CN101495630A - 与人癌细胞的永生化相关的基因及其应用 - Google Patents

与人癌细胞的永生化相关的基因及其应用 Download PDF

Info

Publication number
CN101495630A
CN101495630A CNA2007800208629A CN200780020862A CN101495630A CN 101495630 A CN101495630 A CN 101495630A CN A2007800208629 A CNA2007800208629 A CN A2007800208629A CN 200780020862 A CN200780020862 A CN 200780020862A CN 101495630 A CN101495630 A CN 101495630A
Authority
CN
China
Prior art keywords
immortalization
gene
leu
ala
glu
Prior art date
Legal status (The legal status is an assumption and is not a legal conclusion. Google has not performed a legal analysis and makes no representation as to the accuracy of the status listed.)
Granted
Application number
CNA2007800208629A
Other languages
English (en)
Other versions
CN101495630B (zh
Inventor
西山正彦
桧山桂子
谷本圭司
增子寻郎
Current Assignee (The listed assignees may be inaccurate. Google has not performed a legal analysis and makes no representation or warranty as to the accuracy of the list.)
Yakult Honsha Co Ltd
Original Assignee
Yakult Honsha Co Ltd
Priority date (The priority date is an assumption and is not a legal conclusion. Google has not performed a legal analysis and makes no representation as to the accuracy of the date listed.)
Filing date
Publication date
Application filed by Yakult Honsha Co Ltd filed Critical Yakult Honsha Co Ltd
Publication of CN101495630A publication Critical patent/CN101495630A/zh
Application granted granted Critical
Publication of CN101495630B publication Critical patent/CN101495630B/zh
Expired - Fee Related legal-status Critical Current
Anticipated expiration legal-status Critical

Links

Images

Classifications

    • AHUMAN NECESSITIES
    • A61MEDICAL OR VETERINARY SCIENCE; HYGIENE
    • A61PSPECIFIC THERAPEUTIC ACTIVITY OF CHEMICAL COMPOUNDS OR MEDICINAL PREPARATIONS
    • A61P35/00Antineoplastic agents
    • AHUMAN NECESSITIES
    • A61MEDICAL OR VETERINARY SCIENCE; HYGIENE
    • A61PSPECIFIC THERAPEUTIC ACTIVITY OF CHEMICAL COMPOUNDS OR MEDICINAL PREPARATIONS
    • A61P43/00Drugs for specific purposes, not provided for in groups A61P1/00-A61P41/00
    • CCHEMISTRY; METALLURGY
    • C07ORGANIC CHEMISTRY
    • C07KPEPTIDES
    • C07K14/00Peptides having more than 20 amino acids; Gastrins; Somatostatins; Melanotropins; Derivatives thereof
    • C07K14/435Peptides having more than 20 amino acids; Gastrins; Somatostatins; Melanotropins; Derivatives thereof from animals; from humans
    • C07K14/46Peptides having more than 20 amino acids; Gastrins; Somatostatins; Melanotropins; Derivatives thereof from animals; from humans from vertebrates
    • C07K14/47Peptides having more than 20 amino acids; Gastrins; Somatostatins; Melanotropins; Derivatives thereof from animals; from humans from vertebrates from mammals
    • C07K14/4701Peptides having more than 20 amino acids; Gastrins; Somatostatins; Melanotropins; Derivatives thereof from animals; from humans from vertebrates from mammals not used
    • C07K14/4702Regulators; Modulating activity
    • C07K14/4703Inhibitors; Suppressors
    • CCHEMISTRY; METALLURGY
    • C07ORGANIC CHEMISTRY
    • C07KPEPTIDES
    • C07K16/00Immunoglobulins [IGs], e.g. monoclonal or polyclonal antibodies
    • C07K16/18Immunoglobulins [IGs], e.g. monoclonal or polyclonal antibodies against material from animals or humans
    • CCHEMISTRY; METALLURGY
    • C12BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
    • C12QMEASURING OR TESTING PROCESSES INVOLVING ENZYMES, NUCLEIC ACIDS OR MICROORGANISMS; COMPOSITIONS OR TEST PAPERS THEREFOR; PROCESSES OF PREPARING SUCH COMPOSITIONS; CONDITION-RESPONSIVE CONTROL IN MICROBIOLOGICAL OR ENZYMOLOGICAL PROCESSES
    • C12Q1/00Measuring or testing processes involving enzymes, nucleic acids or microorganisms; Compositions therefor; Processes of preparing such compositions
    • C12Q1/68Measuring or testing processes involving enzymes, nucleic acids or microorganisms; Compositions therefor; Processes of preparing such compositions involving nucleic acids
    • C12Q1/6876Nucleic acid products used in the analysis of nucleic acids, e.g. primers or probes
    • C12Q1/6883Nucleic acid products used in the analysis of nucleic acids, e.g. primers or probes for diseases caused by alterations of genetic material
    • C12Q1/6886Nucleic acid products used in the analysis of nucleic acids, e.g. primers or probes for diseases caused by alterations of genetic material for cancer
    • GPHYSICS
    • G01MEASURING; TESTING
    • G01NINVESTIGATING OR ANALYSING MATERIALS BY DETERMINING THEIR CHEMICAL OR PHYSICAL PROPERTIES
    • G01N33/00Investigating or analysing materials by specific methods not covered by groups G01N1/00 - G01N31/00
    • G01N33/48Biological material, e.g. blood, urine; Haemocytometers
    • G01N33/50Chemical analysis of biological material, e.g. blood, urine; Testing involving biospecific ligand binding methods; Immunological testing
    • G01N33/5005Chemical analysis of biological material, e.g. blood, urine; Testing involving biospecific ligand binding methods; Immunological testing involving human or animal cells
    • G01N33/5008Chemical analysis of biological material, e.g. blood, urine; Testing involving biospecific ligand binding methods; Immunological testing involving human or animal cells for testing or evaluating the effect of chemical or biological compounds, e.g. drugs, cosmetics
    • G01N33/5011Chemical analysis of biological material, e.g. blood, urine; Testing involving biospecific ligand binding methods; Immunological testing involving human or animal cells for testing or evaluating the effect of chemical or biological compounds, e.g. drugs, cosmetics for testing antineoplastic activity
    • GPHYSICS
    • G01MEASURING; TESTING
    • G01NINVESTIGATING OR ANALYSING MATERIALS BY DETERMINING THEIR CHEMICAL OR PHYSICAL PROPERTIES
    • G01N33/00Investigating or analysing materials by specific methods not covered by groups G01N1/00 - G01N31/00
    • G01N33/48Biological material, e.g. blood, urine; Haemocytometers
    • G01N33/50Chemical analysis of biological material, e.g. blood, urine; Testing involving biospecific ligand binding methods; Immunological testing
    • G01N33/53Immunoassay; Biospecific binding assay; Materials therefor
    • G01N33/574Immunoassay; Biospecific binding assay; Materials therefor for cancer
    • G01N33/57484Immunoassay; Biospecific binding assay; Materials therefor for cancer involving compounds serving as markers for tumor, cancer, neoplasia, e.g. cellular determinants, receptors, heat shock/stress proteins, A-protein, oligosaccharides, metabolites
    • CCHEMISTRY; METALLURGY
    • C12BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
    • C12QMEASURING OR TESTING PROCESSES INVOLVING ENZYMES, NUCLEIC ACIDS OR MICROORGANISMS; COMPOSITIONS OR TEST PAPERS THEREFOR; PROCESSES OF PREPARING SUCH COMPOSITIONS; CONDITION-RESPONSIVE CONTROL IN MICROBIOLOGICAL OR ENZYMOLOGICAL PROCESSES
    • C12Q2600/00Oligonucleotides characterized by their use
    • C12Q2600/136Screening for pharmacological compounds
    • CCHEMISTRY; METALLURGY
    • C12BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
    • C12QMEASURING OR TESTING PROCESSES INVOLVING ENZYMES, NUCLEIC ACIDS OR MICROORGANISMS; COMPOSITIONS OR TEST PAPERS THEREFOR; PROCESSES OF PREPARING SUCH COMPOSITIONS; CONDITION-RESPONSIVE CONTROL IN MICROBIOLOGICAL OR ENZYMOLOGICAL PROCESSES
    • C12Q2600/00Oligonucleotides characterized by their use
    • C12Q2600/158Expression markers
    • GPHYSICS
    • G01MEASURING; TESTING
    • G01NINVESTIGATING OR ANALYSING MATERIALS BY DETERMINING THEIR CHEMICAL OR PHYSICAL PROPERTIES
    • G01N2500/00Screening for compounds of potential therapeutic value
    • G01N2500/04Screening involving studying the effect of compounds C directly on molecule A (e.g. C are potential ligands for a receptor A, or potential substrates for an enzyme A)

Landscapes

  • Health & Medical Sciences (AREA)
  • Life Sciences & Earth Sciences (AREA)
  • Chemical & Material Sciences (AREA)
  • Engineering & Computer Science (AREA)
  • Immunology (AREA)
  • Molecular Biology (AREA)
  • Organic Chemistry (AREA)
  • Biomedical Technology (AREA)
  • General Health & Medical Sciences (AREA)
  • Biochemistry (AREA)
  • Proteomics, Peptides & Aminoacids (AREA)
  • Analytical Chemistry (AREA)
  • Medicinal Chemistry (AREA)
  • Pathology (AREA)
  • Urology & Nephrology (AREA)
  • Hematology (AREA)
  • Genetics & Genomics (AREA)
  • Zoology (AREA)
  • Physics & Mathematics (AREA)
  • Microbiology (AREA)
  • Cell Biology (AREA)
  • Biotechnology (AREA)
  • Biophysics (AREA)
  • Bioinformatics & Cheminformatics (AREA)
  • Hospice & Palliative Care (AREA)
  • Toxicology (AREA)
  • Wood Science & Technology (AREA)
  • Oncology (AREA)
  • Food Science & Technology (AREA)
  • General Physics & Mathematics (AREA)
  • Gastroenterology & Hepatology (AREA)
  • General Engineering & Computer Science (AREA)
  • Tropical Medicine & Parasitology (AREA)
  • General Chemical & Material Sciences (AREA)
  • Nuclear Medicine, Radiotherapy & Molecular Imaging (AREA)
  • Pharmacology & Pharmacy (AREA)
  • Chemical Kinetics & Catalysis (AREA)
  • Animal Behavior & Ethology (AREA)
  • Public Health (AREA)
  • Veterinary Medicine (AREA)

Abstract

本发明提供与癌细胞永生化相关的基因(永生化规定基因)以及对将具有该基因的永生化癌细胞作为靶标的选择性癌治疗有用的方法。使用与序列编号1~13中的任一个所示的碱基序列内的至少15个碱基长的连续碱基序列特异性杂交、且具有15个碱基长以上的碱基序列的多核苷酸,判断永生化癌细胞。该多核苷酸在该判断方法中,作为用于检测在永生化癌细胞中特异性地高度表达的永生化规定基因的引物、探针来使用。

