CN102344925A - 一种缺失型α地中海贫血-2基因及其检测试剂盒和检测方法 - Google Patents

一种缺失型α地中海贫血-2基因及其检测试剂盒和检测方法 Download PDF

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CN102344925A CN2011103205423A CN201110320542A CN102344925A CN 102344925 A CN102344925 A CN 102344925A CN 2011103205423 A CN2011103205423 A CN 2011103205423A CN 201110320542 A CN201110320542 A CN 201110320542A CN 102344925 A CN102344925 A CN 102344925A
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Abstract

本发明公开了缺失型α地中海贫血-2基因-α2.8,其序列如SEQIDNO:1所示。检测试剂盒,含有可识别上述基因试剂。本发明首次在人类基因组中分离并鉴定得到的α-地贫基因。该致病基因缺失了整个α2基因,可导致α-珠蛋白表达产物量降低。本发明的新基因为更为全面的进行地贫筛选创造了条件。使用本发明的检测试剂盒,可以检测出这一新型基因缺陷。

Description

一种缺失型α地中海贫血-2基因及其检测试剂盒和检测方法
技术领域
本发明涉及一种新的致病基因及其检测试剂盒,特别涉及一种缺失型α地中海贫血-2基因及其检测试剂盒。
背景技术
地中海贫血(“地贫”)是一常见的常染色体隐性遗传病,是世界上最常见的人类单基因遗传性血液病之一,被世界卫生组织列为危害人类健康的6种常见病之一。该疾病是由于珠蛋白基因或其相关调控序列的缺失或点突变,导致珠蛋白肽链合成障碍,使得组成珠蛋白的α链和β链合成失去平衡而导致的溶血性贫血病。根据受累珠蛋白链的不同,分为α地中海贫血与β地中海贫血。
人的α类珠蛋白基因位于16p13.3,长约40kb,整个α类珠蛋白基因簇共由7个基因组成,包括4个可编码基因和3个假基因:端粒-ξ-ψξ1-ψα2-ψα1-α2-α1-θ-着丝粒。珠蛋白族基因表达受着严格的时空调控,其中ξ-珠蛋白基因在胚胎期表达,α2、α1和θ珠蛋白基因在胎儿和成人期表达。
在我国大于80%的α地中海贫血是由于编码α-珠蛋白的α基因(α2和/或α1)的大片段缺失引起,而这其中最为常见的又为--SEA,-α3.7与-α4.2 3种类型,但却不仅限于此,一些新的缺失如:--11.1、--HW、-α2.7、-α2.4、-α27.6也相继被发现。这些发现我国的α-地中海贫血基因谱特别广。这也提醒我们在地贫的基因筛查时需特别谨慎。
目前对于α-地贫的诊断主要依靠基因检测,即检测到α-地贫基因而确诊。检测方法有多重Gap-PCR、多重连接酶依赖的探针扩增技术(MLPA)、实时荧光定量PCR、斑点杂交、直接基因测序等方法。
要进行地贫的全面基因筛查,需要找到尽可能多的致病基因。
发明内容
本发明的目的在于提供一种新的α-地中海贫血2基因。
本发明所采取的技术方案是:
缺失型α地中海贫血-2基因-α2.8,其序列如SEQ ID NO:1所示。
一种检测试剂盒,含有可识别上述基因的试剂。
优选的,检测试剂盒含有可特异性识别上述基因或其产物的试剂。
缺失型α地中海贫血-2基因-α2.8的检测方法,包括如下步骤:
(1)提取待测患者外周血的基因组DNA;
(2)以基因组DNA为模板进行PCR,得到PCR产物;
(3)对PCR产物作琼脂糖凝胶电泳分析检测出扩增产物;
(4)对检测出阳性PCR产物进行直接基因测序,对测序结果与参考序列NG_000006.1进行比对,确定断裂位点(NG_000006.1: g.32486-35380 del 2895)。
优选的,PCR反应中的引物序列为:Primer F: GGACCTCCTGGTGCTTCTGCTTCCT (SEQ ID NO:2);Primer R:CTCCCTGTCTGCCACCCTCTTCT (SEQ ID NO:3),PCR产物直接测序的引物序列为:SEQ_2R: GGGCCACCATGCCCGGCTGATT(SEQ ID NO:4)。
本发明的有益效果是:
本发明首次在人类基因组中分离并鉴定得到的α-地贫基因。该致病基因缺失了整个α2基因,可导致α-珠蛋白表达产物量降低。本发明的新基因为更为全面的进行地贫筛选创造了条件。
使用本发明的检测试剂盒,可以检测出这一新型基因缺陷。
附图说明
图1泳道2是样本患者的多重Gap-PCR 检测中国人常见的3种缺失型α-地中海贫血基因结果,其中长度为1800bp的条带是α-珠蛋白正常基因的扩增产物,长度为2000bp、1600bp、1300bp的条带分别是-α3.7、-α4.2、--SEA缺失型扩增产物;
图2是样本患者的MLPA检测结果,其中a :图中蓝色示正常α珠蛋白基因MLPA检测原始结果,红色示患者α珠蛋白基因MLPA检测原始结果。b :示将a中的患者MLPA结果量化后的结果,其中比值0.73-1.3则无相应基因序列缺失,比值0.4-0.7则存在相应序列的杂合缺失。比值为0.0则存在相应序列的纯合缺失(其中探针9所检测序列即a中箭头所示片段缺失乃是由于在连接位点的SNP导致的假阳性)。c : 示各探针在α珠蛋白基因上的相对位置(其中探针13,16同时可检测α2与α1基因序列)图中红色粗线条示新缺失片段的区域;
图3是样本患者的Gap-PCR产物测序结果图, a:示断裂位点附近序列;b:示正常α-珠蛋白基因(αα)与新缺失型α-地贫基因-α2.8
具体实施方式
样本来源:
