寡聚或多聚亚基蛋白质分离纯化的方法
技术领域
本发明涉及蛋白质的制备技术领域,特别涉及一种寡聚或多聚亚基蛋白质,和在分离纯化寡聚或多聚亚基蛋白质的过程中,既能保护其活性又可提高收率的方法及用途。
背景技术
在基因工程药物蛋白质的生产中,收率低和纯度低是亟待解决的关键问题。这里除了生物组份复杂、难以分离外,许多目标蛋白质自身活性的丧失也是一个重要原因。由于药物蛋白质昂贵的市场价格,回收率稍有提高就有可能带来巨大的经济效益,所以,有关蛋白质在分离纯化中的失活及其对策在近年来受到了极大的关注。
寡聚或多聚亚基蛋白质指的是由两个以上彼此独立的亚基通过分子之间相互作用结合在一起的聚合体。其中,每个亚基一般由一条肽链组成,但也有二条以上肽链经二硫键相连组成。每个亚基自身折叠成一定的空间构型,然后不同亚基之间依靠疏水作用、氢键、离子键与作用力聚集在一起,形成蛋白质的四级结构,亚基之间相互作用构成有生物化学活性的整体。在自然界中,这种由寡聚(2个、3个、4个等)和多聚(十几个至上百个)亚基组成的蛋白质在整个蛋白质家族中为数不少。例如,血红蛋白由2个α和2个β亚基组成,四聚体结构决定了其结合与释放氧的特性。人肿瘤坏死因子由三个亚基构成,每个亚基的分子量为1.7万,整个分子的分子量为5.1万。虫荧光素酶也是一个三聚体,其活性由三聚体结构决定。许多病毒含有多聚体结构,如烟草在叶斑病毒是一个多聚亚基的螺旋体,每圈16.3个亚基,螺距为2.3nm。由病毒颗粒改造的疫苗也常常是亚基多聚体,如乙型肝炎疫苗(HBsAg)是由多个分子量为2.0~3.0万的蛋白组成的球体,分子量约在200万左右。
寡聚或多聚亚基蛋白质的生物学活性常常与其聚集体的结构有关。血红蛋白的四聚体结构决定了它的氧合曲线为S型;而单独的亚基或αβ二聚体则不具备这种特性。人肿瘤坏死因子TNF-α三聚体的生物学活性最高,是每个亚基单独存在时活性的8倍。酵母醇脱氢酶有四个亚基,每个分子量为4.5万,单一亚基没有任何催化活性,只有四个亚基组合在一起才可能有活性。
分离纯化寡聚或多聚亚基蛋白质的难点在于如何防止亚基的解离。亚基之间的作用力包括疏水相互作用、氢键、离子键、范德华力,属于弱相互作用。它们的稳定自由能ΔGstab一般在5-15kcal/mol左右,构象稳定性很低,这在《生物化学趋势》杂志中有报道[Pace,C.N.,Trends Biochem.Sci.1990,15:14-17]。在分离纯化过程中,搅拌、温升、pH变化、盐浓度变化、添加表面活性剂或有机溶剂等是分离纯化难以避免的结果和所必需的操作,但这些结果和操作常常造成亚基的解离和结构变化。一方面会导致回收率的下降,另一方面也会导致生物学活性丧失。失活的蛋白质就成为杂质,不仅无用,还可能有毒。
关于蛋白质溶液中的稳定性已经有很多研究,从分子结构上讲,水溶性羟基化合物如本领域研究人员所熟悉的各种低元醇、聚低元醇、单糖、二糖、寡糖和多糖的共性是含有不同数量的羟基和醚基,具有良好的亲水性,与蛋白质可以共存于溶液中。但当它们存在时,溶液的热力学性质则发生变化。对此,Timasheff用优先排除理论(Timasheff,S.N.,in Stability of Protein Pharmaceuticals Part B,Ahern,T.J.and Manning,M.C.(eds.),New York,Plenum Press,1992,265-285)进行了解释,认为象聚乙二醇这样的亲水性聚合物分子与蛋白质分子在溶液中都优先与分子结合而避免彼此结合。由于彼此争夺水分子,而水分子在它们周围形成有序排列,溶液的自由能高,所以蛋白质分子将尽可能减小其表面。保持稳定的紧凑结构。在紧凑结构下,蛋白质最为稳定,不易发生结构变化。因此,象低元醇中的丙三醇、聚低元醇中的聚乙二醇、单糖中的葡萄糖都被作为蛋白质冷冻干燥和存储时的保存剂。例如,中国专利申请96195830,美国基因技术股份公司(Genentech)申请保护一种稳定的冻干蛋白质制剂,其中就含有水溶性羟基化合物。中国专利申请00109612,沈阳三生制药股份公司申请保护重组人血小板生成素制剂的制备生产方法,最终加入的成品保护剂也含有水溶性羟基化合物。类似的用于蛋白质制剂的冷冻干燥和保存的美国专利、欧洲专利还很多。
