2≤(m+m’)≤4。
2.权利要求1的化合物或其药用盐，其中所述式I化合物选自式II化合物：
3.权利要求2的化合物或其药用盐，其中R3选自苯基，其任选取代有一个或两个独立选自以下的取代基：低级烷基、低级卤代烷基、低级烷氧基、低级卤代烷氧基和卤素。
4.权利要求3的化合物或其药用盐，其中R3选自苯基、2-甲基苯基、3-甲基苯基、4-甲基苯基、2-氟苯基、3-氟苯基、4-氟苯基、2-氯苯基、3-氯苯基、4-氯苯基、3-氯-2-氟苯基、2,6-二氟苯基、2,5-二甲基苯基、2,6-二甲基苯基、2-氯-6-氟苯基、2-氟-6-甲基苯基、2,4-二氟苯基、4-(二氟甲氧基)苯基和3-氟-2-甲基苯基。
5.权利要求2的化合物或其药用盐，其中R3选自吡啶-2-基、吡啶-4-基和吡嗪-2-基，其各自任选取代有一个或两个独立选自以下的取代基：低级烷基和卤素。
6.权利要求5的化合物或其药用盐，其中R3选自5-氟吡啶-2-基、吡嗪-2-基和3-甲基吡啶-4-基。
7.权利要求2的化合物或其药用盐，其中R3选自环丙基和环戊基，其各自任选取代有一个或两个独立选自以下的取代基：低级烷基和卤素。
8.权利要求7的化合物或其药用盐，其中R3选自环丙基和环戊基。
9.权利要求2的化合物或其药用盐，其中R3选自异丙基。
10.权利要求2-9中任一项的化合物或其药用盐，其中R4为氢。
11.权利要求1的化合物或其药用盐，其中所述式I化合物选自式III化合物：
12.权利要求11的化合物或其药用盐，其中R3选自低级烷基、低级卤代烷基和任选取代有卤素的芳烷基。
13.权利要求12的化合物或其药用盐，其中R3选自甲基、2,2,2,-三氟乙基和4-氟苄基。
14.权利要求11的化合物或其药用盐，其中R3选自苯基，其任选取代有一个或两个独立选自以下的取代基：低级烷基、低级卤代烷基、低级烷氧基、低级卤代烷氧基和卤素。
15.权利要求14的化合物或其药用盐，其中R3选自2-氟苯基、4-(二氟甲氧基)苯基、4-氟-2-甲基苯基和3-甲基苯基。
16.权利要求11的化合物或其药用盐，其中R3选自吡啶-2-基和吡啶-4-基，其各自任选取代有一个或两个独立选自以下的取代基：低级烷基和卤素。
17.权利要求15的化合物或其药用盐，其中R3选自3-甲基吡啶-4-基、3-氯吡啶-2-基和3-氟吡啶-2-基。
18.权利要求11-17中任一项的化合物或其药用盐，其中R4选自氢、环丙基和任选取代有卤素的苯基。
19.权利要求18的化合物或其药用盐，其中R4为氢。
20.权利要求1的化合物或其药用盐，其中所述式I化合物选自式IV化合物：
21.权利要求20的化合物或其药用盐，其中R3为氢。
22.权利要求20或21的化合物或其药用盐，其中R4为环丙基。
23.权利要求1的化合物或其药用盐，其中所述式I化合物选自式V化合物：
24.权利要求23的化合物或其药用盐，其中R3选自：
氢，
环烷基，其任选取代有一个或两个独立选自以下的基团：卤素、低级烷基、低级卤代烷基和低级烷氧基，
杂芳基，其任选取代有一个或两个独立选自以下的基团：卤素、低级烷基、低级卤代烷基和低级烷氧基，
苯基，其任选取代有一个或两个独立选自以下的基团：卤素、低级烷基、低级卤代烷基和低级烷氧基，
苄基，其在芳族部分上任选取代有一个或两个独立选自以下的基团：卤素、低级烷基、低级卤代烷基和低级烷氧基，和
-NHS(O)2R10，其中R10选自苯基。
25.权利要求24的化合物或其药用盐，其中R3选自氢、环丙基、任选取代有一个或两个独立选自氟和甲基的基团的苯基、嘧啶-5-基、任选取代有甲基的1H-吡唑-5-基、任选取代有甲基的1H-吡唑-4-基、任选取代有甲氧基的吡啶-2-基、在芳族部分上任选取代有三氟甲基的苄基和-NHS(O)2R10，其中R10选自苯基。
26.权利要求1的化合物或其药用盐，其中所述式I化合物选自式VI化合物：
27.权利要求26的化合物或其药用盐，其中R3选自氢、低级烷基、低级卤代烷基、环烷基、任选取代有卤素的苯基和杂芳基。
28.权利要求27的化合物或其药用盐，其中R3选自氢、三氟甲基、环丙基、任选取代有卤素的苯基和吡啶-3-基。
29.权利要求26至28中任一项的化合物或其药用盐，其中R4为氢。
30.权利要求1的化合物或其药用盐，其中所述式I化合物选自式VII化合物：
31.权利要求30的化合物或其药用盐，其中R3为氢。
32.权利要求30或31的化合物或其药用盐，其中R4为氢。
33.权利要求1的化合物或其药用盐，其中所述式I化合物选自式VIII化合物：
