CN105543201B - 一种头孢菌素c酰化酶突变体 - Google Patents

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Abstract

本发明通过点突变法构建了头孢菌素C酰化酶,相比Pseudomonas sp.GK16来源的野生型头孢菌素C酰化酶,本发明的头孢菌素C酰化酶的酶活力提高了20.5倍至150倍,可用于一步酶法生产7‑ACA。

Description

一种头孢菌素C酰化酶突变体
技术领域
本发明属于基因工程技术领域,具体地说,涉及通过点突变法构建的用于一步酶法生产7-ACA(7-氨基头孢烷酸)的头孢菌素C酰化酶。
背景技术
头孢类抗生素是现在应用最广泛的β-内酰胺类抗生素,该类抗生素大部分是通过7-氨基头孢烷酸(7-aminocephalosporanic acid,简称为7-ACA)合成的7-ACA衍生物,这类抗生素占到了全球抗生素市场40%的份额。
7-ACA一般通过化学法或生物酶法裂解头孢菌素C(Cephalosporin C,简称为CPC),脱去分子侧链而获得。因化学法工艺复杂、能耗高,污染严重,近几年来,工业生产7-ACA基本已替换为生物酶法制备。目前使用的生物酶法又分为两步酶法和一步酶法。两步酶法采用得较早,主要用到D-氨基酸氧化酶(D-Amino Acid Oxidase,以下简称为DAAO)和戊二酰基-7-氨基头孢烷酸(Glutaryl-7-Amidocephalospranic Acid,以下简称为GL-7-ACA)酰化酶,CPC在DAAO的作用下生成GL-7-ACA,然后再在GL-7-ACA酰化酶的作用下脱去侧链,生成7-ACA。虽然该方法因环保、低能耗、高收率等特点已经基本取代了化学法,但该方法中DAAO催化反应的副产物H2O2对CPC有降解作用,且为两步催化反应,步骤较为复杂。因此,人们开发出了一步酶法制备7-ACA的技术,即利用CPC酰化酶催化CPC脱去侧链,生成7-ACA。
自20世纪80年代以来,人们从自然界中发现了产CPC酰化酶(头孢菌素C酰化酶)的菌株,如Pseudomonas sp.SE83、Pseudomonas diminuta N176、Pseudomonas sp.P130、Pseudomonas sp.GK16等,但这些酶严格来说是GL-7-ACA酰化酶,它们的CPC酰化酶活力均比较低,只有GL-7-ACA酰化酶活力的2-4%。迄今为止,自然界尚未发现产高催化活力的CPC酰化酶野生菌。野生型的CPC酰化酶还不能满足工业化生产CPC的要求,因此一步酶法至今不能完全取代两步酶法来大规模生产7-ACA。现在对Pseudomonas sp.SE83来源的CPC酰化酶改造的研究相对比较多,通过改造筛选,CPC酰化酶活性较野生酶提高了几十倍,但该类型的CPC酰化酶都有很强的7-ACA产物抑制性。近年来,对Pseudomonas sp.GK16菌株来源的CPC酰化酶改造出现了较大的进展,将该来源的CPC酰化酶的β亚基的第45位由I替换成V、β亚基的第58位由F替换成V、β亚基的第153位由Y替换成T、β亚基的第177位由F替换成L、β亚基的第382位由V替换成L,获得的突变体的CPC酰化酶酶活提高了25.3倍,但该酶活仍然无法满足工业生产的要求。
发明内容
为了克服现有一步酶法生产7-ACA技术中的上述缺陷,得到酶活性更高、底物特异性更高的CPC酰化酶,本发明利用基因工程技术来对微生物来源的野生型CPC酰化酶进行改造和筛选,构建高酶活性的CPC酰化酶突变体,从而实现一步酶法生产7-ACA的工业化。
为此,本发明通过随机突变、半理性设计等技术对Pseudomonas sp.GK16来源的GL-7-ACA酰化酶(SEQ ID NO:1)进行改造,获得以CPC作为特异性底物的高酶活的CPC酰化酶突变体,以便高效地将CPC催化生成7-ACA。
因此,本发明的第一个目的在于提供一种用于生产7-ACA的高酶活力的CPC酰化酶突变体。
本发明的第二个目的在于提供编码上述CPC酰化酶突变体的基因。
本发明的第三个目的在于提供包含上述基因的质粒。
本发明的第四个目的在于提供转化了上述质粒的微生物。
