BR112020022185A2 - terapia de combinação de uma terapia de células t do receptor de antígeno quimérico (car) e um inibidor de quinase - Google Patents

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BR112020022185A2
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Stanley R. Frankel
Jens Hasskarl
Jason A. Dubovsky
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Abstract

  TERAPIA DE COMBINAÇÃO DE UMA TERAPIA DE CÉLULAS T DO RECEPTOR DE ANTÍGENO QUIMÉRICO (CAR) E UM INIBIDOR DE QUINASE. A presente invenção refere-se a terapias de combinação que envolvem imunoterapia, por exemplo, uma terapia de célula T de receptor de antígeno quimérico (CAR), e o uso de um inibidor de quinase, por exemplo, um inibidor de BTK/lTK, por exemplo, ibrutinib, para o tratamento de indivíduos portadores de cânceres, tais como certas malignidades de célula B, e métodos relacionados, composições, usos e artigos de fabricação. A terapia de célula T de CAR inclui células que expressam receptores recombinantes, tais como CARS anti-CD19. Em algumas modalidades, a malignidade de célula B é um lifoma não Hodgkin (NHL), tal como NHL recidivada ou refratária ou subtipo de NHL específico.

Description

Relatório Descritivo da Patente de Invenção para “TERAPIA DE COMBINAÇÃO DE UMA TERAPIA DE CÉLULAS T DO RECEP- TOR DE ANTÍGENO QUIMÉRICO (CAR) E UM INIBIDOR DE QUI- NASE”. Referência Cruzada aos Pedidos Relacionados
[001] Este pedido reivindica prioridade do pedido provisório Norte- americano Nº 62/666.653, depositado em 3 de maio de 2018, intitulado "TERAPIA DE COMBINAÇÃO DE UMA TERAPIA DE CÉLULA T E UM INIBIDOR DE QUINASE", cujo conteúdo é incorporado por referência em sua íntegra. Incorporação por Referência de Listagem de Sequência
[002] O presente pedido está sendo protocolado junto com uma Listagem de Sequências em formato eletrônico. A Listagem de Sequên- cia é fornecida como um arquivo intitulado 735042017540SeqList.txt, criado em 30 de abril de 2019, que tem 34,4 quilobytes de tamanho. As informações no formato eletrônico da Listagem de Sequência são incor- poradas por referência em sua íntegra. Campo
[003] A presente descrição refere-se em alguns aspectos a méto- dos, composições, usos e artigos de fabricação de terapias de com- binação envolvendo imunoterapias, tais como terapia de células adoti- vas, por exemplo, terapia de células T, e o uso de um inibidor de quinase, por exemplo, um Inibidor de BTK/ITK, para o tratamento de indivíduos com doenças e condições, tais como certas malignidades de células B e métodos, composições, usos e artigos de fabricação relacio- nados. A terapia com células T inclui células que expressam receptores recombinantes, como receptores de antígenos quiméricos (CARs). Em algumas modalidades, a doença ou condição é um linfoma não Hodgkin (NHL), como NHL recidivante ou refratário ou subtipo específico de NHL.
Antecedentes
[004] Várias estratégias estão disponíveis para imunoterapia, por exemplo, a administração de células T modificadas para terapia adotiva. Por exemplo, estratégias estão disponíveis para modificar células T que expressam receptores de antígenos geneticamente modificados, como CARs, e administrar composições contendo tais células a indivíduos. Estratégias melhoradas são necessárias para melhorar a eficácia das células, por exemplo, melhorando a persistência, atividade e/ou prolifer- ação das células após a administração a indivíduos. São fornecidos métodos, composições, kits e sistemas que atendem a essas neces- sidades. Sumário
[005] São aqui fornecidos métodos, composições, usos, artigo de fabricação envolvendo terapias de combinação envolvendo a admin- istração de uma imunoterapia envolvendo uma terapia celular, como uma terapia de células T, e a administração ao indivíduo de um inibidor de quinase como aqui descrito, tal como ibrutinibibrutinib, a um indivíduo com câncer, por exemplo, uma malignidade de células B. Em alguns aspectos, a malignidade de células B é um linfoma não Hodgkin (NHL), como NHL recidivante ou refratário ou subtipo específico de NHL. Em alguns aspectos, os métodos, usos e artigo de fabricação fornecidos envolvem a administração de uma terapia com células T, como células T que expressam CAR compreendem um domínio de ligação ao antígeno que se liga a um antígeno expresso em células B.
[006] É aqui fornecido um método de tratamento, incluindo a ad- ministração a um indivíduo com câncer de uma quantidade eficaz de um inibidor de quinase que é ou inclui a estrutura
, ou um sal farmaceuticamente aceitável do mesmo; e administrar uma terapia de células T autólogas ao indivíduo, a referida terapia de células T contendo uma dose de células T geneti- camente modificadas que expressam um receptor de antígeno quimé- rico (CAR) que se liga especificamente a um CD19, em que, antes de administrar a terapia de células T, um amostra foi obtida a partir do in- divíduo e processada, o processamento inclui a modificação genética de células T da amostra, opcionalmente pela introdução de uma molé- cula de ácido nucleico que codifica o CAR nas referidas células T, em que a administração do inibidor de quinase é iniciada pelo menos em ou cerca de 3 dias antes da obtenção da amostra e é realizado em um regime de dosagem compreendendo administrações repetidas do inibi- dor em um intervalo de dosagem, ao longo de um período de tempo que se estende pelo menos para incluir a administração no dia ou após o dia em que a amostra é obtida do indivíduo.
[007] É aqui fornecido um método de tratamento, incluindo a ad- ministração a um indivíduo com câncer de uma quantidade eficaz de um inibidor de quinase que é ou inclui a estrutura , ou um sal farmaceuticamente aceitável do mesmo; obtendo do indivíduo uma amostra biológica e processando cé- lulas T da referida amostra, gerando assim uma composição contendo células T geneticamente modificadas que expressam um receptor de antígeno quimérico (CAR) que se liga especificamente a um CD19; e administrar ao indivíduo uma terapia de células T autólogas contendo uma dose das células T geneticamente modificadas, em que a adminis- tração do inibidor de quinase é realizada em um regime de dosagem que é iniciado pelo menos em ou cerca de 3 dias antes da obtenção da amostra e que compreende administrações repetidas do inibidor, em um intervalo de dosagem, ao longo de um período de tempo e se estende pelo menos para incluir a administração do inibidor em ou após o dia em que a amostra é obtida do indivíduo.
[008] É aqui fornecido um método de tratamento, incluindo a ad- ministração a um indivíduo com câncer de uma quantidade eficaz de um inibidor de quinase com a estrutura , ou um sal farmaceuticamente aceitável do mesmo, em que o indivíduo é um candidato ao tratamento ou deve ser tratado com uma terapia de células T autólogas, a referida terapia de células T contendo uma dose de células T geneticamente modificadas que expressam um receptor de antígeno quimérico (CAR) que se liga especificamente a um CD19, em que antes de administrar a terapia com células T, uma amostra biológica foi obtida do indivíduo e processada, o processamento compreendendo a modificação genética de células T da amostra, opcionalmente pela introdução de uma molécula de ácido nucleico que codifica o CAR nas referidas células T; e a administração do inibidor de quinase é iniciada pelo menos ou cerca de 3 dias antes da obtenção da amostra e é realizada em um regime de dosagem com- preendendo administrações repetidas do inibidor em um intervalo de do- sagem por um período de tempo que se estende pelo menos para incluir a administração no dia ou após o dia em que a amostra é obtida do indivíduo. Em algumas modalidades, o método inclui ainda a adminis- tração ao indivíduo da terapia com células T.
[009] Em algumas modalidades, após o início da administração do inibidor da quinase e antes da administração da terapia com células T, o indivíduo foi precondicionado com uma terapia de linfodepleção. Em alguns aspectos, após o início da administração do inibidor de quinase e antes da administração da terapia de células T, administrar uma tera- pia de linfodepleção ao indivíduo. Em algum exemplo, a administração do inibidor da quinase é interrompida ou interrompida durante a terapia de linfodepleção.
[0010] Em algumas modalidades, o regime de dosagem inclui a ad- ministração do inibidor da quinase durante um período de tempo que se estende pelo menos para incluir a administração até o início da terapia de linfodepleção. Em alguns exemplos, o regime de dosagem inclui a administração do inibidor de quinase ao longo de um período de tempo que inclui a administração até o início da terapia de linfodepleção, se- guida pela descontinuação ou interrupção da administração do inibidor de quinase durante a terapia de linfodepleção e, em seguida, adminis- tração adicional do inibidor da quinase por um período que se estende por pelo menos 15 dias após o início da administração da terapia com células T.
[0011] É aqui fornecido um método de tratamento, incluindo a ad- ministração a um indivíduo com câncer de uma quantidade eficaz de um inibidor de quinase com a estrutura , ou um sal farmaceuticamente aceitável do mesmo; administrar uma terapia de linfodepleção ao indivíduo; e admi- nistrar uma terapia com células T autólogas ao indivíduo, a referida te- rapia com células T contendo uma dose de células T geneticamente modificadas que expressam um receptor de antígeno quimérico (CAR)
que se liga especificamente a um CD19, em que, antes da administra- ção da terapia com células T contendo o amostra foi obtida a partir do indivíduo e processada, o processamento compreendendo a modifica- ção genética de células T da amostra, opcionalmente pela introdução de uma molécula de ácido nucleico que codifica o CAR nas referidas células T, em que a administração do inibidor de quinase é iniciada pelo menos em ou cerca de 3 dias antes da obtenção da amostra e é reali- zado em um regime de dosagem compreendendo administrações repe- tidas do inibidor de quinase em um intervalo de dosagem ao longo de um período de tempo que inclui a administração até o início da terapia de linfodepleção, seguida pela descontinuação ou interrupção da admi- nistração do inibidor de quinase durante a terapia de linfodepleção e, em seguida, adm início da administração do inibidor da quinase por um período que se estende por pelo menos 15 dias após o início da admi- nistração da terapia com células T. Em algumas modalidades, o método inclui ainda obtendo do indivíduo a amostra biológica e processando cé- lulas T da referida amostra, gerando assim uma composição contendo as células T geneticamente modificadas que expressam o receptor de antígeno quimérico (CAR) que se liga especificamente a um CD19.
[0012] Em algumas de tais modalidades, a administração do inibidor de quinase é iniciada pelo menos por ou cerca de 4 dias, pelo menos por ou cerca de 5 dias, pelo menos por ou 6 dias, pelo menos por ou cerca de 7 dias, por pelo menos, ou cerca de 14 dias ou mais antes de obter a amostra do indivíduo. Em alguns exemplos, a administração do inibidor de quinase é iniciada pelo menos ou em ou cerca de 5 dias a 7 dias antes da obtenção da amostra do indivíduo.
[0013] Em algumas modalidades, a administração da terapia de lin- fodepleção é concluída em 7 dias antes do início da administração da terapia com células T. Em algumas modalidades, a administração da terapia de linfodepleção é concluída 2 a 7 dias antes do início da admi- nistração da terapia de células T.
[0014] Em algumas modalidades, a administração adicional é por um período que se estende de 15 dias a 29 dias após o início da admi- nistração da terapia com células T. Em algumas modalidades, a admi- nistração adicional do inibidor de quinase é por um período que se es- tende por ou cerca de ou mais de três meses após o início da adminis- tração da terapia com células T. Em algumas de tais modalidades, a administração do inibidor de quinase é realizada uma vez por dia em cada dia em que é administrado durante o regime de dosagem.
[0015] Em algumas de tais modalidades, a quantidade eficaz com- preende de ou de cerca de 140 mg a ou a cerca de 840 mg ou de ou de cerca de 140 mg a ou a cerca de 560 mg por cada dia em que o inibidor de quinase é administrado.
[0016] Em alguns exemplos, a quantidade eficaz inclui de ou de cerca de 140 mg a ou a cerca de 560 mg por cada dia em que o inibidor de quinase é administrado.
[0017] É aqui fornecido um método de tratamento incluindo a admi- nistração a um indivíduo com câncer de um inibidor de quinase, em que o inibidor de quinase é ou inclui a estrutura , ou é um sal farmaceuticamente aceitável deste; e administrar uma terapia com células T autólogas ao indivíduo, a refe- rida terapia com células T contendo uma dose de células T genetica- mente modificadas que expressam um receptor de antígeno quimérico (CAR) que se liga especificamente a um CD19, em que, antes de admi- nistrar a terapia com células T, uma amostra biológica foi obtido a partir do indivíduo e processado, o processamento compreendendo a modifi- cação genética de células T da amostra, opcionalmente pela introdução de uma molécula de ácido nucleico que codifica o CAR nas referidas células T, em que a administração do inibidor de quinase é iniciada pelo menos em ou cerca de 5 a 7 dias antes da obtenção da amostra e é realizada em um regime de dosagem compreendendo a administração repetida do inibidor de quinase em um intervalo de dosagem ao longo de um período de tempo que se estende pelo menos para incluir a ad- ministração no dia ou após o dia em que a amostra é obtida do indivíduo e administração adicional que se estende por cerca de ou mais de três meses após o início da administração da terapia com células T, em que o inibidor da quinase é administrado em uma quantidade de ou de cerca de 140 mg a ou a cerca de 560 mg uma vez por dia, cada dia, é admi- nistrado durante o regime de dosagem. Em algumas modalidades, após o início da administração do inibidor da quinase e antes da administra- ção da terapia com células T, o indivíduo foi precondicionado com uma terapia de linfodepleção. Em alguns casos, o método inclui ainda, após a administração do inibidor da quinase e antes da administração da te- rapia com células T, a administração de uma terapia de linfodepleção ao indivíduo.
[0018] Em algumas modalidades, a administração da terapia de lin- fodepleção é concluída em 7 dias antes do início da administração da terapia com células T. Em alguns exemplos, a administração da terapia de linfodepleção é concluída 2 a 7 dias antes do início da administração da terapia com células T. Em alguns casos, o regime de dosagem inclui a interrupção da administração do inibidor da quinase durante a terapia de linfodepleção.
[0019] É aqui fornecido um método de tratamento, incluindo a ad- ministração a um indivíduo com câncer de um inibidor de quinase, em que o inibidor de quinase tem a estrutura , ou é um sal farmaceuticamente aceitável deste; e administrar uma terapia de lin- fodepleção ao indivíduo; e administrar uma terapia de células T autólo- gas ao indivíduo dentro de 2 a 7 dias após a conclusão da terapia de linfodepleção, a referida terapia de células T compreendendo uma dose de células T geneticamente modificadas que expressam um receptor de antígeno quimérico (CAR) que se liga especificamente a um CD19, em que, antes de administrar a terapia com células T, uma amostra bioló- gica foi obtida do indivíduo e processada, o processamento compreen- dendo a modificação genética das células T da amostra, opcionalmente pela introdução de uma molécula de ácido nucleico que codifica o CAR nas referidas células T, em que a administração do O inibidor da quinase é iniciado pelo menos por ou cerca de 5 a 7 dias antes da obtenção da amostra e é realizado em um regime de dosagem que compreende a administração do inibidor da quinase até o início da terapia de linfode- pleção, descontinuando a administração do inibidor da quinase durante a terapia de linfodepleção e administração adicional do inibidor da qui- nase por um período que se estende por pelo menos ou mais de três meses após o início da administração da terapia com células T, em que o inibidor da quinase é administrado em uma quantidade de ou de cerca de 140 mg a ou cerca de 560 mg uma vez por dia, cada dia, é adminis- trado durante o regime de dosagem.
[0020] Em algumas modalidades, o método inclui ainda obtendo do indivíduo a amostra biológica e processando células T da referida amos- tra, gerando assim uma composição que compreende as células T ge- neticamente modificadas que expressam o receptor de antígeno quimé- rico (CAR) que se liga especificamente a um CD19. Em algumas de tais modalidades, a administração do inibidor de quinase por dia em que é administrado é de ou de cerca de 280 mg a ou a cerca de 560 mg. Em alguns aspectos, a administração do inibidor de quinase é iniciada no mínimo por ou cerca de 7 dias antes da obtenção da amostra do indiví- duo.
[0021] Em algumas de tais modalidades, a administração do inibidor da quinase é iniciada a partir de ou de cerca de 30 a ou a cerca de 40 dias antes de iniciar a administração da terapia de células T; a amostra é obtida do indivíduo de ou de cerca de 23 a ou a cerca de 38 dias antes de iniciar a administração da terapia com células T; e/ou a terapia de linfodepleção é completada em ou cerca de 5 a 7 dias antes do início da administração da terapia com células T. Em algumas modalidades, a administração do inibidor da quinase é iniciada em ou cerca de 35 dias antes do início da administração da terapia com células T; a amostra é obtida do indivíduo de ou de cerca de 28 a ou a cerca de 32 dias antes de iniciar a administração da terapia com células T; e/ou a terapia de linfodepleção é completada em ou cerca de 5 a 7 dias antes do início da administração da terapia com células T.
[0022] Em algumas modalidades, a terapia de linfodepleção inclui a administração de fludarabina e/ou ciclofosfamida. Em algumas modali- dades, a terapia de linfodepleção inclui a administração de ciclofosfa- mida em ou cerca de 200-400 mg/m2, opcionalmente em ou cerca de 300 mg/m2, inclusive, e/ou fludarabina em ou cerca de 20-40 mg/m2, opcionalmente 30 mg/m2, diariamente durante 2-4 dias, opcionalmente durante 3 dias, ou em que a terapia de linfodepleção inclui a administra- ção de ciclofosfamida a ou cerca de 500 mg/m2. Em alguns exemplos, a terapia de linfodepleção inclui a administração de ciclofosfamida a ou cerca de 300 mg/m2 e fludarabina a ou cerca de 30 mg/m2 diariamente durante 3 dias; e/ou a terapia de linfodepleção inclui a administração de ciclofosfamida a ou cerca de 500 mg/m2 e fludarabina a ou cerca de 30 mg/m2 diariamente durante 3 dias.
[0023] Em algumas modalidades, a administração do inibidor de quinase por dia em que é administrado é em uma quantidade igual a ou cerca de 140 mg. Em algumas modalidades, a administração do inibidor de quinase por dia é administrado em uma quantidade de ou cerca de 280 mg. Em algumas modalidades, a administração do inibidor de qui- nase por dia é administrado em uma quantidade de ou cerca de 420 mg. Em alguns casos, a administração do inibidor de quinase por dia é ad- ministrado em uma quantidade de ou cerca de 560 mg.
[0024] Em algumas modalidades, o período se estende por ou cerca de ou mais de quatro meses após o início da administração da terapia com células T. Em alguns casos, o período se estende por ou cerca de ou mais de cinco meses após o início da administração da terapia com células T. Em algumas modalidades, a administração adicional é por um período que se estende por ou cerca de ou superior a seis meses.
[0025] Em algumas de tais modalidades, a administração adicional do inibidor da quinase é interrompida no final do período, se, no final do período, o indivíduo exibir uma resposta completa (RC) após o trata- mento. Em algumas modalidades, a administração adicional do inibidor da quinase é interrompida no final do período se, no final do período, o câncer progrediu ou recidivou após a remissão após o tratamento. Em alguns casos, o período estende-se de ou de ou cerca de três meses a ou seis meses. Em alguns exemplos, o período se estende por ou cerca de três meses após o início da administração da terapia com células T.
[0026] Em algumas modalidades, o período se estende por ou cerca de 3 meses após o início da administração da terapia com células T se o indivíduo, antes de ou cerca de 3 meses, atingiu uma resposta com- pleta (RC) após o tratamento ou o câncer progrediu ou recidivou após a remissão após o tratamento. Em alguns casos, o período se estende por ou cerca de 3 meses após o início da administração da terapia com células T se o indivíduo em 3 meses atingiu uma resposta completa (RC). Em alguns exemplos, o período se estende por ou cerca de seis meses após o início da administração da terapia com células T. Em al- gumas modalidades, o período se estende por ou cerca de 6 meses após o início da administração da terapia com células T se o indivíduo, antes de ou cerca de 6 meses, atingiu uma resposta completa (RC) após o tratamento ou o câncer progrediu ou recidiva após remissão após o tratamento. Em alguns casos, o período se estende por ou cerca de 6 meses após o início da administração da terapia com células T se o indivíduo em 6 meses atingiu uma resposta completa (RC).
[0027] Em algumas modalidades, a administração adicional é con- tinuada durante o período, mesmo que o indivíduo tenha alcançado uma resposta completa (RC) em um ponto de tempo antes do final do perí- odo. Em algumas modalidades, o indivíduo atinge uma resposta com- pleta (RC) em um momento durante o período e antes do final do perí- odo. Em algumas modalidades, o método inclui ainda a continuação da administração adicional após o final do período, se, no final do período, o indivíduo exibir uma resposta parcial (RP) ou doença estável (DE). Em algumas modalidades, a administração adicional é continuada por mais de seis meses se, em ou cerca de seis meses, o indivíduo exibe uma resposta parcial (RP) ou doença estável (DE) após o tratamento. Em alguns casos, a administração adicional é continuada até que o indiví- duo tenha alcançado uma resposta completa (RC) após o tratamento ou até que o câncer tenha progredido ou recidivado após a remissão após o tratamento.
[0028] Em algumas modalidades, o inibidor da quinase inibe a tiro- sina quinase de Bruton (BTK) e/ou inibe a quinase de células T induzível por IL2 (ITK). Em algumas modalidades, o inibidor da quinase inibe ITK e o inibidor inibe ITK ou inibe ITK com metade da concentração inibidora máxima (IC50) menor do que ou menor do que cerca de 1000 nM, 900 nM, 800 nM, 600 nM, 500 nM, 400 nM, 300 nM, 200 nM, 100 nM ou menos.
[0029] Em algumas modalidades, o indivíduo havia recebido anteri- ormente o inibidor da quinase antes da administração do inibidor da qui- nase nos métodos fornecidos. Em algumas modalidades, o indivíduo não recebeu anteriormente o inibidor da quinase antes da administração do inibidor da quinase nos métodos fornecidos.
[0030] Em algumas modalidades, o indivíduo e/ou o câncer (a) é resistente à inibição da tirosina quinase de Bruton (BTK) e/ou (b) inclui uma população de células que são resistentes à inibição pelo inibidor da quinase, opcionalmente em que a população de células é ou inclui uma população de células B e/ou não inclui células T; o indivíduo e/ou o câncer contém uma mutação em um ácido nucleico que codifica uma BTK, opcionalmente em que a mutação é capaz de reduzir ou prevenir a inibição de BTK pelo inibidor da quinase, opcionalmente em que a mutação é C481S; o indivíduo e/ou o câncer contém uma mutação em um ácido nucleico que codifica fosfolipase C gama 2 (PLCgama2), op- cionalmente em que a mutação resulta em atividade de sinalização constitutiva, opcionalmente em que a mutação é R665W ou L845F; no momento do início da administração do inibidor da quinase e, opcional- mente, no momento do início da administração da terapia com células T, o indivíduo apresentou recaída após remissão após um tratamento anterior com, ou foi considerado refratário a um tratamento anterior com o inibidor da quinase e/ou com uma terapia com inibidor de BTK; no momento do início da administração do inibidor da quinase e, opcional- mente, no momento do início da terapia com células T, o indivíduo pro- grediu após um tratamento anterior com o inibidor e/ou com uma terapia com inibidor de BTK, opcionalmente em que o o indivíduo exibiu doença progressiva como a melhor resposta ao tratamento anterior ou progres- são após a resposta anterior ao tratamento anterior; e/ou no momento do início da administração do inibidor da quinase e, opcionalmente, no momento do início da terapia com células T, o indivíduo exibiu uma res- posta menor do que a resposta completa (RC) após um tratamento an- terior por pelo menos 6 meses com o inibidor e/ou com uma terapia com inibidor de BTK.
[0031] Em algumas de tais modalidades, o câncer é uma maligni- dade de células B. Em alguns casos, a malignidade das células B é um linfoma. Em alguns casos, o linfoma é um linfoma não Hodgkin (NHL). Em alguns exemplos, o NHL inclui NHL agressivo, linfoma difuso de grandes células B (DLBCL), DLBCL-NOS, opcionalmente transformado indolente; DLBCL-NOS EBV-positivo; linfoma de grandes células B rico em células T/histiócitos; linfoma mediastinal primário de grandes células B (PMBCL); linfoma folicular (FL), opcionalmente, linfoma folicular Grau 3B (FL3B); e/ou linfoma de células B de alto grau com rearranjos MYC e BCL2 e/ou BCL6 com histologia de DLBCL (duplo/triplo hit).
[0032] Em algumas modalidades, o indivíduo é ou foi identificado como tendo um status de Status de Desempenho do Eastern Coopera- tive Oncology Group Eastern Cooperative Oncology Group (ECOG) me- nor ou igual a 1.
[0033] Em algumas de tais modalidades, o inibidor da quinase é ad- ministrado por via oral.
[0034] Em algumas modalidades, o CD19 é um CD19 humano. Em alguns aspectos, o receptor de antígeno quimérico (CAR) inclui um do- mínio de reconhecimento de antígeno extracelular que se liga especifi- camente ao CD19 e um domínio de sinalização intracelular incluindo um ITAM. Em alguns casos, o domínio de sinalização intracelular inclui um domínio de sinalização de uma cadeia CD3-zeta (CD3ζ), opcionalmente uma cadeia CD3-zeta humana. Em algumas modalidades, o receptor de antígeno quimérico (CAR) contém ainda uma região de sinalização co- estimuladora. Em alguns casos, a região de sinalização coestimuladora inclui um domínio de sinalização de CD28 ou 4-1BB, opcionalmente CD28 humano ou 4-1BB humano. Em algumas modalidades, o domínio coestimulatório é ou inclui um domínio de sinalização de 4-1BB humano.
[0035] Em algumas modalidades, o CAR contém um scFv especí- fico para o CD19; um domínio transmembranar; um domínio de sinali- zação citoplasmático derivado de uma molécula coestimuladora, que opcionalmente é ou inclui um 4-1BB, opcionalmente 4-1BB humano; e um domínio de sinalização citoplasmático derivado de uma molécula contendo ITAM de sinalização primária, que opcionalmente é ou inclui um domínio de sinalização CD3zeta, opcionalmente um domínio de si- nalização CD3zeta humano; e opcionalmente em que o CAR inclui ainda um espaçador entre o domínio transmembranar e o scFv; o CAR con- tém, na ordem, um scFv específico para o CD19; um domínio transmem- branar; um domínio de sinalização citoplasmático derivado de uma mo- lécula coestimuladora, que opcionalmente é ou inclui um domínio de si- nalização 4-1BB, opcionalmente um domínio de sinalização 4-1BB hu- mano; e um domínio de sinalização citoplasmático derivado de uma mo- lécula contendo ITAM de sinalização primária, que opcionalmente é um domínio de sinalização CD3zeta, opcionalmente domínio de sinalização CD3zeta humano; ou o CAR contenha, na ordem, um scFv específico para o CD19; um espaçador; um domínio transmembrana, um domínio de sinalização citoplasmático derivado de uma molécula coestimula- dora, que opcionalmente é um domínio de sinalização 4-1BB, e um do- mínio de sinalização citoplasmático derivado de uma molécula contendo ITAM de sinalização primária, que opcionalmente é ou inclui um domínio de sinalização CD3zeta.
[0036] Em algumas modalidades, o CAR contém um espaçador e o espaçador é um espaçador de polipeptídeo que (a) inclui ou consiste em toda ou uma parte de uma articulação de imunoglobulina ou uma versão modificada da mesma ou inclui cerca de 15 aminoácidos ou me- nos, e não inclui uma região extracelular de CD28 ou uma região extra- celular de CD8, (b) inclui ou consiste em toda ou uma porção de uma articulação de imunoglobulina, opcionalmente, uma articulação de IgG4 ou uma versão modificada da mesma e/ou inclui cerca de 15 aminoáci- dos ou menos, e não inclui uma região extracelular de CD28 ou uma região extracelular de CD8, ou (c) tem ou cerca de 12 aminoácidos de comprimento e/ou inclui ou consiste em toda ou uma porção de uma articulação de imunoglobulina, opcionalmente uma IgG4 ou uma modi- ficada versão do mesmo; ou (d) tem ou consiste na sequência da SEQ ID NO: 1, uma sequência codificada pela SEQ ID NO: 2, SEQ ID NO: 30, SEQ ID NO: 31, SEQ ID NO: 32, SEQ ID NO: 33, SEQ ID NO: 34, ou uma variante de qualquer uma das anteriores tendo pelo menos 85 %, 86 %, 87 %, 88 %, 89 %, 90 %, 91 %, 92 %, 93 %, 94 %, 95 %, 96 %, 97 %, 98 %, 99 % ou mais identidade de sequência com a mesma, ou (e) inclui ou consiste na fórmula X1PPX2P (SEQ ID NO: 58), onde X1 é glicina, cisteína ou arginina e X2 é cisteína ou treonina; e/ou o domínio coestimulador inclui SEQ ID NO: 12 ou uma variante da mesma tendo pelo menos 85 %, 86 %, 87 %, 88 %, 89 %, 90 %, 91 %, 92 %, 93 %, 94 %, 95 %, 96 %, 97 %, 98 %, 99 % ou mais identidade de sequência; e/ou o domínio de sinalização primário inclui SEQ ID NO: 13 ou 14 ou 15 tendo pelo menos 85 %, 86 %, 87 %, 88 %, 89 %, 90 %, 91 %, 92 %, 93 %, 94 %, 95 %, 96 %, 97 %, 98 %, 99 % ou mais identidade de sequência; e/ou o scFv inclui uma sequência CDRL1 de RASQDISKYLN (SEQ ID NO: 35), uma sequência CDRL2 de SRLHSGV (SEQ ID NO: 36) e/ou uma sequência CDRL3 de GNTLPYTFG (SEQ ID NO: 37) e/ou uma sequência CDRH1 de DYGVS (SEQ ID NO: 38), uma sequência CDRH2 de VIWGSETTYYNSALKS (SEQ ID NO: 39), e/ ou uma sequên- cia CDRH3 de YAMDYWG (SEQ ID NO: 40) ou em que o scFv inclui uma região variável de cadeia pesada de FMC63 e uma região variável de cadeia leve de FMC63 e/ou uma sequência CDRL1 de FMC63, uma sequência CDRL2 de FMC63, a Sequência CDRL3 de FMC63, uma se- quência CDRH1 de FMC63, uma sequência CDRH2 de FMC63 e uma sequência CDRH3 de FMC63 ou liga-se ao mesmo epítopo ou compete pela ligação com qualquer um dos anteriores e, opcionalmente, em que o scFv inclui, em ordem, uma VH, um ligante, opcionalmente incluindo SEQ ID NO: 41 e uma VL e/ou o scFv inclui um ligante flexível e/ou inclui a sequência de aminoácidos apresentada como SEQ ID NO: 42.
[0037] Em algumas de tais modalidades, a dose de células T gene- ticamente modificadas contém a partir de ou a partir de cerca de 1 x 105 a 5 x 108 células T expressando CAR no total, 1 x 106 a 2,5 x 108 células T que expressam CAR totais, 5 x 106 a 1 x 108 células T que expressam CAR totais, 1 x 107 a 2,5 x 108 células T que expressam CAR totais, 5 x 107 a 1 x 108 células T que expressam CAR totais, cada inclusive. Em algumas modalidades, a dose de células T geneticamente modificadas contém pelo menos ou pelo menos cerca de 1 x 105 células que expres- sam CAR, pelo menos ou pelo menos cerca de 2,5 x 105 células que expressam CAR, pelo menos ou pelo menos cerca de 5 x 10 5 células que expressam CAR, pelo menos ou pelo menos cerca de 1 x 106 célu- las que expressam CAR, pelo menos ou pelo menos cerca de 2,5 x 106 células que expressam CAR, pelo menos ou pelo menos cerca de 5 x 106 células que expressam CAR, pelo menos ou pelo pelo menos cerca de 1 x 107 células que expressam CAR, pelo menos ou pelo menos cerca de 2,5 x 107 células que expressam CAR, pelo menos ou pelo menos cerca de 5 x 107 células que expressam CAR, pelo menos ou pelo menos cerca de 1 x 108 células que expressam CAR células, pelo menos ou pelo menos cerca de 2,5 x 108 células que expressam CAR, ou pelo menos ou pelo menos cerca de 5 x 108 células que expressam CAR. Em alguns casos, a dose de células T geneticamente modificadas contém pelo menos 5 x 107 células T que expressam CAR totais. Em alguns casos, a dose de células T geneticamente modificadas contém cerca de 1 x 108 células que expressam CAR. Em algumas modalida- des, a dose de células T geneticamente modificadas inclui células T CD4+ que expressam o CAR e células T CD8+ que expressam o CAR e a administração da dose contém a administração de uma pluralidade de composições separadas, a referida pluralidade de composições se- paradas incluindo uma primeira composição incluindo uma das células T CD4+ e das células T CD8+ e a segunda composição incluindo a outra das células T CD4+ ou as células T CD8+.
[0038] Em algumas modalidades, a primeira composição e a se- gunda composição são administradas com 0 a 12 horas de intervalo, 0 a 6 horas de intervalo ou 0 a 2 horas de intervalo ou em que a adminis- tração da primeira composição e a administração da segunda composi- ção são realizadas no mesmo dia, são realizadas entre cerca de 0 e cerca de 12 horas de intervalo, entre cerca de 0 e cerca de 6 horas de intervalo ou entre cerca de 0 e 2 horas de intervalo; e/ou o início da administração da primeira composição e o início da administração da segunda composição são realizados entre cerca de 1 minuto e cerca de 1 hora de intervalo ou entre cerca de 5 minutos e cerca de 30 minutos de intervalo. Em alguns aspectos, a primeira composição e a segunda composição são administradas não mais do que 2 horas, não mais do que 1 hora, não mais do que 30 minutos, não mais do que 15 minutos, não mais do que 10 minutos ou não mais do que 5 minutos de intervalo.
[0039] Em algumas modalidades, a primeira composição contém as células T CD4+. Em algumas modalidades, a primeira composição con- tém as células T CD8+. Em algumas modalidades, a primeira composi- ção é administrada antes da segunda composição. Em algumas moda- lidades, a dose de células é administrada por via parenteral, opcional- mente por via intravenosa. Em algumas de tais modalidades, as células T são células T primárias obtidas a partir da amostra do indivíduo. Em alguns casos, as células T são autólogas para o indivíduo.
[0040] Em algumas de tais modalidades, o processamento inclui o isolamento de células T, opcionalmente células T CD4+ e/ou CD8+, a partir da amostra obtida do indivíduo, produzindo assim uma composi- ção de entrada contendo células T primárias; e a introdução da molécula de ácido nucleico que codifica o CAR nas células T da composição de entrada. Em alguns casos, o isolamento inclui a realização de seleção baseada em imunoafinidade.
[0041] Em algumas modalidades, a amostra biológica é ou inclui uma amostra de sangue total, uma amostra de camada leucocitária, uma amostra de células mononucleares de sangue periférico (PBMC), uma amostra de células T não fracionadas, uma amostra de linfócitos, uma amostra de glóbulos brancos, um produto de aférese ou um pro- duto de leucaferese.
[0042] Em algumas modalidades, antes da introdução, o processo inclui incubar a composição de entrada sob condições de estimulação, as referidas condições de estimulação incluindo a presença de um rea- gente estimulador capaz de ativar um ou mais domínios de sinalização intracelular de um ou mais componentes de um complexo de TCR e/ou um ou mais domínios de sinalização intracelular de uma ou mais molé- culas coestimuladoras, gerando assim uma composição estimulada, em que a molécula de ácido nucleico que codifica o CAR é introduzida na composição estimulada. Em alguns exemplos, o reagente estimulador inclui um agente primário que se liga especificamente a um membro de um complexo de TCR, opcionalmente que se liga especificamente a CD3. Em alguns casos, o reagente estimulador inclui ainda um agente secundário que se liga especificamente a uma molécula coestimuladora de células T, opcionalmente em que a molécula coestimuladora é sele- cionada a partir de CD28, CD137 (4-1-BB), OX40 ou ICOS. Em alguns exemplos, os agentes primários e/ou secundários incluem um anticorpo,
opcionalmente em que o reagente estimulador inclui incubação com um anticorpo anti-CD3 e um anticorpo anti-CD28, ou um fragmento de liga- ção ao antígeno do mesmo.
