CN102334085A - 用于处理用于组织病理学的组织样本的系统和方法 - Google Patents

用于处理用于组织病理学的组织样本的系统和方法 Download PDF

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CN102334085A CN2009801576699A CN200980157669A CN102334085A CN 102334085 A CN102334085 A CN 102334085A CN 2009801576699 A CN2009801576699 A CN 2009801576699A CN 200980157669 A CN200980157669 A CN 200980157669A CN 102334085 A CN102334085 A CN 102334085A
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    • G16H10/00—ICT specially adapted for the handling or processing of patient-related medical or healthcare data
    • G16H10/40—ICT specially adapted for the handling or processing of patient-related medical or healthcare data for data related to laboratory analysis, e.g. patient specimen analysis

Abstract

本发明涉及一种用于在组织病理学处理期间处理组织活检样本的系统，包括构建成在组织病理学处理的至少一个步骤期间承载组织活检样本(54)的组织载体(40)，存储与组织活检样本相关联和与组织处理过程相关联的信息的数据库，与组织载体(40)物理相关联的机器可读指示器(50)，该机器可读指示器(50)包括标识组织活检样本(54)的机器可读参考标记；以及操作用于读取参考标记的电子控制(48)，其使用参考标记以访问数据库中的信息，并且根据所访问的信息而实施组织处理过程的至少一部分。

Description

用于处理用于组织病理学的组织样本的系统和方法
本申请要求享有2008年12月30日(未决)提交的未决临时申请序列号No.61/141324的优先权，所述文献的公开内容在此全文引入作为参考。
背景技术
当前的患者记录包含主要涉及患者和医生身份以及保险和/或保险支付范围的信息。例如，当患者在挂号处挂号时，初始化医疗提供者的就诊记录。通常，这些记录存储在医院记录中的健康护理信息系统(HIS)中。该记录可以示出账单编码、保险数据、在患者治疗期间使用的服务和材料。当患者需要外科活检的情况下，必须维持记录以追踪活检组织样本，外科活检有时简单地称为活检。
当前，患者记录是纸质图、粘胶标签、条形码和计算机账单记录等的汇总，但是该信息将不包含特定的操作指令或者组织样本自身的特定历史。逐个样本地选择计量和处理参数，或者通过样本的基础分类而手动计量，该分类例如，类似组织类型和/或类似组织样本尺寸。
当从患者获得组织活检时，获得追踪(一个或多个)样本所需的信息。包括许多不同的步骤，并且这些步骤受错误或在组织病理学处理期间的下游过程中有用的信息的损耗影响。当今，将单一追踪号分配给从患者获得的活检组织样本。该追踪号可以被手动地记录，或者可以采取应用于活检容器和组织制备盒上的标贴或粘胶标贴上的条形码的形式。使用活检容器以将组织转送至组织病理学分析的实验室，同时可以使用盒处理组织用于将组织样本包埋在石蜡中、薄片切片和显微镜载片制备。
通常随后用于处理诊断组织样本的各个步骤或过程的查看，示出了在不同处理步骤期间在保管中发生了多少改变。保管中这些改变中的每个带来了潜在错误的情况。然而，这些不同处理步骤中的每个还提供了定制下游步骤或过程中的组织特异处理参数的机会。此外，当前未由用于组织病理学处理中的步骤或过程的机器自动使用特异于组织样本的信息。
通常，通过各种方法在外科手术室中从患者获取或获得组织样本。将样本放置在活检容器中，活检容器中包含缓冲和固定液，以在组织到达组织病理学实验室之前保持组织健康。更特别地，下列步骤示出了典型的处理：
1、在外科手术室中，可以将日期、患者ID、主治医师、样本类型信息手写在每个独立的样本容器上和手术记录中。
2、将样本转送至组织病理学实验室可以简单至使用在医院里建立的递送路线。在农村地区，样本可能经过数英里，而从外科手术室传输至独立的病理学实验室或者甚至可以由商业运输工具发送样本。
3、样本容器必须在其上具有足够的信息，以能够确定地将该容器与在步骤1中创建的患者手术记录相链接。
4、一旦将样本递送至病理学实验室，实验室人员将患者请求匹配至样本容器，并且在具有相同信息的记录本上进行标记和注明日期。
5、在登录之后，将组织学样品或样本信息输入实验室记录计算机数据库中。数据库软件检查生日和姓名，以核实正确的患者身份。所有情况都具有分配给该病例的唯一入藏登记号。随着将这些样本录入组织病理学系统而按序产生这些号。
6、随后组织学专家将入藏登记号写在请求书和样本容器上。相应地标注组织处理盒。
7、病理学家或他/她的助手，在收取病例时，核实请求书、样本容器和盒上的入藏登记号的匹配。
8、其中具有组织样本的组织处理盒置于组织处理器中。在处理以从样本中移除液体之后，将组织样本包埋在石蜡块中，将其准备用于在薄片切片机中切割。
9、在薄片切片期间，组织样本和盒录入置于载玻片上的薄切片中，其中，薄片切片是将包埋在石蜡中的组织切成薄片的步骤。在此时，病例入藏登记号需要被传递至由石蜡块形成的每个独立载片上。
10、每个载片均染色并且盖片。将完成的载片递送至病理学家，用于在显微镜下进行诊断检查。
11、病理学家接收带有手术报告、收取(gross in)信息和处理信息的每个病例或(一个或多个)载片。病理学家形成他/她的诊断，并且完成手术病理学报告。
12、存储载片和石蜡块，以备需要第二意见或第二次查看。
在工业中使用RFID标签或芯片以追踪货物是已知的。当今，一些商业货运使用RFID标签以在货运期间在各个时间点追踪包裹，以监视和记录货运朝向其终点的位置。已经提出了通过将RFID标签附着至显微镜载片的合适区域，在组织病理学处理的末期使用RFID标签。期望提供用于使用机器可读指示器以更全面地控制组织病理学处理及其各个过程的设备、方法和系统。
发明内容
在第一示意性实施例中，本发明包括一种系统，用于在组织病理学处理期间处理组织活检样本，其大体上包括组织载体、数据库、与组织载体物理相关联的机器可读指示器以及电子控制。该组织载体构建成在组织病理学处理的步骤期间承载组织活检样本。数据库存储与组织活检样本相关联以及与在组织病理学处理期间使用的组织处理过程相关联的信息。机器可读指示器包括标识组织活检样本的机器可读参考标记。电子控制操作用于读取与组织载体物理相关联的参考标记、使用参考标记访问数据库中的信息、并且根据所访问的信息实施组织处理过程的至少一部分。
组织处理设备可以直接包括电子控制，以实施组织处理过程的至少一部分，例如，使用该组织处理设备执行。备选地，电子控制可以与组织处理设备分离，甚至与其远离。例如，组织处理设备可以是组织收取设备、组织处理器、组织包埋设备、组织切片设备、组织载片制备设备或者诊断载片读取设备。可以使用其他类型的组织处理以实施本发明及其备选方案。电子控制可以具有各种功能，诸如更新数据库中的信息和更新存储在机器可读指示器中的信息，此外，通过使用包含在机器可读指示器上和/或独立数据库中的信息的至少一部分而实施或控制组织处理过程的至少一部分。机器可读指示器可以包括各种形式。例如，指示器可以是RFID标签或另一电子存储器设备。备选地，机器可读指示器可以包括更简单的形式，诸如机器可读数字参考码(DRC)。在该形式中，例如，数字参考码或DRC可以是简单的只读指示器。更具体地，这种只读指示器可以包括条形码、蚀刻码或者机器可读且与组织载体物理相关联的其他标记。
