BRPI1011495B1 - Método para produção de uma planta transgênica tendo tolerância aumentada ao estresse por calor em relação a um controle do tipo selvagem - Google Patents

Método para produção de uma planta transgênica tendo tolerância aumentada ao estresse por calor em relação a um controle do tipo selvagem Download PDF

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Abstract

método para produção de uma planta transgênica tendo tolerância aumentada ao estresse por calor em relação a um controle do tipo selvagem a invenção se refere a métodos para produção de um fenótipo desejado em uma planta pela manipulação da expressão do gene na planta. o método diz respeito aos meios para aumentar o nível de expressão de uma expressão ou atividade de gene bhlh do subgrupo 1b, em que um fenótipo desejado, tal como tolerância ao calor aumentada em relação a uma planta de controle do tipo selvagem após estresse por calor resulta em aborto de flor reduzido e rendimento aumentado. são incluídas plantas produzidas pelos métodos referidos. a invenção também se refere às sequências de ácidos nucléicos e construtos úteis para tais métodos e métodos para geração e isolamento de plantas tendo expressão aumentada de uma expressão ou atividade de bhlh do subgrupo 1b.

Description

“MÉTODO PARA PRODUÇÃO DE UMA PLANTA TRANSGÊNICA TENDO TOLERÂNCIA AUMENTADA AO ESTRESSE POR CALOR EM RELAÇÃO A UM CONTROLE DO TIPO SELVAGEM”
REFERÊNCIA A PEDIDOS RELACIONADOS [001]Este Pedido reivindica a prioridade para o Pedido Provisório US No. de série 61/221.813, depositado em 30 de junho de 2009, os conteúdos dos quais sendo incorporados neste documento por referência em sua totalidade.
CAMPO DA INVENÇÃO [002]A invenção está no campo da biologia molecular de plantas e se refere a plantas transgênicas tendo novos fenótipos, métodos de produção de tais plantas e polinucleotídeos e polipeptídeos úteis em tais métodos. Mais especificamente, a invenção se refere à expressão de um regulador transcricional e plantas transgênicas tendo atividade aumentada do regulador transcricional para produzir uma planta tendo um fenótipo benéfico.
FUNDAMENTOS DA INVENÇÃO [003]Os estresses ambientais são responsáveis pelo aumento de rendimento significativo em culturas agrícolas. A relação entre a variação e produção climática de milho e soja nos Estados Unidos para o período de 1982-1998 foi estudada (Lobell e Asner, 2003) e foi verificado que até mesmo mudanças graduais de temperatura têm um impacto mensurável no rendimento das culturas. Para o milho e soja foi estimado que o rendimento é reduzido por 17% por grau na medida em que a temperatura se eleva acima da ótima para a estação. Tanto monocotiledôneas quanto dicotiledôneas são sensíveis ao estresse calórico, particularmente, durante o desenvolvimento de semente e floração que se traduz em um impacto significativo no rendimento de sementes (Young et al., 2004; Sato et al., 2002; Angadi et al., 2000; Carlson, 1990; Wahid, A., et al. 2007). No campo, o estresse de calor é muitas vezes acompanhado com outros estresses ambientais como a seca que adiciona ainda
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2/104 ónus à produtividade da planta. O estresse por calor pode ter uma infinidade de efeitos celulares em plantas, tais como, fluidez e permeabilidade da membrana alterada, agregação de proteínas e desnaturação de proteínas, danos celulares resultantes podem resultar em mudanças prejudiciais no crescimento e desenvolvimento das plantas que impacta a capacidade de sobreviver. Foi sugerido que as plantas possuem uma capacidade inerente para termotolerância basal e adquirida e que um mecanismo de resposta ao calor comum está presente em diversas espécies de plantas (Kapoor et al., 1990; Vierling, 1991; Flahaut et al., 1996; Burke et al., 2000; Hong and Vieling, 2000; Massie et al., 2003; Larkindale et al., 2005). Uma série de estudos foi conduzida para identificar e caracterizar genes e vias que estão envolvidos na termotolerância da planta. Por exemplo, os fatores de transcrição de choque térmico (HSF) e proteínas de choque térmico (HSP) têm recebido muita atenção para elucidar os papéis e efeitos desses genes em resposta ao estresse térmico assim como hormônios de crescimento para plantas, tais como o ácido abscísico e etileno. Não está claro como as plantas sentem o calor, no entanto, é evidente que múltiplas vias de sinalização e componentes celulares estão envolvidos (Larkindale et al. 2005, Physiol Plant. 138:882-897) e que matéria cruzada de vias de sinalização existe entre os estresses ambientais e nutricionais tais como, estresse de choque térmico, estresse de água/seca, estresse causado pelo frio, estresse oxidativo e estresse de metais pesados.
[004]Os fatores de transcrição são proteínas de ligação ao DNA que interagem como sequências intensificadoras ou promotoras específicas e alteram a expressão genética do gene associado. Quando a sequência específica que se liga ao fator de transcrição está associada a um conjunto de genes, vias inteiras podem ser reguladas coordenadamente com vários genes componentes sendo simultaneamente suprarreguladas ou infrarreguladas. Um fator de transcrição pode alterar coordenadamente um conjunto de genes em resposta a um estímulo, tal como um estresse
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3/104 ambiental, estado nutricional ou ataque de patógenos, por exemplo, ou pode ser um componente de uma via de sinalização, tal como uma via de sinalização hormonal, por exemplo. Os fatores de transcrição possuem uma estrutura modular e são classificados principalmente com base no domínio de ligação ao DNA. Alguns reguladores de transcrição são participantes em cascatas de sinais múltiplas. A via e os genes a jusante regulados podem variar dependendo da presença ou ausência de outros componentes reguladores e de via. Os reguladores de transcrição interagem como uma rede em que o resultado depende de uma multiplicidade de fatores que interagem.
[005]A ativação transcricional é mediada principalmente através de fatores de transcrição que interagem com elementos intensificadores e promotores. A ligação de fatores de transcrição de para tais elementos de DNA constitui uma etapa crucial na iniciação da transcrição. Cada fator de transcrição se liga a sua sequência de ligação específica em um promotor e ativa a expressão da região de codificação ligada através de interações com coativadores e/ou proteínas que fazem parte do complexo de transcrição.
[006]O fator de transcrição bHLH39 é um membro de uma das maiores famílias de fatores de transcrição em Arabidopsis thaliana composto de tanto quanto 162 proteínas (Heim et al., 2003, Toledo-Ortiz et al. 2003, Bailey et al., 2003). Esta família de proteínas é distinguida de outros fatores de transcrição por seu domínio hélicealça-hélice básico (bHLH). Estudos têm demonstrado que a região básica é crítica para a ligação ao DNA, embora a região hélice-alça-hélice hidrofóbica seja necessária para a formação de homodímero e heterodímero. As proteínas bHLH pode ter vários parceiros de ligação e, consequentemente, modulam o nível de expressão um subconjunto diferente de genes dependendo de seu parceiro atual (Zhang et al., 2003). Estudos funcionais implicaram as proteínas bHLH em uma variedade de processos celulares tal como a determinação do destino de células epidérmicas da raiz
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4/104 (Tominaga, R., et al, 2007), produção de antocianina (Ramsay et al., 2003), e sinalização de luz (Martinez-Garica et al., 2000) e absorção de ferro (Ling et al., 2002).
[007]A região básica de proteínas bHLH, consistindo em aproximadamente 15-17 resíduos, é responsável pela ligação a elementos cis em promotores de genes alvos. Setenta e cinco por cento de todas as proteínas bHLH Arabidopsis estão previstos para se ligar ao motivo central conhecido como E-box (5'CANNTG-3 ') (Toledo-Ortiz et al., 2003). A especificidade para o E-box pode ser prevista de acordo com a presença de dois resíduos críticos, ácido glutâmico-85 e arginina-88. O bHLH39, e seus três homólogos de Arabidopsis mais próximos, bhLH38, bHLH100 e bHLH101 todos contêm a arginina e ácido glutâmico crítico e, portanto, estão previstos para se ligar a esse motivo. O tipo de ligação E-box pode ser ainda dividido de acordo com a preferência de ligação de dois nucleotídeos centrais. O bHLH39 está previsto para se ligar ao motivo G-box CACGTG de acordo com a presença de dois resíduos, arginina-89 e histadina-81. A arginina-89 e histadina-81 são responsáveis por contatar os dois nucleotídeos CG centrais no G-box e estabilizar a interação. Esses dois resíduos críticos também são conservados em outros três homólogos de Arabidopsis bHLH39. Os quatro resíduos críticos são conservados em todos os 95 homólogos, exceto em dois casos, o homólogo de Cicer arietinum tem uma arginina no lugar do histadina-81, e um homólogo de Vitis vinifera tem uma valina substituída pelo ácido glutâmico-85 (Fig. 1).
[008]Evidências adicionais suportam a especificidade de ligação de bHLH39 vêm de relatórios do ortólogo de arroz OsIRO2 que se liga ao 5'-CACGTGG-3 '(Ogo et al., 2006). Como é o caso com OsIRO2, os resíduos externos do motivo de ligação central mais provavelmente também afetam especificidade de ligação.
[009]As proteínas bHLH se ligam como dímeros a seus alvos de DNA, e a especificidade do parceiro de ligação é codificada no domínio hélice-alça-hélice. Evidências de estrutura cristalina de um complexo de Max-DNA humano intacto
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5/104 mostrou resíduo de leucina 99 como sendo crítico para a formação de dímero (Brownlie et al, 1997). Este resíduo é conservado em todos os homólogos bHLH39, exceto um homólogo de Vitis vinifera. Outros resíduos que mostram mais de 95% de conservação em todos os homólogos de bHLH39 incluíram Arginina-100, Tirosina124, Isoleucina-125, e Prolina-126. A exigência para uma prolina na posição 126 parece ser específica para bHLH39, bHLH38, bHLH100 e bHLH101, sugerindo que este resíduo é importante para facilitar a especificidade dimerização para este grupo.
[0010]De acordo com semelhanças estruturais externas do domínio de ligação ao DNA, bHLH39 é semelhante a 10 outras proteínas bHLH, que juntas formam o subgrupo 1b (Heim et al., 2003). O bHLH39 e seu homólogo de Arabidopsis mais próximo, bHLH38, mostram similaridade de 79% e estão localizados em tandem no genoma, o que sugere uma duplicação evolutiva recente. Outros membros do subgroup1b incluem bHLH100 e bHLH101. O percentual de similaridade entre AtbHLH39 e três outros membros do subgrupo 1b AtbHLH (de acordo com o alinhamento Clustal W) são mostrados abaixo na Tabela A.
Tabela A: Percentual de similaridade entre AtbHLH39, AtbHLH38, AtbHLH100 e AtbHLH101
At At At- At-
bHLH39 bHLH38 bHLH100 bHLH101
At- 1 7 60 31
bHLH39 00 9
At- 1 57 32
bHLH38 00
At- 10 29
bHLH100 0 %
At- 10
bHLH101 0
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6/104 [0011]Tanto bHLH39 quanto bHLH38 foram identificados em uma busca de alvos a jusante de uma ligação de DNA com um fator de transcrição de dedo (Dof), fator de ligação ao elemento- ocs (OBP3), que é induzível pelo ácido salicílico. Neste caso bHLH39 foi nomeado ORG3 e bHLH38 foi nomeado ORG2. O bHLH39 e bHLH38 mostraram ter expressão co-regulada e intensificada em linhagens de superexpressão de OBP3 e ser infrarreguladas em OBF3 linhagens de função perda (Kang et al., 2003). Posteriormente, bHLH39 e bHLH38 mostraram-se responsivas ao estresse mediada por deficiência de ferro, juntamente com seus dois homólogos mais próximos no subgrupo 1b de bHLH, bHLH100, e bHLH101. O papel de expressão de bHLH39 e bHLH38 em relação à deficiência de ferro foi estudado. Um regulador transcricional FIT (AtbHLH29) mostrou interagir com bHLH28 ou bHLH39 para regular transcricionalmente os genes de absorção do ferro FRO2 e IRT1. A superexpressão de qualquer dentre AtbHLH38 ou AtbHLH39 com FIT foi verificada como alterando o padrão de expressão de FRO2 e IRT1 para ativação constitutiva e resultam na tolerância de deficiência de ferro (Yuan, et al., 2008). A FRO2, uma redutase de quelato férrico, é responsável pelo aumento de ferro no solo, um processo necessário para aumentar a solubilidade e biodisponibilidade do ferro. O ferro é posteriormente transportado através da membrana pelo transportador de ferro, IRT1. A expressão ectópica de qualquer dentre a proteína AtbHLH38 ou AtbHLH39 sob o controle do promotor 35S em plantas de tabaco leva à síntese e excreção de riboflavina, um mecanismo de defesa conhecido para condições deficientes de ferro (Vorwieger et al., 2007).
[0012]Em uma via reguladora de transcrição é comum um primeiro regulador de transcrição regular um segundo regulador de transcrição, dependendo da rede de fatores de interação, um único regulador transcricional pode desempenhar um papel em uma variedade de vias, resultando em uma variedade de resultados fisiológicos
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7/104 ou bioquímicos. Tal relação tem sido demonstrada entre alguns MYB e algumas proteínas bHLH (Ramsay e Glover, 2005).
[0013]A família MYB de fatores de transcrição é composta de pelo menos 198 genes (Yanhui et al. 2006) e foi proposta como tendo funções reguladoras em um amplo arranjo de processos que variando desde o crescimento e desenvolvimento para respostas de defesa. As proteínas MYB de plantas são classificadas com base na presença e no número de repetições de MYB imperfeitas cada uma composta por cerca de 52 aminoácidos. O domínio MYB forma uma conformação de hélice-volta-hélice e representa o domínio de ligação ao DNA. Os três grandes grupos de proteínas MYB foram classificados como proteínas relacionadas a R1R2R3-MYB, R2R3-MYB e MYB.
[0014]A família de R2R3-MYB de proteínas em Arabidopsis consiste em 125 proteínas e é caracterizada por ter um domínio de ligação ao DNA R2R3 em seus Nterminais (Kranz et al. 1998, e Stracke et al., 2001). Estes genes estão envolvidos em uma série de processos biológicos, incluindo ações hormonais de mediação, metabolismo secundário (Paz-Ares et al., 1987), controle de desenvolvimento de morfogênese celular (Oppenheimer et al., 1991), meristema, floral e da semente (Kirik et al, 1998, Schmitz et al, 2002) e resposta a vários fatores ambientais (Kranz et al, 1998; Jin e Martin, 1999; Meissner et al, 1999).
RESUMO DA INVENÇÃO [0015]Esta invenção é baseada na verificação de que a superexpressão de um regulador transcricional de gene do bHLH de subgrupo 1b resulta em uma planta com um fenótipo alterado tal como, por exemplo, tolerância ao estresse por calor aumentada, aborto de flores reduzido durante o estresse de calor e rendimento aumentado em relação a uma planta do tipo selvagem.
[0016]Mais especificamente, a invenção refere-se à identificação de um bHLH39 ou bHLH101 como reguladores transcricionais que quando superexpressos
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8/104 irá produzir plantas tendo um fenótipo de tolerância ao estresse por calor.
[0017]Em um aspecto a invenção fornece um método para produção de uma planta transgênica, pela transformação de uma planta, uma cultura de tecido de planta, ou uma célula de planta com um vetor contendo um construto de ácido nucleico que aumenta a expressão ou atividade de um gene do bHLH de subgrupo 1b para obter uma planta, cultura de tecido ou uma célula de planta com atividade ou expressão do bHLH de subgrupo 1b aumentada e crescimento de plantas ou regenerar uma planta a partir da cultura de tecidos de plantas ou células de plantas, em que uma planta tendo tolerância ao estresse por calor aumentada em relação a uma planta do tipo selvagem é produzida.
[0018]Assim, a presente invenção fornece um método para produção de uma planta tendo uma propriedade melhorada, em que o método inclui o aumento da expressão ou atividade de um gene do bHLH de subgrupo 1b endógeno, em que uma planta é produzida tendo um fenótipo vantajoso ou propriedade melhorada. Em uma modalidade particular, a presente invenção fornece um método para produzir plantas tendo tolerância aumentada ao estresse por calor em relação a uma planta do tipo selvagem, em que o método inclui a geração de plantas transgênicas e modificação do genoma de plantas usando os métodos descritos neste documento.
[0019]A tolerância ao estresse por calor se refere à capacidade de uma planta para suportar os efeitos debilitantes do calor que reduz o rendimento de uma planta tipo selvagem e tem melhor desempenho que uma planta do tipo selvagem. Como usado neste documento, o termo tolerância ao estresse por calor amentada se refere a uma planta com tolerância ao estresse por calor maior em comparação com a tolerância ao estresse por calor de uma planta do tipo selvagem correspondente. Por exemplo, uma planta tendo tolerância ao estresse por calor aumentada, em comparação com uma planta do tipo selvagem pode ter 5%, 10%, 15%, 20%, 25%, 30%, 40%, 50%, 60% a 70%, 75 % ou maior tolerância ao estresse por calor do que a
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9/104 planta do tipo selvagem correspondente.
[0020]Os métodos da invenção envolvem o aumento da atividade de um gene bHLH do subgrupo 1b heterólogo ou endógeno por superexpressão ou modificação do promotor, em que uma planta é produzida tendo um fenótipo vantajoso ou propriedade melhorada, tal como a tolerância ao estresse por calor aumentada em relação a uma planta do tipo selvagem. Em um aspecto, a invenção fornece um método para produção de uma planta com tolerância ao estresse por calor aumentada em relação a uma planta do tipo selvagem, pela introdução em uma célula de planta de um construto de ácidos nucléicos que aumenta a expressão ou atividade do gene ou proteína bHLH de subgrupo 1b. Por exemplo, uma planta tendo tolerância ao estresse por calor aumentada em relação a uma planta do tipo selvagem é produzida por a) fornecer um construto de ácidos nucleicos contendo um promotor operavelmente ligado a um construto de ácido nucleico que expressa a atividade de bHLH de subgrupo 1b; b) inserir um construto de ácido nucléico em um vetor; c) transformar uma planta, cultura de tecido, ou uma célula de planta com o vetor para obter uma planta, cultura de tecido, ou uma célula da planta com a atividade de bHLH de subgrupo 1b aumentada; d) crescer a planta ou regenerar uma planta a partir da cultura de tecido ou célula de planta, em que uma planta com tolerância ao estresse por calor aumentada em relação a uma planta do tipo selvagem é produzida. O construto inclui um promotor tal como um promotor constitutivo, um promotor específico de tecido ou um promotor induzível. Preferencialmente, o promotor específico de tecido é um promotor da raiz. Um promotor induzível preferível é um promotor induzível por calor ou secura.
[0021]Uma planta transgênica é fornecida pela invenção tendo um fenótipo vantajoso ou propriedade melhorada, tal como tolerância aumentada ao estresse por calor, produzida pelos métodos descritos neste documento.
[0022]Em outro aspecto a invenção, uma planta é fornecida tendo uma mu
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10/104 tação de ocorrência não natural em um gene bHLH, em que a planta tem expressão ou atividade de bHLH de subgrupo 1b aumentada e a planta tem tolerância ao estresse por calor aumentada em relação a uma planta do tipo selvagem. Expressão ou atividade de bHLH aumentada refere-se a um aumento de 2, 3, 4, 5, 6, 7, 8, 9, 10, 15, 20, 25, 30, 40, 50, 60 ou 75 vezes ou maior, no nível de DNA, RNA ou proteína de um gene bHLH em relação a bHLH do tipo selvagem, ou um aumento de 2, 3, 4, 5, 6, 7, 8, 9, 10, 15, 20, 25, 30, 40, 50, 60 ou 75 vezes da atividade de bHLH em relação à atividade de bHLH do tipo selvagem.
[0023]Um aspecto adicional é uma planta tendo um gene bHLH de subgrupo 1b endógeno que tem uma sequência promotora alterada operavelmente associada com ele. A inserção de elementos intensificadores ou mutações promotoras que resultam na expressão do gene aumentada são previstas pela presente invenção.
[0024]A invenção fornece adicionalmente uma semente transgênica produzida pela planta(s) transgênica da invenção, em que a semente produz planta tendo um fenótipo vantajoso ou propriedade melhorada, tal como, por exemplo, tolerância ao estresse por calor aumentada em relação a uma planta do tipo selvagem.
[0025]Em outra modalidade, a invenção fornece ácidos nucléicos para a expressão de ácidos nucléicos em uma célula de planta para produzir uma planta transgênica tendo um fenótipo vantajoso ou propriedade melhorada tais tal como tolerância aumentada ao estresse por calor em relação a uma planta do tipo selvagem.
[0026]As sequências exemplares que codificam um gene bHLH do tipo selvagem ou porção do mesmo que encontram uso nos aspectos da presente invenção são descritas nas SEQ ID NOs: 1-17, 29-52, 79-83 e 89-97. As sequências exemplares que codificam um gene bHLH39 estão descritas na SEQ ID NO é :1-17. As sequências exemplares que codificam um gene bHLH38 estão descritas na SEQ ID NO é :29-52. As sequências exemplares que codificam um gene bHLH101 estão
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11/104 descritas na SEQ ID NO é :79-83. As sequências exemplares que codificam um gene bHLH100 estão descritas na SEQ ID NO é :89-97. A invenção fornece adicionalmente composições que contêm os ácidos nucléicos da invenção para a expressão em uma célula de planta para produzir as plantas transgênicas descritos neste documento.
[0027]Salvo indicação em contrário, todos os termos técnicos e científicos usados neste documento têm o mesmo significado como comumente entendido por uma pessoa versada na técnica a que pertence esta invenção. Embora os métodos e materiais similares ou equivalentes aos descritos aqui possam ser usados na prática ou teste da presente invenção, métodos e materiais adequados estão descritos abaixo. Todas as publicações, pedidos de patentes, patentes e outras referências mencionadas neste documento são incorporados por referência em sua totalidade. No caso de conflito, o presente relatório descritivo, incluindo definições, prevalecerá. Além disso, os materiais, métodos e exemplos são meramente ilustrativos e não pretendem ser limitantes.
[0028]Outras características e vantagens da invenção serão aparentes e são abrangidas pela seguinte descrição detalhada e reivindicações.
BREVE DESCRIÇÃO DOS DESENHOS [0029]A Figura 1 é um alinhamento de ClustalW de várias proteínas AtbLHL, incluindo AtbHLH39, AtbHLH38, AtbHLH100 e AtbHLH101.
DESCRIÇÃO DETALHADA [0030]A invenção é baseada em parte na verificação de que as plantas que têm uma propriedade agronômica melhorada, tal como, por exemplo, tolerância aumentada ao estresse por calor em relação a um controle do tipo selvagem. Mais especificamente, a invenção é baseada na verificação de que a superexpressão de um regulador transcricional bHLH do subgrupo 1b confere à planta uma propriedade agronômica melhorada, como por exemplo, tolerância ao estresse por calor aumen
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12/104 tada em relação a um controle do tipo selvagem que pode incluir o aborto de flores reduzido e rendimento aumentado [0031]O resultado surpreendente de que a superexpressão de um gene bHLH39 do subgrupo 1b é suficiente para conferir tolerância ao calor foi demonstrado. De acordo com a análise de EMSA e micromatriz, o bHLH39 é um alvo a jusante de Myb68, um outro fator de transcrição que confere tolerância ao calor, quando superexpresso. A análise de micromatriz mostra que a expressão gênica de IRT1 não é significativamente afetada no 35S-bHLH39, sugerindo que a tolerância ao calor conferida pelo bHLH39 ocorre através de uma via separada a partir da resposta a privação de ferro.
[0032]Desta forma, a invenção fornece métodos para intensificar (por exemplo, aumentando) a tolerância ao estresse por calor de plantas pelo aumento da expressão ou atividade de um gene ou polipeptídeo bHLH do subgrupo 1b. Os métodos para aumentar a expressão ou atividade de um gene bHLH do subgrupo 1b são conhecidos na técnica. Por exemplo, uma planta tendo tolerância ao estresse por calor aumentada em comparação com uma planta do tipo selvagem (por exemplo, controle) é produzida pela introdução para uma célula de planta de um construto de ácido nucléico que aumenta a expressão ou atividade de um gene ou polipeptídeo bHLH do subgrupo 1b. A invenção também inclui as plantas transgênicas produzidas pelos métodos da invenção e as sementes produzidas pelas plantas transgênicas que produzem uma planta tendo tolerância aumentada ao estresse por calor.
[0033]Por conveniência, antes da descrição adicional da presente invenção, certos termos empregados na especificação, exemplos e reivindicações apensas são definidos neste documento. Estas definições devem ser lidas à luz do restante da divulgação e como é entendido por uma pessoa versada na técnica.
[0034]Salvo indicação em contrário, todos os termos técnicos e científicos usados neste documento têm o mesmo significado que comumente entendido por
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13/104 uma pessoa versada na técnica a que pertence esta invenção. Embora métodos e materiais similares ou equivalentes aos descritos neste documento possam ser usados na prática ou teste da presente invenção, os métodos e materiais adequados estão descritos abaixo. Todas as publicações, pedidos de patentes, patentes e outras referências mencionadas neste são incorporadas por referência em sua totalidade. No caso de conflito, o presente relatório descritivo, incluindo as definições, prevalecerá. Além disso, os materiais, métodos e exemplos são apenas ilustrativos e não pretendem ser limitantes.
[0035]A sequência de promotora, ou promotor, significa uma sequência de ácido nucléico capaz de induzir a transcrição de uma sequência de gene operavelmente ligado em uma célula de planta. Os promotores incluem, por exemplo, (mas não estão limitados a) promotores constitutivos, promotores específicos de tecidos, tal como um promotor de raiz, um promotor induzível, tal como um promotor induzível de secura, um promotor induzível de calor ou um promotor endógeno, tal como um promotor, normalmente associado a um gene de interesse, ou seja, um gene bHLH do subgrupo 1b ou sequências de promotores críticos ou sintéticos que são capazes de dirigir a expressão de um gene em uma célula de planta, mas não são normalmente associados com um gene expressível.
[0036]Um cassete de expressão significa um construto de vetor em que um gene ou uma sequência de ácidos nucléicos é transcrita. Além disso, o mRNA expresso pode ser traduzido em um polipeptídeo.
[0037]Os termos expressão ou superexpressão são usados intercambiavelmente e significam a expressão de um gene de tal forma que o transgene ou gene operavelmente ligado é expresso. O nível total de expressão em uma célula pode ser elevado em relação a uma célula do tipo selvagem correspondente.
[0038]A mutação de ocorrência não natural se refere a qualquer método que introduz mutações ou mudanças genéticas em uma população de plantas ou
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14/104 plantas. Por exemplo, a mutagênese química, tal como etano metil sulfonato ou etil éster de ácido metanossulfônico, mutagênese de nêutrons rápidos, meios insercionais de DNA, tais como um método de mutagênese sítio-dirigida ou inserção de TDNA. Também estão incluídos métodos para induzir mudanças genéticas, tais como métodos de meganuclease que são uma classe particular de tesouras de DNA, eles são capazes de cortar um cromossomo em um local específico em uma célula viva.
[0039]O termo estresse térmico se refere a uma condição onde o crescimento ou produtividade da planta é inibido em relação a uma planta onde o calor não é um fator limitante.
[0040]O termo tolerância ao estresse por calor se refere à capacidade de uma planta para ter melhor desempenho que uma planta tipo selvagem em condições de estresse por calor.
[0041]O termo estresse por secura se refere a uma condição onde o crescimento ou produtividade da planta é inibido em relação a uma planta onde a água não é limitante. O termo estresse por água é usado como sinônimo e intercambiavelmente com o estresse por água e secura.
[0042]A tolerância à seca se refere à capacidade de uma planta para ter melhor desempenho que uma planta tipo selvagem em condições de estresse por secura ou condições limitadas por água ou para uso de menos água durante o crescimento e desenvolvimento em relação a uma planta do tipo selvagem.