Description

与人癌细胞的永生化相关的基因及其应用
技术领域
本发明涉及与癌细胞的永生化相关的基因(永生化规定基因)以及对以具有该基因的永生化癌细胞为靶标的选择性癌治疗有用的方法。更具体而言,本发明涉及以永生化规定基因为指标的永生化癌细胞的判断方法、以及该判断中使用的试剂。本发明还涉及筛选以永生化癌细胞为靶标的选择性抗癌剂(永生化癌细胞增殖抑制剂)的有效成分的方法、以及该抗癌剂(永生化癌细胞增殖抑制剂)。
背景技术
人实体癌除非进行根治手术,否则就会预后不良,其主要原因是因为目前的化学疗法效果并不充分。以往的化学疗法药物以核酸合成过程、DNA、微管为作用点,以抑制从核酸至蛋白质生成过程为基本,因此不仅对癌细胞进行抑制,也无法避免对进行细胞增殖的再生性组织正常细胞的抑制。最近,逐渐鉴定出在癌细胞中特异性表达的分子,以其为靶标的抑制剂能够使对正常细胞的有害反应止于最小限度,其结果是给药量也能够增大。对这样的分子靶标治疗药也进行了开发,但其最大的缺点是,并非对大多病例有效,而是因各个病例的不同而效果不同,给药前所进行的预测是不完全的。作为分子靶标治疗药的效果因各个病例而大不相同的原因,可以举出被作为治疗靶标的分子是与癌症发生过程、转移相关的基因。癌症发生过程不仅因癌类型的不同而不同,即使在同类型癌中也是多种多样的,因此可以认为,作为靶标的分子与癌增殖相关的程度因各个病例而不同。因此,如果能鉴定出无论癌类型而普遍地发挥核心作用的分子,就可以开发出能够期待对多种癌症具有普遍效果的分子靶标治疗药。
包括人在内的所有脊椎动物的染色体的两末端连续有称为“TTAGGG”的简单重复序列(人中约为10kb,小鼠约为数倍),在每次伴随细胞分裂的DNA复制时不能完全复制末端而每次少量(人中约为200碱基)缩短。该末端结构为“端粒”,当端粒随着细胞分裂而缩短至一定(人非癌细胞中约为5kb)以下时,细胞就已经变得无法分裂。如果癌化则能够继续分裂,但如果端粒缩短到极限(约2kb),则细胞消亡。通过将该缩短的端粒延长而稳定保持端粒长度能够延长细胞分裂寿命的是逆转录酶“端粒酶”(参照非专利文献1),该端粒酶不在通常的正常体细胞中表达,因此能够分裂的次数仅限于数十次,而在能够无限增殖的生殖细胞和永生化癌细胞中高度表达。以往普遍认为癌细胞均永生化,但由如下的情况,即,存在即使是临床上明显的癌也未必检测出端粒酶活性的例子(参照非专利文献2和3等);即便使端粒酶成分TERT在非癌细胞中强制表达,也不显现癌细胞的性状(参照非专利文献4)等情况,目前认为癌化与永生化是不同的现象。
非专利文献1:Harley CB,Mutation Res,256:271-82,1991
非专利文献2:Kim NW等,Science 266:2011-5,1994
非专利文献3:Hiyama K等,J Natl Cancer Inst 87:895-902,1995
非专利文献4:Morales CP等,Nat Genet 21:115-8,1999
非专利文献5:Shay JW,Bacchetti S,Eur J Cancer 33:787-91,1997
非专利文献6:Hiyama K等,J Immunol 155:3711-5,1995
非专利文献7:Hiyama E等,Int J Oncol 9:453-8,1996
非专利文献8:Forsyth NR等,Aging Cell 2:235-43,2003
非专利文献9:BodnarAG等,Exp Cell Res 228:58-64,1996
非专利文献10:Hiyama K等,Int J Oncol 27:87-95,2005
发明内容
本发明涉及永生化癌细胞的判断方法、以及该判断中使用的试剂。本发明还涉及筛选具有特异性抑制永生化癌细胞的增殖的作用、且作为选择性抗癌剂而有用的永生化癌细胞增殖抑制剂的有效成分的方法以及该永生化癌细胞增殖抑制剂。
本发明人等致力于能够期待对癌治疗、尤其是普遍对多种癌病例具有效果的分子靶标治疗药的开发,着眼于与癌细胞的癌化(恶性化)性状不同的另一性状“永生化”。即,即使体内出现癌细胞,只要抑制无限增殖,则不仅不会增大、转移直至使宿主死亡,而且还可以期待通过采用通常的化学疗法、非根治性手术来减少一定程度残留的癌细胞数,从而使在其再次增大之前分裂寿命耗尽而自然消亡。由如下的情况等,即,在迄今为止检测的数千样本中临床癌样本的80%以上表达端粒酶(参照非专利文献5);在迄今为止检测的所有癌类型中均确认了端粒酶的表达;来源于人癌的细胞株几乎全部都表达端粒酶(参照非专利文献2);一度表达了端粒酶的癌细胞不能自然转为阴性等情况,从而可以认为,与多种多样的癌症发生过程不同,该永生化过程是在多数癌细胞中极普遍地共有存在的过程。即,通过将规定永生化的分子作为靶标,能够期待无论癌类型而普遍对多数病例有效的癌的无限增殖抑制成为可能。在此意义上,也尝试了以端粒酶本身为靶标的抗癌战略。
然而,本发明人等由如下的情况等,即,已发现即使是正常体细胞,在再生性组织的前体细胞、淋巴细胞中也检测出了端粒酶活性(参照非专利文献6和7);而且即便使端粒酶成分TERT在非癌细胞中强制表达,也未必会永生化(参照非专利文献8);表达端粒酶的正常前体细胞、淋巴细胞也并非永生化,而仅是延长寿命(参照非专利文献6和9)等情况,从而表明,仅凭端粒酶的表达细胞并不能永生化。即,要使人细胞永生化,延长染色体末端端粒的酶即端粒酶的活化几乎是必须的,但却并不充分,除了端粒酶活化之外,还存在永生化所不可或缺的分子,可以设想该分子在癌细胞中特异性地发挥作用。事实上,本发明人等确认,在正常体细胞中导入TERT而使端粒酶强制表达从而永生化的克隆中,特异性地表达变化的基因与已报道的癌细胞中的表达变化完全不同(参照非专利文献10)。由这样的事实也可以说与正常细胞的永生化和癌细胞的永生化相关的基因是不同的。如果以端粒酶本身作为靶标,则淋巴细胞、血液前体细胞和消化道粘膜隐窝细胞等的分裂能力受到抑制,作为癌治疗的有害现象而致命的免疫功能、造血功能和消化道功能受损害的危险性高,但如果以仅在癌细胞中起作用的永生化规定因子作为靶标,则可以认为能够在不损害端粒酶活性阳性的正常干/前体细胞、淋巴细胞等的功能的情况下进行癌细胞特异性无限增殖的抑制。
在该见解的基础上,本发明人等为了发现与人癌细胞的永生化普遍相关的基因进行了悉心研究。其结果是想到,该基因与正常细胞中基于端粒酶活化而延续生命无关,而是对癌细胞的增殖维持起特异性作用,从而特定了该永生化规定基因13个基因(参照表1)。其概要如下。首先,将无论癌类型而普遍表达增强的基因通过基因芯片分析而提取出来,从得到的基因中,选择如下的13种基因,即,在由永生化的癌细胞构成的临床癌组织中,比由未永生化的癌细胞构成的癌组织的表达水平表达增强,并且在正常细胞中导入端粒酶而使其表达的细胞中表达未增强的基因。然后,在永生化癌细胞内通过siRNA来抑制得到的13种基因的表达,确认永生化癌细胞的增殖均得到了抑制。
本发明人等在上述见解的基础上进一步进行了反复研究,结果完成了本发明。即,本发明具有下述方式。
第1项.一种用于判断癌细胞的永生化的基因标记,由多核苷酸构成,该多核苷酸与序列编号1~13中任一个所示的碱基序列内的至少15个碱基长的连续碱基序列特异性杂交、且具有15个碱基长以上的碱基序列。
第2项.根据第1项所述的用于判断癌细胞的永生化的基因标记,是探针或引物。
第3项.一种永生化癌细胞的判断方法,包括下述工序(1)~(3):
(1)使RNA或该RNA的衍生物与第1或2项中任一项所述的基因标记结合的工序,其中,所述RNA由从被测者采集的能够含有癌细胞的机体试样制备;
(2)以上述基因标记为指标测定与上述基因标记结合的RNA或其衍生物的量;
(3)将上述工序(2)中得到的RNA或该RNA的衍生物的量(以下,将其总称为“RNA量”)与未永生化的正常或癌细胞中相应的RNA或该RNA衍生物的量(以下,将其总称为“对照RNA量”)进行比较的工序。
第4项.根据第3项所述的永生化癌细胞的判断方法,还包括下述工序(4):
(4)当工序(2)的RNA量比对照RNA量高时,判断为被测者的癌细胞永生化,当不高时,判断为被测者的癌细胞未永生化的工序。
第5项.一种抗体,识别由序列编号14~26中任一个所示的氨基酸序列构成的多肽。该抗体优选用于判断癌细胞的永生化。
第6项.一种永生化癌细胞的判断方法,包括下述工序(1’)~(3’):
(1’)使含有多肽的蛋白质含有级分与第5项所述的抗体结合的工序,其中,所述含有多肽的蛋白质含有级分由从被测者采集的能够含有癌细胞的机体试样制备;
(2’)以该抗体为指标测定与所述抗体结合的多肽的量的工序;
(3’)将上述工序(2’)中得到的多肽量与未永生化的正常或癌细胞中相应的多肽量(以下,称为“对照多肽量”)进行比较的工序。
第7项.根据第6项所述的永生化癌细胞的判断方法,还包括下述工序(4’):
(4’)当工序(2’)的多肽量比对照多肽量高时,判断为被测者的癌细胞永生化,当不高时,判断为被测者的癌细胞未永生化的工序。
第8项.一种永生化癌细胞判断用试剂盒,含有选自第1项所述的基因标记和第5项所述的抗体中的至少1种作为永生化细胞判断用试剂。
第9项.一种抑制永生化癌细胞增殖的物质的筛选方法,包括下述工序(A)~(D):
(A)使被测物质与能够表达由序列编号1~13中任一个所示的碱基序列构成的基因的细胞接触的工序;
(B)对于与被测物质接触的细胞,测定由序列编号1~13中任一个所示的碱基序列构成的基因的表达量的工序;
(C)将上述工序(B)中得到的基因的表达量与未与被测物质接触的对照细胞中相应的基因的表达量进行比较的工序;以及
(D)当上述工序(B)中得到的基因的表达量比对照表达量低时,选择该被测物质作为抑制永生化癌细胞增殖的物质的工序。
第10项.一种抑制永生化癌细胞增殖的物质的筛选方法,包括下述工序(A’)~(D’):
(A’)使被测物质与由序列编号14~26中任一个所示的氨基酸序列构成的多肽接触的工序;
(B’)测定与被测物质接触的由序列编号14~26中任一个所示的氨基酸序列构成的多肽的活性的工序;
(C’)将上述工序(B’)中得到的多肽的活性与未与被测物质接触的对照的活性进行比较的工序;
(D’)当上述工序(B’)中得到的多肽的活性比对照的活性低时,选择该被测物质作为抑制永生化癌细胞增殖的物质的工序。
第11项.一种永生化癌细胞增殖抑制剂,以多核苷酸作为有效成分,该多核苷酸与序列编号1~13中任一个所示的碱基序列的至少15个碱基长以上的连续碱基序列特异性杂交、且由15个碱基以上的碱基序列构成。
第12项.根据第11项所述的永生化癌细胞增殖抑制剂,所述多核苷酸是由序列编号27~39中任一个所示的碱基序列构成的多核苷酸。
第13项.一种抗癌疗法,具有将第11或12项所述的永生化癌细胞增殖抑制剂导入患者的癌细胞中的工序。
第14项.一种多核苷酸在制造永生化癌细胞增殖抑制剂中的应用,该多核苷酸与序列编号1~13中的任一个所示的碱基序列的至少15个碱基长以上的连续碱基序列特异性杂交、且具有15个碱基以上的碱基序列。
第15项.根据第14项所述的应用,所述多核苷酸是由序列编号27~39中任一个所示的碱基序列构成的多核苷酸。
根据本发明,弄清了在多数癌类型中,在永生化癌细胞中特异性地表达增强、且无论癌类型而普遍地控制癌细胞的永生化的基因。根据本发明的永生化癌细胞的判断方法以及在该判断方法中使用的试剂,能够识别该永生化规定基因的表达程度,并由该程度鉴别用通常的病理诊断无法判断的永生化细胞和有限寿命细胞。而且根据该鉴别,在癌的早期诊断、治疗选择、预后预测中的临床应用成为可能。
根据本发明的以永生化规定基因作为靶标的筛选方法,还能够得到能够特异性抑制永生化癌细胞增殖的抗癌剂的有效成分。
附图说明
图1是表示人细胞的癌化永生化的机制的概略图。
图2是表示在本发明中进行的靶标基因提取方法的概略图。
图3表示基于寡阵列的各种永生化癌细胞的UBE2S基因的表达水平。
图4表示基于寡阵列的各种永生化癌细胞的RFC4基因的表达水平。
图5表示基于寡阵列的各种永生化癌细胞的PTGES2基因的表达水平。
图6表示基于寡阵列的各种永生化癌细胞的MAF1基因的表达水平。
图7表示基于寡阵列的各种永生化癌细胞的ACVR2B基因的表达水平。
图8表示基于寡阵列的各种永生化癌细胞的FAM119A基因的表达水平。
图9表示基于寡阵列的各种永生化癌细胞的LTB4DH基因的表达水平。
图10表示基于寡阵列的各种永生化癌细胞的DPM2基因的表达水平。
图11表示基于寡阵列的各种永生化癌细胞的SEPX1基因的表达水平。
图12表示基于寡阵列的各种永生化癌细胞的PSMA3基因的表达水平。
图13表示基于寡阵列的各种永生化癌细胞的CHCHD3基因的表达水平。
图14表示基于寡阵列的各种永生化癌细胞的LSM3基因的表达水平。
图15表示基于寡阵列的各种永生化癌细胞的GTSE1基因的表达水平。
图16表示癌细胞株中基于siRNA的UBE2S基因的表达抑制及其增殖抑制效果(实施例2)。
图17表示癌细胞株中基于siRNA的RFC4基因的表达抑制及其增殖抑制效果(实施例2)。
图18表示癌细胞株中基于siRNA的PTGES2基因的表达抑制及其增殖抑制效果(实施例2)。
图19表示癌细胞株中基于siRNA的MAF1基因的表达抑制及其增殖抑制效果(实施例2)。
图20表示癌细胞株中基于siRNA的ACVR2B基因的表达抑制及其增殖抑制效果(实施例2)。
图21表示癌细胞株中基于siRNA的FAM119A基因的表达抑制及其增殖抑制效果(实施例2)。
图22表示癌细胞株中基于siRNA的LTB4DH基因的表达抑制及其增殖抑制效果(实施例2)。
图23表示癌细胞株中基于siRNA的DPM2基因的表达抑制及其增殖抑制效果(实施例2)。
图24表示癌细胞株中基于siRNA的SEPX1基因的表达抑制及其增殖抑制效果(实施例2)。
图25表示癌细胞株中基于siRNA的PSMA3基因的表达抑制及其增殖抑制效果(实施例2)。
图26表示癌细胞株中基于siRNA的CHCHD3基因的表达抑制及其增殖抑制效果(实施例2)。
图27表示癌细胞株中基于siRNA的LSM3基因的表达抑制及其增殖抑制效果(实施例2)。
图28表示癌细胞株中基于siRNA的GTSE1基因的表达抑制及其增殖抑制效果(实施例2)。
序列编号27表示与UBE2S基因相关的siRNA-1(44-64)的有义链的碱基序列。
序列编号28表示与UBE2S基因相关的siRNA-1(146-166)的有义链的碱基序列。
序列编号29表示与UBE2S基因相关的siRNA-2的有义链的碱基序列。
序列编号30表示与UBE2S基因相关的siRNA-3的有义链的碱基序列。
序列编号31表示与RFC4基因相关的siRNA-1(897-917)的有义链的碱基序列。
序列编号32表示与RFC4基因相关的siRNA-1(189-209)的有义链的碱基序列。
序列编号33表示与RFC4基因相关的siRNA-2的有义链的碱基序列。
序列编号34表示与RFC4基因相关的siRNA-3的有义链的碱基序列。
序列编号35表示与PTGES2基因相关的siRNA-1(2003-2023)的有义链的碱基序列。
序列编号36表示与PTGES2基因相关的siRNA-1(1105-1125)的有义链的碱基序列。
序列编号37表示与PTGES2基因相关的siRNA-2的有义链的碱基序列。
序列编号38表示与PTGES2基因相关的siRNA-3的有义链的碱基序列。
序列编号39表示与MAF1基因相关的siRNA-1(1538-1558)的有义链的碱基序列。
序列编号40表示与MAF1基因相关的siRNA-1(1031-1051)的有义链的碱基序列。
序列编号41表示与MAF1基因相关的siRNA-2的有义链的碱基序列。
序列编号42表示与MAF1基因相关的siRNA-3的有义链的碱基序列。
序列编号43表示与ACVR2B基因相关的siRNA-1(626-646)的有义链的碱基序列。
序列编号44表示与ACVR2B基因相关的siRNA-1(208-228)的有义链的碱基序列。
序列编号45表示与ACVR2B基因相关的siRNA-2的有义链的碱基序列。
序列编号46表示与ACVR2B基因相关的siRNA-3的有义链的碱基序列。
序列编号47表示与FAM119A基因相关的siRNA-1(754-774)的有义链的碱基序列。
序列编号48表示与FAM119A基因相关的siRNA-1(1068-1088)的有义链的碱基序列。
序列编号49表示与FAM119A基因相关的siRNA-2的有义链的碱基序列。
序列编号50表示与FAM119A基因相关的siRNA-3的有义链的碱基序列。
序列编号51表示与LTB4DH基因相关的siRNA-1(775-795)的有义链的碱基序列。
序列编号52表示与LTB4DH基因相关的siRNA-1(658-678)的有义链的碱基序列。
序列编号53表示与LTB4DH基因相关的siRNA-2的有义链的碱基序列。
序列编号54表示与LTB4DH基因相关的siRNA-3的有义链的碱基序列。
序列编号55表示与DPM2基因相关的siRNA-1(145-165)的有义链的碱基序列。
序列编号56表示与DPM2基因相关的siRNA-1(84-104)的有义链的碱基序列。
序列编号57表示与DPM2基因相关的siRNA-2的有义链的碱基序列。
序列编号58表示与DPM2基因相关的siRNA-3的有义链的碱基序列。
序列编号59表示与SEPX1基因相关的siRNA-1(870-890)的有义链的碱基序列。
序列编号60表示与SEPX1基因相关的siRNA-1(794-814)的有义链的碱基序列。
序列编号61表示与SEPX1基因相关的siRNA-2的有义链的碱基序列。
序列编号62表示与SEPX1基因相关的siRNA-3的有义链的碱基序列。
序列编号63表示与PSMA3基因相关的siRNA-1(853-873)的有义链的碱基序列。
序列编号64表示与PSMA3基因相关的siRNA-1(686-706)的有义链的碱基序列。
序列编号65表示与PSMA3基因相关的siRNA-2的有义链的碱基序列。
序列编号66表示与PSMA3基因相关的siRNA-3的有义链的碱基序列。
序列编号67表示与CHCHD3基因相关的siRNA-1(546-566)的有义链的碱基序列。
序列编号68表示与CHCHD3基因相关的siRNA-1(1450-1470)的有义链的碱基序列。
序列编号69表示与CHCHD3基因相关的siRNA-2的有义链的碱基序列。
序列编号70表示与CHCHD3基因相关的siRNA-3的有义链的碱基序列。
序列编号71表示与LSM3基因相关的siRNA-1(540-560)的有义链的碱基序列。
序列编号72表示与LSM3基因相关的siRNA-1(37-57)的有义链的碱基序列。
序列编号73表示与LSM3基因相关的siRNA-2的有义链的碱基序列。
序列编号74表示与LSM3基因相关的siRNA-3的有义链的碱基序列。
序列编号75表示与GTSE1基因相关的siRNA-2的有义链的碱基序列。
序列编号76表示与GTSE1基因相关的siRNA-3的有义链的碱基序列。
具体实施方式
(1)永生化规定基因
本发明中,所谓“未永生化癌细胞”,是指癌细胞中,(1)端粒酶活性为阴性、(2)端粒长度缩短、且(3)不能确认端粒酶蛋白的表达的有限寿命细胞。另一方面,本发明中,所谓“永生化癌细胞”,是指癌细胞中,不具有上述(1)~(3)中的至少一项特征的细胞,即,是指端粒酶活性为阳性、或者端粒长度延长、或者能够确认端粒酶蛋白的表达的细胞,是能够无限地进行细胞增殖的细胞。
本发明中,所谓“永生化规定基因”,是指规定癌细胞的永生化的基因。
作为本发明对象的癌细胞没有特别限制,作为其来源,可以列举例如肺癌、乳癌、食道癌、头颈部癌、胃癌、结肠癌、直肠癌、肝癌、胆囊、胆管癌、胰腺癌、膀胱癌、前列腺癌、子宫颈癌等。
作为永生化规定基因,具体来说,可以列举(1)UBE2S基因、(2)RFC4基因、(3)PTGES2基因、(4)MAF1基因、(5)ACVR2B基因、(6)FAM119A基因、(7)LTB4DH基因、(8)DPM2基因、(9)SEPX1基因、(10)PSMA3基因、(11)CHCHD3基因、(12)LSM3基因以及(13)GTSE1基因,这些基因的基因库登记号、正式的基因名、基因符号以及表示这些基因的碱基序列的序列编号示于下述表1。此外,表中的基因名、基因符号等根据NCBI中互联网公开(http://www.ncbi.nlm.nih.gov/)的数据来记载。
[表1]
  序列编号   基因库登记号   基因名   基因符号
  1   NM_014501   ubiquitin-conjugating enzyme E2S   UBE2S
  2   NM_002916   replication factor C(activator 1)4,37kDa   RFC4
  3   NM_025072   prostaglandin E synthase 2   PTGES2
  4   NM_032272   MAF1 homolog(S.cerevisiae)   MAF1
  5   NM_001106   activin A receptor,type IIB   ACVR2B
6 NM_145280   family with sequence similarity 119,memberA FAM119A
7   NM_012212(D49387,BQ214856) leukotriene B4 12-hydroxydehydrogenase LTB4DH
8 NM_003863   dolichyl-phosphate mannosyltransferasepolypeptide 2,regulatory subunit DPM2
  9   NM_016332   selenoprotein X,1   SEPX1
10 NM_002788   proteasome(prosome,macropain)subunit,alpha type,3 PSMA3
11 NM_017812   coiled-coil-helix-coiled-coil-helixdomain containing 3 CHCHD3
12 NM_014463   LSM3 homolog,U6 small nuclear RNAassociated(S.cerevisiae) LSM3
  13   NM_016426   G-2 and S-phase expressed 1   GTSE1
如实施例1所示,上述各种永生化规定基因均在来源于肺癌、食道癌和乳癌等多种癌类型的永生化癌细胞中特异性地高度表达。此外,如实施例2所示,在永生化细胞内通过siRNA来抑制这13种基因的表达,则永生化癌细胞的增殖均得到抑制。由这些结果可以认为,上述13种永生化规定基因均为规定癌细胞的永生化的基因(永生化规定基因)。
(II)用于判断癌细胞的永生化的试剂(基因标记)
如上所述,由于由序列编号1~13所示的碱基序列构成的各永生化规定基因((1)~(13))均在来源于多种癌类型的永生化癌细胞中特异性地高度表达,因此通过将其作为指标(标记基因),可以判断癌细胞永生化的有无。
本发明提供为了判断所述癌细胞的永生化而优选使用的工具(试剂),作为永生化规定基因标记(在本发明中,省略称为“基因标记”)。该基因标记以与上述序列编号1~13中任一个所示的永生化规定基因的碱基序列内的至少15个碱基长的连续碱基序列特异性杂交的方式,设计为具有至少15个碱基长的多核苷酸。此外,本发明的基因标记的方式可以根据目的进行适当设定,可以是单链DNA、单链RNA、双链DNA、双链RNA和DNA:RNA杂合体中的任一种。
该基因标记包括在判断永生化癌细胞时对检测癌细胞中的永生化规定基因的表达的有无、其程度(表达量)有用的探针、引物。此外,这些探针、引物在筛选抑制永生化癌细胞的增殖的物质时,作为检测永生化规定基因的表达变化的工具(检测试剂)也是有用的。
(II-1)探针
癌细胞的永生化的判断通过检测在永生化癌细胞中特异性地高度表达的上述永生化规定基因[(1)UBE2S基因、(2)RFC4基因、(3)PTGES2基因、(4)MAF1基因、(5)ACVR2B基因、(6)FAM119A基因、(7)LTB4DH基因、(8)DPM2基因、(9)SEPX1基因、(10)PSMA3基因、(11)CHCHD3基因、(12)LSM3基因或(13)GTSE1基因]中的至少任一个来进行。
为了检测出这些永生化规定基因,将与这些各基因的碱基序列特异性地杂交、而能够特异性地检测出该永生化规定基因的多核苷酸作为探针使用。此外,在本发明中,术语“多核苷酸”中还包括由多个碱基序列构成的寡核苷酸。
该多核苷酸以与各永生化规定基因的碱基序列内的至少15个碱基长~各永生化规定基因的总碱基长、优选20个碱基长~各永生化规定基因的总碱基长、更优选30个碱基长~各永生化规定基因的总碱基长的连续碱基序列特异性杂交的方式,设计为具有与上述对应的碱基长的多核苷酸。
本说明书通篇、及权利要求书中,所谓“特异性杂交”,是指在严谨杂交条件下,形成特异性的杂合体,不形成非特异性的杂合体。严谨杂交条件可以根据按照常法形成杂合体的核酸的熔解温度(Tm)等来确定。作为具体的能够维持杂交状态的洗净条件,可以列举通常为“1×SSC、0.1%SDS、37℃”程度的条件,更严格为“0.5×SSC、0.1%SDS、42℃”程度的条件,进一步严格为“0.1×SSC、0.1%SDS、65℃”程度的条件。
此外,多核苷酸(探针)优选具有与上述永生化规定基因的至少15个碱基长的连续碱基序列互补的碱基序列,但只要能够进行上述特异性杂交即可,不必完全互补。作为该多核苷酸,优选的是,与由永生化规定基因的碱基序列中连续的至少15个碱基以上的碱基序列构成的多核苷酸或其互补多核苷酸相比,在碱基序列中具有70%以上、优选80%以上、更优选90%以上、进一步优选95%以上、特别优选98%以上的同源性的多核苷酸。这里,碱基序列的同源性可以用同源性检索、序列比对程序、BLAST、FASTA、Clustal W等进行计算。
作为本发明采用为对象的探针,具体来说,可以列举与选自下述(1)~(13)中的至少1个多核苷酸(其中,该多核苷酸为RNA时,序列中的碱基“t”替换为“u”)进行杂交、且由15个碱基长~各永生化规定基因的总碱基长、优选20个碱基长~各永生化规定基因的总碱基长、更优选30个碱基长~各永生化规定基因的总碱基长的连续碱基序列构成的寡或多核苷酸。
(1)由UBE2S基因的碱基序列(序列编号1)中15个碱基长以上的连续碱基序列构成的多核苷酸、
(2)由RFC4基因的碱基序列(序列编号2)中15个碱基长以上的连续碱基序列构成的多核苷酸、
(3)由PTGES2基因的碱基序列(序列编号3)中15个碱基长以上的连续碱基序列构成的多核苷酸、
(4)由MAF1基因的碱基序列(序列编号4)中15个碱基长以上的连续碱基序列构成的多核苷酸、
(5)由ACVR2B基因的碱基序列(序列编号5)中15个碱基长以上的连续碱基序列构成的多核苷酸、
(6)由FAM119A基因的碱基序列(序列编号6)中15个碱基长以上的连续碱基序列构成的多核苷酸、
(7)由LTB4DH基因的碱基序列(序列编号7)中15个碱基长以上的连续碱基序列构成的多核苷酸、
(8)由DPM2基因的碱基序列(序列编号8)中15个碱基长以上的连续碱基序列构成的多核苷酸、
(9)由SEPX1基因的碱基序列(序列编号9)中15个碱基长以上的连续碱基序列构成的多核苷酸、
(10)由PSMA3基因的碱基序列(序列编号10)中15个碱基长以上的连续碱基序列构成的多核苷酸、
(11)由CHCHD3基因的碱基序列(序列编号11)中15个碱基长以上的连续碱基序列构成的多核苷酸、
(12)由LSM3基因的碱基序列(序列编号12)中15个碱基长以上的连续碱基序列构成的多核苷酸、
(13)由GTSE1基因的碱基序列(序列编号13)中15个碱基长以上的连续碱基序列构成的多核苷酸。
此外,这些多核苷酸(探针)可以基于各永生化规定基因的碱基序列,使用例如市售的核苷酸合成机,按照常法进行制备。还可以将永生化规定基因的碱基序列作为模板,用PCR法进行制备。
进而优选的是,为了能够容易地检测出各永生化规定基因,该探针可以用放射性物质、荧光物质、化学发光物质、或酶进行标记(详细内容后述)。
此外,这些探针还可以固定化于任意的固相来使用。因此,本发明采用为对象的探针中,还包括将上述多核苷酸固定化于任意的固相的探针(例如将探针固定化的基因芯片、cDNA微阵列、寡DNA阵列、滤膜等)。该探针可以优选作为永生化规定基因检测用、即永生化癌细胞检测用的DNA芯片来利用。
上述探针(多核苷酸)的固定化中使用的固相,只要能够将多核苷酸固定化就没有特别限制,可以列举例如玻璃板、尼龙膜、微珠、硅片、毛细管或其它基板等。多核苷酸向固相的固定可以是使预先合成的多核苷酸置于固相上的方法,还可以是在固相上合成目标多核苷酸的方法。固定方法,例如为DNA微阵列时,利用市售的点样仪(COSMOBIO公司制等)等,根据固定化探针的种类而在该技术领域为公知[例如,采用光刻技术(Affymetrix公司)、喷墨技术(Rosetta Inpharmatics公司)的多核苷酸的原位合成等]。
(II-2)引物
本发明作为基因标记提供作为用于特异性地扩增各永生化规定基因的碱基序列区域的引物而使用的多核苷酸。
作为该多核苷酸,可以列举如下的多核苷酸,即,与选自下述(1)~(13)中至少1个的多核苷酸(其中,该多核苷酸为RNA时,序列中的碱基“t”替换为“u”)的一部分特异性地杂交,用于特异性地扩增该多核苷酸或其一部分区域,且由15个碱基长、优选15~100个碱基长、更优选15~50个碱基长、进一步优选15~35个碱基长的连续碱基序列构成。
(1)由UBE2S基因的碱基序列(序列编号1)中15个碱基长以上的连续碱基序列构成的多核苷酸、
(2)由RFC4基因的碱基序列(序列编号2)中15个碱基长以上的连续碱基序列构成的多核苷酸、
(3)由PTGES2基因的碱基序列(序列编号3)中15个碱基长以上的连续碱基序列构成的多核苷酸、
(4)由MAF1基因的碱基序列(序列编号4)中15个碱基长以上的连续碱基序列构成的多核苷酸、
(5)由ACVR2B基因的碱基序列(序列编号5)中15个碱基长以上的连续碱基序列构成的多核苷酸、
(6)由FAM119A基因的碱基序列(序列编号6)中15个碱基长以上的连续碱基序列构成的多核苷酸、
(7)由LTB4DH基因的碱基序列(序列编号7)中15个碱基长以上的连续碱基序列构成的多核苷酸、
(8)由DPM2基因的碱基序列(序列编号8)中15个碱基长以上的连续碱基序列构成的多核苷酸、
(9)由SEPX1基因的碱基序列(序列编号9)中15个碱基长以上的连续碱基序列构成的多核苷酸、
(10)由PSMA3基因的碱基序列(序列编号10)中15个碱基长以上的连续碱基序列构成的多核苷酸、
(11)由CHCHD3基因的碱基序列(序列编号11)中15个碱基长以上的连续碱基序列构成的多核苷酸、
(12)由LSM3基因的碱基序列(序列编号12)中15个碱基长以上的连续碱基序列构成的多核苷酸、
(13)由GTSE1基因的碱基序列(序列编号13)中15个碱基长以上的连续碱基序列构成的多核苷酸。
这样的多核苷酸(引物)与探针同样,优选具有与上述各永生化规定基因的至少15个碱基长的连续碱基序列互补的碱基序列,但只要能够进行上述特异性杂交即可,不必完全互补。作为该多核苷酸,优选的是,与具有永生化规定基因的碱基序列中连续的至少15个碱基以上的碱基序列的多核苷酸或其互补多核苷酸相比,在碱基序列中具有70%以上、优选80%以上、更优选90%以上、进一步优选95%以上、特别优选98%以上的同源性的多核苷酸。
此外,这些多核苷酸与探针同样,可以基于上述各永生化规定基因的碱基序列,使用市售的核苷酸合成机,按照常法进行制备。
(II-3)标记物
上述本发明的基因标记(探针或引物)中,包括在上述多核苷酸中添加有用于检测永生化规定基因的适当的标记物,例如荧光色素、酶、蛋白质、放射性同位素、化学发光物质、生物素等的基因标记。
例如,作为在本发明中使用的荧光色素、放射性同位素或化学发光物质等标记物,可以优选使用一般标记核苷酸并在核酸的检测、定量中使用的标记物。例如,作为荧光色素,可以列举,HEX(4,7,2’,4’,5’,7’-hexachloro-6-carboxylfluorescein、绿色荧光色素)、荧光素(fluorescein)、NED(商品名、Applied Biosystems公司制、黄色荧光色素)、或者6-FAM(商品名、Applied Biosystems公司制、黄绿色荧光色素)、若丹明(rhodamin)或其衍生物〔例如、四甲基若丹明(TMR)〕,但不限于这些。用荧光色素标记核苷酸的方法可以使用公知的标记法中适当的方法[参照Nature Biotechnology,14,303-308(1996)]。此外,还可以使用市售的荧光标记试剂盒(例如,AmershamPharmacia公司制寡核苷酸ECL 3’-oligo labeling system等)。
以上的基因标记(未标记或标记的探针或引物)可以用作永生化规定基因检测用试剂,换言之即永生化癌细胞检测用试剂。
(II-4)永生化癌细胞检测用试剂盒
本发明还将上述永生化癌细胞检测用试剂[基因标记(未标记或标记的探针或引物)]作为试剂盒而提供。该试剂盒作为上述探针或引物使用。含有未标记或标记的多核苷酸(另外它们也可以固定化于固相)中的至少1个。本发明的试剂盒除了上述基因标记(探针或引物)之外,根据需要还可以适当含有杂交用试剂、探针的标记、标记体检测剂、缓冲液等、实施后述的本发明方法所必须的试剂、器具等。
(III)永生化癌细胞的判断方法
(III-1)通过使用上述本发明的基因标记(探针或引物),可以对从被测者采集的癌细胞测定永生化规定基因(标记基因)的表达量,进而,可以基于该表达量来判断该癌细胞为“永生化癌细胞”或“未永生化癌细胞”。用以往的病理诊断无法判定永生化癌细胞,但根据本发明的永生化癌细胞的判断方法,能够判断即使是进展前的早期的永生化癌细胞,由此能够尽早促成适于患者的癌治疗。
这时,上述本发明的引物用作用于特异性地识别并扩增由上述永生化规定基因的表达而生成的RNA或由其制备的多核苷酸(例如,cDNA)的引物,而本发明的探针用作用于特异性地检测该RNA或由其衍生的多核苷酸(例如cDNA或由RNA、cDNA扩增的DNA)的探针。
即,本发明的基因标记(探针或引物)可以用作用于通过称为RNA印迹法、RT-PCR法、原位杂交法等的特异性地检测特定基因的公知方法,来特异性地检测永生化规定基因的引物和探针。此外,癌细胞中永生化规定基因的表达量可以使用DNA芯片进行检测或定量。这时,本发明的探针可以作为该DNA芯片的探针来使用。
例如,采用RNA印迹法的永生化规定基因的表达量的测定可以通过使用本发明的探针、优选经放射性同位素、荧光物质或化学发光物质等标记物标记的探针来进行。具体来说,将由被测者的癌细胞制备的RNA转移至尼龙膜等中,使经标记的探针与其杂交。然后,将形成的探针与RNA的双链的量以来源于该探针的标记物的信号进行测定。信号的测定可以根据探针的标记物而采用常法,例如可以用放射性检测器、荧光检测器等测定来进行。此外,还可以利用市售的RNA印迹法用试剂盒,按照该试剂盒的方案进行。
此外,采用RT-PCR法的永生化规定基因的表达量的测定可以通过使用本发明的引物、优选经放射性同位素、荧光物质或化学发光物质等标记物标记的引物来进行。具体来说,将由被测者的癌细胞制备的RNA所制备的cDNA作为模板,使经标记的一对引物与其杂交,根据常法进行PCR。然后,将得到的扩增双链DNA的量以来源于该引物的标记的信号进行测定。信号的检测可以采用常法,例如用放射性检测器、荧光检测器等测定来进行。此外,还可以利用市售的RT-PCR用试剂盒,按照该试剂盒的方案进行。
采用DNA芯片分析的永生化规定基因的表达量的测定,可以通过使用本发明的探针,优选经放射性同位素、荧光物质等标记物标记的探针来进行。具体来说,首先,准备使经放射性同位素、荧光物质或化学发光物质等标记的探针固定在适当的载体上而成的DNA芯片。然后,使基于由被测者的癌细胞制备的RNA所制备的标记DNA或RNA与该DNA芯片杂交。然后,将形成的探针与标记DNA或RNA的双链的量以来源于该探针的标记物的信号进行测定。信号的检测可以采用常法,例如用放射性检测器、荧光检测器等测定而进行。此外,只要是固定有与本发明的探针相当的DNA的DNA芯片,也可以使用市售的DNA芯片。
这些永生化规定基因的表达量的测定基本上具有下述工序(1)和(2)。
(1)使由从被测者采集的能够含有癌细胞的机体试样制备的RNA或该RNA的衍生物与本发明的探针或引物结合的工序;
(2)以该探针或引物为指标测定与探针或引物结合的RNA或该RNA的衍生物的量的工序。
此外,在上述工序(1)中,机体试样是被测者本身的试样,只要是有可能含有癌细胞的试样就没有特别限制,可以例示体液(血液、尿等)、组织、其提取物和采集的组织的培养物等。此外,机体试样的采集方法可以根据机体试样的种类、癌类型相应的方法来适当进行选择。由机体试样制备RNA可以通过常法来进行。
此外,本说明书通篇、及权利要求书中,所谓“RNA衍生物”,是指以由机体试样制备的RNA为原料而制备的物质,包括由RNA转录制备的互补多核苷酸(cDNA)、以及由该RNA或cDNA通过PCR法而扩增的DNA。cDNA可以通过常法来制备,而上述DNA可以通过对上述各永生化规定基因使用本发明的引物进行PCR来制备。此外,工序(1)中使用的本发明的探针或引物优选经放射性同位素、荧光物质或化学发光物质等标记物进行标记。
上述工序(2)中得到的RNA或该RNA的衍生物的量反映被测者的永生化规定基因的表达量。因此,通过将上述工序(2)中得到的RNA或该RNA的衍生物的量(以下,也将这些总称而简单地称为“RNA量”)与未永生化的正常或癌细胞中相应的RNA或该RNA的衍生物的量(以下,也将这些总称而简单地称为“对照RNA量”)进行比较,能够判断被测者的癌细胞是否永生化。即,上述工序(2)中得到的被测者的RNA量(永生化规定基因的表达量)比对照RNA量(对照的永生化规定基因的表达量)高时,可以判断为被测者的癌细胞永生化,不高时可以判断为被测者的癌细胞未永生化。
因此,本发明的永生化癌细胞的判断方法除了上述工序(1)和(2)之外,还包括下述的工序(3),更优选包括工序(4)。
(3)将上述工序(2)中得到的RNA或该RNA的衍生物的量(RNA量)与未永生化的正常或癌细胞中相应的RNA或该RNA的衍生物的量(对照RNA量)进行比较的工序;
(4)工序(2)的RNA量比对照RNA量高时,判断为被测者的癌细胞永生化,RNA量不比对照RNA量高时,判断为被测者的癌细胞未永生化的工序。
此外,未永生化的正常或癌细胞中的永生化规定基因的RNA量(对照RNA量),可以在均一条件下预先测定多个未永生化的正常细胞或癌细胞中的永生化规定基因的RNA量,采用该RNA量的平均值或中间值。
(III-2)此外,癌细胞的永生化的判断可以基于本发明的永生化规定基因的表达产物、即由该基因所编码的多肽(以下,称为“永生化规定多肽”)的产量来进行。该永生化规定多肽的产量可以通过使用识别该多肽的抗体来进行测定。
这里,作为本发明采用为对象的永生化规定多肽,可以列举与上述的各种永生化规定基因[(1)~(13)]对应的下述多肽。
(14)UBE2S多肽:由序列编号1所示的碱基序列构成的UBE2S基因(1)所编码的多肽,具体为由序列编号14所示的氨基酸序列构成的多肽;
(15)RFC4多肽:由序列编号2所示的碱基序列构成的RFC4基因(2)所编码的多肽,具体为由序列编号15所示的氨基酸序列构成的多肽;
(16)PTGES2多肽:由序列编号3所示的碱基序列构成的PTGES2基因(3)所编码的多肽,具体为由序列编号16所示的氨基酸序列构成的多肽;
(17)MAF1多肽:由序列编号4所示的碱基序列构成的MAF1基因(4)所编码的多肽,具体为由序列编号17所示的氨基酸序列构成的多肽;
(18)ACVR2B多肽:由序列编号5所示的碱基序列构成的ACVR2B基因(5)所编码的多肽,具体为由序列编号18所示的氨基酸序列构成的多肽;
(19)FAM119A多肽:由序列编号6所示的碱基序列构成的FAM119A基因(6)所编码的多肽,具体为由序列编号19所示的氨基酸序列构成的多肽;
(20)LTB4DH多肽:由序列编号7所示的碱基序列构成的LTB4DH基因(7)所编码的多肽,具体为由序列编号20所示的氨基酸序列构成的多肽;
(21)DPM2多肽:由序列编号8所示的碱基序列构成的DPM2基因(8)所编码的多肽,具体为由序列编号21所示的氨基酸序列构成的多肽;
(22)SEPX1多肽:由序列编号9所示的碱基序列构成的SEPX1基因(9)所编码的多肽,具体为由序列编号22所示的氨基酸序列构成的多肽;
(23)PSMA3多肽:由序列编号10所示的碱基序列构成的PSMA3基因(10)所编码的多肽,具体为由序列编号23所示的氨基酸序列构成的多肽;
(24)CHCHD3多肽:由序列编号11所示的碱基序列构成的CHCHD3基因(11)所编码的多肽,具体为由序列编号24所示的氨基酸序列构成的多肽;
(25)LSM3多肽:由序列编号12所示的碱基序列构成的LSM3基因(12)所编码的多肽,具体为由序列编号25所示的氨基酸序列构成的多肽;
(26)GTSE1多肽:由序列编号13所示的碱基序列构成的GTSE1基因(13)所编码的多肽,具体为由序列编号26所示的氨基酸序列构成的多肽。
这里,(14)UBE2S多肽是公知的多肽,其获得方法也如J.Biol.Chem.267(22),15829-15835(1992)中所记载而公知。同样地,(15)RFC4多肽也如Proc.Natl.Acad.Sci.U.S.A.89(12),5211-5215(1992)中所记载而公知,以下,(16)PTGES2多肽如Biochem.Biophys.Res.Commun.291(4),884-889(2002);(18)ACVR2B多肽如Mol.Cell Biol.16(3),1066-1073(1996);(20)LTB4DH多肽如J.Biol.Chem.271(5),2844-2850(1996);(21)DPM2多肽如EMBOJ.19(11),2475-2482(2000);(22)SEPX1多肽如J.Biol.Chem.274(48),33888-33897(1999);(23)PSMA3多肽如Biochem.Biophys.Res.Commun.207(1),318-323(1995);(25)LSM3多肽如EMBOJ.18(12),3451-3462(1999);(26)GTSE1多肽如Gene 254(1-2),229-236(2000)中所记载,均为公知的多肽。
此外,这些永生化规定多肽[(14)~(26)]也可以如下进行制备,即,克隆对应的永生化规定基因[(1)~(13)],与细菌质粒进行连接后,向大肠杆菌等宿主细胞进行转化,培养得到的转化细胞,从培养物中进行回收。
本发明中使用的抗体只要是识别上述永生化规定多肽的抗体就没有特别限制,可以是单克隆抗体和多克隆抗体中的任一种。此外,抗体可以是以上述永生化规定多肽为免疫抗原而制备的抗体,还可以是对由构成该永生化规定多肽的氨基酸序列中的至少连续8个氨基酸、优选15个氨基酸、更优选20个氨基酸构成的多肽具有抗原结合性的抗体。该多肽可以根据本发明的永生化规定多肽的氨基酸序列、编码其的碱基序列,用通常公知的方法进行合成。例如,可以例举采用氨基酸合成机的化学合成方法、基因工程学的方法。
本发明的抗体可以通过常法制造(例如,Current protocols inMolecular Biology edit.Ausubel et al.(1987),Publish.John Wiley andSons.Section 11.12-11.13)。例如,为多克隆抗体时,可以如下得到,即,使用按照常法在大肠杆菌中表达而纯化的上述多肽,或者使用按照常法以具有这些的部分氨基酸序列的方式合成的多肽,对实验动物进行免疫,由该免疫动物的血清按照常法得到。另一方面,例如为单克隆抗体时,可以如下得到,即,使用按照常法在大肠杆菌等中表达而纯化的上述多肽,或者使用按照常法以具有这些的部分氨基酸序列的方式合成的多肽,对实验动物进行免疫,使由该实验动物得到的脾细胞和骨髓瘤细胞融合而合成杂交瘤细胞,从该细胞中得到。
此外,这些抗体还可以含有用于判断上述癌细胞的永生化的试剂和试剂盒的一成分。
永生化癌细胞的判断具体可以通过下述工序(1’)~(2’)进行。
(1’)将由从被测者采集的能够含有癌细胞的机体试样制备的含有多肽的蛋白质含有级分和识别本发明的永生化规定多肽的抗体混合的工序;
(2’)以该抗体为指标测定与上述抗体结合的多肽的量的工序。
此外,上述工序(2’)中得到的多肽的量反映永生化规定多肽的产生量。
在上述工序(2’)中,机体试样是被测者本身的试样,只要是有可能含有癌细胞的试样就没有特别限制,可以例示体液(血液、尿等)、组织、其提取物和采集的组织的培养物等。此外,机体试样的采集方法可以根据与机体试样的种类、癌类型相应的方法来适当进行选择。由机体试样制备蛋白质含有级分(含有多肽),可以将公知的分离、纯化方法适当组合来进行。在对该蛋白质含有级分进行的例如蛋白质印迹法、酶免疫法(EIA)、放射免疫法(RIA)、荧光免疫法等免疫学的检测方法时,通过使用上述抗体作为探针,能够检测出永生化规定多肽。
以使用蛋白质印迹法测定多肽量(永生化规定多肽的产生量)的情况为例,对工序(1’)及(2’)详细进行说明,首先,将该永生化规定多肽的抗体作为一次抗体,与由被测者的机体试样制备的蛋白质含有级分混合,与该蛋白质含有级分中含有的永生化规定多肽结合。然后,使经放射性同位素、荧光物质或化学发光物质等标记物标记的二次抗体与一次抗体结合。接着,将永生化规定多肽的量作为来源于二次抗体的标记的信号进行测定。信号的检测可以采用常法,例如用放射性检测器、荧光检测器等测定而进行。
