BRPI0609801A2

BRPI0609801A2 - polipeptìdeo, polinucleotìdeo, construção de ácido nucleico, vetor de expressão recombinante, célula hospedeira recombinante, método para produção do polipeptìdeo, planta transgênica, parte de planta ou célula de planta, composição, método para matar ou inibir o crescimento de células microbianas, e, usos de um polipeptìdeo e de pelo menos um polipeptìdeo antimicrobiano

Info

Publication number: BRPI0609801A2
Application number: BRPI0609801-0A
Authority: BR
Inventors: Jesper Vind; Dorotea Raventos Segura; Hans-Henrik Kristensen Hoegenhaug; Per Holse Mygind; Olivier Taboureau
Original assignee: Novozymes As
Priority date: 2005-06-06
Filing date: 2006-06-02
Publication date: 2011-10-11
Also published as: RU2007145188A; JP2008545425A; CN101189256B; US20100120690A1; BRPI0609801B1; EP1891097A1; KR20080023218A; IL186857A0; RU2415150C2; CA2607841A1; NO20080067L; AR053402A1; US7671175B2; CA2607841C; AU2006256791B2; AU2006256791A1; TW200740841A; JP5118023B2; CN101189256A; EP1891097B1

Abstract

POLIPEPTìDEO, POLINUCLEOTìDEO, CONSTRUçãO DE áCIDO NUCLEICO, VETOR DE EXPRESSãO RECOMBINANTE, CéLULA HOSPEDEIRA RECOMBINANTE, MéTODO PARA PRODUçãO DO POLIPEPTìDEO, PLANTA TRANSGêNICA, PARTE DE PLANTA OU CéLULA DE PLANTA, COMPOSIçãO, MéTODO PARA MATAR OU INIBIR O CRESCIMENTO DE CéLULAS MICROBIANAS, E, USOS DE UM POLIPEPTìDEO E DE PELO MENOS UM POLIPEPTìDEO ANTIMICROBIANO. A presente invenção se refere a polipeptídeos isolados tendo atividade antimicrobiana e polinucleotídeos isolados que codificam os polipeptídeos. A invenção também se refere a construções de ácido nucleico, vetores e células hospedeiras compreendendo os polinucleotídeos, bem como métodos para produção e uso dos polipeptídeos.

Description

"POLIPEPTIDEO, POLINUCLEOTÍDEO, CONSTRUÇÃO DE ÁCIDO NUCLEICO, VETOR DE EXPRESSÃO RECOMBINANTE, CÉLULA HOSPEDEIRA RECOMBINANTE, MÉTODO PARA PRODUÇÃO DO POLIPEPTIDEO, PLANTA TRANSGÊNICA, PARTE DE PLANTA OU CÉLULA DE PLANTA, COMPOSIÇÃO, MÉTODO PARA MATAR OU INIBIR O CRESCIMENTO DE CÉLULAS MICROBIANAS, E, USOS DE UM POLIPEPTIDEO E DE PELO MENOS UM POLIPEPTIDEO ANTIMICROBIANO"

CAMPO DA INVENÇÃO

A presente invenção se refere a polipeptídeos isolados tendo atividade antimicrobiana e polinucleotídeos isolados que codificam os polipeptídeos. A invenção também se refere a construções de ácido nucleico, vetores e células hospedeiras compreendendo o polinucleotídeo, bem como a métodos para produção e uso dos polipeptídeos.

ANTECEDENTES DA INVENÇÃO

E um objetivo da presente invenção proporcionar polipeptídeos tendo atividade antimicrobiana aperfeiçoada. Os polipeptídeos podem exibir atividade hemolítica reduzida e/ou citotoxicidade reduzida. Os polipeptídeos também podem exibir sensibilidade reduzida a cátions, tais como Ca2+, Mg2+, Na+. Os polipeptídeos também podem exibir um espectro antimicrobiano diferente comparado à SEQ ID NO: 1.

SUMÁRIO DA INVENÇÃO

A presente invenção proporciona um polipeptídeo tendo atividade antimicrobiana o qual compreende, de preferência consiste de, uma seqüência de aminoácido a qual tem pelo menos 80% de identidade com aminoácidos 1 a 40 da seqüência de aminoácido:

G-X1-G-C-X2-X3-X4-X5-X6-X7-X8-X9-X10-X11-C-H-X12-X13-C-X-X14-X15-X16-X17~X18-X19-X20-G-G-X21-C-X22-X23-X24-X25-X26-X27-C-X28-C-X29 ; em que X1 = F, L, W ou I; de preferência, X1 = F;

X2 = N, R, Q, V, G, S, A, K, L, M, D, H ou Y; de preferência, X2 = N, R, Q, V, G, S, A, K ou Y;

X3 = G, R, A ou K; de preferência, X3 = G;

X4 = P, A, L, V, K ou R; de preferência, X4 = Ρ, K ou R;

X5 = W ou R;

X6 = D, A, G, K, L, Τ, N, F, Η, Μ, P, Q, S, C, I, R, V ou Y; de preferência, X6 = D, A, G, K, L, Τ, N, F, Η, Μ, P, Q, S, V ou Y;

X7 = E, G, A, L, C, Q ou S; de preferência, X7 = E, G ou S;

X8 = D, F, G, Ν, V, Υ, Η, K, L, P, S, T, W, I, M, A, C ou R; de preferência, X8 = D, F, G, Ν, V, Υ, Η, K, L, P, S, T, W, I, M ou R;

X9 = D ou P; de preferência, X9 = D; Xi0 = M, R, S, V, A, F, G, L, Τ, Y, W, E ou K; de preferência, Xi0 = M, R, S, V, G, Y, L, F, T, W ou K;

X11 = Q, R, L, F, G, H, S, A, C, I, Κ, Μ, Ρ, Τ, V, W ou Y; de preferência, X11 = Q, R, L, F, G, H, S, K ou Y;

X12 - N, R, I, Υ, V, Κ, T, Q, S, F, A, W, E ou H;

X13 = H, A, F, Q, Τ, V ou L; de preferência, X13 = H ou L;

X14 = K, Q ou R; de preferência, X14 = K ou R;

X15 = S, A, V, N ou F;

X16 = I, L, Μ, T, W ou V; de preferência, X16 = I, L ou V;

X17 = Κ, T ou R;

X18 = G, Η, Κ, A, P, F, I, Q, R, S, Τ, Y ou N; de preferência, X18 = G, H, R, K ou N;

X19 = Υ, Η, K, L, Μ, N, Q, S, V ou R; de preferência, X19 = Y ou R;

X20 = K, F, Η, T, C ou R; de preferência, X20 = K ou R;

X21 = Y, F, R, A, H, L, M, S ou W; de preferência, X21 - Y, F, R ou W; X22 = Α, Κ, Ν, Q, Τ, Ε, Η, I, Rj Sj V, G ou Υ; de preferência, X22 = Aj Kj Nj Qj Tj S ou Υ; Χ23 = Kj R ou Τ; de preferência, X23 = K ou R;

X24 = Gj Κ, Qj Ε, Ν, S, Tj A ou R; de preferência, X24 = G, Kj Q, A ou R;

X25 = Gj Kj Hj W ou R; de preferência, X25 = G, K ou R;

X26 = Fj Aj Hj Ij Mj Vj Wj R ou L; de preferência, X26 = F ou L;

X27 = V, Lj Μ, I, K, Qj R ou T; de preferência, X27 = V, L, M ou T;

X28 = Κ, Η, N ou R; de preferência, X28 = K ou R;

X29 = Υ, I, YRCG ou YR; de preferência, X29 = Y ou YR;

e a qual tem menos de 100% de identidade com aminoácidos 1 a 40 de SEQ ID NO: 1. 15 A presente invenção também se refere a construções de ácido

nucleico, vetores de expressão recombinantes e células hospedeiras recombinantes compreendendo os polinucleotídeos.

A presente invenção também se refere a métodos para produção de tais polipeptídeos tendo atividade antimicrobiana 20 compreendendo (a) cultura de uma célula hospedeira recombinante compreendendo uma construção de ácido nucleico compreendendo um polinucleotídeo que codifica o polipeptídeo sob condições condutivas à formação do polipeptídeo; e (b) recuperação do polipeptídeo.

A presente invenção também se refere a métodos de uso dos 25 polipeptídeos da invenção.

DEFINIÇÕES

Atividade Antimicrobiana. O termo "atividade antimicrobiana" é definido aqui como uma atividade a qual é capaz de matar ou inibir o crescimento de células microbianas. No contexto da presente invenção, o termo "antimicrobiano" se destina a significar que há um efeito bactericida e/ou bacteriostático e/ou fungicida e/ou fungistático e/ou virucida, em que o termo "bactericida" deve ser entendido como capaz de matar células bacterianas. O termo "bacteriostático" deve ser entendido como capaz de inibir o crescimento bacteriano, isto é, inibição do crescimento de células bacterianas. O termo "fungicida" deve ser entendido como capaz de matar células fungicas. O termo "fungistático" deve ser entendido como capaz de inibir o crescimento füngico, isto é, inibição de crescimento de células fungicas. O termo "virucida" deve ser entendido como capaz de inativar vírus. O termo "células microbianas" denota células bacterianas ou fungicas (incluindo levedos).

No contexto da presente invenção, o termo "inibição de crescimento de células microbianas" se destina a significar que as células estão no estado de não-crescimento, isto é, elas não são capazes de propagar.

Para fins da presente invenção, atividade antimicrobiana pode ser determinada de acordo com o procedimento descrito por Lehrer e colaboradores, Journal of Immunological Methods, Vol. 137 (2) páginas 167-174 (1991). Alternativamente, atividade antimicrobiana pode ser determinada de acordo com as diretrizes NCCLS do CLSI (Clinicai and Laboratory Standards Institute; formalmente conhecido como National Committee for Clinicai and Laboratory Standards).

Polipeptídeos tendo atividade antimicrobiana podem ser capazes de redução do número de células vivas de Escherichia coli (DSM 1576) para 1/100 após 24 horas (de preferência após 12 horas, mais preferivelmente após 8 horas, mais preferivelmente após 4 horas, mais preferivelmente após 2 horas, ainda mais preferivelmente após 1 hora e, em particular, após 30 minutos) de incubação a 20 °C em uma solução aquosa de 25% (peso/peso); de preferência, em uma solução aquosa de 10% (peso/peso); mais preferivelmente, em uma solução aquosa de 5% (peso/peso); ainda mais preferivelmente, em uma solução aquosa de 1% (peso/peso); ainda mais preferivelmente, em uma solução aquosa de 0,5% (peso/peso); e, em particular, em uma solução aquosa de 0,1% (peso/peso) dos polipeptídeos tendo atividade antimicrobiana.

Polipeptídeos tendo atividade antimicrobiana também podem ser capazes de inibição do crescimento de Escherichia coli (DSM 1576) durante 24 horas a 25 °C em um substrato de crescimento microbiano, quando adicionados em uma concentração de 1000 ppm; de preferência, quando adicionados em uma concentração de 500 ppm; mais preferivelmente, quando adicionados em uma concentração de 250 ppm; ainda mais preferivelmente, quando adicionados em uma concentração de 100 ppm; ainda mais preferivelmente, quando adicionados em uma concentração de 50 ppm; e, em particular, quando adicionados em uma concentração de 25 ppm.

Polipeptídeos tendo atividade antimicrobiana podem ser capazes de redução do número de células vivas de Bacillus subtilis (ATCC 6633) para 1/100 após 24 horas (de preferência após 12 horas, mais preferivelmente após 8 horas, mais preferivelmente após 4 horas, mais preferivelmente após 2 horas, ainda mais preferivelmente após 1 hora e, em particular, após 30 minutos) de incubação a 20 °C em uma solução aquosa de 25% (peso/peso); de preferência, em uma solução aquosa de 10% (peso/peso); mais preferivelmente, em uma solução aquosa de 5% (peso/peso); ainda mais preferivelmente, em uma solução aquosa de 1% (peso/peso); ainda mais preferivelmente, em uma solução aquosa de 0,5% (peso/peso); e, em particular, em uma solução aquosa de 0,1% (peso/peso) dos polipeptídeos tendo atividade antimicrobiana.

Polipeptídeos tendo atividade antimicrobiana também podem ser capazes de inibição do crescimento de Baeillus subtilis (ATCC 6633) durante 24 horas a 25 0C em um substrato de crescimento microbiano, quando adicionados em uma concentração de 1000 ppm; de preferência, quando adicionados em uma concentração de 500 ppm; mais preferivelmente, quando adicionados em uma concentração de 250 ppm; ainda mais preferivelmente, quando adicionados em uma concentração de 100 ppm; ainda mais preferivelmente, quando adicionados em uma concentração de 50 ppm; e, em particular, quando adicionados em uma concentração de 25 ppm.

Os polipeptídeos da presente invenção têm pelo menos 20%, de preferência pelo menos 40%, mais preferivelmente pelo menos 50%, mais preferivelmente pelo menos 60%, mais preferivelmente pelo menos 70%, mais preferivelmente pelo menos 80%, ainda mais preferivelmente pelo menos 90%, ainda mais preferivelmente pelo menos 95% e, ainda mais preferivelmente, pelo menos 100% da atividade antimicrobiana do polipeptídeo consistindo da seqüência de aminoácido mostrada como aminoácidos 1 a 40 de qualquer uma de SEQ ID NO: 3 a SEQ ID NO: 225 ou qualquer uma de SEQ ID NO: 226 a SEQ ID NO: 251 ou qualquer uma de SEQ ID NO: 252 a SEQ ID NO:274.

Defensina: O termo "defensina", conforme usado aqui, se refere a polipeptídeos reconhecidos por uma pessoa habilitada na técnica como pertencendo à classe defensina de peptídeos antimicrobianos. Para determinar se um polipeptídeo é uma defensina de acordo com a invenção, a seqüência de aminoácido é, de preferência, comparada com os perfis do modelo de Markov ocultos (perfis HMM) do banco de dados PFAM através de uso do pacote de software HMMER gratuitamente disponível (veja Exemplo 7).

As famílias defensina no PFAM incluem Defensina_l ou "Defensina de mamífero" (no. de acesso PF00323), Defensina_2 ou "Defensina de artrópode" (no. de acesso PFO1097), Defensina beta ou "Beta defensina" (no. de acesso PF00711), Defensina_propep ou "Pró-peptídeo de defensina" (no. de acesso PF00879) e Gama-tionina ou "Família das gama-tioninas" (no. de acesso PF00304). As defensinas podem pertencem à classe da alfa-defensina, à classe da beta-defensina, à classe da teta-defensina, às classes de defensina de inseto ou artrópode ou à classe de defensina de planta. Em uma modalidade, a seqüência de aminoácido de uma defensina de acordo com a invenção compreende 4, 5, 6, 7 ou 8 resíduos de cisteína, de preferência 4, 5 ou 6 resíduos de cisteína, mais preferivelmente 4 ou 6 resíduos de cisteína e, ainda mais preferivelmente, 6 resíduos de cisteína.

As defensinas também podem ser defensinas sintéticas compartilhando os aspectos característicos de qualquer uma das classes de defensina.

Exemplos de tais defensinas incluem, mas não estão limitados a, α-Defensina HNP-I (peptídeo de neutrófilo humano) HNP-2 e HNP-3; β-Defensina-12, Drosomicina, Heliomicina, γΐ-purotionina, Defensina A de inseto e as defensinas divulgadas nos pedidos PCT WO 99/53053, WO 02/06324, WO 02/085934, PCT/DK2005/000725, PCT/DK2005/000735 e PCT/DK2006/000155.

Polipeptídeo Isolado. O termo "polipeptídeo isolado", conforme usado aqui, se refere a um polipeptídeo o qual é pelo menos 20% puro, de preferência pelo menos 40% puro, mais preferivelmente pelo menos 60% puro, ainda mais preferivelmente pelo menos 80%, ainda mais preferivelmente pelo menos 90% puro e, ainda mais preferivelmente, pelo menos 95% puro, conforme determinado através de SDS-PAGE.

Polipeptídeo Substancialmente Puro: O termo "polipeptídeo substancialmente puro" denota aqui um preparado de polipeptídeo o qual contém no máximo 10%, de preferência no máximo 8%, mais preferivelmente no máximo 6%, mais preferivelmente no máximo 5%, mais preferivelmente no máximo 4%, no máximo 3%, ainda mais preferivelmente no máximo 2%, ainda mais preferivelmente no máximo 1% e, ainda mais preferivelmente, no máximo 0,5% em peso de outro material polipeptídeos com o qual ele está nativamente associado. Portanto, é preferido que o polipeptídeo substancialmente puro seja pelo menos 92% puro, de preferência pelo menos 94% puro, mais preferivelmente pelo menos 95% puro, mais preferivelmente pelo menos 96% puro, mais preferivelmente pelo menos 96% puro, mais preferivelmente pelo menos 97% puro, mais preferivelmente pelo menos 98% puro, ainda mais preferivelmente pelo menos 99%, ainda mais preferivelmente pelo menos 99,5% puro e, ainda mais preferivelmente, 100% puro em peso do material polipeptídico total presente no preparado.

Os polipeptídeos da presente invenção estão, de preferência, em uma forma substancialmente pura. Em particular, é preferido que os polipeptídeos estejam em uma "forma essencialmente pura", isto é, que o preparado de polipeptídeo seja essencialmente livre de outro material polipeptídico com o qual ele é nativamente associado. Isso pode ser obtido, por exemplo, através de preparo do polipeptídeo por meio de métodos recombinantes bem conhecidos ou métodos clássicos de purificação.

Aqui, o termo "polipeptídeo substancialmente puro" é sinônimo dos termos "polipeptídeo isolado" e "polipeptídeo na forma isolada".

Variante. O termo "variante" é definido aqui como um polipeptídeo antimicrobiano compreendendo uma ou mais alterações, tais como substituições, inserções, deleções e/ou truncamentos de um ou mais resíduos de aminoácido específicos em uma ou mais posições específicas no polipeptídeo.

Numeração de Variantes. Na presente invenção, uma numeração específica de posições de resíduo de aminoácido nas variantes de polipeptídeo antimicrobiano é empregada. Por exemplo, através de alinhamento das seqüências de aminoácido de polipeptídeos antimicrobianos conhecidos, é possível designar um número de posição de aminoácido a qualquer resíduo de aminoácido em qualquer polipeptídeo antimicrobiano. Usando o sistema de numeração originário da seqüência de aminoácido do polipeptídeo antimicrobiano divulgado em SEQ ID NO: 1, alinhada com a seqüência de uma série de outros polipeptídeos antimicrobianos, é possível indicar a posição de um resíduo de aminoácido em um polipeptídeo antimicrobiano em regiões de homologia estrutural.

Múltiplos alinhamentos de seqüências de proteína podem ser feitos, por exemplo, usando "Clustal W" (Thompson, J. D., Higgins, D.G. e Gibson, T.J., 1994, CLUSTAL W: Improving the sensitivity of progressive multiple sequence alignment through sequence weighting, positions-specific gap penalties and weight matrix choice, Nucleic Acids Research 22: 4673-4680). Múltiplos alinhamentos de seqüências de DNA podem ser feitos usando o alinhamento de proteína como um modelo, substituindo os aminoácidos pelo códon correspondente da seqüência de DNA.

Algoritmos de comparação de seqüência em pares em uso comum são adequados para detectar similaridades entre seqüências de proteína que não divergiram além do ponto de aproximadamente 20-30% de identidade de seqüência (Doolittle, 1992, Protein Sei. 1: 191-200; Brenner e colaboradores, 1998, Proc. Natl. Acad. Sei. USA 95, 6073-6078). Contudo, proteínas verdadeiramente homólogas com a mesma dobra e função biológica similar freqüentemente têm divergido até o ponto onde comparação seqüência-baseada tradicional falha em detectar sua relação (Lindahl e Elofsson, 2000, J. Mol. Biol. 295: 613-615). Maior sensibilidade em busca seqüência-baseada pode ser obtida usando programas de busca que utilizam representações probabilísticas de famílias de proteínas (perfis) para buscar em bancos de dados. Por exemplo, o programa PSI-BLAST gera perfis através de um processo de busca em bancos de dados iterativo e é capaz de detecção de homólogos remotos (Atschul e colaboradores, 1997, Nueleie Aeids Res. 25: 3389-3402). Sensibilidade ainda maior pode ser obtida se a família ou superfamília para a proteína de interesse tem um ou mais representantes nos bancos de dados de estrutura de proteína. Programas tal como GenTHREADER (Jones 1999, J. Mol. Biol. 287: 797-815; McGuffin e Jones, 2003, Bioinformatics 19: 874-881) utilizam informação de uma variedade de fontes (PSI-BLAST, previsão de estrutura secundária, perfis de alinhamento estrutural e potenciais de solvatação) como uma entrada em uma rede neural que prevê a dobra estrutural para uma seqüência de busca. Similarmente, o método de Gough e colaboradores, 2000, J. Mol. Biol. 313: 903-919, pode ser usado para alinhar uma seqüência de estrutura desconhecida com os modelos de superfamília presentes no banco de dados SCOP. Esses alinhamentos, por sua vez, podem ser usados para gerar modelos de homologia para a proteína de interesse e tais modelos podem ser avaliados com relação à precisão usando uma variedade de ferramentas desenvolvidas para essa finalidade.

Para proteínas de estrutura conhecida, várias ferramentas e recursos estão disponíveis para recuperação e geração de alinhamentos estruturais. Por exemplo, as superfamílias SCOP de proteínas foram estruturalmente alinhadas e esses alinhamentos são acessíveis e passíveis de download. Esses alinhamentos podem ser usados para prever os resíduos de aminoácido estrutural e funcionalmente correspondentes em proteínas dentro da mesma superfamília estrutural. Essa informação, junto com informação derivada de modelamento de homologia e buscas de perfil, pode ser usada para prever em quais resíduos realizar mutação quando movendo mutações de interesse de uma proteína para um homólogo íntimo ou remoto.

Na descrição de diversas variantes de polipeptídeo antimicrobiano da presente invenção, a nomenclatura descrita abaixo é adaptada para facilidade de referência. Em todos os casos, a abreviação aceita de aminoácido com uma única letra ou com três letras da IUPAC é empregada.

Para uma substituição de aminoácido, a seguinte nomenclatura é usada: aminoácido original, posição, aminoácido(s) substituído(s). Conseqüentemente, a substituição de treonina por alanina na posição 226 é designada como "T226A"; e substituição de tirosina por tirosina e arginina na posição 40 (efetivamente adicionando arginina após tirosina) é designada como "Y40YR". Múltiplas mutações são separadas através da adição de marcas ("+"), por exemplo, "G205R + S411F", representando mutações em posições 205 e 411 substituindo glicina (G) por arginina (R) e serina (S) por fenilalanina (F), respectivamente.

Polipeptídeo Antimicrobiano Precursor: O termo polipeptídeo antimicrobiano "precursor", conforme usado aqui, significa um polipeptídeo antimicrobiano no qual modificações, por exemplo, substituição(ões), inserção(ões), deleção(ões) e/ou truncamento(s), são feitas para produzir as variantes de polipeptídeo antimicrobiano da presente invenção. Esse termo também se refere ao polipeptídeo com o qual uma variante é comparada e alinhada. O precursor pode ser um polipeptídeo que ocorre naturalmente (tipo selvagem) ou pode mesmo ser uma variante do mesmo, preparado através de qualquer meio adequado. Por exemplo, a proteína precursora pode ser uma variante de um polipeptídeo que ocorre naturalmente o qual tenha sido modificado ou alterado na seqüência de aminoácido. Um precursor também pode ser uma variante alélica a qual é um polipeptídeo codificado por qualquer uma de duas ou mais formas alternativas de um gene que ocupa o mesmo locus cromossômico.

Identidade: A relação entre duas seqüências de aminoácido ou entre duas seqüências de nucleotídeo é descrita pelo parâmetro "identidade".

Para fins da presente invenção, o grau de identidade entre duas seqüências de aminoácido é determinado através de uso do programa FASTA incluído na versão 2.Ox do pacote de programa FASTA (veja W. R. Pearson e D. J. Lipman (1988), "Improved Tools for Biological Sequence Analysis", PNAS 85: 2444-2448; e W. R. Pearson (1990) "Rapid and Sensitive Sequence Comparison with FASTP and FASTA", Methods in Enzymology 183: 63-98). A matriz de escore usada foi BLOSUM50, penalidade por gap foi de -12 e penalidade por extensão de gap foi de -2.

O grau de identidade entre duas seqüências de nucleotídeo é determinado usando o mesmo algoritmo e pacote de software conforme descrito acima. A matriz de escore usada foi a matriz de identidade, penalidade por gap foi de -16 e penalidade por extensão de gap foi de -4.

Alternativamente, um alinhamento de duas seqüências de aminoácido é determinada através de uso do programa de Needle do pacote EMBOSS (http ://emboss. org) versão 2.8.0. O programa de Needle implementa o algoritmo de alinhamento global descrito em Needleman, S. B. e Wunsch, C. D. (1970) J. Mol BioL 48, 443-453. A matriz de substituição usada é BLOSUM62, penalidade por abertura de gap é 10 e penalidade por extensão de gap é 0,5. O grau de identidade entre uma seqüência de aminoácido da presente invenção (tal como aminoácidos 1 a 40 de SEQ ID NO: 1) e uma seqüência de aminoácido diferente é calculado como o número de combinações exatas em um alinhamento das duas seqüências, dividido pelo comprimento (número de resíduos de aminoácido) da seqüência da presente invenção; ou, alternativamente, o produto de Needle designado "identidade mais longa" é usado como a identidade percentual e é calculado como segue: (resíduos Idênticos χ 100)/(Comprimento de Alinhamento -Número de Gaps no Alinhamento). O resultado é expresso em identidade percentual.

Fragmento de Polipeptídeo: O termo "fragmento de polipeptídeo" é definido aqui como um polipeptídeo tendo um ou mais aminoácidos deletados do amino e/ou carbóxi término de SEQ ID NO: 2 ou uma seqüência homóloga à mesma, em que o fragmento tem atividade antimicrobiano.

Sub-seqüência: O termo "sub-seqüência" é definido aqui como uma seqüência de nucleotídeo tendo um ou mais nucleotídeos deletados da extremidade 5' e/ou 3' de SEQ ID NO: 1 ou uma seqüência homóloga à mesma, em que a sub-seqüência codifica um fragmento de polipeptídeo tendo atividade antimicrobiano.

Variante Alélica: O termo "variante alélica" denota aqui qualquer uma de duas ou mais formas alternativas de um gene que ocupa o mesmo locus cromossômico. Variação alélica surge naturalmente através de mutação e pode resultar em polimorfismo dentro de populações. Mutações de gene podem ser silenciosas (nenhuma alteração no polipeptídeo codificado) ou podem codificar polipeptídeos tendo seqüências de aminoácido alteradas.

Uma variante alélica de um polipeptídeo é um polipeptídeo codificado por uma variante alélica de um gene. Polinucleotídeo Substancialmente Puro: O termo "polinucleotídeo substancialmente puro", conforme usado aqui, se refere a um preparado de polinucleotídeo livre de outros nucleotídeos estranhos ou indesejados e em uma forma adequada para uso dentro de sistemas de produção de proteína geneticamente manipulados. Assim, um polinucleotídeo substancialmente puro contém no máximo 10%, de preferência no máximo 8%, mais preferivelmente no máximo 6%, mais preferivelmente no máximo 5%, mais preferivelmente no máximo 4%, mais preferivelmente no máximo 3%, ainda mais preferivelmente no máximo 2%, ainda mais preferivelmente no máximo 1% e, ainda mais preferivelmente, no máximo 0,5% em peso de outro material de polinucleotídeo com o qual ele está nativamente associado. Um polinucleotídeo substancialmente puro pode, contudo, incluir regiões não traduzidas 5' e 3' que ocorrem naturalmente, tais como promotores e terminadores. E preferido que o polinucleotídeo substancialmente puro seja pelo menos 90% puro, de preferência pelo menos 92% puro, mais preferivelmente pelo menos 94% puro, mais preferivelmente pelo menos 95% puro, mais preferivelmente pelo menos 96% puro, mais preferivelmente pelo menos 97% puro, ainda mais preferivelmente pelo menos 98% puro, ainda mais preferivelmente pelo menos 99% e, ainda mais preferivelmente, pelo menos 99,5% puro em peso. Os polinucleotídeos da presente invenção estão, de preferência, em uma forma substancialmente pura. Em particular, é preferido que os polinucleotídeos divulgados aqui estejam em uma "forma essencialmente pura", isto é, que o preparado de polinucleotídeo seja essencialmente livre de outro material de polinucleotídeo com o qual ele está nativamente associado. Aqui, o termo "polinucleotídeo substancialmente puro" é sinônimo dos termos "polinucleotídeo isolado" e "polinucleotídeo na forma isolada". Os polinucleotídeos podem ser de origem genômica, cDNA, RNA, semi-sintéticos, sintéticos ou quaisquer combinações dos mesmos.

cDNA: O termo "cDNA" é definido aqui como uma molécula de DNA a qual pode ser preparada através de transcrição reversa a partir de uma molécula de mRNA madura, unida, obtida de uma célula eucariota. CDNA carece de seqüências de íntron que estão usualmente presentes no DNA genômico correspondente. O transcrito de RNA inicial primário é um precursor ao mRNA, o qual é processado através de uma série de etapas antes de aparecer como mRNA unido maduro. Essas etapas incluem a remoção de seqüências de íntron através de um processo denominado união. CDNA derivado de mRNA carece, portanto, de quaisquer seqüências de íntron.

Construção de ácido nucleico: O termo "construção de ácido nucleico", conforme usado aqui, se refere a uma molécula de ácido nucleico, quer fita simples ou dupla, a qual é isolada de um gene que ocorre naturalmente ou a qual é modificada para conter segmentos de ácidos nucleicos de uma maneira que, de outro modo, não existiria na natureza. O termo construção de ácido nucleico é sinônimo do termo "cassete de expressão" quando a construção de ácido nucleico contém as seqüências de controle requeridas para expressão de uma seqüência de codificação da presente invenção.