[0043]O peso seco significa tecido vegetal que tenha sido seco para remover a maioria da água celular e é usado como sinônimo e intercambiavelmente com o termo biomassa.
[0044]O termo nulo é definido como um irmão segregado de uma linhagem transgênica que perdeu o transgene inserido e é, por isso, usado como uma linhagem de controle.
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15/104 [0045]Uma série de várias abreviações padrões tem sido usada em toda a divulgação, tais como g, grama; WT, do tipo selvagem; DW, peso seco; WUE, eficiência do uso da água; d, dia.
[0046]O termo bHLH do subgrupo 1b significa um regulador transcricional bHLH39, bHLH38, bHLH100 ou bHLH101. Em alguns casos o termo bHLH é usado para se referir ao bHLH do subgrupo 1b, como apropriado no contexto.
[0047]O termo ácido nucléico bHLH refere-se a pelo menos uma porção de um ácido nucléico bHLH. Da mesma forma o termo proteína bHLH ou polipeptídeo bHLH refere-se a pelo menos uma porção do mesmo. Uma porção é de pelo menos 21 nucleotídeos de comprimento em relação a um ácido nucléico e uma porção de uma proteína ou polipeptídeo é de pelo menos 7 aminoácidos. O termo AtbHLH se refere a um gene bHLH de Arabidopsis thaliana, o termo Bn bHLH se refere a um gene bHLH Brassica napus.
[0048]Determinação da homologia entre duas ou mais sequências [0049]Para determinar o percentual de homologia entre duas sequências de aminoácidos ou entre dois ácidos nucléicos, as sequências são alinhadas para fins de comparação ótima (por exemplo, os gaps (lacunas) podem ser introduzidos em qualquer uma das sequências que estão sendo comparadas para o alinhamento ótimo entre as sequências). Os resíduos de aminoácidos ou nucleotídeos em posições de aminoácidos ou posições de nucleotídeos correspondentes são então comparados. Quando uma posição na primeira sequência é ocupada pelo mesmo resíduo de aminoácido ou nucleotídeo como a posição correspondente na segunda sequência, então, as moléculas são homólogas nessa posição (isto é, como usado neste documento a homologia de aminoácido ou ácido nucléico é equivalente à identidade de aminoácidos ou ácidos nucleicos).
[0050]A homologia de sequências de ácido nucléico pode ser determinada como o grau de identidade entre duas sequências. A homologia pode ser determina
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16/104 da usando programas de computador conhecidos na técnica, tais como software GAP fornecido no pacote do programa GCG. Ver, Needleman e Wunsch (1970). Usando o software GAP GCG com as seguintes configurações para a comparação de sequência de ácidos nucleicos: penalidade de criação de GAP 5,0 e penalidade de extensão de GAP 0,3, a região de codificação das sequências de ácidos nucleicos análogas referidas acima exibe um grau de identidade de pelo, preferencialmente, menos 70%, 75%, 80%, 85%, 90%, 95%, 98%, ou 99%, com a porção de sequência de codificação da sequência de DNA mostrada na SEQ ID NO: 1.
[0051]O termo identidade de sequência refere-se ao grau em que duas sequências de polinucleotídeos ou polipeptídeos são idênticas em uma base de resíduo por resíduo de mais de uma região particular de comparação. O termo percentual de identidade de sequência é calculado pela comparação de duas sequências perfeitamente alinhadas sobre aquela região de comparação, determinando o número de posições em que a base de ácido nucléico idêntica (por exemplo, A, T, C, G, U ou I, no caso de ácidos nucléicos) ocorre em ambas as sequências para produzir o número de posições correspondentes, dividindo o número de posições correspondentes pelo número total de posições na região de comparação (ou seja, o tamanho da janela), e multiplicando o resultado por 100 para produzir o percentual de identidade de sequência. O termo identidade substancial como usado neste documento denota uma característica de uma sequência de polinucleotídeo, em que o polinucleotídeo compreende uma sequência que tem pelo menos 80 por cento de identidade de sequência, preferencialmente, pelo menos 85 por cento de identidade e, frequentemente de 90 a 95 por cento de identidade sequência, mais geralmente, pelo menos 99 por cento de identidade sequência, em comparação com uma sequência de referência sobre uma região de comparação. O termo percentual de resíduos positivos é calculado comparando duas sequências perfeitamente alinhadas sobre aquela região de comparação, determinando o número de posições em que as
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17/104 substituições de aminoácidos idênticas e conservativas, como definido acima, ocorrem em ambas as sequências para produzir o número de posições correspondentes, dividindo o número de posições correspondentes pelo número total de posições na região de comparação (ou seja, o tamanho da janela), e multiplicando o resultado por 100 para produzir o percentual de resíduos positivos.
[0052]Expressão aumentada da expressão e atividade de bHLH do subgrupo 1b [0053]Um aspecto da invenção refere-se aos meios e métodos para aumentar ou superexpressar a expressão e atividade do gene bHLH do subgrupo 1b, resultando em um aumento da expressão e atividade da proteína bHLH do subgrupo 1b. A expressão ou atividade bHLH” abrange ambos os níveis de aumento. A expressão ou atividade de bHLH aumentada refere-se a um aumento de 2, 3, 4, 5, 6, 7, 8, 9, 10, 15, 20, 25, 30, 40, 50, 60 ou 75 vezes ou maior, no nível de DNA, RNA ou proteína de um gene bHLH do subgrupo 1b em relação ao bHLH do tipo selvagem, ou um aumento de 2, 3, 4, 5, 6, 7, 8, 9, 10, 15, 20, 25, 30, 40, 50, 60 ou 75 vezes de atividade da proteína bHLH do subgrupo 1b, em comparação com a atividade de bHLH do subgrupo 1b do tipo selvagem.
[0054]As sequências de codificação de um gene bHLH do subgrupo 1b ou porção do mesmo que são úteis na preparação de construtos para a expressão de bHLH do subgrupo 1b incluem, por exemplo, as SEQ ID NOs: 1-17, 29-52, 79-83 e 89-97.
[0055]Os construtos de expressão são para fornecer superexpressão ou constitutivamente em toda a planta, ou em tecidos específicos. Alternativamente, a expressão pode ser projetada para ocorrer em resposta a um estímulo, temporal espacial ou ambientalmente regulado.
[0056]As estratégias da expressão gênica serão evidentes para o técnico no assunto incluindo aquelas que não discutidas neste documento e aquelas desenvolPetição 870180045232, de 28/05/2018, pág. 77/168
18/104 vidas no futuro.
[0057]Identificação de homólogos de AtbHLH [0058]Os homólogos de bHLH do subgrupo 1b de Arabidopsis thaliana (AtbHLH) foram identificados usando ferramentas de busca de sequência do banco de dados, tal como a Ferramenta de Busca de Alinhamento Local Básico (BLAST) (Altschul et al.,. 1990 and Altschul et al.,. 1997). Os programas de análise de sequência tblastn ou blastn foram empregados usando matriz de escore BLOSUM-62 (Henikoff e Henikoff, 1992). A saída de um relatório BLAST fornece um escore que leva em conta o alinhamento de resíduos similares ou idênticos e quaisquer gaps necessários a fim de alinhar as sequências. A matriz de escore atribui um escore para alinhar qualquer par de sequências possível. Os valores de P refletem quantas vezes espera-se ver um escore ocorrer por acaso. Os escores mais altos são os preferidos e um valor P de baixo limiar é o preferido. Estes são os critérios de identidade de sequência. O programa de análise da sequência tblastn foi usado para consultar uma sequência polipeptídica contra seis modos de traduções de sequências em um banco de dados de nucleotídeos. Os sucessos com um valor P de menos que 25, preferencialmente, menos que -70, e mais preferencialmente, menos que -100, foram identificados como sequências homólogas (critérios de sequência selecionados exemplares). O programa de análise de sequência blastn foi usado para consultar uma sequência de nucleotídeos contra um banco de dados de sequência de nucleotídeos. Também neste caso, os escores mais altos foram preferidos e um valor P limiar preferido foi de menos que -13, preferencialmente, menos que -50, e mais preferencialmente, menos que -100.
[0059]Um gene bHLH do subgrupo 1 b pode ser isolados através de técnicas de amplificação de PCR padrão. Uso de iniciadores para regiões conservadas do gene bHLH do subgrupo 1b e amplificação por PCR produz um fragmento ou cópia de comprimento completo do gene desejado. O modelo pode ser o DNA genômico
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19/104 ou uma biblioteca de cDNA, ou RNA ou mRNA para uso com técnicas de PCR de transcriptase reversa (RTPCR). As regiões conservadas podem ser identificadas usando ferramentas de comparação de sequência, tais como BLAST ou CLUSTALW, por exemplo. Os iniciadores (primers) foram usados e descritos no presente pedido.
[0060]Alternativamente, um fragmento de uma sequência de um gene bHLH do subgrupo 1b é radiomarcada com 32P- por iniciação aleatória (Sambrook et al., 1989) e usada para a triagem de uma biblioteca genômica de plantas (os polinucleotídeos de teste exemplares). Como um exemplo, o DNA total da planta a partir de Arabidopsis thaliana, Nicotiana tabacum, Lycopersicon pimpinellifolium, Prunus avium, Prunus cerasus, Cucumis sativus, ou Oryza sativa é isolado de acordo com Stockinger et al. (Stockinger et al., 1996). Aproximadamente de 2 a 10 pg de cada amostra de DNA são digeridos com restrição, transferidos para membrana de nailon (Micron Separations, Westboro, Mass.) e hibridizados. As condições de hibridização são: 42°C. em formamida a 50%, SSC 5X, tampão fosfato 20 mM 1X Denhardt, sulfato de dextrana a10%, e 100 pg/ml de DNA de esperma de arenque. Quatro lavagens de baixa severidade a Temperatura Ambiente (RT) em sarcosil de sódio 0,05% e pirofosfato de sódio 0,02%, 2X SSC, são realizadas antes das lavagens de alta severidade a 55°C em sarcosil de sódio 0,05%, 0,2.vezes de SSC, e pirofosfato de sódio 0,01%. As lavagens de alta severidade são realizadas até que não são detectadas na lavagem de acordo com Walling et al. (Walling et al., 1988). Os isolados positivos são identificados, purificados e sequenciados. Outros métodos estão disponíveis para hibridização, por exemplo, a solução de hibridização de ExpressHybTM disponível a partir de Clontech.
[0061]Células Hospedeiras e Vetores de Expressão Recombinante bHLH [0062]Outro aspecto da invenção refere-se aos vetores, preferencialmente, vetores de expressão, contendo um ácido nucléico que codifica uma proteína bHLH
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20/104 do subgrupolb, um gene bHLH do subgrupo 1b ou sequência genômica ou porções dos mesmos e análogos ou homólogos dos mesmos. Como usado neste documento o termo vetor de expressão inclui vetores, que são projetados para fornecer a transcrição da sequência de ácidos nucléicos. As sequências transcritas podem ser projetadas para expressar o construto do gene para aumentar a expressão ou atividade total de uma atividade de gene endógeno que correlaciona com a sequência transcrita. A sequência expressa pode ser uma proteína de codificação de bHLH do subgrupo 1b endógena ou a partir de uma espécie heteróloga.
[0063]O ácido nucléico transcrito pode ser traduzido em um produto de polipeptídeo ou proteína. O polipeptídeo pode ser uma variante mutante ou modificada de comprimento não completo da proteína endógena. Como usado neste documento, o termo vetor refere-se a uma molécula de ácido nucléico capaz de transportar um outro ácido nucléico ao qual o mesmo foi ligado. Um tipo de vetor é um plasmídeo, que se refere a uma alça de DNA de dupla fita circular em que segmentos de DNA adicionais podem ser ligados. Um outro tipo de vetor é um vetor viral, em que os segmentos de DNA adicional podem ser ligados no genoma viral. Certos vetores são capazes de replicação autônoma em uma célula hospedeira em que eles são introduzidos (por exemplo, vetores de bactérias tendo uma origem bacteriana da replicação). Outros vetores são integrados no genoma de uma célula hospedeira mediante a introdução na célula hospedeira e, portanto, são replicados junto com o genoma do hospedeiro. Além disso, certos vetores são capazes de dirigir a expressão dos genes aos quais eles estão operativamente ligados. Os vetores são referidos aqui como vectores de expressão. Em geral, os vetores de expressão de utilidade em técnicas de DNA recombinante estão muitas vezes na forma de plasmídeos. No presente relatório descritivo, plasmídeo e vector podem ser usados intercambiavelmente na medida em que o plasmídeo é a forma mais comumente usada de vetor. No entanto, a invenção destina-se a incluir outras formas de vetores de expres
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21/104 são, tais como vetores virais ou vetores de transformação de plantas, binários ou não, que têm funções equivalentes.
[0064]Os vetores de expressão recombinante da invenção compreendem um ácido nucléico da invenção em uma forma adequada para a expressão do ácido nucléico em uma célula hospedeira, o que significa que os vetores de expressão recombinantes incluem uma ou mais sequências reguladoras, selecionadas com base nas células hospedeiras para serem usadas para a expressão, que são operativamente ligadas à sequência de ácido nucléico a ser expressa. Dentro de um vetor de expressão recombinante, operavelmente ligado destina-se a significar que a sequência de nucleotídeos de interesse está ligada à sequência(s) reguladora de uma maneira que permite a expressão da sequência de nucleotídeos (por exemplo, em um sistema de tradução/transcrição in vitro ou em uma célula hospedeira quando o vetor é introduzido na célula hospedeira).
[0065]O termo sequência reguladora destina-se a incluir promotores, intensificadores e outros elementos de controle de expressão (por exemplo, sinais de poliadenilação). Tais sequências reguladoras são descritas, por exemplo, em Goeddel (1990). As sequências reguladoras incluem aquelas que dirigem a expressão constitutiva de uma sequência de nucleotídeos em muitos tipos de células hospedeiras e aquelas dirigem a expressão da sequência de nucleotídeos apenas em certas células hospedeiras (por exemplo, sequências reguladoras específicas de tecidos) ou promotores induzíveis (por exemplo, induzidos em resposta a fatores abióticos como condições ambientais, calor, secura, estado nutricional ou estado fisiológico da célula ou bióticos, como responsivo ao patógeno). Exemplos de promotores adequados incluem, por exemplo, promotores constitutivos, promotores induzíveis por ABA, promotores específicos de tecido e promotores induzíveis por estresse abiótico ou biótico. Será apreciado por aqueles versados na técnica que o projeto do vetor de expressão pode depender de fatores como a escolha da célula hospedeira a ser
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22/104 transformada, o nível de expressão da proteína desejada, bem como horário e local de expressão, etc.. Os vetores de expressão da invenção podem ser introduzidos nas células hospedeiras para assim produzir proteínas ou peptídeos, incluindo proteínas ou peptídeos de fusão, codificados por ácidos nucléicos, como descritos neste documento (por exemplo, as proteínas bHLH do subgrupo 1b, formas mutantes das proteínas bHLH do subgrupo1b, proteínas de fusão, etc.).
[0066]Os vetores de expressão recombinante da invenção podem ser projetados para a expressão de genes bHLH do subgrupo 1b, proteínas bHLH do subgrupo1b, ou porção dos mesmos, em células procarióticas ou eucarióticas. Por exemplo, os genes bHLH do subgrupo 1b ou proteínas bHLH do subgrupo 1b podem ser expressos em células bacterianas, como a Escherichia coli, células de inseto (usando vetores de expressão de baculovírus)) as células de levedura, células de plantas ou células de mamíferos. As células hospedeiras adequadas são discutidas em Goeddel (1990). Alternativamente, o vetor de expressão recombinante pode ser transcrito e traduzido in vitro, por exemplo, usando sequências reguladoras promotoras T7 e polimerase T7.
[0067]Em uma modalidade, um ácido nucléico da invenção é expresso em células de plantas usando um vetor de expressão de plantas. Exemplos de sistemas de vetores de expressão de planta incluem plasmídeo (Ti) de indução de tumor ou porção do mesmo encontrado em Agrobacterium, o vírus do mosaico da couve-flor (CaMV) DNA e vetores, tais como pBI121.
[0068]Para expressão em plantas, o cassete de expressão recombinante conterá, além dos ácidos nucléicos bHLH do subgrupo 1b, uma região promotora que funciona em uma célula de planta, um sítio de iniciação de transcrição (se a sequência de codificação para transcrita não tem um) e, opcionalmente, uma sequência de terminação/poliadenilação de transcrição. A região de terminação/poliadenilação pode ser obtida a partir do mesmo gene como a sequência pro
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23/104 motora ou podem ser obtidos a partir de genes diferentes. Os sítios de enzima de restrição única nas extremidades 5 'e 3' do cassete são tipicamente incluídos para permitir a fácil inserção em um vetor pré-existente.
[0069]Exemplos de promotores adequados incluem promotores de vírus de plantas, tais como o promotor 35S do vírus do mosaico da couve-flor (CaMV) (Odell et al., 1985), os promotores dos genes, tais como actina do arroz (McElroy et al., 1990), ubiquitina (Christensen et al, 1992;. pEMU (Last et al., 1991), MAS (Velten et al, 1984.), histona H3 do milho (Lepetit et al, 1992.);. e Atanassvoa et al, 1992), o promotor 5'- ou 3'- derivado de T-DNA de Agrobacterium tumefaciens, o promotor de Smas, o promotor de cinamil álcool desidrogenase (Patente US 5.683.439), o promotor Nos, o promotor rubisco, o promotor GRP1-8, promoter ALS, (WO 96/30530), um promotor sintético, tal como Rsyn7, SCP e promotores UCP, ribulose 1,3difosfato carboxilase, promotores específicos de fruta, promotores de choque térmico (HSP 81,1 ou HSP18.2), promotores específicos de semente, promotores específicos de raiz, ou seja, uclacyanin2 (UCC2, At2g44790) e outras regiões de iniciação de transcrição de vários genes de plantas, por exemplo, incluindo várias regiões de iniciação opina, como por exemplo, octopina, mannopina e nopalina. Em alguns casos, um promotor associado com o gene de interesse (por exemplo, bHLH) pode ser usado para expressar um construto que tem como alvo o gene de interesse, por exemplo, o promotor AtbHLH nativo. Elementos reguladores adicionais que podem ser conectados a uma sequência de ácidos nucléicos de codificação bHLH do subgrupo 1b para expressão em células de plantas incluem sequências de poliadenilação, terminadoras, e sequências de ácidos nucleicos que codificam do peptídeos sinais que permitem a localização dentro de uma célula de planta ou secreção da proteína da célula. Esses elementos reguladores e métodos para adicionar ou trocar estes elementos com os elementos reguladores do gene bHLH do subgrupo 1b são conhecidos e incluem, mas não estão limitados a, regiões de poliadenilação e/ou
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24/104 terminação 3', tais como os do gene (nos) sintase nopalina Agrobacterium tumefaciens (Bevan et al, 1983); gene inibidor de proteinase II de batata (PINII) (Keil et al, 1986) e incorporado neste documento por referência); e An et al. (1989); e o gene CaMV 19S (Mogen et al, 1990).
[0070]As sequências sinais de planta, incluindo, mas não limitadas a, sequências de DNA/RNA que codificam peptídeo sinal que têm como alvo proteínas para a matriz extracelular da célula de planta (Dratewka-Kos et al., 1989) e o gene extensão Nicotiana plumbaginifolia (De Loose et al., 1991), ou peptídeos sinais que têm como alvo as proteínas para o vacúolo tipo o gene sporamin da batata doce (Matsuoka et al., 1991) e o gene de lectina da cevada (Wilkins et al., 1990), ou sinais que fazem com que as proteínas sejam secretadas como as de PRIb (Lund et al., 1992), ou aquelas as proteínas alvos para os plastídios, tais como as de enoil-ACP redutase de colza (Verwoert et al., 1994) são úteis na invenção.
[0071]Em outra modalidade, o vetor de expressão recombinante é capaz de dirigir a expressão do ácido nucleico, preferencialmente, em um tipo de célula particular (por exemplo, elementos reguladores específicos de tecidos são usados para expressar o ácido nucléico). Os elementos reguladores específicos de tecidos são conhecidos na técnica. Por exemplo, o promotor associado a uma sequência de codificação identificada na base de dados TAIR como At2g44790 (P4790) é um promotor específico de raiz. Especialmente úteis em conexão com os ácidos nucléicos da presente invenção são os sistemas de expressão que são operáveis em plantas. Estes incluem os sistemas que estão sob controle de um promotor específico de tecido, bem como aqueles que envolvem os promotores que são operáveis em todos os tecidos da planta.
[0072]Os promotores específicos para órgãos também são bem conhecidos. Por exemplo, o gene de chalcona sintase-A (van der Meer et al., 1990) ou o promotor di-hidroflavonol-4-redutase (dfr) (Elomaa et al., 1998) dirige a expressão em teci
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25/104 dos florais específicos. Também está disponível o promotor patatin classe I que é transcricionalmente ativado somente do tubérculo da batata e pode ser usado para a expressão do gene alvo no tubérculo (Bevan, 1986). Outro promotor específico de batata é o promotor de amido sintase ligada grânulo (GBSS) (Visser et al., 1991).
[0073]Outros promotores específicos de órgãos apropriados para um órgão alvo desejado podem ser isolados através de procedimentos conhecidos. Essas sequências de controle são geralmente associadas com genes expressos exclusivamente no órgão desejado. Em uma planta superior típica, cada órgão tem milhares de mRNAs que estão ausentes de outros sistemas de órgãos (revisto em Goldberg, 1986).
[0074]O sistema ou cassete de expressão resultante é ligado em, ou construído para ser incluído em um vetor recombinante que é apropriado para transformação de plantas. O vetor também pode conter um gene marcador selecionável pelo qual as células de plantas transformadas podem ser identificadas na cultura. O gene marcador pode codificar a resistência a antibióticos. Esses marcadores incluem resistência ao G418, higromicina, bleomicina, canamicina e gentamicina. Alternativamente, o gene marcador pode codificar um gene de tolerância a herbicidas que fornece tolerância aos herbicidas do tipo glufosinato ou glifosato. Depois de transformar as células de planta, as células tendo o vetor serão identificadas por sua capacidade de crescer em meio contendo o antibiótico ou herbicida particular. As sequências de replicação, de origem bacteriana ou viral, geralmente são também incluídas para permitir que o vetor seja clonado em um hospedeiro de bactérias ou fagos, preferencialmente, uma ampla faixa de hospedeiro de origem procariótica de replicação é incluída. Um marcador selecionável para bactérias também deve ser incluído para permitir a seleção de células bacterianas portando o construto desejado. Os marcadores procarióticos selecionáveis adequados também incluem resistência a antibióticos como canamicina ou tetraciclina.
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26/104 [0075]Outras sequências de DNA que codificam funções adicionais também podem estar presentes no vetor, como é conhecido na técnica. Por exemplo, no caso de transformações de Agrobacterium, as sequências de T-DNA também serão incluídas para posterior transferência aos cromossomos de plantas.
[0076]Outro aspecto da invenção refere-se às células hospedeiras em que um vetor de expressão recombinante da invenção foi introduzido. Os termos célula hospedeira e célula hospedeira recombinante são usados intercambiavelmente neste documento. Entende-se que tais termos não se referem apenas à célula ao sujeito particular, mas também à prole ou progênie potencial dessa célula. Devido a certas modificações poderem ocorrer em sucessivas gerações, quer devido à mutação ou a influências ambientais, tais progênies não podem, de fato, ser idênticas à célula-mãe, mas ainda estão incluídas no âmbito do termo como usados neste documento.
[0077]O vetor de DNA pode ser introduzido em células procarióticas ou eucarióticas através de técnicas de transformação ou transfecção convencionais. Como usado neste documento, os termos transformação e transfecção destinam-se a se referir a uma variedade de técnicas de reconhecidas na técnica para a introdução de ácido nucléico estranho (por exemplo, DNA) em uma célula hospedeira.
[0078]Uma célula hospedeira da invenção, tal como uma célula hospedeira procariótica ou eucariótica em cultura, pode ser usada para produzir (ou seja, expressar) um polipeptídeo da invenção codificado em uma estrutura de leitura aberta de um polinucleotídeo da invenção. Assim, a invenção ainda fornece métodos para produzir um polipeptídeo com as células hospedeiras da invenção. Em uma modalidade, o método compreende cultivar a célula hospedeira da invenção (em que um vetor de expressão recombinante que codifica um polipeptídeo da invenção foi introduzido) em um meio adequado tal que o polipeptídeo seja produzido. Em outra modalidade, o método ainda compreende isolar o polipeptídeo do meio ou da célula
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27/104 hospedeira.
[0079]Uma série de tipos celulares pode agir como célula hospedeira adequada para a expressão de um polipeptídeo codificado por uma estrutura de leitura aberta em um polinucleotídeo da invenção. As células hospedeiras da planta incluem, por exemplo, células de plantas que poderiam funcionar como hospedeiros adequados para a expressão de um polinucleotídeo da invenção incluem as células epidérmicas, mesofilo e outros tecidos da terra, e os tecidos vasculares em folhas, caules, órgãos florais e raízes de uma variedade de espécies de plantas, tais como Arabidopsis thaliana, Nicotiana tabacum, Brassica napus, Zea mays, Oryza sativa, Gossypium hirsutum e Glycine max.
[0080]Plantas transgênicas e células de plantas transformadas [0081]A invenção inclui um protoplasto, célula de planta, tecido de plantas e planta (por exemplo, monocotiledôneas ou dicotiledôneas) transformados com um ácido nucléico bHLH do subgrupo 1 b, um vetor contendo um ácido nucléico bHLH do subgrupo 1b ou um vetor de expressão contendo um ácido nucléico bHLH do subgrupo 1b. Como usado neste documento, planta se destina a incluir não apenas planta no todo, mas também uma porção da mesma (isto é, células e tecidos, incluindo, por exemplo, folhas, caules, brotos, raízes, flores, frutos e sementes).
[0082]A planta pode ser qualquer tipo de planta, incluindo, por exemplo, espécies dos gêneros Arabidopsis, Brassica, Oryza, Zea, Sorgo, Brachypodium, Miscanthus, Gossypium, Triticum, Glycine, Pisum, Phaseolus, Lycopersicon, Trifolium, Cannabis, Cucurbita, Rosa, Vitis, Juglans, Fragaria, Lotus, Medicago, Onobrychis, Trigonella, Vigna, Citrus, Linum, Gerânio, Manihot, Daucus, Raphanus, Sinapis, Atropa, Capsicum, Datura, Hyoscyamus, Nicotiana, Solanum, Petúnia, Digitalis, Majorana, Ciahorium , Helianthus, Lactuca, Bromus, Espargos, Antirrhinum, Heterocallis, Nemesis, Pelargonium, Panieum, Pennisetum, Ranunculus, Senecio, Salpiglossis, Cucumis, Browaalia, Lolium, Avena, Hordeum, Secale, Picea, Caco, e Populus.
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28/104 [0083]A invenção também inclui células, tecidos, incluindo, por exemplo, folhas, caules, brotos, raízes, flores, frutos e sementes e a progênie derivada da planta transformada.
[0084]Vários métodos para a introdução de genes estranhos em plantas são conhecidos e podem ser usados para inserir um gene em uma planta hospedeira, incluindo protocolos de transformação de plantas biológicas e físicas (Ver, por exemplo, Miki et al., (1993) Procedure for Introducing Foreign DNA into Plants, In: Methods in Plant Molecular Biology and Biotechnology, Glick e Thompson, eds., CRC Press, Inc., Boca Raton, páginas 67-88; e Andrew Bent em, Clough SJ and Bent AF, (1998) “Floral dipping: a simplified method for Agrobacterium-mediated transformation of Arabidopsis thaliana”). Os métodos escolhidos variam de acordo com a planta hospedeira, e incluem métodos de transfecção química, tais como fosfato de cálcio, transformação com polietileno glicol (PEG), transferência de genes mediada por micro-organismo, tal como Agrobacterium (Horsch et al., 1985), eletroporação, transformação por protoplastos, microinjeção, imersão de flor, e bombardeio biobalístico.
