CN105602945B - 一种同时检测海水鱼类三种致病菌的检测引物组、检测试剂盒和检测方法 - Google Patents

一种同时检测海水鱼类三种致病菌的检测引物组、检测试剂盒和检测方法 Download PDF

Info

Publication number
CN105602945B
CN105602945B CN201510749904.9A CN201510749904A CN105602945B CN 105602945 B CN105602945 B CN 105602945B CN 201510749904 A CN201510749904 A CN 201510749904A CN 105602945 B CN105602945 B CN 105602945B
Authority
CN
China
Prior art keywords
primer
detection
bacillus
sample
vibrio harveyi
Prior art date
Legal status (The legal status is an assumption and is not a legal conclusion. Google has not performed a legal analysis and makes no representation as to the accuracy of the status listed.)
Expired - Fee Related
Application number
CN201510749904.9A
Other languages
English (en)
Other versions
CN105602945A (zh
Inventor
苏友禄
冯娟
孙秀秀
郭志勋
马红玲
Current Assignee (The listed assignees may be inaccurate. Google has not performed a legal analysis and makes no representation or warranty as to the accuracy of the list.)
South China Sea Fisheries Research Institute Chinese Academy Fishery Sciences
Original Assignee
South China Sea Fisheries Research Institute Chinese Academy Fishery Sciences
Priority date (The priority date is an assumption and is not a legal conclusion. Google has not performed a legal analysis and makes no representation as to the accuracy of the date listed.)
Filing date
Publication date
Application filed by South China Sea Fisheries Research Institute Chinese Academy Fishery Sciences filed Critical South China Sea Fisheries Research Institute Chinese Academy Fishery Sciences
Priority to CN201510749904.9A priority Critical patent/CN105602945B/zh
Publication of CN105602945A publication Critical patent/CN105602945A/zh
Application granted granted Critical
Publication of CN105602945B publication Critical patent/CN105602945B/zh
Expired - Fee Related legal-status Critical Current
Anticipated expiration legal-status Critical

Links

Landscapes

  • Measuring Or Testing Involving Enzymes Or Micro-Organisms (AREA)

Abstract

本发明公开了一种鰤鱼诺卡氏菌、哈维弧菌和海豚链球菌的检测引物组、检测试剂盒和检测方法;其技术要点:所述引物组包括引物对Ns‑mce、引物对Vh‑tox和引物对Si‑its,所述引物对的核苷酸序列如SEQ ID NO.1~6所示;所述检测试剂盒包括上述检测引物组;所述检测方法运用上述检测试剂盒进行检测,先对样品进行前处理,并提取基因组DNA作为样品组DNA,再采用PCR方法对样品进行检测;旨在建立一套三重PCR检测方法,可用于对各时期的鰤鱼诺卡氏菌、哈维弧菌和海豚链球菌进行跟踪检测,避免病原菌传播流行,加强水产品中致病菌的快速检验检疫;属于水产养殖动物病原菌检测领域。

