CN102071254A - 一种用于预测抗抑郁剂治疗效应的生物芯片及应用 - Google Patents
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Abstract
本发明涉及生物芯片，特别涉及一种用于预测抗抑郁剂治疗效应的生物芯片及应用。一种用于预测抗抑郁剂治疗效应的生物芯片，由载体与生物探针构成，其特征在于所述的生物探针含有序列为SeqNO：1-20任意一种或多种，所述的序列末端经荧光标记修饰。本发明通过生物芯片技术，可以根据患者的遗传基因的特征（单核苷酸多态性），从选用药物的种类、接受治疗患者的性别、药物发挥疗效的推定时间点，以及可能产生的不良反应等方面，早期预测抗抑郁剂对于患者的治疗效应，从而指导临床医生制定和实施个体化的治疗方案。
Description
技术领域
本发明涉及生物芯片，特别涉及一种用于预测抗抑郁剂治疗效应的生物芯片及应用。
背景技术
抑郁症（Major depression disorder, MDD)是一种情感障碍性精神疾病，主要表现持续的情感低落、思维迟缓和意志减退，常伴有认知障碍、行为紊乱及躯体症状。其终生患病率为10%～20%，自杀率高达10%～25%。抑郁症引起的精神残疾给患者、家庭和社会带来了精神上和经济上沉重的负担，自伤自杀等行为更是危害巨大，且许多患者为反复发作病程，因此有效、规范、全程抗抑郁治疗的重要性不言而喻。
目前，以选择性5-HT和5-HT/NE再摄取抑制剂（SSRIs/SNRIs）为代表的各种新型抗抑郁药物以其临床总体的安全性和耐受性较好而得到广泛应用。但是抗抑郁治疗的个体差异非常显著，部分患者出现严重不良反应，30～50％患者治疗无显效，20％成为难治性抑郁；而且，应用抗抑郁药物治疗后即刻导致突触间隙5-HT/NE水平增高，给药1周后脑内药物浓度稳定维持在有效水平，但是临床起效通常需2～3周，充分显效更需4～6周以上，还有部分患者因不良反应而提早停止药物治疗，造成早期复发率增加，病程期间自杀风险显著增加。抗抑郁药物临床疗效差异显著和延迟起效造成的疗效早期预测困难是临床存在的极为普遍而突出的问题，亟待解决!
本发明提供一种生物芯片，可以根据患者遗传基因的特征（单核苷酸多态性），，从选用药物的种类、接受治疗患者的性别、药物发挥疗效的推定时间点，以及可能产生的不良反应等方面，早期预测抗抑郁剂对于患者的治疗效应，从而指导临床医生制定和实施个体化的治疗方案。
发明内容
本发明的目的在于：本发明提供一种生物芯片，可以根据患者的遗传基因的特征（单核苷酸多态性），从选用药物的种类、接受治疗患者的性别、药物发挥疗效的推定时间点，以及可能产生的不良反应等方面，早期预测抗抑郁剂对于患者的治疗效应，从而指导临床医生制定和实施个体化的治疗方案。
一种用于预测抗抑郁药物影响的生物芯片，由载体与生物探针构成，其特征在于所述的生物探针含有序列为Seq NO：1-20任意一种或多种，所述的序列末端经荧光标记修饰。具体来说根据前期科研成果获得的与抗抑郁剂疗效相关的易感基因单核苷酸多态性位点（SNP），采用Primer Primer 5.0 软件，针对每一个SNP位点分别设计并合成一对上下游引物和一对寡核苷酸序列标签探针（野生型标签探针和突变型标签探针），且一对寡核苷酸序列标签探针的序列末端经荧光标记修饰。
一种用于预测抗抑郁剂治疗效应的生物芯片的制备方法为，包括原位合成或预合成后点样。
有益效果
本发明可以通过生物芯片技术可以根据患者的遗传基因的特征（单核苷酸多态性），从选用药物的种类、接受治疗患者的性别、药物发挥疗效的推定时间点，以及可能产生的不良反应等方面，早期预测抗抑郁剂对于患者的治疗效应，从而指导临床医生制定和实施个体化的治疗方案。同时，本发明涉及生物芯片基因分型技术是一种特异性强、高通量的基因分型技术, 适用于临床快速基因分型, 在临床方面具有很大应用前景。
具体实施方式
实施例 1
一、临床患者的入组和评估：
1.入组标准：
入组符合DSM-IV单相抑郁症的诊断标准、汉密尔顿抑郁量表（HAMD-17）评分≥18分、18～60岁、男女首发或复发的中国汉族抑郁症患者，均签写知情同意书，经伦理委员会同意。
2.排除标准：
严格排除有精神分裂症、酒精和药物依赖病史；有脑器质性疾病和内分泌疾病史；经检查血象、心、肝、肾功能异常者；妊娠期和哺乳妇女；有躁狂或轻躁狂发作史；抑郁发作过程中伴有精神病性症状者；电休克治疗者。
3.临床评估：
3.1.抑郁症状：
采用HAMD（17项版本）量表评定抑郁症状严重程度。
3.2.药物治疗和评价：
3.2.1.共入组首发或反复发作患者400例，随机分入SSRI治疗组和SNRI治疗组各200例，治疗前和治疗后每两周（第2、4、6、8、10、12周）均采用HAMD量表（17项版本）评定治疗效应。
3.2.2.治疗效应评定标准：
第6周时HAMD-17减分率 ≥ 50%，为药物治疗有效
＜ 50%，为药物治疗无效
第8周时HAMD-17得 分 ≤ 7分，为病情缓解（痊愈）
＞ 7分，为病情未缓解（未愈）
3.2.3.随访结束后的半年到一年期间，对所有入组患者进行门诊或电话回访，此间出现转躁、转精神分裂症、转其他精神疾病的患者，均不纳入本研究。
4.血液标本采集和基因组DNA提取：
患者入院后第2天晨6～8点，取肘静脉血5ml，以2g/L EDTA抗凝。采用基因组DNA提取试剂盒（TIANGEN-DP318-03，北京天根公司）提取患者血液基因组DNA，采用紫外分光光度计（T6，北京普析通用仪器有限公司）测定浓度和纯度，于-20℃储存。
二．药物基因组学研究
1.遗传标记筛选：