在另一实施例中，提供了一种系统，用于在组织病理学处理期间处理组织活检样本，并且大体包括组织载体、与组织载体物理相关联的机器可读可写指示器以及电子控制。在该实施例中，再次构建组织载体，以在组织病理学处理的至少一个步骤期间承载组织活检样本。机器可读可写指示器与组织载体物理相关联，并且存储标识到活检组织样本的参考标记，并且还存储与组织活检样本的至少一个物理属性相关联的信息。该物理属性可以例如是下列之一或多个：组织尺寸或体积、组织类型、可疑疾病外形或组织的病理学、或者任何其他物理属性。电子控制操作用于读取存储在机器可读可写指示器上的参考标记和信息，并且根据所访问的信息执行组织处理过程的至少一部分。电子控制还可以操作用于将新信息写入机器可读可写指示器。新信息可以包括更新已经存储在机器可读可写指示器上的信息。存储在机器可读可写指示器上的信息可以与存储在独立数据库中的信息的至少一部分相同。当使用独立数据库作为系统除了机器可读可写指示器之外的一部分时，可以由电子控制通过电子控制与机器可读可写指示器以及数据库的相互作用而实施组织处理过程。该数据库可以是远程计算机系统的一部分，或者可以是电子控制的一部分。在各种其他实施例中，数据库可以包括在机器可读指示器的电子器件中。机器可读可写指示器上的信息可以备选地至少部分不同于存储在独立数据库中的信息。系统还可以包括组织处理设备，其包括电子控制，并且操作用于执行组织处理过程的至少一部分。可以并入如本文所大体讨论的该系统的其他特征。
在本发明的另一实施例中，提供了一种用于在组织病理学处理期间包埋组织活检样本的系统，并且大体包括如上讨论的组织载体，以及数据库、机器可读指示器和如上讨论的电子控制。该系统还包括包埋设备，其操作用于包埋组织活检样本，用于随后的组织切片。在该实施例中，电子控制访问数据库中的信息，并且根据信息而执行由包埋设备进行的包埋过程的至少一部分。例如，可以使用存储在数据库中的信息，以指导包埋设备将带有或不带有组织载体的组织活检样本置于用于接收包埋材料的至少两个不同模具中的一个内。这可以包括使用可切割载体，其保持组织活检样本，并且置于具有组织样本的模具中。数据库可以远离组织载体，或者可以位于机器可读指示器自身上。在后一种情况下，可以使用存储在机器可读指示器中的信息以指导包埋设备将组织活检样本放置在用于接收包埋材料的至少两个不同模具中的一个内。例如，这可以允许根据组织载体的尺寸使用小模具和大模具。还可以或备选地使用存储在数据库中的信息，以指导包埋设备加热和/或冷却用于包埋组织活检样本的包埋材料。此外，该信息还可以或备选地更直接地存储在机器可读指示器中。还可以或备选地使用该信息以例如根据组织类型而从包埋组织活检样本的多种类型的材料中选择一种包埋材料。
在另一实施例中，在组织病理学处理期间处理组织活检样本的系统包括组织载体、组织处理器、数据库、机器可读指示器和电子控制。组织载体、数据库、机器可读指示器和电子控制可以大体上如上所述。组织处理器操作用于使得组织活检样本经受一过程，该过程用于允许随后包埋组织活检样本。在常规组织处理器中，这包括使用化学试剂以从组织中移除流体，并且使用石蜡状物质替换这些流体，由此制备用于完全包埋在石蜡中的组织样本。其他组织处理器可以例如使用微波技术，用于从组织移除流体。在根据该实施例构建的系统中，电子控制访问数据库中的信息，并且根据所访问的信息而使用组织处理器实施过程的至少一部分。例如，该信息可以根据如下参数而指导组织处理器：在处理循环期间使用的化学试剂、处理器的循环时间、处理器的循环温度等。
在另一实施例中，提供一种用于实施组织病理学处理的至少一部分的系统。该系统大体包括构建成承载组织活检样本的组织载体、与组织载体物理相关联的机器可读指示器以及数据库。机器可读指示器提供了使用组织活检样本识别的机器可读参考标记。数据库存储与机器可读指示器的参考标记相关联的组织样本记录。组织样本记录中的信息可用于协助活检组织样本的组织病理学处理中至少一个步骤的执行。可以使用组织样本记录中的信息以协助执行例如下列步骤中至少一个：在包埋样本之前处理组织活检样本，包埋组织活检样本、样本的切片载片制备、对显微镜载片上的样本染色或者制备关于组织活检样本的最终病理学报告。
在另一实施例中，提供一种用于在组织病理学处理期间处理组织活检样本的系统，并且其大体包括多个组织载体、操作用于在组织病理学处理期间执行至少一个过程的机器、数据库、分别与多个组织载体相关联的多个机器可读指示器、以及电子控制。在该实施例中，多个组织载体的每一个构建成在组织病理学处理期间承载组织活检样本。每个机器可读指示器包括使用标识与对应组织载体相关联的组织活检样本的机器可读参考标记。在使用唯一参考标记访问数据库中的信息之后，电子控制基于关于不同参考标记存储的类似信息而实施过程的至少一部分。可以使用该系统以实施各种过程。例如，可以使用电子控制基于类似信息以防止过程中的至少一个操作在至少一个组织活检样本上执行。还可以对电子控制编程以使得基于类似信息过程内至少一个操作在至少一个组织活检样本上执行。
本发明还预期各种方法。例如，在一个实施例中，一种在组织病理学处理期间处理组织活检样本的方法包括：读取与组织载体物理相关联的机器可读指示器，以获得与载体所承载的组织活检样本相关联的参考标记；访问数据库中与从机器可读指示器获得的参考标记相关联的信息；以及使用该信息在组织病理学处理期间执行至少一个过程。在一个备选方案中，组织处理设备可以包括读取器，并且可以使用读取器读取机器可读指示器。该方法还包括使用组织处理设备执行该过程。该组织处理设备例如可以包括组织收取设备、组织处理器、组织包埋设备、组织切片设备、组织载片制备设备或诊断载片读取设备或者在组织病理学处理期间使用的任何其他设备。
在组织病理学处理期间处理组织活检样本的另一方法包括读取与组织载体物理相关联的机器可读指示器，以获得与组织载体承载的组织活检样本相关联的信息，并且使用该信息在组织病理学处理期间执行至少一个过程。该方法可以包括使用包括读取器的组织处理设备，而该读取器可以用于读取机器可读指示器。该方法还可以包括使用组织处理设备执行该过程。该组织处理设备可以是前述任意一项，或者是另一设备。
作为说明性示例，本发明的方法可以执行下列步骤中至少一个：a)使用该信息以选择用于将信息记录在组织活检样本上的组织收取过程的参数；b)使用该信息以选择用于制备组织活检样本以用于包埋的组织固着过程的参数；c)使用该信息以选择用于制备用于切片以及显微镜载片制备的组织活检样本的组织包埋过程的参数；以及d)使用该信息以选择用于制备组织活检样本的显微镜载片的切片过程的参数。
在组织病理学处理期间处理组织活检样本的另一方法包括读取与组织载体物理相关联的机器可读指示器，以获得与组织载体所承载的组织活检样本相关联的信息，至少部部基于该信息而访问电子组织样本记录，并且在组织病理学处理期间使用所访问信息控制至少一个过程，而该过程选自下列中的一个或多个：组织固着、组织包埋、切片、显微镜载片制备、显微镜载片染色以及制备病理学报告。
本发明的方法可以包括使用用于组织病理学处理的后续过程中的信息更新电子组织样本记录中的信息。控制至少一个过程还可以包括基于与不同组织载体和/或不同组织活检样本相关联的类似或相似参数的比较而形成包含性或排除性批决定。包含在机器可读指示器上的信息或参考标记，诸如DRC，可以包括与组织活检样本或组织载体中至少一个相关联的数字参考码，而电子组织样本记录可以至少部分地存储在远离机器可读指示器的数据库中。电子组织样本记录可以至少部分地包含在存储于在组织病理学处理自身使用的设备的控制中的数据库中。例如，在如上所述的组织处理期间使用的任何设备可以包括具有上述数据库的电子控制。备选地或附加地，电子组织样本记录可以至少部分地存储在机器可读指示器上。在其他实施例中，机器可读指示器仅包含数字参考码，而电子组织样本记录的其他信息可以存储在远离机器可读指示器的数据库中。
通过对本公开内容的进一步查看以及尤其是在下文对实施例的描述中提供的附加细节，将认识到本发明的各种附加特征和优点。
附图说明
图1是根据本发明的说明性实施例的患者入院过程的示意性图示。
图2是在患者入院过程之后的活检获取过程或步骤的示意性图示。
图3是在从患者获取活检样本之后使用的收取中心或装置的透视图。
图4是在组织样本收取过程之后使用的组织处理机器或组织处理器的透视图。
图5是在组织处理过程之后使用的组织包埋中心或机器的透视图。
