CN102978217B - 基因OsBBX22b在延迟水稻开花期方面的应用 - Google Patents

基因OsBBX22b在延迟水稻开花期方面的应用 Download PDF

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Abstract

本发明公开了基因OsBBX22b在延迟水稻开花期方面的应用。本发明通过PCR方法,扩增出水稻品种日本晴的OsBBX22b基因的全长编码区,正向连接在植物表达载体pCAMBIA1390-ubi上;再进行遗传转化至水稻中,提高OsBBX22b基因的表达,得到OsBBX22b基因表达增强的转基因水稻植株。在转基因的T3代植株中发现,长日条件下阳性转基因水稻植株的开花期较非转基因植株延迟了8-10天,而在短日条件下,转基因水稻的开花时间较非转基因水稻延迟了约15天。本发明利用荧光定量分析结果表明,OsBBX22b过量表达抑制了开花素编码基因Hd3a和RFT1的表达,从而延迟了水稻开花。

Description

基因OsBBX22b在延迟水稻开花期方面的应用
技术领域
本发明涉及植物基因工程技术领域,具体涉及基因OsBBX22b在延迟水稻开花期方面的应用。
背景技术
开花期(从种子萌发到始穗的时间,days to flowering)是水稻及禾谷类农作物的重要农艺性状之一,开花期长短直接反映了水稻品种生育期长短,适宜的生育期在维持水稻高产稳产中扮演着关键角色(Tsuji et al.,Rice,2008,1:25-35;胡时开等,中国水稻科学,2012,26(3):373-382)。一直以来,水稻开花期调控机制是分子生物学家和育种家关注和研究的热点。开花期由许多基因控制,而这些基因的表达水平与环境因子如日照长度和温度密切相关。
光周期调控的开花期是一个复杂的系统过程。叶片测定光周期产生可移动的开花信号(称为成花素,florigen),该信号从叶片移至茎顶端,然后茎顶端分生组织感受信号启动花芽形成。水稻是典型的短日植物,短日(SD)条件诱导Hd3a(Heading date3a)的表达。在SD条件下,Hd3a在叶片韧皮组织中表达上调,这些蛋白质转移至顶端分生组织,诱导花芽的启动,因此Hd3a被称为成花素(Tamaki et al.Science,2007,316:1033-1036)。在植物中最保守的光周期调控开花途径是GI(gigantea)-CO(constans)-FT(glowering locus T)。在拟南芥中,该途径仅仅在长日(LD)条件下有活性,这是因为在LD条件下CO的表达在光期结束时表达提高,这样避免了暗条件下COP1对其降解作用,从而保证有充足的CO诱导FT的表达,然而SD条件下,CO积累出现在暗期,CO蛋白质一旦产生会立即被降解。水稻中对应的光周期开花途径是OsGI-Hd1(Heading date1)-Hd3a,它们分别是拟南芥GI、CO和FT的直系同源基因。OsGI是Hd1的激活子,其表达显示生物节律性,表达峰值出现在光期结束时。Hd1编码B-box锌指蛋白,其C端含有CCT结构域(constans,constans-like,and timing ofcab expression)。在SD条件下,hd1突变体中Hd3a的表达水平降低。Hd1在暗期中间表达水平最高,Hd3a在光期开始时表达水平最高。在SD条件下,Hd3a表达的另一个激活子是Ehd1(Early heading date1),它是一种B型响应调节子(B-type response regulator)(Doi et al.Genes Dev,2004,18:926-936)。Ehd1在拟南芥中无直系同源基因,它的表达受OsMADS51和Ehd2/RID1/OsID1的上调(Wu et al.,Proc Natl Acad Sci USA,2008,105:12915-12920;Itoh et al.,Nat Genet,2010,42:635-638))。此外,OsGI通过OsMADS51或者通过蓝光信号激活Ehd1在光期开始时大量表达(Kim et al.,Plant Physiol,2007,145:1484-1494)。
