CN105683211A - 新型多肽 - Google Patents

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Abstract

本发明涉及共价结合至分子支架的多肽,其中两个或更多个肽环在支架的附着点之间相对。特别地,本发明描述了对人和大鼠的蛋白酶血浆激肽释放酶特异的、并且在一个或两个肽环中存在修饰以增强效能和/或蛋白酶抗性的肽。

Description

新型多肽
技术领域
本发明涉及共价结合至分子支架的多肽,其中两个或更多个肽环在支架的附着点之间相对。特别地,本发明描述了特异于人和大鼠蛋白酶血浆激肽释放酶的并且在一个或两个肽环中存在修饰以增强效能和/或蛋白酶抗性的肽。
背景技术
环肽能够以高亲和性和靶标特异性的方式结合蛋白靶标,并且因此是用于治疗开发的有吸引力的分子类型。实际上,数个环肽已经成功用于临床,例如,如抗菌肽万古霉素,免疫抑制药物环孢霉素或抗癌药物奥曲肽(octreotide)(Driggers等人(2008),NatRevDrugDiscov7(7),608-24)。良好的结合特性来自肽和靶标之间形成的相对大的相互作用表面,以及降低的环状结构构象柔性。典型地,大环结合数百平方埃的表面,例如,环肽CXCR4拮抗剂CVX15(Wu等人(2007),Science330,1066-71)、结合整合素αVb3的具有Arg-Gly-Asp基序的环肽(Xiong等人(2002),Science296(5565),151-5)、或结合尿激酶型纤溶酶原激活物的环肽抑制剂upain-1(Zhao等人(2007)JStructBiol160(1),1-10)。
由于其环状构型,大环肽比线性肽柔性低,导致了在结合靶标时熵损失较少,且得到了较高的结合亲和性。降低的柔性还导致锁定靶标特异性构象,与线性肽相比增加了结合特异性。该效果已经被基质金属蛋白酶8(MMP-8)有效的选择性抑制剂例证了,其中当其环打开时,失去了对其它MMP的选择性(Cherney等人(1998),JMedChem41(11),1749-51)。通过大环化实现的有利的结合特性,甚至在具有一个以上肽环的多环肽中更显著,例如,在万古霉素、乳酸链球菌肽或放线菌素中。
先前不同的研究小组将带有半胱氨酸残基的多肽连接至合成的分子结构上(Kemp和McNamara(1985),J.Org.Chem;Timmerman等人(2005),ChemBioChem)。Meloen和同事使用三(溴甲基)苯和相关分子将多个肽环快速且定量地环化至合成的支架上,用于蛋白表面的结构化模拟(Timmerman等人(2005),ChemBioChem)。生成候选药物化合物的方法公开于WO2004/077062和WO2006/078161中,其中通过将含有半胱氨酸的多肽连接至例如三(溴甲基)苯的分子支架生成所述化合物。
已开发了基于噬菌体展示的组合方法,用于产生和筛选感兴趣的靶标的双环肽的大文库(Heinis等人(2009),NatChemBiol5(7),502-7和WO2009/098450)。简言之,含三个半胱氨酸残基和两个区域的六个随机氨基酸(Cys-(Xaa)6-Cys-(Xaa)6-Cys)(SEQIDNO:97)的线性肽组合文库在噬菌体上展示,并通过半胱氨酸侧链共价连接至小分子(三(溴甲基)苯)进行环化。在对人蛋白酶组织蛋白酶G和血浆激肽释放酶(PK)的亲和性选择中分离的双环肽证实为纳摩尔级的抑制常数。WO2013/050615和WO2013/050616进一步公开了特异于人血浆激肽释放酶的双环肽配体。
发明内容
根据本发明的第一方面,提供了一种特异于血浆激肽释放酶的肽配体,其包含多肽,所述多肽包含被至少两个环序列分隔的至少三个半胱氨酸残基,以及分子支架,所述分子支架与多肽的半胱氨酸残基形成共价键,从而在分子支架上形成至少两个多肽环,其中所述肽配体包含选自以下任意的肽序列:
(a)-Ci-N-X-W-N-P-W-Cii-O/U-X-X-X-O/J-X-Ciii-(SEQIDNO:1);
(b)-Ci-B-N-J-W-N-P-Cii-X-L-O-X-X-X-Ciii-(SEQIDNO:2);
(c)-Ci-Q-K-F-E-S-R-Cii-X-X-X-X-X-X-Ciii-(SEQIDNO:3);
(d)-Ci-P-L-S-D-T-L-Cii-Y-R-R-M-P-P-Ciii-(SEQIDNO:4);
(e)-Ci-P-Y-P-F-R-Cii-X-H-X-X-X-Ciii-(SEQIDNO:5);和
(f)-Ci-(N)a-U-J-P-J-R-Cii-V-Y-Y-P-D-I-Ciii-(SEQIDNO:6);
或其经修饰的衍生物,或药学可接受的盐;
其中:
Ci、Cii和Ciii分别代表第一、第二和第三半胱氨酸残基;
下标“a”代表选自0或1的整数;
X代表任意氨基酸残基;
O代表非极性的脂肪族氨基酸残基,选自G、A、I、L、P和V;
J代表非极性的芳香族氨基酸残基,选自F、W和Y;
U代表极性的不带电的氨基酸残基,选自N、C、Q、M、S和T;以及
B代表极性的带正电的氨基酸残基,选自R、H和K。
根据如文中实施例中描述的生物选择,鉴定本发明的新的结合激肽释放酶的双环肽配体。在生物选择期间,在人和大鼠激肽释放酶间转换靶标诱饵,鉴定具有物种间良好的交叉反应性的前导序列。为增强形成双环肽前导物的能力,在分子上引入增溶修饰,并且大鼠药代动力学分析显示在体内序列具有高代谢稳定性。
根据本发明的其它方面,提供了一种药物组合物,其包含如文中定义的肽配体,所述肽配体与一种或更多种药学可接受的赋形剂组合。
根据本发明的其它方面,提供了一种如文中定义的肽配体在预防、抑制或治疗炎症状态、变应性超敏反应、癌症、细菌或病毒感染和自体免疫性疾病中的用途。
附图说明
图1:相对于交叉反应性的新型结合激肽释放酶的双环前导而言,06-34-18对照的比较性大鼠血浆稳定性。
图2:相对于交叉反应性的新型结合激肽释放酶的双环前导而言,06-34-18对照的比较性人血浆稳定性。
图3:衍生物06-550在人(A)和大鼠(B)血浆中的比较性稳定性。在0(高)、21(中)和46(低)小时取样血浆和肽的混合物。肽的母体峰在2481.9MH+。随着46小时的时间进程观察到很少的降解,母体峰保持高的相对丰度。
图4:在大鼠中两个选择的肽的体内药代动力学谱。特别地,衍生物06-259-02在大鼠循环中显示显著的稳定性,其清除主要通过肾滤过驱动。
图5:在兔的玻璃体内注射两种选择的肽后体内药代动力学分析。包括衍生物06-550的两种肽从玻璃状液中被缓慢地清除,具有20-30小时的清除半衰期。
图6:两种选择的肽对角叉菜胶诱导的足肿胀的作用。在所有时间点,包括衍生物06-259-02的两种肽均抑制由角叉菜胶诱导的足肿胀。
具体实施方式
除非另有定义,所有用于文中的技术和科学术语具有与本领域技术人员通常理解的相同含义,如肽化学领域、细胞培养和噬菌体展示领域、核酸化学和生物化学领域。用于分子生物学、遗传学和生物化学方法的标准技术(参见Sambrook等人,MolecularCloning:ALaboratoryManual,第三版,2001,ColdSpringHarborLaboratoryPress,ColdSpringHarbor,NY;Ausubel等人,ShortProtocolsinMolecularBiology(1999)第四版,JohnWiley&Sons,Inc.)引入文中作参考。
肽配体
如文中所指的肽配体,指与分子支架共价连接的肽。典型地,该肽包含两个或更多个能够与支架形成共价键的反应基团(即半胱氨酸残基),以及在所述反应基团之间相对(subtended)的序列,其被称为环序列,因为当肽和支架结合时,其形成环。在本情况中,肽包含至少三个半胱氨酸残基(文中指Ci、Cii和Ciii),并在支架上形成至少两个环。
在一个实施方案中,所述肽配体包含式(a)的序列。如实施例1和表2和表4中描述的,式(a)的一致性序列含有来自初始前导双环肽06-259的基序,以及通过初始前导物的亲和性成熟鉴定的每个最有前景的肽序列的基序。
在其它的实施方案中,式(a)的肽包含选自-Ci-N-X-W-N-P-W-Cii-O/U-X-X-X-O-X-Ciii-(SEQIDNO:7)的序列。
在另一个实施方案中,式(a)的肽包含选自-Ci-N-T/H/Y-W-N-P-W-Cii-G/S/P-A/V/W/D/S-D/E/V/T/P-A/G/P/I/R/D-G/P/Y/I-F/I/L/V/R/G/D-Ciii-(SEQIDNO:8)的序列。
在另一个实施方案中,式(a)的肽包含选自-Ci-N-T/H/Y-W-N-P-W-Cii-G/S/P-A/V/W-D/E/V-A/G/P-G/P-F/I/L/V-Ciii-(SEQIDNO:9)的序列。
在另一个实施方案中,式(a)的肽包含选自以下的序列:
-Ci-N-T-W-N-P-W-Cii-G-W-V-G-G-F-Ciii-(06-259)(SEQIDNO:10);
-Ci-N-H-W-N-P-W-Cii-S-V-E-P-P-V-Ciii-(06-259-01)(SEQIDNO:11);
-Ci-N-T-W-N-P-W-Cii-P-W-D-A-P-L-Ciii-(06-259-02)(SEQIDNO:12);
-Ci-N-H-W-N-P-W-Cii-S-A-D-P-P-I-Ciii-(06-259-03)(SEQIDNO:13);
-Ci-N-Y-W-N-P-W-Cii-P-W-D-A-P-L-Ciii-(06-259-04)(SEQIDNO:14);
-Ci-N-H-W-N-P-W-Cii-S-A-D-P-P-R-Ciii-(06-259-F1)(SEQIDNO:15);
-Ci-N-H-W-N-P-W-Cii-P-A-D-I-P-V-Ciii-(06-259-E2)(SEQIDNO:16);
-Ci-N-H-W-N-P-W-Cii-S-D-D-P-Y-I-Ciii-(06-259-H3)(SEQIDNO:17);
-Ci-N-H-W-N-P-W-Cii-S-S-D-P-P-V-Ciii-(06-259-H4)(SEQIDNO:18);
-Ci-N-Y-W-N-P-W-Cii-S-D-T-R-I-G-Ciii-(06-259-A6)(SEQIDNO:19);和
-Ci-N-T-W-N-P-W-Cii-S-W-P-D-I-D-Ciii-(06-259-F2)(SEQIDNO:20)。
在仍然更进一步的实施方案中,式(a)的肽包含选自以下的序列:
-Ci-N-H-W-N-P-W-Cii-S-V-E-P-P-V-Ciii-(06-259-01)(SEQIDNO:11);
-Ci-N-T-W-N-P-W-Cii-P-W-D-A-P-L-Ciii-(06-259-02)(SEQIDNO:12);
-Ci-N-H-W-N-P-W-Cii-S-A-D-P-P-I-Ciii-(06-259-03)(SEQIDNO:13);和
-Ci-N-Y-W-N-P-W-Cii-P-W-D-A-P-L-Ciii-(06-259-04)(SEQIDNO:14)。
根据亲和性成熟,该实施方案中的肽被鉴定为最有效的候选物之一(参见实施例1和表4)。此外,该实施方案的每个肽被鉴定证实是高效的,并且在大鼠和人激肽释放酶间具有良好的交叉反应性(参见表5)。
在仍然更进一步的实施方案中,式(a)的肽包含选自-Ci-N-T-W-N-P-W-Cii-P-W-D-A-P-L-Ciii-(06-259-02)(SEQIDNO:12)的序列。该实施方案的肽被鉴定为式(a)的肽配体家族中最有效、最具交叉反应性的和最稳定性的成员(参见实施例1和2)。例如,正如长达10天的检测窗口所判断的,使用文中描述的方法#1初始筛选表明06-259-02相比余下大部分的双环前导物更为稳定(数据未显示)。此外,离体稳定性还在体内、特别是在大鼠中是可重复的,正如清除以及与已知的肾小球滤过率的比较所判断的,肽的代谢几乎是不存在的(实施例4)。
在一个实施方案中,所述肽配体包含式(b)的序列。如实施例1和表2和表3中描述的,式(b)的一致性序列含有来自初始前导双环肽06-254和06-255的基序,以及通过初始前导物06-254的亲和性成熟鉴定的每个最有前景的肽序列的基序。
在另一实施方案中,式(b)的肽包含选自-Ci-K/R-N-Y-W-N-P-Cii-D/T/G-L-I/V/L-E/M/N/P/T/Q/S/Y/G/D/W/R/H/A-D/G/I/T/A/S/P/V-P/S/T/A/K/G/H/F/Q/D/L/I/M/R/Y-Ciii-(SEQIDNO:21)的序列。
在又一个实施方案中,式(b)的肽包含选自-Ci-K/R-N-Y-W-N-P-Cii-D/T-L-I/V-E/M/N/P/T-D/G/I/T-P/S/T-Ciii-(SEQIDNO:22)的序列。
在另一个实施方案中,式(b)的肽包含选自以下的序列:
-Ci-K-N-Y-W-N-P-Cii-D-L-V-T-I-S-Ciii-(06-254)(SEQIDNO:23);
-Ci-K-N-Y-W-N-P-Cii-D-L-I-E-T-T-Ciii-(06-254-01)(SEQIDNO:24);
-Ci-K-N-Y-W-N-P-Cii-D-L-I-P-G-P-Ciii-(06-254-02)(SEQIDNO:25);
-Ci-K-N-Y-W-N-P-Cii-D-L-V-M-D-T-Ciii-(06-254-03)(SEQIDNO:26);