本发明的第五个目的在于提供上述CPC酰化酶突变体或微生物在生产7-ACA中的用途。
为了达到上述目的,本发明提供如下头孢菌素C酰化酶:
一种头孢菌素C酰化酶(CPC酰化酶),其氨基酸序列为:
SEQ ID NO:3,其为SEQ ID NO:1第240位的V替换为F的突变体,其氨基酸序列为:
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SEQ ID NO:4,其为SEQ ID NO:1第306位的A替换为T的突变体,其氨基酸序列为:
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SEQ ID NO:5,其为SEQ ID NO:1第553位的R替换为L的突变体,其氨基酸序列为:
MEPTSTPQAPIAAYKPRSNEILWDGYGVPHIYGVDAPSAFYGYGWAQARSHGDNILRLYGEARGKGAEYWGPDYEQTTVWLLTNGVPERAQQWYAQQSPDFRANLDAFAAGINAYAQQNPDDISPEVRQVLPVSGADVVAHAHRLMNFLYVASPGRTLGEGDPPDLADQGSNSWAVAPGKTANGNALLLQNPHLSWTTDYFTYYEAHLVTPDFEIYGATQIGLPVIRFAFNQRMGITNTVNGMVGATNYRLTLQDGGYLYDGQVRPFERRQASYRLRQADGTTVDKPLEIRSSVHGPVFERADGTAVAVRVAGLDRPGMLEQYFDMITADSFDDYEAALARMQVPTFNIVYADREGTINYSFNGVAPKRAEGDIAFWQGLVPGDSSRYLWTETHPLDDLPRVTNPPGGFVQNSNDPPWTPTWPVTYTPKDFPSYLAPQTPHSLRAQQSVRLMSENDDLTLERFMALQLSHRAVMADRTLPDLIPAALIDPDPEVQAAARLLAAWDREFTSDSRAALLFEEWARLFAGQNFAGQAGFATPWSLDKPVSTPYGVLDPKAAVDQLRTAIANTKRKYGAIDRPFGDASRMILNDVNVPGAAGYGNLGSFRVFTWSDPDENGVRTPVHGETWVAMIEFSTPVRAYGLMSYGNSRQPGTTHYSDQIERVSRADFRELLLRREQVEAAVQERTPFNFKP;
SEQ ID NO:6,其为SEQ ID NO:1第623位的H替换为N的突变体,其氨基酸序列为:
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SEQ ID NO:7,其为SEQ ID NO:1第240位的V替换为F、第306位的A替换为T、第623位的H替换为T的突变体,其氨基酸序列为:
MEPTSTPQAPIAAYKPRSNEILWDGYGVPHIYGVDAPSAFYGYGWAQARSHGDNILRLYGEARGKGAEYWGPDYEQTTVWLLTNGVPERAQQWYAQQSPDFRANLDAFAAGINAYAQQNPDDISPEVRQVLPVSGADVVAHAHRLMNFLYVASPGRTLGEGDPPDLADQGSNSWAVAPGKTANGNALLLQNPHLSWTTDYFTYYEAHLVTPDFEIYGATQIGLPVIRFAFNQRMGITNTFNGMVGATNYRLTLQDGGYLYDGQVRPFERRQASYRLRQADGTTVDKPLEIRSSVHGPVFERADGTTVAVRVAGLDRPGMLEQYFDMITADSFDDYEAALARMQVPTFNIVYADREGTINYSFNGVAPKRAEGDIAFWQGLVPGDSSRYLWTETHPLDDLPRVTNPPGGFVQNSNDPPWTPTWPVTYTPKDFPSYLAPQTPHSLRAQQSVRLMSENDDLTLERFMALQLSHRAVMADRTLPDLIPAALIDPDPEVQAAARLLAAWDREFTSDSRAALLFEEWARLFAGQNFAGQAGFATPWSLDKPVSTPYGVRDPKAAVDQLRTAIANTKRKYGAIDRPFGDASRMILNDVNVPGAAGYGNLGSFRVFTWSDPDENGVRTPVTGETWVAMIEFSTPVRAYGLMSYGNSRQPGTTHYSDQIERVSRADFRELLLRREQVEAAVQERTPFNFKP;