Description

一种同时检测海水鱼类三种致病菌的检测引物组、检测试剂 盒和检测方法
技术领域
本发明属于水产养殖动物病原菌检测领域,具体涉及一种鰤鱼诺卡氏菌、哈维弧菌和海豚链球菌的检测引物组、检测试剂盒和检测方法。
背景技术
鰤鱼诺卡氏菌(Nocardia seriolae)、哈维弧菌(Vibrio harveyi)和海豚链球菌(Streptococcus iniae)是三种常见的海水养殖鱼类病原菌,其中鰤鱼诺卡氏菌和海豚链球菌属于革兰氏阳性菌,而哈维弧菌属于革兰氏性阴菌。这三种菌在海洋环境及水产养殖环境中广泛分布,可通过饵料、水环境等进行传播,它们在生物学特性和致病性上有一定区别,但都可导致多种水产养殖动物大量死亡,给水产养殖业造成严重的经济损失。
鰤鱼诺卡氏菌在在25~40℃均能生长,最适温度为25~28℃,生长的盐度范围为0~4.5%,广泛分布于空气、土壤、海水、淡水、腐烂的植被及动物的排泄物中,以腐生为主。当养殖鱼类体质虚弱、免疫力低下时,通过消化道、鳃或创伤而感染。该病最危险的特点是潜伏期长,自然发病率15%~60%,诺卡氏菌生长缓慢,但受感染的鱼在发病初期通常未出现外部症状或症状不明显,故给该病的早期检测、诊断及治疗带来了极大困难。
哈维弧菌主要存在于自由水体、浮游动植物体表、海底沉积物中,是石斑鱼、东方鲀、鮸鱼、鲈鱼、大黄鱼和卵形鲳鲹等多种鱼类的重要病原菌。此外,哈维弧菌还能感染人类,引起继发性败血症。被感染的鱼类因种类、体质、部位等不同而表现出复杂多样的症状,且引起较高的死亡率,给水产养殖业造成了严重的经济损失,在养殖生产中亟需快速准确、操作简便的针对哈维弧菌的检测技术。
海豚链球菌是危害世界养殖业的重要病原菌之一,可感染包括淡水河海水在内的多种野生或养殖鱼类,近年来,陆续有关于海豚链球菌引起哺乳动物甚至人类的疾病报道。链球菌感染鱼的主要临床症状为眼球突出,角膜混浊,游动异常,并伴有脑膜炎、组织出血及肝胆症状等解剖病变,但一些鱼类感染海豚链球菌却不表现出症状。在疾病爆发后的幸存鱼体内也可分离到该病原,这些幸存鱼很可能成为未来疾病爆发的携带者。因此,病原的早期检测与及时采取有效的防控措施尤为重要。
基于现有的技术检测水产动物致病菌大多采用病样细菌分离、培养及鉴定等方法,其操作过程复杂、耗时,且检测的灵敏度较低,结果不确定常延误病情的诊断。在应对突发的疾病发生事件时则不能满足诊断及时、灵敏度和特异性高、检测结果准确以及样品数量较大的要求。针对鰤鱼诺卡氏菌、哈维弧菌和海豚链球菌的快速检测方面,国内外学者已构建针对单一致病菌的细菌培养鉴定和PCR等检测方法,然而在海水水生动物养殖过程中,进行相关疾病的预防和控制时,其样本量大,时间紧,需要对多种致病菌进行同时快速检测,而采用单一的致病菌PCR检测方法或一般的细菌分离方法则不能满足上述要求。三重PCR是在普通PCR的基础上,在同一反应体系中加入三对引物,同时特异性扩增出三种目的基因片段。在本发明中,在同一反应管内鰤鱼诺卡氏菌、哈维弧菌和海豚链球菌的基因片段,将大大节省时间和试剂,节约经费,为检测提供更多更准确的信息。
多重PCR以其快速、高效、灵敏和特性的特点,在病原微生物检测中具有重要作用,也符合卫生、质检等快速检测的需要,是一种准确、科学、可靠的检测方法。有鉴于此,开发一种同时检测鰤鱼诺卡氏菌、哈维弧菌和海豚链球菌的多重PCR势在必行,对于加强水产养殖过程中病原的监测和预警、水产品中致病菌的快速检验检疫等具有重要意义。
发明内容
针对上述不足,本发明的目的是提供一种能同时检测鰤鱼诺卡氏菌、哈维弧菌和海豚链球菌的检测引物组,试剂盒及其方法,该试剂盒精确度高、检测方便。
为解决上述技术问题,本发明提供的前一技术方案是这样的:
一种鰤鱼诺卡氏菌、哈维弧菌和海豚链球菌的检测引物组,其特征在于,包括引物对Ns-mce、引物对Vh-tox和引物对Si-its;其中,所述引物对Ns-mce包括核苷酸序列如SEQID NO.1所示的Ns-mceF和核苷酸序列如SEQ ID NO.2所示的Ns-mceR;所述引物对Vh-tox包括核苷酸序列如SEQ ID NO.3所示的Vh-toxF和核苷酸序列如SEQ ID NO.4所示的Vh-toxR;所述引物对Si-its包括核苷酸序列如SEQ ID NO.5所示的Si-itsF和核苷酸序列如SEQ IDNO.6所示的Si-itsF。
本发明提供的另一个技术方案,是提供含有上述的鰤鱼诺卡氏菌、哈维弧菌和海豚链球菌的检测引物组的试剂盒。
进一步的,上述的鰤鱼诺卡氏菌、哈维弧菌和海豚链球菌的检测试剂盒,还包括蛋白酶K、SDS溶液、酚-氯仿-异戊醇混合溶液、异丙醇、体积浓度为70%的乙醇、TE缓冲液、CTAB的NaCl溶液、阳性对照品和PCR DsMix。
进一步的,上述的鰤鱼诺卡氏菌、哈维弧菌和海豚链球菌的检测试剂盒,所述酚-氯仿-异戊醇混合溶液中酚、氯仿和异戊醇的体积比为25:24:1。
