CN103282997B - 用于触发用于数据获取的相关频谱的方法 - Google Patents
用于触发用于数据获取的相关频谱的方法 Download PDFInfo
- Publication number
- CN103282997B CN103282997B CN201180063330.XA CN201180063330A CN103282997B CN 103282997 B CN103282997 B CN 103282997B CN 201180063330 A CN201180063330 A CN 201180063330A CN 103282997 B CN103282997 B CN 103282997B
- Authority
- CN
- China
- Prior art keywords
- time
- time interval
- fragment ion
- scanning
- varying
- Prior art date
- Legal status (The legal status is an assumption and is not a legal conclusion. Google has not performed a legal analysis and makes no representation as to the accuracy of the status listed.)
- Active
Links
Classifications
-
- G—PHYSICS
- G01—MEASURING; TESTING
- G01N—INVESTIGATING OR ANALYSING MATERIALS BY DETERMINING THEIR CHEMICAL OR PHYSICAL PROPERTIES
- G01N23/00—Investigating or analysing materials by the use of wave or particle radiation, e.g. X-rays or neutrons, not covered by groups G01N3/00 – G01N17/00, G01N21/00 or G01N22/00
-
- H—ELECTRICITY
- H01—ELECTRIC ELEMENTS
- H01J—ELECTRIC DISCHARGE TUBES OR DISCHARGE LAMPS
- H01J49/00—Particle spectrometers or separator tubes
- H01J49/0027—Methods for using particle spectrometers
- H01J49/0031—Step by step routines describing the use of the apparatus
-
- H—ELECTRICITY
- H01—ELECTRIC ELEMENTS
- H01J—ELECTRIC DISCHARGE TUBES OR DISCHARGE LAMPS
- H01J49/00—Particle spectrometers or separator tubes
- H01J49/004—Combinations of spectrometers, tandem spectrometers, e.g. MS/MS, MSn
- H01J49/0045—Combinations of spectrometers, tandem spectrometers, e.g. MS/MS, MSn characterised by the fragmentation or other specific reaction
-
- H—ELECTRICITY
- H01—ELECTRIC ELEMENTS
- H01J—ELECTRIC DISCHARGE TUBES OR DISCHARGE LAMPS
- H01J49/00—Particle spectrometers or separator tubes
- H01J49/02—Details
- H01J49/025—Detectors specially adapted to particle spectrometers
Landscapes
- Chemical & Material Sciences (AREA)
- Analytical Chemistry (AREA)
- Chemical Kinetics & Catalysis (AREA)
- Physics & Mathematics (AREA)
- Health & Medical Sciences (AREA)
- Life Sciences & Earth Sciences (AREA)
- Biochemistry (AREA)
- General Health & Medical Sciences (AREA)
- General Physics & Mathematics (AREA)
- Immunology (AREA)
- Pathology (AREA)
- Other Investigation Or Analysis Of Materials By Electrical Means (AREA)
- Electron Tubes For Measurement (AREA)
Abstract
