CN103725686A - 黄曲霉毒素b1的核酸适体afb1-20及其应用 - Google Patents

黄曲霉毒素b1的核酸适体afb1-20及其应用 Download PDF

Info

Publication number
CN103725686A
CN103725686A CN201410015498.9A CN201410015498A CN103725686A CN 103725686 A CN103725686 A CN 103725686A CN 201410015498 A CN201410015498 A CN 201410015498A CN 103725686 A CN103725686 A CN 103725686A
Authority
CN
China
Prior art keywords
afb
aptamer
beads
afb1
aflatoxin
Prior art date
Legal status (The legal status is an assumption and is not a legal conclusion. Google has not performed a legal analysis and makes no representation as to the accuracy of the status listed.)
Granted
Application number
CN201410015498.9A
Other languages
English (en)
Other versions
CN103725686B (zh
Inventor
杨朝勇
朱玲
邹远
刘如迪
朱志
庄峙厦
Current Assignee (The listed assignees may be inaccurate. Google has not performed a legal analysis and makes no representation or warranty as to the accuracy of the list.)
Xiamen University
Original Assignee
Xiamen University
Priority date (The priority date is an assumption and is not a legal conclusion. Google has not performed a legal analysis and makes no representation as to the accuracy of the date listed.)
Filing date
Publication date
Application filed by Xiamen University filed Critical Xiamen University
Priority to CN201410015498.9A priority Critical patent/CN103725686B/zh
Publication of CN103725686A publication Critical patent/CN103725686A/zh
Application granted granted Critical
Publication of CN103725686B publication Critical patent/CN103725686B/zh
Expired - Fee Related legal-status Critical Current
Anticipated expiration legal-status Critical

Links

Images

Landscapes

  • Measuring Or Testing Involving Enzymes Or Micro-Organisms (AREA)

Abstract

黄曲霉毒素B1的核酸适体AFB1-20及其应用,涉及一种核酸。还涉及所述核酸适体的衍生物,包括截短核酸适体及其制备方法与应用。所述黄曲霉毒素B1的核酸适体是通过基于琼脂糖微珠分离-流式细胞术分析的亲和SELEX方法筛选制备。所述黄曲霉毒素B1的核酸适体及其衍生物富含G碱基,具有茎环结构,亲和力高,稳定性好,无毒,易于合成和标记,可作为样品中黄曲霉毒素B1的一种潜在分离富集和检测试剂。