然而,LD条件抑制Hd3a表达。在LD条件下,Hd1抑制Hd3a的表达,Hd3a的表达水平相当低,这样OsGI-Hd1-Hd3a形成了一个开花阻遏途径。光敏色素介导的信号是Hd1从SD下的促进子转变成LD下的阻遏子的重要调节因子。LD下,Hd1阻遏子的功能还被CK2(casein kinase2)活性增强。此外,在LD下,Hd3a的表达也被Ehd1上调,而Ehd1被Ghd7(Grain number,plant height and heading date7)抑制。在LD下,Ghd7的表达被特异性地上调,因此Ghd7通过抑制Ehd1-Hd3a途径而下调Hd3a表达,从而抑制开花(Xue et al.,Nat Genet,2008,40(6):761-767)。另外E3泛素连接酶SPL11(Spotted leaf11)通过与其相互作用蛋白质SPIN相互作用而抑制Hd3a的表达。在长日条件下,OsMADS56、LEC1和FUSCA-LIKE1(OsLFL1)能够消弱Ehd1的表达。
水稻是短日植物,但是在LD条件下,水稻最终也能开花。这可能是因为,尽管LD下Hd3a的表达相当低,但是残余的Hd3a也能够最终诱导水稻开花。然而Hd3a RNAi转基因植株在SD条件下开花延迟,但在LD下对开花无影响。据此推测,除了Hd3a,还有其他成花素控制开花。后来研究表明RFT1(rice flowering locus1)是另一个成花素(Komiya et al.,Development,2009,135:3443-3450)。RFT1RNAi株系对SD下的花期无影响,但明显延迟长日照下的开花。可见水稻根据光周期不同利用两种成花素Hd3a和RFT1控制开花(Komiyaetal.,Development,2008,135:767-774)。当Hd3a和RFT1的表达均被抑制时,水稻不能开花,这表明水稻开花完全依赖于成花素活性。在长日条件,RFT1促进开花,其表达受OsMADS50和Ehd1正调控,OsMADS50-Ehd1-RFT1这条途径也是LD下所特有的。Ghd7通过抑制Ehd1的表达而下调RFT1基因的表达(Osugi et al.,Plant Physiol,2011,157(3):1128-1137.)。Hd3a或者RFT1作为成花素从叶片移至顶端分生组织,促进OsMADS14和OsMADS15基因的表达,从而启动生殖生长的开始(Komiya et al.,Development,2009,135:3443-3450)。
发明内容
本发明从水稻日本晴中分离克隆到B-box锌指蛋白的OsBBX22b基因(进化树分析表明,该蛋白质与拟南芥的BBX22属于同一个分支,该基因编码的氨基酸序列与拟南芥的AtBBX22蛋白质同源性为68%,故命名为OsBBX22b),该基因在水稻中过量表达后,转基因阳性植株的开花时间明显较非转基因植株延迟,在长日条件下延迟8-10天,在短日条件下延迟15天。因此,在水稻中过量表达OsBBX22b基因对于延迟水稻开花期具有重要意义,这为调控水稻及其它植物开花时间提供了新的基因资源和新思路。
本发明申请人在一个水稻光敏色素突变体中,利用基因表达图谱鉴定到一个序列号为AK106865的、编码B-box锌指蛋白的OsBBX22b基因的信使RNA序列。水稻OsBBX22b基因信使RNA序列为2055个碱基,编码377个氨基酸和一个终止密码子。本发明是通过PCR方法,扩增出水稻品种日本晴的OsBBX22b基因的全长编码区,包含1134个碱基,正向连接在植物表达载体pCAMBIA1390-ubi上;再进行遗传转化至水稻中,提高OsBBX22b基因的表达,得到OsBBX22b基因表达增强的转基因水稻植株。在转基因的T3代植株中发现,试验田条件下(5月-9月,山东济南,长日条件),阳性转基因水稻植株的开花期较非转基因植株延迟了8-10天,而在短日条件下(9小时光照,30°C±1;15小时黑暗,27°C±1),转基因水稻的开花时间较非转基因水稻延迟了约15天。利用荧光定量分析结果表明,OsBBX22b过量表达抑制了开花素编码基因Hd3a和RFT1的表达,从而延迟了水稻开花。
