CN104946555B - 一种完全降解赤霉烯酮的微杆菌及其应用 - Google Patents

一种完全降解赤霉烯酮的微杆菌及其应用 Download PDF

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本发明属于微生物技术领域,具体为一种完全降解赤霉烯酮的微杆菌及其应用。本发明发现一株微杆菌可以降解赤霉烯酮,命名为Microbacteriumsp. FY1538。该微杆菌属于微杆菌属(Microbacterium sp.),分离自青藏高原青海湖边的草皮(N36.34.243 E100.32.285)。Microbacteriumsp. FY1538在LB培养基中培养,添加终浓度10ul/ml的甲醇,培养基pH 7.4,培养温度30 ℃,摇瓶震荡培养48 h,转速220rpm,发酵上清液具有完全降解赤霉烯酮的能力。本发明提供的微杆菌可应用于玉米等发霉农作物的脱毒。

Description

一种完全降解赤霉烯酮的微杆菌及其应用
技术领域
本发明属于微生物技术领域,具体涉及一种微杆菌及其完全降解赤霉烯酮的应用。
背景技术
赤霉烯酮(zearalenone,ZEN),又称为F-2毒素,是一种具有类雌激素生物活性的霉菌毒素,主要是由镰刀属(Fusariumsp.)真菌的某些种,如禾谷镰刀菌(Fusariumgraminearum)等通过聚酮类合成代谢途径生成。能导致人或动物的生殖系统紊乱,临床表现为雌激素过多症,还有潜在致癌性与肝肾损伤能力。镰刀菌生态适应性强,既营寄生又营腐生生活,分布广泛。赤霉烯酮物化性质稳定,不溶于水,难于清除。农作物生长、收获和储存、加工等多个环节中,都极易被镰刀菌侵害而污染赤霉烯酮。
近些年全球各地越来越多地在谷物(如玉米等)中检测出赤霉烯酮,严重威胁着食用者的健康安全和养殖业的饲料安全。
微杆菌属(Microbacterium sp.)是一种在土壤中广泛分布的常见革兰氏阳性菌,不生孢,不抗酸。不运动或以1~3根鞭毛运动。好氧,弱厌氧。在酵母膏-蛋白胨-葡萄糖 琼脂上菌落不透明,有光泽,黄色。化能异养菌,以呼吸代谢为主,也可能弱发酵产酸。营养要求复杂。最适生长温度30℃。已报道微杆菌属菌株可以降解黄原胶、壳聚糖、氯乙酰及多种含苯环化合物,目前尚无关于降解赤霉烯酮的微杆菌属菌株的报道。
本发明从青藏高原青海湖边的草皮(N36.34.243 E100.32.285)中筛选到一株具有赤霉烯酮降解能力的微杆菌属菌株,命名为Microbacterium sp.FY1538,菌株保藏号为:CGMCC NO. 10614,其发酵上清液可以完全降解赤霉烯酮。该菌可应用于玉米等发霉谷物的脱毒。
发明内容
本发明的目的在于提供一株可以降解赤霉烯酮的微杆菌属的菌株Microbacterium sp.FY1538,以及其应用。
本发明提供的微杆菌属的菌株,是从青藏高原青海湖边的草皮(N36.34.243E100.32.285)中分离获得,该菌种保藏号为CGMCC NO. 10614,保藏日期为2015年3月11号,保藏单位为中国微生物菌种保藏管理委员会普通微生物中心,保藏地址为北京市朝阳区北辰西路1号院3号中国科学院微生物研究所。对该菌株的16S rDNA(SEQ ID NO 1),表明该菌株来源于细菌中的微杆菌属,命名为Microbacterium sp.FY1538。其16S rDNA序列与Microbacterium paraoxydans、Microbacterium oxydans菌种相似度均为97%。该菌株在LB平板上生长的菌落为圆形,培养36h后直径大约1.5mm,不透明,有光泽,黄色(见图1),革兰氏染色及显微镜观察,该菌株为革兰氏阳性菌(见图2)。