-Ci-K-N-Y-W-N-P-Cii-D-L-I-Q-D-A-Ciii-(06-254-F4)(SEQIDNO:27);
-Ci-K-N-Y-W-N-P-Cii-D-L-I-S-I-K-Ciii-(06-254-B3)(SEQIDNO:28);
-Ci-K-N-Y-W-N-P-Cii-D-L-I-P-T-G-Ciii-(06-254-G3)(SEQIDNO:29);
-Ci-K-N-Y-W-N-P-Cii-D-L-V-Q-I-H-Ciii-(06-254-H4)(SEQIDNO:30);
-Ci-K-N-Y-W-N-P-Cii-D-L-I-G-I-T-Ciii-(06-254-G2)(SEQIDNO:31);
-Ci-K-N-Y-W-N-P-Cii-D-L-V-D-T-F-Ciii-(06-254-A4)(SEQIDNO:32);
-Ci-K-N-Y-W-N-P-Cii-D-L-V-E-A-Q-Ciii-(06-254-G4)(SEQIDNO:33);
-Ci-K-N-F-W-N-P-Cii-D-L-I-P-I-S-Ciii-(06-254-D3)(SEQIDNO:34);
-Ci-K-N-Y-W-N-P-Cii-D-L-I-W-T-D-Ciii-(06-254-E2)(SEQIDNO:35);
-Ci-K-N-Y-W-N-P-Cii-D-L-I-P-D-L-Ciii-(06-254-F5)(SEQIDNO:36);
-Ci-K-N-Y-W-N-P-Cii-D-L-L-E-S-T-Ciii-(06-254-E5)(SEQIDNO:37);
-Ci-K-N-Y-W-N-P-Cii-D-L-I-R-P-P-Ciii-(06-254-D1)(SEQIDNO:38);
-Ci-K-N-Y-W-N-P-Cii-D-L-L-G-I-A-Ciii-(06-254-B9)(SEQIDNO:39);
-Ci-K-N-Y-W-N-P-Cii-D-L-V-H-D-I-Ciii-(06-254-E3)(SEQIDNO:40);
-Ci-K-N-Y-W-N-P-Cii-D-L-I-P-D-M-Ciii-(06-254-D6)(SEQIDNO:41);
-Ci-K-N-Y-W-N-P-Cii-D-L-I-A-D-L-Ciii-(06-254-H3)(SEQIDNO:42);
-Ci-K-N-Y-W-N-P-Cii-D-L-L-H-V-R-Ciii-(06-254-A7)(SEQIDNO:43);
-Ci-K-N-Y-W-N-P-Cii-D-L-I-A-P-Y-Ciii-(06-254-C1)(SEQIDNO:44);
-Ci-K-N-Y-W-N-P-Cii-G-L-V-Y-S-T-Ciii-(06-254-E6)(SEQIDNO:45);
-Ci-K-N-Y-W-N-P-Cii-D-L-L-P-D-L-Ciii-(06-254-B1)(SEQIDNO:46);和
-Ci-R-N-Y-W-N-P-Cii-T-L-I-N-I-T-Ciii-(06-255)(SEQIDNO:47)。
在仍然更进一步的实施方案中,式(b)的肽包含选自以下的序列:
-Ci-K-N-Y-W-N-P-Cii-D-L-I-E-T-T-Ciii-(06-254-01)(SEQIDNO:24);
-Ci-K-N-Y-W-N-P-Cii-D-L-I-P-G-P-Ciii-(06-254-02)(SEQIDNO:25);
-Ci-K-N-Y-W-N-P-Cii-D-L-V-M-D-T-Ciii-(06-254-03)(SEQIDNO:26);和
-Ci-R-N-Y-W-N-P-Cii-T-L-I-N-I-T-Ciii-(06-255)(SEQIDNO:47)。
根据亲和性成熟,该实施方案中的肽被鉴定为最有效的候选物(参见实施例1和表3)。此外,该实施方案的每一个肽被鉴定证实具有高效能,并且在大鼠和人激肽释放酶间具有良好的交叉反应性(参见表5)。
在仍然更进一步的实施方案中,式(b)的肽包含选自以下的序列:
-Ci-K-N-Y-W-N-P-Cii-D-L-I-P-G-P-Ciii-(06-254-02)(SEQIDNO:25);和
-Ci-R-N-Y-W-N-P-Cii-T-L-I-N-I-T-Ciii-(06-255)(SEQIDNO:47)。
该实施方案的肽被鉴定为式(b)的每个肽配体家族中最有效的成员(参见实施例2)。
在仍更进一步的实施方案中,式(b)的肽包含选自-Ci-R-N-Y-W-N-P-Cii-T-L-I-N-I-T-Ciii-(06-255)(SEQIDNO:47)的序列。正如长达10天的检测窗口所判断的,使用文中描述的方法#1初始筛选表明06-255相比余下大部分的双环前导更为稳定(数据未显示)。
在一个实施方案中,肽配体包含式(c)的序列。如实施例1和表2中描述的,式(c)的一致性序列含有来自初始前导双环肽06-256的环1中固定的QKFESR(SEQIDNO:48)基序及其所含有的相似衍生物。
在另一实施方案中,式(c)的肽包含选自-Ci-Q-K-F-E-S-R-Cii-R-V-D-T-R-Y-Ciii-(06-256)(SEQIDNO:49)的序列。06-256在人、大鼠和兔间的交叉反应性数据在表1和表5中显示。
在一个实施方案中,肽配体包含式(d)的序列。式(d)的肽序列对应于在实施例1和表1中描述的初始前导双环肽06-257的序列。06-257在人、大鼠和兔间的交叉反应性数据在表1和表5中显示。
在一个实施方案中,肽配体包含式(e)的序列。式(e)的一致性序列含有在初始前导双环肽06-258中的环1中保守的PYPFR(SEQIDNO:50)基序,以及在环2的位置2的组氨酸残基,其中一致性是基于在初始选择循环中鉴定的相似的序列(实施例1和表2)。
在另一个实施方案中,式(f)的肽包含选自-Ci-(N)a-U-F-P-J-R-Cii-V-Y-Y-P-D-I-Ciii-(SEQIDNO:51)的序列。
在另一个实施方案中,式(e)的肽包含选自-Ci-P-Y-P-F-R-Cii-L-H-E-N-L-Ciii-(06-258)(SEQIDNO:52)的序列。该实施方案的肽被鉴定证实具有高效能,并且在大鼠和人激肽释放酶间具有良好交叉反应性(参见表5)。
在一个实施方案中,肽配体包含式(f)的序列。如实施例1和表1和2描述的,式(f)的一致性序列含有来自初始前导双环肽06-261和06-550的基序,以及来自初始筛选鉴定的每个最具有前景的肽序列的基序。
在更进一步的实施方案中,式(f)的肽包含选自-Ci-(N)a-N/S-F-P-F/Y-R-Cii-V-Y-Y-P-D-I-Ciii-(SEQIDNO:53)的序列。
在另一实施方案中,式(f)的肽包含选自以下的序列:
-Ci-N-N-F-P-F-R-Cii-V-Y-Y-P-D-I-Ciii-(06-261)(SEQIDNO:54);或者
-Ci-S-F-P-Y-R-Cii-V-Y-Y-P-D-I-Ciii-(06-550)(SEQIDNO:55)。
在仍然更进一步的实施方案中,式(f)的肽包含选自-Ci-N-N-F-P-F-R-Cii-V-Y-Y-P-D-I-Ciii-(06-261)(SEQIDNO:54)的序列。根据选择,该实施方案的肽被鉴定为最有效的候选物之一(参见实施例1和表1)。此外,该实施方案的肽被鉴定证实具有高效能,并且在大鼠和人激肽释放酶间具有良好的交叉反应性(参见表5)。
在一个可替换的实施方案中,式(f)的肽包含选自-Ci-S-F-P-Y-R-Cii-V-Y-Y-P-D-I-Ciii-(06-550)(SEQIDNO:55)的序列。证实06-550的优势的数据在实施例3和4中描述,其中其可被理解为是有效的嵌合双环。特别地,在人、大鼠和兔激肽释放酶间交叉反应性可以参见表7。
在一个实施方案中,本发明的特定肽配体对人、大鼠和/或兔血浆激肽释放酶是特异性的。在另一实施方案中,本发明的特定肽配体对人和/或大鼠血浆激肽释放酶是特异性的。在更进一步的实施方案中,本发明的特定肽配体对人血浆激肽释放酶是特异性的。
肽配体的优势
本发明的特定双环肽具有若干有利的特性,能够使其作为合适的类药物分子用于注射、吸入、鼻、眼、口服或局部施用。这些有利的特性包括:
-物种交叉反应性。这是临床前药效学和药代动力学评估典型的需求;
-蛋白酶稳定性。理想地,双环肽前导候选肽配体应证实对血浆蛋白酶的稳定性、对上皮(“膜锚定”)蛋白酶的稳定性、对胃肠蛋白酶的稳定性、对肺表面蛋白酶的稳定性、对胞内蛋白酶等的稳定性。应当在不同的物种之间维持蛋白酶稳定性,从而可以在动物模型中开发双环前导候选物,并有信心向人施用;
-希望的溶解度谱。这是带电的亲水性残基相对于疏水性残基的比例以及分子内/分子间的氢键的比例的函数,其对制剂和吸收目的而言很重要;以及
-在循环中最佳的血浆半衰期。根据临床适应症和治疗方案,可能需要开发双环肽用于在急性疾病管理设置中的短期暴露,或开发双环肽以增强在循环中的保留,且因此对于较慢性疾病状态的管理是最佳的。
药学可接受的盐
应理解盐的形式在本发明的范围内,且引用式(I)的化合物包括所述化合物的盐形式。
本发明的盐可以通过传统的化学方法(例如在PharmaceuticalSalts:Properties,Selection,andUse,P.HeinrichStahl(编者),CamilleG.Wermuth(编者),ISBN:3-90639-026-8,精装,388页,2002年8月,中描述的方法),从含有碱性或酸性半簇(moiety)的母体化合物合成。一般地,该盐可以通过在水中或在有机溶剂中、或二者的混合物中使这些化合物的游离的酸或碱形式与合适的碱或酸起反应而制备。
酸加成盐(单盐或双盐)可以由多种酸(无机酸和有机酸)形成。酸加成盐的示例包括以选自以下的酸形成的单盐或双盐:乙酸、2,2-二氯乙酸、己二酸、藻酸(alginic)、抗坏血酸(例如L-抗坏血酸)、L-天冬氨酸、苯磺酸、苯甲酸、4-乙酰氨基苯甲酸、丁酸、(+)樟脑酸、樟脑磺酸、(+)-(1S)-樟脑-10-磺酸、癸酸、己酸、辛酸、肉桂酸、柠檬酸、环拉酸、十二烷基硫酸、乙烷-1,2-二磺酸、乙烷磺酸、2-羟乙基磺酸、甲酸、反丁烯二酸、粘酸、龙胆酸、葡庚糖酸、D-葡萄糖酸、葡萄糖醛酸(例如D-葡萄糖醛酸)、谷氨酸(例如L-谷氨酸)、α-酮戊二酸、乙醇酸、马尿酸、氢卤酸(例如氢溴酸、盐酸、氢碘酸)、羟乙磺酸、乳酸(例如(+)-L-乳酸、(±)-DL-乳酸)、乳糖酸、马来酸、苹果酸、(-)-L-苹果酸、丙二酸、(±)-DL-扁桃酸、甲基磺酸、萘-2-磺酸、萘-1,5-二磺酸、1-羟基-2-萘甲酸、烟酸、硝酸、油酸、乳清酸、草酸、棕榈酸、双羟萘酸、磷酸、丙酸、丙酮酸、L-焦谷氨酸、水杨酸、4-氨基-水杨酸、癸二酸、硬脂酸、琥珀酸、硫酸、单宁酸、(+)-L-酒石酸、硫氰酸、p-甲苯磺酸、十一碳烯酸和戊酸、以及酰化氨基酸和阳离子交换树脂。
一组具体的盐包括由以下所形成的盐:乙酸、盐酸、氢碘酸、磷酸、硝酸、硫酸、柠檬酸、乳酸、琥珀酸、马来酸、苹果酸、羟乙磺酸、反丁烯二酸、苯磺酸、对甲苯磺酸、硫酸、甲基磺酸(甲磺酸)、乙烷磺酸、萘磺酸、戊酸、丙酸、丁酸、丙二酸、葡萄糖醛酸和乳糖酸。一个具体的盐是盐酸盐。另一个具体的盐是乙酸盐。
经修饰的衍生物
应理解如文中定义的肽配体的经修饰的衍生物在本发明的范围内。该经合适修饰的衍生物的示例包括选自以下的一种或更多种修饰:N端和/或C端修饰;以一个或更多个非天然氨基酸残基取代一个或更多个氨基酸残基(例如以一个或更多个同配位(isosteric)或等电子氨基酸取代一个或更多个极性氨基酸残基;以其它的非天然的同配位或等电子氨基酸取代一个或更多个疏水性氨基酸残基);添加间隔基团(spacergroup);以一个或更多个抗氧化氨基酸残基取代一个或更多个氧化敏感氨基酸残基;以丙氨酸取代一个或更多个氨基酸残基,以一个或更多个D-氨基酸残基取代一个或更多个L-氨基酸残基;在双环肽配体中的一个或更多个酰胺键的N-烷基化;以替代键(surrogatebond)取代一个或更多个肽键;肽骨架长度修饰;以另外的化学基团置换一个或更多个氨基酸残基的α-碳上的氢,以及用合适的胺、硫醇、羧酸和苯酚反应试剂进行的氨基酸的合成后修饰,其中所述的氨基酸例如半胱氨酸、赖氨酸、谷氨酸/天冬氨酸和酪氨酸。
在一个实施方案中,所述经修饰的衍生物包含N端和/或C端修饰。
在另一实施方案中,所述经修饰的衍生物包含N端修饰。在另一实施方案中,N端修饰包含N端乙酰基团。在该实施方案中,在肽合成期间,N端半胱氨酸基团(基团在文中称为Ci)用乙酸酐或其它合适的试剂加帽,产生了N端乙酰化的分子。该实施方案提供了这样一种优势,即去除氨基肽酶可能的识别位点,且避免了双环肽的降解的可能。
在另一实施方案中,所述经修饰的衍生物包含C端修饰。在另一实施方案中,C端修饰包含酰胺基团。在该实施方案中,在肽合成期间,C端半胱氨酸基团(文中称为Ciii的基团)作为酰胺被合成,产生了C端酰胺化的分子。该实施方案提供了这样一种优势,即去除羧基肽酶可能的识别位点,且避免了双环肽的降解的可能。
在一个实施方案中,所述经修饰的衍生物包含以一个或更多个非天然的氨基酸残基取代一个或更多个氨基酸残基。在该实施方案中,可以选择具有同配位/等电子侧链的非天然氨基酸,其不再被降解蛋白酶识别且对靶标效能不具有任何影响。
可替换地,可以使用具有受限制的氨基酸侧链的非天然氨基酸,从而附近肽键的蛋白酶解水解作用在构象上和空间上受到阻碍。特别是,其涉及脯氨酸类似物、庞大的侧链、Cα-双取代衍生物(例如氨基异丁酸,Aib),和环氨基酸,这是一种简单的衍生物是氨基环丙基羧酸。
