CN104962553A - 微量核酸释放剂提取病毒dna的使用方法 - Google Patents
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Abstract
本发明公开了一种利用微量核酸释放剂提取生物样本中病毒DNA的方法,属于分子生物学技术领域,特别是涉及利用微量核酸释放剂提取病毒核酸(DNA)的试剂及其使用方法;微量核酸释放剂裂解生物样本(血清或血浆)中病毒DNA同时,佐以促释放剂能更有效地保证裂解、释放效率;微量核酸释放剂在完全释放核酸的同时,还具有封闭样本中对PCR扩增具有干扰作用的蛋白质、药物及溶血等各种因素物质的功能,避免检测过程的假阴性;样本提取简便、灵敏、快速、准确,避免反复离心、洗脱开盖所引起的污染和核酸丢失,实现PCR提取的“一步法”和“一室化”操作。
Description
技术领域
本发明属于分子生物学技术领域,特别是涉及利用微量核酸释放剂提取病毒核酸(DNA)的试剂及其使用方法。
背景技术
核酸提取是下游核酸检测、研究或产品开发的起点,所分离的核酸的质量和完整性直接影响研究或诊断结果,因此核酸抽提是分子生物学最关键的方法之一,通常成功的核酸分离纯化需要四个重要的步骤:组织或细胞的破碎和裂解,核蛋白复合体的变性,核酸酶的灭活以及污染物的去除,理想的提取方法可以获取高质量的靶核酸,同时没有蛋白、糖脂和其它核酸污染,目前已有很多专业化的核酸抽提方法可以从各种生物样品中抽提DNA或者总核酸。
目前核酸分离技术虽然发展迅速,但是均存在一些缺点,例如:酚氯仿抽提法虽然核酸纯度高,但是其主要成分对人体有害,且容易造成环境污染,同时提取过程需要反复抽提,多次换管,步骤繁琐,会造成样本的丢失与污染;碱裂解法:该法提取的核酸不容易保存;硅胶膜吸附柱法提取的核酸DNA浓度纯度低操作复杂;磁珠法因提取成本较高,从而限制了广泛应用;本试剂用于生物样本病毒DNA提取,样本需求量少、操作简便、无需繁琐的离心、洗脱等步骤,微量核酸释放剂在完全释放核酸的同时,还具有封闭样本中对PCR扩增具有干扰作用的蛋白质、药物及溶血等各种因素物质的功能,避免反复离心、洗脱开盖所引起的污染和核酸丢失;实现PCR提取的“一步法”和“一室化”操作。
发明内容
本发明是提供一种微量核酸释放剂,它采用一步法操作完成血清、血浆中 DNA 的快速释放,获得的核酸适用于荧光定量 PCR 等下游检测,具有操作简便、使用安全、成本低廉的优点,适合在临床基因检测中推广应用。
根据本发明的一个优选实施方案,试剂组分如下:微量核酸释放剂、促释放剂、封闭剂;微量核酸释放剂含有 5~500mM的 KCl、0. 5~20% Triton X-100 、1~100mg/ml的蛋白酶K、1~20mM的NaOH;促释放剂含有pH值5~8的DMSO、终浓度0.5~10%的BSA。
在优选的情况下,微量核酸释放剂配制方法为:在灭菌去离子水中加入KCl终浓度为5~500mM,终浓度0. 5~20% Triton X-100 、终浓度1~100mg/ml的蛋白酶K、终浓度1~20mM的NaOH;促释放剂:在灭菌去离子水中加入终浓度10%,pH值5~8的DMSO、终浓度0.5~10%的BSA;质量或体积百分比以提取试剂体积为计算基准;配制的试剂长期保存需-20℃冻存。
具体的,在一个优选的实施方案中,本发明所述方法包括如下步骤:
1)取微量核酸释放剂5μl加入等体积的血清或血浆样本,用移液器吹打混匀10次;
2)每管加入30μl的封闭剂;
3)盖好管盖置于普通PCR仪中反应,具体参数如下:第一步:95℃,10分钟;第二步:4℃,2分钟;
4)将经过裂解处理的PCR反应管从普通PCR仪中取出,小心打开管盖,每管加入2.5μl促释放剂并用移液器反复吹打混匀10次。
本发明的微量核酸释放剂采用蛋白变性剂,能快速破坏病毒颗粒外壳蛋白结构释放 DNA,与传统的热裂解方式结合同步进行,更有效的保证样本中核酸裂解效率,微量核酸释放剂在完全释放核酸的同时,还具有封闭样本中对PCR扩增具有干扰作用的蛋白质、药物及溶血等各种因素物质的功能,避免检测过程的假阴性;且微量核酸释放剂中含有抑制核酸酶的组分,对 PCR后续实验不会产生影响。
附图说明
图1为采用本发明的试剂提取的HBV血浆梯度稀释扩增结果。
图2为采用本发明的试剂提取的HBV血浆精密度扩增结果。
具体实施方式
参照一下实施例可以对本发明作进一步详细说明;但是,以下实施例仅仅是例证,本发明并不局限于这些实施例。
实施例1:用本发明方法对乙肝病毒核酸血浆样本(HBV-DNA)梯度稀释进行提取;1)取已知浓度(2×107IU/ml)HBV阳性样本,用基质血清依次十倍稀释至200IU/ml备用;2)准备相应数量200μl无核酸酶PCR反应管,每管加入5μl微量核酸释放剂,加入5μl待检HBV样本(2×107IU/ml~200IU/ml六个浓度),用移液器反复吹打10次;
3)加入30μl封闭剂;
4)盖好管盖置于普通PCR仪中反应,具体参数如下:第一步:95℃,10分钟;第二步:4℃,2分钟;
5)将经过裂解处理的PCR反应管从普通PCR仪中取出,小心打开管盖,每管加入2.5μl促释放剂并用移液器反复吹打混匀10次;
6)加入HBV反应液,设置HBV程序扩增。
实施例2:用本发明方法对乙肝病毒核酸血浆样本(HBV-DNA)精密度进行提取;
1)取已知浓度(2×107IU/ml)HBV阳性样本,用基质血清依次十倍稀释至2×103IU/ml备用;
2)准备相应数量200μl无核酸酶PCR反应管,每管加入5μl微量核酸释放剂,加入5μl待检HBV样本(2×105IU/ml和2×103IU/ml两个浓度,每个浓度样本8个复孔),用移液器反复吹打10次;
3)加入30μl封闭剂;
4)盖好管盖置于普通PCR仪中反应,具体参数如下:第一步:95℃,10分钟;第二步:4℃,2分钟;
5)将经过裂解处理的PCR反应管从普通PCR仪中取出,小心打开管盖,每管加入2.5μl促释放剂并用移液器反复吹打混匀10次;
6)加入HBV反应液,设置HBV程序扩增。
Claims (3)
1.一种利用微量核酸释放剂提取血清或血浆样本中病毒核酸(DNA)的方法。
2.该试剂含有核酸释放剂、促释放剂、封闭剂;核酸释放剂含有 KCl、Triton X-100 、蛋白酶K、NaOH;促释放剂含有DMSO、BSA;封闭剂中含有等体积的石蜡油和矿物油。
3.该技术采用微量核酸释放剂(MNRR),可在一管中进行DNA核酸提取;取5μl的微量核酸释放剂加入等体积血清或血浆样本,反复吹打混匀10次,加入30μl封闭剂,置于PCR仪94℃裂解10分钟,然后迅速降至4℃,小心打开管盖加入2.5μl促释放剂并混匀,所得的混合液可直接加PCR扩增试剂进行荧光定量检测。
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