CN105112524A - 基于cdc27基因用于结直肠癌辅助诊断和/或预后判断的试剂盒 - Google Patents
基于cdc27基因用于结直肠癌辅助诊断和/或预后判断的试剂盒 Download PDFInfo
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Abstract
本发明公开了一种用于结直肠癌辅助诊断和/或预后判断的试剂盒,该试剂盒包括试剂A和/或试剂B:试剂A是用于检测CDC27基因表达水平的引物对,试剂B是用于检测CDC27蛋白含量的试剂。在结直肠癌组织和细胞中,CDC27mRNA和蛋白水平显著高于正常组织,因此通过对CDC27mRNA和蛋白表达水平的检测就可以诊断结直肠癌有无发生。此外,预后分析证明CDC27高表达者预后较差。本发明据此针对CDC27设计了特异性的引物和试剂,用作结直肠癌辅助诊断和/或预后判断的试剂盒。
Description
技术领域
本发明属于生物医学分子诊断领域,具体涉及基于与结直肠癌转移及预后相关的基因CDC27而开发得到的一种用于结直肠癌辅助诊断和/或预后判断的试剂盒。
背景技术
大肠癌(colorectalcancer,CRC)是人类主要恶性肿瘤之一,其发病率和死亡率分别位于第三位和第四位。每年有120万新确诊的病例,并且有超过60万名患者死于结直肠癌。
近年来由于生活水平的提高和膳食结构的改变,结直肠癌正逐渐成为我国常见的恶性肿瘤,尤其是在我国大中城市,结直肠癌的发病率上升趋势更加明显,已成为我国肿瘤患者死亡的重要原因。随着外科手术治疗的进步及新兴化疗药物的问世,结直肠癌病人的近期疗效得到了显著提高,但其5年总存活率始终在50-60%。
大量研究表明,传统的遗传学改变和表观遗传学改变共同促进了结直肠癌的发生、发展。阐明大肠癌的发生、发展及转移的重要驱动分子事件,将有助于其早期诊断、预后预测及开发新的治疗手段。
CDC27是泛素化连接酶(anaphase-promotingcomplex,APC)的核心组成部分。已有研究表明,CDC27在结直肠癌中具有较高的突变率。另外,在前列腺癌、骨肉瘤、肾上腺皮质肿瘤以及生殖细胞肿瘤的测序研究中,CDC27也同样被发现存在着较高的突变率。
发明内容
本发明的目的在于提供一种用于结直肠癌辅助诊断和/或预后判断的试剂盒,该试剂盒可以特异性检测CDC27基因的表达有无上调,从而作为结直肠癌诊断和预后判断的依据。
本发明的目的通过下述技术方案实现:
一种用于结直肠癌辅助诊断和/或预后判断的试剂盒,包括试剂A和/或试剂B:
试剂A是用于检测CDC27基因表达水平的引物对,也即用于在实时定量PCR检测CDC27mRNA表达水平的引物对,所述引物对为以下任意一对:
引物1:其序列如SEQIDNO:1和SEQIDNO:2所示;
引物2:其序列如SEQIDNO:5和SEQIDNO:6所示;
引物3:其序列如SEQIDNO:7和SEQIDNO:8所示;
引物4:其序列如SEQIDNO:9和SEQIDNO:10所示;
引物5:其序列如SEQIDNO:11和SEQIDNO:12所示;
引物6:其序列如SEQIDNO:13和SEQIDNO:14所示;
引物7:其序列如SEQIDNO:15和SEQIDNO:16所示;
引物8:其序列如SEQIDNO:17和SEQIDNO:18所示;
引物9:其序列如SEQIDNO:19和SEQIDNO:20所示;
引物10:其序列如SEQIDNO:21和SEQIDNO:22所示;
试剂B是用于检测CDC27蛋白含量的试剂,优选抗CDC27蛋白的抗体。
实验证明,在结直肠癌组织和细胞中,CDC27mRNA和蛋白水平显著高于正常组织,因此通过对CDC27mRNA和蛋白表达水平的检测就可以诊断结直肠癌有无发生。此外,预后分析证明CDC27高表达者预后较差。本发明据此针对CDC27设计了特异性的引物和试剂,用作结直肠癌辅助诊断和/或预后判断的试剂盒。