[0043] Em alguns casos, o agente primário e/ou o agente secundá- rio estão presentes na superfície de um suporte sólido. Em alguns exemplos, o suporte sólido é ou inclui um grânulo, opcionalmente em que o grânulo é magnético ou superparamagnético. Em algumas moda- lidades, o grânulo inclui um diâmetro maior ou maior que cerca de 3,5 µm, mas não mais que cerca de 9 µm ou não mais que cerca de 8 µm ou não mais que cerca de 7 µm ou não mais que cerca de 6 µm ou não mais que cerca de 5 µm. Em alguns exemplos, o grânulo inclui um diâ- metro de ou cerca de 4,5 µm.
[0044] Em algumas modalidades, a introdução inclui a transdução de células da composição estimulada com um vetor viral incluindo um polinucleotídeo que codifica o receptor recombinante. Em alguns casos, o vetor viral é um vetor retroviral. Em alguns exemplos, o vetor viral é um vetor lentiviral ou gamarretroviral.
[0045] Em algumas modalidades, o processo inclui ainda após a in- trodução do cultivo das células T, opcionalmente em que o cultivo é re- alizado sob condições para resultar na proliferação ou expansão das células para produzir uma composição de saída contendo a terapia com células T. Em alguns casos, após o cultivo, o método inclui ainda a for- mulação de células da composição de saída para criopreservação e/ou para administração da terapia com células T ao indivíduo, opcional- mente em que a formulação está na presença de um excipiente farma- ceuticamente aceitável.
[0046] Em algumas de tais modalidades, o indivíduo é um ser hu- mano.
[0047] Em algumas modalidades, pelo menos 35 %, pelo menos 40 % ou pelo menos 50 % dos indivíduos tratados de acordo com o método alcançam uma resposta completa (RC) que é durável, ou é durável em pelo menos 60, 70, 80, 90 ou 95 % dos indivíduos que alcançaram o RC, por pelo menos 6 meses ou por ou mais que 9 meses; e/ou pelo menos 60, 70, 80, 90 ou 95 % dos indivíduos que alcançaram uma RC em seis meses permanecem em resposta, permanecem em RC e/ou sobrevivem ou sobrevivem sem progressão, por mais ou mais de 3 me- ses e/ou igual ou superior a 6 meses e/ou superior a nove meses; e/ou pelo menos 50 %, pelo menos 60 % ou pelo menos 70 % dos indivíduos tratados de acordo com o método alcançam a resposta objetiva (RO) opcionalmente em que a OR é durável, ou é durável em pelo menos 60, 70, 80, 90 ou 95 % dos indivíduos que alcançaram a OR, por pelo menos 6 meses ou por mais de 9 meses; e/ou pelo menos 60, 70, 80, 90 ou 95 % dos indivíduos que atingem uma OR em seis meses permanecem em resposta ou sobrevivem por mais ou mais do que 3 meses e/ou por ou mais do que 6 meses.
[0048] Em algumas modalidades, no momento ou imediatamente antes do momento da administração da dose de células, o indivíduo teve uma recaída após a remissão após o tratamento com, ou tornou-se re- fratário a, uma ou mais terapias anteriores para o linfoma, opcional- mente o NHL, opcionalmente, uma, duas ou três terapias anteriores di- ferentes de outra dose de células que expressam o CAR. Em algumas modalidades, durante ou antes da administração da terapia com células T contendo a dose de células, o indivíduo é ou foi identificado como tendo um linfoma de duplo/triplo hit; o indivíduo é ou foi identificado como tendo um linfoma quimiorrefratário, opcionalmente um DLBCL qui- miorrefratário; e/ou o indivíduo não atingiu uma resposta completa (RC) em resposta a uma terapia anterior.
[0049] São aqui fornecidos kits contendo uma ou mais doses unitá- rias de um inibidor de quinase que é ou compreende a estrutura
, ou é um sal farmaceuticamente aceitável do mesmo e instruções para realizar qualquer um dos métodos aqui forne- cidos.
[0050] É fornecido aqui um kit contendo uma ou mais doses unitárias de um inibidor de quinase que é ou inclui a estrutura , ou é um sal farmaceuticamente aceitável do mesmo, e instruções para administrar uma ou mais doses unitárias a um indivíduo com um câncer que é um candidato ao tratamento com ou que será tratado com uma terapia com células T autólogas, a referida terapia com células T contendo uma dose de células T geneticamente modificadas que expressam um receptor de antígeno quimérico (CAR) que se liga especificamente a um CD19, e em que, antes da adminis- tração da terapia com células T, uma amostra biológica é obtida do in- divíduo e processada, o processamento compreendendo as células T geneticamente modificadas da amostra, opcionalmente pela introdução de um ácido nucleico que codifica o CAR nas células T, em que as ins- truções especificam o início da administração de uma dose unitária do inibidor de quinase ao indivíduo pelo menos cerca de 3 dias antes da obtenção da amostra e em um regime de dosagem compreendendo ad- ministrações repetidas de uma ou mais doses unitárias em um intervalo de dosagem ao longo de um período de tempo que se estende pelo menos até inclui administração no dia ou após o dia em que a amostra é obtida do indivíduo.
[0051] Em alguns casos, as instruções especificam ainda mais a administração da terapia com células T ao indivíduo. Em alguns casos, as instruções especificam ainda, após o início da administração do ini- bidor da quinase e antes da administração da terapia com células T, a administração de uma terapia de linfodepleção ao indivíduo. Em algu- mas modalidades, as instruções especificam que a administração do inibidor da quinase deve ser interrompida durante a administração da terapia de linfodepleção. Em alguns casos, as instruções especificam que o regime de dosagem inclui a administração do inibidor da quinase por um período de tempo que se estende pelo menos até o início da terapia de linfodepleção.
[0052] Em algumas modalidades, as instruções especificam que o regime de dosagem inclui a administração do inibidor da quinase ao longo de um período de tempo que inclui a administração até o início da terapia de linfodepleção, seguida pela descontinuação ou interrupção da administração do inibidor da quinase durante a terapia de linfodeple- ção e então administração adicional do inibidor da quinase por um perí- odo que se estende por pelo menos 15 dias após o início da administra- ção da terapia com células T. Em algumas modalidades, as instruções especificam que a administração do inibidor de quinase é iniciada pelo menos por ou cerca de 4 dias, pelo menos por ou cerca de 5 dias, pelo menos por ou cerca de 6 dias, pelo menos por ou cerca de 7 dias, pelo menos por ou cerca de 14 dias ou mais antes de obter a amostra do indivíduo. Em alguns aspectos, as instruções especificam que a admi- nistração do inibidor da quinase é iniciada pelo menos por ou cerca de 5 dias a 7 dias antes da obtenção da amostra do indivíduo. Em alguns casos, as instruções especificam que a administração da terapia de lin- fodepleção deve ser concluída dentro de 7 dias antes do início da admi-
nistração da terapia com células T. Em algumas modalidades, as instru- ções especificam que a administração da terapia de linfodepleção deve ser concluída 2 a 7 dias antes do início da administração da terapia com células T.
[0053] Em algumas modalidades, as instruções especificam que a administração adicional do inibidor da quinase é por um período que se estende por ou cerca de ou mais de três meses após o início da admi- nistração da terapia com células T. Em algumas modalidades, as instru- ções especificam que a administração de cada dose unitária do inibidor da quinase é realizada uma vez por dia em cada dia em que é adminis- trada durante o regime de dosagem.
[0054] Em algumas modalidades, uma ou mais doses unitárias, cada uma contém a partir de ou a partir de cerca de 140 mg a ou cerca de 840 mg. Em algumas modalidades, uma ou mais doses unitárias con- têm, cada uma, a partir de ou a partir de cerca de 140 mg a ou cerca de 560 mg por cada dia em que o inibidor de quinase é administrado. Em alguns casos, uma ou mais doses unitárias contêm cada uma a partir de ou a partir de cerca de 280 mg a ou a cerca de 560 mg.
[0055] Em algumas modalidades, as instruções especificam que a administração do inibidor da quinase é iniciada no mínimo por ou cerca de 7 dias antes da obtenção da amostra do indivíduo. Em algumas mo- dalidades, as instruções especificam que a administração do inibidor da quinase é iniciada a partir a partir de ou a partir de cerca de 30 a ou a cerca de 40 dias antes de iniciar a administração da terapia com células T; a amostra é obtida do indivíduo a partir de ou a partir de cerca de 23 a ou a cerca de 38 dias antes de iniciar a administração da terapia com células T; e/ou a terapia de linfodepleção é completada em ou cerca de 5 a 7 dias antes do início da administração da terapia com células T. Em algumas modalidades, as instruções especificam que a administração do inibidor da quinase é iniciada em ou cerca de 35 dias antes do início da administração da terapia com células T; a amostra é obtida do indi- víduo a partir de ou a partir de cerca de 28 a ou a cerca de 32 dias antes de iniciar a administração da terapia com células T; e/ou a terapia de linfodepleção for concluída em, ou cerca de 5 a 7 dias antes do início da administração da terapia com células T.
[0056] Em algumas modalidades, a terapia de linfodepleção inclui a administração de fludarabina e/ou ciclofosfamida. Em algumas modali- dades, as instruções especificam a administração da terapia de linfode- pleção inclui a administração de ciclofosfamida em ou cerca de 200-400 mg/m2, opcionalmente em ou cerca de 300 mg/m2, inclusive, e/ou fluda- rabina em ou cerca de 20-40 mg/m2, opcionalmente 30 mg/m2, diaria- mente durante 2-4 dias, opcionalmente durante 3 dias, ou em que a te- rapia de linfodepleção inclui a administração de ciclofosfamida a ou cerca de 500 mg/m2. Em algumas modalidades, as instruções especifi- cam que a terapia de linfodepleção inclui a administração de ciclofosfa- mida em ou cerca de 300 mg/m2 e fludarabina em ou cerca de 30 mg/m2 diariamente por 3 dias; e/ou a terapia de linfodepleção inclui a adminis- tração de ciclofosfamida a ou cerca de 500 mg/m2 e fludarabina a ou cerca de 30 mg/m2 diariamente durante 3 dias.
[0057] Em algumas modalidades, cada dose unitária do inibidor de quinase é ou é de cerca de 140 mg e/ou as instruções especificam a administração do inibidor de quinase por dia em que é administrado em uma quantidade de ou cerca de 140 mg. Em alguns exemplos, cada dose unitária do inibidor de quinase é ou é de cerca de 280 mg e/ou as instruções especificam a administração do inibidor de quinase por dia em que é administrado em uma quantidade de ou cerca de 280 mg. Em alguns casos, cada dose unitária do inibidor de quinase é ou é de cerca de 420 mg e/ou as instruções especificam a administração do inibidor de quinase por dia em que é administrado em uma quantidade de ou cerca de 420 mg. Em algumas modalidades, cada dose unitária do ini- bidor de quinase é ou é de cerca de 560 mg e/ou as instruções especi- ficam a administração do inibidor de quinase por dia em que é adminis- trado em uma quantidade de ou cerca de 560 mg.
[0058] Em algumas modalidades, as instruções especificam que o período se estende por ou cerca ou mais de quatro meses após o início da administração da terapia com células T. Em alguns casos, as instru- ções especificam que o período se estende por ou cerca de ou mais de cinco meses após o início da administração da terapia com células T. Em algumas modalidades, as instruções especificam que a administra- ção adicional é por um período que se estende por ou cerca de ou su- perior a seis meses.
[0059] Em algumas modalidades, as instruções especificam que a administração adicional do inibidor da quinase é interrompida no final do período, se, no final do período, o indivíduo exibir uma resposta com- pleta (RC) após o tratamento. Em algumas modalidades, as instruções especificam que a administração adicional do inibidor da quinase é in- terrompida no final do período se, no final do período, o câncer progrediu ou recidivou após a remissão após o tratamento. Em algumas modali- dades, as instruções especificam que o período se estende por ou de ou cerca de três meses a ou seis meses. Em alguns casos, as instru- ções especificam que o período se estende por ou cerca de três meses após o início da administração da terapia com células T.
[0060] Em algumas modalidades, as instruções especificam que o período se estende por ou cerca de 3 meses após o início da adminis- tração da terapia com células T se o indivíduo, antes de ou cerca de 3 meses, atingiu uma resposta completa (RC) após o tratamento ou o cân- cer progrediu ou recidivou após a remissão após o tratamento. Em al- gumas modalidades, as instruções especificam que o período se es- tende por ou cerca de 3 meses após o início da administração da terapia com células T se o indivíduo tiver atingido uma resposta completa (RC) em 3 meses.
[0061] Em algumas modalidades, as instruções especificam que o período se estende por ou cerca de seis meses após o início da admi- nistração da terapia com células T. Em algumas modalidades, as instru- ções especificam que o período se estende por ou cerca de 6 meses após o início da administração da terapia com células T se o indivíduo, antes de ou cerca de 6 meses, atingiu uma resposta completa (RC) após o tratamento ou o câncer progrediu ou recidivou após a remissão após o tratamento. Em alguns casos, as instruções especificam que o período se estende por até ou cerca de 6 meses após o início da administração da terapia com células T, se o indivíduo em 6 meses tiver alcançado uma resposta completa (RC).
[0062] Em algumas modalidades, as instruções especificam que a administração adicional é continuada pela duração do período, mesmo se o indivíduo tiver obtido uma resposta completa (RC) em um ponto de tempo antes do final do período. Em algumas modalidades, as instru- ções especificam ainda incluindo a continuação da administração pos- terior após o final do período, se, no final do período, o indivíduo exibir uma resposta parcial (RP) ou doença estável (DE). Em alguns casos, as instruções especificam que a administração posterior é continuada por mais de seis meses se, em ou cerca de seis meses, o indivíduo exibe uma resposta parcial (RP) ou doença estável (DE) após o trata- mento. Em alguns casos, as instruções especificam que a administra- ção posterior é continuada até que o indivíduo tenha alcançado uma resposta completa (RC) após o tratamento ou até que o câncer tenha progredido ou recidivado após a remissão após o tratamento.
[0063] Em algumas modalidades, o inibidor da quinase inibe a tiro- sina quinase de Bruton (BTK) e/ou inibe a quinase de células T induzível por IL2 (ITK). Em alguns exemplos, o inibidor da quinase inibe ITK e o inibidor inibe ITK ou inibe ITK com metade da concentração inibidora máxima (IC50) menor do que ou menor do que cerca de 1000 nM, 900 nM, 800 nM, 600 nM, 500 nM, 400 nM, 300 nM, 200 nM, 100 nM ou menos.
[0064] Em algumas modalidades, as instruções especificam que o indivíduo recebeu ou pode ter recebido anteriormente o inibidor da qui- nase antes da administração de uma ou mais doses unitárias do inibidor da quinase. Em alguns aspectos, as instruções especificam que o indi- víduo não recebeu ou é aquele a quem não foi anteriormente adminis- trado o inibidor da quinase antes da administração de uma ou mais do- ses unitárias do inibidor da quinase.
[0065] Em algumas modalidades, o indivíduo e/ou o câncer (a) é resistente à inibição da tirosina quinase de Bruton (BTK) e/ou (b) contém uma população de células que são resistentes à inibição pelo inibidor da quinase, opcionalmente em que a população de células é ou contém uma população de células B e/ou não contém células T; o indivíduo e/ou o câncer inclui uma mutação em um ácido nucleico que codifica uma BTK, opcionalmente em que a mutação é capaz de reduzir ou prevenir a inibição de BTK pelo inibidor da quinase, opcionalmente em que a mutação é C481S; o indivíduo e/ou o câncer inclui uma mutação em um ácido nucleico que codifica fosfolipase C gama 2 (PLCgama2), opcio- nalmente em que a mutação resulta em atividade de sinalização consti- tutiva, opcionalmente em que a mutação é R665W ou L845F; no mo- mento do início da administração do inibidor da quinase e, opcional- mente, no momento do início da administração da terapia com células T, o indivíduo apresentou recaída após remissão após um tratamento anterior com, ou foi considerado refratário a um tratamento anterior com, o inibidor de quinase e/ou com uma terapia com inibidor de BTK; no momento do início da administração do inibidor da quinase e, opcional-
mente, no momento do início da terapia com células T, o indivíduo pro- grediu após um tratamento anterior com o inibidor e/ou com uma terapia com inibidor de BTK, opcionalmente em que o o indivíduo exibiu doença progressiva como a melhor resposta ao tratamento anterior ou progres- são após a resposta anterior ao tratamento anterior; e/ou no momento do início da administração do inibidor da quinase e, opcionalmente, no momento do início da terapia com células T, o indivíduo exibiu uma res- posta menor do que a uma resposta completa (RC) após um tratamento anterior por pelo menos 6 meses com o inibidor e/ou com uma terapia com inibidor de BTK.
[0066] Em algumas modalidades, o câncer é uma malignidade de células B. Em alguns casos, a malignidade das células B é um linfoma. Em alguns casos, o linfoma é um linfoma não Hodgkin (NHL). Em alguns exemplos, o NHL inclui NHL agressivo, linfoma difuso de grandes célu- las B (DLBCL), DLBCL-NOS, opcionalmente transformado indolente; DLBCL-NOS EBV-positivo; linfoma de grandes células B rico em células T/histiócitos; linfoma mediastinal primário de grandes células B (PMBCL); linfoma folicular (FL), opcionalmente, linfoma folicular Grau 3B (FL3B); e/ou linfoma de células B de alto grau com rearranjos MYC e BCL2 e/ou BCL6 com histologia de DLBCL (duplo/triplo hit).
[0067] Em algumas modalidades, o indivíduo é ou foi identificado como tendo um status de Status de Desempenho do Eastern Coopera- tive Oncology Group (ECOG) menor ou igual a 1. Em algumas modali- dades, uma ou mais doses unitárias do inibidor da quinase é (são) for- mulada (s) para administração oral e/ou as instruções especificam ainda que uma ou mais doses unitárias do inibidor da quinase são administra- das por via oral.
[0068] Em algumas modalidades, o CD19 é um CD19 humano. Em algumas modalidades, o receptor de antígeno quimérico (CAR) inclui um domínio de reconhecimento de antígeno extracelular que se liga es- pecificamente ao CD19 e um domínio de sinalização intracelular inclu- indo um ITAM. Em alguns exemplos, o domínio de sinalização intrace- lular inclui um domínio de sinalização de uma cadeia CD3-zeta (CD3ζ), opcionalmente uma cadeia CD3-zeta humana. Em alguns casos, o re- ceptor de antígeno quimérico (CAR) inclui ainda uma região de sinaliza- ção coestimuladora. Em alguns exemplos, a região de sinalização co- estimuladora inclui um domínio de sinalização de CD28 ou 4-1BB, opci- onalmente CD28 humano ou 4-1BB humano. Em alguns casos, o domí- nio coestimulatório é ou inclui um domínio de sinalização de 4-1BB hu- mano.
[0069] Em algumas modalidades, o CAR inclui um scFv específico para o CD19; um domínio transmembranar; um domínio de sinalização citoplasmático derivado de uma molécula coestimuladora, que opcional- mente é ou inclui um 4-1BB, opcionalmente 4-1BB humano; e um domí- nio de sinalização citoplasmático derivado de uma molécula contendo ITAM de sinalização primária, que opcionalmente é ou inclui um domínio de sinalização CD3zeta, opcionalmente um domínio de sinalização CD3zeta humano; e opcionalmente em que o CAR inclui ainda um es- paçador entre o domínio transmembranar e o scFv; o CAR inclui, por pedido, um scFv específico para o CD19; um domínio transmembranar; um domínio de sinalização citoplasmático derivado de uma molécula co- estimuladora, que opcionalmente é ou inclui um domínio de sinalização 4-1BB, opcionalmente um domínio de sinalização 4-1BB humano; e um domínio de sinalização citoplasmático derivado de uma molécula con- tendo ITAM de sinalização primária, que opcionalmente é um domínio de sinalização CD3zeta, opcionalmente domínio de sinalização CD3zeta humano; ou o CAR inclui, por ordem, um scFv específico para o CD19; um espaçador; um domínio transmembrana, um domínio de sinalização citoplasmático derivado de uma molécula coestimuladora,
que opcionalmente é um domínio de sinalização 4-1BB, e um domínio de sinalização citoplasmático derivado de uma molécula contendo ITAM de sinalização primária, que opcionalmente é ou inclui um domínio de sinalização CD3zeta.
[0070] Em algumas modalidades, o CAR inclui um espaçador, e o espaçador é um espaçador polipeptídico que (a) inclui ou consiste em toda ou uma parte de uma articulação de imunoglobulina ou uma versão modificada da mesma ou inclui cerca de 15 aminoácidos ou menos, e não inclui uma região extracelular de CD28 ou uma região extracelular de CD8, (b) inclui ou consiste em toda ou uma porção de uma articula- ção de imunoglobulina, opcionalmente, uma articulação de IgG4 ou uma versão modificada da mesma e/ou inclui cerca de 15 aminoácidos ou menos, e não inclui uma região extracelular de CD28 ou uma região extracelular de CD8, ou (c) tem ou cerca de 12 aminoácidos de compri- mento e/ou inclui ou consiste em toda ou uma porção de uma articula- ção de imunoglobulina, opcionalmente uma IgG4 ou uma modificada versão do mesmo; ou (d) tem ou consiste na sequência da SEQ ID NO: 1, uma sequência codificada pela SEQ ID NO: 2, SEQ ID NO: 30, SEQ ID NO: 31, SEQ ID NO: 32, SEQ ID NO: 33, SEQ ID NO: 34, ou uma variante de qualquer uma das anteriores tendo pelo menos 85 %, 86 %, 87 %, 88 %, 89 %, 90 %, 91 %, 92 %, 93 %, 94 %, 95 %, 96 %, 97 %, 98 %, 99 % ou mais identidade de sequência com a mesma, ou (e) inclui ou consiste na fórmula X1PPX2P (SEQ ID NO: 58), onde X1 é glicina, cisteína ou arginina e X2 é cisteína ou treonina; e/ou o domínio coesti- mulador inclui SEQ ID NO: 12 ou uma variante da mesma tendo pelo menos 85 %, 86 %, 87 %, 88 %, 89 %, 90 %, 91 %, 92 %, 93 %, 94 %, 95 %, 96 %, 97 %, 98 %, 99 % ou mais identidade de sequência; e/ou o domínio de sinalização primário inclui SEQ ID NO: 13 ou 14 ou 15 tendo pelo menos 85 %, 86 %, 87 %, 88 %, 89 %, 90 %, 91 %, 92 %, 93 %, 94 %, 95 %, 96 %, 97 %, 98 %, 99 % ou mais identidade de sequência;
e/ou o scFv inclui uma sequência CDRL1 de RASQDISKYLN (SEQ ID NO: 35), uma sequência CDRL2 de SRLHSGV (SEQ ID NO: 36) e/ou uma sequência CDRL3 de GNTLPYTFG (SEQ ID NO: 37) e/ou uma se- quência CDRH1 de DYGVS (SEQ ID NO: 38), uma sequência CDRH2 de VIWGSETTYYNSALKS (SEQ ID NO: 39) e/ou uma sequência CDRH3 de YAMDYWG (SEQ ID NO: 40) ou em que o scFv inclui uma região de cadeia pesada variável de FMC63 e uma região de cadeia leve variável de FMC63 e/ou uma sequência CDRL1 de FMC63, uma sequência CDRL2 de FMC63, uma sequência CDRL3 de FMC63, uma sequência CDRH1 de FMC63, uma sequência CDRH2 de FMC63 e uma sequência CDRH3 de FMC63 ou se liga ao mesmo epítopo ou compete pela ligação com qualquer um dos anteriores e, opcionalmente, em que o scFv inclui, em ordem, uma VH, um ligante, opcionalmente incluindo SEQ ID NO: 41 e uma VL e/ou o scFv inclui um ligante flexível e/ou inclui a sequência de aminoácidos apresentada como SEQ ID NO: 42.
[0071] Em algumas modalidades, a dose de células T genetica- mente modificadas contém de ou cerca de 1 x 105 a 5 x 108 células T que expressam CAR totais, 1 x 106 a 2,5 x 108 células T que expressam CAR totais, 5 x 106 para 1 x 108 células T que expressam CAR totais, 1 x 107 a 2,5 x 108 células T que expressam CAR totais, 5 x 107 a 1 x 108 células T que expressam CAR totais, cada inclusive. Em algumas modalidades, a dose de células T geneticamente modificadas contém pelo menos ou pelo menos cerca de 1 x 105 células que expressam CAR, pelo menos ou pelo menos cerca de 2,5 x 105 células que expres- sam CAR, pelo menos ou pelo menos cerca de 5 x 105 células que ex- pressam CAR, pelo menos ou pelo menos cerca de 1 x 106 células que expressam CAR, pelo menos ou pelo menos cerca de 2,5 x 106 células que expressam CAR, pelo menos ou pelo menos cerca de 5 x 106 célu- las que expressam CAR, pelo menos ou pelo pelo menos cerca de 1 x 107 células que expressam CAR, pelo menos ou pelo menos cerca de
2,5 x 107 células que expressam CAR, pelo menos ou pelo menos cerca de 5 x 107 células que expressam CAR, pelo menos ou pelo menos cerca de 1 x 108 células que expressam CAR células, pelo menos ou pelo menos cerca de 2,5 x 108 células que expressam CAR, ou pelo menos ou pelo menos cerca de 5 x 108 células que expressam CAR. Em alguns casos, a dose de células T geneticamente modificadas con- tém pelo menos 5 x 107 células T que expressam CAR totais. Em alguns casos, a dose de células T geneticamente modificadas contém cerca de 1 x 108 células que expressam CAR.
[0072] Em algumas modalidades, a dose de células T genetica- mente modificadas inclui células T CD4+ que expressam o CAR e célu- las T CD8+ que expressam o CAR e as instruções especificam que a administração da dose inclui a administração de uma pluralidade de composições separadas, a referida pluralidade de composições separa- das incluindo uma primeira composição contendo uma das células T CD4+ e as células T CD8+ e a segunda composição contendo a outra das células T CD4+ ou as células T CD8+.
[0073] Em alguns exemplos, as instruções especificam que a primeira composição e a segunda composição são administradas com 0 a 12 horas de intervalo, 0 a 6 horas de intervalo ou 0 a 2 horas de intervalo ou em que a administração da primeira composição e a admin- istração da segunda composição são realizadas no mesmo dia, são re- alizadas entre cerca de 0 e cerca de 12 horas de intervalo, entre cerca de 0 e cerca de 6 horas de intervalo ou entre cerca de 0 e 2 horas de intervalo; e/ou o início da administração da primeira composição e o início da administração da segunda composição são realizados entre cerca de 1 minuto e cerca de 1 hora de intervalo ou entre cerca de 5 minutos e cerca de 30 minutos de intervalo. Em alguns casos, as in- struções especificam que a primeira composição e a segunda com- posição são administradas não mais do que 2 horas, não mais do que 1 hora, não mais do que 30 minutos, não mais do que 15 minutos, não mais do que 10 minutos ou não mais do que 5 minutos separados.
[0074] Em algumas modalidades, as instruções especificam que a primeira composição contém as células T CD4+. Em algumas modali- dades, as instruções especificam que a primeira composição contém as células T CD8+. Em algumas modalidades, as instruções especificam que a primeira composição é administrada antes da segunda com- posição. Em algumas modalidades, as instruções especificam que a dose de células é administrada por via parenteral, opcionalmente por via intravenosa.
[0075] Em algumas modalidades, as células T são células T primár- ias obtidas a partir da amostra do indivíduo. Em alguns casos, as células T são autólogas para o indivíduo. Em algumas modalidades, as in- struções especificam ainda o processo para a produção da terapia com células T. Em algumas modalidades, o processo para produzir a terapia com células T inclui o isolamento de células T, opcionalmente células T CD4+ e/ou CD8+, a partir da amostra obtida do indivíduo, produzindo assim uma composição de entrada contendo células T primárias; e a introdução da molécula de ácido nucleico que codifica o CAR na com- posição de entrada.
[0076] Em alguns casos, o isolamento inclui a realização de seleção baseada em imunoafinidade. Em alguns exemplos, a amostra biológica é ou contém uma amostra de sangue total, uma amostra de camada leucocitária, uma amostra de células mononucleares de sangue perifé- rico (PBMC), uma amostra de células T não fracionadas, uma amostra de linfócitos, uma amostra de glóbulos brancos, um produto de aférese, ou um produto de leucaferese.
[0077] Em algumas modalidades, antes da introdução, o processo inclui incubar a composição de entrada sob condições de estimulação,
as referidas condições de estimulação incluindo a presença de um rea- gente estimulador capaz de ativar um ou mais domínios de sinalização intracelular de um ou mais componentes de um complexo de TCR e/ou um ou mais domínios de sinalização intracelular de uma ou mais moléculas coestimuladoras, gerando assim uma composição estimu- lada, em que a molécula de ácido nucleico que codifica o CAR é intro- duzida na composição estimulada. Em algumas modalidades, o rea- gente estimulador inclui um agente primário que se liga especificamente a um membro de um complexo de TCR, opcionalmente que se liga es- pecificamente a CD3. Em alguns exemplos, o reagente estimulador in- clui ainda um agente secundário que especificamente se liga liga-se a uma molécula coestimuladora de células T, opcionalmente em que a molécula coestimuladora é selecionada a partir de CD28, CD137 (4-1- BB), OX40 ou ICOS. Em alguns casos, os agentes primários e/ou secundários incluem um anticorpo, opcionalmente em que o reagente estimulador inclui incubação com um anticorpo anti-CD3 e um anticorpo anti-CD28 ou um fragmento de ligação ao antígeno do mesmo.
[0078] Em algumas modalidades, o agente primário e/ou o agente secundário estão presentes na superfície de um suporte sólido. Em al- guns exemplos, o suporte sólido é ou inclui um grânulo, opcionalmente em que o grânulo é magnético ou superparamagnético. Em alguns casos, o grânulo inclui um diâmetro maior ou maior que cerca de 3,5 µm, mas não mais que cerca de 9 µm ou não mais que cerca de 8 µm ou não mais que cerca de 7 µm ou não mais que cerca de 6 µm ou não mais que cerca de 5 µm. Em alguns exemplos, o grânulo inclui um diâmetro de ou cerca de 4,5 µm.
[0079] Em algumas modalidades, a introdução inclui a transdução de células da composição estimulada com um vetor viral incluindo um polinucleotídeo que codifica o receptor recombinante. Em alguns casos, o vetor viral é um vetor retroviral. Em alguns casos, o vetor viral é um vetor lentiviral ou gamarretroviral.
[0080] Em algumas modalidades, o processo inclui ainda após a in- trodução do cultivo das células T, opcionalmente, em que o cultivo é realizado sob condições para resultar na proliferação ou expansão das células para produzir uma composição de saída contendo a terapia com células T. Em alguns exemplos, subsequente ao cultivo, o processo in- clui ainda a formulação de células da composição de saída para cri- opreservação e/ou para administração da terapia com células T ao indi- víduo, opcionalmente em que a formulação está na presença de um ex- cipiente farmaceuticamente aceitável.
[0081] Em algumas modalidades, as instruções especificam que o indivíduo é um ser humano.
[0082] Em algumas modalidades, as instruções especificam, du- rante ou antes da administração da terapia com células T incluindo a dose de células, o indivíduo é ou foi identificado como tendo um linfoma de duplo/triplo hit; o indivíduo é ou foi identificado como tendo um lin- foma quimiorrefratário, opcionalmente um DLBCL quimiorrefratário; e/ou o indivíduo não atingiu uma resposta completa (RC) em resposta a uma terapia anterior.
[0083] É fornecido neste documento um artigo de fabricação que contém qualquer um dos kits fornecidos neste documento. Breve Descrição dos Desenhos
[0084] A FIG. 1A mostra gráficos de números de células alvo nor- malizados avaliando a atividade citolítica específica do alvo em cavi- dades triplicadas cocultivados com células T de CAR com ibrutinibibru- tinib (média ± SEM). A FIG. 1B mostra uma imagem representativa de células alvo (células NucLight Red K562.CD19) cocultivadas com célu- las T de CAR em uma relação efetor para alvo (E:T) de 2,5:1 no início e no final do ensaio citotóxico. A FIG. 1C mostra os efeitos da dose de ibrutinib na atividade citolítica de células T de CAR anti-CD19. Os gráfi- cos mostram dados de três doadores independentes e são normaliza- dos para controle não tratado (100 %). A média ± SEM são representa- das e as diferenças estatisticamente significativas são indicadas como P < 0,00001 (****).
[0085] A FIG. 2A mostra a expressão de células T de CAR de CD25, CD28, CD39 e CD95 após cultura de células CD4+ e CD8+ na presença ou ausência das concentrações indicadas de ibrutinib. A FIG. 2B mostra resultados representativos de células T de CAR de células derivadas de um doador para a porcentagem de TCM (CCR7+CD45RA-) e TEM (CCR7- CD45RA-) ao longo de quatro dias após a estimulação inicial na presença de ibrutinib. As FIG. 2C e FIG. 2D mostram a expressão de células T de CAR de CD69, CD107a e PD-1 após cultura de células T CD4+ e CD8+, respectivamente, na presença ou ausência das concen- trações indicadas de ibrutinib.
[0086] A FIG. 3A representa gráficos representativos da cinética de produção de citocinas ao longo de 4 dias a partir de células T de CAR geradas a partir de um doador na presença ou ausência de ibrutinib. A FIG. 3B representa a alteração percentual na produção de citocinas após a estimulação de células T de CAR por 2 dias na presença de ibrutinib em comparação com sua ausência em 2 experimentos inde- pendentes.
[0087] A FIG. 4A mostra a alteração do número de células T de CAR após cada ciclo de reestimulação em um ensaio de estimulação serial na ausência de ibrutinib (controle) ou na presença de ibrutinib 50 nM ou 500 nM. A FIG. 4B mostra o número de duplicações dos números de células T de CAR após cada ciclo de reestimulação na ausência de ib- rutinib (controle) ou na presença de ibrutinib 50 nM ou 500 nM em um ensaio de estimulação serial. A FIG. 4C mostra o número de células no dia 4 e 18 após 1 e 5 ciclos de reestimulação, respectivamente, na presença ou ausência de ibrutinib em um ensaio de estimulação serial.
[0088] A FIG. 5A mostra um gráfico de citometria de fluxo repre- sentativo para a expressão de marcadores de superfície TH1 após a estimulação de células T na presença de ibrutinib. A FIG. 5B mostra a porcentagem de células TH1 observadas ao longo do tempo, conforme medido pelo ensaio de citometria de fluxo, para células T cultivadas na presença ou ausência de ibrutinib. A FIG. 5C mostra a porcentagem de células TH1 em culturas de células T estimuladas na presença de várias concentrações de ibrutinib. A FIG. 5D mostra a expressão de CD25, CD38, CD39 e CD45RO nos dias 0, 11, 18 e 21 de estimulação serial na presença de ibrutinib. Os resultados representativos das células T de CAR de uma célula derivada de um doador são mostrados. A FIG. 5E mostra a expressão de CD62L, CD69, CD107a e PD-1 nos dias 0, 11, 18 e 21 de estimulação serial na presença de ibrutinib. Os resultados representativos das células T de CAR de uma célula derivada de um doador são mostrados.