进一步的,上述的鰤鱼诺卡氏菌、哈维弧菌和海豚链球菌的检测试剂盒,所述CTAB的NaCl溶液为将CTAB溶于0.5mol/L的NaCl溶液中,CTAB和所述NaCl溶液的质量体积比为1:20。
进一步的,上述的鰤鱼诺卡氏菌、哈维弧菌和海豚链球菌的检测试剂盒,所述阳性对照品包括鰤鱼诺卡氏菌、哈维弧菌和海豚链球菌的DNA模板。
进一步的,上述鰤鱼诺卡氏菌、哈维弧菌和海豚链球菌的检测试剂盒,所述检测引物组中的引物浓度均为10μM。
本发明的最后一个技术方案是提供所述检测试剂盒进行检测的方法,包括如下步骤:
1)取待检测样品50~100mg并加入500-550μL的TE缓冲液,用玻璃匀浆器充分匀浆后,于12000r/min离心10min;
2)步骤1)离心后去除沉淀,取上清备用;
3)向步骤2)上清溶液中加入30μL质量浓度为10%SDS和15μL 20mg/mL的蛋白酶K,并于37℃温育1h;
4)向步骤3)温育后的溶液中加入100μL 5mol/L的NaCl溶液,充分混匀后再加入80μLCTAB的NaCl溶液,65℃温育20min;
5)向步骤4)温育后的溶液中加入与温育后的溶液等体积的酚-氯仿-异戊醇混合溶液混匀,12000g/min离心4-5min;
6)将步骤5)离心后的上清转入一只新管中,加入上清液0.6-0.8倍体积的异丙醇,12000g/min离心4-5min;
7)步骤6)离心后去上清,沉淀用1mL的体积浓度为70%的乙醇洗涤后,12000g/min离心4-5min;
8)步骤7)离心后去上清,沉淀常温干燥5-10min,重溶于30-50μL TE缓冲液,即为样品DNA模板;
9)样品组三重PCR反应体系包括:12.5μL 2×PCR DsMix、1.0μL引物Ns-mceF、1.0μL引物Ns-mceR、0.7μL引物Vh-toxF、0.7μL引物Vh-toxR、1.8μL引物Si-itsF、1.8μL引物Si-itsR、3.0μL步骤8)得到的样品DNA模板和2.5μL无菌水;
10)阳性对照组三重PCR反应体系包括:12.5μL 2×PCR DsMix、1.0μL引物Ns-mceF、1.0μL引物Ns-mceR、0.7μL引物Vh-toxF、0.7μL引物Vh-toxR、1.8μL引物Si-itsF、1.8μL引物Si-itsR、3.0μL阳性对照品和2.5μL无菌水;
11)将步骤9)制得的样品组和步骤10)制得的阳性对照组分别混匀后12000g/min离心10s,置于PCR仪中,分别于94℃预变性4min,94℃变性30s、58℃退火30s、72℃延伸1min,35个循环,72℃延伸10min,进行PCR反应;
12)对步骤11)PCR反应结果进行电泳检测,分别设置样品孔、阳性对照孔和参比孔;所述样品孔取步骤11)样品组PCR反应产物5μL与6×Loading Buffer 1μL混合,加入到1%琼脂糖凝胶点样孔中;所述阳性对照孔取步骤11)阳性对照组PCR反应产物5μL与6×Loading Buffer 1μL混合,加入到1%琼脂糖凝胶点样孔中;所述参比孔取5μL DL2000DNAMarker加入到1%琼脂糖凝胶点样孔中;以120V电压分别对所述样品孔、所述阳性对照孔和所述参比孔进行电泳25min后,于凝胶成像系统下观察结果;若样品孔电泳条带出现与阳性对照孔相同大小的条带,则说明待测样品中含有相对应的细菌。
相比现有技术,本发明具有如下有益效果:
1、本发明引物组具有高特异性,可以根据是否扩增就能判断目标基因的存在与否,从而能够确定样品是否含有鰤鱼诺卡氏菌、哈维弧菌和海豚链球菌,能够实现对鰤鱼诺卡氏菌、哈维弧菌和海豚链球菌进行检测。
2、采用本发明检测试剂盒可以同时对三种病原菌进行检测,即进行一次实验就可以得到三种病原菌的检测结果,并且在5个小时左右完成检测。相比传统检测方法,不仅节约了成本和时间,也减少了劳动力的支出。
3、本发明的鰤鱼诺卡氏菌、哈维弧菌和海豚链球菌三重PCR检测方法,不但使得海水鱼类养殖水体病原检测更加快速,而且可用于海水鱼类养殖过程中各时期跟踪检测中,可以对病害的爆发进行及时预警,避免病原菌传播流行,降低海水养殖鱼类疾病爆发的风险,提高科学管理效率,具有很高的实用价值,有利于增加养殖效益。4、本发明的检测操作简单,不需要使用复杂仪器,也不需要特殊试剂,只需常规PCR仪即可,对检测人员的技术素质要求较低,只需进行简单培训即可。
5、本发明应用范围广泛。本发明不仅可以检测海水鱼类体内和养殖水体中的鰤鱼诺卡氏菌、哈维弧菌和海豚链球菌,也可针对其他环境或患病动物进行快速检测。
6、本发明检测试剂盒制备成本低廉,制备工艺简单,容易实现工业化大生产,具有广阔的市场前景。
附图说明
图1为实施例2中三重PCR扩增产物及单一PCR扩增产物检测结果电泳图。
