CN101532012B - 一种快速抽提纯化rna的试剂盒以及方法 - Google Patents
一种快速抽提纯化rna的试剂盒以及方法 Download PDFInfo
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Abstract
本发明涉及分子生物学领域,尤其涉及一种快速抽提纯化RNA的试剂盒及方法。本发明的试剂盒包括:裂解液、前处理液、RNA结合液、RNA洗液I和II、以及RNA过滤柱和结合柱。本发明的方法包括裂解、前处理、过滤、结合RNA、清洗提纯和洗脱等步骤。本发明摒弃了以往经典的酸性酚法及大公司的Trizol法,创造了一种全新的RNA抽提纯化方法,它使抽提纯化的时间大大缩短,只需10分钟,即可从各种材料中提纯可用于下游各种实验的高纯度RNA,如:cDNA的转录、Northern blot、RNAi等。
Description
技术领域
本发明涉及分子生物学领域,尤其涉及一种快速抽提纯化RNA的试剂盒及方法。
背景技术
RNA是遗传的基本物质之一,也是蛋白合成的模板,分离高纯度的RNA是现代分子生物学研究(包括临床医学诊断等)和分子治疗(如:RNAi治疗)的必要技术手段,也是不可逾越的试验过程。RNA具有易降解,难纯化的特点。它极易被无处不在RNase降解,也很容易在抽提过程中被DNA和蛋白污染;传统的方法,如:AGPC法或酸性酚法、氯化铯密度梯度离心法等以及现在常用的Trizol法,必须用到毒性极强的酚和氯仿等,对环境和试验人员易造成危害。并且操作过程复杂、操作时间长,这样都容易导致提纯的RNA被污染降解,并且这些方法对操作环境的要求都十分的苛刻,为了保证RNA不被污染,在提取之前,需要做大量的配液、处理环境及耗材的工作,费时又费力,增加的提取成本,且不利于大规模操作,限制了大规模临床检测应用及分子和基因组学的发展。
发明内容
因此,为了解决上述问题,本发明的发明人提出并完成了本发明。
本发明的目的为提供一种快速抽提纯化RNA的试剂盒。
本发明的另一目的为提供一种快速抽提纯化RNA的方法。
根据本发明的快速抽提纯化RNA的试剂盒包括:
1)样品裂解液,
所述裂解液针对含多糖的材料的配方为:
4.0-6M GuCl
20-80mM MES-NaOH,pH 5.2-6.5
10-50mM柠檬酸钠
0.1-0.6%TritonX-100
0.5-2%N-月桂酰肌氨酸
5-20ul/mlβ-巯基乙醇
所述裂解液针对其它材料的配方为:
3.5-5.5M GuSCN
20-80mM MES-NaOH,pH5.2-6.3
10-50mM柠檬酸钠
0.1-0.6%TritonX-100
0.5-2%N-月桂酰肌氨酸
5-20ul/mlβ-巯基乙醇;
2)RNA结合柱前处理溶液,其配方为:
3.5-4.5M LiCl
0.005-0.02M HCl
0.05-0.3%TritonX-100;
3)RNA结合溶液,其配方为;
a)200-500mM MES pH4.5-5.5
b)90-100%乙醇,且a∶b=1-5∶95-99;
4)RNA洗液I,其配方为:
50-200mM MES-NaOH,pH5~6,
3.5-4.5M GuSCN
0.1-1%TritonX-100
15-30%乙醇;
5)RNA洗液II,
对于植物材料所述洗液II的配方为:
70-85%乙醇
0.5-1.5%丙酮
0.005-0.05%DEPC,
对于其它材料所述洗液II的配方为:
70-85%乙醇和0.005-0.05%DEPC;
6)Rnase-free H2O;
7)RNA过滤柱。
8)RNA结合柱。
根据本发明的试剂盒,所述RNA结合柱的材料为二氧化硅纤维膜。
