CN104024258A - 吡咯并吡嗪激酶抑制剂 - Google Patents

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CN104024258A CN201280053274.6A CN201280053274A CN104024258A CN 104024258 A CN104024258 A CN 104024258A CN 201280053274 A CN201280053274 A CN 201280053274A CN 104024258 A CN104024258 A CN 104024258A
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Abstract

本发明涉及新的式I的吡咯并吡嗪衍生物的用途,其中各变量的定义如本申请所述,该新的式I的吡咯并吡嗪衍生物抑制JAK和SYK,并可用于治疗自身免疫性疾病和炎性疾病。

Description

吡咯并吡嗪激酶抑制剂
技术领域
本发明涉及新的吡咯并吡嗪衍生物的用途,该新的吡咯并吡嗪衍生物为JAK和SYK抑制剂且选择性抑制JAK3,并可用于治疗自身免疫性疾病和炎性疾病。本申请涉及US申请13/110062(2011年5月18日提交)、13/11005(2011年5月18日提交)、13/040310(3月4日提交)、13/039433(2011年3月3日提交)、12/378,837(2009年2月20日提交)、12/378,869(2009年2月20日提交)、12/378,971(2009年2月20日提交)、12/378,977(2009年2月20日提交)和12/378,978(2009年2月20日提交),将这些公开均引入本申请作为参考。
背景技术
JAKs(JAnus激酶)是一类胞质蛋白酪氨酸激酶,包括JAK1、JAK2、JAK3和TYK2。JAKs中的每一种优先与离散细胞因子受体在细胞质内部分结合(Annu.Rev.Immunol.16(1998),pp.293–322)。
JAK/STAT信号传导已经牵涉在许多异常免疫应答如变态反应、哮喘、自身免疫性疾病如移植物(同种异体移植物)排斥反应、类风湿性关节炎、肌萎缩侧索硬化症和多发性硬化的介导中,以及在实体恶性疾病和血液恶性疾病如白血病和淋巴瘤中。
动物研究表明,JAK3不仅在B和T淋巴细胞成熟中扮演重要角色,而且在组成上需要JAK3以保持T细胞功能。通过这种新的机制调控免疫活性可以证实有用于治疗T细胞增殖性疾病如移植物排斥反应和自身免疫性疾病中。
JAK3抑制剂是有用的疗法,可用于器官移植物的免疫抑制剂、异种移植、狼疮、多发性硬化、类风湿性关节炎、银屑病、I型糖尿病和来自糖尿病的并发症、癌症、哮喘、特应性皮炎、自身免疫性甲状腺疾病、溃疡性结肠炎、克罗恩病、阿尔茨海默病、白血病和其他期望免疫抑制的适应症。
SYK(脾酪氨酸激酶)是一种非受体酪氨酸激酶,其对于通过BCR信号传导的B细胞激活而言是必要的。SYK在结合至磷酸化BCR时被激活,并因此引发早期信号传导事件以及随后的BCR激活。小鼠在SYK的缺陷显示了B细胞发育的早期阻断(Cheng et al.Nature378:303,1995;Turner et al.Nature378:298,1995)。因此,提议抑制细胞中SYK酶活性作为通过其对自身抗体产生的作用来治疗自身免疫性疾病。
SYK牵涉在包括哮喘的过敏性疾病中(综述见Wong et al.Expert OpinInvestig Drugs13:743,2004)。因此,SYK的小分子抑制剂将可用于治疗过敏诱导的炎性疾病,包括哮喘。
根据被认为受益于涉及调控JAK和/或SYK途径的治疗的多种病症,非常显然的是调控JAK和/或SYK途径的新化合物和使用这些化合物的方法应当向广泛范围的患者提供实质的治疗益处。本申请提供的是新的吡咯并吡嗪衍生物,其用于治疗靶向JAK和/或SYK途径或抑制JAK或SYK激酶、特别是JAK3的病症,并且在治疗上可用于治疗自身免疫性疾病和炎性疾病。
本申请提供的新的吡咯并吡嗪衍生物选择性抑制JAK3和/或SYK途径,且可用于治疗自身免疫性疾病和炎性疾病。例如,本发明的化合物可以抑制JAK3和SYK。此外,本发明的化合物可以抑制JAK3和JAK2,其中优选的化合物对于JAK激酶的JAK3而言是选择性的,并且是可用于治疗自身免疫性疾病和炎性疾病的新的吡咯并吡嗪衍生物。类似地,本发明的化合物可以抑制JAK3和JAK1,其中优选的化合物对于JAK激酶的JAK3而言是选择性的,并且是可用于治疗自身免疫性疾病和炎性疾病的新的吡咯并吡嗪衍生物。特别地,挂在式I化合物的吡咯并吡嗪核上的二环杂芳基侧链(由变量Q表示)使得这些分子对于JAK激酶的JAK3和/或SYK的选择性出人意料地增加。与吡咯并吡嗪核的酰氨基链接的侧链(-C(=O)NRR’)(其使式I化合物相比于在吡咯并吡嗪核上的相同位置上具有不同于酰氨基侧链的侧链的吡咯并吡嗪化合物而言具有意料不到的潜力)组合,式I化合物对JAK激酶的JAK3和/或SYK是出人意料地有潜力的且为选择性的。
发明内容
本申请提供式I化合物,或其药用盐:
其中:
R为H;
R’为低级烷氧基或
或R和R’一起形成杂环烷基,其任选被–CN取代;
R1为H或R1a
R1a为低级烷基、环烷基、低级烷氧基、羟基低级烷基或卤代低级烷基;
R1’为H或低级烷基;
或R1a和R1’一起形成杂环烷基、环烷基、茚满-1-基、苯基或杂芳基,它们任选被一个或多个R1”取代;
各R1”独立地为羟基、氨基、氧代、低级烷基、–C(=O)NH2、–CN、卤代低级烷基、苄基、氰基低级烷基或–NHC(=O)OC(CH3)3
R2为H、羟基、–CN、–C(=O)NH2、–C(=O)OH、–C(=O)OC(CH3)3、R2a或R2b
R2a为低级烷基、苯基、苯基低级烷基、环烷基、杂芳基、杂环烷基、杂环烷基低级烷基、杂芳基低级烷基、苯基低级烷氧基、低级烷氧基,它们任选被一个或多个R2a’取代;
各R2a’独立地为羟基、–CN、氨基、低级烷基磺酰基氨基、低级烷氧基、卤代、低级烷基、氰基低级烷基、卤代低级烷基、低级烷基磺酰基、氧代、卤代低级烷氧基、环烷基、–C(=O)OCH3
R2b为–C(=O)R3或–CH2C(=O)R3
R3为杂环烷基,其任选被一个或多个R3’取代;
各R3’独立地为–CN、卤代、低级烷基或低级烷基磺酰基;
Q为5,6-二环杂芳基环系、6,6-二环杂芳基环系、5,5-二环杂芳基环系、6,5-二环杂芳基环系或5,7-二环杂芳基环系,它们任选被一个或多个Qa或Qb取代;
各Qa独立地为卤代、–CN、羟基或–(CH2)nC(=O)Qa’
各Qa’独立地为羟基、氨基或杂环烷基,其中杂环烷基任选被一个或多个Qa”取代;
各Qa”独立地为低级烷基或卤代低级烷基;
n为1、2或3;
各Qb独立地为低级烷基、环烷基、低级烷氧基、苯氧基、低级烷基磺酰基、杂环烷基、杂环烷基低级烷基或杂芳基低级烷基,它们任选被一个或多个Qb’取代;且
各Qb’独立地为羟基、卤代、–CN、氨基、杂环烷基、低级烷基、苄基或低级烷基磺酰基。
定义
在本申请所使用的短语“一个”或“一种”实体是指一个或多个该实体;例如,一种化合物是指一个或多个化合物或至少一个化合物。同样地,术语“一个”(或“一种”)、“一个或多个”和“至少一个”在本申请中可以互换使用。
如在本说明书中所使用的,无论是在过渡段中还是在权利要求主体中,术语"包括"和"包含"意在解释为具有开放式含义。即,这些术语意在解释为与短语"具有至少"或"包括至少"是同义词。当在方法的上下文中使用时,术语"包括"表示该方法包括至少所引述的步骤,但是也可以包括额外的步骤。当在化合物或组合物的上下文中使用时,术语"包括"表示化合物或组合物包括至少所引述的特征或组分,但是也可以包括额外的特征或组分。
如本申请所使用的,除非另有说明,词语"或"以"和/或"的"包含性"意义使用,而不是“或者/或者”的“排除性”含义使用。
在本申请所使用的术语“独立(地)”表示不考虑存在或不存在在相同化合物内具有相同或不同定义的变量,在任一情况下应用变量。因此,在其中R"显示两次且定义为"独立的碳或氮"的化合物中,两个R"可以为碳,两个R"可以为氮,或一个R"可以为碳且另一个为氮。
当任一变量(例如,X、X’或Q)在描绘和描述本发明使用或要求保护的化合物的任何部分或化学式中出现多于一次时,其定义在每次出现时独立于其在其他每一次出现时的定义。此外,各取代基和/或变量的组合在该化合物产生稳定化合物的情况下才是允许的。
在键的端点的符号"*"或者穿过键所划的符号"------"均涉及官能团或其他化学部分连接至其作为其一部分的分子其余部分的连接点。因此,例如:
MeC(=O)OR4其中
画入环系中的键(如与在远端连接相反)表示该键可以连接着任何合适的环原子。
在本申请所使用的术语“任选”或“任选地”表示后续描述的事件或环境可以但没有必要发生,以及描述内容包括事件或环境发生或不发生的情形。例如,“任选取代的”表示任选取代的部分可以结合氢或取代基。
本申请所使用的短语“与……一起形成二环环系”表示联合形成二环环系,其中各环可以由4-7个碳原子或4-7个碳和杂原子构成,并可以为饱和的或不饱和的。
在本申请使用的术语"约"表示大致,在……范围、粗略或周围。当术语"约"与数值范围联用时,其改变了范围,将限值扩大至高于或低于所给数值。一般而言,术语"约"在本申请用来修饰数值在数值以上和以下的20%变化。
本申请所描述的定义可以附上以形成化学相关的组合,如“杂烷基芳基”、“卤代烷基杂芳基”、“芳基烷基杂环基”、“烷基羰基”、“烷氧基烷基”、“环烷基烷基”,等。当术语“烷基”用作其他术语的后缀时,如在“苯基烷基”或“羟基烷基”那样,其意指如上所述的烷基被一个或两个选自其他指名基团的取代基所取代。因此,例如,“苯基烷基”是指具有一个或两个苯基取代基的烷基,并因此包括苄基、苯基乙基和联苯基。“烷基氨基烷基”为具有一个至两个烷基氨基取代基的烷基。“羟基烷基”包括2-羟基乙基、2-羟基丙基、1-(羟基甲基)-2-甲基丙基、2-羟基丁基、2,3-二羟基丁基、2-(羟基甲基)、3-羟基丙基,等。因此,如本申请使用的,术语“羟基烷基”用来定义下文所定义的杂烷基的子集。术语-(芳)烷基是指未经取代的烷基或芳烷基。术语(杂)芳基或(杂)芳基是指芳基或杂芳基。
式I化合物可显示互变异构现象。互变异构化合物可作为两个或者多个相互转化的种类存在。质子移变互变异构体(prototropic tautomer)由两个原子之间的共价连接的氢原子的迁移获得。互变异构体通常平衡存在且对于分离单个互变异构体的尝试通常产生化学和物理性质与化合物的混合物一致的混合物。平衡的位置取决于分子内的化学特征。例如,在许多脂族醛和酮诸如乙醛中,酮式占优势;而在酚中,烯醇式占优势。常见的质子移变互变异构体包括酮/烯醇 酰胺/亚氨酸和脒 互变异构体。后两种在杂芳基和杂环基环中是特别常见的且本发明涵盖化合物的所有互变异构形式。
除非另作定义,本申请使用的技术和科学术语具有本发明所属领域的技术人员通常所理解的含义。本申请对于各种方法学和物质的引用对于本领域技术人员而言是已知的。阐述药理学的一般原理的标准参考工具包括Goodman和Gilman的The Pharmacological Basis of Therapeutics,10th Ed.,McGraw Hill CompaniesInc.,New York(2001)。本领域技术人员知道的任何合适的物质和/或方法可以用于实施本发明。然而,描述的是优选的物质和方法。物质、试剂以及在如下说明书和实施例中引用参考文献的物质可由商业来源获得,除非另作说明。
本申请所使用的术语“酰基”表示其中R为如本申请所定义的氢或低级烷基的式-C(=O)R基团。本申请所使用的术语"烷基羰基"表示其中R为如本申请所定义的烷基的式C(=O)R基团。术语C1-6酰基是指含有1-6个碳原子的-C(=O)R基团。本申请所示用的术语"芳基羰基"表示式C(=O)R基团,其中R为芳基;本申请所使用的术语"苯甲酰基"为其中R为苯基的"芳基羰基"。
本申请所使用的术语“烷基”表示含有1至10个碳原子的无支链或者支链的饱和单价烃基。术语“低级烷基”表示含有1至6个碳原子的直链或支链烃基。本申请所使用的"C1-10烷基"表示包含1至10个碳原子的烷基。烷基的实例包括,但不限于,低级烷基包括甲基、乙基、丙基、异丙基、正丁基、异丁基、叔丁基或戊基、异戊基、新戊基、己基、庚基和辛基,并任选完全或部分氘化的。
当术语“烷基”用作其他术语的后缀时,例如在“苯基烷基”或“羟基烷基”中,其意在表示如上所定义的烷基,其被一个或两个选自其他具体指定基团的取代基所取代。因此,例如,“苯基烷基”表示这样的基团R'R"-,其中R'为苯基,且R"为亚烷基,如本申请所定义的,理解为苯基烷基部分的链接点在亚烷基上。芳基烷基的实例包括但不限于苄基、苯基乙基、3-苯基丙基。术语“芳基烷基”、“芳基烷基”或"芳烷基"类似地进行解释,除了R'为芳基。术语"杂芳基烷基"或"杂芳基烷基"类似地进行解释,除了R'任选为芳基或杂芳基。
本申请所使用的术语“卤代烷基”表示如上定义的无支链或支链烷基,其中1、2、3或更多个氢原子被卤素取代。术语“卤代低级烷基”表示含有1至6个碳原子的直链或支链烃基,其中1、2、3或更多的氢原子被卤素取代。实例为1-氟甲基、1-氯甲基、1-溴甲基、1-碘甲基、二氟甲基、三氟甲基、三氯甲基、三溴甲基、三碘甲基、1-氟乙基、1-氯乙基、1-溴乙基、1-碘乙基、2-氟乙基、2-氯乙基、2-溴乙基、2-碘乙基、2,2-二氯乙基、3-溴丙基或2,2,2-三氟乙基。
本申请所使用的术语"亚烷基"表示1至10个碳原子的二价饱和直连烃基(例如,(CH2)n)或2至10个碳原子的支链饱和饱和二价烃基(例如,-CHMe-或-CH2CH(i-Pr)CH2-),除非另有说明。除非在亚甲基的情况下,亚烷基的开放键不连接至相同原子。亚烷基的实例包括但不限于,亚甲基、亚乙基、亚丙基、2-甲基-亚丙基、1,1-二甲基-亚乙基、亚丁基、2-乙基亚丁基。
本申请所使用的术语"烷氧基"表示-O-烷基,其中烷基如上所定义,例如甲氧基、乙氧基、正丙基氧基、异丙基氧基、正丁基氧基、异丁基氧基、叔丁基氧基、戊基氧基、己基氧基,包括它们的异构体。本申请所使用的"低级烷氧基"表示"低级烷基"如前述定义的烷氧基,且任选全部或部分氘化的。
本申请所使用的术语"羟基烷基"表示本申请所使用的烷基,其中在不同碳原子上的一至三个氢原子被羟基取代。
本申请所使用的术语“环烷基”是指含有3至8个碳原子的饱和碳环基,即,环丙基、环丁基、环戊基、环己基、环庚基或环辛基。本申请所使用的“C3-7环烷基”是指在碳环中包括3-7个碳的环烷基。
术语“环烯基”是指含5~7个碳原子(除非另有说明)并且在环内具有碳碳双键的部分不饱和的碳环。例如,C5-6环烯基是指具有5~6个成员原子的环烯基。在一些实施方案中,环烯基在环内具有一个碳碳双键。在其他实施方案中,环烯基在环内具有多于一个碳碳双键。然而,环烯基环不是芳香性的。环烯基可以任选经一个或多个取代基取代。环烯基的实例包括,但不限于,环戊烯基和环己烯基。
本申请所使用的术语"卤素"或"卤代"表示氟、氯、溴或碘。
本申请所使用的术语“氨基”包括-NR2,其中各R基团独立地为H或低级烷基,其中低级烷基如本申请所限定。氨基的实例包括二甲基氨基、甲基氨基和NH2
本申请所使用的术语“芳基”表示单环或二环(也称为“联芳基”)、取代或未经取代的碳环芳香基。芳基的实例为苯基、萘基等。
本申请所使用的术语"杂芳基”表示5~18个环原子且具有至少一个芳香族环的单环、二环或三环基团,每个环具有四至八个原子,结合了一个或多个N、O或S杂原子,剩余的环原子为碳,并理解为杂芳基的连接点在芳香环上。如本领域技术人员所公知的,杂芳基环具有比它们的全碳对应部分更少的芳香性。因此,出于本发明的目的,杂芳基仅需要一定程度的芳香性。杂芳基部分的实例包括具有5~6个环原子和1~3个杂原子的单环芳香性杂环,包括但不限于吡啶基、嘧啶基、吡嗪基、吡咯基、吡唑基、咪唑基、吲哚基、噁唑基、异噁唑基、噻唑基、异噻唑基、三唑啉基、三唑基、噻吩基、呋喃基、噻二唑基和噁二唑啉基,它们可任选被一个或多个、优选一个或两个选自以下的取代基取代:羟基、氰基、烷基、烷氧基、硫基、卤代低级烷氧基、烷硫基、卤代、卤代烷基、烷基亚磺酰基、烷基磺酰基、卤素、氨基、烷基氨基、二烷基氨基、氨基烷基、烷基氨基烷基和二烷基氨基烷基、硝基、烷氧基羰基和氨基甲酰基、烷基氨基甲酰基、二烷基氨基甲酰基、芳基氨基甲酰基、烷基羰基氨基和芳基羰基氨基。二环基团的实例包括,但不限于,喹啉基、吲唑基、异喹啉基、苯并呋喃基、苯并噻吩基、苯并噁唑基、苯并异噁唑基、苯并噻唑基、吡咯并吡啶基、吡咯并吡嗪基和苯并异噻唑基。
本申请所使用的术语“5,6-二环杂芳基环系”表示含有至少一个N、O或S杂原子(其余环原子为碳)的部分饱和或不饱和的5,6-二环系,其中理解为杂芳基环系的连接点在5元环上。实例包括,但不限于:1H-吲唑-3-基、4,5,6,7-四氢-1H-吲唑-3-基、1H-吲哚-3-基、5,6,7,8-四氢-咪唑并[1,5-a]吡啶-1-基、咪唑并[1,5-a]吡啶-1-基、吲唑-1-基、1H-吡唑并[3,4-b]吡啶-3-基、1H-吡唑并[4,3-b]吡啶-3-基、咪唑并[1,2-a]吡啶-3-基、2-氧基-4,5,6,7-四氢-1H-吲唑-3-基和苯并咪唑-1-基,其中每一个均可被任选取代。
本申请所使用的术语“6,6-二环杂芳基环系”表示含有至少一个N、O或S杂原子(其余环原子为碳)的部分饱和或不饱和的6,6-二环环系,其中理解为杂芳基环系的连接点在含有至少一个N、O或S杂原子的6元环上。实例包括,但不限于:异喹啉-1-基和异喹啉-8-基,其中每一个均可被任选取代。
本申请所使用的术语“5,5-二环杂芳基环系”表示含有至少一个N、O或S杂原子(其余环原子为碳)的部分饱和或不饱和的二环环系,其中理解为杂芳基环系的连接点在含有至少一个N、O或S杂原子的5-元环上。实例包括但不限于:1H-噻吩并[3,2-c]吡唑-3-基,1,4,5,6-四氢-环戊二烯并吡唑-3-基和5,6-二氢-4H-环戊二烯并吡唑-1-基,其中每一个均可被任选取代。
本申请所使用的术语“5,7-二环杂芳基环系”表示含有至少一个N、O或S杂原子(其余环原子为碳)的部分饱和或不饱和的二环环系,其中理解为杂芳基环系的连接点在含有至少一个N、O或S杂原子的5-元环上。实例包括但不限于:1,4,5,6,7,8-六氢-环庚三烯并吡唑-3-基,其中每一个均可被任选取代。
本申请所使用的术语“6,5-二环杂芳基环系”表示含有至少一个N、O或S杂原子(其余环原子为碳)的部分饱和或不饱和的6,5-二环系,其中理解为杂芳基环系的连接点在任选含有至少一个N、O或S杂原子的5-员环上。实例包括,但不限于:1H-吲哚-7-基、1H-吡咯并[2,3-c]吡啶-7-基、1H-吲唑-4-基和1H-吲唑-7-基,其中每一个都可以被任选取代。
本申请所使用的术语“杂环烷基”、“杂环基”或“杂环”表示单价饱和环基团,其由一个或多个环、优选一个至两个或三个环构成,每个环三至八个原子,结合一个或多个环碳原子和一个或多个环杂原子(选自N、O或S(=O)0-2),其中连接点可以为碳原子或杂原子,且其可任选独立地被选自以下的一个或多个、优选一个或两个或三个取代基所取代:羟基、氧代、氰基、低级烷基、低级烷氧基、卤代低级烷氧基、烷基硫基、卤代、卤素烷基、羟基烷基、硝基、烷氧基羰基、氨基、烷基氨基、烷基磺酰基、芳基磺酰基、烷基氨基磺酰基、芳基氨基磺酰基、烷基磺酰基氨基、芳基磺酰基氨基、烷基氨基羰基、芳基氨基羰基、烷基羰基氨基、芳基羰基氨基,除非另有说明。杂环基的实例包括,但不限于,氮杂环丁烷基、吡咯烷基、六氢氮杂基、氧杂环丁烷基、四氢呋喃基、四氢噻吩基、噁唑烷基、噻唑烷基、异噁唑烷基、吡咯烷基、吗啉基、哌嗪基、哌啶基、异吲哚啉基、二氢异喹啉基、四氢吡喃基、四氢咔啉基、咪唑啉基、硫吗啉基、奎宁环基和咪唑啉基。
短语“器官排斥反应”包括在带血管移植或非带血管(例如骨髓、胰岛细胞)移植的设置中的急性同种异体移植物或异种移植排斥反应和慢性同种异体移植物或异种移植排斥反应。
本申请所使用的术语“赋形剂”是指有用于制备药物组合物且一般是安全无毒的且不是生物学上等不利的化合物,且包括对于兽用和人药物使用的可接受的赋形剂。本发明的化合物可以单独给予,但是一般可以与一种或多种就目标给药途径和标准药学操作而言合适所选择的药用赋形剂、稀释剂或载体一起混合给予。
“药用(的)”表示那些有用于制备药物组合物且一般是安全无毒的且不是生物学上等不利的,其包括对于兽和人药物使用的可接受的。
“药用盐”形式的活性成分也可以首先向以活性成分赋予所期望的不存在于非盐形式中的药代动力学性质,并且甚至可以就其在体内的治疗活性而言有利地影响活性成分的药代动力学。短语化合物的“药用盐”表示药用的且具有母体化合物所需药理学活性的盐。这样的盐包括:(1)与无机酸形成的酸加成盐,所述无机酸如盐酸、氢溴酸、硫酸、硝酸、磷酸等;或与有机酸形成的酸加成盐,所述有机酸如乙酸、丙酸、己酸、环戊烷丙酸、乙醇酸、丙酮酸、乳酸、丙二酸、琥珀酸、苹果酸、马来酸、富马酸、酒石酸、柠檬酸、苯甲酸、3-(4-羟基苯甲酰基)苯甲酸、肉桂酸、扁桃酸、甲磺酸、乙磺酸、1,2-乙烷-二磺酸、2-羟基乙磺酸、苯磺酸、4-氯苯磺酸、2-萘磺酸、4-甲苯磺酸、樟脑磺酸、4-甲基二环[2.2.2]-辛-2-烯-1-羧酸、葡庚糖酸、3-苯基丙酸、三甲基乙酸、叔丁基乙酸、月桂基硫酸、葡萄糖酸、谷氨酸、羟基萘甲酸、水杨酸、硬脂酸、粘糠酸等;或(2)在存在于母体化合物中的酸性质子被金属离子如碱金属离子、碱土金属离子或铝离子置换时所形成的盐;或与有机碱如乙醇胺、二乙醇胺、三乙醇胺、三羟甲基氨基甲烷、N-甲基葡糖胺等配位时所形成的盐。
JAK3和/或SYK的抑制剂
本申请提供式I化合物,或其药用盐:
式I化合物
其中:
R为H;
R’为低级烷氧基或
或R和R’一起形成杂环烷基,其任选被–CN取代;
R1为H或R1a
R1a为低级烷基、环烷基、低级烷氧基、羟基低级烷基或卤代低级烷基;
R1’为H或低级烷基;
或R1a和R1’一起形成杂环烷基、环烷基、茚满-1-基、苯基或杂芳基,它们任选被一个或多个R1”取代;
各R1”独立地为羟基、氨基、氧代、低级烷基、–C(=O)NH2、–CN、卤代低级烷基、苄基、氰基低级烷基或–NHC(=O)OC(CH3)3
R2为H、羟基、–CN、–C(=O)NH2、–C(=O)OH、–C(=O)OC(CH3)3、R2a或R2b
R2a为低级烷基、苯基、苯基低级烷基、环烷基、杂芳基、杂环烷基、杂环烷基低级烷基、杂芳基低级烷基、苯基低级烷氧基、低级烷氧基,它们任选被一个或多个R2a’取代;
各R2a’独立地为羟基、–CN、氨基、低级烷基磺酰基氨基、低级烷氧基、卤代、低级烷基、氰基低级烷基、卤代低级烷基、低级烷基磺酰基、氧代、卤代低级烷氧基、环烷基、–C(=O)OCH3
R2b为–C(=O)R3or–CH2C(=O)R3
R3为杂环烷基,其任选被一个或多个R3’取代;
各R3’独立地为–CN、卤代、低级烷基或低级烷基磺酰基;
Q为5,6-二环杂芳基环系、6,6-二环杂芳基环系、5,5-二环杂芳基环系、6,5-二环杂芳基环系或5,7-二环杂芳基环系,它们任选被一个或多个Qa或Qb取代;
各Qa独立地为卤代、–CN、羟基或–(CH2)nC(=O)Qa’
各Qa’独立地为羟基、氨基或杂环烷基,其中杂环烷基任选被一个或多个Qa”取代;
各Qa”独立地为低级烷基或卤代低级烷基;
n为1、2或3;
各Qb独立地为低级烷基、环烷基、低级烷氧基、苯氧基、低级烷基磺酰基、杂环烷基、杂环烷基低级烷基或杂芳基低级烷基,它们任选被一个或多个Qb’取代;且
各Qb’独立地为羟基、卤代、–CN、氨基、杂环烷基、低级烷基、苄基或低级烷基磺酰基。
本申请提供式I化合物,其中R为H。
本申请提供式I化合物,其中R’为
本申请提供式I化合物,其中R为H且R’为
本申请提供式I化合物,其中R1’为H或低级烷基。
本申请提供式I化合物,其中R1’为H或低级烷基
R为H且R’为
本申请提供式I化合物,其中R1为低级烷基。
本申请提供式I化合物,其中R1为低级烷基,R1’为H或低级烷基,R为H,且R’为
本申请提供式I化合物,其中R1和R1’均为H。
本申请提供式I化合物,其中R为H,R’为且R1和R1’均为H。
本申请提供式I化合物,其中R2为–C(=O)R3
本申请提供式I化合物,其中R2为–C(=O)R3,R1为低级烷基,R1’为H或低级烷基,R为H且R’为
本申请提供式I化合物,其中R2为低级烷基,其任选被一个或多个R2a’取代。
本申请提供式I化合物,其中R2为低级烷基,其任选被一个或多个R2a’取代,R1为低级烷基,R1’为H或低级烷基,R为H,且R’为
本申请提供式I化合物,其中Q为5,6-二环杂芳基环系,其任选被一个或多个Qa或Qb取代。
本申请提供式I化合物,其中Q为5,6-二环杂芳基环系,其任选被一个或多个Qa或Qb取代,R2为低级烷基,其任选被一个或多个R2a’取代,R1为低级烷基,R1’为H或低级烷基,R为H,且R’为
本申请提供式I化合物,其中Q为吲唑-3-基,其任选被一个或多个Qa或Qb取代。
本申请提供式I化合物,其中Qa为卤代或低级烷基。
本申请提供式I化合物,其中Q为吲唑-3-基,其任选被一个或多个Qa或Qb取代,且Qa为卤代或低级烷基。
本申请提供式I化合物,其中Qb为低级烷基。
本申请提供式I化合物,其中Q为吲唑-3-基,其任选被一个或多个Qa或Qb取代,且Qa为卤代或低级烷基,和Qb为低级烷基。
本申请提供式I化合物,其中R1a和R1’一起形成杂环烷基或环烷基,它们任选被一个或多个R1”取代。
本申请提供式I化合物,其中R1a和R1’一起形成杂环烷基或环烷基,它们任选被一个或多个R1”取代,Q为吲唑-3-基,其任选被一个或多个Qa或Qb取代,且Qa为卤代或低级烷基,和Qb为低级烷基。
本申请提供式I化合物,其中R1”为氨基或–CN。
本申请提供式I化合物,其中R1”为氨基或–CN,R1a和R1’一起形成杂环烷基或环烷基,它们任选被一个或多个R1”取代,Q为吲唑-3-基,其任选被一个或多个Qa或Qb取代,且Qa为卤代或低级烷基,和Qb为低级烷基。
本申请提供式I化合物,其中R2为低级烷基。
本申请提供式I化合物,其中R2为低级烷基,R1”为氨基或–CN,R1a和R1’一起形成杂环烷基或环烷基,它们任选被一个或多个R1”取代,Q为吲唑-3-基,其任选被一个或多个Qa或Qb取代,且Qa为卤代或低级烷基,和Qb为低级烷基。
本申请提供选自表I所列化合物的化合物。
本申请提供治疗炎性病症或自身免疫性病症的方法,包括向有此需要的患者给予治疗有效量的式I化合物。
本申请提供上述方法,其进一步包括给予选自以下的额外治疗剂:化学治疗或抗增殖剂、抗炎剂、免疫调节或免疫抑制剂、神经营养因子、心血管疾病的治疗剂、糖尿病的治疗剂或免疫缺陷疾病的治疗剂。
本申请提供治疗类风湿性关节炎的方法,包括向有此需要的患者给予治疗有效量的式I化合物。
本申请提供治疗哮喘的方法,包括向有此需要的患者给予治疗有效量的式I化合物。
本申请提供治疗炎性病症的方法,包括向有此需要的患者给予治疗有效量的式I化合物。
本申请提供抑制T细胞增殖性疾病的方法,包括向有此需要的患者给予治疗有效量的式I化合物。
本申请提供抑制T细胞增殖性疾病的方法,包括向有此需要的患者给予治疗有效量的式I化合物。
本申请提供上述方法,其中所述增殖性疾病为癌症。
本申请提供治疗B-细胞增殖性疾病的方法,包括向有此需要的患者给予治疗有效量的式I化合物。
本申请提供治疗免疫性疾病的方法,包括向有此需要的患者给予治疗有效量的式I化合物,所述免疫性疾病包括狼疮、多发性硬化、类风湿性关节炎、银屑病、I型糖尿病、来自器官移植物的并发症、异种移植、糖尿病、癌症、哮喘、特应性皮炎、自身免疫性甲状腺疾病、溃疡性结肠炎、克罗恩病、阿尔茨海默病和白血病。
本申请提供预防或治疗各种形式的器官排斥反应的方法,包括向有此需要的患者给予式I化合物,所述器官排斥反应包括带血管移植或非带血管移植的急性同种异体移植物或异种移植排斥反应和慢性同种异体移植物或异种移植排斥反应。
本申请提供移植JAK3活性的方法,包括给予式I化合物,其中所述化合物在JAK3活性的体外生化测定中显示50微摩尔或更小的IC50
本申请提供上述方法,其中所述化合物在JAK3活性的体外生化测定中显示100纳摩尔或更小的IC50
本申请提供上述方法,其中所述化合物在JAK3活性的体外生化测定中显示10纳摩尔或更小的IC50
一种抑制SYK活性的方法,包括给予式I化合物,其中所述化合物在SYK活性的体外生化测定中显示50微摩尔或更小的IC50
本申请提供上述方法,其中所述化合物在SYK活性的体外生化测定中显示100纳摩尔或更小的IC50
本申请提供上述方法,其中所述化合物在SYK活性的体外生化测定中显示10纳摩尔或更小的IC50
本申请提供治疗炎性病症的方法,包括向有此需要的患者共同给药治疗有效量的抗炎化合物与式I化合物的组合。
本申请提供治疗免疫性疾病的方法,包括向有此需要的患者共同给药治疗有效量的免疫抑制化合物与式I化合物的组合。
本申请提供药物组合物,其包含式I化合物与至少一种药用载体、赋形剂或稀释剂的混合物。
本申请提供上述组合物,进一步包含选自以下的额外治疗剂:化学治疗或抗增殖剂、抗炎剂、免疫调节或免疫抑制剂、神经营养因子、心血管疾病的治疗剂、糖尿病的治疗剂和免疫缺陷疾病的治疗剂。
本申请提供式I化合物的制备方法。
本申请提供式I化合物在制备用于治疗炎性病症的药物中的用途。
本申请提供式I化合物在制备用于治疗免疫性疾病的药物中的用途。
本申请提供权利要求1-15中任一项的化合物在制备用于治疗关节炎或哮喘的药物中的用途。
本申请提供如前文所述的发明。
化合物
本发明所包括的以及本发明范围内的代表性化合物的实施例提供在下表中。提供了这些实施例以及随后的制备以使本领域技术人员更清楚地理解并实践本发明。它们不应当被认为限制本发明的范围,而仅是本发明的示例以及代表。
一般而言,在本申请中使用的命名法是基于AUTONOMTM v.4.0,BeilsteinInstitute计算机化的系统,用于生成IUPAC系统命名。如果在所示结构与相应结构所给名称之间存在差异,所示的结构更加合意。此外,如果结构或结构的一部分的立体化学未以例如粗线或点划线示出,则该结构或结构的一部分应被解释为包括其所有的立体异构体。
表I显示了根据式I的示例性化合物。
表I
合成
一般方案
方案1
方案2
方案3
方案4
操作1.
2-溴-5-(2-三甲基甲硅烷基-乙氧基甲基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-甲醛
方法A
步骤1
(2-溴-7-羟基甲基-吡咯并[2,3-b]吡嗪-5-基)-甲醇
向2-溴-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪(5.0g,25.2mmol)在1,4-二噁烷(100mL)中的部分悬浮液中加入2.0M NaOH水溶液(25mL,50.0mmol)和37%甲醛水溶液(19mL,252mmol)。将深色均匀的反应混合物在室温搅拌过夜。将有机物减压蒸发。将水层以1.0M HCl中和,并用EtOAc(2x)萃取。浓缩合并的有机物得到2.6g的橙色固体。静置后,稠的棕色析出物形成在水层中。将析出物通过过滤收集并干燥。将棕色固体用热的10%MeOH/EtOAc(3x200mL)萃取。合并萃取物并蒸发,得到另外的3.05g的橙色固体。总收率为5.65g(87%)的(2-溴-7-羟基甲基-吡咯并[2,3-b]吡嗪-5-基)-甲醇。1H NMR(DMSO-d6,400MHz):δ(ppm)8.43(s,1H),7.96(s,1H),6.71(t,J=7.3Hz,1H),5.59(d,J=7.6Hz,2H),5.10(t,J=5.3Hz,1H),4.66(d,J=5.6Hz,2H)。
步骤2
(2-溴-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-基)-甲醇
向(2-溴-7-羟基甲基-吡咯并[2,3-b]吡嗪-5-基)-甲醇(5.65g,21.9mmol)在THF(150mL)中的悬浮液中加入2.0M NaOH水溶液(33mL,66mmol)。将均匀的反应混合物搅拌过夜,然后减压除去有机物。以1.0M HCl水溶液将含水残余物调节至pH4。将所得析出物经由过滤收集,并用H2O淋洗,得到3.68g的黄色固体。将滤液以EtOAc(2x)萃取,减压浓缩有机物,得到另外的0.92g的黄色固体。总收率为4.60g(92%)的(2-溴-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-基)-甲醇。1H NMR(DMSO-d6,300MHz):δ(ppm)12.19(宽单峰,1H),8.33(s,1H),7.85(s,1H),4.96(t,J=5.3Hz,1H),4.62(d,J=4.9Hz,2H)。
步骤3
2-溴-5-(2-三甲基甲硅烷基-乙氧基甲基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-甲醛
通过将浓H2SO4(2.3mL)小心地添加至CrO3(2.67g)中然后以H2O稀释成10mL来制备琼斯试剂(2.67M)的储备液。向(2-溴-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-基)-甲醇(4.6g,20.1mmol)在丙酮(300mL)中的部分悬浮液中缓慢地添加琼斯试剂(9mL,24.0mmol)。添加期间,起始物质逐渐地溶解并形成厚的绿色沉淀。搅拌反应混合物15分钟,然后以i-PrOH(2mL)淬灭,并经硅藻土过滤,以丙酮淋洗。将滤液浓缩得到4.76g的2-溴-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-甲醛,为黄橙色固体,其不经进一步纯化即可使用。于0℃向该固体在DMF(50mL)中的溶液中添加NaH(60%在矿物油中,1.2g,30.1mmol)。将反应混合物在室温搅拌30分钟,然后冷却回0℃并缓慢地添加2-(三甲基甲硅烷基)乙氧基甲基氯(4.3mL,24.1mmol)。将反应混合物温热至室温并搅拌1小时,然后以H2O淬灭并以EtOAc(3x)萃取。将合并的有机物以H2O(3x)和盐水洗涤,然后经MgSO4干燥并浓缩。将残余物通过SiO2色谱(20%至30%EtOAc/己烷)纯化,分离出3.82g(53%)的2-溴-5-(2-三甲基甲硅烷基-乙氧基甲基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-甲醛,为黄色固体。1H NMR(CDCl3,300MHz):δ(ppm)10.37(s,1H),8.50(s,1H),8.33(s,1H),5.73(s,2H),3.53-3.70(m,2H),0.90-1.05(m,2H),0.00(s,9H).
方法B
步骤1
2-溴-5-(2-三甲基甲硅烷基-乙氧基甲基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪
在干燥的圆底烧瓶中,将2-溴-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪(5.0g,25.2mmol)溶解于DMF(50mL)中。将反应混合物冷却至0℃并添加氢化钠(60%在矿物油中的分散液,1.22g,30.6mmol)。将反应混合物温热至室温并搅拌15分钟,然后冷却回0℃,并缓慢地添加SEM-Cl(5.4mL,30.4mmol)。在完成添加后,移去冰浴,将反应混合物在室温搅拌1.5小时。将反应混合物以50mL水淬灭,并以150mL乙醚(2x)萃取。将合并的有机层以30mL水洗涤两次,以30mL盐水洗涤一次,然后经硫酸钠干燥,过滤并浓缩。将残余物吸收在~20g SiO2上,并在200g SiO2上经色谱以EtOAc/己烷(梯度:0-15%EtOAc)纯化。合并含有产物的所有馏分并浓缩得到6.61g(80%)的2-溴-5-(2-三甲基甲硅烷基-乙氧基甲基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪,为淡黄色油状物,其逐渐固化。1HNMR(CDCl3,300MHz):δ(ppm)8.38(s,1H),7.70(d,J=3.8Hz,1H),6.76(d,J=3.8Hz,1H),5.68(s,2H),3.50-3.65(m,2H),0.88-1.03(m,2H),0.00(s,9H).
步骤2
2-溴-5-(2-三甲基甲硅烷基-乙氧基甲基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-甲醛
在圆底烧瓶中,将2-溴-5-(2-三甲基甲硅烷基-乙氧基甲基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪(6.58g,20.0mmol)溶解于氯仿(戊烯稳定化,120mL)中并添加氯亚甲基二甲基氯化铵(10.3g,80.2mmol)。在稳定的氮气流鼓泡通过反应混合物时,回流搅拌反应混合物8小时。将深棕色溶液冷却至室温并搅拌过夜。将反应混合物以~100mL饱和NaHCO3-溶液小心地淬灭(小心:放热),并然后以200mL乙醚萃取两次。合并有机层,经硫酸钠干燥,过滤并浓缩。将残余物吸收至~20g SiO2上并在200g SiO2上通过色谱以EtOAc/己烷(梯度:0-25%EtOAc)纯化。合并含产物的所有馏分并浓缩得到5.92g(83%)的2-溴-5-(2-三甲基甲硅烷基-乙氧基甲基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-甲醛和2-氯-5-(2-三甲基甲硅烷基-乙氧基甲基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-甲醛的约3:1混合物,为黄色固体。溴化物:1H NMR(CDCl3,300MHz):δ(ppm)10.37(s,1H),8.50(s,1H),8.33(s,1H),5.73(s,2H),3.56-3.67(m,2H),0.91-1.02(m,2H),0.00(s,9H);氯化物:1H NMR(CDCl3,300MHz):δ(ppm)10.36(s,1H),8.41(s,1H),8.35(s,1H),5.74(s,2H),3.56-3.67(m,2H),0.91-1.02(m,2H),0.00(s,9H).
过程2.
2-溴-5-(2-三甲基甲硅烷基乙氧基甲基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-羧酸
在烧瓶中,将2-溴-5-(2-三甲基甲硅烷基乙氧基甲基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-甲醛(3.11g,8.74mmol)溶解于二噁烷(120mL)和H2O(30mL)中并于0℃冷却混合物。添加氨基磺酸(5.09g,52.4mmol),并接着经由滴液漏斗经15分钟添加亚氯酸钠(1.28g,11.4mmol)和磷酸二氢钾(14.3g,104.9mmol)在H2O(75mL)中的溶液。经2小时将混合物温热至室温。将所得黄色固体滤出,以H2O和己烷洗涤并干燥。然后将滤液以EtOAc萃取,且将合并的有机物以盐水洗涤,经MgSO4干燥,并浓缩得到另外的产物。总计得到3.71g的2-溴-5-(2-三甲基甲硅烷基乙氧基甲基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-羧酸,为黄色固体。1HNMR(CDCl3,400MHz):δ(ppm)8.52(s,1H),8.42(s,1H),5.73(s,2H),3.56-3.65(m,2H),0.90-1.02(m,2H),0.00(s,9H).
过程3.
2-溴-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-羧酸甲酯
步骤1
2-溴-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-羧酸
于40℃向(2-溴-7-羟基甲基-吡咯并[2,3-b]吡嗪-5-基)-甲醇(0.525g,2.03mmol)在200mL的丙酮的搅拌溶液中添加CrO3(0.832g,8.32mmol)和H2SO4(1.32g,13.4mmol)在水(3ml)中的溶液。然后于40℃搅拌反应混合物16小时,然后经硅藻土过滤。将滤液于40℃减压蒸发得到2-溴-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-羧酸(0.527g),为灰白色固体。LCMS:(M+H)+=264;1H NMR(300MHz,DMSO-d6):δ13.04(s,1H),8.53(s,1H),8.45(s,1H),5.63(s,1H).
步骤2
2-溴-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-羧酸甲酯
于室温向2-溴-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-羧酸(0.527g,2.18mmol)在50mL的甲醇中的搅拌溶液中缓慢地添加H2SO4(1.5mL)。回流下搅拌反应混合物16小时。于40℃减压蒸发溶剂,然后将残余物悬浮于5mL的水中,添加固体NaHCO3直到pH=7。将溶液以乙酸乙酯(90mL)萃取,然后将有机物以水(20mL)、盐水(20mL)洗涤并经无水硫酸钠干燥。将干燥的试剂通过过滤除去,且于40℃减压蒸发溶剂得到粗产物,将其通过柱色谱(硅胶,200-300目筛,以石油醚和乙酸乙酯的混合物(1:1,v/v)洗脱)纯化得到2-溴-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-羧酸甲酯(0.24g,43%),为白色固体。LCMS:(M+H)+=278;1H NMR(300MHz,DMSO-d6):δ8.62(s,1H),8.48(s,1H),3.91(s,3H).
药物组合物和给药
本发明的化合物可以配制成广泛范围的口服剂型和载体。口服剂型可以为片剂、包衣片、糖衣片、硬明胶胶囊和软明胶胶囊、溶液剂、乳剂、糖浆剂或悬浮剂的形式。本发明的化合物在通过其他给予途径给予时是有效的,其他给予途径包括连续(静脉内滴注)、局部肠胃外、肌内、静脉内、皮下、透皮(其可以包括渗透增强剂)、舌下、经鼻、吸入和栓剂给药等其他给药途径。给药的优选方式一般为使用便利的每日给药方案的口服给药,其可以根据痛苦程度和患者对活性成分的响应进行调节。
本发明的一种或多种化合物以及它们的药用盐与一种或多种常规的赋形剂、载体或稀释剂一起可以置入药物组合物和单位剂量的形式中。药物组合物和单位剂型可以包括常规比例的常规成分,含有或不含有额外的活性化合物或基本成分,并且所述单位剂型可以含有任何合适有效量的活性成分,其与要使用的目的每日剂量范围相符。药物组合物可以用作固体,如片剂或填充胶囊、半固体、粉末剂、缓释制剂,或液体,如溶液剂、悬浮剂、乳剂、酏剂或口服用填充胶囊;或直肠或阴道给药的栓剂形式;或肠胃外使用的灭菌注射液的形式。典型的制剂会含有约5%至约95%的一种或多种活性化合物或化合物(w/w)。术语"制剂"或"剂型"意在包括活性化合物的固体和液体制剂这两种,且本领域技术人员将会理解活性成分可以不同制剂存在,这取决于目标器官或组织和所需剂量和药代动力学参数。
固体形式制剂包括粉末剂、片剂、丸剂、胶囊剂、扁囊剂、栓剂和分散颗粒。固体载体可以为一种或多种如下物质:其也可以作用为稀释剂、调味剂、增溶剂、润滑剂、助悬剂、粘合剂、防腐剂、片剂崩解剂或包囊材料。在粉末剂中,载体一般为细分散的固体,其为与细分散活性成分的混合物。在片剂中,活性成分一般以合适比例与具有必要结合能力载体混合,并压实成所需的形状和尺寸。合适的载体包括,但不限于,碳酸镁、硬脂酸镁、滑石、糖、乳糖、果胶、糊精、淀粉、明胶、黄蓍胶、甲基纤维素、羧甲基纤维素钠、低熔点蜡、可可脂,等。除了活性成分之外,固体形式制剂可以含有着色剂、调味剂、稳定剂、缓冲剂、人工和天然甜味剂、分散剂、增稠剂、增溶剂,等。
液体制剂也合适于口服给药,液体制剂包括乳剂、糖浆剂、醑剂、水溶液剂、水性悬浮剂。这些包括固体形式制剂,其意在于使用前即刻转化为液体形式制剂。乳剂可以配制成溶液剂,例如,丙二醇水溶液,或可以含有乳化剂,如卵磷脂、脱水山梨糖醇单油酸酯,或阿拉伯胶。水溶液可以通过将活性成分溶解在水中并添加合适的着色剂、调味剂、稳定剂和增稠剂来制备。水性悬浮剂可以通过将细分散的活性成分与粘性物质如天然或合成橡胶、树脂、甲基纤维素、羧甲基纤维素钠和其他已知助悬剂一起分散在水中而制备。
本发明的化合物可以配制为肠胃外给药(例如,通过注射,例如,推注或连续输液),并可以单位剂型存在于添加有防腐剂的安瓿、预填注射器、小体积输注或多剂量容器中。该组合物可以采取以下形式如悬浮剂、溶液剂或在油性载体或水性载体中的乳剂,例如在水性聚乙二醇中的溶液。油性或非水性载体、稀释剂、溶剂或媒介物的实例包括丙二醇、聚乙二醇、植物油(例如,橄榄油)和注射用有机酯(例如,油酸乙酯),并且可以含有配制试剂,如防腐剂、润湿剂、乳化剂或助悬剂、稳定剂和/或分散剂。可选择地,活性成分可以为粉末剂形式,其通过无菌隔离灭菌固体或通过从在使用前冻干含合适载体如无菌无热源的水构成溶液而获得。
本发明的化合物可以配制为作为软膏、乳膏或洗剂或作为透皮贴剂局部给药至表皮。软膏和乳膏可以,例如,以水性或油性基质配制,添加合适的增稠剂和/或凝胶剂。洗剂可以以水性或油性基质配制,并且一般会含有一个或多个乳化剂、稳定剂、分散剂、助悬剂、增稠剂或着色剂。适合于口腔局部给药的制剂包括含片,其包括调味基质中的活性剂,通常是乳糖和阿拉伯胶或黄蓍胶;锭剂,其包含在惰性基质中的活性成分,如明胶和甘油或乳糖和阿拉伯胶;和漱口水,其包含在合适液体载体中的活性成分。
本发明的化合物可以配制为作为栓剂给药。首先将低熔点蜡如脂肪酸甘油酯或可可脂的混合物熔化,且将活性成分通过例如搅拌均匀地分散。然后将熔化的均匀混合物倒入便利的定性模具中,让其冷却并固化。
本发明的化合物可以配制为阴道给药。除了活性成分之外含有例如载体的阴道栓剂、棉塞、乳膏剂、凝胶剂、糊剂、泡沫剂或喷雾剂在本领域中已知是合适的。
本发明的化合物可以配制为经鼻给药。将溶液剂或悬浮剂通过传统手段(例如滴管、吸管或喷雾)直接施用至鼻腔。制剂可以单剂型或多剂型形式提供。在滴管或吸管的后一种情形中,这可以通过对患者给予合适的预定体积的溶液剂或悬浮剂来实现。在喷雾剂的情况下,这可以通过例如计量雾化喷雾泵来实现。
本发明的化合物可以配制为气溶胶给药,特别地给药至呼吸道并包括鼻内给药。化合物将通常具有小粒度,例如在五(5)微米或更小的量级。这样的粒度可以通过本领域中已知的方法例如微粉化来获得。活性成分以具有合适的推进剂如氯氟碳(CFC)来提供加压包装,氯氟碳例如二氯二氟甲烷、三氯氟甲烷或二氯四氟乙烷或二氧化碳或其他合适的气体。气溶胶也可以方便地含有表面活性剂如卵磷脂。药物剂量可以通过计量阀控制。可选择地,活性成分可以干粉剂形式提供,例如化合物在合适的粉末基料例如乳糖、淀粉、淀粉衍生物如羟基丙基甲基纤维素和聚乙烯吡咯烷(PVP)中的粉末混合物。粉剂载体会在鼻腔中形成凝胶。粉剂组合物可以单位剂型存在,例如明胶或泡罩包装的胶囊或药筒(cartridge),由此粉剂可通过吸入剂给药。
当需要时,制剂可以适于缓释或控释给予活性成分的肠溶性包衣制备。例如,本发明的化合物可以配制在透皮或皮下给药装置中。当化合物的缓释是必要的且当患者顺应治疗方案是重要的时候,这些给药系统是有利的。在透皮给药系统中的化合物常常贴附至皮肤胶粘性固体支撑体。关注的化合物也可以与渗透增强剂例如Azone(1-十二烷基氮杂-环庚-2-酮)混合。缓释递送体系通过手术或注射从皮下插入真皮层中。真皮植入物包封在液体可溶性膜例如硅橡胶或生物可降解的聚合物如聚乳酸中的化合物。
与药用载体、稀释剂和赋形剂一起的合适制剂描述于Remington:TheScience and Practice of Pharmacy1995,E.W.Martin编辑,Mack PublishingCompany,第19版,Easton,Pennsylvania中。制剂领域的科学家可以在本说明书教导范围内调节制剂,得到用于特定给药途径的大量制剂,而不造成本发明组合物不稳定或损害它们的治疗活性。
调节本发明化合物使它们更溶于水或其他媒介物中,例如,可以更容易地通过微小调节(盐制剂,酯化,等)来实现,其为本领域技术人员公知的。本领域技术人员也公知的是调节给药途径和特定化合物的剂量方案使得管理本发明化合物的药代动力学以实现患者中的最大有益效用。
本申请所使用的术语"治疗有效量"表示降低个体疾病症状所需的量。该剂量可以在各特定情况中调节成单个需求。取决于多种因素如待治疗疾病的严重性、患者的年龄和一般健康状况、其他用于治疗患者的药物、给药途径和形式以及相关的医学执业者的偏好和经验,剂量可以在宽的范围内变化。对于口服给药,约0.01~约1000mg/kg体重/天的每日剂量应当在单治疗和/或在组合治疗中是合适的。优选的每日剂量为约0.1~约500mg/kg体重/天,更优选0.1~约100mg/kg体重/天且最优选1.0~约10mg/kg体重/天。因此,对于向70kg人给药,剂量范围为约7mg~0.7g/天。每日剂量可以作为单个剂量或分开剂量给药,典型地为每天1~5个剂量。一般而言,治疗以比化合物的最优剂量更小的剂量开始。然后,该剂量逐渐小量增加,直到实现单个患者的最优作用。本申请描述的在治疗疾病的普通技术人员,无需过度实验且根据个人知识、经验和本申请的公开即可能够确定对于给定疾病和患者的本发明化合物的治疗有效量。
药用制剂优选为单位剂型。在这种剂型中,制剂细分为含有合适量的活性成分的单位剂量。单位剂型可以为包装制剂,该包装含有离散量的制剂,如包装的片剂、胶囊和在小瓶或安瓿中的粉末剂。同样地,单位剂型可以为胶囊、片剂、扁囊剂或锭剂本身,或其可以为合适数量的这些包装形式中的任一种。
适应症和治疗方法
本申请提供治疗炎性病症或自身免疫性病症的方法,包括向有此需要的患者给予治疗有效量的式I化合物。
本申请提供上述方法,进一步包括给予选自以下的额外治疗剂:化学治疗或抗增殖剂、抗炎剂、免疫调节或免疫抑制剂、神经营养因子、心血管疾病的治疗剂、糖尿病的治疗剂或免疫缺陷疾病的治疗剂。
本申请提供治疗类风湿性关节炎的方法,包括向有此需要的患者给予治疗有效量的式I化合物。
本申请提供治疗哮喘的方法,包括向有此需要的患者给予治疗有效量的式I化合物。
本申请提供治疗炎性病症的方法,包括向有此需要的患者给予治疗有效量的式I化合物。
本申请提供抑制T-细胞增殖性疾病的方法,包括向有此需要的患者给予治疗有效量的式I化合物。
本申请提供抑制T-细胞增殖性疾病的方法,包括向有此需要的患者给予治疗有效量的式I化合物。
本申请提供上述方法,其中所述增殖性疾病为癌症。
本申请提供治疗B-细胞增殖性疾病的方法,包括向有此需要的患者给予治疗有效量的式I化合物。
本申请提供治疗免疫性疾病的方法,包括向有此需要的患者给予治疗有效量的式I化合物,所述免疫性疾病包括狼疮、多发性硬化、类风湿性关节炎、银屑病、I型糖尿病、来自器官移植物的并发症、异种移植、糖尿病、癌症、哮喘、特应性皮炎、自身免疫性甲状腺疾病、溃疡性结肠炎、克罗恩病、阿尔茨海默病和白血病。
本申请提供预防或治疗各种形式的器官排斥反应的方法,包括向有此需要的患者给予式I化合物,所述器官排斥反应包括带血管或非带血管的移植物的急性同种异体移植物或异种移植排斥反应和慢性同种异体移植物或异种移植排斥反应。
本申请提供抑制JAK3活性的方法,包括给予式I化合物,其中所述化合物在JAK3活性的体外生化测定中显示50微摩尔或更小的IC50
本申请提供上述方法,其中所述化合物在JAK3活性的体外生化测定中显示100纳摩尔或更小的IC50
本申请提供上述方法,其中所述化合物在JAK3活性的体外生化测定中显示10纳摩尔或更小的IC50
抑制SYK活性的方法,包括给予式I化合物,其中所述化合物在SYK活性的体外生化测定中显示50微摩尔或更小的IC50
本申请提供上述方法,其中所述化合物在SYK活性的体外生化测定中显示100纳摩尔或更小的IC50
本申请提供上述方法,其中所述化合物在SYK活性的体外生化测定中显示100纳摩尔或更小的IC50
本申请提供治疗炎性病症的方法,包括向有此需要的患者共同给予治疗有效量的抗炎化合物与式I化合物的组合。
本申请提供治疗炎性疾病的方法,包括向有此需要的患者共同给予治疗有效量的免疫抑制化合物与式I化合物的组合。
具体实施方式实施例
以下实施例示例说明在本发明范围内的化合物的制备以及生物学评价。一般而言,在本节所用的命名基于AUTONOMTM v.4.0,如上文所述的,或者,可选择地,基于ChemDraw。提供了这些实施例和随后的制备以使本领域技术人员更清楚地理解并实践本发明。它们不应当被认为限制本发明的范围,而仅是本发明的示例以及代表。
缩写
通常使用的缩写包括:乙酰基(Ac),偶氮-二-异丁腈(AIBN),大气压(Atm),9-硼杂二环[3.3.1]壬烷(9-BBN或BBN),叔丁氧基羰基(Boc),焦炭酸二-叔丁酯或boc酸酐(BOC2O),苄基(Bn),丁基(Bu),化学文摘登记号(ChemicalAbstracts Registration Number,CASRN),苄基氧基羰基(CBZ或Z),羰基二咪唑(CDI),1,4-二氮杂二环[2.2.2]辛烷(DABCO),二乙基氨基三氟化硫(DAST),二亚苄基丙酮(dba),1,5-二氮杂二环[4.3.0]壬-5-烯(DBN),1,8-二氮杂二环[5.4.0]十一碳-7-烯(DBU),N,N'-二环己基碳二亚胺(DCC),1,2-二氯乙烷(DCE),二氯甲烷(DCM),偶氮二羧酸二乙酯(DEAD),偶氮二羧酸二-异丙酯(DIAD),二-异丁基氢化铝(DIBAL或DIBAL-H),二异丙基乙基胺(DIPEA),N,N-二甲基乙酰胺(DMA),4-N,N-二甲基氨基吡啶(DMAP),N,N-二甲基甲酰胺(DMF),二甲基亚砜(DMSO),1,1'-二-(二苯基膦基)乙烷(dppe),1,1'-二-(二苯基膦基)二茂铁(dppf),1-(3-二甲基氨基丙基)-3-乙基碳二亚胺盐酸盐(EDCI),乙基(Et),乙酸乙酯(EtOAc),乙醇(EtOH),2-乙氧基-2H-喹啉-1-羧酸乙酯(EEDQ),乙醚(Et2O),O-(7-氮杂苯并三唑-1-基)-N,N,N’N’-四甲基脲鎓六氟磷酸盐乙酸盐(HATU),乙酸(HOAc),1-N-羟基苯并三唑(HOBt),高效液相色谱(HPLC),异丙醇(IPA),六甲基二硅氮烷锂(LiHMDS),甲醇(MeOH),熔点(mp或MP),MeSO2-(甲磺酰基或Ms),甲基(Me),乙腈(MeCN),间氯过苯甲酸(MCPBA),质谱(ms或MS),甲基叔丁基醚(MTBE),N-溴琥珀酰亚胺(NBS),N-羧酸酐(NCA),N-氯琥珀酰亚胺(NCS),N-甲基吗啉(NMM),N-甲基吡咯烷酮(NMP),氯铬酸吡啶(PCC),重铬酸吡啶(PDC),苯基(Ph),丙基(Pr),异丙基(i-Pr),磅每平方英尺(psi),吡啶(pyr),室温(rt或RT),2-(三甲基甲硅烷基)乙氧基甲基氯(SEMCl),叔丁基二甲基甲硅烷基或t-BuMe2Si(TBDMS),三乙胺(TEA或Et3N),2,2,6,6-四甲基哌啶1-氧基(TEMPO),三氟甲磺酸酯或CF3SO2-(Tf),三氟乙酸(TFA),1,1'-二-2,2,6,6-四甲基庚烷-2,6-二酮(TMHD),O-苯并三唑-1-基-N,N,N',N'-四甲基脲鎓四氟硼酸盐(TBTU),薄层色谱(TLC),四氢呋喃(THF),三甲基甲硅烷基或Me3Si(TMS),对甲苯磺酸一水合物(TsOH或pTsOH),4-Me-C6H4SO2-或甲苯磺酰基(Ts),N-氨基甲酸乙酯-N-羧酸酐(UNCA)。常规的命名,包括前缀正(n)、异(i-)、仲(sec-)、叔(tert-)和新(neo)具有它们在烷基部分中使用的惯常含义。(J.Rigaudy and D.P.Klesney,Nomenclature in Organic Chemistry,IUPAC1979Pergamon Press,Oxford.).
制备实施例
实施例1.
2-(1-甲基-1H-吲唑-3-基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-羧酸[(R)-2-(4-氰基-哌啶-1-基)-1-环丙基-2-氧代-乙基]-酰胺
步骤1
3-碘-1H-吲唑
在50mL圆底烧瓶中,将吲唑(0.80g,6.8mmol)溶解在DMF(14mL)中。添加碘(3.4g,13.5mmol),接着添加氢氧化钾(1.47g,26.2mmol)。将深色的反应混合物在室温搅拌1.25小时,然后以10%NaHSO3水溶液淬灭,并以乙醚(2x)萃取。将合并的有机层以水和盐水洗涤,然后经硫酸钠干燥,过滤并浓缩得到1.65g(95%)的3-碘-1H-吲唑,为浅黄色固体。1H NMR(CDCl3,300MHz):δ(ppm)10.56(宽单峰,1H),7.47-7.57(m,3H),7.23-7.30(m,1H)。
步骤2
3-碘-1-甲基-1H-吲唑
在50mL圆底烧瓶中,将3-碘-1H-吲唑(1.0g,3.9mmol)溶解在THF(12ml)中并将溶液冷却至0℃。添加叔丁醇钾(612mg,5.45mmol)并在0℃搅拌反应混合物1.25小时。滴加甲基碘(0.29ml,4.64mmol),然后移去冰浴,并且将反应混合物在室温搅拌2小时。用水淬灭反应混合物,并用EtOAc(2x)萃取。将合并的有机层以水和盐水洗涤,然后经硫酸钠干燥,过滤并浓缩。将残余物经硅胶色谱以EtOAc/己烷(梯度0-10%EtOAc)纯化得到863mg(86%)的3-碘-1-甲基-1H-吲唑,为黄色油状物。1H NMR(CDCl3,300MHz):δ(ppm)7.42-7.53(m,2H),7.33-7.40(m,1H),7.22(ddd,J=8.0,6.9,0.9Hz,1H),4.11(s,3H).
步骤3
1-甲基-3-三丁基甲锡烷基-1H-吲唑
将3-碘-1-甲基-1H-吲唑(0.15g,0.58mmol)溶解于THF(3ml)并使用NaCl/冰浴将溶液冷却至-16℃。滴加异丙基氯化镁(2.0M在THF中,0.32ml,0.64mmol),并且在-16℃搅拌反应混合物15分钟。缓慢添加三丁基氯甲锡烷(0.18ml,0.66mmol),并经1.5小时让反应混合物温热至室温。将反应混合物以NH4Cl饱和溶液淬灭,并用EtOAc(2x)萃取。将合并的有机层以水和盐水洗涤,然后经硫酸钠干燥,过滤并浓缩。将残余物通过硅胶色谱以EtOAc/己烷(0.5%三乙胺,梯度0-5%EtOAc)纯化得到224mg(92%)的1-甲基-3-三丁基甲锡烷基-1H-吲唑,为无色油状物。1H NMR(CDCl3,300MHz):δ(ppm)7.70(d,J=8.3Hz,1H),7.32-7.45(m,2H),7.11(ddd,J=8.0,6.3,1.5Hz,1H),1.52-1.69(m,6H),1.19-1.44(m,12H),0.83-0.95(m,9H).
步骤4
[(R)-2-(4-氰基哌啶-1-基)-1-环丙基-2-氧代-乙基]-氨基甲酸叔丁酯
在圆底烧瓶中,将Boc-D-环丙基甘油(1.80g,8.36mmol)和哌啶-4-甲腈(1.2g,10.9mmol)溶解于DMF(30ml)。添加HATU(3.5g,9.2mmol)和N,N-二异丙基乙胺(2.3ml,13.2mmol)并且将黄色溶液在室温搅拌过夜。将反应混合物以水淬灭并用乙醚(2x)萃取。将合并的有机层以水洗涤两次并以盐水洗涤一次,然后经硫酸钠干燥,过滤并浓缩得到2.72g(95%)的[(R)-2-(4-氰基哌啶-1-基)-1-环丙基-2-氧代-乙基]-氨基甲酸叔丁酯,为浅黄色油状物,其不经进一步纯化即可使用。
步骤5
1-((R)-2-氨基-2-环丙基-乙酰基)-哌啶-4-甲腈三氟乙酸盐
在圆底烧瓶中,将[(R)-2-(4-氰基哌啶-1-基)-1-环丙基-2-氧代-乙基]-氨基甲酸叔丁酯(2.71g,7.93mmol)溶解于二氯甲烷(50ml)。将溶液冷却至0℃,并缓慢添加三氟乙酸(18ml,234mmol)。在完成添加后,移去冰浴并且将反应混合物在室温搅拌2小时。浓缩反应混合物得到1-((R)-2-氨基-2-环丙基-乙酰基)-哌啶-4-甲腈三氟乙酸盐,为黄色油状物,其不经进一步纯化即可使用。
步骤6
2-溴-5-(2-三甲基甲硅烷基-乙氧基甲基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-羧酸[(R)-2-(4-氰基-哌啶-1-基)-1-环丙基-2-氧代-乙基]-酰胺
在圆底烧瓶中,将1-((R)-2-氨基-2-环丙基-乙酰基)-哌啶-4-甲腈三氟乙酸盐(5.19g,7.27mmol)溶解于DMF(25ml),并添加N,N-二异丙基乙胺(8.5ml,48.7mmol)。然后添加2-溴-5-((2-(三甲基甲硅烷基)乙氧基)甲基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-羧酸(2.20g,5.91mmol)(约2:1Br:Cl)和HATU(2.47g,6.5mmol),并且将反应混合物在室温搅拌过夜。将反应混合物以水淬灭并用乙醚(2x)萃取。将合并的有机层以水洗涤两次并以盐水洗涤一次,然后经硫酸钠干燥,过滤并浓缩。将残余物通过硅胶色谱以EtOAc/己烷(梯度0-80%EtOAc)纯化得到3.0g的灰白色泡沫。SFC色谱(Chiralpak IA-H2x25柱,40%MeOH)得到1.71g(52%)的2-溴-5-(2-三甲基甲硅烷基-乙氧基甲基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-羧酸[(R)-2-(4-氰基-哌啶-1-基)-1-环丙基-2-氧代-乙基]-酰胺,为白色泡沫,和779mg(26%)2-氯-5-(2-三甲基甲硅烷基-乙氧基甲基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-羧酸[(R)-2-(4-氰基-哌啶-1-基)-1-环丙基-2-氧代-乙基]-酰胺,为灰白色泡沫。
步骤7
2-(1-甲基-1H-吲唑-3-基)-5-(2-三甲基甲硅烷基-乙氧基甲基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-羧酸[(R)-2-(4-氰基-哌啶-1-基)-1-环丙基-2-氧代-乙基]-酰胺
在干燥的圆底烧瓶中,将2-溴-5-(2-三甲基甲硅烷基-乙氧基甲基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-羧酸[(R)-2-(4-氰基-哌啶-1-基)-1-环丙基-2-氧代-乙基]-酰胺(0.12g,o.21mmol)和1-甲基-3-三丁基甲锡烷基-1H-吲唑(117mg,0.28mmol)溶解于DMF(2ml)中。将反应混合物抽真空并回填以氩气,然后添加四(三苯基膦)钯(0)(13mg,0.011mmol)和碘化亚铜(I)(9mg,0.047mmol)。在80℃搅拌反应混合物1.5小时,然后冷却至室温,以水淬灭并用乙醚(2x)萃取。将合并的有机层以水和盐水洗涤两次,然后经硫酸钠干燥,过滤并浓缩。将残余物通过硅胶色谱以MeOH/CH2Cl2(0.5%NH4OH)(梯度0-3%MeOH)纯化得到161mg的2-(1-甲基-1H-吲唑-3-基)-5-(2-三甲基甲硅烷基-乙氧基甲基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-羧酸[(R)-2-(4-氰基-哌啶-1-基)-1-环丙基-2-氧代-乙基]-酰胺,为黄色油状物。
步骤8
2-(1-甲基-1H-吲唑-3-基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-羧酸[(R)-2-(4-氰基-哌啶-1-基)-1-环丙基-2-氧代-乙基]-酰胺
在圆底烧瓶中,将2-(1-甲基-1H-吲唑-3-基)-5-(2-三甲基甲硅烷基-乙氧基甲基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-羧酸[(R)-2-(4-氰基-哌啶-1-基)-1-环丙基-2-氧代-乙基]-酰胺(0.158g,0.193mmol)溶解于二氯甲烷(1ml)中并添加三氟乙酸(0.6ml,7.8mmol)。将反应混合物在室温搅拌2小时,然后浓缩。将残余物再溶解于二氯甲烷(1ml)并添加乙二胺(0.8ml,11.7mmol)。将溶液在室温搅拌1小时,然后以水淬灭,并以EtOAc(2x)萃取。将合并的有机层以水和盐水洗涤,然后经硫酸钠干燥,过滤并浓缩。将残余物通过硅胶色谱以MeOH/CH2Cl2(0.5%NH4OH)(梯度0-4%MeOH)纯化,接着以乙酸乙酯研磨得到31mg(32%)的2-(1-甲基-1H-吲唑-3-基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-羧酸[(R)-2-(4-氰基-哌啶-1-基)-1-环丙基-2-氧代-乙基]-酰胺,为浅黄色粉末。MS:(M+H)+=483;1H NMR(DMSO-d6,300MHz):δ(ppm)12.89(宽单峰,1H),9.17(s,1H),8.79(d,J=7.9Hz,1H),8.65(d,J=8.3Hz,1H),8.45(d,J=9.4Hz,1H),7.75(d,J=8.3Hz,1H),7.50(t,J=7.6Hz,1H),7.13-7.33(m,1H),4.88(t,J=7.9Hz,1H),4.19(s,3H),3.68-4.05(m,2H),3.34-3.66(m,2H),3.14(宽单峰,1H),1.47-2.07(m,4H),1.34(宽单峰,1H),0.37-0.65(m,4H).
实施例2.
2-(6-氯-1-甲基-1H-吲唑-3-基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-羧酸[(R)-2-(4-氰基-哌啶-1-基)-1-环丙基-2-氧代-乙基]-酰胺
根据在实施例1中阐述的操作,以6-氯-1H-吲唑替代步骤1中的吲唑。MS:(M+H)+=517;1H NMR(DMSO-d6,300MHz):δ(ppm)12.93(s,1H),9.15(s,1H),8.83(dd,J=8.5,2.8Hz,1H),8.59(d,J=8.3Hz,1H),8.46(d,J=7.9Hz,1H),7.97(d,J=1.5Hz,1H),7.23(t,J=7.0Hz,1H),4.86-4.99(m,1H),4.17(s,3H),3.67-4.04(m,2H),3.06-3.67(m,3H),1.49-2.08(m,4H),1.31(宽单峰,1H),0.28-0.61(m,4H).
实施例3.
2-(5-氯-1-甲基-1H-吲唑-3-基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-羧酸[(R)-2-(4-氰基-哌啶-1-基)-1-环丙基-2-氧代-乙基]-酰胺
根据在实施例1中阐述的操作,以5-氯-1H-吲唑替代步骤1中的吲唑。MS:(M+H)+=517;1H NMR(DMSO-d6,300MHz):δ(ppm)12.91(s,1H),9.16(s,1H),8.70(宽单峰,2H),8.46(d,J=9.4Hz,1H),7.83(d,J=8.9Hz,1H),7.51(dd,J=8.9,1.5Hz,1H),4.88(t,J=7.7Hz,1H),4.20(s,3H),3.07-3.98(m,5H),1.33-2.12(m,5H),0.38-0.65(m,4H).
实施例4.
2-(6-氯-1-甲基-1H-吲唑-3-基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-羧酸[(R)-2-(3-氰基-氮杂环丁烷-1-基)-1-甲基-2-氧代-乙基]-酰胺
步骤1
6-氯-3-碘-1H-吲唑
在圆底烧瓶中,将6-氯-1H-吲唑(90mg,0.59mmol)溶解于DMF(1.4mL)中。添加碘(300mg,1.18mmol)并接着添加氢氧化钾(128mg,2.28mmol)。将深色反应混合物在室温搅拌3小时,然后以10%NaHSO3水溶液淬灭并用乙醚(2x)萃取。将合并的有机层以水和盐水洗涤,然后经硫酸钠干燥,过滤并浓缩得到169mg(98%)的6-氯-3-碘-1H-吲唑,为橙色固体。
步骤2
6-氯-3-碘-1-甲基-1H-吲唑
在圆底烧瓶中,将6-氯-3-碘-1H-吲唑(167mg,0.57mmol)溶解于THF(2ml)中并将溶液冷却至0℃。添加叔丁醇钾(90mg,0.80mmol),并在0℃搅拌反应混合物1.25小时。滴加甲基碘(0.045ml,0.72mmol),然后移去冰浴,将反应混合物在室温搅拌2小时。将反应混合物以水淬灭并以EtOAc(2x)萃取。将合并的有机层以水和盐水洗涤,然后经硫酸钠干燥,过滤并浓缩。将残余物通过硅胶色谱以EtOAc/己烷(梯度0-5%EtOAc)纯化得到110mg(63%)的6-氯-3-碘-1-甲基-1H-吲唑,为黄色固体。
步骤3
6-氯-1-甲基-3-三丁基甲锡烷基-1H-吲唑
将6-氯-3-碘-1-甲基-1H-吲唑(108mg,0.35mmol)溶解于THF(2ml)中并使用NaCl/冰浴将溶液冷却至-16℃。滴加异丙基氯化镁(2.0M在THF中,0.20ml,0.40mmol),并在-16℃搅拌反应混合物15分钟。缓慢添加三丁基氯甲锡烷(0.11ml,0.40mmol),经1.5小时让反应混合物温热至室温。将反应混合物以NH4Cl饱和溶液淬灭并以EtOAc(2x)萃取。将合并的有机层以水和盐水洗涤,然后经硫酸钠干燥,过滤并浓缩得到6-氯-1-甲基-3-三丁基甲锡烷基-1H-吲唑,为棕色油状物,其不经进一步纯化即可使用。
步骤4
[(R)-2-(3-氰基氮杂环丁烷-1-基)-1-甲基-2-氧代-乙基]-氨基甲酸叔丁酯
在圆底烧瓶中混合Boc-D-丙氨酸(500mg,2.64mmol)、氮杂环丁烷-3-甲腈盐酸盐(376mg,3.17mmol)、HOBT(445mg,2.91mmol)和HATU(1.11g,2.91mmol)。然后添加DMF(5mL),接着添加N,N-二异丙基乙胺(1.38mL,7.93mmol)。将黄色反应混合物在室温搅拌3小时,然后以水淬灭并以EtOAc(3x)萃取。将合并的有机物以水(3x)洗涤,经MgSO4干燥并浓缩。将残余物通过SiO2色谱(50%至100%EtOAc/己烷)纯化得到493mg(74%)的[(R)-2-(3-氰基氮杂环丁烷-1-基)-1-甲基-2-氧代-乙基]-氨基甲酸叔丁酯,为白色固体。
步骤5
1-((R)-2-氨基-丙酰基)-氮杂环丁烷-3-甲腈三氟乙酸盐
向[(R)-2-(3-氰基氮杂环丁烷-1-基)-1-甲基-2-氧代-乙基]-氨基甲酸叔丁酯(860mg,3.4mmol)在CH2Cl2(20mL)的溶液中添加三氟乙酸(4.0mL)。将反应混合物在室温搅拌2小时,然后浓缩得到1-((R)-2-氨基-丙酰基)-氮杂环丁烷-3-甲腈三氟乙酸盐,为淡黄色油状物,其不经进一步纯化即可使用。
步骤6
2-溴-5-(2-三甲基甲硅烷基-乙氧基甲基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-羧酸[(R)-2-(3-氰基-氮杂环丁烷-1-基)-1-甲基-2-氧代-乙基]-酰胺
在圆底烧瓶中混合2-溴-5-((2-(三甲基甲硅烷基)乙氧基)甲基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-羧酸(1.05g,2.82mmol)(约3:1Br:Cl)、1-((R)-2-氨基-丙酰基)-氮杂环丁烷-3-甲腈三氟乙酸盐(900mg,3.37mmol)和HATU(1.18g,3.1mmol)。然后添加DMF(10mL),接着添加N,N-二异丙基乙胺(1.48mL,8.46mmol)。将黄色反应混合物在室温搅拌过夜,然后以水淬灭并以EtOAc(3x)萃取。将合并的有机物以水(3x)洗涤,经MgSO4干燥并浓缩。将残余物通过SiO2色谱(30%至100%EtOAc/己烷)纯化得到1.19g(83%)的2-溴-5-(2-三甲基甲硅烷基-乙氧基甲基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-羧酸[(R)-2-(3-氰基-氮杂环丁烷-1-基)-1-甲基-2-氧代-乙基]-酰胺,为白色泡沫状固体(Br和Cl化合物的约3:1的混合物)。
步骤7
2-(6-氯-1-甲基-1H-吲唑-3-基)-5-(2-三甲基甲硅烷基-乙氧基甲基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-羧酸[(R)-2-(3-氰基-氮杂环丁烷-1-基)-1-甲基-2-氧代-乙基]-酰胺
在圆底烧瓶中,将2-溴-5-(2-三甲基甲硅烷基-乙氧基甲基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-羧酸[(R)-2-(3-氰基-氮杂环丁烷-1-基)-1-甲基-2-氧代-乙基]-酰胺(0.135g,0.27mmol)和6-氯-1-甲基-3-三丁基甲锡烷基-1H-吲唑(来自步骤3的粗产物,342mg,0.38mmol)溶解于DMF(2.4ml)。将烧瓶抽真空并回填以氩气,然后添加四(三苯基膦)钯(0)(16mg,0.014mmol)和碘化亚铜(I)(11mg,0.058mmol)。在90℃在油浴中搅拌反应混合物3小时。将反应混合物冷却至室温,以水淬灭并用乙醚(2x)萃取。将合并的有机层以水洗涤两次并以盐水洗涤一次,然后经硫酸钠干燥,过滤并浓缩。将残余物吸收在硅胶上,并通过色谱MeOH/CH2Cl2/0.5%NH4OH(梯度0-2.5%MeOH)纯化得到157mg(90%)的2-(6-氯-1-甲基-1H-吲唑-3-基)-5-(2-三甲基甲硅烷基-乙氧基甲基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-羧酸[(R)-2-(3-氰基-氮杂环丁烷-1-基)-1-甲基-2-氧代-乙基]-酰胺,为浅黄色固体。
步骤8
2-(6-氯-1-甲基-1H-吲唑-3-基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-羧酸[(R)-2-(3-氰基-氮杂环丁烷-1-基)-1-甲基-2-氧代-乙基]-酰胺
在圆底烧瓶中,将2-(6-氯-1-甲基-1H-吲唑-3-基)-5-(2-三甲基甲硅烷基-乙氧基甲基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-羧酸[(R)-2-(3-氰基-氮杂环丁烷-1-基)-1-甲基-2-氧代-乙基]-酰胺(154mg,0.23mmol)溶解于二氯甲烷(1.2ml)中并添加三氟乙酸(0.72ml,9.35mmol)。将橙色反应混合物在室温搅拌2小时,然后浓缩。将残余物再溶解于二氯甲烷(1.2ml)并添加乙二胺(1.0ml,14.8mmol)。将溶液在室温搅拌1.5小时,然后以水淬灭并用乙酸乙酯稀释。将所得悬浮液经过滤,以水(热)、乙酸乙酯和二氯甲烷洗涤,然后高真空干燥得到37mg(33%)的2-(6-氯-1-甲基-1H-吲唑-3-基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-羧酸[(R)-2-(3-氰基-氮杂环丁烷-1-基)-1-甲基-2-氧代-乙基]-酰胺,为白色粉末。MS:(M+H)+=463;1HNMR(DMSO-d6,300MHz):δ(ppm)12.70(宽单峰,1H),9.15(s,1H),8.73(d,J=8.7Hz,1H),8.47(t,J=7.4Hz,2H),7.98(s,1H),7.27(d,J=8.7Hz,1H),4.47-4.84(m,3H),4.18(s,3H),4.02-4.32(m,2H),3.86(宽单峰,1H),1.42(d,J=4.5Hz,3H).
实施例5.
2-(5-氯-1-甲基-1H-吲唑-3-基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-羧酸[(R)-2-(3-氰基-氮杂环丁烷-1-基)-1-甲基-2-氧代-乙基]-酰胺
根据在实施例4中阐述的操作制备,以5-氯-1H-吲唑替代步骤1中6-氯-1H-吲唑。MS:(M+H)+=463;1H NMR(DMSO-d6,300MHz):δ(ppm)11.73(宽单峰,1H),9.13(s,1H),8.36-8.59(m,3H),7.83(d,J=9.1Hz,1H),7.52(d,J=8.7Hz,1H),4.45-4.77(m,3H),4.20(s,3H),3.95-4.34(m,2H),3.74-3.92(m,1H),1.50(t,J=6.0Hz,3H)。
实施例6.
2-(5,6-二氯-1-甲基-1H-吲唑-3-基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-羧酸[(R)-2-(3-氰基-氮杂环丁烷-1-基)-1-甲基-2-氧代-乙基]-酰胺
根据在实施例5中阐述的操作制备,以5,6-二氯-1H-吲唑替代步骤1中的6-氯-1H-吲唑。MS:(M+H)+=497;1H NMR(DMSO-d6,300MHz):δ(ppm)12.82(宽单峰,1H),9.11(s,1H),8.71(s,1H),8.47(t,J=8.3Hz,2H),8.24(s,1H),4.47-4.79(m,3H),4.18(s,3H),3.97-4.27(m,2H),3.77-3.93(m,1H),1.48(t,J=6.4Hz,3H).
实施例7.
2-(1-甲基-1H-吲唑-3-基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-羧酸[(R)-2-(3-氰基-氮杂环丁烷-1-基)-1-甲基-2-氧代-乙基]-酰胺
根据在实施例5中阐述的操作制备,以吲唑替代步骤1中的6-氯-1H-吲唑。MS:(M+H)+=429;1H NMR(DMSO-d6,300MHz):δ(ppm)12.80(宽单峰,1H),9.16(s,1H),8.69(d,J=7.9Hz,1H),8.51(d,J=7.9Hz,1H),8.47(d,J=8.7Hz,1H),7.76(d,J=8.7Hz,1H),7.52(t,J=7.6Hz,1H),7.23-7.38(m,1H),4.49-4.80(m,3H),4.14-4.28(m,1H),4.14-4.28(m,1H),4.21(s,3H),4.03-4.13(m,1H),3.75-3.95(m,1H),1.43(dd,J=6.6,4.3Hz,3H).
实施例8.
2-(5-氯-1-甲基-1H-吲唑-3-基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-羧酸[(R)-1-(4-氰基-哌啶-1-羰基)-2,2-二甲基-丙基]-酰胺
步骤1
[(R)-1-(4-氰基-哌啶-1-羰基)-2,2-二甲基-丙基]-氨基甲酸叔丁酯
向圆底烧瓶中装入Boc-D-叔亮氨酸(2.5g,10.8mmol)、HOBT(4.2g,24.9mmol)、EDC(4.77g,24.9mmol)和哌啶-4-甲腈(2.98g,27.0mmol)。然后添加DMF(50mL),接着添加N,N-二异丙基乙胺(10.7ml,61.6mmol)。将黄色反应混合物在室温搅拌过夜,然后以10%柠檬酸淬灭并以EtOAc(2x)萃取。将合并的有机层以10%柠檬酸洗涤两次,以LiCl饱和溶液洗涤两次,并以盐水洗涤一次,然后经MgSO4干燥,过滤并浓缩得到3.4g(97%)的[(R)-1-(4-氰基-哌啶-1-羰基)-2,2-二甲基-丙基]-氨基甲酸叔丁酯,为米色泡沫状固体。
步骤2
1-((R)-2-氨基-3,3-二甲基-丁酰基)-哌啶-4-甲腈三氟乙酸盐
向[(R)-1-(4-氰基-哌啶-1-羰基)-2,2-二甲基-丙基]-氨基甲酸叔丁酯(3.4g,10.5mmol)在CH2Cl2(60mL)的溶液中添加三氟乙酸(20mL)。将反应混合物在室温搅拌过夜,然后浓缩得到1-((R)-2-氨基-3,3-二甲基-丁酰基)-哌啶-4-甲腈三氟乙酸盐,为浅棕色油状物,其不经进一步纯化即可使用。
步骤3
2-溴-5-(2-三甲基甲硅烷基-乙氧基甲基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-羧酸[(R)-1-(4-氰基-哌啶-1-羰基)-2,2-二甲基-丙基]-酰胺
在烧瓶中混合2-溴-5-(2-三甲基甲硅烷基乙氧基甲基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-羧酸(1.6g,4.3mmol)、1-((R)-2-氨基-3,3-二甲基-丁酰基)-哌啶-4-甲腈三氟乙酸盐(来自步骤2的粗产物)、EDC(1.89g,9.9mmol)和HOBt(1.67g,9.9mmol)。添加DMF(40mL),接着添加i-Pr2NEt(5.2mL,30.1mmol)。将反应混合物在室温搅拌过夜,然后浓缩。将残余物吸收在EtOAc和10%柠檬酸中并将有机层以10%柠檬酸、NaHCO3饱和溶液、LiCl饱和溶液和盐水洗涤,经MgSO4干燥并浓缩。将残余物经硅胶色谱(40%-100%EtOAc/己烷)纯化,得到1.46g(59%)的2-溴-5-(2-三甲基甲硅烷基-乙氧基甲基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-羧酸[(R)-1-(4-氰基-哌啶-1-羰基)-2,2-二甲基-丙基]-酰胺,为米色泡沫状固体。
步骤4
2-(5-氯-1-甲基-1H-吲唑-3-基)-5-(2-三甲基甲硅烷基-乙氧基甲基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-羧酸[(R)-1-(4-氰基-哌啶-1-羰基)-2,2-二甲基-丙基]-酰胺
在圆底烧瓶中,将2-溴-5-(2-三甲基甲硅烷基-乙氧基甲基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-羧酸[(R)-1-(4-氰基-哌啶-1-羰基)-2,2-二甲基-丙基]-酰胺(150mg,0.26mmol)和5-氯-1-甲基-3-三丁基甲锡烷基-1H-吲唑(372mg,0.45mmol)溶解于DMF(2.4ml)中。将烧瓶抽真空并回填以氩气,然后添加四(三苯基膦)钯(0)(15mg,0.013mmol)和碘化亚铜(I)(10mg,0.053mmol)。在90℃在油浴中搅拌反应混合物3.5小时,然后冷却至室温,以水淬灭并用乙醚(2x)萃取。将合并的有机层以水洗涤两次并以盐水洗涤一次,然后经硫酸钠干燥,过滤并浓缩。将残余物通过硅胶色谱以MeOH/CH2Cl2/0.5%NH4OH(梯度0-2%MeOH)纯化,分离出137mg(80%)的2-(5-氯-1-甲基-1H-吲唑-3-基)-5-(2-三甲基甲硅烷基-乙氧基甲基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-羧酸[(R)-1-(4-氰基-哌啶-1-羰基)-2,2-二甲基-丙基]-酰胺,为黄色油状物。
步骤5
2-(5-氯-1-甲基-1H-吲唑-3-基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-羧酸[(R)-1-(4-氰基-哌啶-1-羰基)-2,2-二甲基-丙基]-酰胺
在圆底烧瓶中,将2-(5-氯-1-甲基-1H-吲唑-3-基)-5-(2-三甲基甲硅烷基-乙氧基甲基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-羧酸[(R)-1-(4-氰基-哌啶-1-羰基)-2,2-二甲基-丙基]-酰胺(0.158g,0.193mmol)溶解于二氯甲烷(1ml)中,并添加三氟乙酸(0.6ml,7.8mmol)。将反应混合物在室温搅拌2小时,然后浓缩。将残余物再溶解于二氯甲烷(1ml),并添加乙二胺(0.8ml,11.7mmol)。将溶液在室温搅拌1小时,然后以水淬灭并以EtOAc(2x)萃取。将合并的有机层以水和盐水洗涤,然后经硫酸钠干燥,过滤并浓缩。将残余物通过硅胶色谱以EtOAc/己烷(梯度0-100%EtOAc)纯化得到26mg(24%)的2-(5-氯-1-甲基-1H-吲唑-3-基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-羧酸[(R)-1-(4-氰基-哌啶-1-羰基)-2,2-二甲基-丙基]-酰胺,为灰白色固体。MS:(M+H)+=533;1H NMR(DMSO-d6,300MHz):δ(ppm)12.92(宽单峰,1H),9.09(s,1H),8.73(d,J=6.8Hz,1H),8.61(t,J=8.1Hz,1H),8.46(d,J=9.1Hz,1H),7.80(d,J=9.1Hz,1H),7.50(d,J=9.1Hz,1H),5.20(d,J=9.4Hz,1H),4.19(s,3H),3.97-4.12(m,1H),3.35-3.91(m,2H),3.01-3.23(m,2H),1.39-2.07(m,4H),1.04(d,J=6.4Hz,9H).
实施例9.
2-(6-环丙基-1-甲基-1H-吲唑-3-基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-羧酸[(R)-2-(4-氰基-哌啶-1-基)-1-环丙基-2-氧代-乙基]-酰胺
步骤1
6-溴-1-(2-三甲基甲硅烷基-乙氧基甲基)-1H-吲唑
在圆底烧瓶中,将6-溴-1H-吲唑(0.70g,3.55mmol)溶解于DMF(7.5ml)中。将反应混合物冷却至0℃,并添加氢化钠(60%在矿物油中的分散液,172mg,4.3mmol)。让反应混合物温热至室温,并搅拌30分钟,然后冷却至0℃,缓慢添加SEM-Cl(0.76ml,4.28mmol)。在完成添加后,移去冰浴,让反应混合物温热至室温。在1.5小时后,将反应混合物以水淬灭并用乙醚(2x)萃取。将合并的有机层以水洗涤两次并以盐水洗涤一次,然后经硫酸钠干燥,过滤并浓缩。将残余物经硅胶色谱以EtOAc/己烷(梯度0-10%EtOAc)纯化得到802mg(69%)的6-溴-1-(2-三甲基甲硅烷基-乙氧基甲基)-1H-吲唑,为浅黄色油状物。
步骤2
6-环丙基-1-(2-三甲基甲硅烷基-乙氧基甲基)-1H-吲唑
向圆底烧瓶中装入6-溴-1-(2-三甲基甲硅烷基-乙氧基甲基)-1H-吲唑(0.80g,2.44mmol)、环丙基硼酸(377mg,4.39mmol)、乙酸钯(II)(28mg,0.125mmol)、磷酸钾(1.04g,4.88mmol)、甲苯(9ml)和水(0.9ml)。在100℃在油浴中搅拌反应混合物过夜,然后冷却至室温,以水淬灭并以EtOAc(2x)萃取。将合并的有机层以水和盐水洗涤,然后经硫酸钠干燥,过滤并浓缩。将残余物经硅胶色谱以EtOAc/己烷(梯度0-5%EtOAc)纯化得到670mg(90%)的6-环丙基-1-(2-三甲基甲硅烷基-乙氧基甲基)-1H-吲唑,为浅黄色油状物。
步骤3
6-环丙基-1H-吲唑
在圆底烧瓶中,将6-环丙基-1-(2-三甲基甲硅烷基-乙氧基甲基)-1H-吲唑(668mg,2.2mmol)溶解于二氯甲烷(12ml)中并添加三氟乙酸(6.5ml,84.4mmol)。将黄色反应混合物在室温搅拌2.25小时,然后浓缩。将残余物再溶解于二氯甲烷(12ml),并添加乙二胺(9.0ml,133mmol)。将溶液在室温搅拌1小时,然后以水淬灭并以EtOAc(2x)萃取。将合并的有机层以水和盐水洗涤,然后经硫酸钠干燥,过滤并浓缩。将残余物经硅胶色谱以EtOAc/己烷(梯度0-25%EtOAc)纯化得到317mg(91%)的6-环丙基-1H-吲唑,为浅黄色固体。1HNMR(CDCl3,300MHz):δ(ppm)7.99-8.08(m,1H),7.59-7.70(m,1H),7.16-7.25(m,1H),6.88-7.01(m,1H),1.94-2.14(m,1H),0.96-1.11(m,2H),0.71-0.84(m,2H).
步骤4
2-(6-环丙基-1-甲基-1H-吲唑-3-基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-羧酸[(R)-2-(4-氰基-哌啶-1-基)-1-环丙基-2-氧代-乙基]-酰胺
根据在实施例1中阐述的操作,以6-环丙基-1H-吲唑替代步骤1中的吲唑。MS:(M+H)+=523;1H NMR(DMSO-d6,300MHz):δ(ppm)12.88(宽单峰,1H),9.15(s,1H),8.63(t,J=8.7Hz,2H),8.44(d,J=9.4Hz,1H),7.37(s,1H),7.04(宽单峰,1H),4.74-4.95(m,1H),4.14(s,3H),3.35-4.06(m,4H),3.17(宽单峰,1H),2.13(宽单峰,1H),1.51-2.05(m,4H),1.35(宽单峰,1H),1.04(d,J=6.8Hz,2H),0.83(d,J=3.4Hz,2H),0.34-0.65(m,4H).
实施例10.
2-(1-甲基-4,5,6,7-四氢-1H-吲唑-3-基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-羧酸[(R)-2-(4-氰基-哌啶-1-基)-1-环丙基-2-氧代-乙基]-酰胺
根据在实施例1中阐述的操作,以4,5,6,7-四氢-1H-吲唑替代步骤1中的吲唑。MS:(M+H)+=487;1H NMR(DMSO-d6,400MHz):δ(ppm)12.76(s,1H),8.93(s,1H),8.58(d,J=8.1Hz,1H),8.36(d,J=15.2Hz,1H),4.66(t,J=8.1Hz,1H),3.78(s,3H),3.34-4.04(m,4H),2.84-3.18(m,3H),2.60-2.70(m,2H),1.44-1.97(m,8H),1.17-1.31(m,1H),0.29-0.66(m,4H).
实施例11.
2-(5-氯-1-甲基-1H-吲唑-3-基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-羧酸((S)-1,2,2-三甲基-丙基)-酰胺
步骤1
2-溴-5-(2-三甲基甲硅烷基-乙氧基甲基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-羧酸((S)-1,2,2-三甲基-丙基)-酰胺
向圆底烧瓶中装入2-溴-5-(2-三甲基甲硅烷基乙氧基甲基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-羧酸(150mg,0.40mmol)、HOBT(68mg,0.44mmol)和EDC(85mg,0.44mmol)。添加DMF(1.8ml),接着添加(S)-3,3-二甲基丁-2-胺(0.10ml,0.73mmol)和N,N-二异丙基乙胺(0.11ml,0.63mmol)。将反应混合物在室温搅拌过夜,然后以水淬灭并用乙醚(2x)萃取。将合并的有机层以水洗涤两次并以盐水洗涤一次,然后合并,经硫酸钠干燥,过滤并浓缩。将残余物经硅胶色谱以EtOAc/己烷(梯度0-20%EtOAc)纯化得到97mg(50%)的2-溴-5-(2-三甲基甲硅烷基-乙氧基甲基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-羧酸((S)-1,2,2-三甲基-丙基)-酰胺,为浅棕色油状物。
步骤2
2-(5-氯-1-甲基-1H-吲唑-3-基)-5-(2-三甲基甲硅烷基-乙氧基甲基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-羧酸((S)-1,2,2-三甲基-丙基)-酰胺
在圆底烧瓶中,将2-溴-5-(2-三甲基甲硅烷基-乙氧基甲基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-羧酸((S)-1,2,2-三甲基-丙基)-酰胺(94mg,0.21mmol)和5-氯-1-甲基-3-三丁基甲锡烷基-1H-吲唑(367mg,0.40mmol)溶解于DMF(1.9ml)中。将烧瓶抽真空并回填以氩气,然后添加四(三苯基膦)钯(0)(12mg,0.010mmol)和碘化亚铜(I)(8mg,0.042mmol)。在90℃在油浴中搅拌反应混合物3.5小时,然后冷却至室温,以水淬灭并用乙醚(2x)萃取。将合并的有机层以水洗涤两次并以盐水洗涤一次,然后经硫酸钠干燥,过滤并浓缩。将残余物经硅胶色谱以EtOAc/己烷(梯度0-40%EtOAc)纯化得到92mg(82%)的2-(5-氯-1-甲基-1H-吲唑-3-基)-5-(2-三甲基甲硅烷基-乙氧基甲基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-羧酸((S)-1,2,2-三甲基-丙基)-酰胺,为灰白色固体。
步骤3
2-(5-氯-1-甲基-1H-吲唑-3-基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-羧酸((S)-1,2,2-三甲基-丙基)-酰胺
在圆底烧瓶中,将2-(5-氯-1-甲基-1H-吲唑-3-基)-5-(2-三甲基甲硅烷基-乙氧基甲基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-羧酸((S)-1,2,2-三甲基-丙基)-酰胺(90mg,0.17mmol)溶解于二氯甲烷(0.8ml),并添加三氟乙酸(0.5ml,6.6mmol)。将反应混合物在室温搅拌2小时,然后浓缩。将残余物再溶解于二氯甲烷(0.8ml),并添加乙二胺(0.7ml,9.9mmol)。将溶液在室温搅拌1.5小时,然后以水淬灭并用乙酸乙酯稀释。将所得悬浮液经过滤,以热水和乙酸乙酯淋洗,然后高真空干燥得到60mg(83%)的2-(5-氯-1-甲基-1H-吲唑-3-基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-羧酸((S)-1,2,2-三甲基-丙基)-酰胺,为浅黄色粉末。MS:(M+H)+=411;1H NMR(DMSO-d6,300MHz):δ(ppm)12.43(宽单峰,1H),9.08(s,1H),8.45(s,1H),8.33(s,1H),8.00(d,J=10.2Hz,1H),7.85(d,J=8.9Hz,1H),7.55(dd,J=8.9,1.5Hz,1H),4.20(s,3H),4.06-4.28(m,1H),1.33(d,J=6.8Hz,3H),0.92(s,9H).
实施例12.
2-(6-氯-1-甲基-1H-吲唑-3-基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-羧酸((R)-2-羟基-1,2-二甲基-丙基)-酰胺
步骤1
((R)-2-羟基-1,2-二甲基-丙基)-氨基甲酸叔丁酯
于0℃向Boc-D-丙氨酸甲酯(5.00g,24.6mmol)在THF(100mL)中的溶液中缓慢添加甲基溴化镁(3.0M的Et2O溶液,28.7mL,86.1mmol)。将所得白色浆料在0℃搅拌1小时,然后室温搅拌2小时。将反应混合物以饱和NH4Cl水溶液淬灭,以H2O稀释,并以EtOAc萃取。将合并的有机物以盐水洗涤,并经MgSO4干燥并浓缩得到4.93g(99%)((R)-2-羟基-1,2-二甲基-丙基)-氨基甲酸叔丁酯,为无色粘稠油状物。
步骤2
(R)-3-氨基-2-甲基-丁-2-醇盐酸盐
将((R)-2-羟基-1,2-二甲基-丙基)-氨基甲酸叔丁酯(4.93g,24.2mmol)溶解于1.0M HCl(150mL)并在50℃搅拌4小时。浓缩得到4.01g的(R)-3-氨基-2-甲基-丁烷-2-醇盐酸盐,为淡棕色固体,其不经进一步纯化即可使用。
步骤3
2-溴-5-(2-三甲基甲硅烷基-乙氧基甲基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-羧酸((R)-2-羟基-1,2-二甲基-丙基)-酰胺
在烧瓶中混合2-溴-5-(2-三甲基甲硅烷基乙氧基甲基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-羧酸(3.25g,8.74mmol)、(R)-3-氨基-2-甲基-丁-2-醇盐酸盐(3.05g,21.9mmol)、EDC(3.85g,20.1mmol)和HOBt(2.72g,20.1mmol)。然后添加DMF(50mL),接着添加i-Pr2NEt(4.87mL,28.0mmol)。将混合物在室温搅拌过夜,然后减压浓缩。将残余物通过SiO2色谱(20-100%EtOAc/己烷)纯化得到2.40g(60%)的2-溴-5-(2-三甲基甲硅烷基-乙氧基甲基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-羧酸((R)-2-羟基-1,2-二甲基-丙基)-酰胺,为黄色固体。
步骤4
2-(6-氯-1-甲基-1H-吲唑-3-基)-5-(2-三甲基甲硅烷基-乙氧基甲基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-羧酸((R)-2-羟基-1,2-二甲基-丙基)-酰胺
在圆底烧瓶中,将2-溴-5-(2-三甲基甲硅烷基-乙氧基甲基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-羧酸((R)-2-羟基-1,2-二甲基-丙基)-酰胺(120mg,0.26mmol)和6-氯-1-甲基-3-三丁基甲锡烷基-1H-吲唑(319mg,0.42mmol)溶解于DMF(2.5ml)中。将烧瓶抽真空并回填以氩气,然后添加四(三苯基膦)钯(0)(16mg,0.014mmol)和碘化亚铜(I)(10mg,0.053mmol)。在90℃在油浴中搅拌反应混合物过夜,然后冷却至室温,以水淬灭并用乙醚(2x)萃取。将合并的有机层以水洗涤两次并以盐水洗涤一次,然后经硫酸钠干燥,过滤并浓缩。将残余物经硅胶色谱以MeOH/CH2Cl2/0.5%NH4OH(梯度0-2%MeOH)纯化得到122mg(86%)的2-(6-氯-1-甲基-1H-吲唑-3-基)-5-(2-三甲基甲硅烷基-乙氧基甲基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-羧酸((R)-2-羟基-1,2-二甲基-丙基)-酰胺,为灰白色固体。
步骤5
2-(6-氯-1-甲基-1H-吲唑-3-基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-羧酸((R)-2-羟基-1,2-二甲基-丙基)-酰胺
在圆底烧瓶中,将2-(6-氯-1-甲基-1H-吲唑-3-基)-5-(2-三甲基甲硅烷基-乙氧基甲基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-羧酸((R)-2-羟基-1,2-二甲基-丙基)-酰胺(121mg,0.22mmol)溶解于二氯甲烷(1ml),并添加三氟乙酸(0.7ml,9.0mmol)。将反应混合物在室温搅拌2.5小时,然后浓缩。将残余物再溶解于二氯甲烷(1ml),并添加乙二胺(0.9ml,13.3mmol)。将溶液在室温搅拌1小时,然后以水淬灭并用乙酸乙酯稀释。将所得悬浮液经过滤,以热水和乙酸乙酯淋洗,然后高真空干燥得到53mg(58%)的2-(6-氯-1-甲基-1H-吲唑-3-基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-羧酸((R)-2-羟基-1,2-二甲基-丙基)-酰胺,为灰白色粉末。MS:(M+H)+=413;1H NMR(DMSO-d6,300MHz):δ(ppm)12.83(宽单峰,1H),9.14(s,1H),8.75(d,J=8.7Hz,1H),8.42(s,1H),8.16(d,J=9.4Hz,1H),7.95(d,J=1.1Hz,1H),7.36(dd,J=8.7,1.1Hz,1H),4.78(s,1H),4.17(s,3H),4.03-4.16(m,1H),1.22-1.28(m,6H),1.16(s,3H).
实施例13.
2-(1,5,5-三甲基-4,5,6,7-四氢-1H-吲唑-3-基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-羧酸[(R)-2-(3-氰基-氮杂环丁烷-1-基)-1-甲基-2-氧代-乙基]-酰胺
步骤1
2-[1-羟基-亚甲-(Z)-基]-4,4-二甲基-环己酮
向干燥的圆底烧瓶装入氢化钠(60%在矿物油中的分散液,475mg,11.9mmol)和乙醚(24ml)。将反应混合物冷却至0℃,并滴加乙醇(0.06ml,1.03mmol)。在0℃搅拌悬浮液20分钟,然后经15分钟滴加4,4-二甲基环己酮(1.50g,11.9mmol)和甲酸乙酯(1.45ml,17.8mmol)在乙醚(3ml)中的溶液。在0℃搅拌黄色溶液3小时,然后缓慢过夜温热至室温。滴加乙醇(0.24ml),并且混合物在室温搅拌1小时,然后以水淬灭,并以乙醚萃取。将水层以6M HCl酸化,直达pH=2,然后以乙醚(2x)萃取。将合并的有机层以盐水洗涤,然后经硫酸钠干燥,过滤并浓缩得到1.30g(71%)的2-[1-羟基-亚甲-(Z)-基]-4,4-二甲基-环己酮,为淡棕色油状物,其不经进一步纯化即可使用。1H NMR(CDCl3,300MHz):δ(ppm)14.40(宽单峰,1H),8.58(s,1H),2.39(t,J=6.8Hz,2H),2.13(s,2H),1.48(t,J=6.8Hz,2H),1.00(s,6H).
步骤2
5,5-二甲基-4,5,6,7-四氢-1H-吲唑
在100ml圆底烧瓶中,将2-[1-羟基-亚甲-(Z)-基]-4,4-二甲基-环己酮(1.30g,8.43mmol)溶解于甲醇(8.5ml)中。非常缓慢地添加肼(0.27ml,8.43mmol),这产生了放热反应。将反应混合物在室温搅拌50分钟,然后浓缩。将残余物用石油醚研磨得到1.05g(83%)的5,5-二甲基-4,5,6,7-四氢-1H-吲唑,为浅棕色固体。1H NMR(CDCl3,300MHz):δ(ppm)7.28(s,1H),2.67(t,J=6.6Hz,2H),2.32(s,2H),1.60(t,J=6.6Hz,2H),0.99(s,6H).
步骤3
3-碘-5,5-二甲基-4,5,6,7-四氢-1H-吲唑
在圆底烧瓶中,将5,5-二甲基-4,5,6,7-四氢-1H-吲唑(0.50g,3.33mmol)溶解于DMF(7mL)中。添加碘(1.69g,6.66mmol),接着添加氢氧化钾(723mg,12.9mmol)。将深色的反应混合物在室温搅拌1.25小时。添加额外的碘(1.69g,6.66mmol)和氢氧化钾(723mg,12.9mmol),将深棕色的反应混合物在室温搅拌1.5小时。将反应混合物以10%NaHSO3水溶液淬灭,并用乙醚(2x)萃取。将合并的有机层以水洗涤两次并以盐水洗涤一次,然后经硫酸钠干燥,过滤并浓缩。将残余物吸收在硅胶上,并且以EtOAc/己烷(梯度0-20%EtOAc)色谱纯化得到645mg(70%)的3-碘-5,5-二甲基-4,5,6,7-四氢-1H-吲唑,为白色固体。1H NMR(CDCl3,300MHz):δ(ppm)2.66(t,J=6.6Hz,2H),2.14(s,2H),1.59(t,J=6.4Hz,2H),1.01(s,6H).
步骤4
3-碘-1,5,5-三甲基-4,5,6,7-四氢-1H-吲唑
在圆底烧瓶中,将3-碘-5,5-二甲基-4,5,6,7-四氢-1H-吲唑(642mg,2.33mmol)溶解于THF(8.5ml)中。将溶液冷却至0℃,并添加叔丁醇钾(365mg,3.26mmol)。于0℃搅拌反应混合物40分钟,然后滴加甲基碘(0.18ml,2.88mmol)。将反应混合物温热至室温并搅拌1.5小时,然后以水淬灭并以EtOAc(2x)萃取。将合并的有机层以水和盐水洗涤,然后经硫酸钠干燥,过滤并浓缩。将残余物经硅胶色谱以EtOAc/己烷(梯度0-15%EtOAc)纯化提供497mg(74%)的3-碘-1,5,5-三甲基-4,5,6,7-四氢-1H-吲唑,为白色固体。1H NMR(CDCl3,300MHz):δ(ppm)3.76(s,3H),2.53(t,J=6.4Hz,2H),2.11(s,2H),1.58(t,J=6.6Hz,2H),0.99(s,6H).
步骤5
1,5,5-三甲基-3-三丁基甲锡烷基-4,5,6,7-四氢-1H-吲唑
在圆底烧瓶中,将3-碘-1,5,5-三甲基-4,5,6,7-四氢-1H-吲唑(140mg,0.48mmol)溶解于THF(3ml)中。将无色溶液冷却至-16℃(NaCl/冰浴),并滴加异丙基氯化镁(2.0M在THF中,0.27ml,0.54mmol)。在-16℃搅拌反应混合物20分钟,然后缓慢滴加三丁基氯甲锡烷(0.15ml,0.55mmol)。经1.5小时让反应混合物温热至室温,然后以NH4Cl饱和溶液淬灭,以水稀释并以EtOAc(2x)萃取。将合并的有机层以水和盐水洗涤,然后经硫酸钠干燥,过滤并浓缩得到1,5,5-三甲基-3-三丁基甲锡烷基-4,5,6,7-四氢-1H-吲唑,为无色油状物,其不经进一步纯化即可使用。
步骤6
5-(2-三甲基甲硅烷基-乙氧基甲基)-2-(1,5,5-三甲基-4,5,6,7-四氢-1H-吲唑-3-基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-羧酸[(R)-2-(3-氰基-氮杂环丁烷-1-基)-1-甲基-2-氧代-乙基]-酰胺
在圆底烧瓶中,将2-溴-5-(2-三甲基甲硅烷基-乙氧基甲基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-羧酸[(R)-2-(3-氰基-氮杂环丁烷-1-基)-1-甲基-2-氧代-乙基]-酰胺(130mg,0.26mmol)和1,5,5-三甲基-3-(三丁基甲锡烷基)-4,5,6,7-四氢-1H-吲唑(375mg,0.41mmol)溶解于DMF(2.4ml)中。将烧瓶抽真空并回填以氩气,然后添加四(三苯基膦)钯(0)(15mg,0.013mmol)和碘化亚铜(I)(10mg,0.053mmol)。在90℃在油浴中搅拌反应混合物2.5小时,然后冷却至室温,以水淬灭并用乙醚(2x)萃取。将合并的有机层以水洗涤两次并以盐水洗涤一次,然后经硫酸钠干燥,过滤并浓缩。将残余物经硅胶色谱以MeOH/CH2Cl2/0.5%NH4OH(梯度0-5%MeOH)纯化得到113mg(75%)的5-(2-三甲基甲硅烷基-乙氧基甲基)-2-(1,5,5-三甲基-4,5,6,7-四氢-1H-吲唑-3-基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-羧酸[(R)-2-(3-氰基-氮杂环丁烷-1-基)-1-甲基-2-氧代-乙基]-酰胺,为浅黄色泡沫。
步骤7
2-(1,5,5-三甲基-4,5,6,7-四氢-1H-吲唑-3-基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-羧酸[(R)-2-(3-氰基-氮杂环丁烷-1-基)-1-甲基-2-氧代-乙基]-酰胺
在圆底烧瓶中,将5-(2-三甲基甲硅烷基-乙氧基甲基)-2-(1,5,5-三甲基-4,5,6,7-四氢-1H-吲唑-3-基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-羧酸[(R)-2-(3-氰基-氮杂环丁烷-1-基)-1-甲基-2-氧代-乙基]-酰胺(112mg,0.19mmol)溶解于二氯甲烷(0.9ml)中并添加三氟乙酸(0.6ml,7.5mmol)。将黄色溶液在室温搅拌2.5小时,然后浓缩。将残余物再溶解于二氯甲烷(0.9ml),并添加乙二胺(0.8ml,11.4mmol)。将反应混合物在室温搅拌1小时,然后以水淬灭并用乙酸乙酯稀释。将所得悬浮液经过滤,经热水和乙酸乙酯洗涤,并经高真空干燥得到47mg(51%)的2-(1,5,5-三甲基-4,5,6,7-四氢-1H-吲唑-3-基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-羧酸[(R)-2-(3-氰基-氮杂环丁烷-1-基)-1-甲基-2-氧代-乙基]-酰胺,为白色粉末。MS:(M+H)+=461;1H NMR(DMSO-d6,300MHz):δ(ppm)12.61(宽单峰,1H),8.94(s,1H),8.27-8.41(m,2H),4.43-4.80(m,3H),3.94-4.24(m,2H),3.80(s,3H),3.72-3.91(m,1H),2.89(d,J=15.9Hz,1H),2.59-2.71(m,3H),1.59(t,J=6.2Hz,2H),1.40(dd,J=6.8,3.0Hz,3H),1.00(s,6H).
实施例14.
2-(6-氯-1-甲基-1H-吲唑-3-基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-羧酸[(R)-2-(3,3-二氟-氮杂环丁烷-1-基)-1-甲基-2-氧代-乙基]-酰胺
步骤1
2-(6-氯-1-甲基-1H-吲唑-3-基)-5-(2-三甲基甲硅烷基-乙氧基甲基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-甲醛
在圆底烧瓶中,将2-溴-5-(2-三甲基甲硅烷基-乙氧基甲基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-甲醛(400mg,1.12mmol)和6-氯-1-甲基-3-三丁基甲锡烷基-1H-吲唑(1.11g,1.7mmol)溶解于DMF(10mL)中。将烧瓶抽真空并回填以氩气,然后添加四(三苯基膦)钯(0)(65mg,0.056mmol)和碘化亚铜(I)(43mg,0.23mmol)。在80℃在油浴中搅拌反应混合物过夜,然后冷却至室温,以水淬灭并用乙醚(2x)萃取。将合并的有机层以水洗涤两次并以盐水洗涤一次,然后经硫酸钠干燥,过滤并浓缩。将残余物吸收在硅胶上,并以EtOAc/己烷(梯度0-30%EtOAc)色谱纯化得到416mg(84%)的2-(6-氯-1-甲基-1H-吲唑-3-基)-5-(2-三甲基甲硅烷基-乙氧基甲基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-甲醛,为黄色固体。
步骤2
2-(6-氯-1-甲基-1H-吲唑-3-基)-5-(2-三甲基甲硅烷基-乙氧基甲基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-羧酸
在圆底烧瓶中,将2-(6-氯-1-甲基-1H-吲唑-3-基)-5-(2-三甲基甲硅烷基-乙氧基甲基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-甲醛(412mg,0.93mmol)悬浮在1,4-二噁烷(15ml)和水(3ml)中。将悬浮液冷却至0℃,并添加氨基磺酸(543mg,5.59mmol)。然后,经~20分钟将亚氯酸钠(80%,137mg,1.21mmol)和磷酸二氢钾(1.52g,11.2mmol)在水(9ml)中的溶液经滴液漏斗添加。在完成添加后,移去冰浴,将反应混合物在室温搅拌3小时。添加THF(15ml),将反应混合物在室温再搅拌3小时。以水稀释反应混合物,并以EtOAc(2x)萃取。将合并的有机层以水和盐水洗涤,然后经硫酸钠干燥,过滤并浓缩。将残余物以乙酸乙酯/己烷研磨得到358mg(84%)的2-(6-氯-1-甲基-1H-吲唑-3-基)-5-(2-三甲基甲硅烷基-乙氧基甲基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-羧酸,为浅黄色粉末。
步骤3
[(R)-2-(3,3-二氟-氮杂环丁烷-1-基)-1-甲基-2-氧代-乙基]-氨基甲酸叔丁酯
向圆底烧瓶中装入Boc-D-丙氨酸(400mg,2.11mmol)、3,3-二氟氮杂环丁烷盐酸盐(383mg,2.96mmol)、HOBT(356mg,2.33mmol)和EDC(446mg,2.33mmol)。添加DMF(9ml),接着添加N,N-二异丙基乙胺(1.0ml,5.73mmol)。将反应混合物在室温搅拌48小时,然后以水淬灭并用乙醚(2x)萃取。将合并的有机层以水洗涤两次并以盐水洗涤一次,然后经硫酸钠干燥,过滤并浓缩得到509mg(91%)的[(R)-2-(3,3-二氟-氮杂环丁烷-1-基)-1-甲基-2-氧代-乙基]-氨基甲酸叔丁酯,为浅黄色固体。1H NMR(CDCl3,300MHz):δ(ppm)5.14(d,J=7.2Hz,1H),4.59-4.80(m,1H),4.17-4.55(m,4H),1.45(s,9H),1.32(d,J=7.2Hz,3H).
步骤4
(R)-2-氨基-1-(3,3-二氟-氮杂环丁烷-1-基)-丙-1-酮
向5ml微波小瓶中装入[(R)-2-(3,3-二氟-氮杂环丁烷-1-基)-1-甲基-2-氧代-乙基]-氨基甲酸叔丁酯(170mg,0.64mmol)和2,2,2-三氟乙醇(2.4ml,32.9mmol)。该小瓶以氩气冲洗、密封并在150℃于微波辐射下加热3小时。将反应混合物经浓缩得到102mg(97%)的(R)-2-氨基-1-(3,3-二氟-氮杂环丁烷-1-基)-丙-1-酮,为棕色油状物,其不经进一步纯化即可使用。
步骤5
2-(6-氯-1-甲基-1H-吲唑-3-基)-5-(2-三甲基甲硅烷基-乙氧基甲基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-羧酸[(R)-2-(3,3-二氟-氮杂环丁烷-1-基)-1-甲基-2-氧代-乙基]-酰胺
向圆底烧瓶中装入2-(6-氯-1-甲基-1H-吲唑-3-基)-5-(2-三甲基甲硅烷基-乙氧基甲基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-羧酸(110mg,0.24mmol)、(R)-2-氨基-1-(3,3-二氟-氮杂环丁烷-1-基)-丙-1-酮(98mg,0.60mmol)、HOBT(41mg,0.27mmol)和EDC(51mg,0.27mmol)。添加DMF(1.1ml),接着添加N,N-二异丙基乙胺(0.10ml,0.57mmol)。将反应混合物在室温搅拌48小时,然后以水淬灭并用乙醚(2x)萃取。将合并的有机层以水洗涤两次并以盐水洗涤一次,然后经硫酸钠干燥,过滤并浓缩。将残余物经硅胶色谱以EtOAc/己烷(梯度0-50%EtOAc)纯化得到89mg(61%)的2-(6-氯-1-甲基-1H-吲唑-3-基)-5-(2-三甲基甲硅烷基-乙氧基甲基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-羧酸[(R)-2-(3,3-二氟-氮杂环丁烷-1-基)-1-甲基-2-氧代-乙基]-酰胺,为浅黄色固体。
步骤6
2-(6-氯-1-甲基-1H-吲唑-3-基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-羧酸[(R)-2-(3,3-二氟-氮杂环丁烷-1-基)-1-甲基-2-氧代-乙基]-酰胺
在圆底烧瓶中,将2-(6-氯-1-甲基-1H-吲唑-3-基)-5-(2-三甲基甲硅烷基-乙氧基甲基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-羧酸[(R)-2-(3,3-二氟-氮杂环丁烷-1-基)-1-甲基-2-氧代-乙基]-酰胺(88mg,0.146mmol)溶解于二氯甲烷(0.7ml)中并添加三氟乙酸(0.45ml,5.84mmol)。将反应混合物在室温搅拌2.5小时,然后浓缩。将残余物溶解于二氯甲烷(0.7ml)并添加乙二胺(0.6ml,8.74mmol)。将溶液在室温搅拌1小时,然后以水淬灭并用乙酸乙酯稀释。将所得悬浮液经过滤,经热水和乙酸乙酯洗涤,并经高真空干燥得到45mg(62%)的2-(6-氯-1-甲基-1H-吲唑-3-基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-羧酸[(R)-2-(3,3-二氟-氮杂环丁烷-1-基)-1-甲基-2-氧代-乙基]-酰胺,为浅黄色粉末。MS:(M+H)+=474;1H NMR(DMSO-d6,300MHz):δ(ppm)10.55-11.71(b.s,1H),9.13(s,1H),8.71(d,J=8.7Hz,1H),8.40-8.54(m,2H),7.97(d,J=1.5Hz,1H),7.26(dd,J=8.7,1.5Hz,1H),4.67-4.99(m,3H),4.38(t,J=12.7Hz,2H),4.17(s,3H),1.44(d,J=6.8Hz,3H).
实施例15.
2-(6-氯-1-甲基-1H-吲唑-3-基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-羧酸((R)-1-甲磺酰基-哌啶-3-基)-酰胺
步骤1
(R)-3-{[2-(6-氯-1-甲基-1H-吲唑-3-基)-5-(2-三甲基甲硅烷基-乙氧基甲基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-羰基]-氨基}-哌啶-1-羧酸叔丁酯
向圆底烧瓶中装入2-(6-氯-1-甲基-1H-吲唑-3-基)-5-(2-三甲基甲硅烷基-乙氧基甲基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-羧酸(120mg,0.26mmol)、(R)-3-氨基哌啶-1-羧酸叔丁酯(80mg,0.40mmol)、HOBT(45mg,0.29mmol)和EDC(56mg,0.29mmol)。添加DMF(1.2ml),接着添加N,N-二异丙基乙胺(0.10ml,0.57mmol)。将反应混合物在室温搅拌48小时,然后以水淬灭并用乙醚(2x)萃取。将合并的有机层以水洗涤两次并以盐水洗涤一次,然后经硫酸钠干燥,过滤并浓缩。将残余物经硅胶色谱以EtOAc/己烷(梯度0-50%EtOAc)纯化得到139mg(83%)的(R)-3-{[2-(6-氯-1-甲基-1H-吲唑-3-基)-5-(2-三甲基甲硅烷基-乙氧基甲基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-羰基]-氨基}-哌啶-1-羧酸叔丁酯,为浅黄色固体。
步骤2
2-(6-氯-1-甲基-1H-吲唑-3-基)-5-(2-三甲基甲硅烷基-乙氧基甲基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-羧酸(R)-哌啶-3-基酰胺
在圆底烧瓶中,将(R)-3-{[2-(6-氯-1-甲基-1H-吲唑-3-基)-5-(2-三甲基甲硅烷基-乙氧基甲基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-羰基]-氨基}-哌啶-1-羧酸叔丁酯(138mg,0.22mmol)悬浮于甲醇(2ml)。将反应混合物冷却至0℃,并经10分钟滴加乙酰基氯(0.30ml,4.22mmol)。将所得亮黄色悬浮液在室温搅拌50分钟。添加THF(1ml)和甲醇(1ml),并在室温继续搅拌1小时,然后将溶剂在室温蒸发。将残余物悬浮于二氯甲烷中,并以Na2CO3饱和溶液洗涤。将水层以二氯甲烷萃取。合并有机层,经硫酸钠干燥,过滤并浓缩得到105mg(90%)的2-(6-氯-1-甲基-1H-吲唑-3-基)-5-(2-三甲基甲硅烷基-乙氧基甲基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-羧酸(R)-哌啶-3-基酰胺,为浅黄色固体。
步骤3
2-(6-氯-1-甲基-1H-吲唑-3-基)-5-(2-三甲基甲硅烷基-乙氧基甲基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-羧酸((R)-1-甲磺酰基-哌啶-3-基)-酰胺
于0℃,向2-(6-氯-1-甲基-1H-吲唑-3-基)-5-(2-三甲基甲硅烷基-乙氧基甲基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-羧酸(R)-哌啶-3-基酰胺(104mg,0.19mmol)在二氯甲烷(1.5ml)中的溶液中添加三乙胺(0.04ml,0.29mmol),接着添加甲磺酰氯(0.02ml,0.26mmol)。将反应混合物在室温搅拌过夜,然后以水淬灭,并以二氯甲烷(2x)萃取。合并有机层,经硫酸钠干燥,过滤并浓缩。将残余物经硅胶色谱以MeOH/CH2Cl2/0.5%NH4OH(梯度0-4%MeOH)纯化,然后以乙酸乙酯研磨得到106mg(89%)的2-(6-氯-1-甲基-1H-吲唑-3-基)-5-(2-三甲基甲硅烷基-乙氧基甲基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-羧酸((R)-1-甲磺酰基-哌啶-3-基)-酰胺,为浅黄色固体。
步骤4
2-(6-氯-1-甲基-1H-吲唑-3-基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-羧酸((R)-1-甲磺酰基-哌啶-3-基)-酰胺
在圆底烧瓶中,将2-(6-氯-1-甲基-1H-吲唑-3-基)-5-(2-三甲基甲硅烷基-乙氧基甲基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-羧酸((R)-1-甲磺酰基-哌啶-3-基)-酰胺(103mg,0.167mmol)溶解于二氯甲烷(0.8ml)中并添加三氟乙酸(0.5ml,6.6mmol)。将反应混合物在室温搅拌2.5小时,然后浓缩。将残余物溶解于二氯甲烷(0.8ml)中并添加乙二胺(0.67ml,9.92mmol)。将所得浅黄色悬浮液在室温搅拌45分钟,然后以水淬灭并用乙酸乙酯稀释。将悬浮液经过滤,经热水和乙酸乙酯洗涤,并经高真空干燥得到54mg(63%)的2-(6-氯-1-甲基-1H-吲唑-3-基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-羧酸((R)-1-甲磺酰基-哌啶-3-基)-酰胺,为浅黄色粉末。MS:(M+H)+=488;1H NMR(DMSO-d6,300MHz):δ(ppm)9.06(s,1H),8.47(s,1H),8.41(d,J=8.7Hz,1H),8.13(d,J=7.6Hz,1H),8.00(s,1H),7.36(d,J=8.7Hz,1H),4.17(s,3H),4.06-4.15(m,1H),3.66-3.75(m,1H),3.34-3.41(m,1H),2.89-2.99(m,1H),2.86(s,3H),2.80(d,J=10.6Hz,1H),2.11(宽单峰,1H),1.87(宽单峰,1H),1.51-1.74(m,2H)
实施例16.
2-(6-氯-1-甲基-1H-吲唑-3-基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-羧酸((R)-1-环丙基-乙基)-酰胺
根据实施例14步骤5-6中阐述的操作制备,以(R)-1-环丙基乙胺替代步骤5中的(R)-2-氨基-1-(3,3-二氟-氮杂环丁烷-1-基)-丙-1-酮。MS:(M+H)+=395;1H NMR(DMSO-d6,300MHz):δ(ppm)10.64(宽单峰,1H),9.10(s,1H),8.48(d,J=8.7Hz,1H),8.42(s,1H),8.16(d,J=8.4Hz,1H),8.01(s,1H),7.28(dd,J=8.4,0.9Hz,1H),4.18(s,4H),3.52-3.74(m,1H),1.35(d,J=6.8Hz,3H),0.95-1.14(m,1H),0.24-0.64(m,4H).
实施例17.
2-(6-环丙基-1-甲基-1H-吲唑-3-基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-羧酸[(R)-2-(3-氰基-氮杂环丁烷-1-基)-1-甲基-2-氧代-乙基]-酰胺
根据在实施例4中阐述的操作制备,以6-环丙基-1H-吲唑替代步骤1中的6-氯-1H-吲唑。MS:(M+H)+=469;1H NMR(DMSO-d6,300MHz):δ(ppm)12.88(宽单峰,1H),9.14(s,1H),8.42-8.59(m,3H),7.40(s,1H),7.06(dd,J=7.9,3.8Hz,1H),4.48-4.81(m,3H),4.14(s,3H),4.01-4.29(m,2H),3.77-3.92(m,1H),2.06-2.21(m,1H),1.44(dd,J=6.2,4.3Hz,3H),0.95-1.10(m,2H),0.77-0.88(m,2H).
实施例18.
2-(1-甲基-6-三氟甲基-1H-吲唑-3-基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-羧酸[(R)-2-(3-氰基-氮杂环丁烷-1-基)-1-甲基-2-氧代-乙基]-酰胺
根据在实施例4中阐述的操作制备,以6-三氟甲基-1H-吲唑替代步骤1中的6-氯-1H-吲唑。MS:(M+H)+=497;1H NMR(DMSO-d6,300MHz):δ(ppm)12.93(宽单峰,1H),9.16(s,1H),8.93(d,J=8.3Hz,1H),8.48(t,J=7.6Hz,2H),8.29(s,1H),7.50(dd,J=8.1,4.0Hz,1H),4.49-4.85(m,3H),4.28(s,3H),4.17-4.40(m,1H),4.03-4.17(m,1H),3.78-3.96(m,1H),1.36-1.48(m,3H).
实施例19.
2-(6-氯-1-甲基-1H-吲唑-3-基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-羧酸[(R)-1-(4-氰基-哌啶-1-羰基)-2,2-二甲基-丙基]-酰胺
根据实施例14步骤5-6中阐述的操作制备,以1-((R)-2-氨基-3,3-二甲基-丁酰基)-哌啶-4-甲腈三氟乙酸盐替代步骤5中的R)-2-氨基-1-(3,3-二氟-氮杂环丁烷-1-基)-丙-1-酮。MS:(M+H)+=533;1H NMR(DMSO-d6,300MHz):δ(ppm)12.94(宽单峰,1H),9.16(s,1H),9.02(dd,J=8.5,6.2Hz,1H),8.60(dd,J=9.6,5.5Hz,1H),8.47(d,J=5.7Hz,1H),7.95(s,1H),7.12-7.28(m,1H),5.30(d,J=9.8Hz,1H),4.17(s,3H),3.40-4.10(m,4H),3.05-3.26(m,1H),1.44-2.10(m,4H),1.02(d,J=6.0Hz,9H).
实施例20.
2-(6-氯-1-甲基-1H-吲唑-3-基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-羧酸[(R)-1-(3-氰基-氮杂环丁烷-1-羰基)-丙基]-酰胺
步骤1
[(R)-1-(3-氰基-氮杂环丁烷-1-羰基)-丙基]-氨基甲酸叔丁酯
在圆底烧瓶中,将Boc-D-2-氨基丁酸(400mg,1.97mmol)和氮杂环丁烷-3-甲腈盐酸盐(373mg,3.15mmol)溶解于DMF(9ml)中。添加N,N-二异丙基乙胺(1.0ml,5.73mmol),接着添加HATU(823mg,2.16mmol)。将反应混合物在室温搅拌48小时,然后以水淬灭并用乙醚(2x)萃取。将合并的有机层以水洗涤两次并以盐水洗涤一次,然后经硫酸钠干燥,过滤并浓缩得到410mg(70%)的[(R)-1-(3-氰基-氮杂环丁烷-1-羰基)-丙基]-氨基甲酸叔丁酯,为灰白色固体。
步骤2
1-((R)-2-氨基-丁酰基)-氮杂环丁烷-3-甲腈三氟乙酸盐
向[(R)-1-(3-氰基-氮杂环丁烷-1-羰基)-丙基]-氨基甲酸叔丁酯(200mg,0.67mmol)在二氯甲烷(4ml)中的溶液中添加三氟乙酸(1.8ml,23.4mmol)。将反应混合物在室温搅拌2小时,然后浓缩得到1-((R)-2-氨基-丁酰基)-氮杂环丁烷-3-甲腈三氟乙酸盐,为浅黄色油状物,其不经进一步纯化即可使用。
步骤3
2-(6-氯-1-甲基-1H-吲唑-3-基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-羧酸[(R)-1-(3-氰基-氮杂环丁烷-1-羰基)-丙基]-酰胺
根据实施例14步骤5-6中阐述的操作制备,以1-((R)-2-氨基-丁酰基)-氮杂环丁烷-3-甲腈三氟乙酸盐替代步骤5中的(R)-2-氨基-1-(3,3-二氟-氮杂环丁烷-1-基)-丙-1-酮。MS:(M+H)+=477;1H NMR(DMSO-d6,300MHz):δ(ppm)12.73(s,1H),9.15(s,1H),8.73(d,J=8.7Hz,1H),8.40-8.55(m,2H),7.99(s,1H),7.24(d,J=8.3Hz,1H),4.48-4.79(m,3H),4.18(s,3H),3.99-4.33(m,2H),3.75-3.96(m,1H),1.62-1.97(m,2H),0.83-1.02(m,3H).
实施例21.
2-(6-氯-1-甲基-1H-吲唑-3-基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-羧酸[(R)-2-(3-氰基-氮杂环丁烷-1-基)-1-环丙基-2-氧代-乙基]-酰胺
步骤1
[(R)-2-(3-氰基-氮杂环丁烷-1-基)-1-环丙基-2-氧代-乙基]-氨基甲酸叔丁酯
在圆底烧瓶中,将Boc-D-环丙基甘油(500mg,2.32mmol)和氮杂环丁烷-3-甲腈盐酸盐(441mg,3.72mmol)溶解于DMF(10ml)中。添加N,N-二异丙基乙胺(1.2ml,6.87mmol),接着添加HATU(972mg,2.56mmol)。将反应混合物在室温搅拌过夜,然后以水淬灭并用乙醚(2x)萃取。将合并的有机层以水洗涤两次并以盐水洗涤一次,然后经硫酸钠干燥,过滤并浓缩。将残余物以石油醚研磨得到384mg(59%)的[(R)-2-(3-氰基-氮杂环丁烷-1-基)-1-环丙基-2-氧代-乙基]-氨基甲酸叔丁酯,为灰白色固体。
步骤2
1-((R)-2-氨基-2-环丙基-乙酰基)-氮杂环丁烷-3-甲腈三氟乙酸盐
向[(R)-2-(3-氰基-氮杂环丁烷-1-基)-1-环丙基-2-氧代-乙基]-氨基甲酸叔丁酯(190mg,0.69mmol)在二氯甲烷(4ml)中的溶液中添加三氟乙酸(1.8ml,23.4mmol)。将反应混合物在室温搅拌2.5小时,然后浓缩得到1-((R)-2-氨基-2-环丙基-乙酰基)-氮杂环丁烷-3-甲腈三氟乙酸盐,为浅黄色油状物,其不经进一步纯化即可使用。
步骤3
2-(6-氯-1-甲基-1H-吲唑-3-基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-羧酸[(R)-2-(3-氰基-氮杂环丁烷-1-基)-1-环丙基-2-氧代-乙基]-酰胺
根据实施例14步骤5-6的过程制备,以1-((R)-2-氨基-2-环丙基-乙酰基)-氮杂环丁烷-3-甲腈三氟乙酸盐替代步骤5中的(R)-2-氨基-1-(3,3-二氟-氮杂环丁烷-1-基)-丙-1-酮。MS:(M+H)+=489;1H NMR(DMSO-d6,400MHz):δ(ppm)12.92(宽单峰,1H),9.15(s,1H),8.72(dd,J=8.6,3.5Hz,1H),8.43-8.56(m,2H),7.98(s,1H),7.24(t,J=7.1Hz,1H),4.44-4.76(m,2H),4.17(s,3H),4.01-4.36(m,3H),3.81-3.93(m,1H),1.24-1.38(m,1H),0.36-0.65(m,4H).
实施例22.
2-(6-氰基-1-甲基-1H-吲唑-3-基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-羧酸[(R)-2-(3-氰基-氮杂环丁烷-1-基)-1-甲基-2-氧代-乙基]-酰胺
根据在实施例4中阐述的操作制备,以6-氰基-1H-吲唑替代步骤1中的6-氯-1H-吲唑。MS:(M+H)+=454;1H NMR(DMSO-d6,400MHz):δ(ppm)12.93(宽单峰,1H),9.15(s,1H),8.89(d,J=8.1Hz,1H),8.39-8.55(m,3H),7.49-7.59(m,1H),4.50-4.83(m,3H),4.25(s,3H),4.20-4.28(m,1H),4.07-4.18(m,1H),3.79-3.93(m,1H),1.41(t,J=6.8Hz,3H).
实施例23.
2-(6-氯-1H-吲唑-3-基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-羧酸[(R)-2-(3-氰基-氮杂环丁烷-1-基)-1-甲基-2-氧代-乙基]-酰胺
步骤1
6-氯-3-三丁基甲锡烷基-1H-吲唑
在圆底烧瓶中,将6-氯-3-碘-1H-吲唑(250mg,0.85mmol)溶解于THF(5ml)中,并添加氢化钠(60%在矿物油中的分散液,41mg,1.03mmol)。将反应混合物在室温搅拌10分钟,然后冷却至-16℃(NaCl/冰浴),并滴加异丙基氯化镁(2.0M的THF溶液,0.52ml,1.04mmol)。在-16℃搅拌反应混合物30分钟,然后添加另外的异丙基氯化镁(2.0M在THF中,0.14ml,0.28mmol)。在-16℃搅拌反应混合物10分钟,然后缓慢添加三丁基氯甲锡烷(0.28ml,1.03mmol)。经2.5小时让反应混合物温热至室温,然后以NH4Cl-饱和溶液淬灭,并以EtOAc(2x)萃取。将合并的有机层以水和盐水洗涤,然后经硫酸钠干燥,过滤、浓缩得到6-氯-3-三丁基甲锡烷基-1H-吲唑,为黄色油状物,其不经进一步纯化即可使用。
步骤2
2-(6-氯-1H-吲唑-3-基)-5-(2-三甲基甲硅烷基-乙氧基甲基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-羧酸[(R)-2-(3-氰基-氮杂环丁烷-1-基)-1-甲基-2-氧代-乙基]-酰胺
在圆底烧瓶中,将2-溴-5-(2-三甲基甲硅烷基-乙氧基甲基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-羧酸[(R)-2-(3-氰基-氮杂环丁烷-1-基)-1-甲基-2-氧代-乙基]-酰胺(190mg,0.37mmol)和6-氯-3-三丁基甲锡烷基-1H-吲唑(来自步骤1的粗产物,619mg,0.70mmol)溶解于DMF(3.4ml)中。将烧瓶抽真空并回填以氩气,然后添加四(三苯基膦)钯(0)(22mg,0.019mmol)和碘化亚铜(I)(15mg,0.079mmol)。于90℃在油浴中搅拌反应混合物3小时,然后冷却至室温,以水淬灭并用乙醚(2x)萃取。将合并的有机层以水洗涤两次并以盐水洗涤一次,然后浓缩。将残余物吸收在硅胶上,并以MeOH/CH2Cl2/0.5%NH4OH(梯度0-3%MeOH)色谱纯化,然后以乙醚/乙酸乙酯研磨得到159mg(73%)的2-(6-氯-1H-吲唑-3-基)-5-(2-三甲基甲硅烷基-乙氧基甲基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-羧酸[(R)-2-(3-氰基-氮杂环丁烷-1-基)-1-甲基-2-氧代-乙基]-酰胺,为浅棕色粉末。
步骤3
2-(6-氯-1H-吲唑-3-基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-羧酸[(R)-2-(3-氰基-氮杂环丁烷-1-基)-1-甲基-2-氧代-乙基]-酰胺
在圆底烧瓶中,将2-(6-氯-1H-吲唑-3-基)-5-(2-三甲基甲硅烷基-乙氧基甲基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-羧酸[(R)-2-(3-氰基-氮杂环丁烷-1-基)-1-甲基-2-氧代-乙基]-酰胺(65mg,0.112mmol)溶解于二氯甲烷(0.6ml)中,并添加三氟乙酸(0.35ml,4.5mmol)。将反应混合物在室温搅拌2小时,然后浓缩。将残余物再溶解于二氯甲烷(0.6ml),并添加乙二胺(0.46ml,6.8mmol)。将溶液在室温搅拌1小时,然后以水淬灭并用乙酸乙酯稀释。将所得悬浮液经过滤,经热水和乙酸乙酯洗涤,并经高真空干燥得到30mg(59%)的2-(6-氯-1H-吲唑-3-基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-羧酸[(R)-2-(3-氰基-氮杂环丁烷-1-基)-1-甲基-2-氧代-乙基]-酰胺,为浅黄色粉末。MS:(M+H)+=449.
1H NMR(DMSO-d6,400MHz):δ(ppm)13.35-13.88(m,1H),12.77(s,1H),9.20(s,1H),8.73(dd,J=8.7,2.9Hz,1H),8.48(d,J=8.0Hz,2H),7.74(d,J=1.5Hz,1H),7.22-7.28(m,1H),4.71-4.78(m,1H),4.64-4.70(m,1H),4.60(d,J=7.8Hz,1H),4.51-4.57(m,1H),4.23(td,J=9.5,3.4Hz,1H),4.06-4.15(m,1H),3.80-3.93(m,1H),1.41(t,J=6.5Hz,3H).
实施例24.
2-[6-氯-1-(2-甲氧基-乙基)-1H-吲唑-3-基]-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-羧酸[(R)-2-(3-氰基-氮杂环丁烷-1-基)-1-甲基-2-氧代-乙基]-酰胺
步骤1
2-[6-氯-1-(2-甲氧基-乙基)-1H-吲唑-3-基]-5-(2-三甲基甲硅烷基-乙氧基甲基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-羧酸[(R)-2-(3-氰基-氮杂环丁烷-1-基)-1-甲基-2-氧代-乙基]-酰胺
在圆底烧瓶中,将2-(6-氯-1H-吲唑-3-基)-5-(2-三甲基甲硅烷基-乙氧基甲基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-羧酸[(R)-2-(3-氰基-氮杂环丁烷-1-基)-1-甲基-2-氧代-乙基]-酰胺(90mg,0.155mmol)溶解于DMF(1ml)中。将反应混合物冷却至0℃,并添加氢化钠(60%在矿物油中的分散液,8mg,0.20mmol)。于0℃搅拌反应混合物30分钟,然后添加1-溴-2-甲氧基乙烷(22μl,0.23mmol)。于0℃搅拌反应混合物3小时,然后在室温搅拌过夜。将反应混合物以水淬灭并用乙醚(2x)萃取。将合并的有机层以水洗涤两次并以盐水洗涤一次,然后经硫酸钠干燥,过滤并浓缩。将残余物经硅胶色谱以MeOH/CH2Cl2/0.5%NH4OH(梯度0-3%MeOH)纯化得到51mg(52%)的2-[6-氯-1-(2-甲氧基-乙基)-1H-吲唑-3-基]-5-(2-三甲基甲硅烷基-乙氧基甲基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-羧酸[(R)-2-(3-氰基-氮杂环丁烷-1-基)-1-甲基-2-氧代-乙基]-酰胺,为黄色泡沫。
步骤2
2-[6-氯-1-(2-甲氧基-乙基)-1H-吲唑-3-基]-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-羧酸[(R)-2-(3-氰基-氮杂环丁烷-1-基)-1-甲基-2-氧代-乙基]-酰胺
在圆底烧瓶中,将2-[6-氯-1-(2-甲氧基-乙基)-1H-吲唑-3-基]-5-(2-三甲基甲硅烷基-乙氧基甲基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-羧酸[(R)-2-(3-氰基-氮杂环丁烷-1-基)-1-甲基-2-氧代-乙基]-酰胺(50mg,0.079mmol)溶解于二氯甲烷(0.5ml)中并添加三氟乙酸(0.25ml,3.24mmol)。将反应混合物在室温搅拌2小时,然后浓缩。将残余物溶解于二氯甲烷(0.5ml)中并添加乙二胺(0.32ml,4.74mmol)。将反应混合物在室温搅拌1.5小时,然后以水淬灭并用乙酸乙酯稀释。将所得悬浮液经过滤,经热水和乙酸乙酯洗涤,并经真空干燥得到19mg(48%)的2-[6-氯-1-(2-甲氧基-乙基)-1H-吲唑-3-基]-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-羧酸[(R)-2-(3-氰基-氮杂环丁烷-1-基)-1-甲基-2-氧代-乙基]-酰胺,为浅黄色粉末。MS:(M+H)+=507;1H NMR(DMSO-d6,400MHz):δ(ppm)12.88(宽单峰,1H),9.16(s,1H),8.72(dd,J=8.6,3.0Hz,1H),8.49(dd,J=8.6,4.8Hz,2H),8.00(s,1H),7.23-7.30(m,1H),4.52-4.79(m,5H),4.19-4.28(m,1H),4.08-4.16(m,1H),3.85(t,J=5.3Hz,3H),3.24(s,3H),1.41(t,J=6.6Hz,3H).
实施例25.
2-(6-氯-1-甲基-1H-吲唑-3-基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-羧酸((R)-1-苯基乙基)-酰胺
根据实施例14步骤5-6阐述的操作制备,以(R)-1-苯基乙胺替代步骤5中的(R)-2-氨基-1-(3,3-二氟-氮杂环丁烷-1-基)-丙-1-酮。MS:(M+H)+=431;1HNMR(DMSO-d6,300MHz):δ(ppm)12.73(宽单峰,1H),9.11(s,1H),8.42-8.53(m,2H),8.28(d,J=8.7Hz,1H),7.99(d,J=1.1Hz,1H),7.46(d,J=7.6Hz,2H),7.34(t,J=7.4Hz,2H),7.17-7.29(m,1H),7.08(dd,J=8.7,1.5Hz,1H),5.34(quin,J=7.2Hz,1H),4.17(s,3H),1.64(d,J=7.2Hz,3H).
实施例26.
2-(1-甲基-4,5,6,7-四氢-1H-吲唑-3-基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-羧酸[(R)-2-(3-氰基-氮杂环丁烷-1-基)-1-甲基-2-氧代-乙基]-酰胺
根据在实施例4中阐述的操作制备,以4,5,6,7-四氢-1H-吲唑替代步骤1中的6-氯-1H-吲唑。MS:(M+H)+=433;1H NMR(DMSO-d6,300MHz):δ(ppm)12.64(宽单峰,1H),8.93(s,1H),8.36(d,J=9.8Hz,2H),4.57-4.73(m,2H),4.43-4.57(m,1H),4.08-4.20(m,1H),3.95-4.06(m,1H),3.79-3.89(m,1H),3.77(s,3H),2.93-3.07(m,1H),2.86(d,J=18.5Hz,1H),2.58-2.68(m,2H),1.76(dd,J=13.6,6.0Hz,4H),1.33(dd,J=6.8,3.8Hz,3H).
实施例27.
2-(6-氯-1-甲基-1H-吲唑-3-基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-羧酸[(R)-1-甲基-2-(2-氧杂-6-氮杂-螺[3.3]庚-6-基)-2-氧代-乙基]-酰胺
根据实施例14步骤3-6中阐述的操作制备,以2-氧杂-6-氮杂-螺[3.3]庚烷草酸酯替代步骤3中的3,3-二氟氮杂环丁烷盐酸盐。MS:(M+H)+=480;1HNMR(DMSO-d6,300MHz):δ(ppm)12.83(宽单峰,1H),9.14(s,1H),8.78(d,J=8.7Hz,1H),8.40-8.49(m,2H),7.96(d,J=1.5Hz,1H),7.24(dd,J=8.7,1.5Hz,1H),4.59-4.82(m,5H),4.40-4.56(m,2H),4.16(s,3H),4.11(s,2H),1.37(d,J=6.8Hz,3H).
实施例28.
2-(6-氯-1-甲基-1H-吲唑-3-基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-羧酸((R)-1-甲基-2-吗啉-4-基-2-氧代-乙基)-酰胺
根据实施例14步骤3-6中阐述的操作制备,以吗啉替代步骤3中的3,3-二氟氮杂环丁烷盐酸盐。MS:(M+H)+=468;1H NMR(DMSO-d6,300MHz):δ(ppm)12.47(宽单峰,1H),9.16(s,1H),8.88(d,J=8.7Hz,1H),8.62(d,J=8.3Hz,1H),8.47(s,1H),7.97(d,J=1.5Hz,1H),7.26(dd,J=8.7,1.5Hz,1H),5.23(quin,J=7.1Hz,1H),4.18(s,3H),3.47-3.73(m,8H),1.42(d,J=6.8Hz,3H).
实施例29.
2-(6-氯-1-甲基-1H-吲哚-3-基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-羧酸[(R)-2-(3-氰基-氮杂环丁烷-1-基)-1-甲基-2-氧代-乙基]-酰胺
步骤1
2-(6-氯-1H-吲哚-3-基)-5-(2-三甲基甲硅烷基-乙氧基甲基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-羧酸[(R)-2-(3-氰基-氮杂环丁烷-1-基)-1-甲基-2-氧代-乙基]-酰胺
向小瓶中装入2-溴-5-(2-三甲基甲硅烷基-乙氧基甲基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-羧酸[(R)-2-(3-氰基-氮杂环丁烷-1-基)-1-甲基-2-氧代-乙基]-酰胺(158mg,0.31mmol)、6-氯-3-(4,4,5,5-四甲基-1,3,2-二氧杂硼杂环戊烷-2-基)-1H-吲哚-1-羧酸叔丁酯(176mg,0.47mmol)和四(三苯基膦)钯(0)(18.0mg,0.016mmol)。将小瓶抽真空并回填以氩气,然后添加1,2-二甲氧基乙烷(1.8ml),并添加2M碳酸钠水溶液(0.47ml,0.940mmol)。将小瓶密封,并且反应混合物在90℃在油浴中搅拌过夜。将反应混合物冷却至室温,以水淬灭并以EtOAc(2x)萃取。将合并的有机层以水和盐水洗涤,然后经硫酸钠干燥,过滤并浓缩。将残余物经硅胶色谱以MeOH/CH2Cl2/0.5%NH4OH(梯度0-3%MeOH)纯化,分离出93mg(52%)2-(6-氯-1H-吲哚-3-基)-5-(2-三甲基甲硅烷基-乙氧基甲基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-羧酸[(R)-2-(3-氰基-氮杂环丁烷-1-基)-1-甲基-2-氧代-乙基]-酰胺,为浅绿色泡沫。还分离出少量的不纯的6-氯-3-[7-[(R)-2-(3-氰基-氮杂环丁烷-1-基)-1-甲基-2-氧代-乙基氨基甲酰基]-5-(2-三甲基甲硅烷基-乙氧基甲基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-2-基]-吲哚-1-羧酸叔丁酯,为浅棕色固体。
步骤2
2-(6-氯-1-甲基-1H-吲哚-3-基)-5-(2-三甲基甲硅烷基-乙氧基甲基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-羧酸[(R)-2-(3-氰基-氮杂环丁烷-1-基)-1-甲基-2-氧代-乙基]-酰胺
在圆底烧瓶中,将2-(6-氯-1H-吲哚-3-基)-5-(2-三甲基甲硅烷基-乙氧基甲基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-羧酸[(R)-2-(3-氰基-氮杂环丁烷-1-基)-1-甲基-2-氧代-乙基]-酰胺(90mg,0.156mmol)溶解于DMF(1ml)中。将反应混合物冷却至0℃,并添加氢化钠(60%在矿物油中的分散液,8mg,0.20mmol)。于0℃搅拌反应混合物30分钟,然后添加甲基碘(10μl,0.16mmol)。于0℃搅拌反应混合物1.5小时,然后以水淬灭并用乙醚(2x)萃取。将合并的有机层以水洗涤两次并以盐水洗涤一次,然后经硫酸钠干燥,过滤并浓缩。将残余物经硅胶色谱以MeOH/CH2Cl2/0.5%NH4OH(梯度0-2%MeOH)纯化得到56mg(61%)的2-(6-氯-1-甲基-1H-吲哚-3-基)-5-(2-三甲基甲硅烷基-乙氧基甲基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-羧酸[(R)-2-(3-氰基-氮杂环丁烷-1-基)-1-甲基-2-氧代-乙基]-酰胺,为黄色泡沫。
步骤3
2-(6-氯-1-甲基-1H-吲哚-3-基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-羧酸[(R)-2-(3-氰基-氮杂环丁烷-1-基)-1-甲基-2-氧代-乙基]-酰胺
在圆底烧瓶中,将2-(6-氯-1-甲基-1H-吲哚-3-基)-5-(2-三甲基甲硅烷基-乙氧基甲基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-羧酸[(R)-2-(3-氰基-氮杂环丁烷-1-基)-1-甲基-2-氧代-乙基]-酰胺(54mg,0.091mmol)溶解于二氯甲烷(0.5ml)中,并添加三氟乙酸(0.28ml,3.63mmol)。将深红色溶液室温搅拌2小时,然后浓缩。将残余物再溶解于二氯甲烷(0.5ml)中并添加乙二胺(0.37ml,5.48mmol)。将反应混合物在室温搅拌1小时,然后以水淬灭并用乙酸乙酯稀释。将所得悬浮液经过滤,经热水和乙酸乙酯洗涤,并经高真空干燥得到28mg(63%)的2-(6-氯-1-甲基-1H-吲哚-3-基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-羧酸[(R)-2-(3-氰基-氮杂环丁烷-1-基)-1-甲基-2-氧代-乙基]-酰胺,为黄色粉末。MS:(M+H)+=462;1HNMR(DMSO-d6,300MHz):δ(ppm)12.62(宽单峰,1H),8.88(s,1H),8.61(d,J=7.6Hz,1H),8.55(d,J=8.7Hz,1H),8.27-8.39(m,2H),7.70(d,J=1.5Hz,1H),7.17(dd,J=8.5,2.5Hz,1H),4.46-4.77(m,3H),4.14-4.27(m,1H),4.01-4.12(m,1H),3.88(s,3H),3.83(宽单峰,1H),1.40(dd,J=6.8,4.2Hz,3H).
实施例30.
2-(6-氯-5-氟-1-甲基-1H-吲唑-3-基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-羧酸[(R)-2-(3-氰基-氮杂环丁烷-1-基)-1-甲基-2-氧代-乙基]-酰胺
根据在实施例4中阐述的操作制备,以6-氯-5-氟-1H-吲唑替代步骤1中的6-氯-1H-吲唑。MS:(M+H)+=481;1H NMR(DMSO-d6,300MHz):δ(ppm)12.87(宽单峰,1H),9.13(s,1H),8.49(d,J=7.9Hz,2H),8.44(d,J=7.6Hz,1H),8.21(d,J=6.0Hz,1H),4.48-4.77(m,3H),4.20(s,3H),4.13-4.28(m,1H),4.07(dt,J=9.7,5.1Hz,1H),3.79-3.93(m,1H),1.45(t,J=6.2Hz,3H).
实施例31.
2-(6-甲基-咪唑并[1,5-a]吡啶-1-基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-羧酸[(R)-2-(3-氰基-氮杂环丁烷-1-基)-1-甲基-2-氧代-乙基]-酰胺
步骤1
(5-甲基-吡啶-2-基)-甲基胺
在干燥的圆底烧瓶中,将5-甲基-吡啶-2-甲腈(1.0g,8.46mmol)溶解于THF(45ml)中。将溶液冷却至0℃,并经20分钟滴加氢化锂铝(1.0M在THF中,25ml,25.0mmol)。于0℃搅拌反应混合物30分钟,然后小心地添加十水硫酸钠。当停止产生气体后,移去冰浴,添加硫酸钠并在室温剧烈搅拌混合物30分钟。将悬浮液经硅藻土过滤并以乙酸乙酯、二氯甲烷和甲醇淋洗。将滤液经浓缩得到(5-甲基-吡啶-2-基)-甲基胺,为棕色固体,其不经进一步纯化即可使用。
步骤2
N-(5-甲基-吡啶-2-基甲基)-甲酰胺
在圆底烧瓶中,将(5-甲基-吡啶-2-基)-甲基胺(来自步骤1的粗产物)溶解于88%甲酸(6.0ml,156mmol)中。于油浴中深棕色溶液在回流下搅拌过夜。将反应混合物冷却至0℃,并通过添加25%氢氧化铵水溶液小心的调节至pH=8。将混合物以水稀释,并且将水层以二氯甲烷(3x)萃取。合并有机层,经硫酸钠干燥,过滤并浓缩得到N-(5-甲基-吡啶-2-基甲基)-甲酰胺,为深棕色固体,并不经进一步纯化而是用。
步骤3
6-甲基-咪唑并[1,5-a]吡啶
在圆底烧瓶中,将N-(5-甲基-吡啶-2-基甲基)-甲酰胺(来自步骤2的粗产物)溶解于甲苯(30ml)中,并添加三氯氧磷(1.2ml,12.9mmol)。于100℃在油浴中搅拌反应混合物过夜,然后冷却至0℃,并小心地以冰淬灭。添加25%氢氧化铵溶液直到pH=~9。将混合物以水稀释,并以二氯甲烷(2x)淬灭。合并有机层,经硫酸钠干燥,过滤并浓缩。将残余物吸收在硅胶上,以EtOAc/己烷(梯度0-80%EtOAc)色谱纯化得到386mg(41%,3个步骤)的6-甲基-咪唑并[1,5-a]吡啶,为浅棕色固体。1H NMR(CDCl3,300MHz):δ(ppm)8.09(s,1H),7.74(s,1H),7.32-7.43(m,2H),6.60(dd,J=9.4,1.1Hz,1H),2.25(d,J=1.1Hz,3H).
步骤4
1-碘-6-甲基-咪唑并[1,5-a]吡啶
在圆底烧瓶中,将碳酸氢钠(215mg,2.56mmol)悬浮于水(0.6ml)和乙醇(1.2ml)中。添加6-甲基-咪唑并[1,5-a]吡啶(90mg,0.68mmol),接着添加碘(242mg,0.95mmol)。将深棕色悬浮液在室温搅拌过夜,然后以10%Na2S2O3-溶液淬灭并以EtOAc(2x)萃取。将有机层以水和盐水洗涤,然后经硫酸钠干燥,过滤并浓缩。将残余物经硅胶色谱以EtOAc/己烷(梯度0-30%EtOAc)纯化得到99mg(56%)的1-碘-6-甲基-咪唑并[1,5-a]吡啶,为浅棕色固体。1H NMR(CDCl3,300MHz):δ(ppm)8.11(s,1H),7.73(s,1H),7.24(d,J=9.4Hz,1H),6.67(d,J=9.1Hz,1H),2.27(s,3H).
步骤5
6-甲基-1-三丁基甲锡烷基-咪唑并[1,5-a]吡啶
在圆底烧瓶中,将1-碘-6-甲基-咪唑并[1,5-a]吡啶(97mg,0.38mmol)溶解于THF(3ml)中。将溶液冷却至-16℃(NaCl/冰浴),并滴加异丙基氯化镁(2.0M在THF中的溶液,0.23ml,0.46mmol)。于-16℃搅拌反应混合物20分钟,然后缓慢添加三丁基氯甲锡烷(0.12ml,0.44mmol)。然后将反应混合物温热至室温并搅拌2小时,然后以饱和NH4Cl水溶液淬灭并以EtOAc(2x)萃取。将合并的有机层以水和盐水洗涤,然后经硫酸钠干燥,过滤并浓缩得到6-甲基-1-三丁基甲锡烷基-咪唑并[1,5-a]吡啶,为棕色油状物,其不经进一步纯化即可使用。
步骤6
2-(6-甲基-咪唑并[1,5-a]吡啶-1-基)-5-(2-三甲基甲硅烷基-乙氧基甲基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-羧酸[(R)-2-(3-氰基-氮杂环丁烷-1-基)-1-甲基-2-氧代-乙基]-酰胺
在圆底烧瓶中,将2-溴-5-(2-三甲基甲硅烷基-乙氧基甲基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-羧酸[(R)-2-(3-氰基-氮杂环丁烷-1-基)-1-甲基-2-氧代-乙基]-酰胺(100mg,0.20mmol)和6-甲基-1-三丁基甲锡烷基-咪唑并[1,5-a]吡啶(来自步骤5的粗产物,307mg,0.36mmol)溶解于DMF(1.8ml)中。将烧瓶抽真空并回填以氩气,然后添加四(三苯基膦)钯(0)(12mg,0.010mmol)和碘化亚铜(I)(8mg,0.042mmol)。于90℃在油浴中搅拌反应混合物过夜,然后冷却至室温,以水淬灭并用乙醚(2x)萃取。将合并的有机层以水洗涤两次并以盐水洗涤一次,然后经硫酸钠干燥,过滤并浓缩。将残余物吸收在硅胶上,并以MeOH/CH2Cl2/0.5%NH4OH(梯度0-3%MeOH)色谱纯化得到98mg(89%)的2-(6-甲基-咪唑并[1,5-a]吡啶-1-基)-5-(2-三甲基甲硅烷基-乙氧基甲基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-羧酸[(R)-2-(3-氰基-氮杂环丁烷-1-基)-1-甲基-2-氧代-乙基]-酰胺,为黄色油状物。
步骤7
2-(6-甲基-咪唑并[1,5-a]吡啶-1-基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-羧酸[(R)-2-(3-氰基-氮杂环丁烷-1-基)-1-甲基-2-氧代-乙基]-酰胺
在圆底烧瓶中,将2-(6-甲基-咪唑并[1,5-a]吡啶-1-基)-5-(2-三甲基甲硅烷基-乙氧基甲基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-羧酸[(R)-2-(3-氰基-氮杂环丁烷-1-基)-1-甲基-2-氧代-乙基]-酰胺(92mg,0.165mmol)溶解于二氯甲烷(0.8ml)中,并添加三氟乙酸(0.5ml,6.6mmol)。将反应混合物在室温搅拌2小时,然后浓缩。将残余物溶解于二氯甲烷(0.8ml)并添加乙二胺(0.67ml,9.9mmol)。将反应混合物在室温搅拌1小时,然后以水淬灭并用乙酸乙酯稀释。将所得悬浮液经过滤,经热水和乙酸乙酯洗涤,并经高真空干燥得到48mg(65%)的2-(6-甲基-咪唑并[1,5-a]吡啶-1-基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-羧酸[(R)-2-(3-氰基-氮杂环丁烷-1-基)-1-甲基-2-氧代-乙基]-酰胺,为黄色粉末。MS:(M+H)+=429;1H NMR(DMSO-d6,300MHz):δ(ppm)12.40(宽单峰,1H),9.11(s,1H),8.39-8.61(m,3H),8.34(d,J=7.2Hz,1H),8.28(s,1H),6.79-7.05(m,1H),4.41-4.86(m,3H),4.15-4.33(m,1H),3.99-4.15(m,1H),3.71-3.94(m,1H),2.26(s,3H),1.40(d,J=4.9Hz,3H).
实施例32.
2-(6-氟-咪唑并[1,5-a]吡啶-1-基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-羧酸[(R)-2-(3-氰基-氮杂环丁烷-1-基)-1-甲基-2-氧代-乙基]-酰胺
步骤1
(5-氟-吡啶-2-基)-甲基胺
在帕尔压力瓶中,将2-氰基-5-氟吡啶(2.0g,16.4mmol)溶解于乙醇(60ml)中。添加钯/炭,10%Pd(湿)(574mg,5.39mmol),接着添加浓HCl(4.6ml,56.0mmol)。将瓶置于帕尔氢化器上,并在45psi氢气氛下震荡3.5小时。将反应混合物经硅藻土过滤,并经甲醇淋洗。将滤液浓缩成浅黄色固体。将固体吸收在二氯甲烷中,冷却至0℃,并以饱和NaHCO3水溶液碱化。将水层以二氯甲烷(3x)萃取,且将合并的有机物经硫酸钠干燥,过滤并浓缩得到558mg(27%)的(5-氟-吡啶-2-基)-甲基胺,为黄色油状物,其不经进一步纯化即可使用。
步骤2
N-(5-氟-吡啶-2-基甲基)-甲酰胺
在圆底烧瓶中,将(5-氟-吡啶-2-基)甲基胺(557mg,4.42mmol)溶解于88%甲酸(3.6ml,82.6mmol)中。将棕色的溶液在回流下在油浴中搅拌过夜。将反应混合物冷却至0℃并通过添加25%氢氧化铵水溶液小心地调节至pH=9。将混合物以水稀释,并且将水层以二氯甲烷(3x)萃取。合并有机层,经硫酸钠干燥,过滤并浓缩得到614mg(90%)的N-(5-氟-吡啶-2-基甲基)-甲酰胺,为棕色油状物,其不经进一步纯化即可使用。
步骤3
6-氟-咪唑并[1,5-a]吡啶
在圆底烧瓶中,将N-(5-氟-吡啶-2-基甲基)-甲酰胺(612mg,3.97mmol)溶解于甲苯(16ml)中,并添加三氯氧磷(0.68ml,7.3mmol)。于100℃在油浴中搅拌反应混合物4小时,然后冷却至0℃,并小心地以并淬灭。添加25%氢氧化铵水溶液直到pH=~9。将混合物以水稀释,以二氯甲烷(3x)萃取。合并有机层,经硫酸钠干燥,过滤并浓缩得到517mg(96%)的6-氟-咪唑并[1,5-a]吡啶,为浅棕色油状物。1H NMR(CDCl3,300MHz):δ(ppm)8.16(s,1H),7.84-7.94(m,1H),7.50(s,1H),7.46(dd,J=9.8,5.3Hz,1H),6.69(ddd,J=9.8,7.7,2.1Hz,1H).
步骤4
2-(6-氟-咪唑并[1,5-a]吡啶-1-基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-羧酸[(R)-2-(3-氰基-氮杂环丁烷-1-基)-1-甲基-2-氧代-乙基]-酰胺
根据实施例31步骤4-7中阐述的操作制备,以6-氟-咪唑并[1,5-a]吡啶代替步骤4中的6-甲基-咪唑并[1,5-a]吡啶。MS:(M+H)+=433;1H NMR(DMSO-d6,300MHz):δ(ppm)12.76(宽单峰,1H),9.14(s,1H),8.62-8.80(m,2H),8.53(s,1H),8.31-8.47(m,2H),7.00-7.15(m,1H),4.44-4.83(m,3H),4.25(q,J=9.2Hz,1H),4.05-4.18(m,1H),3.77-3.94(m,1H),1.40(t,J=5.7Hz,3H).
实施例33.
2-(6,8-二氟-咪唑并[1,5-a]吡啶-1-基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-羧酸[(R)-2-(3-氰基-氮杂环丁烷-1-基)-1-甲基-2-氧代-乙基]-酰胺
步骤1
(3,5-二氟-吡啶-2-基)-甲基胺
在帕尔压力瓶中,将2-氰基-3,5-二氟吡啶(1.0g,7.14mmol)溶解于乙醇(30ml)中。添加钯/炭,10%Pd(湿)(250mg,2.35mmol),接着添加浓HCl(2.0ml,24.4mmol)。将瓶置于帕尔氢化器中并在45psi氢气气氛下震荡3.5小时。将反应混合物经硅藻土过滤,并经甲醇淋洗。将滤液浓缩成浅黄色固体。将固体吸收在二氯甲烷中,冷却至0℃,并以饱和NaHCO3水溶液碱化。将水层以二氯甲烷(3x)萃取,将合并的有机物经硫酸钠干燥,过滤并浓缩得到662mg(64%)的(3,5-二氟-吡啶-2-基)-甲基胺,为浅黄色油状物,其不经进一步纯化即可使用。
步骤2
N-(3,5-二氟-吡啶-2-基甲基)-甲酰胺
在圆底烧瓶中,将(3,5-二氟-吡啶-2-基)甲基胺(660mg,4.58mmol)溶解于88%甲酸(3.6ml,82.6mmol)中。将棕色的溶液在回流下在油浴中搅拌过夜。将反应混合物冷却至0℃,并通过添加25%氢氧化铵水溶液小心地调节至pH=8。将混合物以水稀释,并且将水层以二氯甲烷(3x)萃取。合并有机层,经硫酸钠干燥,过滤并浓缩。NMR显示出起始物质与产物的比例为约50%。将该混合物再次经历相同的反应条件。在后处理后,将分离的657mg棕色油状物经NMR确定为约3:1比例的N-(3,5-二氟-吡啶-2-基甲基)-甲酰胺与起始物质。该产品不经进一步纯化即可使用。
步骤3
6,8-二氟-咪唑并[1,5-a]吡啶
在圆底烧瓶中,将N-(3,5-二氟-吡啶-2-基甲基)-甲酰胺(来自步骤2的粗产物)溶解于甲苯(14ml)中,并添加三氯氧磷(0.65ml,7.0mmol)。于100℃在油浴中搅拌反应混合物3.5小时,然后冷却至0℃,并以冰小心地淬灭。添加25%氢氧化铵水溶液直到pH=~9。将混合物以水稀释,以二氯甲烷(3x)萃取。合并有机层,经硫酸钠干燥,过滤并浓缩。将残余物吸收在硅胶上,并以EtOAc/己烷(梯度0-60%EtOAc)色谱纯化得到319mg(45%,2个步骤)的6,8-二氟-咪唑并[1,5-a]吡啶,为黄色固体。1H NMR(CDCl3,300MHz):δ(ppm)8.36(d,J=3.0Hz,1H),7.84(d,J=3.4Hz,1H),7.65(s,1H),6.39-6.57(m,1H).
步骤4
2-(6,8-二氟-咪唑并[1,5-a]吡啶-1-基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-羧酸[(R)-2-(3-氰基-氮杂环丁烷-1-基)-1-甲基-2-氧代-乙基]-酰胺
根据实施例31步骤4-7中阐述的操作制备,以6,8-二氟-咪唑并[1,5-a]吡啶替代步骤4中的6-甲基-咪唑并[1,5-a]吡啶。MS:(M+H)+=451;1H NMR(DMSO-d6,300MHz):δ(ppm)12.39(宽单峰,1H),9.03(s,1H),8.70(d,J=2.3Hz,1H),8.63(dd,J=4.2,1.5Hz,1H),8.54(d,J=7.2Hz,1H),8.41(d,J=11.0Hz,1H),7.21(t,J=10.2Hz,1H),4.40-4.74(m,3H),4.08-4.24(m,1H),3.95-4.07(m,1H),3.74-3.90(m,1H),1.31-1.44(m,3H).
实施例34.
2-(6-氟-3-甲基-咪唑并[1,5-a]吡啶-1-基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-羧酸[(R)-2-(3-氰基-氮杂环丁烷-1-基)-1-甲基-2-氧代-乙基]-酰胺
步骤1
(5-氟-吡啶-2-基)-甲基胺二盐酸盐
在帕尔压力瓶中,将2-氰基-5-氟吡啶(1.0g,8.2mmol)溶解于乙醇(30ml)中。添加钯/炭,10%Pd(湿)(290mg,2.73mmol),接着添加浓HCl(2.3ml,28.0mmol)。将瓶置于帕尔氢化器中,并在45psi氢气气氛震荡4小时。将反应混合物经硅藻土过滤,并经甲醇淋洗。将滤液浓缩得到1.61g(99%)的(5-氟-吡啶-2-基)-甲基胺二盐酸盐,为浅黄色固体,其不经进一步纯化即可使用。
步骤2
N-(5-氟-吡啶-2-基甲基)-乙酰胺
在圆底烧瓶中,将(5-氟吡啶-2-基)甲基胺二盐酸盐(800mg,4.0mmol)悬浮于THF(15ml)中。将悬浮液冷却至0℃,并添加三乙胺(1.75ml,12.6mmol)添加,接着滴加乙酰基氯(0.30ml,4.22mmol)。在完成添加后,移去冰浴,将反应混合物在室温搅拌2小时。将反应混合物以水淬灭并以EtOAc(2x)萃取。将合并的有机层以水和盐水洗涤,然后经硫酸钠干燥,过滤并浓缩得到654mg(97%)的N-(5-氟-吡啶-2-基甲基)-乙酰胺,为浅棕色油状物,其不经进一步纯化即可使用。
步骤3
6-氟-3-甲基-咪唑并[1,5-a]吡啶
在圆底烧瓶中,将N-(5-氟-吡啶-2-基甲基)-乙酰胺(653mg,3.88mmol)溶解于甲苯(19ml)中,并添加三氯氧磷(0.66ml,7.1mmol)。于100℃在油浴中搅拌反应混合物过夜,然后冷却至0℃,并小心地用冰淬灭。添加25%氢氧化铵水溶液直到pH=~9。将混合物以水稀释,以二氯甲烷(3x)萃取。合并有机层,经硫酸钠干燥,过滤并浓缩。将残余物经硅胶色谱以EtOAc/己烷(梯度0-70%EtOAc)纯化得到255mg(44%)的6-氟-3-甲基-咪唑并[1,5-a]吡啶,为黄色固体。1H NMR(CDCl3,300MHz):δ(ppm)7.61(d,J=5.3Hz,1H),7.38-7.50(m,2H),6.67(ddd,J=9.7,7.6,1.9Hz,1H),2.66(s,3H).
步骤4
2-(6-氟-3-甲基-咪唑并[1,5-a]吡啶-1-基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-羧酸[(R)-2-(3-氰基-氮杂环丁烷-1-基)-1-甲基-2-氧代-乙基]-酰胺
根据实施例31步骤4-7中阐述的操作制备,以6-氟-3-甲基-咪唑并[1,5-a]吡啶替代步骤4中的6-甲基-咪唑并[1,5-a]吡啶。MS:(M+H)+=447;1H NMR(DMSO-d6,300MHz):δ(ppm)12.53(宽单峰,1H),9.09(s,1H),8.61-8.76(m,1H),8.28-8.54(m,3H),7.01(宽单峰,1H),4.45-4.81(m,3H),4.19-4.32(m,1H),4.14(宽单峰,1H),3.87(宽单峰,1H),2.67(s,3H),1.39(宽单峰,3H).
实施例35.
2-(6-氟-3-羟基甲基-咪唑并[1,5-a]吡啶-1-基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-羧酸[(R)-2-(3-氰基-氮杂环丁烷-1-基)-1-甲基-2-氧代-乙基]-酰胺
步骤1
N-(5-氟-吡啶-2-基甲基)-草氨酸甲酯
在圆底烧瓶中,将(5-氟吡啶-2-基)甲基胺二盐酸盐(800mg,4.0mmol)悬浮于THF(15ml)中。将悬浮液冷却至0℃,并添加三乙胺(1.75ml,12.6mmol)接着滴加甲基草酰氯(0.40ml,4.18mmol)。在完成添加后,移去冰浴,并且将反应混合物在室温搅拌2.5小时。将反应混合物以水淬灭并以EtOAc(2x)萃取。将合并的有机层以水和盐水洗涤,然后经硫酸钠干燥,过滤并浓缩得到N-(5-氟-吡啶-2-基甲基)-草氨酸甲酯,为浅棕色油状物,其不经进一步纯化即可使用。
步骤2
6-氟-咪唑并[1,5-a]吡啶-3-羧酸甲酯
在圆底烧瓶中,将N-(5-氟-吡啶-2-基甲基)-草氨酸甲酯(来自步骤1的粗产物)溶解于甲苯(8ml)中,并添加三氯氧磷(1.5ml,16.1mmol)。于105℃在油浴中搅拌反应混合物过夜,然后冷却至0℃,并以冰小心地淬灭。添加25%氢氧化铵水溶液直到pH=~9。将混合物以水稀释,以二氯甲烷(3x)萃取。合并有机层,经硫酸钠干燥,过滤并浓缩。将残余物吸收在硅胶上,并以EtOAc/己烷(梯度0-50%EtOAc)色谱纯化得到230mg(31%,2个步骤)的6-氟-咪唑并[1,5-a]吡啶-3-羧酸甲酯,为浅棕色固体。1H NMR(CDCl3,300MHz):δ(ppm)9.33(dd,J=5.1,1.3Hz,1H),7.75(s,1H),7.69(dd,J=9.8,5.3Hz,1H),7.09(ddd,J=9.7,7.5,2.1Hz,1H),4.06(s,3H).
步骤3
(6-氟-咪唑并[1,5-a]吡啶-3-基)-甲醇
在圆底烧瓶中,将6-氟-咪唑并[1,5-a]吡啶-3-羧酸甲酯(223mg,1.15mmol)溶解于THF(7ml)中。将溶液冷却至0℃,并滴加氢化锂铝(1.0M在THF中,1.4ml,1.4mmol)。于0℃搅拌反应混合物1.5小时,然后小心地添加十水硫酸钠。当停止产生气体时,移去冰浴,添加硫酸钠,并在室温剧烈地搅拌混合物30分钟。将悬浮液经硅藻土过滤,并以乙酸乙酯和甲醇淋洗。将滤液浓缩得到225mg的(6-氟-咪唑并[1,5-a]吡啶-3-基)-甲醇,为棕色固体,其不经进一步纯化即可使用。
步骤4
(6-氟-1-碘-咪唑并[1,5-a]吡啶-3-基)-甲醇
在圆底烧瓶中,将(6-氟-咪唑并[1,5-a]吡啶-3-基)-甲醇(225mg,1.15mmol)溶解于乙醇(2ml)和水(1ml)中。添加碳酸氢钠(341mg,4.06mmol),接着添加碘(383mg,1.51mmol)。将深棕色的悬浮液在室温搅拌3小时,然后以10%Na2S2O3溶液淬灭并以EtOAc(2x)萃取。将有机层以水和盐水洗涤,然后经硫酸钠干燥,过滤并浓缩。将残余物吸收在硅胶上,并以EtOAc/己烷(梯度0-40%EtOAc)色谱纯化得到157mg(50%,2个步骤)的(6-氟-1-碘-咪唑并[1,5-a]吡啶-3-基)-甲醇,为浅黄色固体。
步骤5
(6-氟-1-三丁基甲锡烷基-咪唑并[1,5-a]吡啶-3-基)-甲醇
在圆底烧瓶中,将(6-氟-1-碘-咪唑并[1,5-a]吡啶-3-基)-甲醇(156mg,0.53mmol)溶解于THF(4ml)中。添加氢化钠(60%在矿物油中的分散液,26mg,0.65mmol),并将反应混合物在室温搅拌10分钟。将反应混合物冷却至-16℃(NaCl/冰浴),并滴加异丙基氯化镁(2.0M在THF中,0.32ml,0.64mmol)。将反应混合物在-16℃搅拌25分钟,然后缓慢地添加三丁基氯甲锡烷(0.17ml,0.63mmol)。让反应混合物温热至室温,并搅拌1.5小时,然后以饱和NH4Cl水溶液淬灭,并以EtOAc(2x)萃取。将合并的有机层以水和盐水洗涤,然后经硫酸钠干燥,过滤并浓缩得到(6-氟-1-三丁基甲锡烷基-咪唑并[1,5-a]吡啶-3-基)-甲醇,为棕色半固体,其不经进一步纯化即可使用。
步骤6
2-(6-氟-3-羟基甲基-咪唑并[1,5-a]吡啶-1-基)-5-(2-三甲基甲硅烷基-乙氧基甲基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-羧酸[(R)-2-(3-氰基-氮杂环丁烷-1-基)-1-甲基-2-氧代-乙基]-酰胺
在圆底烧瓶中,将2-溴-5-(2-三甲基甲硅烷基-乙氧基甲基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-羧酸[(R)-2-(3-氰基-氮杂环丁烷-1-基)-1-甲基-2-氧代-乙基]-酰胺(100mg,0.20mmol)和(6-氟-1-三丁基甲锡烷基-咪唑并[1,5-a]吡啶-3-基)-甲醇(来自步骤5的粗产物)溶解于DMF(2ml)中。将烧瓶抽真空并回填以氩气,然后添加四(三苯基膦)钯(0)(12mg,0.010mmol)和碘化亚铜(I)(8mg,0.042mmol)。于90℃在油浴中搅拌反应混合物3小时,然后冷却至室温,以水淬灭,并以二氯甲烷(2x)萃取。将合并的有机层以水洗涤两次并以盐水洗涤一次,然后经硫酸钠干燥,过滤并浓缩。将残余物吸收在硅胶上,并以MeOH/CH2Cl2/0.5%NH4OH(梯度0-3%MeOH)色谱纯化得到83mg(71%)的2-(6-氟-3-羟基甲基-咪唑并[1,5-a]吡啶-1-基)-5-(2-三甲基甲硅烷基-乙氧基甲基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-羧酸[(R)-2-(3-氰基-氮杂环丁烷-1-基)-1-甲基-2-氧代-乙基]-酰胺,为浅棕色固体。
步骤7
2-(6-氟-3-羟基甲基-咪唑并[1,5-a]吡啶-1-基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-羧酸[(R)-2-(3-氰基-氮杂环丁烷-1-基)-1-甲基-2-氧代-乙基]-酰胺
在圆底烧瓶中,将2-(6-氟-3-羟基甲基-咪唑并[1,5-a]吡啶-1-基)-5-(2-三甲基甲硅烷基-乙氧基甲基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-羧酸[(R)-2-(3-氰基-氮杂环丁烷-1-基)-1-甲基-2-氧代-乙基]-酰胺(82mg,0.138mmol)溶解于二氯甲烷(0.7ml)中并添加三氟乙酸(0.43ml,5.6mmol)。将反应混合物在室温搅拌2小时,然后浓缩。将残余物溶解于二氯甲烷(0.7ml)中,并添加乙二胺(0.56ml,8.3mmol)。将反应混合物在室温搅拌1小时,然后以水淬灭,并以二氯甲烷稀释。将所得沉淀经过滤,以水和二氯甲烷洗涤,然后高真空干燥得到46mg(68%)的2-(6-氟-3-羟基甲基-咪唑并[1,5-a]吡啶-1-基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-羧酸[(R)-2-(3-氰基-氮杂环丁烷-1-基)-1-甲基-2-氧代-乙基]-酰胺,为黄色粉末。MS:(M+H)+=463;1H NMR(DMSO-d6,300MHz):δ(ppm)12.30(宽单峰,1H),9.12(s,1H),8.79(dd,J=9.6,3.2Hz,1H),8.55(d,J=4.9Hz,1H),8.44(d,J=7.9Hz,1H),8.40(d,J=5.7Hz,1H),7.07-7.17(m,1H),5.61(t,J=5.7Hz,1H),4.94(d,J=5.3Hz,2H),4.50-4.81(m,3H),4.20-4.32(m,1H),4.14(dt,J=10.3,5.2Hz,1H),3.81-3.93(m,1H),1.40(t,J=6.0Hz,3H).
实施例36.
2-(6-氯-1-甲基-1H-吲唑-3-基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-羧酸((1R,3R)-3-氰基-环戊基)-酰胺
步骤1
((1R,3R)-3-氨基甲酰基-环戊基)-氨基甲酸叔丁酯
在圆底烧瓶中,将(1R,3R)-N-Boc-1-氨基环戊烷-3-羧酸(300mg,1.31mmol)和氯化铵(210mg,3.93mmol)悬浮在DMF(6ml)中。添加HATU(547mg,1.44mmol)和N,N-二异丙基乙胺(0.80ml,4.58mmol),并将黄色悬浮液在室温搅拌72小时。将反应混合物以水淬灭并用乙醚(2x)萃取。将合并的有机层以水洗涤两次并以盐水洗涤一次,然后经硫酸钠干燥,过滤并浓缩得到97mg(33%)的((1R,3R)-3-氨基甲酰基-环戊基)-氨基甲酸叔丁酯,为白色固体。
步骤2
((1R,3R)-3-氰基-环戊基)-氨基甲酸叔丁酯
在圆底烧瓶中,将((1R,3R)-3-氨基甲酰基-环戊基)-氨基甲酸叔丁酯(96mg,0.42mmol)悬浮于THF(2.5ml)中。将反应混合物冷却至0℃,并添加三乙胺(0.28ml,2.01mmol),接着添加三氟乙酸酐(0.095ml,0.67mmol)。在0℃均匀地搅拌反应混合物1.5小时,然后以水淬灭,并以二氯甲烷(2x)萃取。将合并的有机层经硫酸钠干燥,过滤并浓缩得到((1R,3R)-3-氰基-环戊基)-氨基甲酸叔丁酯,为灰白色蜡状固体,其含有一些三乙胺三氟乙酸盐作为主要杂质。该物质不经进一步纯化即可使用。
步骤3
(1R,3R)-3-氨基-环戊烷甲腈三氟乙酸盐
在圆底烧瓶中,将((1R,3R)-3-氰基-环戊基)-氨基甲酸叔丁酯(来自步骤2的粗产物)溶解于二氯甲烷(2.5ml)。将溶液冷却至0℃,并缓慢添加三氟乙酸(1.1ml,14.3mmol)。在完成添加后,移去冰浴,并且将反应混合物在室温搅拌2小时,然后浓缩得到(1R,3R)-3-氨基-环戊烷甲腈三氟乙酸盐,为浅棕色油状物,其不经进一步纯化即可使用。
步骤4
2-(6-氯-1-甲基-1H-吲唑-3-基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-羧酸((1R,3R)-3-氰基-环戊基)-酰胺
根据实施例14步骤5-6的过程制备,以(1R,3R)-3-氨基-环戊烷甲腈三氟乙酸盐替代步骤5中的(R)-2-氨基-1-(3,3-二氟-氮杂环丁烷-1-基)-丙-1-酮。MS:(M+H)+=420;1H NMR(DMSO-d6,300MHz):δ(ppm)12.48(宽单峰,1H),9.08(s,1H),8.44(s,1H),8.42(d,J=8.7Hz,1H),8.13(d,J=6.8Hz,1H),8.00(s,1H),7.35(dd,J=8.7,1.5Hz,1H),4.44-4.58(m,1H),4.17(s,3H),3.22-3.29(m,1H),2.19-2.39(m,3H),1.99-2.12(m,1H),1.81-1.97(m,1H),1.62-1.76(m,1H).
实施例37.
2-(6-氯-1-甲基-1H-吲唑-3-基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-羧酸(3-氨基-环戊基)-酰胺
步骤1
(3-{[2-(6-氯-1-甲基-1H-吲唑-3-基)-5-(2-三甲基甲硅烷基-乙氧基甲基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-羰基]-氨基}-环戊基)-氨基甲酸叔丁酯
向圆底烧瓶中装入2-(6-氯-1-甲基-1H-吲唑-3-基)-5-(2-三甲基甲硅烷基-乙氧基甲基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-羧酸(300mg,0.66mmol)和(3-氨基环戊基)-氨基甲酸叔丁酯盐酸盐(233mg,0.98mmol)。添加DMF(3ml),接着添加HATU(274mg,0.72mmol)和N,N-二异丙基乙胺(0.30ml,1.72mmol)。将反应混合物在室温搅拌30分钟。添加另外的DMF(2ml),将浅黄色悬浮液在室温搅拌过夜。添加水,且将所得悬浮液经过滤,以水和石油醚洗涤并高真空干燥得到413mg(99%)的(3-{[2-(6-氯-1-甲基-1H-吲唑-3-基)-5-(2-三甲基甲硅烷基-乙氧基甲基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-羰基]-氨基}-环戊基)-氨基甲酸叔丁酯,为灰白色粉末。将分离的产物通过NMR分析确定为未知相关立体化学的单个非对映异构体。
步骤2
2-(6-氯-1-甲基-1H-吲唑-3-基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-羧酸(3-氨基-环戊基)-酰胺
在圆底烧瓶中,将(3-{[2-(6-氯-1-甲基-1H-吲唑-3-基)-5-(2-三甲基甲硅烷基-乙氧基甲基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-羰基]-氨基}-环戊基)-氨基甲酸叔丁酯(80mg,0.125mmol)溶解于二氯甲烷(0.7ml)中并添加三氟乙酸(0.4ml,5.0mmol)。将反应混合物在室温搅拌3.5小时,然后浓缩。将残余物溶解于二氯甲烷(0.7ml)中并添加乙二胺(0.5ml,7.5mmol)。将溶液在室温搅拌2小时,然后以水淬灭并用乙酸乙酯稀释。将所得悬浮液经过滤,经热水和乙酸乙酯洗涤,并经高真空干燥得到40mg(74%)的2-(6-氯-1-甲基-1H-吲唑-3-基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-羧酸(3-氨基-环戊基)-酰胺,为灰白色粉末。MS:(M+H)+=410;1H NMR(DMSO-d6,300MHz):δ(ppm)9.07(s,1H),8.55(d,J=8.7Hz,1H),8.40(s,1H),8.24(d,J=7.6Hz,1H),7.99(s,1H),7.40(d,J=9.1Hz,1H),5.54(宽单峰,2H),4.34-4.45(m,1H),4.17(s,3H),3.36-3.44(m,1H),2.25-2.37(m,1H),2.03-2.16(m,1H),1.71-1.88(m,2H),1.51-1.62(m,1H),1.32-1.43(m,1H)。将分离的产物通过NMR分析确定为未知相关立体化学的单个非对映异构体。
实施例38.
2-(6-氯-1-甲基-1H-吲唑-3-基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-羧酸(3-甲磺酰基氨基-环戊基)-酰胺
步骤1
2-(6-氯-1-甲基-1H-吲唑-3-基)-5-(2-三甲基甲硅烷基-乙氧基甲基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-羧酸(3-氨基-环戊基)-酰胺盐酸盐
在圆底烧瓶中,将(3-{[2-(6-氯-1-甲基-1H-吲唑-3-基)-5-(2-三甲基甲硅烷基-乙氧基甲基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-羰基]-氨基}-环戊基)-氨基甲酸叔丁酯(150mg,0.23mmol)悬浮于甲醇(2ml)中。将反应混合物冷却至0℃,并滴加乙酰基氯(0.33ml,4.64mmol)。移去冰浴且将反应混合物在室温搅拌1.5小时。将溶剂在室温蒸发,并且将残余物高真空干燥得到147mg(98%)的2-(6-氯-1-甲基-1H-吲唑-3-基)-5-(2-三甲基甲硅烷基-乙氧基甲基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-羧酸(3-氨基-环戊基)-酰胺盐酸盐,为浅黄色固体。
步骤2
2-(6-氯-1-甲基-1H-吲唑-3-基)-5-(2-三甲基甲硅烷基-乙氧基甲基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-羧酸(3-甲磺酰基氨基-环戊基)-酰胺
在圆底烧瓶中,将2-(6-氯-1-甲基-1H-吲唑-3-基)-5-(2-三甲基甲硅烷基-乙氧基甲基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-羧酸(3-氨基-环戊基)-酰胺盐酸盐(145mg,0.23mmol)悬浮于二氯甲烷(2.5ml)。将悬浮液冷却至0℃,并添加三乙胺(0.10ml,0.72mmol),接着添加甲磺酰氯(0.02ml,0.26mmol。将反应混合物在室温搅拌过夜,然后以水淬灭,并以二氯甲烷(2x)淬灭。将合并的有机层经硫酸钠干燥,过滤并浓缩。将残余物经硅胶色谱以MeOH/CH2Cl2/0.5%NH4OH(梯度0-5%MeOH)纯化得到111mg(79%)的2-(6-氯-1-甲基-1H-吲唑-3-基)-5-(2-三甲基甲硅烷基-乙氧基甲基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-羧酸(3-甲磺酰基氨基-环戊基)-酰胺,为浅黄色固体。
步骤3
2-(6-氯-1-甲基-1H-吲唑-3-基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-羧酸(3-甲磺酰基氨基-环戊基)-酰胺
在圆底烧瓶中,将2-(6-氯-1-甲基-1H-吲唑-3-基)-5-(2-三甲基甲硅烷基-乙氧基甲基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-羧酸(3-甲磺酰基氨基-环戊基)-酰胺(109mg,0.176mmol)溶解于二氯甲烷(0.9ml)中并添加三氟乙酸(0.54ml,7.0mmol)。将橙色溶液在室温搅拌2小时,然后浓缩。将残余物溶解于二氯甲烷(0.9ml)中并添加乙二胺(0.7ml,10.5mmol)。将黄色溶液在室温搅拌1.5小时,然后以水淬灭并用乙酸乙酯稀释。将所得悬浮液经过滤,经热水和乙酸乙酯洗涤,并经真空干燥得到76mg(88%)的2-(6-氯-1-甲基-1H-吲唑-3-基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-羧酸(3-甲磺酰基氨基-环戊基)-酰胺,为灰白色粉末。MS:(M+H)+=488;1H NMR(DMSO-d6,300MHz):δ(ppm)12.30(宽单峰,1H),9.11(s,1H),8.42-8.52(m,2H),8.17(d,J=7.2Hz,1H),8.02(s,1H),7.41(dd,J=8.7,1.5Hz,1H),7.31(d,J=7.2Hz,1H),4.27-4.40(m,1H),4.18(s,3H),3.67-3.82(m,1H),2.92(s,3H),2.53-2.63(m,1H),1.97-2.20(m,2H),1.65-1.81(m,2H),1.55(dt,J=12.3,9.0Hz,1H).
实施例39.
2-(3-氯-6-氟-咪唑并[1,5-a]吡啶-1-基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-羧酸((S)-2-甲氧基-1-甲基-乙基)-酰胺
步骤1
2-(6-氟-咪唑并[1,5-a]吡啶-1-基)-5-(2-三甲基甲硅烷基-乙氧基甲基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-甲醛
在圆底烧瓶中,将6-氟-1-三丁基甲锡烷基-咪唑并[1,5-a]吡啶(577mg,0.81mmol)和2-溴-5-(2-三甲基甲硅烷基-乙氧基甲基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-甲醛(210mg,0.59mmol)溶解于DMF(5ml)中。将烧瓶抽真空并回填以氩气,然后添加四(三苯基膦)钯(0)(33mg,0.029mmol)和碘化亚铜(I)(22mg,0.12mmol)。于80℃油浴中搅拌反应混合物4小时,然后冷却至室温。添加水,并且过滤所得悬浮液。将滤饼以水和石油醚洗涤然后高真空干燥得到256mg(95%)的2-(6-氟-咪唑并[1,5-a]吡啶-1-基)-5-(2-三甲基甲硅烷基-乙氧基甲基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-甲醛,为黄色粉末。
步骤2
2-(3-氯-6-氟-咪唑并[1,5-a]吡啶-1-基)-5-(2-三甲基甲硅烷基-乙氧基甲基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-羧酸
在圆底烧瓶中,将2-(6-氟-咪唑并[1,5-a]吡啶-1-基)-5-(2-三甲基甲硅烷基-乙氧基甲基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-甲醛(254mg,0.55mmol)悬浮于THF(10ml)和水(2ml)中。将悬浮液冷却至0℃并添加氨基磺酸(324mg,3.33mmol)。然后,经10分钟滴加亚氯酸钠(80%,88mg,0.78mmol)和磷酸二氢钾(907mg,6.67mmol)在水(6ml)中的溶液。在完成添加后,移去冰浴,将反应混合物在室温搅拌4小时。以水稀释反应混合物,并以EtOAc(2x)萃取。将合并的有机层以水和盐水洗涤,然后经硫酸钠干燥,过滤并浓缩。将残余物以己烷研磨,得到184mg的2-(3-氯-6-氟-咪唑并[1,5-a]吡啶-1-基)-5-(2-三甲基甲硅烷基-乙氧基甲基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-羧酸,为浅绿色粉末,其不经进一步纯化即可使用。
步骤3
2-(3-氯-6-氟-咪唑并[1,5-a]吡啶-1-基)-5-(2-三甲基甲硅烷基-乙氧基甲基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-羧酸((S)-2-甲氧基-1-甲基-乙基)-酰胺
向圆底烧瓶中装入2-(3-氯-6-氟-咪唑并[1,5-a]吡啶-1-基)-5-(2-三甲基甲硅烷基-乙氧基甲基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-羧酸(90mg,0.16mmol)和(S)-1-甲氧基丙-2-胺盐酸盐(40mg,0.32mmol)。添加DMF(1ml),接着添加N,N-二异丙基乙胺(0.1ml,0.57mmol)和HATU(71mg,0.19mmol)。将反应混合物在室温搅拌过夜,然后添加水。将所得悬浮液经过滤,以水和石油醚洗涤。将棕色粉末经硅胶色谱MeOH/CH2Cl2/0.5%NH4OH(梯度0-2%MeOH)纯化得到37mg(44%)的2-(3-氯-6-氟-咪唑并[1,5-a]吡啶-1-基)-5-(2-三甲基甲硅烷基-乙氧基甲基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-羧酸((S)-2-甲氧基-1-甲基-乙基)-酰胺,为黄色固体。
步骤4
2-(3-氯-6-氟-咪唑并[1,5-a]吡啶-1-基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-羧酸((S)-2-甲氧基-1-甲基-乙基)-酰胺
在圆底烧瓶中,将2-(3-氯-6-氟-咪唑并[1,5-a]吡啶-1-基)-5-(2-三甲基甲硅烷基-乙氧基甲基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-羧酸((S)-2-甲氧基-1-甲基-乙基)-酰胺(36mg,0.068mmol)溶解于二氯甲烷(0.4ml)中并添加三氟乙酸(0.22ml,2.86mmol)。将反应混合物在室温搅拌2小时,然后浓缩。将残余物溶解于二氯甲烷(0.4ml)并添加乙二胺(0.3ml,4.3mmol)。将反应混合物在室温搅拌1小时,然后以水淬灭并用乙酸乙酯稀释。将所得悬浮液经过滤,经热水和乙酸乙酯洗涤,并经高真空干燥得到21mg(77%)的2-(3-氯-6-氟-咪唑并[1,5-a]吡啶-1-基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-羧酸((S)-2-甲氧基-1-甲基-乙基)-酰胺,为黄色粉末。MS:(M+H)+=403;1H NMR(DMSO-d6,300MHz):δ(ppm)12.01(宽单峰,1H),9.03(s,1H),8.58(d,J=3.8Hz,1H),8.49(dd,J=10.0,5.5Hz,1H),8.40(s,1H),8.10(d,J=8.3Hz,1H),7.18-7.29(m,1H),4.39(d,J=7.9Hz,1H),3.50(qd,J=9.9,4.3Hz,2H),3.30(s,3H),1.31(d,J=6.8Hz,3H).
实施例40.
2-(6,8-二氟-咪唑并[1,5-a]吡啶-1-基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-羧酸((S)-2-甲氧基-1-甲基-乙基)-酰胺
步骤1
2-溴-5-(2-三甲基甲硅烷基-乙氧基甲基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-羧酸((S)-2-甲氧基-1-甲基-乙基)-酰胺
在圆底烧瓶中混合2-溴-5-((2-(三甲基甲硅烷基)乙氧基)甲基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-羧酸(120mg,0.32mmol)和(S)-1-甲氧基丙烷-2-胺盐酸盐(61mg,0.49mmol)。添加DMF(1.5mL),接着添加N,N-二异丙基乙胺(0.15mL,0.86mmol)和HATU(135mg,0.36mmol)。将黄色反应混合物在室温搅拌过夜,然后添加水。将所得悬浮液经过滤,并且将滤饼以水和石油醚洗涤然后高真空干燥得到129mg(90%)的2-溴-5-(2-三甲基甲硅烷基-乙氧基甲基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-羧酸((S)-2-甲氧基-1-甲基-乙基)-酰胺,为灰白色粉末。
步骤2
2-(6,8-二氟-咪唑并[1,5-a]吡啶-1-基)-5-(2-三甲基甲硅烷基-乙氧基甲基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-羧酸((S)-2-甲氧基-1-甲基-乙基)-酰胺
在圆底烧瓶中,将2-溴-5-(2-三甲基甲硅烷基-乙氧基甲基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-羧酸((S)-2-甲氧基-1-甲基-乙基)-酰胺(125mg,0.28mmol)和6,8-二氟-1-三丁基甲锡烷基-咪唑并[1,5-a]吡啶(458mg,0.62mmol)溶解于DMF(2.5ml)中。将烧瓶抽真空并回填以氩气,然后添加四(三苯基膦)钯(0)(17mg,0.015mmol)和碘化亚铜(I)(11mg,0.058mmol)。于90℃在油浴中搅拌反应混合物1.5小时,然后冷却至室温,以水淬灭并用乙醚(2x)萃取。将合并的有机层以水洗涤两次并以盐水洗涤一次,然后经硫酸钠干燥,过滤并浓缩。将残余物经硅胶色谱MeOH/CH2Cl2/0.5%NH4OH(梯度0-3%MeOH)纯化两次得到136mg(89%)的2-(6,8-二氟-咪唑并[1,5-a]吡啶-1-基)-5-(2-三甲基甲硅烷基-乙氧基甲基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-羧酸((S)-2-甲氧基-1-甲基-乙基)-酰胺,为黄色固体。
步骤3
2-(6,8-二氟-咪唑并[1,5-a]吡啶-1-基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-羧酸((S)-2-甲氧基-1-甲基-乙基)-酰胺
在圆底烧瓶中,将2-(6,8-二氟-咪唑并[1,5-a]吡啶-1-基)-5-(2-三甲基甲硅烷基-乙氧基甲基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-羧酸((S)-2-甲氧基-1-甲基-乙基)-酰胺(134mg,0.25mmol)溶解于二氯甲烷(1.2ml)中并添加三氟乙酸(0.75ml,9.8mmol)。将反应混合物在室温搅拌2小时,然后浓缩。将残余物溶解于二氯甲烷(1.2ml)并添加乙二胺(1.0ml,14.8mmol)。将黄色的溶液在室温搅拌1小时,然后以水淬灭并用乙酸乙酯稀释。将所得悬浮液经过滤,经热水和乙酸乙酯洗涤,并经高真空干燥得到74mg(78%)的2-(6,8-二氟-咪唑并[1,5-a]吡啶-1-基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-羧酸((S)-2-甲氧基-1-甲基-乙基)-酰胺,为黄色粉末。MS:(M+H)+=387;1H NMR(DMSO-d6,300MHz):δ(ppm)12.14(宽单峰,1H),9.03(s,1H),8.70(d,J=1.9Hz,1H),8.63(dd,J=4.2,1.9Hz,1H),8.37(s,1H),8.29(d,J=8.3Hz,1H),7.24-7.36(m,1H),4.32(dt,J=13.2,6.6Hz,1H),3.42-3.51(m,1H),3.35-3.41(m,1H),3.25(s,3H),1.24(d,J=6.8Hz,3H).
实施例41.
2-(6-氟-咪唑并[1,5-a]吡啶-1-基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-羧酸((S)-2-甲氧基-1-甲基-乙基)-酰胺
根据实施例40步骤2-3中阐述的操作制备,以6-氟-1-三丁基甲锡烷基-咪唑并[1,5-a]吡啶替代步骤2中的6,8-二氟-1-三丁基甲锡烷基-咪唑并[1,5-a]吡啶。MS:(M+H)+=369;1H NMR(DMSO-d6,300MHz):δ(ppm)12.15(宽单峰,1H),9.11(s,1H),8.68-8.75(m,1H),8.54(s,1H),8.44(dd,J=9.8,5.7Hz,1H),8.35(s,1H),8.16(d,J=8.7Hz,1H),7.08-7.18(m,1H),4.39(d,J=7.2Hz,1H),3.49(qd,J=9.8,4.5Hz,2H),3.30(s,3H),1.31(d,J=6.8Hz,3H).
实施例42.
2-(6-氟-3-甲磺酰基-咪唑并[1,5-a]吡啶-1-基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-羧酸[(R)-2-(3-氰基-氮杂环丁烷-1-基)-1-甲基-2-氧代-乙基]-酰胺
步骤1
6-氟-2H-咪唑并[1,5-a]吡啶-3-硫酮
在圆底烧瓶中,将(5-氟吡啶-2-基)甲基胺二盐酸盐(600mg,3.0mmol)悬浮于甲醇(16ml)中。添加三乙胺(1.4ml,10.0mmol),接着添加二硫化碳(1.4ml,23.2mmol)。在回流下搅拌反应混合物(油浴温度=75℃)过夜,然后冷却至室温且然后浓缩。将残余物在二氯甲烷和水之间分配。将水层以二氯甲烷萃取,然后合并有机层,经硫酸钠干燥,过滤并浓缩。将残余物吸收在硅胶上,并以EtOAc/己烷(梯度0-60%EtOAc)色谱纯化得到169mg(33%)的6-氟-2H-咪唑并[1,5-a]吡啶-3-硫酮,为橙色固体。1H NMR(DMSO-d6,300MHz):δ(ppm)13.47(宽单峰,1H),8.04(dd,J=4.9,1.1Hz,1H),7.43-7.56(m,2H),6.88(ddd,J=10.0,7.9,2.1Hz,1H).
步骤2
6-氟-3-甲基硫基-咪唑并[1,5-a]吡啶
在圆底烧瓶中,将6-氟-2H-咪唑并[1,5-a]吡啶-3-硫酮(158mg,0.94mmol)悬浮于甲醇(1ml)中并滴加甲醇钠(0.5M in MeOH,2.0ml,1.0mmol)。将反应混合物在室温搅拌10分钟,然后滴加甲基碘(0.07ml,1.12mmol)。将反应混合物在室温搅拌2小时,然后浓缩。将残余物在二氯甲烷和水之间分配。将水层以二氯甲烷萃取,然后合并有机层,经硫酸钠干燥,过滤并浓缩得到179mg的6-氟-3-甲基硫基-咪唑并[1,5-a]吡啶,为棕色油状物,其不经进一步纯化即可使用。1H NMR(CDCl3,400MHz):δ(ppm)7.98-8.05(m,1H),7.58(s,1H),7.45(dd,J=9.3,4.8Hz,1H),6.73(ddd,J=9.6,7.6,2.0Hz,1H),2.56(s,3H).