本发明提供用于实时地触发信息相关质谱扫描的方法及系统。由质谱仪在一时间周期的每一时间间隔处执行对分离的样本混合物的质谱扫描。所述质谱仪从分离装置接收所述分离的样本混合物。在某一时间间隔处确定在所述时间间隔处的所接收质谱扫描及一个或一个以上先前所接收质谱扫描包含表示已知化合物的两个或两个以上碎片离子跃迁的两个或两个以上时变离子信号。如果所述两个或两个以上时变离子信号的特性满足选择准则,那么在所述时间间隔处指示所述质谱仪针对所述已知化合物的前驱物离子执行对所述分离的样本混合物的相关质谱扫描。
Description
相关申请案交叉参考
本申请案主张2010年12月29日提出申请的第61/427,860号美国临时专利申请案的权益,所述专利申请案以全文引用的方式并入本文中。
技术领域
本发明涉及一种用于触发用于数据获取的相关频谱的方法或系统。
背景技术
质谱仪通常与色谱系统耦合以便识别并表征来自测试样本的洗脱物质。在此经耦合系统中,将洗脱溶剂离子化且在规定的时间间隔处获得所述洗脱溶剂的一系列质谱图像,从而产生质谱图。举例来说,这些时间间隔介于从1秒到100分钟或更大的范围内。由于测试样本可能含有许多物质或化合物,因此通常需要能够在所关注物质或化合物洗脱时自动地确定或识别所述物质或化合物并执行串联质谱分析或质谱/质谱(MS/MS)分析以表征所述物质或化合物。然而,实时地识别复杂混合物中的所关注物质可为具挑战性的任务。
发明内容
本发明提供一种用于实时地触发信息相关质谱扫描的系统,其包括:分离装置,其在一时间周期内从样本混合物分离一种或一种以上化合物;质谱仪,其在所述时间周期的多个时间间隔处对所述分离的样本混合物执行质谱扫描;及处理器,其在所述多个时间间隔中的每一时间间隔处从所述质谱仪接收每一质谱扫描,在所述多个时间间隔中的一时间间隔处确定在所述时间间隔处的所接收质谱扫描及一个或一个以上先前所接收质谱扫描包含表示已知化合物的两个或两个以上碎片离子跃迁的两个或两个以上时变离子信号,且如果所述两个或两个以上时变离子信号的特性满足选择准则,那么在所述时间间隔处指示所述质谱仪针对所述已知化合物的前驱物离子执行对所述分离的样本混合物的相关质谱扫描。
本发明还提供一种用于实时地触发信息相关质谱扫描的方法,其包括:在一时间周期的多个时间间隔中的每一时间间隔处从质谱仪接收对分离的样本混合物的质谱扫描,其中所述质谱仪从分离装置接收所述分离的样本混合物;在所述多个时间间隔中的一时间间隔处确定在所述时间间隔处的所接收质谱扫描及一个或一个以上先前所接收质谱扫描包含表示已知化合物的两个或两个以上碎片离子跃迁的两个或两个以上时变离子信号,且如果所述两个或两个以上时变离子信号的特性满足选择准则,那么在所述时间间隔处指示所述质谱仪针对所述已知化合物的前驱物离子执行对所述分离的样本混合物的相关质谱扫描。
本发明进一步提供一种计算机程序产品,其包括非暂时且有形计算机可读存储媒体,所述非暂时且有形计算机可读存储媒体的内容包含具有指令的程序,所述指令在处理器上执行以便执行用于实时地触发信息相关质谱扫描的方法,所述方法包括:提供系统,其中所述系统包括一个或一个以上不同软件模块,且其中所述不同软件模块包括测量模块、分析模块及相关扫描控制模块;使用所述测量模块,在一时间周期的多个时间间隔中的每一时间间隔处从质谱仪接收对分离的样本混合物的质谱扫描,其中所述质谱仪从分离装置接收所述分离的样本混合物;使用所述分析模块,在所述多个时间间隔中的一时间间隔处确定在所述时间间隔处的所接收质谱扫描及一个或一个以上先前所接收质谱扫描包含表示已知化合物的两个或两个以上碎片离子跃迁的两个或两个以上时变离子信号,且如果所述两个或两个以上时变离子信号的特性满足选择准则,那么使用所述相关扫描控制模块在所述时间间隔处指示所述质谱仪针对所述已知化合物的前驱物离子执行对所述分离的样本混合物的相关质谱扫描。
附图说明
所属领域的技术人员将理解下文所描述的图式仅出于图解说明的目的。所述图式绝不打算限制本发明教示的范围。
图1是图解说明根据各种实施例的计算机系统的框图。
图2是展示使用常规信息相关获取(IDA)系统的选定反应监测(SRM)或多反应监测(MRM)方法的示范性流程图。
图3是根据各种实施例在质谱图中检测的三个碎片离子的离子信号的示范性曲线图且展示在何时触发相关质谱扫描。
图4是展示根据各种实施例的使用IDA系统的SRM或MRM方法的示范性流程图。
图5是展示根据各种实施例的用于实时地触发信息相关质谱扫描的分离耦合质谱系统的示意图。
图6是展示根据各种实施例的用于实时地触发信息相关质谱扫描的方法的示范性流程图。
图7是根据各种实施例的用于实时地触发信息相关质谱扫描的方法的包含一个或一个以上不同软件模块的系统的示意图。
在详细描述本发明教示的一个或一个以上实施例之前,所属领域的技术人员将了解,本发明教示在其对以下详细描述中所阐述或图式中所图解说明的构造的细节、组件的布置及步骤的布置的应用方面不受限制。此外,应理解,本文中所使用的短语及术语是出于描述目的而不应视为具有限制性。
具体实施方式
计算机实施的系统
图1是图解说明可在其上实施本发明教示的实施例的计算机系统100的框图。计算机系统100包含总线102或用于传递信息的其它通信机构及与总线102耦合以用于处理信息的处理器104。计算机系统100还包含耦合到总线102以用于存储待由处理器104执行的指令的存储器106,其可为随机存取存储器(RAM)或其它动态存储装置。存储器106还可用于在待由处理器104执行的指令的执行期间存储暂时变量或其它中间信息。计算机系统100进一步包含耦合到总线102以用于存储用于处理器104的静态信息及指令的只读存储器(ROM)108或其它静态存储装置。提供存储装置110(例如磁盘或光盘)且其耦合到总线102以用于存储信息及指令。