34.权利要求33的化合物或其药用盐，其中R3为苯基，其任选取代有1至3个独立选自以下的取代基：卤素、烷基、环烷基、卤代烷基、羟基和烷氧基。
35.权利要求34的化合物或其药用盐，其中R3为苯基。
36.权利要求1至35中任一项的化合物或其药用盐，其中R2选自芳基，其任选取代有1至3个独立选自以下的取代基：卤素、烷基、环烷基、卤代烷基、羟基、烷氧基和腈基团。
37.权利要求36的化合物或其药用盐，其中R2选自苯基，其任选取代有1至3个独立选自以下的取代基：卤素、烷基、环烷基、卤代烷基、羟基、烷氧基和腈基团。
38.权利要求37的化合物或其药用盐，其中R2选自苯基，其任选取代有1至3个独立选自以下的取代基：卤素和烷基。
39.权利要求38的化合物或其药用盐，其中R2选自苯基和3-氟-2-甲基苯基。
40.权利要求39的化合物或其药用盐，其中R2为3-氟-2-甲基苯基。
41.权利要求1至40中任一项的化合物或其药用盐，其中m为1且m’为1。
42.权利要求1至40中任一项的化合物或其药用盐，其中m为1且m’为2。
43.权利要求1至40中任一项的化合物或其药用盐，其中m为0且m’为2。
44.权利要求1至40中任一项的化合物或其药用盐，其中m为2且m’为2。
45.权利要求1至44中任一项的化合物或其药用盐，其中R1为-N(OH)C(O)R9。
46.权利要求45的化合物或其药用盐，其中R9为低级烷基。
47.权利要求1至44中任一项的化合物或其药用盐，其中R1选自-C(O)NH(OH)。
48.权利要求1至44中任一项的化合物或其药用盐，其中R5、R6、R7和R8在每次出现时为氢。
49.权利要求1的化合物或其药用盐，其中所述式I化合物选自：
(S)-5-(3-氟-2-甲基苯基)-N-羟基-1-苯基-1,4,5,6-四氢环戊并[c]吡唑-5-甲酰胺；
(S)-5-(3-氟-2-甲基苯基)-N-羟基-1-(邻甲苯基)-1,4,5,6-四氢环戊并[c]吡唑-5-甲酰胺；
(S)-5-(3-氟-2-甲基苯基)-1-(2-氟苯基)-N-羟基-1,4,5,6-四氢环戊并[c]吡唑-5-甲酰胺；
(S)-1-(3-氯苯基)-5-(3-氟-2-甲基苯基)-N-羟基-1,4,5,6-四氢环戊并[c]吡唑-5-甲酰胺；
(S)-5-(3-氟-2-甲基苯基)-1-(4-氟苯基)-N-羟基-1,4,5,6-四氢环戊并[c]吡唑-5-甲酰胺；
(S)-5-(3-氟-2-甲基苯基)-1-(3-氟苯基)-N-羟基-1,4,5,6-四氢环戊并[c]吡唑-5-甲酰胺；
(S)-1-(2-氯苯基)-5-(3-氟-2-甲基苯基)-N-羟基-1,4,5,6-四氢环戊并[c]吡唑-5-甲酰胺；
(S)-1-(4-氯苯基)-5-(3-氟-2-甲基苯基)-N-羟基-1,4,5,6-四氢环戊并[c]吡唑-5-甲酰胺；
(S)-5-(3-氟-2-甲基苯基)-N-羟基-1-(对甲苯基)-1,4,5,6-四氢环戊并[c]吡唑-5-甲酰胺；
(S)-1-(3-氯-2-氟苯基)-5-(3-氟-2-甲基苯基)-N-羟基-1,4,5,6-四氢环戊并[c]吡唑-5-甲酰胺；
(S)-1-(2,6-二氟苯基)-5-(3-氟-2-甲基苯基)-N-羟基-1,4,5,6-四氢环戊并[c]吡唑-5-甲酰胺；
(S)-1-(2,5-二甲基苯基)-5-(3-氟-2-甲基苯基)-N-羟基-1,4,5,6-四氢环戊并[c]吡唑-5-甲酰胺；
(S)-1-(2,6-二甲基苯基)-5-(3-氟-2-甲基苯基)-N-羟基-1,4,5,6-四氢环戊并[c]吡唑-5-甲酰胺；
(S)-1-(2-氯-6-氟苯基)-5-(3-氟-2-甲基苯基)-N-羟基-1,4,5,6-四氢环戊并[c]吡唑-5-甲酰胺；
(S)-5-(3-氟-2-甲基苯基)-1-(2-氟-6-甲基苯基)-N-羟基-1,4,5,6-四氢环戊并[c]吡唑-5-甲酰胺；
(S)-5-(3-氟-2-甲基苯基)-1-(5-氟吡啶-2-基)-N-羟基-1,4,5,6-四氢环戊并[c]吡唑-5-甲酰胺；
(S)-1-(2,4-二氟苯基)-5-(3-氟-2-甲基苯基)-N-羟基-1,4,5,6-四氢环戊并[c]吡唑-5-甲酰胺；
(S)-1-环戊基-5-(3-氟-2-甲基苯基)-N-羟基-1,4,5,6-四氢环戊并[c]吡唑-5-甲酰胺；
(S)-5-(3-氟-2-甲基苯基)-N-羟基-1-(吡嗪-2-基)-1,4,5,6-四氢环戊并[c]吡唑-5-甲酰胺；
(S)-1-(4-(二氟甲氧基)苯基)-5-(3-氟-2-甲基苯基)-N-羟基-1,4,5,6-四氢环戊并[c]吡唑-5-甲酰胺；
