具体实施方式
实施例1、重组水蛭素基因的获得
水蛭素是由65个氨基酸组成的活性多肽,将氨基酸解译为相应的密码子时,尽量使氨基酸的密码子的频数分布与多形汉逊酵母偏爱密码子频数分布一致,为了便于克隆和表达,N端前面加了必须的碱基顺序,包括限制性内切酶识别位点EcoRI和BamHI及酿酒酵母α信号肽序列,并反复搜寻调整使基因中不存在7个碱基以上的发卡结构序列;不存在启动子序列和核糖体结合位点如转录起始序列TATA和翻译位点GGAGG;不出现下列终止子序列:如ATTATTTTAT、TTTTTATA(富含AT)…TTT、TAG(富含T)TA(T)GT等;只存在最高1处为7个碱基正向重复序列;并且基因转录后的RNA序列二级结构自由能降低至-135.90kcal/mo。最终确定由474个碱基组成的整个序列,如序列表中序列2所示。
利用全人工合成方法合成序列表中序列2所示的DNA序列。其中,序列2的自5′末端第7-459位序列编码酿酒酵母α信号肽和水蛭素的融合蛋白;序列2的自5′末端第262-459位为水蛭素基因的编码序列,编码序列表中序列1的蛋白。
EcoRI和BamHI酶切合成的DNA序列,电泳回收酶切后的片段,-20℃保存备用。
实施例2、构建生产重组水蛭素的重组多形汉逊酵母
a)载体pMPT-02的构建
以多形汉逊酵母CGMCC 2.2497基因组DNA为模板,克隆1.5kb的甲醇氧化酶基因(MOX)启动子、350bp的甲醇氧化酶基因(MOX)终止子、1.0kb的自主复制序列HARS;并从YIp5(GenBank Acession No.L09157)质粒中克隆出1.1kb的酿酒酵母脲嘧啶基因ScURA3;将上述4部分连接后,插入pBluescrip II质粒的多克隆位点,构建成穿梭载体pMPT-02。
b)载体pMPT-hirudin的构建
用EcoRI和BamHI酶切载体pMPT-02,低熔点琼脂糖凝胶电泳回收酶切后的大片段,T4-DNA连接酶的作用下,与同样双酶切的合成的DNA序列连接,得到载体pMPT-hirudin,见图1。
c)重组菌的获得
用Sac I酶切载体pMPT-hirudin,使载体线性化。线性化的载体通过电转化法(天津理工大学生产的LN-101型基因脉冲导入仪,1.5kV,50μF,200Q,3-5mSec)转化多形汉逊酵母(Hansenula polymorpha)CGMCC NO.1218。在含有13.4g/1000mlYNB(酵母氮源基础培养基),20g/1000ml葡萄糖的培养基平板上筛选转化子。
d)实时荧光定量PCR检测外源基因整合的拷贝数
水蛭素基因通过质粒载体转化到受体菌并稳定整合后才能高效表达,其拷贝数一定程度上反映工程菌株能否高效表达目的蛋白。
实时荧光定量PCR检测外源基因整合的拷贝数用来筛选水蛭素高表达的候选菌株。采用相对定量法,即同时对同一样品细胞中的外源基因(合成Hirudin基因)和已知单拷贝MOX基因进行扩增,通过两者比较而确定单个细胞内外源基因的拷贝数。
实时荧光定量PCR检测引物序列如下,由大连宝生物工程有限公司合成。
水蛭素基因正向引物:5′-TCATCAACACCACTATTGCCTC-3′;
水蛭素基因反向引物:5′-GGGATTTCCTCAAAGTCGC-3′。
MOX基因正向引物:5′-GCCACCTTCTACTCGTCCAG-3′;
MOX基因反向引物:5′-ACTCCCAGTCGTCGTAGTCG-′3。