本发明相对于现有技术具有如下的优点及效果:
本发明首次报导了CDC27在结直肠癌组织和细胞株中高表达,并证明其促进结直肠癌细胞的迁移,为结直肠癌转移的辅助诊断提供了新的有力工具,具有重要的意义和极大的应用价值。
附图说明
图1是CDC27在21对结直肠癌病人组织中mRNA相对表达水平比较。
图2是western检测CDC27在结直肠癌细胞株中蛋白表达水平。
图3是免疫组织化学染色检测CDC27在结直肠癌癌旁及肿瘤组织中蛋白染色强度。
图4是CDC27蛋白在结直肠癌病人癌旁和肿瘤组织中相对表达量的比较。
图5是Kaplan-Meier生存分析证实在晚期结直肠癌病人中CDC27高表达者预后较差。
图6是THC8307细胞过表达CDC27基因后细胞的迁移图。
图7是DLD1细胞干扰CDC27基因的表达后细胞的迁移图。
具体实施方式
下面结合实施例及附图对本发明作进一步详细的描述,但本发明的实施方式不限于此。
下述实施例中的实施方法,如无特别说明,均为常规方法。
以下是实施例所用到的部分实验材料来源:
结直肠癌细胞株HT29、HCT116、SW480、SW620、DLD1、colo205、SW1116及正常肠上皮细胞FHC,均购自美国菌种保藏委员会(AmericanTypeCultureCollection,ATCC)。
细胞培养基DMEM、胎牛血清购自Gibco公司。
实时荧光定量PCR试剂盒SYBRGreenPCRKit购自Invitrogen公司。
抗体anti-CDC27(sc-9972)购自SANTA公司。
实施例中所用到的其它原始试剂和材料均可商购得到。
实施例1、临床样本收集
对于蛋白含量测定样本:选取中山大学肿瘤防治中心1999年至2005结直肠癌各期标本共166例,石蜡标本室温保存,切取的白片保存于4℃冰箱。
对于每个入选病例,入选标准为初诊、经病理学诊断为结直肠单发腺癌、无术前放化疗,TNMI、II、III期病例要求行根治术。每例病人包含肿瘤和正常对照(距离切缘5cm以上的正常粘膜)。
对于所有纳入研究的病例,其临床病理资料均来自中山大学肿瘤防治中心病案报告,相应的随访资料来自随访科。病人的肿瘤分级均按照UICC/AJCC(第七版)的标准分级。整体生存期(Overallsurvival,OS)的计算方法是从病人手术日期到死亡日期止,无进展生存期(Progression-freesurvival,PFS)的计算方法是从病人手术日期到病人复发、转移或最后一个随访日期止。手术病人在术后两年内每三个月随访一次,术后三到四年内每半年随访一次,术后五年及以后每一年随访一次,随访时记录病人复发/转移/死亡情况并记录日期,末次随访日期是2014年12月31日。
实施例2
实时荧光定量PCR检测CDC27在结直肠癌组织mRNA水平,包括以下步骤:
1)使用TRIZOL法提取20例结直肠癌组织及其正常对照、7个结直肠癌细胞株(结直肠癌细胞株HT29、HCT116、SW480、SW620、DLD1、colo205、SW1116)和1个正常对照细胞株(正常肠上皮细胞FHC)的总RNA,分别取2μg总RNA逆转录为cDNA。
2)查询NCBI的Gene数据库,得到CDC27和GAPDH(内参)的cDNA序列,根据序列设计PCR引物如下:
3)建立以下反应体系,每个样本设置三个反应复孔:
混匀以上组分,加入8联管各孔,盖紧盖子,排除气泡,离心使液体聚集到管底。热循环参数如下:95℃10min,95℃30s,60℃30s,72℃40s,40次循环,95℃1min,60℃30s,95℃30s。
实验结果如图1-2所示,表明CDC27在肿瘤组织中呈现高表达,在多数结直肠癌细胞株中呈现高表达。
实施例3
CDC27蛋白含量在结直肠癌组织标本中的测定,包括以下步骤:
1)166例病人组织中制作石蜡切片,经二甲苯脱蜡、梯度酒精水化、0.3%H2O2去组织过氧化物酶、枸橼酸盐溶液微波修复、santa公司anti-CDC27(sc-9972)抗体(1:200)和相应种属二抗孵育、3,3-二氨基苯联胺(DAB)和苏木素显色、盐酸酒精分化、梯度酒精脱水,二甲苯透明步骤后,中性树胶封片。
2)组织标本的染色评估由200×倒置显微镜拍照,癌旁、癌组织各取5个视野/病例对图片进行分析。细胞中CDC27的染色强度分为:阴性(0),弱阳性(1),中等阳性(2)和强阳性(3)四个等级。判断每个标本染色的最终指标为强度×阳性率(H-score)。
实验结果如图3-图5所示,CDC27在结直肠癌组织中染色强度明显高于癌旁组织,表明CDC27在肿瘤组织中高表达,且预后分析证明CDC27高表达者预后较差。
实施例4
细胞迁移实验,包括以下步骤:
(1)采用Transwell方法。Transwell小室购自BD公司,杯孔直径6.5mm,孔径0.8μm,聚碳酸脂微孔滤膜封闭。
(2)应用Lipo2000将种于六孔板中的结直肠癌细胞株THC8307转染pcDNA3.1-CDC27(该质粒购于复能基因,货号H1792;该组为CDC27过表达组)及对照质粒3ug,DLD1细胞株转染CDC27的siRNA序列(CDC27干扰组)100nmol,转染24h后用胰酶消化,然后用无血清DMEM重悬细胞至浓度为5×105cells/ml;
干扰组siRNA序列为:5’-GGAAAUAGCCGAGAGGUAA-3’(SEQIDNO:23)
对照组siRNA序列为:5’-CGUACGCGGAAUACUUCGA-3’(SEQIDNO:24)
(3)Transwell小室上室加200uL以上细胞悬液,下室加入600μL含10%FBS的细胞培养基,每组3复孔,37℃,5%CO2培养细胞。
(4)16-20小时后,取出Transwell小室,PBS漂洗,棉签擦去上室上面未发生侵袭的细胞,移去Transwells,倒置,风干。
(5)染色:24孔板中加入500μL含0.1%结晶紫,将小室置于其中,使膜浸没在培养基中,室温染色10分钟,取出,PBS清洗,风干。
实验结果如图6-图7所示:在THC8307细胞株中过表达CDC27后,穿出小室的细胞数目明显高于对照组;在DLD1细胞中干扰CDC27表达后,穿出小室的细胞数目明显低于对照组,说明CDC27促进结直肠癌细胞的迁移,干扰CDC27后抑制结直肠癌细胞的迁移。
上述实施例为本发明较佳的实施方式,但本发明的实施方式并不受上述实施例的限制,其他的任何未背离本发明的精神实质与原理下所作的改变、修饰、替代、组合、简化,均应为等效的置换方式,都包含在本发明的保护范围之内。
Claims (2)
1.一种用于结直肠癌辅助诊断和/或预后判断的试剂盒,其特征在于包括试剂A和/或试剂B:
试剂A是用于检测CDC27基因表达水平的引物对,所述引物对为以下任意一对:
引物1:其序列如SEQIDNO:1和SEQIDNO:2所示;
引物2:其序列如SEQIDNO:5和SEQIDNO:6所示;
引物3:其序列如SEQIDNO:7和SEQIDNO:8所示;
引物4:其序列如SEQIDNO:9和SEQIDNO:10所示;
引物5:其序列如SEQIDNO:11和SEQIDNO:12所示;
引物6:其序列如SEQIDNO:13和SEQIDNO:14所示;
引物7:其序列如SEQIDNO:15和SEQIDNO:16所示;
引物8:其序列如SEQIDNO:17和SEQIDNO:18所示;
引物9:其序列如SEQIDNO:19和SEQIDNO:20所示;
引物10:其序列如SEQIDNO:21和SEQIDNO:22所示;
试剂B是用于检测CDC27蛋白含量的试剂。
2.根据权利要求1所述的用于结直肠癌辅助诊断和/或预后判断的试剂盒,其特征在于:所述的试剂B是抗CDC27蛋白的抗体。
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