在另一实施方案中,脯氨酸残基可以被L-氮杂环丁烷羧酸残基取代,和/或精氨酸残基可以被N-α-甲基精氨酸或L-高精氨酸残基取代。文中显示的数据证实该非天然的氨基酸的存在增强蛋白酶解稳定性,并且同时维持或增强双环肽配体的靶标亲和性。
实施例3证实所选择的06-550肽配体的非天然的衍生物。因此,在一个实施方案中,本发明提供了式(f)的非天然衍生物,其包含肽,所述肽具有选自以下的序列:
-Ci-S-F-P-Y-[hR]-Cii-V-Y-Y-P-D-I-Ciii-((06-550)HArg5)(SEQIDNO:56);
-Ci-S-F-[Aze]-Y-R-Cii-V-Y-Y-P-D-I-Ciii-(SEQIDNO:57);
-Ci-S-F-[Aze]-Y-[hR]-Cii-V-Y-Y-P-D-I-Ciii-((06-550)Aze3HArg5)(SEQIDNO:58);
-Ci-S-F-P-Y-[NMeR]-Cii-V-Y-Y-P-D-I-Ciii-((06-550)NMeArg5)(SEQIDNO:59);和
-Ci-S-F-[Aze]-Y-[NMeR]-Cii-V-Y-Y-P-D-I-Ciii-((06-550)Aze3NMeArg5)(SEQIDNO:60);
其中Aze代表L-氮杂环丁烷羧酸残基,hR代表L-高精氨酸残基,以及NMeR代表N-α-甲基精氨酸残基。
在另一实施方案中,本发明提供了式(f)的非天然衍生物,其包含肽,所述肽具有选自以下的序列:
-Ci-S-F-P-Y-[hR]-Cii-V-Y-Y-P-D-I-Ciii-((06-550)HArg5)(SEQIDNO:56);
-Ci-S-F-[Aze]-Y-[hR]-Cii-V-Y-Y-P-D-I-Ciii-((06-550)Aze3HArg5)(SEQIDNO:58);
-Ci-S-F-P-Y-[NMeR]-Cii-V-Y-Y-P-D-I-Ciii-((06-550)NMeArg5)(SEQIDNO:59);和
-Ci-S-F-[Aze]-Y-[NMeR]-Cii-V-Y-Y-P-D-I-Ciii-((06-550)Aze3NMeArg5)(SEQIDNO:60);
其中Aze代表L-氮杂环丁烷羧酸残基,hR代表L-高精氨酸残基,以及NMeR代表N-α-甲基精氨酸残基。
这些经修饰的肽在人、大鼠和兔激肽释放酶间的交叉反应性可以参见表7。
在又一实施方案中,本发明提供了式(f)的经修饰的衍生物,其包含肽,所述肽具有选自以下的序列:
-Ci-S-F-P-Y-[hR]-Cii-V-Y-Y-P-D-I-Ciii-((06-550)HArg5)(SEQIDNO:56);和
-Ci-S-F-[Aze]-Y-[hR]-Cii-V-Y-Y-P-D-I-Ciii-((06-550)Aze3HArg5)(SEQIDNO:58);
其中Aze代表L-氮杂环丁烷羧酸残基,以及hR代表L-高精氨酸残基。
该实施方案的肽被证实相比对应的N-甲基修饰的衍生物更合适(参见实施例3)。
在仍然更近一步的实施方案中,本发明提供了式(f)的非天然衍生物,其包含肽,所述肽具有选自-Ci-S-F-[Aze]-Y-[hR]-Cii-V-Y-Y-P-D-I-Ciii-((06-550)Aze3HArg5)(SEQIDNO:58)的序列,其中Aze代表L-氮杂环丁烷羧酸残基,以及hR代表L-高精氨酸残基。
该实施方案的肽被证实是良好地耐受的,因为人和大鼠的亲和性是高的(参见实施例3和表7)。
在一个实施方案中,所述经修饰的衍生物包含间隔基团的添加。在另一实施方案中,所述经修饰的衍生物包含添加至N端半胱氨酸(Ci)和/或C端半胱氨酸(Ciii)的间隔基团。在又一实施方案中,所述经修饰的衍生物包含添加至C端半胱氨酸(Ciii)的间隔基团。在仍然更进一步的实施方案中,所述间隔基团包含连接至两个或更多个D-精氨酸残基(合适地,2个D-精氨酸残基)的一个或更多个肌氨酸基团(合适地,3个肌氨酸基团)。文中显示的数据证实该间隔基团的存在增强了双环肽配体的水溶性。
在一个实施方案中,本发明提供了式(a)的经修饰的衍生物,其包含的肽具有选自-Ci-N-T-W-N-P-W-Cii-P-W-D-A-P-L-Ciii-Sar3-(D-Arg)2((06-259-02(Sar3-(D-Arg)2)(SEQIDNO:61)的序列;其中Sar3代表3个肌氨酸间隔物,以及(D-Arg)2代表两个D-精氨酸残基。
如实施例4描述的,证实该实施方案的肽在体内的药代动力学谱是有利的。特别地,证实了肽在大鼠循环中显著的稳定性,因为其清除主要通过肾滤过驱动。此外,如实施例6中描述的,还证实了该实施方案的肽高度显著抑制角叉菜胶(carrageenan)诱导的足肿胀(pawswelling),其与用于该模型的金标准(吲哚美辛)具有可比性。
在一个实施方案中,本发明提供了式(f)的经修饰的衍生物,其包含肽,所述肽具有选自以下的序列:
-Ci-S-F-P-Y-R-Cii-V-Y-Y-P-D-I-Ciii-Sar3-(D-Arg)2((06-550)-Sar3-(DArg2))(SEQIDNO:62);和
-Ci-S-F-[Aze]-Y-[hR]-Cii-V-Y-Y-P-D-I-Ciii-Sar3-(D-Arg)2((06-550)-Sar3-(DArg2)Aze3HArg5)(SEQIDNO:63);
其中,Sar3代表3个肌氨酸间隔物,(D-Arg)2代表两个D-精氨酸残基,Aze代表L-氮杂环丁烷羧酸残基,以及hR代表L-高精氨酸残基。
该实施方案的肽被证实具有更有利的水溶性(参见实施例3)。更重要的是,Sar3-(D-Arg)2(SEQIDNO:98)基团的添加是良好耐受的,因为与没有该修饰相比其效能保持不变(参见实施例3和表7)。
在另一实施方案中,本发明提供了式(f)的经修饰的衍生物,其包含的肽具有选自-Ci-S-F-[Aze]-Y-[hR]-Cii-V-Y-Y-P-D-I-Ciii-Sar3-(D-Arg)2((06-550)-Sar3-(DArg2)Aze3HArg5)(SEQIDNO:63)的序列;其中,Sar3代表3个肌氨酸间隔物,(D-Arg)2代表两个D-精氨酸残基,Aze代表L-氮杂环丁烷羧酸残基,以及hR代表L-高精氨酸残基。在实施例3中证实该实施方案的肽具有高稳定性,因为观察到很少的降解产物。此外,如实施例4中描述的,证实该实施方案的肽在体内药代动力学谱是有利的。此外,如实施例5中描述的,证实玻璃体内注射至兔眼部后,该实施方案的肽从玻璃状液中缓慢的清除。其本身已经是有利的,该特性另外提供这样的优势,即非常适合用于眼部施用的缓释制剂。
在一个实施方案中,所述经修饰的衍生物包含以一个或更多个抗氧化氨基酸残基取代一个或更多个氧化敏感氨基酸残基。在另一实施方案中,经修饰的衍生物包含以苯丙氨酸残基取代色氨酸残基。该实施方案提供了改善获得的双环肽配体的药物稳定性谱的优势。
在一个实施方案中,所述经修饰的衍生物包含以一个或更多个疏水性氨基酸残基取代一个或更多个带电的氨基酸残基。在一个可替换的实施方案中,经修饰的衍生物包含以一个或更多个带电的氨基酸残基取代一个或更多个疏水性氨基酸残基。带电氨基酸残基对比疏水性氨基酸残基的正确平衡是双环肽配体重要的性质。例如,疏水性氨基酸残基影响血浆蛋白结合的程度,并且因此影响血浆中游离的可用部分的浓度,同时带电氨基酸残基(特别是精氨酸)可以影响肽与细胞表面磷脂膜的相互作用。二者组合可以影响半衰期、分布体积和肽药物的暴露,并且可以根据临床端点进行定制。此外,带电氨基酸残基对比疏水性氨基酸残基的正确的组合和数值可以减少在注射部位的刺激(为皮下施用的肽药物)。
在一个实施方案中,所述经修饰的衍生物包含以一个或更多个D-氨基酸残基取代一个或更多个L-氨基酸残基。该实施方案被认为通过空间阻碍、以及通过D-氨基酸稳定β转角构象的倾向,增加蛋白酶解的稳定性(Tugyi等人(2005)PNAS,102(2),413–418)。
在一个实施方案中,所述经修饰的衍生物在双环肽配体中包含一个或更多个酰胺键的N-烷基化衍生物。该实施方案被认为是通过对易断裂酰胺键的直接修饰而给予蛋白酶解保护(Fiacco等人,Chembiochem.(2008),9(14),2200–3)。N-甲基化还被认为强烈地影响肽键的扭转角,并被认为有助于细胞穿透和口服利用度(Biron等人(2008),Angew.Chem.Int.Ed.,47,2595–99)。
在一个实施方案中,经修饰的衍生物包含以替代键取代一个或更多个肽键,所述替代键选自以下的一个或更多个:N-烷基化衍生物(例如-CO-NR)、还原的肽键(例如-CH2-NH-)、类肽键(例如–NR-CH2-CO-)、硫代酰胺键(例如-CS-NH-)、氮杂肽键(azapeptidebond)、(例如-CO-NH-NR-)、反式烯烃键(例如–RHC=C-)、翻转键(retro-inversobond)(例如–NH-CO-)以及尿素替代物键(例如–NH-CO-NHR-)。
在一个实施方案中,所述经修饰的衍生物包含任何丙氨酸氨基酸残基的去除。该实施方案提供了去除可能的蛋白酶解的攻击位点的优势。
在一个实施方案中,所述经修饰的衍生物包含肽骨架长度修饰。在另一实施方案中,肽骨架长度修饰包含一个或更多个β2/3-氨基酸残基(例如–NH-CR-CH2-CO或–NH-CH2-CHR-CO-)的使用。
在一个实施方案中,所述经修饰的衍生物包含一个或更多个氨基酸残基在α碳上的置换。该实施方案提供了限制骨架构象的优势。在另一实施方案中,所述经修饰的衍生物包含以2-氨基异丁酸(还称为α-氨基异丁酸(AIB)、α-甲基丙氨酸或2-甲基丙氨酸)取代一个或更多个氨基酸残基。
应注意的是,上述修饰中的每一个可以用于有意改善肽对靶标的效能。基于修饰的进一步效能改善可以通过以下机制实现:
-引入开拓疏水作用并产生较低的解离率(offrate)的疏水半簇,从而实现较高的亲和性;
-引入开拓大范围离子相互作用的带电基团,产生较快的结合率(onrate)和较高的亲和性(参见例如Schreiber等人Rapid,electrostaticallyassistedassociationofproteins(1996),NatureStruct.Biol.3,427-31);以及
-引入对肽另外的限制,即通过例如正确地限制氨基酸侧链,使得与靶标结合时熵的损失最小,限制骨架的扭转角,使得与靶标结合时熵的损失最小,以及以同一理由在分子中引入另外的环化。
(综述参见Gentilucci等人Curr.PharmaceuticalDesign,(2010),16,3185-203,以及Nestor等人,Curr.MedicinalChem(2009),16,4399-418)。
结合活性
在本文中,特异性指配体结合或与其同类(cognate)靶标相互作用、而排除与所述靶标相似的实体的能力。例如,特异性可以指配体抑制人酶的相互作用、但不抑制来自不同物种的同源酶的相互作用的能力。使用文中描述的方法,可以调控(即增加或降低)特异性,从而使配体与预期靶标的同系物或旁系物的相互作用能力更强或更弱。特异性与活性、亲和性或亲合力(avidity)并不是同义词,配体对其靶标的作用的效能(如,例如结合亲和性或抑制水平)并不一定与其特异性相关。
如文中使用的结合活性,例如文中所描述的,指来自结合试验的定量结合测量。因此,结合活性指在给定靶标浓度下结合的肽配体的量。
多特异性是结合两个或更多个靶标的能力。典型地由于其构象特征,结合肽能结合单一靶标,如抗体情况中的表位。但是可开发能结合两个或更多靶标的肽;例如,如以上提到的本领域中已知的双特异性抗体。本发明中,肽配体能结合两个或更多靶标,因此是多特异性的。合适地,其结合两个靶标,是双特异性的。结合可以是独立的,这意味着在肽上对靶标的结合位点不被一个或其它靶标所结合而结构性地阻碍。在这样的情况中,两个靶标可独立地结合。更一般的是,可预期一个靶标的结合将至少部分地阻碍另一个的结合。
双特异性配体和具有包括两个相关靶标特异性的配体之间存在根本的差异。在第一种情况中,配体分别对两个靶标有特异性,以特异的方式与每个靶标相互作用。例如,配体中的第一环可以结合第一靶标,第二环结合第二靶标。在第二种情况中,因为其不能区分两个靶标,所以配体是非特异性的,例如其通过与两个靶标共同的靶标表位相互作用。
在本发明的上下文中,例如,对靶标和直系同源物具有活性的配体有可能是双特异性配体。但是,在一个实施方案中,配体不是双特异性的,但是其特异性的精度较低,从而其结合靶标和一个或多个直系同源物。一般地,没有针对靶标和其直系同源物选择的配体不太可能是双特异性的,因为对双特异性缺乏选择压力。双环肽中的环长度在提供定制结合表面中是决定性的,从而可以获得良好的靶标和直系同源物的交叉反应性,然而保持对不相关的同系物的高选择性。
如果配体确实是双特异性的,在一个实施方案中,配体靶标特异性的至少一种将是所选配体中共同的,且可通过文中公开的方法调控该特异性水平。第二或进一步的特异性没有必要是共享的,也不需要是文中所示过程的对象。
靶标是肽配体结合、或与肽配体相互作用的分子或其部分。尽管结合被看作大多数活性类型的首要条件,其自身就是一种活性,还可以设想其它活性。因而,本发明不需要测量直接或间接结合。
分子支架是能够在多个点上连接肽以便给予肽一种或多种结构特性的任何分子。优选的,分子支架包含至少三个肽附着点,被称为支架反应基团。这些基团能够与肽上的半胱氨酸残基(Ci、Cii和Ciii)反应,以形成共价键。其不仅形成二硫键,二硫键经受分子的还原切割伴随解体,还形成稳定的、共价的硫醚键。优选的分子支架的结构如下所述。