[0089] A FIG. 6A mostra o efeito do tratamento com ibrutinib na carga tumoral em comparação com o tratamento com veículo em um modelo de camundongo de xenoenxerto de tumor disseminado identifi- cado como resistente à inibição de BTK. A FIG. 6B mostra os resultados do mesmo estudo em pontos de tempo maiores após a injeção pós-tu- mor em camundongos que foram tratados com células T de CAR+ de duas células derivadas de doador diferentes na presença ou ausência de ibrutinib ou controle de veículo. Os resultados nas FIG. 6A e FIG. 6B representam o crescimento do tumor ao longo do tempo, conforme in- dicado pela medição da radiância média por bioluminescência. A FIG. 6C mostra uma curva Kaplan meier que descreve a sobrevivência de camundongos com tumor administrados com células T de CAR na presença ou ausência de iburtinibe. A FIG. 6D mostra resultados de so-
brevivência no mesmo estudo em pontos de tempo maiores após a in- jeção pós-tumor em camundongos que foram tratados com células T de CAR+ de duas células derivadas de doador diferentes na presença ou ausência de ibrutinib ou controle de veículo.
[0090] A FIG. 7A mostra uma curva Kaplan meier que descreve a sobrevivência observada de camundongos com tumor administrados com células T de CAR geradas a partir de dois doadores diferentes, sozinhos ou em combinação com a administração de ibrutinib diário ad- ministrado via água potável. As diferenças estatisticamente significa- tivas são mostradas como P < 0,001 (***). A FIG. 7B mostra o cresci- mento do tumor ao longo do tempo, conforme indicado pela medição da radiância média por bioluminescência de camundongos administrados com células T de CAR geradas de dois doadores diferentes e tratados com ibrutinib administrado via água potável. Diferenças estatisticamente significativas são mostradas como ANOVA de duas vias P < 0,05 (*), P < 0,01 (**).A FIG. 7C mostra o nível de células T de CAR no sangue, medula óssea e baço de camundongos tratados com ou sem ibrutinib. A FIG. 7D mostra o nível de células T de CAR no sangue no dia 19 após a transferência de células T de CAR após o tratamento com ou sem ibrutinb. As diferenças estatisticamente significativas são indicadas como * p < 0,05. A FIG. 7E mostra a contagem de células tumorais no sangue, medula óssea e baço de camundongos tratados com ou sem ibrutinib. Diferenças estatisticamente significativas são indicadas como P < 0,001 (***) e P < 0,0001 (****).
[0091] A FIG. 8A representa a análise de alta dimensão de incor- poração estocástica de vizinhança distribuída por T (t-SNE) de marca- dores de superfície em células T modificadas por CAR colhidas da medula óssea de animais no dia 12 pós-transferência com células T de CAR e em combinação com ibrutinib ou controle . A FIG. 8B representa quatro populações derivadas de análise dimensional elevada de incor- poração de vizinhança estocástica distribuída em T (t-SNE) de células T modificadas por CAR colhidas da medula óssea de animais no dia 12 pós-transferência com células T de CAR e ibrutinib ou controle de veículo. A FIG. 8C representa histogramas que mostram os perfis de expressão individuais de CD4, CD8, CD62L, CD45RA, CD44 e CXCR3 a partir do t-SNE 4 fechado sobreposto na expressão da população total (histograma sombreado). A FIG. 8D representa a porcentagem e a mu- dança de duplicação de cada população t-SNE de camundongos de controle ou camundongos tratados com ibrutinib.
[0092] A FIG. 9A mostra o número de duplicações da população em um ensaio de estimulação serial ao longo de um período de cultura de 21 dias de células modificadas por CAR, geradas a partir de células ob- tidas de indivíduos com linfoma difuso de grandes células B (DLBCL), na ausência de ibrutinib (controle) ou na presença de ibrutinib 50 nM ou 500 nM. As setas indicam o ponto de tempo de cada reestimulação em que as células T de CAR foram contadas e novas células alvo junta- mente com ibrutinib foram adicionadas. A FIG. 9B mostra a atividade citolítica das células T de CAR geneticamente modificadas para células alvo que expressam CD19 após 16 dias de reestimulação serial na presença ou ausência de ibrutinib. A porcentagem de morte foi normal- izada para o controle não tratado (100 %). Dados apresentados como média ± SEM de cavidades replicadas. As diferenças estatisticamente significativas são indicadas como P < 0,001 (***), P < 0,0001 (****).
[0093] A FIG. 10A é um gráfico de Volcano que representa genes expressos diferencialmente a partir do dia 18 de células T de CAR es- timuladas em série tratadas com 500 nM de ibrutinib em comparação com o controle. Genes significativamente diferencialmente regulados estão no lado direito da linha tracejada direita e genes significativamente diferencialmente regulados para baixo estão no lado esquerdo da linha tracejada esquerda (FDR < 0,05, abslog2FC> 0,5). A FIG. 10B é um mapa de calor que descreve a expressão normalizada (média de tran- scrições por milhão por doador + condição, pontuação z normalizada por gene) dos 23 genes expressos diferencialmente da FIG. 10A nos grupos controle e ibrutinib 500 nM. A FIG. 10C representa um gráfico de Volcano de genes expressos a partir do dia 18 de células T de CAR estimuladas em série tratadas com ibrutinib 50 nM em comparação com o controle. A FIG. 10D representa um mapa de calor de alterações de expressão gênica normalizadas (normalizadas como descrito na FIG. 10B) a partir do dia 18 células T de CAR estimuladas em série nos grupos controle e tratados com ibrutinib 50 nM.
[0094] A FIG. 11A-11E representa os perfis de gráfico de caixa de expressão (TPM, transcrições por milhão) de genes indicados re- sumidos entre doadores e experimentos por condição de células T de CAR estimuladas em série tratadas com 50 nM (Ibr50) ou 500 nM ibru- tinib (Ibr500) em comparação com o controle (Ctrl).
[0095] A FIG. 12A é um histograma representativo da expressão de CD62L em células T de CAR a partir de células derivadas de um doador após 18 dias de estimulação serial, conforme medido por citometria de fluxo. A FIG. 12B representa a alteração na porcentagem de células T de CAR CD62L+ de uma célula derivada de um doador após 18 dias de estimulação serial normalizada para controle, conforme medido por citometria de fluxo. Os dados são de duas experiências independentes (média ± SEM). Descrição Detalhada
[0096] São fornecidos métodos e usos de células modificadas, como células T (por exemplo, células T que expressam CAR) e um in- ibidor de uma família TEC de quinases, como um inibidor de BTK ou ITK. Em alguns aspectos, as modalidades fornecidas envolvem uma ter-
apia de combinação, por exemplo, uma terapia de combinação en- volvendo a administração de um inibidor de uma família TEC de quinases, como um inibidor de BTK, por exemplo, ibrutinib e admin- istração da terapia com células adotivas, como uma terapia com células T (por exemplo, células T que expressam CAR), a um indivíduo, por exemplo, para o tratamento de indivíduos com um câncer ou doença proliferativa.
[0097] Em algumas modalidades, são fornecidos métodos e usos de células modificadas, como células T (por exemplo, células T de CAR) e um inibidor de quinase que é ibrutinib, que é um composto com a es- trutura , ou é um sal farmaceuticamente aceitável, solvato, hidrato, estereoisômero, tautômero ou misturas racêmicas dos mesmos, e composições dos mesmos, para o tratamento de indivíduos com um câncer ou doença proliferativa. Em alguns aspec- tos, a terapia com células T é uma terapia com células T adotiva com- preendendo células T que reconhecem e/ou visam especificamente um antígeno associado ao câncer ou doença proliferativa, tal como um antígeno associado a uma malignidade de células B, por exemplo, lin- foma Não Hodgkin (NHL) ou um subtipo deste. Em alguns aspectos, a terapia com células T compreende células T modificadas com um re- ceptor de antígeno quimérico (CAR) compreendendo um domínio de ligação ao antígeno que se liga, tal como se liga especificamente, ao antígeno. Em alguns casos, o antígeno direcionado pela terapia com células T é CD19. Também são fornecidas combinações e artigos de fabricação, como kits, que contêm uma composição que compreende a terapia com células T e/ou uma composição que compreende um inibi- dor de quinase, como um inibidor de BTK/ITK, por exemplo, ibrutinib e usos de tais composições e combinações para tratar ou prevenir doen- ças, condições e distúrbios, incluindo câncer, como uma malignidade de células B.
[0098] Terapias celulares, tais como terapias baseadas em células T, por exemplo, terapias de células T adotivas (incluindo aquelas en- volvendo a administração de células que expressam receptores quimé- ricos específicos para uma doença ou distúrbio de interesse, como re- ceptores de antígenos quiméricos (CARs) e/ou outros receptores de antígeno recombinante, bem como outras células imunes adotivas e ter- apias de células T adotivas) podem ser eficazes no tratamento de doen- ças e distúrbios, como uma malignidade de células B. A expressão mod- ificada de receptores recombinantes, como receptores de antígenos qui- méricos (CARs), na superfície das células T permite o redirecionamento da especificidade das células T. Em estudos clínicos, as células T de CAR, por exemplo, células T de CAR anti-CD19, produziram respostas completas e duráveis em pacientes com leucemia e linfoma (Porter et al. (2015) Sci Transl Med., 7: 303ra139; Kochenderfer (2015) J. Clin. Oncol., 33: 540-9; Lee et al. (2015) Lancet, 385: 517-28; Maude et al. (2014) N Engl J Med, 371: 1507-17).
[0099] Em certos contextos, as abordagens disponíveis para a ter- apia celular adotiva podem nem sempre ser inteiramente satisfatórias. Por exemplo, embora a persistência de células T de CAR possa ser de- tectada em muitos indivíduos com linfoma, menos respostas completas (RCs) foram observadas em indivíduos com NHL em comparação com indivíduos com LLA. Mais especificamente, embora as taxas de re- sposta geral mais altas de até 80 % (taxa de RC de 47 % a 60 %) tenham sido relatadas após a infusão de células T de CAR, as respostas em alguns são transitórias e os indivíduos mostraram recidiva na presença de T de CAR persistente células (Neelapu, 58ª. Annual Meeting of the American Society of Hematology (ASH): 2016; San Diego, CA, USA. Abstract No. LBA-6.2016; Abramson, Blood. 01 de Dezembro de 2016; 128(22):4192). Outro estudo relatou uma taxa de RC de longo prazo de 40 % (Schuster, Ann Hematol. Out. de 2016; 95 (11): 1805-10).
[00100] Em alguns aspectos, uma explicação para isso é a exaustão imunológica das células T circulantes que expressam o CAR e/ou al- terações nas populações de linfócitos T. Isso ocorre porque, em alguns contextos, a eficácia ideal pode depender da capacidade das células administradas de ter a capacidade de se tornarem ativadas, expandir, de exercer várias funções efetoras, incluindo a eliminação citotóxica e a secreção de vários fatores, como citocinas, para persistir, incluindo longo prazo, para diferenciar, fazer a transição ou se envolver na repro- gramação em certos estados fenotípicos (como memória de longa du- ração, estados menos diferenciados e efetores), para evitar ou reduzir as condições imunossupressoras no microambiente local de uma doença, para fornecer respostas de recordação eficazes e robustas após a eliminação e reexposição ao ligante ou antígeno alvo, e evitar ou reduzir exaustão, anergia, tolerância periférica, diferenciação terminal e/ou diferenciação em um estado supressivo.
[00101] Em alguns casos, as respostas podem ser melhoradas pela administração ou precondicionamento com uma terapia de linfo- depleção, que em alguns aspectos aumenta a persistência e/ou eficácia das células após a administração, em comparação com métodos nos quais o precondicionamento não é realizado ou é realizada com uma terapia diferente de linfodepleção. A terapia de linfodepleção geral- mente inclui a administração de fludarabina, tipicamente em com- binação com outra quimioterapia ou outro agente, como a ciclo- fosfamida, que pode ser administrada sequencialmente ou simultane- amente em qualquer ordem. Em um estudo clínico recente de fase I/II,
a resposta completa (RC) em pacientes com leucemia linfoblástica aguda (LLA), linfoma não Hodgkin (NHL) e leucemia linfocítica crônica (LLC) foi de 94 %, 47 % e 50 %, respectivamente, e as taxas de so- brevida livre de doença foram maiores em pacientes que receberam ciclofosfamida e linfodepleção de fludarabina em comparação com aqueles que receberam ciclofosfamida, mas não fludarabina (Cameron et al. (2016) J Clin Oncol, 34 (suppl; res. 102). Em alguns aspectos, no entanto, mesmo com terapias linfodepletoras, as terapias com células T de CAR nem sempre são consistentemente eficazes em todos os indi- víduos.
[00102] Em algumas modalidades, a exposição, persistência e funções das células modificadas são reduzidas ou declina após a ad- ministração ao indivíduo. No entanto, as observações indicam que, em alguns casos, as células administradas que expressam os receptores recombinantes (por exemplo, aumento do número de células ou dura- ção ao longo do tempo) podem reexpandir e/ou ser reativadas in vivo para melhorar a eficácia e os resultados terapêuticos em terapia celular.
[00103] Os métodos fornecidos são baseados em observações de que um inibidor de quinase, como um inibidor de BTK/ITK, por exemplo, ibrutinib, melhora a função de células T de uma terapia de células T modificada, incluindo funções relacionadas à expansão, proliferação e persistência de T células. Em algumas modalidades, os métodos são vantajosos em virtude da administração de terapia com células T, como uma composição incluindo células para terapia com células adotivas, por exemplo, como uma terapia com células T (por exemplo, células T que expressam CAR) em combinação com um inibidor de quinase, Por exemplo, ibrutinib. Em alguns aspectos, os métodos e usos fornecidos fornecem ou alcançam respostas ou eficácia melhoradas ou mais du- ráveis em comparação com certos métodos alternativos. Em alguns as- pectos, os métodos fornecidos aumentam ou modulam a proliferação e/ou atividade da atividade das células T associada à administração da terapia com células T (por exemplo, células T que expressam CAR).
[00104] Em alguns aspectos, os métodos e usos fornecidos for- necem ou alcançam respostas ou eficácia melhoradas ou mais duráveis em comparação com certos métodos alternativos, como em determina- dos grupos de indivíduos tratados. Em algumas modalidades, os méto- dos são vantajosos em virtude da administração de uma imunoterapia ou agente imunoterapêutico, tal como uma composição incluindo célu- las para terapia celular adotiva, por exemplo, tal como uma terapia de células T (por exemplo, células T que expressam CAR), e um inibidor de uma quinase da família TEC, por exemplo, Inibidor de BTK ou inibidor de ITK, por exemplo, ibrutinib.
[00105] Os métodos fornecidos são baseados em observações de que um inibidor de uma quinase da família TEC, por exemplo, ibrutinib, melhora a função das células T, incluindo funções relacionadas com a expansão, proliferação e persistência das células T. O ibrutinib é um inibidor irreversível de pequenas moléculas (SMI) que bloqueia a ativid- ade da tirosina quinase de Bruton (BTK) e também exibe atividade na ITK. O ibrutinib está aprovado para uso no linfoma de células de re- vestimento (MCL) e na macroglobulinemia de Waldenström no cenário refratário recidivante (Davids et al. (2014) Future Oncol., 10: 957-67). Em alguns casos, a ativação aberrante da via de sinalização do receptor de células B (BCR) é o principal mecanismo subjacente a malignidades de células B, como MCL e CLL, por meio do qual a sinalização BTK crônica pode iniciar uma cascata de fosforilação através do realçador da cadeia leve capa do fator nuclear de células B ativadas (NFκB) e proteínas quinases ativadas por mitógenos (MAP quinases) promov- endo a sobrevivência das células B e ativação aberrante. Assim, os métodos existentes de emprego de inibidores de quinase da família
TEC, tais como inibidores de BTK/ITK, por exemplo, ibrutinib, são usa- dos para tratar doenças malignas de células B.
[00106] As descobertas fornecidas indicam que a terapia combinada do inibidor em métodos envolvendo células T, como envolvendo a ad- ministração de terapia com células T adotivas, atinge a função melhorada da terapia com células T. Em algumas modalidades, a com- binação da terapia celular (por exemplo, administração de células T modificadas) com o inibidor de quinase, por exemplo, inibidor de BTK e/ou inibidor de ITK (como um inibidor seletivo e/ou irreversível de tal quinase), melhora ou intensifica uma ou mais funções e/ou efeitos da terapia com células T, como persistência, expansão, citotoxicidade e/ou resultados terapêuticos, por exemplo, capacidade de matar ou reduzir a carga do tumor ou outra doença ou célula alvo. Em algumas modali- dades, as observações neste documento indicam que um inibidor de quinase da família TEC, como um inibidor de BTK e/ou inibidor de ITK, por exemplo, ibrutinib pode diminuir a ativação de T de CAR em con- centrações mais altas, enquanto aumenta a ativação em concentrações mais baixas.
[00107] Em alguns aspectos, tais efeitos são observados apesar de o tumor ou doença ou célula-alvo em si ser insensível, resistente e/ou não suficientemente responsiva ao inibidor, aos inibidores direcionados à quinase para a qual o inibidor é seletivo, e/ou é resistente à inibição de uma quinase da família TEC, opcionalmente é resistente à inibição da quinase da família TEC pelo inibidor e/ou é resistente à inibição de outra quinase da família TEC e/ou é resistente a outro inibidor de uma quinase da família TEC, opcionalmente, uma família de quinase TEC diferente em comparação com um ou mais direcionados pelo (ou que é o alvo principal do) inibidor. Por exemplo, em algumas modalidades, o câncer é insensível ou tornou-se resistente ao inibidor ou à inibição da quinase da família TEC pelo inibidor e/ou por outro inibidor.
[00108] Em algumas modalidades, os métodos, usos e terapias de combinação fornecidos incluem a administração do inibidor de quinase, em combinação com uma terapia de células T, como células T de CAR+, em um indivíduo que já recebeu o inibidor ou outro inibidor de quinase, em um contexto em que tal indivíduo foi considerado refratário ou re- sistente ao inibidor e/ou não suficientemente responsivo ao tratamento com a administração anterior de tal inibidor. Em algumas modalidades, a terapia de combinação, métodos e usos incluem a administração con- tinuada do inibidor de quinase, por exemplo, ibrutinib, em combinação com uma terapia de células T (por exemplo, células T de CAR+) em um indivíduo que recebeu anteriormente a administração do inibidor de quinase, por exemplo, ibrutinib, mas na ausência de (ou não em com- binação com) uma terapia de células T e/ou na ausência de uma terapia de células T modificada e/ou na ausência de uma terapia de células T modificada dirigida à mesma doença ou alvo como aquele direcionado pela terapia, método ou uso fornecido.
[00109] Em algumas modalidades, os métodos e combinações re- sultam em melhorias na função ou fenótipo das células T, por exemplo, na funcionalidade intrínseca das células T e/ou no fenótipo intrínseco das células T, das células T da terapia com células T. Tais melhorias em alguns aspectos resultam sem comprometer, ou sem comprometer substancialmente, uma ou mais outras propriedades de funcionalidade desejadas, por exemplo, da funcionalidade de células T de CAR. Em algumas modalidades, a combinação com o inibidor, embora melhore um ou mais resultados ou atributos funcionais das células T, não reduz a capacidade das células de se tornarem ativadas, secretar uma ou mais citocinas desejadas, expandir e/ou persistir, por exemplo, con- forme medido em um ensaio in vitro em comparação com tais células cultivadas em condições que de outra forma seriam as mesmas, mas na ausência do inibidor.
[00110] Em algumas modalidades, as modalidades fornecidas en- volvem o início da administração de um inibidor de quinase, como um inibidor de BTK/ITK, por exemplo, ibrutinib, antes da administração da terapia com células T e continua até o início da administração da terapia com células T ou após o início da administração da terapia com células T. Em alguns aspectos, as modalidades fornecidas envolvem o trata- mento prolongado com um inibidor da quinase, como um inibidor de BTK/ITK, por exemplo, ibrutinib, como um pré-tratamento prolongado com o inibidor da quinase, por exemplo, ibrutinib. Em alguns aspectos, as modalidades fornecidas, por exemplo, envolvendo tratamento pro- longado com um inibidor de quinase, por exemplo, ibrutinib, podem aju- dar a restaurar a função das células T, reduzir a carga do tumor, inter- romper o microambiente tumoral, reduzir a geração de células su- pressoras derivadas de mieloide (MDSCs), aliviando assim ou super- ando a imunossupressão específica do microambiente tumoral (TME). Em alguns aspectos, mutações de BTK ou fosfolipase C-γ2 (PLCγ2) não foram observadas como afetando negativamente a eficácia de certas terapias celulares.
[00111] Em alguns aspectos, as modalidades fornecidas envolvem a administração continuada, retomada e/ou adicional de um inibidor de quinase, como um inibidor de BTK/ITK, por exemplo, ibrutinib, após o início da administração da terapia com células T. Em alguns aspectos, omodalidades fornecidas, por exemplo, envolvendo administração con- tinuada, retomada e/ou adicional após o início da administração da ter- apia celular, podem reduzir o potencial de exaustão das células admin- istradas, reduzir o risco de toxicidades, como a síndrome de liberação de citocina (CRS) ou neurotoxicidade (NT), reduzem o risco de mu- tações resistentes por dupla segmentação ortogonal e suprimem o mi- croambiente tumoral (por exemplo, neutralizando atividades imunossu-
pressoras no microambiente tumoral). Em alguns aspectos, as vantag- ens das modalidades fornecidas também incluem a capacidade de mod- ular a dosagem ou administração do inibidor de quinase, por exemplo, ibrutinib, ou remover ou descontinuar a administração do inibidor de quinase, por exemplo, ibrutinib, dependendo da tolerabilidade no indi- víduo.
[00112] Em alguns aspectos, o inibidor de quinase, por exemplo, ib- rutinib, pode aumentar as funções intrínsecas das células administradas para resultar em melhor desempenho das células. Em algumas modali- dades, os efeitos dos inibidores da quinase são modulados pela inibição covalente e não covalente fora do alvo. Em alguns aspectos, a inibição de ITK pode resultar em polarização enviesada Th1. Em alguns aspec- tos, a administração de um inibidor da quinase, por exemplo, ibrutinib, pode restaurar a funcionalidade das células T em indivíduos com LLC. Em algumas modalidades, os efeitos da linfocitose podem interromper o TME e podem contribuir para melhorar o acesso ao tumor pelas célu- las administradas. Em alguns aspectos, as toxicidades, como a sín- drome de liberação de citocina (CRS), podem ser reduzidas limitando a reatividade mieloide aguda. Em alguns aspectos, a administração de um inibidor de quinase, por exemplo, ibrutinib, em combinação pode resultar em proliferação, sobrevivência e/ou expansão realçadas de células modificadas administradas e resultar em atividade antitumoral aumen- tada. Em algumas modalidades, tais melhorias podem ser observadas em células de indivíduos que podem não exibir atividade ideal. Em al- gumas modalidades, o tratamento com um inibidor de quinase, por ex- emplo, ibrutinib, foi observado para aumentar as células que expressam marcadores associados a subpopulações semelhantes à memória das células modificadas após a estimulação serial e os perfis de expressão gênica foram observados como modificados. Além disso, o aumento da eficácia in vivo das células T de CAR+ administradas foi observado em terapia de combinação com um inibidor de quinase, por exemplo, ibru- tinib. Devido à atividade fora do alvo do ibrutinib para inibir ITK, o trata- mento com ibrutinib, em alguns casos, foi considerado como conse- qüência da atividade das células T. Em alguns aspectos, a observação da atividade melhorada e/ou função efetora das células T administradas em combinação com o tratamento com ibrutinib fornece uma vantagem inesperada para melhorar a terapia com células T. Em alguns aspectos, a administração de um inibidor de quinase, como um inibidor de BTK/ITK (por exemplo, ibrutinib) pode restaurar a funcionalidade das células T, melhorar a função efetora da terapia de células T admin- istrada, limitar a disfunção imunológica mediada pelo ambiente tumoral e resultar em redução da carga tumoral, melhoria da eliminação do tu- mor e sobrevivência prolongada dos indivíduos tratados com a com- binação.
[00113] Em algumas modalidades, os métodos fornecidos podem po- tencializar a terapia com células T de CAR, que, em alguns aspectos, pode melhorar os resultados para o tratamento de indivíduos que têm um câncer que é resistente ou refratário a outras terapias, é um agres- sivo ou alto risco de câncer e/ou que é ou é provável que exiba uma taxa de resposta relativamente mais baixa a uma terapia de células T de CAR administrada sem o inibidor em comparação com outro tipo de câncer.
[00114] Em algumas modalidades dos métodos fornecidos, uma ou mais propriedades de células administradas por engenharia genética podem ser melhoradas ou aumentadas ou maiores em comparação com as células administradas de uma composição de referência, tal como expansão aumentada ou mais longa e/ou persistência de tais células administradas no indivíduo ou uma resposta de recordação aumentada ou maior após a reestimulação com antígeno. Em algumas modali- dades, o aumento pode ser pelo menos 1,2 vezes, pelo menos 1,5 vezes, pelo menos 2 vezes, pelo menos 3 vezes, pelo menos 4 vezes, pelo menos 5 vezes, pelo menos 6 vezes, aumento de pelo menos 7 vezes, pelo menos 8 vezes, pelo menos 9 vezes ou pelo menos 10 vezes em tal propriedade ou característica em comparação com a mesma propriedade ou característica após a administração de terapias celulares usando outros métodos, por exemplo, não tendo sido incubado ou administrado na presença de um inibidor da quinase, por exemplo, ibrutinib. Em algumas modalidades, o aumento em uma ou mais de tais propriedades ou características pode ser observado ou está presente dentro de um mês, dois meses, três meses, quatro meses, cinco meses, seis meses ou 12 meses após a administração das células genetica- mente modificadas.
[00115] Os métodos fornecidos incluem a administração de um inibi- dor de quinase, como um inibidor de BTK/ITK, por exemplo, ibrutinib, em uma quantidade eficaz para exibir um efeito modulador de células T. Dosagens particulares e/ou regime de dosagem de um inibidor de quinase, por exemplo, ibrutinib, podem aumentar ou realçar a função de células T de uma terapia de células T, por exemplo, terapia com células T de CAR. Em alguns aspectos, o início de uma administração do inibi- dor de quinase, por exemplo, ibrutinib, pode ser antes da administração da terapia com células T, por exemplo, terapia com células T de CAR. Em alguns aspectos, o início da administração do inibidor da quinase, por exemplo, ibrutinib, pode ser antes da obtenção de células do indi- víduo para engenharia genética. Em alguns aspectos, a administração do inibidor da quinase, por exemplo, ibrutinib, é continuada com base no regime particular, por um determinado período de tempo. Em alguns aspectos, a administração do inibidor da quinase, por exemplo, ibrutinib, é continuada até após o início da terapia com células T, por exemplo, terapia com células T de CAR, como por um determinado período de tempo após o início da terapia com células T. Em alguns aspectos, um inibidor da quinase, por exemplo, ibrutinib, é administrado a longo prazo. Em alguns aspectos, a administração de longo prazo do inibidor de quinase, por exemplo, ibrutinib, incluindo ao longo de vários ciclos de administração, pode resultar em proliferação, sobrevivência e/ou ati- vação melhoradas das células T administradas. Em alguns aspectos, a administração de um inibidor de quinase, por exemplo, ibrutinib, de acordo com os métodos fornecidos pode aumentar a atividade de célu- las que expressam CAR para o tratamento de um câncer, por exemplo, malignidade de células B, como NHL, por exemplo, DLBCL, ao restaurar a função das células T e a atividade das células T modificadas, e, em alguns aspectos, também pode exibir seus efeitos antineoplásicos autônomos de células. Em alguns aspectos, as células T de CAR+ gera- das a partir de indivíduos DLBCL demonstraram função citolítica aumen- tada na presença de um inibidor da quinase, por exemplo, ibrutinib, após estimulação serial. Em alguns aspectos, a atividade antitumoral das células T de CAR+ administradas contra o linfoma de células de re- vestimento (MCL) foi observada para ser melhorada e a redução da sín- drome de liberação de citocinas (CRS) foi observada, em certos contex- tos.
[00116] Em algumas modalidades, os métodos fornecidos incluem a administração de uma quantidade eficaz de um inibidor de quinase, por exemplo, ibrutinib, por dia a um indivíduo para modular a atividade e/ou função da terapia com células T. Em algumas modalidades, a quan- tidade eficaz está entre aproximadamente 140 mg/dia e aproximad- amente 560 mg/dia. Em algumas modalidades, a quantidade de um in- ibidor de quinase, por exemplo, ibrutinib, é administrada diariamente. A administração de um inibidor de quinase, por exemplo, ibrutinib, é real- izada por um período de tempo, tal como geralmente por mais de uma semana, tal como por ou mais de um mês, em ou mais de dois meses, em ou maior que três meses, igual ou superior a quatro meses, igual ou superior a cinco meses, igual ou superior a seis meses, igual ou superior a sete meses, ou igual ou superior a oito meses. Regimes de dosagem exemplares são descritos neste documento.
[00117] Em algumas modalidades, a administração de um inibidor de quinase, por exemplo, ibrutinib, é iniciada em um momento antes do início da administração de células T modificadas. Em algumas modali- dades, a administração de um inibidor de quinase, por exemplo, ibru- tinib, é iniciada antes que as células T a serem modificadas sejam obti- das do indivíduo, por exemplo, antes da aférese ou leucaferese dos in- divíduos. Em alguns aspectos, o início da administração do inibidor de quinase, por exemplo, ibrutinib, é pelo menos 7, 6, 5, 4, 3, 2 ou 1 dia antes da aférese ou leucaferese. Em alguns aspectos, a administração do inibidor de quinase, por exemplo, ibrutinib, é continuada até após a administração das células T modificadas. Em algumas modalidades, a administração de um inibidor de quinase, por exemplo, ibrutinib, é con- tinuada se o indivíduo não exibe uma toxicidade grave após a admin- istração da terapia celular.
[00118] Em algumas modalidades, os métodos fornecidos não re- sultam em uma alta taxa ou probabilidade de toxicidade ou resultados tóxicos, ou reduzem a taxa ou probabilidade de toxicidade ou resultados tóxicos, como neurotoxicidade (NT), síndrome de liberação de citocina (CRS), ou toxicidades hematológicas, como neutropenia, como em comparação com certas outras terapias celulares ou regimes de drogas imunomoduladores.
[00119] Em algumas modalidades, os métodos não resultam ou não aumentam o risco de NT (sNT) grave, SRC grave (sCRS), síndrome de ativação macrofágica, síndrome de lise tumoral, febre de pelo menos 38 ou cerca de graus Celsius por três ou mais dias e um nível plasmático de CRP de pelo menos ou cerca de 20 mg/dL. Em algumas modali- dades, mais ou mais do que cerca de 30 %, 35 %, 40 %, 50 %, 55 %,
60 % ou mais dos indivíduos tratados de acordo com os métodos forne- cidos não exibem qualquer grau de CRS ou qualquer grau de neurotox- icidade. Em algumas modalidades, não mais do que 50 % dos indi- víduos tratados (por exemplo, pelo menos 60 %, pelo menos 70 %, pelo menos 80 %, pelo menos 90 % ou mais dos indivíduos tratados) exibem uma síndrome de liberação de citocina (CRS) maior do que grau 2 e/ou neurotoxicidade superior ao grau 2. Em algumas modalidades, pelo menos 50 % dos indivíduos tratados de acordo com o método (por ex- emplo, pelo menos 60 %, pelo menos 70 %, pelo menos 80 %, pelo menos 90 % ou mais dos indivíduos tratados) não exibem um resultado tóxico grave (por exemplo, SRC grave ou neurotoxicidade grave), como não apresentam grau 3 ou neurotoxicidade superior e/ou não exibe SRC grave, ou não o faz dentro de um certo período de tempo após o trata- mento, tal como dentro de uma semana, duas semanas ou um mês após a administração das células.
[00120] Em alguns casos, um inibidor de quinase, como um inibidor de BTK/ITK, por exemplo, ibrutinib, administrado em um momento em que pode aumentar ou preparar as células de forma eficiente/eficaz. Em algumas modalidades, os métodos fornecidos podem potencializar a terapia com células T, por exemplo, terapia com células T de CAR, que, em alguns aspectos, pode melhorar os resultados do tratamento. Em algumas modalidades, os métodos são particularmente vantajosos em indivíduos em que as células da terapia com células T exibem uma ex- pansão fraca, se exauriram, exibem uma persistência reduzida ou diminuída no indivíduo e/ou em indivíduos que têm um câncer que é resistente ou refratário a outras terapias e/ou um câncer agressivo ou de alto risco.
[00121] Em algumas modalidades, um indivíduo que recebeu a ad- ministração de uma terapia com células T, por exemplo, a célula T de CAR é monitorada quanto à presença, ausência ou nível de células T da terapia no indivíduo, tal como em uma amostra biológica do indi- víduo, por exemplo, no sangue do indivíduo. Em algumas modalidades, os métodos fornecidos resultam em células geneticamente modificadas com maior persistência e/ou melhor potência em um indivíduo ao qual é administrado. Em algumas modalidades, a persistência de células ge- neticamente modificadas, como células T que expressam CAR, no indi- víduo é maior em comparação com o que seria alcançado por métodos alternativos, como aqueles envolvendo a administração de uma terapia de células T, mas na ausência de administração de um inibidor da quinase, como um inibidor de BTK/ITK, por exemplo, ibrutinib. Em algu- mas modalidades, a persistência é aumentada pelo menos ou cerca de pelo menos 1,5 vezes, 2 vezes, 3 vezes, 4 vezes, 5 vezes, 6 vezes, 7 vezes, 8 vezes, 9 vezes, 10 vezes, 20 vezes, 30 vezes, 50 vezes, 60 vezes, 70 vezes, 80 vezes, 90 vezes, 100 vezes ou mais.
[00122] Em algumas modalidades, o grau ou extensão de persistên- cia das células administradas pode ser detectado ou quantificado após a administração a um indivíduo. Por exemplo, em alguns aspectos, PCR quantitativo (qPCR) é usado para avaliar a quantidade de células que expressam o receptor recombinante (por exemplo, células que expres- sam CAR) no sangue ou soro ou órgão ou tecido (por exemplo, sítio da doença) do indivíduo . Em alguns aspectos, a persistência é quantifi- cada como cópias de DNA ou plasmídeo que codificam o receptor, por exemplo, CAR, por micrograma de DNA, por exemplo, DNA total obtido de uma amostra, ou como o número de expressão do receptor, por ex- emplo, expressão de CAR, células por microlitro da amostra, por exem- plo, de sangue ou soro, ou por número total de células mononucleares do sangue periférico (PBMCs) ou glóbulos brancos ou células T por mi- crolitro da amostra. Em algumas modalidades, os ensaios de citometria de fluxo que detectam células que expressam o receptor geralmente usando anticorpos específicos para os receptores também podem ser realizados. Ensaios baseados em células também podem ser usados para detectar o número ou porcentagem de células funcionais, tais como células capazes de se ligar a e/ou neutralizar e/ou induzir respostas, por exemplo, respostas citotóxicas, contra células da doença ou condição ou expressar a antígeno reconhecido pelo receptor. Em qualquer uma dessas modalidades, a extensão ou nível de expressão de outro marca- dor associado ao receptor recombinante (por exemplo, células que ex- pressam CAR) pode ser usado para distinguir as células administradas de células endógenas em um indivíduo.