29岁疑似地贫女性患者外周血,患者既往无输血史,发育正常,无黄疸及肝脾肿大。贫血筛查示:RBC(红细胞计数)5.55×1012/l,Hb(血红蛋白)92g/l,MCV(红细胞平均体积)54fl,MCH(平均血红蛋白含量)16.5pg。血红蛋白电泳结果示:HbA含量96.96%,HbA2含量1.89%,HbH含量1.15%。符合轻型HbH病表现。
多重Gap-PCR 检测
采用亚能生物技术有限公司生产的α-地中海贫血基因诊断试剂盒进行多重Gap-PCR检测,该诊断试剂盒可同时检测中国人群中常见的--SEA,-α3.7与-α4.2三种α-地贫基因。按照说明书进行检测,其检测结果如图1所示,图中,其中长度为1800bp的条带是α-珠蛋白正常基因的扩增产物,长度为2000bp、1600bp、1300bp的条带分别是-α3.7、-α4.2、--SEA缺失型扩增产物。
结果显示该个体基因型为--SEA纯合子(--SEA/--SEA),即缺失了4个α基因,与患者表型不符。提示该个体可能携带本试剂盒不能检测到的α-地贫基因。
MLPA检测
用荷兰MRC-Holland公司的Salsa MLPA P140-B3 HBA试剂盒进行检测。该试剂盒中含有针对α-珠蛋白基因簇的HS 40、α2、α1基因序列以及ξ、ψξ1、ψα2、ψα1、HS 40、α2、α1基因间DNA序列的多对探针。可同时专一检测α1与α2第1及第3外显子、α2第2内含子及第3外显子DNA序列,以及上游调控序列HS 40和α-珠蛋白基因簇上的ξ、ψξ1、ψα2、ψα1序列。因此该试剂盒能筛查α-珠蛋白基因簇上的各相应DNA序列的缺失情况。按照试剂盒说明书对该个体DNA进行检测。结果显示(见图2):除外一常见--SEA 缺失(SALSA probe HBA2P/HBA1P-04637-L04018 到probe HBQ1 3.7kb dw’ HBA1 06707-L06294*,图2c中探针8-25),还存在另一缺失,范围从探针04628-L04008(NG_000006.1: 33103-33102,图2c中探针12)到探针04626-L04740(NG_000006.1: 34974-34975,图2c中探针18)。
根据MLPA结果,锁定上游断裂位点位于探针08492-L08415(NG_000006.1:31233-31232,图2c中探针11)与04628-L04008(NG_000006.1: 33103-33102,图2c中探针12)之间的区域内,下游断裂位点位于探针04626-L04740(NG_000006.1: 34974-34975,图2c中探针18)与探针08493-L08416 (NG_000006.1: 35557-35558,图2c中探针19)之间的区域内。因此,基于此结果设计引物:
Primer F: GGACCTCCTGGTGCTTCTGCTTCCT (SEQ ID NO:2);
Primer R:CTCCCTGTCTGCCACCCTCTTCT (SEQ ID NO:3)进行跨越断裂点扩增。扩增体系可以为:
Figure 2011103205423100002DEST_PATH_IMAGE002
PCR扩增试剂盒可以为购自宝生物公司的Primer STARTM HS DNA Polymerase 试剂。
扩增程序可以为:98℃, 5 min; (98℃ 10 S;72℃-0.2℃/循环 ,2.5min)20 次循环; 98℃ 10 S; 68℃, 2.5min)15次循环s; 72℃,7min; 4℃ 保存。PCR扩增在ABI公司的9700 PCR仪上运行。扩增完成后取5ul PCR产物于1.0%琼脂糖凝胶电泳,凝胶成像仪观察扩增是否成功。若扩增成功应显示一约2~3kb的产物条带。
扩增成功后,产物直接测序,测序仪为ABI公司的3130XL遗传分析仪,所用试剂为ABI公司的Bigdye v3.1。测序引物第一轮直接采用上述扩增引物,可得到一段可读长度约400bp的DNA序列,然后再利用这段序列设计引物,继续下轮测序,引物序列为:
SEQ_2R: GGGCCACCATGCCCGGCTGATT(SEQ ID NO:4)。将测序结果与参考序列NG_000006.1比对。获得具体断裂位点。结果为:断裂位点5‘端位于32486位置,3‘端位于35380位置,因此缺失片段为:NG_000006.1: g.32486-35380 del 2895(断裂位点附近序列见图3),该缺失片段包含了整个α2基因片段(NG_000006.1: g.33710-34573),命名为-α2.8
本发明首次在人类基因组中分离并鉴定得到的α-地贫基因。因该致病基因缺失了整个α2基因,可导致α-珠蛋白表达产物量降低。该基因的分离个体同时携带一--SEA地贫基因,因此该个体缺失了3个α基因,仅剩下1个α1-珠蛋白基因,基因型符合缺失型HbH病的基因型(--/-α)。经过血红蛋白与红细胞相关参数测定以及对该个体的临床表现调查发现其临床表现及实验室检测结果与缺失型HbH病吻合,表现为轻型HbH病。预测该致病基因(/-α2.8)为α-地贫2基因。
检测试剂盒,含有可识别缺失型α地中海贫血-2基因-α2.8的试剂,其特征在于:包括如下步骤:(1)提取待测患者外周血的基因组DNA;(2)以基因组DNA为模板进行PCR,得到PCR产物;(3)对PCR产物作琼脂糖凝胶电泳分析检测出扩增产物;(4)对检测出阳性PCR产物进行直接基因测序,对测序结果与参考序列NG_000006.1进行比对,确定断裂位点(NG_000006.1: g.32486-35380 del 2895),PCR反应中的引物序列为:Primer F: GGACCTCCTGGTGCTTCTGCTTCCT (SEQ ID NO:2);Primer R:CTCCCTGTCTGCCACCCTCTTCT (SEQ ID NO:3),PCR产物直接测序的引物序列为:SEQ_2R: GGGCCACCATGCCCGGCTGATT(SEQ ID NO:4)。
