CN104955821B - 肼基‑吲哚化合物和偶联物 - Google Patents

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Abstract

本公开提供了偶联物结构(例如，多肽偶联物)和用于产生这些偶联物的肼基‑吲哚化合物。本公开还提供了产生所述偶联物的方法，以及使用其的方法。

Description

肼基-吲哚化合物和偶联物
相关申请的交叉引用
本申请要求2012年11月16日提交的美国临时申请号61/727,603的权益，这个临时申请的公开内容以引用的方式并入本文中。
引言
蛋白质-小分子治疗性偶联物的领域已有很大进展，从而提供在未来几年中具有前景的许多临床上有益的药物。蛋白质偶联物治疗剂可以提供若干优点，这是由于例如特异性、功能多样性以及相对低的脱靶活性，从而引起更少的副作用。蛋白质的化学修饰可以通过促使其更有效、稳定或多模式而扩充这些优点。
许多标准化学转化通常用于在蛋白质上创建并操纵翻译后修饰。存在许多方法，其中一种方法能够选择性地修饰某些氨基酸的侧链。举例来说，羧酸侧链(天冬氨酸和谷氨酸)可以通过用水溶性碳化二亚胺试剂初始活化并且随后与胺反应来靶向。类似地，赖氨酸可以通过使用活化酯或异硫氰酸酯来靶向，并且半胱氨酸硫醇可以用马来酰亚胺和α-卤羰基来靶向。
形成化学上改变的蛋白质治疗剂或试剂的一个重大障碍是产生生物活性的同质形式的蛋白质。药物或可检测标记与多肽的偶联可能难以控制，从而得到在所连接的药物分子的数目和化学偶联的位置方面不同的偶联物的异质混合物。在一些情况下，可能需要使用合成有机化学的工具控制偶联的位点和/或偶联至多肽的药物或可检测标记以引导多肽上化学键的精确和选择性的形成。
发明概要
本公开提供了偶联物结构和用于产生这些偶联物的肼基-吲哚化合物。本公开还提供了产生所述偶联物的方法，以及使用其的方法。
本公开的实施方案包括一种偶联物，其包括式(I)的至少一个修饰的氨基酸残基：
其中
n为0或1；
R1选自氢、烷基、经取代的烷基、烯基、经取代的烯基、炔基、经取代的炔基、芳基、经取代的芳基、杂芳基、经取代的杂芳基、环烷基、经取代的环烷基、杂环基以及经取代的杂环基；
R2和R3各自独立地选自氢、烷基、经取代的烷基、烯基、经取代的烯基、炔基、经取代的炔基、烷氧基、经取代的烷氧基、氨基、经取代的氨基、羧基、羧基酯、酰基、酰氧基、酰基氨基、氨基酰基、烷基酰胺、经取代的烷基酰胺、磺酰基、硫代烷氧基、经取代的硫代烷氧基、芳基、经取代的芳基、杂芳基、经取代的杂芳基、环烷基、经取代的环烷基、杂环基以及经取代的杂环基；
X1、X2、X3以及X4各自独立地选自C、N、O以及S；
X5为C；
Y1、Y2、Y3、Y4以及Y5各自独立地选自氢、卤素、烷基、经取代的烷基、烯基、经取代的烯基、炔基、经取代的炔基、烷氧基、经取代的烷氧基、氨基、经取代的氨基、羧基、羧基酯、酰基、酰氧基、酰基氨基、氨基酰基、烷基酰胺、经取代的烷基酰胺、磺酰基、硫代烷氧基、经取代的硫代烷氧基、芳基、经取代的芳基、杂芳基、经取代的杂芳基、环烷基、经取代的环烷基、杂环基以及经取代的杂环基；
Q1为键结至X4或X5的键，其中如果Q1为键结至X4的键，那么Y4不存在，或如果Q1为键结至X5的键，那么Y5不存在；并且
L为任选的连接子，
其中W1和W2中的一者为多肽并且另一者为药物或可检测标记。
在一些实施方案中，Q1为键结至X4的键并且Y4不存在。
在一些实施方案中，Q1为键结至X5的键并且Y5不存在。
在一些实施方案中，n为1。
在一些实施方案中，R2和R3各自独立地选自烷基和经取代的烷基。
在一些实施方案中，R2和R3各自为甲基。
在一些实施方案中，X1、X2、X3以及X4各自为C。
在一些实施方案中，Y1、Y2以及Y3各自为H，并且Y4或Y5中的一者为H。
在一些实施方案中，L存在并且包括选自以下的基团：烷基、经取代的烷基、烯基、经取代的烯基、炔基、经取代的炔基、烷氧基、经取代的烷氧基、氨基、经取代的氨基、羧基、羧基酯、酰基氨基、烷基酰胺、经取代的烷基酰胺、芳基、经取代的芳基、杂芳基、经取代的杂芳基、环烷基、经取代的环烷基、杂环基以及经取代的杂环基。
在一些实施方案中，L存在并且包括聚合物。在一些实施方案中，聚合物为聚乙二醇。
在一些实施方案中，可检测标记包括荧光团。
在一些实施方案中，W1为药物或可检测标记，并且W2为多肽。
在一些实施方案中，W1为多肽，并且W2为药物或可检测标记。
在一些实施方案中，偶联物包括式(II)的至少一个修饰的氨基酸残基：
在一些实施方案中，偶联物包括式(IIa)的至少一个修饰的氨基酸残基：
在一些实施方案中，偶联物包括式(III)的至少一个修饰的氨基酸残基：
在一些实施方案中，偶联物包括式(IIIa)的至少一个修饰的氨基酸残基：
本公开的实施方案包括式(IV)化合物：
其中
Q2和Q3中的一者为-(CH2)nNR3NHR2并且另一者为Y4；
n为0或1；
R2和R3各自独立地选自氢、烷基、经取代的烷基、烯基、经取代的烯基、炔基、经取代的炔基、烷氧基、经取代的烷氧基、氨基、经取代的氨基、羧基、羧基酯、酰基、酰氧基、酰基氨基、氨基酰基、烷基酰胺、经取代的烷基酰胺、磺酰基、硫代烷氧基、经取代的硫代烷氧基、芳基、经取代的芳基、杂芳基、经取代的杂芳基、环烷基、经取代的环烷基、杂环基以及经取代的杂环基；
X1、X2、X3以及X4各自独立地选自C、N、O以及S；
Y1、Y2、Y3以及Y4各自独立地选自氢、卤素、烷基、经取代的烷基、烯基、经取代的烯基、炔基、经取代的炔基、烷氧基、经取代的烷氧基、氨基、经取代的氨基、羧基、羧基酯、酰基、酰氧基、酰基氨基、氨基酰基、烷基酰胺、经取代的烷基酰胺、磺酰基、硫代烷氧基、经取代的硫代烷氧基、芳基、经取代的芳基、杂芳基、经取代的杂芳基、环烷基、经取代的环烷基、杂环基以及经取代的杂环基；
L为任选的连接子；并且
W1选自药物、可检测标记以及多肽。
在一些实施方案中，Q2为-(CH2)nNR3NHR2并且Q3为Y4。
在一些实施方案中，Q3为-(CH2)nNR3NHR2并且Q2为Y4。
在一些实施方案中，n为1。
在一些实施方案中，R2和R3各自独立地选自烷基和经取代的烷基。
在一些实施方案中，R2和R3各自为甲基。
在一些实施方案中，X1、X2、X3以及X4各自为C。
在一些实施方案中，Y1、Y2、Y3以及Y4各自为H。
在一些实施方案中，L存在并且包括选自以下的基团：烷基、经取代的烷基、烯基、经取代的烯基、炔基、经取代的炔基、烷氧基、经取代的烷氧基、氨基、经取代的氨基、羧基、羧基酯、酰基氨基、烷基酰胺、经取代的烷基酰胺、芳基、经取代的芳基、杂芳基、经取代的杂芳基、环烷基、经取代的环烷基、杂环基以及经取代的杂环基。
在一些实施方案中，L存在并且包括聚合物。在一些实施方案中，聚合物为聚乙二醇。
在一些实施方案中，可检测标记包括荧光团。
在一些实施方案中，化合物为式(V)化合物：
在一些实施方案中，化合物为式(Va)化合物：
在一些实施方案中，化合物为式(VI)化合物：
在一些实施方案中，化合物为式(VIa)化合物：
本公开的实施方案包括一种产生偶联物的方法。这种方法包括在反应混合物中组合式(IV)化合物与包括反应基团的第二化合物，其中这种组合是在适合于促进这种化合物与第二化合物的反应基团之间的反应的反应条件下进行以形成偶联物。这种方法还包括从反应混合物中分离偶联物。
在一些实施方案中，W1为药物或可检测标记，并且第二化合物为多肽。
在一些实施方案中，W1为多肽，并且第二化合物为药物或可检测标记。
在一些实施方案中，反应基团包括反应性醛基或反应性酮基。
在一些实施方案中，反应混合物包括水。
在一些实施方案中，反应混合物的pH为7。
在一些实施方案中，反应条件为37℃的温度。
本公开的实施方案包括一种药物组合物，其包括式(I)的偶联物和药学上可接受的赋形剂。
本公开的实施方案包括一种将偶联物递送至受试者的方法。这种方法包括向受试者施用有效量的式(I)的偶联物。
本公开的实施方案包括一种治疗受试者的病状的方法。这种方法包括向患有病状的受试者施用治疗有效量的包括式(I)的偶联物的药物组合物，其中这种施用有效治疗受试者的病状。
附图简述
图1A和1B示出了根据本公开的实施方案，用于产生包括肼基-吲哚偶合部分的多肽偶联物的反应流程。
图2A示出了根据本公开的实施方案，用于合成官能化的可检测标记的反应流程。图2B示出了根据本公开的实施方案，官能化的可检测标记与抗体的偶联反应的示意图。图2C示出了根据本公开的实施方案，显示反应结果的SDS-PAGE凝胶的图像。
图3示出了根据本公开的实施方案，显示抗体-可检测标记偶联物经过6天的时段的稳定性的SDS-PAGE凝胶的图像。
图4示出了根据本公开的实施方案，偶联至HIPS-6PEG-美登素(Maytansine)的加醛标签的抗体的疏水相互作用柱(HIC)迹线。
图5示出了根据本公开的实施方案，模型胺化合物与苄氧基乙醛的缩合反应的动力学。图5A示出了实验中所用的一组胺的化学结构。图5B示出了在柠檬酸钠(pH 4.0-5.5)或磷酸钠(pH 6.0-7.5)缓冲液中转化成产物的百分比的图。反应含有50μM胺和苄氧基乙醛并且在室温下进行2小时，随后进行HPLC分析。
图6示出了根据本公开的实施方案，小分子动力学实验的HPLC迹线，其显示在pH6.0下2小时后化合物4(图6A)、化合物6(图6B)、化合物7(图6C)以及化合物8(图6D)与苄氧基乙醛的反应。在每个色谱图中标出作为内标物添加的苄氧基乙醛(°)和溴甲酚绿(*)。
图7示出了根据本公开的实施方案，用HIPS接合和其它常用醛生物偶联化学品对含醛蛋白质所作的荧光标记。图7A示出了HIPS接合试剂(化合物9)、酰肼试剂(化合物10)、皮克特-施彭格勒(Pictet-Spengler)接合试剂(化合物11)以及氨氧基试剂(化合物12)的结构。凝胶扫描示出了用试剂9-12对FGly-MBP(图7B)、FGly-α-HER2(图7C)以及N端转氨的Mb(图7D)所作的相对标记。在所有情况下，在37℃下用400μM荧光团将pH 6.0的缓冲蛋白质溶液处理2小时，随后通过SDS-PAGE分析。
图8示出了根据本公开的实施方案，MBP-AF488偶联物经过5天水解的图。在37℃下孵育含有10μg/mL由氮杂咔啉或肟连接的MBP-AF488偶联物的人血浆。通过ELISA分析每隔约12小时获取的等分试样。误差条代表六个重复样品的标准偏差。
定义
除非另有指示，否则以下术语具有以下含义。任何未定义的术语具有其在技术上公认的含义。
“烷基”指的是具有1至10个碳原子并且优选1至6个碳原子的单价饱和脂肪族烃基。举例来说，这个术语包括直链和支链烃基，诸如甲基(CH3-)、乙基(CH3CH2-)、正丙基(CH3CH2CH2-)、异丙基((CH3)2CH-)、正丁基(CH3CH2CH2CH2-)、异丁基((CH3)2CHCH2-)、仲丁基((CH3)(CH3CH2)CH-)、叔丁基((CH3)3C-)、正戊基(CH3CH2CH2CH2CH2-)以及新戊基((CH3)3CCH2-)。
术语“经取代的烷基”指的是如本文所定义的烷基，其中烷基链中的一个或多个碳原子已经任选地被诸如-O-、-N-、-S-、-S(O)n-(其中n为0至2)、-NR-(其中R为氢或烷基)的杂原子置换并且具有1至5个选自由以下组成的群组的取代基：烷氧基、经取代的烷氧基、环烷基、经取代的环烷基、环烯基、经取代的环烯基、酰基、酰基氨基、酰氧基、氨基、氨基酰基、氨基酰氧基、氧氨基酰基、叠氮基、氰基、卤素、羟基、氧代、硫酮基、羧基、羧基烷基、硫代芳氧基、硫杂芳氧基、硫杂环氧基、硫醇基、硫代烷氧基、经取代的硫代烷氧基、芳基、芳氧基、杂芳基、杂芳氧基、杂环基、杂环氧基、羟氨基、烷氧基氨基、硝基、-SO-烷基、-SO-芳基、-SO-杂芳基、-SO2-烷基、-SO2-芳基、-SO2-杂芳基以及-NRaRb，其中R'和R"可以是相同的或不同的并且选自氢、任选地经取代的烷基、环烷基、烯基、环烯基、炔基、芳基、杂芳基以及杂环。
“亚烷基”指的是优选地具有1至6个并且更优选地具有1至3个碳原子的的二价脂肪族烃基，其为直链或支链，并且任选地间杂有一个或多个选自以下的基团：-O-、-NR10-、-NR10C(O)-、-C(O)NR10-，等等。举例来说，这个术语包括亚甲基(-CH2-)、亚乙基(-CH2CH2-)、亚正丙基(-CH2CH2CH2-)、亚异丙基(-CH2CH(CH3)-)、(-C(CH3)2CH2CH2-)、(-C(CH3)2CH2C(O)-)、(-C(CH3)2CH2C(O)NH-)、(-CH(CH3)CH2-)，等等。
“经取代的亚烷基”指的是1至3个氢被如下文在“经取代”的定义中关于碳所描述的取代基置换的亚烷基。
术语“烷烃”指的是如本文所定义的烷基和亚烷基。
术语“烷基氨基烷基”、“烷基氨基烯基”以及“烷基氨基炔基”指的是基团R'NHR"-，其中R'为如本文所定义的烷基并且R"为如本文所定义的亚烷基、亚烯基或亚炔基。
术语“烷芳基”或“芳烷基”指的是基团-亚烷基-芳基和-经取代的亚烷基-芳基，其中亚烷基、经取代的亚烷基、以及芳基定义于本文中。
“烷氧基”指的是基团-O-烷基，其中烷基如本文所定义。举例来说，烷氧基包括甲氧基、乙氧基、正丙氧基、异丙氧基、正丁氧基、叔丁氧基、仲丁氧基、正戊氧基，等等。术语“烷氧基”也指的是基团烯基-O-、环烷基-O-、环烯基-O-以及炔基-O-，其中烯基、环烷基、环烯基以及炔基如本文所定义。
术语“经取代的烷氧基”指的是基团经取代的烷基-O-、经取代的烯基-O-、经取代的环烷基-O-、经取代的环烯基-O-以及经取代的炔基-O-，其中经取代的烷基、经取代的烯基、经取代的环烷基、经取代的环烯基以及经取代的炔基如本文所定义。
术语“烷氧基氨基”指的是基团-NH-烷氧基，其中烷氧基定义于本文中。
术语“卤烷氧基”指的是基团烷基-O-，其中烷基上的一个或多个氢原子已经被卤基取代，并且举例来说，包括诸如三氟甲氧基等基团。
术语“卤烷基”指的是如上文所描述的经取代的烷基，其中烷基上的一个或多个氢原子已经被卤基取代。所述基团的实例非限制性地包括氟烷基，诸如三氟甲基、二氟甲基、三氟乙基，等等。
术语“烷基烷氧基”指的是基团-亚烷基-O-烷基、亚烷基-O-经取代的烷基、经取代的亚烷基-O-烷基以及经取代的亚烷基-O-经取代的烷基，其中烷基、经取代的烷基、亚烷基以及经取代的亚烷基如本文所定义。
术语“烷基硫代烷氧基”指的是基团-亚烷基-S-烷基、亚烷基-S-经取代的烷基、经取代的亚烷基-S-烷基以及经取代的亚烷基-S-经取代的烷基，其中烷基、经取代的烷基、亚烷基以及经取代的亚烷基如本文所定义。
“烯基”指的是具有2至6个碳原子并且优选2至4个碳原子并且具有至少1个并且优选1至2个双键不饱和位点的直链或支链烃基。举例来说，这个术语包括联乙烯基、烯丙基以及丁-3-烯-1-基。这个术语包括顺式和反式同分异构体或这些同分异构体的混合物。
术语“经取代的烯基”指的是具有1至5个取代基或1至3个取代基的如本文所定义的烯基，所述取代基选自烷氧基、经取代的烷氧基、环烷基、经取代的环烷基、环烯基、经取代的环烯基、酰基、酰基氨基、酰氧基、氨基、经取代的氨基、氨基酰基、氨基酰氧基、氧氨基酰基、叠氮基、氰基、卤素、羟基、氧代、硫酮基、羧基、羧基烷基、硫代芳氧基、硫杂芳氧基、硫杂环氧基、硫醇基、硫代烷氧基、经取代的硫代烷氧基、芳基、芳氧基、杂芳基、杂芳氧基、杂环基、杂环氧基、羟氨基、烷氧基氨基、硝基、-SO-烷基、-SO-经取代的烷基、-SO-芳基、-SO-杂芳基、-SO2-烷基、-SO2-经取代的烷基、-SO2-芳基以及-SO2-杂芳基。
“炔基”指的是具有2至6个碳原子并且优选2至3个碳原子并且具有至少1个并且优选1至2个三键不饱和位点的直链或支链单价烃基。所述炔基的实例包括乙炔基(-C≡CH)和炔丙基(-CH2C≡CH)。
术语“经取代的炔基”指的是具有1至5个取代基或1至3个取代基的如本文所定义的炔基，所述取代基选自烷氧基、经取代的烷氧基、环烷基、经取代的环烷基、环烯基、经取代的环烯基、酰基、酰基氨基、酰氧基、氨基、经取代的氨基、氨基酰基、氨基酰氧基、氧氨基酰基、叠氮基、氰基、卤素、羟基、氧代、硫酮基、羧基、羧基烷基、硫代芳氧基、硫杂芳氧基、硫杂环氧基、硫醇基、硫代烷氧基、经取代的硫代烷氧基、芳基、芳氧基、杂芳基、杂芳氧基、杂环基、杂环氧基、羟氨基、烷氧基氨基、硝基、-SO-烷基、-SO-经取代的烷基、-SO-芳基、-SO-杂芳基、-SO2-烷基、-SO2-经取代的烷基、-SO2-芳基以及-SO2-杂芳基。
“炔氧基”指的是基团-O-炔基，其中炔基如本文所定义。举例来说，炔氧基包括乙炔氧基、丙炔氧基，等等。
“酰基”指的是基团H-C(O)-、烷基-C(O)-、经取代的烷基-C(O)-、烯基-C(O)-、经取代的烯基-C(O)-、炔基-C(O)-、经取代的炔基-C(O)-、环烷基-C(O)-、经取代的环烷基-C(O)-、环烯基-C(O)-、经取代的环烯基-C(O)-、芳基-C(O)-、经取代的芳基-C(O)-、杂芳基-C(O)-、经取代的杂芳基-C(O)-、杂环基-C(O)-以及经取代的杂环基-C(O)-，其中烷基、经取代的烷基、烯基、经取代的烯基、炔基、经取代的炔基、环烷基、经取代的环烷基、环烯基、经取代的环烯基、芳基、经取代的芳基、杂芳基、经取代的杂芳基、杂环以及经取代的杂环如本文所定义。举例来说，酰基包括“乙酰基”基团CH3C(O)-。
“酰基氨基”指的是基团-NR20C(O)烷基、-NR20C(O)经取代的烷基、NR20C(O)环烷基、-NR20C(O)经取代的环烷基、-NR20C(O)环烯基、-NR20C(O)经取代的环烯基、-NR20C(O)烯基、-NR20C(O)经取代的烯基、-NR20C(O)炔基、-NR20C(O)经取代的炔基、-NR20C(O)芳基、-NR20C(O)经取代的芳基、-NR20C(O)杂芳基、-NR20C(O)经取代的杂芳基、-NR20C(O)杂环以及-NR20C(O)经取代的杂环，其中R20为氢或烷基并且其中烷基、经取代的烷基、烯基、经取代的烯基、炔基、经取代的炔基、环烷基、经取代的环烷基、环烯基、经取代的环烯基、芳基、经取代的芳基、杂芳基、经取代的杂芳基、杂环以及经取代的杂环如本文所定义。
“氨基羰基”或术语“氨基酰基”指的是基团-C(O)NR21R22，其中R21和R22独立地选自由以下组成的群组：氢、烷基、经取代的烷基、烯基、经取代的烯基、炔基、经取代的炔基、芳基、经取代的芳基、环烷基、经取代的环烷基、环烯基、经取代的环烯基、杂芳基、经取代的杂芳基、杂环以及经取代的杂环并且其中R21和R22任选地与其所结合的氮连接在一起形成杂环或经取代的杂环基，并且其中烷基、经取代的烷基、烯基、经取代的烯基、炔基、经取代的炔基、环烷基、经取代的环烷基、环烯基、经取代的环烯基、芳基、经取代的芳基、杂芳基、经取代的杂芳基、杂环以及经取代的杂环如本文所定义。
“氨基羰基氨基”指的是基团-NR21C(O)NR22R23，其中R21、R22以及R23独立地选自氢、烷基、芳基或环烷基，或其中两个R基团连接形成杂环基。
术语“烷氧基羰基氨基”指的是基团-NRC(O)OR，其中每个R独立地为氢、烷基、经取代的烷基、芳基、杂芳基或杂环基，其中烷基、经取代的烷基、芳基、杂芳基以及杂环基如本文所定义。
术语“酰氧基”指的是基团烷基-C(O)O-、经取代的烷基-C(O)O-、环烷基-C(O)O-、经取代的环烷基-C(O)O-、芳基-C(O)O-、杂芳基-C(O)O-以及杂环基-C(O)O-，其中烷基、经取代的烷基、环烷基、经取代的环烷基、芳基、杂芳基以及杂环基如本文所定义。
“氨基磺酰基”指的是基团-SO2NR21R22，其中R21和R22独立地选自由以下组成的群组：氢、烷基、经取代的烷基、烯基、经取代的烯基、炔基、经取代的炔基、芳基、经取代的芳基、环烷基、经取代的环烷基、环烯基、经取代的环烯基、杂芳基、经取代的杂芳基、杂环、经取代的杂环并且其中R21和R22任选地与其所结合的氮连接在一起形成杂环或经取代的杂环基，并且烷基、经取代的烷基、烯基、经取代的烯基、炔基、经取代的炔基、环烷基、经取代的环烷基、环烯基、经取代的环烯基、芳基、经取代的芳基、杂芳基、经取代的杂芳基、杂环以及经取代的杂环如本文所定义。
“磺酰基氨基”指的是基团-NR21SO2R22，其中R21和R22独立地选自由以下组成的群组：氢、烷基、经取代的烷基、烯基、经取代的烯基、炔基、经取代的炔基、芳基、经取代的芳基、环烷基、经取代的环烷基、环烯基、经取代的环烯基、杂芳基、经取代的杂芳基、杂环以及经取代的杂环并且其中R21和R22任选地与其所结合的原子连接在一起形成杂环或经取代的杂环基，并且其中烷基、经取代的烷基、烯基、经取代的烯基、炔基、经取代的炔基、环烷基、经取代的环烷基、环烯基、经取代的环烯基、芳基、经取代的芳基、杂芳基、经取代的杂芳基、杂环以及经取代的杂环如本文所定义。
“芳基”或“Ar”指的是具有单环(诸如存在于苯基中)或具有多个缩合环的环系统(所述芳香族环系统的实例包括萘基、蒽基以及茚满基)的6至18个碳原子的单价芳香族碳环基，这些缩合环可能是或可能不是芳香族，条件是连接点是经由芳香族环的原子。举例来说，这个术语包括苯基和萘基。除非另外受芳基取代基的定义所限制，否则所述芳基可以任选地被1至5个取代基或1至3个取代基取代，所述取代基选自酰氧基、羟基、硫醇基、酰基、烷基、烷氧基、烯基、炔基、环烷基、环烯基、经取代的烷基、经取代的烷氧基、经取代的烯基、经取代的炔基、经取代的环烷基、经取代的环烯基、氨基、经取代的氨基、氨基酰基、酰基氨基、烷芳基、芳基、芳氧基、叠氮基、羧基、羧基烷基、氰基、卤素、硝基、杂芳基、杂芳氧基、杂环基、杂环氧基、氨基酰氧基、氧酰基氨基、硫代烷氧基、经取代的硫代烷氧基、硫代芳氧基、硫杂芳氧基、-SO-烷基、-SO-经取代的烷基、-SO-芳基、-SO-杂芳基、-SO2-烷基、-SO2-经取代的烷基、-SO2-芳基、-SO2-杂芳基以及三卤甲基。
“芳氧基”指的是基团-O-芳基，其中芳基如本文所定义，举例来说，包括苯氧基、萘氧基等，包括也如本文所定义的任选地经取代的芳基。
“氨基”指的是基团-NH2。
术语“经取代的氨基”指的是基团-NRR，其中每个R独立地选自由以下组成的群组：氢、烷基、经取代的烷基、环烷基、经取代的环烷基、烯基、经取代的烯基、环烯基、经取代的环烯基、炔基、经取代的炔基、芳基、杂芳基以及杂环基，条件是至少一个R不为氢。
术语“叠氮基”指的是基团-N3。
“羧基(carboxyl/carboxy)”或“羧酸盐”指的是-CO2H或其盐。
“羧基酯(carboxyl ester/carboxy ester)”或术语“羧基烷基(carboxyalkyl/carboxylalkyl)”指的是基团-C(O)O-烷基、-C(O)O-经取代的烷基、-C(O)O-烯基、-C(O)O-经取代的烯基、-C(O)O-炔基、-C(O)O-经取代的炔基、-C(O)O-芳基、-C(O)O-经取代的芳基、-C(O)O-环烷基、-C(O)O-经取代的环烷基、-C(O)O-环烯基、-C(O)O-经取代的环烯基、-C(O)O-杂芳基、-C(O)O-经取代的杂芳基、-C(O)O-杂环以及-C(O)O-经取代的杂环，其中烷基、经取代的烷基、烯基、经取代的烯基、炔基、经取代的炔基、环烷基、经取代的环烷基、环烯基、经取代的环烯基、芳基、经取代的芳基、杂芳基、经取代的杂芳基、杂环以及经取代的杂环如本文所定义。
“(羧基酯)氧基”或“碳酸酯基”指的是基团-O-C(O)O-烷基、-O-C(O)O-经取代的烷基、-O-C(O)O-烯基、-O-C(O)O-经取代的烯基、-O-C(O)O-炔基、-O-C(O)O-经取代的炔基、-O-C(O)O-芳基、-O-C(O)O-经取代的芳基、-O-C(O)O-环烷基、-O-C(O)O-经取代的环烷基、-O-C(O)O-环烯基、-O-C(O)O-经取代的环烯基、-O-C(O)O-杂芳基、-O-C(O)O-经取代的杂芳基、-O-C(O)O-杂环以及-O-C(O)O-经取代的杂环，其中烷基、经取代的烷基、烯基、经取代的烯基、炔基、经取代的炔基、环烷基、经取代的环烷基、环烯基、经取代的环烯基、芳基、经取代的芳基、杂芳基、经取代的杂芳基、杂环以及经取代的杂环如本文所定义。
“氰基”或“腈”指的是基团-CN。
“环烷基”指的是具有单环或包括稠合、桥连以及螺式环系统的多环的3至10个碳原子的环状烷基。举例来说，适合的环烷基的实例包括金刚烷基、环丙基、环丁基、环戊基、环辛基，等等。举例来说，所述环烷基包括单环结构，诸如环丙基、环丁基、环戊基、环辛基，等等；或多环结构，诸如金刚烷基，等等。
术语“经取代的环烷基”指的是具有1至5个取代基或1至3个取代基的环烷基，所述取代基选自烷基、经取代的烷基、烷氧基、经取代的烷氧基、环烷基、经取代的环烷基、环烯基、经取代的环烯基、酰基、酰基氨基、酰氧基、氨基、经取代的氨基、氨基酰基、氨基酰氧基、氧氨基酰基、叠氮基、氰基、卤素、羟基、氧代、硫酮基、羧基、羧基烷基、硫代芳氧基、硫杂芳氧基、硫杂环氧基、硫醇基、硫代烷氧基、经取代的硫代烷氧基、芳基、芳氧基、杂芳基、杂芳氧基、杂环基、杂环氧基、羟氨基、烷氧基氨基、硝基、-SO-烷基、-SO-经取代的烷基、-SO-芳基、-SO-杂芳基、-SO2-烷基、-SO2-经取代的烷基、-SO2-芳基以及-SO2-杂芳基。
“环烯基”指的是具有单环或多环并且具有至少一个双键并且优选1至2个双键的3至10个碳原子的非芳香族环状烷基。
术语“经取代的环烯基”指的是具有1至5个取代基或1至3个取代基的环烯基，所述取代基选自烷氧基、经取代的烷氧基、环烷基、经取代的环烷基、环烯基、经取代的环烯基、酰基、酰基氨基、酰氧基、氨基、经取代的氨基、氨基酰基、氨基酰氧基、氧氨基酰基、叠氮基、氰基、卤素、羟基、酮基、硫酮基、羧基、羧基烷基、硫代芳氧基、硫杂芳氧基、硫杂环氧基、硫醇基、硫代烷氧基、经取代的硫代烷氧基、芳基、芳氧基、杂芳基、杂芳氧基、杂环基、杂环氧基、羟氨基、烷氧基氨基、硝基、-SO-烷基、-SO-经取代的烷基、-SO-芳基、-SO-杂芳基、-SO2-烷基、-SO2-经取代的烷基、-SO2-芳基以及-SO2-杂芳基。
“环炔基”指的是具有单环或多环并且具有至少一个三键的5至10个碳原子的非芳香族环烷基。
“环烷氧基”指的是-O-环烷基。
“环烯氧基”指的是-O-环烯基。
“卤基”或“卤素”指的是氟、氯、溴以及碘。
“羟基(hydroxy/hydroxyl)”指的是基团-OH。
“杂芳基”指的是在环内具有1至15个碳原子(诸如1至10个碳原子)和1至10个选自由氧、氮以及硫组成的群组的杂原子的芳香族基团。所述杂芳基可以具有单环(诸如吡啶基、咪唑基、呋喃基)或环系统中的多个缩合环(例如，在诸如吲哚嗪基、喹啉基、苯并呋喃、苯并咪唑基或苯并噻吩基的基团中)，其中环系统内的至少一个环是芳香族并且环系统内的至少一个环是芳香族，条件是连接点是经由芳香族环的原子。在某些实施方案中，杂芳基的氮和/或硫环原子任选地被氧化以提供N-氧化物(N→O)、亚磺酰基或磺酰基部分。举例来说，这个术语包括吡啶基、吡咯基、吲哚基、苯硫基以及呋喃基。除非另外受杂芳基取代基的定义所限制，否则所述杂芳基可以任选地被1至5个取代基或1至3个取代基取代，所述取代基选自酰氧基、羟基、硫醇基、酰基、烷基、烷氧基、烯基、炔基、环烷基、环烯基、经取代的烷基、经取代的烷氧基、经取代的烯基、经取代的炔基、经取代的环烷基、经取代的环烯基、氨基、经取代的氨基、氨基酰基、酰基氨基、烷芳基、芳基、芳氧基、叠氮基、羧基、羧基烷基、氰基、卤素、硝基、杂芳基、杂芳氧基、杂环基、杂环氧基、氨基酰氧基、氧酰基氨基、硫代烷氧基、经取代的硫代烷氧基、硫代芳氧基、硫杂芳氧基、-SO-烷基、-SO-经取代的烷基、-SO-芳基、-SO-杂芳基、-SO2-烷基、-SO2-经取代的烷基、-SO2-芳基以及-SO2-杂芳基，以及三卤甲基。
术语“杂芳烷基”指的是基团-亚烷基-杂芳基，其中亚烷基和杂芳基定义于本文中。举例来说，这个术语包括吡啶基甲基、吡啶基乙基、吲哚基甲基，等等。
“杂芳氧基”指的是-O-杂芳基。
“杂环(heterocycle/heterocyclic)”、“杂环烷基”以及“杂环基”指的是具有单环或多个缩合环，包括稠合、桥连以及螺式环系统并且具有3至20个环原子，包括1至10个杂原子的饱和或不饱和基团。这些环原子选自由氮、硫或氧组成的群组，其中在稠合环系统中，一个或多个环可以为环烷基、芳基或杂芳基，条件是连接点是经由非芳香族环。在某些实施方案中，杂环基的氮和/或硫原子任选地被氧化以提供N-氧化物、-S(O)-或-SO2-部分。
杂环和杂芳基的实例包括(但不限于)氮杂环丁烷、吡咯、咪唑、吡唑、吡啶、吡嗪、嘧啶、哒嗪、吲哚嗪、异吲哚、吲哚、二氢吲哚、吲唑、嘌呤、喹嗪、异喹啉、喹啉、酞嗪、萘基吡啶、喹喔啉、喹唑啉、噌啉、蝶啶、咔唑、咔啉、菲啶、吖啶、菲咯啉、异噻唑、吩嗪、异噁唑、吩噁嗪、吩噻嗪、咪唑烷、咪唑啉、哌啶、哌嗪、吲哚啉、邻苯二甲酰亚胺、1,2,3,4-四氢异喹啉、4,5,6,7-四氢苯并[b]噻吩、噻唑、噻唑烷、噻吩、苯并[b]噻吩、吗啉基、硫吗啉基(也被称作噻吗啉基)、1,1-二氧代硫吗啉基、哌啶基、吡咯烷、四氢呋喃基，等等。
除非另外受杂环取代基的定义所限制，否则所述杂环基可以任选地被1至5个或1至3个取代基取代，所述取代基选自烷氧基、经取代的烷氧基、环烷基、经取代的环烷基、环烯基、经取代的环烯基、酰基、酰基氨基、酰氧基、氨基、经取代的氨基、氨基酰基、氨基酰氧基、氧氨基酰基、叠氮基、氰基、卤素、羟基、氧代、硫酮基、羧基、羧基烷基、硫代芳氧基、硫杂芳氧基、硫杂环氧基、硫醇基、硫代烷氧基、经取代的硫代烷氧基、芳基、芳氧基、杂芳基、杂芳氧基、杂环基、杂环氧基、羟氨基、烷氧基氨基、硝基、-SO-烷基、-SO-经取代的烷基、-SO-芳基、-SO-杂芳基、-SO2-烷基、-SO2-经取代的烷基、-SO2-芳基、-SO2-杂芳基以及稠合杂环。
“杂环氧基”指的是基团-O-杂环基。
术语“杂环硫基”指的是基团杂环-S-。
术语“亚杂环基”指的是由如本文所定义的杂环形成的双自由基基团。
术语“羟氨基”指的是基团-NHOH。
“硝基”指的是基团-NO2。
“氧代”指的是原子(＝O)。
“磺酰基”指的是基团SO2-烷基、SO2-经取代的烷基、SO2-烯基、SO2-经取代的烯基、SO2-环烷基、SO2-经取代的环烷基、SO2-环烯基、SO2-经取代的环烯基、SO2-芳基、SO2-经取代的芳基、SO2-杂芳基、SO2-经取代的杂芳基、SO2-杂环以及SO2-经取代的杂环，其中烷基、经取代的烷基、烯基、经取代的烯基、炔基、经取代的炔基、环烷基、经取代的环烷基、环烯基、经取代的环烯基、芳基、经取代的芳基、杂芳基、经取代的杂芳基、杂环以及经取代的杂环如本文所定义。举例来说，磺酰基包括甲基-SO2-、苯基-SO2-以及4-甲基苯基-SO2-。
“磺酰氧基”指的是基团-OSO2-烷基、OSO2-经取代的烷基、OSO2-烯基、OSO2-经取代的烯基、OSO2-环烷基、OSO2-经取代的环烷基、OSO2-环烯基、OSO2-经取代的环烯基、OSO2-芳基、OSO2-经取代的芳基、OSO2-杂芳基、OSO2-经取代的杂芳基、OSO2-杂环以及OSO2经取代的杂环，其中烷基、经取代的烷基、烯基、经取代的烯基、炔基、经取代的炔基、环烷基、经取代的环烷基、环烯基、经取代的环烯基、芳基、经取代的芳基、杂芳基、经取代的杂芳基、杂环以及经取代的杂环如本文所定义。
术语“氨基羰氧基”指的是基团-OC(O)NRR，其中每个R独立地为氢、烷基、经取代的烷基、芳基、杂芳基或杂环，其中烷基、经取代的烷基、芳基、杂芳基以及杂环如本文所定义。
“硫醇基”指的是基团-SH。
“硫代”或术语“硫酮基”指的是原子(＝S)。
“烷硫基”或术语“硫代烷氧基”指的是基团-S-烷基，其中烷基如本文所定义。在某些实施方案中，硫可以被氧化成-S(O)-。亚砜可以作为一个或多个立体异构体存在。
术语“经取代的硫代烷氧基”指的是基团-S-经取代的烷基。
术语“硫代芳氧基”指的是基团芳基-S-，其中芳基如本文所定义，包括本文也定义的任选地经取代的芳基。
术语“硫杂芳氧基”指的是基团杂芳基-S-，其中杂芳基如本文所定义，包括也如本文所定义的任选地经取代的芳基。
术语“硫杂环氧基”指的是基团杂环基-S-，其中杂环基如本文所定义，包括也如本文所定义的任选地经取代的杂环基。
除了本文中的公开内容之外，术语“经取代”当用于修饰指定基团时，也可以意味着指定基团的一个或多个氢原子各自彼此独立地被如下文所定义的相同或不同取代基置换。
除了关于本文中的个别术语所公开的基团之外，除非另有规定，否则用于取代指定基团中的饱和碳原子上的一个或多个氢(单个碳上的任何两个氢可以被＝O、＝NR70、＝N-OR70、＝N2或＝S置换)的取代基为-R60、卤基、＝O、-OR70、-SR70、-NR80R80、三卤甲基、-CN、-OCN、-SCN、-NO、-NO2、＝N2、-N3、-SO2R70、-SO2O-M+、-SO2OR70、-OSO2R70、-OSO2O-M+、-OSO2OR70、-P(O)(O-)2(M+)2、-P(O)(OR70)O-M+、-P(O)(OR70)2、-C(O)R70、-C(S)R70、-C(NR70)R70、-C(O)O-M+、-C(O)OR70、-C(S)OR70、-C(O)NR80R80、-C(NR70)NR80R80、-OC(O)R70、-OC(S)R70、-OC(O)O-M+、-OC(O)OR70、-OC(S)OR70、-NR70C(O)R70、-NR70C(S)R70、-NR70CO2 -M+、-NR70CO2R70、-NR70C(S)OR70、-NR70C(O)NR80R80、-NR70C(NR70)R70以及-NR70C(NR70)NR80R80，其中R60选自由以下组成的群组：任选地经取代的烷基、环烷基、杂烷基、杂环烷基烷基、环烷基烷基、芳基、芳基烷基、杂芳基以及杂芳基烷基，每个R70独立地为氢或R60；每个R80独立地为R70，或者，两个R80’连同其所键结的氮原子一起形成5元、6元或7元杂环烷基，所述杂环烷基可以任选地包括1至4个相同或不同的选自由O、N以及S组成的群组的额外杂原子，其中N可以具有-H或C1-C3烷基取代；并且每个M+为具有净的单正电荷的反离子。每个M+可以独立地为例如碱金属离子，诸如K+、Na+、Li+；铵离子，诸如+N(R60)4；或碱土金属离子，诸如[Ca2+]0.5、[Mg2+]0.5或[Ba2+]0.5(“下标0.5意味着所述二价碱土金属离子的一个反离子可以是本发明的化合物的电离形式并且另一个是诸如氯离子的典型反离子，或本文所公开的两个电离化合物可以充当所述二价碱土金属离子的反离子，或本发明的双电离化合物可以充当所述二价碱土金属离子的反离子)。作为特定实例，-NR80R80意图包括-NH2、-NH-烷基、N-吡咯烷基、N-哌嗪基、4N-甲基-哌嗪-1-基以及N-吗啉基。
除了本文中的公开内容之外，除非另有规定，否则“经取代”的烯烃、炔烃、芳基以及杂芳基中的不饱和碳原子上的氢的取代基为-R60、卤基、-O-M+、-OR70、-SR70、-S-M+、-NR80R80、三卤甲基、-CF3、-CN、-OCN、-SCN、-NO、-NO2、-N3、-SO2R70、-SO3 -M+、-SO3R70、-OSO2R70、-OSO3 -M+、-OSO3R70、-PO3 -2(M+)2、-P(O)(OR70)O-M+、-P(O)(OR70)2、-C(O)R70、-C(S)R70、-C(NR70)R70、-CO2 -M+、-CO2R70、-C(S)OR70、-C(O)NR80R80、-C(NR70)NR80R80、-OC(O)R70、-OC(S)R70、-OCO2 -M+、-OCO2R70、-OC(S)OR70、-NR70C(O)R70、-NR70C(S)R70、-NR70CO2 -M+、-NR70CO2R70、-NR70C(S)OR70、-NR70C(O)NR80R80、-NR70C(NR70)R70以及-NR70C(NR70)NR80R80，其中R60、R70、R80以及M+如先前所定义，条件是在经取代的烯烃或炔烃的情况下，取代基不为-O-M+、-OR70、-SR70或-S-M+。
除了关于本文中的个别术语所公开的基团之外，除非另有规定，否则“经取代”的杂烷基和环杂烷基中的氮原子上的氢的取代基为-R60、-O-M+、-OR70、-SR70、-S-M+、-NR80R80、三卤甲基、-CF3、-CN、-NO、-NO2、-S(O)2R70、-S(O)2O-M+、-S(O)2OR70、-OS(O)2R70、-OS(O)2O-M+、-OS(O)2OR70、-P(O)(O-)2(M+)2、-P(O)(OR70)O-M+、-P(O)(OR70)(OR70)、-C(O)R70、-C(S)R70、-C(NR70)R70、-C(O)OR70、-C(S)OR70、-C(O)NR80R80、-C(NR70)NR80R80、-OC(O)R70、-OC(S)R70、-OC(O)OR70、-OC(S)OR70、-NR70C(O)R70、-NR70C(S)R70、-NR70C(O)OR70、-NR70C(S)OR70、-NR70C(O)NR80R80、-NR70C(NR70)R70以及-NR70C(NR70)NR80R80，其中R60、R70、R80以及M+如先前所定义。
除了本文中的公开内容之外，在某个实施方案中，被取代的基团具有1个、2个、3个或4个取代基，1个、2个或3个取代基，1个或2个取代基，或1个取代基。
应了解，在上文所定义的所有经取代的基团中，通过定义本身具有其它取代基的取代基而得到的聚合物(例如，经取代的芳基具有经取代的芳基作为取代基，这个取代基本身被经取代的芳基取代，而这个经取代的芳基进一步被经取代的芳基取代，等等)不意图包括于本文中。在所述情况下，所述取代基的最大数目是三个。举例来说，本文中特定涵盖的经取代的芳基的系列取代限于经取代的芳基-(经取代的芳基)-经取代的芳基。
除非另有指示，否则本文中未明确定义的取代基的命名是通过命名官能团的末端部分，接下来命名接近连接点的相邻官能团来达成。举例来说，取代基“芳基烷氧基羰基”指的是基团(芳基)-(烷基)-O-C(O)-。