图6是在组织包埋过程之后的切片过程期间使用的装置的透视图。
图7是备选的自动切片装置和载片制备中心或设备的示意性正视图。
图8是载片染色中心或设备的透视图。
图9是病理学检查和报告过程的示意图。
具体实施方式
本发明的各个实施例大体包括创建、记录和利用关于活检或其他组织样品的信息的设备、系统和方法，该信息可以用于定制用于该特定样本的组织病理学组织处理参数。在患者登记时初始化数字记录，在本文中称为组织样本记录或TSR。可以补充或建立数字记录或TSR，以包含直接涉及组织样本或者更一般地与样本相关联的数据，例如涉及随着样本持续通过组织病理学系统而处理组织样本的数据。将与患者组织样本相关联的信息添加至数字记录或TSR中，例如活检过程记录、组织病理学报告和诊断，以及关于组织样本的、改进对样本的处理和诊断的数据。当然，本发明的原理将适用于一次处理许多样本。
TSR可以包括伴随样本的组织特异处理指令。TSR防止丢失对患者样本的追踪，正如当使用多个记录并且随后变得失联时可能发生的。此外，实验室处理装备可以使用TSR以对每个组织样本的特异处理参数进行多变量分析。本发明能够使得在组织病理学处理的步骤或过程中建立和使用发展性地更智能、全面和有用的记录。这并不仅包括诸如组织样本的各个项目的连续追踪。本发明能够使得关于每个独立样本的信息对于一个或多个自动机器可获得，所述机器用于通过持续更新关于每个组织样本的信息(即TSR)的数据库以及其对于优选处理和诊断结果的需求，而在组织操作、处理和载片制备处理中自动形成决定。此外，本发明允许自动机器在整个组织病理学处理中交流关于各个活检或者批处理的信息，由此允许各个机器接受来自其他智能机器的工作流程并与其交流。
本发明不仅增强了现有组织追踪系统，还允许以对于下游组织样本处理唯一有用和不同的方式收集、存储和使用新信息。对于每个组织样本存储在数据记录或TSR中的新信息，对于计算机控制的组织处理机器而言可获得。该信息可能涉及与组织样本相关联的记录和处理，并且可以允许新的处理效率和诊断能力，之前用高工作量的手动系统不可能或者非常难以实现这样的处理效率和诊断能力。
可以使用记录在数字记录或TSR中的信息以允许针对以下内容定制组织特异处理，例如，组织类型、可疑疾病类型、包埋材料类型等。可以使用诸如通过限定特定载片染色、不同包埋材料、不同组织处理参数等的信息而定制诊断制备。此外，可以将关于诊断报告和病理学实验室处理的信息存储或记录在数据记录或TSR中，用于报告和归档建议。
如上所述，在所公开的系统中，数据记录包括动态组织样本记录(TSR)，随着活检样本经过各个过程的同时处理组织样本，TSR持续更新。在组织病理学处理的多个时点，将更多信息添加至TSR，这将允许在整个处理中的随后步骤增加效率、能力和精确性。系统或方法的数个部件可以一同工作，以允许在系统的部件之间存储和归档信息。最后，这可以在对组织样本的诊断报告中达到顶峰。
在更基本的形式中，本发明可以包括一系列组织载体，其具有与其物理相关联的机器可读指示器。机器可读指示器可以包括基本技术，诸如条形码或组织载体上的激光蚀刻、或者更精密的只读或读/写存储器技术，例如RFID标签或芯片。机器可读指示器包括参考标记，其可以简单至组织载体标识元件。还将本文称为数字参考码(DRC)的组织载体标识号存储在中心数据库中，并且与用于由特定组织载体承载的样本的TSR相关联。随着使用关于组织样本的信息持续更新数据库，TSR成为动态的和可读/可写的。当通过在整个处理中使用的机器的控制可访问TSR时，改善各个样本制备成为可能。
通过使用涉及处理中的在先步骤或过程的信息持续更新TSR，随着样本向最终诊断报告行进，TSR成为更有用的下游产物。
组织病理学处理的下列部件或步骤可以部分或整体升级，以允许数据存储使用和从这样的系统的更新。例如，可以包括下列步骤：
1、患者入院：如果活检是过程的一部分，初始化患者记录和TSR。
2、手术组织获取：使用例如可疑疾病类型、特定操作过程、用于显微镜载片制备的染色需求和用于可疑诊断的其他参数，而更新TSR。
3、运送至实验室的组织：在制备中，使用诸如组织样本的数量、固定液的类型和固定液中(一个或多个)组织样本的初始浸泡的时间/日期而更新TSR。
4、在病理学实验室定向的组织收取：使用例如组织样本的需求、在收取之前的组织样本的数字记录(例如数字照片)、在该步骤识别的特异组织处理需求而更新的TSR。
5、使用溶剂/化学药品、微波等的组织处理：在制备中，使用例如特异组织处理参数、诸如使用的试剂、循环时间和温度而更新TSR。
6、组织包埋：在制备中，使用例如用于基底模具选择尺寸以最小化包埋材料(例如石蜡)的盒类型、石蜡类型和温度暴露而更新TSR。
7、组织切片和载片制备：在制备中，使用例如制备用于显微镜载片制备和染色的组织切片厚度和切片数量更新TSR。
8、组织染色：在制备中，使用例如用于特异组织类型或疾病状态的组织染色而更新的TSR。
9、病理学诊断和报告：使用例如改进的组织标识和描述方法而更新TSR，所述方法诸如超声成像、数字记录的照片或视频以及数字记录的口头描述和这些描述的转录。
10、组织块载片和报告归档：TSR允许更容易、更有效地调取归档块，更容易地发送数字病理学报告至用于第二次意见的职业顾问。
一般地，利用设备、系统和方法以读取/写入数据并且使得能够从该数据增强处理存在三个主要的特征：
1、组织载体—这可以采取任何机械(一个或多个)设备或(一个或多个)支撑的形式，以固定通过收取从初始获取获得的(一个或多个)组织样本，在盒中处理组织并且然后将其置于显微镜载片上。组织载体还承载机器可读指示器，其可以具有相关联的数字参考码或DRC。
2、组织病理学处理装备或机器—收取站、组织处理器、自动包埋、切片、显微镜载片制备、诊断等。
3、组织样本记录(TSR)和更新系统—其部分可以存储在机器可读指示器和/或处理装备中，但是完整的TSR理想地存在于可由组织处理装备访问的一个或多个数据库中。
通过电子地链接上述三个特征，对于每个获取的组织样本，可以维持具有增强能力和更完整且精确的记录的更有效的处理系统。电子或数字TSR可以在从组织获取至最终病理学诊断记录和报告的时间内，或者仅在整个组织病理学处理的一个或多个步骤期间，追踪组织样本信息。
RFID标签可以附着至组织载体或者用作为机器可读指示器。虽然RFID标签(芯片)由于其读写信息的能力而具有吸引力，但是与每个组织样本相关联的大部分信息可以远程地记录在服务器上的数据库记录中。该组织载体仅需要具有参考标记，诸如唯一号或码，其可以与患者手术记录相关联。事实上，在为组织载体实现读写能力(诸如具有物理相关联的RFID标签的那些)之前，首先初始化本发明的预测性的和增强的处理方面可能是更经济的。通过使用RFID技术或其他读/写存储器技术，可以实现更完整的利益，正如从本文的说明书中可注意到的。
RFID标签包括各种天线和具有数据存储能力的射频收发电路。RFID标签或设备应当充分地包埋或者与每个组织载体集成，以防止因各个组织处理步骤而退化，其可以包括溶剂、试剂、来自组织处理器的微波辐射、升高和降低的温度、正或负大气压以及基本震动和振动。此外，RFID标签或其他存储器设备在用于归档目的持续至少10年期间不能损失其存储。期望使用包埋在玻璃或抗试剂塑料中的RFID标签或其他存储器设备。
可以建立组织样本记录或TSR，以允许处理装备不仅追踪各个样本，还能够在整个处理中的下游过程或步骤中推荐那些样本的其他处理增强。一些实验室将实现在各个阶段中的技术。因而，可能需要具有能够读取其他类型的机器可读指示器的系统，诸如在先已经实现在组织病理学处理中的条形码。可以并入能够读取这些其他类型的机器可读指示器并且将它们记录在对于每个步骤而持续更新的组织样本记录(TSR)中的设备。数字TSR不需要包含所有所需信息。由于大部分医院系统具有追踪账单记录的数据库计算机，可以构想的是，系统可以利用可以被添加至这些数据库的软件。
特定TSR链接至在获取时间从患者获得的每个组织样本，并且利用在病理学处理的部分或全部期间的新信息对该特定TSR进行更新。随着组织样本经过整个处理，可以将数字更新码记录在与组织载体物理相关联的机器可读指示器上(通过机器可读码)，或者可以将数字更新码传送至远离组织载体的中心数据库记录中的TSR，但是借助于DRC标记到组织载体。这将更新TSR，并且保持该信息对于组织病理学处理中的下一步骤已经准备好和可获得。