步骤3
6-氟-1-碘-3-甲基硫基-咪唑并[1,5-a]吡啶
在圆底烧瓶中,将6-氟-3-甲基硫基-咪唑并[1,5-a]吡啶(178mg,0.88mmol)溶解于乙醇(1.6ml)中。添加水(0.8ml)、碳酸氢钠(278mg,3.31mmol)和碘(312mg,1.23mmol)。将深棕色的悬浮液在室温搅拌过夜,然后以10%Na2S2O3水溶液淬灭,并以EtOAc(2x)萃取。将合并的有机层以10%Na2S2O3水溶液、水和盐水洗涤,然后经硫酸钠干燥,过滤并浓缩。将残余物吸收在硅胶上,并以EtOAc/己烷(梯度0-10%EtOAc)色谱纯化得到110mg(41%)的6-氟-1-碘-3-甲基硫基-咪唑并[1,5-a]吡啶,为棕色固体。
步骤4
6-氟-3-甲基硫基-1-三丁基甲锡烷基-咪唑并[1,5-a]吡啶
在圆底烧瓶中,将6-氟-1-碘-3-甲基硫基-咪唑并[1,5-a]吡啶(109mg,0.35mmol)溶解于THF(3ml)中。将浅棕色溶液冷却至-16℃(NaCl/冰浴)并滴加异丙基氯化镁(2.0M在THF中,0.21ml,0.42mmol)。于-16℃搅拌反应混合物20分钟,然后缓慢地添加三丁基氯甲锡烷(0.11ml,0.40mmol)。让反应混合物温热至室温,并搅拌2小时,然后以饱和NH4Cl水溶液淬灭,并以乙酸乙酯(2x)萃取。将合并的有机层以水和盐水洗涤,然后经硫酸钠干燥,过滤并浓缩得到6-氟-3-甲基硫基-1-三丁基甲锡烷基-咪唑并[1,5-a]吡啶,为棕色油状物,其不经进一步纯化即可使用。
步骤5
2-(6-氟-3-甲基硫基-咪唑并[1,5-a]吡啶-1-基)-5-(2-三甲基甲硅烷基-乙氧基甲基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-羧酸[(R)-2-(3-氰基-氮杂环丁烷-1-基)-1-甲基-2-氧代-乙基]-酰胺
在圆底烧瓶中,将2-溴-5-(2-三甲基甲硅烷基-乙氧基甲基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-羧酸[(R)-2-(3-氰基-氮杂环丁烷-1-基)-1-甲基-2-氧代-乙基]-酰胺(100mg,0.20mmol)和6-氟-3-甲基硫基-1-三丁基甲锡烷基-咪唑并[1,5-a]吡啶(来自步骤4的粗产物)溶解于DMF(2ml)中。将烧瓶抽真空并回填以氩气,然后添加四(三苯基膦)钯(0)(12mg,0.010mmol)和碘化亚铜(I)(8mg,0.042mmol)。于80℃在油浴中搅拌反应混合物过夜,然后冷却至室温,以水淬灭并用乙醚(2x)萃取。将合并的有机层以水洗涤两次并以盐水洗涤一次,然后经硫酸钠干燥,过滤并浓缩。将残余物经硅胶色谱以MeOH/CH2Cl2/0.5%NH4OH(梯度0-2.5%MeOH)纯化得到109mg(82%)的2-(6-氟-3-甲基硫基-咪唑并[1,5-a]吡啶-1-基)-5-(2-三甲基甲硅烷基-乙氧基甲基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-羧酸[(R)-2-(3-氰基-氮杂环丁烷-1-基)-1-甲基-2-氧代-乙基]-酰胺,为棕色油状物。
步骤6
2-(6-氟-3-甲磺酰基-咪唑并[1,5-a]吡啶-1-基)-5-(2-三甲基甲硅烷基-乙氧基甲基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-羧酸[(R)-2-(3-氰基-氮杂环丁烷-1-基)-1-甲基-2-氧代-乙基]-酰胺
在圆底烧瓶中,将2-(6-氟-3-甲基硫基-咪唑并[1,5-a]吡啶-1-基)-5-(2-三甲基甲硅烷基-乙氧基甲基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-羧酸[(R)-2-(3-氰基-氮杂环丁烷-1-基)-1-甲基-2-氧代-乙基]-酰胺(105mg,0.155mmol)溶解于二氯甲烷(4ml)中。将溶液冷却至0℃并添加m-CPBA(75%,79mg,0.343mmol)。移去冰浴,且将反应混合物在室温搅拌过夜。添加另外的m-CPBA(75%,36mg,0.155mmol),将反应混合物在室温搅拌30分钟。添加10%Na2S2O3水溶液(3ml),且该两相混合物在室温搅拌1小时。以水稀释反应混合物,并以二氯甲烷萃取。将有机层以饱和NaHCO3水溶液洗涤。将水层以二氯甲烷(2x)萃取。将合并的有机层经硫酸钠干燥,过滤并浓缩。将残余物经硅胶色谱以MeOH/CH2Cl2/0.5%NH4OH(梯度0-2.5%MeOH)纯化得到25mg(25%)的2-(6-氟-3-甲磺酰基-咪唑并[1,5-a]吡啶-1-基)-5-(2-三甲基甲硅烷基-乙氧基甲基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-羧酸[(R)-2-(3-氰基-氮杂环丁烷-1-基)-1-甲基-2-氧代-乙基]-酰胺,为浅棕色油状物。
步骤7
2-(6-氟-3-甲磺酰基-咪唑并[1,5-a]吡啶-1-基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-羧酸[(R)-2-(3-氰基-氮杂环丁烷-1-基)-1-甲基-2-氧代-乙基]-酰胺
在圆底烧瓶中,将2-(6-氟-3-甲磺酰基-咪唑并[1,5-a]吡啶-1-基)-5-(2-三甲基甲硅烷基-乙氧基甲基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-羧酸[(R)-2-(3-氰基-氮杂环丁烷-1-基)-1-甲基-2-氧代-乙基]-酰胺(0.024g,37.5μmol,当量:1.00)溶解于二氯甲烷(0.3ml)中并添加三氟乙酸(0.12ml,1.6mmol)。将反应混合物在室温搅拌2.5小时,然后浓缩。将残余物再溶解于二氯甲烷/甲醇/氢氧化铵(60:10:1)(3.5ml)。将溶液在室温搅拌过夜,然后浓缩。将残余物吸收在硅胶上,并以MeOH/CH2Cl2/0.5%NH4OH(梯度0-7%MeOH)色谱纯化得到6mg(30%)的2-(6-氟-3-甲磺酰基-咪唑并[1,5-a]吡啶-1-基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-羧酸[(R)-2-(3-氰基-氮杂环丁烷-1-基)-1-甲基-2-氧代-乙基]-酰胺,为黄色固体。MS:(M+H)+=511;1H NMR(DMSO-d6,300MHz):δ(ppm)12.92(宽单峰,1H),9.17(s,1H),9.01-9.10(m,1H),8.95(d,J=3.0Hz,1H),8.47-8.53(m,1H),8.42(d,J=7.6Hz,1H),7.43-7.53(m,1H),4.51-4.80(m,3H),4.27(q,J=9.6Hz,1H),4.11-4.21(m,1H),3.81-3.94(m,1H),3.57(s,3H),1.40(t,J=6.4Hz,3H).
实施例43.
2-(6-氯-1-甲基-1H-吲唑-3-基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-羧酸[(R)-1-(3-氰基-氮杂环丁烷-1-羰基)-2,2-二甲基-丙基]-酰胺
步骤1
[(R)-1-(3-氰基-氮杂环丁烷-1-羰基)-2,2-二甲基-丙基]-氨基甲酸叔丁酯
向圆底烧瓶中装入Boc-D-叔亮氨酸(300mg,1.3mmol)和氮杂环丁烷-3-甲腈盐酸盐(231mg,1.95mmol)。添加DMF(6ml),接着添加N,N-二异丙基乙胺(0.68ml,3.9mmol)和HATU(543mg,1.43mmol)。将浅黄色溶液在室温搅拌48小时,然后以水淬灭,并用乙醚(2x)萃取。将合并的有机层以水洗涤两次并以盐水洗涤一次,然后经硫酸钠干燥,过滤并浓缩得到458mg的[(R)-1-(3-氰基-氮杂环丁烷-1-羰基)-2,2-二甲基-丙基]-氨基甲酸叔丁酯,为浅黄色油状物。
步骤2
1-((R)-2-氨基-3,3-二甲基-丁酰基)-氮杂环丁烷-3-甲腈三氟乙酸盐
于0℃向[(R)-1-(3-氰基-氮杂环丁烷-1-羰基)-2,2-二甲基-丙基]-氨基甲酸叔丁酯(180mg,0.49mmol)在二氯甲烷(3ml)中的溶液中添加三氟乙酸(1.2ml,15.6mmol)。将反应混合物在室温搅拌2小时,然后浓缩得到1-((R)-2-氨基-3,3-二甲基-丁酰基)-氮杂环丁烷-3-甲腈三氟乙酸盐,为浅黄色油状物,其不经进一步纯化即可使用。
步骤3
2-(6-氯-1-甲基-1H-吲唑-3-基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-羧酸[(R)-1-(3-氰基-氮杂环丁烷-1-羰基)-2,2-二甲基-丙基]-酰胺
根据实施例14步骤5-6的过程制备,以1-((R)-2-氨基-3,3-二甲基-丁酰基)-氮杂环丁烷-3-甲腈三氟乙酸盐代替步骤5中的(R)-2-氨基-1-(3,3-二氟-氮杂环丁烷-1-基)-丙-1-酮。MS:(M+H)+=505;1H NMR(DMSO-d6,300MHz):δ(ppm)12.92(宽单峰,1H),9.15(s,1H),8.90(dd,J=8.5,5.9Hz,1H),8.54(d,J=9.8Hz,1H),8.49(d,J=7.6Hz,1H),7.94(s,1H),7.21(d,J=8.7Hz,1H),4.57-4.70(m,2H),4.52(m,1H),4.17(s,3H),4.07-4.31(m,2H),3.76-3.95(m,1H),1.01(d,J=4.2Hz,9H).
实施例44.
2-(6-氟-1-甲基-1H-吲唑-3-基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-羧酸((R)-2-氟-1,2-二甲基-丙基)-酰胺
步骤1
((R)-2-羟基-1,2-二甲基-丙基)-氨基甲酸叔丁酯
于0℃向Boc-D-丙氨酸甲酯(5.00g,24.6mmol)在THF(100mL)中的溶液中缓慢地添加甲基溴化镁(3.0M的Et2O溶液,28.7mL,86.1mmol)。将所得白色浆料在0℃搅拌1小时,然后在室温搅拌2小时。将反应混合物以饱和NH4Cl水溶液淬灭,以H2O稀释并以EtOAc萃取。将合并的有机物以盐水洗涤,经MgSO4干燥并浓缩得到4.93g(99%)((R)-2-羟基-1,2-二甲基-丙基)-氨基甲酸叔丁酯,为无色粘稠油状物。
步骤2
((R)-2-氟-1,2-二甲基-丙基)-氨基甲酸叔丁酯
在干燥的圆底烧瓶中,将((R)-2-羟基-1,2-二甲基-丙基)-氨基甲酸叔丁酯(534mg,2.36mmol)溶解于二氯甲烷(22ml)中。将溶液冷却至-76℃并滴加DAST(0.34ml,2.57mmol)。于-76℃搅拌反应混合物1.5小时,然后以饱和NaHCO3水溶液(5mL)淬灭,温热至室温并以二氯甲烷(2x)萃取。合并有机层,经硫酸钠干燥,过滤并浓缩得到534mg的((R)-2-氟-1,2-二甲基-丙基)-氨基甲酸叔丁酯,为黄色油状物,其不经进一步纯化即可使用。
步骤3
(R)-2-氟-1,2-二甲基-丙胺盐酸盐
将((R)-2-氟-1,2-二甲基-丙基)-氨基甲酸叔丁酯(140mg,0.61mmol)溶解于1.0M HCl在MeOH(10mL)中的溶液中。将反应混合物在室温搅拌过夜,然后浓缩提供(R)-2-氟-1,2-二甲基-丙胺盐酸盐,为浅棕色油状物,其不经进一步纯化即可使用。
步骤4
2-(6-氟-1-甲基-1H-吲唑-3-基)-5-(2-三甲基甲硅烷基-乙氧基甲基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-羧酸((R)-2-氟-1,2-二甲基-丙基)-酰胺
向10ml的圆底烧瓶装入2-(6-氟-1-甲基-1H-吲唑-3-基)-5-(2-三甲基甲硅烷基-乙氧基甲基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-羧酸(120mg,0.27mmol)和(R)-2-氟-1,2-二甲基-丙胺盐酸盐(来自步骤3的粗产物,155mg,0.55mmol)。添加DMF(1.2ml),接着添加N,N-二异丙基乙胺(0.20ml,1.15mmol)和HATU(114mg,0.30mmol)。将反应混合物在室温搅拌5小时。添加水,并过滤所得悬浮液。将滤饼以水和石油醚洗涤然后高真空干燥得到95mg(66%)的2-(6-氟-1-甲基-1H-吲唑-3-基)-5-(2-三甲基甲硅烷基-乙氧基甲基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-羧酸((R)-2-氟-1,2-二甲基-丙基)-酰胺,为浅棕色粉末。
步骤5
2-(6-氟-1-甲基-1H-吲唑-3-基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-羧酸((R)-2-氟-1,2-二甲基-丙基)-酰胺
在圆底烧瓶中,将2-(6-氟-1-甲基-1H-吲唑-3-基)-5-(2-三甲基甲硅烷基-乙氧基甲基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-羧酸((R)-2-氟-1,2-二甲基-丙基)-酰胺(93mg,0.176mmol)溶解于二氯甲烷(0.9ml)中并添加三氟乙酸(0.54ml,7.0mmol)。将反应混合物在室温搅拌2小时,然后浓缩。将残余物溶解于二氯甲烷(0.9ml)并添加乙二胺(0.7ml,10.5mmol)。将黄色的溶液在室温搅拌1小时,然后以水淬灭并以二氯甲烷(2x)淬灭。合并有机层,经硫酸钠干燥,过滤并浓缩。将残余物吸收在硅胶上,并以MeOH/CH2Cl2/0.5%NH4OH(梯度0-6%MeOH)色谱纯化,然后以乙酸乙酯研磨得到34mg(46%)的2-(6-氟-1-甲基-1H-吲唑-3-基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-羧酸((R)-2-氟-1,2-二甲基-丙基)-酰胺,为浅黄色粉末。MS:(M+H)+=399;1H NMR(DMSO-d6,300MHz):δ(ppm)12.90(宽单峰,1H),9.12(s,1H),8.45-8.54(m,2H),8.25(d,J=9.8Hz,1H),7.68(dd,J=9.8,2.3Hz,1H),7.09(td,J=9.1,2.3Hz,1H),4.30-4.48(m,1H),4.15(s,3H),1.29-1.52(m,9H).
实施例45.
2-(6-氟-1-甲基-1H-吲唑-3-基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-羧酸((S)-1,2,2-三甲基-丙基)-酰胺
步骤1
2-(6-氟-1-甲基-1H-吲唑-3-基)-5-(2-三甲基甲硅烷基-乙氧基甲基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-羧酸((S)-1,2,2-三甲基-丙基)-酰胺
在圆底烧瓶中,将2-(6-氟-1-甲基-1H-吲唑-3-基)-5-(2-三甲基甲硅烷基-乙氧基甲基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-羧酸(120mg,0.27mmol)溶解于DMF(1.2ml)中。添加(S)-3,3-二甲基丁-2-胺(0.25ml,1.84mmol),接着添加HATU(114mg,0.30mmol),且将黄色的溶液在室温搅拌过夜。添加水并过滤所得悬浮液。将滤饼以水和石油醚洗涤然后高真空干燥得到104mg(73%)的2-(6-氟-1-甲基-1H-吲唑-3-基)-5-(2-三甲基甲硅烷基-乙氧基甲基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-羧酸((S)-1,2,2-三甲基-丙基)-酰胺,为浅黄色粉末。
步骤2
2-(6-氟-1-甲基-1H-吲唑-3-基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-羧酸((S)-1,2,2-三甲基-丙基)-酰胺
在圆底烧瓶中,将2-(6-氟-1-甲基-1H-吲唑-3-基)-5-(2-三甲基甲硅烷基-乙氧基甲基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-羧酸((S)-1,2,2-三甲基-丙基)-酰胺(102mg,0.194mmol)溶解于二氯甲烷(0.9ml)中并添加三氟乙酸(0.6ml,7.8mmol)。将反应混合物在室温搅拌2小时,然后浓缩。将残余物溶解于二氯甲烷(0.9ml)并添加乙二胺(0.8ml,11.7mmol)。将黄色的溶液在室温搅拌1小时,然后以水淬灭并用乙酸乙酯稀释。将悬浮液经过滤,经热水和乙酸乙酯洗涤,并经高真空干燥得到52mg(64%)的2-(6-氟-1-甲基-1H-吲唑-3-基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-羧酸((S)-1,2,2-三甲基-丙基)-酰胺,为浅黄色粉末。MS:(M+H)+=395;1H NMR(DMSO-d6,300MHz):δ(ppm)12.38(宽单峰,1H),9.08(s,1H),8.44(s,1H),8.40(dd,J=9.1,5.3Hz,1H),8.03(d,J=9.8Hz,1H),7.69(dd,J=9.8,1.9Hz,1H),7.20(td,J=9.1,2.3Hz,1H),4.15(s,3H),4.09-4.19(m,1H),1.26(d,J=6.8Hz,3H),0.93(s,9H).
实施例46.
2-(6-氟-1-甲基-1H-吲唑-3-基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-羧酸(顺式-3-羟基-环戊基)-酰胺
步骤1
(顺式-3-羟基-环戊基)-氨基甲酸叔丁酯和(反式-3-羟基-环戊基)-氨基甲酸叔丁酯
在干燥的圆底烧瓶中,将N-1-Boc-氨基-3-环戊烯(1.0g,5.46mmol)溶解于THF(7ml)中。将溶液冷却至0℃并滴加硼烷四氢呋喃复合物(1.0M在THF中,6.0ml,6.0mmol)。将反应混合物在0℃搅拌1小时,然后过夜温热至室温。将混合物再冷却回0℃并添加水(2ml)。然后滴加10%氢氧化钠水溶液(8ml,20.0mmol),并接着滴加过氧化氢(30%在水中的溶液,5.0ml,49mmol)。在完成添加后,移去冰浴且将反应混合物在室温搅拌5小时。将反应混合物以乙酸乙酯(2x)萃取。将合并的有机层以盐水洗涤,然后经硫酸钠干燥,过滤并浓缩。将残余物经硅胶色谱以EtOAc/己烷(梯度0-60%EtOAc)纯化得到330mg(30%)的(顺式-3-羟基-环戊基)-氨基甲酸叔丁酯,为无色油状物。1H NMR(CDCl3,300MHz):δ(ppm)5.12(宽单峰,1H),4.39(m,1H),4.03(宽单峰,1H),1.95-2.17(m,2H),1.78(d,J=2.6Hz,3H),1.64(d,J=12.5Hz,1H),1.44(s,9H).
还分离出99mg(9%)的(反式-3-羟基-环戊基)-氨基甲酸叔丁酯,为白色固体。1H NMR(CDCl3,300MHz):δ(ppm)4.35-4.51(m,2H),4.15(宽单峰,1H),2.15-2.30(m,1H),1.98-2.10(m,2H),1.45(s,9H),1.34-1.72(m,3H).
步骤2
顺式-3-氨基-环戊醇三氟乙酸盐
在圆底烧瓶中,将(顺式-3-羟基-环戊基)-氨基甲酸叔丁酯(320mg,1.59mmol)溶解于二氯甲烷(10ml)中,并缓慢地添加三氟乙酸(3.6ml,46.7mmol)。将反应混合物在室温搅拌2小时,然后浓缩得到顺式-3-氨基-环戊醇三氟乙酸盐,为浅黄色油状物,其不经进一步纯化即可使用。
步骤3
2-(6-氟-1-甲基-1H-吲唑-3-基)-5-(2-三甲基甲硅烷基-乙氧基甲基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-羧酸(顺式-3-羟基-环戊基)-酰胺
在圆底烧瓶中,将顺式-3-氨基-环戊醇三氟乙酸盐(来自步骤2的粗产物)溶解于DMF(1.2ml)中并添加N,N-二异丙基乙胺(0.40ml,2.3mmol)。然后添加2-(6-氟-1-甲基-1H-吲唑-3-基)-5-(2-三甲基甲硅烷基-乙氧基甲基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-羧酸(120mg,0.27mmol)和HATU(114mg,0.30mmol)。将反应混合物在室温搅拌过夜,然后以水淬灭并用乙醚(2x)萃取。将合并的有机层以水洗涤两次并以盐水洗涤一次,然后浓缩。将残余物吸收在硅胶上,并以MeOH/CH2Cl2/0.5%NH4OH(梯度0-4%MeOH)色谱纯化得到50mg(35%)的2-(6-氟-1-甲基-1H-吲唑-3-基)-5-(2-三甲基甲硅烷基-乙氧基甲基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-羧酸(顺式-3-羟基-环戊基)-酰胺,为浅黄色固体。
步骤4
2-(6-氟-1-甲基-1H-吲唑-3-基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-羧酸(顺式-3-羟基-环戊基)-酰胺
在圆底烧瓶中,将2-(6-氟-1-甲基-1H-吲唑-3-基)-5-(2-三甲基甲硅烷基-乙氧基甲基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-羧酸(顺式-3-羟基-环戊基)-酰胺(49mg,0.093mmol)溶解于二氯甲烷(0.5ml)中,并添加三氟乙酸(0.3ml,3.8mmol)。将橙色反应混合物在室温搅拌2小时,然后浓缩。将残余物溶解于二氯甲烷(0.5ml)中,并添加乙二胺(0.4ml,5.7mmol)。将浅黄色溶液在室温搅拌1小时,然后以水淬灭并用乙酸乙酯稀释。将所得沉淀经过滤,经热水和乙酸乙酯洗涤,并经高真空干燥得到29mg(75%)的2-(6-氟-1-甲基-1H-吲唑-3-基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-羧酸(顺式-3-羟基-环戊基)-酰胺,为灰白色粉末。MS:(M+H)+=395;1H NMR(DMSO-d6,300MHz):δ(ppm)12.42(宽单峰,1H),9.11(s,1H),8.59(dd,J=9.1,5.3Hz,1H),8.42(s,1H),8.20(d,J=8.3Hz,1H),7.68(dd,J=9.6,2.1Hz,1H),7.24(td,J=9.2,2.1Hz,1H),4.78(宽单峰,1H),4.36-4.52(m,1H),4.22(宽单峰,1H),4.15(s,3H),2.30(ddd,J=13.7,8.2,5.7Hz,1H),2.04-2.19(m,1H),1.67-1.86(m,3H),1.49-1.63(m,1H).
实施例47.
2-(6-氟-1-甲基-1H-吲唑-3-基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-羧酸(反式-3-羟基-环戊基)-酰胺
根据实施例46中阐述的操作制备,但是以(反式-3-羟基-环戊基)-氨基甲酸叔丁酯替代步骤2中的(顺式-3-羟基-环戊基)-氨基甲酸叔丁酯。MS:(M+H)+=395.1H NMR(DMSO-d6,300MHz):δ(ppm)12.26(宽单峰,1H),9.06(s,1H),8.36-8.47(m,2H),8.09(d,J=7.6Hz,1H),7.69(d,J=9.8Hz,1H),7.06-7.22(m,1H),4.49-4.71(m,2H),4.30(宽单峰,1H),4.13(s,3H),2.17-2.32(m,1H),1.92-2.10(m,2H),1.65-1.77(m,1H),1.43-1.62(m,2H).
实施例48.
2-(6-氯-1-甲基-1H-吲唑-3-基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-羧酸(1-噁唑-2-基-乙基)-酰胺
步骤1
2-甲基-丙烷-2-亚磺酸1-噁唑-2-基-亚甲-(E)-基酰胺
在圆底烧瓶中,将噁唑-2-甲醛(300mg,3.09mmol)溶解于THF(7ml)中,并添加2-甲基丙烷-2-亚磺酰胺(450mg,3.71mmol)和乙醇钛(IV)(1.3ml,6.18mmol)。将反应混合物在室温搅拌过夜,然后通过滴加盐水(2ml)缓慢地淬灭,这导致形成厚的黄色沉淀。将反应混合物以乙酸乙酯稀释,在室温剧烈搅拌10分钟。将悬浮液经硅藻土过滤,并以乙酸乙酯淋洗。浓缩滤液,且将残余物经硅胶色谱以EtOAc/己烷(梯度0-30%EtOAc)纯化得到419mg(68%)的2-甲基-丙烷-2-亚磺酸1-噁唑-2-基-亚甲-(E)-基酰胺,为浅黄色固体。
步骤2
2-甲基-丙烷-2-亚磺酸(1-噁唑-2-基-乙基)-酰胺
在圆底烧瓶中,将2-甲基-丙烷-2-亚磺酸1-噁唑-2-基-亚甲-(E)-基酰胺(414mg,2.07mmol)溶解于二氯甲烷(7ml)中。将反应混合物冷却至0℃,并滴加甲基溴化镁(3.0M的乙醚溶液,0.76ml,2.28mmol)。在0℃搅拌反应混合物1小时,然后以饱和NH4Cl水溶液淬灭,并以乙酸乙酯(2x)萃取。将合并的有机层以水和盐水洗涤,然后经硫酸钠干燥,过滤并浓缩得到453mg(96%)的2-甲基-丙烷-2-亚磺酸(1-噁唑-2-基-乙基)-酰胺,为黄色油状物。
步骤3
1-噁唑-2-基-乙胺二盐酸盐
在圆底烧瓶中,将2-甲基-丙烷-2-亚磺酸(1-噁唑-2-基-乙基)-酰胺(449mg,1.97mmol)溶解于甲醇(3.5ml)中,并滴加氯化氢(4.0M在1,4-二噁烷中的溶液,1.0ml,4.0mmol)。将反应混合物在室温搅拌15分钟,然后浓缩得到417mg的1-噁唑-2-基-乙胺二盐酸盐,为橙色蜡状固体,其不经进一步纯化即可使用。
步骤4
2-(6-氯-1-甲基-1H-吲唑-3-基)-5-(2-三甲基甲硅烷基-乙氧基甲基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-羧酸(1-噁唑-2-基-乙基)-酰胺
向圆底烧瓶中装入2-(6-氯-1-甲基-1H-吲唑-3-基)-5-(2-三甲基甲硅烷基-乙氧基甲基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-羧酸(100mg,0.22mmol)和1-噁唑-2-基-乙胺二盐酸盐(91mg,0.39mmol)。添加DMF(1ml),接着添加N,N-二异丙基乙胺(0.25ml,1.43mmol)和HATU(92mg,0.24mmol)。将浅黄色溶液在室温搅拌48小时。添加水并过滤所得悬浮液。将固体以水和石油醚洗涤然后高真空干燥得到108mg(90%)的2-(6-氯-1-甲基-1H-吲唑-3-基)-5-(2-三甲基甲硅烷基-乙氧基甲基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-羧酸(1-噁唑-2-基-乙基)-酰胺,为灰白色粉末。
步骤5
2-(6-氯-1-甲基-1H-吲唑-3-基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-羧酸(1-噁唑-2-基-乙基)-酰胺
在圆底烧瓶中,将2-(6-氯-1-甲基-1H-吲唑-3-基)-5-(2-三甲基甲硅烷基-乙氧基甲基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-羧酸(1-噁唑-2-基-乙基)-酰胺(106mg,0.192mmol)溶解于二氯甲烷(0.9ml)中并添加三氟乙酸(0.6ml,7.7mmol)。将反应混合物在室温搅拌2小时,然后浓缩。将残余物溶解于二氯甲烷(0.9ml)中,并添加乙二胺(0.8ml,11.7mmol)。将黄色的溶液在室温搅拌1小时,然后以水淬灭并用乙酸乙酯稀释。将所得悬浮液经过滤,经热水和乙酸乙酯洗涤,并经高真空干燥得到66mg(82%)的2-(6-氯-1-甲基-1H-吲唑-3-基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-羧酸(1-噁唑-2-基-乙基)-酰胺,为灰白色粉末。MS:(M+H)+=422;1H NMR(DMSO-d6,300MHz):δ(ppm)12.91(宽单峰,1H),9.13(s,1H),8.66(d,J=8.3Hz,1H),8.51(s,1H),8.46(d,J=8.3Hz,1H),8.11(s,1H),8.00(s,1H),7.23(s,1H),7.15-7.21(m,1H),5.47-5.61(m,1H),4.18(s,3H),1.66(d,J=7.2Hz,3H).
实施例49.
2-(6-氟-1-甲基-1H-吲唑-3-基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-羧酸(1-噁唑-2-基-乙基)-酰胺
步骤1
2-(6-氟-1-甲基-1H-吲唑-3-基)-5-(2-三甲基甲硅烷基-乙氧基甲基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-羧酸(1-噁唑-2-基-乙基)-酰胺
向圆底烧瓶中装入2-(6-氟-1-甲基-1H-吲唑-3-基)-5-(2-三甲基甲硅烷基-乙氧基甲基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-羧酸(210mg,0.48mmol)和1-噁唑-2-基-乙胺二盐酸盐(198mg,0.86mmol)。添加DMF(2.2ml),接着添加N,N-二异丙基乙胺(0.55ml,3.15mmol)和HATU(199mg,0.52mmol)。将浅黄色溶液在室温搅拌过夜。添加水并过滤所得悬浮液。将固体以水和石油醚洗涤然后高真空干燥得到248mg(97%)的2-(6-氟-1-甲基-1H-吲唑-3-基)-5-(2-三甲基甲硅烷基-乙氧基甲基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-羧酸(1-噁唑-2-基-乙基)-酰胺,为浅黄色粉末。
步骤2
2-(6-氟-1-甲基-1H-吲唑-3-基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-羧酸(1-噁唑-2-基-乙基)-酰胺
在圆底烧瓶中,将2-(6-氟-1-甲基-1H-吲唑-3-基)-5-(2-三甲基甲硅烷基-乙氧基甲基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-羧酸(1-噁唑-2-基-乙基)-酰胺(64mg,0.12mmol)溶解于二氯甲烷(0.6ml)中并添加三氟乙酸(0.4ml,5.0mmol)。将反应混合物在室温搅拌2.5小时,然后浓缩。将残余物溶解于二氯甲烷(0.6ml)中并添加乙二胺(0.5ml,7.3mmol)。将黄色的溶液在室温搅拌1小时,然后以水淬灭并用乙酸乙酯稀释。将所得悬浮液经过滤,经热水和乙酸乙酯洗涤,并经高真空干燥得到33mg(65%)的2-(6-氟-1-甲基-1H-吲唑-3-基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-羧酸(1-噁唑-2-基-乙基)-酰胺,为浅黄色粉末。MS:(M+H)+=406;1HNMR(DMSO-d6,300MHz):δ(ppm)12.93(宽单峰,1H),9.13(s,1H),8.66(d,J=8.7Hz,1H),8.51(s,1H),8.47(dd,J=8.9,5.5Hz,1H),8.11(s,1H),7.69(dd,J=9.8,2.3Hz,1H),7.25(s,1H),7.07(td,J=9.2,2.1Hz,1H),5.48-5.61(m,1H),4.15(s,3H),1.67(d,J=7.2Hz,3H).
实施例50.
2-(6-氟-1-甲基-1H-吲唑-3-基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-羧酸((R)-1-噁唑-2-基-乙基)-酰胺
步骤1
2-(6-氟-1-甲基-1H-吲唑-3-基)-5-(2-三甲基甲硅烷基-乙氧基甲基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-羧酸((R)-1-噁唑-2-基-乙基)-酰胺和2-(6-氟-1-甲基-1H-吲唑-3-基)-5-(2-三甲基甲硅烷基-乙氧基甲基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-羧酸((S)-1-噁唑-2-基-乙基)-酰胺
将2-(6-氟-1-甲基-1H-吲唑-3-基)-5-(2-三甲基甲硅烷基-乙氧基甲基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-羧酸(1-噁唑-2-基-乙基)-酰胺(182mg,0.34mmol)的外消旋样品经历手性SFC色谱。对映异构体的分离以WHELK-O1R,R柱使用30%EtOH/CO2作为洗脱液来实现。得到76mg(42%)的2-(6-氟-1-甲基-1H-吲唑-3-基)-5-(2-三甲基甲硅烷基-乙氧基甲基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-羧酸((R)-1-噁唑-2-基-乙基)-酰胺,为浅黄色固体,和72mg(40%)的2-(6-氟-1-甲基-1H-吲唑-3-基)-5-(2-三甲基甲硅烷基-乙氧基甲基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-羧酸((S)-1-噁唑-2-基-乙基)-酰胺,为浅黄色固体。
步骤2
2-(6-氟-1-甲基-1H-吲唑-3-基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-羧酸((R)-1-噁唑-2-基-乙基)-酰胺
在圆底烧瓶中,将2-(6-氟-1-甲基-1H-吲唑-3-基)-5-(2-三甲基甲硅烷基-乙氧基甲基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-羧酸((R)-1-噁唑-2-基-乙基)-酰胺(75mg,0.14mmol)溶解于二氯甲烷(0.7ml)中并添加三氟乙酸(0.45ml,5.6mmol)。将反应混合物在室温搅拌2.5小时,然后浓缩。将残余物溶解于二氯甲烷(0.7ml)中并添加乙二胺(0.6ml,8.4mmol)。将黄色的溶液在室温搅拌1小时,然后以水淬灭并用乙酸乙酯稀释。将所得悬浮液经过滤,经热水和乙酸乙酯洗涤,并经高真空干燥得到23mg(39%)的2-(6-氟-1-甲基-1H-吲唑-3-基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-羧酸((R)-1-噁唑-2-基-乙基)-酰胺,为浅黄色粉末。MS:(M+H)+=406;1H NMR(DMSO-d6,300MHz):δ(ppm)12.95(宽单峰,1H),9.13(s,1H),8.66(d,J=8.7Hz,1H),8.51(s,1H),8.47(dd,J=9.1,5.3Hz,1H),8.11(s,1H),7.69(dd,J=9.6,2.1Hz,1H),7.24(s,1H),7.02-7.11(m,1H),5.48-5.60(m,1H),4.15(s,3H),1.66(d,J=7.2Hz,3H).
实施例51.
2-(6-氟-1-甲基-1H-吲唑-3-基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-羧酸((S)-1-噁唑-2-基-乙基)-酰胺
根据实施例50制备,以2-(6-氟-1-甲基-1H-吲唑-3-基)-5-(2-三甲基甲硅烷基-乙氧基甲基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-羧酸((S)-1-噁唑-2-基-乙基)-酰胺替代步骤2中的2-(6-氟-1-甲基-1H-吲唑-3-基)-5-(2-三甲基甲硅烷基-乙氧基甲基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-羧酸((R)-1-噁唑-2-基-乙基)-酰胺。MS:(M+H)+=406;1H NMR(DMSO-d6,300MHz):δ(ppm)12.93(宽单峰,1H),9.12(s,1H),8.64(d,J=8.7Hz,1H),8.50(s,1H),8.46(dd,J=9.1,5.3Hz,1H),8.10(s,1H),7.68(dd,J=9.8,2.3Hz,1H),7.23(s,1H),7.05(td,J=9.1,2.3Hz,1H),5.53(quin,J=7.5Hz,1H),4.14(s,3H),1.65(d,J=7.2Hz,3H).
实施例52.
2-(6-氟-1-甲基-1H-吲唑-3-基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-羧酸(1-噁唑-4-基-乙基)-酰胺
步骤1
2-甲基-丙烷-2-亚磺酸1-噁唑-4-基-亚甲-(E)-基酰胺
在圆底烧瓶中,将噁唑-4-甲醛(300mg,3.09mmol)溶解于THF(7ml)中并添加2-甲基丙烷-2-亚磺酰胺(450mg,3.71mmol)和乙醇钛(IV)(1.3ml,6.18mmol)。将反应混合物在室温搅拌过夜,然后通过滴加盐水(2ml)缓慢地淬灭,这导致形成厚的浅黄色沉淀。将反应混合物以乙酸乙酯稀释,在室温剧烈搅拌30分钟。将悬浮液经硅藻土过滤,并以乙酸乙酯淋洗。浓缩滤液,且将残余物经硅胶色谱以EtOAc/己烷(梯度0-40%EtOAc)纯化得到552mg(89%)的2-甲基-丙烷-2-亚磺酸1-噁唑-4-基-亚甲-(E)-基酰胺,为白色固体。
步骤2
2-甲基-丙烷-2-亚磺酸(1-噁唑-4-基-乙基)-酰胺
在圆底烧瓶中,将2-甲基-丙烷-2-亚磺酸1-噁唑-4-基-亚甲-(E)-基酰胺(548mg,2.74mmol)溶解于二氯甲烷(9ml)中。将反应混合物冷却至0℃,并滴加甲基溴化镁(3.0M的乙醚溶液,1.0ml,3.0mmol)。于0℃搅拌反应混合物1小时,然后以饱和NH4Cl水溶液淬灭,并以乙酸乙酯(2x)萃取。将合并的有机层以水和盐水洗涤,然后经硫酸钠干燥,过滤并浓缩得到588mg的2-甲基-丙烷-2-亚磺酸(1-噁唑-4-基-乙基)-酰胺,为浅黄色油状物。
步骤3
1-噁唑-4-基-乙胺二盐酸盐
在圆底烧瓶中,将2-甲基-丙烷-2-亚磺酸(1-噁唑-4-基-乙基)-酰胺(585mg,2.57mmol)溶解于甲醇(4.5ml)中,并滴加氯化氢(4.0M的1,4-二噁烷溶液,1.3ml,5.2mmol)。将反应混合物在室温搅拌15分钟,然后浓缩得到1-噁唑-4-基-乙胺二盐酸盐,为粘稠的橙色油状物,其不经进一步纯化即可使用。
步骤4
2-(6-氟-1-甲基-1H-吲唑-3-基)-5-(2-三甲基甲硅烷基-乙氧基甲基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-羧酸(1-噁唑-4-基-乙基)-酰胺
向圆底烧瓶中装入2-(6-氟-1-甲基-1H-吲唑-3-基)-5-(2-三甲基甲硅烷基-乙氧基甲基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-羧酸(100mg,0.23mmol)和1-噁唑-2-基-乙胺二盐酸盐(来自步骤3的粗产物,90mg,0.41mmol)。添加DMF(1.1ml),接着添加N,N-二异丙基乙胺(0.26ml,1.49mmol)和HATU(95mg,0.25mmol)。将浅黄色溶液在室温搅拌48小时。添加水并过滤所得悬浮液。将固体以水和石油醚洗涤然后高真空干燥得到113mg(93%)的2-(6-氟-1-甲基-1H-吲唑-3-基)-5-(2-三甲基甲硅烷基-乙氧基甲基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-羧酸(1-噁唑-4-基-乙基)-酰胺,为灰白色粉末。
步骤5
2-(6-氟-1-甲基-1H-吲唑-3-基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-羧酸(1-噁唑-4-基-乙基)-酰胺
在圆底烧瓶中,将2-(6-氟-1-甲基-1H-吲唑-3-基)-5-(2-三甲基甲硅烷基-乙氧基甲基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-羧酸(1-噁唑-4-基-乙基)-酰胺(110mg,0.205mmol)溶解于二氯甲烷(1ml)中并添加三氟乙酸(0.63ml,8.2mmol)。将反应混合物在室温搅拌2小时,然后浓缩。将残余物溶解于二氯甲烷(1ml)中并添加乙二胺(0.83ml,12.3mmol)。将黄色的溶液在室温搅拌1小时,然后以水淬灭并用乙酸乙酯稀释。将所得悬浮液经过滤,经热水和乙酸乙酯洗涤,并经高真空干燥得到58mg(70%)的2-(6-氟-1-甲基-1H-吲唑-3-基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-羧酸(1-噁唑-4-基-乙基)-酰胺,为浅黄色粉末。MS:(M+H)+=406;1H NMR(DMSO-d6,300MHz):δ(ppm)12.83(宽单峰,1H),9.12(s,1H),8.42-8.51(m,2H),8.32-8.42(m,2H),8.20(s,1H),7.68(dd,J=9.8,1.9Hz,1H),7.04(td,J=9.3,1.9Hz,1H),5.28-5.46(m,1H),4.14(s,3H),1.58(d,J=6.8Hz,3H).
实施例53.
2-(6-氟-1-甲基-1H-吲唑-3-基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-羧酸(1-异噁唑-3-基-乙基)-酰胺
步骤1
2-甲基-丙烷-2-亚磺酸1-异噁唑-3-基-亚甲-(E)-基酰胺
在圆底烧瓶中,将异噁唑-3-甲醛(300mg,3.09mmol)溶解于THF(7ml)种并添加2-甲基丙烷-2-亚磺酰胺(450mg,3.71mmol)和乙醇钛(IV)(1.3ml,6.18mmol)。将反应混合物在室温搅拌过夜,然后通过滴加盐水(2ml)缓慢地淬灭,这导致形成厚的黄色沉淀。将反应混合物以乙酸乙酯稀释,在室温剧烈搅拌10分钟。将悬浮液经硅藻土过滤,并以乙酸乙酯淋洗。浓缩滤液,将残余物经硅胶色谱以EtOAc/己烷(梯度0-20%EtOAc)纯化得到585mg(95%)的2-甲基-丙烷-2-亚磺酸1-异噁唑-3-基-亚甲-(E)-基酰胺,为无色油状物。
步骤2
2-甲基-丙烷-2-亚磺酸(1-异噁唑-3-基-乙基)-酰胺
在圆底烧瓶中,将2-甲基-丙烷-2-亚磺酸1-异噁唑-3-基-亚甲-(E)-基酰胺(584mg,2.92mmol)溶解于二氯甲烷(10ml)中。将反应混合物冷却至0℃,并滴加甲基溴化镁(3.0M的乙醚溶液,1.1ml,3.3mmol)。于0℃搅拌反应混合物2小时,然后以饱和NH4Cl水溶液淬灭,并以乙酸乙酯(2x)萃取。将合并的有机层以水和盐水洗涤,然后经硫酸钠干燥,过滤并浓缩得到655mg的2-甲基-丙烷-2-亚磺酸(1-异噁唑-3-基-乙基)-酰胺,为无色油状物。
步骤3
1-异噁唑-3-基-乙胺盐酸盐
在圆底烧瓶中,将2-甲基-丙烷-2-亚磺酸(1-异噁唑-3-基-乙基)-酰胺(652mg,2.71mmol)溶解于甲醇(5ml)中并滴加氯化氢(4.0M的1,4-二噁烷溶液,1.4ml,5.6mmol)。将反应混合物在室温搅拌15分钟,然后浓缩得到1-异噁唑-3-基-乙胺盐酸盐,为灰白色固体,其不经进一步纯化即可使用。
步骤4
2-(6-氟-1-甲基-1H-吲唑-3-基)-5-(2-三甲基甲硅烷基-乙氧基甲基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-羧酸(1-异噁唑-3-基-乙基)-酰胺
向圆底烧瓶中装入2-(6-氟-1-甲基-1H-吲唑-3-基)-5-(2-三甲基甲硅烷基-乙氧基甲基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-羧酸(100mg,0.23mmol)和1-异噁唑-3-基-乙胺盐酸盐(来自步骤3的粗产物,81mg,0.41mmol)。添加DMF(1.1ml),接着添加N,N-二异丙基乙胺(0.26ml,1.49mmol)和HATU(95mg,0.25mmol)。将黄色的溶液在室温搅拌48小时。添加水并过滤所得悬浮液。将固体以水和石油醚洗涤然后高真空干燥得到115mg(95%)的2-(6-氟-1-甲基-1H-吲唑-3-基)-5-(2-三甲基甲硅烷基-乙氧基甲基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-羧酸(1-异噁唑-3-基-乙基)-酰胺,为灰白色粉末。
步骤5
2-(6-氟-1-甲基-1H-吲唑-3-基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-羧酸(1-异噁唑-3-基-乙基)-酰胺
在圆底烧瓶中,将2-(6-氟-1-甲基-1H-吲唑-3-基)-5-(2-三甲基甲硅烷基-乙氧基甲基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-羧酸(1-异噁唑-3-基-乙基)-酰胺(113mg,0.211mmol)溶解于二氯甲烷(1.1ml)中并添加三氟乙酸(0.65ml,8.4mmol)。将反应混合物在室温搅拌2小时,然后浓缩。将残余物溶解于二氯甲烷(1.1ml)中并添加乙二胺(0.86ml,12.7mmol)。将黄色的溶液在室温搅拌1小时,然后以水淬灭并用乙酸乙酯稀释。将所得悬浮液经过滤,经热水和乙酸乙酯洗涤,并经高真空干燥得到46mg(54%)的2-(6-氟-1-甲基-1H-吲唑-3-基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-羧酸(1-异噁唑-3-基-乙基)-酰胺,为浅黄色粉末。MS:(M+H)+=406;1H NMR(DMSO-d6,300MHz):δ(ppm)12.89(宽单峰,1H),9.12(s,1H),8.91(d,J=1.5Hz,1H),8.58(d,J=8.7Hz,1H),8.50(s,1H),8.44(dd,J=8.9,5.5Hz,1H),7.68(dd,J=9.6,2.1Hz,1H),7.02(td,J=9.1,1.9Hz,1H),6.68(d,J=1.5Hz,1H),5.53(quin,J=7.2Hz,1H),4.15(s,3H),1.65(d,J=6.8Hz,3H).
实施例54.
2-(6-氟-1-甲基-1H-吲唑-3-基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-羧酸[1-(5-甲基-异噁唑-3-基)-乙基]-酰胺
根据实施例53中阐述的操作制备,以5-甲基-异噁唑-3-甲醛代替步骤1中的异噁唑-3-甲醛。MS:(M+H)+=420.
1H NMR(DMSO-d6,300MHz):δ(ppm)12.86(宽单峰,1H),9.12(s,1H),8.55(d,J=8.3Hz,1H),8.50(s,1H),8.45(dd,J=8.9,5.5Hz,1H),7.68(dd,J=9.8,2.3Hz,1H),7.04(td,J=9.2,2.1Hz,1H),6.31(s,1H),5.38-5.50(m,1H),4.15(s,3H),2.37(s,3H),1.62(d,J=7.2Hz,3H).
实施例55.
2-(6-氟-1-甲基-1H-吲唑-3-基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-羧酸(1-异噁唑-5-基-乙基)-酰胺
步骤1
异噁唑5-基-甲醇
在圆底烧瓶中,将异噁唑-5-羧酸(1.0g,8.84mmol)溶解于THF(35ml)中。将溶液冷却至0℃并添加三乙胺(1.4ml,10.0mmol),接着添加氯甲酸乙酯(0.94ml,9.8mmol)。在添加后者时形成厚的沉淀。将悬浮液在0℃搅拌15分钟,然后经移液管分份添加硼氢化钠(1.00g,26.5mmol)在水(14ml)中的溶液。观察到剧烈地生成气体。于0℃搅拌反应混合物1小时,然后以水和饱和NH4Cl水溶液稀释,以二氯甲烷(3x)萃取。合并有机层,经硫酸钠干燥,过滤并浓缩。将残余物经硅胶色谱以EtOAc/己烷(梯度0-50%EtOAc)纯化得到513mg(59%)的异噁唑-5-基-甲醇,为无色油状物。1H NMR(CDCl3,300MHz):δ(ppm)8.23(d,J=1.9Hz,1H),6.26-6.30(m,1H),4.82(s,2H),2.13(宽单峰,1H).
步骤2
异噁唑-5-甲醛
在圆底烧瓶中,将异噁唑5-基-甲醇(511mg,5.16mmol)溶解于二氯甲烷(30ml)中。添加戴斯-马丁高碘剂(2.3g,5.41mmol),将反应混合物在室温搅拌1.5小时。将反应混合物以50ml的10%Na2S2O3水溶液和饱和NaHCO3水溶液的1:1溶液淬灭,且然后以二氯甲烷(2x)萃取。将有机层以饱和NaHCO3水溶液、水和盐水洗涤。将水层以二氯甲烷反萃取。合并有机层,经硫酸钠干燥,过滤并浓缩。将残余物经硅胶色谱以EtOAc/己烷(梯度0-40%EtOAc)纯化得到226mg(45%)的异噁唑-5-甲醛,为无色油状物。1H NMR(CDCl3,300MHz):δ(ppm)10.05(s,1H),8.44(d,J=1.9Hz,1H),7.02(d,J=1.9Hz,1H).
步骤3
2-(6-氟-1-甲基-1H-吲唑-3-基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-羧酸(1-异噁唑-5-基-乙基)-酰胺
根据实施例53中阐述的操作制备,以异噁唑-5-甲醛代替步骤1中的异噁唑-3-甲醛。MS:(M+H)+=406.
1H NMR(DMSO-d6,300MHz):δ(ppm)12.94(宽单峰,1H),9.12(s,1H),8.49-8.62(m,3H),8.34(dd,J=8.9,5.5Hz,1H),7.69(dd,J=9.8,1.9Hz,1H),7.12(td,J=9.2,2.1Hz,1H),6.56(d,J=1.9Hz,1H),5.62(quin,J=7.5Hz,1H),4.15(s,3H),1.67(d,J=7.2Hz,3H).
实施例56.
2-(6-氟-1-甲基-1H-吲唑-3-基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-羧酸((R)-2,2-二氟-1-甲基-丙基)-酰胺
步骤1
[(R)-1-(甲氧基-甲基-氨基甲酰基)-乙基]-氨基甲酸叔丁酯
向圆底烧瓶中装入Boc-D-丙氨酸(1.0g,5.29mmol)和N,O-二甲基羟基胺盐酸盐(670mg,6.87mmol)。添加DMF(12ml),接着添加N,N-二异丙基乙胺(2.4ml,13.7mmol)和HATU(2.21g,5.81mmol)。将黄色的悬浮液在室温搅拌48小时。将反应混合物以水淬灭并添加石油醚。将所得悬浮液经过滤,以水和石油醚洗涤并高真空干燥得到1.05g(85%)的[(R)-1-(甲氧基-甲基-氨基甲酰基)-乙基]-氨基甲酸叔丁酯,为白色粉末。
步骤2
((R)-1-甲基-2-氧代-丙基)-氨基甲酸叔丁酯
在圆底烧瓶中,将[(R)-1-(甲氧基-甲基-氨基甲酰基)-乙基]-氨基甲酸叔丁酯(3.00g,12.9mmol)溶解于THF(100ml)中。将溶液冷却至-16℃(NaCl/冰浴)且经20分钟滴加甲基溴化镁(3.0M的乙醚溶液,12.0ml,36.0mmol)。在添加后,让反应混合物缓慢冷却至室温过夜。将反应混合物冷却至0℃,以饱和NH4Cl水溶液淬灭并以EtOAc(2x)萃取。将合并的有机层以水和盐水洗涤,然后经硫酸钠干燥,过滤并浓缩。将残余物经硅胶色谱以EtOAc/己烷(梯度0-20%EtOAc)纯化得到2.21g(91%)的((R)-1-甲基-2-氧代-丙基)-氨基甲酸叔丁酯,为白色固体。
步骤3
((R)-2,2-二氟-1-甲基-丙基)-氨基甲酸叔丁酯
在圆底烧瓶中,将((R)-1-甲基-2-氧代-丙基)-氨基甲酸叔丁酯(300mg,1.6mmol)溶解于二氯甲烷(15ml)中。室温滴加DAST(0.64ml,4.84mmol),将反应混合物在室温搅拌过夜,然后回流下搅拌7小时。将反应混合物冷却至室温,并以15ml的饱和NaHCO3水溶液淬灭,且然后以二氯甲烷(2x)萃取。合并有机层,经硫酸钠干燥,过滤并浓缩。将残余物经硅胶色谱以EtOAc/己烷(梯度0-5%EtOAc)纯化得到152mg(45%)的((R)-2,2-二氟-1-甲基-丙基)-氨基甲酸叔丁酯,为浅黄色固体。1H NMR(CDCl3,300MHz):δ(ppm)4.59(宽单峰,1H),3.90-4.08(m,1H),1.62(t,J=18.9Hz,3H),1.46(s,9H),1.23(d,J=6.8Hz,3H).
步骤4
(R)-2,2-二氟-1-甲基-丙胺三氟乙酸盐
在圆底烧瓶中,将((R)-2,2-二氟-1-甲基-丙基)-氨基甲酸叔丁酯(148mg,0.71mmol)溶解于二氯甲烷(3ml)中并缓慢地添加三氟乙酸(1.6ml,20.8mmol)。将反应混合物在室温搅拌1.5小时,然后浓缩得到(R)-2,2-二氟-1-甲基-丙胺三氟乙酸盐,为浅棕色油状物,其不经进一步纯化即可使用。
步骤5
2-(6-氟-1-甲基-1H-吲唑-3-基)-5-(2-三甲基甲硅烷基-乙氧基甲基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-羧酸((R)-2,2-二氟-1-甲基-丙基)-酰胺
在圆底烧瓶中,将(R)-2,2-二氟-1-甲基-丙胺三氟乙酸盐(来自步骤4的粗产物)溶解于DMF(1.2ml)中并添加N,N-二异丙基乙胺(0.5ml,2.86mmol)。然后添加2-(6-氟-1-甲基-1H-吲唑-3-基)-5-(2-三甲基甲硅烷基-乙氧基甲基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-羧酸(110mg,0.25mmol),接着添加HATU(104mg,0.27mmol)。将黄色的溶液在室温搅拌过夜。添加水,并过滤悬浮液。将滤饼以水和石油醚洗涤然后高真空干燥得到108mg(81%)的2-(6-氟-1-甲基-1H-吲唑-3-基)-5-(2-三甲基甲硅烷基-乙氧基甲基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-羧酸((R)-2,2-二氟-1-甲基-丙基)-酰胺,为灰白色粉末。
步骤6
2-(6-氟-1-甲基-1H-吲唑-3-基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-羧酸((R)-2,2-二氟-1-甲基-丙基)-酰胺
在圆底烧瓶中,将2-(6-氟-1-甲基-1H-吲唑-3-基)-5-(2-三甲基甲硅烷基-乙氧基甲基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-羧酸((R)-2,2-二氟-1-甲基-丙基)-酰胺(105mg,197mmol)溶解于二氯甲烷(1ml)中并添加三氟乙酸(0.6ml,7.9mmol)。将反应混合物在室温搅拌2小时,然后浓缩。将残余物溶解于二氯甲烷(1ml)并添加乙二胺(0.8ml,11.8mmol)。将反应混合物在室温搅拌1小时,然后以水淬灭并用乙酸乙酯稀释。将所得悬浮液经过滤,经热水和乙酸乙酯洗涤,并经高真空干燥得到48mg(61%)的2-(6-氟-1-甲基-1H-吲唑-3-基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-羧酸((R)-2,2-二氟-1-甲基-丙基)-酰胺,为灰白色粉末。MS:(M+H)+=403;1H NMR(DMSO-d6,300MHz):δ(ppm)12.85(宽单峰,1H),9.12(s,1H),8.51(s,1H),8.45(dd,J=8.9,5.5Hz,1H),8.32(d,J=9.8Hz,1H),7.69(dd,J=9.8,2.3Hz,1H),7.10(td,J=9.1,1.9Hz,1H),4.56-4.80(m,1H),4.15(s,3H),1.72(t,J=19.3Hz,3H),1.37(d,J=6.8Hz,3H).
实施例57.
2-(6-氟-1-甲基-1H-吲唑-3-基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-羧酸(顺式-3-氰基甲基-环戊基)-酰胺
步骤1
3-氧代-2-氮杂-二环[2.2.1]庚-5-烯-2-羧酸叔丁酯
在圆底烧瓶中,将2-氮杂二环[2.2.1]庚-5-烯-3-酮(1.0g,9.16mmol)悬浮于THF(10ml)中并添加三乙胺(1.9ml,13.6mmol)、一缩二碳酸二-叔丁酯(2.4g,11.0mmol)和4-二甲基氨基吡啶(112mg,0.92mmol)。将反应混合物在室温搅拌过夜,然后以水淬灭,并以乙酸乙酯(2x)萃取。将合并的有机层以水和盐水洗涤,然后经硫酸钠干燥,过滤并浓缩。将残余物经硅胶色谱以EtOAc/己烷(梯度0-30%EtOAc)纯化得到1.79g(93%)的3-氧代-2-氮杂-二环[2.2.1]庚-5-烯-2-羧酸叔丁酯,为浅黄色固体。
步骤2
3-氧代-2-氮杂-二环[2.2.1]庚烷-2-羧酸叔丁酯
在帕尔压力瓶中,将3-氧代-2-氮杂-二环[2.2.1]庚-5-烯-2-羧酸叔丁酯(1.77g,8.46mmol)溶解于甲醇(12ml)中并小心地添加10%钯/炭(湿,170mg,0.16mmol)。将瓶置于帕尔氢化器中并在40psi氢气气氛下震荡2小时。将反应混合物经硅藻土过滤,并经甲醇/乙酸乙酯淋洗。将滤液浓缩得到1.88g的3-氧代-2-氮杂-二环[2.2.1]庚烷-2-羧酸叔丁酯,为浅灰色油状物,其不经进一步纯化即可使用。
步骤3
(顺式-3-羟基甲基-环戊基)-氨基甲酸叔丁酯
在圆底烧瓶中,将3-氧代-2-氮杂-二环[2.2.1]庚烷-2-羧酸叔丁酯(来自步骤2的粗产物,1.87g)溶解于THF(20ml)和水(2ml)中。将反应混合物冷却至0℃并添加硼氢化钠(301mg,7.97mmol)。将反应混合物在0℃搅拌30分钟,然后添加第二份硼氢化钠(301mg,7.97mmol)。于0℃搅拌反应混合物7.5小时,然后添加第三份硼氢化钠(602mg,15.94mmol)。将反应混合物在室温搅拌过夜,然后添加第四份硼氢化钠(602mg,15.94mmol)。将反应混合物在室温搅拌过夜,然后冷却至0℃,以1M HCl小心地淬灭。当停止产生气体(pH=~6),将混合物以二氯甲烷(3x)萃取。合并有机层,经硫酸钠干燥,过滤并浓缩。将残余物经硅胶色谱以EtOAc/己烷(梯度0-60%EtOAc)纯化得到1.73g(95%,2个步骤)的(顺式-3-羟基甲基-环戊基)-氨基甲酸叔丁酯,为灰白色固体。
步骤4
甲磺酸(顺式)-3-叔丁氧基羰基氨基-环戊基甲酯
在圆底烧瓶中,将(顺式-3-羟基甲基-环戊基)-氨基甲酸叔丁酯(500mg,2.21mmol)溶解于二氯甲烷(5ml)中。将溶液冷却至0℃,并添加三乙胺(0.40ml,2.87mmol),接着添加甲磺酰氯(0.20ml,2.57mmol)。于0℃搅拌反应混合物45分钟,然后以水淬灭并以二氯甲烷(2x)淬灭。合并有机层,经硫酸钠干燥,过滤并浓缩得到780mg的甲磺酸(顺式)-3-叔丁氧基羰基氨基-环戊基甲酯,为淡黄色油状物,其不经进一步纯化即可使用。
步骤5
(顺式-3-氰基甲基-环戊基)-氨基甲酸叔丁酯
在圆底烧瓶中,将甲磺酸(顺式)-3-叔丁氧基羰基氨基-环戊基甲酯(来自步骤4的粗产物,779mg)溶解于DMF(5ml)中。添加氰化钾(277mg,4.25mmol)并于80℃搅拌反应混合物过夜。添加氰化钠(104mg,2.12mmol)并于80℃搅拌反应混合物48小时。将反应混合物冷却至室温,以水淬灭并用乙醚(2x)萃取。将合并的有机层以水洗涤两次并以盐水洗涤一次,然后经硫酸钠干燥,过滤并浓缩。将残余物经硅胶色谱以EtOAc/己烷(梯度0-30%EtOAc)纯化得到190mg(38%,2个步骤)的(顺式-3-氰基甲基-环戊基)-氨基甲酸叔丁酯,为浅黄色油状物。
步骤6
(顺式-3-氨基-环戊基)-乙腈三氟乙酸盐
在圆底烧瓶中,将(顺式-3-氰基甲基-环戊基)-氨基甲酸叔丁酯(188mg,0.84mmol)溶解于二氯甲烷(5ml)中并缓慢添加三氟乙酸(2.0ml,26.0mmol)。将反应混合物在室温搅拌2小时,然后浓缩得到(顺式-3-氨基-环戊基)-乙腈三氟乙酸盐,为黄色油状物,其不经进一步纯化即可使用。
步骤7
2-(6-氟-1-甲基-1H-吲唑-3-基)-5-(2-三甲基甲硅烷基-乙氧基甲基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-羧酸(顺式-3-氰基甲基-环戊基)-酰胺
在圆底烧瓶中,将(顺式-3-氨基-环戊基)-乙腈三氟乙酸盐(来自步骤6的粗产物)溶解于DMF(1.3ml)中并添加N,N-二异丙基乙胺(0.65ml,3.72mmol)。然后,添加2-(6-氟-1-甲基-1H-吲唑-3-基)-5-(2-三甲基甲硅烷基-乙氧基甲基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-羧酸(110mg,0.25mmol)和HATU(104mg,0.27mmol)。将黄色的溶液在室温搅拌48小时。添加水和石油醚,并过滤所得悬浮液。将滤饼以水和石油醚洗涤然后高真空干燥得到128mg(94%)的2-(6-氟-1-甲基-1H-吲唑-3-基)-5-(2-三甲基甲硅烷基-乙氧基甲基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-羧酸(顺式-3-氰基甲基-环戊基)-酰胺,为灰白色粉末。
步骤8
2-(6-氟-1-甲基-1H-吲唑-3-基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-羧酸(顺式-3-氰基甲基-环戊基)-酰胺
在圆底烧瓶中,将2-(6-氟-1-甲基-1H-吲唑-3-基)-5-(2-三甲基甲硅烷基-乙氧基甲基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-羧酸(顺式-3-氰基甲基-环戊基)-酰胺(126mg,0.23mmol)溶解于二氯甲烷(1.2ml)中并添加三氟乙酸(0.7ml,9.2mmol)。将反应混合物在室温搅拌2小时,然后浓缩。将残余物溶解于二氯甲烷(1.2ml)中并添加乙二胺(0.93ml,13.8mmol)。将黄色的溶液在室温搅拌1.25小时,然后以水淬灭并用乙酸乙酯稀释。将所得悬浮液经过滤,经热水和乙酸乙酯洗涤,并经高真空干燥得到75mg(74%)的2-(6-氟-1-甲基-1H-吲唑-3-基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-羧酸(顺式-3-氰基甲基-环戊基)-酰胺,为浅黄色粉末。MS:(M+H)+=418;1H NMR(DMSO-d6,300MHz):δ(ppm)12.61(宽单峰,1H),9.09(s,1H),8.40-8.49(m,2H),8.18(d,J=7.2Hz,1H),7.69(dd,J=9.8,2.3Hz,1H),7.24(td,J=9.2,2.1Hz,1H),4.29-4.45(m,1H),4.15(s,3H),2.66(d,J=6.4Hz,2H),2.34-2.43(m,1H),2.23-2.34(m,1H),2.11-2.23(m,1H),1.85-2.00(m,1H),1.46-1.74(m,2H),1.28-1.41(m,1H).
实施例58.
2-(6-氟-咪唑并[1,5-a]吡啶-1-基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-羧酸((R)-1-噁唑-2-基-乙基)-酰胺
步骤1
2-溴-5-(2-三甲基甲硅烷基-乙氧基甲基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-羧酸(1-噁唑-2-基-乙基)-酰胺
向圆底烧瓶中装入2-溴-5-((2-(三甲基甲硅烷基)乙氧基)甲基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-羧酸(300mg,0.81mmol)和1-噁唑-2-基-乙胺二盐酸盐(244mg,1.0mmol)。添加DMF(4ml),接着添加N,N-二异丙基乙胺(0.9ml,5.15mmol)和HATU(337mg,0.89mmol)。将反应混合物在室温搅拌过夜,然后以水淬灭并以石油醚稀释。过滤所得悬浮液。将滤饼以水和石油醚洗涤然后高真空干燥得到268mg(71%)的2-溴-5-(2-三甲基甲硅烷基-乙氧基甲基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-羧酸(1-噁唑-2-基-乙基)-酰胺,为灰白色粉末。
步骤2
2-溴-5-(2-三甲基甲硅烷基-乙氧基甲基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-羧酸((R)-1-噁唑-2-基-乙基)-酰胺和2-溴-5-(2-三甲基甲硅烷基-乙氧基甲基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-羧酸((S)-1-噁唑-2-基-乙基)-酰胺
将2-溴-5-(2-三甲基甲硅烷基-乙氧基甲基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-羧酸(1-噁唑-2-基-乙基)-酰胺(268mg)的外消旋样品经历SFC色谱。对映异构体的分离以DAICEL OD3x25柱使用20%MeOH/CO2作为洗脱液实现。得到152mg(57%)的2-溴-5-(2-三甲基甲硅烷基-乙氧基甲基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-羧酸((R)-1-噁唑-2-基-乙基)-酰胺,为灰白色粉末,和85mg(32%)的2-溴-5-(2-三甲基甲硅烷基-乙氧基甲基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-羧酸((S)-1-噁唑-2-基-乙基)-酰胺,为灰白色粉末。
步骤3
2-(6-氟-咪唑并[1,5-a]吡啶-1-基)-5-(2-三甲基甲硅烷基-乙氧基甲基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-羧酸((R)-1-噁唑-2-基-乙基)-酰胺
在圆底烧瓶中,将2-溴-5-(2-三甲基甲硅烷基-乙氧基甲基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-羧酸((R)-1-噁唑-2-基-乙基)-酰胺(148mg,0.32mmol)和6-氟-1-三丁基甲锡烷基-咪唑并[1,5-a]吡啶(380mg,0.45mmol)溶解于DMF(3ml)中。将烧瓶抽真空并回填以氩气,然后添加四(三苯基膦)钯(0)(19mg,0.016mmol)和碘化亚铜(I)(13mg,0.068mmol)。于80℃在油浴中搅拌反应混合物过夜,然后冷却至室温,以水淬灭并用乙醚(2x)萃取。将合并的有机层以水洗涤两次并以盐水洗涤一次,然后经硫酸钠干燥,过滤并浓缩。将残余物以硅胶色谱MeOH/CH2Cl2/0.5%NH4OH(梯度0-2%MeOH)纯化得到109mg(66%)的2-(6-氟-咪唑并[1,5-a]吡啶-1-基)-5-(2-三甲基甲硅烷基-乙氧基甲基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-羧酸((R)-1-噁唑-2-基-乙基)-酰胺,为黄色固体。
步骤4
2-(6-氟-咪唑并[1,5-a]吡啶-1-基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-羧酸((R)-1-噁唑-2-基-乙基)-酰胺
在圆底烧瓶中,将2-(6-氟-咪唑并[1,5-a]吡啶-1-基)-5-(2-三甲基甲硅烷基-乙氧基甲基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-羧酸((R)-1-噁唑-2-基-乙基)-酰胺(107mg,0.205mmol)溶解于二氯甲烷(1.1ml)中并添加三氟乙酸(0.64ml,8.3mmol)。将反应混合物在室温搅拌2小时,然后浓缩。将残余物溶解于二氯甲烷(1.1ml)中并添加乙二胺(0.84ml,12.4mmol)。将黄色反应混合物在室温搅拌1小时,然后以水淬灭并用乙酸乙酯稀释。将所得悬浮液经过滤,经热水和乙酸乙酯洗涤,并经高真空干燥得到76mg(90%)的2-(6-氟-咪唑并[1,5-a]吡啶-1-基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-羧酸((R)-1-噁唑-2-基-乙基)-酰胺,为黄色粉末。MS:(M+Na)+=414;1H NMR(DMSO-d6,300MHz):δ(ppm)12.76(宽单峰,1H),9.12(s,1H),8.70(dd,J=4.7,2.1Hz,1H),8.60(d,J=8.7Hz,1H),8.54(s,1H),8.36-8.46(m,2H),8.11(s,1H),7.25(s,1H),7.04(ddd,J=9.9,7.8,1.9Hz,1H),5.45-5.60(m,1H),1.65(d,J=6.8Hz,3H).
实施例59.
2-(6-氟-1-甲基-1H-吲唑-3-基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-羧酸[(R)-1-(3-氟-氮杂环丁烷-1-羰基)-丁基]-酰胺
步骤1
[(R)-1-(3-氟-氮杂环丁烷-1-羰基)-丁基]-氨基甲酸叔丁酯
向圆底烧瓶中装入Boc-D-正缬氨酸(300mg,1.38mmol)和3-氟氮杂环丁烷盐酸盐(216mg,1.93mmol)。添加DMF(6ml),接着添加N,N-二异丙基乙胺(0.65ml,3.72mmol)和HATU(578mg,1.52mmol)。将黄色反应混合物在室温搅拌48小时,以水淬灭并用乙醚(2x)萃取。将合并的有机层以水洗涤两次并以盐水洗涤一次,然后经硫酸钠干燥,过滤并浓缩得到417mg的[(R)-1-(3-氟-氮杂环丁烷-1-羰基)-丁基]-氨基甲酸叔丁酯,为浅黄色固体。
步骤2
(R)-2-氨基-1-(3-氟-氮杂环丁烷-1-基)-戊-1-酮三氟乙酸盐
在圆底烧瓶中,将[(R)-1-(3-氟-氮杂环丁烷-1-羰基)-丁基]-氨基甲酸叔丁酯(200mg,0.66mmol)溶解于二氯甲烷(4ml)中并缓慢地添加三氟乙酸(1.6ml,20.8mmol)。将反应混合物在室温搅拌2小时,然后浓缩,得到(R)-2-氨基-1-(3-氟-氮杂环丁烷-1-基)-戊-1-酮三氟乙酸盐,为淡棕色油状物,其不经进一步纯化即可使用。
步骤3
2-(6-氟-1-甲基-1H-吲唑-3-基)-5-(2-三甲基甲硅烷基-乙氧基甲基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-羧酸[(R)-1-(3-氟-氮杂环丁烷-1-羰基)-丁基]-酰胺
在圆底烧瓶中,将(R)-2-氨基-1-(3-氟-氮杂环丁烷-1-基)-戊-1-酮三氟乙酸盐(来自步骤2的粗产物)溶解于DMF(1.5ml)中并添加N,N-二异丙基乙胺(0.60ml,3.44mmol)。然后添加2-(6-氟-1-甲基-1H-吲唑-3-基)-5-(2-三甲基甲硅烷基-乙氧基甲基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-羧酸(110mg,0.25mmol)和HATU(104mg,0.27mmol)。将黄色反应混合物在室温搅拌过夜,然后以水淬灭并以石油醚稀释。过滤所得悬浮液。将滤饼以水和石油醚洗涤然后高真空干燥得到128mg(86%)的2-(6-氟-1-甲基-1H-吲唑-3-基)-5-(2-三甲基甲硅烷基-乙氧基甲基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-羧酸[(R)-1-(3-氟-氮杂环丁烷-1-羰基)-丁基]-酰胺,为灰白色粉末。
步骤4
2-(6-氟-1-甲基-1H-吲唑-3-基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-羧酸[(R)-1-(3-氟-氮杂环丁烷-1-羰基)-丁基]-酰胺
在圆底烧瓶中,将2-(6-氟-1-甲基-1H-吲唑-3-基)-5-(2-三甲基甲硅烷基-乙氧基甲基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-羧酸[(R)-1-(3-氟-氮杂环丁烷-1-羰基)-丁基]-酰胺(126mg,0.21mmol)溶解于二氯甲烷(1.1ml)中并添加三氟乙酸(0.65ml,8.4mmol)。将反应混合物在室温搅拌2.5小时,然后浓缩。将残余物溶解于二氯甲烷(1.1ml)中并添加乙二胺(0.85ml,12.7mmol)。将反应混合物在室温搅拌1小时,然后以水淬灭并用乙酸乙酯稀释。将所得悬浮液经过滤,经热水和乙酸乙酯洗涤,并经高真空干燥得到49mg(50%)的2-(6-氟-1-甲基-1H-吲唑-3-基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-羧酸[(R)-1-(3-氟-氮杂环丁烷-1-羰基)-丁基]-酰胺,为灰白色粉末。MS:(M+H)+=468;1H NMR(DMSO-d6,300MHz):δ(ppm)12.84(宽单峰,1H),9.15(s,1H),8.74(dt,J=9.3,4.6Hz,1H),8.41-8.52(m,2H),7.68(d,J=7.9Hz,1H),7.02-7.17(m,1H),5.29-5.61(m,1H),4.18-4.84(m,4H),4.16(s,3H),3.87-4.09(m,1H),1.62-1.91(m,2H),1.41(d,J=7.2Hz,2H),0.82-0.97(m,3H).
实施例60.
2-(6-氟-1-甲基-1H-吲唑-3-基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-羧酸[(R)-1-(4,5-二氢-噁唑-2-基)-乙基]-酰胺
步骤1
[(R)-1-(2-羟基-乙基氨基甲酰基)-乙基]-氨基甲酸叔丁酯
在圆底烧瓶中,将Boc-D-丙氨酸(1.0g,5.29mmol)溶解于THF(40ml)中并添加1,1’-羰基二咪唑(1.03g,6.34mmol)。于60℃搅拌反应混合物45min,然后冷却至室温,并添加乙醇胺(3.2ml,52.9mmol)。将反应混合物在室温搅拌过夜,然后以1M HCl水溶液(15ml)淬灭并以二氯甲烷萃取。将有机层以1M HCl水溶液、水和盐水洗涤。将水层以二氯甲烷(2x)反萃取。合并有机层,经硫酸钠干燥,过滤并浓缩得到1.11g(90%)的[(R)-1-(2-羟基-乙基氨基甲酰基)-乙基]-氨基甲酸叔丁酯,为无色油状物。
步骤2
(R)-2-氨基-N-(2-羟基-乙基)-丙酰胺三氟乙酸盐
在圆底烧瓶中,将[(R)-1-(2-羟基-乙基氨基甲酰基)-乙基]-氨基甲酸叔丁酯(180mg,0.78mmol)溶解于二氯甲烷(5ml)中并缓慢地添加三氟乙酸(1.8ml,23.4mmol)。将淡黄色反应混合物在室温搅拌2小时,然后浓缩得到(R)-2-氨基-N-(2-羟基-乙基)-丙酰胺三氟乙酸盐,为浅黄色油状物,其不经进一步纯化即可使用。
步骤3
2-(6-氟-1-甲基-1H-吲唑-3-基)-5-(2-三甲基甲硅烷基-乙氧基甲基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-羧酸[(R)-1-(2-羟基-乙基氨基甲酰基)-乙基]-酰胺
在圆底烧瓶中,将(R)-2-氨基-N-(2-羟基-乙基)-丙酰胺三氟乙酸盐(来自步骤2的粗产物)溶解于DMF(2ml)中并添加N,N-二异丙基乙胺(0.70ml,4.0mmol)。然后添加2-(6-氟-1-甲基-1H-吲唑-3-基)-5-(2-三甲基甲硅烷基-乙氧基甲基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-羧酸(170mg,0.39mmol),接着添加HATU(161mg,0.42mmol)。将黄色反应混合物在室温搅拌过夜,然后以水淬灭并以石油醚稀释。过滤所得悬浮液。将滤饼以水和石油醚洗涤,然后高真空干燥。将残余物经硅胶色谱以EtOAc/己烷(梯度0-100%EtOAc)和MeOH/EtOAc(梯度0-10%MeOH)纯化得到127mg(59%)的2-(6-氟-1-甲基-1H-吲唑-3-基)-5-(2-三甲基甲硅烷基-乙氧基甲基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-羧酸[(R)-1-(2-羟基-乙基氨基甲酰基)-乙基]-酰胺,为灰白色固体。
步骤4
2-(6-氟-1-甲基-1H-吲唑-3-基)-5-(2-三甲基甲硅烷基-乙氧基甲基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-羧酸[(R)-1-(4,5-二氢-噁唑-2-基)-乙基]-酰胺
在圆底烧瓶中,将2-(6-氟-1-甲基-1H-吲唑-3-基)-5-(2-三甲基甲硅烷基-乙氧基甲基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-羧酸[(R)-1-(2-羟基-乙基氨基甲酰基)-乙基]-酰胺(126mg,0.23mmol)溶解于二氯甲烷(2.2ml)中。将溶液冷却至-76℃并添加DAST(45μl,0.34mmol)。于-76℃搅拌淡黄色反应混合物6小时,然后以一份添加无水碳酸钾(64mg,0.46mmol)。让反应混合物温热至室温,以饱和NaHCO3水溶液淬灭,以二氯甲烷(3x)萃取。合并有机层,经硫酸钠干燥,过滤并浓缩。将残余物经硅胶色谱以EtOAc/己烷(梯度0-90%EtOAc)纯化得到86mg(71%)的2-(6-氟-1-甲基-1H-吲唑-3-基)-5-(2-三甲基甲硅烷基-乙氧基甲基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-羧酸[(R)-1-(4,5-二氢-噁唑-2-基)-乙基]-酰胺,为浅黄色固体。
步骤5
2-(6-氟-1-甲基-1H-吲唑-3-基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-羧酸[(R)-1-(4,5-二氢-噁唑-2-基)-乙基]-酰胺
在小瓶中,将2-(6-氟-1-甲基-1H-吲唑-3-基)-5-(2-三甲基甲硅烷基-乙氧基甲基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-羧酸[(R)-1-(4,5-二氢-噁唑-2-基)-乙基]-酰胺(85mg,0.16mmol)溶解于四丁基氟化铵(1.0M在THF中,1.6ml,1.6mmol)。于60℃搅拌黄色反应混合物过夜然后冷却至室温,以水淬灭并以EtOAc(2x)萃取。将合并的有机层以水和盐水洗涤,然后经硫酸钠干燥,过滤并浓缩。将残余物经硅胶色谱以MeOH/CH2Cl2/0.5%NH4OH(梯度0-5%MeOH)纯化得到27mg(40%)的2-(6-氟-1-甲基-1H-吲唑-3-基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-羧酸[(R)-1-(4,5-二氢-噁唑-2-基)-乙基]-酰胺,为灰白色固体。MS:(M+Na)+=430;1H NMR(DMSO-d6,300MHz):δ(ppm)12.93(宽单峰,1H),9.14(s,1H),8.69(dd,J=9.1,5.3Hz,1H),8.57(d,J=8.3Hz,1H),8.49(s,1H),7.69(dd,J=9.8,1.9Hz,1H),7.14(td,J=9.1,2.3Hz,1H),4.97(quin,J=7.5Hz,1H),4.27-4.39(m,2H),4.16(s,3H),3.79(td,J=9.3,4.3Hz,2H),1.50(d,J=7.2Hz,3H).
实施例61.
2-(6-氟-1-甲基-1H-吲唑-3-基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-羧酸((R)-2,2-二氟-1-甲基-3-苯基-丙基)-酰胺
步骤1
((R)-1-甲基-2-氧代-3-苯基-丙基)-氨基甲酸叔丁酯
在圆底烧瓶中,将[(R)-1-(甲氧基-甲基-氨基甲酰基)-乙基]-氨基甲酸叔丁酯(300mg,1.29mmol)溶解于THF(8ml)中。将溶液冷却至-16℃(NaCl/冰浴)并滴加苄基氯化镁(1.0M的乙醚溶液,3.8ml,3.8mmol)。在添加后,让反应混合物缓慢地温热室温并搅拌5.5小时。将反应混合物以饱和NH4Cl水溶液淬灭并以EtOAc(2x)萃取。将合并的有机层以水和盐水洗涤,然后经硫酸钠干燥,过滤并浓缩。将残余物经硅胶色谱以EtOAc/己烷(梯度0-20%EtOAc)纯化得到353mg(99%)的((R)-1-甲基-2-氧代-3-苯基-丙基)-氨基甲酸叔丁酯,为无色油状物。
步骤2
((R)-2,2-二氟-1-甲基-3-苯基-丙基)-氨基甲酸叔丁酯
在干燥的圆底烧瓶中,将((R)-1-甲基-2-氧代-3-苯基-丙基)-氨基甲酸叔丁酯(171mg,0.65mmol)溶解于二氯甲烷(0.3ml)中。于室温滴加DAST(0.26ml,1.97mmol),且将反应混合物在室温搅拌过夜。将反应混合物以二氯甲烷稀释,并以5ml的饱和NaHCO3水溶液缓慢地淬灭。将水层以二氯甲烷萃取(2x)。合并有机层,经硫酸钠干燥,过滤并浓缩。将残余物经硅胶色谱以EtOAc/己烷(梯度0-5%EtOAc)纯化得到95mg(51%)的((R)-2,2-二氟-1-甲基-3-苯基-丙基)-氨基甲酸叔丁酯,为浅黄色固体。1H NMR(CDCl3,300MHz):δ(ppm)7.23-7.39(m,5H),4.57-4.72(m,1H),3.93-4.14(m,1H),3.12-3.28(m,2H),1.47(s,9H),1.24(dd,J=6.8,1.1Hz,3H).
步骤3
(R)-2,2-二氟-1-甲基-3-苯基-丙胺三氟乙酸盐
在圆底烧瓶中,将((R)-2,2-二氟-1-甲基-3-苯基-丙基)-氨基甲酸叔丁酯(92mg,0.32mmol)溶解于二氯甲烷(2ml)中并缓慢地添加三氟乙酸(0.75ml,9.73mmol)。将反应混合物在室温搅拌2小时,然后浓缩得到(R)-2,2-二氟-1-甲基-3-苯基-丙胺三氟乙酸盐,为浅棕色油状物,其不经进一步纯化而使用。
步骤4
2-(6-氟-1-甲基-1H-吲唑-3-基)-5-(2-三甲基甲硅烷基-乙氧基甲基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-羧酸((R)-2,2-二氟-1-甲基-3-苯基-丙基)-酰胺
在圆底烧瓶中,将(R)-2,2-二氟-1-甲基-3-苯基-丙胺三氟乙酸盐(来自步骤3的粗产物)溶解于DMF(1.1ml)中并添加N,N-二异丙基乙胺(0.25ml,1.43mmol)。然后添加2-(6-氟-1-甲基-1H-吲唑-3-基)-5-(2-三甲基甲硅烷基-乙氧基甲基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-羧酸(100mg,23mmol),接着添加HATU(95mg,0.25mmol)。将黄色的反应混合物在室温搅拌过夜,然后以水淬灭并用乙醚(2x)萃取。将合并的有机层以水洗涤两次并以盐水洗涤一次,然后经硫酸钠干燥,过滤并浓缩。将残余物以石油醚研磨得到136mg(94%)的2-(6-氟-1-甲基-1H-吲唑-3-基)-5-(2-三甲基甲硅烷基-乙氧基甲基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-羧酸((R)-2,2-二氟-1-甲基-3-苯基-丙基)-酰胺,为灰白色粉末。
步骤5
2-(6-氟-1-甲基-1H-吲唑-3-基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-羧酸((R)-2,2-二氟-1-甲基-3-苯基-丙基)-酰胺
在圆底烧瓶中,将2-(6-氟-1-甲基-1H-吲唑-3-基)-5-(2-三甲基甲硅烷基-乙氧基甲基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-羧酸((R)-2,2-二氟-1-甲基-3-苯基-丙基)-酰胺(133mg,0.21mmol溶解于二氯甲烷(1.1ml)中并添加三氟乙酸(0.64ml,8.3mmol)。将反应混合物在室温搅拌2小时,然后浓缩。将残余物溶解于二氯甲烷(1.1ml)中并添加乙二胺(0.84ml,12.4mmol)。将黄色的溶液在室温搅拌1小时,然后以水淬灭并以EtOAc(2x)萃取。将合并的有机层以水和盐水洗涤,然后经硫酸钠干燥,过滤并浓缩。将残余物以5%EtOAc/乙醚研磨得到73mg(70%)的2-(6-氟-1-甲基-1H-吲唑-3-基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-羧酸((R)-2,2-二氟-1-甲基-3-苯基-丙基)-酰胺,为浅黄色粉末。MS:(M+Na)+=501;1H NMR(DMSO-d6,400MHz):δ(ppm)12.94(宽单峰,1H),9.12(s,1H),8.52(s,1H),8.47(dd,J=8.9,5.4Hz,1H),8.36(d,J=9.8Hz,1H),7.68(dd,J=9.8,2.0Hz,1H),7.23-7.35(m,5H),7.02(td,J=9.0,2.3Hz,1H),4.60-4.78(m,1H),4.15(s,3H),3.33-3.45(m,2H),1.41(d,J=7.0Hz,3H).
实施例62.
2-(6-氟-1-甲基-1H-吲唑-3-基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-羧酸[(R)-1-(4-氰基甲基-噁唑-2-基)-乙基]-酰胺
步骤1
2-((R)-2-叔丁氧基羰基氨基-丙酰基氨基)-3-羟基-丙酸甲酯
向圆底烧瓶中装入Boc-D-丙氨酸(600mg,3.17mmol)和DL-丝氨酸甲酯盐酸盐(691mg,4.44mmol)。添加DMF(12ml),接着添加N,N-二异丙基乙胺(1.5ml,8.6mmol)和HATU(1.33g,3.49mmol)。将黄色反应混合物在室温搅拌48小时,然后以水淬灭并用乙醚(2x)萃取。将合并的有机层以水洗涤两次并以盐水洗涤一次,然后经硫酸钠干燥,过滤并浓缩得到422mg(41%)的2-((R)-2-叔丁氧基羰基氨基-丙酰基氨基)-3-羟基-丙酸甲酯,为无色油状物。
步骤2
2-((R)-1-叔丁氧基羰基氨基-乙基)-4,5-二氢-噁唑-4-羧酸甲酯
在圆底烧瓶中,将2-((R)-2-叔丁氧基羰基氨基-丙酰基氨基)-3-羟基-丙酸甲酯(419mg,1.3mmol)溶解于二氯甲烷(11ml)。将溶液冷却至-76℃并滴加DAST(0.20ml,1.51mmol)。于-76℃搅拌浅黄色溶液2小时,然后以一份添加无水碳酸钾(269mg,1.95mmol)。让反应混合物温热至室温,以10ml的饱和NaHCO3水溶液淬灭,以二氯甲烷(3x)萃取。合并有机层,经硫酸钠干燥,过滤并浓缩得到339mg(91%)的2-((R)-1-叔丁氧基羰基氨基-乙基)-4,5-二氢-噁唑-4-羧酸甲酯,为棕色油状物。
步骤3
2-((R)-1-叔丁氧基羰基氨基-乙基)-噁唑-4-羧酸甲酯
在圆底烧瓶中,将2-((R)-1-叔丁氧基羰基氨基-乙基)-4,5-二氢-噁唑-4-羧酸甲酯(337mg,1.18mmol)溶解于二氯甲烷(11ml)中。将溶液冷却至-16℃(NaCl/冰浴)并添加DBU(0.35ml,2.32mmol)。5分钟后,添加溴三氯甲烷(0.13ml,1.33mmol),并让反应混合物缓慢地温热至室温,并搅拌4天。将反应混合物以0.1M HCl水溶液淬灭并以EtOAc(2x)萃取。将合并的有机层以水和盐水洗涤,然后经硫酸钠干燥,过滤并浓缩。将残余物经硅胶色谱以EtOAc/己烷(梯度0-30%EtOAc)纯化得到152mg(48%)的2-((R)-1-叔丁氧基羰基氨基-乙基)-噁唑-4-羧酸甲酯,为灰白色固体。
步骤4
[(R)-1-(4-羟基甲基-噁唑-2-基)-乙基]-氨基甲酸叔丁酯
在圆底烧瓶中,将2-((R)-1-叔丁氧基羰基氨基-乙基)-噁唑-4-羧酸甲酯(151mg,0.56mmol)溶解于THF(4ml)中。将淡黄色溶液冷却至0℃,并滴加氢化锂铝(1.0M在THF中,0.60ml,0.60mmol)。于0℃搅拌反应混合物1.5小时,然后小心地添加十水硫酸钠。当停止产生气体时,移去冰浴,添加硫酸钠,并于室温剧烈搅拌混合物30分钟。将悬浮液经硅藻土过滤,并以乙酸乙酯/甲醇淋洗。将滤液浓缩得到140mg(93%)的[(R)-1-(4-羟基甲基-噁唑-2-基)-乙基]-氨基甲酸叔丁酯,为黄色油状物,其不经进一步纯化即可使用。
步骤5
[2-((R)-1-氨基-乙基)-噁唑-4-基]-甲醇三氟乙酸盐
在圆底烧瓶中,将[(R)-1-(4-羟基甲基-噁唑-2-基)-乙基]-氨基甲酸叔丁酯(137mg,0.51mmol)溶解于二氯甲烷(3ml)中并缓慢地添加三氟乙酸(1.2ml,15.6mmol)。将反应混合物在室温搅拌1.5小时,然后浓缩得到[2-((R)-1-氨基-乙基)-噁唑-4-基]-甲醇三氟乙酸盐,为棕色油状物,其不经进一步纯化即可使用。
步骤6
2-(6-氟-1-甲基-1H-吲唑-3-基)-5-(2-三甲基甲硅烷基-乙氧基甲基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-羧酸[(R)-1-(4-羟基甲基-噁唑-2-基)-乙基]-酰胺
在圆底烧瓶中,将[2-((R)-1-氨基-乙基)-噁唑-4-基]-甲醇三氟乙酸盐(来自步骤5的粗产物)溶解于DMF(1.5ml)中并添加N,N-二异丙基乙胺(0.70ml,4.0mmol)。然后添加2-(6-氟-1-甲基-1H-吲唑-3-基)-5-(2-三甲基甲硅烷基-乙氧基甲基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-羧酸(140mg,0.32mmol),接着添加HATU(133mg,0.35mmol)。将反应混合物在室温搅拌过夜,然后以水淬灭并用乙醚(2x)萃取。将合并的有机层以水洗涤两次并以盐水洗涤一次,然后经硫酸钠干燥,过滤并浓缩。将残余物经硅胶色谱以EtOAc/己烷(梯度0-100%EtOAc)纯化得到118mg(66%)的2-(6-氟-1-甲基-1H-吲唑-3-基)-5-(2-三甲基甲硅烷基-乙氧基甲基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-羧酸[(R)-1-(4-羟基甲基-噁唑-2-基)-乙基]-酰胺,为浅棕色泡沫。
步骤7
甲磺酸2-((R)-1-{[2-(6-氟-1-甲基-1H-吲唑-3-基)-5-(2-三甲基甲硅烷基-乙氧基甲基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-羰基]-氨基}-乙基)-噁唑-4-基甲酯
在圆底烧瓶中,将2-(6-氟-1-甲基-1H-吲唑-3-基)-5-(2-三甲基甲硅烷基-乙氧基甲基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-羧酸[(R)-1-(4-羟基甲基-噁唑-2-基)-乙基]-酰胺(115mg,0.20mmol)溶解于二氯甲烷(1ml)中。将溶液冷却至0℃并添加三乙胺(0.04ml,0.29mmol)和甲磺酰氯(19μl,0.24mmol)。于0℃搅拌反应混合物2小时,然后以水淬灭并以二氯甲烷(2x)萃取。合并有机层,经硫酸钠干燥,过滤并浓缩得到147mg的甲磺酸2-((R)-1-{[2-(6-氟-1-甲基-1H-吲唑-3-基)-5-(2-三甲基甲硅烷基-乙氧基甲基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-羰基]-氨基}-乙基)-噁唑-4-基甲酯,为黄色泡沫,其不经进一步纯化即可使用。
步骤8
2-(6-氟-1-甲基-1H-吲唑-3-基)-5-(2-三甲基甲硅烷基-乙氧基甲基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-羧酸[(R)-1-(4-氰基甲基-噁唑-2-基)-乙基]-酰胺
在圆底烧瓶中,将甲磺酸2-((R)-1-{[2-(6-氟-1-甲基-1H-吲唑-3-基)-5-(2-三甲基甲硅烷基-乙氧基甲基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-羰基]-氨基}-乙基)-噁唑-4-基甲酯(146mg,0.18mmol)溶解于DMF(0.5ml)中。添加氰化钠(27mg,0.55mmol)并于80℃搅拌反应混合物过夜。将反应冷却至室温,以水淬灭并用乙醚(2x)萃取。将合并的有机层以水洗涤两次并以盐水洗涤一次,然后经硫酸钠干燥,过滤并浓缩。将残余物经硅胶色谱以EtOAc/己烷(梯度0-60%EtOAc)纯化分离出37mg(36%)的2-(6-氟-1-甲基-1H-吲唑-3-基)-5-(2-三甲基甲硅烷基-乙氧基甲基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-羧酸[(R)-1-(4-氰基甲基-噁唑-2-基)-乙基]-酰胺,为黄色固体。
步骤9
2-(6-氟-1-甲基-1H-吲唑-3-基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-羧酸[(R)-1-(4-氰基甲基-噁唑-2-基)-乙基]-酰胺
在圆底烧瓶中,将2-(6-氟-1-甲基-1H-吲唑-3-基)-5-(2-三甲基甲硅烷基-乙氧基甲基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-羧酸[(R)-1-(4-氰基甲基-噁唑-2-基)-乙基]-酰胺(36mg,0.063mmol)溶解于二氯甲烷(0.4ml)中并添加三氟乙酸(0.20ml,2.6mmol)。将反应混合物在室温搅拌2小时,然后浓缩。将残余物溶解于二氯甲烷(0.4ml)中并添加乙二胺(0.26ml,3.8mmol)。将黄色的溶液在室温搅拌1小时,然后以水淬灭并用乙酸乙酯稀释。将所得悬浮液经过滤,经热水和乙酸乙酯洗涤,并经高真空干燥得到18mg(65%)的2-(6-氟-1-甲基-1H-吲唑-3-基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-羧酸[(R)-1-(4-氰基甲基-噁唑-2-基)-乙基]-酰胺,为灰白色粉末。MS:(M+Na)+=467;1H NMR(DMSO-d6,400MHz):δ(ppm)12.93(宽单峰,1H),9.12(s,1H),8.66(d,J=8.3Hz,1H),8.50(s,1H),8.46(dd,J=8.9,5.4Hz,1H),8.06(t,J=1.0Hz,1H),7.69(dd,J=9.7,2.1Hz,1H),7.12(td,J=9.0,2.3Hz,1H),5.44-5.56(m,1H),4.15(s,3H),3.92(d,J=1.3Hz,2H),1.68(d,J=7.0Hz,3H).
实施例63.
2-(6-氟-1-甲基-1H-吲唑-3-基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-羧酸[(R)-(S)-1-(四氢-呋喃-2-基)-乙基]-酰胺
步骤1
(S)-2-甲基-丙烷-2-亚磺酸1-呋喃-2-基-亚甲-(E)-基酰胺
在圆底烧瓶中,将呋喃-2-甲醛(800mg,8.33mmol)溶解于THF(20ml)中并添加(S)-2-甲基丙烷-2-亚磺酰胺(1.21g,10.0mmol)和乙醇钛(IV)(3.5ml,16.7mmol)。将反应混合物在室温搅拌5小时,然后通过滴加盐水(5ml)缓慢地淬灭,其导致形成厚的沉淀。将反应混合物以乙酸乙酯稀释,在室温剧烈搅拌15分钟。将悬浮液经硅藻土过滤,并以乙酸乙酯淋洗。浓缩滤液,将残余物经硅胶色谱以EtOAc/己烷(梯度0-25%EtOAc)纯化得到1.48g(89%)的(S)-2-甲基-丙烷-2-亚磺酸1-呋喃-2-基-亚甲-(E)-基酰胺,为浅黄色油状物。
步骤2
(S)-2-甲基-丙烷-2-亚磺酸((R)-1-呋喃-2-基-乙基)-酰胺
在圆底烧瓶中,将(S)-2-甲基-丙烷-2-亚磺酸1-呋喃-2-基-亚甲-(E)-基酰胺(500mg,2.51mmol)溶解于二氯甲烷(10ml)中。将溶液冷却至-76℃并滴加甲基溴化镁(3.0M的乙醚溶液,1.0ml,3.00mmol)。于-76℃搅拌反应混合物1.5小时,然后经1.5小时温热至室温。将反应混合物再冷却至-76℃,并滴加第二份甲基溴化镁(3.0M的乙醚溶液,1.0ml,3.00mmol)。于-76℃搅拌反应混合物1小时,然后经3小时温热至室温。将反应混合物再冷却至-76℃,并滴加第三份甲基溴化镁(3.0M的乙醚溶液,0.5ml,1.5mmol)。让反应混合物缓慢地温热至室温过夜,然后以饱和NH4Cl水溶液淬灭,并以乙酸乙酯(2x)萃取。将合并的有机层以水和盐水洗涤,然后经硫酸钠干燥,过滤并浓缩得到515mg(91%)的黄色固体。NMR分析显示非对映异构体的9:1混合物(80%de),其中主要非对映异构体指定为(S)-2-甲基-丙烷-2-亚磺酸((R)-1-呋喃-2-基-乙基)-酰胺,基于文献关系。
步骤3
(R)-1-呋喃-2-基-乙胺盐酸盐
在圆底烧瓶中,将(S)-2-甲基-丙烷-2-亚磺酸((R)-1-呋喃-2-基-乙基)-酰胺(514mg,2.27mmol)溶解于甲醇(4ml)中并滴加氯化氢(4.0M的1,4-二噁烷溶液,1.2ml,4.8mmol)。将反应混合物在室温搅拌15分钟,然后浓缩得到416mg的(R)-1-呋喃-2-基-乙胺盐酸盐,为深棕色蜡状固体,其不经进一步纯化即可使用。
步骤4
2-(6-氟-1-甲基-1H-吲唑-3-基)-5-(2-三甲基甲硅烷基-乙氧基甲基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-羧酸((R)-1-呋喃-2-基-乙基)-酰胺
向圆底烧瓶中装入2-(6-氟-1-甲基-1H-吲唑-3-基)-5-(2-三甲基甲硅烷基-乙氧基甲基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-羧酸(300mg,0.68mmol)和(R)-1-呋喃-2-基-乙胺盐酸盐(416mg,1.55mmol)。添加DMF(3.5ml),接着添加N,N-二异丙基乙胺(0.85ml,4.87mmol)和HATU(284mg,0.75mmol)。将反应混合物在室温搅拌过夜,然后添加水和石油醚。过滤所得悬浮液。将滤饼以水和石油醚洗涤然后高真空干燥得到338mg(88%)的2-(6-氟-1-甲基-1H-吲唑-3-基)-5-(2-三甲基甲硅烷基-乙氧基甲基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-羧酸((R)-1-呋喃-2-基-乙基)-酰胺,为浅棕色粉末。
步骤5
2-(6-氟-1-甲基-1H-吲唑-3-基)-5-(2-三甲基甲硅烷基-乙氧基甲基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-羧酸[(R)-1-(四氢-呋喃-2-基)-乙基]-酰胺
在圆底烧瓶中,将2-(6-氟-1-甲基-1H-吲唑-3-基)-5-(2-三甲基甲硅烷基-乙氧基甲基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-羧酸((R)-1-呋喃-2-基-乙基)-酰胺(370mg,0.66mmol)溶解于甲醇(6ml)和乙酸乙酯(2ml)中。
将烧瓶以氩气冲洗,然后添加20%氢氧化钯/炭(50%水,100mg,0.71mmol)。在氢气气氛(气球)中于室温搅拌反应混合物48小时,然后经硅藻土过滤并以二氯甲烷/乙酸乙酯淋洗。浓缩滤液,且将残余物经硅胶色谱以MeOH/CH2Cl2/0.5%NH4OH(梯度0-2.5%MeOH)纯化得到300mg(86%)的2-(6-氟-1-甲基-1H-吲唑-3-基)-5-(2-三甲基甲硅烷基-乙氧基甲基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-羧酸[(R)-1-(四氢-呋喃-2-基)-乙基]-酰胺,为浅黄色固体。
步骤6
2-(6-氟-1-甲基-1H-吲唑-3-基)-5-(2-三甲基甲硅烷基-乙氧基甲基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-羧酸[(R)-(S)-1-(四氢-呋喃-2-基)-乙基]-酰胺和2-(6-氟-1-甲基-1H-吲唑-3-基)-5-(2-三甲基甲硅烷基-乙氧基甲基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-羧酸[(R)-(R)-1-(四氢-呋喃-2-基)-乙基]-酰胺
将2-(6-氟-1-甲基-1H-吲唑-3-基)-5-(2-三甲基甲硅烷基-乙氧基甲基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-羧酸[(R)-1-(四氢-呋喃-2-基)-乙基]-酰胺(300mg,0.56mmol)的样品经历手性SFC色谱。非对映异构体的分离以WHELK-O1R,R3x25柱使用45%MeOH/CO2(添加有0.2%三乙胺)作为洗脱液实现。得到163mg(54%)的2-(6-氟-1-甲基-1H-吲唑-3-基)-5-(2-三甲基甲硅烷基-乙氧基甲基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-羧酸[(R)-(S)-1-(四氢-呋喃-2-基)-乙基]-酰胺,为灰白色固体和38mg(13%)2-(6-氟-1-甲基-1H-吲唑-3-基)-5-(2-三甲基甲硅烷基-乙氧基甲基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-羧酸[(R)-(R)-1-(四氢-呋喃-2-基)-乙基]-酰胺,为灰白色粉末。
步骤7
2-(6-氟-1-甲基-1H-吲唑-3-基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-羧酸[(R)-(S)-1-(四氢-呋喃-2-基)-乙基]-酰胺
在圆底烧瓶中,将2-(6-氟-1-甲基-1H-吲唑-3-基)-5-(2-三甲基甲硅烷基-乙氧基甲基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-羧酸[(R)-(S)-1-(四氢-呋喃-2-基)-乙基]-酰胺(152mg,0.28mmol)溶解于二氯甲烷(1.4ml)中并添加三氟乙酸(0.87ml,11.3mmol)。将反应混合物在室温搅拌2小时,然后浓缩。将残余物溶解于二氯甲烷(1.4ml)中并添加乙二胺(1.2ml,17.8mmol)。将黄色的溶液在室温搅拌1小时,然后以水淬灭并用乙酸乙酯稀释。将所得悬浮液经过滤,经热水和乙酸乙酯洗涤,并经高真空干燥得到46mg(40%)的2-(6-氟-1-甲基-1H-吲唑-3-基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-羧酸[(R)-(S)-1-(四氢-呋喃-2-基)-乙基]-酰胺,为灰白色粉末。MS:(M+Na)+=431;1H NMR(DMSO-d6,300MHz):δ(ppm)12.09(宽单峰,1H),9.13(s,1H),8.64(dd,J=8.7,5.3Hz,1H),8.44(s,1H),8.22(d,J=9.4Hz,1H),7.67(d,J=8.3Hz,1H),7.10(t,J=8.1Hz,1H),4.32(宽单峰,1H),4.15(s,3H),3.96(d,J=3.0Hz,1H),3.52-3.68(m,2H),1.86-2.00(m,1H),1.52-1.84(m,3H),1.33(d,J=6.8Hz,3H).
实施例64.
2-(6-氟-1-甲基-1H-吲唑-3-基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-羧酸[(R)-(R)-1-(四氢-呋喃-2-基)-乙基]-酰胺
根据实施例63,步骤7制备,以2-(6-氟-1-甲基-1H-吲唑-3-基)-5-(2-三甲基甲硅烷基-乙氧基甲基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-羧酸[(R)-(R)-1-(四氢-呋喃-2-基)-乙基]-酰胺代替2-(6-氟-1-甲基-1H-吲唑-3-基)-5-(2-三甲基甲硅烷基-乙氧基甲基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-羧酸[(R)-(S)-1-(四氢-呋喃-2-基)-乙基]-酰胺。MS:(M+Na)+=431;1H NMR(DMSO-d6,300MHz):δ(ppm)9.12(s,1H),8.56(dd,J=8.7,5.3Hz,1H),8.44(s,1H),8.24(d,J=9.1Hz,1H),7.69(dd,J=9.8,2.3Hz,1H),7.14(td,J=9.1,2.3Hz,1H),4.26(dd,J=13.4,7.0Hz,1H),4.15(s,3H),3.79-4.00(m,2H),3.69(q,J=7.3Hz,1H),1.65-2.02(m,4H),1.26(d,J=6.4Hz,3H).
实施例65.
2-(5-羟基-1-甲基-1H-吲唑-3-基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-羧酸异丙基酰胺
步骤1
5-(叔丁基-二甲基-甲硅烷基氧基)-1H-吲唑
在圆底烧瓶中,将5-羟基-1H-吲唑(700mg,5.22mmol)溶解于DMF(15ml)中并添加TBDMS-Cl(865mg,5.74mmol)和咪唑(426mg,6.26mmol)。将反应混合物在室温搅拌过夜,然后以水淬灭并用乙醚(2x)萃取。将合并的有机层以水洗涤两次并以盐水洗涤一次,然后经硫酸钠干燥,过滤并浓缩。将残余物经硅胶色谱以EtOAc/己烷(梯度0-30%EtOAc)纯化得到1.21g(93%)的5-(叔丁基-二甲基-甲硅烷基氧基)-1H-吲唑,为灰白色固体。
步骤2
5-(叔丁基-二甲基-甲硅烷基氧基)-3-碘-1H-吲唑
在圆底烧瓶中,将5-(叔丁基-二甲基-甲硅烷基氧基)-1H-吲唑(1.20g,4.83mmol)溶解于DMF(12ml)中。添加碘(2.45g,9.66mmol),接着添加碳酸钾(2.58g,18.7mmol)。将深色的悬浮液在室温搅拌3小时,然后以10%NaHSO3水溶液淬灭并用乙醚(2x)萃取。将合并的有机层以10%NaHSO3水溶液洗涤,以水洗涤三次,并以盐水洗涤一次,然后经硫酸钠干燥,过滤并浓缩得到1.65g(91%)的5-(叔丁基-二甲基-甲硅烷基氧基)-3-碘-1H-吲唑,为深色泡沫。
步骤3
5-(叔丁基-二甲基-甲硅烷基氧基)-3-碘-1-甲基-1H-吲唑
在圆底烧瓶中,将5-(叔丁基-二甲基-甲硅烷基氧基)-3-碘-1H-吲唑(1.65g,4.41mmol)溶解于THF(16ml)中。将溶液冷却至0℃并添加叔丁醇钾(697mg,6.22mmol)。于0℃搅拌反应混合物30分钟,然后滴加甲基碘(0.38ml,6.08mmol)。在完成添加后,移去冰浴,将反应混合物在室温搅拌4.5小时。将反应混合物以水淬灭并以EtOAc(2x)萃取。将合并的有机层以水和盐水洗涤,然后经硫酸钠干燥,过滤并浓缩。将残余物经硅胶色谱以EtOAc/己烷(梯度0-10%EtOAc)纯化得到770mg(45%)的5-(叔丁基-二甲基-甲硅烷基氧基)-3-碘-1-甲基-1H-吲唑,为浅黄色固体。
步骤4
5-(叔丁基-二甲基-甲硅烷基氧基)-1-甲基-3-三丁基甲锡烷基-1H-吲唑
在圆底烧瓶中,将5-(叔丁基-二甲基-甲硅烷基氧基)-3-碘-1-甲基-1H-吲唑(140mg,0.36mmol)溶解于THF(2ml)中。将溶液冷却至-16℃(NaCl/冰浴)并滴加异丙基氯化镁(2.0M的THF溶液,0.22ml,0.44mmol)。于-16℃搅拌反应混合物20分钟,然后缓慢地添加三丁基氯甲锡烷(0.11ml,0.41mmol)。经1.5小时让反应混合物温热至室温,然后以饱和NH4Cl水溶液淬灭并以EtOAc(2x)萃取。将合并的有机层以水和盐水洗涤,然后经硫酸钠干燥,过滤并浓缩得到5-(叔丁基-二甲基-甲硅烷基氧基)-1-甲基-3-三丁基甲锡烷基-1H-吲唑,为浅黄色油状物,其不经进一步纯化即可使用。
步骤5
2-[5-(叔丁基-二甲基-甲硅烷基氧基)-1-甲基-1H-吲唑-3-基]-5-(2-三甲基甲硅烷基-乙氧基甲基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-羧酸异丙基酰胺
在圆底烧瓶中,将2-溴-5-(2-三甲基甲硅烷基-乙氧基甲基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-羧酸异丙基酰胺(100mg,0.24mmol)和5-(叔丁基-二甲基-甲硅烷基氧基)-1-甲基-3-三丁基甲锡烷基-1H-吲唑(来自步骤4的粗产物)溶解于DMF(2ml)中。将烧瓶抽真空并回填以氩气,然后添加四(三苯基膦)钯(0)(14mg,0.012mmol)和碘化亚铜(I)(10mg,0.053mmol)。于80℃搅拌反应混合物2小时。然后冷却至室温,以水淬灭并用乙醚(2x)萃取。将合并的有机层以水洗涤两次并以盐水洗涤一次,然后经硫酸钠干燥,过滤并浓缩。将残余物经硅胶色谱以EtOAc/己烷(梯度0-30%EtOAc)纯化得到104mg(72%)的2-[5-(叔丁基-二甲基-甲硅烷基氧基)-1-甲基-1H-吲唑-3-基]-5-(2-三甲基甲硅烷基-乙氧基甲基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-羧酸异丙基酰胺,为浅黄色固体。
步骤6
2-[5-(叔丁基-二甲基-甲硅烷基氧基)-1-甲基-1H-吲唑-3-基]-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-羧酸异丙基酰胺
在圆底烧瓶中,将2-[5-(叔丁基-二甲基-甲硅烷基氧基)-1-甲基-1H-吲唑-3-基]-5-(2-三甲基甲硅烷基-乙氧基甲基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-羧酸异丙基酰胺(100mg,0.168mmol)溶解于二氯甲烷(0.8ml)并添加三氟乙酸(0.52ml,6.75mmol)。将反应混合物在室温搅拌2小时,然后浓缩。将残余物溶解于二氯甲烷(0.8ml)并添加乙二胺(0.68ml,10.1mmol)。将黄色的溶液在室温搅拌1小时,然后以水淬灭并以EtOAc(2x)萃取。将合并的有机层以水和盐水洗涤,然后经硫酸钠干燥,过滤并浓缩。将残余物以乙酸乙酯研磨得到55mg(70%)的2-[5-(叔丁基-二甲基-甲硅烷基氧基)-1-甲基-1H-吲唑-3-基]-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-羧酸异丙基酰胺,为黄色粉末。
步骤7
2-(5-羟基-1-甲基-1H-吲唑-3-基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-羧酸异丙基酰胺
在圆底烧瓶中,将2-[5-(叔丁基-二甲基-甲硅烷基氧基)-1-甲基-1H-吲唑-3-基]-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-羧酸异丙基酰胺(50mg,0.108mmol)悬浮于THF(1.2ml)中并添加四丁基氟化铵(1.0M在THF中,0.11ml,110mmol)。将反应混合物在室温搅拌1小时,然后以水淬灭并用乙酸乙酯稀释。将所得悬浮液经过滤,且固体经热水和乙酸乙酯洗涤,然后高真空干燥得到33mg(83%)的2-(5-羟基-1-甲基-1H-吲唑-3-基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-羧酸异丙基酰胺,为黄色粉末。MS:(M+Na)+=373;1H NMR(DMSO-d6,300MHz):δ(ppm)12.77(宽单峰,1H),9.25(s,1H),9.06(s,1H),8.38(s,1H),8.16(d,J=7.6Hz,1H),7.73(d,J=1.9Hz,1H),7.60(d,J=9.1Hz,1H),7.10(dd,J=9.1,2.3Hz,1H),4.23(dq,J=13.6,6.7Hz,1H),4.13(s,3H),1.35(d,J=6.8Hz,6H).
实施例66.
2-(5-氯-吲唑-1-基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-羧酸[(R)-2-(4-氰基-哌啶-1-基)-1-环丙基-2-氧代-乙基]-酰胺
步骤1
2-(5-氯-吲唑-1-基)-5-(2-三甲基甲硅烷基-乙氧基甲基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-羧酸[(R)-2-(4-氰基-哌啶-1-基)-1-环丙基-2-氧代-乙基]-酰胺
向5ml微波小瓶中装入2-溴-5-(2-三甲基甲硅烷基-乙氧基甲基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-羧酸[(R)-2-(4-氰基-哌啶-1-基)-1-环丙基-2-氧代-乙基]-酰胺(252mg,0.45mmol)、碘化钠(112mg,0.75mmol)和碘化亚铜(I)(8mg,0.04mmol)。将小瓶抽真空,回填以氩气,然后经由注射器添加甲苯(0.4ml)和反式-N,N'-二甲基环己烷-1,2-二胺(0.015ml,0.095mmol)。将小瓶密封并于110℃在油浴中搅拌反应混合物22小时。将反应混合物冷却至室温且添加5-氯-1H-吲唑(57mg,0.37mmol)和磷酸三钾(167mg,0.79mmol)。再次对小瓶抽真空,回填以氩气,密封并于110℃在油浴中搅拌19小时。将反应混合物冷却至室温,通过硅藻土过滤,并以乙酸乙酯洗涤。浓缩滤液且将残余物通过硅胶色谱以MeOH/CH2Cl2(0.5%NH4OH)(梯度0-2.5%MeOH)纯化得到53mg(22%)的2-(5-氯-吲唑-1-基)-5-(2-三甲基甲硅烷基-乙氧基甲基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-羧酸[(R)-2-(4-氰基-哌啶-1-基)-1-环丙基-2-氧代-乙基]-酰胺,为黄色油状物,和76mg(33%)的2-碘-5-(2-三甲基甲硅烷基-乙氧基甲基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-羧酸[(R)-2-(4-氰基-哌啶-1-基)-1-环丙基-2-氧代-乙基]-酰胺,为浅棕色固体。
步骤2
2-(5-氯-吲唑-1-基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-羧酸[(R)-2-(4-氰基-哌啶-1-基)-1-环丙基-2-氧代-乙基]-酰胺
在圆底烧瓶中,将2-(5-氯-吲唑-1-基)-5-(2-三甲基甲硅烷基-乙氧基甲基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-羧酸[(R)-2-(4-氰基-哌啶-1-基)-1-环丙基-2-氧代-乙基]-酰胺(51mg,0.08mmol)溶解于二氯甲烷(0.5ml)中并添加三氟乙酸(0.25ml,3.24mmol)。将黄色反应混合物在室温搅拌2.5小时然后浓缩。将残余物溶解于二氯甲烷(0.5ml)中并添加乙二胺(0.33ml,4.89mmol)。将反应混合物在室温搅拌1.5小时,然后以水淬灭并以EtOAc(2x30ml)萃取。将合并的有机层以水和盐水洗涤,然后经硫酸钠干燥,过滤并浓缩。将残余物通过硅胶色谱以EtOAc/己烷(梯度0-100%EtOAc)纯化接着以EtOAc/己烷(1:1)研磨,得到22mg(52%)的2-(5-氯-吲唑-1-基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-羧酸[(R)-2-(4-氰基-哌啶-1-基)-1-环丙基-2-氧代-乙基]-酰胺,为黄色固体。MS:(M+H)+=503;1H NMR(DMSO-d6,300MHz):δ(ppm)13.01(宽单峰,1H),9.10(s,1H),8.94(dd,J=8.9,5.1Hz,1H),8.54(d,J=0.8Hz,1H),8.51(d,J=6.8Hz,1H),8.29(d,J=8.3Hz,1H),8.07(d,J=1.9Hz,1H),7.56(t,J=6.6Hz,1H),4.92-5.02(m,1H),3.70-4.06(m,2H),3.09-3.68(m,3H),1.50-2.08(m,4H),1.20-1.39(m,1H),0.31-0.61(m,4H).
实施例67.
2-(5,6-二氯-1-甲基-1H-吲唑-3-基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-羧酸[(R)-2-(4-氰基-哌啶-1-基)-1-环丙基-2-氧代-乙基]-酰胺
步骤1
4,5-二氯-2-甲基苯胺
向1,2-二氯-4-甲基-5-硝基苯(2.0g,9.71mmol)在MeOH(25ml)、水(25ml)和THF(10ml)中的部分悬浮液中添加NH4Cl(5.19g,97.1mmol),并添加铁粉(2.71g,48.5mmol)。于100℃将非均相反应混合物加热3小时,然后冷却至室温,并经布氏漏斗过滤,以MeOH淋洗。将滤液以水和饱和NaHCO3水溶液稀释,然后以CH2Cl2(3x)萃取。将合并的有机物经MgSO4干燥并浓缩得到1.69g(99%)的4,5-二氯-2-甲基苯胺,为白色固体。1H NMR(CDCl3,300MHz):δ(ppm)7.10(s,1H),6.75(s,1H),3.74(宽单峰,2H),2.12(s,3H).
步骤2
5,6-二氯-1H-吲唑
于0℃向4,5-二氯-2-甲基苯胺(1.69g,9.6mmol)在CHCl3(25ml)中的溶液中缓慢地添加乙酸酐(2.09ml,22.1mmol)。将反应混合物温热至室温并搅拌1小时。逐渐形成厚的白色沉淀。添加乙酸钾(283mg,2.88mmol),接着缓慢添加亚硝酸异戊酯(2.78ml,20.6mmol)。在回流下加热反应混合物过夜。将均匀的深橙色反应混合物冷却至室温并浓缩。添加水(10mL),将混合物再浓缩成橙色固体。将该固体悬浮于浓HCl(15mL),并于60℃加热2小时,然后冷却至0℃,并以50%NaOH中和。以EtOAc萃取,经MgSO4干燥并浓缩成橙色固体。将该固体溶解于THF/MeOH(1:1,25mL)中并添加10%NaOH(3mL)。将深栗色反应混合物在室温搅拌5分钟,然后以1.0M HCl中和并以水稀释。将混合物以EtOAc(2x)萃取,然后经MgSO4干燥并浓缩,将残余物吸收至硅胶上并经色谱以30%至50%EtOAc/己烷纯化得到1.50g(84%)的5,6-二氯-1H-吲唑,为浅橙色固体。1H NMR(CDCl3,300MHz):δ(ppm)8.04(s,1H),7.89(s,1H),7.68(s,1H).
步骤3
5,6-二氯-3-碘-1H-吲唑
于室温向5,6-二氯-1H-吲唑(0.50g,2.67mmol)在DMF(8ml)中的溶液中添加粉末状氢氧化钾(450mg,8.02mmol)和碘(1.02g,4.01mmol)。将栗色反应混合物在室温搅拌45分钟,然后以10%Na2S2O3水溶液淬灭,并以水稀释。将混合物以EtOAc(2x)萃取。将合并的有机物以水(3x)洗涤,经MgSO4干燥并浓缩得到827mg(99%)的5,6-二氯-3-碘-1H-吲唑,为淡黄色固体。1H NMR(DMSO-d6,400MHz):δ(ppm)13.79(s,1H),7.94(s,1H),7.72(s,1H).
步骤4
5,6-二氯-3-碘-1-甲基-1H-吲唑
于0℃向5,6-二氯-3-碘-1H-吲唑(820mg,2.62mmol)在THF(8ml)中的溶液中添加KOt-Bu(412mg,3.67mmol)。于0℃搅拌反应混合物30分钟,然后添加碘甲烷(0.23ml,3.67mmol)。于0℃搅拌30分钟,然后温热至室温,并搅拌1.5小时。将反应混合物以水淬灭并以EtOAc(2x)萃取。将合并的有机物经MgSO4干燥并浓缩。将粗残余物吸收在硅胶上,并通过色谱以20%至30%EtOAc/己烷纯化得到585mg(68%)的5,6-二氯-3-碘-1-甲基-1H-吲唑,为浅黄色固体。1H NMR(CDCl3,400MHz):δ(ppm)7.61(s,1H),7.56(s,1H),4.09(s,3H)。次要产物5,6-二氯-3-碘-2-甲基-1H-吲唑位置异构体也被观察到但未分离。
步骤5
5,6-二氯-1-甲基-3-三丁基甲锡烷基-1H-吲唑
于-10℃(冰/丙酮)向5,6-二氯-3-碘-1-甲基-1H-吲唑(150mg,0.44mmol)在THF(3mL)中的溶液中缓慢地添加异丙基氯化镁(2.0M在THF中,0.26mL,0.52mmol)。于-10℃搅拌亮黄色非均相反应混合物15分钟,然后滴加三丁基氯甲锡烷(0.14mL,0.52mmol)。于-10℃继续搅拌30分钟,然后在室温搅拌1小时。将反应混合物以水淬灭并以EtOAc(2x)萃取。将合并的有机物经MgSO4干燥并浓缩得到5,6-二氯-1-甲基-3-三丁基甲锡烷基-1H-吲唑,为淡黄色油状物,其不经进一步纯化即可在下一步中使用。
步骤6
2-(5,6-二氯-1-甲基-1H-吲唑-3-基)-5-(2-三甲基甲硅烷基-乙氧基甲基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-羧酸[(R)-2-(4-氰基-哌啶-1-基)-1-环丙基-2-氧代-乙基]-酰胺
向5,6-二氯-1-甲基-3-三丁基甲锡烷基-1H-吲唑(来自步骤5的粗产物,218mg,0.44mmol)和2-溴-5-(2-三甲基甲硅烷基-乙氧基甲基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-羧酸[(R)-2-(4-氰基-哌啶-1-基)-1-环丙基-2-氧代-乙基]-酰胺(125mg,0.22mmol)在DMF(2mL)中的溶液中添加Pd(PPh3)4(12.9mg,0.011mmol)和碘化亚铜(I)(8mg,0.044mmol)。于90℃加热黄色反应混合物1.5小时,然后冷却至室温,以水淬灭并以EtOAc(2x)萃取。将合并的有机物以水(3x)和盐水洗涤,然后经MgSO4干燥并浓缩。将粗残余物通过硅胶色谱以50%至100%EtOAc/己烷纯化分离出130mg(86%)的2-(5,6-二氯-1-甲基-1H-吲唑-3-基)-5-(2-三甲基甲硅烷基-乙氧基甲基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-羧酸[(R)-2-(4-氰基-哌啶-1-基)-1-环丙基-2-氧代-乙基]-酰胺,为淡黄色泡沫状固体。
步骤7
2-(5,6-二氯-1-甲基-1H-吲唑-3-基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-羧酸[(R)-2-(4-氰基-哌啶-1-基)-1-环丙基-2-氧代-乙基]-酰胺
向2-(5,6-二氯-1-甲基-1H-吲唑-3-基)-5-(2-三甲基甲硅烷基-乙氧基甲基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-羧酸[(R)-2-(4-氰基-哌啶-1-基)-1-环丙基-2-氧代-乙基]-酰胺(130mg,0.19mmol)在CH2Cl2(4mL)的溶液中添加TFA(2.0mL,26.0mmol)。将反应混合物在室温搅拌3小时,然后浓缩。将残余物再溶解于CH2Cl2(4mL)中并添加乙二胺(0.4mL,5.92mmol)。将反应混合物在室温搅拌0.5小时,然后以水淬灭并以CH2Cl2(3x)萃取。将合并的有机物经浓缩。将残余物通过硅胶色谱以0%至4%MeOH/CH2Cl2(0.5%NH4OH)纯化接着以Et2O研磨得到白色固体。该固体通过从MeOH/EtOAc重结晶进一步纯化得到22mg的2-(5,6-二氯-1-甲基-1H-吲唑-3-基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-羧酸[(R)-2-(4-氰基-哌啶-1-基)-1-环丙基-2-氧代-乙基]-酰胺,为白色固体。MS:(M+Na)+=573;1H NMR(DMSO-d6,300MHz):δ(ppm)12.92(宽单峰,1H),9.14(s,1H),8.88(s,1H),8.69(d,J=8.7Hz,1H),8.46(d,J=8.7Hz,1H),8.24(s,1H),4.93(t,J=7.4Hz,1H),4.18(s,3H),3.45-3.94(m,3H),3.15(d,J=4.9Hz,2H),1.35-1.91(m,5H),0.51(宽单峰,4H).
实施例68.
2-(5,6-二氯吲唑-1-基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-羧酸[(R)-2-(4-氰基-哌啶-1-基)-1-环丙基-2-氧代-乙基]-酰胺
步骤1
2-碘-5-(2-三甲基甲硅烷基-乙氧基甲基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-羧酸[(R)-2-(4-氰基-哌啶-1-基)-1-环丙基-2-氧代-乙基]-酰胺
在5mL微波小瓶中置入碘化亚铜(I)(5mg,0.027mmol)、碘化钠(120mg,0.80mmol)、2-溴-5-(2-三甲基甲硅烷基-乙氧基甲基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-羧酸[(R)-2-(4-氰基-哌啶-1-基)-1-环丙基-2-氧代-乙基]-酰胺(150mg,0.27mmol)、1,4-二噁烷(1mL)和反式-N,N'-二甲基环己烷-1,2-二胺(8mg,0.054mmol)。将小瓶以氮气流冲洗,然后密封并于110℃在油浴中加热20小时。将反应混合物冷却至室温,并以饱和NH4OH水溶液(3mL)淬灭,然后以水稀释,并以CH2Cl2萃取。将有机物经MgSO4干燥并浓缩。将残余物通过硅胶色谱以50%至80%EtOAc/己烷纯化分离出130mg(80%)的2-碘-5-(2-三甲基甲硅烷基-乙氧基甲基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-羧酸[(R)-2-(4-氰基-哌啶-1-基)-1-环丙基-2-氧代-乙基]-酰胺,为橙色泡沫状固体。
步骤2
2-(5,6-二氯-吲唑-1-基)-5-(2-三甲基甲硅烷基-乙氧基甲基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-羧酸[(R)-2-(4-氰基-哌啶-1-基)-1-环丙基-2-氧代-乙基]-酰胺
在5mL微波小瓶中置入碘化亚铜(I)(6mg,0.033mmol)、K3PO4(146mg,0.69mmol)、5,6-二氯-1H-吲唑(74mg,0.39mmol)、2-碘-5-(2-三甲基甲硅烷基-乙氧基甲基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-羧酸[(R)-2-(4-氰基-哌啶-1-基)-1-环丙基-2-氧代-乙基]-酰胺(200mg,0.33mmol)、甲苯(1.2mL)和反式-N,N'-二甲基环己烷-1,2-二胺(9mg,0.066mmol)。将小瓶以氮气流冲洗,然后密封并于110℃在油浴中加热48小时。将反应混合物冷却至室温,并以EtOAc稀释,然后经布氏漏斗过滤,以EtOAc淋洗。浓缩滤液,且将所得残余物通过硅胶色谱以0%至2%MeOH/CH2Cl2(0.5%NH4OH)纯化得到215mg(98%)的2-(5,6-二氯-吲唑-1-基)-5-(2-三甲基甲硅烷基-乙氧基甲基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-羧酸[(R)-2-(4-氰基-哌啶-1-基)-1-环丙基-2-氧代-乙基]-酰胺,为浅黄色泡沫。
步骤3
2-(5,6-二氯-吲唑-1-基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-羧酸[(R)-2-(4-氰基-哌啶-1-基)-1-环丙基-2-氧代-乙基]-酰胺
向2-(5,6-二氯-吲唑-1-基)-5-(2-三甲基甲硅烷基-乙氧基甲基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-羧酸[(R)-2-(4-氰基-哌啶-1-基)-1-环丙基-2-氧代-乙基]-酰胺(220mg,0.33mmol)在CH2Cl2(4mL)中的溶液中添加TFA(2.0mL,26.0mmol)。将黄色反应混合物在室温搅拌3小时,然后浓缩。将残余物再溶解于CH2Cl2(4mL)中并添加乙二胺(0.4mL,5.92mmol)。将反应混合物在室温搅拌0.5小时,然后以水淬灭并以CH2Cl2(3x)萃取。将合并的有机物经浓缩且将残余物通过硅胶色谱以0%至5%MeOH/CH2Cl2(0.5%NH4OH)纯化然后以Et2O研磨得到95mg(54%)的2-(5,6-二氯-吲唑-1-基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-羧酸[(R)-2-(4-氰基-哌啶-1-基)-1-环丙基-2-氧代-乙基]-酰胺,为浅黄色固体。MS:(M+Na)+=559;1H NMR(DMSO-d6,300MHz):δ(ppm)12.91(宽单峰,1H),8.91(s,1H),8.79(s,1H),8.44(s,1H),8.41(d,J=7.9Hz,1H),8.29(d,J=7.9Hz,1H),8.18(s,1H),4.77(t,J=7.6Hz,1H),3.59-3.86(m,2H),3.32-3.46(m,1H),2.95-3.05(m,2H),1.45-1.92(m,4H),1.24(宽单峰,1H),0.32-0.48(m,4H).
实施例69.
2-(5-氯吲唑-1-基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-羧酸[(R)-2-(3-氰基-氮杂环丁烷-1-基)-1-甲基-2-氧代-乙基]-酰胺
步骤1
2-碘-5-(2-三甲基甲硅烷基-乙氧基甲基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-羧酸[(R)-2-(3-氰基-氮杂环丁烷-1-基)-1-甲基-2-氧代-乙基]-酰胺
在5mL微波小瓶中置入碘化亚铜(I)(6mg,0.03mmol)、碘化钠(133mg,0.89mmol)、2-溴-5-(2-三甲基甲硅烷基-乙氧基甲基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-羧酸[(R)-2-(3-氰基-氮杂环丁烷-1-基)-1-甲基-2-氧代-乙基]-酰胺(150mg,0.30mmol)、1,4-二噁烷(1mL)和反式-N,N'-二甲基环己烷-1,2-二胺(9mg,0.06mmol)。将小瓶以氮气流冲洗,然后密封并在110℃在油浴中加热48小时。将反应混合物冷却至室温,并以饱和NH4OH水溶液(3mL)淬灭,然后以水稀释,并以CH2Cl2萃取。将有机物经MgSO4干燥并浓缩得到2-碘-5-(2-三甲基甲硅烷基-乙氧基甲基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-羧酸[(R)-2-(3-氰基-氮杂环丁烷-1-基)-1-甲基-2-氧代-乙基]-酰胺,为栗色油状物,其不经进一步纯化即可使用。
步骤2
2-(5-氯-吲唑-1-基)-5-(2-三甲基甲硅烷基-乙氧基甲基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-羧酸[(R)-2-(3-氰基-氮杂环丁烷-1-基)-1-甲基-2-氧代-乙基]-酰胺
在5mL微波小瓶中置入碘化亚铜(I)(6mg,0.033mmol)、K3PO4(132mg,0.62mmol)、5-氯-1H-吲唑(54mg,0.36mmol)、2-碘-5-(2-三甲基甲硅烷基-乙氧基甲基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-羧酸[(R)-2-(3-氰基-氮杂环丁烷-1-基)-1-甲基-2-氧代-乙基]-酰胺(164mg,0.30mmol)、甲苯(1.2mL)和反式-N,N'-二甲基环己烷-1,2-二胺(9mg,0.066mmol)。将小瓶以氮气流冲洗,然后密封并于110℃在油浴中加热24小时。将反应混合物冷却至室温,并以EtOAc稀释,然后经布氏漏斗过滤,以EtOAc淋洗。浓缩滤液,且将所得残余物通过硅胶色谱以50%至80%EtOAc/己烷纯化得到100mg(58%)的2-(5-氯-吲唑-1-基)-5-(2-三甲基甲硅烷基-乙氧基甲基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-羧酸[(R)-2-(3-氰基-氮杂环丁烷-1-基)-1-甲基-2-氧代-乙基]-酰胺,为浅黄色泡沫。
步骤3
2-(5-氯吲唑-1-基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-羧酸[(R)-2-(3-氰基-氮杂环丁烷-1-基)-1-甲基-2-氧代-乙基]-酰胺
向2-(5-氯-吲唑-1-基)-5-(2-三甲基甲硅烷基-乙氧基甲基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-羧酸[(R)-2-(3-氰基-氮杂环丁烷-1-基)-1-甲基-2-氧代-乙基]-酰胺(100mg,0.17mmol)在CH2Cl2(4mL)中的溶液中添加TFA(2.0mL,26.0mmol)。将黄色反应混合物在室温搅拌3小时,然后浓缩。将残余物再溶解于CH2Cl2(4mL)中并添加乙二胺(0.4mL,5.92mmol)。将反应混合物在室温搅拌0.5小时,然后以水淬灭并以CH2Cl2(3x)萃取。将合并的有机物经浓缩且将残余物以EtOAc研磨得到45mg(58%)的2-(5-氯吲唑-1-基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-羧酸[(R)-2-(3-氰基-氮杂环丁烷-1-基)-1-甲基-2-氧代-乙基]-酰胺,为浅黄色固体。MS:(M+Na)+=471;1H NMR(DMSO-d6,300MHz):δ(ppm)12.88(s,1H),8.95(s,1H),8.72(dd,J=9.1,4.5Hz,1H),8.36-8.43(m,2H),7.99-8.07(m,1H),7.94(d,J=1.9Hz,1H),7.41-7.52(m,1H),4.36-4.66(m,3H),4.06-4.18(m,1H),3.94-4.04(m,1H),3.66-3.81(m,1H),1.26(t,J=6.0Hz,3H).
实施例70.
2-(1,6,6-三甲基-4,5,6,7-四氢-1H-吲唑-3-基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-羧酸[(R)-2-(3-氰基-氮杂环丁烷-1-基)-1-甲基-2-氧代-乙基]-酰胺
步骤1
2-[1-羟基-亚甲-(Z)-基]-5,5-二甲基-环己酮
于0℃向氢化钠(60%在矿物油中的分散液,475mg,11.9mmol)在乙醚(25mL)中的悬浮液中滴加添加乙醇(0.06ml,1.03mmol)。于0℃搅拌灰色的悬浮液20分钟。经10分钟滴加3,3-二甲基环己酮(1.50g,11.9mmol)和甲酸乙酯(1.45ml,17.8mmol)在乙醚(3mL)中的溶液。于0℃搅拌黄色非均相反应混合物1小时,然后温热至室温并搅拌2小时。添加乙醇(1mL)且将混合物在室温搅拌1小时,然后以水(25mL)淬灭。分离各层,且将水相以乙醚洗涤。将水层以1M HCl酸化直到pH=2,然后以乙醚(2x)萃取。将合并的有机层经MgSO4干燥并浓缩得到1.64g(90%)的2-[1-羟基-亚甲-(Z)-基]-5,5-二甲基-环己酮,为浅黄色油状物。1H NMR(CDCl3,400MHz):δ(ppm)14.38(宽单峰,1H),8.79(s,1H),2.34-2.47(m,2H),2.16(s,2H),1.42-1.53(m,2H),1.00(s,6H).
步骤2
6,6-二甲基-4,5,6,7-四氢-1H-吲唑
向2-[1-羟基-亚甲-(Z)-基]-5,5-二甲基-环己酮(1.64g,10.6mmol)在MeOH(10mL)中的溶液中滴加肼(0.33mL,10.6mmol)。通过间歇性使用冰浴控制放热反应。将黄色反应混合物在室温搅拌30分钟,然后浓缩。将残余物溶解于CH2Cl2,并以水洗涤。将有机层经MgSO4干燥并浓缩得到1.53g(96%)的6,6-二甲基-4,5,6,7-四氢-1H-吲唑,为黄色固体。1H NMR(CDCl3,300MHz):δ(ppm)7.32(s,1H),2.55(t,J=6.4Hz,2H),2.44(s,2H),1.53(t,J=6.4Hz,2H),1.01(s,6H).
步骤3
3-碘-6,6-二甲基-4,5,6,7-四氢-1H-吲唑
于室温向6,6-二甲基-4,5,6,7-四氢-1H-吲唑(0.50g,3.33mmol)在DMF(8mL)中的溶液中添加粉末状氢氧化钾(560mg,10.0mmol)和碘(1.69g,6.66mmol)。将栗色反应混合物在室温搅拌45分钟,然后以10%Na2S2O3水溶液淬灭,以水稀释并以EtOAc(2x)萃取。将合并的有机物以水(3x)洗涤,经MgSO4干燥并浓缩得到920mg(99%)的3-碘-6,6-二甲基-4,5,6,7-四氢-1H-吲唑,为浅黄色蜡状固体。1H NMR(CDCl3,300MHz):δ(ppm)2.44(s,2H),2.35(t,J=6.4Hz,2H),1.55(t,J=6.4Hz,2H),1.01(s,6H).
步骤4
3-碘-1,6,6-三甲基-4,5,6,7-四氢-1H-吲唑和3-碘-2,6,6-三甲基-4,5,6,7-四氢-2H-吲唑
于0℃向3-碘-6,6-二甲基-4,5,6,7-四氢-1H-吲唑(919mg,3.33mmol)在THF(8mL)中的溶液中添加KOt-Bu(523mg,4.66mmol)。于0℃搅拌反应混合物30分钟,然后添加碘甲烷(0.29mL,4.66mmol)。于0℃搅拌反应混合物30分钟,然后温热至室温,并搅拌1.5小时。将反应混合物以水淬灭并以EtOAc(2x)萃取。将合并的有机物经MgSO4干燥并浓缩。将残余物吸收至SiO2上并通过色谱以10%至20%EtOAc/己烷纯化得到523mg(54%)的3-碘-1,6,6-三甲基-4,5,6,7-四氢-1H-吲唑,为无色油状物。1H NMR(CDCl3,300MHz):δ(ppm)3.72(s,3H),2.33(t,J=6.4Hz,2H),2.29(s,2H),1.51(t,J=6.4Hz,2H),1.02(s,6H)。还分离出160mg(17%)的3-碘-2,6,6-三甲基-4,5,6,7-四氢-2H-吲唑,为白色固体。1H NMR(CDCl3,300MHz):δ(ppm)3.87(s,3H),2.41(s,2H),2.36(t,J=6.6Hz,2H),1.54(t,J=6.6Hz,2H),1.00(s,6H).
步骤5
1,6,6-三甲基-3-三丁基甲锡烷基-4,5,6,7-四氢-1H-吲唑
于0℃向3-碘-1,6,6-三甲基-4,5,6,7-四氢-1H-吲唑(0.150g,0.49mmol)在THF(3mL)中的溶液中缓慢地添加异丙基氯化镁(2.0M在THF中)(0.30mL,0.59mmol)。于0℃搅拌反应混合物20分钟,然后滴加三丁基氯甲锡烷(0.16mL,0.59mmol)。于0℃搅拌反应混合物30分钟,然后温热至室温,并搅拌1小时。将反应混合物以水淬灭并以EtOAc(2x)萃取。将合并的有机物经MgSO4干燥并浓缩。将残余物通过硅胶色谱以0%至10%EtOAc/己烷(0.5%Et3N)纯化得到116mg(52%)的1,6,6-三甲基-3-三丁基甲锡烷基-4,5,6,7-四氢-1H-吲唑,为无色油状物。1H NMR(CDCl3,300MHz):δ(ppm)3.74(s,3H),2.49(t,J=6.4Hz,2H),2.30(s,2H),1.45-1.61(m,8H),1.25-1.41(m,6H),1.04-1.13(m,6H),1.01(s,6H),0.89(t,J=7.2Hz,9H).
步骤6
5-(2-三甲基甲硅烷基-乙氧基甲基)-2-(1,6,6-三甲基-4,5,6,7-四氢-1H-吲唑-3-基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-羧酸[(R)-2-(3-氰基-氮杂环丁烷-1-基)-1-甲基-2-氧代-乙基]-酰胺
向1,6,6-三甲基-3-三丁基甲锡烷基-4,5,6,7-四氢-1H-吲唑(110mg,0.24mmol)和2-溴-5-(2-三甲基甲硅烷基-乙氧基甲基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-羧酸[(R)-2-(3-氰基-氮杂环丁烷-1-基)-1-甲基-2-氧代-乙基]-酰胺(95mg,0.19mmol)在DMF(2mL)中的溶液中添加Pd(PPh3)4(11mg,0.01mmol)和碘化亚铜(I)(7mg,0.037mmol)。于90℃加热反应混合物2小时,然后冷却至室温并搅拌过夜。将反应混合物以水淬灭并以EtOAc(2x)萃取。将合并的有机物以水(3x)和盐水洗涤,然后经MgSO4干燥并浓缩。将粗的棕色油状物通过硅胶色谱以0%至3%MeOH/CH2Cl2纯化得到43mg(38%)的5-(2-三甲基甲硅烷基-乙氧基甲基)-2-(1,6,6-三甲基-4,5,6,7-四氢-1H-吲唑-3-基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-羧酸[(R)-2-(3-氰基-氮杂环丁烷-1-基)-1-甲基-2-氧代-乙基]-酰胺,为淡橙色泡沫。
步骤7
2-(1,6,6-三甲基-4,5,6,7-四氢-1H-吲唑-3-基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-羧酸[(R)-2-(3-氰基-氮杂环丁烷-1-基)-1-甲基-2-氧代-乙基]-酰胺
向5-(2-三甲基甲硅烷基-乙氧基甲基)-2-(1,6,6-三甲基-4,5,6,7-四氢-1H-吲唑-3-基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-羧酸[(R)-2-(3-氰基-氮杂环丁烷-1-基)-1-甲基-2-氧代-乙基]-酰胺(40mg,0.068mmol)在CH2Cl2(3mL)中的溶液中添加TFA(1.5mL,19.5mmol)。将黄色反应混合物在室温搅拌3小时,然后浓缩。将残余物再溶解于CH2Cl2(3mL)中并添加乙二胺(0.3mL,4.44mmol)。将反应混合物在室温搅拌0.5小时,然后以水淬灭并以CH2Cl2(3x)萃取。将合并的有机物浓缩成黄色油状固体。以EtOAc/Et2O研磨得到17mg(55%)的2-(1,6,6-三甲基-4,5,6,7-四氢-1H-吲唑-3-基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-羧酸[(R)-2-(3-氰基-氮杂环丁烷-1-基)-1-甲基-2-氧代-乙基]-酰胺,为灰白色固体。MS(M+H)+=461;1H NMR(DMSO-d6,400MHz):δ(ppm)8.94(d,J=2.0Hz,1H),8.34-8.44(m,2H),4.46-4.74(m,3H),4.10-4.21(m,1H),4.02(dd,J=9.9,6.4Hz,1H),3.78-3.86(m,1H),3.77(s,3H),2.98-3.08(m,1H),2.85-2.94(m,1H),2.45(s,2H),1.52(t,J=6.4Hz,2H),1.29-1.39(m,3H),1.03(s,6H).
实施例71.
2-(6-氯-1-甲基-1H-吲唑-3-基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-羧酸[1-(1-甲磺酰基-氮杂环丁烷-3-基)-乙基]-酰胺
步骤1
3-{[(E)-2-甲基-丙烷-2-亚磺酰基亚氨基]-甲基}-氮杂环丁烷-1-羧酸叔丁酯
向3-甲酰基-氮杂环丁烷-1-羧酸叔丁酯(1.0g,5.4mmol)和2-甲基丙烷-2-亚磺酰胺(654mg,5.4mmol)在无水CH2Cl2(10mL)中的溶液中添加无水CuSO4(1.9g,11.9mmol)。将非均相反应混合物在室温搅拌过夜,然后经硅藻土过滤,以CH2Cl2淋洗。浓缩滤液,将所得残余物吸收至SiO2上,并通过柱状色谱以20%至40%EtOAc/己烷纯化得到1.26g(81%)的3-{[(E)-2-甲基-丙烷-2-亚磺酰基亚氨基]-甲基}-氮杂环丁烷-1-羧酸叔丁酯,为白色固体。1H NMR(CDCl3,300MHz):δ(ppm)8.20(d,J=4.5Hz,1H),4.14-4.23(m,2H),4.00-4.13(m,2H),3.53-3.65(m,1H),1.45(s,9H),1.21(s,9H).
步骤2
3-[1-(2-甲基-丙烷-2-亚磺酰基氨基)-乙基]-氮杂环丁烷-1-羧酸叔丁酯
于0℃向3-{[(E)-2-甲基-丙烷-2-亚磺酰基亚氨基]-甲基}-氮杂环丁烷-1-羧酸叔丁酯(0.25g,0.87mmol)在CH2Cl2(4mL)中的溶液中滴加甲基溴化镁(3.0M的Et2O溶液,0.35mL,1.04mmol)。于0℃搅拌反应混合物1小时,然后以饱和NH4Cl水溶液淬灭,以水稀释并以EtOAc(2x)萃取。将合并的有机物经MgSO4干燥并浓缩得到273mg的3-[1-(2-甲基-丙烷-2-亚磺酰基氨基)-乙基]-氮杂环丁烷-1-羧酸叔丁酯,为灰白色泡沫状固体,其不经进一步纯化即可使用。
步骤3
3-(1-氨基-乙基)-氮杂环丁烷-1-羧酸叔丁酯
于0℃向3-[1-(2-甲基-丙烷-2-亚磺酰基氨基)-乙基]-氮杂环丁烷-1-羧酸叔丁酯(来自步骤2的粗产物,264mg,0.87mmol)在MeOH中的溶液中滴加4.0MHCl在二噁烷(0.28mL,1.13mmol)中的溶液。于0℃搅拌反应混合物1小时,然后以饱和NaHCO3水溶液淬灭,以水稀释并以CH2Cl2(3x)萃取。将合并的有机物经MgSO4干燥并浓缩得到3-(1-氨基-乙基)-氮杂环丁烷-1-羧酸叔丁酯,为浓稠无色油状物,其不经进一步纯化即可使用。
步骤4
3-(1-{[2-(6-氯-1-甲基-1H-吲唑-3-基)-5-(2-三甲基甲硅烷基-乙氧基甲基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-羰基]-氨基}-乙基)-氮杂环丁烷-1-羧酸叔丁酯
向3-(1-氨基-乙基)-氮杂环丁烷-1-羧酸叔丁酯(来自步骤3的粗产物,63mg,0.31mmol在DMF(2mL)中的溶液中添加N,N-二异丙基乙胺(69μL,0.39mmol)、2-(6-氯-1-甲基-1H-吲唑-3-基)-5-(2-三甲基甲硅烷基-乙氧基甲基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-羧酸(120mg,0.26mmol)和HATU(110mg,0.29mmol)。将黄色反应混合物在室温搅拌过夜,然后以水淬灭并以EtOAc(3x)萃取。将合并的有机物以水(3x)和盐水洗涤,然后经MgSO4干燥并浓缩。将残余物通过硅胶色谱以30%至60%EtOAc/己烷纯化得到158mg(94%)的3-(1-{[2-(6-氯-1-甲基-1H-吲唑-3-基)-5-(2-三甲基甲硅烷基-乙氧基甲基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-羰基]-氨基}-乙基)-氮杂环丁烷-1-羧酸叔丁酯,为白色泡沫。1H NMR(CDCl3,300MHz):δ(ppm)9.23(s,1H),8.36(t,J=4.3Hz,2H),8.18(d,J=9.1Hz,1H),7.52(s,1H),7.24-7.29(m,1H),5.73(s,2H),4.57-4.68(m,1H),4.18(s,3H),3.87-4.08(m,3H),3.79(dd,J=8.7,6.0Hz,1H),3.55-3.65(m,2H),2.73(宽单峰,1H),1.39(s,9H),1.36(d,J=6.8Hz,6H),0.89-1.01(m,2H),-0.03(s,9H).
步骤5
2-(6-氯-1-甲基-1H-吲唑-3-基)-5-(2-三甲基甲硅烷基-乙氧基甲基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-羧酸(1-氮杂环丁烷-3-基-乙基)-酰胺盐酸盐
于0℃经5分钟向3-(1-{[2-(6-氯-1-甲基-1H-吲唑-3-基)-5-(2-三甲基甲硅烷基-乙氧基甲基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-羰基]-氨基}-乙基)-氮杂环丁烷-1-羧酸叔丁酯(150mg,0.23mmol)在MeOH(4mL)中的溶液中滴加乙酰基氯(0.33mL,4.69mmol)。将反应混合物在室温搅拌1小时,逐渐形成厚的沉淀。将溶剂在室温蒸发,将残余物高真空干燥分离出145mg的2-(6-氯-1-甲基-1H-吲唑-3-基)-5-(2-三甲基甲硅烷基-乙氧基甲基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-羧酸(1-氮杂环丁烷-3-基-乙基)-酰胺盐酸盐,为黄色固体。
步骤6
2-(6-氯-1-甲基-1H-吲唑-3-基)-5-(2-三甲基甲硅烷基-乙氧基甲基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-羧酸[1-(1-甲磺酰基-氮杂环丁烷-3-基)-乙基]-酰胺
于0℃向2-(6-氯-1-甲基-1H-吲唑-3-基)-5-(2-三甲基甲硅烷基-乙氧基甲基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-羧酸(1-氮杂环丁烷-3-基-乙基)-酰胺盐酸盐(65mg,0.11mmol)在CH2Cl2(2mL)中的悬浮液中添加三乙胺(47μL,0.33mmol),接着添加甲磺酰氯(10μL,0.12mmol)。于0℃搅拌反应混合物30分钟,然后于室温搅拌1小时。将反应混合物以水淬灭并以CH2Cl2萃取。将合并的有机物经MgSO4干燥并浓缩。将残余物通过硅胶色谱以0%至5%MeOH/CH2Cl2(0.5%NH4OH)纯化得到35mg(50%)的2-(6-氯-1-甲基-1H-吲唑-3-基)-5-(2-三甲基甲硅烷基-乙氧基甲基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-羧酸[1-(1-甲磺酰基-氮杂环丁烷-3-基)-乙基]-酰胺,为淡黄色固体。
步骤7
2-(6-氯-1-甲基-1H-吲唑-3-基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-羧酸[1-(1-甲磺酰基-氮杂环丁烷-3-基)-乙基]-酰胺
向2-(6-氯-1-甲基-1H-吲唑-3-基)-5-(2-三甲基甲硅烷基-乙氧基甲基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-羧酸[1-(1-甲磺酰基-氮杂环丁烷-3-基)-乙基]-酰胺(30mg,0.049mmol)在CH2Cl2(2mL)中的溶液中添加TFA(0.3mL,3.89mmol)。将黄色反应混合物在室温搅拌3小时,然后浓缩。将残余物再溶解于CH2Cl2(2mL)中并添加乙二胺(0.3mL,4.49mmol)。将反应混合物在室温搅拌1小时,然后以水淬灭并以MeOH/CH2Cl2(1:9)萃取。将有机层以水洗涤,且将水层以CH2Cl2反萃取。将合并的有机物经浓缩且将残余物以MeOH/EtOAc/Et2O研磨得到15mg(63%)的2-(6-氯-1-甲基-1H-吲唑-3-基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-羧酸[1-(1-甲磺酰基-氮杂环丁烷-3-基)-乙基]-酰胺,为淡黄色固体。MS(M+H)+=488;1H NMR(DMSO-d6,300MHz):δ(ppm)9.05(宽单峰,1H),8.86(s,1H),8.63(s,1H),8.41(d,J=8.7Hz,1H),7.92(s,1H),7.26(d,J=8.7Hz,1H),4.35-4.45(m,1H),4.22-4.33(m,1H),4.12(s,3H),4.04-4.10(m,1H),3.62-3.74(m,1H),3.45-3.58(m,1H),3.25(s,3H),2.57-268(m,1H),1.38(d,J=6.8Hz,3H).
实施例72.
2-(6-氯-1-甲基-1H-吲唑-3-基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-羧酸((R)-1-甲基-3-氧代-3-吡咯烷-1-基-丙基)-酰胺
步骤1
((R)-1-甲基-3-氧代-3-吡咯烷-1-基-丙基)-氨基甲酸叔丁酯
向(R)-3-叔丁氧基羰基氨基-丁酸(150mg,0.74mmol)和HATU(309mg,0.81mmol)在DMF(2mL)中的溶液中添加吡咯烷(0.19mL,2.21mmol)。将所得黄色反应混合物在室温搅拌过夜,然后以水淬灭并以EtOAc(2x)萃取。将合并的有机物以水(3x)和盐水洗涤,然后经MgSO4干燥并浓缩得到((R)-1-甲基-3-氧代-3-吡咯烷-1-基-丙基)-氨基甲酸叔丁酯,为无色油状物,其不经进一步纯化即可使用。
步骤2
(R)-3-氨基-1-吡咯烷-1-基-丁-1-酮三氟乙酸盐
向((R)-1-甲基-3-氧代-3-吡咯烷-1-基-丙基)-氨基甲酸叔丁酯(来自步骤1的粗产物,189mg,0.74mmol)在CH2Cl2(5mL)的溶液中添加三氟乙酸(2.0mL,27.0mmol)。将反应混合物在室温搅拌2小时,然后浓缩得到(R)-3-氨基-1-吡咯烷-1-基-丁-1-酮三氟乙酸盐,为淡黄色油状物,其不经进一步纯化即可使用。
步骤3
2-(6-氯-1-甲基-1H-吲唑-3-基)-5-(2-三甲基甲硅烷基-乙氧基甲基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-羧酸((R)-1-甲基-3-氧代-3-吡咯烷-1-基-丙基)-酰胺
向(R)-3-氨基-1-吡咯烷-1-基-丁-1-酮三氟乙酸盐(来自步骤2的粗产物,118mg,0.44mmol)在DMF(2mL)的溶液中添加N,N-二异丙基乙胺(0.19mL,1.09mmol)、2-(6-氯-1-甲基-1H-吲唑-3-基)-5-(2-三甲基甲硅烷基-乙氧基甲基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-羧酸(100mg,0.22mmol)和HATU(91mg,0.24mmol)。将反应混合物在室温搅拌过夜,然后以水淬灭并以EtOAc(3x)萃取。将合并的有机物以水(3x)和盐水洗涤,然后经MgSO4干燥并浓缩。将残余物通过硅胶色谱以50%至100%EtOAc/己烷纯化得到125mg(96%)的2-(6-氯-1-甲基-1H-吲唑-3-基)-5-(2-三甲基甲硅烷基-乙氧基甲基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-羧酸((R)-1-甲基-3-氧代-3-吡咯烷-1-基-丙基)-酰胺,为白色固体。
步骤4
2-(6-氯-1-甲基-1H-吲唑-3-基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-羧酸((R)-1-甲基-3-氧代-3-吡咯烷-1-基-丙基)-酰胺
向2-(6-氯-1-甲基-1H-吲唑-3-基)-5-(2-三甲基甲硅烷基-乙氧基甲基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-羧酸((R)-1-甲基-3-氧代-3-吡咯烷-1-基-丙基)-酰胺(125mg,0.21mmol)在CH2Cl2(2mL)中的溶液中添加TFA(0.5mL,6.49mmol)。将黄色反应混合物在室温搅拌3小时,然后浓缩。将残余物再溶解于CH2Cl2(2mL)中并添加乙二胺(0.4mL,6.0mmol)。将反应混合物在室温搅拌1小时,然后以水淬灭。将所得沉淀经过滤收集并以水和EtOAc洗涤。将固体溶解于10%MeOH/CH2Cl2,并以水洗涤。将水层以CH2Cl2反萃取。将合并的有机物经MgSO4干燥并浓缩得到64mg(66%)的2-(6-氯-1-甲基-1H-吲唑-3-基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-羧酸((R)-1-甲基-3-氧代-3-吡咯烷-1-基-丙基)-酰胺,为灰白色固体。MS:(M+H)+=466;1H NMR(DMSO-d6,300MHz):δ(ppm)9.07(s,1H),8.57(d,J=8.7Hz,1H),8.41(s,1H),8.26(d,J=7.9Hz,1H),7.97(d,J=1.1Hz,1H),7.28(dd,J=8.7,1.5Hz,1H),4.36-4.54(m,1H),4.16(s,3H),3.40(t,J=6.6Hz,2H),3.10-3.25(m,2H),2.52-2.76(m,2H),1.61-1.90(m,4H),1.38(d,J=6.8Hz,3H).
实施例73.
2-(6-氟-1-甲基-1H-吲唑-3-基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-羧酸[1-(顺式-3-羟基-环丁基)-乙基]-酰胺
步骤1
顺式-3-羟基-环丁烷甲腈
3-氧代环丁烷甲腈根据Elend,D.;Fengas,D.;Fray,J.M.SyntheticCommunications,2005,35,657制备。于0℃向3-氧代环丁烷甲腈(600mg,6.31mmol)在MeOH(25mL)中的溶液中缓慢地添加硼氢化钠(263mg,6.94mmol)。于0℃搅拌反应混合物1小时,然后以水和盐水淬灭并以EtOAc(3x)萃取。将合并的有机物经MgSO4干燥并浓缩得到500mg(82%)的顺式-3-羟基-环丁烷甲腈,为无色油状物。1H NMR(CDCl3,300MHz):δ(ppm)4.26(quin,J=7.5Hz,1H),2.70-2.82(m,2H),2.50-2.66(m,1H),2.26-2.41(m,2H),2.09(宽单峰,1H).
步骤2
顺式-3-(叔丁基二甲基甲硅烷基氧基)-环丁烷甲腈
于室温向顺式-3-羟基-环丁烷甲腈(500mg,5.15mmol)在DMF(3mL)的溶液中添加咪唑(876mg,12.9mmol),接着添加TBDMS-Cl(854mg,5.66mmol)。将反应混合物在室温搅拌过夜,然后以水淬灭并以EtOAc(2x)萃取。将合并的有机物以水(3x)洗涤,经MgSO4干燥并浓缩。将残余物通过硅胶色谱以0%至10%EtOAc/己烷纯化得到890mg(82%)的顺式-3-(叔丁基二甲基甲硅烷基氧基)-环丁烷甲腈,为无色油状物。1H NMR(CDCl3,400MHz):δ(ppm)4.10-4.19(m,1H),2.57-2.67(m,2H),2.43-2.54(m,1H),2.22-2.34(m,2H),0.84(s,9H),0.00(s,6H).
步骤3
顺式-3-(叔丁基二甲基甲硅烷基氧基)-环丁烷甲醛
于-70℃向顺式-3-(叔丁基二甲基甲硅烷基氧基)环丁烷甲腈(0.89g,4.21mmol)在CH2Cl2(25mL)中的溶液中缓慢地添加DIBAL-H(1.05mL,5.89mmol)。搅拌反应混合物2.5小时,温度逐渐增加至0℃。将浑浊的反应混合物以MeOH(1mL)淬灭,然后以CH2Cl2(20mL)稀释,并加入饱和Na+K+酒石酸盐(25mL)水溶液。室温剧烈地搅拌两相混合物1小时。分离各层,且将水相以CH2Cl2(2x)萃取。将合并的有机物经MgSO4干燥并浓缩得到顺式-3-(叔丁基二甲基甲硅烷基氧基)-环丁烷甲醛,为无色油状物,其不经进一步纯化即可使用。
步骤4
2-甲基-丙烷-2-亚磺酸1-[顺式-3-(叔丁基二甲基甲硅烷基氧基)-环丁基]-亚甲-(E)-基酰胺
向顺式-3-(叔丁基二甲基甲硅烷基氧基)-环丁烷甲醛(来自步骤3的粗产物,900mg,4.2mmol)和2-甲基丙烷-2-亚磺酰胺(509mg,4.2mmol)在无水CH2Cl2(10mL)中的溶液中添加无水CuSO4(1.47g,9.24mmol)。将非均相反应混合物在室温搅拌过夜,然后经硅藻土过滤,以CH2Cl2淋洗。将滤液吸收至SiO2上,并经色谱以0%至20%EtOAc/己烷纯化分离出642mg(48%)的2-甲基-丙烷-2-亚磺酸1-[顺式-3-(叔丁基二甲基甲硅烷基氧基)-环丁基]-亚甲-(E)-基酰胺,为无色油状物。1H NMR(CDCl3,300MHz):δ(ppm)8.04(d,J=5.3Hz,1H),4.25(quin,J=7.4Hz,1H),2.73-2.88(m,1H),2.46-2.59(m,2H),2.06-2.18(m,2H),1.19(s,9H),0.89(s,9H),0.05(s,6H).
步骤5
2-甲基-丙烷-2-亚磺酸{1-[顺式-3-(叔丁基-二甲基-甲硅烷基氧基)-环丁基]-乙基}-酰胺
于0℃向2-甲基-丙烷-2-亚磺酸1-[顺式-3-(叔丁基二甲基甲硅烷基氧基)-环丁基]-亚甲-(E)-基酰胺(640mg,2.02mmol)在CH2Cl2(10mL)中的溶液中缓慢地添加甲基溴化镁(3.0M的Et2O溶液,1.14mL,3.43mmol)。于0℃搅拌反应混合物1小时,然后以饱和NH4Cl水溶液淬灭,以水稀释并以EtOAc(3x)萃取。将合并的有机物经MgSO4干燥并浓缩,得到685mg的2-甲基-丙烷-2-亚磺酸{1-[顺式-3-(叔丁基-二甲基-甲硅烷基氧基)-环丁基]-乙基}-酰胺,为灰白色蜡状固体,其不经进一步纯化即可使用。1H NMR(CDCl3,300MHz):δ(ppm)4.05-4.18(m,1H),3.16-3.31(m,1H),2.85(d,J=7.2Hz,1H),2.21-2.44(m,2H),1.59-1.76(m,3H),1.20(s,9H),1.18(d,J=6.0Hz,3H),0.88(s,9H),0.03(s,6H).
步骤6
顺式-3-(1-氨基乙基)-环丁醇盐酸盐
向2-甲基-丙烷-2-亚磺酸{1-[顺式-3-(叔丁基-二甲基-甲硅烷基氧基)-环丁基]-乙基}-酰胺(200mg,0.60mmol)在MeOH(3mL)中的溶液中添加氯化氢(4.0M的1,4-二噁烷溶液,0.30mL,1.2mmol)。将反应混合物在室温搅拌20分钟,然后浓缩得到顺式-3-(1-氨基乙基)-环丁醇盐酸盐,为灰白色半固体,其不经进一步纯化即可使用。1H NMR(甲醇-d4,300MHz):δ(ppm)4.09(quind,J=7.5,3.8Hz,1H),3.17(dt,J=6.0,3.0Hz,1H),2.36-2.56(m,2H),1.78-1.96(m,1H),1.59-1.77(m,2H),1.22(dd,J=6.8,3.8Hz,3H).
步骤7
2-(6-氟-1-甲基-1H-吲唑-3-基)-5-(2-三甲基甲硅烷基-乙氧基甲基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-羧酸[1-(顺式-3-羟基-环丁基)-乙基]-酰胺
向顺式-3-(1-氨基乙基)-环丁醇盐酸盐(来自步骤6的粗产物,91mg,0.60mmol)在DMF(2mL)中的溶液中添加N,N-二异丙基乙胺(0.24mL,1.36mmol)、2-(6-氟-1-甲基-1H-吲唑-3-基)-5-(2-三甲基甲硅烷基-乙氧基甲基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-羧酸(120mg,0.27mmol)和HATU(114mg,0.30mmol)。将黄色反应混合物在室温搅拌过夜,然后以水淬灭并以EtOAc(3x)萃取。将合并的有机物以水(3x)和盐水洗涤,然后经MgSO4干燥并浓缩成淡黄色固体。以EtOAc/Et2O研磨得到108mg(74%)的2-(6-氟-1-甲基-1H-吲唑-3-基)-5-(2-三甲基甲硅烷基-乙氧基甲基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-羧酸[1-(顺式-3-羟基-环丁基)-乙基]-酰胺,为白色固体。
步骤8
2-(6-氟-1-甲基-1H-吲唑-3-基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-羧酸[1-(顺式-3-羟基-环丁基)-乙基]-酰胺
向2-(6-氟-1-甲基-1H-吲唑-3-基)-5-(2-三甲基甲硅烷基-乙氧基甲基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-羧酸[1-(顺式-3-羟基-环丁基)-乙基]-酰胺(60mg,0.11mmol)在CH2Cl2(2mL)中的溶液中添加TFA(1mL,13.0mmol)。将亮黄橙色反应混合物在室温搅拌3小时,然后浓缩。将残余物再溶解于CH2Cl2(2mL)中并添加乙二胺(0.4mL,6.0mmol)。将反应混合物在室温搅拌1小时,然后以水淬灭并以CH2Cl2稀释。形成非常细的沉淀,其经过过滤收集。将该固体吸收在MeOH/CH2Cl2(200mL)中,并再次过滤,以MeOH/CH2Cl2淋洗。浓缩滤液,并以EtOAc/MeOH研磨得到28mg(62%)的2-(6-氟-1-甲基-1H-吲唑-3-基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-羧酸[1-(顺式-3-羟基-环丁基)-乙基]-酰胺,为浅黄色固体。MS:(M+H)+=409;1H NMR(DMSO-d6,300MHz):δ(ppm)9.08(s,1H),8.37-8.48(m,2H),7.96(d,J=8.7Hz,1H),7.70(dd,J=9.8,1.9Hz,1H),7.18(td,J=9.1,2.3Hz,1H),4.92(宽单峰,1H),4.14(s,3H),4.04-4.13(m,1H),3.87(宽单峰,1H),2.14-2.34(m,2H),1.78-1.93(m,1H),1.58(quin,J=9.8Hz,2H),1.19(d,J=6.8Hz,3H).
实施例74.
2-(6-氟-1-甲基-1H-吲唑-3-基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-羧酸[1-(反式-3-氰基环丁基)-乙基]-酰胺
步骤1
甲磺酸顺式-3-(1-{[2-(6-氟-1-甲基-1H-吲唑-3-基)-5-(2-三甲基甲硅烷基-乙氧基甲基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-羰基]-氨基}-乙基)-环丁基酯
于0℃向2-(6-氟-1-甲基-1H-吲唑-3-基)-5-(2-三甲基甲硅烷基-乙氧基甲基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-羧酸[1-(顺式-3-羟基-环丁基)-乙基]-酰胺(100mg,0.19mmol)在CH2Cl2(3mL)中的部分溶液中添加三乙胺(39μL,0.28mmol),接着添加甲磺酰氯(16μL,0.21mmol)。于0℃搅拌反应混合物1小时,然后以水淬灭并以CH2Cl2萃取,将有机物经MgSO4干燥并浓缩得到甲磺酸顺式-3-(1-{[2-(6-氟-1-甲基-1H-吲唑-3-基)-5-(2-三甲基甲硅烷基-乙氧基甲基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-羰基]-氨基}-乙基)-环丁基酯,为灰白色泡沫,其不经进一步纯化即可使用。
步骤2
2-(6-氟-1-甲基-1H-吲唑-3-基)-5-(2-三甲基甲硅烷基-乙氧基甲基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-羧酸[1-(反式-3-氰基-环丁基)-乙基]-酰胺
于室温向甲磺酸顺式-3-(1-{[2-(6-氟-1-甲基-1H-吲唑-3-基)-5-(2-三甲基甲硅烷基-乙氧基甲基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-羰基]-氨基}-乙基)-环丁基酯(来自步骤1的粗产物,114mg,0.19mmol)在DMSO(1.5mL)中的溶液中添加氰化钾(48mg,0.74mmol)。于60℃加热反应混合物2.5小时。添加18-冠醚-6(10mg,0.04mmol)并于80℃继续加热2小时,然后于100℃过夜。将反应混合物冷却至室温,以水淬灭,并以EtOAc(3x)萃取。将合并的有机物以水(3x)和盐水洗涤,然后经MgSO4干燥并浓缩。将残余物经由色谱以30%至50%EtOAc/己烷纯化分离出46mg(45%)的2-(6-氟-1-甲基-1H-吲唑-3-基)-5-(2-三甲基甲硅烷基-乙氧基甲基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-羧酸[1-(反式-3-氰基-环丁基)-乙基]-酰胺,为黄色泡沫。
步骤3
2-(6-氟-1-甲基-1H-吲唑-3-基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-羧酸[1-(反式-3-氰基环丁基)-乙基]-酰胺
向2-(6-氟-1-甲基-1H-吲唑-3-基)-5-(2-三甲基甲硅烷基-乙氧基甲基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-羧酸[1-(反式-3-氰基-环丁基)-乙基]-酰胺(44mg,0.08mmol)在CH2Cl2(2mL)的溶液中添加TFA(1mL,13.0mmol)。将亮黄橙色反应混合物在室温搅拌3小时,然后浓缩。将残余物再溶解于CH2Cl2(2mL)中并添加乙二胺(0.4mL,6.0mmol)。将反应混合物在室温搅拌1小时,然后以水淬灭,并以5%MeOH/CH2Cl2(2x)萃取。将合并的有机物经浓缩且将残余物以EtOAc研磨得到19mg(57%)的2-(6-氟-1-甲基-1H-吲唑-3-基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-羧酸[1-(反式-3-氰基环丁基)-乙基]-酰胺,为浅黄色固体。MS:(M+H)+=418;1H NMR(DMSO-d6,300MHz):δ(ppm)9.08(s,1H),8.43(s,1H),8.40(dd,J=8.9,5.5Hz,1H),7.96(d,J=9.1Hz,1H),7.70(dd,J=9.8,2.3Hz,1H),7.29(td,J=9.1,1.9Hz,1H),4.19-4.31(m,1H),4.14(s,3H),2.64-2.77(m,2H),2.34-2.45(m,1H),2.22-2.33(m,3H),1.18(d,J=6.4Hz,3H).
实施例75.
2-(6-氟-1-甲基-1H-吲唑-3-基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-羧酸[1-(反式-3-羟基-环丁基)-乙基]-酰胺
步骤1
4-硝基苯甲酸反式-3-(1-{[2-(6-氟-1-甲基-1H-吲唑-3-基)-5-(2-三甲基甲硅烷基-乙氧基甲基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-羰基]-氨基}-乙基)-环丁基酯
向2-(6-氟-1-甲基-1H-吲唑-3-基)-5-(2-三甲基甲硅烷基-乙氧基甲基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-羧酸[1-(顺式-3-羟基-环丁基)-乙基]-酰胺(200mg,0.37mmol)在THF(4mL)中的溶液中添加4-硝基苯甲酸(124mg,0.74mmol)和三苯基膦(204mg,0.78mmol)。然后,将反应混合物冷却至0℃并滴加偶氮二羧酸二乙酯(123μL,0.78mmol)。将反应混合物在室温搅拌过夜,然后以CH2Cl2(25mL)稀释,并以1.0M NaOH水溶液洗涤。将水相以CH2Cl2反萃取,然后将合并的有机物经MgSO4干燥并浓缩。将残余物吸收至SiO2上,并经由色谱以20%至80%EtOAc/己烷纯化提供250mg(98%)的4-硝基苯甲酸反式-3-(1-{[2-(6-氟-1-甲基-1H-吲唑-3-基)-5-(2-三甲基甲硅烷基-乙氧基甲基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-羰基]-氨基}-乙基)-环丁基酯,为白色固体。
步骤2
2-(6-氟-1-甲基-1H-吲唑-3-基)-5-(2-三甲基甲硅烷基-乙氧基甲基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-羧酸[1-(反式-3-羟基-环丁基)-乙基]-酰胺
向4-硝基苯甲酸反式-3-(1-{[2-(6-氟-1-甲基-1H-吲唑-3-基)-5-(2-三甲基甲硅烷基-乙氧基甲基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-羰基]-氨基}-乙基)-环丁基酯(250mg,0.36mmol)在THF(12mL)中的溶液中添加10%氢氧化钠水溶液(0.44mL,1.09mmol)、水(1mL)和MeOH(2mL)。将反应混合物在室温搅拌30分钟,然后以水稀释,并以CH2Cl2(3x)萃取。将合并的有机物经MgSO4干燥并浓缩。将残余物通过硅胶色谱以30%至80%EtOAc/己烷纯化得到140mg(72%)的2-(6-氟-1-甲基-1H-吲唑-3-基)-5-(2-三甲基甲硅烷基-乙氧基甲基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-羧酸[1-(反式-3-羟基-环丁基)-乙基]-酰胺,为灰白色固体。
步骤3
2-(6-氟-1-甲基-1H-吲唑-3-基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-羧酸[1-(反式-3-羟基-环丁基)-乙基]-酰胺
向2-(6-氟-1-甲基-1H-吲唑-3-基)-5-(2-三甲基甲硅烷基-乙氧基甲基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-羧酸[1-(顺式-3-羟基-环丁基)-乙基]-酰胺(50mg,0.09mmol)在CH2Cl2(2mL)中的溶液中添加TFA(1mL,13.0mmol)。将亮黄橙色反应混合物在室温搅拌3小时,然后浓缩。将残余物再溶解于CH2Cl2(2mL)中并添加乙二胺(0.4mL,6.0mmol)。将反应混合物在室温搅拌1小时,然后以水淬灭并以5%MeOH/CH2Cl2(2x)萃取。将合并的有机物经浓缩且以EtOAc研磨得到19mg(50%)的2-(6-氟-1-甲基-1H-吲唑-3-基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-羧酸[1-(反式-3-羟基-环丁基)-乙基]-酰胺,为浅黄色固体。MS:(M+H)+=409;1H NMR(DMSO-d6,300MHz):δ(ppm)9.09(s,1H),8.42(s,1H),8.39(dd,J=8.7,5.3Hz,1H),7.94(d,J=8.7Hz,1H),7.71(dd,J=9.6,2.1Hz,1H),7.26(td,J=9.1,1.9Hz,1H),4.96(宽单峰,1H),4.14(s,3H),4.07-4.26(m,2H),2.23-2.41(m,1H),1.98-2.19(m,3H),1.84-1.98(m,1H),1.20(d,J=6.4Hz,3H).
实施例76.
2-(6-氟-1-甲基-1H-吲唑-3-基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-羧酸[1-(顺式-3-氰基环丁基)-乙基]-酰胺
步骤1
甲磺酸反式-3-(1-{[2-(6-氟-1-甲基-1H-吲唑-3-基)-5-(2-三甲基甲硅烷基-乙氧基甲基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-羰基]-氨基}-乙基)-环丁基酯
于0℃向2-(6-氟-1-甲基-1H-吲唑-3-基)-5-(2-三甲基甲硅烷基-乙氧基甲基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-羧酸[1-(反式-3-羟基-环丁基)-乙基]-酰胺(85mg,0.16mmol)在CH2Cl2(3mL)中的溶液中添加三乙胺(33μL,0.24mmol),接着添加甲磺酰氯(14μL,0.18mmol)。于0℃搅拌反应混合物1小时,然后以水淬灭并以CH2Cl2萃取。将有机物经MgSO4干燥并浓缩得到甲磺酸反式-3-(1-{[2-(6-氟-1-甲基-1H-吲唑-3-基)-5-(2-三甲基甲硅烷基-乙氧基甲基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-羰基]-氨基}-乙基)-环丁基酯,为灰白色泡沫,其不经进一步纯化即可使用。
步骤2
2-(6-氟-1-甲基-1H-吲唑-3-基)-5-(2-三甲基甲硅烷基-乙氧基甲基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-羧酸[1-(顺式-3-氰基-环丁基)-乙基]-酰胺
于室温向甲磺酸反式-3-(1-{[2-(6-氟-1-甲基-1H-吲唑-3-基)-5-(2-三甲基甲硅烷基-乙氧基甲基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-羰基]-氨基}-乙基)-环丁基酯(来自步骤1的粗产物,97mg,0.16mmol)在DMSO(1.5mL)中的溶液中添加氰化钾(41mg,0.63mmol)和18-冠醚-6(8mg,0.03mmol)。于100℃将反应混合物加热过夜然后冷却至室温,以水淬灭,并以EtOAc(3x)萃取。将合并的有机物以水(3x)和盐水洗涤,然后经MgSO4干燥并浓缩。将残余物经由色谱以20%至50%EtOAc/己烷纯化分离出34mg(40%)的2-(6-氟-1-甲基-1H-吲唑-3-基)-5-(2-三甲基甲硅烷基-乙氧基甲基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-羧酸[1-(顺式-3-氰基-环丁基)-乙基]-酰胺,为黄色泡沫。
步骤3
2-(6-氟-1-甲基-1H-吲唑-3-基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-羧酸[1-(顺式-3-氰基环丁基)-乙基]-酰胺
向2-(6-氟-1-甲基-1H-吲唑-3-基)-5-(2-三甲基甲硅烷基-乙氧基甲基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-羧酸[1-(顺式-3-氰基-环丁基)-乙基]-酰胺(34mg,0.06mmol)在CH2Cl2(2mL)中的溶液中添加TFA(1mL,13.0mmol)。将亮黄橙色反应混合物在室温搅拌3小时,然后浓缩。将残余物再溶解于CH2Cl2(2mL)中并添加乙二胺(0.4mL,6.0mmol)。将反应混合物在室温搅拌1小时,然后浓缩,直接经由硅胶色谱以50%至100%EtOAc/己烷~5%MeOH/EtOAc纯化得到15mg(58%)的2-(6-氟-1-甲基-1H-吲唑-3-基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-羧酸[1-(顺式-3-氰基环丁基)-乙基]-酰胺,为白色固体。MS:(M+H)+=418;1H NMR(DMSO-d6,300MHz):δ(ppm)12.86(宽单峰,1H),9.08(s,1H),8.44(s,1H),8.40(dd,J=9.1,5.3Hz,1H),7.98(d,J=8.7Hz,1H),7.70(dd,J=9.8,1.9Hz,1H),7.25(td,J=9.0,2.1Hz,1H),4.17-4.28(m,1H),4.14(s,3H),3.20(t,J=8.7Hz,1H),2.30-2.46(m,3H),2.04-2.20(m,2H),1.18(d,J=6.8Hz,3H).
实施例77.
2-异喹啉-1-基-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-羧酸[(R)-2-(3-氰基-氮杂环丁烷-1-基)-1-甲基-2-氧代-乙基]-酰胺
步骤1
2-异喹啉-1-基-5-(2-三甲基甲硅烷基-乙氧基甲基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-羧酸[(R)-2-(3-氰基-氮杂环丁烷-1-基)-1-甲基-2-氧代-乙基]-酰胺
向六甲基二锡(90mg,0.28mmol)和2-溴-5-(2-三甲基甲硅烷基-乙氧基甲基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-羧酸[(R)-2-(3-氰基-氮杂环丁烷-1-基)-1-甲基-2-氧代-乙基]-酰胺(100mg,0.20mmol)在甲苯(2mL)中的溶液中添加Pd(Ph3P)4(23mg,0.02mmol)。使氮气流温和地鼓泡通过反应混合物15分钟,然后将其加热至95℃。1.5小时后,以一份添加1-碘代异喹啉(50mg,0.20mmol)和Pd(Ph3P)4(23mg,0.02mmol)。于95℃继续加热1.5小时,并添加额外地1-碘代异喹啉(25mg,0.10mmol)、DMF(0.5mL)和碘化亚铜(I)(5mg)。于95℃加热反应混合物过夜。添加额外地1-碘代喹啉(25mg,0.10mmol)和Pd(Ph3P)4(23mg,0.02mmol),并继续加热8小时。将反应混合物冷却至室温,以水淬灭,并以EtOAc(3x)萃取。将合并的有机物以水(3x)和盐水洗涤,然后经MgSO4干燥并浓缩。将残余物通过硅胶色谱以30%至80%EtOAc/己烷纯化得到52mg(48%)的2-异喹啉-1-基-5-(2-三甲基甲硅烷基-乙氧基甲基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-羧酸[(R)-2-(3-氰基-氮杂环丁烷-1-基)-1-甲基-2-氧代-乙基]-酰胺,为黄色泡沫。
步骤2
2-异喹啉-1-基-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-羧酸[(R)-2-(3-氰基-氮杂环丁烷-1-基)-1-甲基-2-氧代-乙基]-酰胺
向2-异喹啉-1-基-5-(2-三甲基甲硅烷基-乙氧基甲基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-羧酸[(R)-2-(3-氰基-氮杂环丁烷-1-基)-1-甲基-2-氧代-乙基]-酰胺(52mg,0.094mmol)在CH2Cl2(2mL)中的溶液中添加TFA(1mL,13.0mmol)。将反应混合物在室温搅拌3小时,然后浓缩。将残余物再溶解于CH2Cl2(2mL)中并添加乙二胺(0.4mL,6.0mmol)。搅拌反应混合物1小时,然后以水淬灭并以CH2Cl2萃取。将合并的有机物经浓缩且将残余物通过硅胶色谱以0%至5%MeOH/CH2Cl2(0.5%NH4OH)纯化得到17mg(43%)的2-异喹啉-1-基-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-羧酸[(R)-2-(3-氰基-氮杂环丁烷-1-基)-1-甲基-2-氧代-乙基]-酰胺,为灰白色固体。MS(M+H)+=426;mp=180-185℃;1H NMR(DMSO-d6,300MHz):δ(ppm)13.02(宽单峰,1H),9.09(s,1H),8.91(d,J=8.7Hz,1H),8.68(d,J=5.7Hz,1H),8.55(d,J=9.1Hz,1H),8.44(d,J=7.6Hz,1H),8.09(d,J=7.9Hz,1H),7.98(d,J=5.7Hz,1H),7.84(t,J=7.6Hz,1H),7.66-7.77(m,1H),4.40-4.70(m,3H),4.12(q,J=9.7Hz,1H),3.93-4.04(m,1H),3.74-3.88(m,1H),1.22(t,J=6.6Hz,3H).
实施例78.
2-(6-氟-1-甲基-1H-吲唑-3-基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-羧酸((R)-1-吡啶-2-基-乙基)-酰胺盐酸盐
步骤1
(R)-2-甲基-丙烷-2-亚磺酸((R)-1-吡啶-2-基-乙基)-酰胺
标题化合物根据Kuduk,et.al.Tetrahedron Lett.2004,45,6641阐述的操作从吡啶-2-甲醛制备。得到的产物为有利于RSR非对映异构体的10:1混合物,如NMR所判断的,这与文献相一致。1H NMR(CDCl3,300MHz):δ(ppm)8.55(d,J=4.9Hz,1H),7.66(td,J=7.6,1.7Hz,1H),7.29(d,J=7.6Hz,1H),7.18(dd,J=7.6,4.9Hz,1H),4.83(d,J=4.9Hz,1H),4.53-4.66(m,1H),1.51(d,J=6.8Hz,3H),1.26(s,9H).
步骤2
(R)-1-吡啶-2-基-乙胺二盐酸盐
向(R)-2-甲基-丙烷-2-亚磺酸((R)-1-吡啶-2-基-乙基)-酰胺(1.10g,4.86mmol)在MeOH(12mL)中的溶液中添加4.0M氯化氢的二噁烷溶液(3.04mL,12.1mmol)。将反应混合物在室温搅拌30分钟,然后浓缩并高真空干燥得到1.0g的(R)-1-吡啶-2-基-乙胺二盐酸盐,为浅黄色固体。1H NMR(甲醇-d4,300MHz):δ(ppm)8.80(t,J=3.8Hz,1H),8.32(tdd,J=7.9,4.5,1.7Hz,1H),7.88(dd,J=7.9,4.5Hz,1H),7.72-7.83(m,1H),4.78(qd,J=6.9,4.5Hz,1H),1.73(dd,J=6.9,4.5Hz,3H)。基于10:1dr的起始物质,假设82%ee。
步骤3
2-(6-氟-1-甲基-1H-吲唑-3-基)-5-(2-三甲基甲硅烷基-乙氧基甲基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-羧酸((R)-1-吡啶-2-基-乙基)-酰胺
向(R)-1-吡啶-2-基-乙胺二盐酸盐(66mg,0.34mmol)在DMF(2mL)中的溶液中添加N,N-二异丙基乙胺(0.20mL,1.13mmol)、2-(6-氟-1-甲基-1H-吲唑-3-基)-5-(2-三甲基甲硅烷基-乙氧基甲基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-羧酸(100mg,0.23mmol)和HATU(95mg,0.25mmol)。将黄色反应混合物在室温搅拌过夜,然后以水淬灭并以EtOAc(3x)萃取。将合并的有机物以水(3x)和盐水洗涤,然后经MgSO4干燥并浓缩。将残余物通过硅胶色谱以50%至100%EtOAc/己烷纯化得到117mg(95%)的2-(6-氟-1-甲基-1H-吲唑-3-基)-5-(2-三甲基甲硅烷基-乙氧基甲基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-羧酸((R)-1-吡啶-2-基-乙基)-酰胺,为白色固体。
步骤4
2-(6-氟-1-甲基-1H-吲唑-3-基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-羧酸((R)-1-吡啶-2-基-乙基)-酰胺盐酸盐
向2-(6-氟-1-甲基-1H-吲唑-3-基)-5-(2-三甲基甲硅烷基-乙氧基甲基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-羧酸((R)-1-吡啶-2-基-乙基)-酰胺(117mg,0.21mmol)在CH2Cl2(2mL)中的溶液中添加TFA(1mL,13.0mmol)。将亮黄橙色反应混合物在室温搅拌3小时,然后浓缩。将残余物再溶解于CH2Cl2(2mL)中并添加乙二胺(0.5mL,7.50mmol)。搅拌反应混合物1小时,然后直接以50%至100%EtOAc/己烷~5%MeOH/EtOAc色谱纯化。以EtOAc研磨由此分离的白色固体,然后悬浮在CH2Cl2和MeOH(1:1,6mL)中。添加1.0M HCl的MeOH溶液(2当量),其导致完全的溶解。将溶液经浓缩并高真空干燥得到67mg(69%)的2-(6-氟-1-甲基-1H-吲唑-3-基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-羧酸((R)-1-吡啶-2-基-乙基)-酰胺盐酸盐,为浅黄色固体。MS(M+H)+=416;1H NMR(DMSO-d6,300MHz):δ(ppm)12.93(d,J=2.6Hz,1H),9.13(s,1H),8.83(d,J=7.6Hz,1H),8.73(dd,J=8.9,5.5Hz,1H),8.59(d,J=4.9Hz,1H),8.44(d,J=3.0Hz,1H),8.07(宽单峰,1H),7.76(d,J=7.9Hz,1H),7.68(dd,J=9.6,2.1Hz,1H),7.53(宽单峰,1H),7.05(td,J=9.1,1.9Hz,1H),5.44(quin,J=7.0Hz,1H),4.15(s,3H),1.67(d,J=6.8Hz,3H)。
实施例79.
2-(6-氟-1-甲基-1H-吲唑-3-基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-羧酸[(R)-1-(4-三氟甲基-吡啶-2-基)-乙基]-酰胺
步骤1
(4-三氟甲基-吡啶-2-基)-甲醇
于0℃向4-三氟甲基-吡啶-2-羧酸(500mg,2.62mmol)在THF(20mL)中的溶液中添加三乙胺(0.40mL,2.88mmol),接着添加氯甲酸乙酯(0.28mL,2.88mmol)。形成厚的白色沉淀。于0℃搅拌反应混合物15分钟,然后经由移液管缓慢地添加硼氢化钠(297mg,7.85mmol)在水(5mL)中的溶液。观察到剧烈地产生气体并且所有固体都溶解。将反应混合物在0℃搅拌10分钟,然后温热至室温并搅拌1小时。将反应混合物以水稀释,并以CH2Cl2(3x)萃取。将合并的有机物经MgSO4干燥并浓缩。将残余物通过色谱以20%至50%EtOAc/己烷纯化得到296mg(64%)的(4-三氟甲基-吡啶-2-基)-甲醇,为无色油状物,其在刚低于室温时凝固。1H NMR(CDCl3,300MHz):δ(ppm)8.76(d,J=4.9Hz,1H),7.55(s,1H),7.45(d,J=4.9Hz,1H),4.87(s,2H).
步骤2
4-三氟甲基-吡啶-2-甲醛
在室温向(4-三氟甲基-吡啶-2-基)-甲醇(290mg,1.64mmol)在CH2Cl2(15mL)中的溶液中添加戴斯-马丁高碘剂(764mg,1.8mmol)。将反应混合物在室温搅拌1小时,然后以饱和NaHCO3水溶液(10mL)和10%Na2S2O3水溶液(10mL)淬灭。将两相混合物以CH2Cl2稀释,并剧烈搅拌10分钟。分离各层,将水层以CH2Cl2萃取。将合并的有机物经MgSO4干燥并浓缩得到300mg的4-三氟甲基-吡啶-2-甲醛,为淡黄色油状物,其不经进一步纯化即可使用。1HNMR(CDCl3,300MHz):δ(ppm)10.15(s,1H),9.00(d,J=5.3Hz,1H),8.19(s,1H),7.77(dd,J=5.3,1.3Hz,1H).
步骤3
(R)-2-甲基-丙烷-2-亚磺酸1-(4-三氟甲基-吡啶-2-基)-亚甲-(E)-基酰胺
向4-三氟甲基-吡啶-2-甲醛(287mg,1.64mmol)和(R)-2-甲基丙烷-2-亚磺酰胺(209mg,1.72mmol)在CH2Cl2(10mL)中的溶液中添加无水硫酸铜(II)(576mg,3.61mmol)。将反应混合物在室温搅拌过夜然后经布氏漏斗过滤,以CH2Cl2淋洗。浓缩滤液,且将残余物吸收至SiO2上并通过色谱以20%至40%EtOAc/己烷纯化得到340mg(75%)的(R)-2-甲基-丙烷-2-亚磺酸1-(4-三氟甲基-吡啶-2-基)-亚甲-(E)-基酰胺,为淡黄色油状物。
步骤4
(R)-2-甲基-丙烷-2-亚磺酸[(R)-1-(4-三氟甲基-吡啶-2-基)-乙基]-酰胺
于-78℃向(R)-2-甲基-丙烷-2-亚磺酸1-(4-三氟甲基-吡啶-2-基)-亚甲-(E)-基酰胺(0.34g,1.22mmol)在THF(5mL)中的溶液中缓慢地添加甲基溴化镁(3.0M的Et2O溶液)(0.73mL,2.2mmol)。于-78℃搅拌反应混合物30分钟,然后以饱和NH4Cl水溶液冷淬灭。将混合物温热至室温,以水稀释,并以EtOAc(2x)萃取。将合并的有机物经MgSO4干燥并浓缩。NMR分析显示非对映异构体的约8:1混合物。将残余物通过色谱以50%至100%EtOAc/己烷纯化得到225mg(63%)的(R)-2-甲基-丙烷-2-亚磺酸[(R)-1-(4-三氟甲基-吡啶-2-基)-乙基]-酰胺,为无色油状物。1H NMR(CDCl3,300MHz):δ(ppm)8.75(d,J=5.3Hz,1H),7.51(s,1H),7.42(d,J=5.3Hz,1H),4.77(d,J=4.9Hz,1H),4.67(quin,J=6.3Hz,1H),1.55(d,J=6.8Hz,3H),1.27(s,9H)。所得单个非对映异构体指派为基于在先文献的RSR(Kuduk,et.al.Tetrahedron Lett.2004,45,6641)。
步骤5
(R)-1-(4-三氟甲基-吡啶-2-基)-乙胺二盐酸盐
向(R)-2-甲基-丙烷-2-亚磺酸[(R)-1-(4-三氟甲基-吡啶-2-基)-乙基]-酰胺(225mg,0.76mmol)在MeOH(4mL)中的溶液中添加4.0M氯化氢的二噁烷溶液(0.48mL,1.9mmol)。将反应混合物在室温搅拌30分钟,然后浓缩并高真空干燥得到225mg的(R)-1-(4-三氟甲基-吡啶-2-基)-乙胺二盐酸盐,为粘稠无色油状物,其不经进一步纯化即可使用。
步骤6
2-(6-氟-1-甲基-1H-吲唑-3-基)-5-(2-三甲基甲硅烷基-乙氧基甲基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-羧酸[(R)-1-(4-三氟甲基-吡啶-2-基)-乙基]-酰胺
向(R)-1-(4-三氟甲基-吡啶-2-基)-乙胺二盐酸盐(89mg,0.34mmol)在DMF(2mL)中的溶液中添加N,N-二异丙基乙胺(0.20mL,1.13mmol)、2-(6-氟-1-甲基-1H-吲唑-3-基)-5-(2-三甲基甲硅烷基-乙氧基甲基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-羧酸(100mg,0.23mmol)和HATU(95mg,0.25mmol)。将黄色反应混合物在室温搅拌过夜,然后以水淬灭并以EtOAc(3x)萃取。将合并的有机物以水(3x)和盐水洗涤,然后经MgSO4干燥并浓缩。将残余物通过硅胶色谱以50%至100%EtOAc/己烷纯化得到122mg(88%)的2-(6-氟-1-甲基-1H-吲唑-3-基)-5-(2-三甲基甲硅烷基-乙氧基甲基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-羧酸[(R)-1-(4-三氟甲基-吡啶-2-基)-乙基]-酰胺,为白色固体。
步骤7
2-(6-氟-1-甲基-1H-吲唑-3-基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-羧酸[(R)-1-(4-三氟甲基-吡啶-2-基)-乙基]-酰胺
向2-(6-氟-1-甲基-1H-吲唑-3-基)-5-(2-三甲基甲硅烷基-乙氧基甲基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-羧酸[(R)-1-(4-三氟甲基-吡啶-2-基)-乙基]-酰胺(122mg,0.20mmol)在CH2Cl2(3mL)中的溶液中添加TFA(1mL,13.0mmol)。将亮黄橙色反应混合物在室温搅拌3小时,然后浓缩。将残余物再溶解于CH2Cl2(3mL)中并添加乙二胺(0.5mL,7.50mmol)。搅拌反应混合物1小时,然后以水淬灭并以5%MeOH/CH2Cl2(2x)萃取。将合并的有机物经浓缩且以MeOH/CH2Cl2研磨分离出65mg(68%)的2-(6-氟-1-甲基-1H-吲唑-3-基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-羧酸[(R)-1-(4-三氟甲基-吡啶-2-基)-乙基]-酰胺,为灰白色固体。MS:(M+Na)+=506;1H NMR(DMSO-d6,300MHz):δ(ppm)12.79(宽单峰,1H),9.12(s,1H),8.86(d,J=7.9Hz,1H),8.71-8.81(m,2H),8.43(s,1H),7.91(s,1H),7.60-7.73(m,2H),7.03(td,J=9.2,2.1Hz,1H),5.55(quin,J=7.3Hz,1H),4.15(s,3H),1.64(d,J=6.8Hz,3H).
实施例80.
2-(6-氯-1-甲基-1H-吲唑-3-基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-羧酸((S)-2-氰基-1,2,2-三甲基-乙基)-酰胺
步骤1
(R)-2-甲基-丙烷-2-亚磺酸(E)-亚乙基酰胺
在烧瓶中,将(R)-2-甲基-丙烷-2-亚磺酸酰胺(4.00g,33.0mmol)溶解于CH2Cl2(14.0mL)中。添加乙醛(16.7mL,297mmol)、MgSO4(11.9g,99.0mmol)和甲苯磺酸吡啶(415mg,1.65mmol)。于室温搅拌反应混合物过夜,过滤并浓缩得到5.21g的(R)-2-甲基-丙烷-2-亚磺酸(E)-亚乙基酰胺,为黄色油状物,其不经进一步纯化即可使用。
步骤2
(R)-2-甲基-丙烷-2-亚磺酸((S)-2-氰基-1,2,2-三甲基-乙基)-酰胺
在烧瓶中,将异丁腈(6.39g,92.4mmol)溶解于乙醚(190mL)中并于-78℃冷却。添加NaHMDS(1.0M在THF中,99.0mL,99.0mmol)并于-78℃搅拌混合物30分钟。缓慢添加(R)-2-甲基-丙烷-2-亚磺酸(E)-亚乙基酰胺(来自步骤1的粗产物,5.21g,33.0mmol)在THF(50.0mL)中的溶液。-78℃搅拌混合物2小时,然后温热至室温过夜。将反应混合物以饱和氯化铵水溶液淬灭并以EtOAc萃取。将合并的有机物以盐水洗涤,经MgSO4干燥并浓缩。将残余物通过SiO2色谱纯化(20-100%EtOAc/己烷)得到2.93g(41%)(R)-2-甲基-丙烷-2-亚磺酸((S)-2-氰基-1,2,2-三甲基-乙基)-酰胺,为浅黄色油状物。1H NMR(CDCl3,300MHz):δ(ppm)3.28(dq,J=8.7,6.4Hz,1H),3.08(d,J=8.7Hz,1H),1.45(d,J=6.4Hz,3H),1.39(s,3H),1.34(s,3H),1.26(s,9H).
步骤3
(S)-3-氨基-2,2-二甲基-丁腈盐酸盐
将(R)-2-甲基-丙烷-2-亚磺酸(2-氰基-1,2,2-三甲基-乙基)-酰胺(2.93g,13.6mmol)溶解于MeOH中并添加HCl(4.0M的1,4-二噁烷溶液,6.8mL,27.2mmol)。将反应混合物在室温搅拌1小时,然后浓缩得到1.90g(94%)的(S)-3-氨基-2,2-二甲基-丁腈盐酸盐,为白色固体,其不经进一步纯化即可使用。
步骤4
2-溴-5-(2-三甲基甲硅烷基-乙氧基甲基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-羧酸((S)-2-氰基-1,2,2-三甲基-乙基)-酰胺
在烧瓶中混合2-溴-5-(2-三甲基甲硅烷基乙氧基甲基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-羧酸(1.10g,2.95mmol)、(S)-3-氨基-2,2-二甲基-丁腈盐酸盐(439mg,2.95mmol)、EDC(1.3g,6.8mmol)和HOBt(1.15g,6.8mmol)。添加DMF(27mL),接着添加i-Pr2NEt(3.6mL,20.7mmol)。将反应混合物在室温搅拌18小时,其然后以水淬灭并以EtOAc萃取。将有机物以10%柠檬酸、饱和NaHCO3、饱和LiCl和饱和NaCl洗涤,然后经MgSO4干燥并浓缩。将残余物通过SiO2色谱(50-100%EtOAc/己烷)纯化得到1.32g(96%)的2-溴-5-(2-三甲基甲硅烷基-乙氧基甲基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-羧酸((S)-2-氰基-1,2,2-三甲基-乙基)-酰胺,为灰白色粉末。
步骤5
2-(6-氯-1-甲基-1H-吲唑-3-基)-5-(2-三甲基甲硅烷基-乙氧基甲基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-羧酸((S)-2-氰基-1,2,2-三甲基-乙基)-酰胺
向6-叔丁基-1-甲基-3-三丁基甲锡烷基-1H-吲唑(222mg,0.49mmol)和2-溴-5-(2-三甲基甲硅烷基-乙氧基甲基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-羧酸((S)-2-氰基-1,2,2-三甲基-乙基)-酰胺(110mg,0.24mmol)在DMF(1.5mL)中的溶液中添加Pd(PPh3)4(14mg,0.012mmol)和碘化亚铜(I)(9mg,0.05mmol)。将黄色反应混合物以氩气冲洗,然后于80℃加热2小时,然后冷却至室温,以饱和NH4Cl淬灭并以EtOAc(2x)萃取。将合并的有机物以饱和LiCl和盐水洗涤,然后经MgSO4干燥并浓缩。将粗残余物通过硅胶色谱以20%至50%EtOAc/庚烷纯化分离120mg(92%)的2-(6-氯-1-甲基-1H-吲唑-3-基)-5-(2-三甲基甲硅烷基-乙氧基甲基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-羧酸((S)-2-氰基-1,2,2-三甲基-乙基)-酰胺,为白色粉末。
步骤6
2-(6-氯-1-甲基-1H-吲唑-3-基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-羧酸((S)-2-氰基-1,2,2-三甲基-乙基)-酰胺
向2-(6-氯-1-甲基-1H-吲唑-3-基)-5-(2-三甲基甲硅烷基-乙氧基甲基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-羧酸((S)-2-氰基-1,2,2-三甲基-乙基)-酰胺(120mg,0.22mmol)在CH2Cl2(2mL)中的溶液中添加TFA(0.75mL)。将反应混合物在室温搅拌2小时,然后浓缩。将残余物再溶解于10:90:0.5MeOH/CH2Cl2/NH4OH(3mL)并在室温搅拌3小时,然后浓缩。将残余物吸收至10%MeOH/CH2Cl2上并添加水。将所得沉淀经过滤收集,然后以EtOAc研磨得到77mg(84%)的2-(6-氯-1-甲基-1H-吲唑-3-基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-羧酸((S)-2-氰基-1,2,2-三甲基-乙基)-酰胺,为浅黄色粉末。MS:(M+H)+=422;mp=322-328℃;1HNMR(DMSO-d6,400MHz):δ(ppm)12.78(s,1H),8.99(s,1H),8.38(s,1H),8.34(d,J=9.1Hz,1H),8.01(d,J=9.6Hz,1H),7.86(d,J=1.5Hz,1H),7.19(dd,J=8.6,1.5Hz,1H),4.20-4.34(m,1H),4.04(s,3H),1.31(d,J=6.6Hz,3H),1.28(s,3H),1.25(s,3H).
实施例81.
2-(6-叔丁基-1-甲基-1H-吲唑-3-基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-羧酸[(R)-2-(3-氰基-氮杂环丁烷-1-基)-1-甲基-2-氧代-乙基]-酰胺
步骤1
5-叔丁基-2-甲基苯胺
向4-叔丁基-1-甲基-2-硝基苯(3.58g,18.5mmol)在MeOH(80ml)中的溶液中添加10%Pd/炭(湿,358mg)。在氢气氛下(气球)搅拌反应混合物4小时,然后经硅藻土过滤,以EtOAc淋洗。将滤液经浓缩得到2.48g(82%)的5-叔丁基-2-甲基苯胺,为棕色油状物,其不经进一步纯化即可使用。
步骤2
6-叔丁基-1H-吲唑
于0℃向5-叔丁基-2-甲基苯胺(2.48g,15.2mmol)在CHCl3(40ml)中的溶液中缓慢地添加乙酸酐(3.3ml,34.9mmol)。将反应混合物温热至室温并搅拌1小时。添加乙酸钾(446mg,4.55mmol),接着缓慢添加亚硝酸异戊酯(4.4ml,32.6mmol)。回流加热反应混合物过夜。将反应混合物冷却至室温并浓缩。将残余物溶解于EtOAc并以水、饱和NaHCO3和盐水洗涤,然后经MgSO4干燥并浓缩。将残余物溶解于THF/MeOH(1:1,40mL)中并添加10%NaOH(4.5mL)。将反应混合物在室温搅拌10分钟,然后以1.0M HCl中和,以水稀释并以EtOAc(2x)萃取。将合并的有机物以盐水洗涤,然后经MgSO4干燥并浓缩。将残余物通过硅胶色谱以20%至50%EtOAc/庚烷纯化得到1.02g(39%)的6-叔丁基-1H-吲唑,为灰白色固体。1H NMR(CDCl3,300MHz):δ(ppm)8.03(s,1H),7.70(d,J=8.7Hz,1H),7.48(s,1H),7.29(dd,J=8.7,1.5Hz,1H),1.40(s,9H).
步骤3
6-叔丁基-3-碘-1H-吲唑
在室温向6-叔丁基-1H-吲唑(1.02g,5.84mmol)在DMF(20ml)中的溶液中添加氢氧化钾(983mg,17.5mmol)和碘(2.22g,8.76mmol)。将栗色反应混合物在室温搅拌1小时,然后以10%Na2S2O3水溶液淬灭并以水稀释。将混合物以EtOAc(2x)萃取。将合并的有机物以水、饱和LiCl和饱和NaCl洗涤,然后经MgSO4干燥并浓缩得到1.92g6-叔丁基-3-碘-1H-吲唑,为浅棕色固体。
步骤4
6-叔丁基-3-碘-1-甲基-1H-吲唑
于0℃向6-叔丁基-3-碘-1H-吲唑(820mg,2.73mmol)在THF(8ml)中的溶液中添加KOt-Bu(429mg,3.82mmol)。于0℃搅拌反应混合物30分钟,然后添加碘甲烷(0.24ml,3.82mmol)。于0℃搅拌30分钟,然后温热至室温并搅拌1.5小时。将反应混合物以水淬灭并以EtOAc(2x)萃取。将合并的有机物以盐水洗涤,然后经MgSO4干燥并浓缩。将粗残余物通过硅胶色谱以10%至50%EtOAc/庚烷纯化得到592mg(69%)的6-叔丁基-3-碘-1-甲基-1H-吲唑,为白色固体。1H NMR(CDCl3,300MHz):δ(ppm)7.37-7.43(m,1H),7.31(d,J=9.8Hz,2H),4.10(s,3H),1.41(s,9H)。微量6-叔丁基-3-碘-2-甲基-1H-吲唑区域异构体也被观察到但未分离。
步骤5
6-叔丁基-1-甲基-3-三丁基甲锡烷基-1H-吲唑
于0℃向6-叔丁基-3-碘-1-甲基-1H-吲唑(150mg,0.45mmol)在THF(3mL)中的溶液中缓慢地添加异丙基氯化镁(2.0M的THF溶液,0.27mL,0.54mmol)。于0℃搅拌亮黄色非均相反应混合物1小时,然后滴加三丁基氯甲锡烷(0.15mL,0.54mmol)。于0℃继续搅拌20分钟,然后于室温搅拌3小时。将反应混合物以水淬灭并以EtOAc(2x)萃取。将合并的有机物以盐水洗涤,然后经MgSO4干燥和浓缩得到6-叔丁基-1-甲基-3-三丁基甲锡烷基-1H-吲唑,为粘稠黄色油状物,其不经进一步纯化即可在下一步中使用。
步骤6
2-(6-叔丁基-1-甲基-1H-吲唑-3-基)-5-(2-三甲基甲硅烷基-乙氧基甲基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-羧酸[(R)-2-(3-氰基-氮杂环丁烷-1-基)-1-甲基-2-氧代-乙基]-酰胺
向6-叔丁基-1-甲基-3-三丁基甲锡烷基-1H-吲唑(来自步骤5的粗产物,217mg,0.45mmol)和2-溴-5-(2-三甲基甲硅烷基-乙氧基甲基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-羧酸[(R)-2-(3-氰基-氮杂环丁烷-1-基)-1-甲基-2-氧代-乙基]-酰胺(125mg,0.25mmol)在DMF(1.5mL)中的溶液中添加Pd(PPh3)4(14mg,0.012mmol)和碘化亚铜(I)(9mg,0.05mmol)。将黄色反应混合物以氩气冲洗,然后于80℃加热1.5小时,然后冷却至室温,以饱和NH4Cl淬灭并以EtOAc(2x)萃取。将合并的有机物以饱和LiCl和盐水洗涤,然后经MgSO4干燥并浓缩。将粗残余物通过硅胶色谱以50%至100%EtOAc/庚烷纯化分离出129mg(85%)的2-(6-叔丁基-1-甲基-1H-吲唑-3-基)-5-(2-三甲基甲硅烷基-乙氧基甲基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-羧酸[(R)-2-(3-氰基-氮杂环丁烷-1-基)-1-甲基-2-氧代-乙基]-酰胺,为白色固体。
步骤7
2-(6-叔丁基-1-甲基-1H-吲唑-3-基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-羧酸[(R)-2-(3-氰基-氮杂环丁烷-1-基)-1-甲基-2-氧代-乙基]-酰胺
向2-(6-叔丁基-1-甲基-1H-吲唑-3-基)-5-(2-三甲基甲硅烷基-乙氧基甲基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-羧酸[(R)-2-(3-氰基-氮杂环丁烷-1-基)-1-甲基-2-氧代-乙基]-酰胺(129mg,0.21mmol)在CH2Cl2(2mL)中的溶液中添加TFA(0.75mL)。将反应混合物在室温搅拌4小时,然后浓缩。将残余物再溶解于10:90:0.5MeOH/CH2Cl2/NH4OH(3mL)中并在室温搅拌3小时。将反应混合物经浓缩,且将残余物通过硅胶色谱以0%至5%MeOH/EtOAc纯化得到74mg(73%)的2-(6-叔丁基-1-甲基-1H-吲唑-3-基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-羧酸[(R)-2-(3-氰基-氮杂环丁烷-1-基)-1-甲基-2-氧代-乙基]-酰胺,为浅黄色粉末。MS:(M+H)+=485;mp=180-195℃;1H NMR(CDCl3,400MHz):δ(ppm)10.08-10.28(m,1H),9.02-9.14(m,1H),8.65(d,J=7.1Hz,1H),8.46(d,J=8.6Hz,1H),7.99-8.13(m,1H),7.40-7.49(m,1H),7.36(s,1H),4.86-5.08(m,1H),4.23-4.76(m,4H),4.11(s,3H),3.52-3.59(m,1H),1.55-1.71(m,3H),1.48(s,9H).
实施例82.
2-(1,6-二甲基-1H-吲唑-3-基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-羧酸[(R)-2-(3-氰基-氮杂环丁烷-1-基)-1-甲基-2-氧代-乙基]-酰胺
根据实施例81步骤3-7中阐述的操作制备,以6-甲基-1H-吲唑替代步骤3中的6-叔丁基-1H-吲唑。MS:(M+H)+=443;mp=260-275℃;1H NMR(DMSO-d6,400MHz):δ(ppm)9.23(s,1H),8.63(d,J=8.1Hz,1H),8.59(d,J=8.1Hz,1H),8.54(d,J=11.6Hz,1H),7.63(s,1H),7.17-7.27(m,1H),4.59-4.89(m,3H),4.26-4.35(m,1H),4.23(s,3H),4.17(dd,J=9.6,6.1Hz,1H),3.91-3.97(m,1H),1.52(t,J=6.3Hz,3H).
实施例83.
2-(6-氟-1-甲基-1H-吲唑-3-基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-羧酸[(R)-2-(3-氰基-氮杂环丁烷-1-基)-1-甲基-2-氧代-乙基]-酰胺
根据实施例81步骤3-7中阐述的操作制备,以6-氟-1H-吲唑替代步骤3中的6-叔丁基-1H-吲唑。MS:(M+H)+=447;mp=270-277℃;1H NMR(DMSO-d6,400MHz):δ(ppm)12.91(宽单峰,1H),9.15(s,1H),8.71-8.80(m,1H),8.42-8.52(m,2H),7.68(dd,J=9.9,2.3Hz,1H),7.13(d,J=2.0Hz,1H),4.50-4.80(m,3H),4.19-4.29(m,1H),4.16(s,3H),4.11(dd,J=9.9,6.3Hz,1H),3.82-3.93(m,1H),1.42(t,J=6.6Hz,3H).
实施例84.
2-(6-甲氧基-1-甲基-1H-吲唑-3-基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-羧酸[(R)-2-(3-氰基-氮杂环丁烷-1-基)-1-甲基-2-氧代-乙基]-酰胺
根据实施例81步骤3-7中阐述的操作制备,以6-甲氧基-1H-吲唑替代步骤3中的6-叔丁基-1H-吲唑。MS:(M+Na)+=481;mp=220-240℃;1H NMR(DMSO-d6,400MHz):δ(ppm)12.88(宽单峰,1H),9.13(s,1H),8.53(d,J=9.1Hz,1H),8.43-8.51(m,2H),7.22(d,J=2.0Hz,1H),6.88(dd,J=8.8,2.8Hz,1H),4.50-4.78(m,3H),4.22(td,J=9.5,5.3Hz,1H),4.14(s,3H),4.05-4.12(m,1H),3.91(s,3H),3.81-3.90(m,1H),1.42(t,J=6.3Hz,3H).