关于本文所公开的含有一个或多个取代基的任何基团，应了解，当然，所述基团不含空间上不可实现和/或合成上不可行的任何取代或取代模式。另外，主题化合物包括由这些化合物的取代而产生的所有立体化学同分异构体。
术语“药学上可接受的盐”意味着对于施用于患者，诸如哺乳动物可接受的盐(具有对于给定的给药方案可接受的哺乳动物安全性的与反离子形成的盐)。所述盐可以来源于药学上可接受的无机或有机碱并且来源于药学上可接受的无机或有机酸。“药学上可接受的盐”指的是化合物的药学上可接受的盐，这些盐来源于本领域中熟知的多种有机和无机反离子，并且仅举例来说，包括钠、钾、钙、镁、铵、四烷基铵，等等；并且当分子含有碱性官能团时，包括有机或无机酸的盐，诸如盐酸盐、氢溴酸盐、甲酸盐、酒石酸盐、苯磺酸盐、甲磺酸盐、乙酸盐、马来酸盐、草酸盐，等等。
术语“其盐”意味着当酸的质子被诸如金属阳离子或有机阳离子等阳离子置换时所形成的化合物。在适用情况下，盐是药学上可接受的盐，不过这对于不意图施用于患者的中间化合物的盐不是必需的。举例来说，本发明化合物的盐包括那些盐，其中化合物被无机或有机酸质子化以形成阳离子，其中无机或有机酸的共轭碱作为盐的阴离子组分。
“溶剂化物”指的是通过溶剂分子与溶质的分子或离子组合而形成的复合物。溶剂可以为有机化合物、无机化合物，或两者的混合物。溶剂的一些实例包括(但不限于)甲醇、N,N-二甲基甲酰胺、四氢呋喃、二甲亚砜以及水。当溶剂为水时，所形成的溶剂化物为水合物。
“立体异构体”指的是在空间中具有相同的原子连接但不同的原子排列的化合物。立体异构体包括顺-反同分异构体、E和Z同分异构体、对映体以及非对映体。
“互变异构体”指的是仅在原子的电子键结和/或质子的位置方面不同的分子的变换形式，诸如烯醇-酮和亚胺-烯胺互变异构体；或含有-N＝C(H)-NH-环原子排列的杂芳基的互变异构形式，诸如吡唑、咪唑、苯并咪唑、三唑以及四唑。本领域的一般技术人员将认识到其它互变异构环原子排列是可能的。
应了解，术语“或其盐或溶剂化物或立体异构体”意图包括盐、溶剂化物以及立体异构体的所有编排，诸如主题化合物的立体异构体的药学上可接受的盐的溶剂化物。
“药学有效量”和“治疗有效量”指的是足以治疗指定的病症或疾病或其一种或多种症状和/或预防疾病或病症出现的化合物的量。关于致瘤性增生性病症，药学或治疗有效量包括足以尤其引起肿瘤缩小或降低肿瘤的生长速率的量。
“患者”指的是人类和非人类受试者，尤其哺乳动物受试者。
如本文所用的术语“治疗(treat/treatment)”意味着对患者，诸如哺乳动物(特别是人类)的疾病或医学病状的治疗，包括：(a)预防疾病或医学病状出现，诸如对受试者的预防性治疗；(b)改善疾病或医学病状，诸如消除患者的疾病或医学病状或引起患者的疾病或医学病状消退；(c)抑制疾病或医学病状，例如通过减缓或阻遏患者的疾病或医学病状发展；或(d)减轻患者的疾病或医学病状的症状。
术语“多肽”、“肽”以及“蛋白质”在本文中可互换使用以指代任何长度的氨基酸的聚合形式。除非另有特别指示，否则“多肽”、“肽”以及“蛋白质”可以包括遗传编码和非编码的氨基酸、化学或生物化学修饰或衍生的氨基酸，以及具有修饰的肽骨架的多肽。这个术语包括融合蛋白质，包括(但不限于)具有异源氨基酸序列的融合蛋白质、具有异源和同源前导序列的融合体、含有至少一个N端甲硫氨酸残基(例如，以有助于在重组细菌宿主细胞中产生)的蛋白质；加免疫标签的蛋白质；等等。
“原生氨基酸序列”或“亲本氨基酸序列”在本文中可互换使用以指代在经过修饰以包括修饰的氨基酸残基之前的多肽的氨基酸序列。
术语“氨基酸类似物”、“非天然氨基酸”等可以互换使用，并且包括在结构和/或整体形状方面类似于天然存在的蛋白质中通常发现的一个或多个氨基酸(例如，Ala或A、Cys或C、Asp或D、Glu或E、Phe或F、Gly或G、His或H、Ile或I、Lys或K、Leu或L、Met或M、Asn或N、Pro或P、Gln或Q、Arg或R、Ser或S、Thr或T、Val或V、Trp或W、Tyr或Y)的类氨基酸化合物。氨基酸类似物还包括具有修饰的侧链或骨架的天然氨基酸。氨基酸还包括呈D型而非L型的天然存在的氨基酸。在一些情况下，氨基酸类似物共用一个或多个天然氨基酸的骨架结构和/或侧链结构，但差异在于分子中的一个或多个修饰的基团。所述修饰可以包括(但不限于)原子(诸如N)取代相关原子(诸如S)、添加基团(诸如甲基或羟基，等等)或原子(诸如Cl或Br，等等)、缺失基团、取代共价键(单键取代双键，等等)，或其组合。举例来说，氨基酸类似物可以包括α-羟基酸和α-氨基酸，等等。
术语“抗体”在最宽泛的意义上使用并且包括单克隆抗体(包括全长单克隆抗体)、多克隆抗体以及多特异性抗体(例如，双特异性抗体)、人源化抗体、单链抗体、嵌合抗体、抗体片段(例如，Fab片段)，等等。抗体能够结合靶抗原(Janeway,C.,Travers,P.,Walport,M.,Shlomchik(2001)Immuno Biology,第5版,Garland Publishing,New York)。靶抗原可以具有一个或多个结合位点，也称为表位，其被抗体的一个或多个可变区形成的互补决定区(CDR)识别。
术语“天然抗体”指的是如下抗体：其中抗体的重链和轻链已经由多细胞生物体的免疫系统制得并配对。脾、淋巴结、骨髓以及血清是产生天然抗体的组织的实例。举例来说，由从经过抗原免疫的第一个动物中分离的抗体产生细胞所产生的抗体是天然抗体。
术语“人源化抗体”或“人源化免疫球蛋白”指的是所含的一个或多个氨基酸(例如，在构架区、恒定区或CDR中)已经被来自人类抗体的处于对应位置的氨基酸取代的非人类(例如，小鼠或兔)抗体。一般来说，人源化抗体与相同抗体的非人源化型式相比在人类宿主中产生减小的免疫反应。抗体可以使用本领域中已知的多种技术进行人源化，这些技术包括例如CDR移植(EP 239,400；PCT公布WO 91/09967；美国专利号5,225,539、5,530,101以及5,585,089)、镶饰或重塑(EP 592,106；EP 519,596；Padlan,Molecular Immunology 28(4/5):489-498(1991)；Studnicka等,Protein Engineering 7(6):805-814(1994)；Roguska.等,PNAS 91:969-973(1994))，以及链改组(美国专利号5,565,332)。在某些实施方案中，构架取代是通过对CDR与构架残基的相互作用进行建模以鉴别对于抗原结合重要的构架残基并且进行序列比较以鉴别在特定位置处的非常见构架残基来鉴别(参看例如美国专利号5,585,089；Riechmann等,Nature 332:323(1988))。对预期用于本发明中的抗体进行人源化的额外方法描述于美国专利号5,750,078、5,502,167、5,705,154、5,770,403、5,698,417、5,693,493、5,558,864、4,935,496和4,816,567，以及PCT公布WO 98/45331和WO98/45332中。在特定实施方案中，主题兔抗体可以根据US20040086979和US20050033031中所阐述的方法进行人源化。因此，上文所描述的抗体可以使用本领域中熟知的方法进行人源化。
术语“嵌合抗体”指的是轻链和重链基因已经通常通过遗传工程改造从属于不同物种的可变区和恒定区基因来构建的抗体。举例来说，来自小鼠单克隆抗体的基因的可变区段可以连接至人类恒定区段，诸如γ1和γ3。治疗性嵌合抗体的一个实例是由来自小鼠抗体的可变域或抗原结合域和来自人类抗体的恒定域或效应域组成的杂交蛋白质，不过可以使用来自其它哺乳动物物种的域。
如关于多肽、肽或蛋白质的氨基酸序列所用的“可遗传编码”意味着氨基酸序列由能够通过编码氨基酸序列的核酸的转录和翻译而产生的氨基酸残基组成，其中转录和/或翻译可以在细胞中或无细胞体外转录/翻译系统中发生。
术语“控制序列”指的是有助于可操作地连接的编码序列在特定表达系统(例如，哺乳动物细胞、细菌细胞、无细胞合成，等等)中表达的DNA序列。举例来说，适合用于原核生物系统的控制序列包括启动子、任选的操纵子序列以及核糖体结合位点。真核细胞系统可以利用启动子、多腺苷酸化信号以及增强子。
核酸当置于与另一个核酸序列成功能关系时是“可操作地连接的”。举例来说，如果前序列或分泌前导序列表现为参与多肽分泌的前蛋白，那么这个前序列或分泌前导序列的DNA可操作地连接至这个多肽的DNA；如果启动子或增强子影响编码序列的转录，那么这个启动子或增强子可操作地连接至这个序列；或如果核糖体结合位点经过定位以有助于起始翻译，那么这个核糖体结合位点可操作地连接至编码序列。一般来说，“可操作地连接”意味着所连接的DNA序列是相连的，并且在分泌前导序列的情况下，是相连的并且在阅读框架中。连接是通过接合或经由扩增反应来实现。合成寡核苷酸衔接子或连接子可以用于根据常规惯例来连接序列。
如本文所用的术语“表达盒”指的是可以插入核酸中(例如，通过使用与接合至所关注的构建体中相容的限制位点或通过同源重组至所关注的构建体中或至宿主细胞基因组中)的核酸区段，通常为DNA。一般来说，核酸区段包含编码所关注的多肽的多核苷酸，并且盒和限制位点被设计成有助于将盒插入适当阅读框架中用于转录和翻译。表达盒还可以包含有助于在宿主细胞中表达编码所关注的多肽的多核苷酸的元件。这些元件可以包括(但不限于)：启动子、最小启动子、增强子、反应元件、终止子序列、多腺苷酸化序列，等等。
如本文所用的术语“分离的”意图描述处于不同于化合物天然存在的环境的环境中的所关注的化合物。“分离的”意图包括在大量富集所关注的化合物的样品内和/或所关注的化合物被部分或大量纯化的化合物。
如本文所用的术语“大量纯化”指的是从天然环境中移出并且至少60％不含、至少75％不含、至少80％不含、至少85％不含、至少90％不含、至少95％不含、至少98％不含、或超过98％不含与其天然相关的其它组分的化合物。
术语“生理条件”意图包涵与活细胞相容的那些条件，例如，与活细胞相容的温度、pH、盐度等主要含水条件。
“反应伴侣”意味着与另一个反应伴侣特异性地反应以产生反应产物的分子或分子部分。例示性反应伴侣包括硫酸酯酶基序的半胱氨酸或丝氨酸和甲酰甘氨酸生成酶(FGE)，其反应形成含有甲酰甘氨酸(fGly)替代基序中的半胱氨酸或丝氨酸的转化醛标签的反应产物。其它例示性反应伴侣包括转化醛标签的fGly残基的醛和“醛反应性反应伴侣”，这个反应伴侣包含醛反应基团和所关注的部分，并且反应形成所关注的部分经由修饰的fGly残基偶联至修饰的多肽的修饰的加醛标签的多肽的反应产物。
“N端”指的是具有游离胺基的多肽的末端氨基酸残基，在非N端氨基酸残基中的胺基通常形成多肽的共价骨架的一部分。
“C端”指的是具有游离羧基的多肽的末端氨基酸残基，在非C端氨基酸残基中的羧基通常形成多肽的共价骨架的一部分。
如关于多肽或多肽的氨基酸序列所用的“内部位点”意味着不在N端或C端的多肽的区域。
在进一步描述本发明之前，应了解，本发明并不限于所描述的特定实施方案，所述实施方案当然可能有变化。还应了解，本文所用的术语仅为了描述特定实施方案的目的，并且不意图有限制性，因为本发明的范围将仅受随附权利要求书所限制。
在提供值的范围的情况下，应了解，除非上下文另有明确规定，否则介于那个范围的上限与下限之间的每个居中值至下限单位的十分之一以及在那个规定范围内的任何其它规定值或居中值涵盖于本发明内。这些较小范围的上限和下限可以独立地包括于较小范围内，并且也涵盖于本发明内，服从于在规定范围内任何特定排除的界限。在规定范围包括一个或两个界限的情况下，排除那些所包括的界限中的任一者或两者的范围也包括于本发明中。
应了解，为清楚起见在独立的实施方案的情形中描述的本发明的某些特征也可以在单个实施方案中以组合形式提供。反之，为简便起见在单个实施方案的情形中描述的本发明的各种特征也可以独立地或以任何适合的子组合形式提供。本发明特定地包涵并且本文公开了属于本发明的实施方案的所有组合，正如个别地并且明确地公开每个组合一样，达到所述组合包涵标的物程度，例如，作为稳定化合物的化合物(即，可以被制得、分离、表征并且测试生物活性的化合物)。另外，本发明也特定地包涵并且本文公开了各种实施方案和其要素(例如，描述所述变量的实施方案中所列的化学基团的要素)的所有子组合，正如本文中个别地并且明确地公开每个所述子组合一样。
除非另有规定，否则本文所用的所有技术和科学术语具有与本发明所属领域的一般技术人员通常所理解的含义相同的含义。尽管类似或等效于本文所描述的那些的任何方法和材料也可以用于实施或测试本发明，但现在描述优选的方法和材料。本文所提及的所有出版物以引用的方式并入本文中以与所引用的出版物相结合来公开并描述方法和/或材料。
必须注意，除非上下文另有明确规定，否则如本文和随附权利要求书中所用的单数形式“一(a/an)”和“所述”包括复数个指示物。应进一步注意，权利要求书可以被拟定为排除任何任选的要素。这样的话，这个陈述打算充当与列举权利要求书的要素或使用“负向”限制相结合来使用诸如“只”、“仅”等排他性术语的前置基础。
应了解，为清楚起见在独立的实施方案的情形中描述的本发明的某些特征也可以在单个实施方案中以组合形式提供。反之，为简便起见在单个实施方案的情形中描述的本发明的各种特征也可以独立地或以任何适合的子组合形式提供。
本文所论述的出版物仅仅为了其在本申请的提交日期之前的公开内容而提供。本文中的任何内容都不应被解释为承认本发明依据在先发明没有先于所述出版物的资格。此外，所提供的出版物的日期可能不同于实际出版日期，这可能需要被独立地确认。
发明详述
本公开提供了偶联物(例如，多肽偶联物)、用于产生偶联物的肼基-吲哚化合物，以及制造和使用其的方法。每一者的实施方案在以下章节中更详细地描述。
偶联物
本公开提供了偶联物。“偶联物”意味着与第二部分稳定缔合的第一部分。“稳定缔合”意味着在标准条件下一个部分结合至另一个部分或结构。在某些实施方案中，第一和第二部分经由一个或多个共价键结合至彼此。
在某些实施方案中，偶联物是多肽偶联物，其包括偶联至第二部分的多肽。如下文更详细地描述，偶联至多肽的部分可以为多种部分中的任一者，诸如(但不限于)可检测标记、药物、水溶性聚合物，或用于将多肽固定至膜或表面的部分。所关注的部分可以在多肽的任何所需位点处偶联至多肽。因此，举例来说，本公开提供了具有在多肽的C端或C端附近的位点处偶联的部分的修饰的多肽。其它实例包括具有在多肽的N端或N端附近的位置处偶联的部分的修饰的多肽。实例还包括具有在多肽的C端与N端之间的位置处(例如，在多肽的内部位点处)偶联的部分的修饰的多肽。在修饰的多肽偶联至两个或更多个部分的情况下，上述的组合也是可能的。
本公开的实施方案包括偶联物，其中多肽偶联至一个或多个部分，诸如2个部分、3个部分、4个部分、5个部分、6个部分、7个部分、8个部分、9个部分、或10个或更多个部分。这些部分可以在多肽中的一个或多个位点处偶联至多肽。举例来说，多肽可以偶联至一个部分，例如，一个部分可以偶联至多肽的单个氨基酸残基。在一些情况下，第一部分偶联至多肽的第一氨基酸残基并且第二部分偶联至多肽的第二氨基酸残基。额外部分可以偶联至多肽的其它氨基酸残基。
偶联至一个或多个部分的一个或多个氨基酸残基可以为天然存在的氨基酸、非天然氨基酸或其组合。举例来说，偶联物可以包括偶联至多肽的天然存在的氨基酸残基的部分。在其它情况下，偶联物可以包括偶联至多肽的非天然氨基酸残基的部分。多肽中的一个或多个天然或非天然氨基酸残基可以偶联至如本文所描述的部分。举例来说，多肽中的两个(或更多个)氨基酸残基(例如，天然或非天然氨基酸残基)可以各自偶联至一个部分，以使得多肽中的多个位点被修饰。
尽管本文中以偶联至一个或多个部分(例如，药物、可检测标记、多肽，等等)的多肽进行描述，但本公开的实施方案还包括一个部分(例如，药物、可检测标记、多肽，等等)偶联至一个或多个其它部分(例如，药物、可检测标记、多肽，等等)的偶联物。举例来说，药物可以偶联至一个或多个其它部分(例如，药物、可检测标记、多肽，等等)，或在其它实施方案中，可检测标记可以偶联至一个或多个其它部分(例如，药物、可检测标记、多肽，等等)。因此，举例来说，本公开的实施方案包括(但不限于)以下：多肽与药物的偶联物；多肽与可检测标记的偶联物；两个或更多个多肽的偶联物；两个或更多个药物的偶联物；两个或更多个可检测标记的偶联物；药物与可检测标记的偶联物；多肽、药物以及可检测标记的偶联物；多肽与两个或更多个药物的偶联物；多肽与两个或更多个可检测标记的偶联物；药物与两个或更多个多肽的偶联物；可检测标记与两个或更多个多肽的偶联物；等等。
在某些实施方案中，多肽与所关注的部分经由偶合部分而偶联。举例来说，多肽和所关注的部分可以各自结合(例如，共价键结)至偶合部分，由此经由偶合部分将多肽与所关注的部分间接地结合在一起。在一些情况下，偶合部分包括肼基-吲哚化合物或肼基-吲哚化合物的衍生物。举例来说，用于经由肼基-吲哚偶合部分将所关注的部分偶合至多肽的一般流程示于以下一般反应流程中。
在上述反应流程中，R可以为偶联至多肽的所关注的部分。如本文所描述，这个部分可以为多种部分中的任一者，诸如(但不限于)可检测标记、药物、水溶性聚合物，或用于将多肽固定至底物的膜或表面的部分。R'和R”可以各自独立地为任何所需的取代基，诸如(但不限于)氢、烷基、经取代的烷基、烯基、经取代的烯基、炔基、经取代的炔基、烷氧基、经取代的烷氧基、氨基、经取代的氨基、羧基、羧基酯、酰基、酰氧基、酰基氨基、氨基酰基、烷基酰胺、经取代的烷基酰胺、磺酰基、硫代烷氧基、经取代的硫代烷氧基、芳基、经取代的芳基、杂芳基、经取代的杂芳基、环烷基、经取代的环烷基、杂环基以及经取代的杂环基。
其它肼基-吲哚偶合部分也是可能的。举例来说，用于经由肼基-吲哚偶合部分将所关注的部分偶合至多肽的另一个一般流程示于以下一般反应流程中。
在上述反应流程中，R可以为偶联至多肽的所关注的部分。如上文所描述，这个部分可以为多种部分中的任一者，诸如(但不限于)可检测标记、药物、水溶性聚合物，或用于将多肽固定至底物的膜或表面的部分。R'和R”可以各自独立地为任何所需的取代基，诸如(但不限于)氢、烷基、经取代的烷基、烯基、经取代的烯基、炔基、经取代的炔基、烷氧基、经取代的烷氧基、氨基、经取代的氨基、羧基、羧基酯、酰基、酰氧基、酰基氨基、氨基酰基、烷基酰胺、经取代的烷基酰胺、磺酰基、硫代烷氧基、经取代的硫代烷氧基、芳基、经取代的芳基、杂芳基、经取代的杂芳基、环烷基、经取代的环烷基、杂环基以及经取代的杂环基。其它偶合部分也是可能的，如下文更详细描述的偶联物和化合物中所示。
在某些实施方案中，偶联物包括式(I)的至少一个修饰的氨基酸残基：
其中
n为0或1；
R1选自氢、烷基、经取代的烷基、烯基、经取代的烯基、炔基、经取代的炔基、芳基、经取代的芳基、杂芳基、经取代的杂芳基、环烷基、经取代的环烷基、杂环基以及经取代的杂环基；
R2和R3各自独立地选自氢、烷基、经取代的烷基、烯基、经取代的烯基、炔基、经取代的炔基、烷氧基、经取代的烷氧基、氨基、经取代的氨基、羧基、羧基酯、酰基、酰氧基、酰基氨基、氨基酰基、烷基酰胺、经取代的烷基酰胺、磺酰基、硫代烷氧基、经取代的硫代烷氧基、芳基、经取代的芳基、杂芳基、经取代的杂芳基、环烷基、经取代的环烷基、杂环基以及经取代的杂环基；
X1、X2、X3以及X4各自独立地选自C、N、O以及S；
X5为C；
Y1、Y2、Y3、Y4以及Y5各自独立地选自氢、卤素、烷基、经取代的烷基、烯基、经取代的烯基、炔基、经取代的炔基、烷氧基、经取代的烷氧基、氨基、经取代的氨基、羧基、羧基酯、酰基、酰氧基、酰基氨基、氨基酰基、烷基酰胺、经取代的烷基酰胺、磺酰基、硫代烷氧基、经取代的硫代烷氧基、芳基、经取代的芳基、杂芳基、经取代的杂芳基、环烷基、经取代的环烷基、杂环基以及经取代的杂环基；
Q1为键结至X4或X5的键，其中如果Q1为键结至X4的键，那么Y4不存在，或如果Q1为键结至X5的键，那么Y5不存在；并且
L为任选的连接子，
其中W1和W2中的一者为多肽并且另一者为药物或可检测标记。
在某些实施方案中，n为0或1。在某些实施方案中，n为0。在某些实施方案中，n为1。
在某些实施方案中，R1选自氢、烷基、经取代的烷基、烯基、经取代的烯基、炔基、经取代的炔基、芳基、经取代的芳基、杂芳基、经取代的杂芳基、环烷基、经取代的环烷基、杂环基以及经取代的杂环基。在某些实施方案中，R1为氢。在某些实施方案中，R1为烷基或经取代的烷基。在某些实施方案中，R1为烯基或经取代的烯基。在某些实施方案中，R1为炔基或经取代的炔基。在某些实施方案中，R1为芳基或经取代的芳基。在某些实施方案中，R1为杂芳基或经取代的杂芳基。在某些实施方案中，R1为环烷基或经取代的环烷基。在某些实施方案中，R1为杂环基或经取代的杂环基。
在某些实施方案中，R2选自氢、烷基、经取代的烷基、烯基、经取代的烯基、炔基、经取代的炔基、烷氧基、经取代的烷氧基、氨基、经取代的氨基、羧基、羧基酯、酰基、酰氧基、酰基氨基、氨基酰基、烷基酰胺、经取代的烷基酰胺、磺酰基、硫代烷氧基、经取代的硫代烷氧基、芳基、经取代的芳基、杂芳基、经取代的杂芳基、环烷基、经取代的环烷基、杂环基以及经取代的杂环基。在某些实施方案中，R2为氢。在某些实施方案中，R2为烷基或经取代的烷基。在某些实施方案中，R2为烯基或经取代的烯基。在某些实施方案中，R2为炔基或经取代的炔基。在某些实施方案中，R2为烷氧基或经取代的烷氧基。在某些实施方案中，R2为氨基或经取代的氨基。在某些实施方案中，R2为羧基或羧基酯。在某些实施方案中，R2为酰基或酰氧基。在某些实施方案中，R2为酰基氨基或氨基酰基。在某些实施方案中，R2为烷基酰胺或经取代的烷基酰胺。在某些实施方案中，R2为磺酰基。在某些实施方案中，R2为硫代烷氧基或经取代的硫代烷氧基。在某些实施方案中，R2为芳基或经取代的芳基。在某些实施方案中，R2为杂芳基或经取代的杂芳基。在某些实施方案中，R2为环烷基或经取代的环烷基。在某些实施方案中，R2为杂环基或经取代的杂环基。
在某些实施方案中，R2为烷基或经取代的烷基。举例来说，R2可以为烷基或经取代的烷基，诸如C1-C10烷基或C1-C10经取代的烷基(例如，C1-C6烷基或C1-C6经取代的烷基)。在一些情况下，R2为甲基、乙基、正丙基、异丙基、正丁基、仲丁基、异丁基、叔丁基，等等。在某些情况下，R2为甲基。
在某些实施方案中，R3选自氢、烷基、经取代的烷基、烯基、经取代的烯基、炔基、经取代的炔基、烷氧基、经取代的烷氧基、氨基、经取代的氨基、羧基、羧基酯、酰基、酰氧基、酰基氨基、氨基酰基、烷基酰胺、经取代的烷基酰胺、磺酰基、硫代烷氧基、经取代的硫代烷氧基、芳基、经取代的芳基、杂芳基、经取代的杂芳基、环烷基、经取代的环烷基、杂环基以及经取代的杂环基。在某些实施方案中，R3为氢。在某些实施方案中，R3为烷基或经取代的烷基。在某些实施方案中，R3为烯基或经取代的烯基。在某些实施方案中，R3为炔基或经取代的炔基。在某些实施方案中，R3为烷氧基或经取代的烷氧基。在某些实施方案中，R3为氨基或经取代的氨基。在某些实施方案中，R3为羧基或羧基酯。在某些实施方案中，R3为酰基或酰氧基。在某些实施方案中，R3为酰基氨基或氨基酰基。在某些实施方案中，R3为烷基酰胺或经取代的烷基酰胺。在某些实施方案中，R3为磺酰基。在某些实施方案中，R3为硫代烷氧基或经取代的硫代烷氧基。在某些实施方案中，R3为芳基或经取代的芳基。在某些实施方案中，R3为杂芳基或经取代的杂芳基。在某些实施方案中，R3为环烷基或经取代的环烷基。在某些实施方案中，R3为杂环基或经取代的杂环基。
在某些实施方案中，R3为烷基或经取代的烷基。举例来说，R3可以为烷基或经取代的烷基，诸如C1-C10烷基或C1-C10经取代的烷基(例如，C1-C6烷基或C1-C6经取代的烷基)。在一些情况下，R3为甲基、乙基、正丙基、异丙基、正丁基、仲丁基、异丁基、叔丁基，等等。在某些情况下，R3为甲基。
在某些实施方案中，R2和R3各自独立地选自烷基和经取代的烷基。举例来说，R2可以为烷基或经取代的烷基，诸如C1-C10烷基或C1-C10经取代的烷基(例如，C1-C6烷基或C1-C6经取代的烷基)，并且R3可以为烷基或经取代的烷基，诸如C1-C10烷基或C1-C10经取代的烷基(例如，C1-C6烷基或C1-C6经取代的烷基)。在一些情况下，R2和R3各自独立地选自甲基、乙基、正丙基、异丙基、正丁基、仲丁基、异丁基、叔丁基，等等。在某些情况下，R2和R3各自为甲基。
在某些实施方案中，X1选自C、N、O以及S。在某些实施方案中，X1为C。在某些实施方案中，X1为N。在某些实施方案中，X1为O。在某些实施方案中，X1为S。
在某些实施方案中，X2选自C、N、O以及S。在某些实施方案中，X2为C。在某些实施方案中，X2为N。在某些实施方案中，X2为O。在某些实施方案中，X2为S。
在某些实施方案中，X3选自C、N、O以及S。在某些实施方案中，X3为C。在某些实施方案中，X3为N。在某些实施方案中，X3为O。在某些实施方案中，X3为S。
在某些实施方案中，X4选自C、N、O以及S。在某些实施方案中，X4为C。在某些实施方案中，X4为N。在某些实施方案中，X4为O。在某些实施方案中，X4为S。
X1、X2、X3以及X4的各种组合是可能的。举例来说，在某些实施方案中，X1、X2、X3以及X4中的每一者为C。在其它情况下，X1、X2、X3以及X4中的三者为C并且X1、X2、X3以及X4中的一者为N。在其它实施方案中，X1、X2、X3以及X4中的两者为C并且X1、X2、X3以及X4中的两者为N。在其它实施方案中，X1、X2、X3以及X4中的一者为C并且X1、X2、X3以及X4中的三者为N。在需要时，C、N、O以及S的其它组合对于X1、X2、X3以及X4是可能的。
在某些实施方案中，X5为C。
在某些实施方案中，Y1选自氢、卤素、烷基、经取代的烷基、烯基、经取代的烯基、炔基、经取代的炔基、烷氧基、经取代的烷氧基、氨基、经取代的氨基、羧基、羧基酯、酰基、酰氧基、酰基氨基、氨基酰基、烷基酰胺、经取代的烷基酰胺、磺酰基、硫代烷氧基、经取代的硫代烷氧基、芳基、经取代的芳基、杂芳基、经取代的杂芳基、环烷基、经取代的环烷基、杂环基以及经取代的杂环基。在某些实施方案中，Y1为氢。在某些实施方案中，Y1为卤素，诸如F、Cl、Br或I。在某些实施方案中，Y1为F。在某些实施方案中，Y1为Cl。在某些实施方案中，Y1为Br。在某些实施方案中，Y1为I。在某些实施方案中，Y1为烷基或经取代的烷基。在某些实施方案中，Y1为烯基或经取代的烯基。在某些实施方案中，Y1为炔基或经取代的炔基。在某些实施方案中，Y1为烷氧基或经取代的烷氧基。在某些实施方案中，Y1为氨基或经取代的氨基。在某些实施方案中，Y1为羧基或羧基酯。在某些实施方案中，Y1为酰基或酰氧基。在某些实施方案中，Y1为酰基氨基或氨基酰基。在某些实施方案中，Y1为烷基酰胺或经取代的烷基酰胺。在某些实施方案中，Y1为磺酰基。在某些实施方案中，Y1为硫代烷氧基或经取代的硫代烷氧基。在某些实施方案中，Y1为芳基或经取代的芳基。在某些实施方案中，Y1为杂芳基或经取代的杂芳基。在某些实施方案中，Y1为环烷基或经取代的环烷基。在某些实施方案中，Y1为杂环基或经取代的杂环基。
在某些实施方案中，Y2选自氢、卤素、烷基、经取代的烷基、烯基、经取代的烯基、炔基、经取代的炔基、烷氧基、经取代的烷氧基、氨基、经取代的氨基、羧基、羧基酯、酰基、酰氧基、酰基氨基、氨基酰基、烷基酰胺、经取代的烷基酰胺、磺酰基、硫代烷氧基、经取代的硫代烷氧基、芳基、经取代的芳基、杂芳基、经取代的杂芳基、环烷基、经取代的环烷基、杂环基以及经取代的杂环基。在某些实施方案中，Y2为氢。在某些实施方案中，Y2为卤素，诸如F、Cl、Br或I。在某些实施方案中，Y2为F。在某些实施方案中，Y2为Cl。在某些实施方案中，Y2为Br。在某些实施方案中，Y2为I。在某些实施方案中，Y2为烷基或经取代的烷基。在某些实施方案中，Y2为烯基或经取代的烯基。在某些实施方案中，Y2为炔基或经取代的炔基。在某些实施方案中，Y2为烷氧基或经取代的烷氧基。在某些实施方案中，Y2为氨基或经取代的氨基。在某些实施方案中，Y2为羧基或羧基酯。在某些实施方案中，Y2为酰基或酰氧基。在某些实施方案中，Y2为酰基氨基或氨基酰基。在某些实施方案中，Y2为烷基酰胺或经取代的烷基酰胺。在某些实施方案中，Y2为磺酰基。在某些实施方案中，Y2为硫代烷氧基或经取代的硫代烷氧基。在某些实施方案中，Y2为芳基或经取代的芳基。在某些实施方案中，Y2为杂芳基或经取代的杂芳基。在某些实施方案中，Y2为环烷基或经取代的环烷基。在某些实施方案中，Y2为杂环基或经取代的杂环基。
在某些实施方案中，Y3选自氢、卤素、烷基、经取代的烷基、烯基、经取代的烯基、炔基、经取代的炔基、烷氧基、经取代的烷氧基、氨基、经取代的氨基、羧基、羧基酯、酰基、酰氧基、酰基氨基、氨基酰基、烷基酰胺、经取代的烷基酰胺、磺酰基、硫代烷氧基、经取代的硫代烷氧基、芳基、经取代的芳基、杂芳基、经取代的杂芳基、环烷基、经取代的环烷基、杂环基以及经取代的杂环基。在某些实施方案中，Y3为氢。在某些实施方案中，Y3为卤素，诸如F、Cl、Br或I。在某些实施方案中，Y3为F。在某些实施方案中，Y3为Cl。在某些实施方案中，Y3为Br。在某些实施方案中，Y3为I。在某些实施方案中，Y3为烷基或经取代的烷基。在某些实施方案中，Y3为烯基或经取代的烯基。在某些实施方案中，Y3为炔基或经取代的炔基。在某些实施方案中，Y3为烷氧基或经取代的烷氧基。在某些实施方案中，Y3为氨基或经取代的氨基。在某些实施方案中，Y3为羧基或羧基酯。在某些实施方案中，Y3为酰基或酰氧基。在某些实施方案中，Y3为酰基氨基或氨基酰基。在某些实施方案中，Y3为烷基酰胺或经取代的烷基酰胺。在某些实施方案中，Y3为磺酰基。在某些实施方案中，Y3为硫代烷氧基或经取代的硫代烷氧基。在某些实施方案中，Y3为芳基或经取代的芳基。在某些实施方案中，Y3为杂芳基或经取代的杂芳基。在某些实施方案中，Y3为环烷基或经取代的环烷基。在某些实施方案中，Y3为杂环基或经取代的杂环基。
在某些实施方案中，Y4(如果存在)选自氢、卤素、烷基、经取代的烷基、烯基、经取代的烯基、炔基、经取代的炔基、烷氧基、经取代的烷氧基、氨基、经取代的氨基、羧基、羧基酯、酰基、酰氧基、酰基氨基、氨基酰基、烷基酰胺、经取代的烷基酰胺、磺酰基、硫代烷氧基、经取代的硫代烷氧基、芳基、经取代的芳基、杂芳基、经取代的杂芳基、环烷基、经取代的环烷基、杂环基以及经取代的杂环基。在某些实施方案中，Y4为氢。在某些实施方案中，Y4为卤素，诸如F、Cl、Br或I。在某些实施方案中，Y4为F。在某些实施方案中，Y4为Cl。在某些实施方案中，Y4为Br。在某些实施方案中，Y4为I。在某些实施方案中，Y4为烷基或经取代的烷基。在某些实施方案中，Y4为烯基或经取代的烯基。在某些实施方案中，Y4为炔基或经取代的炔基。在某些实施方案中，Y4为烷氧基或经取代的烷氧基。在某些实施方案中，Y4为氨基或经取代的氨基。在某些实施方案中，Y4为羧基或羧基酯。在某些实施方案中，Y4为酰基或酰氧基。在某些实施方案中，Y4为酰基氨基或氨基酰基。在某些实施方案中，Y4为烷基酰胺或经取代的烷基酰胺。在某些实施方案中，Y4为磺酰基。在某些实施方案中，Y4为硫代烷氧基或经取代的硫代烷氧基。在某些实施方案中，Y4为芳基或经取代的芳基。在某些实施方案中，Y4为杂芳基或经取代的杂芳基。在某些实施方案中，Y4为环烷基或经取代的环烷基。在某些实施方案中，Y4为杂环基或经取代的杂环基。
在某些实施方案中，Y5(如果存在)选自氢、卤素、烷基、经取代的烷基、烯基、经取代的烯基、炔基、经取代的炔基、烷氧基、经取代的烷氧基、氨基、经取代的氨基、羧基、羧基酯、酰基、酰氧基、酰基氨基、氨基酰基、烷基酰胺、经取代的烷基酰胺、磺酰基、硫代烷氧基、经取代的硫代烷氧基、芳基、经取代的芳基、杂芳基、经取代的杂芳基、环烷基、经取代的环烷基、杂环基以及经取代的杂环基。在某些实施方案中，Y5为氢。在某些实施方案中，Y5为卤素，诸如F、Cl、Br或I。在某些实施方案中，Y5为F。在某些实施方案中，Y5为Cl。在某些实施方案中，Y5为Br。在某些实施方案中，Y5为I。在某些实施方案中，Y5为烷基或经取代的烷基。在某些实施方案中，Y5为烯基或经取代的烯基。在某些实施方案中，Y5为炔基或经取代的炔基。在某些实施方案中，Y5为烷氧基或经取代的烷氧基。在某些实施方案中，Y5为氨基或经取代的氨基。在某些实施方案中，Y5为羧基或羧基酯。在某些实施方案中，Y5为酰基或酰氧基。在某些实施方案中，Y5为酰基氨基或氨基酰基。在某些实施方案中，Y5为烷基酰胺或经取代的烷基酰胺。在某些实施方案中，Y5为磺酰基。在某些实施方案中，Y5为硫代烷氧基或经取代的硫代烷氧基。在某些实施方案中，Y5为芳基或经取代的芳基。在某些实施方案中，Y5为杂芳基或经取代的杂芳基。在某些实施方案中，Y5为环烷基或经取代的环烷基。在某些实施方案中，Y5为杂环基或经取代的杂环基。
在某些实施方案中，Q1为键结至X4或X5的键。在某些实施方案中，Q1为键结至X4的键。在某些实施方案中，如果Q1为键结至X4的键，那么Y4不存在。在某些实施方案中，Q1为键结至X5的键。在某些实施方案中，如果Q1为键结至X5的键，那么Y5不存在。
在某些实施方案中，L为任选的连接子。在某些实施方案中，L不存在，并且因此吲哚环的氮直接键结至W1。在某些实施方案中，L存在，并且因此吲哚环的氮经由连接子L间接键结至W1。
在某些实施方案中，L包括选自以下的基团：烷基、经取代的烷基、烯基、经取代的烯基、炔基、经取代的炔基、烷氧基、经取代的烷氧基、氨基、经取代的氨基、羧基、羧基酯、酰基氨基、烷基酰胺、经取代的烷基酰胺、芳基、经取代的芳基、杂芳基、经取代的杂芳基、环烷基、经取代的环烷基、杂环基以及经取代的杂环基。在某些实施方案中，L包括烷基或经取代的烷基。在某些实施方案中，L包括烯基或经取代的烯基。在某些实施方案中，L包括炔基或经取代的炔基。在某些实施方案中，L包括烷氧基或经取代的烷氧基。在某些实施方案中，L包括氨基或经取代的氨基。在某些实施方案中，L包括羧基或羧基酯基。在某些实施方案中，L包括酰基氨基。在某些实施方案中，L包括烷基酰胺或经取代的烷基酰胺基。在某些实施方案中，L包括芳基或经取代的芳基。在某些实施方案中，L包括杂芳基或经取代的杂芳基。在某些实施方案中，L包括环烷基或经取代的环烷基。在某些实施方案中，L包括杂环基或经取代的杂环基。
在某些实施方案中，L包括聚合物。举例来说，聚合物可以包括聚烷二醇和其衍生物，包括聚乙二醇、甲氧基聚乙二醇、聚乙二醇均聚物、聚丙二醇均聚物、乙二醇与丙二醇的共聚物(例如，其中均聚物和共聚物未经取代或在一端被烷基取代)、聚乙烯醇、聚乙烯基乙基醚、聚乙烯吡咯烷酮、其组合，等等。在某些实施方案中，聚合物为聚烷二醇。在某些实施方案中，聚合物为聚乙二醇。
在某些实施方案中，W1选自药物、可检测标记以及多肽。在某些实施方案中，W1为药物。在某些实施方案中，W1为可检测标记。在某些实施方案中，W1为多肽。
在某些实施方案中，W2选自药物、可检测标记以及多肽。在某些实施方案中，W2为药物。在某些实施方案中，W2为可检测标记。在某些实施方案中，W2为多肽。
在某些实施方案中，W1和W2中的一者为多肽并且另一者为药物或可检测标记。在某些实施方案中，W1为药物或可检测标记，并且W2为多肽。在某些实施方案中，W1为多肽，并且W2为药物或可检测标记。
在某些实施方案中，偶联物包括式(II)的至少一个修饰的氨基酸残基：
其中
n为0或1；
R1选自氢、烷基、经取代的烷基、烯基、经取代的烯基、炔基、经取代的炔基、芳基、经取代的芳基、杂芳基、经取代的杂芳基、环烷基、经取代的环烷基、杂环基以及经取代的杂环基；
R2和R3各自独立地选自氢、烷基、经取代的烷基、烯基、经取代的烯基、炔基、经取代的炔基、烷氧基、经取代的烷氧基、氨基、经取代的氨基、羧基、羧基酯、酰基、酰氧基、酰基氨基、氨基酰基、烷基酰胺、经取代的烷基酰胺、磺酰基、硫代烷氧基、经取代的硫代烷氧基、芳基、经取代的芳基、杂芳基、经取代的杂芳基、环烷基、经取代的环烷基、杂环基以及经取代的杂环基；
X1、X2、X3以及X4各自独立地选自C、N、O以及S；
Y1、Y2、Y3以及Y4各自独立地选自氢、卤素、烷基、经取代的烷基、烯基、经取代的烯基、炔基、经取代的炔基、烷氧基、经取代的烷氧基、氨基、经取代的氨基、羧基、羧基酯、酰基、酰氧基、酰基氨基、氨基酰基、烷基酰胺、经取代的烷基酰胺、磺酰基、硫代烷氧基、经取代的硫代烷氧基、芳基、经取代的芳基、杂芳基、经取代的杂芳基、环烷基、经取代的环烷基、杂环基以及经取代的杂环基；
L为任选的连接子；并且
其中W1和W2中的一者为多肽并且另一者为药物或可检测标记。
在某些实施方案中，式(II)的取代基与上文关于式(I)所描述的相同。举例来说，在某些实施方案中，n为0或1。在某些实施方案中，n为0。在某些实施方案中，n为1。
在某些实施方案中，R1选自氢、烷基、经取代的烷基、烯基、经取代的烯基、炔基、经取代的炔基、芳基、经取代的芳基、杂芳基、经取代的杂芳基、环烷基、经取代的环烷基、杂环基以及经取代的杂环基。在某些实施方案中，R1为氢。在某些实施方案中，R1为烷基或经取代的烷基。在某些实施方案中，R1为烯基或经取代的烯基。在某些实施方案中，R1为炔基或经取代的炔基。在某些实施方案中，R1为芳基或经取代的芳基。在某些实施方案中，R1为杂芳基或经取代的杂芳基。在某些实施方案中，R1为环烷基或经取代的环烷基。在某些实施方案中，R1为杂环基或经取代的杂环基。
在某些实施方案中，R2选自氢、烷基、经取代的烷基、烯基、经取代的烯基、炔基、经取代的炔基、烷氧基、经取代的烷氧基、氨基、经取代的氨基、羧基、羧基酯、酰基、酰氧基、酰基氨基、氨基酰基、烷基酰胺、经取代的烷基酰胺、磺酰基、硫代烷氧基、经取代的硫代烷氧基、芳基、经取代的芳基、杂芳基、经取代的杂芳基、环烷基、经取代的环烷基、杂环基以及经取代的杂环基。在某些实施方案中，R2为氢。在某些实施方案中，R2为烷基或经取代的烷基。在某些实施方案中，R2为烯基或经取代的烯基。在某些实施方案中，R2为炔基或经取代的炔基。在某些实施方案中，R2为烷氧基或经取代的烷氧基。在某些实施方案中，R2为氨基或经取代的氨基。在某些实施方案中，R2为羧基或羧基酯。在某些实施方案中，R2为酰基或酰氧基。在某些实施方案中，R2为酰基氨基或氨基酰基。在某些实施方案中，R2为烷基酰胺或经取代的烷基酰胺。在某些实施方案中，R2为磺酰基。在某些实施方案中，R2为硫代烷氧基或经取代的硫代烷氧基。在某些实施方案中，R2为芳基或经取代的芳基。在某些实施方案中，R2为杂芳基或经取代的杂芳基。在某些实施方案中，R2为环烷基或经取代的环烷基。在某些实施方案中，R2为杂环基或经取代的杂环基。