(S)-2-(4-(二氟甲氧基)苯基)-5-(3-氟-2-甲基苯基)-N-羟基-2,4,5,6-四氢环戊并[c]吡唑-5-甲酰胺；
(S)-5-(3-氟-2-甲基苯基)-1-(4-氟-2-甲基苯基)-N-羟基-1,4,5,6-四氢环戊并[c]吡唑-5-甲酰胺；
(S)-5-(3-氟-2-甲基苯基)-2-(4-氟-2-甲基苯基)-N-羟基-2,4,5,6-四氢环戊并[c]吡唑-5-甲酰胺；
(S)-5-(3-氟-2-甲基苯基)-N-羟基-1-(间甲苯基)-1,4,5,6-四氢环戊并[c]吡唑-5-甲酰胺；
(S)-5-(3-氟-2-甲基苯基)-N-羟基-2-(间甲苯基)-2,4,5,6-四氢环戊并[c]吡唑-5-甲酰胺；
(S)-5-(3-氟-2-甲基苯基)-N-羟基-1-(3-甲基吡啶-4-基)-1,4,5,6-四氢环戊并[c]吡唑-5-甲酰胺；
(S)-5-(3-氟-2-甲基苯基)-N-羟基-2-(3-甲基吡啶-4-基)-2,4,5,6-四氢环戊并[c]吡唑-5-甲酰胺；
(S)-2-(3-氯吡啶-2-基)-5-(3-氟-2-甲基苯基)-N-羟基-2,4,5,6-四氢环戊并[c]吡唑-5-甲酰胺；
(S)-5-(3-氟-2-甲基苯基)-2-(3-氟吡啶-2-基)-N-羟基-2,4,5,6-四氢环戊并[c]吡唑-5-甲酰胺；
(R)-5-(3-氟-2-甲基苯基)-N-羟基-1-苯基-1,4,5,6-四氢环戊并[c]吡唑-5-甲酰胺；
E1-(abs)-5-(3-氟-2-甲基苯基)-N-羟基-1-苯基-4,5,6,7-四氢-1H-吲唑-5-甲酰胺；
E2-(abs)-5-(3-氟-2-甲基苯基)-N-羟基-1-苯基-4,5,6,7-四氢-1H-吲唑-5-甲酰胺；
E1-(abs)-5-(3-氟-2-甲基苯基)-2-(2-氟苯基)-N-羟基-4,5,6,7-四氢-2H-吲唑-5-甲酰胺；
E2-(abs)-5-(3-氟-2-甲基苯基)-2-(2-氟苯基)-N-羟基-4,5,6,7-四氢-2H-吲唑-5-甲酰胺；
5-(3-氟-2-甲基苯基)-N-羟基-1-(2,2,2-三氟乙基)-4,5,6,7-四氢-1H-吲唑-5-甲酰胺和5-(3-氟-2-甲基苯基)-N-羟基-2-(2,2,2-三氟乙基)-4,5,6,7-四氢-2H-吲唑-5-甲酰胺；
5-(3-氟-2-甲基苯基)-1-(4-氟苄基)-N-羟基-4,5,6,7-四氢-1H-吲唑-5-甲酰胺和5-(3-氟-2-甲基苯基)-2-(4-氟苄基)-N-羟基-4,5,6,7-四氢-2H-吲唑-5-甲酰胺；
E1-(abs)-5-(3-氟-2-甲基苯基)-N-羟基-1-(邻甲苯基)-4,5,6,7-四氢-1H-吲唑-5-甲酰胺；
E2-(abs)-5-(3-氟-2-甲基苯基)-N-羟基-1-(邻甲苯基)-4,5,6,7-四氢-1H-吲唑-5-甲酰胺；
3-环丙基-5-(3-氟-2-甲基苯基)-N-羟基-2-(2,2,2-三氟乙基)-4,5,6,7-四氢-2H-吲唑-5-甲酰胺；
2-环丙基-6-(3-氟-2-甲基苯基)-N-羟基-4-氧代-3,4,5,6,7,8-六氢喹唑啉-6-甲酰胺；
6-(3-氟-2-甲基苯基)-N-羟基-2-(苯基磺酰氨基)-4,5,6,7-四氢苯并[d]噻唑-6-甲酰胺；
2-环丙基-6-(3-氟-2-甲基苯基)-N-羟基-4,5,6,7-四氢苯并[d]噻唑-6-甲酰胺；
6-(3-氟-2-甲基苯基)-N-羟基-2-(嘧啶-5-基)-4,5,6,7-四氢苯并[d]噻唑-6-甲酰胺；
6-(3-氟-2-甲基苯基)-N-羟基-4,5,6,7-四氢苯并[d]噻唑-6-甲酰胺；
6-(3-氟-2-甲基苯基)-N-羟基-5,6,7,8-四氢喹唑啉-6-甲酰胺；
2-环丙基-6-(3-氟-2-甲基苯基)-N-羟基-5,6,7,8-四氢喹唑啉-6-甲酰胺；
6-(3-氟-2-甲基苯基)-N-羟基-2-苯基-5,6,7,8-四氢喹唑啉-6-甲酰胺；
(S)-2-(2-氯苯基)-6-(3-氟-2-甲基苯基)-N-羟基-6,7-二氢-5H-环戊并[d]嘧啶-6-甲酰胺；
(R)-2-(2-氯苯基)-5-(3-氟-2-甲基苯基)-N-羟基-6,7-二氢-5H-环戊并[d]嘧啶-5-甲酰胺；
(R)-2-环丙基-6-(3-氟-2-甲基苯基)-N-羟基-6,7-二氢-5H-环戊并[d]嘧啶-6-甲酰胺；
(S)-2-环丙基-5-(3-氟-2-甲基苯基)-N-羟基-6,7-二氢-5H-环戊并[d]嘧啶-5-甲酰胺；