在整个处理期间，通过将组织样本的保管链与对于每个患者组织样本而构建采取TSR形式的数字数据库的能力相关联，而确保简明的记录。
将组织样本记录(TSR)链接至数字参考码(DRC)，数字参考码例如可以采取二进制码或十六进制码或者与组织载体物理相关联的任何其他类型的机器可读码。因而可以使用DRC作为特定标识，其在TSR存储在远离组织载体的数据库中时允许患者组织载体链接至TSR。通过机器可读指示器，DRC与组织载体物理相关联，并且与数据库中的TSR相关联。例如，实施例可以是条形码标签，其包含DRC、激光雕刻光学可读码(DRC)或者编程在诸如RFID设备的数字存储设备中的码(DRC)。DRC可以标注为或者与从患者获得的任何组织样本相关联。RFID标签或其他机器可读指示器可以并入容器、载片或在组织病理学处理期间用于运输或保存(一个或多个)组织样本的任何其他组织载体中或者与其物理相连。
DRC是组织载体、和因此的载体内或上的(一个或多个)组织样本以及TSR之间的链接。由于当前的RFID芯片数据存储限制和成本，可能有利的是限制物理驻留在组织载体的信息量。成本效率对于实现便宜的装置以将数据与每个组织载体、以及因而每个组织样本相关联，是重要的。正如任何数字存储设备，存储的信息位数越多，成本越大。因而，可能期望混合系统，其使用位于一些载体上的条形码或类似简单机器可读指示器以及更复杂的机器可读指示器的组合，所述更复杂的机器诸如在其他处的RFID标签或其他读/写存储器设备。因而，可能期望一个或多个数据库作为所有TSR的中心仓库，这是有成本效率的。此外，可以由医院或实验室处的信息技术人员备份和归档这些记录。
该系统还可以包括将数据写在机器可读指示器上的设备和方法，并且可以由处理装备在组织处理的连续步骤中使用该数据。例如，如果装备的一件或多件未电子地链接至数据库，并且不能调取远程存储在数据库中的数据，那么这将是有用的。可以在机器或装备中使用诸如光读取器的读取器，以读取已经写到组织载体上的码。可以直接沿着与载体物理相关联或连接的RFID芯片而传递特定量的信息。可以从远离载体的一个或多个数据库中的TSR调取其他信息。DRC将能够将所有患者组织样本和诊断工作链接至存储在一个或多个中心数据库中的TSR。虽然今天的RFID标签不可用于操作建立TSR所需的所有数据，可以构想的是在未来，可以将整个TSR存储在与组织载体相关联的RFID芯片上。在该情况下，存储在这种精密机器可读指示器上的参考标记将包括更详细的信息和/或与用于对应组织样本的处理相关联的指令。还可能分配链接至查找表的事件码。以这种方式，简单的二进制码可以与一些TSR相关联。例如，仅存在三种类型的石蜡，可以用于包埋组织样本，因而两代码二进制码将覆盖所有三个。
随着与组织载体相关联的机器可读指示器的存储水平发展，可以设计一种系统允许更多的存储。直到诸如RFID技术的读/写存储变得成本更低，将实现更简单的系统，其取决于远程数据存储与以有效方式访问数字TSR的混合，以使得信息对于小型组织处理机器可获得。下文示出了在三个不同示例性精密度水平的DRC的迁移路径。
第一水平将是在每个患者的处理期间仅使用单一组织标识DRC。然后，单一组织标识DRC将每个组织处理站链接回存储在健康护理信息系统的(一个或多个)数据库中的TSR。这将需要与组织载体物理相关联的最少量的存储器，并且对于组织载体无需RFID芯片或其他精密存储器设备。例如，DRC可以简单的是唯一条形码或者其他机器可读指示器的形式，其被分配给来自特定患者的特定组织样本或多个样本，并且以合适的方式施加于组织载体。该系统可以仍然允许将有限的信息存储在组织载体上，以帮助对该特定组织样本作出智能处理决定。
在下一情况或第二水平中，存储在少量读/写存储器中的TSR在机器可读指示器上可获得。在该情况下，机器可读指示器可以包括RFID芯片或其他读/写存储器设备。这将允许系统随着通过组织病理学处理的各个站而更新机器可读指示器，由此添加对于组织处理的下游定制有用的信息。处理中一个或多个机器可以独立地读取对于正被处理的每个样本的TSR。在该情况下，每个机器对于当前在批中正运行的组织样本的制定决定处理而言基本上是独立的。
在第三水平中，构建关于组织特异测试和处理参数的信息，以作出全面的动态数字文件(TSR)，允许对于每个样本对定制处理参数进行排序。在医院系统中，对于机器可读指示器而言其可能简单地具有唯一的号，该唯一的号访问唯一的数据库记录，每当样本完成一个处理步骤时，就对数据库记录进行更新。然后，每个处理机器可以通过参考与组织载体相关联的DRC而询问数据库，以确保每个步骤正确地更新样本记录。这是期望的步骤，因为可以追踪保管中的每个改变至特定机器或用户，并且随着组织样本朝向病理学家用于诊断，而创建TSR的历史记录。当也包括的数据以直接编程RFID芯片到组织载体上的情况下，可以存储短代码以指示对于该步骤已经编程组织载体。这也是在整个处理的步骤期间追踪样本的方法，并且确认例如样本已经以正确的顺序完成了每个步骤。最精密形式的机器可读指示器可以携带大部分(或者全部)TSR，但是仍然期望将TSR电子地存储在远离机器可读指示器的一个或多个其他数据库中，至少用于备份和归档目的。
组织样本与TSR链接的第一位置是在从患者获取样本的外科手术室。每个样本或样本组置于组织载体中，诸如活检容器。每个活检容器具有机器可读指示器，诸如RFID标签、条形码、激光蚀刻码等，其将包含在患者的住院处理或开始进入实验室系统期间分配的DRC。机器可读指示器还可以包含需要传递至病理学实验室中的下一处理步骤或过程的其他信息。该信息可以包括关于可疑病理学类型的手术医生的观察。该信息在与处理样本相关联的后期步骤期间可能是重要的，诸如对于特定类型的细胞或疾病的特异载片染色。这种信息对于病理学家或组织技术专家，或者对于下文将描述的自动收取系统而言是有用的。TSR还将包括执行手术的医生姓名，以及手术过程所特有的信息，诸如放置在样本容器中的活检样本的数量。如果正如在现有医院追踪系统中已经对仪器给定追踪号，那么可以使用指示用于获取活检的仪器的信息而更新TSR。然后，根据组织类型，特定的疾病或组织类型能够接收特定的组织处理指令。一些罕见的疾病可能需要特定的载片染色。在该情况下，可以从标准运行批中自动精选出组织，并且在独立的染色装备上处理。
在美国专利No.5817032中，描述了一种系统，其包括数字视频收取。收取站将位于病理学实验室中。这预想为具有数字摄像机系统的区域，样本将置于数字摄像机系统下。可以使用立体摄像机系统，从而可能在将样本置于盒内之前并且在化学/溶剂处理、包埋和切片之前记录描述样本的三维图像。在照片中的尺寸标线将允许系统软件计算组织样本的总面积。可以使用超声成像以确定组织样本的高度或体积。使用已记录的这些参数，软件可以做出关于最适用于包埋组织样本的盒类型的决定或建议。该收取站还将具有读取和写入机器可读指示器的系统，诸如RFID标签，或者创建更简单的机器可读指示器，诸如施加于组织载体的条形码标贴或激光蚀刻码。读取系统将借助于组织载体上的机器可读指示器(例如，样本容器)而读取例如来自外科手术室的样本信息和特定处理指令。
数字视频收取取代手动收取系统，由此可以由病理学家在从手术中接收组织之后将组织收取特征描述入听写系统中。使用视频收取，将可以给出的任何口头描述与视频数据一同记录，并且随后转换成数字形式，诸如转换成.wav文件。这些文件可以在TSR中存储为语音记录，或者随后可以使用听写软件转录或由转录员录入。无论如何，所有这些记录可以对医院外部的检索可获得。例如，可以向在远程位置的转录员提供对该天工作的特定TSR的访问。由于每个TSR具有唯一的DRC，已写入的转录可以在完成时链接回TSR中。该信息将数字地添加至TSR。TSR成为存放关于患者活检和诊断处理和报告的所有信息的中心位置。如前所述，TSR可以电子地存储在一个或多个远程数据库中，或者位于组织载体自身上，或者使用两者的组合。
