CN102154384A - 一种生产手性纯(2s,3s)-2,3-丁二醇的方法 - Google Patents
一种生产手性纯(2s,3s)-2,3-丁二醇的方法 Download PDFInfo
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Abstract
本发明公开了一种生产手性纯(2S,3S)-2,3-丁二醇的方法,是将(2S,3S)-2,3-丁二醇脱氢酶基因在大肠杆菌中表达,并以此重组大肠杆菌全细胞为生物催化剂,以双乙酰和葡萄糖为底物转化生产手性纯(2S,3S)-2,3-丁二醇。本发明方法中参与菌株要求的培养基简单、成本低,并且生产过程及产物分离方便。生产的手性纯(2S,3S)-2,3-丁二醇最高产量可达到26gL-1以上,ee值大于99%,具有推广应用价值和可观的经济效益。
Description
技术领域
本发明涉及一种生产手性纯2,3-丁二醇(2,3-BD)的方法,尤其涉及一种生产手性纯(2S,3S)-2,3-丁二醇(2S,3S-BD)的方法,具体说,是将(2S,3S)-2,3-丁二醇脱氢酶(2S,3S-BDH)基因在大肠杆菌(E.coli)中表达,并以此重组E.coli全细胞为生物催化剂,以双乙酰(DA)和葡萄糖为底物高效生产手性纯2S,3S-BD的方法。
背景技术
2,3-BD在常温下是一种无色无味透明的液体,有三种同分异构体:meso-2,3-丁二醇(meso-BD)、(2R,3R)-2,3-丁二醇(2R,3R-BD)和2S,3S-BD。2,3-BD广泛应用于化工、食品、燃料及航天航空等多个领域(Syu M J.,Appl.Microbiol.Biotechnol.,2001,55:10-18)。具有光学活性的2R,3R-BD和2S,3S-BD还可用作防冻剂,由于其具有手性碳原子,在不对称合成中也有重要用途(Celinska E.& Grajek W.,Biotechnol.Adv.,2009,27:715-725)。除此之外,2S,3S-BD可抑制腺嘌呤环化酶(Adenylyl cyclase)7,同时刺激Adenylyl cyclase 6和Adenylyl cyclase 9,这对cAMP产生系统具有重要意义(Hasanuzzaman M.,Yoshimura M.,Alcohol.Clin.Exp.Res.,2010,34:743-749)。
在发酵生产2,3-BD的菌种中,肺炎克雷伯氏菌(Klebsiella pneumoniae)和产气肠杆菌(Enterobacter aerogenes)以meso-BD为主要代谢产物,只有少量的2S,3S-BD(CelinskaE.& Grajek W.,Biotechnol.Adv.,2009,27(6):715-725;Qin J.et al.,Chinese J.Chem.Eng.,2006,14:132-136);多粘芽孢杆菌(Paenibacillus polymyxa)发酵主要代谢产物为2R,3R-BD(Nakashimada Y.et al.,J.Biosci.Bioeng.,2000,90:661-664)。因此,采用菌株进行发酵生产不能得到手性纯的2S,3S-BD。
2001年,Ui等将解糖短杆菌(Brevibacterium saccharolyticum)中2S,3S-BDH编码基因在E.coli中表达,以外消旋的乙偶姻(AC)为底物,可生产3.7g L-1的2S,3S-BD(ee值为95%)(Ui et al.,Lett.Appl.Microbiol.,2001,32(2):93-98)。2004年,Ui等将K.pneumoniae中meso-2,3-丁二醇脱氢酶(meso-BDH)和B.saccharolyticum中2S,3S-BDH编码基因在E.coli中共表达,以DA为底物,可生产2.2g L-1的2S,3S-BD(ee值为96%)(Uiet al.,Lett.Appl.Microbiol.,2004,39(6):533-537)。