本发明还提供利用Microbacterium sp.FY1538菌株培养液上清完全降解赤霉烯酮的方法。具体步骤为:将所述菌株培养在 LB液体培养基中(LB培养基的组成为胰蛋白胨10g/L,酵母提取物 5g/L,氯化钠10g/L,pH 7.4,水溶液);添加终浓度5-15μl/ml的甲醇(优选终浓度10-12μl/ml);培养温度为25-35℃,震荡或者搅拌培养,转速为100-800rpm,培养时间为24-72小时(优选培养时间为48-60小时);对Microbacterium sp.FY1538的培养液,通过离心或者过滤的方法去除菌体,获得培养液上清溶液;将该培养液上清在30-50℃条件下,与赤霉烯酮经过20-24小时的反应。用TLC方法分析反应体系中赤霉烯酮的残留,用HPLC的方法分析赤霉烯酮的降解,表明赤霉烯酮已完全降解(图3,图4)。
本发明提供的菌株Microbacterium sp.FY1538可应用于玉米等发霉谷物的脱毒。
附图说明
图1. Microbacterium sp. FY1538菌落形态图。该菌株在LB平板上菌落为圆形较小,不透明,有光泽,黄色。该菌落形态的特征与微杆菌属细菌形态特征相符合。
图2. Microbacterium sp. FY1538细胞经过革兰氏染色后在显微镜下的形态。与革兰氏阳性菌特征吻合。
图3. TLC方法分析赤霉烯酮的降解。Microbacterium sp. FY1538在含有甲醇的LB培养基中的培养48小时后,取发酵液上清与赤霉烯酮在30℃条件下反应24小时后,用乙酸乙酯萃取,收集乙酸乙酯蒸干并用少量乙醇溶解,用TLC方法分析反应体系中赤霉烯酮的残留。TLC的展开剂为石油醚:丙酮:乙酸乙酯=5:4:1。泳道1:Microbacterium sp. FY1538菌株在含甲醇的LB中培养2天后的培养液上清;泳道2:赤霉烯酮标准样;泳道3:Microbacterium sp. FY1538在加甲醇的LB中培养2天后的培养液上清与赤霉烯酮反应24小时。
图4:HPLC的方法分析赤霉烯酮的降解。Microbacterium sp. FY1538培养液上清与赤霉烯酮在30℃条件下反应0小时、1小时,3小时、6小时和20小时后,用HPLC(AgilentEclipse Plus C18)分析反应体系中赤霉烯酮的残留。HPLC流动相为甲醇和水,甲醇5%-100%梯度洗脱30min,紫外检测波长240nm。蓝色:0小时;红色:催化反应1小时;绿色:催化反应3小时;粉色:催化反应6小时;黄色:催化反应20小时。
具体实施方式
所用实验材料和相关操作方法如下,未详述处可以参考冷泉实验室的《分子克隆》(J.Sambrook, et al., 第二版,1996):
1.培养基
LB 培养基:胰蛋白胨 10g/L,酵母提取物 5g/L,氯化钠10g/L,其余为水,pH 7.4。
2. 实验试剂:甲醇、乙醇、石油醚、丙酮、乙酸乙酯、环戊酮,各种无机盐类购于国药集团化学试剂(沪试),分析纯;赤霉烯酮购于Sigma公司(货号z2125);引物合成和DNA测序由上海杰李生物技术有限公司完成。TLC展开剂用石油醚:丙酮:乙酸乙酯=5:4:1配制而成,现用现配。
3. TLC的分析方法:用Microbacterium sp. FY1538降解赤霉烯酮的方法:将Microbacterium sp. FY1538接种于50 mL LB培养基中,添加终浓度10μl/ml的甲醇,30℃,震荡培养48 h;取发酵液12000rpm离心,其上清,每500μl加入25μg赤霉烯酮,在30℃水浴反应24h后,用适量乙酸乙酯萃取反应液,收集乙酸乙酯蒸干并用少量乙醇溶解析出物,用TLC方法(MERCK公司TLC硅胶板60F254,展开剂为石油醚:丙酮:乙酸乙酯=5:4:1)检验赤霉烯酮残留。
4. HPLC的分析方法:将Microbacterium sp. FY1538接种于50 mL LB培养基中,添加终浓度10μl/ml的甲醇,30 ℃,震荡培养48 h;发酵液12000rpm离心,上清液每500μl加入25μg赤霉烯酮,在30℃水浴反应不同时间,用HPLC进行分析。HPLC层析柱为AgilentEclipse Plus C18,流动相为甲醇和水,甲醇5%-100%梯度洗脱30min,紫外检测波长240nm。