分子支架
分子支架描述于,例如WO2009/098450中,以及描述于其中引用的文献,特别是WO2004/077062和WO2006/078161中。
如先前的文献中注意到的,分子支架可以是小分子,如小的有机分子。
在一个实施方案中,分子支架可以是(或者可以是基于)天然单体,如核苷、糖或甾体。例如,分子支架可以包含这样的实体的短聚合物,如二聚物或三聚物。
在一个实施方案中,分子支架是毒性已知的化合物,例如,低毒性的化合物。合适的化合物的示例包括胆固醇、核苷酸、甾体或现有的药物,如羟基安定(tamazepam)。
在一个实施方案中,分子支架可以是大分子。在一个实施方案中,分子支架是由氨基酸、核苷酸或碳水化合物组成的大分子。
在一个实施方案中,分子支架包含能够与多肽官能团反应而形成共价键的反应基团。
分子支架可以包括化学基团如胺、巯基、醇、酮、醛、腈、羧酸、酯、烯烃、炔烃、叠氮化物、酸酐、琥珀酰亚胺、马来酰亚胺、烷基卤和酰基卤。
在一个实施方案中,分子支架可以包含、或可以由三(溴甲基)苯组成,特别是1,3,5-三(溴甲基)苯(“TBMB”)或其衍生物。
在一个实施方案中,分子支架是2,4,6-三(溴甲基)三甲基苯。该分子与1,3,5-三(溴甲基)苯类似,但是含有额外的三个附着于苯环的甲基。其优点是额外的甲基可形成与多肽进一步的接触,因而增加了额外的结构性限制。
本发明的分子支架含有化学基团,该化学基团允许本发明编码文库的多肽的官能团与分子支架形成共价键。所述化学基团选自大范围的官能基,包括胺、巯基、醇、酮、醛、腈、羧酸、酯、烯烃、炔烃、酸酐、琥珀酰亚胺、马来酰亚胺、叠氮化物、烷基卤和酰基卤。
可用于分子支架上与半胱氨酸的巯基反应的支架反应基团是烷基卤(或也称为卤代烃或卤代烷)。
实例包括溴甲基苯(由TBMB示例的支架反应基团)或碘乙酰胺。用于选择性地将化合物偶联至蛋白中半胱氨酸的其它支架反应基团是马来酰亚胺。可用作本发明中分子支架的马来酰亚胺的实例包括:三-(2-马来酰亚胺乙基)胺、三-(2-马来酰亚胺乙基)苯、三-(马来酰亚胺基)苯。硒代半胱氨酸也是天然氨基酸,其具有与半胱氨酸相似的反应性,可用于相同的反应。因而,除非上下文特别指明,无论在何处提及半胱氨酸,典型地可认为其可取代硒代半胱氨酸。
效应物和官能团
可将效应物和/或官能团附着至,例如,多肽的N或C端,或附着至分子支架。
合适的效应物基团包括抗体和其部分或片段。例如,效应物基团可包括抗体轻链恒定区(CL)、抗体CH1重链结构域、抗体CH2重链结构域、抗体CH3重链结构域、或其任意组合,另外还包括一个或多个恒定区结构域。效应物基团还可以包括抗体铰链区(这种区域通常存在于IgG分子的CH1和CH2结构域之间)。
在本发明该方面的其它实施方案中,根据本发明的效应物基团是IgG分子的Fc区域。有利地,根据本发明的肽配体效应物基团包括或由肽配体Fc融合体(fusion)组成,所述肽配体Fc融合体具有1天或更长、2天或更长、3天或更长、4天或更长、5天或更长、6天或更长、或7天或更长的tβ半衰期。最有利地,根据本发明的肽配体包含或由具有1天或更长的tβ半衰期的肽配体Fc融合体组成。
官能团通常包括结合基团、药物、用于其它实体附着的反应基团、辅助大环肽摄入细胞的官能团等等。
肽穿透至细胞中的能力将允许肽针对细胞内的靶标起效。可被具有穿透细胞能力的肽接近的靶标包括转录因子、细胞内信号传导分子如酪氨酸激酶、以及参与凋亡通路的分子。能够穿透细胞的官能团包括被添加到肽或分子支架的肽或化学基团。如那些衍生自如VP22、HIV-Tat、果蝇(触角足)同源盒蛋白的肽,例如,在Chen和Harrison,BiochemicalSocietyTransactions(2007)35卷,第四部分,p821;Gupta等人在AdvancedDrugDiscoveryReviews(2004)57卷9637中描述的。已经表明在通过浆膜移位中有效的短肽示例包括来自果蝇触角足蛋白的16个氨基酸的穿透肽(Derossi等人(1994)JBiol.Chem.269卷p10444),18个氨基酸的“模型两亲性肽”(Oehlke等人(1998)BiochimBiophysActs1414卷p127)和HIVTAT蛋白的富含精氨酸的区域。非肽的方法包括使用容易附着于生物分子的小分子模拟物或SMOC(Okuyama等人(2007)NatureMethods4卷p153)。向分子添加胍基的其它化学策略也能增强细胞穿透(Elson-Scwab等人(2007)JBiolChem282卷p13585)。可以将小分子量分子如甾体添加到分子支架以增强细胞的摄入。
可附着至肽配体的一类官能团包括抗体和其结合片段,如Fab、Fv或单一结构域片段。特别是,可以使用结合能够增加肽配体体内半衰期的蛋白的抗体。
还可以引入RGD肽,所述RGD肽结合存在于许多细胞上的整合素。
在一个实施方案中,根据本发明的肽配体效应物基团具有选自如下的tβ半衰期:12小时或更长、24小时或更长、2天或更长、3天或更长、4天或更长、5天或更长、6天或更长、7天或更长、8天或更长、9天或更长、10天或更长、11天或更长、12天或更长、13天或更长、14天或更长、15天或更长或20天或更长。有利地,根据本发明的肽配体效应物基团或组合物具有12至60小时范围内的tβ半衰期。在另一实施方案中,其具有1天或更长的tβ半衰期。在另一实施方案中,其在12至26小时范围内。
官能团包括药物,如用于癌症治疗的细胞毒性剂。这些包括烷化剂,如顺铂和卡铂、以及奥沙利铂、氮芥、环磷酰胺、苯丁酸氮芥、异环磷酰胺;抗代谢物,包括嘌呤类似物硫唑嘌呤和巯嘌呤或嘧啶类似物;植物生物碱和萜,包括长春花生物碱,如长春新碱、长春碱、长春瑞滨和长春地辛;足叶草毒素及其衍生物依托泊苷和替尼泊苷;紫杉烷,包括紫杉醇(paclitaxel),最初被称为紫杉醇(Taxol);拓扑异构酶抑制剂,包括喜树碱:伊立替康和拓扑替康,以及II型抑制剂,包括安吖啶、依托泊苷、磷酸依托泊苷、和替尼泊苷。其它制剂可包括抗肿瘤抗生素,其包括免疫抑制剂更生霉素(其用于肾移植)、多柔比星、表柔比星、博来霉素等。
可能的效应物基团还包括酶,例如如用于酶/前药治疗中的羧肽酶G2,其中肽配体取代了ADEPT中的抗体。
合成
本发明的肽可通过标准技术制备合成,随后在体外与分子支架反应。当进行时,可使用标准化学方法。这使得能够快速大规模地制备可溶性物质,用于进一步的下游实验或验证。该方法可使用传统的化学方法完成,如在Timmerman等人中公开的(上文)。
因而,本发明还涉及制备如文中所示选择的多肽或缀合物,其中制备任选地包括如下所解释的其它步骤。在一个实施方案中,这些步骤在化学合成得到的终产物多肽/缀合物上进行。
任选地,制备缀合物或复合物时,感兴趣的多肽中的氨基酸残基可被置换。
例如,肽还可以被延伸以引入另一个环,从而引入多特异性。
为了延伸肽,可以使用标准固相或溶液相化学方法,使用正交保护的赖氨酸(和类似物),在其N端或C端或环内简单地化学延伸。标准蛋白化学方法可用于导入可激活的N或C端。可替换地,可通过如(Dawson等人1994.SynthesisofProteinsbyNativeChemicalLigation.Science266:776-779)中描述的片段缩合或天然化学连接、或通过酶进行添加,例如使用如(Chang等人ProcNatlAcadSciUSA.1994Dec20;91(26):12544-8或者在Hikari等人Bioorganic&MedicinalChemistryLetters18卷,22期,2008年11月15日,6000-6003页)中描述的副连接酶(subtiligase)。
可替换地,可通过二硫键的进一步缀合使肽延伸或修饰。其具有另外的优点,即一旦在细胞的还原环境中时,允许第一和第二肽彼此分离。在这样的情况中,可在第一肽的化学合成期间添加分子支架(如TBMB),从而与三个半胱氨酸基团反应;然后可将另外的半胱氨酸附加于第一肽的N端,从而该半胱氨酸仅与第二肽的游离半胱氨酸反应。
相似的技术可同样地应用于两个双环和双特异性大环的合成/偶联,可能产生一个四特异性分子。
此外,可以使用适当的化学方法,在N端或C端偶联或通过侧链以相同的方式完成其它官能团或效应物基团的添加。在一个实施方案中,以这样的方式进行偶联,其不阻断任一实体的活性。
药物组合物
根据本发明的其它方面,提供了一种药物组合物,其包含如文中定义的肽配体,所述肽配体与一种或更多种药学可接受的赋形剂组合。
一般地,本发明的肽配体将以纯化形式与药理学上合适的赋形剂或载体一起使用。典型地,这些赋形剂或载体包括水溶液或醇/水溶液、乳液或悬浮液,包括盐和/或缓冲介质。肠胃外载体包括氯化钠溶液、林格氏右旋糖、右旋糖和氯化钠和乳酸林格氏液。如果需要保持悬浮液中的多肽复合物,可以从增稠剂如羧甲基纤维素、聚乙烯吡咯烷酮、明胶和藻酸盐中选择合适的生理学上可接受的佐剂。
静脉内载体包括液体和营养补充剂和电解质补充剂,如基于林格氏右旋糖的那些。也可存在防腐剂和其它添加剂,如抗微生物剂、抗氧化剂、螯合剂和惰性气体(Mack(1982)Remington’sPharmaceuticalSciences,第16版)。
本发明的肽配体可作为独立施用的组合物或与其它试剂联合施用。其可以包括抗体、抗体片段和各种免疫治疗药物,例如环孢菌素、甲氨蝶呤、阿霉素或顺铂和免疫毒素。药物组合物可包括各种细胞毒性或其它试剂与本发明的蛋白配体相组合的“混合物”,或甚至具有不同特异性的根据本发明的所选多肽的组合,如使用不同靶标配体所选的多肽,无论是否在施用之前将其合并到一起。
根据本发明的药物组合物的施用途径可以是任何本领域普通技术人员通常知道的那些。对于治疗,包括但不局限于免疫治疗,本发明的肽配体可以根据标准技术施用给任何患者。可以通过任何合适的模式施用,包括肠胃外、静脉内、肌肉内、腹膜内、经皮、经肺途径、或也适当地,通过直接的导管输注。施用的剂量和频率取决于患者的年龄、性别和状态、其它药物的同时施用、禁忌症和临床人员需要考虑的其它参数。
应理解的是,当本发明的肽配体被制剂成眼科组合物用于眼科疾病的治疗时,典型地,施用的途径将是直接在眼科疾病的位置,例如通过眼部途径施用,例如局部、结膜下、筋膜下(sub-Tenon)、眼内、眼植入等。在一个实施方案中,施用的途径是通过眼内注射。在一个可替换的实施方案中,眼科组合物被局部递送(例如眼外应用)或系统递送(例如口服或其它肠胃外途径,如例如皮下注射),只要是在位于眼或相邻的眼中的细胞或组织中足够量的肽实现了与眼科疾病位点的接触。在一个可替换的实施方案中,眼科组合物被肠胃外地递送。当根据WO2007/104541中描述的常见的一般知识和方法解决待治疗的眼科疾病时,精准的施用途径对技术人员是立即显而易见的,WO2007/104541的内容通过参考并入此处。
本发明的肽配体可被冻干用于保存,并在使用前在适当的载体中重配。表明该技术是有效的,可以使用本领域公知的冻干和重配技术。本领域技术人员将理解冻干和重配将导致不同程度的活性损失,可能不得不向上调整水平以补偿该活性的损失。
可施用包含本发明肽配体或其混合物的组合物用于预防性和/或治疗性治疗。在特定治疗的应用中,实现所选细胞群的至少部分抑制(inhibition)、抑制(suppression)、调控、杀死、或某些其它可测量参数的足够的量被定义为“治疗有效剂量”。需要实施该剂量的量将取决于疾病的严重性和患者自身免疫系统的一般状态,但是选择的肽配体通常范围从每千克体重0.005至5.0mg,0.05至2.0mg/kg/剂量的剂量更常使用。为了预防的应用,含有本发明肽配体或其混合物的组合物还可以以相似或稍低的剂量施用。
含有根据本发明肽配体的组合物可用于预防和治疗设置,以辅助改变、失活、杀死或移除哺乳动物中所选的靶标细胞群。另外,文中描述的肽配体可用于离体或体外选择性杀死、消除或有效地从异质细胞集合中移除靶标细胞群。来自哺乳动物的血液可在体外和选择的肽配体组合,从而杀死或从血液中移除不想要的细胞,再根据标准技术重输回哺乳动物。
治疗用途
根据本发明的方法选择的多肽配体可用于体内治疗和预防的应用、体外和体内诊断应用、体外试验和试剂应用等。具有选定特异性水平的配体在涉及检测非人动物的应用中是有用的,其中希望有交叉反应,或在诊断应用中是有用的,其中需要仔细控制与同系物或旁系物的交叉反应。在某些应用中,例如疫苗应用中,可利用激发对预定范围抗原的免疫反应的能力定制特定疾病和病原体的疫苗。
优选将至少90至95%同质性的基本上纯的肽配体施用于哺乳动物,最优选98至99%或更高同质性的基本上纯的肽配体用于药学应用,特别是当哺乳动物是人时。一旦纯化、部分纯化、或纯化至希望的同质性,所选的多肽可用于诊断或治疗(包括体外的)或开发和进行试验步骤、免疫荧光染色等等(Lefkovite和Pernis,(1979和1981)ImmunologicalMethods,卷I和II,AcademicPress,NY)。
本发明的肽配体典型地在预防、抑制或治疗炎症状态、变应性超敏反应、癌症、细菌或病毒感染和自体免疫性疾病(其包括但不局限于I型糖尿病、多发硬化、类风湿性关节炎、系统性红斑狼疮、克罗恩氏病和重症肌无力)中是有用的。
因此,本发明的其它方面,提供了一种如文中定义的肽配体在预防、抑制或治疗炎症状态、变应性超敏反应、癌症、细菌或病毒感染和自体免疫性疾病中的用途。
根据本发明的另一个方面,提供了一种用于预防、抑制或治疗炎症状态、过敏性超敏反应、癌症、细菌或病毒感染、眼科疾病和自身免疫性疾病的方法,所述方法包括向有需要的患者施用本文所限定的肽配体。