计算机系统100可经由总线102耦合到显示器112(例如,阴极射线管(CRT)或液晶显示器(LCD))以用于向计算机用户显示信息。包含字母数字键及其它键的输入装置114耦合到总线102以用于将信息及命令选择传递到处理器104。另一类型的用户输入装置为用于将方向信息及命令选择传递到处理器104且用于控制显示器112上的光标移动的光标控制件116,例如鼠标、轨迹球或光标方向键。此输入装置通常具有沿两个轴(第一轴(即,x)及第二轴(即,y))的两个自由度,其允许所述装置规定平面中的位置。
计算机系统100可执行本发明教示。依照本发明教示的某些实施方案,由计算机系统100响应于处理器104执行存储器106中所含有的一个或一个以上指令的一个或一个以上序列而提供结果。可将此些指令从另一计算机可读媒体(例如存储装置110)读取到存储器106中。存储器106中所含有的指令序列的执行致使处理器104执行本文中所描述的过程。或者,可代替或结合软件指令而使用硬连线电路来实施本发明教示。因此,本发明教示的实施方案并不限于硬件电路与软件的任何特定组合。
如本文中所使用的术语“计算机可读媒体”指代参与将指令提供到处理器104以用于执行的任何媒体。此媒体可采取许多形式,包含但不限于:非易失性媒体、易失性媒体及传输媒体。举例来说,非易失性媒体包含光盘或磁盘,例如存储装置110。易失性媒体包含动态存储器,例如存储器106。传输媒体包含同轴电缆、铜导线及光纤,包含包括总线102的导线。
举例来说,常见形式的计算机可读媒体包含软盘、柔性盘、硬盘、磁带或任何其它磁性媒体、CD-ROM、数字视盘(DVD)、蓝光光盘、任何其它光学媒体、拇指驱动器、存储器卡、RAM、PROM及EPROM、快闪EPROM、任何其它存储器芯片或卡匣或计算机可从其读取的任何其它有形媒体。
在将一个或一个以上指令的一个或一个以上序列载运到处理器104以用于执行时可涉及各种形式的计算机可读媒体。举例来说,最初可在远程计算机的磁盘上载运指令。所述远程计算机可将所述指令加载到其动态存储器中并使用调制解调器经由电话线发送所述指令。在计算机系统100本地的调制解调器可在电话线上接收数据并使用红外线发射器将所述数据转换为红外线信号。耦合到总线102的红外线检测器可接收在红外线信号中载运的数据并将所述数据置于总线102上。总线102将所述数据载运到存储器106,处理器104从存储器106检索并执行指令。由存储器106接收的指令可任选地在由处理器104执行之前或之后存储于存储装置110上。
根据各种实施例,经配置以由处理器执行以执行方法的指令存储于计算机可读媒体上。所述计算机可读媒体可为存储数字信息的装置。举例来说,计算机可读媒体包含如此项技术中已知的用于存储软件的光盘只读存储器(CD-ROM)。所述计算机可读媒体由适合于执行经配置以被执行的指令的处理器存取。
已出于图解说明及描述的目的呈现了对本发明教示的各种实施方案的以下描述。其并非详尽的且并不将本发明教示限制于所揭示的精确形式。鉴于以上教示,可能有若干修改形式及变化形式或可从本发明教示的实践获取该等修改形式及变化形式。另外,所描述的实施方案包含软件,但本发明教示可实施为硬件与软件的组合或以单独硬件实施。可借助对象导向程序设计系统及非对象导向程序设计系统两者来实施本发明教示。
识别分离的化合物
各种实施例包含用于在分离装置/质谱系统中识别分离的化合物的系统及方法。基于在来自分离装置的时变图像中发现的两个或两个以上质谱/质谱(MS/MS)跃迁目标的群组的特性而触发一个或一个以上相关质谱扫描。在各种实施例中,使用与质谱仪及分离装置相关联的数据获取与分析软件来实现此目标。
示范性且众所周知的数据获取与分析软件包含由AB Sciex出售的信息相关获取(IDA)系统。在数据获取过程期间,此软件识别质谱图中的质量峰值以便选择前驱物离子。所述软件接着引导其中使所选前驱物离子碎裂的一个或一个以上后续质谱级,例如MS/MS、质谱/质谱/质谱(MS/MS/MS)或任何更高量级的级质谱(MSn,其中n为正数)。所得MS/MS(或更高)频谱是在能量方面允许的所有碎裂过程的合成物。这些过程包含前驱物离子与碎片离子的反应及碎片离子与其它碎片离子的反应。
例如IDA的软件对于选定反应监测(SRM)或多反应监测(MRM)实验是特别有用的。此些实验可阐明用以在搜索频谱数据库或MS/MS库时提供在表征化合物或识别化合物中所使用的结构信息的频谱丰富度及/或离解路径。
图2是展示使用常规IDA系统的SRM或MRM方法200的示范性流程图。
在方法200的步骤210中,针对分离装置起始分析周期。
在步骤220中,激活离子源以发射离子束。
在步骤230中,在质谱图中针对化合物检测信号。
在步骤240中,确定在质谱图中针对所述化合物检测的信号是否高于阈值。
在步骤250中,如果针对所述化合物检测的信号高于阈值,那么使用质谱仪执行相关扫描以使所述化合物碎裂。
在步骤260中,将来自相关扫描的碎片数据存储于存储器中。
如上文所描述,例如IDA的实时数据获取软件的使用在其中可能相当容易地检测到所关注质量峰值的应用(例如体外样本分析或单蛋白质消化分析)中提供良好结果。然而,当处理较复杂样本集(例如,生物流体(例如,尿液或血浆提取物)或经消化蛋白质的混合物(例如,经胰蛋白酶消化的细胞裂解物))时,常规数据获取与分析软件并不达标。举例来说,可能存在同时洗脱的许多其它主要组分或物质。这些其它主要组分或物质通常具有对应于所关注分析物或物质的信号的相同前驱物离子中的一者或一者以上,因此使得难以有效地选择真正关注的(经离子化)物质。
对由用于MS/MS的系统“挑选”的质量峰值的选择可通过基于个别MRM离子信号特性(例如对应于选定前驱物离子的碎片离子的m/z的强度)而触发来自用于前驱物离子选择的候选者列表的相关扫描来改进。然而,通常借助每化合物多个MRM(肽定量、杀虫剂测试中的离子比及其它)来运行MRM实验。因此,由于每一MRM跃迁是个别评估的,因此可能针对同一化合物数次地触发相关扫描或在其中错误化合物洗脱的分离运行中(例如当来自同一化合物的MRM的离子比不正确时)一次触发。本质上,此可导致错误且冗余的数据,从而使得对结果的解释更复杂。