本发明用于构建过量表达OsBBX22b基因的植物表达载体、增强OsBBX22b基因表达的DNA序列如SEQ ID NO:1所示,氨基酸序列如SEQ ID NO:2所示。
本发明利用水稻品种日本晴的OsBBX22b基因的cDNA片段作为应用基因,将该基因正向转入水稻中,提高OsBBX22b基因的表达水平,转基因水稻植株表现出开花期延迟。
本发明的优点在于:
(1)本发明提供了一种延迟开花的水稻基因OsBBX22b的应用。申请人在水稻中过量表达OsBBX22b基因表达后,发现转基因阳性植株的开花期延迟。
(2)本发明首次分离克隆了水稻OsBBX22b基因,并首次在水稻中过量表达了OsBBX22b基因。为改良过早成熟的水稻品种提供了新的思路,也为其它作物利用异源基因技术延迟开花期提供了理论支持。
(3)本发明首次揭示了水稻OsBBX22b基因延迟开花的机制,为水稻等禾谷类作物以及其它作物改良开花期的研究提供支持。
附图说明
图1为本发明的OsBBX22b基因表达载体的构建示意图。将克隆在pMD18-T载体上的OsBBX22b基因利用BamHI和SpeI酶切,替换pCAMBIA1390-ubi植物表达载体上BamHI和SpeI之间的DNA片段,这样OsBBX22b基因正向插入玉米泛素基因启动子(Pubi)后,即pCAMBIA1390-ubi-BBX22b植物表达载体。
图2为检测T3代转基因水稻阳性植株中OsBBX22b基因转录本相对表达水平结果图。其中OsBBX22b-OX表示转OsBBX22b基因的植株,#3、#5、#7、#16和#17代表独立的阳性转基因株系;WT代表野生型水稻植株。EF-1a作为荧光定量PCR分析的内参基因。
图3为转OsBBX22b基因水稻植株和野生型植株在大田条件及短日条件下开花时间比较图。A图是大田条件下的开花时间,材料生长在山东济南,生长期是2012年5月-2012年10月;B图是短日条件下的开花时间,短日光周期条件是9小时光照(30°C±1)/15小时黑暗(27°C±1)。C图是短日条件下转OsBBX22b基因水稻株系(#7)与野生型植株开花期表型图。其中OsBBX22b-OX表示转OsBBX22b基因的植株,#3、#7和#16代表三个独立的阳性转基因株系;WT代表野生型水稻植株。
图4为转OsBBX22b基因水稻植株和野生型植株生物钟节律比较图。A图是OsBBX22b基因和生物钟核心组分基因(OsLHY和OsPRR1)在非转基因水稻中的表达模式图;B图是OsBBX22b基因和生物钟核心组分基因(OsLHY和OsPRR1)在OsBBX22b转基因植株中的表达模式图。其中OsBBX22b-OX表示转OsBBX22b基因的植株(#7株系);WT代表野生型水稻植株。
图5为转OsBBX22b基因水稻植株和野生型植株中开花相关基因的表达水平比较图。其中OsBBX22b-OX表示转OsBBX22b基因的植株,#7和#16代表独立的阳性转基因株系;WT代表野生型水稻植株。Hd3a和RFT1是水稻的两个开花素基因;Hd1和Ehd1是两个开花素基因的上游基因。6:00、10:00、14:00和18:00代表取材时间是上午6点和10点,下午2点和6点。
图6为OsBBX22b基因延迟水稻开花期的机制图。生物钟调控OsBBX22b基因的表达,而OsBBX22b抑制成花素编码基因Hd3a和RFT1基因的表达,从而延迟水稻开花期。
具体实施方式
以下实施例定义了本发明,并描述了本发明在分离克隆用于构建OsBBX22b基因植物表达载体的DNA片段,以及验证功能的方法。根据以下的描述和这些实施例,本领域技术人员可以确定本发明的基本特征,并且在不偏离本发明精神和范围的情况下,可以对本发明做出各种改变和修改,以使其使用不同的用途和条件。
实施例1:分离克隆用于构建OsBBX22b基因植物表达载体的DNA片段