实施例85.
2-(6-氯-1-乙基-1H-吲唑-3-基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-羧酸[(R)-2-(3-氰基-氮杂环丁烷-1-基)-1-甲基-2-氧代-乙基]-酰胺
步骤1
6-氯-1-乙基-3-碘-1H-吲唑
于0℃向6-氯-3-碘-1H-吲唑(913mg,3.28mmol)在THF(12ml)中的溶液中添加KOt-Bu(429mg,3.82mmol)。于0℃搅拌反应混合物30分钟,然后添加碘代乙烷(0.37ml,4.6mmol)。于0℃搅拌30分钟,然后温热至室温,并搅拌48小时。将反应混合物以水淬灭并以EtOAc(2x)萃取。将合并的有机物以盐水洗涤,然后经MgSO4干燥并浓缩。将粗残余物通过硅胶色谱以10%至50%EtOAc/庚烷纯化得到622mg(62%)的6-氯-1-乙基-3-碘-1H-吲唑,为白色粉末。1H NMR(CDCl3,300MHz):δ(ppm)7.37-7.43(m,2H),7.17(dd,J=8.7,1.1Hz,1H),4.41(q,J=7.2Hz,2H),1.51(t,J=7.2Hz,3H)。还分离出174mg(17%)的6-氯-2-乙基-3-碘-2H-吲唑,为更加极性、更次要的区域异构体。1H NMR(CDCl3,300MHz):δ(ppm)7.66-7.70(m,1H),7.35(d,J=9.1Hz,1H),7.04-7.12(m,1H),4.56(q,J=7.2Hz,2H),1.58(t,J=7.2Hz,3H).
步骤2
6-氯-1-乙基-3-三丁基甲锡烷基-1H-吲唑
于0℃向6-氯-1-乙基-3-碘-1H-吲唑(150mg,0.47mmol)在THF(3mL)中的溶液中缓慢地添加异丙基氯化镁(2.0M在THF中,0.28mL,0.56mmol)。于0℃搅拌亮黄色非均相反应混合物20分钟,然后滴加三丁基氯甲锡烷(0.15mL,0.56mmol)。于0℃继续搅拌20分钟,然后于室温搅拌2小时。将反应混合物以水淬灭并以EtOAc(2x)萃取。将合并的有机物以盐水洗涤,然后经MgSO4干燥并浓缩。萃取反应在相同规模上再重复一次。将两批残余物合并且通过硅胶色谱以10%至50%EtOAc/庚烷(0.5%Et3N)纯化得到128mg(29%)的6-氯-1-乙基-3-三丁基甲锡烷基-1H-吲唑,为无色油状物。
步骤3
2-(6-氯-1-乙基-1H-吲唑-3-基)-5-(2-三甲基甲硅烷基-乙氧基甲基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-羧酸[(R)-2-(3-氰基-氮杂环丁烷-1-基)-1-甲基-2-氧代-乙基]-酰胺
向6-氯-1-乙基-3-三丁基甲锡烷基-1H-吲唑(125mg,0.27mmol)和2-溴-5-(2-三甲基甲硅烷基-乙氧基甲基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-羧酸[(R)-2-(3-氰基-氮杂环丁烷-1-基)-1-甲基-2-氧代-乙基]-酰胺(125mg,0.25mmol)在DMF(1.5mL)中的溶液中添加Pd(PPh3)4(14mg,0.012mmol)和碘化亚铜(I)(9mg,0.05mmol)。将黄色反应混合物以氩气冲洗,然后于80℃加热0.5小时,然后冷却至室温,以饱和NH4Cl淬灭并以EtOAc(2x)萃取。将合并的有机物以饱和LiCl和盐水洗涤,然后经MgSO4干燥并浓缩。将粗残余物通过硅胶色谱以50%至100%EtOAc/庚烷纯化分离出156mg的2-(6-氯-1-乙基-1H-吲唑-3-基)-5-(2-三甲基甲硅烷基-乙氧基甲基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-羧酸[(R)-2-(3-氰基-氮杂环丁烷-1-基)-1-甲基-2-氧代-乙基]-酰胺,为粘稠无色油状物。
步骤4
2-(6-氯-1-乙基-1H-吲唑-3-基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-羧酸[(R)-2-(3-氰基-氮杂环丁烷-1-基)-1-甲基-2-氧代-乙基]-酰胺
向2-(6-氯-1-乙基-1H-吲唑-3-基)-5-(2-三甲基甲硅烷基-乙氧基甲基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-羧酸[(R)-2-(3-氰基-氮杂环丁烷-1-基)-1-甲基-2-氧代-乙基]-酰胺(150mg,0.25mmol)在CH2Cl2(2mL)中的溶液中添加TFA(0.75mL)。将反应混合物在室温搅拌5小时,然后浓缩。将残余物再溶解于10:90:0.5MeOH/CH2Cl2/NH4OH(3mL)中并在室温搅拌3小时。将反应混合物经浓缩,且将残余物通过硅胶色谱以0%至5%MeOH/EtOAc纯化,接着以MeOH研磨得到88mg(75%)的2-(6-氯-1-乙基-1H-吲唑-3-基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-羧酸[(R)-2-(3-氰基-氮杂环丁烷-1-基)-1-甲基-2-氧代-乙基]-酰胺,为白色粉末。MS:(M+Na)+=499;mp=248-255℃;1H NMR(DMSO-d6,300MHz):δ(ppm)12.92(宽单峰,1H),9.14(s,1H),8.71(d,J=8.7Hz,1H),8.47(dd,J=7.6,3.4Hz,2H),8.02(s,1H),7.25(d,J=8.7Hz,1H),4.48-4.79(m,5H),4.04-4.28(m,2H),3.77-3.92(m,1H),1.47(t,J=7.2Hz,3H),1.39(dd,J=6.8,4.5Hz,3H).
实施例86.
2-(6,7-二氟-1-甲基-1H-吲唑-3-基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-羧酸[(R)-2-(3-氰基-氮杂环丁烷-1-基)-1-甲基-2-氧代-乙基]-酰胺
步骤1
6,7-二氟-1H-吲唑
在微波小瓶中,将2,3,4-三氟苯甲醛(1.5g,9.4mmol)溶解于1,4-二噁烷(6mL)中并添加肼(6mL,191mmol)。将小瓶密封并于微波辐射下在150℃加热30分钟。将反应混合物以水淬灭并以EtOAc萃取。将有机层以盐水洗涤,然后经MgSO4干燥并浓缩。将残余物通过硅胶色谱以20%至50%EtOAc/庚烷纯化提供664mg(46%)的6,7-二氟-1H-吲唑,为浅棕色粉末。1H NMR(CDCl3,300MHz):δ(ppm)8.10(d,J=3.4Hz,1H),7.47(dd,J=8.9,4.0Hz,1H),7.05(ddd,J=10.6,8.9,6.6Hz,1H).
步骤2
2-(6,7-二氟-1-甲基-1H-吲唑-3-基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-羧酸[(R)-2-(3-氰基-氮杂环丁烷-1-基)-1-甲基-2-氧代-乙基]-酰胺
根据实施例81步骤3-7中阐述的操作制备,以6,7-二氟-1H-吲唑替代步骤3中的6-叔丁基-1H-吲唑。MS:(M+Na)+=487;mp=240-250℃;1H NMR(DMSO-d6,300MHz):δ(ppm)12.92(s,1H),9.11(s,1H),8.53(dd,J=9.1,4.2Hz,1H),8.48(d,J=6.8Hz,1H),8.38(d,J=7.6Hz,1H),7.18-7.33(m,1H),4.48-4.78(m,3H),4.28(s,3H),4.16-4.26(m,1H),4.05-4.14(m,1H),3.84(dd,J=9.3,5.1Hz,1H),1.38(t,J=5.9Hz,3H).
实施例87.
2-(6-乙基-1-甲基-1H-吲唑-3-基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-羧酸[(R)-2-(3-氰基-氮杂环丁烷-1-基)-1-甲基-2-氧代-乙基]-酰胺
步骤1
6-乙烯基-1H-吲唑
向6-溴-1H-吲唑(600mg,3.05mmol)在甲苯(18ml)和1,2-二甲氧基乙烷(6ml)中的悬浮液中添加三丁基(乙烯基)锡(1.33ml,4.57mmol)和PdCl2(PPh3)2(214mg,0.31mmol)。将反应混合物以氩气冲洗,然后在回流下加热3小时。再添加三丁基(乙烯基)锡(0.66ml,2.28mmol)和PdCl2(PPh3)2(107mg,0.15mmol)并继续加热1小时。相同的反应在另一批的6-溴-1H-吲唑(200mg,1.02mmol)上进行且合并两批粗产物。将反应混合物以乙酸乙酯稀释,以水和盐水洗涤,经MgSO4干燥并浓缩。将残余物通过硅胶色谱以5%至50%EtOAc/庚烷纯化分离出350mg(60%)的6-乙烯基-1H-吲唑,为黄色固体。1H NMR(CDCl3,300MHz):δ(ppm)8.07(s,1H),7.72(d,J=8.3Hz,1H),7.48(s,1H),7.35(d,J=8.3Hz,1H),6.85(dd,J=17.4,11.0Hz,1H),5.86(d,J=17.4Hz,1H),5.35(d,J=11.0Hz,1H).
步骤2
6-乙基-1H-吲唑
向6-乙烯基-1H-吲唑(350mg,2.42mmol)在MeOH(24ml)中的溶液中添加10%Pd/炭(湿,443mg)。在氢气氛(气球)下搅拌反应混合物2.5小时,然后经硅藻土过滤,以EtOAc淋洗。将滤液经浓缩得到305mg(86%)的6-乙基-1H-吲唑,为白色半固体。1H NMR(CDCl3,300MHz):δ(ppm)8.04(s,1H),7.67(d,J=8.3Hz,1H),7.32(s,1H),7.06(d,J=8.3Hz,1H),2.80(q,J=7.6Hz,2H),1.31(t,J=7.6Hz,3H).
步骤3
2-(6-乙基-1-甲基-1H-吲唑-3-基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-羧酸[(R)-2-(3-氰基-氮杂环丁烷-1-基)-1-甲基-2-氧代-乙基]-酰胺
根据实施例81步骤3-7中阐述的操作制备,以6-乙基-1H-吲唑替代步骤3中的6-叔丁基-1H-吲唑。MS:(M+Na)+=479;mp=185-190℃;1H NMR(DMSO-d6,300MHz):δ(ppm)12.87(宽单峰,1H),9.13(s,1H),8.50-8.58(m,2H),8.41-8.49(m,2H),7.54(s,1H),7.15(dd,J=8.3,3.0Hz,1H),4.63-4.80(m,2H),4.44-4.63(m,2H),4.00-4.28(m,4H),3.74-3.94(m,1H),2.80(q,J=7.6Hz,2H),1.43(dd,J=6.8,4.2Hz,3H),1.29(t,J=7.6Hz,3H).
实施例88.
2-(4,6-二氟-1-甲基-1H-吲唑-3-基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-羧酸[(R)-2-(3-氰基-氮杂环丁烷-1-基)-1-甲基-2-氧代-乙基]-酰胺
步骤1
4,6-二氟-1H-吲唑
向2,4,6-三氟苯甲醛(0.80g,5.0mmol)在1,2-二甲氧基乙烷(10mL)中的溶液中添加碳酸钾(1.04g,7.5mmol)和O-甲基羟基胺盐酸盐(438mg,5.25mmol)。将反应混合物于50℃加热5小时,然后冷却至室温并过滤,以二氯甲烷淋洗。浓缩滤液。将残余物溶解于1,2-二甲氧基乙烷(10mL)中并添加肼(0.17mL,5.5mmol)。将反应混合物于100℃加热1.5小时。再添加肼(0.17mL,5.5mmol)并继续加热30分钟。将反应混合物冷却至室温,倒入水中并以乙酸乙酯萃取。将有机层以饱和LiCl和盐水洗涤,然后经MgSO4干燥并浓缩。将残余物通过硅胶色谱以20%至50%EtOAc/庚烷纯化提供358mg(47%)的4,6-二氟-1H-吲唑,为浅黄色固体。1H NMR(DMSO-d6,300MHz):δ(ppm)13.47(宽单峰,1H),8.19(s,1H),7.22(d,J=9.1Hz,1H),6.96(td,J=10.0,1.9Hz,1H).
步骤2
2-(4,6-二氟-1-甲基-1H-吲唑-3-基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-羧酸[(R)-2-(3-氰基-氮杂环丁烷-1-基)-1-甲基-2-氧代-乙基]-酰胺
根据实施例81步骤3-7中阐述的步骤制备,以4,6-二氟-1H-吲唑代替步骤3中的6-叔丁基-1H-吲唑。MS:(M+Na)+=487;mp=235-265℃;1H NMR(DMSO-d6,300MHz):δ(ppm)12.94(宽单峰,1H),8.99(s,1H),8.54(d,J=7.2Hz,1H),8.47(dd,J=10.8,3.2Hz,1H),7.55-7.63(m,1H),7.09(t,J=10.2Hz,1H),4.40-4.68(m,3H),4.15(s,3H),4.08-4.17(m,1H),3.93-4.03(m,1H),3.73-3.86(m,1H),1.35(t,J=5.7Hz,3H).
实施例89.
2-(1,6-二甲基-1H-吡唑并[3,4-b]吡啶-3-基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-羧酸[(R)-2-(3-氰基-氮杂环丁烷-1-基)-1-甲基-2-氧代-乙基]-酰胺
步骤1
2-氯-6-甲基吡啶-3-甲醛
于-78℃向2-氯-6-甲基烟腈(2.0g,13.1mmol)在二氯甲烷(40mL)中的溶液中滴加DIBAL-H(2.92mL,16.4mmol)。将反应混合物在-78℃搅拌5分钟,然后温热至室温并搅拌6小时。将反应混合物小心地以1N HCl(40mL)淬灭且将混合物在回流下加热30分钟。冷却后,将反应混合物以10%NaOH变成碱性并以EtOAc(3x)萃取。将合并的有机物以盐水洗涤,然后经MgSO4干燥和浓缩得到1.98g(97%)的2-氯-6-甲基吡啶-3-甲醛,为浅黄色固体。
步骤2
6-甲基-1H-吡唑并[3,4-b]吡啶
在微波小瓶中,将2-氯-6-甲基吡啶-3-甲醛(1.98g,12.7mmol)溶解于1,4-二噁烷(12mL)中并添加肼(6.0mL,191mmol)。将小瓶密封并于微波辐射下在150℃加热1小时。将反应混合物以水淬灭并以EtOAc萃取。将有机层以盐水洗涤,然后经MgSO4干燥并浓缩。将残余物通过硅胶色谱以50%至100%EtOAc/庚烷纯化提供863mg(41%)的6-甲基-1H-吡唑并[3,4-b]吡啶,为浅黄色固体。1H NMR(CDCl3,300MHz):δ(ppm)8.06(s,1H),8.03(d,J=8.3Hz,1H),7.07(d,J=8.3Hz,1H),2.79(s,3H).
步骤3
2-(1,6-二甲基-1H-吡唑并[3,4-b]吡啶-3-基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-羧酸[(R)-2-(3-氰基-氮杂环丁烷-1-基)-1-甲基-2-氧代-乙基]-酰胺
根据实施例81步骤3-7中阐述的操作制备,以6-甲基-1H-吡唑并[3,4-b]吡啶替代步骤3的6-叔丁基-1H-吲唑。MS:(M+Na)+=466;mp=275-285℃;1H NMR(DMSO-d6,300MHz):δ(ppm)12.92(宽单峰,1H),9.14(s,1H),8.98(d,J=8.3Hz,1H),8.47(d,J=6.4Hz,2H),7.22(dd,J=8.3,3.4Hz,1H),4.46-4.80(m,3H),4.17-4.30(m,1H),4.13(s,3H),4.07-4.15(m,1H),3.77-3.93(m,1H),2.66(s,3H),1.31-1.48(m,3H).
实施例90.
2-[6-氯-1-(2-羟基-乙基)-1H-吲唑-3-基]-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-羧酸[(R)-2-(3-氰基-氮杂环丁烷-1-基)-1-甲基-2-氧代-乙基]-酰胺
步骤1
2-{6-氯-1-[2-(四氢-吡喃-2-基氧基)-乙基]-1H-吲唑-3-基}-5-(2-三甲基甲硅烷基-乙氧基甲基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-羧酸[(R)-2-(3-氰基-氮杂环丁烷-1-基)-1-甲基-2-氧代-乙基]-酰胺
在圆底烧瓶中,将2-(6-氯-1H-吲唑-3-基)-5-(2-三甲基甲硅烷基-乙氧基甲基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-羧酸[(R)-2-(3-氰基-氮杂环丁烷-1-基)-1-甲基-2-氧代-乙基]-酰胺(参见实施例23,120mg,0.21mmol)溶解于DMF(1.3ml)中。将反应混合物冷却至0℃并添加氢化钠(60%在矿物油中的分散液,10mg,0.25mmol)。于0℃搅拌反应混合物30分钟,然后添加2-(2-溴乙氧基)四氢-2H-吡喃(47μl,0.31mmol)。于0℃搅拌反应混合物1小时,然后于室温搅拌4小时。将反应混合物以水淬灭,并以乙酸乙酯(2x)萃取。将合并的有机层以水、饱和LiCl和盐水洗涤,然后经MgSO4干燥并浓缩。将残余物经硅胶色谱以50%至100%EtOAc/庚烷纯化得到138mg(94%)的2-{6-氯-1-[2-(四氢-吡喃-2-基氧基)-乙基]-1H-吲唑-3-基}-5-(2-三甲基甲硅烷基-乙氧基甲基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-羧酸[(R)-2-(3-氰基-氮杂环丁烷-1-基)-1-甲基-2-氧代-乙基]-酰胺,为粘稠黄色油状物。
步骤2
2-[6-氯-1-(2-羟基-乙基)-1H-吲唑-3-基]-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-羧酸[(R)-2-(3-氰基-氮杂环丁烷-1-基)-1-甲基-2-氧代-乙基]-酰胺
向2-{6-氯-1-[2-(四氢-吡喃-2-基氧基)-乙基]-1H-吲唑-3-基}-5-(2-三甲基甲硅烷基-乙氧基甲基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-羧酸[(R)-2-(3-氰基-氮杂环丁烷-1-基)-1-甲基-2-氧代-乙基]-酰胺(138mg,0.20mmol)在CH2Cl2(2mL)中的溶液中添加TFA(0.75mL)。将反应混合物在室温搅拌6小时,然后浓缩。将残余物再溶解于10:90:0.5MeOH/CH2Cl2/NH4OH(3mL)中并在室温搅拌3小时。将反应混合物经浓缩,且将残余物通过硅胶色谱以0%至10%MeOH/CH2Cl2纯化得到63mg(65%)的2-[6-氯-1-(2-羟基-乙基)-1H-吲唑-3-基]-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-羧酸[(R)-2-(3-氰基-氮杂环丁烷-1-基)-1-甲基-2-氧代-乙基]-酰胺,为白色固体。MS:(M+Na)+=515;mp=225-250℃;1H NMR(DMSO-d6,300MHz):δ(ppm)12.92(宽单峰,1H),9.14(s,1H),8.69(d,J=8.7Hz,1H),8.47(d,J=7.2Hz,2H),7.95(d,J=1.5Hz,1H),7.24(d,J=8.7Hz,1H),4.92(t,J=5.5Hz,1H),4.49-4.78(m,5H),4.17-4.27(m,1H),4.05-4.15(m,1H),3.83-3.93(m,3H),1.39(dd,J=6.6,4.7Hz,3H).
实施例91.
2-(6-氯-1-异丙基-1H-吲唑-3-基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-羧酸[(R)-2-(3-氰基-氮杂环丁烷-1-基)-1-甲基-2-氧代-乙基]-酰胺
根据实施例90中阐述的操作制备,以2-溴丙烷替代步骤1中的2-(2-溴乙氧基)四氢-2H-吡喃。MS:(M+H)+=491;mp=204-208℃;1H NMR(DMSO-d6,300MHz):δ(ppm)12.91(宽单峰,1H),9.16(s,1H),8.70(d,J=8.3Hz,1H),8.47(dd,J=7.6,2.6Hz,2H),8.03(d,J=1.1Hz,1H),7.19-7.29(m,1H),5.14(quin,J=6.6Hz,1H),4.46-4.79(m,3H),4.15-4.27(m,1H),4.03-4.14(m,1H),3.78-3.92(m,1H),1.56(dd,J=6.6,3.0Hz,6H),1.39(dd,J=6.6,4.7Hz,3H).
实施例92.
2-[6-氯-1-丙基-1H-吲唑-3-基]-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-羧酸[(R)-2-(3-氰基-氮杂环丁烷-1-基)-1-甲基-2-氧代-乙基]-酰胺
步骤1
2-(1-烯丙基-6-氯-1H-吲唑-3-基)-5-(2-三甲基甲硅烷基-乙氧基甲基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-羧酸[(R)-2-(3-氰基-氮杂环丁烷-1-基)-1-甲基-2-氧代-乙基]-酰胺
在圆底烧瓶中,将2-(6-氯-1H-吲唑-3-基)-5-(2-三甲基甲硅烷基-乙氧基甲基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-羧酸[(R)-2-(3-氰基-氮杂环丁烷-1-基)-1-甲基-2-氧代-乙基]-酰胺(参见实施例23,396mg,0.68mmol)溶解于DMF(4.5ml)。将反应混合物冷却至0℃并添加氢化钠(60%在矿物油中的分散液,33mg,0.83mmol)。于0℃搅拌反应混合物20分钟,然后添加烯丙基溴(65μl,0.75mmol)。于0℃搅拌反应混合物20分钟,然后于室温搅拌1小时。将反应混合物以水淬灭,并以乙酸乙酯(2x)萃取。将合并的有机层以水、饱和LiCl和盐水洗涤,然后经MgSO4干燥并浓缩。将残余物经硅胶色谱以50%至100%EtOAc/庚烷纯化得到388mg(92%)的2-(1-烯丙基-6-氯-1H-吲唑-3-基)-5-(2-三甲基甲硅烷基-乙氧基甲基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-羧酸[(R)-2-(3-氰基-氮杂环丁烷-1-基)-1-甲基-2-氧代-乙基]-酰胺,为浅黄色泡沫。
步骤2
2-(6-氯-1-丙基-1H-吲唑-3-基)-5-(2-三甲基甲硅烷基-乙氧基甲基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-羧酸[(R)-2-(3-氰基-氮杂环丁烷-1-基)-1-甲基-2-氧代-乙基]-酰胺
向2-(1-烯丙基-6-氯-1H-吲唑-3-基)-5-(2-三甲基甲硅烷基-乙氧基甲基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-羧酸[(R)-2-(3-氰基-氮杂环丁烷-1-基)-1-甲基-2-氧代-乙基]-酰胺(50mg,0.08mmol)在MeOH(6ml)中的溶液中添加10%Pd/炭(湿,17mg)。在氢气氛(气球)下搅拌反应混合物1.5小时,然后经硅藻土过滤,以EtOAc淋洗。浓缩滤液,且将残余物通过硅胶色谱以50%至100%EtOAc/庚烷纯化得到38mg(76%)的2-(6-氯-1-丙基-1H-吲唑-3-基)-5-(2-三甲基甲硅烷基-乙氧基甲基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-羧酸[(R)-2-(3-氰基-氮杂环丁烷-1-基)-1-甲基-2-氧代-乙基]-酰胺,为粘稠无色油状物。
步骤3
2-[6-氯-1-丙基-1H-吲唑-3-基]-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-羧酸[(R)-2-(3-氰基-氮杂环丁烷-1-基)-1-甲基-2-氧代-乙基]-酰胺
向2-(6-氯-1-丙基-1H-吲唑-3-基)-5-(2-三甲基甲硅烷基-乙氧基甲基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-羧酸[(R)-2-(3-氰基-氮杂环丁烷-1-基)-1-甲基-2-氧代-乙基]-酰胺(38mg,0.06mmol)在CH2Cl2(1.5mL)中的溶液中添加TFA(0.5mL)。将反应混合物在室温搅拌3小时,然后浓缩。将残余物再溶解于10:90:0.5MeOH/CH2Cl2/NH4OH(3mL)并在室温搅拌3小时。将反应混合物经浓缩,且将残余物通过硅胶色谱以0%至10%MeOH/CH2Cl2纯化得到10mg(32%)的2-[6-氯-1-丙基-1H-吲唑-3-基]-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-羧酸[(R)-2-(3-氰基-氮杂环丁烷-1-基)-1-甲基-2-氧代-乙基]-酰胺,为白色固体。MS:(M+Na)+=513;mp=219-221℃;1H NMR(DMSO-d6,300MHz):δ(ppm)12.93(s,1H),9.13(s,1H),8.71(d,J=9.1Hz,1H),8.46(dd,J=7.6,2.6Hz,2H),8.03(s,1H),7.25(d,J=9.1Hz,1H),4.43-4.78(m,5H),4.16-4.27(m,1H),4.05-4.13(m,1H),3.78-3.91(m,1H),1.86-1.96(m,2H),1.39(dd,J=6.6,4.3Hz,3H),0.89(t,J=7.4Hz,3H).
实施例93.
2-(6-氯-1-氰基甲基-1H-吲唑-3-基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-羧酸[(R)-2-(3-氰基-氮杂环丁烷-1-基)-1-甲基-2-氧代-乙基]-酰胺
根据实施例90中阐述的操作制备,以2-碘代乙腈替代步骤1中的2-(2-溴乙氧基)四氢-2H-吡喃。MS:(M+Na)+=510;1H NMR(DMSO-d6,300MHz):δ(ppm)13.00(宽单峰,1H),9.14(s,1H),8.79(dd,J=8.7,2.3Hz,1H),8.52(d,J=6.4Hz,1H),8.42(d,J=7.9Hz,1H),8.15(s,1H),7.36(d,J=9.1Hz,1H),5.94(s,2H),4.48-4.78(m,3H),4.17-4.28(m,1H),4.06-4.15(m,1H),3.80-3.89(m,1H),1.33-1.44(m,3H).
实施例94.
2-[6-氯-1-(2,3-二羟基-丙基)-1H-吲唑-3-基]-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-羧酸[(R)-2-(3-氰基-氮杂环丁烷-1-基)-1-甲基-2-氧代-乙基]-酰胺
步骤1
甲磺酸2,2-二甲基-[1,3]二氧杂环戊烷-4-基甲酯
于0℃向(2,2-二甲基-[1,3]二氧杂环戊烷-4-基)-甲醇(1.25g,9.46mmol)和三乙胺(9.2ml,66.2mmol)在二氯甲烷(60ml)中的溶液中缓慢地添加甲磺酰氯(2.2ml,28.4mmol)。于0℃搅拌反应混合物2小时,然后以水淬灭且将水层以二氯甲烷萃取。将合并的有机物以10%柠檬酸、饱和NaHCO3和盐水洗涤,然后经MgSO4干燥和浓缩得到甲磺酸2,2-二甲基-[1,3]二氧杂环戊烷-4-基甲酯,为浅棕色油状物,其不经进一步纯化即可使用。
步骤2
2-[6-氯-1-(2,2-二甲基-[1,3]二氧杂环戊烷-4-基甲基)-1H-吲唑-3-基]-5-(2-三甲基甲硅烷基-乙氧基甲基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-羧酸[(R)-2-(3-氰基-氮杂环丁烷-1-基)-1-甲基-2-氧代-乙基]-酰胺
在圆底烧瓶中,将2-(6-氯-1H-吲唑-3-基)-5-(2-三甲基甲硅烷基-乙氧基甲基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-羧酸[(R)-2-(3-氰基-氮杂环丁烷-1-基)-1-甲基-2-氧代-乙基]-酰胺(参见实施例23,120mg,0.21mmol)溶解于DMF(1.3ml)中。将反应混合物冷却至0℃并添加氢化钠(60%在矿物油中的分散液,12mg,0.31mmol)。于0℃搅拌反应混合物30分钟,然后加入甲磺酸2,2-二甲基-[1,3]二氧杂环戊烷-4-基甲酯(131mg,0.62mmol)在DMF(0.5ml)中的溶液。于0℃搅拌反应混合物1小时,然后于室温搅拌48小时。将反应混合物以水淬灭,并以乙酸乙酯(2x)萃取。将合并的有机层以水、饱和LiCl和盐水洗涤,然后经MgSO4干燥并浓缩得到2-[6-氯-1-(2,2-二甲基-[1,3]二氧杂环戊烷-4-基甲基)-1H-吲唑-3-基]-5-(2-三甲基甲硅烷基-乙氧基甲基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-羧酸[(R)-2-(3-氰基-氮杂环丁烷-1-基)-1-甲基-2-氧代-乙基]-酰胺,为浅棕色粘稠油状物,其不经进一步纯化即可使用。
步骤3
2-[6-氯-1-(2,3-二羟基-丙基)-1H-吲唑-3-基]-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-羧酸[(R)-2-(3-氰基-氮杂环丁烷-1-基)-1-甲基-2-氧代-乙基]-酰胺
向2-[6-氯-1-(2,2-二甲基-[1,3]二氧杂环戊烷-4-基甲基)-1H-吲唑-3-基]-5-(2-三甲基甲硅烷基-乙氧基甲基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-羧酸[(R)-2-(3-氰基-氮杂环丁烷-1-基)-1-甲基-2-氧代-乙基]-酰胺(来自步骤2的粗产物)在CH2Cl2(3mL)中的溶液中添加TFA(1mL)。将反应混合物在室温搅拌48小时,然后浓缩。将残余物再溶解于10:90:0.5MeOH/CH2Cl2/NH4OH(3mL)并在室温搅拌3小时。将反应混合物经浓缩,且将残余物通过硅胶色谱以0%至10%MeOH/CH2Cl2纯化得到22mg(20%,2个步骤)的2-[6-氯-1-(2,3-二羟基-丙基)-1H-吲唑-3-基]-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-羧酸[(R)-2-(3-氰基-氮杂环丁烷-1-基)-1-甲基-2-氧代-乙基]-酰胺,为白色固体。MS:(M+Na)+=545;mp=165-180℃;1H NMR(DMSO-d6,300MHz):δ(ppm)9.14(s,1H),8.69(d,J=8.7Hz,1H),8.47(d,J=7.6Hz,2H),7.91(s,1H),7.23(d,J=6.8Hz,1H),5.15(d,J=5.3Hz,1H),5.03(dd,J=5.3,3.0Hz,1H),4.84(t,J=5.5Hz,1H),4.35-4.80(m,5H),4.18-4.26(m,1H),3.93-4.15(m,2H),3.79-3.90(m,1H),3.34-3.49(m,2H),1.33-1.45(m,3H).
实施例95.
2-[6-氯-1-(2-羟基-丙基)-1H-吲唑-3-基]-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-羧酸[(R)-2-(3-氰基-氮杂环丁烷-1-基)-1-甲基-2-氧代-乙基]-酰胺
步骤1
2-(2-溴-1-甲基-乙氧基)-四氢-2H-吡喃
于0℃向1-溴丙烷-2-醇(1.25g,9.0mmol)和3,4-二氢-2H-吡喃(2.04ml,22.5mmol)在二氯甲烷(50ml)中的溶液中添加对甲苯磺酸一水合物(85mg,0.45mmol)。于0℃搅拌反应混合物15分钟,然后温热至室温并搅拌2小时。将反应混合物以EtOAc洗涤,并以水、饱和NaHCO3和盐水洗涤,然后经MgSO4干燥和浓缩得到2-(2-溴-1-甲基-乙氧基)-四氢-2H-吡喃,为浅棕色油状物,其不经进一步纯化即可使用。
步骤2
2-[6-氯-1-(2-羟基-丙基)-1H-吲唑-3-基]-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-羧酸[(R)-2-(3-氰基-氮杂环丁烷-1-基)-1-甲基-2-氧代-乙基]-酰胺
根据实施例90中阐述的操作制备,以2-(2-溴-1-甲基-乙氧基)-四氢-2H-吡喃替代步骤1的2-(2-溴乙氧基)四氢-2H-吡喃。MS:(M+Na)+=529;mp=160-165℃;1H NMR(DMSO-d6,300MHz):δ(ppm)12.91(宽单峰,1H),9.13(s,1H),8.69(d,J=8.7Hz,1H),8.47(d,J=7.6Hz,2H),7.95(s,1H),7.17-7.27(m,1H),4.93(dd,J=5.1,2.8Hz,1H),4.49-4.78(m,3H),4.42(d,J=6.0Hz,2H),4.06-4.27(m,3H),3.80-3.87(m,1H),1.39(dd,J=6.6,4.7Hz,3H),1.11-1.21(m,3H).
实施例96.
2-[6-氯-1-(3-羟基-丙基)-1H-吲唑-3-基]-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-羧酸[(R)-2-(3-氰基-氮杂环丁烷-1-基)-1-甲基-2-氧代-乙基]-酰胺
步骤1
2-(3-溴丙氧基)-四氢-2H-吡喃
于0℃向3-溴丙烷-1-醇(1.25g,9.0mmol)和3,4-二氢-2H-吡喃(2.04ml,22.5mmol)在二氯甲烷(50ml)中的溶液中添加对甲苯磺酸一水合物(85mg,0.45mmol)。于0℃搅拌反应混合物15分钟,然后温热至室温并搅拌2小时。将反应混合物以EtOAc洗涤,并以水、饱和NaHCO3和盐水洗涤,然后经MgSO4干燥和浓缩得到2-(3-溴丙氧基)-四氢-2H-吡喃,为浅棕色油状物,其不经进一步纯化即可使用。
步骤2
2-[6-氯-1-(3-羟基-丙基)-1H-吲唑-3-基]-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-羧酸[(R)-2-(3-氰基-氮杂环丁烷-1-基)-1-甲基-2-氧代-乙基]-酰胺
根据实施例90中阐述的操作制备,以2-(3-溴丙氧基)-四氢-2H-吡喃替代步骤1中的2-(2-溴乙氧基)四氢-2H-吡喃。MS:(M+Na)+=529;mp=240-250℃;1H NMR(DMSO-d6,300MHz):δ(ppm)12.92(宽单峰,1H),9.14(s,1H),8.71(d,J=9.1Hz,1H),8.47(dd,J=7.4,4.0Hz,2H),7.96(d,J=1.5Hz,1H),7.20-7.30(m,1H),4.49-4.79(m,6H),4.17-4.28(m,1H),4.04-4.14(m,1H),3.78-3.89(m,1H),3.44(q,J=5.9Hz,2H),2.05(t,J=6.6Hz,2H),1.39(dd,J=6.8,4.5Hz,3H).
实施例97.
2-(4,6-二氯-1-甲基-1H-吲唑-3-基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-羧酸[(R)-2-(3-氰基-氮杂环丁烷-1-基)-1-甲基-2-氧代-乙基]-酰胺
步骤1
2,4,6-三氯苯甲醛
2,4,6-三氯苯甲醛根据Synthesis2008,279中阐述的操作制备。于-78℃经20分钟向1,3,5-三氯苯(10.0g,55.1mmol)在THF(200ml)中的溶液中缓慢地添加n-BuLi(1.6M的己烷溶液,34.4ml,55.1mmol)。于-78℃搅拌反应混合物30分钟,然后滴加DMF(7.5ml,96.4mmol)。在-78℃再搅拌反应混合物1.5小时,然后以3N HCl(200ml)淬灭并温热至室温。将混合物以EtOAc萃取。将有机层以饱和NaHCO3和盐水洗涤,然后经MgSO4干燥和浓缩得到10.7g(93%)的2,4,6-三氯苯甲醛,为白色固体。
步骤2
4,6-二氯-1H-吲唑
在微波小瓶中,将2,4,6-三氯苯甲醛(4.0g,19.1mmol)溶解于1,4-二噁烷(8mL)中并添加肼(7.2mL,229mmol)。将小瓶密封并于微波辐射下在160℃加热30分钟。将反应混合物以水淬灭并以EtOAc萃取。将有机层以盐水洗涤,然后经MgSO4干燥并浓缩。将残余物通过硅胶色谱以50%至100%EtOAc/庚烷纯化提供1.38g(38%)的4,6-二氯-1H-吲唑,为白色固体。1H NMR(CDCl3,300MHz):δ(ppm)8.14(s,1H),7.44(s,1H),7.20(d,J=1.5Hz,15H).
步骤3
2-(4,6-二氯-1-甲基-1H-吲唑-3-基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-羧酸[(R)-2-(3-氰基-氮杂环丁烷-1-基)-1-甲基-2-氧代-乙基]-酰胺
根据实施例81步骤3-7中阐述的操作制备,以4,6-二氯-1H-吲唑替代步骤3中的6-叔丁基-1H-吲唑。MS:(M+Na)+=519;mp=196-200℃;1H NMR(DMSO-d6,300MHz):δ(ppm)8.75(s,1H),8.45-8.56(m,2H),8.03(s,1H),7.42(s,1H),4.38-4.66(m,3H),4.17(s,3H),3.91-4.14(m,2H),3.73-3.86(m,1H),1.23-1.32(m,3H).
实施例98.
2-(1-甲基-1H-吡唑并[4,3-b]吡啶-3-基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-羧酸[(R)-2-(3-氰基-氮杂环丁烷-1-基)-1-甲基-2-氧代-乙基]-酰胺
步骤1
1-吡唑并[4,3-b]吡啶-1-基-乙酮
于0℃向3-氨基-2-甲基吡啶(1.0g,9.25mmol)在CHCl3(24ml)中的溶液中缓慢地添加乙酸酐(2.0ml,21.3mmol)。将反应混合物温热至室温并搅拌1小时。添加乙酸钾(272mg,2.77mmol),接着缓慢添加亚硝酸异戊酯(2.7ml,19.9mmol)。回流加热反应混合物过夜。将反应混合物冷却至室温并浓缩。将残余物溶解于EtOAc,并以水、饱和NaHCO3和盐水洗涤,然后经MgSO4干燥并浓缩。将残余物通过硅胶色谱以20%至100%EtOAc/庚烷纯化得到973mg(65%)的1-吡唑并[4,3-b]吡啶-1-基-乙酮,为浅黄色固体。
步骤2
1H-吡唑并[4,3-b]吡啶
将吡唑并[4,3-b]吡啶-1-基-乙酮(973mg,6.04mmol)溶解于THF/MeOH(1:1,16mL)中并添加10%NaOH(1.8mL)。将反应混合物在室温搅拌30分钟,然后以1.0M HCl中和,以水稀释并以EtOAc(2x)萃取。将合并的有机物以盐水洗涤,然后经MgSO4干燥并浓缩得到687mg(96%)的1H-吡唑并[4,3-b]吡啶,为浅黄色固体。1H NMR(DMSO-d6,300MHz):δ(ppm)13.29(宽单峰,1H),8.50(d,J=4.5Hz,1H),8.27(s,1H),8.00(d,J=8.7Hz,1H),7.34(dd,J=8.7,4.5Hz,1H).
步骤3
2-(1-甲基-1H-吡唑并[4,3-b]吡啶-3-基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-羧酸[(R)-2-(3-氰基-氮杂环丁烷-1-基)-1-甲基-2-氧代-乙基]-酰胺
根据实施例81步骤3-7中阐述的操作制备,以1H-吡唑并[4,3-b]吡啶替代步骤3的6-叔丁基-1H-吲唑。MS:(M+H)+=430;mp=194-198℃;1H NMR(DMSO-d6,300MHz):δ(ppm)12.86(宽单峰,1H),9.32(s,1H),9.05(t,J=7.9Hz,1H),8.68(d,J=4.2Hz,1H),8.44(d,J=12.1Hz,1H),8.27(d,J=8.3Hz,1H),7.52(dd,J=8.7,4.2Hz,1H),4.40-4.79(m,3H),4.21(s,3H),3.98-4.05(m,2H),3.74-3.84(m,1H),1.49(d,J=6.8Hz,3H).
实施例99.
2-(1-甲基-1H-噻吩并[3,2-c]吡唑-3-基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-羧酸[(R)-2-(3-氰基-氮杂环丁烷-1-基)-1-甲基-2-氧代-乙基]-酰胺
步骤1
N-二苯亚甲基-N'-[1-(3-溴-噻吩-2-基)-亚甲-(E)-基]-肼
向3-溴噻吩-2-甲醛(5.57g,29.2mmol)在EtOH(90mL)中的溶液添加(二苯基亚甲基)肼(6.3g,32.1mmol)。将反应混合物在65℃加热4小时,然后浓缩。将残余物通过硅胶色谱以10%至20%EtOAc/庚烷纯化得到11g的N-二苯亚甲基-N'-[1-(3-溴-噻吩-2-基)-亚甲-(E)-基]-肼,为粘稠黄色油状物。
步骤2
N-二苯亚甲基-N'-[2-(二苯亚甲基-亚肼基甲基)-噻吩-3-基]-肼
向N-二苯亚甲基-N'-[1-(3-溴-噻吩-2-基)-亚甲-(E)-基]-肼(10.8g,29.2mmol)在甲苯(200mL)中的溶液中添加(二苯基亚甲基)肼(6.9g,35.1mmol)、碳酸铯(16.2g,49.7mmol)、Pd(OAc)2(1.31g,5.85mol)和1,1’-二(二苯基膦基)二茂铁(2.43g,4.4mmol)。将反应混合物于100℃加热8.5小时,然后冷却至室温,以EtOAc稀释并经硅藻土过滤,以EtOAc淋洗。浓缩滤液,且将残余物通过硅胶色谱以10%至20%EtOAc/庚烷纯化得到12.8g的N-二苯亚甲基-N'-[2-(二苯亚甲基-亚肼基甲基)-噻吩-3-基]-肼,为粘稠棕色油状物。
步骤3
1H-噻吩并[3,2-c]吡唑
向N-二苯亚甲基-N'-[2-(二苯亚甲基-亚肼基甲基)-噻吩-3-基]-肼(12.8g,26.4mmol)在EtOH(300mL)的溶液中添加浓HCl(150mL)。于85℃搅拌深红色反应混合物1小时,然后冷却至室温,以水稀释并以Na2CO3中和。将混合物以EtOAc萃取。将有机层以盐水洗涤,然后经MgSO4干燥并浓缩。将残余物通过硅胶色谱以20%至100%EtOAc/庚烷纯化得到2.0g(60%)的1H-噻吩并[3,2-c]吡唑,为棕色固体。NMR显示为1H和2H互变异构体的混合物:主要物质1H NMR(DMSO-d6,300MHz):δ(ppm)13.00(宽单峰,1H),7.74(s,1H),7.60(d,J=5.3Hz,1H),7.09(d,J=5.3Hz,1H);次要物质1H NMR(DMSO-d6,300MHz):δ(ppm)13.32(s,1H),8.02(s,1H),7.56(d,J=4.9Hz,1H),7.13(d,J=4.9Hz,1H).
步骤4
3-碘-1H-噻吩并[3,2-c]吡唑
于室温向1H-噻吩并[3,2-c]吡唑(1.0g,8.05mmol)在DMF(65ml)中的溶液中添加氢氧化钾(1.36g,24.2mmol)和碘(3.07g,12.1mmol)。将栗色反应混合物在室温搅拌3小时,然后以10%Na2S2O3水溶液淬灭并以水稀释。将混合物以EtOAc(2x)萃取。将合并的有机物以水、饱和LiCl和饱和NaCl洗涤,然后经MgSO4干燥和浓缩得到2.0g(99%)的3-碘-1H-噻吩并[3,2-c]吡唑,为浅棕色固体。1H NMR(DMSO-d6,300MHz):δ(ppm)13.38(宽单峰,1H),7.68(d,J=5.3Hz,1H),7.21(d,J=5.3Hz,1H).
步骤5
3-碘-1-甲基-1H-噻吩并[3,2-c]吡唑
于0℃向3-碘-1H-噻吩并[3,2-c]吡唑(500mg,2.0mmol)在THF(7ml)中的溶液中添加KOt-Bu(314mg,2.8mmol)。于0℃搅拌反应混合物30分钟,然后添加碘甲烷(0.17ml,2.8mmol)。于0℃搅拌30分钟,然后温热至室温并搅拌1.5小时。将反应混合物以水淬灭并以EtOAc(2x)萃取。将合并的有机物以盐水洗涤,然后经MgSO4干燥并浓缩。将粗残余物通过硅胶色谱以20%至50%EtOAc/庚烷纯化得到292mg(55%)的3-碘-1-甲基-1H-噻吩并[3,2-c]吡唑,为浅棕色粘稠油状物。1H NMR(CDCl3,300MHz):δ(ppm)7.41(d,J=5.3Hz,1H),6.97(d,J=5.3Hz,1H),4.05(s,3H)。还分离了141mg(27%)的3-碘-2-甲基-2H-噻吩并[3,2-c]吡唑,为灰白色固体。1H NMR(CDCl3,300MHz):δ(ppm)7.36(d,J=5.3Hz,1H),7.16(d,J=5.3Hz,1H),4.13(s,3H).
步骤6
1-甲基-3-三丁基甲锡烷基-1H-噻吩并[3,2-c]吡唑
于-15℃向3-碘-1-甲基-1H-噻吩并[3,2-c]吡唑(290mg,1.10mmol)在THF(6mL)中的溶液中缓慢地添加异丙基氯化镁(2.0M在THF中,0.66mL,1.32mmol)。于-15℃搅拌亮黄色非均相反应混合物20分钟,然后滴加三丁基氯甲锡烷(0.36mL,1.32mmol)。于-15℃继续搅拌20分钟,然后于室温搅拌2小时。将反应混合物以水淬灭并以EtOAc(2x)萃取。将合并的有机物以盐水洗涤,然后经MgSO4干燥并浓缩。将残余物通过硅胶色谱以10%至20%EtOAc/庚烷(0.5%Et3N)纯化得到298mg(63%)的1-甲基-3-三丁基甲锡烷基-1H-噻吩并[3,2-c]吡唑,为浅黄色油状物。1H NMR(CDCl3,300MHz):δ(ppm)7.36(d,J=5.3Hz,1H),6.90(d,J=5.3Hz,1H),4.06(s,3H),1.54-1.67(m,6H),1.36(dq,J=14.7,7.3Hz,6H),1.13-1.22(m,6H),0.90(t,J=7.3Hz,9H).
步骤7
2-(1-甲基-1H-噻吩并[3,2-c]吡唑-3-基)-5-(2-三甲基甲硅烷基-乙氧基甲基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-羧酸[(R)-2-(3-氰基-氮杂环丁烷-1-基)-1-甲基-2-氧代-乙基]-酰胺
向1-甲基-3-三丁基甲锡烷基-1H-噻吩并[3,2-c]吡唑(111mg,0.26mmol)和2-溴-5-(2-三甲基甲硅烷基-乙氧基甲基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-羧酸[(R)-2-(3-氰基-氮杂环丁烷-1-基)-1-甲基-2-氧代-乙基]-酰胺(120mg,0.24mmol)在DMF(1.2mL)中的溶液中添加Pd(PPh3)4(14mg,0.012mmol)和碘化亚铜(I)(9mg,0.05mmol)。将黄色反应混合物以氩气冲洗,然后于80℃加热1.5小时,然后冷却至室温,以饱和NH4Cl淬灭并以EtOAc(2x)萃取。将合并的有机物以饱和LiCl和盐水洗涤,然后经MgSO4干燥并浓缩。将粗残余物通过硅胶色谱以50%至100%EtOAc/庚烷纯化提供131mg(98%)的2-(1-甲基-1H-噻吩并[3,2-c]吡唑-3-基)-5-(2-三甲基甲硅烷基-乙氧基甲基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-羧酸[(R)-2-(3-氰基-氮杂环丁烷-1-基)-1-甲基-2-氧代-乙基]-酰胺,为灰白色固体。
步骤8
2-(1-甲基-1H-噻吩并[3,2-c]吡唑-3-基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-羧酸[(R)-2-(3-氰基-氮杂环丁烷-1-基)-1-甲基-2-氧代-乙基]-酰胺
向2-(1-甲基-1H-噻吩并[3,2-c]吡唑-3-基)-5-(2-三甲基甲硅烷基-乙氧基甲基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-羧酸[(R)-2-(3-氰基-氮杂环丁烷-1-基)-1-甲基-2-氧代-乙基]-酰胺(131mg,0.23mmol)在CH2Cl2(2mL)的溶液中添加TFA(0.75mL)。将反应混合物在室温搅拌5小时,然后浓缩。将残余物再溶解于10:90:0.5MeOH/CH2Cl2/NH4OH(3mL)并在室温搅拌3小时。将反应混合物经浓缩,且将残余物通过硅胶色谱以0%至10%MeOH/CH2Cl2纯化得到83mg(83%)的2-(1-甲基-1H-噻吩并[3,2-c]吡唑-3-基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-羧酸[(R)-2-(3-氰基-氮杂环丁烷-1-基)-1-甲基-2-氧代-乙基]-酰胺,为白色固体。MS(M+Na)+=457;mp=310-320℃;1H NMR(DMSO-d6,300MHz):δ(ppm)12.93(宽单峰,1H),9.07(s,1H),8.46(d,J=11.0Hz,1H),8.19(d,J=7.9Hz,1H),7.82(d,J=5.3Hz,1H),7.32(d,J=5.3Hz,1H),4.42-4.77(m,3H),4.13–4.21(m,1H),4.12(s,3H),3.97-4.08(m,1H),3.76-3.89(m,1H),1.51(dd,J=6.8,2.6Hz,3H).
实施例100.
2-(6-氟-1-甲基-1H-吲唑-3-基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-羧酸[(R)-1-(1-氰基-环戊基)-乙基]-酰胺
步骤1
(S)-2-甲基-丙烷-2-亚磺酸(E)-亚乙基酰胺
在烧瓶中,将(S)-2-甲基-丙烷-2-亚磺酸酰胺(1.50g,12.4mmol)溶解于CH2Cl2(6mL)中。添加乙醛(6.25mL,111mmol)、MgSO4(4.47g,37.1mmol)和甲苯磺酸吡啶(156mg,0.62mmol)。于室温搅拌反应混合物过夜,过滤并浓缩得到(S)-2-甲基-丙烷-2-亚磺酸(E)-亚乙基酰胺,为淡红色油状物,其不经进一步纯化即可使用。
步骤2
(S)-2-甲基-丙烷-2-亚磺酸[(R)-1-(1-氰基-环戊基)-乙基]-酰胺
在烧瓶中,将环戊烷甲腈(3.53g,37.1mmol)溶解于THF(40mL)中并于-78℃冷却。添加LiHMDS(1.0M的THF溶液,41mL,41mmol)并于-78℃搅拌混合物30分钟。缓慢添加(S)-2-甲基-丙烷-2-亚磺酸(E)-亚乙基酰胺(来自步骤1的粗产物,1.82g,12.4mmol)在THF(10mL)中的溶液。将混合物于-78℃搅拌2小时,然后温热至室温过夜。将反应混合物以饱和氯化铵水溶液淬灭并以EtOAc萃取。将合并的有机物以盐水洗涤,经MgSO4干燥并浓缩。将残余物通过SiO2色谱(50-100%EtOAc/庚烷)纯化得到1.96g(65%)的(S)-2-甲基-丙烷-2-亚磺酸[(R)-1-(1-氰基-环戊基)-乙基]-酰胺,为白色固体。
步骤3
1-((R)-1-氨基-乙基)-环戊烷甲腈盐酸盐
将(S)-2-甲基-丙烷-2-亚磺酸[(R)-1-(1-氰基-环戊基)-乙基]-酰胺(1.96g,8.07mmol)溶解于MeOH(16mL)中并添加HCl(4.0M的1,4-二噁烷溶液,4.0mL,16.0mmol)。将反应混合物在室温搅拌30分钟,然后浓缩得到1-((R)-1-氨基-乙基)-环戊烷甲腈盐酸盐,为灰白色固体,其不经进一步纯化即可使用。
步骤4
2-(6-氟-1-甲基-1H-吲唑-3-基)-5-(2-三甲基甲硅烷基-乙氧基甲基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-羧酸[(R)-1-(1-氰基-环戊基)-乙基]-酰胺
在烧瓶中混合2-(6-氟-1-甲基-1H-吲唑-3-基)-5-(2-三甲基甲硅烷基-乙氧基甲基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-羧酸(120mg,0.27mmol)、1-((R)-1-氨基-乙基)-环戊烷甲腈盐酸盐(48mg,0.27mmol)、EDC(120mg,0.63mmol)和HOBt(106g,0.63mmol)。添加DMF(3mL),接着添加i-Pr2NEt(0.28mL,1.63mmol)。将反应混合物在室温搅拌3小时,然后以水淬灭并以EtOAc萃取。将有机物以10%柠檬酸、饱和NaHCO3、饱和LiCl和饱和NaCl洗涤,然后经MgSO4干燥并浓缩。将残余物通过SiO2色谱(20-100%EtOAc/庚烷)纯化得到140mg(92%)的2-(6-氟-1-甲基-1H-吲唑-3-基)-5-(2-三甲基甲硅烷基-乙氧基甲基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-羧酸[(R)-1-(1-氰基-环戊基)-乙基]-酰胺,为白色固体。
步骤5
2-(6-氟-1-甲基-1H-吲唑-3-基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-羧酸[(R)-1-(1-氰基-环戊基)-乙基]-酰胺
向2-(6-氟-1-甲基-1H-吲唑-3-基)-5-(2-三甲基甲硅烷基-乙氧基甲基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-羧酸[(R)-1-(1-氰基-环戊基)-乙基]-酰胺(140mg,0.25mmol)在CH2Cl2(2mL)中的溶液中添加TFA(0.75mL)。将反应混合物在室温搅拌4小时,然后浓缩。将残余物再溶解于10:90:0.5MeOH/CH2Cl2/NH4OH(3mL)并在室温搅拌3小时,然后浓缩。将残余物通过硅胶色谱以0%至5%MeOH/EtOAc纯化得到92mg(86%)的2-(6-氟-1-甲基-1H-吲唑-3-基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-羧酸[(R)-1-(1-氰基-环戊基)-乙基]-酰胺,为浅黄色粉末。MS(M+Na)+=454;mp=300-315℃;1H NMR(DMSO-d6,300MHz):δ(ppm)12.96(宽单峰,1H),9.11(s,1H),8.51-8.56(m,1H),8.50(s,1H),8.19(d,J=9.1Hz,1H),7.67(dd,J=9.8,1.9Hz,1H),7.15(td,J=9.1,2.3Hz,1H),4.34-4.50(m,1H),4.14(s,3H),1.92-2.14(m,3H),1.63-1.90(m,5H),1.46(d,J=6.8Hz,3H).
实施例101.
2-(4,6-二氟-1-甲基-1H-吲唑-3-基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-羧酸异丙基酰胺
步骤1
4,6-二氟-3-碘-1H-吲唑
于室温向4,6-二氟-1H-吲唑(1.16g,7.53mmol)在DMF(60ml)中的溶液中添加氢氧化钾(1.27g,22.6mmol)和碘(2.87g,11.3mmol)。将栗色反应混合物在室温搅拌2小时,然后以10%Na2S2O3水溶液淬灭并以水稀释。将混合物以EtOAc(2x)萃取。将合并的有机物以水、饱和LiCl和饱和NaCl洗涤,然后经MgSO4干燥和浓缩得到2.18g的4,6-二氟-3-碘-1H-吲唑,为浅棕色固体。
步骤2
4,6-二氟-3-三丁基甲锡烷基-1H-吲唑
于0℃向4,6-二氟-3-碘-1H-吲唑(2.11g,7.53mmol)在THF(45mL)中的溶液中缓慢加入氢化钠(60%在矿物油中,362mg,9.04mmol)。将反应混合物在室温搅拌10分钟,然后冷却至-10℃并添加异丙基氯化镁(2.0M在THF中,4.52mL,9.04mmol)。于-10℃搅拌反应混合物30分钟,然后滴加三丁基氯甲锡烷(2.66mL,9.8mmol)。于-10℃继续搅拌20分钟,然后于室温搅拌3小时。将反应混合物以饱和NH4Cl水溶液淬灭然后以水稀释并以EtOAc(2x)萃取。将合并的有机物以盐水洗涤,然后经MgSO4干燥并浓缩。将残余物通过硅胶色谱以10%至20%EtOAc/庚烷(0.5%Et3N)纯化得到1.94g(58%)的4,6-二氟-3-三丁基甲锡烷基-1H-吲唑,为淡黄色粘稠油状物。1H NMR(CDCl3,300MHz):δ(ppm)7.03(dd,J=8.9,2.1Hz,1H),6.60(td,J=9.8,2.1Hz,1H),1.51-1.64(m,6H),1.29-1.42(m,6H),1.20-1.29(m,6H),0.88(t,J=7.4Hz,9H)。
步骤3
2-(4,6-二氟-1H-吲唑-3-基)-5-(2-三甲基甲硅烷基-乙氧基甲基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-甲醛
在圆底烧瓶中,将2-溴-5-(2-三甲基甲硅烷基-乙氧基甲基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-甲醛(1.56g,4.38mmol)和4,6-二氟-3-三丁基甲锡烷基-1H-吲唑(1.94g,4.38mmol)溶解于DMF(40mL)中并添加四(三苯基膦)钯(0)(253mg,0.22mmol)和碘化亚铜(I)(167mg,0.88mmol)。将反应混合物以氩气冲洗,在室温搅拌4小时,然后于80℃加热1小时。将反应混合物冷却至室温,以饱和NH4Cl淬灭并以EtOAc(2x)萃取。将合并的有机物以饱和LiCl和盐水洗涤,然后经MgSO4干燥并浓缩。将粗残余物通过硅胶色谱以50%至100%EtOAc/庚烷纯化提供1.89g的2-(4,6-二氟-1H-吲唑-3-基)-5-(2-三甲基甲硅烷基-乙氧基甲基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-甲醛,为棕色固体。
步骤4
2-(4,6-二氟-1-甲基-1H-吲唑-3-基)-5-(2-三甲基甲硅烷基-乙氧基甲基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-甲醛
于0℃向2-(4,6-二氟-1H-吲唑-3-基)-5-(2-三甲基甲硅烷基-乙氧基甲基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-甲醛(890mg,2.1mmol)在DMF(9ml)中的溶液添加氢化钠(60%在矿物油中,279mg,2.49mmol)。于0℃搅拌反应混合物10分钟,然后缓慢地添加碘甲烷(0.18ml,2.9mmol)。将混合物于0℃搅拌30分钟,然后于室温搅拌30分钟。将反应混合物以饱和NH4Cl淬灭,以水稀释并以EtOAc(2x)萃取。将合并的有机物以饱和LiCl和盐水洗涤,然后经MgSO4干燥并浓缩。将粗残余物通过硅胶色谱以20%至100%EtOAc/庚烷纯化提供226mg(22%)的2-(4,6-二氟-1-甲基-1H-吲唑-3-基)-5-(2-三甲基甲硅烷基-乙氧基甲基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-甲醛,为黄色固体。
步骤5
2-(4,6-二氟-1-甲基-1H-吲唑-3-基)-5-(2-三甲基甲硅烷基-乙氧基甲基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-羧酸
于0℃向2-(4,6-二氟-1-甲基-1H-吲唑-3-基)-5-(2-三甲基甲硅烷基-乙氧基甲基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-甲醛(226mg,0.51mmol)在1,4-二噁烷(15ml)和水(3ml)中的溶液中添加氨基磺酸(297mg,3.06mmol)。然后经滴液漏斗经~15分钟添加亚氯酸钠(80%,75mg,0.66mmol)和磷酸二氢钾(834mg,6.13mmol)在水(12ml)中的溶液。在完成添加后,移去冰浴且将反应混合物在室温搅拌3小时。以水稀释反应混合物,并以EtOAc(3x)萃取。将合并的有机层以盐水洗涤,然后经MgSO4干燥和浓缩得到230mg(98%)的2-(4,6-二氟-1-甲基-1H-吲唑-3-基)-5-(2-三甲基甲硅烷基-乙氧基甲基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-羧酸,为浅黄色粉末。
步骤6
2-(4,6-二氟-1-甲基-1H-吲唑-3-基)-5-(2-三甲基甲硅烷基-乙氧基甲基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-羧酸异丙基酰胺
向2-(4,6-二氟-1-甲基-1H-吲唑-3-基)-5-(2-三甲基甲硅烷基-乙氧基甲基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-羧酸(75mg,0.16mmol)、HOBt(63mg,0.38mmol)和EDC(72mg,0.38mmol)在DMF中的溶液中添加异丙胺(84ul,0.98mmol)。将反应混合物在室温搅拌1.5小时,然后再添加HOBt、EDC和异丙胺。将反应混合物在室温搅拌过夜,然后添加二异丙基乙胺(170ul,0.98mmol)。搅拌反应混合物1小时,然后以水淬灭并以EtOAc(2x)萃取。将合并的有机层以10%柠檬酸、饱和NaHCO3、饱和LiCl和盐水洗涤,然后经MgSO4干燥并浓缩。将残余物经硅胶色谱以20%至100%EtOAc/庚烷纯化得到30mg(37%)的2-(4,6-二氟-1-甲基-1H-吲唑-3-基)-5-(2-三甲基甲硅烷基-乙氧基甲基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-羧酸异丙基酰胺,为白色固体。
步骤7
2-(4,6-二氟-1-甲基-1H-吲唑-3-基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-羧酸异丙基酰胺
向2-(4,6-二氟-1-甲基-1H-吲唑-3-基)-5-(2-三甲基甲硅烷基-乙氧基甲基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-羧酸异丙基酰胺(30mg,0.06mmol)在CH2Cl2(1.5mL)中的溶液中添加TFA(0.5mL)。将反应混合物在室温搅拌4小时,然后浓缩。将残余物再溶解于10:90:0.5MeOH/CH2Cl2/NH4OH(3mL)中并在室温搅拌3小时,然后浓缩。将残余物通过硅胶色谱以0%至5%MeOH/EtOAc纯化得到18mg(82%)的2-(4,6-二氟-1-甲基-1H-吲唑-3-基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-羧酸异丙基酰胺,为浅黄色粉末。MS(M+Na)+=393;1H NMR(DMSO-d6,300MHz):δ(ppm)12.83(s,1H),8.99(s,1H),8.40(s,1H),8.27(d,J=7.9Hz,1H),7.59(dd,J=9.1,1.9Hz,1H),7.12-7.23(m,1H),4.16-4.27(m,1H),4.14(s,3H),1.22(d,J=6.4Hz,6H).
实施例102.
2-(6-氟-1-氧杂环丁烷-3-基-1H-吲唑-3-基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-羧酸异丙基酰胺
步骤1
6-氟-3-碘-1H-吲唑
于室温向6-氟-1H-吲唑(5.50g,40.4mmol)在DMF(150ml)中的溶液中添加氢氧化钾(6.8g,121mmol)和碘(15.4g,60.6mmol)。将栗色反应混合物在室温搅拌8小时,然后以10%Na2S2O3水溶液淬灭并以水稀释。将混合物以EtOAc(2x)萃取。将合并的有机物以水、饱和LiCl和饱和NaCl洗涤,然后经MgSO4干燥和浓缩得到8.6g(81%)的6-氟-3-碘-1H-吲唑,为浅黄色固体。1H NMR(CDCl3,300MHz):δ(ppm)7.48(dd,J=8.9,5.1Hz,1H),7.20(dd,J=8.9,2.1Hz,1H),7.02(td,J=9.1,2.1Hz,1H)
步骤2
6-氟-3-三丁基甲锡烷基-1H-吲唑
于0℃向6-氟-3-碘-1H-吲唑(8.6g,32.8mmol)在THF(200mL)中的溶液中缓慢地分份添加氢化钠(60%在矿物油中,1.58g,39.4mmol)。将反应混合物在室温搅拌10分钟,然后冷却至-10℃并添加异丙基氯化镁(2.0M的THF溶液,19.7mL,39.4mmol)。于-10℃搅拌反应混合物30分钟,然后再添加异丙基氯化镁(2.0M在THF中,8.2mL,16.4mmol)。于-10℃搅拌反应混合物30分钟,然后缓慢地添加三丁基氯甲锡烷(11.6mL,42.7mmol)。于-10℃继续搅拌20分钟,然后于室温搅拌3小时。将反应混合物以饱和NH4Cl水溶液淬灭然后以水稀释并以EtOAc(2x)萃取。将合并的有机物以盐水洗涤,然后经MgSO4干燥并浓缩。将残余物通过硅胶色谱以10%至20%EtOAc/庚烷(0.5%Et3N)纯化得到6.53g(47%)的6-氟-3-三丁基甲锡烷基-1H-吲唑,为浅棕色粘稠油状物。1H NMR(CDCl3,300MHz):δ(ppm)7.65(dd,J=8.7,5.3Hz,1H),7.20(dd,J=9.3,2.1Hz,1H),6.92(td,J=9.0,2.1Hz,1H),1.53-1.67(m,6H),1.28-1.43(m,6H),1.20-1.28(m,6H),0.89(t,J=7.4Hz,9H)。
步骤3
2-(6-氟-1H-吲唑-3-基)-5-(2-三甲基甲硅烷基-乙氧基甲基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-甲醛
在圆底烧瓶中,将2-溴-5-(2-三甲基甲硅烷基-乙氧基甲基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-甲醛(5.47g,15.4mmol)和6-氟-3-三丁基甲锡烷基-1H-吲唑(6.53g,15.4mmol)溶解于DMF(140mL)中并添加四(三苯基膦)钯(0)(888mg,0.76mmol)和碘化亚铜(I)(585mg,3.07mmol)。将反应混合物以氩气冲洗,然后于80℃加热1小时。将反应混合物冷却至室温,以饱和NH4Cl淬灭并以EtOAc(2x)萃取。将合并的有机物以饱和LiCl和盐水洗涤,然后经MgSO4干燥并浓缩。将粗残余物从EtOAc重结晶得到3.74g的白色固体。将母液通过硅胶色谱以50%至100%EtOAc/庚烷纯化得到另外的1.75g白色固体。全部收率为5.49g(87%)的2-(6-氟-1H-吲唑-3-基)-5-(2-三甲基甲硅烷基-乙氧基甲基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-甲醛。1H NMR(CDCl3,300MHz):δ(ppm)10.49(s,1H),9.34(s,1H),8.83(dd,J=9.1,5.3Hz,1H),8.32(s,1H),7.08-7.25(m,2H),5.77(s,2H),3.55-3.71(m,2H),0.87-1.03(m,2H),-0.03(s,9H).
步骤4
2-(6-氟-1-氧杂环丁烷-3-基-1H-吲唑-3-基)-5-(2-三甲基甲硅烷基-乙氧基甲基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-甲醛
在微波小瓶中,将2-(6-氟-1H-吲唑-3-基)-5-(2-三甲基甲硅烷基-乙氧基甲基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-甲醛(300mg,0.73mmol)溶解于DMF(5ml)中并添加碳酸铯(714mg,2.19mmol)和3-碘代氧杂环丁烷(200mg,1.08mmol)。将小瓶密封并于100℃微波辐射加热2小时。将反应混合物经冷却,以水淬灭并以EtOAc(2x)萃取。将合并的有机物以饱和LiCl和盐水洗涤,然后经MgSO4干燥并浓缩。将粗残余物通过硅胶色谱以20%至100%EtOAc/庚烷纯化得到295mg(86%)的2-(6-氟-1-氧杂环丁烷-3-基-1H-吲唑-3-基)-5-(2-三甲基甲硅烷基-乙氧基甲基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-甲醛,为白色固体。1H NMR(CDCl3,300MHz):δ(ppm)10.48(s,1H),9.40(s,1H),8.86(dd,J=9.1,5.3Hz,1H),8.31(s,1H),7.11-7.25(m,2H),5.72-5.86(m,3H),5.41(t,J=6.6Hz,2H),5.20(t,J=7.4Hz,2H),3.56-3.70(m,2H),0.85-1.06(m,2H),-0.02(s,9H).
步骤5
2-(6-氟-1-氧杂环丁烷-3-基-1H-吲唑-3-基)-5-(2-三甲基甲硅烷基-乙氧基甲基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-羧酸
于0℃向2-(6-氟-1-氧杂环丁烷-3-基-1H-吲唑-3-基)-5-(2-三甲基甲硅烷基-乙氧基甲基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-甲醛(293mg,0.63mmol)在1,4-二噁烷(20ml)和水(4ml)的溶液中添加氨基磺酸(365mg,3.76mmol)。然后经~15分钟添加亚氯酸钠(80%,92mg,0.82mmol)和磷酸二氢钾(1.02g,7.52mmol)在水(16ml)中的溶液。在完成添加后,移去冰浴,且将反应混合物在室温搅拌30分钟。添加THF(20ml)并继续搅拌2小时。以水稀释反应混合物,并以EtOAc(3x)萃取。将合并的有机层以盐水洗涤,然后经MgSO4干燥和浓缩得到340mg的2-(6-氟-1-氧杂环丁烷-3-基-1H-吲唑-3-基)-5-(2-三甲基甲硅烷基-乙氧基甲基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-羧酸,为灰白色粉末。
步骤6
2-(6-氟-1-氧杂环丁烷-3-基-1H-吲唑-3-基)-5-(2-三甲基甲硅烷基-乙氧基甲基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-羧酸异丙基酰胺
向2-(4,6-二氟-1-甲基-1H-吲唑-3-基)-5-(2-三甲基甲硅烷基-乙氧基甲基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-羧酸(115mg,0.23mmol)、HOBt(92mg,0.55mmol)和EDC(105mg,0.55mmol)在DMF(3ml)中的溶液中添加异丙胺(41ul,0.48mmol)和N,N-二异丙基乙胺(0.17ml,0.95mmol)。将反应混合物在室温搅拌过夜,然后以水淬灭并以EtOAc(2x)萃取。将合并的有机层以10%柠檬酸、饱和NaHCO3、饱和LiCl和盐水洗涤,然后经MgSO4干燥并浓缩。将残余物经硅胶色谱以20%至100%EtOAc/庚烷纯化得到98mg(78%)的2-(6-氟-1-氧杂环丁烷-3-基-1H-吲唑-3-基)-5-(2-三甲基甲硅烷基-乙氧基甲基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-羧酸异丙基酰胺,为白色固体。
步骤7
2-(6-氟-1-氧杂环丁烷-3-基-1H-吲唑-3-基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-羧酸异丙基酰胺
向2-(6-氟-1-氧杂环丁烷-3-基-1H-吲唑-3-基)-5-(2-三甲基甲硅烷基-乙氧基甲基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-羧酸异丙基酰胺(98mg,0.18mmol)在CH2Cl2(1.5mL)中的溶液中添加TFA(0.5mL)。将反应混合物在室温搅拌3小时,然后浓缩。将残余物再溶解于10:90:0.5MeOH/CH2Cl2/NH4OH(3mL)中并在室温搅拌3小时,然后浓缩。将残余物在水和10%MeOH/CH2Cl2之间分配。将水层以10%MeOH/CH2Cl2(3x)萃取。将合并的有机物经浓缩且将残余物通过硅胶色谱以0%至5%MeOH/CH2Cl2(0.5%NH4OH)纯化得到30mg(41%)的2-(6-氟-1-氧杂环丁烷-3-基-1H-吲唑-3-基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-羧酸异丙基酰胺,为白色固体。MS(M+Na)+=417;1H NMR(DMSO-d6,300MHz):δ(ppm)12.87(宽单峰,1H),9.20(s,1H),8.45-8.51(m,1H),8.44(s,1H),8.04(d,J=7.6Hz,1H),7.73(dd,J=9.8,1.9Hz,1H),7.22(td,J=9.1,1.9Hz,1H),6.13(quin,J=7.0Hz,1H),5.11-5.20(m,2H),4.99-5.10(m,2H),4.21(dq,J=13.5,6.4Hz,1H),1.30(d,J=6.4Hz,6H).
实施例103.
2-(6-氟-1-氧杂环丁烷-3-基-1H-吲唑-3-基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-羧酸((S)-2-甲氧基-1-甲基-乙基)-酰胺
根据实施例102步骤6-7中阐述的操作制备,以(S)-1-甲氧基丙烷-2-胺盐酸盐替代步骤6中的异丙胺。MS:(M+Na)+=447;1H NMR(DMSO-d6,400MHz):δ(ppm)12.87(宽单峰,1H),9.25(s,1H),8.56(dd,J=9.0,5.2Hz,1H),8.47(s,1H),8.21(d,J=8.3Hz,1H),7.74(dd,J=9.7,2.1Hz,1H),7.20(td,J=9.0,2.1Hz,1H),6.09-6.22(m,1H),5.18(q,J=6.1Hz,2H),5.03-5.11(m,2H),4.34-4.44(m,1H),3.40-3.57(m,2H),3.31(s,3H),1.32(d,J=6.8Hz,3H).
实施例104.
2-(1-氮杂环丁烷-3-基-6-氟-1H-吲唑-3-基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-羧酸异丙基酰胺
步骤1
2-[1-(1-二苯甲基-氮杂环丁烷-3-基)-6-氟-1H-吲唑-3-基]-5-(2-三甲基甲硅烷基-乙氧基甲基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-甲醛
在微波小瓶中,将2-(6-氟-1H-吲唑-3-基)-5-(2-三甲基甲硅烷基-乙氧基甲基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-甲醛(300mg,0.73mmol)溶解于DMF(6ml)中并添加碳酸铯(713mg,2.19mmol)和甲磺酸1-二苯甲基-氮杂环丁烷-3-基酯(347mg,1.09mmol)。将小瓶密封并在微波反应器中于100℃加热3小时。将反应混合物经冷却,以水淬灭并以EtOAc(2x)萃取。将合并的有机物以水和盐水洗涤,然后经MgSO4干燥并浓缩。将粗残余物通过硅胶色谱以20%至30%EtOAc/己烷纯化提供176mg(38%)的2-[1-(1-二苯甲基-氮杂环丁烷-3-基)-6-氟-1H-吲唑-3-基]-5-(2-三甲基甲硅烷基-乙氧基甲基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-甲醛,为橙色泡沫。
步骤2
2-[1-(1-二苯甲基-氮杂环丁烷-3-基)-6-氟-1H-吲唑-3-基]-5-(2-三甲基甲硅烷基-乙氧基甲基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-羧酸
于0℃向2-[1-(1-二苯甲基-氮杂环丁烷-3-基)-6-氟-1H-吲唑-3-基]-5-(2-三甲基甲硅烷基-乙氧基甲基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-甲醛(170mg,0.27mmol)在1,4-二噁烷(10mL)和水(2mL)中的溶液中添加氨基磺酸(157mg,1.61mmol)。然后经5分钟滴加NaClO2(43mg,0.37mmol)和KH2PO4(439mg,3.22mmol)在水(4mL)中的溶液。移去冰浴并将黄色浑浊反应混合物在室温搅拌过夜。将混合物以水稀释并以EtOAc(2x)萃取。将合并的有机层经MgSO4干燥并浓缩。将残余物以石油醚研磨分离出45mg(26%)的2-[1-(1-二苯甲基-氮杂环丁烷-3-基)-6-氟-1H-吲唑-3-基]-5-(2-三甲基甲硅烷基-乙氧基甲基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-羧酸,为浅黄色固体。
步骤3
2-[1-(1-二苯甲基-氮杂环丁烷-3-基)-6-氟-1H-吲唑-3-基]-5-(2-三甲基甲硅烷基-乙氧基甲基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-羧酸异丙基酰胺
向2-[1-(1-二苯甲基-氮杂环丁烷-3-基)-6-氟-1H-吲唑-3-基]-5-(2-三甲基甲硅烷基-乙氧基甲基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-羧酸(130mg,0.20mmol)在DMF(2mL)中的溶液中添加HATU(84mg,0.22mmol)和异丙胺(86μL,1.00mmol)。将反应混合物在室温搅拌过夜,然后以水淬灭并以EtOAc(2x)萃取。将合并的有机物以水(3x)和盐水洗涤,然后经MgSO4干燥并浓缩。将残余物通过硅胶色谱以50%EtOAc/己烷纯化分离出74mg(54%)的2-[1-(1-二苯甲基-氮杂环丁烷-3-基)-6-氟-1H-吲唑-3-基]-5-(2-三甲基甲硅烷基-乙氧基甲基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-羧酸异丙基酰胺,为灰白色泡沫状固体.
步骤4
2-(1-氮杂环丁烷-3-基-6-氟-1H-吲唑-3-基)-5-(2-三甲基甲硅烷基-乙氧基甲基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-羧酸异丙基酰胺
在圆底烧瓶中,将甲酸铵(135mg,2.15mmol)溶解于MeOH(1.5mL)中。将该溶液添加至2-[1-(1-二苯甲基-氮杂环丁烷-3-基)-6-氟-1H-吲唑-3-基]-5-(2-三甲基甲硅烷基-乙氧基甲基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-羧酸异丙基酰胺(74mg,0.107mmol)在THF(1.5mL)中的溶液中,这导致形成白色沉淀。将该浆料经移液管转移至压力管(含10%钯/炭(湿,23mg),在MeOH(1mL)中)。将压力管密封并于50℃加热4小时,然后冷却至室温过夜。将混合物经硅藻土过滤,以CH2Cl2淋洗。浓缩滤液。将残余物吸收至SiO2上并以0%至10%MeOH/CH2Cl2(0.5%NH4OH)色谱纯化得到38mg(68%)的2-(1-氮杂环丁烷-3-基-6-氟-1H-吲唑-3-基)-5-(2-三甲基甲硅烷基-乙氧基甲基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-羧酸异丙基酰胺,为淡黄色泡沫状固体。
步骤5
2-(1-氮杂环丁烷-3-基-6-氟-1H-吲唑-3-基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-羧酸异丙基酰胺
向2-(1-氮杂环丁烷-3-基-6-氟-1H-吲唑-3-基)-5-(2-三甲基甲硅烷基-乙氧基甲基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-羧酸异丙基酰胺(36mg,0.69mmol)在CH2Cl2(1mL)中的溶液中添加TFA(0.5mL,6.5mmol)。将反应混合物在室温搅拌3小时,然后浓缩。将残余物再溶解于CH2Cl2(1mL)并添加乙二胺(0.2mL,3.00mmol)。将反应混合物在室温搅拌1小时,然后以水淬灭,并以5%MeOH/CH2Cl2(3x)萃取。将合并的有机层经MgSO4干燥并浓缩。将残余物以EtOAc研磨得到17mg(63%)的2-(1-氮杂环丁烷-3-基-6-氟-1H-吲唑-3-基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-羧酸异丙基酰胺为淡黄色粉末。MS:(M+H)+=394;1HNMR(DMSO-d6,300MHz):δ(ppm)9.14(s,1H),8.40-8.50(m,2H),8.04(d,J=7.6Hz,1H),7.78-7.86(m,1H),7.13-7.24(m,1H),5.65-5.76(m,1H),4.12-4.28(m,3H),3.86(t,J=7.9Hz,2H),1.30(d,J=6.4Hz,3H).
实施例105.
2-(6-氯-1-甲基-1H-吲唑-3-基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-羧酸((R)-2-甲磺酰基-1-甲基-乙基)-酰胺
步骤1
2-(6-氯-1-甲基-1H-吲唑-3-基)-5-(2-三甲基甲硅烷基-乙氧基甲基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-羧酸((R)-2-甲磺酰基-1-甲基-乙基)-酰胺
将2-(6-氯-1-甲基-1H-吲唑-3-基)-5-(2-三甲基甲硅烷基-乙氧基甲基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-羧酸(80mg,0.175mmol)、O-苯并三唑-1-基-N,N,N’,N’-四甲基脲鎓四氟硼酸盐(84mg,0.26mmol)和N,N-二异丙基乙胺(0.076ml,0.44mmol)溶解于乙腈(1.75ml)中。添加(R)-1-(甲基磺酰基)丙烷-2-胺盐酸盐(36mg,0.21mmol)且将混合物在室温搅拌3小时。添加水和乙酸乙酯。分离各层,且将水层以乙酸乙酯萃取两次。将合并的有机层以氯化钠溶液洗涤,经硫酸钠干燥并浓缩。将残余物通过硅胶色谱纯化(乙酸乙酯/己烷)得到65mg(64%)的2-(6-氯-1-甲基-1H-吲唑-3-基)-5-(2-三甲基甲硅烷基-乙氧基甲基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-羧酸((R)-2-甲磺酰基-1-甲基-乙基)-酰胺。(M+H)+=578.
步骤2
2-(6-氯-1-甲基-1H-吲唑-3-基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-羧酸((R)-2-甲磺酰基-1-甲基-乙基)-酰胺
将2-(6-氯-1-甲基-1H-吲唑-3-基)-5-(2-三甲基甲硅烷基-乙氧基甲基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-羧酸((R)-2-甲磺酰基-1-甲基-乙基)-酰胺(65mg,0.113mmol)溶解于二氯甲烷(0.8ml)且然后在冰浴中搅拌。缓慢地添加三氟乙酸(0.4ml)并移去冰浴。将反应混合物在室温搅拌3小时,然后在冰浴中冷却。添加碳酸氢钠溶液且将混合物以乙酸乙酯萃取三次。将合并的有机层以氯化钠溶液洗涤并经硫酸钠干燥。蒸发后,将残余物溶解于无水乙醇(7ml)中并添加乙酸钠(185mg,2.25mmol)。于60℃搅拌混合物20小时。将反应混合物经冷却,添加水和乙酸乙酯。将水层以乙酸乙酯萃取两次。将合并的有机层以氯化钠溶液洗涤,经硫酸钠干燥并蒸发得到残余物。硅胶色谱(甲醇/二氯甲烷)纯化后,得到18.6mg(37%)的2-(6-氯-1-甲基-1H-吲唑-3-基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-羧酸((R)-2-甲磺酰基-1-甲基-乙基)-酰胺。MS:(M+H)+=447;mp=287-290℃.1H NMR(300MHz,DMSO-d6)δppm12.91(s,1H)9.10(s,1H)8.54(d,J=8.7Hz,1H)8.47(s,1H)8.26(d,J=7.9Hz,1H)7.97-8.02(m,1H)7.35(dd,J=8.7,1.5Hz,1H)4.60-4.72(m,1H)4.18(s,3H)3.45-3.63(m,2H)3.06(s,3H)1.52(d,J=6.8Hz,3H).
实施例106.
2-(6-氯-1-甲基-1H-吲唑-3-基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-羧酸环戊基酰胺
根据实施例105中阐述的操作制备,以环戊基胺替代步骤1中的(R)-1-(甲基磺酰基)丙烷-2-胺盐酸盐。MS:(M+H)+=395;mp=341-343℃.1H NMR(300MHz,DMSO-d6)δppm12.81-12.89(m,1H)9.07(s,1H)8.42(d,J=3.0Hz,1H)8.39(d,J=8.7Hz,1H)8.05-8.13(m,1H)8.00(d,J=1.5Hz,1H)7.24(dd,J=8.7,1.5Hz,1H)4.30-4.43(m,1H)4.16(s,3H)2.00-2.15(m,2H)1.50-1.83(m,6H).
实施例107.
2-(6-氯-1-甲基-1H-吲唑-3-基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-羧酸(四氢呋喃-3-基)-酰胺
根据实施例105中阐述的操作制备,以四氢呋喃-3-基胺盐酸盐代替步骤1中的(R)-1-(甲基磺酰基)丙烷-2-胺盐酸盐。MS:(M+Na)+=419;mp=345-347℃.1H NMR(300MHz,DMSO-d6)δppm12.89(宽单峰,1H)9.10(s,1H)8.44(d,J=8.7Hz,1H)8.46(d,J=3.4Hz,1H)8.29(d,J=7.6Hz,1H)7.99(s,1H)7.27(dd,J=8.7,1.5Hz,1H)4.62-4.74(m,1H)4.16(s,3H)3.74-4.00(m,4H)2.27-2.41(m,1H)1.88-2.01(m,1H).
实施例108.
2-(6-氯-1-甲基-1H-吲唑-3-基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-羧酸异丙基酰胺
步骤1
2-(6-氯-1-甲基-1H-吲唑-3-基)-5-(2-三甲基甲硅烷基-乙氧基甲基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-羧酸异丙基酰胺
将2-(6-氯-1-甲基-1H-吲唑-3-基)-5-(2-三甲基甲硅烷基-乙氧基甲基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-羧酸(80mg,0.175mmol)、O-苯并三唑-1-基-N,N,N’,N’-四甲基脲鎓四氟硼酸盐(84mg,0.26mmol)和N,N-二异丙基乙胺(0.076ml,0.44mmol)溶解于乙腈(1.75ml)中。添加异丙胺(0.018ml,0.21mmol)且将混合物在室温搅拌过夜。添加水和乙酸乙酯,分离各层,将水层以乙酸乙酯萃取两次。将合并的有机层以氯化钠溶液洗涤,经硫酸钠干燥并浓缩。将残余物通过硅胶色谱纯化(乙酸乙酯/己烷)得到45mg(52%)的2-(6-氯-1-甲基-1H-吲唑-3-基)-5-(2-三甲基甲硅烷基-乙氧基甲基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-羧酸异丙基酰胺。(M+H)+=500.
步骤2
2-(6-氯-1-甲基-1H-吲唑-3-基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-羧酸异丙基酰胺
将2-(6-氯-1-甲基-1H-吲唑-3-基)-5-(2-三甲基甲硅烷基-乙氧基甲基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-羧酸异丙基酰胺(45mg,0.09mmol)溶解于二氯甲烷(0.9ml)中并在冰浴中冷却。缓慢地添加三氟乙酸(0.3ml)和将反应混合物在室温搅拌3.5小时。蒸发反应混合物且将残余物溶解于二氯甲烷(2ml)中。添加乙二胺(0.36ml,5.4mmol)且将混合物在室温搅拌18小时。将水和然后乙酸乙酯添加至混合物。将所得沉淀经过滤、以水淋洗并高真空干燥得到21mg(81%)的2-(6-氯-1-甲基-1H-吲唑-3-基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-羧酸异丙基酰胺。(M+Na)+=391;mp=356-362℃.1H NMR(400MHz,DMSO-d6)δppm12.79-12.90(m,1H)9.09(s,1H)8.44(d,J=9.1Hz,1H)8.42(s,1H)8.02(d,J=7.6Hz,1H)8.00(d,J=1.5Hz,1H)7.30(dd,J=8.8,1.8Hz,1H)4.19-4.27(m,1H)4.17(s,3H)1.32(d,J=6.6Hz,6H).
实施例109.
2-(6-氯-1-甲基-1H-吲唑-3-基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-羧酸乙基酰胺
根据实施例108中阐述的操作制备,以乙胺替代步骤1中的异丙胺。MS:(M+Na)+=377;mp=373-377℃.1H NMR(300MHz,DMSO-d6)δ:12.79-12.88(m,1H),9.09(s,1H),8.42(s,1H),8.43(d,J=8.6Hz,1H),8.07-8.14(m,1H),7.99(d,J=1.5Hz,1H),7.32(dd,J=8.6,1.5Hz,1H),4.17(s,3H),3.44-3.54(m,2H),1.31(t,J=7.3Hz,3H).
实施例110.
2-(6-氯-1-甲基-1H-吲唑-3-基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-羧酸环己基酰胺
根据实施例108中阐述的操作制备,以环己基胺替代步骤1中的异丙胺。MS:(M+H)+=409;mp=321-323℃.1H NMR(300MHz,DMSO-d6)δ:12.81-12.89(m,1H),9.08(s,1H),8.41(d,J=8.3Hz,1H),8.43(s,1H),8.06(d,J=7.9Hz,1H),8.00(d,J=1.5Hz,1H),7.27(dd,J=8.7,1.5Hz,1H),4.17(s,3H),3.84-3.98(m,1H),1.99-2.09(m,2H),1.74-1.84(m,2H),1.59-1.70(m,1H),1.20-1.49(m,5H).
实施例111.
2-(6-氯-1-甲基-1H-吲唑-3-基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-羧酸(四氢-吡喃-3-基)-酰胺
根据实施例108中阐述的操作制备,以四氢-2H-吡喃-3-基胺盐酸盐替代步骤1中的异丙胺。MS:(M+Na)+=433;mp=339-342℃.1H NMR(300MHz,DMSO-d6)δ:12.91-13.01(m,1H),9.11(s,1H),8.52(d,J=8.3Hz,1H),8.45(d,J=3.0Hz,1H),8.19(d,J=7.9Hz,1H),7.97-8.01(m,1H),7.26(dd,J=8.7,1.5Hz,1H),4.17(s,3H),4.04-4.22(m,1H),3.85-3.95(m,1H),3.56-3.72(m,2H),3.47-3.56(m,1H),1.68-1.85(m,2H),1.49-1.65(m,2H).
实施例112.
2-(6-氯-1-甲基-1H-吲唑-3-基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-羧酸(四氢-吡喃-4-基)-酰胺
根据实施例108中阐述的操作制备,以四氢-2H-吡喃-4-基胺盐酸盐替代步骤1中的异丙胺。MS:(M+Na)+=433;mp=355-358℃.1H NMR(300MHz,DMSO-d6)δ:12.85-12.93(m,1H),9.09(s,1H),8.43(d,J=8.3Hz,1H),8.46(s,1H),8.11(d,J=7.6Hz,1H),8.01(s,1H),7.26-7.33(m,1H),4.07-4.23(m,4H),3.90-4.00(m,2H),3.42-3.55(m,2H),1.97-2.08(m,2H),1.51-1.68(m,2H).
实施例113.
2-(6-氯-1-甲基-1H-吲唑-3-基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-羧酸(1,1-二氧代-四氢-噻吩-3-基)-酰胺
根据实施例108中阐述的操作制备,以1,1-二氧代-四氢-噻吩-3-基胺(如WO2008033562A2中所制备)替代步骤1中的异丙胺。MS:(M+Na)+=467;mp=383-385℃.1H NMR(300MHz,DMSO-d6)δ:9.11(s,1H),8.50(d,J=9.8Hz,1H),8.49(s,1H),8.36(d,J=7.2Hz,1H),7.97-8.02(m,1H),7.34-7.41(m,1H),4.77-4.93(m,1H),4.17(s,3H),3.59-3.70(m,1H),3.40-3.51(m,2H),3.11-3.23(m,1H),2.61-2.75(m,1H),2.20-2.37(m,1H).
实施例114.
2-(6-氟-1-甲基-1H-吲唑-3-基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-羧酸(3-羟基-2,2-二甲基-丙基)-酰胺
步骤1
2-(6-氟-1-甲基-1H-吲唑-3-基)-5-(2-三甲基甲硅烷基-乙氧基甲基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-羧酸(3-羟基-2,2-二甲基-丙基)-酰胺
将2-(6-氟-1-甲基-1H-吲唑-3-基)-5-(2-三甲基甲硅烷基-乙氧基甲基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-羧酸(80mg,0.18mmol)、O-苯并三唑-1-基-N,N,N’,N’-四甲基脲鎓四氟硼酸盐(87mg,0.27mmol)和N,N-二异丙基乙胺(0.16ml,0.91mmol)溶解于乙腈(1.8ml)中。添加3-氨基-2,2-二甲基丙烷-1-醇(22mg,0.22mmol)且将混合物在室温搅拌过夜。添加水和乙酸乙酯,分离各层,将水层以乙酸乙酯萃取两次。将合并的有机层以氯化钠溶液洗涤,经硫酸钠干燥并浓缩。将残余物通过硅胶色谱(乙酸乙酯/己烷)纯化得到85mg(89%)的2-(6-氟-1-甲基-1H-吲唑-3-基)-5-(2-三甲基甲硅烷基-乙氧基甲基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-羧酸(3-羟基-2,2-二甲基-丙基)-酰胺。(M+Na)+=549.
步骤2
2-(6-氟-1-甲基-1H-吲唑-3-基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-羧酸(3-羟基-2,2-二甲基-丙基)-酰胺
将2-(6-氟-1-甲基-1H-吲唑-3-基)-5-(2-三甲基甲硅烷基-乙氧基甲基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-羧酸(3-羟基-2,2-二甲基-丙基)-酰胺(82mg,0.156mmol)悬浮于二氯甲烷(1.1ml)中并在冰浴中冷却。缓慢地添加三氟乙酸(0.5ml)且将反应混合物在室温搅拌3.5小时。蒸发反应混合物且将残余物溶解于二氯甲烷(1.6ml)中。添加乙二胺(0.63ml,9.3mmol)且将混合物在室温搅拌18小时。将水和然后乙酸乙酯添加至混合物中,分离各层,且将水层以乙酸乙酯萃取两次。将合并的有机层以氯化钠溶液洗涤,经硫酸钠干燥并浓缩。将残余物通过硅胶色谱(甲醇/二氯甲烷)纯化得到39mg(63%)的2-(6-氟-1-甲基-1H-吲唑-3-基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-羧酸(3-羟基-2,2-二甲基-丙基)-酰胺,为灰白色固体。(M+Na)+=419;mp=291-293℃.1H NMR(300MHz,DMSO-d6)δ:9.10(s,1H),8.45(s,1H),8.41-8.49(m,1H),8.19-8.27(m,1H),7.67(dd,J=9.8,2.3Hz,1H),7.14-7.23(m,1H),4.63-4.72(m,1H),4.14(s,3H),3.37-3.43(m,2H),3.16-3.24(m,2H),0.90(s,6H).
实施例115.
2-(6-氟-1-甲基-1H-吲唑-3-基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-羧酸(2,2-二甲基-丙基)-酰胺
根据实施例114中阐述的操作制备,以2,2-二甲基丙胺替代步骤1中的3-氨基-2,2-二甲基丙烷-1-醇。MS:(M+Na)+=403;mp=294-295℃.1H NMR(300MHz,DMSO-d6)δ:12.81-12.93(m,1H),9.09(s,1H),8.44(s,1H),8.41(dd,J=8.9,5.5Hz,1H),8.21-8.29(m,1H),7.67(dd,J=9.8,2.3Hz,1H),7.12-7.22(m,1H),4.14(s,3H),3.33-3.38(m,2H),0.95(s,9H).
实施例116.
2-(6-氟-1-甲基-1H-吲唑-3-基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-羧酸异丁基-酰胺
根据实施例114中阐述的操作制备,以异丁基胺替代步骤1中的3-氨基-2,2-二甲基丙烷-1-醇。MS:(M+H)+=367;mp=285-287℃.1H NMR(300MHz,DMSO-d6)δ:12.79-12.89(m,1H),9.09(s,1H),8.42(dd,J=9.1,5.3Hz,1H),8.43(s,1H),8.18-8.28(m,1H),7.68(dd,J=9.6,2.1Hz,1H),7.13-7.23(m,1H),4.14(s,3H),3.34-3.37(m,2H),1.91(s,1H),0.98(d,J=6.8Hz,6H).
实施例117.
2-(6-氟-1-甲基-1H-吲唑-3-基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-羧酸环丙基甲基-酰胺
根据实施例114中阐述的操作制备,以环丙基甲基胺替代步骤1中的3-氨基-2,2-二甲基丙烷-1-醇。MS:(M+Na)+=387;mp=319-322℃.1H NMR(300MHz,DMSO-d6)δ:12.80-12.88(m,1H),9.09-9.12(m,1H),8.48(dd,J=8.9,5.5Hz,1H),8.43(s,1H),8.17-8.25(m,1H),7.68(dd,J=9.8,2.3Hz,1H),7.13-7.23(m,1H),4.15(s,3H),3.34-3.39(m,2H),1.08-1.22(m,1H),0.52-0.60(m,2H),0.29-0.36(m,2H).
实施例118.
2-(6-氯-1-甲基-1H-吲唑-3-基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-羧酸[(R)-2-((S)-3-氟-吡咯烷-1-基)-1-甲基-2-氧代-乙基]-酰胺
步骤1
[(R)-2-((S)-3-氟-吡咯烷-1-基)-1-甲基-2-氧代-乙基]-氨基甲酸叔丁酯
将(R)-2-叔丁氧基羰基氨基-丙酸(1.0g,5.3mmol)、1-(3-(二甲基氨基)-丙基)-3-乙基碳二亚胺(2.33g,12.2mmol)和羟基苯并三唑(1.64g,12.2mmol)溶解于DMF(50ml)中。添加(S)-3-氟吡咯烷盐酸盐(1.66g,13.2mmol)和N,N-二异丙基乙胺(2.95ml,16.9mmol)且将混合物在室温搅拌16小时。添加乙酸乙酯且将溶液以10%柠檬酸溶液洗涤三次。将有机层以碳酸氢钠溶液洗涤,其然后以乙酸乙酯反萃取四次。将合并的有机层然后进一步以氯化锂溶液、氯化钠溶液洗涤,并经硫酸钠干燥。浓缩溶液得到1.3g(94%)的[(R)-2-((S)-3-氟-吡咯烷-1-基)-1-甲基-2-氧代-乙基]-氨基甲酸叔丁酯。
步骤2
(R)-2-氨基-1-((S)-3-氟-吡咯烷-1-基)-丙-1-酮三氟乙酸盐
将[(R)-2-((S)-3-氟-吡咯烷-1-基)-1-甲基-2-氧代-乙基]-氨基甲酸叔丁酯(43mg,0.127mmol)溶解于二氯甲烷(1.6ml)中并于冰浴中冷却。缓慢地添加三氟乙酸(0.8ml)且将反应混合物在室温搅拌3小时,然后蒸发并高真空干燥得到(R)-2-氨基-1-((S)-3-氟-吡咯烷-1-基)-丙-1-酮三氟乙酸盐,其不经进一步纯化即可使用。
步骤3
2-(6-氯-1-甲基-1H-吲唑-3-基)-5-(2-三甲基甲硅烷基-乙氧基甲基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-羧酸[(R)-2-((S)-3-氟-吡咯烷-1-基)-1-甲基-2-氧代-乙基]-酰胺
将(R)-2-氨基-1-((S)-3-氟-吡咯烷-1-基)-丙-1-酮三氟乙酸盐(来自步骤2的粗产物)溶解于乙腈(4ml),向其中然后添加2-(6-氯-1-甲基-1H-吲唑-3-基)-5-(2-三甲基甲硅烷基-乙氧基甲基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-羧酸(60mg,0.13mmol)、O-苯并三唑-1-基-N,N,N’,N’-四甲基脲鎓四氟硼酸盐(63mg,0.197mmol)和N,N-二异丙基乙胺(0.092ml,0.52mmol)。将反应混合物在室温搅拌18小时,然后添加水和乙酸乙酯。分离各层,且将水层再次以乙酸乙酯萃取。将合并的有机层以氯化钠溶液洗涤并经硫酸钠干燥。蒸发后,将残余物通过硅胶色谱(乙酸乙酯/己烷)纯化得到55mg(70%)的2-(6-氯-1-甲基-1H-吲唑-3-基)-5-(2-三甲基甲硅烷基-乙氧基甲基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-羧酸[(R)-2-((S)-3-氟-吡咯烷-1-基)-1-甲基-2-氧代-乙基]-酰胺。1H NMR(300MHz,CDCl3)δ:9.29(s,1H),8.88-8.93(m,1H),8.85(d,J=8.1Hz,1H),8.32(s,1H),7.43-7.46(m,1H),7.35-7.39(m,1H),5.70-5.74(m,2H),5.21-5.26(m,1H),4.15(s,3H),3.61-4.00(m,5H),3.54-3.61(m,2H),2.06-2.46(m,2H),1.59(d,J=6.6Hz,3H),0.90-0.97(m,2H),-0.05(s,9H).
步骤4
2-(6-氯-1-甲基-1H-吲唑-3-基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-羧酸[(R)-2-((S)-3-氟-吡咯烷-1-基)-1-甲基-2-氧代-乙基]-酰胺
将2-(6-氯-1-甲基-1H-吲唑-3-基)-5-(2-三甲基甲硅烷基-乙氧基甲基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-羧酸[(R)-2-((S)-3-氟-吡咯烷-1-基)-1-甲基-2-氧代-乙基]-酰胺(54mg,0.09mmol)溶解于二氯甲烷(0.9ml)中并在冰浴中冷却。缓慢地添加三氟乙酸(0.45ml)且将反应混合物在室温搅拌2.5小时。蒸发反应混合物且将残余物悬浮于二氯甲烷(0.9ml)。添加乙二胺(0.36ml,5.4mmol)并搅拌混合物18小时。将水和然后乙酸乙酯添加至混合物。将所得沉淀经过滤、以水淋洗并高真空干燥得到24mg(58%)的2-(6-氯-1-甲基-1H-吲唑-3-基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-羧酸[(R)-2-((S)-3-氟-吡咯烷-1-基)-1-甲基-2-氧代-乙基]-酰胺。MS:(M+H)+=470;mp=269-271℃.1H NMR(300MHz,DMSO-d6)δ:9.16(s,1H),8.81-8.91(m,1H),8.53-8.62(m,1H),8.47(d,J=2.0Hz,1H),7.97(s,1H),7.25-7.33(m,1H),5.27-5.52(m,1H),4.95-5.11(m,1H),4.18(s,3H),3.96-4.12(m,1H),3.73-3.92(m,1H),3.61-3.72(m,1H),2.08-2.35(m,1H),1.38-1.48(m,3H).
实施例119.
2-(6-氯-1-甲基-1H-吲唑-3-基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-羧酸[(R)-2-((R)-3-氟-吡咯烷-1-基)-1-甲基-2-氧代-乙基]-酰胺
根据实施例118中阐述的操作制备,以(R)-3-氟-吡咯烷盐酸盐替代步骤1中的(S)-3-氟吡咯烷盐酸盐。MS:(M+H)+=470;mp=272-274℃.1H NMR(300MHz,DMSO-d6)δ:12.85-12.95(m,1H),9.15(s,1H),8.80-8.87(m,1H),8.55(d,J=8.6Hz,1H),8.46(d,J=2.5Hz,1H),7.97(d,J=1.5Hz,1H),7.24-7.32(m,1H),5.26-5.53(m,1H),4.92-5.09(m,1H),4.18(s,3H),3.67-3.95(m,2H),3.36-3.62(m,2H),2.09-2.34(m,2H),1.40-1.47(m,3H).
实施例120.
2-(6-氯-1-甲基-1H-吲唑-3-基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-羧酸[(R)-2-(3-氟-氮杂环丁烷-1-基)-1-甲基-2-氧代-乙基]-酰胺
根据实施例118中阐述的操作制备,以3-氟-氮杂环丁烷盐酸盐替代步骤1中的(S)-3-氟吡咯烷盐酸盐。MS:(M+H)+=456;mp=257-260℃.1H NMR(300MHz,DMSO-d6)δ:9.14(s,1H),8.70-8.81(m,1H),8.48(宽单峰,1H),8.42-8.53(m,1H),7.97(s,1H),7.22-7.31(m,1H),5.30-5.59(m,1H),4.20-4.85(m,4H),4.17(s,3H),3.90-4.10(m,1H),1.36-1.48(m,3H).
实施例121.
2-(6-氯-1-甲基-1H-吲唑-3-基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-羧酸[(R)-2-((R)-3-氟-吡咯烷-1-基)-1-甲基-乙基]-酰胺
步骤1
[(R)-2-((R)-3-氟-吡咯烷-1-基)-1-甲基-2-氧代-乙基]-氨基甲酸叔丁酯
步骤1
将(R)-2-叔丁氧基羰基氨基-丙酸(1.0g,5.3mmol)、1-(3-(二甲基氨基)-丙基)-3-乙基碳二亚胺(2.33g,12.2mmol)和羟基苯并三唑(1.64g,12.2mmol)溶解于DMF(50ml)中。添加(R)-3-氟吡咯烷盐酸盐(1.66g,13.2mmol)和N,N-二异丙基乙胺(2.95ml,16.9mmol),且将混合物在室温搅拌16小时。添加乙酸乙酯且将溶液以10%柠檬酸溶液洗涤三次。将有机层以碳酸氢钠溶液洗涤,其然后以乙酸乙酯反萃取四次。将合并的有机层然后进一步以氯化锂溶液、氯化钠溶液洗涤,并经硫酸钠干燥。浓缩溶液得到1.3g(94%)的[(R)-2-((R)-3-氟-吡咯烷-1-基)-1-甲基-2-氧代-乙基]-氨基甲酸叔丁酯.
步骤2
[(R)-2-((R)-3-氟-吡咯烷-1-基)-1-甲基-乙基]-氨基甲酸叔丁酯
将[(R)-2-((R)-3-氟-吡咯烷-1-基)-1-甲基-2-氧代-乙基]-氨基甲酸叔丁酯(50mg,0.19mmol)溶解于乙醚(0.8ml)中并在冰/水浴中搅拌。滴加氢化锂铝(1.0M在乙醚中,0.38ml,0.38mmol)。将反应混合物于0℃搅拌,并通过TLC监控。当判断反应完成时,添加水(15ul)、然后10%氢氧化钠溶液(23ul)和然后水(45ul)。将反应混合物温热至室温然后过滤。蒸发滤液得到47mg(99%)的[(R)-2-((R)-3-氟-吡咯烷-1-基)-1-甲基-乙基]-氨基甲酸叔丁酯。
步骤3
(R)-2-((R)-3-氟-吡咯烷-1-基)-1-甲基-乙胺二三氟乙酸盐
将[(R)-2-((R)-3-氟-吡咯烷-1-基)-1-甲基-乙基]-氨基甲酸叔丁酯(48mg,0.185mmol)溶解于二氯甲烷(1.2ml)中并在冰浴中冷却。缓慢地添加三氟乙酸(0.74ml)且将反应混合物在室温搅拌2小时,然后蒸发得到(R)-2-((R)-3-氟-吡咯烷-1-基)-1-甲基-乙胺二三氟乙酸盐,其不经进一步纯化即可使用。
步骤4
2-(6-氯-1-甲基-1H-吲唑-3-基)-5-(2-三甲基甲硅烷基-乙氧基甲基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-羧酸[(R)-2-((R)-3-氟-吡咯烷-1-基)-1-甲基-乙基]-酰胺
将(R)-2-((R)-3-氟-吡咯烷-1-基)-1-甲基-乙胺二三氟乙酸盐(来自步骤3的粗产物)溶解于乙腈(4ml)中,然后向其中添加2-(6-氯-1-甲基-1H-吲唑-3-基)-5-(2-三甲基甲硅烷基-乙氧基甲基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-羧酸(65mg,0.14mmol)、O-苯并三唑-1-基-N,N,N’,N’-四甲基脲鎓四氟硼酸盐(68mg,0.21mmol)和N,N-二异丙基乙胺(0.12ml,0.71mmol)。将反应混合物在室温搅拌18小时,且然后添加水和乙酸乙酯。分离各层,且将水层再次以乙酸乙酯萃取。将合并的有机层以氯化钠溶液洗涤并经硫酸钠干燥。蒸发后,将残余物通过硅胶色谱(甲醇/二氯甲烷)纯化得到65mg(78%)的2-(6-氯-1-甲基-1H-吲唑-3-基)-5-(2-三甲基甲硅烷基-乙氧基甲基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-羧酸[(R)-2-((R)-3-氟-吡咯烷-1-基)-1-甲基-乙基]-酰胺。(M+H)+=586.
步骤5
2-(6-氯-1-甲基-1H-吲唑-3-基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-羧酸[(R)-2-((R)-3-氟-吡咯烷-1-基)-1-甲基-乙基]-酰胺
将2-(6-氯-1-甲基-1H-吲唑-3-基)-5-(2-三甲基甲硅烷基-乙氧基甲基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-羧酸[(R)-2-((R)-3-氟-吡咯烷-1-基)-1-甲基-乙基]-酰胺(65mg,0.11mmol)溶解于二氯甲烷(0.7ml)中并在冰浴中冷却。缓慢地添加三氟乙酸(0.4ml)且将反应混合物在室温搅拌3小时。蒸发反应混合物且将残余物悬浮于二氯甲烷(1.1ml)中。添加乙二胺(0.45ml,6.65mmol)并搅拌混合物18小时。将水和然后乙酸乙酯添加至混合物。分离各层,且将水层以乙酸乙酯萃取两次。将合并的有机层以氯化钠溶液洗涤并经硫酸钠干燥。蒸发后。将残余物通过硅胶色谱(甲醇/二氯甲烷)纯化得到33mg(65%)的2-(6-氯-1-甲基-1H-吲唑-3-基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-羧酸[(R)-2-((R)-3-氟-吡咯烷-1-基)-1-甲基-乙基]-酰胺。MS(M+H)+=456;mp=233-234℃.1H NMR(300MHz,DMSO-d6)δ:12.81-12.93(m,1H),9.10(s,1H),8.44(s,1H),8.38-8.46(m,1H),8.07(d,J=8.3Hz,1H),7.99-8.03(m,1H),7.28-7.36(m,1H),4.97-5.24(m,1H),4.20-4.33(m,1H),4.17(s,3H),2.54-2.90(m,1H),2.54-2.90(m,4H),2.32-2.44(m,1H),1.66-2.13(m,2H),1.32(d,J=6.4Hz,3H).
实施例122.
2-(6-氯-1-甲基-1H-吲唑-3-基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-羧酸[(R)-2-((S)-3-氟-吡咯烷-1-基)-1-甲基-乙基]-酰胺
根据实施例121中阐述的操作制备,以(S)-3-氟吡咯烷盐酸盐替代步骤1中的(R)-3-氟吡咯烷盐酸盐。MS:(M+H)+=456;mp=251-253℃.1H NMR(300MHz,DMSO-d6)δ:12.81-12.94(m,1H),9.09(s,1H),8.43(s,1H),8.43(d,J=8.7Hz,1H),8.04-8.11(m,1H),8.01(d,J=1.1Hz,1H),7.32(dd,J=8.7,1.5Hz,1H),4.96-5.23(m,1H),4.20-4.34(m,1H),4.17(s,3H),2.58-2.93(m,5H),2.37-2.47(m,1H),1.65-2.12(m,2H),1.33(d,J=6.4Hz,3H).
实施例123.
2-(6-氯-1-甲基-1H-吲唑-3-基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-羧酸[(R)-2-(3-氟-氮杂环丁烷-1-基)-1-甲基-乙基]-酰胺
根据实施例121中阐述的操作制备,以3-氟-氮杂环丁烷盐酸盐替代步骤1中的(R)-3-氟吡咯烷盐酸盐。MS:(M+H)+=442;mp=182-185℃.1H NMR(300MHz,DMSO-d6)δ:12.76-12.96(m,1H),9.11(s,1H),8.44(s,1H),8.38-8.49(m,1H),8.05(d,J=8.3Hz,1H),8.02(d,J=1.5Hz,1H),7.29-7.35(m,1H),4.88-5.18(m,1H),4.18(s,3H),4.08-4.22(m,1H),3.48-3.73(m,2H),3.04-3.29(m,2H),2.62-2.85(m,2H),1.29(d,J=6.8Hz,3H).
实施例124.
2-(6-氯-4-氟-1-甲基-1H-吲唑-3-基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-羧酸[(R)-2-(3-氰基-氮杂环丁烷-1-基)-1-甲基-2-氧代-乙基]-酰胺
步骤1
6-氯-4-氟-1H-吲唑
将4-氯-2,6-二氟-苯甲醛(15g,85mmol)溶解于1,2-二甲氧基乙烷(170ml)中。然后添加O-甲基-羟基胺盐酸盐(7.1g,85mmol)和碳酸钾(12.9g,93.5mmol),并于35℃搅拌混合物24小时。过滤反应混合物,以二氯甲烷淋洗,蒸发并再溶解于DMF(170ml)中。添加肼(2.9ml93.5mmol),于100℃搅拌反应混合物1小时。冷却后,添加水和乙酸乙酯。分离各层,将水层以乙酸乙酯萃取两次。将合并的有机层以水和氯化钠溶液洗涤,然后以硫酸钠干燥。蒸发溶剂留下固体,其通过硅胶色谱(乙醚/己烷)纯化得到7g(49%)的6-氯-4-氟-1H-吲唑。(M+H)+=171.
步骤2
6-氯-4-氟-3-碘-1H-吲唑
将6-氯-4-氟-1H-吲唑(7.6g,44.6mmol)溶解于DMF(110ml)中。添加碘(22.6g,89.1mmol),接着添加氢氧化钾(9.5g,169mmol)。将反应混合物在室温搅拌1.5小时。添加水、1M硫代硫酸钠溶液和乙醚。分离各层,且将水层以乙醚再萃取一次。将有机层以水和氯化钠溶液洗涤,且然后以硫酸钠干燥。蒸发溶剂得到11.16g(85%)的6-氯-4-氟-3-碘-1H-吲唑,为浅棕色固体。(M-H)-=295.
步骤3
6-氯-4-氟-3-三丁基甲锡烷基-1H-吲唑
将6-氯-4-氟-3-碘-1H-吲唑(10.1g,34.1mmol)溶解于THF(170ml)中。将反应烧瓶在水浴中搅拌,并添加氢化钠(60%分散液,1.64g,40.9mmol)。将混合物搅拌15分钟,然后在冰/盐浴中冷却至-15℃。滴加异丙基氯化镁(2.0M在THF中,20.6ml,41.2mmol)。40分钟后,缓慢地添加三丁基氯化锡(11.6ml,42.6mmol)并让反应混合物温热至室温。再搅拌2小时后,添加氯化铵溶液和乙酸乙酯。分离各层,且将水层再次以乙酸乙酯萃取。将合并的有机层以氯化钠溶液洗涤并经硫酸钠干燥。蒸发溶剂得到6-氯-4-氟-3-三丁基甲锡烷基-1H-吲唑,为油状物,其直接用于后续步骤中。
步骤4
2-(6-氯-4-氟-1H-吲唑-3-基)-5-(2-三甲基甲硅烷基-乙氧基甲基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-甲醛
将2-溴-5-(2-三甲基甲硅烷基-乙氧基甲基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-甲醛(7.6g,18.6mmol)和6-氯-4-氟-3-三丁基甲锡烷基-1H-吲唑(来自步骤3的粗产物)溶解于DMF(180ml)中,并以Ar气冲洗。添加四(三苯基膦)钯(1.07g,0.93mmol)且然后添加碘化铜(707mg,3.71mmol),且塞上烧瓶且在90℃油浴中搅拌20小时。冷却反应混合物并添加水、乙酸乙酯和碳酸氢钠溶液。分离各层,且将水层以乙酸乙酯萃取两次。将合并的有机层以水和氯化钠溶液洗涤,然后以硫酸钠干燥。蒸发后,将残余物通过硅胶色谱(甲醇/二氯甲烷)纯化,接着以乙醚/己烷研磨得到3.9g(47%)的2-(6-氯-4-氟-1H-吲唑-3-基)-5-(2-三甲基甲硅烷基-乙氧基甲基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-甲醛。(M+H)+=446.
步骤5
2-(6-氯-4-氟-1-甲基-1H-吲唑-3-基)-5-(2-三甲基甲硅烷基-乙氧基甲基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-甲醛
将2-(6-氯-4-氟-1H-吲唑-3-基)-5-(2-三甲基甲硅烷基-乙氧基甲基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-甲醛(0.5g,1.12mmol)溶解于DMF(5.6ml)中并在冰浴中冷却。小心地添加氢化钠(60%分散液,67mg,1.68mmol)。搅拌混合物10分钟,然后添加碘甲烷(84ul,1.35mmol),且反应混合物温热至室温并搅拌18小时。将水和乙酸乙酯添加至反应混合物。分离各层,且将水层以乙酸乙酯萃取两次。将合并的有机层以水和氯化钠溶液洗涤,并经硫酸钠干燥。蒸发后,将剩余的残余物通过硅胶色谱(乙酸乙酯/二氯甲烷)纯化得到257mg(50%)的2-(6-氯-4-氟-1-甲基-1H-吲唑-3-基)-5-(2-三甲基甲硅烷基-乙氧基甲基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-甲醛。(M+H)+=460.
步骤6
2-(6-氯-4-氟-1-甲基-1H-吲唑-3-基)-5-(2-三甲基甲硅烷基-乙氧基甲基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-羧酸
将2-(6-氯-4-氟-1-甲基-1H-吲唑-3-基)-5-(2-三甲基甲硅烷基-乙氧基甲基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-甲醛(255mg,0.55mmol)溶解于THF(8.3ml)和水(2.8ml)中。添加氨基磺酸(517mg,5.3mmol)。将反应烧瓶在冰/水浴中冷却并缓慢地添加亚氯酸钠(104mg,1.15mmol)和磷酸二氢钾(1.45g,10.6mmol)在水(8ml)中的溶液中。1小时后,将反应混合物倒入乙酸乙酯和水中。分离各层,且将水层再次以乙酸乙酯萃取。将合并的有机层以水和氯化钠溶液洗涤,并经硫酸钠干燥。蒸发溶剂得到270mg的2-(6-氯-4-氟-1-甲基-1H-吲唑-3-基)-5-(2-三甲基甲硅烷基-乙氧基甲基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-羧酸,为浅黄色固体。(M+H)+=476.
步骤7
1-((R)-2-氨基-丙酰基)-氮杂环丁烷-3-甲腈三氟乙酸盐
将[(R)-2-(3-氰基氮杂环丁烷-1-基)-1-甲基-2-氧代-乙基]-氨基甲酸叔丁酯(47mg,0.185mmol)溶解于二氯甲烷(1ml)中并在冰浴中冷却。缓慢地添加三氟乙酸(0.5ml)且将反应混合物在室温搅拌2小时,然后蒸发并高真空干燥得到1-((R)-2-氨基-丙酰基)-氮杂环丁烷-3-甲腈三氟乙酸盐,其不经进一步纯化即可使用。
步骤8
2-(6-氯-4-氟-1-甲基-1H-吲唑-3-基)-5-(2-三甲基甲硅烷基-乙氧基甲基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-羧酸[(R)-2-(3-氰基-氮杂环丁烷-1-基)-1-甲基-2-氧代-乙基]-酰胺
将1-((R)-2-氨基-丙酰基)-氮杂环丁烷-3-甲腈三氟乙酸盐(来自步骤7的粗产物)溶解于乙腈(2ml),向其中然后添加2-(6-氯-4-氟-1-甲基-1H-吲唑-3-基)-5-(2-三甲基甲硅烷基-乙氧基甲基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-羧酸(80mg,0.168mmol)、O-苯并三唑-1-基-N,N,N’,N’-四甲基脲鎓四氟硼酸盐(81mg,0.252mmol)和N,N-二异丙基乙胺(0.15ml,0.84mmol)。将反应混合物在室温搅拌18小时且然后添加水和乙酸乙酯。分离各层,且将水层再次以乙酸乙酯萃取。将合并的有机层以氯化钠溶液洗涤并经硫酸钠干燥。蒸发后,将残余物通过硅胶色谱(甲醇/二氯甲烷)纯化得到84mg(82%)的2-(6-氯-4-氟-1-甲基-1H-吲唑-3-基)-5-(2-三甲基甲硅烷基-乙氧基甲基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-羧酸[(R)-2-(3-氰基-氮杂环丁烷-1-基)-1-甲基-2-氧代-乙基]-酰胺。(M+Na)+=633.
步骤9
2-(6-氯-4-氟-1-甲基-1H-吲唑-3-基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-羧酸[(R)-2-(3-氰基-氮杂环丁烷-1-基)-1-甲基-2-氧代-乙基]-酰胺
将2-(6-氯-4-氟-1-甲基-1H-吲唑-3-基)-5-(2-三甲基甲硅烷基-乙氧基甲基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-羧酸[(R)-2-(3-氰基-氮杂环丁烷-1-基)-1-甲基-2-氧代-乙基]-酰胺(84mg,0.137mmol)悬浮于二氯甲烷(2ml)中并在冰浴中冷却。缓慢地添加三氟乙酸(0.9ml)且将反应混合物在室温搅拌3小时,然后蒸发。将残余物溶解于二氯甲烷(1.4ml)中并添加乙二胺(0.55ml,8.25mmol)。将反应混合物搅拌8小时。添加水,得到浑浊混合物,将其以乙酸乙酯萃取八次。将合并的有机层以氯化钠溶液洗涤并经硫酸钠干燥。将干燥试剂经过滤并以10%甲醇/二氯甲烷淋洗,并蒸发得到残余物。将其与在水层中出现的固体合并。将合并的物质通过硅胶色谱(甲醇/二氯甲烷)纯化得到32mg(48%)的2-(6-氯-4-氟-1-甲基-1H-吲唑-3-基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-羧酸[(R)-2-(3-氰基-氮杂环丁烷-1-基)-1-甲基-2-氧代-乙基]-酰胺。(M+H)+=481;mp=267-268℃.1HNMR(300MHz,DMSO-d6)δ:9.00(s,1H),8.54(d,J=7.2Hz,1H),8.49(d,J=10.6Hz,1H),7.86-7.90(m,1H),7.18(d,J=10.2Hz,1H),4.42-4.69(m,3H),4.18(s,3H),4.07-4.17(m,1H),3.95-4.05(m,1H),3.76-3.87(m,1H),1.32-1.41(m,3H).
实施例125.
2-(6-氯-1-甲基-1H-吲唑-3-基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-羧酸[2-(3-氰基-吡咯烷-1-基)-1-甲基-乙基]-酰胺
步骤1
[2-(6-氯-1-甲基-1H-吲唑-3-基)-5-(2-三甲基甲硅烷基-乙氧基甲基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-基]-(2-甲基-氮丙啶-1-基)-甲酮
将2-(6-氯-1-甲基-1H-吲唑-3-基)-5-((2-(三甲基甲硅烷基)乙氧基)甲基)-5H-吡咯并[3,2-b]吡嗪-7-羧酸(100mg,0.218mmol)悬浮于二氯甲烷(2.2ml)中。添加4-二甲基氨基吡啶(5.3mg,0.044mmol)、N,N-二异丙基乙胺(76ul,0.44mmol)和然后1-(3-(二甲基氨基)-丙基)-3-乙基碳二亚胺(84mg,0.44mmol)。搅拌溶液5分钟,然后在冰浴中冷却。添加2-甲基氮丙啶(23ul,0.33mmol)和将反应混合物温热至室温。继续搅拌直到通过TLC判断完成。然后添加水、稀HCl和乙酸乙酯。将水层再以乙酸乙酯萃取一次,且将合并的有机层以碳酸氢钠溶液洗涤并经硫酸钠干燥。蒸发后,将残余物通过硅胶色谱(乙酸乙酯/己烷)纯化得到70mg(64%)的[2-(6-氯-1-甲基-1H-吲唑-3-基)-5-(2-三甲基甲硅烷基-乙氧基甲基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-基]-(2-甲基-氮丙啶-1-基)-甲酮。1HNMR(300MHz,CDCl3)δppm9.23(s,1H)8.76(d,J=8.7Hz,1H)8.33(s,1H)7.44(s,1H)7.24(d,J=8.7Hz,1H)5.73(s,2H)4.14(s,3H)3.56-3.65(m,6H)2.80-2.91(m,1H)2.59(d,J=6.0Hz,1H)2.33(d,J=3.8Hz,1H)1.41(d,J=5.3Hz,3H)0.89-0.99(m,2H)-0.05(s,9H).
步骤2
2-(6-氯-1-甲基-1H-吲唑-3-基)-5-(2-三甲基甲硅烷基-乙氧基甲基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-羧酸[2-(3-氰基-吡咯烷-1-基)-1-甲基-乙基]-酰胺
将[2-(6-氯-1-甲基-1H-吲唑-3-基)-5-(2-三甲基甲硅烷基-乙氧基甲基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-基]-(2-甲基-氮丙啶-1-基)-甲酮(70mg,0.14mmol)溶解于1:1THF:乙腈(1.5ml)中。添加3-氰基吡咯烷盐酸盐(28mg,0.21mmol)和N,N-二异丙基乙胺(37ul,0.21mmol)并在微波反应器中于120℃加热反应混合物2小时。再添加0.5当量的3-氰基吡咯烷盐酸盐和N,N-二异丙基乙胺,且再重复加热两次。然后将水和乙酸乙酯添加至冷却的溶液中。将水层以乙酸乙酯萃取两次,且将合并的有机物以氯化钠溶液洗涤,并经硫酸钠干燥。蒸发溶剂后,将粗残余物通过硅胶色谱(乙酸乙酯/二氯甲烷)纯化得到21mg(25%)的2-(6-氯-1-甲基-1H-吲唑-3-基)-5-(2-三甲基甲硅烷基-乙氧基甲基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-羧酸[2-(3-氰基-吡咯烷-1-基)-1-甲基-乙基]-酰胺。(M+H)+=593.
步骤3
2-(6-氯-1-甲基-1H-吲唑-3-基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-羧酸[2-(3-氰基-吡咯烷-1-基)-1-甲基-乙基]-酰胺
将2-(6-氯-1-甲基-1H-吲唑-3-基)-5-(2-三甲基甲硅烷基-乙氧基甲基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-羧酸[2-(3-氰基-吡咯烷-1-基)-1-甲基-乙基]-酰胺(37mg,0.062mmol)溶解于二氯甲烷(0.8ml)中且在冰浴中冷却。缓慢地添加三氟乙酸(0.4ml)且将反应混合物在室温搅拌2小时。蒸发反应混合物且将残余物溶解于二氯甲烷(1.2ml)中。添加乙二胺(0.25ml,3.7mmol)并搅拌混合物18小时。将水和然后乙酸乙酯添加至混合物。分离各层,且将水层以乙酸乙酯萃取两次。将合并的有机层以氯化钠溶液洗涤并经硫酸钠干燥。蒸发后,将残余物通过硅胶色谱(甲醇/二氯甲烷)纯化得到15mg(52%)的2-(6-氯-1-甲基-1H-吲唑-3-基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-羧酸[2-(3-氰基-吡咯烷-1-基)-1-甲基-乙基]-酰胺。MS:(M+H)+=463;mp=206-209℃.1H NMR(300MHz,DMSO-d6)δ:12.83-12.94(m,1H),9.10(s,1H),8.38-8.51(m,2H),8.04-8.13(m,1H),7.99-8.04(m,1H),7.30-7.39(m,1H),4.20-4.36(m,1H),4.18(s,3H),3.07-3.22(m,1H),2.53-2.88(m,5H),1.99-2.15(m,1H),1.74-1.92(m,1H),1.33(d,J=6.4Hz,3H).
实施例126.
2-(6-氯-1-甲基-1H-吲唑-3-基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-羧酸[(R)-2-(3-氰基-氮杂环丁烷-1-基)-1-甲基-乙基]-酰胺
步骤1
(R)-2-甲基-1-(4-硝基-苯磺酰基)-氮丙啶
将4-硝基苯-1-磺酰氯(6.9g,31mmol)溶解于乙腈(8ml)中并在冰浴中搅拌。缓慢地添加(R)-2-氨基丙烷-1-醇(1g,13.3mmol)在吡啶(5ml)中的溶液且搅拌反应混合物2小时。添加乙酸乙酯(25ml)和水(10ml)且搅拌反应混合物10分钟。分离各层,且将有机层以1M柠檬酸溶液洗涤两次并以水洗涤一次。将有机层冷却至10℃且添加7mL的水,接着滴加N,N-二异丙基乙胺(3.7ml,21.3mmol)。搅拌1小时后,分离各层,且将水层以乙酸乙酯萃取。将合并的有机物以1M柠檬酸溶液洗涤两次并以水洗涤两次。然后添加异丙醇(70ml),缓慢地蒸发溶剂留下大部分异丙醇。在从异丙醇重结晶后得到(R)-2-甲基-1-(4-硝基-苯磺酰基)-氮丙啶2.2g(69%)。1H NMR(300MHz,CDCl3)δ:8.40(d,J=9.1Hz,2H),8.16(d,J=9.1Hz,2H),2.92-3.04(m,1H),2.74(d,J=7.2Hz,1H),2.13(d,J=4.5Hz,1H),1.30(d,J=5.7Hz,3H).
步骤2
N-[(R)-2-(3-氰基-氮杂环丁烷-1-基)-1-甲基-乙基]-4-硝基-苯磺酰胺
将(R)-2-甲基-1-(4-硝基-苯磺酰基)-氮丙啶(0.2g,0.83mmol)溶解于THF(1ml)中。添加3-氰基氮杂环丁烷盐酸盐(117mg,0.99mmol)和N,N-二异丙基乙胺(0.2ml,1.16mmol)且搅拌反应混合物64小时。然后添加水和乙酸乙酯。将水层以乙酸乙酯萃取两次,将合并的有机物以氯化钠溶液洗涤,并经硫酸钠干燥。蒸发后,将残余物通过硅胶色谱(乙酸乙酯/己烷)纯化得到133mg(49%)的N-[(R)-2-(3-氰基-氮杂环丁烷-1-基)-1-甲基-乙基]-4-硝基-苯磺酰胺。(M+H)+=325.
步骤3
N-[(R)-2-(3-氰基-氮杂环丁烷-1-基)-1-甲基-乙基]-4-硝基-苯磺酰胺
将N-[(R)-2-(3-氰基-氮杂环丁烷-1-基)-1-甲基-乙基]-4-硝基-苯磺酰胺(133mg,0.41mmol)溶解于DMF(2ml)中。添加一缩二碳酸二叔丁酯(98mg,0.45mmol)和4-二甲基氨基吡啶(55mg,0.45mmol)且搅拌反应混合物6小时。然后添加硫苯酚(63ul,0.615mmol)和碳酸钾(170mg,1.23mmol)且于0℃让反应混合物静置16小时。然后添加水、氢氧化钠溶液和乙酸乙酯。将水层再以乙酸乙酯萃取一次,且将合并的有机层以氯化钠溶液洗涤并经硫酸钠干燥。蒸发后,将残余物通过硅胶色谱(乙酸乙酯/己烷)纯化得到75mg(76%)的[(R)-2-(3-氰基-氮杂环丁烷-1-基)-1-甲基-乙基]-氨基甲酸叔丁酯。(M+H)+=240.
步骤4
1-((R)-2-氨基-丙基)-氮杂环丁烷-3-甲腈二三氟乙酸盐
将[(R)-2-(3-氰基-氮杂环丁烷-1-基)-1-甲基-乙基]-氨基甲酸叔丁酯(35mg,0.146mmol)溶解于二氯甲烷(1ml)中并在冰浴中冷却。缓慢地添加三氟乙酸(0.45ml)且将反应混合物在室温搅拌2小时,然后蒸发并高真空干燥得到1-((R)-2-氨基-丙基)-氮杂环丁烷-3-甲腈二三氟乙酸盐,其不经进一步纯化即可使用。
步骤5
2-(6-氯-1-甲基-1H-吲唑-3-基)-5-(2-三甲基甲硅烷基-乙氧基甲基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-羧酸[(R)-2-(3-氰基-氮杂环丁烷-1-基)-1-甲基-乙基]-酰胺
将1-((R)-2-氨基-丙基)-氮杂环丁烷-3-甲腈二三氟乙酸盐(来自步骤4的粗产物)溶解于乙腈(1.5ml)中,向其中然后添加2-(6-氯-1-甲基-1H-吲唑-3-基)-5-(2-三甲基甲硅烷基-乙氧基甲基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-羧酸(60mg,0.132mmol)、O-苯并三唑-1-基-N,N,N’,N’-四甲基脲鎓四氟硼酸盐(70mg,0.22mmol和N,N-二异丙基乙胺(0.13ml,0.73mmol)。将反应混合物在室温搅拌18小时,且然后添加水和乙酸乙酯。分离各层,将水层再次以乙酸乙酯萃取。将合并的有机层以氯化钠溶液洗涤并经硫酸钠干燥。蒸发后,将残余物通过硅胶色谱(甲醇/二氯甲烷)纯化得到58mg(64%)的2-(6-氯-1-甲基-1H-吲唑-3-基)-5-(2-三甲基甲硅烷基-乙氧基甲基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-羧酸[(R)-2-(3-氰基-氮杂环丁烷-1-基)-1-甲基-乙基]-酰胺。(M+H)+=579.
步骤6
2-(6-氯-1-甲基-1H-吲唑-3-基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-羧酸[(R)-2-(3-氰基-氮杂环丁烷-1-基)-1-甲基-乙基]-酰胺
将2-(6-氯-1-甲基-1H-吲唑-3-基)-5-(2-三甲基甲硅烷基-乙氧基甲基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-羧酸[(R)-2-(3-氰基-氮杂环丁烷-1-基)-1-甲基-乙基]-酰胺(58mg,0.10mmol)溶解于二氯甲烷(1.4ml)中并在冰浴中冷却。缓慢地添加三氟乙酸(0.6ml)且将反应混合物在室温搅拌5小时。蒸发反应混合物且将残余物溶解于二氯甲烷(1ml)。添加乙二胺(0.40ml,6.0mmol)并搅拌混合物18小时。将水和然后乙酸乙酯添加至混合物。分离各层,且将水层以乙酸乙酯萃取两次。将合并的有机层以氯化钠溶液洗涤并经硫酸钠干燥。蒸发后,将残余物通过硅胶色谱(甲醇/二氯甲烷)纯化得到29mg(64%)的2-(6-氯-1-甲基-1H-吲唑-3-基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-羧酸[(R)-2-(3-氰基-氮杂环丁烷-1-基)-1-甲基-乙基]-酰胺。MS:(M+H)+=449;mp=235-238℃.1H NMR(300MHz,DMSO-d6)δ:9.10(s,1H),8.44(d,J=8.7Hz,1H),8.43(s,1H),8.01(d,J=1.5Hz,1H),8.02(d,J=8.3Hz,1H),7.34(dd,J=8.7,1.5Hz,1H),4.18(s,3H),4.04-4.16(m,1H),3.36-3.53(m,4H),3.28(d,J=7.9Hz,1H),2.60-2.68(m,2H),1.28(d,J=6.8Hz,3H).
实施例127.
2-(6-氯-4-氟-1-甲基-1H-吲唑-3-基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-羧酸异丙基酰胺
步骤1
2-(6-氯-4-氟-1-甲基-1H-吲唑-3-基)-5-(2-三甲基甲硅烷基-乙氧基甲基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-羧酸异丙基酰胺
将2-(6-氯-4-氟-1-甲基-1H-吲唑-3-基)-5-(2-三甲基甲硅烷基-乙氧基甲基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-羧酸(59mg,0.124mmol)、O-苯并三唑-1-基-N,N,N’,N’-四甲基脲鎓四氟硼酸盐(60mg,0.186mmol)、N,N-二异丙基乙胺(0.11ml,0.62mmol)和异丙胺(11ul,0.124mmol)一起添加至乙腈(1.3ml)中。将反应混合物在室温搅拌18小时,然后添加水和乙酸乙酯。分离各层,且将水层以乙酸乙酯萃取两次。将合并的有机层以氯化钠溶液洗涤并经硫酸钠干燥。蒸发后,将残余物通过硅胶色谱(乙酸乙酯/己烷)纯化得到46mg(72%)的2-(6-氯-4-氟-1-甲基-1H-吲唑-3-基)-5-(2-三甲基甲硅烷基-乙氧基甲基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-羧酸异丙基酰胺。(M+H)+=517.
步骤2
2-(6-氯-4-氟-1-甲基-1H-吲唑-3-基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-羧酸异丙基酰胺
将2-(6-氯-4-氟-1-甲基-1H-吲唑-3-基)-5-(2-三甲基甲硅烷基-乙氧基甲基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-羧酸异丙基酰胺(46mg,0.09mmol)溶解于二氯甲烷(1.2ml)中并在冰浴中冷却。缓慢地添加三氟乙酸(0.6ml)且将反应混合物在室温搅拌2小时。蒸发反应混合物且将残余物溶解于二氯甲烷(1ml)中并添加乙二胺(0.36ml,5.3mmol)且搅拌混合物18小时。将水和然后乙酸乙酯添加至混合物。将所得沉淀经过滤,以水、乙醚和乙酸乙酯淋洗并静置。将有机滤液经分离,以氯化钠溶液洗涤,并经硫酸钠干燥。蒸发后,将残余物与上述收集的沉淀合并。将固体经高真空干燥得到34mg(98%)的2-(6-氯-4-氟-1-甲基-1H-吲唑-3-基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-羧酸异丙基酰胺。MS:(M+H)+=387;mp=347-349℃.1H NMR(300MHz,DMSO-d6)δ:9.01(s,1H),8.42(s,1H),8.22-8.33(m,1H),7.88(s,1H),7.20-7.32(m,1H),4.13-4.30(m,1H),4.18(s,3H),1.24(d,J=6.4Hz,6H).
实施例128.
2-[6-氯-1-(2-二甲基氨基-乙基)-4-氟-1H-吲唑-3-基]-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-羧酸异丙基酰胺盐酸盐
步骤1
2-[6-氯-1-(2-二甲基氨基-乙基)-4-氟-1H-吲唑-3-基]-5-(2-三甲基甲硅烷基-乙氧基甲基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-甲醛
将2-(6-氯-4-氟-1H-吲唑-3-基)-5-(2-三甲基甲硅烷基-乙氧基甲基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-甲醛(100mg,0.22mmol)溶解于DMF(0.5ml)中并在冰浴中冷却。小心地添加氢化钠(60%分散液,22mg,0.56mmol)。搅拌混合物10分钟,然后添加二甲基氨基乙基氯盐酸盐(36mg,0.25mmol)和碘化钾(4mg,0.022mmol),且然后将反应混合物温热至室温并于50℃搅拌过夜。冷却至室温后,将水和乙酸乙酯添加至反应混合物。分离各层,且将水层以乙酸乙酯萃取两次。将合并的有机层以水和氯化钠溶液洗涤,并经硫酸钠干燥。蒸发后,将残余物通过硅胶色谱(甲醇/二氯甲烷)纯化得到46mg(40%)的2-[6-氯-1-(2-二甲基氨基-乙基)-4-氟-1H-吲唑-3-基]-5-(2-三甲基甲硅烷基-乙氧基甲基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-甲醛。(M+H)+=517.
步骤2
2-[6-氯-1-(2-二甲基氨基-乙基)-4-氟-1H-吲唑-3-基]-5-(2-三甲基甲硅烷基-乙氧基甲基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-羧酸
将2-[6-氯-1-(2-二甲基氨基-乙基)-4-氟-1H-吲唑-3-基]-5-(2-三甲基甲硅烷基-乙氧基甲基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-甲醛(46mg,0.09mmol)溶解于THF(1.3ml)中并添加水(0.4ml)和氨基磺酸(83mg,0.85mmol)。缓慢地添加亚氯酸钠(17mg,0.185mmol)和磷酸二氢钾(232mg,1.7mmol)在水(1.4ml)中的溶液。1小时后,将反应混合物倒入乙酸乙酯和水中。将pH值调节至6,分离各层,且将水层以乙酸乙酯萃取五次。将合并的有机层经硫酸钠干燥并浓缩得到53mg的2-[6-氯-1-(2-二甲基氨基-乙基)-4-氟-1H-吲唑-3-基]-5-(2-三甲基甲硅烷基-乙氧基甲基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-羧酸。
步骤3
2-[6-氯-1-(2-二甲基氨基-乙基)-4-氟-1H-吲唑-3-基]-5-(2-三甲基甲硅烷基-乙氧基甲基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-羧酸异丙基酰胺
将2-[6-氯-1-(2-二甲基氨基-乙基)-4-氟-1H-吲唑-3-基]-5-(2-三甲基甲硅烷基-乙氧基甲基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-羧酸(50mg,0.094mmol)、O-苯并三唑-1-基-N,N,N’,N’-四甲基脲鎓四氟硼酸盐(45mg,0.14mmol)、N,N-二异丙基乙胺(0.08ml,0.47mmol)和异丙胺(10ul,0.11mmol)一起添加至乙腈(1ml)中。将反应混合物在室温搅拌18小时,然后添加水和乙酸乙酯。分离各层,且将水层以乙酸乙酯萃取两次。将合并的有机层以氯化钠溶液洗涤并经硫酸钠干燥。蒸发后,将残余物通过硅胶色谱(甲醇/二氯甲烷)纯化得到35mg(65%)的2-[6-氯-1-(2-二甲基氨基-乙基)-4-氟-1H-吲唑-3-基]-5-(2-三甲基甲硅烷基-乙氧基甲基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-羧酸异丙基酰胺。
步骤4
2-[6-氯-1-(2-二甲基氨基-乙基)-4-氟-1H-吲唑-3-基]-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-羧酸异丙基酰胺盐酸盐
将2-[6-氯-1-(2-二甲基氨基-乙基)-4-氟-1H-吲唑-3-基]-5-(2-三甲基甲硅烷基-乙氧基甲基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-羧酸异丙基酰胺(35mg,0.06mmol)溶解于二氯甲烷(1.6ml)中并在冰浴中冷却。缓慢地添加三氟乙酸(0.8ml)且将反应混合物在室温搅拌2小时。蒸发反应混合物且将残余物溶解于二氯甲烷(1ml)中。添加乙二胺(0.25ml,3.7mmol)并搅拌混合物18小时。将水和然后乙酸乙酯添加至混合物。分离各层,且将水层以乙酸乙酯萃取三次。将合并的有机层以氯化钠溶液洗涤,经硫酸钠干燥并蒸发。将残余物通过硅胶色谱(甲醇/二氯甲烷)纯化。将由此分离的产物溶解于甲醇/二氯甲烷,并以4当量的在1,4-二噁烷中的4M HCl处理。蒸发溶剂提供固体,其真空干燥得到18mg(62%)的2-[6-氯-1-(2-二甲基氨基-乙基)-4-氟-1H-吲唑-3-基]-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-羧酸异丙基酰胺盐酸盐。MS:(M+H)+=444;mp=281-283℃.1H NMR(300MHz,DMSO-d6)δ:10.17-10.33(m,1H),9.08(s,1H),8.44(d,J=3.0Hz,1H),8.26(d,J=7.9Hz,1H),8.03-8.08(m,1H),7.34(d,J=10.6Hz,1H),4.94-5.05(m,2H),4.14-4.30(m,1H),3.66-3.77(m,2H),2.89(d,J=4.5Hz,6H),1.24(d,J=6.8Hz,6H).
实施例129.
2-[6-氯-4-氟-1-(2-吗啉-4-基-乙基)-1H-吲唑-3-基]-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-羧酸异丙基酰胺盐酸盐
步骤1
2-(6-氯-4-氟-1H-吲唑-3-基)-5-(2-三甲基甲硅烷基-乙氧基甲基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-羧酸
将2-(6-氯-4-氟-1H-吲唑-3-基)-5-(2-三甲基甲硅烷基-乙氧基甲基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-甲醛(139mg,0.31mmol)溶解于THF(4.7ml)和水(1.6ml)中并添加氨基磺酸(291mg,3.0mmol)。缓慢地添加亚氯酸钠(17mg,0.185mmol)和磷酸二氢钾(232mg,1.7mmol)在水(1.4ml)中的溶液。1小时后,将反应混合物倒入乙酸乙酯和水中。分离各层,且将水层再次以乙酸乙酯萃取。将合并的有机层经硫酸钠干燥并浓缩得到136mg的2-(6-氯-4-氟-1H-吲唑-3-基)-5-(2-三甲基甲硅烷基-乙氧基甲基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-羧酸。
步骤2
2-(6-氯-4-氟-1H-吲唑-3-基)-5-(2-三甲基甲硅烷基-乙氧基甲基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-羧酸异丙基酰胺
将2-(6-氯-4-氟-1H-吲唑-3-基)-5-(2-三甲基甲硅烷基-乙氧基甲基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-羧酸(140mg,0.30mmol)、O-苯并三唑-1-基-N,N,N’,N’-四甲基脲鎓四氟硼酸盐(146mg,0.46mmol)、N,N-二异丙基乙胺(0.27ml,1.52mmol)和异丙胺(31ul,0.36mmol)一起添加至乙腈(1ml)中。将反应混合物在室温搅拌18小时,然后添加水和乙酸乙酯。分离各层,且将水层以乙酸乙酯萃取两次。将合并的有机层以氯化钠溶液洗涤并经硫酸钠干燥。蒸发后,将残余物通过硅胶色谱(甲醇/二氯甲烷)纯化得到77mg(51%)的2-(6-氯-4-氟-1H-吲唑-3-基)-5-(2-三甲基甲硅烷基-乙氧基甲基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-羧酸异丙基酰胺。
步骤3
2-[6-氯-4-氟-1-(2-吗啉-4-基-乙基)-1H-吲唑-3-基]-5-(2-三甲基甲硅烷基-乙氧基甲基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-羧酸异丙基酰胺
将2-(6-氯-4-氟-1H-吲唑-3-基)-5-(2-三甲基甲硅烷基-乙氧基甲基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-羧酸异丙基酰胺(77mg,0.15mmol)溶解于DMF(2.5ml)中并在冰浴中冷却。小心地添加氢化钠(60%分散液,8mg,0.20mmol)。搅拌混合物15分钟,然后再添加氢化钠(60%分散液,10mg,0.25mmol)和4-(2-溴乙基)吗啉盐酸盐(42mg,0.18mmol)。将反应混合物温热至室温并搅拌过夜。将水、碳酸氢钠溶液和乙酸乙酯添加至反应混合物。分离各层,且将水层以乙酸乙酯萃取三次。将合并的有机层以水和氯化钠溶液洗涤,并经硫酸钠干燥。蒸发后,将残余物通过硅胶色谱纯化(甲醇/二氯甲烷)得到66mg(70%)的2-[6-氯-4-氟-1-(2-吗啉-4-基-乙基)-1H-吲唑-3-基]-5-(2-三甲基甲硅烷基-乙氧基甲基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-羧酸异丙基酰胺。
步骤4
2-[6-氯-4-氟-1-(2-吗啉-4-基-乙基)-1H-吲唑-3-基]-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-羧酸异丙基酰胺盐酸盐
将2-[6-氯-4-氟-1-(2-吗啉-4-基-乙基)-1H-吲唑-3-基]-5-(2-三甲基甲硅烷基-乙氧基甲基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-羧酸异丙基酰胺(66mg,0.107mmol)溶解于二氯甲烷(1.4ml)中并在冰浴中冷却。缓慢地添加三氟乙酸(0.7ml)且将反应混合物在室温搅拌2小时。蒸发反应混合物且将残余物溶解于二氯甲烷(1ml)中。添加乙二胺(0.43ml,6.4mmol)且搅拌混合物18小时。将水和然后乙酸乙酯添加至混合物。分离各层,将水层以乙酸乙酯萃取三次。将合并的有机层以氯化钠溶液洗涤,经硫酸钠干燥并蒸发。将残余物通过硅胶色谱(甲醇/二氯甲烷)纯化。将由此分离的产物溶解于甲醇/二氯甲烷中,并以2当量的在1,4-二噁烷中的4M HCl处理。蒸发溶剂提供固体,其真空干燥得到40mg(72%)的2-[6-氯-4-氟-1-(2-吗啉-4-基-乙基)-1H-吲唑-3-基]-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-羧酸异丙基酰胺盐酸盐。MS:(M+H)+=486;mp=190-195℃.1H NMR(300MHz,DMSO-d6)δ:12.86-12.98(m,1H),10.92-11.17(m,1H),9.06(s,1H),8.45(d,J=3.0Hz,1H),8.26(d,J=7.9Hz,1H),8.05(s,1H),7.35(d,J=10.6Hz,1H),5.05(宽单峰,2H),4.14-4.30(m,1H),3.93-4.09(m,2H),3.68-3.85(m,4H),3.54-3.64(m,2H),3.11-3.30(m,2H),1.24(d,J=6.4Hz,6H).
实施例130.
2-[6-氯-1-(3-二甲基氨基-丙基)-4-氟-1H-吲唑-3-基]-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-羧酸异丙基酰胺
根据实施例128中阐述的操作制备,以二甲基氨基丙基氯盐酸盐替代步骤1中的二甲基氨基乙基氯盐酸盐。最终产物的盐不形成在步骤4中。MS:(M+H)+=458;;mp=249-255℃.1H NMR(300MHz,DMSO-d6)δ:9.04(s,1H),8.43(s,1H),8.27(d,J=7.9Hz,1H),7.93(s,1H),7.28(d,J=10.6Hz,1H),4.59(s,2H),4.18-4.30(m,1H),2.56-2.66(m,2H),2.39(宽单峰,6H),2.12-2.16(m,2H),1.24(d,J=6.8Hz,6H).
实施例131.
2-[6-氯-1-(3-二甲基氨基-丙基)-4-氟-1H-吲唑-3-基]-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-羧酸异丙基酰胺盐酸盐
根据实施例128中阐述的操作制备,以二甲基氨基丙基氯盐酸盐替代步骤1中的二甲基氨基乙基氯盐酸盐。MS:(M+H)+=458;mp=304-305℃.1HNMR(300MHz,DMSO-d6)δ:12.84-12.93(m,1H),10.12-10.30(m,1H),9.05(s,1H),8.44(d,J=3.0Hz,1H),8.22-8.31(m,1H),7.96-8.02(m,1H),7.30(d,J=9.8Hz,1H),4.59-4.71(m,2H),4.13-4.31(m,1H),3.09-3.23(m,2H),2.75(d,J=4.9Hz,6H),2.24-2.41(m,2H),1.24(d,J=6.8Hz,6H).
实施例132.
2-[6-氯-4-氟-1-(3-吗啉-4-基-丙基)-1H-吲唑-3-基]-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-羧酸异丙基酰胺盐酸盐
根据实施例128中阐述的操作制备,以4-(3-氯丙基)吗啉替代步骤1中的二甲基氨基乙基氯盐酸盐。MS:(M+H)+=500;mp=282-285℃.1H NMR(300MHz,DMSO-d6)δ:12.86-12.92(m,1H),10.72-10.88(m,1H),9.06(s,1H),8.43(d,J=3.0Hz,1H),8.27(d,J=7.9Hz,1H),7.96-8.01(m,1H),7.30(d,J=10.6Hz,1H),4.61-4.72(m,2H),4.13-4.30(m,1H),3.88-3.99(m,2H),3.68-3.83(m,2H),3.41-3.46(m,2H),3.15-3.27(m,2H),2.96-3.13(m,2H),2.31-2.45(m,2H),1.24(d,J=6.8Hz,6H).
实施例133.
2-(6-氟-1-甲基-1H-吲唑-3-基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-羧酸((R)-1-甲基-2-吡唑-1-基-乙基)-酰胺
步骤1
((R)-2-羟基-1-甲基-乙基)-氨基甲酸叔丁酯
步骤1
将R-(-)-2-氨基丙烷-1-醇(2.0g,26.6mmol)溶解于二氯甲烷(133ml)中且分份添加一缩二碳酸二叔丁酯(11.6g,53.3mmol)。将反应混合物在室温搅拌16小时。添加水,且将水层以二氯甲烷萃取一次。将合并的有机层以氯化钠溶液洗涤并经硫酸钠干燥。蒸发后,将残余物通过硅胶色谱(甲醇/二氯甲烷)纯化得到4.0g(85%)的((R)-2-羟基-1-甲基-乙基)-氨基甲酸叔丁酯。(M+Na)+=198.
步骤2
甲磺酸(R)-2-叔丁氧基羰基氨基-丙基酯
将((R)-2-羟基-1-甲基-乙基)-氨基甲酸叔丁酯(0.5g,2.85mmol)溶解于二氯甲烷(14ml)在并在冰浴中搅拌。缓慢地添加N,N-二异丙基乙胺(0.75ml,4.28mmol)和然后甲磺酰氯(0.27ml,3.4mmol),并经16小时将反应混合物温热至室温。将氯化铵溶液添加至反应混合物,且其以乙酸乙酯萃取两次。将合并的有机物以氯化钠溶液洗涤,并经硫酸钠干燥。蒸发得到0.73g的甲磺酸(R)-2-叔丁氧基羰基氨基-丙基酯,为蜡状白色固体。1H NMR(CDCl3)δ:4.51-4.68(m,1H),4.19-4.28(m,1H),4.11-4.18(m,1H),3.90-4.04(m,1H),3.03(s,3H),1.24(d,J=6.8Hz,3H).
步骤3
((R)-1-甲基-2-吡唑-1-基-乙基)-氨基甲酸叔丁酯
将1H-吡唑(70mg,1.03mmol)溶解于DMF(5ml)中并在冰浴中冷却。添加氢化钠(60%在矿物油中的分散液,41mg,1.03mmol),且搅拌反应混合物15分钟。然后添加甲磺酸(R)-2-叔丁氧基羰基氨基-丙基酯(200mg,0.79mmol),将混合物于50℃搅拌16小时。将反应混合物冷却至室温,添加水和乙酸乙酯。将水层再以乙酸乙酯萃取两次,且将合并的有机层以氯化钠溶液洗涤并经硫酸钠干燥。蒸发后,将残余物通过硅胶色谱(甲醇/二氯甲烷)纯化得到129mg(72%)的((R)-1-甲基-2-吡唑-1-基-乙基)-氨基甲酸叔丁酯。(M+H)+=226.
步骤4
(R)-1-甲基-2-吡唑-1-基-乙胺三氟乙酸盐
将((R)-1-甲基-2-吡唑-1-基-乙基)-氨基甲酸叔丁酯(49mg,0.22mmol)溶解于二氯甲烷(2.4ml)并在冰浴中冷却。缓慢地添加三氟乙酸(1.2ml)且将反应混合物在室温搅拌2小时,然后蒸发并高真空干燥得到(R)-1-甲基-2-吡唑-1-基-乙胺三氟乙酸盐,其不经进一步纯化即可使用。
步骤5
2-(6-氟-1-甲基-1H-吲唑-3-基)-5-(2-三甲基甲硅烷基-乙氧基甲基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-羧酸((R)-1-甲基-2-吡唑-1-基-乙基)-酰胺
将(R)-1-甲基-2-吡唑-1-基-乙胺三氟乙酸盐(来自步骤4的粗产物)溶解于乙腈(1.8ml),向其中然后添加2-(6-氟-1-甲基-1H-吲唑-3-基)-5-(2-三甲基甲硅烷基-乙氧基甲基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-羧酸(80mg,0.18mmol)、O-苯并三唑-1-基-N,N,N’,N’-四甲基脲鎓四氟硼酸盐(87mg,0.27mmol)和N,N-二异丙基乙胺(0.16ml,0.91mmol)。将反应混合物在室温搅拌18小时,然后添加水和乙酸乙酯。分离各层,且将水层以乙酸乙酯萃取三次。将合并的有机层以氯化钠溶液洗涤并经硫酸钠干燥。蒸发后,将残余物通过硅胶色谱(甲醇/二氯甲烷)纯化得到89mg(81%)的2-(6-氟-1-甲基-1H-吲唑-3-基)-5-(2-三甲基甲硅烷基-乙氧基甲基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-羧酸((R)-1-甲基-2-吡唑-1-基-乙基)-酰胺。
步骤6
2-(6-氟-1-甲基-1H-吲唑-3-基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-羧酸((R)-1-甲基-2-吡唑-1-基-乙基)-酰胺
将2-(6-氟-1-甲基-1H-吲唑-3-基)-5-(2-三甲基甲硅烷基-乙氧基甲基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-羧酸((R)-1-甲基-2-吡唑-1-基-乙基)-酰胺(86mg,0.16mmol)溶解于二氯甲烷(2.2ml)中并在冰浴中冷却。缓慢地添加三氟乙酸(1ml)且将反应混合物在室温搅拌2小时。蒸发反应混合物且将残余物溶解于二氯甲烷(1ml)。添加乙二胺(0.63ml,9.4mmol)且搅拌混合物18小时。将水和然后乙酸乙酯添加至混合物。将所得沉淀经过滤,以水和乙醚淋洗,并高真空干燥得到37mg(57%)的2-(6-氟-1-甲基-1H-吲唑-3-基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-羧酸((R)-1-甲基-2-吡唑-1-基-乙基)-酰胺。MS:(M+Na)+=441;mp=252-253℃.1H NMR(300MHz,DMSO-d6)δ:9.08(s,1H),8.46(s,1H),8.21-8.33(m,1H),8.12(d,J=7.9Hz,1H),7.63-7.75(m,2H),7.31-7.40(m,1H),6.97-7.10(m,1H),6.12-6.23(m,1H),4.46-4.63(m,1H),4.32-4.44(m,2H),4.14(s,3H),1.23(d,J=6.4Hz,3H).
实施例134.
2-(6-氯-1-甲基-1H-吲唑-3-基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-羧酸((R)-2-咪唑-1-基-1-甲基-乙基)-酰胺
根据在实施例133中阐述的操作制备,以1H-咪唑替代步骤3中的1H-吡唑且以2-(6-氯-1-甲基-1H-吲唑-3-基)-5-((2-(三甲基甲硅烷基)乙氧基)甲基)-5H-吡咯并[3,2-b]吡嗪-7-羧酸替代步骤5中的2-(6-氟-1-甲基-1H-吲唑-3-基)-5-(2-三甲基甲硅烷基-乙氧基甲基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-羧酸。MS:(M+H)+=435;mp=276-279℃.1H NMR(300MHz,DMSO-d6)δ:12.76-13.03(m,1H),9.08(s,1H),8.47(s,1H),8.01-8.14(m,2H),7.98(宽单峰,1H),7.62(宽单峰,1H),7.18-7.27(m,1H),7.15(宽单峰,1H),6.82(s,1H),4.36-4.50(m,1H),4.16(宽单峰,3H),4.09-4.36(m,2H),1.26(d,J=6.4Hz,3H).
实施例135.
2-(6-氟-1-甲基-1H-吲唑-3-基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-羧酸((S)-2-甲氧基-丙基)-酰胺
步骤1
((S)-2-羟基-丙基)-氨基甲酸叔丁酯
将(S)-1-氨基丙烷-2-醇(1.0g,13.3mmol)溶解于二氯甲烷(67ml)中且分份添加一缩二碳酸二-叔丁酯(5.8g,26.6mmol)。将反应混合物在室温搅拌16小时。添加氯化铵溶液和水,且将水层以乙酸乙酯萃取两次。将合并的有机层以氯化钠溶液洗涤并经硫酸钠干燥。蒸发后,将残余物通过硅胶色谱(甲醇/二氯甲烷)纯化得到2.35g(99%)的((S)-2-羟基-丙基)-氨基甲酸叔丁酯。
步骤2
((S)-2-甲氧基-丙基)-氨基甲酸叔丁酯
将((S)-2-羟基-丙基)-氨基甲酸叔丁酯(0.25g,1.43mmol)溶解于乙腈(14ml)和碘甲烷(1.78ml,28.5mmol)中,然后添加氧化银(0.53g,2.28mmol;如Org.Syn.Coll.Vol.VII,p.386中制备)。覆盖反应烧瓶以隔离光且将反应混合物在回流下加热24小时。再添加碘甲烷(1.8ml)和氧化银(0.26g)且继续加热直到通过标准反相LC/MS判断反应完全。将反应混合物通过硅藻土过滤,以乙酸乙酯淋洗。蒸发后,将残余物通过硅胶色谱(乙酸乙酯/己烷)纯化得到85mg(32%)的((S)-2-甲氧基-丙基)-氨基甲酸叔丁酯。(M+Na)+=212.
步骤3
2-(6-氟-1-甲基-1H-吲唑-3-基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-羧酸((S)-2-甲氧基-丙基)-酰胺
根据在实施例133步骤4-6中阐述的操作制备,以((S)-2-甲氧基-丙基)-氨基甲酸叔丁酯替代步骤4中的((R)-1-甲基-2-吡唑-1-基-乙基)-氨基甲酸叔丁酯。MS:(M+H)+=383;mp=269-271℃.1H NMR(300MHz,DMSO-d6)δ:12.81-12.92(m,1H),9.12(s,1H),8.55(dd,J=9.1,5.3Hz,1H),8.45(s,1H),8.24-8.33(m,1H),7.67(dd,J=9.8,2.3Hz,1H),7.13(ddd,J=9.1,2.3Hz,1H),4.15(s,3H),3.65-3.75(m,1H),3.40-3.60(m,2H),3.26(s,3H),1.17(d,J=6.0Hz,3H).
实施例136.
2-(6-氟-1-甲基-1H-吲唑-3-基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-羧酸((R)-2-氰基-2-甲基-乙基)-酰胺
步骤1
((R)-2-氨基甲酰基-丙基)-氨基甲酸叔丁酯
将(R)-3-(叔丁氧基羰基氨基)-2-甲基丙酸(465mg,2.3mmol)溶解于二氯甲烷(11ml)中。添加4-二甲基氨基吡啶(280mg,2.3mmol)和1-(3-二甲基氨基丙基)-3-乙基碳二亚胺(877mg,4.58mmol),接着添加N-羟基琥珀酰亚胺(290mg,2.52mmol)。在室温搅拌4小时后,缓慢地添加浓氢氧化铵(1.6ml)。再搅拌反应混合物20分钟,然后添加HCl水溶液和乙酸乙酯,将水层以乙酸乙酯萃取六次。将合并的有机层以碳酸氢钠溶液洗涤并经硫酸钠干燥。蒸发后,将残余物通过硅胶色谱得到335mg(72%)的((R)-2-氨基甲酰基-丙基)-氨基甲酸叔丁酯纯化。(M+Na)+=225.
步骤2
((R)-2-氰基-2-甲基-乙基)-氨基甲酸叔丁酯
将((R)-2-氨基甲酰基-丙基)-氨基甲酸叔丁酯(50mg,0.247mmol)溶解于THF(1.4ml)中。滴加吡啶(40ul,0.49mmol)和然后三氟乙酸酐(42ul,0.30mmol)。将反应混合物在室温搅拌1小时,且然后再添加吡啶(40ul,0.49mmol)和三氟乙酸酐(42ul,0.30mmol)。将反应混合物在室温搅拌16小时,然后添加水、碳酸钠溶液和乙酸乙酯。将水层以乙酸乙酯萃取三次。将合并的有机层以水和氯化钠溶液洗涤,并经硫酸钠干燥。蒸发后,将残余物通过硅胶色谱(甲醇/二氯甲烷)纯化得到40mg(87%)的((R)-2-氰基-2-甲基-乙基)-氨基甲酸叔丁酯。(M+Na)+=207.
步骤3
(R)-3-氨基-2-甲基-丙腈三氟乙酸盐
将((R)-2-氰基-2-甲基-乙基)-氨基甲酸叔丁酯(42mg,0.23mmol)溶解于二氯甲烷(1.2ml)中并在冰浴中冷却。缓慢地添加三氟乙酸(0.7ml)且将反应混合物在室温搅拌3小时,然后蒸发并高真空干燥得到(R)-3-氨基-2-甲基-丙腈三氟乙酸盐,其不经进一步纯化即可使用。
步骤4
2-(6-氟-1-甲基-1H-吲唑-3-基)-5-(2-三甲基甲硅烷基-乙氧基甲基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-羧酸((R)-2-氰基-2-甲基-乙基)-酰胺
将(R)-3-氨基-2-甲基-丙腈三氟乙酸盐(来自步骤3的粗产物)溶解于乙腈(2.8ml)中,向其中然后添加2-(6-氟-1-甲基-1H-吲唑-3-基)-5-(2-三甲基甲硅烷基-乙氧基甲基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-羧酸(80mg,0.18mmol)、O-苯并三唑-1-基-N,N,N’,N’-四甲基脲鎓四氟硼酸盐(70mg,0.22mmol)和N,N-二异丙基乙胺(0.11ml,0.63mmol)。将反应混合物在室温搅拌18小时。再添加O-苯并三唑-1-基-N,N,N’,N’-四甲基脲鎓四氟硼酸盐(50mg,0.16mmol)和N,N-二异丙基乙胺(0.11ml,0.63mmol),继续搅拌24小时。添加水和乙酸乙酯。分离各层,且将水层以乙酸乙酯萃取两次。将合并的有机层以氯化钠溶液洗涤并经硫酸钠干燥。蒸发后,将残余物通过硅胶色谱(甲醇/二氯甲烷)纯化得到33mg(36%)的2-(6-氟-1-甲基-1H-吲唑-3-基)-5-(2-三甲基甲硅烷基-乙氧基甲基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-羧酸((R)-2-氰基-2-甲基-乙基)-酰胺。(M+Na)+=530.
步骤5
2-(6-氟-1-甲基-1H-吲唑-3-基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-羧酸((R)-1-甲基-2-吡唑-1-基-乙基)-酰胺
将2-(6-氟-1-甲基-1H-吲唑-3-基)-5-(2-三甲基甲硅烷基-乙氧基甲基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-羧酸((R)-2-氰基-2-甲基-乙基)-酰胺(32mg,0.06mmol)溶解于二氯甲烷(1.6ml)中并在冰浴中冷却。缓慢地添加三氟乙酸(0.8ml)且将反应混合物在室温搅拌2.5小时。蒸发反应混合物且将残余物溶解于二氯甲烷(1ml)。添加乙二胺(0.26ml,3.8mmol)并搅拌混合物18小时。将水和然后乙酸乙酯添加至混合物。分离各层,且将水层以乙酸乙酯萃取两次。将合并的有机层以氯化钠溶液洗涤,经硫酸钠干燥并蒸发。将残余物通过硅胶色谱(甲醇/二氯甲烷)纯化得到5mg(20%)的2-(6-氟-1-甲基-1H-吲唑-3-基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-羧酸((R)-2-氰基-2-甲基-乙基)-酰胺.MS:(M+Na)+=400.1HNMR(300MHz,DMSO-d6)δ:12.80-12.98(m,1H),9.11(s,1H),8.50(s,1H),8.44-8.56(m,2H),7.67(dd,J=9.8,2.3Hz,1H),7.20(ddd,J=9.3,1.9Hz,1H),4.15(s,3H),3.64-3.76(m,2H),3.18-3.27(m,1H),1.34(d,J=6.8Hz,3H).
实施例137.
2-(6-氟-1-甲基-1H-吲唑-3-基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-羧酸((R)-2-氨基甲酰基-丙基)-酰胺
从实施例136步骤5分离出额外产物(3mg,12%)。MS:(M+Na)+=418.1HNMR(300MHz,DMSO-d6)δ:9.11(s,1H),8.49-8.60(m,1H),8.44(s,1H),8.22-8.30(m,1H),7.65(dd,J=9.8,2.3Hz,1H),7.40(s,1H),7.30(ddd,J=9.3,2.3Hz,1H),6.84(s,1H),4.15(s,3H),3.39-3.67(m,2H),2.62-2.74(m,1H),1.13(d,J=6.8Hz,3H).
实施例138.
2-(6-氯-1-甲基-1H-吲唑-3-基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-羧酸(S)-N-(四氢-吡喃-3-基)-酰胺
步骤1
(S)-2-叔丁氧基羰基氨基-戊二酸二乙酯
将(S)-1,5-二乙氧基-1,5-二氧代戊烷-2-胺盐酸盐(1.0g,4.17mmol)溶解于二氯甲烷(10ml)中并在冰浴中冷却。添加三乙胺(0.58ml,4.17mmol),接着添加一缩二碳酸二-叔丁酯(1.09g,5.0mmol)且混合物经16小时温热至室温。添加水和乙酸乙酯,并且水层再以乙酸乙酯萃取。将合并的有机层以氯化钠溶液洗涤并经硫酸钠干燥。蒸发后,将残余物通过硅胶色谱(乙酸乙酯/己烷)纯化得到1.11g(87%)的(S)-2-叔丁氧基羰基氨基-戊二酸二乙酯。(M+Na)+=326.
步骤2
((S)-4-羟基-1-羟基甲基-丁基)-氨基甲酸叔丁酯
将硼氢化锂(2.0M在THF中,4.12ml,8.24mmol)在冰浴中冷却并滴加(S)-2-叔丁氧基羰基氨基-戊二酸二乙酯(0.5g,1.65mmol)在THF(5.5ml)中的溶液。将反应混合物温热至室温,并搅拌16小时。非常缓慢地将甲醇添加至反应混合物。在延迟的剧烈的气体产生平息后,添加水和乙酸乙酯。将水层以乙酸乙酯萃取五次,将合并的有机层以氯化钠溶液洗涤并经硫酸钠干燥。蒸发后,将残余物通过硅胶色谱(甲醇/二氯甲烷)纯化得到0.3g(83%)的((S)-4-羟基-1-羟基甲基-丁基)-氨基甲酸叔丁酯。(M+Na)+=242.
步骤3
(S)-(四氢-吡喃-3-基)-氨基甲酸叔丁酯
将((S)-4-羟基-1-羟基甲基-丁基)-氨基甲酸叔丁酯(100mg,0.46mmol)溶解于温苯(1.5ml)中。添加氰基亚甲基三丁基膦烷(165mg,0.68mmol),密封反应容器,并于100℃搅拌24小时。将反应混合物经冷却,蒸发并通过硅胶色谱(乙酸乙酯/己烷)纯化得到64mg(69%)的(S)-(四氢-吡喃-3-基)-氨基甲酸叔丁酯。(M+Na)+=224.
步骤4
(S)-(四氢-吡喃-3-基)胺三氟乙酸盐
将(S)-(四氢-吡喃-3-基)-氨基甲酸叔丁酯(42mg,0.21mmol)溶解于二氯甲烷(2.2ml)并在冰浴中冷却。缓慢地添加三氟乙酸(1.2ml)且将反应混合物在室温搅拌3小时,然后蒸发并高真空干燥得到(S)-(四氢-吡喃-3-基)胺三氟乙酸盐,其不经进一步纯化即可使用。
步骤5
2-(6-氯-1-甲基-1H-吲唑-3-基)-5-(2-三甲基甲硅烷基-乙氧基甲基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-羧酸(S)-N-(四氢-吡喃-3-基)-酰胺
将(S)-(四氢-吡喃-3-基)胺三氟乙酸盐(来自步骤4的粗产物)溶解于乙腈(1.8ml)中,向其中然后添加2-(6-氯-1-甲基-1H-吲唑-3-基)-5-(2-三甲基甲硅烷基-乙氧基甲基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-羧酸(80mg,0.175mmol)、O-苯并三唑-1-基-N,N,N’,N’-四甲基脲鎓四氟硼酸盐(84mg,0.26mmol)和N,N-二异丙基乙胺(0.15ml,0.87mmol)。将反应混合物在室温搅拌18小时。再添加O-苯并三唑-1-基-N,N,N’,N’-四甲基脲鎓四氟硼酸盐(50mg,0.16mmol)和N,N-二异丙基乙胺(0.11ml,0.63mmol)并继续搅拌24小时。添加水和乙酸乙酯。分离各层,且将水层以乙酸乙酯萃取两次。将合并的有机层以氯化钠溶液洗涤并经硫酸钠干燥。蒸发后,将残余物通过硅胶色谱(乙酸乙酯/己烷)纯化得到55mg(58%)的2-(6-氯-1-甲基-1H-吲唑-3-基)-5-(2-三甲基甲硅烷基-乙氧基甲基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-羧酸(S)-N-(四氢-吡喃-3-基)-酰胺。(M+Na)+=563.
步骤6
2-(6-氯-1-甲基-1H-吲唑-3-基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-羧酸(S)-N-(四氢-吡喃-3-基)-酰胺
将2-(6-氯-1-甲基-1H-吲唑-3-基)-5-(2-三甲基甲硅烷基-乙氧基甲基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-羧酸(S)-N-(四氢-吡喃-3-基)-酰胺(55mg,0.10mmol)溶解于二氯甲烷(1.2ml)中并在冰浴中冷却。缓慢地添加三氟乙酸(0.6ml)且将反应混合物在室温搅拌3小时。将反应混合物经蒸发且将残余物溶解于二氯甲烷(1ml)中。添加乙二胺(0.41ml,6.1mmol)并搅拌混合物18小时。将水和然后是乙酸乙酯添加至混合物中。分离各层,且将水层以乙酸乙酯萃取两次。将合并的有机层以氯化钠溶液洗涤,经硫酸钠干燥并蒸发。将残余物通过硅胶色谱纯化(甲醇/二氯甲烷)得到30mg(71%)的2-(6-氯-1-甲基-1H-吲唑-3-基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-羧酸(S)-N-(四氢-吡喃-3-基)-酰胺。MS:(M+H)+=411;mp=320-323℃.1H NMR(300MHz,DMSO-d6)δ:9.10(s,1H),8.50(d,J=8.7Hz,1H),8.44(s,1H),8.16(d,J=7.6Hz,1H),7.96(d,J=1.9Hz,1H),7.24(dd,J=8.5,1.7Hz,1H),4.16(s,3H),4.04-4.14(m,1H),3.86-3.94(m,1H),3.62-3.73(m,2H),3.46-3.55(m,1H),1.93-2.08(m,1H),1.69-1.89(m,2H),1.50-1.68(m,1H).
实施例139.
2-(6-氯-1-甲基-1H-吲唑-3-基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-羧酸(R)-N-(四氢-吡喃-3-基)-酰胺
步骤1
(R)-2-叔丁氧基羰基氨基-戊二酸二甲酯
将(R)-2-叔丁氧基羰基氨基)戊二酸(1.0g,4.04mmol)溶解于甲苯(31.5ml)中并添加甲醇(9ml)。将溶液在冰浴中搅拌并缓慢地添加TMS-重氮甲烷(2.0M在乙醚中的溶液,16.2ml,32.4mmol)。经16小时在搅拌的同时将反应混合物温热至室温。将反应混合物经蒸发并通过硅胶色谱(乙酸乙酯/己烷)纯化得到0.95g(85%)的(R)-2-叔丁氧基羰基氨基-戊二酸二甲酯。(M+Na)+=298.
步骤2
2-(6-氯-1-甲基-1H-吲唑-3-基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-羧酸(R)-N-(四氢-吡喃-3-基)-酰胺
根据实施例138步骤2-6中阐述的操作制备,以(R)-2-叔丁氧基羰基氨基-戊二酸二甲酯替代步骤2中的(S)-2-叔丁氧基羰基氨基-戊二酸二乙酯。MS:(M+H)+=411;mp=316-318℃.1H NMR(300MHz,DMSO-d6)δ:9.11(s,1H),8.52(d,J=8.7Hz,1H),8.46(s,1H),8.18(d,J=7.9Hz,1H),7.98(d,J=1.5Hz,1H),7.26(dd,J=8.7,1.5Hz,1H),4.17(s,3H),4.01-4.15(m,1H),3.86-3.95(m,1H),3.56-3.74(m,2H),3.44-3.56(m,1H),1.94-2.09(m,1H),1.70-1.90(m,2H),1.51-1.65(m,1H).
实施例140.
2-(6-氯-1-甲基-1H-吲唑-3-基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-羧酸((S)-1-环丙基-乙基)-酰胺
步骤1
2-(6-氯-1-甲基-1H-吲唑-3-基)-5-(2-三甲基甲硅烷基-乙氧基甲基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-羧酸((S)-1-环丙基-乙基)-酰胺
将(S)-1-环丙基乙胺(32mg,0.373mmol)、3mL的二氯甲烷、2-(6-氯-1-甲基-1H-吲唑-3-基)-5-(2-三甲基甲硅烷基-乙氧基甲基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-羧酸(77mg,0.169mmol)、4-二甲基氨基吡啶(21mg,0.169mmol)和N-(3-二甲基氨基丙基)-N’-乙基碳二亚胺盐酸盐(71mg,0.371mmol)的溶液搅拌18小时,然后浓缩成灰白色固体。将固体在10mL的乙酸乙酯和10mL的10%柠檬酸溶液之间分配。将有机层顺序用10mL的水、10mL的10%NaOH溶液、10mL的水和10mL的饱和NaCl水溶液洗涤;经Na2SO4干燥,过滤并浓缩为70mg(80%)的粗2-(6-氯-1-甲基-1H-吲唑-3-基)-5-(2-三甲基甲硅烷基-乙氧基甲基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-羧酸((S)-1-环丙基-乙基)-酰胺,其不经进一步纯化即可使用。MS:(M+Na)+=547.
步骤2
2-(6-氯-1-甲基-1H-吲唑-3-基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-羧酸((S)-1-环丙基-乙基)-酰胺
将粗2-(6-氯-1-甲基-1H-吲唑-3-基)-5-(2-三甲基甲硅烷基-乙氧基甲基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-羧酸((S)-1-环丙基-乙基)-酰胺(70mg,0.134mmol)、2mL的二氯甲烷和2mL的三氟乙酸的溶液搅拌1小时,然后浓缩成黄色固体。将固体溶解于2mL的二氯甲烷和1mL的乙二胺,并搅拌黄色的溶液30分钟。添加水(20mL)。将所得沉淀通过布氏过滤分离,以水然后以二氯甲烷充分淋洗,并通过空气然后高真空干燥得到33mg(56%)的2-(6-氯-1-甲基-1H-吲唑-3-基)-5H-吡咯并[2,3b]吡嗪-7-羧酸((S)-1-环丙基-乙基)-酰胺,为淡黄色固体。MS:(M+Na)+=417;1H NMR(300MHz,DMSO-d6)δppm9.10(s,1H),8.46(d,J=8.69Hz,1H),8.42(s,1H),8.14(d,J=7.93Hz,1H),8.00(d,J=1.51Hz,1H),7.27(dd,J=8.50,1.70Hz,1H),4.17(s,3H),3.55-3.70(m,1H),1.34(d,J=6.80Hz,3H),1.00-1.16(m,1H),0.56(td,J=8.31,3.40Hz,1H),0.42-0.50(m,1H),0.26-0.41(m,2H).
实施例141.
2-(6-氯-4-氟-1-甲基-1H-吲唑-3-基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-羧酸((S)-1-环丙基-乙基)-酰胺
根据实施例140中阐述的操作制备,以2-(6-氯-4-氟-1-甲基-1H-吲唑-3-基)-5-(2-三甲基甲硅烷基-乙氧基甲基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-羧酸替代步骤1中的2-(6-氯-1-甲基-1H-吲唑-3-基)-5-(2-三甲基甲硅烷基-乙氧基甲基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-羧酸。MS:(M-H)-=411;1H NMR(300MHz,DMSO-d6)δppm12.84(宽单峰,1H),9.01(s,1H),8.41(s,1H),8.37(d,J=7.93Hz,1H),7.87(s,1H),7.26(d,J=10.95Hz,1H),4.17(s,3H),3.57-3.70(m,1H),1.21-1.32(m,3H),0.94-1.08(m,1H),0.18-0.52(m,4H).
实施例142.
2-(6-氯-1-甲基-1H-吲唑-3-基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-羧酸((S)-2-氰基-1-甲基-乙基)-酰胺
根据实施例140中阐述的操作制备,以(S)-3-氨基丁腈替代步骤1中的(S)-1-环丙基乙胺。MS:(M-H)-=392;1H NMR(300MHz,DMSO-d6.)δppm12.92(宽单峰,1H),9.09(s,1H),8.47-8.54(m,2H),8.21(d,J=7.55Hz,1H),7.99(s,1H),7.27-7.34(m,1H),4.33-4.45(m,1H),4.17(s,3H),2.96(qd,J=16.62,5.29Hz,2H),1.44(d,J=6.80Hz,3H)。
实施例143.
2-(6-氯-1-甲基-1H-吲唑-3-基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-羧酸(2-氨基-乙基)-酰胺三氟乙酸盐
步骤1
2-(6-氯-1-甲基-1H-吲唑-3-基)-5-(2-三甲基甲硅烷基-乙氧基甲基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-羧酸(1H-咪唑-2-基)-酰胺
将2-(6-氯-1-甲基-1H-吲唑-3-基)-5-(2-三甲基甲硅烷基-乙氧基甲基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-羧酸(205mg,0.447mmol)、1mL的N,N-二甲基甲酰胺和O-(7-氮杂苯并三唑e-1-基)-N,N,N’,N’-四甲基脲鎓六氟磷酸盐(208mg,0.548mmol)的溶液搅拌10分钟。向溶液添加新研磨的2-氨基咪唑硫酸盐(62mg,0.468mmol)和二异丙基乙胺(0.39mL,2.2mmol)。将烧瓶加热至70℃且将浑浊的黄色溶液搅拌18.5小时,期间形成白色沉淀。让混合物冷却,然后以20mL的水处理。将沉淀通过布氏过滤分离,以水充分淋洗并通过空气干燥然后高真空干燥得到177mg的不纯的2-(6-氯-1-甲基-1H-吲唑-3-基)-5-(2-三甲基甲硅烷基-乙氧基甲基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-羧酸(1H-咪唑-2-基)-酰胺,为淡黄色固体。MS:(M+H)+=523.
步骤2
2-(6-氯-1-甲基-1H-吲唑-3-基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-羧酸(2-氨基-乙基)-酰胺三氟乙酸盐
将来自步骤1的不纯的2-(6-氯-1-甲基-1H-吲唑-3-基)-5-(2-三甲基甲硅烷基-乙氧基甲基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-羧酸(1H-咪唑-2-基)-酰胺(175mg,0.334mmol)在2mL的二氯甲烷和2mL的三氟乙酸中的溶液搅拌1小时,然后浓缩成橙色油状物。向该油状物中添加5mL的二氯甲烷和1mL的乙二胺。将黄色的悬浮液搅拌30分钟。添加水(20mL),且将沉淀通过布氏过滤分离,以水和二氯甲烷充分淋洗,并通过空气干燥然后高真空干燥得到109mg的黄褐色固体。将固体以15mL的沸腾甲醇研磨,让混合物冷却至室温,且将固体通过布氏过滤分离,以甲醇充分淋洗,并通过空气干燥得到53mg的黄褐色固体。将固体以2mL的甲醇和1mL的1.0M HCl的甲醇溶液处理。将固体以10mL的乙醚沉淀,通过布氏过滤分离,并通过空气干燥然后高真空干燥得到45mg的橙色固体。通过反相高效液相色谱(C-182x10cm柱,以(A).05%TFA/水(B).05%TFA/乙腈在25ml/mn的线性梯度洗脱)的最终纯化得到两种产物,为三氟乙酸盐:7mg(4%)的2-(6-氯-1-甲基-1H-吲唑-3-基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-羧酸(1H-咪唑-2-基)-酰胺三氟乙酸盐,为淡黄色固体(第二峰,MS:(M+H)+=393;1H NMR(300MHz,DMSO-d6)δppm13.24(宽单峰,1H),11.33(宽单峰,1H),9.19(s,1H),8.70-8.79(m,2H),8.00(s,1H),7.29(d,J=8.69Hz,1H),7.11(宽单峰,2H),4.18(s,3H).)和0.016g(10%)的2-(6-氯-1-甲基-1H-吲唑-3-基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-羧酸(2-氨基-乙基)-酰胺三氟乙酸盐,为白色固体(第一峰,MS:(M+H)+=370;1H NMR(300MHz,DMSO-d6)δppm12.92(宽单峰,1H),9.10(s,1H),8.44-8.51(m,2H),8.33(t,J=5.67Hz,1H),8.00(s,1H),7.85(宽单峰,3H),7.38(d,J=8.69Hz,1H),4.17(s,3H),3.70(q,J=6.04Hz,2H),3.02-3.16(m,2H).)。
实施例144.
2-(6-氯-1-甲基-1H-吲唑-3-基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-羧酸(反式-4-羟基-环己基)-酰胺
步骤1
2-(6-氯-1-甲基-1H-吲唑-3-基)-5-(2-三甲基甲硅烷基-乙氧基甲基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-羧酸(反式-4-羟基-环己基)酰胺
在100mL圆底烧瓶中,将2-(6-氯-1-甲基-1H-吲唑-3-基)-5-(2-三甲基甲硅烷基-乙氧基甲基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-羧酸(0.150g,0.295mmol)、EDC(61mg,0.32mmol)、DIEA(52μl,0.295mmol)与二氯甲烷(3ml)混合得到黄色溶液。搅拌30分钟,然后添加反式-4-氨基环己醇(48mg,0.42mmol)。将反应混合物在室温搅拌24小时,然后以二氯甲烷稀释并以水洗涤。将有机层经Na2SO4干燥并真空浓缩。将粗物质通过快速色谱(硅胶,0%至5%MeOH的DCM溶液)纯化并从乙酸乙酯重结晶得到60mg的2-(6-氯-1-甲基-1H-吲唑-3-基)-5-(2-三甲基甲硅烷基-乙氧基甲基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-羧酸(反式-4-羟基-环己基)酰胺,为白色固体。MS:[M+H]+=555.
步骤2
2-(6-氯-1-甲基-1H-吲唑-3-基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-羧酸(反式-4-羟基-环己基)-酰胺
在25mL圆底烧瓶中,将2-(6-氯-1-甲基-1H-吲唑-3-基)-5-(2-三甲基甲硅烷基-乙氧基甲基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-羧酸(反式-4-羟基-环己基)酰胺(60mg,0.108mmol)溶解于二氯甲烷(3mL)中。添加三氟乙酸(0.2mL,2.6mmol)且将橙色反应混合物在室温搅拌15小时。再添加三氟乙酸(0.7mL)且将反应混合物再搅拌5小时。然后减压浓缩反应混合物。将所得粗固体溶解于二氯甲烷(3mL)和乙二胺(0.20mL,2.96mmol)中。将浅黄色反应混合物在室温搅拌20小时。浓缩反应混合物且用水沉淀残余物。搅拌悬浮液1小时并过滤收集粗固体。将粗固体连续用水、二氯甲烷、乙酸乙酯和己烷洗涤,得到28mg(60%)的2-(6-氯-1-甲基-1H-吲唑-3-基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-羧酸(反式-4-羟基-环己基)酰胺,为浅黄色固体。MS:[M+H]+=525;1H NMR(300MHz,DMSO-d6)δ:9.08(s,2H),8.40(s,1H),8.43(d,J=1.0Hz,1H),8.02(d,J=1.0Hz,1H),8.01(s,1H),7.28(dd,J=8.6,2.0Hz,1H),4.45-4.76(m,1H),4.17(s,3H),3.70-3.96(m,1H),3.43-3.59(m,1H),2.07(d,J=11.1Hz,2H),1.92(d,J=10.6Hz,2H),1.18-1.55(m,4H).
实施例145.
2-(6-氯-1-甲基-1H-吲唑-3-基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-羧酸(顺式-4-氨基-环己基)-酰胺
步骤1
2-(6-氯-1-甲基-1H-吲唑-3-基)-5-(2-三甲基甲硅烷基-乙氧基甲基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-羧酸(顺式-4-氨基-环己基)酰胺
在20mL闪烁小瓶中,将2-(6-氯-1-甲基-1H-吲唑-3-基)-5-(2-三甲基甲硅烷基-乙氧基甲基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-羧酸(0.10g,0.22mmol)、2-(1H-苯并[d][1,2,3]三唑-1-基)-1,1,3,3-四甲基异脲鎓六氟磷酸盐(91mg,0.24mmol)、1H-苯并[d][1,2,3]三唑-1-醇(33mg,0.240mmol)和N,N-二异丙基乙胺(38μl,0.22mmol)与DMF(4ml)混合得到浅黄色溶液。将反应混合物在室温搅拌45分钟。在20mL圆底烧瓶中,将顺式-环己烷-1,4-二胺(249mg,2.18mmol)溶解于0.4mL DMF中得到无色溶液。将羧酸反应混合物滴加至胺溶液。将反应混合物在室温搅拌24小时。将反应混合物以EtOAc(~50mL)洗涤,并以饱和NaHCO3(3x25mL)和H2O(3x25mL)洗涤。将有机层经Na2SO4干燥并真空浓缩。将粗物质经色谱中在SiO2上以0%至10%MeOH的DCM溶液(含0.1%NH4OH)纯化得到86mg的2-(6-氯-1-甲基-1H-吲唑-3-基)-5-(2-三甲基甲硅烷基-乙氧基甲基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-羧酸(顺式-4-氨基-环己基)酰胺,为白色固体。MS:[M+H]+=554.
步骤2
2-(6-氯-1-甲基-1H-吲唑-3-基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-羧酸(顺式-4-氨基-环己基)-酰胺
在25mL圆底烧瓶中,将2-(6-氯-1-甲基-1H-吲唑-3-基)-5-(2-三甲基甲硅烷基-乙氧基甲基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-羧酸(顺式-4-氨基-环己基)酰胺(85mg,0.153mmol)溶解于二氯甲烷(8mL)中。添加三氟乙酸(2.5mL,32.4mmol)且将橙色反应混合物在室温搅拌3小时。然后减压浓缩反应混合物。将所得粗固体溶解于二氯甲烷(8mL)并添加乙二胺(1mL,14.8mmol)。将反应混合物在室温搅拌2小时。浓缩反应混合物且用水沉淀残余物。搅拌悬浮液1小时和过滤收集粗固体。将粗固体连续以水、二氯甲烷、乙酸乙酯和己烷洗涤得到61mg(93%)的2-(6-氯-1-甲基-1H-吲唑-3-基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-羧酸(顺式-4-氨基-环己基)-酰胺,为浅黄色固体。MS:[M+H]+=424;1H NMR(300MHz,DMSO-d6)δ:9.05(d,J=1.0Hz,1H),8.47(d,J=9.1Hz,1H),8.42(d,J=1.0Hz,1H),8.08(d,J=7.1Hz,1H),7.98(s,1H),7.40(d,J=9.1Hz,1H),4.17(d,J=1.0Hz,3H),4.00(宽单峰,1H),2.96(宽单峰,1H),1.87-2.02(m,2H),1.66-1.76(m,2H),1.55-1.66(m,2H),1.44-1.54(m,2H).
实施例146.
2-(6-氯-1-甲基-1H-吲唑-3-基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-羧酸(反式-4-氨基-环己基)-酰胺
根据在实施例2中阐述的操作制备,以反式-环己烷-1,4-二胺替代步骤1中的顺式-环己烷-1,4,二胺。分离出最终化合物,为灰白色固体,33mg(68%);MS:[M+H]+=424;1H NMR(300MHz,DMSO-d6)δ:9.04(d,J=1.5Hz,1H),8.44(dd,J=8.6,1.0Hz,1H),8.41(d,J=1.5Hz,1H),8.03(d,J=8.1Hz,1H),8.00(s,1H),7.26(d,J=8.6Hz,1H),4.17(d,J=1.5Hz,3H),3.83(宽单峰,1H),2.64-2.76(m,1H),2.08(d,J=10.1Hz,2H),1.88(d,J=12.1Hz,2H),1.33-1.43(m,2H),1.18-1.30(m,2H).
实施例147.
2-(6-氯-1-甲基-1H-吲唑-3-基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-羧酸(3-氧代-环己基)-酰胺
步骤1
2-(6-氯-1-甲基-1H-吲唑-3-基)-5-(2-三甲基甲硅烷基-乙氧基甲基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-羧酸(3-羟基-环己基)酰胺
向25mL圆底烧瓶中装入2-(6-氯-1-甲基-1H-吲唑-3-基)-5-(2-三甲基甲硅烷基-乙氧基甲基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-羧酸(0.10g,0.22mmol)、3-氨基环己醇(顺式和反式的混合物)(45mg,0.39mmol)、HBTU(0.10g,0.26mmol)和HOBT(0.03g,0.26mmol)。然后添加DMF(1.0mL),接着添加N,N-二异丙基乙胺(0.07ml,0.26mmol)。将黄色反应混合物在室温搅拌过夜,然后以水淬灭并以EtOAc(30mL)萃取。将有机层以饱和NaHCO3和水洗涤一次。将合并的有机层以EtOAc(25mL)反萃取。将合并的有机层经硫酸钠干燥,过滤并浓缩。将残余物经色谱在SiO2上以EtOAc/己烷(梯度:0-100%EtOAc)纯化得到106mg的2-(6-氯-1-甲基-1H-吲唑-3-基)-5-(2-三甲基甲硅烷基-乙氧基甲基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-羧酸(3-羟基-环己基)酰胺,为灰白色泡沫。MS:[M+H]+=556.
步骤2
2-(6-氯-1-甲基-1H-吲唑-3-基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-羧酸(3-羟基-环己基)-酰胺
在25mL圆底烧瓶中,将2-(6-氯-1-甲基-1H-吲唑-3-基)-5-(2-三甲基甲硅烷基-乙氧基甲基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-羧酸(3-羟基-环己基)酰胺(106mg,0.19mmol)溶解在二氯甲烷(3mL)中。添加三氟乙酸(0.2mL,2.6mmol)且将橙色反应混合物在室温搅拌15小时。再添加三氟乙酸(0.7mL)且将反应混合物再搅拌5小时。然后减压浓缩反应混合物。将所得粗固体溶解于二氯甲烷(3mL)中并添加乙二胺(0.20mL,2.96mmol)。将浅黄色反应混合物在室温搅拌20小时。浓缩反应混合物且用水沉淀残余物。搅拌悬浮液1小时和过滤收集粗固体。将粗固体连续以水、二氯甲烷、乙酸乙酯和己烷洗涤得到74mg(91%)的2-(6-氯-1-甲基-1H-吲唑-3-基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-羧酸(3-羟基-环己基)-酰胺,为白色固体,其为顺式和反式异构体的2:1混合物(未指定)。MS:[M+Na]447.
步骤3
2-(6-氯-1-甲基-1H-吲唑-3-基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-羧酸(3-氧代-环己基)-酰胺
向25mL圆底烧瓶中装入2-(6-氯-1-甲基-1H-吲唑-3-基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-羧酸(3-羟基-环己基)酰胺(22mg,0.052mmol)和二氯甲烷(5mL)。以一份将戴斯-马丁高碘剂(34.0mg,0.08mmol)添加至反应混合物。将反应混合物置于Ar下并于室温搅拌2小时。添加DMF(1.5mL)且再搅拌反应混合物18小时。将反应混合物以EtOAc稀释至100mL并以饱和NaHCO3(3x20mL)洗涤。将粗白色沉淀经过滤并保存。将有机层经Na2SO4干燥并真空浓缩得到粗固体。将合并的粗固体以EtOAc(1x20mL)研磨,然后通过色谱在SiO2上以MeOH/二氯甲烷(梯度:0%-5%MeOH)纯化得到6mg(27%)的2-(6-氯-1-甲基-1H-吲唑-3-基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-羧酸(3-氧代-环己基)-酰胺,为白色固体。MS:[M+H]+=423,1H NMR(300MHz,DMSO-d6)δ:12.89(宽单峰,1H),9.09(s,1H),8.47(s,1H),8.42(d,J=8.7Hz,1H),8.16(d,J=7.6Hz,1H),8.01(d,J=1.5Hz,1H),7.39(dd,J=8.7,1.9Hz,1H),4.23-4.41(m,1H),4.18(s,3H),2.69-2.78(m,1H),2.58(d,J=10.2Hz,1H),2.42(dd,J=11.1,5.9Hz,1H),2.17-2.34(m,2H),1.96-2.08(m,1H),1.80-1.93(m,1H),1.65-1.80(m,1H).
实施例148和149.
2-(6-氯-1-甲基-1H-吲唑-3-基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-羧酸(反式-3-羟基-环己基)-酰胺和2-(6-氯-1-甲基-1H-吲唑-3-基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-羧酸(顺式-3-羟基-环己基)-酰胺
将2-(6-氯-1-甲基-1H-吲唑-3-基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-羧酸(3-羟基-环己基)-酰胺(实施例147,步骤2)的样品经色谱在SiO2上以MeOH/二氯甲烷(梯度:0%-10%MeOH,含0.1%NH4OH)纯化得到8mg的2-(6-氯-1-甲基-1H-吲唑-3-基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-羧酸(反式-3-羟基-环己基)-酰胺;1H NMR(300MHz,DMSO-d6)δ:12.85(br s,1H),9.08(s,1H),8.48(d,J=8.7Hz,1H),8.42(s,1H),8.09(d,J=7.9Hz,1H),8.01(d,J=1.1Hz,1H),7.31(dd,J=8.5,1.3Hz,1H),4.79(宽单峰,1H),4.17(s,3H),3.84-4.02(m,1H),3.49-3.61(m,1H),2.28(app d,J=10.6Hz,1H),2.03(app d,J=12.8Hz,1H),1.88(app d,J=10.6Hz,1H),1.77(app d,J=13.2Hz,1H),1.06-1.43(m,4H)and3mg的2-(6-氯-1-甲基-1H-吲唑-3-基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-羧酸(顺式-3-羟基-环己基)-酰胺;1H NMR(300MHz,DMSO-d6)δ:12.85(br s,1H),9.10(s,1H),8.46(d,J=8.7Hz,1H),8.40(d,J=7.9Hz,1H),8.02(s,1H),8.01(d,J=8.3Hz,1H),7.30(dd,J=9.1,1.3Hz,1H),4.57(br d,J=3.8Hz,1H),4.26-4.43(m,1H),4.18(s,3H),3.96-4.05(m,1H),1.92(app d,J=11.7Hz,1H),1.77(app d,J=13.2Hz,1H),1.65(app d,J=12.8Hz,1H),1.49-1.58(m,1H),1.10-1.43(m,4H).
实施例150.
2-(6-氯-1-甲基-1H-吲唑-3-基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-羧酸(1-甲基-2-苯基-乙基)-酰胺
根据实施例145中阐述的操作制备,以d,l-硫酸苯丙胺替代步骤1中的顺式-环己烷-1,4,二胺。分离出最终化合物,为浅黄色固体,31mg(67%);MS:[M+Na]+=467;1H NMR(300MHz,DMSO-d6)δppm12.83(宽单峰,1H)9.09(s,1H)8.44(s,1H)8.16(d,J=8.7Hz,1H)8.09(d,J=8.3Hz,1H)7.99(d,J=1.5Hz,1H)7.04-7.31(m,6H)4.41(dt,J=13.8,6.7Hz,1H)4.17(s,3H)2.84-3.05(m,2H)1.27(d,J=6.4Hz,3H).
实施例151.
2-(6-氯-1-甲基-1H-吲唑-3-基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-羧酸((1R,3S)-3-羟基-环戊基)-酰胺
根据实施例145中阐述的操作制备,以(1S,3R)-3-氨基环戊醇替代步骤1中的顺式-环己烷-1,4,二胺。分离出最终化合物,为浅黄色固体,26mg(97%);MS:[M+Na]+=432;1H NMR(300MHz,DMSO-d6)δ:12.61(宽单峰,1H),9.12(s,1H),8.57(d,J=8.7Hz,1H),8.42(s,1H),8.19(d,J=8.3Hz,1H),7.99(s,1H),7.37(dd,J=8.5,1.3Hz,3H),4.80(d,J=2.6Hz,1H),4.44(sxt,J=7.5Hz,1H),4.20-4.26(m,1H),4.17(s,3H),2.30(ddd,J=13.7,8.2,5.7Hz,1H),2.07-2.18(m,1H),1.69-1.86(m,3H),1.51-1.62(m,1H).
实施例152.
2-(6-氯-1-甲基-1H-吲唑-3-基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-羧酸(2-甲氧基-1-甲基-乙基)-酰胺
根据实施例145中阐述的操作制备,以1-甲氧基丙烷-2-胺替代步骤1中的顺式-环己烷-1,4,二胺。分离出最终化合物,为浅黄色固体,28mg(69%);MS:[M+H]+=399;1H NMR(300MHz,DMSO-d6)δ:9.11(s,1H),8.53(d,J=8.7Hz,1H),8.44(s,1H),8.20(d,J=8.7Hz,1H),8.01(d,J=1.5Hz,1H),7.28(dd,J=8.7,1.5Hz,1H),4.30-4.47(m,1H),4.18(s,3H),3.50(qd,J=9.6,4.5Hz,2H),3.27(s,3H),1.31(d,J=6.8Hz,3H).
实施例153.
2-(6-氯-1-甲基-1H-吲唑-3-基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-羧酸(2-甲基-环己基)-酰胺
根据实施例145中阐述的操作制备,以2-甲基环己基胺替代步骤1中的顺式-环己烷-1,4,二胺。分离出最终化合物,为浅黄色固体,非对映异构体的2:3混合物,39mg(58%);MS:[M+H]+=423;1H NMR(300MHz,DMSO-d6)δ:9.08(s,1H),9.01(s,1H),8.42(s,1H),8.43(d,J=8.7Hz,1H),8.39(s,1H),8.35(d,J=8.7Hz,1H),8.07(s,1H),8.03(d,J=8.7Hz,1H),8.02(d,J=8.9Hz,1H),7.99(s,1H),7.26(d,J=8.3Hz,1H),7.25(d,J=8.3Hz,1H),4.25(宽单峰,2H),4.17(s,6H),1.06-2.12(m,18H),0.98(d,J=6.4Hz,3H),0.90(d,J=6.8Hz,3H)).
实施例154.
2-(6-氯-1-甲基-1H-吲唑-3-基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-羧酸[1-(四氢-呋喃-2-基)-乙基]-酰胺
根据实施例145中阐述的操作制备,以1-(四氢呋喃-2-基)乙胺替代步骤1中的顺式-环己烷-1,4,二胺。分离出最终化合物,为灰白色固体和异构体的混合物,36mg(71%)MS:[M+H]+=425;1H NMR(300MHz,DMSO-d6)δ:12.81(宽单峰,2H),9.15(s,1H),9.12(s,1H),8.64(d,J=8.7Hz,1H),8.54(d,J=8.7Hz,1H),8.45(s,2H),8.23(d,J=9.4Hz,2H),8.00(d,J=1.5Hz,2H),7.27(dd,J=8.7,1.5Hz,1H),7.25(dd,J=8.7,1.5Hz,1H),4.18-4.41(m,2H),4.18(s,6H),3.91-4.02(m,1H),3.85(q,J=6.9Hz,1H),3.65-3.75(m,1H),3.53-3.66(m,1H),3.36(s,2H),1.52-2.05(m,8H),1.34(d,J=6.8Hz,3H),1.26(d,J=6.8Hz,3H).
实施例155.
2-(6-氯-1-甲基-1H-吲唑-3-基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-羧酸(反式-3-氨基甲酰基-环己基)-酰胺
根据实施例145中阐述的操作制备,以反式-3-氨基环己烷甲酰胺盐酸盐替代步骤1中的顺式-环己烷-1,4,二胺。分离出最终化合物,为灰白色固体,4.5mg(29%);MS:[M+Na]+=474;1H NMR(DMSO-d6)δ:12.85(宽单峰,1H),9.05(s,1H),8.46(s,1H),8.41(d,J=8.7Hz,1H),8.12(d,J=7.6Hz,1H),8.00(d,J=1.5Hz,1H),7.27(dd,J=8.7,1.5Hz,1H),7.16(宽单峰,1H),6.69(宽单峰,1H),4.27-4.39(m,1H),4.18(s,3H),2.39-2.52(m,1H),1.43-1.95(m,8H).
实施例156.
2-(6-氯-1-甲基-1H-吲唑-3-基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-羧酸(反式-3-氰基-环己基)-酰胺
步骤1
2-(6-氯-1-甲基-1H-吲唑-3-基)-5-(2-三甲基甲硅烷基-乙氧基甲基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-羧酸(反式-3-氨基甲酰基-环己基)-酰胺
向25mL圆底烧瓶中装入2-(6-氯-1-甲基-1H-吲唑-3-基)-5-(2-三甲基甲硅烷基-乙氧基甲基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-羧酸(0.15g,0.33mmol)、反式-3-氨基环己烷甲酰胺盐酸盐(88mg,0.49mmol)、HBTU(155mg,0.41mmol)和HOBT(49mg,0.41mmol)。然后添加DMF(1.0mL),接着添加N,N-二异丙基乙胺(0.17mL,0.97mmol)。将黄色反应混合物在室温搅拌过夜,然后以水淬灭并以EtOAc(30mL)萃取。将有机层以饱和NaHCO3和水洗涤一次。将合并的有机层以EtOAc(25mL)反萃取。将合并的有机层经硫酸钠干燥,过滤并浓缩。将残余物经色谱在SiO2上以EtOAc/己烷(梯度:0-100%EtOAc)纯化得到119mg(62%)的2-(6-氯-1-甲基-1H-吲唑-3-基)-5-(2-三甲基甲硅烷基-乙氧基甲基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-羧酸(反式-3-氨基甲酰基-环己基)-酰胺,为白色固体。MS:[M+Na]+=604.
步骤2
2-(6-氯-1-甲基-1H-吲唑-3-基)-5-(2-三甲基甲硅烷基-乙氧基甲基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-羧酸(反式-3-氰基-环己基)-酰胺
在25mL梨形烧瓶中,将2-(6-氯-1-甲基-1H-吲唑-3-基)-5-(2-三甲基甲硅烷基-乙氧基甲基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-羧酸(反式-3-氨基甲酰基-环己基)-酰胺(72mg,0.124mmol)与吡啶(412μl)混合得到灰白色溶液。将反应混合物在0℃冷却并滴加三氟乙酸酐(0.71M在吡啶中,26μl,0.18mmol)。将反应混合物在室温搅拌30分钟且然后浓缩。将残余物经色谱在SiO2上以EtOAc/己烷(梯度:0-50%EtOAc)纯化得到27mg(39%)的2-(6-氯-1-甲基-1H-吲唑-3-基)-5-(2-三甲基甲硅烷基-乙氧基甲基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-羧酸(反式-3-氰基-环己基)-酰胺,为白色固体。1H NMR(300MHz,DMSO-d6)δ:9.14(s,1H),8.66(s,1H),8.40(d,J=8.7Hz,1H),8.06(d,J=7.9Hz,1H),8.01(d,J=1.0Hz,1H),7.38(dd,J=8.7,1.0Hz,1H),5.73(s,2H),4.18(s,3H),4.09-4.28(m,1H),3.59(t,J=7.9Hz,2H),3.41-3.60(宽单峰,1H),2.24(app.d,J=12.5Hz,1H),2.07(app.d,J=12.1Hz,1H),1.59-1.91(m,5H),1.39-1.59(m,1H),0.86(t,J=7.9Hz,2H),-0.08(s,9H).
步骤3
2-(6-氯-1-甲基-1H-吲唑-3-基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-羧酸(反式-3-氰基-环己基)-酰胺
在25mL圆底烧瓶中,将2-(6-氯-1-甲基-1H-吲唑-3-基)-5-(2-三甲基甲硅烷基-乙氧基甲基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-羧酸(反式-3-氰基-环己基)-酰胺(48mg,0.085mmol)溶解于二氯甲烷(3mL)中。添加三氟乙酸(1.2mL,15.6mmol)且将橙色反应混合物在室温搅拌2小时。然后减压浓缩反应混合物。将所得粗固体溶解于二氯甲烷(3mL)中并添加乙二胺(0.50mL,7.4mmol)。将浅黄色反应混合物在室温搅拌18小时。浓缩反应混合物且用水沉淀残余物。搅拌悬浮液1小时和过滤收集粗固体。将粗固体连续以水、乙酸乙酯和己烷洗涤得到35mg(95%)的2-(6-氯-1-甲基-1H-吲唑-3-基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-羧酸(反式-3-氰基-环己基)-酰胺,为灰白色固体。MS:[M+Na]+=474;1H NMR(DMSO-d6)δ:12.79(宽单峰,1H),9.08(s,1H),8.46(s,1H),8.40(d,J=8.7Hz,1H),8.08(d,J=7.9Hz,1H),8.00(d,J=0.8Hz,1H),7.37(dd,J=8.5,1.1Hz,1H),4.17(s,3H),4.01-4.31(m,1H),3.30-3.49(m,1H),2.24(d,J=13.2Hz,1H),2.07(d,J=12.1Hz,1H),1.59-1.94(m,5H),1.36-1.59(m,1H).
实施例157.
2-(6-氯-1-甲基-1H-吲唑-3-基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-羧酸(R)-茚满-1-基酰胺
根据实施例145中阐述的操作制备,以(R)-2,3-二氢-1H-茚-1-胺替代步骤1中的顺式-环己烷-1,4,二胺。分离出最终化合物,为灰白色固体,15mg(21%);MS:[M+Na]+=475;1H NMR(DMSO-d6)δ:12.91(宽单峰,1H),9.09(s,1H),8.52-8.55(m,1H),8.50(d,J=8.7Hz,1H),7.91(d,J=1.0Hz,1H),7.83(d,J=8.7Hz,1H),7.41(t,J=9.1Hz,1H),7.32(t,J=7.2Hz,2H),7.22(t,J=7.6Hz,1H),6.51(dd,J=8.7,1.5Hz,1H),5.73(q,J=7.8Hz,1H),4.14-4.20(m,1H),4.12(s,3H),3.01-3.16(m,1H),2.86-3.01(m,1H),2.59-2.77(m,1H),1.79-2.02(m,1H).