在一个实施方案中,本发明的眼科疾病是涉及视网膜血管渗透性和/或完整性受损的疾病。在另一实施方案中,本发明的眼科疾病是涉及视网膜微血管破裂而导致灶性出血的疾病。在另一实施方案中,本发明的眼科疾病是眼后部的疾病,特别是视网膜疾病。在另一实施方案中,本发明的眼科疾病是眼前部的疾病。在另一实施方案中,本发明的眼科疾病是与眼的过度血管通透性和/或水肿相关的疾病。
合适的“眼科疾病”的示例(包括渗出性和/或炎症性眼科疾病,涉及视网膜血管渗透性和/或完整性受损的疾病,涉及视网膜微血管破裂而导致灶性出血的疾病,眼后部的疾病,视网膜疾病和眼前部的疾病)包括但不限于:年龄相关性黄斑变性(ARMD)、渗出性黄斑变性(也被称为“湿性”或新生血管性年龄相关的黄斑变性(湿性AMD)、黄斑水肿、老年盘状黄斑变性、囊样黄斑水肿、眼睑水肿、视网膜水肿、糖尿病性视网膜病变、急性黄斑视神经视网膜病变、中心性浆液性脉络膜视网膜病变、脉络膜视网膜病变、脉络膜血管新生、新生血管性黄斑病变、新生血管性青光眼、阻塞性动脉和静脉视网膜病(例如视网膜静脉阻塞或视网膜动脉阻塞)、中央视网膜静脉阻塞、弥散性血管内凝血病、视网膜分支静脉阻塞、高血压性眼底改变、眼部缺血综合征、视网膜动脉微动脉瘤、Coat病、旁中心凹毛细血管扩张、半侧视网膜静脉阻塞、视乳头静脉炎(papillophlebitis)、中央视网膜动脉阻塞、视网膜分支动脉阻塞、颈动脉病(CAD)、霜样树枝状(frostedbranch)脉管炎、镰状红细胞性视网膜病和其它血红蛋白病、血管样条纹、外因(aetiologies)比如疾病(如糖尿病性黄斑水肿)、眼伤或眼外科手术所导致的黄斑水肿发作;例如损伤、外伤或肿瘤所导致的视网膜缺血或变性、葡萄膜炎、虹膜炎、视网膜脉管炎、眼内炎、全眼球炎、转移性眼炎、脉络膜炎、视网膜色素上皮炎、结膜炎、睫状体炎、巩膜炎、巩膜外层炎、视神经炎、球后视神经炎、角膜炎、睑炎、渗出性视网膜脱离、角膜溃疡、结膜溃疡、慢性钱币状角膜炎、泰格森(thygeson)角膜炎、进行性蚕蚀性角膜溃疡,由细菌或病毒感染以及眼科手术所引起的眼炎症性疾病,由眼的物理损伤引起的眼炎症性疾病,眼炎症性疾病引起的症状,包括痒、耀斑、水肿和溃疡、红斑、红斑渗出性多形性红斑、结节性红斑、环形红斑、硬皮病、皮炎、血管神经性水肿、喉头水肿、声门水肿、声门下喉炎、支气管炎、鼻炎、咽炎、鼻窦炎、喉炎或中耳炎。
本文涉及的“眼后部的疾病”包括影响视网膜、黄斑、眼后部区域中的中央凹(fovea)中的疾病。合适的“眼后部的疾病”的示例包括但不限于:黄斑水肿,如临床黄斑水肿或各种病因(如糖尿病)引起的血管造影囊样黄斑水肿、渗出性黄斑变性和视网膜的激光治疗引起的黄斑水肿、年龄相关性黄斑变性、早产儿视网膜病变(也称为晶状体后纤维组织增生症)、视网膜缺血和脉络膜血管新生、视网膜病(糖尿病性视网膜病变、糖尿病性视网膜水肿,视网膜脱离、由于视网膜下血管新生导致的老年性黄斑变性、近视性视网膜病变);炎症性疾病;与肿瘤(如视网膜母细胞瘤或假神经胶质瘤)相关的葡萄膜炎;玻璃体切割术后的血管新生;血管疾病(视网膜缺血、脉络膜血管功能不全、脉络膜血栓、颈动脉缺血引起的视网膜病变);和视神经的血管新生。
本文涉及的“眼前部的疾病”指的是主要影响眼的前部组织(如角膜、虹膜、睫状体、结膜等)的疾病。合适的“眼前部的疾病”的示例包括但不限于:角膜血管新生(因炎症、移植、虹膜发育不全、伴有渗出性或炎症性成分的角膜疾病或浑浊、由于穿透眼睛或挫伤性眼损伤导致的血管新生;慢性葡萄膜炎;前葡萄膜炎;外科手术(如LASIK、LASEK、屈光手术、IOL植入术)导致的炎症性疾病;作为白内障手术并发症的不可逆角膜水肿;(物理的、化学的、药理的等)刺激(insult)或外伤导致的水肿;炎症;结膜炎(如,持续性过敏、巨乳头性季节性间歇性过敏、常年性过敏、细菌、病毒或衣原体感染引起的中毒性结膜炎);(春季性、特应性、干燥性)角结膜炎;虹膜睫状体炎;虹膜炎;巩膜炎;巩膜外层炎;感染性角膜炎;浅层点状角膜炎;圆锥角膜;后发多形性营养不良;Fuch营养不良(角膜和内皮);无晶状体的和人工晶状体的大泡性角膜病;角膜水肿;巩膜疾病;眼部疤痕性类天疱疮;睫状体扁平部炎;波斯纳睫状体综合征;白塞氏病;小柳原田综合征;过敏反应;眼表疾病;结膜水肿;弓形虫病脉络膜视网膜炎;眼眶炎症性假瘤;球结膜水肿;结膜静脉充血;眼眶蜂窝织炎;急性泪囊炎;非特异性脉管炎;结节病;和巨细胞病毒感染。
合适的“与眼的过度血管通透性和/或水肿相关的疾病”的示例,如在视网膜或玻璃体中,包括但不限于:年龄相关性黄斑变性(AMD)、视网膜水肿、视网膜出血、玻璃体出血、黄斑水肿(ME)、糖尿病性黄斑水肿(DME)、增殖性糖尿病视网膜病变(PDR)和非增生性糖尿病视网膜病变(DR)、辐射性视网膜病变、毛细血管扩张、中心性浆液性视网膜病变、以及视网膜静脉阻塞。视网膜水肿是流体在视网膜内的空间的积累。糖尿病患者中发生的视网膜微血管变化导致DME。这种血-视网膜屏障的折衷导致血浆组分泄漏到周围的视网膜中,造成视网膜水肿。视网膜的其它疾病包括视网膜静脉阻塞(例如分支或中央静脉阻塞)、辐射性视网膜病变、镰状细胞性视网膜病变、早产儿视网膜病变、VonHippelLindau病、后葡萄膜炎、慢性视网膜脱离、欧文盖斯综合征、Eals病、视网膜炎和/或脉络膜炎。
文中引用的术语“预防”包括在疾病诱发之前施用保护性组合物。“抑制”指诱导事件之后,但在疾病的临床表现出现前施用组合物。“治疗”涉及疾病的症状明显之后施用保护性组合物。
可用于筛选肽配体保护免受疾病或治疗疾病有效性的动物模型系统是可获得的。本发明促进了动物模型系统的利用,其允许开发能与人和动物靶标交叉反应的多肽配体,以允许使用动物模型。
检验易感小鼠中系统性红斑狼疮(SLE)的方法是本领域公知的(Knight等人.(1978)JExp.Med.,147:1653;Reinersten等人(1978)NewEng.J:Med.,299:515)。通过使用来自另一物种的可溶性AchR蛋白诱导疾病,在SJL/J雌性小鼠中检测重症肌无力(MG)(Lindstrom等人.(1988)Adv.Immunol.,42:233)。通过注射II型胶原蛋白在小鼠易感株中诱导关节炎(Stuart等人(1984)Ann.Rev.Immunol.,42:233)。已经描述了通过注射结核分枝杆菌热休克蛋白在易感大鼠中诱导佐剂性关节炎的模型(VanEden等人(1988)Nature,331:171)。如所述,通过施用甲状腺球蛋白在小鼠中诱导甲状腺炎(Maron等人(1980)J.Exp.Med.,152:1115)。胰岛素依赖型糖尿病(IDDM)是天然发生的或如Kanasawa等人(1984)Diabetologia,27:113所述的在某些小鼠株中诱导。小鼠和大鼠中的EAE用作人MS的模型。在该模型中,通过施用髓鞘碱性蛋白诱导脱髓鞘疾病(参见Paterson(1986)TextbookofImmunopathology,Mischer等人编.,Grune和Stratton,NewYork,pp.179-213;McFarlin等人(1973)Science,179:478:以及Satoh等人(1987)J;Immunol.,138:179)。
参照以下实施例进一步描述本发明。
实施例
材料和方法
噬菌体文库的克隆
根据Heinis等人,NatChemBiol2009,5(7),502-7生成噬菌体文库。
噬菌体选择
噬菌体文库的甘油储液在500ml2YT/氯霉素(30mg/ml)培养物中稀释至OD600=0.1,在30℃下过夜生产噬菌体(15-16小时)。如Heinis,等人,NatChemBiol2009,5(7)502-7中描述的,纯化和化学修饰噬菌体,生物素化hPK(3mg)(IHPKA,来自人血浆,InnovativeResearch,Novi,MI,USA)与50ml预先清洗的磁性链霉亲和素珠(Dynal,来自Invitrogen的M-280,Paisley,英国)在室温下孵育10分钟。清洗珠3次,而后用含1%BSA和0.1%Tween20的0.5ml清洗缓冲液(10mMTris-Cl,pH7.4,150mMNaCl,10mMMgCl2,1mMCaCl2)在室温下旋转封闭30分钟。同时通过加入含有3%BSA和0.3%Tween20的1ml清洗缓冲液封闭化学修饰的噬菌体(典型地1010-1011t.u.溶解于2ml清洗缓冲液)。而后封闭的珠与封闭的化学修饰的噬菌体混合,在室温下在旋转轮上孵育30分钟。用含有0.1%Tween20的清洗缓冲液清洗珠8次,并用清洗缓冲液清洗2次,而后用100ml50mM甘氨酸,pH2.2孵育5分钟。将洗脱的噬菌体转移到50ml1MTris-Cl,pH8进行中和,与30mlOD600=0.4的TG1细胞在37℃下孵育90分钟,将细胞铺板于大的2YT/氯霉素板。使用相同的过程进行一或二轮额外的选择(panning)。在第二轮选择中,包被亲和素的磁珠被用来防止链霉亲和素特异性肽的富集。根据供应商的说明书,通过0.8mg亲和素(Pierce,Rockford,IL,USA)与0.5ml甲苯磺酰基激活的磁珠(Dynal,来自Invitrogen的M-280,Paisley,英国)反应制备亲和素珠。
使用5x5和6x6文库的标准选择步骤,在循环一和二使用递减浓度的生物素化的人激肽释放酶,随后在循环三和四使用人或大鼠生物素化的激肽释放酶。人激肽释放酶是非重组的,且因此存在重链,大鼠激肽释放酶是重组的,缺少重链,与预期相比可能活性较低(基于人蛋白质的活性)。由于可能活性较低,大鼠靶标的浓度未降低至像人蛋白质的那样。
人、猴和大鼠PK的克隆和表达
人、猴和大鼠PK的催化结构域在哺乳动物细胞中作为失活的前体表达,所述失活的前体具有通过proTEV切割位点使N端连接至催化结构域的前肽。克隆表达载体,并如下所述表达、激活和纯化蛋白。编码PK信号序列、多组氨酸标签、proTEV切割位点、PK的成熟催化结构域和终止密码子的合成基因购自Geneart(雷根斯堡,德国)(补充材料)。制备含有人、猴(Macacamulatta)和大鼠PK合成基因的质粒DNA,使用限制性酶对XhoI和HindIII(Fermentas,维尔纽斯,拉脱维亚),以及T4DNA连接酶(Fermentas)将基因转移到pEXPR-IBA42哺乳动物表达载体(IBABiotechnology,德国)。将连接的质粒转化到XL-1蓝色电效能细胞(Stratagene,SantaClara,USA),铺板于含氨苄西林(10μg/ml)的2YT琼脂板上。生成来自三个表达载体的DNA(命名为mPK、rPK和hPK),通过DNA测序确认正确的序列(Macrogen,首尔,韩国)。
如下在哺乳动物细胞中表达三种直系同源血浆激肽释放酶。50ml悬浮液配制的HEK-293细胞在不含血清的ExCell293介质中(SAFCBiosciences,St.Louis,MO)生长,所述介质中存在4mM谷氨酰胺和组蛋白去乙酰化酶抑制剂丙戊酸(3.75mM),在100ml烧瓶中在存在5%CO2、在37℃下在ISF-4-W培养箱(KühnerAG,Birsfelden,瑞士)中以180rpm轨道振荡。胚肾(HEK-293)细胞在高细胞密度下(20x106细胞/ml)(Backliwal等人BiotechnolBioeng2008,99(3),721-7)使用线性聚乙烯亚胺(PEI,Polysciences,Eppenheim,德国)转染三种质粒(300mg/ml)。在7天的生产相结束时,在4℃、2500rpm离心15分钟,收获细胞。通过0.45μmPES膜(Filter-top250ml低蛋白结合TPP)过滤从介质中除去任何额外的细胞碎片。使用Ni-NTA树脂、清洗缓冲液(500mMNaCl,25mMNa2HPO4,pH7.4)和洗脱缓冲液(500mMNaCl,25mMNa2HPO4,pH7.4,500mM咪唑)通过Ni亲和性色谱纯化带有多组氨酸标签的蛋白。用(50单位)proTEV(Promega,Madison,威斯康星州,USA)部分激活蛋白,用Ni亲和性色谱和凝胶过滤(PD10柱,150mMNaCl,0.5mMEDTA,50mMHEPES,pH7)额外地纯化蛋白。
开发具有改进的结合活性的多肽
各位置的随机化
文库构建:为了绘制结合激肽释放酶的双环肽中的氨基酸,构建了一套小文库。对于含有2个5残基环的双环,生成10个独立的文库,其中每个文库在肽序列中特定密码子上随机化。设计各文库的寡核苷酸,以通过位点定向诱变突变噬菌体基因组DNA。诱变包括感兴趣密码子的随机化(变成NNS),从模板基因组序列中移除独特的ApaL1限制性位点。使用QIAgenQIAquickPCR纯化试剂盒纯化诱变产物,其中在超纯水中洗脱。使用各文库,通过使用BioRadMicropulser仪器(Ec1程序)和1mmBioRad比色皿,通过电穿孔分别转化TG1大肠杆菌。在37℃下、1mlSOC介质中回收1小时后,文库转化体过夜生长在含抗生素的25ml2TY肉汤中,以选择性地仅生长文库转化体。通过离心收获细菌,使用QIAgenPlasmidPlusMidi试剂盒从大肠杆菌中纯化文库噬菌体DNA,并在蒸馏水中洗脱。NewEnglandBiolabs缓冲液4中用ApaL1将纯化的DNA消化2小时,以除去母体物质。消化后,用QIAgenPCR纯化试剂盒(如上所述)再纯化DNA,并将其用于转化TG1(电穿孔;如上所述)。在SOC中回收1小时后,将转化体铺板于含选择性抗生素的LB琼脂板上,使菌落在37C下过夜生长。