采用TRIZOL试剂(Invitrogen)从水稻品种日本晴(公开报道的一个品种)的叶片中提取总RNA。具体步骤如下:将20毫克叶片放至液氮预冷的研钵中,加入液氮快速磨成粉末,将粉末装入1.5ml离心管中,迅速加入1ml Trizol(Invitrogen)颠倒混匀,室温静置5分钟。在4℃,12000rpm离心10分钟,取上清液移至新的1.5ml离心管中。加入200μl氯仿,用手剧烈摇动15秒钟,室温静置2-3分钟。4℃,12000rpm离心15分钟。取无色水相至一新的1.5ml离心管中,加入250μl异丙醇,250μl高盐溶液,颠倒混匀,室温静置10分钟。4℃,12000rpm离心10分钟,吸除上清液。加入1ml冰冷的75%乙醇,上下倒置几次,然后4℃,7500rpm离心5分钟,弃上清,在室温下干燥至沉淀变透明。加入适量的DEPC水(一般为60μl)溶解沉淀,利用紫外分光光度计测定RNA的浓度。
利用反转录酶SuperScript II(Invitrogen)将其反转录成cDNA,具体步骤如下:依次加入1μl500μg/ml oligo(dT)12-18、2μg总RNA、1μl10mM dNTP混合物和DEPC水至12μl,在65℃水浴中5分钟,迅速冰浴5分钟,稍微离心收集样品于管底。然后依次加入4μl5×第一链缓冲液、2μl0.1M DTT和1μl RNaseOUT(40U/μl),42℃,2分钟。然后加入1μlSuperScript II,轻微混合均匀,42℃反应50分钟,然后70℃水浴15分钟使酶失活,这样就合成了第一链cDNA,以第一链cDNA为模板扩增目的基因。用带有酶切位点的上游引物OsBBX22bF(5’-ATGGATCCATGTCGCCTCCTCCTCCACCATATTA-3’,SEQ ID NO:3),序列特异引物外加BamHI位点和两个保护碱基;和下游引物OsBBX22bR(5’-AACTAGTTTATTGCCTCCGGCGTTTGGAGGTG-3’,SEQ ID NO:4),序列特异引物外加SpeI位点和两个保护碱基。利用PrimerSTAR HS DNA polymerase with GC buffer(TaKaRa)扩增目的片段,PCR反应条件是94℃预变性1分钟;98℃10秒,68℃4分钟,30个循环。利用TArget Clone TM-Plus试剂盒(TOYOBO)在PCR产物末端加A。然后连接到pMD18-T载体(TaKaRa)。筛选阳性克隆并测序,获得所需DNA片段(序列如SEQ ID NO:1所示),将该克隆命名为pMD18-OsBBX22b cDNA。
实施例2:OsBBX22b基因植物表达载体的构建和遗传转化
为了能更好地分析OsBBX22b的功能,申请人通过过量表达技术使OsBBX22b基因在水稻中表达水平提高。根据转基因植株的农艺性状特征研究该基因的功能。
OsBBX22b基因植物表达载体的构建方法如下:首先将实施例1中得到的阳性克隆pMD18-OsBBX22b cDNA用BamHI和SpeI双酶切,回收插入片段;并用同样的方法酶切pCAMBIA1390-ubi的植物表达载体,回收载体片段。用回收的插入片段和载体片段做连接反应,转化大肠杆菌XL1-Blue。通过酶切筛选阳性克隆,获得植物表达载体,命名为pCAMBIA1390-ubi-BBX22b(见图1)。pCAMBIA1390-ubi是在国际常用的植物遗传转化载体(见图1)。将pCAMBIA1390-ubi-BBX22b转化至农杆菌菌株EHA105。
通过农杆菌介导的水稻遗传转化体系(参见本发明后面的实施例)将其导入到水稻品种日本晴中,经过预培养、侵染、共培养、筛选具有潮霉素抗性的愈伤、分化、生根、移苗得到转基因植株。农杆菌介导的水稻遗传转化体系在Hiei等人报道的方法基础上进行改良(Hiei等,1994,PlantJ.,6:271-282)。转化共获得18株独立的转基因水稻植株。
具体步骤如下:
(1)愈伤诱导:去壳的野生型日本晴水稻种子,用70%乙醇表面消毒1分钟;5%(活性氯含量)NaClO溶液表面消毒20分钟;无菌水冲洗4-5次;播种于愈伤诱导培养基上诱导愈伤组织(成分见后),于25-26℃暗培养4-7天后,将从成熟胚盾片处诱导出初生愈伤组织,同时用镊子去掉胚上长出的胚芽,继代于愈伤诱导培养基继续培养2周,直至长出色泽淡黄,质地坚硬呈颗粒状的胚性愈伤组织。