用玻璃珠制备法(A.亚当斯等,《酵母遗传学方法实验指南》,科学出版社,2000)提取多形汉逊酵母(Hansenula polymorpha)重组水蛭素转化子基因组DNA。取某一基因组DNA溶液先稀释20倍,然后进行系列稀释,每次稀释10倍,稀释4次,此稀释要求精确。其他的基因组DNA溶液先稀释20倍,然后进行系列稀释,每次稀释10倍,稀释2次。以上述稀释后的基因组DNA溶液为模板。
实时定量PCR反应体系:总体积20μL,其中正反向引物(10mmol/L)各0.5μL,EX Premix Taq(4mmol/L Mg2+、0.4mmol/L dNTP、0.5U ExTaq)10μL,SYBR0.5μL模板5μL。
实时定量PCR检测使用澳大利亚Corbett Research公司的荧光定量PCR仪(型号:Rotor-Gene 3000)。实时定量PCR反应热循环参数:预变性94℃5min,变性94℃15secs,退火及延伸60℃50secs,35个循环。
其中,所扩增Hirudin基因片段长度为241bp,扩增的MOX基因片段长度为145bp,扩增时两种片段都采用SYBR Green I作为荧光指示剂,荧光强度变化由Rotor-Gene检测系统在每个循环延伸阶段末期进行检测,扩增反应结束后作溶解曲线,从60℃缓慢升温到94℃,每5秒升温一次,每次升温0.5℃,每升高一次进行信号采集。
利用Rotor-Gene 5.0.28(Corbett Research)软件分析样品拷贝数。
将外源基因整合拷贝数高达198个的重组多形汉逊酵母工程菌株命名为多形汉逊酵母205-17,所述205-17已于2008年3月28日保藏于中国微生物菌种保藏管理委员会普通微生物中心(简称CGMCC,地址为:北京市朝阳区大屯路),保藏号为CGMCC No.2424。
e)高密度发酵生产重组水蛭素
用多形汉逊酵母205-17 CGMCC No.2424高密度发酵生产重组水蛭素。
①培养基的配制:
种子培养基:20g/1000ml葡萄糖、13.4g/1000ml YNB;一级种子培养基200mL,二级种子培养基1600mL,高压灭菌。
发酵培养基:发酵起始体积12L;NH4H2PO4 192g、MgSO4·7H2O 36g、苯二甲酸氢钾128g、NaCl 4g、甘油384g,另加10mL消泡剂,罐内110-115℃高压灭菌30分钟。
补料/去阻遏溶液:共计5L;NH4H2PO4 80g、MgSO4·7H2O 15g、苯二甲酸氢钾53g、NaCl 1.7g,以上原料溶于1.25L水中,高压灭菌;另取3.75L甘油,高压灭菌。
②发酵过程:
种子培养:分两级扩大培养,-72℃保存的多形汉逊酵母205-17 CGMCC No.2424菌种一支(1mL、OD600nm≈100)接入200mL一级种子培养基,31℃培养20小时转接1600mL二级种子培养基扩大培养,31℃培养18小时细胞OD600nm达到10以上,作为发酵种子。
发酵工艺:用日本丸菱理化装置研究所生产的30L发酵罐(型号:MSJ-J2)进行发酵工艺,用上海佳田制造有限公司的全自动电热蒸汽发生器(型号:DZF26)产生的蒸汽对发酵罐进行灭菌,华东理工大学生物工程学院的FC-280型溶解氧监控仪进行溶氧的监测和控制。
多形汉逊酵母205-17 CGMCC No.2424原代种子经两级种子扩大培养后,将1800mL二级种子接入装有12L发酵培养基灭菌的发酵罐中开始发酵。多形汉逊酵母205-17 CGMCC No.2424的发酵工艺主要包含两个时相,即生长时相和去阻遏时相。
生长时相:
I发酵罐pH值控制设定在5.4-5.5;发酵温度控制30℃;罐压0.5Kg/cm2。