个体克隆的结合试验:随机挑选文库转化体菌落,作为个体培养物在含有选择性抗生素的2TY肉汤中生长。使用QIAgenPyroMarkQ96DNA测序仪DNA测序所挑选的菌落,以揭示在每个克隆中存在的氨基酸取代。分离时,如下所述分析了各独特取代的克隆的人血浆激肽释放酶结合。从培养物中收获含噬菌体的上清,根据Heinis等人(NatureChemicalBiology卷5pp502-507(2009))的方法用三溴甲基苯(TBMB)环化噬菌体。使用基于同质板的结合试验,分析该步骤中纯化的噬菌体对生物素化人血浆激肽释放酶的结合;在BMGLabtechPherastarFS板阅读器上测量试验的读取。来自一式三份试验样本的定量结合数据取平均(平均值),表示为信号:背景(其中背景是没有靶标物质的试验样本)。信号:背景表示为平行母体样本的%。误差条指示平均值的标准偏差。所示的试验代表至少2个独立的实验。分析数据与肽序列相关。灰色标记的取代是未检测的(克隆不是分离自随机文库取样)。平行分析未结合的双环样本(任意的),以说明试验的基线。
肽结构域的随机化
文库构建:根据上述Heinis等人在“噬菌体文库的克隆”中描述的方法生成小的噬菌体文库。修饰sficx3ba引物,从而使编码双环的部分基于母体5x5或6x6双环(5x5:两个5-残基的环,6x6:两个6-残基的环)DNA序列,其中仅4-6个密码子随机化成NNS。随机化密码子是编码感兴趣的肽结构域/基序的那些。
个体克隆的结合试验:挑选文库转化体菌落、或选择输出的菌落,作为个体培养物在含有选择性抗生素的2TY肉汤中生长。使用QIAgenPyroMarkQ96DNA测序仪DNA测序所挑选的菌落,以揭示在每个克隆中存在的氨基酸取代,如下所述分析了其对人血浆激肽释放酶的结合。从培养物中收获含噬菌体的上清,根据Heinis等人(NatureChemicalBiology卷5pp502-507(2009))的方法用三溴甲基苯(TBMB)环化噬菌体。使用基于同质板的结合试验,分析该步骤中纯化的噬菌体对生物素化人血浆激肽释放酶的结合;在BMGLabtechPherastarFS板阅读器上测量试验的读取。来自一式三份试验样本的定量结合数据取平均(平均值),表示为信号:背景。所示的分析数据代表至少2个独立的实验。分析数据与肽序列相关。
肽合成
肽合成基于Fmoc化学、使用PeptideInstruments制造的Symphony肽合成仪进行。使用标准Fmoc氨基酸(Sigma,Merck),其具有以下的侧链保护基:Arg(Pbf);Asn(Trt);Asp(OtBu);Cys(Trt);Glu(OtBu);Gln(Trt);His(Trt);Lys(Boc);Ser(tBu);Thr(tBu);Trp(Boc),Tyr(tBu)(Sigma)。偶联试剂是HCTU(Pepceuticals),二异丙基乙胺(DIPEA,Sigma)用作碱,用20%DMF中的哌啶(AGTC)实现脱保护。使用0.37mmol/grFmoc-Rink酰胺AM树脂(AGTC),在100μ摩尔规模上进行合成,以相对于氨基酸而言4倍过量地使用Fmoc氨基酸,以及4倍过量地使用碱。氨基酸以0.2M溶解于DMF中,HCTU以0.4M溶解于DMF,DIPEA以1.6M溶解于N-甲基吡咯烷酮(AlfaAesar)。偶联时间一般为30分钟,脱保护时间为2x2.5分钟。Fmoc-N-甲基甘氨酸(Fmoc-Sar-OH,Merck)偶联1小时,随后残基的脱保护和偶联时间分别是20分钟和1小时。合成后,用二氯甲烷清洗树脂,并干燥。使用10mL95:2.5:2.5:2.5v/v/v/w的TFA/H2O/iPr3SiH/二硫苏糖醇持续3小时有效从支持物上切割侧链保护基。切割后,通过过滤除去用过的树脂,将滤液加入35mL已经在-80℃中冷却的二乙醚中。离心肽沉淀物,弃去醚上清,用冷却的乙醚清洗肽沉淀物2次以上。然后将肽再溶解于5-10mL乙腈-水中,冻干。取少量样本用于通过质谱分析粗产品的纯度(MALDI-TOF,来自AppliedBiosystems的VoyagerDE)。冻干后,将肽粉末溶解于补充有0.5mL1M二硫苏糖醇的10mLH2O中的6M盐酸胍中,并加样到C8Luna制备型HPLC柱(Phenomenex)。用0.1%七氟丁酸酸化溶剂(H2O,乙腈)。15分钟内的梯度范围为30-70%乙腈、以15/20mL/分钟的流速、使用Gilson制备型HPLC系统。组合含有纯的线性肽物质(如通过MALDI鉴定的)的馏分,并用三溴甲基苯(TBMB,Sigma)修饰。为此,线性肽用H2O稀释到~35mL,加入~500μL100mM乙腈中的TBMB,并且用5mL1M的H2O中NH4HCO3启动反应。使反应在室温下继续进行~30-60分钟,一旦反应完成(通过MALDI判断),冻干。冻干后,如上述纯化修饰的肽,但是用GeminiC18柱(Phenomenex)取代LunaC8,并将酸变成0.1%三氟乙酸。合并含有正确TMB-修饰物质的纯馏分,冻干并保存在-20℃下进行储存。
除非另有注明,所有氨基酸以L-构型使用。
从噬菌体选择直接鉴定的双环肽,通常在N/C端含有两个恒定的丙氨酸。为了肽在血浆稳定性和药代动力学研究中的追踪,如所示的再合成肽,如所示的缺失末端氨基酸,且N端乙酰化。
用于在实施例4中药代动力学研究的肽在10mMHCl的水中冻干3次,以形成盐酸盐的化合物。溶液以1mg/mL在50mMHepespH7.0、5%丙三醇、1.9%DMSO,对于两种化合物(Ac-(06-550)Aze3HArg5Sar3-(D-Arg2))和(06-259-02)-Sar3-(D-Arg2))以5mg/kg通过静脉推注给药至SpraguelyDawely大鼠。在所示时间点,采集连续血液样本(~0.2mL)至EDTA管,并且通过离心分离血浆,并且在-20C冷冻用于分析。采用标准的生物分析技术,然后使用Waters,XevoTQSLC-MS分析血浆样本并且对母体剩余化合物定量。使用来自SummitResearchServices的软件包PKSolutions2.0确定PK参数。
用于实施例5和6研究的肽获得自纯的(>95%)馏分,所述馏分收集自存在0.5%乙酸的反相纯化运行,其在冻干后,得到肽的乙酸盐。
酶试验
在10mMTrisHCl,150mMNaCl,10mMMgCl2,1mMCaCl2和1mg/mLBSA(均来自Sigma英国)pH7.4中,在25℃下,在固体黑色96孔板或384孔板上进行功能性酶试验。简言之,26.5pM人血浆激肽释放酶(购自Stratech,英国)或13.25pM大鼠血浆激肽释放酶(在室内表达和纯化),在不存在或存在浓度递增的测试肽下孵育15分钟,而后添加产生荧光的底物Z-PheArg-AMC(EnzoLifesciences英国)至在4%DMSO中的最终试验浓度100μM。使用PherastarFS(BMGLabtech),在360nm激发和460nm发射下,测量AMC释放。在MARS数据分析软件中(BMGlabtech)计算反应线性相的速率(通常5至45分钟)。然后在Prism(GraphPad)中用该速率计算IC50和Ki。四参数抑制非线性回归方程用来计算IC50。单一位点拟合(Onesite-fit)Ki方程用于计算Ki,对于150μM人酶的底物,和200μM的大鼠直系同源物的底物,将Ki限制至Km。所有Ki/IC50值是至少两个(并且对于Ki值低于1nM的肽至少三个)独立实验的平均值。对于兔激肽释放酶,以50μMKm的33μM的底物,使用7至14pM的酶。
肽作为TFA盐以其粉末形式溶解,存储溶液通常在水中制备。离心并过滤(20μm注射器过滤器)所有的溶液,而后在280nm测量吸光度。根据肽和TMB的Trp/Tyr含量计算消光系数(TMB核心,当包含在肽中时,具有~300M-1cm-1的消光系数)。
血浆稳定性谱
方法#1:
开发了一种快速的血浆稳定性谱试验,其应用母体质量的质谱检测(MALDI-TOF,VoyagerDE,AppliedBiosystems),直至母体肽的质量再也观察不到时。特别地,在35%大鼠或人血浆(血清实验室,使用柠檬酸作为抗凝剂)存在时、在37℃下孵育200μM肽,其中补充了1xPBS(来自10xPBS存储液,Sigma)。在不同的时间点(即,t=0、3、24小时,而后是每天,直至第10天),将2μL样本加入到18μL1:1的乙腈:H2O混合物中30mM碳酸氢铵中。在-80℃样本冷冻直至分析的时候。对于质谱分析,确定该肽的大约的检测窗口,将给定时间点的乙腈:H2O稀释的样本在MALDI板上直接点样(0.7μL)。基质(α-氰基肉桂酸,Sigma,制备成含有0.1%三氟乙酸的1:1乙腈:水中的饱和溶液)盖在样本(1μL)上。可在相似的激光强度设定下,在MALDITOF上,随后确定时间,直到不再检测到母体肽。应当指出,这是一个定性试验,用于检测血浆稳定性的相对变化。
方法#2:
为了更快地获得稳定性的数据,还在95%血浆中评估了肽。在此,省去PBS,将1-5mM肽存储液(DMSO中)直接稀释于血浆(即,2.5μL存储液至47.5μL血浆中),指定最终浓度为50μM。在适当的时间点取5μL样本,冷冻于-80℃。为了分析,将样本解冻,与25μL的3:3:1乙腈:甲醇:水混合,在13k离心5分钟。吸取5μL含肽的上清,并与乙腈:H2O的1:1混合液中的30mM碳酸氢铵混合。然后将1μL该混合物点样在MALDI板上,如上所述进行分析。如上所述,应当指出,这是一个用于检测血浆稳定性的相对变化的定性测量。
方法#3:
为了定量获得血浆稳定性,肽存储液(DMSO中1mM)运送到Biofocus,英国,其进行该分析。将肽用水稀释到100μM,以1:20在血浆中稀释(5μM最终浓度,血浆为95%),适时地取样,如上述沉淀,使用WatersXevoTQ-MS通过LC-MS定量。
实施例1:鉴定具有有利的同系物选择性和物种交叉反应性的结合激肽释放酶的双环肽
(a)鉴定新的、有效的、人和大鼠交叉反应的前导序列
对于任意给定的治疗性双环肽,其药效学和药代动力学特性需要在临床前动物物种中评估。常见的临床前的物种包括:大鼠、小鼠、兔、狗、小型猪和食蟹猕猴。
一般地,由于双环肽的高选择性(在某种程度上得益于其与靶标蛋白大的接触面积),对人靶标蛋白的高亲和性双环肽可能不与衍生自给定的临床前物种的相同靶标蛋白交叉反应,使得临床前难以评估该前导。一个示例包括PK15(如WO2009/098450中公开的),其是有效的双环肽(6x6环大小),具有对人激肽释放酶~1.2nM的Ki。对大鼠激肽释放酶的效能显著地降低,在~500nM的Ki,使得该前导不适合用于临床前评估。
为了鉴定具有对人激肽释放酶高效能的5x5和6x6前导双环肽,同时对大鼠激肽释放酶保留相当的效能,进行了噬菌体选择,其中在每次选择循环期间,大鼠和人激肽释放酶被交替作为诱饵。通过在选择循环期间调整诱饵的浓度,可以鉴定出不同的交叉反应性前导序列。以结合人激肽释放酶筛选每次选择输出的样本,并随后测序。
特别地,在靶标浓度范围3至100nM,以人激肽释放酶进行前两次选择循环,随后以30nM的靶标浓度,使用大鼠激肽释放酶进行两次选择循环。
在同质筛选试验中,对于激肽释放酶结合的个体噬菌体克隆的筛选显示,若干独特的序列相对于背景信号增加高达50倍。这些序列作为合成肽被制备,并评估其对人、大鼠、和兔激肽释放酶的抑制(表1)。
表1:新的、交叉反应的双环前导的总结
恒定的半胱氨酸以灰色表示,且每个前导的保守残基以下划线表示。
一些前导在大鼠和人激肽释放酶间显示良好的交叉反应性:06-254、06-255、06-258、和06-261(表1)。通过对每个前导家族评估序列输出,可鉴定出半保守的残基,并且以下划线表示(表1)。
06-254和06-255分享几乎一致的第一环,但是其第二环不同。06-258是唯一的交叉反应性前导序列,其被鉴定在环1和环2中均含有5个氨基酸(5x5)。
(b)大鼠-人激肽释放酶交叉反应的双环肽序列的亲和性成熟。
所选择的双环肽候选物(表1)被选择用于进行亲和性成熟。从初始选择输出推测一致性残基。根据在表2中的信息,对于亲和性成熟,呈现在一致性区域以外的残基进行随机化。
表2:每个结合激肽释放酶的双环肽前导的亲和性成熟文库
序列ID编号:06-254母体(SEQIDNO:23)、文库(SEQIDNO:64);06-256母体(SEQIDNO:49)、文库(SEQIDNO:65);06-258母体(SEQIDNO:52),文库(SEQIDNO:66);06-259母体(SEQIDNO:10),文库(SEQIDNO:67);06-261母体(SEQIDNO:54),文库(SEQIDNO:99)。
较保守的结合基序以外的残基被随机化(“X”)。在06-261的情况中,其06-34-18-样FPFR基序(SEQIDNO:100)被随机化,然而周围的残基被固定。
以两个示例06-254和06-259显示亲和性成熟的文库的序列输出:
06-254序列输出:
表3显示通过筛选试验鉴定的最有效的06-254变体。
表3:06-254亲和性成熟文库的序列输出
S:B指信号:背景。通过同质筛选试验鉴定有效的结合物,并且与其母体序列(06-254)和6x6激肽释放酶结合物PK15(WO2009/098450)相比较。
选择最有效的候选物(06-254-01、06-254-02和06-254-03)用于肽合成,并且评估对于大鼠和人激肽释放酶的抑制。
06-259序列输出
表4显示通过筛选试验鉴定的最有效的06-259变体。