通过将上述工序(2’)中得到的被测者中的多肽量(永生化规定多肽的产生量)与未永生化的正常或癌细胞中相应的多肽量(对照多肽量)(即,对照的永生化规定多肽的产生量(对照产生量))进行比较,并识别其程度,从而能够判断被测者的癌细胞是否永生化。即,上述工序(2’)中得到的被测者中的多肽量(永生化规定多肽的产生量)比对照多肽量(对照产生量)高时,判断为被测者的癌细胞永生化,不高时判断为被测者的癌细胞未永生化。
因此,本发明的永生化癌细胞的判断方法,除了上述工序(1’)和(2’)之外,还包括下述的工序(3),更优选包括工序(4)。
(3’)将上述工序(2’)中得到的多肽量与未永生化的正常或癌细胞中相应的多肽量(对照多肽量)进行比较的工序;
(4’)上述工序(2’)的多肽量比对照多肽量高时,判断为被测者的癌细胞永生化,不高时,判断为被测者的癌细胞未永生化的工序。
在此,作为未永生化的正常或癌细胞中的永生化规定多肽的产生量,可以在均一条件下预先测定多个未永生化的正常细胞或癌细胞中的永生化规定多肽的产生量,采用该产生量的平均值或中间值。
(IV)永生化癌细胞增殖抑制剂的筛选方法
(IV-1)如实施例所示,本发明的永生化规定基因((1)~(13))在永生化癌细胞中特异性地高度表达,而且,通过使用该各永生化规定基因的siRNA来抑制其表达,能够抑制永生化癌细胞的增殖。这一情况显示,具有抑制永生化规定基因((1)~(13))的表达的作用的物质,能够成为永生化癌细胞增殖抑制剂(抗癌剂)。即,通过将上述的永生化规定基因((1)~(13))的表达抑制作为指标,能够筛选具有抑制永生化癌细胞增殖的作用的物质。
因此,本发明提供以上述永生化规定基因((1)~(13))的表达抑制作为指标的永生化癌细胞增殖抑制剂的筛选方法。
该方法可以具有下述工序(A)~(D)。
(A)使被测物质与能够表达(1)~(13)中的任一个永生化规定基因的细胞接触的工序;
(B)测定与被测物质接触的细胞中该永生化规定基因的表达量的工序;
(C)将上述工序(B)中得到的永生化规定基因的表达量与未与被测物质接触的细胞中该永生化规定基因的表达量(对照表达量)进行比较的工序;
(D)当上述工序(B)中得到的基因的表达量比对照表达量低时,选择该被测物质作为抑制永生化癌细胞增殖的物质的工序。
本发明中使用的细胞只要能够表达上述(1)~(13)中的至少任一种永生化规定基因,就可以是来源于任意组织的细胞,作为其来源,可以列举例如肺、胃、结肠、直肠、肝、胆囊、胆管、胰腺、肾、膀胱、前列腺、子宫、骨髓、淋巴结、血液等。细胞的来源可以是哺乳类或鸟类中的任一种,更优选哺乳类,进一步优选人。此外,永生化规定基因的表达可以是内原性也可以是外源性。
作为被测物质没有特别限制,可以是核酸(包括多核苷酸)、肽(包括多肽)、有机化合物、无机化合物等中的任一种。筛选可以具体通过使被测物质或含有该被测物质的试样(被测试样)与能够表达上述永生化规定基因的细胞接触而进行。作为该被测试样,包括细胞提取液、基因文库的表达产物、植物或动物的天然物的提取物等。
此外,筛选时,使细胞与被测物质接触的条件只要是细胞不会死亡且在该细胞中永生化规定基因能够表达的条件就没有特别限制。
上述工序(B)和(C)中永生化规定基因的表达量,可以使用上述的本发明的探针或引物,通过RNA印迹法或RT-PCR法等方法,来测定永生化规定基因的mRNA或由其衍生的cDNA、双链DNA的量。此外,作为上述工序(B)和(C)中的永生化规定基因的表达量,可以采用作为永生化规定基因的表达产物的永生化规定多肽的量。永生化规定多肽的量可以使用上述的永生化规定多肽的抗体,通过进行蛋白质印迹法、酶免疫法(EIA)、放射免疫法(RIA)、荧光免疫法等免疫学的检测方法来测定。
在工序(C)中,通过将上述工序(B)中得到的永生化规定基因的表达量与未使被测物质与细胞接触时的永生化规定基因的表达量(对照表达量)进行比较,能够选择抑制永生化癌细胞增殖的物质。即,当上述工序(B)中得到的永生化规定基因的表达量比对照表达量低时,选择该被测物质作为抑制永生化癌细胞增殖的物质。
(IV-2)永生化癌细胞的增殖抑制剂的筛选还可以通过将作为本发明的永生化规定基因((1)~(13))的表达产物的永生化规定多肽((14)~(26))的活性抑制作为指标来进行。例如,已知(14)UBE2S多肽具有泛素化活性(E2)(J.Biol.Chem.267(22),15829-15835(1992))。同样地,分别已知,(16)PTGES2多肽具有将前列腺素H2转化为前列腺素E2的活性(Biochem.Biophys.Res.Commun.291(4),884-889(2002));(18)ACVR2B多肽为跨膜受体,其细胞内结构域中具有Ser/Thr激酶活性(Mol.Cell Biol.16(3),1066-1073(1996));(20)LTB4DH多肽具有将白三烯B4转化为12-氧-白三烯B4的活性(J.Biol.Chem.271(5),2844-2850(1996));(22)SEPX1多肽具有甲硫氨酸亚砜还原活性(Mol.Biol.Cell 15(3),1055-1064(2004))。因此,永生化癌细胞的增殖抑制剂的筛选,特别是可以通过以这些永生化规定多肽的活性抑制为指标来进行。
具体来说,通过下述工序(A’)~(D’),能够筛选抑制永生化癌细胞增殖的物质。
(A’)使被测物质与(14)~(26)中的任一种永生化规定多肽接触的工序;
(B’)测定与被测物质接触的永生化规定多肽的活性的工序;
(C’)将上述工序(B’)中得到的永生化规定多肽的活性与未与被测物质接触的水溶液、细胞或细胞级分中的细胞中的永生化规定多肽的活性(对照活性)进行比较的工序;
(D’)当上述工序(B’)中得到的永生化规定多肽的活性比对照活性低时,选择该被测物质作为抑制永生化癌细胞增殖的物质的工序。
该筛选以永生化规定多肽的活性作为指标,可以将含有(14)~(26)[优选(14)、(16)、(18)、(20)或(22)]中的任一种永生化规定多肽、或者能够含有其的物质作为对象来进行,具体来说,根据永生化规定多肽的功能(活性),可以列举含有(14)~(26)[优选(14)、(16)、(18)、(20)或(22)]中的任一种永生化规定多肽的水溶液;能够表达(1)~(13)[优选(1)、(3)、(5)、(7)或(9)]中的任一种永生化规定基因的细胞或者由该细胞制备的细胞级分中的任一形式。这里所谓水溶液,只要含有永生化规定多肽即可,没有限制,例如,除了通常的水溶液外,还包括细胞溶解液、核提取液、或培养上清液等。此外,作为细胞,可以列举无论是内原性和外源性等来源,只要处于能够表达永生化规定基因的状态的细胞。此外所谓细胞级分,是指来源于该细胞的各种级分,可以列举例如细胞膜级分、细胞质级分、细胞核级分等。
此外,筛选中使用的细胞和作为对象的被测物质可以使用与上述的筛选方法同样的细胞和被测物质。
工序(B’)中的UBE2S多肽(14)的泛素化活性的测定可以通过公知的方法进行,例如可以如J.Biol.Chem.267(22),15829-15835(1992)所述,通过在含有泛素、泛素活化酶(E1)和UBE2S多肽的体系中,进行UBE2S多肽的泛素化反应,测定与UBE2S多肽结合的泛素的量来进行。这里,泛素量的测定可以用公知的方法进行,例如,可以通过使用经放射性物质、酶等标记的泛素进行上述反应,测定该标记物的量来进行(J.Biol.Chem.267(22),15829-15835(1992)、J.Biol.Chem.279(51),52970-52977(2004))。此外,还可以通过用抗泛素抗体进行检测来测定(J.Biol.Chem.279(51),52970-52977(2004))。泛素和泛素活化酶(E1)可以通过公知的蛋白质合成法获得,还可以使用市售品。
工序(B’)中的PTGES2多肽(16)的前列腺素E2合成活性的测定可以用公知的方法进行,例如可以如Biochem.Biophys.Res.Commun.291(4),884-889(2002)所述,通过在含有PTGES2多肽和前列腺素H2的体系中进行基于PTGES2多肽的前列腺素E2转化反应,测定产生的前列腺素E2的量来进行。这里,前列腺素E2的量的测定可以用公知的方法进行,例如,可以通过使用经放射性物质、酶等标记的前列腺素H2进行上述反应,测定产生的前列腺素E2的标记物的量来进行(Proc.Natl.Acad.Sci.U.S.A.96(13),7220-7225(1999))。此外,还可以通过用抗前列腺素E2抗体进行检测来测定(J.Dairy.Sci.87(7),2197-2210(2004))。前列腺素H2可以通过公知的合成法获得,还可以使用市售品。
工序(B’)中的ACVR2B多肽(18)的Ser/Thr激酶活性的测定可以用公知的方法进行,例如可以如Mol.Cell Biol.16(3),1066-1073(1996)所述,通过在含有ACVR2B多肽的体系中,在基质和ATP的存在下进行激酶反应,测定基质的磷酸化量来进行。这里,基质的磷酸化量的测定可以用公知的方法进行,例如可以通过将γ32P-ATP或γ33P-ATP作为示踪物使用来测定放射活性,从而测定磷酸化量(Mol.CellBiol.16(3),1066-1073(1996))。此外,还可以通过使用经荧光物质、生物素等标记的基质进行磷酸化反应,测定磷酸化标记物的量来进行。作为基质,可以列举ACVR2B多肽、特异性基质或肽。
工序(B’)中的LTB4DH多肽(20)的白三烯B4转化活性的测定可以用公知的方法进行,例如可以如J.Biol.Chem.271(5),2844-2850(1996)所述,通过在含有LTB4DH多肽和白三烯B4的体系中进行基于LTB4DH多肽的白三烯B4转化反应,测定产生的12-氧-白三烯B4的量来进行。这里,12-氧-白三烯B4的量的测定可以用公知的方法进行,例如可以通过HPLC等公知的方法进行测定。白三烯B4可以通过公知的化学合成法获得,还可以使用市售品。
工序(B’)中的SEPX1多肽(22)的甲硫氨酸亚砜还原活性的测定可以用公知的方法进行,例如可以如Mol.Biol.Cell 15(3),1055-1064(2004)所述,通过在含有SEPX1多肽和甲硫氨酸亚砜的体系中进行基于SEPX1多肽的甲硫氨酸亚砜还原反应,测定产生的甲硫氨酸的量来进行。这里,甲硫氨酸的量的测定可以用公知的方法进行,例如可以通过HPLC等公知的方法进行测定。甲硫氨酸亚砜可以通过公知的化学合成法获得,还可以使用市售品。
在工序(C’)和(D’)中,通过将上述工序(B’)中得到的永生化规定多肽的活性与对照活性进行比较,能够选择抑制永生化癌细胞增殖的物质。即,当上述工序(B’)中得到的永生化规定多肽的活性比对照活性低时,选择该被测物质作为抑制永生化癌细胞增殖的物质。
如实施例中所说明,表2所示的反义多核苷酸(siRNA)(序列编号27~39),通过在癌细胞内与本发明的永生化规定基因进行杂交,抑制该永生化规定基因的表达,其结果是抑制永生化癌细胞的增殖。因此,这些反义多核苷酸(siRNA)可以作为永生化癌细胞增殖抑制剂使用。因此,本发明提供以该反义多核苷酸作为有效成分的永生化癌细胞增殖抑制剂。
该反义多核苷酸由15个碱基长以上的多核苷酸构成,该多核苷酸与由(1)~(13)的永生化规定基因中的任一碱基序列的至少15个碱基以上的连续碱基序列构成的多核苷酸特异性杂交。较理想的是,该多核苷酸具有与上述(1)~(13)的永生化规定基因中的至少15个碱基以上的连续碱基序列互补的碱基序列,但只要能够进行上述特异性杂交,且能够通过与该永生化规定基因杂交来抑制该永生化规定基因的表达即可,不必完全互补。例如,可以是如下的多核苷酸,即,与该永生化规定基因的互补序列相比,在碱基序列中具有70%以上、优选80%以上、更优选90%以上、进一步优选95%以上、特别优选98%以上的同源性,并且能够通过与该永生化规定基因的RNA杂交而抑制该永生化规定基因的表达。此外,本发明的反义多核苷酸的碱基长优选为15~1000个碱基长,更优选15~500个碱基长,特别优选16~30个碱基长。
本发明的反义多核苷酸优选为由序列编号27~39中的任一碱基序列构成的多核苷酸,更优选它们的双链RNA。
此外,为了提高稳定性和细胞透过性,本发明的反义多核苷酸可以进行公知的修饰。例如,为了防止因核酸酶等水解酶所致的分解,各核苷酸的磷酸残基可以取代为硫代磷酸酯、甲基磷酸酯、二硫代磷酸酯等化学修饰磷酸残基。
本发明的反义多核苷酸的形式可以是单链DNA、单链RNA、双链DNA、双链RNA和DNA:RNA杂合体中的任一种。
本发明的反义多核苷酸通常可以用公知的方法合成,例如,可以使用合成机来化学合成。
本发明的反义多核苷酸可以利用逆转录病毒载体、腺病毒载体、腺病毒伴随病毒载体等病毒载体、脂质体等非病毒载体等,通过回体(ex vivo)法、体内(in vivo)法等导入患者的癌细胞中,从而可以很好地用于抗癌疗法中。因此,本发明中包括抗癌疗法,其含有对癌患者给予以该反义多核苷酸为有效成分的永生化癌细胞增殖抑制剂的工序。
本发明的永生化癌细胞增殖抑制剂以上述反义多核苷酸为有效成分,在不损害其细胞增殖抑制作用的范围内可以含有稳定化剂、悬浮剂、冷冻剂、缓冲液、溶剂等。此外,本发明的永生化癌细胞增殖抑制剂对患者的给药量和给药计划可以根据对象患者、患者的年龄、体重等由本领域技术人员来适当设定。作为这样的给药计划,例如,可以举出以3周为1疗程,其中以2~3周连续静脉给药2~10mg/kg/day的上述反义多核苷酸的给药计划;以1周为1疗程,其中以5天连续静脉给药80~120mg/m2/day的上述反义多核苷酸的给药计划;以及以4周为1疗程,其中以3周连续静脉给药80~120mg/m2/day的上述反义多核苷酸的给药计划。
实施例
以下,示出实施例,对本发明进一步详细进行说明,但本发明的范围并不受这些实施例的限制。
实施例1永生化规定基因的鉴定
1.由人组织样品和人癌细胞株、人非肿瘤性培养细胞制备总RNA
使用RNeasyTM Mini kit(Qiagen公司制),按照附带的方案从9种肺癌细胞株、21种食道癌细胞株、9种消化器癌、其它各种癌(胃癌、大肠癌、头颈部癌、白血病)细胞株以及2种非肿瘤性食道上皮细胞、2种正常呼吸道上皮提取总RNA,在-80℃保存。
然后,同样地从11种乳癌细胞株、10种卵巢癌细胞株、10种胰腺癌细胞株、1种非肿瘤性永生化乳腺上皮、1种非肿瘤性乳腺上皮、来源于同一胰腺癌患者的胰腺癌组织和非癌部胰腺组织10组、来源于同一非小细胞性肺癌患者的原发灶和3处转移肺癌组织提取总RNA并保存。总RNA使用2100 Bioanalyzer(Agilent Technologies公司制)和RNALabChip(Agilent Technologies公司制)确认18S和28S rRNA的峰鲜明且为高品质后,供微阵列分析。
2. 微阵列分析
使用上述中制备的总RNA,进行采用微阵列的全基因表达分析。微阵列使用CodeLink UniSet Human 20K I Bioarray(19881探针),按照(1)由总RNA合成cDNA、(2)由cDNA合成标记化cRNA、(3)标记化cRNA的片断化、(4)片断化cRNA和微阵列的杂交、(5)微阵列的染色、(6)微阵列的扫描、(7)基因表达分析的顺序进行。
(1)由总RNA合成cDNA
使用CodeLink Expression Assay Reagent Kit(GE HealthcareBioscience公司制),按照其方案进行第一链(first-strand)cDNA合成。即,将1中得到的各总RNA 1μg用无核酸酶的水(Nuclease-freeWater)调整至10μl,混合该试剂盒中含有的1μl Bacterial ControlmRNA稀释溶液、1μl T7 Oligo(dT)Primer,将合计12μl在70℃加热10分钟后,在冰上迅速冷却3分钟。在冰上加入该试剂盒中含有的2μl的10×first-strand Buffer、4μl的5mM dNTP Mix、1μl的RNaseInhibitor、1μl的Reverse Transcriptase(200U/μl),将合计20μl在42℃加热2小时。
然后,按照方案分解RNA-DNA杂合体中的RNA,将RNA链置换为DNA链而合成Second-strand cDNA(双链cDNA)。即,在上述20μl第一链cDNA反应液中加入63μl无核酸酶的水、该试剂盒中含有的10×Second-strand Buffer(10μl)、5mM dNTP Mix(4μl)、DNAPolymerase Mix(2μl:10U/μl)、1μl RNase H,将合计100μl混合良好,在16℃加热2小时。
反应结束后,使用QIAquick PCR purification Kit(QIAGEN公司制),按照附带的方案,纯化合成的双链cDNA。即,在cDNA溶液100μl中添加混合该试剂盒中含有的500μl的Buffer PB,添加入安装于2ml离心管中的QIAquick离心柱中,以13,000rpm离心50秒。除去洗脱液后再次安装QIAquick离心柱,添加该试剂盒中含有的700μl的Buffer PE,以13,000rpm离心1分钟。除去洗脱液后再次安装QIAquick离心柱,再次以13,000rpm离心1分钟而完全除去Buffer PE。将QIAquick离心柱安装于新的1.5ml试管中,将30μl的无核酸酶的水直接添加在QIAquick离心柱的膜上,静置1分钟后以13,000rpm离心1分钟,再次重复该操作(合计用60μl洗脱)。用真空干燥机,将cDNA溶液浓缩至9.5μl以下,用无核酸酶的水定容至9.5μl。
(2)由cDNA合成标记化cRNA
然后,按照CodeLink Expression Assay Reagent Kit(GEHealthcareBioscience公司制)的方案,在生物素标记核苷酸的存在下进行体外转录反应(IVT)反应,合成cRNA。即,将该试剂盒中含有的4.0μl的10×T7Reaction Buffer、4.0μl的T7 ATP Solution、4.0μl的T7GTP Solution、4.0μl的T7CTP Solution、3.0μl的T7 UTP Solution混合,再加入7.5μl的10mMBiotin-11-UTP(Perkin Elmer公司制),将合计26.5μl添加入(1)中制备的9.5μl cDNA溶液中。再加入该试剂盒中含有的4.0μl的10×T7EnzymeMix,将合计40.0μl混合良好,在气相中在37℃加热14小时。反应结束后,使用RNeasy Mini Kit(QIAGEN公司制),按照附带方案,纯化合成的cRNA。即,在IVT反应液(40μl)中添加60μl的无核酸酶的水,在合计100μl的溶液中添加该试剂盒中含有的350μl的Buffer RLT并混合良好,再添加250μl的100%乙醇并混合良好,将总量(700μl)添加到该试剂盒中含有的RNeasy小型离心柱上,以12,000rpm离心15秒。将RNeasy小型离心柱安装在新的2ml试管中,将该试剂盒中含有的500μl的BufferRPE添加在柱上,以12,000rpm离心15秒,再次重复该操作。除去洗脱液后,再次将RNeasy小型离心柱安装在原来的2ml试管中,以12,000rpm离心2分钟,使柱内的膜干燥后,将RNeasy小型离心柱转移至新1.5ml试管中,将50μl的无核酸酶的水直接添加在膜上。在室温静置10分钟后,以12,000rpm离心1分钟,再次重复该操作(合计用100μl洗脱)。
将样品混合良好,2μl移液用于采用Agilent 2100Bioanalyzer的cRNA品质检查,2μl用灭菌蒸馏水稀释50倍并移液用于cRNA定量,剩余在-80℃保存。定量是测定50倍稀释溶液的260nm和280nm的吸光度,定量cRNA浓度,并确认260nm/280nm的吸光度比在1.8以上。cRNA浓度在0.5μg/μl以下时用真空干燥机进行浓缩。cRNA的品质检查使用Agilent 2100Bioanalyzer和RNA LabChip,按照附带的方案进行电泳,确认弥散峰的长度为500个碱基以上。
(3)标记化cRNA的片断化
然后,按照CodeLink Expression Assay Reagent Kit(GEHealthcareBioscience公司制)的方案,将cRNA片断化为约100~200个碱基。即,用无核酸酶的水使10μg的cRNA定容为20μl,添加该试剂盒中含有的5μl的5×Fragmentation Buffer,在94℃加热20分钟后,在冰上迅速冷却。在含有片断化的10μg的cRNA的25μl溶液中,加入该试剂盒中含有的78μlHybridization Buffer A、130μl Hybridization Buffer B、27μl无核酸酶的水,制备合计260μl的杂交溶液。以最高速度涡旋5秒并旋转减弱后,在90℃加热5分钟,进行cRNA的热变性,在冰上冷却。
(4)片断化cRNA和微阵列的杂交
使用CodeLink Shaker Kit(GEHealthcare Bioscience公司制)、CodeLink INNOVA Shaker,按照方案进行杂交。即,将CodeLink UniSetHuman 20K I Bioarray安装在该试剂盒中含有的12 Slide Shaker Tray上。将(3)中制备的杂交溶液以最高速度涡旋5秒并旋转减弱后,将杂交溶液250μl从阵列的密封型腔右下的孔注入,用阵列附带的Sealing strip(密封条)将孔密封。将装载了阵列的Shaker Tray设置在CodeLink INNOVAShaker中,一边以37℃、300rpm回旋一边加热18小时。
(5)微阵列的染色
使用CodeLink Parallel Processing Kit(GEHealthcare Bioscience公司制),按照方案进行阵列的染色和洗净。即,将上述得到的完成杂交的阵列的密封腔剥下,在室温下充满13ml的0.75×TNT Buffer(0.1M Tris-HCl(pH7.6)、0.15M NaCl、0.05%Tween 20),插入安装有该试剂盒中含有的Bioarray Rack的Medium Reagent Reservoir的各狭槽中。上下振动Rack数次使残余部分的杂交溶液从阵列落下,将保持阵列的BioarrayRack转移至充满了加热至46℃的240ml 0.75×TNT Buffer的LargeReagent Reservoir中,在46℃加热1小时。
作为染色液,将用无核酸酶的水将每片阵列溶解为1mg/ml而得的Streptavidin-Cy5液6.8μl,用室温的3393.2μl的TNB Buffer(0.1M Tris-HCl(pH7.6)、0.15M NaCl、0.5%TSA Blocking Reagent(Perkin Elmer公司制)稀释500倍,将3.4ml充满该试剂盒中含有的Small Reagent Reservoir的狭缝中。将保持阵列的Bioarray Rack转移至该Small Reagent Reservoir中,用铝等遮光并在室温(23℃±2℃)下染色30分钟。
染色后,将Bioarray Rack转移至充满了240ml的TNT Buffer(室温)的Large Reagent Reservoir中,上下数次后在室温放置5分钟,转移至充满了新的TNT Buffer(室温)的Large Reagent Reservoir中上下数次后在室温放置5分钟,将该操作重复4次进行洗净。最后一边用240ml的0.05%Tween 20溶液上下振动5秒一边进行洗净,再次重复该操作。将Bioarray Rack安装在干燥的Medium Reagent Reservoir中,以600×g、室温离心3分钟使其干燥。
(6)微阵列的扫描
将染色的各阵列供给Agilent G2565(Agilent公司制)扫描仪,读取染色蛋白质,保存为TIFF image。将TIFF image用CodeLink ExpressionAnalysis软件进行处理,将阵列上的各基因点的信号强度数值化。
(7)基因表达分析
将上述中得到的信号强度数据使用GeneSpring GX(Agilent公司制)微阵列基因表达分析软件进行标准化分析。即,从点信号中减去背景信号,该值小于0.01则取0.01,将除以阵列的全部点信号的中值而得的值作为各个基因的标准化的相对表达量。如下所述选择该相对表达量与正常细胞(图1,左上)相比同时在永生化癌细胞株(图1,右下)中增加的基因。可以设想,无论脏器而普遍地表达增强的基因与其说是与正常体细胞(图1,左上)的癌化(图1中,向下的蓝色箭头)相关的基因,毋宁为与癌细胞的永生化(图1中,向右的红色箭头)相关的基因。
作为在9种肺癌细胞株中的8种以上中,比2种的正常呼吸道上皮的中值高度表达2倍以上;在21种食道癌细胞株中的19种以上中,比2种非肿瘤性食道上皮的中值高度表达2倍以上;并且在9种消化器癌、其它各种癌(胃癌、大肠癌、头颈部癌、白血病)细胞株中的8种以上中,比上述4种非肿瘤性上皮(2种呼吸道上皮和2种食道上皮)的中值高度表达2倍以上的基因,提取出51个基因(图2,左上)。另一方面,作为这三组的各脏器癌细胞株的表达水平的平均值分别为作为对照的正常上皮的平均值的2倍以上(其中,基于该平均值而选择使用的食道癌细胞株为最初进行分析的7种)、并且由永生化肺癌细胞构成的转移肺癌组织中的表达水平是由同一病例的非永生化肺癌细胞构成的原发组织及转移组织的平均值的2倍以上的基因,提取出80个基因(图2,右上)。在这些两组中提取出的基因中,7个基因为两组共有而被提取出。
癌细胞株均为已永生化的细胞是公知事实,这里使用的永生化、非永生化肺癌组织,通过端粒酶活性(Hiyama K等、J Natl Cancer Inst 87:895-902,1995,Case G)、端粒长(Hiyama K等、Oncogene 10:937-44,1995,Case 92-D)、及hTERT蛋白原位表达(Hiyama E等、Neoplasia 3:17-26,2001,Fig 6A,B)分析,确认同一病例的原发灶(图3中,“D2Pr”)和肝转移灶(图3中,“D5M3”)并未永生化(端粒酶活性阴性、端粒长缩短、未确认hTERT蛋白表达);淋巴结转移灶中的一个(图3中,“D4M2”)几乎仅由永生化细胞构成(高端粒酶活性、端粒长延长、在几乎全部的细胞中hTERT蛋白表达),而另一个转移灶(图3中,“D3M1”)则永生化细胞混在于非永生化细胞之中(低端粒酶活性、hTERT蛋白表达细胞混在于非表达细胞之中)。
进而,筛得了在乳癌11细胞株、卵巢癌10细胞株、胰腺癌10细胞株中共同高度表达的基因,最终确认,(1)ubiquitin-conjugating enzymeE2S(UBE2S)、(2)replication factor C(activator 1)4,37kDa(RFC4)(3)prostaglandin E synthase 2(PTGES2)、(4)MAF1 homolog(S.cerevisiae)(MAF1)、(5)activin A receptor,type IIB(ACVR2B)、(6)family with sequence similarity 119,member A(FAM119A)、(7)leukotriene B4 12-hydroxydehydrogenase(LTB4DH)、(8)dolichyl-phosphate mannosyltransferase polypeptide 2,regulatory subunit(DPM2)、(9)selenoprotein X,1(SEPX1)、(10)proteasome(prosome,macropain)subunit,alpha type,3(PSMA3)、(11)coiled-coil-helix-coiled-coil-helix domain containing 3(CHCHD3)、(12)LSM3 homolog,U6small nuclear RNA associated(S.cerevisiae)(LSM3)、和(13)G-2 and S-phase expressed 1(GTSE1)合计13个基因,在肺癌细胞株、食道癌细胞株、消化器癌细胞株、乳癌细胞株、卵巢癌细胞株、胰腺癌细胞株、其他的癌细胞株的大部分中,共同地比有限寿命非肿瘤性细胞高度表达,在端粒酶阳性肺癌转移组织(永生化癌细胞)中比在同一病例的端粒酶阴性肺癌肺癌转移组织和原发组织(非永生化癌细胞)中高度表达,进而与在混在有未永生化的癌细胞的胰腺癌组织相比,在仅由永生化的细胞构成的胰腺癌细胞株中高度表达(图3)。这里使用的胰腺癌组织,与同一病例的正常胰腺组织相比,编码端粒酶的基因TERT的全长mRNA表达量高,但与永生化胰腺癌细胞株相比明显低,可以认为是混在有未永生化的细胞。
如图3~15所示,上述的13个基因是如下的基因,即,
(1)在永生化细胞(图3~15涂黑处:除MCF-12A、SV11e、SV11-106以外全部为来源于人癌的细胞株)中,与有限寿命的非肿瘤性细胞(图3~15留白处)相比,表达亢进;
(2)来源于人癌的永生化癌细胞(图3~15除MCF-12A、SV11e、SV11-106以外的涂黑处)中,比有限寿命癌细胞(图3~15除SV12e、SV12-72以外的斜线)表达亢进;
(3)在将正常肺纤维芽细胞中导入编码端粒酶的基因TERT而得的非肿瘤性端粒酶表达延命细胞(图3~15菱形点TERT6e、TERT6-85)中,与亲细胞(TIG-1)相比,没有表达亢进;
是特异性地在癌细胞端粒酶阳性永生化细胞中高度表达的基因。由此可以认为,这些基因是规定癌细胞的永生化的基因(永生化规定基因)。
进而、在将编码端粒酶的基因TERT和编码SV40 early antigen的基因导入正常肺纤维芽细胞中而得的永生化转化细胞(从图3 15 SV11e、SV11-106:确认用软琼脂集落形成试验(colony formation assay with softagar)制作菌落,而且能够续代300PDL以上)中、与亲细胞(TIG-1)、非肿瘤性延命细胞(TERT6e,TERT6-85:确认不能用软琼脂集落形成试验制作菌落,且在小于100PDL时细胞增殖停止)相比,除MAF1、LTB4DH以外表达亢进。可以认为,对于这两个基因,体外转化的细胞未必与人的癌同一性状。
实施例2利用永生化规定基因的siRNA(small interfering RNA)的癌细胞增殖抑制
为了分析实施例1中特定的13种永生化规定基因与癌细胞增殖的关联性,设计、制作各基因序列特异性siRNA后,在3种癌细胞株(HeLa:子宫颈癌、KYSE150:食道癌、HCC50:大肠癌)中导入基因,研究永生化规定基因的mRNA表达抑制以及对导入后96小时后的细胞增殖能力的影响。
(1)永生化规定基因序列特异性siRNA(small interfering RNA)的设计和制作
对于13种各永生化规定基因,设定2种或4种特异性siRNA序列,由有义链和反义链构成的形成有双链的siRNA从Qiagen公司和Japan BioService公司购得。制成的各siRNA序列中,仅将有义链示于表2和表3中。各基因的siRNA-1为2种等摩尔混合。
表2
Figure A20078002086200441
表3
Figure A20078002086200451
2)人癌细胞株的培养
3种癌细胞株(HeLa:子宫颈癌、KYSE150:食道癌、HCC50:大肠癌)分别在以下条件下进行培养。HeLa使用含有10%胎牛血清(FetalBovine Serum)(Sigma公司制)和庆大霉素(Sigma公司制)的DMEM培养基(Nacalai Tesque公司制),KYSE150和HCC50使用含有10%胎牛血清和庆大霉素的RPMI 1640培养基(Nacalai Tesque公司制)进行培养。
(3)永生化规定基因序列特异性siRNA向癌细胞株的基因导入
在转染前一天,将预培养的各癌细胞用胰蛋白酶处理回收,悬浮于(2)中所述的培养基中后,在24孔板的每孔中,以HeLa为1.2×104个、KYSE150为2×104个、HCC50为1.5×104个的细胞数进行接种。转染当天交换为无血清培养基Opti-MEM(Invitrogen公司制),使用Oligofectamine(Invitrogen公司制)或Lipofectamine 2000(Invitrogen公司制)转染表2所示的siRNA。此外,转染时的siRNA的浓度为每孔40nM。作为阴性对照,使用Control(non-silencing)siRNA(Qiagen公司制)。
(4)永生化规定基因的相对mRNA表达量的抑制分析
使用RNeasy Mini(Qiagen公司制),按照产品的说明书,从(3)中进行的转染1天后的各癌细胞株中提取总RNA。使用QuantiTect ProbeRT-PCR(Qiagen公司制)和永生化规定基因序列特异性TaqMan Probe(ABI公司制),采用以下条件进行定量RT-PCR(使用ABI公司制ABIPRISM 7000 sequence detection system)。
i)50℃、30分钟;
ii)95℃、15分钟;
iii)94℃、15秒→60℃、1分钟进行35~45循环。
作为内标使用β-actin,由各扩增曲线将表达量数值化。作为对照使用导入了NS序列siRNA的细胞的值。此外,永生化规定基因的相对mRNA量的测定,在同一目标基因、同一癌细胞株中,在相同条件下各进行2次。
将以对照中的各永生化规定基因的mRNA量为100%时导入了各siRNA的细胞中的各永生化规定基因的相对mRNA量,在图16~28中以mRNA定量1、mRNA定量2示出。在全部目标基因中,确认了由siRNA导致的mRNA表达量的抑制。
(5)癌细胞株的增殖测定
癌细胞株的增殖使用活细胞数测定试剂SF(Nacalai Tesque公司制)来进行。在(3)中进行的转染96小时后,每孔添加WST试剂10μl,在37℃培养3小时后,使用酶标仪(Perkin Elmer公司制、Wallac ARVOMX1420 Multilabel Counter)测定450nm和595nm(参考波长)的吸光度。用450nm吸光度-595nm的吸光度-BG(仅培养基)的吸光度进行数值化,求出每3孔的平均值,将NS序列siRNA导入细胞的值作为100%来表示。此外,癌细胞株的增殖测定,在同一目标基因、同一癌细胞株中,在相同条件下各进行2次。
将NS序列siRNA导入时的细胞数作为100%时的各siRNA导入时的细胞数,在图16~28中以MTT assay1、MTT assay2示出。在全部的目标基因中,均确认了由siRNA所致的3种癌细胞中的增殖抑制,由此显示,这些13种永生化规定基因能够成为普遍性地导致永生化癌细胞的增殖抑制的分子靶标。
在癌细胞中鉴别永生化和有限寿命,不仅在治疗药的开发中意义重大,作为疾病标记的意义也重大。通常的癌诊断通过病理所见而进行,虽然也能够诊断分化度、非典型性,但对于该细胞是否永生化、即是否获得了无限寿命,通过通常的病理分析却无法判断。以往,人端粒酶的活化作为永生化的标志而受到瞩目,但如上所述,也已知即使是正常细胞的一部分端粒酶也被活化,仅凭端粒酶的活化细胞也未必永生化。而且,端粒酶的表达量非常低,虽然已确立了免疫组织染色法,但仅在部分研究室中获得了成功(Hiyama E等,Neoplasia 3:17-26,2001)。通过将上述本发明的永生化规定基因的表达作为标记使用,能够将用通常的病理诊断无法判断的永生化癌细胞与有限寿命细胞鉴别开来,期待在癌的早期诊断、治疗选择、预后预测中的临床应用。
序列表
<110>国立大学法人广岛大学
<110>大鹏药品工业株式会社
<120>与人癌细胞的永生化相关的基因及其应用
<130>P07-68
<150>JP 2006-161350
<151>2006-06-09
<160>76
<170>PatentIn version 3.1
<210>1
<211>890
<212>DNA
<213>智人
<400>1
ggcggaccga agaacgcagg aagggggccg gggggacccg cccccggccg gccgcagcca     60
tgaactccaa cgtggagaac ctacccccgc acatcatccg cctggtgtac aaggaggtga    120
cgacactgac cgcagaccca cccgatggca tcaaggtctt tcccaacgag gaggacctca    180
ccgacctcca ggtcaccatc gagggccctg aggggacccc atatgctgga ggtctgttcc    240
gcatgaaact cctgctgggg aaggacttcc ctgcctcccc acccaagggc tacttcctga    300
ccaagatctt ccacccgaac gtgggcgcca atggcgagat ctgcgtcaac gtgctcaaga    360
gggactggac ggctgagctg ggcatccgac acgtactgct gaccatcaag tgcctgctga    420
tccaccctaa ccccgagtct gcactcaacg aggaggcggg ccgcctgctc ttggagaact    480
acgaggagta tgcggctcgg gcccgtctgc tcacagagat ccacgggggc gccggcgggc    540
ccagcggcag ggccgaagcc ggtcgggccc tggccagtgg cactgaagct tcctccaccg    600
accctggggc cccagggggc ccgggagggg ctgagggtcc catggccaag aagcatgctg    660
gcgagcgcga taagaagctg gcggccaaga aaaagacgga caagaagcgg gcgctgcggg    720
cgctgcggcg gctgtagtgg gctctcttcc tccttccacc gtgaccccaa cctctcctgt    780
cccctccctc caactctgtc tctaagttat ttaaattatg gctggggtcg gggagggtac    840
agggggcact gggacctgga tttgtttttc taaataaagt tggaaaagca               890
<210>2
<211>1427
<212>DNA
<213>智人
<400>3
accggcgtat tcccgccctg cttttcgccc gccgttccgt ggcgggaact gaggcgactg     60
tggggacatc agtgatcgta agtctcctgg gcccgttatt ctcagattag gtgacggagc    120
taagacttcg agaccatctc gtcctttttg tatcgcggaa acctgaggaa cgagccggcg    180
gcggtgacct gcacgagaag ccaggctaac tgggtgaagt accatgcaag catttcttaa    240
aggtacatcc atcagtacta aacccccgct gaccaaggat cgaggagtag ctgccagtgc    300
gggaagtagc ggagagaaca agaaagccaa acccgttccc tgggtggaaa aatatcgccc    360
aaaatgtgtg gatgaagttg ctttccagga agaagtggtt gcagtgctga aaaaatcttt    420
agaaggagca gatcttccta atctcttgtt ttacggacca cctggaactg gaaaaacatc    480
cactattttg gcagcagcta gagaactctt tgggcctgaa cttttccgat taagagttct    540
tgagttaaat gcatctgatg aacgtggaat acaagtagtt cgagagaaag tgaaaaattt    600
tgctcaatta actgtgtcag gaagtcgctc agatgggaag ccgtgtccgc cttttaagat    660
tgtgattctg gatgaagcag attctatgac ctcagctgct caggcagctt taagacgtac    720
catggagaag gagtcgaaaa ccacccgatt ctgtcttatc tgtaactatg tcagtcgaat    780
aattgaaccc ctgacctcta gatgttcaaa attccgcttc aagcctctgt cagataaaat    840
tcaacagcag cgattactag acattgccaa gaaggaaaat gtcaaaatta gtgatgaggg    900
aatagcttat cttgttaaag tgtcagaagg agacttaaga aaagccatta catttcttca    960
aagcgctact cgattaacag gtggaaagga gatcacagag aaagtgatta cagacattgc   1020
cggggtaata ccagctgaga aaattgatgg agtatttgct gcctgtcaga gtggctcttt   1080
tgacaaacta gaagctgtgg tcaaggattt aatagatgag ggtcatgcag caactcagct   1140
cgtcaatcaa ctccatgatg tggttgtaga aaataactta tctgataaac agaagtctat   1200
tatcacagaa aaacttgccg aagttgacaa atgcctagca gatggtgctg atgaacattt   1260
gcaactcatc agcctttgtg caactgtgat gcagcagtta tctcagaatt gttaacgtga   1320
atatatctgg atggggggtt ttgtaaataa tgaagttgta ataaaaataa aatgaccaaa   1380
agcaccttta aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaa                 1427
<210>3
<211>2120
<212>DNA
<213>智人
<400>3
ggagggcaga gagaaccgca acacctggtg ccgggtcggg tcgtttccgg ggctttcagt     60
ggccggaagt cgcggcgcct gtactgactc taggaagggc tggagttgtt ttgaatgggc    120
gcccgtaaga gaggtgggca agtacgtgtt acagacggcc acgccgccct ttaggcggtc    180
aaggtggggc gagcagacgt tcgcccccct gcagtcggcc gggtcactac ccaagagcct    240
ttggaggcgg aagcatggaa cggtctgcaa acgttcccga gcgggcctct gcggctctgg    300
cgggcgtttc gaacttgggc gccgggcaca cgcccagtcc cgagagcgct gagggttccc    360
ttagcgtcgc cctcaccccg gccaacccgc ggggcgccag agtcctggcc ctttaaacgc    420
cgcgcgtgcc tcggcgtctt cgtttcgcgc gcccgcccgc ggcgccggcg gagcgaacat    480
ggacccggct gcgcgggtgg tgcgggcgct gtggcctggt gggtgcgcct tggcctggag     540
gctgggaggc cgcccccagc cgctgctacc cacgcagagc cgggctggct tcgcgggggc     600
ggcgggcggc ccgagccccg tggctgcagc tcgtaagggg agcccgcggc tgctgggagc     660
tgcggcgctg gccctggggg gagccctggg gctgtaccac acggcgcggt ggcacctgcg     720
cgcccaggac ctccacgcag agcgctcagc cgcgcagctc tccctgtcca gccgcctgca     780
gctgaccctg taccagtaca agacgtgtcc cttctgcagc aaggtccgag ccttcctcga     840
cttccatgcc ctgccctacc aggtggtgga ggtgaaccct gtgcgcaggg ctgagatcaa     900
gttctcctcc tacagaaagg tgcccatcct ggtggcccag gaaggagaaa gctcgcaaca     960
actaaatgac tcctctgtca tcatcagcgc cctcaagacc tacctggtgt cggggcagcc    1020