但是迄今为止,从原料液(细胞培养液、组织提取液)中分离纯化蛋白质时如何稳定蛋白质的结构不发生变化,这方面的研究还很少;尚未见到的蛋白质分离纯化中将低元醇、聚低元醇、单糖、二糖、寡糖和多糖作为保护剂、使之伴随部分或整个分离纯化过程的报道;特别是对寡聚或多聚亚基蛋白质,如何避免亚基在分离纯化过程中的解离还没有见到任何报道。
发明内容
本发明的目的在于:在分离纯化寡聚和多聚亚基蛋白质过程中避免蛋白质的结构发生变化;以及为了在分离纯化寡聚和多聚亚基蛋白质过程中提高产物回收率;从而提供一种寡聚或多聚亚基蛋白质,和在分离纯化寡聚或多聚亚基蛋白质的过程中,既能保护其活性又可提高收率的方法及用途。
本发明的目的是按以下技术方案实现的:
本发明提供的寡聚或多聚亚基蛋白质是由2个以上独立亚基靠分子间力聚合在一起的蛋白质;如醇脱氢酶(四聚体)、人肿瘤坏死因子(三聚体)、人血红蛋白(四聚体)、基因工程乙肝疫苗(多亚基聚体)等。
本发明提供的分离纯化寡聚或多聚亚基蛋白质方法,包括以下步骤:
(1)在常温下,在细胞破碎上清液、平衡液和洗脱液中加入重量/体积为0.5-40%的水溶性羟基化合物保护剂;
(2)按常规工艺进行膜分离和层析分离纯化,从而得到寡聚或多聚亚基蛋白质。
其中保护剂为水溶性羟基化合物,该水溶性羟基化合物包括:一元醇如甲醇、乙醇、丙醇;二元醇如乙二醇、丙二醇、丁二醇;三元醇如丙三醇;二醇聚合物如聚乙二醇、聚丙二醇、乙二醇与丙二醇的共聚物;多羟基单糖如葡萄糖、果糖、甘露糖、木糖、二糖如蔗糖、乳糖、麦芽糖;多糖如淀粉、葡聚糖。
本发明提供的寡聚和多聚亚基蛋白质,应用于基因工程蛋白质或疫苗制备过程。
蛋白质是指来自动物、植物和微生物细胞代谢的或用基因工程方法生产的寡聚或多聚亚基蛋白质。
如果将低元醇、聚低元醇、单糖、二糖、寡糖和多糖用于蛋白质分离纯化,则要解决它们是否与现有分离技术兼容的问题,即它们的加入是否会降低分离纯化的效率。这个问题在本发明中得到解决。根据本发明,破碎细胞(Cell disruption,Cell disintegration)、膜分离(Membrane separation)、吸附(Adsorption)和层析(Chromatography)可以与上述保护剂兼容。
低元醇、聚低元醇、单糖、二糖、寡糖和多糖可以单独使用,也可以混合使用。对某些蛋白质,混合使用的效果更好。
对于不同的目标蛋白质,通过加入和调节保护剂的种类、分子量和浓度,都能达到保护蛋白质活性和分离纯化效果的双重目的。虽然对于不同蛋白质的有效保护剂的种类常常不同,但是一般说来,低元醇中的丙三醇效果较好;聚低元醇中下列结构效果较好:
HO-(CH2-CH2-O)n-(CH2-CH2-O)m-H
n和m为0-200的整数,n+m大于等于1。实际上这包括聚乙二醇、聚丙二醇或两者的混合物。单糖中葡萄糖、二糖中蔗糖、多糖中聚葡萄糖的效果较好。
保护剂在蛋白质溶液中的浓度非常重要。不同蛋白质在不同分离纯化步骤中所需的保护剂浓度不同,其最佳范围常常为0.5-40%重量/体积(W/V)。浓度过低保护作用差,浓度过高容易引起蛋白质的沉淀。
本发明的方法具有如下优点和效果:
该方法包括以水溶性羟基化合物为保护剂,在进行从细胞培养液、动物或植物组织提取液中分离纯化寡聚或多聚严基蛋白质的过程中,通过添加和控制培养液或提取液中保护剂的种类和浓度,保护蛋白质的寡聚或多聚亚基不发生裂解,从而保护该蛋白质的生物学活性,同时也满足分离纯化该蛋白质的需要。将该方法应用于基因工程蛋白质或疫苗制备过程如:萃取细胞内部物质、用膜分离大小不同分子以及用角谱层析吸附分离不同生物大分子等,能有效保护蛋白质的分子结构的完整性,降低分离纯化操作对其生物学活性造成的损失,使目标蛋白质的收率提高。对于不同的目标蛋白质,通过调节保护剂的种类、分子量和浓度,可以达到保护蛋白质活性和分离纯化效果的双重目的。