Seqüência de Controle: O termo "seqüências de controle" é definido aqui para incluir todos os componentes os quais são necessários ou vantajosos para a expressão de um polinucleotídeo que codifica um polipeptídeo da presente invenção. Cada seqüência de controle pode ser nativa ou estranha à seqüência de nucleotídeo que codifica o polipeptídeo.

Tais seqüências de controle incluem, mas não estão limitadas a, uma seqüência líder, de poliadenilação, seqüência de pró-peptídeo, promotor, seqüência de peptídeo sinalizador e terminador de transcrição. No mínimo, as seqüências de controle incluem um promotor e sinais de término de transcrição e tradução. As seqüências de controle podem ser fornecidas com ligantes para fins de introdução de sítios de restrição específicos que facilitam a ligação das seqüências de controle com a região de codificação da seqüência de nucleotídeo que codifica um polipeptídeo.

Operavelmente ligado: O termo "operavelmente ligado" denota aqui uma configuração na qual uma seqüência de controle é colocada em uma posição apropriada com relação à seqüência de codificação da seqüência de polinucleotídeo, de modo que a seqüência de controle dirige a expressão da seqüência de codificação de um polipeptídeo.

Seqüência de codificação: Quando usado aqui, o termo "seqüência de codificação" significa uma seqüência de nucleotídeo a qual especifica diretamente a seqüência de aminoácido de seu produto de proteína. Os limites da seqüência de codificação são, em geral, determinados por uma rede de leitura aberta, a qual usualmente começa com o códon inicial ATG ou códons iniciais alternativos, tais como GTG e TTG. A seqüência de codificação pode ser uma seqüência de DNA, cDNA ou de nucleotídeo recombinante.

Expressão: O termo "expressão" inclui qualquer etapa envolvida na produção do polipeptídeo incluindo, mas não limitado a, transcrição, modificação pós-transcricional, tradução, modificação pós-traducional e secreção. Vetor de expressão: O termo "vetor de expressão" é definido aqui como uma molécula de DNA circular ou linear que compreende um polinucleotídeo que codifica um polipeptídeo da invenção e a qual está operavelmente ligada a nucleotídeos adicionais que proporcionam sua expressão.

Célula hospedeira: O termo "célula hospedeira", conforme usado aqui, inclui qualquer tipo de célula o qual é suscetível à transformação, transfecção, transdução e semelhantes com uma construção de ácido nucleico compreendendo um polinucleotídeo da presente invenção.

Modificação: O termo "modificação" significa aqui qualquer modificação química do polipeptídeo consistindo de aminoácidos 1 a 40 de qualquer uma de SEQ ID NO: 2 a SEQ ID NO: 225 ou qualquer uma de SEQ ID NO: 226 a SEQ ID NO: 251 ou qualquer uma de SEQ ID NO: 252 a SEQ ID NO: 274, bem como manipulação genética do DNA que codifica esse 15 polipeptídeo. A(s) modificação(ões) pode(m) ser substituição(ões), deleção(ões) e/ou inserção(ões) do(s) aminoácido(s), bem como substituição(ões) de cadeia(s) lateral(is) de aminoácido; ou uso de aminoácidos não naturais com características similares na seqüência de aminoácido. Em particular, a(s) modificação(ões) pode(m) ser amidações, tal 20 como amidação do C-término.

DESCRIÇÃO DETALHADA DA INVENÇÃO

Polipeptídeos Tendo Atividade Antimicrobiana

Em um primeiro aspecto, a presente invenção proporciona um polipeptídeo tendo atividade antimicrobiana o qual compreende, de preferência consiste de, uma seqüência de aminoácido a qual tem pelo menos 70% de identidade (de preferência pelo menos 80% de identidade, mais preferivelmente pelo menos 85% de identidade, ainda mais preferivelmente pelo menos 90% de identidade, ainda mais preferivelmente pelo menos 95% de identidade, ainda mais preferivelmente 97% de identidade e, em particular, 100% de identidade) com aminoácidos 1 a 40 da seqüência de aminoácido (I):

G-X1-G-C-X2-X3-X4-X5-X6-X7-X8-Xp-Xio-Xii-C-H-X12-X13-C-X14-Xi5-Xi6-X17-X18-X19-X2o-G-G-X21-C-X22-X23-X24-X25-X26-X27-C-X28-C-X29;

em que

X1 = F, L, W ou I; de preferência, X1 = F;

X3 = G, R, A ou K; de preferência, X3 = G;

X4 = P, A, L, V, K ou R; de preferência, X4 = Ρ, K ou R;

X5 = WouR;

Χ7 = E, G, A, L, C, Q ou S; de preferência, X7 = E, G ou S;

X9 = D ou P; de preferência, X9 = D; X10 = M, R, S, V, A, F, G, L, Τ, Y, W, E ou K; de preferência, X10 = M, R, S, V, G, Y, L, F, T, W ou K;

X11 = Q, R, L, F, G, H, S, A, C, I, Κ, Μ, Ρ, Τ, V, W ou Y; de preferência, X11 = Q5 R, L, F, G, H, S, K ou Y;

X12 = N, R, I, Υ, V, Κ, T, Q, S, F, A, W, E ou H;

X13 = H, A, F, Q, Τ, V ou L; de preferência, X13 = H ou L;

X14 = K, Q ou R; de preferência,

X14 = K ou R;

X15 = S, A, V, N ou F;

X16 = I, L, Μ, T, W ou V; de preferência, X16 = I, L ou V;

X17 = Κ, T ou R;

X18 = G, Η, Κ, A, P, F, I, Q, R, S, Τ, Y ou N; de preferência, X18 = G, H, R5KouN;

X19 = Υ, Η, K, L, Μ, N, Q, S, V ou R; de preferência, X19 = Y ou R;

Χ20 = Κ, F, Η, Τ, C ou R; de preferência, Χ2ο = K ou R; X21 = Υ, F, R, A, Η, L, Μ, S ou W; de preferência, X21 = Y, F,

Rou W;

X22 = A, Κ, N, Q, Τ, Ε, Η, I, R, S, V, G ou Y; de preferência, X22 = A, Κ, N, Q, T, S ou Y;

X23 = K, R ou T; de preferência, X23 = K ou R;

X24 = G, K, Q, Ε, N, S, Τ, A ou R; de preferência, X24 = G, K, Q, A ou R;

X25 = G, Κ, H, W ou R; de preferência, X25 = G, K ou R;

X26 = F, A, Η, I, Μ, V, W, R ou L; de preferência, X26 = F ou L;

X27 = V, L, Μ, I, K, Q, R ou T; de preferência, X27 = V, L, M ou T;

X2g = Κ, Η, N ou R; de preferência, X28 = K ou R;

X29 = Υ, I, YRCG ou YR; de preferência, X29 = Y ou YR; e a qual tem menos de 100% de identidade com aminoácidos 1 a 40 de SEQ ID NO: 1.

Em uma modalidade, o polipeptídeo da invenção é um 20 polipeptídeo tendo atividade antimicrobiana o qual compreende, de preferência consiste de, uma seqüência de aminoácido a qual tem pelo menos pelo menos 70% de identidade (de preferência pelo menos 80% de identidade, mais preferivelmente pelo menos 85% de identidade, ainda mais preferivelmente pelo menos 90% de identidade, ainda mais preferivelmente 25 pelo menos 95% de identidade, ainda mais preferivelmente 97% de identidade e, em particular, 100% de identidade) com aminoácidos 1 a 40 da seqüência de aminoácido (II):

G-F -G-C-X \ -G-X2-X3 -X4-X5-X6-D-X7-X8-C-H-X9-X 10 Q-C-X 10 X11 -X12-X-13-X-14-X-15-X- 16-G-G-X17 -C-X- 18-K-X19-X20-X21 -X22-C-K-C-X23; em que

X1 = Ν, R, Q, V, G, S5 A, K ou Y; de preferência, X1 = N, R, S ou G;

X2 = Ρ, K ou R;

X3 = W ou R;

X4 = D, A, G, K, L, Τ, N, F, Η, Μ, P, Q, S, V ou Y; de preferência, X4 = D, S, A, G ou N;

X5 = E, G ou S;

X6 = D, F, G, Ν, V, Υ, Η, K, L, P, S, T, W, I, M ou R; de preferência,

X6 = D, G ou N;

X7 = M, R, S, V, G, Y, L, F, T, W ou K; de preferência, X7 = M, L, G ou V;

X8 = Q, R, L, F, G, H, S, K ou Y; de preferência, X8 = Q, K, R ou F;

X9 = N, R, I1 Υ, V, Κ, T, S, Q ou H; de preferência, X9 = N, R, V ou Q;

X10 — H ou L;

X10 = K ou R;

X12 = 1, L ou V;

X13 = K ou R;

X14 = G, H, R, K ou N; de preferência, X14 = G ou R;

X15 = You R;

X16 = K ou R;

X17 = Y, F, R ou W;

X18 = A, Κ, N, Q, T, S ou Y; de

preferência,

X18 = A, S ou T;

X19 = G, K, Q, A ou R; de preferência, X19 = G ou A;

X20 = G, K ou R; X21 = F ou L; X22 = V, L, M ou Τ; de preferência, X22 = V ou L;

X23 = Y ou YR;

e a qual tem menos de 100% de identidade com aminoácidos 1 a 40 de SEQ ID NO: 1.

Em outra modalidade, a seqüência de aminoácido (I) e/ou (II) tem 1, 2, 3, 4, 5, 6, 7 ou 8 diferenças de aminoácido comparado com a seqüência de aminoácido de SEQ ID NO: 1. De preferência, 1, 2, 3, 4, 5 ou 6; mais preferivelmente 1, 2, 3, 4 ou 5; ainda mais preferivelmente 1, 2, 3 ou 4; ainda mais preferivelmente 1, 2 ou 3; e, ainda mais preferivelmente, 1 ou 2 aminoácidos são diferentes comparado com a seqüência de aminoácido de SEQ ID NO: 1.

Em outra modalidade, a seqüência de aminoácido (I) e/ou (II) tem pelo menos 60% de identidade com aminoácidos 1 a 40 de SEQ ID NO: 1, de preferência pelo menos 65% de identidade, pelo menos 70% de identidade, pelo menos 75% de identidade, pelo menos 80% de identidade, pelo menos 85% de identidade, pelo menos 90% de identidade ou pelo menos 95% de identidade com aminoácidos 1 a 40 de SEQ ID NO: 1.

Em outra modalidade, a seqüência de aminoácido (I) e/ou (II) tem 0, 1, 2, 3, 4 ou 5 inserções, de preferência 0, 1, 2 ou 3 inserções, mais preferivelmente, 0, 1 ou 2 inserções; e 0, 1, 2, 3, 4 ou 5 deleções, de preferência 0, 1, 2 ou 3 deleções, mais preferivelmente 0, 1 ou 2 deleções, quando comparado à SEQ ID NO: 1 ou qualquer uma de SEQ ID NO: 3 a SEQ ID NO: 225 ou qualquer uma de SEQ ID NO: 226 a SEQ ID NO: 251 ou qualquer uma de SEQ ID NO: 252 a SEQID NO: 274.

Em outra modalidade, o polipeptídeo da invenção compreende, de preferência consiste de, uma seqüência de aminoácido a qual tem pelo menos 60% de identidade (de preferência 70% de identidade, mais preferivelmente 80% de identidade, ainda mais preferivelmente 85% de identidade, ainda mais preferivelmente 90% de identidade, ainda mais preferivelmente 95% de identidade e, ainda mais preferivelmente, 100% de identidade) com aminoácidos 1 a 40 de qualquer uma de SEQ ID NO: 3 a SEQ ID NO: 225 ou qualquer uma de SEQ ID NO: 226 a SEQ ID NO: 251 ou qualquer uma de SEQ ID NO: 252 a SEQ ID NO: 274, de preferência 5 qualquer uma de SEQ ID NO: 3 a SEQ ID NO: 117 ou qualquer uma de SEQ ID NO: 226 a SEQ ID NO: 251 ou qualquer uma de SEQ ID NO: 252 a SEQ ID NO: 274.

O termo "qualquer uma de SEQ ID NO: 3 a SEQ ID NO: 117" se destina a significar SEQ ID NO: 3, SEQ ID NO: 4, SEQ ID NO: 5, SEQ ID 10 NO: 6, SEQ ID NO: 7, SEQ ID NO: 8, SEQ ID NO: 9, SEQ ID NO: 10, SEQ ID NO: 11, SEQ ID NO: 12, SEQ ID NO: 13, SEQ ID NO: 14, SEQ ID NO: 15, SEQ ID NO: 16, SEQ ID NO: 17, SEQ ID NO: 18, SEQ ID NO: 19, SEQ ID NO: 20, SEQ ID NO: 21, SEQ ID NO: 22, SEQ ID NO: 23, SEQ ID NO: 24, SEQ ID NO: 25, SEQ ID NO: 26, SEQ ID NO: 27, SEQ ID NO: 28, SEQ 15 ID NO: 29, SEQ ID NO: 30, SEQ ID NO: 31, SEQ ID NO: 32, SEQ ID NO: 33, SEQ ID NO: 34, SEQ ID NO: 35, SEQ ID NO: 36, SEQ ID NO: 37, SEQ ID NO: 38, SEQ ID NO: 39, SEQ ID NO: 40, SEQ ID NO: 41, SEQ ID NO: 42, SEQ ID NO: 43, SEQ ID NO: 44, SEQ ID NO: 45, SEQ ID NO: 46, SEQ ID NO: 47, SEQ ID NO: 48, SEQ ID NO: 49, SEQ ID NO: 50, SEQ ID NO: 20 51, SEQ ID NO: 52, SEQ ID NO: 53, SEQ ID NO: 54, SEQ ID NO: 55, SEQ ID NO: 56, SEQ ID NO: 57, SEQ ID NO: 58, SEQ ID NO: 59, SEQ ID NO: 60, SEQ ID NO: 61, SEQ ID NO: 62, SEQ ID NO: 63, SEQ ID NO: 64, SEQ ID NO: 65, SEQ ID NO: 66, SEQ ID NO: 67, SEQ ID NO: 68, SEQ ID NO: 69, SEQ ID NO: 70, SEQ ID NO: 71, SEQ ID NO: 72, SEQ ID NO: 73, SEQ 25 ID NO: 74, SEQ ID NO: 75, SEQ ID NO: 76, SEQ ID NO: 77, SEQ ID NO: 78, SEQ ID NO: 79, SEQ ID NO: 80, SEQ ID NO: 81, SEQ ID NO: 82, SEQ ID NO: 83, SEQ ID NO: 84, SEQ ID NO: 85, SEQ ID NO: 86, SEQ ID NO: 87, SEQ ID NO: 88, SEQ ID NO: 89, SEQ ID NO: 90, SEQ ID NO: 91, SEQ ID NO: 92, SEQ ID NO: 93, SEQ ID NO: 94, SEQ ID NO: 95, SEQ ID NO: 96, SEQ ID NO: 97, SEQ ID NO: 98, SEQ ID NO: 99, SEQ ID NO: 100, SEQ ID NO: 101, SEQ ID NO: 102, SEQ ID NO: 103, SEQ ID NO: 104, SEQ ID NO: 105, SEQ ID NO: 106, SEQ ID NO: 107, SEQ ID NO: 108, SEQ ID NO: 109, SEQ ID NO: 110, SEQ ID NO: 111, SEQ ID NO: 112, SEQ ID NO: 113, SEQ ID NO: 114, SEQ ID NO: 115, SEQ ID NO: 116 ou SEQ ID NO: 117.

O termo "qualquer uma de SEQ ID NO: 118 a SEQ ID NO 225" se destina a significar qualquer uma de SEQ ID NO 118, SEQID NO: 119, SEQ ID NO: 120, SEQ ID NO: 121, SEQ ID NO: 122, SEQ ID NO: 123, SEQ ID NO: 124, SEQ ID NO: 125, SEQ ID NO: 126, SEQ ID NO: 127, SEQ ID NO: 128, SEQ ID NO: 129, SEQ ID NO: 130, SEQ ID NO: 131, SEQ ID NO: 132, SEQ ID NO: 133, SEQ ID NO: 134, SEQ ID NO: 135, SEQ ID NO: 136, SEQ ID NO: 137, SEQ ID NO: 138, SEQ ID NO: 139, SEQ ID NO: 140, SEQ ID NO: 141, SEQ ID NO: 142, SEQ ID NO: 143, SEQ ID NO: 144, SEQ ID NO: 145, SEQ ID NO: 146, SEQ ID NO: 147, SEQ ID NO: 148, SEQ ID NO: 149, SEQ ID NO: 150, SEQ ID NO: 151, SEQ ID NO: 152, SEQ ID NO: 153, SEQ ID NO: 154, SEQ ID NO: 155, SEQ ID NO: 156, SEQ ID NO: 157, SEQ ID NO: 158, SEQ ID NO: 159, SEQ ID NO: 160, SEQ ID NO: 161, SEQ ID NO: 162, SEQ ID NO: 163, SEQ ID NO: 164, SEQ ID NO: 165, SEQ ID NO: 166, SEQ ID NO: 167, SEQ ID NO: 168, SEQ ID NO: 169, SEQ ID NO: 170, SEQ ID NO: 171, SEQ ID NO: 172, SEQ ID NO: 173, SEQ ID NO: 174, SEQ ID NO: 175, SEQ ID NO: 176, SEQ ID NO: 177, SEQ ID NO: 178, SEQ ID NO: 179, SEQ ID NO: 180, SEQ ID NO: 181, SEQ ID NO: 182, SEQ ID NO: 183, SEQ ID NO: 184, SEQ ID NO: 185, SEQ ID NO: 186, SEQ ID NO: 187, SEQ ID NO: 188, SEQ ID NO: 189, SEQ ID NO: 190, SEQ ID NO: 191, SEQ ID NO: 192, SEQ ID NO: 193, SEQ ID NO: 194, SEQ ID NO: 195, SEQ ID NO: 196, SEQ ID NO: 197, SEQ ID NO: 198, SEQ ID NO: 199, SEQ ID NO: 200, SEQ ID NO: 201, SEQ ID NO: 202, SEQ ID NO: 203, SEQ ID NO: 204, SEQ ID NO: 205, SEQ ID NO: 206, SEQ ID NO: 207, SEQ ID NO: 208, SEQ ID NO: 209, SEQ ID NO: 210, SEQ ID NO: 211, SEQ ID NO: 212, SEQ ID NO: 213, SEQ ID NO: 214, SEQ ID NO: 215, SEQ ID NO: 216, SEQ ID NO: 217, SEQ ID NO: 218, SEQ ID NO: 5 219, SEQ ID NO: 220, SEQ ID NO: 221, SEQ ID NO: 222, SEQ ID NO: 223, SEQ ID NO: 224 ou SEQ ID NO: 225.

O termo "qualquer uma de SEQ ID NO: 226 a SEQ ID NO: 251" se destina a significar qualquer uma de SEQ ID NO: 226, SEQ ID NO: 227, SEQ ID NO: 228, SEQ ID NO: 229, SEQ ID NO: 230, SEQ ID NO: 10 231, SEQ ID NO: 232, SEQ ID NO: 233, SEQ ID NO: 234, SEQ ID NO: 235, SEQ ID NO: 236, SEQ ID NO: 237, SEQ ID NO: 238, SEQ ID NO: 239, SEQ ID NO: 240, SEQ ID NO: 241, SEQ ID NO: 242, SEQ ID NO: 243, SEQ ID NO: 244, SEQ ID NO: 245, SEQ ID NO: 246, SEQ ID NO: 247, SEQ ID NO: 248, SEQ ID NO: 249, SEQ ID NO: 250 ou SEQ ID NO: 15 251.

O termo "qualquer uma de SEQ ID NO: 252 a SEQ ID NO: 274" se destina a significar qualquer uma de SEQ ID NO: 252, SEQ ID NO: 253, SEQ ID NO: 254, SEQ ID NO: 255, SEQ ID NO: 256, SEQ ID NO: 257, SEQ ID NO: 258, SEQ ID NO: 259, SEQ ID NO: 260, SEQ ID NO: 20 261, SEQ ID NO: 262, SEQ ID NO: 263, SEQ ID NO: 264, SEQ ID NO: 265, SEQ ID NO: 266, SEQ ID NO: 267, SEQ ID NO: 268, SEQ ID NO: 269, SEQ ID NO: 270, SEQ ID NO: 271, SEQ ID NO: 272, SEQ ID NO: 273 ou SEQ ID NO: 274.

O termo "qualquer uma de SEQ ID NO: 3 a SEQ ID NO: 225" 25 se destina a significar qualquer uma de SEQ ID NO: 3 a SEQ ID NO: 117 ou qualquer uma de SEQ ID NO: 118 a SEQ ID NO: 225.

O termo "qualquer uma de SEQ ID NO: 2 a SEQ ID NO: 225" se destina a significar SEQ ID NO: 2 ou qualquer uma de SEQ ID NO: 3 a SEQ ID NO: 225. Os aminoácidos que compõem os polipeptídeos da invenção podem ser independentemente selecionados de formas D ou L. De preferência, o polipeptídeo da invenção é um polipeptídeo de defensina; mais preferivelmente, uma alfa defensina, uma beta defensina ou uma defensina de inseto (artrópode).

Os polipeptídeos da invenção podem exibir atividade antimicrobiana superior ou pelo menos igual, de preferência superior, comparado com o polipeptídeo de SEQ ID NO: 1, determinada como a Concentração Inibitória Mínima (MIC), contra Staphylococcus carnosus ATCC51365, Staphylococcus aureus ATCC29213 ou Staphyloeoecus aureus ATCC25923 de acordo com as diretrizes NCCLS / CLSI, protocolo M7-A6, vol. 20, No. 2: Methods for Dilution Antimicrobial Susceptibility Tests for Bactéria That Grow Aerobically.

Em uma modalidade, a presente invenção se refere à variantes artificiais compreendendo uma substituição, deleção e/ou inserção conservativa de um ou mais aminoácidos de SEQ ID NO: 2 a SEQ ID NO: 225 ou qualquer uma de SEQ ID NO: 226 a SEQ ID NO: 251 ou qualquer uma de SEQ ID NO: 252 a SEQ ID NO: 274. De preferência, alterações de aminoácido são de uma natureza mínima, isto é, substituições ou inserções de aminoácido conservativas que não afetam significativamente a duplicação e/ou atividade da proteína; pequenas deleções, tipicamente de um a cerca de 10 aminoácidos; pequenas extensões amino- ou carbóxi-terminais, tal como um resíduo de metionina amino-terminal; um pequeno peptídeo ligante de até cerca de 20-25 resíduos; ou uma pequena extensão que facilita purificação através de alteração da carga líquida ou outra função, tal como um trato de poli-histidina, um epítopo antigênico ou um domínio de ligação.

Exemplos de substituições conservativas estão dentro do grupo de aminoácido básicos (arginina, lisina e histidina), aminoácidos ácidos (ácido glutâmico e ácido aspártico), aminoácidos polares (glutamina e asparagina), aminoácidos hidrofóbicos (leucina, isoleucina e valina), aminoácidos aromáticos (fenilalanina, triptofano e tirosina) e pequenos aminoácidos (glicina, alanina, serina, treonina e metionina). Substituições de aminoácido as quais geralmente não alteram a atividade específica são conhecidas na técnica e são descritas, por exemplo, por H. Neurath e R. L. Hill, 1979, em The Proteins, Academic Press, Nova Iorque. As trocas que ocorrem mais comumente são Ala/Ser, Val/lle, Asp/Glu, Thr/Ser, Ala/Gly, Ala/Thr, Ser/Asn, Ala/Vai, Ser/Gly, Tyr/Phe, Ala/Pro, Lys/Arg, Asp/Asn, Leu/lle, Leu/Vai, Ala/Glu e Asp/Gly.

Além dos 20 aminoácidos padrões, aminoácidos não-padrões (tais como 4-hidróxiprolina, 6-N-metil lisina, ácido 2-aminoisobutírico, isovalina e alfa-metil serina) podem ser substituídos por resíduos de aminoácidos de um polipeptídeo do tipo selvagem. Um número limitado de aminoácidos não-conservativos, aminoácidos que não são codificados pelo código genético e aminoácidos não naturais pode ser substituído por resíduos de aminoácido. "Aminoácidos não naturais" foram modificados após síntese de proteína e/ou têm uma estrutura química, em sua(s) cadeia(s) lateral(is), diferente daquela dos aminoácidos padrões. Aminoácidos não naturais podem ser quimicamente sintetizados e, de preferência, estão comercialmente disponíveis e incluem ácido pipecólico, ácido tiazolidina carboxílico, dehidroprolina, 3- e 4-metilprolina e 3,3-dimetilprolina.

Alternativamente, as alterações de aminoácido são de uma natureza tal que as propriedades físico-químicas dos polipeptídeos são alteradas. Por exemplo, alterações de aminoácido podem melhorar a estabilidade térmica do polipeptídeo, alterar a especificidade do substrato, alterar o pH ótimo e semelhantes.

Aminoácidos essenciais no polipeptídeo precursor podem ser identificados de acordo com procedimentos conhecidos na técnica, tais como mutagênese direcionada por sítio ou mutagênese por exploração de alanina (Cunningham e Wells, 1989, Science 244: 1081-1085). Na última técnica, mutações únicas de alanina são introduzidas em cada resíduo na molécula e as moléculas mutantes resultantes são testadas com relação à atividade biológica (isto é, atividade antimicrobiana) para identificar resíduos de aminoácido que são críticos para a atividade da molécula. Veja também Hilton e colaboradores, 1996, J. Biol. Chem. 271: 4699-4708. A interação biológica também pode ser determinada através de análise física de construção, conforme determinado através de técnicas tais como ressonância magnética nuclear, cristalografia, difração de elétrons ou rotulação por fotoafinidade, em conjunto com mutação de aminoácidos de sítio de contato putativo. Veja, por exemplo, de Vos e colaboradores, 1992, Science 255: 306- 312; Smith e colaboradores, 1992, J. Mol. Biol. 224: 899-904; Wlodaver e colaboradores, 1992, FEBS Lett. 309: 59- 64. As identidades de aminoácidos essenciais também podem ser inferidas a partir de análise de identidades com polipeptídeos os quais estão relacionados a um polipeptídeo de acordo com a invenção.

Uma única ou múltiplas substituições de aminoácido podem ser feitas e testadas usando métodos conhecidos de mutagênese, recombinação e/ou embaralhamento, seguindo por um procedimento de seleção relevante, tal como aqueles divulgados por Reidhaar-Olson e Sauer, 1988, Science 241: 53-57; Bowie e Sauer, 1989, Proc. Natl. Acad. Sei. USA 86: 2152-2156; WO 95/17413; ou WO 95/22625. Outros métodos que podem ser usados incluem PCR propensa a erro, exibição fágica (por exemplo, Lowman e colaboradores, 1991, Biochem. 30: 10832-10837; Patente U.S. No. 5.223.409; WO 92/06204) e mutagênese direcionada por região (Derbyshire e colaboradores, 1986, Gene 46:145; Ner e colaboradores, 1988, DNA 7: 127).

Métodos de mutagênese/embaralhamento podem ser combinados com métodos de seleção automáticos de elevado rendimento para detectar atividade de polipeptídeos clonados com mutação expressos por células hospedeiras. Moléculas de DNA com mutação que codificam polipeptídeos ativos podem ser recuperadas das células hospedeiras e rapidamente seqüenciadas usando métodos padrões na técnica. Esses métodos permitem a determinação rápida da importância de resíduos de aminoácido individuais em um polipeptídeo de interesse e podem ser aplicados a polipeptídeos de estrutura desconhecida.

O número total de substituições, deleções e/ou inserções de aminoácido dos aminoácidos 1 a 40 de qualquer uma de SEQ ID NO: 2 a SEQ ID NO: 225 ou qualquer uma de SEQ ID NO: 226 a SEQ ID NO: 251 ou qualquer uma de SEQ ID NO: 252 a SEQ ID NO: 274 é 10, de preferência 9, mais preferivelmente 8, mais preferivelmente 7, mais preferivelmente no máximo 6, mais preferivelmente no máximo 5, mais preferivelmente 4, ainda mais preferivelmente 3, ainda mais preferivelmente 2 e, ainda mais preferivelmente, 1.

Em outro aspecto, a presente invenção proporciona uma variante de um polipeptídeo antimicrobiano precursor, polipeptídeo antimicrobiano precursor o qual tem pelo menos 60% de identidade com a seqüência de aminoácido de SEQ ID NO: 1, em que a variante tem atividade antimicrobiana e compreende uma substituição em uma ou mais posições e em que as substituições são selecionadas de:

F2L, F2W ou F2I;

N5R, N5Q, N5V, N5G, N5S, N5A, N5K, N5L, N5M, N5D,

N5H ou N5Y;

G6R, G6A ou G6K;

P7A, P7L, P7V, P7K ou P7R;

W8R;

D9A, D9G, D9K, D9L, D9T, D9N, D9F, D9H, D9M, D9P,

D9Q, D9S, D9C, D9I, D9R, D9V ou D9Y;

ElOG, E10A, ElOL, E10C, ElOQ ou E10S; Dl 1F, Dl 1G, Dll Ν, Dl IV, DllΥ, Dll Η, Dll Κ, Dll L, DllP5 Dl 1S, Dl 1Τ, Dl 1W, Dl II, DllM5 Dl ΙΑ, DllC ou Dll R; D12P;

M13R, M13S, M13V, ΜΠΑ, M13F, M13G, M13L, Μ13Τ, Ml3Υ, M13W, Μ13Ε ou Μ13Κ;

Q14R, Q14L, Q14F, Q14G, Q14H, Q14S, Q14A, Q14C, Ql 41, Q14K, Q14M, Q14P, Q14T, Q14V, Q14W ou Q14Y;

N17R, Nl71, Nl7Υ, N17V, Ν17Κ, Ν17Τ, N17S, N17Q, Nl 7F, Nl7Α, N17W, Nl 7Ε ou Nl7Η;

Hl 8Α, Hl 8F, Hl8Q, Hl 8Τ, Hl 8V ou Hl 8L; K20Q ou K20R; S21A, S21V, S21 N ou S21F; I22L, Ι22Μ, Ι22Τ, I22W ou I22V; K23R ou K23T;

G24H, G24K, G24A, G24P, G24F, G24I, G24Q, G24R, G24S, G24T, G24Y ou G24N;

Y25H, Y25K, Y25L, Y25M, Y25N, Y25Q, Y25S, Y25V ou Y25R;

K26F, K26H, K26T, K26C ou K26R; Y29F, Y29R, Y29A, Y29H, Y29L, Y29M, Y29S ou Y29W; A31K, A31 N, A31Q, A31T, A31E, A31H, A31 I, A31 R, A31S, A31V, A31G ou A31Y;

K32R ou K32T;

G33K, G33Q, G33E, G33N, G33S, G33T, G33A ou G33R; G34K, G34H, G34W ou G34R;

F35A, F35H, F35I, F35M, F35V, F35W, F35R ou F35L; V36L, V36M, V36I, V36K, V36Q, V36R ou V36T; K38H, K38N ouK38R;e Y40I, Y40YRCG ou Y40YR. De preferência, o polipeptídeo antimicrobiano precursor tem pelo menos 70% de identidade, mais preferivelmente pelo menos 80% de identidade, ainda mais preferivelmente pelo menos 90% de identidade e, ainda mais preferivelmente, 95% de identidade com a seqüência de aminoácido de SEQ ID NO: 1. Em particular, o polipeptídeo antimicrobiano precursor pode ser idêntico à seqüência de aminoácido de SEQ ID NO: 1.