II生长时相中,发酵罐内溶氧会缓慢下降,当下降至60%左右时(发酵约16小时),连接好补料管路,用蠕动泵匀速打入约385mL补料溶液。
III当发酵罐溶氧水平降至40%以下时,将空气流量调至15L/min,搅拌转速调至700rpm。
IV生长时相后期(发酵约22小时左右),若细胞生长状态良好,发酵罐溶氧水平可下降至20%以下;细胞OD600nm达到80以上。
去阻遏时相:
I溶氧回升前将蠕动泵电源插头与溶解氧监控仪信号输出电源连接;监控仪溶氧控制40%,死区为2%,高端打开;蠕动泵电源开关关闭。
II当观察到发酵罐溶氧由最低点回升到60%以上时,进入去阻遏时相;此时打开蠕动泵电源开关,设定泵速22rpm,开始流加去阻遏溶液。
III发酵罐pH值控制设定在3.9-4.0;细胞代谢产物偏酸性,pH可自然下降至控制点,只检测发酵液pH值,不控制,pH值自然下降至3.9时开始控制pH值,设定3.9-4.0。
IV去阻遏后期,若细胞生长良好,OD600nm可达到350以上,发酵时间大约96小时。
上述发酵实验重复三次。
f)重组水蛭素的纯化及定量
用阳离子交换层析和反相层析纯化重组水蛭素,高效液相色谱分析水蛭素纯度及含量。
阳离子交换层析前微滤收获发酵液上清,用德国Sartorius公司的切向流微滤/超滤系统(型号:
2Plus),配以0.22μm规格的膜包。取10L发酵液,微滤过程中进口压力保持在1bar,回流压力为0.5bar,滤过压力为0.2bar,通过微滤回收滤过端溶液4L。向切向流微滤/超滤系统中添加4L缓冲液(20mM,pH3.0的柠檬酸缓冲液)混匀,继续微滤回收滤过端溶液4L。再次向切向流微滤/超滤系统中添加4L同样柠檬酸缓冲液,混匀,微滤回收滤过端溶液4L。将三次回收的过滤端溶液合并共12L。
阳离子交换层析采用如下方法:
应用SP-550C matrix(TosoHaas)阳离子-交换层析树脂填充层析柱(100mmIDx140mm),在美国COMetro公司的层析系统(型号:6000 Series FPLC System)上经层析柱初级分离重组水蛭素。微滤收获12L样品与上样缓冲液(20mM,pH3.0的柠檬酸缓冲液)混合约18L至电导小于5mS/cm,用H3PO4调节pH至3.0作为离子交换层析的上样液。层析柱使用前用0.5M NaOH清洁消毒。在室温下用5倍柱体积上样缓冲液平衡层析柱,280nm波长监测,上样液以150mL/min上柱,用2倍柱体积上样缓冲液流洗,用3倍柱体积洗脱液I(20mM,pH3.0的柠檬酸缓冲液和0.1MNaCl)洗脱层析柱,再用2倍柱体积洗脱液II(20mM,pH3.0的柠檬酸缓冲液和1.0MNaCl)洗脱层析柱,收集洗脱峰组分,用高效液相色谱检测各组分中水蛭素含量纯度。
反相层析纯化采用如下方法:
用GC 300sd matrix(TosoHaas)层析树脂填充层析柱(49mm IDx490mm),在美国Lab Alliance公司的液相系统(Model 500检测器,SeriesIII泵配40mL泵头)上经反向层析柱分离重组水蛭素。上一步阳离子交换层析洗脱液I洗脱收集组分作为反向层析的上样液。在室温下,流速25mL/min,依次用1个柱体积Buffer A(0.1%三氯乙酸)、1个柱体积Buffer B(0.1%三氯乙酸+40%异丙醇)和2个柱体积Buffer A平衡层析柱,280nm波长监测。上样液以流速20mL/min上柱,以流速25mL/min用300min从100%Buffer A到100%Buffer B线性梯度洗脱层析柱,分部收集组分,用RP-HPLC检测各组分中水蛭素含量纯度,收集纯度大于95%的组分合并,冷冻干燥前4℃保存。