根据本发明的试剂盒,所述RNA过滤柱的过滤介质为1μM孔径的氧化铝滤片。
根据本发明的试剂盒,所述RNA结合柱由孔径为0.5μM的酸化玻璃纤维材料制成。
根据本发明的快速抽提纯化RNA的方法包括以下步骤:
1)裂解样品,将样品研磨,并加入样品裂解液进行裂解,
所述裂解液针对含多糖的材料的配方为:
4.0-6M GuCl
20-80mM MES-NaOH,pH 5.2-6.5
10-50mM柠檬酸钠
0.1-0.6%TritonX-100
0.5-2%N-月桂酰肌氨酸
5-20ul/mlβ-巯基乙醇
所述裂解液针对其它材料的配方为:
3.5-5.5M GuSCN
20-80mM MES-NaOH,pH5.2-6.3
10-50mM柠檬酸钠
0.1-0.6%TritonX-100
0.5-2%N-月桂酰肌氨酸
5-20ul/mlβ-巯基乙醇;
2)前处理,将200μLRNA结合柱前处理液注入RNA结合柱中,然后离心去除溶液,
所述RNA结合柱前处理溶液的配方为:
35-4.5M LiCl
0.005-0.02M HCl
0.05-0.3%TritonX-100;
3)过滤,将裂解样品用过滤柱过滤,在滤液中加入0.5倍体积的RNA结合溶液并混匀,
所述RNA结合液的配方为:
a)200-500mM MES pH4.5-5.5
b)90-100%乙醇,且a∶b=1-5∶95-99;
4)结合RNA,将步骤3)获得的溶液加入到RNA结合柱上,并离心去除溶液;
5)清洗提纯RNA,加500μLRNA洗液I于RNA结合柱中,并离心去除溶液,然后再加750μLRNA洗液II于RNA结合柱中,并离心去除溶液,
所述RNA洗液I的配方为:
50-200mM MES-NaOH,pH5~6,
3.5-4.5M GuSCN
0.1-1%TritonX-100
15-30%乙醇,
对于植物材料所述洗液II的配方为:
70-85%乙醇
0.5-1.5%丙酮
0.005-0.05%DEPC,
对于其它材料所述洗液II的配方为:
70-85%乙醇和0.005-0.05%DEPC;
6)洗脱RNA,向经步骤5)处理的RNA结合柱中加入Rnase-free的H2O,静止,并离心收集溶液,得到高纯度的RNA。
根据本发明的方法,所述RNA过滤柱的过滤介质为1μM孔径的氧化铝滤片。
根据本发明的方法,所述RNA结合柱由孔径为0.5μM的酸化玻璃纤维材料制成。
本发明摒弃了以往经典的酸性酚法及大公司的Trizol法,创造了一种全新的RNA抽提纯化方法,它使抽提纯化的时间大大缩短,只需10分钟,即可从各种材料中提纯可用于下游各种实验的高纯度RNA,如:cDNA的转录、Northern blot、RNAi等。
综上,本发明具有以下优点:
1、摒弃以往商用“Trizol”法、氯化铯密度梯度离心法和酸性酚法所用的酚抽提步骤,采用温和变性剂裂解法,辅助氧化铝剪切,不使用任何对环境造成污染的药品。
2、不离心沉淀收集收集样品,直接裂解,一步过滤,一步结合,两步特异清洗纯化。
3、采用特殊的全新溶液配方前处理二氧化硅纤维膜,使蛋白、DNA等杂质更易清除,而且RNA更易结合。
4、大大缩短抽分离提纯时间,10分钟即可完成。
5、此法为RNA抽提的自动化和大规模化奠定了技术基础。
具体实施方式
实施例使用本发明的试剂盒快速抽提纯化烟草叶的总RNA
一、配制溶液
配制以下溶液:
1)样品裂解液,
针对含多糖的材料的裂解液:
5M GuCl
50mM Mes-NaOH,pH 6.3
20mM柠檬酸钠
0.5%TritonX-100
1%N-月桂酰肌氨酸
10ul/mlβ-巯基乙醇
针对其它材料的裂解液:
4.25M GuSCN
50mM MES-NaOH,pH 6.3