在各种实施例中,通过将两个或两个以上MRM跃迁的相关群组的离子信号特性组合在一起,可用可表示MRM离子信号特性群组的单一选择准则填充候选者列表。所述选择准则可基于根据所有MRM跃迁计算的性质,使得当触发相关扫描时,同时满足表示MRM跃迁群组的离子信号特性中的每一者。因重叠离子信号特性而洗脱但不满足选择准则的任何物质可能不触发相关扫描,从而有效地降低假阳性触发的可能性。
在各种实施例中,两个或两个以上MRM跃迁的群组包含两个或两个以上碎片离子或产物离子跃迁,且选择准则是基于两个或两个以上碎片离子跃迁的一个或一个以上信号特性。前驱物离子可具有多个碎片跃迁目标。可使用个别碎片跃迁中的每一者的组合来指派表示MRM跃迁群组的选择准则。
在一个示范性实施例中,两个或两个以上碎片离子跃迁的一个或一个以上信号特性包含最小强度水平。所述选择准则可为为了触发相关扫描两个或两个以上碎片离子跃迁的每一碎片离子必须超过的最小强度水平。举例来说,所述强度水平是每秒碎片离子的计数。
举例来说,考虑所关注化合物,“化合物Z”,其具有以下预定MRM跃迁:475→250amu;475→175amu;及475→100amu。可将也可针对每一跃迁或碎片离子独立设定的最小强度水平(比如说,每秒1000计数(cps))识别为对应于碎片离子在250、175及100amu下的m/z中的每一者的阈值。具有含有化合物Z及其它化合物的混合物的样本从分离装置共洗脱,且通过本技术中通常已知的手段,产生离子信号。当对应于目标碎片离子在250、175及100amu下的质荷比(m/z)中的每一者的候选离子信号在相同洗脱时间洗脱时,触发相关扫描,前提是所检测离子信号中的每一者具有高于阈值的强度水平。除强度以外,还可基于其它信号特性或参数而分析离子信号,包含但不限于信号的面积、形状或任何其它数学处理,例如计算信号的一阶导数。
图3是根据各种实施例在质谱图中检测的三个碎片离子的离子信号的示范性曲线图300且展示在何时触发相关质谱扫描。曲线图300展示第一碎片离子的离子信号310、第二碎片离子的离子信号320及第三碎片离子的离子信号330。曲线图300还展示强度阈值340。如上文所描述,在一个示范性实施例中,如果两个或两个以上碎片离子跃迁的每一碎片离子均超过最小强度阈值,那么触发相关质谱扫描。如曲线图300中所展示,阈值340为最小强度阈值。在时间350处,第一碎片离子的离子信号310超过阈值340。然而,第二碎片离子的离子信号320及第三碎片离子的离子信号330不超过阈值340,因此在时间350处未触发相关质谱扫描。相比之下,在时间360处,所有三个离子信号均超过阈值340。因此,根据此实施例,在时间360处触发相关质谱扫描。
在另一示范性实施例中,两个或两个以上碎片离子跃迁的一个或一个以上信号特性包含离子强度增加的速率。可预先确定针对一群组中的MRM跃迁目标中的每一者离子强度增加的速率以供用作用于每一洗脱的对应离子信号的单一选择准则。具体来说,当从分离检测到两个或两个以上离子信号候选者作为跃迁目标时,如果针对两个或两个以上离子信号侯选者中的每一者信号增加的速率与在相同跃迁时间的预定速率一致,那么触发相关扫描。因此,由于每一离子信号候选者服从相同速率增加准则,因此使相关扫描的误触发最小化。
在另一示范性实施例中,两个或两个以上碎片离子跃迁的一个或一个以上信号特性包含来自两个或两个以上碎片离子跃迁的离子信号的强度的和。举例来说,选择准则为等于或超过预定值的分离离子信号的分离离子强度的和。在检测到目标离子信号群组时,将每一MRM跃迁的强度相加并将其与预期或预定总值进行比较。如果求和比较等于或大于预定总值,那么触发相关扫描。
在另一示范性实施例中,两个或两个以上碎片离子跃迁的一个或一个以上信号特性包含来自两个或两个以上碎片离子跃迁的离子信号的非零强度计数。举例来说,可使用基于MRM跃迁的乘法因数来识别非零目标候选离子强度。在样本分离时,在使或不使离子信号服从上述阈值准则时,将每一候选者的强度乘在一起。如果任何MRM候选离子均具有零计数值,那么分离的化合物不触发相关扫描。一旦整个MRM目标群组具有非零信号,则触发相关扫描。
已参考监测多个反应的群组的扫描及基于这些反应的目标跃迁的选择准则描述了所述实施例。然而,应理解,各种实施例可应用于多种多样的可添加额外维度以降低目标化合物的假阳性触发的进一步选择准则,举例来说,包含取指派给相关MRM跃迁群组的候选强度的平均值或所述候选强度的其它统计函数(例如,一阶导数)。还应理解,各种实施例可应用于毛细管电泳质谱系统(CE-MS)、色谱质谱系统(包含气相与液相色谱(GC-MS及LC-MS))、迁移率质谱系统及此处未提及的其它离子源或分离质谱组合。所属领域的技术人员将了解,可在不背离本发明的精神的情况下对优选实施例做出多种修改。
图4是展示根据各种实施例的使用IDA系统的SRM或MRM方法400的示范性流程图。
在方法400的步骤410中,针对分离装置起始分析周期。
在步骤420中,激活离子源以发射离子束。
在步骤430中,在质谱图中针对化合物检测两个或两个以上信号。
在步骤440中,基于选择准则而评估所述两个或两个以上信号。
在步骤450中,确定两个或两个以上信号是否满足选择准则。
在步骤460中,如果所述两个或两个以上信号满足选择准则,那么使用质谱仪执行相关扫描以使所述化合物碎裂。
在步骤470中,将来自相关扫描的碎片数据存储于存储器中。
数据处理的系统及方法
分离耦合质谱系统
图5是展示根据各种实施例的用于实时地触发信息相关质谱扫描的分离耦合质谱系统500的示意图。系统500包含分离装置510、质谱仪520及处理器530。分离装置510在一时间周期内从样本混合物分离一种或一种以上化合物。分离装置510可包含但不限于电泳装置、色谱装置或迁移率装置。