2010年,Xiao等将枯草芽孢杆菌(Bacillussubtilis)中2R,3R-2,3-丁二醇脱氢酶(2R,3R-BDH)和短乳杆菌(Lactobacillus brevis)中NADH氧化酶编码基因在E.coli中表达,拆分混合2,3-BD,可生产2.4g L-1的2S,3S-BD(ee值>99%)(Xiao Z.et al.,PLoS One,2010,5(1),e8860)。但由于产物浓度和光学纯度的限制,使上述方法无法满足工业生产需求。因此有必要寻找更好的方法,以实现手性纯2S,3S-BD的高效生产。
近年来,生物催化剂由于其具有高立体选择性和底物选择性,更多的被应用于高值化合物合成;全细胞作为一种常用的生物催化剂,在有机合成中被广泛应用。全细胞常被应用于需要辅因子再生的合成反应,比如还原酶催化的反应,只需加入廉价的葡萄糖,就可达到细胞内部辅因子再生(Goldberg K.et al.,Appl.Microbiol.Biotechnol.,2007,76:249-255)。此外,全细胞催化法产物分离较简单,具有工业化应用前景(Schmid A.et al.,Nature,2001,409:258-268)。
发明内容
针对上述现有方法中,2S,3S-BD的产量低、ee值低,难以大规模生产的不足,本发明要解决的问题是提供一种生产手性纯2S,3S-BD的方法。
本发明是利用2S,3S-BDH可催化DA生成S-乙偶姻(S-AC),同时可催化S-AC和2S,3S-BD之间转化的性质,加入葡萄糖补充该过程消耗的NADH,使细胞中NADH再生。将2S,3S-BDH基因在E.coli中表达,以此重组E.coli全细胞为生物催化剂,以双乙酰(DA)和葡萄糖为底物,实现手性纯2S,3S-BD的高效生产。
本发明所述生产手性纯2S,3S-BD的方法,其特征在于:将2S,3S-BDH基因在E.coli中表达,并以此重组E.coli全细胞为生物催化剂,以双乙酰(DA)和葡萄糖为底物转化生产手性纯2S,3S-BD。
其中:所述2S,3S-BDH基因来源于肠杆菌属(Enterobacter)、克雷伯氏菌属(Klebsiella)和棒杆菌属(Corynebacterium)、泛菌属(Pantoea)、乳杆菌属(Lactobacillus)、明串珠菌属(Leuconostoc)、链球菌属(Streptococcus)。
进一步的,所述2S,3S-BDH基因来源菌株优选是E.cloacae ssp.dissolvens SDM、K.pneumonia ATCC 49790或C.glutamicum ATCC 13032。
上述的重组E.coli是采用常规(参考科学出版社出版的《精编分子生物学指南)的方法先克隆到2S,3S-BDH基因,再构建重组质粒,转化到E.coli(优选E.coli BL21)中,然后经筛选获得;其含有2S,3S-BDH基因,为革兰氏阴性菌,需氧或兼性厌氧生长,较佳培养温度为37±1℃,可以在含有100μg mL-1氨苄青霉素的LB培养基上生长,可以用于催化双乙酰(DA)和葡萄糖生产手性纯2S,3S-BD。
本发明所述生产手性纯2S,3S-BD的方法中:以重组E.coli全细胞为生物催化剂,以双乙酰(DA)和葡萄糖为底物转化生产手性纯2S,3S-BD的具体方法是:
(1)平板培养:将重组E.coli菌株划线到含有质量体积比为1.5~1.8%琼脂的并含有100μgmL-1氨苄青霉素的LB平板上,37±1℃培养12±1小时;
(2)一级种子:在无菌的条件下,用无菌的牙签挑取步骤(1)平板上的一个单菌落,然后接种到5mL的含有100μg mL-1氨苄青霉素的LB液体培养基中,37±1℃摇床震荡培养12±1小时;
(3)二级种子:在无菌条件下,取步骤(2)所培养的菌液以体积比1~3%的接种量,接种到30~500mL含有100μg mL-1氨苄青霉素的LB液体培养基中,37±1℃摇床震荡培养12±1小时;