Description

黄曲霉毒素B1的核酸适体AFB1-20及其应用
技术领域
本发明涉及一种核酸,特别是涉及黄曲霉毒素B1的核酸适体AFB1-20及其应用。
背景技术
在粮油食品的生物性污染问题中,真菌毒素的污染是最主要的因素之一,而黄曲霉毒素(Aflatoxins,AF)是迄今发现的毒性和致癌性最强的天然污染物。黄曲霉毒素是由黄曲霉菌和寄生曲霉菌等产生的一组化学结构类似的次生代谢产物,具有二呋喃环和氧杂萘邻酮(香豆素)的基本结构,目前已发现20多种,主要包括B1、B2、G1、G2、M1和M2等。其中,AFB1的毒性最强,存在量最大,稳定性也最高,其毒性为氰化钾的10倍、砒霜的68倍,主要作用于肝脏等器官,可诱发原发性肝癌、胃癌和肺癌等,并于1993年被世界卫生组织癌症研究机构划定为一类致癌物。AFB1广泛存在于土壤和动植物中,尤其是植物性食物,如花生、玉米、大米、小麦、牛奶和各种坚果等。AFB1的理化性质比较稳定,脂溶性,耐热,难以去毒,对人和动物的健康产生极大的危害。AFB1含量是国际食品卫生和农产品贸易中的必检指标,许多国家均制定了其在食品中允许量的国家标准。因此,对AFB1开展有效、快速、高灵敏检测具有重要的意义。(1.Wogan,G.N.Chemical nature and biological effects of theaflatoxins.Bacteriol Rev1966,30,460-470;2.Shankaran,R.;Raj,H.G.;Venkitasubramanian,T.A.Biochemical changes in liver due to aflatoxin.Br J ExpPathol1970,51,487-491)。
目前,常用的AFB1检测方法概况起来主要有化学分析法和免疫分析法。化学分析法主要有薄层层析色谱法(TLC)、高效液相色谱法(HPLC)和微柱法等,这些常规检测方法具备了较高的检测灵敏度和准确度,但存在繁杂的样品前处理、分离检测耗时、仪器设备昂贵笨重而难以实现现场快速分析、需要专业技术人员等缺点。免疫分析法主要是基于抗黄曲霉毒素单克隆抗体的高亲和力和高特异性发展的一系列免疫学检测方法,其中的酶联免疫吸附法(ELISA)灵敏度高、安全性好、干扰少,操作简便快速,是目前最普遍实用的AFB1的检测方法。但AFB1是一种剧毒小分子,其抗体的制备存在较大困难,试剂寿命较短难保存,批间差异也较大等,这些瓶颈限制了免疫学检测方法的应用范围和快速发展(3.Jin Hwan Do;Dong-Kug Choi.Aflatoxins:Detection,Toxicity,and Biosynthesis.Biotechnology andBioprocess Engineering2007,12,585-593;4.Liu Z.;Gao J..Advances in researchon detection methods for aflatoxins.Journal of Anhui Agricultural University2004,31,223-226)。因此,面向AFB1的新型检测试剂和检测方法亟待发展。
核酸适体(aptamer)是一类新型功能性核酸分子探针,基于指数富集配体系统进化技术(SELEX)从随机寡核苷酸文库中体外筛选获得,被誉为“人工抗体”,能与靶分子高亲和力和高特异性结合,具有筛选周期短、化学合成便捷经济且无批量差异、稳定性高、易于精确定点修饰等诸多优点,是潜在的抗体替代物,在生化分析检测领域显示出巨大的应用前景。目前,基于核酸适体的识别与检测方法逐渐成为一种新的普遍适用的技术(5.Liu,J.;Cao,Z.;Lu,Y.Functional nucleic acid sensors.Chem Rev2009,109,1948-1998;6.Clark,S.L.;Remcho,V.T.Aptamers as analytical reagents.Electrophoresis2002,23,1335-1340)。核酸适体技术应用于真菌毒素检测分析的生物传感器正处于积极开发研制中。例如,赭曲霉毒素A(Ochratoxin A,OTA)和伏马毒素B1(Fumonisin B1,FB1)等多种真菌毒素的核酸适体已经筛选出来,并发展了多种检测体系(7.Screening and Initial BindingAssessment of Fumonisin B1Aptamers Int.J.Mol.Sci.2010,11,4864-4881.8.Determination of Ochratoxin A with a DNA Aptamer.J.Agric.Food Chem.2008,56,10456–10461.9.Yang,C.;Wang,Y.;Marty,J.;Yang,X.Aptamer-Based ColorimetricBiosensing of Ochratoxin A using Unmodified Gold Nanoparticles Indicator.Biosens.Bioelectron.2010.10.Kuang,H.;Chen,W.;Xu,D.;Xu,L.;Zhu,Y.;Liu,L.;Chu,H.;Peng,C.;Xu,C.;Zhu,S.Fabricated Aptamer-Based Electrochemical“signal-Off”Sensor of Ochratoxin A.Biosens.Bioelectron.2010,26,710–716)。因此,筛选AFB1的特异性核酸适体并发展核酸适体技术用于AFB1的检测新方法具有重要的研究意义和市场应用价值。
发明内容
本发明的第一目的在于提供黄曲霉毒素B1的核酸适体AFB1-20。该核酸适体应用基于琼脂糖微珠分离-流式细胞术分析的亲和SELEX技术筛选获得,能够高亲和力识别黄曲霉毒素B1
本发明的第二目的在于提供黄曲霉毒素B1的核酸适体AFB1-20的衍生物,包括截短核酸适体。