(2)愈伤组织的预培养:将愈伤组织转至新鲜的愈伤诱导培养基培养,于25-26℃暗培养4天。
(3)农杆菌培养:挑取农杆菌单克隆接种到5mLYEP液体培养基中(含有50mg/L的卡那霉素),28℃,220rpm,培养至对数生长晚期(大约培养18-24小时)。将获得的菌液按1%接种量转接到50mL新鲜的、含有50mg/L卡那霉素的AB液体培养基中(成分见后);28℃,220rpm,培养至OD600值为0.5左右(培养5-6小时)。
(4)农杆菌侵染:把50mL菌液转入离心管,4℃,4000g离心10分钟,弃上清,加入等体积的AAM培养基重悬菌体。把(2)的日本晴胚性愈伤组织浸入上述AAM菌液,侵染2分钟,缓慢摇动。用无菌吸水纸将愈伤组织吸干,置于共培养培养基上(培养基上铺一层无菌滤纸),26℃,黑暗共培养2-3天。
(5)愈伤洗涤和选择培养:共培养后的愈伤组织用无菌水洗4次,然后再用含500mg/L羧苄青霉素Cb的无菌水洗2次,再用无菌吸水纸吸干后置于工作台吹30分钟。将愈伤组织置于固体筛选培养基(含有25mg/L潮霉素,400mg/L羧苄青霉素)上,26℃暗培养2周。然后转移到固体筛选培养基(含有30mg/L潮霉素,300mg/L羧苄青霉素)上,26℃暗培养,每2周继代一次,筛选4周。
(6)分化培养:把抗性愈伤组织转移至分化培养基上,28℃光照培养7天,转接一次后,培养至产生再生苗。
(7)壮苗、移栽:将再生的小植株转至新鲜的1/2MS培养基上,于培养瓶中生根壮苗。待小苗长至10cm左右,打开封口膜,炼苗2-3天,将再生苗移至土中培养。
试剂配方:
(1)试剂和溶液缩写:本发明中作用到的植物激素的缩写表示如下:Cb(Cabenicillin,羧苄青霉素);KT(Kinetin,激动素);NAA(Napthalene acetic acid,萘乙酸);2,4-D(2,4-Dichlorophenoxyacetic acid,2,4-二氯苯氧乙酸);AS(Acetosyringone,乙酰丁香酮);DMSO(Dimethyl sulfoxide,二甲基亚砜)。
(2)用于水稻遗传转化的培养基配方:
1)YEP液体培养基:2g Bacto-蛋白胨,2g酵母粉,1g NaCl,加水定容至200mL,用5N NaOH调PH至7.0。
2)愈伤诱导培养基:N6大量,N6微量,铁盐,N6维生素,0.5g/L酸水解酪蛋白,30g/L蔗糖,2mg/L2,4-D,Gelrite(Sigma)4g/L,pH5.8。
3)AB液体培养基:3g/LK2HPO4,1g/LNaH2PO4,1g/LNH4Cl,300mg/LMgSO4·7H2O,150mg/L KCl,10mg/L CaCl2·2H2O,2.5mg/L FeSO4·7H2O,5g/L葡萄糖,pH7.0。
4)AAM培养基:AA大量,AA微量,0.9g/L L-谷氨酰胺,0.3g天冬氨酸,MS维生素,0.5g/L酸水解酪蛋白,36g/L葡萄糖,68.5g/L蔗糖,20mg/LAS,pH5.2。
5)共培养培养基:N6大量,N6微量,铁盐,N6维生素,30g/L蔗糖,10g/L葡萄糖,0.5g/L酸水解酪蛋白,2mg/L2,4-D,20mg/LAS,Gelrite(Sigma)4g/L,pH5.8。
6)固体筛选培养基:N6大量、N6微量和N6维生素,0.5g/L酸水解酪蛋白,30g/L蔗糖,2mg/L2,4-D,Gelrite(Sigma)4g/L,pH5.8,合适浓度的潮霉素和羧苄青霉素。
7)分化培养基:MS大量,MS微量,铁盐和MS维生素,2g/L酸水解酪蛋白,30g/L蔗糖,30g/L山梨醇,2mg/LKT,0.2mg/LNAA,pH5.8,30mg/L潮霉素B,200mg/L羧苄青霉素。
8)1/2MS培养基:1/2MS大量,1/2MS微量,MS维生素,30g/L蔗糖,4g/L Gelrite,30mg/L潮霉素B,200mg/L羧苄青霉素,pH5.8.