在某些实施方案中，R2为烷基或经取代的烷基。举例来说，R2可以为烷基或经取代的烷基，诸如C1-C10烷基或C1-C10经取代的烷基(例如，C1-C6烷基或C1-C6经取代的烷基)。在一些情况下，R2为甲基、乙基、正丙基、异丙基、正丁基、仲丁基、异丁基、叔丁基，等等。在某些情况下，R2为甲基。
在某些实施方案中，R3选自氢、烷基、经取代的烷基、烯基、经取代的烯基、炔基、经取代的炔基、烷氧基、经取代的烷氧基、氨基、经取代的氨基、羧基、羧基酯、酰基、酰氧基、酰基氨基、氨基酰基、烷基酰胺、经取代的烷基酰胺、磺酰基、硫代烷氧基、经取代的硫代烷氧基、芳基、经取代的芳基、杂芳基、经取代的杂芳基、环烷基、经取代的环烷基、杂环基以及经取代的杂环基。在某些实施方案中，R3为氢。在某些实施方案中，R3为烷基或经取代的烷基。在某些实施方案中，R3为烯基或经取代的烯基。在某些实施方案中，R3为炔基或经取代的炔基。在某些实施方案中，R3为烷氧基或经取代的烷氧基。在某些实施方案中，R3为氨基或经取代的氨基。在某些实施方案中，R3为羧基或羧基酯。在某些实施方案中，R3为酰基或酰氧基。在某些实施方案中，R3为酰基氨基或氨基酰基。在某些实施方案中，R3为烷基酰胺或经取代的烷基酰胺。在某些实施方案中，R3为磺酰基。在某些实施方案中，R3为硫代烷氧基或经取代的硫代烷氧基。在某些实施方案中，R3为芳基或经取代的芳基。在某些实施方案中，R3为杂芳基或经取代的杂芳基。在某些实施方案中，R3为环烷基或经取代的环烷基。在某些实施方案中，R3为杂环基或经取代的杂环基。
在某些实施方案中，R3为烷基或经取代的烷基。举例来说，R3可以为烷基或经取代的烷基，诸如C1-C10烷基或C1-C10经取代的烷基(例如，C1-C6烷基或C1-C6经取代的烷基)。在一些情况下，R3为甲基、乙基、正丙基、异丙基、正丁基、仲丁基、异丁基、叔丁基，等等。在某些情况下，R3为甲基。
在某些实施方案中，R2和R3各自独立地选自烷基和经取代的烷基。举例来说，R2可以为烷基或经取代的烷基，诸如C1-C10烷基或C1-C10经取代的烷基(例如，C1-C6烷基或C1-C6经取代的烷基)，并且R3可以为烷基或经取代的烷基，诸如C1-C10烷基或C1-C10经取代的烷基(例如，C1-C6烷基或C1-C6经取代的烷基)。在一些情况下，R2和R3各自独立地选自甲基、乙基、正丙基、异丙基、正丁基、仲丁基、异丁基、叔丁基，等等。在某些情况下，R2和R3各自为甲基。
在某些实施方案中，X1选自C、N、O以及S。在某些实施方案中，X1为C。在某些实施方案中，X1为N。在某些实施方案中，X1为O。在某些实施方案中，X1为S。
在某些实施方案中，X2选自C、N、O以及S。在某些实施方案中，X2为C。在某些实施方案中，X2为N。在某些实施方案中，X2为O。在某些实施方案中，X2为S。
在某些实施方案中，X3选自C、N、O以及S。在某些实施方案中，X3为C。在某些实施方案中，X3为N。在某些实施方案中，X3为O。在某些实施方案中，X3为S。
在某些实施方案中，X4选自C、N、O以及S。在某些实施方案中，X4为C。在某些实施方案中，X4为N。在某些实施方案中，X4为O。在某些实施方案中，X4为S。
X1、X2、X3以及X4的各种组合是可能的。举例来说，在某些实施方案中，X1、X2、X3以及X4中的每一者为C。在其它情况下，X1、X2、X3以及X4中的三者为C并且X1、X2、X3以及X4中的一者为N。在其它实施方案中，X1、X2、X3以及X4中的两者为C并且X1、X2、X3以及X4中的两者为N。在其它实施方案中，X1、X2、X3以及X4中的一者为C并且X1、X2、X3以及X4中的三者为N。在需要时，C、N、O以及S的其它组合对于X1、X2、X3以及X4是可能的。
在某些实施方案中，Y1选自氢、卤素、烷基、经取代的烷基、烯基、经取代的烯基、炔基、经取代的炔基、烷氧基、经取代的烷氧基、氨基、经取代的氨基、羧基、羧基酯、酰基、酰氧基、酰基氨基、氨基酰基、烷基酰胺、经取代的烷基酰胺、磺酰基、硫代烷氧基、经取代的硫代烷氧基、芳基、经取代的芳基、杂芳基、经取代的杂芳基、环烷基、经取代的环烷基、杂环基以及经取代的杂环基。在某些实施方案中，Y1为氢。在某些实施方案中，Y1为卤素，诸如F、Cl、Br或I。在某些实施方案中，Y1为F。在某些实施方案中，Y1为Cl。在某些实施方案中，Y1为Br。在某些实施方案中，Y1为I。在某些实施方案中，Y1为烷基或经取代的烷基。在某些实施方案中，Y1为烯基或经取代的烯基。在某些实施方案中，Y1为炔基或经取代的炔基。在某些实施方案中，Y1为烷氧基或经取代的烷氧基。在某些实施方案中，Y1为氨基或经取代的氨基。在某些实施方案中，Y1为羧基或羧基酯。在某些实施方案中，Y1为酰基或酰氧基。在某些实施方案中，Y1为酰基氨基或氨基酰基。在某些实施方案中，Y1为烷基酰胺或经取代的烷基酰胺。在某些实施方案中，Y1为磺酰基。在某些实施方案中，Y1为硫代烷氧基或经取代的硫代烷氧基。在某些实施方案中，Y1为芳基或经取代的芳基。在某些实施方案中，Y1为杂芳基或经取代的杂芳基。在某些实施方案中，Y1为环烷基或经取代的环烷基。在某些实施方案中，Y1为杂环基或经取代的杂环基。
在某些实施方案中，Y2选自氢、卤素、烷基、经取代的烷基、烯基、经取代的烯基、炔基、经取代的炔基、烷氧基、经取代的烷氧基、氨基、经取代的氨基、羧基、羧基酯、酰基、酰氧基、酰基氨基、氨基酰基、烷基酰胺、经取代的烷基酰胺、磺酰基、硫代烷氧基、经取代的硫代烷氧基、芳基、经取代的芳基、杂芳基、经取代的杂芳基、环烷基、经取代的环烷基、杂环基以及经取代的杂环基。在某些实施方案中，Y2为氢。在某些实施方案中，Y2为卤素，诸如F、Cl、Br或I。在某些实施方案中，Y2为F。在某些实施方案中，Y2为Cl。在某些实施方案中，Y2为Br。在某些实施方案中，Y2为I。在某些实施方案中，Y2为烷基或经取代的烷基。在某些实施方案中，Y2为烯基或经取代的烯基。在某些实施方案中，Y2为炔基或经取代的炔基。在某些实施方案中，Y2为烷氧基或经取代的烷氧基。在某些实施方案中，Y2为氨基或经取代的氨基。在某些实施方案中，Y2为羧基或羧基酯。在某些实施方案中，Y2为酰基或酰氧基。在某些实施方案中，Y2为酰基氨基或氨基酰基。在某些实施方案中，Y2为烷基酰胺或经取代的烷基酰胺。在某些实施方案中，Y2为磺酰基。在某些实施方案中，Y2为硫代烷氧基或经取代的硫代烷氧基。在某些实施方案中，Y2为芳基或经取代的芳基。在某些实施方案中，Y2为杂芳基或经取代的杂芳基。在某些实施方案中，Y2为环烷基或经取代的环烷基。在某些实施方案中，Y2为杂环基或经取代的杂环基。
在某些实施方案中，Y3选自氢、卤素、烷基、经取代的烷基、烯基、经取代的烯基、炔基、经取代的炔基、烷氧基、经取代的烷氧基、氨基、经取代的氨基、羧基、羧基酯、酰基、酰氧基、酰基氨基、氨基酰基、烷基酰胺、经取代的烷基酰胺、磺酰基、硫代烷氧基、经取代的硫代烷氧基、芳基、经取代的芳基、杂芳基、经取代的杂芳基、环烷基、经取代的环烷基、杂环基以及经取代的杂环基。在某些实施方案中，Y3为氢。在某些实施方案中，Y3为卤素，诸如F、Cl、Br或I。在某些实施方案中，Y3为F。在某些实施方案中，Y3为Cl。在某些实施方案中，Y3为Br。在某些实施方案中，Y3为I。在某些实施方案中，Y3为烷基或经取代的烷基。在某些实施方案中，Y3为烯基或经取代的烯基。在某些实施方案中，Y3为炔基或经取代的炔基。在某些实施方案中，Y3为烷氧基或经取代的烷氧基。在某些实施方案中，Y3为氨基或经取代的氨基。在某些实施方案中，Y3为羧基或羧基酯。在某些实施方案中，Y3为酰基或酰氧基。在某些实施方案中，Y3为酰基氨基或氨基酰基。在某些实施方案中，Y3为烷基酰胺或经取代的烷基酰胺。在某些实施方案中，Y3为磺酰基。在某些实施方案中，Y3为硫代烷氧基或经取代的硫代烷氧基。在某些实施方案中，Y3为芳基或经取代的芳基。在某些实施方案中，Y3为杂芳基或经取代的杂芳基。在某些实施方案中，Y3为环烷基或经取代的环烷基。在某些实施方案中，Y3为杂环基或经取代的杂环基。
在某些实施方案中，Y4选自氢、卤素、烷基、经取代的烷基、烯基、经取代的烯基、炔基、经取代的炔基、烷氧基、经取代的烷氧基、氨基、经取代的氨基、羧基、羧基酯、酰基、酰氧基、酰基氨基、氨基酰基、烷基酰胺、经取代的烷基酰胺、磺酰基、硫代烷氧基、经取代的硫代烷氧基、芳基、经取代的芳基、杂芳基、经取代的杂芳基、环烷基、经取代的环烷基、杂环基以及经取代的杂环基。在某些实施方案中，Y4为氢。在某些实施方案中，Y4为卤素，诸如F、Cl、Br或I。在某些实施方案中，Y4为F。在某些实施方案中，Y4为Cl。在某些实施方案中，Y4为Br。在某些实施方案中，Y4为I。在某些实施方案中，Y4为烷基或经取代的烷基。在某些实施方案中，Y4为烯基或经取代的烯基。在某些实施方案中，Y4为炔基或经取代的炔基。在某些实施方案中，Y4为烷氧基或经取代的烷氧基。在某些实施方案中，Y4为氨基或经取代的氨基。在某些实施方案中，Y4为羧基或羧基酯。在某些实施方案中，Y4为酰基或酰氧基。在某些实施方案中，Y4为酰基氨基或氨基酰基。在某些实施方案中，Y4为烷基酰胺或经取代的烷基酰胺。在某些实施方案中，Y4为磺酰基。在某些实施方案中，Y4为硫代烷氧基或经取代的硫代烷氧基。在某些实施方案中，Y4为芳基或经取代的芳基。在某些实施方案中，Y4为杂芳基或经取代的杂芳基。在某些实施方案中，Y4为环烷基或经取代的环烷基。在某些实施方案中，Y4为杂环基或经取代的杂环基。
在某些实施方案中，L为任选的连接子。在某些实施方案中，L不存在，并且因此吲哚环的氮直接键结至W1。在某些实施方案中，L存在，并且因此吲哚环的氮经由连接子L间接键结至W1。
在某些实施方案中，L包括选自以下的基团：烷基、经取代的烷基、烯基、经取代的烯基、炔基、经取代的炔基、烷氧基、经取代的烷氧基、氨基、经取代的氨基、羧基、羧基酯、酰基氨基、烷基酰胺、经取代的烷基酰胺、芳基、经取代的芳基、杂芳基、经取代的杂芳基、环烷基、经取代的环烷基、杂环基以及经取代的杂环基。在某些实施方案中，L包括烷基或经取代的烷基。在某些实施方案中，L包括烯基或经取代的烯基。在某些实施方案中，L包括炔基或经取代的炔基。在某些实施方案中，L包括烷氧基或经取代的烷氧基。在某些实施方案中，L包括氨基或经取代的氨基。在某些实施方案中，L包括羧基或羧基酯基。在某些实施方案中，L包括酰基氨基。在某些实施方案中，L包括烷基酰胺或经取代的烷基酰胺基。在某些实施方案中，L包括芳基或经取代的芳基。在某些实施方案中，L包括杂芳基或经取代的杂芳基。在某些实施方案中，L包括环烷基或经取代的环烷基。在某些实施方案中，L包括杂环基或经取代的杂环基。
在某些实施方案中，L包括聚合物。举例来说，聚合物可以包括聚烷二醇和其衍生物，包括聚乙二醇、甲氧基聚乙二醇、聚乙二醇均聚物、聚丙二醇均聚物、乙二醇与丙二醇的共聚物(例如，其中均聚物和共聚物未经取代或在一端被烷基取代)、聚乙烯醇、聚乙烯基乙基醚、聚乙烯吡咯烷酮、其组合，等等。在某些实施方案中，聚合物为聚烷二醇。在某些实施方案中，聚合物为聚乙二醇。
在某些实施方案中，W1选自药物、可检测标记以及多肽。在某些实施方案中，W1为药物。在某些实施方案中，W1为可检测标记。在某些实施方案中，W1为多肽。
在某些实施方案中，W2选自药物、可检测标记以及多肽。在某些实施方案中，W2为药物。在某些实施方案中，W2为可检测标记。在某些实施方案中，W2为多肽。
在某些实施方案中，W1和W2中的一者为多肽并且另一者为药物或可检测标记。在某些实施方案中，W1为药物或可检测标记，并且W2为多肽。在某些实施方案中，W1为多肽，并且W2为药物或可检测标记。
在某些实施方案中，偶联物包括式(IIa)的至少一个修饰的氨基酸残基：
在某些实施方案中，式(IIa)中的取代基如上文关于式(II)所描述。举例来说，在某些实施方案中，R1选自氢、烷基、经取代的烷基、烯基、经取代的烯基、炔基、经取代的炔基、芳基、经取代的芳基、杂芳基、经取代的杂芳基、环烷基、经取代的环烷基、杂环基以及经取代的杂环基。在某些实施方案中，R1为氢。在某些实施方案中，R1为烷基或经取代的烷基。在某些实施方案中，R1为烯基或经取代的烯基。在某些实施方案中，R1为炔基或经取代的炔基。在某些实施方案中，R1为芳基或经取代的芳基。在某些实施方案中，R1为杂芳基或经取代的杂芳基。在某些实施方案中，R1为环烷基或经取代的环烷基。在某些实施方案中，R1为杂环基或经取代的杂环基。
在式(IIa)的某些实施方案中，R2选自氢、烷基、经取代的烷基、烯基、经取代的烯基、炔基、经取代的炔基、烷氧基、经取代的烷氧基、氨基、经取代的氨基、羧基、羧基酯、酰基、酰氧基、酰基氨基、氨基酰基、烷基酰胺、经取代的烷基酰胺、磺酰基、硫代烷氧基、经取代的硫代烷氧基、芳基、经取代的芳基、杂芳基、经取代的杂芳基、环烷基、经取代的环烷基、杂环基以及经取代的杂环基。在某些实施方案中，R2为氢。在某些实施方案中，R2为烷基或经取代的烷基。在某些实施方案中，R2为烯基或经取代的烯基。在某些实施方案中，R2为炔基或经取代的炔基。在某些实施方案中，R2为烷氧基或经取代的烷氧基。在某些实施方案中，R2为氨基或经取代的氨基。在某些实施方案中，R2为羧基或羧基酯。在某些实施方案中，R2为酰基或酰氧基。在某些实施方案中，R2为酰基氨基或氨基酰基。在某些实施方案中，R2为烷基酰胺或经取代的烷基酰胺。在某些实施方案中，R2为磺酰基。在某些实施方案中，R2为硫代烷氧基或经取代的硫代烷氧基。在某些实施方案中，R2为芳基或经取代的芳基。在某些实施方案中，R2为杂芳基或经取代的杂芳基。在某些实施方案中，R2为环烷基或经取代的环烷基。在某些实施方案中，R2为杂环基或经取代的杂环基。
在式(IIa)的某些实施方案中，R2为烷基或经取代的烷基。举例来说，R2可以为烷基或经取代的烷基，诸如C1-C10烷基或C1-C10经取代的烷基(例如，C1-C6烷基或C1-C6经取代的烷基)。在一些情况下，R2为甲基、乙基、正丙基、异丙基、正丁基、仲丁基、异丁基、叔丁基，等等。在某些情况下，R2为甲基。
在式(IIa)的某些实施方案中，R3选自氢、烷基、经取代的烷基、烯基、经取代的烯基、炔基、经取代的炔基、烷氧基、经取代的烷氧基、氨基、经取代的氨基、羧基、羧基酯、酰基、酰氧基、酰基氨基、氨基酰基、烷基酰胺、经取代的烷基酰胺、磺酰基、硫代烷氧基、经取代的硫代烷氧基、芳基、经取代的芳基、杂芳基、经取代的杂芳基、环烷基、经取代的环烷基、杂环基以及经取代的杂环基。在某些实施方案中，R3为氢。在某些实施方案中，R3为烷基或经取代的烷基。在某些实施方案中，R3为烯基或经取代的烯基。在某些实施方案中，R3为炔基或经取代的炔基。在某些实施方案中，R3为烷氧基或经取代的烷氧基。在某些实施方案中，R3为氨基或经取代的氨基。在某些实施方案中，R3为羧基或羧基酯。在某些实施方案中，R3为酰基或酰氧基。在某些实施方案中，R3为酰基氨基或氨基酰基。在某些实施方案中，R3为烷基酰胺或经取代的烷基酰胺。在某些实施方案中，R3为磺酰基。在某些实施方案中，R3为硫代烷氧基或经取代的硫代烷氧基。在某些实施方案中，R3为芳基或经取代的芳基。在某些实施方案中，R3为杂芳基或经取代的杂芳基。在某些实施方案中，R3为环烷基或经取代的环烷基。在某些实施方案中，R3为杂环基或经取代的杂环基。
在式(IIa)的某些实施方案中，R3为烷基或经取代的烷基。举例来说，R3可以为烷基或经取代的烷基，诸如C1-C10烷基或C1-C10经取代的烷基(例如，C1-C6烷基或C1-C6经取代的烷基)。在一些情况下，R3为甲基、乙基、正丙基、异丙基、正丁基、仲丁基、异丁基、叔丁基，等等。在某些情况下，R3为甲基。
在式(IIa)的某些实施方案中，R2和R3各自独立地选自烷基和经取代的烷基。举例来说，R2可以为烷基或经取代的烷基，诸如C1-C10烷基或C1-C10经取代的烷基(例如，C1-C6烷基或C1-C6经取代的烷基)，并且R3可以为烷基或经取代的烷基，诸如C1-C10烷基或C1-C10经取代的烷基(例如，C1-C6烷基或C1-C6经取代的烷基)。在一些情况下，R2和R3各自独立地选自甲基、乙基、正丙基、异丙基、正丁基、仲丁基、异丁基、叔丁基，等等。在某些情况下，R2和R3各自为甲基。
在式(IIa)的某些实施方案中，Y1选自氢、卤素、烷基、经取代的烷基、烯基、经取代的烯基、炔基、经取代的炔基、烷氧基、经取代的烷氧基、氨基、经取代的氨基、羧基、羧基酯、酰基、酰氧基、酰基氨基、氨基酰基、烷基酰胺、经取代的烷基酰胺、磺酰基、硫代烷氧基、经取代的硫代烷氧基、芳基、经取代的芳基、杂芳基、经取代的杂芳基、环烷基、经取代的环烷基、杂环基以及经取代的杂环基。在某些实施方案中，Y1为氢。在某些实施方案中，Y1为卤素，诸如F、Cl、Br或I。在某些实施方案中，Y1为F。在某些实施方案中，Y1为Cl。在某些实施方案中，Y1为Br。在某些实施方案中，Y1为I。在某些实施方案中，Y1为烷基或经取代的烷基。在某些实施方案中，Y1为烯基或经取代的烯基。在某些实施方案中，Y1为炔基或经取代的炔基。在某些实施方案中，Y1为烷氧基或经取代的烷氧基。在某些实施方案中，Y1为氨基或经取代的氨基。在某些实施方案中，Y1为羧基或羧基酯。在某些实施方案中，Y1为酰基或酰氧基。在某些实施方案中，Y1为酰基氨基或氨基酰基。在某些实施方案中，Y1为烷基酰胺或经取代的烷基酰胺。在某些实施方案中，Y1为磺酰基。在某些实施方案中，Y1为硫代烷氧基或经取代的硫代烷氧基。在某些实施方案中，Y1为芳基或经取代的芳基。在某些实施方案中，Y1为杂芳基或经取代的杂芳基。在某些实施方案中，Y1为环烷基或经取代的环烷基。在某些实施方案中，Y1为杂环基或经取代的杂环基。
在式(IIa)的某些实施方案中，Y2选自氢、卤素、烷基、经取代的烷基、烯基、经取代的烯基、炔基、经取代的炔基、烷氧基、经取代的烷氧基、氨基、经取代的氨基、羧基、羧基酯、酰基、酰氧基、酰基氨基、氨基酰基、烷基酰胺、经取代的烷基酰胺、磺酰基、硫代烷氧基、经取代的硫代烷氧基、芳基、经取代的芳基、杂芳基、经取代的杂芳基、环烷基、经取代的环烷基、杂环基以及经取代的杂环基。在某些实施方案中，Y2为氢。在某些实施方案中，Y2为卤素，诸如F、Cl、Br或I。在某些实施方案中，Y2为F。在某些实施方案中，Y2为Cl。在某些实施方案中，Y2为Br。在某些实施方案中，Y2为I。在某些实施方案中，Y2为烷基或经取代的烷基。在某些实施方案中，Y2为烯基或经取代的烯基。在某些实施方案中，Y2为炔基或经取代的炔基。在某些实施方案中，Y2为烷氧基或经取代的烷氧基。在某些实施方案中，Y2为氨基或经取代的氨基。在某些实施方案中，Y2为羧基或羧基酯。在某些实施方案中，Y2为酰基或酰氧基。在某些实施方案中，Y2为酰基氨基或氨基酰基。在某些实施方案中，Y2为烷基酰胺或经取代的烷基酰胺。在某些实施方案中，Y2为磺酰基。在某些实施方案中，Y2为硫代烷氧基或经取代的硫代烷氧基。在某些实施方案中，Y2为芳基或经取代的芳基。在某些实施方案中，Y2为杂芳基或经取代的杂芳基。在某些实施方案中，Y2为环烷基或经取代的环烷基。在某些实施方案中，Y2为杂环基或经取代的杂环基。
在式(IIa)的某些实施方案中，Y3选自氢、卤素、烷基、经取代的烷基、烯基、经取代的烯基、炔基、经取代的炔基、烷氧基、经取代的烷氧基、氨基、经取代的氨基、羧基、羧基酯、酰基、酰氧基、酰基氨基、氨基酰基、烷基酰胺、经取代的烷基酰胺、磺酰基、硫代烷氧基、经取代的硫代烷氧基、芳基、经取代的芳基、杂芳基、经取代的杂芳基、环烷基、经取代的环烷基、杂环基以及经取代的杂环基。在某些实施方案中，Y3为氢。在某些实施方案中，Y3为卤素，诸如F、Cl、Br或I。在某些实施方案中，Y3为F。在某些实施方案中，Y3为Cl。在某些实施方案中，Y3为Br。在某些实施方案中，Y3为I。在某些实施方案中，Y3为烷基或经取代的烷基。在某些实施方案中，Y3为烯基或经取代的烯基。在某些实施方案中，Y3为炔基或经取代的炔基。在某些实施方案中，Y3为烷氧基或经取代的烷氧基。在某些实施方案中，Y3为氨基或经取代的氨基。在某些实施方案中，Y3为羧基或羧基酯。在某些实施方案中，Y3为酰基或酰氧基。在某些实施方案中，Y3为酰基氨基或氨基酰基。在某些实施方案中，Y3为烷基酰胺或经取代的烷基酰胺。在某些实施方案中，Y3为磺酰基。在某些实施方案中，Y3为硫代烷氧基或经取代的硫代烷氧基。在某些实施方案中，Y3为芳基或经取代的芳基。在某些实施方案中，Y3为杂芳基或经取代的杂芳基。在某些实施方案中，Y3为环烷基或经取代的环烷基。在某些实施方案中，Y3为杂环基或经取代的杂环基。
在式(IIa)的某些实施方案中，Y4选自氢、卤素、烷基、经取代的烷基、烯基、经取代的烯基、炔基、经取代的炔基、烷氧基、经取代的烷氧基、氨基、经取代的氨基、羧基、羧基酯、酰基、酰氧基、酰基氨基、氨基酰基、烷基酰胺、经取代的烷基酰胺、磺酰基、硫代烷氧基、经取代的硫代烷氧基、芳基、经取代的芳基、杂芳基、经取代的杂芳基、环烷基、经取代的环烷基、杂环基以及经取代的杂环基。在某些实施方案中，Y4为氢。在某些实施方案中，Y4为卤素，诸如F、Cl、Br或I。在某些实施方案中，Y4为F。在某些实施方案中，Y4为Cl。在某些实施方案中，Y4为Br。在某些实施方案中，Y4为I。在某些实施方案中，Y4为烷基或经取代的烷基。在某些实施方案中，Y4为烯基或经取代的烯基。在某些实施方案中，Y4为炔基或经取代的炔基。在某些实施方案中，Y4为烷氧基或经取代的烷氧基。在某些实施方案中，Y4为氨基或经取代的氨基。在某些实施方案中，Y4为羧基或羧基酯。在某些实施方案中，Y4为酰基或酰氧基。在某些实施方案中，Y4为酰基氨基或氨基酰基。在某些实施方案中，Y4为烷基酰胺或经取代的烷基酰胺。在某些实施方案中，Y4为磺酰基。在某些实施方案中，Y4为硫代烷氧基或经取代的硫代烷氧基。在某些实施方案中，Y4为芳基或经取代的芳基。在某些实施方案中，Y4为杂芳基或经取代的杂芳基。在某些实施方案中，Y4为环烷基或经取代的环烷基。在某些实施方案中，Y4为杂环基或经取代的杂环基。
在式(IIa)的某些实施方案中，L为任选的连接子。在某些实施方案中，L不存在，并且因此吲哚环的氮直接键结至W1。在某些实施方案中，L存在，并且因此吲哚环的氮经由连接子L间接键结至W1。
在式(IIa)的某些实施方案中，L包括选自以下的基团：烷基、经取代的烷基、烯基、经取代的烯基、炔基、经取代的炔基、烷氧基、经取代的烷氧基、氨基、经取代的氨基、羧基、羧基酯、酰基氨基、烷基酰胺、经取代的烷基酰胺、芳基、经取代的芳基、杂芳基、经取代的杂芳基、环烷基、经取代的环烷基、杂环基以及经取代的杂环基。在某些实施方案中，L包括烷基或经取代的烷基。在某些实施方案中，L包括烯基或经取代的烯基。在某些实施方案中，L包括炔基或经取代的炔基。在某些实施方案中，L包括烷氧基或经取代的烷氧基。在某些实施方案中，L包括氨基或经取代的氨基。在某些实施方案中，L包括羧基或羧基酯基。在某些实施方案中，L包括酰基氨基。在某些实施方案中，L包括烷基酰胺或经取代的烷基酰胺基。在某些实施方案中，L包括芳基或经取代的芳基。在某些实施方案中，L包括杂芳基或经取代的杂芳基。在某些实施方案中，L包括环烷基或经取代的环烷基。在某些实施方案中，L包括杂环基或经取代的杂环基。
在式(IIa)的某些实施方案中，L包括聚合物。举例来说，聚合物可以包括聚烷二醇和其衍生物，包括聚乙二醇、甲氧基聚乙二醇、聚乙二醇均聚物、聚丙二醇均聚物、乙二醇与丙二醇的共聚物(例如，其中均聚物和共聚物未经取代或在一端被烷基取代)、聚乙烯醇、聚乙烯基乙基醚、聚乙烯吡咯烷酮、其组合，等等。在某些实施方案中，聚合物为聚烷二醇。在某些实施方案中，聚合物为聚乙二醇。
在式(IIa)的某些实施方案中，W1选自药物、可检测标记以及多肽。在某些实施方案中，W1为药物。在某些实施方案中，W1为可检测标记。在某些实施方案中，W1为多肽。
在式(IIa)的某些实施方案中，W2选自药物、可检测标记以及多肽。在某些实施方案中，W2为药物。在某些实施方案中，W2为可检测标记。在某些实施方案中，W2为多肽。
在式(IIa)的某些实施方案中，W1和W2中的一者为多肽并且另一者为药物或可检测标记。在某些实施方案中，W1为药物或可检测标记，并且W2为多肽。在某些实施方案中，W1为多肽，并且W2为药物或可检测标记。
在某些实施方案中，偶联物包括式(IIb)的至少一个修饰的氨基酸残基：
在某些实施方案中，式(IIb)中的取代基如上文关于式(II)所描述。举例来说，在某些实施方案中，L为任选的连接子。在某些实施方案中，L不存在，并且因此吲哚环的氮直接键结至W1。在某些实施方案中，L存在，并且因此吲哚环的氮经由连接子L间接键结至W1。
在式(IIb)的某些实施方案中，L包括选自以下的基团：烷基、经取代的烷基、烯基、经取代的烯基、炔基、经取代的炔基、烷氧基、经取代的烷氧基、氨基、经取代的氨基、羧基、羧基酯、酰基氨基、烷基酰胺、经取代的烷基酰胺、芳基、经取代的芳基、杂芳基、经取代的杂芳基、环烷基、经取代的环烷基、杂环基以及经取代的杂环基。在某些实施方案中，L包括烷基或经取代的烷基。在某些实施方案中，L包括烯基或经取代的烯基。在某些实施方案中，L包括炔基或经取代的炔基。在某些实施方案中，L包括烷氧基或经取代的烷氧基。在某些实施方案中，L包括氨基或经取代的氨基。在某些实施方案中，L包括羧基或羧基酯基。在某些实施方案中，L包括酰基氨基。在某些实施方案中，L包括烷基酰胺或经取代的烷基酰胺基。在某些实施方案中，L包括芳基或经取代的芳基。在某些实施方案中，L包括杂芳基或经取代的杂芳基。在某些实施方案中，L包括环烷基或经取代的环烷基。在某些实施方案中，L包括杂环基或经取代的杂环基。
在式(IIb)的某些实施方案中，L包括聚合物。举例来说，聚合物可以包括聚烷二醇和其衍生物，包括聚乙二醇、甲氧基聚乙二醇、聚乙二醇均聚物、聚丙二醇均聚物、乙二醇与丙二醇的共聚物(例如，其中均聚物和共聚物未经取代或在一端被烷基取代)、聚乙烯醇、聚乙烯基乙基醚、聚乙烯吡咯烷酮、其组合，等等。在某些实施方案中，聚合物为聚烷二醇。在某些实施方案中，聚合物为聚乙二醇。
在式(IIb)的某些实施方案中，W1选自药物、可检测标记以及多肽。在某些实施方案中，W1为药物。在某些实施方案中，W1为可检测标记。在某些实施方案中，W1为多肽。
在式(IIb)的某些实施方案中，W2选自药物、可检测标记以及多肽。在某些实施方案中，W2为药物。在某些实施方案中，W2为可检测标记。在某些实施方案中，W2为多肽。
在式(IIb)的某些实施方案中，W1和W2中的一者为多肽并且另一者为药物或可检测标记。在某些实施方案中，W1为药物或可检测标记，并且W2为多肽。在某些实施方案中，W1为多肽，并且W2为药物或可检测标记。
在某些实施方案中，偶联物包括式(III)的至少一个修饰的氨基酸残基：
其中
n为0或1；
R1选自氢、烷基、经取代的烷基、烯基、经取代的烯基、炔基、经取代的炔基、芳基、经取代的芳基、杂芳基、经取代的杂芳基、环烷基、经取代的环烷基、杂环基以及经取代的杂环基；
R2和R3各自独立地选自氢、烷基、经取代的烷基、烯基、经取代的烯基、炔基、经取代的炔基、烷氧基、经取代的烷氧基、氨基、经取代的氨基、羧基、羧基酯、酰基、酰氧基、酰基氨基、氨基酰基、烷基酰胺、经取代的烷基酰胺、磺酰基、硫代烷氧基、经取代的硫代烷氧基、芳基、经取代的芳基、杂芳基、经取代的杂芳基、环烷基、经取代的环烷基、杂环基以及经取代的杂环基；
X1、X2、X3以及X4各自独立地选自C、N、O以及S；
Y1、Y2、Y3以及Y5各自独立地选自氢、卤素、烷基、经取代的烷基、烯基、经取代的烯基、炔基、经取代的炔基、烷氧基、经取代的烷氧基、氨基、经取代的氨基、羧基、羧基酯、酰基、酰氧基、酰基氨基、氨基酰基、烷基酰胺、经取代的烷基酰胺、磺酰基、硫代烷氧基、经取代的硫代烷氧基、芳基、经取代的芳基、杂芳基、经取代的杂芳基、环烷基、经取代的环烷基、杂环基以及经取代的杂环基；
L为任选的连接子；并且
其中W1和W2中的一者为多肽并且另一者为药物或可检测标记。
在某些实施方案中，n为0或1。在某些实施方案中，n为0。在某些实施方案中，n为1。
在某些实施方案中，R1选自氢、烷基、经取代的烷基、烯基、经取代的烯基、炔基、经取代的炔基、芳基、经取代的芳基、杂芳基、经取代的杂芳基、环烷基、经取代的环烷基、杂环基以及经取代的杂环基。在某些实施方案中，R1为氢。在某些实施方案中，R1为烷基或经取代的烷基。在某些实施方案中，R1为烯基或经取代的烯基。在某些实施方案中，R1为炔基或经取代的炔基。在某些实施方案中，R1为芳基或经取代的芳基。在某些实施方案中，R1为杂芳基或经取代的杂芳基。在某些实施方案中，R1为环烷基或经取代的环烷基。在某些实施方案中，R1为杂环基或经取代的杂环基。
在某些实施方案中，R2选自氢、烷基、经取代的烷基、烯基、经取代的烯基、炔基、经取代的炔基、烷氧基、经取代的烷氧基、氨基、经取代的氨基、羧基、羧基酯、酰基、酰氧基、酰基氨基、氨基酰基、烷基酰胺、经取代的烷基酰胺、磺酰基、硫代烷氧基、经取代的硫代烷氧基、芳基、经取代的芳基、杂芳基、经取代的杂芳基、环烷基、经取代的环烷基、杂环基以及经取代的杂环基。在某些实施方案中，R2为氢。在某些实施方案中，R2为烷基或经取代的烷基。在某些实施方案中，R2为烯基或经取代的烯基。在某些实施方案中，R2为炔基或经取代的炔基。在某些实施方案中，R2为烷氧基或经取代的烷氧基。在某些实施方案中，R2为氨基或经取代的氨基。在某些实施方案中，R2为羧基或羧基酯。在某些实施方案中，R2为酰基或酰氧基。在某些实施方案中，R2为酰基氨基或氨基酰基。在某些实施方案中，R2为烷基酰胺或经取代的烷基酰胺。在某些实施方案中，R2为磺酰基。在某些实施方案中，R2为硫代烷氧基或经取代的硫代烷氧基。在某些实施方案中，R2为芳基或经取代的芳基。在某些实施方案中，R2为杂芳基或经取代的杂芳基。在某些实施方案中，R2为环烷基或经取代的环烷基。在某些实施方案中，R2为杂环基或经取代的杂环基。
在某些实施方案中，R2为烷基或经取代的烷基。举例来说，R2可以为烷基或经取代的烷基，诸如C1-C10烷基或C1-C10经取代的烷基(例如，C1-C6烷基或C1-C6经取代的烷基)。在一些情况下，R2为甲基、乙基、正丙基、异丙基、正丁基、仲丁基、异丁基、叔丁基，等等。在某些情况下，R2为甲基。
在某些实施方案中，R3选自氢、烷基、经取代的烷基、烯基、经取代的烯基、炔基、经取代的炔基、烷氧基、经取代的烷氧基、氨基、经取代的氨基、羧基、羧基酯、酰基、酰氧基、酰基氨基、氨基酰基、烷基酰胺、经取代的烷基酰胺、磺酰基、硫代烷氧基、经取代的硫代烷氧基、芳基、经取代的芳基、杂芳基、经取代的杂芳基、环烷基、经取代的环烷基、杂环基以及经取代的杂环基。在某些实施方案中，R3为氢。在某些实施方案中，R3为烷基或经取代的烷基。在某些实施方案中，R3为烯基或经取代的烯基。在某些实施方案中，R3为炔基或经取代的炔基。在某些实施方案中，R3为烷氧基或经取代的烷氧基。在某些实施方案中，R3为氨基或经取代的氨基。在某些实施方案中，R3为羧基或羧基酯。在某些实施方案中，R3为酰基或酰氧基。在某些实施方案中，R3为酰基氨基或氨基酰基。在某些实施方案中，R3为烷基酰胺或经取代的烷基酰胺。在某些实施方案中，R3为磺酰基。在某些实施方案中，R3为硫代烷氧基或经取代的硫代烷氧基。在某些实施方案中，R3为芳基或经取代的芳基。在某些实施方案中，R3为杂芳基或经取代的杂芳基。在某些实施方案中，R3为环烷基或经取代的环烷基。在某些实施方案中，R3为杂环基或经取代的杂环基。
在某些实施方案中，R3为烷基或经取代的烷基。举例来说，R3可以为烷基或经取代的烷基，诸如C1-C10烷基或C1-C10经取代的烷基(例如，C1-C6烷基或C1-C6经取代的烷基)。在一些情况下，R3为甲基、乙基、正丙基、异丙基、正丁基、仲丁基、异丁基、叔丁基，等等。在某些情况下，R3为甲基。
在某些实施方案中，R2和R3各自独立地选自烷基和经取代的烷基。举例来说，R2可以为烷基或经取代的烷基，诸如C1-C10烷基或C1-C10经取代的烷基(例如，C1-C6烷基或C1-C6经取代的烷基)，并且R3可以为烷基或经取代的烷基，诸如C1-C10烷基或C1-C10经取代的烷基(例如，C1-C6烷基或C1-C6经取代的烷基)。在一些情况下，R2和R3各自独立地选自甲基、乙基、正丙基、异丙基、正丁基、仲丁基、异丁基、叔丁基，等等。在某些情况下，R2和R3各自为甲基。
在某些实施方案中，X1选自C、N、O以及S。在某些实施方案中，X1为C。在某些实施方案中，X1为N。在某些实施方案中，X1为O。在某些实施方案中，X1为S。
在某些实施方案中，X2选自C、N、O以及S。在某些实施方案中，X2为C。在某些实施方案中，X2为N。在某些实施方案中，X2为O。在某些实施方案中，X2为S。
在某些实施方案中，X3选自C、N、O以及S。在某些实施方案中，X3为C。在某些实施方案中，X3为N。在某些实施方案中，X3为O。在某些实施方案中，X3为S。
在某些实施方案中，X4选自C、N、O以及S。在某些实施方案中，X4为C。在某些实施方案中，X4为N。在某些实施方案中，X4为O。在某些实施方案中，X4为S。
X1、X2、X3以及X4的各种组合是可能的。举例来说，在某些实施方案中，X1、X2、X3以及X4中的每一者为C。在其它情况下，X1、X2、X3以及X4中的三者为C并且X1、X2、X3以及X4中的一者为N。在其它实施方案中，X1、X2、X3以及X4中的两者为C并且X1、X2、X3以及X4中的两者为N。在其它实施方案中，X1、X2、X3以及X4中的一者为C并且X1、X2、X3以及X4中的三者为N。在需要时，C、N、O以及S的其它组合对于X1、X2、X3以及X4是可能的。
在某些实施方案中，Y1选自氢、卤素、烷基、经取代的烷基、烯基、经取代的烯基、炔基、经取代的炔基、烷氧基、经取代的烷氧基、氨基、经取代的氨基、羧基、羧基酯、酰基、酰氧基、酰基氨基、氨基酰基、烷基酰胺、经取代的烷基酰胺、磺酰基、硫代烷氧基、经取代的硫代烷氧基、芳基、经取代的芳基、杂芳基、经取代的杂芳基、环烷基、经取代的环烷基、杂环基以及经取代的杂环基。在某些实施方案中，Y1为氢。在某些实施方案中，Y1为卤素，诸如F、Cl、Br或I。在某些实施方案中，Y1为F。在某些实施方案中，Y1为Cl。在某些实施方案中，Y1为Br。在某些实施方案中，Y1为I。在某些实施方案中，Y1为烷基或经取代的烷基。在某些实施方案中，Y1为烯基或经取代的烯基。在某些实施方案中，Y1为炔基或经取代的炔基。在某些实施方案中，Y1为烷氧基或经取代的烷氧基。在某些实施方案中，Y1为氨基或经取代的氨基。在某些实施方案中，Y1为羧基或羧基酯。在某些实施方案中，Y1为酰基或酰氧基。在某些实施方案中，Y1为酰基氨基或氨基酰基。在某些实施方案中，Y1为烷基酰胺或经取代的烷基酰胺。在某些实施方案中，Y1为磺酰基。在某些实施方案中，Y1为硫代烷氧基或经取代的硫代烷氧基。在某些实施方案中，Y1为芳基或经取代的芳基。在某些实施方案中，Y1为杂芳基或经取代的杂芳基。在某些实施方案中，Y1为环烷基或经取代的环烷基。在某些实施方案中，Y1为杂环基或经取代的杂环基。
在某些实施方案中，Y2选自氢、卤素、烷基、经取代的烷基、烯基、经取代的烯基、炔基、经取代的炔基、烷氧基、经取代的烷氧基、氨基、经取代的氨基、羧基、羧基酯、酰基、酰氧基、酰基氨基、氨基酰基、烷基酰胺、经取代的烷基酰胺、磺酰基、硫代烷氧基、经取代的硫代烷氧基、芳基、经取代的芳基、杂芳基、经取代的杂芳基、环烷基、经取代的环烷基、杂环基以及经取代的杂环基。在某些实施方案中，Y2为氢。在某些实施方案中，Y2为卤素，诸如F、Cl、Br或I。在某些实施方案中，Y2为F。在某些实施方案中，Y2为Cl。在某些实施方案中，Y2为Br。在某些实施方案中，Y2为I。在某些实施方案中，Y2为烷基或经取代的烷基。在某些实施方案中，Y2为烯基或经取代的烯基。在某些实施方案中，Y2为炔基或经取代的炔基。在某些实施方案中，Y2为烷氧基或经取代的烷氧基。在某些实施方案中，Y2为氨基或经取代的氨基。在某些实施方案中，Y2为羧基或羧基酯。在某些实施方案中，Y2为酰基或酰氧基。在某些实施方案中，Y2为酰基氨基或氨基酰基。在某些实施方案中，Y2为烷基酰胺或经取代的烷基酰胺。在某些实施方案中，Y2为磺酰基。在某些实施方案中，Y2为硫代烷氧基或经取代的硫代烷氧基。在某些实施方案中，Y2为芳基或经取代的芳基。在某些实施方案中，Y2为杂芳基或经取代的杂芳基。在某些实施方案中，Y2为环烷基或经取代的环烷基。在某些实施方案中，Y2为杂环基或经取代的杂环基。
在某些实施方案中，Y3选自氢、卤素、烷基、经取代的烷基、烯基、经取代的烯基、炔基、经取代的炔基、烷氧基、经取代的烷氧基、氨基、经取代的氨基、羧基、羧基酯、酰基、酰氧基、酰基氨基、氨基酰基、烷基酰胺、经取代的烷基酰胺、磺酰基、硫代烷氧基、经取代的硫代烷氧基、芳基、经取代的芳基、杂芳基、经取代的杂芳基、环烷基、经取代的环烷基、杂环基以及经取代的杂环基。在某些实施方案中，Y3为氢。在某些实施方案中，Y3为卤素，诸如F、Cl、Br或I。在某些实施方案中，Y3为F。在某些实施方案中，Y3为Cl。在某些实施方案中，Y3为Br。在某些实施方案中，Y3为I。在某些实施方案中，Y3为烷基或经取代的烷基。在某些实施方案中，Y3为烯基或经取代的烯基。在某些实施方案中，Y3为炔基或经取代的炔基。在某些实施方案中，Y3为烷氧基或经取代的烷氧基。在某些实施方案中，Y3为氨基或经取代的氨基。在某些实施方案中，Y3为羧基或羧基酯。在某些实施方案中，Y3为酰基或酰氧基。在某些实施方案中，Y3为酰基氨基或氨基酰基。在某些实施方案中，Y3为烷基酰胺或经取代的烷基酰胺。在某些实施方案中，Y3为磺酰基。在某些实施方案中，Y3为硫代烷氧基或经取代的硫代烷氧基。在某些实施方案中，Y3为芳基或经取代的芳基。在某些实施方案中，Y3为杂芳基或经取代的杂芳基。在某些实施方案中，Y3为环烷基或经取代的环烷基。在某些实施方案中，Y3为杂环基或经取代的杂环基。