在记录了收取数据之后，病理学家制备组织样本，并且将它们置于各个组织载体中，例如，采取盒的形式。随后，盒分别按照对于各个患者而言唯一的数字参考码(DRC)而序列化。该号或码还借助于和与盒物理相关联的机器可读指示器相关联的机器可读码，而与每个盒相关联。当病理学家首次遇到来自患者的组织样本时，收取站将询问样本容器以获得DRC。询问可以以任何形式，诸如光可读码、RF标识或者甚至在计算机键盘上的手动输入。此外，在该收取站的控制面板将允许病理学家添加指令，诸如从选择菜单或者暗示处理器码，其关于在处理中将如何处理和进一步切片组织，而相应地对于每个独立盒更新TSR。该信息随后可以允许使用随后的智能处理和包埋机器，这显著地减少了所需的人/样本交互，并且允许机器作出自动处理决定。智能处理可以包含诸如组织类型、组织方向、或者特定疾病或组织类型所需的特殊载片染色的信息。因而，已经指示具有特殊组织处理特征或需求的样本可以根据这些特征或需求而被精确处理。
在组织样本收取之后，将制备的样本置于一个或多个独立组织载体中，诸如活检盒，并且将盒转送至组织处理机器中，组织处理机器可以使用诸如溶剂和化学药品的试剂或微波等，以制备用于包埋和切片的组织。可以在进入处理机器的处理腔之前询问盒的机器可读指示器，并且基于样本厚度或尺寸以及组织类型、根据所需的处理长度、试剂参数、热或真空限制等而分类。这是在收取每个样本时添加至TSR的信息。这还将允许对样本交叉核查以确保对它们进行正确的处理。例如，在处理机器中以比大活检样本更快的循环处理小活检。由于可以更快地运行小活检，如果腔完全填充有小活检，那么可以以短循环运行该处理。随后机器可以制定包含性决定以根据类似处理需求而对样本进行分批，并且将该批样本一同运行通过组织学处理的一个或多个部分。相反地，如果一个或多个样本与其余样本不同，那么机器可以从该批中排除该一个或多个样本，并且分别地运行(一个或多个)样本，或者转移至另一处理机器。作为进一步示例，乳房组织具有高的脂肪含量，而某些试剂比其余试剂更好地清除脂肪。这种系统可以调整时间和温度和化学药品(试剂)组成，以使得对于装配成基于每个组织样本的需求而改变组织处理参数的机器可获得组织类型特异的处理。
全自动机器可以根据处理类型而对盒分类，并且对于该处理样本类型而将正确的样本装载在合适的处理腔内。该系统还允许在特定样本上运行特定试剂和/或促进剂，以便于穿刺厚组织或出于其他理由。该系统将挑出这些样本，并且防止它们在标准批中被处理。机器将根据处理腔中样本的组成而自动调整处理参数。
一旦处理了组织样本，可以将它们引导至自动包埋站或中心内。再一次，可以由自动包埋机器读取与每个组织载体的机器可读指示器相关联的信息。例如，如果组织载体(例如，盒)包括RFID标签或条形码上的DRC，例如，可以调取用于该样本的数据库记录，以由包埋机器和下游机器使用。可以对处理中的上游机器实现相同的步骤。如果组织载体的机器可读指示器不包含该信息自身，机器简单地询问远程或本地数据库记录，查找与该组织载体相关联的个体DRC，并且调出TSR以获得对于该样本的特定包埋需求。
在该步骤或过程期间，将逐个盒地命令包埋机器如何包埋特定样本。TSR中的信息还将控制配备用于特殊类型的活检的特殊包埋介质。例如，优选对于不同类型的组织选择不同分子量的石蜡切片。诸如乳房组织的脂肪组织，与肌肉或胆囊组织切割非常不同。因为存在数以百计的不同类型的组织和许多盒与基底模具的尺寸，可能的组合数量可能非常大。自动系统将根据例如存储在每个机器中的查找表而管理许多可能的排列。具有许多可编程变量的系统，诸如已经访问增强TSR的那些，将允许组织学技术人员或智能处理机器，使用正确的处理和包埋信息控制每个机器用于精确的样本制备，而运行对每个盒或其他组织载体所选的最优处理参数。
各种切片机可切组织载体是已知的。可切片组织操作技术将演变成不同类型的组织固定。可以预想的是，这些不同类型的固定将需要不同的组合处理步骤。因而，除了机器可读指示器上的组织样本信息，特定组织处理和包埋信息可以源于与盒类型或者正使用的其他组织样本固定设备相关联的预编程码。存储在TSR中的信息涉及不仅是组织所需的也是所使用的组织固定系统类型所需的特定类型的处理。
关于特殊样本或与其相关联的信息的可用性应当允许包埋机器基于组织样本和盒的尺寸和数量而确定配备多少石蜡。当在包埋中心识别样本类型时，用于进一步自动化和处理控制的其他选择可能变得可获得。例如，特殊样本可能需要真空辅助设备，以将非常小的气泡从石蜡中抽出，并且在基于TSR中的信息的指令之后，自动启动该步骤。例如，还可以基于与任何特定盒或者其他固定设备相关联的包埋材料流动特征，而初始化更长或更短的处理参数。
随着处理继续进行，随后将每个包埋盒(或者其他固定设备或组织载体)传递至组织切片站，其中将石蜡包埋的组织样本和硬化的包埋材料(例如石蜡)切割成薄切片，以应用于显微镜载片。通过具有切片机可访问的信息，还可以允许自动组织切片站。该信息可以包括基于特殊盒或组织的可切割性的特定参数。可以编程控制诸如初始刮面切片厚度(initial facingsection thickness)的参数以建立在暴露和切割组织之前需要移除的材料的精确厚度。智能切片机可以读取与组织载体相关联的DRC。正如前述所讨论的，DRC链接至数据库中的TSR，数据库中的TSR随后可以使用在切片步骤或过程期间使用的相关联参数而更新切片机。例如，这些参数可以包括用于该特殊类型的组织或盒的正确类型的刀刃和刀刃或卡盘设置。同样地，理解现有包埋处理的重要性是重要的。在自动包埋中心中，将记录用于在每个独立组织载体设备中使用的特殊类型的石蜡。在不同的温度和利用组织切片刀刃上的不同类型的研磨，来切割不同类型的石蜡具有更好的效果。因而，通过提供用于特殊样本的石蜡类型的行进记录(TSR)，自动切片中心可以调整其参数以在特定温度、刀刃速度和切片厚度而切割组织，或者向用户指示特定刀刃和/或刀刃设置或其它参数。
如果装配有读/写存储器设备，诸如RFID标签，读取器/记录器将读取盒上的码，以访问对于特殊样本的TSR，并且随着将薄切片转送至载片上，将对载片给定与相关联组织载体相同的DRC。这将每个载片相关回到与该样本相关联的TSR中的信息，TSR中的信息包括所有其他相关联的处理信息，以及用于该特殊活检的患者信息。这样，具有在TSR中建立的数字参考标记的完整非断裂链，其从(患者挂号时采集)原始患者和腕带延伸直到由病理学家在显微镜诊断进行分析。
概言之，当前从活检样本取回到诊断载片分析的处理包括许多手动系统，用于记录必须随同给定组织样本的相关联信息。使用诸如本文所述的系统和方法，可以包括所有患者/账单信息，以及任何组织病理学信息，以帮助定义样本所需的特殊处理。在诊断时对于病理学家有用的信息可以使用机器可读指示器绑定于每个样本，其中根据与机器可读指示器相关联的精密度水平，机器可读指示器带有或不带有对独立数据库的参考标记。该系统以其任何形式，允许随着样本从取回行进到诊断，而创建和更新单一TSR。下文中，参考附图给出了说明性实施例的更详细描述。
图1示出了患者入院中对TSR的初始化。在入住医院或其他医疗机构之后，将腕带10分配给每个患者12。该带10标识患者12和他的医生(未示出)。带10包括条形码标贴或RFID标签14，取决于上述讨论所需的精密水平，其将唯一参考标记、诸如数字参考码(DRC)分配给患者12。在该示例中，腕带10上的RFID标签14被编程有患者唯一标识DRC。随后，可以使用该DRC以将患者记录或TSR 15与诊断处理的每个部件连接。RFID标签14可以由医院雇员16编程，例如，使用具有WiFi或无线能力的计算机20。将意识到，在本文所述的整体处理中发生的任何数据传输可以是无线的、硬布线的或其组合。还可以使用因特网和/或更局部化的内联网用于数据传输。
在入院时，初始化患者记录或TSR，其与DRC相关联，而TSR可以接收患者信息(姓名、地址和社会保险号)、保险信息、过程数据以及医生和过程详细信息(例如，医生参考的测试和有序的手术过程)。这建立了用于最终诊断报告的组织样本记录(TSR)。
使用无线界面或WiFi，具有硬连线的计算机键盘输入或者扫描设备30和计算机20，将入院信息或TSR传输至计算机数据库15，其中，可以在活检样本处理中的任意点从计算机数据库15中调取该信息。
图2示出了例如在外科手术室发生的处理的步骤。在外科手术室，使用机器码读取器或扫描仪30经由包括条形码或RFID标签14的腕带10确认患者12的身份。护士或医务人员32可以将患者手术信息记录到TSR服务器文件或数据库15，并且可以确认将执行的过程。