<110>  昆明金域医学检验所有限公司
<120>  一种缺失型α地中海贫血-2基因及其检测试剂盒和检测方法
<130>
<160>  1   
<170>  PatentIn version 3.5
<210>  1
<211>  40163
<212>  DNA
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ccattctgga tgtttcctaa aaatggctta tctaagcccc acagtttcat gcagcacgta     6000
gcctctggtg tgtgacgtcc ttcacttggt gtaatggttc gaggcttgtc catgtcgtag     6060
cctgggtcag aacttcattt tcatggctga ataatatctc acggtgtgga aatatcacag     6120
tttgcttatc tgttcatcca gtgatggaca tttgggttgt ttctaccttt tggctattgg     6180
gaatggaagg gataacattt tttaattgga tttttaaagt cactagtttg actgcattaa     6240
aattacaaac ttttgtttaa cgagaatatc actaagatac agagttgggg agatctaaca     6300
cataaaagtg acaaaggaat tatatccaga atatttttga aatttctaca aatcagtgac     6360
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gagaaaccac tacacactca ccaaaaatca cacacccaat aaaaaggtaa tttttttttt     6540
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cccttcctgc cagagggtag gtggctggag tgagggtgct ggccctactc acacttcctg    30780
tgtcacggtg accctctgag agcagcccag tcagtgggga aggaggaagg ggctgggatg    30840
ctcacagccg gcagcccaca cctggggaga ctcttcagca gagcaccttg cggccttact    30900
cctgcacgtc tcctgcagtt tgtaaggtgc attcagaact cactgtgtgc ccagccctga    30960
gctcccagct aattgcccca cccagggcct ctgggacctc ctggtgcttc tgcttcctgt    31020
gctgccagca acttctggaa acgtccctgt ccccggtgct gaagtcctgg aatccatgct    31080
gggaagttgc acagcccatc tggctctcag ccagcctagg aacacgagca gcacttccag    31140
cccagcccct gccccacagc aagcctcccc ctccacactc acagtactga attgagcttt    31200
gggtagggtg gagaggaccc tgtcaccgct tttcttctgg acatggacct ctctgaattg    31260
ttggggagtt ccctccccct ctccaccacc cactcttcct gtgcctcaca gcccagagca    31320
ttgttatttc aacagaaaca ctttaaaaaa taaactaaaa tccgacaggc acggtggctc    31380
acacctgtaa tcccagtact ttgggaggct gaggcgagag gatcacctga ggtcgggagt    31440
ttgagaccag cctgaccaat atggagaaac cccagttata ctaaaaatac aaaattagct    31500
gggtgtggtg gcgcatgcct gtaatcctag ctactaggaa ggctgaggca ggagaatcgc    31560
ttgaacccgg gaggtggagg ttgaggtgag ctgagatcac gccattgcac tccagcctgg    31620
gcaacaagag caaaactccg tctcaaaaaa taaataaata aataaataaa taaactaaaa    31680
tctatccatg ctttcacaca cacacacaca cacacacaca cacacccttt tttgtgttac    31740
ttaaagtagg agagtgtctc tctttcctgt ctcctcacac ccacccccag aagagaccaa    31800
aatgaagggt ttggaactca gcccatgggc cccatcccat gctgagggaa cacagctaca    31860
tctacaacta ctgccacagg ctctcttttt ggacaaaaat accatcatac tgtagatacc    31920