(S)-5-(3-氟-2-甲基苯基)-N-羟基-1-异丙基-1,4,5,6-四氢环戊并[c]吡唑-5-甲酰胺；
(4R)-4-(3-氟-2-甲基-苯基)-1-苯基-5,6-二氢环戊并[c]吡唑-4-异羟肟酸；
(6S)-6-(3-氟-2-甲基-苯基)-2-(4-氟苯基)-5,7-二氢环戊并[d]嘧啶-6-异羟肟酸；
(S)-6-(3-氟-2-甲基苯基)-N-羟基-2-(三氟甲基)-6,7-二氢-5H-环戊并[d]嘧啶-6-甲酰胺；
(R)-2-环丙基-5-(3-氟-2-甲基苯基)-N-羟基-6,7-二氢-5H-环戊并[d]嘧啶-5-甲酰胺；
(S)-2-环丙基-6-(3-氟-2-甲基苯基)-N-羟基-6,7-二氢-5H-环戊并[d]嘧啶-6-甲酰胺；
(S)-1-环丙基-5-(3-氟-2-甲基苯基)-N-羟基-1,4,5,6-四氢环戊并[c]吡唑-5-甲酰胺；
(R)-1-环丙基-4-(3-氟-2-甲基苯基)-N-羟基-1,4,5,6-四氢环戊并[c]吡唑-4-甲酰胺；
(S)-6-(3-氟-2-甲基苯基)-N-羟基-2-(吡啶-3-基)-6,7-二氢-5H-环戊并[d]嘧啶-6-甲酰胺；
E1-(abs)-5-(3-氟-2-甲基苯基)-2-(2-氟苯基)-N-羟基-5,6-二氢-4H-环戊并[d]噻唑-5-甲酰胺；
E2-(abs)-5-(3-氟-2-甲基苯基)-2-(2-氟苯基)-N-羟基-5,6-二氢-4H-环戊并[d]噻唑-5-甲酰胺；
5-(3-氟-2-甲基苯基)-N-羟基-2-(3-(三氟甲基)苄基)-5,6-二氢-4H-环戊并[d]噻唑-5-甲酰胺；
E1-(abs)-5-(3-氟-2-甲基苯基)-2-(3-氟苯基)-N-羟基-5,6-二氢-4H-环戊并[d]噻唑-5-甲酰胺；
E2-(abs)-5-(3-氟-2-甲基苯基)-2-(3-氟苯基)-N-羟基-5,6-二氢-4H-环戊并[d]噻唑-5-甲酰胺；
(R)-5-(3-氟-2-甲基苯基)-2-(4-氟苯基)-N-羟基-5,6-二氢-4H-环戊并[d]噻唑-5-甲酰胺；
(S)-5-(3-氟-2-甲基苯基)-2-(4-氟苯基)-N-羟基-5,6-二氢-4H-环戊并[d]噻唑-5-甲酰胺；
(S)-5-(3-氟-2-甲基苯基)-N-羟基-2-(1-甲基-1H-吡唑-5-基)-5,6-二氢-4H-环戊并[d]噻唑-5-甲酰胺；
(R)-5-(3-氟-2-甲基苯基)-N-羟基-2-(1-甲基-1H-吡唑-5-基)-5,6-二氢-4H-环戊并[d]噻唑-5-甲酰胺；
(R)-2-(1,3-二甲基-1H-吡唑-5-基)-5-(3-氟-2-甲基苯基)-N-羟基-5,6-二氢-4H-环戊并[d]噻唑-5-甲酰胺；
(R)-5-(3-氟-2-甲基苯基)-N-羟基-2-(5-甲氧基吡啶-2-基)-5,6-二氢-4H-环戊并[d]噻唑-5-甲酰胺；
(S)-2-环丙基-6-(3-氟-2-甲基苯基)-N-羟基-5,6-二氢-4H-环戊并[d]噻唑-6-甲酰胺；
(S)-6-(3-氟-2-甲基苯基)-N-羟基-2-(邻甲苯基)-5,6-二氢-4H-环戊并[d]噻唑-6-甲酰胺；
E1-(abs)-5-(3-氟-2-甲基苯基)-2-(4-氟-2-甲基苯基)-N-羟基-5,6-二氢-4H-环戊并[d]噻唑-5-甲酰胺；
E2-(abs)-5-(3-氟-2-甲基苯基)-2-(4-氟-2-甲基苯基)-N-羟基-5,6-二氢-4H-环戊并[d]噻唑-5-甲酰胺；
E1-(abs)-2-(1,5-二甲基-1H-吡唑-4-基)-5-(3-氟-2-甲基苯基)-N-羟基-5,6-二氢-4H-环戊并[d]噻唑-5-甲酰胺；
E2-(abs)-2-(1,5-二甲基-1H-吡唑-4-基)-5-(3-氟-2-甲基苯基)-N-羟基-5,6-二氢-4H-环戊并[d]噻唑-5-甲酰胺；
(S)-6-(3-氟-2-甲基苯基)-2-(4-氟苯基)-N-羟基-5,6-二氢-4H-环戊并[d]噻唑-6-甲酰胺；
(R)-5-(3-氟-2-甲基苯基)-3-(4-氟苯基)-N-羟基-2-甲基-2,4,5,6-四氢环戊并[c]吡唑-5-甲酰胺；
E1-(abs)-5-(3-氟-2-甲基苯基)-N-羟基-3-苯基-5,6-二氢-4H-环戊并[d]异噻唑-5-甲酰胺；
E2-(abs)-5-(3-氟-2-甲基苯基)-N-羟基-3-苯基-5,6-二氢-4H-环戊并[d]异噻唑-5-甲酰胺；
2-(3-氟-2-甲基苯基)-N-羟基-2,3-二氢-1H-茚-2-甲酰胺；