质谱仪520在所述时间周期的多个时间间隔处对来自分离装置510的分离的样本混合物执行质谱扫描。质谱仪520可包含执行两个或两个以上质量分析的一个或一个以上物理质量分析仪。举例来说,质谱仪520为串联质谱仪。质谱仪520的质量分析仪可包含但不限于飞行时间(TOF)、四极、离子捕集器、线性离子捕集器、轨道捕集器、磁性四扇区质量分析仪、混合四极飞行时间(Q-TOF)质量分析仪或傅里叶变换质量分析仪。质谱仪520可分别包含在空间或时间上的单独质谱级或步骤。
处理器530与质谱仪520通信。处理器530还可与分离装置510通信。处理器530可为但不限于计算机、微处理器或能够将控制信号发送到质谱仪520及从质谱仪520接收控制信号并处理数据的任何装置。
处理器530在所述多个时间间隔中的每一时间间隔处从质谱仪520接收每一质谱扫描。因此,在样本混合物正分离时,可实时地逐段形成质谱图。
处理器530在所述多个时间间隔中的某一时间间隔处确定在所述时间间隔处的所接收质谱扫描及一个或一个以上先前所接收质谱扫描包含表示已知化合物的两个或两个以上碎片离子跃迁的两个或两个以上时变离子信号。换句话说,可在每一时间间隔处根据当前扫描及一个或一个以上先前扫描确定时变信号。举例来说,如果这些信号的m/z值与两个或两个以上碎片离子跃迁的m/z值相匹配,那么所述信号表示已知化合物的两个或两个以上碎片离子跃迁。
如果两个或两个以上时变离子信号的特性满足选择准则,那么处理器530在所述时间间隔处指示质谱仪520针对已知化合物的前驱物离子执行分离的样本混合物的相关质谱扫描。换句话说,识别匹配的信号必须满足经组合水平或必须个别地达到为了触发相关扫描所述信号的预定值。
在一个示范性实施例中,选择准则包含在所述时间间隔处两个或两个以上时变离子信号中的每一者必须超过的最小信号强度。
在另一示范性实施例中,选择准则包含在所述时间间隔处两个或两个以上时变离子信号中的每一者必须超过的最小信号强度增加速率。
在另一示范性实施例中,选择准则包含在所述时间间隔处两个或两个以上时变离子信号中的每一者的强度的和必须超过的最小经组合信号强度。
在另一示范性实施例中,选择准则包括在所述时间间隔处两个或两个以上时变离子信号中的每一者的非零强度计数。
质谱方法
图6是展示根据各种实施例的用于实时地触发信息相关质谱扫描的方法600的示范性流程图。
在方法600的步骤610中,在一时间周期的多个时间间隔中的每一时间间隔处从质谱仪接收分离的样本混合物的质谱扫描。所述质谱仪从分离装置接收分离的样本混合物。
在步骤620中,在某一时间间隔处确定在所述时间间隔处的所接收质谱扫描及一个或一个以上先前所接收质谱扫描包含表示已知化合物的两个或两个以上碎片离子跃迁的两个或两个以上时变离子信号。
在步骤630中,如果两个或两个以上时变离子信号的特性满足选择准则,那么在所述时间间隔处指示所述质谱仪针对已知化合物的前驱物离子执行分离的样本混合物的相关质谱扫描。
质谱计算机程序产品
在各种实施例中,计算机程序产品包含非暂时且有形计算机可读存储媒体,其内容包含具有指令的程序,所述指令在处理器上执行以便执行用于实时地触发信息相关质谱扫描的方法。此方法由包含一个或一个以上不同软件模块的系统执行。
图7是根据各种实施例的包含用于实时地触发信息相关质谱扫描的方法的一个或一个以上不同软件模块的系统700的示意图。系统700包含测量模块710、分析模块720及相关扫描控制模块730。
测量模块710在一时间周期的多个时间间隔中的每一时间间隔处从质谱仪接收对分离的样本混合物的质谱扫描。所述质谱仪从分离装置接收分离的样本混合物。
分析模块720在某一时间间隔处确定在所述时间间隔处的所接收质谱扫描及一个或一个以上先前所接收质谱扫描包含表示已知化合物的两个或两个以上碎片离子跃迁的两个或两个以上时变离子信号。
如果两个或两个以上时变离子信号的特性满足选择准则,那么相关扫描控制模块730在所述时间间隔处指示所述质谱仪针对已知化合物的前驱物离子执行对分离的样本混合物的相关质谱扫描。
尽管结合各种实施例描述了本发明教示,但本发明教示并不打算限制于此些实施例。相反,本发明教示涵盖如所属领域的技术人员将了解的各种替代方案、修改形式及等效形式。
此外,在描述各种实施例时,本说书可能已将方法及/或过程呈现为特定步骤序列。然而,只要所述方法或过程不依赖于本文中所阐述的特定步骤次序,所述方法或过程就不应限制于所描述的特定步骤序列。如所属领域的技术人员将了解,可能有其它步骤序列。因此,本说明书中所阐述的步骤的特定次序不应解释为对权利要求书的限制。另外,针对所述方法及/或过程的权利要求书不应限制于以所写的次序执行其步骤,且所属领域的技术人员可容易了解,所述序列可变化且仍保持于各种实施例的精神及范围内。
Claims (10)
1.一种用于实时地触发信息相关质谱扫描的系统,其包括:
分离装置,其在一时间周期内从样本混合物分离一种或一种以上化合物;
质谱仪,其在所述时间周期的多个时间间隔的每个时间间隔处针对所分离的样本混合物执行对已知化合物的已知前驱物离子的具有两个或更多个多反应监测MRM跃迁的群组的质谱扫描,其中具有所述两个或更多个MRM跃迁的群组中的每一MRM跃迁是从所述已知前驱物离子到不同碎片离子的跃迁;及
处理器,其
在所述多个时间间隔中的每一时间间隔处从所述质谱仪接收具有所述两个或更多个MRM跃迁的群组中的每一跃迁的碎片离子强度,
针对所述已知化合物,在所述多个时间间隔中的每一时间间隔处确定两个或更多个时变碎片离子信号,所述两个或更多个时变碎片离子信号表示在所述每一时间间隔处以及所有先前的时间间隔处的具有所述两个或更多个MRM跃迁的群组的碎片离子强度,