20mM柠檬酸钠
0.5%TritonX-100
0.5%N-月桂酰肌氨酸
10ul/mlβ-巯基乙醇;
2)RNA结合柱前处理溶液:
4M LiCl
0.01M HCl
0.1%TritonX-100;
3)RNA结合溶液,其配方为;
a)500mM MES pH5.0
b)100%乙醇,且a∶b=1∶96;
4)RNA洗液I:
100mM MES-NaOH,pH5~6,
4M GuSCN
0.7%TritonX-100
20%乙醇;
5)RNA洗液II,
对于植物材料的洗液II:
78%乙醇
1%丙酮
0.01%DEPC,
对于其它材料的洗液II为:
78%乙醇和0.01%DEPC;
6)Rnase-free H2O;
二、提取烟草的总RNA
1、裂解样品
取样品(约为50mg)放入液氮轮动磨碎,加入裂解液450μl,剧烈震荡,温育60℃,静置2分钟。
2、同时前处理DNA结合柱:将200μL DNA前处理溶液加入柱中,11000rpm离心10秒,弃除溶液。
3、过滤
将裂解样品用RNA过滤柱过滤(剪切基因组DNA),滤液中加入0.5倍体积的结合溶液,混匀。
4、特异结合RNA
将以上得到的所有样品上样到RNA结合柱上,11,000rpm(8200×g)离心20秒,弃除溶液。
5、清洗提纯RNA
加500μl洗液I于RNA结合柱,11,000rpm(8200×g)离心20秒,弃除溶液。再加750μl洗液II,11,000rpm(8200×g)离心10秒,弃除溶液,再离心1分钟。
6、洗脱高纯度RNA
将已结合RNA的干燥柱,加入RNAse-free的H2O,静置1分钟,11,000rpm(8200×g)离心1分钟,收集溶液,得高纯度RNA约为50μL(0.4μg/μL)。
实施例二提取酵母细胞的总RNA
以与实施例一相同的方法,提取酵母细胞的总RNA。
实施例三使用本发明的试剂盒快速抽提纯化烟草叶的总RNA
一、配制溶液
配制以下溶液:
1)样品裂解液,
针对含多糖的材料的裂解液:
4.0M GuCl
20mM Mes-NaOH,pH 6.3
10mM柠檬酸钠
0.1%TritonX-100
0.5%N-月桂酰肌氨酸
5ul/mlβ-巯基乙醇
针对其它材料的裂解液:
3.5M GuSCN
20mM MES-NaOH,pH 5.2
10mM柠檬酸钠
0.1%TritonX-100
0.5%N-月桂酰肌氨酸
5ul/mlβ-巯基乙醇;
2)RNA结合柱前处理溶液:
3.5M LiCl
0.005M HCl
0.05%TritonX-100;
3)RNA结合溶液,其配方为;
a)200mM MES pH5.0
b)90%乙醇,且a∶b=1∶96;
4)RNA洗液I:
50mM MES-NaOH,pH5~6,
3.5M GuSCN
0.1%TritonX-100
15%乙醇;
5)RNA洗液II,
对于植物材料的洗液II:
70%乙醇
0.5%丙酮
0.005%DEPC,
对于其它材料的洗液II为:
70%乙醇和0.005%DEPC;
6)Rnase-free H2O;
二、提取烟草的总RNA
1、裂解样品
取样品(约为50mg)放入液氮轮动磨碎,加入裂解液450μl,剧烈震荡,温育60℃,静置2分钟。
2、同时前处理DNA结合柱:将200μL DNA前处理溶液加入柱中,11000rpm离心10秒,弃除溶液。
3、过滤
将裂解样品用RNA过滤柱过滤(剪切基因组DNA),滤液中加入0.5倍体积的结合溶液,混匀。
4、特异结合RNA
将以上得到的所有样品上样到RNA结合柱上,11,000rpm(8200×g)离心20秒,弃除溶液。
5、清洗提纯RNA