图2为实施例5中养殖水体样品检测结果电泳图。
具体实施方式
下面结合具体实施例和附图对本发明作进一步详细说明。本实施案例在以本发明技术为前提下进行实施,现给出详细的实施方式和具体的操作过程,但本发明的保护范围不限于以下的实施例。
实施例1细菌基因组DNA的提取
分别取鰤鱼诺卡氏菌、哈维弧菌和海豚链球菌(中国水产科学研究院南海水产研究所渔业生物病害研究室自存),采用如下步骤进行DNA提取:
(1)用500-550μL的TE缓冲液重悬细菌;
(2)向步骤(1)重悬后的溶液中加入30μL质量浓度为10%SDS和15μL的蛋白酶K(20mg/mL),混合均匀并于37℃温育1h;
(3)向步骤(2)温育后的溶液中加入100μL 5mol/L的NaCl溶液,充分混匀后再加入80μL CTAB的NaCl溶液溶液(将CTAB溶于0.5mol/L的NaCl溶液中,CTAB和所述NaCl溶液的质量体积比为1:20),于65℃温育20min;
(4)向步骤(3)温育后的溶液中加入与步骤(3)温育后的溶液等体积的酚-氯仿-异戊醇(酚、氯仿和异戊醇的体积比为25:24:1)的混合溶液混匀,12000g/min离心4-5min;
(5)将步骤(4)离心后的上清转入一只新管中,加入上清液0.6-0.8倍体积的异丙醇,12000g/min离心4-5min;
(6)步骤(5)离心后去上清,沉淀用1mL的体积浓度为70%乙醇洗涤后,12000g/min离心4-5min;
(7)步骤(6)离心后去上清,沉淀常温干燥5-10min,重溶于30-50μL TE缓冲液,备用。
实施例2鰤鱼诺卡氏菌、哈维弧菌和海豚链球菌三重PCR检测引物组的设计和有效性检测
1、分别选取鰤鱼诺卡氏菌、哈维弧菌和海豚链球菌的特异性基因,采用PrimerPremier 5.0软件分析设计出相应的引物对,各引物对能分别各自专一性鉴别上述细菌的特异性,引物序列如下所示:
2、有效性检测:
(1)合成上述设计的引物组,用引物组的引物分别对实施例1提取的鰤鱼诺卡氏菌、哈维弧菌和海豚链球菌的DNA进行单一PCR验证,其中单一PCR反应体系如下:
(2)同时对鰤鱼诺卡氏菌、哈维弧菌和海豚链球菌进行三重PCR验证,采用如下三重PCR反应体系:
(3)采用如下PCR反应程序,对上述PCR反应体系进行PCR反应:
1)94℃预变性4min。
2)94℃变性30s。
58℃退火30s。
72℃延伸1min。
共计35个循环。
3)72℃延伸10min。
上述PCR反应结束后,分别取各组PCR反应产物5μL与6×Loading Buffer 1μL混合,分别加入到质量浓度为1%的琼脂糖凝胶点样孔中,同时在样品孔旁添加对照组,对照组琼脂糖凝胶点样孔中加入5μL DL2000DNA Marker作对照,以120V电压进行电泳,约25min后于凝胶成像系统下观察结果。
3、检测结果:
检测结果如图1所示,图1中泳道M为Marker DL2000;泳道1为鰤鱼诺卡氏菌单一PCR的扩增结果,目的扩增片段长度为964bp;泳道2为鰤鱼诺卡氏菌单一PCR的阴性对照;泳道3为哈维弧菌单一PCR的扩增结果,目的扩增片段长度为528bp;泳道4为哈维弧菌单一PCR的阴性对照;泳道5为海豚链球菌单一PCR的扩增结果,目的扩增片段长度为205bp;泳道6为海豚链球菌单一PCR的阴性对照;泳道7为三种病原菌三重PCR的扩增结果,从上到下依次为鰤鱼诺卡氏菌、哈维弧菌和海豚链球菌;泳道8为三种病原菌三重PCR的的阴性对照;从图1可以看出单一PCR检测相应的单一条带及三重PCR检测相应的3条单一条带,分别与鰤鱼诺卡氏菌、哈维弧菌和海豚链球菌的扩增片段长度分别为964、528和205bp相吻合,即说明本发明的鰤鱼诺卡氏菌、哈维弧菌和海豚链球菌检测用引物组可以准确、特异性地检测出鰤鱼诺卡氏菌、哈维弧菌和海豚链球菌。
实施例4检测试剂盒
本实施例的检测试剂盒可用于三重PCR快速诊断样品中是否含有鰤鱼诺卡氏菌、哈维弧菌和海豚链球菌,该检测试剂盒由鰤鱼诺卡氏菌、哈维弧菌和海豚链球菌的检测用引物组、蛋白酶K、SDS溶液、酚-氯仿-异戊醇混合溶液、异丙醇、体积浓度为70%的乙醇、TE缓冲液、CTAB的NaCl溶液、阳性对照品和PCR DsMix组成,其中:
(1)鰤鱼诺卡氏菌、哈维弧菌和海豚链球菌检测用引物组:1管内装鰤鱼诺卡氏菌引物Ns-mceF及Ns-mceR,其核苷酸序列分别如SEQ ID NO.1和SEQ ID NO.2所示;2管内装哈维弧菌引物Vh-toxF及Vh-toxR,其核苷酸序列分别如SEQ ID NO.3和SEQ ID NO.4所示;3管内装海豚链球菌引物Si-itsF及Si-itsR,其核苷酸序列分别如SEQ ID NO.5和SEQ ID NO.6所示;以上引物浓度分别为10μM。
(2)蛋白酶K(20mg/mL),置于容器,1管;