(3)主要溶液配方:
1)N6大量元素(10×)
Figure BDA00002638488500081
用水定容1L
2)N6微量(1000×):
Figure BDA00002638488500082
用水定容1L
3)N6维生素(1000×)
Figure BDA00002638488500083
用水定容100mL
3)MS大量元素(10×)
Figure BDA00002638488500084
用水定容1L
4)MS微量(1000×):
Figure BDA00002638488500091
用水定容1L
5)MS维生素(1000×)
Figure BDA00002638488500092
用水定容100mL
6)铁盐(200×)
FeSO4.7H2O            5.56g
Na2EDTA.2H2O          7.46g
7)AA大量(200×)
Figure BDA00002638488500093
8)AA微量(1000×)
Figure BDA00002638488500094
用水定容1L
9)2,4-D储存液(2mg/ml)
称取2,4-D100mg,溶于1ml DMSO,加入蒸馏水定溶至49ml,然后加入0.5N NaOH,至完全溶解,于-20℃保存。
10)Kinetin储存液(0.2mg/ml)
称取Kinetin10mg,溶于1ml1NKOH,加蒸馏水定溶至50ml,于4℃保存。
11)NAA储存液(0.2mg/ml)
称取NAA10mg,溶于0.5ml1N KOH,加蒸馏水定溶至50ml,于4℃保存。
12)乙酰丁香酮(100mg/ml)
称取乙酰丁香酮100mg,溶于1ml DMSO,于-20℃保存。
13)卡那霉素(50mg/ml)
称取卡那霉素500mg,溶于8ml蒸馏水中,加蒸馏水定溶至10ml,然后用0.22μm滤器过滤除菌,于-20℃保存。
实施例3:检测转基因水稻植株和野生型水稻的OsBBX22b基因的转录本水平
以水稻野生型日本晴和7个独立的T3代转基因水稻植株为材料,提取四叶期水稻叶片的RNA,利用RT-PCR检测水稻叶片中OsBBX22b基因的转录本水平。具体方法如下:采用TRIZOL试剂(Invitrogen)从上述材料收集0.03g水稻叶片提取总RNA,具体步骤如实施例1的描述。
利用RNase-free DNase(TaKaRa)除去RNA中的DNA,具体步骤如下:依次加入TotalRNA50μg,10×DNase I Buffer5μl,DNase I(RNase-free,5U/μl)2μl,RNase Inhibitor(50U/μl)0.4μl,加DEPC水补足总体积至50μl。反应体系混匀后在37℃反应30min。然后在反应体系中加入50μl DEPC水补足至100μl。随后加入苯酚∶氯仿∶异戊醇(25∶24∶1)混合物100μl,充分混匀,4℃,12000rpm离心15min。将上层移至新的1.5ml离心管中。加入100μl氯仿∶异戊醇(24∶1)混合物,充分混匀,4℃,12000rpm离心15分钟。取最上层移至另一新的1.5ml离心管中,加入1/10体积的3M NaAc(pH=5.2)和2.5倍体积的冷无水乙醇,-80℃放置1小时,4℃,12000rpm离心10分钟,吸除上清液。加入1ml冰冷的75%乙醇,上下倒置几次,然后4℃,7500rpm离心5分钟,弃上清,在室温干燥至沉淀变透明。加入25μl DEPC水溶解沉淀,利用紫外分光光度计测定RNA的浓度。
根据PrimeScriptTM RT Enzyme Mix I(TaKaRa)说明书合成cDNA第一链。具体步骤如下:依次加入上述总RNA1μg、5×PrimeScript buffer2μl、PrimeScript RT Enzyme Mix0.5μl、Random6mers(100μM)和Oligo dT Prime(50μM)各0.5μl,最后用RNase Free dH2O补充至总体积为10μl。然后将反应体系在37℃下保温15分钟,使反转录反应进行,然后用85℃高温处理5秒使酶失活,即完成了cDNA第一链的合成。