高效液相色谱分析具体方法如下:
检测设备:Lab Alliance(Model 500检测器,SeriesIII泵配10mL泵头);
分析软件:ANASTAR CHROMATOGRAPHY;
分析柱:C18柱4.6*250mm,5μ,
流动相:A液:5ml/100ml乙腈、高氯酸钠3.5g/100ml、0.1g/100ml三氟乙酸;B液:80ml/100ml乙腈、0.1g/100ml三氟乙酸。
线性梯度:时间 流速 A B
0 1 90 10
16 1 45 55
18 1 10 90
20 1 10 90
22 1 90 10
25 1 90 10
流速:1ml/min;检测波长:214nm。
纯化得到的样品用德国Marin Christ公司的真空离心浓缩仪(型号:RVC2-18)脱去异丙醇,用同一家公司的冷冻干燥机(型号:ALPHA 1-2 LD)隔夜冷冻干燥后-20℃保存。
三批发酵、纯化得到纯度为95%以上的重组水蛭素总量分别为10.2g、9.8g和9.5g。
2.重组水蛭素的抗凝比活性测定
采用生色底物的比色法,测定重组水蛭素的抗凝比活性。
生色底物的比色法的原理是利用凝血酶水解生色底物Chromonym TH中酰胺键产生生色效应,而水蛭素以1∶1关系抑制凝血酶,通过比色法测定不同稀释度水蛭素的回归直线方程,可以精确测定出水蛭素的单位抗凝活性(ATU/ml),ATU为能够完全中和1NIH单位凝血酶的水蛭素的量。实验重复3次。抗凝比活性(ATU/mg)=单位抗凝活性(ATU/ml)/单位蛋白(mg/ml)
具体方法如下:
溶液的配制:①工作液缓冲液:Tris 50mM,NaCl 227mM,BSA 0.1%(质量百分含量),NaN3 0.1%(质量百分含量),2M HCl调pH至8.3;②生色试剂Chromozym TH(Roche),用工作液缓冲液配制成2mM;③凝血酶溶液,凝血酶(Sigma,NIH units)溶于工作液缓冲液中,凝血酶终浓度为11.65IU/mL;④醋酸终止液,50%醋酸;⑤以水为溶剂,配制不同浓度的水蛭素样品溶液。
测定步骤如下:
①7个1.5mL离心管,每管分别加入50uL不同浓度水蛭素样品溶液;
②每管加入50uL凝血酶溶液,37℃保温5分钟;
③每管加入50uL生色试剂Chromozym TH,37℃反应2分钟;
④每管加入50uL醋酸终止液;
⑤每管补加600uL蒸馏水后,立即在405nm处测OD值。
以水蛭素含量为横坐标,OD值为纵坐标,做线性回归,与横坐标交点处表明水蛭素在此含量下能全部抑制凝血酶的活力,假设这点横坐标截距为X,则:
水蛭素抗凝比活性(ATU/mg)=(11.65×50/1000)/(X/10-6)
第1次测定的回归方程为:Y=-0.0127X+0.4027 R2=0.9983
抗凝比活性活性=(11.65×50/1000)/(31.7087/10-6)=18370.3ATU/mg
第2次测定的回归方程为:Y=-0.0158X+0.4672 R2=0.9961
抗凝比活性活性=(11.65×50/1000)/(29.5696/10-6)=19699.3ATU/mg
第3次测定的回归方程为:Y=-0.0161x+0.476 R2=0.9973
抗凝比活性活性=(11.65×50/1000)/(29.5652/10-6)=19702.2ATU/mg
生色底物的比色法测定重组水蛭素的抗凝比活性的平均值为19257.3ATU/mg,达到现有的水蛭素的抗凝比活性最高水平。
实施例4、重组水蛭素的应用