Em uma modalidade, o polipeptídeo antimicrobiano precursor é um polipeptídeo de defensina; mais preferivelmente, uma alfa defensina, uma beta defensina ou uma defensina de inseto (artrópode). De preferência, a seqüência de aminoácido precursora exibe atividade antimicrobiano.

Em outra modalidade, o polipeptídeo antimicrobiano precursor tem 1, 2, 3, 4, 5, 6, 7 ou 8 diferenças de aminoácido comparado com a seqüência de aminoácido de SEQ ID NO: 1. De preferência 1, 2, 3, 4, 5 ou 6; mais preferivelmente 1, 2, 3, 4 ou 5; ainda mais preferivelmente 1, 2, 3 ou 4; ainda mais preferivelmente 1, 2 ou 3; e, ainda mais preferivelmente, 1 ou 2 aminoácidos são diferentes comparado com a seqüência de aminoácido de SEQ ID NO: 1.

Extensão N-terminal

Uma extensão N-terminal dos polipeptídeos da invenção pode, adequadamente, consistir de 1 a 50 aminoácidos, de preferência 2-20 aminoácidos, especialmente 3-15 aminoácidos. Em uma modalidade, extensão de peptídeo N-terminal não contém uma Arg (R). Em outra modalidade, a extensão N-terminal compreende um sítio de clivagem kex2 ou semelhante a kex2, conforme será definido ainda abaixo. Em uma modalidade preferida, a extensão N-terminal é um peptídeo compreendendo pelo menos dois resíduos de aminoácido Glu (E) e/ou Asp (D), tal como uma extensão N-terminal compreendendo uma das seguintes seqüências: EAE, EE, DE e DD.

Sítios Kex2

Sítios Kex2 (veja, por exemplo, Methods in Enzymology Vol 185, ed. D. Goeddel, Academic Press Inc. (1990), San Diego, CA, "Gene Expression Technology") e sítios semelhantes a kex2 são sítios de reconhecimento di-básicos (isto é, sítios de clivagem) encontrados entre a região de codificação de pró-peptídeo e a região madura de algumas proteínas.

Foi mostrado que, em determinados casos, inserção de um sítio kex2 ou um sítio semelhante a kex2 melhora processamento correto de endopeptidase no sítio de clivagem de pró-peptídeo, resultando em níveis aumentados de secreção de proteína.

No contexto da invenção, inserção de um sítio kex2 ou semelhante a kex2 resulta na possibilidade de obter clivagem em uma determinada posição na extensão N-terminal, resultando em um polipeptídeo antimicrobiano sendo estendido em comparação com aminoácidos 1 a 40 de qualquer uma de SEQ ID NO: 2 a SEQ ID NO: 225 ou qualquer uma de SEQ ID NO: 226 a SEQ ID NO: 251 ou qualquer uma de SEQ ID NO: 252 a SEQ ID NO: 274.

Polipeptídeos Fundidos

Os polipeptídeos da presente invenção também incluem polipeptídeos fundidos ou polipeptídeos de fusão cliváveis nos quais outro polipeptídeo é fundido no N-término ou no C-término do polipeptídeo da invenção ou um fragmento do mesmo. Um polipeptídeo fundido é produzido através de fusão de uma seqüência de nucleotídeo (ou uma porção da mesma) que codifica outro polipeptídeo a uma seqüência de nucleotídeo (ou uma porção da mesma) da presente invenção. Métodos para produção de polipeptídeos de fusão são conhecidos na técnica e incluem ligação das seqüências de codificação que codificam os polipeptídeos, de modo que elas estejam em rede e que expressão do polipeptídeo fundido esteja sob o controle do(s) mesmo(s) promotor(es) e terminador(es).

Fontes de Polipeptídeos Tendo Atividade Antimicrobiano Um polipeptídeo da presente invenção pode ser obtido a partir de microorganismos de qualquer gênero. Para fins da presente invenção, o termo "obtido de", conforme usado aqui com relação a uma determinada fonte, significará que o polipeptídeo codificado por uma seqüência de nucleotídeo é produzido pela fonte ou por uma cepa na qual a seqüência de nucleotídeo da fonte foi inserida. Em um aspecto preferido, o polipeptídeo obtido de uma determinada fonte é secretado extracelularmente.

Um polipeptídeo da presente invenção pode ser um polipeptídeo bacteriano. Por exemplo, o polipeptídeo pode ser um polipeptídeo bacteriano gram positivo, tal como um polipeptídeo de Bacillus, por exemplo, um polipeptídeo de Bacillus alkalophilus, Bacillus amyloliquefaciens, Bacillus brevis, Bacillus circulans, Bacillus coagulans, Bacillus lautus, Bacillus lentus, Bacillus licheniformis, Bacillus megaterium, Bacillus stearothermophilus, Bacillus subtilis ou Bacillus thuringiensis; ou um polipeptídeo de Streptomyces, por exemplo, um polipeptídeo de Streptomyces lividans ou Streptomyces murinus; ou um polipeptídeo bacteriano negativo, por exemplo, um polipeptídeo de E. coli ou Pseudomonas sp.

Um polipeptídeo da presente invenção pode também ser um polipeptídeo fungico e, mais preferivelmente, um polipeptídeo de levedo, tal como um polipeptídeo de Candida, Kluyveromyces, Pichia, Saccharomyces, Schizosaccharomyces ou Yarrowia; ou, mais preferivelmente, um polipeptídeo fungico filamentoso, tal como um polipeptídeo de Acremonium, Aspergillus, Aureobas idium, Cryptococcus, Filibasidium, Fusarium, Humicola, Magnaporthe, Mucor, Myceliophthora, Neocallimastix, Neurospora, Paecilomyces, Penicillium, Piromyces, Schizophyllum, Talaromyces, Thermoascus, Thielavia, Tolypocladium ou Trichoderma.

Em um aspecto preferido, o polipeptídeo é um polipeptídeo de Saccharomyces carlsbergensis, Saccharomyces cerevisiae, Saccharomyces diastaticus, Saccharomyces douglasii, Saccharomyees kluyveri, Saccharomyces norbensis ou Saccharomyees oviformis tendo atividade antimicrobiana.

Em outro aspecto preferido, o polipeptídeo é um polipeptídeo de Aspergillus aeuleatus, Aspergillus awamori, Aspergillus fumigatus, Aspergillus foetidus, Aspergillus japonieus, Aspergillus nidulans, Aspergillus niger, Aspergillus oryzae, Fusarium baetridioides, Fusarium eerealis, Fusarium erookwellense, Fusarium eulmorum, Fusarium graminearum, Fusarium graminum, Fusarium heterosporum, Fusarium negundi, Fusarium oxysporum, Fusarium retieulatum, Fusarium roseum, Fusarium sambueinum, Fusarium sareoehroum, Fusarium sporotriehioides, Fusarium sulphureum, Fusarium torulosum, Fusarium triehotheeioides, Fusarium venenatum, Humieola insolens, Humieola lanuginosa, Mueor miehei, Myceliophthora thermophila, Neurospora crassa, Penieillium purpurogenum, Triehoderma harzianum, Triehoderma koningii, Triehoderma longibraehiatum, Triehoderma reesei ou Triehoderma viride.

Será compreendido que, para as espécies antes mencionadas, a invenção abrange os estados perfeito e imperfeito e outros equivalentes taxonômicos, por exemplo, anamorfos, a despeito do nome da espécie pelo qual eles são conhecidos. Aqueles habilitados na técnica reconhecerão prontamente a identidade de equivalentes apropriados.

Cepas dessas espécies estão prontamente acessíveis ao público em uma série de coleções de cultura, tal como a American Type Culture Collection (ATCC), Deutsche Sammlung von Mikroorganismen und Zellkulturen GmbH (DSM), Centraalbureau Voor Schimmelcultures (CBS) e Agricultural Research Service Patent Culture Collection, Northern Regional Research Center (NRRL).

Polipeptídeos da presente invenção também incluem polipeptídeos fundidos ou polipeptídeos de fusão cliváveis nos quais outro polipeptídeo é fundido ao N-término ou ao C-término do polipeptídeo ou fragmento do mesmo. Um polipeptídeo fundido é produzido através de fusão de uma seqüência de nucleotídeo (ou uma porção da mesma) que codifica outro polipeptídeo a uma seqüência de nucleotídeo (ou uma porção da mesma) da presente invenção. Métodos para produção de polipeptídeos de fusão são conhecidos na técnica e incluem ligação das seqüências de codificação que codificam os polipeptídeos de modo que elas estejam em rede e que expressão do polipeptídeo fundido esteja sob o controle do(s) mesmo(s) promotor(es) e terminador(es).

Polinucleotídeos

A presente invenção se refere a polinucleotídeos tendo uma seqüência de nucleotídeo a qual codifica um polipeptídeo da invenção. Em particular, a presente invenção se refere a polinucleotídeos consistindo de uma seqüência de nucleotídeo a qual codifica um polipeptídeo da invenção.

Em virtude da degenerância do código genético, a pessoa habilitada pode reconhecer facilmente que várias seqüências de nucleotídeo que codificam cada um dos polipeptídeos da invenção podem ser preparadas. É bem sabido na técnica quais nucleotídeos compõem códons que codificam os aminoácidos dos polipeptídeos da invenção.

A presente invenção também se refere a polinucleotídeos os quais codificam fragmentos da seqüência de aminoácido mostrada como qualquer uma de SEQ ID NO: 2 a SEQ ID NO: 225 ou qualquer uma de SEQ ID NO: 226 a SEQ ID NO: 251 ou qualquer uma de SEQ ID NO: 252 a SEQ ID NO: 274 que tem atividade antimicrobiana. Uma sub-seqüência dos polinucleotídeos é uma seqüência de nucleotídeo em que um ou mais nucleotídeos das extremidades 5' e/ou 3' tenham sido deletados.

A seqüência de nucleotídeo pode ser obtida através de procedimentos padrões de clonagem usados em engenharia genética para deslocar a seqüência de nucleotídeo de um local para um local diferente onde ela será reproduzida. Os procedimentos de clonagem podem envolver excisão e isolamento de um fragmento desejado compreendendo a seqüência de nucleotídeo que codifica o polipeptídeo, inserção do fragmento em uma molécula de vetor e incorporação do vetor recombinante em uma célula hospedeira onde múltiplas cópias ou clones da seqüência de nucleotídeo serão replicados. A seqüência de nucleotídeo pode ser de origem genômica, cDNA, RNA, semi-sintética, sintética ou quaisquer combinações dos mesmos.

Modificação de uma seqüência de nucleotídeo que codifica um polipeptídeo da presente invenção pode ser necessária para a síntese de um polipeptídeo, o qual compreende uma seqüência de aminoácido que tem pelo menos uma substituição, deleção e/ou inserção quando comparado aos aminoácidos 1 a 40 de qualquer uma de SEQ ID NO: 2 a SEQ ID NO: 225 ou qualquer uma de SEQ ID NO: 226 a SEQ ID NO: 251 ou qualquer uma de SEQ ID NO: 252 a SEQ ID NO: 274. Essas variantes artificiais podem diferir, em alguma forma manipulada, do polipeptídeo isolado de sua fonte nativa, por exemplo, variantes que diferem quando à atividade específica, termoestabilidade, pH ótimo ou semelhante.

Será evidente para aqueles habilitados na técnica que tais substituições podem ser feitas fora das regiões críticas para a função da molécula e ainda resultar em um polipeptídeo ativo. Resíduos de aminoácido essenciais para a atividade do polipeptídeo codificado por um polinucleotídeo isolado da invenção e, portanto, de preferência, não submetido à substituição, podem ser identificados de acordo com procedimentos conhecidos na técnica, tais como mutagênese direcionada por sítio ou mutagênese por exploração da alanina (veja, por exemplo, Cunningham e Wells, 1989, Science 244: 1081- 1085). Na última técnica, mutações são introduzidas em cada resíduo positivamente carregado na molécula e as moléculas mutantes resultantes são testadas com relação à atividade antimicrobiana para identificar resíduos de aminoácido que são críticos para a atividade da molécula. Sítios de interação também podem ser determinados através de análise da construção tridimensional, conforme determinado através de técnicas tais como análise por ressonância magnética nuclear, cristalografia ou rotulação por fotoafinidade (veja, por exemplo, de Vos e colaboradores, 1992, Science 255: 306-312; Smith e colaboradores, 1992, Journal of Molecular Biology 224: 899-904; Wlodaver e colaboradores, 1992, FEBSLetters 309: 59-64).

Além disso, uma seqüência de nucleotídeo que codifica um polipeptídeo da presente invenção pode ser modificada através de introdução de substituições de nucleotídeo as quais não dão origem a outra seqüência de aminoácido do polipeptídeo codificado pela seqüência de nucleotídeo, mas a qual corresponde ao uso de códon do organismo hospedeiro destinado à produção do polipeptídeo antimicrobiano.

Construções de Acido Nucleico

A presente invenção também se refere a construções de ácido nucleico compreendendo um polinucleotídeo isolado da presente invenção operavelmente ligado a uma ou mais seqüências de controle as quais direcionam a expressão da seqüência de codificação em uma célula hospedeira adequada sob condições compatíveis com as seqüências de controle.

Um polinucleotídeo isolado que codifica um polipeptídeo da invenção pode ser manipulado em uma variedade de formas para proporcionar expressão do polipeptídeo. Manipulação da seqüência de polinucleotídeo antes de sua inserção em um vetor pode ser desejável ou necessária, dependendo do vetor de expressão. Os métodos para modificação de seqüências de polinucleotídeo utilizando métodos de DNA recombinante são bem conhecidos na técnica.

A seqüência de controle pode ser uma seqüência promotora apropriada, uma seqüência de nucleotídeo a qual é reconhecida por uma célula hospedeira para expressão de um polinucleotídeo que codifica um polipeptídeo da presente invenção. A seqüência promotora contém seqüências de controle transcricional as quais mediam a expressão do polipeptídeo. O promotor pode ser qualquer seqüência de nucleotídeo a qual mostra atividade transcricional na célula hospedeira de escolha, incluindo promotores mutantes, truncados e híbridos e pode ser obtido de genes que codificam polipeptídeos extracelulares ou intracelulares, quer homólogos ou heterólogos à célula hospedeira.

Exemplos de promotores adequados para direcionar a transcrição das construções de ácido nucleico da presente invenção, especialmente em uma célula hospedeira bacteriana, são os promotores obtidos do operon Iac de E. coli, gene de agarase de Streptomyces coelicolor {dagA), gene de levansucrase de Bacillus subtilis {sacB), gene de alfa-amilase de Bacillus lieheniformis (amyL), gene de amilase maltogênica de Bacillus stearothermophilus (iamyM), gene de alfa-amilase de Bacillus amyloliquefaeiens (amyQ), gene de penicilinase de Bacillus lieheniformis (penP), genes xylA e xylB de Bacillus subtilis e gene de beta-lactamase procariota (Villa-Kamaroff e colaboradores, 1978, Proceedings of the National Aeademy of Sciences USA 75: 3727-3731), bem como o promotor tac (DeBoer e colaboradores, 1983, Proceedings of the National Academy of Sciences USA 80: 21-25). Outros promotores são descritos em "Useful proteins from recombinant bactéria" em Scientific American, 1980, 242: 74- 94; e em Sambrook e colaboradores, 1989, supra.

Exemplos de promotores adequados para direcionar a transcrição das construções de ácido nucleico da presente invenção em uma célula hospedeira fungica filamentosa são promotores obtidos dos genes para amilase TAKlA de Aspergillus oryzae, proteinase aspártica de Rhizomucor miehei, alfa-amilase neutra de Aspergillus niger, alfa-amilase ácido-estável de Aspergillus niger, glicoamilase de Aspergillus niger ou Aspergillus awamori (glaA), lipase de Rhizomucor miehei, protease alcalina de Aspergillus oryzae, isomerase de fosfato de triose de Aspergillus oryzae, acetamidase de Aspergillus nidulans, amiloglicosidase de Fusarium venenatum (WO 00/56900), Fusarium venenatum Daria (WO 00/56900), Fusarium venenatum Quinn (WO 00/56900), protease semelhante à tripsina de Fusarium oxysporum (WO 96/00787), beta-glicosidase de Trichoderma reesei, celobiohidrolase I de Trichoderma reesei, endoglucanase I de Trichoderma reesei, endoglucanase II de Trichoderma reesei, endoglucanase III de Triehoderma reesei, endoglucanase IV de Trichoderma reesei, endoglucanase V de Triehoderma reesei, xilanase I de Triehoderma reesei, xilanase II de Triehoderma reesei, beta-xilosidase de Triehoderma reesei, bem como o promotor NA2-tpi (um híbrido dos promotores para os genes para alfa- amilase neutra de Aspergillus niger e isomerase de fosfato de triose de Aspergillus oryzae), e promotores mutantes, truncados e híbridos dos mesmos.

Em um hospedeiro de levedo, promotores úteis são obtidos dos genes para enolase de Saceharomyces cerevisiae (ENO-1), galactoquínase de Saceharomyces cerevisiae (GAL1), desidrogenase de álcool/desidrogenase de gliceraldeído-3-fosfato de Saccharomyces cerevisiae (ADH1, ADH2/GAP), isomerase de fosfato de triose de Saccharomyces cerevisiae (TPI), metalotionina de Saccharomyces cerevisiae (CUPl) e quínase de 3- fosfoglicerato de Saccharomyces cerevisiae. Outros promotores úteis para células hospedeiras de levedo são descritos por Romanos e colaboradores, 1992, Yeast 8: 423-488.

A seqüência de controle também pode ser uma seqüência terminadora de transcrição adequada, uma seqüência reconhecida por uma célula hospedeira para terminar a transcrição. A seqüência terminadora é operavelmente ligada ao 3' término da seqüência de nucleotídeo que codifica o polipeptídeo. Qualquer terminador o qual é funcional na célula hospedeira de escolha pode ser usado na presente invenção. Terminadores preferidos para células hospedeiras de fungo filamentoso são obtidos dos genes para amilase TAKA de Aspergillus oryzae, glicoamilase de Aspergillus niger, sintase de antranilato de Aspergillus nidulans, alfa-glicosidase de Aspergillus niger e protease semelhante à tripsina de Fusarium oxysporum.

Terminadores preferidos para células hospedeiras de levedo são obtidos dos genes para enolase de Saccharomyces eerevisiae, citocroma C de Saceharomyces eerevisiae (CYCl) e desidrogenase de gliceraldeído-3- fosfato de Saccharomyces eerevisiae. Outros terminadores úteis para células hospedeiras de levedo são descritos por Romanos e colaboradores, 1992, supra.

A seqüência de controle pode também ser uma seqüência líder adequada, uma região não traduzida de um mRNA a qual é importante para tradução pela célula hospedeira. A seqüência líder é operavelmente ligada ao 5' término da seqüência de nucleotídeo que codifica o polipeptídeo. Qualquer seqüência líder que é funcional na célula hospedeira de escolha pode ser usada na presente invenção. Líderes preferidos para células hospedeiras fungicas filamentosas são obtidos os genes para amilase TAXA de Aspergillus oryzae e isomerase de fosfato de triose de Aspergillus nidulans.

Líderes adequados para células hospedeiras de levedo podem ser obtidos dos genes para enolase de Saceharomyces eerevisiae (ENO-1), quínase de 3-fosfoglicerato de Saccharomyees eerevisiae, alfa-fator de Saccharomyees eerevisiae e desidrogenase de álcool/desidrogenase de gliceraldeído-3-fosfato de Saceharomyces eerevisiae (ADH2/GAP).

A seqüência de controle também pode ser uma seqüência de poliadenilação, uma seqüência operavelmente ligada ao 3' término da seqüência de nucleotídeo e a qual, quando transcrita, é reconhecida pela célula hospedeira como um sinal para adicionar resíduos de poliadenosina ao mRNA transcrito. Qualquer seqüência de poliadenilação a qual é funcional na célula hospedeira de escolha pode ser usada na presente invenção. Seqüências de poliadenilação preferidas para células hospedeiras fungicas filamentosas são obtidas dos genes para amilase TAKA de Aspergillus oryzae, glicoamilase de Aspergillus niger, sintase de antranilato de Aspergillus nidulans, protease semelhante à tripsina de Fusarium oxysporum e alfa-glicosidase de Aspergillus niger.

Seqüências de poliadenilação úteis para células hospedeiras de levedo são descritas por Guo e Sherman, 1995, Molecular Cellular Biology 15: 5983-5990.

A seqüência de controle também pode ser uma região de codificação de peptídeo sinalizador que codifica uma seqüência de aminoácido ligada ao amino término de um polipeptídeo e dirige o polipeptídeo codificado para a via secretória da célula. A extremidade 5' da seqüência de codificação da seqüência de nucleotídeo pode conter, inerentemente, uma região de codificação de peptídeo sinalizador naturalmente ligada, em uma rede de leitura de tradução, ao segmento da região de codificação a qual codifica o polipeptídeo secretado.

Alternativamente, a extremidade 5' da seqüência de codificação pode conter uma região de codificação de peptídeo sinalizador a qual é estranha à seqüência de codificação. A região de codificação de peptídeo sinalizador estranha pode ser requerida onde a seqüência de codificação não contém naturalmente uma região de codificação de peptídeo sinalizador.

Alternativamente, a região de codificação do peptídeo sinalizador estranha pode simplesmente substituir a região de codificação de peptídeo sinalizador natural de forma a intensificar a secreção do polipeptídeo. Contudo, qualquer região de codificação de peptídeo sinalizador a qual dirige o polipeptídeo expressão na via secretória de uma célula hospedeira de escolha pode ser usada na presente invenção.

Regiões de codificação de peptídeo sinalizador eficazes para células hospedeiras bacterianas são as regiões de codificação de peptídeo sinalizador obtidas dos genes para amilase maltogênica de Bacillus NCIB 11837, alfa-amilase de Bacillus stearothermophilus, Bacillus Iieheniformis subtilisin, beta-lactamase de Bacillus lieheniformis, proteases neutras de Bacillus stearothermophilus (nprT, nprS, nprM) e prsA de Bacillus subtilis. Outros peptídeos sinalizadores são descritos por Simonen e Paiva, 1993, Microbiological Reviews 57: 109-137.

Regiões de codificação de peptídeo sinalizador eficazes para células hospedeiras fungicas filamentosas são as regiões de codificação de peptídeo sinalizador obtidas dos genes para amilase TAKA de Aspergillus oryzae, amilase neutra de Aspergillus niger, glicoamilase de Aspergillus niger, proteinase aspártica de Rhizomueor miehei, celulase de Humieola insolens e lipase de Humieola lanuginosa.

Peptídeos sinalizadores úteis para células hospedeiras de levedo são obtidos dos genes para alfa-fator de Saccharomyees eerevisiae e invertase de Saccharomyees eerevisiae. Outras regiões de codificação de peptídeo sinalizador úteis são descritas por Romanos e colaboradores, 1992, supra.

A seqüência de controle também pode ser uma região de codificação de pró-peptídeo que codifica uma seqüência de aminoácido posicionada no amino término de um polipeptídeo. O polipeptídeo resultante é conhecido como uma pró-enzima ou pró-polipeptídeo (ou um zimógeno em alguns casos). Um pró-polipeptídeo é geralmente inativo e pode ser convertido em um polipeptídeo ativo maduro através de clivagem catalítica ou autocatalítica do pró-peptídeo a partir do pró-polipeptídeo. A região de codificação de pró-peptídeo pode ser obtida dos genes para protease alcalina de Bacillus subtilis (aprE), protease neutra de Bacillus subtilis (nprT), alfa- fator de Saccharomyces eerevisiae, proteinase aspártica de Rhizomueor miehei e lacase de Myceliophthora thermophila (WO 95/33836).

Onde ambas as regiões de peptídeo sinalizador e pró-peptídeo estão presentes no amino término de um polipeptídeo, a região de pró- peptídeo está posicionada próximo ao amino término de um polipeptídeo e a região de peptídeo sinalizador está posicionada próxima ao amino término da região de pró-peptídeo.

Também pode ser desejável adicionar seqüências regulatórias as quais permitem a regulação da expressão do polipeptídeo com relação ao crescimento da célula hospedeira. Exemplos de sistemas regulatórios são aqueles os quais fazem com que a expressão do gene seja ativada ou desativada em resposta a um estímulo químico ou físico, incluindo a presença de um composto regulatório. Sistemas regulatórios em sistemas procariotas incluem os sistemas do operador lac, tac e trp. Em levedo, o sistema ADH2 ou o sistema GALl pode ser usado. Em fungos filamentosos, o promotor de alfa-amilase TAKA, promotor de glicoamilase de Aspergillus niger e o promotor de glicoamilase de Aspergillus oryzae podem ser usados como seqüências regulatórias. Outros exemplos de seqüências regulatórias são aquelas as quais permitem amplificação de gene. Em sistemas eucariotas, essas incluem o gene de reductase de dihidrofolato o qual é amplificado na presença de metotrexato e os genes de metalotioneína os quais são amplificados com metais pesados. Nesses casos, a seqüência de nucleotídeo que codifica o polipeptídeo seria operavelmente ligada à seqüência regulatória.

Vetores de Expressão

A presente invenção também se refere a vetores de expressão recombinantes compreendendo um polinucleotídeo da invenção, um promotor e sinais de término de transcrição e tradução. Os vários ácidos nucleicos e seqüências de controle descritas acima podem ser unidos juntos para produzir um vetor de expressão recombinante o qual pode incluir um ou mais sítios de restrição convenientes para permitir inserção ou substituição da seqüência de nucleotídeo que codifica o polipeptídeo em tais sítios. Alternativamente, uma seqüência de nucleotídeo da presente invenção pode ser expressa através de inserção da seqüência de nucleotídeo ou uma construção de ácido nucleico compreendendo a seqüência em um vetor apropriado para expressão. Na criação do vetor de expressão, a seqüência de codificação está localizada no vetor, de modo que a seqüência de codificação esteja operavelmente ligada às seqüências de controle apropriadas para expressão.

O vetor de expressão recombinante pode ser qualquer vetor (por exemplo, um plasmídeo ou vírus) o qual pode ser convenientemente submetido a procedimentos de DNA recombinante e pode levar à expressão da seqüência de nucleotídeo. A escolha do vetor dependerá, tipicamente, da compatibilidade do vetor com a célula hospedeira na qual o vetor tem de ser introduzido. Os vetores podem ser plasmídeos lineares ou circulares fechados.

O vetor pode ser um vetor de replicação autônoma, isto é, um vetor o qual existe como uma entidade extracromossômica, a replicação do qual é independente de replicação cromossômica, por exemplo, um plasmídeo, um elemento extracromossômico, um minicromossoma ou um cromossoma artificial. O vetor pode conter quaisquer meios para assegurar auto-replicação. Alternativamente, o vetor pode ser um o qual, quando introduzido na célula hospedeira, é integrado no genoma e replicado junto com o(s) cromossoma(s) no(s) qual(is) ele foi integrado. Além disso, um único vetor ou plasmídeo ou dois ou mais vetores ou plasmídeos os quais, juntos, contêm o DNA total a ser introduzido no genoma da célula hospedeira ou um transposon pode ser usado.

Os vetores da presente invenção contêm, de preferência, um ou mais marcadores selecionáveis os quais permitem seleção fácil de células transformadas. Um marcador selecionável é um gene, o produto do qual proporciona resistência a biocida ou viral, resistência a metais pesados, prototrofia a auxotrofos e semelhantes.

Exemplos de marcadores selecionáveis bacterianos são os genes dal de Bacillus subtilis ou Bacillus licheniformis ou marcadores os quais conferem resistência a antibiótico, tal como resistência à ampicilina, canamicina, cloranfenicol ou tetraciclina. Marcadores adequados para células hospedeiras de levedo são ADE2, fflS3, LEU2, LYS2, MET3, TRPl e URA3. Marcadores adequados para uso em uma célula hospedeira fungica filamentosa incluem, mas não estão limitados a, amdS (acetamidase), argB (carbamoiltransferase de ornitina), bar (acetiltransferase de fosfinotricina), hph (fosfotransferase de higromicina), niaD (reductase de nitrato), pyrG (decarboxilase de orotidina-5'-fosfato), sC (adeniltransferase de sulfato) e trpC (sintase de antranilato), bem como equivalentes dos mesmos. Preferidos para uso em uma célula de Aspergillus são os genes amdS e pyrG de Aspergillus nidulans ou Aspergillus oryzae e o gene bar de Streptomyees hygroseopieus.

Os vetores da presente invenção contêm, de preferência, (um) elemento(s) que permite(m) integração do vetor no genoma da célula hospedeira ou replicação autônoma do vetor na célula independente do genoma.

