CN101936948A - 血清多肽的质谱检测方法 - Google Patents
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Abstract
本发明公开了一种血清多肽的质谱检测方法,用磁珠支持基质的方法捕获血清中胃癌多肽组,用磁性分离器分离磁珠及样品,无需离心样品。然后用质谱法分析多肽谱图。本发明的方法可用于正常人与胃癌患者的血清样品检测,其检测结果在早期胃癌的诊断中可以作为重要的检测依据。本发明检测方法准确、方便且快捷。
Description
技术领域
本发明属于生物技术领域,具体涉及血清多肽的质谱检测方法。
背景技术
胃癌是消化道常见恶性肿瘤之一,2006年,全球新增胃癌病例近93万,死亡70万。而我国胃癌死亡率男性(40.8/10万)和女性(18.6/10万)分别为欧美发达国家的4.2-7.9倍和3.8-8.0倍。可见我国胃癌死亡率比较高,形势严峻。外科手术是唯一可以治愈胃癌的方法,由于其诊断时常常处于进展期,从而失去手术彻底切除的机会。因而,早期诊断和早期治疗对于提高胃癌患者的长期存活率有重要意义。
目前胃镜检查是发现早期胃癌的有效手段,但胃镜检查不易被人接受,难于用在人群普查,因而,寻找一种简单,微创或无创且灵敏度和特异性高的早期胃癌诊断方法是研究热点,至今仍未找到一种理想的肿瘤标志物。近年来,表面增强激光解吸附离子化/时间-飞行质谱(surface enhanced laser desorption ionization time of flight mass spectrometry,SELDI/TOF-MS)被广泛用于胃癌标志物研究。但是用于研究的病例数都比较有限,因而会有一定的局限性。
发明内容
本发明提供了一种血清多肽的质谱检测方法,对胃癌患者血清多肽进行定量测定,有利于胃癌的早期诊断,治疗方案的确定以及预后的判断。
一种血清多肽的质谱检测方法,依次包括以下步骤:
(1)对血清样品进行预处理;
(2)将弱阳离子交换型(WCX)磁珠分装到聚合酶链式反应管(PCR管)中,然后将聚合酶链式反应管置于磁性处理器上,移除聚合酶链式反应管内的液体;
(3)将聚合酶链式反应管从磁性处理器中取出,向聚合酶链式反应管里加入缓冲液并混合均匀;再将聚合酶链式反应管置于磁性处理器上,移除聚合酶链式反应管内的缓冲液;所述的缓冲液为40~50mmol/L乙酸钠缓冲液,其pH为3.5~4.5;
(4)将聚合酶链式反应管从磁性处理器中取出,向聚合酶链式反应管中加入步骤(1)预处理后的血清样品,混合均匀后静置;
(5)将聚合酶链式反应管置于磁性处理器上,移除聚合酶链式反应管内的液体;
(6)将聚合酶链式反应管从磁性处理器中取出,向聚合酶链式反应管中加入所述的缓冲液并混合均匀;再将聚合酶链式反应管置于磁性处理器上,移除聚合酶链式反应管内的缓冲液;
(7)将聚合酶链式反应管从磁性处理器中取出,向聚合酶链式反应管中加入洗脱液,混合均匀后静置;所述的洗脱液为体积百分比为0.5~1%的三氟乙酸(TFA),配制所述的洗脱液所用的溶剂是色谱级水(HPLC级水);
(8)将聚合酶链式反应管置于磁性处理器上,吸取聚合酶链式反应管内的液体;
(9)将步骤(8)中所吸取的液体与饱和芥子酸溶液混合均匀形成混合液,吸取所述的混合液到基质辅助激光解析电离质谱的靶上,待靶上的溶液结晶后放入质谱仪中进行检测,得到血清多肽谱图。
本发明中,所述的磁珠可以通过商业途径购买得到,比如荷兰MagSi公司的WCX磁珠,Dynal的WCX磁珠,优选采用直径为1um~1.2um的磁珠。
本发明中,所述的磁性处理器为内部设有磁铁的装置,可设有各种形状的支架,其具有磁力并可分离磁珠。当含有磁珠的反应体系放置在磁性处理器上时,在磁力的作用下,溶液中本来相对均匀分布的磁珠集中在磁极方向,从而达到分离磁珠的目的。
本发明中,所述的步骤(1)中所述的预处理的方法如下:
将血清样本预先保存于-70℃以下,使用时,先在冰上融解后,再以体积比为1∶2的比例稀释在U9缓冲液中(U9缓冲液是指:9mol/LUrea,2%CHAPS,50mmol/L Tris-HCL,pH 9.0)。通常所述的稀释在小管中进行,如1.5毫升离心管。
本发明中,所述的芥子酸饱和溶液按以下方法配制:
将每10毫克芥子酸溶于300微升的乙腈和三氟乙酸的水溶液中而成,所述乙腈和三氟乙酸的水溶液中,乙腈的体积百分比为50%,三氟乙酸的体积百分比为0.5%,水为色谱级水(HPLC级水)。
本发明中,所述的质谱仪中离子化方式可以为基质辅助激光解吸电离(MALDI),例如德国Bruker公司的flex系列,如MicroFlex、AutoFlex、UltraFlex等,Ciphergen biosystems公司的SELDI-TOF等。
本发明中,所述的缓冲液优选为50mmol/L乙酸钠缓冲液,其pH为4.5。
本发明中,所述的洗脱液优选为体积百分比为1%的三氟乙酸,配制所述的洗脱液所用的溶剂是色谱级水。
本发明中,优选在每次检测前标准化质控血清监测整个方法体系稳定性,包括所用试剂和质谱能量。
本发明中,优选定期使用分子量校正品校正质谱分子量,通常为每周校正一次。
与现有技术相比,本发明具有以下有益的技术效果:
通过血清学微创、简便的方法结合质谱分析,检测出特征差异峰,作为早期胃癌的诊断中的重要检测依据,从而在人群中筛选出高疑患者,然后结合内镜和病理技术做进一步的确诊,大大提高早期胃癌的发现率。
具体实施方式
下面结合实施例来详细说明本发明,但本发明并不仅限于此。
实施例1
本发明的血清多肽的质谱检测方法,其具体步骤如下:
先将选好的磁珠(Dynal公司的WCX磁珠)按32ul/管分装到聚合酶链式反应管(即PCR管)中(分装前磁珠要混合均匀),将PCR管放到冰箱里,在4℃的环境下保存待用;
取一分装好磁珠的PCR管置于磁性处理器上,1-2分钟后移除PCR管内液体;
将PCR管从磁性处理器中取出,向PCR管内加入100μL 50m mol/L乙酸钠缓冲液(pH值为4.5),混合均匀后室温放置3-5分钟,然后把PCR管置于磁性处理器上,1-2分钟后移除PCR管内的液体,重复上述操作一次;
将PCR管从磁性处理器中取出,向PCR管内加入100μL预处理后制得的血清样品(预处理过程为:将预先保存于-80℃冰箱的胃癌患者血清样本取出10μl在冰上融化,然后向标记好的1.5ml离心管中依次加入20μLU9缓冲液(9mol/L Urea,2%CHAPS,50mmol/LTris-HCl,1%DTT,pH9.0)和10μl融化的血清样本,混匀,室温静置10min。然后再加入360μl50mmol/L乙酸钠缓冲液混匀),混合均匀后室温放置10-15分钟;
将PCR管置于磁性处理器上,1-2分钟后移除PCR管内的液体;
将PCR管从磁性处理器中取出,向PCR管内加入100μL 50mmol/L乙酸钠缓冲液,混匀后放置3-5min,将PCR管置于磁性处理器上,1-2分钟后移除PCR管内的缓冲液,重复上述操作一次;
然后再将PCR管从磁性处理器中取出,向PCR管内加入10μL体积百分比为1%的TFA,混合均匀后室温放置5min;
接着,将PCR管置于磁性处理器上,1-2分钟后吸取5μL PCR管内的液体到另一个新的PCR管中,同时加入5μL饱和芥子酸溶液(即饱和SPA溶液)充分混匀,再吸取1μL该混合液点样到用于SELDI-TOF质谱的专用芯片上,待芯片上的溶液结晶后将该芯片放入质谱仪中进行检测,并分析分子量和相对含量。
质谱仪采用美国Ciphergen biosystems公司的PBSⅡc型号,测试前先用加有All-in-one标准蛋白质的NP20芯片校正仪器,使分子量的误差范围在0.1%内。
芯片阅读仪参数设置如下:激光强度185,检测灵敏度8,优化范围1000~15000,最高分子量50000,芯片上的每个点采集90次。用Ciphergen ProteinChip 3.2.1软件收集数据。
实施例2
以42例胃癌患者(其中Ⅰ期12例,Ⅱ期6例,Ⅲ期18例,Ⅳ期6例,男女各半)和42人性别年龄匹配的健康人群的血清作为血清样本。采用实施例1相同的方法逐一进行检测。并对测得的血清多肽谱图进行原始蛋白指纹图谱标准化处理,再采用Biomarker Wizard软件分析,在分子量2000~30000范围内共检测到75个蛋白峰,其中13个峰在胃癌组与对照健康人群组比较中有极显著差异(P<0.001),不同峰的丰度见表1,表1为42例胃癌患者与42例健康人群的血清蛋白差异峰。
表1
统计学上,所有的P<0.001.
