CN102965372A - 一种干涉GDF9基因表达的 siRNA及其应用 - Google Patents
一种干涉GDF9基因表达的 siRNA及其应用 Download PDFInfo
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Abstract
本发明公开了一种抑制水牛生长分化因子9(growthdifferentiationfactor9,GDF9)基因表达的siRNA,属于基因工程技术领域。本发明所述的siRNA正义链具有SEQ ID NO:1~3所示的任一序列。本发明还公开了含有该siRNA的shRNA编码基因及由其构建的慢病毒干扰质粒pshRNA-copGFPLentivector。通过实时定量Real-timePCR检测,相对表达量公式计算,其中两个siRNA片段分别对水牛GDF9mRNA抑制效率超过100%,ELISA检测GDF9蛋白表达量也相应降低。本发明的siRNA片段及其表达载体可用于制备抑制水牛GDF9表达的制剂,能够显著下调GDF9基因的表达量。
Description
技术领域
本发明涉及分子生物学以及生物工程技术领域,具体涉及抑制水牛生长分化因子9(GDF9)基因表达的siRNA片段。
背景技术
RNAi(RNA interference),即RNA干扰,是真核生物中普遍存在的抵抗病毒入侵、抑制转座子活动、调控基因表达的监控机制。RNAi是通过双链RNA诱导与之同源的mRNA降解,导致目标基因转录后缄默的现象或机制。此现象于1998年在对线虫的研究中首次发现。siRNA是进入细胞内的外源dsRNA或内源产生的dsRNA,被Dicer酶切割成为2l-23nt长的小分子,这种siRNA是RNAi机制中的关键中间产物,具有非常强的RNAi效应。
RNAi途径中,RISC(RNA induced silencing complex)的形成发挥了极大的作用。RISC是由小分子RNA(siRNA/miRNA),Dicer,DadR蛋白和Argonaute家族蛋白组成的复合体,其作用是直接造成与复合体中siRNA高度互补的mRNA被降解。RISC作用过程中,mRNA的切割发生在对应的siRNA 5’端10~11位核苷酸间,切割将mRNA一分为二,切割后mRNA从RISC上释放。完成一次切割后,引导 siRNA仍然结合在RISC中,继续完成更多轮的切割。
生长分化因子9(growth differentiation factor 9 ,GDF9)主要在卵泡中表达,同时在非性腺组织中有表达,能促进始基卵泡的发育,与FSH协同刺激卵泡生长,主要调控卵泡的生长发育和生殖功能。GDF9基因敲除小鼠因初级卵泡发育受阻,从而影响生殖。而体外给予生物活性的GDF9可诱导窦前卵泡生长和细胞分泌。以上表明GDF9对卵泡的生长发育影响是有阶段依耐性。Hanrahan等(2004)发现GDF9的FecGH突变(G8突变)能显著提高杂合绵羊的排卵率。
siRNA作为一种新型的基因工具来抑制特定基因的表达,目前大规模应用于生物细胞、组织和个体,特别是用来制备基因敲低模式动物,从动物整体水平研究基因的功能,siRNA的抑制特定基因的优点是其他基因技术都无法比拟的。而对于水牛生长分化因子9的siRNA还未见研究报道。
发明内容
本发明的目的在于通过下调GDF9基因的部分功能来提高水牛的繁殖率,由于水牛繁殖率普遍较低,本发明提供了一种抑制水牛生长分化因子9(GDF9)基因表达的siRNA。
本发明通过以下技术方案实现上述目的:
一种抑制水牛生长分化因子9(GDF9)基因表达的siRNA,分别命名为GDF9-1、GDF9-2和GDF9-3,其核苷酸双链中正义链序列如下:
GDF9-1: SEQ ID NO:1;
GDF9-2: SEQ ID NO:2;
GDF9-3: SEQ ID NO:3。
所述siRNA与GDF9基因mRNA反向互补,其长度为19~27bp。
含有上述siRNA的shRNA。
上述shRNA的编码基因,两端带有BamHⅠ和EcoR I酶切位点的序列,便于构建表达质粒,双链核苷酸序列如下:
GDF9-1dsDNA:正义链具有如SEQ ID NO:4所示的核苷酸序列,反义链具有如SEQ ID NO:5所示的核苷酸序列;
GDF9-2dsDNA:正义链具有如SEQ ID NO:6所示的核苷酸序列,反义链具有如SEQ ID NO:7所示的核苷酸序列;