Para integração no genoma da célula hospedeira, o vetor pode contar com a seqüência de polinucleotídeo que codifica o polipeptídeo ou qualquer outro elemento do vetor para integração no genoma através de recombinação homóloga ou não-homóloga. Alternativamente, o vetor pode conter seqüências de nucleotídeo adicionais para direcionar a integração através de recombinação homóloga no genoma da célula hospedeira em (um) local(is) preciso(s) no(s) cromossoma(s). Para aumentar a probabilidade de integração em um local preciso, os elementos integracionais conterão, de preferência, um número suficiente de ácidos nucleicos, tal como 100 a 10.000 pares de base, de preferência 400 a 10.000 pares de base e, ainda mais preferivelmente, 800 a 10.000 pares de base, os quais têm um alto grau de identidade com a seqüência alvo correspondente para intensificar a probabilidade de recombinação homóloga. Os elementos integracionais podem ser qualquer seqüência que é homóloga à seqüência alvo no genoma da célula hospedeira. Além disso, os elementos integracionais podem ser seqüências de nucleotídeo de codificação ou não-codificação. Por outro lado, o vetor pode ser integrado no genoma da célula hospedeira através de recombinação não-homóloga.

Para replicação autônoma, o vetor pode ainda compreender uma origem de replicação que permite que o vetor se reproduza de modo autônomo na célula hospedeira em questão. A origem de replicação pode ser qualquer reprodutor de plasmídeo que media replicação autônoma o qual funciona em uma célula. O termo "origem de replicação" ou "reprodutor de plasmídeo" é definido aqui como uma seqüência de nucleotídeo que permite que um plasmídeo ou vetor se reproduza in vivo.

Exemplos de origens de replicação bacterianas são as origens de replicação de plasmídeos pBR322, pUC19, pACYC177 e pACYC184, que permitem replicação em E. coli e pUBllO, pE194, pTA1060 e ρΑΜβΙ, que permitem replicação em Bacillus.

Exemplos de origens de replicação para uso em uma célula hospedeira de levedo são a origem de replicação de 2 mícrons, ARS1, ARS4, a combinação de ARSl e CEN3 e a combinação de ARS4 e CEN6.

Exemplos de origens de replicação úteis em uma célula fungica filamentosa são AMAI e ANSI (Gems e colaboradores, 1991, Gene 98: 61-67; Cullen e colaboradores, 1987, Nucleic Acids Research 15: 9163- 9175; WO 00/24883). Isolamento do gene AMAI e construção de plasmídeos ou vetores compreendendo o gene podem ser realizados de acordo com os métodos divulgados no WO 00/24883.

Mais de uma cópia de um polinucleotídeo da presente invenção pode ser inserida na célula hospedeira para aumentar a produção do produto do gene. Um aumento no número de cópias do polinucleotídeo pode ser obtido através de integração de pelo menos uma cópia adicional da seqüência no genoma da célula hospedeira ou através de inclusão de um gene marcador selecionável amplificável com o polinucleotídeo, onde células contendo cópias amplificadas do gene marcador selecionável e, desse modo, cópias adicionais do polinucleotídeo, podem ser selecionadas através de cultura das células na presença do agente selecionável apropriado.

Os procedimentos usados para ligar os elementos descritos acima para construir os vetores de expressão recombinantes da presente invenção são bem conhecidos por aqueles habilitados na técnica (veja, por exemplo, Sambrook e colaboradores, 1989, supra).

Células Hospedeiras

A presente invenção também se refere à células hospedeiras recombinantes compreendendo um polinucleotídeo da presente invenção as quais são, vantajosamente, usadas na produção recombinante dos polipeptídeos. Um vetor compreendendo um polinucleotídeo da invenção é introduzido em uma célula hospedeira, de modo que o vetor é mantido como um integrante cromossômico ou como um vetor extra-cromossômico de auto- replicação, conforme descrito anteriormente. O termo "célula hospedeira" abrange qualquer prole de uma célula precursora que não é idêntica à célula precursora em virtude de mutações que ocorrem durante replicação. A escolha de uma célula hospedeira dependerá, até grande ponto, do gene que codifica o polipeptídeo e sua fonte.

A célula hospedeira pode ser um microorganismo unicelular, por exemplo, um procariota, ou um microorganismo não-unicelular, por exemplo, um eucariota.

Microorganismos unicelulares úteis são células bacterianas, tais como bactérias gram positivas incluindo, mas não limitado a, uma célula de Bacillus, por exemplo, Bacillus alkalophilus, Bacillus amyloliquefaciens, Bacillus brevis, Bacillus circulans, Bacillus clausii, Bacillus coagulans, Bacillus lautus, Bacillus lentus, Bacillus licheniformis, Baeillus megaterium, Bacillus stearothermophilus, Bacillus subtilis e Baeillus thuringiensis; ou uma célula de Streptomyees, por exemplo, Streptomyces lividans e Streptomyees murinus ou bactérias gram negativas, tais como E. eoli e Pseudomonas sp. Em um aspecto preferido, a célula hospedeira bacteriana é uma célula de Bacillus lentus, Bacillus licheniformis, Bacillus stearothermophilus ou Bacillus subtilis. Em outro aspecto preferido, a célula de Bacillus é um Bacillus alcalofílico.

A introdução de um vetor em uma célula hospedeira bacteriana pode, por exemplo, ser realizada através de transformação de protoplasta (veja, por exemplo, Chang e Cohen, 1979, Molecular General Genetics 168: 111-115), usando células competentes (veja, por exemplo, Young e Spizizin, 1961, Journal of Bacteriology 81: 823-829 ou Dubnau e Davidoff-Abelson, 1971, Journal of Molecular Biology 56: 209-221), eletroporação (veja, por exemplo, Shigekawa e Dower, 1988, Biotechniques 6: 742-751) ou conjugação (veja, por exemplo, Koehler e Thome, 1987, Journal of Bacteriology 169: 5771-5278).

A célula hospedeira também pode ser um eucariota, tal como uma célula de mamífero, inseto, planta ou fungica.

Em um aspecto preferido, a célula hospedeira é uma célula fungica. "Fungos", conforme usado aqui, inclui os gêneros Ascomycota, Basidiomycota, Chytridiomycota e Zygomycota (conforme definido por Hawksworth e colaboradores, em Ainsworth and Bisby's Dictionary of The Fungi, 8a edição, 1995, CAB International, University Press, Cambridge, Reino Unido), bem como Oomycota (conforme citado em Hawksworth e colaboradores, 1995, supra, página 171) e todos os fungos mitospóricos (Hawksworth e colaboradores, 1995, supra).

Em um aspecto mais preferido, a célula hospedeira fungica é uma célula de levedo. "Levedo", conforme usado aqui, inclui levedo ascosporogêneo (Endomicetales), levedo basidiosporogêneo e levedo pertencendo aos Fungi lmperfecti (Blastomicetes). Uma vez que a classificação de levedo pode mudar no futuro, para fins da presente invenção, levedo será definido conforme descrito em Biology and Activities of Yeast (Skinner, F.A., Passmore, S. M. e Davenport, R.R., eds, Soe. App. Bacteriol. Symposium Series No. 9, 1980).

Em um aspecto ainda mais preferido, a célula hospedeira de levedo é uma célula de Condida, Hansenula, Kluyveromyces, Piehia, Saccharomyees, Schizosaccharomyces ou Yarrowia.

Em um aspecto mais preferido, a célula hospedeira de levedo é uma célula de Saccharomyees earlsbergensis, Saccharomyces eerevisiae, Saccharomyees diastatieus, Saccharomyees douglasii, Saccharomyees kluyveri, Saccharomyces norbensis ou Saccharomyces oviformis. Em outro aspecto mais preferido, a célula hospedeira de levedo é uma célula de Kluyveromyces laetis. Em outro aspecto mais preferido, a célula hospedeira de levedo é uma célula de Yarrowia lipolyties.

Em outro aspecto mais preferido, a célula hospedeira fungica é uma célula fungica filamentosa. "Fungos filamentosos" incluem todas as formas filamentosas da subdivisão Eumycota e Oomycota (conforme definido por Hawksworth e colaboradores, 1995, supra). Os fungos filamentosos são, em geral, caracterizados por uma parede micelial composta de quitina, celulose, glicana, quitosana, manana e outros polissacarídeos complexos. Crescimento vegetativo é através de alongamento hifal e catabolismo de carbono é obrigatoriamente aeróbico. Em contraste, crescimento vegetativo por levedos, tal como, é através de germinação de um talo unicelular e catabolismo de carbono pode ser fermentativo.

Em um aspecto ainda mais preferido, a célula hospedeira fungica filamentosa é uma célula de Aeremonium, Aspergillus, Aureobasidium, Bjerkandera, Ceriporiopsis, Coprinus, Coriolus, Cryptococcus, Filibasidium, Fus^um, Humicola, Magnaporthe, Mucor, Myceliophthora, Neocallimastix, Neurospora, Paecilomyces, Penieillium, Phaneroehaete, Phlebia, Piromyees, Pleurotus, Sehízophyllum, Talaromyees, Thermoaseus, Thielavia, Tolypoeladium, Trametes ou Trichoderma. Em um aspecto mais preferido, a célula hospedeira fungica filamentosa é uma célula de Aspergillus awamori, Aspergillus fumigatus, Aspergillus foetidus, Aspergillus japonicus, Aspergillus nidulans, Aspergillus niger ou Aspergillus oryzae. Em outro aspecto mais preferido, a célula hospedeira fungica filamentosa é uma célula de Fusarium bactridioides, Fusarium cerealis, Fusarium crookwellense, Fusarium culmorum, Fusarium graminearum, Fusarium graminum, Fusarium heterosporum, Fusarium negundi, Fusarium oxysporum, Fusarium reticulatum, Fusarium roseum, Fusarium sambucinum, Fusarium sarcochroum, Fusarium sporotrichioides, Fusarium sulphureum, Fusarium torulosum, Fusarium trichothecioides ou Fusarium venenatum. Em outro aspecto mais preferido, a célula hospedeira fungica filamentosa é uma célula da cepa Bjerkandera adusta, Ceriporiopsis aneirina, Ceriporiopsis aneirina, Ceriporiopsis caregiea, Ceriporiopsis gilvescens, Ceriporiopsis pannocinta, Ceriporiopsis rivulosa, Ceriporiopsis subrufa ou Ceriporiopsis subvermispora, Coprinus cinereus, Coriolus hirsutus, Humicola insolens, Humicola lanuginosa, Mucor miehei, Myceliophthora thermophila, Neurospora crassa, Penieillium purpurogenum, Phaneroehaete chrysosporium, Phlebia radiata, Pleurotus eryngii, Thielavia terrestris, Trametes villosa, Trametes versicolor, Trichoderma harzianum, Trichoderma koningii, Trichoderma longibrachiatum, Trichoderma reesei ou Trichoderma νiride.

Células fungicas podem ser transformadas através de um processo envolvendo formação de protoplasta, transformação dos protoplastas e regeneração da parede celular de uma maneira conhecida per se.

Procedimentos adequados para transformação de células hospedeiras de Aspergillus e Trichoderma são descritos no EP 238 023 e Yelton e colaboradores, 1984, Proceedings of the National Aeademy of Sciences USA 81: 1470-1474. Métodos adequados para transformação de espécies Fusarium são descritos por Malardier e colaboradores, 1989, Gene 78: 147-156 e WO 96/00787. Levedo pode ser transformado usando os procedimentos descritos por Becker e Guarente, em Abelson, J.N. e Simon, M.I., editores, Guide to Yeast Genetics and Molecular Biology, Methods in Enzymology, Volume 194, páginas 182-187, Academic Press, Inc., Nova Iorque; Ito e colaboradores, 1983, Journal of Bacteriology 153: 163; e Hinnen e colaboradores, 1978, Proceedings of the National Aeademy of Sciences USA 75: 1920.

Métodos de Produção

A presente invenção também se refere a métodos para produção de um polipeptídeo da presente invenção compreendendo (a) cultura de uma célula a qual, em sua forma do tipo selvagem, é capaz de produção do polipeptídeo, sob condições condutivas à produção do polipeptídeo; e (b) recuperação do polipeptídeo.

A presente invenção também se refere a métodos para produção de um polipeptídeo da presente invenção compreendendo (a) cultura de uma célula hospedeira sob condições condutivas à produção do polipeptídeo; e (b) recuperação do polipeptídeo.

Nos métodos de produção da presente invenção, as células são cultivadas em um meio nutriente adequado para produção do polipeptídeo usando métodos bem conhecidos na técnica. Por exemplo, a célula pode ser cultivada através de cultura em frasco de agitação e fermentação em pequena escala ou larga escala (incluindo fermentações contínua, em batelada, alimentada-em batelada ou em estado sólido) em fermentadores de laboratório ou industriais, realizada em um meio adequado e sob condições que permitem que o polipeptídeo seja expresso e/ou isolado. A cultura ocorre em um meio nutriente adequado compreendendo fontes de carbono e nitrogênio e sais inorgânicos, usando procedimentos conhecidos na técnica. Meios adequados estão disponíveis de fornecedores comerciais ou podem ser preparados de acordo com composições publicadas (por exemplo, em catálogos da American Type Culture Collection). Se o polipeptídeo é secretado no meio nutriente, o polipeptídeo pode ser recuperado diretamente do meio. Se o polipeptídeo não é secretado, ele pode ser recuperado de lisados de célula.

Os polipeptídeos podem ser detectados usando métodos conhecidos na técnica que são específicos para os polipeptídeos. Esses métodos de detecção podem incluir uso de anticorpos específicos. Por exemplo, um ensaio de atividade antimicrobiana pode ser usado para determinar a atividade do polipeptídeo, conforme descrito aqui.

O polipeptídeo resultante pode ser recuperado usando métodos conhecidos na técnica. Por exemplo, o polipeptídeo pode ser recuperado do meio nutriente através de procedimentos convencionais incluindo, mas não limitado a, centrifugação, filtração, extração, liofilização, evaporação ou precipitação.

Os polipeptídeos da presente invenção podem ser purificados através de uma variedade de procedimentos conhecidos na técnica incluindo, mas não limitado a, cromatografia (por exemplo, troca de íons, afinidade, hidrofóbica, cromatofocalização e exclusão de tamanho), procedimentos eletroforéticos (por exemplo, focalização isoelétrica preparativa), solubilidade diferencial (por exemplo, precipitação com sulfato de amônio), SDS-PAGE ou extração (veja, por exemplo, Protein Purification, J.-C. Janson e Lars Ryden, editores, VCH Publishers, Nova Iorque, 1989).

Plantas

A presente invenção também se refere a uma planta transgênica, parte de planta ou célula de planta a qual tenha sido transformada com uma seqüência de nucleotídeo que codifica um polipeptídeo tendo atividade antimicrobiana da presente invenção, de modo a expressar e produzir o polipeptídeo em quantidades recuperáveis. O polipeptídeo pode ser recuperado da planta ou parte de planta. Alternativamente, a planta ou parte de planta contendo o polipeptídeo recombinante pode ser usada como tal para melhorar a qualidade de um alimento ou ração, por exemplo, melhorar o valor nutricional, palatabilidade e propriedades reológicas ou destruir um fator anti- nutritivo.

A planta transgênica pode ser dicotiledônea (uma dicot) ou monocotiledônea (uma monocot). Exemplos de plantas monocot são gramíneas, tais como capim do prado (capim-do-campo, Poa), capim de forragem, tal como Festuca, Lolium, capim temperado, tal como Agrostis e cereais, por exemplo, trigo, aveias, centeio, cevada, arroz, sorgo e milho (milho).

Exemplos de plantas dicots são tabaco, legumes, tais como lúpulos, batata, beterraba sacarínica, ervilha, feijão e soja e plantas crucíferas (família Brassicaceae), tais como couve-flor, colza e o organismo modelo intimamente relacionado Arabidopsis thaliana.

Exemplos de partes de planta são tronco, caule, folhas, raiz, frutos, sementes e tubérculos, bem como os tecidos individuais compreendendo essas partes, por exemplo, epiderme, mesófilo, parênquima, tecidos vasculares, meristemas. Compartimentos celulares de planta específicos, tais como cloroplastas, apoplastas, mitocôndrias, vacúolos, peroxissomas e citoplasma, também são considerados como sendo uma parte da planta. Além disso, qualquer célula de planta, qualquer que seja a origem tecidual, é considerada como sendo uma parte de planta. Da mesma forma, partes de planta, tais como tecidos e células específicas isoladas para facilitar a utilização da invenção, também são considerados partes de planta, por exemplo, embriões, endospermas, aleurona e envoltórios de sementes.

Também incluída dentro do escopo da presente invenção está a prole de tais plantas, partes de planta e células de planta. A planta ou célula de planta transgênica expressando um polipeptídeo da presente invenção pode ser construída de acordo com métodos conhecidos na técnica. Em resumo, a planta ou célula de planta é construída através de incorporação de uma ou mais construções de ácido nucleico que codificam um polipeptídeo da presente invenção no genoma hospedeiro da planta e propagação da planta modificada ou célula de planta resultante em uma planta ou célula de planta transgênica.

A construção de expressão é, convenientemente, uma construção de ácido nucleico a qual compreende um polinucleotídeo que codifica um polipeptídeo da presente invenção operavelmente ligado com seqüências regulatórias apropriadas requeridas para expressão da seqüência de nucleotídeo na planta ou parte de planta de escolha. Além disso, a construção de expressão pode compreender um marcador selecionável útil para identificação de células hospedeiras nas quais a construção de expressão tenha sido integrada e seqüências de DNA necessárias para introdução da construção na planta em questão (o último depende do método de introdução de DNA a ser usado).

A escolha de seqüências regulatórias, tais como seqüências terminadoras e promotoras e, opcionalmente, seqüências de sinal ou trânsito, é determinada, por exemplo, com base em quando, onde e como se deseja que o polipeptídeo seja expresso. Por exemplo, a expressão do gene que codifica um polipeptídeo da presente invenção pode ser constitutiva ou induzível ou pode ser específica ao desenvolvimento, estágio ou tecido e o produto do gene pode ser objetivado a um tecido ou parte de planta específica, tais como sementes ou folhas. Seqüências regulatórias são, por exemplo, descritas por Tague e colaboradores, 1988, Plant Physiology 86: 506.

Para expressão constitutiva, os promotores de 3 5-CaMV, ubiquitina 1 de milho e actina 1 de arroz podem ser usados (Franck e colaboradores, 1980, Cell 21: 285-294, Christensen e colaboradores, 1992, Plant Mol. Biol. 18: 675-689; Zhang e colaboradores, 1991, Plant Cell 3: 1155-1165). Promotores órgão-específicos podem ser, por exemplo, um promotor de tecidos de retenção de armazenamento, tais como sementes, batata, tubérculos e frutos (Edwards & Coruzzi, 1990, Ann. Rev. Genet. 24: 275-303) ou de tecidos de retenção metabólica, tais como meristemas (Ito e colaboradores, 1994, Plant Mol. Biol. 24: 863-878), um promotor semente- específico, tal como os promotores de glutelina, prolamina, globulina ou albumina de arroz (Wu e colaboradores, 1998, Plant and Cell Physiology 39: 885-889), um promotor de Vicia faba da legumina B4 e o gene de proteína de semente desconhecida de Vicia faba (Conrad e colaboradores, 1998, Journal of Plant Physiology 152: 708- 711), um promotor de uma proteína de corpo óleo de semente (Chen e colaboradores, 1998, Plant and Cell Physiology 39: 935-941), o promotor napA de proteína de armazenamento de Brassica napus ou qualquer outro promotor semente-específico conhecido na técnica, por exemplo, conforme descrito no WO 91/14772. Além disso, o promotor pode ser um promotor folha-específico, tal como o promotor rbcs de arroz ou tomate (Kyozuka e colaboradores, 1993, Plant Physiology 102: 991-1000), o promotor do gene de metiltransferase de adenina do vírus chlorella (Mitra e Higgins, 1994, Plant Molecular Biology 26: 85-93) ou o protomor do gene aldP de arroz (Kagaya e colaboradores, 1995, Molecular and General Genetics 248: 668-674) ou um promotor ferida-induzível, tal como o promotor pin2 de batata (Xu e colaboradores, 1993, Plant Molecular Biology 22: 573-588). Da mesma forma, o promotor pode ser induzível por tratamentos abióticos, tais como temperatura, estiagem ou alterações na salinidade ou induzido por substâncias exogenamente aplicadas que ativam o promotor, por exemplo, etanol, estrogênios, hormônios vegetais, tais como etileno, ácido abscísico e ácido giberélico e metais pesados.

Um elemento intensificador promotor também pode ser usado para obter maior expressão de um polipeptídeo da presente invenção na planta. Por exemplo, o elemento intensificador promotor pode ser um íntron o qual é colocado entre o promotor e a seqüência de nucleotídeo que codifica um polipeptídeo da presente invenção, por exemplo, Xu e colaboradores, 1993, supra, divulgam o uso do primeiro íntron do gene de actina 1 de arroz para intensificar expressão.

O gene marcador selecionável e quaisquer outras partes da construção de expressão podem ser escolhidos daqueles disponíveis na técnica.

A construção de ácido nucleico é incorporada no genoma da planta de acordo com métodos convencionais conhecidos na técnica, incluindo transformação Agrobacterium-mediada, transformação vírus- mediada, microinjeção, bombardeamento de partícula, transformação biolística e eletroporação (Gasser e colaboradores, 1990, Science 244: 1293; Potrykus, 1990, Bio/Technology 8: 535; Shimamoto e colaboradores, 1989, Nature 338: 274).

Presentemente, transferência gene de Agrobacterium tumefaciens-mediada é o método de escolha para geração de dicots transgênicas (para uma revisão, veja Hooykas e Schilperoort, 1992, Plant Molecular Biology 19: 15-38) e pode também ser usado para transformação de monocots, embora outros métodos de transformação sejam freqüentemente usados para essas plantas. Presentemente, o método de escolha para geração de monocots transgênicas é bombardeamento de partícula (partículas microscópicas de ouro ou tungstênio revestidas com o DNA de transformação) de caules embriônicos ou embriões em desenvolvimento (Christou, 1992, Plant Journal 2: 275-281; Shimamoto, 1994, Current Opinion Biotechnology 5: 158-162; Vasil e colaboradores, 1992, Bio/Technology 10: 667-674). Um método alternativo para transformação de monocots é baseado em transformação de protoplasta, conforme descrito por Omirulleh e colaboradores, 1993, Plant Molecular Biology 21: 415-428. Após transformação, os transformantes tendo incorporada a construção de expressão são selecionados e regenerados em plantas inteiras de acordo com métodos bem conhecidos na técnica.

Freqüentemente, o procedimento de transformação é projetado para a eliminação seletiva de genes de seleção, durante regeneração ou nas gerações seguintes através de uso, por exemplo, de co-transformação com duas construções de T-DNA distintas ou excisão sítio-específica do gene de seleção por uma recombinase específica. A presente invenção também se refere a métodos para produção de um polipeptídeo da presente invenção compreendendo (a) cultura de uma planta ou uma célula de planta transgênica compreendendo um polinucleotídeo que codifica um polipeptídeo tendo atividade antimicrobiana da presente invenção sob condições condutivas à produção do polipeptídeo; e (b) recuperação do polipeptídeo.

Composições

A presente invenção também se refere à composições, tais como composições farmacêuticas, compreendendo um polipeptídeo da presente invenção. De preferência, as composições são enriquecidas em tal polipeptídeo. O termo "enriquecida" indica que a atividade antimicrobiana da composição foi aumentada, por exemplo, com um fator de enriquecimento de 1,1.

As composições podem ainda compreender outro agente farmaceuticamente ativo, tal como um agente biocida ou biostático adicional, tal como outro polipeptídeo antimicrobiano exibindo atividade antimicrobiana conforme definido acima. O agente biocida pode ser um antibiótico, conforme conhecido na técnica. Classes de antibióticos incluem penicilinas, por exemplo, penicilina G, penicilina V, meticilina, oxacilina, carbenicilina, nafcilina, ampicilina, etc.; penicilinas em combinação com inibidores de beta- lactamase, cefalosporinas, por exemplo, cefaclor, cefazolina, cefuroxima, moxalactam, etc.; carbapenems; monobactames; aminoglicosídeos; tetraciclinas; macrolídeos; lincomicinas; polimixinas; sulfonamidas; quinolonas; cloranfenical; metronidazola; espectinomicina; trimetoprim; vancomicina; etc. O agente biocida pode também ser um agente anti-micótico, incluindo polienos, por exemplo, anfotericina B, nistatina; 5-flucosina; e azolas, por exemplo, miconazol, cetoconazol, itraconazol e fluconazol.

Em uma modalidade, o agente biocida é um agente químico não-enzimático. Em outra modalidade, o agente biocida é um agente químico não-polipeptídico.

As composições podem compreender um material veículo adequado. As composições também podem compreender um veículo de distribuição adequado capaz de distribuição dos polipeptídeos antimicrobianos da invenção ao locus desejado quando as composições são usadas como um medicamento.

As composições de polipeptídeo podem ser preparadas de acordo com métodos conhecidos na técnica e podem estar na forma de um líquido ou uma composição seca. Por exemplo, a composição de polipeptídeo pode estar na forma de um granulado ou um microgranulado. O polipeptídeo a ser incluído na composição pode ser estabilizado de acordo com métodos conhecidos na técnica.

Exemplos são fornecidos abaixo de usos preferidos das composições de polipeptídeo da invenção. A dosagem da composição de polipeptídeo da invenção e outras condições sob as quais a composição é usada podem ser determinadas com base em métodos conhecidos na técnica.

Métodos e Usos

A presente invenção também é dirigida a métodos para uso dos polipeptídeos tendo atividade antimicrobiana. Os polipeptídeos antimicrobianos são, tipicamente, úteis em qualquer locus sujeito à contaminação por bactérias, fungos, levedo ou algas. Tipicamente, Ioci estão em sistemas aquosos, tais como sistemas de água de refrigeração, água de enxágüe de lavanderia, sistemas de óleo, tais como óleos de corte, lubrificantes, campos petrolíferos e semelhantes, onde microorganismos precisam ser mortos ou onde seu crescimento precisa ser controlado. Contudo, a presente invenção também pode ser usada em todas as aplicações para as quais composições antimicrobianas conhecidas são úteis, tais como proteção de madeira, látex, adesivo, cola, papel, papelão, têxtil, couro, plásticos, calafetagem e ração.

Outros usos incluem preservação de alimentos, bebidas, cosméticos, tais como loções, cremes, géis, pomadas, sabonetes, xampus, condicionadores, anti-transpirantes, desodorantes, anti-séptico bucal, produtos para lentes de contato, formulações enzimáticas ou ingredientes alimentícios.

Assim, os polipeptídeos antimicrobianos da invenção podem ser úteis como um desinfetante, por exemplo, no tratamento de infecções nos olhos ou na boca, infecções da pele; em anti-transpirantes ou desodorantes; para limpeza e desinfecção de lentes de contato e dentes (cuidados orais).

Em geral, considera-se que os polipeptídeos antimicrobianos da presente invenção são úteis para limpeza, desinfecção ou inibição de crescimento microbiano sobre qualquer superfície. Exemplos de superfícies as quais podem, vantajosamente, ser contatadas com os polipeptídeos antimicrobianos da invenção são superfícies de equipamento de processo usado, por exemplo, fábricas de processo de produtos lácteos, químicos ou farmacêuticos, sistemas de sanitarização de água, fábricas de processamento de óleo, fábricas de processamento de polpa de papel, fábricas de tratamento de água e torres de refrigeração. Os polipeptídeos antimicrobianos da invenção deverão ser usados em uma quantidade a qual é eficaz para limpeza, desinfecção ou inibição de crescimento microbiano sobre a superfície em questão.

Os polipeptídeos antimicrobianos da invenção podem, adicionalmente, ser usados para limpeza de superfícies e utensílios de cozinha em fábricas de processamento de alimento e em qualquer área na qual alimento é preparado ou servido, tais como hospitais, casas de repouso e restaurantes.

Eles também podem ser usados como um agente conservante ou um agente de desinfecção em tintas baseadas em água.

A invenção se refere ao uso de um polipeptídeo antimicrobiano ou composição da invenção como um medicamento. Ainda, um polipeptídeo antimicrobiano ou composição da invenção também pode ser usada para a fabricação de um medicamento para controle ou combate de microorganismos, tais como organismos fungicos ou bactérias, de preferência bactérias gram positivas.

A composição e polipeptídeo antimicrobiano da invenção podem ser usados como um agente terapêutico ou profilático antimicrobiano humano ou veterinário. Assim, a composição e polipeptídeo antimicrobiano da invenção podem ser usados no preparo de agentes terapêuticos ou agentes profiláticos humanos ou veterinários para o tratamento de infecções microbianas, tais como infecções bacterianas ou fungicas, de preferência infecções bacterianas gram positivas. Em particular, as infecções microbianas podem estar associadas à doenças do pulmão incluindo, mas não limitado a, tuberculose, pneumonia e fibrose cística; e doenças sexualmente transmissíveis incluindo, mas não limitado a, gonorréia e clamídia.

A composição da invenção compreende uma quantidade eficaz do polipeptídeo antimicrobiano da invenção.

O termo "quantidade eficaz", quando usado aqui, se destina a significar uma quantidade dos polipeptídeos antimicrobianos da invenção a qual é suficiente para inibir o crescimento dos microorganismos em questão.

A invenção também se refere à composições para cicatrização de ferimentos ou produtos tais como bandagens, dispositivos médicos tais como, por exemplo, cateteres e ainda a produtos anti-caspa para os cabelos, tais como xampus. Formulações dos polipeptídeos antimicrobianos da invenção são administradas a um hospedeiro sofrendo de ou pré-disposto a uma infecção microbiana. Administração pode ser tópica, localizada ou sistêmica, dependendo do microorganismo específico, de preferência, ela será localizada. Geralmente, a dose dos polipeptídeos antimicrobianos da invenção será suficiente para diminuir a população microbiana em pelo menos cerca de 50%, usualmente em pelo menos 1 Iog e pode ser em 2 ou mais Iogs de morte.