本发明所涉及的部分水溶性羟基化合物已经被前人应用于蛋白质制剂的冷冻干燥和保存,但不是作为保护剂添加在起始的生物提取液中作为分离纯化过程的保护剂。如前所述,象低元醇中的丙三醇、聚低元醇中的聚乙二醇、单糖中的葡萄糖都被作为蛋白质冷冻干燥和存储时的保存剂。
但是迄今为止,尚未见到的蛋白质分离纯化中将低元醇、聚低元醇、单糖、二糖、寡糖和多糖作为保护剂、使之伴随部分或整个分离纯化过程的专利、论文或报道;也就是说,本发明在进行从细胞培养液、动物或植物组织提取液中分离纯化寡聚或多聚亚基蛋白质的过程(包括萃取细胞内部物质、用膜分离大小不同分子以及用色谱层析吸附分离不同生物大分子等过程)中,通过添加和控制培养液或提取液中保护剂的种类和浓度,保护蛋白质的寡聚或多聚亚基不发生裂解,从而保护该蛋白质的生物学活性,同时也满足分离纯化该蛋白质的需要,降低分离纯化操作对其生物学活性造成的损失,使目标蛋白质的收率提高。
附图说明:
图1:加入PEG(1%)或不加PEG对阴离子交换介质DEAE-Sepharose CL 6B吸附纯化rhTNF-α过程影响的比较研究图。
PEG重量/体积浓度:1%,吸附柱:16×55mm,进料量:10mg/ml介质。料液中rhTNF-α的总活性:5.0×107u
具体实施方式
实施例1 从酵母中提取乙醇脱氢酶(四聚体蛋白质)
酵母:将市售干面包酵母(荷兰Gist-Brocades酵母有限公司)溶解于蒸馏水中,酵母浓度为10%重量/体积(W/V)(干重),配制成8升酵母悬浮液。在4℃下搅拌一小时以活化酵母。
加入保护剂:一小时后,将细胞悬浮液分为两份(各4升),在搅拌下,向其中一份活化后的酵母悬浮液加入1升甘油和20%(W/V)蔗糖的混合溶液,使悬浮液体积为5升;另一份细胞悬浮液,不加任何保护剂,用蒸馏水补充为5升作为参照比较。
破碎细胞:采用美国APV Manton Gaulin公司生产的高压均浆泵,将五升原料液加入到进料桶中并进行搅拌,注意调节搅拌强度,不要因为搅拌过于剧烈而使溶液混入大量气泡,影响高压均浆破细胞的效率。本实验采用的搅拌转速为150rpm。启动高压均浆泵后,均速调节压力为60Mpa,在泵出口外连接一收集器收集破碎的细胞浆液,收集器置于4℃冷却下,待收集全部浆液后,再将浆液导回进料桶重复破碎以提高细胞破碎率。反复破碎次数为4次。
活性分析:破碎后细胞浆液于4℃,15,000g下离心15min除去细胞碎片,取上清液做酶活性分析。蛋白质浓度分析采用考马斯亮兰法[Bradford,M.M.1976.Anal.Biochem.72:248-254],用考马斯亮兰G250为试剂,在酸性条件下与蛋白质形成复合物,在595nm下有最大吸收峰,吸光度与蛋白质浓度比例,以牛血清白蛋白作为标准蛋白制得标准曲线。乙醇脱氢酶分析采用辅酶I在乙醇氧化为乙醛后生成还原态的辅酶I后在340nm处的吸收为特征,作为醇脱氢酶活性测量(蒋传葵等著,《工具酶的活力测定》,上海科学技术出版社,1982)。
实验结果:不加任何保护剂所得到的乙醇脱氢酶的活力为25u/ml,其中u代表酶活力单位,/ml表示每毫升细胞破碎后的浆液。在同样的实验条件下,加入甘油和蔗糖后,所得到的乙醇脱氢酶的活力为40u/ml,比不加保护剂提高60%。
实施例2 从基因工程大肠杆菌中提取人肿瘤坏死因子(三聚体)
大肠杆菌(E.coli细胞)培养:重组人肿瘤坏死因子(rhTNF-α)大肠杆菌JM103,培养基为1.5%重量/体积(W/V)胰蛋白胨,1.3%重量/体积(W/V)酵母浸粉,0.25重量/体积(W/V)NaCl,0.2%重量/体积(W/V)葡萄糖,pH7.5四环素的终浓度为12.5μg/l。重组菌的发酵用6升发酵罐(美国New Brunswick Scientific,Co.产品,型号BIOFLO II)在37℃下进行,发酵周期为12小时。发酵后,于4,500g,下离心20min收集E.coli细胞。细胞经10mmol Tris CHl,1mmol EDTA,pH8.0的缓冲溶液洗涤,再用同样缓冲溶液悬浮细胞成浓度为20wt%的细胞悬浮液。