cctggaagag atcatcacct actacccagc catgaaggct gtgaacgagc agggcaagga    1080
ggtgaccgag ttcggcaata agtactggct catgctcaac gagaaggagg cccagcaagt    1140
gtatggtggg aaggaggcca ggacggagga gatgaagtgg cggcagtggg cggacgactg    1200
gctggtgcac ctgatctccc ccaatgtgta ccgcacgccc accgaggctc tggcgtcctt    1260
tgactacatt gtccgcgagg gcaagttcgg agccgtggag ggtgccgtgg ccaagtacat    1320
gggtgcagcg gccatgtacc tcatcagcaa gcgactcaag agcaggcacc gcctccagga    1380
caacgtgcgc gaggacctct atgaggctgc tgacaagtgg gtggctgctg tgggcaagga    1440
ccggcccttc atggggggcc agaagccgaa tctcgctgat ttggcggtgt atggcgtgct    1500
gcgtgtgatg gaggggctgg atgcattcga tgacctgatg cagcacacgc acatccagcc    1560
ctggtacctg cgggtggaga gggccatcac cgaggcctcc ccagcgcact gaatgtcccc    1620
gcgcagagca gagggaaggc agcggaagac gccagctgcc agggcctggg gccactgggc    1680
cagcgcctgg cgatactggt tgggggcagg atcattctgc cccttgtcca cgcaccccca    1740
ccagccctct cgcttctaac acagggcacc tgctggggct cagggatgtt agggacgagt    1800
tccagccctg ccactgccct ggggcgaccc ctccctgtcc ctgcctccct gctctgccgc    1860
ccctcttcct ggaccctcag tggctgtccc atggctacat cctgtgggtg ggggccctcg    1920
acaggacagc aggacggttt gttttcagtg gaatcccatc cctgggttcc cctggttccc    1980
actcttccca agcctcccgg gactgggaca tgtttgcaat aaaggaaagg tttgtggcgc    2040
ctgtcatggc aggcatctca tggaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa    2100
aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa                                                2120
<210>4
<211>1766
<212>DNA
<213>智人
<400>4
acccgatggc tattcgagct ctcgatctcg gagactggag cgggccattc agaggcgcgg      60
ggccgggccc ggcggacgct tgttgttgtc cggccggggg aggcggaggt cgctcgctcg     120
ctcgctcggc tcgctgactc gccggagcgc tctgtggcgg tcggcggcag gtcggtcgcg     180
agagcgggct ctgtggaagg gggcgaggct atgtcgcggt ggcagcccgg atgggccggc     240
agggccggga gtaacgggac gtcgccgcgg agcttcttcc cccggataca gtgcggcccg     300
agcggaggcc gcggcgccgc cctccgatct tgaagagccc gcgctgcgcg gagcccgccc     360
ccgcctgcgc accggcaccg acgcggagcg acccagccca gccagacccg gcccggcgcg     420
gcctgatcta acccagccag gcaggcaata ctagcccctc tggagcacgg agctccttcc     480
ccaaagacat gaagctattg gagaactcga gctttgaagc catcaactca cagctgactg     540
tggagaccgg agatgcccac atcattggca ggattgagag ctactcatgt aagatggcag     600
gagacgacaa acacatgttc aagcagttct gccaggaggg ccagccccac gtgctggagg     660
cactttctcc accccagact tcaggactga gccccagcag actcagcaaa agccaaggcg     720
gtgaggagga gggccccctc agtgacaagt gcagccgcaa gaccctcttc tacctgattg     780
ccacgctcaa tgagtccttc aggcctgact atgacttcag cacagcccgc agccatgagt     840
tcagccggga gcccagcctt agctgggtgg tgaatgcagt caactgcagt ctgttctcag     900
ctgtgcggga ggacttcaag gatctgaaac cacagctgtg gaacgcggtg gacgaggaga     960
tctgcctggc tgaatgtgac atctacagct ataacccaga cttggactca gatcccttcg    1020
gggaggatgg tagcctctgg tccttcaact acttcttcta caacaagcgg ctcaagcgaa    1080
tcgtcttctt tagctgccgt tccatcagtg gctccaccta cacaccctca gaggcaggca    1140
acgagctgga catggagctg ggggaggagg aggtggagga agaaagcaga agcaggggca    1200
gtggggccga ggagaccagc accatggagg aggacagggt cccagtgatc tgtatttgat    1260
gaggaggagc cgaggcccca gcttcatcca gcttcaacca atgcctggac ctgtccacct    1320
gagaggcccc tggggcctcc ccagctgctg gccagaccct ggcgctgcca cagtcctggc    1380
actgcccaag gccatacctg cctagccctt tggctccatc ctgtggatgc ccactcaccc    1440
ctcagactcc tgctgcccat gctgtggccg gacttgtcag cagggggcct ggtgggagga    1500
gcgactgccc tgcccaaatg aactgccaca gcagggacag ctggaccgca gagtttattt    1560
ttgtatttct actgggcctg cacactccag cccaaagggt ctgtggccgg aggccccacg    1620
agcaggcccc agcagtcacc ggctctggtc ttgggccggc cccggtgccc acctgtaccc    1680
ccacctcgcc catttggccg cgtgcactga gtgtcacttt gctgcagctc gtttctttcc    1740
aataaaagtt tctgtgactt agaaaa                                         1766
<210>5
<211>1584
<212>DNA
<213>智人
<400>5
gaacatgacg gcgccctggg tggccctcgc cctcctctgg ggatcgctgt ggcccggctc      60
tgggcgtggg gaggctgaga cacgggagtg catctactac aacgccaact gggagctgga     120
gcgcaccaac cagagcggcc tggagcgctg cgaaggcgag caggacaagc ggctgcactg     180
ctacgcctcc tgggccaaca gctctggcac catcgagctc gtgaagaagg gctgctggct     240
agatgacttc aactgctacg ataggcagga gtgtgtggcc actgaggaga acccccaggt     300
gtacttctgc tgctgtgaag gcaacttctg caacgagcgc ttcactcatt tgccagaggc     360
tgggggcccg gaagtcacgt acgagccacc cccgacagcc cccaccctgc tcacggtgct     420
ggcctactca ctgctgccca tcgggggcct ttccctcatc gtcctgctgg ccttttggat     480
gtaccggcat cgcaagcccc cctacggtca tgtggacatc catgaggacc ctgggcctcc     540
accaccatcc cctctggtgg gcctgaagcc actgcagctg ctggagatca aggctcgggg     600
gcgctttggc tgtgtctgga aggcccagct catgaatgac tttgtagctg tcaagatctt     660
cccactccag gacaagcagt cgtggcagag tgaacgggag atcttcagca cacctggcat     720
gaagcacgag aacctgctac agttcattgc tgccgagaag cgaggctcca acctcgaagt     780
agagctgtgg ctcatcacgg ccttccatga caagggctcc ctcacggatt acctcaaggg     840
gaacatcatc acatggaacg aactgtgtca tgtagcagag acgatgtcac gaggcctctc     900
atacctgcat gaggatgtgc cctggtgccg tggcgagggc cacaagccgt ctattgccca     960
cagggacttt aaaagtaaga atgtattgct gaagagcgac ctcacagccg tgctggctga    1020
ctttggcttg gctgttcgat ttgagccagg gaaacctcca ggggacaccc acggacaggt    1080
aggcacgaga cggtacatgg ctcctgaggt gctcgaggga gccatcaact tccagagaga    1140
tgccttcctg cgcattgaca tgtatgccat ggggttggtg ctgtgggagc ttgtgtctcg    1200
ctgcaaggct gcagacggac ccgtggatga gtacatgctg ccctttgagg aagagattgg    1260
ccagcaccct tcgttggagg agctgcagga ggtggtggtg cacaagaaga tgaggcccac    1320
cattaaagat cactggttga aacacccggg cctggcccag ctttgtgtga ccatcgagga    1380
gtgctgggac catgatgcag aggctcgctt gtccgcgggc tgtgtggagg agcgggtgtc    1440
cctgattcgg aggtcggtca acggcactac ctcggactgt ctcgtttccc tggtgacctc    1500
tgtcaccaat gtggacctgc cccctaaaga gtcaagcatc taagcccagg acatgagtgt    1560
ctctccagac tcagtggatc tgaa                                           1584
<210>6
<211>1770
<212>DNA
<213>智人
<400>6
ccacgcgtcc gcacttccag ggtcggggag acggaactgc ggcgaccatg tatttctggt      60
ttatcaaacc gctaacaccc agtctaaggg caggttctgt cccattgtta tcactatcga     120
agcagccgat ggaggagggg aggtctgagc agagggcggg gtgcaggcgg aatggccctc     180
gtgccctatg aggagaccac ggaatttggg ttgcagaaat tccacaagcc tcttgcaact     240
ttttcctttg caaaccacac gatccagatc cggcaggact ggagacacct gggagtcgca     300
gcggtggttt gggatgcggc catcgttctt tccacatacc tggagatggg agctgtggag     360
ctcaggggcc gctctgccgt ggagctgggt gctggcacgg ggctggtggg catagtggct     420
gccctgctgg gtgctcatgt gactatcacg gatcgaaaag tagcattaga atttcttaaa     480
tcaaacgttc aagccaactt acctcctcat atccaaacta aaactgttgt taaggagctg     540
acttggggac aaaatttggg gagtttttct cctggagaat ttgacctgat acttggtgct     600
gatatcatat atttagaaga aacattcaca gatcttcttc aaacactgga acatctctgt     660
agcaatcact ctgtgattct tttagcatgc cgaattcgct atgaacggga taacaacttc     720
ttagcaatgc tggagaggca atttattgtg agaaaggttc actacgatcc tgaaaaagat     780
gtacatattt acgaagcaca gaagagaaac cagaaggagg acttataatt ggctataatt     840
tataagaatg ttgtcattga gtgtgtcact taaggtctta gactgcaaat ctaaccatat     900
ttaatgaaat gtcttactgt acaaaaagtc taagccaaag gttctcaggg gagaaagcac     960
atgtgcagtt ttaaaacaaa gcagtgcttt gtcccattgc tgtgattttt agtcagactt    1020
tactcagtct gaaatgcaat taacattaaa ggattaagtg tgagatttcg atttatgcta    1080
tttgtgtatc ccatactcct cccttttaat aaacagtttc cactgatgat atgaagggcc    1140
ggtataaaga agtctttaaa tgagtaagct ttcttggtaa gattaaatct tacaaattat    1200
ttttaaaacc ttgtgatata tacaatgttt agctgagttt tctaattttc tggatgtaaa    1260
acaaaaggtt taacctatac attccttgag ctgttagtgc tatttaaatc ttttgccctg    1320
tttaggtcct aaacactttt agttgagtag gatatgagct tttttgggtc tcatatcatg    1380
ctttttgcct taatttcagg tatatatata tataagtaaa ggaattaagt aaaaataaaa    1440
tttcagttac tttttaaaag cacctgaaat ctggccggat gcggtggctc atgcctgtaa    1500
tcccaccact ttgggaggcc gaggcgggca gatcacctga ggtcgggagt tcaagaccag    1560
cctggccaac atggtgaaac cccatctcta ctaaaaatac aaaaattagc cgggcgtggt    1620
gtcgggcgcc tgtagtccca gctgctcggg aggctgaggc aggggaatcg cttgaacctg    1680
ggaggcggag gttgcagtga gctgagattg cgccattgta ctccagcctg ggggacagga    1740
gcgagactcc atctcaaaaa aaaaaaaaaa                                     1770
<210>7
<211>1257
<212>DNA
<213>智人
<400>7
gtcccgacgc ctcccgcccc cgcagttcct tggagagctt ggagccgcgc gccggaggga      60
ataggaaagc ttggttacaa cccgggacac ccggagcttc aggatggttc gtactaagac     120
atggaccctg aagaagcact ttgttggcta tcctactaat agtgactttg agttgaagac     180
atctgagctc ccacccttaa aaaatggaga ggtcctgctt gaagctttgt tcctcaccgt     240
ggatccctac atgagagtgg cagccaaaag attgaaggaa ggtgatacaa tgatggggca     300
gcaagtggcc aaagttgtgg aaagtaaaaa tgtagcccta ccaaaaggaa ctattgtact     360
ggcttctcca ggctggacaa cgcactccat ttctgatggg aaagatctgg aaaagctgct     420
gacagagtgg ccagacacaa taccactgtc tttggctctg gggacagttg gcatgccagg     480
cctgactgcc tactttggcc tacttgaaat ctgtggtgtg aagggtggag aaacagtgat     540
ggttaatgca gcagctggag ctgtgggctc agtcgtgggg cagattgcaa agctcaaggg     600
ctgcaaagtt gttggagcag tagggtctga tgaaaaggtt gcctaccttc aaaagcttgg     660
atttgatgtc gtctttaact acaagacggt agagtctttg gaagaaacct tgaagaaagc     720
gtctcctgat ggttatgatt gttattttga taatgtaggt ggagagtttt caaacactgt     780
tatcggccag atgaagaaat ttggaaggat tgccatatgt ggagccatct ctacatataa     840
cagaaccggc ccacttcccc caggcccacc cccagagatt gttatctatc aggagcttcg     900
catggaagct tttgtcgtct accgctggca aggagatgcc cgccaaaaag ctctgaagga     960
cttgctgaaa tgggtcttag agggtaaaat ccagtacaag gaatatatca ttgaaggatt    1020
tgaaaacatg ccagccgcat ttatgggaat gctgaaagga gataatttgg ggaagacaat    1080
agtgaaagca tgaaaaagag gacacatgga atctggaggc catttagatg attagttaat    1140
ttgtttttca ccatttagca aaaatgtata ctaccttaaa tgtcttaaga aatagtactc    1200
ataatgagtt tgagctactt aataaaatac atttaagtgg taaaaaaaaa aaaaaaa       1257
<210>8
<211>910
<212>DNA
<213>智人
<400>8
gtggcttgcg gctcgggtgg ctgagcgcgc ggggaaatgg ccacggggac agaccaggtg      60
gtgggactcg gcctcgtcgc cgttagcctg atcatcttca cctactacac cgcctgggtg     120
attctcttgc cattcatcga cagtcagcat gtcatccaca agtatttcct gccccgagcc     180
tatgctgtcg ccatcccact ggctgcaggc ctcctgctgc tcctgtttgt gggactgttc     240
atctcctatg tgatgctgaa gaccaagaga gtgaccaaga aggctcagtg aaggtcccgc     300
agggatgagg ctgccagccc cttctctgct tcccctccag cacagggacc aagtggggga     360
gcctgcagaa cctgtccagg cacagtggct cctcaagcct gcctgtcctg cagagtcccc     420
atggcatgga gcttacacct gactgactgg agccccctcc ccgactccca cttccagaag     480
ctaggaggga gggatacctg gaagactccg gtcacctcct tcttgctcag ggcctaaaag     540
atgctggtcc tcccaacctc actctcagac tccctgccac cttttcccct gggttctgcc     600
gtcttgcctc acttcccctc ctgtcacatg ctgacgttgg acttagcagg ttctaaggcc     660
acatgtgtga cctctctgac ttctcttcct ccaccaaggc agctttcctt accctgacac     720
agccccagac cccacaaagc cttctggacc tggaaagcct ggggaaggac tgacagaccc     780
caggaccagc cctggggctc agggcagcca ccccgggccg ctgaccgact gacctctcct     840
cacggaggcc cagccccaaa gccccagggc tggcccgttt gggacagctg accaataaac     900
actgatggtg                                                            910
<210>9
<211>1386
<212>DNA
<213>智人
<400>9
ggaagccggg attcgccctc cggggagcga ttggtcctcg ggaggggcgg ggaggtggac      60
gcgggtaccg gcggtcgtcg ggtcggcagc ctttggtcag ttggcagcgg caagcgcgct     120
gcggttccgg tggcgccatg tcgttctgca gcttcttcgg gggcgaggtt ttccagaatc     180
actttgaacc tggcgtttac gtgtgtgcca agtgtggcta tgagctgttc tccagccgct     240
cgaagtatgc acactcgtct ccatggccgg cgttcaccga gaccattcac gccgacagcg     300
tggccaagcg tccggagcac aatagatctg aagccttgaa ggtgtcctgt ggcaagtgtg     360
gcaatgggtt gggccacgag ttcctgaacg acggccccaa gccggggcag tcccgattct     420
gaatattcag cagctcgctg aagtttgtcc ctaaaggcaa agaaacttct gcctcccagg     480
gtcactaggc gggcagccca cacccacccc agacggccac cacactgagg ccacacgttg     540
gccattccac cttggagttg gaaccctggg cgtcgagaca ggaaggcagg gcgcagtggt     600
tgaaacatca ggacactccc aaggccccgg ctctgaacaa gaccttttcg tttcttggaa     660
aagagactca tttgctgatg gttcatgcct tctgctggga caggcctggg ctgtgcagcc     720
acactgtcgg ctgacttagc cccctgctca ctctaggtgc ctccaggagg tgagccctgg     780
gtgcagctgg tctctgaatg acgttacacc ctcaccttct tttcctggcc ctgtctctgg     840
actctcccct gtgaggccca attccaagac agactctcgt cctcaccgaa gcttaggccc     900
acatctccca ggctgcttag gagacagaat ggaaacggag gccgcccctg ccagccgccc     960
tggccctggt cactgcatga tccgctctgg tcaaaccctt ccaggccagc cagagtgggg    1020
atggtctgtg acctgctggg aaggcaggct gatggggcac acccttggcc tctcgtccac    1080
gaggggagaa acctaaaccc tgtttcacaa tctgtgcgga agtagcttgc ctcacttctg    1140
cttaggaaag cggctgttgc tccataactc taaccagcac agggctgagg cctgcagtgc    1200
acacctgcag ggaggccctt cccaaggtgt ggtgactgtg ccttactgta catgctcgga    1260
ggcctggcca tataggaggg tgggtgatgc tgaaatcacc ccccatctta agtaattact    1320
ttctggagta atcaggtgga aatccataga caaatgaaac attcagaaaa aaaaaaaaaa    1380
aaaaaa                                                               1386
<210>10
<211>949
<212>DNA
<213>智人
<400>10
gcgctccggg cctggaatcc ctacgcgtcc ctttgggttt agcacgatga gctcaatcgg      60
cactgggtat gacctgtcag cctctacatt ctctcctgac ggaagagttt ttcaagttga     120
atatgctatg aaggctgtgg aaaatagtag tacagctatt ggaatcagat gcaaagatgg     180
tgttgtcttt ggggtagaaa aattagtcct ttctaaactt tatgaagaag gttccaacaa     240
aagacttttt aatgttgatc ggcatgttgg aatggcagta gcaggtttgt tggcagatgc     300
tcgttcttta gcagacatag caagagaaga agcttccaac ttcagatcta actttggcta     360
caacattcca ctaaaacatc ttgcagacag agtggccatg tatgtgcatg catatacact     420
ctacagtgct gttagacctt ttggctgcag tttcatgtta gggtcttaca gtgtgaatga     480
cggtgcgcaa ctctacatga ttgacccatc aggtgtttca tacggttatt ggggctgtgc     540
catcggcaaa gccaggcaag ctgcaaagac ggaaatagag aagcttcaga tgaaagaaat     600
gacctgccgt gatatcgtta aagaagttgc aaaaataatt tacatagtac atgacgaagt     660
taaggataaa gcttttgaac tagaactcag ctgggttggt gaattaacta atggaagaca     720
tgaaattgtt ccaaaagata taagagaaga agcagagaaa tatgctaagg aatctctgaa     780
ggaagaagat gaatcagatg atgataatat gtaacattta ctccagcatc tattgtattt     840
taaatttcta ctccagtcca atgtaactat ttagccctgg attatacata ctgtccaatt     900
ttcattaaat ttttgtctta taactataaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaa                 949
<210>11
<211>1623
<212>DNA
<213>智人
<400>11
gctggtttct gggggtcgtg gccttgctcc cgctgtgcgg gaaaagaatc caggcccttc      60
cacgcgcgtg tgggtgcggg ggccccgaag tgctcgtggt tccccgctag gtctccgctg     120
gggcaggaac cggaatcatg ggtgggacca ccagcacccg ccgggtcacc ttcgaggcgg     180
acgagaatga gaacatcacc gtggtgaagg gcatccggct ttcggaaaat gtgattgatc     240
gaatgaagga atcctctcca tctggttcga agtctcagcg gtattctggt gcttatggtg     300
cctcagtttc tgatgaagaa ttgaaaagaa gagtagctga ggagctggca ttggagcaag     360
ccaagaaaga atccgaagat cagaaacgac taaagcaagc caaagagctg gaccgagaga     420
gggctgctgc caatgagcag ttaaccagag ccatccttcg ggagaggata tgtagcgagg     480
aggaacgcgc taaggcaaag cacctggcta ggcagctgga agagaaagac cgagtgctaa     540
agaagcagga tgcattctac aaagaacagc tggctagact ggaggagagg agctcagagt     600
tctacagagt caccactgaa caatatcaga aagctgctga agaggtggaa gcaaagttca     660
agcgatatga gtctcatcca gtctgtgctg atctgcaggc caaaattctt cagtgttacc     720
gtgagaacac ccaccagacc ctcaaatgct ccgctctggc cacccagtat atgcactgtg     780
tcaatcatgc caaacagagc atgcttgaga agggaggata aaaactttca gaatgagcaa     840
aacaccatca acgttaattc cagagatgga acattttttt tcctagtgag aaaacaaccc     900
atttgaagag aagaccacta atgagaagac cactaaagag agacatcaag aatggattca     960
gcagaatcat ttcacgtttt gaacagcagc agtttgaagg gccaaagcct tgatcaggga    1020
tcagtcatta aaggacactc ttgagtatta gtaaaccctc ttatgatgat taaaagagaa    1080
gggcagccct ctccaccttt tggtactttc tattcaactt gcactgacca taaaatgttt    1140
ctcttctgaa caagccccat catttggtga acctccaccc taacaaagta ggatggggtt    1200
gggggctaaa ttaattggag tggggcgagg agagagccag aaaacataga tccgagggca    1260
gcagtgctgg gtggagagag ccagaaaaca gatctggagg cagcagtgct ggatggaatt    1320
gtctaggctg tggcatgttg gttttgtctt tcttttctcc tttgattatg taagagctat    1380
ttcattataa cttattatgg tgattataca ggcaagaaga caaaaaggag agaaaatgta    1440
cctcttctac tggaataatg tttatgatta caagtgagat aaggtatttt tatcaatatg    1500
aaggcaacct tggctgataa aacctctata gtgaatactc acatctttac ttcactcact    1560
atcaataata aatatatttt ctgacaaaga ctggcaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa    1620
aaa                                                                  1623
<210>12
<211>579
<212>DNA
<213>智人
<400>12
acgaggggaa agggcgcagg gtttgaaaca tggcggacga cgtagaccag caacaaacta      60
ccaacactgt agaggagccc ctggatctta tcaggctcag cctagatgag cgaatttatg     120
tgaaaatgag aaatgaccga gagcttcgag gcagattaca tgcttatgat caacatttaa     180
atatgatctt gggagatgtg gaagaaactg tgactactat agaaattgat gaagaaacat     240
atgaagagat atataaatca acgaaacgga atattccaat gctctttgtc cggggagatg     300
gcgttgtcct ggttgcccct ccactgagag ttggctgaaa caaagaattt gtcctgtatg     360
gaaaacggga gactttgtac agtggcctct ctaaaagtac aaaacattca taagagaaac     420
ctgcatacat tttgatatta agaaataatt ccggggattc ttccactcct gaaatgagtt     480
gatttgcaga taactcacaa cttcttaagc taaatggtat tttcattttt ctcaagctct     540
ccaataaata tgaccaccaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaa                            579
<210>13
<211>4493
<212>DNA
<213>智人
<400>13
atcgtctgcc gctttggtga cttctgacag ctctctccat ggaaggaggc ggcggccgcg      60
atgagccttc agcctgccgg gcaggggacg tgaacatgga tgaccctaag aaggaagaca     120
ttcttctttt ggccgatgaa aaatttgact tcgatctttc attgtcttct tcgagtgcaa     180
atgaagatga tgaagtcttc ttcggaccct ttggacataa agaaagatgt attgctgcca     240
gcttggaatt aaataatccg gttcccgaac agcctccgtt gcccacatct gagagtccct     300
ttgcctggag ccctctggcc ggggagaagt tcgtggaggt gtacaaagaa gctcacttac     360
tggctttaca cattgagagc agcagccgga accaggcagc ccaagctgcc aagcctgaag     420
accctcggag ccagggcgtg gaaagattca tacaggagtc aaaattaaaa ataaacctct     480
ttgagaaaga aaaggaaatg aagaaaagcc ccacgtctct taaaagggag acatactacc     540
tgtcagacag ccccttgctg gggccccctg tgggtgagcc tcggctcttg gcctcctccc     600
cggccctgcc cagctctggt gcccaggccc gcctcacccg ggcgccgggg cctccgcact     660
ctgctcatgc tttgcccagg gaatcatgca ctgctcatgc tgcaagtcag gcagcgactc     720
agaggaagcc cgggaccaaa ttgctgctgc ctcgagcggc ctctgttaga ggaagaagca     780
tccctggggc tgcggagaag cccaagaaag agattccagc tagtccttcc aggacaaaaa     840
tcccagctga gaaggaatcc caccgggatg ttctccctga caaacctgcc ccgggtgctg     900
tcaatgtgcc ggccgccgga agccacttgg gccagggcaa gcgggcgatc cctgttccaa     960
acaagttggg gctgaagaag accctgttaa aagcacccgg ctctaccagc aatctcgcaa    1020
ggaagtcctc ctcggggcct gtttggagcg gggcatccag tgcgtgcaca tccccagcag    1080
tgggcaaagc taaatcaagt gaatttgcaa gtattcctgc aaatagctcc cggcctctgt    1140
caaacatcag caagtcaggc agaatgggac ccgccatgct gcggccagct ctgcctgcag    1200
gccctgtggg ggcatcctcc tggcaggcca agcgggtcga tgtttctgag ctggcagcgg    1260
agcagctcac ggcacccccc tcagcatccc ccacccaacc ccagactccg gaaggtggcg    1320
gccagtggct gaactccagt tgcgcttggt cagaatcttc tcaattgaat aagactagaa    1380
gtatcagacg gcgagattcc tgtctaaatt ccaagacaaa ggttatgcct actcctacaa    1440
atcaatttaa aattcctaag ttttctattg gtgactcccc ggacagctca acaccaaagc    1500
tttcgcgggc acagcggccg cagtcgtgca cgtcagttgg cagggtcact gtccacagca    1560
ccccggttag acgctcatct gggccagcac cacaaagcct gctgagcgca cggcgtgtgt    1620
cagccttgcc cacacccgcc agccggcgct gctctggcct tccaccgatg acccccaaaa    1680
cgatgcccag ggccgtgggc tctcccctgt gtgtgccagc tcggagacgt tcctctgagc    1740
cccgcaagaa ctctgcaatg agaactgaac caacaaggga gagcaacaga aagacagatt    1800
ccaggctggt ggatgtgtcc cctgacaggg gttctcctcc ttcccgtgtg cctcaggcac    1860
ttaacttttc tccagaggaa agcgattcta ctttctccaa aagtactgcc acagaagtag    1920
ctcgggagga agccaagccg ggtggagatg cagcccctag tgaggctctt cttgtagata    1980
tcaaactgga accactcgcg gtcactccag atgctgcaag ccagcccctc attgaccttc    2040
ctctcatcga cttctgcgat accccagaag cacacgtggc tgtaggatct gaaagcaggc    2100
ctctgatcga cctcatgaca aacactccag acatgaataa aaatgtggcc aaaccttcac    2160
cggtggtggg acagctcata gacctgagct cccctctgat ccagctgagc cctgaggctg    2220