SEQ ID NO:8,其为SEQ ID NO:1第240位的V替换为F、第306位的A替换为T、第553位的R替换为L的突变体、第623位的H替换为T的突变体,其氨基酸序列为:
MEPTSTPQAPIAAYKPRSNEILWDGYGVPHIYGVDAPSAFYGYGWAQARSHGDNILRLYGEARGKGAEYWGPDYEQTTVWLLTNGVPERAQQWYAQQSPDFRANLDAFAAGINAYAQQNPDDISPEVRQVLPVSGADVVAHAHRLMNFLYVASPGRTLGEGDPPDLADQGSNSWAVAPGKTANGNALLLQNPHLSWTTDYFTYYEAHLVTPDFEIYGATQIGLPVIRFAFNQRMGITNTFNGMVGATNYRLTLQDGGYLYDGQVRPFERRQASYRLRQADGTTVDKPLEIRSSVHGPVFERADGTTVAVRVAGLDRPGMLEQYFDMITADSFDDYEAALARMQVPTFNIVYADREGTINYSFNGVAPKRAEGDIAFWQGLVPGDSSRYLWTETHPLDDLPRVTNPPGGFVQNSNDPPWTPTWPVTYTPKDFPSYLAPQTPHSLRAQQSVRLMSENDDLTLERFMALQLSHRAVMADRTLPDLIPAALIDPDPEVQAAARLLAAWDREFTSDSRAALLFEEWARLFAGQNFAGQAGFATPWSLDKPVSTPYGVLDPKAAVDQLRTAIANTKRKYGAIDRPFGDASRMILNDVNVPGAAGYGNLGSFRVFTWSDPDENGVRTPVTGETWVAMIEFSTPVRAYGLMSYGNSRQPGTTHYSDQIERVSRADFRELLLRREQVEAAVQERTPFNFKP;
SEQ ID NO:9,其为SEQ ID NO:1第215位的I替换为V、第228位的F替换为V、第240位的V替换为F、第306位的A替换为T、第323位的Y替换为T、第347位的F替换为L、第552位的V替换为L的突变体、第553位的R替换为L的突变体、第623位的H替换为T的突变体,其氨基酸序列为:
MEPTSTPQAPIAAYKPRSNEILWDGYGVPHIYGVDAPSAFYGYGWAQARSHGDNILRLYGEARGKGAEYWGPDYEQTTVWLLTNGVPERAQQWYAQQSPDFRANLDAFAAGINAYAQQNPDDISPEVRQVLPVSGADVVAHAHRLMNFLYVASPGRTLGEGDPPDLADQGSNSWAVAPGKTANGNALLLQNPHLSWTTDYFTYYEAHLVTPDFEVYGATQIGLPVIRVAFNQRMGITNTFNGMVGATNYRLTLQDGGYLYDGQVRPFERRQASYRLRQADGTTVDKPLEIRSSVHGPVFERADGTTVAVRVAGLDRPGMLEQTFDMITADSFDDYEAALARMQVPTLNIVYADREGTINYSFNGVAPKRAEGDIAFWQGLVPGDSSRYLWTETHPLDDLPRVTNPPGGFVQNSNDPPWTPTWPVTYTPKDFPSYLAPQTPHSLRAQQSVRLMSENDDLTLERFMALQLSHRAVMADRTLPDLIPAALIDPDPEVQAAARLLAAWDREFTSDSRAALLFEEWARLFAGQNFAGQAGFATPWSLDKPVSTPYGLLDPKAAVDQLRTAIANTKRKYGAIDRPFGDASRMILNDVNVPGAAGYGNLGSFRVFTWSDPDENGVRTPVTGETWVAMIEFSTPVRAYGLMSYGNSRQPGTTHYSDQIERVSRADFRELLLRREQVEAAVQERTPFNFKP。