加入保护剂:将20wt%的细胞悬浮液分成4份,分别加入聚乙二醇(PEG)200,1000,4000,最后一份不加任何保护剂作为参照。前三份悬浮液中的聚乙二醇浓度为:15%重量/体积(W/V);10wt%(W/V),4wt%(W/V)。
破碎细胞:细胞破碎采用高速水平式珠磨机(Dyno-Mill,瑞士WAB公司产品。)装珠量为90%腔体积。操作条件为3℃,2500r.p.m,3min。
活性分析:破碎后细胞浆液于4℃,15,000g下离心15min除去细胞碎片,取上清液做生物这活性分析。TNF活性分析参照Aggarwal等人的方法[Aggarwal,B.B.,Kohr,w.j.,Hass,P.E.,Moffar,B.,Spence,S.A.,Henzel,W.J.,Bringman,T.S.,Nedwin,G.E.,Goeddel,D.V.and Harkins,R.N.J.Biol.Chem.260,2345-2354,1985.]进行。蛋白质浓度分析按照Bradford法进行[Bradford,M.M.1976.Anal.Biochem.72:248-254],以牛血清白蛋白作为标准蛋白。
实验结果:四份破碎细胞后的浆液的rhTNF-α活性如下:
从上表可以看出,加入保护剂使RhTNF-α活性提高30%以上,其中PEG200的效果最好,使活性提高2倍以上。
实施例3 吸附法纯化基因工程人肿瘤坏死因子
吸附:将阴离子交换介质DEAE-Sepharoes C1-6B装入吸附柱(16×55mm),用0.01MTris-HCl,pH8.0(含或不含聚乙二醇PEG)充分平衡。将浓度为1wt%聚乙二醇PEG200、600或4000分别加入到无聚乙二醇PEG存在的细胞破碎上清液、平衡液、洗脱液中。进料,用平衡缓冲液淋洗除去未被吸附的蛋白质至基线,用75mM NaCl,10mM Tris-HCl进行分段洗脱,收集各洗脱峰并测定蛋白质浓度和RhTNF-α的活性。
活性分析:TNF活性分析参照Aggarwal等人的方法[Aggarwal,B.B.,Kohr,w.j.,Hass,P.E.,Moffar,B.,Spence,S.A.,Henzel,W.J.,Bringman,T.S.,Nedwin,G.E.,Goeddel,D.V.and Harkins,R.N.J.Biol.Chem.260,2345-2354,1985.]进行。蛋白质浓度分析按照Bradford法进行[Bradford,M.M.1976.Anal.Biochem.72:248-254],以牛血清白蛋白作为标准蛋白。
实验结果:图1显示了加入PEG200、PEG600、PEG4000或不加PEG对DEAE-SepharoseCL 6B吸附纯化rhTNF-α过程影响。结果表明,在没有PEG存在活性回收率仅为65%、纯化倍数为7。当进料液中加入不同分子量的PEG时,回收率和纯化倍数都有所提高。PEG200和PEG4000则使得回收率超过或达到100%,说明少量变化的产物恢复了活性。
实施例4 疏水相互作用层析制备脱磷脂牛血红蛋白
疏水相互作用层析:将疏水相互作用层析介质琼脂糖-6B型装入层析柱(130mm×16mm),用0.01M磷酸盐缓冲液(含或不含PEG)充分平衡。将PEG4000或PEG10000加入到无PEG的红细胞破碎液、平衡液、洗脱液中。进料,用洗脱液淋洗出血红蛋白,收集后测定蛋白质浓度和磷脂含量。
蛋白质浓度分析:按照Bradford法尽进行(Bradford,M.M.1976.Anal.Biochem.72:248-254)
实验结果:
表2-3以不同重量体积浓度和分子量的PEG磷酸缓冲液洗脱的效果比较
从上表可以看出,疏水相互作用层析在加入保护剂使血红蛋白的回收率提高了3倍以上,而且对磷脂的去除没有影响。