acaaggagaa cgtggattcc ccactcctca agttctaagc cgaaccaaat cctttgcctt    2280
gaaagaacag ccctaaagtg gttttcaacc ctcagaaaca agctttaggc tggtcgcagt    2340
ggcttacact tgtaacccta gaacttggga ggctgaggtg ggcggattac ttgagcccag    2400
gagttcggga ccagcctggg aaatatagtg aaactcctgt ccctacaaaa aatacaaaaa    2460
ttagccgggt gtggtagtgc atgcctgtag tcccagctac ttgggaggct gaagtgggag    2520
gatggcctga gctcaaggag atgcaggctg cagtgggctg tgattgtgcc actgcactcc    2580
agcctgggca ccaatgtgag aacctgtctt ggaaaaaaaa aaaaagaaac atgttttagt    2640
agaagtttta tttgaaaaag aaaaataagc ataaatatat tcccagtgct ggagagggtg    2700
ggctgaggga ctggggccag cacggaccac ccaaggcctc tgcttcccgc cgccaccctc    2760
ctcgctgcca ttctctgggc tggaatgtga agcctcagtc actctaaatg aagaattttc    2820
ttttgaatgt tttgtatgta aaatagcaag tggctatttt taaagttaag tttgtataaa    2880
tagttagata ttctagattt acattaaatt gtaaaataaa tggacttatt gaagcatatc    2940
ttgattttta agcttatctt gattttcaaa catgcatagc tatttttatc actctaatca    3000
gtaaggctac tatctagact cgaatgcttt catacaagtg attttcaaaa attagtcaat    3060
aaaaattgat gtcagtgcag gcccaggccc gcccccagat acactagttt ctaggtctgg    3120
ggccagccta gtaattgtta ctaggcacac aggtgatgct gactcgatgg cctgagacac    3180
accccttgag aagaagctgc tctggggaga cgagggtatg agtggaaaga ggatgggcga    3240
ggaggccggg cttacctgga cactaaggtg atggacggcg tctgctgggc aggcctcggg    3300
gaggacccct cagctttgct ctcagcaggg gcccgacaag ctcagtgggc agtggcagga    3360
actgagtgcc actggaaagc ccattccctt tatttagaaa acgagctcca ggaagccgct    3420
actttgtgtc catttctctt gaggaaactt accaccttgg ttgagcggct tcatggcaga    3480
cagcagcgag ccagcggccg gactctgtat ttcggacccc actccagtgc tccctgggtc    3540
ataccaggat ctgcctctgt ccacaaagat gagggaaaat gatgactgtg ctgtgctctc    3600
tacttcctgc ggttactgcg tgattctaaa gctgccactc ggaacagcga gtcctctgcc    3660
gtcgagagca gggaggggta gggtggacag gcgatgccgt ggaaagacgt ctcggtggaa    3720
actgccatgg tggaaaggtg gcgcgcttct cacggctgag ttgctgcgcc tgcagacgga    3780
agctccccac aggcagagct gcttggatgt gtgagtcatg aagccagaga agccccgctc    3840
catgagcagt gactccccag gccctgtgac ctccctcctg tcttgcagct cctcctggca    3900
ccagtcccca gggctctcct gttggtagtt cctgcttttc ttcttggaaa ttcctcgtgg    3960
acctcgagat ctttacccta aaatagttct gttgaatttc accctggcaa tgtaaattga    4020
tagcttatct tcacagatgc cagacaatgg acaactcacc atcagtcctc tgctcacctg    4080
agacaaatgc atgtctgatt gcttcctctg ccctattgtt tatgtgaaaa tgcagattca    4140
ctgagccaga ctaaggcatc agtgactgtt cctctacctg cctctcacat ggagattgtg    4200
tattcagtga aaggctgatc aaagacccaa aggaatgcaa cagtttatct cttatctacc    4260
tatgacctgc gagctgccca ccacccccag ttgttgcgcc tttccagaca gaaccagtgt    4320
acatcttaca cgtattaatt gatgtcctgt gtctccctaa tatgtatcaa agcaagctgt    4380
gcctcgacca ccttgggcac atatcctcag gacatcatcc tgaggctgtg tcactggcat    4440
gtccttaacc ttggcaaaat aaactttcta aattgaaaaa aaaaaaaaaa aaa           4493
<210>14
<211>225
<212>PRT
<213>智人
<400>14
Met Asn Ser Asn Val Glu Asn Leu Pro Pro His Ile Ile Arg Leu Val
1               5                   10                  15
Tyr Lys Glu Val Thr Thr Leu Thr Ala Asp Pro Pro Asp Gly Ile Lys
            20                  25                  30
Val Phe Pro Asn Glu Glu Asp Leu Thr Asp Leu Gln Val Thr Ile Glu
        35                  40                  45
Gly Pro Glu Gly Thr Pro Tyr Ala Gly Gly Leu Phe Arg Met Lys Leu
    50                  55                  60
Leu Leu Gly Lys Asp Phe Pro Ala Ser Pro Pro Lys Gly Tyr Phe Leu
65                  70                  75                  80
Thr Lys Ile Phe His Pro Asn Val Gly Ala Asn Gly Glu Ile Cys Val
                85                  90                  95
Asn Val Leu Lys Arg Asp Trp Thr Ala Glu Leu Gly Ile Arg His Val
            100                 105                 110
Leu Leu Thr Ile Lys Cys Leu Leu Ile His Pro Asn Pro Glu Ser Ala
        115                 120                 125
Leu Asn Glu Glu Ala Gly Arg Leu Leu Leu Glu Asn Tyr Glu Glu Tyr
    130                 135                 140
Ala Ala Arg Ala Arg Leu Leu Thr Glu Ile His Gly Gly Ala Gly Gly
145                 150                 155                 160
Pro Ser Gly Arg Ala Glu Ala Gly Arg Ala Leu Ala Ser Gly Thr Glu
                165                 170                 175
Ala Ser Ser Thr Asp Pro Gly Ala Pro Gly Gly Pro Gly Gly Ala Glu
            180                 185                 190
Gly Pro Met Ala Lys Lys His Ala Gly Glu Arg Asp Lys Lys Leu Ala
        195                 200                 205
Ala Lys Lys Lys Thr Asp Lys Lys Arg Ala Leu Arg Ala Leu Arg Arg
    210                 215                 220
Leu
225
<210>15
<211>363
<212>PRT
<213>智人
<400>15
Met Gln Ala Phe Leu Lys Gly Thr Ser Ile Ser Thr Lys Pro Pro Leu
1               5                   10                  15
Thr Lys Asp Arg Gly Val Ala Ala Ser Ala Gly Ser Ser Gly Glu Asn
            20                  25                  30
Lys Lys Ala Lys Pro Val Pro Trp Val Glu Lys Tyr Arg Pro Lys Cys
        35                  40                  45
Val Asp Glu Val Ala Phe Gln Glu Glu Val Val Ala Val Leu Lys Lys
    50                  55                  60
Ser Leu Glu Gly Ala Asp Leu Pro Asn Leu Leu Phe Tyr Gly Pro Pro
65                  70                  75                  80
Gly Thr Gly Lys Thr Ser Thr Ile Leu Ala Ala Ala Arg Glu Leu Phe
                85                  90                  95
Gly Pro Glu Leu Phe Arg Leu Arg Val Leu Glu Leu Asn Ala Ser Asp
            100                 105                 110
Glu Arg Gly Ile Gln Val Val Arg Glu Lys Val Lys Asn Phe Ala Gln
        115                 120                 125
Leu Thr Val Ser Gly Ser Arg Ser Asp Gly Lys Pro Cys Pro Pro Phe
    130                 135                 140
Lys Ile Val Ile Leu Asp Glu Ala Asp Ser Met Thr Ser Ala Ala Gln
145                 150                 155                 160
Ala Ala Leu Arg Arg Thr Met Glu Lys Glu Ser Lys Thr Thr Arg Phe
                165                 170                 175
Cys Leu Ile Cys Asn Tyr Val Ser Arg Ile Ile Glu Pro Leu Thr Ser
            180                 185                 190
Arg Cys Ser Lys Phe Arg Phe Lys Pro Leu Ser Asp Lys Ile Gln Gln
        195                 200                 205
Gln Arg Leu Leu Asp Ile Ala Lys Lys Glu Asn Val Lys Ile Ser Asp
    210                 215                 220
Glu Gly Ile Ala Tyr Leu Val Lys Val Ser Glu Gly Asp Leu Arg Lys
225                 230                 235                 240
Ala Ile Thr Phe Leu Gln Ser Ala Thr Arg Leu Thr Gly Gly Lys Glu
                245                 250                 255
Ile Thr Glu Lys Val Ile Thr Asp Ile Ala Gly Val Ile Pro Ala Glu
            260                 265                 270
Lys Ile Asp Gly Val Phe Ala Ala Cys Gln Ser Gly Ser Phe Asp Lys
        275                 280                 285
Leu Glu Ala Val Val Lys Asp Leu Ile Asp Glu Gly His Ala Ala Thr
    290                 295                 300
Gln Leu Val Asn Gln Leu His Asp Val Val Val Glu Asn Asn Leu Ser
305                 310                 315                 320
Asp Lys Gln Lys Ser Ile Ile Thr Glu Lys Leu Ala Glu Val Asp Lys
                325                 330                 335
Cys Leu Ala Asp Gly Ala Asp Glu His Leu Gln Leu Ile Ser Leu Cys
            340                 345                 350
Ala Thr Val Met Gln Gln Leu Ser Gln Asn Cys
        355                 360
<210>16
<211>377
<212>PRT
<213>智人
<400>16
Met Asp Pro Ala Ala Arg Val Val Arg Ala Leu Trp Pro Gly Gly Cys
1               5                   10                  15
Ala Leu Ala Trp Arg Leu Gly Gly Arg Pro Gln Pro Leu Leu Pro Thr
            20                  25                  30
Gln Ser Arg Ala Gly Phe Ala Gly Ala Ala Gly Gly Pro Ser Pro Val
        35                  40                  45
Ala Ala Ala Arg Lys Gly Ser Pro Arg Leu Leu Gly Ala Ala Ala Leu
    50                  55                  60
Ala Leu Gly Gly Ala Leu Gly Leu Tyr His Thr Ala Arg Trp His Leu
65                  70                  75                  80
Arg Ala Gln Asp Leu His Ala Glu Arg Ser Ala Ala Gln Leu Ser Leu
                85                  90                  95
Ser Ser Arg Leu Gln Leu Thr Leu Tyr Gln Tyr Lys Thr Cys Pro Phe
            100                 105                 110
Cys Ser Lys Val Arg Ala Phe Leu Asp Phe His Ala Leu Pro Tyr Gln
        115                 120                 125
Val Val Glu Val Asn Pro Val Arg Arg Ala Glu Ile Lys Phe Ser Ser
    130                 135                 140
Tyr Arg Lys Val Pro Ile Leu Val Ala Gln Glu Gly Glu Ser Ser Gln
145                 150                 155                 160
Gln Leu Asn Asp Ser Ser Val Ile Ile Ser Ala Leu Lys Thr Tyr Leu
                165                 170                 175
Val Ser Gly Gln Pro Leu Glu Glu Ile Ile Thr Tyr Tyr Pro Ala Met
            180                 185                 190
Lys Ala Val Asn Glu Gln Gly Lys Glu Val Thr Glu Phe Gly Asn Lys
        195                 200                 205
Tyr Trp Leu Met Leu Asn Glu Lys Glu Ala Gln Gln Val Tyr Gly Gly
    210                 215                 220
Lys Glu Ala Arg Thr Glu Glu Met Lys Trp Arg Gln Trp Ala Asp Asp
225                 230                 235                 240
Trp Leu Val His Leu Ile Ser Pro Asn Val Tyr Arg Thr Pro Thr Glu
                245                 250                 255
Ala Leu Ala Ser Phe Asp Tyr Ile Val Arg Glu Gly Lys Phe Gly Ala
            260                 265                 270
Val Glu Gly Ala Val Ala Lys Tyr Met Gly Ala Ala Ala Met Tyr Leu
        275                 280                 285
Ile Ser Lys Arg Leu Lys Ser Arg His Arg Leu Gln Asp Asn Val Arg
    290                 295                 300
Glu Asp Leu Tyr Glu Ala Ala Asp Lys Trp Val Ala Ala Val Gly Lys
305                 310                 315                 320
Asp Arg Pro Phe Met Gly Gly Gln Lys Pro Asn Leu Ala Asp Leu Ala
                325                 330                 335
Val Tyr Gly Val Leu Arg Val Met Glu Gly Leu Asp Ala Phe Asp Asp
            340                 345                 350
Leu Met Gln His Thr His Ile Gln Pro Trp Tyr Leu Arg Val Glu Arg
        355                 360                 365
Ala Ile Thr Glu Ala Ser Pro Ala His
    370                 375
<210>17
<211>256
<212>PRT
<213>智人
<400>17
Met Lys Leu Leu Glu Asn Ser Ser Phe Glu Ala Ile Asn Ser Gln Leu
1               5                   10                  15
Thr Val Glu Thr Gly Asp Ala His Ile Ile Gly Arg Ile Glu Ser Tyr
            20                  25                  30
Ser Cys Lys Met Ala Gly Asp Asp Lys His Met Phe Lys Gln Phe Cys
        35                  40                  45
Gln Glu Gly Gln Pro His Val Leu Glu Ala Leu Ser Pro Pro Gln Thr
    50                  55                  60
Ser Gly Leu Ser Pro Ser Arg Leu Ser Lys Ser Gln Gly Gly Glu Glu
65                  70                  75                  80
Glu Gly Pro Leu Ser Asp Lys Cys Ser Arg Lys Thr Leu Phe Tyr Leu
                85                  90                  95
Ile Ala Thr Leu Asn Glu Ser Phe Arg Pro Asp Tyr Asp Phe Ser Thr
            100                 105                 110
Ala Arg Ser His Glu Phe Ser Arg Glu Pro Ser Leu Ser Trp Val Val
        115                 120                 125
Asn Ala Val Asn Cys Ser Leu Phe Ser Ala Val Arg Glu Asp Phe Lys
    130                 135                 140
Asp Leu Lys Pro Gln Leu Trp Asn Ala Val Asp Glu Glu Ile Cys Leu
145                 150                 155                 160
Ala Glu Cys Asp Ile Tyr Ser Tyr Asn Pro Asp Leu Asp Ser Asp Pro
                165                 170                 175
Phe Gly Glu Asp Gly Ser Leu Trp Ser Phe Asn Tyr Phe Phe Tyr Asn
            180                 185                 190
Lys Arg Leu Lys Arg Ile Val Phe Phe Ser Cys Arg Ser Ile Ser Gly
        195                 200                 205
Ser Thr Tyr Thr Pro Ser Glu Ala Gly Asn Glu Leu Asp Met Glu Leu
    210                 215                 220
Gly Glu Glu Glu Val Glu Glu Glu Ser Arg Ser Arg Gly Ser Gly Ala
225                 230                 235                 240
Glu Glu Thr Ser Thr Met Glu Glu Asp Arg Val Pro Val Ile Cys Ile
                245                 250                 255
<210>18
<211>512
<212>PRT
<213>智人
<400>18
Met Thr Ala Pro Trp Val Ala Leu Ala Leu Leu Trp Gly Ser Leu Trp
1               5                   10                  15
Pro Gly Ser Gly Arg Gly Glu Ala Glu Thr Arg Glu Cys Ile Tyr Tyr
            20                  25                  30
Asn Ala Asn Trp Glu Leu Glu Arg Thr Asn Gln Ser Gly Leu Glu Arg
        35                  40                  45
Cys Glu Gly Glu Gln Asp Lys Arg Leu His Cys Tyr Ala Ser Trp Ala
    50                  55                  60
Asn Ser Ser Gly Thr Ile Glu Leu Val Lys Lys Gly Cys Trp Leu Asp
65                  70                  75                  80
Asp Phe Asn Cys Tyr Asp Arg Gln Glu Cys Val Ala Thr Glu Glu Asn
                85                  90                  95
Pro Gln Val Tyr Phe Cys Cys Cys Glu Gly Asn Phe Cys Asn Glu Arg
            100                 105                 110
Phe Thr His Leu Pro Glu Ala Gly Gly Pro Glu Val Thr Tyr Glu Pro
        115                 120                 125
Pro Pro Thr Ala Pro Thr Leu Leu Thr Val Leu Ala Tyr Ser Leu Leu
    130                 135                 140
Pro Ile Gly Gly Leu Ser Leu Ile Val Leu Leu Ala Phe Trp Met Tyr
145                 150                 155                 160
Arg His Arg Lys Pro Pro Tyr Gly His Val Asp Ile His Glu Asp Pro
                165                 170                 175
Gly Pro Pro Pro Pro Ser Pro Leu Val Gly Leu Lys Pro Leu Gln Leu
            180                 185                 190
Leu Glu Ile Lys Ala Arg Gly Arg Phe Gly Cys Val Trp Lys Ala Gln
        195                 200                 205
Leu Met Asn Asp Phe Val Ala Val Lys Ile Phe Pro Leu Gln Asp Lys
    210                 215                 220
Gln Ser Trp Gln Ser Glu Arg Glu Ile Phe Ser Thr Pro Gly Met Lys
225                 230                 235                 240
His Glu Asn Leu Leu Gln Phe Ile Ala Ala Glu Lys Arg Gly Ser Asn
                245                 250                 255
Leu Glu Val Glu Leu Trp Leu Ile Thr Ala Phe His Asp Lys Gly Ser
            260                 265                 270
Leu Thr Asp Tyr Leu Lys Gly Asn Ile Ile Thr Trp Asn Glu Leu Cys
        275                 280                 285
His Val Ala Glu Thr Met Ser Arg Gly Leu Ser Tyr Leu His Glu Asp
    290                 295                 300
Val Pro Trp Cys Arg Gly Glu Gly His Lys Pro Ser Ile Ala His Arg
305                 310                 315                 320
Asp Phe Lys Ser Lys Asn Val Leu Leu Lys Ser Asp Leu Thr Ala Val
                325                 330                 335
Leu Ala Asp Phe Gly Leu Ala Val Arg Phe Glu Pro Gly Lys Pro Pro
            340                 345                 350
Gly Asp Thr His Gly Gln Val Gly Thr Arg Arg Tyr Met Ala Pro Glu
        355                 360                 365
Val Leu Glu Gly Ala Ile Asn Phe Gln Arg Asp Ala Phe Leu Arg Ile
    370                 375                 380
Asp Met Tyr Ala Met Gly Leu Val Leu Trp Glu Leu Val Ser Arg Cys
385                 390                 395                 400
Lys Ala Ala Asp Gly Pro Val Asp Glu Tyr Met Leu Pro Phe Glu Glu
                405                 410                 415
Glu Ile Gly Gln His Pro Ser Leu Glu Glu Leu Gln Glu Val Val Val
            420                 425                 430
His Lys Lys Met Arg Pro Thr Ile Lys Asp His Trp Leu Lys His Pro
        435                 440                 445
Gly Leu Ala Gln Leu Cys Val Thr Ile Glu Glu Cys Trp Asp His Asp
    450                 455                 460
Ala Glu Ala Arg Leu Ser Ala Gly Cys Val Glu Glu Arg Val Ser Leu
465                 470                 475                 480
Ile Arg Arg Ser Val Asn Gly Thr Thr Ser Asp Cys Leu Val Ser Leu
                485                 490                 495
Val Thr Ser Val Thr Asn Val Asp Leu Pro Pro Lys Glu Ser Ser Ile
            500                 505                 510
<210>19
<211>218
<212>PRT
<213>智人
<400>19
Met Ala Leu Val Pro Tyr Glu Glu Thr Thr Glu Phe Gly Leu Gln Lys
1               5                   10                  15
Phe His Lys Pro Leu Ala Thr Phe Ser Phe Ala Asn His Thr Ile Gln
            20                  25                  30
Ile Arg Gln Asp Trp Arg His Leu Gly Val Ala Ala Val Val Trp Asp
        35                  40                  45
Ala Ala Ile Val Leu Ser Thr Tyr Leu Glu Met Gly Ala Val Glu Leu
    50                  55                  60
Arg Gly Arg Ser Ala Val Glu Leu Gly Ala Gly Thr Gly Leu Val Gly
65                  70                  75                  80
Ile Val Ala Ala Leu Leu Gly Ala His Val Thr Ile Thr Asp Arg Lys
                85                  90                  95
Val Ala Leu Glu Phe Leu Lys Ser Asn Val Gln Ala Asn Leu Pro Pro
            100                 105                 110
His Ile Gln Thr Lys Thr Val Val Lys Glu Leu Thr Trp Gly Gln Asn
        115                 120                 125
Leu Gly Ser Phe Ser Pro Gly Glu Phe Asp Leu Ile Leu Gly Ala Asp
    130                 135                 140
Ile Ile Tyr Leu Glu Glu Thr Phe Thr Asp Leu Leu Gln Thr Leu Glu
145                 150                 155                 160
His Leu Cys Ser Asn His Ser Val Ile Leu Leu Ala Cys Arg Ile Arg
                165                 170                 175
Tyr Glu Arg Asp Asn Asn Phe Leu Ala Met Leu Glu Arg Gln Phe Ile
            180                 185                 190
Val Arg Lys Val His Tyr Asp Pro Glu Lys Asp Val His Ile Tyr Glu
        195                 200                 205
Ala Gln Lys Arg Asn Gln Lys Glu Asp Leu
    210                 215
<210>20
<211>329
<212>PRT
<213>智人
<400>20
Met Val Arg Thr Lys Thr Trp Thr Leu Lys Lys His Phe Val Gly Tyr
1               5                   10                  15
Pro Thr Asn Ser Asp Phe Glu Leu Lys Thr Ala Glu Leu Pro Pro Leu
            20                  25                  30
Lys Asn Gly Glu Val Leu Leu Glu Ala Leu Phe Leu Thr Val Asp Pro
        35                  40                  45
Tyr Met Arg Val Ala Ala Lys Arg Leu Lys Glu Gly Asp Thr Met Met
    50                  55                  60
Gly Gln Gln Val Ala Lys Val Val Glu Ser Lys Asn Val Ala Leu Pro
65                  70                  75                  80
Lys Gly Thr Ile Val Leu Ala Ser Pro Gly Trp Thr Thr His Ser Ile
                85                  90                  95
Ser Asp Gly Lys Asp Leu Glu Lys Leu Leu Thr Glu Trp Pro Asp Thr
            100                 105                 110
Ile Pro Leu Ser Leu Ala Leu Gly Thr Val Gly Met Pro Gly Leu Thr
        115                 120                 125
Ala Tyr Phe Gly Leu Leu Glu Ile Cys Gly Val Lys Gly Gly Glu Thr
    130                 135                 140
Val Met Val Asn Ala Ala Ala Gly Ala Val Gly Ser Val Val Gly Gln
145                 150                 155                 160
Ile Ala Lys Leu Lys Gly Cys Lys Val Val Gly Ala Val Gly Ser Asp
                165                 170                 175
Glu Lys Val Ala Tyr Leu Gln Lys Leu Gly Phe Asp Val Val Phe Asn
            180                 185                 190
Tyr Lys Thr Val Glu Ser Leu Glu Glu Thr Leu Lys Lys Ala Ser Pro
        195                 200                 205
Asp Gly Tyr Asp Cys Tyr Phe Asp Asn Val Gly Gly Glu Phe Ser Asn
    210                 215                 220
Thr Val Ile Gly Gln Met Lys Lys Phe Gly Arg Ile Ala Ile Cys Gly
225                 230                 235                 240
Ala Ile Ser Thr Tyr Asn Arg Thr Gly Pro Leu Pro Pro Gly Pro Pro
                245                 250                 255
Pro Glu Ile Val Ile Tyr Gln Glu Leu Arg Met Glu Ala Phe Val Val
