CN105602945A - 一种同时检测海水鱼类三种致病菌的检测引物组、检测试剂盒和检测方法 - Google Patents

一种同时检测海水鱼类三种致病菌的检测引物组、检测试剂盒和检测方法 Download PDF

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Abstract

本发明公开了一种鰤鱼诺卡氏菌、哈维弧菌和海豚链球菌的检测引物组、检测试剂盒和检测方法;其技术要点:所述引物组包括引物对Ns-mce、引物对Vh-tox和引物对Si-its,所述引物对的核苷酸序列如SEQ?ID?NO.1~6所示;所述检测试剂盒包括上述检测引物组;所述检测方法运用上述检测试剂盒进行检测,先对样品进行前处理,并提取基因组DNA作为样品组DNA,再采用PCR方法对样品进行检测;旨在建立一套三重PCR检测方法,可用于对各时期的鰤鱼诺卡氏菌、哈维弧菌和海豚链球菌进行跟踪检测,避免病原菌传播流行,加强水产品中致病菌的快速检验检疫;属于水产养殖动物病原菌检测领域。

Description

一种同时检测海水鱼类三种致病菌的检测引物组、检测试剂盒和检测方法
技术领域
本发明属于水产养殖动物病原菌检测领域,具体涉及一种鰤鱼诺卡氏菌、哈维弧菌和海豚链球菌的检测引物组、检测试剂盒和检测方法。
背景技术
鰤鱼诺卡氏菌(Nocardiaseriolae)、哈维弧菌(Vibrioharveyi)和海豚链球菌(Streptococcusiniae)是三种常见的海水养殖鱼类病原菌,其中鰤鱼诺卡氏菌和海豚链球菌属于革兰氏阳性菌,而哈维弧菌属于革兰氏性阴菌。这三种菌在海洋环境及水产养殖环境中广泛分布,可通过饵料、水环境等进行传播,它们在生物学特性和致病性上有一定区别,但都可导致多种水产养殖动物大量死亡,给水产养殖业造成严重的经济损失。
鰤鱼诺卡氏菌在在25~40℃均能生长,最适温度为25~28℃,生长的盐度范围为0~4.5%,广泛分布于空气、土壤、海水、淡水、腐烂的植被及动物的排泄物中,以腐生为主。当养殖鱼类体质虚弱、免疫力低下时,通过消化道、鳃或创伤而感染。该病最危险的特点是潜伏期长,自然发病率15%~60%,诺卡氏菌生长缓慢,但受感染的鱼在发病初期通常未出现外部症状或症状不明显,故给该病的早期检测、诊断及治疗带来了极大困难。
哈维弧菌主要存在于自由水体、浮游动植物体表、海底沉积物中,是石斑鱼、东方鲀、鮸鱼、鲈鱼、大黄鱼和卵形鲳鲹等多种鱼类的重要病原菌。此外,哈维弧菌还能感染人类,引起继发性败血症。被感染的鱼类因种类、体质、部位等不同而表现出复杂多样的症状,且引起较高的死亡率,给水产养殖业造成了严重的经济损失,在养殖生产中亟需快速准确、操作简便的针对哈维弧菌的检测技术。
海豚链球菌是危害世界养殖业的重要病原菌之一,可感染包括淡水河海水在内的多种野生或养殖鱼类,近年来,陆续有关于海豚链球菌引起哺乳动物甚至人类的疾病报道。链球菌感染鱼的主要临床症状为眼球突出,角膜混浊,游动异常,并伴有脑膜炎、组织出血及肝胆症状等解剖病变,但一些鱼类感染海豚链球菌却不表现出症状。在疾病爆发后的幸存鱼体内也可分离到该病原,这些幸存鱼很可能成为未来疾病爆发的携带者。因此,病原的早期检测与及时采取有效的防控措施尤为重要。