1.1.功能SNP（fSNP）：主要通过物种间保守序列的比对，筛选原则包括：a.改变氨基酸理化性质的SNPs；b.改变内含子剪切位点的SNPs；c.启动子或增强子区域可能会影响表达的SNPs。 采用dbSNP数据库结合Hapmap Project,筛选fSNPs.
1.2.标签SNP（tSNP）：染色体上某一个SNP往往倾向于与其附近的若干个SNPs组合在一起共同遗传，这样形成的组合称为单倍域。单倍域内SNP的变化较少，基因的遗传多态性主要表现为单倍域之间的重组改变。因此tSNP的遗传特征可以代表其所属的整个单倍域（其中包含了除tSNP外的多个SNPs）的遗传特征，具有简化并且优化遗传关联分析的优势。采用Haploview 4.0软件筛选tSNPs。
2.候选基因位点分型：采用Illumina Golden Gate 定制芯片进行分型检测。
3.药物疗效相关易感基因确定：应用统计学软件及建立数学模型进行SNPs与疗效的关联分析、单倍型分析以及基因-基因交互模型分析，以此来确定精神药物疗效相关的易感基因。
4.1.统计分析:
4.1.1.运用t检验和卡方检验分析比较（有效/无效，缓解/未缓解）两组的性别、年龄、病程、发病次数、有无家族史等一般资料，采用SPSS13.0软件。两组间上述一般资料的差异无统计学意义。
4.1.2.计算每个SNP位点的基因型检出率（call rate）、最小等位基因频率（MAF）、哈迪温伯格频率（HWE），采用Haploview 4.0软件。筛选保留同时符合以下条件的SNP 位点基因型数据：call rate ≥95%、MAF ≥5%、HWE ≥0.001%。
4.1.3.运用Multinomial Logistic model EM方法进行SNP基因型频率、等位基因频率与疗效的关联分析，采用Unphased 3.0.13软件。
4.1.4.单倍型分析，采用Unphased 3.0.13软件。
4.2.分析筛选出与抗抑郁药物疗效相关的易感基因和多态性位点。
三、探针的制备方法：
一种用于预测抗抑郁剂治疗效应的生物芯片，由载体与生物探针构成，其特征在于所述的生物探针含有序列为Seq NO：1-20任意一种或多种，所述的序列末端经荧光标签修饰。根据前期科研成果获得的与抗抑郁剂疗效相关的易感基因单核苷酸多态性位点（SNP），采用Primer Primer 5.0 软件，针对每一个SNP位点分别设计并合成一对上下游引物和一对寡核苷酸序列标签探针（野生型标签探针和突变型标签探针），且一对寡核苷酸序列标签探针的序列末端经荧光标记修饰。
四、生物芯片的制备方法：
将丙烯酰胺修饰的PCR产物核酸片段、丙烯酰胺单体、过硫酸铵、丙三醇和水混合成预聚合物，其中，PCR产物核酸片段的浓度在0.001-100uM之间，丙烯酰胺单体重量浓度在1-30％之间，过硫酸铵重量浓度在0.01-5％之间，丙三醇的重量浓度为10-50％。充分振荡后离心静置,移入96孔板,用微阵列点样仪点样至经丙烯酰基硅烷修饰的固体基片（玻片）的反应槽内。点样完后将点样基片置于一放置有四甲基乙二胺（TEMED）的密闭盒中，使四甲基乙二胺挥发，挥发的四甲基乙二胺与固体基板上预聚合物阵点接触并使其发生聚合反应，使各阵点上的核酸通过共聚反应在固体基板上固定。保存于4℃备用。
五、生物芯片杂交反应和信号检测
配制杂交反应液，每一种杂交反应液只包含单个SNP位点的成对Cy3/cy5双色荧光标记的探针各2mmol/L（MicroHybTM 杂交液成分购自TeleChem公司）。
固定好的三维凝胶核酸芯片置于0.1mmol/L NaOH溶液中5V/cm电泳10min，变性处理为单链 DNA阵列。
每一个反应槽内只加入一种含单个SNP成对荧光标记探针的杂交反应液10ul。然后其上覆盖疏水化盖玻片, 使杂交液在反应槽内充分展开,同时反应槽之间彼此隔离。杂交反应在37℃持续2h，反应槽保持潮湿密闭状态。
完成杂交的芯片置于含有MgCl2的1×TBE中5V/cm电泳8min，清除非特异吸附探针。氮气吹干芯片后, 设置扫描仪Lux Scan 10K（北京博奥生物芯片公司）的激光功率(Power)70%,光电倍增管效率(PMT Gain)70 %, 对微阵列进行扫描,分别得到 Cy3扫描图与 Cy5扫描图,可得到绿、黄、红三种颜色的图像，分别对应于野生纯合子、杂合子和突变纯合子，通过颜色的区分可很容易地对SNP进行分型。进一步使用 Quant Array软件分析每一样本点的荧光强度，得到样本在两种激光源扫描下的荧光强度及背景强度，据此求得样品的基因型，修正肉眼直接观察的结果。
其中患者的基因组DNA扩增产物制备方法为多重 PCR 扩增。反应体系为50ul，其中含10mmol/L Tris-HCl(pH 8.3)，50mmol/L KCl，2.0mmol/L MgCl2，200umol/L dNTPs，各60pmol/每一对上游和下游引物，5U Taq DNA聚合酶(Promaga公司)，患者血液样本抽提基因组DNA 250ng。将 PCR 反应体系在PTC220型扩增仪上进行如下程序：94℃预变性5min，然后94℃变性30s，62℃退火30s，72℃延伸30s，共35个循环，最后72℃再延伸5min。
其中上、下游引物为Seq NO：21-40。
六、生物芯片的效果验证试验
为验证芯片的分型结果, 随机抽取20份标本使用普通引物进行 PCR 扩增，PCR产物纯化后通过3730XL自动测序仪（ABI公司）直接测序验证。20份标本的直接测序结果与基因芯片分型结果一致。
SEQUENCELISTING
<110> 东南大学
<120> 基于生物芯片的抗抑郁药物疗效风险评估系统
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<170> PatentInversion3.3