[00123] Em algumas modalidades, um inibidor de quinase, como um inibidor de BTK/ITK, por exemplo, ibrutinib, é administrado por um período de tempo para realçar, aumentar ou otimizar a durabilidade da resposta. Em alguns aspectos, os métodos fornecidos são baseados em observações de que os indivíduos que alcançam ou estão em remissão completa ou resposta completa (RC) em 3 meses, como geralmente em 6 meses após o início da administração da terapia com células T, são mais propensos a sustentar a resposta a longo prazo, como sobreviver ou sobreviver sem progressão por mais ou mais do que cerca de três meses, quatro meses, cinco meses, seis meses, sete meses, oito meses, nove meses, dez meses, onze meses ou doze meses após ter- minar o tratamento ou após alcançar uma resposta completa (RC) após a administração da terapia combinada. Em alguns aspectos, os méto- dos são realizados para administrar um inibidor de quinase, por exem- plo, ibrutinib, tal como em um regime de ciclagem particular conforme descrito, por um período de tempo que é de pelo menos 3 meses, tal como pelo menos quatro meses, pelo menos cinco meses ou pelo menos seis meses após o início da administração da terapia com células T. Em algumas modalidades, um inibidor de quinase, por exemplo, ibru- tinib, é administrado, tal como em um regime de ciclagem específico, conforme descrito, por pelo menos seis meses ou pelo menos 180 dias após o início da administração da terapia com células T. Em algumas modalidades, no final do período, a administração de um inibidor de quinase, por exemplo, ibrutinib, é encerrada ou interrompida se o indi- víduo exibe uma RC ou se a doença ou condição progrediu ou recidivou no indivíduo após a remissão após receber o tratamento (terapia com- binada). Em alguns aspectos, a administração continuada de um inibi- dor de quinase, por exemplo, ibrutinib, pode ser realizada em indivíduos que, no final do período de tempo (por exemplo, em ou cerca de 6 meses) exibem uma resposta parcial (RP) ou doença estável (DE). Em outros aspectos, o período de tempo é uma duração fixa e nenhuma administração adicional de um inibidor de quinase, por exemplo, ibru- tinib, é realizada.
[00124] Em alguns aspectos, os métodos e usos fornecidos for- necem ou alcançam respostas ou eficácia melhoradas ou mais duráveis em comparação com certos métodos alternativos, por exemplo, méto- dos que incluem a administração da terapia com células T ou um inibidor da quinase, por exemplo, ibrutinib, como uma monoterapia ou sem ad- ministração como uma terapia de combinação em conjunto, como aqui descrito, tal como em grupos particulares de indivíduos tratados. Em al- gumas modalidades, os métodos são vantajosos em virtude da admin- istração de terapia com células T, como uma composição incluindo célu- las para terapia com células adotivas, por exemplo, como uma terapia com células T (por exemplo, células T que expressam CAR) e um inibi- dor de quinase, por exemplo, ibrutinib. Em algumas modalidades, tais respostas são observadas em pacientes de alto risco com mau prognóstico, como aqueles com doença de alto risco, por exemplo, NHL de alto risco. Em alguns aspectos, os métodos tratam indivíduos com uma forma de linfoma não Hodgkin de células B agressivo e/ou de mau prognóstico (NHL), como o NHL que recidivou ou é refratário (R/R) à terapia padrão ou tem um mau prognóstico. Em algumas modalidades,
os indivíduos tratados de acordo com os métodos fornecidos têm lin- foma difuso de grandes células B (DLBCL) ou linfoma folicular (FL).
[00125] Em algumas modalidades, pelo menos 35 %, pelo menos 40 %, pelo menos 50 %, pelo menos 55 %, pelo menos 60 %, pelo menos 65 %, pelo menos 70 %, ou pelo menos 75 % ou mais de os indivíduos tratados de acordo com os métodos fornecidos e/ou com os artigos de fabricação ou composições fornecidos, alcançam uma resposta com- pleta (RC). Em algumas modalidades, o indivíduo está em RC e exibe doença residual mínima (MRD). Em algumas modalidades, o indivíduo está em RC e é MRD-. Em algumas modalidades, pelo menos 50 %, pelo menos 60 %, pelo menos 70 %, pelo menos 80 % ou pelo menos 90 % dos indivíduos tratados de acordo com os métodos fornecidos e/ou com os artigos de fabricação ou composições fornecidos, alcançar uma resposta objetiva de uma resposta parcial (RP). Em algumas modali- dades, pelo menos 60 %, pelo menos 70 %, pelo menos 80 %, pelo menos 90 %, pelo menos 95 % ou mais dos indivíduos tratados de acordo com os métodos fornecidos e/ou com os artigos de fabricação fornecidos ou composições, atingir uma RC ou PR aos seis meses, aos sete meses, aos oito meses, aos nove meses, aos dez meses, aos onze meses ou um ano após o início da administração da terapia celular.
[00126] Em algumas modalidades, por três meses, quatro meses, cinco meses, seis meses, sete meses, oito meses, nove meses, dez meses, onze meses ou doze meses ou mais após o início da admin- istração da terapia celular, pelo menos 60 %, pelo menos 70 %, pelo menos 80 %, pelo menos 90 %, pelo menos 95 % ou mais dos indivíduos tratados de acordo com os métodos fornecidos e/ou com os artigos de fabricação ou composições fornecidos permanecem em resposta, como permanecer em RC ou uma resposta objetiva (RO). Em algumas modal- idades, tal resposta, como RC ou OR, é durável por pelo menos três meses, quatro meses, cinco meses, seis meses, sete meses, oito meses, nove meses, dez meses, onze meses, doze meses ou mais, como em pelo menos ou cerca de pelo menos 60 %, pelo menos 70 %, pelo menos 80 %, pelo menos 90 %, pelo menos 95 % ou mais dos indivíduos tratados de acordo com os métodos fornecidos ou em tais indivíduos que alcançam uma RC por três meses, quatro meses, cinco meses ou seis meses. Em algumas modalidades, pelo menos 60 %, pelo menos 70 %, pelo menos 80 %, pelo menos 90 %, pelo menos 95 % ou mais dos indivíduos tratados de acordo com os métodos forneci- dos e/ou com os artigos de fabricação fornecidos ou composições, ou tais indivíduos que alcançam uma RC em três meses, quatro meses, cinco meses ou seis meses sobrevivem ou sobrevivem sem progressão por mais ou mais que cerca de seis meses, sete meses, oito meses, nove meses, dez meses, onze meses, doze meses ou mais.
[00127] Também são fornecidos métodos para a modificação, preparação e produção das células, composições contendo as células e/ou inibidor e kits e artigos de fabricação para usar, produzir e admin- istrar as células e/ou inibidor, tal como de acordo com os métodos de terapia de combinação fornecidos.
[00128] Todas as publicações, incluindo documentos de patentes, ar- tigos científicos e bancos de dados, referidos neste pedido são incorpo- rados por referência em sua totalidade para todos os fins, na mesma medida como se cada publicação individual fosse individualmente incor- porada por referência. Se uma definição aqui estabelecida for contrária a, ou de outra forma inconsistente com, uma definição estabelecida nas patentes, pedidos, pedidos publicados e outras publicações que são in- corporadas neste documento por referência, a definição estabelecida neste documento prevalece sobre a definição que é incorporada neste documento por referência.
[00129] Os títulos das seções usados neste documento são apenas para fins organizacionais e não devem ser interpretados como limitando o assunto descrito. I. TERAPIA DE COMBINAÇÃO
[00130] São aqui fornecidos métodos para terapia de combinação para o tratamento de uma doença ou distúrbio, por exemplo, um câncer ou doença proliferativa, que inclui a administração a um indivíduo de uma terapia de combinação de 1) um inibidor de quinase e 2) uma tera- pia celular, por exemplo, terapia de células T (por exemplo, células T que expressam CAR). Também são fornecidos métodos e usos de célu- las modificadas, como células T (por exemplo, células T que expressam CAR) e um inibidor de uma quinase da família TEC, tal como tirosina quinase de Bruton (BTK). Em alguns aspectos, o inibidor é um inibidor da tirosina quinase de Bruton (BTK) e/ou quinase de células T induzível por IL-2 (ITK), tal como ibrutinib. Em alguns aspectos, o inibidor tem a estrutura , ou um sal farmaceuticamente aceitável, solvato, hidrato, estereoisômero, tautômero ou misturas racêmicas dos mesmos, incluindo e composições dos mesmos, para o tratamento de indivíduos com câncer.
[00131] A terapia de combinação, por exemplo, incluindo células modificadas que expressam um receptor recombinante, como um re- ceptor de antígeno quimérico (CAR) e um inibidor de quinase, por ex- emplo, ibrutinib, ou composições compreendendo as células modifica- das e/ou o inibidor de quinase, por exemplo, O ibrutinib, aqui descrito, é útil em uma variedade de indicações terapêuticas, diagnósticas e pro- filáticas. Por exemplo, as combinações são úteis no tratamento de uma variedade de doenças e distúrbios em um indivíduo. Tais métodos e usos incluem métodos e usos terapêuticos, por exemplo, envolvendo a administração das células modificadas, inibidor de quinase, por exem- plo, ibrutinib, e/ou composições contendo um ou ambos, a um indivíduo com uma doença, condição ou distúrbio, tal como um tumor ou câncer. Em algumas modalidades, as células modificadas, o inibidor de quinase, por exemplo, ibrutinib, e/ou composições contendo um ou ambos são administrados em uma quantidade eficaz para efetuar o tratamento da doença ou distúrbio. Os usos incluem o uso de células modificadas, in- ibidor de quinase, por exemplo, ibrutinib e/ou composições contendo um ou ambos em tais métodos e tratamentos e na preparação de um medicamento a fim de realizar tais métodos terapêuticos. Em algumas modalidades, os métodos são realizados pela administração de células modificadas, inibidor de quinase, por exemplo, ibrutinib, e/ou com- posições contendo um ou ambos, ao indivíduo com ou suspeito de ter a doença ou condição. Em algumas modalidades, os métodos tratam as- sim a doença ou condição ou distúrbio no indivíduo.
[00132] Em algumas modalidades, os métodos são para o trata- mento de um indivíduo com malignidade de células B. Em alguns as- pectos, os métodos são para o tratamento de aleuquemia ou um lin- foma, como um linfoma não Hodgkin (NHL). Em alguns aspectos, os métodos e usos fornecem ou alcançam uma resposta melhorada e/ou respostas ou eficácia mais duráveis, por exemplo, em grupos específi- cos de indivíduos tratados, em comparação com certos métodos alter- nativos. Em algumas modalidades, a terapia celular compreende a ad- ministração de células T que reconhecem e/ou visam especificamente um antígeno associado a uma doença ou distúrbio, por exemplo, um câncer ou doença proliferativa. Também são fornecidas combinações e artigos de fabricação, tais como kits, que contêm uma composição que compreende a terapia de células T e/ou uma composição que com- preende o inibidor de quinase, como um inibidor de BTK/ITK, por exem- plo, ibrutinib, e usos de tais composições e combinações para tratar ou prevenir doenças, condições e distúrbios, incluindo câncer.
[00133] Em algumas modalidades, os métodos e usos incluem 1) ad- ministrar ao indivíduo uma terapia de células T envolvendo células que expressam receptores de superfície celular geneticamente modificados (por exemplo, receptor de antígeno recombinante), que geralmente são receptores quiméricos, como receptores de antígenos quiméricos (CARs), reconhecendo um antígeno expresso por, associado com e/ou específico para a malignidade de células B, como uma leucemia ou lin- foma (por exemplo, NHL) e/ou tipo de célula a partir do qual é derivado, e 2) administrar ao indivíduo uma quinase inibidor, como um inibidor de BTK/ITK, por exemplo, ibrutinib. Os métodos geralmente envolvem a administração de uma ou mais doses das células e mais de uma dose de um inibidor de quinase, por exemplo, ibrutinib, ao indivíduo.
[00134] Em algumas modalidades, o método de terapia de com- binação fornecido envolve a administração ao indivíduo de uma quan- tidade terapeuticamente eficaz de um inibidor de quinase, como um in- ibidor de BTK/ITK, por exemplo, ibrutinib, e a terapia celular, como uma terapia de células T (por exemplo, células T que expressam CAR). Em algumas modalidades, os métodos de terapia de combinação fornecidos envolvem o início da administração de um inibidor de quinase, como um inibidor de BTK/ITK, por exemplo, ibrutinib, antes de, subse- quentemente, durante, durante o curso de, simultaneamente, quase simultaneamente, sequencialmente, concorrentemente e/ou intermiten- temente com o início da terapia celular, como uma terapia com células T (por exemplo, células T que expressam CAR).
[00135] Em algumas modalidades, as modalidades fornecidas en- volvem o início da administração de um inibidor de quinase, como um inibidor de BTK/ITK, por exemplo, ibrutinib, antes da administração da terapia com células T e continua até o início da administração da terapia com células T ou após o início da administração da terapia com células
T. Em alguns aspectos, as modalidades fornecidas envolvem o trata- mento prolongado com um inibidor da quinase, como um inibidor de BTK/ITK, por exemplo, ibrutinib, como um pré-tratamento prolongado com o inibidor da quinase, por exemplo, ibrutinib. Em algumas modali- dades, o método envolve a administração contínua do inibidor de quinase, como um inibidor de BTK/ITK, por exemplo, ibrutinib. Em algu- mas modalidades, a administração contínua do inibidor de quinase, como um inibidor de BTK/ITK, por exemplo, ibrutinib, envolve a admin- istração de doses múltiplasdo inibidor da quinase, por exemplo, ibrutinib. Em algumas modalidades, o inibidor da quinase, por exemplo, ibrutinib, não é continuado ou administrado após o início da terapia com células T. Em algumas modalidades, o cronograma de dosagem compreende a administração do inibidor da quinase, por exemplo, ibrutinib, antes e após o início da terapia com células T. Em algumas modalidades, o cronograma de dosagem compreende a administração do inibidor de quinase, por exemplo, ibrutinib, simultaneamente com a administração da terapia com células T.
[00136] Em alguns aspectos, os métodos envolvem a administração do inibidor de quinase, por exemplo, ibrutinib, que é iniciado em ou pelo menos cerca de 3 dias ou um mínimo de ou cerca de 3 dias antes de obter uma amostra compreendendo células T do indivíduo, por exemplo, para produzir uma terapia de células T para administração. Em alguns aspectos, a terapia com células T é produzida por um processo que compreende a obtenção de uma amostra compreendendo células T do indivíduo e a introdução de uma molécula de ácido nucleico que codifica o CAR em uma composição que compreende as células T. Em algumas modalidades, o inibidor da quinase, por exemplo, ibrutinib, é admin- istrado em um regime de dosagem que compreende a administração por um período de tempo que se estende pelo menos até que a amostra seja obtida do indivíduo. Em alguns aspectos, a administração do inibi- dor de quinase, por exemplo, ibrutinib, é iniciada ou pelo menos cerca de 3 dias antes da obtenção da amostra do indivíduo e é realizada em um regime de dosagem que compreende a administração por um período de tempo que se estende em pelo menos até que a amostra seja obtida do indivíduo.
[00137] Em algumas modalidades, os métodos e usos envolvem: (1) administrar a um indivíduo com câncer uma quantidade eficaz de um inibidor de quinase, por exemplo, um inibidor de quinase com a estrutura , ou um sal farmaceuticamente aceitável do mesmo; e (2) administrar uma terapia de células T autólogas ao indi- víduo, a referida terapia de células T compreendendo uma dose de célu- las T geneticamente modificadas que expressam um receptor de antígeno quimérico (CAR) que se liga especificamente a um antígeno associado a uma doença ou distúrbio, por exemplo, um CD19. Em algu- mas modalidades, antes de administrar a terapia com células T, uma amostra biológica foi obtida do indivíduo e processada, o proces- samento compreendendo a modificação genética de células T da amos- tra, por exemplo, pela introdução de uma molécula de ácido nucleico que codifica o CAR nas referidas células T. Em algumas modalidades, a administração do inibidor de quinase é iniciada pelo menos ou cerca de 3 dias antes da obtenção da amostra e é realizada em um regime de dosagem que compreende administrações repetidas do inibidor em um intervalo de dosagem, ao longo de um período de tempo que se estende pelo menos para incluir a administração no dia ou após o dia em que a amostra é obtida do indivíduo.
[00138] Em algumas modalidades, os métodos e usos envolvem: (1) administrar a um indivíduo com câncer uma quantidade eficaz de um inibidor de quinase, por exemplo, um inibidor de quinase com a estrutura , ou um sal farmaceuticamente aceitável do mesmo; (2) obtendo do indivíduo uma amostra biológica e processando células T da referida amostra, gerando assim uma composição com- preendendo células T geneticamente modificadas que expressam um receptor de antígeno quimérico (CAR) que se liga especificamente a um antígeno associado a uma doença ou distúrbio, por exemplo, CD19, e (3) administração ao indivíduo de uma terapia com células T autólogas compreendendo uma dose das células T geneticamente modificadas. Em alguns aspectos, a administração do inibidor de quinase é realizada em um regime de dosagem que é iniciado pelo menos ou cerca de 3 dias antes da obtenção da amostra e que compreende administrações repetidas do composto, em um intervalo de dosagem, ao longo de um período de tempo e estende-se pelo menos para incluir a administração do composto no dia ou após o dia em que a amostra é obtida do indi- víduo.
[00139] Em algumas modalidades, os métodos e usos envolvem: (1) administrar a um indivíduo com câncer uma quantidade eficaz de um inibidor de quinase, por exemplo, um inibidor de quinase com a estrutura , ou um sal farmaceuticamente aceitável do mesmo; e (2) administrar uma terapia de células T autólogas ao indi- víduo, a referida terapia de células T compreendendo uma dose de célu- las T geneticamente modificadas que expressam um receptor de antígeno quimérico (CAR) que se liga especificamente a um antígeno associado a uma doença ou distúrbio, por exemplo, um CD19. Em al- guns aspectos, a terapia com células T é produzida por um processo que compreende a obtenção de uma amostra compreendendo células T do indivíduo e a introdução de uma molécula de ácido nucleico que codifica o CAR em uma composição que compreende as células T, em que a administração do inibidor de quinase é iniciada em ou pelo menos cerca de 3 dias ou um mínimo de ou cerca de 3 dias antes da obtenção da amostra do indivíduo e é realizada em um regime de dosagem que compreende a administração por um período de tempo que se estende pelo menos até que a amostra seja obtida do indivíduo.
[00140] Em alguns aspectos, os métodos e usos fornecidos en- volvem a administração a um indivíduo com câncer de uma quantidade eficaz de um inibidor de quinase, por exemplo, um inibidor de quinase com a estrutura , ou um sal farmaceuti- camente aceitável do mesmo, em que o indivíduo é um candidato ao tratamento ou deve ser tratado com uma terapia de células T. Em alguns aspectos, a terapia com células T compreende uma dose de células T geneticamente modificadas que expressam um receptor de antígeno quimérico (CAR) que se liga especificamente a um antígeno associado a uma doença ou distúrbio, por exemplo, um CD19. Em alguns aspec- tos, a terapia com células T é produzida por um processo que com-
preende a obtenção de uma amostra compreendendo células T do indi- víduo e a introdução de uma molécula de ácido nucleico que codifica o CAR em uma composição que compreende as células T. Em alguns aspectos, a administração do inibidor de quinase, por exemplo, ibrutinib, e é iniciada em ou pelo menos cerca de 3 dias ou um mínimo de ou cerca de 3 dias antes da obtenção da amostra do indivíduo e é realizada em um regime de dosagem compreendendo a administração por um período de tempo que se estende pelo menos até que a amostra seja obtida do indivíduo. Em alguns aspectos, os métodos e usos também envolvem a administração ao indivíduo da terapia com células T, por exemplo, uma composição compreendendo células T obtidas do indi- víduo que foram introduzidas com uma molécula de ácido nucleico que codifica um CAR. Em algumas modalidades, a obtenção de uma amos- tra do indivíduo inclui a obtenção de uma amostra que é ou compreende uma amostra de sangue total, uma amostra de camada leucocitária, uma amostra de células mononucleares de sangue periférico (PBMC), uma amostra de células T não fracionadas, uma amostra de linfócitos, uma amostra de glóbulos brancos, um produto de aférese ou um produto de leucaferese. Em algumas modalidades, a obtenção de uma amostra do indivíduo também é referida como aférese ou leucaferese.
[00141] Em alguns aspectos, após o início da administração do inibi- dor da quinase, por exemplo, ibrutinib, e antes da administração da ter- apia com células T, o indivíduo foi precondicionado com uma terapia de linfodepleção. Em alguns aspectos, a terapia de linfodepleção é ou com- preende qualquer terapia de linfodepleção aqui descrita, por exemplo, na Seção I.C. Em alguns aspectos, os métodos e usos envolvem a ad- ministração de uma terapia de linfodepleção ao indivíduo, após o início da administração do inibidor da quinase, por exemplo, ibrutinib, e antes da administração da terapia com células T. Em algumas modalidades,
o regime de dosagem para administrar o inibidor de quinase, por exem- plo, ibrutinib, envolve a administração por um período de tempo que se estende pelo menos até o início da terapia de linfodepleção.
[00142] Em algumas modalidades dos métodos e usos, a admin- istração do inibidor de quinase, por exemplo, ibrutinib, é descontinuada ou pausada, durante a terapia de linfodepleção. Em algumas modali- dades, a descontinuação pode ser uma descontinuação temporária, por exemplo, uma pausa ou interrupção temporária da administração. Em algumas modalidades dos métodos e usos, a administração do inibidor de quinase, por exemplo, ibrutinib, pode ser opcionalmente retomada após a terapia de linfodepleção. Em algumas modalidades, o inibidor da quinase, por exemplo, ibrutinib, é ainda administrado ou a administração é retomada, após a terapia de linfodepleção. Em algumas modalidades, a quantidade de dosagem, frequência, horários ou regime da admin- istração inicial do inibidor de quinase, por exemplo, ibrutinib, antes de uma terapia de linfodepleção e/ou uma descontinuação ou pausa, é o mesmo que a quantidade de dosagem, frequência, horários ou regime de administração adicional ou administração retomada do inibidor da quinase, por exemplo, ibrutinib, após terapia de linfodepleção e/ou uma descontinuação ou pausa. Em algumas modalidades, a quantidade de dosagem, frequência, horários ou regime da administração inicial do in- ibidor de quinase, por exemplo, ibrutinib, antes de uma terapia de linfo- depleção e/ou uma descontinuação ou pausa, é diferente ou modificada em comparação com a quantidade de dosagem, frequência, horários ou regime de administração adicional ou administração retomada do inibi- dor de quinase, por exemplo, ibrutinib, após terapia de linfodepleção e/ou uma descontinuação ou pausa.
[00143] Em alguns aspectos, o regime de dosagem para administrar o inibidor de quinase, por exemplo, ibrutinib, envolve a administração do inibidor de quinase até o início da terapia de linfodepletação, descontin- uação da administração do inibidor de quinase durante a terapia de linfo- depleção e administração adicional de inibidor de quinase por um período que se estende por pelo menos 15 dias, tal como pelo menos 15, 30, 60, 90, 120, 150 ou 180 dias, após o início da administração da terapia com células T.
[00144] Em algumas modalidades, a terapia celular é uma terapia celular adotiva. Em algumas modalidades, a terapia celular é ou com- preende uma terapia linfocítica de infiltração tumoral (TIL), uma terapia de TCR transgênica ou uma terapia celular que expressa o receptor re- combinante (opcionalmente terapia com células T), que opcionalmente é um receptor de antígeno quimérico (CAR) que expressa terapia celu- lar. Em algumas modalidades, a terapia tem como alvo o CD19 ou é uma terapia direcionada às células B. Em algumas modalidades, as células e os regimes de dosagem para administrar as células podem incluir qualquer um aqui descrito.
[00145] Em algumas modalidades, o inibidor de quinase, por exem- plo, inibidor de quinase da família TEC, inibe uma ou mais quinase da família TEC, incluindo tirosina quinase de Bruton (BTK), quinase de células T induzível por IL-2 (ITK), proteína tec tirosina quinase (TEC), gene da tirosina quinase da medula óssea na proteína tirosina quinase não receptora do cromossoma X (BMX) (também conhecida como ti- rosina quinase epitelial e endotelial; ETK) e tirosina quinase TXK (TXK). Em algumas modalidades, o inibidor é um inibidor da tirosina quinase de Bruton (BTK). Em algumas modalidades, as células e os regimes de dosagem para administrar o inibidor podem incluir qualquer um aqui descrito.
[00146] Em algumas modalidades, a imunoterapia, como uma tera- pia com células T (por exemplo, células T que expressam CAR) e o in-
ibidor são fornecidos como composições farmacêuticas para admin- istração ao indivíduo. Em algumas modalidades, as composições far- macêuticas contêm quantidades terapeuticamente eficazes de um ou ambos os agentes para terapia de combinação, por exemplo, células T para terapia de células adotivas e um inibidor conforme descrito. Em algumas modalidades, os agentes são formulados para administração em composições farmacêuticas separadas. Em algumas modalidades, qualquer uma das composições farmacêuticas fornecidas neste docu- mento pode ser formulada em formas de dosagem adequadas para cada via de administração.
[00147] Em algumas modalidades, a terapia de combinação, que in- clui a administração de imunoterapia (por exemplo, terapia de células T, incluindo células modificadas, como terapia de células T de CAR) e o inibidor, é administrada a um indivíduo ou paciente com uma doença ou condição a ser tratada (por exemplo, câncer) ou em risco de ter a doença ou condição (por exemplo, câncer). Em alguns aspectos, os métodos tratam, por exemplo, melhoram um ou mais sintomas da doença ou condição, tal como diminuindo a carga tumoral em um câncer que expressa um antígeno reconhecido pela imunoterapia ou agente imunoterapêutico, por exemplo, reconhecido por uma célula T modifi- cada.
[00148] Em algumas modalidades, a doença ou condição que é tratada pode ser qualquer uma em que a expressão de um antígeno está associada e/ou envolvida na etiologia de uma condição ou distúrbio de doença, por exemplo, causa, agrava ou de outra forma está en- volvida em tal doença, condição ou distúrbio. Doenças e condições ex- emplares podem incluir doenças ou condições associadas com malign- idade ou transformação de células (por exemplo, câncer), doença au- toimune ou inflamatória ou uma doença infecciosa, por exemplo,
causada por bactérias, vírus ou outros patógenos. Antígenos exem- plares, que incluem antígenos associados a várias doenças e condições que podem ser tratadas, incluem qualquer um dos antígenos aqui descritos. Em modalidades particulares, o receptor recombinante ex- presso em células modificadas de uma terapia de combinação, incluindo um receptor de antígeno quimérico ou TCR transgênico, se liga especifi- camente a um antígeno associado à doença ou condição.
[00149] Em algumas modalidades, a doença ou condição é um tu- mor, como um tumor sólido, linfoma, leucemia, tumor sanguíneo, tumor metastático ou outro tipo de câncer ou tumor.
[00150] Em algumas modalidades, a terapia de combinação é admin- istrada a um indivíduo com uma determinada malignidade de células B. A malignidade das células B que é tratada pode ser qualquer uma em que a expressão de um antígeno está associada e/ou envolvida na eti- ologia da malignidade das células B, por exemplo, causa, agrava ou de outra forma está envolvida na malignidade de células B. As maligni- dades de células B exemplares podem incluir doenças ou condições as- sociadas à malignidade ou transformação de células (por exemplo, um câncer). Antígenos exemplares, que incluem antígenos associados a várias doenças malignas de células B que podem ser tratadas, são descritos neste documento. Em modalidades particulares, o receptor de antígeno quimérico se liga especificamente a um antígeno associado à doença ou condição. Em algumas modalidades, os antígenos direciona- dos pelos receptores incluem antígenos associados a uma malignidade de células B, como qualquer um de uma série de marcadores de células B. Em algumas modalidades, o antígeno é expresso por ou nas células B, incluindo células B humanas. Em algumas modalidades, o antígeno direcionado pelo receptor é CD20, CD19, CD22, ROR1, CD45, CD21, CD5, CD33, Igcapa, Iglambda, CD79a, CD79b ou CD30. Em algumas modalidades, o antígeno é CD19 e o receptor de antígeno quimérico liga especificamente CD19. Em algumas modalidades, o antígeno CD19 é um CD19 humano.
[00151] Em algumas modalidades, a malignidade de células B a ser tratada inclui leucemia e linfoma, por exemplo, leucemia mieloide aguda (ou mieloide) (AML), leucemia mieloide crônica (ou mieloide) (CML), leucemia linfocítica aguda (ou linfoblástica) (ALL), leucemia linfocítica crônica (CLL), leucemia de células pilosas (HCL), linfoma linfocítico pe- queno (SLL), linfoma de células de revestimento (MCL), linfoma da zona marginal, linfoma de Burkitt, linfoma de Hodgkin (HL), linfoma não Hodg- kin (NHL), linfoma anaplásico de células grandes (ALCL), linfoma folicu- lar (FL), linfoma folicular refratário, linfoma difuso de grandes células B (DLBCL) e mieloma múltiplo (MM). Em algumas modalidades, a doença ou condição é uma malignidade de células B selecionada entre leucemia linfoblástica aguda (ALL), ALL do adulto, leucemia linfoblástica crônica (CLL), linfoma não Hodgkin (NHL) e linfoma difuso de grandes células B (DLBCL). Em algumas modalidades, a doença ou condição é NHL e o NHL é selecionado do grupo que consiste em NHL agressivo, linfoma difuso de grandes células B (DLBCL), NOS (de novo e transformado de indolente), linfoma mediastinal primário de grandes células B (PMBCL), linfoma de células B grandes rico em células T/histócitos (TCHRBCL), linfoma de Burkitt, linfoma de células de revestimento (MCL) e/ou lin- foma folicular (FL), opcionalmente, linfoma folicular de grau 3B (FL3B).
[00152] Em algumas modalidades, os métodos envolvem o trata- mento de um indivíduo com linfoma ou leucemia, como um linfoma não Hodgkin (NHL) pela administração de células que expressam receptor de antígeno (por exemplo, células que expressam CAR) e um inibidor de quinase, tal como um inibidor de BTK/ITK, por exemplo, ibrutinib. Em algumas modalidades, o início da administração do inibidor da quinase, por exemplo, ibrutinib, é antes da administração das células que expres- sam o receptor recombinante (por exemplo, células que expressam
CAR), como antes de iniciar a administração das células que expressam o receptor recombinante (por exemplo, células que expressam CAR).
[00153] Em algumas modalidades, NHL pode ser encenado com base na classificação de Lugano (veja, por exemplo, Cheson et al., (2014) JCO 32 (27): 3059-3067; Cheson, BD (2015) Chin Clin Oncol 4 (1): 5). Em alguns casos, os estágios são descritos por algarismos ro- manos I a IV (1-4), e os linfomas de estágio limitado (I ou II) que afetam um órgão fora do sistema linfático (um órgão extranodal) são indicados por E. O estágio I representa envolvimento em um nó ou um grupo de nós adjacentes, ou uma única lesão extranodal sem envolvimento nodal (IE). O estágio 2 representa o envolvimento em dois ou mais grupos nodais no mesmo lado do diafragma ou estágio I ou II por extensão nodal com envolvimento extranodal contíguo limitado (IIE). O estágio III representa o envolvimento dos nódulos em ambos os lados do di- afragma ou nódulos acima do diafragma com envolvimento do baço. O estágio IV representa envolvimento em envolvimento extralinfático não contíguo adicional. Além disso, “doença volumosa” pode ser usada para descrever grandes tumores no tórax, em particular para o estágio II. A extensão da doença é determinada por tomografia por emissão de pósitrons (PET) - tomografia computadorizada (TC) para linfomas ávidos e TC para histologias não ávidas.
[00154] Em algumas modalidades, o indicador de status de desem- penho do Eastern Cooperative Oncology Group (ECOG) pode ser usado para avaliar ou selecionar indivíduos para o tratamento, por exemplo, indivíduos que tiveram desempenho ruim de terapias anteriores (veja, por exemplo, Oken et al. (1982) Am J Clin Oncol. 5: 649-655). Em algu- mas modalidades, o indivíduo tem um status ECOG menor ou igual a 1. A Escala ECOG de Status de Desempenho descreve o nível de fun- cionamento de um paciente em termos de sua capacidade de cuidar de si mesmo, atividade diária e capacidade física (por exemplo, caminhar,
trabalhar, etc.). Em algumas modalidades, um status de desempenho de ECOG de 0 indica que um indivíduo pode realizar uma atividade nor- mal. Em alguns aspectos, os indivíduos com um status de desempenho de ECOG de 1 exibem alguma restrição na atividade física, mas o indi- víduo é totalmente deambulador. Em alguns aspectos, os pacientes com um status de desempenho de ECOG de 2 são mais de 50 % ambulato- riais. Em alguns casos, o indivíduo com um status de desempenho de ECOG de 2 também pode ser capaz de cuidar de si mesmo; veja, por exemplo, Sørensen et al., (1993) Br J Cancer 67 (4) 773-775. Os crité- rios que refletem o status de desempenho de ECOG são descritos na Tabela 1 abaixo: Tabela 1. Critérios de status de desempenho de ECOG Grau Status de desempenho de ECOG 0 Totalmente ativo, capaz de realizar todo o desempenho pré- doença sem restrição 1 Restrito a atividades fisicamente extenuantes, mas de ambu- latório e capaz de realizar trabalhos de natureza leve ou se- dentária, por exemplo, trabalho doméstico leve, trabalho de escritório 2 Ambulatório e capaz de todo autocuidado, mas incapaz de realizar qualquer atividade laboral; acima e cerca de mais de 50 % das horas de vigília 3 Capaz de apenas autocuidado limitado; confinado à cama ou cadeira mais de 50 % das horas de vigília 4 Completamente desativado; não pode cuidar de si mesmo; totalmente confinado à cama ou cadeira 5 Morto
[00155] Em algumas modalidades, o indivíduo foi ou foi identificado como tendo um linfoma de duplo/triplo hit ou um linfoma dos subtipos moleculares de duplo/triplo hit. Em algumas modalidades, o linfoma é um linfoma de duplo hit caracterizado pela presença de rearranjos gênicos MYC (oncogene de mielocitomatose), BCL2 (linfoma 2 de célu- las B) e/ou BCL6 (linfoma 6 de células B) (por exemplo, translocações). Em algumas modalidades, o linfoma é um linfoma triplo caracterizado pela presença de rearranjos gênicos MYC, BCL2 e BCL6; veja, por ex- emplo, Aukema et al., (2011) Blood 117: 2319-2331. Em alguns aspec- tos de tais modalidades, o indivíduo é ECOG 0-1. Em aspectos, a tera- pia é indicada para tais indivíduos e/ou as instruções indicam a admin- istração a um indivíduo dentro de tal população. Em algumas modali- dades, com base nos critérios da OMS de 2016 (Swerdlow et al., (2016) Blood 127 (20): 2375-2390), o linfoma de duplo/triplo hit pode ser con- siderado linfoma de células B de alto grau, com rearranjos MYC e BCL2 e/ou BCL6 com histologia de DLBCL (duplo/triplo hit).
[00156] Em algumas modalidades, a terapia de combinação é admin- istrada a indivíduos que são ou provavelmente serão ou que se prevê que respondam mal e/ou que não respondem, provavelmente não re- sponderão e/ou que se prevê que não responderão ou não respondem dentro de um certo tempo e/ou até certo ponto ao tratamento com uma terapia celular (por exemplo, células T de CAR+). Em algumas modali- dades, a terapia de combinação é administrada a indivíduos que não exibem ou não têm probabilidade ou não se prevê que exibam uma re- sposta completa ou resposta geral, tal como dentro de 1 mês, dentro de dois meses ou dentro de três meses após o início da administração de uma terapia celular. Em algumas modalidades, a terapia de combinação é administrada a indivíduos que exibem ou têm probabilidade de exibir ou que se prevê exibirem doença progressiva (DP), tal como dentro de 1 mês, dois meses ou três meses, após a administração da terapia celu- lar. Em algumas modalidades, é provável ou previsto que um indivíduo não exiba uma resposta ou uma certa resposta com base em uma plu- ralidade de indivíduos em situação semelhante tratados ou previamente tratados com a terapia celular.