以上述cDNA为模板,用OsBBX22b基因的特异性上游引物OsBBX22bqF1(5’-TCCTCCACCATATTACCACCA-3’,SEQ ID NO:5),和下游引物OsBBX22bqR1(5’-GCGCTGCACAGTAGCTTCAT-3’,SEQ ID NO:6)进行荧光定量PCR分析。同时用水稻内源翻译延伸因子基因(转OsBBX22b基因水稻植株和野生型植株中表达模式比较图)作为荧光定量PCR分析的内参基因,其特异上游引物为OsEF-1aF(5’-TTTCACTCTTGGTGTGAAGCAGAT-3’,SEQ ID NO:7),特异下游引物为OsEF-1aR(5’-GACTTCCTTCACGATTTCATCGTAA-3’,SEQ ID NO:8)。利用SYBR Premix Ex TaqTMPCR试剂盒(TaKaRa)进行荧光定量PCR反应。具体步骤如下:依次加入10μl2×SYBRPremix Ex TaqTM、2.0μl cDNA模板、0.2μM基因特异性引物对,用RNase-free H2O补足反应体系为20μl。PCR反应条件是95℃预变性30秒;95℃变性30秒,60℃退火延伸30秒,40个循环。PCR反应结束后,分析各个样品的扩增曲线和溶解曲线以确定实验结果的可信度。然后用Excel通过2-Δ△Ct法处理荧光定量PCR获得的Ct值并计算标准误差,对最终处理结果作图。结果表明过表达株系中OsBBX22b基因的转录本水平是非转基因水稻植株的5-15倍,从而证明OsBBX22b基因已整合到水稻基因组中并且在水稻中大量表达(图2)。
实施例4:转OsBBX22b基因水稻在不同光周期条件下开花期延迟
本实施例分析了转基因水稻植株和野生型水稻植株苗期的开花期。具体步骤如下:将转基因植株(#3、#7和#16)和非转基因野生型植株的种子用70%乙醇表面消毒1分钟;5%(活性氯含量)NaClO溶液表面消毒20分钟,然后无菌水冲洗4-5次,然后分别进行了长日照和短日照光周期条件下培育,比较转基因水稻植株和野生型植株在不同光周期条件下的开花期。长日照条件即为大田条件的实验如下:2012年5月21日将消毒后的种子播种于营养土,在自然光照条件下培养20天后,每种材料转移20株至稻田中,至幼穗从旗叶叶鞘中露出一半时记录为开花日期,结果表明,转OsBBX22b基因水稻植株的开花期较非转基因水稻延迟了8-10天(图3A);短日照条件的实验如下:将表面消毒后的种子在黑暗中(28±1°C)放置3天,诱导萌发,然后每种材料转移20个萌发一致的种子至土壤中,在植物生长室中培养,光照和温度条件分别为光期9小时(30±1°C)、暗期15小时(27±1°C),至幼穗从旗叶叶鞘中露出一半时记录开花日期,并照相。结果表明转OsBBX22b基因水稻植株的开花时间较非转基因水稻延迟了约15天(图3B和3C)。上述结果表明,OsBBX22b基因过量表达导致水稻开花时间延迟。
实施例5:转OsBBX22b基因水稻植株和野生型植株中生物钟核心组分基因的表达模式比较
为了分析OsBBX22b延迟水稻开花的机制,我们首先利用荧光定量PCR分析了OsBBX22b过量表达是否影响生物钟。具体步骤如下:转基因(#7)和野生型水稻种子用70%乙醇表面消毒1分钟;5%(活性氯含量)NaClO溶液表面消毒20分钟;无菌水冲洗4-5次,在暗条件下萌发3天。随后转移至土壤中在植物生长室生长培养至三叶期,植物生长室的光照和温度条件分别是14小时光期(30±1°C)、10小时暗期(27±1°C)。然后转移到连续光照条件下,继续培养2天,每隔3h取材。根据实施例3的方法提取RNA、合成cDNA第一链。
以上述cDNA为模板,利用荧光定量PCR分析OsBBX22b和生物钟核心组分基因(OsLHY和OsPRR1)的表达模式。荧光定量PCR所用引物如下:OsBBX22b基因的特异性上游引物OsBBX22bqF1(SEQ ID NO:5),和下游引物OsBBX22bqR1(SEQ ID NO:6)。OsLHY基因的特异性上游引物OsLHYqF1(5’-CAGATAAGGCCGACACCAAAC-3’,SEQ ID NO:9),和下游引物OsLHYqR1(5’-GGTGTGTTGGAACCACATG-3’,SEQ ID NO:10)。OsPRR1基因的特异性上游引物OsPRR1qF1(5’-CTGCTGAACCTCTGGACCCA-3’,SEQ ID NO:11)和下游引物OsPRR1qR1(5’-GGTTCCGATAACGCCAACTC-3’,SEQ ID NO:12)。同时用水稻内源翻译延伸因子基因(OsEF-1a)作为荧光定量PCR分析的内参基因,其特异上游引物为OsEF-1aF(SEQ ID NO:7),特异下游引物为OsEF-1aR(SEQ ID NO:8)。