加500μl洗液I于RNA结合柱,11,000rpm(8200×g)离心20秒,弃除溶液。再加750μl洗液II,11,000rpm(8200×g)离心10秒,弃除溶液,再离心1分钟。
6、洗脱高纯度RNA
将已结合RNA的干燥柱,加入RNAse-free的H2O,静置1分钟,11,000rpm(8200×g)离心1分钟,收集溶液,得高纯度RNA约为50μL(0.4μg/μL)。
实施例四使用本发明的试剂盒快速抽提纯化烟草叶的总RNA
一、配制溶液
配制以下溶液:
1)样品裂解液,
针对含多糖的材料的裂解液:
6M GuCl
80mM Mes-NaOH,pH 6.3
50mM柠檬酸钠
0.6%TritonX-100
2%N-月桂酰肌氨酸
20ul/mlβ-巯基乙醇
针对其它材料的裂解液:
5.5M GuSCN
80mM MES-NaOH,pH 6.3
50mM柠檬酸钠
0.6%TritonX-100
2%N-月桂酰肌氨酸
20ul/mlβ-巯基乙醇;
2)RNA结合柱前处理溶液:
4.5M LiCl
0.02M HCl
0.3%TritonX-100;
3)RNA结合溶液,其配方为;
a)500mM MES pH5.5
b)100%乙醇,且a∶b=1∶96;
4)RNA洗液I:
200mM MES-NaOH,pH5~6,
4.5M GuSCN
1%TritonX-100
30%乙醇;
5)RNA洗液II,
对于植物材料的洗液II:
85%乙醇
1.5%丙酮
0.05%DEPC,
对于其它材料的洗液II为:
85%乙醇和0.05%DEPC;
6)Rnase-free H2O;
二、提取烟草的总RNA
1、裂解样品
取样品(约为50mg)放入液氮轮动磨碎,加入裂解液450μl,剧烈震荡,温育60℃,静置2分钟。
2、同时前处理DNA结合柱:将200μL DNA前处理溶液加入柱中,11000rpm离心10秒,弃除溶液。
3、过滤
将裂解样品用RNA过滤柱过滤(剪切基因组DNA),滤液中加入0.5倍体积的结合溶液,混匀。
4、特异结合RNA
将以上得到的所有样品上样到RNA结合柱上,11,000rpm(8200×g)离心20秒,弃除溶液。
5、清洗提纯RNA
加500μl洗液I于RNA结合柱,11,000rpm(8200×g)离心20秒,弃除溶液。再加750μl洗液II,11,000rpm(8200×g)离心10秒,弃除溶液,再离心1分钟。
6、洗脱高纯度RNA
将已结合RNA的干燥柱,加入RNAse-free的H2O,静置1分钟,11,000rpm(8200×g)离心1分钟,收集溶液,得高纯度RNA约为50μL(0.4μg/μL)。
Claims (6)
1.一种快速RNA抽提纯化试剂盒,其特征在于,所述试剂盒包括以下组分:
1)样品裂解液,
所述裂解液针对含多糖的材料的配方为:
4.0-6M GuCl
20-80mM MES-NaOH,pH 5.2-6.5
10-50mM柠檬酸钠
0.1-0.6% TritonX-100
0.5-2%N-月桂酰肌氨酸
5-20ul/ml β-巯基乙醇
所述裂解液针对其它材料的配方为:
3.5-5.5M GuSCN
20-80mM MES-NaOH,pH5.2-6.3
10-50mM柠檬酸钠
0.1-0.6% TritonX-100
0.5-2%N-月桂酰肌氨酸
5-20ul/ml β-巯基乙醇;
2)RNA结合柱前处理溶液,其配方为:
3.5-4.5M LiCl
0.005-0.02M HCl
0.05-0.3% TritonX-100;
3)RNA结合溶液,其配方为;
a)200-500mM MES pH4.5-5.5
b)90-100%乙醇,且a∶b=1∶96;
4)RNA洗液I,其配方为:
50-200mM MES-NaOH,pH5~6,