实施例1:赤霉烯酮降解菌株的筛选分离与鉴定
土壤样品采自青藏高原青海湖边的草皮(N36.34.243 E100.32.285)。取2 g土样,加入10 mL 0.15M氯化钠水溶液,振荡30 min,使样品充分打散后,室温静置1min,立刻取1mL上清,涂布于LB平板上,30℃培养至单克隆生长,挑取不同形态单菌落,接种于液体LB培养基中(添加甲醇溶解的终浓度25μg/ml的赤霉烯酮),30℃培养2天,离心取上清,用适量乙酸乙酯萃取,收集乙酸乙酯蒸干并用少量甲醇溶解析出物,用TLC方法(展开剂为石油醚:丙酮:乙酸乙酯=5:4:1)检验培养液中赤霉烯酮的残留。由此将可以降解赤霉烯酮的菌群在LB平板上反复划线纯化单克隆,最终筛选到一株可以独立降解赤霉烯酮的单一菌株(图1)。革兰氏染色后,证明该菌株是革兰氏阳性菌(图2)。
对该菌株抽提基因组DNA,PCR扩增16S rDNA。扩增用引物序列为16S rDNA通用引物27F(AGAGTTTGATCMTGGCTCAG(SEQ ID NO 2))和1492R(TACGGYTACCTTGTTACGACTT(SEQ IDNO 3))。得到该菌株16S rDNA序列(SEQ ID NO 1),在genbank数据库(http:// www.ncbi.nlm.nih.gov/)中进行比对分析,结果表明该赤霉烯酮降解菌株属于微杆菌属,命名为Microbacterium sp.FY1538,保存在中国微生物菌种保藏管理委员会普通微生物中心,保藏号为CGMCC NO. 10614。
实施例2:Microbacterium sp.FY1538的发酵培养
Microbacterium sp.FY1538菌株发酵上清用来降解赤霉烯酮,需要用甲醇诱导。对菌株进行分离纯化后,挑取单菌落接种于50 mL LB培养基中,添加终浓度10μl/ml的甲醇,30 ℃,震荡培养48 h后,发酵液12000rpm离心,获得发酵上清液。
实施例3:Microbacterium sp.FY1538发酵上清液降解赤霉烯酮的能力分析
取发酵上清液500μl,加入25ug赤霉烯酮,在30℃水浴反应24小时,用1000μl乙酸乙酯萃取反应液,收集乙酸乙酯相,蒸干并用少量甲醇溶解析出物,用TLC方法(MERCK公司TLC硅胶板60F254,展开剂为石油醚:丙酮:乙酸乙酯=5:4:1)检验赤霉烯酮残留。如图3所示,Microbacterium sp.FY1538发酵上清液与赤霉烯酮催化反应24小时后,TLC方法检测不到反应体系中的赤霉烯酮。
进一步用HPLC分析Microbacterium sp.FY1538发酵上清液在不同反应时间内降解赤霉烯酮的能力。HPLC层析柱为Agilent Eclipse Plus C18,流动相为甲醇和水,甲醇5%-100%梯度洗脱30min,紫外检测波长240nm。如图4所示,反应时间1小时,3小时,6小时,反应液中的赤霉烯酮逐渐下降,反应20小时后,HPLC已经检测不到反应体系中的赤霉烯酮,说明Microbacterium sp.FY1538发酵上清液具有完全完全降解赤霉烯酮的能力。
本发明提供的菌株Microbacterium sp.FY1538可应用于玉米等发霉谷物的脱毒。
<110> 复旦大学
<120> 一种完全降解赤霉烯酮的微杆菌及其应用
<130> 001
<160> 3
<170> PatentIn version 3.3
<210> 1
<211> 1116
<212> DNA
<213>
<400> 1
ttccttgcaa gtcgaacggt ggacacggag cttgctctgt gggatcagtg gcgaacgggt 60
gagtaacacg tgagcaacct gcccctgact ctgggataag cgctggaaac ggcgtctaat 120
actggatatg tgacgtgacc gcatggtctg cgtttggaaa gatttttcgg ttggggatgg 180