优选上述头孢菌素C酰化酶的氨基酸序列为SEQ ID NO:9。
一种编码上述头孢菌素C酰化酶的基因。
优选地,编码上述头孢菌素C酰化酶SEQ ID NO:9的基因具有下述碱基序列:
atggaaccgacctccaccccgcaggctccgatcgctgcttacaaaccgcgttccaacgaaatcctgtgggacggttacggtgttccgcacatctacggtgttgacgctccgtccgctttctacggttacggttgggctcaggctcgttcccacggtgacaacatcctgcgtctgtacggtgaagctcgtggtaaaggtgctgaatactggggtccggactacgaacagaccaccgtttggctgctgaccaacggtgttccggaacgtgctcagcagtggtacgctcagcagtccccggacttccgtgctaacctggacgctttcgctgctggtatcaacgcttacgctcagcagaacccggacgacatctccccggaagttcgtcaggttctgccggtttccggtgctgacgttgttgctcacgctcaccgtctgatgaacttcctgtacgttgcttccccgggtcgtaccctgggtgaaggtgacccgccggacctggctgaccagggttccaactcctgggctgttgctccgggtaaaaccgctaacggtaacgctctgctgctgcagaacccgcacctgtcctggaccaccgactacttcacctactacgaagctcacctggttaccccggacttcgaagtttacggtgctacccagatcggtctgccggttatccgtgttgctttcaaccagcgtatgggtatcaccaacaccttcaacggtatggttggtgctaccaactaccgtctgaccctgcaggacggtggttacctgtacgacggtcaggttcgtccgttcgaacgtcgtcaggcttcctaccgtctgcgtcaggctgacggtaccaccgttgacaaaccgctggaaatccgttcctccgttcacggtccggttttcgaacgtgctgacggtaccaccgttgctgttcgtgttgctggtctggaccgtccgggtatgctggaacagaccttcgacatgatcaccgctgactccttcgacgactacgaagctgctctggctcgtatgcaggttccgaccctgaacatcgtttacgctgaccgtgaaggtaccatcaactactccttcaacggtgttgctccgaaacgtgctgaaggtgacatcgctttctggcagggtctggttccgggtgactcctcccgttacctgtggaccgaaacccacccgctggacgacctgccgcgtgttaccaacccgccgggtggtttcgttcagaactccaacgacccgccgtggaccccgacctggccggttacctacaccccgaaagacttcccgtcctacctggctccgcagaccccgcactccctgcgtgctcagcagtccgttcgtctgatgtccgaaaacgacgacctgaccctggaacgtttcatggctctgcagctgtcccaccgtgctgttatggctgaccgtaccctgccggacctgatcccggctgctctgatcgacccggacccggaagttcaggctgctgctcgtctgctggctgcttgggaccgtgaattcacctccgactcccgtgctgctctgctgttcgaagaatgggctcgtctgttcgctggtcagaacttcgctggtcaggctggtttcgctaccccgtggtccctggacaaaccggtttccaccccgtacggtctgctggacccgaaagctgctgttgaccagctgcgtaccgctatcgctaacaccaaacgtaaatacggtgctatcgaccgtccgttcggtgacgcttcccgtatgatcctgaacgacgttaacgttccgggtgctgctggttacggtaacctgggttccttccgtgttttcacctggtccgacccggacgaaaacggtgttcgtaccccggttaccggtgaaacctgggttgctatgatcgaattctccaccccggttcgtgcttacggtctgatgtcctacggtaactcccgtcagccgggtaccacccactactccgaccagatcgaacgtgtttcccgtgctgacttccgtgaactgctgctgcgtcgtgaacaggttgaagctgctgttcaggaacgtaccccgttcaacttcaaaccg(SEQ ID NO:10)。
一种包含上述基因的质粒。该质粒包含用于表达上述基因的载体,优选载体是PET系列,比如载体是pET24a(+),但并不受限于此。
一种转化了上述质粒的微生物,该微生物可作为宿主用于表达上述头孢菌素C酰化酶。
优选地,上述微生物选自枯草芽孢杆菌、毕赤酵母、酿酒酵母、大肠杆菌,优选大肠杆菌,更优选大肠杆菌BL21(DE3)。
上述头孢菌素C酰化酶或者微生物可以用于生产7-ACA、尤其是一步酶法生产7-ACA。
在生产7-ACA中,以头孢菌素C为底物原料,用上述头孢菌素C酰化酶或者微生物作为催化剂来催化反应。
生产7-ACA可采用常规的工艺条件,比如,头孢菌素C(CPC)的浓度可选择1~3wt%,优选2.5wt%;反应温度选择10~37℃,优选15℃。
本发明的CPC酰化酶突变体水解CPC产生7-ACA的活性相较野生酶提高了20.5倍至150倍,底物特异性更高,产物抑制性更低,当应用于一步法生产7-ACA时,7-ACA生成率超过98%,极具工业化前景。
具体实施方式
以下结合具体实施例对本发明做进一步详细说明。应理解,以下实施例仅用于说明本发明而非用于限定本发明的范围。
本文中涉及到多种物质的添加量、含量及浓度,其中所述的百分含量,除特别说明外,皆指质量百分含量。
为简要起见,本文中的氨基酸缩写既可以使用英文三字母、也可以采用英文单字母,这是本领域技术人员熟知的,这些缩写列于下表中:
表1氨基酸中英文对照及缩写
作为构建头孢菌素C酰化酶突变体的基础模板,Pseudomonas sp.GK16来源的野生型GL-7-ACA酰化酶的氨基酸序列是序列表中的SEQ ID NO:1。其编码基因是序列表中的SEQID NO:2。
为了获得酶活性更高的CPC酰化酶突变体,本发明对野生型CPC酰化酶SEQ ID NO:1的基因序列SEQ ID NO:2进行点突变。通过易错PCR技术获得一个或多个氨基酸位点取代的突变体氨基酸序列,筛选出多个可提高CPC酰化酶的酶活的位点,包括240位缬氨酸(β肽第70位)、306位丙氨酸(β肽第136位)、553位精氨酸(β肽第383位)和623位组氨酸(β肽第453位)。然后以定点突变技术对上述位点进行随机组合突变,获得本发明中具有氨基酸序列SEQ ID NO:7-8的突变体。最后再在SEQ ID NO:8的基础上进行定点突变,获得本发明中具有氨基酸序列SEQ ID NO:9的突变体。
其中,SEQ ID NO:1是这些氨基酸序列SEQ ID NO:3-9的共同序列,这些氨基酸序列都是在SEQ ID NO:1的基础上进行1个、或2个、最多9个氨基酸的替换而获得的突变体,这些突变体氨基酸序列保持了98%以上的同源性。
在本发明中,术语“CPC酰化酶突变体”、“突变体CPC酰化酶”、“突变CPC酰化酶”和“突变酶”表示相同的意义,都是指头孢菌素C酰化酶的突变体。
在本发明中,术语“野生(型)”、“野生酶”、“野生型酶”表示相同的意义,都是指野生型的GL-7-ACA酰化酶或称CPC酰化酶(SEQ ID NO:1)。
本发明的CPC酰化酶突变体的氨基酸数量只有692个,且结构明确,因此本领域技术人员很容易获得其编码基因、包含这些基因的表达盒和质粒、以及包含该质粒的转化体。
这些基因、表达盒、质粒、转化体可以通过本领域技术人员所熟知的基因工程构建方式获得。