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tcagctctgc gccattccac agtctcactg attattacta tgtttccatc atgatccccc    32040
caaaaaatca tgactttatt tttttatttt tattattatt attttttttt ttttttttgt    32100
gacggagtct cgctctgtca cccaggctgg agtgcagtgg cacaatctcg gctcactgca    32160
agctccacct cgcaggttca cgccattctc ctccctcagc ctcccgagta gctgagtagc    32220
tgggactaca ggcgcccccc actacgcctg gctaattttt tctattttta atagagacag    32280
agtttcactg cattagcgag gatggtctcg atctcctgac ctcgcatctg cccgcctcag    32340
cctcccaatg tgctgggatt acaggcgtga gccaccgcgc ccggccttat gtatttattt    32400
ttttgagaca gagtctcgct gtgtcgtcag gctagagtgc tgtggcacga tctcggctca    32460
ctgcaacctc caactccctg gttcatgagc agcacttcca acccagtccc tgccccacag    32520
caagcctccc cctccacact cacagtactg gattgagctt tggggagggt ggagaggacc    32580
ctgtcactgc tttccttctg gacatggacc tctctgaatt gttggggagt tccctcccct    32640
ctccaccacc cgctcttcct gcgcctcaca gcccagagca ttgttatttc agcagaaaca    32700
ctttaaaaaa taaactaaaa tccgacaggc acggtggctc acgcctgtaa tcccagcact    32760
ttgggaggcc gaggtgggag gatcacctga ggtcgggagt ttgagaccac cctgatcaac    32820
atgtagaaac cccatctata ctaaaaatac aaaatcagcc gggcatggtg gcccatgcct    32880
gtaaacccac ctactccgga ggctgaggca ggagaatcat tttaaccaag gaggcagagg    32940
ttgcagtgag ctaagatcac accattgcac tccagcctgg aaaacaacag cgaaactccg    33000
cctcaaaaaa aaaaaagccc ccacatctta tctttttttt ttccttcagg ctgtgggcag    33060
agtcagaaga gggtggcaga cagggagggg aaatgagaag atccaacggg ggaagcattg    33120
ctaagctggt cggagctact tccttctctg cccaaggcag cttaccctgg cttgctcctg    33180
gacacccagg gcagggcctg agtaagggcc tggggagaca gggcagggag caggctgaag    33240
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tatcagtgat ttctcaggct gttttctcct cagtaccatc cccccaaaaa acatcacttt    33360
tcatgcacag ggatgcaccc actggcactc ctgcacctcc cacccttccc cagaagtcca    33420
ccccttcctt cctcaccctg caggagctgg ccagcctcat caccccaaca tctccccacc    33480
tccattctcc aaccacaggg cccttgtctc ctctgtcctt tcccctcccc gagccaagcc    33540
tcctccctcc tccacctcct ccacctaata catatcctta agtctcacct cctccaggaa    33600
gccctcagac taaccctggt caccttgaat gcctcgtcca cacctccaga cttcctcagg    33660
gcctgtgatg aggtctgcac ctctgtgtgt acttgtgtga tggttagagg actgcctacc    33720
tcccagagga ggttgaatgc tccagccggt tccagctatt gctttgttta cctgtttaac    33780
cagtatttac ctagcaagtc ttccatcaga tagcatttgg agagctgggg gtgtcacagt    33840
gaaccacgac ctctaggcca gtgggagagt cagtcacaca aactgtgagt ccatgacttg    33900
gggcttagcc agcacccacc accccacgcg ccaccccaca accccgggta gaggagtctg    33960
aatctggagc cgcccccagc ccagccccgt gctttttgcg tcctggtgtt tattccttcc    34020