基于现有的技术检测水产动物致病菌大多采用病样细菌分离、培养及鉴定等方法,其操作过程复杂、耗时,且检测的灵敏度较低,结果不确定常延误病情的诊断。在应对突发的疾病发生事件时则不能满足诊断及时、灵敏度和特异性高、检测结果准确以及样品数量较大的要求。针对鰤鱼诺卡氏菌、哈维弧菌和海豚链球菌的快速检测方面,国内外学者已构建针对单一致病菌的细菌培养鉴定和PCR等检测方法,然而在海水水生动物养殖过程中,进行相关疾病的预防和控制时,其样本量大,时间紧,需要对多种致病菌进行同时快速检测,而采用单一的致病菌PCR检测方法或一般的细菌分离方法则不能满足上述要求。三重PCR是在普通PCR的基础上,在同一反应体系中加入三对引物,同时特异性扩增出三种目的基因片段。在本发明中,在同一反应管内鰤鱼诺卡氏菌、哈维弧菌和海豚链球菌的基因片段,将大大节省时间和试剂,节约经费,为检测提供更多更准确的信息。
多重PCR以其快速、高效、灵敏和特性的特点,在病原微生物检测中具有重要作用,也符合卫生、质检等快速检测的需要,是一种准确、科学、可靠的检测方法。有鉴于此,开发一种同时检测鰤鱼诺卡氏菌、哈维弧菌和海豚链球菌的多重PCR势在必行,对于加强水产养殖过程中病原的监测和预警、水产品中致病菌的快速检验检疫等具有重要意义。
发明内容
针对上述不足,本发明的目的是提供一种能同时检测鰤鱼诺卡氏菌、哈维弧菌和海豚链球菌的检测引物组,试剂盒及其方法,该试剂盒精确度高、检测方便。
为解决上述技术问题,本发明提供的前一技术方案是这样的:
一种鰤鱼诺卡氏菌、哈维弧菌和海豚链球菌的检测引物组,其特征在于,包括引物对Ns-mce、引物对Vh-tox和引物对Si-its;其中,所述引物对Ns-mce包括核苷酸序列如SEQIDNO.1所示的Ns-mceF和核苷酸序列如SEQIDNO.2所示的Ns-mceR;所述引物对Vh-tox包括核苷酸序列如SEQIDNO.3所示的Vh-toxF和核苷酸序列如SEQIDNO.4所示的Vh-toxR;所述引物对Si-its包括核苷酸序列如SEQIDNO.5所示的Si-itsF和核苷酸序列如SEQIDNO.6所示的Si-itsF。
本发明提供的另一个技术方案,是提供含有上述的鰤鱼诺卡氏菌、哈维弧菌和海豚链球菌的检测引物组的试剂盒。
进一步的,上述的鰤鱼诺卡氏菌、哈维弧菌和海豚链球菌的检测试剂盒,还包括蛋白酶K、SDS溶液、酚-氯仿-异戊醇混合溶液、异丙醇、体积浓度为70%的乙醇、TE缓冲液、CTAB的NaCl溶液、阳性对照品和PCRDsMix。
进一步的,上述的鰤鱼诺卡氏菌、哈维弧菌和海豚链球菌的检测试剂盒,所述酚-氯仿-异戊醇混合溶液中酚、氯仿和异戊醇的体积比为25:24:1。
进一步的,上述的鰤鱼诺卡氏菌、哈维弧菌和海豚链球菌的检测试剂盒,所述CTAB的NaCl溶液为将CTAB溶于0.5mol/L的NaCl溶液中,CTAB和所述NaCl溶液的质量体积比为1:20。
进一步的,上述的鰤鱼诺卡氏菌、哈维弧菌和海豚链球菌的检测试剂盒,所述阳性对照品包括鰤鱼诺卡氏菌、哈维弧菌和海豚链球菌的DNA模板。
进一步的,上述鰤鱼诺卡氏菌、哈维弧菌和海豚链球菌的检测试剂盒,所述检测引物组中的引物浓度均为10μM。
本发明的最后一个技术方案是提供所述检测试剂盒进行检测的方法,包括如下步骤:
1)取待检测样品50~100mg并加入500-550μL的TE缓冲液,用玻璃匀浆器充分匀浆后,于12000r/min离心10min;
2)步骤1)离心后去除沉淀,取上清备用;
3)向步骤2)上清溶液中加入30μL质量浓度为10%SDS和15μL20mg/mL的蛋白酶K,并于37℃温育1h;
4)向步骤3)温育后的溶液中加入100μL5mol/L的NaCl溶液,充分混匀后再加入80μLCTAB的NaCl溶液,65℃温育20min;
5)向步骤4)温育后的溶液中加入与温育后的溶液等体积的酚-氯仿-异戊醇混合溶液混匀,12000g/min离心4-5min;