实施例158.
2-(6-氯-1-甲基-1H-吲唑-3-基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-羧酸(顺式-4-羟基-环己基)-酰胺
根据实施例145中阐述的操作制备,以顺式-4-氨基环己醇盐酸盐替代步骤1中的顺式-环己烷-1,4,二胺。分离出最终化合物,为浅黄色固体,47mg(91%);MS:[M+Na]+=447;1H NMR(300MHz,DMSO-d6)δ:12.35(宽单峰,1H),9.11(s,1H),8.47(d,J=8.7Hz,1H),8.43(s,1H),8.14(d,J=7.9Hz,1H),8.00(d,J=1.5Hz,1H),7.42(dd,J=8.7,1.5Hz,1H),4.58(宽单峰,1H),4.18(s,3H),3.88-4.09(m,1H),3.81(宽单峰,1H),1.53-1.93(m,8H).
实施例159.
2-(6-氯-1-甲基-1H-吲唑-3-基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-羧酸((R)-2-甲氧基-1-甲基-乙基)-酰胺
步骤1
2-(6-氯-1-甲基-1H-吲唑-3-基)-5-(2-三甲基甲硅烷基-乙氧基甲基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-羧酸((R)-2-羟基-1-甲基-乙基)-酰胺
向25mL圆底烧瓶中装入2-(6-氯-1-甲基-1H-吲唑-3-基)-5-(2-三甲基甲硅烷基-乙氧基甲基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-羧酸(0.15g,0.33mmol)、(R)-2-氨基丙烷-1-醇(49mg,0.66mmol)、HBTU(155mg,0.41mmol)和HOBT(58mg,0.49mmol)。然后添加DMF(1.1mL),接着添加N,N-二异丙基乙胺(0.17mL,0.97mmol)。将黄色反应混合物在室温搅拌过夜,然后以水淬灭并以EtOAc(30mL)萃取。将有机层以饱和NaHCO3和水洗涤一次。将合并的有机层以EtOAc(25mL)反萃取。将合并的有机层经硫酸钠干燥,过滤并浓缩。将残余物经色谱在SiO2上以EtOAc/己烷(梯度:0-60%EtOAc)纯化得到110mg(65%)的2-(6-氯-1-甲基-1H-吲唑-3-基)-5-(2-三甲基甲硅烷基-乙氧基甲基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-羧酸((R)-2-羟基-1-甲基-乙基)-酰胺,为灰白色固体。MS:[M+H]+=515.
步骤2
2-(6-氯-1-甲基-1H-吲唑-3-基)-5-(2-三甲基甲硅烷基-乙氧基甲基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-羧酸((R)-2-甲氧基-1-甲基-乙基)-酰胺
在25mL圆底烧瓶中,将2-(6-氯-1-甲基-1H-吲唑-3-基)-5-(2-三甲基甲硅烷基-乙氧基甲基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-羧酸((R)-2-羟基-1-甲基-乙基)-酰胺(70mg,0.136mmol)、氧化银(51mg,0.22mmol)和甲基碘(100μl,1.6mmol)与MeCN混合得到黑色悬浮液。将圆底烧瓶以箔包裹以排除光。将系统置于沙浴中并搅拌加热至40℃。保持该温度2天。冷却时,将反应混合物通过硅藻土垫过滤。浓缩滤液。将粗物质经色谱在SiO2上以EtOAc/己烷(梯度:0%-40%EtOAc)纯化得到32mg(45%)的2-(6-氯-1-甲基-1H-吲唑-3-基)-5-(2-三甲基甲硅烷基-乙氧基甲基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-羧酸((R)-2-甲氧基-1-甲基-乙基)-酰胺,为灰白色固体。[M+Na]+=551.
步骤3
2-(6-氯-1-甲基-1H-吲唑-3-基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-羧酸((R)-2-甲氧基-1-甲基-乙基)-酰胺
在密封的25mL圆底烧瓶中,将2-(6-氯-1-甲基-1H-吲唑-3-基)-5-(2-三甲基甲硅烷基-乙氧基甲基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-羧酸((R)-2-甲氧基-1-甲基-乙基)-酰胺(32mg,0.061mmol)和TFA(0.9ml,11.7mmol)混合以二氯甲烷(3ml)得到橙色溶液。室温搅拌反应混合物直到消耗起始物质(2.5小时)。然后减压浓缩反应混合物。将所得粗固体溶解于二氯甲烷(3mL)中并添加乙二胺(300μl,4.44mmol)。将反应混合物在室温搅拌18小时。浓缩反应混合物且用水沉淀残余物。搅拌悬浮液1小时和过滤收集粗固体。将粗固体通过(1:1二氯甲烷/庚烷)研磨纯化得到14mg(59%)的2-(6-氯-1-甲基-1H-吲唑-3-基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-羧酸((R)-2-甲氧基-1-甲基-乙基)-酰胺,为灰白色固体。MS:[M+H]+=399;1H NMR(300MHz,DMSO-d6)δ:9.11(s,1H),8.53(d,J=8.6Hz,1H),8.44(s,1H),8.20(d,J=8.6Hz,1H),8.01(d,J=1.5Hz,1H),7.28(dd,J=8.6,2.0Hz,1H),4.30-4.46(m,1H),4.18(s,3H),3.53(dd,J=9.6,5.1Hz,1H),3.47(dd,J=9.6,4.5Hz,1H),3.27(s,3H),1.31(d,J=6.6Hz,3H).
实施例160.
2-(6-氯-1-甲基-1H-吲唑-3-基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-羧酸(2,2,2-三氟-1-甲基-乙基)-酰胺
根据实施例145中阐述的操作制备,以1,1,1-三氟丙烷-2-胺替代步骤1中的顺式-环己烷-1,4,二胺。分离出最终化合物,为浅黄色固体,25mg(68%);MS:[M+H]+=423;1H NMR(300MHz,DMSO-d6)δ:12.76(宽单峰,1H),9.13(s,1H),8.57(s,1H),8.42(d,J=8.7Hz,1H),8.43(d,J=9.4Hz,1H),8.02(d,J=1.5Hz,1H),7.26(dd,J=8.7,1.9Hz,1H),4.96-5.15(m,1H),4.18(s,3H),1.49(d,J=7.2Hz,3H).
实施例161.
2-(6-氯-1-甲基-1H-吲唑-3-基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-羧酸((R)-1-羟基甲基-丙基)-酰胺
步骤1
2-(6-氯-1-甲基-1H-吲唑-3-基)-5-(2-三甲基甲硅烷基-乙氧基甲基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-羧酸((R)-1-羟基甲基-丙基)-酰胺
向25mL圆底烧瓶中装入2-(6-氯-1-甲基-1H-吲唑-3-基)-5-(2-三甲基甲硅烷基-乙氧基甲基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-羧酸(0.10g,0.22mmol)、(R)-2-氨基丁烷-1-醇(65mg,0.73mmol)、HBTU(108mg,0.28mmol)和HOBT(44mg,0.28mmol)。然后添加DMF(1mL),接着添加N,N-二异丙基乙胺(0.11mL,0.66mmol)。将黄色反应混合物在室温搅拌过夜,然后以水淬灭并以EtOAc(30mL)萃取。将有机层以饱和NaHCO3和水洗涤一次。将合并的有机层以EtOAc(25mL)反萃取。将合并的有机层经硫酸钠干燥,过滤并浓缩。将残余物经色谱在SiO2上以EtOAc/己烷(梯度:0-50%EtOAc)纯化得到70mg(61%)的2-(6-氯-1-甲基-1H-吲唑-3-基)-5-(2-三甲基甲硅烷基-乙氧基甲基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-羧酸((R)-1-羟基甲基-丙基)-酰胺,为灰白色固体。
步骤2
2-(6-氯-1-甲基-1H-吲唑-3-基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-羧酸((R)-1-羟基甲基-丙基)-酰胺
在密封的25mL圆底烧瓶中,将2-(6-氯-1-甲基-1H-吲唑-3-基)-5-(2-三甲基甲硅烷基-乙氧基甲基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-羧酸((R)-1-羟基甲基-丙基)-酰胺(34mg,0.064mmol)和TFA(0.6ml,7.8mmol)与二氯甲烷(2ml)混合得到橙色溶液。将反应混合物在室温搅拌2.5小时。然后减压浓缩反应混合物。将所得粗固体溶解于二氯甲烷(2mL)中并添加乙二胺(420μl,6.3mmol)。将反应混合物在室温搅拌18小时。浓缩反应混合物且用水沉淀残余物。搅拌悬浮液1小时和过滤收集粗固体。将粗固体通过研磨(1:1二氯甲烷/庚烷)纯化得到8mg(30%)的2-(6-氯-1-甲基-1H-吲唑-3-基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-羧酸((R)-1-羟基甲基-丙基)-酰胺,为黄色固体。MS:[M+H]+=399;1H NMR(DMSO-d6)δ:12.74(宽单峰,1H),9.13(s,1H),8.64(d,J=8.7Hz,1H),8.43(s,1H),8.18(d,J=9.1Hz,1H),7.98(d,J=1.1Hz,1H),7.20-7.38(m,1H),5.04(t,J=5.1Hz,1H),4.17(s,3H),3.98-4.13(m,1H),3.50-3.70(m,2H),1.55-1.85(m,2H),0.94(t,J=7.4Hz,3H).
实施例162.
2-(6-氯-1-甲基-1H-吲唑-3-基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-羧酸((R)-1-甲氧基甲基-丙基)-酰胺
步骤1
2-(6-氯-1-甲基-1H-吲唑-3-基)-5-(2-三甲基甲硅烷基-乙氧基甲基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-羧酸((R)-1-甲氧基甲基-丙基)-酰胺
在25mL反应管中,将NaH(60%在矿物油中,20mg,0.50mmol)与DMF(0.2ml)混合得到灰色悬浮液。将反应混合物置于氩气下且添加2-(6-氯-1-甲基-1H-吲唑-3-基)-5-(2-三甲基甲硅烷基-乙氧基甲基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-羧酸((R)-1-羟基甲基-丙基)-酰胺(161mg,0.30mmol)在DMF(1ml)中的溶液。将反应混合物在室温搅拌30分钟,然后添加碘甲烷(23μl,0.37mmol)。搅拌反应混合物18小时,然后以氯化铵水溶液(5mL)淬灭且以EtOAc(3x10mL)萃取。将合并的有机层以盐水洗涤,经Na2SO4干燥并浓缩。将粗物质经色谱在SiO2上以EtOAc/己烷(梯度:0%至40%EtOAc)纯化得到25mg(15%)的2-(6-氯-1-甲基-1H-吲唑-3-基)-5-(2-三甲基甲硅烷基-乙氧基甲基)-5H-吡咯并[2,3b]吡嗪-7-羧酸((R)-1-甲氧基甲基-丙基)-酰胺,为灰白色固体。1H NMR(DMSO-d6)δ:9.18(s,1H),8.65(s,1H),8.50(d,J=8.7Hz,1H),8.15(d,J=9.4Hz,1H),8.02(d,J=1.5Hz,1H),7.26(dd,J=8.5,1.7Hz,1H),5.74(s,2H),4.19(s,3H),4.14-4.30(m,1H),3.60(t,J=7.9Hz,2H),3.54-3.63(m,1H),3.49(dd,J=9.4,4.2Hz,1H),3.27(s,3H),1.78(dq,J=13.6,6.9Hz,1H),1.66(dq,J=14.5,7.0Hz,1H),0.96(t,J=7.4Hz,3H),0.86(t,J=7.9Hz,2H),-0.08(s,9H).
步骤2
2-(6-氯-1-甲基-1H-吲唑-3-基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-羧酸((R)-1-甲氧基甲基-丙基)-酰胺
在密封的25mL圆底烧瓶中,将2-(6-氯-1-甲基-1H-吲唑-3-基)-5-(2-三甲基甲硅烷基-乙氧基甲基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-羧酸((R)-1-甲氧基甲基-丙基)-酰胺(40mg,0.074mmol)和TFA(0.9ml,11.7mmol)与二氯甲烷(3ml)混合得到橙色溶液。将反应混合物在室温搅拌2.5小时。然后减压浓缩反应混合物。将所得粗固体溶解于二氯甲烷(3mL)中并添加乙二胺(500μl,7.4mmol)。将反应混合物在室温搅拌18小时。浓缩反应混合物且用水沉淀残余物。搅拌悬浮液1小时和过滤收集粗固体。将粗固体通过研磨(11:1:1热庚烷/二氯甲烷/EtOAc)纯化得到21mg(69%)的2-(6-氯-1-甲基-1H-吲唑-3-基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-羧酸((R)-1-甲氧基甲基-丙基)-酰胺,为灰白色固体。MS:[M+H]+=413;1HNMR(DMSO-d6)δ:12.84(宽单峰,1H),9.12(s,1H),8.51(d,J=8.7Hz,1H),8.45(s,1H),8.17(d,J=9.1Hz,1H),8.01(d,J=1.5Hz,1H),7.25(dd,J=8.7,1.5Hz,1H),4.16-4.27(m,1H),4.18(s,3H),3.57(dd,J=9.6,4.3Hz,1H),3.47(dd,J=9.6,4.3Hz,1H),3.27(s,3H),1.71-1.89(m,1H),1.47-1.71(m,1H),0.96(t,J=7.4Hz,3H).
实施例163.
2-(6-氯-1-甲基-1H-吲唑-3-基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-羧酸(5-羟基-1,5-二甲基-己基)-酰胺
根据实施例145中阐述的操作制备,以6-氨基-2-甲基庚-2-醇盐酸盐代替步骤1中的顺式-环己烷-1,4-二胺。最终化合物分离为白色固体,23mg(35%);[M+Na]+=477;1H NMR(DMSO-d6)δ:12.84(宽单峰,1H),9.10(s,1H),8.34-8.48(m,2H),8.02(t,J=4.2Hz,2H),7.31(dd,J=8.5,1.3Hz,1H),4.18(s,3H),4.07-4.16(m,1H),1.32-1.70(m,6H),1.29(d,J=6.8Hz,3H),0.96(d,J=2.3Hz,6H).
实施例164.
2-(6-氯-1-甲基-1H-吲唑-3-基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-羧酸((S)-2-羟基-1-甲基-乙基)-酰胺
步骤1
2-(6-氯-1-甲基-1H-吲唑-3-基)-5-(2-三甲基甲硅烷基-乙氧基甲基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-羧酸((S)-2-羟基-1-甲基-乙基)-酰胺
向25mL圆底烧瓶中装入2-(6-氯-1-甲基-1H-吲唑-3-基)-5-(2-三甲基甲硅烷基-乙氧基甲基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-羧酸(0.20g,0.44mmol)、(S)-2-氨基丙烷-1-醇(0.10ml,1.31mmol)、HBTU(331mg,0.87mmol)和HOBT(134mg,0.87mmol)。然后添加DMF(1mL),接着添加N,N-二异丙基乙胺(0.31mL,1.75mmol)。将黄色反应混合物在室温搅拌过夜,然后以水淬灭,并以EtOAc(30mL)萃取。将有机层以饱和NaHCO3和水洗涤一次。将合并的有机层以EtOAc(25mL)反萃取。将合并的有机层经硫酸钠干燥,过滤并浓缩。将残余物经色谱在SiO2上以EtOAc/己烷(梯度:0-100%EtOAc)纯化得到149mg(66%)的2-(6-氯-1-甲基-1H-吲唑-3-基)-5-(2-三甲基甲硅烷基-乙氧基甲基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-羧酸((S)-2-羟基-1-甲基-乙基)-酰胺,为白色固体。
步骤2
2-(6-氯-1-甲基-1H-吲唑-3-基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-羧酸((S)-2-羟基-1-甲基-乙基)-酰胺
在密封的25mL圆底烧瓶中,将2-(6-氯-1-甲基-1H-吲唑-3-基)-5-(2-三甲基甲硅烷基-乙氧基甲基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-羧酸((S)-2-羟基-1-甲基-乙基)-酰胺(41mg,0.080mmol)和TFA(0.6ml,7.8mmol)与二氯甲烷(2ml)混合得到橙色溶液。室温搅拌反应混合物直到耗尽起始物质(2.5小时)。然后减压浓缩反应混合物。将所得粗固体溶解于二氯甲烷(2mL)中并添加乙二胺(400μl,5.9mmol)。将反应混合物在室温搅拌18小时。浓缩反应混合物且用水沉淀残余物。搅拌悬浮液1小时并过滤收集粗固体。将该粗固体通过研磨(9:1二氯甲烷/MeOH)纯化得到11mg(36%)的2-(6-氯-1-甲基-1H-吲唑-3-基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-羧酸((S)-2-羟基-1-甲基-乙基)-酰胺,为灰白色固体。MS:[M+H]+=385;1H NMR(300MHz,DMSO-d6)δ:12.84(宽单峰,1H),9.13(s,1H),8.66(d,J=8.7Hz,1H),8.43(s,1H),8.21(d,J=8.3Hz,1H),7.91-8.04(m,1H),7.32(dd,J=8.7,1.5Hz,1H),5.09(t,J=5.1Hz,1H),4.18(s,3H),4.08-4.33(m,1H),3.58(t,J=4.7Hz,2H),1.28(d,J=6.8Hz,3H).
实施例165.
2-(6-氯-1-甲基-1H-吲唑-3-基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-羧酸((S)-2-甲氧基-1-甲基-乙基)-酰胺
步骤1
2-(6-氯-1-甲基-1H-吲唑-3-基)-5-(2-三甲基甲硅烷基-乙氧基甲基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-羧酸((S)-2-甲氧基-1-甲基-乙基)-酰胺
在10mL圆底烧瓶中,将2-(6-氯-1-甲基-1H-吲唑-3-基)-5-(2-三甲基甲硅烷基-乙氧基甲基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-羧酸((S)-2-羟基-1-甲基-乙基)-酰胺(44mg,0.085mmol)溶解于THF(0.85ml)中得到无色溶液。将反应混合物在冰浴中冷却。将碎KOH(64mg,1.14mmol)、催化性18-冠醚-6和碘甲烷(9μl,0.147mmol)连续添加至该冷却的溶液中。于0℃搅拌反应混合物1小时,然后移去冰浴。将反应混合物在室温搅拌2小时,然后以二氯甲烷稀释(10mL),并以氯化铵水溶液(10mL)、水(10mL)和饱和碳酸氢钠(10mL)洗涤。将有机层经Na2SO4干燥并浓缩。将粗物质经色谱在SiO2上以EtOAc/庚烷(梯度:0%-100%EtOAc)纯化得到22mg(49%)的2-(6-氯-1-甲基-1H-吲唑-3-基)-5-(2-三甲基甲硅烷基-乙氧基甲基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-羧酸((S)-2-甲氧基-1-甲基-乙基)-酰胺,为白色固体。MS:[M+Na]+=551.
步骤2
2-(6-氯-1-甲基-1H-吲唑-3-基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-羧酸((S)-2-甲氧基-1-甲基-乙基)-酰胺
在密封的25mL圆底烧瓶中,将2-(6-氯-1-甲基-1H-吲唑-3-基)-5-(2-三甲基甲硅烷基-乙氧基甲基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-羧酸((S)-2-甲氧基-1-甲基-乙基)-酰胺(32mg,0.061mmol)和TFA(1.2ml,15.6mmol)与二氯甲烷(4ml)混合得到橙色溶液。室温搅拌反应混合物直到耗尽起始物质(2.5小时)。然后减压浓缩反应混合物。将所得粗固体溶解于二氯甲烷(2mL)中并添加乙二胺(300μl,4.5mmol)。将反应混合物在室温搅拌18小时。浓缩反应混合物且用水沉淀残余物。搅拌悬浮液1小时和过滤收集粗固体。将粗固体通过研磨(9:1二氯甲烷/庚烷)纯化得到22mg(93%)的2-(6-氯-1-甲基-1H-吲唑-3-基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-羧酸((S)-2-甲氧基-1-甲基-乙基)-酰胺,为灰白色固体。MS:[M+H]+=399;1H NMR(DMSO-d6)δ:12.72(宽单峰,1H),9.11(s,1H),8.53(d,J=8.7Hz,1H),8.44(s,1H),8.20(d,J=8.7Hz,1H),8.01(d,J=1.9Hz,1H),7.28(dd,J=8.7,1.9Hz,1H),4.30-4.45(m,1H),4.18(s,3H),3.50(qd,J=9.6,4.7Hz,2H),3.27(s,3H),1.31(d,J=6.8Hz,3H).
实施例166.
2-(6-氯-1-甲基-1H-吲唑-3-基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-羧酸(2-甲氧基-1-甲氧基甲基-乙基)-酰胺
步骤1
2-(6-氯-1-甲基-1H-吲唑-3-基)-5-(2-三甲基甲硅烷基-乙氧基甲基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-羧酸(2-羟基-1-羟基甲基-乙基)-酰胺
向25mL圆底烧瓶中装入2-(6-氯-1-甲基-1H-吲唑-3-基)-5-(2-三甲基甲硅烷基-乙氧基甲基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-羧酸(0.20g,0.44mmol)、2-氨基丙烷-1,3-二醇(119mg,1.31mmol),HBTU(331mg,0.87mmol)和HOBT(134mg,0.87mmol)。然后添加DMF(1mL),接着添加N,N-二异丙基乙胺(0.31mL,1.75mmol)。将黄色反应混合物在室温搅拌过夜,然后以水淬灭并以EtOAc(30mL)萃取。将有机层以饱和NaHCO3和水洗涤一次。将合并的有机层以EtOAc(25mL)反萃取。将合并的有机层经硫酸钠干燥,过滤并浓缩。将残余物经色谱在SiO2上以EtOAc/己烷(梯度:0-100%EtOAc)纯化得到157mg(68%)的2-(6-氯-1-甲基-1H-吲唑-3-基)-5-(2-三甲基甲硅烷基-乙氧基甲基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-羧酸(2-羟基-1-羟基甲基-乙基)-酰胺,为白色固体。MS:[M+Na]+=552.
步骤2
2-(6-氯-1-甲基-1H-吲唑-3-基)-5-(2-三甲基甲硅烷基-乙氧基甲基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-羧酸(2-甲氧基-1-甲氧基甲基-乙基)-酰胺
在10mL圆底烧瓶中,将2-(6-氯-1-甲基-1H-吲唑-3-基)-5-(2-三甲基甲硅烷基-乙氧基甲基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-羧酸(2-羟基-1-羟基甲基-乙基)-酰胺(60mg,0.113mmol)溶解于THF(2.5ml)中。将反应混合物在冰浴中冷却并连续添加碎KOH(76mg,1.35mmol)、18-冠醚-6(15mg,0.057mmol)和碘甲烷(18μl,0.28mmol)。于0℃搅拌反应混合物1小时,然后移去冰浴。将反应混合物在室温搅拌2小时,然后以二氯甲烷稀释(10mL)并以水(10mL)和饱和碳酸氢钠(10mL)洗涤。将有机层经Na2SO4干燥并浓缩。将粗物质经色谱在SiO2上以EtOAc/庚烷(梯度:0%-100%EtOAc)纯化得到53mg(84%)的2-(6-氯-1-甲基-1H-吲唑-3-基)-5-(2-三甲基甲硅烷基-乙氧基甲基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-羧酸(2-甲氧基-1-甲氧基甲基-乙基)-酰胺,为白色固体。MS:[M+H]+=559.
步骤3
2-(6-氯-1-甲基-1H-吲唑-3-基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-羧酸(2-甲氧基-1-甲氧基甲基-乙基)-酰胺
在密封的25mL圆底烧瓶中,将2-(6-氯-1-甲基-1H-吲唑-3-基)-5-(2-三甲基甲硅烷基-乙氧基甲基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-羧酸(2-甲氧基-1-甲氧基甲基-乙基)-酰胺(40mg,0.071mmol)和TFA(0.6ml,7.8mmol)与二氯甲烷(2ml)混合得到橙色溶液。室温搅拌反应混合物直到耗尽起始物质(2.5小时)。然后减压浓缩反应混合物。将所得粗固体溶解于二氯甲烷(2mL)中并添加乙二胺(400μl,5.9mmol)。将反应混合物在室温搅拌18小时。浓缩反应混合物且用水沉淀残余物。搅拌悬浮液1小时和过滤收集粗固体。将粗固体通过研磨(己烷/二氯甲烷/EtOAc)纯化得到19mg(62%)的2-(6-氯-1-甲基-1H-吲唑-3-基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-羧酸(2-甲氧基-1-甲氧基甲基-乙基)-酰胺,为灰白色固体。MS:[M+H]+=429;1H NMR(300MHz,DMSO-d6)δ:12.88(宽单峰,1H),9.13(s,1H),8.55(d,J=8.7Hz,1H),8.46(s,1H),8.30(d,J=9.1Hz,1H),8.01(s,1H),7.25(dd,J=8.7,1.1Hz,1H),4.33-4.67(m,1H),4.18(s,3H),3.61(dd,J=9.8,5.3Hz,2H),3.56(dd,J=9.4,5.3Hz,1H),3.27(s,3H).
实施例167.
2-(6-氯-1-甲基-1H-吲唑-3-基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-羧酸(顺式-3-氰基-环己基)-酰胺
步骤1:
(顺式-3-氨基甲酰基-环己基)-氨基甲酸叔丁酯
在100mL圆底烧瓶中,将顺式-3-(叔丁氧基羰基氨基)-环己烷羧酸(2.26g,9.29mmol)悬浮于THF(15mL)中。在丙酮-干冰浴中将悬浮液冷却至-10℃。向冷却的悬浮液中缓慢地添加TEA(2.6mL,18.7mmol)并接着添加氯甲酸乙酯(1.03mL,10.7mmol)使得保持温度。添加时移去冷却浴且将反应混合物在室温搅拌3小时。将反应混合物冷却至-10℃并缓慢地添加NH4OH(2.17mL,55.7mmol)。室温搅拌18小时后,将沉淀通过过滤收集。将沉淀以水洗涤并于50℃真空干燥得到1.67g(74%)的(顺式-3-氨基甲酰基-环己基)-氨基甲酸叔丁酯,为白色固体。1H NMR(300MHz,DMSO-d6)δ:7.19(宽单峰,1H),6.76(d,J=7.9Hz,1H),6.65(宽单峰,1H),3.04-3.30(m,1H),1.98-2.21(m,1H),1.50-1.84(m,4H),1.37(s,9H),0.90-1.29(m,4H)
步骤2:
顺式-(3-氰基-环己基)-氨基甲酸叔丁酯
在25mL圆底烧瓶中,将(顺式-3-氨基甲酰基-环己基)-氨基甲酸叔丁酯(1.00g,4.13mmol)悬浮于二氯甲烷(7mL)中。在丙酮-干冰浴中将悬浮液冷却至-10℃。向冷却的悬浮液中缓慢地添加三乙胺(1.15mL,8.25mmol)并接着添加TFAA(0.62mL,4.39mmol)从而保持温度。在该温度搅拌反应混合物3小时且然后以水和二氯甲烷稀释。将有机层以水洗涤,经Na2SO4干燥并真空浓缩。将粗物质通过快速色谱(硅胶,0%至60%EtOAc的庚烷溶液)纯化得到0.803g(87%)的顺式-(3-氰基-环己基)-氨基甲酸叔丁酯,为白色结晶固体。1H NMR(300MHz,DMSO-d6)δ:6.86(d,J=7.9Hz,1H),3.09-3.30(m,1H),2.77(tt,J=12.0,3.3Hz,1H),2.04(d,J=12.1Hz,1H),1.90(d,J=9.1Hz,1H),1.61-1.80(m,2H),1.37(s,9H),1.21-1.35(m,3H),0.98-1.20(m,1H).
步骤3:
顺式-3-氨基-环己烷甲腈三氟乙酸盐
在25mL圆底烧瓶中,将顺式-(3-氰基-环己基)-氨基甲酸叔丁酯(212mg,0.945mmol)与二氯甲烷(3ml)混合得到无色溶液。添加三氟乙酸(0.9mL,11.7mmol)得到黄色溶液,其在室温搅拌1.5小时。然后减压浓缩反应混合物。将残余物与甲苯共沸得到321mg的顺式-3-氨基-环己烷甲腈三氟乙酸盐,为粗固体,其不经纯化用于后续步骤。1H NMR(300MHz,DMSO-d6)δ:7.96(宽单峰,3H),2.93-3.14(m,1H),2.87(tt,J=12.2,3.5Hz,1H),2.22(d,J=12.1Hz,1H),1.96(d,J=10.2Hz,1H),1.87(d,J=11.3Hz,1H),1.68-1.81(m,1H),1.49(q,J=12.1Hz,1H),1.18-1.41(m,3H).
步骤4
2-(6-氯-1-甲基-1H-吲唑-3-基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-羧酸(顺式-3-氰基-环己基)-酰胺
根据在实施例2中阐述的操作制备,以顺式-3-氨基环己烷甲腈三氟乙酸盐代替步骤1中的顺式-环己烷-1,4-二胺。分离最终化合物,为灰白色固体,37mg(74%);MS:[M+H]+=434;1H NMR(DMSO-d6)δ:12.87(宽单峰,1H),9.10(s,1H),8.46(s,1H),8.44(d,J=8.7Hz,1H),8.08(d,J=7.6Hz,1H),8.01(d,J=1.5Hz,1H),7.34(dd,J=8.5,1.7Hz,1H),4.18(s,3H),3.82-4.05(m,1H),2.91-3.08(m,1H),1.94-2.16(m,2H),1.77-1.92(m,J=7.2,4.2Hz,1H),1.29-1.73(m,5H)。
实施例168.
2-(6-氯-1-甲基-1H-吲唑-3-基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-羧酸[(R)-1-(2,2,2-三氟-乙基)-哌啶-3-基]-酰胺盐酸盐
步骤1
[(R)-1-(2,2,2-三氟-乙基)-哌啶-3-基]-氨基甲酸叔丁酯
在25mL圆底烧瓶中,将(R)-哌啶-3-基-氨基甲酸叔丁酯(1.00g,4.99mmol)和DIPEA(0.96mL,5.49mmol)与二氯甲烷(20ml)混合。将反应混合物置于氩气氛下并在冰浴中冷却。滴加1,1,1-三氟-2-(三氟甲基磺酰基)乙烷(1.19g,5.49mmol)的溶液。将反应混合物温热至室温。搅拌18小时后,将反应混合物以二氯甲烷稀释并连续以水、饱和碳酸氢盐和盐水洗涤。将有机层经Na2SO4干燥并浓缩。将粗物质通过快速色谱(硅胶,24g,0%至70%EtOAc的庚烷溶液)纯化得到1.20g(85%)的[(R)-1-(2,2,2-三氟-乙基)-哌啶-3-基]-氨基甲酸叔丁酯,为白色结晶固体。1H NMR(300MHz,CDCl3)δ:4.97(宽单峰,1H),3.75(宽单峰,1H),2.98(q,J=9.4Hz,2H),2.82(app d,J=11.7Hz,1H),2.64-2.76(m,1H),2.46-2.64(m,2H),1.66-1.81(m,1H),1.60(m.,3H),1.45(s,9H).
步骤2:
(R)-1-(2,2,2-三氟乙基)哌啶-3-胺二盐酸盐
在250mL圆底烧瓶中,将[(R)-1-(2,2,2-三氟-乙基)-哌啶-3-基]-氨基甲酸叔丁酯(1.20g,4.25mmol)与MeOH(100ml)混合得到无色悬浮液。将反应混合物置于氮气氛下并在冰浴中冷却。缓慢地添加乙酰基氯(6.04ml,85.0mmol)。于5℃再搅拌反应混合物10分钟,然后温热至室温。室温搅拌17小时后,将反应混合物浓缩至干得到1.10g(定量)的(R)-1-(2,2,2-三氟乙基)哌啶-3-胺二盐酸盐,为浅黄色固体。1H NMR(300MHz,DMSO-d6)δ:8.27(宽单峰,3H),3.39(q,J=10.2Hz,2H),3.15-3.27(m,1H),3.10(dd,J=11.3,3.0Hz,1H),2.83(app d,J=11.7Hz,1H),2.56(d,J=10.2Hz,1H),2.45(d,J=9.8Hz,1H),1.83-2.04(m,1H),1.62-1.83(m,1H),1.45-1.62(m,1H),1.25-1.45(m,1H).
步骤3
2-(6-氯-1-甲基-1H-吲唑-3-基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-羧酸[(R)-1-(2,2,2-三氟-乙基)-哌啶-3-基]-酰胺盐酸盐
根据在实施例2中阐述的操作制备,以(R)-1-(2,2,2-三氟乙基)哌啶-3-胺二盐酸盐替代步骤1中的顺式-环己烷-1,4,二胺。最终化合物以HCl(4.0M的1,4-二噁烷溶液)处理分离出盐,为橙色固体,32mg(46%);MS:[M+H]+=492;1H NMR(300MHz,DMSO-d6)δ:12.92(d,J=2.6Hz,1H),9.09(s,1H),8.46(d,J=3.0Hz,1H),8.43(d,J=8.7Hz,1H),8.21(宽单峰,1H),8.11(d,J=8.3Hz,1H),8.02(s,1H),7.32(dd,J=8.7,1.1Hz,1H),4.09-4.25(m,1H),4.09-4.25(m,3H),3.30-3.52(m,1H),3.25(br.d,J=9.8Hz,1H),3.02-3.11(m,1H),2.88-3.01(m,1H),1.96-2.07(m,1H),1.78-1.91(m,1H),1.57-1.75(m,1H),1.36-1.56(m,1H)。
实施例169.
2-(6-氯-1-甲基-1H-吲唑-3-基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-羧酸(3-氨基-环己基)-酰胺盐酸盐
根据实施例145中阐述的操作制备,以环己烷-1,3-二胺替代步骤1中的顺式-环己烷-1,4,二胺。最终化合物以HCl(4.0M的1,4-二噁烷溶液)处理分离出盐,为黄色固体(非对映异构体的混合物),34mg(56%);MS:[M+H]+=424;1H NMR(DMSO-d6)δ:12.92(d,J=3.0Hz,1H),9.12(s,1H),8.48(s,1H),8.42(d,J=8.7Hz,1H),8.11(d,J=7.9Hz,1H),8.03(d,J=1.1Hz,1H),7.46(dd,J=8.7,1.1Hz,1H),4.18(s,3H),3.96-4.12(m,1H),3.19-3.30(m,1H),1.18-2.14(m,8H).
实施例170.
2-(6-氯-4-氟-1-甲基-1H-吲唑-3-基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-羧酸((S)-2-甲氧基-1-甲基-乙基)-酰胺
步骤1
2-(6-氯-4-氟-1H-吲唑-3-基)-5-(2-三甲基甲硅烷基-乙氧基甲基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-羧酸((S)-2-甲氧基-1-甲基-乙基)-酰胺
向25mL圆底烧瓶中装入2-(6-氯-4-氟-1H-吲唑-3-基)-5-(2-三甲基甲硅烷基-乙氧基甲基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-羧酸(0.39g,0.84mmol)、(S)-1-甲氧基丙烷-2-胺盐酸盐(253mg,2.0mmol)、HBTU(457mg,1.27mmol)和HOBT(125mg,0.93mmol)。然后添加DMF(2mL),接着添加N,N-二异丙基乙胺(0.59mL,3.38mmol)。将黄色反应混合物在室温搅拌过夜,然后以水淬灭并以EtOAc(30mL)萃取。将有机层以饱和NaHCO3和水洗涤一次。将合并的有机层以EtOAc(25mL)反萃取。将合并的有机层经硫酸钠干燥,过滤并浓缩。将残余物经色谱在SiO2上以EtOAc/庚烷(梯度:0-100%EtOAc)纯化得到401mg(89%)的2-(6-氯-4-氟-1H-吲唑-3-基)-5-(2-三甲基甲硅烷基-乙氧基甲基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-羧酸((S)-2-甲氧基-1-甲基-乙基)-酰胺,为浅黄色固体。MS:[M+H]+=533.
步骤2
2-(6-氯-4-氟-1-甲基-1H-吲唑-3-基)-5-(2-三甲基甲硅烷基-乙氧基甲基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-羧酸((S)-2-甲氧基-1-甲基-乙基)-酰胺
向50mL圆底烧瓶装入2-(6-氯-4-氟-1H-吲唑-3-基)-5-(2-三甲基甲硅烷基-乙氧基甲基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-羧酸((S)-2-甲氧基-1-甲基-乙基)-酰胺(120mg,0.225mmol)和DMF(0.45ml)得到浅黄色溶液。将反应混合物置于氩气氛下并在0℃浴中冷却。添加NaH(60%在矿物油中,23mg,0.575mmol)。于0℃搅拌反应混合物10分钟并于室温搅拌10分钟,然后返回至冷却浴并添加碘甲烷(21μl,0.34mmol)。将反应混合物在0℃搅拌10分钟,然后移去浴并再于室温继续搅拌18小时。将反应混合物以水淬灭且将沉淀通过过滤收集。将粗物质通过色谱在SiO2上以EtOAc/庚烷(梯度:0-100%EtOAc)纯化得到41mg(33%)的2-(6-氯-4-氟-1-甲基-1H-吲唑-3-基)-5-(2-三甲基甲硅烷基-乙氧基甲基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-羧酸((S)-2-甲氧基-1-甲基-乙基)-酰胺,为灰白色固体。MS:[M+H]+=547.
步骤3
2-(6-氯-4-氟-1-甲基-1H-吲唑-3-基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-羧酸((S)-2-甲氧基-1-甲基-乙基)-酰胺
在25mL圆底烧瓶中,将2-(6-氯-4-氟-1-甲基-1H-吲唑-3-基)-5-(2-三甲基甲硅烷基-乙氧基甲基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-羧酸((S)-2-甲氧基-1-甲基-乙基)-酰胺(40mg,0.073mmol)和TFA(0.60ml,7.8mmol)与二氯甲烷(2ml)混合得到橙色溶液。将反应混合物在室温搅拌2.5小时,然后减压浓缩。将所得粗固体溶解于二氯甲烷(2mL)中并添加乙二胺(0.40ml,5.9mmol)。将反应混合物在室温搅拌18小时,然后浓缩且将残余物以水沉淀。搅拌悬浮液1小时和过滤收集粗固体。将粗固体通过研磨(二氯甲烷/庚烷)纯化得到17mg(55%)的2-(6-氯-4-氟-1-甲基-1H-吲唑-3-基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-羧酸((S)-2-甲氧基-1-甲基-乙基)-酰胺,为灰白色固体。MS:[M+H]+=417;1H NMR(300MHz,DMSO-d6)δ:12.68(宽单峰,1H),9.00(s,1H),8.44(s,1H),8.32(d,J=8.7Hz,1H),7.89(d,J=1.5Hz,1H),7.27(dd,J=10.6,1.5Hz,1H),4.31(dt,J=13.5,7.0Hz,1H),4.19(s,3H),3.45(dd,J=9.3,5.8Hz,3H),3.36(dd,J=9.8,5.3Hz,1H),3.20(s,3H),1.22(d,J=6.8Hz,3H).
实施例171.
2-(6-氯-1-甲基-1H-吲唑-3-基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-羧酸((S)-2-乙氧基-1-甲基-乙基)-酰胺
根据实施例145中阐述的操作制备,以(S)-1-乙氧基丙烷-2-胺盐酸盐替代步骤1中的顺式-环己烷-1,4,二胺。分离最终化合物,为白色固体,35mg(68%);MS:[M+H]+=413;1H NMR(300MHz,DMSO-d6)δ:12.49-13.15(m,1H),9.11(s,1H),8.41-8.48(m,1H),8.41-8.56(m,2H),8.21(d,J=8.3Hz,1H),8.00(d,J=1.5Hz,1H),7.28(dd,J=8.7,1.5Hz,1H),4.27-4.45(m,1H),4.18(s,3H),3.56(dd,J=9.4,4.5Hz,1H),3.48(dd,J=9.2,4.5Hz,1H),3.45(q,J=7.2Hz,2H),1.33(d,J=6.8Hz,3H),0.97(t,J=7.0Hz,3H).
实施例172.
2-(6-氯-1-甲基-1H-吲唑-3-基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-羧酸(2-羟基-1-甲基-丙基)-酰胺
根据实施例145中阐述的操作制备,以3-氨基丁烷-2-醇替代步骤1中的顺式-环己烷-1,4,二胺。分离出最终化合物,为灰白色固体(非对映异构体的混合物),22mg(73%);[M+H]+=399;1H NMR(300MHz,DMSO-d6)δ:12.76(宽单峰,1H),9.15(s,1H),8.78(d,J=8.7Hz,1H),8.42(s,1H),8.12(d,J=9.4Hz,1H),7.96(s,1H),7.33(dd,J=8.7,1.5Hz,1H),5.18(d,J=4.2Hz,1H),4.17(s,3H),4.12-4.22(m,1H),3.77-3.89(m,1H),1.27(d,J=6.8Hz,3H),1.11(d,J=6.4Hz,3H).
实施例173.
2-(6-氯-1-甲基-1H-吲唑-3-基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-羧酸((S)-1-甲氧基甲基-丙基)-酰胺
根据实施例166中阐述的操作制备,以(S)-2-氨基丁烷-1-醇替代步骤1中的2-氨基丙烷-1,3-二醇。分离出最终化合物,为灰白色固体,20mg(70%);MS:[M+H]+=413;1H NMR(300MHz,DMSO-d6)δ:12.85(宽单峰,1H),9.12(s,1H),8.50(d,J=8.7Hz,1H),8.44(s,1H),8.17(d,J=9.1Hz,1H),8.00(d,J=1.5Hz,1H),7.25(dd,J=8.7,1.5Hz,1H),4.15-4.20(m,3H),4.10-4.32(m,1H),3.57(dd,J=9.5,4.2Hz,1H),3.47(dd,J=9.7,4.3Hz,1H),3.27(s,3H),1.50-1.92(m,2H),0.96(t,J=7.4Hz,3H).
实施例174.
2-(6-氯-1-甲基-1H-吲唑-3-基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-羧酸[(R)-2-(3-氟-氮杂环丁烷-1-基)-1-甲氧基甲基-2-氧代-乙基]-酰胺
步骤1
[(R)-2-(3-氟-氮杂环丁烷-1-基)-1-甲氧基甲基-2-氧代-乙基]-氨基甲酸叔丁酯
向25mL圆底烧瓶中装入(R)-2-叔丁氧基羰基氨基-3-甲氧基-丙酸(0.40g,1.82mmol)、3-氟氮杂环丁烷盐酸盐(204mg,1.82mmol)、HBTU(989mg,2.74mmol)和HOBt(375mg,2.74mmol)。然后添加DMF(3.6mL),接着添加N,N-二异丙基乙胺(1.27mL,7.3mmol)。将反应混合物在室温搅拌过夜,然后以水淬灭并以EtOAc(30mL)萃取。将有机层以饱和NaHCO3和水洗涤一次。将合并的有机层以EtOAc(25mL)反萃取。将合并的有机层经硫酸钠干燥,过滤并浓缩。将残余物经色谱在SiO2上以EtOAc/庚烷(梯度:0-50%EtOAc)纯化得到267mg(53%)的[(R)-2-(3-氟-氮杂环丁烷-1-基)-1-甲氧基甲基-2-氧代-乙基]-氨基甲酸叔丁酯,为白色固体。
步骤2
(R)-2-氨基-1-(3-氟-氮杂环丁烷-1-基)-3-甲氧基-丙-1-酮三氟乙酸盐
在25mL圆底烧瓶中,将[(R)-2-(3-氟-氮杂环丁烷-1-基)-1-甲氧基甲基-2-氧代-乙基]-氨基甲酸叔丁酯(265mg,0.96mmol)溶解于二氯甲烷(5ml)中。将反应混合物冷却至0℃和缓慢地添加三氟乙酸(1.5ml,19.5mmol)。将反应混合物在室温搅拌3小时,然后浓缩,得到(R)-2-氨基-1-(3-氟-氮杂环丁烷-1-基)-3-甲氧基-丙-1-酮三氟乙酸盐,为无色粘稠油状物,其不经进一步纯化即可使用。
步骤3
2-(6-氯-1-甲基-1H-吲唑-3-基)-5-(2-三甲基甲硅烷基-乙氧基甲基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-羧酸[(R)-2-(3-氟-氮杂环丁烷-1-基)-1-甲氧基甲基-2-氧代-乙基]-酰胺
向10mL圆底烧瓶中装入2-(6-氯-1-甲基-1H-吲唑-3-基)-5-(2-三甲基甲硅烷基-乙氧基甲基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-羧酸(75mg,0.16mmol)、(R)-2-氨基-1-(3-氟-氮杂环丁烷-1-基)-3-甲氧基-丙-1-酮三氟乙酸盐(63mg,0.21mmol)和HATU(63mg,0.21mmol)。然后添加乙腈(1mL),接着N,N-二异丙基乙胺(0.55mL,3.15mmol)。将浅黄色反应混合物在室温搅拌过夜,然后以水淬灭。将混合物以二氯甲烷萃取。合并有机层,经Na2SO4干燥,并浓缩。将残余物经色谱在SiO2上以EtOAc/庚烷(梯度:5-90%EtOAc)纯化得到47mg(47%)的2-(6-氯-1-甲基-1H-吲唑-3-基)-5-(2-三甲基甲硅烷基-乙氧基甲基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-羧酸[(R)-2-(3-氟-氮杂环丁烷-1-基)-1-甲氧基甲基-2-氧代-乙基]-酰胺,为灰白色固体。MS:[M+H]+=616.
步骤4
2-(6-氯-1-甲基-1H-吲唑-3-基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-羧酸[(R)-2-(3-氟-氮杂环丁烷-1-基)-1-甲氧基甲基-2-氧代-乙基]-酰胺
在25mL圆底烧瓶中,将2-(6-氯-1-甲基-1H-吲唑-3-基)-5-(2-三甲基甲硅烷基-乙氧基甲基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-羧酸[(R)-2-(3-氟-氮杂环丁烷-1-基)-1-甲氧基甲基-2-氧代-乙基]-酰胺(47mg,0.076mmol)和TFA(1.2ml,15.6mmol)与二氯甲烷(4ml)混合得到橙色溶液。将反应混合物在室温搅拌2.5小时,然后减压浓缩。将所得粗固体溶解于二氯甲烷(4mL)中并添加乙二胺(0.36ml,5.3mmol)。将反应混合物在室温搅拌18小时,然后浓缩且将残余物以水沉淀。搅拌悬浮液1小时和过滤收集粗固体。将粗固体通过研磨(二氯甲烷/庚烷)纯化得到24mg(64%)的2-(6-氯-1-甲基-1H-吲唑-3-基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-羧酸[(R)-2-(3-氟-氮杂环丁烷-1-基)-1-甲氧基甲基-2-氧代-乙基]-酰胺,为灰白色固体。MS:[M+H]+=486;1H NMR(300MHz,DMSO-d6)δ:12.85(宽单峰,1H),9.16(s,1H),8.76(dd,J=8.7,5.3Hz,1H),8.55(d,J=8.3Hz,1H),8.49(s,1H),7.97(d,J=1.5Hz,1H),7.24(d,J=9.1Hz,1H),5.23-5.58(m,1H),4.97(dt,J=8.1,5.8Hz,1H),4.56-4.82(m,1H),4.21-4.56(m,2H),4.18(s,3H),3.87-4.10(m,1H),3.68(qd,J=9.8,5.7Hz,2H),3.28(app.d,J=3.4Hz,3H).
实施例175.
2-(6-氯-1-甲基-1H-吲唑-3-基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-羧酸[(R)-2-(3-氰基-氮杂环丁烷-1-基)-1-甲氧基甲基-2-氧代-乙基]-酰胺
步骤1
[(R)-2-(3-氰基-氮杂环丁烷-1-基)-1-甲氧基甲基-2-氧代-乙基]-氨基甲酸叔丁酯
向25mL圆底烧瓶中装入(R)-2-叔丁氧基羰基氨基-3-甲氧基-丙酸(0.475g,2.17mmol)、氮杂环丁烷-3-甲腈盐酸盐(314mg,2.65mmol)和HATU(832mg,2.19mmol)。然后添加DMF(3.6mL),接着添加N,N-二异丙基乙胺(1.5mL,8.67mmol)。将反应混合物在室温搅拌过夜,然后以水淬灭并以EtOAc(30mL)萃取。将有机层以饱和NaHCO3和水洗涤一次。将合并的水层以EtOAc(25mL)反萃取。将合并的有机层经硫酸钠干燥,过滤并浓缩。将残余物经色谱在SiO2上以EtOAc/庚烷(梯度:0-100%EtOAc)纯化得到288mg(47%)的[(R)-2-(3-氰基-氮杂环丁烷-1-基)-1-甲氧基甲基-2-氧代-乙基]-氨基甲酸叔丁酯,为粘稠无色油状物。
步骤2
1-((R)-2-氨基-3-甲氧基-丙酰基)-氮杂环丁烷-3-甲腈三氟乙酸盐
在25mL圆底烧瓶中,将[(R)-2-(3-氰基-氮杂环丁烷-1-基)-1-甲氧基甲基-2-氧代-乙基]-氨基甲酸叔丁酯(286mg,1.00mmol)溶解于二氯甲烷(4ml)中。将反应混合物冷却至0℃并缓慢地添加三氟乙酸(1.2ml,15.6mmol)。将反应混合物在室温搅拌3小时,然后浓缩,得到1-((R)-2-氨基-3-甲氧基-丙酰基)-氮杂环丁烷-3-甲腈三氟乙酸盐,为无色粘稠油状物,其不经进一步纯化即可使用。
步骤3
2-(6-氯-1-甲基-1H-吲唑-3-基)-5-(2-三甲基甲硅烷基-乙氧基甲基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-羧酸[(R)-2-(3-氰基-氮杂环丁烷-1-基)-1-甲氧基甲基-2-氧代-乙基]-酰胺
向10mL圆底烧瓶中装入2-(6-氯-1-甲基-1H-吲唑-3-基)-5-(2-三甲基甲硅烷基-乙氧基甲基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-羧酸(50mg,0.11mmol)、1-((R)-2-氨基-3-甲氧基-丙酰基)-氮杂环丁烷-3-甲腈三氟乙酸盐(42mg,0.14mmol)和HATU(42mg,0.11mmol)。然后添加乙腈(1mL),接着N,N-二异丙基乙胺(0.19mL,1.1mmol)。将浅黄色反应混合物在室温搅拌过夜,然后以水淬灭。将混合物以二氯甲烷萃取。合并有机层,经Na2SO4干燥,并浓缩。将残余物经色谱在SiO2上以EtOAc/庚烷(梯度:5-90%EtOAc)纯化得到44mg(63%)的2-(6-氯-1-甲基-1H-吲唑-3-基)-5-(2-三甲基甲硅烷基-乙氧基甲基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-羧酸[(R)-2-(3-氰基-氮杂环丁烷-1-基)-1-甲氧基甲基-2-氧代-乙基]-酰胺,为灰白色固体。MS:[M+H]+=623.
步骤4
2-(6-氯-1-甲基-1H-吲唑-3-基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-羧酸[(R)-2-(3-氰基-氮杂环丁烷-1-基)-1-甲氧基甲基-2-氧代-乙基]-酰胺
在25mL圆底烧瓶中,将2-(6-氯-1-甲基-1H-吲唑-3-基)-5-(2-三甲基甲硅烷基-乙氧基甲基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-羧酸[(R)-2-(3-氰基-氮杂环丁烷-1-基)-1-甲氧基甲基-2-氧代-乙基]-酰胺(44mg,0.071mmol)和TFA(1.8ml,23.4mmol)与二氯甲烷(6ml)混合得到橙色溶液。将反应混合物在室温搅拌2.5小时,然后减压浓缩。将所得粗固体溶解于二氯甲烷(4mL)中并添加乙二胺(0.30ml,4.4mmol)。将反应混合物在室温搅拌18小时,然后浓缩且将残余物以水沉淀。搅拌悬浮液1小时和过滤收集粗固体。将粗固体通过研磨(热二氯甲烷/庚烷)纯化得到21mg(59%)的2-(6-氯-1-甲基-1H-吲唑-3-基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-羧酸[(R)-2-(3-氰基-氮杂环丁烷-1-基)-1-甲氧基甲基-2-氧代-乙基]-酰胺,为白色固体。MS:[M+H]+=492;1H NMR(300MHz,DMSO-d6)δ:12.72(宽单峰,1H),9.16(s,1H),8.74(d,J=8.7Hz,1H),8.55(d,J=8.3Hz,1H),8.50(d,J=4.9Hz,1H),7.97(d,J=1.5Hz,1H),7.23(d,J=8.7Hz,1H),4.86-5.04(m,1H),4.46-4.73(m,2H),4.17-4.19(m,1H),4.16-4.28(m,4H),4.04-4.16(m,1H),3.77-3.93(m,1H),3.72(dd,J=9.5,4.9Hz,1H),3.59-3.68(m,1H),3.27(app d,J=4.9Hz,3H).
实施例176.
2-(6-氯-1-甲基-1H-吲唑-3-基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-羧酸(2-羟基-1-甲基-丙基)-酰胺
步骤1
2-(6-氟-1-甲基-1H-吲唑-3-基)-5-(2-三甲基甲硅烷基-乙氧基甲基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-羧酸((1R,2R)-2-羟基-1-羟基甲基-丙基)-酰胺
向25mL圆底烧瓶中装入2-(6-氟-1-甲基-1H-吲唑-3-基)-5-(2-三甲基甲硅烷基-乙氧基甲基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-羧酸(100mg,0.226mmol)、(2R,3R)-2-氨基丁烷-1,3-二醇(25mg,0.24mmol)和HATU(90mg,0.24mmol)。然后添加乙腈(2mL),接着N,N-二异丙基乙胺(0.10mL,0.57mmol)。将反应混合物在室温搅拌过夜,然后以水淬灭。将混合物以乙酸乙酯(3x)萃取。合并有机层,经Na2SO4干燥,并浓缩。将残余物通过以1:1庚烷/二氯甲烷研磨纯化得到115mg(96%)的2-(6-氟-1-甲基-1H-吲唑-3-基)-5-(2-三甲基甲硅烷基-乙氧基甲基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-羧酸((1R,2R)-2-羟基-1-羟基甲基-丙基)-酰胺,为白色固体。MS:[M+H]+=529.
步骤2
2-(6-氟-1-甲基-1H-吲唑-3-基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-羧酸((1R,2R)-2-羟基-1-羟基甲基-丙基)-酰胺
在圆底烧瓶中,将2-(6-氟-1-甲基-1H-吲唑-3-基)-5-(2-三甲基甲硅烷基-乙氧基甲基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-羧酸((1R,2R)-2-羟基-1-羟基甲基-丙基)-酰胺(30mg,0.057mmol)和TFA(0.3ml,3.9mmol)与二氯甲烷(1ml)混合得到橙色溶液。将反应混合物在室温搅拌2.5小时,然后减压浓缩。将所得粗固体溶解于二氯甲烷(1mL)中并添加乙二胺(0.10ml,1.5mmol)。将反应混合物在室温搅拌18小时,然后浓缩且将残余物以水沉淀。搅拌悬浮液1小时和过滤收集粗固体。将粗固体通过研磨(热二氯甲烷/庚烷)纯化得到9mg(40%)的2-(6-氟-1-甲基-1H-吲唑-3-基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-羧酸((1R,2R)-2-羟基-1-羟基甲基-丙基)-酰胺,为浅黄色固体。MS:[M+H]+=399;1H NMR(DMSO-d6)δ:12.61(宽单峰,1H),9.16(s,1H),8.83(dd,J=8.9,5.5Hz,1H),8.44(s,1H),8.15(d,J=9.4Hz,1H),7.64(dd,J=9.8,1.9Hz,1H),7.15(td,J=9.3,1.9Hz,1H),5.07(d,J=4.2Hz,1H),4.85(t,J=4.9Hz,1H),4.15(s,3H),3.98-4.24(m,2H),3.54-3.71(m,2H),1.13(d,J=6.0Hz,3H).
实施例177.
2-(6-氟-1-甲基-1H-吲唑-3-基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-羧酸((1R,2R)-2-羟基-1-甲氧基甲基-丙基)-酰胺
步骤1
2-(6-氟-1-甲基-1H-吲唑-3-基)-5-(2-三甲基甲硅烷基-乙氧基甲基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-羧酸((1R,2R)-2-羟基-1-甲氧基甲基-丙基)-酰胺
在10mL圆底烧瓶中,将2-(6-氟-1-甲基-1H-吲唑-3-基)-5-(2-三甲基甲硅烷基-乙氧基甲基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-羧酸((1R,2R)-2-羟基-1-羟基甲基-丙基)-酰胺(81mg,0.152mmol)溶解于THF(1.5ml)中得到无色溶液。将反应混合物在冰浴中冷却并顺序添加碎KOH(86mg,1.52mmol)、18-冠醚-6(40mg,0.152mmol)和碘甲烷(10μl,0.152mmol)。于0℃搅拌反应混合物1小时,然后移去冰浴。将反应混合物在室温搅拌2小时,然后以二氯甲烷(10mL)稀释和以氯化铵水溶液(10mL)、水(10mL)和饱和碳酸氢钠(10mL)洗涤。将有机层经Na2SO4干燥并浓缩。将粗物质经色谱在SiO2上以EtOAc/庚烷(梯度:0%-60%EtOAc)纯化到30mg(36%)的2-(6-氟-1-甲基-1H-吲唑-3-基)-5-(2-三甲基甲硅烷基-乙氧基甲基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-羧酸((1R,2R)-2-羟基-1-甲氧基甲基-丙基)-酰胺,为灰白色固体。1H NMR(300MHz,DMSO-d6)δ:9.22(s,1H),8.78(dd,J=8.9,5.5Hz,1H),8.66(s,1H),8.14(d,J=9.4Hz,1H),7.67(dd,J=9.8,2.3Hz,1H),7.17(td,J=9.2,2.1Hz,1H),5.75(s,2H),5.21(d,J=4.2Hz,1H),4.22-4.34(m,1H),4.17(s,3H),3.97-4.12(m,1H),3.61(app t,J=8.2Hz,3H),3.52(dd,J=9.8,6.4Hz,1H),3.28(s,3H),1.14(d,J=6.4Hz,3H),0.87(t,J=7.9Hz,2H),-0.07(s,9H).
步骤2
2-(6-氟-1-甲基-1H-吲唑-3-基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-羧酸((1R,2R)-2-羟基-1-甲氧基甲基-丙基)-酰胺
在圆底烧瓶中,将2-(6-氟-1-甲基-1H-吲唑-3-基)-5-(2-三甲基甲硅烷基-乙氧基甲基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-羧酸((1R,2R)-2-羟基-1-甲氧基甲基-丙基)-酰胺(30mg,0.055mmol)和TFA(0.3ml,3.9mmol)与二氯甲烷(1ml)混合得到橙色溶液。将反应混合物在室温搅拌2.5小时,然后减压浓缩。将所得粗固体溶解于二氯甲烷(1mL)中并添加乙二胺(0.26ml,3.9mmol)。将反应混合物在室温搅拌18小时,然后浓缩且将残余物以水沉淀。搅拌悬浮液1小时和过滤收集粗固体。将粗固体通过研磨(热二氯甲烷/庚烷)纯化得到11mg(47%)的2-(6-氟-1-甲基-1H-吲唑-3-基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-羧酸((1R,2R)-2-羟基-1-甲氧基甲基-丙基)-酰胺,为浅黄色固体。1H NMR(300MHz,DMSO-d6)δ:12.85(宽单峰,1H),9.16(s,1H),8.78(dd,J=8.9,5.5Hz,1H),8.43(s,1H),8.15(d,J=9.4Hz,1H),7.65(dd,J=9.6,2.1Hz,1H),7.15(td,J=9.2,2.5Hz,1H),5.17(d,J=4.2Hz,1H),4.20-4.33(m,1H),4.15(s,3H),3.98-4.09(m,1H),3.59(dd,J=9.8,6.8Hz,1H),3.50(dd,J=9.4,6.4Hz,1H),3.27(s,3H),1.13(d,J=6.4Hz,3H).
实施例178.
2-(6-氟-1-甲基-1H-吲唑-3-基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-羧酸((S)-仲丁基)-酰胺
步骤1
2-(6-氟-1-甲基-1H-吲唑-3-基)-5-(2-三甲基甲硅烷基-乙氧基甲基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-羧酸((S)-仲丁基)-酰胺
向25mL圆底烧瓶中装入2-(6-氟-1-甲基-1H-吲唑-3-基)-5-(2-三甲基甲硅烷基-乙氧基甲基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-羧酸(50mg,0.11mmol)、(S)-丁烷-2-胺(9mg,0.12mmol)和HATU(45mg,0.12mmol)。然后添加乙腈(1mL),接着N,N-二异丙基乙胺(0.09mL,0.55mmol)。将反应混合物在室温搅拌过夜,然后以水淬灭。将混合物以乙酸乙酯(3x)萃取。合并有机层,经Na2SO4干燥,并浓缩。将残余物经色谱在SiO2上以EtOAc/庚烷(梯度:0-50%EtOAc)纯化得到40mg(71%)的2-(6-氟-1-甲基-1H-吲唑-3-基)-5-(2-三甲基甲硅烷基-乙氧基甲基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-羧酸((S)-仲丁基)-酰胺,为白色固体。[M+Na]+=519.
步骤2
2-(6-氟-1-甲基-1H-吲唑-3-基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-羧酸((S)-仲丁基)-酰胺
在10mL圆底烧瓶中,将2-(6-氟-1-甲基-1H-吲唑-3-基)-5-(2-三甲基甲硅烷基-乙氧基甲基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-羧酸((S)-仲丁基)-酰胺(40mg,0.080mmol)和TFA(0.9ml,11.7mmol)与二氯甲烷(3ml)混合得到橙色溶液。将反应混合物在室温搅拌2.5小时,然后减压浓缩。将所得粗固体溶解于二氯甲烷(3mL)中并添加乙二胺(0.38ml,5.6mmol)。将反应混合物在室温搅拌18小时,然后浓缩且将残余物以水沉淀。搅拌悬浮液1小时和过滤收集粗固体。将粗固体通过研磨(热二氯甲烷/庚烷)纯化得到19mg(67%)的2-(6-氟-1-甲基-1H-吲唑-3-基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-羧酸((S)-仲丁基)-酰胺,为灰白色固体。[M+H]+=367;1H NMR(300MHz,DMSO-d6)δ:12.77(宽单峰,1H),9.09(s,1H),8.43(s,1H),8.43(dd,J=9.1,5.5Hz,1H),8.00(d,J=8.7Hz,1H),7.70(dd,J=9.8,1.9Hz,1H),7.19(td,J=9.1,2.3Hz,1H),4.15(s,3H),4.03-4.14(m,1H),1.57-1.73(m,2H),1.28(d,J=6.4Hz,3H).
实施例179.
2-(6-氟-1-甲基-1H-吲唑-3-基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-羧酸((S)-1-甲氧基甲基-3-甲基-丁基)-酰胺
步骤1
2-(6-氟-1-甲基-1H-吲唑-3-基)-5-(2-三甲基甲硅烷基-乙氧基甲基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-羧酸((S)-1-羟基甲基-3-甲基-丁基)-酰胺
向25mL圆底烧瓶中装入2-(6-氟-1-甲基-1H-吲唑-3-基)-5-(2-三甲基甲硅烷基-乙氧基甲基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-羧酸(100mg,0.226mmol)、(S)-2-氨基-4-甲基戊烷-1-醇(28mg,0.24mmol)和HATU(90mg,0.24mmol)。然后添加乙腈(2mL),接着N,N-二异丙基乙胺(0.13mL,0.77mmol)。将反应混合物在室温搅拌过夜,然后以水淬灭。将混合物以乙酸乙酯(3x)萃取。合并有机层,经Na2SO4干燥,并浓缩得到73mg(59%)的2-(6-氟-1-甲基-1H-吲唑-3-基)-5-(2-三甲基甲硅烷基-乙氧基甲基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-羧酸((S)-1-羟基甲基-3-甲基-丁基)-酰胺,为白色固体。MS:[M+H]+=541.
步骤2
2-(6-氟-1-甲基-1H-吲唑-3-基)-5-(2-三甲基甲硅烷基-乙氧基甲基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-羧酸((S)-1-甲氧基甲基-3-甲基-丁基)-酰胺
在10mL圆底烧瓶中,将2-(6-氟-1-甲基-1H-吲唑-3-基)-5-(2-三甲基甲硅烷基-乙氧基甲基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-羧酸((S)-1-羟基甲基-3-甲基-丁基)-酰胺(73mg,0.135mmol)溶解于THF(1.4ml)中得到无色溶液。将反应混合物在冰浴中冷却并连续添加碎KOH(76mg,1.35mmol)、18-冠醚-6(36mg,0.135mmol)和碘甲烷(9μl,0.135mmol)。于0℃搅拌反应混合物1小时,然后移去冰浴。将反应混合物在室温搅拌2小时,然后以二氯甲烷(10mL)稀释并以氯化铵水溶液(10mL)、水(10mL)和饱和碳酸氢钠(10mL)洗涤。将有机层经Na2SO4干燥并浓缩。将粗物质经色谱在SiO2上以EtOAc/庚烷(梯度:0%-70%EtOAc)纯化得到38mg(50%)的2-(6-氟-1-甲基-1H-吲唑-3-基)-5-(2-三甲基甲硅烷基-乙氧基甲基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-羧酸((S)-1-甲氧基甲基-3-甲基-丁基)-酰胺,为灰白色固体。1H NMR(300MHz,DMSO-d6)δ:9.18(s,1H),8.64(s,1H),8.52(dd,J=9.1,5.3Hz,1H),8.15(d,J=9.4Hz,1H),7.72(dd,J=9.6,2.1Hz,1H),7.13(td,J=9.1,1.9Hz,1H),5.73(s,2H),4.41(td,J=9.0,5.1Hz,1H),4.17(s,3H),3.60(t,J=7.9Hz,2H),3.44-3.55(m,2H),3.27(s,3H),1.48-1.72(m,3H),0.91(d,J=6.0Hz,3H),0.86(d,J=6.0Hz,3H),0.85(t,J=7.6Hz,2H),-0.08(s,9H).
步骤3
2-(6-氟-1-甲基-1H-吲唑-3-基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-羧酸((S)-1-甲氧基甲基-3-甲基-丁基)-酰胺
在圆底烧瓶中,将2-(6-氟-1-甲基-1H-吲唑-3-基)-5-(2-三甲基甲硅烷基-乙氧基甲基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-羧酸((S)-1-甲氧基甲基-3-甲基-丁基)-酰胺(35mg,0.063mmol)和TFA(0.6ml,7.8mmol)与二氯甲烷(2ml)混合得到橙色溶液。将反应混合物在室温搅拌2.5小时,然后减压浓缩。将所得粗固体溶解于二氯甲烷(1mL)和添加乙二胺(0.32ml,4.7mmol)。将反应混合物在室温搅拌18小时,然后浓缩且将残余物以水沉淀。搅拌悬浮液1小时和过滤收集粗固体。将粗固体通过研磨(热二氯甲烷/庚烷)纯化得到16mg(60%)的2-(6-氟-1-甲基-1H-吲唑-3-基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-羧酸((S)-1-甲氧基甲基-3-甲基-丁基)-酰胺,为白色固体。MS:[M+H]+=425,1H NMR(300MHz,DMSO-d6)δ:12.87(s,1H),9.13(s,1H),8.53(dd,J=8.7,5.3Hz,1H),8.44(s,1H),8.17(d,J=9.4Hz,1H),7.71(dd,J=9.8,2.3Hz,1H),7.11(td,J=9.1,2.3Hz,1H),4.41(td,J=9.1,4.9Hz,1H),4.16(s,3H),3.52(dd,J=9.4,4.2Hz,1H),3.46(dd,J=9.4,4.2Hz,1H),3.27(s,3H),1.48-1.75(m,3H),0.91(d,J=6.4Hz,3H),0.86(d,J=6.0Hz,3H).
实施例180.
2-(6-氟-1-甲基-1H-吲唑-3-基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-羧酸((R)-仲丁基)-酰胺
根据实施例178中阐述的操作制备,以(R)-丁烷-2-胺替代步骤1中的(S)-丁烷-2-胺。分离出最终化合物,为灰白色固体,17mg(82%);[M+H]+=367;1H NMR(300MHz,DMSO-d6)δ:12.76(宽单峰,1H),9.10(s,1H),8.43(s,1H),8.43(dd,J=8.7,5.4Hz,2H),8.01(d,J=8.7Hz,1H),7.71(dd,J=9.8,2.3Hz,1H),7.19(td,J=9.1,1.9Hz,1H),4.15(s,3H),4.02-4.14(m,1H),1.56-1.75(m,2H),1.28(d,J=6.8Hz,3H),0.96(t,J=7.6Hz,3H).
实施例181.
2-(6-氟-1-甲基-1H-吲唑-3-基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-羧酸((S)-2-甲氧基-1-甲基-乙基)-酰胺
根据实施例178中阐述的操作制备,以(S)-1-甲氧基丙烷-2-胺盐酸盐替代步骤1中的(S)-丁烷-2-胺。分离出最终化合物,为灰白色固体,27mg(73%);MS:[M+Na]+=405;1H NMR(300MHz,DMSO-d6)δ:12.85(宽单峰,1H),9.12(s,1H),8.54(dd,J=9.1,5.3Hz,1H),8.44(s,1H),8.21(d,J=8.3Hz,1H),7.70(dd,J=9.8,2.3Hz,1H),7.16(td,J=9.1,2.3Hz,1H),4.30-4.47(m,1H),4.15(s,3H),3.50(qd,J=9.3,4.5Hz,2H),3.28(s,3H),1.31(d,J=6.4Hz,3H).
实施例182.
2-(6-氟-1-甲基-1H-吲唑-3-基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-羧酸((S)-1-甲基-2-三氘代甲氧基-乙基)-酰胺
步骤1
2-(6-氟-1-甲基-1H-吲唑-3-基)-5-(2-三甲基甲硅烷基-乙氧基甲基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-羧酸((S)-2-羟基-1-甲基-乙基)-酰胺
向25mL圆底烧瓶中装入2-(6-氟-1-甲基-1H-吲唑-3-基)-5-(2-三甲基甲硅烷基-乙氧基甲基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-羧酸(115mg,0.26mmol)、(S)-2-氨基丙烷-1-醇(0.21ul,0.27mmol)和HATU(104mg,0.27mmol)。然后添加乙腈(2mL),接着N,N-二异丙基乙胺(0.2mL,1.12mmol)。将黄色反应混合物在室温搅拌过夜,然后以水淬灭并以EtOAc(3x)萃取。合并有机层,经硫酸钠干燥,过滤并浓缩得到76mg(57%)的2-(6-氟-1-甲基-1H-吲唑-3-基)-5-(2-三甲基甲硅烷基-乙氧基甲基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-羧酸((S)-2-羟基-1-甲基-乙基)-酰胺,为白色固体。
步骤2
2-(6-氟-1-甲基-1H-吲唑-3-基)-5-(2-三甲基甲硅烷基-乙氧基甲基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-羧酸((S)-1-甲基-2-三氘代甲氧基-乙基)-酰胺
在10mL圆底烧瓶中,将2-(6-氟-1-甲基-1H-吲唑-3-基)-5-(2-三甲基甲硅烷基-乙氧基甲基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-羧酸((S)-2-羟基-1-甲基-乙基)-酰胺(70mg,0.14mmol)溶解于THF(1.4ml)中得到无色溶液。将反应混合物在冰浴中冷却并顺序添加碎KOH(91mg,1.62mmol)、18-冠醚-6(44mg,0.166mmol)和碘代三氘代甲烷(9μl,0.147mmol)。于0℃搅拌反应混合物1小时,然后移去冰浴。将反应混合物在室温搅拌2小时,然后以二氯甲烷(10mL)稀释并以氯化铵水溶液(10mL)、水(10mL)和饱和碳酸氢钠(10mL)洗涤。将有机层经Na2SO4干燥并浓缩。将粗物质经色谱在SiO2上以EtOAc/庚烷(梯度:5%-60%EtOAc)纯化得到38mg(53%)的2-(6-氟-1-甲基-1H-吲唑-3-基)-5-(2-三甲基甲硅烷基-乙氧基甲基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-羧酸((S)-1-甲基-2-三氘代甲氧基-乙基)-酰胺,为白色固体。MS:[M+Na]+=538.
步骤3
2-(6-氟-1-甲基-1H-吲唑-3-基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-羧酸((S)-1-甲基-2-三氘代甲氧基-乙基)-酰胺
在圆底烧瓶中,将2-(6-氟-1-甲基-1H-吲唑-3-基)-5-(2-三甲基甲硅烷基-乙氧基甲基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-羧酸((S)-1-甲基-2-三氘代甲氧基-乙基)-酰胺(38mg,0.074mmol)和TFA(0.5ml,6.5mmol)与二氯甲烷(1.5ml)混合得到橙色溶液。将反应混合物在室温搅拌2.5小时,然后减压浓缩。将所得粗固体溶解于二氯甲烷(1mL)中并添加乙二胺(0.10ml,1.5mmol)。将反应混合物在室温搅拌18小时,然后浓缩且将残余物以水沉淀。搅拌悬浮液1小时和过滤收集粗固体。将粗固体通过研磨(二氯甲烷/庚烷)纯化得到27mg(96%)的2-(6-氟-1-甲基-1H-吲唑-3-基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-羧酸((S)-1-甲基-2-三氘代甲氧基-乙基)-酰胺,为灰白色固体。MS:[M+H]+=386;1H NMR(300MHz,DMSO-d6)δ:12.85(宽单峰,1H),9.11(s,1H),8.54(dd,J=8.9,5.5Hz,1H),8.44(s,1H),8.21(d,J=8.3Hz,1H),7.70(dd,J=9.8,2.3Hz,1H),7.15(td,J=9.1,2.3Hz,1H),4.25-4.45(m,1H),4.15(s,3H),3.49(qd,J=9.3,4.5Hz,2H),1.31(d,J=6.8Hz,3H).
实施例183.
2-(6-氟-1-甲基-1H-吲唑-3-基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-羧酸(3-羟基-1,3-二甲基-丁基)-酰胺
步骤1
2-(6-氟-1-甲基-1H-吲唑-3-基)-5-(2-三甲基甲硅烷基-乙氧基甲基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-羧酸(3-羟基-1,3-二甲基-丁基)-酰胺
向25mL圆底烧瓶中装入2-(6-氟-1-甲基-1H-吲唑-3-基)-5-(2-三甲基甲硅烷基-乙氧基甲基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-羧酸(98mg,0.22mmol)、4-氨基-2-甲基戊烷-2-醇[根据US2003/0171584A1制备](27mg,0.23mmol)和HATU(89mg,0.23mmol)。然后添加乙腈(2mL),接着N,N-二异丙基乙胺(0.2mL,1.12mmol)。将黄色反应混合物在室温搅拌过夜,然后以EtOAc稀释并以水洗涤(3x)。合并有机层,经Na2SO4干燥,并浓缩。将残余物经色谱在SiO2上以EtOAc/庚烷(梯度:5-90%EtOAc)纯化得到75mg(63%)的2-(6-氟-1-甲基-1H-吲唑-3-基)-5-(2-三甲基甲硅烷基-乙氧基甲基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-羧酸(3-羟基-1,3-二甲基-丁基)-酰胺,为灰白色固体。MS:[M+H]+=541.
步骤2
2-(6-氟-1-甲基-1H-吲唑-3-基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-羧酸(3-羟基-1,3-二甲基-丁基)-酰胺
在125mL圆底烧瓶中,将2-(6-氟-1-甲基-1H-吲唑-3-基)-5-(2-三甲基甲硅烷基-乙氧基甲基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-羧酸(3-羟基-1,3-二甲基-丁基)-酰胺(25mg,0.046mmol)、氟化铯(70mg,0.46mmol)和18-冠醚-6(12mg,0.046mmol)与乙腈混合得到灰白色悬浮液。在回流下搅拌反应混合物72小时。添加大量过量CsF和18-冠醚-6且再加热反应混合物24小时。将反应混合物以乙酸乙酯稀释,并以水洗涤。将有机层经Na2SO4干燥并浓缩。将粗物质悬浮于水并通过过滤收集然后以1:2二氯甲烷/庚烷研磨得到4mg(21%)的2-(6-氟-1-甲基-1H-吲唑-3-基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-羧酸(3-羟基-1,3-二甲基-丁基)-酰胺,为黄色固体。MS:[M+Na]+=433,1H NMR(300MHz,DMSO-d6)δ:12.83(宽单峰,1H),9.10(s,1H),8.57(dd,J=8.9,5.5Hz,1H),8.41(d,J=2.3Hz,1H),8.15(d,J=8.3Hz,1H),7.71(dd,J=9.8,1.9Hz,1H),7.20(td,J=9.1,2.3Hz,1H),4.35(s,1H),4.29-4.43(m,1H),4.16(s,3H),1.83(dd,J=14.4,7.9Hz,1H),1.73(dd,J=16.6,4.9Hz,1H),1.31(d,J=6.4Hz,3H),1.15(s,3H),1.12(s,3H).
实施例184.
2-(6-氟-1-甲基-1H-吲唑-3-基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-羧酸(1-甲基-丁基)-酰胺
根据实施例178中阐述的操作制备,以1-甲基-丁基胺替代步骤1中的(S)-丁烷-2-胺。分离出最终化合物,为浅黄色固体,25mg(96%);MS:[M+H]+=403;1H NMR(300MHz,DMSO-d6)δ:12.83(宽单峰,1H),9.10(s,1H),8.42(s,1H),8.43(dd,J=8.9,5.3Hz,1H),8.00(d,J=8.7Hz,1H),7.71(dd,J=9.8,1.9Hz,1H),7.18(td,J=9.1,2.3Hz,1H),4.15(s,3H),4.18(quin,J=6.8Hz,1H),1.55-1.67(m,2H),1.36-1.48(m,2H),1.28(d,J=6.4Hz,3H),0.89(t,J=7.4Hz,3H).
实施例185.
2-(6-氟-1-甲基-1H-吲唑-3-基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-羧酸(3,3,3-三氟-1-甲基-丙基)-酰胺
步骤1
3,3,3-三氟-1-甲基-丙胺盐酸盐
该胺盐根据在Gassen,K.-R;Kirmse,W.Chem.Ber.,1986,119,2233-2248中阐述的操作制备。
步骤2
2-(6-氟-1-甲基-1H-吲唑-3-基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-羧酸(3,3,3-三氟-1-甲基-丙基)-酰胺
根据实施例178中阐述的操作制备,以3,3,3-三氟-1-甲基-丙胺盐酸盐替代步骤1中的(S)-丁烷-2-胺。分离出最终化合物,为灰白色固体,16mg(38%);MS:[M+H]+=421;1H NMR(300MHz,DMSO-d6)δ:12.83(宽单峰,1H),9.10(s,1H),8.45-8.46(m,1H),8.48(dd,J=9.0,5.3Hz,1H),8.17(d,J=8.3Hz,1H),7.70(dd,J=9.8,2.3Hz,1H),7.18(td,J=9.1,2.3Hz,1H),4.42-4.59(m,1H),4.15(s,3H),2.70-2.78(m,1H),2.62-2.70(m,1H),1.43(d,J=6.8Hz,3H).
实施例186.
2-(6-氟-1-甲基-1H-吲唑-3-基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-羧酸(2-环丙基-1-甲基-乙基)-酰胺
步骤1
2-甲基-丙烷-2-亚磺酸[2-环丙基-1-甲基-亚乙-(E)-基]-酰胺
在氩气气氛下向25mL圆底烧瓶中装入在THF(1.45mL)中的Ti(OEt)4(工业等级,0.37mL,1.4mmol)和1-环丙基丙烷-2-酮(79.0mg,0.81mmol)。然后添加2-甲基丙烷-2-亚磺酰胺(88.7mg,0.73mmol)并将反应混合物回流加热过夜。冷却至室温后,将反应混合物倒至盐水(1.7mL)上,伴随快速搅拌。将所得悬浮液经硅藻土垫过滤。减压浓缩滤液得到粗2-甲基-丙烷-2-亚磺酸[2-环丙基-1-甲基-亚乙-(E)-基]-酰胺,其不经纯化直接用于后续步骤。步骤2
2-甲基-丙烷-2-亚磺酸(2-环丙基-1-甲基-乙基)-酰胺
在氩气气氛下向25mL圆底烧瓶中装入2-甲基-丙烷-2-亚磺酸[2-环丙基-1-甲基-亚乙-(E)-基]-酰胺(120mg,0.596mmol)和二氯甲烷(2ml)。将反应混合物在-78℃浴冷却。缓慢地滴加DIBAL-H(0.80ml,0.800mmol)。搅拌反应混合物45分钟,之后移去冷却浴。室温搅拌反应混合物15分钟,之后将反应混合物返回冷却浴。将反应混合物以MeOH(0.08mL,1.98mmol)淬灭。将反应混合物以二氯甲烷(8mL)和1.0M Na+K+酒石酸水溶液(5mL)稀释。室温搅拌过夜,将混合物以二氯甲烷萃取。将有机层经浓缩得到50mg的2-甲基-丙烷-2-亚磺酸(2-环丙基-1-甲基-乙基)-酰胺,其不经纯化直接用于后续步骤。
步骤3
2-环丙基-1-甲基-乙胺盐酸盐
向含MeOH(10mL)的冷却的(5℃)50mL圆底烧瓶中缓慢地添加乙酰基氯(0.10mL,1.41mmol)。搅拌溶液30分钟。将新制备的在MeOH中的HCl转移至圆底烧瓶(含2-甲基-丙烷-2-亚磺酸(2-环丙基-1-甲基-乙基)-酰胺(50mg,0.25mmol))。室温搅拌30分钟后,将反应混合物经浓缩得到2-环丙基-1-甲基-乙胺盐酸盐,其不经进一步纯化即可使用。MS:[M+H]+=100.
步骤4
2-(6-氟-1-甲基-1H-吲唑-3-基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-羧酸(2-环丙基-1-甲基-乙基)-酰胺
根据实施例178中阐述的操作制备,以2-环丙基-1-甲基-乙胺盐酸盐替代步骤1中的(S)-丁烷-2-胺。分离最终化合物,为浅黄色针状物,9mg(28%);MS:[M+H]+=393;1H NMR(300MHz,DMSO-d6)δ:12.70(宽单峰,1H),9.10(s,1H),8.46(dd,J=9.1,5.3Hz,1H),8.42(s,1H),7.17(td,J=9.1,2.3Hz,1H),4.17-4.31(m,1H),4.15(s,3H),1.63(dt,J=13.7,6.8Hz,1H),1.47(dt,J=13.7,6.6Hz,1H),1.35(d,J=6.8Hz,3H),0.72-0.93(m,1H),0.32-0.43(m,2H),0.08(app.t,J=5.3Hz,2H)。
实施例187.
2-(6-氟-1-甲基-1H-吲唑-3-基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-羧酸(1,3-二甲基-丁基)-酰胺
根据实施例178中阐述的操作制备,以1,3-二甲基-丁基胺替代步骤1中的(S)-丁烷-2-胺。分离最终化合物,为浅黄色针状物,24mg(76%);MS:[M+Na]+=417;1H NMR(DMSO-d6)δ:12.83(宽单峰,1H),9.09(s,1H),8.42(s,1H),8.41(dd,J=8.9,5.7Hz,1H),7.98(d,J=8.7Hz,1H),7.70(dd,J=9.8,2.3Hz,1H),7.16(td,J=9.1,2.3Hz,1H),4.18-4.34(m,1H),4.15(s,3H),1.64-1.78(m,1H),1.51-1.65(m,1H),1.38-1.51(m,1H),1.27(d,J=6.4Hz,3H),0.92(d,J=6.4Hz,3H),0.87(d,J=6.4Hz,3H).
实施例188.
2-(6-氟-1-甲基-1H-吲唑-3-基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-羧酸((1R,2S)-2-羟基-1-甲氧基甲基-丙基)-酰胺
步骤1
2-(6-氟-1-甲基-1H-吲唑-3-基)-5-(2-三甲基甲硅烷基-乙氧基甲基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-羧酸((1R,2S)-2-羟基-1-羟基甲基-丙基)-酰胺
向25mL圆底烧瓶中装入2-(6-氟-1-甲基-1H-吲唑-3-基)-5-(2-三甲基甲硅烷基-乙氧基甲基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-羧酸(102mg,0.23mmol)、(2R,3S)-2-氨基丁烷-1,3-二醇(34mg,0.32mmol)和HATU(97mg,0.25mmol)。然后添加乙腈(6mL),接着N,N-二异丙基乙胺(0.25mL,1.43mmol)。将反应混合物在室温搅拌过夜,然后以水淬灭。将混合物以乙酸乙酯(3x)萃取。合并有机层,经Na2SO4干燥,并浓缩。将残余物经色谱在SiO2上以EtOAc/庚烷(梯度:5-100%EtOAc)纯化得到100mg(82%)的2-(6-氟-1-甲基-1H-吲唑-3-基)-5-(2-三甲基甲硅烷基-乙氧基甲基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-羧酸((1R,2S)-2-羟基-1-羟基甲基-丙基)-酰胺,为白色固体。MS:[M+Na]+=551.
步骤2
2-(6-氟-1-甲基-1H-吲唑-3-基)-5-(2-三甲基甲硅烷基-乙氧基甲基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-羧酸((1R,2S)-2-羟基-1-甲氧基甲基-丙基)-酰胺和2-(6-氟-1-甲基-1H-吲唑-3-基)-5-(2-三甲基甲硅烷基-乙氧基甲基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-羧酸((1R,2S)-2-甲氧基-1-甲氧基甲基-丙基)-酰胺
在压力管中,将2-(6-氟-1-甲基-1H-吲唑-3-基)-5-(2-三甲基甲硅烷基-乙氧基甲基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-羧酸((1R,2S)-2-羟基-1-羟基甲基-丙基)-酰胺(93mg,0.176mmol)、氧化银(83mg,0.36mmol)和甲基碘(200μl,3.2mmol)与乙腈混合得到黑色悬浮液。将压力管包裹在箔中以排除光。将系统置于沙浴中并在搅拌的同时加热至40℃。保持该温度21小时。冷却时,将反应混合物通过硅藻土垫过滤。浓缩滤液。将粗物质经色谱在SiO2上以EtOAc/己烷(梯度:15%-90%EtOAc)纯化得到45mg(47%)的2-(6-氟-1-甲基-1H-吲唑-3-基)-5-(2-三甲基甲硅烷基-乙氧基甲基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-羧酸((1R,2S)-2-羟基-1-甲氧基甲基-丙基)-酰胺,为浅黄色固体([M+H]+=543)和20mg(20%)的2-(6-氟-1-甲基-1H-吲唑-3-基)-5-(2-三甲基甲硅烷基-乙氧基甲基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-羧酸((1R,2S)-2-甲氧基-1-甲氧基甲基-丙基)-酰胺,为白色固体([M+H]+=557).
步骤3
2-(6-氟-1-甲基-1H-吲唑-3-基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-羧酸((1R,2S)-2-羟基-1-甲氧基甲基-丙基)-酰胺
在圆底烧瓶中,将2-(6-氟-1-甲基-1H-吲唑-3-基)-5-(2-三甲基甲硅烷基-乙氧基甲基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-羧酸((1R,2S)-2-羟基-1-甲氧基甲基-丙基)-酰胺(44mg,0.081mmol)和TFA(0.3ml,3.9mmol)与二氯甲烷(1ml)混合得到橙色溶液。将反应混合物在室温搅拌2.5小时,然后减压浓缩。将所得粗固体溶解于二氯甲烷(1mL)中并添加乙二胺(0.15ml,2.2mmol)。将反应混合物在室温搅拌18小时,然后浓缩且将残余物以水沉淀。搅拌悬浮液1小时和过滤收集粗固体。将粗固体通过研磨(热二氯甲烷/庚烷)纯化得到15mg(46%)的2-(6-氟-1-甲基-1H-吲唑-3-基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-羧酸((1R,2S)-2-羟基-1-甲氧基甲基-丙基)-酰胺,为灰白色固体。MS:[M+H]+=413;1H NMR(300MHz,DMSO-d6)δ:12.83(宽单峰,1H),9.14(s,1H),8.62(dd,J=8.8,5.3Hz,1H),8.44(s,1H),8.30(d,J=9.6Hz,1H),7.68(dd,J=9.6,1.8Hz,1H),7.13(td,J=9.1,2.0Hz,1H),4.94(d,J=5.6Hz,1H),4.17-4.23(m,1H),4.15(s,3H),3.85-3.96(m,1H),3.75(dd,J=9.6,5.6Hz,1H),3.57(dd,J=9.6,3.5Hz,1H),3.25(s,3H),1.17(d,J=6.1Hz,3H).
实施例189.
2-(6-氟-1-甲基-1H-吲唑-3-基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-羧酸((1R,2S)-2-羟基-1-甲氧基甲基-丙基)-酰胺
根据实施例188步骤3中阐述的操作制备,以2-(6-氟-1-甲基-1H-吲唑-3-基)-5-(2-三甲基甲硅烷基-乙氧基甲基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-羧酸((1R,2S)-2-甲氧基-1-甲氧基甲基-丙基)-酰胺替代2-(6-氟-1-甲基-1H-吲唑-3-基)-5-(2-三甲基甲硅烷基-乙氧基甲基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-羧酸((1R,2S)-2-羟基-1-甲氧基甲基-丙基)-酰胺。分离最终化合物,为白色固体,11mg(81%);MS:[M+H]+=427;1H NMR(DMSO-d6)δ:12.87(宽单峰,1H),9.14(s,1H),8.58(dd,J=8.8,5.3Hz,1H),8.45(s,1H),8.33(d,J=9.6Hz,1H),7.69(dd,J=9.6,2.0Hz,1H),7.10(td,J=9.0,2.3Hz,1H),4.38(dq,J=9.7,5.0Hz,1H),4.16(s,3H),3.69(dd,J=10.1,5.6Hz,1H),3.56-3.60(m,1H),3.56(dd,J=10.1,4.0Hz,1H),3.28(s,3H),3.25(s,3H),1.17(d,J=6.1Hz,3H).
实施例190.
2-(6-氟-1-甲基-1H-吲唑-3-基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-羧酸[2-羟基-1-(四氢-呋喃-2-基)-乙基]-酰胺
根据实施例178中阐述的操作制备,以2-氨基-2-(四氢呋喃-2-基)乙醇代替步骤1中的(S)-丁烷-2-胺。分离出最终化合物,为灰白色固体(非对映异构体的混合物),10mg(59%);MS:[M+H]+=425;1H NMR(300MHz,DMSO-d6)δ:12.87(宽单峰,2H),9.14(s,2H),8.71(dd,J=9.0,5.5Hz,1H),8.70(dd,J=9.1,5.2Hz,1H),8.45(s,2H),8.35(t,J=9.1Hz,2H),7.67(dd,J=9.8,1.9Hz,2H),7.16(tt,J=9.1,2.1Hz,2H),5.16(t,J=4.2Hz,1H),5.13(t,J=4.9Hz,1H),4.15(s,6H),4.10-4.27(m,2H),3.88(t,J=7.9Hz,1H),3.75(t,J=8.3Hz,1H),3.45-3.76(m,10H),2.58-2.69(m,2H),2.01-2.13(m,1H),1.85-1.97(m,1H),1.63-1.78(m,2H).
实施例191.
2-(6-氟-1-甲基-1H-吲唑-3-基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-羧酸[2-甲氧基-1-(四氢-呋喃-2-基)-乙基]-酰胺
根据实施例179中阐述的操作制备,以2-氨基-2-(四氢呋喃-2-基)乙醇代替步骤1中的(S)-2-氨基-4-甲基戊-1-醇。分离出最终化合物,为灰白色固体(1:1非对映异构体的混合物),12mg(53%);MS:[M+Na]+=461;1H NMR(300MHz,DMSO-d6)δ:12.88(宽单峰,2H),9.13(s,2H),8.56(dd,J=9.1,5.3Hz,2H),8.46(s,2H),8.33(t,J=9.3Hz,2H),7.70(dd,J=9.8,2.3Hz,2H),7.15(tt,J=9.0,2.3Hz,2H),4.26-4.41(m,2H),4.16(s,6H),3.86(t,J=7.9Hz,1H),3.76(t,J=8.1Hz,1H),3.43-3.74(m,10H),3.27(s,3H),3.26(s,3H),2.56-2.67(m,2H),1.99-2.11(m,1H),1.86-1.98(m,1H),1.64-1.82(m,2H).
实施例192.
2-(6-氟-1-甲基-1H-吲唑-3-基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-羧酸((S)-3-甲磺酰基-1-甲氧基甲基-丙基)-酰胺
步骤1
2-(6-氟-1-甲基-1H-吲唑-3-基)-5-(2-三甲基甲硅烷基-乙氧基甲基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-羧酸((S)-1-羟基甲基-3-甲基硫基-丙基)-酰胺
向25mL圆底烧瓶中装入2-(6-氟-1-甲基-1H-吲唑-3-基)-5-(2-三甲基甲硅烷基-乙氧基甲基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-羧酸(100mg,0.23mmol)、(S)-2-氨基-4-(甲基硫基)丁烷-1-醇(32mg,0.24mmol)和HATU(90mg,0.24mmol)。然后添加乙腈(4mL),接着添加N,N-二异丙基乙胺(0.19mL,1.1mmol)。将反应混合物在室温搅拌过夜,然后以水淬灭。将混合物以乙酸乙酯(3x)萃取。合并有机层,经Na2SO4干燥,并浓缩。将残余物经色谱在SiO2上以EtOAc/庚烷(梯度:5-50%EtOAc)纯化得到105mg(83%)的2-(6-氟-1-甲基-1H-吲唑-3-基)-5-(2-三甲基甲硅烷基-乙氧基甲基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-羧酸((S)-1-羟基甲基-3-甲基硫基-丙基)-酰胺,为灰白色泡沫。MS:[M+H]+=559.
步骤2
2-(6-氟-1-甲基-1H-吲唑-3-基)-5-(2-三甲基甲硅烷基-乙氧基甲基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-羧酸((S)-1-羟基甲基-3-甲磺酰基-丙基)-酰胺
在25mL圆底烧瓶中,将2-(6-氟-1-甲基-1H-吲唑-3-基)-5-(2-三甲基甲硅烷基-乙氧基甲基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-羧酸((S)-1-羟基甲基-3-甲基硫基-丙基)-酰胺(105mg,0.188mmol)与二氯甲烷(2ml)混合得到灰白色溶液。以冰浴将溶液冷却至5℃。缓慢添加mCPBA(87mg,0.388mmol)在二氯甲烷(2ml)中的溶液。室温搅拌反应混合物1小时,其后添加20滴MeOH。室温搅拌反应混合物18小时,然后以二氯甲烷稀释并以碳酸氢钠的饱和溶液(2x15mL)洗涤。将有机层经Na2SO4干燥并浓缩得到2-(6-氟-1-甲基-1H-吲唑-3-基)-5-(2-三甲基甲硅烷基-乙氧基甲基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-羧酸((S)-1-羟基甲基-3-甲磺酰基-丙基)-酰胺,其不经进一步纯化即可使用。
步骤3
2-(6-氟-1-甲基-1H-吲唑-3-基)-5-(2-三甲基甲硅烷基-乙氧基甲基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-羧酸((S)-1-甲氧基甲基-3-甲磺酰基-丙基)-酰胺
在10mL圆底烧瓶中,将2-(6-氟-1-甲基-1H-吲唑-3-基)-5-(2-三甲基甲硅烷基-乙氧基甲基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-羧酸((S)-1-羟基甲基-3-甲磺酰基-丙基)-酰胺(102mg,0.173mmol)溶解于THF(1.9ml)中得到无色溶液。将反应混合物在冰浴中冷却并顺序添加碎KOH(97mg,1.73mmol)、18-冠醚-6(46mg,0.173mmol)和碘甲烷(11μl,0.173mmol)。于0℃搅拌反应混合物1小时,之后移去冰浴。将反应混合物在室温搅拌2小时,然后以二氯甲烷(10mL)稀释并以氯化铵水溶液(10mL)、水(10mL)和饱和碳酸氢钠(10mL)洗涤。将有机层经Na2SO4干燥并浓缩。将粗物质经色谱在SiO2上以EtOAc/庚烷(梯度:0%-60%EtOAc)纯化得到30mg(29%)的2-(6-氟-1-甲基-1H-吲唑-3-基)-5-(2-三甲基甲硅烷基-乙氧基甲基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-羧酸((S)-1-甲氧基甲基-3-甲磺酰基-丙基)-酰胺,为灰白色固体。MS:[M+Na]+=627).
步骤4
2-(6-氟-1-甲基-1H-吲唑-3-基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-羧酸((S)-3-甲磺酰基-1-甲氧基甲基-丙基)-酰胺
在圆底烧瓶中,将2-(6-氟-1-甲基-1H-吲唑-3-基)-5-(2-三甲基甲硅烷基-乙氧基甲基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-羧酸((S)-1-甲氧基甲基-3-甲磺酰基-丙基)-酰胺(35mg,0.058mmol)和TFA(0.5ml,6.5mmol)与二氯甲烷(1.5ml)混合得到橙色溶液。将反应混合物在室温搅拌2.5小时,然后减压浓缩。将所得粗固体溶解于二氯甲烷(1mL)并添加乙二胺(0.19ml,2.8mmol)。将反应混合物在室温搅拌18小时,然后浓缩且将残余物以水沉淀。搅拌悬浮液1小时并过滤收集粗固体。将粗固体通过研磨(二氯甲烷/庚烷)纯化得到12mg(44%)的2-(6-氟-1-甲基-1H-吲唑-3-基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-羧酸((S)-3-甲磺酰基-1-甲氧基甲基-丙基)-酰胺,为浅黄色固体。MS:[M+Na]+=497;1H NMR(300MHz,DMSO-d6)δ:12.87(宽单峰,1H),9.12(s,1H),8.54(dd,J=8.7,5.3Hz,1H),8.47(s,1H),8.28(d,J=9.1Hz,1H),7.69(dd,J=9.8,2.3Hz,1H),7.19(td,J=9.1,2.3Hz,1H),4.35-4.55(m,1H),4.15(s,3H),3.60(dd,J=9.8,4.2Hz,1H),3.51(dd,J=9.4,4.2Hz,1H),3.26(s,3H),3.20-3.28(m,2H),2.97(s,3H),2.02-2.23(m,2H).
实施例193.
2-(6-氟-1-甲基-1H-吲唑-3-基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-羧酸((S)-2-二氟甲氧基-1-甲基-乙基)-酰胺
步骤1
2-(6-氟-1-甲基-1H-吲唑-3-基)-5-(2-三甲基甲硅烷基-乙氧基甲基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-羧酸((S)-2-二氟甲氧基-1-甲基-乙基)-酰胺
在25mL压力管中,将2-(6-氟-1-甲基-1H-吲唑-3-基)-5-(2-三甲基甲硅烷基-乙氧基甲基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-羧酸((S)-2-羟基-1-甲基-乙基)-酰胺(60mg,0.12mmol)和碘化亚铜(I)(14mg,0.070mmol)与乙腈(3mL)混合得到浅黄色悬浮液。对混合物进行脱气并置于氩气下。在沙浴中将反应混合物加热至50℃。缓慢地滴加2,2-二氟-2-(氟磺酰基)乙酸(12μL,0.112mmol)得到浅黄色溶液。将反应混合物再搅拌5分钟。将反应混合物以水淬灭并以乙酸乙酯萃取。将合并的有机物连续用水、饱和碳酸氢钠和盐水洗涤,然后经Na2SO4干燥并浓缩。将粗物质通过硅胶上的快速色谱(梯度:0%至50%EtOAc的己烷溶液)纯化得到12mg(18%)的2-(6-氟-1-甲基-1H-吲唑-3-基)-5-(2-三甲基甲硅烷基-乙氧基甲基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-羧酸((S)-2-二氟甲氧基-1-甲基-乙基)-酰胺,为白色固体。MS:[M+H]+=549.
步骤2
2-(6-氟-1-甲基-1H-吲唑-3-基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-羧酸((S)-2-二氟甲氧基-1-甲基-乙基)-酰胺
在圆底烧瓶中,将2-(6-氟-1-甲基-1H-吲唑-3-基)-5-(2-三甲基甲硅烷基-乙氧基甲基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-羧酸((S)-2-二氟甲氧基-1-甲基-乙基)-酰胺(10mg,0.018mmol)和TFA(0.5ml,6.5mmol)与二氯甲烷(1.5ml)混合得到橙色溶液。将反应混合物在室温搅拌2.5小时,然后减压浓缩。将所得粗固体溶解于二氯甲烷(1mL)中并添加乙二胺(30ul,0.46mmol)。将反应混合物在室温搅拌18小时,然后浓缩且将残余物以水沉淀。搅拌悬浮液1小时并过滤收集粗固体。将粗固体通过研磨(二氯甲烷)纯化得到2mg(32%)的2-(6-氟-1-甲基-1H-吲唑-3-基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-羧酸((S)-2-二氟甲氧基-1-甲基-乙基)-酰胺,为灰白色固体。MS:[M+H]+=419;1H NMR(300MHz,DMSO-d6)δ:12.86(宽单峰,1H),9.11(s,1H),8.47(s,1H),8.49(dd,J=9.1,5.3Hz,1H),8.19(d,J=8.3Hz,1H),7.70(dd,J=9.8,2.3Hz,1H),7.15(td,J=9.2,2.1Hz,1H),6.70(t,J=75.2Hz,1H),4.36-4.54(m,1H),4.16(s,3H),4.00(d,J=4.5Hz,2H),1.37(d,J=6.8Hz,3H).
实施例194.
2-(5-环丙基-1-甲基-1H-吲唑-3-基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-羧酸((S)-2-甲氧基-1-甲基-乙基)-酰胺
步骤1
5-环丙基-1-(2-三甲基甲硅烷基-乙氧基甲基)-1H-吲唑
向250ml2颈圆底烧瓶装入5-溴-1-((2-(三甲基甲硅烷基)乙氧基)甲基)-1H-吲唑(2.5g,7.64mmol)、环丙基硼酸(1.18g,13.7mmol)、乙酸钯(II)(85.7mg,0.38mmol)、三环己基膦(214mg,0.764mmol)、磷酸三钾(3.24g,15.3mmol)、甲苯(40ml)和水(4ml)。于100℃搅拌反应混合物过夜。将反应混合物冷却至室温,然后以EtOAc(100ml)和水(20ml)稀释。将混合物以EtOAc(100mL)萃取。将有机层以水(20mL)和盐水(20mL)洗涤。将有机层经硫酸钠干燥,过滤并浓缩。将残余物吸收至SiO2上并通过色谱在SiO2上以EtOAc/CH2Cl2(梯度:0-10%EtOAc)纯化得到1.7g(77%)的5-环丙基-1-(2-三甲基甲硅烷基-乙氧基甲基)-1H-吲唑,为浅黄色油状物。1H NMR(300MHz,CDCl3)δ:7.93(s,1H),7.48(d,J=8.7Hz,1H),7.44(s,1H),7.19(dd,J=8.5,1.7Hz,1H),3.53(app t,J=8.3Hz,2H),1.93-2.12(m,1H),0.92-1.04(m,2H),0.88(app t,J=8.3Hz,2H),0.64-0.78(m,2H),-0.07(s,9H).
步骤2
5-环丙基-1H-吲唑
在1L圆底烧瓶,将5-环丙基-1-(2-三甲基甲硅烷基-乙氧基甲基)-1H-吲唑(1.7g,5.89mmol)溶解于二氯甲烷(292mL)和三氟乙酸(194mL)的溶液中。室温搅拌过夜后,将反应混合物减压浓缩。将所得粗固体溶解于二氯甲烷中并添加乙二胺(24.2mL,5.89mmol)。室温搅拌过夜后,将反应混合物倒至水(50mL)上并以EtOAc(2x100mL)萃取。将有机层经MgSO4干燥并减压浓缩得到1g的5-环丙基-1H-吲唑,其不经进一步纯化而使用。MS:[M+H]+=299
步骤3
5-环丙基-1-甲基-3-三丁基甲锡烷基-1H-吲唑
根据在实施例1步骤1-3中阐述的操作,以5-环丙基-1H-吲唑替代步骤1中的吲唑。
步骤4
2-(5-环丙基-1-甲基-1H-吲唑-3-基)-5-(2-三甲基甲硅烷基-乙氧基甲基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-羧酸
根据实施例14步骤1-2中阐述的操作制备,以5-环丙基-1-甲基-3-三丁基甲锡烷基-1H-吲唑步骤1中的6-氯-1-甲基-3-三丁基甲锡烷基-1H-吲唑。1H NMR(300MHz,DMSO-d6)δ:9.10(s,1H),8.69(s,1H),8.62(s,1H),7.61(d,J=9.1Hz,1H),7.34(dd,J=8.7,1.9Hz,1H),5.72(s,2H),4.14(s,3H),3.60(t,J=8.2Hz,2H),2.01-2.15(m,1H),0.94-1.03(m,2H),0.85(t,J=8.3Hz,2H),0.78-0.85(m,2H),-0.09(s,9H).
步骤5
2-(5-环丙基-1-甲基-1H-吲唑-3-基)-5-(2-三甲基甲硅烷基-乙氧基甲基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-羧酸((S)-2-甲氧基-1-甲基-乙基)-酰胺
向25mL圆底烧瓶中装入2-(5-环丙基-1-甲基-1H-吲唑-3-基)-5-(2-三甲基甲硅烷基-乙氧基甲基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-羧酸(70mg,0.15mmol)、(S)-1-甲氧基丙烷-2-胺盐酸盐(21mg,0.16mmol)和HATU(63mg,0.16mmol)。然后添加乙腈(2mL)接着添加N,N-二异丙基乙胺(0.08mL,0.45mmol)。将反应混合物在室温搅拌过夜,然后以水淬灭。将混合物以乙酸乙酯(3x)萃取。合并有机层,经Na2SO4干燥,并浓缩。将粗物质通过硅胶上的快速色谱(梯度:15%至100%EtOAc在庚烷中的溶液)纯化得到34mg(42%)的2-(5-环丙基-1-甲基-1H-吲唑-3-基)-5-(2-三甲基甲硅烷基-乙氧基甲基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-羧酸((S)-2-甲氧基-1-甲基-乙基)-酰胺,为白色固体。MS:[M+H]+=535.
步骤6
2-(5-环丙基-1-甲基-1H-吲唑-3-基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-羧酸((S)-2-甲氧基-1-甲基-乙基)-酰胺
在圆底烧瓶中,将2-(5-环丙基-1-甲基-1H-吲唑-3-基)-5-(2-三甲基甲硅烷基-乙氧基甲基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-羧酸((S)-2-甲氧基-1-甲基-乙基)-酰胺(34mg,0.065mmol)和TFA(0.5ml,6.5mmol)与二氯甲烷(1.5ml)混合得到橙色溶液。将反应混合物在室温搅拌2.5小时,然后减压浓缩。将所得粗固体溶解于二氯甲烷(1.5mL)中并添加乙二胺(0.11ml,1.6mmol)。将反应混合物在室温搅拌18小时,然后浓缩且将残余物以水沉淀。搅拌悬浮液1小时和过滤收集粗固体。将粗固体通过研磨(二氯甲烷/庚烷)纯化得到10mg(38%)的2-(5-环丙基-1-甲基-1H-吲唑-3-基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-羧酸((S)-2-甲氧基-1-甲基-乙基)-酰胺,为灰白色固体。MS:[M+H]+=405;1H NMR(300MHz,DMSO-d6)δ:12.79(宽单峰,1H),9.09(s,1H),8.42(s,1H),8.30(s,1H),8.26(d,J=8.3Hz,1H),7.66(d,J=8.7Hz,1H),7.10(dd,J=8.7,1.5Hz,1H),4.28-4.43(m,1H),4.15(s,3H),3.53(dd,J=9.1,4.5Hz,1H),3.45(dd,J=9.1,4.9Hz,1H),3.20(s,3H),2.18-2.25(m,1H),1.35(d,J=6.8Hz,3H),0.94-1.02(m,2H),0.76(td,J=5.3,4.2Hz,2H).
实施例195.
2-(5-环丙基-1-甲基-1H-吲唑-3-基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-羧酸异丙基酰胺
根据实施例194步骤5-6中阐述的操作制备,以异丙胺替代步骤5中的(S)-1-甲氧基丙烷-2-胺盐酸盐。分离出最终化合物,为灰白色固体,18mg(62%);MS:[M+H]+=375;1H NMR(300MHz,DMSO-d6)δ:12.72(宽单峰,1H),9.06(s,1H),8.41(s,1H),8.26(s,1H),8.13(d,J=7.9Hz,1H),7.67(d,J=8.7Hz,1H),7.15(dd,J=8.7,1.5Hz,1H),4.24(dq,J=13.9,6.8Hz,1H),4.15(s,3H),2.12(app.quin,J=4.9Hz,1H),1.34(s,3H),1.32(s,3H),0.93-1.02(m,2H),0.70-80(m,2H).
实施例196.
2-(5-环丙基-1-甲基-1H-吲唑-3-基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-羧酸(2-羟基-1,1-二甲基-乙基)-酰胺
根据实施例194步骤5-6中阐述的操作制备,以2-氨基-2-甲基丙烷-1-醇替代步骤5中的(S)-1-甲氧基丙烷-2-胺盐酸盐。分离出最终化合物,为灰白色固体,25mg(55%);MS:[M+H]+=405;1H NMR(300MHz,DMSO-d6)δ:12.70(宽单峰,1H),9.03(s,1H),8.37(s,1H),8.29(s,1H),8.02(s,1H),7.64(d,J=8.7Hz,1H),7.11(dd,J=8.7,1.5Hz,1H),5.00(t,J=5.7Hz,1H),4.14(s,3H),3.65(d,J=5.3Hz,2H),2.18(app.quin,J=4.9Hz,1H),1.44(s,6H),0.92-1.00(m,2H),0.69-0.76(m,2H).
实施例197.
2-(5-环丙基-1-甲基-1H-吲唑-3-基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-羧酸叔丁基酰胺
根据实施例194步骤5-6中阐述的操作制备,以叔丁基胺替代步骤5中的(S)-1-甲氧基丙烷-2-胺盐酸盐。分离出最终化合物,为灰白色固体,25mg(79%);MS:[M+H]+=389;1H NMR(300MHz,DMSO-d6)δ:12.17(宽单峰,1H),9.01(s,1H),8.36(s,1H),8.24(s,1H),8.06(s,1H),7.65(d,J=8.7Hz,1H),7.14(dd,J=8.7,1.5Hz,1H),4.14(s,3H),2.10(s,1H),1.51(s,9H),0.88-1.08(m,2H),0.65-0.80(m,2H).
实施例198.
2-(6-氟-1-甲基-1H-吲唑-3-基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-羧酸[(1R,2R)-1-(3-氟-氮杂环丁烷-1-羰基)-2-羟基-丙基]-酰胺
步骤1
[(1R,2R)-1-(3-氟-氮杂环丁烷-1-羰基)-2-羟基-丙基]-氨基甲酸9H-芴-9-基甲酯
向25mL圆底烧瓶中装入(2R,3R)-2-(((9H-芴-9-基)甲氧基)羰基氨基)-3-羟基丁酸(184mg,0.54mmol)、3-氟氮杂环丁烷盐酸盐(66mg,0.59mmol)和HATU(242mg,0.64mmol)。然后添加乙腈(1.1mL),接着N,N-二异丙基乙胺(0.20mL,1.1mmol)和N-甲基吗啉(0.05mL,0.45mmol)。将反应混合物在室温搅拌过夜然后浓缩。将粗固体经色谱在SiO2上以EtOAc/庚烷(梯度:10-80%EtOAc)纯化得到112mg(52%)的[(1R,2R)-1-(3-氟-氮杂环丁烷-1-羰基)-2-羟基-丙基]-氨基甲酸9H-芴-9-基甲酯,为白色固体。MS:[M+H]+=399.
步骤2:
(2R,3R)-2-氨基-1-(3-氟-氮杂环丁烷-1-基)-3-羟基-丁-1-酮
在25mL圆底烧瓶中,将[(1R,2R)-1-(3-氟-氮杂环丁烷-1-羰基)-2-羟基-丙基]-氨基甲酸9H-芴-9-基甲酯(112mg,0.28mmol)和二乙胺(0.29ml,2.81mmol)与乙腈(6ml)混合得到白色悬浮液。将反应混合物在室温搅拌2.5小时,然后浓缩至干得到(2R,3R)-2-氨基-1-(3-氟-氮杂环丁烷-1-基)-3-羟基-丁-1-酮,其不经进一步纯化即可使用。
步骤3
2-(6-氟-1-甲基-1H-吲唑-3-基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-羧酸[(1R,2R)-1-(3-氟-氮杂环丁烷-1-羰基)-2-羟基-丙基]-酰胺
根据实施例178中阐述的操作制备,以(2R,3R)-2-氨基-1-(3-氟-氮杂环丁烷-1-基)-3-羟基-丁-1-酮替代步骤1中的(S)-丁烷-2-胺。分离最终化合物,为白色固体,31mg(63%),MS:[M+H]+=470;1H NMR(300MHz,DMSO-d6)δ:12.58(宽单峰,1H),9.14(s,1H),8.65-8.98(m,1H),8.47(s,1H),8.48(d,J=13.2Hz,1H),7.65(dd,J=9.6,2.1Hz,1H),7.10(tt,J=9.0,2.5Hz,1H),5.43(d,J=56.3Hz,1H),5.19(宽单峰,1H),4.69-4.77(m,1H),4.64(t,J=8.3Hz,1H),4.32-4.52(m,1H),4.18-4.32(m,1H),4.14(s,3H),3.98(宽单峰,2H),1.16(d,J=6.0Hz,3H).
实施例199.
2-(6-氯-1-甲基-1H-吲唑-3-基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-羧酸[1-(1-甲基-1H-咪唑-2-基)-乙基]-酰胺
步骤1
2-甲基-丙烷-2-亚磺酸1-(1-甲基-1H-咪唑-2-基)-亚甲-(E)-基酰胺
在25mL小瓶中,将硫酸铜(1.96g,12.3mmol)、1-甲基-1H-咪唑-2-甲醛(450mg,4.09mmol)和2-甲基丙烷-2-亚磺酰胺(594mg,4.9mmol)与二氯甲烷(2ml)混合得到浅蓝色悬浮液。于25℃搅拌反应混合物15小时,然后通过硅藻土过滤。将反应混合物再次通过硅胶以乙酸乙酯洗脱来过滤。将粗反应混合物经真空浓缩提供670mg(76%)的2-甲基-丙烷-2-亚磺酸1-(1-甲基-1H-咪唑-2-基)-亚甲-(E)-基酰胺,为油状物。1H NMR(300MHz,CDCl3):δ8.62(s,1H),7.27(bs,1H),7.08(bs,1H),4.02(s,1H),1.26(s,9H).
步骤2
2-甲基-丙烷-2-亚磺酸[1-(1-甲基-1H-咪唑-2-基)-乙基]-酰胺
在250mL圆底烧瓶中,将2-甲基-丙烷-2-亚磺酸1-(1-甲基-1H-咪唑-2-基)-亚甲-(E)-基酰胺(670mg,3.14mmol)与THF混合得到无色溶液。于0℃添加在乙醚中的甲基溴化镁(3.0M,5.24ml,15.7mmol)。将反应混合物在0℃搅拌2小时。将反应混合物以饱和NH4Cl水溶液稀释。将水层以二氯甲烷(2x100mL)反萃取。将水层以EtOAc(1x125mL)反萃取。将粗反应混合物经真空浓缩提供700mg(92%)的2-甲基-丙烷-2-亚磺酸[1-(1-甲基-1H-咪唑-2-基)-乙基]-酰胺,为单一非对映异构体。1H NMR(300MHz,DMSO-d6):δ6.98(bs,1H),6.82(bs,1H),4.61(q,1H,J=6Hz),4.10(bs,1H),1.61(d,1H,J=6Hz),1.29(s,9H).
步骤3
1-(1-甲基-1H-咪唑-2-基)-乙胺二盐酸盐
在250mL圆底烧瓶中,于0℃将2-甲基-丙烷-2-亚磺酸[1-(1-甲基-1H-咪唑-2-基)-乙基]-酰胺(700mg,3.05mmol)与甲醇混合得到无色溶液。添加氯化氢(4.0M的1,4-二噁烷溶液,10ml,40.0mmol)。于0℃搅拌反应混合物2小时,然后真空浓缩提供1-(1-甲基-1H-咪唑-2-基)-乙胺二盐酸盐。1H NMR(300MHz,DMSO-d6):δ9.28(bs,1H),7.67(bs,2H),4.92(bs,1H),3.93(bd,1H),1.67(bd,3H).
步骤4
2-(6-氯-1-甲基-1H-吲唑-3-基)-5-(2-三甲基甲硅烷基-乙氧基甲基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-羧酸[1-(1-甲基-1H-咪唑-2-基)-乙基]-酰胺
在20mL闪烁小瓶中,将2-(6-氯-1-甲基-1H-吲唑-3-基)-5-(2-三甲基甲硅烷基-乙氧基甲基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-羧酸(400mg,0.87mmol)、1-(1-甲基-1H-咪唑-2-基)-乙胺二盐酸盐(219mg,1.75mmol)、HBTU(431mg,1.14mmol)、HOBt(153mg,1.14mmol)和DIPEA(0.31ml,1.75mmol)与DMF(6ml)混合得到浅黄色溶液。室温搅拌过夜后,将反应混合物以EtOAc(50mL)稀释,并以饱和NaHCO3(3x25mL)和H2O(3x25mL)洗涤。将有机层经Na2SO4干燥并真空浓缩。将粗物质通过快速色谱(硅胶,4g,0%至10%MeOH的DCM溶液,含0.1%NH4OH)纯化提供300mg(61%)的2-(6-氯-1-甲基-1H-吲唑-3-基)-5-(2-三甲基甲硅烷基-乙氧基甲基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-羧酸[1-(1-甲基-1H-咪唑-2-基)-乙基]-酰胺。MS:(M+H)+=566.
步骤5
2-(6-氯-1-甲基-1H-吲唑-3-基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-羧酸[1-(1-甲基-1H-咪唑-2-基)-乙基]-酰胺
将2-(6-氯-1-甲基-1H-吲唑-3-基)-5-(2-三甲基甲硅烷基-乙氧基甲基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-羧酸[1-(1-甲基-1H-咪唑-2-基)-乙基]-酰胺(300mg,0.531mol)溶解于TFA:DCM的4:6溶液(142mL)中。室温搅拌过夜后,减压除去挥发物。然后将粗物质溶解在二氯甲烷中并以乙二胺(319mg,5.31mmol)处理。室温搅拌过夜后,过滤收集沉淀得到100mg(43%)的2-(6-氯-1-甲基-1H-吲唑-3-基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-羧酸[1-(1-甲基-1H-咪唑-2-基)-乙基]-酰胺,为黄色固体。MS:(M+H)+=435;1H NMR(300MHz,DMSO-d6)δppm9.12(s,1H)8.50-8.63(m,2H)8.49-8.50(m,1H)7.96(d,J=1.51Hz,1H)7.29(dd,J=8.69,1.51Hz,1H)7.09(s,1H)6.85(s,1H)5.40-5.68(m,1H)4.15(s,3H)3.63-3.77(m,3H)1.61(d,J=6.80Hz,3H).
实施例200.
2-(6-氯-1-甲基-1H-吲唑-3-基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-羧酸((R)-2-羟基-1-甲基-乙基)-酰胺
步骤1
2-(6-氯-1-甲基-1H-吲唑-3-基)-5-(2-三甲基甲硅烷基-乙氧基甲基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-羧酸((R)-2-羟基-1-甲基-乙基)-酰胺
在20mL闪烁小瓶中,将2-(6-氯-1-甲基-1H-吲唑-3-基)-5-(2-三甲基甲硅烷基-乙氧基甲基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-羧酸(400mg,0.87mmol)、D-丙氨醇(131mg,1.75mmol)、HBTU(431mg,1.14mmol)、HOBt(153mg,1.14mmol)和DIPEA(0.31ml,1.75mmol)与DMF(6ml)混合得到浅黄色溶液。室温搅拌过夜后,将反应混合物以EtOAc(50mL)稀释,并以饱和NaHCO3(3x25mL)和H2O(3x25mL)洗涤。将有机层经Na2SO4干燥并真空浓缩。将粗物质通过快速色谱(硅胶,4g,0%至10%MeOH的DCM溶液,含0.1%NH4OH)纯化提供250mg(56%)的2-(6-氯-1-甲基-1H-吲唑-3-基)-5-(2-三甲基甲硅烷基-乙氧基甲基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-羧酸((R)-2-羟基-1-甲基-乙基)-酰胺,为灰白色固体。MS:(M+H)+=516.
步骤2
2-(6-氯-1-甲基-1H-吲唑-3-基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-羧酸((R)-2-羟基-1-甲基-乙基)-酰胺
将2-(6-氯-1-甲基-1H-吲唑-3-基)-5-(2-三甲基甲硅烷基-乙氧基甲基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-羧酸((R)-2-羟基-1-甲基-乙基)-酰胺(35mg,0.068mol)溶解于TFA:DCM的4:6溶液(10mL)中。室温搅拌过夜后,减压除去挥发物。然后将粗物质溶解在二氯甲烷中并以乙二胺(41mg,0.68mmol)处理。室温搅拌过夜后,过滤收集沉淀得到15mg(57%)的2-(6-氯-1-甲基-1H-吲唑-3-基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-羧酸((R)-2-羟基-1-甲基-乙基)-酰胺,为黄色固体。MS:(M+H)+=385;1H NMR(300MHz,DMSO-d6)δppm8.97(d,J=2.64Hz,1H)8.66(d,J=8.69Hz,1H)8.36(s,1H)8.15(d,J=7.93Hz,1H)7.92(s,1H)7.26(d,J=8.31Hz,1H)3.96-4.39(m,3H)3.31-3.68(m,1H)1.25(d,J=6.80Hz,3H).
实施例201.
2-(6-氯-1-甲基-1H-吲唑-3-基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-羧酸(反式-2-羟基-1-甲基-丙基)-酰胺
步骤1
反式-3-氨基-丁烷-2-醇
向20mL微波小瓶中添加氨(7.87g,10ml,462mmol)、顺式-2,3-二甲基环氧乙烷(1.0g,13.9mmol)和异丙基醇(3ml)。对小瓶封盖并在微波中于160℃加热1小时。将反应混合物冷却至室温并将溶剂蒸发提供1.24g的反式-3-氨基-丁烷-2-醇,为无色油状物。1H NMR(300MHz,d6-DMSO):δ4.36(bs,1H),3.19(q,1H,J=12Hz),2.48(m,1H),1.39(bs,2H),0.97(m,3H),0.86(m,3H).
步骤2
2-(6-氯-1-甲基-1H-吲唑-3-基)-5-(2-三甲基甲硅烷基-乙氧基甲基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-羧酸(反式-2-羟基-1-甲基-丙基)-酰胺
在20mL闪烁小瓶中,将2-(6-氯-1-甲基-1H-吲唑-3-基)-5-(2-三甲基甲硅烷基-乙氧基甲基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-羧酸(120mg,0.26mmol)、反式-3-氨基丁烷-2-醇(47mg,0.524mmol)、HBTU(129mg,0.341mmol)、HOBt(46mg,0.341mmol)和DIPEA(169mg,1.31mmol)与DMF(1.8ml)混合得到浅黄色溶液。室温搅拌过夜后,将反应混合物以EtOAc(50mL)稀释,并以饱和NaHCO3(3x25mL)和H2O(3x25mL)洗涤。将有机层经Na2SO4干燥并真空浓缩。将粗物质通过快速色谱(硅胶,4g,0%至10%MeOH的DCM溶液,含0.1%NH4OH)纯化提供127mg(91%)的2-(6-氯-1-甲基-1H-吲唑-3-基)-5-(2-三甲基甲硅烷基-乙氧基甲基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-羧酸(反式-2-羟基-1-甲基-丙基)-酰胺,为灰白色固体。MS:(M+H)+=530.
步骤3
2-(6-氯-1-甲基-1H-吲唑-3-基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-羧酸(反式-2-羟基-1-甲基-丙基)-酰胺
将2-(6-氯-1-甲基-1H-吲唑-3-基)-5-(2-三甲基甲硅烷基-乙氧基甲基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-羧酸(反式-2-羟基-1-甲基-丙基)-酰胺(120mg,0.227mol)溶解于TFA:DCM的4:6溶液(34mL)。室温搅拌过夜后,减压除去挥发物。然后将粗物质溶解在二氯甲烷中并以乙二胺(136mg,2.27mmol)处理。室温搅拌过夜后,添加水且将所得沉淀通过过滤收集得到77mg(85%)的2-(6-氯-1-甲基-1H-吲唑-3-基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-羧酸(反式-2-羟基-1-甲基-丙基)-酰胺,为黄色固体。MS:(M+H)+=399.1H NMR(300MHz,DMSO-d6)δppm12.65(宽单峰,1H)9.13(s,1H)8.76(d,J=8.69Hz,1H)8.40(s,1H)8.10(d,J=9.06Hz,1H)7.94(s,5H)7.32(d,J=8.69Hz,1H)5.16(宽单峰,1H)4.01-4.30(m,4H)3.81(宽单峰,1H)1.26(d,J=6.80Hz,3H)1.09(d,J=6.04Hz,3H).
实施例202.
2-(6-氟-1-甲基-1H-吲唑-3-基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-羧酸(1-甲基-2-苯氧基-乙基)-酰胺
步骤1
2-(6-氟-1-甲基-1H-吲唑-3-基)-5-(2-三甲基甲硅烷基-乙氧基甲基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-羧酸(1-甲基-2-苯氧基-乙基)-酰胺
在100mL圆底烧瓶中,将HBTU(78mg,0.21mmol)、许尼希碱(0.14ml,0.79mmol)和2-(6-氟-1-甲基-1H-吲唑-3-基)-5-(2-三甲基甲硅烷基-乙氧基甲基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-羧酸(70mg,0.16mmol)与DMF(3ml)混合得到浅黄色溶液。添加1-苯氧基丙烷-2-胺(48mg,0.32mmol)且于25℃搅拌反应混合物16小时。将反应混合物以EtOAc稀释。将反应混合物倒入50mL饱和NaHCO3中并以EtOAc(2x50mL)萃取。合并有机层并以水(2x50mL)洗涤,然后经MgSO4干燥和真空浓缩提供81mg(89%)的2-(6-氟-1-甲基-1H-吲唑-3-基)-5-(2-三甲基甲硅烷基-乙氧基甲基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-羧酸(1-甲基-2-苯氧基-乙基)-酰胺,为白色固体。MS:(M+H)+=575.
步骤2
2-(6-氟-1-甲基-1H-吲唑-3-基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-羧酸(1-甲基-2-苯氧基-乙基)-酰胺
将2-(6-氟-1-甲基-1H-吲唑-3-基)-5-(2-三甲基甲硅烷基-乙氧基甲基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-羧酸(1-甲基-2-苯氧基-乙基)-酰胺(80mg,0.139mol)溶解于TFA:DCM的4:6溶液(6.5mL)中。室温搅拌过夜后,减压除去挥发物。然后将粗物质溶解在二氯甲烷中并以乙二胺(837mg,13.9mmol)处理。室温搅拌过夜后,添加水且将所得沉淀通过过滤收集提供35mg(57%)的2-(6-氟-1-甲基-1H-吲唑-3-基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-羧酸(1-甲基-2-苯氧基-乙基)-酰胺,为黄色固体。MS:(M+H)+=445;1H NMR(300MHz,DMSO-d6)δppm12.56(s,1H)9.09(s,1H)8.37-8.61(m,2H)8.30(d,J=7.93Hz,1H)7.67(d,J=7.93Hz,1H)7.11-7.36(m,2H)6.76-7.07(m,4H)4.54(宽单峰,1H)3.98-4.27(m,5H)1.18-1.62(m,3H).
实施例203.
2-(6-氟-1-甲基-1H-吲唑-3-基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-羧酸[2-羟基-1-甲基-2-(四氢-吡喃-4-基)-乙基]-酰胺(非对映异构体A)
步骤1
2-硝基-1-(四氢-吡喃-4-基)-丙烷-1-醇
在100mL圆底烧瓶中,将硝基乙烷(1.42ml,26.3mmol)和四氢-2H-吡喃-4-甲醛(1.0g,8.76mmol)与THF(5ml)和叔丁醇混合得到无色溶液。室温添加叔丁醇钾(197mg,1.75mmol)。室温30分钟后,将反应混合物以EtOAc和水稀释。将有机相经分离、干燥和蒸发提供1.3g(79%)的粗2-硝基-1-(四氢-吡喃-4-基)-丙烷-1-醇,为无色油状物。1H NMR(300MHz,CDCl3)δppm4.74(quin,J=6.61Hz,1H),4.61(qd,J=6.80,3.02Hz,1H),3.91-4.10(m,7H),3.60(t,J=5.48Hz,1H),3.28-3.54(m,3H),2.20-2.28(m,3H),1.89-2.00(m,4H),1.11-1.74(m,16H).
步骤2
2-氨基-1-(四氢-吡喃-4-基)-丙烷-1-醇
将2-硝基-1-(四氢-吡喃-4-基)-丙烷-1-醇(1.3g,6.87mmol)溶解于乙醇(55mL)并以钯/炭(0.2g)在1atm氢气下处理。室温搅拌过夜后,滤除钯并减压减少溶剂提供1.0g(91%)的2-氨基-1-(四氢-吡喃-4-基)-丙烷-1-醇。MS:(M+H)+=160.
步骤3
2-(6-氟-1-甲基-1H-吲唑-3-基)-5-(2-三甲基甲硅烷基-乙氧基甲基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-羧酸[2-羟基-1-甲基-2-(四氢-吡喃-4-基)-乙基]-酰胺(非对映异构体A和非对映异构体B)
在100mL圆底烧瓶中,将HBTU(112mg,0.29mmol)、许尼希碱(0.20ml,1.13mmol)和2-(6-氟-1-甲基-1H-吲唑-3-基)-5-(2-三甲基甲硅烷基-乙氧基甲基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-羧酸(100mg,0.23mmol)与DMF(3.0ml)混合得到浅黄色溶液。添加2-氨基-1-(四氢-2H-吡喃-4-基)丙烷-1-醇(72mg,0.45mmol)并于25℃搅拌反应混合物16小时。将反应混合物以EtOAc稀释。将反应混合物倒入50mL饱和NaHCO3中并以EtOAc(2x50mL)萃取。合并有机层并以H2O(2x50mL)洗涤,然后经MgSO4干燥和真空浓缩提供粗物质。将产物通过快速色谱(硅胶,80g,20%至50%EtOAc的己烷溶液)纯化提供2-(6-氟-1-甲基-1H-吲唑-3-基)-5-(2-三甲基甲硅烷基-乙氧基甲基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-羧酸[2-羟基-1-甲基-2-(四氢-吡喃-4-基)-乙基]-酰胺,为两份离散的非对映异构体(任意指定的)。非对映异构体A(30mg,22%),为白色粉末:1H NMR(300MHz,CDCl3)δppm9.20(m,1H),8.68(dd,J=8.69,5.29Hz,1H),8.41(d,J=9.44Hz,1H),8.27(s,1H)6.96-7.13(m,2H)5.70(s,2H)4.54-4.67(m,1H)4.06-4.20(m,4H)3.87-4.04(m,2H)3.56-3.65(m,2H)3.42(d,J=6.80Hz,1H)3.21-3.39(m,2H),2.53(d,J=4.15Hz,1H)1.85(d,J=12.84Hz,2H)1.76(ddd,J=11.52,7.93,3.97Hz,1H),1.33-1.56(m,5H),0.75-1.04(m,2H),-0.05(s,9H)。非对映异构体B(70mg,53%),为白色粉末:1H NMR(300MHz,CDCl3)δppm9.21(s,1H)8.42-8.61(m,2H)8.27(s,1H)6.96-7.15(m,2H)5.51-5.76(m,2H)4.40-4.64(m,1H)3.93-4.24(m,3H)3.62-3.83(m,2H)3.50-3.62(m,2H)3.26-3.50(m,2H)2.70(d,J=5.29Hz,1H)1.92-2.10(m,2H)1.14-1.84(m,5H)0.67-1.07(m,2H)-0.33-0.16(m,9H).
步骤4
2-(6-氟-1-甲基-1H-吲唑-3-基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-羧酸[2-羟基-1-甲基-2-(四氢-吡喃-4-基)-乙基]-酰胺(非对映异构体A)
将2-(6-氟-1-甲基-1H-吲唑-3-基)-5-(2-三甲基甲硅烷基-乙氧基甲基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-羧酸[2-羟基-1-甲基-2-(四氢-吡喃-4-基)-乙基]-酰胺,非对映异构体A(26mg,0.034mmol)溶解于TFA:DCM的4:6溶液(5.7mL)中。室温搅拌过夜后,减压除去挥发物。然后将粗物质溶解在二氯甲烷中并以乙二胺(206mg,3.43mmol)处理。室温搅拌过夜后,添加水且将所得沉淀通过过滤收集得到13mg(83%)的2-(6-氟-1-甲基-1H-吲唑-3-基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-羧酸[2-羟基-1-甲基-2-(四氢-吡喃-4-基)-乙基]-酰胺(非对映异构体A),为灰白色固体。MS:(M+H)+=453.1H NMR(300MHz,DMSO-d6)δppm12.79(宽单峰,1H)9.15(s,1H)8.85(dd,J=8.88,5.48Hz,1H)8.40(s,1H)8.13(d,J=9.44Hz,1H)7.56-7.78(m,1H)7.11-7.37(m,1H)5.49(d,J=5.67Hz,1H)4.34-4.53(m,1H)4.13(s,3H)3.80(d,J=10.58Hz,2H)3.18-3.28(m,1H)3.11(t,J=11.14Hz,2H)1.66-1.89(m,2H)1.42-1.66(m,1H)1.10-1.36(m,5H).
实施例204.
2-(6-氟-1-甲基-1H-吲唑-3-基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-羧酸[2-羟基-1-甲基-2-(四氢-吡喃-4-基)-乙基]-酰胺(非对映异构体B)
将2-(6-氟-1-甲基-1H-吲唑-3-基)-5-(2-三甲基甲硅烷基-乙氧基甲基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-羧酸[2-羟基-1-甲基-2-(四氢-吡喃-4-基)-乙基]-酰胺,非对映异构体B(70mg,0.120mmol)溶解于TFA:DCM的4:6溶液(5.7mL)中。室温搅拌过夜后,减压除去挥发物。然后将粗物质溶解在二氯甲烷中并以乙二胺(722mg,12mmol)处理。室温搅拌过夜后,添加水且将所得沉淀通过过滤收集提供30mg(55%)的2-(6-氟-1-甲基-1H-吲唑-3-基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-羧酸[2-羟基-1-甲基-2-(四氢-吡喃-4-基)-乙基]-酰胺(非对映异构体B),为灰白色固体。MS:(M+H)+=453.1H NMR(300MHz,DMSO-d6)δppm12.73(宽单峰,1H)8.99-9.30(m,1H)8.70(dd,J=9.06,5.29Hz,1H)8.22-8.48(m,1H)7.65(dd,J=9.82,1.89Hz,2H)6.94-7.22(m,1H)4.97(d,J=6.80Hz,1H)4.35(m,1H)4.2(s,1H),3.71(m,2H)1.87(d,J=13.60Hz,1H)1.43-1.77(m,2H)0.97-1.43(m,5H).
实施例205.
2-(6-氯-1-甲基-1H-吲唑-3-基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-羧酸((R)-3-氰基-1-甲基-丙基)-酰胺
步骤1
((R)-3-氰基-1-甲基-烯丙基)-氨基甲酸叔丁酯
在20mL闪烁小瓶中,将((R)-1-甲基-2-氧代-乙基)-氨基甲酸叔丁酯(2.5g,14.4mmol)和(三苯基膦亚基)乙腈(6.52g,21.7mmol)混合在二氯甲烷(20mL)中并在室温搅拌16小时。蒸发溶剂得到粗物质,其通过柱色谱(硅胶,梯度正己烷/乙酸乙酯)纯化提供1.8g(63%)的((R)-3-氰基-1-甲基-烯丙基)-氨基甲酸叔丁酯,呈3:1的非对映选择性(E:Z),为无色油状物。1H NMR(300MHz,CDCl3)δppm6.38-6.79(m,1H),5.47(dd,J=16.24,1.89Hz,1H),4.48(bs,1H),4.47(bs,1H),1.45(s,1H),1.28(d,J=7.18Hz,9H).
步骤2
((R)-3-氰基-1-甲基-丙基)-氨基甲酸叔丁酯
在250mL圆底烧瓶中,将钯/炭(150mg)和3:1E:Z烯烃((R)-3-氰基-1-甲基-烯丙基)-氨基甲酸叔丁酯(375mg,1.91mmol)的混合物与乙醇混合得到黑色悬浮液。于25℃在氢气气球下搅拌反应混合物16小时。将反应混合物通过硅藻土过滤。将粗反应混合物经真空浓缩提供250mg(66%)的((R)-3-氰基-1-甲基-丙基)-氨基甲酸叔丁酯,为无色油状物,其不经进一步纯化即可使用。1H NMR(300MHz,CDCl3)δppm4.30-4.65(m,1H),3.52-3.81(m,1H),2.28(m,1H),2.72(m,1H),1.58-1.97(m,1H),1.04-1.24(m,3H).
步骤3
(R)-4-氨基戊腈三氟乙酸盐
在100mL圆底烧瓶中,将((R)-3-氰基-1-甲基-丙基)-氨基甲酸叔丁酯(158mg,0.80mmol)与TFA(2ml)和二氯甲烷(8mL)混合得到无色溶液。于25℃搅拌反应混合物15小时。蒸发溶剂提供53mg(68%)的(R)-4-氨基戊腈三氟乙酸盐,其不经进一步纯化用于后续步骤。
步骤4
2-(6-氯-1-甲基-1H-吲唑-3-基)-5-(2-三甲基甲硅烷基-乙氧基甲基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-羧酸((R)-3-氰基-1-甲基-丙基)-酰胺
在20mL闪烁小瓶中,将2-(6-氯-1-甲基-1H-吲唑-3-基)-5-(2-三甲基甲硅烷基-乙氧基甲基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-羧酸(120mg,0.26mmol)、(R)-4-氨基戊腈三氟乙酸盐(51mg,0.524mmol)、HBTU(129mg,0.341mmol)、HOBt(46mg,0.341mmol)和DIPEA(169mg,1.31mmol)与DMF(1.8ml)混合得到浅黄色溶液。室温过夜后,将反应混合物以EtOAc(50mL)稀释,并以饱和NaHCO3(3x25mL)和H2O(3x25mL)洗涤。将有机层经Na2SO4干燥并真空浓缩。将粗物质通过快速色谱(硅胶,4g,0%至10%MeOH的DCM溶液,含0.1%NH4OH)纯化提供99mg(70%)的2-(6-氯-1-甲基-1H-吲唑-3-基)-5-(2-三甲基甲硅烷基-乙氧基甲基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-羧酸((R)-3-氰基-1-甲基-丙基)-酰胺,为灰白色固体。MS:(M+H)+=539.
步骤5
2-(6-氯-1-甲基-1H-吲唑-3-基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-羧酸((R)-3-氰基-1-甲基-丙基)-酰胺
将2-(6-氯-1-甲基-1H-吲唑-3-基)-5-(2-三甲基甲硅烷基-乙氧基甲基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-羧酸((R)-3-氰基-1-甲基-丙基)-酰胺(120mg,0.223mmol)溶解于TFA:DCM的4:6溶液(57mL)中。室温搅拌过夜后,减压除去挥发物。然后将粗物质溶解在二氯甲烷中并以乙二胺(134mg,2.23mmol)处理。室温搅拌过夜后,添加水且将所得沉淀通过过滤收集提供45mg(49%)的2-(6-氯-1-甲基-1H-吲唑-3-基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-羧酸((R)-3-氰基-1-甲基-丙基)-酰胺,为黄色固体。MS:(M+H)+=408.1H NMR(300MHz,DMSO-d6)δppm12.81(宽单峰,1H)8.88-9.14(m,1H)8.35-8.51(m,1H)7.93-8.10(m,2H)7.35(dd,J=8.69,1.89Hz,1H)4.08-4.36(m,4H)2.61(t,J=7.36Hz,2H)1.76-2.02(m,2H)1.32(d,J=6.80Hz,3H).
实施例206.
2-(6-氯-1-甲基-1H-吲唑-3-基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-羧酸[(R)-1-(2-氰基-环丙基)-乙基]-酰胺(非对映异构体A)
步骤1
[(R)-1-(2-氰基-环丙基)-乙基]-氨基甲酸叔丁酯(非对映异构体A和非对映异构体B)
于0℃将DMSO添加至三甲基碘化锍(1.79g,8.15mmol)和氢化钠(60%在矿物油中,326mg,8.15mmol)。然后添加((R)-3-氰基-1-甲基-烯丙基)-氨基甲酸叔丁酯(0.4g,2.04mmol)在DMSO中的3:1E:Z混合物。将反应混合物温热至室温过夜。将反应混合物在室温搅拌2天,然后以水和乙酸乙酯稀释。将有机层经MgSO4干燥并真空浓缩。将粗物质通过快速色谱(硅胶,80g,20%至50%EtOAc的己烷溶液)纯化提供[(R)-1-(2-氰基-环丙基)-乙基]-氨基甲酸叔丁酯,为两种离散的非对映异构体(任意指定)。非对映异构体A(250mg,58%),为无色油状物;MS:(M+H)+=211。非对映异构体B(130mg,30%),为白色粉末;M+Na)+=233.
步骤2
2-((R)-1-氨基-乙基)-环丙烷甲腈三氟乙酸盐(非对映异构体A)
在100mL圆底烧瓶中,将[(R)-1-(2-氰基-环丙基)-乙基]-氨基甲酸叔丁酯,非对映异构体A(250mg,1.19mmol)溶解于TFA(2ml)和二氯甲烷(8mL)中。于25℃搅拌反应混合物15小时,且减压除去挥发物得到2-((R)-1-氨基-乙基)-环丙烷甲腈三氟乙酸盐(非对映异构体A),其不经进一步纯化即可在下一步中使用。
步骤3
2-(6-氯-1-甲基-1H-吲唑-3-基)-5-(2-三甲基甲硅烷基-乙氧基甲基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-羧酸[(R)-1-(2-氰基-环丙基)-乙基]-酰胺(非对映异构体A)
将2-((R)-1-氨基-乙基)-环丙烷甲腈三氟乙酸盐,非对映异构体A(来自步骤2的粗产物)以1-羟基苯并三唑(153mg,1.14mmol)、2-(1H-苯并[d][1,2,3]三唑-1-基)-1,1,3,3-四甲基异脲鎓六氟磷酸盐(V)(662mg,1.75mmol)、DIPEA(0.76ml,4.37mmol)、2-(6-氯-1-甲基-1H-吲唑-3-基)-5-(2-三甲基甲硅烷基-乙氧基甲基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-羧酸(400mg,0.87mmol)和DMF(6.0ml)处理得到浅黄色溶液。室温搅拌过夜后,将反应混合物以乙酸乙酯和水稀释。将有机层经MgSO4干燥并真空浓缩。将粗物质通过快速色谱(硅胶,40g,EtOAc的庚烷梯度)纯化提供210mg(44%)的2-(6-氯-1-甲基-1H-吲唑-3-基)-5-(2-三甲基甲硅烷基-乙氧基甲基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-羧酸[(R)-1-(2-氰基-环丙基)-乙基]-酰胺(非对映异构体A),为无色油状物。MS:(M+H)+=551.
步骤4
2-(6-氯-1-甲基-1H-吲唑-3-基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-羧酸[(R)-1-(2-氰基-环丙基)-乙基]-酰胺(非对映异构体A)
将2-(6-氯-1-甲基-1H-吲唑-3-基)-5-(2-三甲基甲硅烷基-乙氧基甲基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-羧酸[(R)-1-(2-氰基-环丙基)-乙基]-酰胺,非对映异构体A(210mg,0.382mmol)溶解于TFA:DCM的4:6溶液(57mL)。室温搅拌过夜后,减压除去挥发物。然后将粗物质溶解在二氯甲烷中并以乙二胺(229mg,3.82mmol)处理。室温搅拌过夜后,添加水且将所得沉淀通过过滤收集得到140mg(87%)的2-(6-氯-1-甲基-1H-吲唑-3-基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-羧酸[(R)-1-(2-氰基-环丙基)-乙基]-酰胺(非对映异构体A),为浅黄色固体。MS:(M+H)+=420.1H NMR(300MHz,DMSO-d6)δppm9.70(bs,1H)9.08(s,4H)8.32-8.58(m,2H)8.13(dd,J=12.27,8.12Hz,1H)7.98(s,1H)7.24-7.44(m,1H)4.16(s,3H)3.80(d,J=5.29Hz,1H)1.61-1.96(m,2H)1.40(m,3H)0.98-1.30(m,2H).
实施例207.
2-(6-氯-1-甲基-1H-吲唑-3-基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-羧酸[(R)-1-(2-氰基-环丙基)-乙基]-酰胺(非对映异构体B)
根据在实施例206步骤2-4中阐述的操作制备,以[(R)-1-(2-氰基-环丙基)-乙基]-氨基甲酸叔丁酯,非对映异构体B替代步骤2中的[(R)-1-(2-氰基-环丙基)-乙基]-氨基甲酸叔丁酯,非对映异构体A。分离产物,为浅黄色固体。MS:(M+H)+=420(M+H)+.1H NMR(300MHz,DMSO-d6)δppm9.10(s,1H)8.40-8.52(m,2H)8.32(d,J=7.93Hz,1H)7.99(s,1H)7.35(d,J=8.69Hz,1H)4.06-4.22(m,3H)3.80(d,J=9.82Hz,1H)1.92-2.10(m,1H)1.56-1.73(m,1H)1.49(d,J=6.80Hz,3H)0.94-1.35(m,2H).
实施例208.
2-(6-氟-1-甲基-1H-吲唑-3-基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-羧酸[1-(4-溴-苯基)-环丙基]-酰胺
步骤1
2-(6-氟-1-甲基-1H-吲唑-3-基)-5-(2-三甲基甲硅烷基-乙氧基甲基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-羧酸[1-(4-溴-苯基)-环丙基]-酰胺
向2-(6-氟-1-甲基-1H-吲唑-3-基)-5-(2-三甲基甲硅烷基-乙氧基甲基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-羧酸(150mg,0.34mmol)在DMF(5mL)中的搅拌悬浮液中添加HATU(258mg,0.68mmol)和1-(4-溴-苯基)-环丙胺(108mg,0.51mmol),接着于室温在氮气气氛下添加DIPEA(0.24mL,1.36mmol)。将所得浅黄色溶液搅拌15小时同时TLC分析(Hex:EA,1:1,Rf=0.5)表明新的点的存在。然后,以水稀释反应混合物,将有机化合物在EtOAc(3x25mL)中萃取。将合并的萃取物以盐水溶液洗涤,然后经无水MgSO4干燥。过滤干燥试剂并浓缩滤液得到粗产物,其通过使用ISCO柱色谱(40g)纯化(以EtOAc的己烷溶液(0-60%)洗脱10分钟)。合并期望的馏分并真空除去溶剂得到197mg(91%)的2-(6-氟-1-甲基-1H-吲唑-3-基)-5-(2-三甲基甲硅烷基-乙氧基甲基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-羧酸[1-(4-溴-苯基)-环丙基]-酰胺,为灰白色固体。
步骤2
2-(6-氟-1-甲基-1H-吲唑-3-基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-羧酸[1-(4-溴-苯基)-环丙基]-酰胺
于室温向2-(6-氟-1-甲基-1H-吲唑-3-基)-5-(2-三甲基甲硅烷基-乙氧基甲基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-羧酸[1-(4-溴-苯基)-环丙基]-酰胺(50mg,0.078mmol)在THF(3mL)的搅拌溶液添加TBAF的溶液(1.0M的THF溶液,1.18mL,1.18mmol)。将所得浅棕色溶液加热至85℃并搅拌3小时,此时TLC分析(EA,Rf=0.3)显示不存在起始物质。然后,将反应混合物冷却至室温并添加3mL的丙酮和9mL的饱和碳酸氢钠溶液,且搅拌所得悬浮液1小时。将反应悬浮液以水稀释,将有机化合物在EtOAc(3x25mL)中萃取,将合并的萃取物以盐水溶液洗涤,经MgSO4干燥。过滤干燥试剂并真空除去溶剂得到粗固体,其随着加热溶解于乙腈中。将所得绿色溶液存储在冰箱中15小时并将固体通过过滤收集并以乙腈洗涤。在空气中干燥后,分离出25mg(63%)的2-(6-氟-1-甲基-1H-吲唑-3-基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-羧酸[1-(4-溴-苯基)-环丙基]-酰胺,为灰白色固体。LC-MS(M+H)+=507;1H NMR(300MHz,DMSO-d6)δ:12.91(s,1H),9.11(s,1H),8.99(s,1H),8.52(s,1H),8.39-8.51(m,1H),7.68(dd,J=9.7,1.9Hz,1H),7.47(d,J=8.5Hz,2H),7.27(d,J=8.5Hz,2H),7.14(td,J=9.0,2.0Hz,1H),4.14(s,3H),1.44(s,4H)。
实施例209.
2-(6-氟-1-甲基-1H-吲唑-3-基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-羧酸[1-(3-溴-苯基)-环丁基]-酰胺
步骤1
2-(6-氟-1-甲基-1H-吲唑-3-基)-5-(2-三甲基甲硅烷基-乙氧基甲基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-羧酸[1-(3-溴-苯基)-环丁基]-酰胺
向2-(6-氟-1-甲基-1H-吲唑-3-基)-5-(2-三甲基甲硅烷基-乙氧基甲基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-羧酸(200mg,0.45mmol)在DMF(5mL)中的搅拌悬浮液中添加HATU(344mg,0.91mmol)和1-(3-溴-苯基)-环丁胺盐酸盐(178mg,0.68mmol),接着于室温在氮气气氛下添加DIPEA(0.40mL,2.26mmol)。将所得浅黄色溶液搅拌15h,同时TLC分析(Hex:EA,1:1,Rf=0.5)表明新的点的存在。然后,以水稀释反应混合物,将有机化合物萃取至EtOAc(3x25mL)。将合并的萃取物以盐水溶液洗涤,然后经无水MgSO4干燥。过滤干燥试剂并浓缩滤液得到粗产物,其通过使用ISCO柱色谱(40g)纯化(以EtOAc的己烷溶液(0-60%)洗脱10分钟)。合并期望的馏分并真空除去溶剂得到234mg(80%)的2-(6-氟-1-甲基-1H-吲唑-3-基)-5-(2-三甲基甲硅烷基-乙氧基甲基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-羧酸[1-(3-溴-苯基)-环丁基]-酰胺,为浅棕色固体。
步骤2
2-(6-氟-1-甲基-1H-吲唑-3-基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-羧酸[1-(3-溴-苯基)-环丁基]-酰胺
于室温在氮气氛下向2-(6-氟-1-甲基-1H-吲唑-3-基)-5-(2-三甲基甲硅烷基-乙氧基甲基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-羧酸[1-(3-溴-苯基)-环丁基]-酰胺(50mg,0.077mmol)在二氯甲烷(3mL)中的浅棕色溶液中添加过量的TFA(1.2mL,15.4mmol)。将所得浅棕色溶液搅拌4h,此时TLC分析(EA,Rf=0.35)显示不存在起始物质。然后真空除去溶剂并将残余物与甲苯共沸得到浅棕色固体。然后于室温在氮气气氛下将该固体以过量的三乙胺(1.07mL,7.7mmol)的甲醇(3mL)溶液处理。将所得悬浮液搅拌15h,然后真空除去溶剂。将残余物以乙腈研磨,将固体通过过滤收集并以乙腈洗涤。在空气中干燥后,分离出15mg(38%)的2-(6-氟-1-甲基-1H-吲唑-3-基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-羧酸[1-(3-溴-苯基)-环丁基]-酰胺,为浅黄色固体。LC-MS(M+H)+=519;1H NMR(300MHz,DMSO-d6)δ:12.80(宽单峰,1H),9.10(s,1H),8.77(s,1H),8.55(dd,J=8.8,5.5Hz,1H),8.36(s,1H),7.64-7.80(m,2H),7.57(d,J=7.8Hz,1H),7.41(d,J=7.8Hz,1H),7.23-7.35(m,1H),7.15(t,J=8.2Hz,1H),4.15(s,3H),2.56-2.81(m,4H),2.19(d,J=8.5Hz,1H),1.96(d,J=8.3Hz,1H).
实施例210.
2-(6-氟-1-甲基-1H-吲唑-3-基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-羧酸[1-(4-溴-苯基)-环丁基]-酰胺
根据实施例209中阐述的操作制备,以1-(4-溴-苯基)-环丁胺盐酸盐替代步骤1中的1-(3-溴-苯基)-环丁胺盐酸盐。LC-MS(M+H)+=519;1H NMR(300MHz,DMSO-d6)δ:12.87(宽单峰,1H),9.10(s,1H),8.76(s,1H),8.48(dd,J=8.5,5.3Hz,1H),8.35(s,1H),7.69(d,J=9.3Hz,1H),7.52(s,4H),7.13(t,J=8.5Hz,1H),4.15(s,3H),2.68(t,J=7.4Hz,4H),2.17(d,J=7.8Hz,1H),1.85-2.03(m,1H)。
实施例211.
2-(6-氟-1-甲基-1H-吲唑-3-基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-羧酸[(R)-1-(4-溴-苯基)-2,2,2-三氟-乙基]-酰胺
根据实施例209中阐述的操作制备,以(R)-1-(4-溴-苯基)-2,2,2-三氟乙胺替代步骤1中的1-(3-溴-苯基)-环丁胺盐酸盐。LC-MS(M+H)+=547;1H NMR(300MHz,DMSO-d6)δ:12.87(宽单峰,1H),8.81-9.13(m,2H),8.47(s,1H),8.21-8.36(m,1H),7.34-7.69(m,4H),6.88(t,J=8.4Hz,1H),6.08-6.27(m,1H),5.63(s,1H),4.03(s,3H).
实施例212.
2-(5,6-二氟-1-甲基-1H-吲唑-3-基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-羧酸((S)-2-甲氧基-1-甲基-乙基)-酰胺
步骤1
3-溴-5,6-二氟-1-甲基-1H-吲唑
于室温向3-溴-5,6-二氟-1H-吲唑(1.0g,4.29mmol)和碳酸钾(4.15g,30.0mmol)在N-甲基吡咯烷(20mL)中的浅棕色悬浮液中添加碘甲烷(0.81mL,12.9mmol)。于室温在氮气气氛下将所得深棕色溶液搅拌15h,同时TLC(2:1,Hex:EA,Rf=0.6,主要和0.4,次要)表明期望化合物的存在。将反应混合物以水(~100mL)稀释,将有机化合物以乙酸乙酯(3x50mL)萃取且将合并的萃取物以盐水溶液洗涤。经MgSO4干燥后,将滤液浓缩得到粗浅棕色固体,其经色谱使用ISCO(80g)柱纯化(以己烷(1分钟),0-15%EA的己烷溶液(2分钟),15-40%EA的己烷溶液(15分钟)洗脱)得到746mg(70%)的3-溴-5,6-二氟-1-甲基-1H-吲唑,为白色固体,和186mg(18%)的3-溴-5,6-二氟-2-甲基-2H-吲唑,为浅黄色固体。
步骤2
2-溴-5-(2-三甲基甲硅烷基-乙氧基甲基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-羧酸((S)-2-甲氧基-1-甲基-乙基)-酰胺
于室温在氮气气氛下向2-溴-5-(2-三甲基甲硅烷基-乙氧基甲基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-羧酸(2.0g,5.37mmol)、(S)-1-甲氧基丙烷-2-胺(718mg,8.06mmol)和HATU(4.09g,10.7mmol)的混合物中添加DMF(20mL)和DIPEA(3.75mL,21.5mmol)。将所得溶液在室温搅拌15h,此时LCMS分析和TLC(1:1,Hex:EA,Rf=0.4)系统表明期望化合物的存在。将反应混合物以水(~100mL)稀释,将有机化合物以乙酸乙酯(3x50mL)萃取且将合并的萃取物以盐水溶液洗涤。在经MgSO4干燥后,将滤液浓缩得到粗浅棕色固体(~4.1g),其经色谱使用ISCO(120g)柱纯化(以己烷(1分钟),0-30%EA的己烷溶液(2分钟),30-60%EA的己烷溶液(15分钟)洗脱)得到1.9g(80%)的2-溴-5-(2-三甲基甲硅烷基-乙氧基甲基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-羧酸((S)-2-甲氧基-1-甲基-乙基)-酰胺,为白色固体。
步骤3
2-(5,6-二氟-1-甲基-1H-吲唑-3-基)-5-(2-三甲基甲硅烷基-乙氧基甲基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-羧酸((S)-2-甲氧基-1-甲基-乙基)-酰胺
于-5℃(冰/丙酮)经3-5分钟向3-溴-5,6-二氟-1-甲基-1H-吲唑(247mg,1.00mmol)在THF(3mL,蒸馏)中的无色溶液中滴加异丙基氯化镁的溶液(2.0M的THF溶液,0.715mL,1.43mmol)。于0℃将所得非常浅黄色的溶液搅拌2小时,此时TLC分析(Hex:EA,2:1,Rf=0.5新点,Rf=0.65,SM)的水解等份表明存在更为极性的点,但是起始物质也存在。将澄清的浅黄色溶液缓慢地温热至室温。在该阶段期间,形成黄色悬浮液,其再搅拌3小时以完成反应。然后,室温将氯化锌(273mg,2.0mmol)(无水ZnCl2以加热枪高真空加热至熔融,然后冷却至室温,然后溶解在THF中)在THF(3mL)中的溶液添加至黄色的悬浮液。将所得浅黄色悬浮液搅拌10分钟。
在分开的单颈25mL圆底烧瓶中装入二-(二亚苄基丙酮)-钯(29mg,0.050mmol)和三邻甲苯基膦(61mg,0.20mmol)且将烧瓶以氮气冲洗。添加THF(1mL)且将所得浅棕色悬浮液搅拌5分钟,然后室温在氮气气氛下添加2-溴-5-(2-三甲基甲硅烷基-乙氧基甲基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-羧酸((S)-2-甲氧基-1-甲基-乙基)-酰胺(111mg,0.25mmol)在THF(2mL)中的溶液。然后将上述制备的黄色锌悬浮液添加至该混合物。添加期间,其变为浅棕色溶液,然后加热至60℃并搅拌15小时,此时TLC分析(Hex:EA,1:1,Rf=0.5和0.55,对于SM)的水解反应混合物表明新的点的存在。将反应混合物冷却至室温并以饱和氯化铵溶液和EtOAc稀释。分离两层且将水层以EtOAc萃取。将合并的有机萃取物以盐水溶液洗涤,并经无水MgSO4干燥。过滤干燥试剂并浓缩滤液得到粗产物,且经色谱使用ISCO(40g)柱纯化(以己烷(1分钟),0-25%EA的己烷溶液(2分钟),25-60%EA的己烷溶液(10分钟),60-100%EA的己烷溶液(2分钟)和纯的EA(5分钟)洗脱)。合并期望的馏分并真空除去溶剂得到57mg(43%)的2-(5,6-二氟-1-甲基-1H-吲唑-3-基)-5-(2-三甲基甲硅烷基-乙氧基甲基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-羧酸((S)-2-甲氧基-1-甲基-乙基)-酰胺,为浅棕色固体。
步骤4
2-(5,6-二氟-1-甲基-1H-吲唑-3-基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-羧酸((S)-2-甲氧基-1-甲基-乙基)-酰胺
于室温向2-(5,6-二氟-1-甲基-1H-吲唑-3-基)-5-(2-三甲基甲硅烷基-乙氧基甲基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-羧酸((S)-2-甲氧基-1-甲基-乙基)-酰胺(52mg,0.098mmol)在THF(3mL)中的的搅拌溶液中添加TBAF的溶液(1.0M的THF溶液,1.96mL,1.96mmol)。将所得浅棕色溶液加热至85℃并搅拌3小时,此时TLC分析(EA,Rf=0.3)显示不存在起始物质。然后,将反应混合物冷却至室温并添加3mL的丙酮和9mL的饱和碳酸氢钠溶液,且将所得悬浮液搅拌2小时。将反应悬浮液以水稀释,将有机化合物萃取至EtOAc(3x)且将合并的萃取物以水和盐水溶液洗涤,然后经MgSO4干燥。过滤干燥试剂并真空除去溶剂得到粗产物,其溶解于热乙腈。添加EtOAc且将溶液存储在冰箱中15小时。将所得固体通过过滤收集,以乙腈洗涤,且空气干燥得到15mg的灰白色固体。将母液经色谱使用ISCO(40g)柱纯化(以二氯甲烷(1分钟)、0-100%(10%甲醇的二氯甲烷溶液)在二氯甲烷中(5分钟)和10%甲醇的二氯甲烷溶液(5分钟)洗脱)得到另外的10mg的浅黄色固体。总计,分离出25mg(64%)的2-(5,6-二氟-1-甲基-1H-吲唑-3-基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-羧酸((S)-2-甲氧基-1-甲基-乙基)-酰胺。LC-MS(M+H)+=401;mp=295-297℃;1H NMR(300MHz,DMSO-d6)δ:12.87(宽单峰,1H),9.09(s,1H),8.44(s,1H),8.34(dd,J=10.2,7.9Hz,1H),8.12(d,J=8.5Hz,1H),8.00(dd,J=10.7,6.7Hz,1H),4.27-4.48(m,1H),4.16(s,3H),3.42-3.57(m,2H),3.32(宽单峰,3H),1.33(d,J=6.8Hz,3H)。
实施例213.
2-(6-氟-1-甲基-1H-吲唑-3-基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-羧酸((R)-1-苄基-吡咯烷-3-基)-酰胺
步骤1
2-溴-5-(2-三甲基甲硅烷基-乙氧基甲基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-羧酸((R)-1-苄基-吡咯烷-3-基)-酰胺
在100mL圆底烧瓶中,将2-溴-5-(2-三甲基甲硅烷基-乙氧基甲基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-羧酸(1.0g,2.69mmol)与二氯甲烷(3ml)混合得到黄色溶液。添加(R)-1-苄基吡咯烷-3-胺(710mg,4.03mmol)和然后DIEA(1.88ml,10.7mmol)。向澄清溶液中添加HATU(2.04g,5.37mmol)并向该混合物中添加DMF(4ml)。将反应混合物在氮气下搅拌过夜,然后浓缩并在水(100ml)和EtOAc(100ml)之间分配。将水层以EtOAc(50ml)洗涤,然后将合并的有机物以盐水洗涤,经MgSO4干燥,过滤并浓缩。将粗品溶解于EtOAc(支撑在硅胶上),并通过快速色谱(120g Silicycle)以0%至100%EtOAc的己烷溶液纯化。合并合适的馏分并浓缩得到1.38g(97%)的2-溴-5-(2-三甲基甲硅烷基-乙氧基甲基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-羧酸((R)-1-苄基-吡咯烷-3-基)-酰胺,为具有略红/棕色色泽的澄清粘稠半固体。LC-MS(M+H)+=530.
步骤2
2-(6-氟-1-甲基-1H-吲唑-3-基)-5-(2-三甲基甲硅烷基-乙氧基甲基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-羧酸((R)-1-苄基-吡咯烷-3-基)-酰胺
向含有2-溴-5-(2-三甲基甲硅烷基-乙氧基甲基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-羧酸((R)-1-苄基-吡咯烷-3-基)-酰胺(1.32g,2.49mmol)的40ml小瓶中添加6-氟-1-甲基-3-三丁基甲锡烷基-1H-吲唑(1.20g,2.73mmol)在DMF(25ml)中的溶液中。将小瓶回填以氮气并添加以四(三苯基膦)钯(0)(159mg,0.14mmol)和碘化亚铜(I)(107mg,0.56mmol)。再次以氮气回填小瓶,然后密封并在热块中于80℃搅拌反应混合物4小时。将反应混合物冷却至室温,以EtOAc/己烷(100/30ml)稀释且以水(100ml)洗涤。将水层以EtOAc/己烷(100/30ml)萃取。将合并的有机层以盐水洗涤,然后经MgSO4干燥,过滤,并浓缩。将粗品通过快速色谱(120g Analogix)以20%至100%EtOAc的己烷溶液纯化。合并合适的馏分并浓缩得到1.02g(62%)的2-(6-氟-1-甲基-1H-吲唑-3-基)-5-(2-三甲基甲硅烷基-乙氧基甲基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-羧酸((R)-1-苄基-吡咯烷-3-基)-酰胺,为浅黄色固体。LC-MS(M+H)+=600.
步骤3
2-(6-氟-1-甲基-1H-吲唑-3-基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-羧酸((R)-1-苄基-吡咯烷-3-基)-酰胺
向含有2-(6-氟-1-甲基-1H-吲唑-3-基)-5-(2-三甲基甲硅烷基-乙氧基甲基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-羧酸((R)-1-苄基-吡咯烷-3-基)-酰胺(51mg,0.085mmol)(溶解在THF(1ml)中)的20mL小瓶中添加TBAF(1.0M的THF溶液,1.0ml,1.0mmol)。将小瓶以氮气回填,然后密封并置于80℃的热快中3小时。将反应混合物冷却至室温,以丙酮(2ml)和饱和NaHCO3(20ml)淬灭。搅拌混合物1小时,然后以EtOAc萃取且将有机物以盐水洗涤。将水相再以EtOAc萃取且将有机物以盐水洗涤。合并有机物,经MgSO4干燥,过滤并浓缩。将粗品溶解于MeOH和EtOAc(支撑在硅藻土上)中,并通过快速色谱(4gSilicycle)以0%至10%MeOH的二氯甲烷溶液至10%MeOH的EtOAc溶液纯化。合并合适的馏分并浓缩。将固体以二氯甲烷、Et2O和己烷研磨分离出11mg(29%)的2-(6-氟-1-甲基-1H-吲唑-3-基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-羧酸((R)-1-苄基-吡咯烷-3-基)-酰胺,为白色固体。LC-MS(M+H)+=470;1H NMR(300MHz,DMSO-d6)δ:12.87(宽单峰,1H),9.10(s,1H),8.34-8.54(m,3H),7.68(dd,J=9.8,1.8Hz,1H),7.11-7.26(m,5H),6.97(td,J=9.1,1.9Hz,1H),4.60(宽单峰,1H),4.16(s,3H),3.61(s,2H),2.82-2.97(m,1H),2.58-2.75(m,2H),2.29-2.44(m,2H),1.75(宽单峰,1H)。
实施例214.
2-(6-氟-1-甲基-1H-吲唑-3-基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-羧酸((R)-1-氰基甲基-吡咯烷-3-基)-酰胺
步骤1
2-(6-氟-1-甲基-1H-吲唑-3-基)-5-(2-三甲基甲硅烷基-乙氧基甲基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-羧酸(R)-吡咯烷-3-基酰胺
向含2-(6-氟-1-甲基-1H-吲唑-3-基)-5-(2-三甲基甲硅烷基-乙氧基甲基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-羧酸((R)-1-苄基-吡咯烷-3-基)-酰胺(530mg,0.88mmol)和质子海绵(132mg,0.62mmol)的100ml圆底烧瓶中添加1,2-二氯乙烷(20ml)。将澄清溶液在氮气下搅拌并在冰浴中冷却10分钟。向其中添加1-氯甲酸乙酯(0.19ml,1.77mmol)。将反应混合物在冰浴中搅拌5分钟,移去冰浴且将反应混合物温热至室温20分钟。将反应混合物置于油浴中并于85℃加热4小时,然后冷却至室温过夜并浓缩。将残余物悬浮于甲醇(20ml)且在回流下加热3小时,然后除去热并冷却至室温。冷却期间沉淀一些产物,并过滤且以甲醇洗涤。将剩余的产物从母液中回收。浓缩液体,悬浮在乙酸乙酯中并以碳酸氢钠水溶液洗涤。将含有固体的水溶液以二氯甲烷萃取四次。合并有机层并以盐水(100ml)洗涤,经硫酸钠干燥,过滤,浓缩,并从乙酸乙酯和己烷的混合物干燥。将粗品悬浮于沸腾的乙酸乙酯(20ml),冷却,过滤并以乙酸乙酯和己烷洗涤得到2-(6-氟-1-甲基-1H-吲唑-3-基)-5-(2-三甲基甲硅烷基-乙氧基甲基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-羧酸(R)-吡咯烷-3-基酰胺,为白色固体。该物质与来自反应的沉淀混合并不经进一步纯化而使用。LC-MS:(M+H)+=510.
步骤2
2-(6-氟-1-甲基-1H-吲唑-3-基)-5-(2-三甲基甲硅烷基-乙氧基甲基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-羧酸((R)-1-氰基甲基-吡咯烷-3-基)-酰胺
来自步骤1的2-(6-氟-1-甲基-1H-吲唑-3-基)-5-(2-三甲基甲硅烷基-乙氧基甲基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-羧酸(R)-吡咯烷-3-基酰胺溶解于二氯甲烷,并添加以三乙胺和溴-乙腈。浓缩反应混合物并从二氯甲烷和己烷的混合物干燥。将粗品溶解于二氯甲烷、四氢呋喃和甲醇的混合物(支撑在硅胶上)并通过快速色谱(4g Silicycle)以0%至10%MeOH的二氯甲烷溶液(0.5%Et3N)纯化。合并合适的馏分并浓缩。将所得固体以Et2O和己烷研磨。弃去固体并浓缩母液得到220mg(45%)的2-(6-氟-1-甲基-1H-吲唑-3-基)-5-(2-三甲基甲硅烷基-乙氧基甲基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-羧酸((R)-1-氰基甲基-吡咯烷-3-基)-酰胺,为白色固体,220mg(45%产率)。LC-MS(M+H)+=549.
步骤3
2-(6-氟-1-甲基-1H-吲唑-3-基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-羧酸((R)-1-氰基甲基-吡咯烷-3-基)-酰胺
向含2-(6-氟-1-甲基-1H-吲唑-3-基)-5-(2-三甲基甲硅烷基-乙氧基甲基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-羧酸((R)-1-氰基甲基-吡咯烷-3-基)-酰胺(216mg,0.394mmol)(悬浮于THF(5ml)中)的100ml圆底烧瓶中添加TBAF(1.0M的THF溶液,5.0ml,5.0mmol)。将小瓶以氮气回填,然后密封并在油浴中于85℃加热2小时。将反应混合物冷却至室温,以丙酮(5ml)和饱和NaHCO3(10ml)淬灭。搅拌混合物1小时,然后以水稀释并以EtOAc萃取。添加盐水且将水层以EtOAc萃取两次。将合并的有机物以水和盐水洗涤,然后经MgSO4干燥,过滤并浓缩。将粗固体以Et2O、EtOAc和己烷研磨得到54mg(33%)的2-(6-氟-1-甲基-1H-吲唑-3-基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-羧酸((R)-1-氰基甲基-吡咯烷-3-基)-酰胺,为白色固体。LC-MS(M+H)+=419;1H NMR(300MHz,DMSO-d6)δ:12.87(宽单峰,1H),9.10(s,1H),8.39-8.52(m,2H),8.31(d,J=7.8Hz,1H),7.63-7.73(m,1H),7.18-7.31(m,1H),4.64(宽单峰,1H),4.14(s,3H),3.81-4.05(m,2H),2.97(td,J=8.6,4.6Hz,1H),2.86(dd,J=9.2,6.7Hz,1H),2.72(dd,J=9.3,3.5Hz,1H),2.52-2.62(m,1H),2.36-2.45(m,1H),1.70-1.85(m,1H)。
实施例215.
2-(6-氟-1-甲基-1H-吲唑-3-基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-羧酸[(R)-1-(3-溴-苯基)-乙基]-酰胺
根据实施例208中阐述的操作制备,以(R)-1-(3-溴苯基)乙胺替代步骤1中的1-(4-溴-苯基)-环丙胺。LC-MS(M+H)+=493/495;1H NMR(300MHz,DMSO-d6)δ:12.91(宽单峰,1H),9.11(s,1H),8.31-8.59(m,3H),7.60-7.75(m,2H),7.46(t,J=6.5Hz,2H),7.24-7.37(m,1H),7.03(td,J=9.0,2.0Hz,1H),5.30(quin,J=7.0Hz,1H),4.15(s,3H),1.64(d,J=7.0Hz,3H)。
实施例216.
2-(6-氟-1-甲基-1H-吲唑-3-基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-羧酸[(R)-1-(4-溴-苯基)-乙基]-酰胺
根据实施例208中阐述的操作制备,以(R)-1-(4-溴苯基)乙胺替代步骤1中的1-(4-溴-苯基)-环丙胺。LC-MS(M+H)+=493/495;1H NMR(300MHz,DMSO-d6)δ:12.90(宽单峰,1H),9.10(s,1H),8.41-8.54(m,2H),8.28(dd,J=8.9,5.4Hz,1H),7.68(dd,J=9.8,2.0Hz,1H),7.53(d,J=8.5Hz,2H),7.42(d,J=8.3Hz,2H),6.98(td,J=9.1,2.1Hz,1H),5.28(quin,J=7.0Hz,1H),4.14(s,3H),1.62(d,J=6.8Hz,3H)。
实施例217.
2-(6-氟-1-甲基-1H-吲唑-3-基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-羧酸[(R)-1-(3-氰基-苯基)-乙基]-酰胺
根据实施例208中阐述的操作制备,以(R)-1-(3-氰基苯基)乙胺替代步骤1的1-(4-溴-苯基)-环丙胺。LC-MS(M+H)+=440;1H NMR(300MHz,DMSO-d6)δ:12.91(宽单峰,1H),9.11(s,1H),8.54(d,J=7.3Hz,1H),8.35-8.49(m,2H),7.94(s,1H),7.80(d,J=7.8Hz,1H),7.65-7.76(m,2H),7.48-7.61(m,1H),7.05(t,J=8.0Hz,1H),5.32(t,J=6.9Hz,1H),4.15(s,3H),1.66(d,J=7.0Hz,3H)。
实施例218.
2-(6-氟-1-甲基-1H-吲唑-3-基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-羧酸[(R)-1-(4-氰基-苯基)-乙基]-酰胺
步骤1
2-(6-氟-1-甲基-1H-吲唑-3-基)-5-(2-三甲基甲硅烷基-乙氧基甲基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-羧酸[(R)-1-(4-氰基-苯基)-乙基]-酰胺
向20ml微波小瓶中添加2-(6-氟-1-甲基-1H-吲唑-3-基)-5-(2-三甲基甲硅烷基-乙氧基甲基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-羧酸[(R)-1-(4-溴-苯基)-乙基]-酰胺(62mg,0.10mmol)、氰化铜(I)(18mg,0.20mmol)和N-甲基-吡咯烷酮(6ml)(HPLC等级,以4A粉末化分子筛干燥)。将所得溶液以氮气冲洗,然后密封小瓶,并在油浴中于200℃加热。2.5小时后,经17小时将反应混合物冷却至室温。将反应混合物分到两个小瓶中,并且将每个独立地在微波器中于200-230℃加热2.5小时。合并反应混合物,以水(50ml)稀释,并以乙酸乙酯(50ml)萃取两次(5mL的盐水添加至澄清相)。将有机层以盐水(25ml)洗涤,合并,经硫酸钠干燥,过滤,且进一步在氮气流下干燥。将粗棕色固体通过快速色谱(4gSilicycle)以0%至60%EtOAc的己烷溶液纯化。合并合适的馏分并从二氯甲烷和己烷的混合物干燥得到32mg(56%)的2-(6-氟-1-甲基-1H-吲唑-3-基)-5-(2-三甲基甲硅烷基-乙氧基甲基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-羧酸[(R)-1-(4-氰基-苯基)-乙基]-酰胺,为浅黄色固体。
步骤2
2-(6-氟-1-甲基-1H-吲唑-3-基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-羧酸[(R)-1-(4-氰基-苯基)-乙基]-酰胺
在含2-(6-氟-1-甲基-1H-吲唑-3-基)-5-(2-三甲基甲硅烷基-乙氧基甲基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-羧酸[(R)-1-(4-氰基-苯基)-乙基]-酰胺(32mg,0.056mmol)(溶解在THF(1ml)中)的圆底烧瓶中添加TBAF(1.0M的THF溶液,1.0ml,1.0mmol)。将烧瓶回填以氮气,然后密封并置于油浴中于85℃2小时。将反应混合物冷却至室温,以丙酮(2ml)和饱和NaHCO3(4ml)淬灭。搅拌混合物1小时,然后以水稀释并以EtOAc萃取。添加盐水且将水层以EtOAc萃取两次。将合并的有机物以水和盐水洗涤,然后经MgSO4干燥,过滤并浓缩。将粗固体通过快速色谱(4g Silicycle)以0%至7.5%MeOH的二氯甲烷溶液纯化。合并合适的馏分并浓缩得到4mg(19%)的2-(6-氟-1-甲基-1H-吲唑-3-基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-羧酸[(R)-1-(4-氰基-苯基)-乙基]-酰胺,为白色固体。LC-MS(M+H)+=440;1H NMR(300MHz,DMSO-d6)δ:12.97(宽单峰,1H),9.17(s,1H),8.33-8.69(m,3H),7.85(d,J=8.3Hz,2H),7.64-7.78(m,3H),7.08(d,J=2.0Hz,1H),5.39(宽单峰,1H),4.20(s,3H),1.70(d,J=7.0Hz,3H)。
实施例219.
2-(6-氟-1-甲基-1H-吲唑-3-基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-羧酸((S)-2-氰基甲氧基-1-甲基-乙基)-酰胺
步骤1
2-(6-氟-1-甲基-1H-吲唑-3-基)-5-(2-三甲基甲硅烷基-乙氧基甲基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-羧酸((S)-2-氰基甲氧基-1-甲基-乙基)-酰胺
在氮气下向含2-(6-氟-1-甲基-1H-吲唑-3-基)-5-(2-三甲基甲硅烷基-乙氧基甲基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-羧酸(S)-2-羟基-1-甲基-乙基)-酰胺(176mg,0.35mmol)的100ml三颈瓶中添加THF(4ml),且将混合物在冰浴中冷却。向混合物滴加二(三甲基甲硅烷基)氨基锂(1.0M的THF溶液,1.06ml,1.06mmol),这导致澄清的红色溶液。30分钟后,将反应混合物从冰浴移去并经1小时温热至室温。滴加2-溴乙腈(0.10ml,1.44mmol),这引起反应混合物变为深棕/绿色。3小时后,再添加2-溴乙腈(0.10ml,1.44mmol)且将反应混合物在室温搅拌3天。将反应混合物以水稀释并以乙酸乙酯萃取三次(将盐水添加至澄清乳液中)。将有机层以盐水洗涤,合并,经硫酸钠干燥,过滤,并浓缩成棕色半固体。将粗物质通过快速色谱(12g Analogix)以0%至75%乙酸乙酯纯化。合并合适的馏分并浓缩得到57mg(30%)的2-(6-氟-1-甲基-1H-吲唑-3-基)-5-(2-三甲基甲硅烷基-乙氧基甲基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-羧酸((S)-2-氰基甲氧基-1-甲基-乙基)-酰胺,为黄色固体。
步骤2
2-(6-氟-1-甲基-1H-吲唑-3-基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-羧酸((S)-2-氰基甲氧基-1-甲基-乙基)-酰胺
在含2-(6-氟-1-甲基-1H-吲唑-3-基)-5-(2-三甲基甲硅烷基-乙氧基甲基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-羧酸((S)-2-氰基甲氧基-1-甲基-乙基)-酰胺(55mg,0.102mmol)(溶解在THF(1ml)中)的圆底烧瓶中添加TBAF(1.0M的THF溶液,1.0ml,1.0mmol)。将烧瓶回填以氮气,然后密封并置于油浴中于85℃2小时。将反应混合物冷却至室温,以丙酮(2ml)和饱和NaHCO3(4ml)淬灭。搅拌混合物1小时,然后以水稀释并以EtOAc萃取两次。将合并的有机物以水和盐水洗涤,然后经MgSO4干燥,过滤并浓缩。将粗固体通过快速色谱(4gSilicycle)以0%至10%MeOH的二氯甲烷溶液纯化。合并合适的馏分并浓缩。将固体以Et2O研磨得到7mg(16%)的2-(6-氟-1-甲基-1H-吲唑-3-基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-羧酸((S)-2-氰基甲氧基-1-甲基-乙基)-酰胺,为浅棕色固体。LC-MS(M+H)+=408;1H NMR(300MHz,DMSO-d6)δ:12.95(宽单峰,1H),9.17(s,1H),8.47-8.62(m,2H),8.26(d,J=8.5Hz,1H),7.76(dd,J=9.8,2.0Hz,1H),7.25(td,J=9.0,2.3Hz,1H),4.57(s,2H),4.43-4.53(m,1H),4.21(s,3H),3.66-3.85(m,2H),1.40(d,J=6.8Hz,3H)。
实施例220.
2-咪唑并[1,2-a]吡啶-3-基-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-羧酸[(R)-2-(3-氰基-氮杂环丁烷-1-基)-1-甲基-2-氧代-乙基]-酰胺
步骤1
3-碘代咪唑并[1,2-a]吡啶
在1L三颈烧瓶中,将在THF中的咪唑并[1,2-a]吡啶(4.1g,34.7mmol)以丁基锂(14.6ml,36.4mmol)于-50℃处理。缓慢滴加在50ml THF中的N-碘代琥珀酰亚胺(8.59g,38.2mmol),并让温度升至0℃。其以水和己烷稀释。将有机层以10%盐水/水洗涤(2x),干燥(MgSO4)并蒸发得到固体。将固体溶解于THF/DCM中并通过快速色谱(80-100%乙酸乙酯/己烷)纯化得到期望的异构体3-碘代咪唑并[1,2-a]吡啶。1H NMR(300MHz,DMSO-d6)δ:8.32(m,1H)7.72(s,1H)7.62(m,1H)7.34(m,1H)7.06(t,1H).
步骤2
3-三丁基甲锡烷基-咪唑并[1,2-a]吡啶
在100mL三颈烧瓶中,将3-碘代咪唑并[1,2-a]吡啶(0.9g,3.69mmol)溶解于50ml THF(-5℃,使用丙酮/冰浴)中。将异丙基氯化镁(1.3M,2.84ml,3.69mmol)经注射器添加并形成浅白色悬浮液。0.5小时后,添加三丁基氯甲锡烷(1.15g,0.95μl,3.69mmol)。其于20℃搅拌1.5小时。将反应混合物以己烷(100ml)稀释,以氯化铵的饱和溶液淬灭且将有机物以50%盐水/水洗涤。将有机层经硫酸钠干燥,过滤并浓缩得到3-三丁基甲锡烷基-咪唑并[1,2-a]吡啶,为油状物。1H NMR(300MHz,CDCl3)δ8.03(d,1H)7.61(d,1H)7.59(s,1H)7.17(m,1H)6.72(m,1H)0.9-1.55(m,27).
步骤3
2-咪唑并[1,2-a]吡啶-3-基-5-(2-三甲基甲硅烷基-乙氧基甲基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-羧酸[(R)-2-(3-氰基-氮杂环丁烷-1-基)-1-甲基-2-氧代-乙基]-酰胺
将2-溴-5-(2-三甲基甲硅烷基-乙氧基甲基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-羧酸[(R)-2-(3-氰基-氮杂环丁烷-1-基)-1-甲基-2-氧代-乙基]酰胺(110mg,0.22mmol)与已经以氮气冲洗10分钟的在DMF中的3-三丁基甲锡烷基-咪唑并[1,2-a]吡啶(159mg,0.39mmol)混合。向其中添加四(三苯基膦)钯(0)(25mg,0.022mmol)并且将混合物加热至70-80℃且保持3小时。通过高真空蒸发除去所有的溶剂且将产物通过硅胶色谱纯化得到2-咪唑并[1,2-a]吡啶-3-基-5-(2-三甲基甲硅烷基-乙氧基甲基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-羧酸[(R)-2-(3-氰基-氮杂环丁烷-1-基)-1-甲基-2-氧代-乙基]-酰胺。LCMS:(M+H)+=544.
步骤4
2-咪唑并[1,2-a]吡啶-3-基-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-羧酸[(R)-2-(3-氰基-氮杂环丁烷-1-基)-1-甲基-2-氧代-乙基]-酰胺
将2-咪唑并[1,2-a]吡啶-3-基-5-(2-三甲基甲硅烷基-乙氧基甲基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-羧酸[(R)-2-(3-氰基-氮杂环丁烷-1-基)-1-甲基-2-氧代-乙基]-酰胺使用所描述的两步操作(TFA,接着水基)脱保护接着通过色谱得到2-咪唑并[1,2-a]吡啶-3-基-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-羧酸[(R)-2-(3-氰基-氮杂环丁烷-1-基)-1-甲基-2-氧代-乙基]-酰胺。(ES+):414.1H NMR(300MHz,DMSO-d6)δ:12.9(m,1H9.86(m,1H)9.11(s,1H)8.57(s,1H)8.42(d,1H)8.34(d,1H)7.78(d,1H)7.47(t,1H)7.19(m,1H)4.65(m,1H)4.13(m,2H)3.89(m,2H)3.78(m,1H)1.39(d,3H)
实施例221.
2-(7-氯-咪唑并[1,2-a]吡啶-3-基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-羧酸[(R)-2-(3-氰基-氮杂环丁烷-1-基)-1-甲基-2-氧代-乙基]-酰胺
根据实施例220中阐述的操作制备,以7-氯-咪唑并[1,2-a]吡啶步骤1中的咪唑并[1,2-a]吡啶。LCMS:(M+H)+=448.
实施例222.
2-(7-氰基-咪唑并[1,2-a]吡啶-3-基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-羧酸((S)-2-甲氧基-1-甲基-乙基)-酰胺
步骤1
3-碘-咪唑并[1,2-a]吡啶-7-甲腈
在50mL圆底烧瓶中,将咪唑并[1,2-a]吡啶-7-甲腈(1.1g,7.68mmol)和N-碘代琥珀酰亚胺(2.07g,9.22mmol)与DMF(50ml)混合得到无色溶液。将反应混合物保持在20℃并搅拌2小时。将反应混合物以乙酸乙酯(150ml)、THF(50ml)和300mL的5%硫代硫酸钠稀释,并充分震荡。将水层以乙酸乙酯(1x100mL)反萃取。合并有机层,以水、盐水洗涤,干燥(MgSO4)并蒸发。将粗物质通过快速色谱(硅胶,60%至80%乙酸乙酯/己烷)纯化得到3-碘-咪唑并[1,2-a]吡啶-7-甲腈。1H NMR(300MHz,DMSO-d6)δ:8.52(d,1H)8.44(d,1H)8.04(d,1H)7.36(dd,1H).
步骤2
2-(7-氰基-咪唑并[1,2-a]吡啶-3-基)-5-(2-三甲基甲硅烷基-乙氧基甲基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-羧酸((S)-2-甲氧基-1-甲基-乙基)-酰胺
将2-溴-5-(2-三甲基甲硅烷基-乙氧基甲基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-羧酸((S)-2-甲氧基-1-甲基-乙基)-酰胺(100mg,0.196mmol)和六甲基锡(72mg,0.22mmol)在氮气冲洗的甲苯溶液(5ml)中混合。添加四(三苯基膦)钯(0)(19.5mg,0.17mmol)并将溶液加热至95℃且保持2小时。冷却反应混合物并添加3-碘-咪唑并[1,2-a]吡啶-7-甲腈(54mg,0.2mmol)以及另外的四(三苯基膦)钯(0)(20mg,0.02mmol)。将混合物于100℃加热14小时,冷却并直接通过硅胶色谱纯化得到2-(7-氰基-咪唑并[1,2-a]吡啶-3-基)-5-(2-三甲基甲硅烷基-乙氧基甲基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-羧酸((S)-2-甲氧基-1-甲基-乙基)-酰胺。
步骤3
2-(7-氰基-咪唑并[1,2-a]吡啶-3-基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-羧酸((S)-2-甲氧基-1-甲基-乙基)-酰胺
标准脱保护使用所描述的两步操作(TFA,接着水基)得到固体,其经色谱纯化得到2-(7-氰基-咪唑并[1,2-a]吡啶-3-基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-羧酸((S)-2-甲氧基-1-甲基-乙基)-酰胺。LCMS:(M+H)+=376.1H NMR(300MHz,DMSO-d6)δ:12.9(m,1H)9.68(m,1H)9.10(s,1H)8.75(s,1H)8.56(m,1H)8.45(s,1H)7.96(d,1H)7.36(m,1H)4.35(m,1H)3.48-3.52(m,2H)3.27(s,3H)1.29(d,3H).
实施例223.
2-(5-氯-苯并咪唑-1-基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-羧酸((S)-2-甲氧基-1-甲基-乙基)-酰胺
步骤1
2-(5-氯-苯并咪唑-1-基)-5-(2-三甲基甲硅烷基-乙氧基甲基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪和2-(6-氯-苯并咪唑-1-基)-5-(2-三甲基甲硅烷基-乙氧基甲基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪
在75mL三颈烧瓶中,将氢化钠(60%分散液,134mg,3.35mmol)和6-氯-1H-苯并[d]咪唑(511mg,3.35mmol)与NMP(15ml)混合得到浅棕色溶液。添加2-溴-5-(2-三甲基甲硅烷基-乙氧基甲基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪(1.0g,3.05mmol)。将反应混合物加热至135℃并搅拌15小时。将反应混合物经冷却,倒入50%水/盐水中并萃取至50%乙酸乙酯/己烷。将粗物质通过快速色谱(硅胶,40%至50%乙酸乙酯的己烷溶液)纯化得到两种区域异构体:2-(5-氯-苯并咪唑-1-基)-5-(2-三甲基甲硅烷基-乙氧基甲基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪;1H NMR(300MHz,DMSO-d6)δ:9.15(s,1H)9.02(s,1H)8.38(m,1H)8.31(m,1H)7.90(d,1H)7.48(m,1H)6.99(d,1H)5.75(s,2H)3.66(t,2H)0.94(t,2H)0.02(s,9H);and2-(6-氯-苯并咪唑-1-基)-5-(2-三甲基甲硅烷基-乙氧基甲基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪;1H NMR(300MHz,DMSO-d6)δ:9.16(s,1H)9.02(s,1H)8.36(m,1H)8.34(m,1H)7.96(d,1H)7.48(m,1H)6.94(d,1H)5.75(s,2H)3.66(t,2H)0.94(t,2H)0.02(s,9H).
步骤2
2-(5-氯-苯并咪唑-1-基)-5-(2-三甲基甲硅烷基-乙氧基甲基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-甲醛
在5℃将DMF溶液以磷酰三氯(483mg,3.2mmol)处理0.5小时。添加2-(5-氯-苯并咪唑-1-基)-5-(2-三甲基甲硅烷基-乙氧基甲基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪(210mg,0.52mmol)并将混合物在65-70℃搅拌7小时。冷却反应混合物并以NaHCO3(aq)淬灭,然后萃取至乙酸乙酯(2x)。将有机物以水和盐水洗涤,然后干燥(MgSO4)。经快速色谱纯化得到2-(5-氯-苯并咪唑-1-基)-5-(2-三甲基甲硅烷基-乙氧基甲基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-甲醛。LCMS:(M+H)+=428.
步骤3
2-(5-氯-苯并咪唑-1-基)-5-(2-三甲基甲硅烷基-乙氧基甲基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-羧酸
在50mL圆底烧瓶中,将氨基磺酸(187mg,1.54mmol)和2-(5-氯-苯并咪唑-1-基)-5-(2-三甲基甲硅烷基-乙氧基甲基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-甲醛(110mg,0.26mmol)与二噁烷(6ml)混合得到灰白色悬浮液。将反应混合物冷却至5℃并经5分钟经由注射器滴加亚氯酸钠(30.2mg,0.33mmol)和磷酸二氢钾(35.0mg,0.26mmol)在水(2ml)中的溶液。将反应混合物温热至室温并搅拌1小时。将反应混合物以EtOAc(25ml)稀释,并以50%盐水/水洗涤。将水层以EtOAc(15mL)反萃取。合并有机层,以盐水洗涤并干燥(MgSO4)。蒸发溶剂得到90mg(79%)的2-(5-氯-苯并咪唑-1-基)-5-(2-三甲基甲硅烷基-乙氧基甲基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-羧酸,为固体。(M+H)+=444.
步骤4
2-(5-氯-2-苯并咪唑-1-基)-5-(三甲基甲硅烷基-乙氧基甲基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-羧酸((S)-2-甲氧基-1-甲基-乙基)-酰胺
在5mL梨形烧瓶中,将2-(5-氯-苯并咪唑-1-基)-5-(2-三甲基甲硅烷基-乙氧基甲基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-羧酸(40mg,0.09mmol)、(S)-1-甲氧基丙烷-2-胺盐酸盐(12.0mg,0.135mmol)和HATU(51mg,0.135mmol)与DMF(3ml)和N,N-二异丙基乙胺(0.22ml,1.26mmol)混合。将反应混合物在室温搅拌16小时,然后浓缩。将残余物以水稀释并以EtOAc(2x)萃取。将有机层经MgSO4干燥并浓缩得到2-(5-氯-2-苯并咪唑-1-基)-5-(三甲基甲硅烷基-乙氧基甲基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-羧酸((S)-2-甲氧基-1-甲基-乙基)-酰胺.
步骤5
2-(5-氯-苯并咪唑-1-基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-羧酸((S)-2-甲氧基-1-甲基-乙基)-酰胺
于室温将2-(5-氯-2-苯并咪唑-1-基)-5-(三甲基甲硅烷基-乙氧基甲基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-羧酸((S)-2-甲氧基-1-甲基-乙基)-酰胺(40mg,0.078mmol)溶解于二氯甲烷(2ml)并添加1.5mL的TFA。将反应混合物搅拌4小时,然后蒸发所有溶剂且将残余物经高真空干燥。将粗物质溶解于甲醇并以0.5mL的三乙胺处理。搅拌反应混合物14小时。蒸发溶剂且将残余物悬浮于10%THF/EtOAc(20ml),以50%乙酸乙酯/己烷(25ml)稀释并以水和盐水洗涤,干燥并蒸发。将残余物以乙醚研磨并过滤得到22mg(73%)的2-(5-氯-苯并咪唑-1-基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-羧酸((S)-2-甲氧基-1-甲基-乙基)-酰胺,为白色固体。MS:(M+H)+=385,1H NMR(300MHz,DMSO-d6)δ:13.1(s,1H)9.11(s,1H)9.01(s,1H)8.58(m,1H)8.29(d,1H)7.95-8.01(m,2H)7.47(d,1H)4.28(m,1H)3.48(m,2H)3.28(s,3H)1.23(d,3H).
实施例224.
2-(6-氯-苯并咪唑-1-基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-羧酸((S)-2-甲氧基-1-甲基-乙基)-酰胺
根据实施例223步骤2-5中阐述的操作制备,以2-(6-氯-苯并咪唑-1-基)-5-(2-三甲基甲硅烷基-乙氧基甲基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪替代步骤2中的2-(5-氯-苯并咪唑-1-基)-5-(2-三甲基甲硅烷基-乙氧基甲基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪。MS:(M+H)+=385.1H NMR(300MHz,DMSO-d6)δ:10.5(s,1H)8.66(s,1H)8.49(s,1H)8.39(m,1H)8.06(d,1H)7.89(m,1H)7.76(d,1H)7.34(d,1H)4.44(m,1H)3.50(m,2H)3.28(s,3H)1.31(d,3H).
实施例225.
2-(5-氯-苯并咪唑-1-基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-羧酸[(R)-2-(3-氰基-氮杂环丁烷-1-基)-1-甲基-2-氧代-乙基]-酰胺
根据实施例223步骤4-5中阐述的操作制备,以1-((R)-2-氨基-丙酰基)-氮杂环丁烷-3-甲腈三氟乙酸盐替代步骤4中的(S)-1-甲氧基丙烷-2-胺盐酸盐。MS:(M+H)+=449.1H NMR(300MHz,DMSO-d6)δ:13.1(s,1H)9.16(s,1H)9.03(s,1H)8.59(d,1H)8.42(d,1H)7.29(d,1H)7.91(s,1H)7.42(d,1H)4.48-4.71(m,3H)4.20(m,1H)4.09(m,1H)3.83(m,1H)1.33(d,3H).
实施例226.
(6-氯-3-{7-[(R)-2-(3-氰基-氮杂环丁烷-1-基)-1-甲基-2-氧代-乙基氨基甲酰基]-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-2-基}-吲唑-1-基)-乙酸
步骤1
{6-氯-3-[7-[(R)-2-(3-氰基-氮杂环丁烷-1-基)-1-甲基-2-氧代-乙基氨基甲酰基]-5-(2-三甲基甲硅烷基-乙氧基甲基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-2-基]-吲唑-1-基}-乙酸叔丁酯
在20mL梨形烧瓶中,将2-(6-氯-1H-吲唑-3-基)-5-(2-三甲基甲硅烷基-乙氧基甲基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-羧酸[(R)-2-(3-氰基-氮杂环丁烷-1-基)-1-甲基-2-氧代-乙基]-酰胺(80mg,0.14mmol)与THF(3ml)混合得到浅黄色溶液。将其冷却至0℃并添加叔丁醇钾(19mg,0.17mmol)。其于0℃搅拌30分钟并滴加2-溴乙酸叔丁酯(22μl,0.14mmol)且将反应混合物在0℃搅拌1小时。将反应混合物以NH4Cl水溶液和水吸收,然后以Et2O(2x30ml)萃取。将合并的有机物以水和盐水洗涤,然后经MgSO4干燥并浓缩。将粗残余物通过SiO2色谱(5%至80%EtOAc/CH2Cl2)纯化分离出35mg(37%){6-氯-3-[7-[(R)-2-(3-氰基-氮杂环丁烷-1-基)-1-甲基-2-氧代-乙基氨基甲酰基]-5-(2-三甲基甲硅烷基-乙氧基甲基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-2-基]-吲唑-1-基}-乙酸叔丁酯,为发泡固体。MS:(M+H)+=694.
步骤2
(6-氯-3-{7-[(R)-2-(3-氰基-氮杂环丁烷-1-基)-1-甲基-2-氧代-乙基氨基甲酰基]-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-2-基}-吲唑-1-基)-乙酸
在5mL梨形烧瓶中,将{6-氯-3-[7-[(R)-2-(3-氰基-氮杂环丁烷-1-基)-1-甲基-2-氧代-乙基氨基甲酰基]-5-(2-三甲基甲硅烷基-乙氧基甲基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-2-基]-吲唑-1-基}-乙酸叔丁酯(30mg,0.043mmol)与CH2Cl2(1ml)混合得到浅黄色溶液。添加TFA(0.10ml,1.3mmol)且将反应混合物在室温搅拌2小时。将粗反应混合物经真空浓缩且再溶解于CH2Cl2中。滴加乙二胺(88μl,1.3mmol)且将反应混合物在室温搅拌30分钟。将粗反应混合物经真空浓缩。将残余物溶解于水且将其冻干过夜。将黄色蜡状固体悬浮于水并过滤,以水洗涤,然后在高真空干燥得到8mg(32%)的(6-氯-3-{7-[(R)-2-(3-氰基-氮杂环丁烷-1-基)-1-甲基-2-氧代-乙基氨基甲酰基]-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-2-基}-吲唑-1-基)-乙酸,为黄色固体。MS:(M+H)+=507.
实施例227.
2-(6-氯-1-二甲基氨基甲酰基甲基-1H-吲唑-3-基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-羧酸[(R)-2-(3-氰基-氮杂环丁烷-1-基)-1-甲基-2-氧代-乙基]-酰胺
根据实施例226中阐述的操作制备,以2-氯-N,N-二甲基乙酰胺替代步骤1中的2-溴乙酸叔丁酯。MS:(M+H)+=534;1H NMR(DMSO-d6)δ:9.05-9.13(m,1H),8.73(dd,J=8.6,4.3Hz,1H),8.42-8.53(m,2H),7.90(s,1H),7.12-7.37(m,1H),5.58(s,2H),4.46-4.83(m,3H),4.18-4.31(m,1H),4.06-4.16(m,1H),3.86(d,J=5.9Hz,1H),3.15(s,3H),2.88(s,3H),1.41(t,J=6.2Hz,3H).
实施例228.
2-[6-氯-1-(2-吗啉-4-基-2-氧代-乙基)-1H-吲唑-3-基]-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-羧酸[(R)-2-(3-氰基-氮杂环丁烷-1-基)-1-甲基-2-氧代-乙基]-酰胺
根据实施例226中阐述的操作制备,以2-氯-1-吗啉代乙酮替代步骤1中的2-溴乙酸叔丁酯。MS:(M+H)+=577;1H NMR(DMSO-d6)δ:9.20(s,1H),8.83(dd,J=8.6,3.9Hz,1H),8.55-8.65(m,2H),8.02(s,2H),7.37(d,J=7.0Hz,1H),5.73(s,2H),4.55-4.92(m,3H),4.28-4.39(m,1H),4.15-4.25(m,1H),3.82(宽单峰,1H),3.71(宽单峰,4H),3.54(d,J=4.3Hz,4H),1.90(s,3H).
实施例229.
2-[6-氯-1-(2-二甲基氨基-乙基)-1H-吲唑-3-基]-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-羧酸[(R)-2-(3-氰基-氮杂环丁烷-1-基)-1-甲基-2-氧代-乙基]-酰胺
步骤1
2-[6-氯-1-(2-二甲基氨基-乙基)-1H-吲唑-3-基]-5-(2-三甲基甲硅烷基-乙氧基甲基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-羧酸[(R)-2-(3-氰基-氮杂环丁烷-1-基)-1-甲基-2-氧代-乙基]-酰胺
在10mL梨形烧瓶中,于0℃将2-(6-氯-1H-吲唑-3-基)-5-(2-三甲基甲硅烷基-乙氧基甲基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-羧酸[(R)-2-(3-氰基-氮杂环丁烷-1-基)-1-甲基-2-氧代-乙基]-酰胺(280mg,0.48mmol)与DMF(8ml)混合得到黄色溶液。添加氢化钠(60%在矿物油中,70mg,1.74mmol)且将反应混合物在0℃搅拌10分钟。添加二甲基氨基乙基溴氢溴酸盐(169mg,0.73mmol)且将反应混合物在0℃搅拌30分钟,然后温热至室温并搅拌2小时。将反应混合物以5mL的盐水和10mL的水淬灭然后以EtOAc萃取(2x)。将合并的有机物以水和盐水洗涤,然后干燥并通过SiO2色谱(0%至10%MeOH/CH2Cl2)纯化分离出135mg(43%)的2-[6-氯-1-(2-二甲基氨基-乙基)-1H-吲唑-3-基]-5-(2-三甲基甲硅烷基-乙氧基甲基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-羧酸[(R)-2-(3-氰基-氮杂环丁烷-1-基)-1-甲基-2-氧代-乙基]-酰胺,为泡沫状固体。MS:(M+H)+=651.
步骤2
2-[6-氯-1-(2-二甲基氨基-乙基)-1H-吲唑-3-基]-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-羧酸[(R)-2-(3-氰基-氮杂环丁烷-1-基)-1-甲基-2-氧代-乙基]-酰胺
在10mL梨形烧瓶中,将2-[6-氯-1-(2-二甲基氨基-乙基)-1H-吲唑-3-基]-5-(2-三甲基甲硅烷基-乙氧基甲基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-羧酸[(R)-2-(3-氰基-氮杂环丁烷-1-基)-1-甲基-2-氧代-乙基]-酰胺(130mg,0.20mmol)与CH2Cl2(1ml)混合得到黄色溶液。添加TFA(0.24ml,3.2mmol)且将反应混合物在室温搅拌2小时。将粗反应混合物经真空浓缩且再溶解于CH2Cl2中。滴加乙二胺(0.33ml,5.0mmol)且将反应混合物在室温搅拌20分钟。将粗反应混合物经真空浓缩。将残余物悬浮于冷水中并过滤,以水洗涤,然后在高真空干燥得到70mg(64%)的2-[6-氯-1-(2-二甲基氨基-乙基)-1H-吲唑-3-基]-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-羧酸[(R)-2-(3-氰基-氮杂环丁烷-1-基)-1-甲基-2-氧代-乙基]-酰胺,为黄色固体。MS:(M+H)+=520;1H NMR(DMSO-d6)δ:9.14(s,1H),8.70(d,J=7.0Hz,1H),8.36-8.63(m,2H),8.03(s,1H),7.25(d,J=6.6Hz,1H),4.48-4.82(m,5H),4.16-4.34(m,1H),4.01-4.15(m,1H),3.86(d,J=5.1Hz,1H),3.33(宽单峰,1H),2.80(t,J=6.1Hz,2H),2.20(s,6H),1.40(t,J=6.4Hz,3H).
实施例230.
2-[6-氯-1-(2-二甲基氨基-乙基)-1H-吲唑-3-基]-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-羧酸[(R)-2-(3-氰基-氮杂环丁烷-1-基)-1-甲基-2-氧代-乙基]-酰胺盐酸盐
在10mL梨形烧瓶中,将2-[6-氯-1-(2-二甲基氨基-乙基)-1H-吲唑-3-基]-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-羧酸[(R)-2-(3-氰基-氮杂环丁烷-1-基)-1-甲基-2-氧代-乙基]-酰胺盐酸盐(40mg,0.077mmol)与HCl(4N在二噁烷中)(0.2mL,0.80mmol)混合得到悬浮液。添加水,其变成黄色糊状悬浮液。添加Et2O,搅拌混合物并倾析有机层。将其重复5次(5x8ml)。将黄色固体经过滤并以Et2O洗涤并高真空干燥得到35mg(85%)的2-[6-氯-1-(2-二甲基氨基-乙基)-1H-吲唑-3-基]-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-羧酸[(R)-2-(3-氰基-氮杂环丁烷-1-基)-1-甲基-2-氧代-乙基]-酰胺盐酸盐,为黄色固体。MS:(M+H)+=520;1H NMR(DMSO-d6)δ:13.03(宽单峰,1H),10.22(宽单峰,1H),9.20(s,1H),8.76(d,J=8.6Hz,1H),8.44-8.54(m,2H),8.15(s,1H),7.29-7.35(m,1H),4.96-5.02(m,2H),4.99(t,J=6.1Hz,2H),4.64-4.79(m,1H),4.52-4.62(m,1H),4.07-4.26(m,2H),3.72(d,J=5.9Hz,2H),2.89(d,J=4.7Hz,6H),1.40(t,J=6.8Hz,3H).
实施例231.
2-[6-氯-1-(2-吗啉-4-基-乙基)-1H-吲唑-3-基]-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-羧酸[(R)-2-(3-氰基-氮杂环丁烷-1-基)-1-甲基-2-氧代-乙基]-酰胺
根据实施例229中阐述的操作制备,以4-(2-溴乙基)吗啉替代步骤1中的二甲基氨基乙基溴氢溴酸盐。MS:(M+H)+=563;1H NMR(DMSO-d6)δ:9.15(s,1H),8.70(d,J=8.0Hz,1H),8.42-8.50(m,2H),8.05(s,1H),7.25(d,J=8.0Hz,1H),4.45-4.80(m.,5H),4.20-4.28(m,1H),4.05-4.12(宽单峰,1H),3.80-3.90(m,1H),3.45-3.52(m.,4H),3.26-3.32(m,4H),2.80-2.88(m.,2H),1.40(t,J=6.4Hz,3H).
实施例232.