在某些实施方案中，Y5选自氢、卤素、烷基、经取代的烷基、烯基、经取代的烯基、炔基、经取代的炔基、烷氧基、经取代的烷氧基、氨基、经取代的氨基、羧基、羧基酯、酰基、酰氧基、酰基氨基、氨基酰基、烷基酰胺、经取代的烷基酰胺、磺酰基、硫代烷氧基、经取代的硫代烷氧基、芳基、经取代的芳基、杂芳基、经取代的杂芳基、环烷基、经取代的环烷基、杂环基以及经取代的杂环基。在某些实施方案中，Y5为氢。在某些实施方案中，Y5为卤素，诸如F、Cl、Br或I。在某些实施方案中，Y5为F。在某些实施方案中，Y5为Cl。在某些实施方案中，Y5为Br。在某些实施方案中，Y5为I。在某些实施方案中，Y5为烷基或经取代的烷基。在某些实施方案中，Y5为烯基或经取代的烯基。在某些实施方案中，Y5为炔基或经取代的炔基。在某些实施方案中，Y5为烷氧基或经取代的烷氧基。在某些实施方案中，Y5为氨基或经取代的氨基。在某些实施方案中，Y5为羧基或羧基酯。在某些实施方案中，Y5为酰基或酰氧基。在某些实施方案中，Y5为酰基氨基或氨基酰基。在某些实施方案中，Y5为烷基酰胺或经取代的烷基酰胺。在某些实施方案中，Y5为磺酰基。在某些实施方案中，Y5为硫代烷氧基或经取代的硫代烷氧基。在某些实施方案中，Y5为芳基或经取代的芳基。在某些实施方案中，Y5为杂芳基或经取代的杂芳基。在某些实施方案中，Y5为环烷基或经取代的环烷基。在某些实施方案中，Y5为杂环基或经取代的杂环基。
在某些实施方案中，L为任选的连接子。在某些实施方案中，L不存在，并且因此吲哚环的氮直接键结至W1。在某些实施方案中，L存在，并且因此吲哚环的氮经由连接子L间接键结至W1。
在某些实施方案中，L包括选自以下的基团：烷基、经取代的烷基、烯基、经取代的烯基、炔基、经取代的炔基、烷氧基、经取代的烷氧基、氨基、经取代的氨基、羧基、羧基酯、酰基氨基、烷基酰胺、经取代的烷基酰胺、芳基、经取代的芳基、杂芳基、经取代的杂芳基、环烷基、经取代的环烷基、杂环基以及经取代的杂环基。在某些实施方案中，L包括烷基或经取代的烷基。在某些实施方案中，L包括烯基或经取代的烯基。在某些实施方案中，L包括炔基或经取代的炔基。在某些实施方案中，L包括烷氧基或经取代的烷氧基。在某些实施方案中，L包括氨基或经取代的氨基。在某些实施方案中，L包括羧基或羧基酯基。在某些实施方案中，L包括酰基氨基。在某些实施方案中，L包括烷基酰胺或经取代的烷基酰胺基。在某些实施方案中，L包括芳基或经取代的芳基。在某些实施方案中，L包括杂芳基或经取代的杂芳基。在某些实施方案中，L包括环烷基或经取代的环烷基。在某些实施方案中，L包括杂环基或经取代的杂环基。
在某些实施方案中，L包括聚合物。举例来说，聚合物可以包括聚烷二醇和其衍生物，包括聚乙二醇、甲氧基聚乙二醇、聚乙二醇均聚物、聚丙二醇均聚物、乙二醇与丙二醇的共聚物(例如，其中均聚物和共聚物未经取代或在一端被烷基取代)、聚乙烯醇、聚乙烯基乙基醚、聚乙烯吡咯烷酮、其组合，等等。在某些实施方案中，聚合物为聚烷二醇。在某些实施方案中，聚合物为聚乙二醇。
在某些实施方案中，W1选自药物、可检测标记以及多肽。在某些实施方案中，W1为药物。在某些实施方案中，W1为可检测标记。在某些实施方案中，W1为多肽。
在某些实施方案中，W2选自药物、可检测标记以及多肽。在某些实施方案中，W2为药物。在某些实施方案中，W2为可检测标记。在某些实施方案中，W2为多肽。
在某些实施方案中，W1和W2中的一者为多肽并且另一者为药物或可检测标记。在某些实施方案中，W1为药物或可检测标记，并且W2为多肽。在某些实施方案中，W1为多肽，并且W2为药物或可检测标记。
在某些实施方案中，偶联物包括式(IIIa)的至少一个修饰的氨基酸残基：
在某些实施方案中，式(IIIa)中的取代基如上文关于式(III)所描述。举例来说，在某些实施方案中，R1选自氢、烷基、经取代的烷基、烯基、经取代的烯基、炔基、经取代的炔基、芳基、经取代的芳基、杂芳基、经取代的杂芳基、环烷基、经取代的环烷基、杂环基以及经取代的杂环基。在某些实施方案中，R1为氢。在某些实施方案中，R1为烷基或经取代的烷基。在某些实施方案中，R1为烯基或经取代的烯基。在某些实施方案中，R1为炔基或经取代的炔基。在某些实施方案中，R1为芳基或经取代的芳基。在某些实施方案中，R1为杂芳基或经取代的杂芳基。在某些实施方案中，R1为环烷基或经取代的环烷基。在某些实施方案中，R1为杂环基或经取代的杂环基。
在式(IIIa)的某些实施方案中，R2选自氢、烷基、经取代的烷基、烯基、经取代的烯基、炔基、经取代的炔基、烷氧基、经取代的烷氧基、氨基、经取代的氨基、羧基、羧基酯、酰基、酰氧基、酰基氨基、氨基酰基、烷基酰胺、经取代的烷基酰胺、磺酰基、硫代烷氧基、经取代的硫代烷氧基、芳基、经取代的芳基、杂芳基、经取代的杂芳基、环烷基、经取代的环烷基、杂环基以及经取代的杂环基。在某些实施方案中，R2为氢。在某些实施方案中，R2为烷基或经取代的烷基。在某些实施方案中，R2为烯基或经取代的烯基。在某些实施方案中，R2为炔基或经取代的炔基。在某些实施方案中，R2为烷氧基或经取代的烷氧基。在某些实施方案中，R2为氨基或经取代的氨基。在某些实施方案中，R2为羧基或羧基酯。在某些实施方案中，R2为酰基或酰氧基。在某些实施方案中，R2为酰基氨基或氨基酰基。在某些实施方案中，R2为烷基酰胺或经取代的烷基酰胺。在某些实施方案中，R2为磺酰基。在某些实施方案中，R2为硫代烷氧基或经取代的硫代烷氧基。在某些实施方案中，R2为芳基或经取代的芳基。在某些实施方案中，R2为杂芳基或经取代的杂芳基。在某些实施方案中，R2为环烷基或经取代的环烷基。在某些实施方案中，R2为杂环基或经取代的杂环基。
在式(IIIa)的某些实施方案中，R2为烷基或经取代的烷基。举例来说，R2可以为烷基或经取代的烷基，诸如C1-C10烷基或C1-C10经取代的烷基(例如，C1-C6烷基或C1-C6经取代的烷基)。在一些情况下，R2为甲基、乙基、正丙基、异丙基、正丁基、仲丁基、异丁基、叔丁基，等等。在某些情况下，R2为甲基。
在式(IIIa)的某些实施方案中，R3选自氢、烷基、经取代的烷基、烯基、经取代的烯基、炔基、经取代的炔基、烷氧基、经取代的烷氧基、氨基、经取代的氨基、羧基、羧基酯、酰基、酰氧基、酰基氨基、氨基酰基、烷基酰胺、经取代的烷基酰胺、磺酰基、硫代烷氧基、经取代的硫代烷氧基、芳基、经取代的芳基、杂芳基、经取代的杂芳基、环烷基、经取代的环烷基、杂环基以及经取代的杂环基。在某些实施方案中，R3为氢。在某些实施方案中，R3为烷基或经取代的烷基。在某些实施方案中，R3为烯基或经取代的烯基。在某些实施方案中，R3为炔基或经取代的炔基。在某些实施方案中，R3为烷氧基或经取代的烷氧基。在某些实施方案中，R3为氨基或经取代的氨基。在某些实施方案中，R3为羧基或羧基酯。在某些实施方案中，R3为酰基或酰氧基。在某些实施方案中，R3为酰基氨基或氨基酰基。在某些实施方案中，R3为烷基酰胺或经取代的烷基酰胺。在某些实施方案中，R3为磺酰基。在某些实施方案中，R3为硫代烷氧基或经取代的硫代烷氧基。在某些实施方案中，R3为芳基或经取代的芳基。在某些实施方案中，R3为杂芳基或经取代的杂芳基。在某些实施方案中，R3为环烷基或经取代的环烷基。在某些实施方案中，R3为杂环基或经取代的杂环基。
在式(IIIa)的某些实施方案中，R3为烷基或经取代的烷基。举例来说，R3可以为烷基或经取代的烷基，诸如C1-C10烷基或C1-C10经取代的烷基(例如，C1-C6烷基或C1-C6经取代的烷基)。在一些情况下，R3为甲基、乙基、正丙基、异丙基、正丁基、仲丁基、异丁基、叔丁基，等等。在某些情况下，R3为甲基。
在式(IIIa)的某些实施方案中，R2和R3各自独立地选自烷基和经取代的烷基。举例来说，R2可以为烷基或经取代的烷基，诸如C1-C10烷基或C1-C10经取代的烷基(例如，C1-C6烷基或C1-C6经取代的烷基)，并且R3可以为烷基或经取代的烷基，诸如C1-C10烷基或C1-C10经取代的烷基(例如，C1-C6烷基或C1-C6经取代的烷基)。在一些情况下，R2和R3各自独立地选自甲基、乙基、正丙基、异丙基、正丁基、仲丁基、异丁基、叔丁基，等等。在某些情况下，R2和R3各自为甲基。
在式(IIIa)的某些实施方案中，Y1选自氢、卤素、烷基、经取代的烷基、烯基、经取代的烯基、炔基、经取代的炔基、烷氧基、经取代的烷氧基、氨基、经取代的氨基、羧基、羧基酯、酰基、酰氧基、酰基氨基、氨基酰基、烷基酰胺、经取代的烷基酰胺、磺酰基、硫代烷氧基、经取代的硫代烷氧基、芳基、经取代的芳基、杂芳基、经取代的杂芳基、环烷基、经取代的环烷基、杂环基以及经取代的杂环基。在某些实施方案中，Y1为氢。在某些实施方案中，Y1为卤素，诸如F、Cl、Br或I。在某些实施方案中，Y1为F。在某些实施方案中，Y1为Cl。在某些实施方案中，Y1为Br。在某些实施方案中，Y1为I。在某些实施方案中，Y1为烷基或经取代的烷基。在某些实施方案中，Y1为烯基或经取代的烯基。在某些实施方案中，Y1为炔基或经取代的炔基。在某些实施方案中，Y1为烷氧基或经取代的烷氧基。在某些实施方案中，Y1为氨基或经取代的氨基。在某些实施方案中，Y1为羧基或羧基酯。在某些实施方案中，Y1为酰基或酰氧基。在某些实施方案中，Y1为酰基氨基或氨基酰基。在某些实施方案中，Y1为烷基酰胺或经取代的烷基酰胺。在某些实施方案中，Y1为磺酰基。在某些实施方案中，Y1为硫代烷氧基或经取代的硫代烷氧基。在某些实施方案中，Y1为芳基或经取代的芳基。在某些实施方案中，Y1为杂芳基或经取代的杂芳基。在某些实施方案中，Y1为环烷基或经取代的环烷基。在某些实施方案中，Y1为杂环基或经取代的杂环基。
在式(IIIa)的某些实施方案中，Y2选自氢、卤素、烷基、经取代的烷基、烯基、经取代的烯基、炔基、经取代的炔基、烷氧基、经取代的烷氧基、氨基、经取代的氨基、羧基、羧基酯、酰基、酰氧基、酰基氨基、氨基酰基、烷基酰胺、经取代的烷基酰胺、磺酰基、硫代烷氧基、经取代的硫代烷氧基、芳基、经取代的芳基、杂芳基、经取代的杂芳基、环烷基、经取代的环烷基、杂环基以及经取代的杂环基。在某些实施方案中，Y2为氢。在某些实施方案中，Y2为卤素，诸如F、Cl、Br或I。在某些实施方案中，Y2为F。在某些实施方案中，Y2为Cl。在某些实施方案中，Y2为Br。在某些实施方案中，Y2为I。在某些实施方案中，Y2为烷基或经取代的烷基。在某些实施方案中，Y2为烯基或经取代的烯基。在某些实施方案中，Y2为炔基或经取代的炔基。在某些实施方案中，Y2为烷氧基或经取代的烷氧基。在某些实施方案中，Y2为氨基或经取代的氨基。在某些实施方案中，Y2为羧基或羧基酯。在某些实施方案中，Y2为酰基或酰氧基。在某些实施方案中，Y2为酰基氨基或氨基酰基。在某些实施方案中，Y2为烷基酰胺或经取代的烷基酰胺。在某些实施方案中，Y2为磺酰基。在某些实施方案中，Y2为硫代烷氧基或经取代的硫代烷氧基。在某些实施方案中，Y2为芳基或经取代的芳基。在某些实施方案中，Y2为杂芳基或经取代的杂芳基。在某些实施方案中，Y2为环烷基或经取代的环烷基。在某些实施方案中，Y2为杂环基或经取代的杂环基。
在式(IIIa)的某些实施方案中，Y3选自氢、卤素、烷基、经取代的烷基、烯基、经取代的烯基、炔基、经取代的炔基、烷氧基、经取代的烷氧基、氨基、经取代的氨基、羧基、羧基酯、酰基、酰氧基、酰基氨基、氨基酰基、烷基酰胺、经取代的烷基酰胺、磺酰基、硫代烷氧基、经取代的硫代烷氧基、芳基、经取代的芳基、杂芳基、经取代的杂芳基、环烷基、经取代的环烷基、杂环基以及经取代的杂环基。在某些实施方案中，Y3为氢。在某些实施方案中，Y3为卤素，诸如F、Cl、Br或I。在某些实施方案中，Y3为F。在某些实施方案中，Y3为Cl。在某些实施方案中，Y3为Br。在某些实施方案中，Y3为I。在某些实施方案中，Y3为烷基或经取代的烷基。在某些实施方案中，Y3为烯基或经取代的烯基。在某些实施方案中，Y3为炔基或经取代的炔基。在某些实施方案中，Y3为烷氧基或经取代的烷氧基。在某些实施方案中，Y3为氨基或经取代的氨基。在某些实施方案中，Y3为羧基或羧基酯。在某些实施方案中，Y3为酰基或酰氧基。在某些实施方案中，Y3为酰基氨基或氨基酰基。在某些实施方案中，Y3为烷基酰胺或经取代的烷基酰胺。在某些实施方案中，Y3为磺酰基。在某些实施方案中，Y3为硫代烷氧基或经取代的硫代烷氧基。在某些实施方案中，Y3为芳基或经取代的芳基。在某些实施方案中，Y3为杂芳基或经取代的杂芳基。在某些实施方案中，Y3为环烷基或经取代的环烷基。在某些实施方案中，Y3为杂环基或经取代的杂环基。
在式(IIIa)的某些实施方案中，Y5选自氢、卤素、烷基、经取代的烷基、烯基、经取代的烯基、炔基、经取代的炔基、烷氧基、经取代的烷氧基、氨基、经取代的氨基、羧基、羧基酯、酰基、酰氧基、酰基氨基、氨基酰基、烷基酰胺、经取代的烷基酰胺、磺酰基、硫代烷氧基、经取代的硫代烷氧基、芳基、经取代的芳基、杂芳基、经取代的杂芳基、环烷基、经取代的环烷基、杂环基以及经取代的杂环基。在某些实施方案中，Y5为氢。在某些实施方案中，Y5为卤素，诸如F、Cl、Br或I。在某些实施方案中，Y5为F。在某些实施方案中，Y5为Cl。在某些实施方案中，Y5为Br。在某些实施方案中，Y5为I。在某些实施方案中，Y5为烷基或经取代的烷基。在某些实施方案中，Y5为烯基或经取代的烯基。在某些实施方案中，Y5为炔基或经取代的炔基。在某些实施方案中，Y5为烷氧基或经取代的烷氧基。在某些实施方案中，Y5为氨基或经取代的氨基。在某些实施方案中，Y5为羧基或羧基酯。在某些实施方案中，Y5为酰基或酰氧基。在某些实施方案中，Y5为酰基氨基或氨基酰基。在某些实施方案中，Y5为烷基酰胺或经取代的烷基酰胺。在某些实施方案中，Y5为磺酰基。在某些实施方案中，Y5为硫代烷氧基或经取代的硫代烷氧基。在某些实施方案中，Y5为芳基或经取代的芳基。在某些实施方案中，Y5为杂芳基或经取代的杂芳基。在某些实施方案中，Y5为环烷基或经取代的环烷基。在某些实施方案中，Y5为杂环基或经取代的杂环基。
在式(IIIa)的某些实施方案中，L为任选的连接子。在某些实施方案中，L不存在，并且因此吲哚环的氮直接键结至W1。在某些实施方案中，L存在，并且因此吲哚环的氮经由连接子L间接键结至W1。
在式(IIIa)的某些实施方案中，L包括选自以下的基团：烷基、经取代的烷基、烯基、经取代的烯基、炔基、经取代的炔基、烷氧基、经取代的烷氧基、氨基、经取代的氨基、羧基、羧基酯、酰基氨基、烷基酰胺、经取代的烷基酰胺、芳基、经取代的芳基、杂芳基、经取代的杂芳基、环烷基、经取代的环烷基、杂环基以及经取代的杂环基。在某些实施方案中，L包括烷基或经取代的烷基。在某些实施方案中，L包括烯基或经取代的烯基。在某些实施方案中，L包括炔基或经取代的炔基。在某些实施方案中，L包括烷氧基或经取代的烷氧基。在某些实施方案中，L包括氨基或经取代的氨基。在某些实施方案中，L包括羧基或羧基酯基。在某些实施方案中，L包括酰基氨基。在某些实施方案中，L包括烷基酰胺或经取代的烷基酰胺基。在某些实施方案中，L包括芳基或经取代的芳基。在某些实施方案中，L包括杂芳基或经取代的杂芳基。在某些实施方案中，L包括环烷基或经取代的环烷基。在某些实施方案中，L包括杂环基或经取代的杂环基。
在式(IIIa)的某些实施方案中，L包括聚合物。举例来说，聚合物可以包括聚烷二醇和其衍生物，包括聚乙二醇、甲氧基聚乙二醇、聚乙二醇均聚物、聚丙二醇均聚物、乙二醇与丙二醇的共聚物(例如，其中均聚物和共聚物未经取代或在一端被烷基取代)、聚乙烯醇、聚乙烯基乙基醚、聚乙烯吡咯烷酮、其组合，等等。在某些实施方案中，聚合物为聚烷二醇。在某些实施方案中，聚合物为聚乙二醇。
在式(IIIa)的某些实施方案中，W1选自药物、可检测标记以及多肽。在某些实施方案中，W1为药物。在某些实施方案中，W1为可检测标记。在某些实施方案中，W1为多肽。
在式(IIIa)的某些实施方案中，W2选自药物、可检测标记以及多肽。在某些实施方案中，W2为药物。在某些实施方案中，W2为可检测标记。在某些实施方案中，W2为多肽。
在式(IIIa)的某些实施方案中，W1和W2中的一者为多肽并且另一者为药物或可检测标记。在某些实施方案中，W1为药物或可检测标记，并且W2为多肽。在某些实施方案中，W1为多肽，并且W2为药物或可检测标记。
在某些实施方案中，偶联物包括式(IIIb)的至少一个修饰的氨基酸残基：
在某些实施方案中，式(IIIb)中的取代基如上文关于式(III)所描述。举例来说，在某些实施方案中，L为任选的连接子。在某些实施方案中，L不存在，并且因此吲哚环的氮直接键结至W1。在某些实施方案中，L存在，并且因此吲哚环的氮经由连接子L间接键结至W1。
在式(IIIb)的某些实施方案中，L包括选自以下的基团：烷基、经取代的烷基、烯基、经取代的烯基、炔基、经取代的炔基、烷氧基、经取代的烷氧基、氨基、经取代的氨基、羧基、羧基酯、酰基氨基、烷基酰胺、经取代的烷基酰胺、芳基、经取代的芳基、杂芳基、经取代的杂芳基、环烷基、经取代的环烷基、杂环基以及经取代的杂环基。在某些实施方案中，L包括烷基或经取代的烷基。在某些实施方案中，L包括烯基或经取代的烯基。在某些实施方案中，L包括炔基或经取代的炔基。在某些实施方案中，L包括烷氧基或经取代的烷氧基。在某些实施方案中，L包括氨基或经取代的氨基。在某些实施方案中，L包括羧基或羧基酯基。在某些实施方案中，L包括酰基氨基。在某些实施方案中，L包括烷基酰胺或经取代的烷基酰胺基。在某些实施方案中，L包括芳基或经取代的芳基。在某些实施方案中，L包括杂芳基或经取代的杂芳基。在某些实施方案中，L包括环烷基或经取代的环烷基。在某些实施方案中，L包括杂环基或经取代的杂环基。
在式(IIb)的某些实施方案中，L包括聚合物。举例来说，聚合物可以包括聚烷二醇和其衍生物，包括聚乙二醇、甲氧基聚乙二醇、聚乙二醇均聚物、聚丙二醇均聚物、乙二醇与丙二醇的共聚物(例如，其中均聚物和共聚物未经取代或在一端被烷基取代)、聚乙烯醇、聚乙烯基乙基醚、聚乙烯吡咯烷酮、其组合，等等。在某些实施方案中，聚合物为聚烷二醇。在某些实施方案中，聚合物为聚乙二醇。
在式(IIIb)的某些实施方案中，W1选自药物、可检测标记以及多肽。在某些实施方案中，W1为药物。在某些实施方案中，W1为可检测标记。在某些实施方案中，W1为多肽。
在式(IIIb)的某些实施方案中，W2选自药物、可检测标记以及多肽。在某些实施方案中，W2为药物。在某些实施方案中，W2为可检测标记。在某些实施方案中，W2为多肽。
在式(IIIb)的某些实施方案中，W1和W2中的一者为多肽并且另一者为药物或可检测标记。在某些实施方案中，W1为药物或可检测标记，并且W2为多肽。在某些实施方案中，W1为多肽，并且W2为药物或可检测标记。
适用于产生偶联物的肼基-吲哚化合物
本公开提供了适用于产生本文所描述的偶联物的化合物(例如，肼基-吲哚化合物)。在某些实施方案中，化合物可以为适用于偶联多肽与第二部分的偶合部分。举例来说，化合物可以结合至多肽并且也结合至第二部分，由此将多肽与第二部分间接地结合在一起。
在某些情况下，化合物可以为肼基-吲哚衍生物。化合物的实施方案包括式(IV)化合物：
其中
Q2和Q3中的一者为-(CH2)nNR3NHR2并且另一者为Y4；
n为0或1；
R2和R3各自独立地选自氢、烷基、经取代的烷基、烯基、经取代的烯基、炔基、经取代的炔基、烷氧基、经取代的烷氧基、氨基、经取代的氨基、羧基、羧基酯、酰基、酰氧基、酰基氨基、氨基酰基、烷基酰胺、经取代的烷基酰胺、磺酰基、硫代烷氧基、经取代的硫代烷氧基、芳基、经取代的芳基、杂芳基、经取代的杂芳基、环烷基、经取代的环烷基、杂环基以及经取代的杂环基；
X1、X2、X3以及X4各自独立地选自C、N、O以及S；
Y1、Y2、Y3以及Y4各自独立地选自氢、卤素、烷基、经取代的烷基、烯基、经取代的烯基、炔基、经取代的炔基、烷氧基、经取代的烷氧基、氨基、经取代的氨基、羧基、羧基酯、酰基、酰氧基、酰基氨基、氨基酰基、烷基酰胺、经取代的烷基酰胺、磺酰基、硫代烷氧基、经取代的硫代烷氧基、芳基、经取代的芳基、杂芳基、经取代的杂芳基、环烷基、经取代的环烷基、杂环基以及经取代的杂环基；
L为任选的连接子；并且
W1选自药物、可检测标记以及多肽。
在某些实施方案中，Q2和Q3中的一者为-(CH2)nNR3NHR2并且另一者为Y4。在某些实施方案中，Q2为-(CH2)nNR3NHR2并且Q3为Y4。在某些实施方案中，Q3为-(CH2)nNR3NHR2并且Q2为Y4。
在某些实施方案中，n为0或1。在某些实施方案中，n为0。在某些实施方案中，n为1。
在某些实施方案中，R2选自氢、烷基、经取代的烷基、烯基、经取代的烯基、炔基、经取代的炔基、烷氧基、经取代的烷氧基、氨基、经取代的氨基、羧基、羧基酯、酰基、酰氧基、酰基氨基、氨基酰基、烷基酰胺、经取代的烷基酰胺、磺酰基、硫代烷氧基、经取代的硫代烷氧基、芳基、经取代的芳基、杂芳基、经取代的杂芳基、环烷基、经取代的环烷基、杂环基以及经取代的杂环基。在某些实施方案中，R2为氢。在某些实施方案中，R2为烷基或经取代的烷基。在某些实施方案中，R2为烯基或经取代的烯基。在某些实施方案中，R2为炔基或经取代的炔基。在某些实施方案中，R2为烷氧基或经取代的烷氧基。在某些实施方案中，R2为氨基或经取代的氨基。在某些实施方案中，R2为羧基或羧基酯。在某些实施方案中，R2为酰基或酰氧基。在某些实施方案中，R2为酰基氨基或氨基酰基。在某些实施方案中，R2为烷基酰胺或经取代的烷基酰胺。在某些实施方案中，R2为磺酰基。在某些实施方案中，R2为硫代烷氧基或经取代的硫代烷氧基。在某些实施方案中，R2为芳基或经取代的芳基。在某些实施方案中，R2为杂芳基或经取代的杂芳基。在某些实施方案中，R2为环烷基或经取代的环烷基。在某些实施方案中，R2为杂环基或经取代的杂环基。
在某些实施方案中，R2为烷基或经取代的烷基。举例来说，R2可以为烷基或经取代的烷基，诸如C1-C10烷基或C1-C10经取代的烷基(例如，C1-C6烷基或C1-C6经取代的烷基)。在一些情况下，R2为甲基、乙基、正丙基、异丙基、正丁基、仲丁基、异丁基、叔丁基，等等。在某些情况下，R2为甲基。
在某些实施方案中，R3选自氢、烷基、经取代的烷基、烯基、经取代的烯基、炔基、经取代的炔基、烷氧基、经取代的烷氧基、氨基、经取代的氨基、羧基、羧基酯、酰基、酰氧基、酰基氨基、氨基酰基、烷基酰胺、经取代的烷基酰胺、磺酰基、硫代烷氧基、经取代的硫代烷氧基、芳基、经取代的芳基、杂芳基、经取代的杂芳基、环烷基、经取代的环烷基、杂环基以及经取代的杂环基。在某些实施方案中，R3为氢。在某些实施方案中，R3为烷基或经取代的烷基。在某些实施方案中，R3为烯基或经取代的烯基。在某些实施方案中，R3为炔基或经取代的炔基。在某些实施方案中，R3为烷氧基或经取代的烷氧基。在某些实施方案中，R3为氨基或经取代的氨基。在某些实施方案中，R3为羧基或羧基酯。在某些实施方案中，R3为酰基或酰氧基。在某些实施方案中，R3为酰基氨基或氨基酰基。在某些实施方案中，R3为烷基酰胺或经取代的烷基酰胺。在某些实施方案中，R3为磺酰基。在某些实施方案中，R3为硫代烷氧基或经取代的硫代烷氧基。在某些实施方案中，R3为芳基或经取代的芳基。在某些实施方案中，R3为杂芳基或经取代的杂芳基。在某些实施方案中，R3为环烷基或经取代的环烷基。在某些实施方案中，R3为杂环基或经取代的杂环基。
在某些实施方案中，R3为烷基或经取代的烷基。举例来说，R3可以为烷基或经取代的烷基，诸如C1-C10烷基或C1-C10经取代的烷基(例如，C1-C6烷基或C1-C6经取代的烷基)。在一些情况下，R3为甲基、乙基、正丙基、异丙基、正丁基、仲丁基、异丁基、叔丁基，等等。在某些情况下，R3为甲基。
在某些实施方案中，R2和R3各自独立地选自烷基和经取代的烷基。举例来说，R2可以为烷基或经取代的烷基，诸如C1-C10烷基或C1-C10经取代的烷基(例如，C1-C6烷基或C1-C6经取代的烷基)，并且R3可以为烷基或经取代的烷基，诸如C1-C10烷基或C1-C10经取代的烷基(例如，C1-C6烷基或C1-C6经取代的烷基)。在一些情况下，R2和R3各自独立地选自甲基、乙基、正丙基、异丙基、正丁基、仲丁基、异丁基、叔丁基，等等。在某些情况下，R2和R3各自为甲基。
在某些实施方案中，X1选自C、N、O以及S。在某些实施方案中，X1为C。在某些实施方案中，X1为N。在某些实施方案中，X1为O。在某些实施方案中，X1为S。
在某些实施方案中，X2选自C、N、O以及S。在某些实施方案中，X2为C。在某些实施方案中，X2为N。在某些实施方案中，X2为O。在某些实施方案中，X2为S。
在某些实施方案中，X3选自C、N、O以及S。在某些实施方案中，X3为C。在某些实施方案中，X3为N。在某些实施方案中，X3为O。在某些实施方案中，X3为S。
在某些实施方案中，X4选自C、N、O以及S。在某些实施方案中，X4为C。在某些实施方案中，X4为N。在某些实施方案中，X4为O。在某些实施方案中，X4为S。
X1、X2、X3以及X4的各种组合是可能的。举例来说，在某些实施方案中，X1、X2、X3以及X4中的每一者为C。在其它情况下，X1、X2、X3以及X4中的三者为C并且X1、X2、X3以及X4中的一者为N。在其它实施方案中，X1、X2、X3以及X4中的两者为C并且X1、X2、X3以及X4中的两者为N。在其它实施方案中，X1、X2、X3以及X4中的一者为C并且X1、X2、X3以及X4中的三者为N。在需要时，C、N、O以及S的其它组合对于X1、X2、X3以及X4是可能的。
在某些实施方案中，Y1选自氢、卤素、烷基、经取代的烷基、烯基、经取代的烯基、炔基、经取代的炔基、烷氧基、经取代的烷氧基、氨基、经取代的氨基、羧基、羧基酯、酰基、酰氧基、酰基氨基、氨基酰基、烷基酰胺、经取代的烷基酰胺、磺酰基、硫代烷氧基、经取代的硫代烷氧基、芳基、经取代的芳基、杂芳基、经取代的杂芳基、环烷基、经取代的环烷基、杂环基以及经取代的杂环基。在某些实施方案中，Y1为氢。在某些实施方案中，Y1为卤素，诸如F、Cl、Br或I。在某些实施方案中，Y1为F。在某些实施方案中，Y1为Cl。在某些实施方案中，Y1为Br。在某些实施方案中，Y1为I。在某些实施方案中，Y1为烷基或经取代的烷基。在某些实施方案中，Y1为烯基或经取代的烯基。在某些实施方案中，Y1为炔基或经取代的炔基。在某些实施方案中，Y1为烷氧基或经取代的烷氧基。在某些实施方案中，Y1为氨基或经取代的氨基。在某些实施方案中，Y1为羧基或羧基酯。在某些实施方案中，Y1为酰基或酰氧基。在某些实施方案中，Y1为酰基氨基或氨基酰基。在某些实施方案中，Y1为烷基酰胺或经取代的烷基酰胺。在某些实施方案中，Y1为磺酰基。在某些实施方案中，Y1为硫代烷氧基或经取代的硫代烷氧基。在某些实施方案中，Y1为芳基或经取代的芳基。在某些实施方案中，Y1为杂芳基或经取代的杂芳基。在某些实施方案中，Y1为环烷基或经取代的环烷基。在某些实施方案中，Y1为杂环基或经取代的杂环基。
在某些实施方案中，Y2选自氢、卤素、烷基、经取代的烷基、烯基、经取代的烯基、炔基、经取代的炔基、烷氧基、经取代的烷氧基、氨基、经取代的氨基、羧基、羧基酯、酰基、酰氧基、酰基氨基、氨基酰基、烷基酰胺、经取代的烷基酰胺、磺酰基、硫代烷氧基、经取代的硫代烷氧基、芳基、经取代的芳基、杂芳基、经取代的杂芳基、环烷基、经取代的环烷基、杂环基以及经取代的杂环基。在某些实施方案中，Y2为氢。在某些实施方案中，Y2为卤素，诸如F、Cl、Br或I。在某些实施方案中，Y2为F。在某些实施方案中，Y2为Cl。在某些实施方案中，Y2为Br。在某些实施方案中，Y2为I。在某些实施方案中，Y2为烷基或经取代的烷基。在某些实施方案中，Y2为烯基或经取代的烯基。在某些实施方案中，Y2为炔基或经取代的炔基。在某些实施方案中，Y2为烷氧基或经取代的烷氧基。在某些实施方案中，Y2为氨基或经取代的氨基。在某些实施方案中，Y2为羧基或羧基酯。在某些实施方案中，Y2为酰基或酰氧基。在某些实施方案中，Y2为酰基氨基或氨基酰基。在某些实施方案中，Y2为烷基酰胺或经取代的烷基酰胺。在某些实施方案中，Y2为磺酰基。在某些实施方案中，Y2为硫代烷氧基或经取代的硫代烷氧基。在某些实施方案中，Y2为芳基或经取代的芳基。在某些实施方案中，Y2为杂芳基或经取代的杂芳基。在某些实施方案中，Y2为环烷基或经取代的环烷基。在某些实施方案中，Y2为杂环基或经取代的杂环基。
在某些实施方案中，Y3选自氢、卤素、烷基、经取代的烷基、烯基、经取代的烯基、炔基、经取代的炔基、烷氧基、经取代的烷氧基、氨基、经取代的氨基、羧基、羧基酯、酰基、酰氧基、酰基氨基、氨基酰基、烷基酰胺、经取代的烷基酰胺、磺酰基、硫代烷氧基、经取代的硫代烷氧基、芳基、经取代的芳基、杂芳基、经取代的杂芳基、环烷基、经取代的环烷基、杂环基以及经取代的杂环基。在某些实施方案中，Y3为氢。在某些实施方案中，Y3为卤素，诸如F、Cl、Br或I。在某些实施方案中，Y3为F。在某些实施方案中，Y3为Cl。在某些实施方案中，Y3为Br。在某些实施方案中，Y3为I。在某些实施方案中，Y3为烷基或经取代的烷基。在某些实施方案中，Y3为烯基或经取代的烯基。在某些实施方案中，Y3为炔基或经取代的炔基。在某些实施方案中，Y3为烷氧基或经取代的烷氧基。在某些实施方案中，Y3为氨基或经取代的氨基。在某些实施方案中，Y3为羧基或羧基酯。在某些实施方案中，Y3为酰基或酰氧基。在某些实施方案中，Y3为酰基氨基或氨基酰基。在某些实施方案中，Y3为烷基酰胺或经取代的烷基酰胺。在某些实施方案中，Y3为磺酰基。在某些实施方案中，Y3为硫代烷氧基或经取代的硫代烷氧基。在某些实施方案中，Y3为芳基或经取代的芳基。在某些实施方案中，Y3为杂芳基或经取代的杂芳基。在某些实施方案中，Y3为环烷基或经取代的环烷基。在某些实施方案中，Y3为杂环基或经取代的杂环基。
在某些实施方案中，Y4选自氢、卤素、烷基、经取代的烷基、烯基、经取代的烯基、炔基、经取代的炔基、烷氧基、经取代的烷氧基、氨基、经取代的氨基、羧基、羧基酯、酰基、酰氧基、酰基氨基、氨基酰基、烷基酰胺、经取代的烷基酰胺、磺酰基、硫代烷氧基、经取代的硫代烷氧基、芳基、经取代的芳基、杂芳基、经取代的杂芳基、环烷基、经取代的环烷基、杂环基以及经取代的杂环基。在某些实施方案中，Y4为氢。在某些实施方案中，Y4为卤素，诸如F、Cl、Br或I。在某些实施方案中，Y4为F。在某些实施方案中，Y4为Cl。在某些实施方案中，Y4为Br。在某些实施方案中，Y4为I。在某些实施方案中，Y4为烷基或经取代的烷基。在某些实施方案中，Y4为烯基或经取代的烯基。在某些实施方案中，Y4为炔基或经取代的炔基。在某些实施方案中，Y4为烷氧基或经取代的烷氧基。在某些实施方案中，Y4为氨基或经取代的氨基。在某些实施方案中，Y4为羧基或羧基酯。在某些实施方案中，Y4为酰基或酰氧基。在某些实施方案中，Y4为酰基氨基或氨基酰基。在某些实施方案中，Y4为烷基酰胺或经取代的烷基酰胺。在某些实施方案中，Y4为磺酰基。在某些实施方案中，Y4为硫代烷氧基或经取代的硫代烷氧基。在某些实施方案中，Y4为芳基或经取代的芳基。在某些实施方案中，Y4为杂芳基或经取代的杂芳基。在某些实施方案中，Y4为环烷基或经取代的环烷基。在某些实施方案中，Y4为杂环基或经取代的杂环基。
在某些实施方案中，L为任选的连接子。在某些实施方案中，L不存在，并且因此吲哚环的氮直接键结至W1。在某些实施方案中，L存在，并且因此吲哚环的氮经由连接子L间接键结至W1。
在某些实施方案中，L包括选自以下的基团：烷基、经取代的烷基、烯基、经取代的烯基、炔基、经取代的炔基、烷氧基、经取代的烷氧基、氨基、经取代的氨基、羧基、羧基酯、酰基氨基、烷基酰胺、经取代的烷基酰胺、芳基、经取代的芳基、杂芳基、经取代的杂芳基、环烷基、经取代的环烷基、杂环基以及经取代的杂环基。在某些实施方案中，L包括烷基或经取代的烷基。在某些实施方案中，L包括烯基或经取代的烯基。在某些实施方案中，L包括炔基或经取代的炔基。在某些实施方案中，L包括烷氧基或经取代的烷氧基。在某些实施方案中，L包括氨基或经取代的氨基。在某些实施方案中，L包括羧基或羧基酯基。在某些实施方案中，L包括酰基氨基。在某些实施方案中，L包括烷基酰胺或经取代的烷基酰胺基。在某些实施方案中，L包括芳基或经取代的芳基。在某些实施方案中，L包括杂芳基或经取代的杂芳基。在某些实施方案中，L包括环烷基或经取代的环烷基。在某些实施方案中，L包括杂环基或经取代的杂环基。
在某些实施方案中，L包括聚合物。举例来说，聚合物可以包括聚烷二醇和其衍生物，包括聚乙二醇、甲氧基聚乙二醇、聚乙二醇均聚物、聚丙二醇均聚物、乙二醇与丙二醇的共聚物(例如，其中均聚物和共聚物未经取代或在一端被烷基取代)、聚乙烯醇、聚乙烯基乙基醚、聚乙烯吡咯烷酮、其组合，等等。在某些实施方案中，聚合物为聚烷二醇。在某些实施方案中，聚合物为聚乙二醇。
在某些实施方案中，W1选自药物、可检测标记以及多肽。在某些实施方案中，W1为药物。在某些实施方案中，W1为可检测标记。在某些实施方案中，W1为多肽。
化合物的实施方案包括式(V)化合物：
其中
n为0或1；
R2和R3各自独立地选自氢、烷基、经取代的烷基、烯基、经取代的烯基、炔基、经取代的炔基、烷氧基、经取代的烷氧基、氨基、经取代的氨基、羧基、羧基酯、酰基、酰氧基、酰基氨基、氨基酰基、烷基酰胺、经取代的烷基酰胺、磺酰基、硫代烷氧基、经取代的硫代烷氧基、芳基、经取代的芳基、杂芳基、经取代的杂芳基、环烷基、经取代的环烷基、杂环基以及经取代的杂环基；
X1、X2、X3以及X4各自独立地选自C、N、O以及S；
Y1、Y2、Y3以及Y4各自独立地选自氢、卤素、烷基、经取代的烷基、烯基、经取代的烯基、炔基、经取代的炔基、烷氧基、经取代的烷氧基、氨基、经取代的氨基、羧基、羧基酯、酰基、酰氧基、酰基氨基、氨基酰基、烷基酰胺、经取代的烷基酰胺、磺酰基、硫代烷氧基、经取代的硫代烷氧基、芳基、经取代的芳基、杂芳基、经取代的杂芳基、环烷基、经取代的环烷基、杂环基以及经取代的杂环基；
L为任选的连接子；并且
W1选自药物、可检测标记以及多肽。
在某些实施方案中，式(V)的取代基与上文关于式(IV)所描述的相同。举例来说，在某些实施方案中，n为0或1。在某些实施方案中，n为0。在某些实施方案中，n为1。
在某些实施方案中，R2选自氢、烷基、经取代的烷基、烯基、经取代的烯基、炔基、经取代的炔基、烷氧基、经取代的烷氧基、氨基、经取代的氨基、羧基、羧基酯、酰基、酰氧基、酰基氨基、氨基酰基、烷基酰胺、经取代的烷基酰胺、磺酰基、硫代烷氧基、经取代的硫代烷氧基、芳基、经取代的芳基、杂芳基、经取代的杂芳基、环烷基、经取代的环烷基、杂环基以及经取代的杂环基。在某些实施方案中，R2为氢。在某些实施方案中，R2为烷基或经取代的烷基。在某些实施方案中，R2为烯基或经取代的烯基。在某些实施方案中，R2为炔基或经取代的炔基。在某些实施方案中，R2为烷氧基或经取代的烷氧基。在某些实施方案中，R2为氨基或经取代的氨基。在某些实施方案中，R2为羧基或羧基酯。在某些实施方案中，R2为酰基或酰氧基。在某些实施方案中，R2为酰基氨基或氨基酰基。在某些实施方案中，R2为烷基酰胺或经取代的烷基酰胺。在某些实施方案中，R2为磺酰基。在某些实施方案中，R2为硫代烷氧基或经取代的硫代烷氧基。在某些实施方案中，R2为芳基或经取代的芳基。在某些实施方案中，R2为杂芳基或经取代的杂芳基。在某些实施方案中，R2为环烷基或经取代的环烷基。在某些实施方案中，R2为杂环基或经取代的杂环基。
在某些实施方案中，R2为烷基或经取代的烷基。举例来说，R2可以为烷基或经取代的烷基，诸如C1-C10烷基或C1-C10经取代的烷基(例如，C1-C6烷基或C1-C6经取代的烷基)。在一些情况下，R2为甲基、乙基、正丙基、异丙基、正丁基、仲丁基、异丁基、叔丁基，等等。在某些情况下，R2为甲基。
在某些实施方案中，R3选自氢、烷基、经取代的烷基、烯基、经取代的烯基、炔基、经取代的炔基、烷氧基、经取代的烷氧基、氨基、经取代的氨基、羧基、羧基酯、酰基、酰氧基、酰基氨基、氨基酰基、烷基酰胺、经取代的烷基酰胺、磺酰基、硫代烷氧基、经取代的硫代烷氧基、芳基、经取代的芳基、杂芳基、经取代的杂芳基、环烷基、经取代的环烷基、杂环基以及经取代的杂环基。在某些实施方案中，R3为氢。在某些实施方案中，R3为烷基或经取代的烷基。在某些实施方案中，R3为烯基或经取代的烯基。在某些实施方案中，R3为炔基或经取代的炔基。在某些实施方案中，R3为烷氧基或经取代的烷氧基。在某些实施方案中，R3为氨基或经取代的氨基。在某些实施方案中，R3为羧基或羧基酯。在某些实施方案中，R3为酰基或酰氧基。在某些实施方案中，R3为酰基氨基或氨基酰基。在某些实施方案中，R3为烷基酰胺或经取代的烷基酰胺。在某些实施方案中，R3为磺酰基。在某些实施方案中，R3为硫代烷氧基或经取代的硫代烷氧基。在某些实施方案中，R3为芳基或经取代的芳基。在某些实施方案中，R3为杂芳基或经取代的杂芳基。在某些实施方案中，R3为环烷基或经取代的环烷基。在某些实施方案中，R3为杂环基或经取代的杂环基。
在某些实施方案中，R3为烷基或经取代的烷基。举例来说，R3可以为烷基或经取代的烷基，诸如C1-C10烷基或C1-C10经取代的烷基(例如，C1-C6烷基或C1-C6经取代的烷基)。在一些情况下，R3为甲基、乙基、正丙基、异丙基、正丁基、仲丁基、异丁基、叔丁基，等等。在某些情况下，R3为甲基。
在某些实施方案中，R2和R3各自独立地选自烷基和经取代的烷基。举例来说，R2可以为烷基或经取代的烷基，诸如C1-C10烷基或C1-C10经取代的烷基(例如，C1-C6烷基或C1-C6经取代的烷基)，并且R3可以为烷基或经取代的烷基，诸如C1-C10烷基或C1-C10经取代的烷基(例如，C1-C6烷基或C1-C6经取代的烷基)。在一些情况下，R2和R3各自独立地选自甲基、乙基、正丙基、异丙基、正丁基、仲丁基、异丁基、叔丁基，等等。在某些情况下，R2和R3各自为甲基。
在某些实施方案中，X1选自C、N、O以及S。在某些实施方案中，X1为C。在某些实施方案中，X1为N。在某些实施方案中，X1为O。在某些实施方案中，X1为S。