(4)发酵罐培养:在无菌条件下,取步骤(3)所得的菌液以体积比为6~10%的接种量接种到2~10L的含有100μg mL-1氨苄青霉素的LB液体培养基中,37±1℃培养5~20小时,然后再加入终浓度为1mM的IPTG,10~37℃诱导5~24小时,停止发酵;
其中,上述步骤(1)~(4)中所述的LB培养基配方为:1L蒸馏水中含:10g蛋白胨,5g酵母粉,10gNaCl,121℃条件下灭菌15分钟。
(5)收集菌体:将步骤(4)培养得到的培养物8,000±500rpm离心15分钟;并用0.85wt%的生理盐水洗涤菌体2~3遍,然后将细胞悬起到pH 7、200mM的Tris-HCl缓冲液中,使细胞的终浓度为2~10g L-1;将菌体置于4℃的冰箱中保藏,即得到重组E.coli全细胞生物催化剂,待用;
(6)转化实验制备产物:以浓度为2~10g L-1的生物催化剂,在10~42℃、pH 5.0~9.0条件下,180rpm摇床震荡,转化初始浓度为5~20g L-1的DA,并加入5~120g L-1的葡萄糖以补充反应所需辅因子的消耗;每隔2小时取样,样品以8,000±500rpm离心10~15分钟,去除所加入的生物催化剂,检测上清中DA和葡萄糖浓度,根据DA和葡萄糖浓度补加DA和葡萄糖,使DA浓度达到5~20g L-1,葡萄糖浓度达到5~120g L-1;对上清进行气相色谱分析测定转化液中2S,3S-BD的浓度及光学纯度;当2S,3S-BD的浓度不再增加时,停止转化。
上述底物DA的检测方法是:
样品进行设定的稀释后,取680μL样品加入20μL 0.5%的3,3′-二氨基联苯胺盐酸盐,室温下,黑暗处理1分钟;加入200μL 3M的硫酸和100μL的水,室温下黑暗处理10分钟;366nm处检测吸光度(Pien J.et al.,Lait,1937,17:673-698)。
上述底物葡萄糖的检测方法是:
样品进行设定的稀释后,采用生物传感分析仪SBA-40C(山东省科学院生物研究所)测定。测定原理为利用固定化葡萄糖氧化酶膜专一性测定葡萄糖含量。
上述转化产物2S,3S-BD的检测方法是:
每500mL乙酸乙酯中加入1mL异戊醇,作为萃取剂;利用该萃取剂,对步骤(6)中转化产物的样品进行等体积萃取,利用涡旋振荡器对萃取的样品震荡1分钟,然后静置,取上层样品进行气相检测。具体的气相检测条件如下:
所用气相色谱仪的型号为Agilent 6820,氮气作为载气,进样器和检测器的温度均设为280℃,检测过程的柱温设定为:40℃保持3分钟;然后以每分钟1.5℃的速率升温到80℃;以每分钟0.5℃的速率升温到86℃;以每分钟30℃的速率升温到200℃。进样量1.5μL,进行气相检测。
上述生产手性纯2S,3S-BD的方法中,
步骤(4)所述诱导培养温度优选10~30℃;诱导培养时间优选10~20小时。
步骤(6)所述转化实验优选以浓度为3.0~8.0g干细胞L-1的生物催化剂,在20~37℃,pH 6.0~8.0,180rpm震荡条件下对底物进行转化。
步骤(6)所述初始DA浓度优选10~25g L-1,初始葡萄糖浓度优选20~100g L-1。
步骤(6)所述转化实验过程中补加DA和葡萄糖,使DA浓度优选达到10~25g L-1,葡萄糖浓度优选达到20~100g L-1。
本发明成功的实现了将2S,3S-BDH基因在E.coli中表达,并以此重组E.coli全细胞为生物催化剂,以DA和葡萄糖为底物高效生产手性纯2S,3S-BD。
本发明具有以下特点:
(1)应用表达2S,3S-BDH的重组E.coli全细胞为生物催化剂,催化DA生产手性纯2S,3S-BD。
(2)在转化体系中加入葡萄糖,实现细胞内辅因子的再生。
(3)参与菌株要求的培养基简单、成本低。
(4)利用全细胞生产手性纯2S,3S-BD,操作过程简单,产物分离方便。