本发明的第三目的在于提供黄曲霉毒素B1的核酸适体AFB1-20及其衍生物作为样品中黄曲霉毒素B1的一种潜在检测试剂的应用。
本发明的第四目的在于提供黄曲霉毒素B1的核酸适体AFB1-20及其衍生物用于样品中黄曲霉毒素B1的分离富集的应用。
所述黄曲霉毒素B1的核酸适体AFB1-20,其序列如下:
ATACCAGCTTATTCAATTGGGGCGTTGCATTGGTGGGTAGGTGGCGGGGGGAGTTCAGGCTGGAGATAGTAAGTGCAATCT
所述黄曲霉毒素B1的核酸适体AFB1-20的衍生物,包括具有相同功能用途的截短核酸适体,分别命名为[AFB1-20]-00、[AFB1-20]-11、[AFB1-20]-22和[AFB1-20]-33,其序列分别为:
[AFB1-20]-00:
CCAGCTTATTCAATTGGGGCGTTGCATTGGTGGGTAGGTGGCGGGGGGAGTTCAGGCTGG
[AFB1-20]-11:
ACCAGCTTATTCAATTGGGGCGTTGCATTGGTGGGTAGGTGGCGGGGGGAGTTCAGGCTGGA
[AFB1-20]-22:
TACCAGCTTATTCAATTGGGGCGTTGCATTGGTGGGTAGGTGGCGGGGGGAGTTCAGGCTGGAG
[AFB1-20]-33:
ATACCAGCTTATTCAATTGGGGCGTTGCATTGGTGGGTAGGTGGCGGGGGGAGTTCAGGCTGGAGA
所述黄曲霉毒素B1的核酸适体AFB1-20,利用OligoAnalyzer3.1在线软件模拟其二级结构,具有一种可能的茎环结构,其茎环结构如下:
所述黄曲霉毒素B1的核酸适体AFB1-20的衍生物,包括截短核酸适体[AFB1-20]-00、[AFB1-20]-11、[AFB1-20]-22和[AFB1-20]-33,利用OligoAnalyzer3.1在线软件模拟其二级结构,具有一种可能的茎环结构,其茎环结构如下:
[AFB1-20]-00:
Figure BDA0000456506400000041
[AFB1-20]-11:
Figure BDA0000456506400000042
[AFB1-20]-22:
Figure BDA0000456506400000051
[AFB1-20]-33:
Figure BDA0000456506400000052
所述黄曲霉毒素B1的核酸适体AFB1-20及其衍生物,与靶分子黄曲霉毒素B1结合之后形成的复合物具有荧光偏振响应,并且黄曲霉毒素B1本身的荧光会被猝灭,因此基于荧光偏振技术或荧光光谱方法,所述黄曲霉毒素B1的核酸适体AFB1-20及其衍生物可以作为样品中黄曲霉毒素B1的一种潜在检测试剂,在制备样品中黄曲霉毒素B1检测试剂中的应用。
所述黄曲霉毒素B1的核酸适体AFB1-20及其衍生物,可以结合琼脂糖微珠或者磁珠形成固相萃取系统,用于样品中黄曲霉毒素B1的分离富集,包括以下步骤:
(1)将黄曲霉毒素B1的核酸适体AFB1-20固定在固相载体表面,得到固相载体-核酸适体复合物。其中,固相载体通常为琼脂糖微珠或磁珠;核酸适体与固相载体连接处之间包括一个间隔臂,通常为常规的重复腺嘌呤碱基或胸腺嘧啶碱基序列,长度在12-15bp为佳;核酸适体还化学修饰着配体或受体如生物素或氨基,固相载体表面相应地包被着受体或配体如链霉亲和素或N-N-羟基琥珀酰亚胺,配体和受体发生特异性相互作用将核酸适体偶联到固相载体表面。
(2)固相载体-适体复合物与封闭液反应,以封闭固相载体表面的空余结合位点。封闭液通常为2wt%牛血清白蛋白(BSA)溶液。
(3)固相载体-核酸适体复合物与含有黄曲霉毒素B1的待测样品溶液充分混合,然后分离,充分清洗,去除游离组分,然后从微珠上解离得到单组份黄曲霉毒素B1
本发明的优点在于:1)核酸适体通过基于琼脂糖微珠分离-流式细胞术分析的亲和SELEX技术筛选获得,体外筛选及检测简便快速;2)核酸适体本身是一段寡核苷酸,可以大量化学合成,无批量差异,稳定性好,易于保存;3)核酸适体能高亲和力识别黄曲霉毒素B1,可与抗体媲美;4)核酸适体易于定点修饰标记,应用形式灵活多样,并且黄曲霉毒素B1为有机小分子,本身具有荧光性质,两者性质相结合可发展一系列生物传感器,在检测分析领域的应用前景广阔。5)将功能核酸系统与纳米材料修饰技术互补结合,可为食品中黄曲霉毒素B1提供一种新型、高效和快速的检测分析平台。
附图说明
图1为AFB1-beads的荧光显微镜成像图。图a为对照组Control-beads的明场成像,图b为样品组AFB1-beads的明场成像,图c为对照组Control-beads的荧光暗场成像,图d为样品组AFB1-beads的荧光暗场成像。
图2为AFB1-beads的荧光光谱扫描图。曲线a为样品组AFB1-beads。曲线b为对照组Control-beads。
图3为流式细胞术监测筛选进程中DNA初始文库对于靶分子AFB1-beads富集的荧光偏移图。曲线a为空白AFB1-beads,曲线b为DNA初始文库,曲线c为第4轮富集库,曲线d为第6轮富集库,曲线e为第8轮富集库,曲线f为第11轮富集库。
图4为流式细胞术监测筛选进程中DNA初始文库对于反筛分子COOH-beads富集的荧光偏移图。曲线a为空白COOH-beads,曲线b为DNA初始文库,曲线c为第4轮富集库,曲线d为第6轮富集库,曲线e为第8轮富集库,曲线f为第11轮富集库。
图5为黄曲霉毒素B1与核酸适体结合的荧光偏振响应图。曲线a为空白组自由AFB1,曲线b为对照组随机序列Random,曲线c为样品组核酸适体AFB1-20,曲线d为样品组截短核酸适体[AFB1-20]-00,曲线e为样品组截短核酸适体[AFB1-20]-11,曲线f为样品组截短核酸适体[AFB1-20]-22,曲线g为样品组截短核酸适体[AFB1-20]-33。