2-[6-氯-1-(2-吡啶-2-基-乙基)-1H-吲唑-3-基]-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-羧酸[(R)-2-(3-氰基-氮杂环丁烷-1-基)-1-甲基-2-氧代-乙基]-酰胺
根据实施例229中阐述的操作制备,以2-(2-溴乙基)吡啶氢溴酸盐替代步骤1中的二甲基氨基乙基溴氢溴酸盐。MS:(M+H)+=555;1H NMR(DMSO-d6)δ:9.11(s,1H),8.68(d,J=6.8Hz,1H),8.41-8.54(m,3H),7.81(s,1H),7.64(t,J=7.2Hz,1H),7.16-7.31(m,3H),4.92(t,J=6.4Hz,2H),4.49-4.81(m,3H),4.23(宽单峰,1H),4.10(宽单峰,1H),3.86(宽单峰,1H),3.39(t,J=6.7Hz,2H),1.33-1.47(m,3H).
实施例233.
2-(6-氯-1-吡啶-2-基甲基-1H-吲唑-3-基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-羧酸[(R)-2-(3-氰基-氮杂环丁烷-1-基)-1-甲基-2-氧代-乙基]-酰胺
根据实施例229中阐述的操作制备,以2-(氯甲基)吡啶盐酸盐替代步骤1中的二甲基氨基乙基溴氢溴酸盐。MS:(M+H)+=540;1H NMR(DMSO-d6)δ:9.10(s,1H),8.75(d,J=7.0Hz,1H),8.35-8.57(m,3H),8.01(s,1H),7.78(t,J=7.4Hz,1H),7.16-7.37(m,3H),5.92(s,2H),4.48-4.82(m,3H),4.04-4.29(m,2H),3.86(宽单峰,1H),1.34-1.47(m,3H).
实施例234.
2-[6-氯-1-(2-二甲基氨基-乙基)-1H-吲唑-3-基]-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-羧酸((S)-2-甲氧基-1-甲基-乙基)-酰胺
步骤1
2-(6-氯-1H-吲唑-3-基)-5-(2-三甲基甲硅烷基-乙氧基甲基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-羧酸((S)-2-甲氧基-1-甲基-乙基)-酰胺
将6-氯-3-三丁基甲锡烷基-1H-吲唑(1.04g,2.35mmol)、碘化亚铜(I)(17mg,0.09mmol)和2-溴-5-(2-三甲基甲硅烷基-乙氧基甲基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-羧酸((S)-2-甲氧基-1-甲基-乙基)-酰胺(400mg,0.90mmol)与DMF(6mL)混合得到黄色溶液。将混合物以鼓泡氮气脱气10分钟,然后添加四(三苯基膦)钯(0)(52mg,0.045mmol)和将反应混合物在氮气下于90℃搅拌15小时。冷却反应混合物,以乙醚(60mL)稀释并以水和盐水洗涤。将有机层经硫酸钠干燥,过滤并真空浓缩。将粗物质通过硅胶色谱(0-10%甲醇的二氯甲烷溶液,含0.5%氢氧化铵)纯化得到300mg(65%)的2-(6-氯-1H-吲唑-3-基)-5-(2-三甲基甲硅烷基-乙氧基甲基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-羧酸((S)-2-甲氧基-1-甲基-乙基)-酰胺,为泡沫状固体。MS:(M+H)+=516.
步骤2
2-[6-氯-1-(2-二甲基氨基-乙基)-1H-吲唑-3-基]-5-(2-三甲基甲硅烷基-乙氧基甲基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-羧酸((S)-2-甲氧基-1-甲基-乙基)-酰胺
于0℃将2-(6-氯-1H-吲唑-3-基)-5-(2-三甲基甲硅烷基-乙氧基甲基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-羧酸((S)-2-甲氧基-1-甲基-乙基)-酰胺(80mg,0.16mmol)与DMF(8mL)混合得到黄色溶液。添加氢化钠(60%在矿物油中,19mg,0.47mmol)且将反应混合物在0℃搅拌10分钟。添加二甲基氨基乙基溴氢溴酸盐(54mg,0.23mmol)且将反应混合物在0℃搅拌30分钟,然后温热至室温并搅拌2小时。将反应混合物以5mL的盐水和10mL的水淬灭,然后以乙酸乙酯(2x30mL)萃取。将合并的有机层以水和盐水洗涤,然后干燥并真空浓缩。将粗物质通过硅胶色谱纯化(0-10%甲醇的二氯甲烷溶液)得到50mg(55%)的2-[6-氯-1-(2-二甲基氨基-乙基)-1H-吲唑-3-基]-5-(2-三甲基甲硅烷基-乙氧基甲基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-羧酸((S)-2-甲氧基-1-甲基-乙基)-酰胺,为发泡固体。MS:(M+H)+=587.
步骤3
2-[6-氯-1-(2-二甲基氨基-乙基)-1H-吲唑-3-基]-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-羧酸((S)-2-甲氧基-1-甲基-乙基)-酰胺
将2-[6-氯-1-(2-二甲基氨基-乙基)-1H-吲唑-3-基]-5-(2-三甲基甲硅烷基-乙氧基甲基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-羧酸((S)-2-甲氧基-1-甲基-乙基)-酰胺(50mg,0.085mmol)与二氯甲烷(1mL)混合并添加三氟乙酸(0.19ml,2.56mmol)。搅拌2小时后,将反应混合物经真空浓缩且将残余物溶解于二氯甲烷(1mL)。添加乙二胺(0.17ml,2.56mmol)。搅拌20分钟后,真空浓缩反应混合物。将残余物以水(2mL)研磨。过滤沉淀,以水洗涤并干燥得到30mg(73%)的2-[6-氯-1-(2-二甲基氨基-乙基)-1H-吲唑-3-基]-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-羧酸((S)-2-甲氧基-1-甲基-乙基)-酰胺,为黄色固体。MS:(M+H)+=456;1H NMR(DMSO-d6)δ:9.11(s,1H),8.51(d,J=8.5Hz,1H),8.44(s,1H),8.45(s.,1H),8.20(d,J=8.0Hz,1H),8.06(s,1H),7.26(d,J=8.3Hz,1H),4.62(宽单峰,2H),4.38(宽单峰,1H),3.50(dd,J=16.1,4.0Hz,2H),3.28(s,3H),2.81(宽单峰,2H),2.21(s,6H),1.31(d,J=6.5Hz,3H).
实施例235.
2-(6-氯-1-吡啶-3-基甲基-1H-吲唑-3-基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-羧酸((S)-2-甲氧基-1-甲基-乙基)-酰胺
根据实施例234步骤2-3中阐述的操作制备,以3-(氯甲基)吡啶盐酸盐替代步骤2中的二甲基氨基乙基溴氢溴酸盐。MS:(M+H)+=476;1H NMR(DMSO-d6)δ:9.22(s,1H),8.77(宽单峰,1H),8.48-8.69(m,3H),8.21-8.34(m,2H),7.84(d,J=7.3Hz,1H),7.32-7.54(m,3H),5.94(宽单峰,2H),4.46(宽单峰,1H),3.57(dd,J=15.4,3.9Hz,2H),3.35(s,3H),1.39(d,J=6.3Hz,3H).
实施例236.
2-[6-氯-1-(2-吗啉-4-基-乙基)-1H-吲唑-3-基]-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-羧酸((S)-2-甲氧基-1-甲基-乙基)-酰胺
根据实施例234步骤2-3中阐述的操作制备,以4-(2-溴乙基)吗啉盐酸盐替代步骤2中的二甲基氨基乙基溴氢溴酸盐。MS:(M+H)+=498;1H NMR(DMSO-d6)δ:9.12(s,1H),8.51(d,J=8.5Hz,1H),8.45(s,1H),8.20(d,J=8.0Hz,1H),8.06(宽单峰,2H),7.27(d,J=8.0Hz,1H),4.66(宽单峰,2H),4.38(宽单峰,1H),3.51(宽单峰,7H),3.21-3.38(m,5H),2.85(宽单峰,2H),1.32(d,J=6.3Hz,3H).
实施例237.
2-[6-氟-1-(6-吗啉-4-基-吡啶-3-基甲基)-1H-吲唑-3-基]-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-羧酸((S)-2-甲氧基-1-甲基-乙基)-酰胺
步骤1
2-(6-氟-1H-吲唑-3-基)-5-(2-三甲基甲硅烷基-乙氧基甲基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-羧酸((S)-2-甲氧基-1-甲基-乙基)-酰胺
将6-氟-3-三丁基甲锡烷基-1H-吲唑(1.10g,2.59mmol)、碘化亚铜(I)(24mg,0.13mmol)和2-溴-5-(2-三甲基甲硅烷基-乙氧基甲基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-羧酸((S)-2-甲氧基-1-甲基-乙基)-酰胺(560mg,1.26mmol)与DMF(6mL)混合得到黄色溶液。将混合物以鼓泡氮气脱气10分钟,然后添加四(三苯基膦)钯(0)(73mg,0.06mmol)且将反应混合物在氮气下于80℃搅拌2小时。冷却反应混合物,以乙醚(60mL)稀释并以水和盐水洗涤。将有机层经硫酸钠干燥,过滤并真空浓缩。将粗物质通过硅胶色谱(0-10%甲醇的二氯甲烷溶液,含0.5%氢氧化铵)纯化得到580mg(92%)的2-(6-氟-1H-吲唑-3-基)-5-(2-三甲基甲硅烷基-乙氧基甲基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-羧酸((S)-2-甲氧基-1-甲基-乙基)-酰胺,为灰白色固体。MS:(M+H)+=499.
步骤2
2-[6-氟-1-(6-吗啉-4-基-吡啶-3-基甲基)-1H-吲唑-3-基]-5-(2-三甲基甲硅烷基-乙氧基甲基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-羧酸((S)-2-甲氧基-1-甲基-乙基)-酰胺
于0℃将2-(6-氟-1H-吲唑-3-基)-5-(2-三甲基甲硅烷基-乙氧基甲基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-羧酸((S)-2-甲氧基-1-甲基-乙基)-酰胺(80mg,0.16mmol)与DMF(8mL)混合得到黄色溶液。添加氢化钠(60%在矿物油中,19mg,0.48mmol)且将反应混合物在0℃搅拌10分钟。添加4-(5-(氯甲基)吡啶-2-基)吗啉盐酸盐(60mg,0.24mmol)且于0℃搅拌反应混合物30分钟,然后温热至室温并搅拌2小时。将反应混合物以5mL的盐水和10mL的水淬灭并以乙酸乙酯(2x30mL)萃取。将合并的有机层以水和盐水洗涤,然后干燥并真空浓缩。将粗物质通过硅胶色谱(0-10%甲醇的二氯甲烷溶液)纯化得到58mg(53%)的2-[6-氟-1-(6-吗啉-4-基-吡啶-3-基甲基)-1H-吲唑-3-基]-5-(2-三甲基甲硅烷基-乙氧基甲基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-羧酸((S)-2-甲氧基-1-甲基-乙基)-酰胺,为发泡固体。MS:(M+H)+=675.
步骤3
2-[6-氟-1-(6-吗啉-4-基-吡啶-3-基甲基)-1H-吲唑-3-基]-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-羧酸((S)-2-甲氧基-1-甲基-乙基)-酰胺
将2-[6-氟-1-(6-吗啉-4-基-吡啶-3-基甲基)-1H-吲唑-3-基]-5-(2-三甲基甲硅烷基-乙氧基甲基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-羧酸((S)-2-甲氧基-1-甲基-乙基)-酰胺(50mg,0.074mmol)与二氯甲烷(1mL)混合并添加三氟乙酸(0.17ml,2.22mmol)。搅拌2小时后,将反应混合物经真空浓缩。将残余物溶解于二氯甲烷(1mL)中并添加乙二胺(0.15ml,2.22mmol)。20分钟后,将反应混合物经真空浓缩且将残余物以水(2mL)研磨。过滤沉淀,以水洗涤并干燥得到33mg(77%)的2-[6-氟-1-(6-吗啉-4-基-吡啶-3-基甲基)-1H-吲唑-3-基]-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-羧酸((S)-2-甲氧基-1-甲基-乙基)-酰胺,为浅黄色固体。MS:(M+H)+=545;1H NMR(DMSO-d6)δ:9.14(s,1H),8.52-8.60(m,1H),8.45(s,1H),8.31(宽单峰,1H),8.19(d,J=8.3Hz,1H),7.89(d,J=9.5Hz,1H),7.63(d,J=8.3Hz,1H),7.16(t,J=9.0Hz,1H),6.79(d,J=8.3Hz,1H),5.63(宽单峰,2H),4.37(宽单峰,1H),3.65(宽单峰,4H),3.44-3.57(m,2H),3.39(宽单峰,4H),3.27(s,3H),1.30(d,J=6.3Hz,3H).
实施例238.
2-[6-氟-1-(2-吗啉-4-基-乙基)-1H-吲唑-3-基]-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-羧酸((S)-2-甲氧基-1-甲基-乙基)-酰胺
根据实施例237步骤2-3中阐述的操作制备,以4-(2-溴乙基)吗啉盐酸盐替代步骤2中的4-(5-(氯甲基)吡啶-2-基)吗啉盐酸盐。MS:(M+H)+=482;1HNMR(DMSO-d6)δ:9.12(s,1H),8.53(dd,J=8.7,5.4Hz,1H),8.44(s,1H),8.21(d,J=8.5Hz,1H),7.76(d,J=9.8Hz,1H),7.15(t,J=8.2Hz,1H),4.62(t,J=6.3Hz,2H),4.38(宽单峰,1H),3.41-3.62(m,7H),3.30(d,J=18.3Hz,6H),2.85(t,J=6.3Hz,2H),1.31(d,J=6.8Hz,3H).
实施例239.
2-[1-(2-二甲基氨基-乙基)-6-氟-1H-吲唑-3-基]-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-羧酸((S)-2-甲氧基-1-甲基-乙基)-酰胺
根据实施例237步骤2-3中阐述的操作制备,以二甲基氨基乙基溴氢溴酸盐替代步骤2中的4-(5-(氯甲基)吡啶-2-基)吗啉盐酸盐。MS:(M+H)+=440;1H NMR(DMSO-d6)δ:9.11(s,1H),8.52(dd,J=8.5,5.3Hz,1H),8.44(s,1H),8.21(d,J=8.3Hz,1H),7.76(d,J=9.3Hz,1H),7.14(t,J=8.4Hz,1H),4.59(t,J=6.0Hz,2H),4.38(宽单峰,1H),3.42-3.61(m,2H),3.28(s,3H),2.80(t,J=6.1Hz,2H),2.20(s.,6H),1.31(d,J=6.5Hz,3H).
实施例240.
2-(6-氟-1-吡啶-2-基甲基-1H-吲唑-3-基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-羧酸((S)-2-甲氧基-1-甲基-乙基)-酰胺
根据实施例237步骤2-3中阐述的操作制备,以2-(氯甲基)吡啶盐酸盐替代步骤2中的4-(5-(氯甲基)吡啶-2-基)吗啉盐酸盐。MS:(M+H)+=460;1HNMR(DMSO-d6)δ:9.08(s,1H),8.48-8.63(m,2H),8.45(s,1H),8.20(d,J=8.5Hz,1H),7.69-7.78(m,2H),7.29-7.39(m,1H),7.15-7.26(m,2H),5.89(s,2H),4.38(宽单峰,1H),3.42-3.59(m,2H),3.28(s,3H),1.31(d,J=6.8Hz,3H).
实施例241.
2-(6-氟-1-吡啶-3-基甲基-1H-吲唑-3-基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-羧酸((S)-2-甲氧基-1-甲基-乙基)-酰胺
根据实施例237步骤2-3中阐述的操作制备,以3-(氯甲基)吡啶盐酸盐替代步骤2中的4-(5-(氯甲基)吡啶-2-基)吗啉盐酸盐。MS:(M+H)+=460;1HNMR(DMSO-d6)δ:9.13(s,1H),8.69(s,1H),8.40-8.61(m,3H),8.18(d,J=8.5Hz,1H),7.88(d,J=8.8Hz,1H),7.77(d,J=7.8Hz,1H),7.32-7.45(m,1H),7.18(t,J=8.2Hz,1H),5.82(s,2H),4.37(宽单峰,1H),3.49(dd,J=14.1,4.5Hz,2H),3.27(s,3H),1.30(d,J=6.8Hz,3H).
实施例242.
2-[6-氟-1-(2-吡咯烷-1-基-乙基)-1H-吲唑-3-基]-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-羧酸((S)-2-甲氧基-1-甲基-乙基)-酰胺
根据实施例237步骤2-3中阐述的操作制备,以1-(2-溴乙基)吡咯烷步骤2中的4-(5-(氯甲基)吡啶-2-基)吗啉盐酸盐。MS:(M+H)+=466;1H NMR(DMSO-d6)δ:9.12(s,1H),8.53(宽单峰,1H),8.43(s,1H),8.20(d,J=8.0Hz,1H),7.74(d,J=9.5Hz,1H),7.03-7.22(m,1H),4.61(宽单峰,2H),3.43-3.57(m,2H),3.29(m,8H),2.98(宽单峰,2H),1.64(宽单峰,4H),1.31(d,J=6.5Hz,3H).
实施例243.
2-{6-氟-1-[2-((S)-3-氟-吡咯烷-1-基)-乙基]-1H-吲唑-3-基}-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-羧酸((S)-2-甲氧基-1-甲基-乙基)-酰胺
根据实施例237步骤2-3中阐述的操作制备,以(S)-1-(2-氯乙基)-3-氟吡咯烷替代步骤2中的4-(5-(氯甲基)吡啶-2-基)吗啉盐酸盐。MS:(M+H)+=484;1H NMR(DMSO-d6)δ:9.12(s,1H),8.53(dd,J=8.8,5.3Hz,1H),8.43(s,1H),8.20(d,J=8.3Hz,1H),7.76(d,J=9.0Hz,1H),7.15(t,J=8.7Hz,1H),5.23(宽单峰,1H),5.09(宽单峰,1H),4.62(t,J=6.3Hz,2H),4.38(宽单峰,1H),3.40-3.59(m,2H),3.23-3.32(s,3H),2.79-3.10(m,4H),2.57-2.75(m,1H),2.32-2.47(m,1H),2.05(m.,1H),1.31(d,J=6.8Hz,3H).
实施例244.
2-[6-氟-1-(2-吡唑-1-基-乙基)-1H-吲唑-3-基]-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-羧酸((S)-2-甲氧基-1-甲基-乙基)-酰胺
根据实施例237步骤2-3中阐述的操作制备,以1-(2-溴乙基)-1H-吡唑替代步骤2中的4-(5-(氯甲基)吡啶-2-基)吗啉盐酸盐。MS:(M+H)+=463;1HNMR(DMSO-d6)δ:12.84(宽单峰,1H),9.11(s,1H),8.37-8.58(m,2H),8.17(d,J=8.3Hz,1H),7.49(d,J=2.0Hz,1H),7.39(s,1H),7.22-7.31(m,1H),6.97-7.17(m,1H),6.08(s,1H),4.91(t,J=5.5Hz,2H),4.62-4.74(m,2H),4.37(宽单峰,1H),3.49(dt,J=17.9,4.7Hz,2H),3.27(s,3H),1.30(d,J=6.8Hz,3H).
实施例245.
2-[6-氯-1-(2-吗啉-4-基-乙基)-1H-吲唑-3-基]-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-羧酸(1-吡啶-3-基-乙基)-酰胺
步骤1
2-溴-5-(2-三甲基甲硅烷基-乙氧基甲基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-羧酸(1-吡啶-3-基-乙基)-酰胺
将2-溴-5-((2-(三甲基甲硅烷基)乙氧基)甲基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-羧酸(300mg,0.81mmol)、1-(吡啶-3-基)乙胺(148mg,1.21mmol)和DIPEA(0.42mL,2.42mmol)与DMF(5mL)混合得到黄色溶液。然后添加HATU(306mg,0.81mmol)且将反应混合物在室温搅拌4小时。将反应混合物以盐水稀释并以乙酸乙酯(2x30mL)萃取。将合并的有机层以水和盐水洗涤,然后经MgSO4干燥,过滤并真空浓缩得到350mg(91%)的2-溴-5-(2-三甲基甲硅烷基-乙氧基甲基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-羧酸(1-吡啶-3-基-乙基)-酰胺,为黄色油状物。MS:(M+H)+=477.
步骤2
2-(6-氯-1H-吲唑-3-基)-5-(2-三甲基甲硅烷基-乙氧基甲基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-羧酸(1-吡啶-3-基-乙基)-酰胺
将6-氯-3-三丁基甲锡烷基-1H-吲唑(584mg,1.32mmol)、碘化亚铜(I)(14mg,0.074mmol)和2-溴-5-(2-三甲基甲硅烷基-乙氧基甲基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-羧酸(1-吡啶-3-基-乙基)-酰胺(350mg,0.74mmol)与DMF(6mL)混合得到黄色溶液。将混合物以氮气脱气10分钟,然后添加四(三苯基膦)钯(0)(42mg,0.037mmol)且将反应混合物于90℃在氮气下搅拌15小时。冷却反应混合物,以醚(60mL)稀释并以水和盐水洗涤。将有机层经硫酸钠干燥,过滤并真空浓缩。将残余物通过硅胶色谱(0-3%甲醇的二氯甲烷溶液,含0.5%氢氧化铵)纯化得到203mg(48%)的2-(6-氯-1H-吲唑-3-基)-5-(2-三甲基甲硅烷基-乙氧基甲基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-羧酸(1-吡啶-3-基-乙基)-酰胺,为发泡固体。MS:(M+H)+=549.
步骤3
2-[6-氯-1-(2-吗啉-4-基-乙基)-1H-吲唑-3-基]-5-(2-三甲基甲硅烷基-乙氧基甲基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-羧酸(1-吡啶-3-基-乙基)-酰胺
于0℃将2-(6-氯-1H-吲唑-3-基)-5-(2-三甲基甲硅烷基-乙氧基甲基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-羧酸(1-吡啶-3-基-乙基)-酰胺(100mg,0.18mmol)与DMF(2mL)混合得到黄色溶液。添加氢化钠(60%在矿物油中,22mg,0.55mmol)且将反应混合物在0℃搅拌10分钟。添加4-(2-溴乙基)吗啉盐酸盐(63mg,0.27mmol)且将反应混合物在0℃搅拌30分钟,然后温热至室温并搅拌2小时。将反应混合物以5mL的盐水和10mL的水淬灭并以乙酸乙酯(2x30mL)萃取。将合并的有机层以水和盐水洗涤,然后以MgSO4干燥,过滤并真空浓缩。将粗物质通过硅胶色谱(0-10%甲醇的二氯甲烷溶液)纯化得到40mg(33%)的2-[6-氯-1-(2-吗啉-4-基-乙基)-1H-吲唑-3-基]-5-(2-三甲基甲硅烷基-乙氧基甲基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-羧酸(1-吡啶-3-基-乙基)-酰胺,为发泡固体。MS:(M+H)+=662.
步骤4
2-[6-氯-1-(2-吗啉-4-基-乙基)-1H-吲唑-3-基]-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-羧酸(1-吡啶-3-基-乙基)-酰胺
将2-[6-氯-1-(2-吗啉-4-基-乙基)-1H-吲唑-3-基]-5-(2-三甲基甲硅烷基-乙氧基甲基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-羧酸(1-吡啶-3-基-乙基)-酰胺(50mg,0.076mmol)与二氯甲烷(1mL)混合并添加三氟乙酸(0.17ml,2.27mmol)。搅拌2小时后,将反应混合物经真空浓缩。将残余物溶解于二氯甲烷(1mL)中并添加乙二胺(0.15ml,2.27mmol)。搅拌反应混合物20分钟,然后真空浓缩且将残余物以水(2mL)研磨。过滤沉淀,以水洗涤并干燥得到29mg(68%)的2-[6-氯-1-(2-吗啉-4-基-乙基)-1H-吲唑-3-基]-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-羧酸(1-吡啶-3-基-乙基)-酰胺,为黄色固体。MS:(M+H)+=531;1H NMR(DMSO-d6)δ:9.11(s,1H),8.71(宽单峰,1H),8.43-8.58(m,3H),8.29-8.38(m,1H),8.05(s,1H),7.86(d,J=7.3Hz,1H),7.36(宽单峰,1H),7.15(d,J=8.3Hz,1H),5.35(t,J=6.9Hz,1H),4.65(宽单峰,2H),3.50(宽单峰,4H),3.33(宽单峰,4H),2.84(宽单峰,2H),1.68(d,J=6.3Hz,3H).
实施例246.
2-[6-氯-1-(2-二甲基氨基-乙基)-1H-吲唑-3-基]-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-羧酸(1-吡啶-3-基-乙基)-酰胺
根据实施例245步骤3-4中阐述的操作制备,以2-溴-N,N-二甲基乙胺氢溴酸盐替代步骤3中的4-(2-溴乙基)吗啉盐酸盐。MS:(M+H)+=489;1H NMR(DMSO-d6)δ:9.11(s,1H),8.71(宽单峰,1H),8.43-8.55(m,3H),8.31(d,J=8.5Hz,1H),8.04(s,1H),7.85(d,J=7.5Hz,1H),7.33-7.39(m,1H),7.15(d,J=8.5Hz,1H),5.34(t,J=6.8Hz,1H),4.61(宽单峰,2H),2.72-2.84(m,2H),2.20(s,6H),1.68(d,J=6.5Hz,3H).
实施例247.
2-(6-氯-1-甲基-1H-吲唑-3-基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-羧酸(1-吡啶-3-基-乙基)-酰胺
根据实施例245步骤3-4中阐述的操作制备,以碘甲烷替代步骤3中的4-(2-溴乙基)吗啉盐酸盐。MS:(M+H)+=431.
实施例248.
2-[6-氟-1-(2-吗啉-4-基-乙基)-1H-吲唑-3-基]-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-羧酸(1-吡啶-4-基-乙基)-酰胺
步骤1
2-溴-5-(2-三甲基甲硅烷基-乙氧基甲基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-羧酸(1-吡啶-4-基-乙基)-酰胺
将2-溴-5-((2-(三甲基甲硅烷基)乙氧基)甲基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-羧酸(320mg,0.86mmol)、1-(吡啶-4-基)乙胺(105mg,0.86mmol)和DIPEA(449mg,2.58mmol)与DMF(5mL)混合得到黄色溶液。添加HATU(327mg,0.86mmol)并将反应混合物在室温搅拌2小时。将反应混合物以盐水稀释并以乙酸乙酯萃取(3x20mL)。将合并的有机层以水和盐水洗涤,然后以MgSO4干燥,过滤并真空浓缩得到380mg(93%)的2-溴-5-(2-三甲基甲硅烷基-乙氧基甲基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-羧酸(1-吡啶-4-基-乙基)-酰胺,为红色油状物。MS:(M+H)+=477.
步骤2
2-(6-氟-1H-吲唑-3-基)-5-(2-三甲基甲硅烷基-乙氧基甲基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-羧酸(1-吡啶-4-基-乙基)-酰胺
将6-氟-3-三丁基甲锡烷基-1H-吲唑(0.48g,1.13mmol)、碘化亚铜(I)(16mg,0.084mmol)和2-溴-5-(2-三甲基甲硅烷基-乙氧基甲基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-羧酸(1-吡啶-4-基-乙基)-酰胺(400mg,0.84mmol)与DMF(6mL)混合得到黄色溶液。将混合物脱气10分钟,然后添加四(三苯基膦)钯(0)(45mg,0.039mmol)。于90℃在氮气下搅拌反应混合物15小时。冷却反应混合物,以乙醚(60mL)稀释并以水和盐水洗涤。将有机层经无水硫酸钠干燥,过滤并真空浓缩。将残余物通过硅胶色谱(0-3%甲醇的二氯甲烷溶液,含0.5%氢氧化铵)纯化得到390mg(87%)的2-(6-氟-1H-吲唑-3-基)-5-(2-三甲基甲硅烷基-乙氧基甲基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-羧酸(1-吡啶-4-基-乙基)-酰胺,为黄色固体。MS:(M+H)+=532.
步骤3
2-[6-氟-1-(2-吗啉-4-基-乙基)-1H-吲唑-3-基]-5-(2-三甲基甲硅烷基-乙氧基甲基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-羧酸(1-吡啶-4-基-乙基)-酰胺
于0℃将2-(6-氟-1H-吲唑-3-基)-5-(2-三甲基甲硅烷基-乙氧基甲基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-羧酸(1-吡啶-4-基-乙基)-酰胺(100mg,0.19mmol)与DMF(2mL)混合得到黄色溶液。添加氢化钠(60%在矿物油中,23mg,0.56mmol)且将反应混合物在0℃搅拌10分钟。添加4-(2-溴乙基)吗啉盐酸盐(55mg,0.28mmol)且将反应混合物在0℃搅拌30分钟,然后温热至室温。室温搅拌反应混合物2小时,然后以5mL的盐水和10mL的水淬灭,并以乙酸乙酯萃取(2x30mL)。将合并的有机层以水和盐水洗涤,然后以MgSO4干燥,过滤并真空浓缩。将粗物质通过硅胶色谱(0-10%甲醇的二氯甲烷溶液)纯化得到70mg(58%)的2-[6-氟-1-(2-吗啉-4-基-乙基)-1H-吲唑-3-基]-5-(2-三甲基甲硅烷基-乙氧基甲基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-羧酸(1-吡啶-4-基-乙基)-酰胺,为发泡固体。MS:(M+H)+=645.
步骤4
2-[6-氟-1-(2-吗啉-4-基-乙基)-1H-吲唑-3-基]-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-羧酸(1-吡啶-4-基-乙基)-酰胺
将2-[6-氟-1-(2-吗啉-4-基-乙基)-1H-吲唑-3-基]-5-(2-三甲基甲硅烷基-乙氧基甲基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-羧酸(1-吡啶-4-基-乙基)-酰胺(70mg,0.11mmol)与二氯甲烷(1mL)混合然后添加三氟乙酸(0.24ml,3.26mmol)。搅拌2小时后,将反应混合物经真空浓缩。将残余物溶解于二氯甲烷(1mL)并添加乙二胺(0.22ml,3.26mmol)。搅拌反应混合物20分钟,然后真空浓缩。将残余物以水稀释然后以CH2Cl2(2x20mL)萃取。将合并的有机层以MgSO4干燥,过滤并真空浓缩得到26mg(44%)的2-[6-氟-1-(2-吗啉-4-基-乙基)-1H-吲唑-3-基]-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-羧酸(1-吡啶-4-基-乙基)-酰胺,为黄色固体。MS:(M+H)+=515;1H NMR(DMSO-d6)δ:9.13(s,1H),8.44-8.62(m,4H),8.35(dd,J=8.9,5.4Hz,1H),7.73(dd,J=10.0,2.0Hz,1H),7.45(d,J=6.0Hz,2H),6.98(d,J=2.0Hz,1H),5.29(t,J=7.2Hz,1H),4.62(t,J=6.4Hz,2H),3.42-3.59(m,4H),3.30(m,4H),2.85(t,J=6.4Hz,2H),1.65(d,J=7.0Hz,3H).
实施例249.
2-[6-氟-1-(2-二甲基氨基-乙基)-1H-吲唑-3-基]-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-羧酸(1-吡啶-4-基-乙基)-酰胺
根据实施例248步骤3-4中阐述的操作制备,以2-溴-N,N-二甲基乙胺氢溴酸盐代替步骤3中的4-(2-溴乙基)吗啉盐酸盐。MS:(M+H)+=473;1H NMR(DMSO-d6)δ:9.12(s,1H),8.42-8.63(m,4H),8.35(dd,J=8.8,5.3Hz,1H),7.70-7.81(m,1H),7.45(d,J=5.8Hz,2H),6.98(d,J=1.8Hz,1H),5.29(t,J=7.2Hz,1H),4.58(t,J=6.4Hz,2H),2.81(t,J=6.4Hz,2H),2.21(s,6H),1.65(d,J=7.0Hz,3H).
实施例250.
2-[6-氟-1-(2-吡咯烷-1-基-乙基)-1H-吲唑-3-基]-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-羧酸(1-甲基-2-吡啶-2-基-乙基)-酰胺
步骤1
2-溴-5-(2-三甲基甲硅烷基-乙氧基甲基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-羧酸(1-甲基-2-吡啶-2-基-乙基)-酰胺
将2-溴-5-((2-(三甲基甲硅烷基)乙氧基)甲基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-羧酸(300mg,0.81mmol)、1-(吡啶-2-基)丙烷-2-胺(165mg,1.21mmol)和DIPEA(312mg,2.42mmol)与DMF(5mL)混合得到黄色溶液。添加HATU(306mg,0.81mmol)且将反应混合物在室温搅拌过夜。将反应混合物以盐水稀释并以乙酸乙酯(2x30mL)萃取。将合并的有机层以水和盐水洗涤,然后以MgSO4干燥、过滤并真空浓缩。将残余物通过硅胶色谱(0-5%甲醇的二氯甲烷溶液)纯化得到360mg(86%)的2-溴-5-(2-三甲基甲硅烷基-乙氧基甲基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-羧酸(1-甲基-2-吡啶-2-基-乙基)-酰胺,为黄色油状物。MS:(M+H)+=491.
步骤2
2-(6-氟-1H-吲唑-3-基)-5-(2-三甲基甲硅烷基-乙氧基甲基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-羧酸(1-甲基-2-吡啶-2-基-乙基)-酰胺
将6-氟-3-三丁基甲锡烷基-1H-吲唑(0.20g,0.47mmol)、碘化亚铜(I)(12mg,0.06mmol)和2-溴-5-(2-三甲基甲硅烷基-乙氧基甲基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-羧酸(1-甲基-2-吡啶-2-基-乙基)-酰胺(200mg,0.41mmol)与DMF(6mL)混合得到黄色溶液。将混合物以氮气脱气10分钟,然后添加四(三苯基膦)钯(0)(23mg,0.02mmol)。将反应混合物于90℃在氮气下搅拌15小时。将反应混合物经冷却,以乙醚(60mL)稀释,以水和盐水洗涤。将有机层经无水硫酸钠干燥,过滤并真空浓缩。将残余物通过硅胶色谱(0-3%甲醇的二氯甲烷溶液,含0.5%氢氧化铵)纯化得到136mg(61%)的2-(6-氟-1H-吲唑-3-基)-5-(2-三甲基甲硅烷基-乙氧基甲基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-羧酸(1-甲基-2-吡啶-2-基-乙基)-酰胺,为发泡固体。MS:(M+H)+=546.
步骤3
2-[6-氟-1-(2-吡咯烷-1-基-乙基)-1H-吲唑-3-基]-5-(2-三甲基甲硅烷基-乙氧基甲基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-羧酸(1-甲基-2-吡啶-2-基-乙基)-酰胺
于0℃,将2-(6-氟-1H-吲唑-3-基)-5-(2-三甲基甲硅烷基-乙氧基甲基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-羧酸(1-甲基-2-吡啶-2-基-乙基)-酰胺(70mg,0.13mmol)与DMF(2mL)混合得到黄色溶液。添加氢化钠(60%的矿物油溶液,14mg,0.385mmol)并将反应混合物在0℃搅拌10分钟。添加1-(2-溴乙基)吡咯烷盐酸盐(41mg,0.19mmol)且将反应混合物在0℃搅拌30分钟,然后温热至室温。搅拌反应混合物2小时,然后以5mL的盐水和10mL的水淬灭,并以乙酸乙酯(2x30mL)萃取。将合并的有机层以水和盐水洗涤,然后以MgSO4干燥,过滤并真空浓缩。将残余物通过硅胶色谱纯化(0-10%甲醇的二氯甲烷溶液)得到75mg(91%)的2-[6-氟-1-(2-吡咯烷-1-基-乙基)-1H-吲唑-3-基]-5-(2-三甲基甲硅烷基-乙氧基甲基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-羧酸(1-甲基-2-吡啶-2-基-乙基)-酰胺,为发泡固体。MS:(M+H)+=643.
步骤4
2-[6-氟-1-(2-吡咯烷-1-基-乙基)-1H-吲唑-3-基]-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-羧酸(1-甲基-2-吡啶-2-基-乙基)-酰胺
将2-[6-氟-1-(2-吡咯烷-1-基-乙基)-1H-吲唑-3-基]-5-(2-三甲基甲硅烷基-乙氧基甲基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-羧酸(1-甲基-2-吡啶-2-基-乙基)-酰胺(75mg,0.117mmol)与二氯甲烷(1mL)混合然后添加三氟乙酸(0.26ml,3.50mmol)。搅拌2小时后,将反应混合物经真空浓缩。将残余物溶解于二氯甲烷(1mL)中并添加乙二胺(0.23ml,3.50mmol)且将反应混合物在室温搅拌20分钟。将反应混合物经真空浓缩且将残余物以水(2mL)研磨。过滤沉淀,以水洗涤并干燥得到26mg(41%)的2-[6-氟-1-(2-吡咯烷-1-基-乙基)-1H-吲唑-3-基]-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-羧酸(1-甲基-2-吡啶-2-基-乙基)-酰胺(26mg,41%),为黄色固体。MS:(M+H)+=513;1H NMR(DMSO-d6)δ:9.07(s,1H),8.32-8.44(m,2H),8.22(d,J=8.3Hz,1H),7.73(d,J=9.8Hz,1H),7.50-7.66(m,2H),7.27(d,J=7.8Hz,1H),7.03-7.16(m,2H),4.53-4.67(m,4H),4.46(s,1H),3.02-3.25(m,2H),2.98(t,J=6.5Hz,3H),1.64(宽单峰,5H),1.29(d,J=6.5Hz,3H).
实施例251.
2-[6-氟-1-(2-吗啉-4-基-2-氧代-乙基)-1H-吲唑-3-基]-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-羧酸叔丁基酰胺
步骤1
2-[6-氟-1-(2-吗啉-4-基-2-氧代-乙基)-1H-吲唑-3-基]-5-(2-三甲基甲硅烷基-乙氧基甲基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-甲醛
向5ml微波小瓶中装入2-(6-氟-1H-吲唑-3-基)-5-(2-三甲基甲硅烷基-乙氧基甲基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-甲醛(300mg,0.73mmol)、4-(2-氯乙酰基)吗啉(0.19ml,1.46mmol)、碳酸铯(713mg,2.19mmol)和DMF(3.3ml)。将小瓶以氩气冲洗、密封并在微波反应器中于100℃加热2小时。将反应混合物以水淬灭并用乙醚(2x)萃取。将有机层以水洗涤两次并以盐水洗涤一次,然后经硫酸钠干燥,过滤并浓缩。将残余物经硅胶色谱以EtOAc/己烷(梯度0-70%EtOAc)纯化得到268mg(68%)的2-[6-氟-1-(2-吗啉-4-基-2-氧代-乙基)-1H-吲唑-3-基]-5-(2-三甲基甲硅烷基-乙氧基甲基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-甲醛,为黄色粉末。
步骤2
2-[6-氟-1-(2-吗啉-4-基-2-氧代-乙基)-1H-吲唑-3-基]-5-(2-三甲基甲硅烷基-乙氧基甲基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-羧酸
在50ml圆底烧瓶中,将2-[6-氟-1-(2-吗啉-4-基-2-氧代-乙基)-1H-吲唑-3-基]-5-(2-三甲基甲硅烷基-乙氧基甲基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-甲醛(265mg,0.49mmol)溶解于THF(10ml)和水(2ml)中。将黄色的溶液冷却至0℃并添加氨基磺酸(287mg,2.95mmol)。然后经由移液管滴加亚氯酸钠(80%,76mg,0.67mmol)和磷酸二氢钾(803mg,5.9mmol)在水(6ml)中的溶液。在完成添加后,移去冰浴且将反应混合物在室温搅拌2小时。以水稀释反应混合物,并以EtOAc(2x)萃取。将合并的有机层以水和盐水洗涤,然后经硫酸钠干燥,过滤并浓缩。将残余物以己烷/乙酸乙酯研磨得到259mg(95%)的2-[6-氟-1-(2-吗啉-4-基-2-氧代-乙基)-1H-吲唑-3-基]-5-(2-三甲基甲硅烷基-乙氧基甲基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-羧酸,为浅黄色粉末。
步骤3
2-[6-氟-1-(2-吗啉-4-基-2-氧代-乙基)-1H-吲唑-3-基]-5-(2-三甲基甲硅烷基-乙氧基甲基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-羧酸叔丁基酰胺
在15ml圆底烧瓶中,将2-[6-氟-1-(2-吗啉-4-基-2-氧代-乙基)-1H-吲唑-3-基]-5-(2-三甲基甲硅烷基-乙氧基甲基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-羧酸(110mg,0.20mmol)悬浮于THF(3ml)中并添加1,1’-羰基二咪唑(39mg,0.24mmol)。将浅黄色悬浮液于60℃搅拌45分钟,期间所有固体溶解。将反应混合物冷却至室温,添加叔丁基胺(0.20ml,1.9mmol),并且将反应混合物在室温搅拌过夜。将反应混合物以水淬灭并以EtOAc(2x)萃取。将合并的有机层以水和盐水洗涤,然后经硫酸钠干燥,过滤并浓缩。将残余物经硅胶色谱以EtOAc/己烷(梯度:0-80%EtOAc)纯化得到84mg(70%)的2-[6-氟-1-(2-吗啉-4-基-2-氧代-乙基)-1H-吲唑-3-基]-5-(2-三甲基甲硅烷基-乙氧基甲基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-羧酸叔丁基酰胺,为灰白色固体。
步骤4
2-[6-氟-1-(2-吗啉-4-基-2-氧代-乙基)-1H-吲唑-3-基]-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-羧酸叔丁基酰胺
在圆底烧瓶中,将2-[6-氟-1-(2-吗啉-4-基-2-氧代-乙基)-1H-吲唑-3-基]-5-(2-三甲基甲硅烷基-乙氧基甲基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-羧酸叔丁基酰胺(81mg,0.13mmol)溶解于二氯甲烷(0.7ml)中并添加三氟乙酸(0.41ml,5.32mmol)。将黄色反应混合物在室温搅拌2小时,然后浓缩。将残余物溶解于二氯甲烷(0.7ml)中并添加乙二胺(0.54ml,8.00mmol)。将反应混合物在室温搅拌1小时,然后以水淬灭并用乙酸乙酯稀释。将所得悬浮液经过滤,并经热水和乙酸乙酯洗涤,并经高真空干燥得到38mg(60%)的2-[6-氟-1-(2-吗啉-4-基-2-氧代-乙基)-1H-吲唑-3-基]-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-羧酸叔丁基酰胺,为灰白色粉末。MS:(M+Na)+=502;1H NMR(DMSO-d6,400MHz):δ(ppm)12.81(宽单峰,1H),9.04(s,1H),8.49(dd,J=8.8,5.3Hz,1H),8.40(s,1H),7.95(s,1H),7.62(dd,J=10.0,2.1Hz,1H),7.16(td,J=9.1,2.3Hz,1H),5.60(s,2H),3.69-3.77(m,2H),3.57-3.67(m,4H),3.42-3.50(m,2H),1.53(s,9H).
实施例252.
2-(6-氟-1-甲基-1H-吲唑-3-基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-羧酸((R)-1-氧杂环丁烷-3-基-乙基)-酰胺
步骤1
氧杂环丁烷-3-甲醛
在50mL圆底烧瓶中,将氧杂环丁烷-3-基甲醇(330mg,3.75mmol)溶解于二氯甲烷(16ml)。添加氯铬酸吡啶(888mg,4.12mmol)且将反应混合物在室温搅拌过夜。将深棕色的悬浮液经硅藻土过滤,并以二氯甲烷淋洗。于室温浓缩滤液得到氧杂环丁烷-3-甲醛,为深棕色油状物,其不经进一步纯化即可使用。
步骤2
(S)-2-甲基-丙烷-2-亚磺酸1-氧杂环丁烷-3-基-亚甲-(E)-基酰胺
在圆底烧瓶中,将氧杂环丁烷-3-甲醛(452mg,3.15mmol)溶解于二氯甲烷(18ml)和(S)-2-甲基丙烷-2-亚磺酰胺(435mg,3.59mmol)中并添加无水硫酸铜(II)(1.11g,6.93mmol)。将反应混合物在室温搅拌48小时,然后通过玻璃微纤维过滤器过滤,以二氯甲烷淋洗。浓缩滤液,并将残余物经硅胶色谱以EtOAc/己烷(梯度:0-30%EtOAc)纯化得到173mg(29%)的(S)-2-甲基-丙烷-2-亚磺酸1-氧杂环丁烷-3-基-亚甲-(E)-基酰胺,为无色油状物。1H NMR(CDCl3,300MHz):δ(ppm)8.28(d,J=4.9Hz,1H),4.74-5.00(m,4H),4.00-4.19(m,1H),1.23(s,9H).
步骤3
(S)-2-甲基-丙烷-2-亚磺酸((R)-1-氧杂环丁烷-3-基-乙基)-酰胺
在圆底烧瓶中,将(S)-2-甲基-丙烷-2-亚磺酸1-氧杂环丁烷-3-基-亚甲-(E)-基酰胺(172mg,0.91mmol)溶解于二氯甲烷(3.6ml)中。将无色溶液冷却至-76℃并滴加甲基溴化镁(3.0M的乙醚溶液,0.91ml,2.73mmol)。于-76℃搅拌反应混合物3小时,并且然后缓慢地温热至室温过夜。将反应混合物以饱和NH4Cl-溶液淬灭,然后以EtOAc(2x)萃取。将合并的有机层以水和盐水洗涤,然后经硫酸钠干燥,过滤并浓缩得到143mg(77%)的(S)-2-甲基-丙烷-2-亚磺酸((R)-1-氧杂环丁烷-3-基-乙基)-酰胺,为浅黄色油状物,其不经进一步纯化即可使用。
步骤3
(R)-1-氧杂环丁烷-3-基-乙胺
在圆底烧瓶中,将(S)-2-甲基-丙烷-2-亚磺酸((R)-1-氧杂环丁烷-3-基-乙基)-酰胺(142mg,0.69mmol)溶解于甲醇(3ml)中。将淡黄色溶液冷却至0℃并滴加氯化氢(4.0M的1,4-二噁烷溶液,0.24ml,0.96mmol)。于0℃搅拌反应混合物1小时,然后以饱和NaHCO3水溶液淬灭,并以二氯甲烷(2x)萃取。将合并的有机层经硫酸钠干燥,过滤并浓缩得到(R)-1-氧杂环丁烷-3-基-乙胺,为浅黄色油状物,其不经进一步纯化即可使用。
步骤4
2-(6-氟-1-甲基-1H-吲唑-3-基)-5-(2-三甲基甲硅烷基-乙氧基甲基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-羧酸((R)-1-氧杂环丁烷-3-基-乙基)-酰胺
向圆底烧瓶中装入2-(6-氟-1-甲基-1H-吲唑-3-基)-5-(2-三甲基甲硅烷基-乙氧基甲基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-羧酸(100mg,0.23mmol)和(R)-1-氧杂环丁烷-3-基-乙胺(120mg,0.59mmol)。添加DMF(1ml),接着添加N,N-二异丙基乙胺(0.16ml,0.92mmol)和HATU(95mg,0.25mmol)。将黄色反应混合物在室温搅拌过夜,然后以水淬灭并用乙醚(2x)萃取。将合并的有机层以水洗涤两次并以盐水洗涤一次,然后经硫酸钠干燥,过滤并浓缩。将残余物经硅胶色谱以EtOAc/己烷(梯度:0-60%EtOAc)纯化得到31mg(26%)的2-(6-氟-1-甲基-1H-吲唑-3-基)-5-(2-三甲基甲硅烷基-乙氧基甲基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-羧酸((R)-1-氧杂环丁烷-3-基-乙基)-酰胺,为灰白色固体。
步骤5
2-(6-氟-1-甲基-1H-吲唑-3-基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-羧酸((R)-1-氧杂环丁烷-3-基-乙基)-酰胺
在圆底烧瓶中,将2-(6-氟-1-甲基-1H-吲唑-3-基)-5-(2-三甲基甲硅烷基-乙氧基甲基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-羧酸((R)-1-氧杂环丁烷-3-基-乙基)-酰胺(29mg,0.055mmol)溶解于四丁基氟化铵(1.0M在THF中,0.56ml,0.56mmol)中。于70℃搅拌浅棕色反应混合物4小时然后冷却至室温,以水淬灭并以EtOAc(2x)萃取。将合并的有机层以水和盐水洗涤,然后经硫酸钠干燥,过滤并浓缩。将残余物经硅胶色谱以MeOH/CH2Cl2(0.5%NH4OH)(梯度:0-5%MeOH)纯化得到14mg(64%)的2-(6-氟-1-甲基-1H-吲唑-3-基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-羧酸((R)-1-氧杂环丁烷-3-基-乙基)-酰胺,为浅黄色固体。通过手性HPLC光学纯度经确定为60%ee。MS:(M+Na)+=417;1H NMR(DMSO-d6,400MHz):δ(ppm)12.87(宽单峰,1H),9.10(s,1H),8.46(s,1H),8.42(dd,J=8.8,5.3Hz,1H),8.07(d,J=8.6Hz,1H),7.71(dd,J=9.9,1.8Hz,1H),7.25(td,J=9.1,2.0Hz,1H),4.69(dd,J=7.6,6.1Hz,1H),4.53-4.65(m,2H),4.50(t,J=6.1Hz,1H),4.42(t,J=6.3Hz,1H),4.16(s,3H),3.10-3.23(m,1H),1.24(d,J=6.6Hz,3H).
实施例253.
2-(6-氟-1-甲基-1H-吲唑-3-基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-羧酸[(S)-1-(3-三氟甲氧基-苯基)-乙基]-酰胺
步骤1
(S)-2-甲基-丙烷-2-亚磺酸1-(3-三氟甲氧基-苯基)-亚甲-(E)-基酰胺
在50mL圆底烧瓶中,将3-(三氟甲氧基)苯甲醛(400mg,2.1mmol)溶解于二氯甲烷(12ml)中并添加(S)-2-甲基丙烷-2-亚磺酰胺(281mg,2.31mmol)和无水硫酸铜(II)(739mg,4.63mmol)。将反应混合物在室温搅拌过夜,然后通过玻璃微纤维过滤器过滤,以二氯甲烷淋洗。浓缩滤液,且将残余物经硅胶色谱以EtOAc/己烷(梯度0-20%EtOAc)纯化得到430mg(70%)的(S)-2-甲基-丙烷-2-亚磺酸1-(3-三氟甲氧基-苯基)-亚甲-(E)-基酰胺,为浅黄色油状物。
步骤2
(S)-2-甲基-丙烷-2-亚磺酸[(R)-1-(3-三氟甲氧基-苯基)-乙基]-酰胺和(S)-2-甲基-丙烷-2-亚磺酸[(S)-1-(3-三氟甲氧基-苯基)-乙基]-酰胺
在圆底烧瓶中,将(S)-2-甲基-丙烷-2-亚磺酸1-(3-三氟甲氧基-苯基)-亚甲-(E)-基酰胺(424mg,1.45mmol)溶解于THF(2.9ml)中。将浅黄色溶液冷却至-76℃并滴加甲基溴化镁(3.0M的乙醚溶液,0.86ml,2.58mmol)。让反应混合物缓慢地温热至室温过夜,然后以饱和NH4Cl水溶液淬灭并以EtOAc(2x)萃取。将合并的有机层以水和盐水洗涤,然后经硫酸钠干燥,过滤并浓缩。将残余物经硅胶色谱以EtOAc/己烷(梯度:0-10%EtOAc)纯化得到225mg(50%)的(S)-2-甲基-丙烷-2-亚磺酸[(R)-1-(3-三氟甲氧基-苯基)-乙基]-酰胺,为无色油状物。1H NMR(CDCl3,400MHz):δ(ppm)7.33-7.41(m,1H),7.24-7.28(m,1H),7.22(s,1H),7.13(dd,J=8.1,1.0Hz,1H),4.62(q,J=6.7Hz,1H),1.55(d,J=6.6Hz,3H),1.22(s,9H)。还分离出161mg(36%)的(S)-2-甲基-丙烷-2-亚磺酸[(S)-1-(3-三氟甲氧基-苯基)-乙基]-酰胺,为无色油状物。1H NMR(CDCl3,400MHz):δ(ppm)7.35-7.43(m,1H),7.28-7.33(m,1H),7.21(s,1H),7.11-7.18(m,1H),4.58(qd,J=6.4,2.9Hz,1H),1.53(d,J=6.6Hz,3H),1.25(s,9H).
步骤3
(S)-1-(3-三氟甲氧基-苯基)-乙胺盐酸盐
在25mL圆底烧瓶中,将(S)-2-甲基-丙烷-2-亚磺酸[(S)-1-(3-三氟甲氧基-苯基)-乙基]-酰胺(157mg,0.51mmol)溶解于甲醇(1ml)中并滴加氯化氢(4.0M的1,4-二噁烷溶液,0.26ml,1.04mmol)。将反应混合物在室温搅拌20分钟,然后浓缩得到(S)-1-(3-三氟甲氧基-苯基)-乙胺盐酸盐,为灰白色蜡状固体,其不经进一步纯化即可使用。
步骤4
2-(6-氟-1-甲基-1H-吲唑-3-基)-5-(2-三甲基甲硅烷基-乙氧基甲基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-羧酸[(S)-1-(3-三氟甲氧基-苯基)-乙基]-酰胺
向10ml的圆底烧瓶装入2-(6-氟-1-甲基-1H-吲唑-3-基)-5-(2-三甲基甲硅烷基-乙氧基甲基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-羧酸(100mg,0.23mmol)和(S)-1-(3-三氟甲氧基-苯基)-乙胺盐酸盐(155mg,0.45mmol)。添加DMF(1.1ml),接着添加N,N-二异丙基乙胺(0.28ml,1.6mmol)和HATU(95mg,0.25mmol)。将黄色反应混合物在室温搅拌过夜,然后添加水和石油醚。将所得灰白色沉淀通过过滤收集。将滤饼以水和石油醚洗涤然后高真空干燥得到126mg(89%)的2-(6-氟-1-甲基-1H-吲唑-3-基)-5-(2-三甲基甲硅烷基-乙氧基甲基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-羧酸[(S)-1-(3-三氟甲氧基-苯基)-乙基]-酰胺,为灰白色粉末。
步骤5
2-(6-氟-1-甲基-1H-吲唑-3-基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-羧酸[(S)-1-(3-三氟甲氧基-苯基)-乙基]-酰胺
在10mL圆底烧瓶中,将2-(6-氟-1-甲基-1H-吲唑-3-基)-5-(2-三甲基甲硅烷基-乙氧基甲基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-羧酸[(S)-1-(3-三氟甲氧基-苯基)-乙基]-酰胺(123mg,0.196mmol)溶解于二氯甲烷(1ml)中并添加三氟乙酸(0.6ml,7.9mmol)。将浅黄色反应在室温搅拌2小时,然后浓缩。将残余物溶解于二氯甲烷(1ml)中并添加乙二胺(0.80ml,11.8mmol)。将黄色反应混合物在室温搅拌1小时,然后以水淬灭并用乙酸乙酯稀释。将所得悬浮液经过滤,并经热水和乙酸乙酯洗涤,并且将所收集的固体经高真空干燥得到56mg(57%)的2-(6-氟-1-甲基-1H-吲唑-3-基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-羧酸[(S)-1-(3-三氟甲氧基-苯基)-乙基]-酰胺,为浅黄色粉末。MS:(M+Na)+=521;1H NMR(DMSO-d6,400MHz):δ(ppm)12.85(宽单峰,1H),9.11(s,1H),8.53(d,J=7.8Hz,1H),8.45(s,1H),8.36(dd,J=9.2,5.2Hz,1H),7.67(dd,J=9.7,1.9Hz,1H),7.39-7.54(m,3H),7.24(d,J=7.1Hz,1H),6.98(td,J=9.0,2.1Hz,1H),5.27-5.43(m,1H),4.14(s,3H),1.65(d,J=7.1Hz,3H).
实施例254.
2-(6-氟-1-甲基-1H-吲唑-3-基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-羧酸[(R)-1-(3-三氟甲氧基-苯基)-乙基]-酰胺
根据实施例253步骤3-5中阐述的操作制备,以(S)-2-甲基-丙烷-2-亚磺酸[(R)-1-(3-三氟甲氧基-苯基)-乙基]-酰胺代替步骤3中的(S)-2-甲基-丙烷-2-亚磺酸[(S)-1-(3-三氟甲氧基-苯基)-乙基]-酰胺。MS:(M+Na)+=521;1H NMR(DMSO-d6,400MHz):δ(ppm)12.85(宽单峰,1H),9.11(s,1H),8.54(d,J=7.8Hz,1H),8.45(s,1H),8.37(dd,J=8.6,5.6Hz,1H),7.67(dd,J=9.9,2.0Hz,1H),7.39-7.54(m,3H),7.24(d,J=7.1Hz,1H),6.98(td,J=9.0,2.1Hz,1H),5.28-5.42(m,1H),4.15(s,3H),1.66(d,J=7.1Hz,3H).
实施例255.
2-(6-氟-1-甲基-1H-吲唑-3-基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-羧酸[1-(1-羟基-1-甲基-乙基)-环丁基]-酰胺
步骤1
1-叔丁氧基羰基氨基-环丁烷羧酸乙酯
向1-氨基-1-环丁烷-羧酸乙酯盐酸盐(1.20g,6.67mmol)在DMF(13mL)中的溶液中添加一缩二碳酸二-叔丁酯(1.61g,7.35mmol)。滴加三乙胺(1.12mL,8.04mmol)并将反应混合物在室温搅拌3.5小时,添加然后水和乙醚。将水层以乙醚萃取。将合并的有机层以1.0M HCl、水和盐水洗涤然后经Na2SO4干燥并浓缩得到1.58g(97%)的1-叔丁氧基羰基氨基-环丁烷羧酸乙酯,为灰白色固体。
步骤2
[1-(1-羟基-1-甲基-乙基)-环丁基]-氨基甲酸叔丁酯
在100mL3-颈圆底烧瓶中,将1-叔丁氧基羰基氨基-环丁烷羧酸乙酯(700mg,3.05mmol)溶解于THF(22mL)。将溶液冷却至0℃并经15分钟滴加甲基溴化镁(3.0M在Et2O中的溶液,4.0mL,12.0mmol)。将反应混合物缓慢地温热至室温过夜。将反应混合物冷却至0℃并以饱和NH4Cl水溶液淬灭,然后以1.0M HCl水溶液稀释并以EtOAc(2x)萃取。将合并的有机物以H2O和盐水洗涤然后经Na2SO4干燥并浓缩。将残余物经24g的SiO2色谱使用EtOAc/己烷(梯度:0-20%EtOAc)纯化提供492mg(70%)的[1-(1-羟基-1-甲基-乙基)-环丁基]-氨基甲酸叔丁酯,为浅黄色油状物。
步骤3
2-(1-氨基-环丁基)-丙烷-2-醇三氟乙酸盐
在25ml圆底烧瓶中,将[1-(1-羟基-1-甲基-乙基)-环丁基]-氨基甲酸叔丁酯(150mg,0.65mmol)溶解于二氯甲烷(3.8ml)且缓慢地添加三氟乙酸(1.5ml,19.5mmol)。将淡黄色反应混合物在室温搅拌2.5小时,然后浓缩得到2-(1-氨基-环丁基)-丙烷-2-醇三氟乙酸盐,为浅棕色油状物,其不经进一步纯化即可使用。
步骤4
2-(6-氟-1-甲基-1H-吲唑-3-基)-5-(2-三甲基甲硅烷基-乙氧基甲基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-羧酸[1-(1-羟基-1-甲基-乙基)-环丁基]-酰胺
在圆底烧瓶中,将2-(1-氨基-环丁基)-丙烷-2-醇三氟乙酸盐(214mg,0.62mmol)溶解于DMF(1.2ml)和N,N-二异丙基乙胺(0.44ml,2.52mmol)中。然后添加2-(6-氟-1-甲基-1H-吲唑-3-基)-5-(2-三甲基甲硅烷基-乙氧基甲基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-羧酸(110mg,0.25mmol)和HATU(104mg,0.27mmol)。将黄色反应混合物在室温搅拌过夜,然后添加水和石油醚。将所得沉淀通过过滤收集。将滤饼以水和石油醚洗涤然后高真空干燥得到142mg(98%)的2-(6-氟-1-甲基-1H-吲唑-3-基)-5-(2-三甲基甲硅烷基-乙氧基甲基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-羧酸[1-(1-羟基-1-甲基-乙基)-环丁基]-酰胺,为灰白色粉末。
步骤5
2-(6-氟-1-甲基-1H-吲唑-3-基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-羧酸[1-(1-羟基-1-甲基-乙基)-环丁基]-酰胺
在10ml圆底烧瓶中,将2-(6-氟-1-甲基-1H-吲唑-3-基)-5-(2-三甲基甲硅烷基-乙氧基甲基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-羧酸[1-(1-羟基-1-甲基-乙基)-环丁基]-酰胺(140mg,0.24mmol)溶解于二氯甲烷(1.2ml)中并添加三氟乙酸(0.75ml,9.7mmol)。将橙色反应混合物在室温搅拌3小时,然后浓缩。将残余物溶解于二氯甲烷(1.2ml)中并添加乙二胺(1.0ml,14.8mmol)。将反应混合物在室温搅拌1小时,然后以水淬灭并用乙酸乙酯稀释。将所得悬浮液经过滤,经热水和乙酸乙酯洗涤,然后高真空干燥得到67mg(63%)的2-(6-氟-1-甲基-1H-吲唑-3-基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-羧酸[1-(1-羟基-1-甲基-乙基)-环丁基]-酰胺,为浅黄色粉末。MS:(M+Na)+=445;1H NMR(DMSO-d6,300MHz):δ(ppm)9.11(s,1H),8.53(dd,J=8.9,5.5Hz,1H),8.41(s,1H),8.31(s,1H),7.68(dd,J=9.8,2.3Hz,1H),7.08-7.23(m,1H),4.99(宽单峰,1H),4.15(s,3H),2.38-2.62(m,4H),1.84-2.02(m,1H),1.66-1.83(m,1H),1.23(s,6H).
实施例256.
2-(6-氟-1-甲基-1H-吲唑-3-基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-羧酸(1-羟基甲基-环丁基)-酰胺
步骤1
(1-羟基甲基-环丁基)-氨基甲酸叔丁酯
在15ml圆底烧瓶中,将1-叔丁氧基羰基氨基-环丁烷羧酸乙酯(180mg,0.74mmol)溶解于THF(4mL)。将无色溶液冷却至0℃并滴加氢化锂铝(1.0M的THF溶液,0.78ml,0.78mmol)。于0℃搅拌反应混合物1.5小时,然后小心地添加十水硫酸钠。当停止产生气体时,移去冰浴,添加硫酸钠并室温搅拌混合物30分钟。将悬浮液经硅藻土过滤并以乙酸乙酯/甲醇淋洗。将滤液浓缩得到(1-羟基甲基-环丁基)-氨基甲酸叔丁酯,为灰白色蜡状固体,其不经进一步纯化即可使用。
步骤2
2-(6-氟-1-甲基-1H-吲唑-3-基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-羧酸(1-羟基甲基-环丁基)-酰胺
根据实施例255步骤3-5中阐述的操作制备,以(1-羟基甲基-环丁基)-氨基甲酸叔丁酯替代步骤3中的[1-(1-羟基-1-甲基-乙基)-环丁基]-氨基甲酸叔丁酯。MS:(M+Na)+=417.1H NMR(DMSO-d6,400MHz):δ(ppm)9.09(s,1H),8.56(dd,J=9.0,5.2Hz,1H),8.37(s,1H),8.31(s,1H),7.66(dd,J=9.9,2.0Hz,1H),7.14(td,J=9.1,2.3Hz,1H),5.10(宽单峰,1H),4.14(s,3H),3.75(s,2H),2.34-2.45(m,2H),2.16-2.27(m,2H),1.80-1.98(m,2H).
实施例257.
2-(6-氟-1-哌啶-4-基-1H-吲唑-3-基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-羧酸叔丁基酰胺
步骤1
4-{6-氟-3-[7-甲酰基-5-(2-三甲基甲硅烷基-乙氧基甲基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-2-基]-吲唑-1-基}-哌啶-1-羧酸叔丁酯
向微波小瓶装入2-(6-氟-1H-吲唑-3-基)-5-(2-三甲基甲硅烷基-乙氧基甲基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-甲醛(182mg,0.44mmol)、4-溴哌啶-1-羧酸叔丁酯(234mg,0.89mmol)、碳酸铯(432mg,1.33mmol)和DMF(2ml)。将小瓶以氩气冲洗,密封,并在微波反应器中于100℃加热2小时。将反应混合物以水淬灭并用乙醚(2x)萃取。将合并的有机层以水洗涤两次并以盐水洗涤一次,然后经硫酸钠干燥,过滤并浓缩。将残余物经硅胶色谱以EtOAc/己烷(梯度:0-30%EtOAc)纯化得到108mg(41%)的4-{6-氟-3-[7-甲酰基-5-(2-三甲基甲硅烷基-乙氧基甲基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-2-基]-吲唑-1-基}-哌啶-1-羧酸叔丁酯,为浅棕色固体。
步骤2
2-[1-(1-叔丁氧基羰基-哌啶-4-基)-6-氟-1H-吲唑-3-基]-5-(2-三甲基甲硅烷基-乙氧基甲基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-羧酸
在50mL圆底烧瓶中,将4-{6-氟-3-[7-甲酰基-5-(2-三甲基甲硅烷基-乙氧基甲基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-2-基]-吲唑-1-基}-哌啶-1-羧酸叔丁酯(190mg,0.32mmol)溶解于THF(7ml)和水(1.4ml)中。将浅黄色溶液冷却至0℃并添加氨基磺酸(186mg,1.92mmol)。然后,经由移液管滴加亚氯酸钠(80%,50mg,0.44mmol)和磷酸二氢钾(522mg,3.83mmol)在水(4.2ml)中的溶液。在完成添加后,移去冰浴且将反应混合物在室温搅拌1.5小时。将反应混合物以水稀释并以EtOAc(2x)萃取。将合并的有机层以水和盐水洗涤,然后经硫酸钠干燥,过滤并浓缩。将残余物以己烷研磨得到176mg(90%)的2-[1-(1-叔丁氧基羰基-哌啶-4-基)-6-氟-1H-吲唑-3-基]-5-(2-三甲基甲硅烷基-乙氧基甲基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-羧酸,为浅黄色粉末。
步骤3
2-[1-(1-叔丁氧基羰基-哌啶-4-基)-6-氟-1H-吲唑-3-基]-5-(2-三甲基甲硅烷基-乙氧基甲基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-羧酸叔丁基酰胺
在10mL圆底烧瓶中,将2-[1-(1-叔丁氧基羰基-哌啶-4-基)-6-氟-1H-吲唑-3-基]-5-(2-三甲基甲硅烷基-乙氧基甲基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-羧酸(85mg,0.14mmol)溶解于DMF(1.5ml)中并添加叔丁基胺(0.06ml,0.57mmol)andHATU(59mg,0.155mmol)。将浅黄色悬浮液在室温搅拌过夜,然后添加水和石油醚。过滤所得悬浮液。将滤饼以水和石油醚洗涤然后高真空干燥。将残余物在8g硅胶上以EtOAc/己烷(梯度:0-30%EtOAc)色谱纯化得到47mg(51%)的2-[1-(1-叔丁氧基羰基-哌啶-4-基)-6-氟-1H-吲唑-3-基]-5-(2-三甲基甲硅烷基-乙氧基甲基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-羧酸叔丁基酰胺,为灰白色固体。
步骤4
2-(6-氟-1-哌啶-4-基-1H-吲唑-3-基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-羧酸叔丁基酰胺
在10mL圆底烧瓶中,将2-[1-(1-叔丁氧基羰基-哌啶-4-基)-6-氟-1H-吲唑-3-基]-5-(2-三甲基甲硅烷基-乙氧基甲基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-羧酸叔丁基酰胺(46mg,0.069mmol)溶解于二氯甲烷(0.4ml)中并添加三氟乙酸(0.22ml,2.86mmol)。将反应混合物在室温搅拌2小时,然后浓缩。将残余物悬浮于二氯甲烷(0.4ml)中并添加乙二胺(0.28ml,4.15mmol)。将浅黄色悬浮液在室温搅拌1小时,然后以水淬灭并用乙酸乙酯稀释。将悬浮液经过滤并经热水和乙酸乙酯洗涤,然后高真空干燥得到27mg(85%)的2-(6-氟-1-哌啶-4-基-1H-吲唑-3-基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-羧酸叔丁基酰胺,为浅黄色粉末。MS:(M+H)+=436;1H NMR(DMSO-d6,300MHz):δ(ppm)9.08(s,1H),8.47(dd,J=8.9,5.5Hz,1H),8.39(s,1H),7.96(s,1H),7.77-7.85(m,1H),7.10-7.22(m,1H),4.70-4.88(m,1H),3.13(d,J=12.1Hz,2H),2.67-2.81(m,2H),2.01-2.20(m,2H),1.88-2.01(m,2H),1.52(s,9H).
实施例258.
2-(6-氟-1-吡咯烷-3-基-1H-吲唑-3-基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-羧酸叔丁基酰胺
步骤1
3-甲磺酰基氧基-吡咯烷-1-羧酸叔丁酯
在50mL圆底烧瓶中,将3-羟基吡咯烷-1-羧酸叔丁酯(300mg,1.6mmol)溶解于二氯甲烷912mL)。将无色溶液冷却至0℃并添加三乙胺(0.34ml,2.44mmol)和甲磺酰氯(0.14ml,1.8mmol)。于0℃搅拌反应混合物1.5小时,然后以水淬灭并以二氯甲烷(2x)萃取。合并有机层,经硫酸钠干燥,过滤并浓缩得到3-甲磺酰基氧基-吡咯烷-1-羧酸叔丁酯,为黄色油状物,其不经进一步纯化即可使用。
步骤2
2-(6-氟-1-吡咯烷-3-基-1H-吲唑-3-基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-羧酸叔丁基酰胺
根据实施例257中阐述的操作制备,以3-甲磺酰基氧基-吡咯烷-1-羧酸叔丁酯替代步骤1中的4-溴哌啶-1-羧酸叔丁酯。MS:(M+H)+=422.1H NMR(DMSO-d6,300MHz):δ(ppm)9.11(s,1H),8.46(dd,J=8.9,5.5Hz,1H),8.37(s,1H),7.94(s,1H),7.78(dd,J=10.2,1.9Hz,1H),7.15(td,J=9.1,1.9Hz,1H),5.25-5.42(m,1H),3.10-3.31(m,3H),2.88-3.01(m,1H),2.12-2.38(m,2H),1.51(s,9H).
实施例259.
2-(1-甲基-1H-吡唑并[4,3-b]吡啶-3-基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-羧酸叔丁基酰胺
步骤1
2-溴-5-(2-三甲基甲硅烷基-乙氧基甲基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-羧酸叔丁基酰胺
在100ml圆底烧瓶中,将2-溴-5-(2-三甲基甲硅烷基-乙氧基甲基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-羧酸(1.00g,2.69mmol)溶解于DMF(6ml)。添加叔丁基胺(1.7ml,16.2mmol),接着添加HATU(1.12g,2.95mmol)。将黄色的悬浮液在室温搅拌72小时,然后以水淬灭并以乙醚和EtOAc的混合物萃取。将有机层以水洗涤两次并以盐水洗涤一次,然后合并,经硫酸钠干燥,过滤并浓缩。将残余物以石油醚研磨得到989mg(86%)的2-溴-5-(2-三甲基甲硅烷基-乙氧基甲基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-羧酸叔丁基酰胺,为灰白色粉末。1H NMR(CDCl3,300MHz):δ(ppm)8.40(s,1H),8.31(s,1H),7.86(s,1H),5.65(s,2H),3.46-3.58(m,2H),1.54(s,9H),0.84-0.98(m,2H),-0.04(s,9H).
步骤2
2-(1-甲基-1H-吡唑并[4,3-b]吡啶-3-基)-5-(2-三甲基甲硅烷基-乙氧基甲基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-羧酸叔丁基酰胺
在圆底烧瓶中,将2-溴-5-(2-三甲基甲硅烷基-乙氧基甲基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-羧酸叔丁基酰胺(110mg,0.26mmol)和1-甲基-3-三丁基甲锡烷基-1H-吡唑并[4,3-b]吡啶(参见实施例98,340mg,0.40mmol)溶解于DMF(2.4mL)。将反应混合物抽真空并回填以氩气然后添加四(三苯基膦)钯(0)(15mg,0.013mmol)和碘化亚铜(I)(10mg,0.053mmol)。于80℃搅拌反应混合物过夜然后冷却至室温,以水淬灭并用乙醚(2x)萃取。将合并的有机层以水洗涤两次并以盐水洗涤一次,然后经硫酸钠干燥,过滤并浓缩。将残余物在12g硅胶上以EtOAc/己烷(梯度:0-70%EtOAc)色谱纯化得到51mg(41%)的2-(1-甲基-1H-吡唑并[4,3-b]吡啶-3-基)-5-(2-三甲基甲硅烷基-乙氧基甲基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-羧酸叔丁基酰胺,为浅黄色固体。
步骤3
2-(1-甲基-1H-吡唑并[4,3-b]吡啶-3-基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-羧酸叔丁基酰胺
在10mL圆底烧瓶中,将2-(1-甲基-1H-吡唑并[4,3-b]吡啶-3-基)-5-(2-三甲基甲硅烷基-乙氧基甲基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-羧酸叔丁基酰胺(49mg,0.102mmol)溶解于二氯甲烷(0.6ml)中并添加三氟乙酸(0.32ml,4.15mmol)。将黄色反应混合物在室温搅拌2小时,然后浓缩。将残余物溶解于二氯甲烷(0.6ml)中并添加乙二胺(0.42ml,6.22mmol)。将黄色的溶液在室温搅拌1小时,然后以水淬灭并用乙酸乙酯稀释。将所得悬浮液经过滤,经热水和乙酸乙酯洗涤,将产物经高真空干燥提供23mg(64%)的2-(1-甲基-1H-吡唑并[4,3-b]吡啶-3-基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-羧酸叔丁基酰胺,为浅黄色粉末。MS:(M+H)+=350;1H NMR(DMSO-d6,400MHz):δ(ppm)12.58(宽单峰,1H),9.34(s,1H),8.69(s,1H),8.65(dd,J=4.3,1.3Hz,1H),8.34(s,1H),8.27(dd,J=8.6,1.3Hz,1H),7.52(dd,J=8.6,4.3Hz,1H),4.21(s,3H),1.53(s,9H).
实施例260.
2-(5-氰基-1-甲基-1H-吲唑-3-基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-羧酸叔丁基酰胺
步骤1
3-碘-1H-吲唑-5-甲腈
在25mL圆底烧瓶中,将1H-吲唑-5-甲腈(400mg,2.79mmol)溶解于DMF(7ml)。添加氢氧化钾(607mg,10.8mmol),接着添加碘(1.42g,5.59mmol)。将深棕色的悬浮液在室温搅拌3小时,然后以10%NaHSO3水溶液淬灭并用乙醚(2x)萃取。将合并的有机层以水洗涤两次并以盐水洗涤一次,然后经硫酸钠干燥,过滤并浓缩得到396mg(53%)的3-碘-1H-吲唑-5-甲腈,为浅黄色粉末。
步骤2
3-碘-1-甲基-1H-吲唑-5-甲腈
在圆底烧瓶中,将3-碘-1H-吲唑-5-甲腈(391mg,1.45mmol)溶解于THF(5.3ml)。将浅黄色溶液冷却至0℃并添加叔丁醇钾(230mg,2.05mmol)。于0℃搅拌反应混合物30分钟,然后滴加碘甲烷(0.12ml,1.92mmol)。在完成添加后,移去冰浴且将反应混合物在室温搅拌1.5小时。将反应混合物以水淬灭并以EtOAc(2x)萃取。将合并的有机层以水和盐水洗涤,然后经硫酸钠干燥,过滤并浓缩得到384mg(93%)的浅黄色固体。NMR分析粗产物显示3-碘-1-甲基-1H-吲唑-5-甲腈(主要)和3-碘-2-甲基-2H-吲唑-5-甲腈(次要)的约5:1混合物。将混合物不经进一步纯化即可使用。
步骤3
1-甲基-3-三丁基甲锡烷基-1H-吲唑-5-甲腈
在圆底烧瓶中,将3-碘-1-甲基-1H-吲唑-5-甲腈(383mg,1.35mmol)溶解于THF(10ml)。将浅黄色悬浮液冷却至-16℃(NaCl/冰浴)并滴加异丙基氯化镁(2.0M的THF溶液,0.82ml,1.64mmol)。于-16℃搅拌反应混合物30分钟,然后缓慢地添加三丁基氯甲锡烷(0.43ml,1.59mmol)。将反应混合物温热至室温并搅拌1.5小时,然后以饱和NH4Cl水溶液淬灭并以EtOAc(2x)萃取。将合并的有机层以水和盐水洗涤,然后经硫酸钠干燥,过滤并浓缩得到1-甲基-3-三丁基甲锡烷基-1H-吲唑-5-甲腈,为棕色油状物,其不经进一步纯化即可使用。
步骤4
2-(5-氰基-1-甲基-1H-吲唑-3-基)-5-(2-三甲基甲硅烷基-乙氧基甲基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-羧酸叔丁基酰胺
在50ml圆底烧瓶中,将2-溴-5-(2-三甲基甲硅烷基-乙氧基甲基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-羧酸叔丁基酰胺(300mg,0.70mmol)和1-甲基-3-三丁基甲锡烷基-1H-吲唑-5-甲腈(来自步骤3的粗产物,847mg,1.14mmol)溶解于DMF(6.6mL)。将反应混合物抽真空并回填以氩气然后添加四(三苯基膦)钯(0)(41mg,0.036mmol)和碘化亚铜(I)(27mg,0.14mmol)。于80℃搅拌反应混合物过夜,然后冷却至室温并添加水和乙醚。将所得棕色沉淀经过滤收集,以水和乙醚洗涤。将棕色粉末吸收在硅胶上并以MeOH/CH2Cl2/0.5%NH4OH(梯度:0-2%MeOH)色谱纯化得到254mg(72%)的2-(5-氰基-1-甲基-1H-吲唑-3-基)-5-(2-三甲基甲硅烷基-乙氧基甲基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-羧酸叔丁基酰胺,为浅黄色固体。
步骤5
2-(5-氰基-1-甲基-1H-吲唑-3-基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-羧酸叔丁基酰胺
在圆底烧瓶中,将2-(5-氰基-1-甲基-1H-吲唑-3-基)-5-(2-三甲基甲硅烷基-乙氧基甲基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-羧酸叔丁基酰胺(80mg,0.16mmol)溶解于二氯甲烷(0.8ml)中并添加三氟乙酸(0.5ml,6.4mmol)。将反应混合物在室温搅拌2小时,然后浓缩。将残余物悬浮于二氯甲烷(0.8ml)并添加乙二胺(0.65ml,9.63mmol)。将浅黄色悬浮液在室温搅拌1小时,然后添加水和乙酸乙酯。将悬浮液经过滤并经热水和乙酸乙酯洗涤。将收集的产物经高真空干燥得到43mg(73%)的2-(5-氰基-1-甲基-1H-吲唑-3-基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-羧酸叔丁基酰胺,为黄色粉末。MS:(M+Na)+=396;1H NMR(DMSO-d6,300MHz):δ(ppm)12.48(宽单峰,1H),9.10(s,1H),8.87(s,1H),8.41(s,1H),7.93-8.05(m,1H),7.78-7.90(m,2H),4.23(s,3H),1.54(s,9H).
实施例261.
2-(5-二氟甲氧基-1-哌啶-4-基-1H-吲唑-3-基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-羧酸叔丁基酰胺
步骤1
5-二氟甲氧基-3-三丁基甲锡烷基-1H-吲唑
在圆底烧瓶中,将5-二氟甲氧基-3-碘-1H-吲唑(200mg,0.6mmol)溶解于THF(3.6ml)并添加氢化钠(60%在矿物油中,64mg,1.6mmol)。将反应混合物在室温搅拌10分钟,然后冷却至-16℃(NaCl/冰浴)并滴加异丙基氯化镁(2.0M的THF溶液,0.46ml,0.920mmol)。于-16℃搅拌反应混合物30分钟,然后缓慢地添加三丁基氯甲锡烷(0.22ml,0.81mmol)。将反应混合物温热至室温并搅拌1小时,然后以饱和NH4Cl-溶液淬灭并以EtOAc(2x)萃取。将合并的有机层以水和盐水洗涤,然后经硫酸钠干燥,过滤并浓缩得到5-二氟甲氧基-3-三丁基甲锡烷基-1H-吲唑,为黄色油状物,其不经进一步纯化即可使用。
步骤2
2-(5-二氟甲氧基-1H-吲唑-3-基)-5-(2-三甲基甲硅烷基-乙氧基甲基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-羧酸叔丁基酰胺
在圆底烧瓶中,将2-溴-5-(2-三甲基甲硅烷基-乙氧基甲基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-羧酸叔丁基酰胺(200mg,0.47mmol)和5-二氟甲氧基-3-三丁基甲锡烷基-1H-吲唑(来自步骤1的粗产物,509mg,0.59mmol)溶解于DMF(3.2mL)。将反应混合物抽真空并回填以氩气然后添加四(三苯基膦)钯(0)(27.0mg,0.023mmol)和碘化亚铜(I)(18mg,0.095mmol)。于90℃搅拌反应混合物2小时,然后冷却至室温,以水淬灭并以乙酸乙酯/乙醚(2x)萃取。将合并的有机层以水洗涤三次和以盐水洗涤一次然后浓缩。将残余物吸收在硅胶上,并以EtOAc/二氯甲烷(梯度:0-30%EtOAc)色谱纯化。合并合适的馏分并浓缩且将残余物以乙醚研磨得到158mg(64%)的2-(5-二氟甲氧基-1H-吲唑-3-基)-5-(2-三甲基甲硅烷基-乙氧基甲基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-羧酸叔丁基酰胺,为灰白色粉末。
步骤3
4-{3-[7-叔丁基氨基甲酰基-5-(2-三甲基甲硅烷基-乙氧基甲基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-2-基]-5-二氟甲氧基-吲唑-1-基}-哌啶-1-羧酸叔丁酯
向压力管中装入2-(5-二氟甲氧基-1H-吲唑-3-基)-5-(2-三甲基甲硅烷基-乙氧基甲基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-羧酸叔丁基酰胺(180mg,0.34mmol)、4-溴哌啶-1-羧酸叔丁酯(179mg,0.68mmol)、碳酸铯(332mg,1.02mmol)和DMF(1.5ml)。将压力管以氩气冲洗,密封并于100℃在油浴中搅拌过夜。将反应混合物冷却至室温并再添加4-溴哌啶-1-羧酸叔丁酯(179mg,0.68mmol)和碳酸铯(332mg,1.02mmol)。将压力管再次以氩气冲洗,密封并于100℃在油浴中搅拌6小时。将反应混合物冷却至室温,以水淬灭并用乙醚(2x)萃取。将合并的有机层以水洗涤两次并以盐水洗涤一次,然后经硫酸钠干燥,过滤并浓缩。将残余物放在25g硅胶上以EtOAc/己烷(梯度:0-30%EtOAc)色谱纯化得到197mg(81%)的4-{3-[7-叔丁基氨基甲酰基-5-(2-三甲基甲硅烷基-乙氧基甲基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-2-基]-5-二氟甲氧基-吲唑-1-基}-哌啶-1-羧酸叔丁酯,为灰白色固体。
步骤4
2-(5-二氟甲氧基-1-哌啶-4-基-1H-吲唑-3-基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-羧酸叔丁基酰胺
在圆底烧瓶中,将4-{3-[7-叔丁基氨基甲酰基-5-(2-三甲基甲硅烷基-乙氧基甲基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-2-基]-5-二氟甲氧基-吲唑-1-基}-哌啶-1-羧酸叔丁酯(65mg,0.091mmol)溶解于二氯甲烷(0.5ml)并添加三氟乙酸(0.28ml,3.63mmol)。将反应混合物在室温搅拌2小时,然后浓缩。将残余物溶解于二氯甲烷(0.5ml)中并添加乙二胺(0.37ml,5.48mmol)。将反应混合物在室温搅拌1小时,然后添加水和乙酸乙酯。将所得悬浮液经过滤,并经热水和乙酸乙酯洗涤。将收集的产物经高真空干燥得到37mg(80%)的2-(5-二氟甲氧基-1-哌啶-4-基-1H-吲唑-3-基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-羧酸叔丁基酰胺,为灰白色粉末。MS:(M+H)+=484;1H NMR(DMSO-d6,300MHz):δ(ppm)9.06(s,1H),8.37(s,1H),8.19(d,J=2.3Hz,1H),7.96(d,J=9.1Hz,1H),7.89(s,1H),7.38(dd,J=9.1,2.3Hz,1H),7.18(t,J=74.8Hz,1H),4.73-4.93(m,1H),3.12(d,J=12.8Hz,2H),2.63-2.81(m,2H),2.01-2.19(m,2H),1.89-2.01(m,2H),1.49(s,9H).
实施例262.
4-[3-(7-叔丁基氨基甲酰基-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-2-基)-5-二氟甲氧基-吲唑-1-基]-丁酸
步骤1
4-{3-[7-叔丁基氨基甲酰基-5-(2-三甲基甲硅烷基-乙氧基甲基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-2-基]-5-二氟甲氧基-吲唑-1-基}-丁酸甲酯
向微波小瓶装入2-(5-二氟甲氧基-1H-吲唑-3-基)-5-(2-三甲基甲硅烷基-乙氧基甲基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-羧酸叔丁基酰胺(100mg,0.19mmol)、4-溴丁酸甲酯(69mg,0.38mmol)、碳酸铯(184mg,0.57mmol)和DMF(0.85ml)。将小瓶以氩气冲洗,密封并在微波反应器中于100℃加热2小时。将反应混合物以水淬灭并用乙醚(2x)萃取。将合并的有机层以水洗涤两次并以盐水洗涤一次,然后经硫酸钠干燥,过滤并浓缩。将残余物在12g硅胶上以EtOAc/己烷(梯度:0-30%EtOAc)色谱纯化得到99mg(83%)的4-{3-[7-叔丁基氨基甲酰基-5-(2-三甲基甲硅烷基-乙氧基甲基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-2-基]-5-二氟甲氧基-吲唑-1-基}-丁酸甲酯,为浅黄色固体。
步骤2
4-{3-[7-叔丁基氨基甲酰基-5-(2-三甲基甲硅烷基-乙氧基甲基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-2-基]-5-二氟甲氧基-吲唑-1-基}-丁酸
在圆底烧瓶中,将4-{3-[7-叔丁基氨基甲酰基-5-(2-三甲基甲硅烷基-乙氧基甲基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-2-基]-5-二氟甲氧基-吲唑-1-基}-丁酸甲酯(98mg,0.155mmol)悬浮于THF(1.1ml)、甲醇(1.1ml)和水(1.1mL)中。然后,添加1.0M氢氧化锂水溶液(0.80ml,0.80mmol)。将浅黄色悬浮液于75℃搅拌8小时,然后冷却至室温并搅拌过夜。将反应混合物以水稀释并以1M HCl酸化直到pH=~2然后以二氯甲烷(3x)萃取。合并有机层,经硫酸钠干燥,过滤并浓缩。将残余物以乙醚研磨得到81mg(85%)的4-{3-[7-叔丁基氨基甲酰基-5-(2-三甲基甲硅烷基-乙氧基甲基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-2-基]-5-二氟甲氧基-吲唑-1-基}-丁酸,为棕色粉末。
步骤3
4-[3-(7-叔丁基氨基甲酰基-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-2-基)-5-二氟甲氧基-吲唑-1-基]-丁酸
在圆底烧瓶中,将4-{3-[7-叔丁基氨基甲酰基-5-(2-三甲基甲硅烷基-乙氧基甲基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-2-基]-5-二氟甲氧基-吲唑-1-基}-丁酸(80mg,0.13mmol)溶解于二氯甲烷(0.7ml)并添加三氟乙酸(0.40ml,5.2mmol)。将反应混合物在室温搅拌2小时,然后浓缩。将残余物溶解于二氯甲烷(0.7ml)中并添加乙二胺(0.53ml,7.85mmol)。将反应混合物在室温搅拌1小时,然后以水稀释并以1M HCl然后浓HCl酸化至pH=~4。将所得悬浮液经过滤,并经热水和乙酸乙酯洗涤,且将产物经高真空干燥得到27mg(41%)的4-[3-(7-叔丁基氨基甲酰基-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-2-基)-5-二氟甲氧基-吲唑-1-基]-丁酸,为棕色粉末。MS:(M+Na)+=509;1H NMR(DMSO-d6,400MHz):δ(ppm)9.09(s,1H),8.39(s,1H),8.22(d,J=2.0Hz,1H),7.86-7.92(m,2H),7.42(dd,J=9.1,2.3Hz,1H),7.21(t,J=74.3Hz,1H),4.59(t,J=6.8Hz,2H),2.26-2.33(m,2H),2.08-2.19(m,2H),1.51(s,9H).
实施例263.
2-[5-二氟甲氧基-1-(1-甲基-哌啶-4-基)-1H-吲唑-3-基]-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-羧酸叔丁基酰胺
步骤1
2-(5-二氟甲氧基-1-哌啶-4-基-1H-吲唑-3-基)-5-(2-三甲基甲硅烷基-乙氧基甲基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-羧酸叔丁基酰胺盐酸盐
在圆底烧瓶中,将4-{3-[7-叔丁基氨基甲酰基-5-(2-三甲基甲硅烷基-乙氧基甲基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-2-基]-5-二氟甲氧基-吲唑-1-基}-哌啶-1-羧酸叔丁酯(102mg,0.143mmol)悬浮于甲醇(1.4ml)。将悬浮液冷却至0℃并滴加乙酰基氯(0.20ml,2.81mmol)。在完成添加后,移去冰浴且将反应混合物在室温搅拌1.5小时。将溶剂在室温蒸发,将残余物经高真空干燥得到92mg(99%)的2-(5-二氟甲氧基-1-哌啶-4-基-1H-吲唑-3-基)-5-(2-三甲基甲硅烷基-乙氧基甲基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-羧酸叔丁基酰胺盐酸盐,为黄色固体,其不经进一步纯化即可使用。
步骤2
2-[5-二氟甲氧基-1-(1-甲基-哌啶-4-基)-1H-吲唑-3-基]-5-(2-三甲基甲硅烷基-乙氧基甲基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-羧酸叔丁基酰胺
在圆底烧瓶中,将2-(5-二氟甲氧基-1-哌啶-4-基-1H-吲唑-3-基)-5-(2-三甲基甲硅烷基-乙氧基甲基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-羧酸叔丁基酰胺盐酸盐(91mg,0.14mmol)悬浮于1,2-二氯乙烷(1.5ml)中并添加三乙胺(0.03ml,0.22mmol)。将混合物在室温搅拌10分钟,然后添加甲醛(37%水溶液,13μl,0.175mmol)和三乙氧基硼氢化钠(119mg,0.56mmol)。将黄色的悬浮液在室温搅拌1.5小时,然后以饱和NaHCO3水溶液淬灭,并以二氯甲烷(3x)萃取。合并有机层,经硫酸钠干燥,过滤并浓缩得到2-[5-二氟甲氧基-1-(1-甲基-哌啶-4-基)-1H-吲唑-3-基]-5-(2-三甲基甲硅烷基-乙氧基甲基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-羧酸叔丁基酰胺,为黄色泡沫,其不经进一步纯化即可使用。
步骤3
2-[5-二氟甲氧基-1-(1-甲基-哌啶-4-基)-1H-吲唑-3-基]-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-羧酸叔丁基酰胺
在10mL圆底烧瓶中,将2-[5-二氟甲氧基-1-(1-甲基-哌啶-4-基)-1H-吲唑-3-基]-5-(2-三甲基甲硅烷基-乙氧基甲基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-羧酸叔丁基酰胺(来自步骤2的粗产物,103mg,0.131mmol)溶解于二氯甲烷(0.7ml)并添加三氟乙酸(0.40ml,5.2mmol)。将反应混合物在室温搅拌2小时,然后浓缩。将残余物悬浮于二氯甲烷(0.7ml)并添加乙二胺(0.53ml,7.85mmol)。将浅黄色悬浮液在室温搅拌1小时,然后添加水和乙酸乙酯。将悬浮液经过滤并经热水和乙酸乙酯洗涤。将收集的产物经高真空干燥得到57mg(83%)的2-[5-二氟甲氧基-1-(1-甲基-哌啶-4-基)-1H-吲唑-3-基]-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-羧酸叔丁基酰胺,为浅黄色粉末。MS:(M+H)+=498;1H NMR(DMSO-d6,300MHz):δ(ppm)9.08(s,1H),8.38(s,1H),8.20(s,1H),7.86-8.00(m,2H),7.39(d,J=8.3Hz,1H),7.19(t,J=74.4Hz,1H),4.67-4.83(m,1H),2.95(d,J=7.9Hz,2H),2.27(s,3H),2.12-2.32(m,4H),2.00(d,J=10.2Hz,2H),1.50(s,9H).
实施例264.
2-(5-二氟甲氧基-1-吡啶-3-基甲基-1H-吲唑-3-基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-羧酸叔丁基酰胺
步骤1
2-(5-二氟甲氧基-1-吡啶-3-基甲基-1H-吲唑-3-基)-5-(2-三甲基甲硅烷基-乙氧基甲基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-羧酸叔丁基酰胺
在25ml圆底烧瓶中,将2-(5-二氟甲氧基-1H-吲唑-3-基)-5-(2-三甲基甲硅烷基-乙氧基甲基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-羧酸叔丁基酰胺(120mg,0.23mmol)溶解于DMF(1.7ml)。将浅黄色溶液冷却至0℃并添加氢化钠(60%在矿物油中,37mg,0.93mmol)。将反应混合物在0℃搅拌15分钟,然后添加3-(溴甲基)吡啶氢溴酸盐(91mg,0.36mmol)。于0℃搅拌反应混合物1小时,然后以水淬灭并以石油醚稀释。将悬浮液经过滤,以水和石油醚洗涤且将收集的产物经高真空干燥得到126mg(90%)的2-(5-二氟甲氧基-1-吡啶-3-基甲基-1H-吲唑-3-基)-5-(2-三甲基甲硅烷基-乙氧基甲基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-羧酸叔丁基酰胺,为黄色粉末。
步骤2
2-(5-二氟甲氧基-1-吡啶-3-基甲基-1H-吲唑-3-基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-羧酸叔丁基酰胺
在圆底烧瓶中,将2-(5-二氟甲氧基-1-吡啶-3-基甲基-1H-吲唑-3-基)-5-(2-三甲基甲硅烷基-乙氧基甲基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-羧酸叔丁基酰胺(124mg,0.20mmol)溶解于二氯甲烷(1ml)中并添加三氟乙酸(0.62ml,8.05mmol)。将反应混合物在室温搅拌2小时,然后浓缩。将残余物溶解于二氯甲烷(1ml)并添加乙二胺(0.81ml,12.0mmol)。将黄色的溶液在室温搅拌1小时,然后以水淬灭并以EtOAc(2x)萃取。将合并的有机层以水和盐水洗涤,然后经硫酸钠干燥,过滤并浓缩。将残余物以少量的乙醚(含数滴的乙酸乙酯)研磨得到83mg(80%)的2-(5-二氟甲氧基-1-吡啶-3-基甲基-1H-吲唑-3-基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-羧酸叔丁基酰胺,为浅黄色粉末。MS:(M+H)+=492;1H NMR(DMSO-d6,300MHz):δ(ppm)12.78(宽单峰,1H),9.09(s,1H),8.68(d,J=1.9Hz,1H),8.50(dd,J=4.7,1.3Hz,1H),8.39(s,1H),8.22(d,J=2.3Hz,1H),8.02(d,J=9.4Hz,1H),7.87(s,1H),7.75(d,J=7.9Hz,1H),7.32-7.46(m,2H),7.07(t,J=74.0Hz,1H),5.88(s,2H),1.50(s,9H).
实施例265.
2-(5-二氟甲氧基-1-吡咯烷-3-基甲基-1H-吲唑-3-基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-羧酸叔丁基酰胺
步骤1
3-甲磺酰基氧基甲基-吡咯烷-1-羧酸叔丁酯
在圆底烧瓶中,将3-(羟基甲基)吡咯烷-1-羧酸叔丁酯(120mg,0.60mmol)溶解于二氯甲烷(4.4mL)。将无色溶液冷却至0℃并添加三乙胺(0.13ml,0.93mmol)和甲磺酰氯(0.05ml,0.64mmol)。于0℃搅拌反应混合物3小时,然后以水淬灭,并以二氯甲烷(2x)萃取。合并有机层,经硫酸钠干燥,过滤并浓缩得到3-甲磺酰基氧基甲基-吡咯烷-1-羧酸叔丁酯,为浅黄色油状物,其不经进一步纯化即可使用。
步骤2
3-{3-[7-叔丁基氨基甲酰基-5-(2-三甲基甲硅烷基-乙氧基甲基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-2-基]-5-二氟甲氧基-吲唑-1-基甲基}-吡咯烷-1-羧酸叔丁酯
向圆底烧瓶中装入2-(5-二氟甲氧基-1H-吲唑-3-基)-5-(2-三甲基甲硅烷基-乙氧基甲基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-羧酸叔丁基酰胺(120mg,0.23mmol)、3-甲磺酰基氧基甲基-吡咯烷-1-羧酸叔丁酯(来自步骤1的粗产物,215mg,0.54mmol)、碳酸铯(258mg,0.79mmol)和DMF(1ml)。于110℃搅拌反应混合物1.5小时,然后冷却至室温,以水淬灭并用乙醚(2x)萃取。将合并的有机层以水洗涤两次并以盐水洗涤一次,然后经硫酸钠干燥,过滤并浓缩。将残余物在12g硅胶上以EtOAc/己烷(梯度:0-40%EtOAc)色谱纯化。合并合适的馏分并浓缩并将残余物以石油醚研磨得到138mg(86%)的3-{3-[7-叔丁基氨基甲酰基-5-(2-三甲基甲硅烷基-乙氧基甲基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-2-基]-5-二氟甲氧基-吲唑-1-基甲基}-吡咯烷-1-羧酸叔丁酯,为浅黄色粉末。
步骤3
2-(5-二氟甲氧基-1-吡咯烷-3-基甲基-1H-吲唑-3-基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-羧酸叔丁基酰胺
在圆底烧瓶中,将3-{3-[7-叔丁基氨基甲酰基-5-(2-三甲基甲硅烷基-乙氧基甲基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-2-基]-5-二氟甲氧基-吲唑-1-基甲基}-吡咯烷-1-羧酸叔丁酯(134mg,0.188mmol)溶解于二氯甲烷(1ml)中并添加三氟乙酸(0.58ml,7.53mmol)。将反应混合物在室温搅拌2小时,然后浓缩。将残余物溶解于二氯甲烷(1ml)中并添加乙二胺(0.76ml,11.3mmol)。将浅黄色溶液在室温搅拌45分钟,然后添加水和乙酸乙酯。将所得悬浮液经过滤,并经热水和乙酸乙酯洗涤,然后高真空干燥得到33mg(35%)的2-(5-二氟甲氧基-1-吡咯烷-3-基甲基-1H-吲唑-3-基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-羧酸叔丁基酰胺,为浅黄色粉末。MS:(M+H)+=484;1H NMR(DMSO-d6,300MHz):δ(ppm)9.06(s,1H),8.38(s,1H),8.21(s,1H),7.94(d,J=9.1Hz,1H),7.88(s,1H),7.40(d,J=9.1Hz,1H),7.20(t,J=74.8Hz,1H),4.50(d,J=6.8Hz,2H),2.58-2.97(m,6H),1.69-1.84(m,1H),1.51(s,9H).
实施例266.
2-(7-羟基甲基-1H-吲唑-3-基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-羧酸叔丁基酰胺
步骤1
(1H-吲唑-7-基)-甲醇
在圆底烧瓶中,将1H-吲唑-7-羧酸乙酯(600mg,3.15mmol)溶解于THF(16ml)。将浅黄色溶液冷却至0℃并滴加氢化锂铝(1.0M的THF溶液,3.8ml,3.8mmol)。于0℃搅拌亮黄色反应混合物1.25小时,然后小心地滴加十水硫酸钠。当停止产生气体时,移去冰浴,添加硫酸钠并室温搅拌混合物30分钟。将悬浮液经硅藻土过滤并以乙酸乙酯/甲醇淋洗。将滤液经浓缩得到(1H-吲唑-7-基)-甲醇,为浅黄色固体,其不经进一步纯化即可使用。
步骤2
(3-碘-1H-吲唑-7-基)-甲醇
在圆底烧瓶中,将(1H-吲唑-7-基)-甲醇(572mg,3.09mmol)溶解于DMF(8ml)并添加氢氧化钾(671mg,12.0mmol)和碘(1.57g,6.18mmol)。将深棕色的悬浮液在室温搅拌过夜,然后以10%Na2S2O3水溶液淬灭并用乙醚(2x)萃取。将合并的有机层以水洗涤两次并以盐水洗涤一次,然后经硫酸钠干燥,过滤并浓缩得到433mg(51%)的(3-碘-1H-吲唑-7-基)-甲醇,为浅黄色固体。
步骤3
7-(叔丁基-二甲基-甲硅烷基氧基甲基)-3-碘-1H-吲唑
在圆底烧瓶中,将(3-碘-1H-吲唑-7-基)-甲醇(317mg,1.16mmol)溶解于DMF(3.6ml)并添加咪唑(197mg,2.89mmol)和叔丁基二甲基甲硅烷基氯(192mg,1.27mmol)。将反应混合物在室温搅拌72小时,然后以水淬灭并用乙醚(2x)萃取。将合并的有机层以水洗涤两次并以盐水洗涤一次,然后经硫酸钠干燥,过滤并浓缩。将残余物在12g硅胶上以EtOAc/己烷(梯度:0-5%EtOAc)色谱纯化得到357mg(80%)的7-(叔丁基-二甲基-甲硅烷基氧基甲基)-3-碘-1H-吲唑,为灰白色固体。1H NMR(CDCl3,300MHz):δ(ppm)10.76(宽单峰,1H),7.42(dd,J=6.8,2.3Hz,1H),7.15-7.20(m,2H),5.09(s,2H),0.95(s,9H),0.13(s,6H).
步骤4
7-(叔丁基-二甲基-甲硅烷基氧基甲基)-3-三丁基甲锡烷基-1H-吲唑
在圆底烧瓶中,将7-(叔丁基-二甲基-甲硅烷基氧基甲基)-3-碘-1H-吲唑(200mg,0.52mmol)溶解于THF(2.8ml)中并添加氢化钠(60%在矿物油中,25mg,0.63mmol)。将反应混合物在室温搅拌10分钟,然后冷却至-16℃(NaCl/冰浴)并滴加异丙基氯化镁(2.0M的THF溶液,0.36ml,0.72mmol)。于-16℃搅拌反应混合物30分钟,然后缓慢地添加三丁基氯甲锡烷(0.16ml,0.59mmol)。将反应混合物温热至室温并搅拌2.5小时,然后以饱和NH4Cl水溶液淬灭并以EtOAc(2x)萃取。将有机层以水和盐水洗涤,然后经硫酸钠干燥,过滤并浓缩得到7-(叔丁基-二甲基-甲硅烷基氧基甲基)-3-三丁基甲锡烷基-1H-吲唑,为黄色油状物,其不经进一步纯化即可使用。
步骤5
2-[7-(叔丁基-二甲基-甲硅烷基氧基甲基)-1H-吲唑-3-基]-5-(2-三甲基甲硅烷基-乙氧基甲基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-羧酸叔丁基酰胺
在25mL圆底烧瓶中,将2-溴-5-(2-三甲基甲硅烷基-乙氧基甲基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-羧酸叔丁基酰胺(180mg,0.42mmol)和7-(叔丁基-二甲基-甲硅烷基氧基甲基)-3-三丁基甲锡烷基-1H-吲唑(来自步骤4的粗产物,462mg,0.50mmol)溶解于DMF(2.8mL)中。将反应混合物抽真空并回填以氩气并添加四(三苯基膦)钯(0)(25mg,0.022mmol)和碘化亚铜(I)(16mg,0.084mmol)。于80℃搅拌反应混合物过夜然后冷却至室温,以水淬灭并用乙醚(2x)萃取。将合并的有机层以水洗涤两次并以盐水洗涤一次,然后浓缩。将残余物在25g硅胶上以EtOAc/己烷(梯度:0-30%EtOAc)色谱纯化得到86mg(34%)的2-[7-(叔丁基-二甲基-甲硅烷基氧基甲基)-1H-吲唑-3-基]-5-(2-三甲基甲硅烷基-乙氧基甲基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-羧酸叔丁基酰胺,为浅黄色固体。
步骤6
2-(7-羟基甲基-1H-吲唑-3-基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-羧酸叔丁基酰胺
在圆底烧瓶中,将2-[7-(叔丁基-二甲基-甲硅烷基氧基甲基)-1H-吲唑-3-基]-5-(2-三甲基甲硅烷基-乙氧基甲基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-羧酸叔丁基酰胺(85mg,0.14mmol)溶解于THF(0.7ml)并滴加四丁基氟化铵(1.0M的THF溶液,1.4ml,1.4mmol)。将浅棕色溶液在室温搅拌10分钟,然后于70℃加热2.5小时。将反应混合物冷却至室温,以水淬灭并以EtOAc(2x)萃取。将合并的有机层以水和盐水洗涤,然后经硫酸钠干燥,过滤并浓缩。将残余物吸收在硅胶上,且以MeOH/CH2Cl2/0.5%NH4OH(梯度:0-10%MeOH)色谱纯化。合并合适的馏分并浓缩且将残余物以乙酸乙酯(含数滴甲醇)研磨得到21mg(41%)的2-(7-羟基甲基-1H-吲唑-3-基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-羧酸叔丁基酰胺,为灰白色粉末。MS:(M+Na)+=387;1H NMR(DMSO-d6,400MHz):δ(ppm)13.49(s,1H),12.77(s,1H),9.15(s,1H),8.39(d,J=8.1Hz,1H),8.36(d,J=3.0Hz,1H),8.01(s,1H),7.38-7.46(m,1H),7.16-7.25(m,1H),5.37(t,J=5.6Hz,1H),4.88(d,J=5.6Hz,2H),1.53(s,9H).
实施例267.
2-(6-氟-1-哌啶-4-基-1H-吲唑-3-基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-羧酸(3-氨基-环戊基)-酰胺
步骤1
4-{3-[7-(3-叔丁氧基羰基氨基-环戊基氨基甲酰基)-5-(2-三甲基甲硅烷基-乙氧基甲基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-2-基]-6-氟-吲唑-1-基}-哌啶-1-羧酸叔丁酯
向10ml的圆底烧瓶装入2-[1-(1-叔丁氧基羰基-哌啶-4-基)-6-氟-1H-吲唑-3-基]-5-(2-三甲基甲硅烷基-乙氧基甲基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-羧酸(85mg,0.14mmol)和(3-氨基环戊基)-氨基甲酸叔丁酯盐酸盐(50mg,0.21mmol)。然后添加DMF(1ml),接着添加N,N-二异丙基乙胺(0.07ml,0.40mmol)和HATU(59mg,0.155mmol)。将反应混合物在室温搅拌过夜,然后以水淬灭并用乙醚(2x)萃取。将合并的有机层以水洗涤两次并以盐水洗涤一次,然后经硫酸钠干燥,过滤并浓缩。将残余物在12g硅胶以EtOAc/己烷(梯度:0-50%EtOAc)色谱纯化得到121mg(99%)的4-{3-[7-(3-叔丁氧基羰基氨基-环戊基氨基甲酰基)-5-(2-三甲基甲硅烷基-乙氧基甲基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-2-基]-6-氟-吲唑-1-基}-哌啶-1-羧酸叔丁酯,为浅黄色油状物。分离的产物通过NMR分析确定为未知相关立体化学的单个非对映异构体。
步骤2
2-(6-氟-1-哌啶-4-基-1H-吲唑-3-基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-羧酸(3-氨基-环戊基)-酰胺
在圆底烧瓶中,将4-{3-[7-(3-叔丁氧基羰基氨基-环戊基氨基甲酰基)-5-(2-三甲基甲硅烷基-乙氧基甲基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-2-基]-6-氟-吲唑-1-基}-哌啶-1-羧酸叔丁酯(113mg,0.13mmol)溶解于二氯甲烷(0.7ml)并添加三氟乙酸(0.40ml,5.2mmol)。将反应混合物在室温搅拌2小时,然后浓缩。将残余物溶解于二氯甲烷(0.7ml)中并添加乙二胺(0.52ml,7.7mmol)。将浅黄色反应在室温搅拌1小时,然后添加水和乙酸乙酯。将所得悬浮液经过滤,并经热水和乙酸乙酯洗涤,然后高真空干燥得到43mg(73%)的2-(6-氟-1-哌啶-4-基-1H-吲唑-3-基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-羧酸(3-氨基-环戊基)-酰胺,为灰白色粉末。MS:(M+H)+=463;1H NMR(DMSO-d6,400MHz):δ(ppm)9.08(s,1H),8.56(dd,J=9.1,5.6Hz,1H),8.40(s,1H),8.27(d,J=7.8Hz,1H),7.76-7.85(m,1H),7.27(t,J=9.0Hz,1H),4.69-4.85(m,1H),4.32-4.47(m,1H),3.33-3.42(m,1H),3.12(d,J=12.6Hz,2H),2.72(t,J=11.2Hz,2H),2.25-2.37(m,1H),2.02-2.17(m,3H),1.88-2.00(m,2H),1.70-1.86(m,2H),1.49-1.62(m,1H),1.30-1.42(m,1H).
实施例268.
2-[7-(1-羟基-1-甲基-乙基)-1H-吲唑-3-基]-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-羧酸叔丁基酰胺
步骤1
2-(1H-吲唑-7-基)-丙烷-2-醇
在50mL圆底烧瓶中,将1H-吲唑-7-羧酸乙酯(350mg,1.84mmol)溶解于THF(10mL)。将黄色的溶液冷却至0℃并滴加甲基溴化镁(3.0M在乙醚中,2.2ml,6.6mmol)。于0℃搅拌反应混合物1.5小时,然后以饱和NH4Cl水溶液淬灭并以EtOAc(2x)萃取。将合并的有机层以水和盐水洗涤,然后经硫酸钠干燥,过滤并浓缩。将残余物在12g硅胶上以EtOAc/己烷(梯度:0-50%EtOAc)色谱纯化得到225mg(69%)的2-(1H-吲唑-7-基)-丙烷-2-醇,为黄色油状物。
步骤2
2-(3-碘-1H-吲唑-7-基)-丙烷-2-醇
在圆底烧瓶中,将2-(1H-吲唑-7-基)-丙烷-2-醇(204mg,1.16mmol)溶解于DMF(3ml)中并添加碘(588mg,2.32mmol)和氢氧化钾(251mg,4.48mmol)。将深棕色的悬浮液在室温搅拌5小时,然后以10%NaHSO3水溶液淬灭并以乙醚和EtOAc(2x)的混合物萃取。将合并的有机层以水洗涤两次并以盐水洗涤一次,然后经硫酸钠干燥,过滤并浓缩得到2-(3-碘-1H-吲唑-7-基)-丙烷-2-醇,为浅黄色油状物,其不经进一步纯化即可使用。
步骤3
3-碘-7-(1-甲基-1-三甲基甲硅烷基氧基-乙基)-1H-吲唑
在圆底烧瓶中,将2-(3-碘-1H-吲唑-7-基)-丙烷-2-醇(来自步骤2的粗产物,479mg,1.11mmol)溶解于DMF(3.2ml)中并添加咪唑(189mg,2.77mmol)和三甲基甲硅烷基氯(0.17ml,1.33mmol)。将反应混合物在室温搅拌过夜,然后以水淬灭并用乙醚(2x)萃取。将合并的有机层以水洗涤两次并以盐水洗涤一次,然后经硫酸钠干燥,过滤并浓缩得到383mg(88%)的3-碘-7-(1-甲基-1-三甲基甲硅烷基氧基-乙基)-1H-吲唑,为浅黄色固体。1H NMR(CDCl3,300MHz):δ(ppm)10.86(宽单峰,1H),7.40(dd,J=6.8,2.3Hz,1H),7.12-7.21(m,2H),1.73(s,6H),0.11(s,9H).
步骤4
2-[7-(1-羟基-1-甲基-乙基)-1H-吲唑-3-基]-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-羧酸叔丁基酰胺
根据实施例266步骤4-6中阐述的操作制备,以3-碘-7-(1-甲基-1-三甲基甲硅烷基氧基-乙基)-1H-吲唑替代步骤4中的7-(叔丁基-二甲基-甲硅烷基氧基甲基)-3-碘-1H-吲唑。MS:(M+Na)+=415.1H NMR(DMSO-d6,400MHz):δ(ppm)13.08(s,1H),12.78(宽单峰,1H),9.14(s,1H),8.39(d,J=7.8Hz,1H),8.35(s,1H),8.03(s,1H),7.35(d,J=6.3Hz,1H),7.16(t,J=7.7Hz,1H),5.49(s,1H),1.64(s,6H),1.53(s,9H).
实施例269.
2-[5-(1-羟基-乙基)-1-甲基-1H-吲唑-3-基]-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-羧酸异丙基酰胺
步骤1
2-[5-(叔丁基-二甲基-甲硅烷基氧基甲基)-1-甲基-1H-吲唑-3-基]-5-(2-三甲基甲硅烷基-乙氧基甲基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-羧酸异丙基酰胺
在圆底烧瓶中,将2-溴-5-(2-三甲基甲硅烷基-乙氧基甲基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-羧酸异丙基酰胺(300mg,0.73mmol)和5-(叔丁基-二甲基-甲硅烷基氧基甲基)-1-甲基-3-三丁基甲锡烷基-1H-吲唑(实施例273,665mg,0.82mmol)溶解于DMF(4.8mL)。将反应混合物抽真空并回填以氩气然后添加四(三苯基膦)钯(0)(42mg,0.036mmol)和碘化亚铜(I)(28mg,0.147mmol)。于80℃搅拌反应混合物过夜然后冷却至室温,以水淬灭并以石油醚稀释。将所得悬浮液经过滤,将固体以水、石油醚和最小量乙醚洗涤,然后高真空干燥得到426mg(92%)的2-[5-(叔丁基-二甲基-甲硅烷基氧基甲基)-1-甲基-1H-吲唑-3-基]-5-(2-三甲基甲硅烷基-乙氧基甲基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-羧酸异丙基酰胺,为棕色粉末。
步骤2
2-(5-羟基甲基-1-甲基-1H-吲唑-3-基)-5-(2-三甲基甲硅烷基-乙氧基甲基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-羧酸异丙基酰胺
在圆底烧瓶中,将2-[5-(叔丁基-二甲基-甲硅烷基氧基甲基)-1-甲基-1H-吲唑-3-基]-5-(2-三甲基甲硅烷基-乙氧基甲基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-羧酸异丙基酰胺(425mg,0.66mmol)溶解于THF(6ml)。将浅黄色溶液冷却至0℃并添加四丁基氟化铵(1.0M的THF溶液,0.24ml,0.240mmol)。将反应混合物经2小时缓慢地温热至室温,然后以水淬灭并以EtOAc(2x)萃取。将合并的有机层以水和盐水洗涤,然后浓缩。将残余物以乙醚研磨得到2-(5-羟基甲基-1-甲基-1H-吲唑-3-基)-5-(2-三甲基甲硅烷基-乙氧基甲基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-羧酸异丙基酰胺,为黄色粉末,其不经进一步纯化即可使用。
步骤3
2-(5-甲酰基-1-甲基-1H-吲唑-3-基)-5-(2-三甲基甲硅烷基-乙氧基甲基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-羧酸异丙基酰胺
在圆底烧瓶中,将2-(5-羟基甲基-1-甲基-1H-吲唑-3-基)-5-(2-三甲基甲硅烷基-乙氧基甲基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-羧酸异丙基酰胺(来自步骤2的粗产物,476mg,0.625mmol)溶解于二氯甲烷(3.2ml)并添加戴斯-马丁高碘剂(292mg,0.688mmol)。将反应混合物在室温搅拌1.5小时,然后以10mL的10%Na2S2O3水溶液和饱和NaHCO3水溶液的1:1混合物淬灭并以二氯甲烷萃取。将有机层以饱和NaHCO3水溶液洗涤然后将水层以二氯甲烷反萃取。将合并的有机层经硫酸钠干燥,过滤并浓缩。将残余物吸收在硅胶上,并以EtOAc/己烷(梯度:0-60%EtOAc)色谱纯化得到218mg(71%)的2-(5-甲酰基-1-甲基-1H-吲唑-3-基)-5-(2-三甲基甲硅烷基-乙氧基甲基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-羧酸异丙基酰胺,为浅黄色固体。1H NMR(CDCl3,400MHz):δ(ppm)9.25(s,1H),8.97(dd,J=1.4,0.9Hz,1H),8.41(s,1H),8.11(d,J=8.6Hz,1H),8.07(dd,J=8.8,1.5Hz,1H),7.60(d,J=8.8Hz,1H),5.75(s,2H),4.42-4.53(m,1H),4.26(s,3H),3.56-3.64(m,2H),1.41(d,J=6.6Hz,6H),0.92-1.00(m,2H),-0.03(s,9H).
步骤4
2-[5-(1-羟基-乙基)-1-甲基-1H-吲唑-3-基]-5-(2-三甲基甲硅烷基-乙氧基甲基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-羧酸异丙基酰胺
在圆底烧瓶中,将2-(5-甲酰基-1-甲基-1H-吲唑-3-基)-5-(2-三甲基甲硅烷基-乙氧基甲基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-羧酸异丙基酰胺(111mg,0.225mmol)悬浮于THF(3ml)。将淡黄色悬浮液冷却至0℃并滴加甲基溴化镁(3.0M在乙醚在的溶液,0.23ml,0.69mmol)。将深红色悬浮液于0℃搅拌1小时,然后以饱和NH4Cl水溶液淬灭并以二氯甲烷(2x)萃取。合并有机层,经硫酸钠干燥,过滤并浓缩。将残余物在12g硅胶上以EtOAc/己烷(梯度:0-80%EtOAc)色谱纯化得到42mg(37%)的2-[5-(1-羟基-乙基)-1-甲基-1H-吲唑-3-基]-5-(2-三甲基甲硅烷基-乙氧基甲基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-羧酸异丙基酰胺,为浅黄色固体。
步骤5
2-[5-(1-羟基-乙基)-1-甲基-1H-吲唑-3-基]-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-羧酸异丙基酰胺
在圆底烧瓶中,将2-[5-(1-羟基-乙基)-1-甲基-1H-吲唑-3-基]-5-(2-三甲基甲硅烷基-乙氧基甲基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-羧酸异丙基酰胺(41mg,0.08mmol)溶解于四丁基氟化铵(1.0M的THF溶液,0.90ml,0.90mmol)。于60℃搅拌反应混合物过夜然后冷却至室温,以水淬灭并以EtOAc(2x)萃取。将合并的有机层以水和盐水洗涤,然后浓缩。将残余物以水、乙酸乙酯和数滴甲醇研磨得到21mg(65%)的2-[5-(1-羟基-乙基)-1-甲基-1H-吲唑-3-基]-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-羧酸异丙基酰胺,为黄色粉末。MS:(M+Na)+=401;1H NMR(DMSO-d6,300MHz):δ(ppm)12.82(宽单峰,1H),9.09(s,1H),8.41(s,1H),8.30(s,1H),8.04(d,J=7.9Hz,1H),7.73(d,J=8.7Hz,1H),7.55(d,J=8.3Hz,1H),5.27(d,J=3.8Hz,1H),4.87-5.00(m,1H),4.19-4.32(m,1H),4.17(s,3H),1.41(d,J=6.0Hz,3H),1.33(d,J=6.8Hz,6H).
实施例270.
2-(6-甲磺酰基-1-甲基-1H-吲唑-3-基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-羧酸叔丁基酰胺
步骤1
3-碘-6-甲磺酰基-1H-吲唑
在25mL圆底烧瓶中,将6-甲基磺酰基-1H-吲唑(250mg,1.27mmol)溶解于DMF(3.2ml)中并添加氢氧化钾(277mg,4.93mmol)和碘(647mg,2.55mmol)。将深棕色的悬浮液在室温搅拌4小时,然后以10%Na2S2O3水溶液淬灭并以乙醚和EtOAc的混合物萃取(2x)。将合并的有机层以水洗涤两次并以盐水洗涤一次,然后经硫酸钠干燥,过滤并浓缩得到165mg的橙色油状物。将合并的有机层以二氯甲烷萃取两次。合并有机层,经硫酸钠干燥,过滤并浓缩。将残余物与来自第一次萃取的165mg橙色油状物混合并高真空干燥得到401mg(98%)的3-碘-6-甲磺酰基-1H-吲唑,为橙色固体。
步骤2
3-碘-6-甲磺酰基-1-甲基-1H-吲唑
在圆底烧瓶中,将3-碘-6-甲基磺酰基-1H-吲唑(396mg,1.23mmol)溶解于THF(4.4ml)。将橙色溶液冷却至0℃并添加叔丁醇钾(200mg,1.78mmol)。于0℃搅拌反应混合物30分钟,然后滴加碘甲烷(0.11ml,1.76mmol)。在完成添加后,移去冰浴且将反应混合物在室温搅拌4小时,然后以水淬灭并以EtOAc(2x)萃取。将合并的有机层以水和盐水洗涤,然后经硫酸钠干燥,过滤并浓缩。将残余物吸收在硅胶上并以EtOAc/己烷(梯度:0-30%EtOAc)色谱纯化得到251mg(61%)的3-碘-6-甲磺酰基-1-甲基-1H-吲唑,为灰白色固体。也观察到次要区域异构体3-碘-6-甲磺酰基-2-甲基-2H-吲唑,但没有分离。
步骤3
6-甲磺酰基-1-甲基-3-三丁基甲锡烷基-1H-吲唑
在圆底烧瓶中,将3-碘-6-甲磺酰基-1-甲基-1H-吲唑(120mg,0.36mmol)溶解于THF(2mL)。将无色溶液冷却至-16℃(NaCl/冰浴)并滴加异丙基氯化镁(2.0M的THF溶液,0.25ml,0.50mmol)。于-16℃搅拌反应混合物1小时,然后缓慢地添加三丁基氯甲锡烷(0.12ml,0.44mmol)。将反应混合物经2.5小时温热至室温,然后以饱和NH4Cl-溶液淬灭并以EtOAc(2x)萃取。将合并的有机层以水和盐水洗涤,然后经硫酸钠干燥,过滤并浓缩得到6-甲磺酰基-1-甲基-3-三丁基甲锡烷基-1H-吲唑,为浅黄色油状物,其不经进一步纯化即可使用。
步骤4
2-(6-甲磺酰基-1-甲基-1H-吲唑-3-基)-5-(2-三甲基甲硅烷基-乙氧基甲基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-羧酸叔丁基酰胺
在圆底烧瓶中,将2-溴-5-(2-三甲基甲硅烷基-乙氧基甲基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-羧酸叔丁基酰胺(110mg,0.26mmol)和6-甲磺酰基-1-甲基-3-三丁基甲锡烷基-1H-吲唑(来自步骤3的粗产物,330mg,0.33mmol)溶解于DMF(1.7ml)。将烧瓶抽真空并回填以氩气并添加四(三苯基膦)钯(0)(15mg,0.013mmol)和碘化亚铜(I)(10mg,0.053mmol)。于90℃搅拌反应混合物3小时,然后冷却至室温过夜。将反应混合物以水淬灭并以乙醚(2x)和EtOAc萃取。将合并的有机层以水洗涤两次并以盐水洗涤一次,然后经硫酸钠干燥,过滤并浓缩。将残余物在25g硅胶上以EtOAc/己烷(梯度:0-40%EtOAc)硅胶色谱得到79mg(55%)的2-(6-甲磺酰基-1-甲基-1H-吲唑-3-基)-5-(2-三甲基甲硅烷基-乙氧基甲基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-羧酸叔丁基酰胺,为浅棕色固体。
步骤5
2-(6-甲磺酰基-1-甲基-1H-吲唑-3-基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-羧酸叔丁基酰胺
在圆底烧瓶中,将2-(6-甲磺酰基-1-甲基-1H-吲唑-3-基)-5-(2-三甲基甲硅烷基-乙氧基甲基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-羧酸叔丁基酰胺(76mg,0.137mmol)溶解于二氯甲烷(0.7ml)并添加三氟乙酸(0.42ml,5.45mmol)。将反应混合物在室温搅拌2.5小时,然后浓缩。将残余物溶解于二氯甲烷(0.7ml)并添加乙二胺(0.55ml,8.14mmol)。将反应混合物在室温搅拌1小时,然后添加水和乙酸乙酯。将所得悬浮液经过滤,并经热水和乙酸乙酯洗涤。将收集的产物经高真空干燥得到39mg(67%)的2-(6-甲磺酰基-1-甲基-1H-吲唑-3-基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-羧酸叔丁基酰胺,为浅黄色粉末。MS:(2M+Na)+=875;1H NMR(DMSO-d6,300MHz):δ(ppm)12.89(宽单峰,1H),9.13(s,1H),8.71(d,J=8.3Hz,1H),8.46(s,1H),8.42(s,1H),7.92(s,1H),7.76(d,J=8.7Hz,1H),4.31(s,3H),3.35(s,3H),1.55(s,9H).
实施例271.
2-(6-氟-1-甲基-1H-吲唑-3-基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-羧酸(顺式-3-氨基-环丁基)-酰胺
步骤1
(顺式-3-{[2-(6-氟-1-甲基-1H-吲唑-3-基)-5-(2-三甲基甲硅烷基-乙氧基甲基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-羰基]-氨基}-环丁基)-氨基甲酸叔丁酯
向圆底烧瓶中装入2-(6-氟-1-甲基-1H-吲唑-3-基)-5-(2-三甲基甲硅烷基-乙氧基甲基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-羧酸(110mg,0.25mmol)和顺式-3-氨基环丁基氨基甲酸叔丁酯(65mg,0.35mmol)。然后添加DMF(1.2ml),接着添加N,N-二异丙基乙胺(0.12ml,0.69mmol)和HATU(104mg,0.27mmol)。将黄色反应混合物在室温搅拌过夜,然后添加水和石油醚。将悬浮液经过滤且将固体以水和少许石油醚洗涤。将收集的产物经高真空干燥得到145mg(95%)的(顺式-3-{[2-(6-氟-1-甲基-1H-吲唑-3-基)-5-(2-三甲基甲硅烷基-乙氧基甲基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-羰基]-氨基}-环丁基)-氨基甲酸叔丁酯,为灰白色粉末。
步骤2
2-(6-氟-1-甲基-1H-吲唑-3-基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-羧酸(顺式-3-氨基-环丁基)-酰胺
在圆底烧瓶中,将(顺式-3-{[2-(6-氟-1-甲基-1H-吲唑-3-基)-5-(2-三甲基甲硅烷基-乙氧基甲基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-羰基]-氨基}-环丁基)-氨基甲酸叔丁酯(144mg,0.236mmol)溶解于二氯甲烷(1.2ml)并添加三氟乙酸(0.73ml,9.48mmol)。将反应混合物在室温搅拌2小时,然后浓缩。将残余物悬浮于二氯甲烷(1.2ml)中并添加乙二胺(0.96ml,14.2mmol)。将浅黄色悬浮液在室温搅拌1小时,然后添加水和乙酸乙酯。将悬浮液经过滤并经热水和乙酸乙酯洗涤。将产物经高真空干燥得到86mg(91%)的2-(6-氟-1-甲基-1H-吲唑-3-基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-羧酸(顺式-3-氨基-环丁基)-酰胺,为浅黄色粉末。MS:(M+H)+=380;1H NMR(DMSO-d6,300MHz):δ(ppm)9.09(s,1H),8.54(dd,J=8.7,5.3Hz,1H),8.41(s,1H),8.28(d,J=7.6Hz,1H),7.71(dd,J=9.8,1.9Hz,1H),7.28(td,J=9.1,1.9Hz,1H),5.54(宽单峰,2H),4.15(s,3H),4.04-4.18(m,1H),3.07-3.22(m,1H),2.65-2.80(m,2H),1.66-1.80(m,2H).
实施例272.
2-(1-甲基-1,4,5,6,7,8-六氢环庚三烯并吡唑-3-基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-羧酸叔丁基酰胺
步骤1
2-[1-羟基-亚甲-(Z)-基]-环庚酮
于0℃氢化钠(60%在矿物油中的分散液,535mg,13.4mmol)在乙醚(25mL)中的悬浮液滴加乙醇(0.06ml,1.03mmol)。将灰色悬浮液于0℃搅拌20分钟。经10分钟滴加环庚酮(1.58ml,13.4mmol)和甲酸乙酯(1.63ml,20.1mmol)在乙醚(3mL)中的溶液。于0℃搅拌淡黄色非均相反应混合物1小时,然后温热至室温4小时。将反应混合物以乙醇(2mL)小心地淬灭然后添加水(25mL)。分离各层,且将水相以乙醚洗涤。将有机层搁置并稍后弃去。将水层以1M HCl酸化直到pH=2,然后以乙醚(2x)萃取。将合并的有机层经MgSO4干燥并浓缩得到1.41g(75%)的2-[1-羟基-亚甲-(Z)-基]-环庚酮,为黄色油状物。1H NMR(CDCl3,400MHz):δ(ppm)14.69(d,J=8.8Hz,1H),7.66(d,J=8.1Hz,1H),2.52-2.61(m,2H),2.23-2.32(m,2H),1.67-1.82(m,4H),1.58-1.67(m,2H).
步骤2
1,4,5,6,7,8-六氢环庚三烯并吡唑
于0℃向2-[1-羟基-亚甲-(Z)-基]-环庚酮(1.35g,9.63mmol)在MeOH(10mL)中的溶液中滴加肼(0.30mL,9.63mmol)。将黄色反应混合物在室温搅拌30分钟,然后浓缩。将残余物溶解于CH2Cl2,并以水洗涤。将有机层经MgSO4干燥并浓缩,得到1.24g(95%)的1,4,5,6,7,8-六氢环庚三烯并吡唑,为淡黄色固体。1H NMR(CDCl3,400MHz):δ(ppm)7.28(s,1H),2.75-2.82(m,2H),2.54-2.62(m,2H),1.80-1.91(m,2H),1.60-1.75(m,4H).
步骤3
3-碘-1,4,5,6,7,8-六氢环庚三烯并吡唑
室温向1,4,5,6,7,8-六氢环庚三烯并吡唑(500mg,3.67mmol)在DMF(8ml)中的溶液添加粉末氢氧化钾(618mg,11.0mmol)和碘(1.86g,7.34mmol)。将栗色反应混合物在室温搅拌1小时,然后以10%Na2S2O3水溶液淬灭,以水稀释,并以EtOAc(2x)萃取。将合并的有机物以水(3x)洗涤,经MgSO4干燥并浓缩。将残余物通过SiO2以20%至50%EtOAc/己烷色谱纯化得到600mg(62%)的3-碘-1,4,5,6,7,8-六氢环庚三烯并吡唑,为白色固体。1H NMR(CDCl3,400MHz):δ(ppm)2.75-2.84(m,2H),2.46-2.55(m,2H),1.80-1.91(m,2H),1.63-1.77(m,4H).
步骤4
3-碘-1-甲基-1,4,5,6,7,8-六氢环庚三烯并吡唑和3-碘-2-甲基-2,4,5,6,7,8-六氢环庚三烯并吡唑
于0℃向3-碘-1,4,5,6,7,8-六氢环庚三烯并吡唑(600mg,2.29mmol)在THF(8ml)中的溶液添加KOt-Bu(360mg,3.2mmol)。于0℃搅拌反应混合物30分钟,然后添加碘甲烷(0.20ml,3.2mmol)。于0℃继续搅拌30分钟,然后于室温搅拌2小时。将反应混合物以水淬灭并以EtOAc(2x)萃取。将有机物经MgSO4干燥并浓缩。将残余物吸收在SiO2上并以10%至20%EtOAc/己烷色谱纯化得到387mg(61%)的3-碘-1-甲基-1,4,5,6,7,8-六氢环庚三烯并吡唑,为无色油状物。1H NMR(CDCl3,300MHz):δ(ppm)3.77(s,3H),2.65-2.76(m,2H),2.43-2.54(m,2H),1.77-1.88(m,2H),1.59-1.76(m,4H)。还分离出200mg(32%)的极性更小的3-碘-2-甲基-2,4,5,6,7,8-六氢环庚三烯并吡唑,为白色固体。1H NMR(CDCl3,300MHz):δ(ppm)3.84(s,3H),2.70-2.79(m,2H),2.42-2.51(m,2H),1.77-1.88(m,2H),1.57-1.73(m,4H).
步骤5
1-甲基-3-三丁基甲锡烷基-1,4,5,6,7,8-六氢环庚三烯并吡唑
于-10℃(冰/丙酮)向3-碘-2-甲基-2,4,5,6,7,8-六氢环庚三烯并吡唑(180mg,0.62mmol)在THF(3mL)中的溶液缓慢地添加异丙基氯化镁(2.0M的THF溶液,0.37mL,0.74mmol)。于-10℃搅拌反应混合物30分钟,然后再添加异丙基氯化镁(2.0M的THF溶液,0.10mL,0.20mmol)。于-10℃继续搅拌20分钟,然后滴加三丁基氯甲锡烷(0.20mL,0.74mmol)。将反应混合物温热至室温并搅拌1小时,然后以水淬灭并以EtOAc(2x)萃取。将有机物经MgSO4干燥并浓缩。将残余物通过硅胶色谱以0%至10%EtOAc/己烷(0.5%Et3N固定在己烷中)纯化得到76mg(28%)的1-甲基-3-三丁基甲锡烷基-1,4,5,6,7,8-六氢环庚三烯并吡唑,为无色油状物。1H NMR(CDCl3,400MHz):δ(ppm)3.82(s,3H),2.66-2.76(m,2H),2.50-2.60(m,2H),1.80-1.89(m,2H),1.61-1.74(m,4H),1.51-1.61(m,6H),1.29-1.41(m,6H),1.04-1.12(m,6H),0.91(t,J=7.3Hz,9H).
步骤6
2-(1-甲基-1,4,5,6,7,8-六氢环庚三烯并吡唑-3-基)-5-(2-三甲基甲硅烷基-乙氧基甲基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-羧酸叔丁基酰胺
向1-甲基-3-三丁基甲锡烷基-1,4,5,6,7,8-六氢环庚三烯并吡唑(74mg,0.17mmol)和2-溴-5-(2-三甲基甲硅烷基-乙氧基甲基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-羧酸叔丁基酰胺(60mg,0.14mmol)在DMF(2mL)中的溶液添加Pd(PPh3)4(8mg,0.007mmol)和碘化亚铜(I)(5mg,0.028mmol)。于80℃加热反应混合物1.5小时,然后冷却至室温,以水淬灭并以EtOAc(2x)萃取。将合并的有机物以水(3x)和盐水洗涤,然后经MgSO4干燥并浓缩。将残余物吸收在SiO2上并以20%至50%EtOAc/己烷色谱纯化分离出42mg(60%)的2-(1-甲基-1,4,5,6,7,8-六氢环庚三烯并吡唑-3-基)-5-(2-三甲基甲硅烷基-乙氧基甲基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-羧酸叔丁基酰胺,为淡橙色-黄色固体。
步骤7
2-(1-甲基-1,4,5,6,7,8-六氢环庚三烯并吡唑-3-基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-羧酸叔丁基酰胺
向2-(1-甲基-1,4,5,6,7,8-六氢环庚三烯并吡唑-3-基)-5-(2-三甲基甲硅烷基-乙氧基甲基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-羧酸叔丁基酰胺(40mg,0.08mmol)在CH2Cl2(2mL)中的溶液添加TFA(1.0mL,13.0mmol)。将黄色反应混合物在室温搅拌3小时,然后浓缩。将残余物再溶解于CH2Cl2(2mL)并添加乙二胺(0.1mL,1.48mmol)。将反应混合物在室温搅拌0.5小时,然后浓缩且直接通过硅胶色谱以0%至3%MeOH/EtOAc纯化分离出20mg(68%)的2-(1-甲基-1,4,5,6,7,8-六氢环庚三烯并吡唑-3-基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-羧酸叔丁基酰胺,为灰白色固体。MS:(M+Na)+=389;1H NMR(DMSO-d6,300MHz):δ(ppm)12.63(宽单峰,1H),8.80(s,1H),8.27(s,1H),7.83(s,1H),3.81(s,3H),3.02-3.12(m,2H),2.74-2.83(m,2H),1.82(宽单峰,2H),1.57-1.73(m,4H),1.44(s,9H).
实施例273.
2-(5-羟基甲基-1-甲基-1H-吲唑-3-基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-羧酸叔丁基酰胺
步骤1
3-碘-1-甲基-1H-吲唑-5-羧酸甲酯
于0℃向3-碘-1H-吲唑-5-羧酸甲酯(1.0g,3.31mmol)在THF(12mL)中的溶液添加KOt-Bu(520mg,4.63mmol)。于0℃搅拌反应混合物30分钟,然后添加碘甲烷(0.29mL,4.63mmol)。于0℃搅拌30分钟,然后温热至室温并搅拌2小时。将反应混合物以水淬灭并以EtOAc(2x)然后以CH2Cl2(2x)萃取。将合并的有机物经MgSO4干燥并浓缩得到950mg的3-碘-1-甲基-1H-吲唑-5-羧酸甲酯,为淡黄色固体。NMR分析表明N1:N2烷基化区域异构体的8:1混合物。主要:1H NMR(CDCl3,300MHz):δ(ppm)8.25(s,1H),8.13(dd,J=8.7,1.5Hz,1H),7.39(d,J=8.7Hz,1H),4.13(s,3H),3.98(s,3H)。
步骤2
(3-碘-1-甲基-1H-吲唑-5-基)-甲醇
于0℃向3-碘-1-甲基-1H-吲唑-5-羧酸甲酯(0.95g,3.01mmol)在CH2Cl2(30mL)中的溶液缓慢地添加DIBAL-H(1.18mL,6.61mmol)。于0℃搅拌反应混合物1.5小时。小心地以MeOH(1mL)淬灭,然后以CH2Cl2(20mL)稀释并添加饱和Na+K+酒石酸盐水溶液(30mL)。在室温剧烈搅拌二相混合物1小时。分离各层,且将水相以CH2Cl2萃取。将合并的有机物以水洗涤,然后经MgSO4干燥并浓缩得到810mg的(3-碘-1-甲基-1H-吲唑-5-基)-甲醇,为黄色蜡状固体。
步骤3
5-(叔丁基-二甲基甲硅烷基氧基甲基)-3-碘-1-甲基-1H-吲唑
向(3-碘-1-甲基-1H-吲唑-5-基)-甲醇(810mg,2.81mmol)在DMF(9mL)中的溶液添加咪唑(479mg,7.03mmol),接着添加叔丁基二甲基甲硅烷基氯(466mg,3.09mmol)。将反应混合物在室温搅拌过夜,然后以水淬灭并以EtOAc(2x)萃取。将合并的有机物以水洗涤(3x)然后经MgSO4干燥并浓缩。将残余物通过硅胶色谱以10%EtOAc/己烷纯化得到732mg(65%)的5-(叔丁基-二甲基甲硅烷基氧基甲基)-3-碘-1-甲基-1H-吲唑,为淡黄色固体。1H NMR(CDCl3,300MHz):δ(ppm)7.26-7.34(m,2H),7.17-7.23(m,1H),4.73(s,2H),3.97(s,3H),0.84(s,9H),0.00(s,6H).
步骤4
5-(叔丁基-二甲基-甲硅烷基氧基甲基)-1-甲基-3-三丁基甲锡烷基-1H-吲唑
于-10℃(冰/丙酮)向5-(叔丁基-二甲基甲硅烷基氧基甲基)-3-碘-1-甲基-1H-吲唑(201mg,0.50mmol)在THF(3mL)中的溶液中添加异丙基氯化镁(2.0M的THF溶液)(0.30mL,0.60mmol)。于-10℃搅拌淡黄色反应混合物20分钟,然后添加三丁基氯甲锡烷(0.16mL,0.60mmol)。于-10℃继续搅拌30分钟,然后于室温搅拌1小时。将反应混合物以水淬灭并以EtOAc(2x)萃取。将合并的有机物经MgSO4干燥并浓缩得到5-(叔丁基-二甲基-甲硅烷基氧基甲基)-1-甲基-3-三丁基甲锡烷基-1H-吲唑,为几乎无色油状物,其不经进一步纯化即可使用。
步骤5
2-[5-(叔丁基-二甲基-甲硅烷基氧基甲基)-1-甲基-1H-吲唑-3-基]-5-(2-三甲基甲硅烷基-乙氧基甲基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-羧酸叔丁基酰胺
向5-(叔丁基-二甲基-甲硅烷基氧基甲基)-1-甲基-3-三丁基甲锡烷基-1H-吲唑(265mg,0.47mmol)和2-溴-5-(2-三甲基甲硅烷基-乙氧基甲基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-羧酸叔丁基酰胺(100mg,0.23mmol)在DMF(2mL)中的溶液中添加Pd(PPh3)4(14mg,0.012mmol)和碘化亚铜(I)(9mg,0.047mmol)。将反应混合物于90℃加热1小时,然后冷却至室温,以水淬灭并以EtOAc(2x)萃取。将合并的有机物以水(3x)和盐水洗涤,然后经MgSO4干燥并浓缩。将残余物吸收在硅胶上并以20%至50%EtOAc/己烷色谱纯化分离出106mg(73%)的2-[5-(叔丁基-二甲基-甲硅烷基氧基甲基)-1-甲基-1H-吲唑-3-基]-5-(2-三甲基甲硅烷基-乙氧基甲基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-羧酸叔丁基酰胺,为米色固体。
步骤6
2-(5-羟基甲基-1-甲基-1H-吲唑-3-基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-羧酸叔丁基酰胺
向2-[5-(叔丁基-二甲基-甲硅烷基氧基甲基)-1-甲基-1H-吲唑-3-基]-5-(2-三甲基甲硅烷基-乙氧基甲基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-羧酸叔丁基酰胺(106mg,0.17mmol)在THF(2mL)中的溶液中添加四丁基氟化铵(1.0M的THF溶液,1.7mL,1.7mmol)。将反应混合物在室温搅拌10分钟,然后在回流下加热2小时。冷却至室温后,将反应混合物以水淬灭并以EtOAc萃取,然后以5%MeOH/CH2Cl2萃取。将合并的有机层经MgSO4干燥并浓缩。将残余物以EtOAc/MeOH研磨且将固体经过收集得到30mg(47%)的2-(5-羟基甲基-1-甲基-1H-吲唑-3-基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-羧酸叔丁基酰胺,为浅黄色固体。MS:(M+Na)+=401;1H NMR(DMSO-d6,300MHz):δ(ppm)12.76(宽单峰,1H),9.04(s,1H),8.35(s,1H),8.31(s,1H),8.00(s,1H),7.71(d,J=8.7Hz,1H),7.48(d,J=8.7Hz,1H),5.20(t,J=5.5Hz,1H),4.64(d,J=5.3Hz,2H),4.16(s,3H),1.49(s,9H).
实施例274.
2-[5-二氟甲氧基-1-(1-甲基-1H-吡唑-4-基甲基)-1H-吲唑-3-基]-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-羧酸叔丁基酰胺
步骤1
(1-甲基-1H-吡唑-4-基)-甲醇
于0℃向1-甲基-1H-吡唑-4-羧酸(0.50g,3.96mmol)在THF(10mL)中的溶液添加三乙胺(61mL,4.36mmol),接着添加氯甲酸乙酯(0.42mL,4.36mmol)。于0℃搅拌该稠浆料15分钟,然后经由移液管小心地添加硼氢化钠(450mg,11.9mmol)在水(4mL)中的溶液。观察到剧烈地生成气体。将反应混合物在0℃搅拌30分钟,然后以水和饱和NH4Cl水溶液稀释并以EtOAc(3x)萃取。将合并的有机物经MgSO4干燥并浓缩。将残余物通过硅胶色谱以30%至80%EtOAc/己烷纯化分离出150mg(34%)的(1-甲基-1H-吡唑-4-基)-甲醇,为蜡状白色固体。1H NMR(CDCl3,300MHz):δ(ppm)7.69(s,1H),7.49(s,1H),4.59(s,2H),3.99(s,3H).
步骤2
甲磺酸1-甲基-1H-吡唑-4-基甲酯
于0℃向(1-甲基-1H-吡唑-4-基)甲醇(75mg,0.67mmol)在CH2Cl2(4mL)中的部分悬浮液添加三乙胺(0.19mL,1.34mmol),接着添加甲磺酰氯(57μL,0.74mmol)。于0℃搅拌该浑浊反应混合物1小时,然后以水淬灭并以CH2Cl2萃取。将有机物经MgSO4干燥并浓缩得到110mg的甲磺酸1-甲基-1H-吡唑-4-基甲酯,为无色油状物,其不经进一步纯化即可使用。
步骤3
2-[5-二氟甲氧基-1-(1-甲基-1H-吡唑-4-基甲基)-1H-吲唑-3-基]-5-(2-三甲基甲硅烷基-乙氧基甲基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-羧酸叔丁基酰胺
向甲磺酸1-甲基-1H-吡唑-4-基甲酯(108mg,0.57mmol)在DMF(2mL)中的溶液添加2-(5-二氟甲氧基-1H-吲唑-3-基)-5-(2-三甲基甲硅烷基-乙氧基甲基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-羧酸叔丁基酰胺(100mg,0.19mmol)和Cs2CO3(184mg,0.57mmol)。将亮黄色反应混合物于90℃加热2小时,然后冷却至室温,以水淬灭并以EtOAc(2x)萃取。将合并的有机物以水洗涤(3x),经MgSO4干燥并浓缩。将残余物以50%至100%EtOAc/己烷色谱纯化得到60mg(51%)的2-[5-二氟甲氧基-1-(1-甲基-1H-吡唑-4-基甲基)-1H-吲唑-3-基]-5-(2-三甲基甲硅烷基-乙氧基甲基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-羧酸叔丁基酰胺,为浅黄色固体。
步骤4
2-[5-二氟甲氧基-1-(1-甲基-1H-吡唑-4-基甲基)-1H-吲唑-3-基]-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-羧酸叔丁基酰胺
向2-[5-二氟甲氧基-1-(1-甲基-1H-吡唑-4-基甲基)-1H-吲唑-3-基]-5-(2-三甲基甲硅烷基-乙氧基甲基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-羧酸叔丁基酰胺(56mg,0.09mmol)在CH2Cl2(2mL)中的溶液添加三氟乙酸(0.5mL,6.5mmol)。将反应混合物在室温搅拌3小时,然后浓缩。将残余物溶解于CH2Cl2(2mL)中并添加乙二胺(0.2mL,2.96mmol。将反应混合物在室温搅拌30分钟,然后以水淬灭并以5%MeOH/CH2Cl2萃取。将有机物经MgSO4干燥并浓缩。将残余物以EtOAc/Et2O研磨且将产物经过滤收集得到29mg(65%)的2-[5-二氟甲氧基-1-(1-甲基-1H-吡唑-4-基甲基)-1H-吲唑-3-基]-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-羧酸叔丁基酰胺,为浅黄色固体。MS:(M+Na)+=517;1H NMR(DMSO-d6,300MHz):δ(ppm)12.62(宽单峰,1H),8.97(s,1H),8.26(s,1H),8.06(d,J=1.9Hz,1H),7.85(d,J=9.1Hz,1H),7.74(s,1H),7.65(s,1H),7.38(s,1H),7.27(dd,J=9.1,1.9Hz,1H),7.06(7,J=75Hz,1H),5.51(s,2H),3.19(s,6H),1.36(s,9H).
实施例275.
2-(5,6,7,8-四氢-咪唑并[1,5-a]吡啶-1-基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-羧酸叔丁基酰胺
步骤1
1-碘-咪唑并[1,5-a]吡啶
向咪唑并[1,5-a]吡啶(0.50g,4.23mmol)在EtOH(8mL)和水(4mL)中的溶液添加碳酸氢钠(1.07g,12.7mmol),接着添加碘(1.61g,6.35mmol)。将深栗色-棕色非均相反应混合物在室温搅拌过夜,然后以10%Na2S2O3水溶液淬灭,以水稀释并以EtOAc(3x)萃取。将合并的有机物以水洗涤,经MgSO4干燥并浓缩。将残余物通过硅胶色谱以20%至50%EtOAc/己烷纯化得到649mg(63%)的1-碘-咪唑并[1,5-a]吡啶,为浅棕色固体(光敏)。1H NMR(CDCl3,300MHz):δ(ppm)8.13(s,1H),7.92(d,J=6.8Hz,1H),7.33(d,J=9.4Hz,1H),6.80(dd,J=9.4,6.8Hz,1H),6.56-6.69(m,1H).
步骤2
1-三丁基甲锡烷基-咪唑并[1,5-a]吡啶
于-10℃(冰/丙酮)向1-碘-咪唑并[1,5-a]吡啶(150mg,0.62mmol)在THF(3mL)中的溶液添加异丙基氯化镁(2.0M的THF溶液,37mL,0.74mmol)。于-10℃搅拌反应混合物20分钟,然后添加三丁基氯甲锡烷(0.20mL,0.74mmol)。于-10℃将反应混合物搅拌30分钟,然后温热至室温并搅拌1小时。将反应混合物以水淬灭并以EtOAc(2x)萃取。将合并的有机物经MgSO4干燥并浓缩得到1-三丁基甲锡烷基-咪唑并[1,5-a]吡啶,为黄色油状物,其不经进一步纯化即可使用。
步骤3
2-咪唑并[1,5-a]吡啶-1-基-5-(2-三甲基甲硅烷基-乙氧基甲基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-羧酸叔丁基酰胺
向1-三丁基甲锡烷基-咪唑并[1,5-a]吡啶(250mg,0.61mmol)和2-溴-5-(2-三甲基甲硅烷基-乙氧基甲基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-羧酸叔丁基酰胺(150mg,0.35mmol)在DMF(2mL)中的溶液添加Pd(PPh3)4(20mg,0.018mmol)和碘化亚铜(I)(13mg,0.07mmol)。将反应混合物于90℃加热2小时,然后冷却至室温过夜。将反应混合物以水淬灭并以EtOAc(3x)萃取。将合并的有机物以水洗涤(3x)然后经MgSO4干燥并浓缩。将残余物以0%至3%MeOH/CH2Cl2(0.5%NH4OH)色谱纯化一次,然后以30%至60%EtOAc/己烷色谱纯化得到74mg(45%)的2-咪唑并[1,5-a]吡啶-1-基-5-(2-三甲基甲硅烷基-乙氧基甲基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-羧酸叔丁基酰胺,为亮黄色固体。1H NMR(CDCl3,300MHz):δ(ppm)9.35(s,1H),8.53(d,J=9.4Hz,1H),8.38(s,1H),8.32(s,1H),8.12(d,J=7.2Hz,1H),8.05(s,1H),6.99(dd,J=9.4,6.6Hz,1H),6.77-6.87(m,1H),5.74(s,2H),3.54-3.68(m,2H),1.67(s,9H),0.90-1.06(m,2H),0.00(s,9H).
步骤4
2-(5,6,7,8-四氢-咪唑并[1,5-a]吡啶-1-基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-羧酸叔丁基酰胺
向2-咪唑并[1,5-a]吡啶-1-基-5-(2-三甲基甲硅烷基-乙氧基甲基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-羧酸叔丁基酰胺(70mg,0.15mmol)在TFA(2mL)中的溶液添加氧化铂(IV)(7mg,0.03mmol)。氢气(气球)下搅拌反应混合物6小时,然后经硅藻土过滤,以CH2Cl2淋洗。浓缩滤液。将残余物溶解于CH2Cl2(3mL)并以乙二胺(0.4mL)处理。搅拌反应混合物1小时,然后以水淬灭并以CH2Cl2(2x)萃取。将合并的有机物经MgSO4干燥并浓缩。将残余物通过硅胶色谱以0%至3%MeOH/CH2Cl2(0.5%NH4OH)纯化。合并合适的馏分并浓缩得到黄色固体,其以Et2O研磨得到13mg(26%)的2-(5,6,7,8-四氢-咪唑并[1,5-a]吡啶-1-基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-羧酸叔丁基酰胺,为淡黄色固体。MS:(M+H)+=339;1H NMR(DMSO-d6,300MHz):δ(ppm)12.50(宽单峰,1H),8.96(s,1H),8.21(s,1H),7.75(s,1H),7.66(s,1H),4.06(t,J=5.9Hz,2H),3.21(t,J=6.2Hz,2H),1.76-1.98(m,4H),1.46(s,9H).
实施例276.
2-(6-氯-1-甲基-1H-吲唑-3-基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-羧酸(3-氨基-环己基)-酰胺(非对映异构体A)
步骤1
(3-{[2-(6-氯-1-甲基-1H-吲唑-3-基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-羰基]-氨基}-环己基)-氨基甲酸叔丁酯(非对映异构体A和非对映异构体B)
将(3-{[2-(6-氯-1-甲基-1H-吲唑-3-基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-羰基]-氨基}-环己基)-氨基甲酸叔丁酯(参见实施例442)的外消旋样品拆分成2份,各份由两种非对映异构体构成,通过使用Thar/Waters Multigram II SFC系统以Daicel AD柱3x25cm在70ml/分钟以30%MeOH/CO2和15mg堆叠注射于220nM以强制时间窗口收集进行洗脱。将非对应异构体对任意指定为反式(非对映异构体A,53mg,浅黄色固体,更为极性)和顺式(非对映异构体B,66mg,灰白色固体,更小极性)。
步骤2
2-(6-氯-1-甲基-1H-吲唑-3-基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-羧酸(3-氨基-环己基)-酰胺(非对映异构体A)
将(3-{[2-(6-氯-1-甲基-1H-吲唑-3-基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-羰基]-氨基}-环己基)-氨基甲酸叔丁酯(53mg,101μmol)的更为极性的非对映异构体A溶解于二氯甲烷(5mL)并以TFA(1.19g,803μL,10.4mmol)处理,浅黄色溶液变成亮红色-橙色溶液,室温继续搅拌18小时。蒸发溶剂且将残余物溶解于二氯甲烷/MeOH中,吸收至硅胶上并通过色谱(25g柱,50μm来自Thomson,0-10%MeOH,含10%氢氧化铵的二氯甲烷溶液,10min梯度)纯化得到灰白色固体,其在MeOH超声并静置促进完全形成固体。将固体通过倾析母液而分离并高真空干燥得到2-(6-氯-1-甲基-1H-吲唑-3-基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-羧酸(3-氨基-环己基)-酰胺(非对映异构体A)(27mg,63%),为灰白色固体。MS(M+H)+=424;1H NMR(DMSO-d6)δ:9.05(s,1H),8.38-8.49(m,2H),8.06(d,J=7.9Hz,1H),7.99(s,1H),7.33(d,J=10.2Hz,1H),4.16(s,3H),3.91(d,J=4.2Hz,1H),3.32(宽单峰,1H),3.15(s,1H),2.22(d,J=11.0Hz,1H),2.04(d,J=11.7Hz,1H),1.79(宽单峰,1H),0.98-1.24(m,3H).
实施例277.
2-(6-氯-1-甲基-1H-吲唑-3-基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-羧酸(3-氨基-环己基)-酰胺(非对映异构体B)
将分离自实施例276的(3-{[2-(6-氯-1-甲基-1H-吲唑-3-基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-羰基]-氨基}-环己基)-氨基甲酸叔丁酯(66mg,126μmol)的极性更小的非对映异构体B溶解于二氯甲烷(5mL)并以TFA(1.48g,1mL,13.0mmol)处理。室温18小时后,蒸发溶剂并将残余物溶解于二氯甲烷/MeOH中,吸收至硅胶上并通过色谱(25g柱,50μm来自Thomson,0~5%MeOH,含10%氢氧化铵)在二氯甲烷中,20min梯度)纯化得到灰白色残余物,其溶解于二氯甲烷(含数滴MeOH)。添加环己烷以促进固体形成。将沉淀通过倾析母液分离,并高真空干燥得到2-(6-氯-1-甲基-1H-吲唑-3-基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-羧酸(3-氨基-环己基)-酰胺(非对映异构体B)(18mg,33.7%),为白色固体。MS(M+H)+=424;1H NMR(DMSO-d6)δ:9.02(s,1H),8.42(s,1H),8.37(d,J=8.7Hz,1H),8.05(d,J=7.9Hz,1H),7.98(s,1H),7.30(d,J=10.2Hz,1H),4.36(宽单峰,1H),4.16(s,3H),3.33(宽单峰,1H),3.13(宽单峰,1H),2.54(宽单峰,1H),1.79(宽单峰,1H),1.59-1.71(m,2H),1.53(d,J=9.4Hz,1H),1.38(s,1H),1.32(s,1H).
实施例278.
N-异丙基-2-(1,5,5-三甲基-4,5,6,7-四氢-1H-吲唑-3-基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-甲酰胺
步骤1
2-溴-N-异丙基-5-((2-(三甲基甲硅烷基)乙氧基)甲基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-甲酰胺
将2-溴-5-((2-(三甲基甲硅烷基)乙氧基)甲基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-羧酸(1.12g,3.01mmol)和HATU(1.37g,3.61mmol)与DMF(5.2mL)混合然后经由注射器添加丙烷-2-胺(711mg,1.03mL,12.0mmol)。于25℃搅拌反应混合物。14小时后,添加水(50mL)且将混合物以EtOAc萃取(4x50mL)。将合并的有机物以水(30mL)、饱和氯化钠溶液(3x20mL)洗涤并以MgSO4干燥。蒸发溶剂且将残余物通过色谱(二氧化硅,0~30%EtOAc的己烷溶液,经15分钟)纯化得到2-溴-N-异丙基-5-((2-(三甲基甲硅烷基)乙氧基)甲基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-甲酰胺(1.17g,2.83mmol,94%),为白色固体。MS(M+Na)+=435;1H NMR(CDCl3)δ:8.41(s,1H),8.35(s,1H),7.72(d,J=4.9Hz,1H),5.65(s,2H),4.19-4.45(m,1H),3.41-3.69(m,2H),1.34(d,J=6.8Hz,6H),0.82-0.97(m,2H),-0.13-0.09(m,9H).
步骤2
N-异丙基-2-(1,5,5-三甲基-4,5,6,7-四氢-1H-吲唑-3-基)-5-((2-(三甲基甲硅烷基)乙氧基)甲基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-甲酰胺
在氩气下将2-溴-N-异丙基-5-((2-(三甲基甲硅烷基)乙氧基)甲基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-甲酰胺(124mg,301μmol)和1,5,5-三甲基-3-(三丁基甲锡烷基)-4,5,6,7-四氢-1H-吲唑(参见实施例13,219mg,483μmol.61)溶解于DMF(2.5mL),添加四(三苯基膦)钯(0)(17.4mg,15.0μmol)和CuI(5.39mg,60.2μmol,定量:0.20)并使用鼓泡氩气超声混合物5分钟。于90℃(油浴温度)搅拌反应混合物2.5小时。将反应混合物经高真空浓缩且将残余物经色谱(115g柱,50μm来自Analogix,0-70%EtOAc/己烷,30min梯度)纯化得到N-异丙基-2-(1,5,5-三甲基-4,5,6,7-四氢-1H-吲唑-3-基)-5-((2-(三甲基甲硅烷基)乙氧基)甲基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-甲酰胺(113mg,227μmol,76%),为浅黄色固体。MS(M+Na)+=497;1H NMR(CDCl3)δ:9.08(s,1H),8.28(s,1H),5.68(s,2H),4.38-4.56(m,1H),3.86(s,3H),3.50-3.59(m,2H),2.80(s,2H),2.65(t,J=6.4Hz,2H),1.69(t,J=6.6Hz,2H),1.36(d,J=6.8Hz,6H),1.07(s,6H),0.88-0.96(m,2H),-0.06(s,9H).
步骤3
N-异丙基-2-(1,5,5-三甲基-4,5,6,7-四氢-1H-吲唑-3-基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-甲酰胺
向N-异丙基-2-(1,5,5-三甲基-4,5,6,7-四氢-1H-吲唑-3-基)-5-((2-(三甲基甲硅烷基)乙氧基)甲基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-甲酰胺(113mg,227μmol)在二氯甲烷(3mL)中的溶液添加TFA(1.48g,1mL,13.0mmol)。于25℃搅拌反应混合物15小时,然后浓缩。将残余物再溶解于5mL的二氯甲烷/MeOH/氢氧化铵60:10:1的溶液;并于25℃搅拌3小时,然后蒸发成黄色固体。将固体溶解于二氯甲烷(含数滴MeOH)并通过色谱(40g,50μm粒径,Analogix,0~5%MeOH,含10%氢氧化铵的二氯甲烷溶液,15分钟)纯化。将纯产物再溶解于MeOH并静置形成固体。将固体通过倾析母液分离,然后干燥得到N-异丙基-2-(1,5,5-三甲基-4,5,6,7-四氢-1H-吲唑-3-基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-甲酰胺(60mg,164μmol,72%),为白色针状物。MS(M+H)+=367;1H NMR(300MHz,DMSO-d6)δppm12.47-12.74(m,1H),8.91(s,1H),8.31(s,1H),7.92(d,J=8.31Hz,1H),4.07-4.48(m,1H),3.78(s,3H),2.72(s,2H),2.64(t,J=6.42Hz,2H),1.60(t,J=6.42Hz,2H),1.26(d,J=6.42Hz,6H),1.01(s,6H).
实施例279.
N-异丙基-2-(1,6,6-三甲基-4,5,6,7-四氢-1H-吲唑-3-基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-甲酰胺
步骤1
N-异丙基-2-(1,6,6-三甲基-4,5,6,7-四氢-1H-吲唑-3-基)-5-((2-(三甲基甲硅烷基)乙氧基)甲基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-甲酰胺
在氩气下2-溴-N-异丙基-5-((2-(三甲基甲硅烷基)乙氧基)甲基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-甲酰胺(107mg,259μmol)和1,6,6-三甲基-3-(三丁基甲锡烷基)-4,5,6,7-四氢-1H-吲唑(参见实施例70,188mg,414μmol.6)溶解于DMF(2.5mL),添加四(三苯基膦)钯(0)(15.0mg,12.9μmol)和CuI(4.64mg,51.8μmol,定量:0.20),且使用鼓泡氩气超声混合物5分钟。于90℃(油浴温度)搅拌反应混合物2.5小时。将反应混合物经高真空浓缩并将残余物经色谱(二氧化硅,40g柱,50μm来自Analogix,0-50%EtOAc的己烷溶液,经15分钟)纯化得到N-异丙基-2-(1,6,6-三甲基-4,5,6,7-四氢-1H-吲唑-3-基)-5-((2-(三甲基甲硅烷基)乙氧基)甲基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-甲酰胺(90mg,181μmol,70.0%),为浅黄色固体且约75%纯度。MS(M+H)+=497.1;1H NMR(CDCl3)δ:9.10(s,1H),8.26(s,1H),8.18(d,J=7.9Hz,1H),5.68(s,2H),4.34-4.60(m,1H),3.82(s,3H),3.48-3.61(m,2H),3.03(t,J=6.2Hz,2H),2.41(s,2H),1.61(t,J=6.4Hz,2H),1.33(d,J=6.8Hz,6H),1.09(s,6H),0.83-0.97(m,2H),-0.06(s,9H)。NMR和LCMS显示杂质为在3-位置连接的四氢吲唑的二聚体(MW326.49)。
步骤5
N-异丙基-2-(1,6,6-三甲基-4,5,6,7-四氢-1H-吲唑-3-基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-甲酰胺
向N-异丙基-2-(1,6,6-三甲基-4,5,6,7-四氢-1H-吲唑-3-基)-5-((2-(三甲基甲硅烷基)乙氧基)甲基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-甲酰胺(90mg,181μmol)在二氯甲烷(3mL)中的溶液添加TFA(1.48g,1.00mL,13.0mmol)。于25℃搅拌反应混合物18小时,然后浓缩。将残余物再溶解于5mL的二氯甲烷/MeOH/氢氧化铵(60:10:1)的溶液并于25℃搅拌3小时,然后蒸发并通过色谱(40g,50μm粒径,Analogix,0~5%MeOH,含10%氢氧化铵在二氯甲烷中,15分钟梯度)纯化。将纯的产物悬浮于二氯甲烷和环己烷,并添加以促进固体形成。将固体通过倾析母液分离,然后干燥得到N-异丙基-2-(1,6,6-三甲基-4,5,6,7-四氢-1H-吲唑-3-基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-甲酰胺(54mg,147μmol,81.3%),为白色固体。MS(M+H)+=367;1H NMR(300MHz,DMSO-d6)δppm12.68(m,1H),8.91(s,1H),8.31(s,1H),8.04(d,J=8.31Hz,1H),4.17-4.26(m,1H),3.75(s,3H),2.92(t,J=6.42Hz,2H),1.52(t,J=6.42Hz,2H),1.37(s,2H),1.22(d,J=6.42Hz,6H),1.01(s,6H).
实施例280.
N-异丙基-2-(1,6,6-三甲基-4,5,6,7-四氢-1H-吲唑-3-基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-甲酰胺
步骤1
4-(3-氯-苯氧基)-2-甲基-1-硝基-苯
向3-氯-苯酚(1.65g,12.89mmol)在DMF(10mL)中的悬浮液中添加KOH(1.45g,25.78mmol)并于110℃混合物加热30分钟。将混合物冷却至25℃并添加4-氟-2-甲基-1-硝基-苯(0.5g,3.22mmol)。将该混合物然后加热至130℃且保持12小时。将反应混合物以10%NaOH溶液处理并以EtOAc萃取(3x25mL)。将有机相以盐水洗涤(3x5mL),经硫酸钠干燥并浓缩。将残余物通过柱色谱(二氧化硅,0.5%EtOAc的己烷溶液)纯化得到4-(3-氯-苯氧基)-2-甲基-1-硝基-苯(400mg,47%)。MS(M+H)+=263;1H NMR(CDCl3)δ:8.05(d,J=7.1Hz,1H),7.33(t,J=6.0Hz,1H),7.20(d,J=5.3Hz,1H),7.06(s,1H),7.03-6.85(m,3H),2.59(s,3H).
步骤2
4-(3-氯-苯氧基)-2-甲基-苯基胺
向4-(3-氯-苯氧基)-2-甲基-1-硝基-苯(0.56g,2.12mmol)在乙醇和水的搅拌溶液中添加铁(594mg,10.6mmol)和饱和氯化铵(569mg,10.6mmol。将该反应混合物然后加热至回流12小时。然后将其通过硅藻土过滤,然后以EtOAc萃取(3x15mL)。将EtOAc层以盐水洗涤,经硫酸钠干燥并浓缩。将其然后通过色谱(11%EtOAc的己烷溶液)纯化得到4-(3-氯-苯氧基)-2-甲基-苯基胺(0.43g,87%)。MS(M+H)+=234.1;1H NMR(CDCl3)δ:7.17(t,J=6.0Hz,1H),6.95(d,J=2.8Hz,1H),6.88–6.86(m,1H),6.82–6.71(m,2H),6.65(d,J=6.27Hz,1H).
步骤3
5-(3-氯-苯氧基)-1H-吲唑
将4-(3-氯-苯氧基)-2-甲基-苯基胺(0.87g,3.74mmol)溶解于氯仿中。然后经10分钟于0℃滴加Ac2O(0.878g,8.61mmol)并于25℃搅拌混合物1小时。将乙酸钾(110mg,1.12mmol)和亚硝酸叔丁酯(829mg,8.05mmol)添加至反应混合物,并于80℃加热混合物16小时。然后浓缩该混合物,并添加浓HBr,并于25℃搅拌混合物16小时。使用KOH溶液将混合物的pH值调节至pH7,且将所得混合物以EtOAc萃取(3x50mL)。将有机相以盐水洗涤(3x10mL),经硫酸钠干燥并浓缩。将残余物通过柱色谱(11%EtOAc的己烷溶液)纯化得到5-(3-氯-苯氧基)-1H-吲唑(152mg,17%)。MS(M+H)+=245;1H NMR(CDCl3)δ:8.03(s,1H),7.50(d,J=8.7Hz,1H),7.37(宽单峰,1H),7.21(d,J=6.18Hz,1H),7.16(dd,J=6.5,1.1Hz,1H);7.08(d,J=5.8Hz,1H),6.93(宽单峰,1H),6.86(d,J=6.0Hz,1H).
步骤4
5-(3-氯苯氧基)-3-碘-1H-吲唑
于25℃向5-(3-氯苯氧基)-1H-吲唑(152mg,621μmol)在DMF(2.36mL)中的溶液添加氢氧化钾(105mg,1.86mmol)和碘(237mg,932μmol)。于25℃搅拌反应混合物75分钟,然后以10%Na2S2O3淬灭并以水稀释。将混合物以EtOAc萃取(3x),然后将合并的有机物以水和盐水(2x)洗涤,经MgSO4干燥并浓缩得到淡黄色油状物,其经色谱(二氧化硅,115g,50μm来自Analogix,0~30%EtOAc的己烷溶液,15分钟)纯化得到5-(3-氯苯氧基)-3-碘-1H-吲唑(194mg,524μmol,84%),为灰白色固体。MS(M+H)+=370.8;1H NMR(CDCl3)δ:7.73(d,J=8.7Hz,1H),7.28(d,J=5.3Hz,1H),7.22-7.25(m,1H),7.17(d,J=1.9Hz,1H),7.08(dt,J=7.9,0.9Hz,1H),6.98(t,J=2.3Hz,1H),6.89(dd,J=8.3,2.3Hz,1H).
步骤5
5-(3-氯苯氧基)-3-碘-1-甲基-1H-吲唑
于0℃向5-(3-氯苯氧基)-3-碘-1H-吲唑(194mg,524μmol)在THF(5mL)中的溶液添加KOtBu(82.2mg,733μmol)并于0℃搅拌混合物30分钟。添加MeI(104mg,45.8μL,733μmol)。于0℃搅拌反应混合物30分钟,然后温热至25℃并搅拌1.5小时。将反应混合物以饱和氯化铵水溶液淬灭并以二氯甲烷萃取。将合并的有机物经MgSO4干燥并浓缩成澄清油状物,然后通过色谱(40g柱,50μm来自Analogix,0-20%EtOAc的己烷溶液,经20分钟)纯化得到期望的极性更小的5-(3-氯苯氧基)-3-碘-1-甲基-1H-吲唑(154mg,400μmol,77%),为澄清黄色油状物.MS(M+H)+=384.8;1H NMR(CDCl3)δ:7.38(d,J=9.1Hz,1H),7.17-7.29(m,2H),7.11(d,J=2.3Hz,1H),7.06(dt,J=7.9,0.9Hz,1H),6.94(t,J=2.3Hz,1H),6.86(dd,J=8.3,2.3Hz,1H),4.12(s,3H)。还得到区域异构体,5-(3-氯苯氧基)-3-碘-2-甲基-2H-吲唑(32mg,83.2μmol,16%),为澄清黄色油状物。
步骤6
5-(3-氯苯氧基)-1-甲基-3-(三丁基甲锡烷基)-1H-吲唑
将5-(3-氯苯氧基)-3-碘-1-甲基-1H-吲唑(0.154g,400μmol)溶解于THF(3.00mL)。将无色溶液冷却至-16℃(NaCl/冰浴)然后于-16℃滴加异丙基氯化镁(2M在THF中的溶液,224μL,448μmol)。于-16℃搅拌反应混合物20分钟,然后缓慢地添加三丁基氯甲锡烷(150mg,125μL,460μmol)。将反应混合物温热至25℃并搅拌1.5小时。将反应混合物以饱和氯化铵溶液淬灭,以二氯甲烷萃取,且将合并的有机物经MgSO4干燥并浓缩成黄色油状物。将残余物经高真空干燥得到5-(3-氯苯氧基)-1-甲基-3-(三丁基甲锡烷基)-1H-吲唑。该物质的质量大于期望产物的理论收率。认为该收率是定量的,并且该物质不经进一步纯化直接用于后续步骤。
步骤7
2-(5-(3-氯苯氧基)-1-甲基-1H-吲唑-3-基)-N-异丙基-5-((2-(三甲基甲硅烷基)乙氧基)甲基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-甲酰胺
于氩气下将2-溴-N-异丙基-5-((2-(三甲基甲硅烷基)乙氧基)甲基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-甲酰胺(103mg,250μmol)和5-(3-氯苯氧基)-1-甲基-3-(三丁基甲锡烷基)-1H-吲唑(219mg,400μmol.6)溶解于DMF(2.5mL),并添加四(三苯基膦)钯(0)(14.4mg,12.5μmol)和CuI(9.52mg,50.0μmol,定量:0.20)和以鼓泡氩气将混合物超声5分钟。于90℃(油浴温度)搅拌反应混合物2.5小时。将反应混合物经高真空浓缩,且将残余物经色谱(40g柱,50μm来自Analogix,0-50%,经30分钟)纯化得到2-(5-(3-氯苯氧基)-1-甲基-1H-吲唑-3-基)-N-异丙基-5-((2-(三甲基甲硅烷基)乙氧基)甲基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-甲酰胺(113mg,191μmol,77%),为浅黄色固体。1H NMR(CDCl3)δ:9.27(s,1H),8.32(s,1H),8.28(d,J=2.3Hz,1H),8.05(d,J=8.3Hz,1H),7.52(d,J=8.7Hz,1H),7.17-7.28(m,2H),6.97-7.06(m,1H),6.79-6.90(m,2H),5.71(s,2H),4.28-4.46(m,1H),4.23(s,3H),3.51-3.66(m,2H),1.22(d,J=6.4Hz,6H),0.85-1.03(m,2H),-0.04(s,9H).
步骤8
N-异丙基-2-(1,6,6-三甲基-4,5,6,7-四氢-1H-吲唑-3-基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-甲酰胺
向N-异丙基-2-(1,6,6-三甲基-4,5,6,7-四氢-1H-吲唑-3-基)-5-((2-(三甲基甲硅烷基)乙氧基)甲基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-甲酰胺(90mg,181μmol)在二氯甲烷(3mL)中的溶液添加TFA(1.48g,1.00mL,13.0mmol)。于25℃搅拌反应混合物过夜然后浓缩。将残余物再溶解于5mL的二氯甲烷/MeOH/氢氧化铵(60:10:1)的混合物中并于25℃搅拌3小时,然后蒸发成黄色固体,溶解于二氯甲烷(含数滴MeOH)并通过色谱(40g,50μm粒径,Analogix,0~5%MeOH,含10%氢氧化铵在二氯甲烷中的溶液)纯化。将纯的产物悬浮于二氯甲烷并添加环己烷以促进固体形成。将固体通过倾析母液分离,然后干燥得到N-异丙基-2-(1,6,6-三甲基-4,5,6,7-四氢-1H-吲唑-3-基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-甲酰胺(54mg,147μmol,81%),为白色固体。MS(M+H)+=461;1H NMR(DMSO-d6)δ:9.11(s,1H),8.37(s,1H),8.17(d,J=1.9Hz,1H),7.90(s,1H),7.87(s,1H),7.27-7.38(m,2H),7.06-7.15(m,1H),6.91(t,J=2.1Hz,1H),6.80-6.89(m,1H),4.20(s,3H),4.11(dq,J=13.9,6.8Hz,1H),1.06(d,J=6.4Hz,6H).
实施例281.
N-异丙基-2-(1-甲基-5-(三氟甲氧基)-1H-吲唑-3-基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-甲酰胺
步骤1
3-碘-5-(三氟甲氧基)-1H-吲唑
向5-(三氟甲氧基)-1H-吲唑-3-羧酸(0.2g,813μmol)和碳酸氢钠(225mg,104μL,2.68mmol)在二氯乙烷(2mL)和水(2.00mL)中的混合物以一份添加碘化钠(317mg,2.11mmol)和碘(268mg,1.06mmol)并于100℃(油浴温度)伴随剧烈搅拌加热混合物45分钟。冷却至25℃后,将混合物以二氯甲烷稀释,然后以10%Na2S2O3和饱和NaHCO3洗涤。将有机物干燥(MgSO4)并浓缩成灰白色固体,其溶解于二氯甲烷中,添加环己烷以促进固体形成,并静置。将固体通过过滤分离,并干燥得到3-碘-5-(三氟甲氧基)-1H-吲唑(178mg,543μmol,67%),为白色针状物。MS(M-H)-=326.8;1H NMR(CDCl3)δ:7.51(d,J=9.1Hz,1H),7.40(s,1H),7.32-7.38(m,1H).
步骤2
3-碘-1-甲基-5-(三氟甲氧基)-1H-吲唑
于0℃向3-碘-5-(三氟甲氧基)-1H-吲唑(178mg,543μmol)在THF(5mL)中的溶液添加KOtBu(85.2mg,760μmol)并于0℃搅拌混合物30分钟,然后添加MeI(108mg,47.5μL,760μmol)。于0℃搅拌反应混合物30分钟,然后温热至25℃并搅拌1.5小时。将反应混合物以饱和氯化铵水溶液淬灭并以二氯甲烷萃取(3x30mL)。将合并的有机物经MgSO4干燥并浓缩成澄清油状物。通过色谱(40g柱,50μm来自Analogix,0-20%EtOAc的己烷溶液,经20分钟)纯化得到3-碘-1-甲基-5-(三氟甲氧基)-1H-吲唑(141mg,412μmol,76%),为白色固体。MS(M+H)+=342.8;1H NMR(CDCl3)δ:7.36-7.43(m,1H),7.23-7.36(m,2H),4.12(s,3H);LCMS ESI+TIC MS显示100%纯度,[M+H]+=342.8。还得到区域异构体,3-碘-2-甲基-5-(三氟甲氧基)-2H-吲唑,(29mg,84.8μmol,16%),为蜡状灰白色固体。
步骤3
1-甲基-3-(三丁基甲锡烷基)-5-(三氟甲氧基)-1H-吲唑
将3-碘-1-甲基-5-(三氟甲氧基)-1H-吲唑(0.141g,412μmol)溶解于THF(3.00mL)中。将无色溶液冷却至-16℃(NaCl/冰浴),然后于-16℃滴加异丙基氯化镁2M在THF(231μL,462μmol)中。于-16℃搅拌反应混合物20分钟。缓慢地添加三丁基氯甲锡烷(154mg,129μL,474μmol)。将反应混合物温热至25℃并搅拌1.5小时。将反应混合物以饱和氯化铵溶液淬灭,以二氯甲烷(3x30mL)萃取,将有机物经MgSO4干燥并浓缩成黄色油状物。将残余物经高真空干燥并不经进一步纯化用于后续步骤。
步骤4
N-异丙基-2-(1-甲基-5-(三氟甲氧基)-1H-吲唑-3-基)-5-((2-(三甲基甲硅烷基)乙氧基)甲基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-甲酰胺
在25mL圆底烧瓶中,将2-溴-N-异丙基-5-((2-(三甲基甲硅烷基)乙氧基)甲基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-甲酰胺(107mg,258μmol)和1-甲基-3-(三丁基甲锡烷基)-5-(三氟甲氧基)-1H-吲唑(209mg,413μmol)在氩气下溶解于DMF(2.5mL)中,添加四(三苯基膦)钯(0)(14.9mg,12.9μmol)和CuI(9.83mg,51.6μmol,定量:0.20)且伴随鼓泡氩气将超声混合物5分钟。于90℃(油浴温度)搅拌反应混合物2.5小时。将反应混合物经高真空浓缩并将残余物经色谱(40g柱,50μm来自Analogix,0-50%EtOAc的己烷溶液,经30分钟)纯化得到N-异丙基-2-(1-甲基-5-(三氟甲氧基)-1H-吲唑-3-基)-5-((2-(三甲基甲硅烷基)乙氧基)甲基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-甲酰胺(113mg,206μmol,80%),为浅黄色固体。MS(M+H)+=549;1H NMR(CDCl3)δ:9.23(s,1H),8.35(s,2H),8.01(d,J=7.9Hz,1H),7.44-7.53(m,1H),7.34-7.43(m,1H),5.70(s,2H),4.38-4.56(m,1H),4.19(s,3H),3.52-3.64(m,2H),1.42(d,J=6.4Hz,6H),0.84-1.00(m,2H),-0.05(s,9H).
步骤5
N-异丙基-2-(1-甲基-5-(三氟甲氧基)-1H-吲唑-3-基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-甲酰胺
向N-异丙基-2-(1-甲基-5-(三氟甲氧基)-1H-吲唑-3-基)-5-((2-(三甲基甲硅烷基)乙氧基)甲基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-甲酰胺(113mg,206μmol)在二氯甲烷(5mL)中的略黄色澄清溶液添加TFA(1.48g,1.00mL,13.0mmol),搅拌反应混合物过夜然后浓缩。将残余物再溶解于5mL的二氯甲烷/MeOH/氢氧化铵(60:10:1)的溶液并于25℃搅拌3小时,然后蒸发成浅黄色固体,溶解于二氯甲烷(含数滴MeOH)并通过色谱(40g柱,50μm来自Analogix,0~5%MeOH,含10%氢氧化铵)/二氯甲烷)纯化。将纯的产物悬浮于二氯甲烷并添加环己烷以促进固体形成,然后将固体通过过滤分离,并干燥得到N-异丙基-2-(1-甲基-5-(三氟甲氧基)-1H-吲唑-3-基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-甲酰胺(78mg,186μmol,91%),为白色固体。MS(M+H)+=419;1H NMR(DMSO-d6)δ:12.86(宽单峰,1H),9.12(s,1H),8.42(s,1H),8.34(s,1H),7.88-7.97(m,2H),7.56(d,J=9.1Hz,1H),4.14-4.36(m,4H),1.30(d,J=6.4Hz,6H).
实施例282.
N-异丙基-2-(1-甲基-1,4,5,6-四氢环戊二烯并[c]吡唑-3-基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-甲酰胺
步骤1
3-碘-1,4,5,6-四氢环戊二烯并[c]吡唑
向1,4,5,6-四氢环戊二烯并[c]吡唑-3-羧酸(0.5g,3.29mmol)和碳酸氢钠(911mg,422μL,10.8mmol)在二氯乙烷(5mL)和水(5mL)中的混合物以一份添加碘化钠(1.28g,8.54mmol)和碘(1.08g,4.27mmol),并伴随剧烈搅拌将混合物加热至100℃(油浴温度)且保持24小时。冷却至25℃后,将混合物以二氯甲烷稀释然后以10%Na2S2O3和饱和NaHCO3洗涤。合并有机相,干燥(MgSO4)并浓缩成黄色固体,其溶解于二氯甲烷中,添加环己烷以促进固体形成并静置。将固体通过过滤分离,并干燥得到3-碘-1,4,5,6-四氢环戊二烯并[c]吡唑(580mg,2.48mmol,75%),为针状物。MS(M+H)+=234.9;1H NMR(CDCl3)δ:2.71-2.99(m,31H),2.39-2.66(m,4H).
步骤2
3-碘-1-甲基-1,4,5,6-四氢环戊二烯并[c]吡唑
于0℃向3-碘-1,4,5,6-四氢环戊二烯并[c]吡唑(305mg,1.3mmol)在THF(8.51mL)中的溶液添加KOtBu1M在THF(1.82mL,1.82mmol)中,并于0℃搅拌混合物30分钟,其变为淡黄色溶液,然后添加MeI(259mg,114μL,1.82mmol)。于0℃搅拌反应混合物30分钟,然后温热至25℃并搅拌1.5小时。将反应混合物以饱和氯化铵水溶液淬灭并以二氯甲烷萃取(3x30mL),将有机物经MgSO4干燥并浓缩成澄清油状物。然后溶解于甲苯并通过色谱(40g柱,50μm来自Analogix,0-20%EtOAc的己烷溶液,经20分钟)纯化得到更为极性的期望的3-碘-1-甲基-1,4,5,6-四氢环戊二烯并[c]吡唑(177mg,714μmol,55%),为白色固体。MS(M+H)+=249;1H NMR(CDCl3)δ:3.78(s,30H),2.68-2.79(m,20H),2.51-2.58(m,4H)。还得到区域异构体产物,3-碘-2-甲基-2,4,5,6-四氢环戊二烯并[c]吡唑,(125mg,504μmol,39%),为白色固体。
步骤3
1-甲基-3-(三丁基甲锡烷基)-1,4,5,6-四氢环戊二烯并[c]吡唑
将3-碘-1-甲基-1,4,5,6-四氢环戊二烯并[c]吡唑(177mg,714μmol)溶解于THF(3mL)。将无色溶液冷却至-16℃(NaCl/冰浴)。于-16℃滴加异丙基氯化镁2M的THF溶液(400μL,799μmol)。于-16℃搅拌反应混合物20分钟。然后,缓慢地添加三丁基氯甲锡烷(267mg,223μL,821μmol)。将反应混合物温热至25℃并搅拌1.5小时。将反应混合物以饱和氯化铵溶液淬灭,然后以EtOAc萃取(3x30mL),将合并的有机物以水(20mL)、盐水(2x20mL)洗涤,经MgSO4干燥并浓缩。将残余物经高真空干燥得到1-甲基-3-(三丁基甲锡烷基)-1,4,5,6-四氢环戊二烯并[c]吡唑,其不经进一步处理用于后续步骤。
步骤4
N-异丙基-2-(1-甲基-1,4,5,6-四氢环戊二烯并[c]吡唑-3-基)-5-((2-(三甲基甲硅烷基)乙氧基)甲基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-甲酰胺
将2-溴-N-异丙基-5-((2-(三甲基甲硅烷基)乙氧基)甲基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-甲酰胺(184mg,446μmol)和1-甲基-3-(三丁基甲锡烷基)-1,4,5,6-四氢环戊二烯并[c]吡唑(293mg,714μmol)在氩气下溶解于DMF(2.5mL),添加四(三苯基膦)钯(0)(25.8mg,22.3μmol)和CuI(17.0mg,89.2μmol)并伴随鼓泡氩气超声混合物5分钟。于90℃(油浴温度)搅拌反应混合物2.5小时。将反应混合物经高真空浓缩,并将残余物经色谱(40g柱,50μm来自Analogix,0-50%EtOAc的己烷溶液,经30分钟)纯化得到N-异丙基-2-(1-甲基-1,4,5,6-四氢环戊二烯并[c]吡唑-3-基)-5-((2-(三甲基甲硅烷基)乙氧基)甲基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-甲酰胺(68mg,150μmol,34%),为浅黄色固体。MS(M+Na)+=477;1H NMR(CDCl3)δ:9.06(s,1H),8.28(s,1H),8.13(d,J=8.3Hz,1H),5.68(s,2H),4.44(dq,J=14.5,6.6Hz,1H),3.89(s,3H),3.47-3.64(m,2H),3.04(t,J=7.0Hz,2H),2.62-2.86(m,4H),1.34(d,J=6.8Hz,6H),0.86-0.96(m,2H),-0.06(s,9H).
步骤5
N-异丙基-2-(1-甲基-1,4,5,6-四氢环戊二烯并[c]吡唑-3-基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-甲酰胺
向N-异丙基-2-(1-甲基-1,4,5,6-四氢环戊二烯并[c]吡唑-3-基)-5-((2-(三甲基甲硅烷基)乙氧基)甲基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-甲酰胺(68mg,150μmol)在二氯甲烷(5mL)中的溶液添加TFA(1.48g,1.00mL,13.0mmol)并搅拌反应混合物15小时,然后浓缩。将残余物再溶解于5mL的二氯甲烷/MeOH/氢氧化铵(60:10:1)的溶液并于25℃搅拌3小时,然后蒸发并通过色谱(40g柱,50μm来自Analogix,0~5%MeOH,含10%氢氧化铵在二氯甲烷中的溶液)纯化。将纯的产物悬浮于二氯甲烷并添加环己烷以促进固体形成,其通过倾析分离,并高真空干燥得到N-异丙基-2-(1-甲基-1,4,5,6-四氢环戊二烯并[c]吡唑-3-基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-甲酰胺(45mg,139μmol,93%),为白色固体。MS(M+H)+=325;1H NMR(DMSO-d6)δ:12.68(宽单峰,1H),8.87(s,1H),8.31(s,1H),8.00(d,J=7.9Hz,1H),4.02-4.46(m,1H),3.79(s,3H),2.92(t,J=6.4Hz,2H),2.73(t,J=6.4Hz,2H),2.60(t,J=6.4Hz,2H),1.24(d,J=6.4Hz,6H).
实施例283.
2-(5-(二氟甲氧基)-1-甲基-1H-吲唑-3-基)-N-异丙基-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-甲酰胺
步骤1
5-(二氟甲氧基)-3-碘-1H-吲唑
向5-(二氟甲氧基)-1H-吲唑-3-羧酸(1g,4.38mmol)和碳酸氢钠(1.22g,563μL,14.5mmol)在二氯乙烷(10.0mL)和水(10.0mL)中的混合物以一份添加碘化钠(1.71g,11.4mmol)和碘(1.45g,5.7mmol),并伴随剧烈搅拌将混合物加热至100℃(油浴温度)且保持45分钟。冷却至25℃后,将混合物以二氯甲烷稀释然后以10%Na2S2O3和饱和NaHCO3洗涤。合并有机相,干燥(MgSO4)并浓缩成灰白色固体,其溶解于二氯甲烷,添加己烷以促进固体形成并静置。将形成的固体通过倾析母液分离,并干燥得到5-(二氟甲氧基)-3-碘-1H-吲唑(1145mg,3.69mmol,84.3%),为白色蓬松固体。MS(M-H)-=308.9;1H NMR(CDCl3)δ:7.52(d,J=9.1Hz,1H),7.28-7.36(m,1H),6.57(t,J=73.7Hz,1H).
步骤2
5-(二氟甲氧基)-3-碘-1-甲基-1H-吲唑
于0℃向5-(二氟甲氧基)-3-碘-1H-吲唑(562mg,1.81mmol)在THF(10.00mL)中的溶液添加KOtBu(1M在THF中,2.54mL,2.54mmol)并于0℃搅拌混合物30分钟,然后添加MeI(360mg,159μL,2.54mmol)。于0℃搅拌反应混合物30分钟,然后温热至25℃并搅拌1.5小时。将反应混合物以饱和氯化铵水溶液淬灭并以二氯甲烷萃取(3x30mL),将有机物经MgSO4干燥并浓缩成澄清油状物。通过色谱(80g柱,50μm来自Analogix,0-20%EtOAc的己烷溶液,经20分钟)纯化得到5-(二氟甲氧基)-3-碘-1-甲基-1H-吲唑(465mg,1.43mmol,79.2%),为蜡状灰白色固体。MS(M+H)+=324.9;1H NMR(CDCl3)δ:7.32-7.40(m,1H),7.24-7.30(m,1H),7.21(d,J=2.3Hz,1H),6.55(t,J=73.7Hz,1H),4.10(s,3H)。还得到区域异构体产物,5-(二氟甲氧基)-3-碘-2-甲基-2H-吲唑(108mg,333μmol,18%),为白色固体。
步骤3
5-(二氟甲氧基)-1-甲基-3-(三丁基甲锡烷基)-1H-吲唑
将5-(二氟甲氧基)-3-碘-1-甲基-1H-吲唑(0.265g,818μmol)溶解于THF(3.00mL)中。将无色溶液冷却至-16℃(NaCl/冰浴)然后于-16℃滴加异丙基氯化镁(2M在THF中,458μL,916μmol)。于-16℃搅拌反应混合物20分钟,然后缓慢地添加三丁基氯甲锡烷(306mg,255μL,940μmol)。将反应混合物温热至25℃并搅拌1.5小时。将反应混合物以饱和氯化铵溶液淬灭,以二氯甲烷(3x30mL)萃取,将有机物经MgSO4干燥并浓缩成黄色油状物。将残余物经高真空干燥且不经进一步纯化即可在下一步中使用。
步骤4
2-(5-(二氟甲氧基)-1-甲基-1H-吲唑-3-基)-5-((2-(三甲基甲硅烷基)乙氧基)甲基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-甲醛
将2-溴-5-((2-(三甲基甲硅烷基)乙氧基)甲基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-甲醛(224mg,629μmol)和5-(二氟甲氧基)-1-甲基-3-(三丁基甲锡烷基)-1H-吲唑(398mg,818μmol.30)在氩气下溶解于DMF(3mL)中,并添加四(三苯基膦)钯(0)(36.3mg,31.4μmol)和CuI(24.0mg,126μmol,定量:0.20)且伴随鼓泡氩气超声混合物5分钟。于90℃(油浴温度)搅拌反应混合物2.5小时。将反应混合物经高真空浓缩且将残余物经色谱(80g柱,50μm来自Analogix,0-50%EtOAc的己烷溶液,经30分钟)纯化得到2-(5-(二氟甲氧基)-1-甲基-1H-吲唑-3-基)-5-((2-(三甲基甲硅烷基)乙氧基)甲基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-甲醛(217mg,458μmol,72.9%),为浅棕色固体。MS(M+H)+=474;1H NMR(CDCl3)δ:10.51(宽单峰,1H),9.29(s,1H),8.61(s,1H),8.30(s,1H),7.38-7.52(m,1H),7.27-7.36(m,1H),6.69(t,J=74.8Hz,1H),5.76(s,2H),4.20(s,3H),3.56-3.70(m,2H),0.91-1.02(m,2H),-0.08-0.06(m,9H).
步骤5
2-(5-(二氟甲氧基)-1-甲基-1H-吲唑-3-基)-5-((2-(三甲基甲硅烷基)乙氧基)甲基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-羧酸
于0℃向2-(5-(二氟甲氧基)-1-甲基-1H-吲唑-3-基)-5-((2-(三甲基甲硅烷基)乙氧基)甲基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-甲醛(217mg,458μmol)在二噁烷(6.5mL)和水(2mL)中的溶液添加氨基磺酸(267mg,2.75mmol),接着经由滴液漏斗经15分钟滴加亚氯酸钠(67.3mg,596μmol)和KH2PO4(748mg,5.5mmol)在水(4.5mL)中的溶液。移去冰浴且于25℃搅拌浅黄色悬浮液18小时。将THF(6.5mL)添加至黄色的悬浮液且于25℃继续反应2小时,然后添加氨基磺酸(267mg,2.75mmol),接着滴加亚氯酸钠(67.3mg,596μmol)和KH2PO4(748mg,5.5mmol)(在5mL的水中)。2小时后,将混合物以水(20mL)稀释,并以二氯甲烷萃取(3x30mL)。将合并的有机层干燥(MgSO4)并蒸发。将浅黄色固体残余物溶解于二氯甲烷/MeOH并蒸发二氯甲烷以促进固体形成,将固体通过过滤分离,以MeOH和己烷淋洗然后干燥得到2-(5-(二氟甲氧基)-1-甲基-1H-吲唑-3-基)-5-((2-(三甲基甲硅烷基)乙氧基)甲基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-羧酸(127mg,259μmol,57%),为浅黄色固体。MS(M+H)+=490;1H NMR(DMSO-d6)δ:12.57(宽单峰,1H),9.12(s,1H),8.69(s,1H),8.65(d,J=2.3Hz,1H),7.80(d,J=9.1Hz,1H),7.35(dd,J=8.9,2.5Hz,1H),7.20(t,J=74.8Hz,1H),5.71(s,2H),4.18(s,3H),3.58(t,J=7.9Hz,2H),0.84(t,J=7.9Hz,2H),-0.21--0.01(s,9H).
步骤6
2-(5-(二氟甲氧基)-1-甲基-1H-吲唑-3-基)-N-异丙基-5-((2-(三甲基甲硅烷基)乙氧基)甲基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-甲酰胺
在16x100mm螺旋盖试管中,添加HATU(28.0mg,73.5μmol.20)和丙烷-2-胺(14.5mg,21.0μL,245μmol)然后添加2-(5-(二氟甲氧基)-1-甲基-1H-吲唑-3-基)-5-((2-(三甲基甲硅烷基)乙氧基)甲基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-羧酸(30mg,61.3μmol)和DMF(2mL)。于25℃搅拌反应混合物15小时。添加丙烷-2-胺(14.5mg,21.0μL,245μmol)和HATU(28.0mg,73.5μmol)。3小时后,蒸发溶剂且将残余物通过色谱(球形硅胶,20-45μm,23g,Versaflash Supelco,0~50%EtOAc的己烷溶液,经30分钟)纯化得到2-(5-(二氟甲氧基)-1-甲基-1H-吲唑-3-基)-N-异丙基-5-((2-(三甲基甲硅烷基)乙氧基)甲基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-甲酰胺(32.5mg,61.3μmol,100%),为浅黄色固体。MS(M+Na)+=553.1;1H NMR(CDCl3)δ:9.25(s,1H),8.40(s,1H),8.27(d,J=2.3Hz,1H),8.20(d,J=7.6Hz,1H),7.45-7.53(m,1H),7.36(dd,J=8.9,2.1Hz,1H),6.53(t,J=74.0Hz,1H),5.73(s,2H),4.38-4.59(m,1H),4.21(s,3H),3.55-3.64(m,2H),1.42(d,J=6.4Hz,6H),0.88-1.03(m,2H),-0.04(s,9H).
步骤7
2-(5-(二氟甲氧基)-1-甲基-1H-吲唑-3-基)-N-异丙基-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-甲酰胺
向2-(5-(二氟甲氧基)-1-甲基-1H-吲唑-3-基)-N-异丙基-5-((2-(三甲基甲硅烷基)乙氧基)甲基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-甲酰胺(32.5mg,61.2μmol)在二氯甲烷(1.44mL)中的淡黄色溶液添加TFA(426mg,288μL,3.73mmol)并于25℃搅拌15小时。将混合物经浓缩然后再溶解于二氯甲烷/MeOH/氢氧化铵(60:10:1)的5mL的溶液并于25℃搅拌3小时,然后蒸发成灰白色固体,其经色谱(球形硅胶,20-45μm,23g,Versaflash Supelco,0~5%MeOH,含10%氢氧化铵,在二氯甲烷中)纯化。将纯的产物溶解于二氯甲烷/MeOH并蒸发二氯甲烷形成固体,然后将固体通过过滤收集并干燥得到2-(5-(二氟甲氧基)-1-甲基-1H-吲唑-3-基)-N-异丙基-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-甲酰胺(23mg,57.4μmol,94%),为浅黄色固体。MS(M+H)+=401;1H NMR(DMSO-d6)δ:12.83(宽单峰,1H),9.10(s,1H),8.41(s,1H),8.20(d,J=2.3Hz,1H),7.96(d,J=7.9Hz,1H),7.86(d,J=9.4Hz,1H),7.42(dd,J=9.1,1.9Hz,1H),7.21(t,J=74.4Hz,1H),4.12-4.33(m,4H),2.49(s,9H),1.30(d,J=6.4Hz,6H).
实施例284.
2-(5-二氟甲氧基-1-甲基-1H-吲唑-3-基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-羧酸叔丁基酰胺
步骤1
N-叔丁基-2-(5-(二氟甲氧基)-1-甲基-1H-吲唑-3-基)-5-((2-(三甲基甲硅烷基)乙氧基)甲基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-甲酰胺
在16x100mm螺旋盖试管中,添加HATU(28.0mg,73.5μmol.20)和2-甲基丙烷-2-胺(17.9mg,245μmol),然后添加2-(5-(二氟甲氧基)-1-甲基-1H-吲唑-3-基)-5-((2-(三甲基甲硅烷基)乙氧基)甲基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-羧酸(30mg,61.3μmol)(溶解于DMF(2.00mL)中),得到浅黄色溶液,其立即形成白色沉淀。于25℃搅拌反应混合物过夜。TLC和LCMS显示不完全的反应,添加2-甲基丙烷-2-胺(17.9mg,245μmol)和HATU(28.0mg,73.5μmol.20),然后于25℃继续反应3小时。将溶剂蒸发且将残余物通过色谱(球形硅胶20-45μm,23g,Versaflash Supelco)纯化(以0~50%EtOAc的己烷溶液洗脱,经30分钟),得到N-叔丁基-2-(5-(二氟甲氧基)-1-甲基-1H-吲唑-3-基)-5-((2-(三甲基甲硅烷基)乙氧基)甲基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-甲酰胺(33.4mg,61.3μmol,100%),为灰白色固体。1H NMR(CDCl3)δ:9.21(s,1H),8.35(s,1H),8.29(d,J=2.3Hz,1H),8.04(s,1H),7.44-7.53(m,1H),7.30-7.38(m,1H),7.27(s,2H),6.39(t,J=74.0Hz,1H),5.72(s,2H),4.21(s,3H),3.50-3.65(m,2H),1.61(s,9H),0.86-1.07(m,2H),-0.04(s,9H).
步骤2.
2-(5-二氟甲氧基-1-甲基-1H-吲唑-3-基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-羧酸叔丁基酰胺
向N-叔丁基-2-(5-(二氟甲氧基)-1-甲基-1H-吲唑-3-基)-5-((2-(三甲基甲硅烷基)乙氧基)甲基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-甲酰胺(33.4mg,61.3μmol)在二氯甲烷(1.44mL)中的淡黄色溶液中添加TFA(426mg,288μL,3.74mmol,61当量)。反应混合物变橙色并于25℃搅拌过夜然后浓缩。将残余物再溶解于5mL的溶液(二氯甲烷/MeOH/氢氧化铵;60:10:1)并于25℃搅拌3小时,然后蒸发成浅黄色固体,溶解于二氯甲烷(含数滴MeOH)并通过色谱(球形硅胶20-45μm,23g,Versaflash Supelco)纯化(以0~5%,经15分钟(MeOH,含10%氢氧化铵)/二氯甲烷洗脱)。将纯产物溶解在二氯甲烷/MeOH中并蒸发二氯甲烷形成固体,将固体通过过滤分离,并干燥得到N-叔丁基-2-(5-(二氟甲氧基)-1-甲基-1H-吲唑-3-基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-甲酰胺(23mg,55.5μmol,90.5%),为灰白色固体。MS(M+H)+=415;1H NMR(DMSO-d6)δ:12.80(宽单峰,1H),9.06(s,1H),8.37(s,1H),8.20(d,J=1.9Hz,1H),7.85(d,J=8.7Hz,2H),7.40(dd,J=8.9,2.1Hz,1H),7.19(t,J=74.4Hz,,1H),4.19(s,3H),1.49(s,9H).
实施例285.
2-(5-二氟甲氧基-1-甲基-1H-吲唑-3-基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-羧酸(2-羟基-1,1-二甲基-乙基)-酰胺
步骤1.
2-(5-(二氟甲氧基)-1-甲基-1H-吲唑-3-基)-N-(1-羟基-2-甲基丙烷-2-基)-5-((2-(三甲基甲硅烷基)乙氧基)甲基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-甲酰胺
在16x100mm螺旋盖试管中添加HATU(28.0mg,73.5μmol.20)和2-氨基-2-甲基丙烷-1-醇(21.8mg,245μmol)然后添加2-(5-(二氟甲氧基)-1-甲基-1H-吲唑-3-基)-5-((2-(三甲基甲硅烷基)乙氧基)甲基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-羧酸(30mg,61.3μmol)(溶解于DMF(2.00mL))得到浅黄色溶液。于25℃搅拌反应混合物过夜。TLC和LCMS显示不完全的反应,添加2-氨基-2-甲基丙烷-1-醇(21.8mg,245μmol)和HATU(28.0mg,73.5μmol)并于25℃继续反应3小时。蒸发溶剂且将残余物通过色谱(球形硅胶20-45μm,23g,Versaflash Supelco)纯化(以0~50%EtOAc的己烷溶液经30分钟洗脱)得到2-(5-(二氟甲氧基)-1-甲基-1H-吲唑-3-基)-N-(1-羟基-2-甲基丙烷-2-基)-5-((2-(三甲基甲硅烷基)乙氧基)甲基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-甲酰胺(34.4mg,61.3μmol,100%),为灰白色固体。1H NMR(CDCl3)δ:9.22(s,1H),8.35(s,1H),8.31(s,1H),8.24(d,J=2.3Hz,1H),7.43-7.52(m,1H),7.34(dd,J=8.9,2.1Hz,1H),6.53(t,J=75.0Hz,1H),5.72(s,2H),4.21(s,3H),3.79(s,2H),3.53-3.64(m,2H),1.55(s,6H),0.85-1.07(m,2H),-0.03(s,9H).
步骤2.
2-(5-二氟甲氧基-1-甲基-1H-吲唑-3-基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-羧酸(2-羟基-1,1-二甲基-乙基)-酰胺
向2-(5-(二氟甲氧基)-1-甲基-1H-吲唑-3-基)-N-(1-羟基-2-甲基丙烷-2-基)-5-((2-(三甲基甲硅烷基)乙氧基)甲基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-甲酰胺(34.4mg,61.4μmol)在二氯甲烷(1.44mL)中的淡黄色溶液添加TFA(426mg,288μL,3.74mmol,定量:60.9),反应混合物变橙色并于25℃搅拌过夜然后浓缩。将残余物再溶解于5mL的溶液(二氯甲烷/MeOH/氢氧化铵;60:10:1)中并于25℃搅拌3小时,然后蒸发成浅黄色固体,溶解于二氯甲烷(含数滴MeOH)并通过色谱(球形硅胶20-45μm,23g,Versaflash Supelco)纯化(以0~5%经15分钟(MeOH,含10%氢氧化铵)/二氯甲烷洗脱)得到2种化合物的混合物,没有得到纯的化合物。再次合并混合物并通过制备型TLC(二氧化硅GF1000μm,20x40cm(石膏粘合剂,荧光指示剂))纯化得到期望的2-(5-(二氟甲氧基)-1-甲基-1H-吲唑-3-基)-N-(1-羟基-2-甲基丙烷-2-基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-甲酰胺(20mg,46.5μmol,75.7%),为白色针状物。MS(M+H)+=431;1H NMR(DMSO-d6)δ:9.07(s,1H),8.37(s,1H),8.21(d,J=1.9Hz,1H),7.80-7.90(m,2H),7.35-7.42(m,1H),7.18(t,J=74.4Hz,,1H),4.95(t,J=5.7Hz,1H),4.19(s,3H),3.62(d,J=5.7Hz,2H),1.42(s,6H).
实施例286.
2-(5-二氟甲氧基-1-甲基-1H-吲唑-3-基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-羧酸(4-羟基甲基-四氢-吡喃-4-基)-酰胺
步骤1.
2-(5-(二氟甲氧基)-1-甲基-1H-吲唑-3-基)-N-(4-(羟基甲基)四氢-2H-吡喃-4-基)-5-((2-(三甲基甲硅烷基)乙氧基)甲基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-甲酰胺
在16x100mm螺旋盖试管中,添加HATU(34.5mg,90.7μmol.20)、(4-氨基四氢-2H-吡喃-4-基)甲醇(39.7mg,302μmol)和2-(5-(二氟甲氧基)-1-甲基-1H-吲唑-3-基)-5-((2-(三甲基甲硅烷基)乙氧基)甲基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-羧酸(37mg,75.6μmol),然后将混合物溶解于DMF(3mL)得到浅黄色溶液。于25℃搅拌反应混合物过夜。蒸发溶剂且将残余物通过色谱(球形硅胶20-45μm,23g,Versaflash Supelco)纯化(以0~5%经30分钟(MeOH,含10%氢氧化铵)/二氯甲烷洗脱)得到2-(5-(二氟甲氧基)-1-甲基-1H-吲唑-3-基)-N-(4-(羟基甲基)四氢-2H-吡喃-4-基)-5-((2-(三甲基甲硅烷基)乙氧基)甲基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-甲酰胺(40mg,66.4μmol,87.8%),为白色固体。MS(M+H)+=603;1H NMR(CDCl3)δ:9.19(s,1H),8.45(s,1H),8.36(s,1H),8.07(d,J=2.3Hz,1H),7.45-7.51(m,1H),7.33(dd,J=9.1,2.3Hz,1H),6.55(t,J=76.0Hz,1H),5.74(s,2H),4.22(s,3H),3.95(s,2H),3.68-3.78(m,4H),3.55-3.66(m,2H),2.11-2.28(m,2H),1.89-2.07(m,2H),0.88-1.04(m,2H),-0.02(s,9H).