(3)质量浓度为10%SDS,置于容器,1管;
(4)酚-氯仿-异戊醇混合溶液(体积比25:24:1),置于容器,1管;
(5)异丙醇,置于容器,1管;
(6)制备体积浓度为70%乙醇,置于容器,1管;
(7)制备TE缓冲液(10mM Tris-HCl,0.1mM EDTA,pH8.0),置于容器,1管;
(8)制备CTAB的NaCl溶液(5g CTAB溶于100mL 0.5M NaCl溶液中),置于容器,1管;
(9)制备阳性对照品:提取鰤鱼诺卡氏菌、哈维弧菌和海豚链球菌的基因组DNA,等体积混合,置于容器,1管;
(10)2×PCR DsMix,置于容器,1管;
(11)一块泡沫板,将上述12个小管分别对应放置于泡沫板的孔内,装于盒中即制备得到本实施例的检测试剂盒。
本实施例中各试剂管制备后均经过抽样质检,对其质量进行监控。
实施例5利用实施例4制得的试剂盒进行检测的方法
1、本实施例采用实施例4制备所得试剂盒,采用三重PCR对海水鱼类养殖水体样品是否含有鰤鱼诺卡氏菌、哈维弧菌和海豚链球菌进行快速检测,其具体步骤如下:
(1)取待检测水体样品50ml于12000r/min离心10min;
(2)步骤1)离心后去上清,加入500-550μL的TE缓冲液重悬沉淀,备用;
(3)向步骤(2)重悬后的溶液中加入30μL质量浓度为10%SDS和15μL的蛋白酶K(20mg/mL),并于37℃温育1h;
(4)向步骤(3)温育后的溶液中加入100μL 5mol/L NaCl,充分混匀后再加入80μLCTAB的NaCl溶液,65℃温育20min;
(5)向步骤(4)温育后的溶液中加入与温育后的溶液等体积的酚-氯仿-异戊醇混合溶液混匀,12000g/min离心4min;
(6)将步骤(5)离心后的上清转入一只新管中,加入上清液0.6倍体积的异丙醇,12000g/min离心4min;
(7)步骤(6)离心后去上清,沉淀用1mL的体积浓度70%乙醇洗涤后,12000g/min离心4min;
(8)步骤(7)离心后去上清,沉淀常温干燥10min,重溶于30-50μL TE缓冲液,即为样品DNA模板;
(9)样品组三重PCR反应体系包括:12.5μL 2×PCR DsMix、1.0μL引物Ns-mceF、1.0μL引物Ns-mceR、0.7μL引物Vh-toxF、0.7μL引物Vh-toxR、1.8μL引物Si-itsF、1.8μL引物Si-itsR、3.0μL步骤8)得到的样品DNA模板和2.5μL无菌水;
(10)阳性对照组三重PCR反应体系包括:12.5μL 2×PCR DsMix、1.0μL引物Ns-mceF、1.0μL引物Ns-mceR、0.7μL引物Vh-toxF、0.7μL引物Vh-toxR、1.8μL引物Si-itsF、1.8μL引物Si-itsR、3.0μL阳性对照品和2.5μL无菌水;
(11)将步骤9)制得的样品组和步骤10)制得的阳性对照组分别混匀后12000g/min离心10s,置于PCR仪中,分别94℃预变性4min,(94℃变性30s、58℃退火30s、72℃延伸1min)35个循环,72℃延伸10min,进行PCR反应;
(12)对步骤11)PCR反应结果进行电泳检测,分别设置样品孔、阳性对照孔和参比孔;所述样品孔取步骤11)样品组PCR反应产物5μL与6×Loading Buffer 1μL混合,加入到1%琼脂糖凝胶点样孔中;所述阳性对照孔取步骤11)阳性对照组PCR反应产物5μL与6×Loading Buffer1μL混合,加入到1%琼脂糖凝胶点样孔中;所述参比孔取5μL DL2000DNAMarker加入到1%琼脂糖凝胶点样孔中;以120V电压分别对所述样品孔、所述阳性对照孔和所述参比孔进行电泳约25min后,于凝胶成像系统下观察结果;若样品电泳条带出现与阳性对照相同大小的条带(鰤鱼诺卡氏菌964bp、哈维弧菌528bp、海豚链球菌205bp),则说明待测样品含有相对应的细菌。
2、检测结果:
检测结果如图2所示,图2中泳道M为Marker DL2000;泳道1为三种病原菌三重PCR阳性对照;泳道2为含有三种病原菌养殖水体样品的三重PCR扩增结果;泳道3为三种病原菌三重PCR阴性对照;泳道4为不含有三种病原菌养殖水体样品的三重PCR扩增结果;从图2可以看出含有三种病原菌养殖水体样品检测出相应的3条条带,并且与阳性对照条带大小相同,不含有三种病原菌养殖水体样品并未检测出条带,即说明本发明的鰤鱼诺卡氏菌、哈维弧菌和海豚链球菌检测用引物组可以准确、特异性地检测出养殖水体是否含有鰤鱼诺卡氏菌、哈维弧菌和海豚链球菌。
上实施例仅用以说明本发明的技术方案而非限制,尽管参照较佳实施例对本发明进行了详细说明,本领域的普通技术人员应当理解,可以对本发明的技术方案进行修改或者等同替换,而不脱离本发明技术方案的宗旨和范围,其均应涵盖在本发明的权利要求范围当中。