在某些实施方案中，X2选自C、N、O以及S。在某些实施方案中，X2为C。在某些实施方案中，X2为N。在某些实施方案中，X2为O。在某些实施方案中，X2为S。
在某些实施方案中，X3选自C、N、O以及S。在某些实施方案中，X3为C。在某些实施方案中，X3为N。在某些实施方案中，X3为O。在某些实施方案中，X3为S。
在某些实施方案中，X4选自C、N、O以及S。在某些实施方案中，X4为C。在某些实施方案中，X4为N。在某些实施方案中，X4为O。在某些实施方案中，X4为S。
X1、X2、X3以及X4的各种组合是可能的。举例来说，在某些实施方案中，X1、X2、X3以及X4中的每一者为C。在其它情况下，X1、X2、X3以及X4中的三者为C并且X1、X2、X3以及X4中的一者为N。在其它实施方案中，X1、X2、X3以及X4中的两者为C并且X1、X2、X3以及X4中的两者为N。在其它实施方案中，X1、X2、X3以及X4中的一者为C并且X1、X2、X3以及X4中的三者为N。在需要时，C、N、O以及S的其它组合对于X1、X2、X3以及X4是可能的。
在某些实施方案中，Y1选自氢、卤素、烷基、经取代的烷基、烯基、经取代的烯基、炔基、经取代的炔基、烷氧基、经取代的烷氧基、氨基、经取代的氨基、羧基、羧基酯、酰基、酰氧基、酰基氨基、氨基酰基、烷基酰胺、经取代的烷基酰胺、磺酰基、硫代烷氧基、经取代的硫代烷氧基、芳基、经取代的芳基、杂芳基、经取代的杂芳基、环烷基、经取代的环烷基、杂环基以及经取代的杂环基。在某些实施方案中，Y1为氢。在某些实施方案中，Y1为卤素，诸如F、Cl、Br或I。在某些实施方案中，Y1为F。在某些实施方案中，Y1为Cl。在某些实施方案中，Y1为Br。在某些实施方案中，Y1为I。在某些实施方案中，Y1为烷基或经取代的烷基。在某些实施方案中，Y1为烯基或经取代的烯基。在某些实施方案中，Y1为炔基或经取代的炔基。在某些实施方案中，Y1为烷氧基或经取代的烷氧基。在某些实施方案中，Y1为氨基或经取代的氨基。在某些实施方案中，Y1为羧基或羧基酯。在某些实施方案中，Y1为酰基或酰氧基。在某些实施方案中，Y1为酰基氨基或氨基酰基。在某些实施方案中，Y1为烷基酰胺或经取代的烷基酰胺。在某些实施方案中，Y1为磺酰基。在某些实施方案中，Y1为硫代烷氧基或经取代的硫代烷氧基。在某些实施方案中，Y1为芳基或经取代的芳基。在某些实施方案中，Y1为杂芳基或经取代的杂芳基。在某些实施方案中，Y1为环烷基或经取代的环烷基。在某些实施方案中，Y1为杂环基或经取代的杂环基。
在某些实施方案中，Y2选自氢、卤素、烷基、经取代的烷基、烯基、经取代的烯基、炔基、经取代的炔基、烷氧基、经取代的烷氧基、氨基、经取代的氨基、羧基、羧基酯、酰基、酰氧基、酰基氨基、氨基酰基、烷基酰胺、经取代的烷基酰胺、磺酰基、硫代烷氧基、经取代的硫代烷氧基、芳基、经取代的芳基、杂芳基、经取代的杂芳基、环烷基、经取代的环烷基、杂环基以及经取代的杂环基。在某些实施方案中，Y2为氢。在某些实施方案中，Y2为卤素，诸如F、Cl、Br或I。在某些实施方案中，Y2为F。在某些实施方案中，Y2为Cl。在某些实施方案中，Y2为Br。在某些实施方案中，Y2为I。在某些实施方案中，Y2为烷基或经取代的烷基。在某些实施方案中，Y2为烯基或经取代的烯基。在某些实施方案中，Y2为炔基或经取代的炔基。在某些实施方案中，Y2为烷氧基或经取代的烷氧基。在某些实施方案中，Y2为氨基或经取代的氨基。在某些实施方案中，Y2为羧基或羧基酯。在某些实施方案中，Y2为酰基或酰氧基。在某些实施方案中，Y2为酰基氨基或氨基酰基。在某些实施方案中，Y2为烷基酰胺或经取代的烷基酰胺。在某些实施方案中，Y2为磺酰基。在某些实施方案中，Y2为硫代烷氧基或经取代的硫代烷氧基。在某些实施方案中，Y2为芳基或经取代的芳基。在某些实施方案中，Y2为杂芳基或经取代的杂芳基。在某些实施方案中，Y2为环烷基或经取代的环烷基。在某些实施方案中，Y2为杂环基或经取代的杂环基。
在某些实施方案中，Y3选自氢、卤素、烷基、经取代的烷基、烯基、经取代的烯基、炔基、经取代的炔基、烷氧基、经取代的烷氧基、氨基、经取代的氨基、羧基、羧基酯、酰基、酰氧基、酰基氨基、氨基酰基、烷基酰胺、经取代的烷基酰胺、磺酰基、硫代烷氧基、经取代的硫代烷氧基、芳基、经取代的芳基、杂芳基、经取代的杂芳基、环烷基、经取代的环烷基、杂环基以及经取代的杂环基。在某些实施方案中，Y3为氢。在某些实施方案中，Y3为卤素，诸如F、Cl、Br或I。在某些实施方案中，Y3为F。在某些实施方案中，Y3为Cl。在某些实施方案中，Y3为Br。在某些实施方案中，Y3为I。在某些实施方案中，Y3为烷基或经取代的烷基。在某些实施方案中，Y3为烯基或经取代的烯基。在某些实施方案中，Y3为炔基或经取代的炔基。在某些实施方案中，Y3为烷氧基或经取代的烷氧基。在某些实施方案中，Y3为氨基或经取代的氨基。在某些实施方案中，Y3为羧基或羧基酯。在某些实施方案中，Y3为酰基或酰氧基。在某些实施方案中，Y3为酰基氨基或氨基酰基。在某些实施方案中，Y3为烷基酰胺或经取代的烷基酰胺。在某些实施方案中，Y3为磺酰基。在某些实施方案中，Y3为硫代烷氧基或经取代的硫代烷氧基。在某些实施方案中，Y3为芳基或经取代的芳基。在某些实施方案中，Y3为杂芳基或经取代的杂芳基。在某些实施方案中，Y3为环烷基或经取代的环烷基。在某些实施方案中，Y3为杂环基或经取代的杂环基。
在某些实施方案中，Y4选自氢、卤素、烷基、经取代的烷基、烯基、经取代的烯基、炔基、经取代的炔基、烷氧基、经取代的烷氧基、氨基、经取代的氨基、羧基、羧基酯、酰基、酰氧基、酰基氨基、氨基酰基、烷基酰胺、经取代的烷基酰胺、磺酰基、硫代烷氧基、经取代的硫代烷氧基、芳基、经取代的芳基、杂芳基、经取代的杂芳基、环烷基、经取代的环烷基、杂环基以及经取代的杂环基。在某些实施方案中，Y4为氢。在某些实施方案中，Y4为卤素，诸如F、Cl、Br或I。在某些实施方案中，Y4为F。在某些实施方案中，Y4为Cl。在某些实施方案中，Y4为Br。在某些实施方案中，Y4为I。在某些实施方案中，Y4为烷基或经取代的烷基。在某些实施方案中，Y4为烯基或经取代的烯基。在某些实施方案中，Y4为炔基或经取代的炔基。在某些实施方案中，Y4为烷氧基或经取代的烷氧基。在某些实施方案中，Y4为氨基或经取代的氨基。在某些实施方案中，Y4为羧基或羧基酯。在某些实施方案中，Y4为酰基或酰氧基。在某些实施方案中，Y4为酰基氨基或氨基酰基。在某些实施方案中，Y4为烷基酰胺或经取代的烷基酰胺。在某些实施方案中，Y4为磺酰基。在某些实施方案中，Y4为硫代烷氧基或经取代的硫代烷氧基。在某些实施方案中，Y4为芳基或经取代的芳基。在某些实施方案中，Y4为杂芳基或经取代的杂芳基。在某些实施方案中，Y4为环烷基或经取代的环烷基。在某些实施方案中，Y4为杂环基或经取代的杂环基。
在某些实施方案中，L为任选的连接子。在某些实施方案中，L不存在，并且因此吲哚环的氮直接键结至W1。在某些实施方案中，L存在，并且因此吲哚环的氮经由连接子L间接键结至W1。
在某些实施方案中，L包括选自以下的基团：烷基、经取代的烷基、烯基、经取代的烯基、炔基、经取代的炔基、烷氧基、经取代的烷氧基、氨基、经取代的氨基、羧基、羧基酯、酰基氨基、烷基酰胺、经取代的烷基酰胺、芳基、经取代的芳基、杂芳基、经取代的杂芳基、环烷基、经取代的环烷基、杂环基以及经取代的杂环基。在某些实施方案中，L包括烷基或经取代的烷基。在某些实施方案中，L包括烯基或经取代的烯基。在某些实施方案中，L包括炔基或经取代的炔基。在某些实施方案中，L包括烷氧基或经取代的烷氧基。在某些实施方案中，L包括氨基或经取代的氨基。在某些实施方案中，L包括羧基或羧基酯基。在某些实施方案中，L包括酰基氨基。在某些实施方案中，L包括烷基酰胺或经取代的烷基酰胺基。在某些实施方案中，L包括芳基或经取代的芳基。在某些实施方案中，L包括杂芳基或经取代的杂芳基。在某些实施方案中，L包括环烷基或经取代的环烷基。在某些实施方案中，L包括杂环基或经取代的杂环基。
在某些实施方案中，L包括聚合物。举例来说，聚合物可以包括聚烷二醇和其衍生物，包括聚乙二醇、甲氧基聚乙二醇、聚乙二醇均聚物、聚丙二醇均聚物、乙二醇与丙二醇的共聚物(例如，其中均聚物和共聚物未经取代或在一端被烷基取代)、聚乙烯醇、聚乙烯基乙基醚、聚乙烯吡咯烷酮、其组合，等等。在某些实施方案中，聚合物为聚烷二醇。在某些实施方案中，聚合物为聚乙二醇。
在某些实施方案中，W1选自药物、可检测标记以及多肽。在某些实施方案中，W1为药物。在某些实施方案中，W1为可检测标记。在某些实施方案中，W1为多肽。
化合物的实施方案包括式(Va)化合物：
在某些实施方案中，式(Va)中的取代基如上文关于式(V)所描述。举例来说，在某些实施方案中，R2选自氢、烷基、经取代的烷基、烯基、经取代的烯基、炔基、经取代的炔基、烷氧基、经取代的烷氧基、氨基、经取代的氨基、羧基、羧基酯、酰基、酰氧基、酰基氨基、氨基酰基、烷基酰胺、经取代的烷基酰胺、磺酰基、硫代烷氧基、经取代的硫代烷氧基、芳基、经取代的芳基、杂芳基、经取代的杂芳基、环烷基、经取代的环烷基、杂环基以及经取代的杂环基。在某些实施方案中，R2为氢。在某些实施方案中，R2为烷基或经取代的烷基。在某些实施方案中，R2为烯基或经取代的烯基。在某些实施方案中，R2为炔基或经取代的炔基。在某些实施方案中，R2为烷氧基或经取代的烷氧基。在某些实施方案中，R2为氨基或经取代的氨基。在某些实施方案中，R2为羧基或羧基酯。在某些实施方案中，R2为酰基或酰氧基。在某些实施方案中，R2为酰基氨基或氨基酰基。在某些实施方案中，R2为烷基酰胺或经取代的烷基酰胺。在某些实施方案中，R2为磺酰基。在某些实施方案中，R2为硫代烷氧基或经取代的硫代烷氧基。在某些实施方案中，R2为芳基或经取代的芳基。在某些实施方案中，R2为杂芳基或经取代的杂芳基。在某些实施方案中，R2为环烷基或经取代的环烷基。在某些实施方案中，R2为杂环基或经取代的杂环基。
在式(Va)的某些实施方案中，R2为烷基或经取代的烷基。举例来说，R2可以为烷基或经取代的烷基，诸如C1-C10烷基或C1-C10经取代的烷基(例如，C1-C6烷基或C1-C6经取代的烷基)。在一些情况下，R2为甲基、乙基、正丙基、异丙基、正丁基、仲丁基、异丁基、叔丁基，等等。在某些情况下，R2为甲基。
在式(Va)的某些实施方案中，R3选自氢、烷基、经取代的烷基、烯基、经取代的烯基、炔基、经取代的炔基、烷氧基、经取代的烷氧基、氨基、经取代的氨基、羧基、羧基酯、酰基、酰氧基、酰基氨基、氨基酰基、烷基酰胺、经取代的烷基酰胺、磺酰基、硫代烷氧基、经取代的硫代烷氧基、芳基、经取代的芳基、杂芳基、经取代的杂芳基、环烷基、经取代的环烷基、杂环基以及经取代的杂环基。在某些实施方案中，R3为氢。在某些实施方案中，R3为烷基或经取代的烷基。在某些实施方案中，R3为烯基或经取代的烯基。在某些实施方案中，R3为炔基或经取代的炔基。在某些实施方案中，R3为烷氧基或经取代的烷氧基。在某些实施方案中，R3为氨基或经取代的氨基。在某些实施方案中，R3为羧基或羧基酯。在某些实施方案中，R3为酰基或酰氧基。在某些实施方案中，R3为酰基氨基或氨基酰基。在某些实施方案中，R3为烷基酰胺或经取代的烷基酰胺。在某些实施方案中，R3为磺酰基。在某些实施方案中，R3为硫代烷氧基或经取代的硫代烷氧基。在某些实施方案中，R3为芳基或经取代的芳基。在某些实施方案中，R3为杂芳基或经取代的杂芳基。在某些实施方案中，R3为环烷基或经取代的环烷基。在某些实施方案中，R3为杂环基或经取代的杂环基。
在式(Va)的某些实施方案中，R3为烷基或经取代的烷基。举例来说，R3可以为烷基或经取代的烷基，诸如C1-C10烷基或C1-C10经取代的烷基(例如，C1-C6烷基或C1-C6经取代的烷基)。在一些情况下，R3为甲基、乙基、正丙基、异丙基、正丁基、仲丁基、异丁基、叔丁基，等等。在某些情况下，R3为甲基。
在式(Va)的某些实施方案中，R2和R3各自独立地选自烷基和经取代的烷基。举例来说，R2可以为烷基或经取代的烷基，诸如C1-C10烷基或C1-C10经取代的烷基(例如，C1-C6烷基或C1-C6经取代的烷基)，并且R3可以为烷基或经取代的烷基，诸如C1-C10烷基或C1-C10经取代的烷基(例如，C1-C6烷基或C1-C6经取代的烷基)。在一些情况下，R2和R3各自独立地选自甲基、乙基、正丙基、异丙基、正丁基、仲丁基、异丁基、叔丁基，等等。在某些情况下，R2和R3各自为甲基。
在式(Va)的某些实施方案中，Y1选自氢、卤素、烷基、经取代的烷基、烯基、经取代的烯基、炔基、经取代的炔基、烷氧基、经取代的烷氧基、氨基、经取代的氨基、羧基、羧基酯、酰基、酰氧基、酰基氨基、氨基酰基、烷基酰胺、经取代的烷基酰胺、磺酰基、硫代烷氧基、经取代的硫代烷氧基、芳基、经取代的芳基、杂芳基、经取代的杂芳基、环烷基、经取代的环烷基、杂环基以及经取代的杂环基。在某些实施方案中，Y1为氢。在某些实施方案中，Y1为卤素，诸如F、Cl、Br或I。在某些实施方案中，Y1为F。在某些实施方案中，Y1为Cl。在某些实施方案中，Y1为Br。在某些实施方案中，Y1为I。在某些实施方案中，Y1为烷基或经取代的烷基。在某些实施方案中，Y1为烯基或经取代的烯基。在某些实施方案中，Y1为炔基或经取代的炔基。在某些实施方案中，Y1为烷氧基或经取代的烷氧基。在某些实施方案中，Y1为氨基或经取代的氨基。在某些实施方案中，Y1为羧基或羧基酯。在某些实施方案中，Y1为酰基或酰氧基。在某些实施方案中，Y1为酰基氨基或氨基酰基。在某些实施方案中，Y1为烷基酰胺或经取代的烷基酰胺。在某些实施方案中，Y1为磺酰基。在某些实施方案中，Y1为硫代烷氧基或经取代的硫代烷氧基。在某些实施方案中，Y1为芳基或经取代的芳基。在某些实施方案中，Y1为杂芳基或经取代的杂芳基。在某些实施方案中，Y1为环烷基或经取代的环烷基。在某些实施方案中，Y1为杂环基或经取代的杂环基。
在式(Va)的某些实施方案中，Y2选自氢、卤素、烷基、经取代的烷基、烯基、经取代的烯基、炔基、经取代的炔基、烷氧基、经取代的烷氧基、氨基、经取代的氨基、羧基、羧基酯、酰基、酰氧基、酰基氨基、氨基酰基、烷基酰胺、经取代的烷基酰胺、磺酰基、硫代烷氧基、经取代的硫代烷氧基、芳基、经取代的芳基、杂芳基、经取代的杂芳基、环烷基、经取代的环烷基、杂环基以及经取代的杂环基。在某些实施方案中，Y2为氢。在某些实施方案中，Y2为卤素，诸如F、Cl、Br或I。在某些实施方案中，Y2为F。在某些实施方案中，Y2为Cl。在某些实施方案中，Y2为Br。在某些实施方案中，Y2为I。在某些实施方案中，Y2为烷基或经取代的烷基。在某些实施方案中，Y2为烯基或经取代的烯基。在某些实施方案中，Y2为炔基或经取代的炔基。在某些实施方案中，Y2为烷氧基或经取代的烷氧基。在某些实施方案中，Y2为氨基或经取代的氨基。在某些实施方案中，Y2为羧基或羧基酯。在某些实施方案中，Y2为酰基或酰氧基。在某些实施方案中，Y2为酰基氨基或氨基酰基。在某些实施方案中，Y2为烷基酰胺或经取代的烷基酰胺。在某些实施方案中，Y2为磺酰基。在某些实施方案中，Y2为硫代烷氧基或经取代的硫代烷氧基。在某些实施方案中，Y2为芳基或经取代的芳基。在某些实施方案中，Y2为杂芳基或经取代的杂芳基。在某些实施方案中，Y2为环烷基或经取代的环烷基。在某些实施方案中，Y2为杂环基或经取代的杂环基。
在式(Va)的某些实施方案中，Y3选自氢、卤素、烷基、经取代的烷基、烯基、经取代的烯基、炔基、经取代的炔基、烷氧基、经取代的烷氧基、氨基、经取代的氨基、羧基、羧基酯、酰基、酰氧基、酰基氨基、氨基酰基、烷基酰胺、经取代的烷基酰胺、磺酰基、硫代烷氧基、经取代的硫代烷氧基、芳基、经取代的芳基、杂芳基、经取代的杂芳基、环烷基、经取代的环烷基、杂环基以及经取代的杂环基。在某些实施方案中，Y3为氢。在某些实施方案中，Y3为卤素，诸如F、Cl、Br或I。在某些实施方案中，Y3为F。在某些实施方案中，Y3为Cl。在某些实施方案中，Y3为Br。在某些实施方案中，Y3为I。在某些实施方案中，Y3为烷基或经取代的烷基。在某些实施方案中，Y3为烯基或经取代的烯基。在某些实施方案中，Y3为炔基或经取代的炔基。在某些实施方案中，Y3为烷氧基或经取代的烷氧基。在某些实施方案中，Y3为氨基或经取代的氨基。在某些实施方案中，Y3为羧基或羧基酯。在某些实施方案中，Y3为酰基或酰氧基。在某些实施方案中，Y3为酰基氨基或氨基酰基。在某些实施方案中，Y3为烷基酰胺或经取代的烷基酰胺。在某些实施方案中，Y3为磺酰基。在某些实施方案中，Y3为硫代烷氧基或经取代的硫代烷氧基。在某些实施方案中，Y3为芳基或经取代的芳基。在某些实施方案中，Y3为杂芳基或经取代的杂芳基。在某些实施方案中，Y3为环烷基或经取代的环烷基。在某些实施方案中，Y3为杂环基或经取代的杂环基。
在式(Va)的某些实施方案中，Y4选自氢、卤素、烷基、经取代的烷基、烯基、经取代的烯基、炔基、经取代的炔基、烷氧基、经取代的烷氧基、氨基、经取代的氨基、羧基、羧基酯、酰基、酰氧基、酰基氨基、氨基酰基、烷基酰胺、经取代的烷基酰胺、磺酰基、硫代烷氧基、经取代的硫代烷氧基、芳基、经取代的芳基、杂芳基、经取代的杂芳基、环烷基、经取代的环烷基、杂环基以及经取代的杂环基。在某些实施方案中，Y4为氢。在某些实施方案中，Y4为卤素，诸如F、Cl、Br或I。在某些实施方案中，Y4为F。在某些实施方案中，Y4为Cl。在某些实施方案中，Y4为Br。在某些实施方案中，Y4为I。在某些实施方案中，Y4为烷基或经取代的烷基。在某些实施方案中，Y4为烯基或经取代的烯基。在某些实施方案中，Y4为炔基或经取代的炔基。在某些实施方案中，Y4为烷氧基或经取代的烷氧基。在某些实施方案中，Y4为氨基或经取代的氨基。在某些实施方案中，Y4为羧基或羧基酯。在某些实施方案中，Y4为酰基或酰氧基。在某些实施方案中，Y4为酰基氨基或氨基酰基。在某些实施方案中，Y4为烷基酰胺或经取代的烷基酰胺。在某些实施方案中，Y4为磺酰基。在某些实施方案中，Y4为硫代烷氧基或经取代的硫代烷氧基。在某些实施方案中，Y4为芳基或经取代的芳基。在某些实施方案中，Y4为杂芳基或经取代的杂芳基。在某些实施方案中，Y4为环烷基或经取代的环烷基。在某些实施方案中，Y4为杂环基或经取代的杂环基。
在式(Va)的某些实施方案中，L为任选的连接子。在某些实施方案中，L不存在，并且因此吲哚环的氮直接键结至W1。在某些实施方案中，L存在，并且因此吲哚环的氮经由连接子L间接键结至W1。
在式(Va)的某些实施方案中，L包括选自以下的基团：烷基、经取代的烷基、烯基、经取代的烯基、炔基、经取代的炔基、烷氧基、经取代的烷氧基、氨基、经取代的氨基、羧基、羧基酯、酰基氨基、烷基酰胺、经取代的烷基酰胺、芳基、经取代的芳基、杂芳基、经取代的杂芳基、环烷基、经取代的环烷基、杂环基以及经取代的杂环基。在某些实施方案中，L包括烷基或经取代的烷基。在某些实施方案中，L包括烯基或经取代的烯基。在某些实施方案中，L包括炔基或经取代的炔基。在某些实施方案中，L包括烷氧基或经取代的烷氧基。在某些实施方案中，L包括氨基或经取代的氨基。在某些实施方案中，L包括羧基或羧基酯基。在某些实施方案中，L包括酰基氨基。在某些实施方案中，L包括烷基酰胺或经取代的烷基酰胺基。在某些实施方案中，L包括芳基或经取代的芳基。在某些实施方案中，L包括杂芳基或经取代的杂芳基。在某些实施方案中，L包括环烷基或经取代的环烷基。在某些实施方案中，L包括杂环基或经取代的杂环基。
在式(Va)的某些实施方案中，L包括聚合物。举例来说，聚合物可以包括聚烷二醇和其衍生物，包括聚乙二醇、甲氧基聚乙二醇、聚乙二醇均聚物、聚丙二醇均聚物、乙二醇与丙二醇的共聚物(例如，其中均聚物和共聚物未经取代或在一端被烷基取代)、聚乙烯醇、聚乙烯基乙基醚、聚乙烯吡咯烷酮、其组合，等等。在某些实施方案中，聚合物为聚烷二醇。在某些实施方案中，聚合物为聚乙二醇。
在式(Va)的某些实施方案中，W1选自药物、可检测标记以及多肽。在某些实施方案中，W1为药物。在某些实施方案中，W1为可检测标记。在某些实施方案中，W1为多肽。
化合物的实施方案包括式(Vb)化合物：
在某些实施方案中，式(Vb)中的取代基如上文关于式(V)所描述。举例来说，在某些实施方案中，L为任选的连接子。在某些实施方案中，L不存在，并且因此吲哚环的氮直接键结至W1。在某些实施方案中，L存在，并且因此吲哚环的氮经由连接子L间接键结至W1。
在式(Vb)的某些实施方案中，L包括选自以下的基团：烷基、经取代的烷基、烯基、经取代的烯基、炔基、经取代的炔基、烷氧基、经取代的烷氧基、氨基、经取代的氨基、羧基、羧基酯、酰基氨基、烷基酰胺、经取代的烷基酰胺、芳基、经取代的芳基、杂芳基、经取代的杂芳基、环烷基、经取代的环烷基、杂环基以及经取代的杂环基。在某些实施方案中，L包括烷基或经取代的烷基。在某些实施方案中，L包括烯基或经取代的烯基。在某些实施方案中，L包括炔基或经取代的炔基。在某些实施方案中，L包括烷氧基或经取代的烷氧基。在某些实施方案中，L包括氨基或经取代的氨基。在某些实施方案中，L包括羧基或羧基酯基。在某些实施方案中，L包括酰基氨基。在某些实施方案中，L包括烷基酰胺或经取代的烷基酰胺基。在某些实施方案中，L包括芳基或经取代的芳基。在某些实施方案中，L包括杂芳基或经取代的杂芳基。在某些实施方案中，L包括环烷基或经取代的环烷基。在某些实施方案中，L包括杂环基或经取代的杂环基。
在式(Vb)的某些实施方案中，L包括聚合物。举例来说，聚合物可以包括聚烷二醇和其衍生物，包括聚乙二醇、甲氧基聚乙二醇、聚乙二醇均聚物、聚丙二醇均聚物、乙二醇与丙二醇的共聚物(例如，其中均聚物和共聚物未经取代或在一端被烷基取代)、聚乙烯醇、聚乙烯基乙基醚、聚乙烯吡咯烷酮、其组合，等等。在某些实施方案中，聚合物为聚烷二醇。在某些实施方案中，聚合物为聚乙二醇。
在式(Vb)的某些实施方案中，W1选自药物、可检测标记以及多肽。在某些实施方案中，W1为药物。在某些实施方案中，W1为可检测标记。在某些实施方案中，W1为多肽。
在某些实施方案中，化合物可以为式(VI)的肼基-吲哚衍生物：
其中
n为0或1；
R2和R3各自独立地选自氢、烷基、经取代的烷基、烯基、经取代的烯基、炔基、经取代的炔基、烷氧基、经取代的烷氧基、氨基、经取代的氨基、羧基、羧基酯、酰基、酰氧基、酰基氨基、氨基酰基、烷基酰胺、经取代的烷基酰胺、磺酰基、硫代烷氧基、经取代的硫代烷氧基、芳基、经取代的芳基、杂芳基、经取代的杂芳基、环烷基、经取代的环烷基、杂环基以及经取代的杂环基；
X1、X2、X3以及X4各自独立地选自C、N、O以及S；
Y1、Y2、Y3以及Y4各自独立地选自氢、卤素、烷基、经取代的烷基、烯基、经取代的烯基、炔基、经取代的炔基、烷氧基、经取代的烷氧基、氨基、经取代的氨基、羧基、羧基酯、酰基、酰氧基、酰基氨基、氨基酰基、烷基酰胺、经取代的烷基酰胺、磺酰基、硫代烷氧基、经取代的硫代烷氧基、芳基、经取代的芳基、杂芳基、经取代的杂芳基、环烷基、经取代的环烷基、杂环基以及经取代的杂环基；
L为任选的连接子；并且
W1选自药物、可检测标记以及多肽。
在某些实施方案中，式(VI)中的取代基如上文关于式(IV)所描述。举例来说，在某些实施方案中，n为0或1。在某些实施方案中，n为0。在某些实施方案中，n为1。
在某些实施方案中，R2选自氢、烷基、经取代的烷基、烯基、经取代的烯基、炔基、经取代的炔基、烷氧基、经取代的烷氧基、氨基、经取代的氨基、羧基、羧基酯、酰基、酰氧基、酰基氨基、氨基酰基、烷基酰胺、经取代的烷基酰胺、磺酰基、硫代烷氧基、经取代的硫代烷氧基、芳基、经取代的芳基、杂芳基、经取代的杂芳基、环烷基、经取代的环烷基、杂环基以及经取代的杂环基。在某些实施方案中，R2为氢。在某些实施方案中，R2为烷基或经取代的烷基。在某些实施方案中，R2为烯基或经取代的烯基。在某些实施方案中，R2为炔基或经取代的炔基。在某些实施方案中，R2为烷氧基或经取代的烷氧基。在某些实施方案中，R2为氨基或经取代的氨基。在某些实施方案中，R2为羧基或羧基酯。在某些实施方案中，R2为酰基或酰氧基。在某些实施方案中，R2为酰基氨基或氨基酰基。在某些实施方案中，R2为烷基酰胺或经取代的烷基酰胺。在某些实施方案中，R2为磺酰基。在某些实施方案中，R2为硫代烷氧基或经取代的硫代烷氧基。在某些实施方案中，R2为芳基或经取代的芳基。在某些实施方案中，R2为杂芳基或经取代的杂芳基。在某些实施方案中，R2为环烷基或经取代的环烷基。在某些实施方案中，R2为杂环基或经取代的杂环基。
在某些实施方案中，R2为烷基或经取代的烷基。举例来说，R2可以为烷基或经取代的烷基，诸如C1-C10烷基或C1-C10经取代的烷基(例如，C1-C6烷基或C1-C6经取代的烷基)。在一些情况下，R2为甲基、乙基、正丙基、异丙基、正丁基、仲丁基、异丁基、叔丁基，等等。在某些情况下，R2为甲基。
在某些实施方案中，R3选自氢、烷基、经取代的烷基、烯基、经取代的烯基、炔基、经取代的炔基、烷氧基、经取代的烷氧基、氨基、经取代的氨基、羧基、羧基酯、酰基、酰氧基、酰基氨基、氨基酰基、烷基酰胺、经取代的烷基酰胺、磺酰基、硫代烷氧基、经取代的硫代烷氧基、芳基、经取代的芳基、杂芳基、经取代的杂芳基、环烷基、经取代的环烷基、杂环基以及经取代的杂环基。在某些实施方案中，R3为氢。在某些实施方案中，R3为烷基或经取代的烷基。在某些实施方案中，R3为烯基或经取代的烯基。在某些实施方案中，R3为炔基或经取代的炔基。在某些实施方案中，R3为烷氧基或经取代的烷氧基。在某些实施方案中，R3为氨基或经取代的氨基。在某些实施方案中，R3为羧基或羧基酯。在某些实施方案中，R3为酰基或酰氧基。在某些实施方案中，R3为酰基氨基或氨基酰基。在某些实施方案中，R3为烷基酰胺或经取代的烷基酰胺。在某些实施方案中，R3为磺酰基。在某些实施方案中，R3为硫代烷氧基或经取代的硫代烷氧基。在某些实施方案中，R3为芳基或经取代的芳基。在某些实施方案中，R3为杂芳基或经取代的杂芳基。在某些实施方案中，R3为环烷基或经取代的环烷基。在某些实施方案中，R3为杂环基或经取代的杂环基。
在某些实施方案中，R3为烷基或经取代的烷基。举例来说，R3可以为烷基或经取代的烷基，诸如C1-C10烷基或C1-C10经取代的烷基(例如，C1-C6烷基或C1-C6经取代的烷基)。在一些情况下，R3为甲基、乙基、正丙基、异丙基、正丁基、仲丁基、异丁基、叔丁基，等等。在某些情况下，R3为甲基。
在某些实施方案中，R2和R3各自独立地选自烷基和经取代的烷基。举例来说，R2可以为烷基或经取代的烷基，诸如C1-C10烷基或C1-C10经取代的烷基(例如，C1-C6烷基或C1-C6经取代的烷基)，并且R3可以为烷基或经取代的烷基，诸如C1-C10烷基或C1-C10经取代的烷基(例如，C1-C6烷基或C1-C6经取代的烷基)。在一些情况下，R2和R3各自独立地选自甲基、乙基、正丙基、异丙基、正丁基、仲丁基、异丁基、叔丁基，等等。在某些情况下，R2和R3各自为甲基。
在某些实施方案中，X1选自C、N、O以及S。在某些实施方案中，X1为C。在某些实施方案中，X1为N。在某些实施方案中，X1为O。在某些实施方案中，X1为S。
在某些实施方案中，X2选自C、N、O以及S。在某些实施方案中，X2为C。在某些实施方案中，X2为N。在某些实施方案中，X2为O。在某些实施方案中，X2为S。
在某些实施方案中，X3选自C、N、O以及S。在某些实施方案中，X3为C。在某些实施方案中，X3为N。在某些实施方案中，X3为O。在某些实施方案中，X3为S。
在某些实施方案中，X4选自C、N、O以及S。在某些实施方案中，X4为C。在某些实施方案中，X4为N。在某些实施方案中，X4为O。在某些实施方案中，X4为S。
X1、X2、X3以及X4的各种组合是可能的。举例来说，在某些实施方案中，X1、X2、X3以及X4中的每一者为C。在其它情况下，X1、X2、X3以及X4中的三者为C并且X1、X2、X3以及X4中的一者为N。在其它实施方案中，X1、X2、X3以及X4中的两者为C并且X1、X2、X3以及X4中的两者为N。在其它实施方案中，X1、X2、X3以及X4中的一者为C并且X1、X2、X3以及X4中的三者为N。在需要时，C、N、O以及S的其它组合对于X1、X2、X3以及X4是可能的。
在某些实施方案中，Y1选自氢、卤素、烷基、经取代的烷基、烯基、经取代的烯基、炔基、经取代的炔基、烷氧基、经取代的烷氧基、氨基、经取代的氨基、羧基、羧基酯、酰基、酰氧基、酰基氨基、氨基酰基、烷基酰胺、经取代的烷基酰胺、磺酰基、硫代烷氧基、经取代的硫代烷氧基、芳基、经取代的芳基、杂芳基、经取代的杂芳基、环烷基、经取代的环烷基、杂环基以及经取代的杂环基。在某些实施方案中，Y1为氢。在某些实施方案中，Y1为卤素，诸如F、Cl、Br或I。在某些实施方案中，Y1为F。在某些实施方案中，Y1为Cl。在某些实施方案中，Y1为Br。在某些实施方案中，Y1为I。在某些实施方案中，Y1为烷基或经取代的烷基。在某些实施方案中，Y1为烯基或经取代的烯基。在某些实施方案中，Y1为炔基或经取代的炔基。在某些实施方案中，Y1为烷氧基或经取代的烷氧基。在某些实施方案中，Y1为氨基或经取代的氨基。在某些实施方案中，Y1为羧基或羧基酯。在某些实施方案中，Y1为酰基或酰氧基。在某些实施方案中，Y1为酰基氨基或氨基酰基。在某些实施方案中，Y1为烷基酰胺或经取代的烷基酰胺。在某些实施方案中，Y1为磺酰基。在某些实施方案中，Y1为硫代烷氧基或经取代的硫代烷氧基。在某些实施方案中，Y1为芳基或经取代的芳基。在某些实施方案中，Y1为杂芳基或经取代的杂芳基。在某些实施方案中，Y1为环烷基或经取代的环烷基。在某些实施方案中，Y1为杂环基或经取代的杂环基。
在某些实施方案中，Y2选自氢、卤素、烷基、经取代的烷基、烯基、经取代的烯基、炔基、经取代的炔基、烷氧基、经取代的烷氧基、氨基、经取代的氨基、羧基、羧基酯、酰基、酰氧基、酰基氨基、氨基酰基、烷基酰胺、经取代的烷基酰胺、磺酰基、硫代烷氧基、经取代的硫代烷氧基、芳基、经取代的芳基、杂芳基、经取代的杂芳基、环烷基、经取代的环烷基、杂环基以及经取代的杂环基。在某些实施方案中，Y2为氢。在某些实施方案中，Y2为卤素，诸如F、Cl、Br或I。在某些实施方案中，Y2为F。在某些实施方案中，Y2为Cl。在某些实施方案中，Y2为Br。在某些实施方案中，Y2为I。在某些实施方案中，Y2为烷基或经取代的烷基。在某些实施方案中，Y2为烯基或经取代的烯基。在某些实施方案中，Y2为炔基或经取代的炔基。在某些实施方案中，Y2为烷氧基或经取代的烷氧基。在某些实施方案中，Y2为氨基或经取代的氨基。在某些实施方案中，Y2为羧基或羧基酯。在某些实施方案中，Y2为酰基或酰氧基。在某些实施方案中，Y2为酰基氨基或氨基酰基。在某些实施方案中，Y2为烷基酰胺或经取代的烷基酰胺。在某些实施方案中，Y2为磺酰基。在某些实施方案中，Y2为硫代烷氧基或经取代的硫代烷氧基。在某些实施方案中，Y2为芳基或经取代的芳基。在某些实施方案中，Y2为杂芳基或经取代的杂芳基。在某些实施方案中，Y2为环烷基或经取代的环烷基。在某些实施方案中，Y2为杂环基或经取代的杂环基。
在某些实施方案中，Y3选自氢、卤素、烷基、经取代的烷基、烯基、经取代的烯基、炔基、经取代的炔基、烷氧基、经取代的烷氧基、氨基、经取代的氨基、羧基、羧基酯、酰基、酰氧基、酰基氨基、氨基酰基、烷基酰胺、经取代的烷基酰胺、磺酰基、硫代烷氧基、经取代的硫代烷氧基、芳基、经取代的芳基、杂芳基、经取代的杂芳基、环烷基、经取代的环烷基、杂环基以及经取代的杂环基。在某些实施方案中，Y3为氢。在某些实施方案中，Y3为卤素，诸如F、Cl、Br或I。在某些实施方案中，Y3为F。在某些实施方案中，Y3为Cl。在某些实施方案中，Y3为Br。在某些实施方案中，Y3为I。在某些实施方案中，Y3为烷基或经取代的烷基。在某些实施方案中，Y3为烯基或经取代的烯基。在某些实施方案中，Y3为炔基或经取代的炔基。在某些实施方案中，Y3为烷氧基或经取代的烷氧基。在某些实施方案中，Y3为氨基或经取代的氨基。在某些实施方案中，Y3为羧基或羧基酯。在某些实施方案中，Y3为酰基或酰氧基。在某些实施方案中，Y3为酰基氨基或氨基酰基。在某些实施方案中，Y3为烷基酰胺或经取代的烷基酰胺。在某些实施方案中，Y3为磺酰基。在某些实施方案中，Y3为硫代烷氧基或经取代的硫代烷氧基。在某些实施方案中，Y3为芳基或经取代的芳基。在某些实施方案中，Y3为杂芳基或经取代的杂芳基。在某些实施方案中，Y3为环烷基或经取代的环烷基。在某些实施方案中，Y3为杂环基或经取代的杂环基。
在某些实施方案中，Y4选自氢、卤素、烷基、经取代的烷基、烯基、经取代的烯基、炔基、经取代的炔基、烷氧基、经取代的烷氧基、氨基、经取代的氨基、羧基、羧基酯、酰基、酰氧基、酰基氨基、氨基酰基、烷基酰胺、经取代的烷基酰胺、磺酰基、硫代烷氧基、经取代的硫代烷氧基、芳基、经取代的芳基、杂芳基、经取代的杂芳基、环烷基、经取代的环烷基、杂环基以及经取代的杂环基。在某些实施方案中，Y4为氢。在某些实施方案中，Y4为卤素，诸如F、Cl、Br或I。在某些实施方案中，Y4为F。在某些实施方案中，Y4为Cl。在某些实施方案中，Y4为Br。在某些实施方案中，Y4为I。在某些实施方案中，Y4为烷基或经取代的烷基。在某些实施方案中，Y4为烯基或经取代的烯基。在某些实施方案中，Y4为炔基或经取代的炔基。在某些实施方案中，Y4为烷氧基或经取代的烷氧基。在某些实施方案中，Y4为氨基或经取代的氨基。在某些实施方案中，Y4为羧基或羧基酯。在某些实施方案中，Y4为酰基或酰氧基。在某些实施方案中，Y4为酰基氨基或氨基酰基。在某些实施方案中，Y4为烷基酰胺或经取代的烷基酰胺。在某些实施方案中，Y4为磺酰基。在某些实施方案中，Y4为硫代烷氧基或经取代的硫代烷氧基。在某些实施方案中，Y4为芳基或经取代的芳基。在某些实施方案中，Y4为杂芳基或经取代的杂芳基。在某些实施方案中，Y4为环烷基或经取代的环烷基。在某些实施方案中，Y4为杂环基或经取代的杂环基。
在某些实施方案中，L为任选的连接子。在某些实施方案中，L不存在，并且因此吲哚环的氮直接键结至W1。在某些实施方案中，L存在，并且因此吲哚环的氮经由连接子L间接键结至W1。
在某些实施方案中，L包括选自以下的基团：烷基、经取代的烷基、烯基、经取代的烯基、炔基、经取代的炔基、烷氧基、经取代的烷氧基、氨基、经取代的氨基、羧基、羧基酯、酰基氨基、烷基酰胺、经取代的烷基酰胺、芳基、经取代的芳基、杂芳基、经取代的杂芳基、环烷基、经取代的环烷基、杂环基以及经取代的杂环基。在某些实施方案中，L包括烷基或经取代的烷基。在某些实施方案中，L包括烯基或经取代的烯基。在某些实施方案中，L包括炔基或经取代的炔基。在某些实施方案中，L包括烷氧基或经取代的烷氧基。在某些实施方案中，L包括氨基或经取代的氨基。在某些实施方案中，L包括羧基或羧基酯基。在某些实施方案中，L包括酰基氨基。在某些实施方案中，L包括烷基酰胺或经取代的烷基酰胺基。在某些实施方案中，L包括芳基或经取代的芳基。在某些实施方案中，L包括杂芳基或经取代的杂芳基。在某些实施方案中，L包括环烷基或经取代的环烷基。在某些实施方案中，L包括杂环基或经取代的杂环基。
在某些实施方案中，L包括聚合物。举例来说，聚合物可以包括聚烷二醇和其衍生物，包括聚乙二醇、甲氧基聚乙二醇、聚乙二醇均聚物、聚丙二醇均聚物、乙二醇与丙二醇的共聚物(例如，其中均聚物和共聚物未经取代或在一端被烷基取代)、聚乙烯醇、聚乙烯基乙基醚、聚乙烯吡咯烷酮、其组合，等等。在某些实施方案中，聚合物为聚烷二醇。在某些实施方案中，聚合物为聚乙二醇。
在某些实施方案中，W1选自药物、可检测标记以及多肽。在某些实施方案中，W1为药物。在某些实施方案中，W1为可检测标记。在某些实施方案中，W1为多肽。
化合物的实施方案包括式(VIa)化合物：
在某些实施方案中，式(VIa)中的取代基如上文关于式(VI)所描述。举例来说，在某些实施方案中，R2选自氢、烷基、经取代的烷基、烯基、经取代的烯基、炔基、经取代的炔基、烷氧基、经取代的烷氧基、氨基、经取代的氨基、羧基、羧基酯、酰基、酰氧基、酰基氨基、氨基酰基、烷基酰胺、经取代的烷基酰胺、磺酰基、硫代烷氧基、经取代的硫代烷氧基、芳基、经取代的芳基、杂芳基、经取代的杂芳基、环烷基、经取代的环烷基、杂环基以及经取代的杂环基。在某些实施方案中，R2为氢。在某些实施方案中，R2为烷基或经取代的烷基。在某些实施方案中，R2为烯基或经取代的烯基。在某些实施方案中，R2为炔基或经取代的炔基。在某些实施方案中，R2为烷氧基或经取代的烷氧基。在某些实施方案中，R2为氨基或经取代的氨基。在某些实施方案中，R2为羧基或羧基酯。在某些实施方案中，R2为酰基或酰氧基。在某些实施方案中，R2为酰基氨基或氨基酰基。在某些实施方案中，R2为烷基酰胺或经取代的烷基酰胺。在某些实施方案中，R2为磺酰基。在某些实施方案中，R2为硫代烷氧基或经取代的硫代烷氧基。在某些实施方案中，R2为芳基或经取代的芳基。在某些实施方案中，R2为杂芳基或经取代的杂芳基。在某些实施方案中，R2为环烷基或经取代的环烷基。在某些实施方案中，R2为杂环基或经取代的杂环基。
在式(VIa)的某些实施方案中，R2为烷基或经取代的烷基。举例来说，R2可以为烷基或经取代的烷基，诸如C1-C10烷基或C1-C10经取代的烷基(例如，C1-C6烷基或C1-C6经取代的烷基)。在一些情况下，R2为甲基、乙基、正丙基、异丙基、正丁基、仲丁基、异丁基、叔丁基，等等。在某些情况下，R2为甲基。
在式(VIa)的某些实施方案中，R3选自氢、烷基、经取代的烷基、烯基、经取代的烯基、炔基、经取代的炔基、烷氧基、经取代的烷氧基、氨基、经取代的氨基、羧基、羧基酯、酰基、酰氧基、酰基氨基、氨基酰基、烷基酰胺、经取代的烷基酰胺、磺酰基、硫代烷氧基、经取代的硫代烷氧基、芳基、经取代的芳基、杂芳基、经取代的杂芳基、环烷基、经取代的环烷基、杂环基以及经取代的杂环基。在某些实施方案中，R3为氢。在某些实施方案中，R3为烷基或经取代的烷基。在某些实施方案中，R3为烯基或经取代的烯基。在某些实施方案中，R3为炔基或经取代的炔基。在某些实施方案中，R3为烷氧基或经取代的烷氧基。在某些实施方案中，R3为氨基或经取代的氨基。在某些实施方案中，R3为羧基或羧基酯。在某些实施方案中，R3为酰基或酰氧基。在某些实施方案中，R3为酰基氨基或氨基酰基。在某些实施方案中，R3为烷基酰胺或经取代的烷基酰胺。在某些实施方案中，R3为磺酰基。在某些实施方案中，R3为硫代烷氧基或经取代的硫代烷氧基。在某些实施方案中，R3为芳基或经取代的芳基。在某些实施方案中，R3为杂芳基或经取代的杂芳基。在某些实施方案中，R3为环烷基或经取代的环烷基。在某些实施方案中，R3为杂环基或经取代的杂环基。