Os compostos da presente invenção são administradas em uma dosagem que reduz a população microbiana, ao mesmo tempo em que minimiza quaisquer efeitos colaterais. Considera-se que a composição será obtida e usada sob a orientação de um médico para uso in vivo. Os polipeptídeos antimicrobianos da invenção são particularmente úteis para matar bactérias gram negativas, incluindo Pseudomonas aeruginosa e Chlamydia trachomatis; e bactérias gram positivas, incluindo estreptococos, tais como Streptococcus pneumonia, S. uberis, S. hyointestinalis, S. pyogenes e S. agalaetiae; e estafilococos, tais como Staphylocoeeus aureus, S. epidermidis, S. simulans, S. xylosus e S. earnosus.

Formulações dos polipeptídeos antimicrobianos da invenção podem ser administradas a um hospedeiro sofrendo de ou pré-disposto a uma infecção microbiana do pulmão, tal como pneumonia; ou a uma infecção microbiana em um ferimento, tal como uma infecção bacteriana em um ferimento.

Formulações dos polipeptídeos antimicrobianos da invenção também podem ser administradas a um hospedeiro sofrendo de ou pré- disposto a uma infecção da pele, tal como acne, dermatite atópica ou dermatite seborréica; de preferência, a infecção da pele é uma infecção bacteriana da pele, por exemplo, causada por Staphylocoeeus epidermidis, Staphylocoeeus aureus, Propionibacterium acnes, Pityrosporum ovale ou Malassezia furfur. Os polipeptídeos antimicrobianos da invenção também são úteis para formulações in vivo para matar micróbios, particularmente onde não se deseja introduzir quantidades de antibióticos convencionais. Por exemplo, os polipeptídeos antimicrobianos da invenção podem ser adicionados a preparados alimentícios para animais e/ou seres humanos; ou eles podem ser incluídos como um aditivo para culturas de células in vitro, para prevenir o crescimento de micróbios em cultura tecidual.

A suscetibilidade de um micróbio particular à morte com os polipeptídeos antimicrobianos da invenção pode ser determinada através de testagem in vitro, conforme detalhado na seção experimental. Tipicamente, uma cultura do micróbio é combinada com o peptídeo antimicrobiano em concentrações variadas durante um período de tempo suficiente para permitir que a proteína atue, usualmente entre cerca de uma hora e um dia. Os micróbios viáveis são, então, contados e o nível de morte determinado.

Micróbios de interesse incluem, mas não estão limitados a, bactérias Gram-negativas, por exemplo: Citrobacter sp.; Enterobaeter sp.; Escheriehia sp., por exemplo, E. eoli; Klebsiella sp.; Morganella sp.; Proteus sp.; Providencia sp.; Salmonella sp., por exemplo, S. typhi, S. typhimurium; Serratia sp.; Shigella sp.; Pseudomonas sp., por exemplo, P. aeruginosa; Yersinia sp., por exemplo, Y. pestis, Y. pseudotubereulosis, Y. enterocolitica; Franciscella sp.; Pasturella sp.; Vibrio sp., por exemplo, V. eholerae, V. parahemolytieus; Campylobaeter sp., por exemplo, C. jejum; Haemophilus sp., por exemplo, H. influenzae, H. duereyi; Bordetella sp., por exemplo, B. pertussis, B. bronchiseptica, B. parapertussis; Brueella sp., Neisseria sp., por exemplo, N. gonorrhoeae, N. meningitidis, etc. Outras bactérias de interesse incluem Legionella sp., por exemplo, L. pneumophila; Listeria sp., por exemplo, L. monoeytogenes; Myeoplasma sp., por exemplo, M. hominis, M. pneumoniae; Mycobaeterium sp., por exemplo, M tubereulosis, M. leprae; Treponema sp., por exemplo, T. pallidum; Borrelia sp., por exemplo, B. burgdorferi; Leptospirae sp.; Rickettsia sp., por exemplo, R. rickettsii, R. typhi; Chlamydia sp., por exemplo, C. trachomatis, C. pneumoniae, C. psittaci; Helicobaeter sp., por exemplo, H. pylori, etc.

Patógenos não-bacterianos de interesse incluem patógenos fungicos e protozoários, por exemplo, Plasmodia sp., por exemplo, P. fàleiparum, Trypanosoma sp., por exemplo, T. brucei\ cistossomas; Entaemoeba sp., Cryptococcus sp., Candida sp., por exemplo, C. albieans\ etc.

Vários métodos para administração podem ser empregados. A formulação de polipeptídeo pode ser fornecida oralmente ou pode ser injetada intravascularmente, subcutaneamente, peritonealmente, através de aerossol, oftalmicamente, intra-bexiga, topicamente, etc. Por exemplo, métodos de administração através de inalação são bem conhecidos na técnica. A dosagem da formulação terapêutica variará amplamente, dependendo do polipeptídeo antimicrobiano específico a ser administrado, da natureza da doença, da freqüência de administração, da maneira de administração, da eliminação do agente do hospedeiro e semelhantes. A dose inicial pode ser maior, seguido por doses de manutenção menores. A dose pode ser administrada tão infreqüentemente quanto semanalmente ou bi-semanalmente ou fracionada em doses menores e administrada uma ou várias vezes ao dia, semi- semanalmente, etc. para manter um nível de dosagem eficaz. As ligações de amida, bem como os amino e carbóxi términos, podem ser modificados para maior estabilidade quando de administração oral. Por exemplo, o carbóxi término pode ser amidado.

Formulações

Os compostos da presente invenção podem ser incorporados em uma variedade de formulações para administração terapêutica. Mais particularmente, os compostos da presente invenção podem ser formulados em composições farmacêuticas através de combinação com veículos ou diluentes farmaceuticamente aceitáveis apropriados e podem ser formulados em preparados nas formas sólida, semi-sólida, líquida ou gasosa, tais como tabletes, cápsulas, pós, grânulos, pomadas, cremes, espumas, soluções, supositórios, injeções, inalantes, géis, microesferas, loções e aerossóis. Como tal, administração dos compostos pode ser obtida de várias formas, incluindo administração oral, bucal, retal, parenteral, intraperitoneal, intradérmica, transdérmica, intraqueal, etc. Os polipeptídeos antimicrobianos da invenção podem ser sistêmicos após administração ou podem ser localizados através do uso de um implante ou outra formulação que atua para reter a dose ativa no local de implante.

Em uma modalidade, uma formulação para uso tópico compreende um agente de quelação que diminui a concentração eficaz de cátions divalentes, particularmente cálcio e magnésio. Por exemplo, agentes tais como citrato, EGTA ou EDTA podem ser incluídos, onde citrato é preferido. A concentração de citrato usualmente será de cerca de 1 a 10 mM.

Os compostos da presente invenção podem ser administrados sozinhos, em combinação uns com os outros ou eles podem ser usados em combinação com outros compostos conhecidos (por exemplo, perforina, agentes anti-inflamatórios, antibióticos, etc.). Em formas de dosagem farmacêuticas, os compostos podem ser administrados na forma de seus sais farmaceuticamente aceitáveis. Os métodos e excipientes a seguir são meramente exemplificativos e não são, de qualquer forma, limitativos.

Para preparados orais, os compostos podem ser usados sozinhos ou em combinação com aditivos apropriados para fazer tabletes, pós, grânulos ou cápsulas, por exemplo, com aditivos convencionais, tais como lactose, manitol, amido de milho ou amido de batata; com aglutinantes, tais como celulose cristalina, derivados de celulose, acácia, amido de milho ou gelatinas; com desintegrantes, tais como amido de milho, amido de batata ou carbóximetil celulose de sódio; com lubrificantes, tais como talco ou estearato de magnésio; e, se desejado, com diluentes, agentes de tamponamento, agentes umidificantes, conservantes e agentes de flavorização.

Os compostos podem ser formulados em preparados para injeções através de dissolução, suspensão ou emulsificação dos mesmos em um solvente aquoso ou não aquoso, tal como óleos vegetais ou outros similares, glicerídeos de ácido alifático sintéticos, ésteres de ácidos alifáticos superiores ou propileno glicol; e, se desejado, com aditivos convencionais, tais como solubilizantes, agentes isotônicos, agentes de suspensão, agentes de emulsificação, estabilizantes e conservantes.

Os compostos podem ser utilizados na formulação em aerossol a ser administrada via inalação. Os compostos da presente invenção podem ser formulados em propelentes pressurizados aceitáveis, tais como diclorodifluorometano, propano, nitrogênio e semelhantes.

Os compostos podem ser usados como loções, por exemplo, para prevenir infecção de queimaduras, através de formulação com aditivos convencionais, tais como solubilizantes, agentes isotônicos, agentes de suspensão, agentes de emulsificação, estabilizantes e conservantes.

Além disso, os compostos podem ser transformados em supositórios através de mistura com uma variedade de bases, tais como bases de emulsificação ou bases solúveis em água. Os compostos da presente invenção podem ser administrados retalmente via um supositório. O supositório pode incluir veículos, tais como manteiga de cacau, carboceras e polietileno glicóis, os quais derretem em temperatura corporal, enquanto que são solidificados em temperatura ambiente.

Formas de dosagem unitária para administração oral ou retal, tais como xaropes, elixires e suspensões podem ser proporcionadas, em que cada unidade de dosagem, por exemplo, colher de chá, colher de sopa, tablete ou supositório, contém uma quantidade predeterminada da composição contendo um ou mais compostos da presente invenção, similarmente, formas de dosagem unitária para injeção ou administração intravenosa podem compreender o composto da presente invenção em uma composição como uma solução em água estéril, solução salina normal ou outro veículo farmaceuticamente aceitável.

Implantes para formulações com liberação sustentada são bem conhecidos na técnica. Implantes são formulados como microesferas, placas, etc. com polímeros biodegradáveis ou não biodegradáveis. Por exemplo, polímeros de ácido láctico e/ou ácido glicólico formam um polímero passível de erosão que é bem tolerado pelo hospedeiro. O implante contendo os polipeptídeos antimicrobianos da invenção é colocado em proximidade ao local de infecção, de modo que a concentração local de agente ativo seja aumentada com relação ao resto do corpo.

O termo "forma de dosagem unitária", conforme usado aqui, se refere à unidades fisicamente distintas adequadas como dosagens unitárias para indivíduos humanos e animais, cada unidade contendo uma quantidade predeterminada de compostos da presente invenção calculada em uma quantidade suficiente para produzir o efeito desejado em associação com um diluente, carreador ou veículo farmaceuticamente aceitável. As especificações para as formas de dosagem unitária da presente invenção dependem do composto empregado em particular e do efeito a ser obtido e da farmacodinâmica associada ao composto no hospedeiro.

Os excipientes farmaceuticamente aceitáveis, tais como veículos, adjuvantes, carreadores ou diluentes, estão prontamente disponíveis ao público. Além disso, substâncias auxiliares farmaceuticamente aceitáveis, tais como agentes para ajuste de pH e tamponamento, agentes para ajuste de tonicidade, estabilizantes, agentes de umedecimento e semelhantes, estão prontamente disponíveis ao público.

Dosagens típicas para administração sistêmica oscilam de 0,1 pg a 100 miligramas por kg de peso do indivíduo por administração. Uma dosagem típica pode ser um tablete tomado de duas a seis vezes ao dia ou uma cápsula ou tablete de liberação com o tempo tomado uma vez ao dia contendo um teor proporcionalmente maior de ingrediente ativo. O efeito de liberação com o tempo pode ser obtido por materiais da cápsula que dissolvem em diferentes valores de pH, por cápsulas que liberam lentamente através de pressão osmótica ou através de quaisquer outros meios conhecidos de liberação controlada.

Aqueles habilitados apreciarão prontamente que níveis de dose podem variar como uma função do composto específico, a gravidade dos sintomas e a suscetibilidade do indivíduo ao efeitos colaterais. Alguns dos compostos são mais potentes do que outros. Dosagens preferidas para um determinado composto são prontamente determináveis por aqueles habilitados na técnica através de uma variedade de meios. Um meio preferido é medir a potência fisiológica de um determinado composto.

O uso de lipossomas como um veículo de distribuição é um método de interesse. Os lipossomas se fundem com as células do sítio alvo e distribuem os conteúdos do lúmen intracelularmente. Os lipossomas são mantidos em contato com as células durante um tempo suficiente para fusão, usando vários meios para manter contato, tais como isolamento, agentes de ligação e semelhantes. Em um aspecto da invenção, lipossomas são projetados para serem aerossolizados para administração pulmonar. Lipossomas podem ser preparados com proteínas purificadas ou peptídeos que mediam fusão de membranas, tal como vírus Sendai ou vírus da influenza, etc. Os lipídios podem ser qualquer combinação útil de lipídios conhecidos que formam lipossomas, incluindo lipídios catiônicos ou zwiteriônicos, tal como fosfatidilcolina. O lipídio restante será, normalmente, lipídios neutros ou ácidos, tais como colesterol, fosfatidil serina, fosfatidil glicerol e semelhantes.

Para preparo de lipossomas, o procedimento descrito por Kato e colaboradores (1991) J. Biol. Chem. 266: 3361 pode ser usado. Resumidamente, os lipídios e composição de lúmen contendo peptídeos são combinados em um meio aquoso apropriado, convenientemente um meio salino, onde os sólidos totais estarão na faixa de cerca de 1-10 por cento em peso. Após agitação intensa durante curtos períodos de tempo, de cerca de 5- 60 seg, o tubo é colocado em um banho de água morna, de cerca de 25-40 0C e esse ciclo é repetido de cerca de 5-10 vezes. A composição é, então, submetida a ultra-som durante um período de tempo conveniente, geralmente de cerca de 1-10 seg. e pode ser ainda agitada através de vórtice. O volume é, então, expandido através de. adição de meio aquoso, geralmente aumentando o volume em cerca de 1-2 vezes, seguido por agitação e resfriamento. Esse método permite a incorporação, no lúmen, de moléculas de elevado peso molecular.

Formulações com Outros Agentes Ativos

Para uso nos métodos em questão, os polipeptídeos antimicrobianos da invenção podem ser formulados com outros agentes farmaceuticamente ativos, particularmente outros agentes antimicrobianos. Outros agentes de interesse incluem uma ampla variedade de antibióticos, conforme conhecido na técnica. Classes de antibióticos incluem penicilinas, por exemplo, penicilina G, penicilina V, meticilina, oxacilina, carbenicilina, nafcilina, ampicilina, etc.; penicilinas em combinação com inibidores de beta- lactamase, cefalosporinas, por exemplo, cefaclor, cefazolina, cefuroxima, moxalactam, etc.; carbapenems; monobactames; aminoglicosídeos; tetraciclinas; macrolídeos; lincomicinas; polimixinas; sulfonamidas; quinolonas; cloranfenical; metronidazola; espectinomicina; trimetoprim; vancomicina; etc.

Agentes anti-micóticos também são úteis, incluindo polienos, por exemplo, anfotericina B, nistatina; 5-flucosina; e azolas, por exemplo, miconazol, cetoconazol, itraconazol e fluconazol. Fármacos anti- tuberculóticos incluem isoniazid, etambutol, estreptomicina e rifampina. Citocinas também podem ser incluídas em uma formulação dos polipeptídeos antimicrobianos da invenção, por exemplo, interferon gama, fator alfa de necrose de tumor, interleucina 2, etc.

Síntese in vitro

Os peptídeos antimicrobianos da invenção podem ser preparados através de síntese in vitro, usando métodos convencionais conforme conhecido na técnica. Vários aparelhos sintéticos comerciais estão disponíveis, por exemplo, sintetizadores automáticos pela Applied Biosystems Inc., Beckman, etc. Através de uso de sintetizadores, aminoácidos que ocorrem naturalmente podem ser substituídos por aminoácidos não naturais, particularmente D-isômeros (ou D-formas), por exemplo, D-alanina e D-isoleucina, diastereoisômeros, cadeias laterais tendo diferentes comprimentos ou funcionalidades e semelhantes. A seqüência particular e a maneira de preparo serão determinados pela conveniência, aspectos econômicos, pureza requerida e semelhantes.

Ligação química pode ser proporcionada a vários peptídeos ou proteínas compreendendo funcionalidades convenientes para ligação, tais como grupos amino para formação de amida ou amida substituída, por exemplo, aminação redutiva, grupos tiol para formação de tioéter ou dissulfeto, grupos carboxila para formação de amida e semelhantes.

Se desejado, vários grupos podem ser introduzidos no peptídeo durante síntese ou durante expressão, os quais permitem ligação à outras moléculas ou a uma superfície. Assim, cisteínas podem ser usadas para fazer tioéteres, histidinas para ligação a um complexo de íons de metal, grupos carboxila para formação de amidas ou ésteres, grupos amino para formação de amidas e semelhantes.

Os polipeptídeo também podem ser isolados e purificados de acordo com métodos convencionais de síntese recombinante. Um lisado pode ser preparado do hospedeiro de expressão e o lisado purificado usando HPLC, cromatografia de exclusão, eletroforese em gel, cromatografia por afinidade ou outra técnica de purificação. Em sua maioria, as composições as quais são usadas compreenderão pelo menos 20% em peso do produto desejado, mais usualmente pelo menos cerca de 75% em peso, de preferência pelo menos cerca de 95% em peso e, para fins terapêuticos, usualmente pelo menos cerca de 99,5% em peso, com relação aos contaminantes relacionados ao método de preparo do produto e sua purificação. Usualmente, os percentuais serão baseados na proteína total.

Ração para Animal

A presente invenção é também dirigida a métodos para uso dos polipeptídeos tendo atividade antimicrobiano em ração para animal, bem como à composições de ração e aditivos para ração compreendendo os polipeptídeos antimicrobianos da invenção.

O termo animal inclui todos os animais, incluindo seres humanos. Exemplos de animais são não-ruminantes e ruminantes, tais como vacas, ovelhas e cavalos. Em uma modalidade particular, o animal é um animal não-ruminante. Animais não-ruminantes incluem animais mono- gástricos, por exemplo, porcos ou suínos (incluindo, mas não limitado a, leitões, porcos em crescimento e porcas); aves, tais como perus e galinhas (incluindo, mas não limitado a, aves para abate, poedeiras); bezerros jovens; e peixe (incluindo, mas não limitado a, salmão).

O termo ração ou composição de ração significa qualquer composto, preparado, mistura ou composição adequada para ou destinada à ingestão por um animal.

No uso de acordo com a invenção, o polipeptídeo antimicrobiano pode ser alimentado ao animal antes, após ou simultaneamente com a dieta. O último é preferido.

Em uma modalidade particular, o polipeptídeo antimicrobiano, na forma na qual ele é adicionado à ração ou quando estando incluído em um aditivo para ração, é bem definido. Bem definido significa que o preparado de polipeptídeo antimicrobiano é pelo menos 50% puro, conforme determinado através de cromatografia por exclusão de tamanho (veja Exemplo 12 do WO 01/58275). Em outras modalidades particulares, o preparado de polipeptídeo antimicrobiano é pelo menos 60, 70, 80, 85, 88, 90, 92, 94 ou pelo menos 95% puro, conforme determinado através desse método.

Um preparado de polipeptídeo antimicrobiano bem definido é vantajoso. Por exemplo, é muito mais fácil dosar corretamente à ração um polipeptídeo antimicrobiano que é essencialmente livre de polipeptídeos antimicrobianos de interferência ou outros contaminantes. O termo dosar corretamente se refere, em particular, ao objetivo de obtenção de resultados consistentes e constantes e à capacidade de otimizar a dosagem baseado no efeito desejado.

Para o uso em ração para animal, contudo, o polipeptídeo antimicrobiano não precisa ser aquele puro; ele pode, por exemplo, incluir outras enzimas, caso no qual ele poderia ser denominado um preparado de polipeptídeo antimicrobiano.

O preparado de polipeptídeo antimicrobiano pode ser (a) adicionado diretamente à ração (ou usado diretamente em um processo de tratamento de proteínas vegetais) ou (b) pode ser usado na produção de uma ou mais composições intermediárias, tais como aditivos para ração ou pré- misturas, que são subseqüentemente adicionados à ração (ou usados em um processo de tratamento). O grau de pureza descrito acima se refere à pureza do preparado de polipeptídeo antimicrobiano original, quer usado de acordo com (a) ou (b) acima.

Preparados de polipeptídeo antimicrobiano com purezas dessa ordem de magnitude são, em particular, obteníveis usando métodos de produção recombinante, enquanto que eles não são tão facilmente obtidos e, assim, estão sujeitos a uma variação lote-a-lote maior quando o polipeptídeo antimicrobiano é produzido através de métodos de fermentação tradicionais.

Tal preparado de polipeptídeo antimicrobiano pode, naturalmente, ser misturado com outras enzimas.

O termo proteínas vegetais, conforme usado aqui, se refere a qualquer composto, composição, preparado ou mistura que inclui pelo menos uma proteína derivada de ou originária de um vegetal, incluindo proteínas modificadas e derivados de proteína. Em modalidades particulares, o teor de proteína das proteínas vegetais é de pelo menos 10, 20, 30, 40, 50, ou 60% (peso/peso).

Proteínas vegetais podem ser derivadas de fontes de proteína vegetal, tais como legumes e cereais, por exemplo, materiais de plantas das famílias Fabaceae (Leguminosae), Cruciferaceae, Chenopodiaceae e Poaceae, tais como farinha de soja, farinha de lúpulo e farinha de colza.

Em uma modalidade particular, a fonte de proteína vegetal é material de uma ou mais plantas da família Fabaceae, por exemplo, soja, lúpulo, ervilha ou feijão.

Em outra modalidade particular, a fonte de proteína vegetal é material de uma ou mais plantas da família Chenopodiaeeae, por exemplo, beterraba, beterraba sacarínica, espinafre ou quinoa.

Outros exemplos de fontes de proteína vegetal são colza e couve.

Soja é uma fonte de proteína vegetal preferida.

Outros exemplos de fontes de proteína vegetal são cereais, tais como cevada, trigo, centeio, aveia, milho (milho), arroz e sorgo.

O polipeptídeo antimicrobiano pode ser adicionado à ração em qualquer forma, seja como um polipeptídeo antimicrobiano relativamente puro ou em mistura com outros componentes destinados à adição à ração para animal, isto é, na forma de aditivos de ração para animal, tais como as assim denominadas pré-misturas para ração para animal. Em um outro aspecto, a presente invenção se refere à composições para uso em ração para animal, tal como ração para animal e aditivos de ração para animal, por exemplo, pré-misturas.

Além do polipeptídeo antimicrobiano da invenção, os aditivos de ração para animal da invenção contêm pelo menos um a vitamina solúvel em gordura e/ou pelo menos uma vitamina solúvel em água e/ou pelo menos um mineral residual e/ou pelo menos um macro mineral.

Ainda, ingredientes aditivos para ração opcionais são agentes de coloração, compostos aromáticos, estabilizantes e/ou pelo menos uma outra enzima selecionada dentre as fitases EC 3.1.3.8 ou 3.1.3.26; xilanases EC 3.2.1.8; galactanases EC 3.2.1.89; e/ou beta-glucanases EC 3.2.1.4.

Em uma modalidade particular, essas outras enzimas são bem definidas (conforme definido acima para preparados de polipeptídeo antimicrobiano).

Exemplos de outros peptídeos antimicrobianos (AMPs) são CAP18, Leucocina A, Tritrpticina, Protegrina-1, Tanatina, Defensina, Ovispirina, tal como Novispirina (Robert Lehrer, 2000) e variantes ou fragmentos dos mesmos os quais retêm atividade antimicrobiana.

Exemplos de outros polipeptídeos antifungicos (AFPs) são os peptídeos de Aspergillus giganteus e Aspergillus niger, bem como variantes e fragmentos dos mesmos os quais retêm atividade antifungica, conforme divulgado no WO 94/01459 e WO 02/090384.

Usualmente, vitaminas solúveis em gordura e água, bem como minerais residuais, formam parte de uma assim denominada pré-mistura destinada à adição à ração, enquanto que macro minerais são usualmente adicionados separadamente à ração. Qualquer um desses tipos de composição, quando enriquecida com um polipeptídeo antimicrobiano da invenção, é um aditivo de ração para animal da invenção..

Em uma modalidade particular, o aditivo de ração para animal da invenção se destina a ser incluído (ou prescrito como tendo sido incluído) em dietas ou ração para animal em níveis de 0,01 a 10,0%; mais particularmente 0,05 a 5,0%, ou 0,2 a 1,0% (% significando g de aditivo por 100 g de ração). Isso é, assim, em particular para pré-misturas.

O seguinte são listas não exclusivas de exemplos desses componentes:

Exemplos de vitaminas solúveis em gordura são vitamina a, vitamina D3, vitamina E e vitamina K, por exemplo, vitamina K3.

Exemplos de vitaminas solúveis em água são vitamina B12, biotina e colina, vitamina B1, vitamina B2, vitamina B6, niacina, ácido fólico e pantotenato, por exemplo, Ca-D-pantotenato.

Exemplos de minerais residuais são manganês, zinco, ferro, cobre, iodo, selênio e cobalto.

Exemplos de macro minerais são cálcio, fósforo e sódio.

Os requisitos nutricionais desses componentes (exemplificado em aves e leitões/porcos) são listados na Tabela A do WO 01/58275. Requisito nutricional significa que esses componentes deverão ser fornecidos na dieta nas concentrações indicadas.

Alternativamente, o aditivo de ração para animal da invenção compreende pelo menos um dos componentes individuais especificados na Tabela A do WO 01/58275. Pelo menos um significa qualquer um de, um ou mais de, um ou dois ou três ou quatro e assim por diante até todos os treze ou até todos os quinze componentes individuais. Mais especificamente, esse pelo menos um componente individual é incluído no aditivo da invenção em uma quantidade tal de modo a proporcionar uma concentração na-ração dentro da faixa indicada na coluna quatro ou coluna cinco ou coluna seis da Tabela A.

A presente invenção também se refere à composições de ração para animal. Composições de ração para animal ou dietas têm um teor relativamente alto de proteína. Dietas para ave e porco podem ser caracterizadas conforme indicado na Tabela B do WO 01/58275, colunas 2-3. Dietas para peixe podem ser caracterizadas conforme indicado na coluna 4 dessa Tabela B. Além disso, tais dietas para peixe usualmente têm um teor de gordura bruta de 200-310 g/kg.

Uma composição de ração para animal de acordo com a invenção tem um teor de proteína bruta de 50-800 g/kg e, além disso, compreende pelo menos um polipeptídeo antimicrobiano conforme reivindicado aqui.

Além disso oú alternativamente (ao teor de proteína bruta indicado acima), a composição de ração para animal da invenção tem um teor de energia metabolizável de 10-30 MJ/kg; e/ou um teor de cálcio de 0,1-200 g/kg; e/ou um teor de fósforo disponível de 0,1-200 g/kg; e/ou um teor de metionina de 0,1-100 g/kg; e/ou um teor de metionina mais cisteína de 0,1- 150 g/kg; e/ou um teor de lisina de 0,5-50 g/kg.

Em modalidades particulares, o teor de energia metabolizável, proteína bruta, cálcio, fósforo, metionina, metionina mais cisteína e/ou lisina está dentro de qualquer uma das faixas 2, 3, 4 ou 5 na Tabela B do WO 01/58275 (R. 2-5).

Proteína bruta é calculada como nitrogênio (N) multiplicado por um fator de 6,25, isto é, Proteína bruta (g/kg) = N (g/kg) χ 6,25. O teor de nitrogênio é determinado através do método de Kjeldahl (A.O.A.C, 1984, Official Methods of Analysis 14a ed., Association of Official Analytical Chemists, Washington DC).

Energia metabolizável pode ser calculada com base na Publicação NRC Nutrient Requirements in Swine, nona edição revista 1988, Subcommittee on Swine Nutrition, Committee on Animal Nutrition, Board of Agriculture, National Research Council. National Academy Press, Washington, D. C, páginas 2-6 e na Tabela Européia de Valores de Energia para Matérias Alimentícias para Aves, Spelderholt Centre for Poultry Research and Extension, 7361 DA Beekbergen, Países Baixos. Grafisch bedrijf Ponsen & looijen bv, Wageningen. ISBN 90-71463-12-5.

O teor dietético de cálcio, fósforo disponível e aminoácidos em dietas completas para animal é calculado com base em tabelas de ração, tais como Veevoedertabel 1997, Gegevens Over Chemische Samenstelling, Verteerbaarheid en Voederwaarde Van Voedermiddelen, Central Veevoederbureau, Runderweg 6, 8219 pk Lelystad. ISBN 90-72839-13-7.

Em uma modalidade particular, a composição de ração para animal da invenção contém pelo menos uma proteína ou fonte de proteína vegetal, conforme definido acima.

Em ainda outras modalidades particulares, a composição de ração para animal da invenção contém 0-80% de milho; e/ou 0-80% de sorgo; e/ou 0-70% de trigo; e/ou 0-70% de cevada; e/ou 0-30% de aveias; e/ou 0- 40% de farinha de soja; e/ou 0-10% de farinha de peixe; e/ou 0-20% de soro. Dietas para animal podem, por exemplo, ser fabricadas como ração amassada (não pelotizada) ou ração pelotizada. Tipicamente, as matérias alimentícias moídas são misturadas e quantidades suficientes de vitaminas e minerais essenciais são adicionadas de acordo com as especificações para a espécie em questão. Enzimas podem ser adicionadas como formulações enzimáticas sólidas ou líquidas. Por exemplo, uma formulação enzimática sólida é, tipicamente, adicionada antes ou durante a etapa de mistura; e um preparado enzimático líquido é, tipicamente, adicionado após a etapa de pelotização. A enzima pode também ser incorporada em um aditivo para ração ou pré- mistura.

A concentração final de enzima na dieta está dentro da faixa de 0,01-200 mg de proteína de enzima por kg de dieta, por exemplo, na faixa de 5-30 mg de proteína de enzima por kg de dieta para animal..

O peptídeo antimicrobiano pode ser administrado em uma ou mais das seguintes quantidades (faixas de dosagem): 0,01-200; ou 0,01-100; ou 0,05-100; ou 0,05-50; ou 0,10-10 - todas essas faixas sendo em mg de proteína de polipeptídeo antimicrobiano por kg de ração (ppm).