Claims (8)

1.一种鰤鱼诺卡氏菌、哈维弧菌和海豚链球菌的检测引物组,其特征在于,包括引物对Ns-mce、引物对Vh-tox和引物对Si-its;其中,所述引物对Ns-mce包括核苷酸序列如SEQ IDNO.1所示的Ns-mceF和核苷酸序列如SEQ ID NO.2所示的Ns-mceR;所述引物对Vh-tox包括核苷酸序列如SEQ ID NO.3所示的Vh-toxF和核苷酸序列如SEQ ID NO.4所示的Vh-toxR;所述引物对Si-its包括核苷酸序列如SEQ ID NO.5所示的Si-itsF和核苷酸序列如SEQ IDNO.6所示的Si-itsF。
2.一种鰤鱼诺卡氏菌、哈维弧菌和海豚链球菌的检测试剂盒,其特征在于,包括权利要求1所述检测引物组。
3.根据权利要求2所述的鰤鱼诺卡氏菌、哈维弧菌和海豚链球菌的检测试剂盒,其特征在于,还包括蛋白酶K、SDS溶液、酚-氯仿-异戊醇混合溶液、异丙醇、体积浓度为70%的乙醇、TE缓冲液、CTAB的NaCl溶液、阳性对照品和PCR DsMix。
4.根据权利要求3所述的鰤鱼诺卡氏菌、哈维弧菌和海豚链球菌的检测试剂盒,其特征在于,所述酚-氯仿-异戊醇混合溶液中酚、氯仿和异戊醇的体积比为25:24:1。
5.根据权利要求3所述的鰤鱼诺卡氏菌、哈维弧菌和海豚链球菌的检测试剂盒,其特征在于,所述CTAB的NaCl溶液为将CTAB溶于0.5mol/L的NaCl溶液中,CTAB和所述NaCl溶液的质量体积比为1:20。
6.根据权利要求3所述的鰤鱼诺卡氏菌、哈维弧菌和海豚链球菌的检测试剂盒,其特征在于,所述阳性对照品包括鰤鱼诺卡氏菌、哈维弧菌和海豚链球菌的DNA模板。
7.根据权利要求2所述鰤鱼诺卡氏菌、哈维弧菌和海豚链球菌的检测试剂盒,其特征在于,所述检测引物组中的引物浓度均为10μM。
8.采用权利要求3~7任一所述检测试剂盒进行检测的方法,该方法适用于非诊断目的,其特征在于,包括如下步骤:
1)取待检测样品50~100mg并加入500-550μL的TE缓冲液,用玻璃匀浆器充分匀浆后,于12000r/min离心10min;
2)步骤1)离心后去除沉淀,取上清备用;
3)向步骤2)上清溶液中加入30μL质量浓度为10%SDS和15μL 20mg/mL的蛋白酶K,并于37℃温育1h;
4)向步骤3)温育后的溶液中加入100μL 5mol/L的NaCl溶液,充分混匀后再加入80μLCTAB的NaCl溶液,65℃温育20min;
5)向步骤4)温育后的溶液中加入与温育后的溶液等体积的酚-氯仿-异戊醇混合溶液混匀,12000g/min离心4-5min;
6)将步骤5)离心后的上清转入一只新管中,加入上清液0.6-0.8倍体积的异丙醇,12000g/min离心4-5min;
7)步骤6)离心后去上清,沉淀用1mL的体积浓度为70%的乙醇洗涤后,12000g/min离心4-5min;
8)步骤7)离心后去上清,沉淀常温干燥5-10min,重溶于30-50μL TE缓冲液,即为样品DNA模板;
9)样品组三重PCR反应体系包括:12.5μL 2×PCR DsMix、1.0μL引物Ns-mceF、1.0μL引物Ns-mceR、0.7μL引物Vh-toxF、0.7μL引物Vh-toxR、1.8μL引物Si-itsF、1.8μL引物Si-itsR、3.0μL步骤8)得到的样品DNA模板和2.5μL无菌水;
10)阳性对照组三重PCR反应体系包括:12.5μL 2×PCR DsMix、1.0μL引物Ns-mceF、1.0μL引物Ns-mceR、0.7μL引物Vh-toxF、0.7μL引物Vh-toxR、1.8μL引物Si-itsF、1.8μL引物Si-itsR、3.0μL阳性对照品和2.5μL无菌水;
11)将步骤9)制得的样品组和步骤10)制得的阳性对照组分别混匀后12000g/min离心10s,置于PCR仪中,分别于94℃预变性4min,94℃变性30s、58℃退火30s、72℃延伸1min,35个循环,72℃延伸10min,进行PCR反应;
12)对步骤11)PCR反应结果进行电泳检测,分别设置样品孔、阳性对照孔和参比孔;所述样品孔取步骤11)样品组PCR反应产物5μL与6×Loading Buffer 1μL混合,加入到1%琼脂糖凝胶点样孔中;所述阳性对照孔取步骤11)阳性对照组PCR反应产物5μL与6×LoadingBuffer1μL混合,加入到1%琼脂糖凝胶点样孔中;所述参比孔取5μL DL2000 DNA Marker加入到1%琼脂糖凝胶点样孔中;以120V电压分别对所述样品孔、所述阳性对照孔和所述参比孔进行电泳25min后,于凝胶成像系统下观察结果;若样品孔电泳条带出现与阳性对照孔相同大小的条带,则说明待测样品中含有相对应的细菌。
CN201510749904.9A 2015-11-04 2015-11-04 一种同时检测海水鱼类三种致病菌的检测引物组、检测试剂盒和检测方法 Expired - Fee Related CN105602945B (zh)