2-环丙基-7-(3-氟-2-甲基苯基)-N-羟基-6,7,8,9-四氢-5H-环庚并[d]嘧啶-7-甲酰胺；
E1-(abs)-6-(3-氟-2-甲基苯基)-N-羟基-2-(2,2,2-三氟乙基)-2,4,5,6,7,8-六氢环庚并[c]吡唑-6-甲酰胺；
E2-(abs)-6-(3-氟-2-甲基苯基)-N-羟基-2-(2,2,2-三氟乙基)-2,4,5,6,7,8-六氢环庚并[c]吡唑-6-甲酰胺；
N-羟基-6-苯基-2-(2,2,2-三氟乙基)-2,4,5,6,7,8-六氢环庚并[c]吡唑-6-甲酰胺；
E1-(abs)-N-羟基-1-苯基-2,3-二氢-1H-茚-1-甲酰胺；
E2-(abs)-N-羟基-1-苯基-2,3-二氢-1H-茚-1-甲酰胺；
N-羟基-2-苯基-2,3-二氢-1H-茚-2-甲酰胺；
(R)-4-(3-氟-2-甲基苯基)-2-(2-氟苄基)-N-羟基-2,4,5,四氢环戊并[c]吡唑-4-甲酰胺；
(S)-1-(2-氯-4-氟苯基)-5-(3-氟-2-甲基苯基)-N-羟基-1,4,5,6-四氢环戊并[c]吡唑-5-甲酰胺；
(S)-2-(4,6-二甲基嘧啶-2-基)-5-(3-氟-2-甲基苯基)-N-羟基-2,4,5,6-四氢环戊并[c]吡唑-5-甲酰胺；
(S)-1-苄基-5-(3-氟-2-甲基苯基)-N-羟基-1,4,5,6-四氢环戊并[c]吡唑-5-甲酰胺；
(R)-1-苄基-4-(3-氟-2-甲基苯基)-N-羟基-1,4,5,6-四氢环戊并[c]吡唑-4-甲酰胺；
(R)-2-苄基-4-(3-氟-2-甲基苯基)-N-羟基-2,4,5,6-四氢环戊并[c]吡唑-4-甲酰胺；和
(R)-2-苄基-4-(3-氟-2-甲基苯基)-N-羟基-2,4,5,6-四氢环戊并[c]吡唑-4-甲酰胺。
50.一种药物组合物，其包含权利要求1-49中任一项的化合物或其药用盐和药用载体。
51.制备药物组合物的方法，其包括将权利要求1-49中任一项的化合物或其药用盐与药用载体混合。
52.在有此需要的患者中治疗由至少一种组蛋白脱乙酰酶介导的病症或障碍的方法，其包括向所述患者给药治疗有效量的权利要求1-49中任一项的化合物或其药用盐。
53.在有此需要的患者中治疗对抑制至少一种组蛋白脱乙酰酶有应答的病症或障碍的方法，其包括向所述患者给药治疗有效量的权利要求1-49中任一项的化合物或其药用盐。
54.权利要求52或53的方法，其中所述至少一种组蛋白脱乙酰酶为HDAC4。
55.权利要求52或53的方法，其中所述病症或障碍涉及神经变性病理。
56.权利要求52或53的方法，其中所述病症或障碍为亨廷顿病。
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Cited By (1)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Publication number Priority date Publication date Assignee Title
CN108379585A (zh) * 2018-04-16 2018-08-10 复旦大学附属中山医院 Hdac4抑制剂在制备治疗心力衰竭的药物中的应用

Families Citing this family (9)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Publication number Priority date Publication date Assignee Title
WO2014159210A1 (en) 2013-03-14 2014-10-02 Chdi Foundation, Inc. Histone deacetylase inhibitors and compositions and methods of use thereof
US9617259B2 (en) 2013-03-14 2017-04-11 Chdi Foundation, Inc. Histone deacetylase inhibitors and compositions and methods of use thereof
EP2968233A4 (en) 2013-03-14 2016-08-03 Chdi Foundation Inc HISTON DEACETYLASE HEMMER AND COMPOSITIONS AND METHOD FOR USE THEREOF