与现在所用的抗凝剂不同,水蛭素是凝血酶的特异性直接抑制剂,它对血液细胞中无机物和蛋白质组份影响最小。为了保护体外检验用血液和血浆,向血液采集管加入抗凝剂和保护剂几乎是不可避免的事,但是它们的加入造成对血液样品的影响,可能干扰对某些检验项目的分析。因此某种抗凝剂更适合检测一些特定的项目,而其它抗凝剂则是禁忌的。含有本发明重组水蛭素的抗凝血浆同时适用于临床血液学(除综合凝血参数如活化部分凝血活酶时间、凝血酶原时间等不能测定外,单一凝血因子如纤维蛋白原、ATIII仍可测定)、临床生物化学、临床免疫学、临床血液流变学、免疫原型分析及RT-PCR技术等方面的检验。
a.制备含有本发明的重组水蛭素的真空采血管
通用真空采血管的制备按中华人民共和国卫行业标准WS/T 224-2002“真空采血管及其添加剂”进行。
使用单头喷雾机(浏阳市集里宏远吸塑包装机械厂)将上述获得的重组水蛭素喷涂于塑料管(PET管)(湖南安信医用高分子材料有限公司)内壁,喷雾量为0.02ml/次,每管喷涂2次,盖上丁基胶塞和塑料帽盖,然后抽真空,在管的外壁贴上带刻度标注的标签制成含有本发明重组水蛭素的真空采血管,将其命名为通用真空采血管。其中,水蛭素的喷涂量为100-2000ATU/ml血量。
b.重组水蛭素对血细胞分析的影响
使用重组水蛭素的喷涂量800ATU/ml血量的通用真空采血管与BD公司生产的K2-EDTA抗凝真空采血管随机采取体检者和住院患者的血液标本50份,每份血液标本2ml,进行21项血细胞分析检验。血细胞分析检验采用如下方法:血细胞分析用日本光电Celltac MEK-6318型全自动血液分析仪(白细胞5分类)及其全部配套试剂。
利用SPSS12.0软件对数据进行正态分布检验后,采用双变量相关性分析法(Spearman相关分析法)判断重组水蛭素的喷涂量800ATU/ml血量的通用真空采血管与BD公司的K2-EDTA抗凝真空采血管采取的血液标本的各指标对比结果的相关性。结果如表1所示
表1.两种真空采血管中的血液样本的各项血细胞分析指标的相关性
*代表0.01<p≤0.05 **代表p≤0.01
使用重组水蛭素的喷涂量800ATU/ml血量的通用真空采血管与BD公司的K2-EDTA抗凝真空采血管采取的血液标本的21项血细胞分析指标对应结果均成正相关;说明重组水蛭素的喷涂量800ATU/ml l血量的通用真空采血管适用于血细胞分析。在血细胞分析中嗜酸性和嗜碱性粒细胞的r值和ICS值略低,这与血细胞分析仪非染色镜检而形成的局限性有关,但结果仍是可接受的。
c.重组水蛭素对血液生化分析的影响
使用重组水蛭素的喷涂量800ATU/ml血量的通用真空采血管与BD公司生产的普通真空采血管或促凝管随机采取体检者和住院患者的血液标本50份,每份血液标本2ml,进行24项血液生化分析检验。血液生化分析检验采用如下方法:血液生化指标检验用日本东芝公司TBA FR-120型全自动生化分析仪,电解质分析用上海迅达公司DSI 903 B型电解质分析仪及配套试剂;
利用SPSS12.0软件对数据进行正态分布检验后,采用双变量相关性分析法(Spearman相关分析法)判断重组水蛭素的喷涂量800ATU/ml血量的通用真空采血管与BD公司生产的普通真空采血管或促凝管采取的血液标本的各指标对比结果的相关性。结果如表2所示。
表2.两种真空采血管中的血液样本的各项血液生化指标的相关性
*代表0.01<p≤0.05 **代表p≤0.01
重组水蛭素的喷涂量800ATU/ml血量的通用真空采血管与BD公司的普通真空采血或促凝管采取的血液标本的24项血液生化分析指标的对应结果均成正相关,说明重组水蛭素的喷涂量800ATU/ml血量的通用真空采血管适用于生化学检验;重组水蛭素的喷涂量800ATU/ml血量的通用真空采血管中血液标本测定的总蛋白量较高,是由于纤维蛋白原在血浆中存在的原故。