步骤2.
2-(5-二氟甲氧基-1-甲基-1H-吲唑-3-基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-羧酸(4-羟基甲基-四氢-吡喃-4-基)-酰胺
向2-(5-(二氟甲氧基)-1-甲基-1H-吲唑-3-基)-N-(4-(羟基甲基)四氢-2H-吡喃-4-基)-5-((2-(三甲基甲硅烷基)乙氧基)甲基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-甲酰胺(40mg,66.4μmol)在乙腈(6mL)中的溶液添加CsF(50.4mg,332μmol,定量:5.00)和18-冠醚-6(17.5mg,66.4μmol),将反应混合物加热至回流72小时,然后以二氯甲烷(20mL)稀释,经硅藻土过滤和浓缩。将残余物溶解于二氯甲烷并通过色谱(球形硅胶20-45μm,23g,Versaflash Supelco)纯化(以0~5%经15分钟(MeOH,含10%氢氧化铵)/二氯甲烷洗脱)。将纯产物溶解于二氯甲烷/MeOH中,并添加环己烷形成固体,其通过过滤分离,并干燥得到2-(5-(二氟甲氧基)-1-甲基-1H-吲唑-3-基)-N-(4-(羟基甲基)四氢-2H-吡喃-4-基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-甲酰胺(16mg,33.9μmol,51.0%),为灰白色固体。MS(M+H)+=473(>90%纯度);1H NMR(DMSO-d6)δ:9.07(s,1H),8.40(s,1H),8.04(d,J=1.9Hz,1H),7.78-7.88(m,2H),7.37-7.43(m,1H),7.21(t,J=74.4Hz,,1H),4.92(t,J=5.7Hz,1H),4.19(s,3H),3.73(d,J=5.7Hz,2H),3.50-3.69(m,4H),2.21(d,J=13.6Hz,2H),1.70-1.89(m,2H)。还回收未反应起始物质(11mg,27%)。
实施例287.
2-(5-甲氧基-1-甲基-1H-吲唑-3-基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-羧酸叔丁基酰胺
步骤1.
3-碘-5-甲氧基-1-甲基-1H-吲唑
于0℃向3-碘-5-甲氧基-1H-吲唑(442mg,1.61mmol)在THF(10.0mL)中的溶液添加KOtBu(1M在THF中)(2.26mL,2.26mmol),并于0℃搅拌混合物30分钟,其变为淡棕色红溶液,然后添加MeI(320mg,141μL,2.26mmol)。于0℃搅拌反应混合物30分钟,然后温热至25℃并搅拌1.5小时。将反应混合物以饱和氯化铵水溶液淬灭并以二氯甲烷萃取(3x30mL),将有机物经MgSO4干燥并浓缩成澄清油状物。然后溶解于甲苯,并通过色谱(80g柱,50μm来自Analogix,0-20%EtOAc的己烷溶液,经20分钟)纯化得到3-碘-5-甲氧基-1-甲基-1H-吲唑(355mg,1.23mmol,76.4%),为灰白色固体。MS(M+H)+=288.9(>90%纯度);1H NMR(CDCl3)δ:7.24(d,J=9.1Hz,1H),7.10(dd,J=9.1,2.6Hz,1H),6.75(d,J=2.6Hz,1H),4.06(s,3H),3.88(s,3H)。还得到区域异构体3-碘-5-甲氧基-2-甲基-2H-吲唑(89mg,309μmol,19.2%),为白色固体。
步骤2.
5-甲氧基-1-甲基-3-(三丁基甲锡烷基)-1H-吲唑
将3-碘-5-甲氧基-1-甲基-1H-吲唑(0.355g,1.23mmol)溶解于THF(3.00mL)中。将黄色的溶液冷却至-16℃(NaCl/冰浴),于-16℃滴加异丙基氯化镁2M在THF中(690μL,1.38mmol.12)。于-16℃搅拌反应混合物20分钟,其中沉淀固体。然后,缓慢地添加三丁基氯甲锡烷(461mg,384μL,1.42mmol.15)。将反应混合物温热至25℃并搅拌1.5小时。将反应混合物以饱和氯化铵溶液淬灭,以二氯甲烷(3x30mL)萃取,将有机物经MgSO4干燥并浓缩成黄色油状物。将残余物经高真空干燥得到粗5-甲氧基-1-甲基-3-(三丁基甲锡烷基)-1H-吲唑,其不经进一步纯化直接用于后续步骤。粗品质量超过期望量,所以收率认定为定量。
步骤3.
2-(5-甲氧基-1-甲基-1H-吲唑-3-基)-5-((2-(三甲基甲硅烷基)乙氧基)甲基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-甲醛
在25mL圆底烧瓶中,在氩气下将2-溴-5-((2-(三甲基甲硅烷基)乙氧基)甲基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-甲醛(439mg,1.23mmol)和5-甲氧基-1-甲基-3-(三丁基甲锡烷基)-1H-吲唑(556mg,1.23mmol)溶解于DMF(3.00mL)中,添加四(三苯基膦)钯(0)(71.2mg,61.6μmol)和CuI(46.9mg,246μmol,定量:0.20),且伴随鼓泡氩气超声混合物5分钟。于90℃(油浴温度)搅拌反应混合物2.5小时。将反应混合物经高真空浓缩且将残余物经色谱(80g柱,50μm来自Analogix,0-50%EtOAc的己烷溶液,经30分钟)纯化得到2-(5-甲氧基-1-甲基-1H-吲唑-3-基)-5-((2-(三甲基甲硅烷基)乙氧基)甲基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-甲醛(443mg,1.01mmol,82.2%),为黄色固体。MS(M+H)+=438(>90%纯度);1H NMR(CDCl3)δ:10.50(s,1H),9.34(s,1H),8.37(d,J=2.3Hz,1H),8.30(s,1H),7.39(d,J=9.1Hz,1H),7.19(dd,J=9.1,2.3Hz,1H),5.80(s,2H),4.21(s,3H),4.07(s,3H),3.59-3.73(m,2H),0.91-1.06(m,2H),0.00(s,8H).
步骤4.
2-(5-甲氧基-1-甲基-1H-吲唑-3-基)-5-((2-(三甲基甲硅烷基)乙氧基)甲基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-羧酸
于0℃向2-(5-甲氧基-1-甲基-1H-吲唑-3-基)-5-((2-(三甲基甲硅烷基)乙氧基)甲基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-甲醛(443mg,1.01mmol)在二噁烷(14mL)和水(4mL)中的黄色悬浮液添加氨基磺酸(590mg,6.07mmol,定量:6.00),接着经由滴液漏斗经15分钟滴加亚氯酸钠(149mg,1.32mmol)和KH2PO4(1.65g,12.1mmol2.00)在水(4.5mL)中的溶液。移去冰浴并于25℃搅拌浅黄色悬浮液18小时。LCMS表明反应完成约50%,将THF(10mL)添加至黄色的悬浮液然后于25℃添加更多试剂:氨基磺酸(590mg,6.07mmol,定量:6.00)固体,接着滴加亚氯酸钠(149mg,1.32mmol)和KH2PO4(1.65g,12.1mmol2.00)在10mL的水中的溶液并于25℃继续搅拌4小时。将混合物以水(50mL)稀释并以二氯甲烷萃取(3x40mL)。将合并的有机层经干燥(MgSO4),并添加一些焦炭加热至回流,冷却至25℃后,经硅藻土垫过滤并蒸发。将浅黄色固体残余物溶解于二氯甲烷/MeOH中并蒸发二氯甲烷以促进固体形成,将固体通过过滤分离,以MeOH和己烷淋洗并干燥得到2-(5-甲氧基-1-甲基-1H-吲唑-3-基)-5-((2-(三甲基甲硅烷基)乙氧基)甲基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-羧酸(238mg,525μmol,51.8%)。MS(M+H)+=454(>90%纯度);1H NMR(CDCl3)δ:9.38(s,1H),8.38(s,1H),7.92(d,J=2.6Hz,1H),7.41(d,J=9.1Hz,1H),7.19(dd,J=9.3,2.5Hz,1H),5.79(s,2H),4.21(s,3H),3.99(s,3H),3.60-3.73(m,2H),0.93-1.06(m,2H),0.00(s,9H).
步骤5.
N-叔丁基-2-(5-甲氧基-1-甲基-1H-吲唑-3-基)-5-((2-(三甲基甲硅烷基)乙氧基)甲基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-甲酰胺
在16x100mm螺旋盖试管中,添加HATU(40.2mg,106μmol.20)和2-甲基丙烷-2-胺(25.8mg,353μmol),然后添加2-(5-甲氧基-1-甲基-1H-吲唑-3-基)-5-((2-(三甲基甲硅烷基)乙氧基)甲基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-羧酸(40mg,88.2μmol)(溶解于DMF(2.00mL)中),得到浅黄色溶液,其立即形成白色沉淀。于25℃搅拌反应混合物过夜,蒸发溶剂且将残余物通过色谱(球形硅胶20-45μm,23g,Versaflash Supelco)纯化(以0~50%EtOAc的己烷溶液经30分钟洗脱)得到N-叔丁基-2-(5-甲氧基-1-甲基-1H-吲唑-3-基)-5-((2-(三甲基甲硅烷基)乙氧基)甲基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-甲酰胺(40mg,78.6μmol,89.2%),为灰白色固体。MS(M+H)+=509(>90%纯度);1H NMR(CDCl3)δ:9.11(s,1H),8.32(s,1H),8.20(s,1H),7.85(d,J=2.3Hz,1H),7.40(d,J=9.1Hz,1H),7.20(dd,J=9.1,2.3Hz,1H),5.72(s,2H),4.18(s,3H),3.92(s,3H),3.54-3.64(m,2H),1.58(s,9H),0.90-1.01(m,2H),-0.03(s,9H).
步骤6.
2-(5-甲氧基-1-甲基-1H-吲唑-3-基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-羧酸叔丁基酰胺
向N-叔丁基-2-(5-甲氧基-1-甲基-1H-吲唑-3-基)-5-((2-(三甲基甲硅烷基)乙氧基)甲基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-甲酰胺(40mg,78.6μmol)在二氯甲烷(2mL)中的淡黄色溶液添加TFA(2.96g,2000μL,26.0mmol,定量:330),反应混合物变成亮橙色,并于25℃搅拌3小时,然后浓缩。将残余物再溶解于5mL的溶液(二氯甲烷/MeOH/氢氧化铵;60:10:1)中并于25℃搅拌过夜,然后蒸发成浅黄色固体,溶解于二氯甲烷(含数滴MeOH)并通过色谱(球形硅胶20-45μm,23g,Versaflash Supelco)纯化(以0~5%经15分钟(MeOH,含10%氢氧化铵)/二氯甲烷洗脱)。将纯的产物溶解于少量的二氯甲烷/MeOH中,添加环己烷并蒸发一些溶剂以形成固体,其通过过滤分离,并干燥得到N-叔丁基-2-(5-甲氧基-1-甲基-1H-吲唑-3-基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-甲酰胺(25mg,66.1μmol,84.0%),为灰白色固体。MS(M+H)+=379(>90%纯度);1H NMR(CDCl3)δ:9.11(s,1H),8.31(d,J=3.0Hz,1H),8.22(s,1H),7.86(d,J=2.3Hz,1H),7.41(d,J=9.1Hz,1H),7.26(宽单峰,2H),7.17-7.23(m,1H),4.18(s,3H),3.92(s,3H),1.59(s,9H).
实施例288.
2-(5-甲氧基-1-甲基-1H-吲唑-3-基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-羧酸(2-羟基-1,1-二甲基-乙基)-酰胺
步骤1.
N-(1-羟基-2-甲基丙烷-2-基)-2-(5-甲氧基-1-甲基-1H-吲唑-3-基)-5-((2-(三甲基甲硅烷基)乙氧基)甲基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-甲酰胺
在16x100mm螺旋盖试管中,添加HATU(40.2mg,106μmol.20)和2-氨基-2-甲基丙烷-1-醇(31.4mg,353μmol)然后添加2-(5-甲氧基-1-甲基-1H-吲唑-3-基)-5-((2-(三甲基甲硅烷基)乙氧基)甲基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-羧酸(40mg,88.2μmol)(溶解于DMF(2.00mL))得到浅黄色溶液。在25℃搅拌反应混合物过夜,蒸发溶剂且将残余物通过色谱(球形硅胶20-45μm,23g,VersaflashSupelco)纯化(以0~50%EtOAc的己烷溶液经25分钟洗脱)得到N-(1-羟基-2-甲基丙烷-2-基)-2-(5-甲氧基-1-甲基-1H-吲唑-3-基)-5-((2-(三甲基甲硅烷基)乙氧基)甲基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-甲酰胺(46.3mg,88.2μmol,100%),为灰白色固体。MS(M+Na)+=547(>90%纯度);1H NMR(CDCl3)δ:9.14(s,1H),8.49(s,1H),8.32(s,1H),7.85(d,J=2.3Hz,1H),7.41(d,J=9.1Hz,1H),7.20(dd,J=9.3,2.5Hz,1H),5.72(s,2H),4.18(s,3H),3.92(s,3H),3.78(s,2H),3.54-3.65(m,2H),1.53(s,6H),0.91-1.01(m,2H),-0.03(s,9H).
步骤2.
N-(1-羟基-2-甲基丙烷-2-基)-2-(5-甲氧基-1-甲基-1H-吲唑-3-基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-甲酰胺
向N-(1-羟基-2-甲基丙烷-2-基)-2-(5-甲氧基-1-甲基-1H-吲唑-3-基)-5-((2-(三甲基甲硅烷基)乙氧基)甲基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-甲酰胺(46.3mg,88.2μmol)在乙腈(5mL)中的溶液添加CsF(134mg,882μmol)和18-冠醚-6(70.0mg,265μmol),将反应混合物搅拌加热至回流48小时,将反应混合物以二氯甲烷(20mL)稀释,经硅藻土过滤并浓缩。将残余物溶解于二氯甲烷且通过色谱(球形硅胶20-45μm,23g,Versaflash Supelco)纯化(以0~5%经15分钟(MeOH,含10%氢氧化铵)/二氯甲烷洗脱)。将纯的产物溶解在二氯甲烷/MeOH并添加环己烷以形成固体,其通过倾析分离,并干燥得到N-(1-羟基-2-甲基丙烷-2-基)-2-(5-甲氧基-1-甲基-1H-吲唑-3-基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-甲酰胺(18mg,45.6μmol,51.7%),为黄色固体。MS(M+H)+=377;1H NMR(DMSO-d6)δ:8.96(s,1H),8.34(s,1H),7.98(宽单峰,1H),7.79(宽单峰,1H),7.68(d,J=9.1Hz,1H),7.22(d,J=8.3Hz,1H),4.93(宽单峰,1H),4.13(s,3H),3.86(s,3H),3.60(d,J=4.9Hz,2H),1.39(s,6H).
实施例289.
2-(5-二氟甲氧基-1H-吲唑-3-基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-羧酸叔丁基酰胺
步骤1.
5-(二氟甲氧基)-3-(三丁基甲锡烷基)-1H-吲唑
将5-(二氟甲氧基)-3-碘-1H-吲唑(0.175g,564μmol)溶解于THF(3mL)。将无色溶液冷却至-16℃(NaCl/冰浴),于-16℃滴加异丙基氯化镁2M在THF中的溶液(621μL,1.24mmol.2)。于-16℃搅拌反应混合物20分钟。然后,缓慢地添加三丁基氯甲锡烷(220mg,184μL,677μmol.2)。将反应混合物温热至25℃并搅拌1.5小时。将反应混合物以饱和氯化铵溶液淬灭,以二氯甲烷(3x30mL)萃取,将有机物经MgSO4干燥并浓缩成黄色油状物。将残余物经高真空干燥并不经进一步纯化用于后续步骤,得到5-(二氟甲氧基)-3-(三丁基甲锡烷基)-1H-吲唑,粗物质质量超过收率,认定为定量。
步骤2.
N-叔丁基-2-(5-(二氟甲氧基)-1H-吲唑-3-基)-5-((2-(三甲基甲硅烷基)乙氧基)甲基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-甲酰胺
在25mL圆底烧瓶中,在氩气下将2-溴-N-叔丁基-5-((2-(三甲基甲硅烷基)乙氧基)甲基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-甲酰胺(220mg,515μmol)和5-(二氟甲氧基)-3-(三丁基甲锡烷基)-1H-吲唑(268mg,566μmol.10)溶解于DMF(1.06mL),添加四(三苯基膦)钯(0)(29.7mg,25.7μmol)和CuI(19.6mg,103μmol,定量:0.20),并伴随鼓泡氩气超声混合物5分钟。于90℃(油浴温度)搅拌反应混合物2.5小时。将反应混合物经高真空浓缩且将残余物经色谱(80g柱,50μm来自Analogix,0-50%EtOAc的己烷溶液,经30分钟)纯化得到N-叔丁基-2-(5-(二氟甲氧基)-1H-吲唑-3-基)-5-((2-(三甲基甲硅烷基)乙氧基)甲基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-甲酰胺(159mg,300μmol,58.2%),为灰白色固体。MS(M+Na)+=553(>90%纯度);1H NMR(CDCl3)δ:10.74(宽单峰,1H),9.29(s,1H),8.42(s,1H),8.36(d,J=2.3Hz,1H),8.09(s,1H),7.64(d,J=9.1Hz,1H),7.40(dd,J=8.9,2.1Hz,1H),6.57(t,J=74.0Hz,1H),5.76(s,2H),3.56-3.70(m,2H),1.67(s,9H),0.92-1.04(m,2H),0.00(s,9H).
步骤3.
N-叔丁基-2-(5-(二氟甲氧基)-1H-吲唑-3-基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-甲酰胺
向N-叔丁基-2-(5-(二氟甲氧基)-1H-吲唑-3-基)-5-((2-(三甲基甲硅烷基)乙氧基)甲基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-甲酰胺(55mg,104μmol)在二氯甲烷(3mL)中的淡黄色溶液添加TFA(1.48g,1000μL,13.0mmol25),反应混合物变成橙色并于25℃搅拌过夜然后浓缩。将残余物再溶解于5mL的(二氯甲烷/MeOH/氢氧化铵;60:10:1)的溶液并于25℃搅拌3小时,然后蒸发成浅黄色固体,溶解于二氯甲烷(增加数滴MeOH并加热)并通过色谱(球形硅胶20-45μm,23g,Versaflash Supelco)纯化(以0~5%经15分钟(MeOH,含10%氢氧化铵)/二氯甲烷洗脱)。将纯的产物悬浮于二氯甲烷中且添加环己烷以完全形成固体,将固体通过倾析分离,并高真空干燥得到N-叔丁基-2-(5-(二氟甲氧基)-1H-吲唑-3-基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-甲酰胺(26mg,64.9μmol,62.7%),为白色固体。MS(M+H)+=401.1(100%纯度);1H NMR(DMSO-d6)δ:9.12(s,1H),8.36(s,1H),8.21(d,J=2.3Hz,1H),7.88(s,1H),7.72(d,J=9.1Hz,1H),7.35(dd,J=9.1,2.3Hz,1H),7.17(t,J=74.4Hz,,1H),1.50(s,9H).
实施例290.
2-(5-甲氧基-1-甲基-1H-吲唑-3-基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-羧酸((3R,4R)-3-氨基-四氢-吡喃-4-基)-酰胺
步骤1.
(3R,4R)-4-(2-(5-甲氧基-1-甲基-1H-吲唑-3-基)-5-((2-(三甲基甲硅烷基)乙氧基)甲基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-甲酰氨基)四氢-2H-吡喃-3-基氨基甲酸叔丁酯
在16x100mm螺旋盖试管中,添加HATU(80.5mg,212μmol.20)和(3R,4R)-4-氨基四氢-2H-吡喃-3-基氨基甲酸叔丁酯(按照WO2010/97248A1,2010中描述所制备;38.1mg,176μmol)然后添加2-(5-甲氧基-1-甲基-1H-吲唑-3-基)-5-((2-(三甲基甲硅烷基)乙氧基)甲基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-羧酸(80mg,176μmol)(溶解于DMF(2.00mL))得到浅黄色溶液,其立即形成白色沉淀。于25℃搅拌反应混合物过夜,蒸发溶剂且将残余物通过色谱(60g柱,50μm来自Analogix,0~5%经15分钟(MeOH,含10%氢氧化铵)/二氯甲烷)纯化得到(3R,4R)-4-(2-(5-甲氧基-1-甲基-1H-吲唑-3-基)-5-((2-(三甲基甲硅烷基)乙氧基)甲基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-甲酰氨基)四氢-2H-吡喃-3-基氨基甲酸酯(115mg,176μmol,100%),为非常浅黄色固体。MS(M+Na)+=674(>90%纯度);1HNMR(CDCl3)δ:9.29(s,1H),8.51(d,J=9.1Hz,1H),8.37(s,2H),7.48(d,J=9.1Hz,1H),7.31(dd,J=9.1,3.0Hz,1H),6.27(d,J=10.2Hz,1H),5.75(s,2H),4.59-4.81(m,1H),4.18-4.36(m,4H),3.91-4.16(m,5H),3.54-3.81(m,4H),2.33(qd,J=12.7,4.9Hz,1H),1.89(d,J=13.2Hz,1H),0.93-1.12(m,2H),0.82(s,9H),0.00(s,9H).
步骤2.
N-((3R,4R)-3-氨基四氢-2H-吡喃-4-基)-2-(5-甲氧基-1-甲基-1H-吲唑-3-基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-甲酰胺
向(3R,4R)-4-(2-(5-甲氧基-1-甲基-1H-吲唑-3-基)-5-((2-(三甲基甲硅烷基)乙氧基)甲基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-甲酰氨基)四氢-2H-吡喃-3-基氨基甲酸叔丁酯(115mg,176μmol)在二氯甲烷(3.00mL)中的淡黄色溶液添加TFA(1.48g,1.00mL,13.0mmol,定量:73.6),反应混合物变成深红色和并于25℃搅拌过夜然后浓缩。将残余物再溶解于5mL的溶液(二氯甲烷/MeOH/氢氧化铵;60:10:1)并于25℃搅拌3小时,然后蒸发成浅黄色固体,溶解于二氯甲烷(增加数滴MeOH和加热)并通过色谱(60g柱,50μm来自Analogix,0~5%经15分钟(MeOH,含10%氢氧化铵)/二氯甲烷)纯化。将纯的产物溶解于二氯甲烷/MeOH和蒸发大部分二氯甲烷用于形成固体,将固体通过倾析分离,并高真空干燥得到N-((3R,4R)-3-氨基四氢-2H-吡喃-4-基)-2-(5-甲氧基-1-甲基-1H-吲唑-3-基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-甲酰胺(48mg,114μmol,64.6%),为灰白色固体。MS(M+H)+=422(100%纯度);1H NMR(DMSO-d6)δ:9.05(s,1H),8.45(d,J=8.3Hz,1H),8.39(s,1H),8.17(d,J=2.6Hz,1H),7.70(d,J=9.1Hz,1H),7.31(dd,J=9.1,2.3Hz,1H),4.23(td,J=7.6,4.0Hz,1H),4.14(s,3H),4.08(q,J=5.3Hz,1H),3.87(s,3H),3.84(宽单峰,1H),3.52-3.72(m,2H),3.38-3.51(m,1H),3.15(d,J=4.9Hz,2H),2.88(宽单峰,1H),1.85-2.07(m,1H),1.70(d,J=11.7Hz,1H).
实施例291.
2-(5-甲氧基-1-甲基-1H-吲唑-3-基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-羧酸((1R,2S)-2-氨基-环己基)-酰胺
步骤1.
N-((1R,2S)-2-氨基环己基)-2-(5-甲氧基-1-甲基-1H-吲唑-3-基)-5-((2-(三甲基甲硅烷基)乙氧基)甲基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-甲酰胺
在16x100mm螺旋盖试管中,添加HATU(80.5mg,212μmol.20)和然后添加(1R,2S)-环己烷-1,2-二胺(20.1mg,176μmol),然后添加2-(5-甲氧基-1-甲基-1H-吲唑-3-基)-5-((2-(三甲基甲硅烷基)乙氧基)甲基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-羧酸(80mg,176μmol)(溶解于DMF(2.00mL))中得到浅黄色溶液,其立即形成白色沉淀。于25℃搅拌反应混合物过夜,蒸发溶剂且将残余物通过色谱(60g柱,50μm来自Analogix,0~5%经15分钟(MeOH,含10%氢氧化铵)/二氯甲烷)纯化得到期望的N-((1R,2S)-2-氨基环己基)-2-(5-甲氧基-1-甲基-1H-吲唑-3-基)-5-((2-(三甲基甲硅烷基)乙氧基)甲基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-甲酰胺(21mg,38.2μmol,21.7%)。MS(M+H)+=550(>90%纯度);1H NMR(CDCl3)δ:9.02(s,1H),8.51(s,1H),7.51(s,1H),7.43(d,J=9.1Hz,1H),7.22(dd,J=9.3,2.1Hz,1H),5.61-5.84(m,2H),4.78(宽单峰,1H),4.18(s,3H),4.02(t,J=3.2Hz,1H),3.91(s,3H),3.76(宽单峰,1H),3.62-3.71(m,2H),2.09(宽单峰,2H),2.03(s,2H),1.80-1.98(m,4H),1.52-1.78(m,4H),0.98(dd,J=9.3,7.4Hz,2H),0.00(s,9H).
步骤2.
2-(5-甲氧基-1-甲基-1H-吲唑-3-基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-羧酸((1R,2S)-2-氨基-环己基)-酰胺
向N-((1R,2S)-2-氨基环己基)-2-(5-甲氧基-1-甲基-1H-吲唑-3-基)-5-((2-(三甲基甲硅烷基)乙氧基)甲基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-甲酰胺(21mg,38.2μmol)在二氯甲烷(3.00mL)中的淡黄色溶液添加TFA(1.48g,1.00mL,13.0mmol,定量:340),反应混合物变成深红色并于25℃搅拌过夜然后浓缩。将残余物再溶解于5mL的溶液(二氯甲烷/MeOH/氢氧化铵;60:10:1)并于25℃搅拌3小时,然后蒸发成浅黄色固体,溶解于二氯甲烷(增加数滴MeOH和加热)并通过色谱(球形硅胶20-45μm,23g,Versaflash Supelco)纯化(以0~10%经15分钟(MeOH,含10%氢氧化铵)/二氯甲烷洗脱)。将纯的产物溶解于热MeOH中并静置过夜用于形成固体。将固体通过倾析分离,并高真空干燥得到N-((1R,2S)-2-氨基环己基)-2-(5-甲氧基-1-甲基-1H-吲唑-3-基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-甲酰胺(9mg,21.5μmol,56.2%),为白色固体。MS(M+H)+=420(100%纯度);1H NMR(DMSO-d6)δ:9.02(s,1H),8.34-8.45(m,2H),8.07(d,J=2.3Hz,1H),7.69(d,J=9.4Hz,1H),7.29(dd,J=9.3,2.5Hz,1H),4.14(s,3H),4.01-4.10(m,1H),3.88(s,3H),3.05(d,J=3.8Hz,1H),1.50-1.82(m,6H),1.40(宽单峰,2H).
实施例292.
2-[5-二氟甲氧基-1-(3-二甲基氨基-丙基)-1H-吲唑-3-基]-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-羧酸叔丁基酰胺
步骤1.
N-叔丁基-2-(5-(二氟甲氧基)-1-(3-(二甲基氨基)丙基)-1H-吲唑-3-基)-5-((2-(三甲基甲硅烷基)乙氧基)甲基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-甲酰胺
在2-5mL Biotage微波小瓶中在DMF(2mL)中混合N-叔丁基-2-(5-(二氟甲氧基)-1H-吲唑-3-基)-5-((2-(三甲基甲硅烷基)乙氧基)甲基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-甲酰胺(109mg,205μmol)、3-氯-N,N-二甲基丙烷-1-氯化铝(97.4mg,616μmol,定量:3.0)和Cs2CO3(402mg,1.23mmol,定量:6.00)。将混合物于25℃搅拌~10分钟,然后在Biotage微波反应器中加热至100℃且保持30分钟,以10mL的二氯甲烷稀释并通过硅藻土垫过滤,于65℃高真空浓缩滤液且将残余物溶解于二氯甲烷在且通过色谱(球形硅胶20-45μm,23g,VersaflashSupelco)以0~5%,经20分钟(MeOH,含10%氢氧化铵)/二氯甲烷洗脱)纯化得到N-叔丁基-2-(5-(二氟甲氧基)-1-(3-(二甲基氨基)丙基)-1H-吲唑-3-基)-5-((2-(三甲基甲硅烷基)乙氧基)甲基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-甲酰胺(97mg,158μmol,76.7%),为浅棕色固体。MS(M+H)+=616(>90%纯度);1H NMR(CDCl3)δ:9.24(s,1H),8.36(s,1H),8.32(d,J=2.3Hz,1H),8.06(s,1H),7.60(d,J=8.7Hz,1H),7.35(dd,J=9.1,2.3Hz,1H),6.55(t,J=74.8Hz,1H),5.75(s,2H),4.60(t,J=6.6Hz,2H),3.53-3.74(m,2H),2.33-2.42(m,2H),2.29(s,6H),2.14-2.27(m,2H),1.65(s,9H),0.90-1.07(m,2H),0.00(s,9H).
步骤2.
2-[5-二氟甲氧基-1-(3-二甲基氨基-丙基)-1H-吲唑-3-基]-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-羧酸叔丁基酰胺
向N-叔丁基-2-(5-(二氟甲氧基)-1-(3-(二甲基氨基)丙基)-1H-吲唑-3-基)-5-((2-(三甲基甲硅烷基)乙氧基)甲基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-甲酰胺(97mg,158μmol)在二氯甲烷(4mL)中的淡黄色溶液添加TFA(1.48g,1mL,13.0mmol,定量:82.4),反应混合物变成橙色并于25℃搅拌2小时,浓缩混合物且将残余物再溶解于5mL的溶液(二氯甲烷/MeOH/氢氧化铵;60:10:1)并于25℃搅拌1小时,然后蒸发成黄色固体,其溶解于二氯甲烷(含数滴MeOH)并通过色谱(40g柱,20-40μm球形硅胶,HP Gold,来自Teledyne/Isco)纯化(以0~5%经15分钟(MeOH,含10%氢氧化铵)/二氯甲烷洗脱)。将纯的产物溶解于二氯甲烷中并添加环己烷形成固体,将灰白色固体通过倾析分离,并高真空干燥得到N-叔丁基-2-(5-(二氟甲氧基)-1-(3-(二甲基氨基)丙基)-1H-吲唑-3-基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-甲酰胺(62mg,128μmol,81.1%)。MS(M+H)+=486(100%纯度);1H NMR(DMSO-d6)δ:9.07(s,1H),8.37(s,1H),8.20(s,1H),7.78-7.95(m,2H),7.39(d,J=8.7Hz,1H),7.19(s,1H),4.55(t,J=6.2Hz,2H),2.17-2.30(m,2H),2.12(s,7H),1.99-2.07(m,2H),1.49(s,10H).
实施例293.
2-(1-甲基-2-氧基-4,5,6,7-四氢-1H-吲唑-3-基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-羧酸异丙基酰胺
步骤1.
3-碘-4,5,6,7-四氢-1H-吲唑
向4,5,6,7-四氢-1H-吲唑-3-羧酸(0.57g,3.43mmol)和碳酸氢钠(951mg,440μL,11.3mmol)在二氯乙烷(5mL)和水(5mL)中的混合物以一份添加碘化钠(1.34g,8.92mmol)和碘(1.13g,4.46mmol)并伴随剧烈搅拌将混合物加热至100℃(油浴温度)且保持24小时。冷却至25℃后,将混合物以二氯甲烷稀释,然后以10%Na2S2O3和饱和NaHCO3洗涤。合并有机相,干燥(MgSO4)并浓缩成灰白色固体,其经色谱(115g柱,50μm来自Analogix,0~5%经15分钟(MeOH,含10%氢氧化铵)/二氯甲烷)纯化得到3-碘-4,5,6,7-四氢-1H-吲唑(674mg,2.72mmol,79.2%),为白色固体。MS(M+H)+=249(>90%纯度);1H NMR(CDCl3)δ:2.75(t,J=5.7Hz,2H),2.35(t,J=5.7Hz,2H),1.61-1.90(m,4H).
步骤2.
3-碘-1-甲基-4,5,6,7-四氢-1H-吲唑
于0℃向3-碘-4,5,6,7-四氢-1H-吲唑(674mg,2.72mmol)在THF(10mL)中的溶液添加KOtBu(1M,在THF(3.8mL,3.8mmol)中)并于0℃搅拌混合物30分钟,其变为棕红色溶液,然后添加MeI(540mg,238μL,3.8mmol)。于0℃搅拌反应混合物30分钟,然后温热至25℃并搅拌18小时。将反应混合物以饱和氯化铵水溶液淬灭并以二氯甲烷萃取(3x30mL),将有机物经MgSO4干燥并浓缩成灰白色固体。然后溶解于甲苯并通过色谱(115g柱,50μm来自Analogix,0-20%EtOAc的己烷溶液,经15分钟)纯化得到极性更大的期望的3-碘-1-甲基-4,5,6,7-四氢-1H-吲唑(570mg,2.17mmol,80.0%),为灰白色固体。MS(M+H)+=263(100%纯度);1H NMR(CDCl3)δ:3.72(s,3H),2.42-2.72(m,2H),2.30(t,J=6.0Hz,2H),1.56-1.93(m,4H)。还得到区域异构体,3-碘-2-甲基-4,5,6,7-四氢-2H-吲唑(182mg,694μmol,25.6%),为白色固体。
步骤3.
1-甲基-3-(三丁基甲锡烷基)-4,5,6,7-四氢-1H-吲唑
将3-碘-1-甲基-4,5,6,7-四氢-1H-吲唑(300mg,1.14mmol)溶解于THF(3.00mL)中。将无色溶液冷却至-16℃(NaCl/冰浴)。于-16℃滴加异丙基氯化镁2M的THF溶液(641μL,1.28mmol.12)。于-16℃搅拌反应混合物20分钟。然后,缓慢地添加三丁基氯甲锡烷(428mg,357μL,1.32mmol.15)。将反应混合物温热至25℃并搅拌1.5小时。将反应混合物以饱和氯化铵溶液淬灭,以二氯甲烷(3x30mL)萃取,将有机物经MgSO4干燥并浓缩成黄色油状物。将残余物经高真空干燥得到1-甲基-3-(三丁基甲锡烷基)-4,5,6,7-四氢-1H-吲唑,设定为定量,且不经进一步处理用于后续步骤。
步骤4.
2-(1-甲基-4,5,6,7-四氢-1H-吲唑-3-基)-5-((2-(三甲基甲硅烷基)乙氧基)甲基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-甲醛
将2-溴-5-((2-(三甲基甲硅烷基)乙氧基)甲基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-甲醛(406mg,1.14mmol)和1-甲基-3-(三丁基甲锡烷基)-4,5,6,7-四氢-1H-吲唑(485mg,1.14mmol)在氩气下溶解于DMF(3.00mL)中,添加四(三苯基膦)钯(0)(65.9mg,57.0μmol)和CuI(43.4mg,228μmol,定量:0.20)且伴随鼓泡氩气超声混合物5分钟。于90℃(油浴温度)搅拌反应混合物18小时。将反应混合物经高真空浓缩并将深黄色固体残余物经色谱(80g柱,50μm,来自Silicycle)梯度0-50%EtOAc的己烷溶液,经30分钟)纯化得到2-(1-甲基-4,5,6,7-四氢-1H-吲唑-3-基)-5-((2-(三甲基甲硅烷基)乙氧基)甲基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-甲醛(265mg,644μmol,56.5%),为浅黄色固体。MS(M+H)+=412;1H NMR(CDCl3)δ:10.50(s,1H),9.07(s,1H),8.29(s,1H),5.77(s,2H),3.89(s,3H),3.57-3.72(m,2H),3.05(t,J=6.0Hz,2H),2.69(t,J=6.0Hz,2H),1.80-2.02(m,4H),0.92-1.09(m,2H),0.00(s,9H).
步骤5.
3-(7-羧基-5-((2-(三甲基甲硅烷基)乙氧基)甲基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-2-基)-1-甲基-4,5,6,7-四氢-1H-吲唑2-氧化物
于0℃向2-(1-甲基-4,5,6,7-四氢-1H-吲唑-3-基)-5-((2-(三甲基甲硅烷基)乙氧基)甲基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-甲醛(265mg,644μmol)在二噁烷(14.0mL)和水(4mL)中的黄棕色溶液(冷却后变成悬浮液)中添加氨基磺酸(375mg,3.86mmol,定量:6.00),接着经由滴液漏斗经15分钟滴加亚氯酸钠(94.6mg,837μmol.30)和KH2PO4(1.05g,7.73mmol2.00)在水(4.5mL)中的溶液。移去冰浴并于25℃搅拌浅黄色悬浮液18小时。将混合物以水(50mL)稀释并以5%MeOH的二氯甲烷溶液(3x40mL)萃取。将合并的有机层经干燥(MgSO4)并蒸发。将浅黄色固体残余物溶解于二氯甲烷且通过色谱(球形硅胶20-45μm,50g,Versaflash Supelco)纯化(以0~5%MeOH的二氯甲烷溶液洗脱)。将纯的化合物溶解于二氯甲烷,添加一些环己烷并蒸发二氯甲烷以促进固体形成,将固体通过过滤分离,以己烷淋洗并干燥得到3-(7-羧基-5-((2-(三甲基甲硅烷基)乙氧基)甲基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-2-基)-1-甲基-4,5,6,7-四氢-1H-吲唑2-氧化物(147mg,331μmol,51.5%),为白色固体。MS(M+H)+=444(100%纯度);1HNMR(CDCl3)δ:9.19(s,1H),8.45(s,1H),5.76(s,2H),3.58-3.71(m,2H),3.50(s,3H),2.39-2.55(m,2H),2.24-2.38(m,2H),1.99-2.22(m,4H),0.91-1.07(m,2H),0.00(s,9H).
步骤6.
3-(7-(异丙基氨基甲酰基)-5-((2-(三甲基甲硅烷基)乙氧基)甲基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-2-基)-1-甲基-4,5,6,7-四氢-1H-吲唑2-氧化物
在16x100mm螺旋盖试管中,添加HATU(46.3mg,122μmol.20)和丙烷-2-胺(24.0mg,406μmol)然后添加3-(7-羧基-5-((2-(三甲基甲硅烷基)乙氧基)甲基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-2-基)-1-甲基-4,5,6,7-四氢-1H-吲唑2-氧化物(45mg,101μmol)(溶解于二氯甲烷(2.50mL)中)得到浅黄色溶液,其立即形成白色沉淀。于25℃搅拌反应混合物过夜,蒸发溶剂且将残余物通过色谱(球形二氧化硅20-45μm,23g,Versaflash Supelco)纯化(以0~50%EtOAc的己烷溶液,经30分钟洗脱)得到3-(7-(异丙基氨基甲酰基)-5-((2-(三甲基甲硅烷基)乙氧基)甲基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-2-基)-1-甲基-4,5,6,7-四氢-1H-吲唑2-氧化物(45mg,92.8μmol,91.5%),为澄清泡沫。MS(M+H)+=485.1(100%纯度);1H NMR(CDCl3)δ:7.91(s,1H),6.41(d,J=8.1Hz,1H),6.11(s,1H),4.54(s,2H),3.22-3.37(m,1H),2.36-2.46(m,2H),2.31(s,3H),1.22-1.44(m,2H),1.00-1.14(m,2H),0.82-1.00(m,4H),0.16(d,J=6.6Hz,7H),-0.30--0.12(m,2H),-1.19(s,9H).
步骤7.
2-(1-甲基-2-氧基-4,5,6,7-四氢-1H-吲唑-3-基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-羧酸异丙基酰胺
将3-(7-(异丙基氨基甲酰基)-5-((2-(三甲基甲硅烷基)乙氧基)甲基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-2-基)-1-甲基-4,5,6,7-四氢-1H-吲唑2-氧化物(45mg,92.8μmol)在二氯甲烷(2.00mL)中的淡黄色溶液添加TFA(1.48g,1.00mL,13.0mmol40),反应混合物变成深红色并于25℃搅拌过夜然后浓缩。将残余物再溶解于5mL的溶液(二氯甲烷/MeOH/氢氧化铵;60:10:1)并于25℃搅拌3小时,然后蒸发成浅黄色固体,溶解于二氯甲烷(增加数滴MeOH并加热)并通过色谱(球形硅胶20-45μm,23g,Versaflash Supelco)纯化(以0~10%经15分钟(MeOH,含10%氢氧化铵)/二氯甲烷洗脱)。将纯的白色固体产物以己烷超声。将固体通过倾析分离,并高真空干燥得到3-(7-(异丙基氨基甲酰基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-2-基)-1-甲基-4,5,6,7-四氢-1H-吲唑2-氧化物(27mg,76.2μmol,82.1%),为白色固体。MS(M+H)+=377(100%纯度);1H NMR(DMSO-d6)δ:12.93(宽单峰,1H),8.93(s,1H),8.45(s,1H),7.45(d,J=8.1Hz,1H),4.13-4.33(m,1H),3.35(s,3H),2.37-2.46(m,2H),1.83-2.18(m,6H),1.22(d,J=6.6Hz,6H).
实施例294.
2-(1-甲基-2-氧基-4,5,6,7-四氢-1H-吲唑-3-基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-羧酸叔丁基酰胺
步骤1.
3-(7-(叔丁基氨基甲酰基)-5-((2-(三甲基甲硅烷基)乙氧基)甲基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-2-基)-1-甲基-4,5,6,7-四氢-1H-吲唑2-氧化物
在16x100mm螺旋盖试管中,添加HATU(46.3mg,122μmol.20)和2-甲基丙烷-2-胺(29.7mg,406μmol)然后添加3-(7-羧基-5-((2-(三甲基甲硅烷基)乙氧基)甲基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-2-基)-1-甲基-4,5,6,7-四氢-1H-吲唑2-氧化物(45mg,101μmol)(溶解于DMF(2.00mL)中)得到浅黄色溶液,其立即形成白色沉淀。于25℃搅拌反应混合物过夜,蒸发溶剂且将残余物通过色谱(球形硅胶20-45μm,23g,Versaflash Supelco)纯化(以0~50%EtOAc的己烷溶液,经30分钟洗脱)得到3-(7-(叔丁基氨基甲酰基)-5-((2-(三甲基甲硅烷基)乙氧基)甲基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-2-基)-1-甲基-4,5,6,7-四氢-1H-吲唑2-氧化物(43mg,86.2μmol,85.0%),为澄清泡沫。MS(M+H)+=499(>90%纯度);1H NMR(CDCl3)δ:7.82(s,1H),6.21(s,1H),4.52(s,2H),2.36-2.45(m,2H),2.30(s,3H),1.23-1.37(m,2H),0.95-1.12(m,2H),0.89(dd,J=10.9,5.6Hz,2H),0.72-0.85(m,2H),0.37(s,9H),-0.29--0.17(m,2H),-1.20(s,9H).
步骤2.
2-(1-甲基-2-氧基-4,5,6,7-四氢-1H-吲唑-3-基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-羧酸叔丁基酰胺
向3-(7-(叔丁基氨基甲酰基)-5-((2-(三甲基甲硅烷基)乙氧基)甲基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-2-基)-1-甲基-4,5,6,7-四氢-1H-吲唑2-氧化物(43mg,86.2μmol)在二氯甲烷(2.00mL)中的淡黄色溶液添加TFA(1.48g,1.00mL,13.0mmol51),反应混合物变成深红色并于25℃搅拌过夜然后浓缩。将残余物再溶解于5mL的溶液(二氯甲烷/MeOH/氢氧化铵;60:10:1)并于25℃搅拌3小时,然后蒸发成浅黄色固体,溶解于二氯甲烷(增加数滴MeOH并加热)并通过色谱(球形硅胶20-45μm,23g,Versaflash Supelco)纯化(以0~10%经15分钟(MeOH,含10%氢氧化铵)/二氯甲烷洗脱)。将纯的白色固体产物以己烷超声。将固体通过倾析分离,并高真空干燥得到3-(7-(叔丁基氨基甲酰基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-2-基)-1-甲基-4,5,6,7-四氢-1H-吲唑2-氧化物(28mg,76.0μmol,88.1%),为白色固体。MS(M+H)+=369.1(100%纯度);1H NMR(DMSO-d6)δ:12.88(宽单峰,1H),8.87(s,1H),8.40(s,1H),7.32(s,1H),3.35(s,3H),2.36-2.46(m,2H),2.03(宽单峰,2H),1.86-1.96(m,4H),1.44(s,9H).
实施例295.
2-(1-甲基-4,5,6,7-四氢-1H-吲唑-3-基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-羧酸叔丁基酰胺
步骤1.
1-甲基-3-(三丁基甲锡烷基)-4,5,6,7-四氢-1H-吲唑
在25mL圆底烧瓶中,将3-碘-1-甲基-4,5,6,7-四氢-1H-吲唑(62mg,237μmol)溶解于THF(3mL)。将无色溶液冷却至-16℃(NaCl/冰浴)并于-16℃滴加异丙基氯化镁2M的THF溶液(132μL,265μmol)。于-16℃搅拌反应混合物20分钟。然后,缓慢地添加三丁基氯甲锡烷(88.6mg,73.8μL,272μmol)。将反应混合物温热至25℃,并搅拌1.5小时。将反应混合物以饱和氯化铵溶液淬灭,以二氯甲烷(3x30mL)萃取,将有机物经MgSO4干燥并浓缩成灰白色蜡状固体。将残余物经高真空干燥,得到1-甲基-3-(三丁基甲锡烷基)-4,5,6,7-四氢-1H-吲唑,认定定量,并不经进一步处理用于后续步骤。
步骤2.
N-叔丁基-2-(1-甲基-4,5,6,7-四氢-1H-吲唑-3-基)-5-((2-(三甲基甲硅烷基)乙氧基)甲基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-甲酰胺
在氩气下,将2-溴-N-叔丁基-5-((2-(三甲基甲硅烷基)乙氧基)甲基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-甲酰胺(100mg,234μmol)和1-甲基-3-(三丁基甲锡烷基)-4,5,6,7-四氢-1H-吲唑(99.5mg,234μmol)溶解于DMF(2.5mL)中,添加四(三苯基膦)钯(0)(13.5mg,11.7μmol)和CuI(8.91mg,46.8μmol,定量:0.20)并伴随鼓泡氩气超声处理混合物5分钟。于90℃(油浴温度)搅拌反应混合物2.5小时。将反应混合物经高真空浓缩且将残余物经色谱(60g柱,50μm来自Analogix,0-50%EtOAc的己烷溶液,经30分钟)纯化得到N-叔丁基-2-(1-甲基-4,5,6,7-四氢-1H-吲唑-3-基)-5-((2-(三甲基甲硅烷基)乙氧基)甲基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-甲酰胺(25mg,51.8μmol,22.1%),为灰白色固体。MS(M+Na)+=505;1H NMR(CDCl3)δ:9.12(s,1H),8.33(s,1H),8.02(s,1H),5.73(s,2H),3.90(s,3H),3.54-3.68(m,2H),3.06(t,J=6.0Hz,2H),2.63-2.78(m,2H),1.91-2.06(m,2H),1.77-1.90(m,2H),1.62(s,9H),0.95-1.02(m,2H),0.00(s,9H).
步骤3.
2-(1-甲基-4,5,6,7-四氢-1H-吲唑-3-基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-羧酸叔丁基酰胺
向N-叔丁基-2-(1-甲基-4,5,6,7-四氢-1H-吲唑-3-基)-5-((2-(三甲基甲硅烷基)乙氧基)甲基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-甲酰胺(25mg,51.8μmol)在二氯甲烷(2.00mL)中的淡黄色溶液添加TFA(2.96g,2.00mL,26.0mmol,定量:501),反应混合物变成棕色并于25℃搅拌18小时。将混合物经浓缩且将残余物再溶解于5mL的溶液(二氯甲烷/MeOH/氢氧化铵;60:10:1)并于25℃搅拌3小时,然后蒸发成浅黄色固体,溶解于二氯甲烷(含数滴MeOH)并通过色谱(球形硅胶20-45μm,23g,Versaflash Supelco)纯化(以0~5%经15分钟(MeOH,含10%氢氧化铵)/二氯甲烷洗脱)。分离产物,为灰白色固体,其以环己烷超声,倾析,然后再次以MeOH超声,倾析,并干燥得到干净的N-叔丁基-2-(1-甲基-4,5,6,7-四氢-1H-吲唑-3-基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-甲酰胺(8mg,22.7μmol,43.8%)。MS(M+H)+=353.1;1H NMR(DMSO-d6)δ:8.91(s,1H),8.26(s,1H),7.74(s,1H),3.76(s,3H),2.91(宽单峰,2H),2.64(宽单峰,2H),1.65-1.84(m,4H),1.45(s,9H);LCMS ESI+TIC MS显示100%纯度,[M+H]+=353.1,[M+Na]+=375.0.
实施例296.
2-{1-[3-(3,3-二氟-氮杂环丁烷-1-基)-丙基]-5-二氟甲氧基-1H-吲唑-3-基}-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-羧酸叔丁基酰胺
步骤1.
1-(2-(1,3-二噁烷-2-基)乙基)-5-(二氟甲氧基)-3-碘-1H-吲唑
于0℃向5-(二氟甲氧基)-3-碘-1H-吲唑(250mg,806μmol)在THF(5mL)中的澄清无色溶液添加KOtBu(1M在THF中)(806μL,806μmol)并于0℃搅拌混合物30分钟形成淡黄色悬浮液(常常为溶液),然后添加2-(2-溴乙基)-1,3-二噁烷(189mg,131μL,968μmol.2)。于0℃搅拌反应混合物30分钟,然后温热至25℃并搅拌18小时并添加更多的KOtBu(1M在THF中)(806μL,806μmol)并于25℃搅拌10分钟且添加2-(2-溴乙基)-1,3-二噁烷(189mg,131μL,968μmol.2)并且将反应混合物加热至50℃且保持18小时。将反应混合物以饱和氯化铵水溶液淬灭并以二氯甲烷萃取(3x30mL),将有机物经MgSO4干燥并浓缩成澄清油状物。然后溶解于甲苯并通过色谱(80g柱,50μm来自Analogix,0-20%EtOAc的己烷溶液,经20分钟)纯化得到1-(2-(1,3-二噁烷-2-基)乙基)-5-(二氟甲氧基)-3-碘-1H-吲唑(242mg,571μmol,70.8%),为澄清致密油状物。MS(M+H)+=424.8;1H NMR(CDCl3)δ:7.42(d,J=8.7Hz,1H),7.27(s,1H),7.14-7.25(m,1H),6.43(t,J=73.7Hz,1H),4.51(t,J=6.8Hz,2H),4.38(t,J=5.1Hz,1H),4.08(dd,J=11.0,4.9Hz,2H),3.65(td,J=12.3,2.3Hz,2H),2.16-2.26(m,2H),1.96-2.15(m,1H),1.32(d,J=13.6Hz,1H)。还得到区域异构体2-(2-(1,3-二噁烷-2-基)乙基)-5-(二氟甲氧基)-3-碘-2H-吲唑(白色蜡状固体;40.5mg,95.5μmol,12%)和未反应的起始物质(31mg,12%)。
步骤2.
1-(2-(1,3-二噁烷-2-基)乙基)-5-(二氟甲氧基)-3-(三丁基甲锡烷基)-1H-吲唑
将1-(2-(1,3-二噁烷-2-基)乙基)-5-(二氟甲氧基)-3-碘-1H-吲唑(242mg,571μmol)溶解于THF(3.00mL)中。将无色溶液冷却至-16℃(NaCl/冰浴),于-16℃滴加异丙基氯化镁(2M在THF中)(319μL,639μmol)。于-16℃搅拌反应混合物20分钟。然后,缓慢地添加三丁基氯甲锡烷(214mg,178μL,656μmol)。将反应混合物温热至25℃并搅拌1.5小时。将反应混合物以饱和氯化铵溶液淬灭,以二氯甲烷(3x30mL)萃取,将有机物经MgSO4干燥并浓缩成黄色油状物。将残余物经高真空干燥并不经进一步纯化用于后续步骤得到1-(2-(1,3-二噁烷-2-基)乙基)-5-(二氟甲氧基)-3-(三丁基甲锡烷基)-1H-吲唑,认定定量,并不经进一步纯化用于后续步骤。
步骤3.
2-(1-(2-(1,3-二噁烷-2-基)乙基)-5-(二氟甲氧基)-1H-吲唑-3-基)-N-叔丁基-5-((2-(三甲基甲硅烷基)乙氧基)甲基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-甲酰胺
在氩气下将2-溴-N-叔丁基-5-((2-(三甲基甲硅烷基)乙氧基)甲基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-甲酰胺(244mg,571μmol)和1-(2-(1,3-二噁烷-2-基)乙基)-5-(二氟甲氧基)-3-(三丁基甲锡烷基)-1H-吲唑(335mg,571μmol)溶解于DMF(3.00mL)中,添加四(三苯基膦)钯(0)(33.0mg,28.6μmol)和CuI(21.7mg,114μmol,定量:0.20)且伴随鼓泡氩气超声混合物5分钟。于90℃(油浴温度)搅拌反应混合物4小时。将反应混合物经高真空浓缩且将残余物(深色固体)经色谱(80g柱,50μm来自Analogix,0-50%EtOAc的己烷溶液,经30分钟)纯化得到2-(1-(2-(1,3-二噁烷-2-基)乙基)-5-(二氟甲氧基)-1H-吲唑-3-基)-N-叔丁基-5-((2-(三甲基甲硅烷基)乙氧基)甲基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-甲酰胺(230mg,357μmol,62.5%),为灰白色固体。MS(M+Na)+=667.1;1H NMR(CDCl3)δ:9.25(s,1H),8.37(s,1H),8.32(d,J=2.0Hz,1H),8.06(s,1H),7.56(dd,J=9.1,0.5Hz,1H),7.35(dd,J=9.1,2.3Hz,1H),6.55(t,J=74.3Hz,1H),5.75(s,2H),4.65(t,J=6.9Hz,2H),4.55(t,J=4.9Hz,1H),4.12-4.21(m,2H),3.74(td,J=12.3,2.5Hz,2H),3.56-3.65(m,2H),2.34(td,J=6.8,5.3Hz,2H),2.05-2.23(m,1H),1.65(s,9H),1.39(dt,J=13.4,1.3Hz,1H),0.94-1.04(m,2H),-0.06-0.05(m,9H).
步骤4.
N-叔丁基-2-(5-(二氟甲氧基)-1-(3-氧代丙基)-1H-吲唑-3-基)-5-((2-(三甲基甲硅烷基)乙氧基)甲基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-甲酰胺
将2-(1-(2-(1,3-二噁烷-2-基)乙基)-5-(二氟甲氧基)-1H-吲唑-3-基)-N-叔丁基-5-((2-(三甲基甲硅烷基)乙氧基)甲基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-甲酰胺(130mg,202μmol)溶解于THF(3mL)中,并添加HCl3N(672μL,2.02mmol0.00)。于25℃搅拌混合物过夜,TLC和LCMS显示约10%的转化。添加0.5mL的浓HCl且将反应混合物再加热至50℃48小时。将饱和碳酸氢钠水溶液添加至反应混合物,且将混合物以二氯甲烷萃取(5x30mL)。将所得有机层经无水硫酸镁干燥。蒸发溶剂,且将所得残余物通过硅胶色谱(正己烷-乙酸乙酯0~100%经30分钟)纯化得到N-叔丁基-2-(5-(二氟甲氧基)-1-(3-氧代丙基)-1H-吲唑-3-基)-5-((2-(三甲基甲硅烷基)乙氧基)甲基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-甲酰胺(34mg,58.0μmol,28.7%)。MS(M+H)+=587;1H NMR(CDCl3)δ:9.97(s,1H),9.20(s,1H),8.42(s,1H),8.30(d,J=2.3Hz,1H),8.08(s,1H),7.63(d,J=9.1Hz,1H),7.39(dd,J=9.1,2.3Hz,1H),6.54(t,J=74.4Hz,1H),5.75(s,2H),5.34(s,1H),4.82(t,J=6.2Hz,2H),3.55-3.65(m,2H),3.33(t,J=6.4Hz,2H),1.64(s,9H),0.90-1.05(m,2H),0.05-0.07(m,1H),0.00(s,9H)。还得到未反应的起始物质(31mg,24%)。
步骤5.
N-叔丁基-2-(1-(3-(3,3-二氟氮杂环丁烷-1-基)丙基)-5-(二氟甲氧基)-1H-吲唑-3-基)-5-((2-(三甲基甲硅烷基)乙氧基)甲基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-甲酰胺
向N-叔丁基-2-(5-(二氟甲氧基)-1-(3-氧代丙基)-1H-吲唑-3-基)-5-((2-(三甲基甲硅烷基)乙氧基)甲基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-甲酰胺(34mg,58.0μmol)在二氯乙烷(6mL)中的溶液添加3,3-二氟氮杂环丁烷盐酸盐(9.76mg,75.3μmol.30)。将混合物于25℃搅拌15分钟,然后添加三乙酰氧基硼氢化钠(18.4mg,86.9μmol0)且继续搅拌18小时。将反应混合物以饱和NaHCO3溶液稀释并以二氯甲烷萃取(5x20mL)。将有机层干燥(MgSO4)并真空浓缩。将所得残余物经色谱(球形硅胶20-45μm,23g,Versaflash Supelco)纯化(以0~5%,经20分钟(MeOH,含10%氢氧化铵)/二氯甲烷洗脱)得到N-叔丁基-2-(1-(3-(3,3-二氟氮杂环丁烷-1-基)丙基)-5-(二氟甲氧基)-1H-吲唑-3-基)-5-((2-(三甲基甲硅烷基)乙氧基)甲基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-甲酰胺(38mg,57.2μmol,98.8%),为灰白色固体。MS(M+Na)+=686;1H NMR(CDCl3)δ:9.22(s,1H),8.36(s,1H),8.32(d,J=2.3Hz,1H),8.05(s,1H),7.59(d,J=9.1Hz,1H),7.36(dd,J=9.1,2.3Hz,1H),6.55(t,J=74.0Hz,1H),5.75(s,2H),4.61(t,J=6.6Hz,2H),3.53-3.72(m,6H),2.64(t,J=6.0Hz,2H),2.14(dq,J=6.8,5.7Hz,2H),1.64(s,9H),0.91-1.08(m,2H),0.00(s,9H).
步骤6.
2-{1-[3-(3,3-二氟-氮杂环丁烷-1-基)-丙基]-5-二氟甲氧基-1H-吲唑-3-基}-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-羧酸叔丁基酰胺
向N-叔丁基-2-(1-(3-(3,3-二氟氮杂环丁烷-1-基)丙基)-5-(二氟甲氧基)-1H-吲唑-3-基)-5-((2-(三甲基甲硅烷基)乙氧基)甲基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-甲酰胺(38mg,57.2μmol)在二氯甲烷(4.00mL)中的淡黄色溶液添加TFA(1.48g,1.00mL,13.0mmol27),反应混合物变成橙色并于25℃搅拌18小时,浓缩混合物且将残余物再溶解于5mL的溶液(二氯甲烷/MeOH/氢氧化铵;60:10:1)并于25℃搅拌1小时,然后蒸发成黄色固体,其溶解于二氯甲烷且通过色谱(球形硅胶20-45μm,23g,Versaflash Supelco)纯化(以0~5%,经20分钟(MeOH,含10%氢氧化铵)/二氯甲烷洗脱)。将纯的产物溶解于二氯甲烷中并添加环己烷形成固体,将灰白色固体通过倾析分离,并高真空干燥得到N-叔丁基-2-(1-(3-(3,3-二氟氮杂环丁烷-1-基)丙基)-5-(二氟甲氧基)-1H-吲唑-3-基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-甲酰胺(29.5mg,55.3μmol,96.6%)。MS(M+H)+=534;1HNMR(DMSO-d6)δ:9.07(s,1H),8.37(s,1H),8.19(s,1H),7.81-7.96(m,2H),7.40(d,J=8.3Hz,1H),7.19(t,J=74.4Hz,,1H),4.56(宽单峰,2H),3.56(t,J=12.5Hz,4H),2.54(宽单峰,2H),1.95(m,J=6.2Hz,2H),1.49(s,9H).
实施例297.
2-[5-二氟甲氧基-1-(2-[1,3]二噁烷-2-基-乙基)-1H-吲唑-3-基]-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-羧酸叔丁基酰胺
将2-(1-(2-(1,3-二噁烷-2-基)乙基)-5-(二氟甲氧基)-1H-吲唑-3-基)-N-叔丁基-5-((2-(三甲基甲硅烷基)乙氧基)甲基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-甲酰胺(100mg,155μmol)溶解于丙酮(3mL)中,并添加HCl3N(1.2g,1mL,3.00mmol9.3)。在搅拌的同时加热至50℃并继续5天。将饱和碳酸氢钠水溶液添加至反应混合物,且将混合物以二氯甲烷萃取(5x30mL)。将合并的有机层经无水硫酸钠干燥。蒸发溶剂,将得到的残余物通过硅胶色谱(正己烷-乙酸乙酯~100%,经20分钟)纯化得到N-叔丁基-2-(5-(二氟甲氧基)-1-(3-氧代丙基)-1H-吲唑-3-基)-5-((2-(三甲基甲硅烷基)乙氧基)甲基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-甲酰胺(27mg,46.0μmol,29.7%)和少量的SEM基团脱保护产物2-(1-(2-(1,3-二噁烷-2-基)乙基)-5-(二氟甲氧基)-1H-吲唑-3-基)-N-叔丁基-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-甲酰胺(5mg,9.72μmol,6.27%),为浅黄色针状物。MS(M+H)+=515;1HNMR(DMSO-d6)δ:12.80(宽单峰,1H),9.08(s,1H),8.37(s,1H),8.20(d,J=2.3Hz,1H),7.87(s,1H),7.81(d,J=9.1Hz,1H),7.39(dd,J=9.1,2.3Hz,1H),7.19(t,J=74.4Hz,,1H),4.45-4.72(m,3H),3.99(dd,J=11.3,4.5Hz,2H),3.55-3.75(m,2H),2.07-2.22(m,2H),1.79-1.97(m,1H),1.49(s,9H),1.38(s,9H),134(m,1H)。还得到未反应的起始物质(34mg,34%)。
实施例298.
2-[5-二氟甲氧基-1-(3-羟基-丙基)-1H-吲唑-3-基]-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-羧酸叔丁基酰胺
步骤1.
N-叔丁基-2-(5-(二氟甲氧基)-1-(3-羟基丙基)-1H-吲唑-3-基)-5-((2-(三甲基甲硅烷基)乙氧基)甲基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-甲酰胺
向N-叔丁基-2-(5-(二氟甲氧基)-1-(3-氧代丙基)-1H-吲唑-3-基)-5-((2-(三甲基甲硅烷基)乙氧基)甲基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-甲酰胺(27mg,46.0μmol)在二氯乙烷(4.76mL)中的溶液添加氮杂环丁烷-3-醇盐酸盐(6.55mg,59.8μmol.30)。将混合物于25℃搅拌15分钟,然后添加三乙酰氧基硼氢化钠(14.6mg,69.0μmol0)且继续搅拌18小时。将反应混合物以饱和NaHCO3溶液稀释并以二氯甲烷萃取(5x20mL)。将有机层经干燥(MgSO4)并真空浓缩。将所得残余物经色谱(球形硅胶20-45μm,23g,Versaflash Supelco)纯化(以0~5%,经20分钟(MeOH,含10%氢氧化铵)/二氯甲烷洗脱),得到痕量的N-叔丁基-2-(5-(二氟甲氧基)-1-(3-(3-羟基氮杂环丁烷-1-基)丙基)-1H-吲唑-3-基)-5-((2-(三甲基甲硅烷基)乙氧基)甲基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-甲酰胺,并主要得到N-叔丁基-2-(5-(二氟甲氧基)-1-(3-羟基丙基)-1H-吲唑-3-基)-5-((2-(三甲基甲硅烷基)乙氧基)甲基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-甲酰胺(17mg,28.9μmol,62.7%),为灰白色固体。MS(M+H)+=589;1H NMR(CDCl3)δ:9.21(s,1H),8.37(s,1H),8.32(d,J=2.3Hz,1H),8.06(s,1H),7.59(d,J=9.1Hz,1H),7.37(dd,J=8.9,2.1Hz,1H),6.55(t,J=74.4Hz,1H),5.75(s,2H),4.70(t,J=6.6Hz,2H),3.74(t,J=5.7Hz,2H),3.55-3.67(m,2H),2.29(quin,J=6.0Hz,2H),1.64(s,9H),0.91-1.05(m,2H),0.00(s,9H).
步骤2.
2-[5-二氟甲氧基-1-(3-羟基-丙基)-1H-吲唑-3-基]-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-羧酸叔丁基酰胺
向N-叔丁基-2-(5-(二氟甲氧基)-1-(3-羟基丙基)-1H-吲唑-3-基)-5-((2-(三甲基甲硅烷基)乙氧基)甲基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-甲酰胺(17mg,28.9μmol)在二氯甲烷(4.00mL)中的淡黄色溶液添加TFA(1480mg,1.0mL,当量450),反应混合物变成橙色并于25℃搅拌24小时,浓缩混合物且将残余物再溶解于5mL的溶液(二氯甲烷/MeOH/氢氧化铵;60:10:1)并于25℃搅拌1小时,然后蒸发成灰白色固体,其溶解于二氯甲烷且通过色谱(球形硅胶20-45μm,23g,Versaflash Supelco)纯化(以0~5%,经20分钟(MeOH,含10%氢氧化铵)/二氯甲烷洗脱)。将纯的产物溶解于二氯甲烷中并添加环己烷形成固体,将浅黄色固体通过过滤分离,并高真空干燥得到N-叔丁基-2-(5-(二氟甲氧基)-1-(3-羟基丙基)-1H-吲唑-3-基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-甲酰胺(12mg,26.2μmol,90.6%)。MS(M+H)+=459;1H NMR(DMSO-d6)δ:9.05(s,1H),8.37(s,1H),8.19(s,1H),7.79-7.94(m,2H),7.38(d,J=8.7Hz,1H),7.18(t,J=74.4Hz,,1H),4.62-4.68(m,1H),4.59(t,J=6.8Hz,2H),3.40-3.51(m,2H),2.06(t,J=6.2Hz,1H),1.49(s,9H).
实施例299.
2-[5-二氟甲氧基-1-(3-吗啉-4-基-丙基)-1H-吲唑-3-基]-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-羧酸叔丁基酰胺
步骤1.
N-叔丁基-2-(5-(二氟甲氧基)-1-(3-吗啉代丙基)-1H-吲唑-3-基)-5-((2-(三甲基甲硅烷基)乙氧基)甲基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-甲酰胺
在2-5mL Biotage微波小瓶中在DMF(2mL)中混合N-叔丁基-2-(5-(二氟甲氧基)-1H-吲唑-3-基)-5-((2-(三甲基甲硅烷基)乙氧基)甲基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-甲酰胺(60mg,113μmol)、4-(3-氯丙基)吗啉(55.5mg,339μmol,定量:3.0)和Cs2CO3(147mg,452μmol)。将混合物于25℃搅拌~10分钟,然后在Biotage微波反应器中加热至100℃且保持30分钟。然后,以10mL的二氯甲烷稀释并通过硅藻土垫过滤,于65℃高真空浓缩滤液且将残余物溶解于二氯甲烷且通过色谱(球形硅胶20-45μm,23g,Versaflash Supelco)纯化(以0~5%,经20分钟(MeOH,含10%氢氧化铵)/二氯甲烷洗脱)得到N-叔丁基-2-(5-(二氟甲氧基)-1-(3-吗啉代丙基)-1H-吲唑-3-基)-5-((2-(三甲基甲硅烷基)乙氧基)甲基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-甲酰胺(62mg,94.2μmol,83.4%),为灰白色固体。MS(M+Na)+=680;1H NMR(CDCl3)δ:9.23(s,1H),8.36(s,1H),8.32(d,J=2.3Hz,1H),8.05(s,1H),7.59(d,J=9.1Hz,1H),7.35(dd,J=8.9,2.1Hz,1H),6.55(t,J=74.4Hz,1H),5.75(s,2H),4.61(t,J=6.4Hz,2H),3.75(宽单峰,4H),3.55-3.66(m,2H),2.45(宽单峰,6H),2.25(宽单峰,2H),1.65(s,9H),0.90-1.06(m,2H),0.00(s,9H).
步骤2.
2-[5-二氟甲氧基-1-(3-吗啉-4-基-丙基)-1H-吲唑-3-基]-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-羧酸叔丁基酰胺
向N-叔丁基-2-(5-(二氟甲氧基)-1-(3-吗啉代丙基)-1H-吲唑-3-基)-5-((2-(三甲基甲硅烷基)乙氧基)甲基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-甲酰胺(62mg,94.2μmol)在二氯甲烷(4.00mL)中的淡黄色溶液添加TFA(1.48g,1.00mL,13.0mmol38),反应混合物变成橙色并于25℃搅拌18小时,浓缩混合物且将残余物再溶解于5mL的溶液(二氯甲烷/MeOH/氢氧化铵;60:10:1)并于25℃搅拌1小时,然后蒸发成黄色固体,其溶解于二氯甲烷且通过色谱(球形硅胶20-45μm,23g,Versaflash Supelco)纯化(以0~5%,经20分钟(MeOH,含10%氢氧化铵)/二氯甲烷洗脱)。将纯的产物溶解在二氯甲烷(含有数滴MeOH)中并添加环己烷形成固体,将浅黄色片通过倾析分离并高真空干燥得到N-叔丁基-2-(5-(二氟甲氧基)-1-(3-吗啉代丙基)-1H-吲唑-3-基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-甲酰胺(45mg,85.3μmol,90.5%)。MS(M+H)+=528;1H NMR(DMSO-d6)δ:12.80(宽单峰,1H),9.06(s,1H),8.37(s,1H),8.19(s,1H),7.77-7.98(m,2H),7.38(d,J=8.7Hz,1H),7.18(t,J=74.4Hz,,1H),4.57(t,J=5.7Hz,2H),3.49(宽单峰,4H),2.26(宽单峰,6H),2.00-2.15(m,2H),1.49(s,9H).
实施例300.
2-{5-二氟甲氧基-1-[3-(3-羟基-氮杂环丁烷-1-基)-丙基]-1H-吲唑-3-基}-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-羧酸叔丁基酰胺
步骤1.
1-(3-氯丙基)氮杂环丁烷-3-醇
在25mL圆底烧瓶中在乙腈(5mL)中混合搅拌的氮杂环丁烷-3-醇盐酸盐(购自Beta Pharma,250mg,2.28mmol)和1-溴-3-氯丙烷(719mg,4.56mmol.0),向悬浮液添加Cs2CO3(1.86g,5.7mmol.50)。将混合物于25℃搅拌18小时,然后以15mL的EtOAc稀释并过滤除去固体。蒸发滤液且将残余物通过色谱(40g柱,50μm来自Analogix,0~5%,经20分钟(MeOH,含10%氢氧化铵)/二氯甲烷(在碘室中进行TLC)纯化得到1-(3-氯丙基)氮杂环丁烷-3-醇(128mg,856μmol,37.5%),为澄清稠密液体。1H NMR(CDCl3)δ:4.25-4.53(m,2H),3.36-3.68(m,4H),2.82-3.04(m,2H),2.58(t,J=7.2Hz,2H),1.80(quin,J=6.8Hz,2H).
步骤2.
N-叔丁基-2-(5-(二氟甲氧基)-1-(3-(3-羟基氮杂环丁烷-1-基)丙基)-1H-吲唑-3-基)-5-((2-(三甲基甲硅烷基)乙氧基)甲基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-甲酰胺
在2-5mL Biotage微波小瓶中在DMF(2mL)中混合N-叔丁基-2-(5-(二氟甲氧基)-1H-吲唑-3-基)-5-((2-(三甲基甲硅烷基)乙氧基)甲基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-甲酰胺(50mg,94.2μmol)、1-(3-氯丙基)氮杂环丁烷-3-醇(42.3mg,283μmol,定量:3.0)和Cs2CO3(123mg,377μmol)。将混合物于25℃搅拌~10分钟,然后在Biotage微波反应器中加热至100℃且保持30分钟。LCMS显示完全反应,以10mL的二氯甲烷稀释并通过硅藻土垫过滤,于65℃高真空浓缩滤液且将残余物溶解于二氯甲烷并通过色谱(球形硅胶20-45μm,23g,Versaflash Supelco)纯化(以0~5%,经20分钟(MeOH,含10%氢氧化铵)/二氯甲烷洗脱)得到N-叔丁基-2-(5-(二氟甲氧基)-1-(3-(3-羟基氮杂环丁烷-1-基)丙基)-1H-吲唑-3-基)-5-((2-(三甲基甲硅烷基)乙氧基)甲基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-甲酰胺(40mg,62.1μmol,65.9%),为浅黄色半固体。MS(M+H)+=644;1H NMR(CDCl3)δ:9.23(s,1H),8.36(s,1H),8.30(d,J=2.3Hz,1H),8.08(s,1H),7.58(d,J=9.1Hz,1H),7.35(dd,J=8.9,2.1Hz,1H),6.55(t,J=74.8Hz,1H),5.75(s,2H),4.43-4.63(m,3H),3.66-3.76(m,2H),3.55-3.65(m,2H),2.88-2.99(m,2H),2.51-2.61(m,2H),2.03-2.17(m,3H),1.65(s,9H),0.92-1.02(m,2H),0.00(s,9H).
步骤3.
2-{5-二氟甲氧基-1-[3-(3-羟基-氮杂环丁烷-1-基)-丙基]-1H-吲唑-3-基}-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-羧酸叔丁基酰胺
向N-叔丁基-2-(5-(二氟甲氧基)-1-(3-(3-羟基氮杂环丁烷-1-基)丙基)-1H-吲唑-3-基)-5-((2-(三甲基甲硅烷基)乙氧基)甲基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-甲酰胺(43mg,66.8μmol)在二氯甲烷(4.00mL)中的淡黄色溶液添加TFA(740mg,0.5mL,6.49mmol,定量:97.2),反应混合物变成橙色并于25℃搅拌18小时,浓缩混合物且将残余物再溶解于5mL的(二氯甲烷/MeOH/氢氧化铵;60:10:1)的溶液并于25℃搅拌1小时,然后蒸发成黄色泡沫,其溶解于二氯甲烷(含有数滴MeOH)并通过色谱(球形硅胶20-45μm,23g,Versaflash Supelco)纯化(以0~10%,经20分钟(MeOH,含10%氢氧化铵)/二氯甲烷洗脱)。将纯的产物溶解于二氯甲烷中并添加环己烷形成固体,将灰白色固体通过倾析分离,并高真空干燥得到N-叔丁基-2-(5-(二氟甲氧基)-1-(3-(3-羟基氮杂环丁烷-1-基)丙基)-1H-吲唑-3-基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-甲酰胺(21mg,40.9μmol,61.2%)。MS(M+H)+=514;1H NMR(DMSO-d6)δ:9.06(s,1H),8.37(s,1H),8.19(s,1H),7.81-7.91(m,2H),7.39(d,J=8.7Hz,1H),7.19(t,J=74.4Hz,,1H),5.23(d,J=6.4Hz,1H),4.53(t,J=6.6Hz,2H),4.07-4.25(m,1H),3.50(t,J=6.4Hz,2H),2.62(t,J=6.8Hz,2H),2.35(t,J=6.8Hz,2H),1.78-2.01(m,2H),1.49(s,9H).
实施例301.
2-{1-[3-(3-氰基-氮杂环丁烷-1-基)-丙基]-5-二氟甲氧基-1H-吲唑-3-基}-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-羧酸叔丁基酰胺
步骤1.
1-(3-氯丙基)氮杂环丁烷-3-甲腈
在25mL圆底烧瓶在乙腈(5mL)中混合搅拌的氮杂环丁烷-3-甲腈盐酸盐(购自ASW MedChem Inc.,250mg,2.11mmol)和1-溴-3-氯丙烷(664mg,415μL,4.22mmol.0),向悬浮液添加Cs2CO3(2.06g,6.33mmol)。将混合物于25℃搅拌18小时,然后以15mL的EtOAc稀释并过滤除去固体。蒸发滤液且将残余物通过色谱(40g柱,50μm来自Analogix,0~5%,经20分钟(MeOH,含10%氢氧化铵)/二氯甲烷(在碘室中进行TLC)纯化得到1-(3-氯丙基)氮杂环丁烷-3-甲腈(230mg,1.45mmol,68.8%),为澄清稠密液体。1H NMR(CDCl3)δ:3.46-3.59(m,4H),3.20-3.31(m,3H),2.55(t,J=6.8Hz,2H),1.75(quin,J=6.6Hz,2H).
步骤2.
N-叔丁基-2-(1-(3-(3-氰基氮杂环丁烷-1-基)丙基)-5-(二氟甲氧基)-1H-吲唑-3-基)-5-((2-(三甲基甲硅烷基)乙氧基)甲基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-甲酰胺
在2-5mL Biotage微波小瓶中在DMF(2.00mL)中混合N-叔丁基-2-(5-(二氟甲氧基)-1H-吲唑-3-基)-5-((2-(三甲基甲硅烷基)乙氧基)甲基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-甲酰胺(50mg,94.2μmol)、1-(3-氯丙基)氮杂环丁烷-3-甲腈(44.8mg,283μmol,定量:3.0)和Cs2CO3(123mg,377μmol)。将混合物于25℃搅拌~10分钟,然后在Biotage微波反应器中加热至100℃且保持30分钟。LCMS显示完全反应,以10mL的二氯甲烷稀释并通过硅藻土垫过滤,在65℃高真空浓缩滤液且将残余物溶解于二氯甲烷且通过色谱(球形硅胶20-45μm,23g,Versaflash Supelco)纯化(以0~5%,经20分钟(MeOH,含10%氢氧化铵)/二氯甲烷洗脱)得到N-叔丁基-2-(1-(3-(3-氰基氮杂环丁烷-1-基)丙基)-5-(二氟甲氧基)-1H-吲唑-3-基)-5-((2-(三甲基甲硅烷基)乙氧基)甲基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-甲酰胺(45mg,68.9μmol,73.2%),为白色固体。MS(M+H)+=653.1;1HNMR(CDCl3)δ:9.22(s,1H),8.36(s,1H),8.31(d,J=2.3Hz,1H),8.04(s,1H),7.58(d,J=9.1Hz,1H),7.36(dd,J=8.9,2.1Hz,1H),6.56(t,J=73.7Hz,1H),5.75(s,2H),4.57(t,J=6.6Hz,2H),3.24-3.40(m,3H),2.50(t,J=6.6Hz,2H),2.08(quin,J=6.5Hz,2H),1.65(s,9H),0.91-1.03(m,2H),0.00(s,9H).
步骤3.
2-{1-[3-(3-氰基-氮杂环丁烷-1-基)-丙基]-5-二氟甲氧基-1H-吲唑-3-基}-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-羧酸叔丁基酰胺
向N-叔丁基-2-(1-(3-(3-氰基氮杂环丁烷-1-基)丙基)-5-(二氟甲氧基)-1H-吲唑-3-基)-5-((2-(三甲基甲硅烷基)乙氧基)甲基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-甲酰胺(45mg,68.9μmol)在二氯甲烷(4.00mL)中的淡黄色溶液添加TFA(740mg,0.5mL,6.49mmol,定量:94.1),反应混合物变成橙色并于25℃搅拌18小时,浓缩混合物且将残余物再溶解于5mL的(二氯甲烷/MeOH/氢氧化铵;60:10:1)的溶液并于25℃搅拌1小时,然后蒸发成黄色固体,其溶解于二氯甲烷(添加数滴MeOH)并通过色谱(球形硅胶20-45μm,23g,Versaflash Supelco)纯化(以0~5%,经20分钟(MeOH,含10%氢氧化铵)/二氯甲烷洗脱)。将纯的产物溶解于二氯甲烷中并添加环己烷形成固体,将浅黄色片通过倾析分离并高真空干燥得到N-叔丁基-2-(1-(3-(3-氰基氮杂环丁烷-1-基)丙基)-5-(二氟甲氧基)-1H-吲唑-3-基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-甲酰胺(33mg,63.2μmol,91.6%)。MS(M+H)+=523;1H NMR(DMSO-d6)δ:12.80(宽单峰,1H),9.06(s,1H),8.37(s,1H),8.19(d,J=2.3Hz,1H),7.81-7.96(m,2H),7.39(dd,J=9.1,2.3Hz,1H),7.19(t,J=74.4Hz,,1H),4.53(t,J=6.6Hz,2H),3.35-3.57(m,3H),3.16-3.25(m,2H),2.38(t,J=6.8Hz,2H),1.78-2.02(m,2H),1.49(s,9H).
实施例302.
2-[1-(2-氮杂环丁烷-3-基-乙基)-6-氟-1H-吲唑-3-基]-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-羧酸叔丁基酰胺
步骤1.
3-(2-羟基乙基)氮杂环丁烷-1-羧酸叔丁酯
将2-(1-(叔丁氧基羰基)氮杂环丁烷-3-基)乙酸(529mg,2.46mmol)在THF(5.29mL)中的溶液冷却至0℃并以硼烷-甲基硫复合物2M在THF(2.46mL,4.92mmol)中处理,然后缓慢地温热至室温。搅拌18小时后,将反应混合物通过滴加2N NaOH(7mL)淬灭,然后以二氯甲烷(4x30mL)萃取。合并有机层,干燥(MgSO4),并浓缩得到3-(2-羟基乙基)氮杂环丁烷-1-羧酸叔丁酯(495mg,2.46mmol,100%),为无色油状物。1H NMR(CDCl3)δ:3.96(t,J=8.3Hz,2H),3.47-3.64(m,4H),2.50-2.67(m,1H),1.73-1.86(m,2H),1.37(s,9H)。
步骤2.
3-(2-碘代乙基)氮杂环丁烷-1-羧酸叔丁酯
于0℃将3-(2-羟基乙基)氮杂环丁烷-1-羧酸叔丁酯(254mg,1.26mmol)、Ph3P(381mg,1.45mmol.15)、咪唑(129mg,1.89mmol0)和乙腈(6.5mL)的搅拌溶液以碘(368mg,1.45mmol.15)处理。让混合物达到25℃并持续搅拌18小时。将反应混合物然后以水稀释,并以己烷萃取(6x25mL)。将合并的有机物经干燥(MgSO4)并浓缩,然后通过色谱(40g柱,50μm来自Analogix,0-30%EtOAc的己烷溶液,经15分钟)纯化得到3-(2-碘代乙基)氮杂环丁烷-1-羧酸叔丁酯(271mg,871μmol,69.0%),为无色油状物。1H NMR(CDCl3)δ:4.03(t,J=8.3Hz,2H),3.56(dd,J=8.7,5.7Hz,2H),3.10(t,J=7.0Hz,2H),2.63(quint,J=7.8,5.4Hz,1H),2.13(q,J=7.1Hz,2H),1.42(s,9H)。
步骤3.
3-(2-(3-(7-(叔丁基氨基甲酰基)-5-((2-(三甲基甲硅烷基)乙氧基)甲基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-2-基)-6-氟-1H-吲唑-1-基)乙基)氮杂环丁烷-1-羧酸叔丁酯
在2-5mL Biotage微波小瓶中在DMF(2.00mL)中混合N-叔丁基-2-(6-氟-1H-吲唑-3-基)-5-((2-(三甲基甲硅烷基)乙氧基)甲基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-甲酰胺(75mg,155μmol)、3-(2-碘代乙基)氮杂环丁烷-1-羧酸叔丁酯(68mg,219μmol.41)和Cs2CO3(203mg,622μmol)。将混合物于25℃搅拌~10分钟,然后在Biotage微波反应器中加热至100℃且保持30分钟,以10mL的二氯甲烷稀释并通过硅藻土垫过滤,于65℃高真空浓缩滤液且将残余物溶解于二氯甲烷且通过色谱(40g柱,50μm硅胶来自Analogix,0~5%,经20分钟(MeOH,含10%氢氧化铵/二氯甲烷)纯化达到3-(2-(3-(7-(叔丁基氨基甲酰基)-5-((2-(三甲基甲硅烷基)乙氧基)甲基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-2-基)-6-氟-1H-吲唑-1-基)乙基)氮杂环丁烷-1-羧酸叔丁酯(103mg,155μmol,99.5%),为白色固体。MS(M+Na)+=688;1H NMR(CDCl3)δ:9.24(s,1H),8.56(dd,J=8.7,5.3Hz,1H),8.37(s,1H),8.09(s,1H),6.98-7.16(m,2H),5.75(s,2H),4.46(t,J=6.4Hz,2H),4.02(t,J=8.3Hz,2H),3.49-3.72(m,5H),2.49-2.69(m,1H),2.33(q,J=6.8Hz,2H),1.65(s,9H),1.48(s,2H),1.45(s,9H),0.92-1.03(m,2H),0.00(s,9H);LCMS ESI+TIC MS显示100%纯度,[M+Na]+=688.0.
步骤4.
2-[1-(2-氮杂环丁烷-3-基-乙基)-6-氟-1H-吲唑-3-基]-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-羧酸叔丁基酰胺
向3-(2-(3-(7-(叔丁基氨基甲酰基)-5-((2-(三甲基甲硅烷基)乙氧基)甲基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-2-基)-6-氟-1H-吲唑-1-基)乙基)氮杂环丁烷-1-羧酸叔丁酯(43mg,64.6μmol)在二氯甲烷(4.00mL)中的淡黄色溶液添加TFA(740mg,500μL,6.49mmol00),反应混合物变成橙色并于25℃搅拌18小时。将反应混合物经浓缩,且将残余物再溶解于5mL的(二氯甲烷/MeOH/氢氧化铵;60:10:1)的溶液中并于25℃搅拌1小时,然后蒸发成黄色固体,其溶解于二氯甲烷(添加数滴MeOH)并通过色谱(球形硅胶20-45μm,23g,VersaflashSupelco)纯化(以0~10%经30分钟(MeOH,含10%氢氧化铵)/二氯甲烷洗脱)。将纯的产物溶解于二氯甲烷(含有数滴MeOH)中,并添加环己烷形成固体,将灰白色固体通过倾析分离并高真空干燥得到2-(1-(2-(氮杂环丁烷-3-基)乙基)-6-氟-1H-吲唑-3-基)-N-叔丁基-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-甲酰胺(23mg,52.8μmol,81.8%)。MS(M+H)+=436;1H NMR(DMSO-d6)δ:9.08(s,1H),8.48(dd,J=8.7,5.3Hz,1H),8.39(s,1H),7.90(s,1H),7.77(dd,J=9.8,1.9Hz,1H),7.16(td,J=9.1,1.9Hz,1H),4.49(t,J=6.6Hz,2H),3.68-3.85(m,2H),3.44-3.56(m,2H),2.75(dt,J=15.2,7.7Hz,1H),2.20(q,J=6.7Hz,2H),1.51(s,9H).
实施例303.
N-叔丁基-2-(2-甲基-1H-吲哚-7-基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-甲酰胺
步骤1
2-甲基-7-(4,4,5,5-四甲基-[1,3,2]二氧杂硼杂环戊烷-2-基)-1H吲哚
将2-甲基-1H-吲哚(500mg,3.81mmol)、4,4,4',4',5,5,5',5'-八甲基-2,2'-二(1,3,2-二氧杂硼杂环戊烷)(726mg,2.86mmol)和4,4'-二-叔丁基-2,2'-联吡啶(40.9mg,152μmol)的混合物以氮气冲洗1分钟,然后添加庚烷(5mL),将反应混合物再次以氮气冲洗1分钟,然后最终添加二(1,5-环辛二烯)二-μ-甲氧基二铱(I)(50.5mg,76.2μmol),且将反应混合物加热至50℃。18小时后,将反应混合物冷却至室温,以乙醚稀释,以水和盐水洗涤,然后干燥(MgSO4),过滤并真空浓缩得到2-甲基-7-(4,4,5,5-四甲基-[1,3,2]二氧杂硼杂环戊烷-2-基)-1H吲哚(0.960g),为深色油状物。该物质不经进一步纯化直接用于后续步骤。
步骤2
N-叔丁基-2-(2-甲基-1H-吲哚-7-基)-5-(2-三甲基甲硅烷基-乙氧基甲基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-甲酰胺
将2-溴-N-叔丁基-5-((2-(三甲基甲硅烷基)乙氧基)甲基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-甲酰胺(79mg,185μmol)、碳酸钾(51.1mg,370μmol)和2-甲基-7-(4,4,5,5-四甲基-1,3,2-二氧杂硼杂环戊烷-2-基)-1H-吲哚(95.1mg,370μmol)溶解于二噁烷(5mL)和水(0.5mL)中,然后将反应混合物以氮气冲洗1分钟。然后添加四(三苯基膦)钯(0)(21.4mg,18.5μmol),并将反应混合物置于氮气氛下并将混合物加热至80℃且保持2小时。添加甲基-7-(4,4,5,5-四甲基-1,3,2-二氧杂硼杂环戊烷-2-基)-1H-吲哚(45mg),且将反应混合物在80℃另外加热2小时。冷却反应混合物,以乙酸乙酯/乙醚(约3:1)稀释,以水和盐水洗涤,干燥(MgSO4),过滤并真空浓缩。将粗残余物经色谱(硅胶,3-15%乙酸乙酯的己烷溶液)纯化得到N-叔丁基-2-(2-甲基-1H-吲哚-7-基)-5-(2-三甲基甲硅烷基-乙氧基甲基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-甲酰胺(65mg),为油状物。MS(M+H)+=478.3.
步骤3
N-叔丁基-2-(2-甲基-1H-吲哚-7-基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-甲酰胺
向N-叔丁基-2-(2-甲基-1H-吲哚-7-基)-5-((2-(三甲基甲硅烷基)乙氧基)甲基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-甲酰胺(60mg,126μmol)在DMF(4mL)中的搅拌溶液中添加乙二胺(355mg,399μL,5.9mmol),然后添加四丁基氟化铵(389μL,389μmol)。伴随搅拌在氮气氛下将溶液加热至60℃且保持20小时。冷却反应混合物,以乙醚稀释,以水和盐水洗涤,然后干燥(MgSO4),过滤并真空浓缩得到油状物,其缓慢地结晶。将晶体以水研磨两次然后真空干燥得到N-叔丁基-2-(2-甲基-1H-吲哚-7-基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-甲酰胺(29mg),为黄色固体。MS(M+H)+=348.1;1H NMR(CDCl3)δ:8.87(s,1H),8.35(d,J=3.0Hz,1H),7.65(d,J=7.8Hz,1H),7.55-7.61(m,1H),7.20-7.30(m,2H),6.33-6.36(m,1H),2.54(s,3H),1.53(s,9H).
实施例304.
N-叔丁基-2-(2-(1H-吲哚-7-基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-甲酰胺
步骤1
N-叔丁基-2-(1H-吲哚-7-基)-5-(2-三甲基甲硅烷基-乙氧基甲基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-甲酰胺
将2-溴-N-叔丁基-5-((2-(三甲基甲硅烷基)乙氧基)甲基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-甲酰胺(50mg,117μmol)、7-(4,4,5,5-四甲基-1,3,2-二氧杂硼杂环戊烷-2-基)-1H-吲哚(37.0mg,152μmol)、碳酸钾(16.2mg,117μmol)在带有特氟隆线密封的反应试管中混合,添加二噁烷(2.5mL)和水(0.5mL),然后将混合物以氮气脱气1分钟。添加四(三苯基膦)钯(0)(13.5mg,11.7μmol),氮气鼓泡通过1分钟,然后将反应混合物加热至85℃且保持6小时,然后于75℃再加热15小时。冷却反应混合物,真空浓缩,且将残余物通过色谱(硅胶,1-15%乙酸乙酯在己烷中的溶液)纯化得到N-叔丁基-2-(1H-吲哚-7-基)-5-(2-三甲基甲硅烷基-乙氧基甲基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-甲酰胺(54mg),为油状物,其缓慢地结晶。MS(M+H)+=464.2.
步骤2
N-叔丁基-2-(2-(1H-吲哚-7-基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-甲酰胺
向N-叔丁基-2-(1H-吲哚-7-基)-5-((2-(三甲基甲硅烷基)乙氧基)甲基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-甲酰胺(54mg,116μmol)在DMF(3mL)中的搅拌溶液添加乙二胺(350mg,393μL,5.82mmol)并于60℃加热混合物。72小时后,冷却反应混合物,以水稀释,并萃取至乙酸乙酯。合并有机相并以水和盐水洗涤然后干燥(MgSO4),过滤并真空浓缩。将残余物以乙醚研磨,然后以水研磨,以二氯甲烷稀释,且最终真空除去溶剂得到N-叔丁基-2-(2-(1H-吲哚-7-基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-甲酰胺(14mg)。MS(M+H)+=334.1;1H NMR(DMSO-d6)δ:12.83(宽单峰,1H),11.46(宽单峰,1H),9.01(s,1H),8.49(s,1H),8.24(s,1H),7.81(d,J=7.8Hz,1H),7.73(d,J=7.5Hz,1H),7.52(宽单峰,1H),7.30(t,J=7.5Hz,1H),6.69(宽单峰,1H),1.55(s,9H).
实施例305.
N-叔丁基-2-(6-氯-1-甲基-1H-吲唑-3-基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-甲酰胺
步骤1
N-叔丁基-2-(6-氯-1-甲基-1H-吲唑-3-基)-5-((2-(三甲基甲硅烷基)乙氧基)甲基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-甲酰胺
于20℃向2-(6-氯-1-甲基-1H-吲唑-3-基)-5-((2-(三甲基甲硅烷基)乙氧基)甲基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-羧酸(111mg,242μmol)在DMF(4mL)中的搅拌悬浮液添加EDC(107mg,557μmol)、HOBT(107mg,557μmol)和2-甲基丙烷-2-胺(78.6mg,0.113mL,1.08mmol)。3小时后,将反应混合物以乙酸乙酯稀释,并以10%柠檬酸溶液洗涤。将有机层然后以饱和碳酸氢钠和盐水洗涤,然后干燥(硫酸钠),过滤并真空浓缩得到粗N-叔丁基-2-(6-氯-1-甲基-1H-吲唑-3-基)-5-((2-(三甲基甲硅烷基)乙氧基)甲基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-甲酰胺(140mg),为浅棕色油状物。其不经进一步纯化直接用于后续步骤。
步骤2
N-叔丁基-2-(6-氯-1-甲基-1H-吲唑-3-基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-甲酰胺
于20℃向N-叔丁基-2-(6-氯-1-甲基-1H-吲唑-3-基)-5-((2-(三甲基甲硅烷基)乙氧基)甲基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-甲酰胺(140mg,273μmol)在二氯甲烷(5mL)中的搅拌溶液添加三氟乙酸(3.11g,2.1mL,27.3mmol)。6小时后,将混合物经真空浓缩。将残余物以二氯甲烷稀释并再次浓缩。将残余物然后悬浮于二氯甲烷(5mL)中并添加乙二胺(1.23g,1.38mL,20.5mmol)。搅拌混合物15小时,然后真空浓缩。将残余物以水研磨且通过过滤得到固体。通过色谱(硅胶,25g预装填Silicycle筒,0-5%甲醇的二氯甲烷溶液梯度之间,经15分钟)纯化得到N-叔丁基-2-(6-氯-1-甲基-1H-吲唑-3-基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-甲酰胺(63mg,165μmol,60%)为淡黄色粉末。MS(M+Na)+=405;1H NMR(CDCl3)δ:11.84(宽单峰,1H),9.05(s,1H),8.38(d,J=8.7Hz,1H),8.14(d,J=3.4Hz,1H),7.96(s,1H),7.39(d,J=1.5Hz,1H),7.08(dd,J=8.5,1.7Hz,1H),4.04(s,3H),1.48(s,9H).
实施例306.
2-(6-氯-1H-吲唑-3-基)-N-异丙基-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-甲酰胺
步骤1
6-氯-3-三丁基甲锡烷基-1H-吲唑
向6-氯-3-碘-1H-吲唑(1.11g,4.0mmol)在THF(25mL)中的搅拌溶液添加氢化钠(192mg,4.8mmol)。15分钟后,将混合物冷却至-16℃。滴加异丙基氯化镁(3.00mL,6.00mmol)并于-16℃搅拌混合物2小时。然后添加三丁基氯化锡(1.56g,1.3mL,4.8mmol)且将反应混合物温热至室温。15小时后,将混合物以水和乙酸乙酯稀释。将有机层以盐水洗涤,干燥(硫酸钠),过滤并真空浓缩。将粗品棕色油状物不经进一步纯化直接用于后续步骤。
步骤2
2-(6-氯-1H-吲唑-3-基)-N-异丙基-5-((2-(三甲基甲硅烷基)乙氧基)甲基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-甲酰胺
于20℃向2-溴-N-异丙基-5-((2-(三甲基甲硅烷基)乙氧基)甲基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-甲酰胺(289mg,700μmol)和6-氯-3-(三丁基甲锡烷基)-1H-吲唑(参见实施例4,2.01g,4.55mmol)在DMF中的搅拌溶液添加碘化亚铜(I)(25.1mg,280μmol),然后将混合物以鼓泡氩气脱气15分钟。添加四(三苯基膦)钯(0)(80.9mg,70.0μmol),然后将反应混合物加热至80℃。15小时后,冷却混合物,并以乙酸乙酯和饱和氯化铵水溶液稀释。分离有机层并以盐水洗涤,然后干燥(硫酸钠),过滤并真空浓缩。将残余物经色谱(硅胶,40gAnalogix柱,20-50%乙酸乙酯在己烷中的溶液,梯度,经15分钟)纯化得到2-(6-氯-1H-吲唑-3-基)-N-异丙基-5-((2-(三甲基甲硅烷基)乙氧基)甲基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-甲酰胺(0.080g),为浅棕色油状物。通过1H NMR,其为约75%纯,单个主要杂质初步指定为6,6'-二氯-1H,1'H-[3,3']二吲唑基,并不经进一步纯化直接用于后续步骤。MS(M-H)-=483;1H NMR(CDCl3)δ:8.41(s,1H),8.35(s,1H),8.07(宽单峰,1H),7.64-7.77(m,2H),7.52(s,1H),7.16(d,J=8.7Hz,1H),5.64(s,2H),4.23-4.47(m,1H),3.45-3.58(m,2H),1.34(d,J=6.4Hz,6H),0.93(s,2H),-0.05(s,9H)
步骤3
2-(6-氯-1H-吲唑-3-基)-N-异丙基-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-甲酰胺
向2-(6-氯-1H-吲唑-3-基)-N-异丙基-5-((2-(三甲基甲硅烷基)乙氧基)甲基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-甲酰胺(0.080g,165μmol)在二氯甲烷(2mL)中的搅拌溶液添加三氟乙酸(1.88g,1.27mL,16.5mmol)。搅拌反应混合物4小时,然后经真空浓缩。将残余物以二氯甲烷稀释并再次真空浓缩,然后悬浮于二氯甲烷中并添加乙二胺(743mg,0.835mL,12.4mmol)。15小时后,浓缩混合物,以水研磨且将通过过滤得到的固体经干燥并通过色谱(硅胶,Silicycle25g筒,0-5%甲醇的二氯甲烷溶液,梯度,经15分钟)纯化得到2-(6-氯-1H-吲唑-3-基)-N-异丙基-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-甲酰胺(24mg,67.0μmol,41%)为淡黄色粉末。MS(M+Na)+=377;1H NMR(DMSO-d6)δ:13.16(宽单峰,1H),12.39(宽单峰,1H),9.12(s,1H),8.39(d,J=8.7Hz,1H),8.17(d,J=2.6Hz,1H),8.10(d,J=7.9Hz,1H),7.53(s,1H),7.09(dd,J=9.1,1.0Hz,1H),4.18-4.41(m,1H),1.31(d,J=6.4Hz,6H)
实施例307
2-(6-氯-1-乙基-1H-吲唑-3-基)-N-异丙基-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-甲酰胺
步骤1
2-(6-氯-1-乙基-1H-吲唑-3-基)-N-异丙基-5-((2-(三甲基甲硅烷基)乙氧基)甲基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-甲酰胺
将2-(6-氯-1H-吲唑-3-基)-N-异丙基-5-((2-(三甲基甲硅烷基)乙氧基)甲基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-甲酰胺(120mg,247μmol)溶解于DMF(1mL)中并冷却至0℃。添加氢化钠(12.9mg,322μmol)且将混合物于0℃搅拌30分钟。添加乙基碘(57.9mg,30.0μL,371μmol)且将混合物温热至20℃。15小时后,将混合物以水稀释,并以乙酸乙酯萃取。将有机萃取物以盐水洗涤,经无水硫酸钠干燥并真空浓缩。将残余物经色谱(硅胶,40g Analogix预填柱,20-50%乙酸乙酯在己烷中的溶液,15分钟梯度)纯化得到2-(6-氯-1-乙基-1H-吲唑-3-基)-N-异丙基-5-((2-(三甲基甲硅烷基)乙氧基)甲基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-甲酰胺(78mg,152μmol,61%),为黄色粉末。MS(M+Na)+=535;1HNMR(CDCl3)δ:9.26(s,1H),8.44-8.49(m,1H),8.39-8.42(m,1H),8.20-8.28(m,1H),7.47-7.56(m,1H),7.23(d,J=1.5Hz,1H),5.67-5.77(m,2H),4.43-4.59(m,1H),4.13(q,J=7.2Hz,1H),3.52-3.67(m,1H),1.57-1.65(m,4H),1.42(d,J=6.4Hz,4H),0.88-1.01(m,2H)
步骤2
2-(6-氯-1-乙基-1H-吲唑-3-基)-N-异丙基-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-甲酰胺
将2-(6-氯-1-乙基-1H-吲唑-3-基)-N-异丙基-5-((2-(三甲基甲硅烷基)乙氧基)甲基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-甲酰胺(78mg,152μmol)溶解于二氯甲烷中并向其中添加三氟乙酸(1.73g,1.17mL,15.2mmol)。搅拌混合物4小时,然后真空浓缩。将残余物以二氯甲烷稀释并再浓缩,且最终再次稀释在二氯甲烷中并向其中添加乙二胺(685mg,770μL,11.4mmol)。在15小时后,将混合物经真空浓缩,以水研磨且将所收集的固体经过滤并干燥。将固体经色谱(硅胶,Silicycle25g筒,0-5%甲醇的二氯甲烷溶液,15分钟梯度)纯化得到2-(6-氯-1-乙基-1H-吲唑-3-基)-N-异丙基-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-甲酰胺(53mg,138μmol,91.1%),为淡黄色粉末。MS(M+H)+=383;1H NMR(CDCl3)δ:11.74(宽单峰,1H),9.11-9.15(m,1H),8.41(d,J=8.7Hz,1H),8.20(d,J=3.0Hz,1H),8.14(d,J=7.9Hz,1H),7.44(s,1H),7.15(dd,J=8.5,1.3Hz,1H),4.28-4.48(m,3H),1.53(t,J=7.2Hz,3H),1.33(d,J=6.4Hz,6H)
实施例308
2-(1-苄基-6-氯-1H-吲唑-3-基)-N-异丙基-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-甲酰胺
步骤1
2-(1-苄基-6-氯-1H-吲唑-3-基)-N-异丙基-5-((2-(三甲基甲硅烷基)乙氧基)甲基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-甲酰胺
将2-(6-氯-1H-吲唑-3-基)-N-异丙基-5-((2-(三甲基甲硅烷基)乙氧基)甲基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-甲酰胺(120mg,247μmol)溶解于DMF(1mL)中并冷却至0℃。添加氢化钠(12.9mg,322μmol)并搅拌混合物30分钟。添加苄基溴(63.5mg,44.1μL,371μmol)且将混合物温热至20℃。15小时后,将混合物以水稀释,并以乙酸乙酯萃取。将有机萃取物以盐水洗涤,经无水硫酸钠干燥并真空浓缩。将残余物经色谱(硅胶,40g Analogix柱,20-50%乙酸乙酯在己烷中的溶液,15分钟梯度)纯化得到2-(1-苄基-6-氯-1H-吲唑-3-基)-N-异丙基-5-((2-(三甲基甲硅烷基)乙氧基)甲基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-甲酰胺(87mg,151μmol,61.1%)为淡黄色粉末。1H NMR(CDCl3)δ:9.29(s,1H),8.48(d,J=8.7Hz,1H),8.38(s,1H),8.20(d,J=7.9Hz,1H),7.43(d,J=1.5Hz,1H),7.20-7.39(m,6H),5.73(s,2H),5.68(s,2H),4.38-4.55(m,1H),3.52-3.64(m,2H),1.42(d,J=6.4Hz,6H),0.86-1.00(m,2H),-0.03(s,9H).
步骤2
2-(1-苄基-6-氯-1H-吲唑-3-基)-N-异丙基-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-甲酰胺
将2-(1-苄基-6-氯-1H-吲唑-3-基)-N-异丙基-5-((2-(三甲基甲硅烷基)乙氧基)甲基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-甲酰胺(87mg,151μmol)溶解于二氯甲烷(25mL)中并向其中添加三氟乙酸(1.72g,1.17mL,15.1mmol)。搅拌混合物4小时,然后真空浓缩。将残余物稀释在二氯甲烷中并再次浓缩,然后悬浮于二氯甲烷中并添加乙二胺(682mg,0.766mL,11.3mmol)。搅拌混合物15小时,然后真空浓缩。将残余物以水研磨且将固体通过过滤收集并干燥。将固体吸收至硅胶上并通过色谱(硅胶,Silicycle25g筒,0-5%甲醇的二氯甲烷溶液,15分钟梯度)纯化得到2-(1-苄基-6-氯-1H-吲唑-3-基)-N-异丙基-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-甲酰胺(78mg,175μmol,定量)为淡黄色粉末。MS(M-H)-=443;1HNMR(DMSO-d6)δ:12.84(宽单峰,1H),9.05-9.13(m,1H),8.37-8.50(m,2H),8.08(d,J=1.1Hz,1H),8.01(d,J=7.6Hz,1H),7.23-7.38(m,6H),5.79(s,2H),4.20(dq,J=13.6,6.7Hz,1H),1.30(d,J=6.4Hz,6H).
实施例309.
2-(6-氯-1-(环丙基甲基)-1H-吲唑-3-基)-N-异丙基-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-甲酰胺
步骤1
2-(6-氯-1-(环丙基甲基)-1H-吲唑-3-基)-N-异丙基-5-((2-(三甲基甲硅烷基)乙氧基)甲基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-甲酰胺
将2-(6-氯-1H-吲唑-3-基)-N-异丙基-5-((2-(三甲基甲硅烷基)乙氧基)甲基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-甲酰胺(120mg,247μmol)溶解于DMF(1mL)在并冷却至0℃。添加氢化钠(12.9mg,322μmol)。30分钟后,添加环丙基甲基溴(50.1mg,0.0360mL,371μmol)并将混合物温热至室温。15小时后,将混合物以水稀释,并以乙酸乙酯萃取。将有机萃取物以盐水洗涤,经无水硫酸钠干燥并真空浓缩。将残余物经色谱(硅胶,40g Analogix柱,20-50%乙酸乙酯在己烷中的溶液,15分钟梯度)纯化得到2-(6-氯-1-(环丙基甲基)-1H-吲唑-3-基)-N-异丙基-5-((2-(三甲基甲硅烷基)乙氧基)甲基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-甲酰胺(99mg,184μmol,74.2%),为黄色粉末。1H NMR(CDCl3)δ:9.27(s,1H),8.43-8.50(m,2H),8.31(d,J=8.3Hz,1H),7.54(s,1H),7.23(s,1H),5.73(s,2H),4.40-4.56(m,1H),4.35(d,J=6.8Hz,2H),3.54-3.64(m,2H),1.42(d,J=6.4Hz,7H),0.89-1.00(m,2H),0.62-0.71(m,2H),0.51(q,J=4.9Hz,2H),-0.07--0.01(m,9H)
步骤2
2-(6-氯-1-(环丙基甲基)-1H-吲唑-3-基)-N-异丙基-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-甲酰胺
将2-(6-氯-1-(环丙基甲基)-1H-吲唑-3-基)-N-异丙基-5-((2-(三甲基甲硅烷基)乙氧基)甲基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-甲酰胺(99mg,184μmol)溶解于二氯甲烷中并向其中添加三氟乙酸(1.73g,1.17mL,15.2mmol)。72小时后,将混合物经真空浓缩,将残余物稀释在二氯甲烷中,然后再次真空浓缩。通过色谱(硅胶,Analogix40g筒,0-5%甲醇的二氯甲烷溶液,梯度经15分钟)纯化得到2-(6-氯-1-(环丙基甲基)-1H-吲唑-3-基)-N-异丙基-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-甲酰胺(15mg,36.7μmol,20.0%),为灰白色粉末。MS(M+Na)+=431;1HNMR(CDCl3)δ:9.67(宽单峰,1H),9.19-9.31(m,1H),8.46(d,J=8.7Hz,1H),8.38(d,J=3.0Hz,1H),8.25(d,J=7.9Hz,1H),7.53(d,J=1.1Hz,1H),7.21-7.26(m,1H),4.41-4.55(m,1H),4.34(d,J=7.2Hz,2H),1.43(d,J=6.4Hz,6H),1.04-1.21(m,1H),0.62-0.71(m,2H),0.51(q,J=4.9Hz,2H).
实施例310.
2-(6-氯-1-(异噁唑-3-基甲基)-1H-吲唑-3-基)-N-异丙基-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-甲酰胺
步骤1
2-(6-氯-1-(异噁唑-3-基甲基)-1H-吲唑-3-基)-N-异丙基-5-((2-(三甲基甲硅烷基)乙氧基)甲基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-甲酰胺
将2-(6-氯-1H-吲唑-3-基)-N-异丙基-5-((2-(三甲基甲硅烷基)乙氧基)甲基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-甲酰胺(80mg,165μmol)溶解于DMF(1mL)中并冷却至0℃。添加氢化钠(10.6mg,264μmol)并于0℃搅拌混合物30分钟。添加3-(溴甲基)异噁唑(29.4mg,181μmol)且将混合物温热至室温。15小时后,将混合物以水稀释,并以乙酸乙酯萃取。将有机萃取物以盐水洗涤,经无水硫酸钠干燥并真空浓缩。通过色谱(硅胶,24g Analogix柱,20-50%乙酸乙酯在己烷中的溶液,15分钟梯度)纯化得到2-(6-氯-1-(异噁唑-3-基甲基)-1H-吲唑-3-基)-N-异丙基-5-((2-(三甲基甲硅烷基)乙氧基)甲基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-甲酰胺(91mg,161μmol,97.5%),为黄色粉末。MS(M+Na)+=588(88%纯度);1H NMR(CDCl3)δ:9.27(s,1H),8.47(d,J=8.7Hz,1H),8.34-8.43(m,2H),8.16(d,J=8.3Hz,1H),8.03(s,1H),7.57(s,1H),6.33(d,J=1.5Hz,1H),5.77(s,2H),5.73(s,2H),4.38-4.56(m,1H),3.53-3.65(m,2H),1.35-1.46(m,6H),0.89-1.01(m,2H),-0.07-0.02(m,9H)
步骤2
2-(6-氯-1-(异噁唑-3-基甲基)-1H-吲唑-3-基)-N-异丙基-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-甲酰胺
将2-(6-氯-1-(异噁唑-3-基甲基)-1H-吲唑-3-基)-N-异丙基-5-((2-(三甲基甲硅烷基)乙氧基)甲基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-甲酰胺溶解于二氯甲烷中并向其中添加三氟乙酸(1.79g,1.21mL,15.7mmol)。搅拌混合物120小时。形成沉淀,将其滤除。将滤液经真空浓缩并与固体合并得到中间体2-(6-氯-1-(异噁唑-3-基甲基)-1H-吲唑-3-基)-5-(羟基甲基)-N-异丙基-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-甲酰胺(73mg,157μmol)。将其溶解于60:20:1二氯甲烷:甲醇:氢氧化铵(10mL),并搅拌混合物2小时。将混合物经真空浓缩,以二氯甲烷稀释并再次浓缩得到2-(6-氯-1-(异噁唑-3-基甲基)-1H-吲唑-3-基)-N-异丙基-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-甲酰胺(67mg,154μmol,98.1%),为白色固体。MS(M+Na)+=458;1HNMR(CDCl3)δ:11.97(宽单峰,1H),9.08(s,1H),8.36(d,J=8.3Hz,1H),8.29(d,J=1.5Hz,1H),8.16(d,J=3.0Hz,1H),7.98-8.07(m,1H),7.46(s,1H),7.12(dd,J=8.5,1.3Hz,1H),6.21(d,J=1.5Hz,1H),5.64(s,2H),4.23-4.39(m,1H),1.20-1.32(m,6H).
实施例311.
2-(6-氯-1-((1-甲基-1H-咪唑-2-基)甲基)-1H-吲唑-3-基)-N-异丙基-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-甲酰胺
步骤1
2-(6-氯-1-((1-甲基-1H-咪唑-2-基)甲基)-1H-吲唑-3-基)-N-异丙基-5-((2-(三甲基甲硅烷基)乙氧基)甲基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-甲酰胺
将2-(6-氯-1H-吲唑-3-基)-N-异丙基-5-((2-(三甲基甲硅烷基)乙氧基)甲基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-甲酰胺(80mg,165μmol)溶解于DMF(1mL)中并冷却至0℃。添加氢化钠(10.6mg,264μmol)并搅拌混合物30分钟。添加2-(氯甲基)-1-甲基-1H-咪唑(23.7mg,181μmol)且将混合物温热至室温。15小时后,将混合物以水稀释,并以乙酸乙酯萃取。将有机萃取物以盐水洗涤,经无水硫酸钠干燥并真空浓缩。将残余物经色谱(硅胶,24g Analogix柱,二氯甲烷)纯化得到2-(6-氯-1-((1-甲基-1H-咪唑-2-基)甲基)-1H-吲唑-3-基)-N-异丙基-5-((2-(三甲基甲硅烷基)乙氧基)甲基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-甲酰胺(106mg),为黄色固体。MS(M+H)+=579.
步骤2
2-(6-氯-1-((1-甲基-1H-咪唑-2-基)甲基)-1H-吲唑-3-基)-N-异丙基-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-甲酰胺
将2-(6-氯-1-((1-甲基-1H-咪唑-2-基)甲基)-1H-吲唑-3-基)-N-异丙基-5-((2-(三甲基甲硅烷基)乙氧基)甲基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-甲酰胺(106mg,183μmol)溶解于二氯乙烷(10mL)中。向该混合物添加三氟乙酸(2.09g,1.41mL,18.3mmol)并将混合物加热至80℃。15小时后,将混合物经真空浓缩。将残余物溶解于60:20:1二氯甲烷:甲醇:氢氧化铵(10mL)中。2小时后,将混合物经真空浓缩,然后通过色谱(硅胶,Analogix40g,0-5%甲醇的二氯甲烷溶液,经15分钟)纯化得到2-(6-氯-1-((1-甲基-1H-咪唑-2-基)甲基)-1H-吲唑-3-基)-N-异丙基-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-甲酰胺(87mg,194μmol,106%),为黄色粉末。MS(M+H)+=449;1H NMR(CDCl3)δ:11.90-12.06(m,1H),8.97-9.07(m,1H),8.27-8.35(m,1H),8.11-8.17(m,1H),7.95-8.05(m,1H),7.72-7.82(m,1H),7.05-7.13(m,1H),6.94-7.03(m,1H),6.81-6.92(m,1H),5.69-5.83(m,2H),4.17-4.38(m,1H),3.72(s,3H),1.24(d,J=6.4Hz,6H).
实施例312.
2-(6-氯-1-((5-甲基异噁唑-3-基)甲基)-1H-吲唑-3-基)-N-异丙基-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-甲酰胺
步骤1
2-(6-氯-1-((5-甲基异噁唑-3-基)甲基)-1H-吲唑-3-基)-N-异丙基-5-((2-(三甲基甲硅烷基)乙氧基)甲基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-甲酰胺
将2-(6-氯-1H-吲唑-3-基)-N-异丙基-5-((2-(三甲基甲硅烷基)乙氧基)甲基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-甲酰胺(80mg,165μmol)溶解于DMF(1mL)在并冷却至0℃。添加氢化钠(10.6mg,264μmol)并搅拌混合物30分钟。添加3-(溴甲基)-5-甲基异噁唑(31.9mg,181μmol)且将混合物温热至室温。15小时后,将混合物以水稀释,并以乙酸乙酯萃取。将有机萃取物以盐水洗涤,经无水硫酸钠干燥并真空浓缩。将残余物经色谱(硅胶,40g Analogix柱,20%-50%乙酸乙酯在己烷中的溶液,15分钟)纯化得到2-(6-氯-1-((5-甲基异噁唑-3-基)甲基)-1H-吲唑-3-基)-N-异丙基-5-((2-(三甲基甲硅烷基)乙氧基)甲基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-甲酰胺(89mg,153μmol,93.0%),为黄色粉末。MS(M+Na)+=602;1H NMR(CDCl3)δ:9.23-9.32(m,1H),8.48(s,2H),8.18-8.30(m,1H),7.54-7.61(m,1H),7.27(m,2H),5.70-5.76(m,2H),5.65-5.69(m,2H),4.38-4.56(m,1H),3.52-3.65(m,2H),2.31-2.41(m,3H),1.35-1.47(m,6H),0.89-1.00(m,2H),-0.03(s,9H).
步骤2
2-(6-氯-1-((5-甲基异噁唑-3-基)甲基)-1H-吲唑-3-基)-N-异丙基-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-甲酰胺
将2-(6-氯-1-((5-甲基异噁唑-3-基)甲基)-1H-吲唑-3-基)-N-异丙基-5-((2-(三甲基甲硅烷基)乙氧基)甲基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-甲酰胺(89mg,153μmol)溶解于1,2-二氯乙烷(3mL)中并置于密封管中。向其中添加三氟乙酸(1.75g,1.18mL,15.3mmol)。将管密封并将混合物加热至80℃。15小时后,将混合物冷却并真空浓缩。将残余物经色谱(硅胶,24g Analogix柱,95:5二氯甲烷:甲醇)纯化,然后经制备型TLC(95:5二氯甲烷/甲醇)纯化得到2-(6-氯-1-((5-甲基异噁唑-3-基)甲基)-1H-吲唑-3-基)-N-异丙基-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-甲酰胺(15mg,33.3μmol,22%)。MS(M+Na)+=472;1H NMR(CDCl3)δ:9.37(s,1H),9.22-9.32(m,1H),8.42-8.51(m,1H),8.34-8.40(m,1H),8.11-8.21(m,1H),7.56-7.63(m,1H),7.19-7.36(m,1H),5.90-5.97(m,1H),5.63-5.75(m,2H),4.38-4.56(m,1H),2.38(s,3H),1.41(d,J=6.4Hz,6H).
实施例313.
N-叔丁基-2-(1-(2-(二甲基氨基)乙基)-6-氟-1H-吲唑-3-基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-甲酰胺
将N-叔丁基-2-(1-(2-(二甲基氨基)乙基)-6-氟-1H-吲唑-3-基)-5-((2-(三甲基甲硅烷基)乙氧基)甲基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-甲酰胺(0.085g,153μmol)置于密封管中并溶解于二氯甲烷(2mL)中。添加三氟乙酸(1.75g,1.18mL,15.3mmol)并将管密封并将混合物加热至80℃。15小时后,将混合物冷却,然后真空浓缩。将残余物从二氯甲烷/甲醇和环己烷重结晶得到N-叔丁基-2-(1-(2-(二甲基氨基)乙基)-6-氟-1H-吲唑-3-基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-甲酰胺(38mg,89.7μmol,58.5%),为白色粉末。MS(M+H)+=424;1H NMR(CDCl3)δ:9.07(s,1H),8.42-8.50(m,1H),8.24(s,1H),7.33-7.41(m,1H),7.02(s,1H),4.88(s,2H),3.68-3.79(m,2H),2.85(s,7H),1.55(s,6H).
实施例314.
2-(6-氟-1-(2-吗啉代-2-氧代乙基)-1H-吲唑-3-基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-甲酰胺
将N-叔丁基-2-(6-氟-1-(2-吗啉代-2-氧代乙基)-1H-吲唑-3-基)-5-((2-(三甲基甲硅烷基)乙氧基)甲基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-甲酰胺(42mg,68.9μmol)并置于密封管中并溶解于二氯甲烷(2mL)中。添加三氟乙酸(785mg,531μL,6.89mmol)并将试管密封并将混合物加热至80℃。15小时后,将混合物冷却并真空浓缩。从二氯甲烷/甲醇和环己烷重结晶得到2-(6-氟-1-(2-吗啉代-2-氧代乙基)-1H-吲唑-3-基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-甲酰胺(7mg,16.5μmol,24.0%),为白色粉末。MS(M-H)-=422;1H NMR(DMSO-d6)δ:8.42(s,1H),7.72(dd,J=8.9,5.1Hz,1H),7.65(s,1H),6.73(d,J=9.4Hz,1H),6.37-6.47(m,1H),4.82(s,2H),2.89-3.09(m,6H),2.82(d,J=4.9Hz,2H).
实施例315.
2-(6-氟-1-甲基-1H-吲唑-3-基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-羧酸d9-叔丁基酰胺
步骤1
2-(6-氟-1-甲基-1H-吲唑-3-基)-5-(2-三甲基甲硅烷基-乙氧基甲基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-羧酸d9-叔丁基酰胺
将2-(6-氟-1-甲基-1H-吲唑-3-基)-5-((2-(三甲基甲硅烷基)乙氧基)甲基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-羧酸(99mg,224μmol)、N1-((乙基亚氨基)亚甲基)-N3,N3-二甲基丙烷-1,3-二胺盐酸盐(98.9mg,516μmol)和1H-苯并[d][1,2,3]三唑-1-醇水合物(98.7mg,516μmol)与DMF(4mL)混合得到无色溶液。添加叔丁基-d9-胺(73.7mg,897μmol)。72小时后,将反应混合物倒入10mL柠檬酸溶液(10%)并以乙酸乙酯萃取(3x15mL)。将粗物质经色谱(硅胶,4g,25-70%乙酸乙酯在己烷中的溶液)纯化得到2-(6-氟-1-甲基-1H-吲唑-3-基)-5-(2-三甲基甲硅烷基-乙氧基甲基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-羧酸d9-叔丁基酰胺(80mg,127μmol,56.4%),被~20%回收的起始物质污染。其不经进一步纯化直接用于后续步骤。MS(M+Na)+=528;1H NMR(CDCl3)δ:9.26(s,1H),8.55(dd,J=9.1,4.9Hz,1H),8.38(s,1H),8.05-8.15(m,1H),7.16(dd,J=9.1,2.3Hz,1H),7.06(dt,J=9.1,2.3Hz,1H),5.76(s,2H),4.19(s,3H),3.58-3.65(m,2H),0.95-1.02(m,2H),-0.03-0.02(m,9H).
步骤2
2-(6-氟-1-甲基-1H-吲唑-3-基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-羧酸d9-叔丁基酰胺
将2-(6-氟-1-甲基-1H-吲唑-3-基)-5-(2-三甲基甲硅烷基-乙氧基甲基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-羧酸d9-叔丁基酰胺(80mg,158μmol)溶解于二氯甲烷(2mL)中。添加三氟乙酸(1.35g,914μL,11.9mmol)。15小时后,将混合物经真空浓缩成黄色固体。将其悬浮于甲醇:氢氧化铵(9:1,10mL)中,搅拌15分钟,然后真空浓缩且通过色谱(球形硅胶,11g,4-10%的氢氧化铵:甲醇1:9混合物的二氯甲烷溶液)纯化得到2-(6-氟-1-甲基-1H-吲唑-3-基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-羧酸d9-叔丁基酰胺(28mg,74.6μmol,47.1%),为浅黄色固体。MS(M+Na)+=398;1H NMR(DMSO-d6)δ:12.5(宽单峰,1H),8.95(s,1H),8.35(dd,J=9.1,5.3Hz,1H),8.26(s,1H),7.78(s,1H),7.55(dd,J=10.2,2.3Hz,1H),7.01(dt,J=9.1,2.6Hz,1H),4.01(s,3H).
实施例316.
2-(6-氯-1-甲基-1H-吲唑-3-基)-N-(1,3-二羟基丙烷-2-基)-5H-吡咯并[3,2-b]吡嗪-7-甲酰胺
步骤1
2-(6-氯-1-甲基-1H-吲唑-3-基)-N-(1,3-二羟基丙烷-2-基)-5-((2-(三甲基甲硅烷基)乙氧基)甲基)-5H-吡咯并[3,2-b]吡嗪-7-甲酰胺
向2-(6-氯-1-甲基-1H-吲唑-3-基)-5-((2-(三甲基甲硅烷基)乙氧基)甲基)-5H-吡咯并[3,2-b]吡嗪-7-羧酸(0.07g,0.15mmol)和HATU(0.07g,0.18mmol)在DMF(4.0mL)的搅拌混合物添加N.N-二异丙基-乙胺(0.024g,0.032mL,0.18mmol)。将混合物在室温搅拌30分钟然后添加2-氨基丙烷-1,3-二醇(0.021g,0.23mmol)。18小时后,将反应混合物以乙酸乙酯和水稀释。将水相以EtOAc萃取,然后将合并的有机相以水和盐水洗涤,干燥(MgSO4),过滤并浓缩。将残余物通过过滤收集,并以二氯甲烷洗涤并在真空烘箱中干燥得到2-(6-氯-1-甲基-1H-吲唑-3-基)-N-(1,3-二羟基丙烷-2-基)-5-((2-(三甲基甲硅烷基)乙氧基)甲基)-5H-吡咯并[3,2-b]吡嗪-7-甲酰胺(0.035g,0.07mmol,43%),为白色固体。1H NMR(CDCl3)δ:9.24(s,1H),8.75(d,J=7.3Hz,1H),8.57(d,J=8.5Hz,1H),8.35(s,1H),7.44(s,1H),7.24(s,1H),5.68(s,2H),4.42(宽单峰,1H),4.14(s,3H),4.01-4.12(m,4H),3.57(t,J=8.0Hz,2H),2.51(宽单峰,2H),0.94(t,J=7.9Hz,2H),-0.04(s,9H)
步骤2
2-(6-氯-1-甲基-1H-吲唑-3-基)-N-(1,3-二羟基丙烷-2-基)-5H-吡咯并[3,2-b]吡嗪-7-甲酰胺
于20℃向2-(6-氯-1-甲基-1H-吲唑-3-基)-N-(1,3-二羟基丙烷-2-基)-5-((2-(三甲基甲硅烷基)乙氧基)甲基)-5H-吡咯并[3,2-b]吡嗪-7-甲酰胺(0.035g,0.066mmol)在二氯甲烷(3mL)中的搅拌溶液添加TFA(0.38g,0.25mL,3.3mmol)。18小时后,将混合物经真空浓缩。将残余物以二氯甲烷稀释并再次浓缩。将残余物然后悬浮于二氯甲烷(3mL)中并添加乙二胺(0.2g,0.22mL,3.3mmol)。搅拌混合物3小时,然后真空浓缩。将残余物通过过滤收集并通过HPLC纯化(以MeCN/水(20-95%)洗脱)得到2-(6-氯-1-甲基-1H-吲唑-3-基)-N-(1,3-二羟基丙烷-2-基)-5H-吡咯并[3,2-b]吡嗪-7-甲酰胺(0.009g,0.022mmol,34%),为白色粉末。MS(M+H)+=401;1H NMR(DMSO-d6)δ:12.86(宽单峰,1H),9.15(s,1H),8.73(d,J=8.5Hz,1H),8.44(s,1H),8.24(d,J=8.8Hz,1H),7.96(s,1H),7.32(d,J=8.8Hz,1H),4.93-5.02(m,2H),4.17(s,4H),3.56-3.77(m,4H).
实施例317.
2-(6-氯-1-甲基-1H-吲唑-3-基)-N-(环丙基甲基)-5H-吡咯并[3,2-b]吡嗪-7-甲酰胺
步骤1
2-(6-氯-1-甲基-1H-吲唑-3-基)-N-(环丙基甲基)-5-((2-(三甲基甲硅烷基)乙氧基)甲基)-5H-吡咯并[3,2-b]吡嗪-7-甲酰胺
向2-(6-氯-1-甲基-1H-吲唑-3-基)-5-((2-(三甲基甲硅烷基)乙氧基)甲基)-5H-吡咯并[3,2-b]吡嗪-7-羧酸(0.07g,0.15mmol)和HATU(0.07g,0.18mmol)在DMF(4.0mL)中的搅拌混合物添加N.N-二异丙基-乙胺(0.024g,0.032mL,0.18mmol)。30分钟后,添加环丙基甲胺(0.016g,0.23mmol)。18小时后,将反应混合物以乙酸乙酯和水稀释。将水相以EtOAc萃取,然后将合并的有机相以水和盐水洗涤,干燥(MgSO4)。过滤并浓缩。将残余物经色谱(硅胶,24gAnalogix柱,30-100%EtOAc的己烷溶液,梯度,经40分钟)纯化得到2-(6-氯-1-甲基-1H-吲唑-3-基)-N-(环丙基甲基)-5-((2-(三甲基甲硅烷基))甲基)-5H-吡咯并[3,2-b]吡嗪-7-甲酰胺(0.049g,0.096mmol,63%),为白色固体。1H NMR(CDCl3)δ:9.25(s,1H),8.47(d,J=8.8Hz,1H),8.30-8.39(m,2H),7.49(s,1H),7.21(d,J=8.8Hz,1H),5.73(s,2H),4.17(s,3H),3.59(t,J=8.2Hz,2H),3.42-3.54(m,2H),1.22(dd,J=13.1,6.5Hz,1H),0.95(t,J=8.0Hz,2H),0.66(d,J=7.5Hz,2H),0.40(d,J=4.3Hz,2H),-0.04(s,9H)
步骤2
2-(6-氯-1-甲基-1H-吲唑-3-基)-N-(环丙基甲基)-5H-吡咯并[3,2-b]吡嗪-7-甲酰胺
于20℃向2-(6-氯-1-甲基-1H-吲唑-3-基)-N-(环丙基甲基)-5-((2-(三甲基甲硅烷基)乙氧基)甲基)-5H-吡咯并[3,2-b]吡嗪-7-甲酰胺(0.049g,0.096mmol)在二氯甲烷(5mL)中的搅拌溶液添加TFA(0.55g,0.36mL,4.78mmol)。18小时后,将混合物经真空浓缩。将残余物以二氯甲烷稀释并再次浓缩。将残余物然后悬浮于二氯甲烷(5mL)中并添加乙二胺(0.29g,0.32mL,4.78mmol)。搅拌混合物18小时,然后真空浓缩。将残余物以水研磨并通过过滤收集,以水洗涤并在真空烘箱中干燥得到2-(6-氯-1-甲基-1H-吲唑-3-基)-N-(环丙基甲基)-5H-吡咯并[3,2-b]吡嗪-7-甲酰胺(0.034g,0.089mmol,93%),为黄色固体。MS(M+H)+=381;1H NMR(DMSO-d6)δ:9.10(s,1H),8.47(d,J=8.7Hz,2H),8.44(s,1H),8.21(t,J=5.4Hz,1H),8.00(d,J=1.3Hz,2H),7.31(dd,J=8.6,1.8Hz,2H),4.18(s,3H),3.33-3.40(m,2H),1.04-1.28(m,1H),0.48-0.65(m,2H),0.27-0.41(m,2H).
实施例318.
2-(5-氯-吲唑-1-基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-羧酸(2-羟基-1,1-二甲基-乙基)-酰胺
步骤1
2-(5-氯-1H-吲唑-1-基)-N-(1-羟基-2-甲基丙烷-2-基)-5-((2-(三甲基甲硅烷基)乙氧基)甲基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-甲酰胺
将2-溴-N-(1-羟基-2-甲基丙烷-2-基)-5-((2-(三甲基甲硅烷基)乙氧基)甲基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-甲酰胺(145mg,328μmol)溶解于甲苯(3mL)中并添加碘化亚铜(I)(3.29mg,36.7μmol)、碘化钠(98.2mg,655μmol)和反式-N,N'-二甲基环己烷-1,2-二胺(11.9mg,83.6μmol)。将混合物以鼓泡氮气脱气,然后密封并将混合物加热至110℃。15小时后,添加-氯-1H-吲唑(50mg,328μmol)和磷酸三钾(146mg,688μmol),将混合物再次脱气,并将混合物密封且再加热混合物24小时。将混合物冷却,过滤滤液浓缩并通过色谱(硅胶,24gAnalogix柱,0-40%乙酸乙酯在己烷中的溶液)纯化得到2-(5-氯-吲唑-1-基)-5-(2-三甲基甲硅烷基-乙氧基甲基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-羧酸(2-羟基-1,1-二甲基-乙基)-酰胺(124mg,74%),为固体。MS(M+H)+=515;1H NMR(CDCl3)d:9.19(s,1H),8.52(d,J=8.9Hz,1H),8.37(s,1H),8.24(s,1H),7.89(s,1H),7.81-7.85(m,1H),7.47(dd,J=8.9,1.9Hz,1H),5.73(s,2H),3.81(s,2H),3.60(dd,J=8.8,7.6Hz,2H),1.54(s,6H),0.91-1.01(m,2H),-0.02(s,9H)
步骤2(7166-005)
2-(5-氯-吲唑-1-基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-羧酸(2-羟基-1,1-二甲基-乙基)-酰胺
将2-(5-氯-1H-吲唑-1-基)-N-(1-羟基-2-甲基丙烷-2-基)-5-((2-(三甲基甲硅烷基)乙氧基)甲基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-甲酰胺(124mg,241μmol)溶解于二氯甲烷(3mL)中,然后添加三氟乙酸(1mL)。15小时后,将混合物经真空浓缩并添加1/10/60氢氧化铵/甲醇/二氯甲烷溶液(25mL)。1小时后,将混合物经真空浓缩并通过色谱(硅胶,24g Analogix柱,0-4%的甲醇,含10%氢氧化铵在二氯甲烷中的溶液)纯化得到2-(5-氯-吲唑-1-基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-羧酸(2-羟基-1,1-二甲基-乙基)-酰胺(57.7mg,62%),为固体。MS(M+H)+=385;1H NMR(DMSO-d6)δ:9.04(s,1H),8.70(d,J=9.0Hz,1H),8.53(s,1H),8.43(s,1H),8.07(d,J=1.5Hz,1H),7.63(s,1H),7.60(d,J=2.1Hz,1H),3.59(d,J=5.7Hz,2H),1.44(s,6H).
实施例319.
2-(5-氯-3-甲基-吲唑-1-基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-羧酸(2-羟基-1,1-二甲基-乙基)-酰胺
步骤1
2-(5-氯-3-甲基-1H-吲唑-1-基)-N-(1-羟基-2-甲基丙烷-2-基)-5-((2-(三甲基甲硅烷基)乙氧基)甲基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-甲酰胺
将2-溴-N-(1-羟基-2-甲基丙烷-2-基)-5-((2-(三甲基甲硅烷基)乙氧基)甲基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-甲酰胺(110mg,248μmol)溶解于甲苯(1.4mL)中,并添加碘化亚铜(I)(2.49mg,27.8μmol)、碘化钠(74.4mg,496μmol)和反式-N,N'-二甲基环己烷-1,2-二胺(9.00mg,63.3μmol)。将混合物在氮气下密封且将混合物于110℃加热。15小时后,添加5-氯-3-甲基-1H-吲唑(41.3mg,248μmol)和磷酸三钾(111mg521μmol),对混合物真空脱气,以氮气回填,且将混合物在密封管中于110℃加热24小时。将混合物冷却,过滤,并且将滤饼以乙酸乙酯洗涤。将合并的滤液经浓缩且通过色谱(硅胶,24g Analogix柱,0-40%乙酸乙酯在己烷中的溶液)纯化得到2-(5-氯-3-甲基-1H-吲唑-1-基)-N-(1-羟基-2-甲基丙烷-2-基)-5-((2-(三甲基甲硅烷基)乙氧基)甲基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-甲酰胺(80mg,61%)。1H NMR(CDCl3)d:9.15(s,1H),8.47(d,J=9.0Hz,1H),8.34(s,1H),7.91(s,1H),7.75(d,J=1.5Hz,1H),7.45(dd,J=8.9,1.8Hz,1H),5.72(s,2H),3.81(s,2H),3.53-3.65(m,2H),2.68(s,3H),1.54(s,6H),0.89-1.01(m,2H),-0.03(s,9H).
步骤2
2-(5-氯-3-甲基-吲唑-1-基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-羧酸(2羟基-1,1-二甲基-乙基)-酰胺
将2-(5-氯-3-甲基-1H-吲唑-1-基)-N-(1-羟基-2-甲基丙烷-2-基)-5-((2-(三甲基甲硅烷基)乙氧基)甲基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-甲酰胺(80mg,151μmol)溶解于二氯甲烷(2mL)中并添加三氟乙酸(1mL)。在搅拌15小时后,将混合物经真空浓缩,添加氢氧化铵/甲醇/二氯甲烷的1/10/60混合物(25mL),并搅拌混合物1小时,然后真空浓缩。通过色谱(硅胶,24g Analogix柱,0-4%甲醇,含10%氢氧化铵在二氯甲烷中的溶液)纯化得到2-(5-氯-3-甲基-吲唑-1-基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-羧酸(2羟基-1,1-二甲基-乙基)-酰胺(46.8mg77%),为固体。MS(M-H)-=397;1H NMR(DMSO-d6.)δ:8.99(s,1H),8.65(d,J=9.0Hz,1H),8.39(d,J=2.6Hz,1H),8.05(d,J=1.5Hz,1H),7.59-7.62(m,1H),7.58(d,J=2.1Hz,1H),3.59(d,J=5.7Hz,2H),2.64(s,3H),1.44(s,6H).
实施例320.
2-(5-氟-吲唑-1-基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-羧酸(2-羟基-1,1-二甲基-乙基)-酰胺
步骤1
2-(5-氟-1H-吲唑-1-基)-N-(1-羟基-2-甲基丙烷-2-基)-5((2(三甲基甲硅烷基)乙氧基)甲基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-甲酰胺
将2-溴-N-(1-羟基-2-甲基丙烷-2-基)-5-((2-(三甲基甲硅烷基)乙氧基)甲基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-甲酰胺(110mg,248μmol)溶解于甲苯(1.4mL)中并添加碘化亚铜(I)(2.49mg,27.8μmol)、碘化钠(74.4mg,496μmol)和反式-N,N’-二甲基环己烷-1,2-二胺(9.00mg,63.3μmol)。将混合物密封在氮气下且将混合物于110℃加热15小时。添加5-氟-1H-吲唑(33.8mg,248μmol)和磷酸三钾(111mg521μmol),将混合物以氮气脱气,且将混合物在密封管中于110℃加热15小时。过滤混合物,将滤饼以乙酸乙酯洗涤,且将滤液真空浓缩。通过色谱(硅胶,24g Analogix柱,0-40%乙酸乙酯在己烷中的溶液)纯化得到2-(5-氟-1H-吲唑-1-基)-N-(1-羟基-2-甲基丙烷-2-基)-5((2(三甲基甲硅烷基)乙氧基)甲基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-甲酰胺(111mg,90%)。1H NMR(CDCl3)δ:9.19(s,1H),8.55(dd,J=9.1,4.2Hz,1H),8.37(s,1H),8.26(s,1H),7.92(s,1H),7.49(dd,J=8.1,2.3Hz,1H),7.28-7.33(m,1H),5.73(s,2H),3.81(s,2H),3.53-3.66(m,2H),1.54(s,6H),0.91-1.01(m,2H),-0.02(s,9H).
步骤2
2-(5-氟-吲唑-1-基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-羧酸(2-羟基-1,1-二甲基-乙基)-酰胺
向2-(5-氟-1H-吲唑-1-基)-N-(1-羟基-2-甲基丙烷-2-基)-5-((2-(三甲基甲硅烷基)乙氧基)甲基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-甲酰胺(50mg,100μmol)在二氯甲烷(2mL)中的搅拌溶液添加三氟乙酸(1mL)。15小时后,将混合物经真空浓缩并添加氢氧化铵/甲醇/二氯甲烷的1/10/60混合物(25mL)。1小时后,将混合物经真空浓缩并通过色谱(硅胶,24g Analogix柱,0-4%甲醇,含10%氢氧化铵在二氯甲烷中的溶液)纯化得到2-(5-氟-吲唑-1-基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-羧酸(2-羟基-1,1-二甲基-乙基)-酰胺(25mg,68%)。MS(M-H)-=367;1HNMR(DMSO-d6)δ:9.04(s,1H),8.70(dd,J=9.3,4.6Hz,1H),8.52(d,J=0.8Hz,1H),8.41(s,1H),7.76(dd,J=8.9,2.3Hz,1H),7.63(s,1H),7.49(d,J=2.6Hz,1H),3.57-3.62(m,2H),1.44(s,6H).
实施例321.
2-吲唑-1-基-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-羧酸(2-羟基-1,1-二甲基-乙基)-酰胺
步骤1(7166-008)
N-(1-羟基-2-甲基丙烷-2-基)-2-(1H-吲唑-1-基)-5-((2-(三甲基甲硅烷基)乙氧基)甲基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-甲酰胺
向2-溴-N-(1-羟基-2-甲基丙烷-2-基)-5-((2-(三甲基甲硅烷基)乙氧基)甲基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-甲酰胺(140mg,316μmol)在甲苯(2mL)中的搅拌溶液添加碘化亚铜(I)(3.17mg,35.4μmol)、碘化钠(94.7mg,631μmol)和反式-N,N’-二甲基环己烷-1,2-二胺(11.5mg,80.5μmol)。将反应混合物密封在氮气下且将混合物于110℃加热15小时。向混合物添加1H-吲唑(37.3mg,316μmol)和磷酸三钾(141mg,663μmol),然后对反应器脱气,并填充以氮气,且将混合物在密封管中于110℃加热15小时。过滤混合物,将滤饼以乙酸乙酯洗涤,且将滤液经真空浓缩。通过谱(硅胶,24g Analogix柱,0-40%乙酸乙酯在己烷中的溶液)纯化得到N-(1-羟基-2-甲基丙烷-2-基)-2-(1H-吲唑-1-基)-5-((2-(三甲基甲硅烷基)乙氧基)甲基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-甲酰胺(112mg,74%)。1H NMR(CDCl3)d:9.21(s,1H),8.58(d,J=8.5Hz,1H),8.35(s,1H),8.30(s,1H),8.01(s,1H),7.87(d,J=8.1Hz,1H),7.53(t,J=7.6Hz,1H),7.31-7.41(m,1H),5.73(s,2H),3.81(s,2H),3.55-3.66(m,2H),1.55(s,6H),0.89-1.04(m,2H),-0.02(s,9H).
步骤2
2-吲唑-1-基-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-羧酸(2-羟基-1,1-二甲基-乙基)-酰胺
向N-(1-羟基-2-甲基丙烷-2-基)-2-(1H-吲唑-1-基)-5-((2-(三甲基甲硅烷基)乙氧基)甲基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-甲酰胺(112mg,100μmol)在二氯甲烷(2mL)中的搅拌溶液添加三氟乙酸(1mL)。15小时后,浓缩混合物,添加25mL的氢氧化铵/甲醇/二氯甲烷的1/10/60混合物,并搅拌混合物1小时。将混合物经真空浓缩然后通过色谱(硅胶,24g Analogix柱,0-4%甲醇,含10%氢氧化铵在二氯甲烷中的溶液.15分钟梯度)纯化得到2-吲唑-1-基-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-羧酸(2-羟基-1,1-二甲基-乙基)-酰胺(51mg,63%)。MS(M+H)+=351;1H NMR(DMSO-d6)δ:9.05(s,1H),8.68(d,J=8.1Hz,1H),8.54(s,1H),8.40(s,1H),7.96(d,J=7.9Hz,1H),7.65(s,1H),7.60(t,J=7.8Hz,1H),7.34-7.43(m,1H),3.62(d,J=5.5Hz,2H),1.44(s,6H).
实施例322.
2-(6-氯-吲唑-1-基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-羧酸(2-羟基-1,1-二甲基-乙基)-酰胺
步骤1
2-(6-氯-1H-吲唑-1-基)-N-(1-羟基-2-甲基丙烷-2-基)-5-((2-(三甲基甲硅烷基)乙氧基)甲基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-甲酰胺
向2-溴-N-(1-羟基-2-甲基丙烷-2-基)-5-((2-(三甲基甲硅烷基)乙氧基)甲基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-甲酰胺(140mg,316μmol)在甲苯(2mL)中的搅拌溶液添加碘化亚铜(I)(3.17mg,35.4μmol)、碘化钠(94.7mg,631μmol)和反式-N,N’-二甲基环己烷-1,2-二胺(11.5mg,80.5μmol)。将反应混合物密封在氮气下且将混合物于110℃加热15小时。添加6-氯-1H-吲唑(48.2mg,316μmol)和磷酸三钾(141mg,663μmol)且将混合物脱气并填充以氮气,然后在密封管中于110℃加热15小时。过滤混合物,将滤饼以乙酸乙酯洗涤,且将滤液经真空浓缩。通过色谱(硅胶,24g Analogix柱,0-40%乙酸乙酯在己烷中的溶液)纯化得到2-(6-氯-1H-吲唑-1-基)-N-(1-羟基-2-甲基丙烷-2-基)-5-((2-(三甲基甲硅烷基)乙氧基)甲基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-甲酰胺(124mg,76%)。1H NMR(CDCl3)δ:9.14(s,1H),8.51-8.55(m,1H),8.38(s,1H),8.26(d,J=1.0Hz,1H),7.91(s,1H),7.78(dd,J=8.5,0.5Hz,1H),7.33(dd,J=8.5,1.8Hz,1H),5.73(s,2H),3.80(s,2H),3.57-3.64(m,2H),1.56(s,6H),0.96(dd,J=8.8,7.8Hz,2H),-0.02(s,9H).
步骤2
2-(6-氯-吲唑-1-基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-羧酸(2-羟基-1,1-二甲基-乙基)-酰胺
向2-(6-氯-1H-吲唑-1-基)-N-(1-羟基-2-甲基丙烷-2-基)-5-((2-(三甲基甲硅烷基)乙氧基)甲基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-甲酰胺(124mg,241μmol)在二氯甲烷(2mL)中的搅拌溶液添加三氟乙酸(1mL)。在15小时后,将混合物经浓缩且添加25mL的氢氧化铵/甲醇/二氯甲烷的1/10/60混合物。1小时后,将混合物经真空浓缩。通过色谱(硅胶,24g Analogix柱,0-4%甲醇,含10%氢氧化铵在二氯甲烷中的溶液)纯化得到2-(6-氯-吲唑-1-基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-羧酸(2-羟基-1,1-二甲基-乙基)-酰胺(75mg,81%)。MS(M+H)+=385;1HNMR(DMSO-d6)δ:8.97(s,1H),8.56(s,2H),8.44(s,1H),7.99(d,J=8.7Hz,1H),7.64(s,1H),7.36-7.48(m,1H),3.62(d,J=5.7Hz,2H),1.43(s,6H).
实施例323.
2-(5-甲氧基-吲唑-1-基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-羧酸叔丁基酰胺
步骤1
N-叔丁基-2-(5-甲氧基-1H-吲唑-1-基)-5-((2-(三甲基甲硅烷基)乙氧基)甲基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-甲酰胺
向2-溴-N-叔丁基-5-((2-(三甲基甲硅烷基)乙氧基)甲基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-甲酰胺(150mg,351μmol)在甲苯(1mL)中的搅拌溶液添加碘化亚铜(I)(3.52mg,39.3μmol)、碘化钠(105mg,702μmol)和反式-N,N’-二甲基环己烷-1,2-二胺(12.7mg,89.5μmol)。将反应混合物密封在氮气下且将混合物于110℃加热15小时。添加5-甲氧基-1H-吲唑(52.0mg,351μmol)和磷酸三钾(156mg,737μmol)且将混合物脱气,填充以氮气,且将混合物在密封管中于110℃加热15小时。过滤混合物,将滤饼以乙酸乙酯洗涤,且将滤液经真空浓缩。通过色谱(硅胶,24g Analogix柱,0-40%乙酸乙酯在己烷中的溶液)纯化得到N-叔丁基-2-(5-甲氧基-1H-吲唑-1-基)-5-((2-(三甲基甲硅烷基)乙氧基)甲基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-甲酰胺(22mg,13%)。1H NMR(CDCl3)δ:9.18(s,1H),8.52(d,J=9.0Hz,1H),8.34(s,1H),8.20(s,1H),7.75(s,1H),7.10-7.22(m,2H),5.71(s,2H),3.93(s,3H),3.53-3.64(m,2H),1.61(s,9H),0.89-1.00(m,2H),-0.03(s,9H).
步骤2
2-(5-甲氧基-吲唑-1-基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-羧酸叔丁基酰胺
向N-叔丁基-2-(5-甲氧基-1H-吲唑-1-基)-5-((2-(三甲基甲硅烷基)乙氧基)甲基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-甲酰胺(22mg,44.5μmol)在二氯甲烷(1mL)中的搅拌溶液添加三氟乙酸(0.3mL)。15小时后,将混合物经真空浓缩并添加25mL的氢氧化铵/甲醇/二氯甲烷的1/10/60混合物。1小时后,将混合物经真空浓缩。通过色谱(硅胶,24g Analogix柱,0-5%的甲醇,含10%氢氧化铵在二氯甲烷中的溶液)纯化得到2-(5-甲氧基-吲唑-1-基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-羧酸叔丁基酰胺(7.4mg,46%)。MS(M+H)+=365;1H NMR(DMSO-d6)d:9.04(s,1H),8.70(dd,J=9.3,4.6Hz,1H),8.52(d,J=0.8Hz,1H),8.41(s,1H),7.76(dd,J=8.9,2.3Hz,1H),7.63(s,1H),7.49(d,J=2.6Hz,1H),3.86(s,3H),1.51(s,9H).
实施例324.
2-(5-氯-吲唑-1-基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-羧酸叔丁基酰胺
步骤1
N-叔丁基-2-(5-氯-1H-吲唑-1-基)-5-((2-(三甲基甲硅烷基)乙氧基)甲基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-甲酰胺
向2-溴-N-叔丁基-5-((2-(三甲基甲硅烷基)乙氧基)甲基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-甲酰胺(150mg,351μmol)在甲苯(1mL)中的搅拌溶液添加碘化亚铜(I)(3.52mg,39.3μmol)、碘化钠(105mg,702μmol)和反式-N,N’-二甲基环己烷-1,2-二胺(12.7mg,89.5μmol)。将反应混合物密封在氮气下且将混合物于110℃加热15小时,然后添加5-氯-1H-吲唑(53.5mg,351μmol)和磷酸三钾(156mg,737μmol)。将混合物脱气,填充以氮气,且将混合物在密封管中于110℃加热15小时。过滤混合物,将滤饼以乙酸乙酯洗涤,将滤液真空浓缩。通过色谱(硅胶,24g Analogix柱,0-40%乙酸乙酯在己烷中的溶液)纯化得到N-叔丁基-2-(5-氯-1H-吲唑-1-基)-5-((2-(三甲基甲硅烷基)乙氧基)甲基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-甲酰胺(150mg,86%)。1H NMR(CDCl3)δ:9.17(s,1H),8.56(d,J=8.9Hz,1H),8.37(s,1H),8.24(s,1H),7.83(s,1H),7.68(s,1H),7.46(dd,J=8.9,1.6Hz,1H),5.72(s,2H),3.51-3.65(m,2H),1.61(s,9H),0.87-1.03(m,2H),-0.03(s,9H).
步骤2
2-(5-氯-吲唑-1-基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-羧酸叔丁基酰胺
向N-叔丁基-2-(5-氯-1H-吲唑-1-基)-5-((2-(三甲基甲硅烷基)乙氧基)甲基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-甲酰胺(144mg,289μmol)在二氯甲烷(3mL)中的搅拌溶液添加三氟乙酸(1mL)。在15小时后,然后将混合物经真空浓缩然后添加25mL氢氧化铵/甲醇/二氯甲烷的1/10/60混合物。1小时后,将混合物经真空浓缩。通过色谱(硅胶,24g Analogix柱,0-5%的甲醇溶液,含10%氢氧化铵在二氯甲烷中的溶液)纯化得到2-(5-氯-吲唑-1-基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-羧酸叔丁基酰胺(40.9mg,38%)。MS(M+H)+=369;1H NMR(DMSO-d6)δ:9.02(s,1H),8.60(s,1H),8.57(s,1H),8.53(s,1H),8.43(s,1H),8.09(s,1H),7.61(s,1H),1.50(s,9H).
实施例325.
2-(5-二氟甲氧基-吲唑-1-基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-羧酸叔丁基酰胺
步骤1
N-叔丁基-2-(5-(二氟甲氧基)-1H-吲唑-1-基)-5-((2-(三甲基甲硅烷基)乙氧基)甲基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-甲酰胺
向2-溴-N-叔丁基-5-((2-(三甲基甲硅烷基)乙氧基)甲基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-甲酰胺(150mg,351μmol)在甲苯(1mL)的搅拌溶液添加碘化亚铜(I)(3.52mg,39.3μmol)、碘化钠(105mg,702μmol)和反式-N,N’-二甲基环己烷-1,2-二胺(12.7mg,89.5μmol)。将反应混合物密封在氮气下且将混合物于110℃加热15小时。添加5-(二氟甲氧基)-1H-吲唑(64.6mg,351μmol)和磷酸三钾(156mg,737μmol)然后将混合物经脱气且将混合物在密封管中于110℃加热15小时。过滤混合物,将滤饼以乙酸乙酯洗涤,并将滤液真空浓缩。通过色谱(硅胶,24g Analogix柱,0-40%乙酸乙酯在己烷中的溶液)纯化得到N-叔丁基-2-(5-(二氟甲氧基)-1H-吲唑-1-基)-5-((2-(三甲基甲硅烷基)乙氧基)甲基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-甲酰胺(130mg,70%)。1H NMR(CDCl3)δ:9.18(s,1H),8.61(d,J=9.0Hz,1H),8.36(s,1H),8.27(s,1H),7.69(s,1H),7.59(s,1H),7.32(dd,J=9.0,2.1Hz,1H),6.27-6.89(m,1H),5.72(s,2H),3.53-3.66(m,2H),1.61(s,9H),0.87-1.07(m,2H),-0.03(s,9H).
步骤2
2-(5-二氟甲氧基-吲唑-1-基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-羧酸叔丁基酰胺
向N-叔丁基-2-(5-(二氟甲氧基)-1H-吲唑-1-基)-5-((2-(三甲基甲硅烷基)乙氧基)甲基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-甲酰胺(130mg,245μmol)在二氯甲烷(1mL)中的搅拌溶液添加三氟乙酸(1mL)。15小时后,然后将混合物经真空浓缩并添加25mL的氢氧化铵/甲醇/二氯甲烷的1/10/60混合物。1小时后,将混合物经真空浓缩。通过色谱(硅胶,24g Analogix柱,0-5%的甲醇溶液,含10%氢氧化铵在二氯甲烷中的溶液)纯化得到2-(5-二氟甲氧基-吲唑-1-基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-羧酸叔丁基酰胺(55.3mg,56%)。MS:(M+H)+=401;1H NMR(DMSO-d6)δ:9.09(s,1H),8.57(s,1H),8.51(s,1H),7.78(d,J=2.3Hz,2H),7.43(dd,J=9.0,2.5Hz,2H),7.31(s,1H),1.51(s,9H).
实施例326.
2-(5-氟-吲唑-1-基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-羧酸叔丁基酰胺
步骤1
N-叔丁基-2-(5-氟-1H-吲唑-1-基)-5-((2-(三甲基甲硅烷基)乙氧基)甲基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-甲酰胺
向2-溴-N-叔丁基-5-((2-(三甲基甲硅烷基)乙氧基)甲基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-甲酰胺(140mg,316μmol)、5-氟-1H-吲唑(43.0mg,316μmol)在二噁烷(2mL)的搅拌溶液添加叔丁醇钠(66.8mg,695μmol)和二(三-叔丁基膦)钯(0)(16.1mg,31.6μmol)。将混合物经脱气,然后在密封管中于125℃加热15小时。将混合物冷却,通过硅藻土过滤,将滤饼以乙酸乙酯洗涤,且将合并的滤液经真空浓缩。通过色谱(硅胶,24g Analogix柱,0-40%乙酸乙酯在己烷中的溶液)纯化得到N-叔丁基-2-(5-氟-1H-吲唑-1-基)-5-((2-(三甲基甲硅烷基)乙氧基)甲基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-甲酰胺(120mg,76%)。1H NMR(CDCl3)δ:9.18(s,1H),8.59(dd,J=9.2,4.4Hz,1H),8.35(s,1H),8.25(d,J=0.8Hz,1H),7.69(s,1H),7.42-7.52(m,1H),7.28(d,J=2.5Hz,1H),5.72(s,2H),3.54-3.62(m,2H),1.61(s,9H),0.91-0.99(m,2H).
步骤2
2-(5-氟-吲唑-1-基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-羧酸叔丁基酰胺
向N-叔丁基-2-(5-氟-1H-吲唑-1-基)-5-((2-(三甲基甲硅烷基)乙氧基)甲基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-甲酰胺(120mg,249μmol)在二氯甲烷(3mL)中的搅拌溶液添加三氟乙酸(1mL)。15小时后,将混合物经真空浓缩然后添加25mL氢氧化铵/甲醇/二氯甲烷的1/10/60溶液。1小时后,将混合物经真空浓缩然后通过色谱纯化(硅胶,24g Analogix柱,0-5%甲醇,含10%氢氧化铵在二氯甲烷中的溶液)得到2-(5-氟-吲唑-1-基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-羧酸叔丁基酰胺(24.4mg,28%)。MS:(M+H)+=353;1H NMR(DMSO-d6)δ:9.02(s,1H),8.56-8.61(m,2H),8.53(d,J=0.8Hz,2H),8.42(d,J=3.0Hz,1H),7.78(dd,J=8.8,2.3Hz,1H),7.62(s,1H),7.49(d,J=2.5Hz,1H),1.50(s,9H).
实施例327.
2-(5,6-二氟-吲唑-1-基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-羧酸叔丁基酰胺
步骤1
N-叔丁基-2-(5,6-二氟-1H-吲唑-1-基)-5-((2-(三甲基甲硅烷基)乙氧基)甲基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-甲酰胺
向2-溴-N-叔丁基-5-((2-(三甲基甲硅烷基)乙氧基)甲基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-甲酰胺(150mg,351μmol)和5,6-二氟-1H-吲唑(54.1mg,351μmol)在二噁烷(5.25mL)中的搅拌溶液添加叔丁醇钠(74.2mg,772μmol)和二(三-叔丁基膦)钯(0)(17.9mg,35.1μmol)。将混合物经脱气,然后在密封管中于125℃加热15小时。将混合物冷却,通过硅藻土过滤,将滤饼以乙酸乙酯洗涤,且将合并的滤液经真空浓缩。通过色谱纯化(硅胶,24g Analogix柱,0-40%乙酸乙酯在己烷中的溶液)得到N-叔丁基-2-(5,6-二氟-1H-吲唑-1-基)-5-((2-(三甲基甲硅烷基)乙氧基)甲基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-甲酰胺(120mg,68%)。1HNMR(CDCl3)δ:9.17(s,1H),8.50(d,J=2.5Hz,1H),8.44(dd,J=10.0,6.8Hz,1H),8.37(s,1H),8.30(s,1H),8.24(d,J=0.8Hz,1H),5.72(s,2H),3.55-3.61(m,2H),1.61(s,9H),0.93-0.96(m,2H),-0.03(s,9H).
步骤2
2-(5,6-二氟-吲唑-1-基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-羧酸叔丁基酰胺
向N-叔丁基-2-(5,6-二氟-1H-吲唑-1-基)-5-((2-(三甲基甲硅烷基)乙氧基)甲基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-甲酰胺(120mg,240μmol)在二氯甲烷(3mL)中的搅拌溶液添加三氟乙酸(1mL)。15小时后,将混合物经真空浓缩然后添加25mL的氢氧化铵/甲醇/二氯甲烷的1/10/60混合物。1小时后,将混合物经真空浓缩。通过色谱(硅胶,24g Analogix柱,0-4%的甲醇溶液,含10%氢氧化铵)/二氯甲烷)纯化得到2-(5,6-二氟-吲唑-1-基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-羧酸叔丁基酰胺(14.4mg,16%)。MS:(M+H)+=371;1H NMR(DMSO-d6)δ:9.02(s,1H),8.53-8.60(m,2H),8.44(s,1H),8.06(dd,J=10.0,7.8Hz,1H),7.56(s,1H),1.50(s,9H).
实施例328.
2-(1H-吡咯并[2,3-c]吡啶-7-基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-羧酸叔丁基酰胺
步骤1
7-溴-1-((2-(三甲基甲硅烷基)乙氧基)甲基)-1H-吡咯并[2,3-c]吡啶
向冷却至0℃的7-溴-1H-吡咯并[2,3-c]吡啶(0.2g,1.02mmol)在DMF(5mL)中的搅拌溶液添加氢化钠(46.7mg,1.17mmol)。10分钟后,将混合物温热至25℃。20分钟后,将混合物再冷却至0℃并滴加(2-(氯甲氧基)乙基)三甲基甲硅烷(186mg,1.12mmol)。5分钟后,将混合物温热至25℃。20分钟后,将混合物在乙酸乙酯和水之间分配。将有机相以水洗涤然后真空浓缩。通过色谱(硅胶,12g Analogix柱,0-8%乙酸乙酯在己烷中的溶液)纯化得到7-溴-1-((2-(三甲基甲硅烷基)乙氧基)甲基)-1H-吡咯并[2,3-c]吡啶(0.28g,84%),为无色油状物。MS:(M+H)+=327;1H NMR(CDCl3)δ:8.04(dd,J=5.3,4.3Hz,1H),7.48(dd,J=9.0,5.3Hz,1H),7.38(dd,J=3.3,2.0Hz,1H),6.58(dd,J=6.8,3.3Hz,1H),5.88(d,J=16.8Hz,2H),3.49-3.59(m,2H),0.91(td,J=8.2,3.0Hz,2H),-0.07--0.03(m,9H).
步骤2
N-叔丁基-5-((2-(三甲基甲硅烷基)乙氧基)甲基)-2-(1-((2-(三甲基甲硅烷基)乙氧基)甲基)-1H-吡咯并[2,3-c]吡啶-7-基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-甲酰胺
向2-溴-N-叔丁基-5-((2-(三甲基甲硅烷基)乙氧基)甲基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-甲酰胺(0.2g,468μmol)和六甲基二锡(215mg,655μmol)在甲苯(2.5mL)中的溶液添加Pd(Ph3P)4(54mg)。在鼓泡氮气通过反应混合物15分钟后,将其加热至95℃。1.5小时后,添加7-溴-1-((2-(三甲基甲硅烷基)乙氧基)甲基)-1H-吡咯并[2,3-c]吡啶和Pd(Ph3P)4(108mg,93.6μmol)。72小时后,冷却反应混合物,通过硅藻土过滤,并真空浓缩。通过色谱(硅胶,24g Analogix柱,0-40%乙酸乙酯在己烷中的溶液)纯化得到N-叔丁基-5-((2-(三甲基甲硅烷基)乙氧基)甲基)-2-(1-((2-(三甲基甲硅烷基)乙氧基)甲基)-1H-吡咯并[2,3-c]吡啶-7-基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-甲酰胺(0.13g,47%)。1H NMR(CDCl3)δ:9.01(s,1H),8.46(d,J=5.3Hz,1H),8.34(s,1H),8.13(s,1H),7.68(d,J=5.3Hz,1H),7.41(d,J=3.0Hz,1H),6.69(d,J=3.3Hz,1H),5.74(s,2H),5.51(s,2H),3.59(dd,J=8.9,7.7Hz,2H),2.82-2.89(m,2H),1.42(s,9H),0.92-0.99(m,2H),0.41-0.47(m,2H),-0.02(s,9H),-0.27(s,9H).
步骤3
2-(1H-吡咯并[2,3-c]吡啶-7-基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-羧酸叔丁基酰胺
向N-叔丁基-5-((2-(三甲基甲硅烷基)乙氧基)甲基)-2-(1-((2-(三甲基甲硅烷基)乙氧基)甲基)-1H-吡咯并[2,3-c]吡啶-7-基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-甲酰胺(0.13g,219μmol)在二氯甲烷(2mL)中的搅拌溶液添加三氟乙酸(1mL)。15小时后,将混合物经真空浓缩然后添加25mL的氢氧化铵/甲醇/二氯甲烷的1/10/60混合物。1小时后,将混合物经真空浓缩。通过色谱(硅胶,24g Analogix柱,0-4%的甲醇溶液,含10%氢氧化铵在二氯甲烷中的溶液)纯化得到2-(1H-吡咯并[2,3-c]吡啶-7-基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-羧酸叔丁基酰胺(11mg,15%)。MS:(M+H)+=335;1H NMR(DMSO-d6)δ:9.25(s,1H),8.43(d,J=3.0Hz,1H),8.28(d,J=5.3Hz,1H),7.96(s,1H),7.65-7.69(m,2H),6.65(dd,J=2.9,1.9Hz,1H),1.46(s,8H).
实施例329.
2-(6-氯-吲唑-1-基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-羧酸叔丁基酰胺
步骤1
N-叔丁基-2-(6-氯-1H-吲唑-1-基)-5-((2-(三甲基甲硅烷基)乙氧基)甲基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-甲酰胺
向2-溴-N-叔丁基-5-((2-(三甲基甲硅烷基)乙氧基)甲基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-甲酰胺(150mg,351μmol)和6-氯-1H-吲唑64.3mg,421μmoll)在二噁烷(5.25mL)中的搅拌溶液添加叔丁醇钠(74.2mg,772μmol)和二(三-叔丁基膦)钯(0)(17.9mg,35.1μmol)。将混合物经脱气,然后在密封管中于125℃加热15小时。将混合物冷却,通过硅藻土过滤,将滤饼以乙酸乙酯洗涤,且将合并的滤液经真空浓缩。通过色谱(硅胶,24g Analogix柱,0-40%乙酸乙酯在己烷中的溶液)纯化得到N-叔丁基-2-(6-氯-1H-吲唑-1-基)-5-((2-(三甲基甲硅烷基)乙氧基)甲基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-甲酰胺(120mg,69%)。
步骤2
2-(6-氯-吲唑-1-基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-羧酸叔丁基酰胺
向N-叔丁基-2-(6-氯-1H-吲唑-1-基)-5-((2-(三甲基甲硅烷基)乙氧基)甲基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-甲酰胺(120mg,240μmol)在二氯甲烷(3mL)中的搅拌溶液添加三氟乙酸(1mL)。15小时后,将混合物经真空浓缩,然后添加25mL的氢氧化铵/甲醇/二氯甲烷的1/10/60混合物。1小时后,将混合物经真空浓缩。通过色谱(硅胶,24g Analogix柱,0~5%的甲醇溶液,含10%氢氧化铵在二氯甲烷中的溶液)纯化得到2-(6-氯-吲唑-1-基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-羧酸叔丁基酰胺(50.4mg,57%)。MS:(M+H)+=369;1H NMR(DMSO-d6)δ:8.97(s,1H),8.57(s,2H),8.43(s,1H),8.00(dd,J=8.5,0.5Hz,1H),7.61(s,1H),7.41(dd,J=8.5,1.8Hz,1H),1.50(s,9H).
实施例330.
2-(6-三氟甲基-吲唑-1-基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-羧酸叔丁基酰胺
步骤1
N-叔丁基-2-(6-(三氟甲基)-1H-吲唑-1-基)-5-((2-(三甲基甲硅烷基)乙氧基)甲基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-甲酰胺
向2-溴-N-叔丁基-5-((2-(三甲基甲硅烷基)乙氧基)甲基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-甲酰胺(180mg,421μmol)和6-(三氟甲基)-1H-吲唑(78.4mg,421μmol)在二噁烷(2mL)中的搅拌溶液添加叔丁醇钠(89.0mg,927μmol)和二(三-叔丁基膦)钯(0)(21.5mg,42.1μmol)。将混合物经脱气,然后在密封管中于125℃加热2天。将混合物冷却,通过硅藻土过滤,将滤饼以乙酸乙酯洗涤,且将合并的滤液经真空浓缩。通过色谱(硅胶,24g Analogix柱,0-40%乙酸乙酯在己烷中的溶液)纯化得到N-叔丁基-2-(6-(三氟甲基)-1H-吲唑-1-基)-5-((2-(三甲基甲硅烷基)乙氧基)甲基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-甲酰胺(110mg,49%)。1HNMR(CDCl3)δ:9.05(s,1H),8.74(d,J=0.5Hz,1H),8.42(s,1H),8.38(d,J=1.0Hz,1H),7.99(d,J=8.5Hz,1H),7.86(s,1H),7.70(s,1H),5.74(s,2H),3.57-3.62(m,2H),1.53(s,9H),0.93-0.98(m,2H),-0.03(s,9H).
步骤2
2-(6-三氟甲基-吲唑-1-基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-羧酸叔丁基酰胺
向N-叔丁基-2-(6-(三氟甲基)-1H-吲唑-1-基)-5-((2-(三甲基甲硅烷基)乙氧基)甲基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-甲酰胺(110mg,207μmol)在二氯甲烷(3mL)中的搅拌溶液添加三氟乙酸(1mL)。15小时后,将混合物经真空浓缩然后添加25mL的氢氧化铵/甲醇/二氯甲烷的1/10/60混合物。1小时后,将混合物经真空浓缩。通过色谱(硅胶,24g Analogix柱,0-4%经15分钟(甲醇,含10%氢氧化铵在二氯甲烷中的溶液)纯化得到2-(6-三氟甲基-吲唑-1-基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-羧酸叔丁基酰胺(21.8mg,26%)。MS(M+H)+=403;1H NMR(DMSO-d6)δ:8.93(s,1H),8.78(s,1H),8.71(d,J=0.8Hz,1H),8.46(s,1H),8.23(d,J=8.5Hz,1H),7.68(dd,J=8.5,1.3Hz,1H),7.62(s,1H),1.41(s,9H).
实施例331.
2-(6-甲基-吲唑-1-基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-羧酸叔丁基酰胺
步骤1
N-叔丁基-2-(6-甲基-1H-吲唑-1-基)-5-((2-(三甲基甲硅烷基)乙氧基)甲基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-甲酰胺
向2-溴-N-叔丁基-5-((2-(三甲基甲硅烷基)乙氧基)甲基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-甲酰胺(140mg,328μmol)、6-甲基-1H-吲唑(41.7mg,316μmol)在二噁烷(2mL)中的搅拌溶液添加叔丁醇钠(66.8mg,695μmol)和二(三-叔丁基膦)钯(0)(16.1mg,31.6μmol)。将混合物经脱气,然后在密封管中于125℃加热15小时。将混合物冷却,通过硅藻土过滤,将滤饼以乙酸乙酯洗涤,且将合并的滤液经真空浓缩。通过色谱(硅胶,24g Analogix柱,0-40%乙酸乙酯在己烷中的溶液)纯化得到N-叔丁基-2-(6-甲基-1H-吲唑-1-基)-5-((2-(三甲基甲硅烷基)乙氧基)甲基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-甲酰胺。1H NMR(CDCl3)d:9.08(s,1H),8.35(s,1H),8.30(s,1H),8.23(d,J=1.0Hz,1H),8.03(宽单峰,1H),7.85(s,1H),7.29(s,1H),5.72(s,2H),3.55-3.61(m,2H),2.50(s,3H),1.59(s,9H),0.77-1.01(m,2H),-0.03(s,9H).
步骤2
2-(6-甲基-吲唑-1-基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-羧酸叔丁基酰胺
向N-叔丁基-2-(6-甲基-1H-吲唑-1-基)-5-((2-(三甲基甲硅烷基)乙氧基)甲基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-甲酰胺(100mg,209μmol)在二氯甲烷(3mL)中的搅拌溶液添加三氟乙酸(1mL)。15小时后,将混合物经真空浓缩然后添加25mL的氢氧化铵/甲醇/二氯甲烷的1/10/60混合物。1小时后,将混合物经真空浓缩。通过色谱(硅胶,24g Analogix柱,0-4%甲醇,含10%氢氧化铵在二氯甲烷中的溶液,15分钟梯度)纯化得到2-(6-甲基-吲唑-1-基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-羧酸叔丁基酰胺(35mg,48%)。MS(M+H)+=349;1H NMR(DMSO-d6)δ:8.95(s,1H),8.45(d,J=0.8Hz,1H),8.41(s,1H),8.29(s,1H),7.84(d,J=8.3Hz,1H),7.71(s,1H),7.21(dd,J=8.3,0.8Hz,1H),2.53(s,3H),1.49(s,9H).
实施例332.
2-(6-氟-吲唑-1-基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-羧酸叔丁基酰胺
步骤1
N-叔丁基-2-(6-氟-1H-吲唑-1-基)-5-((2-(三甲基甲硅烷基)乙氧基)甲基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-甲酰胺
向2-溴-N-叔丁基-5-((2-(三甲基甲硅烷基)乙氧基)甲基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-甲酰胺(140mg,328μmol)、6-氟-1H-吲唑(43.0mg,316μmol)在二噁烷(2mL)中的搅拌溶液添加叔丁醇钠(66.8mg,695μmol)和二(三-叔丁基膦)钯(0)(16.1mg,31.6μmol)。将混合物经脱气,然后在密封管中于125℃加热2天。将混合物冷却,通过硅藻土过滤,将滤饼以乙酸乙酯洗涤,且将合并的滤液经真空浓缩。通过色谱(硅胶,24g Analogix柱,0-40%乙酸乙酯在己烷中的溶液)纯化得到N-叔丁基-2-(6-氟-1H-吲唑-1-基)-5-((2-(三甲基甲硅烷基)乙氧基)甲基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-甲酰胺。1H NMR(CDCl3)δ:9.17(s,1H),8.36(s,1H),8.29(dd,J=9.3,2.3Hz,1H),8.26(d,J=1.0Hz,1H),7.80(dd,J=8.8,5.0Hz,1H),7.66(s,1H),7.12(td,J=8.9,2.3Hz,1H),5.72(s,2H),3.54-3.63(m,2H),1.62(s,9H),0.90-1.00(m,2H),-0.03(s,9H).
步骤2
2-(6-氟-吲唑-1-基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-羧酸叔丁基酰胺
向N-叔丁基-2-(6-氟-1H-吲唑-1-基)-5-((2-(三甲基甲硅烷基)乙氧基)甲基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-甲酰胺(101mg,209μmol)在二氯甲烷(3mL)中的搅拌溶液添加三氟乙酸(1mL)。15小时后,将混合物经真空浓缩然后添加25mL的氢氧化铵/甲醇/二氯甲烷的1/10/60混合物。1小时后,将混合物经真空浓缩。通过色谱(硅胶,24g Analogix柱,0-4%甲醇,含10%氢氧化铵在二氯甲烷中的溶液)纯化得到2-(6-氟-吲唑-1-基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-羧酸叔丁基酰胺(31mg,42%)。MS(M+H)+=351;1H NMR(DMSO-d6)δ:9.02(s,1H),8.56(d,J=1.0Hz,1H),8.42(s,1H),8.32(dd,J=9.4,2.1Hz,1H),8.02(dd,J=8.8,5.3Hz,1H),7.58(s,1H),7.28(d,J=2.3Hz,1H),1.50(s,9H).
实施例333.
2-(5-甲基-吲唑-1-基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-羧酸叔丁基酰胺
步骤1
N-叔丁基-2-(5-甲基-1H-吲唑-1-基)-5-((2-(三甲基甲硅烷基)乙氧基)甲基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-甲酰胺
向2-溴-N-叔丁基-5-((2-(三甲基甲硅烷基)乙氧基)甲基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-甲酰胺(140mg,328μmol)、5-甲基-1H-吲唑(41.7mg,316μmol)在二噁烷(2mL)中的搅拌溶液添加叔丁醇钠(66.8mg,695μmol)和二(三-叔丁基膦)钯(0)(16.1mg,31.6μmol)。将混合物经脱气,然后在密封管中于125℃加热2天。将混合物冷却,通过硅藻土过滤,将滤饼以乙酸乙酯洗涤,且将合并的滤液经真空浓缩。通过色谱(硅胶,24g Analogix柱,0-40%乙酸乙酯在己烷中的溶液)纯化得到N-叔丁基-2-(5-甲基-1H-吲唑-1-基)-5-((2-(三甲基甲硅烷基)乙氧基)甲基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-甲酰胺。1H NMR(CDCl3)δ:9.18(s,1H),8.50(d,J=8.5Hz,1H),8.34(s,1H),8.20(d,J=0.8Hz,1H),7.95-8.07(m,1H),7.78(s,1H),7.24(d,J=8.3Hz,1H),5.71(s,2H),3.55-3.60(m,2H),2.53(s,3H),1.63(s,9H),0.92-0.98(m,2H),-0.04(s,9H).
步骤2
2-(5-甲基-吲唑-1-基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-羧酸叔丁基酰胺
向N-叔丁基-2-(5-甲基-1H-吲唑-1-基)-5-((2-(三甲基甲硅烷基)乙氧基)甲基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-甲酰胺(0.1g,209μmol)在二氯甲烷(3mL)中的搅拌溶液添加三氟乙酸(1mL)。15小时后,将混合物经真空浓缩然后添加25mL的氢氧化铵/甲醇/二氯甲烷的1/10/60混合物。1小时后,将混合物经真空浓缩.通过色谱(硅胶,24g Analogix柱,0-4%甲醇,含10%氢氧化铵在二氯甲烷中的溶液)纯化得到2-(5-甲基-吲唑-1-基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-羧酸叔丁基酰胺(19mg,26%)。MS(M+H)+=349;1H NMR(DMSO-d6)δ:9.03(s,1H),8.49(d,J=8.5Hz,1H),8.43-8.46(m,2H),8.39(d,J=3.0Hz,1H),7.73(s,1H),7.65(s,1H),2.48(宽单峰,3H),1.52(s,9H).
实施例334.
2-(3-三氟甲基-5,6-二氢-4H-环戊二烯并吡唑-1-基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-羧酸叔丁基酰胺
步骤1
N-叔丁基-2-(3-(三氟甲基)-5,6-二氢环戊二烯并[c]吡唑-1(4H)-基)-5-((2-(三甲基甲硅烷基)乙氧基)甲基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-甲酰胺
向2-溴-N-叔丁基-5-((2-(三甲基甲硅烷基)乙氧基)甲基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-甲酰胺(200mg,468μmol)、3-(三氟甲基)-1,4,5,6-四氢环戊二烯并[c]吡唑(82.4mg,468μmol)在二噁烷(5.15mL)中的搅拌溶液添加叔丁醇钠(98.9mg,1.03mmol)和二(三-叔丁基膦)钯(0)(23.9mg,46.8μmol)。将混合物经脱气,然后在密封管中于125℃加热2天。将混合物冷却,通过硅藻土过滤,将滤饼以乙酸乙酯洗涤,且将合并的滤液经真空浓缩。通过色谱(硅胶,24g Analogix柱,0-40%乙酸乙酯在己烷中的溶液)纯化得到N-叔丁基-2-(3-(三氟甲基)-5,6-二氢环戊二烯并[c]吡唑-1(4H)-基)-5-((2-(三甲基甲硅烷基)乙氧基)甲基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-甲酰胺。1H NMR(CDCl3)δ:9.11(s,1H),8.43(s,1H),7.41(s,1H),5.69(d,J=8.0Hz,2H),3.50-3.60(m,2H),3.31(t,J=7.3Hz,2H),2.64(d,J=1.0Hz,2H),2.57(d,J=1.5Hz,2H),1.56(d,J=5.3Hz,9H),0.89-0.97(m,2H),-0.05(d,J=5.0Hz,9H).
步骤2
2-(3-三氟甲基-5,6-二氢-4H-环戊二烯并吡唑-1-基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-羧酸叔丁基酰胺
向N-叔丁基-2-(3-(三氟甲基)-5,6-二氢环戊二烯并[c]吡唑-1(4H)-基)-5-((2-(三甲基甲硅烷基)乙氧基)甲基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-甲酰胺(0.1g,209μmol)在二氯甲烷(3mL)中的搅拌溶液添加三氟乙酸(1mL)。15小时后,将混合物经真空浓缩然后添加25mL的氢氧化铵/甲醇/二氯甲烷的1/10/60混合物。1小时后,将混合物经真空浓缩。通过色谱(硅胶,24g Analogix柱,0-4%甲醇,含10%氢氧化铵在二氯甲烷中的溶液)纯化得到2-(3-三氟甲基-5,6-二氢-4H-环戊二烯并吡唑-1-基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-羧酸叔丁基酰胺(22mg,29%)。MS(M+Na)+=415;1H NMR(DMSO-d6)δ:8.92(s,1H),8.47(s,1H),7.33(s,1H),3.25-3.31(m,2H),2.72-2.82(m,2H),2.60-2.70(m,2H),1.47(s,9H).
实施例335.
2-(3-氯-吲唑-1-基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-羧酸叔丁基酰胺
步骤1
N-叔丁基-2-(3-氯-1H-吲唑-1-基)-5-((2-(三甲基甲硅烷基)乙氧基)甲基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-甲酰胺
向2-溴-N-叔丁基-5-((2-(三甲基甲硅烷基)乙氧基)甲基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-甲酰胺(136mg,318μmol)、3-氯-1H-吲唑(48.6mg,318μmol)在二噁烷(3.5mL)中的搅拌溶液添加叔丁醇钠(67.3mg,700μmol)和二(三-叔丁基膦)钯(0)(16.3mg,31.8μmol)。将混合物经脱气,然后在密封管中于125℃加热2天。将混合物冷却,通过硅藻土过滤,将滤饼以乙酸乙酯洗涤,且将合并的滤液经真空浓缩。通过色谱(硅胶,24g Analogix柱,0-40%乙酸乙酯在己烷中的溶液)纯化得到N-叔丁基-2-(3-氯-1H-吲唑-1-基)-5-((2-(三甲基甲硅烷基)乙氧基)甲基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-甲酰胺。1H NMR(CDCl3)δ:9.12(s,1H),8.61(d,J=8.5Hz,1H),8.36(s,1H),7.82(d,J=8.0Hz,1H),7.70(s,1H),7.58(ddd,J=8.5,7.2,1.1Hz,1H),7.42(ddd,J=8.1,7.1,0.9Hz,1H),5.72(s,2H),3.55-3.62(m,2H),1.61(s,9H),0.95(d,J=16.6Hz,2H),-0.03(s,9H).
步骤2
2-(3-氯-吲唑-1-基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-羧酸叔丁基酰胺
向N-叔丁基-2-(3-氯-1H-吲唑-1-基)-5-((2-(三甲基甲硅烷基)乙氧基)甲基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-甲酰胺(0.1g,200μmol)在二氯甲烷(3mL)中的搅拌溶液添加三氟乙酸(1mL)。15小时后,将混合物经真空浓缩然后添加25mL的氢氧化铵/甲醇/二氯甲烷的1/10/60混合物。1小时后,将混合物经真空浓缩。通过色谱(硅胶,24g Analogix柱,0-4%甲醇,含10%氢氧化铵在二氯甲烷中的溶液)纯化得到2-(3-氯-吲唑-1-基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-羧酸叔丁基酰胺(28mg,38%)。MS(M-H)-=367;1H NMR(DMSO-d6)δ:8.96(s,1H),8.62(d,J=8.8Hz,1H),8.44(s,1H),7.89(d,J=8.0Hz,1H),7.70(ddd,J=8.4,7.2,1.0Hz,1H),7.61(s,1H),7.47-7.54(m,1H),1.50(s,9H).
实施例336.
2-(5-甲基-吡唑并[3,4-b]吡啶-1-基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-羧酸叔丁基酰胺
步骤1
N-叔丁基-2-(5-甲基-1H-吡唑并[3,4-b]吡啶-1-基)-5-((2-(三甲基甲硅烷基)乙氧基)甲基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-甲酰胺
向2-溴-N-叔丁基-5-((2-(三甲基甲硅烷基)乙氧基)甲基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-甲酰胺(136mg,318μmol)、5-甲基-1H-吡唑并[3,4-b]吡啶(42.4mg,318μmol)在二噁烷(3.5mL)中的搅拌溶液添加叔丁醇钠(67.3mg,700μmol)和二(三-叔丁基膦)钯(0)(16.3mg,31.8μmol)。将混合物经脱气,然后在密封管中于125℃加热2天。将混合物冷却,通过硅藻土过滤,将滤饼以乙酸乙酯洗涤,且将合并的滤液经真空浓缩。通过色谱(硅胶,24g Analogix柱,0-30%乙酸乙酯在己烷中的溶液)纯化得到N-叔丁基-2-(5-甲基-1H-吡唑并[3,4-b]吡啶-1-基)-5-((2-(三甲基甲硅烷基)乙氧基)甲基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-甲酰胺.1HNMR(CDCl3)δ:9.19(s,1H),8.51(d,J=1.8Hz,1H),8.38(s,1H),8.33(s,1H),8.22(s,1H),7.96(dd,J=2.0,1.0Hz,1H),5.72(s,2H),3.52-3.59(m,2H),2.54(s,3H),1.60(s,9H),0.88-0.97(m,3H),-0.04(s,9H).
步骤2
2-(5-甲基-吡唑并[3,4-b]吡啶-1-基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-羧酸叔丁基酰胺
向N-叔丁基-2-(5-甲基-1H-吡唑并[3,4-b]吡啶-1-基)-5-((2-(三甲基甲硅烷基)乙氧基)甲基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-甲酰胺(0.1g,208μmol)在二氯甲烷(3mL)中的搅拌溶液添加三氟乙酸(1mL)。15小时后,将混合物经真空浓缩然后添加25mL的氢氧化铵/甲醇/二氯甲烷的1/10/60混合物。1小时后,将混合物经真空浓缩。通过色谱(硅胶,24g Analogix柱,0-4%甲醇,含10%氢氧化铵在二氯甲烷中的溶液)纯化得到2-(5-甲基-吡唑并[3,4-b]吡啶-1-基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-羧酸叔丁基酰胺(10mg,14%)。MS(M+H)+=350;1H NMR(DMSO-d6)δ:9.08(s,1H),8.54(d,J=1.8Hz,1H),8.50(s,1H),8.39(s,1H),8.28(s,1H),8.21(dd,J=2.0,0.8Hz,1H),1.49(s,9H).
实施例337.
2-(5-三氟甲基-吲唑-1-基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-羧酸叔丁基酰胺
步骤1
N-叔丁基-2-(5-(三氟甲基)-1H-吲唑-1-基)-5-((2-(三甲基甲硅烷基)乙氧基)甲基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-甲酰胺
向2-溴-N-叔丁基-5-((2-(三甲基甲硅烷基)乙氧基)甲基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-甲酰胺(200mg,468μmol)、5-(三氟甲基)-1H-吲唑(87.1mg,468μmol)在二噁烷(3.5mL)中的搅拌溶液添加叔丁醇钠(98.9mg,1.03mmol)和二(三-叔丁基膦)钯(0)(23.9mg,46.8μmol)。将混合物经脱气,然后在密封管中于125℃加热2天。将混合物冷却,通过硅藻土过滤,将滤饼以乙酸乙酯洗涤,且将合并的滤液经真空浓缩。通过色谱(硅胶,24g Analogix柱,0-30%乙酸乙酯在己烷中的溶液)纯化得到N-叔丁基-2-(5-(三氟甲基)-1H-吲唑-1-基)-5-((2-(三甲基甲硅烷基)乙氧基)甲基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-甲酰胺(110mg,44%)。1HNMR(CDCl3)δ:9.20(s,1H),8.69-8.74(m,2H),8.42(s,2H),8.39(d,J=0.8Hz,1H),8.33-8.36(m,1H),8.18(s,2H),7.70-7.74(m,1H),5.73(s,2H),3.59(dd,J=8.9,7.7Hz,2H),1.63(s,9H),0.92-0.98(m,2H),-0.04(s,9H).
步骤2
2-(5-三氟甲基-吲唑-1-基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-羧酸叔丁基酰胺
向N-叔丁基-2-(5-(三氟甲基)-1H-吲唑-1-基)-5-((2-(三甲基甲硅烷基)乙氧基)甲基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-甲酰胺(110mg,207μmol)在二氯甲烷(3mL)中的搅拌溶液添加三氟乙酸(1mL)。15小时后,将混合物经真空浓缩,添加25mL氢氧化铵/甲醇/二氯甲烷的1/10/60混合物,搅拌1小时。真空浓缩。通过色谱(硅胶,24g Analogix柱,0-4%甲醇,含10%氢氧化铵在二氯甲烷中的溶液)纯化得到2-(5-三氟甲基-吲唑-1-基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-羧酸叔丁基酰胺(6mg,7%)。MS(M-H)-=401;1H NMR(DMSO-d6)δ:9.04(s,1H),8.74(d,J=9.0Hz,1H),8.54(d,J=2.8Hz,1H),8.46(s,1H),8.39(d,J=2.5Hz,1H),8.33(s,1H),8.09(s,1H),1.50(s,4H),1.44(s,9H).
实施例338.
2-(6-甲氧基-吲唑-1-基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-羧酸叔丁基酰胺
步骤1
N-叔丁基-2-(6-甲氧基-1H-吲唑-1-基)-5-((2-(三甲基甲硅烷基)乙氧基)甲基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-甲酰胺
向2-溴-N-叔丁基-5-((2-(三甲基甲硅烷基)乙氧基)甲基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-甲酰胺(200mg,468μmol)、6-甲氧基-1H-吲唑(69.3mg,468μmol)在二噁烷(3.5mL)中的搅拌溶液添加叔丁醇钠(98.9mg,1.03mmol)和二(三-叔丁基膦)钯(0)(23.9mg,46.8μmol)。将混合物经脱气,然后在密封管中于125℃加热2天。将混合物冷却,通过硅藻土过滤,将滤饼以乙酸乙酯洗涤,且将合并的滤液经真空浓缩。通过色谱(硅胶,24g Analogix柱,0-30%乙酸乙酯在己烷中的溶液)纯化得到N-叔丁基-2-(6-甲氧基-1H-吲唑-1-基)-5-((2-(三甲基甲硅烷基)乙氧基)甲基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-甲酰胺(131mg,57%)。1H NMR(CDCl3)δ:9.06(s,1H),8.33(s,1H),8.18(d,J=0.8Hz,1H),7.95(d,J=2.0Hz,1H),7.80(s,1H),7.73(d,J=8.8Hz,1H),7.01(dd,J=8.8,2.3Hz,1H),5.71(s,2H),3.94(s,3H),3.53-3.63(m,2H),1.57(s,9H),0.91-0.98(m,2H),-0.03(s,9H).
步骤2
2-(6-甲氧基-吲唑-1-基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-羧酸叔丁基酰胺
向N-叔丁基-2-(6-甲氧基-1H-吲唑-1-基)-5-((2-(三甲基甲硅烷基)乙氧基)甲基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-甲酰胺(130mg,263μmol)在甲烷(3mL)中的搅拌溶液添加三氟乙酸(1mL)。15小时后,将混合物经真空浓缩,添加25mL氢氧化铵/甲醇/二氯甲烷的1/10/60混合物,搅拌1小时。真空浓缩。通过色谱(硅胶,24g Analogix柱,0-4%甲醇,含10%氢氧化铵在二氯甲烷中的溶液)纯化得到2-(6-甲氧基-吲唑-1-基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-羧酸叔丁基酰胺(63mg,66%)。MS(M+H)+=365;1H NMR(DMSO-d6)δ:8.92(s,1H),8.40(d,J=5.1Hz,2H),8.01(s,1H),7.85(d,J=8.9Hz,1H),7.67(s,1H),7.07(dd,J=8.9,2.0Hz,1H),3.91(s,3H),1.46(s,9H).
实施例339.
2-[5-二氟甲氧基-1-(2-二甲基氨基甲酰基-乙基)-1H-吲唑-3-基]-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-羧酸叔丁基酰胺
步骤1
N-叔丁基-2-(5-(二氟甲氧基)-1-(3-(二甲基氨基)-3-氧代丙基)-1H-吲唑-3-基)-5-((2-(三甲基甲硅烷基)乙氧基)甲基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-甲酰胺
将N-叔丁基-2-(5-(二氟甲氧基)-1H-吲唑-3-基)-5-((2-(三甲基甲硅烷基)乙氧基)甲基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-甲酰胺(100mg,188μmol)、3-氯-N,N-二甲基丙酰胺(25.6mg,188μmol)和碳酸铯(184mg,565μmol)在二甲基甲酰胺(2mL)中在微波中于150℃加热30分钟。将混合物冷却,在乙酸乙酯和水之间分配,以水洗涤3次,干燥并真空浓缩。通过色谱(硅胶,24g Analogix柱,0-100%乙酸乙酯在己烷中的溶液)纯化得到N-叔丁基-2-(5-(二氟甲氧基)-1-(3-(二甲基氨基)-3-氧代丙基)-1H-吲唑-3-基)-5-((2-(三甲基甲硅烷基)乙氧基)甲基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-甲酰胺(70mg,59%),为灰白色固体。MS(M+H)+=630;1HNMR(CDCl3)δ:9.19(s,1H),8.41(s,1H),8.25(d,J=1.9Hz,1H),8.08(s,1H),7.67(d,J=8.7Hz,1H),7.31-7.37(m,1H),6.22-6.78(m,1H),5.72(s,2H),4.79-4.88(m,2H),3.53-3.63(m,2H),3.11(t,J=6.7Hz,2H),2.95(d,J=9.2Hz,6H),1.61(s,9H),0.87-1.01(m,2H),-0.03(s,9H).
步骤2
2-[5-二氟甲氧基-1-(2-二甲基氨基甲酰基-乙基)-1H-吲唑-3-基]-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-羧酸叔丁基酰胺
向N-叔丁基-2-(5-(二氟甲氧基)-1-(3-(二甲基氨基)-3-氧代丙基)-1H-吲唑-3-基)-5-((2-(三甲基甲硅烷基)乙氧基)甲基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-甲酰胺(70mg,111μmol)在二氯甲烷(4mL)中的搅拌溶液添加三氟乙酸(1mL)。15小时后,将混合物经真空浓缩然后添加氢氧化铵/甲醇/二氯甲烷的25mL1/10/60混合物。1小时后,将混合物经真空浓缩。通过色谱(硅胶,24g Analogix柱,0-5%甲醇,含10%氢氧化铵在二氯甲烷中的溶液)纯化得到2-[5-二氟甲氧基-1-(2-二甲基氨基甲酰基-乙基)-1H-吲唑-3-基]-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-羧酸叔丁基酰胺(50mg,90%)。MS(M+H)+=500;1H NMR(CDCl3)δ:9.20(s,1H),8.45(d,J=3.0Hz,1H),8.24(d,J=2.0Hz,1H),8.13(s,1H),7.68(d,J=9.3Hz,1H),7.34(dd,J=9.0,2.3Hz,1H),6.26-6.77(m,1H),4.83(t,J=6.7Hz,2H),3.11(t,J=6.7Hz,2H),2.96(d,J=14.1Hz,6H),1.62(s,9H).
实施例340.
2-[1-(4-苄基-吗啉-2-基甲基)-5-二氟甲氧基-1H-吲唑-3-基]-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-羧酸叔丁基酰胺
步骤1
2-(1-((4-苄基吗啉-2-基)甲基)-5-(二氟甲氧基)-1H-吲唑-3-基)-N-叔丁基-5-((2-(三甲基甲硅烷基)乙氧基)甲基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-甲酰胺
将N-叔丁基-2-(5-(二氟甲氧基)-1H-吲唑-3-基)-5-((2-(三甲基甲硅烷基)乙氧基)甲基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-甲酰胺(100mg,188μmol)、4-苄基-2-(氯甲基)吗啉(51.0mg,226μmol)和碳酸铯(184mg,565μmol)在二甲基甲酰胺(1.4mL)中于微波中于100℃加热45分钟。将混合物冷却,在乙酸乙酯和水之间分配,并合并有机相且以水洗涤3次。将有机相干燥并真空浓缩。通过色谱(硅胶,24g Analogix柱,0-40%乙酸乙酯在己烷中的溶液)纯化得到2-(1-((4-苄基吗啉-2-基)甲基)-5-(二氟甲氧基)-1H-吲唑-3-基)-N-叔丁基-5-((2-(三甲基甲硅烷基)乙氧基)甲基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-甲酰胺(67mg,49%)。
步骤2
2-[1-(4-苄基-吗啉-2-基甲基)-5-二氟甲氧基-1H-吲唑-3-基]-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-羧酸叔丁基酰胺
向2-(1-((4-苄基吗啉-2-基)甲基)-5-(二氟甲氧基)-1H-吲唑-3-基)-N-叔丁基-5-((2-(三甲基甲硅烷基)乙氧基)甲基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-甲酰胺(40mg,55.6μmol)在二氯甲烷(10mL)中的搅拌溶液添加三氟乙酸(1mL)。15小时后,将混合物经真空浓缩然后添加25mL的氢氧化铵/甲醇/二氯甲烷的1/10/60混合物。1小时后,将混合物经浓缩。通过色谱(硅胶,24g Analogix柱,0-5%甲醇,含10%氢氧化铵在二氯甲烷中的溶液)纯化得到2-[1-(4-苄基-吗啉-2-基甲基)-5-二氟甲氧基-1H-吲唑-3-基]-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-羧酸叔丁基酰胺(25mg,76%)。MS(M+H)+=590;1H NMR(DMSO-d6)δ:9.04(s,1H),8.39(s,1H),8.18(d,J=2.3Hz,1H),7.88(d,J=4.0Hz,1H),7.36-7.41(m,1H),7.29-7.33(m,5H),7.22-7.27(m,1H),6.98-7.21(m,1H),4.54-4.68(m,2H),3.96-4.03(m,1H),3.74(d,J=11.0Hz,1H),3.49(s,2H),3.40-3.48(m,1H),2.86(d,J=11.3Hz,1H),2.58(d,J=12.3Hz,1H),1.87-2.11(m,2H),1.50(s,9H).
实施例341.
2-[5-二氟甲氧基-1-(1-甲基-氮杂环丁烷-3-基甲基)-1H-吲唑-3-基]-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-羧酸叔丁基酰胺
步骤1
3-((3-(7-(叔丁基氨基甲酰基)-5-((2-(三甲基甲硅烷基)乙氧基)甲基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-2-基)-5-(二氟甲氧基)-1H-吲唑-1-基)甲基)氮杂环丁烷-1-羧酸叔丁酯
将N-叔丁基-2-(5-(二氟甲氧基)-1H-吲唑-3-基)-5-((2-(三甲基甲硅烷基)乙氧基)甲基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-甲酰胺(100mg,188μmol)、3-(碘代甲基)氮杂环丁烷-1-羧酸叔丁酯(56.0mg,188μmol)和碳酸铯(184mg,565μmol)在二甲基甲酰胺(2mL)中于微波中在150℃加热30分钟。将混合物冷却,在乙酸乙酯和水之间分配,将有机相以水洗涤3次,然后干燥并浓缩。通过色谱(硅胶,24g Analogix柱,0-40%乙酸乙酯在己烷中的溶液)纯化得到3-((3-(7-(叔丁基氨基甲酰基)-5-((2-(三甲基甲硅烷基)乙氧基)甲基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-2-基)-5-(二氟甲氧基)-1H-吲唑-1-基)甲基)氮杂环丁烷-1-羧酸叔丁酯(108mg,82%)。MS(M+H)+=700;1H NMR(CDCl3)δ:9.18(s,1H),8.34(s,1H),8.30(d,J=2.1Hz,1H),8.00(s,1H),7.50(d,J=9.0Hz,1H),7.35(dd,J=9.0,2.1Hz,1H),6.24-6.81(m,1H),5.72(s,3H),5.30(s,2H),4.66(d,J=7.5Hz,2H),3.89(dd,J=8.9,5.2Hz,2H),3.58(dd,J=8.8,7.6Hz,2H),3.21-3.33(m,1H),1.61(s,9H),1.45(s,9H),0.88-1.00(m,2H),-0.08--0.01(m,9H).
步骤2
2-(1-(氮杂环丁烷-3-基甲基)-5-(二氟甲氧基)-1H-吲唑-3-基)-N-叔丁基-5-((2-(三甲基甲硅烷基)乙氧基)甲基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-甲酰胺
将3-((3-(7-(叔丁基氨基甲酰基)-5-((2-(三甲基甲硅烷基)乙氧基)甲基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-2-基)-5-(二氟甲氧基)-1H-吲唑-1-基)甲基)氮杂环丁烷-1-羧酸叔丁酯(180mg,257μmol)在2,2,2-三氟乙醇(2mL)中的搅拌溶液于微波中在150℃加热6小时,然后冷却,浓缩并不经纯化用于后续反应。
步骤3
N-叔丁基-2-(5-(二氟甲氧基)-1-((1-甲基氮杂环丁烷-3-基)甲基)-1H-吲唑-3-基)-5-((2-(三甲基甲硅烷基)乙氧基)甲基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-甲酰胺
向以冰浴冷却至0℃的2-(1-(氮杂环丁烷-3-基甲基)-5-(二氟甲氧基)-1H-吲唑-3-基)-N-叔丁基-5-((2-(三甲基甲硅烷基)乙氧基)甲基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-甲酰胺(37mg,61.7μmol)在甲醇(4mL)中的搅拌溶液添加甲醛水溶液(1mL,13.4mmol),接着添加三乙酰氧基硼氢化钠(29.4mg,139μmol)。将反应混合物在室温搅拌15小时,然后浓缩且通过色谱(硅胶,4g Analogix柱,0-10%甲醇,含10%氢氧化铵在二氯甲烷中的溶液)纯化得到N-叔丁基-2-(5-(二氟甲氧基)-1-((1-甲基氮杂环丁烷-3-基)甲基)-1H-吲唑-3-基)-5-((2-(三甲基甲硅烷基)乙氧基)甲基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-甲酰胺(33mg,87%)。MS(M+H)+=614.
步骤4
2-[5-二氟甲氧基-1-(1-甲基-氮杂环丁烷-3-基甲基)-1H-吲唑-3-基]-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-羧酸叔丁基酰胺
向N-叔丁基-2-(5-(二氟甲氧基)-1-((1-甲基氮杂环丁烷-3-基)甲基)-1H-吲唑-3-基)-5-((2-(三甲基甲硅烷基)乙氧基)甲基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-甲酰胺(33mg,53.8μmol)在二氯甲烷(2mL)中的搅拌溶液添加三氟乙酸(1mL)。室温搅拌15小时后,将混合物经真空浓缩然后添加25mL的氢氧化铵/甲醇/二氯甲烷的1/10/60混合物溶液。1小时后,将混合物经真空浓缩。通过色谱(硅胶,24g Analogix柱,0-4%甲醇,含10%氢氧化铵在二氯甲烷中的溶液)纯化得到2-[5-二氟甲氧基-1-(1-甲基-氮杂环丁烷-3-基甲基)-1H-吲唑-3-基]-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-羧酸叔丁基酰胺(18mg,69%)。MS(M+H)+=484;1H NMR(DMSO-d6)δ:9.07(s,1H),8.39(s,1H),8.21(d,J=2.3Hz,2H),7.93(d,J=9.0Hz,1H),7.87(s,1H),7.38-7.46(m,2H),7.20(s,1H),4.76(d,J=7.3Hz,2H),4.55(s,2H),3.48(t,J=8.0Hz,1H),2.36(s,3H),1.50(s,9H),1.05(t,J=7.3Hz,2H).
实施例342.
2-[5-二氟甲氧基-1-(4-甲基-吗啉-2-基甲基)-1H-吲唑-3-基]-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-羧酸叔丁基酰胺
步骤1
N-叔丁基-2-(5-(二氟甲氧基)-1-(吗啉-2-基甲基)-1H-吲唑-3-基)-5-((2-(三甲基甲硅烷基)乙氧基)甲基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-甲酰胺
向2-(1-((4-苄基吗啉-2-基)甲基)-5-(二氟甲氧基)-1H-吲唑-3-基)-N-叔丁基-5-((2-(三甲基甲硅烷基)乙氧基)甲基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-甲酰胺(参见实施例340,130mg,181μmol)在乙酸乙酯(2mL)和甲醇(1mL)中的搅拌溶液添加钯/炭(19.2mg),且使用填充了氢气的气球氢化混合物。室温搅拌15小时后,将混合物转移至帕尔氢化器并在40psi震荡1小时。过滤混合物,真空浓缩和然后通过色谱(硅胶,24g Analogix柱,0-100%乙酸乙酯在己烷中的溶液,接着5%甲醇在乙酸乙酯中的溶液)纯化得到N-叔丁基-2-(5-(二氟甲氧基)-1-(吗啉-2-基甲基)-1H-吲唑-3-基)-5-((2-(三甲基甲硅烷基)乙氧基)甲基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-甲酰胺(0.10g88%)。MS(M+H)+=630.
步骤2
N-叔丁基-2-(5-(二氟甲氧基)-1-((4-甲基吗啉-2-基)甲基)-1H-吲唑-3-基)-5-((2-(三甲基甲硅烷基)乙氧基)甲基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-甲酰胺
向以冰浴冷却至0℃的N-叔丁基-2-(5-(二氟甲氧基)-1-(吗啉-2-基甲基)-1H-吲唑-3-基)-5-((2-(三甲基甲硅烷基)乙氧基)甲基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-甲酰胺(100mg,159μmol)在甲醇(4mL)中的搅拌溶液添加甲醛水溶液(1mL,13.4mmol),接着添加三乙酰氧基硼氢化钠(75.7mg,357μmol)。将反应混合物在室温搅拌15小时,然后真空浓缩。通过色谱(硅胶,4g Analogix柱,0-10%甲醇,含10%氢氧化铵在二氯甲烷中的溶液)纯化得到N-叔丁基-2-(5-(二氟甲氧基)-1-((4-甲基吗啉-2-基)甲基)-1H-吲唑-3-基)-5-((2-(三甲基甲硅烷基)乙氧基)甲基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-甲酰胺(63mg,62%)。MS(M+H)+=644.
步骤3
2-[5-二氟甲氧基-1-(4-甲基-吗啉-2-基甲基)-1H-吲唑-3-基]-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-羧酸叔丁基酰胺
向N-叔丁基-2-(5-(二氟甲氧基)-1-((4-甲基吗啉-2-基)甲基)-1H-吲唑-3-基)-5-((2-(三甲基甲硅烷基)乙氧基)甲基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-甲酰胺(63mg,97.9μmol)在二氯甲烷(2mL)中的搅拌溶液添加三氟乙酸(1mL)。室温搅拌15小时后将混合物经真空浓缩然后添加氢氧化铵/甲醇/二氯甲烷的25mL1/10/60混合物。1小时后,将混合物经浓缩且通过色谱(硅胶,24g Analogix柱,0-4%甲醇,含10%氢氧化铵在二氯甲烷中的溶液)纯化得到2-[5-二氟甲氧基-1-(4-甲基-吗啉-2-基甲基)-1H-吲唑-3-基]-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-羧酸叔丁基酰胺(22mg,43%)。MS(M+H)+=514;1H NMR(DMSO-d6)δ:9.07(s,1H),8.39(s,1H),8.19(d,J=2.3Hz,1H),7.89(s,1H),7.86(s,1H),7.39(dd,J=9.0,2.3Hz,1H),7.20(s,1H),4.58-4.68(m,2H),3.74(d,J=11.9Hz,1H),3.37-3.48(m,1H),2.79(d,J=11.3Hz,1H),2.57(宽单峰,3H),2.18(s,3H),1.84-2.01(m,1H),1.51(s,9H).