Para determinação do mg de proteína de polipeptídeo antimicrobiano por kg de ração, o polipeptídeo antimicrobiano é purificado da composição de ração e a atividade específica do polipeptídeo antimicrobiano purificado é determinada usando um ensaio relevante (veja sob atividade antimicrobiano, substratos e ensaios). A atividade antimicrobiano da composição de ração como tal é também determinada usando o mesmo ensaio e, com base nessas duas determinações, a dosagem em mg de proteína de polipeptídeo antimicrobiano por kg de ração é calculada.

Os mesmos princípios se aplicam para determinação de mg de proteína de polipeptídeo antimicrobiano em aditivos para ração. Naturalmente, se uma amostra está disponível do polipeptídeo antimicrobiano usado para preparo do aditivo para ração ou da ração, a atividade específica é determinada a partir dessa amostra (não precisa purificar o polipeptídeo antimicrobiano da composição de ração ou do aditivo).

A presente invenção é ainda descrito através dos exemplos a seguir os quais não deverão ser construídos como limitando o escopo da invenção.

EXEMPLOS

Produtos químicos usados como tampões e substratos eram produtos comerciais pelo menos de grau reagente.

EXEMPLO 1

Avaliação de Concentração Mínima Eficaz

Três polipeptídeos antimicrobianos, os quais são variantes de SEQ ID NO: 1, foram testados com relação à atividade antimicrobiano. Um ensaio de Concentração Mínima Eficaz (MEC, expresso como μg/mL) contra diferentes microorganismos foi realizado usando os três mutantes de plectasina, Y40YR, N17R e Y25R, seguindo o protocolo descrito no livro Methods in Molecular Biology, vol 78, Antibacterial peptide protocol William M. Shafer, Human Press.

O mutante de plectasina "Y40YR" foi construído através de adição de um resíduo de arginina à extremidade da seqüência de aminoácido de plectasina.

Os resultados mostraram atividade aperfeiçoada de todos os três peptídeos antimicrobianos comparado com plectasina do tipo selvagem (SEQ ID NO: 1) contra as bactérias Bacillus subtilis, Micrococcus luteus e Staphylocoeeus epidermidis.

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EXEMPLO 2

Avaliação de atividade antimicrobiana

Uma faixa de polipeptídeos antimicrobianos, os quais são variantes de SEQ ID NO: 1 (Plectasina), foi testada com relação à atividade antimicrobiana através de expressão dos mesmos em S. eerevisiae e seleção do sobrenadante dos transformantes de levedo com relação à atividade antimicrobiana contra Staphylocoeeus earnosus ATCC51365.

Meios e soluções de crescimento foram preparados conforme descrito em Sambrook, Fritsch e Maniatis (1989), Molecular eloning, Cold Spring Harbour, Laboratory Press, Nova Iorque.

O Ensaio de Difusão Radial foi realizado conforme descrito em Methods in Molecular Biology, vol 78, Antibacterial peptide protocol, William M. Shafer, Human Press.

200-300 colônias de transformantes de levedo foram colocadas sobre lâminas redondas de 14 cm contendo 25 ml de meio de crescimento SC suplementado com galactose a 1,5%, glicose a 0,5% e agarose a 1,5%. As lâminas foram incubadas durante três horas em temperatura ambiente, sobrepostas com 25 ml do mesmo meio de crescimento e deixadas crescer durante três dias a 30 graus Celsius.

Então, as lâminas foram sobrepostas com 25 ml de meio de crescimento LB contendo agarose a 1,5% e IO5 células da cepa indicadora Staphylococcus carnosus e incubadas a 30 graus Celsius durante a noite para permitir crescimento das células bacterianas. No dia seguinte, as lâminas foram coradas com MTT a 1,5 mM para facilitar visualização das zonas de clarificação.

Colônias de levedo que criaram zonas de clarificação foram transferidas para lâminas de microtitulação contendo 200 μΙ, de meio de crescimento SC suplementado com glicose a 2% e ampicilina (100 mg/L). Tais lâminas, designadas "lâminas mestre", foram incubadas durante 2 dias a 30 graus Celsius com agitação a 450 rpm para permitir crescimento de levedo.

10 μΙ. de meio de crescimento de cada cavidade das lâminas mestre foram transferidos para novas lâminas de microtitulação contendo 200 μΙ. de meio de crescimento SC com galactose a 1,5% e glicose a 0,5%. Essas lâminas foram denominadas lâminas filha e foram incubadas durante 3 dias a 30 graus Celsius sob agitação a 450 rpm para permitir crescimento de levedo e síntese de peptídeo.

Finalmente, um Ensaio de Difusão Radial (RDA) foi realizado seguindo o protocolo descrito em Methods in Molecular Biology para analisar e quantificar a atividade antimicrobiana dos sobrenadantes de levedo contra S. carnosus.

Resumidamente, 30 mL de meio de sustentação mínimo contendo agarose a 1% e 5 χ IO5 cfu/mL de S. carnosus foram entornados em uma lâmina Omnitray (Nunc, 242811). Uma lâmina Nunc TSP (#445497) foi inserida imediatamente sobre a lâmina para permitir uma formação padrão com 96 cavidades. Uma vez que o meio tinha solidificado, a lâmina TSP foi removida e 10 pL de amostras de sobrenadante de levedo foram aplicados sobre os orifícios. As lâminas foram incubadas 3 horas a 37 graus Celsius e sobrepostas com 15 mL de meio de crescimento de agar LB. Finalmente, as lâminas foram incubadas durante a noite a 37 graus Celsius e coradas com MTT a 1,5 mM para visualizar as zonas de clarificação.

Inspeção e medições das zonas de clarificação foram realizadas sobre as lâminas. Os clones de levedo correspondentes que resultaram em zonas de clarificação de tamanho similar ou aumentado com relação aos clones que codificam plectasina do tipo selvagem foram retirados das lâminas mestre e transferidos para lâminas de agar contendo meio de crescimento SC com glicose a 2% e ampicilina (100 mg/L). Tais lâminas foram incubadas durante mais 2 dias a 30 graus Celsius para permitir crescimento de levedo. Subseqüentemente, PCR de colônia foi realizada, seguido por análise de seqüência, para identificar alterações de aminoácido na seqüência da plectasina.

As mutações e atividades antimicrobianas correspondentes, com relação à atividade de plectasina, são mostradas na Tabela 2. Uma atividade de 2 corresponde à atividade de Plectasina. Uma atividade de 3 é melhor do que a Plectasina e 1 é pior do que a Plectasina.

Tabela 2. Dados de atividade antimicrobiana do ensaio de seleção de levedo <table>table see original document page 80</column></row><table> <table>table see original document page 81</column></row><table> <table>table see original document page 82</column></row><table> <table>table see original document page 83</column></row><table> <table>table see original document page 84</column></row><table> <table>table see original document page 85</column></row><table>

EXEMPLO 3

Identificação de peptídeos antimicrobianos com atividade antimicrobiana aperfeiçoada

Uma faixa polipeptídeos antimicrobianos, os quais são variantes de SEQ ID NO: 1, foi testada no ensaio TAPS. TAPS pode ser usado para identificar genes novos ou aperfeiçoados que codificam peptídeos que podem matar ou inibir o crescimento de células alvo (veja pedido PCT WO 2004/033715). O ensaio TAPS, um acrônimo para Sistema de Peptídeo de Trans Atuação, é baseado em ter um hospedeiro sensível que produz um polipeptídeo, seguido por seleção com relação à sua atividade em trans contra uma cepa indicadora. A vantagem desse sistema está baseada no fato de que o peptídeo antimicrobiano é expresso na bactéria Gram-negativa E. coli e sua atividade antimicrobiana pode ser monitorada sobre diferentes micróbios, incluindo Gram-negativos, positivos ou fungos. Adicionalmente, o TAPS oferece a possibilidade de produzir AMPs corretamente duplicados contendo ligações de dissulfeto nas células hospedeiras, desse modo, retendo suas atividades antimicrobianas.

A abordagem TAPS requer primeiro que expressão do peptídeo esteja sob o controle de um promotor induzível com regulação rigorosa, por que as células hospedeiras são sensíveis ao peptídeo quando de produção do mesmo. Segundo, o peptídeo produzido tem de ser liberado dos meios de modo que ele possa interagir com o organismo alvo.

A seleção pelo TAPS pode ser realizada em meios sólidos ou líquidos. Sobre meios sólidos, uma biblioteca de plasmídeo é inicialmente introduzida em células hospedeiras de E. coli. E importante que os transformantes sejam cultivados sobre a superfície de um filtro de acetato de celulose colocado sobre meio de crescimento LB sem indutor (arabinose) para evitar expressão do peptídeo antimicrobiano e, conseqüentemente, inibição de crescimento. Na próxima etapa, o filtro contendo as colônias é transferido para meio de crescimento LB contendo indutor (arabinose a 0,1%) para permitir síntese de peptídeo. Subseqüentemente, a cepa alvo, por exemplo, S. carnosus, é sobreposta sobre a lâmina e deixada crescer durante 12-16 horas a 37 graus Celsius. Finalmente, inspeção visual das células hospedeiras capazes de redução da proliferação das células alvo é realizada e a seqüência de nucleotídeo que codifica o peptídeo antimicrobiano é recuperada das células hospedeiras. Análise de seqüência de DNA das variantes é obtida para elucidar a natureza do peptídeo.

Conforme mencionado acima, a seleção pelo TAPS pode ser realizada usando meio líquido. Esse procedimento requer o uso de robótica para analisar um grande número de clones. Nesse sistema, as células hospedeiras de E. coli são transformadas com a biblioteca de plasmídeo e colocadas sobre meio LB + glicose a 0,2% + ampicilina (200 mg/L). Colônias independentes são, então, inoculadas em lâminas com 96 ou 384 cavidades contendo 200 μί de meio TB + ampicilina (200 mg/L) e cultivadas durante a noite a 37 graus Celsius. Essas culturas são, então, reproduzidas roboticamente e crescidas até a fase exponencial até que indutor (arabinose a 0,1%) seja adicionado para disparar a síntese de peptídeo. A próxima etapa consiste em hidrolise das células, de modo que o peptídeo seja liberado nos meios através de hidrólise com ácido quente. Esse tratamento consiste de adição de tampão de Fosfato de sódio a 1 M, pH de 2,3, para obter um pH final de aproximadamente 2,3 e incubação das culturas durante a noite a 80 graus Celsius. No dia seguinte, uma alíquota de 25 μΐ das culturas hidrolisadas é usada para realizar um teste de atividade contra os organismos alvo desejados. O teste de atividade realizado era um Ensaio de Difusão Radial (RDA), onde uma alíquota das culturas hidrolisadas foi adicionada aos meios de agarose inoculados com a cepa alvo, S. carnosus. RDAs obtidos das lâminas de seleção contendo zonas de clarificação correspondendo a clones exibindo atividade antimicrobiana foram facilmente identificados. Medições do diâmetro das zonas de clarificação foram realizadas para quantificar a potência da atividade antimicrobiana dos peptídeos.

A atividade antimicrobiana (contra Staphylococcus carnosus) das variantes de plectasina testadas, a qual foi medida usando o ensaio TAPS, é mostrada na tabela 3. A atividade antimicrobiana corresponde ao tamanho da zona de clarificação e foi classificada como 4 > 3 > 2 > 1; enquanto que 4 é melhor do que 1 e atividade do tipo selvagem corresponde a 1.

Tabela 3. Dados de atividade antimicrobiana do ensaio TAPS.

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EXEMPLO 4

Avaliação de atividade antimicrobiana

Plectasina do tipo selvagem (SEQ ID NO: 1) e cinco variantes de Plectasina, as quais mostravam atividade aperfeiçoada no método TAPS e/ou no sistema de levedo, foram expressas e purificadas. A Concentração Mínima Eficaz (MIC, μ§/ηιί) foi determinada para testar sua atividade antimicrobiana seguindo as diretrizes do NCCLS (Clinicai and Laboratory Standards Institute; formalmente conhecido como National Committee for Clinicai and Laboratory Standards).

Os resultados mostraram que todas as variantes de plectasina tinha atividade aperfeiçoada, comparado com a plectasina do tipo selvagem, contra Stapylococcus aureus, Micrococcus luteus e Bacillus subtilis.

Tabela 4. Valores de MEC; todos os valores estão em μg/mL.

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EXEMPLO 5

Avaliação de atividade antimicrobiana

Plectasina do tipo selvagem (SEQ ID NO: 1) e cinco variantes de Plectasina foram expressas e purificadas. A Concentração Mínima Eficaz (MIC) foi determinada para testar sua atividade antimicrobiana seguindo as diretrizes do NCCLS (Clinicai and Laboratory Standards Institute; formalmente conhecido como National Committee for Clinicai and Laboratory Standards).

Os peptídeos foram testados contra as seguintes cepas: A: Staphylocoeeus aureus, ATCC 29213; B: Staphylocoeeus aureus, ATCC 25923; C: Staphylocoeeus aureus, ATCC 29737; D: Staphylococcus aureus, MRSA ST5 (2001), isolado humano clínico multi-resistente do Statens Serum Institut, Dinamarca; E: Staphylocoeeus aureus, MRSA ST80 (2003), isolado humano clínico multi-resistente do Statens Serum Instituí, Dinamarca.

Todos os valores de MIC representam uma média de dois experimentos independentes; e todos os resultados na Tabela 5 são expressos com relação à Plectasina do tipo selvagem:

0: > 100% da MIC de Plectasina do tipo selvagem; 1: 80-100% da MIC de Plectasina do tipo selvagem; 2: 50-80% da MIC de Plectasina do tipo selvagem; 3: < 50% da MIC de Plectasina do tipo selvagem.

Tabela 5. Valores relativos de MIC; nd = não determinado.

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EXEMPLO 6

Avaliação de atividade antimicrobiana Um grande número de peptídeos antimicrobianos da invenção foi testado contra um quadro de 6 diferentes cepas de Staphylococcus aureus listadas abaixo:

Staphylococcus ATCC25923, MSSA; cepa de referência no NCCLS; aureus,

Staphyloeoecus ATCC29737, MSSA; cepa de referência no NCCLS; aureus,

Staphyloeoecus E33235, MSSA; aureus,

Staphyloeoecus 698-01, MRSA ST5, Str, Kan, Oxa; aureus,

Staphyloeoecus 566-03, MRSA Oxa, Tet, Fus, Kan. aureus, ST80,

S. aureus E33235, S. aureus 698-01 e S. aureus 566-03 estão disponíveis do Statens Serum Institut, Dinamarca.

Os estafilococos foram expostos às seguintes concentrações de peptídeo: 32; 16; 8; 4; 2; 1; 0,5; 0,25; 0,13; 0,6; e 0,03 μg/mL. Todos os peptídeos foram purificados, quantificados por HPLC e os peptídeos concentrados (>160 μg/mL) foram diluídos para 160 μg/mL em tampão de diluição de peptídeo (BSA a 0,1%, ácido acético a 0,01%).

A determinação de MIC foi feita essencialmente conforme descrito pelas diretrizes do NCCLS / CLSI usando caMHB. As MICs foram lidas apos 18-24 horas de incubações a 37 0C e registradas junto com a CFU na tabela abaixo.

Um número total de 95 peptídeos antimicrobianos da invenção foi avaliado em duplicata contra as 6 cepas bacterianas descritas acima.

Na maioria das determinações duplas (93%), a MIC variava < 2 vezes. Uma MIC média é mostrada na Tabela abaixo. Se a MIC estava acima de 32 \igJmL, um valor de 64 foi usado para calcular a média.

Tabela 6. Valores de MIC média.

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EXEMPLO 7

Usando os arquivos HMM do banco de dados PFAM para identificar uma defensina

Análise de seqüência usando perfis do modelo de Markov oculto (perfis HMM) pode ser realizada online na Internet ou localmente em um computador usando o pacote de software gratuitamente disponível HMMER bem conhecido. A versão atual é HMMER 2.3.2 de Outubro de 2003.

Os perfis HMM podem ser obtidos do banco de dados PFAM bem conhecido. A versão atual é PFAM 16.0 de Novembro de 2004. HMMER e PFAM estão disponíveis para todas as plataformas de computador, por exemplo, da Washington University in St. Louis (EUS), School of Medicine (http://pfam.wustl.edu e http://hmmer.wustl.edu).

Se uma seqüência de aminoácido de busca ou um fragmento da mesma pertence a uma das cinco famílias PFAM a seguir, a seqüência de aminoácido é uma defensina de acordo com a presente invenção:

Defensina_beta ou "Beta Defensina", número de acesso: PF00711;

• Defensina_propep ou "Pró-peptídeo de defensina", númerode acesso: PF00879;

• Defensina_l ou "Defensina de mamífero", número de acesso: PF00323;

• Defensina_2 ou "Defensina de artrópode", número de acesso: PFO1097;

Gama-tionina ou "Família de gama-tioninas", número de acesso: PF00304.

Uma seqüência de aminoácido pertence a uma família PFAM, de acordo com a presente invenção, se ela gera um E-valor o qual é maior do que O5Ie um escore o qual é maior do que ou igual a zero, quando o banco de dados PFAM é usado online ou quando o programa hmmpfam (do pacote de software HMMER) é usado localmente.

Quando a análise de seqüência é realizada localmente usando o programa hmmpfam, é necessário obter (download) os perfis HMM do banco de dados PFAM. Dois perfis existem para cada família; xxx_ls.hmm para buscas globais e xxx_fs.hmm para buscas locais ("xxx" é o nome da família). Isso faz um total de dez perfis para as cinco famílias mencionadas acima.

Esses dez perfis podem ser usados individualmente ou unidos (anexos) em um único perfil (usando um editor de texto - os perfis são arquivos ASCII) que poderia ser denominado, por exemplo, defensina.hmm. Uma seqüência de aminoácido de busca pode, então, ser avaliada através de uso da seguinte linha de comando:

hmmpfam -E 0.1 defensin. hmm sequence_file - em que "sequence_file" é um arquivo com a seqüência de aminoácido de busca em qualquer um dos formatos reconhecidos pelo pacote de software HMMER.

Se o escore é maior do que ou igual a zero (0,0) e o E-valor é maior do que 0,1, a seqüência de aminoácido de busca é uma defensina de acordo com a presente invenção.

O banco de dados PFAM é ainda descrito em Bateman e colaboradores (2004) "The Pfam Protein Families Database", Nucleic Acids Research, Vol. 32 (Edição de Banco de Dados) páginas D138-D141. LISTAGEM DAS SEQÜÊNCIAS

<110> Hovozymes Ã/S

<120> Polipeptídeos Ajitiimcrobianos

<130> 10425.2G4-KO

<160> 274

<l70> PatentIn versioa 1,3

<21Õ> L

<211> 40

<212> PRlt

<213> PseudopleGtania nigrella

<400> 1

Gly j?hê Gly Cys Asn Gly Pro Trp Asp Giu Aap Asp Mst Gln Cys Bis 1 5 10 15

Asn His Cys Lys- Ser Ile Lys GLy Tyii Lys Gly 61 y Tyi= Cys Ala iys 20 25 30

Gly Gly Pte Val Cys Lys Cys Tyr 35 40

<210» 2 <211> 40

<2li> FRiT

<213 > Artificial

<22 Õ>

<223> Polipep tícLeo antimicrobiaiio sintético

<22 Q>

<221> MISC_FEATURE

<22'2> (2)**(2>

<22'3> Xaa « Phe, Leu, Trp or Ile <220>

<221> MI5C_FEATURE

<222> <223> Xaa = Asn, Argr Gla, Vai, Gly, Ser, Ala, Lys, Tyr, Leu, Asρ,

His

ou Met

<220>

<221> misc FEATURE

<222> (6) ,7(6)

<223> xaa » Gly, Arg, Ala or Lys <220>

<221> MISC_FEATURE

<222> (?)..(7)

<223> Xaa » Profi Lysi Arg, Ala, Leu or Val

<220>

<221> KISC^FEATURE

<222> (8).T(S)

<223> Xaa * Trp or Arg

<220>

<221> MISC_FEATURE

<222> (9)..(9)

<223> Xaa - Asp, Ala, Gly, Lys, Leu, Tftt, Asn> Plief Mis, ítet, pro, Glfi,

Ser, Vai, Tyr, Cys, Ile or Arg

<22G>

<22l> MISG FEATURE

<222> (10)7.<IÓ>

<223> Xaa = Glur Gly, Ser, Alar Leu, Cys or Gln <220>

<22l> MISC_FEATURE

<222> (U).. (11)

<223> Xaa = Asp, Ala, Gly, Lys, Leu, Thr, Aso, Phe, Bis, Met, Pro, Gln,

Ser, Vai, Tyr, Jle, Cys, Arg, Trp or Met

<220>

<22l> HISC_FEATURE

<222> (12)7.(12)

<223> %sa « Asp OK Pro <220>

<221> MISC FEATURE

<222> (13)7.(13)

<223> Xaa = Met, Arg, Ser, Vai, Lys, Ala, Phe, Gly, Leu, Thr, Trp, OU Tyr

<220>

<221> MISC_FEATURE

<222> (14)..(14>

<223> Xaa - Gln, Arç, Leu, Phe, Gly, Bis, Leu, Arg, Ser, Tyr, Ala, Cysr

He Lysi Meti Pro? Thr, Val or Trp

<220>

<221> MI SC_FEATURE <222> (17)..(17>

<223> Xaa = Asn, Arg, Ilel Tyr, Vai, Lysr Thr, Ser, Gln, Phei Ala,

Trpr

Glu or His

<220>

< 2 21> MISC_EEATURE

<222> (18)..<1βΓ

<223> Xaa = Hisr Leu, Ala, Phe, Gln, Thr or Val <22 G>

<221> MISC_FEATURE

<222> {2G).,(20>

<223> Xaa - Lys, Arg or Gln

<22 Q>

<221> MISC_FEATURE

<222> (21),.(21)

<223> Xaa = Ser, Ala, Vai, Asn or Phe <220>

<221> MISC FEATURE

<222> (22)7.: (22}

<223> Xaa = Ile, Leu, Vai, Metf Thr or Trp <220>

<221> MISC FBAfURE

<222> {23)7.(23)

<223> Xaa =· Lysr Thr or Arg

<220>

<22l> MISC_FEATORB

<222> (24)..(24)

<223> Xaa = Gly, Hisr Lysf Asn, Ala, Pcor Phô, I1&, Gln, Argr Ser, Thr

ou Tyr <220> <221> <222> <223>

<220> <221> <222> <223>

<22 0> <221> <222> <223> Gly

<220> <221> <222> <223>

<220> <221> <22 2> <223>

<220> <221> <2,2 2> <223>

<220> <221> <22 2> <223>

<220> <221> <222> <223>

MISC FSATURE

(25)7. (25)

Xaa = Tyrp Arg, His, Lys, Leu, Met, Asn, Gln, Ser or Val

MISC FEATURE

{26)7, (2$)

Xaa = Lysr Arg, Phe , Hisr Cys or Thr

MISC FEATURE (29)7. (29)

Xaa = Tyr, Phe, Arg, Trp, Ala, His, Leu, Met or Ser

M1SC_FEATURE (31)..(31>

Xaa = Ala, Lysr Asn, Gln, Thr, Tyr, Glu, Hisf lie, Arg, Ser, ou Val

MlSCmFEATURE (32)/,(32)

Xaa 88 Lysr Arg or Thr

MISCJFEATURE

(33)..(33)

Xaa «■ Glyr Lysf Gln, Acg, Glu, Asft, Ser, Ala 0£ Thr

MISC_FEATURE (34).,(34)

Xaa = Glyr Lysf Arg1- His, or Trp

MISC FEATURE (35)7,(35)

Xaa - Pher Leu, Ala, His, lie, Met, vai, Arg or Trp

MISC_FEATURE (36)..(36)

Xaa = Vsl, Leu, Met, Thr, He, Lys, Gln or Arg

<220> <221> MISC_FEATURE

<222> <38)..<38)

<22 3> Xaa = Lysr His, Asri Or Arg

<220>

<221> MISC_FEATURE

<222> {40).,(40)

<223> Xaa - Tyr, lie, Tyr+Arg+Cys+Gly or Tyr+Arg

<400> 2

Gly Xsa GIy Cys Xaa Xaa Xma Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa Cys His

1 5 10 15

Xaa Xaa Cys Xas Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa Gly Gly Xaa Cys Xaa Xaa

<210> 3

<211> 40

<212> PRT

<213> Artificial

<220> <223>

<400> 3

Gly Phe Gly Cys Arg Gly Pro Trp Asp Glu Asp Asp Met Glri Cys His 1 5 10 15

Asn His Cys Lys Ser Ile Lys Gly Tyr Lys Gly Gly Tyr Cys Ala Lys

20

25

30

Xaa Xaa Xaa Xaa 35

Cys Xaa Cys Xaa 40

20

25

30

Gly Gly Phe Val 35

Cys Lys Cys Tyr 40

<210> 4

<211> 40

<212> PRT

<213> Artificial

<220>

<2 2 3> Polipeptídeo antimicrobiano sintético <400> 4

Gly Phe Gly Cys Gln Gly Pro Trp Asp Glu Asp Asp Met Gln Cys His 1 5 10 15

Asn His Cys Lys Ser Ile Lys Gly Tyr Lys Çly Gly Tyr Cys Ala Lys 20 25 30

GXy Gly Fhe Val Cys Lys Cys Tyr 35 40

<210> S

<211> 40

<212> PRT

<213> Artificial

<220> <223>

<400> 5

Gly Pb© Gly Cys Val Gly Fxo Trp Asp Glo Asp Asp Met Gln Cys Hás 1 5 10 15

Asn His Cys Lys Ser Ile Lys Gly Tyr Lys Gly Gly Tyr Cys Ala Lys 20 25 30

Gly Gly Phe Val Cys Lys Cys Tyr 35 40

<210> 6

<211> 40

<212> PRf

<213> Artificial

<220>

<223> PoIqteptideo antimicrobiaito sintético

<400> 6

Gly Phe Gly Cys Gly Gly Pro Trp Asp Glu Asp Asp Met Gln Cys His Asn His Cys Lys Ser Ile Lys GIy Tyr Lys Gly Gly Tyr Cys Ala Lys 20 25 30

Gly Gly Phe Val Cys Lys Cys Tyr 35 40

<210> 7

<2ll> 40

<212> PRT

<213> Artificial

<220> <22 3>

<400> ?