6)将步骤5)离心后的上清转入一只新管中,加入上清液0.6-0.8倍体积的异丙醇,12000g/min离心4-5min;
7)步骤6)离心后去上清,沉淀用1mL的体积浓度为70%的乙醇洗涤后,12000g/min离心4-5min;
8)步骤7)离心后去上清,沉淀常温干燥5-10min,重溶于30-50μLTE缓冲液,即为样品DNA模板;
9)样品组三重PCR反应体系包括:12.5μL2×PCRDsMix、1.0μL引物Ns-mceF、1.0μL引物Ns-mceR、0.7μL引物Vh-toxF、0.7μL引物Vh-toxR、1.8μL引物Si-itsF、1.8μL引物Si-itsR、3.0μL步骤8)得到的样品DNA模板和2.5μL无菌水;
10)阳性对照组三重PCR反应体系包括:12.5μL2×PCRDsMix、1.0μL引物Ns-mceF、1.0μL引物Ns-mceR、0.7μL引物Vh-toxF、0.7μL引物Vh-toxR、1.8μL引物Si-itsF、1.8μL引物Si-itsR、3.0μL阳性对照品和2.5μL无菌水;
11)将步骤9)制得的样品组和步骤10)制得的阳性对照组分别混匀后12000g/min离心10s,置于PCR仪中,分别于94℃预变性4min,94℃变性30s、58℃退火30s、72℃延伸1min,35个循环,72℃延伸10min,进行PCR反应;
12)对步骤11)PCR反应结果进行电泳检测,分别设置样品孔、阳性对照孔和参比孔;所述样品孔取步骤11)样品组PCR反应产物5μL与6×LoadingBuffer1μL混合,加入到1%琼脂糖凝胶点样孔中;所述阳性对照孔取步骤11)阳性对照组PCR反应产物5μL与6×LoadingBuffer1μL混合,加入到1%琼脂糖凝胶点样孔中;所述参比孔取5μLDL2000DNAMarker加入到1%琼脂糖凝胶点样孔中;以120V电压分别对所述样品孔、所述阳性对照孔和所述参比孔进行电泳25min后,于凝胶成像系统下观察结果;若样品孔电泳条带出现与阳性对照孔相同大小的条带,则说明待测样品中含有相对应的细菌。
相比现有技术,本发明具有如下有益效果:
1、本发明引物组具有高特异性,可以根据是否扩增就能判断目标基因的存在与否,从而能够确定样品是否含有鰤鱼诺卡氏菌、哈维弧菌和海豚链球菌,能够实现对鰤鱼诺卡氏菌、哈维弧菌和海豚链球菌进行检测。
2、采用本发明检测试剂盒可以同时对三种病原菌进行检测,即进行一次实验就可以得到三种病原菌的检测结果,并且在5个小时左右完成检测。相比传统检测方法,不仅节约了成本和时间,也减少了劳动力的支出。
3、本发明的鰤鱼诺卡氏菌、哈维弧菌和海豚链球菌三重PCR检测方法,不但使得海水鱼类养殖水体病原检测更加快速,而且可用于海水鱼类养殖过程中各时期跟踪检测中,可以对病害的爆发进行及时预警,避免病原菌传播流行,降低海水养殖鱼类疾病爆发的风险,提高科学管理效率,具有很高的实用价值,有利于增加养殖效益。4、本发明的检测操作简单,不需要使用复杂仪器,也不需要特殊试剂,只需常规PCR仪即可,对检测人员的技术素质要求较低,只需进行简单培训即可。
5、本发明应用范围广泛。本发明不仅可以检测海水鱼类体内和养殖水体中的鰤鱼诺卡氏菌、哈维弧菌和海豚链球菌,也可针对其他环境或患病动物进行快速检测。
6、本发明检测试剂盒制备成本低廉,制备工艺简单,容易实现工业化大生产,具有广阔的市场前景。
附图说明
图1为实施例2中三重PCR扩增产物及单一PCR扩增产物检测结果电泳图。
图2为实施例5中养殖水体样品检测结果电泳图。