在TSR中查找有序的(一个或多个)特殊手术过程。将执行的特殊过程将指示将使用的医疗仪器并且将从患者12调取或获取多少组织样本。便携式读取器/编程器30可以从外科医生使用的任何仪器中获得数据，其可以触发在整个处理后期的专用操作过程的需求，并且通过与服务器数据库15中的特定TSR相链接，使得该信息对于技师或自动系统或机器可获得。
活检样本容器40标注有患者DRC，例如，使用条形码标贴或RFID标签42。利用放置在容器40中(容器40包含的)的患者组织类型和应当如何在稍后处理步骤操作组织而更新TSR。每个样本容器40上的DRC将唯一地标识特殊患者12和手术过程。这将允许追踪从患者12获得的所有样本在置入容器40后尽快开始，甚至在到达病理学实验室之前。将更新诸如服务器15上的数据库中的患者TSR，以包含完整的样本记录，包括获取的组织样本数量和如何获得样本。稍后，在最终诊断报告中调入该信息。
图3示出了病理学实验室收取步骤，包括使用数字收取中心或部件46。活检容器40到达病理学实验室。在病理学实验室中，通过数字收取中心46处理样本容器40。容器40是可以在整个组织病理学处理中使用的许多种组织载体中的一种。其他容器包括在包埋过程期间使用的组织盒、平台或其它结构，以及用于检查/分析目的的显微镜载片。数字收取中心46通过无线读取样本容器40上的DRC而与TSR交互，以从TSR 15调取关于样本的信息，并且由技师或其它专业人员或者由自动机器而记录在处理中进一步使用的任何新信息。
数字收取中心46包括读取器，由此将特殊样本容器40专门地识别至收取中心46。收取中心46编程机器可读指示器，诸如RFID标签50，可读指示器固定至组织载体，诸如组织样本54将从一个容器40转移至其中的盒52。使用合适的电子控制48，诸如计算机或其他电子处理器，可以实现编程功能。本文所公开的与其他组织学处理装备相关联的其他电子控制同样可以根据所需的能力而包括计算机化控制或电子处理器。立体数字摄影机60允许3D成像，或者红外照相机和灯62、微波、超声或其它类型的成像系统在出现于盒52上或其它组织载体上时记录组织54的一幅图像，在切割之前给出组织样本54的物理记录。这向TSR 15提供了组织的归档图像，包括样本数量及其外观，并且出于后期参考和确认目的而与组织载体52相关联。这还可以允许计算将制作的(一个或多个)样本54的体积，其可以用于指定在组织处理机器中所需的处理时间的长度、自动包埋处理期间每个样本所需的包埋材料的体积和/或整个石蜡体积需求或者其他变量。与运行通过包埋机器的许多盒相关联的(一个或多个)组织样本中的每个所需的包埋材料(例如石蜡)的体积的确定，将提供用于提供至包埋机器的包埋材料的自动存货控制。如果由病理学家识别组织类型，并且将其记录在TSR 15中，可以使用自动查找表以确定组织样本54的密度。可以使用该信息以及其他输入或测量参数，以借助于计算机算法将处理码分配给每个组织样本54。这将确保例如不向例如前列腺组织的小密度组织分配与密度较小的却大得多的肝脏相同的处理码。所以，类似或相同的组织类型能够更有效地被分批进行处理。例如，类似的组织类型可以使用类似的处理试剂和处理循环时间以及类似类型的石蜡。通过使用所有样本信息以及用计算机程序代替手动对类似的组织样本分批，将改善处理效率。
在收取期间对每个样本54拍摄的图像，还可以在创建最终报告时从服务器上的TSR 15被调出，以代替对样本54的书面物理描述或作为其的补充，简化该处理并且使其更完整。
数字收取中心46还可以语音记录病理学家的传统物理描述，将信息存储为.wav文件，该文件随后可以由转录软件或者由转录员自动转录成TSR15。这持续在TSR服务器15上建立信息的数字记录，而在处理末期可以获得该信息以协助形成最终报告。
收取中心46还允许病理学家向用于组织处理中心、包埋中心和/或染色中心的盒52上的机器可读指示器50添加特殊指令，例如在处理后期使用的，以确保最优可视化组织54中感兴趣的特殊特征用于诊断。这给了病理学家分别操作每个组织样本54的机会，并且确保执行合适的过程以获得可能的最佳诊断信息。例如，病理学家可以获得单一样本54，将其切成数片，并且在处理中对每个独立片或样本施加不同的过程和/或染色，以增强样本中的不同特征。不需要其他人为互动以区分每个样本的所需治疗，因为对于进一步处理的指令被编程在盒RFID标签50内，或者从TSR 15调取。
收取中心46还可以允许有效地追踪工作人员。通过要求每个职工在开始工作之前输入工号，可以基于样本的产量而监视生产力。可以在存储于服务器15上的所有TSR上运行子程序，并且可以在组织病理学处理中需要完成一个步骤或过程时进行比较。对于本文所讨论的所有过程而言都是这样的，这些过程包括例如组织切片，其中人为效率是生产力的重要因素。这使得能够进行工作流程分析和成本比较，用于结帐和审计目的。随后可以使用预测性模型以管理材料使用和实施程序，以增加工作流程效率，诸如通过对存在减速或瓶颈的整个处理的任何部分的研究。
图4示出了组织处理过程。在收取之后，将盒52随机插入架70中，以等待处理。通常将组织处理称为组织固着或固定。制备组织用于包埋的步骤可以使得石蜡渗透组织。理想地，随后将组织样本(一个或多个)包埋在石蜡块中，其在其整个横截面上将具有类似的密度和切割特性，包括含有(一个或多个)样本的部分。稍后将参考图5讨论组织包埋过程。组织处理机器，有时称为组织处理器80，可以通过读取DRC、即条形码或RFID标签50而询问每个盒52，并且随后在服务器中访问用于该组织样本的TSR 15。可以结合处理器80使用合适的电子控制84，以有助于读取、访问和其他必须处理功能。TSR包含确定用于该特殊样本的最佳处理循环所需的数据——其由盒尺寸、样本厚度、所需试剂或温度、以及在数字收取中心46处或者在进行手术的情况之前添加至TSR 15的其他参数所指定。随后处理器80可以确定将哪些样本分批在一起、到各个组82中并且运行何种类型的处理循环。处理器或处理机器80将能够根据其处理参数而挑选或设置每个盒52进入处理腔。以该方式，在有效的组中处理盒52，节省处理器试剂和处理时间。此外，对于加急挂号，需要以加速方式处理的组织样本可以由机器80自动挑选出，并且进行适当地处理。这提供了有效自动的处理，而无需过多的人为干预或管理。
组织处理器80可以将关于如何处理每个组织样本的数据写入TSR 15。由此确保最终报告包含关于如何在处理中操作特殊样本的正确信息。在机载计算机的这种系统中，处理器80还可以保持追踪处理了多少个盒52和什么类型的盒52。这可能有助于对供应品计数和排序。该系统还允许处理器80基于实际使用而追踪使用的每个试剂和所推荐的维护。
图5示出了自动包埋中心100及其使用。一旦经处理，每个盒52必须包埋在石蜡中。再次将盒52随机地插入架100中，以在自动包埋中心100中等待包埋，自动包埋中心100诸如Sakura的自动TEC包埋中心或如在美国专利公开No.2005/0226770中所述的包埋中心，该文献在此引入作为参考。使用合适的电子控制102，包埋中心100可以通过读取与RFID标签50或其他机器可读指示器相关联的DRC而询问每个盒52(并且访问TSR 15以确定所需的包埋参数，诸如包埋模具的尺寸、所需包埋材料(石蜡参数)、样本优先权等)。盒52当前具有物理询问点，可以读取物理询问点以确定所需包埋模具的尺寸。更详细的处理说明可以经由位于盒52上的TSR 15或RFID芯片50而链接至特定样本，并且自动更新TSR 15。随后包埋中心100可以使用组120中的类似处理参数而自动对盒52分批，或者在读取其RFID标签50和对应TSR 15之后而对于每个独立盒52而重新配置处理参数。将盒52包埋在石蜡或其他包埋材料中。
包埋中心100使用建立如何处理每个样本的信息而更新每个TSR 15。确保该最终报告包含用于在包埋处理期间如何操作特定样本的正确信息。