在式(VIa)的某些实施方案中，R3为烷基或经取代的烷基。举例来说，R3可以为烷基或经取代的烷基，诸如C1-C10烷基或C1-C10经取代的烷基(例如，C1-C6烷基或C1-C6经取代的烷基)。在一些情况下，R3为甲基、乙基、正丙基、异丙基、正丁基、仲丁基、异丁基、叔丁基，等等。在某些情况下，R3为甲基。
在式(VIa)的某些实施方案中，R2和R3各自独立地选自烷基和经取代的烷基。举例来说，R2可以为烷基或经取代的烷基，诸如C1-C10烷基或C1-C10经取代的烷基(例如，C1-C6烷基或C1-C6经取代的烷基)，并且R3可以为烷基或经取代的烷基，诸如C1-C10烷基或C1-C10经取代的烷基(例如，C1-C6烷基或C1-C6经取代的烷基)。在一些情况下，R2和R3各自独立地选自甲基、乙基、正丙基、异丙基、正丁基、仲丁基、异丁基、叔丁基，等等。在某些情况下，R2和R3各自为甲基。
在式(VIa)的某些实施方案中，Y1选自氢、卤素、烷基、经取代的烷基、烯基、经取代的烯基、炔基、经取代的炔基、烷氧基、经取代的烷氧基、氨基、经取代的氨基、羧基、羧基酯、酰基、酰氧基、酰基氨基、氨基酰基、烷基酰胺、经取代的烷基酰胺、磺酰基、硫代烷氧基、经取代的硫代烷氧基、芳基、经取代的芳基、杂芳基、经取代的杂芳基、环烷基、经取代的环烷基、杂环基以及经取代的杂环基。在某些实施方案中，Y1为氢。在某些实施方案中，Y1为卤素，诸如F、Cl、Br或I。在某些实施方案中，Y1为F。在某些实施方案中，Y1为Cl。在某些实施方案中，Y1为Br。在某些实施方案中，Y1为I。在某些实施方案中，Y1为烷基或经取代的烷基。在某些实施方案中，Y1为烯基或经取代的烯基。在某些实施方案中，Y1为炔基或经取代的炔基。在某些实施方案中，Y1为烷氧基或经取代的烷氧基。在某些实施方案中，Y1为氨基或经取代的氨基。在某些实施方案中，Y1为羧基或羧基酯。在某些实施方案中，Y1为酰基或酰氧基。在某些实施方案中，Y1为酰基氨基或氨基酰基。在某些实施方案中，Y1为烷基酰胺或经取代的烷基酰胺。在某些实施方案中，Y1为磺酰基。在某些实施方案中，Y1为硫代烷氧基或经取代的硫代烷氧基。在某些实施方案中，Y1为芳基或经取代的芳基。在某些实施方案中，Y1为杂芳基或经取代的杂芳基。在某些实施方案中，Y1为环烷基或经取代的环烷基。在某些实施方案中，Y1为杂环基或经取代的杂环基。
在式(VIa)的某些实施方案中，Y2选自氢、卤素、烷基、经取代的烷基、烯基、经取代的烯基、炔基、经取代的炔基、烷氧基、经取代的烷氧基、氨基、经取代的氨基、羧基、羧基酯、酰基、酰氧基、酰基氨基、氨基酰基、烷基酰胺、经取代的烷基酰胺、磺酰基、硫代烷氧基、经取代的硫代烷氧基、芳基、经取代的芳基、杂芳基、经取代的杂芳基、环烷基、经取代的环烷基、杂环基以及经取代的杂环基。在某些实施方案中，Y2为氢。在某些实施方案中，Y2为卤素，诸如F、Cl、Br或I。在某些实施方案中，Y2为F。在某些实施方案中，Y2为Cl。在某些实施方案中，Y2为Br。在某些实施方案中，Y2为I。在某些实施方案中，Y2为烷基或经取代的烷基。在某些实施方案中，Y2为烯基或经取代的烯基。在某些实施方案中，Y2为炔基或经取代的炔基。在某些实施方案中，Y2为烷氧基或经取代的烷氧基。在某些实施方案中，Y2为氨基或经取代的氨基。在某些实施方案中，Y2为羧基或羧基酯。在某些实施方案中，Y2为酰基或酰氧基。在某些实施方案中，Y2为酰基氨基或氨基酰基。在某些实施方案中，Y2为烷基酰胺或经取代的烷基酰胺。在某些实施方案中，Y2为磺酰基。在某些实施方案中，Y2为硫代烷氧基或经取代的硫代烷氧基。在某些实施方案中，Y2为芳基或经取代的芳基。在某些实施方案中，Y2为杂芳基或经取代的杂芳基。在某些实施方案中，Y2为环烷基或经取代的环烷基。在某些实施方案中，Y2为杂环基或经取代的杂环基。
在式(VIa)的某些实施方案中，Y3选自氢、卤素、烷基、经取代的烷基、烯基、经取代的烯基、炔基、经取代的炔基、烷氧基、经取代的烷氧基、氨基、经取代的氨基、羧基、羧基酯、酰基、酰氧基、酰基氨基、氨基酰基、烷基酰胺、经取代的烷基酰胺、磺酰基、硫代烷氧基、经取代的硫代烷氧基、芳基、经取代的芳基、杂芳基、经取代的杂芳基、环烷基、经取代的环烷基、杂环基以及经取代的杂环基。在某些实施方案中，Y3为氢。在某些实施方案中，Y3为卤素，诸如F、Cl、Br或I。在某些实施方案中，Y3为F。在某些实施方案中，Y3为Cl。在某些实施方案中，Y3为Br。在某些实施方案中，Y3为I。在某些实施方案中，Y3为烷基或经取代的烷基。在某些实施方案中，Y3为烯基或经取代的烯基。在某些实施方案中，Y3为炔基或经取代的炔基。在某些实施方案中，Y3为烷氧基或经取代的烷氧基。在某些实施方案中，Y3为氨基或经取代的氨基。在某些实施方案中，Y3为羧基或羧基酯。在某些实施方案中，Y3为酰基或酰氧基。在某些实施方案中，Y3为酰基氨基或氨基酰基。在某些实施方案中，Y3为烷基酰胺或经取代的烷基酰胺。在某些实施方案中，Y3为磺酰基。在某些实施方案中，Y3为硫代烷氧基或经取代的硫代烷氧基。在某些实施方案中，Y3为芳基或经取代的芳基。在某些实施方案中，Y3为杂芳基或经取代的杂芳基。在某些实施方案中，Y3为环烷基或经取代的环烷基。在某些实施方案中，Y3为杂环基或经取代的杂环基。
在式(VIa)的某些实施方案中，Y4选自氢、卤素、烷基、经取代的烷基、烯基、经取代的烯基、炔基、经取代的炔基、烷氧基、经取代的烷氧基、氨基、经取代的氨基、羧基、羧基酯、酰基、酰氧基、酰基氨基、氨基酰基、烷基酰胺、经取代的烷基酰胺、磺酰基、硫代烷氧基、经取代的硫代烷氧基、芳基、经取代的芳基、杂芳基、经取代的杂芳基、环烷基、经取代的环烷基、杂环基以及经取代的杂环基。在某些实施方案中，Y4为氢。在某些实施方案中，Y4为卤素，诸如F、Cl、Br或I。在某些实施方案中，Y4为F。在某些实施方案中，Y4为Cl。在某些实施方案中，Y4为Br。在某些实施方案中，Y4为I。在某些实施方案中，Y4为烷基或经取代的烷基。在某些实施方案中，Y4为烯基或经取代的烯基。在某些实施方案中，Y4为炔基或经取代的炔基。在某些实施方案中，Y4为烷氧基或经取代的烷氧基。在某些实施方案中，Y4为氨基或经取代的氨基。在某些实施方案中，Y4为羧基或羧基酯。在某些实施方案中，Y4为酰基或酰氧基。在某些实施方案中，Y4为酰基氨基或氨基酰基。在某些实施方案中，Y4为烷基酰胺或经取代的烷基酰胺。在某些实施方案中，Y4为磺酰基。在某些实施方案中，Y4为硫代烷氧基或经取代的硫代烷氧基。在某些实施方案中，Y4为芳基或经取代的芳基。在某些实施方案中，Y4为杂芳基或经取代的杂芳基。在某些实施方案中，Y4为环烷基或经取代的环烷基。在某些实施方案中，Y4为杂环基或经取代的杂环基。
在式(VIa)的某些实施方案中，L为任选的连接子。在某些实施方案中，L不存在，并且因此吲哚环的氮直接键结至W1。在某些实施方案中，L存在，并且因此吲哚环的氮经由连接子L间接键结至W1。
在式(VIa)的某些实施方案中，L包括选自以下的基团：烷基、经取代的烷基、烯基、经取代的烯基、炔基、经取代的炔基、烷氧基、经取代的烷氧基、氨基、经取代的氨基、羧基、羧基酯、酰基氨基、烷基酰胺、经取代的烷基酰胺、芳基、经取代的芳基、杂芳基、经取代的杂芳基、环烷基、经取代的环烷基、杂环基以及经取代的杂环基。在某些实施方案中，L包括烷基或经取代的烷基。在某些实施方案中，L包括烯基或经取代的烯基。在某些实施方案中，L包括炔基或经取代的炔基。在某些实施方案中，L包括烷氧基或经取代的烷氧基。在某些实施方案中，L包括氨基或经取代的氨基。在某些实施方案中，L包括羧基或羧基酯基。在某些实施方案中，L包括酰基氨基。在某些实施方案中，L包括烷基酰胺或经取代的烷基酰胺基。在某些实施方案中，L包括芳基或经取代的芳基。在某些实施方案中，L包括杂芳基或经取代的杂芳基。在某些实施方案中，L包括环烷基或经取代的环烷基。在某些实施方案中，L包括杂环基或经取代的杂环基。
在式(VIa)的某些实施方案中，L包括聚合物。举例来说，聚合物可以包括聚烷二醇和其衍生物，包括聚乙二醇、甲氧基聚乙二醇、聚乙二醇均聚物、聚丙二醇均聚物、乙二醇与丙二醇的共聚物(例如，其中均聚物和共聚物未经取代或在一端被烷基取代)、聚乙烯醇、聚乙烯基乙基醚、聚乙烯吡咯烷酮、其组合，等等。在某些实施方案中，聚合物为聚烷二醇。在某些实施方案中，聚合物为聚乙二醇。
在式(VIa)的某些实施方案中，W1选自药物、可检测标记以及多肽。在某些实施方案中，W1为药物。在某些实施方案中，W1为可检测标记。在某些实施方案中，W1为多肽。
化合物的实施方案包括式(VIb)化合物：
在某些实施方案中，式(VIb)中的取代基如上文关于式(VI)所描述。举例来说，在某些实施方案中，L为任选的连接子。在某些实施方案中，L不存在，并且因此吲哚环的氮直接键结至W1。在某些实施方案中，L存在，并且因此吲哚环的氮经由连接子L间接键结至W1。
在式(VIb)的某些实施方案中，L包括选自以下的基团：烷基、经取代的烷基、烯基、经取代的烯基、炔基、经取代的炔基、烷氧基、经取代的烷氧基、氨基、经取代的氨基、羧基、羧基酯、酰基氨基、烷基酰胺、经取代的烷基酰胺、芳基、经取代的芳基、杂芳基、经取代的杂芳基、环烷基、经取代的环烷基、杂环基以及经取代的杂环基。在某些实施方案中，L包括烷基或经取代的烷基。在某些实施方案中，L包括烯基或经取代的烯基。在某些实施方案中，L包括炔基或经取代的炔基。在某些实施方案中，L包括烷氧基或经取代的烷氧基。在某些实施方案中，L包括氨基或经取代的氨基。在某些实施方案中，L包括羧基或羧基酯基。在某些实施方案中，L包括酰基氨基。在某些实施方案中，L包括烷基酰胺或经取代的烷基酰胺基。在某些实施方案中，L包括芳基或经取代的芳基。在某些实施方案中，L包括杂芳基或经取代的杂芳基。在某些实施方案中，L包括环烷基或经取代的环烷基。在某些实施方案中，L包括杂环基或经取代的杂环基。
在式(VIb)的某些实施方案中，L包括聚合物。举例来说，聚合物可以包括聚烷二醇和其衍生物，包括聚乙二醇、甲氧基聚乙二醇、聚乙二醇均聚物、聚丙二醇均聚物、乙二醇与丙二醇的共聚物(例如，其中均聚物和共聚物未经取代或在一端被烷基取代)、聚乙烯醇、聚乙烯基乙基醚、聚乙烯吡咯烷酮、其组合，等等。在某些实施方案中，聚合物为聚烷二醇。在某些实施方案中，聚合物为聚乙二醇。
在式(VIb)的某些实施方案中，W1选自药物、可检测标记以及多肽。在某些实施方案中，W1为药物。在某些实施方案中，W1为可检测标记。在某些实施方案中，W1为多肽。
靶多肽
可以对多种多肽中的任一者进行修饰以偶联至如上文所描述的第二部分。适合于修饰的多肽包括具有天然存在的氨基酸序列、天然存在的多肽的片段、以及非天然存在的多肽和其片段的两种蛋白质。
以下是对于使用本文所描述的化合物和方法修饰以产生本文所描述的多肽偶联物所关注的多肽的种类和类型的实例。
治疗性多肽
在某些实施方案中，将产生偶联物的方法应用于修饰可以提供治疗效益的多肽，诸如连接至一个部分可以提供以下一者或多者的那些多肽：例如，血清半衰期增加、不良免疫反应减小、额外或替代的生物活性或功能性等，或其它效益或不良副作用的降低。在治疗性多肽为疫苗的抗原的情况下，修饰可以提供多肽的增强的免疫原性。
治疗性蛋白质的种类的实例包括作为细胞因子、趋化因子、生长因子、激素、抗体以及抗原的那些。其它实例包括(但不限于)以下：促红细胞生成素(EPO，例如原生EPO或合成EPO(参看例如US 2003/0191291)，诸如(但不限于)或(依泊汀α(epoetin-α))、(达伯汀α(darbepoietin-α))、(依泊汀β(epoetin-β))，等等)；生长激素(例如促生长素，例如 等等)；人生长激素(hGH)；牛生长激素(bGH)；促滤泡激素(FSH)；干扰素(例如，IFN-γ、IFN-α、IFN-β、IFN-ω、IFN-τ、复合干扰素，等等)；胰岛素(例如，诺和灵(Novolin)、优泌林(Humulin)、优泌乐(Humalog)、来得时(Lantus)、优乐停(Ultralente)，等等)、类胰岛素生长因子(例如，IGF-I、IGF-II)；血液因子(例如，因子X、组织纤维蛋白溶酶原活化剂(TPA)，等等，诸如(但不限于)(阿替普酶(alteplase))组织纤维蛋白溶酶原活化剂、(重组人因子VIIa)、因子VIIa、因子VIII(例如，)、因子IX、β-球蛋白、血红蛋白，等等)；集落刺激因子(例如，粒细胞-CSF(G-CSF，例如(非格司亭(filgrastim)))、巨噬细胞-CSF(M-CSF)、粒细胞-巨噬细胞-CSF(GM-CSF)、纽拉思塔(Neulasta)(培非格司亭(pegfilgrastim))、粒细胞-单核细胞集落刺激因子、巨核细胞集落刺激因子，等等)、转化生长因子(例如，TGF-β、TGF-α)；白介素(例如，IL-1、IL-2(例如，)、IL-3、IL-4、IL-5、IL-6、IL-7、IL-8、IL-9、IL-12，等等)；生长因子(例如，表皮生长因子(EGF)、血小板源性生长因子(PDGF，例如(贝卡普勒明(beclapermin)))、成纤维细胞生长因子(FGF，例如aFGF、bFGF，诸如(曲弗明(trafermin)))、胶质细胞系源性生长因子(GDNF)、神经生长因子(NGF)、干细胞因子(例如，(安西司亭(ancestim)))、角化细胞生长因子、肝细胞生长因子，等等)；可溶性受体(例如，TNF-α结合可溶性受体，诸如(依那西普(etanercept))、可溶性VEGF受体、可溶性白介素受体、可溶性γ/δT细胞受体，等等)；酶(例如，α-葡糖苷酶、(伊米苷酶(imiglucarase)、β-葡糖脑苷脂酶(β-glucocerebrosidase)、(阿糖脑苷酶(alglucerase))；酶活化剂(例如，组织纤维蛋白溶酶原活化剂)；趋化因子(例如，IP-10、Mig、Groα/IL-8、调控和正常T细胞表达和分泌因子(RANTES)、MIP-1α、MIP-1β、MCP-1、PF-4，等等)；血管生成剂(例如，血管内皮生长因子(VEGF))；抗血管生成剂(例如，可溶性VEGF受体)；蛋白质疫苗；神经活性肽，诸如缓激肽(bradykinin)、胆囊收缩素(cholecystokinin)、胃泌素(gastin)、分泌素(secretin)、催产素(oxytocin)、促性腺激素释放激素、β-内啡肽(beta-endorphin)、脑啡肽(enkephalin)、物质P、生长抑素(somatostatin)、甘丙肽(galanin)、生长激素释放激素、蛙皮素(bombesin)、华法林(warfarin)、强啡肽(dynorphin)、神经紧张素(neurotensin)、蠕动素(motilin)、促甲状腺素(thyrotropin)、神经肽Y、促黄体激素、降钙素(calcitonin)、胰岛素、胰高血糖素(glucagon)、血管加压素(vasopressin)、血管紧张素II(angiotensin II)、促甲状腺素释放激素、血管活性肠肽、睡眠肽，等等；其它蛋白质，诸如血栓溶解剂、心房钠尿肽、骨形态发生蛋白、血小板生成素(thrombopoietin)、松弛素(relaxin)、胶质原纤维酸性蛋白、促滤泡激素、人类α-1抗胰蛋白酶、白血病抑制因子、转化生长因子、组织因子、类胰岛素生长因子、促黄体激素、促滤泡激素、巨噬细胞活化因子、肿瘤坏死因子、嗜中性粒细胞趋化因子、神经生长因子、金属蛋白酶组织抑制剂；血管活性肠肽、血管生成素(angiogenin)、促血管素(angiotropin)、纤维蛋白；水蛭素(hirudin)；白血病抑制因子；IL-1受体拮抗剂(例如，(阿那白滞素(anakinra)))；等等。应容易了解，上述治疗性蛋白质的原生形式作为本公开中的靶多肽也受关注。
其它实例包括抗体，例如多克隆抗体、单克隆抗体、人源化抗体、抗原结合片段(例如，F(ab)'、Fab、Fv)、单链抗体等(例如，(利妥昔单抗(rituximab))；(英利昔单抗(infliximab))；(曲妥珠单抗(trastuzumab))；HUMIRATM(阿达木单抗(adalimumab))；(奥马珠单抗(omalizumab))；(托西莫单抗(tositumomab))；RAPTIVATM(依法利珠单抗(efalizumab))；ERBITUXTM(西妥昔单抗(cetuximab))；等等)。在一些情况下，抗体包括特异性地结合至肿瘤抗原、免疫细胞抗原(例如，CD4、CD8，等等)、微生物(特别是病原微生物)抗原(例如，细菌、病毒、真菌或寄生虫抗原)等的抗体。
在一些情况下，可以应用本文所描述的方法、偶联物以及化合物以提供在原生或工程改造的糖基化位点(诸如在高糖基化形式的治疗性蛋白质中所发现)处的部分(例如，水溶性聚合物)。
修饰的靶多肽的生物活性可以根据本领域中已知的方法来分析。保留对应的亲本蛋白质的至少一种所需药理活性的修饰的多肽是受关注的。
免疫原性组合物
本文所公开的方法、偶联物以及化合物还适用于产生免疫原性组合物(例如，治疗性疫苗)的组分。举例来说，化合物可以用于促进增加多肽抗原的血清半衰期、增加多肽的免疫原性、或将非氨基酸抗原连接至多肽载体的部分的连接。在这方面，化合物可以用于促进微生物抗原(例如，细菌、病毒、真菌或寄生虫抗原)、肿瘤抗原、以及施用于受试者以引出受试者的免疫反应所关注的其它抗原的修饰。还关注适用于引出可以适用作研究工具的抗体的抗原的修饰。
用于使用本文所公开的化合物进行修饰的所关注的多肽的其它实例包括在试验中用于检测或功能监测所关注的那些(例如，在药物筛选试验中作为研究工具，等等)。这种类型的多肽的实例包括受体(例如，G蛋白偶合受体(GPCR，包括孤儿GPCR))、受体配体(包括天然存在的和合成的)、蛋白质通道(例如，离子通道(例如，钾通道、钙通道、钠通道，等等))，以及其它多肽。在一些实施方案中，细胞表面相关多肽(诸如跨膜多肽)的修饰是受关注的，例如，在多肽存在于膜中的同时实现所述修饰的情况下。下文进一步描述在生理条件下对多肽进行修饰的方法。
多肽产生的方法
一般来说，本文所描述的多肽可以根据常规方式在原核生物或真核生物中表达，这取决于表达的目的。因此，本发明进一步提供了一种宿主细胞，例如，包含编码多肽的核酸的遗传修饰的宿主细胞。
用于产生(包括大规模产生)适合于形成如本文所描述的偶联物的未偶联的或修饰的多肽的宿主细胞可以选自多种可用的宿主细胞中的任一者。宿主细胞的实例包括原核或真核单细胞生物体，诸如细菌(例如，大肠杆菌菌株(Escherichia coli strain)、芽孢杆菌属(Bacillus spp.)(例如，枯草芽孢杆菌(B.subtilis))，等等)、酵母或真菌(例如，酿酒酵母(S.cerevisiae)、毕赤酵母属(Pichia spp.)，等等)的那些，并且可以使用其它所述宿主细胞。最初来源于高等生物体，诸如昆虫、脊椎动物(包括哺乳动物)的宿主细胞的实例(例如，CHO、HEK，等等)可以用作表达宿主细胞。
适合的哺乳动物细胞系包括(但不限于)HeLa细胞(例如，美国菌种保藏中心(American Type Culture Collection；ATCC)编号CCL-2)、CHO细胞(例如，ATCC编号CRL9618和CRL9096)、CHO DG44细胞(Urlaub(1983)Cell 33:405)、CHO-K1细胞(ATCC CCL-61)、293细胞(例如，ATCC编号CRL-1573)、Vero细胞、NIH 3T3细胞(例如，ATCC编号CRL-1658)、Huh-7细胞、BHK细胞(例如，ATCC编号CCL10)、PC12细胞(ATCC编号CRL1721)、COS细胞、COS-7细胞(ATCC编号CRL1651)、RAT1细胞、小鼠L细胞(ATCC编号CCLI.3)、人胚肾(HEK)细胞(ATCC编号CRL1573)、HLHepG2细胞，等等。
所关注的特定表达系统包括源自细菌、酵母、昆虫细胞以及哺乳动物细胞的表达系统。
表达的多肽可以通过本领域中已知的任何适当手段来回收。此外，可以采用任何适宜的蛋白质纯化程序，其中适合的蛋白质纯化方法描述于Guide to ProteinPurification,(Deuthser编)(Academic Press,1990)中。举例来说，可以从包含表达所需多肽的表达载体的细胞制备裂解物，并且使用高效液相色谱法(HPLC)、排阻色谱法、凝胶电泳、亲和色谱法等进行纯化。
多肽修饰的方法
在某些实施方案中，多肽可以偶联至所关注的部分，而没有首先对多肽进行修饰。举例来说，多肽可以包括一个或多个适合于偶联至所关注的部分(例如，包含偶合部分的部分，诸如本文所描述的肼基-吲哚化合物或肼基-吲哚衍生物)的反应基团。在其它实施方案中，多肽在偶联至所关注的部分之前可以被修饰。多肽的修饰可以产生含有一个或多个适合于偶联至所关注的部分的反应基团的修饰的多肽。
在一些情况下，多肽可以在一个或多个氨基酸残基处被修饰以提供一个或多个适合于偶联至所关注的部分(例如，包含偶合部分的部分，诸如本文所描述的肼基-吲哚化合物或肼基-吲哚衍生物)的反应基团。举例来说，引入多肽中的羰基可以选择性地与α-亲核试剂，诸如含氨氧基和含酰肼化合物反应。对具有增强的动力学、位点选择性以及偶联物稳定性的蛋白质上的羰基官能团有选择性的化学反应可以得到改善的生物偶联物并且获取如本文所公开的新产物和治疗标靶。
在某些实施方案中，可以对多肽进行修饰以包括醛标签。“醛标签(aldehyde tag/ald-tag)”意味着含有来源于硫酸酯酶基序的氨基酸序列的氨基酸序列，这个硫酸酯酶基序能够被转化或已经通过甲酰甘氨酸生成酶(FGE)的作用而转化以含有2-甲酰甘氨酸残基(在本文中被称作“fGly”)。由FGE产生的fGly残基在文献中常常被称作“甲酰甘氨酸”。换句话说，术语“醛标签”在本文中用于指代包含“未转化”的硫酸酯酶基序(即，半胱氨酸或丝氨酸残基尚未被FGE转化成fGly，但能够被转化的硫酸酯酶基序，诸如具有以下序列的硫酸酯酶基序：L(C/S)TPSR)的氨基酸序列，以及包含“转化”的硫酸酯酶基序(即，半胱氨酸或丝氨酸残基已经通过FGE的作用转化成fGly的硫酸酯酶基序，例如，L(fGly)TPSR)的氨基酸序列。如在甲酰甘氨酸生成酶(FGE)作用于硫酸酯酶基序的情形中所用的“转化”指的是硫酸酯酶基序中的半胱氨酸或丝氨酸残基生物化学修饰成甲酰甘氨酸(fGly)残基(例如，Cys转化成fGly，或Ser转化成fGly)。醛标签和其在位点特异性蛋白质修饰中的用途的额外方面描述于U.S.7,985,783中，其公开内容以引用的方式并入本文中。
多肽经过转化以包括fGly可以通过基于细胞的方法(体内)或无细胞方法(体外)来实现。类似地，多肽经过修饰以产生适合于偶联的多肽(例如，经过修饰以产生含有适合于偶联的反应基团的多肽)可以通过基于细胞的方法(体内)或无细胞方法(体外)来实现。
或者，分离的、未修饰的多肽可以在缺乏适合酶的宿主细胞中重组产生之后或通过合成产生而分离。分离的多肽然后可以与适合的酶在对多肽提供所需修饰以包括fGly的条件下接触。多肽可以通过本领域中已知的方法(例如，使用热、pH调整、离液剂(例如，脲等等)、有机溶剂(例如，烃：辛烷、苯、氯仿)，等等)解折叠并且变性蛋白与适合的酶接触。修饰的多肽然后可以在适合的条件下重折叠。
在一些情况下，含有fGly残基的修饰的多肽可以通过fGly与如本文所描述的化合物(例如，含有偶合部分的化合物，诸如本文所描述的肼基-吲哚或肼基-吲哚衍生物)反应而偶联至所关注的部分。举例来说，含fGly多肽可以从产生来源分离(例如，重组宿主细胞产生、合成产生)，并且与含反应伴侣的药物或其它部分(例如，可检测标记)在适合于提供药物或其它部分与多肽的偶联的条件下接触。举例来说，含反应伴侣的药物或其它部分可以包括反应部分(例如，如本文所描述的肼基-吲哚化合物或肼基-吲哚衍生物)。含肼基-吲哚的药物或其它部分可以与多肽反应以产生如本文所描述的多肽偶联物。举例来说，图1示出了根据本公开的实施方案的多肽偶联物的示意图。图1A示出了用于产生包括肼基-吲哚偶合部分的多肽偶联物的反应流程。在图1A中，包括fGly的多肽(在图中以阴影球指示)与肼基-吲哚偶合部分(例如，肼基-吲哚化合物或肼基-吲哚衍生物)反应以产生包括偶合部分的多肽偶联物。如图1A中所示，肼基-吲哚偶合部分的肼经历分子内环化以形成部分不饱和的吡唑或哒嗪环，这分别取决于n为0还是1。在图1A中，阴影球可以代表多肽并且R4可以为药物或可检测标记，然而，在其它实施方案中，阴影球可以代表药物或可检测标记并且R4可以为多肽。图1B示出了用于产生包括不同肼基-吲哚偶合部分的多肽偶联物的反应流程。在图1B中，包括fGly的多肽与肼基-吲哚偶合部分反应以产生包括偶合部分的多肽偶联物。如图1B中所示，肼基-吲哚偶合部分的肼经历分子内环化以形成部分不饱和的哒嗪或1,2-二氮杂环庚三烯环，这分别取决于n为0还是1。在图1B中，阴影球可以代表多肽并且R4可以为药物或可检测标记，然而，在其它实施方案中，阴影球可以代表药物或可检测标记并且R4可以为多肽。
多肽偶联物
多肽可以发生偶联以提供多种部分的连接。所关注的部分的实例包括(但不限于)药物、可检测标记、小分子、水溶性聚合物、肽，等等。因此，本公开提供了如上文所描述的多肽偶联物。
所关注的部分作为反应伴侣的组分而提供用于与多肽的残基反应。在某些实施方案中，多肽偶联的方法与适合于多肽的反应条件相容。举例来说，反应条件可以包括有包括水的反应混合物。在一些情况下，反应混合物可以具有与多肽相容的pH，诸如(但不限于)4至11的pH，或5至10的pH，或6至9的pH，或6至8的pH。在某些情况下，反应混合物的pH为7。在一些实施方案中，反应条件是在与多肽相容的温度下执行。举例来说，反应条件可以为20℃至45℃的温度，诸如25℃至40℃，或30℃至40℃，或35℃至40℃。在一些情况下，反应条件为室温(例如，25℃)。在一些情况下，反应条件为37℃的温度。
提供本公开，一般技术人员可以容易地改变多种部分中的任一者以提供用于偶联至如本文所涵盖的多肽的反应伴侣。一般技术人员应了解，诸如pH和位阻(即，修饰的氨基酸残基与所关注的反应伴侣反应的可及性)的因素是重要的。修改反应条件以提供最佳偶联条件充分处于一般技术者的技能范围内，并且在本领域中是常规的。在用存在于活细胞中或活细胞上的多肽进行偶联的情况下，选择条件以使其生理上相容。举例来说，pH可以暂时地下降持续一段足以允许反应发生的时间，但在细胞耐受的时段内(例如，约30分钟至1小时)。用于在细胞表面上进行多肽修饰的生理条件可以类似于在带有细胞表面叠氮化物的细胞修饰中的酮-叠氮化物反应中所用的那些(参看例如U.S.6,570,040)。
在某些实施方案中，本公开提供了一种多肽偶联物，其中多肽为抗体。这样的话，实施方案包括偶联至所关注的部分的抗体，其中偶联至所关注的部分的抗体被称作“抗体偶联物”。Ig多肽一般至少包括Ig重链恒定区或Ig轻链恒定区，并且可以进一步包括Ig可变区(例如，VL区和/或VH区)。Ig重链恒定区包括任何重链同型的Ig恒定区、非天然存在的Ig重链恒定区(包括一致Ig重链恒定区)。可以对Ig恒定区进行修饰以偶联至所关注的部分，其中所关注的部分存在于Ig恒定区的溶剂可及环区中或邻近于这个环区。
在一些情况下，本公开的抗体偶联物可以包括：1)偶联至一个或多个所关注的部分的Ig重链恒定区，和偶联至一个或多个所关注的部分的Ig轻链恒定区；2)偶联至一个或多个所关注的部分的Ig重链恒定区，和不偶联至所关注的部分的Ig轻链恒定区；或3)不偶联至所关注的部分的Ig重链恒定区，和偶联至一个或多个所关注的部分的Ig轻链恒定区。主题抗体偶联物还可以包括可变VH和/或VL域。如上文所描述，一个或多个所关注的部分可以在单个氨基酸残基处偶联至Ig重链恒定区或Ig轻链恒定区(例如，一个或两个所关注的部分偶联至单个氨基酸残基)，或在两个或更多个不同氨基酸残基处偶联至Ig重链恒定区和/或Ig轻链恒定区。
本公开的抗体偶联物可以包括作为偶联部分的如本文所描述的多种化合物中的任一者，例如，药物(例如，肽药物、小分子药物，等等)、水溶性聚合物、可检测标记、合成肽，等等。
抗体偶联物可以具有如上文所描述的多种抗原结合特异性中的任一者，包括例如存在于癌细胞上的抗原；存在于自体免疫细胞上的抗原；存在于病原微生物上的抗原；存在于病毒感染的细胞(例如，人免疫缺陷病毒感染的细胞)上的抗原，例如，CD4或gp120；存在于病变细胞上的抗原；等等。举例来说，抗体偶联物可以结合如上文所提到的抗原，其中抗原存在于细胞表面上。本公开的抗体偶联物可以按适合的结合亲和力结合抗原，这种结合亲和力如5×10-6M至10-7M、10-7M至5×10-7M、5×10-7M至10-8M、10-8M至5×10-8M、5×10-8M至10-9M，或大于10-9M的结合亲和力。
作为非限制性实例，主题抗体偶联物可以结合存在于癌细胞上的抗原(例如，肿瘤特异性抗原；在癌细胞上过度表达的抗原；等等)，并且偶联的部分可以为药物(例如，小分子药物、肽药物，等等)。举例来说，主题抗体偶联物可以对CD19具特异性，其中偶联的部分为药物(例如，小分子药物、肽药物，等等)。作为另一个实例，主题抗体偶联物可以对CD22具特异性，其中偶联的部分可以为药物(例如，小分子药物、肽药物，等等)。
作为其它非限制性实例，主题抗体偶联物可以结合存在于受病毒感染的细胞上的抗原(例如，其中抗原由病毒编码；其中抗原在受病毒感染的细胞类型上表达；等等)，并且偶联的部分可以为病毒融合抑制剂。举例来说，主题抗体偶联物可以结合CD4，并且偶联的部分可以为病毒融合抑制剂。作为另一个实例，主题抗体偶联物可以结合gp120，并且偶联的部分可以为病毒融合抑制剂。
本公开的实施方案还包括多肽偶联物，其中多肽为载体蛋白。举例来说，载体蛋白可以共价地并且位点特异性地结合至药物以提供含药物的支架。载体蛋白可以位点特异性地偶联至所关注的共价结合的分子，诸如药物(例如，肽、小分子药物，等等)、可检测标记，等等。在某些实施方案中，药物-支架偶联物可以提供药物的提高的血清半衰期。
一般来说，“载体蛋白”是如下蛋白质：其为生物惰性的，易发生如本文所公开的修饰，并且可以提供在生理环境中经由载体蛋白中的修饰的氨基酸残基(例如，经由加醛标签的载体蛋白的转化的硫酸酯酶基序内的肟或腙键)偶联至载体蛋白的所关注的部分的溶剂可及呈现。“生物惰性”意图指示载体蛋白当施用于适当受试者时，诸如当施用于人类受试者时展现临床上不显著或不可检测的生物活性。因此，载体蛋白的生物惰性在于其例如具有低免疫原性，不展现显著或可检测的靶向特性(例如，不展现显著或可检测的与特异性受体的结合活性)，并且展现极少可检测或不可检测的可能干扰偶联至加醛标签的载体蛋白的部分(例如，药物或可检测标记)的活性的生物活性。“低免疫原性”意味着载体蛋白在施用于受试者，诸如哺乳动物受试者，例如人类受试者后引出极少可检测或不可检测的免疫反应。载体蛋白可以按单体或多聚(例如，二聚)形式提供。
当折叠时具有提供可经历修饰(并且因此偶联至所关注的部分)的多个不同溶剂可及位点的三维结构的载体蛋白是受关注的。一般来说，所关注的载体蛋白是具有一定尺寸和三维折叠结构的那些以提供所关注的偶联的部分在溶剂可及表面上以空间上充分分离的方式呈现以提供所关注的偶联的部分的活性和生物利用度。载体蛋白可以根据多种因素来选择，包括(但不限于)将要偶联至载体蛋白的部分(例如，药物或可检测标记)。
因此，多种多肽中的任一者可以适合用作用于本公开的载体蛋白偶联物中的载体蛋白。所述载体蛋白可以包括具有天然存在的氨基酸序列、天然存在的多肽的片段、以及非天然存在的多肽和其片段的那些。
载体蛋白的实例包括(但不限于)白蛋白和其片段(例如，人血清白蛋白、牛血清白蛋白，等等)、转铁蛋白和其片段(例如，人转铁蛋白)，以及与哺乳动物Fc受体、尤其人类Fc受体的结合性降低的Fc片段(例如，抗体(例如，IgG)，诸如哺乳动物抗体，例如人类抗体的修饰的Fc片段)。具有降低的Fc受体结合性的修饰的Fc片段的实例以赫赛汀(Herceptin)(曲妥珠单抗)和美罗华(Rituxan)(利妥昔单抗)的Fc片段例示，这些Fc片段含有提供降低的Fc受体结合性的点突变(参看例如Clynes等,Nature Medicine(2000),6,443-446)。可选地或另外，Fc片段的同型可以根据所需水平的Fc受体结合性来选择(例如，使用IgG4同型人类重链恒定区而非来自IgG1或IgG3的Fc片段)(参看例如Fridman FASEB J 1991年9月；5(12):2684-90)。一般来说，载体蛋白可以为至少约4kDa(例如，长度为约50个氨基酸残基)，通常为至少约25kDa，并且尺寸可以更大(例如，转铁蛋白具有90kDa的分子量，而Fc片段可以具有30kDa至50kDa的分子量)。
本文所描述的偶联物可以用于多种应用，包括(但不限于)使用荧光或表位标记进行观测(例如，使用具备用于偶联至本文所描述的化合物和偶联物的反应基团的金粒子的电子显微术)；蛋白质固定(例如，蛋白质微阵列产生)；蛋白质动态和定位研究与应用；以及蛋白质与所关注的部分(例如，改善亲本蛋白质的半衰期的部分(例如，聚(乙二醇))、靶向部分(例如，以增强递送至作用位点)，以及生物活性部分(例如，治疗性部分))的偶联。
多肽偶联物可以包括偶联至提供多种功能或特征中的一者或多者的部分的多肽。一般来说，部分的实例包括(但不限于)以下：可检测标记(例如，荧光标记或荧光团)；光活化的动态部分(例如，偶氮苯介导的孔闭合、偶氮苯介导的结构变化、光致脱囚禁(photodecaging)识别基序)；水溶性聚合物(例如，聚乙二醇化)；纯化标签(例如，以有助于通过亲和色谱法分离(例如，连接FLAG表位)；膜定位域(例如，脂质或糖磷脂酰肌醇(GPI)型锚)；固定标签(例如，以有助于多肽连接至表面，包括选择性连接)；药物(例如，以有助于药物靶向，例如经由药物连接至抗体)；靶向的递送部分(例如，用于结合至靶受体的配体(例如，以有助于病毒连接、存在于脂质体上的靶向蛋白的连接，等等))，等等。
下文提供特定的非限制性实例。
用于偶联至多肽的药物
许多药物中的任一者适合使用，或可以经过修饰以促使其适合使用，以作为偶联至多肽的反应伴侣。药物的实例包括小分子药物和肽药物。因此，本公开提供了药物-多肽偶联物。
如本文所用的“小分子药物”指的是化合物，例如有机化合物，其展现所关注的医药活性并且一般具有800Da或更小、或2000Da或更小的分子量，但可以包涵高达5kDa的分子并且可以大至10kDa。小无机分子指的是不含碳原子的分子，而小有机分子指的是含有至少一个碳原子的化合物。
如本文所用的“肽药物”指的是含氨基酸的聚合化合物，并且意图包涵天然存在的和非天然存在的肽、寡肽、环肽、多肽和蛋白质，以及肽模拟物。肽药物可以通过化学合成而获得或从遗传编码的来源(例如，重组来源)产生。肽药物可以具有一定范围的分子量，并且分子量可以为200Da至10kDa或更大。
在一些情况下，药物是癌症化学治疗剂。举例来说，在多肽为对肿瘤细胞具有特异性的抗体(或其片段)的情况下，抗体可以如本文所描述进行修饰以包括修饰的氨基酸，这个氨基酸随后可以偶联至癌症化学治疗剂。癌症化学治疗剂包括减少癌细胞增殖的非肽(即，非蛋白质)化合物，并且包涵细胞毒性剂和细胞抑制剂。化学治疗剂的非限制性实例包括烷化剂、亚硝基脲、抗代谢物、抗肿瘤抗生素、植物(长春花)生物碱以及类固醇激素。还可以使用肽化合物。
适合的癌症化学治疗剂包括海兔毒素(dolastatin)以及其活性类似物和衍生物；和奥里斯他汀(auristatin)以及其活性类似物和衍生物。参看例如WO 96/33212、WO 96/14856，以及U.S.6,323,315。举例来说，海兔毒素10或奥里斯他汀PE可以包括于本公开的抗体-药物偶联物中。适合的癌症化学治疗剂还包括类美登素(maytansinoid)以及其活性类似物和衍生物(参看例如EP 1391213；以及Liu等(1996)Proc.Natl.Acad.Sci.USA 93:8618-8623)；和倍癌霉素(duocarmycin)以及其活性类似物和衍生物(例如，包括合成类似物KW-2189和CB 1-TM1)。
用以减少细胞增殖的药剂在本领域中是已知的并且被广泛使用。所述药剂包括烷化剂，诸如氮芥、亚硝基脲、乙烯亚胺衍生物、烷基磺酸盐以及三氮烯，包括(但不限于)二氯甲基二乙胺(mechlorethamin e)、环磷酰胺(CytoxanTM)、美法仑(melphalan)(L-沙可来新(L-sarcoly sin))、卡莫司汀(carmustine)(BCNU)、洛莫司汀(lomustine)(CCNU)、司莫司汀(semustine)(甲基-CCNU)、链脲菌素(streptozocin)、氯脲霉素(chlorozotocin)、尿嘧啶氮芥(uracil mustard)、双氯乙基甲胺(chlor methine)、异环磷酰胺(ifosfamide)、苯丁酸氮芥(chlorambucil)、哌泊溴烷(pipobroman)、三乙烯三聚氰胺(triethylenemelamine)、三乙烯硫代磷酸胺(triethylenethiophosphoramine)、白消安(busulfan)、达卡巴嗪(dacarbazine)以及替莫唑胺(temozolomide)。
抗代谢物剂包括叶酸类似物、嘧啶类似物、嘌呤类似物以及腺苷脱氨酶抑制剂，包括(但不限于)阿糖胞苷(cytarabine)(CYTOSAR-U)、胞嘧啶阿拉伯糖苷(cytosinearabinoside)、氟尿嘧啶(5-FU)、氟尿苷(floxuridine)(FudR)、6-硫鸟嘌呤、6-巯基嘌呤(6-MP)、喷司他丁(pentostatin)、5-氟尿嘧啶(5-FU)、甲氨蝶呤(methotrexate)、10-炔丙基-5,8-二脱氮杂叶酸(PDDF，CB3717)、5,8-二脱氮杂四氢叶酸(DDATHF)、甲酰四氢叶酸(leucovorin)、磷酸氟达拉滨(fludarabine phosphate)、喷司他丁以及吉西他滨(gemcitabine)。