cggtgcctgt cactcaagca cactagtgac tatcgccaga gggaaaggga gctgcaggaa    34080
gcgaggctgg agagcaggag gggctctgcg cagaaattct tttgagttcc tatgggccag    34140
ggcgtccggg tgcgcgcatt cctctccgcc ccaggattgg gcgaagcctc ccggctcgca    34200
ctcgctcgcc cgtgtgttcc ccgatcccgc tggagtcgat gcgcgtccag cgcgtgccag    34260
gccggggcgg gggtgcgggc tgactttctc cctcgctagg gacgctccgg cgcccgaaag    34320
gaaagggtgg cgctgcgctc cggggtgcac gagccgacag cgcccgaccc caacgggccg    34380
gccccgccag cgccgctacc gccctgcccc cgggcgagcg ggatgggcgg gagtggagtg    34440
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gcccgccgcc cggccccgcg caggccccgc ccgggactcc cctgcggtcc aggccgcgcc    34560
ccgggctccg cgccagccaa tgagcgccgc ccggccgggc gtgcccccgc gccccaagca    34620
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cgcgcacgct ggcgagtatg gtgcggaggc cctggagagg tgaggctccc tcccctgctc    34800
cgacccgggc tcctcgcccg cccggaccca caggccaccc tcaaccgtcc tggccccgga    34860
cccaaacccc acccctcact ctgcttctcc ccgcaggatg ttcctgtcct tccccaccac    34920
caagacctac ttcccgcact tcgacctgag ccacggctct gcccaggtta agggccacgg    34980
caagaaggtg gccgacgcgc tgaccaacgc cgtggcgcac gtggacgaca tgcccaacgc    35040
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cagctggata gggtaggaaa aggcaggggc gggaggaggg gatggaggag ggaaagtgga    35640
gccaccgcga agtccagctg gaaaaacgct ggaccctaga gtgctttgag gatgcatttg    35700
ctctttcccg agttttattc ccagactttt cagattcaat gcaggtttgc tgaaataatg    35760
aatttatcca tctttacgtt tctgggcact cttgtgccaa gaactggctg gctttctgcc    35820
tgggacgtca ctggtttccc agaggtcctc ccacatatgg gtggtgggta ggtcagagaa    35880
gtcccactcc agcatggctg cattgatccc ccatcgttcc cactagtctc cgtaaaacct    35940
cccagataca ggcacagtct agatgaaatc aggggtgcgg ggtgcaactg caggccccag    36000
gcaattcaat aggggctcta ctttcacccc caggtcaccc cagaatgctc acacaccaga    36060
cactgacgcc ctggggctgt caagatcagg cgtttgtctc tgggcccagc tcagggccca    36120
gctcagcacc cactcagctc ccctgaggct ggggagcctg tcccattgcg actggagagg    36180
agagcggggc cacagaggcc tggctagaag gtcccttctc cctggtgtgt gttttctctc    36240
tgctgagcag gcttgcagtg cctggggtat cagagggagg gttcccggag ctggtagcca    36300
taaagccctg gccctcaact gataggaata tcttttattc cctgagccca tgaatcaccc    36360
ttggtaaaca cctatggcag gccctctgcc tgcgtttgtg atgtccttcc cgcagcctgt    36420
gggtacagta tcaactgtca ggaagacggt gtcttcgtta tttcatcagg aagaatggag    36480
gtctgaccta aaggtagaaa tatgtcaaat gtacagcaga gggctggttg gagtgcagcg    36540
ctttttacaa ttaattgatc agaaccagtt ataaatttat catttccttc tccactcctg    36600