具体实施方式
下面结合具体实施例和附图对本发明作进一步详细说明。本实施案例在以本发明技术为前提下进行实施,现给出详细的实施方式和具体的操作过程,但本发明的保护范围不限于以下的实施例。
实施例1细菌基因组DNA的提取
分别取鰤鱼诺卡氏菌、哈维弧菌和海豚链球菌(中国水产科学研究院南海水产研究所渔业生物病害研究室自存),采用如下步骤进行DNA提取:
(1)用500-550μL的TE缓冲液重悬细菌;
(2)向步骤(1)重悬后的溶液中加入30μL质量浓度为10%SDS和15μL的蛋白酶K(20mg/mL),混合均匀并于37℃温育1h;
(3)向步骤(2)温育后的溶液中加入100μL5mol/L的NaCl溶液,充分混匀后再加入80μLCTAB的NaCl溶液溶液(将CTAB溶于0.5mol/L的NaCl溶液中,CTAB和所述NaCl溶液的质量体积比为1:20),于65℃温育20min;
(4)向步骤(3)温育后的溶液中加入与步骤(3)温育后的溶液等体积的酚-氯仿-异戊醇(酚、氯仿和异戊醇的体积比为25:24:1)的混合溶液混匀,12000g/min离心4-5min;
(5)将步骤(4)离心后的上清转入一只新管中,加入上清液0.6-0.8倍体积的异丙醇,12000g/min离心4-5min;
(6)步骤(5)离心后去上清,沉淀用1mL的体积浓度为70%乙醇洗涤后,12000g/min离心4-5min;
(7)步骤(6)离心后去上清,沉淀常温干燥5-10min,重溶于30-50μLTE缓冲液,备用。
实施例2鰤鱼诺卡氏菌、哈维弧菌和海豚链球菌三重PCR检测引物组的设计和有效性检测
1、分别选取鰤鱼诺卡氏菌、哈维弧菌和海豚链球菌的特异性基因,采用PrimerPremier5.0软件分析设计出相应的引物对,各引物对能分别各自专一性鉴别上述细菌的特异性,引物序列如下所示:
2、有效性检测:
(1)合成上述设计的引物组,用引物组的引物分别对实施例1提取的鰤鱼诺卡氏菌、哈维弧菌和海豚链球菌的DNA进行单一PCR验证,其中单一PCR反应体系如下:
(2)同时对鰤鱼诺卡氏菌、哈维弧菌和海豚链球菌进行三重PCR验证,采用如下三重PCR反应体系:
(3)采用如下PCR反应程序,对上述PCR反应体系进行PCR反应:
1)94℃预变性4min。
2)94℃变性30s。
58℃退火30s。
72℃延伸1min。
共计35个循环。
3)72℃延伸10min。
上述PCR反应结束后,分别取各组PCR反应产物5μL与6×LoadingBuffer1μL混合,分别加入到质量浓度为1%的琼脂糖凝胶点样孔中,同时在样品孔旁添加对照组,对照组琼脂糖凝胶点样孔中加入5μLDL2000DNAMarker作对照,以120V电压进行电泳,约25min后于凝胶成像系统下观察结果。
3、检测结果:
检测结果如图1所示,图1中泳道M为MarkerDL2000;泳道1为鰤鱼诺卡氏菌单一PCR的扩增结果,目的扩增片段长度为964bp;泳道2为鰤鱼诺卡氏菌单一PCR的阴性对照;泳道3为哈维弧菌单一PCR的扩增结果,目的扩增片段长度为528bp;泳道4为哈维弧菌单一PCR的阴性对照;泳道5为海豚链球菌单一PCR的扩增结果,目的扩增片段长度为205bp;泳道6为海豚链球菌单一PCR的阴性对照;泳道7为三种病原菌三重PCR的扩增结果,从上到下依次为鰤鱼诺卡氏菌、哈维弧菌和海豚链球菌;泳道8为三种病原菌三重PCR的的阴性对照;从图1可以看出单一PCR检测相应的单一条带及三重PCR检测相应的3条单一条带,分别与鰤鱼诺卡氏菌、哈维弧菌和海豚链球菌的扩增片段长度分别为964、528和205bp相吻合,即说明本发明的鰤鱼诺卡氏菌、哈维弧菌和海豚链球菌检测用引物组可以准确、特异性地检测出鰤鱼诺卡氏菌、哈维弧菌和海豚链球菌。