上述转化体宿主可以使任何适合表达CPC酰化酶的微生物,包括细菌和真菌。优选微生物是枯草芽孢杆菌、毕赤酵母、酿酒酵母、或者大肠杆菌,优选大肠杆菌,更优选大肠杆菌BL21(DE3)。
当作为生物催化剂用于生产7-ACA时,本发明的CPC酰化酶可以呈现酶的形式或者菌体的形式。所述酶的形式包括游离酶、固定化酶,包括纯化酶、粗酶、发酵液、载体固定的酶等;所述菌体的形式包括存活菌体和死亡菌体。
本发明的CPC酰化酶分离纯化、包括固定化酶制备技术也是本领域技术人员所熟知的。
实施例
本文中的全基因合成、引物合成及测序委托苏州金唯智公司完成。
实施例1野生型CPC酰化酶基因重组大肠杆菌的构建
对于Pseudomonas sp.GK16来源的CPC酰化酶,以其已经公布的基因序列SEQ IDNO:2为基础(Matsuda et.al.,J.Bacteriol.163:1222-1228,1985),全基因合成基因序列,并在基因两端设计限制性内切酶位点NdeI和XhoI,亚克隆到载体pET24a(Novagen)的相应位点,获得重组质粒pET24a-wt-CPC,转化表达宿主大肠杆菌BL21(DE3),得到野生型CPC酰化酶的重组大肠杆菌。
实施例2易错PCR法构建随机突变点库及筛选
2.1易错PCR法构建随机突变点库
以CPC酰化酶野生型基因SEQ ID NO:2为模板,应用易错PCR技术构建随机突变体库。正向引物CPC-Nde-F为5’-CATATGGAGCCGACCTCGAC-3’,反向引物CPC-Xho-R为5’-CTCGAGTGGCTTGAAGTTGAAG-3’
50μL易错PCR反应体系包括:50ng质粒模板pET24a-wt-CPC,30pmol一对引物CPC-Nde-F和CPC-Xho-R,1X Taq buffer,0.2mM dGTP,0.2mM dATP,1mM dCTP,1mM dTTP,7mMMgCl2,(0mM、0.05mM、0.1mM、0.15mM、0.2mM)MnCl2,2.5个单位的Taq酶(fermentas)。PCR反应条件为:95℃ 5min;94℃ 30s,55℃ 30s,72℃ 2min/kbp;30个循环;72℃ 10min。胶回收2.0kb随机突变片段作为大引物,用KOD-plus DNA聚合酶做MegaPrimer PCR:94℃ 5min,;98℃ 10s,60℃ 30s,68℃2min/kbp,25个循环;68℃ 10min。DpnI消化质粒模板,电转化大肠杆菌E.coli BL21(DE3),得到超过104个克隆的随机突变库。
2.2突变体库的高通量筛选
选取突变体库中的转化子接种到含700μL LB培养基的96孔深孔培养板中,培养基中含100μg/mL卡那霉素和0.1mM IPTG,37℃培养6h后,降温至25℃,培养过夜。5000rpm离心10min,弃上清,置于-70℃冷冻1h,室温融化30min。加入200μL含1mg/mL溶菌酶的0.1M磷酸钾盐缓冲液(pH8.0),重悬菌体,37℃孵育1h,4℃,5000rpm离心20min,取20μL上清,用于CPC活力测定。
2.3高通量CPC酰化酶活力测定
底物反应液:含2wt%CPC钠盐的0.1M磷酸钾盐缓冲液(pH8.0),
终止反应液:0.05M NaOH,20v/v%冰醋酸,
显色剂:含0.5wt%的PDAB(p-二甲氨基苯甲醛,p-Dimethyl Aminobenzaldehyde)甲醇溶液。
酶活力定义:每分钟催化CPC产生1微摩尔(μmol)7-ACA所需要的酶量定义为1个单位(U)。
将上述步骤2.2中的上清20μL加入20μL底物反应液,在37℃的条件下反应过夜,加入200μL终止反应液,然后5000rpm离心10min。取200μL离心上清,加入40μL显色液,室温反应10min后,检测415nm下的吸光度。
在随机突变库,通过对约30000个突变体克隆筛选,结果显示V240F、A306T、R553L、H623N这4个突变点能提高CPC酰化酶的酶活。
表2随机突变菌在37℃下的发酵液相对比活结果
菌种编号 突变位点 氨基酸序列号 发酵液相对比活
wtCPC —— 1 1.0