(5)本发明的生物催化剂能转化DA生产手性纯2S,3S-BD,最高产量可达到26gL-1以上,ee值大于99%。
附图说明
图1重组E.coli的蛋白电泳图,M:Maker;1:E.coli;2:未加IPTG诱导的重组E.coli;3:IPTG诱导的重组E.coli;4:2S,3S-BDH纯酶。
图2标准品的气相色谱图谱,其中*为内标异戊醇,其他各物质的保留时间分别为:R-AC:14.240;S-AC::16.036;2S,3S-BD:32.909;2R,3R-BD:34.175;meso-BD:36.034。
图3重组E.coli催化DA生产2S,3S-BD转化液的气相色谱图谱。
具体实施方式
下面通过实施例进一步阐明本发明,但不仅限于此。
实施例1:E.cloacae ssp.dissolvens SDM中的2S,3S-BDH在生产2S,3S-BD中的应用
1、重组基因工程菌的构建
采用常规的方法制备菌株e.cloacae ssp.dissolvens SDM(CGMCC No.4230)的基因组DNA,该过程可参考科学出版社出版的《精编分子生物学指南》中细菌基因组的小量制备的方法,提取E.cloacae ssp.dissolvens SDM的基因组DNA;使用合成的引物从E.cloacaessp.dissolvens SDM基因组DNA中PCR扩增得到2S,3S-BDH基因(budC)。
budC基因的来源菌E.cloacae ssp.dissolvens SDM(CGMCC No.4230)为申请人实验室前期筛选得到的一株高产2,3-BD菌株,其已进行了保藏但未进行基因组测序。
根据已测序的Enterobacter sp.638的基因组序列,设计引物;
上游引物5’-GAATTCAATGCAAAAAGTTGCTCTCG-3’,携带一个EcoRI位点;
下游引物5’-AAGCTTTTAATTGAATACCATCCCACCGT-3’,携带一个HindIII位点。
上述budC基因序列长度为771个碱基,其核苷酸序列如SEQ ID NO.1所不。
将PCR扩增得到的片段连接到pEasy-blunt(购自北京全式金生物技术有限公司)上,得到重组质粒pEasy-blunt-budC;使用EcoRI、HindIII双酶切质粒pETDuet(购自德国默克Merck集团)和pEasy-blunt-budC,回收片段budC及pETDuet,连接,得到重组质粒pETDuet-budC;将上述重组质粒经过转化导入宿主E.coli BL21,得到工程菌株E.coliBL21/pETDuet-budC。该菌株在含100μg mL-1氨苄青霉素的LB液体培养基中,37℃培养4小时,加入终浓度为1mM的IPTG,16℃诱导10小时,得到表达有2S,3S-BDH的重组基因工程菌细胞,经12.5%的SDS-PAGE验证,结果如图1所示。
上述重组基因工程菌株为革兰氏阴性菌,需氧或兼性厌氧生长,可以用于催化DA生产手性纯2S,3S-BD。
2、重组E.coli全细胞催化剂的制备
(1)平板培养:将上述方法得到的重组E.coli菌株划线到含有质量体积比为1.5%琼脂的并含有100μg mL-1氨苄青霉素的LB平板上,37℃培养12小时;
(2)一级种子:在无菌的条件下,用无菌的牙签挑取步骤(1)平板上的一个单菌落,然后接种到5mL的含有100μg mL-1氨苄青霉素的LB液体培养基中,37℃摇床震荡培养12小时;
(3)二级种子:在无菌条件下,取步骤(2)所培养的菌液以体积比2%的接种量,接种到30~500mL含有100μg mL-1氨苄青霉素的LB液体培养基中,37℃摇床震荡培养12小时;
(4)发酵罐培养:在无菌条件下,取步骤(3)所得的菌液以体积比为8%的接种量接种到2~10L的含有100μg mL-1氨苄青霉素的LB液体培养基中,37℃培养10小时,然后再加入终浓度为1mM的IPTG,16℃诱导14小时,停止发酵。
其中,上述步骤(1)~(4)中所述的LB培养基配方为:1L蒸馏水中含:10g蛋白胨,5g酵母粉,10gNaCl,121℃条件下灭菌15分钟。