为了进一步评价上述的13个差异峰的诊断价值,分别通过SPSS 12.0分析了上述的13个差异峰在测试组(204例胃癌患者和70人健康人群)和验证组(229例胃癌患者和50人健康人群)中ROC曲线面积,见表2。表2为13个差异峰在测试组和验证组中ROC曲线面积,表2的结果表明,在测试组和验证组中ROC曲线面积都在0.8以上的有2745、2768、6629、3402、6436m/z等5个差异峰。
ROC分析是国际公认的评价诊断方法效能的客观标准,根据Swet的评价标准,ROC曲线下面积为0.7~0.9时,表示有较好的诊断准确性,可应用在临床诊断中作为参考依据。
表2
多肽峰(m/z) | 测试组中ROC曲线面积 | 验证组中ROC曲线面积 |
2745 | 0.892 | 0.922 |
2768 | 0.884 | 0.904 |
3269 | 0.757 | 0.785 |
4798 | 0.753 | 0.816 |
8692 | 0.795 | 0.811 |
6629 | 0.820 | 0.830 |
3402 | 0.852 | 0.832 |
3321 | 0.789 | 0.801 |
3821 | 0.680 | 0.715 |
16707 | 0.598 | 0.591 |
6436 | 0.814 | 0.823 |
6885 | 0.632 | 0.641 |
7769 | 0.671 | 0.679 |
进一步分析这5个差异峰在测试组和验证组中的诊断灵敏度和特异性,见表3,表3为5个差异峰在测试组和验证组中诊断灵敏度和特异性,表3的结果表明单一峰的诊断灵敏度均在62%以上,特异性均达到88%。
表3
接着对ROC曲线面积都在0.8以上的5个差异峰对早期胃癌的诊断能力进行评价。测试组中ⅠA和ⅠB胃癌患者分别为33和22例,验证组中ⅠA和ⅠB胃癌患者分别为32和22例。2745、2768、6629、3402、6436m/z等5个差异峰在两组ⅠA和ⅠB胃癌患者中灵敏度见表4。表4为5个差异峰在Ⅰ期胃癌中诊断灵敏度,从表4中可见测试组和验证组ⅠA期诊断灵敏度均在60%以上的差异峰有2745、2768和3402m/z,其中2745m/z差异峰均在70%以上。可见2745、2768和3402m/z等3个差异峰在早期胃癌的诊断中可以作为重要的检测依据。
表4
Claims (6)
1.一种血清多肽的质谱检测方法,其特征在于,依次包括以下步骤:
(1)对血清样品进行预处理;
(2)将弱阳离子交换型磁珠分装到聚合酶链式反应管中,然后将聚合酶链式反应管置于磁性处理器上,移除聚合酶链式反应管内的液体;
(3)将聚合酶链式反应管从磁性处理器中取出,向聚合酶链式反应管里加入缓冲液并混合均匀;再将聚合酶链式反应管置于磁性处理器上,移除聚合酶链式反应管内的缓冲液;所述的缓冲液为40~50mmol/L乙酸钠缓冲液,其pH为3.5~4.5;
(4)将聚合酶链式反应管从磁性处理器中取出,向聚合酶链式反应管中加入步骤(1)预处理后的血清样品,混合均匀后静置;
(5)将聚合酶链式反应管置于磁性处理器上,移除聚合酶链式反应管内的液体;
(6)将聚合酶链式反应管从磁性处理器中取出,向聚合酶链式反应管中加入所述的缓冲液并混合均匀;再将聚合酶链式反应管置于磁性处理器上,移除聚合酶链式反应管内的缓冲液;
(7)将聚合酶链式反应管从磁性处理器中取出,向聚合酶链式反应管中加入洗脱液,混合均匀后静置;所述的洗脱液为体积百分比为0.5~1%的三氟乙酸,配制所述的洗脱液所用的溶剂是色谱级水;
(8)将聚合酶链式反应管置于磁性处理器上,吸取聚合酶链式反应管内的液体;
(9)将步骤(8)中所吸取的液体与饱和芥子酸溶液混合均匀形成混合液,吸取混合液到基质辅助激光解析电离质谱的靶上,待靶上的溶液结晶后放入质谱仪中进行检测。
2.如权利要求1所述的方法,其特征在于,所述的磁珠的直径为1um~1.2um。
3.如权利要求1所述的方法,其特征在于,所述的步骤(1)中所述的预处理的方法如下:
将血清样本预先保存于-70℃以下,使用时,先在冰上融解后,再以体积比为1∶2的比例稀释在U9缓冲液中。
4.如权利要求1所述的方法,其特征在于,所述的芥子酸饱和溶液按以下方法配制:
将每10毫克芥子酸溶于300微升的乙腈和三氟乙酸的水溶液中而成,所述乙腈和三氟乙酸的水溶液中,乙腈的体积百分比为50%,三氟乙酸的体积百分比为0.5%,水为色谱级水。
5.如权利要求1所述的方法,其特征在于,所述的缓冲液为50mmol/L乙酸钠缓冲液,其pH为4.5。
6.如权利要求1所述的方法,其特征在于,所述的洗脱液为体积百分比为1%的三氟乙酸,配制所述的洗脱液所用的溶剂是色谱级水。
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---|---|
CN (1) | CN101936948A (zh) |
Cited By (3)
Publication number | Priority date | Publication date | Assignee | Title |