EP 1 V240F 3 2.8
EP 2 A306T 4 2.2
EP 3 R553L 5 4.0
EP 4 H623N 6 3.1
*wtCPC是指野生型头孢菌素C酰化酶的表达菌株。
实施例3通过定点突变技术进行定向进化
根据实例2中筛选出的V240F、A306T、R553L、H623N这4个位点,设计简并引物,以pET24a-wtCPC质粒为模板,构建定点组合突变库。然后通过定点突变技术,以组合突变库中筛选出的高活力菌株质粒为模板,加入I215V、F228V、Y323T、F347L、V552L即β亚基的I45βV、F58βV、Y153βT、F177βL、V382βL五个突变点。构建过程中所用的引物见表3。
表3定向进化引物列表
*其中:N=A/G/C/T。
3.1通过定点突变技术构建定向进化突变库
以pET24a-wtCPC质粒为模板,以240-F1和306-R1、306-F2和553-R2、553-F3和623-R3三组引物对分别进行PCR扩增,通过over-lapping PCR扩增出大片段,然后以大片段为引物进行MegaPrimer PCR,构建定点组合突变库。
50μL PCR反应体系包括:10ng质粒模板,10pmol的引物对,1xKOD plus buffer,0.2mM dNTP,1.5mM MgSO4,5个单位的KOD-plus DNA聚合酶。
PCR反应条件为:95℃ 1min;98℃ 10s,57℃ 30s,68℃ 1min/kbp;30个循环;68℃10min。胶回收三个片段P1、P2、P3。
以P1、P2、P3为模板,以240-F1和623-R3为引物进行第二轮PCR,获得片段P,切胶回收。
PCR反应条件为:95℃ 3min;98℃ 10s,60℃ 30s,68℃ 1min/kbp;25个循环;68℃10min。
以片段P作为大引物,用KOD-plus DNA聚合酶做MegaPrimer PCR:94℃ 5min,;98℃ 10s,60℃ 30s,68℃ 2min/kbp,25个循环;68℃ 10min。DpnI消化质粒模板,电转化大肠杆菌E.coli BL21(DE3),得到超过3×104个克隆的随机突变库。
3.2突变体库的高通量筛选
方法同实施例2的步骤2.2。经筛选获得活力相对较高的ED2菌株,经测序确定该菌株含有V240F,A306T,R553L,H623T四个位点的突变。
3.3定点突变
以ED2菌株提取的质粒为模板,以45/58-F和45/58-R、153-F和153-R、177-F和177-R、382-F和382-R为引物,获得的最终产物经Dpn I消化后转化大肠杆菌E.coli BL21(DE3)。
50μL PCR反应体系包括:10ng质粒模板,10pmol的引物对,1xKOD plus buffer,0.2mM dNTP,1.5mM MgSO4,5个单位的KOD-plus DNA聚合酶。
PCR反应条件为:95℃ 1min;98℃ 10s,57℃ 30s,68℃ 1min/kbp;20个循环;68℃10min。
3.4高通量CPC酰化酶活力测定
底物反应液:含2wt%CPC钠盐的0.1M磷酸钾盐缓冲液(pH8.0),
终止反应液:0.05M NaOH,20v/v%冰醋酸,
显色剂:含0.5wt%的PDAB(p-二甲氨基苯甲醛,p-Dimethyl Aminobenzaldehyde)甲醇溶液。
酶活力定义:每分钟催化CPC产生1微摩尔(μmol)7-ACA所需要的酶量定义为1个单位(U)。
将上述步骤2.2中的上清20μL加入20μL底物反应液,在37℃的条件下反应10min后,加入200μL终止反应液,然后5000rpm离心10min。取200μL离心上清,加入40μL显色液,室温反应10min后,检测415nm下的吸光度,与7-ACA定量标准曲线进行比较定量。
3.5摇瓶发酵
挑取单菌落,接种至5mL含50μg/mL硫酸卡那霉素的LB液体培养基中,37℃,250rpm培养过夜。取2mL过夜培养物接种至200mL TB培养基中,37℃,250rpm培养2-3h,至OD6000.6-0.8时,加入0.1mM IPTG,28℃,200rpm培养过夜。4℃,10000rpm,离心10min,收集菌体。