US10065948B2 (en) 2014-06-02 2018-09-04 Chdi Foundation, Inc. Histone deacetylase inhibitors and compositions and methods of use thereof
WO2018165520A1 (en) 2017-03-10 2018-09-13 Vps-3, Inc. Metalloenzyme inhibitor compounds
EP3664802B1 (en) * 2017-08-07 2022-02-23 Alkermes, Inc. Bicyclic inhibitors of histone deacetylase
KR102118689B1 (ko) * 2018-10-17 2020-06-09 최돈수 유기전자소자용 화합물, 이를 포함하는 유기전자소자 및 유기전자소자를 포함하는 표시장치
WO2023177250A1 (ko) * 2022-03-17 2023-09-21 숙명여자대학교산학협력단 신규 헤테로고리 히스톤 탈아세틸화 효소 저해제 및 이를 포함하는 약학조성물
WO2023177249A1 (ko) * 2022-03-17 2023-09-21 숙명여자대학교산학협력단 신규 이원환의 히스톤 탈아세틸화 효소 저해제 및 이를 포함하는 약학조성물

Citations (7)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Publication number Priority date Publication date Assignee Title
US4760174A (en) * 1984-09-22 1988-07-26 Basf Aktiengesellschaft Tetralin derivatives, their preparation and their use
US6384072B1 (en) * 1997-11-10 2002-05-07 Fujisawa Pharmaceutical Co., Ltd. Benzocycloheptene derivatives
US20070111967A1 (en) * 2003-07-09 2007-05-17 Miller David J Organosilicon compounds and their use
WO2008122115A1 (en) * 2007-04-09 2008-10-16 Methylgene Inc. Inhibitors of histone deacetylase
EP2045246A1 (en) * 2006-07-07 2009-04-08 Universidad De Granada Derivatives of benzo[d] isothiazoles as histone deacetylase inhibitors
US20110046139A1 (en) * 2008-04-28 2011-02-24 Bruno Schoentjes Benzocycloheptane and benzoxepine derivatives
US20110319420A1 (en) * 2008-12-25 2011-12-29 Harbin Gloria Pharmaceuticals Co., Ltd Preparation method of dihydroindene amide compounds, their pharmaceutical compositions containing compounds thereof and use as protein kinases inhibitor

Family Cites Families (20)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Publication number Priority date Publication date Assignee Title
US4003859A (en) 1974-01-30 1977-01-18 The Upjohn Company Novel process for trimerizing polyisocyanates