---|---|---|---|---|
CN102653552A (zh) * | 2011-03-02 | 2012-09-05 | 上海交通大学附属第一人民医院 | 慢性乙型肝炎肝纤维化的血清多肽标记物及其检测方法 |
CN106680360A (zh) * | 2017-01-24 | 2017-05-17 | 山东省分析测试中心 | 基于汞离子电荷载体的气相多肽阳离子的制备方法及应用 |
CN111060585A (zh) * | 2020-01-02 | 2020-04-24 | 上海交通大学医学院附属瑞金医院 | 一种血浆外泌体质谱峰及其运用 |
Citations (3)
Publication number | Priority date | Publication date | Assignee | Title |
---|---|---|---|---|
WO2007111321A1 (ja) * | 2006-03-26 | 2007-10-04 | Japan Science And Technology Agency | 硫酸化多糖または硫酸化オリゴ糖の分析方法、硫酸化多糖または硫酸化オリゴ糖を含む薬学的組成物および医薬、薬学的組成物および医薬の製造方法、疾患の治療、診断、症状の軽減および予防方法 |
CN101440121A (zh) * | 2008-12-31 | 2009-05-27 | 毅新兴业(北京)科技有限公司 | 一种适于分离血清中蛋白多肽的系统及其试剂盒 |
CN101685080A (zh) * | 2008-06-12 | 2010-03-31 | 高尚先 | 一种生物样品中蛋白质组的分析方法 |
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2010
- 2010-08-06 CN CN201010246826.8A patent/CN101936948A/zh active Pending
Patent Citations (3)
Publication number | Priority date | Publication date | Assignee | Title |
---|---|---|---|---|
WO2007111321A1 (ja) * | 2006-03-26 | 2007-10-04 | Japan Science And Technology Agency | 硫酸化多糖または硫酸化オリゴ糖の分析方法、硫酸化多糖または硫酸化オリゴ糖を含む薬学的組成物および医薬、薬学的組成物および医薬の製造方法、疾患の治療、診断、症状の軽減および予防方法 |
CN101685080A (zh) * | 2008-06-12 | 2010-03-31 | 高尚先 | 一种生物样品中蛋白质组的分析方法 |
CN101440121A (zh) * | 2008-12-31 | 2009-05-27 | 毅新兴业(北京)科技有限公司 | 一种适于分离血清中蛋白多肽的系统及其试剂盒 |
Non-Patent Citations (2)
Title |
---|
《基础医学与临床》 20090331 郑智国等 WCX纳米磁珠在宫颈鳞癌血清蛋白质组中的应用及其临床意义 287-291 1-6 第29卷, 第3期 * |
《肿瘤学杂志》 20101020 陶亚利等 早期胃癌及癌前病变的血清蛋白质谱检测和分析 751-755 1-6 第16卷, 第10期 * |
Cited By (5)
Publication number | Priority date | Publication date | Assignee | Title |
---|---|---|---|---|
CN102653552A (zh) * | 2011-03-02 | 2012-09-05 | 上海交通大学附属第一人民医院 | 慢性乙型肝炎肝纤维化的血清多肽标记物及其检测方法 |
CN102653552B (zh) * | 2011-03-02 | 2015-01-07 | 上海交通大学附属第一人民医院 | 慢性乙型肝炎肝纤维化的血清多肽标记物及其检测方法 |
CN106680360A (zh) * | 2017-01-24 | 2017-05-17 | 山东省分析测试中心 | 基于汞离子电荷载体的气相多肽阳离子的制备方法及应用 |
CN111060585A (zh) * | 2020-01-02 | 2020-04-24 | 上海交通大学医学院附属瑞金医院 | 一种血浆外泌体质谱峰及其运用 |
CN111060585B (zh) * | 2020-01-02 | 2022-06-28 | 上海交通大学医学院附属瑞金医院 | 一种血浆外泌体质谱峰及其运用 |
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