GDF9-3dsDNA:正义链具有如SEQ ID NO:8所示的核苷酸序列,反义链具有如SEQ ID NO:9所示的核苷酸序列。
一种表达载体,由上述shRNA的编码基因与出发载体构建的,即将shRNA编码基因插入出发载体上构建而成。
慢病毒载体可以直接高效率地感染分裂期和非分裂期细胞,且转染效果更加稳定,作为上述出发载体中的优选方案,其中病毒载体最优选pshRNA-copGFP Lentivector。该载体具有完整的shRNA插入位点以及绿色荧光蛋白(green fluorescence protein,GFP)报告基因,实现了靶基因shRNA的高效表达、病毒包装以及转基因的直观展示。
本发明的siRNA可以制备成基因药物或其他合适的制剂用于下调水牛生长分化因子9的表达,从而提高水牛的繁殖性能。
与现有技术相比,本发明具有以下有益效果:
本发明的siRNA沉默效果好,能够特异性的下调GDF9基因的表达。通过实时定量Real-time PCR检测发现各干扰片段能使GDF9 mRNA表达量有的发生100%的抑制现象,ELISA检测GDF9蛋白表达量也相应降低。
发明人构建了含有上述siRNA的编码基因的pshRNA-copGFP Lentivector 慢病毒干扰质粒,并对其进行了体外细胞水平的实验,并制备了转基因小鼠模型,结果证明了pshRNA-copGFP Lentivector 慢病毒干扰质粒转入细胞后能表达shRNA,并对水牛GDF9基因进行特异性的抑制,从而在制备用于GDF9下调的生物制剂中有应用价值。
附图说明
图1. pcDNA3.1(+/-)载体图;
图2.pPUC19-GDF9酶切电泳图,M:DL15000 makeer,1:空质粒,2:: BamH I单酶切,3:BamH I/ EcoRⅠ双酶切;
图3. pcDNA3.1(-)载体酶切图,1:BamH I/ EcoRⅠ双酶切,2:BamH I单酶切,3:空质粒,M 15000bp make;
图4. 重组质粒pcDNA3.1- GDF9菌落鉴定电泳图,箭头所指GDF9基因扩增片段;
图5. pshRNA-copGFP Lentivector 载体图;
图6. pshRNA-copGFP Lentivector载体酶切图,1:空质粒,2:BamH I单酶切,3:BamH I/ EcoRⅠ双酶切;
图7.退火产物鉴定电泳图;
图8. 重组质粒Lv-shRNA鉴定,1、2:Lv-shRNA1,3、4:Lv-shRNA2,5:Lv-shRNA3,M:50bp maker;
图9. 细胞总RNA电泳检验图;
图10. 水牛pcDNA3.1(-)-GDF9及LV-siRNA共转染CHO细胞48h荧光显微镜图(40×);
图11.慢病毒干扰质粒对水牛GDF9 mRNA表达水平的影响,其中*表示差异显著(P<0.05);
图12. 转染空质粒和慢病毒质粒后CHO细胞裂解液中GDF9蛋白浓度变化, 其中*表示差异显著(P<0.05)。
具体实施方式
以下结合具体实施方式对本发明作进一步的详细描述。
实施例1 构建pCDNA3.1- GDF9真核表达载体
1. 合成水牛生长分化因子9(GDF9)序列(GenBank登录号NM_174681),连接于载体pUC19上,酶切为点为EcoR I与BamH。双酶切(EcoR I与BamH)和测序证明合成片段正确(见图2)。
2. 构建pCDNA3.1-GDF9真核表达质粒
(1)酶切反应
反应体系:EcoR I与BamHⅠ双酶切PCR产物。EcoR I与BamHⅠ双酶切pcDNA3.1(-),酶切体系:10×Buffer K 2μL,EcoR I 1μL,BamHⅠ 1μL,质粒6μL,蒸馏水10μL,总体积20μL。反应条件:37℃作用1.2h,进行1%琼脂糖凝胶电泳。酶切产物用DNA纯化试剂盒纯化,最后各以30μL水洗脱DNA,-20℃保存。
(2)连接反应
反应体系:线性化pcDNA3.1(-) 4μL,10×Ligation Buffer 2μL,T4 DNA Ligase 1μL,GDF9目的片段13μL,总体积为20μL。反应条件:16℃连接过夜,获得重组pCDNA3.1-GDF9真核表达质粒。
3. 重组质粒转化大肠杆菌
筛选步骤2中pCDNA3.1-GDF9真核表达质粒的阳性克隆,通用引物(T7和BGH),序列号分别为:SEQ ID NO:10和SEQ ID NO:11;扩增有1300bp左右长度的插入片段释放出者视为阳性重组体(见图4)。从上述方法鉴定的阳性克隆中挑选2个克隆,接种于LA培养基中制备新鲜菌液,经测序鉴定插入片段正确,构建pCDNA3.1-GDF9真核表达载体成功。