US5250732A (en) 1991-07-18 1993-10-05 Genentech, Inc. Ketamine analogues for treatment of thrombocytopenia
JP2005508985A (ja) 2001-11-09 2005-04-07 ノボ ノルディスク ヘルス ケア アクチェンゲゼルシャフト Ｖｉｉ因子ポリペプチドおよびアプロチニンポリペプチドを含む薬学的組成物
JP2007508318A (ja) * 2003-10-09 2007-04-05 エートン ファーマ インコーポレーティッド チオフェンおよびベンゾチオフェンヒドロキサム酸誘導体
US20060069157A1 (en) 2004-02-19 2006-03-30 U.S. Department Of Veterans Affairs Method of ameliorating or abrogating the effects of a neurodegenerative disorder, such as Huntington's disease, by sodium butyrate chemotherapy
US7276631B2 (en) 2004-07-20 2007-10-02 Bristol-Myers Squibb Company Cyclopentylamine and cyclohexylamine derivatives as NK-1/SSRI antagonists
GB0510204D0 (en) * 2005-05-19 2005-06-22 Chroma Therapeutics Ltd Enzyme inhibitors
GB0521244D0 (en) 2005-10-19 2005-11-30 Astrazeneca Ab Benzamide compounds
AU2008307575A1 (en) * 2007-10-04 2009-04-09 Merck Sharp & Dohme Corp. N-hydroxy-naphthalene dicarboxamide and N-hydroxy-biphenyl-dicarboxamide compounds as histone deacetylase inhibitors
US20110212969A1 (en) * 2010-02-26 2011-09-01 Millennium Pharmaceuticals, Inc. Substituted hydroxamic acids and uses thereof
WO2012012320A1 (en) * 2010-07-19 2012-01-26 Millenium Pharmaceuticals, Inc. Substituted hydroxamic acids and uses thereof
US8614223B2 (en) 2010-11-16 2013-12-24 Acetylon Pharmaceuticals, Inc. Pyrimidine hydroxy amide compounds as protein deacetylase inhibitors and methods of use thereof
TW201245115A (en) 2011-01-24 2012-11-16 Chdi Foundation Inc Histone deacetylase inhibitors and compositions and methods of use thereof
CN102775368B (zh) * 2011-05-10 2016-08-17 上海驺虞医药科技有限公司 一类噻唑类化合物及其制备方法和用途
AR091773A1 (es) 2012-07-16 2015-02-25 Chdi Foundation Inc Inhibidores de la histona desacetilasa y composiciones y sus metodos de uso
US9617259B2 (en) 2013-03-14 2017-04-11 Chdi Foundation, Inc. Histone deacetylase inhibitors and compositions and methods of use thereof
WO2014159214A1 (en) 2013-03-14 2014-10-02 Chdi Foundation, Inc. Histone deacetylase inhibitors and compositions and methods of use thereof