Priority Applications (1)

Application Number Priority Date Filing Date Title
CN201510749904.9A CN105602945B (zh) 2015-11-04 2015-11-04 一种同时检测海水鱼类三种致病菌的检测引物组、检测试剂盒和检测方法

Applications Claiming Priority (1)

Application Number Priority Date Filing Date Title
CN201510749904.9A CN105602945B (zh) 2015-11-04 2015-11-04 一种同时检测海水鱼类三种致病菌的检测引物组、检测试剂盒和检测方法

Publications (2)

Publication Number Publication Date
CN105602945A CN105602945A (zh) 2016-05-25
CN105602945B true CN105602945B (zh) 2019-05-17

Family

ID=55983290

Family Applications (1)

Application Number Title Priority Date Filing Date
CN201510749904.9A Expired - Fee Related CN105602945B (zh) 2015-11-04 2015-11-04 一种同时检测海水鱼类三种致病菌的检测引物组、检测试剂盒和检测方法

Country Status (1)

Country Link
CN (1) CN105602945B (zh)

Families Citing this family (5)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Publication number Priority date Publication date Assignee Title
CN106801103B (zh) * 2017-02-28 2021-05-14 中国水产科学研究院南海水产研究所 一种无乳链球菌的检测引物组、检测试剂盒和多重pcr检测方法
CN111518928A (zh) * 2019-12-05 2020-08-11 广东美格基因科技有限公司 用于检测哈维弧菌的TaqMan探针定量检测方法及相应的试剂盒
CN112730828A (zh) * 2020-12-16 2021-04-30 广东海大畜牧兽医研究院有限公司 一种魳鱼诺卡氏菌乳胶凝集抗体检测试剂盒及其制备方法与应用
CN115094151A (zh) * 2022-04-19 2022-09-23 仲恺农业工程学院 用于检测鰤鱼诺卡氏菌核酸的引物、荧光探针和试剂盒
CN114634990B (zh) * 2022-05-18 2022-09-09 中国水产科学研究院珠江水产研究所 一种用于检测鰤诺卡氏菌的rpa引物、探针以及检测方法