适合的天然产物和其衍生物(例如，长春花生物碱、抗肿瘤抗生素、酶、淋巴因子以及表鬼臼毒素(epipodophyllotoxin))包括(但不限于)Ara-C、紫杉醇(paclitaxel)多烯紫杉醇(docetaxel)脱氧助间型霉素(deoxycoformycin)、丝裂霉素C(mitomycin-C)、L-天冬酰胺酶、硫唑嘌呤(azathioprine)；布喹那(brequinar)；生物碱，例如长春新碱(vincristine)、长春碱(vinblastine)、长春瑞滨(vinorelbine)、长春地辛(vindesine)等；鬼臼毒素(podophyllotoxin)，例如依托泊苷(etoposide)、替尼泊苷(teniposide)等；抗生素，例如蒽环霉素(anthracycline)、盐酸柔红霉素(daunorubicinhydrochloride)(道诺霉素(daunomycin)、柔红霉素(rubidomycin)、司比定(cerubidine))、伊达比星(idarubicin)、阿霉素(doxorubicin)、表柔比星(epirubicin)以及吗啉代(morpholino)衍生物等；吩噁嗪酮双环肽(phenoxizone biscyclopeptide)，例如放线菌素D(dactinomycin)；碱性糖肽(basic glycopeptide)，例如博莱霉素(bleomycin)；蒽醌苷(anthraquinone glycoside)，例如普卡霉素(plicamycin)(光神霉素(mithramycin))；蒽二酮(anthracenedione)，例如米托蒽醌(mitoxantrone)；氮丙啶吡咯并吲哚二酮(azirinopyrrolo indoledione)，例如丝裂霉素(mitomycin)；大环免疫抑制剂，例如环孢菌素(cyclosporine)、FK-506(他克莫司(tacrolimus)，普乐可复(prograf))、雷帕霉素(rapamycin)等；等等。
其它抗增殖细胞毒性剂为诺维本(navelbene)、CPT-11、阿那曲唑(anastrazole)、来曲唑(letrazole)、卡培他滨(capecitabine)、雷洛昔芬(reloxafine)、环磷酰胺、异环磷酰胺以及屈洛昔芬(droloxafine)。
具有抗增殖活性的微管影响剂也适合使用并且包括(但不限于)别秋水仙碱(allocolchicine)(NSC 406042)、软海绵素B(Halichondrin B)(NSC 609395)、秋水仙碱(colchicine)(NSC 757)、秋水仙碱衍生物(例如，NSC 33410)、海兔毒素10(NSC 376128)、美登素(NSC 153858)、根霉菌素(rhizoxin)(NSC 332598)、紫杉醇 衍生物、多烯紫杉醇硫代秋水仙碱(thiocolchicine)(NSC 361792)、三苯甲基半胱氨酸(trityl cysterin)、硫酸长春碱(vinblastine sulfate)、硫酸长春新碱(vincristine sulfate)、天然和合成埃博霉素(epothilone)(包括(但不限于)埃博霉素A、埃博霉素B)、圆皮海绵内酯(discodermolide)；雌莫司汀(estramustine)、诺考达唑(nocodazole)，等等。
适合使用的激素调节剂和类固醇(包括合成类似物)包括(但不限于)肾上腺皮质类固醇(adrenocorticosteroid)，例如强的松(prednisone)、地塞米松(dexamethasone)等；雌激素和孕酮，例如己酸羟孕酮(hydroxyprogesterone caproate)、醋酸甲羟孕酮(medroxyprogesterone acetate)、醋酸甲地孕酮(megestrol acetate)、雌二醇(estradiol)、克罗米芬(clomiphene)、他莫昔芬(tamoxifen)等；以及肾上腺皮质抑制剂，例如氨鲁米特(aminoglutethimide)；17α-乙炔基雌二醇(17α-ethinylestradiol)；己烯雌酚(diethylstilbestrol)、睾酮(testosterone)、氟甲睾酮(fluoxymesterone)、丙酸屈他雄酮(dromostanolone propionate)、睾内酯(testolactone)、甲泼尼龙(methylprednisolone)、甲基睾酮(methyl-testosterone)、泼尼龙(prednisolone)、曲安西龙(triamcinolone)、氯烯雌醚(chlorotrianisene)、羟孕酮(hydroxyprogesterone)、氨鲁米特、雌莫司汀、醋酸甲羟孕酮、亮丙瑞林(leuprolide)、氟他胺(Flutamide)(佐吉能(Drogenil))、托瑞米芬(Toremifene)(法乐通(Fareston))以及雌激素刺激增殖和分化；因此，结合至雌激素受体的化合物用于阻断这种活性。皮质类固醇可以抑制T细胞增殖。
其它适合的化学治疗剂包括金属络合物，例如顺铂(cisplatin)(顺-DDP)、卡铂(carboplatin)等；脲，例如羟基脲；以及肼，例如N-甲基肼；表鬼臼毒素；拓扑异构酶抑制剂；丙卡巴肼(procarbazine)；米托蒽醌；甲酰四氢叶酸；替加氟(tegafur)；等等。所关注的其它抗增殖剂包括免疫抑制剂，例如霉酚酸(mycophenolic acid)、沙利度胺(thalidomide)、脱氧精胍菌素(desoxyspergualin)、氮杂孢菌素(azasporine)、来氟米特(leflunomide)、咪唑立宾(mizoribine)、氮杂螺烷(azaspirane)(SKF 105685)；(ZD 1839，4-(3-氯-4-氟苯基氨基)-7-甲氧基-6-(3-(4-吗啉基)丙氧基)喹唑啉)；等等。
紫杉烷(taxane)适合使用。“紫杉烷”包括紫杉醇，以及任何活性紫杉烷衍生物或前药。“紫杉醇”(其在本文中应被理解为包括类似物、配制品以及衍生物，诸如多烯紫杉醇、TAXOLTM、TAXOTERETM(多烯紫杉醇的配制品)、紫杉醇的10-脱乙酰基类似物以及紫杉醇的3'N-脱苄酰基-3'N-叔丁氧基羰基类似物)可以容易地利用本领域的技术人员所知的技术来制备(还参看WO 94/07882、WO 94/07881、WO 94/07880、WO 94/07876、WO 93/23555、WO 93/10076；美国专利号5,294,637、5,283,253、5,279,949、5,274,137、5,202,448、5,200,534、5,229,529；以及EP 590,267)，或获自多种商业来源，包括例如Sigma Chemical Co.、St.Louis,Mo.(T7402来自短叶红豆杉(Taxus brevifolia)；或T-1912来自云南红豆杉(Taxus yannanensis))。
紫杉醇应被理解为不仅指代紫杉醇的常见的化学上可用的形式，而且指代类似物和衍生物(例如，如上文所提到的TaxotereTM多烯紫杉醇)以及紫杉醇偶联物(例如，紫杉醇-PEG、紫杉醇-葡聚糖或紫杉醇-木糖)。
术语“紫杉烷”还包括多种已知的衍生物，包括亲水衍生物与疏水衍生物。紫杉烷衍生物包括(但不限于)国际专利申请号WO 99/18113中所描述的半乳糖和甘露糖衍生物；WO 99/14209中所描述的哌嗪代(piperazino)和其它衍生物；WO 99/09021、WO 98/22451以及美国专利号5,869,680中所描述的紫杉烷衍生物；WO 98/28288中所描述的6-硫代衍生物；美国专利号5,821,263中所描述的次磺酰胺(sulfenamide)衍生物；以及美国专利号5,415,869中所描述的泰素(taxol)衍生物。其进一步包括紫杉醇的前药，包括(但不限于)WO98/58927、WO 98/13059以及美国专利号5,824,701中所描述的那些。
适合使用的生物反应调节剂包括(但不限于)(1)酪氨酸激酶(RTK)活性的抑制剂；(2)丝氨酸/苏氨酸激酶活性的抑制剂；(3)肿瘤相关抗原拮抗剂，诸如特异性地结合至肿瘤抗原的抗体；(4)细胞凋亡受体激动剂；(5)白介素-2；(6)IFN-α；(7)IFN-γ；(8)集落刺激因子；以及(9)血管生成的抑制剂。
对药物进行修饰以含有反应伴侣的方法
可以对将要偶联至多肽的药物进行修饰以并入用于与多肽反应的反应伴侣。在药物为肽药物的情况下，反应部分(例如，氨氧基或酰肼)可以位于N端区、N端、C端区、C端、或肽内部的位置处。举例来说，方法的一个实例涉及合成具有氨氧基的肽药物。在这个实例中，从Boc保护的前体合成肽。肽的氨基可以与包含羧酸基和氧基-N-Boc基团的化合物反应。作为一个实例，肽的氨基与3-(2,5-二氧代吡咯烷-1-基氧基)丙酸反应。包含羧酸基和氧基-N-保护基的化合物上的其它变化可以包括亚烷基连接子中的不同数目的碳和亚烷基连接子上的取代基。肽的氨基与包含羧酸基和氧基-N-保护基的化合物之间的反应经由标准肽偶合化学而发生。可以使用的肽偶合试剂的实例包括(但不限于)DCC(二环己基碳化二亚胺)、DIC(二异丙基碳化二亚胺)、二对甲苯甲酰基碳化二亚胺、BDP(1-苯并三唑二乙基磷酸-1-环己基-3-(2-吗啉基乙基)碳化二亚胺)、EDC(1-(3-二甲氨基丙基-3-乙基-碳化二亚胺盐酸盐)、三聚氟氰(cyanuric fluoride)、三聚氯氰(cyanuric chloride)、TFFH(六氟磷酸四甲基氟甲酰胺)、DPPA(二苯基磷酰叠氮化物)、BOP(六氟磷酸苯并三唑-1-基氧基三(二甲氨基)膦)、HBTU(六氟磷酸O-苯并三唑-1-基-N,N,N',N'-四甲基脲)、TBTU(四氟硼酸O-苯并三唑-1-基-N,N,N',N'-四甲基脲)、TSTU(四氟硼酸O-(N-琥珀酰亚胺基)-N,N,N',N'-四甲基脲)、HATU(六氟磷酸N-[(二甲氨基)-1-H-1,2,3-三唑并[4,5,6]-吡啶-1-基亚甲基]--N-甲基甲胺N-氧化物)、BOP-Cl(双(2-氧代-3-噁唑烷基)次磷酰氯)、PyBOP(四氟磷酸(1-H-1,2,3-苯并三唑-1-基氧基)-三(吡咯烷基)膦)、BrOP(六氟磷酸溴代三(二甲氨基)膦)、DEPBT(3-(二乙氧基磷酰氧基)-1,2,3-苯并三嗪-4(3H)-酮)、PyBrOP(六氟磷酸溴代三(吡咯烷基)膦)。作为一个非限制性实例，HOBt和DIC可以用作肽偶合试剂。
对包含N-保护基的肽进行脱保护以暴露氨氧基官能团。举例来说，N-氧基琥珀酰亚胺基的脱保护根据环酰胺基的标准脱保护条件而发生。脱保护条件可以见于Greene和Wuts,Protective Groups in Organic Chemistry,第3版,1999,John Wiley&Sons NY和Harrison等中。某些脱保护条件包括肼试剂、氨基试剂或硼氢化钠。Boc保护基的脱保护可以用TFA进行。用于脱保护的其它试剂包括(但不限于)肼、甲基肼、苯基肼、硼氢化钠以及甲胺。产物和中间物可以通过常规手段来纯化，诸如HPLC纯化。
一般技术人员应了解，诸如pH和位阻(即，氨基酸残基与所关注的反应伴侣反应的可及性)的因素是重要的。修改反应条件以提供最佳偶联条件充分处于一般技术者的技能范围内，并且在本领域中是常规的。在用存在于活细胞中或活细胞上的多肽进行偶联的情况下，选择条件以使其生理上相容。举例来说，pH可以暂时地下降持续一段足以允许反应发生的时间，但在细胞耐受的时段内(例如，约30分钟至1小时)。用于在细胞表面上进行多肽修饰的生理条件可以类似于在带有细胞表面叠氮化物的细胞修饰中的酮-叠氮化物反应中所用的那些(参看例如U.S.6,570,040)。
含有或经过修饰以含有充当本文所公开的化合物或偶联物的反应伴侣的α-亲核基团的小分子复合物也预期用作本公开的多肽-药物偶联物中的药物。一般方法在本领域中已知用于适用于合成所关注的化合物的化学合成流程和条件(参看例如Smith和March,March's Advanced Organic Chemistry:Reactions,Mechanisms,and Structure,第五版,Wiley-Interscience,2001；或Vogel,A Textbook of Practical Organic Chemistry,Including Qualitative Organic Analysis,第四版,New York:Longman,1978)。
肽药物
在一些情况下，偶联物包含共价连接的肽。适合的肽包括(但不限于)细胞毒性肽；血管生成肽；抗血管生成肽；活化B细胞的肽；活化T细胞的肽；抗病毒肽；抑制病毒融合的肽；增加一个或多个淋巴细胞群体的产生的肽；抗微生物肽；生长因子；生长激素释放因子；血管活性肽；消炎肽；调控葡萄糖代谢的肽；抗血栓肽；抗伤害感受肽；舒血管肽；血小板聚集抑制剂；止痛剂；等等。
在一些实施方案中，肽可以经过化学合成以包括与多肽的氨基酸残基或修饰的氨基酸残基反应的基团。适合的合成肽的长度为5个氨基酸至100个氨基酸，或长于100个氨基酸；例如，适合的肽的长度为5个氨基酸(aa)至10aa、10aa至15aa、15aa至20aa、20aa至25aa、25aa至30aa、30aa至40aa、40aa至50aa、50aa至60aa、60aa至70aa、70aa至80aa、80aa至90aa、或90aa至100aa。
在某些实施方案中，可以对肽进行修饰以含有含α-亲核试剂的部分(例如，氨氧基或酰肼部分)，例如，可以与含fGly的多肽反应以得到多肽和肽分别由腙或肟键连接的偶联物。上文描述了合成肽的方法的实例，以使得合成的肽包含与多肽的氨基酸残基或修饰的氨基酸残基反应的反应基团。
适合的肽包括(但不限于)hLF-11(乳铁蛋白(lactoferrin)的11-氨基酸N端片段)，抗微生物肽；颗粒溶素(granulysin)，抗微生物肽；菌丝霉素(Plectasin)(NZ2114；SAR215500)，抗微生物肽；病毒融合抑制剂，诸如福泽昂(Fuzeon)(恩夫韦地(enfuvirtide))、TRI-1249(T-1249；参看例如Matos等(2010)PLoS One 5:e9830)、TRI-2635(T-2635；参看例如Eggink等(2009)J.Biol.Chem.284:26941)、T651以及TRI-1144；C5a受体抑制剂，诸如PMX-53、JPE-1375以及JSM-7717；POT-4，人补体因子C3抑制剂；胰腺蛋白(Pancreate)(INGAP衍生物序列，HIP-人前胰蛋白)；生长抑素；生长抑素类似物，诸如DEBIO 8609(Sanvar)、奥曲肽(octreotide)、奥曲肽(C2L)、奥曲肽QLT、奥曲肽LAR、善得定(Sandostatin)LAR、SomaLAR、索马杜林(Somatuline)(兰瑞肽(lanreotide))，参看例如Deghenghi等(2001)Endocrine 14:29；TH9507(替莫瑞林(Tesamorelin)，生长激素释放因子)；POL7080(猪源抗菌肽(protegrin)类似物，抗微生物肽)；松弛素；促皮质素释放因子激动剂，诸如尾加压素(urotensin)、蛙皮降压肽(sauvagine)，等等；热休克蛋白衍生物，诸如DiaPep277；人免疫缺陷病毒进入抑制剂；热休克蛋白-20模拟物，诸如AZX100；凝血酶受体活化肽，诸如TP508(Chrysalin)；尿皮素2(urocortin 2)模拟物(例如，CRF2激动剂)，诸如尿皮素-2；免疫活化剂，诸如日达仙(Zadaxin)(胸腺法新(thymalfasin)；胸腺素α1(thymosin-α1))，参看例如Sjogren(2004)J.Gastroenterol.Hepatol.19:S69；丙型肝炎病毒(HCV)进入抑制剂E2肽，诸如HCV3；心房钠尿肽，诸如HANP(Sun 4936；卡培立肽(carperitide))；膜联蛋白肽(annexin peptide)；防御素(defensin)(抗微生物肽)，诸如hBD2-4；防御素(抗微生物肽)，诸如hBD-3；防御素(抗微生物肽)，诸如PMX-30063；组胺素(histatin)(抗微生物肽)，诸如组胺素3、组胺素5、组胺素-6以及组胺素9；组胺素(抗微生物肽)，诸如PAC-113；吲哚力西丁(indolicidin)(抗微生物肽)，诸如MX-594AN(奥米加宁(Omniganin)；CLS001)；吲哚力西丁(抗微生物肽)，诸如奥米加德(Omnigard)(MBI-226；CPI-226)；抗微生物肽，诸如昆虫天蚕抗菌肽(insect cecropin)；抗微生物肽，诸如乳铁蛋白(塔乳铁蛋白(talactoferrin))；LL-37/金环蛇抗菌肽(cathelicidin)衍生物(抗微生物肽)，诸如P60.4(OP-145)；爪蟾抗菌肽(magainin)(抗微生物肽)，诸如培西加南(Pexiganan)(MSI-78；苏泊奈(Suponex))；猪源抗菌肽(抗微生物肽)，诸如IB-367(依色加南(Iseganan))；阿甘肽(agan peptide)；β-钠尿肽，诸如内西利他(Natrecor)，或诺拉塔(Noratak)(奈西立肽(Nesiritide))，或乌拉立肽(ularitide)；比伐卢定(bivalarudin)(安吉马(Angiomax))，凝血酶抑制剂；C肽衍生物；降钙素，诸如米卡星(Miacalcin)(复能素(Fortical))；脑啡肽衍生物；红细胞生成刺激肽，诸如培尼沙肽(Hematide)；间隙连接调节剂，诸如达奈加肽(Danegaptide)(ZP1609)；胃泌素释放肽(gastrin-releasing peptide)；饥饿素(ghrelin)；胰高血糖素样肽；胰高血糖素样肽2类似物，诸如ZP1846或ZP1848；葡萄糖胺基胞壁酰二肽，诸如GMDP；糖肽抗生素，诸如奥利万星(Oritavancin)；替考拉宁(teicoplanin)衍生物，诸如达巴万星(Dalbavancin)；促性腺激素释放激素(GnRH)，诸如诺雷德(Zoladex)(鲁泊(Lupon))或曲普瑞林(Triptorelin)；组蛋白脱乙酰酶(HDAC)抑制剂缩酚肽，诸如PM02734(依伐雷克(Irvalec))；整合素(integrin)，诸如埃替非巴肽(eptifibatide)；胰岛素类似物，诸如优泌乐(Humulog)；卡哈拉得(kahalalide)缩酚肽，诸如PM02734；血管舒缓素(kallikrein)抑制剂，诸如卡比托(Kalbitor)(艾卡拉肽(ecallantide))；抗生素，诸如特拉万星(Telavancin)；脂肽，诸如库比星(Cubicin)或MX-2401；促黄体激素释放激素(LHRH)，诸如戈舍瑞林(goserelin)；LHRH合成十肽激动剂类似物，诸如特斯塔(Treistar)(双羟萘酸曲普瑞林(triptorelin pamoate))；LHRH，诸如艾里咖(Eligard)；M2蛋白质通道肽抑制剂；美曲普汀(metreleptin)；黑皮质素(melanocortin)受体激动剂肽，诸如布雷默浪丹(bremalanotide)/PT-141；黑皮质素；胞壁酰三肽，诸如美帕特(Mepact)(米伐木肽(mifamurtide))；髓鞘碱性蛋白肽，诸如MBP 8298(地瑞考肽(dirucotide))；N型电压门控钙通道阻断剂，诸如齐考诺肽(Ziconotide)(派瑞特(Prialt))；甲状旁腺激素肽；甲状旁腺类似物，诸如768974；肽激素类似物，诸如UGP281；前列腺素F2-α受体抑制剂，诸如PDC31；蛋白酶抑制剂，诸如PPL-100；舒法新(surfaxin)；血小板反应蛋白1(thromobspondin-1)(TSP-1)模拟物，诸如CVX-045或ABT 510；血管活性肠肽；血管加压素；Y2R激动剂肽，诸如RG7089；奥滨肽(obinepeptide)；以及TM30339。
可检测标记
本公开的偶联物、化合物以及方法可以用于将可检测标记偶联至多肽。可检测标记的实例包括(但不限于)荧光分子(例如，自体荧光分子、与试剂接触后发荧光的分子，等等)、放射性标记(例如，111In、125I、131I、212B、90Y、186Rh，等等)、生物素(例如，以经由生物素与抗生物素蛋白的反应来检测)、荧光标签、成像试剂，等等。可检测标记还包括可以通过抗体结合来检测的肽或多肽，例如，通过结合以可检测方式标记的抗体或通过经由夹心型试验检测结合的抗体。可检测标记的其它实例包括(但不限于)染料标记(例如，发色团、荧光团，诸如(但不限于)Alexa荧光染料(例如，Alexa350、405、430、488、532、546、555、568、594、595、610、633、635、647、660、680、700、750、790，等等))、生物物理探针(自旋标记、核磁共振(NMR)探针)、福斯特共振能量转移(Resonance Energy Transfer，FRET)型标记(例如，FRET对的至少一个成员，包括荧光团/淬灭团对的至少一个成员)、生物发光共振能量转移(BRET)型标记(例如，BRET对的至少一个成员)、免疫可检测标签(例如，FLAG、His(6)，等等)、定位标签(例如，以在组织或分子细胞水平上鉴别加标签的多肽的缔合(例如，与组织类型或特定细胞膜的缔合))，等等。
连接用于递送至靶位点的部分
本公开的实施方案还包括一种多肽，其偶联至一个或多个部分，诸如(但不限于)药物(例如，小分子药物)、毒素、或用于递送至靶位点(例如，细胞)的其它分子，并且可以提供药理活性或可以充当用于递送其它分子的标靶。
还涵盖偶联物，其包括一对结合伴侣中的一者(例如，配体、受体的配体结合部分、配体的受体结合部分，等等)。举例来说，偶联物可以包括多肽，其充当病毒受体，并且在与病毒包膜蛋白或病毒衣壳蛋白结合后，有助于病毒连接至表达修饰的多肽的细胞表面。或者，偶联物可以包括抗原，其由抗体(例如，单克隆抗体)特异性地结合，以有助于检测和/或分离表达修饰的多肽的宿主细胞。
靶分子连接至支撑物
这些方法可以提供多肽偶联至有助于多肽连接至固体底物(例如，有助于试验)的部分，或偶联至有助于容易分离的部分(例如，由结合至磁性小珠的抗体识别的半抗原)。在一些实施方案中，这些方法用于提供蛋白质连接至呈规定取向的阵列(例如，芯片)。举例来说，可以产生在所选位点处(例如，在N端或N端附近)修饰的多肽，并且这些方法、偶联物以及化合物用于将部分递送至修饰的多肽。这个部分然后可以用作连接位点用于将多肽附着至支撑物(例如，固体或半固体支撑物，诸如适合用作高通量试验中的微芯片的支撑物)。
水溶性聚合物
在一些情况下，偶联物包括共价连接的水溶性聚合物。特别受关注的部分是水溶性聚合物。“水溶性聚合物”指的是可溶于水并且通常基本上是非免疫原性的，并且通常具有大于1,000道尔顿的原子分子量的聚合物。本文所描述的方法、偶联物以及化合物可以用于将一种或多种水溶性聚合物连接至多肽。水溶性聚合物(例如，PEG)与多肽，诸如药学活性(例如，治疗性)多肽的连接可能是需要的，这是因为所述修饰可以通过作为增加的蛋白水解稳定性和/或降低的肾清除率的结果增加血清半衰期来提高治疗指数。另外，一种或多种聚合物的连接(例如，聚乙二醇化)可以降低蛋白质医药品的免疫原性。
在一些实施方案中，水溶性聚合物的有效流体动力学分子量大于5,000Da、大于10,000Da、大于20,000至500,000Da、大于40,000Da至300,000Da、大于50,000Da至70,000Da，诸如大于60,000Da。在一些实施方案中，水溶性聚合物的有效流体动力学分子量为10kDa至20kDa、20kDa至25kDa、25kDa至30kDa、30kDa至50kDa、或50kDa至100kDa。“有效流体动力学分子量”意指如通过水基尺寸排阻色谱法(SEC)测定的聚合物链的有效水溶剂化尺寸。当水溶性聚合物含有具有聚氧化烯重复单元，诸如氧化乙烯重复单元的聚合物链时，每个链可以具有200Da至80,000Da或1,500Da至42,000Da，包括2,000至20,000Da的原子分子量。除非特别地提及，否则分子量意图指代原子分子量。可以使用线性、分支以及末端带电的水溶性聚合物(例如，PEG)。
适用作连接至多肽的部分的聚合物可以具有大范围的分子量，和聚合物亚单元。这些亚单元可以包括生物聚合物、合成聚合物或其组合。所述水溶性聚合物的实例包括：葡聚糖和葡聚糖衍生物，包括硫酸葡聚糖；P-氨基交联糊精和羧甲基糊精；纤维素和纤维素衍生物，包括甲基纤维素和羧甲基纤维素；淀粉和糊精、以及淀粉的衍生物和水解产物；聚烷二醇和其衍生物，包括聚乙二醇、甲氧基聚乙二醇、聚乙二醇均聚物、聚丙二醇均聚物、乙二醇与丙二醇的共聚物，其中所述均聚物和共聚物未经取代或在一端被烷基取代；肝素和肝素的片段、聚乙烯醇和聚乙烯基乙基醚、聚乙烯吡咯烷酮、天冬酰胺以及聚氧乙基化多元醇；连同葡聚糖和葡聚糖衍生物、糊精和糊精衍生物。应了解，还涵盖特别列举的水溶性聚合物的各种衍生物。
水溶性聚合物，诸如上文所描述的那些，包括基于聚氧化烯的聚合物，诸如聚乙二醇“PEG”(参看例如"Poly(ethylene glycol)Chemistry:Biotechnical and BiomedicalApplications",J.M.Harris编,Plenum Press,New York,N.Y.(1992)；和"Poly(ethyleneglycol)Chemistry and Biological Applications",J.M.Harris和S.Zalipsky编,ACS(1997)；以及国际专利申请：WO 90/13540、WO 92/00748、WO 92/16555、WO 94/04193、WO94/14758、WO 94/17039、WO 94/18247、WO 94/28937、WO 95/11924、WO 96/00080、WO 96/23794、WO 98/07713、WO 98/41562、WO 98/48837、WO 99/30727、WO 99/32134、WO 99/33483、WO 99/53951、WO 01/26692、WO 95/13312、WO 96/21469、WO 97/03106、WO 99/45964；以及美国专利号4,179,337、5,075,046、5,089,261、5,100,992、5,134,192、5,166,309、5,171,264、5,213,891、5,219,564、5,275,838、5,281,698、5,298,643、5,312,808、5,321,095、5,324,844、5,349,001、5,352,756、5,405,877、5,455,027、5,446,090、5,470,829、5,478,805、5,567,422、5,605,976、5,612,460、5,614,549、5,618,528、5,672,662、5,637,749、5,643,575、5,650,388、5,681,567、5,686,110、5,730,990、5,739,208、5,756,593、5,808,096、5,824,778、5,824,784、5,840,900、5,874,500、5,880,131、5,900,461、5,902,588、5,919,442、5,919,455、5,932,462、5,965,119、5,965,566、5,985,263、5,990,237、6,011,042、6,013,283、6,077,939、6,113,906、6,127,355、6,177,087、6,180,095、6,194,580、6,214,966)。
所关注的聚合物的实例包括含有聚氧化烯、聚酰胺氧化烯或其衍生物的那些，包括包含式-(CH2-CH2-O)-的氧化乙烯重复单元的聚氧化烯和聚酰胺氧化烯。所关注的聚合物的其它实例包括式-[C(O)-X-C(O)-NH-Y-NH]n-或-[NH-Y-NH-C(O)-X-C(O)]n-的具有1,000道尔顿的分子量的聚酰胺，其中X和Y为二价基团，其可以是相同的或不同的并且可以是分支或线性的，并且n为2至100，诸如2至50的离散整数，并且其中X和Y中的任一者或两者包含可以是线性或分支的生物相容的、基本上非抗原性的水溶性重复单元。水溶性重复单元的其它实例包括式-(CH2-CH2-O)-或-(CH2-CH2-O)-的氧化乙烯。所述水溶性重复单元的数目可以显著变化，其中所述单元的数目为2至500、2至400、2至300、2至200、2至100，例如2至50。实施方案的一个实例为其中X和Y中的一者或两者选自：-((CH2)n1-(CH2-CH2-O)n2-(CH2)-或-((CH2)n1-(O-CH2-CH2)n2-(CH2)n-1-)，其中n1为1至6、1至5、1至4、或1至3，并且其中n2为2至50、2至25、2至15、2至10、2至8、或2至5。实施方案的另一个实例为其中X为-(CH2-CH2)-，并且其中Y为-(CH2-(CH2-CH2-O)3-CH2-CH2-CH2)-或-(CH2-CH2-CH2-(O-CH2-CH2)3-CH2)-。
聚合物可以包括一个或多个间隔子或连接子。间隔子或连接子的实例包括包含在水溶性聚合物中采用的一个或多个重复单元的线性或分支部分、二氨基和/或二酸单元、天然或非天然氨基酸或其衍生物，以及脂肪族部分，包括烷基、芳基、杂烷基、杂芳基、烷氧基，等等，这些部分可以含有例如至多18个碳原子或甚至额外的聚合物链。
聚合物部分，或聚合物部分的间隔子或连接子中的一者或两者(当存在时)，可以包括生物稳定或生物可降解的聚合物链或单元。举例来说，具有重复键联的聚合物在生理条件下具有不同程度的稳定性，这取决于键的不稳定性。具有所述键的聚合物可以基于低分子量类似物的已知水解速率按其在生理条件下的相对水解速率加以分类，例如，从较不稳定至较稳定，例如聚氨酯(-NH-C(O)-O-)>聚原酸酯(-O-C((OR)(R'))-O-)>聚酰胺(-C(O)-NH-)。类似地，将水溶性聚合物连接至靶分子的键联系统可以是生物稳定或生物可降解的，例如，从从较不稳定至较稳定：碳酸酯(-O-C(O)-O-)>酯(-C(O)-O-)>氨基甲酸酯(-NH-C(O)-O-)>原酸酯(-O-C((OR)(R'))-O-)>酰胺(-C(O)-NH-)。一般来说，可能需要避免使用硫酸化多糖，这取决于硫酸酯基的不稳定性。另外，使用聚碳酸酯和聚酯可能不太理想。这些键作为实例而提供，并且不意图限制适用于本文所公开的修饰的加醛标签的多肽中的水溶性聚合物的聚合物链或键联系统中可采用的键的类型。
配制品
本公开的偶联物(包括抗体偶联物)可以按多种不同的方式来配制。一般来说，在偶联物为多肽-药物偶联物的情况下，以与偶联至多肽的药物、将要治疗的病状以及将要使用的施用途径相容的方式来配制偶联物。
偶联物(例如，多肽-药物偶联物)可以按任何适合的形式提供，例如呈药学上可接受的盐形式，并且可以配制成用于任何适合的施用途径，例如经口、局部或肠道外施用。在偶联物作为液体可注射剂提供的情况下(诸如在将其静脉内施用或直接施用至组织中的那些实施方案中)，偶联物可以作为即用剂型，或作为由药学上可接受的载剂和赋形剂组成的可复水的储存稳定的粉末或液体而提供。
配制偶联物的方法可以从本领域中可用的那些方法加以修改。举例来说，偶联物可以在包含治疗有效量的偶联物和药学上可接受的载剂(例如，盐水)的药物组合物中提供。药物组合物可以任选地包括其它添加剂(例如，缓冲剂、稳定剂、防腐剂，等等)。在一些实施方案中，配制品适合施用于哺乳动物，诸如适合施用于人类的那些。
治疗方法
本公开的多肽-药物偶联物应用于治疗通过施用亲本药物(即，在偶联至多肽之前的药物)可得到治疗的受试者的病状或疾病。“治疗”意味着至少改善与困扰宿主的病状相关的症状，其中改善在宽泛的意义上使用以指代至少降低与所治疗的病状相关的参数(例如，症状)的量级。这样的话，治疗还包括病理性病状或至少与其相关的症状完全受抑制(例如防止发生)，或停止(例如终止)的情况，以使得宿主不再罹患病状，或至少表征这种病状的症状。因此，治疗包括：(i)预防，即，降低临床症状发展的风险，包括使得临床症状不发展，例如，防止疾病进展至有害的状态；(ii)抑制，即，阻遏临床症状发展或进一步发展，例如，减轻或完全抑制活动性疾病；和/或(iii)缓解，即，引起临床症状消退。
在癌症的情形中，术语“治疗”包括以下任一者或全部：减少实体肿瘤生长，抑制癌细胞复制，降低总体肿瘤负荷，以及改善一种或多种与癌症相关的症状。
有待治疗的受试者可以为需要疗法的受试者，其中有待治疗的宿主为使用亲本药物可得到治疗的宿主。因此，多种受试者可以使用本文所公开的多肽-药物偶联物得到治疗。一般来说，所述受试者为“哺乳动物”，其中人类是受关注的。其它受试者可以包括家养宠物(例如，狗和猫)、家畜(例如，母牛、猪、山羊、马，等等)、啮齿动物(例如，小鼠、天竺鼠以及大鼠，例如，在疾病的动物模型中)，以及非人类灵长类动物(例如，黑猩猩和猴)。
所施用的多肽-药物偶联物的量可以初始地基于剂量的指导和/或亲本药物的给药方案来确定。一般来说，多肽-药物偶联物可以提供结合的药物的靶向递送和/或提高的血清半衰期，由此提供给药方案中降低的剂量或减少的施用中的至少一者。因此，多肽-药物偶联物相对于在本公开的多肽-药物偶联物中偶联之前的亲本药物可以提供给药方案中降低的剂量和/或减少的施用。
此外，如上文所提到，因为多肽-药物偶联物可以提供受控化学计量的药物递送，所以多肽-药物偶联物的剂量可以基于以每个多肽-药物偶联物为基础所提供的药物分子的数目来计算。
在一些实施方案中，施用多次剂量的多肽-药物偶联物。多肽-药物偶联物的施用频率可以取决于多种因素中的任一者而变化，例如，症状的严重程度、受试者的状况，等等。举例来说，在一些实施方案中，多肽-药物偶联物按每月一次、每月两次、每月三次、每隔一周(qow)、每周一次(qw)、每周两次(biw)、每周三次(tiw)、每周四次、每周五次、每周六次、每隔一天(qod)、每天(qd)、每天两次(qid)、或每天三次(tid)施用。
治疗癌症的方法
本公开提供了将癌症化学治疗剂递送至患有癌症的个体的方法。这些方法适用于治疗多种癌症，包括癌瘤、肉瘤、白血病以及淋巴瘤。
可以使用主题方法治疗的癌瘤包括(但不限于)食道癌、肝细胞癌、基底细胞癌(一种皮肤癌形式)、鳞状细胞癌(各种组织)、膀胱癌(包括移行细胞癌(膀胱的恶性肿瘤))、支气管癌、结肠癌、结直肠癌、胃癌、肺癌(包括肺的小细胞癌和非小细胞癌)、肾上腺皮质癌、甲状腺癌、胰腺癌、乳癌、卵巢癌、前列腺癌、腺癌、汗腺癌、皮脂腺癌、乳头状癌、乳头状腺癌、囊腺癌、髓样癌、肾细胞癌、导管原位癌或胆管癌、绒毛膜癌、精原细胞瘤、胚胎癌、威尔姆氏瘤(Wilm's tumor)、子宫颈癌、子宫癌、睾丸癌、成骨性癌、上皮癌以及鼻咽癌，等等。
可以使用主题方法治疗的肉瘤包括(但不限于)纤维肉瘤、粘液肉瘤、脂肪肉瘤、软骨肉瘤、脊索瘤、成骨性肉瘤、骨肉瘤、血管肉瘤、内皮肉瘤、淋巴管肉瘤、淋巴管内皮肉瘤、滑膜瘤、间皮瘤、尤文氏肉瘤(Ewing's sarcoma)、平滑肌肉瘤、横纹肌肉瘤以及其它软组织肉瘤。
可以使用主题方法治疗的其它实体肿瘤包括(但不限于)神经胶质瘤、星形细胞瘤、成神经管细胞瘤、颅咽管瘤、室管膜瘤、松果体瘤、成血管细胞瘤、听神经瘤、少突神经胶质瘤、脑膜瘤、黑素瘤、成神经细胞瘤以及成视网膜细胞瘤。
可以使用主题方法治疗的白血病包括(但不限于)：a)慢性骨髓增生综合症(多能造血干细胞的肿瘤性病症)；b)急性骨髓性白血病(多能造血干细胞或限制谱系潜能的造血细胞的肿瘤性转化)；c)慢性淋巴细胞性白血病(CLL；免疫学上不成熟并且功能上不胜任的小淋巴细胞的克隆性增殖)，包括B细胞CLL、T细胞CLL、前淋巴细胞性白血病以及毛细胞白血病；以及d)急性成淋巴细胞性白血病(特征为成淋巴细胞的积聚)。可以使用主题方法治疗的淋巴瘤包括(但不限于)B细胞淋巴瘤(例如，伯基特氏淋巴瘤(Burkitt's lymphoma))；霍奇金氏淋巴瘤(Hodgkin's lymphoma)；非霍奇金氏B细胞淋巴瘤(non-Hodgkin's B celllymphoma)；等等。
实施例
提出以下实施例以向本领域的一般技术人员提供如何制造和使用本发明的全面公开和描述，并且不意图限制本发明者视为其发明的范围，也不意图代表下面的实验是所进行的全部或唯一的实验。已经努力确保关于所用数字(例如，量、温度，等等)的准确性，但一些实验误差和偏差应被考虑在内。除非另有指示，否则份数是重量份，分子量是重量平均分子量，温度是摄氏度，并且压力是大气压或接近大气压。可以使用标准缩写，例如，bp，碱基对；kb，千碱基；pl，皮升；s或sec，秒；min，分钟；h或hr，小时；aa，氨基酸；kb，千碱基；bp，碱基对；nt，核苷酸；i.m.，肌肉内；i.p.，腹膜内；s.c.，皮下；等等。
一般合成程序
提供适用于合成所公开的化合物的通常已知的化学合成流程和条件的许多一般参考文献是可用的(参看例如Smith和March,March's Advanced Organic Chemistry:Reactions,Mechanisms,and Structure,第五版,Wiley-Interscience,2001；或Vogel,ATextbook of Practical Organic Chemistry,Including Qualitative OrganicAnalysis,第四版,New York:Longman,1978)。
如本文所描述的化合物可以通过本领域中已知的任何纯化方案来纯化，包括色谱法，诸如HPLC、制备型薄层色谱法、快速柱色谱法以及离子交换色谱法。可以使用任何适合的固定相，包括正相和反相以及离子树脂。在某些实施方案中，所公开的化合物是经由硅胶和/或氧化铝色谱法来纯化。参看例如Introduction to Modern Liquid Chromatography,第2版,L.R.Snyder和J.J.Kirkland编,John Wiley and Sons,1979；以及Thin LayerChromatography,E.Stahl编,Springer-Verlag,New York,1969。