实施例4检测试剂盒
本实施例的检测试剂盒可用于三重PCR快速诊断样品中是否含有鰤鱼诺卡氏菌、哈维弧菌和海豚链球菌,该检测试剂盒由鰤鱼诺卡氏菌、哈维弧菌和海豚链球菌的检测用引物组、蛋白酶K、SDS溶液、酚-氯仿-异戊醇混合溶液、异丙醇、体积浓度为70%的乙醇、TE缓冲液、CTAB的NaCl溶液、阳性对照品和PCRDsMix组成,其中:
(1)鰤鱼诺卡氏菌、哈维弧菌和海豚链球菌检测用引物组:1管内装鰤鱼诺卡氏菌引物Ns-mceF及Ns-mceR,其核苷酸序列分别如SEQIDNO.1和SEQIDNO.2所示;2管内装哈维弧菌引物Vh-toxF及Vh-toxR,其核苷酸序列分别如SEQIDNO.3和SEQIDNO.4所示;3管内装海豚链球菌引物Si-itsF及Si-itsR,其核苷酸序列分别如SEQIDNO.5和SEQIDNO.6所示;以上引物浓度分别为10μM。
(2)蛋白酶K(20mg/mL),置于容器,1管;
(3)质量浓度为10%SDS,置于容器,1管;
(4)酚-氯仿-异戊醇混合溶液(体积比25:24:1),置于容器,1管;
(5)异丙醇,置于容器,1管;
(6)制备体积浓度为70%乙醇,置于容器,1管;
(7)制备TE缓冲液(10mMTris-HCl,0.1mMEDTA,pH8.0),置于容器,1管;
(8)制备CTAB的NaCl溶液(5gCTAB溶于100mL0.5MNaCl溶液中),置于容器,1管;
(9)制备阳性对照品:提取鰤鱼诺卡氏菌、哈维弧菌和海豚链球菌的基因组DNA,等体积混合,置于容器,1管;
(10)2×PCRDsMix,置于容器,1管;
(11)一块泡沫板,将上述12个小管分别对应放置于泡沫板的孔内,装于盒中即制备得到本实施例的检测试剂盒。
本实施例中各试剂管制备后均经过抽样质检,对其质量进行监控。
实施例5利用实施例4制得的试剂盒进行检测的方法
1、本实施例采用实施例4制备所得试剂盒,采用三重PCR对海水鱼类养殖水体样品是否含有鰤鱼诺卡氏菌、哈维弧菌和海豚链球菌进行快速检测,其具体步骤如下:
(1)取待检测水体样品50ml于12000r/min离心10min;
(2)步骤1)离心后去上清,加入500-550μL的TE缓冲液重悬沉淀,备用;
(3)向步骤(2)重悬后的溶液中加入30μL质量浓度为10%SDS和15μL的蛋白酶K(20mg/mL),并于37℃温育1h;
(4)向步骤(3)温育后的溶液中加入100μL5mol/LNaCl,充分混匀后再加入80μLCTAB的NaCl溶液,65℃温育20min;
(5)向步骤(4)温育后的溶液中加入与温育后的溶液等体积的酚-氯仿-异戊醇混合溶液混匀,12000g/min离心4min;
(6)将步骤(5)离心后的上清转入一只新管中,加入上清液0.6倍体积的异丙醇,12000g/min离心4min;
(7)步骤(6)离心后去上清,沉淀用1mL的体积浓度70%乙醇洗涤后,12000g/min离心4min;
(8)步骤(7)离心后去上清,沉淀常温干燥10min,重溶于30-50μLTE缓冲液,即为样品DNA模板;
(9)样品组三重PCR反应体系包括:12.5μL2×PCRDsMix、1.0μL引物Ns-mceF、1.0μL引物Ns-mceR、0.7μL引物Vh-toxF、0.7μL引物Vh-toxR、1.8μL引物Si-itsF、1.8μL引物Si-itsR、3.0μL步骤8)得到的样品DNA模板和2.5μL无菌水;