通过组合具有所述两个或更多个MRM跃迁的群组的每一碎片离子强度来指派单一选择准则以表示具有所述两个或更多个MRM跃迁的群组,及
如果具有所述两个或更多个MRM跃迁的群组的每一碎片离子强度满足所述单一选择准则,那么在所述每一时间间隔处指示所述质谱仪针对所述已知化合物的所述已知前驱物离子执行对所分离的样本混合物的相关质谱扫描。
2.根据权利要求1所述的系统,其中所述单一选择准则包括在所述每一时间间隔处所述两个或更多个时变碎片离子信号中的每一者必须超过的最小信号强度。
3.根据权利要求1所述的系统,其中所述单一选择准则包括在所述每一时间间隔处所述两个或更多个时变碎片离子信号中的每一者必须超过的最小信号强度增加速率。
4.根据权利要求1所述的系统,其中所述单一选择准则包括所述两个或更多个时变碎片离子信号的预定强度总值,其中,在所述每一时间间隔处所述两个或更多个时变碎片离子信号中的每一者的强度的和必须超过所述预定强度总值。
5.根据权利要求1所述的系统,其中所述单一选择准则包括在所述每一时间间隔处所述两个或更多个时变碎片离子信号中的每一者的非零强度计数。
6.一种用于实时地触发信息相关质谱扫描的方法,其包括:
在一时间周期的多个时间间隔中的每一时间间隔处从质谱仪接收针对已知化合物的已知前驱物离子的具有两个或更多个MRM跃迁的群组中的每一跃迁的碎片离子强度,所述碎片离子强度是从对分离的样本混合物的质谱扫描测得的,其中所述质谱仪从分离装置接收所分离的样本混合物,且其中具有所述两个或更多个MRM跃迁的群组中的每一MRM跃迁是从所述已知前驱物离子到不同碎片子的跃迁;
针对所述已知化合物,在所述多个时间间隔中的每一时间间隔处确定两个或更多个时变碎片离子信号,所述两个或更多个时变碎片离子信号表示在所述每一时间间隔处以及所有先前的时间间隔处的具有所述两个或更多个MRM跃迁的群组的碎片离子强度,
通过组合具有所述两个或更多个MRM跃迁的群组的每一碎片离子强度来指派单一选择准则以表示具有所述两个或更多个MRM跃迁的群组,及
如果具有所述两个或更多个MRM跃迁的群组的每一碎片离子强度满足所述单一选择准则,那么在所述每一时间间隔处指示所述质谱仪针对所述已知化合物的所述已知前驱物离子执行对所分离的样本混合物的相关质谱扫描。
7.根据权利要求6所述的方法,其中所述单一选择准则包括在所述每一时间间隔处所述两个或更多个时变碎片离子信号中的每一者必须超过的最小信号强度。
8.根据权利要求6所述的方法,其中所述单一选择准则包括在所述每一时间间隔处所述两个或更多个时变碎片离子信号中的每一者必须超过的最小信号强度增加速率。
9.根据权利要求6所述的方法,其中所述单一选择准则包括所述两个或更多个时变碎片离子信号的预定强度总值,其中,在所述每一时间间隔处所述两个或更多个时变碎片离子信号中的每一者的强度的和必须超过所述预定强度总值。
10.根据权利要求6所述的方法,其中所述单一选择准则包括在所述每一时间间隔处所述两个或更多个时变碎片离子信号中的每一者的非零强度计数。
Applications Claiming Priority (3)
Application Number | Priority Date | Filing Date | Title |
---|---|---|---|
US201061427860P | 2010-12-29 | 2010-12-29 | |
US61/427,860 | 2010-12-29 | ||
PCT/IB2011/003107 WO2012090046A1 (en) | 2010-12-29 | 2011-12-22 | Method for triggering dependent spectra for data acquisition |
Publications (2)
Publication Number | Publication Date |
---|---|
CN103282997A CN103282997A (zh) | 2013-09-04 |
CN103282997B true CN103282997B (zh) | 2017-06-09 |
Family
ID=45554748
Family Applications (1)
Application Number | Title | Priority Date | Filing Date |
---|---|---|---|
CN201180063330.XA Active CN103282997B (zh) | 2010-12-29 | 2011-12-22 | 用于触发用于数据获取的相关频谱的方法 |
Country Status (6)
Country | Link |
---|---|
US (1) | US9513232B2 (zh) |
EP (1) | EP2659500B1 (zh) |
JP (1) | JP5986105B2 (zh) |
CN (1) | CN103282997B (zh) |
CA (1) | CA2821669C (zh) |
WO (1) | WO2012090046A1 (zh) |
Families Citing this family (9)
Publication number | Priority date | Publication date | Assignee | Title |
---|---|---|---|---|
WO2015124982A1 (en) * | 2014-02-20 | 2015-08-27 | Dh Technologies Development Pte. Ltd. | Rapid lc mapping of cov values for selexion technology using mrm-triggered mrm functionality |