表4:06-259亲和性成熟文库的序列输出
S:B指信号:背景。通过同质筛选试验鉴定有效的结合物,并且与其母体序列(06-259)和6x6激肽释放酶结合物PK15(WO2009/098450)相比较。
选择最有效的候选物(06-259-01、06-259-02、06-259-03和06-259-04)用于肽合成,以及进行对大鼠和人激肽释放酶的亲和性测量。
合成肽在体外的效能和交叉反应性总结在表5中。
表5:对人、大鼠和兔激肽释放酶的抑制常数(Ki)的总结
对人/大鼠激肽释放酶的解离率分别低于10/20nM的双环肽前导以粗体表示。
总之,存在一些候选物显示高效能且在大鼠和人激肽释放酶间良好的交叉反应性,例如06-254-01、06-254-02、06-254-03、06-255、06-258、06-259-01、06-259-02、06-259-03、06-259-04和06-261(粗体,参见表5)。
实施例2:结合激肽释放酶的双环肽的血浆稳定性筛选揭示有前景的前导候选物
在实施例1中,鉴定了一些新的双环前导序列,其具有高的人和大鼠效能。选择每个家族最有效的成员用于大鼠和人血浆稳定性的比较。它们是06-254-02、06-255、06-259-02和06-261。使用方法#1的初始筛选表明06-255和06-259-02相比余下的双环肽是更稳定的,正如这两个肽的较长的检测窗口所判断的(长达10天,数据未显示)。余下的肽在2-3天后不能再检测到,显示如未经修饰的序列06-34-18相似的低稳定性。06-255和06-259-02均具有差的溶解性谱,并且因此以增溶C端延伸重合成(Sar3-(D-Arg)2(SEQIDNO:98))。在此,肌氨酸3(Sar3)充当分子间隔物,然而由于D-精氨酸在生理pH时的强离子、水络合性质,其给予分子更高的水溶性。
如表6中表明的,增溶延伸没有显著阻碍酶抑制常数。
表6:具有增溶延伸的对人、大鼠和兔激肽释放酶的抑制常数(Ki)的总结
在方法#2中描述的条件下,在人和大鼠血浆中对肽进行试验。对比06-34-18评估稳定性,06-34-18具有在大鼠血浆中2.3小时和在人血浆中2小时的定量t1/2(WO2013/050616)。图1和2证实了双环肽前导06-259-02具有特别有利的血浆稳定性谱,其中相比06-255和06-34-18,双环肽前导06-259-02对人和大鼠血浆显著的更稳定。
实施例3:不同的双环肽前导间的接枝(Grafting)肽环生成具有有利的特性的新的嵌合结构
先前公开的06-34-18序列(WO2013/050616,序列:CSWPARCLHQDLC(SEQIDNO:86))的第一环与文中鉴定的06-261肽(序列:CNNFPFRCVYYPDIC(SEQIDNO:54))共享相似的FPFR基序(SEQIDNO:100,下划线)。然而06-34-18被描述为含有两个蛋白酶解识别位点,使得肽对血浆蛋白酶不稳定,并因此不适合作为激肽释放酶抑制治疗。这些位点包含06-34-18的残基Arg5和His7(CSWPACLQDLC(SEQIDNO:86):下划线和粗体)。在本公开中的06-261序列(实施例1),等价于环2中组氨酸的蛋白酶解识别位点是不存在的。
由于在06-261的第二环(序列:VYYPDI(SEQIDNO:87))中His7的缺失,本发明的发明人以06-261的第二环取代了06-34-18蛋白酶解不稳定的、含有组氨酸的第二环,希望产出在环2中具有增强蛋白酶解稳定性的、完全有效的嵌合肽。特别地,该序列包含06-34-18的第一环(序列:SFPYR(SEQIDNO:88)),和06-261的第二环(序列:VYYPDI(SEQIDNO:87)),产出嵌合体全序列CSFPYRCVYYPDIC(SEQIDNO:55)(或者WPAR等价物,即CSWPARCVYYPDIC(SEQIDNO:89))。该嵌合肽命名为06-550,并且在环1中具有5个残基,且在环2中具有6个残基。
先前已经公开了(WO2013/050616)在06-34-18中Arg5诱导的蛋白酶解不稳定性可以通过N-α甲基精氨酸(NMe-Arg)或高精氨酸(HArg)取代Arg5而去除或降低。另外,在位置3可以同时引入L-氮杂环丁烷羧酸(Aze)的增强亲和性置换,取代原始脯氨酸3。
由于嵌合双环肽06-550保留了06-34-18的第一环,在Arg5/Pro3实施相同的修饰至HArg5/Aze3,并且该肽命名为06-550Aze3HArg5。
由于在序列中不存在溶解性增强组氨酸7,然而与06-34-18相比,06-550(或06-550Aze3HArg5)显示显著降低的水溶性。为增强这些分子的水溶性,合成含有C端延伸的衍生物,所述C端延伸包含肌氨酸3-间隔物其后具有两个D-精氨酸。包含D-精氨酸导致了这些肽的更有利的水溶性。
这些肽的激肽释放酶抑制常数总结在表7中。
表7:06-550肽对人、大鼠和兔激肽释放酶的抑制常数
从数据明显看出:Aze3-HArg5修饰是良好耐受的,因为对人和大鼠亲和性均是高的。N-甲基修饰是较不合适的。同样地,Sar3-(D-Arg2)(SEQIDNO:98)增溶延伸是良好耐受的,与缺乏该延伸的肽相比,效能保持不变。
06-550衍生物的相对血浆稳定性谱
根据方法#2,评估双环肽“Ac-(06-550)-Sar3-(DArg2)Aze3HArg5”的稳定性(表7)在人和大鼠血浆中的相对稳定性(图3),并与不稳定的06-34-18比较(图1和2)。
在来自两物种的血浆中,肽显示高稳定性,因为观察到很少的降解产物。相比之下,在同样的时间进程,不稳定的06-34-18母体质量很大程度上消失了(数据在实施例2中显示)。因此,衍生自独立的母体序列(06-261和06-34-18)的组合环的概念产出新的、嵌合的、有效的且蛋白酶解稳定的分子。
实施例4:选择的抑制激肽释放酶的双环肽的体内药代动力学行为
选择肽Ac-(06-550)-Sar3-(D-Arg)2Aze3HArg5(其含有稳定的和亲和性增强性的修饰Aze3和HArg5,以及增溶C端延伸Sar3-(D-Arg)2)(SEQIDNO:98)和Ac-(06-259-02)-Sar3-(D-Arg)2在大鼠中进行药代动力学评估。肽以1mg/mL在缓冲溶液中,以5mg/kg静脉注射至SpragueDawley大鼠,并且在注射后若干时间点采样血液和分析肽浓度。
两个肽显示17(06-550)至7ml/min/kg(06-259-02)的清除(表8,图4),其接近公开的在大鼠中的肾滤过率(~8-9mL/min/kg)[JobinJ,BonjourJP,(1985)AmJPhysiol.;248(5Pt2):F734-8]。
这突出了Ac-(06-550)-Sar3-(D-Arg)2Aze3HArg5增强的蛋白酶解稳定性,其含有两种稳定修饰Aze3和HArg5,并且含有在环二中固有的蛋白酶解稳定序列。
Ac-(06-259-02)-Sar3-(D-Arg)2的情况中,天然的序列在大鼠中是足够蛋白酶解稳定的,从而其清除主要通过肾排泄驱动。
表8:在大鼠中Ac-(06-550)-Sar3-(D-Arg)2Aze3HArg5和Ac-(06-259-02)-Sar3-(D-Arg)2的药代动力学参数
实施例5:玻璃体内注射选择的抑制激肽释放酶的双环肽后体内药代动力学分析
在该分析中,对比肽Ac-(06-34-18)Phe2Aze3Tyr4HArg5Ala(ψCH2NH)6(在本研究中指双环2,并且其在PCT/EP2014/057440的表26b和图22中公开),评估肽Ac-(06-550)-Sar3-(D-Arg)2Aze3HArg5(在本研究中指双环1,且其含有稳定的和亲和性增强修饰Aze3和HArg5,以及增溶C端延伸Sar3-(D-Arg)2(SEQIDNO:98);参见文中实施例3和4)。麻醉新西兰白兔(2-3kg),并且根据表9中描述的方案通过玻璃体内注射(100μg/眼)施用两种肽。
表9:用于玻璃体内注射的施用方法
OS=左眼;OD=右眼;
Min=分钟;h=小时。
载体=10mM醋酸钠缓冲溶液,pH5.0,在含2.5%丙三醇的水中。
在合适的时间之后,兔被安乐死,并且取玻璃状液、房水、视网膜和血浆样本。通过LC-MS分析样本以确定肽的浓度。该研究的结果在表5中显示,其中可以观察到两种肽均从玻璃状液中被缓慢地清除,具有20-30小时的清除半衰期。这相比例如抗生素环丙沙星(报告的在正常的兔玻璃体中半衰期2.2小时;Pearson等人1993,Retina13:326-330)的小分子的清除而言,显著更慢。
实施例6:选择的抑制激肽释放酶的双环肽对角叉菜胶诱导的足肿胀的作用
在该分析中,对比肽Ac-(06-34-18)Phe2Aze3Tyr4HArg5Ala(ψCH2NH)6(在本研究中指双环2,且其在PCT/EP2014/057440的表26b和图22中公开)评估肽Ac-(06-259-02)-Sar3-(D-Arg)2(在本研究中指双环3;参见本文中实施例2)。通过在右后足的足底区注射100μL的1%角叉菜胶溶液,在雄性Sprague-Dawley大鼠中(每组n=10)诱导炎症。根据表10,动物接受肽和吲哚美辛的处理。
表10:角叉菜胶诱导分析的剂量方案
*相对于角叉菜胶施用的给药时间
ip=腹腔内
载体=50mM乙酸钠缓冲液,pH5.0,20%PEG400和10%KolliphorEL
角叉菜胶施用后1、2、4和6小时,通过水置换法测量足体积。使用双变量ANOVA(2-wayANOVA)对重复测量进行统计学分析(GraphPadPrism)。
该研究的结果在图6中显示,其中可以观察到在所有时间点两种肽均抑制由角叉菜胶诱导的足肿胀。以肽或阳性对照、吲哚美辛处理均产生足肿胀的高度显著的降低(p<0.001)。重要的是,两种肽和吲哚美辛间的抑制程度具有可比性,吲哚美辛被认为是在该模型中的金标准治疗半簇。

Claims (28)

1.一种特异于血浆激肽释放酶的肽配体,其包含多肽,所述多肽包含被至少两个环序列分隔的至少三个半胱氨酸残基,以及分子支架,所述分子支架与多肽的半胱氨酸残基形成共价键,从而在分子支架上形成至少两个多肽环,其中所述肽配体包含选自以下任意的肽序列:
(a)-Ci-N-X-W-N-P-W-Cii-O/U-X-X-X-O/J-X-Ciii-(SEQIDNO:1);
(b)-Ci-B-N-J-W-N-P-Cii-X-L-O-X-X-X-Ciii-(SEQIDNO:2);
(c)-Ci-Q-K-F-E-S-R-Cii-X-X-X-X-X-X-Ciii-(SEQIDNO:3);
(d)-Ci-P-L-S-D-T-L-Cii-Y-R-R-M-P-P-Ciii-(SEQIDNO:4);
(e)-Ci-P-Y-P-F-R-Cii-X-H-X-X-X-Ciii-(SEQIDNO:5);和
(f)-Ci-(N)a-U-J-P-J-R-Cii-V-Y-Y-P-D-I-Ciii-(SEQIDNO:6);
或其经修饰的衍生物,或药学可接受的盐;
其中:
Ci、Cii和Ciii分别代表第一、第二和第三半胱氨酸残基;
下标“a”代表选自0或1的整数;
X代表任意氨基酸残基;
O代表非极性的脂肪族氨基酸残基,选自G、A、I、L、P和V;
J代表非极性的芳香族氨基酸残基,选自F、W和Y;
U代表极性的不带电的氨基酸残基,选自N、C、Q、M、S和T;以及
B代表极性的带正电的氨基酸残基,选自R、H和K。
2.根据权利要求1所述的肽配体,其包含式(a)的序列。
3.根据权利要求1或2所述的肽配体,其中式(a)的肽包含选自-Ci-N-X-W-N-P-W-Cii-O/U-X-X-X-O-X-Ciii-(SEQIDNO:7)的序列,例如-Ci-N-T/H/Y-W-N-P-W-Cii-G/S/P-A/V/W/D/S-D/E/V/T/P-A/G/P/I/R/D-G/P/Y/I-F/I/L/V/R/G/D-Ciii-(SEQIDNO:8),特别地,-Ci-N-T/H/Y-W-N-P-W-Cii-G/S/P-A/V/W-D/E/V-A/G/P-G/P-F/I/L/V-Ciii-(SEQIDNO:9)。
4.根据权利要求1至3中任一项所述的肽配体,其中式(a)的肽包含选自以下的序列:
-Ci-N-T-W-N-P-W-Cii-G-W-V-G-G-F-Ciii-(06-259)(SEQIDNO:10);
-Ci-N-H-W-N-P-W-Cii-S-V-E-P-P-V-Ciii-(06-259-01)(SEQIDNO:11);
-Ci-N-T-W-N-P-W-Cii-P-W-D-A-P-L-Ciii-(06-259-02)(SEQIDNO:12);
-Ci-N-H-W-N-P-W-Cii-S-A-D-P-P-I-Ciii-(06-259-03)(SEQIDNO:13);
-Ci-N-Y-W-N-P-W-Cii-P-W-D-A-P-L-Ciii-(06-259-04)(SEQIDNO:14);
-Ci-N-H-W-N-P-W-Cii-S-A-D-P-P-R-Ciii-(06-259-F1)(SEQIDNO:15);
-Ci-N-H-W-N-P-W-Cii-P-A-D-I-P-V-Ciii-(06-259-E2)(SEQIDNO:16);
-Ci-N-H-W-N-P-W-Cii-S-D-D-P-Y-I-Ciii-(06-259-H3)(SEQIDNO:17);
-Ci-N-H-W-N-P-W-Cii-S-S-D-P-P-V-Ciii-(06-259-H4)(SEQIDNO:18);