[0085]Transformação Mediada por Agrobacterium [0086]O método mais amplamente usado para a introdução de um vetor de expressão em plantas é baseado no sistema de transformação natural de Agrobacterium tumefaciens e A. rhizogenes que são bactérias fitopatogênicas que transformam geneticamente células de plantas. Os plasmídeos Ti e Ri de A. tumefaciens e A. rhizogenes, respectivamente, carregam genes responsáveis pela transformação genética de plantas (ver, por exemplo, Kado, 1991). Descrições dos sistemas de vetor de Agrobacterium e métodos para transferência de genes mediada por Agrobacterium são fornecidos em Gruber et al. (1993) e Moloney et al., (1989).
[0087]As plantas transgênicas de Arabidopsis podem ser produzidas facilmente pelo método de imersão de plantas com flores em uma cultura de Agrobacte
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29/104 rium, com base no método de Andrew Bent in, Clough SJ and Bent AF, 1998. Floral dipping: a simplified method for Agrobacterium-mediated transformation of Arabidopsis thaliana. As plantas do tipo selvagem são crescidas até que a planta possua tanto flores em desenvolvimento quanto flores abertas. As plantas são invertidas por 1 minuto em uma solução de cultura de Agrobacterium carregando o construto de gene apropriado. As plantas são então deixadas na horizontal em uma bandeja e mantidas cobertas por dois dias para manter a humidade e depois endireitadas e ensacadas para continuar o desenvolvimento das sementes e crescimento. A semente madura é colhida em massa [0088]Transferência de Gene direta [0089]Um método aplicável em geral de transformação de plantas é a transformação mediada por microprojétil, onde o DNA é carregado na superfície dos microprojéteis medindo cerca de 1 a 4 pm. O vetor de expressão é introduzido em tecidos vegetais com um dispositivo biobalístico que acelera os microprojéteis para velocidades de 300 a 600 m/s que é suficiente para penetrar a parede celular da planta e das membranas (Sanford et al, 1993;.. Klein et al, 1992 ).
[0090]A transformação das plantas também pode ser alcançada pelo método de Injector de Feixe de Aerosol (ABI) descrito na Patente US 5.240.842 e Patente US 6.809.232. A tecnologia de feixe de aerosol é usada para acelerar as partículas molhadas ou secas para velocidades que permitem que as partículas penetrem as células vivas. A tecnologia de feixes de aerossol emprega a expansão de jato de um gás inerte na medida em que o mesmo passa de uma região de maior pressão de gás para uma região de baixa pressão do gás através de um pequeno orifício. O gás em expansão acelera as gotículas do aerossol, contendo moléculas de ácido nucléico para serem introduzidas em uma célula ou tecido. As partículas aceleradas são posicionadas para o impacto de um alvo preferido, por exemplo, uma célula de planta. As partículas são construídas como gotículas de um tamanho suficientemente
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30/104 pequeno para que a célula sobreviva à penetração. A célula ou tecido transformado é cultivado para produzir uma planta por meio de técnicas padrões conhecidas por aqueles versados na técnica aplicável.
[0091]Regeneração de Transformantes [0092]O desenvolvimento ou regeneração de plantas a partir de qualquer protoplastos de plantas únicas ou vários explantes é bem conhecido na técnica (Weissbach e Weissbach, 1988). Este processo de regeneração e crescimento geralmente inclui as etapas de seleção de células transformadas, cultivo dessas células individualizadas através dos estágios usuais do desenvolvimento embrionário durante o estágio de plântula enraizada. Os embriões e sementes transgênicas são igualmente regenerados. Os brotos enraizados transgênicos resultantes são posteriormente plantados em um meio de crescimento da planta apropriado, tal como o solo.
[0093]O desenvolvimento ou regeneração de plantas contendo o gene exógeno, estranho que codifica um polipeptídeo de interesse introduzido por Agrobacterium partir de explantes de folhas podem ser alcançado por métodos conhecidos na técnica, como descrito em Horsch et al., 1985. Neste procedimento, os transformantes são cultivados na presença de um agente de seleção e em um meio que induz a regeneração de brotos na cepa da planta que está sendo transformada como descrito em Fraley et al., 1983. Em particular, Patente US. 5.349.124 (especificação incorporada neste documento por referência) detalha a criação de células de alface geneticamente transformadas e as plantas resultantes que expressam proteínas de cristal híbrido que conferem atividade inseticida contra as larvas de Lepidoptera para essas plantas.
[0094]Este procedimento normalmente produz brotos dentro de dois a quatro meses e os brotos são então transferidos para um meio de indução de raiz apropriado contendo o agente seletivo e um antibiótico para impedir o crescimento bacteria
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31/104 no. Os brotos que enraizaram na presença do agente seletivo para formar mudas são então transplantados para o solo ou outros meios para permitir a produção de raízes. Estes procedimentos variam dependendo da cepa de planta determinada empregada, tais variações sendo bem conhecidas na técnica.
[0095]Preferencialmente, as plantas regeneradas são autopolinizadas para fornecer plantas transgênicas homozigóticas, ou os pólens obtidos das plantas regeneradas é cruzado com plantas de sementes crescidas de interesse agronômico, preferencialmente, de linhagens puras. Por outro lado, o pólen de plantas dessas linhagens importantes é usado para polinizar plantas regeneradas. A planta transgênica da presente invenção que contém um polipeptídeo desejado é cultivada usando métodos conhecidos por um técnico no assunto.
[0096]A planta transgênica preferida é um segregado independente e pode transmitir o construto do gene bHLH do subgrupo 1b para sua progênie. Uma planta transgênica mais preferida é homozigótica para o construto de gene, e transmite esse construto de gene para todos os descendentes mediantes o acasalamento sexual. A semente de uma planta transgênica pode ser crescida no campo ou estufa, e as plantas transgênicas sexualmente maduras resultantes são autopolinizadas para gerar plantas de reprodução verdadeira. Os progênies destas plantas se tornam linhagens de reprodução verdadeira que são avaliadas para a expressão aumentada do gene bHLH do subgrupo 1b.
[0097]Método de produção de plantas transgênicas [0098]Também incluídos na invenção estão os métodos de produção de uma planta transgênica tendo tolerância aumentada ao estresse por calor, aborto de flores reduzido e rendimento aumentado em relação a uma planta do tipo selvagem após um estresse por calor. O método inclui a introdução em uma ou mais células da planta de um composto que aumenta a expressão ou atividade de bHLH do subgrupo 1b na planta para gerar uma célula de planta transgênica e regenerar uma
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32/104 planta transgênica a partir da célula transgênica. O composto pode ser, por exemplo, (i) um polipeptídeo bHLH do subgrupo 1b, (ii) um ácido nucléico, análogo, homólogo, ortólogo, porção, variante de bHLH do subgrupo 1b ou complemento dos mesmos; (iii) um ácido nucléico que aumenta a expressão de um ácido nucléico bHLH do subgrupo 1b. Um ácido nucléico que aumenta a expressão de um ácido nucléico bHLH do subgrupo 1b pode incluir elementos promotores ou intensificadores. Os ácidos nucleicos bHLH do subgrupo de 1b podem ser endógenos ou exógenos, por exemplo, um ácido nucléico bHLH do subgrupo 1b de Arabidoposis pode ser introduzido em uma espécies de milho ou Brassica. Preferencialmente, o composto é uma sequência endógena de ácido nucléico bHLH do subgrupo 1b para a espécie que está sendo transformada. Alternativamente, o composto é uma sequência exógena de ácido nucléico bHLH do subgrupo 1b para a espécie que está sendo transformada, tendo pelo menos 70%, 75%, 80%, 85%, 90% ou mais de homologia com a sequência alvo endógena.
[0099]Em vários aspectos a planta transgênica tem um fenótipo alterado em comparação com uma planta do tipo selvagem (isto é, não transformado). Pelo fenótipo alterado quer-se dizer que a planta tem uma ou mais características que é diferente da planta do tipo selvagem. Por exemplo, quando a planta transgênica foi contatada com um composto que aumenta a expressão ou atividade de um ácido nucléico bHLH do subgrupo 1b, a planta tem um fenótipo, tal como tolerância aumentada ao estresse por calor, aborto de flores reduzido e rendimento aumentado em relação a uma planta do tipo selvagem após o estresse por calor.
[00100]A planta pode ser qualquer tipo de planta, incluindo, por exemplo, espécies dos gêneros [00101]Arabidopsis, Brassica, Oryza, Zea, Sorghum, Brachypodium, Miscanthus, Gossypium, Triticum, Glycine, Pisum, Phaseolus,, Lycopersicon, Trifolium, Cannabis, Cucurbita, Rosa, Vitis, Juglans, Fragaria, Lotus, Medicago, Onobrychis,
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Trigonella, Vigna, Citrus, Linum, Geranium, Manihot, Daucus, Raphanus, Sinapis, Atropa, Capsicum, Datura, Hyoscyamus, Nicotiana, Solanum, Petunia, Digitalis, Majorana, Ciahorium, Helianthus, Lactuca, Bromus, Asparagus, Antirrhinum, Heterocallis, Nemesis, Pelargonium, Panieum, Pennisetum, Ranunculus, Senecio, Salpiglossis, Cucumis, Browaalia, Lolium, Avena, Hordeum, Secale, Picea, Caco, e Populus.
EXEMPLOS
Exemplo 1: Identificação de Genes homólogos [00102]Pesquisas de blasto de bHLH39 e seus homólogos Arabidopsis bHLH38, bHLH100, e bHLH101 foram realizadas contra a bancos de dados de proteína NCBI's, nucleotídeo, e EST e bancos de dados unigene TIGR(1e-01). O banco de dados de sequência genômica foi usado para espécies cuja sequência completa é conhecida, como Arroz e Sorgo. Para confirmar uma sequência foi de fato um ortólogo das sequências de interesse, todos os homólogos putativos foram então blasted contra a o banco de dados completo de proteína Arabidopsis, e qualquer sequência cujo Arabidopsis superior alcançado não foi uma das quatro sequências de interesse foi filtrada de qualquer análise. A redundância mínima entre vários hits, todas as sequências EST hits foram montadas usando o programa de montagem cap3 garantindo que tinham um mínimo de 90% de identidade entre pelo menos 40 nucleotídeos com um máximo de 5 gaps. Fases de leitura aberta foram determinadas usando o programa EMBOSS getorf.
[00103]As pesquisas de blasto de AtbHLH39, AtbHLH38, AtbHLH100, AtbHLH101 geraram 96 sequências homólogas de 40 espécies diferentes. A conservação de sequência foi limitada a domínios de ligação de DNA e dimerização, com pouca ou nenhuma conservação foram desta área. Homólogos foram descobertos em ambas monocotiledôneas e dicotiledôneas sugerindo um requisito funcional importante nas plantas. Homólogos de AtbHLH39 em espécies de importância agronômica como arroz e milho foram recuperados bem como espécies usadas em
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34/104 biocombustíveis como Brachypodium e Switchgrass.
[00104]De acordo com a pesquisa de blasto contra o banco de dados genômico de Brachypodium, há três homólogos para este grupo de genes, e todos os três são mais semelhantes a AtbHLH38. Há uma evidência EST para dois dos três homólogos. Se o terceiro homólogo é um pseudogene ou códigos para uma proteína funcional ainda deve ser determinado.
[00105]Em outras duas espécies de monocotiledôneas, arroz e Sorgo, há somente um homólogo para este grupo, e em ambas as espécies o homólogo é mais próximo de AtbHLH38. Em ambos os arroz e Sorgo, o gene codifica pelo menos duas variantes unidas.
[00106]Há pelo menos dois homólogos para este grupo em Brassica napus, uma proteína como homologia próxima a AtbHLH39, e outra com homologia próxima a AtbhLH38. No entanto, o homólogo BnbHLH39 contém uma mutação não-senso que resulta na codificação de uma proteína parcial sem ligação ao domínio de DNA ou de dimerização. Este achado é confirmado com vários EST, e ainda ocorre em Brassica rapa.
Exemplo 2: Construção de Vetor [00107]O vetor binário pBI121 foi otimizado para a transformação de Arabidopsis e diferentes culturas. O gene GUS em pBI121 foi deletado por digestões e religamentos de SmalI e EcolCR1, resultando no vetor pBI121ÁGUS. Este vetor foi usado para clonar gene para superexpressão. A porção C-terminal de 1,1-Kb do gene GUS foi isolado de pBI121 como um fragmento EcoR V-Sac I (posições 66137715 em pBI121) e clonado nos sítios Sma I e Sac I em pBI121ÁGUS, resultando em pBI121tGUS (com porção N-terminal do gene GUS deletado). O vetor foi usado para criar genes Construtos Hairpin de regulação para baixo com a sequência parcial GUS como a alça ou espaçador.
[00108]O gene NPTII no vetor pBI121 e seus derivados contém uma muta
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35/104 ção pontual (G para T na posição 3383 em pBI121, substituição de aminoácido E182D). A enzima mutante mostrou atividade enzimática várias vezes inferior do que seu tipo selvagem (PNAS, 87:3435-3439, 1990). Para melhorar a eficiência da transformação de diferentes culturas, os vetores pBIÁGUS e pBItGUS foram restabelecidos com o gene WT-NPTII: um fragmento Nhe I-BstB I (0,9 kb, posições 2715-3648) foi substituído com um fragmento Nhe I-BstB I de exatamente a mesma sequência exceto pela única diferença de nucleotídeo. O fragmento foi isolado por digestão de restrição do plasmídeo pRD400 que continha genes WT-NPTII (PNAS, 87:34353439, 1990; Gene, 122:383-384, 1992). Os vetores modificados foram nomeados pBI300ÁGUS e pBI300tGUS, respectivamente. O gene WT-NPTII foi ainda isolado de pBI300ÁGUS como um fragmento Nhe I-Hind III (2,2 kb) e clonado nos sítios correspondentes em pBI121. Isto gerou o vetor pBI300GUS. Para distinguir estes vetores dos outros, vetores binários baseados em pBI121 continha o gene WT-NPTII foram desenhados série pBI300.
[00109]Para usar Basta como um agente de seleção, um marcador de resistência Basta foi subclonado em pBI121. Um fragmento de 1,3-kb Ase I englobando o marcador de seleção Basta (35S-Bar-nosT) foi amplificado por PCR do vetor pEGAD usando um iniciador direto contendo um sítio Pme I e um iniciador reverso contendo um sítio Hind III. O fragmento foi clonado, entre os sítios de PmeI (posição 2492) e Hind III (posição 4950) em pBI121, pBIÁGUS e pBItGUS. Como resultado, o marcador de seleção canamicina (Pnos-NPTII-nosT) foi substituído com o marcador de seleção Basta nestes vetores. Para distinguir estes vetores dos ouros, vetores binários a base de pBI121 contendo o gene marcador de seleção Basta foram designados série pBI800.
[00110]Os vetores pBI300 contém o gene WT-NPTII direcionando pelo promotor nopalina sintase (nos). Uma vez que o promotor não é ativo em plantas monocotiledôneas, foi necessário substitui-lo com um promotor forte para transforma
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36/104 ção de plantas monocotiledôneas. Para este fim, o gene promotor Brachyposium TIF1 (BdTIF1, também chamado BdGOS2) foi clonado em vetores da série pBI300 para direcionar o gene WT-NPTII. A sequência de promotor BdTIF1 (-1 até -2548 com relação ao códon inicial ATG, incluindo o primeiro éxon, primeiro intron e parte do segundo éxon) foi amplificado por PCR como um fragmento PmeI-NheI e clonado nos sítios correspondentes em HSP81.1-AtMyb68-pBI300 (um vetor a base de pBI300 contendo a proteína 81.1 promotora de choque térmico de Arabidopsis e a sequência de codificação Myb68 de Arabidopsis, vide abaixo para detalhes). Como resultado o promotor TIF1p foi colocado 5' a montante ao gene WT-NPTII com um pequeno fragmento de cerca de 120 bp (incluindo 65 bp do promotor nos) entre estes. Para delimitar o fragmento de 120-bp, a sequência de codificação WT-NPTII e vetor de sequência de flanqueamento foi amplificado como o fragmento Nhe I-Sal I (2,1 Kb) e ligado ao plasmídeo digerido com Nhe I e Sal I. A clonagem resultou no vetor HSP81.1-AtMyb68-pBI500. Vetores a base de pBI121 contendo o gene WTNPTII direcionados pelo promotor BdTIF1 foram designados série pBI500. A sequência HSP81.1-AtMyb68 foi ainda substituída com a sequência de promotor 35S como um fragmento Hind III-BamH I isolado por digestão de restrição de pBI300ÁGUS. Isto gerou o vetor pBI500ÁGUS.
Exemplo 3: bHLH subgrupo b1 Construtos de superexpressão [00111]Construto 35S-AtbHLH39:
[00112]A sequência de codificação AtbHLH39 (At3g56980) foi amplificada por RT-PCR de Arabidopsis usando iniciador direto BHLH039FW-XbaI e iniciador reverso BHLH039RV-BamH I. O produto de PCR (0,8 Kb) foi clonado no sítio Xba I e BamH I no vetor binário pBI300ÁGUS e pBI800ÁGUS, gerando o Construto 35SAtbHLH39-pBI300 e 35S-AtbHLH39-pBI800, respectivamente.
[00113]Construto 35S-AtbHLH101:
[00114]A sequência de codificação AtbHLH101 (At5g04150) foi amplificada
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37/104 por RT-PCR de Arabidopsis usando iniciador direto BHLH101FW-XbaI e iniciador reverso BHLH101 RV-BamH I. O produto de PCR (0,7 Kb) foi clonado nos sítios Xba I e BamH I no vetor binário pBI300ÁGUS e pBI800ÁGUS, gerando Construto 35SAtbHLH101-pBI300 e 35S-AtbHLH101-pBI800, respectivamente.
[00115]Construto 35S-AtbHLH38:
[00116]Usando a mesma estratégia conforme descrito acima, a sequência de codificação AtbHLH38 (at3g56970) é amplificada por RT-PCR de Arabidopsis usando um iniciador direto contendo um sítio Xba I e iniciador reverso contendo um sítio Bam HI, e clonado no sítio Xba I e BamH I no vetor binário pBI300ÁGUS, gerando o Construto 35S-AtbHLH38-pBI300.
[00117]Construto 35S-AtbHLH100:
[00118]Usando a mesma estratégia conforme descrito acima, a sequência de codificação AtbHLH100 (At2g41240) é amplificada por RT-PCR de Arabidopsis usando um iniciador direto contendo um sítio Xba I e iniciador reverso contendo um sítio Bam HI, e clonado nos sítios Xba I e BamH I no vetor binário pBI300ÁGUS, gerando o Construto 35S-AtbHLH100-pBI300.
[00119]Construtos HSP81.1-AtbHLH39:
[00120]Várias etapas foram envolvidas no desenvolvimento do Construto. Primeiro, a sequência promotora (-401 a -1 com relação ao códon de início ATG) do gene de proteína HSP81.1 de choque térmico de Arabidopsis (At5g52640) foi amplificado por PCR com iniciadores contendo extremidades Sal I e Xba I de DNA genômico de Arabidopsis, e clonados nos mesmos sítios em pBI101, assim substituindo o promotor 35S. Este vetor foi chamado de pHSP81.1-GUS. O sequenciamento revelou mutações pontuais de T para C na posição -266 e C para T em -121 no promotor. A coloração GUS de mudas de Arabidopsis transformadas com o Construto mostrou os mesmos perfis de indução de calor como relatado na literatura. Por isso estas mutações não afetam aparentemente a funcionalidade do promotor. Segundo,
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MCS2-oligo de New England Biolabs foi anelado e ligado a pHSP81.1-GUS que foi digerido com Xba I e Sma I. Isto resultou no vetor pHSP81.1MCS-GUS. Terceiro, a sequência GUS foi deletada por digestão SmaI e EcolCRI, e auto-ligação do vetor. Isto levou ao vetor pHSP81.1MCSÁGUS. Quarto, a sequência de codificação AtMyb68 (At5g65790) foi clonada nos sítios XbaI e BamH I para superexpressão de Myb68. Quinto, a sequência mutante NPTII foi substituída com esta sequência WT conforme descrito acima, produzindo o vetor HSP81.1-AtMyb68-pBI300. Por fim, a sequência de codificação AtbHLH39 como um fragmento Xba I-BamH I foi clonada nos sítios Xba I e BamH I assim, substituindo a sequência AtMyb68, resultando no Construto HSP81.1-AtbHLH39-pBI300. Igualmente, o fragmento Xba I-BamH I da sequência de codificação AtbHLH39 substituiu a sequência AtMyb68 em HSP81.1AtMyb68-pBI500, resultando no t vetor HSP81.1-AtbHLH39-pBI500.
[00121]Construto UCC2-AtBHLH39:
[00122]Gene uclacyanin2 de Arabidopsis (UCC2, At2g44790) é expresso em níveis muito altos nas raízes. Sua expressão é detectável mas em níveis muito baixos em outras partes da planta. Seu perfil de expressão específico em célula na raiz é semelhante ao de AtbHLH39, ou seja, predominantemente expresso em endoderme e córtex e estela. A sequência promotora do gene UCC2 (-1 até -1475 com relação ao códon de início ATG) foi amplificada por PCR usando iniciador direto contendo um sítio Sal I (P790-Sal-F) e iniciador reverso contendo um sítio XbaI (P790-XbR). O produto de PCR do promotor UCC2 foi clonado nos sítios Sal I e Xba I no vetor HSP81.1-AtMyb68-pBI300 (vide acima), substituindo o promotor HSP81.1. A sequência de codificação AtbHLH39 foi então clonada neste vetor como um fragmento Xba I-BamH I, substituindo a sequência de codificação AtMyb68. O vetor resultante é chamado de UCC2-AtbHLH39-pBI300.
[00123]Construto BdBS-AtbHLH39-pBI500:
[00124]O gene promotor de biotina sintase de Brachypodium (BdBS) (-1 até
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-553 com relação ao códon de início ATG) foi amplificado por PCR com um fragmento Sal I-Xba I e foi clonado para substituir o promotor HSP81.1 em HSP81.1AtbHLH39-pBI500. O vetor resultante foi chamado de BdBS-AtbHLH39-pBI500.
[00125]Construto BdUCC-AtbHLH39-pBI500:
[00126]O homólogo mais perto de Brachypodium do gene uclacyanin2 de Arabidopsis foi encontrado na sequência genômica super_67. A sequência foi 34% idêntica às regiões alinhas junto a uclacyanin2 de Arabidopsis. As fases de leitura aberta foram determinadas. Um blasto reverso da sequência de proteína traduzida para as proteínas TAIR8 de Arabidopsis demonstraram ser mais semelhantes à Uclacyanin1 de Arabidopsis, um homólogo próximo de uclacyanin2. Em Arabidopsis, uclacyanin1 compartilha o padrão de expressão semelhante a uclacyanin2 mas com uma expressão geral mais fraca. A sequência promotora de promotor homólogo de uclacyanin de Brachypodium (BdUCC) (-22 até -1405 em relação ao códon de início ATG) foi amplificada como um fragmento Sal I-Xba I conforme foi clonado para substituir o promotor HSP81.1 em HSP81.1-AtbHLH39-pBI500. O vetor resultante foi chamado de BdUCC-AtbHLH39-pBI500.
Exemplo 4: Clonagem de bHLH39 de Brachypodium [00127]Há três genes bHLH de Brachypodium como alta homologia ao bHLH subgrupo 1b de Arabidopsis compreendendo bHLH39, bHLH 38, bHLH 100 e bHLH 101. Todos os três homólogos de Brachypodium são mais proximamente relacionados a AtbHLH38. Há uma forte evidência EST para o homólogo #1 (super_13.506): a porção 5' é idêntica à sequência em EST DV488230 enquanto que a porção 3' é idêntica à DV488393 que contém polyAs. No entanto, DV488393 ainda contém sequência aparentemente que pertence a um intron. Portanto, a fase de leitura aberta exata permanece ainda a ser determinada. A sequência de codificação putativa (BdbHLH39H1) é clonada por RT-PCR usando iniciador direto BdH1-Xb-F (contendo um sítio Xba I) e iniciador reverso BdH1-Bm-R (contendo um sítio BamH I), e clona
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40/104 do nos sítios correspondentes em um vetor para criar Construtos HSP81.1BdbHLH39H1-pBI500, BdBS-BdbHLH39-BI500 e BdUCC-BdbHLH39H1-pBI500.
[00128]Iniciadores
Tabela 1: Iniciad ores de Clonagem
SEQ ID Nome Sequência (5' a 3') Produto de PCR
106 BHLH039FW- XbaI aaaTCTAGAATGTGTGCATTAGTAC- CTCCATTGTTTC AtbHLH39 CDS, 0,8 Kb
107 BHLH039RV- BamHI aaaGGATCCTCATATATATGAG- TTTCCACATTCCTCATAC
108 BHLH101FW- XbaI aaatCTAGAATGGAGTATCCATGGCTGCAG- TCTC AtbHLH101 CDS, 0,7 Kb
109 BHLH101RV- BamHI aaaGGATCCTTATGATTGGCGTAATCCCAA- GAGC
110 P790-Sal-F acgtGTCGAC CTT AGC CAA TGG ATG AGG ATG AtUCC2 promotor, 1,5 Kb
111 P790-Xb-R acgtTCTAGA TTT TTG TTT ACT GTA GAA GAG
112 BdGOS-Pm- F10 acgtGTTTAAAC GCA TAG ACT CTC AGC GGA GAG BdTIF1 promotor, 2,5 Kb
113 BdGOS-Nh-R acgtGCTAGC gaaaactcctggtgagagtgg
114 NPTII-Nh-F acgtGCTAGC atgattgaacaagatggattgcac WT- NPTII e
115 NPTII-Sal-R acgtGTCGAC CTG CAG GCA TGC AAG CTT
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SEQ ID Nome Sequência (5' a 3') Produto de PCR
GG sequência de flanqueamento, 2,1 Kb
116 BdBSp-Sal-F acgtGT CGAC ctctggatgcctaaacaaacgac BdBS promotor, 0,5 Kb
117 BdBSp-Xb-R acgtTCTAGA ggcttttgtcggtcggcctg
118 BdUCCp-Sa-F4 acgtGTCGAC GGA GGT GCA GTT TGC AGC AG BdUCC promotor, 1,4 Kb
119 BdUCCp-Xb-R4 acgtTCTAGA TAT AGA GAG AGG GTG ATC AAC GA
120 BdH1-Xb-F acgtTCTAGA ATG GGG CAC AAG CAG CTG TTC BdbHLH 39 homólog o, su- per_13,5 06 (0,7 Kb)
121 BdH1-Bm-R acgtGGATCC TCA CTG ATG CAT ATG CAG TCC
Exemplo 5: Transformações de Planta [00129]Os Construtos descritos acima foram ou são transformados em Arabidopsis e Brachypodium conforme apropriado. Outras espécies são transformadas
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42/104 com um vetor apropriado e as plantas transformadas são produzidas.