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<211> 20
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<213> 人工序列
<400> 68
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<211> 22
<212> DNA
<213> 人工序列
<400> 69
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<211> 20
<212> DNA
<213> 人工序列
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<212> DNA
<213> 人工序列
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<212> DNA
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tcccccgggcttgacttcctcttggct 27
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<212> DNA
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caagacgttggtgtggaatg 20
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<400> 100
gagtcgaggtcatatcgt 18
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<211> 22
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<212> DNA
<213> 人工序列
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<212> DNA
<213> 人工序列
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<213> 人工序列
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<213> 人工序列
<400> 106
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<213> 人工序列
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<212> DNA
<213> 人工序列
<400> 108
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<213> 人工序列
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<213> 人工序列
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<211> 24
<212> DNA
<213> 人工序列
<400> 112
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<212> DNA
<213> 人工序列
<400> 113
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<213> 人工序列
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<400> 118
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<212> DNA
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<400> 119
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<210> 120
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<213> 人工序列
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cacagcgtgagccaaagttg 20
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cagcctttatcaggaggatggac 23
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<211> 20
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<213> 人工序列
<400> 124
cacagcgtgagccaaagttg 20
Claims (3)
1.一种用于预测抗抑郁剂治疗效应的生物芯片，由载体与生物探针构成，其特征在于所述的生物探针含有序列为Seq NO：1-20任意一种或多种，所述的序列末端经荧光标记修饰。
2.根据一种用于预测抗抑郁剂治疗效应的生物芯片的制备方法，其特征在于包括原位合成或预合成后点样。
3.一种用于预测抗抑郁剂治疗效应的生物芯片的应用。