图6示出了切片中心130及其使用。切片设备132使用例如电子光学或RF读取器136而读取每个独立盒52上的指示器50，并且将标识信息发送至编程设备138，编程设备138将机器可读指示器140上的DRC适当地记录在从盒52接收切片的显微镜载片150上。使用合适的电子控制142，以促进例如读取器136和设备138之间的信息交换，以及如在整个过程的其他部分中那样与TSR 15的信息交换。组织切片设备132从盒52创建薄带切片152，其随后在水浴器154中漂浮到显微镜载片150上。盒52上的RFID标签或其它指示器50维持包埋在石蜡块中，从石蜡块获得切片。随后归档该块并且如果对于之后的检查需要其他切片可以调用(通过块存储设施中的电子RFID询问)该块。可以将归档位置记录在服务器15上的TSR内。显微镜载片150经由RFID标签140标注有盒/石蜡块DRC，以确保原始组织样本TRS 15的可追踪性。这提供了源自对样本的原始收取以及例如指定组织样本所需的染色类型的信息的访问。在TSR 15中创建根据每个盒/石蜡块而形成的显微镜载片的数量的记录以便具有可追踪性。
图7示出了备选自动组织切片和显微镜载片制备中心或部件170及其使用。该部件170自动化图6中所示的处理。使用从盒/石蜡块上的机器可读指示器50调取的信息，载片制备中心170自动化以下处理：接收盒/石蜡块52，将其切片，并且将带切片152施加至适当标注以相关联机器可读指示器140的显微镜载片150。使用编程器172而编码指示器140，例如以具有与对应组织样本匹配的DRC。正如本文所公开的其他装置，使用合适的电子控制174(诸如计算机或电子处理器)，以促进信息交换和控制功能的执行。
图8示出了染色中心200及其使用。以随机顺序将显微镜载片150插入染色中心200中。使用通过从每个载片150上的指示器140读取DRC获得的信息，并且经由电子控制202从TSR 15调取数据，染色中心200可以挑选和设置载片150以使用组210中的类似处理参数对其进行分批。这些参数可以包括常规染色序列、定时、优先权等。使用确认已经通过该中心100处理的每个载片150的信息，而更新用于患者的服务器记录或数据库15。将信息转送至TSR 15，其将用于结帐目的，例如，包括制备的载片数量以及执行的任何特定过程。
染色中心200将载片分类到每个患者的合适的载片盘，用于由病理学家查看。使用(根据已经记录在患者记录中的信息)追踪对每个患者创建的载片150的总数量的能力，分类器可以识别哪个盘已经完成并且已经准备好用于查看，而其他等待所有载片的处理完成。
图9示出了病理学家的查看和最终报告产生。病理学家220在显微镜222下查看了载片150。显微镜222可以包括电子控制224，或者控制224可以是独立部件。在任一情况下，其可以执行与信息交换有关的功能和/或如本文所述的过程的控制功能。使用报告系统，他或她可以调用从患者入院至在外科手术室的样本调取以及载片制备处理已存储的所有信息。他可以验证正确标识和操作样本。标准化的报告形式230包含信息块和数字图像链接，其基于记录在由显微镜载片150承载的指示器140上的DRC而自动填充。还可以记录对载片的显微镜分析的数字记录。可以通过使用麦克风232进行听写以及随后的自动转录和/或手动键盘输入而将附加信息和诊断添加至报告和TSR 15。病理学家220例如使用麦克风而描述他/她的分析，其可以记录作为音频文件，诸如.wav文件。该文件可以作为音频文件和/或文本文件而存储在TSR 15中。麦克风222优选能够允许病理学家拍摄(一个或多个)组织样本的照片图像，而这些图像可以组成病理学报告的部分或者TSR 15的部分。该数字记录随后可以电子地传输回患者的医师240处。
处理步骤的概述表
Figure BPA00001425046300241
Figure BPA00001425046300251
虽然已经通过描述各个优选实施例而描述了本发明，并且已经在一定细节上描述了这些实施例，但是申请人的目的并非限制或以任何方式限定随附权利要求的范围至这样的细节。对于本领域技术人员，附加优点和修改将是显然的。可以根据用户的需求和优先选择而独立或组合使用本文所讨论的各种特征。这已经是对本发明的所示方面和实施例的描述，以及当前已知的实施本发明的优先方法。然而，本发明自身应当仅由随附权利要求所限定。

Claims (63)

1.一种用于在组织病理学处理期间处理组织活检样本的系统，包括：
组织载体，其构建成在所述组织病理学处理的至少一个步骤期间承载组织活检样本；
数据库，其存储与所述组织活检样本相关联和与组织处理过程相关联的信息；
机器可读指示器，其与所述组织载体物理相关联，所述机器可读指示器包括标识所述组织活检样本的机器可读参考标记；以及
电子控制，其操作用于读取所述参考标记、使用所述参考标记访问所述数据库中的所述信息、并且根据所访问的信息而实施所述组织处理过程的至少一部分。
2.根据权利要求1所述的系统，还包括：
组织处理设备，其包括所述电子控制并且操作用于执行所述组织处理过程的至少一部分。
3.根据权利要求2所述的系统，其中，从包括下列项的组中选择所述组织处理设备：
组织收取设备、组织处理器、组织包埋设备、组织切片设备、组织载片制备设备以及诊断载片读取设备。
4.根据权利要求1所述的系统，其中，所述电子控制操作用于更新所述数据库中的所述信息。
5.根据权利要求1所述的系统，其中，所述机器可读指示器存储在建立组织活检样本的处理参数中使用的信息。
6.根据权利要求5所述的系统，其中，所述电子控制操作用于更新存储在所述机器可读指示器上的所述信息。
7.根据权利要求6所述的系统，其中，所述机器可读指示器还包括RFID标签。
8.根据权利要求1所述的系统，其中，所述参考标记还包括数字参考码。
9.根据权利要求1所述的系统，其中，所述机器可读指示器是只读指示器。
10.根据权利要求9所述的系统，其中，所述只读指示器还包括条形码或所述组织载体上的蚀刻。
11.一种在组织病理学处理期间处理组织活检样本的系统，包括：
组织载体，其构建成在所述组织病理学处理的步骤期间承载组织活检样本；
机器可读可写指示器，其与所述组织载体物理相关联，所述机器可读可写指示器存储标识所述组织活检样本的参考标记，并且还存储与所述组织活检样本的至少一个物理属性相关联的信息；以及
电子控制，其操作用于读取所述参考标记和存储在所述机器可读可写指示器上的所述信息，并且根据所访问的信息实施组织处理过程的至少一部分。
12.根据权利要求11所述的系统，其中，所述电子控制还操作用于将新信息写入所述机器可读可写指示器上。
13.根据权利要求12所述的系统，其中，所述新信息包括更新已经存储在所述机器可读可写指示器上的信息。
14.根据权利要求11所述的系统，其中，存储在所述机器可读可写指示器上的信息与存储在独立数据库中的信息的至少一部分相同。
15.根据权利要求11所述的系统，其中，存储在所述机器可读可写指示器上的所述信息至少部分地不同于存储在所述数据库中的所述信息。
16.根据权利要求11所述的系统，还包括：
组织处理设备，其包括所述电子控制并且操作用于执行所述组织处理过程的至少一部分。
17.根据权利要求16所述的系统，其中，从包括下列项的组中选择所述组织处理设备：
组织收取设备、组织处理器、组织包埋设备、组织切片设备、组织载片制备设备以及诊断载片读取设备。
18.根据权利要求11所述的系统，其中，所述电子控制操作用于更新所述数据库中的所述信息。
19.根据权利要求11所述的系统，其中，所述机器可读指示器存储在建立组织活检样本的处理参数中使用的信息。
20.根据权利要求19所述的系统，其中，所述电子控制操作用于更新存储在所述机器可读指示器上的所述信息。
21.根据权利要求20所述的系统，其中，所述机器可读指示器还包括RFID标签。
22.根据权利要求11所述的系统，其中，所述参考标记还包括数字参考码。
23.一种用于在组织病理学处理期间包埋组织活检样本的系统，包括：
组织载体，其构建成在包埋过程期间承载组织活检样本；
包埋设备，其操作用于包埋所述组织活检样本用于后续切片；
数据库，其存储与包埋处理相关联的信息；
机器可读指示器，其与所述组织载体物理相关联，所述机器可读指示器包括标识所述组织活检样本的机器可读参考标记；以及
电子控制，其操作性地与所述包埋设备耦合，并且能够读取所述参考标记和存储在所述机器可读指示器上的信息，访问所述数据库中的所述信息，并且根据所述信息实施所述包埋过程的至少一部分。
24.根据权利要求23所述的系统，其中，使用存储在所述数据库中的所述信息以指导所述包埋设备将所述组织活检样本放置在用于接收包埋材料的至少两个不同模具的一个中。