            260                 265                 270
Tyr Arg Trp Gln Gly Asp Ala Arg Gln Lys Ala Leu Lys Asp Leu Leu
        275                 280                 285
Lys Trp Val Leu Glu Gly Lys Ile Gln Tyr Lys Glu Tyr Ile Ile Glu
    290                 295                 300
Gly Phe Glu Asn Met Pro Ala Ala Phe Met Gly Met Leu Lys Gly Asp
305                 310                 315                 320
Asn Leu Gly Lys Thr Ile Val Lys Ala
                325
<210>21
<211>84
<212>PRT
<213>智人
<400>21
Met Ala Thr Gly Thr Asp Gln Val Val Gly Leu Gly Leu Val Ala Val
1               5                   10                  15
Ser Leu Ile Ile Phe Thr Tyr Tyr Thr Ala Trp Val Ile Leu Leu Pro
            20                  25                  30
Phe Ile Asp Ser Gln His Val Ile His Lys Tyr Phe Leu Pro Arg Ala
        35                  40                  45
Tyr Ala Val Ala Ile Pro Leu Ala Ala Gly Leu Leu Leu Leu Leu Phe
    50                  55                  60
Val Gly Leu Phe Ile Ser Tyr Val Met Leu Lys Thr Lys Arg Val Thr
65                  70                  75                  80
Lys Lys Ala Gln
<210>22
<211>116
<212>PRT
<213>智人
<400>22
Met Ser Phe Cys Ser Phe Phe Gly Gly Glu Val Phe Gln Asn His Phe
1               5                   10                  15
Glu Pro Gly Val Tyr Val Cys Ala Lys Cys Gly Tyr Glu Leu Phe Ser
            20                  25                  30
Ser Arg Ser Lys Tyr Ala His Ser Ser Pro Trp Pro Ala Phe Thr Glu
        35                  40                  45
Thr Ile His Ala Asp Ser Val Ala Lys Arg Pro Glu His Asn Arg Ser
    50                  55                  60
Glu Ala Leu Lys Val Ser Cys Gly Lys Cys Gly Asn Gly Leu Gly His
65                  70                  75                  80
Glu Pne Leu Asn Asp Gly Pro Lys Pro Gly Gln Ser Arg Phe Sec Ile
                85                  90                  95
Phe Ser Ser Ser Leu Lys Phe Val Pro Lys Gly Lys Glu Thr Ser Ala
            100                 105                 110
Ser Gln Gly His
        115
<210>23
<211>255
<212>PRT
<213>智人
<400>23
Met Ser Ser Ile Gly Thr Gly Tyr Asp Leu Ser Ala Ser Thr Phe Ser
1               5                   10                  15
Pro Asp Gly Arg Val Phe Gln Val Glu Tyr Ala Met Lys Ala Val Glu
            20                  25                  30
Asn Ser Ser Thr Ala Ile Gly Ile Arg Cys Lys Asp Gly Val Val Phe
        35                  40                  45
Gly Val Glu Lys Leu Val Leu Ser Lys Leu Tyr Glu Glu Gly Ser Asn
    50                  55                  60
Lys Arg Leu Phe Asn Val Asp Arg His Val Gly Met Ala Val Ala Gly
65                  70                  75                  80
Leu Leu Ala Asp Ala Arg Ser Leu Ala Asp Ile Ala Arg Glu Glu Ala
                85                  90                  95
Ser Asn Phe Arg Ser Asn Phe Gly Tyr Asn Ile Pro Leu Lys His Leu
            100                 105                 110
Ala Asp Arg Val Ala Met Tyr Val His Ala Tyr Thr Leu Tyr Ser Ala
        115                 120                 125
Val Arg Pro Phe Gly Cys Ser Phe Met Leu Gly Ser Tyr Ser Val Asn
    130                 135                 140
Asp Gly Ala Gln Leu Tyr Met Ile Asp Pro Ser Gly Val Ser Tyr Gly
145                 150                 155                 160
Tyr Trp Gly Cys Ala Ile Gly Lys Ala Arg Gln Ala Ala Lys Thr Glu
                165                 170                 175
Ile Glu Lys Leu Gln Met Lys Glu Met Thr Cys Arg Asp Ile Val Lys
            180                 185                 190
Glu Val Ala Lys Ile Ile Tyr Ile Val His Asp Glu Val Lys Asp Lys
        195                 200                 205
Ala Phe Glu Leu Glu Leu Ser Trp Val Gly Glu Leu Thr Asn Gly Arg
    210                 215                 220
His Glu Ile Val Pro Lys Asp Ile Arg Glu Glu Ala Glu Lys Tyr Ala
225                 230                 235                 240
Lys Glu Ser Leu Lys Glu Glu Asp Glu Ser Asp Asp Asp Asn Met
                245                 250                 255
<210>24
<211>227
<212>PRT
<213>智人
<400>24
Met Gly Gly Thr Thr Ser Thr Arg Arg Val Thr Phe Glu Ala Asp Glu
1               5                   10                  15
Asn Glu Asn Ile Thr Val Val Lys Gly Ile Arg Leu Ser Glu Asn Val
            20                  25                  30
Ile Asp Arg Met Lys Glu Ser Ser Pro Ser Gly Ser Lys Ser Gln Arg
        35                  40                  45
Tyr Ser Gly Ala Tyr Gly Ala Ser Val Ser Asp Glu Glu Leu Lys Arg
    50                  55                  60
Arg Val Ala Glu Glu Leu Ala Leu Glu Gln Ala Lys Lys Glu Ser Glu
65                  70                  75                  80
Asp Gln Lys Arg Leu Lys Gln Ala Lys Glu Leu Asp Arg Glu Arg Ala
                85                  90                  95
Ala Ala Asn Glu Gln Leu Thr Arg Ala Ile Leu Arg Glu Arg Ile Cys
            100                 105                 110
Ser Glu Glu Glu Arg Ala Lys Ala Lys His Leu Ala Arg Gln Leu Glu
        115                 120                 125
Glu Lys Asp Arg Val Leu Lys Lys Gln Asp Ala Phe Tyr Lys Glu Gln
    130                 135                 140
Leu Ala Arg Leu Glu Glu Arg Ser Ser Glu Phe Tyr Arg Val Thr Thr
145                 150                 155                 160
Glu Gln Tyr Gln Lys Ala Ala Glu Glu Val Glu Ala Lys Phe Lys Arg
                165                 170                 175
Tyr Glu Ser His Pro Val Cys Ala Asp Leu Gln Ala Lys Ile Leu Gln
            180                 185                 190
Cys Tyr Arg Glu Asn Thr His Gln Thr Leu Lys Cys Ser Ala Leu Ala
        195                 200                 205
Thr Gln Tyr Met His Cys Val Asn His Ala Lys Gln Ser Met Leu Glu
    210                 215                 220
Lys Gly Gly
225
<210>25
<211>102
<212>PRT
<213>智人
<400>25
Met Ala Asp Asp Val Asp Gln Gln Gln Thr Thr Asn Thr Val Glu Glu
1               5                   10                  15
Pro Leu Asp Leu Ile Arg Leu Ser Leu Asp Glu Arg Ile Tyr Val Lys
            20                  25                  30
Met Arg Asn Asp Arg Glu Leu Arg Gly Arg Leu His Ala Tyr Asp Gln
        35                  40                  45
His Leu Asn Met Ile Leu Gly Asp Val Glu Glu Thr Val Thr Thr Ile
    50                  55                  60
Glu Ile Asp Glu Glu Thr Tyr Glu Glu Ile Tyr Lys Ser Thr Lys Arg
65                  70                  75                  80
Asn Ile Pro Met Leu Phe Val Arg Gly Asp Gly Val Val Leu Val Ala
                85                  90                  95
Pro Pro Leu Arg Val Gly
            100
<210>26
<211>720
<212>PRT
<213>智人
<400>26
Met Asp Asp Pro Lys Lys Glu Asp Ile Leu Leu Leu Ala Asp Glu Lys
1               5                   10                  15
Phe Asp Phe Asp Leu Ser Leu Ser Ser Ser Ser Ala Asn Glu Asp Asp
            20                  25                  30
Glu Val Phe Phe Gly Pro Phe Gly His Lys Glu Arg Cys Ile Ala Ala
        35                  40                  45
Ser Leu Glu Leu Asn Asn Pro Val Pro Glu Gln Pro Pro Leu Pro Thr
    50                  55                  60
Ser Glu Ser Pro Phe Ala Trp Ser Pro Leu Ala Gly Glu Lys Phe Val
65                  70                  75                  80
Glu Val Tyr Lys Glu Ala His Leu Leu Ala Leu His Ile Glu Ser Ser
                85                  90                  95
Ser Arg Asn Gln Ala Ala Gln Ala Ala Lys Pro Glu Asp Pro Arg Ser
            100                 105                 110
Gln Gly Val Glu Arg Phe Ile Gln Glu Ser Lys Leu Lys lle Asn Leu
        115                 120                 125
Phe Glu Lys Glu Lys Glu Met Lys Lys Ser Pro Thr Ser Leu Lys Arg
    130                 135                 140
Glu Thr Tyr Tyr Leu Ser Asp Ser Pro Leu Leu Gly Pro Pro Val Gly
145                 150                 155                 160
Glu Pro Arg Leu Leu Ala Ser Ser Pro Ala Leu Pro Ser Ser Gly Ala
                165                 170                 175
Gln Ala Arg Leu Thr Arg Ala Pro Gly Pro Pro His Ser Ala His Ala
            180                 185                 190
Leu Pro Arg Glu Ser Cys Thr Ala His Ala Ala Ser Gln Ala Ala Thr
        195                 200                 205
Gln Arg Lys Pro Gly Thr Lys Leu Leu Leu Pro Arg Ala Ala Ser Val
    210                 215                 220
Arg Gly Arg Ser Ile Pro Gly Ala Ala Glu Lys Pro Lys Lys Glu Ile
225                 230                 235                 240
Pro Ala Ser Pro Ser Arg Thr Lys Ile Pro Ala Glu Lys Glu Ser His
                245                 250                 255
Arg Asp Val Leu Pro Asp Lys Pro Ala Pro Gly Ala Val Asn Val Pro
            260                 265                 270
Ala Ala Gly Ser His Leu Gly Gln Gly Lys Arg Ala Ile Pro Val Pro
        275                 280                 285
Asn Lys Leu Gly Leu Lys Lys Thr Leu Leu Lys Ala Pro Gly Ser Thr
    290                 295                 300
Ser Asn Leu Ala Arg Lys Ser Ser Ser Gly Pro Val Trp Ser Gly Ala
305                 310                 315                 320
Ser Ser Ala Cys Thr Ser Pro Ala Val Gly Lys Ala Lys Ser Ser Glu
                325                 330                 335
Phe Ala Ser Ile Pro Ala Asn Ser Ser Arg Pro Leu Ser Asn Ile Ser
            340                 345                 350
Lys Ser Gly Arg Met Gly Pro Ala Met Leu Arg Pro Ala Leu Pro Ala
        355                 360                 365
Gly Pro Val Gly Ala Ser Ser Trp Gln Ala Lys Arg Val Asp Val Ser
    370                 375                 380
Glu Leu Ala Ala Glu Gln Leu Thr Ala Pro Pro Ser Ala Ser Pro Thr
385                 390                 395                 400
Gln Pro Gln Thr Pro Glu Gly Gly Gly Gln Trp Leu Asn Ser Ser Cys
                405                 410                 415
Ala Trp Ser Glu Ser Ser Gln Leu Asn Lys Thr Arg Ser Ile Arg Arg
            420                 425                 430
Arg Asp Ser Cys Leu Asn Ser Lys Thr Lys Val Met Pro Thr Pro Thr
        435                 440                 445
Asn Gln Phe Lys Ile Pro Lys Phe Ser Ile Gly Asp Ser Pro Asp Ser
    450                 455                 460
Ser Thr Pro Lys Leu Ser Arg Ala Gln Arg Pro Gln Ser Cys Thr Ser
465                 470                 475                 480
Val Gly Arg Val Thr Val His Ser Thr Pro Val Arg Arg Ser Ser Gly
                485                 490                 495
Pro Ala Pro Gln Ser Leu Leu Ser Ala Arg Arg Val Ser Ala Leu Pro
            500                 505                 510
Thr Pro Ala Ser Arg Arg Cys Ser Gly Leu Pro Pro Met Thr Pro Lys
        515                 520                 525
Thr Met Pro Arg Ala Val Gly Ser Pro Leu Cys Val Pro Ala Arg Arg
    530                 535                 540
Arg Ser Ser Glu Pro Arg Lys Asn Ser Ala Met Arg Thr Glu Pro Thr
545                 550                 555                 560
Arg Glu Ser Asn Arg Lys Thr Asp Ser Arg Leu Val Asp Val Ser Pro
                565                 570                 575
Asp Arg Gly Ser Pro Pro Ser Arg Val Pro Gln Ala Leu Asn Phe Ser
            580                 585                 590
Pro Glu Glu Ser Asp Ser Thr Phe Ser Lys Ser Thr Ala Thr Glu Val
        595                 600                 605
Ala Arg Glu Glu Ala Lys Pro Gly Gly Asp Ala Ala Pro Ser Glu Ala
    610                 615                 620
Leu Leu Val Asp Ile Lys Leu Glu Pro Leu Ala Val Thr Pro Asp Ala
625                 630                 635                 640
Ala Ser Gln Pro Leu Ile Asp Leu Pro Leu Ile Asp Phe Cys Asp Thr
                645                 650                 655
Pro Glu Ala His Val Ala Val Gly Ser Glu Ser Arg Pro Leu Ile Asp
            660                 665                 670
Leu Met Thr Asn Thr Pro Asp Met Asn Lys Asn Val Ala Lys Pro Ser
        675                 680                 685
Pro Val Val Gly Gln Leu Ile Asp Leu Ser Ser Pro Leu Ile Gln Leu
    690                 695                 700
Ser Pro Glu Ala Asp Lys Glu Asn Val Asp Ser Pro Leu Leu Lys Phe
705                 710                 715                 720
<210>27
<211>21
<212>RNA
<213>人工序列
<220>
<223>siRNA-1(44-64)oligonucleotide(sense)for human UBE2S mRNA
<400>27
ccggccggcc gcagccauga a                    21
<210>28
<211>21
<212>RNA
<213>人工序列
<220>
<223>siRNA-1(146-166)oligonucleotide(sense)for human UBE2S mRNA
<400>28
uggcaucaag gucuuuccca a                    21
<210>29
<211>19
<212>RNA
<213>人工序列
<220>
<223>siRNA-2oligonucleotide(sense)for human UBE2S mRNA
<400>29
ggagaacuac gaggaguau                       19
<210>30
<211>19
<212>RNA
<213>人工序列
<220>
<223>siRNA-3oligonucleotide(sense)for human UBE2S mRNA
<400>30
uggcgagcgc gauaagaag                       19
<210>31
<211>21
<212>RNA
<213>人工序列
<220>
<223>siRNA-1(897-917)oligonucleotide(sense)for human RFC4mRNA
<400>31
agggaauagc uuaucuuguu a                    21
<210>32
<211>21
<212>RNA
<213>人工序列
<220>
<223>siRNA-1(189-209)oligonucleotide(sense)for human RFC4mRNA
<400>32
cugcacgaga agccaggcua a                     21
<210>33
<211>19
<212>RNA
<213>人工序列
<220>
<223>siRNA-2oligonucleotide(sense)for human RFC4mRNA
<400>33
ccgauucugu cuuaucugu                        19
<210>34
<211>19
<212>RNA
<213>人工序列
<220>
<223>siRNA-3oligonucleotide(sense)for human RFC4mRNA
<400>34
ggguaauacc agcugagaa                        19
<210>35
<211>21
<212>RNA
<213>人工序列
<220>
<223>siRNA-1(2003-2023)oligonucleotide(sense)for human PTGES2mRNA
<400>35
cugggacaug uuugcaauaa a                     21
<210>36
<211>21
<212>RNA
<213>人工序列
<220>
<223>siRNA-1(1105-1125)oligonucleotide(sense)for human PTGES2mRNA
<400>36
cuggcucaug cucaacgaga a                     21
<210>37
<211>19
<212>RNA
<213>人工序列
<220>
<223>siRNA-2oligonucleotide(sense)for human PTGES2mRNA
<400>37
aggagaaagc ucgcaacaa                        19
<210>38
<211>19
<212>RNA
<213>人工序列
<220>
<223>siRNA-3oligonucleotide(sense)for human PTGES2mRNA
<400>38
ccgaguucgg caauaagua                        19
<210>39
<211>2l
<212>RNA
<213>人工序列
<220>
<223>siRNA-1(1538-1558)oligonucleotide(sense)for human MAF1mRNA
<400>39
cagcuggacc gcagaguuua u                     21
<210>40
<211>21
<212>RNA
<213>人工序列
<220>
<223>siRNA-1(1031-1051)oligonucleotide(sense)for human MAF1mRNA
<400>40
uagccucugg uccuucaacu a                     21
<210>41
<211>19
<212>RNA
<213>人工序列
<220>
<223>siRNA-2oligonucleotide(sense)for human MAF1mRNA
<400>41
acgacaaaca cauguucaa                       19
<210>42
<211>19
<212>RNA
<213>人工序列
<220>
<223>siRNA-3oligonucleotide(sense)for human MAF1mRNA
<400>42
gccuuagcug gguggugaa                       19
<210>43
<211>21
<212>RNA
<213>人工序列
<220>
<223>siRNA-1(626-646)oligonucleotide(sense)for human ACVR2B mRNA
<400>43
cagcucauga augacuuugu a                    21
<210>44
<211>21
<212>RNA
<213>人工序列
<220>
<223>siRNA-1(208-228)oligonucleotide(sense)for human ACVR2B mRNA
<400>44
caccaucgag cucgugaaga a                    21
<210>45
<211>19
<212>RNA
<213>人工序列
<220>
<223>siRNA-2oligonucleotide(sense)for human ACVR2B mRNA
<400>45
ggcagaguga acgggagau                       19
<210>46
<211>19
<212>RNA
<213>人工序列
<220>
<223>siRNA-3oligonucleotide(sense)for human ACVR2B mRNA
<400>46
ggaacaucau cacauggaa                       19
<210>47
<211>21
<212>RNA
<213>人工序列
<220>
<223>siRNA-1(754-774)oligonucleotide(sense)for human LOC151194mRNA
<400>47
aagguucacu acgauccuga a                    21
<210>48
<211>21
<212>RNA
<213>人工序列
<220>
<223>siRNA-1(1068-1088)oligonucleotide(sense)for human LOC151194mRNA
<400>48
ucgauuuaug cuauuugugu a                    21
<210>49
<211>19
<212>RNA
<213>人工序列
<220>
<223>siRNA-2oligonucleotide(sense)for human LOC151194mRNA
<400>49
ggaauuuggg uugcagaaa                        19
<210>50
<211>19
<212>RNA
<213>人工序列
<220>
<223>siRNA-3oligonucleotide(sense)for human LOC151194mRNA
<400>50
ccagaaggag gacuuauaa                        19
<210>51
<211>21
<212>RNA
<213>人工序列
<220>
<223>siRNA-1(705-725)oligonucleotide(sense)for human LTB4DH mRNA
<400>51
cacuguuauc ggccagauga a                     21
<210>52
<211>21
<212>RNA
<213>人工序列
<220>
<223>siRNA-1(588-608)oligonucleotide(sense)for human LTB4DH mRNA
<400>52
uggauuugau gucgucuuua a                     21
<210>53
<211>19
<212>RNA
<213>人工序列
<220>
<223>siRNA-2oligonucleotide(sense)for human LTB4DH mRNA
<400>53
gccaaaagau ugaaggaag                        19
<210>54
<211>19
<212>RNA
<213>人工序列
<220>
<223>siRNA-3oligonucleotide(sense)for human LTB4DH mRNA
<400>54
ccugaugguu augauuguu                        19
<210>55
<211>21
<212>RNA
<213>人工序列
<220>
<223>siRNA-1(145-165乯oligonucleotide(sense)for human DPM2mRNA
<400>55
cagcauguca uccacaagua u                     21
<210>56
<211>21
<212>RNA
<213>人工序列
<220>
<223>siRNA-1(84-104乯oligonucleotide(sense)for human DPM2mRNA
<400>56
uagccugauc aucuucaccu a                     21
<210>57
<211>19
<212>RNA
<213>人工序列
<220>
<223>siRNA-2oligonucleotide(sense)for human DPM2mRNA
<400>57
gggugauucu cuugccauu                         19
<210>58
<211>19
<212>RNA
<213>人工序列
<220>
<223>siRNA-3oligonucleotide(sense)for human DPM2mRNA
<400>58
uguuuguggg acuguucau                         19
<210>59
<211>21
<212>RNA
<213>人工序列
<220>
<223>siRNA-1(870-890乯oligonucleotide(sense)for human SEPX1mRNA
<400>59
cagacucucg uccucaccga a                      21
<210>60
<211>21
<212>RNA
<213>人工序列
<220>
<223>siRNA-1(794-814乯oligonucleotide(sense)for human SEPX1mRNA
<400>60
cugaaugacg uuacacccuc a                      21
<210>61
<211>19
<212>RNA
<213>人工序列
<220>
<223>siRNA-2oligonucleotide(sense)for human SEPX1mRNA
<400>61
gggcgagguu uuccagaau                        19
<210>62
<211>19
<212>RNA
<213>人工序列
<220>
<223>siRNA-3oligonucleotide(sense)for human SEPX1mRNA
<400>62
ucacuuugaa ccuggcguu                        19
<210>63
<211>21
<212>RNA
<213>人工序列
<220>
<223>siRNA-I(853-873乯oligonucleotide(sense)for human PSMA3mRNA
<400>63
ccaguccaau guaacuauuu a                     21
<210>64
<211>21
<212>RNA
<213>人工序列
<220>
<223>siRNA-1(686-706乯oligonucleotide(sense)for human PSMA3mRNA
<400>64
cucagcuggg uuggugaauu a                     21
<210>65
<211>19
<212>RNA
<213>人工序列
<220>
<223>siRNA-2oligonucleotide(sense)for human PSMA3mRNA
<400>65
uggcagaugc ucguucuuu                       19
<210>66
<211>19
<212>RNA
<213>人工序列
<220>
<223>siRNA-3oligonucleotide(sense)for human PSMA3mRNA
<400>66
gguguuucau acgguuauu                       19
<210>67
<211>21
<212>RNA
<213>人工序列
<220>
<223>siRNA-1(546-566)oligonucleotide(sense)for human CHCHD3mRNA
<400>67
caggaugcau ucuacaaaga a                    21
<210>68
<211>21
<212>RNA
<213>人工序列
<220>
<223>siRNA-1(1450-1470)oligonucleotide(sense)for human CHCHD3mRNA
<400>68
cuggaauaau guuuaugauu a                    21
<210>69
<211>19
<212>RNA
<213>人工序列
<220>
<223>siRNA-2oligonucleotide(sense)for human CHCHD3mRNA
<400>69
cgaagaucag aaacgacua                      19
<210>70
<211>19
<212>RNA
<213>人工序列
<220>
<223>siRNA-3oligonucleotide(sense)for human CHCHD3mRNA
<400>70
gagaaagacc gagugcuaa                      19
<210>71
<211>21
<212>RNA
<213>人工序列
<220>
<223>siRNA-1(540-560乯oligonucleotide(sense)for human LSM3mRNA
<400>71
uccaauaaau augaccacca a                   21
<210>72
<211>21
<212>RNA
<213>人工序列
<220>
<223>siRNA-1(37-57)oligonucleotide(sense)for human LSM3mRNA
<400>72
acgacguaga ccagcaacaa a                   21
<210>73
<211>19
<212>RNA
<213>人工序列
<220>
<223>siRNA-2oligonucleotide(sense)for human LSM3mRNA
<400>73
gacguagacc agcaacaaa                      19
<210>74
<211>19
<212>RNA
<213>人工序列
<220>
<223>siRNA-3oligonucleotide(sense)for human LSM3mRNA
<400>74
acgaaacgga auauuccaa                               19
<210>75
<211>19
<212>RNA
<213>人工序列
<220>
<223>siRNA-2oligonucleotide(sense)for human GTSE1mRNA
<400>75
gggcaaagcu aaaucaagu                              19
<210>76
<211>19
<212>RNA
<213>人工序列
<220>
<223>siRNA-3oligonucleotide(sense)for human GTSE1mRNA
<400>76
ugacaaacac uccagacau                              19