在制备主题化合物的任何过程中，可能必需和/或需要保护任何相关分子上的敏感或反应基团。这可以借助于如标准著作中所描述的常规保护基来实现，诸如J.F.W.McOmie,"Protective Groups in Organic Chemistry",Plenum Press,London andNew York 1973；T.W.Greene和P.G.M.Wuts,"Protective Groups in OrganicSynthesis",第三版,Wiley,New York 1999；"The Peptides"；第3卷(编者：E.Gross和J.Meienhofer),Academic Press,London and New York 1981；"Methoden derorganischen Chemie",Houben-Weyl,第4版,第15/l卷,Georg Thieme Verlag,Stuttgart1974；H.-D.Jakubke和H.Jescheit,"Aminosauren,Peptide,Proteine",Verlag Chemie,Weinheim,Deerfield Beach,and Basel 1982；和/或Jochen Lehmann,"Chemie derKohlenhydrate:Monosaccharide and Derivate",Georg Thieme Verlag,Stuttgart1974。保护基可以在适宜的后续阶段中使用从本领域中已知的方法来去除。
主题化合物可以经由多种不同的合成途径，使用可商购的起始物质和/或通过常规合成方法制备的起始物质来合成。可以用于合成本文所公开的化合物的合成途径的多种实例描述于下面的流程中。
合成HIPS-AF594
肼基-吲哚可检测标记偶联物(HIPS-AF594)如下面的流程1中图解来合成：
流程1
化合物20(1,2-二甲基肼甲酸2-(三甲基硅烷基)乙酯)从化合物10如下合成。向对称二甲基肼二盐酸盐(7.5mmol)于15mL MeCN中的剧烈搅拌的悬浮液中添加三乙胺(18.8mmol)。过滤所得白色悬浮液并且冷却至0℃。在搅拌同时，经10分钟逐滴添加含N-[2-(三甲基硅烷基)乙氧基羰氧基]琥珀酰亚胺(3.7mmol)的2mL MeCN。在搅拌下经16小时使反应物升温至室温。在真空中浓缩粗反应物，然后分配于100mL EtOAc与30mL水之间。用3×30mL盐水洗涤有机相，经MgSO4干燥，过滤并且在真空中浓缩，得到64％产率的产物。产物不需要进一步纯化。1H NMR(400MHz,CDCl3)δ4.5(bs,1H),4.20(dd,J＝8.8,8.4Hz,2H),3.03(s,3H),2.57(s,3H),1.02(dd,J＝8.8,8.4Hz,2H),0.04(s,9H)。
化合物40(2-((1-(3-甲氧基-3-氧代丙基)-1H-吲哚-2-基)甲基)-1,2-二甲基肼甲酸2-(三甲基硅烷基)乙酯)从化合物20和化合物30如下合成。向烘干的4mL小瓶中馈入含化合物30(3-(2-甲酰基-1H-吲哚-1-基)丙酸甲酯；0.0606mmol)、化合物20(1,2-二甲基肼甲酸2-(三甲基硅烷基)乙酯；0.0828mmol)、乙酸(0.0727mmol)的150μL无水甲醇。添加含氰基硼氢化钠(0.0727mmol)的100μL无水甲醇并且搅拌16小时。通过制备型TLC(500μm厚度，硅胶)使用15％EtOAc:己烷的流动相来纯化粗反应混合物，得到45％产率的产物。1H NMR(400MHz,CDCl3)δ7.57(d,J＝7.6Hz,1H),7.35(d,J＝8.4Hz,1H),7.22(ddd,J＝8.0,7.2,1.2Hz,1H),7.10(ddd,J＝8.0,7.2,1.2Hz,1H),6.40(s,1H),4.65(bs,2H),4.26-4.11(m,4H),3.70(s,3H),2.90(m,5H),2.66(s,3H),0.99(t,J＝8.4,2H),0.05(s,9H)。
化合物50(3-(2-((1,2-二甲基-2-((2-(三甲基硅烷基)乙氧基)羰基)肼基)甲基)-1H-吲哚-1-基)丙酸；也被称作Teoc-HIPS-OH)从化合物40如下合成。向4mL小瓶中馈入化合物40(2-((1-(3-甲氧基-3-氧代丙基)-1H-吲哚-2-基)甲基)-1,2-二甲基肼甲酸2-(三甲基硅烷基)乙酯；0.027mmol)、氢氧化锂(0.054mmol)以及250μL甲醇，并且搅拌24小时。在真空中浓缩溶液，然后在1％AcOH:EtOAc中进行色谱分析，得到89％产率的所需产物。1HNMR(400MHz,CDCl3)δ7.57(d,J＝7.6Hz,1H),7.38(d,J＝8.0Hz,1H),7.24(ddd,J＝8.0,7.6,0.8Hz,1H),7.12(ddd,J＝7.6,7.6,0.8Hz,1H),6.40(s,1H),4.63(bs,2H),4.20(t,J＝8.4,2H),4.13(s,2H),3.11-2.97(m,5H),2.58(s,3H),2.66(s,3H),0.99(t,J＝8.4,2H),0.05(s,9H)。LRMS(ESI)C20H31N3O4Si[M+H]+的计算值：406.22；实测值：405.9。
化合物70(Teoc-HIPS-AF594)从化合物50(Teoc-HIPS-OH)和化合物60(AF594)如下合成。向化合物60(AF594；0.00124mmol)、化合物50(Teoc-HIPS-OH；0.0059mmol)、三乙胺(0.0059mmol)于200μL1:1DCM:DMF中的溶液中添加HATU(六氟磷酸(二甲氨基)-N,N-二甲基(3H-[1,2,3]三唑并[4,5-b]吡啶-3-基氧基)甲亚铵；0.0031)。搅拌反应物4小时。通过快速色谱法(C18)使用0-33％MeCN:水的梯度来纯化粗反应混合物。LRMS(ESI)C61H77N7O12S2Si[M+H]+的计算值：1192.49；实测值：1194.1。
化合物80(HIPS-AF594)从化合物70(Teoc-HIPS-AF594)如下合成。向化合物70(Teoc-HIPS-AF594；0.67μmol)于100μL DMF中的溶液中添加1mg CsF(6.6μmol)，并且加热至60℃维持2小时。然后冷却反应物至室温，并且以0-50％MeCN:水的梯度进行色谱分析(C18)，得到0.4mg所需产物与所需产物+CH2(甲醛加成)的混合物。LRMS(ESI)C54H63N7O11S2[M+H]+的计算值：1050.41；实测值：1151.4。
合成Fmoc-HIPS-OPFP
Fmoc-HIPS-OPFP(1,2-二甲基-2-((1-(3-氧代-3-(全氟苯氧基)丙基)-1H-吲哚-2-基)甲基)肼甲酸(9H-芴-9-基)甲酯)如下面的流程2中图解来合成：
流程2
化合物100(3-(2-甲酰基-1H-吲哚-1-基)丙酸甲酯)从化合物90如下合成。向戴斯-马丁过碘烷(Dess-Martin Periodinane)(1.2mmol)于5mL DCM中的溶液中添加3mmol吡啶并且进行超声处理直至可溶解，之后添加1mmol化合物90(3-(2-(羟甲基)-1H-吲哚-1-基)丙酸甲酯)并且搅拌溶液2.5小时。然后浓缩反应混合物并且在DCM中进行色谱分析，得到0.76mmol产物。1H NMR(400MHz,CDCl3)δ9.90(s,1H),7.75(d,J＝8.4Hz,1H),7.53(dd,J＝8.4,0.8Hz,1H),7.45(ddd,J＝8.0,6.8,0.8Hz,1H),7.32(d,J＝0.8Hz,1H),7.19(ddd,J＝8.0,6.8,0.8Hz,1H),4.86(t,J＝7.2Hz,2H),3.64(s,3H),2.86(t,J＝7.2Hz,2H)。
化合物110(3-(2-甲酰基-1H-吲哚-1-基)丙酸)从化合物100如下合成。向1.03mmol化合物100(3-(2-甲酰基-1H-吲哚-1-基)丙酸甲酯)于5mL甲醇中的溶液中添加3.09mmol氢氧化锂并且搅拌5小时，之后将溶液酸化至pH 2并且分配于5mL水与15mL乙酸乙酯之间。用2×10mL乙酸乙酯洗涤水相。用1×10mL盐水洗涤合并的有机相，然后经硫酸镁干燥，过滤并且通过旋转蒸发而浓缩，得到1.01mmol产物。通过NMR纯化粗物质并且送至后续反应。1H NMR(400MHz,CDCl3)δ9.89(s,1H),7.76(d,J＝8.4Hz,1H),7.52(d,J＝8.4Hz,1H),7.45(ddd,J＝8.4,6.8,1.2Hz,1H),7.33(s),7.22(dd,J＝6.8,0.8Hz,1H),4.86(t,J＝7.2Hz,2H),2.91(t,J＝7.2Hz,2H)。
化合物120(1,2-二甲基肼甲酸(9H-芴-9-基)甲酯)根据如Nicolas,I.等Synlett.2011,3,327-330中所描述的文献程序从化合物10合成，这个文献的公开内容以引用的方式并入本文中。
化合物130(3-(2-((2-(((9H-芴-9-基)甲氧基)羰基)-1,2-二甲基肼基)甲基)-1H-吲哚-1-基)丙酸)从化合物110和化合物120如下合成。向50mL火焰干燥的圆底烧瓶中馈入化合物110(3-(2-甲酰基-1H-吲哚-1-基)丙酸；3.22mmol)、化合物120(1,2-二甲基肼甲酸(9H-芴-9-基)甲酯；5.0mmol)，并且溶解于26mL二氯乙烷(DCE)中。向这个烧瓶中逐份添加三乙酰氧基硼氢化钠(3.54mmol)并且搅拌三小时，然后用5mL 1M NaOH(水溶液)淬灭并且搅拌5分钟。将反应物酸化至pH 2并且用50mL DCM分配。用10mL 5％柠檬酸(水溶液)萃取有机相三次，然后经MgSO4干燥，过滤并且在真空中浓缩，得到55％的所需产物。
化合物140(1,2-二甲基-2-((1-(3-氧代-3-(全氟苯氧基)丙基)-1H-吲哚-2-基)甲基)肼甲酸(9H-芴-9-基)甲酯；也被称作Fmoc-HIPS-OPFP)从化合物130如下合成。向火焰干燥的圆底烧瓶中馈入化合物130(3-(2-((2-(((9H-芴-9-基)甲氧基)羰基)-1,2-二甲基肼基)甲基)-1H-吲哚-1-基)丙酸；0.574mmol)、五氟苯酚(PFP；0.631mmol)、5mL乙酸乙酯(干燥的)，然后冷却至0℃。向这种溶液中添加含N,N'-二环己基碳化二亚胺(0.631mmol)的0.5mL EtOAc，并且在搅拌下升温至20℃。在通过TLC分析消耗掉起始物质(约2小时)后，将粗反应物稀释于60mL EtOAc中，用2×20mL水、2×20mL盐水洗涤，经MgSO4干燥，过滤并且在真空中浓缩。这种物质未经进一步纯化即用于后续反应中。
合成HIPS-6PEG-美登素
HIPS-6PEG-美登素如下面的流程3中图解来合成：
流程3
流程3，接续
化合物150(Fmoc-HIPS-6PEG-OH)从化合物140(Fmoc-HIPS-OPFP)如下合成。向1.6mL小瓶中馈入化合物140(Fmoc-HIPS-OPFP；66.6mg，0.1mmol)、1-氨基-3,6,9,12,15,18-六氧杂二十一烷-21-油酸(74.9mg，0.2mmol)、DIPEA(79.5mg，107.1μL，0.6mmol)以及1mL无水DMF。搅拌反应物2小时，然后以0-100％MeCN:水的梯度进行色谱分析(C18)，得到呈白色膜状的产物(48.6mg，58％产率)。
化合物170如下面的流程中所示，根据如PCT/US2006/030857(以WO 2007/021674公布)中所描述的文献程序从化合物160合成，这个文献的公开内容以引用的方式并入本文中。
化合物180(Fmoc-HIPS-6PEG-脱酰基-美登素)从化合物150(Fmoc-HIPS-6PEG-OH)和化合物170如下合成。向1.6mL小瓶中馈入化合物150(Fmoc-HIPS-6PEG-OH；18.5mg，0.023mmol)、HATU(8.8mg，0.023mmol)、DIPEA(8.8mg，11.9μL，0.068mmol)、0.1mL无水DMF，并且在室温下搅拌15分钟。向此物中添加含化合物170(N-甲基丙氨酸美登素；14.5mg，0.022mmol)的0.1mL无水DMF。搅拌反应物2小时，添加至2mL水中，并且用5×1mL EtOAc萃取。用1×1mL H2O、1×1mL 1M HCl、1×1mL 1.2M NaHCO3、1×1mL H2O、1×1mL 5M NaCl洗涤有机相，并且经Na2SO4干燥。使用0-10％MeOH:CH2Cl2的梯度对产物进行色谱分析(二氧化硅)，得到呈浅黄色膜状的所需化合物(19.9mg，62％产率)。
化合物190(HIPS-6PEG-美登素)从化合物180(Fmoc-HIPS-6PEG-脱酰基-美登素)如下合成。向1.6mL小瓶中馈入化合物180(Fmoc-HIPS-6PEG-脱酰基-美登素；19.9mg，0.014mmol)、哌啶(116.8mg，135.5μL，1.37mmol)以及0.68mL DMA。在如HPLC指示消耗掉起始物质(约20分钟)后，立即使用0-100％MeCN:水的梯度对粗反应物进行色谱分析(C18)，得到呈白色膜状的所需产物(10.2mg，61％产率)。
实施例1：
HIPS-A594与加醛标签的IgG抗体的偶联
在一定范围的时间和pH条件下将HIPS-AF594(化合物80，上述)偶联至加醛标签的抗体。在37℃下于PBS(pH 7.4)、含100mM乙酸钾(pH 4.6)的PBS、含50mM柠檬酸钠(pH 6.0)的PBS、或含100mM Tris(pH 8)的PBS中使HIPS-AF594(92.6药物:醛当量)与5.4μM加醛标签的IgG抗体反应1、2、3、4或24小时。
偶联反应的结果示于图2中，其示出了在一定范围的pH条件下HIPS-AF594与偶联的加醛标签的抗体的偶联。图2A示出了用于合成官能化的可检测标记的反应流程。图2B示出了官能化的可检测标记与抗体的偶联反应的示意图。图2C示出了SDS-PAGE凝胶的图像，其用于分析偶联物。偶联物的存在通过荧光成像来确定。
实施例2：
抗体-可检测标记偶联物的稳定性
在37℃下于128mM氯化钠和50mM柠檬酸钠(pH 6)中使HIPS-AF594(化合物80，上述)(42.4药物:醛当量)于5.9μM加醛标签的IgG抗体反应16小时。通过尺寸排阻色谱法从反应混合物中去除未反应的HIPS-AF594。在4℃或37℃下于血浆或血清(人类与小鼠)中孵育所得抗体-荧光团偶联物1、3或6天。SDS-PAGE用于分析偶联物。偶联物的存在通过荧光成像来确定。如图3中所示，在任一种情况下都没有观测到游离染料并且偶联物没有分解。
偶联反应的结果示于图3中，其示出了显示抗体-可检测标记偶联物经6天的时段的稳定性的SDS-PAGE凝胶的图像。
实施例3：
HIPS-6PEG-美登素与加醛标签的抗体的偶联
在37℃下于含50mM柠檬酸钠(pH 6)和10％DMA的PBS中使HIPS-6PEG-美登素(化合物190，上述；231.5药物:醛当量)与5.4uM加醛标签的抗体(A)反应。在48小时后分析反应混合物。
结果示于图4中，其示出了偶联至HIPS-6PEG-美登素的加醛标签的抗体的疏水相互作用柱(HIC)迹线。观测到未偶联(A)、单偶联(B)以及二偶联(C)蛋白质偶联物。
额外的化合物如下文所描述来合成。
一般合成方法
所有试剂获自Sigma-Aldrich、Acros或TCI并且除了哌啶之外未经进一步纯化即使用，哌啶经CaH2干燥并蒸馏。无水溶剂在密封瓶中获自商业来源。使用Biotage IsoleraPrime色谱仪进行柱色谱法。在配备有Agilent Poroshell 120柱(4.6×150mm)的Agilent1100色谱仪上进行高压液相色谱法，其中在205nm下监测UV吸收。
在Bruker 400MHz光谱仪上由Emeryville Pharmaceutical Services获取NMR光谱。1H NMR光谱是参考残量CHCl3(7.26ppm)、CD2HCN(1.94ppm)或CD2HOD(3.31ppm)。13C NMR光谱是参考CDCl3(77.16ppm)、CD3CN(1.32ppm)或CD3OD(49.00ppm)。使用MestReNova(Mestrelab Research S.L.)处理NMR光谱。在UC Berkeley Mass SpectrometeryFacility处在Thermo LTQ Orbitrap质谱仪上获得小分子的高分辨率ESI质谱。
HIPS接合试剂(化合物4)如下面的流程4中图解来合成：
流程4
合成3-(2-甲酰基-1H-吲哚-1-基)丙酸甲酯(1)
化合物1如下合成。使戴斯-马丁过碘烷(5.195g，12.25mmol，1.09当量)悬浮于二氯甲烷(20mL)与吡啶(2.70mL，33.5mmol，3.0当量)的混合物中。5分钟后，将所得白色悬浮液转移至3-(2-(羟甲基)-1H-吲哚-1-基)丙酸甲酯(2.611g，11.19mmol)于二氯甲烷(10mL)中的溶液中，得到红棕色悬浮液。1小时后，用硫代硫酸钠(10％水溶液，5mL)和碳酸氢钠(饱和水溶液，5mL)淬灭反应物。用二氯甲烷(3×20mL)萃取水层，然后经硫酸钠干燥，过滤，并且浓缩成棕色油状物。通过硅胶色谱法(含5-50％乙酸乙酯的己烷)纯化，得到呈无色油状的产物(2.165g，9.363mmol，84％)。1H NMR(400MHz,CDCl3)δ9.87(s,1H),7.73(dt,J＝8.1,1.0Hz,1H),7.51(dd,J＝8.6,0.9Hz,1H),7.45-7.40(m,1H),7.29(d,J＝0.9Hz,1H),7.18(ddd,J＝8.0,6.9,1.0Hz,1H),4.84(t,J＝7.2Hz,2H),3.62(s,3H),2.83(t,J＝7.2Hz,2H)。13C NMR(101MHz,CDCl3)δ182.52,171.75,140.12,135.10,127.20,126.39,123.46,121.18,118.55,110.62,51.83,40.56,34.97。HRMS(ESI)C13H13NO3Na[M+Na]+的计算值：254.0793；实测值：254.0786。
合成3-(2-甲酰基-1H-吲哚-1-基)丙酸(2)
化合物2从化合物1如下合成。向化合物1(306mg，1.32mmol)溶解于二噁烷(18mL)中的溶液中添加LiOH(2M水溶液，992μL，1.98mmol，1.5当量)。1小时后，逐滴添加盐酸(1M水溶液)，得到pH＝5的溶液。浓缩溶液，并且将所得浅棕色油状物溶解于乙酸乙酯(20mL)中并且用乙酸(5％水溶液，10mL)、水(10mL)以及盐水(10mL)洗涤。经硫酸钠干燥有机层，过滤，并且浓缩成浅棕色油状物。通过硅胶色谱法(含有0.1％乙酸的含5-50％乙酸乙酯的己烷)纯化，得到呈浅黄色固体状的产物(290mg，1.34mmol，定量)。1H NMR(400MHz,CDCl3)δ9.89(s,1H),7.76(dt,J＝8.1,0.9Hz,1H),7.53(dd,J＝8.6,0.9Hz,1H),7.48-7.43(m,1H),7.33(d,J＝0.8Hz,1H),7.21(ddd,J＝8.0,6.9,1.0Hz,1H),4.85(t,J＝7.2Hz,2H),2.91(t,J＝7.2Hz,2H)。13C NMR(101MHz,CDCl3)δ182.65,176.96,140.12,135.02,127.33,126.42,123.53,121.27,118.76,110.55,40.19,34.82。HRMS(ESI)C12H10NO3[M-H]-的计算值：216.0666；实测值：216.0665。
合成3-(2-((2-(((9H-芴-9-基)甲氧基)羰基)-1,2-二甲基肼基)甲基)-1H-吲哚-1-基)丙酸(3)
化合物3从化合物2如下合成。向化合物2(1.193g，5.492mmol)和FmocN(Me)NHMe(2.147g，7.604mmol，1.38当量)于1,2-二氯乙烷(无水，25mL)中的溶液中添加三乙酰氧基硼氢化钠(1.273g，6.006mmol，1.09当量)。搅拌所得黄色悬浮液2小时，然后用碳酸氢钠(饱和水溶液，10mL)淬灭，接下来添加氯化氢(1M水溶液)至pH 4。分离有机层，并且用二氯甲烷(5×10mL)萃取水层。经硫酸钠干燥汇集的有机萃取物，过滤，并且浓缩成橙色油状物。通过C18硅胶色谱法(含20-90％乙腈的水)纯化，得到呈蜡状粉红色固体状的3(1.656g，3.425mmol，62％)。1H NMR(400MHz,CDCl3)δ7.76(d,J＝7.4Hz,2H),7.70-7.47(br m,3H),7.42-7.16(br m,6H),7.12-7.05(m,1H),6.37(s,0.6H),6.05(s,0.4H),4.75-4.30(br m,4H),4.23(m,1H),4.10(br s,1H),3.55(br d,1H),3.11-2.69(m,5H),2.57(br s,2H),2.09(br s,1H)。13C NMR(101MHz,CDCl3)δ174.90,155.65,143.81,141.42,136.98,134.64,127.75,127.48,127.12,124.92,122.00,120.73,120.01,119.75,109.19,103.74,67.33,66.80,51.39,47.30,39.58,39.32,35.23,32.10。HRMS(ESI)C29H30N3O4[M+H]+的计算值：484.2236；实测值：484.2222。
合成3-(2-((1,2-二甲基肼基)甲基)-1H-吲哚-1-基)丙酸哌啶(4)
化合物4从化合物3如下合成。将吲哚3(64.2mg，133μmol)溶解于哌啶于N,N-二甲基乙酰胺中的溶液(20％v/v，1.31mL，2.65mmol，20.0当量)中。20分钟后，通过C18硅胶色谱法(含0-100％乙腈的水)纯化溶液。分离出呈无色油状的产物(28.4mg，82.0μmol，62％)。1HNMR(400MHz,7:5D2O:CD3CN)δ7.84(d,J＝7.9Hz,1H),7.76(d,J＝8.3Hz,1H),7.49(m,1H),7.36(m,1H),6.73(s,1H),4.73-4.69(m,2H),4.25(s,2H),3.36-3.29(m,4H),2.86-2.80(m,2H),2.78(s,3H),2.67(s,3H),1.99-1.95(m,4H),1.88-1.83(m,2H)。13C NMR(151MHz,7:5D2O:CD3CN)δ179.80,137.61,135.78,128.40,122.59,121.29,120.50,110.94,103.70,53.86,45.32,42.79,41.43,38.64,33.95,23.07,22.41,1.32。HRMS(ESI)C14H20N3O2[M-哌啶+H]+的计算值：262.1556；实测值：262.1547。
合成3-(1-((苄氧基)甲基)-2,3-二甲基-3,4-二氢-1H-哒嗪并[4,5-b]吲哚-5(2H)-基)丙酸(5)
使化合物4与苄氧基乙醛反应，苄氧基乙醛由于其UV吸收和水溶解度特性而被选作模型小分子醛，以产生氮杂咔啉产物(化合物5)。向化合物4(16.2mg，46.8μmol)于乙腈水溶液(1:3水:乙腈，800μL)中的溶液中添加苄氧基乙醛(7.23μL，51.5μmol，1.10当量)。1小时后，通过C18硅胶色谱法(含有0.1％乙酸的含0-100％乙腈的水)纯化溶液。将甲苯添加至洗脱液中以帮助去除残余乙酸，并且分离出呈浅棕色油状的产物(16.2mg，41.2μmol，88％)。1H NMR(400MHz,CDCl3)δ7.41(d,J＝7.8Hz,1H),7.38-7.34(m,2H),7.34-7.30(m,3H),7.18-7.15(m,2H),7.08-7.05(m,1H),4.65(d,J＝12.4Hz,1H),4.58(d,J＝12.4Hz,1H),4.28-4.18(m,2H),4.10(m,1H),3.91(t,J＝9.0Hz,1H),3.81(s,1H),3.76-3.64(m,2H),2.69(t,J＝6.8Hz,2H),2.63(s,3H),2.39(s,3H)。13C NMR(151MHz,CDCl3)δ175.08,138.74,136.27,131.75,128.42,127.92,127.60,126.61,121.43,119.61,118.74,109.33,105.41,73.46,71.94,61.61,44.16,41.33,39.19,34.98,31.17。HRMS(ESI)C23H28N3O3[M+H]+的计算值：394.2131；实测值：394.2120。
合成Fmoc-HIPS-PFP
Fmoc-HIPS-PFP如下合成。在0℃下，向Fmoc-HIPS酸(化合物4)(1.4673g，3.0344mmol)和五氟苯酚(608.1mg，3.304mmol，1.09当量)于乙酸乙酯(无水，10mL)中的溶液中添加N,N'-二环己基碳化二亚胺(684.0mg，3.315mmol，1.09当量)于乙酸乙酯(无水，15mL)中的溶液。白色沉淀物开始形成，并且在5分钟后，使溶液升温至室温。90分钟后，冷却悬浮液至0℃并且经硅藻土过滤；用冷乙酸乙酯(5mL)洗涤滤饼。用水(4×10mL)和盐水(10mL)洗涤滤液，经硫酸钠干燥，过滤，且浓缩成浅黄色固体(1.979g，3.046mmol，100％)。这种物质未经进一步纯化即用于后续反应中。
合成Fmoc-HIPS-AF488
Fmoc-HIPS-AF488如下合成。向Fmoc-HIPS-PFP(3.0mg)和Alexa Fluor 488(AF488)尸胺(1mg，1.6μmol)于N,N-二甲基甲酰胺(0.2mL)中的溶液中添加碳酸钠(100mM水溶液，31.2μL，3.12□mol)。2小时后，将反应混合物浓缩成红橙色油状物，通过C18硅胶色谱法(H2O/MeCN)纯化这种油状物。分离出呈红色固体状的产物(1.7mg，1.54μmol，99％)。HRMS(ESI)C55H52N7O13S2[M-Na]-的计算值：1082.3070；实测值：1082.3064。
合成HIPS-AF488接合试剂(化合物9)
HIPS-AF488接合试剂(化合物9)如下合成。将Fmoc-HIPS-AF488(1.7mg，1.54μmol)溶解于二噁烷:MeOH:2M NaOH水溶液(30:9:1，94μL，4.7μmol NaOH，3.1当量NaOH)的溶液中。30分钟后，用乙酸(5％水溶液，50μL)淬灭浅蓝色反应混合物，得到荧光绿溶液，将其浓缩成红色固体。通过C18硅胶色谱法纯化产物，并且通过HPLC在Agilent Zorbax 300SB-C18柱(9.4×250mm)上进一步纯化。分离出呈红色固体状的产物(1.0mg，1.16μmol，75％)。HRMS(ESI)C40H42N7O11S2[M-Na]-的计算值：860.2389；实测值：860.2387。
实施例4：
HIPS接合试剂(化合物4)的反应性
进行实验以研究HIPS试剂(化合物4)相对于模型氨氧基、酰肼以及皮克特-施彭格勒接合试剂与苄氧基乙醛的反应性(图5和图6)。
HPLC动力学试验的实验方案：反应混合物含有含胺4、6、7或8(50μM)、苄氧基乙醛(50μM)、溴甲酚绿(10μM)以及缓冲液(10mM)的120μL水溶液(含有6.7％MeCN)，这种水溶液存在是用来溶解苄氧基乙醛的储备溶液(1mM)。在室温下2小时后，通过HPLC，采用经18分钟含10％至100％乙腈的水的梯度来分析100μL等分试样。
如上文所描述，在室温下将含有50μM胺和醛的缓冲溶液孵育2小时，随后通过HPLC分析。在包涵通常用于醛和酮生物偶联反应的条件的pH范围内，氨氧基吲哚6(模型皮克特-施彭格勒接合试剂)与模型氨氧基化合物7在酸性条件下更快速地反应。酰肼8的反应在任何条件下都不明显发生，这可能是由于腙形成的低平衡常数。在高于pH 6下，吲哚4相比其它胺亲核试剂转化成产物的百分比更高，这指示HIPS接合可能适用于在近中性pH下标记蛋白质。对于与化合物4的反应观测到钟形pH速率曲线；在较低pH下降低的反应速率可能是由于化合物4的肼部分的质子化而引起的限速羰基加成，这是因为三烷基肼(诸如在化合物4中(pKa为约6.56))比O-烷基氨氧基部分(诸如在化合物6中(pKa为约4.60))碱性更大。
实施例5：
化合物4与FGly-MBP的偶联
进行实验以在近中性pH下用化合物4选择性地标记含醛蛋白质(FGly-MBP)。
4偶联至FGly-MBP的实验方案：将吲哚4(1mM)和FGly-MBP(1.41mg/mL)组合于柠檬酸钠缓冲液(50mM，pH 5.0)中，并且在37℃下孵育24小时。通过在离心浓缩机(Amicon，10kDa MWCO)中将缓冲液换成PBS来去除过量化合物4，然后用胰蛋白酶(1.1ug，2wt％)处理样品，并且在37℃下孵育24小时。使用C18柱(The Nest Group)，以含70％乙腈、1％甲酸的水洗脱来使肽脱盐。通过离心蒸发浓缩洗脱液，然后通过nano-LC/MS，在U.C.BerkeleyQB3/Chemistry Mass Spectrometry Facility处在连接至Waters nanoAcquity UPLC的普立尔(premier)电喷雾电离飞行时间质谱仪的Waters Q-T上分析。
加醛标签的麦芽糖结合蛋白(FGly-MBP)，其为在C端附近带有Cα-甲酰甘氨酸(FGly)残基的MBP变体，用作底物。如先前所描述，通过在蛋白质的C端包括短肽序列LCTPSR来安置甲酰甘氨酸残基。MBP与结核分枝杆菌(Mycobacterium tuberculosis)甲酰甘氨酸生成酶的共表达使得一致序列半胱氨酸残基共翻译氧化成甲酰甘氨酸，甲酰甘氨酸与含肼试剂4选择性地反应。使FGly-MBP与吲哚4反应过夜，然后使所得偶联物胰蛋白酶化。通过ESI-MS对胰蛋白酶消化的分析显示化合物4与FGly残基反应。
实施例6：
蛋白质标记实验
进行实验以通过在pH 6.0下评估蛋白质的标记动力学来测定在温和反应条件下HIPS接合的速度。
蛋白质标记实验的实验方案：反应混合物含有含荧光团9、10、11或12(400μM)和蛋白质(MBP，0.67mg/mL；α-HER2，0.37mg/mL；或Mb，0.51mg/mL)的磷酸钠缓冲液(100mM，pH6.0)。在37℃下2小时后，通过添加Tris-Cl至pH 8.5-9使反应停止，并且立即通过SDS-PAGE分析。因为游离荧光团与Mb共洗脱并遮蔽Mb，所以在荧光成像之前将蛋白质转移至硝化纤维素膜以去除游离荧光团，并且使用丽春红S(Ponceau S)评估蛋白质载量。
为了有助于通过SDS-PAGE分析蛋白质偶联实验，通过使化合物3与Alexa Fluor488尸胺偶合，接下来用哌啶进行Fmoc脱保护来制备荧光团官能化的HIPS吲哚(化合物9)。在这些实验中，将HIPS试剂9的相对偶联效率与可商购的AF488酰肼(化合物10)和氨氧基试剂(化合物11)相比较。这种实验设计允许比较HIPS接合与先前所报道的皮克特-施彭格勒接合以及可商购的氨氧基AF488(化合物12，图7A)。在pH 6.0下评估两种带有甲酰甘氨酸的蛋白质的相对标记：FGly-MBP和FGly-α-HER2，在每个重链的C端含有甲酰甘氨酸残基的治疗性单克隆抗体赫赛汀的变体。为了显示除了甲酰甘氨酸之外使用醛的方法的一般性，还评估含有通过磷酸吡哆醛介导的氨基转移而安置的N端乙醛酰胺的化学修饰的肌红蛋白(Mb)的标记。在所有三种情况下，在pH 6.0下用400μM荧光团试剂9-12处理醛官能化的蛋白质2小时显示，用HIPS试剂9标记比用氨氧基和酰肼基-荧光团组标记更快(图7B-7D)。使用FGly-MBP C390A突变体(其缺乏转化成甲酰甘氨酸必需的半胱氨酸残基)、不含醛标签序列的α-HER2、以及野生型Mb(其全部缺乏醛官能团)的对照实验显示用化合物9标记可忽略。使用FGly-α-HER2的实验展示单克隆抗体与小分子在温和条件下位点特异性偶联的方法。
实施例7：
水解稳定性实验
进行实验以确定FGly-MBP相对于肟的键联的水解稳定性，肟在生物偶联化学中对于醛和酮通常是水解稳定的键联。
MBP-AF488偶联物水解ELISA的实验方案
制备MBP-AF488偶联物：将荧光团9或12(545μM)和FGly-MBP(1.61mg/mL，40μg)组合于柠檬酸钠缓冲液(45mM，pH 4.5)中。在37℃下18小时后，通过离子交换色谱法(GEHiTrap SPXL，含5mM至1M NaCl的5mM柠檬酸钠pH 5.5)纯化蛋白质而去除游离荧光团。通过UV-可见光谱法来验证AF488染料的偶联。
孵育含偶联物的人血浆：在37℃下将MBP-AF488偶联物(10μg/mL)于人血浆(0.98x)中的溶液孵育5天。以10至14小时的时间间隔抽出等分试样并且用含1％BSA的PBS稀释至10ng/mL；在-80℃下立即冷冻所得溶液直至通过ELISA分析。
ELISA：在4℃下将96孔微量滴定板(Nunc Maxisorp)用α-MBP(2.5μg/mL，于PBS中，Abcam)涂布过夜。用PBST将孔洗涤两次，然后与BSA(1％，于PBS中)一起孵育2小时。用PBST将孔洗涤两次，然后与MBP-AF488偶联物溶液(10ng/mL)一起孵育。1小时后，用PBST将孔洗涤四次，然后与兔α-AF488IgG(Invitrogen，1:5000)一起孵育1小时。用PBST将孔洗涤四次，然后与HRP偶联的驴α-兔IgG(Jackson ImmunoResearch，1:10000)一起孵育1小时。用PBST将孔洗涤四次后，添加四甲基联苯胺和过氧化氢(Pierce TMB试剂盒)，并且在15分钟后，通过添加1体积的H2SO4(2M)淬灭反应物。在450nm下于板读取器(SpectraMax M5)上读取吸收。
如上文所描述，在37℃下将FGly-MBP的纯化的氮杂咔啉连接和肟连接的AF488偶联物以10μg/mL于人血浆中孵育五天。在这段时间，通过ELISA监测MBP的AF488损失(图8)。夹心ELISA程序包括在α-MBP涂布的微量滴定板上捕获MBP-AF488，接下来使用α-AF488抗体和HRP偶联的二级抗体检测共价结合的AF488。在五天的过程中，没有观测到氮杂咔啉偶联物的明显水解。相比之下，AF488的肟偶联物在一天内分解。
虽然本发明已经参考其特定实施方案加以描述，但本领域的技术人员应了解，在不脱离本发明的真正精神和范围的情况下可以作出各种改变并且可以取代等效物。另外，可以作出许多修改以使特定的情况、材料、物质的组合物、工艺、工艺步骤适于本发明的目的、精神以及范围。所有这些修改意图处于本发明所附的权利要求的范围内。

Claims (15)

1.一种偶联物，其包含：
式(I)的至少一个修饰的氨基酸残基：
其中
n为0或1；
R1为氢；
R2和R3各自独立地选自氢、烷基、以及经取代的烷基；
X1、X2、X3以及X4各自为C；
X5为C；
Y1、Y2、Y3、Y4以及Y5各自为氢；
Q1为键结至X4或X5的键，其中如果Q1为键结至X4的键，那么Y4不存在，或如果Q1为键结至X5的键，那么Y5不存在；并且
L为任选的连接子，
其中W1和W2中的一者为多肽并且另一者为药物或可检测标记。
2.如权利要求1所述的偶联物，其中Q1为键结至X5的键并且Y5不存在。
3.如权利要求1所述的偶联物，其中W1为所述药物或所述可检测标记，并且W2为所述多肽。
4.如权利要求1所述的偶联物，其中所述偶联物包含式(II)的至少一个修饰的氨基酸残基：
或者，所述偶联物包含式(IIa)的至少一个修饰的氨基酸残基：
5.一种式(IV)化合物，
其中
Q2和Q3中的一者为-(CH2)nNR3NHR2并且另一者为Y4；
n为0或1；
R2和R3各自独立地选自氢、烷基、以及经取代的烷基；
X1、X2、X3以及X4各自为C；
Y1、Y2、Y3以及Y4各自为氢；
L为任选的连接子；并且
W1选自药物、可检测标记以及多肽。
6.如权利要求5所述的化合物，其中Q3为-(CH2)nNR3NHR2并且Q2为Y4。
7.如权利要求1所述的偶联物或如权利要求5所述的化合物，其中：
n为1；
R2和R3各自独立地选自烷基和经取代的烷基；
X1、X2、X3以及X4各自为C；以及
Y1、Y2、Y3以及Y4各自为H。
8.如权利要求7所述的偶联物或化合物，其中R2和R3各自为甲基。
9.如权利要求1所述的偶联物或如权利要求5所述的化合物，其中L存在并且包括选自以下的基团：烷基、经取代的烷基、烷氧基、经取代的烷氧基、氨基、经取代的氨基、羧基、羧基酯、以及酰基氨基。
10.如权利要求1所述的偶联物或如权利要求5所述的化合物，其中L存在并且包括聚合物。
11.如权利要求10所述的偶联物或化合物，其中所述聚合物为聚乙二醇。
12.如权利要求5所述的化合物，其中所述化合物为式(V)化合物：
或者，所述化合物为式(Va)化合物：
13.一种产生偶联物的方法，所述方法包括：
在反应混合物中组合：
如权利要求5所述的化合物，以及
包含反应基团的第二化合物，
其中所述组合引起所述化合物与所述第二化合物的所述反应基团之间的反应以形成偶联物；以及
从所述反应混合物中分离所述偶联物。
14.一种药物组合物，其包含：
如权利要求1所述的偶联物；以及
药学上可接受的赋形剂。
15.根据权利要求1至4中任一项所述的偶联物在制备药剂中的用途。
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