(10)阳性对照组三重PCR反应体系包括:12.5μL2×PCRDsMix、1.0μL引物Ns-mceF、1.0μL引物Ns-mceR、0.7μL引物Vh-toxF、0.7μL引物Vh-toxR、1.8μL引物Si-itsF、1.8μL引物Si-itsR、3.0μL阳性对照品和2.5μL无菌水;
(11)将步骤9)制得的样品组和步骤10)制得的阳性对照组分别混匀后12000g/min离心10s,置于PCR仪中,分别94℃预变性4min,(94℃变性30s、58℃退火30s、72℃延伸1min)35个循环,72℃延伸10min,进行PCR反应;
(12)对步骤11)PCR反应结果进行电泳检测,分别设置样品孔、阳性对照孔和参比孔;所述样品孔取步骤11)样品组PCR反应产物5μL与6×LoadingBuffer1μL混合,加入到1%琼脂糖凝胶点样孔中;所述阳性对照孔取步骤11)阳性对照组PCR反应产物5μL与6×LoadingBuffer1μL混合,加入到1%琼脂糖凝胶点样孔中;所述参比孔取5μLDL2000DNAMarker加入到1%琼脂糖凝胶点样孔中;以120V电压分别对所述样品孔、所述阳性对照孔和所述参比孔进行电泳约25min后,于凝胶成像系统下观察结果;若样品电泳条带出现与阳性对照相同大小的条带(鰤鱼诺卡氏菌964bp、哈维弧菌528bp、海豚链球菌205bp),则说明待测样品含有相对应的细菌。
2、检测结果:
检测结果如图2所示,图2中泳道M为MarkerDL2000;泳道1为三种病原菌三重PCR阳性对照;泳道2为含有三种病原菌养殖水体样品的三重PCR扩增结果;泳道3为三种病原菌三重PCR阴性对照;泳道4为不含有三种病原菌养殖水体样品的三重PCR扩增结果;从图2可以看出含有三种病原菌养殖水体样品检测出相应的3条条带,并且与阳性对照条带大小相同,不含有三种病原菌养殖水体样品并未检测出条带,即说明本发明的鰤鱼诺卡氏菌、哈维弧菌和海豚链球菌检测用引物组可以准确、特异性地检测出养殖水体是否含有鰤鱼诺卡氏菌、哈维弧菌和海豚链球菌。
上实施例仅用以说明本发明的技术方案而非限制,尽管参照较佳实施例对本发明进行了详细说明,本领域的普通技术人员应当理解,可以对本发明的技术方案进行修改或者等同替换,而不脱离本发明技术方案的宗旨和范围,其均应涵盖在本发明的权利要求范围当中。

Claims (8)

1.一种鰤鱼诺卡氏菌、哈维弧菌和海豚链球菌的检测引物组,其特征在于,包括引物对Ns-mce、引物对Vh-tox和引物对Si-its;其中,所述引物对Ns-mce包括核苷酸序列如SEQIDNO.1所示的Ns-mceF和核苷酸序列如SEQIDNO.2所示的Ns-mceR;所述引物对Vh-tox包括核苷酸序列如SEQIDNO.3所示的Vh-toxF和核苷酸序列如SEQIDNO.4所示的Vh-toxR;所述引物对Si-its包括核苷酸序列如SEQIDNO.5所示的Si-itsF和核苷酸序列如SEQIDNO.6所示的Si-itsF。
2.一种鰤鱼诺卡氏菌、哈维弧菌和海豚链球菌的检测试剂盒,其特征在于,包括权利要求1所述检测引物组。
3.根据权利要求2所述的鰤鱼诺卡氏菌、哈维弧菌和海豚链球菌的检测试剂盒,其特征在于,还包括蛋白酶K、SDS溶液、酚-氯仿-异戊醇混合溶液、异丙醇、体积浓度为70%的乙醇、TE缓冲液、CTAB的NaCl溶液、阳性对照品和PCRDsMix。
4.根据权利要求3所述的鰤鱼诺卡氏菌、哈维弧菌和海豚链球菌的检测试剂盒,其特征在于,所述酚-氯仿-异戊醇混合溶液中酚、氯仿和异戊醇的体积比为25:24:1。