CN106550609B (zh) * | 2014-05-30 | 2020-06-05 | 英国质谱公司 | 组合式串级质谱法和离子迁移率质谱法 |
CN106796654A (zh) * | 2014-10-08 | 2017-05-31 | Dh科技发展私人贸易有限公司 | 改进ida光谱输出用于数据库检索 |
CN107210181B (zh) * | 2015-02-05 | 2019-11-01 | Dh科技发展私人贸易有限公司 | 在触发碎裂能量的同时迅速扫描宽四极rf窗 |
WO2016125120A1 (en) * | 2015-02-06 | 2016-08-11 | Dh Technologies Development Pte. Ltd. | Lipid screening platform allowing a complete solution for lipidomics research |
CN108604525B (zh) * | 2015-12-01 | 2020-08-07 | Dh科技发展私人贸易有限公司 | 用于靶向ms方法中的自适应保留时间的前哨信号 |
JP2021521582A (ja) * | 2018-04-10 | 2021-08-26 | ディーエイチ テクノロジーズ デベロップメント プライベート リミテッド | Tof質量分析器の抽出領域内でイオンパケットを動的に濃縮する |
US20220189754A1 (en) * | 2019-05-31 | 2022-06-16 | Dh Technologies Development Pte. Ltd. | Method for Real Time Encoding of Scanning SWATH Data and Probabilistic Framework for Precursor Inference |
WO2023073587A1 (en) * | 2021-11-01 | 2023-05-04 | Dh Technologies Development Pte. Ltd. | Ultra high throughput screening combined with definitive testing in a single sample preparation step |
Family Cites Families (13)
Publication number | Priority date | Publication date | Assignee | Title |
---|---|---|---|---|
JPS6382357A (ja) * | 1986-09-26 | 1988-04-13 | Shimadzu Corp | マスクロマトグラフイ分析方法 |
JP3805979B2 (ja) * | 1999-12-27 | 2006-08-09 | 株式会社日立製作所 | 質量分析方法および装置 |
GB2364168B (en) * | 2000-06-09 | 2002-06-26 | Micromass Ltd | Methods and apparatus for mass spectrometry |
CA2340150C (en) * | 2000-06-09 | 2005-11-22 | Micromass Limited | Methods and apparatus for mass spectrometry |
US7351956B2 (en) * | 2004-04-08 | 2008-04-01 | Mdc Inc. | Dynamic background signal exclusion in chromatography/mass spectrometry data-dependent data acquisition |
JP2006138755A (ja) * | 2004-11-12 | 2006-06-01 | Hitachi Ltd | 危険物探知装置および危険物探知方法 |
JP4900048B2 (ja) * | 2007-05-29 | 2012-03-21 | 株式会社島津製作所 | 質量分析装置 |
WO2009029231A2 (en) * | 2007-08-24 | 2009-03-05 | Millipore Corporation | Method of detecting filter extractables in biopharmaceutical products by liquid chromatography-mass spectrometry |
GB0806725D0 (en) | 2008-04-14 | 2008-05-14 | Micromass Ltd | Mass spectrometer |
JP5039656B2 (ja) * | 2008-07-25 | 2012-10-03 | 株式会社日立ハイテクノロジーズ | 質量分析装置および質量分析方法 |
US8101908B2 (en) * | 2009-04-29 | 2012-01-24 | Thermo Finnigan Llc | Multi-resolution scan |
GB0909285D0 (en) * | 2009-05-29 | 2009-07-15 | Micromass Ltd | Method to detect and sequence post translationally modified peptides |