实施例343.
2-{5-二氟甲氧基-1-[3-(3,3-二氟-吡咯烷-1-基)-丙基]-1H-吲唑-3-基}-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-羧酸叔丁基酰胺
步骤1
N-叔丁基-2-(5-(二氟甲氧基)-1-(3-(3,3-二氟吡咯烷-1-基)丙基)-1H-吲唑-3-基)-5-((2-(三甲基甲硅烷基)乙氧基)甲基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-甲酰胺
将N-叔丁基-2-(5-(二氟甲氧基)-1H-吲唑-3-基)-5-((2-(三甲基甲硅烷基)乙氧基)甲基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-甲酰胺(100mg,188μmol)、1-(3-氯丙基)-3,3-二氟吡咯烷(34.6mg,188μmol)和碳酸铯(184mg,565μmol)在二甲基甲酰胺(2mL)中于微波中在100℃加热30分钟。将混合物冷却且在乙酸乙酯和水之间分配。将有机相以水洗涤3次,然后干燥并真空浓缩。通过色谱(硅胶,24g Analogix柱,0-40%乙酸乙酯在己烷中的溶液)纯化得到N-叔丁基-2-(5-(二氟甲氧基)-1-(3-(3,3-二氟吡咯烷-1-基)丙基)-1H-吲唑-3-基)-5-((2-(三甲基甲硅烷基)乙氧基)甲基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-甲酰胺(91mg,72%)。MS(M+H)+=678.
步骤2
2-{5-二氟甲氧基-1-[3-(3,3-二氟-吡咯烷-1-基)-丙基]-1H-吲唑-3-基}-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-羧酸叔丁基酰胺
向N-叔丁基-2-(5-(二氟甲氧基)-1-(3-(3,3-二氟吡咯烷-1-基)丙基)-1H-吲唑-3-基)-5-((2-(三甲基甲硅烷基)乙氧基)甲基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-甲酰胺(91.4mg,135μmol)在二氯甲烷(2mL)中的搅拌溶液添加三氟乙酸(1mL)。在15小时后,将混合物经真空浓缩。添加25mL的氢氧化铵/甲醇/二氯甲烷的1/10/60混合物,且将反应混合物搅拌1小时,然后真空浓缩。通过色谱(硅胶,24g Analogix柱,0-4%甲醇,含10%氢氧化铵在二氯甲烷中的溶液)纯化得到2-{5-二氟甲氧基-1-[3-(3,3-二氟-吡咯烷-1-基)-丙基]-1H-吲唑-3-基}-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-羧酸叔丁基酰胺(32mg,43%)。MS(M+H)+=548;1H NMR(DMSO-d6)δ:9.09(s,1H),8.38(s,1H),8.21(d,J=2.3Hz,2H),7.88(s,2H),7.86(s,1H),7.36-7.43(m,1H),6.92-7.49(m,1H),4.59(t,J=6.8Hz,2H),2.84(t,J=13.6Hz,2H),2.64(t,J=7.0Hz,2H),2.43(t,J=6.7Hz,1H),2.15-2.29(m,2H),2.08(t,J=7.0Hz,2H),1.51(s,9H).
实施例344.
2-(3-甲氧基-吲唑-1-基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-羧酸(2-羟基-1,1-二甲基-乙基)-酰胺
步骤1
N-(1-羟基-2-甲基丙烷-2-基)-2-(3-甲氧基-1H-吲唑-1-基)-5-((2-(三甲基甲硅烷基)乙氧基)甲基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-甲酰胺
向2-溴-N-(1-羟基-2-甲基丙烷-2-基)-5-((2-(三甲基甲硅烷基)乙氧基)甲基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-甲酰胺(150mg,338μmol)、3-甲氧基-1H-吲唑(50.1mg,338μmol)在二噁烷(2mL)中的搅拌溶液添加叔丁醇钠(71.5mg,744μmol)和二(三-叔丁基膦)钯(0)(17.3mg,33.8μmol)。将混合物经脱气,然后在密封管中于125℃加热15小时。将混合物冷却,通过硅藻土过滤,且将滤饼以乙酸乙酯洗涤。将合并的滤液经真空浓缩且将粗残余物通过色谱(硅胶,24gAnalogix柱,0-40%乙酸乙酯在己烷中的溶液)纯化得到N-(1-羟基-2-甲基丙烷-2-基)-2-(3-甲氧基-1H-吲唑-1-基)-5-((2-(三甲基甲硅烷基)乙氧基)甲基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-甲酰胺(138mg,80%)。
步骤2
2-(3-甲氧基-吲唑-1-基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-羧酸(2-羟基-1,1-二甲基-乙基)-酰胺
向N-(1-羟基-2-甲基丙烷-2-基)-2-(3-甲氧基-1H-吲唑-1-基)-5-((2-(三甲基甲硅烷基)乙氧基)甲基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-甲酰胺(101mg,198μmol)在二氯甲烷(3mL)中的搅拌溶液添加三氟乙酸(1mL)。在15小时后,将混合物经真空浓缩然后添加25mL的氢氧化铵/甲醇/二氯甲烷的1/10/60混合物溶液。1小时后,将混合物经真空浓缩。通过色谱(硅胶,24g Analogix柱,0-5%甲醇,含10%氢氧化铵在二氯甲烷中的溶液)纯化得到2-(3-甲氧基-吲唑-1-基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-羧酸(2-羟基-1,1-二甲基-乙基)-酰胺(45mg,60%)。MS(M+H)+=381;1H NMR(DMSO-d6)δ:8.94(s,1H),8.62(d,J=8.7Hz,1H),8.33(s,1H),7.79(d,J=7.9Hz,1H),7.61(s,2H),7.28-7.38(m,1H),4.19(s,3H),3.62(d,J=5.7Hz,2H),1.45(s,6H).
实施例345.
2-[5-二氟甲氧基-1-(3-甲基氨基-丙基)-1H-吲唑-3-基]-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-羧酸叔丁基酰胺
步骤1
3-(3-(7-(叔丁基氨基甲酰基)-5-((2-(三甲基甲硅烷基)乙氧基)甲基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-2-基)-5-(二氟甲氧基)-1H-吲唑-1-基)丙基(甲基)氨基甲酸叔丁酯
将N-叔丁基-2-(5-(二氟甲氧基)-1H-吲唑-3-基)-5-((2-(三甲基甲硅烷基)乙氧基)甲基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-甲酰胺(280mg,528μmol)、3-氯丙基(甲基)氨基甲酸叔丁酯(110mg,528μmol)和碳酸铯(516mg,1.58mmol)在二甲基甲酰胺(4mL)中的溶液于微波中在100℃加热30分钟。将混合物在乙酸乙酯和水之间分配,然后将有机相以水洗涤3次,干燥,过滤并浓缩。粗残余物不经纯化用于后续步骤。MS(M+H)+=702.
步骤2
2-[5-二氟甲氧基-1-(3-甲基氨基-丙基)-1H-吲唑-3-基]-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-羧酸叔丁基酰胺
向3-(3-(7-(叔丁基氨基甲酰基)-5-((2-(三甲基甲硅烷基)乙氧基)甲基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-2-基)-5-(二氟甲氧基)-1H-吲唑-1-基)丙基(甲基)氨基甲酸叔丁酯(0.1g,142μmol)在二氯甲烷(3mL)中的搅拌溶液添加三氟乙酸(1mL)。在15小时后,将混合物经真空浓缩。添加25mL的氢氧化铵/甲醇/二氯甲烷的1/10/60混合物。1小时后,将混合物经真空浓缩。通过色谱(硅胶,24g Analogix柱,0-5%甲醇,含10%氢氧化铵在二氯甲烷中的溶液)纯化得到2-[5-二氟甲氧基-1-(3-甲基氨基-丙基)-1H-吲唑-3-基]-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-羧酸叔丁基酰胺(53mg,78%)。MS(M+H)+=472;1H NMR(DMSO-d6)δ:9.30(s,1H),8.61(s,1H),8.43(s,1H),8.08-8.14(m,2H),7.59-7.68(m,1H),7.12-7.71(m,1H),4.82(t,J=6.7Hz,4H),3.54(宽单峰,3H),2.27(t,J=6.8Hz,2H),1.73(s,9H).
实施例346.
2-{1-[3-(乙酰基-甲基-氨基)-丙基]-5-二氟甲氧基-1H-吲唑-3-基}-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-羧酸叔丁基酰胺
步骤1
N-叔丁基-2-(5-(二氟甲氧基)-1-(3-(N-甲基乙酰氨基)丙基)-1H-吲唑-3-基)-5-((2-(三甲基甲硅烷基)乙氧基)甲基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-甲酰胺
向N-叔丁基-2-(5-(二氟甲氧基)-1-(3-(甲基氨基)丙基)-1H-吲唑-3-基)-5-((2-(三甲基甲硅烷基)乙氧基)甲基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-甲酰胺(83mg,138μmol)和碳酸铯(135mg,414μmol)在二甲基甲酰胺(2mL)中的搅拌溶液添加乙酰基氯(10.8mg,138μmol)并将混合物温热至90℃。2小时后冷却混合物并真空浓缩。通过色谱(硅胶,12g Analogix柱,0-5%甲醇,含10%氢氧化铵在二氯甲烷中的溶液)纯化得到N-叔丁基-2-(5-(二氟甲氧基)-1-(3-(N-甲基乙酰氨基)丙基)-1H-吲唑-3-基)-5-((2-(三甲基甲硅烷基)乙氧基)甲基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-甲酰胺(72mg,81%)。MS(M+H)+=644.
步骤2
2-{1-[3-(乙酰基-甲基-氨基)-丙基]-5-二氟甲氧基-1H-吲唑-3-基}-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-羧酸叔丁基酰胺
向N-叔丁基-2-(5-(二氟甲氧基)-1-(3-(N-甲基乙酰氨基)丙基)-1H-吲唑-3-基)-5-((2-(三甲基甲硅烷基)乙氧基)甲基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-甲酰胺(72mg,112μmol)在二氯甲烷(2mL)中的搅拌溶液添加三氟乙酸(1mL)。15小时后,将混合物经真空浓缩然后添加25mL的氢氧化铵/甲醇/二氯甲烷的1/10/60混合物。1小时后,将混合物经真空浓缩。通过色谱(硅胶,24g Analogix柱,0~5%甲醇,含10%氢氧化铵在二氯甲烷中的溶液)纯化得到2-{1-[3-(乙酰基-甲基-氨基)-丙基]-5-二氟甲氧基-1H-吲唑-3-基}-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-羧酸叔丁基酰胺(32mg,56%)。MS(M+H)+=514;1H NMR(DMSO-d6)δ:9.09(s,1H),8.39(s,1H),8.22(宽单峰,1H),7.84-7.98(m,2H),7.40(d,J=9.8Hz,1H),6.93-7.47(m,1H),4.48-4.60(m,1H),3.36-3.42(m,2H),2.95(s,3H),2.79(s,3H),1.93(d,J=7.5Hz,2H),1.51(s,9H).
实施例347.
2-(3-哌啶-4-基-吲唑-1-基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-羧酸(2-羟基-1,1-二甲基-乙基)-酰胺
步骤1
4-(1-(7-(1-羟基-2-甲基丙烷-2-基氨基甲酰基)-5-((2-(三甲基甲硅烷基)乙氧基)甲基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-2-基)-1H-吲唑-3-基)哌啶-1-羧酸叔丁酯
向2-溴-N-(1-羟基-2-甲基丙烷-2-基)-5-((2-(三甲基甲硅烷基)乙氧基)甲基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-甲酰胺(150mg,338μmol)、4-(1H-吲唑-3-基)哌啶-1-羧酸叔丁酯(102mg,338μmol)在二噁烷(2.5mL)中的搅拌溶液添加叔丁醇钠(71.5mg,744μmol)和二(三-叔丁基膦)钯(0)(17.3mg,33.8μmol)。将混合物经脱气,然后在密封管中于125℃加热15小时。将混合物冷却,通过硅藻土过滤,且将滤饼以乙酸乙酯洗涤。将合并的滤液经真空浓缩。通过色谱(硅胶,24g Analogix柱,0-40%乙酸乙酯在己烷中的溶液)纯化得到4-(1-(7-(1-羟基-2-甲基丙烷-2-基氨基甲酰基)-5-((2-(三甲基甲硅烷基)乙氧基)甲基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-2-基)-1H-吲唑-3-基)哌啶-1-羧酸叔丁酯(198mg,88%).
步骤2
2-(3-哌啶-4-基-吲唑-1-基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-羧酸(2-羟基-1,1-二甲基-乙基)-酰胺
向4-(1-(7-(1-羟基-2-甲基丙烷-2-基氨基甲酰基)-5-((2-(三甲基甲硅烷基)乙氧基)甲基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-2-基)-1H-吲唑-3-基)哌啶-1-羧酸叔丁酯(22mg,33.1μmol)在二氯甲烷(2mL)中的搅拌溶液添加三氟乙酸(0.5mL)。15小时后,然后将混合物经真空浓缩然后添加25mL的氢氧化铵/甲醇/二氯甲烷的1/10/60混合物。1小时后,将混合物经真空浓缩。通过色谱(硅胶,24gAnalogix柱,0-5%甲醇,含10%氢氧化铵在二氯甲烷中的溶液)纯化得到2-(3-哌啶-4-基-吲唑-1-基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-羧酸(2-羟基-1,1-二甲基-乙基)-酰胺(14mg,98%)。MS(M+H)+=434;1H NMR(DMSO-d6)δ:8.98(s,1H),8.63(d,J=8.5Hz,1H),8.37(s,1H),8.01(d,J=8.1Hz,1H),7.65(s,1H),7.57(t,J=7.8Hz,1H),7.30-7.41(m,1H),3.61(s,4H),3.20(宽单峰,3H),2.80-2.93(m,2H),1.88-2.12(m,2H),1.43(s,6H).
实施例348.
2-[3-(1-甲基-哌啶-4-基)-吲唑-1-基]-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-羧酸(2-羟基-1,1-二甲基-乙基)-酰胺
步骤1
N-(1-羟基-2-甲基丙烷-2-基)-2-(3-(哌啶-4-基)-1H-吲唑-1-基)-5-((2-(三甲基甲硅烷基)乙氧基)甲基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-甲酰胺
将4-(1-(7-(1-羟基-2-甲基丙烷-2-基氨基甲酰基)-5-((2-(三甲基甲硅烷基)乙氧基)甲基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-2-基)-1H-吲唑-3-基)哌啶-1-羧酸叔丁酯(120mg,181μmol)在2,2,2-三氟乙醇(2mL)中的搅拌溶液于微波中在150℃加热4小时。将混合物经真空浓缩并不经纯化用于后续步骤。
步骤2
N-(1-羟基-2-甲基丙烷-2-基)-2-(3-(1-甲基哌啶-4-基)-1H-吲唑-1-基)-5-((2-(三甲基甲硅烷基)乙氧基)甲基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-甲酰胺
向N-(1-羟基-2-甲基丙烷-2-基)-2-(3-(哌啶-4-基)-1H-吲唑-1-基)-5-((2-(三甲基甲硅烷基)乙氧基)甲基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-甲酰胺(100mg,177μmol)在甲醇(4mL)中的搅拌溶液,以冰浴冷却至0℃,添加37%甲醛水溶液(1mL,13.4mmol),接着添加三乙酰氧基硼氢化钠(84.6mg,399μmol)。将反应混合物在室温搅拌15小时,然后真空浓缩。通过色谱(硅胶,4g Analogix柱,0-6%甲醇,含10%氢氧化铵在二氯甲烷中的溶液)纯化得到N-(1-羟基-2-甲基丙烷-2-基)-2-(3-(1-甲基哌啶-4-基)-1H-吲唑-1-基)-5-((2-(三甲基甲硅烷基)乙氧基)甲基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-甲酰胺(57mg,56%)。MS(M+H)+=578.
步骤3
2-[3-(1-甲基-哌啶-4-基)-吲唑-1-基]-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-羧酸(2-羟基-1,1-二甲基-乙基)-酰胺
向N-(1-羟基-2-甲基丙烷-2-基)-2-(3-(1-甲基哌啶-4-基)-1H-吲唑-1-基)-5-((2-(三甲基甲硅烷基)乙氧基)甲基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-甲酰胺(57m g,98.7μmol)在二氯甲烷(3mL)中的搅拌溶液添加三氟乙酸(1mL)。在15小时后,将混合物经真空浓缩然后添加25mL的氢氧化铵/甲醇/二氯甲烷的1/10/60混合物。1小时后,将混合物经真空浓缩。通过色谱(硅胶,24g Analogix柱,0-6%甲醇,含10%氢氧化铵在二氯甲烷中的溶液)纯化得到2-[3-(1-甲基-哌啶-4-基)-吲唑-1-基]-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-羧酸(2-羟基-1,1-二甲基-乙基)-酰胺(10mg,23%)。MS(M+H)+=447;1H NMR(DMSO-d6)δ:9.00(s,1H),8.64(d,J=8.5Hz,1H),8.37(s,1H),7.99(d,J=7.9Hz,1H),7.65(s,1H),7.57(t,J=7.3Hz,1H),7.35(t,J=7.5Hz,1H),5.06(t,J=5.7Hz,2H),3.62(d,J=5.7Hz,2H),2.98(d,J=11.5Hz,2H),2.30(s,3H),1.94-2.24(m,5H),1.44(s,6H)
实施例349.
2-(1-氮杂环丁烷-3-基甲基-6-氟-1H-吲唑-3-基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-羧酸叔丁基酰胺三氟乙酸盐
步骤1
3-((6-氟-3-(7-甲酰基-5-((2-(三甲基甲硅烷基)乙氧基)甲基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-2-基)-1H-吲唑-1-基)甲基)氮杂环丁烷-1-羧酸叔丁酯
将2-(6-氟-1H-吲唑-3-基)-5-((2-(三甲基甲硅烷基)乙氧基)甲基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-甲醛(225mg,547μmol)、3-(碘代甲基)氮杂环丁烷-1-羧酸叔丁酯(162mg,547μmol)和碳酸铯(534mg,1.64mmol)在二甲基甲酰胺(4mL)中的溶液于微波中在150℃加热30分钟。将混合物在乙酸乙酯和水之间分配。然后将有机相以水洗涤3次,干燥并真空浓缩。通过色谱(硅胶,24g Analogix柱,0-40%乙酸乙酯在己烷中的溶液)纯化得到3-((6-氟-3-(7-甲酰基-5-((2-(三甲基甲硅烷基)乙氧基)甲基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-2-基)-1H-吲唑-1-基)甲基)氮杂环丁烷-1-羧酸叔丁酯(202mg,64%)。
步骤2
2-(1-((1-(叔丁氧基羰基)氮杂环丁烷-3-基)甲基)-6-氟-1H-吲唑-3-基)-5-((2-(三甲基甲硅烷基)乙氧基)甲基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-羧酸
向冷却至0℃的3-((6-氟-3-(7-甲酰基-5-((2-(三甲基甲硅烷基)乙氧基)甲基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-2-基)-1H-吲唑-1-基)甲基)氮杂环丁烷-1-羧酸叔丁酯(160mg,276μmol)和氨基磺酸(161mg,1.65mmol)在二噁烷(5mL)和水(2mL)中的搅拌溶液滴加亚氯酸钠(32.4mg,358μmol)和磷酸二氢钾(450mg,3.31mmol)在水(3mL)中的溶液。将混合物温热至室温。2.5小时后,将混合物在乙酸乙酯和水之间分配,且分离有机相,并以水洗涤然后干燥,并真空浓缩。认定为定量收率,且粗残余物不经进一步纯化直接用于后续步骤。
步骤3
3-((3-(7-(叔丁基氨基甲酰基)-5-((2-(三甲基甲硅烷基)乙氧基)甲基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-2-基)-6-氟-1H-吲唑-1-基)甲基)氮杂环丁烷-1-羧酸叔丁酯
将2-(1-((1-(叔丁氧基羰基)氮杂环丁烷-3-基)甲基)-6-氟-1H-吲唑-3-基)-5-((2-(三甲基甲硅烷基)乙氧基)甲基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-羧酸(150mg,251μmol)、2-甲基丙烷-2-胺(18.4mg,251μmol)、HATU(105mg,277μmol)和二异丙胺(97.5mg,754μmol)在二甲基甲酰胺(12mL)中的溶液于室温搅拌15小时。将混合物在乙酸乙酯和水之间分配,然后将有机相以水洗涤然后干燥,过滤并真空浓缩。通过色谱(硅胶,24g Analogix柱,0-40%乙酸乙酯在己烷中的溶液)纯化得到3-((3-(7-(叔丁基氨基甲酰基)-5-((2-(三甲基甲硅烷基)乙氧基)甲基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-2-基)-6-氟-1H-吲唑-1-基)甲基)氮杂环丁烷-1-羧酸叔丁酯(150mg,91.5%)。
步骤4
2-(1-氮杂环丁烷-3-基甲基-6-氟-1H-吲唑-3-基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-羧酸叔丁基酰胺三氟乙酸盐
向3-((3-(7-(叔丁基氨基甲酰基)-5-((2-(三甲基甲硅烷基)乙氧基)甲基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-2-基)-6-氟-1H-吲唑-1-基)甲基)氮杂环丁烷-1-羧酸叔丁酯(70mg,107μmol)在二氯甲烷(5mL)中的搅拌溶液添加三氟乙酸(1mL)。在15小时后,将混合物经真空浓缩且将残余物溶解于25mL的氢氧化铵/甲醇/二氯甲烷的1/10/60混合物。1小时后,将混合物经真空浓缩。通过色谱(硅胶,24gAnalogix柱,0-6%甲醇,含10%氢氧化铵在二氯甲烷中的溶液)纯化,接着SFC色谱(洗脱液含TFA)纯化得到2-(1-氮杂环丁烷-3-基甲基-6-氟-1H-吲唑-3-基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-羧酸叔丁基酰胺三氟乙酸盐(10mg,17%)。MS(M+H)+=422;1H NMR(DMSO-d6)δ:9.09(s,1H),8.49(dd,J=8.9,5.4Hz,1H),8.40(s,1H),7.92(s,1H),7.77(dd,J=9.8,1.9Hz,1H),7.20(d,J=2.1Hz,1H),4.77(d,J=7.0Hz,2H),3.87-4.18(m,4H),1.52(s,9H),1.24(d,J=4.5Hz,1H).
实施例350.
2-(1-氮杂环丁烷-3-基甲基-5-二氟甲氧基-1H-吲唑-3-基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-羧酸叔丁基酰胺
步骤1
3-((3-(7-(叔丁基氨基甲酰基)-5-((2-(三甲基甲硅烷基)乙氧基)甲基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-2-基)-5-(二氟甲氧基)-1H-吲唑-1-基)甲基)氮杂环丁烷-1-羧酸叔丁酯
将N-叔丁基-2-(5-(二氟甲氧基)-1H-吲唑-3-基)-5-((2-(三甲基甲硅烷基)乙氧基)甲基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-甲酰胺(152mg,286μmol)、3-(碘代甲基)氮杂环丁烷-1-羧酸叔丁酯(85.1mg,286μmol)和碳酸铯(280mg,859μmol)在二甲基甲酰胺(3mL)中的溶液于微波中在150℃加热30分钟。将混合物在乙酸乙酯和水之间分配,以水洗涤,干燥并真空浓缩。通过色谱(硅胶,24gAnalogix柱,0-40%乙酸乙酯在己烷中的溶液)纯化得到3-((3-(7-(叔丁基氨基甲酰基)-5-((2-(三甲基甲硅烷基)乙氧基)甲基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-2-基)-5-(二氟甲氧基)-1H-吲唑-1-基)甲基)氮杂环丁烷-1-羧酸纯化,其不经纯化直接使用。MS(M+H)+=702.
步骤2
2-(1-氮杂环丁烷-3-基甲基-5-二氟甲氧基-1H-吲唑-3-基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-羧酸叔丁基酰胺
向3-((3-(7-(叔丁基氨基甲酰基)-5-((2-(三甲基甲硅烷基)乙氧基)甲基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-2-基)-5-(二氟甲氧基)-1H-吲唑-1-基)甲基)氮杂环丁烷-1-羧酸叔丁酯(80mg,114μmol)在二氯甲烷(2mL)中的搅拌溶液添加三氟乙酸(1mL)。在15小时后,将混合物经真空浓缩且将残余物溶解于25mL的氢氧化铵/甲醇/二氯甲烷的1/10/60混合物。1小时后,将混合物经真空浓缩。通过色谱(硅胶,24g Analogix柱,0-4%甲醇,含10%氢氧化铵在二氯甲烷中的溶液)纯化得到2-(1-氮杂环丁烷-3-基甲基-5-二氟甲氧基-1H-吲唑-3-基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-羧酸叔丁基酰胺(22mg,41%)。MS(M+H)+=470;1H NMR(DMSO-d6,300MHz):δ=9.06(d,J=4.0Hz,1H),8.38(d,J=7.7Hz,1H),8.17-8.24(m,1H),7.87(s,1H),7.42(d,J=9.4Hz,1H),7.19(d,J=4.1Hz,1H),6.95(d,J=4.1Hz,1H),4.48-4.83(m,2H),3.49-3.73(m,2H),2.85-3.08(m,2H),1.50(d,J=3.8Hz,9H),1.23ppm(s,1H)
实施例351.
N-叔丁基-2-(1-(环丙基甲基)-5-(二氟甲氧基)-1H-吲唑-3-基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-甲酰胺
步骤1
N-叔丁基-2-(5-(二氟甲氧基)-1H-吲唑-3-基)-5-((2-(三甲基甲硅烷基)乙氧基)甲基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-甲酰胺
在Ar下向N-叔丁基-2-(5-(二氟甲氧基)-1H-吲唑-3-基)-5-((2-(三甲基甲硅烷基)乙氧基)甲基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-甲酰胺(117.1mg,221μmol)和(溴甲基)环丙烷(386mg,250μL,2.86mmol)在DMF(60mL)中的搅拌溶液以一份添加碳酸铯(750mg,2.3mmol)。于70℃搅拌反应混合物。18小时后,将反应混合物冷却至25℃并以水(200mL)淬灭。将混合物以乙酸乙酯萃取(3x75mL),且将有机物以盐水(100mL)洗涤。将有机物经硫酸钠干燥并浓缩得到N-叔丁基-2-(1-(环丙基甲基)-5-(二氟甲氧基)-1H-吲唑-3-基)-5-((2-(三甲基甲硅烷基)乙氧基)甲基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-甲酰胺(120mg,205μmol,86%)。MS(M)+=585;1H NMR(DMSO-d6)δ:9.14(s,1H),8.59(s,1H),8.20(d,J=2.0Hz,1H),7.93(s,1H),7.87(s,1H),7.41(dd,J=2.0,8.8Hz,1H),7.21(t,J=74.3Hz,1H),5.86(m,1H),5.07(dd,J=1.5,17.1Hz,1H),4.98(d,J=10.3Hz,1H),4.64(t,J=7.0Hz,2H),3.58(t,J=8.0Hz,2H),2.70(m,2H),1.51(s,9H),0.86(t,J=8.0Hz,2H),-0.08(s,9H).
步骤2
N-叔丁基-2-(1-(环丙基甲基)-5-(二氟甲氧基)-1H-吲唑-3-基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-甲酰胺
于25℃在Ar下向N-叔丁基-2-(1-(环丙基甲基)-5-(二氟甲氧基)-1H-吲唑-3-基)-5-((2-(三甲基甲硅烷基)乙氧基)甲基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-甲酰胺(140mg,239μmol)在二氯甲烷(10mL)中的搅拌溶液添加三氟乙酸(744mg,0.50mL,6.53mmol)。18小时后,真空浓缩反应混合物得到浅棕色残余物。将残余物溶解于二氯甲烷/甲醇/NH3OH(3:2:0.25,10.5mL)的混合物中,并于25℃搅拌。2.5小时后,将反应混合物浓缩得到黄色固体并真空干燥(200mTorr,25℃)。将固体溶解于乙醇(4.5mL,200proof)并冷却至4℃。18小时后,将沉淀的固体通过过滤分离并真空干燥(200mTorr,40℃)得到N-叔丁基-2-(1-(环丙基甲基)-5-(二氟甲氧基)-1H-吲唑-3-基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-甲酰胺(72.8mg,160μmol,66.9%),为黄色固体。MS(M)+=455;1H NMR(DMSO-d6)δ:9.09(s,1H),8.39(s,1H),8.21(d,J=2.3Hz,1H),7.93(d,J=9.0Hz,1H),7.88(s,1H),7.40(dd,J=2.3,9.0Hz,1H),7.20(t,J=74.3Hz,1H),5.86(m,1H),5.08(dd,J=1.5,17.3Hz,2H),4.63(t,J=7.0Hz,2H),2.71(m,2H),1.51(s,9H).
实施例352.
N-叔丁基-2-(5-(二氟甲氧基)-1-(2-氧代-2-(4-(2,2,2-三氟乙基)哌嗪-1-基)乙基)-1H-吲唑-3-基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-甲酰胺
步骤1
2-氯-1-(4-(2,2,2-三氟乙基)哌嗪-1-基)乙酮
向冷却至0℃的1-(2,2,2-三氟乙基)哌嗪二盐酸盐(181.6mg,753μmol)和三乙胺(182mg,250μL,1.79mmol)在二氯甲烷(5mL)中的搅拌溶液经2分钟滴加2-氯乙酰基氯(85.1mg,60.0μL,753μmol),然后搅拌10分钟。将反应混合物经3小时温热至25℃。将反应混合物在饱和碳酸氢钠溶液(25mL)和二氯甲烷(25mL)之间分配。分离有机层,以水(25mL)和盐水(50mL)洗涤,经硫酸钠干燥,并浓缩得到2-氯-1-(4-(2,2,2-三氟乙基)哌嗪-1-基)乙酮(123.3mg,504μmol,67%),为橙色油状物。1H NMR(DMSO-d6)δ:4.73(宽单峰,2H),3.45(宽单峰,4H),3.23(q,J=10.3Hz,2H),2.61(d,J=20.8Hz,4H).
步骤2
N-叔丁基-2-(5-(二氟甲氧基)-1-(2-氧代-2-(4-(2,2,2-三氟乙基)哌嗪-1-基)乙基)-1H-吲唑-3-基)-5-((2-(三甲基甲硅烷基)乙氧基)甲基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-甲酰胺
于25℃在Ar下向2-氯-1-(4-(2,2,2-三氟乙基)哌嗪-1-基)乙酮(115mg,471μmol)在DMF(16mL)中的搅拌溶液以一份添加碳酸钾(200mg,1.45mmol)。1小时后,以一份添加N-叔丁基-2-(5-(二氟甲氧基)-1H-吲唑-3-基)-5-((2-(三甲基甲硅烷基)乙氧基)甲基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-甲酰胺(50mg,94.2μmol)在DMF(4.00mL)中的溶液,且将反应混合物于60℃搅拌。18小时后,将反应混合物冷却至25℃并以水(400mL)淬灭。将产物以乙酸乙酯萃取(3x150mL),且将有机物以盐水(200mL)洗涤。将有机物经硫酸钠干燥并浓缩得到黄色油状物。将油状物经真空干燥(300mTorr,25℃)并通过色谱(硅胶,12gAnalogix柱,5-80%乙酸乙酯在己烷中的溶液,梯度,经1小时)纯化得到N-叔丁基-2-(5-(二氟甲氧基)-1-(2-氧代-2-(4-(2,2,2-三氟乙基)哌嗪-1-基)乙基)-1H-吲唑-3-基)-5-((2-(三甲基甲硅烷基)乙氧基)甲基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-甲酰胺(69.0mg,93.3μmol,99%),为黄色固体。MS(M)+=739;1H NMR(DMSO-d6)δ:9.09(s,1H),8.60(s,1H),8.22(d,J=2.0Hz,1H),7.88(s,1H),7.78(d,J=9.3Hz,1H),7.40(dd,J=2.0,8.8Hz,1H),7.21(t,J=74.3Hz,1H),5.74(s,2H),5.67(s,2H),3.64(宽单峰,2H),3.58(t,J=8.0Hz,2H),3.46(d,J=4.5Hz,2H),2.77(宽单峰,2H),2.61(d,J=18.8Hz,4H),1.52(s,9H),0.86(t,J=8.0Hz,2H),-0.08(s,9H).
步骤3
N-叔丁基-2-(5-(二氟甲氧基)-1-(2-氧代-2-(4-(2,2,2-三氟乙基)哌嗪-1-基)乙基)-1H-吲唑-3-基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-甲酰胺
在Ar下向N-叔丁基-2-(5-(二氟甲氧基)-1-(2-氧代-2-(4-(2,2,2-三氟乙基)哌嗪-1-基)乙基)-1H-吲唑-3-基)-5-((2-(三甲基甲硅烷基)乙氧基)甲基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-甲酰胺(75.9mg,103μmol)在二氯甲烷(5mL)中的搅拌溶液于25℃添加三氟乙酸(744mg,0.50mL,6.52mmol)。96小时后,将反应混合物真空浓缩并在二氯甲烷/甲醇/NH3OH(3:2:0.25,5.25mL)的混合物中于25℃搅拌。2.5小时后,浓缩物质并真空干燥(200mTorr,25℃)得到黄色固体。将固体经色谱纯化(硅胶,12g Analogix柱,10-100%乙酸乙酯在己烷中的溶液,梯度,经1小时)得到黄色油状物。将油状物溶解于乙醇(4.5mL,200proof)并冷却至4℃。通过过滤沉淀固体,并真空干燥(100mTorr,40℃)得到N-叔丁基-2-(5-(二氟甲氧基)-1-(2-氧代-2-(4-(2,2,2-三氟乙基)哌嗪-1-基)乙基)-1H-吲唑-3-基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-甲酰胺(36.2mg,54.1μmol,53%),为黄色固体。MS(M)+=609;1H NMR(DMSO-d6)δ:12.84(d,J=3.0Hz,1H),9.03(s,1H),8.40(d,J=3.0Hz,1H),8.21(d,J=2.3Hz,1H),7.89(s,1H),7.77(d,J=9.0Hz,1H),7.39(dd,J=2.3,9.0Hz,1H),7.20(t,J=74.5Hz,1H),5.66(s,2H),3.64(宽单峰,2H),3.47(宽单峰,2H),3.29(q,J=10.3Hz,2H),2.77(宽单峰,2H),2.64(宽单峰,2H),1.51(s,9H).
实施例353.
N-叔丁基-2-(5-(二氟甲氧基)-1-(2-(4-甲基哌嗪-1-基)-2-氧代乙基)-1H-吲唑-3-基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-甲酰胺
步骤1
N-叔丁基-2-(5-(二氟甲氧基)-1-(2-(4-甲基哌嗪-1-基)-2-氧代乙基)-1H-吲唑-3-基)-5-((2-(三甲基甲硅烷基)乙氧基)甲基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-甲酰胺
于25℃于Ar下向2-氯-1-(4-甲基哌嗪-1-基)乙酮(138.2mg,782μmol)在DMF(32.0mL)中的搅拌溶液添加碳酸钾(328.5mg,2.38mmol)。1小时后,添加N-叔丁基-2-(5-(二氟甲氧基)-1H-吲唑-3-基)-5-((2-(三甲基甲硅烷基)乙氧基)甲基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-甲酰胺(80mg,151μmol)在DMF(8.00mL)中的溶液且将反应混合物于70℃搅拌。18小时后,将反应混合物冷却至25℃并以水(350mL)淬灭。将产物以乙酸乙酯萃取(2x250mL)。合并有机物,经硫酸钠干燥,且除去溶剂得到黄色油状物。将固体经真空干燥(200mTorr,25℃)得到黄色固体。将固体经色谱(硅胶,115g Analogix柱,3-10%乙酸乙酯在己烷中的溶液,梯度,经0.5小时)纯化得到黄色油状物。将产物浓缩成黄色油状物并真空干燥得到N-叔丁基-2-(5-(二氟甲氧基)-1-(2-(4-甲基哌嗪-1-基)-2-氧代乙基)-1H-吲唑-3-基)-5-((2-(三甲基甲硅烷基)乙氧基)甲基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-甲酰胺(41.7mg,62.2μmol,41.2%),为黄色固体。MS(M)+=671;1HNMR(DMSO-d6)δ:9.09(s,1H),8.60(s,1H),8.22(d,J=2.3Hz,1H),7.88(s,1H),7.78(d,J=9.0Hz,1H),7.40(dd,J=2.3,8.8Hz,1H),7.21(t,J=74.4Hz,1H),5.73(s,2H),5.67(s2H),3.61(宽单峰,2H),3.58(t,J=8.0Hz,2H),3.45(宽单峰,2H),2.45(宽单峰,2H),2.32(m,2H),2.33(s,3H),1.52(s,9H),0.86(t,J=8.0Hz,2H),-0.08(s,9H)。
步骤2
N-叔丁基-2-(5-(二氟甲氧基)-1-(2-(4-甲基哌嗪-1-基)-2-氧代乙基)-1H-吲唑-3-基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-甲酰胺
于25℃在Ar下向N-叔丁基-2-(5-(二氟甲氧基)-1-(2-(4-甲基哌嗪-1-基)-2-氧代乙基)-1H-吲唑-3-基)-5-((2-(三甲基甲硅烷基)乙氧基)甲基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-甲酰胺(41.7mg,62.2μmol)在二氯甲烷(3mL)中的搅拌溶液添加三氟乙酸(208mg,0.140mL,1.83mmol)。18小时后,真空浓缩反应混合物得到黄色残余物。将残余物溶解于二氯甲烷/甲醇/NH3OH(3:2:0.25,5.25mL)的混合物中,并于25℃搅拌。2.5小时后,浓缩物质并真空干燥(200mTorr,40℃)得到N-叔丁基-2-(5-(二氟甲氧基)-1-(2-(4-甲基哌嗪-1-基)-2-氧代乙基)-1H-吲唑-3-基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-甲酰胺(22.4mg,41.4μmol,67%),为黄色固体。MS(M)+=541;1H NMR(DMSO-d6)δ:12.84(d,J=2.8Hz,1H),9.02(s,1H),8.41(d,J=3.0Hz,1H),8.23(d,J=2.3Hz,1H),7.89(s,1H),7.75(d,J=9.3Hz,1H),7.41(dd,J=2.3,9.0Hz,1H),7.21(t,J=74.5Hz,1H),5.71(宽单峰,2H),3.82(宽单峰,2H),3.50(宽单峰,2H),2.74(宽单峰,2H),2.67(宽单峰,2H),2.33(s,3H),1.51(s,9H)。
实施例354.
N-叔丁基-2-(5-(二氟甲氧基)-1-(2-(甲基氨基)-2-氧代乙基)-1H-吲唑-3-基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-甲酰胺
步骤1
N-叔丁基-2-(5-(二氟甲氧基)-1-(2-(甲基氨基)-2-氧代乙基)-1H-吲唑-3-基)-5-((2-(三甲基甲硅烷基)乙氧基)甲基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-甲酰胺
于25℃在Ar下向2-氯-N-甲基乙酰胺(80mg,744μmol)在DMF(28.0mL)中的搅拌溶液添加碳酸钾(280mg,2.03mmol)。1小时后,添加N-叔丁基-2-(5-(二氟甲氧基)-1H-吲唑-3-基)-5-((2-(三甲基甲硅烷基)乙氧基)甲基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-甲酰胺(70mg,132μmol)在DMF(7.00mL)中的溶液且将反应混合物于70℃搅拌。6小时后,将反应混合物冷却至25℃并以水(350mL)淬灭。将产物以乙酸乙酯萃取(2x250mL)。将有机层经硫酸钠干燥,通过硅藻土过滤,且真空除去溶剂得到米色固体。将固体在己烷(20mL)研磨,过滤并真空干燥(200mTorr,25℃)得到N-叔丁基-2-(5-(二氟甲氧基)-1-(2-(甲基氨基)-2-氧代乙基)-1H-吲唑-3-基)-5-((2-(三甲基甲硅烷基)乙氧基)甲基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-甲酰胺(62.2mg,103μmol,78%),为浅棕色固体。MS(M)+=602;1H NMR(DMSO-d6)δ:9.10(s,1H),8.60(s,1H),8.22(m,2H),7.88(s,1H),7.82(d,J=9.0Hz,1H),7.41(dd,J=2.3,9.0Hz,1H),7.21(t,J=74.5Hz,1H),5.73(s,2H),5.27(s2H),3.58(t,J=8.0Hz,2H),2.65(d,J=4.5Hz,3H),1.51(s,9H),0.86(t,J=7.8Hz,2H),-0.08(s,9H).
步骤2
N-叔丁基-2-(5-(二氟甲氧基)-1-(2-(甲基氨基)-2-氧代乙基)-1H-吲唑-3-基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-甲酰胺
于25℃在Ar下向N-叔丁基-2-(5-(二氟甲氧基)-1-(2-(甲基氨基)-2-氧代乙基)-1H-吲唑-3-基)-5-((2-(三甲基甲硅烷基)乙氧基)甲基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-甲酰胺(69.0mg,115μmol)在二氯甲烷(3.00mL)中的搅拌溶液添加三氟乙酸(372mg,0.25mL,3.26mmol)。18小时后,除去溶剂且将残余物溶解于二氯甲烷/甲醇/NH3OH(3:2:0.25,5.25mL)的混合物并搅拌。2.5小时后,浓缩反应混合物并真空干燥(200mTorr,25℃)。将固体残余物以水(50mL)研磨并通过过滤分离。将固体以水和己烷洗涤并真空干燥(200mTorr,40℃)得到N-叔丁基-2-(5-(二氟甲氧基)-1-(2-(甲基氨基)-2-氧代乙基)-1H-吲唑-3-基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-甲酰胺(45.6mg,91.9μmol,80%),为浅棕色固体。MS(M)+=472;1H NMR(DMSO-d6)δ:12.83(宽单峰,1H),9.04(s,1H),8.39(d,J=2.8Hz,1H),8.21(m,2H),7.89(s,1H),7.81(d,J=9.0Hz,1H),7.40(dd,J=2.0,9.0Hz,1H),7.20(t,J=74.3Hz,1H),5.24(s2H),2.65(m,3H),1.51(s,9H).
实施例355.
N-叔丁基-2-(7-乙基-1H-吲唑-3-基)-5H-吡咯并[3,2-b]吡嗪-7-甲酰胺
步骤1
7-乙基-1H-吲唑
向以氮气冲洗的5-溴-7-乙基-1H-吲唑(900mg,4.00mmol)在乙醇(16.0mL)中的溶液添加钯/炭(128mg,1.2mmol)并在H2(1atm)下搅拌混合物。70小时后,将反应混合物经硅藻土垫过滤。收集滤液并浓缩。将残余物溶解于乙醇中并添加80mg的钯/炭且于H2(1atm)下搅拌。3小时后,再添加80mg的钯/炭并在H2(1atm)搅拌。16小时后,将反应混合物经过硅藻土垫过滤。收集滤液并浓缩。将所得黄色固体以乙醚研磨,过滤并真空干燥得到7-乙基-1H-吲唑(771mg,5.27mmol,119%),为灰白色固体。其不经进一步纯化而直接使用。MS(M+H)+=146.8;1H NMR(CDCl3)δ:8.54(s,1H),7.78(d,J=8.2Hz,1H),7.59(d,J=7.1Hz,1H),7.43(t,J=7.1Hz,1H),3.25(q,J=7.4Hz,2H),1.48(t,J=7.5Hz,3H).
步骤2
7-乙基-3-碘-1H-吲唑
向碳酸氢钠(1.67g,19.8mmol)在水(4.65mL)和乙醇(9.3mL)中的搅拌溶液添加7-乙基-1H-吲唑(771mg,5.27mmol),接着添加碘(1.87g,7.38mmol)。16小时后,将反应混合物以硫代硫酸钠淬灭,以乙酸乙酯稀释并以水洗涤。将有机层经收集并干燥(MgSO4)。通过色谱(硅胶,5-25%乙酸乙酯/己烷)纯化得到7-乙基-3-碘-1H-吲唑(690mg,2.54mmol,48%),为灰白色固体。MS(M+H)+=272.9;1H NMR(CDCl3)δ:7.39(d,J=8.1Hz,1H),7.30(d,J=7.1Hz,1H),7.22(t,J=7.1Hz,1H),2.95(q,J=7.5Hz,2H),1.41(t,J=7.5Hz,3H).
步骤3
N-叔丁基-2-(7-乙基-1H-吲唑-3-基)-5-((2-(三甲基甲硅烷基)乙氧基)甲基)-5H-吡咯并[3,2-b]吡嗪-7-甲酰胺
在N2下向2-溴-N-叔丁基-5-((2-(三甲基甲硅烷基)乙氧基)甲基)-5H-吡咯并[3,2-b]吡嗪-7-甲酰胺(320mg,749μmol)和7-乙基-3-碘-1H-吲唑(244mg,898μmol)在DMF(2.5mL)中的搅拌溶液添加1,1,1,2,2,2-六丁基二甲锡烷(651mg,412μL,1.12mmol)。10分钟后,添加四(三苯基膦)钯(0)(43.3mg,37.4μmol)并将反应混合物加热至115℃。16小时后,冷却反应混合物并浓缩。将残余物以10%甲醇/二氯甲烷稀释并通过硅藻土垫过滤。通过色谱(硅胶,5-45%乙酸乙酯/己烷)纯化滤液得到N-叔丁基-2-(7-乙基-1H-吲唑-3-基)-5-((2-(三甲基甲硅烷基)乙氧基)甲基)-5H-吡咯并[3,2-b]吡嗪-7-甲酰胺(45mg,91.3μmol,12%),为灰白色固体。MS(M+H)+=493.4;1H NMR(CDCl3)δ:10.57(s,1H),9.34(s,1H),8.49(d,J=7.5,1H),8.43(s,1H),8.24(s,1H),7.35(d,J=7.1Hz,1H),7.29(t,J=7.1Hz,1H),5.77(s,2H),3.62(t,J=8.3,2H),3.07(q,J=7.5Hz,2H),1.68(s,9H),1.50(t,J=7.5Hz,3H),0.98(t,J=8.3,2H),0.0(s,9H).
步骤4
N-叔丁基-2-(7-乙基-1H-吲唑-3-基)-5H-吡咯并[3,2-b]吡嗪-7-甲酰胺
向N-叔丁基-2-(7-乙基-1H-吲唑-3-基)-5-((2(三甲基甲硅烷基)乙氧基)甲基)-5H-吡咯并[3,2-b]吡嗪-7-甲酰胺(45mg,91.3μmol)在二氯甲烷(913μL)中的溶液添加三氟乙酸(417mg,281μL,3.65mmol)并于室温搅拌。16小时后,浓缩反应混合物。将残余物溶解于二氯甲烷(913μL)中并添加乙二胺(329mg,370μL,5.48mmol)且于室温搅拌。1小时后,将反应混合物以10%甲醇/二氯甲烷稀释。通过色谱(硅胶,MeOH/DCM梯度)纯化得到N-叔丁基-2-(7-乙基-1H-吲唑-3-基)-5H-吡咯并[3,2-b]吡嗪-7-甲酰胺(16mg,44.1μmol,48%),为白色固体。MS(M+H)+=363.2;1H NMR(CD3OD)δ:9.17(s,1H),8.36(d,J=7.5Hz,1H),8.27(s,1H),7.81(s,1H),7.27(d,J=7.5Hz,1H),7.18(t,J=7.5Hz,1H),3.03(q,J=7.7Hz,2H),1.62(s,9H);1.42(t,J=7.7Hz,3H).
实施例356.
N-叔丁基-2-(6-氯咪唑并[1,5-a]吡啶-1-基)-5H-吡咯并[3,2-b]吡嗪-7-甲酰胺
步骤1
N-((5-氯吡啶-2-基)甲基)甲酰胺
将(5-氯吡啶-2-基)甲胺盐酸盐(1.0g,5.31mmol)在甲酸(5.09g,4.24mL,106mmol)中的溶液于110℃回流。20小时后,将反应混合物冷却至0℃并添加25%的氢氧化铵水溶液直到实现pH~9。将混合物以水稀释,且然后萃取至二氯甲烷(3x)。合并有机层并干燥(MgSO4),过滤并真空浓缩。其不经进一步纯化而直接用于后续步骤。1H NMR(CDCl3)δ:8.53(s,1H),8.35(s,1H),7.69(m,1H),7.65(m,1H),4.64(d,J=5.3Hz,2H),4.0(s,1H).
步骤2
6-氯咪唑并[1,5-a]吡啶
向N-((5-氯吡啶-2-基)甲基)甲酰胺(740mg,4.34mmol)在甲苯(18.4mL)中的混合物添加三氯氧磷(1.21g,736μL,7.89mmol),并将混合物加热至100℃。16小时后,将冰添加至反应混合物中,接着缓慢添加25%氢氧化铵水溶液直到实现pH~9。将混合物以二氯甲烷稀释并萃取至二氯甲烷(2x)。将有机层以水和盐水洗涤,干燥(MgSO4)并过滤。通过色谱(硅胶,MeOH/DCM梯度)纯化滤液得到6-氯咪唑并[1,5-a]吡啶(417mg,2.73mmol,63.0%),为棕色油状物。MS(M+H)+=152.8;1H NMR(CDCl3)δ:8.10(s,1H),8.01(m,1H),7.47(s,1H),7.43(d,J=9.5Hz,1H),6.69(dd,J=9.5Hz,1.5Hz,1H).
步骤3
6-氯-1-碘代咪唑并[1,5-a]吡啶
向6-氯咪唑并[1,5-a]吡啶(417mg,2.73mmol)在EtOH(5mL)和水(2.4mL)中的溶液添加碳酸氢钠(861mg,10.2mmol)和碘(832mg,3.28mmol)并于室温在N2下搅拌混合物。16小时后,将反应混合物以硫代硫酸钠淬灭,然后萃取至乙酸乙酯。将有机层以水和盐水洗涤,干燥(MgSO4),过滤,并浓缩。通过色谱(硅胶,20-60%乙酸乙酯/己烷)纯化滤液得到6-氯-1-碘代咪唑并[1,5-a]吡啶(271mg,973μmol,36%),为棕色固体。MS(M+H)+=278.8;1H NMR(CDCl3)δ:8.10(s,1H),8.0(m,1H),7.30(d,J=9.5Hz,1H),6.76(9.5m,1H).
步骤4
N-叔丁基-2-(6-氯咪唑并[1,5-a]吡啶-1-基)-5-((2-(三甲基甲硅烷基)乙氧基)甲基)-5H-吡咯并[3,2-b]吡嗪-7-甲酰胺
在N2下向6-氯-1-碘代咪唑并[1,5-a]吡啶(263mg,943μmol)和2-溴-N-叔丁基-5-(2-(三甲基甲硅烷基)乙氧基)-5H-吡咯并[3,2-b]吡嗪-7-甲酰胺(300mg,726μmol)在DMF(2mL)中的搅拌溶液添加1,1,1,2,2,2-六丁基二甲锡烷(631mg,400μL,1.09mmol)和四(三苯基膦)钯(0)(41.9mg,36.3μmol)。将温度增加至120℃。16小时后,将反应混合物冷却并浓缩。将残余物溶解于二氯甲烷且然后通过色谱(硅胶,30-70%乙酸乙酯/己烷)纯化得到N-叔丁基-2-(6-氯咪唑并[1,5-a]吡啶-1-基)-5-((2-(三甲基甲硅烷基)乙氧基)甲基)-5H-吡咯并[3,2-b]吡嗪-7-甲酰胺(50mg,100μmol,13.8%产率),为黄色油状物。MS(M+H)+=499.3;1H NMR(CDCl3-d)δ:9.31(s,1H),8.48(d,J=9.5Hz,1H),8.33(s,1H),8.23(s,1H),8.13(m,1H),7.99(s,1H),6.9(m,1H),5.74(s,2H),3.61(d,J=9.5Hz,2H),1.67(s,9H);0.98(t,J=9.5Hz,2H),0.0(s,9H).
步骤5
N-叔丁基-2-(6-氯咪唑并[1,5-a]吡啶-1-基)-5H-吡咯并[3,2-b]吡嗪-7-甲酰胺
向N-叔丁基-2-(6-氯咪唑并[1,5-a]吡啶-1-基)-5-((2-(三甲基甲硅烷基)乙氧基)甲基)-5H-吡咯并[3,2-b]吡嗪-7-甲酰胺(50mg,100μmol)在二氯甲烷(1.5mL)中的溶液添加三氟乙酸(228mg,154μL,2.00mmol)并于室温搅拌混合物。16小时后,浓缩反应混合物,然后将残余物再溶解于二氯甲烷(2mL)、甲醇(1mL)和氢氧化铵(0.22mL)并于室温搅拌。2小时后,真空浓缩反应混合物。将残余物经色谱(硅胶,30-100%的0.5:10:89.5氢氧化铵:甲醇:二氯甲烷在二氯甲烷中的溶液)纯化。将收集的物质经浓缩,以甲醇研磨并过滤得到N-叔丁基-2-(6-氯咪唑并[1,5-a]吡啶-1-基)-5H-吡咯并[3,2-b]吡嗪-7-甲酰胺(12mg,29.6μmol,30%),为黄色固体。MS(M+H)+=369.1;1H NMR(DMSO-d6)δ:12.69(s,1H),9.08(s,1H),8.79(s,1H),8.53(s,1H),8.34(d,J=9.7Hz,1H),8.30(s,1H),7.84(s,1H),7.05(d,J=9.7Hz,1H);1.52(s,9H).
实施例357.
N-叔丁基-2-(6-氟咪唑并[1,5-a]吡啶-1-基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-甲酰胺
步骤1
6-氟-1-碘代咪唑并[1,5-a]吡啶
向碳酸氢钠(1.3g,15.4mmol)在水(3.66mL)中的溶液添加6-氟咪唑并[1,5-a]吡啶(参见实施例32,560mg,4.11mmol)在EtOH(7.31mL)中的溶液,接着于室温添加碘(1.46g,5.76mmol)。16小时后,再添加800mg的碘。再经16小时后,将反应混合物以硫代硫酸钠淬灭并用乙酸乙酯稀释。将有机相以水和盐水洗涤然后干燥(MgSO4),过滤并真空浓缩。通过色谱(硅胶,乙酸乙酯/己烷梯度)纯化。产物含有微量杂质并不经进一步纯化而使用。MS(M+H)+=262.9;1H NMR(CDCl3)δ:8.14(s,1H),7.90(m,1H),7.35(m,1H),6.77(m,1H).
步骤2
6-氟-1-(三丁基甲锡烷基)咪唑并[1,5-a]吡啶
于-16℃向6-氟-1-碘代咪唑并[1,5-a]吡啶(158mg,603μmol)在THF(4.64mL)中的溶液滴加异丙基氯化镁(368μL,736μmol)。20分钟后,于-16℃滴加三丁基氯甲锡烷(232mg,193μL,712μmol)并温热至室温。2小时后,将反应混合物以饱和氯化铵淬灭并用乙酸乙酯稀释。分离各相且将有机相以盐水洗涤。收集有机层,真空浓缩,并不经进一步纯化用于后续步骤。
步骤3
N-叔丁基-2-(6-氟咪唑并[1,5-a]吡啶-1-基)-5-((2-(三甲基甲硅烷基)乙氧基)甲基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-甲酰胺
向2-溴-N-叔丁基-5-((2-(三甲基甲硅烷基)乙氧基)甲基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-甲酰胺(250mg,585μmol)、6-氟-1-(三丁基甲锡烷基)咪唑并[1,5-a]吡啶(400mg,564μmol)、四(三苯基膦)钯(0)(33.8mg,29.2μmol)和碘化亚铜(I)(22.3mg,117μmol)的混合物添加DMF(5.85mL)并在N2下将反应混合物加热至90℃。16小时后,将反应混合物以乙醚、乙酸乙酯和水稀释。分离有机相,并以水(1x)和盐水(2x)洗涤,然后干燥(MgSO4),过滤并真空浓缩。通过色谱(硅胶,30-80%乙酸乙酯/己烷)纯化得到N-叔丁基-2-(6-氟咪唑并[1,5-a]吡啶-1-基)-5-((2-(三甲基甲硅烷基)乙氧基)甲基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-甲酰胺(88mg,182μmol,31.2%),为黄色固体。MS(M+H)+=483.3;1H NMR(CDCl-3-d)δ:9.34(s,1H),8.54(m,1H),8.34(s,2H),8.04(m,1H),7.98(s,1H),6.9(m,1H),5.74(s,2H),3.61(d,J=8.3Hz,2H),1.66(s,9H);0.98(t,J=8.3Hz,2H),0.0(s,9H).
步骤4
N-叔丁基-2-(6-氟咪唑并[1,5-a]吡啶-1-基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-甲酰胺
于室温向N-叔丁基-2-(6-氟咪唑并[1,5-a]吡啶-1-基)-5-((2-(三甲基甲硅烷基)乙氧基)甲基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-甲酰胺(95mg,197μmol)在二氯甲烷(3mL)中的搅拌溶液添加三氟乙酸(449mg,303μL,3.94mmol)。16小时后浓缩反应混合物。将残余物溶解于二氯甲烷(3mL)、甲醇(1.5mL)和氢氧化铵(0.45mL)。1小时后,浓缩反应混合物。将残余物以水研磨并过滤。将固体以水和乙醚洗涤,然后真空干燥得到N-叔丁基-2-(6-氟咪唑并[1,5-a]吡啶-1-基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-甲酰胺(64mg,182μmol,92%),为黄色固体。MS:(M+H)+=353;1H NMR(CD3OD)δ:9.10(s,1H),8.48(d,J=5.1Hz,1H),8.45(s,1H),8.42(m,1H),8.25(s,1H),7.03(m,1H),1.62(s,9H).
实施例358.
2-(6-氟-1-甲基-1H-吲唑-3-基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-羧酸[(S)-1-(5-三氟甲基-1H-咪唑-2-基)-乙基]-酰胺
步骤1
[(S)-1-(5-三氟甲基-1H-咪唑-2-基)-乙基]-氨基甲酸叔丁酯
向乙酸钠(1.44g,17.6mmol)在水(4mL)中的搅拌溶液添加3,3-二溴-1,1,1-三氟丙烷-2-酮(2.37g,8.8mmol)。将混合物于90℃在氮气下加热30分钟。在将反应混合物冷却至0℃后,添加(R)-1-氧代丙烷-2-基氨基甲酸叔丁酯(1.39g,8mmol)在甲醇(20mL)和氢氧化铵(6mL)中的溶液。3小时后,将混合物经真空浓缩,以水研磨且通过过滤得到固体。将粗品经色谱(硅胶,40g Analogix柱,0-50%乙酸乙酯在己烷中的溶液,梯度,经30分钟)纯化得到[(S)-1-(5-三氟甲基-1H-咪唑-2-基)-乙基]-氨基甲酸叔丁酯(510mg,23%),为浅黄色固体。LCMS,[M+H]=280.
步骤2
(S)-1-(5-三氟甲基-1H-咪唑-2-基)-乙胺盐酸盐
将[(S)-1-(5-三氟甲基-1H-咪唑-2-基)-乙基]-氨基甲酸叔丁酯(50mg,179μmol)在4M HCl(在二噁烷(2mL)中)的溶液在室温搅拌15小时。将混合物经真空浓缩,然后以乙醚研磨得到(S)-1-(5-三氟甲基-1H-咪唑-2-基)-乙胺盐酸盐(35mg,定量),为黄色油状物。LCMS,[M+H]=180.
步骤3
2-(6-氟-1-甲基-1H-吲唑-3-基)-5-((2-(三甲基甲硅烷基)乙氧基)甲基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-羧酸
在冰浴中向2-(6-氟-1-甲基-1H-吲唑-3-基)-5-((2-(三甲基甲硅烷基)乙氧基)甲基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-甲醛(500mg,1.18mmol)和氨基磺酸(685mg,7.05mmol)在二噁烷(25mL)和水(0.556mL)的搅拌悬浮液添加亚氯酸钠(146mg,1.61mmol)和磷酸二氢钾(1.92g,14.1mmol)在水(2.78mL)中的溶液。将反应混合物在室温搅拌过夜。将反应混合物以乙酸乙酯和水稀释。分离有机层,以盐水洗涤然后干燥(硫酸钠),过滤并真空浓缩。将粗残余物从乙酸乙酯和己烷中重结晶得到2-(6-氟-1-甲基-1H-吲唑-3-基)-5-((2-(三甲基甲硅烷基)乙氧基)甲基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-羧酸(467mg,89%),为浅黄色固体。其不经进一步纯化而直接用于后续步骤。LCMS,[M+H]=442.
步骤4
2-(6-氟-1-甲基-1H-吲唑-3-基)-5-((2-(三甲基甲硅烷基)乙氧基)甲基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-羧酸[(S)-1-(5-三氟甲基-1H-咪唑-2-基)-乙基]-酰胺
向2-(6-氟-1-甲基-1H-吲唑-3-基)-5-((2-(三甲基甲硅烷基)乙氧基)甲基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-羧酸(40mg,90.6μmol)、(S)-1-(5-(三氟甲基)-1H-咪唑-2-基)乙胺盐酸盐(32.5mg,151μmol)、二异丙基乙胺(63.3μL,362μmol)在DMF(2mL)的搅拌溶液添加o-(苯并三唑-1-基)-N,N,N’,N’-二(四亚甲基)脲鎓六氟磷酸盐(43.0mg,99.7μmol)。15小时后,将反应混合物以二氯甲烷和水稀释。将有机层以饱和碳酸钠和盐水洗涤,然后干燥(硫酸钠),过滤并真空浓缩。将残余物经色谱(硅胶,12g Analogix柱,50-70%乙酸乙酯在己烷中的溶液,梯度,经30分钟)纯化得到2-(6-氟-1-甲基-1H-吲唑-3-基)-5-((2-(三甲基甲硅烷基)乙氧基)甲基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-羧酸[(S)-1-(5-三氟甲基-1H-咪唑-2-基)-乙基]-酰胺(34mg,62%),为浅黄色固体。LCMS,[M+H]=603.
步骤5
2-(6-氟-1-甲基-1H-吲唑-3-基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-羧酸[(S)-1-(5-三氟甲基-1H-咪唑-2-基)-乙基]-酰胺
于20℃,向2-(6-氟-1-甲基-1H-吲唑-3-基)-5-((2-(三甲基甲硅烷基)乙氧基)甲基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-羧酸[(S)-1-(5-三氟甲基-1H-咪唑-2-基)-乙基]-酰胺(34mg,56.4μmol)在二氯甲烷(0.5mL)中的搅拌溶液添加三氟乙酸(174μL,2.26mmol)。3小时后,将混合物经真空浓缩。将残余物以二氯甲烷稀释并再次浓缩。将残余物然后悬浮于二氯甲烷(1mL)中并添加乙二胺(229μL,3.39mmol)。搅拌混合物1小时,然后以乙酸乙酯和水稀释。将有机层以盐水洗涤,然后干燥(硫酸钠),过滤并真空浓缩。将残余物经色谱(硅胶,12gAnalogix柱,0-10%甲醇的二氯甲烷溶液,梯度,经30分钟)纯化得到2-(6-氟-1-甲基-1H-吲唑-3-基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-羧酸[(S)-1-(5-三氟甲基-1H-咪唑-2-基)-乙基]-酰胺(16mg,60%),为浅黄色固体。MS(M+H)+=473;1H NMR(DMSO-d6)δ:12.94(d,J=3.0Hz,1H),12.80(宽单峰,1H),9.12(s,1H),8.63(d,J=8.5Hz,1H),8.50(d,J=3.3Hz,1H),8.42-8.49(m,1H),7.72(s,1H),7.67(dd,J=9.8,2.0Hz,1H),7.00(td,J=9.2,2.3Hz,1H),5.32-5.59(m,1H),4.14(s,3H),1.64(d,J=6.8Hz,3H).
实施例359.
2-((S)-1-{[2-(6-氟-1-甲基-1H-吲唑-3-基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-羧基]-氨基}-乙基)-3H-咪唑-4-羧酸甲酯
步骤1
2-((S)-1-叔丁氧基羰基氨基-乙基)-3H-咪唑-4-羧酸甲酯
向(S)-1-(5-(三氟甲基)-1H-咪唑-2-基)乙基氨基甲酸叔丁酯(200mg,716μmol)在甲醇(6mL)中的搅拌溶液添加甲醇钠(77.4mg,1.43mmol)。将混合物在微波中于100℃加热60分钟。将混合物经真空浓缩。将残余物溶解于乙酸乙酯,然后以饱和碳酸钠水溶液、盐水洗涤,然后干燥(硫酸钠),过滤并真空浓缩得到2-((S)-1-叔丁氧基羰基氨基-乙基)-3H-咪唑-4-羧酸甲酯(154mg,80%),为黄色固体。其不经进一步纯化而直接用于后续步骤。LCMS,[M+H]=270.
步骤2
2-((S)-1-氨基-乙基)-3H-咪唑-4-羧酸甲酯盐酸盐
将2-((S)-1-叔丁氧基羰基氨基-乙基)-3H-咪唑-4-羧酸甲酯盐酸盐(50mg,186μmol)在4M HCl(二噁烷(2mL)中)中的溶液在室温搅拌15小时。将混合物经真空浓缩,以乙醚洗涤得到2-((S)-1-氨基-乙基)-3H-咪唑-4-羧酸甲酯盐酸盐(40mg,定量),为黄色油状物,LCMS,[M+H]=170.
步骤3
2-((S)-1-{[2-(6-氟-1-甲基-1H-吲唑-3-基)-5-(2-三甲基甲硅烷基-乙氧基甲基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-羧基]-氨基}-乙基)-3H-咪唑-4-羧酸甲酯
向2-(6-氟-1-甲基-1H-吲唑-3-基)-5-((2-(三甲基甲硅烷基)乙氧基)甲基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-羧酸(50mg,113μmol)、(S)-2-(1-氨基乙基)-1H-咪唑-5-羧酸甲酯盐酸盐(38.3mg,186μmol)和二异丙基乙胺(79.1μL,453μmol)在DMF(2.5mL)中的搅拌溶液添加o-(苯并三唑-1-基)-N,N,N’,N’-二(四亚甲基)脲鎓六氟磷酸盐(58.6mg,136μmol)。15小时后,将反应混合物以二氯甲烷和水稀释。将有机层以饱和碳酸铵水溶液和盐水洗涤,然后干燥(硫酸钠),过滤并真空浓缩。将残余物经色谱(硅胶,12g Analogix柱,50-70%乙酸乙酯在己烷中的溶液,梯度,经30分钟)纯化得到2-((S)-1-{[2-(6-氟-1-甲基-1H-吲唑-3-基)-5-(2-三甲基甲硅烷基-乙氧基甲基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-羧基l]-氨基}-乙基)-3H-咪唑-4-羧酸甲酯(35mg,52.1%),为浅黄色固体。LCMS,[M+H]=693.
步骤4
2-((S)-1-{[2-(6-氟-1-甲基-1H-吲唑-3-基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-羧基l]-氨基}-乙基)-3H-咪唑-4-羧酸甲酯
于20℃,向2-((S)-1-{[2-(6-氟-1-甲基-1H-吲唑-3-基)-5-(2-三甲基甲硅烷基-乙氧基甲基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-羧基]-氨基}-乙基)-3H-咪唑-4-羧酸甲酯(32mg,54.0μmol)在二氯甲烷(0.5mL)中的搅拌溶液添加三氟乙酸(249μL,3.24mmol)。15小时后。将残余物以二氯甲烷稀释并再次浓缩。将残余物然后悬浮于二氯甲烷(1mL)中并添加乙二胺(219μL,3.24mmol)。搅拌混合物1小时,然后以乙酸乙酯和水稀释。将有机层以盐水洗涤,然后干燥(硫酸钠),过滤并真空浓缩。将残余物经色谱(硅胶,12g Analogix柱,0-3%甲醇的二氯甲烷溶液,梯度,经30分钟)纯化得到2-((S)-1-{[2-(6-氟-1-甲基-1H-吲唑-3-基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-羧基]-氨基}-乙基)-3H-咪唑-4-羧酸甲酯(18mg,72%),为白色固体。MS(M+H)+=463;1H NMR(DMSO-d6)δ:12.92(宽单峰,1H),12.73(宽单峰,1H),9.12(s,1H),8.57(d,J=8.5Hz,1H),8.49(s,1H),8.35(dd,J=9.0,5.3Hz,1H),7.82(d,J=2.0Hz,1H),7.65(dd,J=9.7,2.1Hz,1H),6.96-7.14(m,1H),5.36-5.51(m,1H),4.14(s,3H),3.69(s,3H),1.64(d,J=7.0Hz,3H).
实施例360.
(3-乙炔基-氮杂环丁烷-1-基)-[2-(6-氟-1-甲基-1H-吲唑-3-基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-基]-甲酮
步骤1
3-乙炔基-氮杂环丁烷盐酸盐
将3-乙炔基氮杂环丁烷-1-羧酸叔丁酯(54mg,298μmol)在4M HCl(在二噁烷(2mL)中)的溶液在室温搅拌15小时。将混合物经真空浓缩。将残余物以乙醚洗涤,然后高真空干燥得到3-乙炔基-氮杂环丁烷盐酸盐(36mg,定量),为白色结晶固体。
步骤2
(3-乙炔基-氮杂环丁烷-1-基)-[2-(6-氟-1-甲基-1H-吲唑-3-基)-5-(2-三甲基甲硅烷基-乙氧基甲基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-基]-甲酮
向2-(6-氟-1-甲基-1H-吲唑-3-基)-5-((2-(三甲基甲硅烷基)乙氧基)甲基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-羧酸(50mg,113μmol)、3-乙炔基-氮杂环丁烷盐酸盐(18.4mg,154μmol)、二异丙基乙胺(79.1μL,453μmol)在DMF(2.5mL)中的溶液添加o-(苯并三唑-1-基)-N,N,N’,N’-二(四亚甲基)脲鎓六氟磷酸盐(48.8mg,113μmol)。15小时后,将反应混合物以二氯甲烷和水稀释。将有机层以饱和碳酸钠和盐水洗涤然后干燥(硫酸钠),过滤并真空浓缩。将残余物经色谱(硅胶,12g Analogix柱,40-70%乙酸乙酯在己烷中的溶液,梯度经30分钟)纯化得到(3-乙炔基-氮杂环丁烷-1-基)-[2-(6-氟-1-甲基-1H-吲唑-3-基)-5-(2-三甲基甲硅烷基-乙氧基甲基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-基]-甲酮(64mg,100%),为黄色油状物。LCMS,[M+H]=505.
步骤3
(3-乙炔基-氮杂环丁烷-1-基)-[2-(6-氟-1-甲基-1H-吲唑-3-基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-基]-甲酮
于20℃向(3-乙炔基-氮杂环丁烷-1-基)-[2-(6-氟-1-甲基-1H-吲唑-3-基)-5-(2-三甲基甲硅烷基-乙氧基甲基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-基]-甲酮(61mg,121μmol)在二氯甲烷(0.5mL)中的搅拌溶液添加三氟乙酸(373μL,4.84mmol)。3小时后,将混合物经真空浓缩。将残余物以二氯甲烷稀释并再次浓缩。将残余物然后悬浮于二氯甲烷(1mL)并添加乙二胺(490μL,7.24mmol)。搅拌混合物1小时,然后以乙酸乙酯和水稀释。将有机层以盐水洗涤,然后干燥(硫酸钠),过滤并真空浓缩。将残余物经色谱(硅胶,12g Analogix柱,0-5%甲醇的二氯甲烷溶液,梯度,经30分钟)纯化得到(3-乙炔基-氮杂环丁烷-1-基)-[2-(6-氟-1-甲基-1H-吲唑-3-基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-基]-甲酮(25mg,55%),为浅黄色固体。MS(M+H)+=375;1H NMR(DMSO-d6)δ:12.73(宽单峰,1H),9.10(s,1H),8.72(dd,J=9.0,5.5Hz,1H),8.33(s,1H),7.65(dd,J=9.8,2.0Hz,1H),7.22(td,J=9.1,2.1Hz,1H),4.53(宽单峰,4H),4.14(s,3H),3.47-3.58(m,1H),3.38(d,J=2.5Hz,3H).
实施例361.
N-叔丁基-2-(6-氯-1-甲基-1H-吲唑-3-基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-甲酰胺
步骤1
2-(6-氟-1-甲基-1H-吲唑-3-基)-5-(2-三甲基甲硅烷基-乙氧基甲基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-羧酸甲氧基-酰胺
于20℃向2-(6-氟-1-甲基-1H-吲唑-3-基)-5-((2-(三甲基甲硅烷基)乙氧基)甲基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-羧酸(50mg,113μmol)和O-甲基羟基胺盐酸盐(11.3mg,136μmol)和二异丙基乙胺(79μL,453μmol)在DMF(2mL)中的搅拌悬浮液添加o-(苯并三唑-1-基)-N,N,N’,N’-二(四亚甲基)脲鎓六氟磷酸盐(58.6mg,136μmol)过夜。将反应混合物以乙酸乙酯稀释,并以1N HCl溶液洗涤。将有机层然后以饱和碳酸氢钠和盐水洗涤,然后干燥(硫酸钠),过滤并真空浓缩得到粗品2-(6-氟-1-甲基-1H-吲唑-3-基)-5-(2-三甲基甲硅烷基-乙氧基甲基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-羧酸甲氧基-酰胺(53mg),为白色固体。其不经进一步纯化而直接用于步骤。MS(M+H)+=471.
步骤2
2-(6-氟-1-甲基-1H-吲唑-3-基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-羧酸甲氧基-酰胺
于20℃向2-(6-氟-1-甲基-1H-吲唑-3-基)-5-(2-三甲基甲硅烷基-乙氧基甲基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-羧酸甲氧基-酰胺(53mg,113μmol)在二氯甲烷(2mL)中的搅拌溶液添加三氟乙酸(0.4mL,5.19mmol)。2小时后,将混合物经真空浓缩。将残余物以二氯甲烷稀释并再次浓缩。将残余物然后悬浮于二氯甲烷(2mL)中并添加乙二胺(0.4mL,5.92mmol)。搅拌混合物1小时,然后真空浓缩。向残余物添加乙酸乙酯和水。将有机层然后以盐水洗涤,然后干燥(硫酸钠),过滤并真空浓缩。通过色谱(硅胶,25g预装填Silicycle筒,40-80%EtOAc的己烷溶液,梯度增加,经15分钟)纯化得到2-(6-氟-1-甲基-1H-吲唑-3-基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-羧酸甲氧基-酰胺(45mg,0.39μmol,39%),为浅黄色粉末。MS(M+H)+=341;1H NMR(DMSO-d6)δ:12.87(宽单峰,1H),10.97(s,1H),9.09(s,1H),8.66(dd,J=8.8,5.3Hz,1H),8.45(s,1H),7.67(d,J=9.8Hz,1H),7.24(t,J=9.3Hz,1H),4.15(s,3H),3.84(s,3H).
实施例362.
2-(6-氟-1-甲基-1H-吲唑-3-基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-羧酸叔丁基酰胺
步骤1
2-(6-氟-1-甲基-1H-吲唑-3-基)-5-((2-(三甲基甲硅烷基)乙氧基)甲基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-羧酸叔丁基酰胺
将2-溴-N-叔丁基-5-((2-(三甲基甲硅烷基)乙氧基)甲基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-甲酰胺(80mg,0.187mmol)和6-氟-1-甲基-3-(三丁基甲锡烷基)-1H-吲唑(0.1g,0.228mmol)溶解于DMF(3mL)中。对反应混合物抽真空并填充以氮气。添加碘化亚铜(I)(6.71mg,0.0749mmol)和四(三苯基膦)钯(0)(10.8mg,0.00936mmol)。将反应混合物于90℃加热2小时。将混合物冷却并在乙酸乙酯和水之间分配,将有机相以盐水洗涤,然后经硫酸钠干燥。将粗品化合物经色谱使用25%乙酸乙酯/己烷纯化得到2-(6-氟-1-甲基-1H-吲唑-3-基)-5-((2-(三甲基甲硅烷基)乙氧基)甲基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-羧酸叔丁基酰胺(5mg,38%).
步骤2
2-(6-氟-1-甲基-1H-吲唑-3-基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-羧酸叔丁基酰胺
将N-叔丁基-2-(6-氟-1-1H-吲唑-3-基)-5-((2-三甲基甲硅烷基)乙氧基)甲基)-5H-吡咯并[3,2-b]吡嗪-7-羧酰胺(35mg,0.0705mmol)和三氟乙酸(0.543mL,7.05mmol)溶解于(3.0mL)中。3小时后,将反应混合物浓缩至干且再溶解于二氯甲烷中。向该混合物添加乙二胺(0.476mL,7.05mmol)。1小时后,将混合物经浓缩并以2mL水稀释。将沉淀经过滤并干燥得到2-(6-氟-1-甲基-1H-吲唑-3-基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-羧酸叔丁基酰胺(9mg,35%),为灰白色固体。MS(M+H)+=367;1H NMR(DMSO-d6)δ:9.05(s,1H),8.14-8.62(m,2H),7.92(s,1H),7.69(dd,J=9.7,1.9Hz,1H),6.84-7.32(m,1H),4.15(s,3H),1.52(s,6H).
实施例363.
2-(6-氟-1-甲基-1H-吲唑-3-基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-羧酸(2-羟基-1,1-二甲基-乙基-酰胺
步骤1.
2-(6-氟-1-甲基-吲唑-3-基)-5-(2-三甲基-甲硅烷基-乙氧基甲基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-羧酸(2-羟基-1,1-二甲基-乙基)-酰胺
将2-溴-N-(1-羟基-2-甲基丙烷-2yl)-5((2-三甲基甲硅烷基)乙氧基)甲基-5H-吡咯并-[2,3-]吡嗪-7-甲酰胺(0.17g,0.383mmol)、6-氟-1-甲基-3-(三丁基甲锡烷基)-1H-吲唑(0.168g,0.383mmol)和碘化亚铜(I)(14.6mg,0.076mmol)混合在DMF(3.0mL)中。将混合物经脱气,并以氮气填充。添加四(三苯基膦)钯(0)(46mg,0.041mmol)并且将反应混合物于90℃加热2小时。将混合物冷却并真空浓缩然后通过色谱(硅胶,3:2乙酸乙酯:己烷)纯化得到2-(6-氟-1-甲基-吲唑-3-基)-5-(2-三甲基-甲硅烷基-乙氧基甲基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-羧酸(2-羟基-1,1-二甲基-乙基)-酰胺(80mg,40%)。
步骤2.
2-(6-氟-1-甲基-1H-吲唑-3-基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-羧酸(2-羟基-1,1-二甲基-乙基-酰胺
将2-(6-氟-1-甲基-1H-吲唑-3-基)-N-(1-羟基-2-甲基丙烷-2-基)-5-((2-(三甲基甲硅烷基)乙氧基)甲基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-甲酰胺(0.08g,0.156mmol)和三氟乙酸(1mL,13.0mmol)在二氯甲烷中搅拌15小时。将反应混合物经真空浓缩然后添加在二氯甲烷(5mL)中的乙二胺(1mL,14.8mmol)。1小时后,将混合物浓缩至干并添加水(1mL)。将固体沉淀通过过滤收集并干燥得到2-(6-氟-1-甲基-1H-吲唑-3-基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-羧酸(2-羟基-1,1-二甲基-乙基-酰胺(24mg,36%)。MS(M+H)+=383;1H NMR(DMSO-d6)δ:9.07(s,1H),8.60(dd,J=8.7,5.5Hz,1H),8.37(s,1H),7.91(s,1H),7.66(d,J=9.8Hz,1H),7.15(t,J=8.3Hz,1H),4.14(s,3H),3.62(s,2H),1.45(s,6H).
实施例364.
2-(6-氯-1-甲基-1H-吲唑-3-基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-羧酸(2-羟基-1,1-二甲基-乙基)-酰胺
步骤1.
2-(6-氯-1-甲基-1H-吲唑-3-基)-5-三甲基-甲硅烷基-乙氧基甲基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-羧酸(2-羟基-1,1-二甲基-乙基)-酰胺
将2-溴-N-叔丁基-5-((2-(三甲基甲硅烷基)乙氧基)甲基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-甲酰胺(90mg,0.203mmol)和6-氯-1-甲基-3-(三丁基甲锡烷基)-1H-吲唑(0.148g,0.228mmol)溶解于DMF(3mL)中。对反应混合物抽真空并填充以氮气然后添加碘化亚铜(I)(9mg,0.081mmol)和四(三苯基膦)钯(0)(46mg,0.046mmol)。将反应混合物于90℃加热2小时,然后在乙酸乙酯和水之间分配。将有机相以盐水洗涤,然后经硫酸钠干燥。将粗物质经色谱使用25%乙酸乙酯/己烷纯化得到2-(6-氯-1-甲基-1H-吲唑-3-基)-5-三甲基-甲硅烷基-乙氧基甲基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-羧酸(2-羟基-1,1-二甲基-乙基)-酰胺(40mg,37%).
步骤2.
2-(6-氯-1-甲基-1H-吲唑-3-基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-羧酸(2-羟基-1,1-二甲基-乙基)-酰胺
将2-(6-氯-1-甲基-1H-吲唑-3-基)-N-(1-羟基-2-甲基丙烷-2-基)-5-((2-(三甲基甲硅烷基)乙氧基)甲基)-5H-吡咯并[3,2-b]吡嗪-7-甲酰胺(0.04g,0.076mmol)、三氟乙酸(0.582mL,7.56mmol)和二氯甲烷(3.00mL)混合并搅拌3小时。将反应混合物浓缩至干并以二氯甲烷(3mL)稀释,然后添加乙二胺(0.510mL,7.56mmol)。1小时后,将混合物浓缩至干并添加冰水(1mL)。将形成的固体通过过滤收集然后以乙酸乙酯研磨得到2-(6-氯-1-甲基-1H-吲唑-3-基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-羧酸(2-羟基-1,1-二甲基-乙基)-酰胺(5mg,16%)。MS(M+H)+=399;1H NMR(DMSO-d6)δ:8.94-9.36(m,1H),8.51-8.76(m,1H),8.37(s,1H),7.80-8.08(m,2H),7.29(t,J=8.8Hz,1H),4.17(d,J=5.8Hz,3H),3.48-3.80(m,2H),1.45(d,J=3.3Hz,6H).
实施例365.
2-(6-甲氧基-1-1H-吲唑-3-基-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-羧酸(2-羟基-1,1-二甲基-乙基)-酰胺
根据实施例364中阐述的操作制备,以6-甲氧基-1-甲基-3-三丁基甲锡烷基-1H-吲唑替代步骤1中的6-氯-1-甲基-3-三丁基甲锡烷基-1H-吲唑。MS:(M+H)+=395;1H NMR(DMSO-d6)δ:9.04(s,1H),8.20-8.65(m,2H),7.93(s,1H),7.20(d,J=2.0Hz,1H),6.88(dd,J=8.9,2.1Hz,1H),4.12(s,3H),3.90(s,3H),3.63(s,2H),1.44(s,6H).
实施例366.
2-(6-甲氧基-1-甲基-1H-吲唑-3-基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-羧酸叔丁基酰胺
根据实施例362中阐述的操作制备,以6-甲氧基-1-甲基-3-三丁基甲锡烷基-1H-吲唑替代步骤1中的6-氟-1-甲基-3-三丁基甲锡烷基-1H-吲唑。MS:(M+H)+=379;1H NMR(DMSO-d6)δ:9.05(s,1H),8.15-8.58(m,2H),7.95(s,1H),7.22(s,1H),6.86(d,J=8.8Hz,1H),4.13(s,3H),3.90(s,3H),1.52(s,9H).
实施例367.
2-(6-乙基-1-甲基-1H-吲唑-3-基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-羧酸叔丁基酰胺
步骤1.
2-(6-乙基-1-甲基-1H-吲唑-3-基)-5-((2-(三甲基甲硅烷基)乙氧基)甲基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-羧酸叔丁基酰胺
根据实施例162步骤1中的过程制备,以6-乙基-1-甲基-3-三丁基甲锡烷基-1H-吲唑(参见实施例87)替代6-氟-1-甲基-3-三丁基甲锡烷基-1H-吲唑。
步骤2.
2-(6-乙基-1-甲基-1H-吲唑-3-基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-羧酸叔丁基酰胺
将N-叔丁基-2-(6-乙基-1-甲基-1H-吲唑-3-基)-5-((2-(三甲基甲硅烷基)乙氧基)甲基)-5H-吡咯并[3,2-b]吡嗪-7-甲酰胺(0.03g,0.059mmol)、乙二胺(1mL,15.0mmol)和TBAF(1mL,3.45mmol)与DMF(3.0mL)混合并将反应混合物温热至60℃。3小时后,将混合物浓缩至干并在乙酸乙酯和水之间分配。将有机相真空浓缩然后通过色谱纯化得到2-(6-乙基-1-甲基-1H-吲唑-3-基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-羧酸叔丁基酰胺(5mg,22%)。MS:(M+H)+=377;1H NMR(DMSO-d6)δ:12.79(宽单峰,1H),8.96-9.28(m,1H),8.19-8.49(m,2H),7.97(s,1H),7.57(s,1H),6.98-7.25(m,1H),4.16(s,3H),2.81(q,J=7.4Hz,2H),1.41-1.66(m,9H),1.21-1.35(m,3H).
实施例368.
2-(1,6-二甲基-吲唑-3-基-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-羧酸(2-羟基-1,1-二甲基-乙基)-酰胺
根据实施例364中阐述的操作制备,以6-甲基-1-甲基-3-三丁基甲锡烷基-1H-吲唑替代步骤1中的6-氯-1-甲基-3-三丁基甲锡烷基-1H-吲唑。MS:(M+H)+=379;1H NMR(DMSO-d6)δ:9.10(s,1H),8.22-8.68(m,2H),7.93(s,1H),7.54(s,1H),7.12(d,J=7.5Hz,1H),5.06(t,J=5.9Hz,1H),4.14(s,3H),3.65(d,J=5.5Hz,2H),1.46(s,6H).
实施例369.
2-(7-甲基-1H-吲唑-3-基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-羧酸叔丁基酰胺
根据实施例362中阐述的操作制备,以7-甲基-3-三丁基甲锡烷基-1H-吲唑替代步骤1中的6-氟-1-甲基-3-三丁基甲锡烷基-1H-吲唑。MS:(M+H)+=349;1H NMR(DMSO-d6)δ:9.09(s,1H),8.34(d,J=8.1Hz,2H),8.00(s,1H),6.96-7.37(m,2H),2.58(s,3H),1.35-1.58(m,9H).
实施例370.
2-(1-甲基-6-三氟甲氧基-1H-吲唑-3-基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-羧酸叔丁基酰胺
根据实施例362中阐述的操作制备,以1-甲基-3-三丁基甲锡烷基-6-三氟甲氧基-1H-吲唑替代步骤1中的6-氟-1-甲基-3-三丁基甲锡烷基-1H-吲唑。MS:(M+H)+=433;1H NMR(DMSO-d6)δ:9.09(s,1H),8.56(d,J=8.8Hz,1H),8.40(s,1H),7.92(s,2H),7.25(d,J=9.0Hz,1H),4.21(s,3H),1.52(s,9H).
实施例371.
2-(1-甲基-6-三氟甲氧基-1H-吲唑-3-基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-羧酸(2-羟基-1,1-二甲基-乙基)酰胺
根据实施例364中阐述的操作制备,以1-甲基-3-三丁基甲锡烷基-6-三氟甲氧基-1H-吲唑替代步骤1中的6-氯-1-甲基-3-三丁基甲锡烷基-1H-吲唑。MS:(M+H)+=449;1H NMR(DMSO-d6)δ:9.11(s,1H),8.70(d,J=9.0Hz,1H),8.38(d,J=3.0Hz,1H),7.89(d,J=2.8Hz,2H),7.25(d,J=8.8Hz,1H),6.52(s,0H),5.13(宽单峰,1H),4.20(s,3H),3.60(宽单峰,2H),1.44(s,6H).
实施例372.
2-(7-甲基-1H-吲唑-3-基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-羧酸(2-羟基-1,1-二甲基-乙基)-酰胺
根据实施例364中阐述的操作制备,以7-甲基-3-三丁基甲锡烷基-1H-吲唑替代步骤1中的6-氯-1-甲基-3-三丁基甲锡烷基-1H-吲唑。MS:(M+H)+=365;1H NMR(DMSO-d6,400MHz):δ(ppm)13.57(宽单峰,1H),9.17(s,1H),8.40(d,J=8.0Hz,1H),8.36(s,1H),7.97(s,1H),7.24(d,J=7.0Hz,1H),7.12-7.19(m,1H),4.98-5.10(m,1H),3.65(d,J=5.0Hz,2H),2.59(s,3H),1.45(s,6H).
实施例373.
N-叔丁基-2-(1-甲基-1H-吡唑并[3,4-b]吡啶-3-基)-5H-吡咯并[3,2-b]吡嗪-7-甲酰胺
步骤1:
3-碘-1-甲基-1H-吡唑并[3,4-b]吡啶
于0℃向3-碘-1H-吡唑并[3,4-b]吡啶(3.5g,14.3mmol)在THF(70mL)中的搅拌溶液添加叔丁醇钾(1.92g,17.1mmol)且于0℃搅拌反应混合物1小时。滴加碘甲烷(2.43g,1.07mL,17.1mmol),然后将混合物温热至室温。6小时后,将混合物以水稀释,以二氯甲烷萃取,然后将合并的有机相经干燥(MgSO4),过滤并真空浓缩。通过色谱(硅胶,20-60%乙酸乙酯在己烷中的溶液)纯化得到3-碘-1-甲基-1H-吡唑并[3,4-b]吡啶(1.14g,4.4mmol,31%),为灰白色固体。MS(M+H)+=260.
步骤2
N-叔丁基-2-(1-甲基-1H-吡唑并[3,4-b]吡啶-3-基)-5-((2-(三甲基甲硅烷基)乙氧基)甲基)-5H-吡咯并[3,2-b]吡嗪-7-甲酰胺
向2-溴-N-叔丁基-5-((2-(三甲基甲硅烷基)乙氧基)甲基)-5H-吡咯并[3,2-b]吡嗪-7-甲酰胺(400mg,936μmol)和3-碘-1-甲基-1H-吡唑并[3,4-b]吡啶(364mg,1.4mmol)在DMF(8mL)中的溶液添加六丁基二锡(814mg,709μL,1.4mmol)然后将混合物以氮气冲洗10分钟。添加四(三苯基膦)钯(0)(54.1mg,46.8μmol)并于125℃加热反应混合物。18小时后,将混合物通过硅藻土填料过滤除去催化剂,然后将滤液以真空浓缩且通过色谱(硅胶,10-70%乙酸乙酯在己烷中的溶液)纯化得到N-叔丁基-2-(1-甲基-1H-吡唑并[3,4-b]吡啶-3-基)-5-((2-(三甲基甲硅烷基)乙氧基)甲基)-5H-吡咯并[3,2-b]吡嗪-7-甲酰胺(306mg,638μmol,68%),为灰白色粉末。MS(M+H)+=480.
步骤3
N-叔丁基-2-(1-甲基-1H-吡唑并[3,4-b]吡啶-3-基)-5H-吡咯并[3,2-b]吡嗪-7-甲酰胺
向N-叔丁基-2-(1-甲基-1H-吡唑并[3,4-b]吡啶-3-基)-5-((2-(三甲基甲硅烷基)乙氧基)甲基)-5H-吡咯并[3,2-b]吡嗪-7-甲酰胺(306mg,638μmol)在DMF(15mL)中的搅拌溶液添加乙二胺(1.92g,2.15mL,31.9mmol),接着添加TBAF(1.91mL,1.91mmol)并于60℃在氮气下加热混合物15小时。将混合物冷却,以二氯甲烷稀释,以水和盐水洗涤,然后干燥(MgSO4),过滤并浓缩得到油状物。将其以水研磨除去四丁基氢氧化铵,过滤,且将残余物通过色谱(硅胶,5-10%甲醇的二氯甲烷溶液)纯化得到N-叔丁基-2-(1-甲基-1H-吡唑并[3,4-b]吡啶-3-基)-5H-吡咯并[3,2-b]吡嗪-7-甲酰胺(19.2mg,55.0μmol,9%),为浅黄色粉末。MS(M+H)+=350;1H NMR(DMSO-d6)δ:9.12(s,1H),8.84(dd,J=8.2,1.6Hz,1H),8.70(dd,J=4.5,1.5Hz,1H),8.42(s,1H),7.93(s,1H),7.39(dd,J=8.0,4.5Hz,1H),4.22(s,3H).
实施例374.
2-(6-氟-1-甲基-1H-吲唑-3-基)-N-(1-(羟基甲基)环丙基)-5H-吡咯并[3,2-b]吡嗪-7-甲酰胺
步骤1
2-溴-5-(新戊酰基氧基甲基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-羧酸甲酯
室温向2-溴-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-羧酸甲酯(0.24g,0.94mmol)和K2CO3(0.156g,1.13mmol)在10mL的DMF中的搅拌混合物滴加戊酸氯甲酯(0.17g,1.13mmol)。然后将混合物在室温搅拌16小时。将混合物然后倒入30mL的水中,以乙酸乙酯(90mL)萃取。将有机相以盐水(10mL)洗涤并经Na2SO4干燥得到粗产物,将其通过柱色谱(硅胶,200-300筛目,以乙酸乙酯和石油醚(1:1,v/v)的混合物洗脱)纯化得到2-溴-5-(新戊酰基氧基甲基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-羧酸甲酯(0.276g,79.5%),为淡黄色固体。LCMS:(M+H)+=370;1H NMR(300MHz,CDCl3):δ8.42(s,1H),8.38(s,1H),6.21(s,2H),3.96(s,3H),1.15(s,9H)。
步骤2
2-(6-氟-1-甲基-1H-吲唑-3-基)-5-(新戊酰基氧基甲基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-羧酸甲酯
在氮气下于室温以一份向6-氟-1-甲基-3-(三丁基甲锡烷基)-1H-吲唑(0.51g,0.616mmol)、2-溴-5-(新戊酰基氧基甲基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-羧酸甲酯(0.18g,0.486mmol)在6mL的DMF中的搅拌溶液中添加CuI(0.04g,0.21mmol)和Pd(PPh3)4(0.057g,0.045mmol)。然后将反应混合物通过鼓泡氮气而脱气10分钟并于90℃在氮气下搅拌16小时。将溶剂于70℃减压蒸发且将残余物通过柱色谱(硅胶,200-300筛目,以乙酸乙酯和石油醚(1:1,v/v)的混合物洗脱)纯化得到2-(6-氟-1-甲基-1H-吲唑-3-基)-5-(新戊酰基氧基甲基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-羧酸甲酯(0.182g,85.2%),为黄色固体。LCMS:(M+H)+=440;1H NMR(300MHz,DMSO):δ9.13(s,1H),8.83-8.78(m,1H),8.70(s,1H),7.63(dd,1H,J1=9.6Hz,J2=2.1Hz),7.23(dt,1H,J1=9.3Hz,J2=2.1Hz),6.30(s,2H),4.13(s,3H),3.92(s,3H),1.08(s,9H).
步骤3
2-(6-氟-1-甲基-1H-吲唑-3-基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-羧酸
将2-(6-氟-1-甲基-1H-吲唑-3-基)-5-(新戊酰基氧基甲基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-羧酸甲酯(0.24g,0.546mmol)、KOH(0.611g,10.9mmol)、水(4mL)和二噁烷(10mL)的混合物于100℃搅拌5小时。然后将反应混合物冷却至室温,并以1N HCl处理至pH=2。将溶剂于40℃减压蒸发,且将残余物以水(10mL)研磨,然后倾析并于40℃减压干燥得到2-(6-氟-1-甲基-1H-吲唑-3-基)-5-(新戊酰基氧基甲基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-羧酸(0.161g,94.8%),为黄色固体。1H NMR(300MHz,DMSO):δ12.87(s,1H),12.28(s,1H),9.05(s,1H),8.82(dd,1H,J1=9.0Hz,J2=5.7Hz),8.48(d,1H,J=2.7Hz),7.61(dd,1H,J1=10.2Hz,J2=2.7Hz),7.15(t,1H,J=12.0Hz),4.12(s,3H)。LCMS:312.0[M+H]+,334.0[M+Na]+.
步骤4
2-(6-氟-1-甲基-1H-吲唑-3-基)-N-(1-(羟基甲基)环丙基)-5H-吡咯并[3,2-b]吡嗪-7-甲酰胺
将2-(6-氟-1-甲基-1H-吲唑-3-基)-5H-吡咯并[3,2-b]吡嗪-7-羧酸(70mg,0.225mmol)、(1-氨基环丙基)甲醇(30mg,0.337mmol)、HATU(171mg,0.45mmol)和DIEA(58mg,0.45mmol)在DMF(3mL)中的混合物于25℃搅拌16小时。然后过滤混合物且将滤饼以MeOH洗涤。将粗产物首先以制备型-HPLC(Gemini5u C18150×21.2mm;注射体积:3mL/注射,流速:20mL/分钟;波长:214nm和254nm;梯度条件为:55%乙腈/45%水(0.1%三氟乙酸,v/v)纯化,9分钟后以线性方式继续以80%乙腈/20%水(0.1%三氟乙酸,v/v))纯化得到2-(6-氟-1-甲基-1H-吲唑-3-基)-N-(1-(羟基甲基)环丙基)-5H-吡咯并[3,2-b]吡嗪-7-甲酰胺(4mg,5%)。MS:(M+H)+=381;1H NMR(300MHz,DMSO):δ12.88(s,1H),9.12(s,1H),8.71(s,1H),8.60-8.55(m,1H),8.46(s,1H),7.72(dd,1H,J=9.6,2.1Hz),7.28-7.21(m,1H),4.17(s,3H),3.60(s,2H),0.96-0.85(m,4H).
实施例375.
2-(6-氟-1-甲基-1H-吲唑-3-基)-N-叔戊基-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-甲酰胺
向2-(6-氟-1-甲基-1H-吲唑-3-基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-羧酸(59mg,0.19mmol)、HATU(91.20mmol,0.24mmol)和DIPEA(49mg,0.38mmol)在6mL的DMF中的搅拌溶液以一份于室温添加2-甲基丁烷-2-胺(21.60mg,0.24mmol)。然后搅拌反应混合物16小时。将溶剂于70℃减压蒸发,且将残余物首先以制备型-HPLC(Gemini5u C18150×21.2mm;注射体积:3mL/注射,流速:20mL/分钟;波长:214nm和254nm;梯度条件为:15%乙腈/75%水(0.1%三氟乙酸,v/v)纯化,在9分钟后以线性方式继续以70%乙腈/30%水(0.1%三氟乙酸,v/v)纯化得到2-(6-氟-1-甲基-1H-吲唑-3-基)-N-叔-戊基-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-甲酰胺(15mg,20.7%),为白色固体。MS:(M+H)+=381;1HNMR(300MHz,DMSO):δ12.82(s,1H),9.07(s,1H),8.47-8.37(m,2H),7.81(s,1H),7.70(dd,1H,J=9.6,2.1Hz),7.17(t,1H,J=2.1Hz),4.15(s,3H),1.89(q,2H,J=7.6Hz),1.46(s,6H),0.87(t,3H,J=7.5Hz).
实施例376.
2-(6-氟-1-甲基-1H-吲唑-3-基)-N-(1-甲基环丁基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-甲酰胺
向2-(6-氟-1-甲基-1H-吲唑-3-基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-羧酸(59mg,0.19mmol)、HATU(91.20mmol,0.24mmol)和DIPEA(49mg,0.38mmol)在6mL的DMF中的搅拌溶液以一份于室温添加1-甲基环丁胺(21.00mg,0.25mmol)且搅拌反应混合物16小时。将溶剂于80℃减压蒸发,且将残余物首先以制备型-HPLC(Gemini5u C18150×21.2mm;注射体积:3mL/注射,流速:20mL/分钟;波长:214nm和254nm;梯度条件为:48%乙腈/52%水(0.1%三氟乙酸,v/v)纯化,经9分钟以线性方式继续以70%乙腈/30%水(0.1%三氟乙酸,v/v)纯化得到2-(6-氟-1-甲基-1H-吲唑-3-基)-N-(1-甲基环丁基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-甲酰胺(10mg,13.7%),为灰白色固体。MS:(M+H)+=379;1HNMR(300MHz,DMSO):δ12.82(s,1H),9.10(s,1H),8.47-8.38(m,2H),8.24(s,1H),7.70(d,1H,J=8.7Hz),7.17(t,1H,J=9.2Hz),4.15(s,3H),2.54-2.45(m,2H),2.15-2.13(m,2H),1.96-1.88(m,2H),1.62(s,3H).
实施例377.
N-(2-氰基丙烷-2-基)-2-(6-氟-1-甲基-1H-吲唑-3-基)-5H-吡咯并[3,2-b]吡嗪-7-甲酰胺
将2-(6-氟-1-甲基-1H-吲唑-3-基)-5H-吡咯并[3,2-b]吡嗪-7-羧酸(60mg,0.193mmol)、2-氨基-2-甲基丙腈(25mg,0.29mmol)、HATU(217mg,0.57mmol)和DIEA(74mg,0.57mmol)在DMF(3mL)中的混合物在室温搅拌16小时。然后过滤混合物,且将滤饼以DMSO和MeOH洗涤得到N-(2-氰基丙烷-2-基)-2-(6-氟-1-甲基-1H-吲唑-3-基)-5H-吡咯并[3,2-b]吡嗪-7-甲酰胺(15mg,20.5%),为浅黄色固体。MS:(M+H)+=400;1H NMR(300MHz,DMSO):δ13.03(s,1H),9.13(s,1H),8.58(s,1H),8.54-8.50(m,1H),8.35(s,1H),7.32-7.69(m,1H),7.23-7.22(m,1H),4.17(s,3H),1.88(s,6H).
实施例378.
2-(6-氟-1-甲基-1H-吲唑-3-基)-N-(1-甲基环丙基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-甲酰胺
将2-(6-氟-1-甲基-1H-吲唑-3-基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-羧酸(70mg,0.23mmol)、1-甲基环丙胺(21mg,0.29mmol)、HATU(110mmol,0.29mmol)和DIPEA(46mg,0.36mmol)在6mL的DMF中的溶液在室温搅拌16小时。将溶剂于70℃减压蒸发且将残余物以二氯甲烷(10mL)、甲醇(10mL)研磨,然后倾析并干燥得到2-(6-氟-1-甲基-1H-吲唑-3-基)-N-(1-甲基环丙基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-甲酰胺(45mg,54.9%),为白色固体。MS:(M+H)+=365;1H NMR(300MHz,DMSO):δ9.09(s,1H),8.54(s,1H),8.48-8.42(m,2H),7.71(dd,1H,J=9.9,2.1Hz),7.25-7.24(m,1H),4.16(s,3H),1.49(s,3H),0.81(brs,2H),0.80(brs,2H).
实施例379.
N-(1-氨基-2-甲基丙烷-2-基)-2-(6-氟-1-甲基-1H-吲唑-3-基)-5H-吡咯并[3,2-b]吡嗪-7-甲酰胺盐酸盐
步骤1
2-(2-(6-氟-1-甲基-1H-吲唑-3-基)-5H-吡咯并[3,2-b]吡嗪-7-甲酰氨基)-2-甲基丙基氨基甲酸叔丁酯
将2-(6-氟-1-甲基-1H-吲唑-3-基)-5H-吡咯并[3,2-b]吡嗪-7-羧酸(70mg,0.225mmol)、2-氨基-2-甲基丙基氨基甲酸叔丁酯(64mg,0.338mmol)、HATU(171mg,0.45mmol)和DIPEA(58mg,0.45mmol)在DMF(3mL)中的混合物于室温搅拌16小时。将混合物倒入水中(5mL)并以EtOAc萃取(3×5mL)。将合并的有机层以盐水洗涤,并经Na2SO4干燥。过滤和浓缩后。残余物不经进一步纯化用于后续步骤。MS:(M+H)+=482.1.
步骤2
N-(1-氨基-2-甲基丙烷-2-基)-2-(6-氟-1-甲基-1H-吲唑-3-基)-5H-吡咯并[3,2-b]吡嗪-7-甲酰胺盐酸盐
将2-(2-(6-氟-1-甲基-1H-吲唑-3-基)-5H-吡咯并[3,2-b]吡嗪-7-甲酰氨基)-2-甲基丙基氨基甲酸叔丁酯(95mg,0.198mmol)溶解于HCl(g)在二噁烷(10mL)中的饱和溶液中。将混合物在室温搅拌16小时。减压除去溶剂。将残余物以二氯甲烷研磨,然后倾析并干燥2-(2-(6-氟-1-甲基-1H-吲唑-3-基)-5H-吡咯并[3,2-b]吡嗪-7-甲酰氨基)-2-甲基丙基氨基甲酸叔丁酯(35mg,46%)。MS:(M+H)+=382;1H NMR(300MHz,DMSO+D2O):δ9.11(s,1H),8.54-8.49(m,1H),8.47(s,1H),8.05(s,1H),7.69(d,1H,J=9.9Hz),7.20(t,1H,J=5.7Hz),4.17(s,3H),3.53-3.52(m,2H),1.55(s,6H).
实施例380.
2-(6-氟-1-甲基-1H-吲唑-3-基)-N-(2-甲基丁-3-炔-2-基)-5H-吡咯并[3,2-b]吡嗪-7-甲酰胺
将2-(6-氟-1-甲基-1H-吲唑-3-基)-5H-吡咯并[3,2-b]吡嗪-7-羧酸(70mg,0.225mmol)、2-甲基丁-3-炔-2-胺(28mg,0.338mmol)、HATU(171mg,0.45mmol)和DIEA(58mg,0.45mmol)在DMF(3mL)中的混合物在室温搅拌16小时。然后将混合物倒入水中并过滤得到粗产物。将粗化合物然后以MeOH洗涤得到2-(6-氟-1-甲基-1H-吲唑-3-基)-N-(2-甲基丁-3-炔-2-基)-5H-吡咯并[3,2-b]吡嗪-7-甲酰胺(20mg,23.5%)。MS:(M+H)+=377;1H NMR(300MHz,DMSO):δ12.92(s,1H),9.13(s,1H),8.50-8.47(m,1H),8.46(s,1H),8.16(s,1H),7.70(dd,1H,J=9.6,1.5Hz),7.19(t,1H,J=1.8Hz),4.17(s,3H),3.40(s,1H),1.82(s,6H).
实施例381.
2-(2-(6-氟-1-甲基-1H-吲唑-3-基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-甲酰氨基)-2-甲基丙酸叔丁酯
将2-(6-氟-1-甲基-1H-吲唑-3-基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-羧酸(100mg,0.323mmol)、2-氨基-2-甲基丙酸叔丁酯盐酸盐(82mg,0.42mmol)、HATU(160mmol,0.42mmol)和DIPEA(66mg,0.51mmol)在6mL的DMF中的溶液在室温搅拌16小时。于70℃减压蒸发溶剂,且将残余物通过柱色谱(硅胶,200–300筛目,以石油醚和乙酸乙酯的混合物(1:1,v/v)洗脱)纯化得到2-(2-(6-氟-1-甲基-1H-吲唑-3-基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-甲酰氨基)-2-甲基丙酸叔丁酯(75mg,51.8%),为白色固体。MS:(M+H)+=453;1H NMR(300MHz,DMSO):δ13.93(s,1H),9.13(s,1H),8.57-8.52(m,1H),8.48(s,1H),8.30(s,1H),7.72(dd,1H,J=9.8,2.1Hz),7.21-7.15(m,1H),4.18(s,3H),1.63(s,6H),1.25(s,9H).
实施例382.
2-(2-(6-氟-1-甲基-1H-吲唑-3-基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-甲酰氨基)-2-甲基丙酸
于室温向2-(2-(6-氟-1-甲基-1H-吲唑-3-基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-甲酰氨基)-2-甲基丙酸叔丁酯(60mg,0.13mmol)在10mL的二氯甲烷的搅拌悬浮液中滴加三氟乙酸(4mL)。然后将混合物在室温搅拌16小时。将溶剂在40℃减压蒸发,且将残余物首先通过制备型-HPLC(Gemini5u C18150×21.2mm;注射体积:3mL/注射,流速:20mL/分钟;波长:214nm和254nm;梯度条件为:40%乙腈/60%水(0.1%三氟乙酸,v/v)纯化,经9分钟以线性方式继续以60%乙腈/40%水(0.1%三氟乙酸,v/v)纯化得到2-(2-(6-氟-1-甲基-1H-吲唑-3-基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-甲酰氨基)-2-甲基丙酸(21mg,40%),为白色固体。MS:(M+H)+=397;1H NMR(300MHz,DMSO):δ12.93(s,1H),12.52(s,1H),9.13(s,1H),8.55-8.54(m,1H),8.45(s,1H),8.34(s,1H),8.71(dd,1H,J=9.9,1.8Hz),7.20(t,1H,J=2.1Hz),4.17(s,3H),1.66(s,6H)。
实施例383.
N-(1,3-二羟基-2-甲基丙烷-2-基)-2-(6-氟-1-甲基-1H-吲唑-3-基)-5H-吡咯并[3,2-b]吡嗪-7-甲酰胺
步骤1
2,2,3,3,6,9,9,10,10-九甲基-4,8-二氧杂-3,9-二硅杂十一烷-6-胺
向2-氨基-2-甲基丙烷-1,3-二醇(1.05g,0.01mol)在二氯甲烷(40mL)中的搅拌溶液中添加叔丁基二甲基甲硅烷基氯(9g,0.06mol),接着添加咪唑(6.8g,0.1mol)。将混合物在室温搅拌16小时。减压除去溶剂。将残余物以水稀释,并以EtOAc(3×20mL)萃取。将合并的有机层以NaHCO3水溶液和盐水洗涤,且然后以硫酸钠干燥。过滤和浓缩后。将残余物通过柱色谱在硅胶上以EtOAc洗脱纯化得到2,2,3,3,6,9,9,10,10-九甲基-4,8-二氧杂-3,9-二硅杂十一烷-6-胺(2.9g,87%),为油状物。MS:(M+H)+=334;1H NMR(300MHz,CDCl3):δ3.37-3.35(m,4H),0.96(s,3H),0.88(s,18H),0.03(s,12H).
步骤2
2-(6-氟-1-甲基-1H-吲唑-3-基)-N-(2,2,3,3,6,9,9,10,10-九甲基-4,8-二氧杂-3,9-二硅杂十一烷-6-基)-5H-吡咯并[3,2-b]吡嗪-7-甲酰胺
将2-(6-氟-1-甲基-1H-吲唑-3-基)-5H-吡咯并[3,2-b]吡嗪-7-羧酸(70mg,0.225mmol)、2,2,3,3,6,9,9,10,10-九甲基-4,8-二氧杂-3,9-二硅杂十一烷-6-胺(112mg,0.338mmol)、HATU(171mg,0.45mmol)和DIPEA(58mg,0.45mmol)在DMF(5mL)中的混合物在室温搅拌16小时。将混合物倒入水(5mL)中并以EtOAc(3×10mL)萃取。将合并的有机层以盐水洗涤,并经Na2SO4干燥。过滤和浓缩后。将残余物通过柱色谱在硅胶上以石油醚/EtOAc(1:1,v/v)洗脱纯化得到2-(6-氟-1-甲基-1H-吲唑-3-基)-N-(2,2,3,3,6,9,9,10,10-九甲基-4,8-二氧杂-3,9-二硅杂十一烷-6-基)-5H-吡咯并[3,2-b]吡嗪-7-甲酰胺(65mg,46%),为白色固体。1H NMR(300MHz,DMSO):δ9.00(s,1H),8.44-8.40(m,1H),8.38(s,1H),7.91(s,1H),7.87(dd,J=10.2,2.7Hz,1H),7.06-7.05(m,1H),4.13(s,3H),3.92-3.84(m,1H),1.43(s,3H),0.64(s,18H),0.01(s,12H).
步骤3
N-(1,3-二羟基-2-甲基丙烷-2-基)-2-(6-氟-1-甲基-1H-吲唑-3-基)-5H-吡咯并[3,2-b]吡嗪-7-甲酰胺
将2-(6-氟-1-甲基-1H-吲唑-3-基)-N-(2,2,3,3,6,9,9,10,10-九甲基-4,8-二氧杂-3,9-二硅杂十一烷-6-基)-5H-吡咯并[3,2-b]吡嗪-7-甲酰胺(65mg,0.104mmol)溶解于HCl(g)在二噁烷(10mL)中的饱和溶液中。将混合物在室温搅拌16小时。减压除去溶剂。将残余物以MeOH研磨,然后倾析并干燥得到N-(1,3-二羟基-2-甲基丙烷-2-基)-2-(6-氟-1-甲基-1H-吲唑-3-基)-5H-吡咯并[3,2-b]吡嗪-7-甲酰胺(28mg,68%)。MS:(M+H)+=399;1H NMR(300MHz,DMSO):δ12.88(s,1H),9.13(s,1H),8.74-8.72(m,1H),8.41(s,1H),7.97(s,1H),7.68(d,1H,J=10.2Hz),6.87-6.86(m,1H),5.06(t,2H,J=5.4Hz),4.17(s,3H),3.82-3.76(m,2H),3.71-3.65(m,2H),1.34(s,3H)。
实施例384.
2-(氟-1-甲基-1H-吲唑-3-基)-N-(1-甲基环戊基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-甲酰胺
步骤1
1-叠氮基-1-甲基环戊烷
于20℃将BF3.Et2O(934mg,6.23mmol)滴加至1-甲基环戊醇(520mg,5.19mmol)和三甲基甲硅烷基叠氮化物(716mg,6.23mmol)在6mL的甲苯中的搅拌溶液。然后将溶液在室温搅拌16小时。将有机相以NaHCO3的10%溶液(10mL)、水(5mL)和盐水(5mL)洗涤,并经无水硫酸钠干燥。将干燥试剂通过过滤除去且将溶剂于35℃减压蒸发得到1-叠氮基-1-甲基环戊烷(720mg),为粗产物。其不经进一步纯化直接用于后续步骤。
步骤2
1-甲基环戊胺盐酸盐
将1-叠氮基-1-甲基环戊烷(720mg,5.19mmol)和10%Pd/炭在100mL的甲醇中的混合物在室温在氢气(1atm)下搅拌16小时。然后添加浓HCl(1mL),将溶剂于40℃减压蒸发得到1-甲基环戊胺盐酸盐(700mg,99%经两步)为油状物。其不经进一步纯化直接用于后续步骤。1H NMR(300MHz,D2O):δ1.59(brs,7H),1.21(s,3H)。
步骤3
2-(6-氟-1-甲基-1H-吲唑-3-基)-N-(1-甲基环戊基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-甲酰胺
将2-(6-氟-1-甲基-1H-吲唑-3-基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-羧酸(62mg,0.20mmol)、1-甲基环戊胺盐酸盐(35mg,0.26mmol)、HATU(98mmol,0.26mmol)和DIEA(42mg,0.33mmol)在6mL的DMF中的溶液于室温搅拌16小时。将溶剂于70℃减压蒸发得到粗产物,其首先以制备型-HPLC(Gemini5uC18150×21.2mm;注射体积:3mL/注射,流速:20mL/分钟;波长:214nm和254nm;梯度条件为:55%乙腈/45%水(0.1%三氟乙酸,v/v)纯化,经9分钟以线性方式继续以80%乙腈/20%水(0.1%三氟乙酸,v/v)纯化得到2-(6-氟-1-甲基-1H-吲唑-3-基)-N-(1-甲基环戊基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-甲酰胺(18mg,22.9%),为灰白色固体。MS:(M+H)+=393;1H NMR(300MHz,DMSO):δ12.84(s,1H),9.09(s,1H),8.49-8.44(m,1H),8.41(s,1H),8.01(s,1H),7.72(d,1H,J=7.8Hz),7.17(t,1H,J=8.1Hz),4.17(s,3H),2.19(brs,2H),1.79-1.76(m,6H),1.57(s,3H).
实施例385.
2-(6-氟-1-甲基-1H-吲唑-3-基)-N-(4-甲基哌啶-4-基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-甲酰胺盐酸盐
步骤1
4-(2-(6-氟-1-甲基-1H-吲唑-3-基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-甲酰氨基)-4-甲基哌啶-1-羧酸叔丁酯
向2-(6-氟-1-甲基-1H-吲唑-3-基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-羧酸(100mg,0.32mmol)在10mL的DMF中的搅拌溶液于室温以一份添加EDCI(122mg,0.64mmol)、4-氨基-4-甲基哌啶-1-羧酸叔丁酯(103mg,0.48mmol)和DMAP(78mg,0.64mmol)。然后搅拌反应混合物16小时,然后倒入50mL的水中并过滤。将滤饼以水(10mL)洗涤且通过硅胶垫(200-300筛目,以石油醚和乙酸乙酯的混合物(1:2,v/v)洗脱)纯化得到4-(2-(6-氟-1-甲基-1H-吲唑-3-基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-甲酰氨基)-4-甲基哌啶-1-羧酸叔丁酯(100mg,61.6%),为白色固体,其不经进一步纯化用于后续步骤。MS:(M+H)+=508.2.
步骤2
2-(6-氟-1-甲基-1H-吲唑-3-基)-N-(4-甲基哌啶-4-基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-甲酰胺盐酸盐
将4-(2-(6-氟-1-甲基-1H-吲唑-3-基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-甲酰氨基)-4-甲基哌啶-1-羧酸叔丁酯(100mg,0.20mmol)溶解于30mL的HCl(g)在二噁烷中的饱和溶液中且将溶液在室温搅拌16小时。过滤反应混合物,以二氯甲烷(20mL)、乙醚(30mL)洗涤并干燥得到2-(6-氟-1-甲基-1H-吲唑-3-基)-N-(4-甲基哌啶-4-基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-甲酰胺盐酸盐(29mg,33.2%),为白色固体。MS:(M+H)+=408;1H NMR(300MHz,DMSO):δ9.16(s,1H),8.57-8.41(m,4H),7.92(s,1H),7.75(d,1H,J=10.5Hz),7.32-7.26(m,1H),6.98-6.93(m,1H),5.75(d,2H,J=6.9Hz),4.19(s,3H),3.16(brs,5H),1.96(brs,3H),1.61(s,3H)。
实施例386.
2-(6-氟-1-甲基-1H-吲唑-3-基)-N-(3-甲基氧杂环丁烷-3-基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-甲酰胺
向2-(6-氟-1-甲基-1H-吲唑-3-基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-羧酸(105mg,0.34mmol)在6mL的DMF中的搅拌溶液以一份于室温添加EDCI(128mmol,0.67mmol)、DMAP(82mg,0.67mmol)和3-甲基氧杂环丁烷-3-胺(44mg,0.50mmol)。然后搅拌混合物16小时。将溶剂于70℃减压蒸发且将残余物以水(10mL)、二氯甲烷(10mL)、甲醇(15mL)研磨,然后倾析并干燥得到2-(6-氟-1-甲基-1H-吲唑-3-基)-N-(3-甲基氧杂环丁烷-3-基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-甲酰胺(50mg,38.9%),为黄色固体。MS:(M+H)+=381;1H NMR(300MHz,DMSO):δ12.90(brs,1H),9.13(s,1H),8.53-8.47(m,3H),7.72(d,1H,J=7.8Hz),7.26-7.21(m,1H),4.91(d,2H,J=6.0Hz),4.55(d,2H,J=6.3Hz),4.18(s,3H),1.77(s,3H).
实施例387.
N-(1-氰基环丙基)-2-(6-氟-1-甲基-1H-吲唑-3-基)-5H-吡咯并[3,2-b]吡嗪-7-甲酰胺
将2-(6-氟-1-甲基-1H-吲唑-3-基)-5H-吡咯并[3,2-b]吡嗪-7-羧酸(90mg,0.29mmol)、1-氨基环丙烷甲腈盐酸盐(41mg,0.348mmol)、EDCI(110mg,0.58mmol)和DMAP(75mg,0.58mmol)在DMF(5mL)中的混合物在室温搅拌16小时。然后将混合物倒入水(5mL)中并过滤得到粗产物,其首先以制备型-HPLC(Gemini5u C18150×21.2mm;注射体积:3mL/注射,流速:20mL/分钟;波长:214nm和254nm;梯度条件为:40%乙腈/60%水(0.1%三氟乙酸,v/v)纯化,经9分钟以线性方式继续以55%乙腈/45%水(0.1%三氟乙酸,v/v)纯化得到N-(1-氰基环丙基)-2-(6-氟-1-甲基-1H-吲唑-3-基)-5H-吡咯并[3,2-b]吡嗪-7-甲酰胺(25mg,23%),为白色固体。MS:(M+H)+=376;1H NMR(300MHz,DMSO):δ12.95(s,1H),9.10(s,1H),8.87(s,1H),8.56-8.53(m,2H),6.69(d,1H,J=8.7Hz),7.26(t,1H,J=8.7Hz),4.15(s,3H),1.70(brs,2H),1.64(brs,2H).
实施例388.
2-(6-氯-1-甲基-1H-吲唑-3-基)-N-(2-苯基丙烷-2-基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-甲酰胺
将2-(6-氯-1-甲基-1H-吲唑-3-基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-羧酸(0.07g,0.3mmol)、2-苯基丙烷-2-胺(0.05g,0.37mmol)、EDCI(0.057g,0.3mmol)、DMAP(0.037g,0.3mmol)、HATU(0.114g,0.3mmol)和DIPEA(0.163g,1.26mmol)在10mL的DMF中的混合物室温搅拌过夜。于70℃减压除去溶剂。将残余物以5mL的水研磨,然后首先以制备型-HPLC(Gemini5u C18150×21.2mm;注射体积:3mL/注射,流速:20mL/分钟;波长:214nm和254nm;梯度条件为:60%乙腈/40%水(0.1%三氟乙酸,v/v)纯化,经9分钟以线性方式继续以80%乙腈/20%水(0.1%三氟乙酸,v/v)纯化得到2-(6-氯-1-甲基-1H-吲唑-3-基)-N-(2-苯基丙烷-2-基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-甲酰胺(0.017g,18%),为黄色固体。MS:(M+H)+=445;1H NMR(300MHz,DMSO):δ12.89(s,1H),9.13(s,1H),8.46-8.43(m,2H),8.38-8.37(m,1H),8.00(s,1H),7.51-7.49(m,2H),7.34-7.16(m,4H),4.20(s,3H),1.86(s,6H).
实施例389.
(S)-2-(6-氯-1-甲基-1H-吲唑-3-基)-N-(1-苯基乙基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-甲酰胺
将2-(6-氯-1-甲基-1H-吲唑-3-基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-羧酸(0.07g,0.3mmol)、S-1-苯基乙胺(0.05g,0.41mmol)、EDCI(0.057g,0.3mmol),DMAP(0.037g,0.3mmol)、HATU(0.114g,0.3mmol)和DIPEA(0.163g,1.26mmol)在10mL的DMF中的混合物室温搅拌过夜。于70℃减压除去溶剂。将残余物以水研磨,然后首先以制备型-HPLC(Gemini5u C18150×21.2mm;注射体积:3mL/注射,流速:20mL/分钟;波长:214nm和254nm;梯度条件为:55%乙腈/45%水(0.1%三氟乙酸,v/v)纯化,经9分钟以线性方式继续以80%乙腈/20%水(0.1%三氟乙酸,v/v)纯化得到S-2-(6-氯-1-甲基-1H-吲唑-3-基)-N-(1-苯基乙基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-甲酰胺(0.02g,22%),为黄色固体。MS:(M+H)+=431;1H NMR(300MHz,DMSO):δ12.93(s,1H),9.13(s,1H),8.52-8.48(m,2H),8.31(d,1H,J=8.7Hz),8.01(s,1H),7.50-7.48(m,2H),7.38-7.11(m,3H),7.09(d,1H,J=2.1Hz),5.36(brs,1H),4.19(s,3H),1.67(d,3H,J=6.9Hz).
实施例390.
2-(6-氯-1-甲基-1H-吲唑-3-基)-N-(1,1,1-三氟-2-甲基丙烷-2-基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-甲酰胺
将2-(6-氯-1-甲基-1H-吲唑-3-基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-羧酸(0.07g,0.3mmol)、1,1,1-三氟-2-甲基丙烷-2-胺(0.05g,0.39mmol)、EDCI(0.057g,0.3mmol)、DMAP(0.037g,0.3mmol)、HATU(0.114g,0.3mmol)和DIPEA(0.163g,1.26mmol)在10mL的DMF中的混合物室温搅拌过夜。于70℃减压除去溶剂。将残余物以水研磨然后首先以制备型-HPLC(Gemini5u C18150×21.2mm;注射体积:3mL/注射,流速:20mL/分钟;波长:214nm和254nm;梯度条件为:55%乙腈/45%水(0.1%三氟乙酸,v/v)纯化,经9分钟以线性方式继续以80%乙腈/20%水(0.1%三氟乙酸,v/v)纯化得到2-(6-氯-1-甲基-1H-吲唑-3-基)-N-(1,1,1-三氟-2-甲基丙烷-2-基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-甲酰胺(0.015g,16%),为白色固体。MS:(M+H)+=437;1H NMR(300MHz,DMSO):δ13.03(s,1H),9.10(s,1H),8.53-8.82(m,1H),8.42(d,1H,J=8.4Hz),8.14(s,1H),8.39(s,1H),7.28(d,1H,J=8.7Hz),4.20(s,3H),1.77(s,6H).
实施例391.
2-(6-氯-1-甲基-1H-吲唑-3-基)-N-叔-戊基-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-甲酰胺
将2-(6-氯-1-甲基-1H-吲唑-3-基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-羧酸(0.07g,0.3mmol)、2-甲基丁烷-2-胺(0.05g,0.57mmol)、EDCI(0.057g,0.3mmol)、DMAP(0.037g,0.3mmol)、HATU(0.114g,0.3mmol)和DIPEA(0.163g,1.26mmol)在10mL的DMF中的混合物室温搅拌过夜。于70℃减压除去溶剂。将残余物以水研磨,然后首先以制备型-HPLC(Gemini5u C18150×21.2mm;注射体积:3mL/注射,流速:20mL/分钟;波长:214nm和254nm;梯度条件为:57%乙腈/43%水(0.1%三氟乙酸,v/v)纯化,经9分钟以线性方式继续以80%乙腈/20%水(0.1%三氟乙酸,v/v)纯化得到2-(6-氯-1-甲基-1H-吲唑-3-基)-N-叔-戊基-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-甲酰胺(0.019g,22%),为白色固体。MS:(M+H)+=397;1H NMR(300MHz,DMSO):δ12.86(s,1H),9.10(s,1H),8.47-8.40(m,2H),8.03(s,1H),7.83(s,1H),7.32(d,1H,J=8.4Hz),4.20(s,3H),2.03-1.91(m,2H),1.48(s,6H),0.89(t,3H,J=7.4Hz).
实施例392.
2-(6-氟-1-甲基-1H-吲唑-3-基)-N-(1-甲基环己基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-甲酰胺
向2-(6-氟-1-甲基-1H-吲唑-3-基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-羧酸(70mg,0.22mmol)在6mL的DMF的搅拌溶液添加EDCI(64mg,0.33mmol)和DMAP(42mg,0.34mmol),接着于室温以一份添加1-甲基环己胺盐酸盐(50mg,0.33mmol)并搅拌16小时。将反应混合物倒入35mL的水,并过滤得到粗产物,其首先通过制备型-HPLC(Gemini5u C18150×21.2mm;注射体积:3mL/注射,流速:20mL/分钟;波长:214nm和254nm;梯度条件为:55%乙腈/45%水(0.1%三氟乙酸,v/v)纯化,经9分钟以线性方式继续以88%乙腈/12%水(0.1%三氟乙酸,v/v)纯化得到2-(6-氟-1-甲基-1H-吲唑-3-基)-N-(1-甲基环己基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-甲酰胺(26mg,28.4%),为淡黄色固体。MS:(M+H)+=407;1H NMR(300MHz,DMSO):δ12.68(s,1H),9.10(s,1H),8.45-8.40(m,2H),7.85(s,1H),7.71(d,1H,J=9.9Hz),7.20-7.14(m,1H),4.17(s,3H),2.33-2.29(m,2H),2.03-2.00(m,1H),1.53-1.46(m,10H).
实施例393.
N-(3-氨基-2,3-二甲基丁烷-2-基)-2-(6-氟-1-甲基-1H-吲唑-3-基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-甲酰胺2,2,2-三氟乙酸盐
于室温向2-(6-氟-1-甲基-1H-吲唑-3-基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-羧酸(80mg,0.26mmol)在6mL的DMF中的搅拌溶液添加EDCI(102mg,0.53mmol)、2,3-二甲基丁烷-2,3-二胺盐酸盐(62mg,0.53mmol)和DMAP(76mg,0.62mmol)并搅拌16小时。将反应混合物倒入50mL的水并过滤得到粗产物,其首先通过制备型-HPLC(Gemini5u C18150×21.2mm;注射体积:3mL/注射,流速:20mL/分钟;波长:214nm和254nm;梯度条件为:20%乙腈/80%水(0.1%三氟乙酸,v/v)纯化,经9分钟以线性方式继续以35%乙腈/65%水(0.1%三氟乙酸,v/v)纯化得到N-(3-氨基-2,3-二甲基丁烷-2-基)-2-(6-氟-1-甲基-1H-吲唑-3-基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-甲酰胺2,2,2-三氟乙酸盐(15mg,11.1%),为淡黄色固体。MS:(M+H)+=410;1H NMR(300MHz,DMSO):δ13.14(s,1H),9.12(s,1H),8.58(s,1H),8.48-8.31(m,5H),7.73(dd,1H,J=9.9Hz,2.1Hz),7.25(t,1H,J=9.0Hz),4.18(s,3H),1.56(s,6h),1.38(s,6H).
实施例394.
N-叔丁基-2-(6-氰基-1-甲基-1H-吲唑-3-基)-5H-吡咯并[3,2-b]吡嗪-7-甲酰胺
步骤1
2-溴-N-叔丁基-5H-吡咯并[3,2-b]吡嗪-7-甲酰胺
在室温搅拌2-溴-5H-吡咯并[3,2-b]吡嗪-7-羧酸(242mg,1mmol)、2-甲基丙烷-2-胺(110mg,1.5mmol)、EDCI(382mg,2mmol)和DMAP(244mg,2mmol)在DMF(5mL)中的混合物3小时。然后将混合物倒入水中并以EtOAc萃取(3×10mL)。将合并的有机层以盐水洗涤,并经Na2SO4干燥。过滤和浓缩后,粗残余物不经进一步纯化即可在下一步中使用。MS:(M+H)+=297.
步骤2
新戊酸(2-溴-7-(叔丁基氨基甲酰基)-5H-吡咯并[3,2-b]吡嗪-5-基)甲酯
向2-溴-N-叔丁基-5H-吡咯并[3,2-b]吡嗪-7-甲酰胺在DMF(5mL)中的搅拌混合物添加新戊酸氯甲酯(225mg,1.5mmol),接着添加K2CO3(276mg,2mmol)。将混合物在室温搅拌16小时。将混合物倒入水中并EtOAc萃取(3×10mL)。将合并的有机层以盐水洗涤,并经Na2SO4干燥。过滤和浓缩后。将残余物通过柱色谱在硅胶上以石油醚/EtOAc(5:1,v/v)洗脱纯化得到新戊酸(2-溴-7-(叔丁基氨基甲酰基)-5H-吡咯并[3,2-b]吡嗪-5-基)甲酯(140mg,34%经两步),为白色固体。MS:(M+H)+=411;1H NMR(300MHz,CDCl3):δ8.41(s,1H),8.33(s,1H),7.80(s,1H),6.20(s,2H),1.52(s,9H),1.15(s,9H)。
步骤3
3-碘-1H-吲唑-6-甲腈
于0℃在冰-水浴中经10分钟向1H-吲唑-6-甲腈(4.5g,31.4mmol)和KOH(5.3g,94.2mmol)在DMSO(50mL)中的悬浮液中分份添加碘(15.9g,62.8mmol)。将最终混合物室温再搅拌2小时。将混合物缓慢地添加饱和亚硫酸钠(300mL),将所形成的固体搅拌10分钟,过滤,以饱和亚硫酸钠(2×50mL)、水(2×20mL)洗涤并干燥,得到3-碘-1H-吲唑-6-甲腈,为浅黄色固体(8.1g,产率95.6%)。MS:(M+H)+=411;1H NMR(300MHz,CDCl3):δ8.41(s,1H),8.33(s,1H),7.80(s,1H),6.20(s,2H),1.52(s,9H),1.15(s,9H).
步骤4
3-碘-1-甲基-1H-吲唑-6-甲腈
在冰-水浴中于0℃向3-碘-1H-吲唑-6-甲腈(2.0g,7.43mmol)、t-BuOK(1.2g,10.4mmol)在THF(50mL)中悬浮液中滴加在THF(5mL)中的碘甲烷(1.2g,10.4mmol)。将所得混合物室温搅拌过夜。形成两种异构体,分别在N-1和N-2位置甲基化。将过量物质减压除去溶剂,将残余物溶解于EtOAc(100mL),以盐水洗涤(2×10mL),将合并的有机物经Na2SO4干燥。在除去干燥试剂并浓缩后,粗混合物(1.6g)不经进一步纯化用于后续步骤。MS:(M+H)+=411;
步骤5
1-甲基-3-(三丁基甲锡烷基)-1H-吲唑-6-甲腈
将3-碘-1-甲基-1H-吲唑-6-甲腈和3-碘-2-甲基-1H-吲唑-6-甲腈(97mg,粗品)的粗混合物溶解于THF(4mL)中。将溶液冷却至-40℃。于-40℃滴加异丙基氯化镁(0.21mL,0.41mmol,2M在THF中)。于-40℃搅拌反应混合物20分钟。然后缓慢地添加氯三丁基锡(0.11mL)。将反应混合物温热至室温并搅拌1.5小时。将反应混合物以NH4Cl饱和溶液萃取,然后以EtOAc萃取(3×5mL),将有机物以水(10mL)、盐水(2×10mL)洗涤并经Na2SO4干燥并浓缩。残余物不经进一步纯化用于后续步骤。
步骤6
新戊酸(7-(叔丁基氨基甲酰基)-2-(6-氰基-1-甲基-1H-吲唑-3-基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-5-基)甲酯
在圆底烧瓶中,在氮气下将新戊酸(2-溴-7-(叔丁基氨基甲酰基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-5-基)甲酯(140mg,0.34mmol)和1-甲基-3-(三丁基甲锡烷基)-1H-吲唑-6-甲腈(粗品,含有一些2-甲基-3-(三丁基甲锡烷基)-1H-吲唑-6-甲腈)溶解于DMF(5mL)。添加Pd(PPh3)4(20mg,0.017mmol)和CuI(13mg,0.068mmol)并将混合物超声5分钟,同时将氮气鼓泡。在80℃搅拌反应混合物16小时。除去溶剂后,将残余物通过柱色谱在硅胶上以石油醚/EtOAc(3:1至1:1,v/v)洗脱纯化得到新戊酸(7-(叔丁基氨基甲酰基)-2-(6-氰基-1-甲基-1H-吲唑-3-基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-5-基)甲酯(80mg,48.5%)。MS:(M+H)+=488.3;1H NMR(300MHz,DMSO):δ9.15(s,1H),8.58-8.53(m,3H),7.83(s,1H),6.31(s,2H),4.25(s,3H),1.52(s,9H),1.10(s,9H)。
步骤7
N-叔丁基-2-(6-氰基-1-甲基-1H-吲唑-3-基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-甲酰胺
在室温向新戊酸(7-(叔丁基氨基甲酰基)-2-(6-氰基-1-甲基-1H-吲唑-3-基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-5-基)甲酯(80mg,0.164mmol)在THF(5mL)中的搅拌溶液添加15%NaOH水溶液(0.5mL)并将反应混合物搅拌15小时。减压蒸发溶剂。将残余物首先以制备型-HPLC(Gemini5u C18150×21.2mm;注射体积:3mL/注射,流速:20mL/分钟;波长:214nm和254nm;梯度条件为:15%乙腈/75%水(0.1%三氟乙酸,v/v)纯化,经9分钟以线性方式继续以70%乙腈/30%水(0.1%三氟乙酸,v/v)纯化得到N-叔丁基-2-(6-氰基-1-甲基-1H-吲唑-3-基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-甲酰胺(45mg,74%)为白色固体。MS:(M+H)+=541;1H NMR(300MHz,DMSO):δ12.35(s,1H),10.56(s,1H),9.35(s,1H),8.95(s,1H),8.90(s,1H),8.55(s,1H),8.36(s,1H),8.05-7.99(m,2H),7.77-7.68(m,3H),7.51(d,1H,J=6.9Hz),7.38(d,1H,J=8.7Hz),7.00(d,1H,J=8.4Hz),3.97(s,3H),3.85(s,3H),3.75(s,3H).
实施例395.
2-(6-氯-1-甲基-1H-吲唑-3-基)-N-(1-甲基环丙基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-甲酰胺
将2-(6-氯-1-甲基-1H-吲唑-3-基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-羧酸(0.07g,0.3mmol)、1-甲基环丙胺(0.04g,0.56mmol)、EDCI(0.057g,0.3mmol)、DMAP(0.037g,0.3mmol)和DIPEA(0.163g,1.26mmol)在10mL的DMF的混合物在室温搅拌5小时,然后添加HATU(0.114g,0.3mmol)。再搅拌最终反应混合物15小时。于70℃减压除去溶剂。将残余物以水研磨,然后首先以制备型-HPLC(Gemini5u C18150×21.2mm;注射体积:3mL/注射,流速:20mL/分钟;波长:214nm和254nm;梯度条件为:50%乙腈/50%水(0.1%三氟乙酸,v/v)纯化,经9分钟以线性方式继续以80%乙腈/20%水(0.1%三氟乙酸,v/v)纯化得到2-(6-氯-1-甲基-1H-吲唑-3-基)-N-(1-甲基环丙基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-甲酰胺(0.035g,43%),为白色固体。MS:(M+H)+=381;1H NMR(300MHz,DMSO):δ12.87(s,1H),9.11(s,1H),8.55(s,1H),8.46-8.44(m,2H),8.04(s,1H),7.38(d,1H,J=8.7Hz),4.20(s,3H),1.50(s,3H),0.90-0.82(m,4H).
实施例396.
2-(6-氯-1-甲基-1H-吲唑-3-基)-N-苯基-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-甲酰胺
将2-(6-氯-1-甲基-1H-吲唑-3-基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-羧酸(0.07g,0.3mmol)、苯胺(0.05g,0.54mmol)、EDCI(0.057g,0.3mmol)、DMAP(0.037g,0.3mmol)和DIPEA(0.163g,1.26mmol)在10mL的DMF中的混合物在室温搅拌5小时。然后添加HATU(0.114g,0.3mmol),搅拌最终反应混合物15小时。于70℃减压除去溶剂。将残余物以水研磨,然后首先以制备型-HPLC(Gemini5u C18150×21.2mm;注射体积:3mL/注射,流速:20mL/分钟;波长:214nm和254nm;梯度条件为:65%乙腈/35%水(0.1%三氟乙酸,v/v)纯化,经9分钟以线性方式继续以72%乙腈/28%水(0.1%三氟乙酸,v/v)纯化得到2-(6-氯-1-甲基-1H-吲唑-3-基)-N-苯基-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-甲酰胺(0.025g,29%),为白色固体。MS:(M+H)+=403;1H NMR(300MHz,DMSO):δ10.21(s,1H),9.12(s,1H),8.63-8.58(m,2H),8.42(brs,2H),8.04(s,1H),7.83-7.80(m,2H),7.49-7.43(m,2H),7.30(d,1H,J=8.7Hz),7.17(d,1H,J=7.2Hz),4.21(s,3H).
实施例397.
N-(1-氨基-2-甲基丙烷-2-基)-2-(6-氯-1-甲基-1H-吲唑-3-基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-甲酰胺
步骤1
2-(2-(6-氯-1-甲基-1H-吲唑-3-基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-甲酰氨基)-2-甲基丙基氨基甲酸叔丁酯
将2-(6-氟-1-甲基-1H-吲唑-3-基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-羧酸(0.1g,0.3mmol)、2-氨基-2-甲基丙基氨基甲酸叔丁酯(0.1g,0.53mmol)、EDCI(0.086g,0.45mmol)、DMAP(0.055g,0.45mmol)和DIPEA(0.232g,1.8mmol)在15mL的DMF中的混合物在室温搅拌5小时。然后添加HATU(0.17g,0.45mmol)。再搅拌最终反应混合物15小时。减压除去溶剂。将残余物以水研磨且然后通过硅胶垫(200-300筛目,以石油醚和乙酸乙酯(3:1,v/v)的混合物洗脱纯化得到2-(2-(6-氯-1-甲基-1H-吲唑-3-基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-甲酰氨基)-2-甲基丙基氨基甲酸叔丁酯(0.1g,粗品),为黄色固体,其不经进一步纯化用于后续步骤。MS:(M+H)+=498.1.
步骤2
N-(1-氨基-2-甲基丙烷-2-基)-2-(6-氯-1-甲基-1H-吲唑-3-基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-甲酰胺
将2-(2-(6-氯-1-甲基-1H-吲唑-3-基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-甲酰氨基)-2-甲基丙基氨基甲酸叔丁酯(0.05g,0.1mmol)在30mL的HCl(g)在二噁烷中的饱和溶液于室温搅拌2小时。除去溶剂且将残余物以乙酸乙酯研磨,过滤且将滤饼顺序以饱和NaHCO3水溶液和水洗涤得到N-(1-氨基-2-甲基丙烷-2-基)-2-(6-氯-1-甲基-1H-吲唑-3-基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-甲酰胺(22mg,55%),为黄色固体。MS:(M+H)+=398;1H NMR(300MHz,DMSO):δ8.97(s,1H),8.60(d,1H,J=8.7Hz),8.36(s,1H),7.96(s,1H),7.90(s,1H),7.32(d,1H,J=8.7Hz),4.17(s,3H),2.90(s,2H),1.30(s,6H).
实施例398.
2-(6-氰基-1-甲基-1H-吲唑-3-基)-N-(1-羟基-2-甲基丙烷-2-基)-5H-吡咯并[3,2-b]吡嗪-7-甲酰胺
步骤1
1-(叔丁基二甲基甲硅烷基氧基)-2-甲基丙烷-2-胺
向2-氨基-2-甲基丙烷-1-醇(1.78g,0.02mol)在二氯甲烷(25mL)中的搅拌溶液添加叔丁基二甲基甲硅烷基氯(5.4g,0.036mol),接着添加咪唑(3.4g,0.05mol)。将混合物在室温搅拌16小时。减压除去溶剂。将残余物以水稀释并以EtOAc萃取(3×30mL)。将合并的有机层以NaHCO3水溶液、盐水洗涤并经Na2SO4干燥。过滤和浓缩后。将残余物通过柱色谱在硅胶上以EtOAc洗脱纯化得到1-(叔丁基二甲基甲硅烷基氧基)-2-甲基丙烷-2-胺(3.1g,76%),为油状物。1H NMR(300MHz,CDCl3):δ3.26(s,2H),1.02(s,6H),0.88(s,9H),0.03(s,6H)。
步骤2
2-溴-N-(1-(叔丁基二甲基甲硅烷基氧基)-2-甲基丙烷-2-基)-5H-吡咯并[3,2-b]吡嗪-7-甲酰胺
将2-溴-5H-吡咯并[3,2-b]吡嗪-7-羧酸(310mg,1.28mmol)、1-(叔丁基二甲基甲硅烷基氧基)-2-甲基丙烷-2-胺(390mg,1.92mmol)、EDCI(489mg,2.56mmol)和DMAP(312mg,2.56mmol)在5mL的DMF中的混合物在室温搅拌16小时。然后将混合物倒入水中并以EtOAc萃取(3×10mL)。将合并的有机层以盐水洗涤,并经Na2SO4干燥。过滤和浓缩后。残余物不经进一步处理用于后续步骤。MS:(M+H)+=427.1.
步骤3
新戊酸(2-溴-7-(1-(叔丁基二甲基甲硅烷基氧基)-2-甲基丙烷-2-基氨基甲酰基)-5H-吡咯并[3,2-b]吡嗪-5-基)甲酯
向2-溴-N-(1-(叔丁基二甲基甲硅烷基氧基)-2-甲基丙烷-2-基)-5H-吡咯并[3,2-b]吡嗪-7-甲酰胺在DMF(5mL)中的搅拌混合物添加新戊酸氯甲酯(288mg,1.92mmol),接着添加K2CO3(353mg,2.56mmol)。将混合物在室温搅拌16小时,然后倒入水中并以EtOAc萃取(3×10mL)。将合并的有机层以盐水洗涤,并经Na2SO4干燥。过滤和浓缩后。将残余物通过柱色谱在硅胶上以石油醚/EtOAc(5:1,v/v)洗脱纯化得到新戊酸(2-溴-7-(1-(叔丁基二甲基甲硅烷基氧基)-2-甲基丙烷-2-基氨基甲酰基)-5H-吡咯并[3,2-b]吡嗪-5-基)甲酯(305mg,44%经两步),为黄色固体。MS:(M+H)+=541;1H NMR(300MHz,CDCl3):δ8.41(s,1H),8.33(s,1H),7.84(s,1H),6.20(s,2H),3.71(s,2H),1.49(s,6H),1.15(s,9H),0.90(s,9H),0.09(s,6H).
步骤4
1-甲基-3-(三丁基甲锡烷基)-1H-吲唑-6-甲腈
将3-碘-1-甲基-1H-吲唑-6-甲腈和3-碘-2-甲基-1H-吲唑-6-甲腈(160mg,0.565mmol)的混合物溶解于THF(6mL)。将溶液冷却至-40℃。于-40℃滴加异丙基氯化镁2M在THF中(0.34mL,0.678mmol)。于-40℃搅拌反应混合物20分钟,然后缓慢地添加氯三丁基锡(0.18mL,0.678mmol)。将反应混合物温热至室温并搅拌1.5小时。将反应混合物以NH4Cl饱和溶液萃取,然后以EtOAc萃取(3×10mL),将合并的有机物以水(10mL)、盐水(10mL)洗涤,经Na2SO4干燥并浓缩。残余物不经进一步处理用于后续步骤。
步骤5
新戊酸(2-(6-氰基-1-甲基-1H-吲唑-3-基)-7-(1-羟基-2-甲基丙烷-2-基氨基甲酰基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-5-基)甲酯
在圆底烧瓶中,在氮气下将新戊酸(2-溴-7-(1-(叔丁基二甲基甲硅烷基氧基)-2-甲基丙烷-2-基氨基甲酰基)-5H-吡咯并[3,2-b]吡嗪-5-基)甲酯(305mg,0.565mmol)以及1-甲基-3-(三丁基甲锡烷基)-1H-吲唑-6-甲腈和1-甲基-3-(三丁基甲锡烷基)-1H-吲唑-6-甲腈的粗混合物溶解于DMF(5mL)中。添加Pd(PPh3)4(32mg,0.028mmol)和CuI(21mg,0.113mmol)且将混合物超声5分钟,同时鼓泡氮气。于80℃搅拌反应混合物16小时。将浓缩的混合物通过柱色谱在硅胶上以石油醚/EtOAc(1:1,v/v)洗脱纯化得到新戊酸(2-(6-氰基-1-甲基-1H-吲唑-3-基)-7-(1-羟基-2-甲基丙烷-2-基氨基甲酰基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-5-基)甲酯(45mg,16%)。MS:(M+H)+=504.
步骤6
2-(6-氰基-1-甲基-1H-吲唑-3-基)-N-(1-羟基-2-甲基丙烷-2-基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-甲酰胺
向新戊酸(2-(6-氰基-1-甲基-1H-吲唑-3-基)-7-(1-羟基-2-甲基丙烷-2-基氨基甲酰基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-5-基)甲酯(45mg,0.089mmol)在2mL的THF中的的搅拌溶液于室温添加10%NaOH(2mL)的溶液并搅拌反应混合物15小时。减压蒸发溶剂。将残余物以水稀释并调节至pH5-6。过滤混合物且将滤饼以DMSO(3mL)、MeOH(3mL)洗涤,然后干燥得到2-(6-氰基-1-甲基-1H-吲唑-3-基)-N-(1-羟基-2-甲基丙烷-2-基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-甲酰胺(4.5mg,12%)为白色固体。MS:(M+H)+=390;1H NMR(300MHz,DMSO):δ12.95(brs,1H),9.14(s,1H),8.79(d,1H,J=8.1Hz),8.54(s,1H),8.42(s,1H),7.91(s,1H),7.62(d,1H,J=8.4Hz),5.15(brs,1H),4.27(s,3H),3.64(d,2H,J=5.4Hz),1.47(s,6H).
实施例399.
N-叔丁基-2-(1H-吲唑-4-基)-5H-吡咯并[3,2-b]吡嗪-7-甲酰胺盐酸盐
步骤1
新戊酸(2-溴-7-(叔丁基氨基甲酰基)-5H-吡咯并[3,2-b]吡嗪-5-基)甲酯
将2-溴-5H-吡咯并[3,2-b]吡嗪-7-羧酸甲酯(0.345g,1.33mmol)、新戊酸氯甲酯(406mg,2.7mmol)和K2CO3(373mg,2.7mmol)在无水DMF(8mL)中的混合物加热至30℃且保持16小时。将反应混合物以水淬灭且将产物以乙酸乙酯(100mL)萃取,将合并的有机物以水(3×10mL)和盐水(2×10mL)洗涤,然后经Na2SO4干燥,过滤并浓缩。将残余物以乙醚(5mL)研磨然后倾析并干燥得到新戊酸(2-溴-7-(叔丁基氨基甲酰基)-5H-吡咯并[3,2-b]吡嗪-5-基)甲酯(414mg,粗品),为黄色固体,其不经进一步纯化用于后续步骤中。LCMS:(M+H)+=411.
步骤2
1-(新戊酰基氧基甲基)-1H-吲唑-4-基硼酸
将1H-吲唑-4-基硼酸(0.2g,1.227mmol)、新戊酸氯甲酯(554mg,3.68mmol)和K2CO3(509mg,3.68mmol)在无水DMF(10mL)中的混合物加热至30℃且保持16小时。将反应混合物以水淬灭且将产物以乙酸乙酯(150mL)萃取,然后以水(3×20mL)和盐水(2×20mL)洗涤,然后经Na2SO4干燥,过滤并浓缩。得到产物(114mg,粗品)且不经进一步处理用于后续步骤。LCMS:(M+Na)+=299.
步骤3
N-叔丁基-2-(1H-吲唑-4-基)-5H-吡咯并[3,2-b]吡嗪-7-甲酰胺盐酸盐
将新戊酸(2-溴-7-(叔丁基氨基甲酰基)-5H-吡咯并[3,2-b]吡嗪-5-基)甲酯(170mg,0.413mmol)、1-(新戊酰基氧基甲基)-1H-吲唑-4-基硼酸(114mg,0.413mmol)、Pd2(dba)3(47mg,0.083mmol)、X-Phos(79mg,0.166mmol)和Na2CO3(131mg,1.24mmol)在二噁烷(20mL)和水(5mL)中的混合物加热至100℃且保持16小时。将反应混合物以水淬灭且将产物以乙酸乙酯(90mL)萃取,然后以水(3×10mL)和盐水(2×10mL)洗涤,然后经Na2SO4干燥,过滤并浓缩。将残余物首先通过柱色谱(硅胶,200-300筛目,以甲醇:二氯甲烷=1:30洗脱)纯化,然后首先通过制备型-HPLC(Gemini5u C18150×21.2mm;注射体积:3mL/注射,流速:20mL/分钟;波长:214nm和254nm;梯度条件为:62%乙腈/38%水(0.1%三氟乙酸,v/v)纯化,然后在仅9分钟后以线性方式继续以64%乙腈/36%水(0.1%三氟乙酸,v/v)纯化。向纯的产物添加1mL浓HCl,搅拌5分钟,过滤并干燥得到N-叔丁基-2-(1H-吲唑-4-基)-5H-吡咯并[3,2-b]吡嗪-7-甲酰胺盐酸盐(33mg,22%),为黄色固体。(M+H)+=335;1H NMR(300MHz,CD3OD):δ8.94(s,1H),8.86(s,1H),8.33(s,1H),7.81-7.67(m,3H),1.52(s,9H)。
实施例400.
2-(6-氟-1-甲基-1H-吲唑-3-基)-N-(4-羟基-2-甲基丁烷-2-基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-甲酰胺
步骤1
N-(4-(叔丁基二甲基甲硅烷基氧基)-2-甲基丁烷-2-基)-2-(6-氟-1-甲基-1H-吲唑-3-基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-甲酰胺
向2-(6-氟-1-甲基-1H-吲唑-3-基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-羧酸(100mg,0.32mmol)在6mL的DMF中的搅拌溶液室温以一份添加EDCI(123mg,0.64mmol)、4-(叔丁基二甲基甲硅烷基氧基)-2-甲基丁烷-2-胺(139mg,0.64mmol)和DMAP(78mg,0.64mmol)并搅拌16小时。将反应混合物倒入35mL的水,过滤且将所得固体通过硅胶垫(200-300筛目,以甲醇和乙酸乙酯(1:20,v/v)的混合物洗脱)纯化得到N-(4-(叔丁基二甲基甲硅烷基氧基)-2-甲基丁烷-2-基)-2-(6-氟-1-甲基-1H-吲唑-3-基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-甲酰胺(70mg,42.8%),为淡黄色固体,其不经进一步纯化用于后续步骤。MS:(M+H)+=511.2.
步骤2
2-(6-氟-1-甲基-1H-吲唑-3-基)-N-(4-羟基-2-甲基丁烷-2-基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-甲酰胺
将N-(4-(叔丁基二甲基甲硅烷基氧基)-2-甲基丁烷-2-基)-2-(6-氟-1-甲基-1H-吲唑-3-基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-甲酰胺(70mg,0.140mmol)溶解于30mL的HCl(g)在二噁烷中的饱和溶液中,且将溶液在室温搅拌1小时。将溶剂于40℃减压蒸发,且将残余物首先通过制备型-HPLC(Gemini5u C18150×21.2mm;注射体积:3mL/注射,流速:20mL/分钟;波长:214nm和254nm;梯度条件为:38%乙腈/62%水(0.1%三氟乙酸,v/v)纯化,经9分钟以线性方式继续以42%乙腈/58%水(0.1%三氟乙酸,v/v)纯化得到2-(6-氟-1-甲基-1H-吲唑-3-基)-N-(4-羟基-2-甲基丁烷-2-基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-甲酰胺(15mg,27.6%),为黄色固体。MS:(M+H)+=397;1H NMR(300MHz,DMSO):δ12.84(s,1H),9.10(s,1H),8.55-8.50(m,1H),8.40(s,1H),7.89(s,1H),7.73-7.69(m,1H),7.22-7.16(m,1H),7.42(t,2H,J=4.6Hz),4.17(s,3H),3.61-3.55(m,2H),2.13-2.09(m,2H),1.25(s,6H).
实施例401.
2-(6-氯-1-甲基-1H-吲唑-3-基)-N-(2-环丙基丙烷-2-基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-甲酰胺
步骤1
(E)-N-(1-环丙基亚乙基)-2-甲基丙烷-2-亚磺酰胺
在搅拌下回流加热1-环丙基乙酮(1g,12mmol)、2-甲基丙烷-2-亚磺酰胺(1.7g,14mmol)、Ti(OEt)4(5.5g,24mmol)在10mL的THF中的混合物过夜。将混合物冷却至室温,减压除去溶剂且将粗残余物通过柱色谱(硅胶,200-300筛目,石油醚和乙酸乙酯(3:1,v/v)纯化得到(E)-N-(1-环丙基亚乙基)-2-甲基丙烷-2-亚磺酰胺(0.6g,27%),为澄清油状物。MS:(M+H)+=188.2;1H NMR(300MHz,CDCl3):δ2.36(s,3H),1.69(m,1H),1.18(s,9H),1.07-0.89(m,4H).
步骤2
N-(2-环丙基丙烷-2-基)-2-甲基丙烷-2-亚磺酰胺
在氮气气氛下于-78℃向(E)-N-(1-环丙基亚乙基)-2-甲基丙烷-2-亚磺酰胺(0.6g,3.2mmol)在30mL的甲苯中的搅拌溶液中添加Me3Al(1.76mL,3.5mmol,2M的甲苯溶液)。于-78℃搅拌20分钟,滴加MeLi(2.3mL,7mmol,3M的二甲氧基甲烷溶液),并于-78℃搅拌混合物4小时。将反应混合物通过添加2mL的水淬灭。将溶剂减压除去且将残余物通过柱色谱(硅胶,200-300筛目,以石油醚和乙酸乙酯(4:1,v/v)的混合物洗脱纯化得到N-(2-环丙基丙烷-2-基)-2-甲基丙烷-2-亚磺酰胺(0.18g,28%),为黄色油状物。MS:(M+H)+=204.1;1H NMR(300MHz,CDCl3):δ3.03(brs,1H),1.17(s,3H),1.16(s,9H),1.12(s,3H),0.98-0.95(m,1H),0.43-0.29(m,4H).
步骤3
2-环丙基丙烷-2-胺盐酸盐
向N-(2-环丙基丙烷-2-基)-2-甲基丙烷-2-亚磺酰胺(0.18g,0.89mmol)在15mL的MeOH的搅拌溶液中添加HCl(g)在二噁烷(2mL)中的饱和溶液。将溶液在室温搅拌1小时。减压除去溶剂。将残余物以EtOAc研磨,然后倾析并干燥得到2-环丙基丙烷-2-胺盐酸盐(0.12g,75%),为白色固体。MS:(M+H)+=100.2;1H NMR(300MHz,CD3OD):δ1.22(s,6H),1.10-1.07(m,1H),0.61-0.49(m,4H)。
步骤4
2-(6-氯-1-甲基-1H-吲唑-3-基)-N-(2-环丙基丙烷-2-基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-甲酰胺
将2-(6-氯-1-甲基-1H-吲唑-3-基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-羧酸(0.07g,0.3mmol)、2-环丙基丙烷-2-胺盐酸盐(0.05g,0.37mmol)、EDCI(0.057g,0.3mmol)、DMAP(0.037g,0.3mmol)和DIPEA(0.163g,1.26mmol)在10mL的DMF中的混合物于室温搅拌5小时。然后添加HATU(0.114g,0.3mmol),搅拌最终的反应混合物另外的15小时。伴随搅拌将混合物倒入30mL的水中。30分钟后,过滤混合物,且将滤饼首先通过制备型-HPLC(Gemini5u C18150×21.2mm;注射体积:3mL/注射,流速:20mL/分钟;波长:214nm和254nm;梯度条件为:35%乙腈/65%水(0.1%三氟乙酸,v/v)纯化,经9分钟以线性方式继续以65%乙腈/35%水(0.1%三氟乙酸,v/v)纯化得到2-(6-氯-1-甲基-1H-吲唑-3-基)-N-(2-环丙基丙烷-2-基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-甲酰胺(0.025g,28%),为黄色固体。MS:(M+H)+=409;1H NMR(300MHz,DMSO):δ12.81(s,1H),9.04(s,1H),8.41-8.38(m,2H),7.95-7.87(m,2H),7.21(d,1H,J=7.2Hz),4.15(s,3H),1.53-1.20(m,7H),0.42(brs,4H).
实施例402.
N-(顺式-4-氨基环己基)-2-(5-(二氟甲氧基)-1-甲基-1H-吲唑-3-基)-5H-吡咯并[3,2-b]吡嗪-7-甲酰胺盐酸盐
步骤1
5-(叔丁基二甲基甲硅烷基氧基)-3-碘-1-甲基-1H-吲唑
于0℃向5-(叔丁基二甲基甲硅烷基氧基)-3-碘-1H-吲唑(3g,8.0mmol)在THF(25mL)中的溶液添加KO-tBu(1.28g,11.2mmol),接着添加MeI(1.58g,11.2mmol),在添加后,将反应混合物温热至室温并搅拌4小时,然后将H2O(25mL)添加至混合物且将产物以EtOAc(100mL)萃取。将有机层以H2O(100mL)、盐水(100mL)洗涤,经Na2SO4干燥并减压浓缩。将残余物通过柱色谱(硅胶,200-300筛目,以石油醚/EtOAc=5:1洗脱)纯化得到5-(叔丁基二甲基甲硅烷基氧基)-3-碘-1-甲基-1H-吲唑(2.5g,80.3%),为白色固体。(M+H)+=389;1H NMR(300MHz,CDCl3),δ7.22-7.19(m,1H),7.03-7.01(m,1H),6.80(s,1H),4.05(s,3H),1.01(s,9H),0.23(s,6H)。
步骤2
3-碘-1-甲基-1H-吲唑-5-醇
于0℃向5-(叔丁基二甲基甲硅烷基氧基)-3-碘-1-甲基-1H-吲唑(1g,2.57mmol)在THF(5mL)中的溶液添加TBAF(6.42mL,12.85mmol),在添加后,将反应混合物温热至室温并搅拌0.5小时,然后将H2O(25mL)添加至混合物且将产物以EtOAc(100mL)萃取。将有机层以H2O(100mL)、盐水(100mL)洗涤,经Na2SO4干燥并减压浓缩。将残余物以石油醚(5mL)研磨,过滤并干燥得到3-碘-1-甲基-1H-吲唑-5-醇(0.85g,93.3%),为白色固体。将粗物质不经进一步处理用于后续步骤。LCMS:(M+H)+=275.
步骤3
5-(二氟甲氧基)-3-碘-1-甲基-1H-吲唑
将溴二氟甲基磷酸二乙酯(9g,10.9mmol)以一份搅拌添加至3-碘-1-甲基-1H-吲唑-5-醇(3g,37.8mmol)和KOH(15g,267mmol)在CH3CN(50mL)和H2O(50mL)的冷却的(无水冰-丙酮浴)溶液中,将反应混合物温热至室温并搅拌0.5小时,将混合物以EtOAc(50mL)洗涤,将有机层以H2O(50mL)、盐水(100mL)洗涤,经Na2SO4干燥并减压浓缩。将残余物通过柱色谱(硅胶,200-300筛目,以石油醚/EtOAc=3:1洗脱)纯化得到5-(二氟甲氧基)-3-碘-1-甲基-1H-吲唑(1.85g,53%),为白色固体。LCMS:(M+H)+=325;1H NMR(300MHz,CDCl3),δ7.36-7.33(m,1H),7.28-7.23(m,1H),7.19(s,1H),6.53(t,1H,J=73.5Hz),4.09(s,3H).
步骤4
5-(二氟甲氧基)-1-甲基-3-(三丁基甲锡烷基)-1H-吲唑
于-16℃在氮气气氛下向5-(二氟甲氧基)-3-碘-1-甲基-1H-吲唑(400mg,1.23mmol)在无水THF(15mL)中的溶液滴加异丙基氯化镁(0.75mL,1.3mmol,2M在THF中的溶液),搅拌30分钟,然后滴加二丁基氯(丙基)甲锡烷(0.5mL,1.45mmol),将反应混合物缓慢地温热至室温并搅拌2小时。将反应混合物以NH4Cl饱和溶液(40mL)淬灭并以EtOAc萃取(3×30mL)。将合并的有机层经Na2SO4干燥,过滤并减压浓缩且残余物不经纯化用于后续步骤(500mg,粗品),为油状物。
步骤5
2-(5-(二氟甲氧基)-1-甲基-1H-吲唑-3-基)-5-(新戊酰基氧基甲基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-羧酸甲酯
向2-溴-5-(新戊酰基氧基甲基)-5H-吡咯并[3,2-b]吡嗪-7-羧酸甲酯(370mg,1.0mmol)和5-(二氟甲氧基)-1-甲基-3-(三丁基甲锡烷基)-1H-吲唑(500mg,1mmol)在DMF(10mL)中的溶液添加CuI(30mg,0.16mmol)和Pd(PPh3)4(47mg,0.041mmol),将反应混合物通过鼓泡氮气脱气3分钟并重填以氮气。将混合物在氮气下加热至80℃且保持5小时,冷却后,添加水(50mL)且将产物以EtOAc萃取(3×40mL),将合并的有机层经Na2SO4干燥并减压浓缩得到2-(5-(二氟甲氧基)-1-甲基-1H-吲唑-3-基)-5-(新戊酰基氧基甲基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-羧酸甲酯(120mg,粗品),为橙色固体,物质不经进一步纯化用于后续步骤。LCMS:(M+H)+=488;(M+Na)+=510.
步骤6
2-(5-(二氟甲氧基)-1-甲基-1H-吲唑-3-基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-羧酸
向2-(5-(二氟甲氧基)-1-甲基-1H-吲唑-3-基)-5-(新戊酰基氧基甲基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-羧酸甲酯(120mg,0.25mmol)在二噁烷/水(10mL/10mL)的悬浮液中添加NaOH(140mg,2.5mmol),将反应混合物在搅拌的同时加热至90℃且保持7小时,减压除去二噁烷,将水层以浓Hcl调节至pH=4,将所得沉淀通过过滤收集并以水(5mL)洗涤且干燥得到2-(1-甲基-5-(三氟甲基)-1H-吲唑-3-基)-5H-吡咯并[3,2-b]吡嗪-7-羧酸(150mg,粗品,为橙色固体,物质不经进一步纯化用于后续步骤。LCMS:(M+H)+=360;(M+Na)+=382.
步骤7
顺式-4-(2-(5-(二氟甲氧基)-1-甲基-1H-吲唑-3-基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-甲酰氨基)环己基氨基甲酸叔丁酯
将2-(5-(二氟甲氧基)-1-甲基-1H-吲唑-3-基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-羧酸(150mg,0.43mmol)、顺式-4-氨基环己基氨基甲酸叔丁酯(102mg,0.48mmol)和HATU(196mg,0.51mmol)在15mL的无水THF中搅拌4小时。将反应混合物蒸发至干燥。将残余物悬浮于50mL的0.5N HCl,以乙酸乙酯萃取(3×50mL),经硫酸钠干燥并浓缩得到顺式-4-(2-(5-(二氟甲氧基)-1-甲基-1H-吲唑-3-基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-甲酰氨基)环己基氨基甲酸叔丁酯(54mg,粗品)。LCMS:(M+H)+=556;(M+Na)+=578.不经纯化用于后续步骤。
步骤8
N-(顺式-4-氨基环己基)-2-(5-(二氟甲氧基)-1-甲基-1H-吲唑-3-基)-5H-吡咯并[3,2-b]吡嗪-7-甲酰胺盐酸盐
向顺式-4-(2-(5-(二氟甲氧基)-1-甲基-1H-吲唑-3-基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-甲酰氨基)环己基氨基甲酸叔丁酯(54mg,0.1mmol)在3mL的1,4-二噁烷中的溶液添加10mL的浓HCl。于25℃搅拌反应混合物过夜。减压蒸发后,将残余物首先以制备型-HPLC(Gemini5u C18150×21.2mm;注射体积:3mL/注射,流速:20mL/分钟;波长:214nm和254nm;梯度条件为:40%乙腈/60%水(0.1%三氟乙酸V/V)纯化,然后在仅9分钟后以线性方式继续以50%乙腈/50%水(0.1%三氟乙酸V/V)纯化。浓缩后,将粗固体以1N HCl(2mL)处理,搅拌混合物10分钟,然后蒸发并干燥得到N-(顺式-4-氨基环己基)-2-(5-(二氟甲氧基)-1-甲基-1H-吲唑-3-基)-5H-吡咯并[3,2-b]吡嗪-7-甲酰胺盐酸盐(13mg,29.5%),为黄色固体。LCMS:(M+H)+=456;1H NMR(300MHz,CD3OD):δ8.96(s,1H),8.22(s,1H),8.01(d,1H,J=2.1Hz),7.56(d,1H,J=9.0Hz),7.26(dd,1H,J1=9.0Hz,J2=2.4Hz),6.76(t,1H,J=74.1Hz),4.16-4.14(m,1H),4.11(s,3H),3.17-3.15(m,1H),2.15-2.11(m,2H),1.91-1.78(m,4H),1.60-1.48(m,2H).
实施例403.
N-(3-氨基环己基)-2-(6-氯-1-甲基-1H-吲唑-3-基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-甲酰胺2,2,2-三氟乙酸盐
将2-(6-氯-1-甲基-1H-吲唑-3-基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-羧酸(0.07g,0.3mmol)、环己烷-1,3-二胺(0.05g,0.44mmol)、EDCI(0.057g,0.3mmol)、DMAP(0.037g,0.3mmol)和DIPEA(0.163g,1.26mmol)在10mL的DMF中的混合物在室温搅拌5小时。然后添加HATU(0.114g,0.3mmol),再搅拌最终反应混合物15小时。于70℃减压除去溶剂。将残余物以水研磨且然后首先以制备型-HPLC(Gemini5u C18150×21.2mm;注射体积:3mL/注射,流速:20mL/分钟;波长:214nm和254nm;梯度条件为:23%乙腈/77%水(0.1%三氟乙酸,v/v)纯化,经9分钟以线性方式继续以45%乙腈/55%水(0.1%三氟乙酸,v/v)纯化得到N-(3-氨基环己基)-2-(6-氯-1-甲基-1H-吲唑-3-基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-甲酰胺2,2,2-三氟乙酸盐(0.013g,14%),为黄色固体。MS:(M+H)+=424;1H NMR(300MHz,DMSO):δ9.02-8.99(m,1H),8.31-8.16(m,2H),7.65(s,1H),7.23-7.18(m,1H),4.10(s,3H),3.42-3.31(m,1H),2.60-2.57(m,1H),2.22-2.06(m,3H),1.93-1.78(m,1H),1.66-1.58(m,1H),1.50-1.38(m,3H)。
实施例404.
2-(6-氯-1-甲基-1H-吲唑-3-基)-N-(3-氰基苯基)-5H-吡咯并[3,2-b]吡嗪-7-甲酰胺
将2-(6-氯-1-甲基-1H-吲唑-3-基)-5H-吡咯并[3,2-b]吡嗪-7-羧酸(70mg,0.23mmol)、3-氨基苯甲腈(41mg,0.344mmol)、EDCI(88mg,0.46mmol)和DMAP(56mg,0.46mmol)在DMF(5mL)中的混合物在室温搅拌16小时。然后将混合物倒入水(5mL)中并过滤得到粗产物。将粗产物以DMSO和MeOH研磨,然后倾析并干燥得到2-(6-氯-1-甲基-1H-吲唑-3-基)-N-(3-氰基苯基)-5H-吡咯并[3,2-b]吡嗪-7-甲酰胺(20mg,20%),为白色固体。MS:(M+H)+=428;1H NMR(300MHz,DMSO):δ10.55(s,1H),8.81(s,1H),8.55-8.50(m,2H),8.15(brs,1H),8.03-8.00(m,1H),7.92(s,1H),7.59(d,1H,J=8.1Hz),7.48(d,1H,J=7.8Hz),7.26(d,1H,J=7.5Hz),4.14(s,3H).
实施例405.
2-(6-氯-1-甲基-1H-吲唑-3-基)-N-(吡啶-3-基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-甲酰胺
将2-(6-氯-1-甲基-1H-吲唑-3-基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-羧酸(0.07g,0.3mmol)、吡啶-3-胺(0.05g,0.53mmol)、EDCI(0.057g,0.3mmol)、DMAP(0.037g,0.3mmol)和DIPEA(0.163g,1.26mmol)在10mL的DMF中的混合物于室温搅拌5小时。然后添加HATU(0.114g,0.3mmol),再搅拌最终反应混合物。于70℃减压除去溶剂。将残余物顺序以水、EtOAc和DMSO研磨,然后倾析并干燥得到2-(6-氯-1-甲基-1H-吲唑-3-基)-N-(吡啶-3-基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-甲酰胺(0.022g,26%),为白色固体。MS:(M+H)+=404;1H NMR(300MHz,DMSO):δ10.20(s,1H),9.09(s,1H),8.90(s,1H),8.63(s,1H),8.54(d,1H,J=8.7Hz),8.34(d,1H,J=4.5Hz),8.26(d,1H,J=8.7Hz),7.98(s,1H),7.47(dd,1H,J=8.4,4.8Hz),7.22(d,1H,J=8.4Hz),4.17(s,3H).
实施例406.
2-(6-氟-1-甲基-1H-吲唑-3-基)-N-(3-甲基吡咯烷-3-基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-甲酰胺盐酸盐
步骤1
3-(2-(6-氟-1-甲基-1H-吲唑-3-基)-5H-吡咯并[3,2-b]吡嗪-7-甲酰氨基)-3-甲基吡咯烷-1-羧酸叔丁酯
于室温向2-(6-氟-1-甲基-1H-吲唑-3-基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-羧酸(100mg,0.32mmol)在6mL的DMF中的搅拌溶液以一份添加EDCI(123mmol,0.64mmol)、DMAP(110mg,0.90mmol)和3-氨基-3-甲基吡咯烷-1-羧酸叔丁酯(128mg,0.64mmol)并搅拌混合物16小时。于70℃减压蒸发溶剂。将残余物以石油醚研磨,然后倾析并干燥得到粗3-(2-(6-氟-1-甲基-1H-吲唑-3-基)-5H-吡咯并[3,2-b]吡嗪-7-甲酰氨基)-3-甲基吡咯烷-1-羧酸叔丁酯(103mg,65.2%),为黄色固体,其不经进一步纯化用于后续步骤。MS:(M+H)+=494.1;.
步骤2
2-(6-氟-1-甲基-1H-吲唑-3-基)-N-(3-甲基吡咯烷-3-基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-甲酰胺盐酸盐
将4-(2-(6-氟-1-甲基-1H-吲唑-3-基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-甲酰氨基)-4-甲基哌啶-1-羧酸叔丁酯(103mg,0.20mmol)溶解于20mL的HCl(g)在二噁烷中的饱和溶液,且将混合物在室温搅拌2小时。将溶剂于40℃减压蒸发,且将残余物首先以制备型-HPLC(Gemini5u C18150×21.2mm;注射体积:3mL/注射,流速:20mL/分钟;波长:214nm和254nm;梯度条件为:20%乙腈/80%水(0.1%三氟乙酸,v/v)纯化,经9分钟以线性方式继续以40%乙腈/60%水(0.1%三氟乙酸,v/v)纯化得到2-(6-氟-1-甲基-1H-吲唑-3-基)-N-(3-甲基吡咯烷-3-基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-甲酰胺盐酸盐(30mg,36.5%),为淡黄色固体。MS:(M+H)+=408;1H NMR(300MHz,DMSO):δ9.16(s,1H),8.57-8.41(m,4H),7.92(s,1H),7.75(d,1H,J=10.5Hz),7.32-7.26(m,1H),6.98-6.93(m,1H),5.75(d,2H,J=6.9Hz),4.19(s,3H),3.16(brs,5H),1.96(brs,3H),1.61(s,3H)。
实施例407.
2-(6-氯-1-甲基-1H-吲唑-3-基)-N-(2-氰基丙烷-2-基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-甲酰胺
将2-(6-氯-1-甲基-1H-吲唑-3-基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-羧酸(0.07g,0.3mmol)、2-氨基-2-甲基丙腈盐酸盐(0.05g,0.42mmol)、EDCI(0.057g,0.3mmol)、DMAP(0.037g,0.3mmol)和DIPEA(0.163g,1.26mmol)在10mL的DMF中的混合物在室温搅拌5小时。然后添加HATU(0.114g,0.3mmol),再搅拌最终反应混合物15小时。于70℃减压除去溶剂,然后将残余物顺序以水和乙酸乙酯研磨,然后倾析并干燥得到2-(6-氯-1-甲基-1H-吲唑-3-基)-N-(2-氰基丙烷-2-基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-甲酰胺(0.026g,31%),为白色固体。MS:(M+H)+=394;1H NMR(300MHz,DMSO):δ13.04(s,1H),9.13(s,1H),8.57(s,1H),8.50(d,1H,J=8.1Hz),8.33(s,1H),8.01(s,1H),7.35(d,1H,J=8.4Hz),4.20(s,3H),1.25(s,6H).
实施例408.
N-(5-氨基-2-甲基戊烷-2-基)-2-(6-氟-1-甲基-1H-吲唑-3-基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-甲酰胺2,2,2-三氟乙酸盐
步骤1
4-(2-(6-氟-1-甲基-1H-吲唑-3-基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-甲酰氨基)-4-甲基戊基氨基甲酸叔丁酯
向2-(6-氟-1-甲基-1H-吲唑-3-基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-羧酸(100mg,0.32mmol)在6mL的DMF中的搅拌溶液以一份室温添加EDCI(123mmol,0.64mmol)、DMAP(110mg,0.90mmol)和4-氨基-4-甲基戊基氨基甲酸叔丁酯(139mg,0.64mmol)且将混合物在室温搅拌16小时。将反应混合物倒入40mL的水,过滤,将滤饼以石油醚洗涤然后干燥得到粗4-(2-(6-氟-1-甲基-1H-吲唑-3-基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-甲酰氨基)-4-甲基戊基氨基甲酸叔丁酯(75mg,46%),为黄色固体。MS:(M+H)+=510.2.
步骤2
N-(5-氨基-2-甲基戊烷-2-基)-2-(6-氟-1-甲基-1H-吲唑-3-基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-甲酰胺2,2,2-三氟乙酸盐
于室温向4-(2-(6-氟-1-甲基-1H-吲唑-3-基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-甲酰氨基)-4-甲基戊基氨基甲酸叔丁酯(75mg,0.15mmol)在6mL的二氯甲烷中的搅拌溶液以一份添加三氟乙酸(3mL)并搅拌溶液2小时。将溶剂于40℃减压蒸发,且将残余物首先以制备型-HPLC(Gemini5u C18150×21.2mm;注射体积:3mL/注射,流速:20mL/分钟;波长:214nm和254nm;梯度条件为:20%乙腈/80%水(0.1%三氟乙酸,v/v)纯化,经9分钟以线性方式继续以45%乙腈/55%水(0.1%三氟乙酸,v/v)纯化得到N-(5-氨基-2-甲基戊烷-2-基)-2-(6-氟-1-甲基-1H-吲唑-3-基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-甲酰胺2,2,2-三氟乙酸盐(35mg,58%),为淡黄色固体。MS:(M+H)+=410;1H NMR(300MHz,DMSO):δ12.98(s,1H),9.11(s,1H),8.49-8.42(m,2H),7.88(s,1H),7.74(d,1H,J=9.9Hz),7.60(brs,3H),7.20(t,1H,J=9.0Hz),4.18(s,3H),2.76(brs,2H),2.00-1.94(m,2H),1.61(brs,2H),1.25(s,6H).
实施例409.
2-(6-氟-1-甲基-1H-吲唑-3-基)-N-(3-甲基氮杂环丁烷-3-基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-甲酰胺2,2,2-三氟乙酸盐
步骤1
3-(2-(6-氟-1-甲基-1H-吲唑-3-基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-甲酰氨基)-3-甲基氮杂环丁烷-1-羧酸叔丁酯
于室温向2-(6-氟-1-甲基-1H-吲唑-3-基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-羧酸(80mg,0.26mmol)和DIEA(83mg,0.64mmol)在6mL的DMF中的搅拌溶液添加EDCI(98mg,0.51mmol)和DMAP(88mg,0.72mmol)。20分钟后,以一份添加3-氨基-3-甲基氮杂环丁烷-1-羧酸叔丁酯(95mg,0.51mmol)且将混合物在室温搅拌16小时。将反应混合物倒入40mL的水,过滤且将滤饼以石油醚洗涤得到粗3-(2-(6-氟-1-甲基-1H-吲唑-3-基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-甲酰氨基)-3-甲基氮杂环丁烷-1-羧酸叔丁酯(75mg,76.9%),为黄色固体。MS:(M+H)+=480.1.
步骤2
2-(6-氟-1-甲基-1H-吲唑-3-基)-N-(3-甲基氮杂环丁烷-3-基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-甲酰胺2,2,2-三氟乙酸盐
室温向3-(2-(6-氟-1-甲基-1H-吲唑-3-基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-甲酰氨基)-3-甲基氮杂环丁烷-1-羧酸叔丁酯(75mg,0.16mmol)在6mL的二氯甲烷中的搅拌溶液以一份添加三氟乙酸(3mL)。然后将溶液在室温搅拌2小时。将溶剂于40℃减压蒸发,且将残余物首先以制备型-HPLC(Gemini5u C18150×21.2mm;注射体积:3mL/注射,流速:20mL/分钟;波长:214nm和254nm;梯度条件为:15%乙腈/75%水(0.1%三氟乙酸,v/v)纯化,经9分钟以线性方式继续以45%乙腈/55%水(0.1%三氟乙酸,v/v)纯化得到2-(6-氟-1-甲基-1H-吲唑-3-基)-N-(3-甲基氮杂环丁烷-3-基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-甲酰胺2,2,2-三氟乙酸盐(40mg,52%),为淡黄色固体。MS:(M+H)+=380;1H NMR(300MHz,DMSO):δ13.04(brs,1H),9.14(s,1H),8.98(brs,2H),8.56-8.51(m,2H),8.38(s,1H),7.72(dd,1H,J=9.6,2.1Hz),7.24(td,J=9.2,1.8Hz),4.57(d,1H,J=10.8Hz),4.17(s,3H),4.99(d,1H,J=10.8Hz),1.78(s,3H)。
实施例410.
N-叔丁基-2-(1-甲基-1H-吲唑-3-基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-甲酰胺
步骤1
2-(1-甲基-1H-吲唑-3-基)-5H-吡咯并[3,2-b]吡嗪-7-羧酸
将2-(1-甲基-1H-吲唑-3-基)-5-(新戊酰基氧基甲基)-5H-吡咯并[3,2-b]吡嗪-7-羧酸甲酯(150mg,0.36mmol)、氢氧化钾(280mg,5mmol)在2.5mL的水和5mL的1,4-二噁烷中的混合物加热至回流90分钟。将反应混合物冷却至室温,蒸发,并以1N HCl酸化,然后过滤并干燥得到2-(1-甲基-1H-吲唑-3-基)-5H-吡咯并[3,2-b]吡嗪-7-羧酸(120mg,粗品),为棕色固体。LCMS:(M+H)+=294。不经进一步纯化用于后续步骤。
步骤2
N-叔丁基-2-(1-甲基-1H-吲唑-3-基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-甲酰胺
将2-(1-甲基-1H-吲唑-3-基)-5H-吡咯并[3,2-b]吡嗪-7-羧酸(120mg,0.41mmol)、叔丁基胺(0.1mL,0.9mmol)和HATU(233mg,0.61mmol)在20mL的无水THF中搅拌4小时。将反应混合物蒸发至干燥,将20mL的0.5N HCl添加至残余物,将产物以乙酸乙酯萃取(3×50mL),将合并的有机物经硫酸钠干燥并浓缩。将残余物通过柱色谱(硅胶,200-300筛目,以乙酸乙酯/石油醚=2:1洗脱)纯化得到N-叔丁基-2-(1-甲基-1H-吲唑-3-基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-甲酰胺(47mg,33.7%)。LCMS:(M+H)+=349;1H NMR(300MHz,DMSO):δ12.75(s,1H),9.07(s,1H),8.48(d,1H,J=7.8Hz),8.35(s,1H),7.96(s,1H),7.5(d,1H,J=7.8Hz),7.49(t,1H,J=7.5Hz),7.27-7.22(m,1H),4.17(s,3H),1.52(s,9H).
实施例411.
N-叔丁基-2-(6-氟-1H-吲唑-3-基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-甲酰胺
步骤1
2-溴-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-羧酸
将2-溴-5-(新戊酰基氧基甲基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-羧酸甲酯(370mg,1mmol)、氢氧化钾(280mg,5mmol)在2.5mL的水和5mL的1,4-二噁烷中的混合物加热至回流90分钟。将反应混合物冷却至室温,蒸发溶剂。将残余物以1N HCl酸化,过滤并干燥得到2-溴-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-羧酸,为棕色固体(320mg,粗品),物质不经进一步纯化用于后续步骤。LCMS:(M+H)+=242/244;(M+Na)+=264/266.
步骤2
2-溴-N-叔丁基-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-甲酰胺
将2-溴-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-羧酸(320mg,0.9mmol)、叔丁基胺(0.5mL,4.5mmol)和HATU(684mg,1.8mmol)在50mL的无水THF中的混合物室温搅拌4小时。将反应混合物蒸发至干燥,然后将残余物悬浮于50mL的0.5N HCl,将产物以乙酸乙酯萃取(50mL×3),以硫酸钠干燥,过滤并浓缩得到2-溴-N-叔丁基-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-甲酰胺(258mg,粗品),物质不经进一步纯化用于后续步骤。LCMS:(M+H)+=297/299;(M+Na)+=319/321.
步骤3
6-氟-3-(三丁基甲锡烷基)-1H-吲唑
将6-氟-3-碘-1H-吲唑(300mg,1.1mmol)在30mL的无水THF中冷却至-20℃。在氮气气氛下,然后添加异丙基氯化镁(1.2mL,2.42mmol)且将混合物于-20℃搅拌15分钟。添加三丁基氯甲锡烷(0.4mL,1.32mmol)且将反应混合物温热至室温并搅拌1小时。将反应混合物以饱和氯化铵淬灭,将产物以乙酸乙酯萃取(3×50mL),以硫酸钠干燥,过滤并浓缩得到6-氟-3-(三丁基甲锡烷基)-1H-吲唑(500mg,粗品),为无色油状物,其不经进一步纯化直接用于后续步骤。
步骤4
N-叔丁基-2-(6-氟-1H-吲唑-3-基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-甲酰胺
将6-氟-3-(三丁基甲锡烷基)-1H-吲唑(500mg,1.17mmol)、2-溴-N-叔丁基-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-甲酰胺(258mg,0.9mmol)、四(三苯基膦)钯(0)(20mg,0.017mmol)、碘化铜(10mg0.052mmol)在15mL的无水DMF中的混合物加热至90℃且保持2.5小时。在氮气气氛下,将反应混合物冷却至室温,以50mL的水稀释并过滤。将固体以二氯甲烷和热甲醇洗涤,然后过滤得到N-叔丁基-2-(6-氟-1H-吲唑-3-基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-甲酰胺,为黄色固体(260mg,82%)。1H NMR(300MHz,DMSO):δ13.82(s,1H),12.96(s,1H),9.10(s,1H),8.48-8.43(m,1H),8.33(s,1H),7.92(s,1H),7.44-7.41(m,1H),7.12-7.06(m,1H),3.14(d,1H,J=5.1Hz),1.51(s,9H)。LCMS:353.0,[M+H]+.
实施例412.
N-叔丁基-2-(1-甲基-5-(三氟甲基)-1H-吲唑-3-基)-5H-吡咯并[3,2-b]吡嗪-7-甲酰胺
步骤1
3-碘-5-(三氟甲基)-1H-吲唑
于0℃向6-氟-1H-吲唑(2.5g,13.4mmol)在DMSO(20mL)中的溶液顺序添加KOH(2.3g,40.6mmol)和I2(4.3g,26.8mmol),然后将反应混合物在室温搅拌5小时。添加水(60mL),过滤收集沉淀并以水(30mL)洗涤,然后干燥得到3-碘-5-(三氟甲基)-1H-吲唑(4.0g,95.2%),为灰白色固体。LCMS:(M+H)+=313.
步骤2
3-碘-1-甲基-5-(三氟甲基)-1H-吲唑
于0℃向3-碘-5-(三氟甲基)-1H-吲唑(4.0g,12.8mmol)在THF(80mL)中的溶液缓慢的添加t-BuOK(2.0g,17.9mmol)且将混合物搅拌30分钟,于0℃添加碘甲烷(1.1mL,17.9mmol),然后温热至室温并搅拌1.5小时,以水(30mL)淬灭并以EtOAc萃取(3×30mL),将有机层经Na2SO4干燥并减压浓缩。将粗产物以乙醚(5mL)洗涤并过滤得到3-碘-1-甲基-5-(三氟甲基)-1H-吲唑(3.3g,79.3%),为白色固体。LCMS:(M+H)+=327.
步骤3
1-甲基-3-(三丁基甲锡烷基)-5-(三氟甲基)-1H-吲唑
于-16℃氮气气氛下向3-碘-1-甲基-5-(三氟甲基)-1H-吲唑(400mg,1.2mmol)在无水THF(15mL)中的溶液滴加异丙基氯化镁(0.7mL,1.3mmol,2M的THF溶液),搅拌30分钟,然后于-16℃在氮气下滴加三丁基氯甲锡烷(0.4mL,1.3mmol),将反应混合物缓慢地温热至室温并搅拌2小时,然后以NH4Cl(40mL)的饱和溶液淬灭且将产物以EtOAc萃取(3×30mL),然后经Na2SO4干燥,过滤并减压浓缩得到1-甲基-3-(三丁基甲锡烷基)-5-(三氟甲基)-1H-吲唑(500mg,粗品),为油状物,其不经任何进一步纯化直接用于后续步骤。
步骤4
2-(1-甲基-5-(三氟甲基)-1H-吲唑-3-基)-5-(新戊酰基氧基甲基)-5H-吡咯并[3,2-b]吡嗪-7-羧酸甲酯
向2-溴-5-(新戊酰基氧基甲基)-5H-吡咯并[3,2-b]吡嗪-7-羧酸甲酯(300mg,0.81mmol)和1-甲基-3-(三丁基甲锡烷基)-5-(三氟甲基)-1H-吲唑(396mg,0.89mmol)在DMF(10mL)中的溶液在添加CuI(30mg,0.16mmol)和Pd(PPh3)4(47mg,0.041mmol),将反应混合物通过鼓泡氮气脱气3分钟并重填以氮气。将混合物在氮气下加热至80℃且保持5小时,冷却后,将水(50mL)添加至混合物且将产物以EtOAc萃取(3×40mL),将合并的有机层经Na2SO4干燥,减压浓缩且将残余物以石油醚(2mL)研磨,然后倾析并干燥得到2-(1-甲基-5-(三氟甲基)-1H-吲唑-3-基)-5-(新戊酰基氧基甲基)-5H-吡咯并[3,2-b]吡嗪-7-羧酸甲酯(280mg,70.7%),为橙色固体。LCMS:(M+H)+=490.
步骤5
2-(1-甲基-5-(三氟甲基)-1H-吲唑-3-基)-5H-吡咯并[3,2-b]吡嗪-7-羧酸
向2-(1-甲基-5-(三氟甲基)-1H-吲唑-3-基)-5-(新戊酰基氧基甲基)-5H-吡咯并[3,2-b]吡嗪-7-羧酸甲酯(50mg,0.1mmol)在二噁烷/水(4mL/4mL)中的悬浮液添加NaOH(40mg,1.0mmol),将反应混合物在搅拌的同时加热至90℃且保持7小时,减压除去二噁烷,以1N HCl将水层调节至pH=3,过滤收集沉淀并以水(5mL)洗涤并干燥得到2-(1-甲基-5-(三氟甲基)-1H-吲唑-3-基)-5H-吡咯并[3,2-b]吡嗪-7-羧酸(40mg,粗品),为橙色固体。LCMS:(M+H)+=362.
步骤6
N-叔丁基-2-(1-甲基-5-(三氟甲基)-1H-吲唑-3-基)-5H-吡咯并[3,2-b]吡嗪-7-甲酰胺
将2-(1-甲基-5-(三氟甲基)-1H-吲唑-3-基)-5H-吡咯并[3,2-b]吡嗪-7-羧酸(100mg,0.28mmol)、2-甲基丙烷-2-胺(20mg,0.28mmol)、HOBt(149mg,1.12mmol)、EDCI(211mg,1.12mmol)和三乙胺(133mg,1.12mmol)在二氯甲烷(15mL)中的混合物在室温搅拌15小时,然后添加水(30mL),将产物以二氯甲烷(3×30mL)萃取,将合并的有机层经浓缩且将残余物通过柱色谱(硅胶,200-300筛目,以石油醚/乙酸乙酯=10:1洗脱)纯化得到N-叔丁基-2-(1-甲基-5-(三氟甲基)-1H-吲唑-3-基)-5H-吡咯并[3,2-b]吡嗪-7-甲酰胺(18mg,15.6%),为橙色固体。LCMS:(M+H)+=417;1H NMR(300MHz,DMSO):δ12.89(s,1H),9.06(s,1H),8.71(s,1H),8.44(s,1H),8.05(d,1H,J=9.0Hz),7.93(s,1H),7.84(d,1H,J=9.0Hz),4.28(s,3H),1.47(s,9H)。
实施例413.
2-(6-氯-1-甲基-1H-吲唑-3-基)-N-(3-羟基-2-甲基丁烷-2-基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-甲酰胺
步骤1
3-叠氮基-3-甲基丁烷-2-酮
将3-溴-3-甲基丁烷-2-酮(1g,6.1mmol)在50mL的丙酮和5mL的水中的搅拌溶液以NaN3(0.4g,6.1mmol)处理。回流下搅拌反应混合物18小时,然后蒸发至干。将残余物在乙酸乙酯和水之间分配,且将有机层以盐水洗涤,蒸发至干得到3-叠氮基-3-甲基丁烷-2-酮(0.5g,65%),其不经进一步纯化即可在下一步中使用。LCMS:对于所需质量没有观察到分子离子。
步骤2
3-氨基-3-甲基丁烷-2-醇
向LiAlH4(0.4g,11mmol)在30mL的无水THF中的悬浮液于室温分份添加3-叠氮基-3-甲基丁烷-2-酮(0.5g,3.9mmol)。4小时后,将反应混合物通过添加5mL的水淬灭,过滤并将滤饼以甲醇洗涤。将滤液浓缩得到3-氨基-3-甲基丁烷-2-醇(0.32g,79.0%),为无色油状物。MS:(M+H)+=104.2;1H NMR(300MHz,CD3OD):δ3.69(q,1H,J=6.6Hz),1.29(s,3H),1.25(s,3H),1.20(d,3H,J=6.6Hz).
步骤3
2-(6-氯-1-甲基-1H-吲唑-3-基)-N-(3-羟基-2-甲基丁烷-2-基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-甲酰胺
将2-(6-氯-1-甲基-1H-吲唑-3-基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-羧酸(0.07g,0.3mmol)、3-氨基-3-甲基丁烷-2-醇(0.05g,0.49mmol)、EDCI(0.057g,0.3mmol)、DMAP(0.037g,0.3mmol)、HOBT(0.041g,0.3mmol)和DIPEA(0.163g,1.26mmol)在10mL的DMF中的混合物在室温搅拌过夜。于70℃减压除去溶剂。将残余物以水研磨且然后首先以制备型-HPLC(Gemini5u C18150×21.2mm;注射体积:3mL/注射,流速:20mL/分钟;波长:214nm和254nm;梯度条件为:15%乙腈/75%水(0.1%三氟乙酸,v/v)纯化,经9分钟以线性方式继续以70%乙腈/30%水(0.1%三氟乙酸,v/v)纯化得到2-(6-氯-1-甲基-1H-吲唑-3-基)-N-(3-羟基-2-甲基丁烷-2-基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-甲酰胺(0.025g,28%),为黄色固体。MS:(M+H)+=413;1H NMR(300MHz,DMSO):δ12.85(s,1H),9.12(s,1H),8.66(d,1H,J=8.7Hz),8.41(s,1H),8.00-7.96(m,1H),7.33(dd,1H,J=8.7,1.5Hz),5.17(d,1H,J=5.7Hz),4.20(s,1H),4.04-4.00(m,1H),1.48(s,6H),1.17(d,3H,J=6.6Hz)。
实施例414.
2-(6-氯-1H-吲唑-3-基)-N-(1-羟基-2-甲基丙烷-2-基)-5H-吡咯并[3,2-b]吡嗪-7-甲酰胺
步骤1
6-氯-3-碘-1H-吲唑
将6-氯-1H-吲唑(2g,13.1mmol)、KOH(2.2g,39.3mmol)和I2(6.6g,26.2mmol)在无水DMF(20mL)中的混合物加热至30℃且保持16小时。将反应混合物以水淬灭,将产物以乙酸乙酯(150mL)萃取,将有机相以水(3×10mL)、盐水(2×10mL)洗涤和经Na2SO4干燥,然后过滤并浓缩得到6-氯-3-碘-1H-吲唑(3.0g,83%),为黄色固体。LCMS:(M+H)+=279.
步骤2
6-氯-3-(三丁基甲锡烷基)-1H-吲唑
于-16℃在N2气氛下向6-氯-3-碘-1H-吲唑(337mg,1.21mmol)在无水四氢呋喃(20mL)中的溶液滴加异丙基氯化镁(1.33mL,2M在THF中,2.66mmol)。搅拌20分钟后,于-16℃滴加三丁基氯甲锡烷(472mg,1.45mmol),然后将其温热至20℃且保持2小时。然后添加NH4Cl溶液(2mL),且将产物以二氯甲烷(15mL)萃取,将有机相以水(2×20mL)和盐水(2×20mL)洗涤。将有机层经Na2SO4干燥,过滤并浓缩得到6-氯-3-(三丁基甲锡烷基)-1H-吲唑(413mg,粗品),为黄色油状物,其不经进一步纯化用于后续步骤。
步骤3
2-(6-氯-1H-吲唑-3-基)-5-(新戊酰基氧基甲基)-5H-吡咯并[3,2-b]吡嗪-7-羧酸甲酯
将2-溴-5-(新戊酰基氧基甲基)-5H-吡咯并[3,2-b]吡嗪-7-羧酸甲酯(0.26g,0.7mmol)、6-氯-3-(三丁基甲锡烷基)-1H-吲唑(0.31g,0.7mmol)、Pd(PPh3)4(81mg,0.07mmol)和CuI(27mg,0.14mmol)在无水DMF(3mL)中的混合物加热至90℃且保持3小时。将产物以乙酸乙酯(60mL)萃取,且将有机相以水(3×10mL)和盐水(2×10mL)洗涤,经Na2SO4干燥,过滤并浓缩得到2-(6-氯-1H-吲唑-3-基)-5-(新戊酰基氧基甲基)-5H-吡咯并[3,2-b]吡嗪-7-羧酸甲酯(265mg,粗品),为棕色油状物。LCMS:(M+H)+=442.
步骤4
2-(6-氯-1H-吲唑-3-基)-5H-吡咯并[3,2-b]吡嗪-7-羧酸
将2-(6-氯-1H-吲唑-3-基)-5-(新戊酰基氧基甲基)-5H-吡咯并[3,2-b]吡嗪-7-羧酸甲酯(202mg,0.457mmol)和KOH(385mg,6.86mmol)在1,4-二噁烷(10mL)和水(5mL)中的混合物加热至回流3小时。将反应混合物经浓缩,且将残余物以1.0M HCl水溶液调节至pH=5。过滤收集沉淀并干燥得到2-(6-氯-1H-吲唑-3-基)-5H-吡咯并[3,2-b]吡嗪-7-羧酸(178mg,粗品),为黄色固体。LCMS:(M+H)+=314.
步骤5
2-(6-氯-1H-吲唑-3-基)-N-(1-羟基-2-甲基丙烷-2-基)-5H-吡咯并[3,2-b]吡嗪-7-甲酰胺
将2-(6-氯-1H-吲唑-3-基)-5H-吡咯并[3,2-b]吡嗪-7-羧酸(140mg,0.446mmol)、2-氨基-2-甲基丙烷-1-醇(48mg,0.536mmol)、EDCI(256mg,1.338mmol)、HOBt(181mg,1.338mmol)和DIPEA(173mg,1.338mmol)在无水DMF(5mL)中的混合物于室温搅拌16小时。添加水(5mL)且将所形成的沉淀通过过滤分离,然后首先以制备型-HPLC(Gemini5u C18150×21.2mm;注射体积:3mL/注射,流速:20mL/分钟;波长:214nm和254nm;梯度条件为:35%乙腈/65%水(0.1%三氟乙酸V/V)纯化,然后在仅9分钟后以线性方式继续以50%乙腈/50%水(0.1%三氟乙酸V/V)纯化得到2-(6-氯-1H-吲唑-3-基)-N-(1-羟基-2-甲基丙烷-2-基)-5H-吡咯并[3,2-b]吡嗪-7-甲酰胺(6mg,3%),为白色固体。LCMS:(M+H)+=385;1H NMR(300MHz,DMSO+D2O):δ9.09(s,1H),8.52(d,1H,J=8.4Hz),8.31(s,1H),7.72(s,1H),7.25(d,1H,J=9.0Hz),3.59(s,2H),1.41(s,6H)。
实施例415.
N-(4-氨基-2-甲基丁烷-2-基)-2-(6-氟-1-甲基-1H-吲唑-3-基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-甲酰胺2,2,2-三氟乙酸盐
步骤1
3-(2-(6-氟-1-甲基-1H-吲唑-3-基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-甲酰氨基)-3-甲基丁基氨基甲酸叔丁酯
向2-(6-氟-1-甲基-1H-吲唑-3-基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-羧酸(100mg,0.32mmol)和DIEA(124mg,0.96mmol)在6mL的DMF中的搅拌溶液于室温添加EDCI(123mg,0.64mmol)和DMAP(110mg,0.90mmol),接着以一份添加3-氨基-3-甲基丁基氨基甲酸叔丁酯(260mg,1.28mmol)且将混合物在室温搅拌16小时。将反应混合物倒入40mL的水,过滤并将滤饼以石油醚洗涤得到3-(2-(6-氟-1-甲基-1H-吲唑-3-基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-甲酰氨基)-3-甲基丁基氨基甲酸叔丁酯(110mg,69.4%),为黄色固体其不经进一步纯化用于后续步骤。MS:(M+H)+=496.2.
步骤2
N-(4-氨基-2-甲基丁烷-2-基)-2-(6-氟-1-甲基-1H-吲唑-3-基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-甲酰胺2,2,2-三氟乙酸盐
向3-(2-(6-氟-1-甲基-1H-吲唑-3-基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-甲酰氨基)-3-甲基丁基氨基甲酸叔丁酯(110mg,0.22mmol)在6mL的二氯甲烷中的搅拌溶液于室温以一份添加三氟乙酸(3mL)且搅拌溶液一小时。将溶剂于40℃减压蒸发,且将残余物首先以制备型-HPLC(Gemini5u C18150×21.2mm;注射体积:3mL/注射,流速:20mL/分钟;波长:214nm和254nm;梯度条件为:20%乙腈/80%水(0.1%三氟乙酸,v/v)纯化,经9分钟以线性方式继续以50%乙腈/50%水(0.1%三氟乙酸,v/v)纯化得到N-(4-氨基-2-甲基丁烷-2-基)-2-(6-氟-1-甲基-1H-吲唑-3-基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-甲酰胺2,2,2-三氟乙酸盐(35mg,30.9%),为黄色固体。MS:(M+H)+=396;1H NMR(300MHz,DMSO):δ12.94(s,1H),9.11(s,1H),8.50-8.43(m,2H),7.89(s,1H),7.74-7.70(m,3H),7.70-7.21(m,1H),4.18(s,3H),2.90(brs,2H),2.31-2.26(m,2H),1.53(s,6H)。
实施例416和417.
N-(反式-4-氨基-1-甲基环己基)-2-(6-氟-1-甲基-1H-吲唑-3-基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-甲酰胺盐酸盐和N-(顺式-4-氨基-1-甲基环己基)-2-(6-氟-1-甲基-1H-吲唑-3-基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-甲酰胺盐酸盐
步骤1
反式-4-羟基环己基氨基甲酸叔丁酯
向反式-4-氨基环己醇盐酸盐(15.1g,0.1mol)和Boc2O(23.7g,0.11mol)在THF(100mL)中的溶液中以一份添加NaHCO3(10.6g,0.1mol)在水(10mL)中的溶液。将所得混合物在室温搅拌15小时。减压除去过量溶剂;将残余物通过EtOAc萃取(3×100mL),将合并的有机物以盐水洗涤,经Na2SO4干燥并浓缩得到粗反式-4-羟基环己基氨基甲酸叔丁酯(20.1g,94%),为白色固体,其不经进一步纯化用于后续步骤。MS:(M+Na)+=238.2.
步骤2
4-氧代环己基氨基甲酸叔丁酯
向反式-4-羟基环己基氨基甲酸叔丁酯(2.0g,9.3mmol)在100mL的二氯甲烷中的搅拌溶液添加PCC(3.0g,14mmol)和硅藻土(5.0g)。将反应混合物在室温搅拌过夜。将反应混合物通过硅藻土垫过滤且将残余物减压浓缩。将粗品化合物通过柱色谱(硅胶,200-300筛目,以乙酸乙酯和石油醚的混合物(1:1,v/v)洗脱)纯化得到4-氧代环己基氨基甲酸叔丁酯(1.6g,80%),为白色固体。1H NMR(300MHz,CDCl3):δ4.52(brs,1H),3.94(brs,1H),2.45-2.40(m,4H),2.20-2.27(m,2H),1.74-1.63(m,2H),1.46(s,9H)。
步骤3
4-(叔丁基亚磺酰基亚氨基)环己基氨基甲酸叔丁酯
将4-氧代环己基氨基甲酸叔丁酯(1.0g,4.7mmol)、2-甲基丙烷-2-亚磺酰胺(0.63g,5.17mmol)和Ti(OEt)4(2.1g,9.2mmol)在10mL的THF中的混合物于50-60℃搅拌过夜。将混合物冷却至室温且将残余物通过柱色谱(硅胶,200-300筛目,以石油醚和乙酸乙酯(4:1,v/v)的混合物洗脱)纯化得到4-(叔丁基亚磺酰基亚氨基)环己基氨基甲酸叔丁酯(1.0g,67%),为澄清油状物。MS:(M+H)+=317.3;1H NMR(300MHz,CDCl3):δ4.88-4.86(m,1H),3.83(brs,1H),3.39-3.38(m,1H),2.62-2.15(m,5H),1.68-1.53(m,2H),1.43(s,9H),1.24(s,9H)。
步骤4
4-(1,1-二甲基乙基亚磺酰氨基)-4-甲基环己基氨基甲酸叔丁酯
向4-(叔丁基亚磺酰基亚氨基)环己基氨基甲酸叔丁酯(0.6g,1.9mmol)在40mL的甲苯中的搅拌溶液于-78℃在氮气气氛下添加Me3Al2M在甲苯中的溶液(2mL,4mmol)。于-78℃搅拌混合物20分钟,然后缓慢地添加MeLi,3M在二甲氧基甲烷中的溶液(2.8mL,8.4mmol),且于-78℃搅拌反应混合物4小时。将反应混合物通过添加2mL的水淬灭且减压蒸发溶剂。将残余物通过硅胶垫(200-300筛目,以石油醚和乙酸乙酯(4:1,v/v)的混合物洗脱)纯化得到4-(1,1-二甲基乙基亚磺酰氨基)-4-甲基环己基氨基甲酸叔丁酯(0.21g,33%),为粗黄色油状物,其不经进一步纯化用于后续步骤。MS:(M+H)+=333.2.