Tabela 2: Transformação de Construtos
CONSTRUTO ESPÉCIES ALVOS Transformado
35S-AtbHLH39-pBI300 Dicotiledôneas i.e.Arabidopsis(At), Brassica(Bn) At, Bn
35S-AtbHLH39-pBI800 Dicotiledôneas i.e.Arabidopsis(At), Brassica(Bn)
35S-AtbHLH101-pBI300 Dicotiledôneas i.e.Arabidopsis(At), Brassica(Bn) At
35S-AtbHLH101-pBI800 Dicotiledôneas i.e.Arabidopsis(At), Brassica(Bn)
35S-AtbHLH38-pBI300 Dicotiledôneas i.e.Arabidopsis(At), Brassica(Bn)
35S-AtbHLH100-pBI300 Dicotiledôneas i.e.Arabidopsis(At), Brassica(Bn)
HSP81.1-AtbHLH39-pBI300 Dicotiledôneas i.e.Arabidopsis(At), Brassica(Bn) At, Bn
HSP81.1-AtbHLH39-pBI500 Monocotiledôneas, i.e. Brachypodium
UCC2-AtbHLH39-pBI300 Dicotiledôneas i.e.Arabidopsis(At), Brassica(Bn)
HSP81.1-AtbHLH39-pBI500 Monocotiledôneas, i.e. Brachypodium
BdBS-AtbHLH39-pBI500 Monocotiledôneas, i.e. Brachypodium
HSP81.1-AtbHLH39-pBI500 Monocotiledôneas, i.e. Brachypodium
BdUCC-AtbHLH39-pBI500 Monocotiledôneas, i.e. Brachypodium
HSP81.1-BdbHLH39H1- pBI500 Monocotiledôneas, i.e. Brachypodium
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CONSTRUTO ESPÉCIES ALVOS Transformado
BdBS-BdbHLH39-BI500 Monocotiledôneas, i.e. Brachypodium
BdUCC-BdbHLH39H1- pBI500 Monocotiledôneas, i.e. Brachypodium
Exemplo 6: Métodos de transformação [00130]Plantas transgênicas Arabidopsis foram feitas pelo método de mergulhar as plantas com flores em uma cultura de Agrobacterium, baseado no método de Andrew Bent in, Clough SJ and Bent AF, 1998. Floral dipping: a simplified method for Agrobacterium-mediated transformation of Arabidopsis thaliana. As plantas tipo selvagem cresceram sob condições padrões como 16 horas, ciclo de dia de 8 horas de luz a escuro, até que a planta tivesse flores em desenvolvimento e flores abertas. A planta foi invertida por 2 minutos em uma solução de cultura de Agrobacterium contendo o Construto de gene apropriado. As plantas foram então deixadas na horizontal em uma bandeja e mantidas cobertas por dois dias para manter a umidade e em seguida ajeitadas e ensacadas para continuar o crescimento e desenvolvimento da semente. A semente madura foi colhida.
[00131]As plantas transformadas T1 foram selecionadas por germinação e crescimento em placas MS contendo 50 pg/ml de canamicina ou um meio apropriado de seleção. Mudas verdes, resistentes a canamicina (KanR) foram identificadas após 2 semanas de crescimento e transplantadas para solo. As plantas foram ensacadas para garantir auto-fertilização e a semente T2 de cada planta colhida separadamente. Durante o crescimento das plantas T1, amostras de folhas foram colhidas, o DNA foi extraído e análises de Southern blot e PCR foram realizadas.
[00132]As sementes T2 foram analisadas para segregação de KanR. A partir destas linhagens que apresentaram um fenótipo resistente 3:1, as plantas T2 sobreviventes cresceram, foram ensacadas durante o conjunto de sementes, e sementes
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T3 foram colhidas de cada linhagem. A semente T3 foi novamente usada para análise de segregação KanR e aquelas linhagens que apresentaram fenótipo 100% KanR foram selecionadas como linhagens homozigotas. Outra análise molecular e fisiológica foi realizada usando mudas T3.
[00133]Plantas transgênicas Brassica napus, Glycine max e Zea maize são produzidas usando transformação mediada por Agrobacterium de tecido pecíolo de cotiledônea. As sementes são esterilizadas como a seguir. As sementes são umedecidas com etanol 95% por um curto período de tempo como 15 segundos. Aproximadamente 30 ml de solução esterilizante I são adicionados (70% Javex, 100pl Tween20) e deixados por aproximadamente 15 minutos. A solução I é removida e substituída com 30 ml de solução II (0,25% cloreto mercúrico, 100pl Tween20) e incubada por cerca de 10 minutos. As sementes são rinsadas com pelo menos 500 ml de água estéril duplamente destilada e armazenadas em um prato estéril. As sementes são germinadas em placas de Meio 1/2 MS, pH 5,8, complementada com sacarose 1% e agar 0,7%. Cotiledôneas totalmente expandidas são colhidas e colocadas em Meio I (Murashige orgânico mínimo (MMO), sacarose 3%, 4,5 mg/L benzil adenina (BA), 0,7% fitoagar, pH5,8). Uma cultura de Agrobacterium contendo o Construto de ácido nucleico de interesse é crescido por 2 dias em meio AB Mínimo. Os explantes de cotiledônea são mergulhados de modo que somente a parte cortada do pecíolo entre em contato com a solução de Agrobacterium. Os explantes são então embebidos em Meio I e mantidos por 5 dias a 24°C, com ciclos de 16,8 hr de luz/escuro. Os explantes são transferidos para o Meio II (Meio I, 300 mg/L timentina) por outros 7 dias e em seguida para o Meio III (Meio II, 20 mg/L canamicina). Qualquer tecido de raiz ou brotos que se desenvolveram neste tempo é dessecado. Tansferir os explantes para placas novas de Meio III após 14 -21 dias. Quando regenerado, o tecido de broto se desenvolve o tecido regenerado é transferido para o Meio IV (MMO, sacarose 3%, 10% fitoagar, 300 mg/L timentina, 20 mg/L 20 mg/L
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45/104 canamicina). Uma vez que o tecido de broto tenha se desenvolvido, o tecido de broto de qualquer calo é mergulhado em 10X IBA e transferido para o Meio V (Murashige e Skooge (MS), sacarose 3%, 0,2 mg/L ácido indol butírico (IBA), 0,7% agar, 300 mg/L timentina, 20 mg/L 20 mg/L canamicina) para enraizar. As plântulas saudáveis são transferidas para o solo. O que foi acima mencionado, com ou sem modificação, é apropriado para a transformação de várias espécies de plantas incluindo Glycine max, Zea maize e algodão.
[00134]Glycine max, Zea maize e algodão transgênicos são produzidos usando métodos a base de meio de Agrobacterium que são conhecidos aos especialistas na técnica. De modo alternativo, pode ser usado um método de transformação por bombardeamento biolístico de partícula ou não partícula. Um exemplo de transformação biolística não partícula é mostrado no Pedido de Patente U.S. 20010026941. Este método foi usado para produzir plantas transgênicas de Glycine max e Zea maize. Plantas viáveis são propagadas e linhagens homozigotas são geradas. As plantas são testadas para a presença de fenótipos de tolerância, fisiológicos e bioquímicos conforme descrito em outro ponto.
[00135]A transformação de tecido de planta como Zea maize, por exemplo, é conseguida por sonicação de cultura de tecido de calo. O tecido de calo foi produzido como a seguir. Ears de milho foram colhidas 18 dias após espigamento e esterilizada na superfície em alvejante 50% v/v por 20 minutos seguido por três lavagens com água estéril destilada. Embriões imaturos variando em tamanho de 2 a 4 mm foram colhidos dos kernels. Os embriões foram colocados em meio MSD1.5 (2% sacarose, 1X MS sais de macronutrientes e micronutrientes, vitaminas 1X MS, 1,5 mg / L 2,4-D, 0,8% agar, pH 5,8) com o escutelo voltado para cima. Os embriões foram incubados a 26-28 °C no escuro. As células friáveis de culturas de 2 semanas de vida foram transferidas para meio novo MSD1.5 e em seguida incubados a 26-28 °C no escuro. O calo friável foi subcultivado para meio novo MSD1.5 a cada 21 dias.
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46/104 [00136]A transformação do tecido de calo foi realizado conforme prescrito abaixo. O Construto foi introduzido em GV3101 Agrobacterium por inoculação de uma única colônia de GV3101 Agrobacterium contendo o plasmídeo HPR-GUS em 10 mL de LB unido com 150 pg/mL rifampicina, 100 pg/mL sulfato de gentamicina, e 50 pg/mL canamicina. A cultura foi deixada crescer durante a noite a 28°C com agitação a 200 rpm. O calo de milho foi cortado em pedaços de aproximadamente 3-5 mm em tamanho. A cultura de Agrobacterium foi centrifugada a 1500 x g por 10 minutos e lavada duas vezes com 10 mL de MSD1.5 líquido (2% sacarose, 1X MS sais de macronutriente e micronutriente, vitaminas 1X MS, 1.5 mg / L 2,4-D, pH 5,8). A bactéria foi ressuspendida em MSD1.5 líquido para um OD600nm de 0,25 e 1 mL de Agrobacterium diluído ou MSD1.5 líquido, para controles negativos, foi colocada em tubos de microcentrífuga de 1,5 mL contendo quatro pedaços de calo adicionado a cada tubo. O calo e a cultura Agrobacterium foram sonicados em um Branson 200 Ultrasonic Cleaner por 0, 3, 10, 30, 100, ou 300 segundos com a bactéria ou 0 ou 300 segundos sem a bactéria (em MSD1.5 líquido isolado). Após sonicação, o calo foi rasgado sobre papel de filtro estéril e colocado em meio MSD1.5A (meio sólido MSD1.5 modificado com 100 pM acetosiringona). O período de co-cultivo foi de 4 dias no escuro a 28°C. O calo foi rinsado em MSD1.5 líquido, rasgado sobre papel de filtro estéril, e colocado em meio MSD1.5T (meio sólido MSD1.5 modificado com 400 pg/mL Timentina) por 3 dias no escuro a 28°C. Sete dias após a sonicação, o calo foi adicionado a 1 mL de solução de coloração GUS (50 mM NaPO4, pH 7,0, 0,1% Triton X-100, 1 mM EDTA, 2 mM DTT, 0,5 mg/mL X-GlcA) e deixado para incubar durante a noite a 37 °C. A solução de coloração foi substituída com 1 mL de tampão de fixação (10% de formaldeído, 50% etanol) e incubado por 30 minutos em temperatura ambiente. O tampão de fixação foi substituído com 80% etanol e incubado por 1 hora em temperatura ambiente. O etanol 80% foi substituído com 100% etanol e incubado por 1 hora em temperatura ambiente. O calo foi avaliado para coloração
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47/104 azul, indicando atividade GUS.
[00137]Outros métodos de transformação de planta são usados quando apropriados e são comumente descritos e conhecidos na técnica.
Exemplo 7: Análise de expressão [00138]O RNA total foi isolado de 22 linhagens transgênicas 35S-AtbHLH39 e tipo selvagem de linhagens Arabidopsis. Aproximadamente 10 pDpg de RNA total foram carregados em cada linha. O Northern foi avaliado com HPR cDNA radiomarcado em solução de hibridização ExpressHyb (Clontech) e exposto usando uma tela de fosfo imagem. Para quantificação os blots foram reavaliados com tubulina, um gene constitutivamente expresso, para um padrão de comparação.
[00139]O nível de expressão de AtbHLH39 foi elevado 4 vezes a 126 vezes superior ao do controle WT Columbia. As linhagens de melhor desempenho (linhagem 34 e linhagem 97) baseadas em tolerância ao calor e secura, tinham aumentos de 50 a 40 vezes na expressão de AtbHLH39, respectivamente.
Exemplo 8: Microarranjo e análise de expressão [00140]O subgrupo 1b bHLH inclui AtbHLH38, AtbHLH39, AtbHLH100 e AtbHLH101. Os dados de microarranjo de linhagens transformadas como um Construto de superexpressão para aumentar a expressão de MYB68 ou atividade (35SAtMYB68) mostraram que a expressão de RNA de AtbHLH39 e AtbHLH101 aumentou 32 vezes 15 vezes, respectivamente quando AtMYB68 foi super expresso 37 vezes. Os genes AtbHLH38 e AtbHLH100 não estavam presentes no chip de microarranjo, assim a expressão destes genes intimamente relacionados ainda está por ser determinada. Os quatro membros AtbHLH38, AtbHLH39, AtbHLH100, AtbHLH101 têm alta sequência de homologia no grupo 1b, e podem ser pelo menos parcialmente redundantes.
[00141]A expressão de AtbHLH39 é principalmente co-localizada com AtMYB68 no periciclo da raiz como é o de Myb68 (Birnbaum et al. 2003; Schmid et
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48/104 al. 2005). A análise do promotor endógeno MYB68 e do promotor AtbHLH39 demonstra que estes promotores se expressam predominantemente no tecido da raiz.
[00142]Outras análises de microarranjo, a expressão do gene de IRT1 não é significativamente afetado nas plantas transgênicas que super expressão AtbHLH39 (Construto 35S-AtbHLH39) sugerindo que o fenótipo de tolerância ao calor conferido pela superexpressão de AtbHLH39 não regula a expressão do gene IRT1 e que o envolvimento relatado de bHLH39 nas respostas à privação de ferro ocorre por uma via separada.
[00143]As características de transcrição dos membros de bHLH subgrupo 1b família de gene de trator de transcrição AtbHLH39, AtbHLH38, AtbHLH100, e AtbHLH101 foram analisadas. AtbHLH39 expressa predominantemente na raiz, enquanto que AtbHLH38, AtbHLH100, e AtbHLH101 têm baixa expressão em tecidos de folha, broto, flor e raiz. A transcrição de AtbHLH38 é pouco detectável em raiz e folha, AtbHLH100 se expressa em nível muito baixo no broto e na flor e AtbHLH101 ainda se expressa em nível muito baixo na raiz e na folha.
Exemplo 9: MYB68 se liga a promotor bHLH39 [00144]Ensaios de troca de mobilidade eletroforética (EMSA) foram realizados para determinar se a proteína MYB68 poderia se ligar à sequência promotora de AtbHLH39. Quatro diferentes segmentos de promotor foram marcados e testados: P1 (-1 a -224, com relação ao códon de início ATG), P2 (-204 a -419), P3 (-401 a 623) e P4 (-601 a -788). A sonda de DNA marcada foi incubada com proteína de fusão purificada MYB68. Um complexo de proteína-DNA foi detectado com a sonda P1 enquanto outras regiões do promotor não apresentaram ligação com MYB68. A formação do complexo P1/Myb68 foi eliminada pela adição de um competidor frio de DNA com a mesma sequência que à sonda, mas não afeta pelos competidores frios de P3. Além disso, nenhum complexo proteína-DNA foi formado quando a sonda P1 foi incubada com uma proteína truncada MYB68 (MYB68CD) na qual os domínios de
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49/104 ligação a R2R3 DNA foram deletados. Os dados demonstraram que a proteína MYB68 se liga especificamente ao promotor AtbHLH39 na região -1 a -224.
[00145]Para ainda localizar o sítio de ligação MYB68, quatro oligonucleotídeos de dupla fita cobrindo a região promotora -1 a -232 foram testados como competidores nos ensaios de ligação: P11 (-1 a -61), P12 (-52 a -118), P13 (-109 a -178) e P14 (-169 a -232). A ligação de MYB68 à sonda P1 foi abolida pelo competidor P12, mas não foi afetado por outros fragmentos, indicando que o sítio de ligação MYB68 está dentro da sequência -52 a -118.
Exemplo 10: Expressão constitutiva de At-bHLH39 em Arabidopsis resulta em aborto de flor reduzido após estresse por calor [00146]Um experimento foi definido com 14 linhagens transgênicas 35SAtbHLH39 e um controle tipo selvagem (WT). As plantas cresceram em potes de 2,25 polegadas sob condições ótimas (22°C, 18hr de luz de 200uE, 60% RH) em uma câmara de crescimento até três dias após o aparecimento da primeira flor. Um tratamento de estresse por calor foi aplicado colocando as plantas a 42°C por 2 horas. Uma semana após o período de estresse, as plantas foram avaliadas para um número de flores abortadas. Os resultados são mostrados na Tabela 3. Dez das linhagens transgênicas tiveram o aborto de flor reduzido em relação aos controles WT. Uma das linhagens (34-1) teve flores menos abortas de maneira estatisticamente significativa em relação ao WT.
Tabela 3: Aborto médio de flor após 2 hr a 42°C (n=6 a 11) ±SE
Entrada # de flores abortadas Aborto de flor como % de WT
97-7 2,5±0,5 44%
34-1 2,9±0,3 51%
46-10 3,2±0,3 56%
57-2 3,6±0,4 64%
1-7 3,8±0,2 67%
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50/104
Entrada # de flores abortadas Aborto de flor como % de WT
41-2 4,1±0,3 72%
38-10 4,5±0,7 79%
96-4 4,5±0,5 79%
12-4 4,7±0,5 82%
30-2 4,8±0,5 85%
94-10 5,1±0,9 90%
10-1 5,7±0,5 100%
52-4 6,2±0,7 108%
103-1 6,2±0,6 109%
WT 5,7±0,6 100%
Exemplo 11: Expressão constitutiva de AtbHLH39 em Arabidopsis resulta em tolerância à secura das plantas [00147]A tolerância à secura foi avaliada em seis linhagens transgênicas AtbHLH39 que ainda apresentaram aborto de flor reduzida após estresse por calor. As plantas foram crescidas (pote 5 por 3 polegadas, n=8) sob condições ótimas em uma câmara de crescimento (22°C, 18hr luz de 200uE, 60% RH) até que a primeira flor se abrisse. O tratamento para secura foi aplicado molhando todas as plantas no mesmo nível de saturação. Mais água foi retida. As plantas foram pesadas diariamente para determinar a perda de peso diária e todas as plantas foram colhidas no dia quatro de tratamento, em cujo tempo todas as plantas estavam visivelmente murchas. A perda de água em relação à biomassa do broto final foi calculada e é um indicador representativo de tolerância à secura. Os dados foram normalizados para WT que foi ajustado como 100% (Tabela 4). Todas as seis linhagens mostraram perda de água reduzida em relação à biomassa de broto, 3 das quais foram estatisticamente significativas. Isto é indicativo de fenótipo de tolerância à secura. Duas das linhagens que melhor desempenharam tolerância à secura foram ainda as
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51/104 que melhor se desempenharam tolerância ao calor indicando uma relação próxima entre os dois traços: tolerância à secura e tolerância ao calor como resultado de uma expressão constitutiva de AtbHLH39 em Arabidopsis.
Tabela 4: Perda de água em relação ao peso seco do broto e tolerância à secura em linhagens transgênicas 35S-bHLH39
Entrada Perda da água em 3d/broto DW d4 Tolerância à secura (% de WT) Broto DW d4 (g)
34-1 125±3 128% 0,56±0,01
97-7 140±5 119% 0,51±0,02
94-10 150±5 113% 0,46±0,02
65-1 153±6 112% 0,47±0,02
30-2 162±4 106% 0,43±0,01
1-7 166±3 104% 0,43±0,01
WT 173±5 100% 0,40±0,01
Exemplo 12: Expressão constitutiva de At-bHLH101 em Arabidopsis resulta em aborto de flor reduzido após estresse por calor [00148]Um experimento foi estabelecido com 17 linhagens transgênicas 35S-AtbHLH101 e um controle WT. As plantas foram crescidas em potes de 2,25 polegadas sob condições ótimas (22C, 18hr de luz de 200uE, 60% RH) em uma câmara de crescimento até três dias após o aparecimento da primeira flor. Um tratamento de estresse por calor foi aplicado colocando as plantas a 42°C por 1,75 hours. Uma semana após o período de estresse as plantas foram avaliadas para o número de flores abortadas. Os resultados são mostrados na Tabela 5 e mostram que dez das linhagens transgênicas tinham pelo menos 10% de aborto de flor reduzidos em relação aos controles WT e duas linhagens tiveram uma redução de 50% em aborto de flor em relação aos controles WT.
Tabela 5: Aborto de flor após estresse por calor (n=12)
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Entrada # de flores aborta- das Aborto de flor (% de WT)
61-1 1,3±0,3 41%
88-3 1,3±0,4 43%
18-1 2,0±0,5 65%
90-1 2,3±0,5 73%
15-2 2,5±0,5 81%
49-5 2,5±0,5 81%
19-4 2,7±0,4 86%
70-8 2,7±0,3 86%
75-2 2,7±0,5 86%
16-2 2,8±0,4 89%
39-11 2,8±0,4 92%
11-1 2,9±0,4 95%
81-3 3,0±0,4 97%
79-6 3,1±0,4 100%
97-2 3,1±0,4 100%
45-2 3,2±0,5 103%
9-1 3,2±0,4 103%
WT 3,1±0,3 100%
Exemplo 13: Expressão constitutiva de AtbHLH101 em Arabidopsis resulta em tolerância à secura das plantas [00149]A tolerância à secura foi avaliada em dez linhagens transgênicas AtbHLH101 que ainda apresentaram aborte reduzido de flor após estresse ao calor. As plantas cresceram (ponte 5 por 3 polegadas) sob condições ótimas em uma câmara de crescimento (22°C, 18hr de luz de 200uE, 60% RH) até que a primeira flor se abrisse. O tratamento para secura foi aplicado em seguida molhando todas as plan
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53/104 tas para o mesmo nível de saturação. Mais água foi retida. As plantas foram pesadas diariamente para determinar a perda de água e todas as plantas foram colhidas no dia quatro de tratamento, em cujo tempo todas as plantas estavam visivelmente murchas. A perda de água em relação à biomassa de broto final foi calculada como um indicador representativo de tolerância à secura. Os dados foram normalizados para WT que foi definido como 100% (Tabela 6). Oito das dez linhagens avaliadas mostraram algum grau de tolerância à secura e uma linhagem teve uma tolerância à secura estatisticamente significativo de 27% superior em relação a WT. Esta linhagem foi ainda uma das quatro que apresentou melhor desempenho de tolerância ao calor como observado pelo reduzido aborto de flor.
Tabela 6: Perda de água em relação ao peso seco do broto e tolerância à secura em linhagens transgênicas 35S-bHLH101
Entrada Perda de água 3d/brotoDW d4 Tolerância à secura (% WT) Broto DW d4 (g)
90-1 147±5 127% 0,48±0,02
16-2 174±6 114% 0,41±0,02
61-1 176±5 113% 0,40±0,01
70-8 177±7 112% 0,41±0,02
6-5 181±3 110% 0,39±0,01
11-1 187±7 107% 0,38±0,02
45-2 189±8 106% 0,37±0,02
19-4 191±5 105% 0,37±0,01
79-6 203±7 100% 0,35±0,01
82-4 203±3 99% 0,34±0,01
WT 202±6 100% 0,34±0,01
Exemplo 14: Expressão constitutiva de At-bHLH39 em Arabidopsis resulta em rendimento aumentado de semente em relação a um controle tipo selvagem
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54/104 após o estresse ao calor [00150]As plantas cresceram (pote 3 por 3”) sob condições ótimas em uma câmara de crescimento (22°C, 18hr luz de 200uE, 60% RH) até florescerem. Nas plantas em floração são divididas em dois grupos onde o primeiro grupo é exposto ao estresse por calor (todas as plantas floresceram dentro de dois dias) e o segundo grupo é mantido sob condições ótimas até a maturidade. O tratamento ao estresse por calor consiste de uma exposição diária a 45°C. As temperaturas são elevadas de 22 a 45°C em um período de uma hora e mantidas a 45°C por um período de tempo de 2hr a 3 hr. Os tratamentos de estresse por calor diários são aplicados por um período de 10 dias. Após o estresse de aquecimento, as plantas são devolvidas às condições ótimas e crescem até amadurecerem. Todas as plantas são colhidas na maturidade e o rendimento final das sementes é determinado. Comparando o rendimento (como % do ótimo) de plantas transgênicas aos WT o grau de proteção de rendimento é calculado.