US8921773B2 (en) * | 2010-01-20 | 2014-12-30 | Waters Technologies Corporation | Techniques for efficient fragmentation of peptides |
-
2011
- 2011-12-22 US US13/995,816 patent/US9513232B2/en active Active
- 2011-12-22 CA CA2821669A patent/CA2821669C/en not_active Expired - Fee Related
- 2011-12-22 CN CN201180063330.XA patent/CN103282997B/zh active Active
- 2011-12-22 EP EP11813809.8A patent/EP2659500B1/en active Active
- 2011-12-22 WO PCT/IB2011/003107 patent/WO2012090046A1/en active Application Filing
- 2011-12-22 JP JP2013546776A patent/JP5986105B2/ja active Active
Also Published As
Publication number | Publication date |
---|---|
US20130289894A1 (en) | 2013-10-31 |
CA2821669A1 (en) | 2012-07-05 |
CN103282997A (zh) | 2013-09-04 |
EP2659500A1 (en) | 2013-11-06 |
US9513232B2 (en) | 2016-12-06 |
EP2659500B1 (en) | 2021-05-26 |
JP5986105B2 (ja) | 2016-09-06 |
WO2012090046A1 (en) | 2012-07-05 |
CA2821669C (en) | 2018-11-27 |
JP2014502725A (ja) | 2014-02-03 |
Similar Documents
Publication | Publication Date | Title |
---|---|---|
CN103282997B (zh) | 用于触发用于数据获取的相关频谱的方法 | |
US11222775B2 (en) | Data independent acquisition of product ion spectra and reference spectra library matching | |
CN103109346B (zh) | 用于通过质谱分析快速筛选样本的系统及方法 | |
US9343276B2 (en) | Use of windowed mass spectrometry data for retention time determination or confirmation | |
US10984996B2 (en) | Background subtraction-mediated data-dependent acquistion | |
JP2001249114A (ja) | 質量分析方法および装置 | |
CN108982729B (zh) | 用于提取质量迹线的系统和方法 | |
US7544930B2 (en) | Tandem type mass analysis system and method | |
CN110506205B (zh) | 质谱分析装置和色谱质谱联用仪 | |
US9768000B2 (en) | Systems and methods for acquiring data for mass spectrometry images | |
CN104024845B (zh) | 智能本底数据采集及减除 | |
EP3745407A1 (en) | Operating a mass spectrometer utilizing a promotion list | |
US11879897B2 (en) | Operating a mass spectrometer utilizing mass spectral database search | |
CN112014514B (zh) | 利用提升列表操作质谱仪 | |
JP6896830B2 (ja) | イオン種の質量を判定するためのシステムおよび方法 | |
EP4102509A1 (en) | Method and apparatus for identifying molecular species in a mass spectrum | |
JP2023546822A (ja) | Ms/msによる定量的分析のためのグループ検出を管理するための高分解能検出 |
Legal Events
Date | Code | Title | Description |
---|---|---|---|
C06 | Publication | ||
PB01 | Publication | ||
C10 | Entry into substantive examination | ||
SE01 | Entry into force of request for substantive examination | ||
GR01 | Patent grant | ||
GR01 | Patent grant |