图6为黄曲霉毒素B1与核酸适体结合的荧光光谱扫描图。曲线a为空白组自由AFB1,曲线b为对照组随机序列Random,曲线c为样品组核酸适体AFB1-20,曲线d为样品组截短核酸适体[AFB1-20]-00,曲线e为样品组截短核酸适体[AFB1-20]-11,曲线f为样品组截短核酸适体[AFB1-20]-22,曲线g为样品组截短核酸适体[AFB1-20]-33。
图7为荧光偏振技术测定黄曲霉毒素B1与核酸适体AFB1-20的结合曲线图。
图8为荧光偏振技术测定黄曲霉毒素B1与核酸适体[AFB1-20]-00的结合曲线图。
图9为荧光偏振技术测定黄曲霉毒素B1与核酸适体[AFB1-20]-11的结合曲线图。
图10为荧光测定基于核酸适体的固相萃取系统在结合缓冲液中对AFB1的相对萃取效率。■为微珠作为空白对照;●为微珠-随机序列作为特异性对照;▲为微珠-核酸适体。
具体实施方式
实施例1靶标AFB1-beads的合成与表征
以琼脂糖微珠作为靶分子的固相载体,有利于分离未结合或弱结合及非特异性结合序列,并且适用于流式细胞术检测。将AFB1偶联到琼脂糖微珠的合成路线具体如下:
Figure BDA0000456506400000071
取7.6mg AFB1溶于4mL吡啶,加入35mg羧甲基羟胺盐酸盐,80℃回流过夜,经真空浓缩和硅胶柱层析(氯仿/甲醇=10:1),分离出AFB1-oxime并溶于3mL无水二氯甲烷,加入5.4mg NHS、9.6mg二环己基碳二亚胺和5mg二甲氨基吡啶,磁转子搅拌过夜,经过滤和蒸发浓缩,获得AFB1-oxime活化酯(11.Chu,F.S.;Hsia,M.T.;Sun,P.S.:Preparationand characterization of aflatox-n B1-1-(O-carboxymethyl)oxime.Journal-Association of Official Analytical Chemists1977,60,791-794.)。取0.107g NHS-beads分散在900μL磷酸氢二钾缓冲液(50mM,pH9.0)中,加入100μL乙二胺,磁转子搅拌过夜。离心去上清,并用PB缓冲液(0.1M,pH8.0)清洗微珠得到NH2-beads。将AFB1-oxime活化酯溶于0.8mL DMF,NH2-beads分散于0.8mL磷酸氢二钾缓冲液(50mM,pH9.0)中,两者混合,磁转子搅拌过夜,然后用50%DMF和PB缓冲液清洗微珠获得AFB1-beads,4℃避光保存。通过荧光光谱扫描(Ex:365nm;Em:380~600nm)和荧光显微镜成像对AFB1-beads进行表征(参见图1和图2)。
实施例2黄曲霉毒素B1的特异性核酸适体的筛选
(1)随机寡核苷酸文库的设计与合成
设计并合成两端固定区域为18个核苷酸、中间随机区域为45个核苷酸的随机寡核苷酸文库如下:5'-ATA CCA GCT TAT TCA ATT-N45-AGA TAG TAA GTG CAA TCT-3',库容量在1015。所用引物序列分别为正向引物(FP):5'-ATA CCA GCT TAT TCA ATT-3',反向引物(RP):5'-AGA TTG CAC TTA CTA TCT-3',荧光标记引物(FFP):5'-FAM-ATA CCA GCT TAT TCA ATT-3',生物素标记引物(BRP):5'-Bio-AGA TTG CAC TTA CTA TCT-3'(12.Shangguan,D.;Li,Y.;Tang,Z.;Cao,Z.C.;Chen,H.W.;Mallikaratchy,P.;Sefah,K.;Yang,C.J.;Tan,W.Aptamers evolved from live cells as effective molecular probes for cancer study.Proc Natl Acad Sci USA2006,103,11838-11843)。
(2)核酸适体的筛选
AFB1-beads作为靶分子,水解NHS-beads形成的COOH-beads作为反筛分子。
取10nmol初始文库溶于200μL结合缓冲液(20mM Tris-HCl,pH8.0,100mM NaCl,5mM KCl,2mM MgCl2,1mM CaCl2)中,95℃5min,冰浴5min,室温30min。次一级文库均使用200pmol。反筛操作从第三轮开始,将变性处理的文库与2μL COOH-beads室温孵育5min。其过滤收集液与2μL AFB1-beads室温孵育60min。使用结合缓冲液清洗微珠,将结合了DNA的AFB1-beads直接进行PCR放大(使用FP和BRP,94℃3min;94℃15s;50℃15s;72℃15s;72℃3min),并用链酶亲和素微珠吸附和经0.1M的NaOH洗脱得到单链核酸文库,用于下一轮筛选。筛选过程逐轮增加筛选强度,共进行11轮。通过流式细胞术检测文库的富集情况(参见图3和4)。最后将富集收敛库进行克隆测序(13.Hu,J.;Wu,J.;Li,C.;Zhu,L.;Zhang,W.Y.;Kong,G.;Lu,Z.;Yang,C.J.A G-quadruplexaptamer inhibits the phosphatase activity of oncogenic protein Shp2in vitro.Chembiochem.2011,12,424-430)。
实施例3荧光偏振与荧光光谱研究核酸适体与黄曲霉毒素B1间的相互作用
用结合缓冲液(20mM Tris-HCl,pH8.0,100mM NaCl,5mM KCl,2mM MgCl2,1mMCaCl2)配制2μM无标记核酸适体溶液,进行热变性处理,95℃5min,冰浴5min,室温放置30min。然后向其中加入黄曲霉毒素B1使其终浓度为0.2μM,并在室温下孵育30min。空白组为相同条件下单独的黄曲霉毒素B1溶液,对照组为随机序列Random。测定各组溶液体系的荧光各向异性值(Ex:365nm;Em:442nm);对各组溶液体系进行荧光光谱扫描(Ex:365nm;Em:380-650nm)(参见图5和6)。