利用SYBRPremix Ex TaqTM PCR试剂盒(TaKaRa)进行荧光定量PCR反应,具体步骤实施例3。PCR反应结束后,分析各个样品的扩增曲线和溶解曲线以确定实验结果的可信度。然后用Excel通过2-Δ△Ct法处理荧光定量PCR获得的Ct值并计算标准误差,对最终处理结果作图。结果表明,在野生型中OsBBX22b基因在光期的表达逐渐降低,而在暗期表达逐渐提高,即使在连续光照条件下,OsBBX22b基因的表达仍保持昼夜节律性,其节律性与生物钟核心组分基因基本OsLHY相同,而与OsPRR1基因相反(图4A)。然而在OsBBX22b过表达株系中,OsBBX22b基因的转录本不再表现出昼夜节律,但是生物钟核心组分基因OsLHY和OsPRR1基因的转录本仍然具有昼夜节律性,与野生型中基本相同(图4B)。这个结果表明,OsBBX22b过表达不影响生物钟功能。考虑到野生型中OsBBX22b的表达具有生物节律性,我们推测OsBBX22b基因可能是在生物钟的输出途径上发挥作用。
实施例6:转OsBBX22b基因水稻植株和野生型植株中开花相关基因表达模式比较
已有报道表明,水稻利用两种成花素Hd3a和RFT1控制开花期。因此我们检测了OsBBX22b过表达株系中Hd3a和RFT1基因的表达水平。具体实施步骤如下:将转基因植株(#7和#16)和非转基因野生型植株的种子用70%乙醇表面消毒1分钟;5%(活性氯含量)NaClO溶液表面消毒20分钟,然后无菌水冲洗4-5次,在自然光照条件下(2012年5月)培养生长20天后,转移至稻田中,在大田中生长至60天时取材。从早晨6:00开始每隔4小时取材一次,每次取3个不同植株相同叶位的材料混合,提取RNA、合成cDNA第一链,并利用荧光定量RT-PCR分析Hd3a和RFT1的转录水平(具体步骤见实施例3)。Hd3a基因的特异性上游引物Hd3aqF1(5’-GCTAACGATGATCCCGAT-3’,SEQ ID NO:13),和下游引物Hd3aqR1(5’-CCTGCAATGTATAGCATGC-3’,SEQ ID NO:14)。RFT1基因的特异性上游引物RFT1qF1(5’-CGTCCATGGTGACCCAACA-3’,SEQ ID NO:15),和下游引物RFT1qR1(5’-CCGGGTCTACCATCACGAGT-3’,SEQ ID NO:16)。结果表明RFT1和Hd3a在过表达株系中的表达水平明显低于野生型(图5)。
利用同样的材料,我们进一步分析了这两个成花素基因上游基因(Hd1和Ehd1)在转基因株系和野生型中的转录水平。具体实施步骤如上,其中Hd1基因的特异性上游引物Hd1qF1(5’-TCAGCAACAGCATATCTTTCTCATCA-3’,SEQ ID NO:17),和下游引物Hd1qR1(5’-TCTGGAATTTGGCATATCTATCACC-3’,SEQ ID NO:18)。Ehd1基因的特异性上游引物Ehd1qF1(5’-GCGCTTTTGATTTCCTGC-3’,SEQ ID NO:19),和下游引物Ehd1qR1(5’-TTCGGAATATGTGCTGCC-3’,SEQ ID NO:20)。结果表明,OsBBX22b过量表达对这开花素上游基因Hd1和Ehd1的表达无影响(图5),据此推测,OsBBX22b通过直接抑制Hd3a和RFT1的表达而延迟开花(图6)。
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Claims (3)

1.基因OsBBX22b在延迟水稻开花期方面的应用,所述基因OsBBX22b的DNA序列如SEQ ID NO:1所示。
2.如权利要求1所述的基因OsBBX22b在延迟水稻开花期方面的应用,其特征是,基因OsBBX22b过量表达抑制了开花素编码基因Hd3a和RFT1的表达,从而延迟了水稻开花。
3.基因OsBBX22b延迟水稻开花期方面的应用方法,其特征是,通过PCR方法,扩增出水稻品种日本晴的OsBBX22b基因的全长编码区,正向连接在植物表达载体pCAMBIA1390-ubi上;再进行遗传转化至水稻中,提高OsBBX22b基因的表达,得到OsBBX22b基因表达增强的转基因水稻植株,阳性转基因水稻植株在长日条件下和在短日条件下均表现出开花期延迟,所述基因OsBBX22b的DNA序列如SEQ ID NO:1所示。
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