d.重组水蛭素对血流变分析的影响
使用重组水蛭素的喷涂量800ATU/ml血量的通用真空采血管与BD公司生产的肝素抗凝真空采血管随机采取体检者和住院患者的血液标本50份,每份血液标本2ml,进行16项血流变学分析检验。血流变学分析检验方法如下:血流变学分析用赛科希德公司SA-6000型全自动血流变仪,纤维蛋白原测定用Stago公司的Compact自动血凝仪。
利用SPSS12.0软件对数据进行正态分布检验后,采用双变量相关性分析法(Spearman相关分析法)判断重组水蛭素的喷涂量800ATU/ml血量的通用真空采血管与BD公司生产的肝素抗凝真空采血管采取的血液标本的各指标对应结果的相关性。结果如表3所示。
表3.两种真空采血管中的血液样本的各项血流变学指标的相关性
*代表0.01<p≤0.05,**代表p≤0.01
重组水蛭素的喷涂量800ATU/ml血量的通用真空采血管与BD公司的肝素抗凝真空采血管采取的血液标本的16项血流变分析指标的对应结果均成正相关,说明重组水蛭素的喷涂量800ATU/ml血量的通用真空采血管适用于血流变学检验。国内血流变学检验应用较多,重组水蛭素的喷涂量800ATU/ml血量的通用真空采血管特别适用于血流变学与上述各检验项目共用,如同时检验可明显减少所用的采血管。
e.重组水蛭素对ELISA试验和发光免疫学检验分析的影响
使用重组水蛭素的喷涂量800ATU/ml血量的通用真空采血管与BD公司生产的普通真空采血管随机采取体检者和住院患者的血液样本50份,每份血液标本2ml,进行ELISA试验和发光免疫学检验。ELISA试验和发光免疫学检验采用如下方法:ELISA检验用Biorad-680型自动酶免疫分析仪,试剂为上海实业科华生物技术有限公司提供的乙型肝炎表面抗原诊断试剂盒和厦门新创公司提供的抗-丙型肝炎ELISA试剂盒。发光免疫学检验用Abbott公司的Axsym全自动免疫发光仪。
利用SPSS12.0软件对数据进行正态分布检验后,采用双变量相关性分析法(Spearman相关分析法)判断重组水蛭素的喷涂量800ATU/ml血量的通用真空采血管与BD公司生产的普通真空采血管采取的血液标本的各指标对应结果的相关性。结果如表4和表5所示。
表4.两种真空采血管中的血液样本的各项免疫指标的相关性
*代表0.01<p≤0.05,**代表p≤0.01
表5.两种采血管中血液样本的ELISA试验对照结果
重组水蛭素的喷涂量800ATU/ml血量的通用真空采血管与BD公司的普通真空采血管采取的血液样本的各项免疫指标对应结果均成正相关;两种采血管中血液样本的ELISA试验的结果完全一致。说明重组水蛭素的喷涂量800ATU/ml血量的通用真空采血管适用于免疫学检验。
f.重组水蛭素对荧光定量PCR试验的影响
使用重组水蛭素的喷涂量800ATU/ml血量的通用真空采血管与BD公司生产的普通真空采血管随机采取体检者和住院患者的血液样本50份,每份血液标本2ml,荧光定量PCR检测血样中乙型肝炎病毒DNA拷贝数。荧光定量PCR检测用Roche公司Lightcycler荧光定量PCR仪。结果如表6所示
表6.两种采血管中血液样本的荧光定量PCR检测结果
重组水蛭素的喷涂量800ATU/ml血量的通用真空采血管与BD公司的普通真空采血管中血液样本的荧光定量PCR检测结果一致,重组水蛭素的喷涂量800ATU/ml血量的通用真空采血管适用于荧光定量PCR检验。