(5)收集菌体:将步骤(4)培养得到的培养物8,000rpm离心15分钟;并用0.85wt%的生理盐水洗涤菌体2~3遍,然后将细胞悬起到pH 7、200mM的Tris-HCl缓冲液中,使细胞的终浓度为8g L-1;将菌体置于4℃的冰箱中保藏,即得到重组E.coli全细胞生物催化剂,待用。
3、利用重组E.coli全细胞催化剂制备2S,3S-BD
选择上述获得的重组E.coli全细胞作为催化剂,以浓度为8g L-1进行如下转化过程:
在30℃、pH 7.0条件下,180rpm摇床震荡,转化初始浓度为20g L-1的DA,并加入40g L-1的葡萄糖以补充反应所需辅因子的消耗;发酵中每隔2小时取样,样品以8,000rpm离心10分钟,去除所加入的生物催化剂,检测上清中DA和葡萄糖浓度,根据DA和葡萄糖浓度补加DA和葡萄糖,使DA浓度达到10g L-1,葡萄糖浓度达到20g L-1;对上清进行气相色谱分析测定转化液中2S,3S-BD的浓度及光学纯度,当2S,3S-BD的浓度不再增加时,停止转化。
14小时后检测结果显示:2S,3S-BD的浓度为26.8g L-1,其ee值大于99%。该样品的气相色谱图谱见图3,保留时间为:32.909的峰即是2S,3S-BD的峰。
实施例2:K.pneumonia ATCC 49790中的2S,3S-BDH在生产2S,3S-BD中的应用
方法同实施例1的操作,只是将2S,3S-BDH的来源菌株改为K.pneumonia ATCC 49790,根据已测序的该菌的基因组序列设计引物如下:
上游引物5’-CCCGGATCCAATGAAAAAAGTCGCAC-3’,携带一个BamHI位点;
下游引物5’-CCCAAGCTTTTAGTTAAACACCATCCCGC-3’,携带一个HindIII位点。
上述2S,3S-BDH基因序列长度为771个碱基,其核苷酸序列如SEQ ID NO.2所示。
同实施例1的操作获得重组E.coli全细胞作为催化剂,并进行转化反应。
对上清进行气相色谱分析测定转化液中2S,3S-BD的浓度及光学纯度,当2S,3S-BD的浓度不再增加时,停止转化。
18小时后检测显示:转化产物中2S,3S-BD的浓度为15.3g L-1,其ee值大于99%。
实施例3:C.glutamicum ATCC 13032中的2S,3S-BDH在生产2S,3S-BD中的应用
方法同实施例1的操作,只是将2S,3S-BDH的来源菌株改为C.glutamicum ATCC13032,根据已测序的该菌的基因组序列设计引物如下:
上游引物5’-AAAGAATTCAATGAGCAAAGTTGCAATGGT-3’,携带一个EcoRI位点;
下游引物5’-TTTAAGCTTCTAGTTGTAGAGCATGCCGC-3’,携带一个HindIII位点。
上述2S,3S-BDH基因序列长度为777个碱基,其核苷酸序列Genebank编号为3345609。
同实施例1的操作获得重组E.coli全细胞作为催化剂,并进行转化反应。
对上清进行气相色谱分析测定转化液中2S,3S-BD的浓度及光学纯度,当2S,3S-BD的浓度不再增加时,停止转化。
18小时后检测显示:转化产物中2S,3S-BD的浓度为9.1g L-1,其ee值大于99%。
Claims (8)
1.一种生产手性纯(2S,3S)-2,3-丁二醇的方法,其特征在于:将(2S,3S)-2,3-丁二醇脱氢酶基因在大肠杆菌中表达,并以此重组大肠杆菌为生物催化剂,以双乙酰和葡萄糖为底物转化生产手性纯(2S,3S)-2,3-丁二醇。
2.如权利要求1所述生产手性纯(2S,3S)-2,3-丁二醇的方法,其特征在于:所述(2S,3S)-2,3-丁二醇脱氢酶基因来源于肠杆菌属(Enterobacter)、克雷伯氏菌属(Klebsiella)和棒杆菌属(Corynebacterium)、泛菌属(Pantoea)、乳杆菌属(Lactobacillus)、明串珠菌属(Leuconostoc)、链球菌属(Streptococcus)。