实施例4核酸适体的亲和力表征
用结合缓冲液(20mM Tris-HCl,pH8.0,100mM NaCl,5mM KCl,2mM MgCl2,1mMCaCl2)配制0-10μM无标记核酸适体溶液,进行热变性处理,95℃5min,冰浴5min,室温放置30min。然后向其中加入黄曲霉毒素B1使其终浓度为0.2μM,并在室温下孵育30min。测定各组溶液体系的荧光各向异性值(Ex:365nm;Em:442nm)。以相对荧光各向异性值对核酸适体浓度作图,利用SigmaPlot10.0软件根据公式y=Bmax x/(Kd+x)进行拟合得到结合解离常数Kd(参见图7~9)。
实施例5基于核酸适体的固相萃取系统分离富集样品中的AFB1
所用固相载体为包被链霉亲和素的琼脂糖微珠,取30μL微珠,按照产品说明书要求用1x偶联缓冲液(20mM Na3PO4,pH7.5,150mM NaCl,)平衡洗涤3次,最后为150μL微珠溶液。然后将50μL浓度为100μM生物素标记的核酸适体经热变性处理之后,加入到上述150μL微珠溶液中,室温轻轻混合30min。微珠-核酸适体复合物用洗涤缓冲液(20mM Na3PO4,pH7.5,150mM NaCl,0.1%Tween20)洗涤3次。加入200μL2wt%牛血清白蛋白(BSA)溶液,室温封闭30min。然后用洗涤缓冲液(20mM Tris-HCl,pH7.5,0.1%Tween20,2wt%BSA)洗涤3次,用结合缓冲液(20mM Tris-HCl,pH8.0,100mM NaCl,5mM KCl,2mM MgCl2,1mM CaCl2)平衡3次,并悬浮于300μL结合缓冲液中。用结合缓冲液配制450μL不同浓度(5~100nM)的黄曲霉毒素B1溶液,加入上述50μL微珠-核酸适体复合物,室温反应2h。离心分离,取上清,测定荧光值。然后从微珠上解离得到单组份黄曲霉毒素B1。用链霉亲和素包被的琼脂糖微珠作为空白对照;用微珠-随机序列复合物作为特异性对照(参见图10)。
结果
实施例1按照在AFB1上加一个羧基,与NH2-beads通过形成稳定的酰胺键的基本思路进行偶联成功合成AFB1-beads,并通过荧光显微镜成像和荧光扫描光谱对其形貌和偶联含量进行表征。如图1所示,在暗场荧光成像中,相对于没有经AFB1修饰的Control-beads,AFB1-beads发出明显的荧光;如图2所示,在365nm紫外光照射下,AFB1-beads在425nm处发出荧光,比Control-beads的荧光值高6倍左右。由此可知,AFB1-beads偶联成功。琼脂糖微珠上AFB1的偶联含量通过基于荧光扫描光谱建立标准工作曲线进行测定,估测为4.5fmol AFB1/beads。
实施例2基于琼脂糖微珠分离-流式细胞术分析的亲和SELEX技术筛选成功获得能够高亲和力识别黄曲霉毒素B1的核酸适体。如图3所示,对于正筛靶分子AFB1-beads,初始库没有明显的荧光偏移,基本上不与AFB1-beads结合,随着筛选轮数的增加,第4、6、8、11轮富集库的荧光偏移逐渐增大,第11轮富集库的荧光偏移强度达到初始库的300倍,说明富集库中与AFB1-beads结合的序列在筛选过程中逐渐富集;如图4所示,对于反筛分子COOH-beads,初始库、第4、6、8、11轮富集库都没有明显的荧光偏移,都不与COOH-beads结合。说明从随机寡核苷酸文库中筛选富集得到了与AFB1-beads结合的核酸序列,因此将第11轮富集库送去克隆测序。
实施例3通过荧光偏振分析和荧光光谱扫描分析研究了核酸适体与靶分子黄曲霉毒素B1之间的结合相互作用,因而验证了所述核酸适体可以作为样品中黄曲霉毒素B1的一种潜在检测试剂。如图5示,不存在核酸适体时,自由的黄曲霉毒素B1由于其本身是有机小分子,分子量仅为312.27g/mol,转动很快,测得其荧光各向异性值约为0.022;当核酸适体AFB1-20、[AFB1-20]-00、[AFB1-20]-11、[AFB1-20]-22或[AFB1-20]-33存在时,测得其荧光各向异性值分别增加到约为0.099、0.074、0.096、0.080和0.085;而当对照随机序列Random存在时,其荧光各向异性值约为0.030,没有明显增加。由此说明所述核酸适体及其截短核酸适体与靶分子黄曲霉毒素B1之间的特异结合相互作用。如图6示,在所用缓冲体系条件下,黄曲霉毒素B1在紫外光365nm照射下,在442nm处发射荧光;当核酸适体AFB1-20、[AFB1-20]-00、[AFB1-20]-11、[AFB1-20]-22或[AFB1-20]-33存在时,其最大发射波长处荧光值分别出现了非常显著的降低;而当对照随机序列Random存在时,相应的荧光值仅稍有降低。由此说明所述核酸适体或其截短核酸适体与靶分子黄曲霉毒素B1结合之后,荧光可能发生猝灭。
实施例4通过荧光偏振技术测定了核酸适体对靶分子AFB1的结合亲和力。如图7~9所示,黄曲霉毒素B1的核酸适体AFB1-20、[AFB1-20]-00和[AFB1-20]-11的结合解离常数Kd分别为0.27±0.056μM、0.38±0.087μM和0.15±0.045μM,展现了非常高的结合亲和力。
实施例5建立基于核酸适体的固相萃取系统用于样品中AFB1的分离富集。选择在[AFB1-20]-11的5端加入一段15bp dT的间隔臂,化学修饰上生物素,偶联到链霉亲和素包被的琼脂糖微珠上,作为固相萃取吸附剂。在结合缓冲液中,用微珠-核酸适体固相萃取系统来萃取不同浓度的AFB1,利用萃取前后体系中AFB1的荧光强度差测定相对萃取效率。如图10所示,链霉亲和素包被的微珠作为空白,Random作为对照,两者的萃取效率基本在0上下微小波动,但随着体系中AFB1含量的增加,微珠-核酸适体固相萃取系统的萃取效率不断增加。因此说明基于核酸适体的固相萃取系统可以应用于样品中AFB1的分离富集,其既具有常规固相萃取系统中吸附剂无法比拟的选择性,又比免疫萃取柱稳定、廉价。
Figure IDA0000456506490000011