实施例2 构建pshRNA-copGFP Lentivector慢病毒干扰质粒
1. 根据水牛生长分化因子9的mRNA序列设计方法和原则筛选出靶序列,设计siRNA,与水牛生长分化因子9基因mRNA反向互补,分别命名为GDF9-1、GDF9-2、GDF9-3,其正义链序列如下:
GDF9-1: SEQ ID NO:1;
GDF9-2: SEQ ID NO:2;
GDF9-3: SEQ ID NO:3。
2. 再根据siRNA靶序列设计构建抑制水牛生长分化因子9基因表达的siRNA载体所需的DNA序列:GDF9 shRNA模板,两端引入BamH I和EcoR I酶切位点,送上海生物工程技术服务有限公司合成。具体序列如下(F表示正义链,R表示反义链):
GDF9-1shRNA F: SEQ ID NO:4;
GDF9-1shRNA R: SEQ ID NO:5;
GDF9-2shRNA F: SEQ ID NO:6;
GDF9-2shRNA R: SEQ ID NO:7;
GDF9-3shRNA F: SEQ ID NO:8;
GDF9-3shRNA R: SEQ ID NO:9。
3. 将合成好的上述寡核苷酸序列溶解并稀释至浓度为1 μg/μL,将上述6条序列分成3对,其中GDF9-1shRNA F和GDF9-1shRNA R为1对,GDF9-2shRNA F和GDF9-2shRNA R为1对,GDF9-3shRNA F和GDF9-3shRNA R为1对。3对序列分别进行退火反应。退火反应体系如下:DNA模板单链1(GDF9-1shRNA F)1μl,DNA模板单链2(GDF9-1shRNA R)1μl,10×退火溶液 1μl,ddH2O 17μl。反应条件:混匀,95℃加热10min;室温静置过夜;稀释至终浓度10ng/μl。-20℃备用。GDF9-2shRNA F和GDF9-2shRNA R,以及GDF9-3shRNA F和GDF9-3shRNA R的退火反应体系同上,DNA模板单链替换成相应核苷酸序列即可。
4. LV-shRNA-GFP空质粒载体(即pshRNA-copGFP Lentivector空质粒,见图6)酶切,酶切体系如下:BamH I 1 μl,EcoR I 1 μl,10×Buffer K 2 μl,LV-shRNA-GFP空质粒6 μl,ddH2O 10 μl。37℃作用1h,进行1 %琼脂糖凝胶电泳,电泳结果见图6。Omega凝胶片断回收纯化试剂盒回收载体片段。
将步骤3所得的退火产物与酶切质粒载体连接,连接体系如下:双酶切质粒LV-shRNA-GFP(0.1μg/μl)1μl,退火产物 1μl,T4 DNA Ligase Buffer 2μl,T4 DNA Ligase 1μl,ddH2O 15μl。充分混匀,16 ℃水浴连接,反应过夜。
5. 转化与阳性克隆的PCR鉴定:转化连接产物,挑取单个菌落,接种到LA液体培养基中,37℃恒温振荡培养3h。PCR鉴定阳性克隆,采用引物设计软件Primer 5设计引物,其中上游引物序列为SEQ ID NO:12,下游引物序列为SEQ ID NO:13,由上海生物工程技术服务有限公司合成。扩增包括插入目的基因的DNA片段。
PCR扩增片段为156bp,反应采用50μL反应体系。体系的组成为:10×PCR缓冲液5μL,2.5mM dNTP 4μL,上游引物(10pmol/μL)1μL,下游引物(10pmol/μL)1μL,步骤5中转化后的菌液3μL,Taq DNA聚合酶(5U/μL)0.3μL,补加ddH2O至50μL。按以下条件进行PCR反应:94℃,5min;94℃,30sec;60℃,30sec;72℃,30sec,共35个循环;72℃,10min延伸后结束反应。分别取5μL PCR产物,2%琼脂糖凝胶电泳,检查目的基因的扩增效果,电泳结果见图8。
6. 阳性克隆测序:挑选阳性克隆菌液测序(由Invitrogen公司进行3730型测序仪进行测序分析)。利用生物分析软件DNAMAN进行同源性分析。构建成功的三种慢病毒干扰质粒分别命名为LV-siRNAⅠ、LV-siRNAⅡ和LV-siRNAⅢ(LV-siRNA是对于用pshRNA-copGFP Lentivector构建的干扰质粒的简称,里面插入了RNA干扰的dsDNA的序列)。
实施例3 RNA干扰有效靶点的筛选