3.如权利要求2所述生产手性纯(2S,3S)-2,3-丁二醇的方法,其特征在于:所述(2S,3S)-2,3-丁二醇脱氢酶基因来源菌株是E.cloacae ssp.dissolvens SDM、Klebsiellapneumonia ATCC 49790或Corynebacterium glutamicum ATCC 13032。
4.如权利要求1所述生产手性纯(2S,3S))-2,3-丁二醇的方法,其特征在于:所述以重组大肠杆菌全细胞为生物催化剂,以双乙酰和葡萄糖为底物转化生产手性纯(2S,3S)-2,3-丁二醇的方法是:
(1)平板培养:将重组大肠杆菌菌株划线到含有质量体积比为1.5~1.8%琼脂的并含有100μg mL-1氨苄青霉素的LB平板上,37±1℃培养12±1小时;
(2)一级种子:在无菌的条件下,用无菌的牙签挑取步骤(1)平板上的一个单菌落,然后接种到5mL的含有100μg mL-1氨苄青霉素的LB液体培养基中,37±1℃摇床震荡培养12±1小时;
(3)二级种子:在无菌条件下,取步骤(2)所培养的菌液以体积比1~3%的接种量,接种到30~500mL含有100μg mL-1氨苄青霉素的LB液体培养基中,37±1℃摇床震荡培养12±1小时;
(4)发酵罐培养:在无菌条件下,取步骤(3)所得的菌液以体积比为6~10%的接种量接种到2~10L的含有100μg mL-1氨苄青霉素的LB液体培养基中,37±1℃培养5~20小时,然后再加入终浓度为1mM的IPTG,10~37℃诱导5~24小时,停止发酵;
其中,上述步骤(1)~(4)中所述的LB培养基配方为:1L蒸馏水中含:10g蛋白胨,5g酵母粉,10gNaCl,121℃条件下灭菌15分钟。
(5)收集菌体:将步骤(4)培养得到的培养物8,000±500rpm离心15分钟;并用0.85wt%的生理盐水洗涤菌体2~3遍,然后将细胞悬起到pH 7、200mM的Tris-HCl缓冲液中,使细胞的终浓度为2~10g L-1;将菌体置于4℃的冰箱中保藏,即得到重组大肠杆菌全细胞生物催化剂,待用;
(6)转化实验制备产物:以浓度为2~10g L-1的生物催化剂,在10~42℃、pH 5.0~9.0条件下,180rpm摇床震荡,转化初始浓度为5~20g L-1的双乙酰,并加入5~120g L-1的葡萄糖以补充反应所需辅因子的消耗;每隔2小时取样,样品以8,000±500rpm离心10~15分钟,去除所加入的生物催化剂,检测上清中双乙酰和葡萄糖浓度,根据双乙酰和葡萄糖浓度补加双乙酰和葡萄糖,使双乙酰浓度达到5~20g L-1,葡萄糖浓度达到5~120g L-1;对上清进行气相色谱分析测定转化液中(2S,3S)-2,3-丁二醇的浓度及光学纯度;当(2S,3S)-2,3-丁二醇的浓度不再增加时,停止转化。
5.如权利要求4所述生产手性纯(2S,3S)-2,3-丁二醇的方法,其特征在于,步骤(4)所述诱导培养温度为10~30℃;诱导培养时间为10~20小时。
6.如权利要求4所述生产手性纯(2S,3S)-2,3-丁二醇的方法,其特征在于,步骤(6)所述转化实验是以浓度为3.0~8.0g干细胞L-1的生物催化剂,在20~37℃,pH 6.0~8.0,180rpm震荡条件下对底物进行转化。
7.如权利要求4所述生产手性纯(2S,3S)-2,3-丁二醇的方法,其特征在于,步骤(6)所述初始双乙酰浓度为10~25g L-1,初始葡萄糖浓度为20~100g L-1。
8.如权利要求4所述生产手性纯(2S,3S)-2,3-丁二醇的方法,其特征在于,步骤(6)所述转化实验过程中补加双乙酰和葡萄糖,使双乙酰浓度达到10~25g L-1,葡萄糖浓度达到20~100g L-1。
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