Claims (8)

1.黄曲霉毒素B1的核酸适体AFB1-20,其特征在于其序列如下:
ATACCAGCTTATTCAATTGGGGCGTTGCATTGGTGGGTAGGTGGCGGGGGGAGTTCAGGCTGGAGATAGTAAGTGCAATCT。
2.如权利要求1所述黄曲霉毒素B1的核酸适体AFB1-20的衍生物,其特征在于与所述黄曲霉毒素B1的核酸适体AFB1-20具有相同功能用途的截短核酸适体,分别命名为[AFB1-20]-00、[AFB1-20]-11、[AFB1-20]-22和[AFB1-20]-33,其序列分别为:
[AFB1-20]-00:
CCAGCTTATTCAATTGGGGCGTTGCATTGGTGGGTAGGTGGCGGGGGGAGTTCAGGCTGG
[AFB1-20]-11:
ACCAGCTTATTCAATTGGGGCGTTGCATTGGTGGGTAGGTGGCGGGGGGAGTTCAGGCTGGA
[AFB1-20]-22:
TACCAGCTTATTCAATTGGGGCGTTGCATTGGTGGGTAGGTGGCGGGGGGAGTTCAGGCTGGAG
[AFB1-20]-33:
ATACCAGCTTATTCAATTGGGGCGTTGCATTGGTGGGTAGGTGGCGGGGGGAGTTCAGGCTGGAGA。
3.如权利要求1所述黄曲霉毒素B1的核酸适体AFB1-20,其特征在于其具有一种可能的茎环结构。
4.如权利要求2所述黄曲霉毒素B1的核酸适体AFB1-20的衍生物,其特征在于其具有一种可能的茎环结构。
5.如权利要求1所述黄曲霉毒素B1的核酸适体AFB1-20在制备样品中黄曲霉毒素B1检测试剂中的应用。
6.如权利要求2所述黄曲霉毒素B1的核酸适体AFB1-20的衍生物在制备样品中黄曲霉毒素B1检测试剂中的应用。
7.如权利要求1所述黄曲霉毒素B1的核酸适体AFB1-20在分离富集样品中黄曲霉毒素B1的应用。
8.如权利要求2所述黄曲霉毒素B1的核酸适体AFB1-20的衍生物在分离富集样品中黄曲霉毒素B1的应用。
CN201410015498.9A 2014-01-14 2014-01-14 黄曲霉毒素b1的核酸适体afb1-20及其应用 Expired - Fee Related CN103725686B (zh)