1. 三种慢病毒干扰质粒转染真核细胞
将pcDNA3.1-GDF9分别和LV-siRNAⅠ、LV-siRNAⅡ和LV-siRNAⅢ共转染入CHO细胞进行表达。设pcDNA3.1- GDF9和LV-shRNA-GFP空质粒共转染CHO细胞作为对照,目的为与处理组转染背景一致,每个处理设6个重复。其中pcDNA3.1- GDF9与慢病毒干扰质粒的比例为1:1。
脂质体转染,按照Polyfect(购自QIAGEN公司)试剂说明书进行。
(1) 转染前一天,在新六孔板培养皿中接种细胞,完全吹散细胞以保证细胞均匀的分布。当转染时细胞最好铺满培养皿的40-90%。
(2) 将pcDNA3.1- GDF9和慢病毒干扰质粒按1:1共4ug,加RPMI-1640培养基补至100ul,温柔地上下颠倒混匀6-8次,室温孵育5min;
(3) 取10ul 的Polyfect加入到100ul DNA/RPMI-1640培养基中温柔地上下颠倒混匀6-8次,室温孵育10min。
(4) 在第3步孵育形成转染混合物的同时,用不含血清和抗生素的RPMI-1640洗细胞一次,然后加入1.5mL含10%血清和1%抗生素的RPMI-1640完全培养基。
(5) 将第3步中产生的DNA/ RPMI-1640试剂混合物逐滴加入第4步中处理的六孔板培养皿中,轻轻地将混合物和培养基混匀,CO2培养箱中37℃培养48小时,荧光倒置显微镜观察转染效率,部分细胞用Trizol收集,-70℃保存,用于RNA提取。
2. 转染细胞总RNA提取
采用Invitrogen公司TRIzol Reagent提取转染细胞总RNA。所用器材均经0.1%DEPC水浸泡过夜,高压灭菌后在鼓风干烤箱中烤干,操作过程均在超净台中进行。具体操作步骤如下:
(1) 在六孔板中立刻加入1mlTrizol/孔,裂解5 min后转移到RNase-free的1.5ml的离心管中;
(2) 每管加入200 ul氯仿;
(3) 旋涡振荡器上混匀2min,室温静置10min,4℃12000rpm离心15min;
(4) 离心后分三层,吸取上层清液(小心尽量不要吸到中层蛋白)到新的离心管中,加入等体积的异戊醇;
(5) 混匀,-20℃静置沉淀40min,4℃12000rpm离心15min;
(6) 离心后可见白色沉淀于管底,小心弃掉上清,加入500ul75%乙醇,4℃,7500rpm离心5min;
(7) 弃去乙醇后再洗涤一次,干燥,加入适量RNase-free水溶解;
(8) RNA定量:取lu1RNA样品,加入99ul无RNA酶水中,混匀,稀释100倍,用无RNA酶水做空白对照,于核酸蛋白分析仪中测OD值,RNA浓度;
(9) RNA电泳检测:取1ul样品上样,电压90V,跑30min,照胶。
为了防止质粒DNA的污染,提取的RNA用无RNase的DNA酶消化(10×buffer 2μL,DNA酶0.1uL,17.9μL RNA,反应总体系20uL,37℃,1h)。然后按加入酚-氯仿抽提,去除DNA酶,异丙醇沉淀,最后用0.1%DEPC水溶解。1%琼脂糖凝胶电泳,结果拍照。(见图9)。
3. Real time-PCR检测细胞内GDF9的表达丰度
GDF9的引物如下,GDF9上游引物SEQ ID NO:14,下游引物SEQ ID NO:15,PCR扩增片段为151bp。同体系设仓鼠β-actin基因为内参(β-actin上游引物SEQ ID NO:16,下游引物SEQ ID NO:17),由上海生工生物工程技术服务有限公司合成,扩增片段为428bp。
以提取的总RNA为模板,以Oligo-dT为引物(工作浓度为10pmol/μL)进行RT反应。取总RNA 10μL,65℃水浴10min,加Oligo-dT引物1μL,70℃预变性5min,立即冰浴5min;在冰浴状态下加入5×AMV缓冲液6μL,Rnasin 0.4μL(40U,Promega),dNTP 1.5μL,AMV 0.2μL(8U,Promega),用水补足至总体积30μL,混匀后于42℃反应1h,80℃灭活5min。所有反转录产物用1×TE稀释4倍,-20℃保存备用。
以RT反应产物为模板,进行PCR反应 (GDF9扩增片段151bp;β-actin扩增片段428bp),体系的组成为:10×PCR缓冲液5μL,2.5mM dNTP 4μL,上、下游引物(10pmol/μL)各1μL,模板2μL,Taq DNA聚合酶(5U/μL)0.3μL,补加ddH2O至50μL。反应条件:95℃预变性5min;95℃ 30sec,56℃ 30sec,72℃,30sec,35个循环;72℃延伸10min。。