Tabela 7: QUADRO DE REFERÊNCIA ID SEQUÊNCIA ID
ESPÉCIE SEQ ID NO: bHLH Referência Tipo de Seq. Compri- mento
ARABIDOPSIS THALIANA 1 bHLH39 AT3G56980 nucleotídeo 777
AVENA SATIVA 2 bHLH39 CN817002 nucleotídeo 222
BRACHYPODIUM DISTACHYON 3 bHLH39 su- per 13.506 gen nucleotídeo 2091
BRACHYPODIUM DISTACHYON 4 bHLH39 su- per 13.506 cds nucleotídeo 729
BRASSICA NAPUS 5 bHLH39 EE515575 nucleotídeo 587
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ESPÉCIE SEQ ID NO: bHLH Referência Tipo de Seq. Compri- mento
BRASSICA NAPUS 6 bHLH39 TC84782 nucleotídeo 595
BRASSICA NAPUS 7 bHLH39 TC88840 nucleotídeo 631
BRASSICA RAPA 8 bHLH39 Contig2 nucleotídeo 693
GLYCINE MAX 9 bHLH39 TC269627 nucleotídeo 723
HORDEUM VULGARE 10 bHLH39 AK251746 nucleotídeo 738
PANICUM VIRGATUM 11 bHLH39 Contig2 nucleotídeo 723
SOLANUM LYCOPERSICUM 12 bHLH39 DV105842 nucleotídeo 351
TRITICUM AESTIVUM 13 bHLH39 TC358765 nucleotídeo 714
TRITICUM AESTIVUM 14 bHLH39 TC343683 nucleotídeo 617
TRITICUM AESTIVUM 15 bHLH39 TC300244 nucleotídeo 434
TRITICUM AESTIVUM 16 bHLH39 CA618726 nucleotídeo 261
ZEA MAYS 17 bHLH39 TC429418 nucleotídeo 228
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ESPÉCIE SEQ ID NO: bHLH Referência Tipo de Seq. Compri- mento
ARABIDOPSIS THALIANA 18 bHLH39 AT3G56980 proteína 258
AVENA SATIVA 19 bHLH39 CN817002 proteína 158
BRACHYPODIUM DISTACHYON 20 bHLH39 su- per 13.506 ORF proteína 242
GLYCINE MAX 21 bHLH39 TC269627 proteína 241
HORDEUM VULGARE 22 bHLH39 AK251746 proteína 246
PANICUM VIRGATUM 23 bHLH39 Contig2 proteína 241
SOLANUM LYCOPERSICUM 24 bHLH39 DV105842 proteína 117
TRITICUM AESTIVUM 25 bHLH39 TC358765 proteína 238
TRITICUM AESTIVUM 26 bHLH39 TC343683 proteína 206
TRITICUM AESTIVUM 27 bHLH39 TC300244 proteína 144
TRITICUM AESTIVUM 28 bHLH39 CA618726 proteína 87
ARABIDOPSIS THALIANA 29 bHLH38 AT3G56970 nucle- otídeo 762
BRASSICA NAPUS 30 bHLH38 TC95626 nucle- otídeo 753
BRASSICA 31 bHLH38 AM061155 nucle- 765
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ESPÉCIE SEQ ID NO: bHLH Referência Tipo de Seq. Compri- mento
OLERACEA otídeo
BRASSICA RAPA 32 bHLH38 EX134222 nucleotídeo 435
CICER ARIETINUM 33 bHLH38 FE670123 nucleotídeo 300
HORDEUM VULGARE 34 bHLH38 TC164142 nucleotídeo 501
HORDEUM VULGARE 35 bHLH38 BAF30424.1 nucleotídeo 759
MEDICAGO TRUNCATULA 36 bHLH38 TC127269 nucleotídeo 767
MEDICAGO TRUNCATULA 37 bHLH38 TC115041 nucleotídeo 780
MEDICAGO TRUNCATULA 38 bHLH38 AJ496888 nucleotídeo 300
PANICUM VIRGATUM 39 bHLH38 Contig1 nucleotídeo 690
POPULUS 40 bHLH38 TC89850 nucleotídeo 549
POPULUS 41 bHLH38 EEF05011.1 nucleotídeo 795
POPULUS 42 bHLH38 EEE91492.1 nucleotídeo 474
RICINUS COMMUNIS 43 bHLH38 EEF30834 nucleotídeo 774
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ESPÉCIE SEQ ID NO: bHLH Referência Tipo de Seq. Compri- mento
RICINUS COMMUNIS 44 bHLH38 EEF30835 nucleotídeo 555
SOLANUM LYCOPERSICUM 45 bHLH38 TC194645 nucleotídeo 717
SORGO BICOLOR 46 bHLH38 TC117663 nucleotídeo 642
TRITICUM AESTIVUM 47 bHLH38 TC337566 nucleotídeo 672
TRITICUM AESTIVUM 48 bHLH38 CA650144 nucleotídeo 390
TRITICUM AESTIVUM 49 bHLH38 CA502657 nucleotídeo 459
VIGNA UNGUICULATA 50 bHLH38 FF388259 nucleotídeo 732
VITIS VINIFERA 51 bHLH38 CAO17950.1 nucleotídeo 1563
VITIS VINIFERA 52 bHLH38 CAN79614 nucleotídeo 735
ARABIDOPSIS THALIANA 53 bHLH38 AT3G56970 proteína 253
BRASSICA NAPUS 54 bHLH38 TC95626 proteína 251
BRASSICA OLERACEA 55 bHLH38 AM061155 proteína 255
BRASSICA RAPA 56 bHLH38 EX134222 proteína 145
CICER 57 bHLH38 FE670123 proteína 100
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ESPÉCIE SEQ ID NO: bHLH Referência Tipo de Seq. Comprimento
ARIETINUM
HORDEUM VULGARE 58 bHLH38 TC164142 proteína 167
HORDEUM VULGARE 59 bHLH38 BAF30424.1 proteína 252
MEDICAGO TRUNCATULA 60 bHLH38 TC127269 proteína 246
MEDICAGO TRUNCATULA 61 bHLH38 TC115041 proteína 260
MEDICAGO TRUNCATULA 62 bHLH38 AJ496888 proteína 100
ORYZA SATIVA 63 bHLH38 NP 001045424.1 proteína 247
PANICUM VIRGATUM 64 bHLH38 Contig1 proteína 230
POPULUS 65 bHLH38 TC89850 proteína 183
POPULUS 66 bHLH38 EEF05011.1 proteína 264
POPULUS 67 bHLH38 EEE91492.1 proteína 158
RICINUS COMMUNIS 68 bHLH38 EEF30834.1 proteína 257
RICINUS COMMUNIS 69 bHLH38 EEF30835.1 proteína 184
SOLANUM LYCOPERSICUM 70 bHLH38 TC194645 proteína 239
SORGO BICOLOR 71 bHLH38 TC117663 proteína 214
TRITICUM 72 bHLH38 TC337566 proteína 224
Petição 870180045232, de 28/05/2018, pág. 119/168
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ESPÉCIE SEQ ID NO: bHLH Referência Tipo de Seq. Compri- mento
AESTIVUM
TRITICUM AESTIVUM 73 bHLH38 CA650144 proteína 130
TRITICUM AESTIVUM 74 bHLH38 CA502657 proteína 153
VIGNA UNGUICULATA 75 bHLH38 FF388259 proteína 244
VITIS VINIFERA 76 bHLH38 CAN64266.1 proteína 245
VITIS VINIFERA 77 bHLH38 CAO17950.1 proteína 520
VITIS VINIFERA 78 bHLH38 CAN79614.1 proteína 244
ARABIDOPSIS THALIANA 79 bHLH101 AT5G04150 nucleotídeo 723
BRASSICA OLERACEA 80 bHLH101 AM060621 nucleotídeo 546
BRASSICA RAPA 81 bHLH101 Contig1 nucleotídeo 678
ORYZA SATIVA 82 bHLH101 CI296230 nucleotídeo 261
ORYZA SATIVA 83 bHLH101 TC345105 nucleotídeo 450
ARABIDOPSIS THALIANA 84 bHLH101 AT5G04150 proteína 240
BRASSICA OLERACEA 85 bHLH101 AM060621 proteína 182
BRASSICA RAPA 86 bHLH101 Contig1 proteína 226
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ESPÉCIE SEQ ID NO: bHLH Referência Tipo de Seq. Compri- mento
ORYZA SATIVA 87 bHLH101 CI296230 proteína 87
ORYZA SATIVA 88 bHLH101 TC345105 proteína 150
ARABIDOPSIS 89 bHLH100_ AT2G41240.2 nucle- 726
THALIANA 2 otídeo
ARABIDOPSIS 90 bHLH100_ AT2G41240.1 nucle- 729
THALIANA 1 otídeo
ORYZA SATIVA 91 bHLH100_ TC340917 nucle- 621
1 otídeo
PANICUM 92 bHLH100_ FL920216 nucle- 711
VIRGATUM 1 otídeo
SORGO BICOLOR 93 bHLH100_ TC113263 nucle- 732
1 otídeo
TRITICUM 94 bHLH100_ TC317240 nucle- 417
AESTIVUM 2 otídeo
TRITICUM 95 bHLH100_ TC303529 nucle- 705
AESTIVUM 1 otídeo
TRITICUM 96 bHLH100_ CD865039 nucle- 691
AESTIVUM 1 otídeo
ZEA MAYS 97 bHLH100_ TC409749 nucle- 465
1 otídeo
ARABIDOPSIS 98 bHLH100_ AT2G41240.2 proteína 241
THALIANA 2
ARABIDOPSIS 99 bHLH100_ AT2G41240.1 proteína 242
THALIANA 1
ORYZA SATIVA 100 bHLH100 TC340917 proteína 207
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ESPÉCIE SEQ ID NO: bHLH Referência Tipo de Seq. Comprimento
1
PANICUM VIRGATUM 101 bHLH100_ 1 FL920216 proteína 237
SORGO BICOLOR 102 bHLH100_ 1 TC113263 proteína 244
TRITICUM AESTIVUM 103 bHLH100_ 2 TC317240 proteína 139
TRITICUM AESTIVUM 104 bHLH100_ 1 TC303529 proteína 235
ZEA MAYS 105 bHLH100_ 1 TC409749 proteína 155
Sequências >SEQIDNO:1
ATGTGTGCATTAGTACCTCCATTGTTTCCAAACTTTGGGTGGCCATCAACGGGA
GAGTACGACAGCTACTACCTCGCCGGAGATATCCTCAACAACGGCGGGTTTCTT GATTTTCCGGTACCGGAGGAGACTTATGGAGCTGTTACAGCGGTGACTCAACAT CAGAATAGCTTTGGTGTTTCTGTTTCGTCGGAGGGAAATGAAATAGACAACAATC
CGGTGGTCGTCAAGAAGCTTAATCACAATGCTAGTGAGCGTGACCGTCGCAGG AAAATTAACTCTTTGTTCTCATCTCTCCGTTCATGTCTTCCTGCCTCTGGCCAATC GAAGAAGCTAAGCATTCCTGCGACGGTTTCTCGAAGCTTGAAGTACATACCAGA GCTGCAAGAGCAAGTGAAGAAGCTAATAAAAAAGAAGGAAGAGCTCTTGGTGCA
AATTTCAGGTCAAAGAAACACTGAATGTTACGTTAAGCAGCCACCAAAGGCCGT
CGCGAATTATATCTCGACCGTTTCTGCGACTAGGCTTGGTGACAACGAAGTGAT GGTCCAAATCTCATCGTCCAAGATTCATAACTTTTCGATATCTAATGTTTTAAGTG
GGTTAGAAGAAGATAGGTTTGTTCTTGTGGACATGTCATCTTCAAGGTCTCAAG
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63/104
GAGAAAGGCTTTTCTACACTTTGCATTTACAAGTGGAGAAGATTGAAAATTACAA
GCTGAATTGCGAAGAGTTAAGTCAGAGGATGTTGTACTTGTATGAGGAATGTGG AAACTCATATATATGA >SEQIDNO:2
GCACGAGGCCTCCCTCCGCTCCCTCCTCCCCGACACCGATCACAGCAAGAAGC
TGAGCATCCCCATCACTGTGACGCGGGTGCTCAAGTACATCCCGGAGCTGCAG
AAGCAGGTGGACACGCTGGAGAAGAAGAAGGAAGAGCTGACCCAGGCGAACT
GCAAACCAGGAGTTGTGGCCATGAAGGAGAACACGGCTCCGATCGTGTCCGCC ACCTGCCTCGA >SEQIDNO:3
ATGGGGCACAAGCAGCTGTTCGTGGACGACCCGTTCGCGAGCAGCATCTCGTC
TCTGGAGGCGGAGGCCATCTTCTCCGGCGCCGGCGGGCAGTGGCGCGCCGG
CGGCGGCCTCGACGACCGTGACCTCTCCGCCATGCCGGCGGCGGCCAACACC TCGTCGGGCGGCTCCGGCTCTCCCGGCGGCGGCGGCAGGAAGATGAGCCACA ACGCGTACGAGCGCGACCGCCGCAAGCAGCTCAACGAGCTCTACTCCTCCCTC CGCTCCCTCCTCCCCGACGCCGACCACACCGTATGCAAATCAAATTGAAGCCAT AGATCATAATTTGATCCTGAATCCTGATGGATCTGGTGATGATTTGACTAATTGC AGAAGAAGCTGAGCATCCCGATCACAGTGTCGCGGGTGCTAAAGTACATCCCG GAGCTGCAGAAGGAAGTGGACGGGCTGGAGAGGAAGAAGGAGGAGCTGACGC GCGCCAACTGCAAGCCCGGGGTGATCGCCATGAAGGACCAGAACGTTGCTCCC GTCGTCTCCGCGACCTGCCTCGACGACAAGGACATCATGGTTCAGGTCAGCTT GCTCAGCGGCATGGCGGCGGCGGCTCTGCCGATGTCCACGTGCATAAAGATTC TGGAGAACGAAGGTCTTCGCCTCGTCAGCTCGTCCACTTCTGCCTTTGGGAACA GGACGTTCTATAACCTCCATCTTCAGGTAATTGGTACATCTGTCTGCATGAAGCC TTAATTTCCTATTGGTAATTATCAATGTCATCGATCCATGCTTGCTCGATTCATTT
Petição 870180045232, de 28/05/2018, pág. 123/168
64/104
TGGCAAATTTGCCTCATACTTACTCGACATCGTAGTAGAAGAGAAGGAAAAAAAA AAGCCCAGCATTTTTCTTTGAGAAACAAAGCACAACATTTTCTGCTCCCAAGATC CATTCCGAAAGCCGGGTGCACAACACTACGAGTAAAAATCGTTTCCTCTTAGTTA TATAACGTGTGGTACCTTCAACTTAAATGAGCATCAGTTGATGCAGAGTGGTACC CCTGTTCGGAAAAGACTTCAACATGGCACCATCTTCACTAGAGGTCCCCCAGCC CCTAATTCAGACGAAGGCATCATTTTAGTCCATTAACCCCGGTAGGTTGAGATTA CAAAGGCTAGATTTATATAACGGTTTTGCTATTTCTAAGGCGACTGAGAAATAAG TATTTCTAACAACCATTTGATCCAATCACTGAGATTCGTGCAAGATCCATACATAT ACAAAGTATTAGAAAACCTTAATCGGATGGATATGATCGTTGACTGAGAAATAGA CACTTCTTTTATGTAAAGGGTGTTTACTATATATATGTGGGTTTTGATATACTCAT ATTGAATAGATTTGAAGATCATGTCAGGCCCTACTTAGGGTAATCTGTTGTGAAA TTAAACTGTGTTCATAGGGCAAAAACATTGTCTTATAAATCAGCACAAAATCAAC GAATTGGGAGTTTTTACGTAACAAATATAAATTGTAGCAACACAAATTAATTGGCT ACAATACAATCCAAGAACAACAAGACGAGTATACACGGCAAACGATCATGCATA TGGTGAGTTGGTGACCAGATCACCCGCTCTACTAGATGCTCCTAGATGCATATG GTGCCATAATTTTAGGAAAACCGAACTGGAAGAAGCACCTAAAAAACGAGTATG AAATCATCAATCGACCAAGATTAGAGGTCGGTCTCATCATCGACAACATGAACAA TTAAGATGCATGCTGGAGAACAGATAATCTAACACAGCCACAGGTTTATTACAAA AAGCTTAACAGAAACTTCGCTAAAGCAACCAAAGAATGAGAACAAAAAAATATAT CTTCTAATAACATGTGTGTGCTGTTGTATAGCATCTGAAGGCGTAATGCGAAACT CTAATTTATCTGAAGTATGTAGTGCTTATATGCTTATATAACATGTAAATAAGCAA TATATATTCATTAATTTCATTTAATTTGTATACTGAAACAGAGAAACCAGCGAACG ATGAGCAAGGAGTGCCCAGCGTTCTGTGACGAGCTGGAGAAAGCCATCAAGAA AAAGGCAGGACTGCATATGCATCAGTGA >SEQIDNO:4 ATGGGGCACAAGCAGCTGTTCGTGGACGACCCGTTCGCGAGCAGCATCTCGTC
Petição 870180045232, de 28/05/2018, pág. 124/168
65/104
TCTGGAGGCGGAGGCCATCTTCTCCGGCGCCGGCGGGCAGTGGCGCGCCGG CGGCGGCCTCGACGACCGTGACCTCTCCGCCATGCCGGCGGCGGCCAACACC TCGTCGGGCGGCTCCGGCTCTCCCGGCGGCGGCGGCAGGAAGATGAGCCACA ACGCGTACGAGCGCGACCGCCGCAAGCAGCTCAACGAGCTCTACTCCTCCCTC CGCTCCCTCCTCCCCGACGCCGACCACACCAAGAAGCTGAGCATCCCGATCAC AGTGTCGCGGGTGCTAAAGTACATCCCGGAGCTGCAGAAGGAAGTGGACGGG CTGGAGAGGAAGAAGGAGGAGCTGACGCGCGCCAACTGCAAGCCCGGGGTGA TCGCCATGAAGGACCAGAACGTTGCTCCCGTCGTCTCCGCGACCTGCCTCGAC GACAAGGACATCATGGTTCAGGTCAGCTTGCTCAGCGGCATGGCGGCGGCGG CTCTGCCGATGTCCACGTGCATAAAGATTCTGGAGAACGAAGGTCTTCGCCTCG TCAGCTCGTCCACTTCTGCCTTTGGGAACAGGACGTTCTATAACCTCCATCTTCA GAGAAACCAGCGAACGATGAGCAAGGAGTGCCCAGCGTTCTGTGACGAGCTGG AGAAAGCCATCAAGAAAAAGGCAGGACTGCATATGCATCAGTGA >SEQIDNO:5
AAAAAAAAATTAGAAAAGAAGAAAAGAGTTTATCGGGTCTCTCTCACGAGTCACG GCGTCGACGAAACTGGAGGTGAAGCCATCTCCGATCGAGAGTCGCCGTCATCC CTATCCCACTCCTGCAATATCTACTCCGACGCTGTCGTCGTTAATTTCGGCACCT CCTCGCCAAGTCGCCATCGTCCCTGTCGTGTGCGAGCTGTCACTGTCCATGCA ACGAATAAATACTCTGTGTCTGCATCGCTTTGACAGTGCTTGGTGCTTCTATGAT ATGTCCTCCGGTTTATGCTTTGCCCAGATTCGGAAGAAGATGGGTTTGTTCTTGT TGATGTTTCATCTTCTAGGTCTCATGGAGAAAGGCTCGTCTACAGTTTGCATCTT CAAATGGGAAACATAAATAATCACGAGCTGACGTGCGAAGAGCTAAGCCAGAGA ATGTATACTTGTATGAGGAATGCGGAAACTCGTTTAGATGATAATCTGTTCTTGT TTCTTTTAGTTATGTCATCTGTTTCTCAACATGTAACATTCATGTAGCCGAGTTGT TTCGTTTATTTTTCTTGTCGAAATCAATGATCGATTATCGC
Petição 870180045232, de 28/05/2018, pág. 125/168
66/104 >SEQIDNO:6
GACGGCGTCGACGAAACTGGAGGTGAAGCCATCTCCGATCGAGAGTCGCCGTC ATCCCTATCCCACTCCTGCAATATCTACTCCGACGCTGTCGTCGTTAATTTCGGC ACCTCCTCGCCAAGTCGCCATCGTCCCTGTCGTGTAAGCCCTAGGTCTGATTTG TCTTTCCTTTTAAATCGACGAAATTGAAATTGTGCGAGCTGTCACTGTCCATGCA ACGAATAAATACTCTGTGTCTGCATCGCTTTGACAGTGCTTGGTGCTTCTATGAT
ATGTCCTCCGGTTTATGCTTTGCCCAGATTCGGAAGAAGATGGGTTTGTTCTTGT TGATGTTTCATCTTCTAGGTCTCATGGAGAAAGGCTCGTCTACAGTTTGCATCTT CAAATGGGAAACATAAATAATCACGAGCTGACGTGCGAAGAGCTAAGCCAGAGA ATGTATACTTGTATGAGGAATGCGGAAACTCGTTTAGATGATAATCTGTTCTTGT TTCTTTTAGGTTATGTCATCTGTTTCTCAACATGTAACATTCATGTAGCCGAGTTG TTTCGTTTATTTTCTTGTCGAAATTCAATGATCGATTATCACATTTAC >SEQIDNO:7
GACGACAAAAAAAAAAATTAGAAAAGAAGAAAAGAGTTTATCGGGTCTCTCTCAC GAGTCACGGCGTCGACGAAACTGGAGGTGAAGCCATCTCCGATCGAGAGTCGC CGTCATCCCTATCCCACTCCTGCAATATCTACTCCGACGCTGTCGTCGTTAATTT CGGCACCTCCTCGCCAAGTCGCCATCGTCCCTGTCGTGTAAGCCCTAGGTGCG AGCTGTCACTGTCCATGCAACGAATAAATACTCTGTGTCTGCATCGCTTTGACAG
TGCTTGGTGCTTCTATGATATGTCCTCCGGTTTATGCTTTGCCCAGATTCGGAAG AAGATGGGTTTGTTCTTGTTGATGTTTCATCTTCTAGGTCTCATGGAGAAAGGCT CGTCTACAGTTTGCATCTTCAAATGGGAAACATAAATAATCACGAGCTGACGTGC GAAGAGCTAAGCCAGAGAATGTATACTTGTATGAGGAATGCGGAAACTCGTTTA GATGATAATCTGTTCTTGTTTCTTTTAGTTATGTCATCTGTTTCTCAACATGTAAC
ATTCATGTAGCCGAGTTGTTTCGTTTATTTTCTTGTCGAAATCAATGATCGATTAT CACATTTACATGCTACTGAATATTGACTG
Petição 870180045232, de 28/05/2018, pág. 126/168
67/104 >SEQIDNO:8
ACGACAAAAAAAAATTAGAAAAGAAGAAAAGAGTTTATCGGGTCTCTCTCACGAG TCACGGCGTCGACGAAACTGGAGGTGAAGCCATCTCCGATCGAGAGTCGCCGT CATCCCTATCCCACTCCTGCAATATCTACTCTGACGCTGTCGTCGTTAATTTCGG CACCTCCTCGCCAAGTCGCCATCGTCCCTGTCGTGTAAGCCCTAGGTCTGATTT GTCTTTCCTTTTAAATCGACGAAATTGAAATTGTGCGAGCTGTCACTGTCCATGC AACGAATAAATACTCTGTGTCTGCATCGCTTTGACAGTGCGTGGTGCTTCTATGA TATGTCCTCTGGTTTATGCTTTGCCCAGATTCGGAAGAAGATGGGTTTGTTCTTT GTTGATGTTTCATCTTCTAGGTCTCATGGAGAAAGGCTCGTCTACAGTTTGCATC TTCAAATGGGAAACATAAATAATCACGAGCTGACGTGCGAAGAGCTAAGCCAGA GAATGTATACCTGTATGAGGAATGCGGAAACTCGTTTAGATGATAATCTGTTCTT GTTTCTTTTTGTTATGTCGTCTGTTTCTCAACATGTAACATTCATGTAGCCGAGTT GTTTCGTTTATTTTCTTGTCGAAATCAATGATCGATTATCACATTTACATGCTACT GAATATTGACTGATTACTATGAAATTCACTAATAT >SEQIDNO:9
ATGGTTGCTTTGTTTTCCCCTCCGGTGTTCTCAACCAAGGGATGGTTCTTAGAAG AAGAGCCATTAAGCTATGATGTGTCTTCAGATTACTCATTTCCCTATCAATTTTTT GCACCACAGACACAGATTGAACTTGAAATAGAAAGGTCCTCTGCACCATCCCCT GAAGACCCTGCCATGGTCAAAAAGCTTAGCCACAACGCTAGTGAACGTGATCGC CGCAAGAAGGTTAATGACTTGGTTTCTTCACTTCGTTCACTTCTTCCTGGGCCAG ATCAAACGAAAAAAATGAGCATTCCAGCTACAGTTTCGCGAGTTTTAAAATACAT ACCTGAGTTACAACATCAAGTGCAAGCACTAACTAAGAAAAAAGAGGAGCTTCT GTGCAGAATTTCAAAAAATCTCAAAGGAGATTCGGTGAACAAAGAATCTCAAAG GAGAATTTCCCATCACAATTCTGATTTTGCTGTTTCAACTAGTAGGCTCAACGAT TGTGAAGCTGTTGTTCACATTTCCTCTTATGAGGCTCACAAGGCTCCACTATCCG ACATCTTGCAATGTTTAGAAAATAATGGCCTTTATTTGCTAAATGCTTCTTCCTCT
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GAAACTTTTGGAGGAAGGGTCTTCTACAACTTGCATTTCCAGGTGGAAAAAACT
CATAGATTAGAGTCCGAAATTCTAACTGAGAAGCTTTTGTCAATATATGAGAAGC AAAGGATTTTC >SEQIDNO:10
ATGGGGCACCAGACCCAGATGTTCGACGACCCGTTCGCGAGCAGTATGTCGTC CCTGGACGCAGACATCTTCTCCGTCGCCGGCGGCCTCCACCCATCGCAGTGGC CGGGACTCGACCACGACGTCTCGCTGGCGCCGGCTGCCAACAACGGCACCTC CTCCGGCGGCTACGGCTCCCCCGGGGGCGGCGATGGCTCGGGCTCCCACCG CAAGATCAGCCACAACGCGTACGAGCGCGACCGCCGCAAGCAGCTCAACGAG CTCTACTCCGACCTCCGCTCCCTCCTCCCCGACTCCGATCACACCAAGAAGCTG
AGCATTCCGATCACGGTGTCGCGGGTGCTCAAGTACATCCCGGAGCTGCAGAA
GCAGGTGGACGGACTGGAGAAGAAGAAGGAGGAGCTTACGAGGGCCAGCTGC
AAGCCAGGCGTATTGACCATGAAGGAGAACACGGTCCCGATCGTGTCCGCCAC
CTGCCTCGACGAAAGGGAGATCATGGTCCAGGTTAGCTTGGTGAGCACCATGG
CCGGAGCTCTGCCCATGTCCAAGTGCATCAAAGTGCTGGAGAACGAAGGCCTC CGCCTCATCAGCTCGTCCACTTCTGCTTTCCAGAACAGGACGTTCTATAGCCTC CATCTTCAGAGAACCCAACGGACGATGAGCAAAGAGTGTCCGGCATTTTGTGAA GAACTGGAGAATGCCCTGACGCAGAAGGCGGGACTACGTCTACATCACCAG >SEQIDNO:11