-Ci-N-Y-W-N-P-W-Cii-S-D-T-R-I-G-Ciii-(06-259-A6)(SEQIDNO:19);和
-Ci-N-T-W-N-P-W-Cii-S-W-P-D-I-D-Ciii-(06-259-F2)(SEQIDNO:20);
例如-Ci-N-H-W-N-P-W-Cii-S-V-E-P-P-V-Ciii-(06-259-01)(SEQIDNO:11);
-Ci-N-T-W-N-P-W-Cii-P-W-D-A-P-L-Ciii-(06-259-02)(SEQIDNO:12);
-Ci-N-H-W-N-P-W-Cii-S-A-D-P-P-I-Ciii-(06-259-03)(SEQIDNO:13);和
-Ci-N-Y-W-N-P-W-Cii-P-W-D-A-P-L-Ciii-(06-259-04)(SEQIDNO:14);
特别地,-Ci-N-T-W-N-P-W-Cii-P-W-D-A-P-L-Ciii-(06-259-02)(SEQIDNO:12)。
5.根据权利要求1所述的肽配体,其包含式(b)的序列。
6.根据权利要求1或5所述的肽配体,其中式(b)的肽包含选自-Ci-K/R-N-Y-W-N-P-Cii-D/T/G-L-I/V/L-E/M/N/P/T/Q/S/Y/G/D/W/R/H/A-D/G/I/T/A/S/P/V-P/S/T/A/K/G/H/F/Q/D/L/I/M/R/Y-Ciii-(SEQIDNO:21)的序列,例如-Ci-K/R-N-Y-W-N-P-Cii-D/T-L-I/V-E/M/N/P/T-D/G/I/T-P/S/T-Ciii-(SEQIDNO:22)。
7.根据权利要求5或6所述的肽配体,其中式(b)的肽包含选自以下的序列:
-Ci-K-N-Y-W-N-P-Cii-D-L-V-T-I-S-Ciii-(06-254)(SEQIDNO:23);
-Ci-K-N-Y-W-N-P-Cii-D-L-I-E-T-T-Ciii-(06-254-01)(SEQIDNO:24);
-Ci-K-N-Y-W-N-P-Cii-D-L-I-P-G-P-Ciii-(06-254-02)(SEQIDNO:25);
-Ci-K-N-Y-W-N-P-Cii-D-L-V-M-D-T-Ciii-(06-254-03)(SEQIDNO:26);
-Ci-K-N-Y-W-N-P-Cii-D-L-I-Q-D-A-Ciii-(06-254-F4)(SEQIDNO:27);
-Ci-K-N-Y-W-N-P-Cii-D-L-I-S-I-K-Ciii-(06-254-B3)(SEQIDNO:28);
-Ci-K-N-Y-W-N-P-Cii-D-L-I-P-T-G-Ciii-(06-254-G3)(SEQIDNO:29);
-Ci-K-N-Y-W-N-P-Cii-D-L-V-Q-I-H-Ciii-(06-254-H4)(SEQIDNO:30);
-Ci-K-N-Y-W-N-P-Cii-D-L-I-G-I-T-Ciii-(06-254-G2)(SEQIDNO:31);
-Ci-K-N-Y-W-N-P-Cii-D-L-V-D-T-F-Ciii-(06-254-A4)(SEQIDNO:32);
-Ci-K-N-Y-W-N-P-Cii-D-L-V-E-A-Q-Ciii-(06-254-G4)(SEQIDNO:33);
-Ci-K-N-F-W-N-P-Cii-D-L-I-P-I-S-Ciii-(06-254-D3)(SEQIDNO:34);
-Ci-K-N-Y-W-N-P-Cii-D-L-I-W-T-D-Ciii-(06-254-E2)(SEQIDNO:35);
-Ci-K-N-Y-W-N-P-Cii-D-L-I-P-D-L-Ciii-(06-254-F5)(SEQIDNO:36);
-Ci-K-N-Y-W-N-P-Cii-D-L-L-E-S-T-Ciii-(06-254-E5)(SEQIDNO:37);
-Ci-K-N-Y-W-N-P-Cii-D-L-I-R-P-P-Ciii-(06-254-D1)(SEQIDNO:38);
-Ci-K-N-Y-W-N-P-Cii-D-L-L-G-I-A-Ciii-(06-254-B9)(SEQIDNO:39);
-Ci-K-N-Y-W-N-P-Cii-D-L-V-H-D-I-Ciii-(06-254-E3)(SEQIDNO:40);
-Ci-K-N-Y-W-N-P-Cii-D-L-I-P-D-M-Ciii-(06-254-D6)(SEQIDNO:41);
-Ci-K-N-Y-W-N-P-Cii-D-L-I-A-D-L-Ciii-(06-254-H3)(SEQIDNO:42);
-Ci-K-N-Y-W-N-P-Cii-D-L-L-H-V-R-Ciii-(06-254-A7)(SEQIDNO:43);
-Ci-K-N-Y-W-N-P-Cii-D-L-I-A-P-Y-Ciii-(06-254-C1)(SEQIDNO:44);
-Ci-K-N-Y-W-N-P-Cii-G-L-V-Y-S-T-Ciii-(06-254-E6)(SEQIDNO:45);
-Ci-K-N-Y-W-N-P-Cii-D-L-L-P-D-L-Ciii-(06-254-B1)(SEQIDNO:46);和
-Ci-R-N-Y-W-N-P-Cii-T-L-I-N-I-T-Ciii-(06-255)(SEQIDNO:47);
例如-Ci-K-N-Y-W-N-P-Cii-D-L-I-E-T-T-Ciii-(06-254-01)(SEQIDNO:24);
-Ci-K-N-Y-W-N-P-Cii-D-L-I-P-G-P-Ciii-(06-254-02)(SEQIDNO:25);
-Ci-K-N-Y-W-N-P-Cii-D-L-V-M-D-T-Ciii-(06-254-03)(SEQIDNO:26);和
-Ci-R-N-Y-W-N-P-Cii-T-L-I-N-I-T-Ciii-(06-255)(SEQIDNO:47);
特别地,-Ci-K-N-Y-W-N-P-Cii-D-L-I-P-G-P-Ciii-(06-254-02)(SEQIDNO:25);和
-Ci-R-N-Y-W-N-P-Cii-T-L-I-N-I-T-Ciii-(06-255)(SEQIDNO:47);
更特别地,-Ci-R-N-Y-W-N-P-Cii-T-L-I-N-I-T-Ciii-(06-255)(SEQIDNO:47)。
8.根据权利要求1所述的肽配体,其包含式(c)的序列。
9.根据权利要求8所述的肽配体,其中式(c)的肽包含选自-Ci-Q-K-F-E-S-R-Cii-R-V-D-T-R-Y-Ciii-(06-256)(SEQIDNO:49)的序列。
10.根据权利要求1所述的肽配体,其包含式(d)的序列。
11.根据权利要求1所述的肽配体,其包含式(e)的序列。
12.根据权利要求11所述的肽配体,式(e)的肽包含选自-Ci-P-Y-P-F-R-Cii-L-H-E-N-L-Ciii-(06-258)(SEQIDNO:52)的序列。
13.根据权利要求1所述的肽配体,其包含式(f)的序列。
14.根据权利要求1或13所述的肽配体,其中式(f)的肽包含选自-Ci-(N)a-N/S-F-P-F/Y-R-Cii-V-Y-Y-P-D-I-Ciii-(SEQIDNO:53)的序列。
15.根据权利要求13或14所述的肽配体,其中式(f)的肽包含选自以下的序列:
-Ci-N-N-F-P-F-R-Cii-V-Y-Y-P-D-I-Ciii-(06-261)(SEQIDNO:54);或者
-Ci-S-F-P-Y-R-Cii-V-Y-Y-P-D-I-Ciii-(06-550)(SEQIDNO:55)。
16.根据权利要求1至15中任一项所述的肽配体,其中所述经修饰的衍生物包括选自以下的一种或更多种修饰:N端和/或C端修饰;以一个或更多个非天然氨基酸残基取代一个或更多个氨基酸残基(例如以一个或更多个同配位或等电子氨基酸取代一个或更多个极性氨基酸残基;以其它的非天然的同配位或等电子氨基酸取代一个或更多个疏水性氨基酸残基);添加间隔基团;以一个或更多个抗氧化氨基酸残基取代一个或更多个氧化敏感氨基酸残基;以丙氨酸取代一个或更多个氨基酸残基,以一个或更多个D-氨基酸残基取代一个或更多个L-氨基酸残基;在双环肽配体中的一个或更多个酰胺键的N-烷基化;以替代键取代一个或更多个肽键;肽骨架长度修饰;以另外的化学基团置换一个或更多个氨基酸残基的α-碳上的氢,以及用合适的胺、硫醇、羧酸和苯酚反应试剂进行的氨基酸合成后的生物正交修饰,其中所述的氨基酸例如半胱氨酸、赖氨酸、谷氨酸和酪氨酸。
17.根据权利要求16所述的肽配体,其中所述经修饰的衍生物包含N端修饰,例如N端乙酰基团,特别地,其中N端半胱氨酸基团(Ci)用乙酸酐加帽。
18.根据权利要求16所述的肽配体,其中所述经修饰的衍生物包含C端修饰,例如C端酰胺基团,特别地,C端半胱氨酸基团(Ciii)的酰胺化。
19.根据权利要求16所述的肽配体,其中所述经修饰的衍生物包含以一个或更多个非天然氨基酸残基取代一个或更多个氨基酸残基,例如以L-氮杂环丁烷羧酸残基取代脯氨酸残基和/或以N-α-甲基精氨酸或L-高精氨酸残基取代精氨酸残基。
20.根据权利要求19所述的肽配体,其是式(f)的非天然衍生物,所述非天然衍生物包含具有选自以下的序列的肽:
-Ci-S-F-P-Y-[hR]-Cii-V-Y-Y-P-D-I-Ciii-((06-550)HArg5)(SEQIDNO:56);
-Ci-S-F-[Aze]-Y-[hR]-Cii-V-Y-Y-P-D-I-Ciii-((06-550)Aze3HArg5)(SEQIDNO:58);
-Ci-S-F-P-Y-[NMeR]-Cii-V-Y-Y-P-D-I-Ciii-((06-550)NMeArg5)(SEQIDNO:59);和
-Ci-S-F-[Aze]-Y-[NMeR]-Cii-V-Y-Y-P-D-I-Ciii-((06-550)Aze3NMeArg5)(SEQIDNO:60);
其中Aze代表L-氮杂环丁烷羧酸残基,hR和HArg代表L-高精氨酸残基,以及NMeR和NMeArg代表N-α-甲基精氨酸残基;
例如-Ci-S-F-P-Y-[hR]-Cii-V-Y-Y-P-D-I-Ciii-((06-550)HArg5)(SEQIDNO:56);和
-Ci-S-F-[Aze]-Y-[hR]-Cii-V-Y-Y-P-D-I-Ciii-((06-550)Aze3HArg5)(SEQIDNO:58);
其中Aze代表L-氮杂环丁烷羧酸残基以及hR和HArg代表L-高精氨酸残基;
特别地,-Ci-S-F-[Aze]-Y-[hR]-Cii-V-Y-Y-P-D-I-Ciii-((06-550)Aze3HArg5)(SEQIDNO:58)
其中Aze代表L-氮杂环丁烷羧酸残基以及hR和HArg代表L-高精氨酸残基。
21.根据权利要求16所述的肽配体,其中所述经修饰的衍生物包含添加的间隔基团,例如间隔基团添加至N端半胱氨酸(Ci)和/或C端半胱氨酸(Ciii)。
22.根据权利要求21所述的肽配体,其中所述的间隔基团包含连接至两个或更多个D-精氨酸残基(合适地,两个D-精氨酸残基)的一个或更多个肌氨酸基团(合适地,三个肌氨酸基团)。
23.根据权利要求21或22所述的肽配体,其是式(a)的经修饰的衍生物,所述肽配体包含具有选自-Ci-N-T-W-N-P-W-Cii-P-W-D-A-P-L-Ciii-Sar3-(D-Arg)2((06-259-02(Sar3-(D-Arg)2)(SEQIDNO:61)的序列的肽;其中Sar3代表三个肌氨酸间隔物以及(D-Arg)2代表两个D-精氨酸残基。
24.根据权利要求21或22所述的肽配体,其是式(f)的经修饰的衍生物,所述肽配体包含具有选自以下的序列的肽:
-Ci-S-F-P-Y-R-Cii-V-Y-Y-P-D-I-Ciii-Sar3-(D-Arg)2((06-550)-Sar3-(DArg2))(SEQIDNO:62);和
-Ci-S-F-[Aze]-Y-[hR]-Cii-V-Y-Y-P-D-I-Ciii-Sar3-(D-Arg)2((06-550)-Sar3-(DArg2)Aze3HArg5)(SEQIDNO:63);
其中Sar3代表三个肌氨酸间隔物,(D-Arg)2代表两个D-精氨酸残基,Aze代表L-氮杂环丁烷羧酸残基,以及hR和HArg代表L-高精氨酸残基;
例如-Ci-S-F-[Aze]-Y-[hR]-Cii-V-Y-Y-P-D-I-Ciii-Sar3-(D-Arg)2((06-550)-Sar3-(DArg2)Aze3HArg5)(SEQIDNO:63);
其中Sar3代表三个肌氨酸间隔物,(D-Arg)2代表两个D-精氨酸残基,Aze代表L-氮杂环丁烷羧酸残基,以及hR和HArg代表L-高精氨酸残基。
25.根据权利要求1至24中任一项所述的肽配体,其中所述药学可接受的盐选自盐酸盐或乙酸盐。
26.根据权利要求1至25中任一项所述的肽配体,其对人、大鼠和/或兔血浆激肽释放酶是特异性的,例如人和/或大鼠血浆激肽释放酶,特别是人血浆激肽释放酶。
27.一种药物组合物,其包含权利要求1至26中任一项所述的肽配体,所述肽配体与一种或更多种药学可接受的赋形剂组合。
28.权利要求1至26中任一项所述的肽配体在预防、抑制或治疗炎症状态、变应性超敏反应、癌症、细菌或病毒感染、眼科疾病和自体免疫性疾病中的用途。
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