25.根据权利要求23所述的系统，其中，所述信息存储在所述机器可读指示器中，并且用于指导所述包埋设备将所述组织活检样本放置在用于接收包埋材料的至少两个不同模具的一个中。
26.根据权利要求23所述的系统，其中，使用存储在所述数据库中的所述信息指导所述包埋设备加热和/或冷却用于包埋所述组织活检样本的包埋材料。
27.根据权利要求23所述的系统，其中，所述信息存储在所述机器可读指示器中，并且用于指导所述包埋设备加热和/或冷却用于包埋所述组织活检样本的包埋材料。
28.根据权利要求23所述的系统，其中，使用存储在所述数据库中的所述信息以选择用于包埋所述组织活检样本的包埋材料。
29.根据权利要求23所述的系统，其中，所述信息存储在所述机器可读指示器中，并且用于选择用于包埋所述组织活检样本的包埋材料。
30.根据权利要求23所述的系统，其中，所述电子控制操作用于更新所述数据库中的所述信息。
31.根据权利要求23所述的系统，其中，所述电子控制操作用于更新存储在所述机器可读指示器上的所述信息。
32.根据权利要求23所述的系统，其中，所述机器可读指示器还包括RFID标签。
33.根据权利要求23所述的系统，其中，所述参考标记还包括数字参考码。
34.一种用于在组织病理学处理期间处理组织活检样本的系统，包括：
组织载体，其构建成在允许随后包埋所述组织活检样本的过程期间承载组织活检样本；
组织处理器，其操作用于使所述组织活检样本经受允许随后包埋所述组织活检样本的所述过程；
数据库，其存储与所述过程相关联的信息；
机器可读指示器，其与所述组织载体物理相关联，所述机器可读指示器包括标识所述组织活检样本的机器可读参考标记；以及
电子控制，其操作性地与所述组织处理器耦合，并且能够读取所述参考标记，使用所述参考标记访问所述数据库中的所述信息，并且根据所述信息而实施所述过程的至少一部分。
35.根据权利要求34所述的系统，其中，使用存储在所述数据库中的所述信息以关于下列中至少一项指导所述组织处理器：在所述过程期间使用的化学试剂、循环时间或者循环温度。
36.根据权利要求34所述的系统，其中，所述信息存储在所述机器可读指示器中，并且使用所述信息关于下列中至少一项指导所述组织处理器：在所述过程期间使用的化学试剂、循环时间或者循环温度。
37.根据权利要求34所述的系统，其中，所述电子控制操作用于更新所述数据库中的所述信息。
38.根据权利要求37所述的系统，其中，所述数据库在所述机器可读指示器上。
39.根据权利要求34所述的系统，其中，所述机器可读指示器还包括RFID标签。
40.根据权利要求34所述的系统，其中，所述参考标记还包括数字参考码。
41.一种用于执行组织病理学处理的至少一部分的系统，包括：
组织载体，其构建成承载组织活检样本；
机器可读指示器，其与所述组织载体物理相关联，所述指示器提供标识所述组织活检样本的机器可读参考标记；以及
数据库，其存储与所述机器可读指示器的所述参考标记相关联的组织样本记录，由此所述组织样本记录中的信息能够用于协助所述活检组织样本的所述组织病理学处理中至少一个步骤的执行。
42.根据权利要求41所述的系统，其中，所述组织样本记录中的所述信息能够用于协助下列中至少一项的执行：在包埋所述组织活检样本之前处理所述组织活检样本、包埋所述组织活检样本、所述组织活检样本的切片载片制备、载片上的所述组织活检样本的染色、或者关于所述组织活检样本的最终病理学报告的制备。
43.一种用于在组织病理学处理期间处理组织活检样本的系统，包括：
多个组织载体，每个组织载体构建成在所述组织病理学处理期间承载组织活检样本；
操作用于在所述组织病理学处理期间执行至少一个过程的机器，
数据库，其存储与所述过程相关联的信息；
多个所述机器可读指示器，其分别与所述组织载体物理相关联，每个机器可读指示器包括标识与对应的组织载体相关联的所述组织活检样本的唯一机器可读参考标记；以及
电子控制，其操作性地与所述机器耦合，并且能够读取所述参考标记、使用所述唯一参考标记访问所述数据库中的所述信息，并且基于关于不同参考标记所存储的类似信息实施所述过程的至少一部分。
44.根据权利要求43所述的系统，其中，所述电子控制基于所述类似信息而排除在所述组织活检样本中的至少一个上执行所述过程中的至少一个操作。
45.根据权利要求44所述的系统，其中，所述电子控制包括基于所述类似信息在所述组织活检样本中的至少一个上执行所述过程中的至少一个操作。
46.根据权利要求44所述的系统，其中，所述电子控制操作用于更新所述数据库中的所述信息。
47.根据权利要求44所述的系统，其中，所述电子控制操作用于更新存储在所述机器可读指示器上的所述信息。
48.根据权利要求44所述的系统，其中，所述机器可读指示器还包括RFID标签。
49.根据权利要求44所述的系统，其中，所述参考标记还包括数字参考码。
50.一种在组织病理学处理期间处理组织活检样本的方法，包括：
读取与组织载体物理相关联的机器可读指示器，以获得与由所述载体承载的组织活检样本相关联的参考标记；
访问与从所述机器可读指示器获得的所述参考标记相关联的数据库中的信息；以及
使用所述信息执行在所述组织病理学处理期间的至少一个过程。
51.根据权利要求50所述的方法，其中，组织处理设备包括读取器，且使用所述读取器以读取所述机器可读指示器，所述方法还包括：
使用所述组织处理设备执行所述过程。
52.根据权利要求51所述的方法，其中，从包括下列项的组中选择所述组织处理设备：
组织收取设备、组织处理器、组织包埋设备、组织切片设备、组织载片制备设备以及诊断载片读取设备。
53.一种在组织病理学处理期间处理组织活检样本的方法，包括：
读取与组织载体物理相关联的机器可读指示器，以获得与由所述组织载体承载的所述组织活检样本相关联的信息；以及
使用所述信息执行在所述组织病理学处理期间的至少一个过程。
54.根据权利要求53所述的方法，其中，组织处理设备包括读取器，且使用所述读取器以读取所述机器可读指示器，所述方法还包括：
使用所述组织处理设备执行所述过程。
55.根据权利要求54所述的方法，其中，从包括下列项的组中选择所述组织处理设备：
组织收取设备、组织处理器、组织包埋设备、组织切片设备、组织载片制备设备以及诊断载片读取设备。
56.根据权利要求53所述的方法，其中，执行所述过程的步骤还包括下列步骤中的至少一个：
a)使用所述信息以选择用于记录与所述组织活检样本相关联的信息的组织收取过程的参数；
b)使用所述信息以选择用于制备所述组织活检样本以用于包埋的组织固定过程的参数；
c)使用所述信息以选择用于制备所述组织活检样本以用于切片和显微镜载片制备的组织包埋过程的参数；和/或
d)使用所述信息以选择用于制备所述组织样本的显微镜载片的切片过程的参数。
57.一种在组织病理学处理期间处理组织活检样本的方法，包括：
读取与组织载体物理相关联的机器可读指示器，以获得与由所述组织载体承载的所述组织活检样本相关联的信息；
至少部分地基于所述信息访问电子组织样本记录；以及
使用所访问的信息控制在所述组织病理学处理期间的至少一个过程，所述过程选自于包括下列项的组：组织固定、组织包埋、切片、显微镜载片制备、显微镜载片染色和病理学报告制备。
58.根据权利要求57所述的方法还包括：
利用在所述组织病理学处理的随后过程中使用的信息更新在所述电子组织样本记录中的信息。
59.根据权利要求57所述的方法，其中，控制至少一个过程还包括：
基于与不同组织载体和/或不同组织活检样本相关联的类似或相似参数的比较而做出关于包含批内和排出批外的决定。
60.根据权利要求57所述的方法，其中，包含在所述机器可读指示器上的信息包括与所述组织活检样本或所述组织载体中至少一个相关联的数字参考码，而所述电子组织样本记录至少部分地存储在远离所述机器可读指示器的数据库中。
61.根据权利要求60所述的方法，其中，所述电子组织样本记录至少部分地包含在存储于在所述组织病理学处理中使用的设备的控制中的数据库中。
62.根据权利要求57所述的方法，其中，所述电子组织样本记录至少部分地存储在所述机器可读指示器上。
63.根据权利要求57所述的方法，其中，所述机器可读指示器仅包含数字参考码，而所述电子组织样本记录的其他信息存储在远离所述机器可读指示器的数据库中。
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