ATGACCCCTTCTCGAGCAGCATCTCGTCGCTGGAGGCGGACATCTTCTCCGCC GGCGGCCAGCGGCGCGTCGCCGCCGTGGCCGGACCTCGAACTCGACCTCGAC CTCGACGACGACGACATCCACGACCTCTCCGCGCCGGCGGCCAACGCCACCT CCTCAGGAGGCTATGGCTCGGGCGGAGGCTCCGGCGGCTCCCACAGGAAGCT CAGCCACAACGCGTACGAGCGCGACCGCCGGAAGCAGCTCAACGAGCTCTACT CCTCGCTCCGCTCCCTCCTCCCCGACGCTGACCACACTAAGAAGCTGAGCATC
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CCCACCACGGTCTCCCGAGTTCTCAAGTACATCCCCGAGCTGCAGAAGCAGGT GGACAACCTGGAGAGGAGGAAGAAGGAGCTGACGAACGCCAACTGCAAACCA GGAGTTCTGAAGACGAGCCAGATTGTAACTCCCATTGTTTCTGCTACCTGCCTC AACGATACGGAGATCATGGTTCAGGTCAGCCTGCAGAGCAATGTGGCTGCCAC AAGTCTTCCTCTGTCCAAGTGCATAAAAGTGCTGGAGAACGAAGGCCTTCACCT GATTAGTTCATCAACTTACTCCACCTTCGACAACAGGACATTCTATAGCCTCCAT CTTCAGAGAAGTCAAAGAACGATGAAGGAGGAGTGCCCAGCATTCTGCGATGA ACTGGAGAGGATTATCAAGAAGAAAGCAGGGGCG >SEQIDNO:12
ATGTTAGCCATTTCTTCTTCTTCTCCTCCTTTATTTTCTACTACTACTAATAATTTT GGTTGGCTTTTGGAAGATCTTATAAGCCATGAATTAACAAATAGTGGAGAAACTT CAAATTCATCTCAAAAAAGCCTTCAACATTGTGATTCAAATAAATTTGATCAAATT ATTATCAACAGTGGTGATCAGTATCAACCTGATCAGACGGTTAAGAAGCTTAATC ATAACGCAAGTGAACGTGACCGTAGAAAGAAAATCAACAGCTTATATTCTTCTCT TCGTTCTTTACTACCTCCTTCTGATCATACGAAAAAGCTAAGCATTCCATCAACA GTATCAAGAATTCTAAAG >SEQIDNO:13
ATGGGGCACCAGCACCAGATGTTCAACGACCCCTTCGCGAGCAGCATGTCGTC ACTGGAGGAAGACATGTTCTCCGGTGCCGGAGGCTACCACCACCTCACGCCGT CCATGCAGTGGCCGGGCTTGGATAACGACATACCGTCGGCGCCGGCTGCCAAC AACGCCACCTCCTCCGGTGGCTCTGGATCACACCGCAAGATGAGTCACAACGC GTACGAACGTGACCGCCGCAAGCAGCTCAACGAGCAATATTCCTCCCTCCGCT CCCTCCTCCCCGACGATGATCACACCAAGAAGATGAGCATTCCGACCACGGTG TCGCGGGTGATCAACTACATCCCGGAGCTGCAGAAGGAGGTAGACCGCCTGGA GAAGAAGAAGGAGGAGCTGAGGCGGGGCAGCTGCGAGCAAGGCGCCATGAGG
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CAGAACACGGCCCCGATCGTGTCCGCCACCTGCCTCGACGACAGGGAGATCAT GGTCCAGGTCAGCCTGGTGAGCACCATGGCGGGAGCTCTGCCCATGTCCAAGT GCATCAAGGTGCTGGAGAACCAAGGCCTTCGCCTCATAAATTCCTCGACTTCCG CGTTTCAGAACAGGACGTTCTACAGCCTCCATCTTCAGAGAACCCAACGGACAA TGAGCAAGGAGGGCCAAACATTTTGTAACGAATTGGAGAACGCTGTGAAGCAAA AGGCGGGACTACATCTACATCAT >SEQIDNO:14
ATGGGGCACCAGCACCAGATGTTCGAAGACCCGTTCGCGAGCAGCATATCGTC GCTGGAGGCCGAGATATTCTCCGTCGCCGGCGGCCACCACCATACGCAGTGG CCGGGCCTCGACCACGACATCCCGCTGGCCCCGGCTGCCAATAACGGCACCT CCTCCGGCGGCTACGGCTCCCCCGGGGGCGGCGATGGCTCGGGCTCCCATCG CAAGATCAGCCACAACGCCTACGAGCGCGACCGCCGCAAGCAGCTCAACGAGC TCTACTCCGACCTCCGCTCCCTCCTCCCCGACACCGATCACACGAAGAAGCTTA GCATTCCGATCACGGTGTCGCGGGTGCTCAAGTACATCCCGGAGCTGCAGAAG CAGGTGGACGGCCTGGAGAAGAAGAAGGAGGAGCTGACGCGCGCCAGCTGCA AGCCCGGCGTGCTGACCATGAAGGGGGACACGGCTCCGATCGTGTCCNGCCA CTGCCTCGACGACAGGGAGATCATGGTCCANNGTCAGCTGGTGAGCACCATGG GCGGAGTCTGCCATGTCAAGTGCTCAGGTGCTGAGACGAAGGCTCGGCTCATA GTCGTCACTCCGGTTCAGACAGACTCTATATTCATCTC >SEQIDNO:15
ATGGGGCACCAGCACCAGATGTTCGAAGACCCGTTCGCGAGCAGCATATCGTC GCTGGAGGCGGACATCTTCTCCGTCGCCGCCGGCCACCACCATCCGCAGTGG CCGGGCCTCGACCACGACGTCCCGTTGGCGCCGGCTGCCAACAACGGCACAT CCTCCGGCGGCTACGGCTCCCCCGGTGGCGGCGACGGCTCGGGCTCCCACCG CAAGATCAGCCACAACGCGTACGAGCGCGACCGCCGCAAGCAGCTCAACGAG
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CTCTACTCCGACCTCCGCTCCCTCCTCCCCGACACCGATCACACGAAGAAACTG
AGCATTCCGATCACGGTGTCGCGGGTGCTCAAGTACATCCCGGAGCTGCAGAA GCAGGTGGACGGACTGGAGAAGAAGAAGGAGGAGCTGACGCGCGCCAACTGC AGCCCGGCGTGCTG >SEQIDNO:16
AACAACGCCACCTCCTCCGGCGGCTCTGGATCACACCGAAAGATGAGTCACAA CGCGTACGAGCGTGACCGCCGCAAGCAGCTCAACGAGCAATATTCCTCCCTCC GCTCCCTCCTCCCCGATGACGACCACAATAAGAAGATGAGCATTCCGACCACG GTGTCGCGGGTGATCAAGTACATCCCGGAGCTGCAGAAGGAGGTAGACGGCCT GGAGAAGAAGAAGGAGGAGCTGAGGCGGGCCAGCTACGAGCAAGCGCCA >SEQIDNO:17
CGTGTCCCGAGTTCTCAAGTACATCCCGGAGCTGCAGAAGCAGGTGGACAACC TGGAGAGGAGGAAGAAGGAGCTGACCAACGCCAACTGCAAGCCGGGAGTTCT GAAAACCACCAAGGCCGTAACTCCCATTGTTTCTGCTACCTGCCTCAACGACAC GGAGATCATGGTTCAGGTCAGCCTGCACAGCGATGTGGCCGCCACAGCTCTCC CTCTCTCCAAGTGCAT >SEQIDNO:18
MCALVPPLFPNFGWPSTGEYDSYYLAGDILNNGGFLDFPVPEETYGAVTAVTQHQN SFGVSVSSEGNEIDNNPVVVKKLNHNASERDRRRKINSLFSSLRSCLPASGQSKKL SIPATVSRSLKYIPELQEQVKKLIKKKEELLVQISGQRNTECYVKQPPKAVANYISTVS ATRLGDNEVMVQISSSKIHNFSISNVLSGLEEDRFVLVDMSSSRSQGERLFYTLHLQ VEKIENYKLNCEELSQRMLYLYEECGNSYI >SEQIDNO:19
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RHEASLRSLLPDTDHSKKLSIPITVTRVLKYIPELQKQVDTLEKKKEELTQANCKPGV
VAMKENTAPIVSATCLDDRDIMVQVSLLSNMAGALPVSKCIKVLENEGLRLVSSSTS AFQNKTFYSLHVQRTQRTISKVCPAFCDELENAIKRAGMRLQQ >SEQIDNO:20
MGHKQLFVDDPFASSISSLEAEAIFSGAGGQWRAGGGLDDRDLSAMPAAANTSSG GSGSPGGGGRKMSHNAYERDRRKQLNELYSSLRSLLPDADHTKKLSIPITVSRVLK YIPELQKEVDGLERKKEELTRANCKPGVIAMKDQNVAPVVSATCLDDKDIMVQVSLL SGMAAAALPMSTCIKILENEGLRLVSSSTSAFGNRTFYNLHLQRNQRTMSKECPAF CDELEKAIKKKAGLHMHQ >SEQIDNO:21
MVALFSPPVFSTKGWFLEEEPLSYDVSSDYSFPYQFFAPQTQIELEIERSSAPSPED PAMVKKLSHNASERDRRKKVNDLVSSLRSLLPGPDQTKKMSIPATVSRVLKYIPELQ HQVQALTKKKEELLCRISKNLKGDSVNKESQRRISHHNSDFAVSTSRLNDCEAVVHI SSYEAHKAPLSDILQCLENNGLYLLNASSSETFGGRVFYNLHFQVEKTHRLESEILTE KLLSIYEKQRIF >SEQIDNO:22
MGHQTQMFDDPFASSMSSLDADIFSVAGGLHPSQWPGLDHDVSLAPAANNGTSS GGYGSPGGGDGSGSHRKISHNAYERDRRKQLNELYSDLRSLLPDSDHTKKLSIPIT VSRVLKYIPELQKQVDGLEKKKEELTRASCKPGVLTMKENTVPIVSATCLDEREIMV QVSLVSTMAGALPMSKCIKVLENEGLRLISSSTSAFQNRTFYSLHLQRTQRTMSKEC PAFCEELENALTQKAGLRLHHQ >SEQIDNO:23
MTPSRAASRRWRRTSSPPAASGASPPWPDLELDLDLDDDDIHDLSAPAANATSSG
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GYGSGGGSGGSHRKLSHNAYERDRRKQLNELYSSLRSLLPDADHTKKLSIPTTVSR
VLKYIPELQKQVDNLERRKKELTNANCKPGVLKTSQIVTPIVSATCLNDTEIMVQVSL QSNVAATSLPLSKCIKVLENEGLHLISSSTYSTFDNRTFYSLHLQRSQRTMKEECPA FCDELERIIKKKAGA >SEQIDNO:24
MLAISSSSPPLFSTTTNNFGWLLEDLISHELTNSGETSNSSQKSLQHCDSNKFDQIII NSGDQYQPDQTVKKLNHNASERDRRKKINSLYSSLRSLLPPSDHTKKLSIPSTVSRI LK >SEQIDNO:25
MGHQHQMFNDPFASSMSSLEEDMFSGAGGYHHLTPSMQWPGLDNDIPSAPAANN ATSSGGSGSHRKMSHNAYERDRRKQLNEQYSSLRSLLPDDDHTKKMSIPTTVSRVI NYIPELQKEVDRLEKKKEELRRGSCEQGAMRQNTAPIVSATCLDDREIMVQVSLVST MAGALPMSKCIKVLENQGLRLINSSTSAFQNRTFYSLHLQRTQRTMSKEGQTFCNE LENAVKQKAGLHLHH >SEQIDNO:26
MGHQHQMFEDPFASSISSLEAEIFSVAGGHHHTQWPGLDHDIPLAPAANNGTSSG GYGSPGGGDGSGSHRKISHNAYERDRRKQLNELYSDLRSLLPDTDHTKKLSIPITVS RVLKYIPELQKQVDGLEKKKEELTRASCKPGVLTMKGDTAPIVSXHCLDDREIMVXX QLVSTMGGVCHVKCSGAETKARLIVVTPVQTDSIFIS >SEQIDNO:27
MGHQHQMFEDPFASSISSLEADIFSVAAGHHHPQWPGLDHDVPLAPAANNGTSSG GYGSPGGGDGSGSHRKISHNAYERDRRKQLNELYSDLRSLLPDTDHTKKLSIPITVS RVLKYIPELQKQVDGLEKKKEELTRANCSPAC
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74/104 >SEQIDNO:28
NNATSSGGSGSHRKMSHNAYERDRRKQLNEQYSSLRSLLPDDDHNKKMSIPTTVS
RVIKYIPELQKEVDGLEKKKEELRRASYEQAP >SEQIDNO:29
ATGTGTGCATTAGTCCCTTCATTTTTCACAAACTTCGGTTGGCCGTCAACGAATC AATACGAAAGCTATTACGGTGCCGGAGATAACCTAAATAACGGCACATTTCTTGA ATTGACGGTACCACAGACTTATGAAGTGACTCATCATCAGAATAGCTTGGGAGT ATCTGTTTCGTCAGAAGGAAATGAGATAGACAACAATCCGGTTGTGGTCAAGAA GCTTAATCACAATGCTAGTGAACGTGACCGACGCAAGAAGATCAACACTTTGTT CTCATCTCTCCGTTCATGTCTTCCAGCTTCTGATCAATCGAAGAAGCTAAGTATT CCTGAAACGGTTTCAAAGAGCTTAAAGTACATACCAGAGCTGCAACAGCAAGTG AAGAGGCTAATACAAAAGAAGGAAGAAATTTTGGTACGAGTATCGGGTCAAAGA GACTTTGAGCTTTACGATAAGCAGCAACCAAAGGCGGTCGCGAGTTATCTCTCA ACGGTTTCTGCCACTAGGCTTGGTGACAACGAAGTGATGGTCCAAGTCTCATCG TCCAAGATTCATAACTTTTCGATATCAAATGTGTTGGGTGGGATAGAAGAAGATG GGTTTGTTCTTGTGGATGTTTCATCATCAAGATCTCAAGGAGAGAGGCTCTTCTA CACTTTGCATCTTCAAGTGGAGAATATGGATGATTACAAGATTAATTGCGAAGAA TTAAGTGAAAGGATGTTGTACTTGTACGAGAAATGTGAAAACTCGTTTAACTAG >SEQIDNO:30
ATGTGTGCATTAGTCCCTCCATTGTTCCCAAACTTTGGGTGGCCGTCGACAGGA GAGTACGAGAGTAACTACCTGGCCGGAGTGAACCTCGAGGACTTTACGTTTCTT GATTTTCCGGCACCAGAGACATATGGAGTGGAACATCATCAGGAGATTCAGGAA ATGTTGGGGGTCTCTGTTCCGTCCGAGGGGAATGGAGTTGTAACCAAGAAGCTT AATCACAATGCTAGTGAGCGTGACCGTCGCAAGAAGATCAACTCTTTGTTCTCG
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TCTCTCCGTTCATGTCTCCCAGCTTCTGATCAAACGAAGAAGCTAAGTATTCCTC AGACGGTTTCTCGGAGCTTGAAGTACATTCCAGAGCTGCAAGAGCAAGTGAAGA AGCTAATACAAAAGAAGGAAGAACTCTTGGTGCGAGTATCAGGTCAAAGAGCCA TTGAACATTATGTTGAGCCGCAGCCAAAGGCCGTTGCACGTTACGTCTCGACCA TTTCTGCGACTAAGCTTGGAGACAACGAAGTGCTGGTCCAAATCTCATCGTCCA AGAATCATAACTTTTCGATATCTAATGTGTTGAGTGGGTTAGAAGAAGATGGGTT TGTTCTTGTTGATGTTTCATCTTCCAGGTATCATGGAAAATGGCTCTTCTACTCTT TGCATCTTCAAATGGGAAATAAAGATAATCACAAACTGAAGTGCGAAGAGCTAA GCCAGAGAATTTTGTACTTGTATGAGGAATGTGAAAACTCATTTAGA >SEQIDNO:31
ATGTGTGCATTAGTCCCTCCACTGTTCCCCGACTTTGGGTGGCCGTCGACGGCA GGTTACGAGAGCTACTACCTCGGCGGAGAAAACCTCAACAACGACATGTTTCTT GATTTTCCGGTTGTGGAAACTTATGGAGTATTGGCTCATCATCAGAACAGCTTAG GAGTTTCTGTTTCGTCGGAGGGAAATGGAATAGACAACAACCCGGTTGTTAAAA AGAAGCTTAATCACAATGCTAGTGAGCGTGACCGTCGCAAGAAGATCAACTCTT TGTTTGCATCTCTCCGCTCATGTCTTCCAACCTCAGATCAATCGAAAAAGCTAAG CATTTCAGCCACCGTTTCACGAAGCTTGAAGTACATACCAGAGTTGCAAGAGCA AGTGAAGAAGTTATTACAAAAGAAGGAAGAACTCTTGGTTCGAGTATCAGGTCA ACGAGACATTGAACTTTACGTTAAGCCACAACCAAAGGCAATTGCAAGTTATGTC TCCACTGTTTCCGCGACTAGGCTTGGAGACAACGAAGTGATGGTCCAAATCTCA TCATCCAAGATTCATAACTTCTCGATATCTAAAGTGTTAACTGGGTTAGAAGAAG ATGGTTTTGTTCTTGTGGATGTTTCATCTTCAAGGTTTCAAGGGGAAAGGCTTTT CTACACTTTGCATCTTCAAGTAGAAAATATGGATGATCATTACAAAATGAATTGC
GAAGAGTTAAGTGAAAGGATGTTGTACTTGTACGAGGAATGTGAAAATTNNNTTA GG
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ATTCCTCAGACGGTTTCTCGGAGCTTGAAGTACATACCAGAGCTACAAGAGCAA GTGAAGAAGCTAATACAAAAGAAGGAAGAACTCTTGGTGCGAGTATCAGGTCAA AGAGACATTGAACATTACGTTGAGCCGCACCCAAAGGCCGTTGCACGTTACGTC TCGACCATTTCTGCGACTAAGCTTGGAGACAACGAAGTGATGGTCCAAATCTCA TCGTCCAAGAATCATAACTTTTCGATATCTAATGTGTTGAGTGGGTTAGAAGAAG ATGGGTTTGTTCTTGTTGATGTTTCATCTTCAAGGTCTCATGGAGAAAGGCTCTT CTACACTTTGCATCTTCAAATGGGAAATAAAGATGATTACAAACTGACATGCGAA GAGCTACGCCAGAGAATGTTATACTTGTATGAGGAATGTGGAAACTCGTTTAGA >SEQIDNO:33
ATTCCAACTCCCTCACAAGCCACAAGCAGCGACCTTAGCATGGTCAAGAAACTT ATCCGCAATGCTAGTGAACGAGATCGCCGCAAGAAAATCAATACTTTGTATTCTT CACTTCGTTCACTTCTTCCTGTGGCAGAACAGATGAAGAAGTTGAGCAATCCGG CAACAATTTCACGAGTCCTAAAGTACATACGTGAGTTACAGAAGCAGGTAGAAG GACTACTTACGAGAAAGGAGGCGATTTTATTGAAACTATCTCCAGAAGTAGATGA GGTGAAGAGTAAAGAATCTGAGAGGAAG >SEQIDNO:34 AGCGACCGCCGCAAGCAGCTCAACGAGCAATATTCCTCCCTCCGCTCCCTCCT CCCCGATGACGATCACAATAAGAAGATGAGCATTCCGACCACGGTGTCGCGGG TGATCAAGTACATCCCGGAGCTACAGAAGGAGGTCGACGGTCTGGAGAAGAAG AAGGAGGAGCTCAGGCGAGCTAGCAGCGAGCAAGGCGTGCTGACTATGAGGC AGAACACGGCTCCTGTCGTCTCCGCCACCTGCCTCGACGACAGGGAAATCATG GTCCAGGTCAGTCTGGTGAGCACCATGGCCGCAGCTCTGCCCATGTCCAAGTG CATCAAGGTGCTGGAGAACGAAGGCCTTCGCCTCATAAATTCCTCGACTTCCGC GTTCCAGAACAGGACCTTCTATAGCCTCCATCTTCAGAGAACCCAACGAACAAT
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GAGCAAGGAGGGCCAAACATTTTGTAACGAACTGGAGAACGCCGTGAAGCAAA AGGCAGGACTGCATCTGCATCAT >SEQIDNO:35
ATGGGGCACCAGACCCAGATGTTCGACGACCCGTTCGCGAGCAGTATGTCGTC CCTGGACGCAGACATCTTCTCCGTCGCCGGCGGCCTCCACCCATCGCAGTGGC CGGGACTCGACCACGACGTCTCGCTGGCGCCGGCTGCCAACAACGGCACCTC CTCCGGCGGCTACGGCTCCCCCGGGGGCGGCGATGGCTCGGGCTCCCACCG CAAGATCAGCCACAACGCGTACGAGCGCGACCGCCGCAAGCAGCTCAACGAG CTCTACTCCGACCTCCGCTCCCTCCTCCCCGACTCCGATCACACCAAGAAGCTG AGCATTCCGATCACGGTGTCGCGCGTGCTCAAGTACATCCCGGAGCTGCAGAA GCAGGTGGACGGACTGGAGAAGAAGAAGGAGGAGCTTACGCGGGCCAGCTGC AAGCCAGGCGTATTGACCATGAAGGAGAACACGGTCCCGATCGTGTCCGCCAC CTGCCTCGACGAAAGGGAGATCATGGTCCAGGTTAGCTTGGTGAGCACCATGG CCGGAGCTCTGCCCATGTCCAAGCGCATCAAAGTGCTGGAGAACGAAGGCCTC CGCCTCATCAGCTCGTCCACTTCTGCTTTCCAGAACAGGACGTTCTATAGCCTC CATCTTCAGAGAACCCAACGGACGATGAGCAAAGAGTGTCCGGCATTTTGTGAA GAACTGGAGAATGCCCTGACGCAGAAGGCGGGGTACGTCTACATCACCAGTAG ATTATATGTAGCAGAATAA >SEQIDNO:36
ATGTTAGCGATATCTCCTCCTATGTTTTCAACAATTGGATGGCCCTTTGAGGAGC CTTTAAGCCATAACCAGCATCAGAATTCATTCTACAAAGACACTGTTGATCAATT ATTTAATTTTCATGATCAAGTTGAGGCAGAAATTAATTCAACAGATCCCTCACAAT CCACAAGCAGTGACCTTAGCATGGTCAAGAAGCTTGTTCATAATGCCAGTGAAC GCGATCGCCGCAAGAAGATCAATAATTTGTATTCATCACTTCGATCACTCCTTCC TGTTTCTGATCAAATGAAATTAAGCATTCCGGGAACAATTTCTAGAGTCCTGAAA
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TACATACCTGAATTACAGAATCAAGTAGAGGGACTAATTAAGAGAAAGGATGAG
ATCTTATTGGGACTTTCTCCACAAGTAGAAGAGTTTATTCTAAGCAAAGAATCTC AAAGGAAGAAGCATAGTTACAACTCTGGTTTTGTAGTTTCAAGTAGTAGGCTCAA TGATAGTGAAATTACCATTCAGATTTCATGTTACACTGTCCAAAAGATTCCACTTT CTGAGATCTTGATTTGTTTGGAAAATGATGGCCTTTTGCTGCTTAATGTTTCTTCA TCAAAGACCTTTGGAGGGAGGGTCTTCTATAATTTGCATTTCCAGGTGGATAAAA CACAGATATTAGAATCTCATATTCTAAATGAGAAGCTCTTATCAATAATGGAGAA GGAAGGAGAGTTTTTAAAACAATAATTAAAGTTTAGGATTTGGCTCTTTAA >SEQIDNO:37
ATGGTTGCATTCTGCCCACCTCAGTTCTCATACTCAAACATGGGATGGCTCTTAG AGGAGTTAGAGCCAGAGTCCTTAATTAGTCATAAAGAGAAGAACTATGCATCTTT AGAGTACTCGTTACCGTATCATCAATTCTCTTCACCAAAGGAACATGTTGAAATT GAAAGGCCACCATCCCCTAAACTTATGGCCAAGAAACTTAACCACAATGCTAGT GAACGTGATCGCCGCAAGAAGATTAATAGCTTGATTTCTTCACTTCGTTCACTTC
TTCCCGGTGAAGATCAAACGAAAAAAATGAGCATTCCGGTAACAATTTCACGTGT CTTAAAATACATCCCTGATTTACAAAAGCAGGTGCAAGGACTTACCAAGAAAAAA GAAGAGCTTCTATCAAGAATTTCTCATCGACAAGAATATGCAGTTAACAAAGAAT CACAAAGGAAGAAAATTCCAAATTACAATTCTGCTTTTGTAGTTTCAACAAGTAG GCTTAATGATACTGAGCTTGTTATTCATATTTCGTCTTATGAGGCCAACAAGATT CCTCTATCTGAGATCTTGATGTGTTTAGAAAATAATGGTCTTCTTCTACTTAACTC TTCTTCTTCTAAAACCTTTGGAGGGAGGCTCTTCTATAACTTGCATTTTCAGGTG
GATAAAACTCAAAGATATGAGTGTGATGATCTGATTCAAAAGCTTTCTTCAATATA TGAGAAGCAGCAAAATAATCATTTGGGCACTATGGATCAAACGATCAATAGTGG TCTGATATAT >SEQIDNO:38
ATGTTAGCGATATCTCCTCCTATGTTTTCAACAATTGGATGGCCCTTTGAGGAGC
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CTTTAAGCCATAACCAGCATCAGAATTCATTCTACAAAGACACTGTTGATCAATT ATTTAATTTTCATGATCAAGTTGAGGCAGAAATTAATTCAACAGATCCCTCACAAT CCACAAGCAGTGACCTTAGCATGGTCAAGAAGCTTGTTCATTATGCCAGTGAAC GCGATCGCCGCAAGAAGATCAATAATTTGTATTCATCACTTCGATCACTCCTTCC TGTTTCTGATCAAATGGTACTTAAT >SEQIDNO:39
ATGGAGCACCAGCTGTTCGATGACCCCTTCTCTAGCAGCATCTCGTCGCTGGAG GCGGACATCTTCTCCGCCGGCGGCCAGCTGCCGTCGCCGCCGTGGCCGGACC TCGACCTCGACCTCGACGACGACGACATCCACGACCTCTCCGCGCCGACCGGC AACCCCACCTCCTCAGGAGGCTATGGCTCGGGCGGAGGCTCCGGAGGCTCCC ACAGGAAGCACAGCCACAACGCGTACGAGCGCGACCGCCGGAAGCAGCTCAA CGAGCTCTACTCCTCGCTCCGCTCCCTCCTCCCCGACGCTGACCACACTAAGAA GCTGAGCATCCCCACCACGGTCTCCCGAGTTCTCAAGTACATCCCCGAGCTGC AGAAGCAGGTGGACAACCTGGAGAGGAGGAAGAAAGAGCTGACGAACGCCAA CTGCAAACCAGGAGTTCTGAACACGAGCCAGATTGTAACTCCCATTGTTTCTGC TACTTGCCTCAACGATACGGAGATCATGGTTCAGGTCAGCCTGCACAGCAACGT GGCTGCCACAAGTCTTCCTCTGTCCAAGTGCATAAAAGTGATGGAGAATGAAGG CCTTCACCTAATTAGTTCATCAACTTACTCCACCTTCGACAACAGGACATTCTAT AGCCTCCATGTTCAGAGAAGTCAAAGAACGATGAAAGAGGAGTGCCCAGCA >SEQIDNO:40
ATGGTCAAGAAACTTAGCCACAACGCTAATGAACGTGACCGTCGCAAGAAGATT AAAAGTTTGTATTCTTCACTTCGTTCACTTCTCCCAGCAGCAGATCAAATGAAGA AATTAAGCGTGCCGGCCACTGTTTCACGTGCGCTTAAGTACCTACCAGAGCTTC AACAGCAAGTGGAGAGACTGGTTCAAAGAAAGGAGGAGCTTTTATCAAAGTTAT CAAAGCAAGGTGGTATAATTCATCAAGAAAATCAAAGAAATGACACCGTGTATAG
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CTCTTTATCATCGGTATCGGCAAGCCAGCTTAGTGATAGAGAAGTTGTCGTTCAT ATTTCCACTTACAAGAACCATAAAAGTCCATTATCAGAAATCTTGCTCACCTTAGA GGAAGATGGACTTGTTCTAAAAAACTCTTCTTCCTTTGAGTCATTTGGGGACAGG GTCTTCTATAATTTACATCTTCAGGTCATGGAAGGAACTTACACATTGGATAGTG AGGCCATGAGGGCGAAGCTTGTGTCTTTATCTGTAAAGAGGGAATCATCGTCTC TA >SEQIDNO:41
ATGTTAGAAGAATTATCTCCCATCAGTTTGTTCTCAACATTTGGATGGCCCTTGG AGGAAGCCATAAGCCATGAACAGCACTACAGCTTTAGAGATGGTGAAACTCCAG AGTCATTTACTCACTTCCCTCCATCTCAGCCAGATGTAAGACAGCTTGATCGCTC CACATCATTCACGGCCCACAGTGGAAGCGGTGACCCTAGCATGGCTAAGAAGC TTAACCACAACGCTAGCGAACGTGACCGTCGCAAAAAGATCAACAGTTTGTATT CTTCACTCCGTTCACTACTTCCTGCAGCCGATCAAAGGAAGAAATTAAGCATACC GTATACAGTTTCACGTGTGCTTGTATACATACCAAAACTTCAACAACAAGTGGAG AGACTGATTCAAAGGAAGGAGGAGCTTCTATCGAAGTTATCTAGGCAAGCTGAC GATTTAACTCATCAAGAAAATCAAAGAAAAGGCACCATGTATAGCTCTTTATCAT CGGTATCGGCGAGCCGGCTCAGTGACAGGGAAGTTGTCATTCATATCTCAACTA ACAAGCTCCATAGAAGTTCATTATCAGAAATCTTGGTTAATTTAGAGGAGGCTGG ACTTCTTCTACTAAATTCTTCTTCCTTCGAGTCCTTTGGAGGCAGAGTCTTCTATA ATTTACACCTTCAGGCCATGGAAGGAACTTACACAGTAGAGTGCGAGGCCTTGA ATGAGAGGCTTGTGTCCTTGTGCGAGAAGAGGGAGTCATTGTTTCCATTAAATT CAAGTTCTCCATATTCTAACTGTGTATTCTAG >SEQIDNO:42 GATCCTAACATGGTTAAGAAGCTTAACCACAACGCTAGCGAACGTGATCGTCGC AAGAAGATCAACAGTTTGTATTCTTCACTCCGTTCACTTCTTCCAGCTTCCGATG