Claims (15)

1.一种用于判断癌细胞的永生化的基因标记,由多核苷酸构成,该多核苷酸与序列编号1~13中的任一个所示的碱基序列内的至少15个碱基长的连续碱基序列特异性杂交、且具有15个碱基长以上的碱基序列。
2.根据权利要求1所述的用于判断癌细胞的永生化的基因标记,为探针或引物。
3.一种永生化癌细胞的判断方法,包括下述工序(1)~(3):
(1)使RNA或该RNA的衍生物与权利要求1或2中任一项所述的基因标记结合的工序,其中,所述RNA由从被测者采集的能够含有癌细胞的机体试样制备;
(2)以所述基因标记为指标测定与所述基因标记结合的RNA或该RNA的衍生物的量的工序;
(3)将所述工序(2)中得到的RNA或其衍生物的量与未永生化的正常或癌细胞中相应的RNA或其衍生物的量进行比较的工序,其中,将所述工序(2)中得到的RNA或其衍生物的量总称为“RNA量”,将未永生化的正常或癌细胞中相应的RNA或其衍生物的量总称为“对照RNA量”。
4.根据权利要求3所述的永生化癌细胞的判断方法,还包括下述工序(4):
(4)当工序(2)中得到的RNA量比对照RNA量高时,判断为被测者的癌细胞永生化,当不高时,判断为被测者的癌细胞未永生化的工序。
5.一种抗体,识别由序列编号14~26中任一个所示的氨基酸序列构成的多肽。
6.一种永生化癌细胞的判断方法,包括下述工序(1’)~(3’):
(1’)使含有多肽的蛋白质含有级分与权利要求5所述的抗体结合的工序,其中,所述含有多肽的蛋白质含有级分由从被测者采集的能够含有癌细胞的机体试样制备;
(2’)以该抗体为指标测定与所述抗体结合的多肽的量的工序;
(3’)将所述工序(2’)中得到的多肽量与未永生化的正常或癌细胞中相应的多肽量进行比较的工序,其中,将未永生化的正常或癌细胞中相应的多肽量称为“对照多肽量”。
7.根据权利要求6所述的永生化癌细胞的判断方法,包括下述工序(4’):
(4’)当工序(2’)中得到的多肽量比对照多肽量高时,判断为被测者的癌细胞永生化,当不高时,判断为被测者的癌细胞未永生化的工序。
8.一种永生化癌细胞判断用试剂盒,含有选自权利要求1所述的基因标记和权利要求5所述的抗体中的至少1种。
9.一种抑制永生化癌细胞增殖的物质的筛选方法,包括下述工序(A)~(D):
(A)使被测物质与能够表达由序列编号1~13中的任一个所示的碱基序列构成的基因的细胞接触的工序;
(B)对于与被测物质接触的细胞,测定由序列编号1~13中任一个所示的碱基序列构成的基因的表达量的工序;
(C)将所述工序(B)中得到的基因的表达量与未与被测物质接触的对照细胞中相应的基因的表达量进行比较的工序,其中,将未与被测物质接触的对照细胞中相应的基因的表达量称为“对照表达量”;
(D)当所述工序(B)中得到的基因的表达量比对照表达量低时,选择该被测物质作为抑制永生化癌细胞增殖的物质的工序。
10.一种抑制永生化癌细胞增殖的物质的筛选方法,包括下述工序(A’)~(D’):
(A’)使被测物质与由序列编号14~26中任一个所示的氨基酸序列构成的多肽接触的工序;
(B’)测定与被测物质接触的由序列编号14~26中任一个所示的氨基酸序列构成的多肽的活性的工序;
(C’)将所述工序(B’)中得到的多肽的活性与未与被测物质接触的对照的活性进行比较,识别所述工序(B’)中得到的多肽的活性程度的工序,其中,将未与被测物质接触的对照的活性称为“对照活性”;以及
(D’)当所述工序(B’)中得到的多肽的活性比对照活性低时,选择该被测物质作为抑制永生化癌细胞增殖的物质的工序。
11.一种永生化癌细胞增殖抑制剂,以多核苷酸作为有效成分,该多核苷酸与序列编号1~13中任一个所示的碱基序列的至少15个碱基长以上的连续碱基序列特异性杂交、且由15个碱基以上的碱基序列构成。
12.根据权利要求11所述的永生化癌细胞增殖抑制剂,所述多核苷酸是由序列编号27~39中任一个所示的碱基序列构成的多核苷酸。
13.一种抗癌疗法,具有将权利要求11或12所述的永生化癌细胞增殖抑制剂导入患者的癌细胞中的工序。
14.一种多核苷酸在制造永生化癌细胞增殖抑制剂中的应用,所述多核苷酸与序列编号1~13中的任一个所示的碱基序列的至少15个碱基长以上的连续碱基序列特异性杂交、且由15个碱基以上的碱基序列构成。
15.根据权利要求14所述的应用,所述多核苷酸是由序列编号27~39中任一个所示的碱基序列构成的多核苷酸。
CN2007800208629A 2006-06-09 2007-06-08 与人癌细胞的永生化相关的基因及其应用 Expired - Fee Related CN101495630B (zh)