3.6酶的提取
菌体用50mL平衡缓冲液(50mM磷酸钾盐缓冲液,200mM NaCl,pH8.0)重悬,然后超声破碎,破碎后的菌体4℃,12000rpm,离心20min,收集上清。上清以1mL/min的速率加入含10mL Ni-NAT基质的亲和层析柱中,然后用含有30mM咪唑的平衡缓冲液冲洗柱料,洗脱杂质。最后用含有500mM咪唑的平衡缓冲液冲洗脱目的蛋白,收集峰值洗脱液。
洗脱液经截留分子量为10kDa的超滤管进行脱盐处理,得纯酶。
3.7纯酶比活力测定
该步骤所用溶液与实施例2中步骤2.3所用试剂相同。
将步骤3.6中的脱盐溶液20μL加入20μL底物反应液,在37℃的条件下反应5min后,加入200μL终止反应液,然后5000rpm离心10min。取200μL离心上清,加入40μL显色液,室温反应10min后,检测415nm下的吸光度,与7-ACA定量标准曲线进行比较定量。
同时采用Thermo Scientific公司的BCA Protein Assay Kit试剂盒测定纯酶的蛋白浓度,从而获得纯酶的比活力。
表4定向进化的纯酶在37℃下的酶活力对比结果
*wtCPC是指野生型头孢菌素C酰化酶的表达菌株。
由表4可以看出,相比野生型头孢菌素C酰化酶SEQ ID NO:1,本发明的头孢菌素C酰化酶突变体SEQ ID NO:7-9的酶活力提高了20.5倍至150倍,其中突变体SEQ ID NO:9的酶活力最高。
实施例4 7-ACA的生产
称取2.5g CPC钠盐,加水溶解,降温至15℃,调整pH至8.2,加入实施例3中步骤3.5制备的500U的突变体SEQ ID NO:9纯酶,搅拌反应。反应过程中控制温度15±0.5℃,pH8.0±0.2,反应40min,检测反应样品。
精确量取100μL反应40min后的样品,用水定容至10mL,进行HPLC分析,分析条件:C18200mm×4.6柱,波长262nm,流动相为0.02M醋酸钠PH5.5:乙腈(93:7),温度25℃。结果显示,反应中CPC钠盐的转化率超过98%。
综上所述,本发明构建了CPC酰化酶突变体,将野生型CPC酰化酶的比活提高了20.5-150倍,用突变体纯酶进行一步酶法生产7-ACA,反应40min,使CPC的转化率超过98%,具有广阔的工业化前景。

Claims (10)

1.一种头孢菌素C酰化酶,其氨基酸序列为:
SEQ ID NO:3,其为SEQ ID NO:1第240位的V替换为F的突变体;
SEQ ID NO:7,其为SEQ ID NO:1第240位的V替换为F、第306位的A替换为T、第623位的H替换为T的突变体;
SEQ ID NO:8,其为SEQ ID NO:1第240位的V替换为F、第306位的A替换为T、第553位的R替换为L、第623位的H替换为T的突变体;或者
SEQ ID NO:9,其为SEQ ID NO:1第215位的I替换为V、第228位的F替换为V、第240位的V替换为F、第306位的A替换为T、第323位的Y替换为T、第347位的F替换为L、第552位的V替换为L、第553位的R替换为L、第623位的H替换为T的突变体。
2.如权利要求1所述头孢菌素C酰化酶,其特征在于,所述氨基酸序列为SEQ ID NO:9。
3.编码如权利要求1或2所述头孢菌素C酰化酶的基因。
4.编码如权利要求2所述头孢菌素C酰化酶的基因,其序列为SEQ ID NO:10。
5.包含如权利要求3或4所述基因的质粒。
6.转化了如权利要求5所述质粒的微生物。
7.如权利要求6所述的微生物,其特征在于,所述微生物选自枯草芽孢杆菌、毕赤酵母、酿酒酵母、大肠杆菌。
8.如权利要求7所述的微生物,其特征在于,所述微生物是大肠杆菌BL21(DE3)。
9.如权利要求1所述头孢菌素C酰化酶或者如权利要求7所述微生物在生产7-ACA中的用途。
10.如权利要求9所述的用途,其特征在于,以头孢菌素C为底物、用权利要求1所述头孢菌素C酰化酶或者如权利要求7所述微生物催化生产7-ACA。
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