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GAATGAAGAAATTAAGCATACCGTCCACAATTTCACGTGTGCTTAAGTACATACC AGAACTTCAACAGCAAGTGGAGAGACAGATCCAAAGGAAGGAGGAGCTTCTATC AAATCTATCTCGGCAAGATGATTTAATTCATCAAGAAAATCAAAGAAAAGACACC ATGTATAGCTCTTTATCATCGGTATCGGCAAGCCGGCTTGGTGATAGAGAAGTT GTCGTTCAAATTTCCACTTGCAAGGTCCTTAAAAGCCCAATATCAGAAATCTTGC TTAATTTAGAGGAAAATGGACTTGTTCTAATAAATTCTTCTTCCTTTGAGTCCTTT GGAGGCAACGTCTTCTACCATTTACATCTTCAGGTA >SEQIDNO:43
ATGTTAGCATTATCTCCTCCTGTATTTCCAACACCTGAATGGCCCTTAGAGGACC CCTTAGGCATTGACCAAATCTCCTACTTCTGTAGAGAAACTCAGCCTGCTACTGC TGCTTTTCTTCCATCTTATCAGCAAGAGTTATTATTATTAGAGCTTGATCATCAAC AATCCACATCTTTCACAGCCTATAATAGCAGTGGTGGTGACGCTAACGATATGG TGAAGAAGCTTAATCATAATGCAAGCGAACGTGATCGTCGCAAGAAGATGAACA CCCTCTATTCTTCCCTCCGATCACTATTTCCGGCCGCCGATGAAATGAAGAAGC TGAGTATACCTGCCACAATTTCGAGGGTGTTGAAGTACATACCAGAACTACAAG AACAGTTAGAGAGATTGGTCCAAAGGAAGGAAGAGATTTTGCTAAGAATATCTAA GCAAAATCATATTGTTAATCCCCAAATAAACCAAAGAAAAGGCACTTCTCACAGC AGTTTATCAGTAGTATCAGCTAATCAAATTAGTGACAAAGAAGCCATTATTCAAAT TTCTACGTACAGTAATACTATCCATACAAGTCCACTATCAGAAATCTTGCTTCTTT TGGAGGAGGAAGGCCTTCTTTTGATTAATTCTTCTTCCGCTGAATCCTTTGGTGG CAGGGTCTTCAACAATTTACATGTTCAGGTTGATGATACTTATACATTGGAATGT GATGCTTTAAGTGAGAAGCTTGCATCTCTGTATGCCAAGAGGGACGGGCTGTTC CCATGA >SEQIDNO:44
ATGGTCAAGAAGCTTAATCATAATGCAAGCGAAAGGGATCGCCGCAAGAAGATG
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AACACTCTCTATTCTTCCCTCCGATCACTTCTTCCGGCCTCCGATCAAATGAAGA AG CTGAG CATACCTGCCACAATTTCCAG GGTGTTGAAGTACATACCAGAACTAC AACAACAATTGGAGAGATTCGTCCAAAGGAAAGAAGAACTATTACTGAGAATATC TAAGCAGAATCATATTATTAATCCCCAAATAAACCAAAGAAAAGGCACTACTCAC AGCACCTTATCAGTAGTATCAGCTAATCAAATTAGTGACAAAGAAGTTGTTATTC AAGTTTCTACTTACAATAATACTATCCATACAAGTCCATTATCAGAAATCTTGCTT CTTCTGGAGGAGGAAGGCCTTCTTCTGATTAATTCTTCCTCCTTTGAGTCCTTTG GAGGCAGGGTCTTCTACAATTTACATCTTCAGGTTGATGGAACTTATATATTGGA GTGTGATGCTTTAAGCGAGAAGCTTGCAGCTTTATATGAGAGAGACGGGTTATT TCCATGA >SEQIDNO:45
ACAACGATAATAACTACGCCTCAATTTCAAACTGATCAGAATAACAAGTTGTTTG AAGGTTTACGTGCCGATAATACTATTGATTTACCTTCATCTCATCATTATCAACAA CAATGTTTGAAAGGAAGTGAGTTTGATGTTGATGAGTTAGGGGTAGAAAGGTCA TTAATGGAGAAGAAGCTAAATCATAATGCAAGTGAACGTAATAGAAGGAAGAAG ATGAATTTTCTTTATTCAACTCTTCGTTCTTTGCTTCCTCCTCCTACTAATAAACAT CAAAAGAAAAAATTAAGCTTTCCAGCAACAGTATCATATGTACAAGAATACATCC CAGAGTTGAAGAAAGAAATAGAGAGGCTAAGCAAAACAAAAGATTTGCTTTTATC AAAGAAATCAAATTATTCATTACTCAAAATTGATGATAATAATAAGAGAAAATTAA TTATTGGTGGAACTTCTTGTAATTCTTCAACAACATCAATTTGTGCAAGTCAACTA AGTAATTCACAAGTTTTGGTACAAATTTCAACAACTCAAGAAAATAATTTTCCAAT TTCACAAGTATTTGCAAGTGTAGAGGAAGATGGATTAATTTTGCTAAATGCATCA TCCTTTAAATCTTTTGGAGACAAGATTTTTCACAGCTTGCATTTTCAGATGCAAG GACCAATTGAAATGGACATTCAGGTTTTGAAGACTAAGCTTTTAGTAATGTGT >SEQIDNO:46
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ATGGACCATCAGCTGTTCGACGACCCCTTCGGGAGCAGCATCTCGTCGCTGGA
GGCGGACATCTTCTCCGCCGGCGGCGGCGGACAGCTGCCGTCGCCGCCGTGG CCGGACCTCGACCTCGACGACGACTACGACATACACGACCTCTCCGCGCCGGC CGCCAACGCCGCCACCTCCTCGGGAGGAGGCTATGGCTCCGGCGGCTCCGGC AGGAAGCTCAGCCACAACGCATACGAGCGCGACCGCCGGAAGCAGCTCAACG AGCTCTACTCCTCGCTCCGATCCCTCCTCCCGGACGCTGATCACACTAAGAAGC TGAGCATCCCCACCACCGTGTCCCGAGTTCTCAACACCAAAGAGATCGTAACTC CCATTGTTTCTGCTACTTGCCTTAACGACACGGAGATCATGGTTCAGGTCAGCC TGCACAGCAATGTGGCCGCCACAGCTCTCCCTCTCTCCAAGTGCATAAAGGTGC TAGAAAACGAAGGCCTTCTCCTCGTCAGCTCATCAACCTACTCCACCTTCGAGA ACAAGACATTCTATAGCCTCCATCTTCAGAGAAGTCAAAGAACGATGAAGGAGC AGTGCCCAGGATTCTGCGACGAACTGGAGAAGATCGTCAGGAAGAAAGCAGGG GCG >SEQIDNO:47
ATGGAGCATCAACTATTCGACGACGCCGTCCCGAGCAGCATGATCTGGCCGTT AGAGGCAGAAAACGGTTTCACCGACGAGCTGCCGTCTTTGCAGTTACCGGACG TGGACCTTGACTTCGACATCCACGAGTTCTCCGCACCGGCAACGGCACCGGCG AAAGCGGCCTCCTCGGGTGGCTCCGGATTGGTTGGTTCCGGTTCAGGATCGCA TAAGAAGCTCAACCACAACGCGTACGAGCGCGACCGGCGGACGCAGCTCAATC AGCTCTACTCGACTCTCCGTTCTCTCATCCCCAACGCAGATCACACAAAGAAGC TGAGCATTCCGACGACGGTGTGTCAGGTCCTCGACTACATACCCAAGCTGCAG AAGCAGGTCGAGGATCTCAAGAAGAAGAAACAGGAGCTCAGTACAGCCAAATG CAGAGAAAGACTGCAGCGCGTCAAGGACAACACATGCCGTATTGTTTCTGCCAC TCCTCTCGATGGCAACGAAATCATGGTCCAGGTTAGCCTGCTGAGCAACATGGC TGCAAGTCTTCCTCTATCCAAGTGCATAAACGTATTTGAGAACAAAGGGCTTCAC CTCATCAGTTCATCGACTTTCTCCACCGAGGTCAATAGAACATTTTACAGCTTCC
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ACTTTGAGGTACGTTTTTACATGCGCCCT >SEQIDNO:48
GGCGATGGCTCGGGCTCCCATCGCAAGATCAGCCACAACGCCTACGAGCGCG ACCGCCGCAAGCAGCTCAACGAGCTCTACTCCGACCTCCGCTCCCTCCTCCCC GACACCGATCACACGAAGAAGCTTAGCATTCCGATCACGGTGTCGCGGGTGCT CAAGTACATCCCGGAGCTGCAGAAGCAGTGGGCTTGNAGAAANAAAGAAGGAG GAGNTGACGCGCGCCAACTGCAACCCGGNGTGNTGACCATGAAGGGGAACAC GGTCCGATTGTTCCGCCACCTGCCTCGACGACAGGGANATTATGGTCCAAGTC AACCTGGTGAGCACATGGCCGGANTNTGCCCATTTCAAATGCATCAAAGTGCTG GAAAACAANNGCTCCGGTCA >SEQIDNO:49
ATGGAGCAGCTGTTCGTCGACGACCCAGCCTTCGCGAGCAGCATGTCGTCGCT TGAGGCGGACATCTTCTCCGGCGCCGGCCAGCTGCCGTCCTCGCCGTGGCTG GACCTAGACCTCGACGACGATGTCCAAGACCTCTCCATGGCGCCGACGACGGC GAACGCGGTGTCCTCCGGCTACGGCTCCGGCGGATCCGGCTCCCACAGGAAG CTCAGCCACAACGCCTACGAGCGCGACCGCCGGAAGCAGCTCAACGAGCTCTA CTCCTCCCTCCGCGCTCTCCTCCCCGACGCCGATCACACTAAGAAGCTGAGCA TCCCGACGACGGTGTCTCGCGTGCTCAAATACATACCCGAGCTGCAGAAGCAG GTGGAGAATCTGGAGAGGAAGAAGAAGGAGCTGACGACGACGAGCACCACCAA CTGCCAACCAAGAGTGTTGGGGAGCCAGCTGATGAGC >SEQIDNO:50
ATGGTCGCATTGTTCTCTCCTCCTCTCTTCTCAACCAAAGGGTGGCTCTTAGAG GAGGAGCCATTCGGCTATAATAATACCCATAATCTCTCCTACAAAGATGATGCGT CTTCTCAGTACTCCTTTCCCTATCAATTTTATTCACCACAGACACAGATTGAGGTT
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GAAATTGAAAGGTCCACTGCACCATCCTCTGACCCTGCCATGGTCAAGAAACTT AGCCACAATGCTAGCGAACGTGATCGCCGCAAGAAGGTCAACAACTTGGTTTCT TCACTTCGCTCACTTCTTCCAATGGCAGATCAAACGAAAAAAATGAGCATTCCTG CAACAGTTTCCAGAGTGTTGAAATACATACCTGAACTACAACAGCAAGTGCAAG CACTAACAAAGAGAAAAGAGGAGCTTCTGTGCAGAATTTCTCGGCAATTGCAAG GAGAAGCAGTGAACAAAGAATCTCAGAGAAAAATTTCCCATCACAACTCTTCTTT TGTTGTCTCAACGACTAGGCTTAACGATTGTGAAGCTGTAGTTCACATTTCATCT CATGAGACACACAAGGCTCCACTATCAGAGATTCTGCAGTGCTTAGAAAATGAT GGCCTTTTTCTGCTACATGCTTCTTCCTCAGAAACCTTTGGAGGAAGGTTCTTCT ACAATTTGCATTTTCACGTGGAGAAAACTGATAGATTAGAGACCGAGATTTTAAC TGAGAAGCTTTTACCAATATAT >SEQIDNO:51
ATGTTAGCATTCTCCCCTCCATTGTTTCCAACCCTTGGATGGCCCTTGGAGGAT CCCATAAGCCATGCACAGAACTACATATATGGAGAAACAGAAACTTCAGAATCG TTTCTTCACTTGCCCTCATCTCAGCCACAAGTGGAACTCAATTGCTCCACCCCAT ATGCAGCAGTTAGTGGTAATCCCACGATGGTTAAGAAACTTAACCACAACGTCA GTGTGCGGGATCGTCGGAAGAAGATCAACAGCTTGTACTCCTCTCTGCGTTCAC TACTTCCATCAGCTGATCAAGTGAAGAAATTAAGCATTCCTTCGACAGTTTCATG TGTGCTAAAATACATACCAGAGCTGCAACGGCAAGTGGAGAGACTGATCCAAAA GAAAGAAGAGTTTTTATCAAAGATTTCTAGGGAAGGAGATCTAATTCACCTAGAA AATCAAAGAAATGGCACACTTGGAAGCTCTTTATCTGCTGTTTCAGCAAGAAGG CTTAGTGACAGGGAAATTGTGGTTCAGATATCCACATTTAAGGTCCATGAGAGT CCACTTTCTGAGGTTTTGTTAAATTTGGAGGAGGATGGGCTTCTTGTAATCAATG CATCATCTTTTGAGTCCTTTGGAGGGAGGGTCTTCTACAACTTACATCTTCAGGT TGAAGGAACTCAAGGAATGGAGTCGACCGCCCACTTGGAGATGACAAGAACTC TAAAAAACAAACACATGAATATATTGGTGATTCATATGGACTTTCCTCCTTTTTTT
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CTTAAGATGTTCCTGATCTTTACAAGAGTATTTACCAATCATATATCAACTTCCTA CCAATGCTATGTTGGTAAATTAATTATCATTCTACTGCTACATGTAATTAAGAAAG AAAATTTTGAAACTTCTAAACATCAATTGGCCAGCGCCGAACCAATAATTGTAGC AGGTCAAGCTGCCAAAAAATTGGATGATGAGCTTCTCTTGGAAACCAAGATGAA AACTGAAGGGATGGGAGTACTGGAAACACCAATATTGATTAAAGCAAAGAATGG TACCAAAGAAATGGTGGAGAGAATCCTTGATCTTTACCCCATGGCAATTCATGAC ATAGACTCCAACAAGAAGAATATAGTGCTATTGGCGGTGGAGAATAGGCACCCC CATGTGTATGAGCTCTTCCTGAAGAGAAATATTGTGAAAGATAGTGTATTTGGTG CAGTTGATAATAAAGGCAACAGTGCATTGCATCTGGCTGCCATGTTTGCAGATTA TCGGCCTTGGGTCACTCCTGGTGTTGCATTGCAAATGCAATGGGAAGTCAAATG GTATGAGTATGTGAAGAAGTCCATGCCACCAAATTTCTTCCGTTTCCACAACAAT GAAAACAAGTCTACAAAGCAGATTTTCACCCGTGAACACAGAGATCTGGTGCAA AAGGGTGGGCAATGGCTAAATAACACAGCCACCTCATGCTCGTTGGTAGTAACA CTCATTGCAACAGTTGCCTTCGCCACATCAACTGCTGTACCGGGCGGCACCAAG GAGGGGACTGATTCATGTCCTCTCAATGGTCCCTAA >SEQIDNO:52
ATGTTAGCATTCTCCCCTCCATTGTTTCCAACCCTTGGATGGCCCTTGGAGGAT CCCATAAGCCATGCACAGAACTACATATATGGAGAAACAGAAACTTCAGAATCG TTTCTTCACTTGTCCTCATCTCAGCCACAAGTGGAACTCAATTGCTCCACCCCAT CTGCAGCAGTTAGTGGTAATCCCACGATGGTTAAGAAACTTAACCACAACGCCA GTGAGCGGGATCGTCGGAAGAAGATCAACAGCTTGTACTCCTCTATGCGTTCAC TACTTCCATCAGCTGATCAAGNGAAGAAATTAAGCATTCCTTCGACAGTTTCACG TGTGCTAAAATACATACCAGAACTGCAACGACAAGTGGAGAGATTGATTCAAAA GAAAGAAGAGTTTTTATCAAAGATTTGTAGGGAAGGAGATCCAATTCACCTAGAA AATCAAAGAAATGGCACACTTGGAAGCTCTTTATCTGCTGTTTCAGCAAGAAGG CTTAGTGACAGGGAAATTGTGGTTCAGATATCCACATTTAATGTCCATGAGAGTC
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CTCTTTCTGAGGTTTTGTTAAATTTGGAGGAGGATGGGCTTCTTGTAATCAATGC
ATCATCTTTTGAGTCCTTTGGAGGGAGGGTCTTCTACAACTTACATCTTCAGGTT GAAGGAACTCAAGGAATGGAGTGTGAGTTGTTGAGCGAGAAGCTACTTTCATTG TGTGAAAGGAGAGAGGCTTTTCCATGA >SEQIDNO:53
MCALVPSFFTNFGWPSTNQYESYYGAGDNLNNGTFLELTVPQTYEVTHHQNSLGV SVSSEGNEIDNNPVVVKKLNHNASERDRRKKINTLFSSLRSCLPASDQSKKLSIPET VSKSLKYIPELQQQVKRLIQKKEEILVRVSGQRDFELYDKQQPKAVASYLSTVSATRL GDNEVMVQVSSSKIHNFSISNVLGGIEEDGFVLVDVSSSRSQGERLFYTLHLQVEN MDDYKINCEELSERMLYLYEKCENSFN >SEQIDNO:54
MCALVPPLFPNFGWPSTGEYESNYLAGVNLEDFTFLDFPAPETYGVEHHQEIQEML GVSVPSEGNGVVTKKLNHNASERDRRKKINSLFSSLRSCLPASDQTKKLSIPQTVSR SLKYIPELQEQVKKLIQKKEELLVRVSGQRAIEHYVEPQPKAVARYVSTISATKLGDN EVLVQISSSKNHNFSISNVLSGLEEDGFVLVDVSSSRYHGKWLFYSLHLQMGNKDN HKLKCEELSQRILYLYEECENSFR >SEQIDNO:55
MCALVPPLFPDFGWPSTAGYESYYLGGENLNNDMFLDFPVVETYGVLAHHQNSLG
VSVSSEGNGIDNNPVVKKKLNHNASERDRRKKINSLFASLRSCLPTSDQSKKLSISA TVSRSLKYIPELQEQVKKLLQKKEELLVRVSGQRDIELYVKPQPKAIASYVSTVSATR LGDNEVMVQISSSKIHNFSISKVLTGLEEDGFVLVDVSSSRFQGERLFYTLHLQVEN MDDHYKMNCEELSERMLYLYEECENXXR >SEQIDNO:56
Petição 870180045232, de 28/05/2018, pág. 147/168
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IPQTVSRSLKYIPELQEQVKKLIQKKEELLVRVSGQRDIEHYVEPHPKAVARYVSTISA TKLGDNEVMVQISSSKNHNFSISNVLSGLEEDGFVLVDVSSSRSHGERLFYTLHLQ MGNKDDYKLTCEELRQRMLYLYEECGNSFR >SEQIDNO:57
IPTPSQATSSDLSMVKKLIRNASERDRRKKINTLYSSLRSLLPVAEQMKKLSNPATIS
RVLKYIRELQKQVEGLLTRKEAILLKLSPEVDEVKSKESERK >SEQIDNO:58
SDRRKQLNEQYSSLRSLLPDDDHNKKMSIPTTVSRVIKYIPELQKEVDGLEKKKEEL RRASSEQGVLTMRQNTAPVVSATCLDDREIMVQVSLVSTMAAALPMSKCIKVLENE GLRLINSSTSAFQNRTFYSLHLQRTQRTMSKEGQTFCNELENAVKQKAGLHLHH >SEQIDNO:59
MGHQTQMFDDPFASSMSSLDADIFSVAGGLHPSQWPGLDHDVSLAPAANNGTSS GGYGSPGGGDGSGSHRKISHNAYERDRRKQLNELYSDLRSLLPDSDHTKKLSIPIT VSRVLKYIPELQKQVDGLEKKKEELTRASCKPGVLTMKENTVPIVSATCLDEREIMV QVSLVSTMAGALPMSKRIKVLENEGLRLISSSTSAFQNRTFYSLHLQRTQRTMSKEC PAFCEELENALTQKAGYVYITSRLYVAE >SEQIDNO:60
MLAISPPMFSTIGWPFEEPLSHNQHQNSFYKDTVDQLFNFHDQVEAEINSTDPSQS TSSDLSMVKKLVHNASERDRRKKINNLYSSLRSLLPVSDQMKLSIPGTISRVLKYIPE LQNQVEGLIKRKDEILLGLSPQVEEFILSKESQRKKHSYNSGFVVSSSRLNDSEITIQI SCYTVQKIPLSEILICLENDGLLLLNVSSSKTFGGRVFYNLHFQVDKTQILESHILNEKL LSIMEKEGEFLKQ
Petição 870180045232, de 28/05/2018, pág. 148/168
89/104 >SEQIDNO:61
MVAFCPPQFSYSNMGWLLEELEPESLISHKEKNYASLEYSLPYHQFSSPKEHVEIER PPSPKLMAKKLNHNASERDRRKKINSLISSLRSLLPGEDQTKKMSIPVTISRVLKYIPD LQKQVQGLTKKKEELLSRISHRQEYAVNKESQRKKIPNYNSAFVVSTSRLNDTELVI HISSYEANKIPLSEILMCLENNGLLLLNSSSSKTFGGRLFYNLHFQVDKTQRYECDDL IQKLSSIYEKQQNNHLGTMDQTINSGLIY >SEQIDNO:62
MLAISPPMFSTIGWPFEEPLSHNQHQNSFYKDTVDQLFNFHDQVEAEINSTDPSQS
TSSDLSMVKKLVHYASERDRRKKINNLYSSLRSLLPVSDQMVLN >SEQIDNO:63
MEQLFVDDPAFASSMSSLEADIFSGAGQLPSSPWLDLDLDDDVQDLSMAPTTANAV SSGYGSGGSGSHRKLSHNAYERDRRKQLNELYSSLRALLPDADHTKLSIPTTVSRV LKYIPELQKQVENLERKKKELTTTSTTNCKPGVLGSQLMSEGMAPIVSATCINDMEI MVQVSLLSNVAGSVLPLSKCIKVLENEGLHFISSSTSSGFGNRTFYSIHLQRSEGTIN EECPAFCERLEKVVRNKAKL >SEQIDNO:64
MEHQLFDDPFSSSISSLEADIFSAGGQLPSPPWPDLDLDLDDDDIHDLSAPTGNPTS SGGYGSGGGSGGSHRKHSHNAYERDRRKQLNELYSSLRSLLPDADHTKKLSIPTT VSRVLKYIPELQKQVDNLERRKKELTNANCKPGVLNTSQIVTPIVSATCLNDTEIMVQ VSLHSNVAATSLPLSKCIKVMENEGLHLISSSTYSTFDNRTFYSLHVQRSQRTMKEE CPA >SEQIDNO:65
MVKKLSHNANERDRRKKIKSLYSSLRSLLPAADQMKKLSVPATVSRALKYLPELQQ
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QVERLVQRKEELLSKLSKQGGIIHQENQRNDTVYSSLSSVSASQLSDREVVVHISTY KNHKSPLSEILLTLEEDGLVLKNSSSFESFGDRVFYNLHLQVMEGTYTLDSEAMRAK LVSLSVKRESSSL >SEQIDNO:66
MLEELSPISLFSTFGWPLEEAISHEQHYSFRDGETPESFTHFPPSQPDVRQLDRSTS FTAHSGSGDPSMAKKLNHNASERDRRKKINSLYSSLRSLLPAADQRKKLSIPYTVSR VLVYIPKLQQQVERLIQRKEELLSKLSRQADDLTHQENQRKGTMYSSLSSVSASRLS DREVVIHISTNKLHRSSLSEILVNLEEAGLLLLNSSSFESFGGRVFYNLHLQAMEGTY TVECEALNERLVSLCEKRESLFPLNSSSPYSNCVF >SEQIDNO:67
DPNMVKKLNHNASERDRRKKINSLYSSLRSLLPASDGMKKLSIPSTISRVLKYIPELQ QQVERQIQRKEELLSNLSRQDDLIHQENQRKDTMYSSLSSVSASRLGDREVVVQIS TCKVLKSPISEILLNLEENGLVLINSSSFESFGGNVFYHLHLQV >SEQIDNO:68
MLALSPPVFPTPEWPLEDPLGIDQISYFCRETQPATAAFLPSYQQELLLLELDHQQS TSFTAYNSSGGDANDMVKKLNHNASERDRRKKMNTLYSSLRSLFPAADEMKKLSIP ATISRVLKYIPELQEQLERLVQRKEEILLRISKQNHIVNPQINQRKGTSHSSLSVVSAN QISDKEAIIQISTYSNTIHTSPLSEILLLLEEEGLLLINSSSAESFGGRVFNNLHVQVDD TYTLECDALSEKLASLYAKRDGLFP >SEQIDNO:69
MVKKLNHNASERDRRKKMNTLYSSLRSLLPASDQMKKLSIPATISRVLKYIPELQQQ LERFVQRKEELLLRISKQNHIINPQINQRKGTTHSTLSVVSANQISDKEVVIQVSTYNN TIHTSPLSEILLLLEEEGLLLINSSSFESFGGRVFYNLHLQVDGTYILECDALSEKLAAL
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YERDGLFP >SEQIDNO:70
TTIITTPQFQTDQNNKLFEGLRADNTIDLPSSHHYQQQCLKGSEFDVDELGVERSLM EKKLNHNASERNRRKKMNFLYSTLRSLLPPPTNKHQKKKLSFPATVSYVQEYIPELK KEIERLSKTKDLLLSKKSNYSLLKIDDNNKRKLIIGGTSCNSSTTSICASQLSNSQVLV QISTTQENNFPISQVFASVEEDGLILLNASSFKSFGDKIFHSLHFQMQGPIEMDIQVLK TKLLVMC >SEQIDNO:71
MDHQLFDDPFGSSISSLEADIFSAGGGGQLPSPPWPDLDLDDDYDIHDLSAPAANA ATSSGGGYGSGGSGRKLSHNAYERDRRKQLNELYSSLRSLLPDADHTKKLSIPTTV SRVLNTKEIVTPIVSATCLNDTEIMVQVSLHSNVAATALPLSKCIKVLENEGLLLVSSS TYSTFENKTFYSLHLQRSQRTMKEQCPGFCDELEKIVRKKAGA >SEQIDNO:72
MEHQLFDDAVPSSMIWPLEAENGFTDELPSLQLPDVDLDFDIHEFSAPATAPAKAAS SGGSGLVGSGSGSHKKLNHNAYERDRRTQLNQLYSTLRSLIPNADHTKKLSIPTTV CQVLDYIPKLQKQVEDLKKKKQELSTAKCRERLQRVKDNTCRIVSATPLDGNEIMVQ VSLLSNMAASLPLSKCINVFENKGLHLISSSTFSTEVNRTFYSFHFEVRFYMRP >SEQIDNO:73
GDGSGSHRKISHNAYERDRRKQLNELYSDLRSLLPDTDHTKKLSIPITVSRVLKYIPE LQKQWAXRXKEGGXDARQLQPGVXTMKGNTVRLFRHLPRRQGXYGPSQPGEHM AGXCPFQMHQSAGKQXLRS >SEQIDNO:74
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MEQLFVDDPAFASSMSSLEADIFSGAGQLPSSPWLDLDLDDDVQDLSMAPTTANAV SSGYGSGGSGSHRKLSHNAYERDRRKQLNELYSSLRALLPDADHTKKLSIPTTVSR VLKYIPELQKQVENLERKKKELTTTSTTNCQPRVLGSQLMS >SEQIDNO:75
MVALFSPPLFSTKGWLLEEEPFGYNNTHNLSYKDDASSQYSFPYQFYSPQTQIEVEI ERSTAPSSDPAMVKKLSHNASERDRRKKVNNLVSSLRSLLPMADQTKKMSIPATVS RVLKYIPELQQQVQALTKRKEELLCRISRQLQGEAVNKESQRKISHHNSSFVVSTTR LNDCEAVVHISSHETHKAPLSEILQCLENDGLFLLHASSSETFGGRFFYNLHFHVEKT DRLETEILTEKLLPIY >SEQIDNO:76 MLAFSPPLFSTFGWPWEDPXSHEQNYIYQETEASESFLHLPSSEPQAELNYSTPSA AVSGNPTMVKKLNHNASERDRRKKINSLYSSLRSLLPAADQAKKLSIPSTVSRVLKYI PELQKQVERLIQKKEELLSKISRQGDIIHQEKQRKATLASSLSAVSANRLSDREIVVQI STFKVHESPLSEVLLNLEEDGLLVINASSFESFGGRVFYNLHLQVEGTHRMECEVLS EKLLSLCEKRRDAFP >SEQIDNO:77 MLAFSPPLFPTLGWPLEDPISHAQNYIYGETETSESFLHLPSSQPQVELNCSTPYAA VSGNPTMVKKLNHNVSVRDRRKKINSLYSSLRSLLPSADQVKKLSIPSTVSCVLKYIP ELQRQVERLIQKKEEFLSKISREGDLIHLENQRNGTLGSSLSAVSARRLSDREIVVQI
STFKVHESPLSEVLLNLEEDGLLVINASSFESFGGRVFYNLHLQVEGTQGMESTAHL EMTRTLKNKHMNILVIHMDFPPFFLKMFLIFTRVFTNHISTSYQCYVGKLIIILLLHVIKK ENFETSKHQLASAEPIIVAGQAAKKLDDELLLETKMKTEGMGVLETPILIKAKNGTKE MVERILDLYPMAIHDIDSNKKNIVLLAVENRHPHVYELFLKRNIVKDSVFGAVDNKGN SALHLAAMFADYRPWVTPGVALQMQWEVKWYEYVKKSMPPNFFRFHNNENKSTK QIFTREHRDLVQKGGQWLNNTATSCSLVVTLIATVAFATSTAVPGGTKEGTDSCPLN
Petição 870180045232, de 28/05/2018, pág. 152/168
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GP >SEQIDNO:78
MLAFSPPLFPTLGWPLEDPISHAQNYIYGETETSESFLHLSSSQPQVELNCSTPSAA VSGNPTMVKKLNHNASERDRRKKINSLYSSMRSLLPSADQXKKLSIPSTVSRVLKYI PELQRQVERLIQKKEEFLSKICREGDPIHLENQRNGTLGSSLSAVSARRLSDREIVV QISTFNVHESPLSEVLLNLEEDGLLVINASSFESFGGRVFYNLHLQVEGTQGMECEL LSEKLLSLCERREAFP >SEQIDNO:79