Priority Applications (1)
| Application Number | Priority Date | Filing Date | Title |
|---|---|---|---|
| CN 201010581089 CN102071254A (zh) | 2010-12-10 | 2010-12-10 | 一种用于预测抗抑郁剂治疗效应的生物芯片及应用 |
Applications Claiming Priority (1)
| Application Number | Priority Date | Filing Date | Title |
|---|---|---|---|
| CN 201010581089 CN102071254A (zh) | 2010-12-10 | 2010-12-10 | 一种用于预测抗抑郁剂治疗效应的生物芯片及应用 |
Publications (1)
| Publication Number | Publication Date |
|---|---|
| CN102071254A true CN102071254A (zh) | 2011-05-25 |
Family
ID=44030011
Family Applications (1)
| Application Number | Title | Priority Date | Filing Date |
|---|---|---|---|
| CN 201010581089 Pending CN102071254A (zh) | 2010-12-10 | 2010-12-10 | 一种用于预测抗抑郁剂治疗效应的生物芯片及应用 |
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| Country | Link |
|---|---|
| CN (1) | CN102071254A (zh) |
Cited By (3)
| Publication number | Priority date | Publication date | Assignee | Title |
|---|---|---|---|---|
| CN104805199A (zh) * | 2015-04-14 | 2015-07-29 | 吴旭平 | 一种Gilbert综合征基因突变检测试剂盒 |
| CN104946735A (zh) * | 2014-03-31 | 2015-09-30 | 湖北维达健基因技术有限公司 | 试剂盒及确定待测dna样本预定snp位点的基因型的方法 |
| WO2023082401A1 (zh) * | 2021-11-11 | 2023-05-19 | 中国科学院深圳理工大学(筹) | 一种预测抑郁障碍患者对治疗反应的基因诊断试剂盒和系统 |
Citations (2)
| Publication number | Priority date | Publication date | Assignee | Title |
|---|---|---|---|---|
| CN101029337A (zh) * | 2006-03-01 | 2007-09-05 | 北京华安佛医药研究中心有限公司 | 多态性位点基因型预测5－羟色胺再摄取抑制剂类药物作用效果的用途和方法 |
| CN101294220A (zh) * | 2008-06-18 | 2008-10-29 | 山西医科大学 | 判断重性抑郁症发病易感性的方法 |
-
2010
- 2010-12-10 CN CN 201010581089 patent/CN102071254A/zh active Pending
Patent Citations (2)
| Publication number | Priority date | Publication date | Assignee | Title |
|---|---|---|---|---|
| CN101029337A (zh) * | 2006-03-01 | 2007-09-05 | 北京华安佛医药研究中心有限公司 | 多态性位点基因型预测5－羟色胺再摄取抑制剂类药物作用效果的用途和方法 |
| CN101294220A (zh) * | 2008-06-18 | 2008-10-29 | 山西医科大学 | 判断重性抑郁症发病易感性的方法 |
Cited By (4)
| Publication number | Priority date | Publication date | Assignee | Title |
|---|---|---|---|---|
| CN104946735A (zh) * | 2014-03-31 | 2015-09-30 | 湖北维达健基因技术有限公司 | 试剂盒及确定待测dna样本预定snp位点的基因型的方法 |
| CN104805199A (zh) * | 2015-04-14 | 2015-07-29 | 吴旭平 | 一种Gilbert综合征基因突变检测试剂盒 |
| CN104805199B (zh) * | 2015-04-14 | 2017-12-29 | 吴旭平 | 一种Gilbert综合征基因突变检测试剂盒 |
| WO2023082401A1 (zh) * | 2021-11-11 | 2023-05-19 | 中国科学院深圳理工大学(筹) | 一种预测抑郁障碍患者对治疗反应的基因诊断试剂盒和系统 |
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