Priority Applications (1)

Application Number Priority Date Filing Date Title
CN201410015498.9A CN103725686B (zh) 2014-01-14 2014-01-14 黄曲霉毒素b1的核酸适体afb1-20及其应用

Applications Claiming Priority (1)

Application Number Priority Date Filing Date Title
CN201410015498.9A CN103725686B (zh) 2014-01-14 2014-01-14 黄曲霉毒素b1的核酸适体afb1-20及其应用

Publications (2)

Publication Number Publication Date
CN103725686A true CN103725686A (zh) 2014-04-16
CN103725686B CN103725686B (zh) 2016-04-27

Family

ID=50449979

Family Applications (1)

Application Number Title Priority Date Filing Date
CN201410015498.9A Expired - Fee Related CN103725686B (zh) 2014-01-14 2014-01-14 黄曲霉毒素b1的核酸适体afb1-20及其应用

Country Status (1)

Country Link
CN (1) CN103725686B (zh)

Cited By (6)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Publication number Priority date Publication date Assignee Title
CN104651369A (zh) * 2015-02-06 2015-05-27 河南省农业科学院 黄曲霉毒素b1核酸适配体及其在样品磁分离中的应用
CN105675565A (zh) * 2016-01-24 2016-06-15 湖南科技大学 一种快速检测黄曲霉毒素b1的方法
CN110592092A (zh) * 2019-08-09 2019-12-20 深圳市检验检疫科学研究院 适配体功能材料及其制备方法和在ota检测的应用
CN114807147A (zh) * 2021-01-19 2022-07-29 中国科学院苏州纳米技术与纳米仿生研究所 黄曲霉毒素b1的核酸适配体及其应用
US20220291208A1 (en) 2021-06-07 2022-09-15 Jiangnan University Method for Detecting Aflatoxin B1 Based on Fluorescent Copper Nanoparticles
WO2022257295A1 (zh) * 2021-06-07 2022-12-15 江南大学 一种基于荧光铜纳米粒子检测黄曲霉毒素b1的方法

Citations (2)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Publication number Priority date Publication date Assignee Title
CN102517289A (zh) * 2011-11-25 2012-06-27 国家纳米技术与工程研究院 黄曲霉毒素b1核酸适体及其应用
CN102952802A (zh) * 2012-09-29 2013-03-06 江南大学 一组特异识别黄曲霉毒素b1的寡核苷酸适配子

Patent Citations (2)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Publication number Priority date Publication date Assignee Title
CN102517289A (zh) * 2011-11-25 2012-06-27 国家纳米技术与工程研究院 黄曲霉毒素b1核酸适体及其应用
CN102952802A (zh) * 2012-09-29 2013-03-06 江南大学 一组特异识别黄曲霉毒素b1的寡核苷酸适配子