Citations (1)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Publication number Priority date Publication date Assignee Title
CN101962678A (zh) * 2010-09-26 2011-02-02 宁波大学 一种鰤鱼诺卡氏菌荧光定量pcr检测试剂盒及检测方法

Patent Citations (1)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Publication number Priority date Publication date Assignee Title
CN101962678A (zh) * 2010-09-26 2011-02-02 宁波大学 一种鰤鱼诺卡氏菌荧光定量pcr检测试剂盒及检测方法

Non-Patent Citations (2)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Title
Development of a multiplex PCR assay for rapid and simultaneous detection of four genera of fish pathogenic bacteria;Zhang et al;《Letters in Applied Microbiology》;20141231;摘要,第472页右栏第2段-第477页左栏第3段,表1-3
大黄鱼感染致病弧菌的检测及其病害的预测预警;葛明峰等;《水产学报》;20141231;全文

Also Published As

Publication number Publication date
CN105602945A (zh) 2016-05-25

Similar Documents

Publication Publication Date Title
CN105602945B (zh) 一种同时检测海水鱼类三种致病菌的检测引物组、检测试剂盒和检测方法
CN105176997B (zh) 一种副溶血弧菌、美人鱼发光杆菌和鰤诺卡氏菌的检测引物组、检测试剂盒和检测方法
CN101911918B (zh) 牙鲆抗病优良品系选育方法
CN107760795B (zh) 一种快速检测茶树炭疽病菌的lamp引物及检测方法
CN104372104B (zh) 一种樟疫霉菌的lamp检测引物组合物及其lamp检测试剂盒和lamp检测方法
CN108384899B (zh) 一种检测新型鹅星状病毒的荧光定量pcr试剂盒及应用
Hiett et al. Direct polymerase chain reaction detection of Campylobacter spp. in poultry hatchery samples
CN107385111A (zh) 一种鹅星状病毒的实时荧光定量pcr检测引物及其试剂盒
CN101962678A (zh) 一种鰤鱼诺卡氏菌荧光定量pcr检测试剂盒及检测方法
CN109609688A (zh) 鹅星状病毒、鹅副黏病毒、鹅细小病毒多重pcr检测引物对及检测方法和应用
CN110358866A (zh) 新型鹅星状病毒SYBR Green染料法荧光定量PCR检测试剂盒
CN109735604A (zh) 一种快速定量检测vbnc状态副溶血性弧菌的方法
CN115679004A (zh) 鉴定瓦氏黄颡鱼、长吻鮠和杂交种的引物、方法和试剂盒
CN113583973B (zh) 一株高裂解性肺炎克雷伯菌噬菌体rdp-kp-20007及其应用
CN101724692B (zh) 用于诊断桑细菌性枯萎病的引物及诊断方法
CN106801103A (zh) 一种无乳链球菌的检测引物组、检测试剂盒和多重pcr检测方法
CN111394483B (zh) 一种同时检测三种鱼源链球菌的试剂盒和检测方法
CN104372092A (zh) 一种木香疫霉的lamp检测引物组合物及其lamp检测试剂盒和lamp检测方法
Suebsing et al. Shewanella putrefaciens in cultured tilapia detected by a new calcein-loop-mediated isothermal amplification (Ca-LAMP) method
CN102876809B (zh) 一种草鱼呼肠孤病毒rt-pcr检测试剂盒及检测方法
CN104304096B (zh) 一种牙鲆抗迟钝爱德华氏菌病优良品系的选育方法
CN102140513B (zh) 一种检测迟缓爱德华氏菌、鲇鱼爱德华氏菌或致病性迟缓爱德华氏菌的引物序列及其检测方法和应用
AU2020103778A4 (en) Primer Set for Detection of Streptococcus agalactiae, Detection Kit and Multiplex PCR Detection Method
CN104195254A (zh) 基于环介导等温扩增技术检测木贼镰孢菌的方法和引物组合物
CN104404157A (zh) 一种掘氏疫霉菌的lamp检测引物组合物及其lamp检测试剂盒和lamp检测方法

Legal Events

Date Code Title Description
C06 Publication
PB01 Publication
C10 Entry into substantive examination
SE01 Entry into force of request for substantive examination
GR01 Patent grant
GR01 Patent grant
CF01 Termination of patent right due to non-payment of annual fee
CF01 Termination of patent right due to non-payment of annual fee

Granted publication date: 20190517

Termination date: 20201104