[00157] Em algumas modalidades, os métodos fornecidos envolvem o tratamento de um grupo específico ou subconjunto de indivíduos, por exemplo, indivíduos identificados como tendo doença de alto risco, por exemplo, NHL de alto risco. Em alguns aspectos, os métodos tratam indivíduos com uma forma de linfoma não Hodgkin de células B agres- sivo e/ou de mau prognóstico (NHL), como o NHL que recidivou ou é refratário (R/R) à terapia padrão tem um prognóstico ruim. Em alguns casos, a taxa de resposta geral (ORR) às terapias disponíveis, a um padrão de atendimento ou a uma terapia de referência para a doença e/ou população de pacientes para a qual a terapia é indicada é menor do que a 40 % e/ou a a resposta completa (RC) é menor do que a 20 %. Em algumas modalidades, em DLBCL quimiorrefratário, a ORR com uma referência ou tratamento disponível ou terapia padrão de atendi- mento é de cerca de 26 % e a RC é de cerca de 8 % (Crump et al. Outomes in refractory aggressive diffuse large B-cell lymphoma (DLBCL): Resultados do estudo internacional SCHOLAR. ASCO 2016 [Abstract 7516]). Em alguns aspectos, os métodos, composições, usos e artigos de fabricação fornecidos alcançam respostas melhoradas e superiores às terapias disponíveis.
[00158] Em algumas modalidades, os métodos e usos para o trata- mento de indivíduos descritos neste documento envolve a seleção ou identificação de um determinado grupo ou subconjunto de indivíduos, por exemplo, com base em tipos específicos de doença, critérios de di- agnóstico, tratamentos anteriores e/ou resposta a tratamentos anteri- ores . Em algumas modalidades, os métodos envolvem o tratamento de um indivíduo que teve uma recaída após a remissão após o tratamento com, ou tornou-se refratário a, uma ou mais terapias anteriores; ou um indivíduo que teve uma recaída ou é refratário (R/R) a uma ou mais ter- apias anteriores, por exemplo, uma ou mais linhas de terapia padrão,
incluindo aquelas aqui descritas.
[00159] Em algumas modalidades, o indivíduo foi submetido a mais de uma, duas, três, quatro, cinco ou seis terapias anteriores. Em algu- mas modalidades, o indivíduo foi submetido a uma terapia anterior. Em algumas modalidades, o indivíduo foi submetido a cerca de duas a quatro terapias anteriores. Em algumas modalidades, o indivíduo foi submetido a cerca de cinco a seis terapias anteriores. Em algumas modalidades, o indivíduo foi submetido a mais de seis terapias anteri- ores.
[00160] Em algumas modalidades, o indivíduo foi tratado anterior- mente com uma terapia ou um agente terapêutico direcionado à malign- idade das células B, por exemplo, NHL, antes da administração das células que expressam o receptor recombinante. Em algumas modali- dades, o indivíduo foi tratado anteriormente com uma terapia celular (por exemplo, células T de CAR+). Em algumas modalidades, o indivíduo foi tratado anteriormente com um transplante de células-tronco hemato- poiéticas (HSCT), por exemplo, HSCT alogênico ou HSCT autogênico. Em algumas modalidades, o indivíduo teve um prognóstico ruim após o tratamento com terapia padrão e/ou falhou em uma ou mais linhas de terapia anterior. Em algumas modalidades, o indivíduo foi tratado ou recebeu anteriormente pelo menos ou cerca de pelo menos ou cerca de 1, 2, 3, 4, 5, 6 ou 7 outras terapias para o tratamento do NHL diferente de uma terapia de linfodepleção. Em algumas modalidades, o indivíduo foi tratado anteriormente com quimioterapia ou radioterapia. Em alguns aspectos, o indivíduo é refratário ou não responde à outra terapia ou agente terapêutico. Em algumas modalidades, o indivíduo tem doença persistente ou recidivante, por exemplo, após o tratamento com outra terapia ou intervenção terapêutica, incluindo quimioterapia ou radiação.
[00161] Em algumas modalidades, a terapia de combinação é admin-
istrada a indivíduos que progrediram em um tratamento anterior. Em al- gumas modalidades, a terapia de combinação é administrada a indi- víduos que pararam de responder a uma terapia anterior. Em algumas modalidades, a terapia de combinação é administrada a indivíduos que tiveram uma recaída após uma remissão após um tratamento anterior. Em algumas modalidades, a terapia de combinação é administrada a indivíduos que são refratários a um tratamento anterior. Em algumas modalidades, a terapia de combinação é administrada a indivíduos que têm menos do que uma resposta ótima (por exemplo, uma resposta completa, uma resposta parcial ou uma doença estável) a uma terapia anterior.
[00162] Em algumas modalidades, os indivíduos são refratários à última terapia anterior. Em algumas modalidades, os indivíduos têm uma recaída para a última terapia anterior. O estado é refratário se um indivíduo obteve menos do que uma resposta parcial à última terapia anterior. Em algumas modalidades, os indivíduos têm uma quimiotera- pia anterior. Em algumas modalidades, os indivíduos são quimior- refratários à quimioterapia anterior. Em algumas modalidades, os indi- víduos são quimiossensíveis à terapia anterior. O status é quimior- refratário é um indivíduo que atingiu doença estável (DE) ou doença progressiva (DP) para o último regime contendo quimioterapia ou recid- iva menos de 12 meses após o transplante autólogo de células-tronco. Caso contrário, o status é quimiossensível.
[00163] Em algumas modalidades, os métodos podem ser usados para tratar doenças malignas de células B ou malignidades hematológi- cas e, em particular, tais doenças malignas em que as respostas, por exemplo, resposta completa, a tratamentos com uma terapia de células T, como células T de CAR, ou um inibidor de quinase, por exemplo, ibrutinib, sozinho ou não como uma terapia de combinação em conjunto como aqui fornecido, não foram inteiramente satisfatórios ou foram rel- ativamente baixos em comparação com tratamentos semelhantes de outras doenças malignas de células B ou em outros indivíduos. Em al- gumas modalidades, a malignidade de células B é aquela em que o tratamento com uma imunoterapia ou agente imunoterapêutico, como uma composição incluindo células para terapia celular adotiva (por ex- emplo, células T que expressam CAR), quando administrado sozinho ou em outra combinação que é distinta de uma terapia de combinação como aqui fornecida e/ou não é uma combinação com uma terapia à base de inibidor de quinase, por exemplo, terapia à base de ibrutinib, resulta em uma RC em menos ou menos de cerca de 60 %, menos de cerca de 50 % ou menos de cerca de 45 % dos indivíduos assim trata- dos. Em algumas modalidades, o indivíduo e/ou a malignidade de célu- las B é aquele que não responde a e/ou foi considerado refratário ou resistente ao tratamento com o inibidor e/ou com uma terapia com inibi- dor de quinase, por exemplo, terapia com ibrutinib, é um câncer agres- sivo ou de alto risco e/ou mais tem uma ou mais características (por exemplo, marcadores) indicativos de mau prognóstico e/ou resultado ruim após o tratamento com o inibidor e/ou com uma terapia com inibidor de quinase, por exemplo, terapia com ibrutinib.
[00164] Em algumas modalidades, a terapia de combinação forne- cida neste documento é para uso em um indivíduo com um câncer no qual, no momento da terapia de combinação fornecida, tal como no mo- mento da administração da terapia de células T (por exemplo, células T que expressam CAR) e no momento da administração do inibidor de quinase, como um inibidor de BTK/ITK, por exemplo, ibrutinib, o indi- víduo não responde e/ou foi considerado refratário ou resistente a um tratamento anterior com o inibidor e/ou com uma terapia com inibidor de BTK. Em algumas modalidades, a terapia de combinação fornecida com o inibidor e imunoterapia é realizada em um indivíduo com uma doença ou condição, por exemplo, malignidade de células B, em que, no mo- mento do início da terapia combinada, o indivíduo tem uma doença que está progredindo após a administração de tal inibidor anterior, mas na ausência de uma terapia envolvendo células T (por exemplo, células T de CAR), tais assim como tem a doença progressiva (DP) como melhor resposta, ou está progredindo após uma resposta anterior.
[00165] Em algumas modalidades, a terapia de combinação forne- cida com um inibidor de quinase, por exemplo, ibrutinib, e uma terapia com células T (por exemplo, células T de CAR) é realizada em um indi- víduo com uma doença ou condição, por exemplo, malignidade de célu- las B, em que, no momento do início da terapia de combinação forne- cida, o indivíduo teve uma resposta menor do que a uma resposta com- pleta (CR) após receber previamente o inibidor e/ou um inibidor da quinase, por exemplo, ibrutinib, por pelo menos 6 meses.
[00166] Em alguns aspectos, o indivíduo para tratamento com a ter- apia de combinação fornecida é ou é identificado como exibindo uma ou mais características de alto risco da doença ou condição e/ou exibe uma doença agressiva ou uma doença associada a mau prognóstico ou re- sultado. Em alguns aspectos, características de alto risco de uma ma- lignidade de células B, como um linfoma ou uma leucemia, por exemplo, CLL ou SLL, incluem a presença de um ou mais marcadores molecula- res, como um ou mais marcadores genéticos, indicativos da gravidade ou prognóstico da doença (veja, por exemplo, Parker e Strout (2011) Discov. Med., 11: 115-23) Em algumas modalidades, o indivíduo tem uma malignidade de células B que é ou é identificada como tendo uma ou mais anormalidades citogenéticas, como duas ou três ou mais anor- malidades cromossômicas, como deleção 17p, deleção 11q, trissomia 12 e/ou deleção 13q, por exemplo, conforme detectado por hibridização fluorescente in situ (FISH). Em algumas modalidades, o indivíduo tem uma malignidade de células B que é ou é identificada como tendo uma ou mais mutações gênicas, como mutação TP53, mutação NOTCH1, mutação SF3B1 e mutação BIRC3, tal como avaliada usando um método baseado em arranjo único de nucleotídeos (SNP), Cromato- grafia Líquida de Alto Desempenho Desnaturante (DHPLC), análise fun- cional de alelos separados em levedura (FASAY) ou por sequencia- mento, incluindo sequenciamento direto ou métodos de sequencia- mento de geração seguinte. Em algumas modalidades, o indivíduo tem uma malignidade de células B que é ou é identificada como tendo uma região variável de cadeia pesada de imunoglobulina não mutada (IGHV). O estado de mutação da região variável de IGH tem valor prognóstico onde não mutado (<2 % em comparação com a linhagem germinativa) está associado à doença agressiva (Hamblin, Best Pract. Res. Clin. Haematol. 20: 455-468 (2007)). A expressão de CD38 e ZAP70, conforme avaliada por citometria de fluxo, são considerados substitutos para o status de mutação de IGH. Em algumas modalidades, o indivíduo tem uma malignidade de células B que exibe características de alto risco que incluem 3 ou mais anormalidades cromossômicas, deleção 17p, mutação TP53 e/ou IGHV não mutado.
[00167] Em algumas modalidades, a terapia de combinação forne- cida neste documento é para uso em um indivíduo com um câncer em que o indivíduo e/ou o câncer é resistente à inibição de BTK ou com- preende uma população de células que são resistentes à inibição pelo inibidor . Em algumas modalidades, o indivíduo exibe uma mutação em uma quinase alvo, como BTK, ou em uma molécula a jusante da via da quinase alvo, tornando o indivíduo resistente ao tratamento com o inibi- dor e/ou uma terapia com inibidor de BTK. As mutações que tornam um indivíduo resistente ou refratário ao tratamento com um inibidor de BTK ou outro inibidor de uma quinase da família TEC são conhecidas, veja, por exemplo, Woyach et al. (2014) N Engl J. Med. 370: 2286-94 e Liu et al. (2015) Blood, 126: 61-8. Em algumas modalidades, a terapia de com- binação aqui fornecida é para uso em um indivíduo com um câncer no qual o indivíduo e/ou o câncer compreende uma mutação ou interrupção em um ácido nucleico que codifica BTK, tal como uma mutação que é capaz de reduzir ou prevenir inibição do BTK pelo inibidor, por exemplo, ibrutinib. Em algumas modalidades, o indivíduo contém a mutação C481S de BTK. Em algumas modalidades, a terapia de combinação aqui fornecida é para uso em um indivíduo com um câncer no qual o indivíduo e/ou o câncer compreende uma mutação ou interrupção em um ácido nucleico que codifica PLCγ2, tal como uma mutação de ganho de função que pode levar à sinalização autônoma. Em algumas modal- idades, o indivíduo contém a mutação R665W e/ou L845F em PLCγ2.
[00168] Em alguns casos, após o tratamento com uma ou mais tera- pias anteriores, como pelo menos duas ou três terapias anteriores, para o tratamento do câncer, o indivíduo não atingiu uma resposta completa (RC), tem doença estável ou progressiva e/ou recaída após uma re- sposta a uma ou mais terapias anteriores. Em algumas modalidades, pelo menos uma das terapias anteriores era um tratamento anterior com o inibidor ou uma terapia com inibidor de BTK, como ibrutinib. Em algu- mas modalidades, o indivíduo estava recebendo o inibidor ou uma tera- pia com inibidor de BTK por pelo menos seis meses com uma resposta menor do que a uma RC e/ou exibe características de alto risco, como anormalidades citogenéticas complexas (3 ou mais anormalidades cromossômicas), deleção 17p, mutação TP53 ou IGHV não mutado.
[00169] Em algumas modalidades, certos cânceres, como NHL, por exemplo, LNH agressivo ou de alto risco, como DLBCL e/ou leucemia linfocítica crônica (LLC) podem estar associados a defeitos ou redução na funcionalidade intrínseca das células T, que, em alguns casos, é in- fluenciada pela própria doença. Por exemplo, a patogênese de muitos cânceres, como CLL e NHL, por exemplo, DLBCL, pode ser associado com imunodeficiência, levando à promoção do crescimento do tumor e evasão imune, tal como devido à imunossupressão de células T, por exemplo, conduzido por um ou mais fatores no microambiente tumoral. Em alguns casos, o alívio de defeitos intrínsecos de células T obtidos de cânceres de tais pacientes para uso em conexão com a terapia de células adotivas pode fornecer respostas mais potentes à terapia de células T adotivas, por exemplo, terapia com células T de CAR.
[00170] Em algumas modalidades, os métodos fornecidos são para o tratamento de um câncer em um indivíduo no qual as células T desse indivíduo exibem ou foram observadas para exibir um nível diminuído de um fator indicativo da função, saúde ou atividade das células T, em comparação a uma população de referência de células T ou um nível de referência ou limite, por exemplo, células T de um indivíduo que não tem ou é suspeito de ter câncer, como de um indivíduo saudável ou normal. Em algumas modalidades, os métodos fornecidos são para o tratamento de indivíduos identificados como tendo NHL de alto risco e/ou NHL agressivo, linfoma difuso de grandes células B (DLBCL), linfoma medi- astinal primário de grandes células B (PMBCL), linfoma de grandes célu- las B ricos em células T/histócitos (TCHRBCL), linfoma de Burkitt, lin- foma de células de revestimento (MCL) e/ou linfoma folicular (FL). Por exemplo, como mostrado aqui, na presença do inibidor de BTK exem- plar ibrutinib, as células T modificadas a partir de indivíduos com DLBCL exibem uma maior atividade funcional das células T, indicando que a função das células T é potencializada na presença do inibidor. Em algu- mas modalidades dos métodos fornecidos, as células T modificadas ad- ministradas são autólogas para o indivíduo. Em algumas modalidades, o indivíduo tem DLBCL. Em algumas modalidades, os métodos forneci- dos são para o tratamento de um indivíduo com leucemia linfocítica crônica (CLL). Em algumas modalidades, os métodos fornecidos são para o tratamento de um indivíduo com linfoma linfocítico pequeno
(SLL).
[00171] Entre os métodos fornecidos neste documento estão os métodos para o tratamento de CLL, que é uma malignidade hemato- lógica caracterizada por um acúmulo progressivo de linfócitos B deriva- dos clonalmente, por exemplo, CD19+, no sangue, medula óssea e te- cido linfático. Embora seja considerada a mesma doença que CLL, em alguns casos, o linfoma linfocítico pequeno (SLL) é usado para se referir à doença quando caracterizada por linfadenopatia (células cancerosas encontradas nos gânglios linfáticos), enquanto que na CLL as células cancerosas são encontradas principalmente no sangue e medula óssea. Para os fins deste documento, a referência a CLL pode incluir SLL, a menos que indicado de outra forma. Em algumas modalidades, CLL in- clui indivíduos que documentaram CLL de acordo com os critérios de IWCLL (Hallek (2008) Blood, 111: 5446-5456), doença mensurável (por exemplo, linfocitose > 5 x 109/L, nódulos linfáticos mensuráveis, hepático e/ou esplenomegalia) Em algumas modalidades, SLL inclui in- divíduos com linfadenopatia e/ou esplenomegalia e <5 x109 linfócitos CD19+ CD5+ B clonais/L (< 5000/µL) no sangue periférico no di- agnóstico com doença mensurável conforme determinado por pelo menos uma lesão > 1,5 cm no maior diâmetro transversal que é SLL comprovado por biópsia. Pacientes com LLC progressiva geralmente têm um prognóstico ruim com uma sobrevida global (OS) de menos de 1 ano, conforme relatado em alguns estudos (Jain et al. (2016) Expt. Rev. Hematol., 9: 793-801).
[00172] O tratamento de CLL com terapia com inibidor de BTK, e em particular ibrutinib, é uma terapia atualmente aprovada de primeira linha para pacientes com LLC. Embora as respostas parciais (RPs) possam ser sustentadas por um longo período, estudos que descobriram que cerca de 25 % dos pacientes com LLC previamente tratados descontin- uam o ibrutinib (Jain et al. (2015) Blood, 125: 2062-2067; Maddocks
(2015) JAMA Oncol ., 1: 80-87; Jain et al. (2017) Cancer, 123: 2268- 2273). Em alguns casos, a descontinuação do ibrutinib é devido à pro- gressão da CLL ou à transformação de Richter. A maioria dos pacientes que descontinuam o ibrutinib para doença progressiva (DP) são aqueles com características de alto risco, como del(17p) (deleção 17p), cariótipo complexo ou anormalidades citogenéticas e região variável da cadeia pesada de imunoglobulina não mutada (IGHV). Além disso, as mu- tações em BTK ou na fosfolipase efetora a jusante Cγ2 (PLCγ2) podem surgir durante o tratamento com ibrutinib e estão associadas à resistên- cia a ibrutinib e, em última instância, recaída (Woyach et al. (2014) N. Engl. J. Med., 370: 2286-2294). Essas mutações são observadas em 87 % dos pacientes com LLC com recidiva de ibrutinib. Há necessidade de terapias alternativas em tais assuntos.
[00173] Em algumas modalidades, o inibidor de quinase, como um inibidor de BTK/ITK, por exemplo, ibrutinib é inicialmente administrado antes de uma terapia com células T, por exemplo, células T de CAR. Em alguns aspectos, a administração do inibidor de quinase, como um inibidor de BTK/ITK, por exemplo, ibrutinib é continuado e/ou o inibidor da quinase, tal como um inibidor de BTK/ITK, por exemplo, O ibrutinib é ainda administrado concomitantemente e/ou após o início da admin- istração de uma terapia com células T, por exemplo, células T de CAR. Em alguns aspectos, o inibidor é administrado diariamente. Em alguns aspectos, a administração, tal como administração diária, de um inibidor de quinase, por exemplo, ibrutinib é iniciado, antes do início da admin- istração de uma terapia com células T, por exemplo, células T de CAR e é continuado por até um número predeterminado de dias. Em alguns aspectos, o número predeterminado de dias é um número predetermi- nado de dias após o início da administração da terapia com células T. Em algumas modalidades, o inibidor é administrado, tal como admin- istrado diariamente, até um momento em que ou até um momento após um nível de terapia com células T, células T de CAR, estar em um pico ou máximo, por exemplo, Cmax, nível após a administração das células T, por exemplo, células T que expressam CAR, no sangue ou sítio da doença do indivíduo.
Em alguns aspectos, a administração do inibidor, por exemplo, ibrutinib é continuado por pelo menos ou pelo menos cerca de 14 dias, pelo menos ou pelo menos cerca de 30 dias, pelo menos ou pelo menos cerca de 60 dias, pelo menos ou pelo menos cerca de 90 dias, pelo menos ou pelo menos cerca de 120 dias ou pelo menos ou pelo menos cerca de 180 dias após o início da administração da terapia com células T.
Em algumas modalidades, a administração do inibidor de quinase, por exemplo, ibrutinib é continuado durante pelo menos ou cerca de pelo menos ou cerca de ou 90 dias após o início da admin- istração da terapia com células T, por exemplo, células T de CAR.
Em alguns aspectos, no momento de terminar a administração do inibidor, a persistência da terapia com células T no indivíduo é observada.
Em algumas modalidades, no momento de terminar a administração do in- ibidor, o indivíduo pode ser avaliado para avaliar se o indivíduo está recebendo um benefício da administração do inibidor de quinase, por exemplo, ibrutinib.
Em algumas modalidades, no momento de encerrar a administração do inibidor, o indivíduo é avaliado para avaliar se o in- divíduo atingiu uma resposta ou um determinado grau ou resultado in- dicativo de uma resposta, como em algumas modalidades uma RC.
Em algumas de tais modalidades, se um indivíduo alcançou uma RC ou outro resultado indicativo de resposta ou indicativo de uma proba- bilidade de RC ou outro resultado, os métodos, composições, artigos de fabricação ou usos fornecidos permitem, especificam ou envolvem a descontinuação de o inibidor ou sua administração.
Em algumas de tais modalidades, se um indivíduo não atingiu uma RC, os métodos forneci- dos permitem a continuação da administração do inibidor.
Assim, em alguns aspectos, os métodos fornecidos e outras modalidades evitam ou reduzem a administração prolongada ou excessivamente prolongada do inibidor. Em alguns aspectos, tal administração prolongada pode re- sultar em, ou aumentar a probabilidade de, um ou mais resultados in- desejáveis, como efeitos colaterais ou interrupção ou redução na quali- dade de vida para o indivíduo ao qual a terapia está sendo administrada, tal como o paciente. Em alguns aspectos, um período de tempo prede- terminado definido, como período de tempo mínimo, de administração, pode aumentar a probabilidade de adesão do paciente ou a proba- bilidade de que o inibidor seja administrado como instrução ou de acordo com os métodos, particularmente no caso de administração diária.
[00174] Em algumas modalidades, a terapia de combinação é admin- istrada a um indivíduo e/ou um câncer que é resistente à inibição da tirosina quinase de Bruton (BTK) e/ou compreende uma população de células que são resistentes à inibição pelo inibidor. Em algumas modal- idades, a terapia de combinação é administrada a um indivíduo e/ou um câncer que compreende uma mutação em um ácido nucleico que codi- fica uma BTK, opcionalmente em que a mutação é capaz de reduzir ou prevenir a inibição do BTK pelo inibidor e/ou por ibrutinib, opcionalmente em que a mutação é C481S. Em algumas modalidades, a terapia de combinação é administrada a um indivíduo e/ou um câncer que com- preende uma mutação em um ácido nucleico que codifica fosfolipase C gama 2 (PLCgama2), opcionalmente em que a mutação resulta em ati- vidade de sinalização constitutiva, opcionalmente em que a mutação é R665W ou L845. Em algumas modalidades, a terapia de combinação é administrada a um indivíduo e/ou um câncer onde, no momento do início da administração do inibidor da quinase, tal como um inibidor de BTK/ITK, por exemplo, ibrutinib e no momento da iniciação de admin- istração da terapia com células T, o indivíduo teve uma recaída após remissão após o tratamento com, ou foi considerado refratário a um tratamento anterior com o inibidor e/ou com uma terapia com inibidor de BTK. Em algumas modalidades, a terapia de combinação é admin- istrada a um indivíduo e/ou um câncer onde, no momento do início da administração do inibidor da quinase, tal como um inibidor de BTK/ITK, por exemplo, ibrutinib e no momento da iniciação de administração da terapia com células T, o indivíduo progrediu após um tratamento anterior com o inibidor e/ou com uma terapia com inibidor de BTK, opcional- mente em que o indivíduo exibiu doença progressiva como a melhor resposta ao tratamento anterior ou progressão após a resposta anterior ao tratamento anterior. Em algumas modalidades, a terapia de com- binação é administrada a um indivíduo e/ou um câncer onde, no mo- mento do início da administração do inibidor de quinase, tal como um inibidor de BTK/ITK, por exemplo, ibrutinib e no momento do início da administração da terapia com células T, o indivíduo exibiu uma resposta menor do que a uma resposta completa (RC) após um tratamento ante- rior por pelo menos 6 meses com o inibidor e/ou com uma terapia com inibidor de BTK.
[00175] Em algumas modalidades, a terapia de combinação é admin- istrada a (i) o indivíduo e/ou o câncer (a) é resistente à inibição da ti- rosina quinase de Bruton (BTK) e/ou (b) compreende uma população de células que são resistente à inibição pelo inibidor; (ii) o indivíduo e/ou o câncer compreende uma mutação em um ácido nucleico que codifica uma BTK, capaz de reduzir ou prevenir a inibição do BTK pelo inibidor e/ou pelo ibrutinib, opcionalmente em que a mutação é C481S; (iii) o indivíduo e/ou o câncer compreende uma mutação em um ácido nucle- ico que codifica fosfolipase C gama 2 (PLCgama2), opcionalmente em que a mutação resulta em atividade de sinalização constitutiva, opcion- almente em que a mutação é R665W ou L845F; (iv) no momento do início da administração do inibidor de quinase, tal como um inibidor de
BTK/ITK, por exemplo, ibrutinib, e o início da administração da com- posição que compreende células T, o indivíduo teve uma recaída após remissão após um tratamento anterior com, ou foi considerado refratário a um tratamento anterior com o inibidor e/ou com uma terapia com in- ibidor de BTK; (v) no momento do início da administração do inibidor de quinase, tal como um inibidor de BTK/ITK, por exemplo, ibrutinib, e o início da administração da composição que compreende células T, o indivíduo progrediu após um tratamento anterior com o inibidor e/ou com uma terapia com inibidor de BTK, opcionalmente em que o indivíduo exibiu doença progressiva como a melhor resposta ao tratamento ante- rior ou progressão após resposta anterior ao tratamento anterior; e/ou (vi) no momento do início da administração do inibidor de quinase, tal como um inibidor de BTK/ITK, por exemplo, ibrutinib, e o início da ad- ministração da composição compreendendo células T, o indivíduo exi- biu uma resposta menor do que a uma resposta completa (RC) após um tratamento anterior por pelo menos 6 meses com o inibidor e/ou com uma terapia com inibidor de BTK. Em algumas modalidades, o indivíduo é um indivíduo que havia recebido anteriormente a administração de um inibidor da quinase, como um inibidor de BTK/ITK, por exemplo, ibru- tinib, e então descontinuou o tratamento com o inibidor da quinase.
[00176] Em algumas modalidades, os métodos, usos e artigos de fabricação envolvem, ou são usados para o tratamento de indivíduos envolvendo, selecionando ou identificando um determinado grupo ou subconjunto de indivíduos, por exemplo, com base em tipos específicos de doença, critérios de diagnóstico, tratamentos e/ou resposta a trata- mentos anteriores, tais como qualquer grupo de indivíduos conforme descrito. Em algumas modalidades, os métodos envolvem o tratamento de um indivíduo que teve uma recaída após a remissão após o trata- mento com, ou tornou-se refratário a, uma ou mais terapias anteriores; ou um indivíduo que teve uma recaída ou é refratário (R/R) a uma ou mais terapias anteriores, por exemplo, uma ou mais linhas de terapia padrão, por exemplo, uma terapia celular (por exemplo, células T de CAR+). Em algumas modalidades, os métodos envolvem o tratamento de indivíduos com linfoma difuso de grandes células B (DLBCL), não especificado de outra forma (NOS; de novo e transformado de indo- lente), linfoma mediastinal primário (tímico) de grandes células B (PMBCL) ou linfoma folicular (FL), opcionalmente, linfoma folicular Grau 3B (FL3B), DLBCL positivo para EBV ou NOS positivo para EBV. Em algumas modalidades, os métodos envolvem o tratamento de um indi- víduo que tem um status de desempenho do Eastern Cooperative On- cology Group (ECOG) menor do que a 1, como 0-1. Em algumas modal- idades, os métodos tratam uma população de mau prognóstico ou de pacientes DLBCL ou seu sujeito que geralmente responde mal a tera- pias ou terapias de referência particulares, como uma tendo uma ou mais, como duas ou três, translocações cromossômicas (como tal chamado de linfoma "duplo hit" ou "triplo hit", que é linfoma de células B de alto grau com rearranjos MYC e BCL2 e/ou BCL6 com histologia de DLBCL; tendo translocações MYC/8q24 loci, geralmente em com- binação com o t (14; 18) (q32; q21) gene bcl-2 ou/e translocação cromossômica BCL6/3q27; veja, por exemplo, Xu et al. (2013) Int J Clin Exp Pathol. 6 (4): 788-794), e/ou um tendo recaída, opcionalmente re- caída dentro de 12 meses, e/ou um tendo sido considerado quimior- refratário.
[00177] Em algumas modalidades, o indivíduo tem DLBCL que é um DLBCL semelhante a um centro germinativo (GCB). Em algumas modal- idades, o indivíduo tem um DLBCL não semelhante a um centro germi- nativo (não GCB). Em algumas modalidades, o indivíduo tem linfoma de duplo hit (DHL). Em algumas modalidades, o indivíduo tem um linfoma de triplo hit (THL). Em algumas modalidades, o indivíduo é positivo para a expressão de um gene indicativo da capacidade de resposta do trata- mento com um inibidor de quinase, como um inibidor de BTK/ITK, por exemplo, ibrutinib. Em algumas modalidades, o indivíduo é negativo para a expressão do gene. Veja Blood 2017 130: 4118.
[00178] Em algumas modalidades, o receptor de antígeno (por ex- emplo, CAR) se liga especificamente a um antígeno alvo associado à doença ou condição, tal como associado ao NHL. Em algumas modali- dades, o antígeno associado à doença ou distúrbio é selecionado a par- tir de CD20, CD19, CD22, ROR1, CD45, CD21, CD5, CD33, Igcapa, Iglambda, CD79a, CD79b ou CD30. Em algumas modalidades, o antígeno é CD19. Em algumas modalidades, o antígeno CD19 é um CD19 humano.
[00179] Em algumas modalidades, os métodos incluem a admin- istração da terapia celular e um inibidor de quinase, como um inibidor de BTK/ITK, por exemplo, ibrutinib, a um indivíduo, que está em risco ou suspeito de ter uma malignidade de células B.
[00180] Em algumas modalidades, os métodos incluem a admin- istração de células a um indivíduo selecionado ou identificado como tendo um certo prognóstico ou risco de NHL. O linfoma não Hodgkin (NHL) pode ser uma doença variável. Alguns indivíduos com NHL po- dem sobreviver sem tratamento, enquanto outros podem requerer inter- venção imediata. Em alguns casos, os indivíduos com NHL podem ser classificados em grupos que podem informar o prognóstico da doença e/ou estratégia de tratamento recomendada. Em alguns casos, esses grupos podem ser de "baixo risco", "risco intermediário", "alto risco" e/ou "risco muito alto" e os pacientes podem ser classificados como tal, de- pendendo de uma série de fatores, incluindo, mas não se limitando a, anomalias genéticas e/ou características morfológicas ou físicas. Em al- gumas modalidades, os indivíduos tratados de acordo com os métodos e/ou com os artigos de fabricação ou composições são classificados ou identificados com base no risco de NHL. Em algumas modalidades, o indivíduo é aquele que tem NHL de alto risco.
[00181] Em algumas modalidades, o indivíduo a ser tratado inclui um grupo de indivíduos com NHL agressivo, em particular, com linfoma difuso de grandes células B (DLBCL), não especificado de outra forma (NOS; de novo e transformado de indolente), T linfoma de células B grandes rico em células/histiócitos, linfoma de células B grandes de me- diastino primário (tímico) (PMBCL), linfoma folicular (FL), opcional- mente, linfoma folicular de Grau 3B (FL3B), DLBCL positivo para EBV, NOS positivo para EBV ou linfoma de células B de alto grau com rear- ranjos MYC e BCL2 e/ou BCL6 com histologia de DLBCL (linfoma de “duplo hit” ou “triplo hit”). Em algumas modalidades, a doença do indi- víduo recidivou ou foi refratária a pelo menos duas linhas anteriores de terapia. Em algumas modalidades, a terapia anterior compreende um agente direcionado a CD20 e/ou uma antraciclina. Em algumas modali- dades, o indivíduo é ou foi identificado como tendo um status de Status de Desempenho do Eastern Cooperative Oncology Group (ECOG) menor ou igual a 1. Em algumas modalidades, os indivíduos têm uma pontuação ECOG de 0-1 na triagem. Em algumas modalidades, os indi- víduos têm doença positiva para tomografia por emissão de pósitrons (PET) de acordo com a Classificação de Lugano (Cheson, 2014). Em algumas modalidades, o indivíduo pode, opcionalmente, ter sido tratado anteriormente com transplante alogênico de células-tronco (SCT).
[00182] Em algumas modalidades, o indivíduo é um adulto. Em algu- mas modalidades, os indivíduos são do sexo masculino. Em algumas modalidades, os indivíduos são do sexo feminino. Em algumas modali- dades, os indivíduos têm pelo menos 40 anos de idade no momento em que recebem a terapia de combinação (por exemplo, no momento em que recebem a terapia celular). Em algumas modalidades, os indivíduos têm menos de 40 anos no momento em que são administrados a terapia de combinação (por exemplo, no momento em que são administrados a terapia celular). Em algumas modalidades, os indivíduos têm cerca de 40-65 anos no momento em que são administrados a terapia de com- binação (por exemplo, no momento em que são administrados a terapia celular). Em algumas modalidades, os indivíduos têm pelo menos 65 anos de idade no momento em que recebem a terapia de combinação (por exemplo, no momento em que recebem a terapia celular).
[00183] Em algumas modalidades dos métodos fornecidos, uma ou mais propriedades de células administradas por engenharia genética podem ser melhoradas ou aumentadas ou maiores em comparação com as células administradas de uma composição de referência, tal como expansão e/ou persistência aumentada ou mais longa de tais células administradas no indivíduo ou uma resposta de recordação aumentada ou maior após a reestimulação com antígeno. Em algumas modali- dades, o aumento pode ser pelo menos 1,2 vezes, pelo menos 1,5 vezes, pelo menos 2 vezes, pelo menos 3 vezes, pelo menos 4 vezes, pelo menos 5 vezes, pelo menos 6 vezes, pelo menos 7 vezes, pelo menos 8 vezes, pelo menos 9 vezes ou pelo menos 10 vezes em tal propriedade ou característica em comparação com a mesma proprie- dade ou característica após a administração de uma composição de célula de referência. Em algumas modalidades, o aumento em uma ou mais de tais propriedades ou características pode ser observado ou está presente dentro de um mês, dois meses, três meses, quatro meses, cinco meses, seis meses ou 12 meses após a administração das células geneticamente modificadas.
[00184] Em algumas modalidades, uma composição de células de referência pode ser uma composição de células T do sangue de um in- divíduo que não tem ou não suspeita de ter câncer ou é uma população de células T obtida, isolada, gerada, produzida, incubada e/ou admin-
istrado nas mesmas condições ou substancialmente nas condições, ex- ceto não ter sido incubado ou administrado na presença de um inibidor da quinase, por exemplo, ibrutinib. Em algumas modalidades, a com- posição de células de referência contém células geneticamente modifi- cadas que são substancialmente as mesmas, incluindo a expressão do mesmo receptor recombinante, por exemplo, CAR. Em alguns aspectos, essas células T são tratadas de forma idêntica ou substancialmente idêntica, tal como fabricadas de forma semelhante, formuladas de forma semelhante, administradas na mesma ou aproximadamente na mesma quantidade de dosagem e outros fatores semelhantes. A. Administração de um Inibidor de Quinase
[00185] Os métodos, composições, combinações, kits e usos de ter- apia de combinação fornecidos envolvem a administração de um inibi- dor de quinase, como o inibidor de quinase da família TEC, por exemplo, ibrutinib, que pode ser administrado antes, subsequentemente, durante, simultaneamente ou quase simultaneamente, sequencialmente e/ou in- termitentemente com a administração da terapia com células T, por ex- emplo, administração de células T que expressam um receptor de antígeno quimérico (CAR) e/ou cuja administração pode começar antes da administração da terapia com células T e continuar até o início de administração da terapia com células T ou após o início da admin- istração da terapia com células T.