首先在荧光定量PCR专用96孔PCR板(置于冰上)的每个孔里分别加入1μl模板(样本的RT产物或系列标准品),然后加入19μl预混溶液(包括10μl Realtime PCR Master Mix、1.2 μl10μM引物、7.8μl灭菌双蒸水),总反应体系为20μl。用小心将荧光定量PCR专用的96孔PCR板封口膜(ABgene公司,英国)覆盖在PCR板上,压紧,保证每个孔不透气,短暂离心。
每个处理设3个重复,并在每块板上同时设阴性对照(以水为模板)。按ABI7500型荧光定量PCR仪的操作说明放入96孔PCR板,设置PCR反应条件为95℃/1min预变性;95℃/15s变性,56℃/15s退火,72℃延伸40s,循环40圈。在确认目的基因与内参照β-actin基因实时荧光定量PCR扩增效率基本接近时(差异小于5%),目的基因GDF9的扩增效率为93%,内参β-actin的扩增效率为91.3%。目的基因mRNA表达丰度可以用 计算得到。转染CHO细胞系荧光图见图10。
结果发现,与共转染pcDNA3.1-GDF9质粒和pshRNA-copGFP Lentivector 空质粒48h后相比,细胞共转染pcDNA3.1-GDF9和慢病毒干扰质粒 LV- siRNA以后,GDF9 mRNA表达极显著下降(见图11)。结果显示三个慢病毒干扰质粒都一定程度抑制了GDF9的表达,数据分析表明LV- siRNAⅠ和LV- siRNAⅡ抑制效率为均达到100%,LV- siRNAⅢ抑制效率为90%以上(见图11)。转染慢病毒质粒后的CHO细胞裂解液中GDF9蛋白浓度明显下降(见图12)。
综上所述,体外细胞实验表明本发明涉及的GDF9 shRNA干扰质粒可有效地干预GDF9基因的表达,可用于制造下调水牛生长分化因子9基因表达的制剂,提高水牛繁殖率。
〈110〉华南农业大学
〈120〉一种抑制水牛生长分化因子9基因表达的siRNA
〈160〉17
〈210〉1
〈211〉21
〈212〉siRNA
〈213〉人工序列
〈220〉
〈223〉GDF9-1
〈400〉1
AAGTCAGTCT TGCTATATAC T 21
〈210〉2
〈211〉21
〈212〉siRNA
〈213〉人工序列
〈220〉
〈223〉GDF9-2
〈400〉2
AAGCTGCTGA GGGTGTAAGA T 21
〈210〉3
〈211〉21
〈212〉siRNA
〈213〉人工序列
〈220〉
〈223〉GDF9-3
〈400〉3
AACTGAAGTG GGACAACTGG A 21
〈210〉4
〈211〉59
〈212〉shRNA
〈213〉人工序列
〈220〉
〈223〉GDF9-1dsDNA-sense
〈400〉4
GATCCGTCAG TCTTGCTATA TACTCTCAAG AGAAGTATAT AGCAAGACTG ACTTTTTTG 59
〈210〉5
〈211〉59
〈212〉shRNA
〈213〉人工序列
〈220〉
〈223〉GDF9-1dsDNA-antisense
〈400〉2
AATTCAAAAA AGTCAGTCTT GCTATATACT TCTCTTGAGA GTATATAGCA AGACTGACG 59
〈210〉6
〈211〉59
〈212〉shRNA
〈213〉人工序列
〈220〉
〈223〉GDF9-2dsDNA-sense
〈400〉6
GATCCGCTGC TGAGGGTGTA AGATCTCAAG AGAATCTTAC ACCCTCAGCA GCTTTTTTG 59
〈210〉7
〈211〉29
〈212〉shRNA
〈213〉人工序列
〈220〉
〈223〉GDF9-2dsDNA-antisense
〈400〉7
AATTCAAAAA AGCTGCTGAG GGTGTAAGAT TCTCTTGAGA TCTTACACCC TCAGCAGCG 29
〈210〉8
〈211〉60
〈212〉shRNA
〈213〉人工序列
〈220〉
〈223〉GDF9-3dsDNA-sense
〈400〉8
GATCCGCTGA AGTGGGACAA CTGGATTCAA GAGATCCAGT TGTCCCACTT CAGTTTTTTG 60
〈210〉9
〈211〉60
〈212〉shRNA
〈213〉人工序列
〈220〉