Cited By (9)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Publication number Priority date Publication date Assignee Title
CN104651369A (zh) * 2015-02-06 2015-05-27 河南省农业科学院 黄曲霉毒素b1核酸适配体及其在样品磁分离中的应用
CN105675565A (zh) * 2016-01-24 2016-06-15 湖南科技大学 一种快速检测黄曲霉毒素b1的方法
CN105675565B (zh) * 2016-01-24 2018-10-09 湖南科技大学 一种快速检测黄曲霉毒素b1的方法
CN110592092A (zh) * 2019-08-09 2019-12-20 深圳市检验检疫科学研究院 适配体功能材料及其制备方法和在ota检测的应用
CN114807147A (zh) * 2021-01-19 2022-07-29 中国科学院苏州纳米技术与纳米仿生研究所 黄曲霉毒素b1的核酸适配体及其应用
CN114807147B (zh) * 2021-01-19 2023-08-15 中国科学院苏州纳米技术与纳米仿生研究所 黄曲霉毒素b1的核酸适配体及其应用
US20220291208A1 (en) 2021-06-07 2022-09-15 Jiangnan University Method for Detecting Aflatoxin B1 Based on Fluorescent Copper Nanoparticles
WO2022257295A1 (zh) * 2021-06-07 2022-12-15 江南大学 一种基于荧光铜纳米粒子检测黄曲霉毒素b1的方法
US11828761B2 (en) 2021-06-07 2023-11-28 Jiangnan University Method for detecting aflatoxin B1 based on fluorescent copper nanoparticles

Also Published As

Publication number Publication date
CN103725686B (zh) 2016-04-27

Similar Documents

Publication Publication Date Title
Hong et al. Single‐stranded DNA aptamers against pathogens and toxins: identification and biosensing applications
Hendrickson et al. Fluorescence polarization-based bioassays: new horizons
CN103725686B (zh) 黄曲霉毒素b1的核酸适体afb1-20及其应用
Song et al. Aptasensor for ampicillin using gold nanoparticle based dual fluorescence–colorimetric methods
CN103852460B (zh) 基于适配体的磁纳米荧光传感器检测抗生素多残留的方法
US20180224444A1 (en) Multiplexed Analyses of Test Samples
Huang et al. Amplified fluorescence polarization aptasensors based on structure-switching-triggered nanoparticles enhancement for bioassays
Li et al. A sensitive, label free electrochemical aptasensor for ATP detection
Zhang et al. SARS-CoV-2 detection using quantum dot fluorescence immunochromatography combined with isothermal amplification and CRISPR/Cas13a
CN107446929B (zh) 特异识别赭曲霉毒素a的核酸适配体及其制备方法
Wood et al. Selective targeting of fingermarks using immunogenic techniques
Diercks-Horn et al. The ALGADEC device: a semi-automated rRNA biosensor for the detection of toxic algae
CN103443614B (zh) 信号增强化合物在电化学发光检测中的用途
CN103695433A (zh) 黄曲霉毒素b1的核酸适体afb1-01及其应用
US20160320377A1 (en) Method for protein analysis
CN107119054A (zh) 基于核酸适配体特异性检测磺胺嘧啶的生物传感探针试剂盒及其应用
CN107129989B (zh) 检测黄曲霉毒素的核酸适配体、试剂盒及其检测方法
CN108698047A (zh) 电化学发光检测中的支链胺
Hu et al. A carbon nanotubes based fluorescent aptasensor for highly sensitive detection of adenosine deaminase activity and inhibitor screening in natural extracts
Chen et al. Target-protecting dumbbell molecular probe against exonucleases digestion for sensitive detection of ATP and streptavidin
CN103725685B (zh) 黄曲霉毒素b1的核酸适体afb1-14及其应用
Yan et al. DNA aptamer folding on magnetic beads for sequential detection of adenosine and cocaine by substrate-resolved chemiluminescence technology
CN108841828B (zh) 一种特异性识别妥布霉素的单链dna适配体及其应用
Wei et al. Screening of a high-affinity aptamer for aflatoxin M1 and development of its colorimetric aptasensor
Wang et al. Multiple functionalities of functional nucleic acids for developing high-performance lateral flow assays

Legal Events

Date Code Title Description
C06 Publication
PB01 Publication
C10 Entry into substantive examination
SE01 Entry into force of request for substantive examination
C14 Grant of patent or utility model
GR01 Patent grant
CF01 Termination of patent right due to non-payment of annual fee

Granted publication date: 20160427

Termination date: 20220114

CF01 Termination of patent right due to non-payment of annual fee