WO2014159210A1 (en) 2013-03-14 2014-10-02 Chdi Foundation, Inc. Histone deacetylase inhibitors and compositions and methods of use thereof
EP2968233A4 (en) 2013-03-14 2016-08-03 Chdi Foundation Inc HISTON DEACETYLASE HEMMER AND COMPOSITIONS AND METHOD FOR USE THEREOF
US10065948B2 (en) 2014-06-02 2018-09-04 Chdi Foundation, Inc. Histone deacetylase inhibitors and compositions and methods of use thereof

Patent Citations (7)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Publication number Priority date Publication date Assignee Title
US4760174A (en) * 1984-09-22 1988-07-26 Basf Aktiengesellschaft Tetralin derivatives, their preparation and their use
US6384072B1 (en) * 1997-11-10 2002-05-07 Fujisawa Pharmaceutical Co., Ltd. Benzocycloheptene derivatives
US20070111967A1 (en) * 2003-07-09 2007-05-17 Miller David J Organosilicon compounds and their use
EP2045246A1 (en) * 2006-07-07 2009-04-08 Universidad De Granada Derivatives of benzo[d] isothiazoles as histone deacetylase inhibitors
WO2008122115A1 (en) * 2007-04-09 2008-10-16 Methylgene Inc. Inhibitors of histone deacetylase
US20110046139A1 (en) * 2008-04-28 2011-02-24 Bruno Schoentjes Benzocycloheptane and benzoxepine derivatives
US20110319420A1 (en) * 2008-12-25 2011-12-29 Harbin Gloria Pharmaceuticals Co., Ltd Preparation method of dihydroindene amide compounds, their pharmaceutical compositions containing compounds thereof and use as protein kinases inhibitor

Cited By (2)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Publication number Priority date Publication date Assignee Title
CN108379585A (zh) * 2018-04-16 2018-08-10 复旦大学附属中山医院 Hdac4抑制剂在制备治疗心力衰竭的药物中的应用
CN108379585B (zh) * 2018-04-16 2020-10-16 复旦大学附属中山医院 Hdac4抑制剂在制备治疗心力衰竭的药物中的应用

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Publication number Publication date
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