〈223〉GDF9-3dsDNA-antisense
〈400〉9
AATTCAAAAA ACTGAAGTGG GACAACTGGA TCTCTTGAAT CCAGTTGTCC CACTTCAGCG 60
〈210〉10
〈211〉20
〈212〉DNA
〈213〉人工序列
〈220〉
〈223〉构建pCDNA3.1-GDF9真核表达载体检测GDF9序列的上游引物
〈400〉10
TAATACGACT CACTATAGGG 20
〈210〉11
〈211〉18
〈212〉DNA
〈213〉人工序列
〈220〉
〈223〉构建pCDNA3.1-GDF9真核表达载体检测GDF9序列的下游引物
〈400〉11
CCTCGACTGT GGCTTCTA 18
〈210〉12
〈211〉21
〈212〉DNA
〈213〉人工序列
〈220〉
〈223〉转化与阳性克隆的PCR鉴定sence
〈400〉12
TATTTGCATG TCGCTATGTG T 21
〈210〉13
〈211〉21
〈212〉DNA
〈213〉人工序列
〈220〉
〈223〉转化与阳性克隆的PCR鉴定Antisense
〈400〉13
AAGCTGCAAT AAACAAGTTC C 21
〈210〉14
〈211〉21
〈212〉DNA
〈213〉人工序列
〈220〉
〈223〉Real time-PCR检测细胞内GDF9的表达丰度上游引物GDF9 F
〈400〉14
CCTAACTCAT TCCCACCTCT C 21
〈210〉15
〈211〉21
〈212〉DNA
〈213〉人工序列
〈220〉
〈223〉Real time-PCR检测细胞内GDF9的表达丰度下游引物GDF9 R
〈400〉15
GAACTCACGA ACCTCACTAC C 21
〈210〉16
〈211〉24
〈212〉DNA
〈213〉人工序列
〈220〉
〈223〉β-actin F
〈400〉16
TAAGGCCAAC CGTGAAAAGA TGAC 24
〈210〉17
〈211〉23
〈212〉DNA
〈213〉人工序列
〈220〉
〈223〉β-actin R
〈400〉17
ACCGCTCGTT GCCAATAGTG ATG 23
Claims (7)
1.一种抑制水牛生长分化因子9基因表达的siRNA,其特征在于,所述siRNA的正义链具有以下任一序列:
GDF9-1:SEQ ID NO:1;
GDF9-2:SEQ ID NO:2;
GDF9-3:SEQ ID NO:3。
2.一种shRNA,其特征在于含有权利要求1所述的siRNA。
3.如权利要求2所述shRNA,其特征在于,是以下任一双链核苷酸序列:
GDF9-1dsDNA:正义链具有如SEQ ID NO:4所示的核苷酸序列,反义链具有如SEQ ID NO:5所示的核苷酸序列;
GDF9-2dsDNA:正义链具有如SEQ ID NO:6所示的核苷酸序列,反义链具有如SEQ ID NO:7所示的核苷酸序列;
GDF9-3dsDNA:正义链具有如SEQ ID NO:8所示的核苷酸序列,反义链具有如SEQ ID NO:9所示的核苷酸序列。
4.一种表达载体,其特征在于是由权利要求3所述的shRNA编码基因与出发载体构建而成。
5.如权利要求4所述的表达载体,其特征在于所述出发载体为慢病毒载体pshRNA-copGFP Lentivector。
6.如权利要求1所述的siRNA在制备抑制水牛生长分化因子9表达的药物中的应用。
7.如权利要求1所述的siRNA在提高水牛繁殖率上的应用。
Priority Applications (1)
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CN2012104380265A CN102965372A (zh) | 2012-11-06 | 2012-11-06 | 一种干涉GDF9基因表达的 siRNA及其应用 |
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Cited By (3)
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---|---|---|---|---|
CN108118055A (zh) * | 2017-12-20 | 2018-06-05 | 中国农业科学院兰州畜牧与兽药研究所 | 一种抑制牛FABP4基因表达的shRNA、构建载体及其应用 |