[00186] Em algumas modalidades, o inibidor de quinase na terapia de combinação é um inibidor de uma tirosina quinase, como um membro da família TEC de quinases que, em alguns casos, estão envolvidas nos mecanismos de sinalização intracelular de receptores de citocinas, su- perfície de linfócitos antígenos, receptores heterotriméricos acoplados à proteína G e moléculas de integrina. Em algumas modalidades, o inibi- dor de quinase na terapia de combinação é um inibidor de um ou mais membros da família TEC de quinases, incluindo tirosina quinase de Bru- ton (BTK), quinase de células T induzível por IL-2 (ITK), proteína tirosina quinase tec (TEC), gene da tirosina quinase da medula óssea na proteína do cromossoma X (BMX) não receptor da tirosina quinase (tam- bém conhecido como tirosina quinase epitelial e endotelial; ETK) e ti- rosina quinase TXK (TXK). Em algumas modalidades, o inibidor da quinase é um inibidor da tirosina quinase de Bruton (BTK). Em algumas modalidades, o inibidor da quinase é um inibidor da quinase de células T induzível por IL-2 (ITK). Em algumas modalidades, o inibidor de quinase é um inibidor de BTK e ITK, como ibrutinib.
[00187] Em algumas modalidades, o inibidor da quinase é um inibidor irreversível de uma ou mais quinases da família TEC. Em algumas modalidades, o inibidor da quinase é um inibidor irreversível de BTK. Em algumas modalidades, o inibidor da quinase é um inibidor irre- versível de ITK.
[00188] Em algumas modalidades, o inibidor da quinase inibe BTK com metade da concentração inibidora máxima (IC50) menor do que ou menor do que cerca de 1000 nM, menor do que ou menor do que cerca de 900 nM, menor do que ou menor do que cerca de 800 nM, menor do que ou menor do que cerca de 700 nM, menor do que ou menor do que cerca de 600 nM, menor do que ou menor do que cerca de 500 nM, menor do que ou menor do que cerca de 400 nM, menor do que ou menor do que cerca de 300 nM, menor do que ou menor do que cerca de 200 nM, menor do que ou menor do que cerca de 100 nM, menor do que ou menor do que cerca de 90 nM, menor do que ou menor do que cerca de 80 nM, menor do que ou menor do que cerca de 70 nM, menor do que ou menor do que cerca de 60 nM, menor do que ou menor do que cerca de 50 nM, menor do que ou menor do que cerca de 40 nM, menor do que ou menor do que cerca de 30 nM, menor do que ou menor do que cerca de 20 nM, menor do que ou menor do que cerca de 10 nM,
menor do que ou menor do que cerca de 9 nM, menor do que ou menor do que cerca de 8 nM, menor do que ou menor do que cerca de 7 nM, menor do que ou menor do que cerca de 6 nM, menor do que ou menor do que cerca de 5 nM, menor do que ou menor do que cerca de 4 nM, menor do que ou menor do que cerca de 3 nM, menor do que ou menor do que cerca de 2 nM, menor do que ou menor do que cerca de 1 nM, menor do que ou menor do que cerca de 0,9 nM, menor do que ou menor do que cerca de 0,8 nM, menor do que ou menor do que cerca de 0,7 nM, menor do que ou menor do que cerca de 0,6 nM, menor do que ou menor do que cerca de 0,5 nM, menor do que ou menor do que cerca de 0,4 nM, menor do que ou menor do que cerca de 0,3 nM, menor do que ou menor do que cerca de 0,2 nM, ou menor do que ou menor do que cerca de 0,1 nM.
[00189] Em algumas modalidades, o inibidor de quinase liga-se a BTK com uma constante de dissociação de equilíbrio (Kd) menor do que ou menor do que cerca de 1000 nM, menor do que ou menor do que cerca de 900 nM, menor do que ou menor do que cerca de 800 nM, menor do que ou menor do que cerca de 700 nM, menor do que ou menor do que cerca de 600 nM, menor do que ou menor do que cerca de 500 nM, menor do que ou menor do que cerca de 400 nM, menor do que ou menor do que cerca de 300 nM, menor do que ou menor do que cerca de 200 nM, menor do que ou menor do que cerca de 100 nM, menor do que ou menor do que cerca de 90 nM, menor do que ou menor do que cerca de 80 nM, menor do que ou menor do que cerca de 70 nM, menor do que ou menor do que cerca de 60 nM, menor do que ou menor do que cerca de 50 nM, menor do que ou menor do que cerca de 40 nM, menor do que ou menor do que cerca de 30 nM, menor do que ou menor do que cerca de 20 nM, menor do que ou menor do que cerca de 10 nM, menor do que ou menor do que cerca de 9 nM, menor do que ou menor do que cerca de 8 nM, menor do que ou menor do que cerca de 7 nM,
menor do que ou menor do que cerca de 6 nM, menor do que ou menor do que cerca de 5 nM, menor do que ou menor do que cerca de 4 nM, menor do que ou menor do que cerca de 3 nM, menor do que ou menor do que cerca de 2 nM, menor do que ou menor do que cerca de 1 nM, menor do que ou menor do que cerca de 0,9 nM, menor do que ou menor do que cerca de 0,8 nM, menor do que ou menor do que cerca de 0,7 nM, menor do que ou menor do que cerca de 0,6 nM, menor do que ou menor do que cerca de 0,5 nM, menor do que ou menor do que cerca de 0,4 nM, menor do que ou menor do que cerca de 0,3 nM, menor do que ou menor do que cerca de 0,2 nM, ou menor do que ou menor do que cerca de 0,1 nM.
[00190] Em algumas modalidades, a constante de inibição (Ki) do in- ibidor de quinase para BTK é menor ou menor que cerca de 1000 nM, menor do que ou menor do que cerca de 900 nM, menor do que ou menor do que cerca de 800 nM, menor do que ou menor do que cerca de 700 nM, menor do que ou menor do que cerca de 600 nM, menor do que ou menor do que cerca de 500 nM, menor do que ou menor do que cerca de 400 nM, menor do que ou menor do que cerca de 300 nM, menor do que ou menor do que cerca de 200 nM, menor do que ou menor do que cerca de 100 nM, menor do que ou menor do que cerca de 90 nM, menor do que ou menor do que cerca de 80 nM, menor do que ou menor do que cerca de 70 nM, menor do que ou menor do que cerca de 60 nM, menor do que ou menor do que cerca de 50 nM, menor do que ou menor do que cerca de 40 nM, menor do que ou menor do que cerca de 30 nM, menor do que ou menor do que cerca de 20 nM, menor do que ou menor do que cerca de 10 nM, menor do que ou menor do que cerca de 9 nM, menor do que ou menor do que cerca de 8 nM, menor do que ou menor do que cerca de 7 nM, menor do que ou menor do que cerca de 6 nM, menor do que ou menor do que cerca de 5 nM, menor do que ou menor do que cerca de 4 nM, menor do que ou menor do que cerca de 3 nM, menor do que ou menor do que cerca de 2 nM, menor do que ou menor do que cerca de 1 nM, menor do que ou menor do que cerca de 0,9 nM, menor do que ou menor do que cerca de 0,8 nM, menor do que ou menor do que cerca de 0,7 nM, menor do que ou menor do que cerca de 0,6 nM, menor do que ou menor do que cerca de 0,5 nM, menor do que ou menor do que cerca de 0,4 nM, menor do que ou menor do que cerca de 0,3 nM, menor do que ou menor do que cerca de 0,2 nM, ou menor do que ou menor do que cerca de 0,1 nM.
[00191] Em algumas modalidades, o inibidor da quinase inibe ITK com metade da concentração inibidora máxima (IC50) menor do que ou menor do que cerca de 1000 nM, menor do que ou menor do que cerca de 900 nM, menor do que ou menor do que cerca de 800 nM, menor do que ou menor do que cerca de 700 nM, menor do que ou menor do que cerca de 600 nM, menor do que ou menor do que cerca de 500 nM, menor do que ou menor do que cerca de 400 nM, menor do que ou menor do que cerca de 300 nM, menor do que ou menor do que cerca de 200 nM, menor do que ou menor do que cerca de 100 nM, menor do que ou menor do que cerca de 90 nM, menor do que ou menor do que cerca de 80 nM, menor do que ou menor do que cerca de 70 nM, menor do que ou menor do que cerca de 60 nM, menor do que ou menor do que cerca de 50 nM, menor do que ou menor do que cerca de 40 nM, menor do que ou menor do que cerca de 30 nM, menor do que ou menor do que cerca de 20 nM, menor do que ou menor do que cerca de 10 nM, menor do que ou menor do que cerca de 9 nM, menor do que ou menor do que cerca de 8 nM, menor do que ou menor do que cerca de 7 nM, menor do que ou menor do que cerca de 6 nM, menor do que ou menor do que cerca de 5 nM, menor do que ou menor do que cerca de 4 nM, menor do que ou menor do que cerca de 3 nM, menor do que ou menor do que cerca de 2 nM, menor do que ou menor do que cerca de 1 nM, menor do que ou menor do que cerca de 0,9 nM, menor do que ou menor do que cerca de 0,8 nM, menor do que ou menor do que cerca de 0,7 nM, menor do que ou menor do que cerca de 0,6 nM, menor do que ou menor do que cerca de 0,5 nM, menor do que ou menor do que cerca de 0,4 nM, menor do que ou menor do que cerca de 0,3 nM, menor do que ou menor do que cerca de 0,2 nM, ou menor do que ou menor do que cerca de 0,1 nM.
[00192] Em algumas modalidades, o inibidor de quinase liga-se a ITK com uma constante de dissociação de equilíbrio (Kd) menor do que ou menor do que cerca de 1000 nM, menor do que ou menor do que cerca de 900 nM, menor do que ou menor do que cerca de 800 nM, menor do que ou menor do que cerca de 700 nM, menor do que ou menor do que cerca de 600 nM, menor do que ou menor do que cerca de 500 nM, menor do que ou menor do que cerca de 400 nM, menor do que ou menor do que cerca de 300 nM, menor do que ou menor do que cerca de 200 nM, menor do que ou menor do que cerca de 100 nM, menor do que ou menor do que cerca de 90 nM, menor do que ou menor do que cerca de 80 nM, menor do que ou menor do que cerca de 70 nM, menor do que ou menor do que cerca de 60 nM, menor do que ou menor do que cerca de 50 nM, menor do que ou menor do que cerca de 40 nM, menor do que ou menor do que cerca de 30 nM, menor do que ou menor do que cerca de 20 nM, menor do que ou menor do que cerca de 10 nM, menor do que ou menor do que cerca de 9 nM, menor do que ou menor do que cerca de 8 nM, menor do que ou menor do que cerca de 7 nM, menor do que ou menor do que cerca de 6 nM, menor do que ou menor do que cerca de 5 nM, menor do que ou menor do que cerca de 4 nM, menor do que ou menor do que cerca de 3 nM, menor do que ou menor do que cerca de 2 nM, menor do que ou menor do que cerca de 1 nM, menor do que ou menor do que cerca de 0,9 nM, menor do que ou menor do que cerca de 0,8 nM, menor do que ou menor do que cerca de 0,7 nM, menor do que ou menor do que cerca de 0,6 nM, menor do que ou menor do que cerca de 0,5 nM, menor do que ou menor do que cerca de 0,4 nM, menor do que ou menor do que cerca de 0,3 nM, menor do que ou menor do que cerca de 0,2 nM, ou menor do que ou menor do que cerca de 0,1 nM.
[00193] Em algumas modalidades, a constante de inibição (Ki) do in- ibidor de quinase para ITK é menor ou menor que cerca de 1000 nM, menor do que ou menor do que cerca de 900 nM, menor do que ou menor do que cerca de 800 nM, menor do que ou menor do que cerca de 700 nM, menor do que ou menor do que cerca de 600 nM, menor do que ou menor do que cerca de 500 nM, menor do que ou menor do que cerca de 400 nM, menor do que ou menor do que cerca de 300 nM, menor do que ou menor do que cerca de 200 nM, menor do que ou menor do que cerca de 100 nM, menor do que ou menor do que cerca de 90 nM, menor do que ou menor do que cerca de 80 nM, menor do que ou menor do que cerca de 70 nM, menor do que ou menor do que cerca de 60 nM, menor do que ou menor do que cerca de 50 nM, menor do que ou menor do que cerca de 40 nM, menor do que ou menor do que cerca de 30 nM, menor do que ou menor do que cerca de 20 nM, menor do que ou menor do que cerca de 10 nM, menor do que ou menor do que cerca de 9 nM, menor do que ou menor do que cerca de 8 nM, menor do que ou menor do que cerca de 7 nM, menor do que ou menor do que cerca de 6 nM, menor do que ou menor do que cerca de 5 nM, menor do que ou menor do que cerca de 4 nM, menor do que ou menor do que cerca de 3 nM, menor do que ou menor do que cerca de 2 nM, menor do que ou menor do que cerca de 1 nM, menor do que ou menor do que cerca de 0,9 nM, menor do que ou menor do que cerca de 0,8 nM, menor do que ou menor do que cerca de 0,7 nM, menor do que ou menor do que cerca de 0,6 nM, menor do que ou menor do que cerca de 0,5 nM, menor do que ou menor do que cerca de 0,4 nM, menor do que ou menor do que cerca de 0,3 nM, menor do que ou menor do que cerca de 0,2 nM, ou menor do que ou menor do que cerca de 0,1 nM.
[00194] Em algumas modalidades, o inibidor da quinase inibe BTK e ITK. Em algumas modalidades, o inibidor de quinase inibe BTK e ITK com uma concentração inibidora de metade da máxima (IC50) menor ou igual a cerca de 1000 nM, menor do que ou menor do que cerca de 900 nM, menor do que ou menor do que cerca de 800 nM, menor do que ou menor do que cerca de 700 nM, menor do que ou menor do que cerca de 600 nM, menor do que ou menor do que cerca de 500 nM, menor do que ou menor do que cerca de 400 nM, menor do que ou menor do que cerca de 300 nM, menor do que ou menor do que cerca de 200 nM, menor do que ou menor do que cerca de 100 nM, menor do que ou menor do que cerca de 90 nM, menor do que ou menor do que cerca de 80 nM, menor do que ou menor do que cerca de 70 nM, menor do que ou menor do que cerca de 60 nM, menor do que ou menor do que cerca de 50 nM, menor do que ou menor do que cerca de 40 nM, menor do que ou menor do que cerca de 30 nM, menor do que ou menor do que cerca de 20 nM, menor do que ou menor do que cerca de 10 nM, menor do que ou menor do que cerca de 9 nM, menor do que ou menor do que cerca de 8 nM, menor do que ou menor do que cerca de 7 nM, menor do que ou menor do que cerca de 6 nM, menor do que ou menor do que cerca de 5 nM, menor do que ou menor do que cerca de 4 nM, menor do que ou menor do que cerca de 3 nM, menor do que ou menor do que cerca de 2 nM, menor do que ou menor do que cerca de 1 nM, menor do que ou menor do que cerca de 0,9 nM, menor do que ou menor do que cerca de 0,8 nM, menor do que ou menor do que cerca de 0,7 nM, menor do que ou menor do que cerca de 0,6 nM, menor do que ou menor do que cerca de 0,5 nM, menor do que ou menor do que cerca de 0,4 nM, menor do que ou menor do que cerca de 0,3 nM, menor do que ou menor do que cerca de 0,2 nM, ou menor do que ou menor do que cerca de 0,1 nM.
[00195] Em algumas modalidades, o inibidor de quinase liga-se a BTK e ITK com uma constante de dissociação de equilíbrio (Kd) menor do que ou menor do que cerca de 1000 nM, menor do que ou menor do que cerca de 900 nM, menor do que ou menor do que cerca de 800 nM, menor do que ou menor do que cerca de 700 nM, menor do que ou menor do que cerca de 600 nM, menor do que ou menor do que cerca de 500 nM, menor do que ou menor do que cerca de 400 nM, menor do que ou menor do que cerca de 300 nM, menor do que ou menor do que cerca de 200 nM, menor do que ou menor do que cerca de 100 nM, menor do que ou menor do que cerca de 90 nM, menor do que ou menor do que cerca de 80 nM, menor do que ou menor do que cerca de 70 nM, menor do que ou menor do que cerca de 60 nM, menor do que ou menor do que cerca de 50 nM, menor do que ou menor do que cerca de 40 nM, menor do que ou menor do que cerca de 30 nM, menor do que ou menor do que cerca de 20 nM, menor do que ou menor do que cerca de 10 nM, menor do que ou menor do que cerca de 9 nM, menor do que ou menor do que cerca de 8 nM, menor do que ou menor do que cerca de 7 nM, menor do que ou menor do que cerca de 6 nM, menor do que ou menor do que cerca de 5 nM, menor do que ou menor do que cerca de 4 nM, menor do que ou menor do que cerca de 3 nM, menor do que ou menor do que cerca de 2 nM, menor do que ou menor do que cerca de 1 nM, menor do que ou menor do que cerca de 0,9 nM, menor do que ou menor do que cerca de 0,8 nM, menor do que ou menor do que cerca de 0,7 nM, menor do que ou menor do que cerca de 0,6 nM, menor do que ou menor do que cerca de 0,5 nM, menor do que ou menor do que cerca de 0,4 nM, menor do que ou menor do que cerca de 0,3 nM, menor do que ou menor do que cerca de 0,2 nM, ou menor do que ou menor do que cerca de 0,1 nM.
[00196] Em algumas modalidades, a constante de inibição (Ki) do in- ibidor de quinase para BTK e ITK é menor ou menor que cerca de 1000 nM, menor do que ou menor do que cerca de 900 nM, menor do que ou menor do que cerca de 800 nM, menor do que ou menor do que cerca de 700 nM, menor do que ou menor do que cerca de 600 nM, menor do que ou menor do que cerca de 500 nM, menor do que ou menor do que cerca de 400 nM, menor do que ou menor do que cerca de 300 nM, menor do que ou menor do que cerca de 200 nM, menor do que ou menor do que cerca de 100 nM, menor do que ou menor do que cerca de 90 nM, menor do que ou menor do que cerca de 80 nM, menor do que ou menor do que cerca de 70 nM, menor do que ou menor do que cerca de 60 nM, menor do que ou menor do que cerca de 50 nM, menor do que ou menor do que cerca de 40 nM, menor do que ou menor do que cerca de 30 nM, menor do que ou menor do que cerca de 20 nM, menor do que ou menor do que cerca de 10 nM, menor do que ou menor do que cerca de 9 nM, menor do que ou menor do que cerca de 8 nM, menor do que ou menor do que cerca de 7 nM, menor do que ou menor do que cerca de 6 nM, menor do que ou menor do que cerca de 5 nM, menor do que ou menor do que cerca de 4 nM, menor do que ou menor do que cerca de 3 nM, menor do que ou menor do que cerca de 2 nM, menor do que ou menor do que cerca de 1 nM, menor do que ou menor do que cerca de 0,9 nM, menor do que ou menor do que cerca de 0,8 nM, menor do que ou menor do que cerca de 0,7 nM, menor do que ou menor do que cerca de 0,6 nM, menor do que ou menor do que cerca de 0,5 nM, menor do que ou menor do que cerca de 0,4 nM, menor do que ou menor do que cerca de 0,3 nM, menor do que ou menor do que cerca de 0,2 nM, ou menor do que ou menor do que cerca de 0,1 nM.
[00197] Em algumas modalidades, a IC50, Kd e/ou Ki é medida ou determinada usando um ensaio in vitro. Os ensaios para avaliar ou quantificar ou medir a atividade dos inibidores da proteína tirosina quinase, conforme descrito, são conhecidos na técnica. Esses ensaios podem ser realizados in vitro e incluem ensaios para avaliar a capaci- dade de um agente para inibir uma função biológica ou bioquímica es- pecífica.
Em algumas modalidades.
Em algumas modalidades, estudos de atividade de quinase podem ser realizados.
As proteínas tirosina quinases catalisam a transferência do grupo fosfato terminal do trifosfato de adenosina (ATP) para o grupo hidroxila de um resíduo de tirosina da própria quinase ou outro substrato de proteína.
Em algumas modali- dades, a atividade da quinase pode ser medida incubando a quinase com o substrato (por exemplo, inibidor) na presença de ATP.
Em algu- mas modalidades, a medição do substrato fosforilado por uma quinase específica pode ser avaliada por vários sistemas repórter, incluindo de- tecção colorimétrica, radioativa e fluorométrica. (Johnson, SA & T.
Hunter (2005) Nat.
Methods 2:17.) Em algumas modalidades, os inibi- dores podem ser avaliados quanto à sua afinidade por uma quinase ou quinases em particular, como por meio do uso de ensaios de ligação de ligante de competição (Ma et al., Expert Opin Drug Discov. 2008 Jun; 3 (6): 607-621) A partir desses ensaios, pode-se calcular a metade da concentração inibidora máxima (IC50). IC50 é a concentração que reduz uma resposta ou função biológica ou bioquímica em 50 % de seu máx- imo.
Em alguns casos, como em estudos de atividade de quinase, IC50 é a concentração do composto que é necessária para inibir a atividade de quinase alvo em 50 %. Em alguns casos, a constante de dissociação de equilíbrio (Kd) e/ou a constante de inibição (valores de Ki) podem ser determinadas adicionalmente ou alternativamente.
IC50 e Kd podem ser calculados por qualquer número de meios conhecidos na técnica.
A constante de inibição (valores Ki) pode ser calculada a partir dos valores IC50 e Kd de acordo com a equação de Cheng-Prusoff: Ki = IC50/(1+ L/Kd), onde L é a concentração do inibidor da quinase (Biochem Phar- macol 22: 3099-3108, 1973). Ki é a concentração do inibidor não mar- cado que causaria a ocupação de 50 % dos locais de ligação presentes na ausência do ligante ou de outros competidores.
[00198] Em algumas modalidades, o inibidor da quinase é uma mo- lécula pequena.
[00199] Em algumas modalidades, o inibidor da quinase é um inibidor de uma proteína tirosina quinase que tem um resíduo de cisteína aces- sível próximo ao sítio ativo da tirosina quinase. Em algumas modalida- des, o inibidor de quinase de uma ou mais quinases da família TEC forma uma ligação covalente com um resíduo de cisteína na proteína tirosina quinase. Em algumas modalidades, o resíduo de cisteína é um resíduo Cys 481. Em algumas modalidades, o resíduo de cisteína é um resíduo Cys 442. Em algumas modalidades, o inibidor de quinase é um inibidor de BTK irreversível que se liga a Cys 481. Em algumas modali- dades, o inibidor de quinase é um inibidor de ITK que se liga a Cys 442. Em algumas modalidades, o inibidor de quinase compreende uma fra- ção aceitadora de Michael que forma uma ligação covalente com o re- síduo de cisteína apropriado da tirosina quinase. Em algumas modali- dades, a fração aceitadora de Michael se liga preferencialmente à ca- deia lateral de cisteína apropriada da proteína tirosina quinase em rela- ção a outras moléculas biológicas que também contêm uma porção -SH avaliável.
[00200] Em algumas modalidades, o inibidor de quinase é um com- posto inibidor de ITK descrito nos Números de Pedido PCT WO2002/0500071, WO2005/070420, WO2005/079791, WO2007/076228, WO2007/058832, WO2004/016610, WO2004/016611, WO2004/016600, WO2004/016615, WO2005/026175, WO2006/065946, WO2007/027594, WO2007/017455, WO2008/025820, WO2008/025821, WO2008/025822, WO2011/017219, WO2011/090760, WO2009/158571, WO2009/051822, WO2014/082085,
WO2014/093383, WO2014/105958, e WO2014/145403, que são incor- porados por referência em sua totalidade. Em algumas modalidades, o inibidor de quinase é um composto inibidor de ITK descrito nos Números de Pedidos Norte-americanos US20110281850, US2014/0256704, US20140315909 e US20140303161, que são incorporados por referên- cia em sua totalidade. Em algumas modalidades, o inibidor de quinase é um composto inibidor de ITK descrito na Patente Norte-americana Nú- mero 8.759.358, que é incorporada por referência em sua totalidade.
[00201] Em algumas modalidades, o inibidor de quinase, como um inibidor de BTK/ITK, tem uma estrutura selecionada a partir de , , ,
, , , , , e .
[00202] Inibidores exemplares de BTK e/ou ITK são conhecidos na técnica. Em algumas modalidades, o inibidor é um inibidor, conforme descrito em Byrd et al., N Engl J Med. 2016;374(4):323–32; Cho et al., J Immunol. 2015, doi:10.4049/jimmunol.1501828; Zhong et. al., J. Biol. Chem., 2015, 290(10): 5960-78; Hendriks et al., Nature, 2014, 14: 219- 232; Akinleye et al., Journal of Hematology & Oncology 2013, 6:59; Wang et al., ACS Med Chem Lett. 2012 Jul 26; 3(9): 705-9; Howard et al., J Med Chem. 2009 Jan 22; 52(2):379-88; Anastassiasdis et al., Nat
Biotechnol. 2011 Oct 30; 29(11): 1039-45; Davis, et al., Nat Biotechnol, 2011; 29:1046-51; Bamborough et al., J Med Chem. 2008 Dec 25; 51(24):7898-914; Roth et al., J Med Chem. 2015; 58:1053-63; Galkin et al., Proc Natl Acad Sci U S A. 2007; 104:270-5; Singh et al., J Med Chem. 2012; 55:3614-43; Hall et al., J Med Chem. 2009 May 28; 52(10):3191-204; Zhou et al., Nature. 2009 Dec 24; 462(7276):1070-4; Zapf et al., J Med Chem. 2012; 55:10047-63; Shi et al., Bioorg Med Chem Lett, 2014; 24:2206-11; Illig, et al., J Med Chem. 2011; 54:7860- 83; e Publicação do pedido de patente Norte-americana nº:
20140371241.
[00203] Exemplos não limitantes de inibidor de quinase, como um ini- bidor de BTK/ITK incluem Ibrutinib (PL-32765); PRN694; Espebrutinibe (CC-292 ou AVL-292); PCI-45292; RN-486; Composto 2c; AT9283; BML-275; Dovitinibe (TKI258); Foretinibe (GSK1363089); Gö6976; Ini- bidor IX de GSK-3; Inibidor XIII de GSK-3; Hesperadina; IDR E804; K- 252a; Lestaurtinibe (CEP701); Nintedanibe (BIBF 1120); NVP-TAE684; R406; SB218078; Estaurosporina (AM-2282); Sunitinibe (SU11248); Ini- bidor Syk; WZ3146; WZ4002; BDBM50399459 (CHEMBL2179805); BDBM50399460 (CHEMBL2179804); BDBM50399458 (CHEMBL2179806); BDBM50399461 (CHEMBL2179790); BDBM50012060 (CHEMBL3263640); BDBM50355504 (CHEMBL1908393); BDBM50355499 (CHEMBL1908395::CHEMBL1908842).
[00204] Em algumas modalidades, o inibidor de quinase, como um inibidor de BTK/ITK é ou compreende ibrutinib. Em algumas modalida- des, o inibidor de quinase tem ou compreende a seguinte estrutura:
ou um enantiômero ou mistura de enantiôme- ros do mesmo, ou um sal, solvato, hidrato, cocristal, clatrato ou poli- morfo farmaceuticamente aceitável do mesmo. Em algumas modalida- des, o inibidor da quinase é ibrutinib e tem ou compreende a seguinte estrutura: ou um enantiômero ou mistura de enantiômeros do mesmo, ou um sal, solvato, hidrato, cocristal, clatrato ou polimorfo farmaceuticamente aceitável do mesmo.
[00205] Em algumas modalidades, o inibidor é um inibidor, conforme descrito na Patente US No. US 2014/0371241; US 2015/0140085; US 2015/0238490; US 2015/0352116; US 2015/0361504; US 2016/0022683; US 2016/0022684; US 2016/0038495; US 2016/0038496; US 2016/0287592; US 2017/0002009; US 2017/0079981; US 2017/0128448; US 2017/0209462; US 2017/0226108; US 2017/0226114; US 2017/0305914; US 2017/0360796; US 2017/0368173; US 2018/0009814; US 2018/0028537; US 2018/0051026; US 2018/0071293; US 2018/0071295; US 2018/0072737; US 7514444; US 8008309; US 8476284; US 8497277; US 8697711; US 8703780; US 8735403; US 8754090; US 8754091; US 8957079; US 8999999; US 9125889; US 9181257; US 9296753; US 9545407; US 9655857; US 9717731; US 9725455; US 9730938; US 9751889; e US 9884869. Em algumas mo- dalidades, o inibidor é ou compreende ibrutinib. Em alguns aspectos, o inibidor é ou compreende ibrutinib ou 1-[(3R)-3-[4-amino-3-(4-fenoxife- nil)pirazolo[3,4-d]pirimidin-1-il]piperidin-1-il]prop-2-en-1-ona (também conhecido como 1-[(3R)-3-[4-Amino-3-(4-fenoxifenil)-1H-pirazolo[3,4- d]pirimidin-1-il]-1-piperidinil]-2-propen-1-ona; 1-[(3R)-3-[4-amino-3-(4- fenoxifenil)pirazolo[3,4-d]pirimidin-1-il]piperidin-1-il]prop-2-en-1-ona; 1- ((3R)-3-(4-amino-3-(4-fenoxifenil)-1H-pirazolo(3,4-d)pirimidin-1-il)-1-pi- peridinil)-2-propen-1-ona; 936563-96-1; PCI-32765; IMBRUVICA; UNII- 1X70OSD4VX; PCI32765; CRA-032765; 1X70OSD4VX; ou CHEBI:76612). Em alguns aspectos, o inibidor é ou compreende 1- [(3R)-3-[4-amino-3-(4-fenoxifenil)pirazolo[3,4-d]pirimidin-1-il]piperidin-1- il]prop-2-en-1-ona (também conhecido como 1-[(3R)-3-[4-Amino-3-(4- fenoxifenil)-1H-pirazolo[3,4-d]pirimidin-1-il]-1-piperidinil]-2-propen-1- ona; 1-[(3R)-3-[4-amino-3-(4-fenoxifenil)pirazolo[3,4-d]pirimidin-1-il]pi- peridin-1-il]prop-2-en-1-ona; 1-((3R)-3-(4-amino-3-(4-fenoxifenil)-1H-pi- razolo(3,4-d)pirimidin-1-il)-1-piperidinil)-2-propen-1-ona; 936563-96-1; PCI-32765; IMBRUVICA; UNII-1X70OSD4VX; PCI32765; CRA-032765; 1X70OSD4VX; ou CHEBI:76612).
[00206] Em algumas modalidades, o inibidor de quinase, como um inibidor de BTK/ITK, o inibidor de quinase, como um inibidor de BTK/ITK, é um enantiômero ou uma mistura de enantiômeros de 1-[(3R)-3-[4- amino-3-(4-fenoxifenil)pirazolo[3,4-d]pirimidin-1-il]piperidin-1-il]prop-2- en-1-ona, ou um sal farmaceuticamente aceitável, solvato, hidrato, co- cristal, clatrato ou polimorfo de 1-[(3R)-3-[4-amino-3-(4-fenoxifenil)pira- zolo[3,4-d]pirimidin-1-il]piperidin-1-il]prop-2-en-1-ona. Em algumas mo- dalidades, o inibidor de quinase, como um inibidor de BTK/ITK, é um solvato de 1-[(3R)-3-[4-amino-3-(4-fenoxifenil)pirazol[3,4-d]pirimidin-1- il] piperidin-1-il]prop-2-en-1-ona. Em algumas modalidades, o inibidor de quinase, como um inibidor de BTK/ITK, é um hidrato de 1-[(3R)-3-[4- amino-3-(4-fenoxifenil)pirazol[3,4-d]pirimidin-1-il] piperidin-1-il] prop-2- en-1-ona. Em algumas modalidades, o inibidor de quinase, como um inibidor de BTK/ITK, é um sal farmaceuticamente aceitável de 1-[(3R)- 3-[4-amino-3-(4-fenoxifenil) pirazol[3,4-d]pirimidin-1-il]piperidin-1- il]prop-2-en-1-ona. Em algumas modalidades, o inibidor de quinase, como um inibidor de BTK/ITK, é 1-[(3R)-3-[4-amino-3-(4-fenoxifenil)pi- razolo[3,4-d]pirimidin-1-il]piperidin-1-il]prop-2-en-1-ona. Em algumas modalidades, o Composto 1 tem a estrutura da Fórmula I. Em certas modalidades, um inibidor de quinase, por exemplo, ibrutinib, é um só- lido. Em certas modalidades, um inibidor da quinase, por exemplo, ibru- tinib, é hidratado. Em certas modalidades, um inibidor de quinase, por exemplo, ibrutinib, é solvatado. Em certas modalidades, um inibidor de quinase, por exemplo, ibrutinib, é anidro. Em certas modalidades, um inibidor de quinase, por exemplo, ibrutinib, é não higroscópico.
[00207] Em certas modalidades, um inibidor de quinase, por exem- plo, ibrutinib, é amorfo. Em certas modalidades, um inibidor de quinase, por exemplo, ibrutinib, é cristalino. Em certas modalidades, o sólido um inibidor de quinase, por exemplo, ibrutinib, está em uma forma cristalina descrita na Patente Norte-americana No. 9.751.889, que é incorporada neste documento por referência em sua totalidade.
[00208] As formas sólidas de um inibidor de quinase, por exemplo, ibrutinib, podem ser preparadas de acordo com os métodos descritos na descrição de WO 2016/151438, US 9884869, US 2017/0226108; WO 2016/151438; WO 2017/134684; WO 2015/145415; WO 2017/137446; WO 2016/088074; WO 2017/134684; WO 2015/145415; WO 2017/085628; e WO 2017/134588 ou qualquer um ou método (s) dispo- nível (is) combinado (s).
[00209] Em algumas modalidades, um inibidor de quinase, por exem- plo, ibrutinib, fornecido aqui contém um centro quiral e pode existir como uma mistura de enantiômeros, por exemplo, uma mistura racêmica. Esta descrição abrange o uso de formas estereomericamente puras de tal composto, bem como o uso de misturas dessas formas. Por exemplo,
as misturas que compreendem quantidades iguais ou desiguais dos enantiômeros de um inibidor da quinase, por exemplo, ibrutinib, aqui for- necidas podem ser usadas em métodos e composições aqui descritas. Estes isômeros podem ser sintetizados assimetricamente ou resolvidos usando técnicas padrão, tais como colunas quirais ou agentes de reso- lução quirais. Veja, e.g., Jacques, J., et al, Enantiomers, Racemates and Resolutions (Wiley-Interscience, New York, 1981); Wilen, S. H., et al, Tetrahedron 33 :2725 (1977); Eliel, E. L., Stereochemistry of Carbon Compounds (McGraw-Hill, NY, 1962); e Wilen, S. H., Tables of Resolv- ing Agents and Optical Resolutions p. 268 (E L. Eliel, Ed., Univ. of Notre Dame Press, Notre Dame, IN, 1972).
[00210] Deve-se notar que se houver uma discrepância entre uma estrutura representada e um nome dado a essa estrutura, a estrutura representada deve receber mais peso. Além disso, se a estereoquímica de uma estrutura ou porção de uma estrutura não for indicada com, por exemplo, linhas em negrito ou tracejadas, a estrutura ou porção da es- trutura deve ser interpretada como abrangendo todos os estereoisôme- ros da estrutura.
1. Composições e formulações
[00211] Em algumas modalidades dos métodos de terapia combi- nada, composições, combinações, kits e usos fornecidos neste docu- mento, a terapia combinada pode ser administrada em uma ou mais composições, por exemplo, uma composição farmacêutica contendo um inibidor de quinase, tal como um inibidor de BTK/ITK, por exemplo, ibru- tinib.