gctcgcggcc tatcagcttg ttggtgaggt aatggctcac caaggcgtcg acgggtagcc 240
ggcctgagag ggtgaccggc cacactggga ctgagacacg gcccagactc ctacgggagg 300
cagcagtggg gaatattgca caatgggcga aagcctgatg cagcaacgcc gcgtgaggga 360
tgacggcctt cgggttgtaa acctctttta gcagggaaga agcgaaagtg acggtacctg 420
cagaaaaagc gccggctaac tacgtgccag cagccgcggt aatacgtagg gcgcaagcgt 480
tatccggaat tattgggcgt aaagagctcg taggcggttt gtcgcgtctg ctgtgaaatc 540
ccgaggctca acctcgggcc tgcagtgggt acgggcagac tagagtgcgg taggggagat 600
tggaattcct ggtgtagcgg tggaatgcgc agatatcagg aggaacaccg atggcgaagg 660
cagatctctg ggccgtaact gacgctgagg agcgaaaggg tggggagcaa acacgcttat 720
ataccctggt agtccacccc gtaaacgttg ggaactagtt gtggggtcca ttccacggat 780
tccgtgacgc agctaacgca ttaagttccc cgcctgggga gtacggccgc aaggctaaaa 840
ctcaaaggaa ttgacgggga ccgcacaagc ggcggagcat gcgattaatt cgatgcaacg 900
cgaagagctt accaagcttg acatatacac aacgggccag aaatgatcaa ctctttggta 960
cactcgtaaa acaggtggtg gcatggtggt cgtcagctcg tgtcttgaat ggtgggatga 1020
agtaccacac cagccaacct cggtctatgc tgcagcaggt taatggtggt aactgcatgg 1080
gaatactgcc gggatccagc tccggaagaa cgtaga 1116
<210> 2
<211> 20
<212> DNA
<213>
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<210> 3
<211> 22
<212> DNA
<213>
<400> 3
tacggytacc ttgttacgac tt 22

Claims (4)

1.一株微杆菌属菌株,能够完全降解赤霉烯酮,命名为Microbacterium sp. FY1538,菌种保藏号为CGMCC NO. 10614。
2.如权利要求1所述的微杆菌属菌株完全降解赤霉烯酮的应用。
3.如权利要求1所述的微杆菌属菌株完全降解赤霉烯酮的应用,其特征在于具体步骤为:将所述菌株培养在 LB液体培养基中,添加终浓度5-15μl/ml的甲醇;培养温度为25-35℃,震荡或者搅拌培养,转速为100-800rpm,培养时间为24-72小时;对Microbacterium sp.FY1538的培养液,通过离心或者过滤的方法去除菌体,获得培养液上清溶液;取培养液上清溶液500μl,赤霉烯酮25ug,将该培养液上清在30-50℃条件下,与赤霉烯酮经过20-24小时的反应。
4.如权利要求1所述的微杆菌属菌株在发霉谷物脱毒中的应用。
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