3.5-4.5M GuSCN
0.1-1% TritonX-100
15-30%乙醇;
5)RNA洗液II,
对于植物材料所述洗液II的配方为:
70-85%乙醇
0.5-1.5%丙酮
0.005-0.05%DEPC,
对于其它材料所述洗液II的配方为:
70-85%乙醇和0.005-0.05%DEPC;
6)Rnase-free H2O;
7)RNA过滤柱;以及
8)RNA结合柱,所述RNA结合柱的材料为二氧化硅纤维膜。
2.根据权利要求1所述的试剂盒,其特征在于,所述RNA过滤柱的过滤介质为0.5-2微米孔径的氧化铝滤片。
3.根据权利要求1所述的试剂盒,其特征在于,所述RNA结合柱由孔径为0.3-0.8微米的酸化玻璃纤维材料制成。
4.一种快速抽提纯化RNA的方法,其特征在于,所述方法包括以下步骤:
1)裂解样品,将样品研磨,并加入样品裂解液进行裂解,
所述裂解液针对含多糖的材料的配方为:
4.0-6M GuCl
20-80mM MES-NaOH,pH 5.2-6.5
10-50mM柠檬酸钠
0.1-0.6%TritonX-100
0.5-2%N-月桂酰肌氨酸
5-20ul/ml β-巯基乙醇
所述裂解液针对其它材料的配方为:
3.5-5.5M GuSCN
20-80mM MES-NaOH,pH5.2-6.3
10-50mM柠檬酸钠
0.1-0.6%TritonX-100
0.5-2%N-月桂酰肌氨酸
5-20ul/ml β-巯基乙醇
2)前处理,将200μL RNA结合柱前处理液注入RNA结合柱中,然后离心去除溶液,
所述RNA结合柱前处理溶液的配方为:
35-4.5M LiCl
0.005-0.02M HCl
0.05-0.3%TritonX-100;
3)过滤,将裂解样品用过滤柱过滤,在滤液中加入0.5倍体积的RNA结合溶液并混匀,
所述RNA结合液的配方为:
a)200-500mM MES pH4.5-5.5
b)90-100%乙醇,且a∶b=1-5∶95-99;
4)结合RNA,将步骤3)获得的溶液加入到RNA结合柱上,并离心去除溶液;
5)清洗提纯RNA,加500μLRNA洗液I于RNA结合柱中,并离心去除溶液,然后再加750μLRNA洗液II于RNA结合柱中,并离心去除溶液,
所述RNA洗液I的配方为:
50-200mM MES-NaOH,pH5~6,
3.5-4.5M GuSCN
0.1-1%TritonX-100
15-30%乙醇,
对于植物材料所述洗液II的配方为:
70-85%乙醇
0.5-1.5%丙酮
0.005-0.05%DEPC,
对于其它材料所述洗液II的配方为:
70-85%乙醇和0.005-0.05%DEPC;
6)洗脱RNA,向经步骤5)处理的RNA结合柱中加入Rnase-free的H2O,静止,并离心收集溶液,得到高纯度的RNA,
其中,所述RNA结合柱的材料为二氧化硅纤维膜。
5.根据权利要求4所述的方法,其特征在于,所述RNA过滤柱的过滤介质为0.5-2微米孔径的氧化铝滤片。
6.根据权利要求4所述的方法,其特征在于,所述RNA结合柱由孔径为0.3-0.8微米的酸化玻璃纤维材料制成。
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WO2007035750A1 (en) * | 2005-09-20 | 2007-03-29 | Agencourt Bioscience Corporation | Method for isolating nucleic acids |
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