ctgcttcagt tgactaagcc taagaaaaaa ttataaaaat tggccgggcg cggtggctca    36660
cacctgtaat tgcagcactt tgccaggctt aggcaggtgg atcacctgaa gtcaggggtt    36720
cgagaccagc ctagccaaca tagtgaaacc ctgtctctac taaaaagaca aaaattgtcc    36780
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aagatcgcgc catcgcactc cagcttgggc aacaagagcg aaactctgtc tcaaaaaaaa    36900
atttaatcta atttaattta atttaaaaat tagcacggtg gttgggcaca gtggctcacg    36960
cctgtaatcc cagcactttg ggaagccaag gtgggcagat cacaaggtca ggaattcgag    37020
accagcctgg ccaatatggg gaaaccccat ctctactaaa aatacaaaaa attagccggg    37080
tgtggtggcg cacgcctgta atcccagcta ctcgggaggt tgaggtagga gaatcacttg    37140
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acaagagcaa aactccatct caaaaaaaat tataaaaatt atacatcagt agatgaatgg    37260
gtaaacaaaa tgtggtggtc tatacacaca atggaatatt atttggccac aaaaagaaat    37320
gaagcactga taggatgtag ctgcaccctg aaaatatttg acaagtaaaa gaagccggac    37380
accaaaggtc acaaactgca tgaccccatc tatatgcaat atccgctaca gccaaatcca    37440
tagggaccaa aagcggatta gtggctgccg gggccagagt tactgttaat gagtaccgag    37500
gtggcgtttg ggatgatgaa aaagttctga cctagatagt ggtgatggct gcataacact    37560
aagtgttctt aatatcacca aattttatac ctgaaaaatg gctacaatgg taatttatgt    37620
ctattttatc acctttttta aaacaaaaaa gatataaggg gtacagcaga gtgagtgctg    37680
catatgcatt tactattatt cttgggttac atcccaggta ctcaataaat gttcactgcc    37740
ctgaagaaac acctgctacg agtcaggcac ctcacagttg ttatccgttt aattctcaca    37800
atctgagaag aaactgtcac cctcatttta tataataaat gagaaaacag actcgggcaa    37860
gtgtcacaat agaatcaaga ggcagaataa actgacttcc aatgccaaat ccatgccgaa    37920
attcagtgct ataataatgt acatggccgg gcgcggtggt tcacgcctgt aatcccagaa    37980
ctttgggagg ctgaggcggg aggatcacct gaggtcggga gtttgagatc agcctaacac    38040
ggtgaaaccc tgtctctact aaaaatacaa aattggcatg gtggcatgca cctgtgatcc    38100
cagttactcg ggaggctgag gcaggagaat cgtttgaacc cgggaggcgg aggttgcagt    38160
gagccggaat ggcgccactg cactcaccgc acccggccaa tttttgtgtt tttagtagag    38220
actaaatacc atatagtgaa cacctaagac ggggggcctt ggatccaggg cgattcagag    38280
ggccccggtc ggagctgtcg gagattgagc gcgcgcggtc ccgggatctc cgacgaggcc    38340
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ccggtccgcg caggcgcagc ggggtcgcag ggcgcggcgg gttccagcgc ggggatggcg    38460
ctgtccgcgg aggaccgggc gctggtgcgc gccctgtgga agaagctggg cagcaacgtc    38520
ggcgtctaca cgacagaggc cctggaaagg tgcggcaggc tgggcgcccc cgcccccagg    38580
ggccctccct ccccaagccc cccggacgcg cctcacccac gttcctctcg caggaccttc    38640