Applications Claiming Priority (3)

Application Number Priority Date Filing Date Title
JP2006161350 2006-06-09
JP161350/2006 2006-06-09
PCT/JP2007/061652 WO2007142336A1 (ja) 2006-06-09 2007-06-08 ヒトがん細胞の不死化に関わる遺伝子およびその利用

Related Child Applications (1)

Application Number Title Priority Date Filing Date
CN201210084320.0A Division CN102618545B (zh) 2006-06-09 2007-06-08 与人癌细胞的永生化相关的基因及其应用

Publications (2)

Publication Number Publication Date
CN101495630A true CN101495630A (zh) 2009-07-29
CN101495630B CN101495630B (zh) 2012-12-26

Family

ID=38801580

Family Applications (2)

Application Number Title Priority Date Filing Date
CN2007800208629A Expired - Fee Related CN101495630B (zh) 2006-06-09 2007-06-08 与人癌细胞的永生化相关的基因及其应用
CN201210084320.0A Expired - Fee Related CN102618545B (zh) 2006-06-09 2007-06-08 与人癌细胞的永生化相关的基因及其应用

Family Applications After (1)

Application Number Title Priority Date Filing Date
CN201210084320.0A Expired - Fee Related CN102618545B (zh) 2006-06-09 2007-06-08 与人癌细胞的永生化相关的基因及其应用

Country Status (10)

Country Link
US (1) US20100249209A1 (zh)
EP (2) EP2034017B1 (zh)
JP (1) JP5312024B2 (zh)
KR (4) KR20090031557A (zh)
CN (2) CN101495630B (zh)
AT (1) ATE542897T1 (zh)
AU (1) AU2007255677B2 (zh)
CA (2) CA2654978C (zh)
RU (1) RU2449016C2 (zh)
WO (1) WO2007142336A1 (zh)

Families Citing this family (2)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Publication number Priority date Publication date Assignee Title
MX357018B (es) * 2013-12-18 2018-06-05 Instituto Nac De Medicina Genomica Método de diagnóstico temprano de carcinoma hepatocelular.
CN116555325A (zh) * 2023-04-11 2023-08-08 内蒙古农业大学 本氏烟m6A甲基化酶基因在抗病毒中的应用

Family Cites Families (11)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Publication number Priority date Publication date Assignee Title
RU2155066C2 (ru) * 1993-03-31 2000-08-27 Про-Ньюрон, Инк. Ингибитор пролиферации стволовых клеток и его использование
US7625697B2 (en) * 1994-06-17 2009-12-01 The Board Of Trustees Of The Leland Stanford Junior University Methods for constructing subarrays and subarrays made thereby
US5776679A (en) * 1994-07-07 1998-07-07 Geron Corporation Assays for the DNA component of human telomerase
DE19928862A1 (de) * 1999-06-24 2001-01-04 Keiper Gmbh & Co Befestigungsvorrichtung für einen Kindersitz
WO2002010436A2 (en) * 2000-07-28 2002-02-07 The Brigham And Women's Hospital, Inc. Prognostic classification of breast cancer
AU2003223661A1 (en) * 2002-04-15 2003-11-03 Rigel Pharmaceuticals, Inc. Methods of assaying for cell cycle modulators
US20030232436A1 (en) * 2002-06-14 2003-12-18 Isis Pharmaceuticals Inc. Antisense modulation of E2-EPF expression
AU2003275065A1 (en) * 2002-09-20 2004-04-08 Wayne State University Molecular targets of cancer and aging
PT2284266E (pt) * 2002-11-14 2013-12-17 Thermo Fisher Scient Biosciences Inc Siarn contra tp53
US8065093B2 (en) * 2004-10-06 2011-11-22 Agency For Science, Technology, And Research Methods, systems, and compositions for classification, prognosis, and diagnosis of cancers
CA2580883A1 (en) * 2004-10-14 2006-04-27 Novartis Ag E2-epf5, a novel therapeutic protein and target

Also Published As

Publication number Publication date
AU2007255677A2 (en) 2009-02-12
WO2007142336A1 (ja) 2007-12-13
US20100249209A1 (en) 2010-09-30
EP2034017A1 (en) 2009-03-11
RU2008152780A (ru) 2010-07-20
RU2449016C2 (ru) 2012-04-27
CA2654978C (en) 2016-05-10
EP2412805A1 (en) 2012-02-01
CN101495630B (zh) 2012-12-26
KR20120030608A (ko) 2012-03-28
EP2034017B1 (en) 2012-01-25
CA2654978A1 (en) 2007-12-13
CA2771971A1 (en) 2007-12-13
AU2007255677A1 (en) 2007-12-13
CN102618545B (zh) 2014-12-10
EP2412805B1 (en) 2014-04-30
ATE542897T1 (de) 2012-02-15
EP2034017A4 (en) 2010-08-04
KR20090031557A (ko) 2009-03-26
JPWO2007142336A1 (ja) 2009-10-29
AU2007255677B2 (en) 2013-01-24
KR20140024054A (ko) 2014-02-27
KR101496745B1 (ko) 2015-03-04
JP5312024B2 (ja) 2013-10-09
KR20110013578A (ko) 2011-02-09
CN102618545A (zh) 2012-08-01

Similar Documents

Publication Publication Date Title
ES2374954T3 (es) Variaciones genéticas asociadas con tumores.
US20040146907A1 (en) Methods and compositions for detecting dysplasia
WO2002068677A2 (en) Novel methods of diagnosis of metastatic colorectal cancer, compositions and methods of screening for modulators of metastatic colorectal cancer
US20040191819A1 (en) Expression profiles for breast cancer and methods of use
EP2176424A2 (en) Compositions, methods and kits for the diagnosis of carriers of mutations in the brca1 and brca2 genes and early diagnosis of cancerous disorders associated with mutations in brca1 and brca2 genes
CN101495630B (zh) 与人癌细胞的永生化相关的基因及其应用
CA2425643A1 (en) Cancer-linked genes as targets for chemotherapy
KR20170124683A (ko) 담도암 진단용 신규 바이오마커로서의 융합 유전자 및 융합 단백질
KR101683961B1 (ko) 방광암 재발 진단 마커
CN111032696A (zh) Dctn1蛋白质与ret蛋白质的融合蛋白
KR20180074109A (ko) 림프절 전이 예측용 마커 및 이를 이용한 림프절 전이 예측 방법
EP1354961A1 (en) Compositions and methods for detection and treatment of proliferative abnormalities associated with overexpression of human transketolase like-1 gene
EP1365032B1 (en) Marker molecules associated with lung tumors
RU2813996C2 (ru) Слитый белок из белка dctn1 с белком ret
TWI327645B (en) Markers for detection of gastric cancer
AU2012268818A1 (en) Gene involved in immortalization of human cancer cell and use thereof
EP1580282B1 (en) Use of human RPS6KA6-related gene variant for diagnosing T cell lymphoblastic lymphoma
CA2474151A1 (en) Androgen regulated nucleic acid molecules and encoded proteins
TW200914830A (en) Genes relating to gastric cancer metastasis
KR20150043925A (ko) 개체의 제엽염 진단용 조성물 및 키트, 개체가 제엽염에 걸렸는지를 진단하는 방법 및 제엽염 치료제를 탐색하는 방법

Legal Events

Date Code Title Description
C06 Publication
PB01 Publication
C10 Entry into substantive examination
SE01 Entry into force of request for substantive examination
C14 Grant of patent or utility model
GR01 Patent grant
CF01 Termination of patent right due to non-payment of annual fee
CF01 Termination of patent right due to non-payment of annual fee

Granted publication date: 20121226