步骤5
4-氨基-4-甲基环己基氨基甲酸叔丁酯盐酸盐
向4-(1,1-二甲基乙基亚磺酰氨基)-4-甲基环己基氨基甲酸叔丁酯(0.2g,0.6mmol)在100mL的MeOH中的搅拌溶液添加HCl(g)在二噁烷(0.72mL)中的饱和溶液。将溶液在室温搅拌过夜。将溶剂减压除去。将残余物以EtOAc(15mL)研磨,然后倾析并干燥得到4-氨基-4-甲基环己基氨基甲酸叔丁酯盐酸盐(0.1g,63%),为白色固体。MS:(M+H)+=229.2.1H NMR(300MHz,CD3OD):δ3.36(m,1H),1.91-1.66(m,9H),1.40(s,9H),1.18(s,3H)。
步骤6
4-(2-(6-氟-1-甲基-1H-吲唑-3-基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-甲酰氨基)-4-甲基环己基氨基甲酸叔丁酯
将2-(6-氟-1-甲基-1H-吲唑-3-基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-羧酸(0.08g,0.26mmol)、4-氨基-4-甲基环己基氨基甲酸叔丁酯盐酸盐(0.07g,0.26mmol)、EDCI(0.076g,0.4mmol)、DMAP(0.05g,0.4mmol)、HOBT(0.054g,0.4mmol)和DIPEA(0.206g,1.6mmol)在20mL的DMF中的混合物在室温搅拌过夜。减压除去溶剂,且将残余物通过硅胶垫(200-300筛目,以石油醚和乙酸乙酯的混合物(4:1,v/v)洗脱)纯化得到4-(2-(6-氟-1-甲基-1H-吲唑-3-基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-甲酰氨基)-4-甲基环己基氨基甲酸叔丁酯(0.065g,49%),为白色固体,其不经进一步纯化用于后续步骤。MS:(M+H)+=522.2.
步骤7
N-(反式-4-氨基-1-甲基环己基)-2-(6-氟-1-甲基-1H-吲唑-3-基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-甲酰胺盐酸盐和N-(顺式-4-氨基-1-甲基环己基)-2-(6-氟-1-甲基-1H-吲唑-3-基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-甲酰胺盐酸盐
将4-(2-(6-氟-1-甲基-1H-吲唑-3-基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-甲酰氨基)-4-甲基环己基氨基甲酸叔丁酯(0.08g,0.19mmol)在30mL的4N HCl(在二噁烷)在室温搅拌4小时。减压除去溶剂,且将残余物首先以制备型-HPLC(Gemini5u C18150×21.2mm;注射体积:3mL/注射,流速:20mL/分钟;波长:214nm和254nm;梯度条件为:23%乙腈/77%水(0.1%三氟乙酸,v/v)纯化,经9分钟以线性方式继续以32%乙腈/68%水(0.1%三氟乙酸,v/v)纯化得到N-(反式-4-氨基-1-甲基环己基)-2-(6-氟-1-甲基-1H-吲唑-3-基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-甲酰胺盐酸盐(18mg,26%),为白色固体。MS:(M+H)+=422;1H NMR(300MHz,DMSO):δ12.91(s,1H),9.10(s,1H),8.50-8.43(m,2H),7.97-7.71(m,5H),7.19(t,1H,J=9.2Hz),4.18(s,3H),3.20(brs,1H),2.17-1.87(m,6H),1.62-1.58(m,5H)和N-(顺式-4-氨基-1-甲基环己基)-2-(6-氟-1-甲基-1H-吲唑-3-基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-甲酰胺盐酸盐(12mg,17%),为白色固体。MS:(M+H)+=541;1H NMR(300MHz,DMSO):δ9.13(s,1H),8.47-8.43(m,2H),7.85(s,1H),7.76-7.72(m,3H),7.26-7.21(m,1H),4.19(s,3H),3.03(brs,1H),2.06-2.01(m,2H),1.72(brs,2H),1.54(brs,7H)。
实施例418.
N-叔丁基-2-(6-氟-1-(2,2,2-三氟乙基)-1H-吲唑-3-基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-甲酰胺
步骤1
N-叔丁基-2-(6-氟-1-(2,2,2-三氟乙基)-1H-吲唑-3-基)-5-((2-(三甲基甲硅烷基)乙氧基)甲基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-甲酰胺
向N-叔丁基-2-(6-氟-1H-吲唑-3-基)-5-((2-(三甲基甲硅烷基)乙氧基)甲基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-甲酰胺(60mg,0.12mmol)和碳酸钾(100mg,0.72mmol)在10mL的DMF中的混合物添加2-碘-1,1,1-三氟乙烷(0.5mL,5.07mmol)。将反应混合物加热至80℃且保持3小时。冷却至室温后,添加50mL的水,且将混合物以乙酸乙酯萃取(2×50mL),将合并的有机物以硫酸钠干燥,过滤并浓缩得到N-叔丁基-2-(6-氟-1-(2,2,2-三氟乙基)-1H-吲唑-3-基)-5-((2-(三甲基甲硅烷基)乙氧基)甲基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-甲酰胺(60mg,粗品)。LCMS:(M+H)+=565;(M+Na)+=587。将粗物质不经进一步纯化用于后续步骤。
步骤2
N-叔丁基-2-(6-氟-1-(2,2,2-三氟乙基)-1H-吲唑-3-基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-甲酰胺
向N-叔丁基-2-(6-氟-1-(2,2,2-三氟乙基)-1H-吲唑-3-基)-5-((2-(三甲基甲硅烷基)乙氧基)甲基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-甲酰胺(60mg,0.12mmol)在3mL的甲醇中的混合物添加浓HCl(10mL)。将反应混合物加热至50℃并搅拌过夜。蒸发溶剂且将残余物以叔丁基甲基醚研磨,过滤并干燥得到N-叔丁基-2-(6-氟-1-(2,2,2-三氟乙基)-1H-吲唑-3-基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-甲酰胺,为黄色固体(30mg,58%)。LCMS:(M+H)+=435;1H NMR(300MHz,DMSO):δ12.86(s,1H),9.04(s,1H),8.52-8.47(m,1H),8.41(d,1H,J=3.0Hz),7.89-7.83(m,2H),7.26-7.23(m,1H),5.62-5.53(m,2H),1.51(s,9H).
实施例419.
(S)-2-(6-氯-1H-吲唑-3-基)-N-(1-羟基丙烷-2-基)-5H-吡咯并[3,2-b]吡嗪-7-甲酰胺
将2-(6-氯-1H-吲唑-3-基)-5H-吡咯并[3,2-b]吡嗪-7-羧酸(200mg,0.638mmol)、(S)-2-氨基丙烷-1-醇(57mg,0.765mmol)、EDCI(366mg,1.914mmol)、HOBt(258mg,1.914mmol)和DIPEA(247mg,1.914mmol)在无水DMF(10mL)中的混合物室温搅拌16小时。添加水(10mL),将所形成的沉淀通过过滤分离,以甲醇(1mL)洗涤,然后首先以制备型-HPLC(Gemini5u C18150×21.2mm;注射体积:3mL/注射,流速:20mL/分钟;波长:214nm和254nm;梯度条件为:30%乙腈/70%水(0.1%三氟乙酸V/V)纯化,然后在仅9分钟后以线性方式继续以60%乙腈/40%水(0.1%三氟乙酸V/V)纯化得到(S)-2-(6-氯-1H-吲唑-3-基)-N-(1-羟基丙烷-2-基)-5H-吡咯并[3,2-b]吡嗪-7-甲酰胺(46mg,26%,经两步),为黄色固体。LCMS:(M+H)+=371;1H NMR(300MHz,DMSO+D2O):δ9.14(s,1H),8.59(d,1H,J=8.7Hz),8.36(s,1H),7.72(s,1H),7.27(dd,1H,J1=8.4Hz,J2=1.8Hz),4.23-4.18(m,1H),3.55(d,1H,J=4.2Hz),1.25(d,1H,J=6.6Hz)。
实施例420.
N-叔丁基-2-(1-甲基-6-(三氟甲基)-1H-吲唑-3-基)-5H-吡咯并[3,2-b]吡嗪-7-甲酰胺
步骤1
3-碘-6-(三氟甲基)-1H-吲唑
将6-(三氟甲基)-1H-吲唑(0.5g,2.69mmol)、KOH(0.45g,8.1mmol)和I2(1.37g,5.38mmol)在无水DMF(20mL)中的混合物于室温搅拌16小时。添加乙酸乙酯(100mL)且将混合物以水(3×10mL)和盐水(2×10mL)洗涤。将有机层经Na2SO4干燥,过滤并浓缩。将残余物然后以醚(2mL)洗涤并过滤得到3-碘-6-(三氟甲基)-1H-吲唑(688mg,粗品),为黄色固体。LCMS:(M+H)+=313.
步骤2
3-碘-1-甲基-6-(三氟甲基)-1H-吲唑
于0℃在N2气氛下向3-碘-6-(三氟甲基)-1H-吲唑(650mg,2.09mmol)在无水四氢呋喃(20mL)中的溶液添加2-甲基丙-2-醇钾(0.35mL,3.13mmol)。30分钟后,于0℃滴加碘甲烷(445mg,3.13mmol),然后将其温热至室温2小时。添加水(2mL)且将产物以二氯甲烷(150mL)萃取,然后将有机相以水(2×20mL)、盐水(2×20mL)洗涤,然后经Na2SO4干燥,过滤并浓缩。将残余物以石油醚(2mL)洗涤并过滤得到3-碘-1-甲基-6-(三氟甲基)-1H-吲唑(491mg,72%),为白色固体。LCMS:(M+H)+=327.
步骤3
1-甲基-3-(三丁基甲锡烷基)-6-(三氟甲基)-1H-吲唑
于-16℃在N2气氛下向3-碘-1-甲基-6-(三氟甲基)-1H-吲唑(491mg,1.51mmol)在无水四氢呋喃(20mL)中的溶液滴加异丙基氯化镁(1.66mL,2M在THF中的溶液,3.31mmol)。搅拌20分钟后,于-16℃滴加三丁基氯甲锡烷(0.49mL,1.81mmol),然后将其温热至室温2小时。添加NH4Cl溶液(2mL)且将产物以二氯甲烷(150mL)萃取,然后以水(3×20mL)和盐水(2×20mL)洗涤。将有机层经Na2SO4干燥,过滤并浓缩得到1-甲基-3-(三丁基甲锡烷基)-6-(三氟甲基)-1H-吲唑(0.98g,粗品),为黄色油状物,其不经进一步纯化用于后续步骤。1H NMR(300MHz,CDCl3):δ7.79(d,1H,J=11.4Hz),7.70(s,1H),7.32(d,1H,J=8.4Hz),1.48-1.32(m,6H),1.25-1.18(m,12H),0.92-0.79(m,9H)。
步骤4
2-(1-甲基-6-(三氟甲基)-1H-吲唑-3-基)-5-(新戊酰基氧基甲基)-5H-吡咯并[3,2-b]吡嗪-7-羧酸甲酯
将2-溴-5-(新戊酰基氧基甲基)-5H-吡咯并[3,2-b]吡嗪-7-羧酸甲酯(0.3g,0.81mmol)、1-甲基-3-(三丁基甲锡烷基)-6-(三氟甲基)-1H-吲唑(0.98g,1.51mmol)、Pd(PPh3)4(174mg,0.151mmol)和CuI(58mg,0.302mmol)在无水DMF(10mL)中的混合物加热至90℃且保持3小时。添加水(10mL)。将所形成的沉淀通过过滤分离,以石油醚(3mL)洗涤得到2-(1-甲基-6-(三氟甲基)-1H-吲唑-3-基)-5-(新戊酰基氧基甲基)-5H-吡咯并[3,2-b]吡嗪-7-羧酸甲酯(200mg,50%),为白色固体。LCMS:(M+H)+=490.
步骤5
2-(1-甲基-6-(三氟甲基)-1H-吲唑-3-基)-5H-吡咯并[3,2-b]吡嗪-7-羧酸
将2-(1-甲基-6-(三氟甲基)-1H-吲唑-3-基)-5-(新戊酰基氧基甲基)-5H-吡咯并[3,2-b]吡嗪-7-羧酸甲酯(200mg,0.409mmol)和KOH(229mg,4.09mmol)在1,4-二噁烷(5mL)和水(2mL)中的混合物加热至回流4小时。将二噁烷经浓缩,且将剩余水层以1.0M HCl调节至pH=4。过滤收集沉淀并干燥得到2-(1-甲基-6-(三氟甲基)-1H-吲唑-3-基)-5H-吡咯并[3,2-b]吡嗪-7-羧酸(230mg,粗品),为黄色固体。LCMS:(M+H)+=362.
步骤6
N-叔丁基-2-(1-甲基-6-(三氟甲基)-1H-吲唑-3-基)-5H-吡咯并[3,2-b]吡嗪-7-甲酰胺
于室温将2-(1-甲基-6-(三氟甲基)-1H-吲唑-3-基)-5H-吡咯并[3,2-b]吡嗪-7-羧酸(190mg,0.526mmol)、2-甲基丙烷-2-胺(58mg,0.789mmol)、EDCI(301mg,1.578mmol)、HOBt(213mg,1.578mmol)和DIPEA(204mg,1.578mmol)在无水DMF(5mL)中的混合物搅拌16小时。添加水(5mL),将所形成的沉淀通过过滤分离。然后首先以制备型-HPLC(Gemini5u C18150×21.2mm;注射体积:3mL/注射,流速:20mL/分钟;波长:214nm和254nm;梯度条件为:50%乙腈/50%水(0.1%三氟乙酸V/V)纯化,然后在仅9分钟后以线性方式继续以90%乙腈/10%水(0.1%三氟乙酸V/V)纯化得到N-叔丁基-2-(1-甲基-6-(三氟甲基)-1H-吲唑-3-基)-5H-吡咯并[3,2-b]吡嗪-7-甲酰胺(47mg,21%),为黄色固体。LCMS:(M+H)+=417;1H NMR(300MHz,DMSO):δ12.82(s,1H),9.08(s,1H),8.63(d,1H,J=8.4Hz),8.38(s,1H),8.30(s,1H),7.89(s,1H),7.49(d,1H,J=8.7Hz),4.28(s,3H),1.22(s,9H).
实施例421.
N-叔丁基-2-(1H-吲唑-7-基)-5H-吡咯并[3,2-b]吡嗪-7-甲酰胺盐酸盐
步骤1
7-溴-1-((2-(三甲基甲硅烷基)乙氧基)甲基)-1H-吲唑
于-20℃在N2气氛下向7-溴-1H-吲唑(1g,5.1mmol)在无水四氢呋喃(20mL)中的溶液添加NaH(305mg,60%,7.65mmol)。20分钟后,添加(2-(氯甲氧基)乙基)三甲基甲硅烷(1g,6.1mmol)且将混合物温热至20℃并搅拌1小时。添加水(2mL)且将产物以二氯甲烷(100mL)萃取,将有机相以水(2×10mL)和盐水(2×10mL)洗涤然后经Na2SO4干燥,过滤并浓缩。将残余物通过柱色谱(硅胶,200-300筛目,以乙酸乙酯:石油醚=1:20洗脱)纯化得到7-溴-1-((2-(三甲基甲硅烷基)乙氧基)甲基)-1H-吲唑(1.27g,77%),为黄色油状物。1H NMR(300MHz,CDCl3):δ8.03(s,1H),7.69(d,1H,J=8.7Hz),7.60(d,1H,J=8.1Hz),7.06-7.01(m,1H),6.08(s,2H),3.60(t,2H,J=7.8Hz),0.90(d,2H,J=8.1Hz),0.01(s,9H).
步骤2
7-(4,4,5,5-四甲基-1,3,2-二氧杂硼杂环戊烷-2-基)-1-((2-(三甲基甲硅烷基)乙氧基)甲基)-1H-吲唑
在N2气氛下将7-溴-1-((2-(三甲基甲硅烷基)乙氧基)甲基)-1H-吲唑(0.5g,1.53mmol)、4,4,5,5-四甲基-2-(4,4,5,5-四甲基-1,3,2-二氧杂硼杂环戊烷-2-基)-1,3,2-二氧杂硼杂环戊烷(465mg,1.83mmol)、乙酸钾(691mg,7.04mmol)和PdCl2(dppf)CH2Cl2(125mg,153mmol)在二噁烷(20mL)中的混合物加热至100℃且保持16小时。将反应混合物经浓缩,且将残余物在水(10mL)和乙酸乙酯(20mL)之间分配。将有机层以盐水(10mL)洗涤,经Na2SO4干燥并浓缩得到7-(4,4,5,5-四甲基-1,3,2-二氧杂硼杂环戊烷-2-基)-1-((2-(三甲基甲硅烷基)乙氧基)甲基)-1H-吲唑(516mg,粗品),为黄色油状物。LCMS:(M+H)+=375.
步骤3
N-叔丁基-2-(1-((2-(三甲基甲硅烷基)乙氧基)甲基)-1H-吲唑-7-基)-5H-吡咯并[3,2-b]吡嗪-7-甲酰胺
在N2气氛下将2-溴-N-叔丁基-5H-吡咯并[3,2-b]吡嗪-7-甲酰胺(0.1g,0.337mmol)、7-(4,4,5,5-四甲基-1,3,2-二氧杂硼杂环戊烷-2-基)-1-((2-(三甲基甲硅烷基)乙氧基)甲基)-1H-吲唑(121mg,0.37mmol)、Pd2(dba)3(39mg,0.067mmol)、X-Phos(64mg,0.135mmol)和Na2CO3(107mg,1.01mmol)在二噁烷(20mL)和水(5mL)中的混合物加热至90℃且保持16小时。将反应混合物经浓缩,且将残余物在乙酸乙酯(20mL)和水(10mL)之间分配,将有机相以盐水(10mL)洗涤然后经Na2SO4干燥并浓缩得到N-叔丁基-2-(1-((2-(三甲基甲硅烷基)乙氧基)甲基)-1H-吲唑-7-基)-5H-吡咯并[3,2-b]吡嗪-7-甲酰胺(120mg,粗品),为黄色油状物。LCMS:(M+H)+=465.
步骤4
N-叔丁基-2-(1H-吲唑-7-基)-5H-吡咯并[3,2-b]吡嗪-7-甲酰胺盐酸盐
向N-叔丁基-2-(1-((2-(三甲基甲硅烷基)乙氧基)甲基)-1H-吲唑-7-基)-5H-吡咯并[3,2-b]吡嗪-7-甲酰胺(120mg,0.258mmol)在二噁烷(20mL)中的搅拌溶液鼓泡HCl气体直到饱和,且将反应混合物在室温搅拌16小时。将反应混合物经浓缩,且将残余物首先以制备型-HPLC(Gemini5u C18150×21.2mm;注射体积:3mL/注射,流速:20mL/分钟;波长:214nm和254nm;梯度条件为:40%乙腈/60%水(0.1%三氟乙酸V/V)纯化,然后在仅9分钟后以线性方式继续以50%乙腈/50%水(0.1%三氟乙酸V/V)纯化。将浓HCl添加至含有纯产物的合并的馏分,然后蒸发溶剂得到N-叔丁基-2-(1H-吲唑-7-基)-5H-吡咯并[3,2-b]吡嗪-7-甲酰胺盐酸盐(20mg,21%),为黄色固体。LCMS:(M+H)+=335;1H NMR(300MHz,CD3OD):δ8.94(s,1H),8.34(s,1H),8.31(s,1H),7.97(s,1H),7.94(s,1H),7.39(t,1H,J=6.9Hz),1.52(s,9H).
实施例422和423.
N-(反式-3-氨基-1-甲基环丁基)-2-(6-氟-1-甲基-1H-吲唑-3-基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-甲酰胺2,2,2-三氟乙酸盐;N-(顺式-3-氨基-1-甲基环丁基)-2-(6-氟-1-甲基-1H-吲唑-3-基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-甲酰胺2,2,2-三氟乙酸盐
步骤1
3-氧代环丁基氨基甲酸叔丁酯
将3-氨基环丁酮盐酸盐(2.0g,16.4mmol)、(Boc)2O(3.9g,18mmol)和Na2CO3(3.5g,33mmol)在水(10mL)和THF(50mL)中的混合物在室温搅拌过夜。减压蒸发溶剂。将残余物通过硅胶垫(200-300筛目,以乙酸乙酯和石油醚(1:3,v/v)的混合物洗脱)纯化得到3-氧代环丁基氨基甲酸叔丁酯(2.2g,73%),为黄色固体,其不经进一步纯化用于后续步骤。MS:(M+H)+=186.1.
步骤2
3-(叔丁基亚磺酰基亚氨基)环丁基氨基甲酸叔丁酯
将3-氧代环丁基氨基甲酸叔丁酯(2.2g,11.9mmol)、2-甲基丙烷-2-亚磺酰胺(1.6g,13.1mmol)、Ti(OEt)4(5.5g,24mmol)在20mL的THF中的混合物于50-60℃搅拌过夜。将混合物冷却至室温,然后以NH4Cl饱和溶液淬灭。将所形成的固体通过过滤除去。蒸发滤液至干且将粗残余物通过硅胶色谱(200-300筛目,以石油醚和乙酸乙酯的混合物(4:1)洗脱)纯化得到3-(叔丁基亚磺酰基亚氨基)环丁基氨基甲酸叔丁酯,为澄清油状物(2.0g,58%)。MS:(M+H)+=289.1;1H NMR(300MHz,CDCl3):δ5.08(m,1H),4.29(s,1H),3.42-3.00(m,4H),1.43(s,9H),1.22(s,9H).
步骤3
3-(1,1-二甲基乙基亚磺酰氨基)-3-甲基环丁基氨基甲酸叔丁酯
向3-(叔丁基亚磺酰基亚氨基)环丁基氨基甲酸叔丁酯(0.8g,2.8mmol)在60mL的甲苯中的搅拌溶液于-78℃添加Me3Al(3.1mL,6.2mmol,2M在甲苯中)。于-78℃搅拌20分钟后,缓慢地添加MeLi(4.1mL,12.3mmol,3M在二甲氧基甲烷中)。于-78℃再搅拌反应混合物4小时,且然后通过添加3mL的水淬灭。减压除去溶剂,且将残余物通过硅胶垫(200-300筛目,以石油醚和乙酸乙酯的混合物(4:1,v/v)洗脱)得到3-(1,1-二甲基乙基亚磺酰氨基)-3-甲基环丁基氨基甲酸叔丁酯(0.45g,53%),为粗油状物,其不经进一步纯化用于后续步骤。MS:(M+H)+=305.2.
步骤4
3-氨基-3-甲基环丁基氨基甲酸叔丁酯盐酸盐
向3-(1,1-二甲基乙基亚磺酰氨基)-3-甲基环丁基氨基甲酸叔丁酯(0.45g,1.48mmol)在150mL的MeOH中的搅拌溶液添加2N HCl(在二噁烷(1.8mL)中)。将溶液在室温搅拌过夜。溶剂减压除去,且将残余物以EtOAc研磨,然后倾析并干燥得到3-氨基-3-甲基环丁基氨基甲酸叔丁酯盐酸盐(0.22g,63%),为白色固体。MS:(M+H)+=201.2;1H NMR(300MHz,DMSO):δ2.24-2.22(m,1H),1.43-1.383(m,13H),1.10(s,3H)。
步骤5
3-(2-(6-氟-1-甲基-1H-吲唑-3-基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-甲酰氨基)-3-甲基环丁基氨基羧酸叔丁酯盐酸盐
将2-(6-氟-1-甲基-1H-吲唑-3-基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-羧酸(0.1g,0.32mmol)、3-氨基-3-甲基环丁基氨基甲酸叔丁酯盐酸盐(0.1g,0.42mmol)、EDCI(0.092g,0.48mmol)、DMAP(0.059g,0.48mmol)、HOBT(0.065g,0.48mmol)和DIPEA(0.248g,1.92mmol)在25mL的DMF中的混合物在室温搅拌过夜。减压除去溶剂,且将残余物通过硅胶垫(200-300筛目,以石油醚和乙酸乙酯(4:1,v/v)的混合物洗脱)得到3-(2-(6-氟-1-甲基-1H-吲唑-3-基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-甲酰氨基)-3-甲基环丁基氨基羧酸叔丁酯盐酸盐(0.11g,69%),为粗白色固体,其不经进一步纯化用于后续步骤。MS:(M+H)+=494.2.
步骤7
N-(顺式-3-氨基-1-甲基环丁基)-2-(6-氟-1-甲基-1H-吲唑-3-基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-甲酰胺2,2,2-三氟乙酸盐;N-(反式-3-氨基-1-甲基环丁基)-2-(6-氟-1-甲基-1H-吲唑-3-基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-甲酰胺2,2,2-三氟乙酸盐
将3-(2-(6-氟-1-甲基-1H-吲唑-3-基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-甲酰氨基)-3-甲基环丁基氨基甲酸叔丁酯盐酸盐(0.11g,0.22mmol)在三氟乙酸(10mL)和二氯甲烷(30mL)中的混合物在室温搅拌过夜。减压除去溶剂,且将残余物首先以制备型-HPLC(Gemini5u C18150×21.2mm;注射体积:3mL/注射,流速:20mL/分钟;波长:214nm和254nm;梯度条件为:23%乙腈/77%水(0.1%三氟乙酸,v/v)纯化,经9分钟以线性方式继续以32%乙腈/68%水(0.1%三氟乙酸,v/v)纯化得到N-(反式-3-氨基-1-甲基环丁基)-2-(6-氟-1-甲基-1H-吲唑-3-基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-甲酰胺2,2,2-三氟乙酸盐(3mg,2.7%)。MS:(M+H)+=394;1H NMR(300MHz,DMSO):δ12.98(brs,1H),9.12(s,1H),8.54-8.47(m,2H),8.26(s,1H),7.75(d,1H,J=9.9Hz),8.04(brs,2H),7.74(d,1H,J=9.6Hz),7.31(t,1H,J=8.8Hz),4.18(s,3H),4.00(brs,1H),2.85-2.78(brs,2H),2.37-2.31(m,2H),1.64(s,3H)。N-(顺式-3-氨基-1-甲基环丁基)-2-(6-氟-1-甲基-1H-吲唑-3-基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-甲酰胺2,2,2-三氟乙酸盐(16mg,14%)。MS:(M+H)+=394;1H NMR(300MHz,DMSO):δ9.14(s,1H),8.54-8.45(m,3H),8.06(brs,2H),7.75(d,1H,J=9.9Hz),7.25(t,1H,J=9.0Hz),4.18(s,3H),3.76(t,1H,J=7.7Hz),2.61(brs,4H),1.63(s,3H).
实施例424.
N-(1-氰基环丙基)-2-(1,6-二甲基-1H-吲唑-3-基)-5H-吡咯并[3,2-b]吡嗪-7-甲酰胺
步骤1
2-(1,6-二甲基-1H-吲唑-3-基)-5-(新戊酰基氧基甲基)-5H-吡咯并[3,2-b]吡嗪-7-羧酸甲酯
向2-溴-5-(新戊酰基氧基甲基)-5H-吡咯并[3,2-b]吡嗪-7-羧酸甲酯(2.5g,6.74mmol)和3-碘-1,6-二甲基-1H-吲唑(1.83g,6.74mmol)在DMF(30mL)中的溶液在添加六-正丁基二锡(5.86g,10.1mmol),接着添加Pd(PPh3)4(0.78g,0.674mmol)。将反应混合物通过鼓泡氮气脱气并于98℃搅拌16小时。将浓缩混合物通过柱色谱在硅胶上以石油醚/EtOAc(5:1至2:1,v/v)洗脱纯化得到2-(1,6-二甲基-1H-吲唑-3-基)-5-(新戊酰基氧基甲基)-5H-吡咯并[3,2-b]吡嗪-7-羧酸甲酯(1.05g,36%),为黄色固体。MS:(M+H)+=436.2;1H NMR(300MHz,DMSO):δ9.13(s,1H),8.67-8.64(m,2H),7.50(s,1H),7.16(d,1H,J=8.1Hz),6.30(s,2H),4.10(s,3H),3.92(s,3H),2.48(s,3H),1.07(s,9H)。
步骤2
2-(1,6-二甲基-1H-吲唑-3-基)-5H-吡咯并[3,2-b]吡嗪-7-羧酸
向2-(1,6-二甲基-1H-吲唑-3-基)-5-(新戊酰基氧基甲基)-5H-吡咯并[3,2-b]吡嗪-7-羧酸甲酯(1g,2.3mmol)在二噁烷/H2O(40mL/10mL)中的搅拌溶液于室温添加KOH(1.39g,34.5mmol)在水(10mL)中的溶液。然后将反应混合物加热至回流4小时。冷却至室温后,减压蒸发溶剂。将残余物以水稀释并以HCl(水溶液,2M)酸化成pH3-4。过滤混合物且干燥滤饼得到2-(1,6-二甲基-1H-吲唑-3-基)-5H-吡咯并[3,2-b]吡嗪-7-羧酸(0.6g,84.5%),为固体,,其不经进一步纯化即可在下一步中使用。MS:(M+H)+=308.1.
步骤3
N-(1-氰基环丙基)-2-(1,6-二甲基-1H-吲唑-3-基)-5H-吡咯并[3,2-b]吡嗪-7-甲酰胺
向2-(1,6-二甲基-1H-吲唑-3-基)-5H-吡咯并[3,2-b]吡嗪-7-羧酸(80mg,0.26mmol)和1-氨基环丙烷甲腈盐酸盐(46mg,0.39mmol)在DMF(3mL)中的搅拌混合物添加EDCI(100mg,0.52mmol),接着添加DMAP(63mg,0.52mmol)。将混合物在室温搅拌16小时。然后将混合物倒入水中(5mL)并过滤,将固体以DMSO和MeOH洗涤,然后干燥得到N-(1-氰基环丙基)-2-(1,6-二甲基-1H-吲唑-3-基)-5H-吡咯并[3,2-b]吡嗪-7-甲酰胺(22mg,23%),为白色固体。MS:(M+H)+=372;1H NMR(300MHz,DMSO):δ12.98(s,1H),9.14(s,1H),8.95(s,1H),8.55(s,1H),7.58(s,1H),7.25(d,1H,J=8.4Hz),4.17(s,3H),2.56(s,3H),1.77(d,2H,J=6.0Hz),1.48-1.44(m,2H)。
实施例425.
2-(1,6-二甲基-1H-吲唑-3-基)-N-(3-甲基吡咯烷-3-基)-5H-吡咯并[3,2-b]吡嗪-7-甲酰胺
步骤1
3-(2-(1,6-二甲基-1H-吲唑-3-基)-5H-吡咯并[3,2-b]吡嗪-7-甲酰氨基)-3-甲基吡咯烷-1-羧酸叔丁酯
向2-(1,6-二甲基-1H-吲唑-3-基)-5H-吡咯并[3,2-b]吡嗪-7-羧酸(100mg,0.326mmol)和2-环丙基丙烷-2-胺盐酸盐(100mg,0.488mmol)在DMF(3mL)中的搅拌混合物添加EDCI(125mg,0.652mmol),接着添加DMAP(80mg,0.652mmol)。将混合物在室温搅拌16小时。然后将混合物倒入水中(5mL)并过滤得到粗3-(2-(1,6-二甲基-1H-吲唑-3-基)-5H-吡咯并[3,2-b]吡嗪-7-甲酰氨基)-3-甲基吡咯烷-1-羧酸叔丁酯(130mg,81%),其不经进一步纯化即可在下一步中使用。MS:(M+H)+=490.2.
步骤2
2-(1,6-二甲基-1H-吲唑-3-基)-N-(3-甲基吡咯烷-3-基)-5H-吡咯并[3,2-b]吡嗪-7-甲酰胺
向3-(2-(1,6-二甲基-1H-吲唑-3-基)-5H-吡咯并[3,2-b]吡嗪-7-甲酰氨基)-3-甲基吡咯烷-1-羧酸叔丁酯(130mg,0.266mmol)在二氯甲烷(2.5mL)中的搅拌混合物于室温滴加三氟乙酸(2mL)且将反应混合物搅拌2小时。将混合物以NaHCO3水溶液稀释,过滤,以水洗涤并干燥得到2-(1,6-二甲基-1H-吲唑-3-基)-N-(3-甲基吡咯烷-3-基)-5H-吡咯并[3,2-b]吡嗪-7-甲酰胺(35mg,34%),为淡色固体。MS:(M+H)+=390;1H NMR(300MHz,DMSO):δ10.15(brs,1H),9.13(s,1H),8.45(d,1H,J=7.5Hz),8.38(d,1H,J=8.1Hz),8.25(s,1H),7.59(s,1H),7.18(d,1H,J=8.4Hz),4.17(s,3H),3.54-3.33(m,4H),2.55(s,3H),2.44-2.42(m,1H),2.19-2.12(m,1H),1.68(s,3H).
实施例426.
2-(1-(2-(二甲基氨基)乙基)-6-甲基-1H-吲唑-3-基)-N-(1-羟基-2-甲基丙烷-2-基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-甲酰胺盐酸盐
步骤1
2-(3-碘-6-甲基-1H-吲唑-1-基)-N,N-二甲基乙胺
将3-碘-6-甲基-1H-吲唑(516mg,2mmol)、2-氯-N,N-二甲基乙胺盐酸盐(346mg,2.4mmol)和碳酸钾(828mg,6mmol)在20mL的DMF中的混合物加热至80度过夜。冷却至室温后,添加水(50mL),将产物以二氯甲烷萃取(3×50mL),将合并的有机物以硫酸钠干燥,并浓缩得到2-(3-碘-6-甲基-1H-吲唑-1-基)-N,N-二甲基乙胺(1g,100%)。1H NMR(300MHz,CDCl3):δ7.33(d,1H,J=8.1Hz),7.15(s,1H),7.03(d,1H,J=0.6Hz),4.47(t,2H,J=7.2Hz),2.81(t,2H,J=7.2Hz),2.51(s,3H),2.34(m,6H).
步骤2
N,N-二甲基-2-(6-甲基-3-(三丁基甲锡烷基)-1H-吲唑-1-基)乙胺
在氮气气氛下将2-(3-碘-6-甲基-1H-吲唑-1-基)-N,N-二甲基乙胺(450mg,1.4mmol)在20mL的无水THF中的溶液冷却至-20℃,添加异丙基氯化镁(1.4mL,2.8mmol,2M的THF溶液)并于-20℃搅拌15分钟。然后添加三丁基氯甲锡烷(0.8mL,2.8mmol)并温热至室温。将反应混合物在冰浴中冷却并以饱和氯化铵溶液淬灭,以乙酸乙酯萃取(3×30mL),将合并的有机物以硫酸钠干燥并浓缩得到1.4g的粗N,N-二甲基-2-(6-甲基-3-(三丁基甲锡烷基)-1H-吲唑-1-基)乙胺,为油状物,其不经进一步纯化直接用于后续步骤。
步骤3
N-(1-(叔丁基二甲基甲硅烷基氧基)-2-甲基丙烷-2-基)-2-(1-(2-(二甲基氨基)乙基)-6-甲基-1H-吲唑-3-基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-甲酰胺
在N2下将2-溴-N-(1-(叔丁基二甲基甲硅烷基氧基)-2-甲基丙烷-2-基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-甲酰胺(210mg,0.5mmol)和N,N-二甲基-2-(6-甲基-3-(三丁基甲锡烷基)-1H-吲唑-1-基)乙胺(1.4g,2.85mmol)与四(三苯基膦)钯(0)(20mg,0.017mmol)、碘化铜(10mg,0.52mmol)在15mL的无水DMF中的混合物加热至85℃过夜。将反应混合物冷却至室温,以50mL的水稀释,以二氯甲烷(8×50mL)萃取,将合并的有机物以硫酸钠干燥并浓缩。粗产物不经进一步纯化用于后续步骤。LCMS:(M+H)+=550.
步骤4
2-(1-(2-(二甲基氨基)乙基)-6-甲基-1H-吲唑-3-基)-N-(1-羟基-2-甲基丙烷-2-基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-甲酰胺盐酸盐
向N-(1-(叔丁基二甲基甲硅烷基氧基)-2-甲基丙烷-2-基)-2-(1-(2-(二甲基氨基)乙基)-6-甲基-1H-吲唑-3-基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-甲酰胺(127mg,0.23mmol)在5mL的甲醇和1mL的THF中的溶液添加1mL的浓HCl,搅拌3小时。过滤沉淀且将滤饼以2-甲氧基-2-甲基丙烷(5mL)洗涤得到25mg的2-(1-(2-(二甲基氨基)乙基)-6-甲基-1H-吲唑-3-基)-N-(1-羟基-2-甲基丙烷-2-基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-甲酰胺盐酸盐。LCMS:(M+H)+=436;1H NMR(300MHz,DMSO):δ12.85(s,1H),10.19(s,1H),9.18(s,1H),8.47(d,1H,J=8.1Hz),8.37(s,1H),7.92(s,1H),7.68(s,1H),7.17(d,1H,J=8.4Hz),4.93(s,2H),3.70-3.63(m,4H),2.89(s,6H),2.50(s,3H),1.45(s,6H).
实施例427.
N-叔丁基-2-(1-(3-(二甲基氨基)丙基)-6-甲基-1H-吲唑-3-基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-甲酰胺盐酸盐
步骤1
3-(3-碘-6-甲基-1H-吲唑-1-基)-N,N-二甲基丙烷-1-胺
将3-碘-6-甲基-1H-吲唑(2.58g,10mmol)、3-氯-N,N-二甲基丙烷-1-胺盐酸盐(2.37g,15mmol)和碳酸钾(4.14g,30mmol)在50mL的DMF中的混合物加热至85℃且保持3小时。冷却至室温后,添加100mL的水且将混合物以乙酸乙酯萃取(4×100mL)。然后向合并的有机相添加20mL的6N HCl,且将该溶液以二氯甲烷萃取(4×50mL)。将合并的有机相以硫酸钠干燥,浓缩得到3-(3-碘-6-甲基-1H-吲唑-1-基)-N,N-二甲基丙烷-1-胺(1.74g,50.6%)。LCMS:(M+H)+=344;1H NMR(300MHz,CDCl3):δ7.33(d,1H,J=8.4Hz),7.21(s,1H),7.03(d,1H,J=8.4Hz),4.43(t,2H,J=6.6Hz),2.51(s,3H),2.27-2.23(m,8H),2.09-2.07(m,2H).
步骤2
N,N-二甲基-3-(6-甲基-3-(三丁基甲锡烷基)-1H-吲唑-1-基)丙烷-1-胺
在氮气气氛下将3-(3-碘-6-甲基-1H-吲唑1-基)-N,N-二甲基丙烷-1-胺(400mg,1.2mmol)在20mL的无水THF中的溶液冷却至-20℃,然后添加异丙基氯化镁(1.2mL,2.4mmol,2M在THF中)并于-20℃搅拌15分钟。然后添加三丁基氯甲锡烷(0.7mL,2.4mmol)并温热至室温。将反应混合物在冰浴中冷却并以饱和氯化铵溶液淬灭,将产物以乙酸乙酯萃取(3×50mL),将合并的有机物以硫酸钠干燥并浓缩得到N,N-二甲基-3-(6-甲基-3-(三丁基甲锡烷基)-1H-吲唑-1-基)丙烷-1-胺(1.2g,粗品),为油状物,其不经进一步纯化直接用于后续步骤。
步骤3
N-叔丁基-2-(1-(3-(二甲基氨基)丙基)-6-甲基-1H-吲唑-3-基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-甲酰胺盐酸盐
在N2下将2-溴-N-叔丁基-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-甲酰胺(150mg,0.5mmol)、N,N-二甲基-3-(6-甲基-3-(三丁基甲锡烷基)-1H-吲唑-1-基)丙烷-1-胺(1.2g,粗品)、四(三苯基膦)钯(0)(40mg,0.035mmol)和碘化铜(20mg,0.1mmol)在15mL的无水DMF中的混合物加热至90℃且保持3小时。将反应混合物冷却至室温,添加50mL的水且形成一些沉淀。过滤后,将固体溶解于HCl在1,4-二噁烷(3mL,1N)中的溶液中并搅拌5分钟。浓缩反应混合物且将残余物首先以制备型-HPLC(Gemini5u C18150×21.2mm;注射体积:3mL/注射,流速:20mL/分钟;波长:214nm和254nm;梯度条件为:40%乙腈/60%水(0.1%三氟乙酸V/V)纯化,然后在仅9分钟后以线性方式继续以50%乙腈/50%水(0.1%三氟乙酸V/V)纯化,得到26mg的N-叔丁基-2-(1-(3-(二甲基氨基)丙基)-6-甲基-1H-吲唑-3-基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-甲酰胺盐酸盐。LCMS:(M+H)+=434;1H NMR(300MHz,DMSO):δ12.80(s,1H),9.53(s,1H),9.10(s,1H),8.39-8.36(m,2H),7.96(s,1H),7.60(s,1H),7.13-7.10(m,1H),4.59-4.55(m,2H),3.21-3.16(m,2H),2.73(s,6H),2.51-2.48(m,2H),2.32-2.27(m,3H),1.53(s,6H).
实施例428.
N-(2-环丙基丙烷-2-基)-2-(1,6-二甲基-1H-吲唑-3-基)-5H-吡咯并[3,2-b]吡嗪-7-甲酰胺
向2-(1,6-二甲基-1H-吲唑-3-基)-5H-吡咯并[3,2-b]吡嗪-7-羧酸(80mg,0.26mmol)和2-环丙基丙烷-2-胺盐酸盐(53mg,0.39mmol)在DMF(3mL)中的搅拌混合物添加EDCI(100mg,0.52mmol),接着添加DMAP(63mg,0.52mmol)。将混合物在室温搅拌16小时,然后倒入水(5mL)中并过滤。将粗固体首先以制备型-HPLC(Gemini5u C18150×21.2mm;注射体积:3mL/注射,流速:20mL/分钟;波长:214nm和254nm;梯度条件为:58%乙腈/42%水(0.1%三氟乙酸,v/v)纯化,经9分钟以线性方式继续以88%乙腈/12%水(0.1%三氟乙酸,v/v)纯化得到N-(2-环丙基丙烷-2-基)-2-(1,6-二甲基-1H-吲唑-3-基)-5H-吡咯并[3,2-b]吡嗪-7-甲酰胺(25mg,25%),为白色固体。MS:(M+H)+=389;1HNMR(300MHz,DMSO):δ9.10(s,1H),8.39-8.36(m,2H),7.97(s,1H),7.55(s,1H),7.08(d,1H,J=8.1Hz),Hz),4.16(s,3H),2.52(s,3H),1.59-1.53(m,1H),1.25(s,6H),0.47-0.43(m,4H).
实施例429.
2-(1,6-二甲基-1H-吲唑-3-基)-N-(1-(羟基甲基)环丙基)-5H-吡咯并[3,2-b]吡嗪-7-甲酰胺
向2-(1,6-二甲基-1H-吲唑-3-基)-5H-吡咯并[3,2-b]吡嗪-7-羧酸(80mg,0.26mmol)和(1-氨基环丙基)甲醇(34mg,0.39mmol)在DMF(3mL)中的搅拌混合物添加EDCI(100mg,0.52mmol),接着添加DMAP(63mg,0.52mmol)。将混合物在室温搅拌16小时。然后将混合物倒入水中(5mL)并过滤。将粗产物首先以制备型-HPLC(Gemini5u C18150×21.2mm;注射体积:3mL/注射,流速:20mL/分钟;波长:214nm和254nm;梯度条件为:35%乙腈/65%水(0.1%三氟乙酸,v/v)纯化,经9分钟以线性方式继续以45%乙腈/55%水(0.1%三氟乙酸,v/v)纯化得到2-(1,6-二甲基-1H-吲唑-3-基)-N-(1-(羟基甲基)环丙基)-5H-吡咯并[3,2-b]吡嗪-7-甲酰胺(35mg,36%),为白色固体。MS:(M+H)+=377;1H NMR(300MHz,DMSO):δ13.84(s,1H),9.12(s,1H),8.74(s,1H),8.43-8.40(m,2H),7.56(s,1H),7.21(d,1H,J=8.4Hz),4.89(brs,1H),4.16(s,3H),3.62(s,2H),2.55(s,3H),0.97-0.86(m,4H)。
实施例430.
2-(1,6-二甲基-1H-吲唑-3-基)-N-(1-(二甲基氨基)-2-甲基丙烷-2-基)-5H-吡咯并[3,2-b]吡嗪-7-甲酰胺2,2,2-三氟乙酸盐
向2-(1,6-二甲基-1H-吲唑-3-基)-5H-吡咯并[3,2-b]吡嗪-7-羧酸(80mg,0.26mmol)和N1,N1,2-三甲基丙烷-1,2-二胺(45mg,0.39mmol)在DMF(3mL)中的搅拌混合物添加EDCI(100mg,0.52mmol),接着添加DMAP(63mg,0.52mmol)。将混合物在室温搅拌16小时。然后将混合物倒入水(5mL)中并以EtOAc(3×10mL)萃取。将合并的有机层以盐水洗涤,并经Na2SO4干燥。过滤和浓缩后。将残余物首先以制备型-HPLC(Gemini5u C18150×21.2mm;注射体积:3mL/注射,流速:20mL/分钟;波长:214nm和254nm;梯度条件为:20%乙腈/80%水(0.1%三氟乙酸,v/v)纯化,经9分钟以线性方式继续以55%乙腈/45%水(0.1%三氟乙酸,v/v)纯化得到2-(1,6-二甲基-1H-吲唑-3-基)-N-(1-(二甲基氨基)-2-甲基丙烷-2-基)-5H-吡咯并[3,2-b]吡嗪-7-甲酰胺2,2,2-三氟乙酸盐(26mg,25%),为黄色固体。MS:(M+H)+=406;1H NMR(300MHz,CD3OD):δ9.07-9.05(m,1H),8.51(s,1H),8.34-8.32(m,1H),8.22-8.19(m,1H),7.33(s,1H),7.07(d,1H,J=8.1Hz),4.08(t,1H,J=2.2Hz),3.77(s,2H),3.03(s,6H),2.54(s,3H),1.74(s,6H)。
实施例431.
2-(6-甲基-1H-吲唑-3-基)-N-(3-甲基吡咯烷-3-基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-甲酰胺2,2,2-三氟乙酸盐
步骤1
3-甲基-3-(2-(6-甲基-1H-吲唑-3-基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-甲酰氨基)吡咯烷-1-羧酸叔丁酯
向2-(6-甲基-1H-吲唑-3-基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-羧酸(100mg,0.34mmol)、EDCI(123mg,0.64mmol)、DMAP(110mg,0.90mmol)和DIEA(131mg,1.02mmol)在6mL的DMF中的搅拌溶液于室温以一份添加3-氨基-3-甲基吡咯烷-1-羧酸叔丁酯(100mg,0.54mmol),然后搅拌混合物16小时。将反应混合物倒入40mL的水,以乙酸乙酯(150mL)萃取。将有机相于40℃减压蒸发且将残余物以石油醚研磨,然后倾析并干燥得到粗3-甲基-3-(2-(6-甲基-1H-吲唑-3-基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-甲酰氨基)吡咯烷-1-羧酸叔丁酯(76mg,47.0%),为黄色固体。MS:(M+H)+=476.2.
步骤2
2-(6-甲基-1H-吲唑-3-基)-N-(3-甲基吡咯烷-3-基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-甲酰胺2,2,2-三氟乙酸盐
向3-甲基-3-(2-(6-甲基-1H-吲唑-3-基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-甲酰氨基)吡咯烷-1-羧酸叔丁酯(76mg,0.16mmol)在6mL的二氯甲烷中的搅拌溶液于室温以一份添加三氟乙酸(3mL)并搅拌一小时。将溶剂于40℃减压蒸发,且将残余物首先以制备型-HPLC(Gemini5u C18150×21.2mm;注射体积:3mL/注射,流速:20mL/分钟;波长:214nm和254nm;梯度条件为:20%乙腈/80%水(0.1%三氟乙酸,v/v)纯化,经9分钟以线性方式继续以45%乙腈/65%水(0.1%三氟乙酸,v/v)纯化得到2-(6-甲基-1H-吲唑-3-基)-N-(3-甲基吡咯烷-3-基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-甲酰胺2,2,2-三氟乙酸盐(18mg,22.9%),为白色固体。MS:(M+H)+=376;1H NMR(300MHz,DMSO):δ13.43(s,1H),9.17(s,1H),8.80(brs,1H),8.49(s,1H),8.38(d,1H,J=8.1Hz),8.29(s,1H),7.47(s,1H),7.16(d,1H,J=8.4Hz),3.94(d,1H,J=12.0Hz),3.51-3.20(m,3H),2.57(s,3H),2.30-2.17(m,2H),1.70(s,3H).
实施例432.
N-(1-(羟基甲基)环丙基)-2-(6-甲基-1H-吲唑-3-基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-甲酰胺
向2-(6-甲基-1H-吲唑-3-基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-羧酸(100mg,0.34mmol)、EDCI(123mg,0.64mmol)和DMAP(110mg,0.90mmol)在6mL的DMF中的搅拌溶液于室温以一份添加(1-氨基环丙基)甲醇(59mg,0.68mmol),然后搅拌混合物16小时。将反应混合物倒入40mL的水,过滤且将滤饼首先以制备型-HPLC(Gemini5u C18150×21.2mm;注射体积:3mL/注射,流速:20mL/分钟;波长:214nm和254nm;梯度条件为:25%乙腈/75%水(0.1%三氟乙酸,v/v)纯化,经9分钟以线性方式继续以50%乙腈/50%水(0.1%三氟乙酸,v/v)纯化得到N-(1-(羟基甲基)环丙基)-2-(6-甲基-1H-吲唑-3-基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-甲酰胺(10mg,8.1%),为黄色固体。MS:(M+H)+=363;1HNMR(300MHz,DMSO):δ13.36(s,1H),12.81(s,1H),9.16(s,1H),8.75(s,1H),8.40-8.38(m,2H),7.43(s,1H),7.16(d,1H,J=8.7Hz),4.89(brs,1H),3.59(brs,2H),2.54(s,3H),0.92-0.83(m,4H).
实施例433.
N-(2-环丙基丙烷-2-基)-2-(6-甲基-1H-吲唑-3-基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-甲酰胺
向2-(6-甲基-1H-吲唑-3-基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-羧酸(100mg,0.34mmol)、EDCI(130mg,0.68mmol)、DMAP(83mg,0.68mmol)和DIEA(88mg,0.68mmol)在6mL的DMF中的搅拌溶液于室温以一份添加2-环丙基丙烷-2-胺盐酸盐(92mg,0.68mmol),然后搅拌混合物16小时。将反应混合物倒入40mL的水,过滤且将滤饼首先以制备型-HPLC(Gemini5u C18150×21.2mm;注射体积:3mL/注射,流速:20mL/分钟;波长:214nm和254nm;梯度条件为:45%乙腈/55%水(0.1%三氟乙酸,v/v)纯化,经9分钟以线性方式继续以75%乙腈/25%水(0.1%三氟乙酸,v/v)纯化得到N-(2-环丙基丙烷-2-基)-2-(6-甲基-1H-吲唑-3-基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-甲酰胺(12mg,9.4%),为黄色固体。MS:(M+H)+=375;1H NMR(300MHz,DMSO):δ13.38(s,1H),12.80(s,1H),9.16(s,1H),8.41-8.35(m,2H),7.95(s,1H),7.41(s,1H),7.06(d,1H,J=8.4Hz),2.57(s,3H),1.67-1.54(m,1H),1.59(s,6H),0.48-0.44(m,4H).
实施例434.
N-(1-羟基-2-甲基丙烷-2-基)-2-(6-甲基-1H-吲唑-3-基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-甲酰胺
步骤1
N-(1-(叔丁基二甲基甲硅烷基氧基)-2-甲基丙烷-2-基)-2-(6-甲基-1H-吲唑-3-基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-甲酰胺
向2-(6-甲基-1H-吲唑-3-基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-羧酸(100mg,0.34mmol)、EDCI(130mg,0.68mmol)、DMAP(83mg,0.68mmol)和DIEA(88mg,0.68mmol)在6mL的DMF中的搅拌溶液于室温以一份添加1-(叔丁基二甲基甲硅烷基氧基)-2-甲基丙烷-2-胺(138mg,0.68mmol),然后搅拌混合物16小时。将反应混合物倒入40mL的水,过滤并将滤饼以石油醚洗涤得到粗N-(1-(叔丁基二甲基甲硅烷基氧基)-2-甲基丙烷-2-基)-2-(6-甲基-1H-吲唑-3-基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-甲酰胺(75mg,46.0%),为浅黄色固体。MS:(M+H)+=479.2.
步骤2
N-(1-羟基-2-甲基丙烷-2-基)-2-(6-甲基-1H-吲唑-3-基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-甲酰胺
于室温将N-(1-(叔丁基二甲基甲硅烷基氧基)-2-甲基丙烷-2-基)-2-(6-甲基-1H-吲唑-3-基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-甲酰胺(75mg,0.16mmol)添加至HCl(g)在二噁烷(15mL)中的饱和溶液并搅拌2小时。过滤反应混合物,将滤饼以2mL的甲醇洗涤,然后于40℃减压干燥得到N-(1-羟基-2-甲基丙烷-2-基)-2-(6-甲基-1H-吲唑-3-基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-甲酰胺(15mg,26.4%),为黄色固体。MS:(M+H)+=365;1H NMR(300MHz,DMSO):δ13.34(s,1H),12.76(s,1H),9.14(s,1H),8.46(d,1H,J=7.8Hz),8.35(s,1H),7.95(s,1H),7.41(s,1H),7.09(d,1H,J=8.4Hz),5.05(t,1H,J=5.7Hz),3.65(d,1H,J=5.7Hz),2.50(s,3H),1.46(s,6H)。
实施例435.
N-(1-氨基-2-甲基丙烷-2-基)-2-(6-甲基-1H-吲唑-3-基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-甲酰胺盐酸盐
步骤1
2-甲基-2-(2-(6-甲基-1H-吲唑-3-基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-甲酰氨基)丙基氨基甲酸叔丁酯
向2-(6-甲基-1H-吲唑-3-基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-羧酸(100mg,0.34mmol)、EDCI(130mmol,0.68mmol)、DMAP(83mg,0.68mmol)和DIEA(88mg,0.68mmol)在6mL的DMF中的搅拌溶液于室温以一份添加2-氨基-2-甲基丙基氨基甲酸叔丁酯(128mg,0.68mmol),然后搅拌混合物16小时。将反应混合物倒入40mL的水,过滤并将滤饼以石油醚洗涤得到粗2-甲基-2-(2-(6-甲基-1H-吲唑-3-基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-甲酰氨基)丙基氨基甲酸叔丁酯(100mg,63.4%),为淡黄色固体。MS:(M+H)+=463.2.
步骤2
N-(1-氨基-2-甲基丙烷-2-基)-2-(6-甲基-1H-吲唑-3-基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-甲酰胺盐酸盐
将2-甲基-2-(2-(6-甲基-1H-吲唑-3-基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-甲酰氨基)丙基氨基甲酸叔丁酯(100mg,0.22mmol)添加至HCl气体在乙酸乙酯(20mL)中的饱和溶液且将混合物在室温搅拌3小时。将所得固体经过滤并以5mL的乙酸乙酯洗涤得到N-(1-氨基-2-甲基丙烷-2-基)-2-(6-甲基-1H-吲唑-3-基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-甲酰胺盐酸盐(25mg,32%),为黄色固体。MS:(M+H)+=364;1H NMR(300MHz,DMSO):δ13.45(s,1H),12.96(s,1H),9.19(s,1H),8.47-8.40(m,2H),8.12-8.10(m,3H),7.46(s,1H),7.12(d,1H,J=8.4Hz),3.84(brs,5H),3.42(d,2H,J=4.8Hz),2.52(s,3H),1.58(s,3H)。
实施例436.
N-(1-(二甲基氨基)-2-甲基丙烷-2-基)-2-(6-甲基-1H-吲唑-3-基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-甲酰胺
向2-(6-甲基-1H-吲唑-3-基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-羧酸(100mg,0.34mmol)、DCI(123mg,0.64mmol)和DMAP(110mg,0.90mmol)在6mL的DMF的搅拌溶液于室温以一份添加N1,N1,2-三甲基丙烷-1,2-二胺(100mg,0.86mmol),然后搅拌混合物16小时。将反应混合物倒入40mL的水,过滤且将滤饼通过柱色谱(硅胶,200-300筛目,以甲醇和THF的混合物(1:3,v/v)洗脱)纯化得到N-(1-(二甲基氨基)-2-甲基丙烷-2-基)-2-(6-甲基-1H-吲唑-3-基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-甲酰胺(22mg,16.5%),为黄色固体。MS:(M+H)+=392;1HNMR(300MHz,DMSO):δ13.38(s,1H),12.90(brs,1H),9.15(s,1H),8.47(d,1H,J=8.4Hz),8.37(s,1H),7.97(s,1h),7.45(s,1H),7.10(d,1H,J=8.4Hz),2.74(s,2H),2.52(s,3H),2.29(s,3H),2.26(s,3H),2.01(s,6H)。
实施例437.
N-(1-氰基环丙基)-2-(6-甲基-1H-吲唑-3-基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-甲酰胺
向2-(6-甲基-1H-吲唑-3-基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-羧酸(100mg,0.34mmol)、DIEA(200mg,1.55mmol)、EDCI(123mg,0.64mmol)和DMAP(110mg,0.90mmol)在6mL的DMF的搅拌溶液于室温以一份添加1-氨基环丙烷甲腈盐酸盐(100mg,0.84mmol),然后搅拌混合物16小时。将反应混合物倒入40mL的水,过滤且将滤饼首先以制备型-HPLC(Gemini5u C18150×21.2mm;注射体积:3mL/注射,流速:20mL/分钟;波长:214nm和254nm;梯度条件为:35%乙腈/65%水(0.1%三氟乙酸,v/v)纯化,经9分钟以线性方式继续以70%乙腈/30%水(0.1%三氟乙酸,v/v)纯化得到N-(1-氰基环丙基)-2-(6-甲基-1H-吲唑-3-基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-甲酰胺(5mg,4.1%),为黄色固体。MS:(M+H)+=358;1H NMR(300MHz,DMSO):δ13.40(s,1H),13.00(s,1H),9.19(s,1H),8.98(s,1H),8.56(d,1H,J=3.0Hz),8.38(d,1H,J=8.1Hz),7.46(s,1H),7.21(d,1H,J=8.4Hz),2.53(s,3H),1.78-1.74(m,2H),1.48-1.44(m,2H)。
实施例438.
N-(1-羟基-2-甲基丙烷-2-基)-2-(6-甲基-1-(3-吗啉代丙基)-1H-吲唑-3-基)-5H-吡咯并[3,2-b]吡嗪-7-甲酰胺盐酸盐
步骤1
2-溴-N-(1-(叔丁基二甲基甲硅烷基氧基)-2-甲基丙烷-2-基)-5H-吡咯并[3,2-b]吡嗪-7-甲酰胺
将2-溴-5H-吡咯并[3,2-b]吡嗪-7-羧酸(2.5g,10.33mmol)、1-(叔丁基二甲基甲硅烷基氧基)-2-甲基丙烷-2-胺(2.52g,12.4mmol)、EDCI(1.97g,10.33mmol)、HOBt(2.8g,20.6mmol)和DIPEA(2.7g,20.66mmol)在无水DMF(30mL)中的混合物加热至30℃且保持16小时。然后添加水(30mL),将所形成的沉淀通过过滤分离,且将滤饼以水(10mL)洗涤并干燥得到1-(2-溴-5H-吡咯并[3,2-b]吡嗪-7-基)-2-(1-(叔丁基二甲基甲硅烷基氧基)-2-甲基丙烷-2-基氨基)乙酮(2.7g,61%),为黄色固体。LCMS:(M+H)+=427.
步骤2
2-溴-N-(1-(叔丁基二甲基甲硅烷基氧基)-2-甲基丙烷-2-基)-5-三苯甲基-5H-吡咯并[3,2-b]吡嗪-7-甲酰胺
将1-(2-溴-5H-吡咯并[3,2-b]吡嗪-7-基)-2-(1-(叔丁基二甲基甲硅烷基氧基)-2-甲基丙烷-2-基氨基)乙酮(1.3g,3.04mmol)、氯三苯基甲烷(1.0g,3.65mmol)和三乙胺(0.46g,4.56mmol)在无水DMF(20mL)中的混合物加热至90℃且保持5小时。将产物以乙酸乙酯(200mL)萃取,将有机相以水(3×20mL)和盐水(2×20mL)洗涤。将有机层然后经Na2SO4干燥,过滤并浓缩且将残余物通过柱色谱(硅胶,200-300筛目,以乙酸乙酯:石油醚=1:10洗脱)纯化得到2-溴-N-(1-(叔丁基二甲基甲硅烷基氧基)-2-甲基丙烷-2-基)-5-三苯甲基-5H-吡咯并[3,2-b]吡嗪-7-甲酰胺(1.73g,85%),为黄色固体。1H NMR(300MHz,CDCl3):8.29(s,1H),8.00(s,1H),7.93(s,1H),7.29-7.26(m,9H),7.14-7.11(m,6H),3.71(s,2H),1.48(s,6H),0.90(s,9H),0.11(s,6H)。
步骤3
N-(1-(叔丁基二甲基甲硅烷基氧基)-2-甲基丙烷-2-基)-2-(6-甲基-1H-吲唑-3-基)-5-三苯甲基-5H-吡咯并[3,2-b]吡嗪-7-甲酰胺
将2-溴-N-(1-(叔丁基二甲基甲硅烷基氧基)-2-甲基丙烷-2-基)-5-三苯甲基-5H-吡咯并[3,2-b]吡嗪-7-甲酰胺(1.73g,2.58mmol)、6-甲基-3-(三丁基甲锡烷基)-1H-吲唑(1.2g,2.84mmol)、Pd(PPh3)4(298mg,0.258mmol)和CuI(98mg,0.516mmol)在无水DMF(20mL)中的混合物加热至90℃且保持4小时。将产物以乙酸乙酯(200mL)萃取,将有机相以水(2×50mL)和盐水(2×50mL)洗涤,然后经Na2SO4干燥,过滤并浓缩。将残余物以石油醚(10mL)研磨然后倾析并干燥得到N-(1-(叔丁基二甲基甲硅烷基氧基)-2-甲基丙烷-2-基)-2-(6-甲基-1H-吲唑-3-基)-5-三苯甲基-5H-吡咯并[3,2-b]吡嗪-7-甲酰胺(1.21g,65%),为黄色固体。LCMS:(M+H)+=721.
步骤4
N-(1-(叔丁基二甲基甲硅烷基氧基)-2-甲基丙烷-2-基)-2-(6-甲基-1-(3-吗啉代丙基)-1H-吲唑-3-基)-5-三苯甲基-5H-吡咯并[3,2-b]吡嗪-7-甲酰胺
将N-(1-(叔丁基二甲基甲硅烷基氧基)-2-甲基丙烷-2-基)-2-(6-甲基-1H-吲唑-3-基)-5-三苯甲基-5H-吡咯并[3,2-b]吡嗪-7-甲酰胺(100mg,0.139mmol)、4-(3-氯丙基)吗啉(27mg,0.166mmol)和K2CO3(58mg,0.417mmol)在无水DMF(20mL)中的混合物加热至90℃且保持3小时。将产物以乙酸乙酯(100mL)萃取,将有机相以水(3×10mL)和盐水(2×10mL)洗涤,然后经Na2SO4干燥,过滤并浓缩得到N-(1-(叔丁基二甲基甲硅烷基氧基)-2-甲基丙烷-2-基)-2-(6-甲基-1-(3-吗啉代丙基)-1H-吲唑-3-基)-5-三苯甲基-5H-吡咯并[3,2-b]吡嗪-7-甲酰胺(95mg,粗品),为黄色油状物。LCMS:(M+H)+=848.
步骤5
N-(1-羟基-2-甲基丙烷-2-基)-2-(6-甲基-1-(3-吗啉代丙基)-1H-吲唑-3-基)-5H-吡咯并[3,2-b]吡嗪-7-甲酰胺盐酸盐
向N-(1-(叔丁基二甲基甲硅烷基氧基)-2-甲基丙烷-2-基)-2-(6-甲基-1-(3-吗啉代丙基)-1H-吲唑-3-基)-5-三苯甲基-5H-吡咯并[3,2-b]吡嗪-7-甲酰胺(95mg,0.112mmol)在二噁烷(40mL)中的搅拌溶液鼓泡HCl气体直到饱和,然后在室温搅拌16小时。将反应混合物经浓缩,且将残余物以甲醇(1mL)研磨然后倾析并干燥得到N-(1-羟基-2-甲基丙烷-2-基)-2-(6-甲基-1-(3-吗啉代丙基)-1H-吲唑-3-基)-5H-吡咯并[3,2-b]吡嗪-7-甲酰胺盐酸盐(42mg,71%),为黄色固体。LCMS:(M+H)+=492;1H NMR(300MHz,DMSO+D2O):δ9.14(s,1H),8.44(d,1H,J=8.1Hz),8.36(s,1H),7.59(s,1H),7.17(d,1H,J=8.4Hz),4.59-4.56(m,2H),4.03-3.99(m,2H),3.78-3.75(m,4H),3.43-3.18(m,6H),2.54(s,3H),2.36(brs,2H),1.43(s,6H)。
实施例439.
N-(1-羟基-2-甲基丙烷-2-基)-2-(6-甲基-1-(2-吗啉代-2-氧代乙基)-1H-吲唑-3-基)-5H-吡咯并[3,2-b]吡嗪-7-甲酰胺盐酸盐
步骤1
N-(1-(叔丁基二甲基甲硅烷基氧基)-2-甲基丙烷-2-基)-2-(6-甲基-1-(2-吗啉代-2-氧代乙基)-1H-吲唑-3-基)-5-三苯甲基-5H-吡咯并[3,2-b]吡嗪-7-甲酰胺
将N-(1-(叔丁基二甲基甲硅烷基氧基)-2-甲基丙烷-2-基)-2-(6-甲基-1H-吲唑-3-基)-5-三苯甲基-5H-吡咯并[3,2-b]吡嗪-7-甲酰胺(100mg,0.139mmol)、2-氯-1-吗啉代乙酮(27mg,0.166mmol)和K2CO3(58mg,0.417mmol)在无水DMF(20mL)中的混合物加热至90℃且保持3小时。冷却至室温后,添加乙酸乙酯(100mL),溶液以水(3×10mL)和盐水(2×10mL)洗涤。将合并的有机层经Na2SO4干燥,浓缩得到残余物,其不经进一步纯化用于后续步骤。LCMS:(M+H)+=848.
步骤2
N-(1-羟基-2-甲基丙烷-2-基)-2-(6-甲基-1-(2-吗啉代-2-氧代乙基)-1H-吲唑-3-基)-5H-吡咯并[3,2-b]吡嗪-7-甲酰胺盐酸盐
向N-(1-(叔丁基二甲基甲硅烷基氧基)-2-甲基丙烷-2-基)-2-(6-甲基-1-(2-吗啉代-2-氧代乙基)-1H-吲唑-3-基)-5-三苯甲基-5H-吡咯并[3,2-b]吡嗪-7-甲酰胺(100mg,0.118mmol)在二噁烷(40mL)中的搅拌溶液鼓泡HCl气体直到饱和,然后在室温搅拌16小时。将混合物经浓缩且将残余物以甲醇(1mL)研磨,倾析溶剂且干燥固体得到N-(1-羟基-2-甲基丙烷-2-基)-2-(6-甲基-1-(2-吗啉代-2-氧代乙基)-1H-吲唑-3-基)-5H-吡咯并[3,2-b]吡嗪-7-甲酰胺盐酸盐(44mg,71%),为黄色固体。LCMS:(M+H)+=492;1H NMR(300MHz,DMSO+D2O):δ9.07(s,1H),8.44(d,1H,J=8.4Hz),8.36(s,1H),7.45(s,1H),7.15(d,1H,J=8.4Hz),5.55(s,2H),3.72-3.65(m,8H),3.47(brs,2H),2.53(s,3H),2.36(brs,2H),1.46(s,6H)。
实施例440.
2-(1-(3-(二甲基氨基)丙基)-6-甲基-1H-吲唑-3-基)-N-(1-羟基-2-甲基丙烷-2-基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-甲酰胺盐酸盐
步骤1
N,N-二甲基-3-(6-甲基-3-(三丁基甲锡烷基)-1H-吲唑-1-基)丙烷-1-胺
在氮气气氛下将3-(3-碘-6-甲基-1H-吲唑-1-基)-N,N-二甲基丙烷-1-胺(480mg,1.4mmol)在20mL的无水THF中的溶液冷却至-20℃,添加异丙基氯化镁(1.4mL,2.8mmol,2M在THF中)并于-20℃搅拌15分钟。然后添加三丁基氯甲锡烷(0.8mL,2.8mmol)并温热至室温。将反应混合物在冰浴中冷却并以饱和氯化铵溶液淬灭,将产物以乙酸乙酯萃取(3×50mL),将合并的有机物以硫酸钠干燥并浓缩得到1.4g的粗N,N-二甲基-3-(6-甲基-3-(三丁基甲锡烷基)-1H-吲唑-1-基)丙烷-1-胺为油状物,其不经进一步纯化直接用于后续步骤。
步骤2
N-(1-(叔丁基二甲基甲硅烷基氧基)-2-甲基丙烷-2-基)-2-(1-(3-(二甲基氨基)丙基)-6-甲基-1H-吲唑-3-基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-甲酰胺
在N2下将2-溴-N-(1-(叔丁基二甲基甲硅烷基氧基)-2-甲基丙烷-2-基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-甲酰胺(300mg,0.7mmol)和N,N-二甲基-3-(6-甲基-3-(三丁基甲锡烷基)-1H-吲唑-1-基)丙烷-1-胺(1.4g,2.76mmol)与四(三苯基膦)钯(0)(10mg,0.087mmol)、碘化铜(10mg,0.52mmol)在15mL的无水DMF中的混合物加热至85℃过夜。将反应混合物冷却至室温,以50mL的水稀释,将所形成的固体通过过滤分离。将固体以2-甲氧基-2-甲基丙烷(5mL)洗涤得到N-(1-(叔丁基二甲基甲硅烷基氧基)-2-甲基丙烷-2-基)-2-(1-(3-(二甲基氨基)丙基)-6-甲基-1H-吲唑-3-基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-甲酰胺(1g,粗品)其不经进一步纯化直接用于后续步骤。LCMS:(M+H)+=564.
步骤3
2-(1-(3-(二甲基氨基)丙基)-6-甲基-1H-吲唑-3-基)-N-(1-羟基-2-甲基丙烷-2-基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-甲酰胺盐酸盐
向N-(1-(叔丁基二甲基甲硅烷基氧基)-2-甲基丙烷-2-基)-2-(1-(3-(二甲基氨基)丙基)-6-甲基-1H-吲唑-3-基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-甲酰胺(1g,1.78mmol)在10mL的甲醇中的溶液添加1mL的浓HCl,搅拌3小时,过滤沉淀且将滤饼以2-甲氧基-2-甲基丙烷洗涤得到25mg的2-(1-(3-(二甲基氨基)丙基)-6-甲基-1H-吲唑-3-基)-N-(1-羟基-2-甲基丙烷-2-基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-甲酰胺盐酸盐。LCMS:(M+H)+=450;1H NMR(300MHz,DMSO):δ12.84(s,1H),9.55(s,1H),9.14(s,1H),8.49(d,1H,J=8.1Hz),8.40(s,1H),7.96(s,1H),7.62(s,1H),7.17(d,1H,J=8.4Hz),4.61-4.58(m,2H),3.67(s,2H),3.21(s,2H),2.82(s,6H),2.55(s,3H),2.33(brs,2H),1.49(s,6H)。
实施例441.
2-(5-(二氟甲氧基)-1-(3-(二甲基氨基)丙基)-1H-吲唑-3-基)-N-(1-羟基-2-甲基丙烷-2-基)-5H-吡咯并[3,2-b]吡嗪-7-甲酰胺
步骤1
3-(5-(二氟甲氧基)-3-碘-1H-吲唑-1-基)-N,N-二甲基丙烷-1-胺
向5-(二氟甲氧基)-3-碘-1H-吲唑(1g,3.2mmol)在DMF(25mL)中的溶液添加K2CO3(1.8g,12.8mmol)和3-氯-N,N-二甲基丙烷-1-胺(1.1g,6.4mmol),在添加后,于80℃搅拌反应混合物4小时。冷却至室温后,添加H2O(25mL)且将产物以乙酸乙酯(100mL)萃取。将有机层以H2O(100mL)、盐水(100mL)洗涤,经Na2SO4干燥并减压浓缩。将残余物通过柱色谱(硅胶,200-300筛目,以二氯甲烷/CH3OH=10:1洗脱)纯化得到3-(5-(二氟甲氧基)-3-碘-1H-吲唑-1-基)-N,N-二甲基丙烷-1-胺(1.1g,78.5%),为黄色油状物。1H NMR(300MHz,CDCl3):δ7.46-7.42(m,1H),7.27-7.17(m,2H),6.87-6.29(t,1H,J=73.8Hz),4.47-4.41(m,2H),2.24-2.18(m,8H),2.08-2.03(m,2H)。LCMS:(M+H)+=396.
步骤2
3-(5-(二氟甲氧基)-3-(三丁基甲锡烷基)-1H-吲唑-1-基)-N,N-二甲基丙烷-1-胺
于-16℃在氮气气氛下向3-(5-(二氟甲氧基)-3-碘-1H-吲唑-1-基)-N,N-二甲基丙烷-1-胺(1.2g,2.78mmol)在无水THF(25mL)中的溶液滴加异丙基氯化镁(1.5mL,2M在THF中,3mmol),搅拌30分钟,于-16℃在氮气下滴加三丁基氯甲锡烷(3.3mL,3.6mmol),然后将反应混合物缓慢地温热至室温并搅拌2小时。然后将反应混合物以NH4Cl(40mL)的饱和溶液淬灭并以EtOAc萃取(3×30mL),将合并的有机层经Na2SO4干燥,过滤并减压浓缩得到3-(5-(二氟甲氧基)-3-(三丁基甲锡烷基)-1H-吲唑-1-基)-N,N-二甲基丙烷-1-胺,(1.1g,71%),为油状物,不经纯化用于后续步骤。
步骤3
N-(1-(叔丁基二甲基甲硅烷基氧基)-2-甲基丙烷-2-基)-2-(5-(二氟甲氧基)-1-(3-(二甲基氨基)丙基)-1H-吲唑-3-基)-5-三苯甲基-5H-吡咯并[3,2-b]吡嗪-7-甲酰胺
向3-(5-(二氟甲氧基)-3-(三丁基甲锡烷基)-1H-吲唑-1-基)-N,N-二甲基丙烷-1-胺(120mg,0.22mmol)和2-溴-N-(1-(叔丁基二甲基甲硅烷基氧基)-2-甲基丙烷-2-基)-5-三苯甲基-5H-吡咯并[3,2-b]吡嗪-7-甲酰胺(200mg,0.26mmol)在DMF(10mL)中的溶液添加CuI(30mg,0.16mmol)和Pd(PPh3)4(47mg,0.041mmol),然后将反应混合物通过鼓泡氮气脱气3分钟并重填以氮气。在氮气下将混合物加热至80℃且保持5小时。冷却至室温后,加入水(50mL)并将产物以EtOAc萃取(3×40mL),将合并的有机层经Na2SO4干燥,过滤并浓缩得到N-(1-(叔丁基二甲基甲硅烷基氧基)-2-甲基丙烷-2-基)-2-(5-(二氟甲氧基)-1-(3-(二甲基氨基)丙基)-1H-吲唑-3-基)-5-三苯甲基-5H-吡咯并[3,2-b]吡嗪-7-甲酰胺(88mg,粗品),为黄色油状物。LCMS:(M+H)+=858.
步骤4
2-(5-(二氟甲氧基)-1-(3-(二甲基氨基)丙基)-1H-吲唑-3-基)-N-(1-羟基-2-甲基丙烷-2-基)-5H-吡咯并[3,2-b]吡嗪-7-甲酰胺
向N-(1-(叔丁基二甲基甲硅烷基氧基)-2-甲基丙烷-2-基)-2-(5-(二氟甲氧基)-1-(3-(二甲基氨基)丙基)-1H-吲唑-3-基)-5-三苯甲基-5H-吡咯并[3,2-b]吡嗪-7-甲酰胺(88mg,0.12mmol)在3mL的二氯甲烷中的溶液添加3mL的三氟乙酸。室温搅拌反应混合物过夜。蒸发溶剂后。将残余物首先以制备型-HPLC(Gemini5u C18150×21.2mm;注射体积:3mL/注射,流速:20mL/分钟;波长:214nm和254nm;梯度条件为:40%乙腈/60%水(0.1%三氟乙酸V/V)纯化,然后在仅9分钟后以线性方式继续以50%乙腈/50%水(0.1%三氟乙酸V/V)纯化得到2-(5-(二氟甲氧基)-1-(3-(二甲基氨基)丙基)-1H-吲唑-3-基)-N-(1-羟基-2-甲基丙烷-2-基)-5H-吡咯并[3,2-b]吡嗪-7-甲酰胺,为黄色固体(22mg,34.5%)。LCMS:(M+H)+=502;1H NMR(300MHz,CD3OD):δ9.04(s,1H),8.17(s,1H),8.11(s,1H),7.66(d,1H,J=8.7Hz),7.35(d,1H,J=8.1Hz),6.85(t,1H,J=74.1Hz),4.59(s,2H),3.84(s,2H),3.34-3.32(m,2H),2.89(s,6H),2.44(s,2H),1.64(s,6H).
实施例442.
3-(2-(6-氯-1-甲基-1H-吲唑-3-基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-甲酰氨基)环己基氨基甲酸叔丁酯
步骤1
N-(3-氨基环己基)-2-溴-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-甲酰胺
将2-溴-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-羧酸(0.2g,0.83mmol)、环己烷-1,3-二胺(0.473g,4.15mmol)、HATU(0.475g,1.25mmol)、DIPEA(0.322g,2.5mmol)在15mL的DMF中的混合物室温搅拌过夜。于70℃减压除去溶剂,得到N-(3-氨基环己基)-2-溴-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-甲酰胺,为粗品,其不经进一步纯化即可在下一步中使用。MS:(M+H)+=338.1.
步骤2
3-(2-溴-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-甲酰氨基)环己基氨基甲酸叔丁酯
将N-(3-氨基环己基)-2-溴-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-甲酰胺、(Boc)2O(3.0g,13.8mmol)和Na2CO3(2.9g,27.6mmol)在水(50mL)和THF(150mL)的混合物溶液中的混合物在室温搅拌过夜。减压蒸发溶剂。将残余物以石油醚研磨,然后倾析并干燥得到3-(2-溴-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-甲酰氨基)环己基氨基甲酸叔丁酯(0.5g,产率72%,经两步),为白色固体,其不经进一步纯化用于后续步骤。MS:(M+H)+=438.1.
步骤3
3-(2-(6-氯-1-甲基-1H-吲唑-3-基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-甲酰氨基)环己基氨基甲酸叔丁酯
将6-氯-1-甲基-3-(三丁基甲锡烷基)-1H-吲唑(0.47g,1.03mmol)、3-(2-溴-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-甲酰氨基)环己基氨基甲酸叔丁酯(0.45g,1.03mmol)、CuI(0.07g,0.37mmol)和Pd(PPh3)4(0.07g,0.06mmol)在100mL的DMF中的混合物于80℃在氮气气氛下搅拌过夜。减压除去溶剂,且将残余物首先以制备型-HPLC(Gemini5u C18150×21.2mm;注射体积:3mL/注射,流速:20mL/分钟;波长:214nm和254nm;梯度条件为:50%乙腈/50%水(0.1%三氟乙酸,v/v)纯化,经9分钟以线性方式继续以85%乙腈/15%水(0.1%三氟乙酸,v/v)纯化得到3-(2-(6-氯-1-甲基-1H-吲唑-3-基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-甲酰氨基)环己基氨基甲酸叔丁酯(0.3g,56%),为黄色固体。MS:(M+H)+=542.2;1H NMR(300MHz,DMSO):δ9.13-9.07(m,1H),8.48-8.39(m,2H),8.13-8.01(m,2H),7.42-7.30(m,1H),5.20(s,3H),3.44-3.35(m,1H),2.30-2.05(m,1H),1.82-1.38(m,4H),1.32-1.17(m,13H)。
实施例443.
N-(1-(氨基甲基)环丙基)-2-(6-氟-1-甲基-1H-吲唑-3-基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-甲酰胺盐酸盐
步骤1
1-氨基环丙烷羧酸乙酯盐酸盐
将1-氨基环丙烷羧酸(5.8g,57.4mmol)在300mL的乙醇中的悬浮液冷却至0℃,经30分钟滴加亚硫酰氯(20.5g,172.7mmol)。然后移去冷浴并回流加热反应混合物2小时,然后将混合物在室温搅拌16小时。将溶剂于40℃减压蒸发,得到1-氨基环丙烷羧酸乙酯盐酸盐(9.53g,100%),为固体,其不经进一步纯化直接用于后续步骤。MS:(M+H)+=130.2;1H NMR(300MHz,DMSO):δ9.04(brs,3H),4.14(q,2H,J=6.9Hz),1.45(d,2H,J=3.3Hz),1.37(d,2H,J=3.2Hz),1.19(t,3H,J=6.9Hz)。
步骤2
1-(苄基氧基羰基氨基)环丙烷羧酸乙酯
将1-氨基环丙烷羧酸乙酯盐酸盐(9.5g,57.3mmol)在450mL的乙酸乙酯中的悬浮液冷却至0℃,缓慢地添加NaHCO3(39.5g,470.3mmol)在325mL的水中的溶液。然后滴加氯甲酸苄酯(13.3g,78.2mmol)。移去冷浴且将混合物在室温搅拌16小时。将有机相以1N HCl(100mL)、饱和NaHCO3溶液(100mL)、盐水(100mL)洗涤,并经无水硫酸钠干燥。将干燥试剂通过过滤除去并将滤液浓缩得到白色固体。将固体通过柱色谱(硅胶,200-300筛目,以乙酸乙酯和石油醚的混合物(1:3,v/v)洗脱)纯化得到1-(苄基氧基羰基氨基)环丙烷羧酸乙酯(13.7g,91%),为白色固体。MS:(M+H)+=286.1;1H NMR(300MHz,CDCl3):δ7.37-7.32(m,5H),5.13(s,2H),4.70(s,1H),4.13(brs,2H),1.59-1.53(m,2H),1.23-1.19(m,5H)。
步骤3
1-(羟基甲基)环丙基氨基甲酸苄酯
室温向1-(苄基氧基羰基氨基)环丙烷羧酸乙酯(8.7g,33.0mmol)在50mL的THF中的搅拌溶液慢地添加LiBH4(2.26g,103.76mmol)且将混合物在室温搅拌16小时。将反应混合物冷却至0℃并通过添加50%HOAc溶液(10mL)淬灭。将反应混合物在70mL的水和70mL的乙醚之间分配。将有机相以饱和NaHCO3水溶液(15mL)、盐水溶液(10mL)洗涤并经无水硫酸钠干燥。将干燥试剂通过过滤除去并于40℃减压蒸发滤液得到粗产物,其通过柱色谱(硅胶,200-300筛目,以石油醚和乙酸乙酯(1:1,v/v)的混合物洗脱)纯化得到1-(羟基甲基)环丙基氨基甲酸苄酯(6.36g,87.1%),为白色固体。MS:(M+H)+=222.1;1H NMR(300MHz,CDCl3):δ7.46-7.35(m,5H),5.38(brs,1H),5.19(s,2H),3.71(s,2H),0.96(s,4H)。
步骤4
甲磺酸(1-(苄基氧基羰基氨基)环丙基)甲酯
于0℃向1-(羟基甲基)环丙基氨基甲酸苄酯(4g,18.1mmol)在100mL的二氯甲烷中的搅拌溶液添加DIEA(3g,23.5mmol),接着缓慢添加MS:Cl(2.28g,19.9mmol)。于0℃搅拌溶液30分钟。将混合物在饱和NaHCO3水溶液(20mL)和盐水(15mL)之间分配,经无水硫酸钠干燥。将干燥试剂通过过滤除去并于40℃减压蒸发滤液得到粗产物,其通过柱色谱(硅胶,200-300筛目,以乙酸乙酯和石油醚(1:1,v/v)的混合物洗脱)纯化得到甲磺酸(1-(苄基氧基羰基氨基)环丙基)甲酯(5g,92.4%),为白色固体。MS:(M+H)+=394;MS:(M+H)+=394;1H NMR(300MHz,CDCl3):δ7.45-7.35(m,5H),5.38(s,1H),5.19(s,2H),4.34(s,2H),3.04(s,3H),1.07(d,4H,J=4.8Hz)。LCMS:300.1[M+H]+,322.1[M+Na]+.
步骤5
1-(叠氮基甲基)环丙基氨基甲酸苄酯
室温向甲磺酸(1-(苄基氧基羰基氨基)环丙基)甲酯的搅拌溶液(5g,16.7mmol)在100mL的DMF中的搅拌溶液以一份添加NaN3(3g,46.15mmol)。然后于70℃搅拌反应混合物16小时。将混合物倒入400mL的水中,以乙酸乙酯(600mL)萃取。将有机相以盐水(50mL)洗涤并经无水硫酸钠干燥。将干燥试剂通过过滤除去并于40℃减压蒸发滤液得到粗产物,为无色油状物,其不经进一步纯化用于后续步骤。MS:(M+H)+=247.2.
步骤6
[1-(叔丁氧基羰基氨基-甲基)-环丙基]-氨基甲酸苄酯
于室温向1-(叠氮基甲基)环丙基氨基甲酸苄酯(2.78g,11.3mmol)在40mL的THF和20mL的水中的搅拌溶液以一份添加PPh3(5.92g,22.6mmol)。然后将混合物在室温搅拌16小时。顺序添加(Boc)2O(3.75g,17.2mmol)和Et3N(2.3g,23mmol)且将最终混合物在室温再搅拌16小时。将混合物以200mL的乙酸乙酯稀释,以盐水(20mL)洗涤。将溶剂于40℃减压蒸发且将残余物溶解于EtOAc(50mL),通过盐水(20mL)洗涤,经Na2SO4干燥。粗白色固体不经进一步纯化用于后续步骤。MS:(M+Na)+=343.2.
步骤7
(1-氨基环丙基)甲基氨基甲酸叔丁酯
室温向[1-(叔丁氧基羰基氨基-甲基)-环丙基]-氨基甲酸苄酯(0.912g,2.85mmol)在120mL的甲醇中的搅拌溶液以一份添加10%Pd/炭(200mg)。然后将混合物通过鼓泡氢气脱气5分钟,然后在氢气气氛下于室温搅拌16小时。过滤混合物除去催化剂并于40℃减压蒸发滤液得到(1-氨基环丙基)甲基氨基甲酸叔丁酯(0.4g,75.4%),为无色油状物,其不经进一步纯化用于后续步骤中。MS:(M+H)+=187.2.
步骤8
(1-(2-(6-氟-1-甲基-1H-吲唑-3-基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-甲酰氨基)环丙基)甲基氨基甲酸叔丁酯
向2-(6-氟-1-甲基-1H-吲唑-3-基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-羧酸(0.10g,0.32mmol)、EDCI(0.123g,0.64mmol)、DMAP(0.122g,1mmol)和DIPEA(0.11g,0.90mmol)在6mL的DMF中的搅拌溶液以一份室温添加(1-氨基环丙基)甲基氨基甲酸叔丁酯(0.20g,1.07mmol)并搅拌16小时。将混合物倒入50mL的水中,并过滤。将滤饼以水洗涤,干燥且不经进一步纯化用于后续步骤。MS:(M+H)+=480.2.
步骤9
N-(1-(氨基甲基)环丙基)-2-(6-氟-1-甲基-1H-吲唑-3-基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-甲酰胺盐酸盐
将(1-(2-(6-氟-1-甲基-1H-吲唑-3-基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-甲酰氨基)环丙基)甲基氨基甲酸叔丁酯(95mg,0.20mmol)溶解于20mL的HCl(g)在二噁烷中的饱和溶液中,将溶液在室温搅拌3小时。将溶剂于40℃减压蒸发,且将残余物以乙酸乙酯(10mL)研磨,然后倾析并干燥得到N-(1-(氨基甲基)环丙基)-2-(6-氟-1-甲基-1H-吲唑-3-基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-甲酰胺盐酸盐(13mg,15.8%),为淡黄色固体。MS:(M+H)+=380.1;1H NMR(300MHz,CD3OD):δ9.18(s,1H),8.43-8.41(m,2H),7.45(d,1H,J=9.3Hz),7.19(s,1H),4.17(s,3H),3.32(s,2H),1.25(s,4H)。
实施例444.
N-叔丁基-2-(异喹啉-8-基)-5H-吡咯并[3,2-b]吡嗪-7-甲酰胺
步骤1
2-溴-N-叔丁基-5H-吡咯并[32-b]吡嗪-7-甲酰胺
将2-溴-5H-吡咯并[3,2-b]吡嗪-7-羧酸(0.2g,0.83mmol)、2-甲基丙烷-2-胺(66mg,0.91mmol)、EDCI(476mg,2.49mmol)和HOBt(112mg,0.83mmol)在无水二氯甲烷(20mL)中的混合物于室温搅拌16小时。将反应混合物浓缩至约一半体积且将所形成的沉淀通过过滤分离,将滤饼经二氯甲烷洗涤并干燥得到2-溴-N-叔丁基-5H-吡咯并[3,2-b]吡嗪-7-甲酰胺(103mg,42%),为黄色固体。LCMS:(M+H)+=297.
步骤2
N-叔丁基-2-(异喹啉-8-基)-5H-吡咯并[3,2-b]吡嗪-7-甲酰胺
于N2气氛下,将2-溴-N-叔丁基-5H-吡咯并[3,2-b]吡嗪-7-甲酰胺(0.1g,0.337mmol)、异喹啉-8-基硼酸(64mg,0.37mmol)、Pd2dba3(77mg,0.067mmol)、X-Phos(64mg,0.135mmol)和Na2CO3(107mg,1.01mmol)在二噁烷(20mL)和水(5mL)中的混合物加热至90℃且保持16小时。将反应混合物经浓缩,且将残余物首先以制备型-TLC(甲醇:二氯甲烷=1:10)得到N-叔丁基-2-(异喹啉-8-基)-5H-吡咯并[3,2-b]吡嗪-7-甲酰胺(76mg,66%),为白色固体。1HNMR(300MHz,CDCl3):δ11.77(s,1H),9.95(s,1H),8.89(s,1H),8.69(d,1H,J=5.7Hz),8.45(s,1H),8.41(s,1H),8.01-7.84(m,4H),1.46(s,9H)。LCMS:(M+H)+=346.
实施例445.
N-(1-羟基-2-甲基丙烷-2-基)-2-(6-甲基-1-(2-吗啉代乙基)-1H-吲唑-3-基)-5H-吡咯并[3,2-b]吡嗪-7-甲酰胺盐酸盐
步骤1
N-(1-(叔丁基二甲基甲硅烷基氧基)-2-甲基丙烷-2-基)-2-(6-甲基-1-(2-吗啉代乙基)-1H-吲唑-3-基)-5-三苯甲基-5H-吡咯并[3,2-b]吡嗪-7-甲酰胺
将N-(1-(叔丁基二甲基甲硅烷基氧基)-2-甲基丙烷-2-基)-2-(6-甲基-1H-吲唑-3-基)-5-三苯甲基-5H-吡咯并[3,2-b]吡嗪-7-甲酰胺(200mg,0.277mmol)、4-(2-氯乙基)吗啉盐酸盐(62mg,0.333mmol)和K2CO3(191mg,1.385mmol)在无水DMF(20mL)中的混合物加热至90℃且保持3小时。将反应混合物以乙酸乙酯(100mL)萃取,将有机相以水(3×10mL)和盐水(2×10mL)洗涤。将有机层经Na2SO4干燥,过滤并浓缩得到N-(1-(叔丁基二甲基甲硅烷基氧基)-2-甲基丙烷-2-基)-2-(6-甲基-1-(2-吗啉代乙基)-1H-吲唑-3-基)-5-三苯甲基-5H-吡咯并[3,2-b]吡嗪-7-甲酰胺(167mg,粗品),为黄色油状物。LCMS:(M+H)+=834.
步骤2
N-(1-羟基-2-甲基丙烷-2-基)-2-(6-甲基-1-(2-吗啉代乙基)-1H-吲唑-3-基)-5H-吡咯并[3,2-b]吡嗪-7-甲酰胺盐酸盐
向N-(1-(叔丁基二甲基甲硅烷基氧基)-2-甲基丙烷-2-基)-2-(6-甲基-1-(2-吗啉代乙基)-1H-吲唑-3-基)-5-三苯甲基-5H-吡咯并[3,2-b]吡嗪-7-甲酰胺(167mg,0.2mmol)在二噁烷(20mL)中的搅拌溶液鼓泡HCl气体直到饱和,然后在室温搅拌16小时。将反应混合物经浓缩,且将残余物以甲醇(1mL)研磨然后倾析并干燥得到N-(1-羟基-2-甲基丙烷-2-基)-2-(6-甲基-1-(2-吗啉代乙基)-1H-吲唑-3-基)-5H-吡咯并[3,2-b]吡嗪-7-甲酰胺盐酸盐(76mg,64%),为白色固体。LCMS:(M+H)+=478;1H NMR(300MHz,CD3OD):δ9.15(s,1H),8.49(d,1H,J=8.4Hz),8.29(s,1H),7.56(s,1H),7.22(d,1H,J=8.1Hz),5.00-4.96(m,2H),4.08-3.85(m,12H),2.59(s,3H),1.56(s,6H).
实施例446.
N-叔丁基-2-(5-(二氟甲氧基)-1-(3,4-二羟基丁基)-1H-吲唑-3-基)-5H-吡咯并[3,2-b]吡嗪-7-甲酰胺
步骤1
5-(叔丁基二甲基甲硅烷基氧基)-1H-吲唑
向1H-吲唑-5-醇(5.0g,37.3mol)和咪唑(12.7g,186.5mmol)在二氯甲烷(200mL)中的搅拌溶液添加叔丁基氯二甲基硅烷(16.8g,112mol)并室温搅拌混合物过夜。然后将反应混合物以盐水洗涤(3×50mL)并经Na2SO4干燥。将粗混合物通过柱色谱(硅胶,200-300筛目,EtOAc:石油醚=1:10,v/v)纯化得到5-(叔丁基二甲基甲硅烷基氧基)-1H-吲唑(9.5g,产率100%),为黄色油状物。MS:(M+H)+=249.2;1H NMR(300MHz,CDCl3):δ7.95(d,1H,J=1.2Hz),7.34(dt,1H,J=8.7,0.75Hz),7.12(s,1H),6.97(dd,1H,J=8.7,2.1Hz),1.01(s,9H),0.23(s,6H)。
步骤2
5-(叔丁基二甲基甲硅烷基氧基)-3-碘-1H-吲唑
于0℃向5-(叔丁基二甲基甲硅烷基氧基)-1H-吲唑(5.3g,0.02mol)在DMSO(50mL)的搅拌溶液添加KOH(3.36g,0.06mol),接着分份添加碘(10.2g,0.04mol)。将混合物在室温再搅拌10分钟,然后将反应混合物以10%Na2S2O3萃取并以水稀释。过滤混合物且将滤饼以水洗涤并干燥得到5-(叔丁基二甲基甲硅烷基氧基)-3-碘-1H-吲唑。将粗固体不经纯化用于后续步骤。MS:(M+H)+=375.
步骤3
5-(叔丁基二甲基甲硅烷基氧基)-3-碘-1H-吲唑-1-羧酸叔丁酯
向5-(叔丁基二甲基甲硅烷基氧基)-3-碘-1H-吲唑(粗品。0.02mol)在二氯甲烷(100mL)中的搅拌溶液添加Boc2O(4.75g,0.022mol),添加接着DMAP(0.48g,0.004mol)和Et3N(2.2g,0.022mol)。将混合物在室温搅拌1小时。减压除去溶剂。将残余物通过柱色谱在硅胶上以石油醚/EtOAc(6:1)洗脱纯化得到5-(叔丁基二甲基甲硅烷基氧基)-3-碘-1H-吲唑-1-羧酸叔丁酯(7.8g,82%经两步),为淡黄色固体。1H NMR(300MHz,CDCl3):δ7.96(d,1H,J=9.0Hz),7.12(dd,1H,J=9,2.4Hz),6.84(d,1H,J=2.4Hz),1.71(s,9H),1.02(s,9H),0.23(s,6H).
步骤4
5-羟基-3-碘-1H-吲唑-1-羧酸叔丁酯
向5-(叔丁基二甲基甲硅烷基氧基)-3-碘-1H-吲唑-1-羧酸叔丁酯(1g,2.11mmol)在THF(10mL)的搅拌溶液中添加在THF(5mL)中的TBAF(5.6g,21.1mmol)。将混合物在室温搅拌0.5小时。减压除去溶剂。将残余物以水稀释并以EtOAc萃取(3×10mL)。将合并的有机层以盐水洗涤,并经Na2SO4干燥。过滤和浓缩后,粗产物不经纯化用于后续步骤。LCMS:361[M+H]+.
步骤5
5-(二氟甲氧基)-3-碘-1H-吲唑-1-羧酸叔丁酯
将溴二氟甲基磷酸二乙酯(1.13g,4.22mmol)以一份添加至冷却(-30℃)的5-羟基-3-碘-1H-吲唑-1-羧酸叔丁酯和KOH(2.36g,42.2mmol)在MeCN/H2O(20mL/20mL)中的溶液。将反应混合物温热至室温。20分钟后,将反应混合物以EtOAc(15mL)洗涤,且分离有机相。将水相以EtOAc(10mL)萃取。将合并的有机层经Na2SO4干燥。蒸发溶剂得到粗产物,通过柱色谱在硅胶上以石油醚/EtOAc(5:1)洗脱纯化得到5-(二氟甲氧基)-3-碘-1H-吲唑-1-羧酸叔丁酯(0.41g,47%经两步),为白色固体。1H NMR(300MHz,CDCl3):δ8.13(d,1H,J=9.0Hz),7.39(dd,1H,J=9,2.4Hz),7.23(d,1H,J=2.4Hz),6.57(t,1H,J=73.2Hz),1.73(s,9H)。
步骤6
5-(二氟甲氧基)-3-碘-1H-吲唑
于室温向5-(二氟甲氧基)-3-碘-1H-吲唑-1-羧酸叔丁酯(410mg,1mmol)在二氯甲烷(10mL)中的的搅拌溶液滴加三氟乙酸(5mL)且搅拌反应混合物1小时。将混合物以NaHCO3水溶液洗涤,然后将有机物经Na2SO4干燥。过滤和浓缩后,得到5-(二氟甲氧基)-3-碘-1H-吲唑(300mg,97%),为白色固体,不经进一步纯化用于后续步骤。MS:(M+H)+=311.
步骤7
2-溴-N-叔丁基-5-三苯甲基-5H-吡咯并[3,2-b]吡嗪-7-甲酰胺
向2-溴-N-叔丁基-5H-吡咯并[3,2-b]吡嗪-7-甲酰胺和(氯甲烷三基)三苯(1.55g,5.56mmol)在DMF(10mL)中的搅拌溶液添加三乙胺(0.56g,5.56mmol)。将混合物在室温搅拌16小时。将混合物倒入水中并以EtOAc萃取(3×15mL)。将合并的有机层以盐水洗涤,并经Na2SO4干燥。过滤和浓缩后。将残余物通过柱色谱在硅胶上以石油醚/EtOAc(10:1)洗脱纯化得到2-溴-N-叔丁基-5-三苯甲基-5H-吡咯并[3,2-b]吡嗪-7-甲酰胺(1.1g,73%),为淡黄色固体。1H NMR(300MHz,DMSO):δ8.30(s,1H),8.00(s,1H),7.70(s,1H),7.38-7.25(m,10H),7.19-7.15(m5H),1.27(s,9H).
步骤8
5-(二氟甲氧基)-3-(三丁基甲锡烷基)-1H-吲唑
在烧瓶中,将5-(二氟甲氧基)-3-碘-1H-吲唑(1.2g,2.93mmol)溶解于THF(30mL)。将溶液冷却至-25℃。于-25℃滴加异丙基氯化镁(8.8mL,8.8mmol,1M在THF中。于-25℃搅拌反应混合物20分钟。然后缓慢地添加氯三丁基锡(1.6mL,5.86mmol)。将反应混合物温热至室温并搅拌1.5小时。将反应混合物以NH4Cl饱和溶液萃取,然后以EtOAc萃取(3×20mL),将有机物以水(10mL)、盐水(2×10mL)洗涤并经Na2SO4干燥并浓缩。将残余物通过柱色谱在硅胶上以石油醚/EtOAc(8:1)洗脱纯化得到5-(二氟甲氧基)-3-(三丁基甲锡烷基)-1H-吲唑(1.1g,79%),为油状物。1H NMR(300MHz,CDCl3):δ7.52-7.46(m,2H),7.19(d,1H,J=7.9Hz),6.51(t,1H,J=88.6Hz),1.68-1.57(m,6H),1.45-1.14(m,12H),0.93-0.84(m,9H).
步骤9
N-叔丁基-2-(5-(二氟甲氧基)-1H-吲唑-3-基)-5-三苯甲基-5H-吡咯并[3,2-b]吡嗪-7-甲酰胺
在圆底烧瓶中,在氮气下将2-溴-N-叔丁基-5-三苯甲基-5H-吡咯并[3,2-b]吡嗪-7-甲酰胺(530mg,1mmol)和5-(二氟甲氧基)-3-(三丁基甲锡烷基)-1H-吲唑(470mg,1mmol)溶解于DMF(10mL)。添加Pd(PPh3)4(58mg,0.05mmol)和CuI(38mg,0.2mmol),且以鼓泡氮气超声混合物5分钟。于80℃搅拌反应混合物4小时。将浓缩的混合物通过柱色谱在硅胶上以石油醚/EtOAc(3:1to1:1,v/v)洗脱纯化得到N-叔丁基-2-(5-(二氟甲氧基)-1H-吲唑-3-基)-5-三苯甲基-5H-吡咯并[3,2-b]吡嗪-7-甲酰胺(410mg,64%),为固体。MS:(M+H)+=643.2;1H NMR(300MHz,CDCl3):δ8.85(d,1H,J=2.4Hz),8.35(s,1H),8.26(s,1H),8.13(s,1H,),7.52-7.48(m,1H),6.51(t,1H,J=74.0Hz),1.60(s,9H)。
步骤10
甲磺酸2-(2,2-二甲基-1,3-二氧杂环戊烷-4-基)乙酯
于0℃向2-(2,2-二甲基-1,3-二氧杂环戊烷-4-基)乙醇(292mg,2.00mmol)在10mL的二氯甲烷的搅拌溶液添加DIEA(284mg,2.20mmol),接着缓慢添加MS:Cl(252mg,2.20mmol)。然后于0℃搅拌反应混合物30分钟。将反应混合物以饱和碳酸氢钠溶液(3mL)淬灭,将有机相经无水硫酸钠干燥。将干燥试剂通过过滤除去并于40℃减压蒸发滤液,得到甲磺酸2-(2,2-二甲基-1,3-二氧杂环戊烷-4-基)乙酯(360mg,80.20%),为无色油状物。其不经进一步纯化直接用于后续步骤。1H NMR(300MHz,CDCl3):δ4.40-4.36(m,2H),4.34-4.23(m,1H),4.20-4.19(m,1H),4.12-4.08(m,1H),3.032(s,3H),2.00-1.99(m,2H),1.41(s,3H),1.35(s,3H)。
步骤11
N-叔丁基-2-(5-(二氟甲氧基)-1-(2-(2,2-二甲基-1,3-二氧杂环戊烷-4-基)乙基)-1H-吲唑-3-基)-5-三苯甲基-5H-吡咯并[3,2-b]吡嗪-7-甲酰胺
向N-叔丁基-2-(5-(二氟甲氧基)-1H-吲唑-3-基)-5-三苯甲基-5H-吡咯并[3,2-b]吡嗪-7-甲酰胺(100mg,0.156mmol)在DMF(5mL)中的溶液中添加甲磺酸2-(2,2-二甲基-1,3-二氧杂环戊烷-4-基)乙酯(42mg,0.187mmol),接着添加K2CO3(65mg,0.468mmol)。将混合物在65℃加热2小时。冷却至室温后,将混合物倒入水中,过滤,将滤饼以水洗涤并干燥得到N-叔丁基-2-(5-(二氟甲氧基)-1-(2-(2,2-二甲基-1,3-二氧杂环戊烷-4-基)乙基)-1H-吲唑-3-基)-5-三苯甲基-5H-吡咯并[3,2-b]吡嗪-7-甲酰胺。粗产物不经纯化用于后续步骤。MS:(M+H)+=771.0.
步骤12
N-叔丁基-2-(5-(二氟甲氧基)-1-(3,4-二羟基丁基)-1H-吲唑-3-基)-5H-吡咯并[3,2-b]吡嗪-7-甲酰胺
于室温向N-叔丁基-2-(5-(二氟甲氧基)-1-(2-(2,2-二甲基-1,3-二氧杂环戊烷-4-基)乙基)-1H-吲唑-3-基)-5-三苯甲基-5H-吡咯并[3,2-b]吡嗪-7-甲酰胺在二氯甲烷(2mL)中的搅拌溶液滴加三氟乙酸(1mL)并搅拌反应混合物2小时。减压除去溶剂,且将残余物首先以制备型-HPLC(Gemini5u C18150×21.2mm;注射体积:3mL/注射,流速:20mL/分钟;波长:214nm和254nm;梯度条件为:38%乙腈/62%水(0.1%三氟乙酸,v/v)纯化,经9分钟以线性方式继续以46%乙腈/54%水(0.1%三氟乙酸,v/v)纯化得到N-叔丁基-2-(5-(二氟甲氧基)-1-(3,4-二羟基丁基)-1H-吲唑-3-基)-5H-吡咯并[3,2-b]吡嗪-7-甲酰胺(30mg,39%经两步),为白色固体。MS:(M+H)+=489.1;1H NMR(300MHz,DMSO):δ12.85(s,1H),9.11(s,1H),8.42(d,1H,J=3.0Hz),8.24(d,1H,J=1.2Hz),7.92-7.88(m,2H),7.45(t,1H,J=9.2Hz),7.23(t,1H,J=74.4Hz),4.67-4.64(m,2H),3.48-3.26(m,4H),2.16-2.10(m,4H),1.86-1.83(m,4H),1.54(s,9H).
实施例447.
N-叔丁基-2-(5-(二氟甲氧基)-1-(3-羟基丁基)-1H-吲唑-3-基)-5H-吡咯并[3,2-b]吡嗪-7-甲酰胺
步骤1
4-氯丁烷-2-酮
经10分钟,向4-羟基丁烷-2-酮(1.0g,11.36mmol)和NaHCO3(2.8g,33.3mmol)在二氯甲烷(100mL)(浸没在冰-水浴中)中的悬浮液滴加SOCl2(2.7g,22.8mmol)在二氯甲烷(5mL)中的溶液。将所得混合物室温再搅拌5小时。将混合物转移至分液漏斗,以盐水洗涤(2×30mL),经Na2SO4干燥并浓缩,粗产物(1.0g)不经进一步纯化即可在下一步中使用,为黄色油状物。1H NMR(300MHz,CDCl3):δ3.72(t,2H,J=6.6Hz),2.90(t,2H,J=6.5Hz),2.19(s,3H)。
步骤2
N-叔丁基-2-(5-(二氟甲氧基)-1-(3-氧代丁基)-1H-吲唑-3-基)-5-三苯甲基-5H-吡咯并[3,2-b]吡嗪-7-甲酰胺
向N-叔丁基-2-(5-(二氟甲氧基)-1H-吲唑-3-基)-5-三苯甲基-5H-吡咯并[3,2-b]吡嗪-7-甲酰胺(100mg,0.156mmol)在DMF(4mL)中的溶液添加4-氯丁烷-2-酮(20mg,0.187mmol),接着添加K2CO3(65mg,0.468mmol)。将混合物在65℃加热1.5小时。冷却至室温后,将混合物倒入水中,过滤并干燥得到N-叔丁基-2-(5-(二氟甲氧基)-1-(3-氧代丁基)-1H-吲唑-3-基)-5-三苯甲基-5H-吡咯并[3,2-b]吡嗪-7-甲酰胺。粗产物不经纯化用于后续步骤。MS:(M+H)+=713.
步骤3
N-叔丁基-2-(5-(二氟甲氧基)-1-(3-羟基丁基)-1H-吲唑-3-基)-5-三苯甲基-5H-吡咯并[3,2-b]吡嗪-7-甲酰胺
于0℃向N-叔丁基-2-(5-(二氟甲氧基)-1-(3-氧代丁基)-1H-吲唑-3-基)-5-三苯甲基-5H-吡咯并[3,2-b]吡嗪-7-甲酰胺(0.156mmol)在MeOH(5mL)中的溶液添加NaBH4(30mg,0.78mmol)。将混合物在室温温热并搅拌1小时。将NH4Cl水溶液添加至混合物且将产物以EtOAc萃取(3×10mL)。将合并的有机层以盐水洗涤,并经Na2SO4干燥。过滤和浓缩后,粗产物不经纯化用于后续步骤。MS:(M+H)+=715.
步骤4
N-叔丁基-2-(5-(二氟甲氧基)-1-(3-羟基丁基)-1H-吲唑-3-基)-5H-吡咯并[3,2-b]吡嗪-7-甲酰胺
于室温向N-叔丁基-2-(5-(二氟甲氧基)-1-(3-羟基丁基)-1H-吲唑-3-基)-5-三苯甲基-5H-吡咯并[3,2-b]吡嗪-7-甲酰胺在二氯甲烷(2mL)的搅拌溶液滴加三氟乙酸(1mL)。然后,搅拌反应混合物1.5小时。减压除去溶剂,且将残余物首先以制备型-TLC(硅胶,石油醚:EtOAc=1:1)得到N-叔丁基-2-(5-(二氟甲氧基)-1-(3-羟基丁基)-1H-吲唑-3-基)-5H-吡咯并[3,2-b]吡嗪-7-甲酰胺(22mg,30%经三步),为白色固体。MS:(M+H)+=473.2;1H NMR(300MHz,DMSO):δ12.86(s,1H),9.11(s,1H),8.42(s,1H),8.24(d,1H,J=1.8Hz),7.92-7.89(m,2H),7.47-7.42(m,1H),7.23(t,1H,J=74.4Hz),4.75-4.61(m,3H),3.65(brs,1H),2.06-1.92(m,2H),1.53(s,9H),1.15(d,3H,J=6.3Hz)。
实施例448.
N-叔丁基-2-(5-(二氟甲氧基)-1-(3-(甲基磺酰基)丙基)-1H-吲唑-3-基)-5H-吡咯并[3,2-b]吡嗪-7-甲酰胺
步骤1
N-叔丁基-2-(5-(二氟甲氧基)-1-(3-(甲基磺酰基)丙基)-1H-吲唑-3-基)-5-三苯甲基-5H-吡咯并[3,2-b]吡嗪-7-甲酰胺
向N-叔丁基-2-(5-(二氟甲氧基)-1H-吲唑-3-基)-5-三苯甲基-5H-吡咯并[3,2-b]吡嗪-7-甲酰胺(100mg,0.156mmol)在DMF(5mL)中的溶液添加1-氯-3-(甲基磺酰基)丙烷(30mg,0.187mmol),接着添加K2CO3(65mg,0.468mmol)。将混合物在65℃加热3小时。冷却至室温后,将混合物倒入水中,过滤并干燥得到N-叔丁基-2-(5-(二氟甲氧基)-1-(3-(甲基磺酰基)丙基)-1H-吲唑-3-基)-5-三苯甲基-5H-吡咯并[3,2-b]吡嗪-7-甲酰胺(105mg,88%)。粗产物不经纯化用于后续步骤。MS:(M+H)+=763.
步骤2
N-叔丁基-2-(5-(二氟甲氧基)-1-(3-(甲基磺酰基)丙基)-1H-吲唑-3-基)-5H-吡咯并[3,2-b]吡嗪-7-甲酰胺
于室温向N-叔丁基-2-(5-(二氟甲氧基)-1-(3-(甲基磺酰基)丙基)-1H-吲唑-3-基)-5-三苯甲基-5H-吡咯并[3,2-b]吡嗪-7-甲酰胺(105mg,0.138mmol)在二氯甲烷(4mL)中的搅拌溶液滴加三氟乙酸(2mL),并搅拌反应混合物2小时。减压除去溶剂,且将残余物首先以制备型-TLC(硅胶,EtOAc为洗脱液)得到N-叔丁基-2-(5-(二氟甲氧基)-1-(3-(甲基磺酰基)丙基)-1H-吲唑-3-基)-5H-吡咯并[3,2-b]吡嗪-7-甲酰胺(50mg,72%),为白色固体。MS:(M+H)+=521.1;1HNMR(300MHz,DMSO):δ12.85(brs,1H),9.13(s,1H),8.42(s,1H),8.25(s,1H),7.93(t,1H,J=7.8Hz),7.47(d,1H,J=9.0Hz),7.24(s,1H),4.72(d,2H,J=6.6Hz),3.28-3.18(m,2H),3.02(s,3H),2.40-2.38(m,2H),1.53(s,9H)。
实施例449.
2-(5-(4-氨基-4-甲基戊基氧基)-1-甲基-1H-吲唑-3-基)-N-叔丁基-5H-吡咯并[3,2-b]吡嗪-7-甲酰胺2,2,2-三氟乙酸盐
步骤1
5-(叔丁基二甲基甲硅烷基氧基)-1-甲基-3-(三丁基甲锡烷基)-1H-吲唑
在氮气下将5-(叔丁基二甲基甲硅烷基氧基)-3-碘-1-甲基-1H-吲唑(3.8g,10mmol)在30mL的无水THF中的溶液冷却至-20℃,添加异丙基氯化镁(6mL,12mmol,2M在THF中的溶液)并于-20℃搅拌15分钟。添加三丁基氯甲锡烷(12mL,14mmol)且将反应混合物温热至室温并搅拌1小时。将混合物以氯化铵的饱和溶液淬灭,以乙酸乙酯萃取(3×50mL),经硫酸钠干燥且浓缩得到5-(叔丁基二甲基甲硅烷基氧基)-1-甲基-3-(三丁基甲锡烷基)-1H-吲唑(5.2g,粗品)为无色油状物,其不经进一步纯化直接用于后续步骤。
步骤2
2-(5-(叔丁基二甲基甲硅烷基氧基)-1-甲基-1H-吲唑-3-基)-5-三苯甲基-5H-吡咯并[3,2-b]吡嗪-7-羧酸甲酯
在氮气下将5-(叔丁基二甲基甲硅烷基氧基)-1-甲基-3-(三丁基甲锡烷基)-1H-吲唑(5.2g,来自上一步的粗品)、2-溴-5-三苯甲基-5H-吡咯并[3,2-b]吡嗪-7-羧酸甲酯(5.6g,11.3mmol)、四(三苯基膦)钯(0)(300mg,0.26mmol)、碘化铜(260mg,1.36mmol)在40mL的无水DMF中的混合物加热至90℃且保持3小时。将反应混合物冷却至室温,以50mL的水稀释,以乙酸乙酯萃取(3×50mL),将有机层经Na2SO4干燥,过滤并浓缩。将残余物以乙醚研磨(5mL),然后倾析并干燥得到2-(5-(叔丁基二甲基甲硅烷基氧基)-1-甲基-1H-吲唑-3-基)-5-三苯甲基-5H-吡咯并[3,2-b]吡嗪-7-羧酸甲酯(3.4g,52%)。LCMS:(M+H)+=680;(M+Na)+=702.
步骤3
2-(5-羟基-1-甲基-1H-吲唑-3-基)-5-三苯甲基-5H-吡咯并[3,2-b]吡嗪-7-羧酸甲酯
于0℃向2-(5-(叔丁基二甲基甲硅烷基氧基)-1-甲基-1H-吲唑-3-基)-5-三苯甲基-5H-吡咯并[3,2-b]吡嗪-7-羧酸甲酯(3.4g,4.9mmol)在THF(25mL)中的溶液添加TBAF(6.42mL,12.85mmol),添加完成后,将反应混合物温热至室温并搅拌0.5小时,然后将H2O(25mL)添加至混合物,以EtOAc(100mL)萃取,将有机层以H2O(100mL)、盐水(100mL)洗涤,经Na2SO4干燥,过滤并减压浓缩得到2-(5-羟基-1-甲基-1H-吲唑-3-基)-5-三苯甲基-5H-吡咯并[3,2-b]吡嗪-7-羧酸甲酯(3.2g,>100%),为黄色固体。LCMS:(M+H)+=566;(M+Na)+=588.
步骤4
2-(1-甲基-5-(4-甲基-4-硝基戊基氧基)-1H-吲唑-3-基)-5-三苯甲基-5H-吡咯并[3,2-b]吡嗪-7-羧酸甲酯
向2-(5-羟基-1-甲基-1H-吲唑-3-基)-5-三苯甲基-5H-吡咯并[3,2-b]吡嗪-7-羧酸甲酯(2.2g,3.9mmol)在DMF(25mL)中的溶液添加K2CO3(1.8g,12.8mmol)和1-氯-4-甲基-4-硝基戊烷(1.0g,5.9mmol),在添加后,将反应混合物搅拌加热至100℃且保持4小时。将反应混合物冷却至室温,添加H2O(25mL),将产物以EtOAc(100mL)萃取。将有机层以H2O(100mL)和盐水(100mL)洗涤,经Na2SO4干燥并减压浓缩得到2-(1-甲基-5-(4-甲基-4-硝基戊基氧基)-1H-吲唑-3-基)-5-三苯甲基-5H-吡咯并[3,2-b]吡嗪-7-羧酸甲酯(1.8g,66.7%),为黄色固体。LCMS:(M+H)+=695.
步骤5
2-(5-(4-氨基-4-甲基戊基氧基)-1-甲基-1H-吲唑-3-基)-5-三苯甲基-5H-吡咯并[3,2-b]吡嗪-7-羧酸甲酯
向2-(1-甲基-5-(4-甲基-4-硝基戊基氧基)-1H-吲唑-3-基)-5-三苯甲基-5H-吡咯并[3,2-b]吡嗪-7-羧酸甲酯(500mg,0.72mmol)在CH3OH(15mL)中的溶液添加Pd/C(0.1g,催化)和HCO2NH4(226mg,3.6mmol),在添加后,将反应混合物搅拌加热至80℃且保持0.5小时,然后过滤混合物且将滤液蒸发,在H2O(25mL)和EtOAc(100mL)之间分配。将有机层以H2O(100mL)、盐水(100mL)洗涤,经Na2SO4干燥,过滤并减压浓缩得到2-(5-(4-氨基-4-甲基戊基氧基)-1-甲基-1H-吲唑-3-基)-5-三苯甲基-5H-吡咯并[3,2-b]吡嗪-7-羧酸甲酯(400mg,85%),为黄色固体。LCMS:(M+H)+=665.
步骤6
2-(5-(4-氨基-4-甲基戊基氧基)-1-甲基-1H-吲唑-3-基)-5-三苯甲基-5H-吡咯并[3,2-b]吡嗪-7-羧酸
将2-(5-(4-氨基-4-甲基戊基氧基)-1-甲基-1H-吲唑-3-基)-5-三苯甲基-5H-吡咯并[3,2-b]吡嗪-7-羧酸甲酯(100mg,0.15mmol)、氢氧化钾(280mg,5mmol)在2.5mL的水和5mL的1,4-二噁烷中的混合物加热至回流90分钟。将反应混合物冷却至室温,蒸发溶剂。将残余物以H2O(25mL)稀释且将混合物以1NHCl酸化至pH=7。将残余物以EtOAc(100mL)萃取。将有机层以H2O(100mL)、盐水(100mL)洗涤,经Na2SO4干燥并减压浓缩得到2-(5-(4-氨基-4-甲基戊基氧基)-1-甲基-1H-吲唑-3-基)-5-三苯甲基-5H-吡咯并[3,2-b]吡嗪-7-羧酸,为黄色固体(100mg,>100%),其不经进一步纯化用于后续步骤。LCMS:(M+H)+=651.
步骤7
2-(5-(4-氨基-4-甲基戊基氧基)-1-甲基-1H-吲唑-3-基)-N-叔丁基-5-三苯甲基-5H-吡咯并[3,2-b]吡嗪-7-甲酰胺
将2-(5-(4-氨基-4-甲基戊基氧基)-1-甲基-1H-吲唑-3-基)-5-三苯甲基-5H-吡咯并[3,2-b]吡嗪-7-羧酸(100mg,0.15mmol)、叔丁基胺(0.05mL,0.45mmol)和HATU(68.4mg,0.18mmol)在10mL的无水THF中的混合物室温搅拌4小时。将反应混合物蒸发至干燥。将残余物悬浮于50mL的0.5N HCl,且将产物以乙酸乙酯萃取(3×50mL)。将合并的有机层经Na2SO4干燥,过滤并浓缩得到2-(5-(4-氨基-4-甲基戊基氧基)-1-甲基-1H-吲唑-3-基)-N-叔丁基-5-三苯甲基-5H-吡咯并[3,2-b]吡嗪-7-甲酰胺(88mg,62%),为深色油状物,物质不经进一步纯化用于后续步骤。LCMS:(M+H)+=706.
步骤8
2-(5-(4-氨基-4-甲基戊基氧基)-1-甲基-1H-吲唑-3-基)-N-叔丁基-5H-吡咯并[3,2-b]吡嗪-7-甲酰胺2,2,2-三氟乙酸盐
向2-(5-(4-氨基-4-甲基戊基氧基)-1-甲基-1H-吲唑-3-基)-N-叔丁基-5-三苯甲基-5H-吡咯并[3,2-b]吡嗪-7-甲酰胺(88mg,0.12mmol)在3mL的二氯甲烷中的溶液添加三氟乙酸(3mL)。于25℃搅拌反应混合物过夜。蒸发溶剂后。将残余物首先以制备型-HPLC(Gemini5u C18150×21.2mm;注射体积:3mL/注射,流速:20mL/分钟;波长:214nm和254nm;梯度条件为:40%乙腈/60%水(0.1%三氟乙酸V/V)纯化,然后在仅9分钟后以线性方式继续以50%乙腈/50%水(0.1%三氟乙酸V/V)纯化得到2-(5-(4-氨基-4-甲基戊基氧基)-1-甲基-1H-吲唑-3-基)-N-叔丁基-5H-吡咯并[3,2-b]吡嗪-7-甲酰胺2,2,2-三氟乙酸盐,为黄色固体(9mg,13%)。LCMS:(M+H)+=464;1H NMR(300MHz,CD3OD):δ9.01(s,1H),8.26(s,1H),7.85(s,1H),7.56(d,1H,J=9.0Hz),7.24(dd,1H,J1=9.0Hz,J2=2.4Hz),4.15-4.12(m,5H),1.87-1.84(m,4H),1.59(s,9H),1.27(s,6H).
实施例450.
2-(5-(二氟甲氧基)-1-甲基-1H-吲唑-3-基)-N-异丙基-5H-吡咯并[3,2-b]吡嗪-7-甲酰胺
步骤1
2-溴-N-异丙基-5H-吡咯并[3,2-b]吡嗪-7-甲酰胺
将2-溴-5H-吡咯并[3,2-b]吡嗪-7-羧酸(250mg,1.03mmol)、丙烷-2-胺(0.15mL,1.5mmol)和HATU(456mg,1.2mmol)在20mL的无水THF中的混合物搅拌4小时。将反应混合物蒸发至干燥。将残余物悬浮于20mL的0.5N HCl,将产物以乙酸乙酯萃取(3×50mL),将合并的有机物以硫酸钠干燥并浓缩。将残余物通过柱色谱(硅胶.200-300筛目,以乙酸乙酯/石油醚=2:1洗脱)纯化得到2-溴-N-异丙基-5H-吡咯并[3,2-b]吡嗪-7-甲酰胺(180mg,62%)。1H NMR(300MHz,DMSO):δ12.95(s,1H),8.49(s,1H),8.43(s,1H),7.59-7.56(m,1H),4.13-4.06(m,1H),1.24-1.20(m,6H)。LCMS:(M+H)+=283/285.
步骤2
2-(5-(二氟甲氧基)-1-甲基-1H-吲唑-3-基)-N-异丙基-5H-吡咯并[3,2-b]吡嗪-7-甲酰胺
向3-(5-(二氟甲氧基)-3-(三丁基甲锡烷基)-1H-吲唑-1-基)-N,N-二甲基丙烷-1-胺(200mg,0.36mmol)和2-溴-N-异丙基-5H-吡咯并[3,2-b]吡嗪-7-甲酰胺(180mg,0.43mmol)在DMF(10mL)的溶液中添加CuI(18mg,0.08mmol)和Pd(PPh3)4(14mg,0.014mmol)。然后将反应混合物通过鼓泡氮气脱气3分钟并重填以氮气。将混合物在氮气下加热至80℃且保持5小时,冷却至室温后,添加水(50mL)且将产物以EtOAc萃取(3×40mL),将合并的有机层经Na2SO4干燥,减压浓缩且将残余物首先以制备型-HPLC(Gemini5u C18150×21.2mm;注射体积:3mL/注射,流速:20mL/分钟;波长:214nm和254nm;梯度条件为:40%乙腈/60%水(0.1%三氟乙酸V/V)纯化,然后在仅9分钟后以线性方式继续以50%乙腈/50%水(0.1%三氟乙酸V/V)纯化得到2-(5-(二氟甲氧基)-1-甲基-1H-吲唑-3-基)-N-异丙基-5H-吡咯并[3,2-b]吡嗪-7-甲酰胺,为黄色固体(13mg,9%)。LCMS:(M+H)+=472;1H NMR(300MHz,CD3OD):δ9.11(s,1H),8.24(s,1H),8.11(s,1H),7.69(d,1H,J=9.0Hz),7.38(d,1H,J=8.7Hz),6.85(t,1H,J=74.1Hz),4.85-4.78(m,2H),4.65-4.60(m,1H),3.34-3.32(m,2H),2.89(s,6H),2.50-2.40(m,2H),1.43(s,3H),1.40(s,3H).
实施例451.
N-叔丁基-2-(1-甲基-1H-吲唑-4-基)-5H-吡咯并[3,2-b]吡嗪-7-甲酰胺盐酸盐
步骤1
2-溴-N-叔丁基-5-三苯甲基-5H-吡咯并[3,2-b]吡嗪-7-甲酰胺
将2-溴-N-叔丁基-5H-吡咯并[3,2-b]吡嗪-7-甲酰胺(378mg,1.272mmol),(氯甲烷三基)三苯(426mg,1.53mmol)和三乙胺(193mg,1.91mmol)在无水DMF(20mL)中的混合物加热至90℃且保持16小时。将反应混合物以乙酸乙酯(100mL)萃取,将有机相以水(3×10mL)和盐水(2×10mL)洗涤,经Na2SO4干燥,过滤并浓缩。将残余物通过柱色谱(硅胶,200-300筛目,以EtOAc:石油醚=1:15洗脱)纯化得到2-溴-N-叔丁基-5-三苯甲基-5H-吡咯并[3,2-b]吡嗪-7-甲酰胺(515mg,75%),为白色固体。1H NMR(300MHz,CDCl3):δ8.29(s,1H),8.01(s,1H),7.29-7.26(m,10H),7.13-7.11(m,5H),1.51(s,9H)。LCMS:(M+H)+=539.
步骤2
N-叔丁基-2-(1H-吲唑-4-基)-5-三苯甲基-5H-吡咯并[3,2-b]吡嗪-7-甲酰胺
将2-溴-N-叔丁基-5-三苯甲基-5H-吡咯并[3,2-b]吡嗪-7-甲酰胺(0.5g,0.928mmol)、1H-吲唑-4-基硼酸(165mg,1.02mmol)、Pd(PPh3)4(214mg,0.186mmol)、X-Phos(177mg,0.371mmol)和Na2CO3(295mg,2.78mmol)在二噁烷(20mL)和水(5mL)中的混合物在N2气氛下加热至100℃且保持16小时。将反应混合物经浓缩,且将残余物首先以制备型-TLC(以甲醇:二氯甲烷=1:100洗脱)得到N-叔丁基-2-(异喹啉-8-基)-5H-吡咯并[3,2-b]吡嗪-7-甲酰胺(375mg,70%),为黄色固体。1H NMR(300MHz,CDCl3):δ10.37(s,1H),8.61(s,1H),8.60(s,1H),8.54(s,1H),8.36(s,1H),7.55-7.49(m,3H),7.30-7.26(m,9H),7.22-7.18(m,6H),1.53(s,9H)。LCMS:(M+H)+=577.
步骤3
N-叔丁基-2-(1-甲基-1H-吲唑-4-基)-5-三苯甲基-5H-吡咯并[3,2-b]吡嗪-7-甲酰胺
在0℃向N-叔丁基-2-(1H-吲唑-4-基)-5-三苯甲基-5H-吡咯并[3,2-b]吡嗪-7-甲酰胺(375mg,0.65mmol)在无水THF(20mL)中的溶液添加2-甲基丙烷-2-醇钾(109mg,0.975mmol)。搅拌30分钟后,在0℃添加碘甲烷(138mg,0.975mmol)。然后将其温热至室温并搅拌1小时。将反应混合物通过添加水(2mL)淬灭,以乙酸乙酯(100mL)萃取,然后将有机相以水(3×10mL)和盐水(2×10mL)洗涤。将有机层经Na2SO4干燥,过滤并浓缩。将残余物通过柱色谱纯化(硅胶,200-300筛目,以EtOAc:石油醚=1:3洗脱)得到N-叔丁基-2-(1-甲基-1H-吲唑-4-基)-5-三苯甲基-5H-吡咯并[3,2-b]吡嗪-7-甲酰胺(154mg,40%),为白色固体。LCMS:(M+H)+=591;1H NMR(300MHz,CDCl3):δ8.54(s,1H),8.50(s,1H),8.40(s,1H),8.35(s,1H),7.53-7.47(m,3H),7.32-7.27(m,9H),7.24-7.19(m,6H),4.14(s,3H),1.52(s,9H)。
步骤4
N-叔丁基-2-(1-甲基-1H-吲唑-4-基)-5H-吡咯并[3,2-b]吡嗪-7-甲酰胺盐酸盐
向N-叔丁基-2-(1-甲基-1H-吲唑-4-基)-5-三苯甲基-5H-吡咯并[3,2-b]吡嗪-7-甲酰胺(154mg,0.261mmol)在二噁烷(20mL)中的搅拌溶液鼓泡HCl气体直到饱和,然后在室温搅拌4小时。将反应混合物经浓缩,且将残余物以甲醇(1mL)研磨然后倾析并干燥得到N-叔丁基-2-(1-甲基-1H-吲唑-4-基)-5H-吡咯并[3,2-b]吡嗪-7-甲酰胺盐酸盐(38mg,38%),为白色固体。LCMS:(M+H)+=349;1H NMR(300MHz,CDCl3):δ9.77(s,1H),8.89(s,1H),8.54(s,1H),8.39(s,2H),7.66-7.52(m,3H),4.20(s,3H),1.58(s,9H)。
实施例452.
2-(5-(二氟甲氧基)-1-(3-(二甲基氨基)丙基)-1H-吲唑-3-基)-N-(1-甲基环丙基)-5H-吡咯并[3,2-b]吡嗪-7-甲酰胺三氟乙酸盐
步骤1
2-溴-N-(1-甲基环丙基)-5H-吡咯并[3,2-b]吡嗪-7-甲酰胺
将2-溴-5H-吡咯并[3,2-b]吡嗪-7-羧酸(250mg,1.03mmol)、1-甲基环丙胺(150mg,2.2mmol)和HATU(456mg,1.2mmol)在20mL的无水THF中的混合物搅拌4小时。将反应混合物蒸发至干燥。将残余物悬浮于20mL的0.5N HCl,将产物以乙酸乙酯萃取(3×50mL),将合并的有机物以硫酸钠干燥,过滤并浓缩。将残余物以石油醚(2mL)研磨,然后倾析并干燥得到2-溴-N-异丙基-5H-吡咯并[3,2-b]吡嗪-7-甲酰胺(125mg,粗品)。LCMS:(M+H)+=285/287.
步骤2
2-溴-N-(1-甲基环丙基)-5-三苯甲基-5H-吡咯并[3,2-b]吡嗪-7-甲酰胺
向2-溴-N-(1-甲基环丙基)-5H-吡咯并[3,2-b]吡嗪-7-甲酰胺(600mg,2.1mmol)在20mL的无水THF中的溶液添加Et3N(0.42mL,4.2mmol)并将反应混合物搅拌5分钟,然后添加(氯甲烷三基)三苯(540mg,2.53mmol)并将反应混合物搅拌10分钟。然后,将反应混合物加热至60℃并持续搅拌3小时。将反应混合物以盐水(10mL)淬灭,将产物以乙酸乙酯萃取(3×20mL),将合并的有机物以硫酸钠干燥,过滤并浓缩得到2-溴-N-(1-甲基环丙基)-5-三苯甲基-5H-吡咯并[3,2-b]吡嗪-7-甲酰胺(400mg,37%),为黄色固体。1H NMR(300MHz,CDCl3):δ8.32(s,1H),8.01(s,1H),7.31-7.26(m,15H),1.51(s,3H),1.25(s,2H),0.90-0.74(m,2H)。LCMS:(M+H)+=537/539.
步骤3
2-(5-(二氟甲氧基)-1-(3-(二甲基氨基)丙基)-1H-吲唑-3-基)-N-(1-甲基环丙基)-5-三苯甲基-5H-吡咯并[3,2-b]吡嗪-7-甲酰胺
向3-(5-(二氟甲氧基)-3-(三丁基甲锡烷基)-1H-吲唑-1-基)-N,N-二甲基丙烷-1-胺(200mg,0.36mmol)和2-溴-N-(1-甲基环丙基)-5-三苯甲基-5H-吡咯并[3,2-b]吡嗪-7-甲酰胺(250mg,0.43mmol)在DMF(10mL)中的溶液添加CuI(18mg,0.08mmol)和Pd(PPh3)4(14mg,0.014mmol),然后将反应混合物通过鼓泡氮气脱气3分钟并重填以氮气。将混合物在氮气下加热至80℃且保持5小时,冷却至室温后,添加水(50mL)并将产物以EtOAc萃取(3×40mL),将合并的有机层经Na2SO4干燥,减压浓缩得到2-(5-(二氟甲氧基)-1-(3-(二甲基氨基)丙基)-1H-吲唑-3-基)-N-(1-甲基环丙基)-5-三苯甲基-5H-吡咯并[3,2-b]吡嗪-7-甲酰胺,为黄色固体(200mg,47%),该物质不经进一步纯化用于后续步骤。LCMS:(M+H)+=726;(M+Na)+=748.
步骤4
2-(5-(二氟甲氧基)-1-(3-(二甲基氨基)丙基)-1H-吲唑-3-基)-N-(1-甲基环丙基)-5H-吡咯并[3,2-b]吡嗪-7-甲酰胺三氟乙酸盐
向2-(5-(二氟甲氧基)-1-(3-(二甲基氨基)丙基)-1H-吲唑-3-基)-N-(1-甲基环丙基)-5-三苯甲基-5H-吡咯并[3,2-b]吡嗪-7-甲酰胺(200mg,0.3mmol)在3mL的二氯甲烷中的溶液添加三氟乙酸(3mL)。将反应混合物在室温搅拌过夜。蒸发溶剂后。将残余物首先以制备型-HPLC(Gemini5u C18150×21.2mm;注射体积:3mL/注射,流速:20mL/分钟;波长:214nm和254nm;梯度条件为:40%乙腈/60%水(0.1%三氟乙酸V/V)纯化,然后在仅9分钟后以线性方式继续以50%乙腈/50%水(0.1%三氟乙酸V/V)纯化得到2-(5-(二氟甲氧基)-1-(3-(二甲基氨基)丙基)-1H-吲唑-3-基)-N-(1-甲基环丙基)-5H-吡咯并[3,2-b]吡嗪-7-甲酰胺三氟乙酸盐(20mg,7%),为黄色固体。LCMS:(M+H)+=484;1HNMR(300MHz,CD3OD):δ9.04(s,1H),8.13(s,1H),8.02(s,1H),7.61(d,1H,J=9.0Hz),7.29(dd,1H,J1=9.0Hz,J2=2.1Hz),6.78(t,1H,J=73.8Hz),4.56-4.52(m,2H),3.19-3.12(m,2H),2.79(s,6H),2.39-2.33(m,2H),1.47(s,3H),0.93-0.89(m,2H),0.76-0.72(m,2H).
实施例453.
2-(5-(二氟甲氧基)-1-(3-(二甲基氨基)丙基)-1H-吲唑-3-基)-N-乙基-5H-吡咯并[3,2-b]吡嗪-7-甲酰胺三氟乙酸盐
步骤1
2-溴-N-乙基-5H-吡咯并[3,2-b]吡嗪-7-甲酰胺
将2-溴-5H-吡咯并[3,2-b]吡嗪-7-羧酸(250mg,1.03mmol)、乙胺(0.2mL2.2mmol)和HATU(456mg,1.2mmol)在20mL的无水THF中的混合物在室温搅拌4小时。将反应混合物蒸发至干燥。将残余物悬浮于20mL的0.5N HCl,将产物以乙酸乙酯萃取(3×50mL),将合并的有机物以硫酸钠干燥,过滤并浓缩。将残余物通过柱色谱纯化(硅胶,200-300筛目,以乙酸乙酯/石油醚2:1洗脱)得到2-溴-N-异丙基-5H-吡咯并[3,2-b]吡嗪-7-甲酰胺(180mg,43%)。LCMS:(M+H)+=269/271;1H NMR(300MHz,CD3OD):δ12.95(s,1H),8.50(s,1H),8.43(s,1H),7.77-7.72(m,1H),3.42-3.36(m,2H),1.25-1.12(m,3H).
步骤2
2-(5-(二氟甲氧基)-1-(3-(二甲基氨基)丙基)-1H-吲唑-3-基)-N-乙基-5H-吡咯并[3,2-b]吡嗪-7-甲酰胺三氟乙酸盐
向3-(5-(二氟甲氧基)-3-(三丁基甲锡烷基)-1H-吲唑-1-基)-N,N-二甲基丙烷-1-胺(200mg,0.36mmol)和2-溴-N-乙基-5H-吡咯并[3,2-b]吡嗪-7-甲酰胺(180mg,0.38mmol)在DMF(10mL)中的溶液添加CuI(18mg,0.08mmol)和Pd(PPh3)4(14mg,0.014mmol),然后将反应混合物通过鼓泡氮气脱气3分钟并重填以氮气。将混合物在氮气下加热至80℃且保持5小时。冷却至室温后,将水(50mL)添加至混合物并将产物以EtOAc萃取(3×40mL),将合并的有机层经Na2SO4干燥,过滤并减压浓缩。将残余物首先以制备型-HPLC(Gemini5uC18150×21.2mm;注射体积:3mL/注射,流速:20mL/分钟;波长:214nm和254nm;梯度条件为:40%乙腈/60%水(0.1%三氟乙酸V/V)纯化,然后在仅9分钟后以线性方式继续以50%乙腈/50%水(0.1%三氟乙酸V/V)纯化得到2-(5-(二氟甲氧基)-1-(3-(二甲基氨基)丙基)-1H-吲唑-3-基)-N-乙基-5H-吡咯并[3,2-b]吡嗪-7-甲酰胺三氟乙酸盐(20mg,7%),为黄色固体。LCMS:(M+H)+=458;1H NMR(300MHz,CD3OD):δ8.97(s,1H),8.09(s,1H),7.90(d,1H,J=1.8Hz),7.57(d,1H,J=9.3Hz),7.24(d,1H,J=9.0Hz),6.75(t,1H,J=73.8Hz),4.53-4.48(m,2H),3.44(q,2H,J=7.2Hz),3.19-3.12(m,2H),2.79(s,6H),2.37-2.34(m,2H),1.26(t,3H,J=7.2Hz)。
实施例454.
2-(1-(4-氨基-4-甲基戊基)-5-(二氟甲氧基)-1H-吲唑-3-基)-N-叔丁基-5H-吡咯并[3,2-b]吡嗪-7-甲酰胺三氟乙酸盐
步骤1
5-(二氟甲氧基)-3-(三丁基甲锡烷基)-1H-吲唑
在-16℃在氮气气氛下向3-(5-(二氟甲氧基)-3-碘-1H-吲唑-1-基)-N,N-二甲基丙-1-胺(1.2g,2.78mmol)在无水THF(25mL)中的溶液滴加异丙基氯化镁(1.5mL,2M在THF中的溶液,3mmol)。将反应混合物搅拌30分钟,然后在-16℃在氮气下滴加二丁基氯(丙基)甲锡烷(3.3mL,3.6mmol),然后将反应混合物缓慢温热至室温并搅拌2小时。将反应混合物以饱和NH4Cl溶液(40mL)淬灭并将产物以EtOAc萃取(3×30mL),将合并的有机物以硫酸钠干燥,过滤并浓缩。粗油状物未经进一步纯化用于后续步骤(1.1g,粗品)。
步骤2
N-叔丁基-2-(5-(二氟甲氧基)-1H-吲唑-3-基)-5-三苯甲基-5H-吡咯并[3,2-b]吡嗪-7-甲酰胺
在氮气下将5-(二氟甲氧基)-3-(三丁基甲锡烷基)-1H-吲唑(250mg,0.57mmol)、2-溴-N-叔丁基-5-三苯甲基-5H-吡咯并[3,2-b]吡嗪-7-甲酰胺(280mg,0.58mmol)、四(三苯基膦)钯(0)(23mg,0.02mmol)、碘化铜(26mg,1.36mmol)在10mL的无水DMF中的混合物加热至90℃且保持3小时。将反应混合物冷却至室温,以50mL的水稀释,将产物以乙酸乙酯萃取(3×20mL),将合并的有机物以硫酸钠干燥,过滤并浓缩得到N-叔丁基-2-(5-(二氟甲氧基)-1H-吲唑-3-基)-5-三苯甲基-5H-吡咯并[3,2-b]吡嗪-7-甲酰胺(208mg,粗品)。LCMS:(M+H)+=643.
步骤3
N-叔丁基-2-(5-(二氟甲氧基)-1-(4-甲基-4-硝基戊基)-1H-吲唑-3-基)-5-三苯甲基-5H-吡咯并[3,2-b]吡嗪-7-甲酰胺
向N-叔丁基-2-(5-(二氟甲氧基)-1H-吲唑-3-基)-5-三苯甲基-5H-吡咯并[3,2-b]吡嗪-7-甲酰胺(208mg,0.35mmol)在DMF(15mL)中的溶液添加K2CO3(193mg,1.4mmol)和1-氯-4-甲基-4-硝基戊烷(100mg,0.59mmol),在添加后,将反应混合物在搅拌的同时加热至100℃且保持4小时。然后,将混合物以H2O(25mL)淬灭并将产物以EtOAc(50mL)萃取。将有机层以H2O(100mL)、盐水(100mL)洗涤,经Na2SO4干燥并减压浓缩得到N-叔丁基-2-(5-(二氟甲氧基)-1-(4-甲基-4-硝基戊基)-1H-吲唑-3-基)-5-三苯甲基-5H-吡咯并[3,2-b]吡嗪-7-甲酰胺(200mg,69%),为黄色固体,该物质不经进一步纯化用于后续步骤。LCMS:(M+H)+=772;(M+Na)+=794.0.
步骤4
2-(1-(4-氨基-4-甲基戊基)-5-(二氟甲氧基)-1H-吲唑-3-基)-N-叔丁基-5-三苯甲基-5H-吡咯并[3,2-b]吡嗪-7-甲酰胺
向2-(1-(4-氨基-4-甲基戊基)-5-(二氟甲氧基)-1H-吲唑-3-基)-N-叔丁基-5-三苯甲基-5H-吡咯并[3,2-b]吡嗪-7-甲酰胺(200mg,0.3mmol)在CH3OH(10mL)中的溶液添加10%Pd/C(0.1g)和HCO2NH4(113mg,1.8mmol),在添加后,将反应混合物在搅拌的同时加热至80℃且保持0.5小时,然后过滤混合物并蒸发。将残余物在H2O(25mL)和EtOAc(50mL)之间分配。将有机层以H2O(100mL)、盐水(100mL)洗涤,经Na2SO4干燥并减压浓缩得到2-(1-(4-氨基-4-甲基戊基)-5-(二氟甲氧基)-1H-吲唑-3-基)-N-叔丁基-5-三苯甲基-5H-吡咯并[3,2-b]吡嗪-7-甲酰胺(54mg,39%),为白色固体,该物质不经进一步纯化用于后续步骤。LCMS:(M+H)+=742.
步骤5
2-(1-(4-氨基-4-甲基戊基)-5-(二氟甲氧基)-1H-吲唑-3-基)-N-叔丁基-5H-吡咯并[3,2-b]吡嗪-7-甲酰胺三氟乙酸盐
向2-(1-(4-氨基-4-甲基戊基)-5-(二氟甲氧基)-1H-吲唑-3-基)-N-叔丁基-5-三苯甲基-5H-吡咯并[3,2-b]吡嗪-7-甲酰胺(54mg,0.08mmol)在3mL的二氯甲烷中的溶液添加3mL的三氟乙酸。室温搅拌反应混合物过夜。蒸发溶剂后。将残余物首先以制备型-HPLC(Gemini5u C18150×21.2mm;注射体积:3mL/注射,流速:20mL/分钟;波长:214nm和254nm;梯度条件为:40%乙腈/60%水(0.1%三氟乙酸V/V)纯化,然后在仅9分钟后以线性方式继续以50%乙腈/50%水(0.1%三氟乙酸V/V)纯化得到2-(1-(4-氨基-4-甲基戊基)-5-(二氟甲氧基)-1H-吲唑-3-基)-N-叔丁基-5H-吡咯并[3,2-b]吡嗪-7-甲酰胺2,2,2-三氟乙酸盐(13mg,34%),为黄色固体。LCMS:(M+H)+=500;1H NMR(300MHz,CD3OD):δ8.98(s,1H),8.13(s,1H),8.07(d,1H,J=2.1Hz),7.60(d,1H,J=9.3Hz),7.29(dd,1H,J1=8.7Hz,J2=2.1Hz),6.72(t,1H,J=74.1Hz),4.49-4.47(m,2H),2.03-1.98(m,2H),1.58-1.53(m,2H),1.49(s,9H),1.19(s,6H).
实施例455.
N-叔丁基-2-(1-(3,4-二羟基丁基)-6-氟-1H-吲唑-3-基)-5H-吡咯并[3,2-b]吡嗪-7-甲酰胺
步骤1
N-叔丁基-2-(6-氟-1H-吲唑-3-基)-5-三苯甲基-5H-吡咯并[3,2-b]吡嗪-7-甲酰胺
在圆底烧瓶中,在氮气下将2-溴-N-叔丁基-5-三苯甲基-5H-吡咯并[3,2-b]吡嗪-7-甲酰胺(600mg,1.12mmol)和6-氟-3-(三丁基甲锡烷基)-1H-吲唑(475mg,1.12mmol)溶解于DMF(10mL)。添加Pd(PPh3)4(65mg,0.056mmol)和CuI(43mg,0.224mmol)并将混合物超声5分钟,同时鼓泡氮气。在85℃搅拌反应混合物16小时。除去溶剂后,将浓缩的混合物通过柱色谱在硅胶上以石油醚/EtOAc(3:1v/v)洗脱纯化得到N-叔-丁基-2-(6-氟-1H-吲唑-3-基)-5-三苯甲基-5H-吡咯并[3,2-b]吡嗪-7-甲酰胺(180mg,27%),为白色固体。LCMS:(M+H)+=595;1H NMR(300MHz,DMSO):δ13.60(s,1H),8.78(s,1H),8.45-8.40(m,1H),8.01(s,1H),7.95(s,1H),7.45-7.33(m,10H),7.21-7.09(m,7H),1.50(s,9H).
步骤2
N-叔丁基-2-(1-(2-(2,2-二甲基-1,3-二氧杂环戊烷-4-基)乙基)-6-氟-1H-吲唑-3-基)-5-三苯甲基-5H-吡咯并[3,2-b]吡嗪-7-甲酰胺
向N-叔丁基-2-(6-氟-1H-吲唑-3-基)-5-三苯甲基-5H-吡咯并[3,2-b]吡嗪-7-甲酰胺(80mg,0.135mmol)在DMF(5mL)中的溶液添加甲磺酸2-(2,2-二甲基-1,3-二氧杂环戊烷-4-基)乙酯(36mg,0.162mmol),接着添加K2CO3(56mg,0.405mmol)。将混合物在65℃加热4小时。冷却至室温后,将混合物倒入水中,过滤并干燥得到N-叔丁基-2-(1-(2-(2,2-二甲基-1,3-二氧杂环戊烷-4-基)乙基)-6-氟-1H-吲唑-3-基)-5-三苯甲基-5H-吡咯并[3,2-b]吡嗪-7-甲酰胺(90mg,92%)。粗品未经进一步纯化用于后续步骤。LCMS:(M+H)+=723.
步骤3
N-叔丁基-2-(1-(3,4-二羟基丁基)-6-氟-1H-吲唑-3-基)-5H-吡咯并[3,2-b]吡嗪-7-甲酰胺
在室温向N-叔丁基-2-(1-(2-(2,2-二甲基-1,3-二氧杂环戊烷-4-基)乙基)-6-氟-1H-吲唑-3-基)-5-三苯甲基-5H-吡咯并[3,2-b]吡嗪-7-甲酰胺(90mg,0.125mmol)在二氯甲烷(2mL)中的搅拌溶液滴加三氟乙酸(2mL)并搅拌反应混合物2小时。减压除去溶剂。将残余物首先以制备型-HPLC(Gemini5u C18150×21.2mm;注射体积:3mL/注射,流速:20mL/分钟;波长:214nm和254nm;梯度条件为:30%乙腈/70%水(0.1%三氟乙酸,v/v)纯化,然后在仅9分钟后以线性方式继续以70%乙腈/30%水(0.1%三氟乙酸,v/v)纯化得到N-叔丁基-2-(1-(3,4-二羟基丁基)-6-氟-1H-吲唑-3-基)-5H-吡咯并[3,2-b]吡嗪-7-甲酰胺(30mg,54.5%),为白色固体。LCMS:(M+H)+=441,(M+Na)+=463;1HNMR(300MHz,DMSO):δ12.81(s,1H),9.06(s,1H),8.47-8.42(m,1H),8.37(s,1H),7.91(s,1H),7.64(d,1H,J=9.9Hz),7.14(dd,1H,J1=9.0Hz,J2=1.8Hz),4.57(t,2H,J=6.5Hz),3.46-3.24(m,5H),2.10-2.08(m,1H),2.06-1.77(m,1H),1.51(s,9H).
实施例456.
N-叔丁基-2-(6-氟-1-(3-(甲基磺酰基)丙基)-1H-吲唑-3-基)-5H-吡咯并[3,2-b]吡嗪-7-甲酰胺
步骤1
N-叔丁基-2-(6-氟-1-(3-(甲基磺酰基)丙基)-1H-吲唑-3-基)-5-三苯甲基-5H-吡咯并[3,2-b]吡嗪-7-甲酰胺
向N-叔丁基-2-(6-氟-1H-吲唑-3-基)-5-三苯甲基-5H-吡咯并[3,2-b]吡嗪-7-甲酰胺(60mg,0.1mmol)在DMF(5mL)中的溶液添加1-氯-3-(甲基磺酰基)丙烷(19mg,0.12mmol),接着添加K2CO3(42mg,0.3mmol)。将混合物在65℃加热4小时。冷却至室温后,将混合物倒入水中,过滤并干燥得到N-叔丁基-2-(6-氟-1-(3-(甲基磺酰基)丙基)-1H-吲唑-3-基)-5-三苯甲基-5H-吡咯并[3,2-b]吡嗪-7-甲酰胺(55mg,77%)。粗品不经进一步纯化即可在下一步中使用。LCMS:(M+H)+=715.
步骤2
N-叔丁基-2-(6-氟-1-(3-(甲基磺酰基)丙基)-1H-吲唑-3-基)-5H-吡咯并[3,2-b]吡嗪-7-甲酰胺
于室温向N-叔丁基-2-(6-氟-1-(3-(甲基磺酰基)丙基)-1H-吲唑-3-基)-5-三苯甲基-5H-吡咯并[3,2-b]吡嗪-7-甲酰胺(55mg,0.077mmol)在二氯甲烷(2mL)中的搅拌溶液滴加三氟乙酸(2mL),且搅拌反应混合物2小时。减压除去溶剂。将残余物以MeOH研磨,然后倾析并干燥并干燥得到N-叔丁基-2-(6-氟-1-(3-(甲基磺酰基)丙基)-1H-吲唑-3-基)-5H-吡咯并[3,2-b]吡嗪-7-甲酰胺(26mg,72%),为白色固体。LCMS:(M+H)+=473;(M+Na)+=495;1H NMR(300MHz,DMSO):δ12.84(s,1H),9.09(s,1H),8.51-8.46(m,1H),8.38(s,1H),7.93(s,1H),7.74(d,1H,J=9.9Hz),7.18(t,1H,J=9.0Hz),4.63(t,2H,J=6.6Hz),3.22(t,2H,J=7.8Hz),2.99(s,3H),2.33(t,2H,J=7.4Hz),1.52(s,9H).
实施例457.
N-(5-氨基-四氢-2H-吡喃-3-基)-2-(6-氟-1-甲基-1H-吲唑-3-基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-甲酰胺盐酸盐
步骤1
5-乙氧基-2H-吡喃-3(6H)-酮
向2H-吡喃-3,5(4H,6H)-二酮钠盐(1.36g,10mmol)在50mL的乙醇中的溶液添加1.5mL的浓硫酸且将反应混合物在室温搅拌过夜。将大部分溶液经真空蒸发。将残余物以饱和碳酸氢钠中和,将产物以乙酸乙酯萃取(4×50mL),将合并的有机物以硫酸钠干燥,过滤并浓缩。将残余物通过柱色谱(硅胶,200-300筛目,以乙酸乙酯/石油醚=1/1洗脱)纯化得到5-乙氧基-2H-吡喃-3(6H)-酮(641mg,45%),为黄色固体。LCMS:(M+H)+=143;1H NMR(300MHz,CDCl3):δ5.44(s,1H),4.25(s,2H),4.06(s,2H),3.98(q,2H,J=6.9Hz),1.38(t,3H,J=6.9Hz).
步骤2
5-氨基-2H-吡喃-3(6H)-酮
将5-乙氧基-2H-吡喃-3(6H)-酮(641mg,4.5mmol)在50mL的乙醇的溶液在无水冰浴中冷却并鼓泡氨气10分钟。搅拌反应混合物过夜,浓缩至干并通过柱色谱(硅胶.200-300筛目,以甲醇/二氯甲烷=1/10洗脱)纯化得到5-氨基-2H-吡喃-3(6H)-酮(290mg,57%),为淡黄色固体。LCMS:(M+H)+=114;1HNMR(300MHz,DMSO):δ4.99(s,1H),4.17(s,2H),3.79(s,2H).
步骤3
5-氨基-四氢-2H-吡喃-3-醇
在氢气装置中于4atm氢气于60℃将5-氨基-2H-吡喃-3(6H)-酮(290mg,2.6mmol)和500mg的湿兰尼镍在20mL的乙醇中的混合物搅拌6小时。将反应混合物冷却至室温,经硅藻土过滤,将滤液浓缩至干得到5-氨基-四氢-2H-吡喃-3-醇(389mg,粗品),为淡黄色固体,物质不经进一步纯化用于后续步骤。LCMS:(M+H)+=118.
步骤4
5-羟基-四氢-2H-吡喃-3-基氨基甲酸叔丁酯
于室温将5-氨基-四氢-2H-吡喃-3-醇(389mg,粗制,约3.3mmol)、一缩二碳酸二-叔丁酯(700mg,3.3mmol)和TEA(0.5mL,3.3mmol)在40mL的THF中搅拌4小时,然后浓缩至干且将残余物通过柱色谱(硅胶.200–300筛目,以乙酸乙酯/石油醚=1/1洗脱)纯化得到5-羟基-四氢-2H-吡喃-3-基氨基甲酸叔丁酯(400mg,56%),为淡黄色固体。LCMS:(M+H)+=240;1H NMR(300MHz,CDCl3):δ4.78-4.72(m,1H),3.94-3.85(m,2H),3.77-3.59(m,3H),3.47-3.33(m,2H),1.92-1.85(m,2H),1.42(s,9H).
步骤5
甲磺酸5-(叔丁氧基羰基氨基)-四氢-2H-吡喃-3-基酯
将5-羟基-四氢-2H-吡喃-3-基氨基甲酸叔丁酯(109mg,0.5mmol)和N,N-二甲基吡啶-4-胺(80mg,0.65mmol)在10mL的二氯甲烷中的溶液于冰浴中冷却,滴加甲磺酰氯(0.05mL,0.6mmol)。室温搅拌反应混合物过夜,然后以50mL的水洗涤,将有机相干燥以硫酸钠过滤并浓缩。将残余物通过柱色谱(硅胶.200-300筛目,以乙酸乙酯/石油醚=1/1洗脱)纯化得到甲磺酸5-(叔丁氧基羰基氨基)-四氢-2H-吡喃-3-基酯(100mg,67%)为白色固体。LCMS:(M+H)+=318;1H NMR(300MHz,CDCl3):δ4.89-4.83(m,1H),3.99-3.62(m,5H),3.06(s,3H),2.26-2.20(m,2H),1.45(s,9H).
步骤6
5-叠氮基-四氢-2H-吡喃-3-基氨基磺酸叔丁酯
将甲磺酸5-(叔丁氧基羰基氨基)-四氢-2H-吡喃-3-基酯(90mg,0.3mmol)和叠氮化钠(30mg,0.5mmol)在10mL的无水N,N-二甲基甲酰胺中的溶液加热至100℃且保持3小时。将反应混合物冷却至室温,添加40mL的水,将产物以乙酸乙酯萃取(2×50mL),将合并的有机物以硫酸钠干燥,过滤并浓缩得到5-叠氮基-四氢-2H-吡喃-3-基氨基甲酸叔丁酯(100mg,粗品),其不经进一步纯化直接用于后续步骤。
步骤7
5-氨基-四氢-2H-吡喃-3-基氨基甲酸叔丁酯
向5-叠氮基-四氢-2H-吡喃-3-基氨基甲酸叔丁酯(1g,4.13mmol)在30mL的乙酸乙酯中的溶液添加Pd/C(10%,1g),在氢气填充的气球下室温搅拌反应混合物过夜。将反应混合物经硅藻土过滤,将滤液浓缩得到5-氨基-四氢-2H-吡喃-3-基氨基甲酸叔丁酯(188mg,21%)为白色固体。LCMS:(M+H)+=217;1H NMR(300MHz,CDCl3):δ3.84-3.57(m,4H),3.19-3.05(m,2H),2.21-1.65(m,2H),1.44(s,9H)。
步骤8
5-(2-(6-氟-1-甲基-1H-吲唑-3-基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-甲酰氨基)-四氢-2H-吡喃-3-基氨基甲酸叔丁酯
将5-氨基-四氢-2H-吡喃-3-基氨基甲酸叔丁酯(100mg,0.46mmol)、2-(6-氟-1-甲基-1H-吲唑-3-基)-5H-吡咯并[3,2-b]吡嗪-7-羧酸(200mg,0.7mmol)、EDCI(134mg,0.7mmol)、N,N-二甲基吡啶-4-胺(85mg,0.7mmol)、HOBt(95mg,0.7mmol)和TEA(0.4mL,2.3mmol)在10mL的无水DMF中的混合物室温搅拌6小时。将反应混合物浓缩至干且将残余物通过柱色谱(硅胶,200–300筛目,以乙酸乙酯洗脱)纯化得到5-(2-(6-氟-1-甲基-1H-吲唑-3-基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-甲酰氨基)-四氢-2H-吡喃-3-基氨基甲酸酯(120mg,51%),为黄色固体。LCMS:(M+H)+=510;(M+Na)+=532;1H NMR(300MHz,DMSO):δ12.87(s,1H),9.08(d,1H,J=9.3Hz),8.45-8.34(m,2H),7.96-7.94(m,1H),7.68-7.65(m,1H),7.23-7.14(m,1H),7.04-7.01(m,1H),4.13-4.04(m,5H),3.82-3.78(m,4H),3.07-3.01(m,2H),1.46(s,9H).
步骤9
N-(5-氨基-四氢-2H-吡喃-3-基)-2-(6-氟-1-甲基-1H-吲唑-3-基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-甲酰胺盐酸盐
向5-(2-(6-氟-1-甲基-1H-吲唑-3-基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-甲酰氨基)-四氢-2H-吡喃-3-基氨基甲酸酯(120mg,0.24mmol)在10mL的二噁烷中的溶液鼓泡HCl气体3小时。室温搅拌反应混合物过夜。将所形成的沉淀通过过滤分离,且将滤饼以10mL的乙醚洗涤得到30mg的N-(5-氨基-四氢-2H-吡喃-3-基)-2-(6-氟-1-甲基-1H-吲唑-3-基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-甲酰胺盐酸盐。LCMS:(M+H)+=410.
实施例458.
N-叔丁基-2-(5-异丙基-1-甲基-1H-吲唑-3-基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-甲酰胺
步骤1
丙-1-烯-2-基硼酸
于室温向丙-1-烯-2-基溴化镁(0.5N在THF中,10mL,5mmol)在10mL的无水THF中的搅拌溶液添加硼酸三甲酯(1.67mL,15mL)。将反应混合物在室温搅拌2.5小时,然后冷却至0℃。添加1N HCl在水中(6mL,6mmol),并持续搅拌10分钟。将所得混合物以乙酸乙酯萃取(2×20mL)。将合并的有机层经Na2SO4干燥并减压浓缩得到粗制丙-1-烯-2-基硼酸(0.6g,粗品),为白色固体。1H NMR(300MHz,DMSO):δ4.09(q,2H,J=7.0Hz),1.99(s,3H).
步骤2
5-(丙-1-烯-2-基)-1H-吲唑
将丙-1-烯-2-基硼酸(1.2g)、5-溴-1H-吲唑(1.0g,5.1mmol)、Pd(dba)2(0.04g,0.07mmol)、X-phos(0.04g,0.08mmol)和Cs2CO3(3.0g,9.2mmol)在30mL的DMF和5mL的水的混合物中的混合物于130℃在氮气下搅拌8小时。减压除去溶剂。将残余物通过硅胶色谱(200-300筛目,以乙酸乙酯和石油醚(1:5,v/v)的混合物洗脱)纯化得到5-(丙-1-烯-2-基)-1H-吲唑和1H-吲唑(0.9g)的2:3混合物。粗混合物不经进一步纯化用于后续步骤。LCMS:(M+H)+=159;1HNMR(300MHz,DMSO):δ8.08(s,1H),7.81–7.80(m,1H),7.62(dd,1H,J1=8.7Hz,J2=1.5Hz),7.53-7.46(m,1H),5.40-5.39(m,1H),5.12-5.11(m,1H),2.24(s,3H)。
步骤3
5-异丙基-1H-吲唑
将5-(丙-1-烯-2-基)-1H-吲唑和1H-吲唑的2:3混合物(0.9g)、10%Pd/C(0.2g)在150mL的甲醇中于室温在H2气球下搅拌3小时。滤出Pd/C并减压浓缩滤液得到粗5-异丙基-1H-吲唑(0.85g),为油状物。LCMS:(M+H)+=161.
步骤4
3-碘-5-异丙基-1H-吲唑
室温向在70mL的DMSO中主要含有5-异丙基-1H-吲唑(0.85g,粗品)的搅拌溶液中添加KOH(0.52g,8mmol)。然后缓慢地添加I2(1.35g,5.3mmol),在添加后,将混合物在室温搅拌2小时。将混合物倒入200mL的饱和Na2SO3溶液中,然后以乙酸乙酯萃取(2×100mL)。将合并的有机层以水(100mL)和盐水(100mL)洗涤,经Na2SO4干燥并减压浓缩得到粗3-碘-5-异丙基-1H-吲唑(0.78g)。LCMS:(M+H)+=287.
步骤5
3-碘-5-异丙基-1-甲基-1H-吲唑
于0℃向3-碘-5-异丙基-1H-吲唑(0.75g,粗品)在50mL的THF中的搅拌溶液以一份添加t-BuOK(0.59g,5.2mmol)。将混合物于0℃搅拌30分钟。添加CH3I(1.1g,7.7mmol)且将溶液在室温搅拌过夜。将反应混合物以30mL的水淬灭并以乙酸乙酯萃取(2×100mL)。将合并的有机层以水(100mL)、盐水(100mL)洗涤并经无水Na2SO4干燥。将干燥试剂通过过滤除去并减压蒸发滤液得到粗3-碘-5-异丙基-1-甲基-1H-吲唑,其含有一些N-2烷基化异构体(0.7g),为油状物。LCMS:(M+H)+=301.
步骤6
5-异丙基-1-甲基-3-(三丁基甲锡烷基)-1H-吲唑
向3-碘-5-异丙基-1-甲基-1H-吲唑(0.3g,粗品)在100mL的无水THF中的搅拌溶液于-16℃在氮气下滴加i-PrMgCl(0.69mL,1.38mmol,2M在THF中)。然后将混合物在-16℃搅拌20分钟。缓慢地添加三丁基氯甲锡烷(0.39g,1.2mmol)且将混合物在室温搅拌2.5小时。将溶液以40mL的水淬灭,以乙酸乙酯(2×100mL)萃取,以水(2×50mL)、盐水(50mL)洗涤并经无水硫酸钠干燥。将干燥试剂通过过滤除去并减压蒸发滤液得到粗5-异丙基-1-甲基-3-(三丁基甲锡烷基)-1H-吲唑,为油状物,其不经进一步纯化用于后续步骤中。
步骤7
新戊酸(7-(叔丁基氨基甲酰基)-2-(5-异丙基-1-甲基-1H-吲唑-3-基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-5-基)甲酯
将新戊酸5-异丙基-1-甲基-3-(三丁基甲锡烷基)-1H-吲唑、(2-溴-7-(叔丁基氨基甲酰基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-5-基)甲酯(0.408g,1mmol)、CuI(0.06g,0.32mmol)和Pd(PPh3)4(0.06g,0.052mmol)在40mL的DMF中的混合物于80℃在氮气下搅拌4小时。减压除去溶剂。将残余物以水(15mL)和石油醚(30mL)研磨,然后倾析并干燥得到粗新戊酸(7-(叔丁基氨基甲酰基)-2-(5-异丙基-1-甲基-1H-吲唑-3-基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-5-基)甲酯(0.15g),为黄色固体,其不经进一步纯化用于后续步骤中。LCMS:(M+H)+=505.
步骤8
N-叔丁基-2-(5-异丙基-1-甲基-1H-吲唑-3-基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-甲酰胺
向新戊酸(7-(叔丁基氨基甲酰基)-2-(5-异丙基-1-甲基-1H-吲唑-3-基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-5-基)甲酯(0.2g,粗品)在二噁烷/水(5mL/10mL)中的搅拌溶液添加KOH(0.23g,4.1mmol)。将混合物在室温搅拌3小时。然后将反应混合物以1N HCl处理至pH=3-4。减压除去溶剂。将残余物以水(15mL)研磨并干燥得到粗产物,将其首先以制备型-HPLC(Gemini5u C18150×21.2mm;注射体积:3mL/注射,流速:20mL/分钟;波长:214nm和254nm;梯度条件为:62%乙腈/38%水(0.1%三氟乙酸,v/v)纯化,然后在仅9分钟后以线性方式继续以64%乙腈/36%水(0.1%三氟乙酸,v/v)纯化得到N-叔丁基-2-(5-异丙基-1-甲基-1H-吲唑-3-基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-甲酰胺(0.05g),为黄色固体。LCMS:(M+H)+=391;1H NMR(300MHz,CD3OD):δ9.05(s,1H),8.29(s,1H),8.16(s,1H),7.61(d,1H,J=8.7Hz),7.48(dd,1H,J1=8.7Hz,J2=1.5Hz),4.18(s,3H),3.19-3.02(m,1H),1.58(s,9H),1.35(d,6H,J=6.6Hz).
实施例459和460.
N-(5-氨基-四氢-2H-吡喃-3-基)-2-(6-氟-1-甲基-1H-吲唑-3-基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-甲酰胺盐酸盐(非对映异构体A和B)
将来自实施例457的滤液浓缩至干并首先通过制备型HPLC(Gemini5uC18150×21.2mm;注射体积:3mL/注射,流速:20mL/分钟;波长:214nm和254nm;梯度条件为:40%乙腈/60%水(0.1%三氟乙酸V/V)纯化,然后在仅9分钟后以线性方式继续以10%乙腈/90%水(0.1%三氟乙酸V/V)纯化得到两种非对映异构体(各10mg),其相对立体化学为任意指定。较为极性的非对映异构体A:LCMS:(M+H)+=410;1H NMR(300MHz,DMSO+D2O):δ9.02(s,1H),8.34-8.28(m,2H),7.51(d,1H,J=9.6Hz),7.24(t,1H,J=9.3Hz),4.14-4.04(m,8H),3.37-3.12(m,3H)。较少极性的非对映异构体B:LCMS:(M+H)+=410;1H NMR(300MHz,DMSO+D2O):δ9.03(s,1H),8.41-8.37(m,2H),8.20(d,1H,J=7.8Hz),7.49(d,1H,J=9.3Hz),7.09(t,1H,J=8.7Hz),4.38(brs,1H),4.04(s,3H),3.89-3.86(m,2H),3.67-3.42(m,3H),2.23-2.01(m,2H).
实施例461.
N-叔丁基-2-(1-甲基-5-(甲基磺酰基)-1H-吲唑-3-基)-5H-吡咯并[3,2-b]吡嗪-7-甲酰胺
步骤1
3-碘-5-(甲基磺酰基)-1H-吲唑
于0℃向5-(甲基磺酰基)-1H-吲唑(430mg,2.19mmol)在DMSO(10mL)中的溶液顺序添加KOH(0.4g,6.57mmol)和I2(1.2g,4.38mmol),然后将反应混合物在室温搅拌3小时。添加水(40mL),将产物以EtOAc萃取(3×30mL),将合并的有机物以硫酸钠干燥,过滤并减压浓缩。将残余物通过柱色谱(硅胶,200-300筛目,以石油醚/EtOAc=20:1洗脱)纯化得到3-碘-5-(甲基磺酰基)-1H-吲唑(410mg,59.9%),为灰白色固体。LCMS:(M+H)+=323;1H NMR(300MHz,DMSO):δ7.98-7.95(m,4H),3.27(s,3H).
步骤2
3-碘-1-甲基-5-(甲基磺酰基)-1H-吲唑
于0℃向3-碘-5-(甲基磺酰基)-1H-吲唑(400mg,1.24mmol)在THF(15mL)中的溶液缓慢地添加t-BuOK(208mg,1.86mmol),将混合物搅拌30分钟,然后于0℃添加碘甲烷(262mg,1.86mmol),然后温热至室温,并搅拌2小时。将反应混合物以水(40mL)淬灭且将产物以EtOAc萃取(3×30mL),将合并的有机物以硫酸钠干燥,过滤并减压浓缩得到固体,其通过柱色谱(硅胶,200-300筛目,以二氯甲烷/甲醇=10:1洗脱)纯化得到3-碘-1-甲基-5-(甲基磺酰基)-1H-吲唑(210mg,50.6%),为白色固体。LCMS:(M+H)+=337;1H NMR(300MHz,DMSO):δ7.97-7.94(m,3H),4.13(s,3H),3.26(s,3H).
步骤3
2-(1-甲基-5-(甲基磺酰基)-1H-吲唑-3-基)-5-(新戊酰基氧基甲基)-5H-吡咯并[32-b]吡嗪-7-羧酸甲酯
向3-碘-1-甲基-5-(甲基磺酰基)-1H-吲唑(127mg,0.37mmol)、2-溴-5-(新戊酰基氧基甲基)-5H-吡咯并[3,2-b]吡嗪-7-羧酸甲酯(128mg,0.34mmol)和Pd(PPh3)4(20mg,0.017mmol)在DMF(8mL)中的溶液添加六-N-丁基二锡(299mg,0.51mmol)。将反应混合物通过鼓泡氮气脱气3分钟并重填以氮气。将混合物在氮气下加热至100℃且保持15小时。冷却至室温后,添加水(40mL)且将产物以EtOAc萃取(3×30mL),将合并的有机物以硫酸钠干燥,过滤并减压浓缩。将残余物通过柱色谱(硅胶,200-300筛目,以EtOAc/石油醚=2:1洗脱)纯化得到2-(1-甲基-5-(甲基磺酰基)-1H-吲唑-3-基)-5-(新戊酰基氧基甲基)-5H-吡咯并[3,2-b]吡嗪-7-羧酸甲酯(120mg,69.7%),为灰白色固体。LCMS:(M+H)+=500;1H NMR(300MHz,DMSO):δ9.43(d,1H,J=1.2Hz),9.21(s,1H),8.95(d,1H,J=1.2Hz),8.77(s,1H),8.01(s,1H),6.33(s,2H),4.24(s,3H),4.04(s,3H),3.28(s,3H),1.09(s,9H).
步骤4
2-(5-甲磺酰基-1-甲基-1H-吲唑-3-基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-羧酸
向2-(1-甲基-5-(甲基磺酰基)-1H-吲唑-3-基)-5-(戊酰基氧基甲基)-5H-吡咯并[3,2-b]吡嗪-7-羧酸甲酯(80mg,0.16mmol)在二噁烷/水(6mL/4mL)中的悬浮液中添加NaOH(100mg,2.5mmol),将反应混合物搅拌加热至85℃且保持4小时,减压除去二噁烷,将水层以2N HCl调节至pH=4。将所形成的沉淀通过过滤收集,以水(3mL)洗涤并干燥得到2-(5-甲磺酰基-1-甲基-1H-吲唑-3-基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-羧酸(40mg,67.7%),为橙色固体。LCMS:(M+H)+=372;1H NMR(300MHz,DMSO):δ12.89(d,1H,J=2.7Hz),12.49(brs,1H),9.47(s,1H),9.08(s,1H),8.50(d,2H,J=3.3Hz),8.01-7.95(m,1H),4.23(s,3H),3.27(s,3H).
步骤5
N-叔丁基-2-(1-甲基-5-(甲基磺酰基)-1H-吲唑-3-基)-5H-吡咯并[3,2-b]吡嗪-7-甲酰胺
将2-(5-甲磺酰基-1-甲基-1H-吲唑-3-基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-羧酸(75mg,0.20mmol)、2-甲基丙烷-2-胺(15mg,0.20mmol)、HOBt(108mg,0.80mmol)、EDCI(153mg,0.80mmol)和DIPEA(103mg,0.80mmol)在DMF(6mL)中的混合物在室温搅拌15小时,然后添加水(30mL),将产物以EtOAc萃取(3×30mL),将合并的有机物以硫酸钠干燥,过滤并减压浓缩且将残余物首先通过制备型-HPLC(Gemini5u C18150×21.2mm;注射体积:3mL/注射,流速:20mL/分钟;波长:214nm和254nm;梯度条件为:30%甲醇/70%水(0.1%三氟乙酸,v/v)纯化,然后在仅9分钟以线性方式继续以50%甲醇/50%水(0.1%三氟乙酸,v/v)纯化得到N-叔丁基-2-(1-甲基-5-(甲基磺酰基)-1H-吲唑-3-基)-5H-吡咯并[3,2-b]吡嗪-7-甲酰胺(7mg,8.1%),为白色固体。LCMS:(M+H)+=427;1H NMR(300MHz,CD3OD):δ9.08(s,1H),8.99(s,1H),8.33(s,1H),8.01(d,1H,J=8.7Hz),7.90(d,1H,J=8.7Hz),4.28(s,3H),3.17(s,3H),1.57(s,9H).
实施例462.
2-(6-氟-1-(3-羟基丁基)-1H-吲唑-3-基)-N-(1-羟基-2-甲基丙烷-2-基)-5H-吡咯并[3,2-b]吡嗪-7-甲酰胺
步骤1
N-(1-(叔丁基二甲基甲硅烷基氧基)-2-甲基丙烷-2-基)-2-(6-氟-1-(3-氧代丁基)-1H-吲唑-3-基)-5-三苯甲基-5H-吡咯并[3,2-b]吡嗪-7-甲酰胺
向N-(1-(叔丁基二甲基甲硅烷基氧基)-2-甲基丙烷-2-基)-2-(6-氟-1H-吲唑-3-基)-5-三苯甲基-5H-吡咯并[3,2-b]吡嗪-7-甲酰胺(60mg,0.083mmol)在DMF(4mL)中的溶液中添加4-氯丁烷-2-酮(11mg,0.1mmol),接着添加K2CO3(34mg,0.25mmol)。将混合物于65℃加热1.5小时。冷却至室温后,将混合物倒入水中并过滤得到N-(1-(叔丁基二甲基甲硅烷基氧基)-2-甲基丙烷-2-基)-2-(6-氟-1-(3-氧代丁基)-1H-吲唑-3-基)-5-三苯甲基-5H-吡咯并[3,2-b]吡嗪-7-甲酰胺(40mg,61%)。干燥后,粗产物不经进一步纯化用于后续步骤中。LCMS:(M+H)+=795.
步骤2
N-(1-(叔丁基二甲基甲硅烷基氧基)-2-甲基丙烷-2-基)-2-(6-氟-1-(3-羟基丁基)-1H-吲唑-3-基)-5-三苯甲基-5H-吡咯并[3,2-b]吡嗪-7-甲酰胺
于0℃向N-(1-(叔丁基二甲基甲硅烷基氧基)-2-甲基丙烷-2-基)-2-(6-氟-1-(3-氧代丁基)-1H-吲唑-3-基)-5-三苯甲基-5H-吡咯并[3,2-b]吡嗪-7-甲酰胺(40mg,0.05mmol)在MeOH(5mL)中的溶液中添加NaBH4(10mg,0.25mmol)。将混合物在室温搅拌1小时。将NH4Cl(水溶液)添加至混合物,淬灭反应混合物。将混合物以EtOAc(3×5mL)萃取。将合并的有机层以盐水洗涤,并经Na2SO4干燥。过滤和浓缩后,粗产物不经纯化用于后续步骤。LCMS:(M+H)+=797.
步骤3
2-(6-氟-1-(3-羟基丁基)-1H-吲唑-3-基)-N-(1-羟基-2-甲基丙烷-2-基)-5H-吡咯并[3,2-b]吡嗪-7-甲酰胺
于室温向N-(1-(叔丁基二甲基甲硅烷基氧基)-2-甲基丙烷-2-基)-2-(6-氟-1-(3-羟基丁基)-1H-吲唑-3-基)-5-三苯甲基-5H-吡咯并[3,2-b]吡嗪-7-甲酰胺在二氯甲烷(2mL)中的搅拌溶液中滴加三氟乙酸(1mL),并搅拌反应混合物1小时。减压除去溶剂。将残余物溶解于二氯甲烷并以NaHCO3(水溶液)洗涤,将有机层经浓缩,且将残余物首先通过制备型-HPLC(Gemini5u C18150×21.2mm;注射体积:3mL/注射,流速:20mL/分钟;波长:214nm和254nm;梯度条件为:36%乙腈/64%水(0.1%三氟乙酸,v/v)纯化,且然后在仅9分钟后以线性方式继续以42%乙腈/58%水(0.1%三氟乙酸,v/v)纯化得到2-(6-氟-1-(3-羟基丁基)-1H-吲唑-3-基)-N-(1-羟基-2-甲基丙烷-2-基)-5H-吡咯并[3,2-b]吡嗪-7-甲酰胺(10mg,45%经三步),为白色固体。LCMS:(M+H)+=441;1HNMR(300MHz,CD3OD):δ9.15(s,1H),8.58(dd,1H,J1=9.Hz,J2=5.4Hz),8.29(s,1H),7.42(d,1H,J=7.8Hz),7.10(d,1H,J=7.2Hz),4.62-4.56(m,2H),3.82(s,2H),3.76(brs,1H),2.19-2.13(m,2H),2.04-1.99(m,2H),1.55(s,6H),1.22(d,3H,J=6.3Hz).
实施例463.
2-(6-氟-1-甲基-1H-吲唑-3-基)-N-((3-羟基氮杂环丁烷-3-基)甲基)-5H-吡咯并[3,2-b]吡嗪-7-甲酰胺三氟乙酸盐
步骤1
3-氧代氮杂环丁烷-1-羧酸叔丁酯
将三乙胺(2.47mL)添加至3-羟基氮杂环丁烷-1-羧酸叔丁酯(0.5g,2.9mmol)在DMSO(5mL)中的溶液中。向该混合物中滴加吡啶三氧化硫(1.8g,11.3mmol)在DMSO(6.5mL)中的溶液,并且将混合物在室温搅拌1.5小时。将混合物倒入冰-水中并以乙酸乙酯(3×50mL)萃取,将合并的有机物以硫酸钠干燥,过滤并浓缩得到3-氧代氮杂环丁烷-1-羧酸叔丁酯,为白色固体(500mg,100%)。1H NMR(300MHz,CDCl3):δ4.68(s,4H),1.48(s,9H)。
步骤2
3-氰基-3-(三甲基甲硅烷基氧基)氮杂环丁烷-1-羧酸叔丁酯
在氮气下于室温将四丁基氰化铵(28mg)在二氯甲烷(5mL)中的溶液滴加至3-氧代氮杂环丁烷-1-羧酸叔丁酯(250mg)和三甲基甲硅烷基氰化物(0.28mL)在二氯甲烷(5mL)中的搅拌溶液中。将混合物搅拌1小时。将混合物以50mL的水稀释,以二氯甲烷(3×15mL)萃取,经硫酸钠干燥并浓缩得到3-氰基-3-(三甲基甲硅烷基氧基)氮杂环丁烷-1-羧酸叔丁酯(300mg,粗产物),其不经进一步纯化直接用于后续步骤。1H NMR(300MHz,CDCl3):δ4.35-4.32(m,2H),4.04-4.01(m,2H),1.45(s,9H),0.27(s,9H)。
步骤3
3-(氨基甲基)-3-羟基氮杂环丁烷-1-羧酸叔丁酯
将3-氰基-3-(三甲基甲硅烷基氧基)氮杂环丁烷-1-羧酸叔丁酯(300mg,1.11mmol)在THF(5mL)中的溶液以硼烷甲基硫复合物(2M在THF中,2mL)处理,并于70℃在氮气下加热混合物1小时。然后将混合物冷却至室温,并以甲醇(5mL)淬灭,接着以乙二胺(0.28mL)处理,将该混合物在25℃搅拌1小时,然后温热至55℃且保持1小时。冷却至室温后,将反应混合物以四丁基氟化铵(1M在THF中,2mL,2mmol)处理,然后于25℃搅拌1小时。将混合物以50mL的水稀释,将产物以乙酸乙酯(3×25mL)萃取,将合并的有机物以硫酸钠干燥,过滤并浓缩得到3-(氨基甲基)-3-羟基氮杂环丁烷-1-羧酸叔丁酯(200mg,粗产物),为白色固体,其不经进一步纯化用于后续步骤。
步骤4
3-((2-(6-氟-1-甲基-1H-吲唑-3-基)-5H-吡咯并[3,2-b]吡嗪-7-甲酰氨基)甲基)-3-羟基氮杂环丁烷-1-羧酸叔丁酯
于室温将2-(6-氟-1-甲基-1H-吲唑-3-基)-5H-吡咯并[3,2-b]吡嗪-7-羧酸(100mg,0.32mmol)、3-(氨基甲基)-3-羟基氮杂环丁烷-1-羧酸叔丁酯(196mg,0.64mmol)、HATU(145mg,0.38mmol)和DIPEA(0.2mL,1.15mmol)在10mL无水THF中的混合物搅拌4小时。将反应混合物蒸发至干燥,将残余物悬浮于20mL的0.5N HCl中,将产物以乙酸乙酯(3×20mL)萃取,将合并的有机物以硫酸钠干燥,过滤并浓缩。将残余物以石油醚(1mL)研磨,然后倾析并干燥得到3-((2-(6-氟-1-甲基-1H-吲唑-3-基)-5H-吡咯并[3,2-b]吡嗪-7-甲酰氨基)甲基)-3-羟基氮杂环丁烷-1-羧酸叔丁酯(86mg,54%),为黄色固体,该物质不经纯化用于后续步骤。LCMS:(M+H)+=496.
步骤5
2-(6-氟-1-甲基-1H-吲唑-3-基)-N-((3-羟基氮杂环丁烷-3-基)甲基)-5H-吡咯并[3,2-b]吡嗪-7-甲酰胺三氟乙酸盐
向3-((2-(6-氟-1-甲基-1H-吲唑-3-基)-5H-吡咯并[3,2-b]吡嗪-7-甲酰氨基)甲基)-3-羟基氮杂环丁烷-1-羧酸叔丁酯(86mg,0.16mmol)在3mL的二氯甲烷中添加3mL的三氟乙酸。室温搅拌反应混合物过夜。蒸发溶剂后。将残余物首先通过制备型-HPLC(Gemini5u C18150×21.2mm;注射体积:3mL/注射,流速:20mL/分钟;波长:214nm和254nm;梯度条件为:40%乙腈/60%水(0.1%三氟乙酸V/V),然后继续在仅9分钟后以线性方式以50%乙腈/50%水(0.1%三氟乙酸V/V)纯化得到2-(6-氟-1-甲基-1H-吲唑-3-基)-N-((3-羟基氮杂环丁烷-3-基)甲基)-5H-吡咯并[3,2-b]吡嗪-7-甲酰胺三氟乙酸盐(6mg,9%),为黄色固体。LCMS:(M+H)+=396;1H NMR(300MHz,CD3OD):δ9.05(s,1H),8.48-8.42(m,1H),8.23(s,1H),7.20(d,1H,J=9.0Hz),6.99(t,1H,J=9.3Hz),4.10-3.89(m,6H).
实施例464
2-(6-氟-1-(3-(甲基磺酰基)丙基)-1H-吲唑-3-基)-N-(1-羟基-2-甲基丙烷-2-基)-5H-吡咯并[3,2-b]吡嗪-7-甲酰胺
步骤1
N-(1-(叔丁基二甲基甲硅烷基氧基)-2-甲基丙烷-2-基)-2-(6-氟-1H-吲唑-3- 基)-5-三苯甲基-5H-吡咯并[3,2-b]吡嗪-7-甲酰胺
在氮气下,将2-溴-N-(1-(叔丁基二甲基甲硅烷基氧基)-2-甲基丙烷-2-基)-5-三苯甲基-5H-吡咯并[3,2-b]吡嗪-7-甲酰胺(287mg,0.674mmol)和6-氟-3-(三丁基甲锡烷基)-1H-吲唑(450mg,0.674mmol)溶解于DMF(8mL)中。添加Pd(PPh3)4(39mg,0.034mmol)和CuI(26mg,0.136mmol),且将混合物超声处理5分钟,同时将氮气鼓泡通过混合物。将反应混合物然后于85℃搅拌4小时。将混合物冷却,真空浓缩且然后通过色谱(硅胶,石油醚:EtOAC5:1v/v)纯化得到N-(1-(叔丁基二甲基甲硅烷基氧基)-2-甲基丙烷-2-基)-2-(6-氟-1H-吲唑-3-基)-5-三苯甲基-5H-吡咯并[3,2-b]吡嗪-7-甲酰胺(100mg,20%),为白色固体。1H NMR(300MHz,CD3Cl):δ8.55(s,1H),8.35(s,1H),8.13(s,1H),8.32(s,1H),7.49-7.47(m,3H),7.29–7.01(m,15H),3.87(s,2H),1.55(s,6H),0.78(s,9H),0.02(s,6H)。LC-MS:725.3[M+H]+.
步骤2
N-(1-(叔丁基二甲基甲硅烷基氧基)-2-甲基丙烷-2-基)-2-(6-氟-1-(3-(甲基 磺酰基)丙基)-1H-吲唑-3-基)-5-三苯甲基-5H-吡咯并[3,2-b]吡嗪-7-甲酰胺
向N-(1-(叔丁基二甲基甲硅烷基氧基)-2-甲基丙烷-2-基)-2-(6-氟-1H-吲唑-3-基)-5-三苯甲基-5H-吡咯并[3,2-b]吡嗪-7-甲酰胺(40mg,0.055mmol)在DMF(3mL)中的溶液中添加1-氯-3-(甲基磺酰基)丙烷(13mg,0.083mmol),接着添加K2CO3(23mg,0.165mmol)。于40℃加热混合物16小时,然后冷却,并倒入水中并过滤得到N-(1-(叔丁基二甲基甲硅烷基氧基)-2-甲基丙烷-2-基)-2-(6-氟-1-(3-(甲基磺酰基)丙基)-1H-吲唑-3-基)-5-三苯甲基-5H-吡咯并[3,2-b]吡嗪-7-甲酰胺(35mg,76%)。将粗物质不经纯化直接用于后续中。LC-MS:845.2[M+H]+.
步骤3
N-叔-2-(6-氟-1-(3-(甲基磺酰基)丙基)-1H-吲唑-3-基)-N-(1-羟基-2-甲基丙 烷-2-基)-5H-吡咯并[3,2-b]吡嗪-7-甲酰胺
于室温向N-(1-(叔丁基二甲基甲硅烷基氧基)-2-甲基丙烷-2-基)-2-(6-氟-1-(3-(甲基磺酰基)丙基)-1H-吲唑-3-基)-5-三苯甲基-5H-吡咯并[3,2-b]吡嗪-7-甲酰胺(35mg,0.042mmol)在DCM(2mL)中的搅拌溶液中滴加三氟乙酸(1mL)。将反应混合物在室温搅拌1小时,然后高真空浓缩。将所得残余物溶解于DCM中,以NaHCO3(水溶液)洗涤,且然后将有机层经浓缩并通过制备型HPLC(Gemini5u C18150×21.2mm;注射体积:3mL/注射,流速:20mL/分钟;波长:214nm和254nm;25%乙腈/75%水(掺杂以0.1%TFA,v/v)至42%乙腈/58%水(掺杂以0.1%TFA,v/v),经9分钟)纯化得到2-(6-氟-1-(3-(甲基磺酰基)丙基)-1H-吲唑-3-基)-N-(1-羟基-2-甲基丙烷-2-基)-5H-吡咯并[3,2-b]吡嗪-7-甲酰胺(10mg,50%),为白色固体。1H NMR(300MHz,DMSO):δ12.81(s,1H),9.10(s,1H),8.63-8.58(m,1H),8.37(s,1H),7.90(s,1H),7.71(d,1H,J=8.1Hz),7.16(t,1H,J=9.2Hz),5.08(t,1H,J=5.5Hz),4.62(t,2H,J=6.6Hz),3.60(d,2H,J=5.4Hz),3.18(t,2H,J=6.4Hz),2.96(s,3H),2.32(t,2H,J=7.6Hz),1.43(s,6H)。LC/MS:489.2[M+H]+,487.0[M-H]-.
实施例I-465
2-(6-氟-1-甲基-1H-吲唑-3-基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-羧酸(顺式-3-羟基-环丁基)-酰胺
步骤1
向瓶中装入2-(6-氟-1-甲基-1H-吲唑-3-基)-5-(2-三甲基甲硅烷基-乙氧基甲基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-羧酸(250mg,0.57mmol)、3-氨基环丁醇盐酸盐(98mg,0.79mmol)和DMF(2.8mL)。添加N,N-二异丙基乙胺(266mg,0.36mL,2.06mmol),接着添加HATU(237mg,0.62mmol)。将黄色的溶液在室温搅拌过夜(形成沉淀)。以水和石油醚稀释反应混合物。将悬浮液经过滤。将固体以水和少量石油醚洗涤。将所得灰白色粉末经真空干燥。将顺式-和反式-产物的混合物(265mg灰白色粉末)经历通过SFC色谱(KROMASIL OD3x25cm,25%MeOH/CO2+0.1%三乙胺)的进一步分离得到139mg(48%)2-(6-氟-1-甲基-1H-吲唑-3-基)-5-(2-三甲基甲硅烷基-乙氧基甲基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-羧酸(顺式-3-羟基-环丁基)-酰胺,为灰白色固体,和102mg(35%)2-(6-氟-1-甲基-1H-吲唑-3-基)-5-(2-三甲基甲硅烷基-乙氧基甲基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-羧酸(反式-3-羟基-环丁基)-酰胺,为灰白色固体。
步骤2
在烧瓶中,将2-(6-氟-1-甲基-1H-吲唑-3-基)-5-(2-三甲基甲硅烷基-乙氧基甲基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-羧酸(顺式-3-羟基-环丁基)-酰胺(138mg,0.27mmol)溶解于二氯甲烷(1.3mL)中。添加三氟乙酸(0.84mL,10.9mmol),且将橙色溶液在室温搅拌2小时。将反应混合物浓缩。将残余物(浅橙色泡沫)悬浮于二氯甲烷(1.3mL)并添加乙二胺(1.1mL,16.3mmol)。将浅黄色悬浮液在室温搅拌1小时。以水和乙酸乙酯稀释反应混合物。将悬浮液经过滤,并以水(热)和乙酸乙酯洗涤。将所得灰白色粉末真空干燥得到81mg(79%)2-(6-氟-1-甲基-1H-吲唑-3-基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-羧酸(顺式-3-羟基-环丁基)-酰胺。LC/MS:[M-H]-=379.
1H NMR(DMSO-d6,400MHz):δ(ppm)12.40-12.97(宽单峰,1H),9.12(s,1H),8.58(dd,J=9.0,5.4Hz,1H),8.43(s,1H),8.37(d,J=8.3Hz,1H),7.73(dd,J=9.9,2.3Hz,1H),7.30(td,J=9.2,2.1Hz,1H),5.31(d,J=4.5Hz,1H),4.17(s,3H),4.08-4.16(m,1H),3.94-4.03(m,1H),2.73-2.84(m,2H),1.91(qd,J=8.6,2.8Hz,2H).
实施例I-466
2-(6-氟-1-甲基-1H-吲唑-3-基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-羧酸(反式-3-羟基-环丁基)-酰胺
在烧瓶中,将2-(6-氟-1-甲基-1H-吲唑-3-基)-5-(2-三甲基甲硅烷基-乙氧基甲基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-羧酸(反式-3-羟基-环丁基)-酰胺(100mg,0.20mmol)溶解于二氯甲烷(1.0mL)中。添加三氟乙酸(0.61mL,7.92mmol)并且将橙色溶液在室温搅拌2小时。将反应混合物经浓缩。将残余物(浅橙色泡沫)悬浮于二氯甲烷(1.0mL)中并添加乙二胺(0.80ml,11.8mmol)。将浅黄色悬浮液在室温搅拌1小时。以水和乙酸乙酯稀释反应混合物。将悬浮液经过滤并以水(热)和乙酸乙酯洗涤。将所得灰白色粉末经真空干燥得到55mg(66%;纯度=90%)2-(6-氟-1-甲基-1H-吲唑-3-基)-5H-吡咯并[2,3-b]吡嗪-7-羧酸(反式-3-羟基-环丁基)-酰胺。LC/MS:[M-H]-=379.1H NMR(DMSO-d6,400MHz):δ(ppm)12.31-12.64(宽单峰,1H),9.10(s,1H),8.52(dd,J=9.0,5.2Hz,1H),8.43(s,1H),8.36(d,J=7.1Hz,1H),7.72(dd,J=9.7,2.1Hz,1H),7.20(td,J=9.1,2.3Hz,1H),5.19-5.26(m,1H),4.52-4.61(m,1H),4.44-4.61(m,1H),4.16(s,3H),2.25-2.40(m,4H).
生物实施例
JAK测定信息
Janus激酶(JAK)抑制的IC50的确定:
所使用的酶和肽底物如下所述:
JAK1:来自Invitrogen的重组人激酶域(Cat#PV4774)
JAK3:来自Millipore的重组人激酶域(Cat#14-629)或制备得到。
JAK2:来自Millipore的重组人激酶域(Cat#14-640)
底物:N-末端的生物素化的14-聚体(14-mer)肽,衍生自JAK1的活化环,肽底物序列:生物素-KAIETDKEYYTVKD
所使用的测定条件描述如下:
测定缓冲液:JAK激酶缓冲液:50mM Hepes[pH7.2],10mM MgCl2,1mMDTT,1mg/ml BSA。该测定在该缓冲液中实施。
测定规格:所有三种JAK激酶的激酶活性使用放射性、终末点测定且使用痕量的33P-ATP来测量。该测定在96孔聚丙烯板中实施。
实验方法:
所有浓度为在反应混合物中的最终浓度,且所有孵育都在室温实施。测定步骤描述如下:
1)将化合物连续稀释在100%DMSO中,典型地以10x稀释,起始浓度为1mM。DMSO在反应混合物中的最终浓度为10%。
2)将化合物以酶(0.5nM JAK3(市售可得)、0.2nM JAK3(制备的)、1nMJAK2、5nM JAK1)预孵育10分钟。
3)反应通过添加两种底物(预混在JAK激酶缓冲液的ATP和肽)的混合液来启动。在JAK2/JAK3测定中,ATP和肽分别以1.5uM和50uM的浓度使用。JAK1测定以10uM的ATP浓度和50uM的肽浓度来实施。
4)JAK2和JAK3的测定持续时间为20分钟。JAK1测定实施40分钟。使用所有三种酶,反应通过添加0.5M EDTA至最终浓度为100mM而终止。
5)将25ul的终止反应混合物转移至在96孔板、1.2um MultiScreen-BV滤板中的150ul的7.5%(v/v)的链菌素包衣的琼脂糖珠在不含MgCl2和CaCl21x磷酸盐缓冲盐水(含50mM的EDTA)中的浆料。
6)在30分钟孵育后,以如下缓冲液真空洗涤所述珠:
a.以200ul的2M NaCl洗涤3~4次。
b.以200ul的2M NaCl加1%(v/v)磷酸洗涤3~4次。
c.以水洗涤1次。
7)在60℃烘箱中干燥洗涤板1~2小时。
8)将70ul的Microscint20闪烁液体添加至滤板的各孔中,且在孵育至少30分钟后,放射性计数在Perkinelmer微孔板闪烁计数器中测量。
SYK测定信息
脾酪氨酸激酶(SYK)抑制的IC50的确定:
SYK激酶测定为适于96孔板规格的标准激酶测定。该测定在96孔规格中实施用于使用8个样品确定IC50,该8个样品代表10个半对数稀释和40μL反应体积。该测定测量放射性标记的33PγATP至N-末端生物素化肽底物的结合,其衍生自天然存在的磷受体一致序列(生物素-11aa DY*E)。磷酸化产物在与EDTA的反应结束和添加链菌素包衣的珠时检测。
测定板:96孔MultiScreen0.65um滤板(Millipore登录号:MADVNOB10)
链菌素包衣的珠:Streptavidin Sepharose TM,悬浮液5.0mL,以50mMEDTA/PBS稀释(1:100),(Amersham,登录号:17-5113-01)
化合物:10mM在100%二甲基亚砜(DMSO)中,最终浓度:化合物0.003-100uM在10%DMSO中
酶:SYK RPA纯化、截断结构的脾酪氨酸激酶aa360-635,储备溶液1mg/mL,MW:31.2KDa,最终浓度:0.0005μM。
肽1:生物素化肽衍生自天然存在的磷受体一致序列(生物素-EPEGDYEEVLE),特别订购自QCB,储备溶液20mM,最终浓度:5.0μM。
ATP:腺苷-5’-三磷酸20mM,(ROCHE登录号:93202720),最终浓度:20μM
缓冲液:HEPES:2-羟基乙基哌嗪-2-乙磺酸(Sigma,登录号:H-3375),最终浓度:50mM HEPES pH7.5
BSA:牛血清白蛋白组分V,无脂肪酸(Roche Diagnostics GmbH,登录号9100221),稀释至0.1%的最终浓度
EDTA:EDTA存储溶液500mM,(GIBCO,登录号:15575-038),最终浓度:0.1mM
DTT:1,4-二硫苏糖醇(Roche Diagnostics GmbH,登录号:197777),最终浓度:1mM
MgCl2x6H2O:MERCK,登录号:105833.1000,最终浓度:10mM
测定稀释缓冲液(ADB):50mM HEPES,0.1mM EGTA,0.1mM钒酸钠,0.1mMβ-甘油磷酸盐,10mM MgCl2,1mM DTT,0,1%BSA,pH7.5
珠洗涤缓冲液:10g/L PBS(磷酸盐缓冲盐水),含2M NaCl+1%磷酸。
实验方法:
在40μL体积中,将以26μL的ADB稀释、纯化的重组人SYK360-635[0.5nM]与4μL的10X浓度的测试化合物[通常100μM-0.003μM]在[10%]DMSO中混合,且将混合物在RT孵育10分钟。
激酶反应通过添加10μL4x底物混合液(含DYE肽底物[0或5μM]、ATP[20μM]和33PγATP[2μCi/rxn])启动。在30℃孵育15分钟后,反应通过将25μL反应样品转移至96孔0.65μm Millipore MADVNOB膜/板(在PBS中含200μL5mM EDTA和20%链菌素包衣的珠)来终止。
将未结合的放射性核苷酸以3x250μL2M NaCl、2x250μL2M NaCl+1%磷酸、1x250μL H2O真空洗涤。在最后洗涤后,将膜/板转移至适配器板,于60℃加热干燥15分钟,且向各孔添加50μL闪烁混合液,并且4小时后,在顶部计数器中对放射性的数量进行计数。
抑制百分比基于未抑制酶率来计算:
%抑制=100/(1+(IC50/抑制剂浓度)n)
以Xlfit软件(ID Business Solution Ltd.,Guilford,Surrey,UK)使用非线性曲线拟合来计算IC50
JAK3和SYK测定的代表性IC50示于下表II中:
表II.
出于清楚和理解的目的,已经通过示例说明和实施例在一定程度上详细地描述了前述发明。对于本领域技术人员明显的是,可以在所附权利要求的范围内进行改变和变化。因此,应当理解的是,上述说明意在示例说明,而不是限制。因此,本发明的范围应当不参考上述说明进行确定,而应当参考所附权利要求以及等同于这些权利要求的全部范围进行确定。
对于所有的目的,以如同将每一篇单独的专利、专利申请或公开被单独提到那样的相同程度将所有在本申请中引用的专利、专利申请以及公开都以其全部内容引入本申请作为参考。

Claims (26)

1.式I化合物或其药用盐
其中:
R为H;
R’为低级烷氧基或
或R和R’一起形成杂环烷基,其任选被–CN取代;
R1为H或R1a
R1a为低级烷基、环烷基、低级烷氧基、羟基低级烷基或卤代低级烷基;
R1’为H或低级烷基;
或R1a和R1’一起形成杂环烷基、环烷基、茚满-1-基、苯基或杂芳基,它们任选被一个或多个R1”取代;
各R1”独立地为羟基、氨基、氧代、低级烷基、–C(=O)NH2、–CN、卤代低级烷基、苄基、氰基低级烷基或–NHC(=O)OC(CH3)3
R2为H、羟基、–CN、–C(=O)NH2、–C(=O)OH、–C(=O)OC(CH3)3、R2a或R2b
R2a为低级烷基、苯基、苯基低级烷基、环烷基、杂芳基、杂环烷基、杂环烷基低级烷基、杂芳基低级烷基、苯基低级烷氧基、低级烷氧基,它们任选被一个或多个R2a’取代;
各R2a’独立地为羟基、–CN、氨基、低级烷基磺酰基氨基、低级烷氧基、卤代、低级烷基、氰基低级烷基、卤代低级烷基、低级烷基磺酰基、氧代、卤代低级烷氧基、环烷基、–C(=O)OCH3
R2b为–C(=O)R3或–CH2C(=O)R3
R3为杂环烷基,其任选被一个或多个R3’取代;
各R3’独立地为–CN、卤代、低级烷基或低级烷基磺酰基;
Q为5,6-二环杂芳基环系、6,6-二环杂芳基环系、5,5-二环杂芳基环系、6,5-二环杂芳基环系或5,7-二环杂芳基环系,它们任选被一个或多个Qa或Qb取代;
各Qa独立地为卤代、–CN、羟基或–(CH2)nC(=O)Qa’
各Qa’独立地为羟基、氨基或杂环烷基,其中杂环烷基任选被一个或多个Qa”取代;
各Qa”独立地为低级烷基或卤代低级烷基;
n为1、2或3;
各Qb独立地为低级烷基、环烷基、低级烷氧基、苯氧基、低级烷基磺酰基、杂环烷基、杂环烷基低级烷基或杂芳基低级烷基,它们任选被一个或多个Qb’取代;且
各Qb’独立地为羟基、卤代、–CN、氨基、杂环烷基、低级烷基、苄基或低级烷基磺酰基。
2.根据权利要求1的化合物,其中R为H且R’为
3.根据权利要求1或2的化合物,其中R1’为H或低级烷基。
4.根据权利要求1至3中任一项的化合物,其中R1为低级烷基。
5.根据权利要求1至3中任一项的化合物,其中R1和R1’均为H。
6.根据权利要求1至4中任一项的化合物,其中R2为–C(=O)R3
7.根据权利要求1至4中任一项的化合物,其中R2为低级烷基,其任选被一个或多个R2a’取代。
8.根据权利要求1至7中任一项的化合物,其中Q为5,6-二环杂芳基环系,其任选被一个或多个Qa或Qb取代。
9.根据权利要求1的化合物,其中Q为吲唑-3-基,其任选被一个或多个Qa或Qb取代。
10.根据权利要求1或9的化合物,其中Qa为卤代或低级烷基。
11.根据权利要求1、9或10的化合物,其中Qb为低级烷基。
12.根据权利要求1、9至11中任一项的化合物,其中R1a和R1’一起形成杂环烷基或环烷基,它们任选被一个或多个R1”取代。
13.根据权利要求1、9至12中任一项的化合物,其中R1”为氨基或–CN。
14.根据权利要求1、9至13中任一项的化合物,其中R2为低级烷基。
15.化合物,其选自表I中所列的化合物。
16.治疗炎性病症或自身免疫性病症的方法,包括向有此需要的患者给予治疗有效量的权利要求1-15中任一项的化合物。
17.权利要求16的方法,进一步包括给予选自以下的额外治疗剂:化学治疗或抗增殖剂、抗炎剂、免疫调节或免疫抑制剂、神经营养因子、心血管疾病的治疗剂、糖尿病的治疗剂或免疫缺陷疾病的治疗剂。
18.治疗类风湿性关节炎的方法,其包括向有此需要的患者给予治疗有效量的权利要求1-15中任一项的化合物。
19.治疗哮喘的方法,其包括向有此需要的患者给予治疗有效量的权利要求1-15中任一项的化合物。
20.治疗免疫疾病的方法,其包括向有此需要的患者给予治疗有效量的权利要求1-15中任一项的化合物,所述免疫疾病包括狼疮、多发性硬化、类风湿性关节炎、银屑病、I型糖尿病、来自器官移植物的并发症、异种移植、糖尿病、癌症、哮喘、特应性皮炎、自身免疫性甲状腺疾病、溃疡性结肠炎、克罗恩病、阿尔茨海默病和白血病。
21.药物组合物,其包含权利要求1-15中任一项的化合物与至少一种药用载体、赋形剂或稀释剂的混合物。
22.权利要求21的药物组合物,其进一步包含选自以下的额外治疗剂:化学治疗或抗增殖剂、抗炎剂、免疫调节或免疫抑制剂、神经营养因子、心血管疾病的治疗剂、糖尿病的治疗剂和免疫缺陷疾病的治疗剂。
23.权利要求1-15中任一项的化合物在制备用于治疗炎性病症或自身免疫性病症的药物中的用途。
24.权利要求1-15中任一项的化合物在制备用于治疗关节炎或哮喘的药物中的用途。
25.权利要求1-15中任一项的化合物,用于治疗关节炎或哮喘。
26.如本发明所述的化合物、方法、组合物或用途。
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