ctggctttcc ccgccacgaa gacctacttc tcccacctgg acctgagccc cggctcctca    38700
caagtcagag cccacggcca gaaggtggcg gacgcgctga gcctcgccgt ggagcgcctg    38760
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gccgcagctc ctgggccact gcctgctggt aaccctcgcc cggcactacc ccggagactt    39000
cagccccgcg ctgcaggcgt cgctggacaa gttcctgagc cacgttatct cggcgctggt    39060
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cccagatcca ggcgcgcctc tttccacctc cagcaggttt ggggcctcgg ccatgggggc    39300
accgaactgc gtgcagcctg accctcccga atggggtggt aggtgagggc cgcgggacgc    39360
cccgggcggc gggctgcgag gacggccgac tctgcccatc ccgagggcgg ctggcttcgc    39420
cctccccact ctgcgccgag cacgcggccc ggacccaccg cgagaactcc gcacctgcag    39480
cgtgaacgca cgcgggcggc gttaagggcc cggggctgac tcggagcagg ttagggaaca    39540
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cctagccacg tagctggcga ggtggaccag gaaccgaccc agacccctgc cgtcacccga    39720
catcactacg gagagtgaag cttttttata tttgtccaca taaaaccaat catggtcatt    39780
gtagaacttc cgaaaacaag gcttgctgca ccttcctgtg tatcccaggt ccaggaatgg    39840
gtgcagcaca tccttcagct gccgcttgac acgcggcaaa ctgtgtcatg tgtaaacaag    39900
aacaggacat ggctgtcata tccaagagca catgtgtaac acagacatgc cacacacaca    39960
cacacacaca cacggggtag aggcaggcct catccacacc cctaacattt gatgcgtagc    40020
tgttccagtc ttctaggcac atgtagagat gcttttcctc agaaatggta ttctcaaggt    40080
gacactgagg aaaagtggac aggccgggcg cggtggctca cgcctgtaat cccagcactc    40140
cgggaggccg aggcgggcgg atc                                            40163
<210>  2
<211>  25
<212>  DNA
<213>  人工引物
<400>  2
ggacctcctg gtgcttctgc ttcct                                             25
 
<210>  3
<211>  23
<212>  DNA
<213>  人工引物
<400>  3
ctccctgtct gccaccctct tct                                               23
 
<210>  4
<211>  22
<212>  DNA
<213>  人工引物
<400>  4
gggccaccat gcccggctga tt                                                22

Claims (5)

1.缺失型α地中海贫血-2基因-α2.8,其序列如SEQ ID NO:1所示。
2.一种检测试剂盒,含有可识别权利要求1所述基因的试剂。
3.根据权利要求2所述的检测试剂盒,其特征在于:所述检测试剂盒含有可特异性识别权利要求1所述基因或其产物的试剂。
4.权利要求1缺失型α地中海贫血-2基因-α2.8的检测方法,包括如下步骤:
(1)提取待测患者外周血的基因组DNA;
(2)以基因组DNA为模板进行PCR,得到PCR产物;
(3)对PCR产物作琼脂糖凝胶电泳分析检测出扩增产物;
(4)对检测出阳性PCR产物进行直接基因测序,对测序结果与参考序列NG_000006.1进行比对,确定断裂位点(NG_000006.1: g.32486-35380 del 2895)。
5.根据权利要求4所述的检测方法,其特征在于:PCR反应中的引物序列为:Primer F: GGACCTCCTGGTGCTTCTGCTTCCT (SEQ ID NO:2);Primer R:CTCCCTGTCTGCCACCCTCTTCT (SEQ ID NO:3),PCR产物直接测序的引物序列为:SEQ_2R: GGGCCACCATGCCCGGCTGATT(SEQ ID NO:4)。
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