5.根据权利要求3所述的鰤鱼诺卡氏菌、哈维弧菌和海豚链球菌的检测试剂盒,其特征在于,所述CTAB的NaCl溶液为将CTAB溶于0.5mol/L的NaCl溶液中,CTAB和所述NaCl溶液的质量体积比为1:20。
6.根据权利要求3所述的鰤鱼诺卡氏菌、哈维弧菌和海豚链球菌的检测试剂盒,其特征在于,所述阳性对照品包括鰤鱼诺卡氏菌、哈维弧菌和海豚链球菌的DNA模板。
7.根据权利要求2所述鰤鱼诺卡氏菌、哈维弧菌和海豚链球菌的检测试剂盒,其特征在于,所述检测引物组中的引物浓度均为10μM。
8.采用权利要求3~7任一所述检测试剂盒进行检测的方法,其特征在于,包括如下步骤:
1)取待检测样品50~100mg并加入500-550μL的TE缓冲液,用玻璃匀浆器充分匀浆后,于12000r/min离心10min;
2)步骤1)离心后去除沉淀,取上清备用;
3)向步骤2)上清溶液中加入30μL质量浓度为10%SDS和15μL20mg/mL的蛋白酶K,并于37℃温育1h;
4)向步骤3)温育后的溶液中加入100μL5mol/L的NaCl溶液,充分混匀后再加入80μLCTAB的NaCl溶液,65℃温育20min;
5)向步骤4)温育后的溶液中加入与温育后的溶液等体积的酚-氯仿-异戊醇混合溶液混匀,12000g/min离心4-5min;
6)将步骤5)离心后的上清转入一只新管中,加入上清液0.6-0.8倍体积的异丙醇,12000g/min离心4-5min;
7)步骤6)离心后去上清,沉淀用1mL的体积浓度为70%的乙醇洗涤后,12000g/min离心4-5min;
8)步骤7)离心后去上清,沉淀常温干燥5-10min,重溶于30-50μLTE缓冲液,即为样品DNA模板;
9)样品组三重PCR反应体系包括:12.5μL2×PCRDsMix、1.0μL引物Ns-mceF、1.0μL引物Ns-mceR、0.7μL引物Vh-toxF、0.7μL引物Vh-toxR、1.8μL引物Si-itsF、1.8μL引物Si-itsR、3.0μL步骤8)得到的样品DNA模板和2.5μL无菌水;
10)阳性对照组三重PCR反应体系包括:12.5μL2×PCRDsMix、1.0μL引物Ns-mceF、1.0μL引物Ns-mceR、0.7μL引物Vh-toxF、0.7μL引物Vh-toxR、1.8μL引物Si-itsF、1.8μL引物Si-itsR、3.0μL阳性对照品和2.5μL无菌水;
11)将步骤9)制得的样品组和步骤10)制得的阳性对照组分别混匀后12000g/min离心10s,置于PCR仪中,分别于94℃预变性4min,94℃变性30s、58℃退火30s、72℃延伸1min,35个循环,72℃延伸10min,进行PCR反应;
12)对步骤11)PCR反应结果进行电泳检测,分别设置样品孔、阳性对照孔和参比孔;所述样品孔取步骤11)样品组PCR反应产物5μL与6×LoadingBuffer1μL混合,加入到1%琼脂糖凝胶点样孔中;所述阳性对照孔取步骤11)阳性对照组PCR反应产物5μL与6×LoadingBuffer1μL混合,加入到1%琼脂糖凝胶点样孔中;所述参比孔取5μLDL2000DNAMarker加入到1%琼脂糖凝胶点样孔中;以120V电压分别对所述样品孔、所述阳性对照孔和所述参比孔进行电泳25min后,于凝胶成像系统下观察结果;若样品孔电泳条带出现与阳性对照孔相同大小的条带,则说明待测样品中含有相对应的细菌。
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