ATGGAGTATCCATGGCTGCAGTCTCAAGTTCATTCCTTTTCACCTACTCTCCATT TTCCTTCCTTCCTTCATCCTTTAGATGATTCCAAGAGCCATAACATCAATCTTCAT CATATGAGTCTTAGTCACAGCAATAATACTAACAGTAACAATAACAATTATCAAGA AGAAGATCGAGGAGCGGTGGTTTTGGAGAAGAAACTGAATCACAACGCAAGCG AACGAGACCGCCGTAGAAAACTTAACGCCTTGTACTCTTCACTTCGTGCTCTCTT
GCCTCTTTCTGATCAAAAGAGGAAGCTGAGCATTCCTATGACGGTAGCGAGAGT AGTGAAATACATACCAGAGCAGAAGCAAGAACTTCAACGTTTGTCTCGGAGAAA AGAAGAGCTCTTGAAGAGGATCTCGAGAAAAACTCACCAAGAGCAGCTGAGAAA CAAAGCAATGATGGACTCAATAGATTCTTCTTCCTCTCAACGGATCGCAGCAAAT TGGCTCACTGACACAGAGATTGCTGTCCAGATTGCTACGTCGAAATGGACATCT
GTTTCAGACATGTTGCTTAGGTTAGAAGAAAACGGGCTTAATGTCATAAGCGTCT CTTCTTCCGTTTCTTCCACCGCAAGGATCTTCTACACTCTACATCTTCAGATGAG AGGAGATTGCAAAGTGAGACTGGAGGAACTCATCAATGGTATGCTCTTGGGATT ACGCCAATCATAA >SEQIDNO:80
ATGTGTGCCTTAACACCAATGTTTCCAAGTAACCAACAAGAATGGTACTCTACTT
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CAACAATGGAGTATCCATGGCTTGATTCCTTCTCTCCTACTCTCCCTTCTTCTCT TTATCCTTCTTTCGACCAACTAGATGAATTCAAGAGCTATAACATCAATCTTCTTC CTCATCATATGAATCTTGCTGACATAAATGGTACTAACAATGATCAAGAAGAACA TCAAGGATCGGTTTTGGAAAAGAAACTGAATCACAACGCAAGTGAACGCGACCG CCGTAGAAAGCTAAACGCCTTATACGCTTCACTTCGTGCTCTCTTGCCTCCTTCT GATCAAAAGAGAAAGTTGAGCATTCCAAAGACCATAGCGGGAGTGGTGAAGTAT ATACCAGAGCAGAAGCAAGAACTTCAACGTTTGTCTAGGAGGAAAGAAGAGCTT ATGAAGAGAATCTCCAATAAGACAGAGACTTTGAATCATCAACAAGAACAGCTGA GAAATAGAGCATTAATGATGGAGTCAATAGATTCTTCTTCACAAAAGATCGCT >SEQIDNO:81
ATGGAGTATCCATGGCTTGATTCCTTCTCTCCTACTCTCCCTTCTTCTCTTTATCC TTCTTTCGACCAACTAGATGAATTCAAGAACTATAACATCAATCTTCTTCCTCATC ATATGAATCTTGCCGACATAAATGGTACTAACAATACCAGTAACAATGATCAAGA AGAACATCAAGGATCGGTTTTGGAAAAGAAACTGAATCACAACGCAAGTGAACG CGACCGCCGTAGAAAGCTAAACGCCTTATACGCTTCACTTCGTGCTCTCTTGCC TCCTTCTGATCAAAAGTCGGCGAATCAGAGAAAGTTGAGCATTCCAAAGACCGT AGCGGGAGTGGTGAAGTATATACCAGAGCAGAAGCAAGAACTTCAACGTTTGTA TAGGAGGAAAGAAGAGCTTATGAAGAGGATCTCCAATAAGATAGAGACTTTGAA TCATCAACAAGAACAGCTGAGAAATAGAGCATTAATGATGGAGTCAATAGATTCT TCTTCACAAAAGATCGCTGCAAATTGGATCACCAACACAGAAATAGCTGTCCAG ATTGCTACATGGAAATGGACATCTATCTCAGACATGTTGCTTAGGTTAGAAGAAA ACGGGCTTAATGTCATAAGCGTCTCTTCTTCGGTTTCTTCCACCGCAAGGATCTT CTACACACTGCATCTTCAGATG >SEQIDNO:82
GCTTTCTCTTTCAGCTCGATCGATCCACAGCTCAACGAGCTCTACTCCTCCCTC
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CGCGCTCTCCTCCCCGACGCCGATCACACTAAGAAGCTGAGCATCCCGACGAC GGTGTCTCGCGTGCTCAAGTACATACCCGAGCTGCAGAAGCAGGTGGAGAATC TGGAGAGGAAGAAGAAGGAGCTGACGACGACGAGCACCACCAACTGCAAACCA GGAGTGTTGGGGAGCCAGCTGATGAGCGAGGGCATGGCTCCCATCGTT >SEQIDNO:83
ATGGAGCAGCTGTTCGTCGACGACCCAGCCTTCGCGAGCAGCATGTCGTCGCT TGAGGCGGACATCTTCTCCGGCGCCGGCCAGCTGCCGTCCTCGCCGTGGCTG GACCTAGACCTCGACGACGATGTCCAAGACCTCTCCATGGCGCCGACGACGGC GAACGCGGTGTCCTCCGGCTACGGCTTCGGCGGATCCGGCTCCCACAGGAAG CTCAGCCACAACGCCTACGAGCGCGACCGCCGGAAGCAGCTCAACGAGCTCTA CTCCTCCCTCCGCGCTCTCCTCCCCGACGCCGATCACACTAAGAAACTGAGCAT TTCGACGAACGTGTCCTGCGTGGTTCAGTACATAACCGAACCTGCAGAAACAAG TGGAGAATATGGAGAAGAAAAAAAAGAGCTGACGACGACGAGCACCACCAACT GTCAACCCCAAGATGTGGGTAGAAGC >SEQIDNO:84
MEYPWLQSQVHSFSPTLHFPSFLHPLDDSKSHNINLHHMSLSHSNNTNSNNNNYQ EEDRGAVVLEKKLNHNASERDRRRKLNALYSSLRALLPLSDQKRKLSIPMTVARVVK YIPEQKQELQRLSRRKEELLKRISRKTHQEQLRNKAMMDSIDSSSSQRIAANWLTDT EIAVQIATSKWTSVSDMLLRLEENGLNVISVSSSVSSTARIFYTLHLQMRGDCKVRLE ELINGMLLGLRQS >SEQIDNO:85
MCALTPMFPSNQQEWYSTSTMEYPWLDSFSPTLPSSLYPSFDQLDEFKSYNINLLP HHMNLADINGTNNDQEEHQGSVLEKKLNHNASERDRRRKLNALYASLRALLPPSD QKRKLSIPKTIAGVVKYIPEQKQELQRLSRRKEELMKRISNKTETLNHQQEQLRNRA
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LMMESIDSSSQKIA >SEQIDNO:86
MEYPWLDSFSPTLPSSLYPSFDQLDEFKNYNINLLPHHMNLADINGTNNTSNNDQE EHQGSVLEKKLNHNASERDRRRKLNALYASLRALLPPSDQKSANQRKLSIPKTVAG VVKYIPEQKQELQRLYRRKEELMKRISNKIETLNHQQEQLRNRALMMESIDSSSQKI AANWITNTEIAVQIATWKWTSISDMLLRLEENGLNVISVSSSVSSTARIFYTLHLQM >SEQIDNO:87
AFSFSSIDPQLNELYSSLRALLPDADHTKKLSIPTTVSRVLKYIPELQKQVENLERKKK
ELTTTSTTNCKPGVLGSQLMSEGMAPIV >SEQIDNO:88
MEQLFVDDPAFASSMSSLEADIFSGAGQLPSSPWLDLDLDDDVQDLSMAPTTANAV SSGYGFGGSGSHRKLSHNAYERDRRKQLNELYSSLRALLPDADHTKKLSISTNVSC VVQYITEPAETSGEYGEEKKELTTTSTTNCQPQDVGRS >SEQIDNO:89
ATGTGTGCACTTGTCCCTCCATTATATCCCAATTTCGGCTGGCCTTGCGGAGAT CATAGCTTCTATGAAACCGACGACGTATCCAACACGTTTCTTGATTTTCCGTTGC CGGACTTGACGGTGACTCATGAGAATGTGTCGTCTGAGAATAACAGAACATTAC TAGACAATCCCGTGGTGATGAAGAAGCTTAATCACAACGCGAGTGAACGTGAGC GTCGCAAGAAGATCAACACAATGTTCTCATCTCTTCGTTCTTGTCTTCCTCCCAC CAATCAAACGAAGTTAAGTGTTTCGGCAACAGTTTCACAAGCATTGAAGTACATA CCAGAGCTGCAAGAGCAAGTTAAAAAGCTCATGAAGAAGAAAGAAGAGCTCTCG TTTCAAATTTCGGGTCAAAGAGATCTCGTTTACACCGACCAAAACAGTAAGTCAG AGGAAGGGGTTACAAGCTATGCGTCGACAGTTTCTTCGACTAGGCTCAGTGAGA
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CTGAAGTGATGGTCCAAATTTCATCGTTACAGACTGAAAAATGTTCGTTTGGGAA TGTCTTGAGTGGTGTAGAAGAAGATGGGTTGGTTCTTGTGGGTGCTTCATCTTC AAGGTCTCATGGAGAGCGACTCTTTTACTCTATGCATCTTCAGATAAAAAATGGC CAGGTGAATTCCGAAGAATTAGGTGATAGATTGTTGTACTTGTACGAGAAATGTG GACACTCGTTTACATGA >SEQIDNO:90
ATGTGTGCACTTGTCCCTCCATTATATCCCAATTTCGGCTGGCCTTGCGGAGAT CATAGCTTCTATGAAACCGACGACGTATCCAACACGTTTCTTGATTTTCCGTTGC CGGACTTGACGGTGACTCATGAGAATGTGTCGTCTGAGAATAACAGAACATTAC TAGACAATCCCGTGGTGATGAAGAAGCTTAATCACAACGCGAGTGAACGTGAGC GTCGCAAGAAGATCAACACAATGTTCTCATCTCTTCGTTCTTGTCTTCCTCCCAC CAATCAAACGAAGAAGTTAAGTGTTTCGGCAACAGTTTCACAAGCATTGAAGTAC ATACCAGAGCTGCAAGAGCAAGTTAAAAAGCTCATGAAGAAGAAAGAAGAGCTC TCGTTTCAAATTTCGGGTCAAAGAGATCTCGTTTACACCGACCAAAACAGTAAGT CAGAGGAAGGGGTTACAAGCTATGCGTCGACAGTTTCTTCGACTAGGCTCAGTG AGACTGAAGTGATGGTCCAAATTTCATCGTTACAGACTGAAAAATGTTCGTTTGG GAATGTCTTGAGTGGTGTAGAAGAAGATGGGTTGGTTCTTGTGGGTGCTTCATC TTCAAGGTCTCATGGAGAGCGACTCTTTTACTCTATGCATCTTCAGATAAAAAAT GGCCAGGTGAATTCCGAAGAATTAGGTGATAGATTGTTGTACTTGTACGAGAAA TGTGGACACTCGTTTACATGA >SEQIDNO:91
CCACGTCGTCTGCGCGGCCGACTCCTTCTACGTCGGCCTCCCGATCCCGGTGG TGTCCGCCGGCGAGGAGCTGATGGCGGGGCGAACCTCATCCACAACGCCTAC GAGCGCGACCGCCGGAAGCAGCGCAACGAGCTCTACTCCTCCCTCCGCGCTCT CCTCCCCGACGCCGATCACACTAAGAAGCTGAGCATCCCGACGACGGTGTCTC
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GCGTGCTCAAGTACATACCCGAGCTGCAGAAGCAGGTGGAGAATCTGGAGAGG
AAGAAGAAGGAGCTGACGACGACGAGCACCACCAACTGCAAACCAGGAGTGTT GGGGAGCCAGCTGATGAGCGAGGGCATGGCTCCCATCGTTTCGGCTACCTGCA TCAATGACATGGAGATCATGGTTCAGGTCAGCTTGTTGAGCAATGTGGCGGGTT CAGTTCTTCCTCTCTCCAAGTGTATCAAAGTACTGGAGAACGAAGGTCTTCACTT
CATCAGTTCATCGACTTCCTCCGGATTTGGGAACAGGACATTCTACAGTATCCAT CTTCAGAGAAGTGAAGGAACGATCAACGAGGAGTGCCCAGCATTTTGTGAAAG GTTGGAGAAAGTCGTCAGGAACAAAGCAAAGCTT >SEQIDNO:92
ATGGAGCACCAGCTGTTCGATGACCCCTTCTCTAGCAGCATCTCGTCGCTGGAG GCGGACATCTTCTCCGCCGGCGGCCAGCTGCCGTCGCCGCCGTGGCCGGACC TCGACCTCGACCTCGACGACGACGACGGCATCCACGACCTCTCCGCGCCGGC CGGCAACCCCACCTCTTCAGGAGGCTATGGCTCGGGCGGAGGCTCCCACAGG
AAGATCAGCCACAACGCGTACGAGCGTGACCGCCGGAAGCAGCTCAACGAGCT CTACTCCTCGCTCCGCTCCCTCCTCCCCGACGCTGACCACACTAAGAAGCTGA GCATCCCCACCACGGTCTCCCGAGTTCTCAAGTACATCCCCGAGCTGCAGAAG CAGGTGGACAACCTGGAGAGGAGGAAGAAGGAGCTGACGAACGCCAACTGCA
AACCAGGAGTTCTGAACACGAGCCAGATTGTAACTCCCATTGTTTCTGCTACTTG
CCTCAACGATACGGAGATCATGGTTCAGGTCAGCCTGCACAGCAACGTGGCTG CCACAAGTCTTCCTCTGTCCAAGTGCATAAAAGTGATGGAGAACGAAGGCCTTC ACCTAATTAGTTCATCAACTTACTCCACCTTCGACAACAGGACATTCTATAGCCT CCATGTTCAGAGAAGTCAAAGAACGATGAAGGAGGAGTGCCCAGCATTCTGCG
ATGAACTGGAGAGGATTATC >SEQIDNO:93
ATGGACCATCAGCTGTTCGACGACCCCTTCGGGAGCAGCATCTCGTCGCTGGA
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GGCGGACATCTTCTCCGCCGGCGGCGGCGGACAGCTGCCGTCGCCGCCGTGG
CCGGACCTCGACCTCGACGACGACTACGACATACACGACCTCTCCGCGCCGGC
CGCCAACGCCGCCACCTCCTCGGGCGGCGGCTATGGCTCCGGCGGCTCCGGC AGGAAGCTCAGCCACAACGCATACGAGCGCGACCGCCGGAAGCAGCTCAACG AGCTCTACTCCTCGCTCCGATCCCTCCTCCCGGACGCTGATCACACTAAGAAGC TGAGCATCCCCACCACCGTGTCCCGAGTTCTCAAGTACATCCCGGAGCTGCAG AAGCAGGTGGATAACCTGGAGAGGAGGAAGAAGGAGCTGACCAACGCCAACTG CAAGCCGGGAGTTCTCAACACCAAAGAGATCGTAACTCCCATTGTTTCTGCTAC TTGCCTTAACGACACGGAGATCATGGTTCAGGTCAGCCTGCACAGCAATGTGGC CGCCACAGCTCTCCCTCTCTCCAAGTGCATAAAGGTGCTAGAAAACGAAGGCCT TCTCCTCGTCAGCTCATCAACCTACTCCACCTTCGAGAACAAGACATTCTATAGC CTCCATCTTCAGAGAAGTCAAAGAACGATGAAGGAGCAGTGCCCAGGATTCTGC GACGAACTGGAGAAGATCGTCAGGAAGAAAGCAGGGGCG >SEQIDNO:94
GCCTCGTGCCGGCGGGTGCTCAAGTACATCCCGGAGCTGCAGAAGCAGGTGG ACGGACTGGAGAAGAAGAAGGAGGAGCTGACGCGCGCCAACTGCAAGCCCGG CGTGCTGACCATGAAGGAGAACATGGCTCCGATCGTGTCCGCCACCTGCCTCG ATGACAGAGAAATCATGGTCCAGGTCAGCCTGGTGAGCACCATGGCCGGAGTT CTGCCCATGTCCAAGTGCATCAAGGTGCTGGAGAACGAAGGCCTACGCCTCAT CAGCTCGTCCACTTCCGCGTTTCACAACAGGACGTTCTATAGCCTCCATCTTCA GAGAACCCAACGGACGATGAGCAAGGAGTGTCCGGCATTTTGTGAAGAACTGG AGAACGCCCTGACGCAAAAGGCAGGACTACGTCTACATCACCACCAG >SEQIDNO:95
ATGGATCACCAGCTGTACGGCGACCCCTCCGCGAGCAGCTTCTCTCCGCTGGA GGCACAGATCTTCTCCGGCCAGCTGCCGCCGTCGTCAACGCCATGGCCAAATC TCGACGTTGACCTCGCCCTGGACCTCGACGTTCTCGAGGATGACATCGTCCGG
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GAGCTCTCTGCTGGCACAGTGGCAAACGCGGCATCGTCAGGTTCCGGCTCCGG CGCCCACAAGAAGCTCAGCCACAACGCGTACGAGCGCGACCGCCGGAAGCAG CTCAACGAGCTATACCTCTCGCTCCGTTCTCTCCTCCCGGACGCCGACCACACC AAGAAGCTGAGTATTCCGACGACGGTGTGTCGAGCGCTCAAGTACATCCCCGA GCTGCAGAAACAGGTCGAGAATCTGGAGAAGAAGAAAGAGAAACTGGCTAGTG CCAACTGCAAACCAGGGGTACTGAGCGTGACCGGCAGCATAGCTCCAACTGTG TCCGCTACTTGCCTCAACCACAAGGAAATCATGGTTCAGATTAGCTTGCTGAGA GATACAGATGCTTCTACAGCTCTACCTCTTTCCAAGTGTATAAATGTACTGGAGA ACGAAGGACTTCAGCTCATCAGTTCATCGACTTCCTCCACCTTTGGGAACAAAA CGTTCTATAACCTCCATCTTCAGAGAAGTCAAGGAGCCACTAAACATGGAGTGC CCATCGTTTTG >SEQIDNO:96 CGCAGATCTTCTCCAGCCAGCTGCCGCCGTCACCGCCGTGGCCGAATCTCGAT GTTGACGTTGACCTGGACCTCGACGTTCTTGAGGACGACGTCGTCCGCGAACT CTCAGGGAGGCCGGCAAACGCGGCATCGTCAGGCTCCGGCTCCGGCGGCCCC GGCTCCCACAAGAAGCTCAGTCACAACGCGTACGAGCGCGACCGCCGGAAGC AGCTCAACGAGCTCTACCTCTCACTCCGTTCTCTCCTGCCGGACGCCGACCACA CTAAGAAGCTGAGTATTCCGACGATGGTGTGTCGAGCGCTCAAGTACATCCCGA GCTGCAGAAACAGGTCGAGAATCTGGAGAAGAAGAAAGAGAAACTTGCTAGTTC CAACTGCAAACCAGAGGTACTGAGCGCAAGCGGCAGCATAGCTCTAACTGTGT CCGCTACTTGCCTCAACGACAAGGAAATCATGGTTCAGATTAGCTTGCTGAGAC ATACGGATGCTGCTACAGCTCTACCTCTTTCCAAGTGTATAAATGTACTGGAGAA CGAAGGACTTGAGCTCGTCAGTTCATCGACTTCCTGCACCTTTGGGAACAAAAT GTTCTATAACCTCCATCTTCAGAGAAGTCAAGGAGCGCTAACATGGGAGTGTCC ATCCTTCTGTGACAAATTGGAACAAGCAATCAGGAAAACAGCAGGATTA
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101/104 >SEQIDNO:97
CGACGGAAGCAGCTCAACGACCTTTACTCCTCGCTCCGCTCCCTCCTCCCGGA
CGCTGACCACACCAAGAAGCTGAGCATCCCCACCACCGTGTCCCGAGTCCTCA AGTACATCCCGGAGCTGCAGAAGCAGGTGGACAACCTGGAGAGGAGGAAGCG GGAGCTGACCAACGCCAACTGCAAGCCGGGAGTTCTCAACACCAGCGAGATCG TAACTACTCCCATTGTTTCTGCTACTTGCCTCAACGACACGGAGATCATGGTTCA GGTCAGCCTGCACAGCAATGTGGCAGCCACGGCTCTCCCTCTCTCCAAGTGCA
TAAAGGTGCTGGAGGACGCAGGCCTTCACCTCATCAGCTCATCAACCTACTCCA CCTTTGGGAACAAGACATTCTATAGCCTCCATCTTCAGGTGTGCATGCATGTTCA TTCAATGGTTCCTGCCGTTTCCTTCAATTTTTTTATC >SEQIDNO:98
MCALVPPLYPNFGWPCGDHSFYETDDVSNTFLDFPLPDLTVTHENVSSENNRTLLD
NPVVMKKLNHNASERERRKKINTMFSSLRSCLPPTNQTKLSVSATVSQALKYIPELQ
EQVKKLMKKKEELSFQISGQRDLVYTDQNSKSEEGVTSYASTVSSTRLSETEVMVQ ISSLQTEKCSFGNVLSGVEEDGLVLVGASSSRSHGERLFYSMHLQIKNGQVNSEEL GDRLLYLYEKCGHSFT >SEQIDNO:99
MCALVPPLYPNFGWPCGDHSFYETDDVSNTFLDFPLPDLTVTHENVSSENNRTLLD NPVVMKKLNHNASERERRKKINTMFSSLRSCLPPTNQTKKLSVSATVSQALKYIPEL QEQVKKLMKKKEELSFQISGQRDLVYTDQNSKSEEGVTSYASTVSSTRLSETEVMV QISSLQTEKCSFGNVLSGVEEDGLVLVGASSSRSHGERLFYSMHLQIKNGQVNSEE LGDRLLYLYEKCGHSFT >SEQIDNO:100
PRRLRGRLLLRRPPDPGGVRRRGADGGANLIHNAYERDRRKQRNELYSSLRALLP
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DADHTKKLSIPTTVSRVLKYIPELQKQVENLERKKKELTTTSTTNCKPGVLGSQLMS
EGMAPIVSATCINDMEIMVQVSLLSNVAGSVLPLSKCIKVLENEGLHFISSSTSSGFG NRTFYSIHLQRSEGTINEECPAFCERLEKVVRNKAKL >SEQIDNO:101
MEHQLFDDPFSSSISSLEADIFSAGGQLPSPPWPDLDLDLDDDDGIHDLSAPAGNPT SSGGYGSGGGSHRKISHNAYERDRRKQLNELYSSLRSLLPDADHTKKLSIPTTVSR VLKYIPELQKQVDNLERRKKELTNANCKPGVLNTSQIVTPIVSATCLNDTEIMVQVSL HSNVAATSLPLSKCIKVMENEGLHLISSSTYSTFDNRTFYSLHVQRSQRTMKEECPA FCDELERII >SEQIDNO:102
MDHQLFDDPFGSSISSLEADIFSAGGGGQLPSPPWPDLDLDDDYDIHDLSAPAANA ATSSGGGYGSGGSGRKLSHNAYERDRRKQLNELYSSLRSLLPDADHTKKLSIPTTV SRVLKYIPELQKQVDNLERRKKELTNANCKPGVLNTKEIVTPIVSATCLNDTEIMVQV SLHSNVAATALPLSKCIKVLENEGLLLVSSSTYSTFENKTFYSLHLQRSQRTMKEQC PGFCDELEKIVRKKAGA >SEQIDNO:103
ASCRRVLKYIPELQKQVDGLEKKKEELTRANCKPGVLTMKENMAPIVSATCLDDREI MVQVSLVSTMAGVLPMSKCIKVLENEGLRLISSSTSAFHNRTFYSLHLQRTQRTMSK ECPAFCEELENALTQKAGLRLHHHQ >SEQIDNO:104
MDHQLYGDPSASSFSPLEAQIFSGQLPPSSTPWPNLDVDLALDLDVLEDDIVRELSA GTVANAASSGSGSGAHKKLSHNAYERDRRKQLNELYLSLRSLLPDADHTKKLSIPTT VCRALKYIPELQKQVENLEKKKEKLASANCKPGVLSVTGSIAPTVSATCLNHKEIMV
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QISLLRDTDASTALPLSKCINVLENEGLQLISSSTSSTFGNKTFYNLHLQRSQGATKH GVPIVL >SEQIDNO:105
RRKQLNDLYSSLRSLLPDADHTKKLSIPTTVSRVLKYIPELQKQVDNLERRKRELTNA NCKPGVLNTSEIVTTPIVSATCLNDTEIMVQVSLHSNVAATALPLSKCIKVLEDAGLHL ISSSTYSTFGNKTFYSLHLQVCMHVHSMVPAVSFNFFI
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Claims (7)

  1. REIVINDICAÇÕES
    1. Método para produção de uma planta transgênica tendo tolerância aumentada ao estresse por calor em relação a um controle do tipo selvagem, o método CARACTERIZADO pelas etapas de transformar uma planta, uma cultura de tecido de planta ou uma célula de planta com um vetor compreendendo um construto de ácido nucléico que compreende uma sequência de ácido nucléico que codifica um polipeptídeo hélice-alça-hélice básico (bHLH) do subgrupo 1b selecionado a partir do grupo que consiste em bHLH38, bHLH39, bHLH100 e bHLH101 para obter uma planta transformada, uma cultura de tecido transformada ou uma célula de planta transformada com expressão ou atividade de bHLH aumentada, e crescer a dita planta transformada ou regenerar uma planta a partir da dita cultura de tecido de planta transformada ou célula de planta transformada, em que o dito construto de ácido nucléico compreende uma sequência de ácido nucléico selecionada a partir das SEQ ID NOs: 1-17, 29-52, 79-83 e 89-97, e em que uma planta tendo tolerância aumentada ao estresse por calor em relação a um controle do tipo selvagem é produzida.
  2. 2. Método, de acordo com a reivindicação 1, CARACTERIZADO pelo fato de que o dito construto de ácido nucléico compreende um promotor constitutivo, um promotor induzível ou um promotor específico de tecido.
  3. 3. Método, de acordo com a reivindicação 2, CARACTERIZADO pelo fato de que o dito promotor específico de tecido é um promotor de raiz.
  4. 4. Método, de acordo com a reivindicação 1, CARACTERIZADO pelo fato de que o dito construto de ácido nucléico compreende uma sequência de ácido nucléico selecionada a partir das SEQ ID NOs: 1 -17.
  5. 5. Método, de acordo com a reivindicação 1, CARACTERIZADO pelo fato de que o dito construto de ácido nucléico compreende uma sequência de ácido nucléico selecionada a partir das SEQ ID NOs: 29-52.
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    2/2
  6. 6. Método, de acordo com a reivindicação 1, CARACTERIZADO pelo fato de que o dito construto de ácido nucléico compreende uma sequência de ácido nucléico selecionada a partir das SEQ ID NOs: 79-83.
  7. 7. Método, de acordo com a reivindicação 1, CARACTERIZADO pelo fato de que o dito construto de ácido nucléico compreende uma sequência de ácido nucléico selecionada a partir das SEQ ID NOs: 89-97.
BRPI1011495-5A 2009-06-30 2010-06-30 Método para produção de uma planta transgênica tendo tolerância aumentada ao estresse por calor em relação a um controle do tipo selvagem BRPI1011495B1 (pt)

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