Gly Ph© Gly Cys S#r Gly Pro Trrp Asp Glu Asp Asp Met Gln Cys His 15 10 15

Asn His Cys Lys Ser II® Lys Gly Tyr Lys Gly Gly fyr Cys Ala Lys 20 2S 30

Gly Gly Fhe Val Cys Lys Cys Tyr 35 40

<210> 8

<211> 40

<212> PBT

<213> Artificial

<220>

<2 2 3> Polqteptideo antimicrolbiaiu) sintético

<40G> 8

Gly Phe Gly Cys Ala Gly Pro Trp Asp Glu Asp Asp Met Gln Cys His

15 10 15 Gly Gly Phe Val Cys Lys Cys Tyr 35 40

<210> 9

<211> 40

<212> PRI1

<213> Artificial

<220> <223>

<400> 9

Gly Phe Gly Cys Asn Gly Lys Ttp Asp Glu Asp Asp Met Glri Cys His

1 5 10 15

Asn His Cys Lys Ser Ile Lys Gly Tyr Lys Gly Gly Tyr Cys Ala Lys 20 25 30

Gly Gly Ph© Val Cys Lys Cys Tyr 35 40

<2l0> 10

<2ll> 40

<212> PRT

21.3 ÃríTT t f ü Cl X

<220>

<22à> Polipeptideo antimãcrobiano sintético

<400> 10

Gly Fhe Gly Cys Asn Gly Arg- Trp Asp Glu Asp Asp Mtet Gln Cys Kis 1 5 10 15

Asn His Cys Lys Ser Ile Lys Gly Tyr Lys Gly Gly Tyr Cys Ala Lys 20 25 30

Gly GIy Phe Val Cys Lys Cys Tyr 35 40

<210> 11

<211> 40

<212> PRT

<213> Artificial

<220>

<223> Polqieptídeo antímicrobiano sintético

<400> 11

Gly Phe Gly Cys Asn Gly Pro Arg Asp Glu Asp Asp Met Gln Cys His 1 5 10 15

Asn His Cys Lys Ser Ile Lys Gly Tyr Lys Gly Gly Tyr Cys Ala Lys 20 25 30

Gly Gly Phe Val Cys Lys Cys Tyr 35 40 <210> <211> <212> <213> 40 PRT Artificial <220> <223> Pblqteptideo anttmicrobiajio sintético <400> 12 Gly Fhe Gly Cys Asn Gly Pro Trp Ma Glu Asp Asp M&t 1 5 10 Gln Cys 15 Asn His Cys tys Ser Ile Lys GIy Tyr Lys Gly Gly Tyr Cys Ala

20 25 30

Gly Gly Phe Val Cys Lys Cys Tyr 35 40

<210> 13 <2ll> 40 <212> PRT <213> Artificial

<22 0>

<223>

<400> 13

Gly Phe Gly Cys Asn Gly Pro Trp Gly Glu Asp Asp Met Gln Cys His 1 5 10 IS

Asn His Cys Lys Ser Ile Lys Gly Tyr Lys Gly Gly Tyr Cys Ala Lys 20 25 30

Gly Gly Phe Val Cys Lys Cys Tyr 35 40

<210> 14

<211> 40

<212> PRT

<213> Artificial

<220>

< 2 2 3 > Polqteptídeo antimicrobiano sintético

<400> 14

Gly Phe Gly Cys Asn Gly Pro Trp Lys Glu Asp Asp Met Gln Cys Hls 1 5 10 15

âsn His Cys Lys Set Ile Lys Gly Tyx Lys 20 25

Gly Tyr Cys Ala 30

Gly Gly Pbe VaI Cys Lys Cys Tyr 35 40

<210> 15

<211> 40

<212> PRT

<213> Artificial <220>

<223> Polipeptideo antunicrobiaiio sintético

<400> 15

Gly Phe Gly Cys Asn Gly Pro Trp Leu Glu Asp Asp Met Gln Cys His 1 5 10 15

Asn His CyS Lys Ser Ile Lys Gly Tyr Lys Gly Gly fyr Cya Ala Lys 20 25 30

Gly Gly Phe Val Cys Lys Cys Tyr 35 40

16 40 FiRT

Artificial

Polipeptídeo antunirrobiano sintético

16

Gly Phe Gly Cys Asn Gly Pro Trp Thr Glu Asp Asp Met Gln Cys His

15 10 15

Asn His Cys Lys Ser Ile Lys Gly Tyr Lys Gly Gly Tyr Cys Ala Lys 20 25 30

Gly Gly Fhe Val Cys Lys Cys Tyr 35 40

<210> 17

<21i> 40

<212> PRT

<213> ArtlCicial

<22Q>

<2 2 3> PoIqieptideo antimic rob iano sintético

<21Q> <2U>

<212> <213>

<220> <223>

<4QG>

<400> 17 Gly Phe Gly Cys Asii Gly Pro Trp Tyr Glu Asp Asp Met Gln Cys His 1 5 10 15

Asn Eis Cys Lys Ser Ile Lys Gly Tyr Lys Gly Gly Tyr Cys Ala Lys 20 25 30

Gly Gly Plie Vâl Cys Lys Cys Tyr 35 40

<210> 18 <211> 40 <212> PRT <213> Artificial <220> <223> <40O> 16 Gly Ph <& Gly Cys Asn

Glu Asp Asp Môt Gln Cys Mls 10 15

Asn His Cys Lys Ser Ile Lys Gly Tyr Lys Gly Gly Tyr Cys Ala Lys

20 25 30

Gly Gly Phe Val Cys Lys Cys Tyr 35 40 <210> 19 <211> 40 <212> PRT <213> Artificial <220> <223> Polipeptídeo antimicrobiano sintético <400> 19

Gly Fhe Gly Cys Asn Gly Pro Trp His Glu Asp Asp Met Gln Cys His 1 5 10 15 Asn His Cys Lys Ser Ile Lys Gly Tyr Lys 20 25

Gly Gly Tyr Cys Ala Lys 30

Gly Gly Phe Val Cys Lys Cys Tyr 35 40

<210> 20

<211> 40

<212> PRf

<2Í3> Artificial

<22Õ> <223>

<400> 20

GIy Fhe Gly Cys Asn Gly Pro Trp Met Glu Asp Asp Met Gln Cys His 1 5 10 15

Asn His Cys Lys Ser Ile Lys Gly Tyr Lys Gly Gly Tyr Cys Ala Lys

20 25 30

Gly Gly Phe Vai Cys Lys Cys Tyr 35 40

<210> 21

<211> 40

<2l2> PRT

<213> Artificial

<220>

<223> Fo lipep tídeo antimicrobiajio sintético

<400> 21

Gly Phe Gly Cys Asn Gly Pro Trp Asn Glu. Asp Asp Met Gln Cys His

1 5 10 15

Asn His Cys Lys Ser Ile Lys Gly Tyr Lys Gly Gly Tyr Cys Ala Lys 20 25 30 Phe Val Cys Lys Cys Tyr 35 40

<2ÍG> 22

<211> 40

<212> PRT

<213> Artificial

<220> <223>

<400> 22

Gly Phe Gly Cys Asn Gly Pro Trp Pro Glu Asp Asp Met Gln Cys His 1 5 10 15

Asri His Cys Lys Ser Ile Lys Gly Tyr Lys Gly Gly Tyr Cys Ala Lys 20 25 30

Gly Gly Ph Val Cys Lys Cys Tyr 35 40

<21G> 23

<211> 40

<212> PRT

<213> Artificial

<220>

<223> PoIqteptideo antimicrobiano sintético

<400> 23

Gly Fhe Gly Cys Asn Gly Pro Trp Gln Glu Asp Asp Met Gln Cys His 1 5 10 15

Asn His Cys Lys Ser Ile Lys Gly Tyr Lys Gly Gly Tyr Cys Ala Lys 20 25 30

Gly Gly Phe Val Cy3 Lys Cys Tyr 35 40 <210> 24 <211> 40 <212> PRT

<213> Artificial

<220>

<223> Fblqpeptidieo antimicrobiaiin sintético

<400> 24

GXy Phê Gly Cys Asn Gly Pro Trp Ser Glu Asp Asp Met Gln Cys His 1 5 10 15

Asn His Cys Lys Ser Ile Lys Gly Tyr Lys Gly Gly Tyr Cys Ala Lys 20 25 30

Gly Gly Phe Val Cys Lys Cys Tyr 35 40

<210> 25

<2ll> 40

<212> PRT

<213> Artificial

<220>

<22 3> Polipeptídjeo antunicrofoiano sintético

<40õ> 25

Gly Phe Gly Cys Asn Gly Pro Trp Val Glu Asp Asp Met Gln Cys His 15 10 15

&sn His Cys

Lys Ser Ile Lys. 20

25

Gly Gly Tyt Cys Alá 30

Gly Gly Phe Val Cys Lys Cys Tyr 35 40

<210> 26 <211> 40 <212> PRT <213> Artificial

<220>

<22 3> Polipeptideo antímicrobiaiio sintético

<400> 26

Gly Fhe Gly Cys Asn Gly Fro Trp Asp Gly Asp Asp Met Gln Cys His 1 5 10 15

Asn His Cys Lys Sei 20

Ile Lys GIy Tyr Lys Gly Gly 25

Tyr Cys Ala 30

Gly Gly Phe Val Cys Lys Cys Tyr 35 40

<210> 21

<211> 40

<212> PJRT

<213> Artificial

<220>

<22 3> Polipeptídeo antiniic rol) iano sintético

<400> 27

Gly Phe Gly Cys Asn Gly Pro Trp Asp Ser Asp Asp Met Gln Cys His 1 5 10 15

Asn His Cy$

Lys Ser Ile 20

GIy Tyr Lys Gly Gly Tyr Cys Ala Lys 25 30

Gly Gly Fhe Val Cys Lys Cys Tyr 35 40

<210> 28

<211> 40

<212> PRT

<213> Artificial

<220>

<22 3> Polipeptídeo antimicrohiano sintético <400> 28

Gly Fhe Gly Cys Asn Gly Pro Trp Asp Glu Phe Asp Met Gln Cys His

1 5 10 15

Asn Hia Cys Lys Ser Ile Lys Gly Tyr Lys Gly Gly Tyr Cys Ala Lys 20 25 30

Gly Gly Fhe Val Cys Lys Cys Tyr 35 40

<210> 29

<211> 40

<212> PRT

<213> Artificial

<220> <223>

<400> 29

Gly fh© Gly Cys Asn Gly Fro Trp Asp Glu Gly Asp Met Gln Cys Iis 1 5 10 15

Asn His Cys Lys Ser Ile Lys Gly Tyr Lys Gly Gly Tyr Cys Ala Lys 20 25 30

Gly Gly Phe Val Cys Lys Cys Tyr 35 40

<210> 30

<211> 40

<2I2> PRT

<213> Artificial

<220>

<223> Polipeptideo antimicrobiano sintético

<400> 30

Gly Phe Gly Cys Asn Gly Pro Trp Asp Glu His Asp Met Gln Cys His Asn His Cys Lys Ser Ile Lys Gly Tyr Lys Gly Gly Tyr Cys Ala Lys 20 25 30

Gly Gly Phe Val Cys Lvs Cys Tyr 35 40

<210> 31

<211> 40

<212> PRT

<213> Artificial

<22Q>

<223> Polipeptídeo antimicrobiane sintético

<400> 31

Gly Gly Cys Asn Gly Pro Trp A$p Glw Lys Asp Met Gln Cys Mis 15 10 15

Asn His Cys Lys Ser Ile X-ys Gly Tyr Lys Gly Gly Tyr Cys Ala Lys 20 25 30

Gly Gly Phe Val Cys Lys Cys Tyr 35 40

<21Q> 32

<211> 40

<212> PRT

<213> Artificial

<22Q>

< 2 2 3 > Polipeptídeo antímicrohiano sintético

<400> 32

Gly Phe Gly Cys Asn Gly Pro Trp Asp Gla Leu Asp Met Gln Cys His 15 10 15

Asn His Cys Lys Ser Ile Lys Gly Tyr Lys Gly Gly Tyr Cys Ala Lys Gly Gly Phe Val Cys Lys Cys Tyr

35

40

<21G> 33

<211> 40

<212> PRT

<213> Artificial

<220>

< 2 2 3 > Polip eptídjeo antimicrobiano sintético

<40Q> 33

Gly Phe Gly Cys Asn Gly Pro Trp Asp Glu Pro Asp Met Gln Cys His 1 5 10 15

Asn His Cys Lys S#r Ile- Lys Gly Tyr Lys Gly Gly Tyr Cys Ala Lys

<210> 34

<211> 40

<212> PRT

<213> Artificial

<220>

<22 3> Polipep tídeo antimicrobiano sintético

<400> 34

Gly Fhe Gly Cys Asni Gly Pro Trp Asp Glu Ser Asp Met Gln Cys Mis 15 10 15

Asn His Cys Lys Ser Ile Lys Gly Tyr Lys Gly Gly Tyr Cys Ala Lys

20

25

30

Gly Gly Fhe Val Cys Lys Cys 35

Tyr 40

20

25

30

Gly Gly Phe Val Cys Lys Cys Tyr 35 40

<21Q> 35

<211> 40

<212> PRT

<213> Artificial

<22G> <223>

<400> 35

Gly Phe Gly Cys Asn Gly Pro Trp Asp Glu Thr Asp Met Gln Cys His 1 5 10 15

Asn His Cys Lys Ser Ile Lys Gly Tyr Lys Gly Gly Tyr Cys Ala Lys 20 25 30

Gly Gly Phe Val Cys Lys Cya Tyr 35 40

<210> <211> <212> <213> 36 40 PRT Artificiai <220> <223> Polqteptideo antímicrobiano sintético <400> 36 Gly Fh 1 © Gly Cys Asn Gly Pro Trp Asp S GltJ Val Asp Met 10 Gln Cys 15 Jks n. Hi,s Cys tys Sec Ile Lys Gly Tyr 20 25 Lys Gly Gly Tyic Cys Ala 30 Gly Gl y Phe Val Cys Lys Cys Tyr 35 40

<210> 37 <21Ι> 40

<212> PRT

<213> Artificial

<22 0>

< 2 2 3 >Fblfeptideo antunicrobiano sintético

<400> 37

Giy Pfte Giy Cys Asn Gly Pro Trp Asp Glo Trp Asp Met Gin Cys His 1 5 10 15

Asn His Cys Lys Ser Ile Lys Gly Tyr Lys Gly Gly Tyr Cys Ala Lys

<210> 38 <211> 40 <212> PRT <213> Artificial

<220>

<223> Fblfeptideo antimicrobiano sintético

<40G> 38

Gly Fhe Gly Cys Asn Gly Pro Trp Asp Glu Ile Asp Met Gln Cys His 1 5 10 15

Asn His Cys Lys Ser Ile Lys Gly Tyr Lys Gly Gly Tyc Cys Ala Lys

20 25 30

Gly Gly Phe Val Cys Lys Cys 35

Tyr 40

<21Õ> 39 <211> 40 <212> PRT

<213> Artificial <220> <223>

<400> 39

Gly Phe Gly Cys Asn Gly Pro Trp Asp Gla Met Asp Met Gln Cys His 1 5 10 15

Asn His Cys Lys Ser Ile Lys Gly Tyr Lys Gly Gly Tyr Cys Ala Lys 20 25 30

Gly Gly Phe Val Cys Lys Cys Tyr 35 40

<210> 40

<211> 40

<212> PRT

<213> Artificial

<220>

<22 3> Pblipeptídeo antimicrofciano sintético

<400> 40

Gly Phe Gly Cys Asn Gly Pro Trp Asp Glu Asn Asp Met Gln Cys His

1 5 10 15

Asn His Cys Lys Ser Ile Lys Gly Tyr Lys Gly Gly Tyr Cys Ala Lys 20 25 30

Gly Gly Phe Val Cys Lys Cys Tyr 35 40 <210> 41 <211> 40 <212> PRT <213> Artificial <220> <22 3> PteIjpeptideo antimicrobiano sintético

<400>

41 Fhe Gly Cys Asn Gly Pro Trp Asp Glu 5 10

Asp Met Gln Cys His 15

Asn His Cys Lys Ser Ile Lys Gly Tyr Lys Gly Gly Tyr Cys Ala Lys 20 25 30

Gly Gly Phe Val CyS Lys CyS Tyr 35 40

<210> 42

<211> 40

<212> PRT

<213> Artificial

<220>

<22 3> Polipeptídeo antimicrohiano sintético

<400> 42

Gly Phe Gly Cys Asn Gly Pro Trp Ãsp Glu Tyr Asp Mat Gln Cys Mis 1 5 10 15

Asn His Cys Lys Ser Ile Lys Gly Tyr Lys Gly Gly Tyr Cys Ala Lys 20 25 30

Gly Gly Phe Val Cys Lys Cys Tyr 35 40

<210> 43

<21,1> 40

<2X2> PBT

<213> Artificial

<22Q>

<22 3> Polipeptídeo antimicrobiano sintético

<40Q> 43

Gly Phe Gly Cys Asn Gly Pro Trp Asp Glu Asp Asp Arg Gln Cys His 15 10 15 Asn His Cys Lys Ser Ile Lys GIy Tyr Lys Gly Gly Iyr Cys Ala Lys 20 25 30

Gly Gly Phe Val Cys Lys Cys Tyr 35 40

<210> 44

<211> 40

<212> PRT

<213> Artificial

<220> <223>

<40G> 44

Gly Phe Gly Cys Asn Gly Pro Trp Asp Glu Asp Asp Ser Gln Cys His 1 S 10 15

Asn His Cys Lys Ser Ile Lys Gly Tyr Lys Gly Gly Tyr Cys Ala 20 25 30

Gly Gly Phe Val Cys Lys Cys Tyr 35 40 <21G> 45 <211> 4,0 <212> FRT <213> Artificial <22Q> <223> Polipeptídeo antunicrobiaiio sintético <4EJ0> 45

Gly Phe Gly Cys Asn Gly Pro Tqp Asp Glo Asp Asp Val Gln Cys His 1 5 10 15

Asn His Cys Lys Ser Ile Lys Gly Tyr Lys Gly Gly Tyr Cys Ala Lys 20 25 30 Gly Phe Val Cys Lys Cys Tyr 35 40

<210> 46

<211> 40

<212> PRT

<213> Artificial

<220>

<223> Polipeptídeo antimicrobiano sintético

<400> 46

Gly Phe Gly Cys Asn Gly Pro Trp Asp Glsi Asp Asp Met Phe Cys His

1 5 10 15

Asn His Cys Lys Ser Ile Lys Gly Tyr Lys Gly Gly Tyr Cys Ala Lys 20 25 30

Gly Gly Phm Val Cys Lys CyS Tyr 35 40

<210> 47

<211> 40

<212> PRT

<213> Artificial

<220>

<22 3> Polqteptideo antÍniicrobiann sintético

<400> 47

Gly Phe Gly Cys Asn Gly Pro Trp Asp Glu Asp Asp Miat Gly Cys His

1 5 10 ,15

Asn His Cys Lys Ser Ile Lys Gly Tyr Lys Gly Gly Tyr Cys Ala Lys 20 25 30

Gly Gly Phe Val Cys Lys Cys Tyr 35 40 <210> 48

<211> 40

<212> PRT

<213> Artificial

<220>

<223> Polipeptídeo antuniirobiaao sintético

<400> 4β

Gly FhB Gly Cys Mn Gly Pro Ttp Asp Glü Asp Asp Mtet His Cys His 1 5 10 IS

Asn His Cys Lys Ser Ile Lys Gly Tyr Eys Gly Gly Tyr Cys Ala Lys 20 25 30

Gly Gly Phe Val Cys Lys Cys Tyr 35 40

<2lQ> 49

<2ll> 40

<2!2> PRT

<213> Artificial

<220>

< 2 2 3 > Polipep tídeo antimicrobiaiio sintético

<400> 49

Gly Phe Gly Cys Asn Gly Pro Trp Asp GIq Asp Asp Met Ser Cys His 1 5 10 15

Asa His Cys Lys Ser Ile Lys Gly Tyr Lys Gly Gly Iyr Cys Ala Lys 20 25 30

Gly Gly Phe Val Cys Lys Cys Tyr 35 40

<210> 50 <211> 40 <212> PRT <2l3> Artificial

<220> <223>

<400> 50

Gly Phe Gly Cys Asn Gly Pro Trp Asp Glti Asp Asp Met Tyr Cys Mis 1 5 10 15

Asn His Cys Lys Ser Ile Lys Gly Tyr Lys Gly Gly Tyr Cys Ala Lys 20 25 30

Gly Gly Fhe Val Cys Lys Cys Tyr 35 40

<21.0> 51 <211> 40 <21.2> PRT <213> Artificial <220> <223> <400> 51 Gly Fhe Gly Cys Asn

10 15

Asn Leu Cys Lys Ser Ile Lys Gly Tyr Lys Gly Gly Tyr Cys Ala Lys 20 25 30

Gly Giy Pte Val Cys Lvs Cys Tyr 35 40

<210> 52

<211> 40

<212> PRT

<213> Artificial

<220>

<2 2 3> Polipeptídeo antunicrobiajin sintético <400> 52

Gly Fhe Gly Cys Asn Gly Pro Trp Asp Glu Asp Asp Mst Gln Cys His 1 5 10 15

Asri His Cys Lys Ses Leu Lys Gly Tyr Lys Gly Gly Tyr Cys Ala Lys 20 25 30

Gly Gly Fhe Vai Cys iys Cys Tyr 35 40

<21Q> 53

<21I> 40

<212> PRT

<213> Artificial

<220> <223>

<400> 53

Gly Phe Gly Cys Asn Gly Fro Trp Asp Glo Asp Asp Met Gln Cys His 1 S 10 IS

Asn His Cys Lys Ser Val Lys Gly Tyr Lys Gly Gly Tyr Cys Ala Lys 20 25 30

Gly Gly Phe Val Cys Lys Cys Tyr 35 40

<210> 54

<2ll> 40

<212> PBT

<21.3> Artificial

<22G>

< 2 2 3 > PoLqteptidjeo antimicrobiano sintético

<400> 54

Gly Phe Gly Cys Asa Gly Pro Trp Asp Glu Asp Asp Met Gln Cys His Asn His Cys Lys Ser Ile Lys His Tyr Lys Gly Gly Tyr Cys Ma Lys 20 25 30

Gly Gly Phe Val CyS Lys CyS Tyr 35 40

<21Q> 55 <2ll> 40 <212> PRT <213> Artificial <220> <223> <400> 55 Gly £"ha Gly Cys Asn

1 5 10 I5

Asn His Cys Lys Ser Ile Lys Lys Tyr Lys Gly Gly Tyr Cys Ala Lys 20 25 30

Gly Gly Fhe Val Cys Lys Cys Tyr 35 40

<21Q> 56

<211> 40

<212> PRT

<213> Artificial

<220>

< 2 23 > Polipeptídeo antimicrobiano sintético

<400> 56

Gly Phe Gly Cys Asn Gly Pro Trp Asp Glu Asp Asp Met Gln Cys His 1 5 10 15

Asn His Cys Lys Ser Ile Lys Asn Tyr Lys Gly Gly Tyr Cys Ala Lys Gly Gly Phe Val Cys Lys Cys Tyr 35 40

<210> 57

<211> 40

<212> PR1F

<213> Artificial

<220>

<22 3> PoLqieptidjeo antimicrobiano sintético

<400> 57

Gly Phe Gly Cys Asu Gly Pro Trp Asp Glu Asp Asp Met Gln Cys His 1 5 10 15

Asn His Cys Lys Ser Ile Lys Gly Tyr Lys Gly Gly Pft® Cys Ala Lys 20 25 30

Phe Val Cys 35

Cys Tyr 40

<210> 58

<211> 40

<212> PRT

<213> Artificial

<220>

<22 3> Rilfeptideo aiitLniicrobiano sintético

<400> 58

Gly fhe Gly Cys Asn Gly Wxo Xrp Asp Glu Asp Asp Met Gln Cys His 1 5 10 15

Asn His Cys Lys Ses 20

Ile Lys Gly Tyr Lys Gly Gly Arg Cys Ala Lys 25 30

Gly Gly Phe Val Cys Lys Cys Tyr <210> 59

<211> 40

<212> PRT

<213> Artificial

<220>

<223> Polipeptídeo antimicrohiaiio sintético

<400> 59

Gly Phe Giy Cys Asn Gly Pro Trp Asp Glu Asp Asp Met Gln Cys His 1 5 10 15

Asn His Cys Eys Ser Ile Lys Gly Tyr Lys Gly Gly Trp Cys Ala Lys 20 25 30

Gly Gly Ph# Val CyS Lys Cys Tyr 35 40

<210> <211> <212> <213> 60 40 PRT Χ· <Í~ ο á» Hi X <220> <223> Polipeptídeo antimicrobiaiio sintético <400> 60 Gly Ph 1 <s Gly Cys Asri Gly Pro Trp Asp 5 Gltt Asp 10 1 Asp Mat Gln Cys 15 Asn Hi s Cys Lys Ser He: Lys Gly Tyr I-ys Gly Gly Tyr Cys Lys

20 25

Gly Gly Phe Val Cys Lys Cys Tyr 35 40

<21ϋ> 61 <2ll> 40

<212> PRT

<213> Artificial,

<220>

<22 3> PoLqteptideo antimicrobiaiui sintético

<400> 61

Gly l>he Gly Cys Asn Gly Pco Trp Asp Slu Asp Asp Met Gln Cys His

1 S 10 IS

Asn His Cys Lys Ser Ile Lys Gly Tyr Lys Gly Gly Tyr Cys Asn Lys 20 25 30

Gly Gly Phe Val Cys Lys Cys Tyr 35 40

<21Q> 62

<211> 40

<212> PRT

<213> Artificial

<22Q>

<22 3> Polipeptídeo antimicrobiano sintético

<4G0> 62

Gly Phe Gly Cys Asn Gly Fro Trp Asp Glu Asp Asp Met Gln Cys His 1 5 10 15

Asn His Cys Lys Ser Ile Lys Gly Tyr Lys Gly Gly Tyc Cys Gln Lys 20 25 30

Gly Gly Fhe Val Cys Iys Cys Tyr 35 40

<210> 63

<211> 40

<212> PRT

<213> Artificial <220>

<223> PolipeptíiLeo antimicrobiano sintético

<400> 63

Gly Phe Gly Cys Asn Gly Pro Trp Asp GIei Asp Aap Met Gln Cys His 1 5 10 15

Asit His CyS Lys Ser He Lys Gly Tyr Lys Gly Gly Tyr Cys Thr Lys 20 25 30

Gly Gly Phe Val Cys Lys Cys Tyr 35 40

<210> 64

<211> 40

<212> PRT

<213> Artificial

<220>

<223> Polipeptídeo antimicrobiano sintético

<400> 64

Gly Phe Gly Cys Asn Gly Pro Trp Asp Glu Asp Asp Met Gln Cys His

1 5 10 15

Asn His Cys Lys Ser Ile Lys Giy Tyr Lys Gly Gly Tyr Cys Tyr Lys

20 25 30

Gly Gly Phe Val Cys Lys Cys Tyr 35 40

<210> 65

<211> 40

<212> PRT

<213> Artificial

<220>

<223> Polipeptideo antimicrobiano sintético

<400> 65 Gly Phe Gly Cys Asn Gly Pro Trp Asp Glu Asp Asp Met Gln Cys His 1 5 10 15

Asn His Cys Lys Ser; Ile Lys Gly Tyr Lys Gly Gly Tyr Cys Ala Lys 20 25 30

40

Lys Gly Phe VaI C 35 <21G> 66 <2li> 40 <212> PRT <213> Artificial <22 0> <223> <4Q0> 66

Gly Phe Gly Cys Asn Gly Pro Trp Asp Glw Asp Asp Met Gln CyS Mls 1 5 10 15

Asn His Cys Lys Ser Ile Lys Gly Tyr Lys Gly Gly Tyr Cys Ala Lys 20 25 30

Gln Gly Phe Val Cys Lys Cys Tyr 35 40 <210> 67 <21,1> 40 <212> PRT <213> Artificial <22G> <223> Polipeptídeo antimicrobiaiio sintético <4Q0> 6?

Gly Fhe Gly Cys Asn Gly Pro Trp Asp Glu Asp Asp Met Gln Cys His 1 5 10- 15 Asn His Cys Lys Ser Ile Lys Gly Tyr Lys Gly Gly Tyr Cys Ma Lys 20 25 30

Arg Gly Phe Val Cys Lys Cys Tyr 35 40

<210> 6S

<211> 40

<212> PRT

<213> Artificial

<220>

<223> Ftolqteptideo antimicrobiano sintético

<400> 60

Gly Phe Gly Cys Asn Gly Pro Trp Asp Glu Asp Asp Met Gln Cys His 1 5 10 15

Asn His Cys Eys Ser lie Lys Gly Tyr Lys Gly Gly Tyr Cys Alá Lys 20 25 30

Gly Lys Phe Val Cys Lys Cys Tyr 35 40

<210> 69

<211> 40

<212> PRT

<213> Artificial

<22Õ>

<22 3> Folipeptídeo antimicrobiano sintético

<400> 69

Gly Phe Gly Cys Asn Gly Pro Trp Asp Glu Asp Asp Met Gln Cys His

1 5 10 15

Asn His Cys Lys Ser Ile Lys Gly Tyr Lys Gly Gly Tyr Cys Ala Lys 20 25 30 Gly Arg Fhe Val Cys Lys Cys Tyr 35 40

<210> 70

<211> 40

<212> PRT

<213> Artificial

<220>

<223> Polipeptídeo antunicrobiano sintético

<400> 70

Gly Fhe Gly Cys Asn Gly Pro Trp Asp Glu Asp Asp Met Gln Cys His 1 5 10 15

Asn His Cys Lys Ser Ile Lys Gly Tyr Lys Gly Gly Tyr Cys Ala Lys 20 25 30

Gly Gly Leu Val Cys Lys Cys Tyr 35 40

<210> 71

<2ll> 40

<212> PRT

<213> Artificial

<220>

< 2 2 3 > Polipeptídeo antimicrobiano sintético

<400> 71

Gly Phe Gly Cys Asn Gly Pro Ttp Asp Sltt Asp Asp Met Gin Cys His 1 5 10 15

Asn His Cys Lys Sej 20

Ile Lys Gly Tyr Lys Gly Gly Tyr Cys Ala Lys 25 30

Gly Gly Phe Leu Cys Lys Cys Tyr 35 40 <210> 72

<2Í1> 40

<212> PRT

<213> Artificial

<220>

<223> Polipeptídeo antimicrobiano sintético

<400> 72

Gly fhe Gly Cys Asn Gly Pro Trp Asp Glu Asp Asp Met Gln Cys His 1 5 10 15

Asn His Cys Lys Ser Ile Lys Gly Tyr Lys Gly Gly Tyr Cys Ala Lys 20 25 30

Gly Gly Phe Met Cys Lys Cys Tyr 35 40

<210> 73

<211> 40

<212> PRT

<213> Artificial

<220>

< 2 2 3 > Polqteptideo antimicrobiano sintético

<400> 73

Gly Phe Gly Cys Asn Gly Pro Trp Asp Glu Asp Asp Met Gln Cys His 1 5 10 15

Asn His Cys Lys Ser Ile Lys Gly Tyr Lys Gly Gly Tyr Cys Ala Lys 20 25 30

Gly Gly Phe Thr Cys Lys Cys Tyr 35 40

<210> 74 <211> 40 <212> PRT <213> Artificial <220>

<223> Polipeptídeo antimicrobiano sintético

<400> 74

Gly Phe Gly Cys Lys Gly Pro Trp Asp Glü Asp Asp Met Gln CyS Mis 1 5 10 15

âsn His Cys Lys Sec Xle Lys Gly Tyr Arg Gly Gly Tyr Cys Ala Lys

<210> 75

<211> 40

<2l2> PRT

<213> Artificial

<220>

<223> Ptolipeptídeo antimitiObiano sintético

<400> 75

Gly Phe Giy Cys Lys Gly Pro Trp Asp Giu Gly Asp Met Gln Cys His 1 5 10 15

Asn His Cys Lys Ser Ile Lys Gly Tyr Lys Gly Gly Tyr Cys Ala Lys

20 25 30

Gly Gly Phe Val Cys Lys Cys Tyr 35 40

20 25 30

Gly Gly Phe

VaI

35

<21Q> 76 <2ll> 40 <212> PTtT

<213> Artificial

<220>

<223> PoLqieptideo antimitrobiano sintético <400> 76

Gly Fhe Gly Cys Ser Gly Pro Trp Asp Glu Asp Asp Met Arg Cys His

1 5 10 15

Asn His Cys Lys Ala Ile Arg- Gly Tyr Lys Gly Gly Tyr Cys Ala Lys 20 25 30

Gly Gly Phe vai Cys Lys Cys Tyt 35 40

<210> 77

<211> 40

<212> PRT

<213> Artificial

<220>

<223> Polipeptideo antimitrobiane sintético

<400> 77

Gly Phe Gly Cys Ser Gly Pro Trp Asp Glu Asp Asp Met Arg Cys Mis 1 5 10 15

Ser His Cys Lys Seis 20

Ile Arg Gly Tyr Lys Gly Gly Tyr Cys Ala Lys 25 30

Gly Gly Phe Val Cys Lys Cys Tyr 35 40

<210> 70

<211> 40

<2!2> PiRT

<213> Artificial

<220>

<2 2 3> PoLqteptideo ajitunicrobiano sintético

<400> 7S

Gly Phe Gly Cys Asa Gly Pro Arg Asp Glu Asp Asp Arg Gln Cys His 1 5 10 15 Asn His Cys Eys Ser Ile Lys Gly Tyr Lys Gly Gly Tyr Cys Ala Lys 20 25 30