[00212] Em algumas modalidades, a composição, por exemplo, uma composição farmacêutica contendo um inibidor de quinase, como um inibidor de BTK/ITK, por exemplo, ibrutinib, pode incluir veículos como um diluente, adjuvante, excipiente ou veículo com o qual uma quinase inibidor, como um inibidor de BTK/ITK, por exemplo, ibrutinib, e/ou as células são administradas. Exemplos de veículos farmacêuticos ade- quados são descritos em "Remington’s Pharmaceutical Sciences" por E. W. Martin. Tais composições conterão uma quantidade terapeutica- mente eficaz de um inibidor de quinase, tal como um inibidor de BTK/ITK, por exemplo, ibrutinib, geralmente na forma purificada, junta- mente com uma quantidade adequada de transportador de modo a for- necer a forma para administração adequada ao paciente. Esses veícu- los farmacêuticos podem ser líquidos estéreis, como água e óleos, in- cluindo os de petróleo, origem animal, vegetal ou sintética, como óleo de amendoim, óleo de soja, óleo mineral e óleo de gergelim. Soluções salinas e soluções aquosas de dextrose e glicerol também podem ser usadas como veículos líquidos, particularmente para soluções injetá- veis. As composições farmacêuticas podem conter qualquer um ou mais de diluente (s), adjuvante (s), antiaderente (s), aglutinante (s), revesti- mento (s), carga (s), sabor (es), cor (es), lubrificante (s), deslizante (s), conservante (s), detergente (s), sorvente (s), agente (s) emulsificante (s), excipiente (s) farmacêutico (s), agente (s) tampão de pH ou ado- çante (s) e uma combinação dos mesmos. Em algumas modalidades, a composição farmacêutica pode ser líquida, sólida, um pó liofilizado, na forma de gel e/ou uma combinação dos mesmos. Em alguns aspectos, a escolha do transportador é determinada em parte pelo inibidor parti- cular e/ou pelo método de administração.
[00213] Os veículos farmaceuticamente aceitáveis são geralmente não tóxicos para os destinatários nas dosagens e concentrações usa- das e incluem, mas não estão limitados a: tampões como fosfato, citrato e outros ácidos orgânicos; antioxidantes incluindo ácido ascórbico e me- tionina; conservantes (tais como cloreto de octadecildimetilbenzilamô- nio; cloreto de hexametônio; cloreto de benzalcônio; cloreto de benze- tônio; fenol, álcool butílico ou benzílico; alquilparabenos, tais como metil ou propilparabeno; catecol; resorcinol; ciclo-hexanol; 3-pentanol; e m-
cresol); polipeptídeos de baixo peso molecular (menos de cerca de 10 resíduos); proteínas, tais como albumina sérica, gelatina ou imunoglo- bulinas; polímeros hidrofílicos como polivinilpirrolidona; aminoácidos, tais como glicina, glutamina, asparagina, histidina, arginina ou lisina; monossacarídeos, dissacarídeos e outros carboidratos, incluindo gli- cose, manose ou dextrinas; agentes quelantes como EDTA; açúcares como sacarose, manitol, trealose ou sorbitol; contra-íons formadores de sal, tais como sódio; complexos de metal (por exemplo, complexos de proteína Zn); e/ou tensoativos não iônicos, tais como polietilenoglicol (PEG), estabilizantes e/ou conservantes. As composições contendo um inibidor de quinase, como um inibidor de BTK/ITK, por exemplo, ibruti- nib, também podem ser liofilizadas.
[00214] Em algumas modalidades, as composições farmacêuticas podem ser formuladas para administração por qualquer via conhecida pelos versados na técnica, incluindo injeção intramuscular, intravenosa, intradérmica, intralesional, intraperitoneal, subcutânea, intratumoral, epidural, nasal, oral, vaginal, administração retal, tópica, local, ótica, ina- latória, bucal (por exemplo, sublingual) e transdérmica ou qualquer via. Em algumas modalidades, outros modos de administração também são considerados. Em algumas modalidades, a administração é por infusão em bolo, por injeção, por exemplo, injeções intravenosas ou subcutâ- neas, injeção intraocular, injeção periocular, injeção subretiniana, inje- ção intravítrea, injeção trans-septal, injeção subescleral, injeção intraco- roidal, injeção intracameral, injeção subconjectval, injeção subconjunti- val, injeção subtenoniana, injeção retrobulbar, injeção peribulbar ou ad- ministração justascleral posterior. Em algumas modalidades, a adminis- tração é por parenteral, intrapulmonar e intranasal e, se desejado para tratamento local, administração intralesional. As infusões parenterais in- cluem administração intramuscular, intravenosa, intra-arterial, intraperi- toneal ou subcutânea. Em algumas modalidades, uma determinada dose é administrada por uma única administração de bolus. Em algumas modalidades, é administrado por múltiplas administrações de bolus, por exemplo, ao longo de um período de não mais de 3 dias, ou por admi- nistração de infusão contínua.
[00215] Em algumas modalidades, a administração pode ser local, tópica ou sistêmica, dependendo do local de tratamento. Em algumas modalidades, a administração local a uma área com necessidade de tratamento pode ser alcançada, por exemplo, mas não se limitando a, infusão local durante a cirurgia, aplicação tópica, por exemplo, em con- junto com um curativo após a cirurgia, por injeção, por meio de um ca- teter, por meio de um supositório, ou por meio de um implante. Em al- gumas modalidades, as composições também podem ser administradas com outros agentes biologicamente ativos, sequencialmente, de forma intermitente ou na mesma composição. Em algumas modalidades, a ad- ministração também pode incluir sistemas de liberação controlada, in- cluindo formulações de liberação controlada e liberação controlada de dispositivo, como por meio de uma bomba. Em algumas modalidades, a administração é oral.
[00216] Em algumas modalidades, um inibidor de quinase, como um inibidor de BTK/ITK, por exemplo, ibrutinib, é tipicamente formulado e administrado em formas de dosagem unitária ou formas de dosagem múltipla. Cada dose unitária contém uma quantidade predeterminada de um inibidor de quinase terapeuticamente ativo, por exemplo, ibrutinib, suficiente para produzir o efeito terapêutico desejado, em associação com o transportador, veículo ou diluente farmacêutico necessário. Em algumas modalidades, as formas de dosagem unitária incluem, mas não estão limitadas a, comprimidos, cápsulas, pílulas, pós, grânulos, solu- ções ou suspensões parenterais estéreis e soluções ou suspensões orais e emulsões em água e óleo contendo quantidades adequadas de um inibidor de quinase, por exemplo, ibrutinib. As formas de dosagem unitária podem conter ampolas e seringas ou comprimidos ou cápsulas embalados individualmente. As formas de dosagem unitária podem ser administradas em frações ou múltiplos das mesmas. Em algumas mo- dalidades, uma forma de dosagem múltipla é uma pluralidade de formas de dosagem unitária idênticas embaladas em um único recipiente para serem administradas na forma de dosagem unitária segregada. Exem- plos de formas de dosagem múltipla incluem frascos, frascos de com- primidos ou cápsulas ou frascos de quartilhos ou galões.
2. Dosagem
[00217] Em algumas modalidades, o método de terapia de combina- ção fornecido envolve a administração ao indivíduo de uma quantidade terapeuticamente eficaz de uma ou mais doses de um inibidor de qui- nase, como um inibidor de BTK/ITK, por exemplo, ibrutinib, e a terapia celular, como uma terapia com células T (por exemplo, células T que expressam CAR). Em algumas modalidades, os métodos de terapia de combinação fornecidos envolvem o início da administração de um inibi- dor de quinase, como um inibidor de BTK/ITK, por exemplo, ibrutinib, antes de, subsequentemente, durante, durante o curso de, simultanea- mente, quase simultaneamente, sequencialmente, concorrentemente e/ou intermitentemente com o início da terapia celular, como uma tera- pia com células T (por exemplo, células T que expressam CAR). Em algumas modalidades, o inibidor da quinase, por exemplo, ibrutinib, é administrado em doses múltiplas em intervalos regulares antes, du- rante, durante o curso e/ou após o período de administração da terapia celular (por exemplo, terapia com células T, como terapia com células T de CAR). Em algumas modalidades, as modalidades fornecidas envol- vem o início da administração de um inibidor de quinase, como um ini- bidor de BTK/ITK, por exemplo, ibrutinib, antes da administração da te- rapia com células T e continua até o início da administração da terapia com células T ou após o início da administração da terapia com células
T.
[00218] Em algumas modalidades, o método envolve a administra- ção do inibidor de quinase, como um inibidor de BTK/ITK, por exemplo, ibrutinib, antes da administração da terapia com células T. Em algumas modalidades, o método envolve continuar a administrar o inibidor de quinase, por exemplo, ibrutinib, após a administração da terapia com células T. Em algumas modalidades, o método envolve o início da ad- ministração do inibidor da quinase, como um inibidor de BTK/ITK, por exemplo, ibrutinib, antes do início da administração da terapia com cé- lulas T. Em algumas modalidades, o inibidor de quinase, por exemplo, ibrutinib, é ainda administrado, após uma descontinuação ou pausa du- rante uma terapia de linfodepleção, tal como até após o início da terapia com células T. Em algumas modalidades, a continuação e/ou adminis- tração adicional do inibidor de quinase, por exemplo, ibrutinib, envolve a administração de doses múltiplas do inibidor de quinase, por exemplo, ibrutinib. Em algumas modalidades, o inibidor da quinase, por exemplo, ibrutinib, não é mais administrado e/ou continuado após o início da te- rapia com células T. Em algumas modalidades, o cronograma de dosa- gem compreende continuar a administrar o inibidor da quinase, por exemplo, ibrutinib, antes e após o início da terapia com células T. Em algumas modalidades, o cronograma de dosagem compreende a admi- nistração do inibidor de quinase, por exemplo, ibrutinib, simultanea- mente com a administração da terapia com células T. Em algumas mo- dalidades, a administração do inibidor de quinase, por exemplo, ibruti- nib, é continuada e/ou administrada adicionalmente ao longo de um pe- ríodo de tempo, por exemplo, até um determinado ponto de tempo ou até que um determinado resultado seja alcançado. Em algumas moda- lidades, a administração do inibidor de quinase, por exemplo, ibrutinib, é descontinuada ou pausada por um período específico de tempo ou duração, por exemplo, durante a terapia de linfodepleção.
[00219] Em algumas modalidades, o inibidor da quinase, por exem- plo, ibrutinib, é administrado várias vezes em doses múltiplas.
Em algu- mas modalidades, o inibidor de quinase, por exemplo, ibrutinib, é admi- nistrado várias vezes ao longo de um período de tempo, por exemplo, até um determinado ponto de tempo ou até que um determinado resul- tado seja alcançado.
Em algumas modalidades, o inibidor da quinase, por exemplo, ibrutinib, é administrado uma vez.
Em algumas modalida- des, o inibidor de quinase, por exemplo, ibrutinib, é administrado seis vezes ao dia, cinco vezes ao dia, quatro vezes ao dia, três vezes ao dia, duas vezes ao dia, uma vez ao dia, a cada dois dias, a cada três dias, duas vezes por semana, uma vez por semana ou uma vez por mês an- tes ou posteriormente ao início da administração da terapia com células (por exemplo, terapia com células T, como a terapia com células T de CAR). Em algumas modalidades, o inibidor da quinase, por exemplo, ibrutinib, é administrado em doses múltiplas em intervalos regulares an- tes, durante, durante o curso e/ou após o período de administração da terapia celular (por exemplo, terapia com células T, como terapia com células T de CAR). Em algumas modalidades, o inibidor da quinase, por exemplo, ibrutinib, é administrado em uma ou mais doses em intervalos regulares antes da administração da terapia celular (por exemplo, tera- pia com células T, como terapia com células T de CAR). Em algumas modalidades, o inibidor da quinase, por exemplo, ibrutinib, é adminis- trado em uma ou mais doses em intervalos regulares após a adminis- tração da terapia celular (por exemplo, terapia com células T, como te- rapia com células T de CAR). Em algumas modalidades, uma ou mais das doses do inibidor de quinase, por exemplo, ibrutinib, podem ocorrer simultaneamente com a administração de uma dose da terapia celular (por exemplo, terapia de células T, como a terapia de células T de CAR). Em algumas modalidades, tais métodos podem incluir a administração do inibidor antes, simultaneamente, durante, durante o curso de (inclu- indo uma vez e/ou periodicamente durante o curso de), e/ou subsequen- temente, a administração (por exemplo, início de administração) da te- rapia com células T (por exemplo, células T que expressam CAR). Em algumas modalidades, as administrações podem envolver administra- ções sequenciais ou intermitentes do inibidor e/ou a terapia celular, por exemplo, terapia com células T.
[00220] Em algumas modalidades, a dose, frequência, duração, tempo e/ou ordem de administração do inibidor de quinase, como um inibidor de BTK/ITK, por exemplo, ibrutinib, é determinada com base em limites ou critérios de resultados de a etapa de triagem e/ou avaliação dos resultados do tratamento aqui descritos, por exemplo, nas Seções III e IV abaixo.
[00221] Em algumas modalidades, os métodos envolvem a adminis- tração da terapia celular a um indivíduo que foi anteriormente adminis- trado com uma quantidade terapeuticamente eficaz ou uma ou mais do- ses do inibidor de quinase, por exemplo, ibrutinib. Em algumas modali- dades, o inibidor de quinase, por exemplo, ibrutinib, é administrado a um indivíduo antes de administrar uma dose de células que expressam um receptor recombinante ao indivíduo. Em algumas modalidades, uma ou mais doses do inibidor de quinase, por exemplo, ibrutinib, são admi- nistradas ao mesmo tempo que o início da administração da dose de células. Em algumas modalidades, o inibidor da quinase, por exemplo, ibrutinib, é administrado após o início da administração da dose de cé- lulas. Em algumas modalidades, o inibidor é administrado em um mo- mento suficiente antes da terapia celular para que o efeito terapêutico da terapia de combinação seja aumentado. Em algumas modalidades, o método envolve a administração do inibidor de quinase, como um ini- bidor de BTK/ITK, por exemplo, ibrutinib, antes da administração da te-
rapia com células T. Em algumas modalidades, o método envolve a ad- ministração do inibidor da quinase, por exemplo, ibrutinib, após a admi- nistração da terapia com células T. Em algumas modalidades, o método envolve o início da administração do inibidor da quinase, como um ini- bidor de BTK/ITK, por exemplo, ibrutinib, antes do início da administra- ção da terapia com células T. Em algumas modalidades, o inibidor de quinase, por exemplo, ibrutinib, é continuado e/ou administrado após uma descontinuação ou pausa durante uma terapia de linfodepleção, tal como até após o início da terapia com células T. Em algumas modalida- des, o método envolve a administração contínua do inibidor de quinase, como um inibidor de BTK/ITK, por exemplo, ibrutinib. Em algumas mo- dalidades, a continuação e/ou administração adicional do inibidor de qui- nase, por exemplo, ibrutinib, envolve a administração de doses múltiplas do inibidor de quinase, por exemplo, ibrutinib. Em algumas modalidades, o inibidor de quinase, por exemplo, ibrutinib, não é continuado ou admi- nistrado apósda terapia com células T. Em algumas modalidades, o cro- nograma de dosagem compreende a administração do inibidor da qui- nase, por exemplo, ibrutinib, antes e após o início da terapia com células T. Em algumas modalidades, o cronograma de dosagem compreende a administração do inibidor de quinase, por exemplo, ibrutinib, simultane- amente com a administração da terapia com células T.
[00222] Em alguns aspectos, os métodos envolvem a administração do inibidor de quinase, por exemplo, ibrutinib, que é iniciado em ou pelo menos cerca de 3 dias ou um mínimo de ou cerca de 3 dias antes de obter uma amostra compreendendo células T do indivíduo, por exemplo, para produzir uma terapia de células T para administração. Em alguns aspectos, a terapia com células T é produzida por um processo que en- volve a obtenção de uma amostra compreendendo células T do indiví- duo e a introdução de uma molécula de ácido nucleico que codifica o CAR, como quaisquer moléculas de ácido nucleico aqui descritas, por exemplo, na Seção II.B, em uma composição que compreende as célu- las T. Em algumas modalidades, o inibidor da quinase, por exemplo, ibrutinib, é administrado em um regime de dosagem que compreende a administração por um período de tempo que se estende pelo menos até que a amostra seja obtida do indivíduo. Em alguns aspectos, a adminis- tração do inibidor de quinase, por exemplo, ibrutinib, é iniciada em ou pelo menos cerca de 3 dias ou um mínimo de ou cerca de 3 dias antes da obtenção da amostra do indivíduo, tal como pelo menos 3, 4, 5, 6 ou 7 dias antes da obtenção da amostra do indivíduo, e é realizada em um regime de dosagem que compreende a administração por um período de tempo que se estende pelo menos até que a amostra seja obtida do indivíduo.
[00223] Em algumas modalidades, os métodos e usos envolvem: (1) administrar a um indivíduo com câncer uma quantidade eficaz de um inibidor de quinase, por exemplo, ibrutinib ou um sal farmaceuticamente aceitável do mesmo; e (2) administrar uma terapia de células T autólo- gas ao indivíduo, a referida terapia de células T compreendendo uma dose de células T geneticamente modificadas que expressam um re- ceptor de antígeno quimérico (CAR) que se liga especificamente a um antígeno associado a uma doença ou distúrbio, por exemplo, qualquer aqui descrito. Em alguns aspectos, a terapia com células T é produzida por um processo que compreende a obtenção de uma amostra compre- endendo células T do indivíduo e a introdução de uma molécula de ácido nucleico que codifica o CAR, como quaisquer moléculas de ácido nu- cleico aqui descritas, por exemplo, na Seção II.B, em uma composição que compreende as células T. Em algumas modalidades, a administra- ção do inibidor de quinase é iniciada em ou pelo menos cerca de 3 dias ou um mínimo de ou cerca de 3 dias antes da obtenção da amostra do indivíduo, tal como pelo menos 3, 4, 5, 6 ou 7 dias antes da obtenção da amostra do indivíduo, e é realizada em um regime de dosagem que compreende a administração por um período de tempo que se estende pelo menos até que a amostra seja obtida do indivíduo.
[00224] Em alguns aspectos, os métodos e usos fornecidos envol- vem a administração a um indivíduo com câncer de uma quantidade eficaz de um inibidor de quinase, por exemplo, ibrutinib, ou um sal far- maceuticamente aceitável do mesmo, em que o indivíduo é um candi- dato para tratamento ou deve ser tratado com uma terapia de células T para o indivíduo. Em alguns aspectos, a terapia com células T compre- ende uma dose de células T geneticamente modificadas que expressam um receptor de antígeno quimérico (CAR) que se liga especificamente a um antígeno associado a uma doença ou distúrbio, por exemplo, qual- quer um aqui descrito. Em alguns aspectos, a terapia com células T é produzida por um processo que compreende a obtenção de uma amos- tra compreendendo células T do indivíduo e a introdução de uma molé- cula de ácido nucleico que codifica o CAR, como quaisquer moléculas de ácido nucleico aqui descritas, por exemplo, na Seção II.B, em uma composição que compreende as células T. Em alguns aspectos, a ad- ministração do inibidor de quinase, por exemplo, ibrutinib, e é iniciada em ou pelo menos cerca de 3 dias ou um mínimo de ou cerca de 3 dias antes da obtenção da amostra do indivíduo, tal como pelo menos 3, 4, 5, 6 ou 7 dias antes da obtenção da amostra do indivíduo, e é realizada em um regime de dosagem que compreende a administração por um período de tempo que se estende pelo menos até que a amostra seja obtida do indivíduo. Em alguns aspectos, os métodos e usos também envolvem a administração ao indivíduo da terapia com células T, por exemplo, uma composição compreendendo células T obtidas do indiví- duo que foram introduzidas com uma molécula de ácido nucleico que codifica um CAR.
[00225] Em algumas modalidades, os métodos e usos envolvem (1)
administrar a um indivíduo com câncer uma quantidade eficaz de inibi- dor de quinase, tal como um inibidor de BTK/ITK, por exemplo, ibrutinib ou um sal farmaceuticamente aceitável do mesmo; (2) administrar uma terapia de linfodepleção ao indivíduo; e (3) administrar uma terapia com células T autólogas ao indivíduo. Em alguns aspectos, a terapia com células T inclui uma dose de células T geneticamente modificadas que expressam um receptor de antígeno quimérico (CAR) que se liga espe- cificamente a um antígeno associado a uma doença ou distúrbio, por exemplo, qualquer um aqui descrito. Em algumas modalidades, a tera- pia com células T é produzida por um processo que compreende a ob- tenção de uma amostra compreendendo células T do indivíduo e a in- trodução de uma molécula de ácido nucleico que codifica o CAR, como quaisquer moléculas de ácido nucleico aqui descritas, por exemplo, na Seção II.B em uma composição que compreende as células T. Em al- gumas modalidades, a administração do inibidor de quinase, por exem- plo, ibrutinib, é iniciada pelo menos 3 dias, tal como pelo menos 3, 4, 5, 6 ou 7 dias, antes de obter a amostra e é realizada em um regime de dosagem compreendendo a administração do inibidor de quinase até o início da terapia de linfodepleção, descontinuação ou pausa da adminis- tração do inibidor de quinase durante a terapia de linfodepleção e reto- mada ou administração adicional do inibidor de quinase por um período que se estende por pelo menos 15 dias após o início da administração de a terapia com células T, tal como pelo menos em ou cerca de 15, 30, 60, 90, 120, 150 ou 180 dias ou mais após o início da administração da terapia com células T.
[00226] Em alguns aspectos, a administração do inibidor de quinase, por exemplo, ibrutinib, é iniciada por ou pelo menos cerca de 3 dias, por ou pelo menos cerca de 4 dias, por ou pelo menos cerca de 5 dias, por ou pelo menos 6 dias, um mínimo de ou cerca de 7 dias, pelo menos 14 dias ou mais antes de obter a amostra do indivíduo. Em algumas moda- lidades, a administração do inibidor de quinase, por exemplo, ibrutinib, é iniciada em ou pelo menos cerca de 5 dias a 7 dias antes da obtenção da amostra do indivíduo. Em alguns aspectos, a administração do inibi- dor de quinase, por exemplo, ibrutinib, é iniciada por um mínimo de ou cerca de 3 dias, um mínimo de ou cerca de 4 dias, um mínimo de ou cerca de 5 dias, um mínimo de ou cerca de 6 dias, um mínimo de ou cerca de 7 dias, um mínimo de ou cerca de 14 dias ou mais antes de obter a amostra do indivíduo. Em algumas modalidades, a administra- ção do inibidor de quinase, por exemplo, ibrutinib, é iniciada em ou pelo menos cerca de 4 dias, em ou pelo menos cerca de 5 dias, em ou pelo menos 6 dias, um mínimo de em ou cerca de 7 dias, em ou pelo menos 14 dias ou mais antes de obter a amostra do indivíduo. Em algumas modalidades, a administração do inibidor de quinase, por exemplo, ibru- tinib, é iniciada em ou pelo menos cerca de ou um mínimo de ou cerca de 5 dias a 7 dias antes da obtenção da amostra do indivíduo.
[00227] Em alguns aspectos, após o início da administração do inibi- dor de quinase, por exemplo, ibrutinib, e antes da administração da te- rapia com células T, o indivíduo foi precondicionado com uma terapia de linfodepleção. Em algumas modalidades, a terapia de linfodepleção inclui qualquer um aqui descrito, por exemplo, na Seção I.C. Em alguns aspectos, os métodos e usos envolvem a administração de uma terapia de linfodepleção ao indivíduo, após o início da administração do inibidor da quinase, por exemplo, ibrutinib, e antes da administração da terapia com células T. Em algumas modalidades dos métodos e usos, a admi- nistração do inibidor da quinase, por exemplo, ibrutinib, é interrompida durante a terapia de linfodepleção. Em alguns aspectos, o regime de dosagem para administrar o inibidor de quinase, por exemplo, ibrutinib, envolve a administração por um período de tempo que se estende pelo menos até o início da terapia de linfodepleção. Em alguns aspectos, o regime de dosagem para administrar o inibidor de quinase, por exemplo, ibrutinib, envolve a administração do inibidor de quinase até o início da terapia de linfodepleção, descontinuação da administração do inibidor de quinase durante a terapia de linfodepleção e retomada e/ou adminis- tração adicional de o inibidor de quinase por um período que se estende por pelo menos 15 dias após o início da administração da terapia com células T, tal como pelo menos por ou cerca de 15, 30, 60, 90, 120, 150 ou 180 dias ou mais após o início da administração da terapia com cé- lulas T.
[00228] Em algumas modalidades, a administração da terapia de lin- fodepleção é concluída 2 a 7 dias, como em cerca de 2, 3, 4, 5, 6 ou 7 dias, antes do início da administração da terapia com células T. Em al- gumas modalidades, a administração da terapia de linfodepleção é con- cluída em 7 dias antes do início da administração da terapia de células T.
[00229] Em algumas modalidades, o inibidor da quinase, por exem- plo, ibrutinib, é administrado antes e/ou concomitantemente com a ad- ministração da terapia celular (por exemplo, terapia com células T, como terapia com células T de CAR) e/ou subsequentemente a o início da administração da terapia celular. Em algumas modalidades, a adminis- tração do inibidor de quinase, por exemplo, ibrutinib é iniciada a partir a partir de ou a partir de cerca de 21 a ou cerca de 49 dias antes do início da administração da terapia celular, tal como a partir de ou a partir de cerca de 25 a ou cerca de 35 dias, de em ou cerca de 28 a cerca de 35 dias, de em ou cerca de 28 a ou cerca de 31 dias, ou em ou cerca de 21, 21, 22, 23, 24, 25, 26, 27, 28, 29, 30, 31, 32, 33, 34, 35, 36, 37, 38, 39, 40,, 42, 43, 44, 45, 46, 47, 48 ou 49 dias antes do início da adminis- tração da terapia com células T. Em algumas modalidades, a adminis- tração de um inibidor de quinase, por exemplo, ibrutinib, é iniciada em ou cerca de 14 a ou cerca de 35 dias antes do início da administração da terapia com células T. Em algumas modalidades, a administração de um inibidor da quinase, por exemplo, ibrutinib, é iniciada por volta de 21 ou cerca de 35 dias antes do início da administração da terapia com células T. Em algumas modalidades, a administração de um inibidor da quinase, por exemplo, ibrutinib, é iniciada por volta de 21 ou cerca de 28 dias antes do início da administração da terapia com células T. Em algumas modalidades, a administração de um inibidor de quinase, por exemplo, ibrutinib, é iniciada em ou cerca de 14 dias, em ou cerca de 15 dias, em ou cerca de 16 dias, em ou cerca de 17 dias, em ou cerca de 18 dias, em ou cerca de 19 dias, em ou cerca de 20 dias, em ou cerca de 21 dias, em ou cerca de 22 dias, em ou cerca de 23 dias, em ou cerca de 24 dias, em ou cerca de 25 dias, em ou cerca de 26 dias, em ou cerca de 27 dias, em ou cerca de 28 dias, em ou cerca de 29 dias, ou em cerca de 30 dias, em ou cerca de 31 dias, em ou cerca de 32 dias, em ou cerca de 33 dias, em ou cerca de 34 dias, ou em ou cerca de 35 dias antes início da administração da terapia com células T.
[00230] Em algumas modalidades, o inibidor de quinase, como um inibidor de BTK/ITK, por exemplo, ibrutinib, é administrado por uma du- ração ou um período de pelo menos cerca de 12 dias, pelo menos ou cerca de 14 dias, pelo menos ou pelo menos cerca de 15 dias, pelo menos ou cerca de pelo menos 21 dias, pelo menos ou pelo menos cerca de 24 dias, pelo menos ou cerca de 28 dias, pelo menos ou cerca de pelo menos 30 dias, pelo menos ou cerca de pelo menos 35 dias, pelo menos ou cerca de pelo menos 42 dias, ou pelo menos ou pelo menos cerca de 49 dias antes do início da administração da terapia ce- lular (por exemplo, terapia com células T, como uma terapia com células T de CAR).
[00231] Em algumas modalidades, o início da administração de um inibidor de quinase, por exemplo, ibrutinib, nos métodos de terapia de combinação fornecidos é antes do início da administração da terapia de células T, tal como antes de obter a amostra para engenharia de células do indivíduo, por exemplo, pelo menos por ou cerca de 3, 4, 5, 6, 7 dias ou mais antes de obter a amostra. Em alguns aspectos, a amostra para engenharia de células é obtida do indivíduo para geração ou produção de uma composição para terapia com células T. Em alguns aspectos, a terapia com células T compreendendo uma dose de células T genetica- mente modificadas que expressam um receptor de antígeno quimérico (CAR), como um CAR que se liga especificamente a um CD19, em que a terapia com células T é produzida por um processo que compreende a obtenção de uma amostra compreendendo células T do indivíduo e introduzindo uma molécula de ácido nucleico que codifica o CAR em uma composição que compreende as células T. Em algumas modalida- des, o início da administração de um inibidor de quinase, por exemplo, ibrutinib, nos métodos de terapia de combinação fornecidos é realizado antes de, como imediatamente antes de, ou pelo menos por cerca de 3, 4, 5, 6, 7 dias ou mais antes de obter a amostra do indivíduo. Em algu- mas modalidades, a administração de um inibidor de quinase, por exem- plo, ibrutinib, nos métodos de terapia de combinação fornecidos é con- tinuada após ou após o início da administração da terapia com células T.
[00232] Em algumas modalidades, a obtenção de uma amostra do indivíduo inclui a obtenção de uma amostra que é ou compreende uma amostra de sangue total, uma amostra de camada leucocitária, uma amostra de células mononucleares de sangue periférico (PBMC), uma amostra de células T não fracionadas, uma amostra de linfócitos, uma amostra de glóbulos brancos, um produto de aférese ou um produto de leucaferese. Em alguns aspectos, as células T, como células T CD4+ e/ou CD8+, podem ser obtidas a partir da amostra do indivíduo. Em al- gumas modalidades, a obtenção de uma amostra do indivíduo também é referida como aférese ou leucaferese. Em alguns aspectos, a obten- ção de uma amostra do indivíduo e/ou modificação subsequente das células, por exemplo, pela introdução de uma molécula de ácido nu- cleico que codifica o CAR, tal como quaisquer moléculas de ácido nu- cleico aqui descritas, por exemplo, na Seção II.B em uma composição compreendendo as células T na amostra obtida do indivíduo, são reali- zadas de acordo com os processos aqui descritos, por exemplo, na Se- ção II.C. Em algumas modalidades, a amostra é obtida do indivíduo a partir de ou a partir de cerca de 23 dias a cerca de 38 dias, tal como cerca de 28 dias a ou cerca de 32 dias, ou a ou cerca de 23, 24, 25, 26, 27, 28, 29, 30, 31, 32, 33, 34, 35, 36, 37 ou 38 dias, antes de iniciar a administração da terapia com células T. Em algumas modalidades, afé- rese ou leucaferese de ou cerca de 23 dias a cerca de 38 dias, tal como cerca de 28 dias a cerca de 32 dias, ou cerca de 23, 24, 25, 26, 27, 28, 29, 30, 31, 32, 33, 34, 35, 36, 37 ou 38 dias, antes de iniciar a adminis- tração da terapia com células T.
[00233] Em algumas modalidades, a administração do inibidor de quinase, por exemplo, ibrutinib, é iniciado em ou pelo menos cerca de 3 dias e/ou um mínimo de ou cerca de 3 dias antes da obtenção da amos- tra do indivíduo, tal como pelo menos cerca de 3, 4, 5, 6 ou 7 dias ou mais antes de obter o amostra do indivíduo (por exemplo, aférese ou leucaferese). Em algumas modalidades, a administração do inibidor de quinase, por exemplo, ibrutinib, é realizada em um regime de dosagem que compreende a administração por um período de tempo que se es- tende pelo menos até que a amostra seja obtida do indivíduo. Em algu- mas modalidades, a administração do inibidor de quinase, por exemplo, ibrutinib, é iniciada a partir a partir de ou a partir de cerca de 26 dias a cerca de 45 dias, tal como cerca de 28 dias a cerca de 35 dias, ou a ou cerca de 26, 27, 28, 29, 30, 31, 32, 33, 34, 35, 36, 37, 38, 39, 40, 41, 42,
43, 44 ou 45 dias, antes de iniciar a administração da terapia com célu- las T.
[00234] Em algumas modalidades, o inibidor de quinase, como um inibidor de BTK/ITK, por exemplo, ibrutinib é administrado várias vezes ao dia, duas vezes ao dia, diariamente, em dias alternados, três vezes por semana, duas vezes por semana ou uma vez uma semana durante o regime de dosagem. Em algumas modalidades, o inibidor da quinase, por exemplo, ibrutinib, é administrado diariamente. Em algumas moda- lidades, o inibidor da quinase, por exemplo, ibrutinib, é administrado duas vezes ao dia. Em algumas modalidades, o inibidor da quinase, por exemplo, ibrutinib, é administrado três vezes ao dia. Em outras modali- dades, o inibidor da quinase, por exemplo, ibrutinib, é administrado em dias alternados. Em algumas modalidades, a administração do inibidor de quinase é realizada uma vez por dia em cada dia em que é adminis- trado durante o regime de dosagem.
[00235] Em algumas modalidades, uma quantidade eficaz do inibidor de quinase, como um inibidor de BTK/ITK, por exemplo, ibrutinib, é ad- ministrada. Em algumas modalidades, uma quantidade eficaz do inibi- dor de quinase, como um inibidor de BTK/ITK, por exemplo, ibrutinib, é administrada em cada dose, quando doses múltiplas do inibidor de qui- nase são administradas. Em algumas modalidades, a quantidade eficaz do inibidor de quinase, por exemplo, ibrutinib, inclui qualquer uma das quantidades de dosagem aqui descritas, administrada como uma dose única ou dividida em 2, 3, 4, 5 ou 6 doses. Em algumas modalidades, cada dose é administrada várias vezes ao dia, duas vezes ao dia, diari- amente, em dias alternados, três vezes por semana, duas vezes por semana ou uma vez por semana. Em algumas modalidades, a quanti- dade de dosagem é administrada diariamente.
[00236] Em algumas modalidades, o inibidor de quinase, por exem- plo, ibrutinib, é administrado em uma quantidade de dosagem a partir de ou a partir de cerca de 25 mg a ou cerca de 2000 mg, a partir de ou cerca de 25 mg a ou cerca de 1000 mg, a partir de ou cerca de 25 mg a ou cerca de 500 mg, a partir de ou cerca de 25 mg a ou cerca de 200 mg, a partir de ou cerca de 25 mg a ou cerca de 100 mg, a partir de ou cerca de 25 mg a ou cerca de 50 mg, a partir de ou cerca de 50 mg a ou cerca de 2000 mg, a partir de ou cerca de 50 mg a ou cerca de 1000 mg, a partir de ou cerca de 50 mg a ou cerca de 500 mg, a partir de ou cerca de 50 mg a ou cerca de 200 mg, a partir de ou cerca de 50 mg a ou cerca de 100 mg, a partir de ou cerca de 100 mg a ou cerca de 2000 mg, a partir de ou cerca de 100 mg a ou cerca de 1000 mg, a partir de ou cerca de 100 mg a ou cerca de 500 mg, a partir de ou cerca de 100 mg a ou cerca de 200 mg, a partir de ou cerca de 200 mg a ou cerca de 2000 mg, a partir de ou cerca de 200 mg a ou cerca de 1000 mg, a partir de ou cerca de 200 mg a ou cerca de 500 mg, a partir de ou cerca de 500 mg a ou cerca de 2000 mg, a partir de ou cerca de 500 mg a ou cerca de 1000 mg or a partir de ou cerca de 1000 mg a ou cerca de 2000 mg, cada um inclusive. Em algumas modalidades, a quantidade de do- sagem pode incluir qualquer uma das quantidades de dosagem anteri- ores administradas diariamente.