CN111440879A (zh) * | 2020-04-27 | 2020-07-24 | 内蒙古大学 | 一种利用gdf9基因提高蒙古羊繁殖力的方法 |
CN111500744A (zh) * | 2020-04-27 | 2020-08-07 | 内蒙古大学 | 一种基于gdf9基因编码区突变的蒙古羊繁殖力提高方法 |
Citations (2)
Publication number | Priority date | Publication date | Assignee | Title |
---|---|---|---|---|
CN101410132A (zh) * | 2006-03-28 | 2009-04-15 | 惠氏公司 | 用于治疗骨疾病的gdf-9/bmp-15调节剂 |
CN101594908A (zh) * | 2007-01-03 | 2009-12-02 | 加利福尼亚大学董事会 | 在体胞内转染用于治疗大动物和人的关节炎和其他整形外科疾病的基因、siRNA、shRNA载体以及其他生物医学诊断和治疗药物的装置和方法 |
-
2012
- 2012-11-06 CN CN2012104380265A patent/CN102965372A/zh active Pending
Patent Citations (2)
Publication number | Priority date | Publication date | Assignee | Title |
---|---|---|---|---|
CN101410132A (zh) * | 2006-03-28 | 2009-04-15 | 惠氏公司 | 用于治疗骨疾病的gdf-9/bmp-15调节剂 |
CN101594908A (zh) * | 2007-01-03 | 2009-12-02 | 加利福尼亚大学董事会 | 在体胞内转染用于治疗大动物和人的关节炎和其他整形外科疾病的基因、siRNA、shRNA载体以及其他生物医学诊断和治疗药物的装置和方法 |
Non-Patent Citations (3)
Title |
---|
ALOK PANDEY等: "Improvement of in vitro oocyte maturation with lectin supplementation and expression analysis of Cx43, GDF-9, FGF-4 and Fibronectin mRNA transcripts in Buffalo (Bubalus bubalis)", 《J ASSIST REPROD GENET》 * |
FENG-TAO SHI,等: "Effects of Endogenous Growth Differentiation Factor 9 on Activin A-Induced Inhibin B Production in Human Granulosa-Lutein Cells", 《J CLIN ENDOCRINOL METAB》 * |
肖敏等: "病毒介导的水牛BMP15及GDF9干涉质粒的筛选", 《畜牧与兽医》 * |
Cited By (4)
Publication number | Priority date | Publication date | Assignee | Title |
---|---|---|---|---|
CN108118055A (zh) * | 2017-12-20 | 2018-06-05 | 中国农业科学院兰州畜牧与兽药研究所 | 一种抑制牛FABP4基因表达的shRNA、构建载体及其应用 |
CN108118055B (zh) * | 2017-12-20 | 2023-05-26 | 中国农业科学院兰州畜牧与兽药研究所 | 一种抑制牛FABP4基因表达的shRNA、构建载体及其应用 |
CN111440879A (zh) * | 2020-04-27 | 2020-07-24 | 内蒙古大学 | 一种利用gdf9基因提高蒙古羊繁殖力的方法 |
CN111500744A (zh) * | 2020-04-27 | 2020-08-07 | 内蒙古大学 | 一种基于gdf9基因编码区突变的蒙古羊繁殖力提高方法 |
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