Gly Gly Phe Val Cys Lys Cys Tyr 35 40

<2!0> 79

<211> 40

<212> PRT

<2l3> Artificial

<22Q>

< 2 2 3 > Polipeptídeo antimitrobiano sintético

<400> 79

Gly Ph® Gly Cys Asn Gly Pro Trp Gly Glti Asp Asp Met Arg Cys His 1 5 10 15

Asn His Cys Lys Ser IXe Arg Gly Tyr Iys Gly Gly Iyr Cys Als Lys 20 25 30

Gly Gly Píie Val Cys Lys Cys Tyr 35 40

<210> 80

<211> 40

<212> PRT

<213> Artificial

<220>

<22 3> Pblipeptídeo antimicrohiano sintético

<400> 80

Gly Phe Gly Cys Asn Gly Pro Trp Asp Gly Asp Asp Met Arg Cys His 1 5 10 15

Asn His Cys Lys Ser Ile Lys Gly Tyr Lys Gly Gly Tyr Cys Ala Lys 20 25 30

Gly Gly Phe Val Cys Lys Cys Tyr 35 40

<2IO 81

<211> 40

<212> PRT

<213> Artificial

<220>

< 2 2 3> FtoI^eptideo antimicrobiaiio sintético

<400> 81

Gly Fhe Gly Cys Asn Gly Pro Trp Asp Gla Gly Asp Met Gln Cys His

1 5 10 15

Asn His Cys Lys Ser Ile Lys Gly Tyr Lys Gly Gly Tyr Cys Ala Arg 20 25 30

Gly Gly Fhe Val Cys Lys Cys Tyr 35 40

<210> 82 <211> 40 <212> PRT <2!3> Artificial <22Q> <223> Ftolfeptideo antimicrobiano sintético <400> 82 Gly Whs Gly Cys Asn. Gly Fro Tr

10 15

Ser His Cys Lys Ser Ile Lys Gly Tyr Lys Gly Gly Tyr Cys Ala Lys 20 25 30

Gly Gly Phe Val Cys Lys Cys Tyr <210>83 <211>40 <212>PRT

<213> Artificial

<223> PolipeptuLeo anturrirrobiano sintético

<400> 83

Gly Fhe Gly Cys Asn Gly Pro Trp Asp Glu Gly Asp Met Gln Cys His 1 5 10 15

Asn His Cys Lys Ser Val Lys Gly Tyr Lys Gly Gly Tyr Cys Ala Lys 20 25 30

Gly Gly Phe Val Cy$ Lys Cys Tyr 35 40

<21Q> 84

<211> 40

<212> PRT

<213> Artificial

<220>

<223> Polipeptídeo antunirrobiano sintético

<400> 84

Gly phe Gly Cys Asn Gly Pro Trp Asp Glu Asn Asp Met Gln Cys His 15 10 15

Asn His Cys Lys Seir lie Lys Gly Tyr Lys Gly 20 25 30

Gly Gly Phe Ile Cys Lys Cys Tyr 35 40

<210> 85 <211> 40

<212> FRT

<213> artificial

<220>

<223> Polipeptídeo antiinicrohiano sintético

<40Ο> 85

Gly I1Ite Gly Cys Asn Gly Pto Trp Asp Glü Arg Asp Ile Gln Cys His

1 5 10 15

Asn His Cys Lys Ser Ile Lys Gly Tyr Lys Gly Gly Tyr Cys Ala Lys

<210> 86

<211> 40

<212> PRT

<213> Artificial

<220>

<2 23> Polipeptídeo antimicrobiano sintético

<400> 86

Gly Fhe Gly Cys Asn Gly Pro Trp Asp Glu Asp Asp Met Val Cys His

1 5 10 15

Asn His Cys Lys Ser Ile Lys Gly Tyr Arg Gly Gly Tyt Cys Ala Lys

20

25

30

Gly Gly Phe Val Cys Lys Cys 35

Tyr 40

20

25

30

40

<21Õ> 87 <211> 40

<212> PRT

<213> Artificial <22Q> <223>

<400> 87

GIy Phe Gly Cys Asn Gly Pro Trp Asp Glu Asp Asp Met Arg Cys His 1 5 10 15

Asn His CyS

Sef Ile Lys Gly Tyr Arg Gly Gly Tyr CyS Ala Lys 20 25 30

Gly Gly Phe Val Gys Arg Cys Tyr 35 40

<210> 88

<21l> 40

<212> FRT

<213> Artificial

<220>

< 2 2 3 > Po lipep tídeo antimicrobiano sintético

<400> 88

Gly Phe Gly Cys Lys Gly Pro Trp Asp Gla Asp Asp Met Gln Cys His 1 5' 10 15

Asn His Cys Lys Ser Ile Lys Gly Tyr Lys Gly Gly Tyr Cys Ala Lys 20 25 30

Gly Phe Val Cy s 35

Iys Cys Tyr 40

<210> 89

<2ll> 40

<212> PRT

<21.3> Artificial

<22Q>

<223> Ptolqieptidieo antimicrobiano sintético

<400> 89 Gly Phe Gly Cys Tyr Gly Fro Tirp Asp Glu Asp Asp Met Gln Cys His 1 5 10 15

Asn His Cys Lys Ser Ile Lys Gly Tyr Lys Gly Gly Tyr Cys Ala Lys 20 25 30

Gly Gly Phe Val Cys Lys Cys Tyr 35 40

<21G> 90

<2ll> 40

<212> PRT

<2l3> Artificial

<220>

<223> Polipeptídeo antimicrobiaiio sintético

<400> 90

Gly Gly CyS Asn Gly Pro Trp Asp Glu Asp Agp Lys Gln Cys Hig

1 5 10 15

Asn His Cys Lys Ser Ile Lys Gly Tyr Lys Gly Gly Tyr Cys Ala Lys 20 25 30

Gly Gly Phe Val Cys Lys Cys Tyr 35 40

<210> 91

<211> 40

<212> ERT

<213> Artificial

<220>

<223> PoLqieptidjeo antunirrobiaiio sintético

<400> 91

Gly Phe Gly Cys Asn Gly Pro Trp Asp Glu Asp Asp Met Leu Cys His 1 5 10 15 Asn His Cys Lys Ser Ile Lys Giy Tyr Eys Gly Gly Tyr Cys Ala Lys 20 25 30

Gly Gly Phe Val Cys Lys Cys Tyr 35 40

<210> 92 <211> 40 <212> POT <213> Artificial <220> <223> PoIipeptideo antimitrobiano sintético <400> 92 Gly Phe Gly Cys Asri Gly Pro Trp

10 15

Asn His Cys Lys Ser Ile Lys Gly Tyr Lys Gly Gly Tyr CyS Ala Lys 20 25 30

Gly Gly Phe Val Cys Lys Cys Tyr 35 40

<210> 93

<211> 40

<212> PRT

<213> Artificial

<22Q>

< 2 2 3 > PolipeptuLeo antimicrobiaiuo sintético

<4Q0> 93

Gly Phe Gly Cys Asn Gly Pro Trp Asp Glo Asp Asp Met Gln Cys His 1 5 10 15

His His Cys Lys Ser Ile Lys Gly Tyr Lys Gly Gly Tyr Cys Ala Lys 20 25 30 Phe Val Cys Lys Cys Tyr 35 40

<210> 94

<211> 40

<212> PRT

<213> Artificial

<220>

<223> Polipeptídeo antiinicrobiajio sintético

<400> 94

Gly Fhe Gly Cys Asn Gly Fro Trp Asp Glu Asp Asp Met Gln Cys His 1 5 10 15

Ile His Cys Lys Ser Ile Lys Gly Tyr Lys Gly Gly Tyr Cys Ala Lys 20 25 30

Gly Gly Phc Val Cys Lys Cys Tyr 35 40

<210> 95

<211> 40

<212> PRT

<213> Artificial

<220>

<223> Polipeptídeo antimicrobiaiio sintético

<400> 95

Gly Fhe Gly Cys Asn Gly Pro Trp Asp Glu Asp Asp Met Gln Cys lis 1 5 10 15

Arg His Cys Lys Ser Ile Lys Gly Tyr Lys Gly Gly Tyr Cys Ala Lys 20 25 30

Gly Gly Phe Val Cys Lys Cys Tyr 35 40 <2X0> 96 <211> 40 <212> PRT <213> Artificial <220> <223> Polip eptídeo antimicrobiano sintético <4(J0> 96 GJLy Fll iê Gly Cys Asn Gly Fro Tr

Glu Asp Asp Met Gln Cys Kis 10 15

Tyr His Cys Lys Ser Ile Lys Gly Tyr Lys Gly Gly Tyr Cys Ala Lys 20 25 30

Gly Gly Phe Vai Cys Lys Cys Tyr 35 40

<21Q> <2l.l> <212> <213> 97 40 PRf Artificial <220> <223> PoIipeptídeo aiitimicrobiano sintético <400> 97 Gly Phe Gly Cys Asn Gly Pro Trp Asp 1 5 Glu Asp Asp Met 10 Gln Cys 15 Asn Hii 3 Cys Arg Ser Ile Lys Gly Tyr 20 25 Lys Gly Gly Tyr Cys Ala 30

Gly Gly Phe Val Cys Lys Cys Tyr 35 40

<210> 98 <211> 40 <212> PRT <213> Artificial

<220>

<223> FoIqieptideo antimicrobiaiio sintético

<40G> 98

Gly Phe Gly Cys Asn Gly PrO Tcp Asp Glü Asp Asp Met Gln Cys His 1 5 10 15

Asn His Cys Lys Ser Ile Lys Gly Tyr Arg Gly Gly Tyr Cys Ala Lys 20 25 30

Gly Gly Phe Val Cys Lys Cys Tyr 35 40

<210> 99

<211> 41

<212> PRT

<213> Artificial

<220>

<22 3> Polipeptídeo antimicrobiano sintético

<400> 99

Gly Phe Gly Cys Asn Gly Pro Trp Asp Glu Asp Asp Met Gln Cys His 1 5 10 15

Asri His Cys Lys Ser Ile Lys Gly Tyr Lys Gly Gly Tyr Cys Ala Lys 20 25 30

Gly Gly Phe Val Cys Lys Cys Tyr Atg 35 40

<21G> 100

<21i> 40

<212> PRT

<213> Artificial

<220>

<223> Pblipeptuleo antLmicrolbiaiio sintético <400> 100

Gly Phe Gly Cys Tyr Gly Pro Trp Asp Glu Asp Asp Met Leu Cys His 15 10 15

Asn His Cys Lys Ser Ile Lys Gly Tyr Lys Gly Gly Tyr Cys Ala Lys 20 25 30

Gly Gly Phe Val Cys Lys Cys Tyr 35 40

<210> 101

<211> 40

<212> PRT

<213> Artificial

<220>

<223> Polipeptldeo antimicrobiano sintético <400> 101

Gly Phe Gly Cys Asn Gly Pro Trp Asp Glu Gly Asp Met Gln Cys His 15 10 15

Asn His Cys Lys Ser Ile Lys Gly Tyr Arg Gly Gly Tyr Cys Ala Lys 20 25 30

Gly Gly Phe Val Cys Lys Cys Tyr 35 40

<210> 102

<211> 40

<212> PRT

<213> Artificial

<220>

<223> Polipeptideo antimicrobiano sintético <400> 102

Gly Phe Gly Cys Asn Gly Pro Trp Asp Glu Gly Asp Lys Gln Cys His Asn His Cys Lys Ser Ile Lys Gly Tyr Arg Gly Gly Tyr Cys Ala Lys 20 25 30

Gly Gly Phe Val Cys Lys Cys Tyr 35 40

<210> 103

<211> 41

<212> PRT

<213> Artificial

<220>

<223> Polipeptldeo antimicrobiano sintético

<400> 103

Gly Phe Gly Cys Asn Gly Pro Trp Asp Glu Asp Asp Lys Gln Cys His 1 5 10 15

Arg His Cys Lys Ser Ile Lys Gly Tyr Lys Gly Gly Tyr Cys Ala Lys 20 25 30

Gly Gly Phe Val Cys Lys Cys Tyr Arg 35 40

<210> 104

<211> 41

<212> PRT

<213> Artificial

<220>

<223> Polipeptideo antimicrobiano sintético <400> 104

Gly Phe Gly Cys Asn Gly Pro Trp Asp Glu Asp Asp Met Gln Cys His 15 10 15

Arg His Cys Lys Ser Ile Lys Gly Tyr Lys Gly Gly Tyr Cys Ala Lys 20 25 30

Gly Gly Phe Val Cys Lys Cys Tyr Arg 35 40

<210> 105

<211> 40

<212> PRT

<213> Artificial

<220>

<223> polipeptídeo antimicrobiano sintético

<400> 105

Gly Phe Gly Cys Asn Gly Pro Trp Asp Glu Asn Asp Met Gln Cys His 1 5 10 15

Asn His Cys Lys Phe Ile Lys Gly Tyr Lys Gly Gly Tyr Cys Ala Lys 20 25 30

Gly Gly Phe Val Cys Lys Cys Tyr 35 40

<210> 106

<211> 40

<212> PRT

<213> Artificial

<220>

<223> Polipeptideo antimicrobiano sintético

<400> 106

Gly Phe Gly Cys Asn Gly Pro Trp Asp Glu Asp Asp Lys Gln Cys His 1 5 10 15

Arg His Cys Lys Ser Ile Lys Gly Tyr Lys Gly Gly Tyr Cys Ala Lys 20 25 30

Gly Gly Phe Val Cys Lys Cys Tyr <210> 107

<211> 41

<212> PRT

<213> Artificial

<220>

<223> Polipeptídeo antimicrobiano sintético

<400> 107

Gly Phe Gly Cys Asn Gly Pro Trp Asp Glu Asp Asp Lys Gln Cys His 15 10 15

Asn His Cys Lys Ser Ile Lys Gly Tyr Lys Gly Gly Tyr Cys Ala Lys 20 25 30

Gly Gly Phe Val Cys Lys Cys Tyr Arg 35 40

<210> 108

<211> 40

<212> PRT

<213> Artificial

<220>

<223> Polipeptídeo antimicrobiano sintético <400> 108

Gly Phe Gly Cys Asn Gly Pro Trp Asp Glu Asp Asp Lys Gln Cys His 15 10 15

Asn His Cys Lys Ser Ile Lys Gly Tyr Arg Gly Gly Tyr Cys Ala Lys 20 25 30

Gly Gly Phe Val Cys Lys Cys Tyr 35 40

<210> 109 <211> 40 <212> PRT <213> Artificial

<220>

<223> Polipeptideo antimicrobiano sintético

<400> 109

Gly Phe Gly Cys Asn Gly Pro Trp Asp Glu Asp Asp Lys Gln Cys His 1 5 10 15

Asn His Cys Lys Ser Ile Lys Gly Tyr Lys Gly Gly Tyr Cys Ala Lys 20 25 30

Gly Gly Phe Val Cys Arg Cys Tyr 35 40

<210> 110

<211> 41

<212> PRT

<213> Artificial

<220>

<223> Polipeptideo antimicrobiano sintético

<400> 110

Gly Phe Gly Cys Asn Gly Pro Trp Asp Glu Gly Asp Met Gln Cys His 1 5 10 15

Asn His Cys Lys Ser Ile Lys Gly Tyr Arg Gly Gly Tyr Cys Ala Lys 20 25 30

Gly Gly Phe Val Cys Lys Cys Tyr Arg 35 40

<210> 111

<211> 41

<212> PRT

<213> Artificial <220>

<223> Polipeptídeo antimicrobiano sintético <400> 111

Gly Phe Gly Cys Asn Gly Pro Trp Asp Glu Gly Asp Lys Gln Cys His 15 10 15

Asn His Cys Lys Ser Ile Lys Gly Tyr Arg Gly Gly Tyr Cys Ala Lys 20 25 30

Gly Gly Phe Val Cys Lys Cys Tyr Arg 35 40

112

41

PRT

Artificial

<210> <211> <212> <213>

<220>

<223> Polipeptídeo antimicrobiano sintético <400> 112

Gly Phe Gly Cys Asn Gly Pro Trp Asp Glu Asp Asp Met Arg Cys His 15 10 15

Asn His Cys Lys Ser Ile Lys Gly Tyr Lys Gly Gly Tyr Cys Ala Lys 20 25 30

Gly Gly Phe Val Cys Lys Cys Tyr Arg 35 40

<210> 113

<211> 40

<212> PRT

<213> Artificial

<220>

<223> Polipeptídeo antimicrobiano sintético

<400> 113 Gly Phe Gly Cys Asn Gly Pro Trp Asp Glu Asp Asp Met Arg Cys His 1 5 10 15

Asn His Cys Lys Ser Ile Lys Gly Tyr Lys Gly Gly Tyr Cys Ala Lys 20 25 30

Gly Gly Phe Ile Cys Lys Cys Tyr 35 40

<210> 114

<211> 40

<212> PRT

<213> Artificial

<220>

<223> Polipeptideo antimicrobiano sintético <400> 114

Gly Phe Gly Cys Asn Gly Pro Trp Asp Glu Asp Asp Met Arg Cys His 1 5 10 15

Asn His Cys Lys Ser Ile Lys Gly Tyr Arg Gly Gly Tyr Cys Ala Lys 20 25 30

Gly Gly Phe Val Cys Lys Cys Tyr 35 40

<210> 115

<211> 40

<212> PRT

<213> Artificial

<220>

<223> Polipeptideo antimicrobiano sintético

<400> 115

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<220>

<223> Polipeptídeo antimicrobiano sintético

<400> 238

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<220>

<223> Polipeptídeo antimicrobiano sintético

<400> 239

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<223> Polipeptídeo antimicrobiano sintético

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<223> Polipeptídeo antimicrobiano sintético <400> 242

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<223> Polipeptídeo antimicrobiano sintético

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<223> Polipeptídeo antimicrobiano sintético <400> 244

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<223> Polipeptideo antimicrobiano sintético

<400> 245

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<223> Polipeptideo antimicrobiano sintético

<400> 246

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<223> Polipeptídeo antimicrobiano sintético

<400> 247

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<223> Polipeptídeo antimicrobiano sintético

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<220>

<223> Polipeptideo antimicrobiano sintético

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<220>

<223> Polipeptideo antimicrobiano sintético

<400> 250

Gly Phe Gly Cys Ser Gly Pro Trp Ser Glu Asp Asp Met Gln Cys His 15 10 15

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<223> Polipeptideo antimicrobiano sintético

<400> 251

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<220>

<223> Polipeptideo antimicrobiano sintético

<400> 252

Gly Phe Gly Cys Asn Gly Pro Trp Asp Glu Asp Asp Arg Lys Cys His 15 10 15

Asn His Cys Lys Ser Ile Lys Gly Tyr Arg Gly Gly Tyr Cys Ala Lys 20 25 30

Gly Gly Phe Val Cys Lys Cys Tyr 35 40

<210> 253 <211> 40 <212> PRT <213> Artificial

<220>

<223> Polipeptídeo antimicrobiano sintético

<400> 253

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<220>

<223> Polipeptídeo antimicrobiano sintético

<400> 254

Gly Phe Gly Cys Gly Gly Pro Trp Asp Glu Asp Asp Trp Gln Cys His 1 5 10 15

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<212> PRT

<213> Artificial <220>

<223> Polipeptídeo antimicrobiano sintético <400> 255

Gly Phe Gly Cys Asn Gly Pro Trp Asp Glu Asp Asp Ala Lys Cys His 1 5 10 15

Asn His Cys Lys Ser Ile Lys Gly Tyr Arg Gly Gly Tyr Cys Ala Lys

20

25

30

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<220>

<223> Polipeptídeo antimicrobiano sintético

<400> 256

Gly Phe Gly Cys Lys Gly Pro Trp Asp Glu Asp Asp Leu Gln Cys His 1 5 10 15

Asn His Cys Lys Ser Ile Lys Gly Tyr Lys Gly Gly Tyr Cys Ala Lys 20 25 30

Gly Gly Phe Val Cys Lys Cys Tyr 35 40

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<212> PRT

<213> Artificial

<220>

<223> Polipeptídeo antimicrobiano sintético

<400>

257 Gly Phe Gly Cys Gly Gly Pro Trp Asp Glu Asp Asp Trp Glri Cys His 15 10 15

Ser His Cys Lys Ser Ile Lys Gly Tyr Lys Gly Gly Tyr Cys Ala Lys 20 25 30

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<212> PRT

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<220>

<223> Polipeptldeo antimicrobiano sintético <400> 258

Gly Phe Gly Cys Asn Gly Pro Trp Asp Glu Asp Asp Met Gln Cys His 15 10 15

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<220>

<223> Polipeptideo antimicrobiano sintético <400> 259

Gly Phe Gly Cys Asn Gly Pro Trp Asp Glu Asp Asp Met Gln Cys His 15 10 15 Asn His Cys Lys Asn Ile Lys Gly Tyr Lys Gly Gly Tyr Cys Ala Lys 20 25 30

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<220>

<223> Polipeptídeo antimicrobiano sintético <400> 260

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Gly Phe Gly Cys His Gly Pro Trp Asp Glu Asp Asp Glu Gln Cys His 1 5 10 15

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<212> PRT

<213> Artificial

<220>

<223> Polipeptldeo antimicrobiano sintético

<400> 262

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<223> Polipeptideo antimicrobiano sintético

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<212> PRT

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<223> Polipeptideo antimicrobiano sintético <400> 264

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<212> PRT

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<220>

<223> Polipeptídeo antimicrobiano sintético <400> 265

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<220>

<223> Polipeptídeo antimicrobiano sintético <400> 266

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<220>

<223> Polipeptídeo antimicrobiano sintético

<400> 267

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<220>

<223> Polipeptídeo antimicrobiano sintético <400> 268

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<220>

<223> Polipeptideo antimicrobiano sintético

<400> 269

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<223> Polipeptideo antimicrobiano sintético <400> 270

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<223> Polipeptídeo antimicrobiano sintético

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<220>

<223> Polipeptídeo antimicrobiano sintético

<400> 272

Gly Phe Gly Cys Ser Gly Pro Trp Asp Glu Asp Asp Val Gln Cys His 15 10 15

Ala His Cys Lys Ser Ile Lys Gly Tyr Lys Gly Gly Tyr Cys Ala Lys 20 25 30 Gly Gly Phe Val Cys Lys Cys Tyr 35 40

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<213> Artificial

<220>

<223> Polipeptídeo antimicrobiano sintético <400> 273

Gly Phe Gly Cys Asn Gly Pro Trp Asp Glu Asp Asp Met Gln Cys His 15 10 15

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<212> PRT

<213> Artificial

<220>

<223> Polipeptídeo antimicrobiano sintético <400> 274

Gly Phe Gly Cys Asn Gly Pro Trp Asp Glu Asp Asp Met Gln Cys His 15 10 15

Asn His Cys Lys Val Ile Lys Gly Tyr Lys Gly Gly Tyr Cys Ala Lys 20 25 30

Gly Gly Phe Val Cys Lys Cys Tyr 35 40

Claims

1. Polipeptídeo tendo atividade antimicrobiana, caracterizado pelo fato de compreender uma seqüência de aminoácido a qual tem pelo menos 80% de identidade com aminoácidos 1 a 40 de SEQ ID NO: 2: G-X1-G-C-X2-X3-X4-X5-X6-X7-X8-X9-XIO-Xii-C-H-X12-X13-C-XI4-XI5-XI6- X17-X18-X19-X2O-G-G-X21-C-X22-X23-X24-X25-X26-X27-C-X2B-C-X29; em que XI = F, L, W ou I; de preferência, X1 = F; X2 = N, R, Q, V, G, S, A, K, L, M, D, H ou Y; de preferência, X2 = N, R, Q, V, G, S, A, K ou Y; X3 = G, R, A ou K; de preferência, X3 = G; X4 = P, A, L, V, K ou R; de preferência, X4 = Ρ, K ou R; X5 = W ou R; X6 = D, A, G, K, L, Τ, N, F, Η, Μ, P, Q, S, C, I, R, V ou Y; de preferência, X6 = D, A, G, K, L, Τ, N, F, Η, Μ, P, Q, S, V ou Y; X7 = E, G, A, L, C, Q ou S; de preferência, X7 = E, G ou S; X8 = D, F, G, Ν, V, Υ, Η, K, L, P, S, T, W, I, M, A, C ou R; de preferência, X8 = D, F, G, Ν, V, Υ, Η, K, L, P, S, T, W, I, M ou R; X9 = D ou P; de preferência, X9 = D; X10 = M, R, S, V, A, F, G, L, Τ, Y, W, E ou K; de preferência, X10 = M, R, S, V, G, Y, L, F, T, W ou K; XII = Q, R, L, F, G, H, S, A, C, I, Κ, Μ, Ρ, Τ, V, W ou Y; de preferência, X11 = Q, R, L, F, G, H, S, K ou Y; X12 = N, R, I, Υ, V, Κ, T, Q, S, F, A, W, E ou H; X13 = H, A, F, Q, Τ, V ou L; de preferência, X13 = H ou L; X14 = K, Q ou R; de preferência, X14 = KouR; X15 = S, A, V, N ou F; X16 = I, L, Μ, T, W ou V; de preferência, X16 = I, L ou V; X17 = Κ, T ou R; X18 = G, Η, Κ, Α, Ρ, F, I, Q, R, S, Τ, Y ou Ν; de preferência, X18 = Gj Η, R5Kou Ν; X19 = Υ, Η, Κ, L, Μ, Ν, Q, S, V ou R; de preferência, X19 = Y ou R; X20 = Κ, F, Η, Τ, C ou R; de preferência, X2o = KouR; X21 = Y, F, R, A, H, L, M, S ou W; de preferência, X21 = Y, F, Rou W; X22 = A, Κ, N, Q, Τ, Ε, Η, I, R, S, V, G ou Y; de preferência, X22 = A, Κ, N, Q, T, S ou Y; X23 = K, R ou T; de preferência, X23 = K ou R; X24 = G, K, Q, Ε, N, S, Τ, A ou R; de preferência, X24 = G, K, Q, A ou R; X25 = G, Κ, H, W ou R; de preferência, X25 = G, K ou R; X26 = F, A, Η, I, Μ, V, W, R ou L; de preferência, X26 = Fou L; X27 = V, L, Μ, I, K, Q, R ou T; de preferência, X27 = V, L, M ou T; X28 = Κ, Η, N ou R; de preferência, X28 = K ou R; X29 = Υ, I, YRCG ou YR; de preferência, X29 = Y ou YR; e a qual tem menos de 100% de identidade com aminoácidos 1 a 40 de SEQ ID NO: 1.

2. Polipeptídeo de acordo com a reivindicação 1 caracterizado pelo fato de a seqüência de aminoácido ter pelo menos 85% de identidade com aminoácidos 1 a 40 de SEQ ID NO: 2, de preferência pelo menos 90% de identidade, ou pelo menos 95% de identidade com aminoácidos 1 a 40 de SEQ ID NO: 2.

3. Polipeptídeo de acordo com a reivindicação 1 caracterizado pelo fato de compreender a seqüência de aminoácido de SEQ ID NO: 2.

4. Polipeptídeo de acordo com qualquer uma das reivindicações 1 a 3, caracterizado pelo fato de compreender a seqüência de aminoácido de qualquer uma de SEQ ID NO: 3 a SEQ ID NO: 225 ou qualquer uma de SEQ ID NO: 226 a SEQ ID NO: 251 ou qualquer uma de SEQ ID NO: 252 a SEQ ID NO: 274.

5. Polipeptídeo de acordo com qualquer uma das reivindicações 1 a 3, caracterizado pelo fato de consistir da seqüência de aminoácido de SEQ ID NO: 2; ou um fragmento da mesma tendo atividade antimicrobiana e compreendendo 6 resíduos de cisteína.

6. Polipeptídeo de acordo com a reivindicação 5, caracterizado pelo fato de consistir da seqüência de aminoácido de qualquer uma de SEQ ID NO: 3 a SEQ ID NO: 225 ou qualquer uma de SEQ ID NO: 226 a SEQ ID NO: 251 ou qualquer uma de SEQ ID NO: 252 a SEQ ID NO: 274; ou um fragmento das mesmas tendo atividade antimicrobiana e compreendendo 6 resíduos de cisteína.

7. Polinucleotídeo, caracterizado pelo fato de compreender uma seqüência de nucleotídeo a qual codifica o polipeptídeo como definido em qualquer uma das reivindicações 1 a 6.

8. Construção de ácido nucleico, caracterizada pelo fato de compreender o polinucleotídeo como definido na reivindicação 7 operavelmente ligado a uma ou mais seqüências de controle que direcionam a produção do polipeptídeo em um hospedeiro de expressão.

9. Vetor de expressão recombinante, caracterizado pelo fato de compreender a construção de ácido nucleico como definida na reivindicação 8.

10. Célula hospedeira recombinante, caracterizada pelo fato de compreender a construção de ácido nucleico como definida na reivindicação 8.

11. Método para produção do polipeptídeo como definido em qualquer uma das reivindicações 1 a 6, caracterizado pelo fato de compreender (a) cultura da célula hospedeira recombinante como definida na reivindicação 10 sob condições condutivas à produção do polipeptídeo; e (b) recuperação do polipeptídeo.

12. Planta transgênica, parte de planta ou célula de planta, caracterizada pelo fato de ter sido transformada com um polinucleotídeo que codifica o polipeptídeo como definido em qualquer uma das reivindicações 1 a 6.

13. Composição, caracterizada pelo fato de compreender um polipeptídeo antimicrobiano como definido em qualquer uma das reivindicações 1 a 6.

14. Método para matar ou inibir o crescimento de células microbianas, caracterizado pelo fato de compreender contato das células microbianas com um polipeptídeo antimicrobiano como definido em qualquer uma das reivindicações 1 a 6.

15. Polipeptídeo antimicrobiano de acordo com qualquer uma das reivindicações 1 a 6, caracterizado pelo fato de ser para uso como um medicamento ou um agente terapêutico ou profilático antimicrobiano veterinário ou humano.

16. Uso de um polipeptídeo antimicrobiano como definido em qualquer uma das reivindicações 1 a 6, caracterizado pelo fato de ser para o preparo de um agente terapêutico veterinário ou humano para o tratamento de uma infecção microbiana ou para uso profilático.

17. Uso de pelo menos um polipeptídeo antimicrobiano como definido em qualquer uma das reivindicações 1 a 6, caracterizado pelo fato de ser em uma ração para animal.