[00237] Em algumas modalidades, o inibidor de quinase, por exem- plo, ibrutinib, é administrado em uma quantidade de dosagem a partir de ou a partir de cerca de 50 mg a ou cerca de 560 mg, a partir de ou cerca de 50 mg a ou cerca de 420 mg, a partir de ou cerca de 50 mg a ou cerca de 400 mg, a partir de ou cerca de 50 mg a ou cerca de 380 mg, a partir de ou cerca de 50 mg a ou cerca de 360 mg, a partir de ou cerca de 50 mg a ou cerca de 340 mg, a partir de ou cerca de 50 mg a ou cerca de 320 mg, a partir de ou cerca de 50 mg a ou cerca de 300 mg, a partir de ou cerca de 50 mg a ou cerca de 280 mg, a partir de ou cerca de 100 mg a ou cerca de 560 mg, a partir de ou cerca de 100 mg a ou cerca de 420 mg, a partir de ou cerca de 100 mg a ou cerca de 400 mg, a partir de ou cerca de 100 mg a ou cerca de 380 mg, a partir de ou cerca de 100 mg a ou cerca de 360 mg, a partir de ou cerca de 100 mg a ou cerca de 340 mg, a partir de ou cerca de 100 mg a ou cerca de 320 mg, a partir de ou cerca de 100 mg a ou cerca de 300 mg, a partir de ou cerca de 100 mg a ou cerca de 280 mg, a partir de ou cerca de 100 mg a ou cerca de 200 mg, a partir de ou cerca de 140 mg a ou cerca de 560 mg, a partir de ou cerca de 140 mg a ou cerca de 420 mg, a partir de ou cerca de 140 mg a ou cerca de 400 mg, a partir de ou cerca de 140 mg a ou cerca de 380 mg, a partir de ou cerca de 140 mg a ou cerca de 360 mg, a partir de ou cerca de 140 mg a ou cerca de 340 mg, a partir de ou cerca de 140 mg a ou cerca de 320 mg, a partir de ou cerca de 140 mg a ou cerca de 300 mg, a partir de ou cerca de 140 mg a ou cerca de 280 mg, a partir de ou cerca de 140 mg a ou cerca de 200 mg, a partir de ou cerca de 180 mg a ou cerca de 560 mg, a partir de ou cerca de 180 mg a ou cerca de 420 mg, a partir de ou cerca de 180 mg a ou cerca de 400 mg, a partir de ou cerca de 180 mg a ou cerca de 380 mg, a partir de ou cerca de 180 mg a ou cerca de 360 mg, a partir de ou cerca de 180 mg a ou cerca de 340 mg, a partir de ou cerca de 180 mg a ou cerca de 320 mg, a partir de ou cerca de 180 mg a ou cerca de 300 mg, a partir de ou cerca de 180 mg a ou cerca de 280 mg, a partir de ou cerca de 200 mg a ou cerca de 560 mg, a partir de ou cerca de 200 mg a ou cerca de 420 mg, a partir de ou cerca de 200 mg a ou cerca de 400 mg, a partir de ou cerca de 200 mg a ou cerca de 380 mg, a partir de ou cerca de 200 mg a ou cerca de 360 mg, a partir de ou cerca de 200 mg a ou cerca de 340 mg, a partir de ou cerca de 200 mg a ou cerca de 320 mg, a partir de ou cerca de 200 mg a ou cerca de 300 mg, a partir de ou cerca de 200 mg a ou cerca de 280 mg, a partir de ou cerca de 220 mg a ou cerca de 560 mg, a partir de ou cerca de 220 mg a ou cerca de 420 mg, a partir de ou cerca de 220 mg a ou cerca de 400 mg, a partir de ou cerca de 220 mg a ou cerca de 380 mg, a partir de ou cerca de 220 mg a ou cerca de 360 mg, a partir de ou cerca de 220 mg a ou cerca de 340 mg, a partir de ou cerca de 220 mg a ou cerca de 320 mg, a partir de ou cerca de 220 mg a ou cerca de 300 mg, a partir de ou cerca de 220 mg a ou cerca de 280 mg, a partir de ou cerca de 240 mg a ou cerca de 560 mg, a partir de ou cerca de 240 mg a ou cerca de 420 mg, a partir de ou cerca de 240 mg a ou cerca de 400 mg, a partir de ou cerca de 240 mg a ou cerca de 380 mg, a partir de ou cerca de 240 mg a ou cerca de 360 mg, a partir de ou cerca de 240 mg a ou cerca de 340 mg, a partir de ou cerca de 240 mg a ou cerca de 320 mg, a partir de ou cerca de 240 mg a ou cerca de 300 mg, a partir de ou cerca de 240 mg a ou cerca de 280 mg, a partir de ou cerca de 280 mg a ou cerca de 560 mg, a partir de ou cerca de 280 mg a ou cerca de 420 mg, a partir de ou cerca de 300 mg a ou cerca de 560 mg, a partir de ou cerca de 300 mg a ou cerca de 420 mg, a partir de ou cerca de or a partir de ou cerca de 300 mg a ou cerca de 400 mg, cada um inclusive. Em algumas modalidades, a quantidade de dosagem pode incluir qualquer uma das quantidades de dosagem anteriores adminis- tradas diariamente.
[00238] Em algumas modalidades, o inibidor de quinase, como um inibidor de BTK/ITK, por exemplo, ibrutinib, é administrado em uma quantidade de dosagem diária total de pelo menos ou pelo menos cerca de 50 mg/dia, 100 mg/dia, 140 mg/dia, 150 mg/dia, 175 mg/dia, 200 mg/dia, 250 mg/dia, 280 mg/dia, 300 mg/dia, 350 mg/dia, 400 mg/dia, 420 mg/dia, 440 mg/dia, 460 mg/dia, 480 mg/dia, 500 mg/dia, 520 mg/dia, 540 mg/dia, 560 mg/dia, 580 mg/dia, 600 mg/dia, 700 mg/dia, 750 mg/dia, 800 mg/dia, 850 mg/dia or 960 mg/dia. Em algumas moda- lidades, o inibidor é administrado em uma quantidade de ou cerca de 420 mg/dia. Em algumas modalidades, o inibidor é administrado em uma quantidade que é menor ou menor que cerca de 560 mg/dia e pelo menos cerca ou pelo menos 140 mg/dia. Em algumas modalidades, o inibidor é administrado em uma quantidade que é menor ou menor que cerca de 420 mg/dia e pelo menos cerca ou pelo menos 280 mg/dia. Em algumas modalidades, o inibidor é administrado em uma quantidade de ou cerca de, ou pelo menos em ou cerca de, 140 mg/dia, 280 mg/dia, 420 mg/dia ou 560 mg/dia. Em algumas modalidades, o inibidor é admi- nistrado em uma quantidade de ou cerca de, ou pelo menos em ou cerca de 420 mg/dia ou 560 mg/dia. Em algumas modalidades, o inibidor é administrado em uma quantidade não superior a 140 mg/dia, 280 mg/dia, 420 mg/dia ou 560 mg/dia. Em algumas modalidades, o inibidor é administrado em uma quantidade não superior a 420 mg/dia ou 560 mg/dia. Em algumas modalidades, a quantidade eficaz compreende a partir de ou a partir de cerca de 140 mg a ou cerca de 840 mg por cada dia em que o inibidor de quinase, por exemplo, ibrutinib, é administrado. Em algumas modalidades, a quantidade eficaz compreende a partir de ou a partir de cerca de 140 mg a ou cerca de 560 mg por cada dia em que o inibidor de quinase, por exemplo, ibrutinib é administrado.
[00239] Em algumas modalidades, os métodos ou usos envolvem: (1) administrar a um indivíduo com câncer um inibidor de quinase, tal como um inibidor de BTK/ITK, por exemplo, ibrutinib ou um sal farma- ceuticamente aceitável do mesmo; e (2) administrar uma terapia com células T autólogas ao indivíduo. Em alguns aspectos, a terapia com células T inclui uma dose de células T geneticamente modificadas que expressam um receptor de antígeno quimérico (CAR) que se liga espe- cificamente a um antígeno associado a uma doença ou distúrbio, por exemplo, qualquer um aqui descrito. Em algumas modalidades, a tera- pia com células T é produzida por um processo que compreende a ob- tenção de uma amostra compreendendo células T do indivíduo e a in- trodução de uma molécula de ácido nucleico que codifica o CAR, como quaisquer moléculas de ácido nucleico aqui descritas, por exemplo, na Seção II.B em uma composição que compreende as células T.
[00240] Em alguns aspectos, a administração do inibidor de quinase é iniciada em ou pelo menos cerca de 5 a ou cerca de 7 dias, tal como em ou cerca de 5, 6 ou 7 dias, antes de obter a amostra do indivíduo e é realizada em um regime de dosagem que compreende a administra- ção do inibidor de quinase pelo menos até que a amostra seja obtida do indivíduo e a administração continuada e/ou adicional do inibidor de qui- nase que se estende por cerca de ou mais de três meses após o início da administração do Terapia com células T. Em algumas modalidades, o inibidor de quinase, por exemplo, ibrutinib, é administrado em uma quantidade a partir de ou a partir de cerca de 140 mg a ou a cerca de 560 mg uma vez por dia, cada dia, é administrado durante o regime de dosagem. Em algumas modalidades, após o início da administração do inibidor da quinase e antes da administração da terapia com células T, o indivíduo foi precondicionado com uma terapia de linfodepleção. Em algumas modalidades, os métodos incluem ainda a administração de uma terapia de linfodepleção ao indivíduo subsequente à administração do inibidor de quinase e antes da administração da terapia de células T. Em algumas modalidades, a administração da terapia de linfodepleção é concluída em 7 dias antes do início da administração da terapia de células T. Em algumas modalidades, a administração da terapia de lin- fodepleção é concluída em ou cerca de 2 a em ou cerca de 7 dias, tal como em ou cerca de 7 dias, antes do início da administração da terapia com células T. Em algumas modalidades, o regime de dosagem com- preende a interrupção ou pausa da administração do inibidor da quinase durante a terapia de linfodepleção. Em algumas modalidades, o regime de dosagem compreende retomar ou ainda administrar o inibidor da qui- nase após a conclusão da terapia de linfodepleção.
[00241] Em algumas modalidades, os métodos ou usos envolvem: (1) administrar a um indivíduo com câncer um inibidor de quinase, como um inibidor de BTK/ITK, por exemplo, ibrutinib ou um sal farmaceutica-
mente aceitável do mesmo; e (2) administrar uma terapia de linfodeple- ção ao indivíduo; e (3) administrar uma terapia de células T autólogas ao indivíduo dentro de 2 a 7 dias, após completar a terapia de linfode- pleção. Em alguns aspectos, a terapia com células T inclui uma dose de células T geneticamente modificadas que expressam um receptor de antígeno quimérico (CAR) que se liga especificamente a um antígeno associado a uma doença ou distúrbio, por exemplo, qualquer um aqui descrito. Em algumas modalidades, a terapia com células T é produzida por um processo que compreende a obtenção de uma amostra compre- endendo células T do indivíduo e a introdução de uma molécula de ácido nucleico que codifica o CAR, como quaisquer moléculas de ácido nu- cleico aqui descritas, por exemplo, na Seção II.B em uma composição que compreende as células T. Em alguns aspectos, a administração do inibidor de quinase é iniciada em ou pelo menos cerca de 5 a 7 dias, tal como 7 dias, antes da obtenção da amostra do indivíduo e é realizada em um regime de dosagem que compreende a administração do inibidor de quinase até para o início da terapia de linfodepleção, descontinuação ou pausa da administração do inibidor da quinase durante a terapia de linfodepleção e retomada ou administrar ainda o inibidor da quinase por um período que se estende por pelo menos três meses após o início da administração da terapia com células T, em que o inibidor da quinase é administrado em uma quantidade a partir de ou a partir de cerca de 140 mg a ou a cerca de 560 mg uma vez por dia cada dia é administrado durante o regime de dosagem. Em algumas modalidades, a administra- ção do inibidor de quinase por dia em que é administrado é a partir de ou a partir de cerca de 280 mg a ou a cerca de 560 mg. Em algumas modalidades, a administração do inibidor da quinase é iniciada pelo me- nos cerca de 7 dias antes da obtenção da amostra do indivíduo.
[00242] Em algumas modalidades, a administração do inibidor de quinase é iniciada a partir a partir de ou a partir de cerca de 30 a cerca de 40 dias antes do início da administração da terapia com células T; a amostra é obtida do indivíduo a partir de ou a partir de cerca de 23 dias a cerca de 38 dias antes do início da administração da terapia com cé- lulas T; e/ou a terapia de linfodepleção é concluída em ou cerca de 5 a 7 dias, tal como 7 dias, antes do início da administração da terapia com células T.
[00243] Em algumas modalidades, a administração do inibidor de quinase é iniciada em ou cerca de 35 dias antes do início da adminis- tração da terapia com células T; a amostra é obtida do indivíduo a partir de ou a partir de cerca de 28 dias a cerca de 32 dias antes de iniciar a administração da terapia com células T; e/ou a terapia de linfodepleção é concluída cerca de 5 a cerca de 7 dias, tal como 7 dias, antes do início da administração da terapia com células T.
[00244] Em algumas de quaisquer modalidades nas quais o inibidor de uma quinase da família TEC é dado antes da terapia celular (por exemplo, terapia com células T, como terapia com células T de CAR), a administração do inibidor da quinase, por exemplo, ibrutinib, continua em intervalos regulares até o início da terapia celular e/ou por um perí- odo após o início da terapia celular.
[00245] Em algumas das modalidades anteriores, o inibidor da qui- nase, por exemplo, ibrutinib, é administrado antes e após o início da administração da terapia celular (por exemplo, terapia com células T, como terapia com células T de CAR). Em algumas modalidades, o ini- bidor da quinase, por exemplo, ibrutinib, é administrado, ou é continuado e/ou administrado posteriormente, após a administração da terapia ce- lular. Em algumas modalidades, o inibidor da quinase, por exemplo, ibrutinib é administrado simultaneamente, ou dentro de ou dentro de cerca de 1 hora, 2 horas, 6 horas, 12 horas, 24 horas, 48 horas, 96 horas, 4 dias, 5 dias, 6 dias ou 7 dias, 14 dias, 15 dias, 21 dias, 24 dias, 28 dias, 30 dias, 36 dias, 42 dias, 60 dias, 72 dias, 90 dias, 120 dias,
180 dias, 210 dias, 240 dias, 270 dias, 300 dias, 330 dias, 360 dias ou 720 dias após o início da administração da terapia celular (por exemplo, terapia com células T). Em algumas modalidades, os métodos forneci- dos envolvem administração continuada e/ou adicional, tal como em in- tervalos regulares, do inibidor da quinase, por exemplo, ibrutinib, após o início da administração da terapia celular, por exemplo, por uma dura- ção de qualquer um dos períodos anteriores após o início da terapia com células T.
[00246] Em algumas modalidades, o inibidor de quinase, tal como um inibidor de BTK/ITK, por exemplo, ibrutinib, é continuado e/ou adminis- trado posteriormente, tal como é administrado diariamente, por até ou até cerca de 1 dia, até ou até cerca de 2 dias, até ou até cerca de 3 dias, até ou até cerca de 4 dias, até ou até cerca de 5 dias, até ou até cerca de 6 dias, até ou até cerca de 7 dias, até ou até cerca de 12 dias, até ou até cerca de 14 dias, até ou até cerca de 21 dias, até ou até cerca de 24 dias, até ou até cerca de 28 dias, até ou até cerca de 30 dias, até ou até cerca de 35 dias, até ou até cerca de 42 dias, até ou até cerca de 60 dias or até ou até cerca de 90 dias, até ou até cerca de 120 dias, até ou até cerca de 180 dias, até ou até cerca de 240 dias, até ou up cerca de 360 dias, or até ou até cerca de 720 dias or mais após a administra- ção da terapia celular (por exemplo, terapia com células T, como terapia com células T de CAR). Em algumas modalidades, o inibidor de qui- nase, como um inibidor de BTK/ITK, por exemplo, ibrutinib, é continuado e/ou administrado adicionalmente, tal como é administrado diariamente, por até ou até cerca de 1 semana, 2 semanas, 3 semanas, 4 semanas, 1 mês, 2 meses, 3 meses, 4 meses, 5 meses, 6 meses, 7 meses, 8 meses, 9 meses, 10 meses, 11 meses, 12 meses, 1 ano ou 2 anos ou mais após a administração de a terapia celular (por exemplo, terapia com células T, como a terapia com células T de CAR). Em algumas modalidades, o período, por exemplo, para administração continuada e/ou adicional do inibidor de quinase, por exemplo, ibrutinib, se estende por ou cerca de ou mais de quatro meses após o início da administração da terapia com células T. Em algumas modalidades, o período, por exemplo, para a administração continuada do inibidor da quinase, por exemplo, ibrutinib, se estende por ou cerca ou mais de cinco meses após o início da administração da terapia com células T. Em algumas modalidades, o período, por exemplo, para a administração continuada do inibidor de quinase, por exemplo, ibrutinib, se estende por cerca de ou mais de seis meses após o início da administração da terapia com células T.
[00247] Em algumas modalidades, o regime de dosagem para a ad- ministração de um inibidor de quinase, como um inibidor de BTK/ITK, por exemplo, ibrutinib, é realizado por um período de tempo subse- quente ao início da administração da terapia com células T. Em algumas modalidades, a administração de um inibidor de quinase, por exemplo, ibrutinib, se estende por um período de mais de uma semana após o início da administração da terapia com células T. Em algumas modali- dades, a administração de um inibidor de quinase, por exemplo, ibruti- nib, se estende por um período de cerca de ou pelo menos cerca de um mês após o início da administração da terapia com células T. Em algu- mas modalidades, a administração de um inibidor de quinase, por exem- plo, ibrutinib, se estende por um período de cerca de ou pelo menos cerca de dois meses após o início da administração da terapia com cé- lulas T. Em algumas modalidades, a administração de um inibidor da quinase, por exemplo, ibrutinib, se estende por um período de cerca de ou pelo menos cerca de três meses após o início da administração da terapia com células T. Em algumas modalidades, a administração de um inibidor de quinase, por exemplo, ibrutinib, se estende por um perí- odo de cerca de ou pelo menos cerca de quatro meses após o início da administração da terapia com células T. Em algumas modalidades, a administração de um inibidor de quinase, por exemplo, ibrutinib, se es- tende por um período de cerca de ou pelo menos cerca de cinco meses após o início da administração da terapia com células T. Em algumas modalidades, a administração de um inibidor de quinase, por exemplo, ibrutinib, se estende por um período de cerca de ou pelo menos cerca de seis meses após o início da administração da terapia com células T.
[00248] Em algumas modalidades, a administração de um inibidor de quinase, por exemplo, ibrutinib, se estende por um período de pelo me- nos três meses. Em algumas modalidades, a administração de um ini- bidor de quinase, por exemplo, ibrutinib, se estende por um período de ou cerca de 90 dias, em ou cerca de 100 dias, em ou cerca de 105 dias, em ou cerca de 110 dias, em ou cerca de 115 dias, em ou cerca de 120 dias, por ou cerca de 125 dias, por ou cerca de 130 dias, por ou cerca de 135 dias, por ou cerca de 140 dias, por ou cerca de 145 dias, por ou cerca de 150 dias, por ou cerca de 155 dias, por ou cerca de 160 dias, por ou cerca de 165 dias, por ou cerca de 170 dias, por ou cerca de 175 dias, por ou cerca de 180 dias, por ou cerca de 185 dias, por ou cerca de 190 dias, por ou cerca de 195 dias, por ou cerca de 200 dias ou mais após o início da administração da terapia com células T.
[00249] Em algumas modalidades, a administração de um inibidor de quinase, por exemplo, ibrutinib, se estende por um período de ou cerca de 90 dias ou em ou cerca de três meses após o início da administração da terapia com células T (por exemplo, terapia com células T de CAR) . Em algumas modalidades, a administração de um inibidor de quinase, por exemplo, ibrutinib, se estende por um período de cerca de 120 dias ou quatro meses após o início da administração da terapia com células T (por exemplo, terapia com células T de CAR). Em algumas modalida- des, a administração de um inibidor de quinase, por exemplo, ibrutinib, se estende por um período de cerca de 150 dias ou cinco meses após o início da administração da terapia com células T (por exemplo, terapia com células T de CAR). Em algumas modalidades, a administração de um inibidor de quinase, por exemplo, ibrutinib, se estende por um perí- odo de cerca de 180 dias ou seis meses após o início da administração da terapia com células T (por exemplo, terapia com células T de CAR).
[00250] Em alguns aspectos, o inibidor de quinase, como um inibidor de BTK/ITK, por exemplo, ibrutinib, é administrado, tal como é adminis- trado diariamente, por até ou até cerca de 180 dias após a administra- ção da terapia celular. Em algumas modalidades, a administração con- tinuada e/ou adicional do inibidor da quinase, por exemplo, ibrutinib, é por um período que se estende de 15 dias a 29 dias após o início da administração da terapia com células T. Em algumas modalidades, a continuação e/ou a administração adicional do inibidor de quinase, por exemplo, ibrutinib, é por um período que se estende por ou cerca de ou mais de três meses após o início da administração da terapia com célu- las T.
[00251] Em algumas modalidades, a administração de um inibidor de quinase, por exemplo, ibrutinib, é encerrada ou interrompida no final do período (por exemplo, em ou cerca de 3, 4, 5 ou 6 meses) após o início da administração da terapia com células T (por exemplo, terapia com células T de CAR) se o indivíduo, antes ou por volta de 6 meses, atingiu uma resposta completa (RC) após o tratamento ou o câncer (por exem- plo, malignidade de células B) progrediu ou recidivou após a remissão após a tratamento. Em algumas modalidades, o período tem uma dura- ção fixa, de modo que a administração de um inibidor de quinase, por exemplo, ibrutinib, é continuada durante o período, mesmo se o indiví- duo tiver alcançado uma resposta completa (RC) em um ponto de tempo antes do final de o período. Em algumas modalidades, o indivíduo tem uma RC com doença residual mínima (MRD). Em algumas modalida- des, o indivíduo tem uma RC que é MRD-.
[00252] Em algumas modalidades, a administração de um inibidor de quinase, por exemplo, ibrutinib, é continuada após o final do período, por exemplo, continuou por mais tempo do que em ou cerca de 3, 4, 5 ou 6 meses após o início da administração da terapia com células T (por exemplo, células T de CAR), se o indivíduo exibir uma resposta parcial (RP) ou doença estável (DE) após o tratamento. Em algumas modalida- des, a administração de um inibidor de quinase, por exemplo, ibrutinib, é continuada por mais de 6 meses após o início da administração da terapia com células T (por exemplo, terapia com células T de CAR). Em algumas modalidades, para indivíduos que exibiram uma RP ou DE no final do período inicial, a administração de um inibidor de quinase, por exemplo, ibrutinib, é continuada até que o indivíduo tenha alcançado uma resposta completa (RC) após o tratamento ou até o câncer (por exemplo, malignidade de células B, como NHL, por exemplo, DLBCL) progrediu ou recidivou após a remissão após o tratamento.
[00253] Em algumas modalidades, no momento da administração de um inibidor de quinase, por exemplo, ibrutinib, o indivíduo não exibe uma toxicidade grave após a administração da terapia com células T (por exemplo, células T de CAR). Em algumas modalidades, a maligni- dade de células B é NHL, como NHL agressivo recorrente/refratário ou DLBCL. Em algumas modalidades, a terapia celular, como células T que expressam CAR, compreende um receptor de antígeno quimérico que se liga especificamente a um antígeno de célula B. Em algumas moda- lidades, o antígeno de células B é CD19.
[00254] Em algumas modalidades, no momento da administração de um inibidor de quinase, por exemplo, ibrutinib, o indivíduo não exibe uma toxicidade grave após a administração da terapia celular. Em algu- mas modalidades, a administração de um inibidor de quinase, por exem- plo, ibrutinib, é encerrado ou interrompido, se o indivíduo, antes ou pró- ximo ao final do período, atingiu uma resposta completa (RC) após o tratamento ou câncer, por exemplo, A malignidade das células B, pro- grediu ou recidivou após a remissão após o tratamento. Em algumas modalidades, a administração de um inibidor de quinase, por exemplo, ibrutinib, é continuada durante o período, mesmo se o indivíduo tiver alcançado uma resposta completa (RC) em um ponto de tempo antes do final do período. Em algumas modalidades, a administração de um inibidor de quinase, por exemplo, ibrutinib, é continuada após o final do período inicial se, após o início da administração da terapia com células T, o indivíduo exibir uma resposta parcial (RP) ou doença estável (DE) após o tratamento. Em algumas modalidades, a administração de um inibidor de quinase, por exemplo, ibrutinib, é repetida até que o indivíduo tenha alcançado uma resposta completa (RC) após o tratamento ou até o câncer, por exemplo, A malignidade das células B progrediu ou reci- divou após a remissão após o tratamento. Em algumas modalidades, a malignidade das células B é NHL, tal como NHL agressivo recorrente/re- fratário ou DLBCL. Em algumas modalidades, a terapia com células T, como células T que expressam CAR, compreende um receptor de antí- geno quimérico que se liga especificamente a um antígeno de células B. Em algumas modalidades, o antígeno de células B é CD19.
[00255] Em algumas modalidades, a administração do inibidor de quinase, por exemplo, ibrutinib, é continuada e/ou retomada ou ainda administrada após (após) o início da terapia celular, como uma terapia com células T (por exemplo, células T que expressam CAR), por um período ou uma duração de tempo até um ponto de tempo específico para a rescisão. O ponto de tempo para rescisão pode ser qualquer ponto de tempo definido descrito acima, ou um ponto de tempo onde critérios, resultados ou resultados específicos são observados ou alcan- çados.
[00256] Em alguns aspectos, a administração continuada e/ou adici- onal do inibidor da quinase, por exemplo, ibrutinib, é interrompida no final do período, se, no final do período, o indivíduo exibir uma resposta completa (RC) após o tratamento.
Em algumas modalidades, a adminis- tração continuada e/ou adicional do inibidor de quinase, por exemplo, ibrutinib, é interrompida no final do período se, no do período, o câncer progrediu ou recidivou após a remissão após o tratamento.
Em algumas modalidades, o período se estende por ou a partir de ou cerca de três meses a ou seis meses.
Em algumas modalidades, o período se es- tende por ou cerca de três meses após o início da administração da terapia com células T.
Em algumas modalidades, o período se estende por ou cerca de 3 meses após o início da administração da terapia com células T se o indivíduo, antes de ou cerca de 3 meses, atingiu uma resposta completa (RC) após o tratamento ou o câncer progrediu ou recidiva após remissão após o tratamento.
Em algumas modalidades, o período se estende por ou cerca de 3 meses após o início da adminis- tração da terapia com células T se o indivíduo em 3 meses atingiu uma resposta completa (RC). Em algumas modalidades, o período se es- tende por ou cerca de seis meses após o início da administração da terapia com células T.
Em algumas modalidades, o período se estende por ou cerca de 6 meses após o início da administração da terapia com células T se o indivíduo, antes de ou cerca de 6 meses, atingiu uma resposta completa (RC) após o tratamento ou o câncer progrediu ou recidiva após remissão após o tratamento.
Em algumas modalidades, o período se estende por ou cerca de 6 meses após o início da adminis- tração da terapia com células T se o indivíduo em 6 meses atingiu uma resposta completa (RC). Em algumas modalidades, a administração continuada e/ou adicional é continuada durante o período, mesmo que o indivíduo tenha alcançado uma resposta completa (RC) em um ponto de tempo antes do final do período.
Em algumas modalidades, o indiví- duo atinge uma resposta completa (RC) em um momento durante o pe- ríodo e antes do final do período.
[00257] Em algumas modalidades, os métodos e usos também en- volvem a administração continuada e/ou adicional após o final do perí- odo, se, no final do período, o indivíduo exibir uma resposta parcial (RP) ou doença estável (DE). Em algumas modalidades, a administração continuada e/ou adicional é continuada por mais de seis meses se, em ou cerca de seis meses, o indivíduo exibe uma resposta parcial (RP) ou doença estável (DE) após o tratamento. Em algumas modalidades, a administração continuada e/ou adicional é continuada até que o indiví- duo tenha alcançado uma resposta completa (RC) após o tratamento ou até que o câncer tenha progredido ou recidivado após a remissão após o tratamento.
[00258] Em algumas modalidades, a administração de um inibidor de quinase, por exemplo, ibrutinib, é continuada, até ou após o pico ou nível máximo das células da terapia com células T ser detectável no sangue do indivíduo. Em alguns casos, o início da administração de um inibidor da quinase, por exemplo, ibrutinib, é realizado em ou dentro de uma semana, tal como dentro de 1, 2 ou 3 dias após (i) um momento em que pico ou nível máximo das células da terapia com células T são detectá- veis no sangue do indivíduo; (ii) o número de células da terapia com células T detectáveis no sangue, depois de ter sido detectável no san- gue, não é detectável ou é reduzido, opcionalmente reduzido em com- paração com um ponto de tempo anterior após a administração da tera- pia com células T; (iii) o número de células da terapia com células T detectáveis no sangue é diminuído em ou mais de 1,5 vezes, 2,0 vezes, 3,0 vezes, 4,0 vezes, 5,0 vezes, 10 vezes ou mais o pico ou número máximo de células da terapia com células T detectáveis no sangue do indivíduo após o início da administração da terapia com células T; (iv) em um momento após um pico ou nível máximo das células da terapia com células T serem detectáveis no sangue do indivíduo, o número de células ou derivadas das células detectáveis no sangue do indivíduo é menor que menos do que 10 %, menos do que 5 %, menos do que 1 % ou menos do que 0,1 % do total de células mononucleares do sangue periférico (PBMCs) no sangue do indivíduo; (v) o indivíduo exibe pro- gressão da doença e/ou recidiva após remissão após o tratamento com a terapia de células T; e/ou (iv) o indivíduo exibe carga tumoral aumen- tada em comparação com carga tumoral em um momento antes ou após a administração das células e antes do início da administração de um inibidor de quinase, por exemplo, ibrutinib. Em certos aspectos, os mé- todos fornecidos são realizados para realçar, aumentar ou potenciar a terapia com células T em indivíduos nos quais foi observada uma res- posta de pico à terapia com células T, mas em que a resposta, por exemplo, presença de células T e/ou redução na carga tumoral, tornou- se reduzida ou não é mais detectável.
[00259] Em algumas modalidades, no momento em que o indivíduo é administrado pela primeira vez um inibidor de quinase, por exemplo, ibrutinib, e/ou em qualquer momento subsequente após o início da ad- ministração, o indivíduo não exibe um sinal ou sintoma de uma severa toxicidade, como a síndrome de liberação de citocina grave (SRC) ou toxicidade grave. Em algumas modalidades, a administração de um ini- bidor de quinase, por exemplo, ibrutinib, está em um momento em que o indivíduo não exibe um sinal ou sintoma de SRC grave e/ou não exibe SRC de grau 3 ou superior, como SRC de grau 3 prolongado ou CRS de grau 4 ou 5. Em algumas modalidades, a administração de um inibi- dor de quinase, por exemplo, ibrutinib, ocorre em um momento em que o indivíduo não exibe um sinal ou sintoma de neurotoxicidade grave e/ou não exibe neurotoxicidade de grau 3 ou superior, como grau 3 prolon- gado neurotoxicidade ou neurotoxicidade de grau 4 ou 5. Em alguns aspectos, entre o momento do início da administração da terapia com células T e o momento da administração de um inibidor de quinase, por exemplo, ibrutinib, o indivíduo não exibiu CRS grave e/ou não exibiu grau 3 ou superior CRS, como CRS de grau 3 prolongada ou CRS de grau 4 ou 5. Em alguns casos, entre o momento do início da administra- ção da terapia com células T e o momento da administração de um ini- bidor da quinase, por exemplo, ibrutinib, o indivíduo não exibiu neuroto- xicidade grave e/ou não exibe grau 3 ou superior neurotoxicidade, como neurotoxicidade de grau 3 prolongada ou neurotoxicidade de grau 4 ou
5.
[00260] Em algumas modalidades, um inibidor de quinase, por exem- plo, ibrutinib, é administrado em uma quantidade que alcança uma con- centração máxima de (Cmax) um inibidor de quinase, por exemplo, ibru- tinib, no sangue, após administração oral, tal como dentro de ou de cerca de 1, 2, 3, 4, 5, 6, 7, 8, 9, 10, 11 ou 12 horas após administração oral, em uma faixa de ou de cerca de 10 ng/mL até ou cerca de 100 ng/mL, de ou de cerca de 20 ng/mL até ou cerca de 100 ng/mL, de ou de cerca de 30 ng/mL até ou cerca de 100 ng/mL, de ou de cerca de 40 ng/mL até ou cerca de 100 ng/mL, de ou de cerca de 50 ng/mL até ou cerca de 100 ng/mL, de ou de cerca de 60 ng/mL até ou cerca de 100 ng/mL, de ou de cerca de 70 ng/mL até ou cerca de 100 ng/mL, de ou de cerca de 80 ng/mL até ou cerca de 100 ng/mL, de ou de cerca de 90 ng/mL até ou cerca de 100 ng/mL, de ou de cerca de 10 ng/mL até ou cerca de 80 ng/mL, de ou de cerca de 20 ng/mL até ou cerca de 80 ng/mL, de ou de cerca de 30 ng/mL até ou cerca de 80 ng/mL, de ou de cerca de 40 ng/mL até ou cerca de 80 ng/mL, de ou de cerca de 50 ng/mL até ou cerca de 80 ng/mL, de ou de cerca de 60 ng/mL até ou cerca de 80 ng/mL, de ou de cerca de 70 ng/mL até ou cerca de 80 ng/mL, de ou de cerca de 10 ng/mL até ou cerca de 60 ng/mL, de ou de cerca de 20 ng/mL até ou cerca de 60 ng/mL, de ou de cerca de 30 ng/mL até ou cerca de 60 ng/mL, de ou de cerca de 40 ng/mL até ou cerca de 60 ng/mL, de ou de cerca de 50 ng/mL até ou cerca de 60 ng/mL, de ou de cerca de 10 ng/mL até ou cerca de 40 ng/mL, de ou de cerca de 20 ng/mL até ou cerca de 40 ng/mL, de ou de cerca de 30 ng/mL até ou cerca de 40 ng/mL, tal como de, ou de cerca de 10 ng/mL, 20 ng/mL, 30 ng/mL, 40 ng/mL, 50 ng/mL, 60 ng/mL, 70 ng/mL, 80 ng/mL, 90 ng/mL, ou 100 ng/mL. Em algumas modalidades, um inibidor de quinase, tal como um inibidor de BTK/ITK, por exemplo, ibrutinib, é administrado em uma quantidade que alcança uma Cmax de um inibidor de quinase, por exemplo, ibrutinib, no sangue em cerca de ou pelo me- nos cerca de 10 ng/mL, 20 ng/mL, 30 ng/mL, 40 ng/mL, 50 ng/mL, 60 ng/mL, 70 ng/mL, 80 ng/mL, 90 ng/mL, ou 100 ng/mL. Em algumas mo- dalidades, um inibidor de quinase, tal como um inibidor de BTK/ITK, por exemplo, ibrutinib, é administrado em uma quantidade que mantém a Cmax na faixa de pelo menos cerca de 30 minutos ou 1, 2, 3, 4, 5, 6, 7, 8, 9, 10, 11 ou 12 horas.
[00261] Em algumas modalidades, administração de um inibidor de quinase, tal como um inibidor de BTK/ITK, por exemplo, ibrutinib, é rea- lizada em um regime de dosagem compreendendo administrar o inibidor de quinase, por exemplo, ibrutinib, em uma quantidade de ou de cerca de 140 mg a cerca de 560 mg por dia durante um período de cerca de ou maior que três meses (por exemplo, durante um período de ou de cerca de três meses, quatro meses, cinco meses, ou seis meses) após início de administração da terapia de célula T (por exemplo, terapia de célula T CAR). Em algumas modalidades, a administração de um inibi- dor de quinase, por exemplo, ibrutinib, é iniciada mais do que cerca de 14 a cerca de 35 dias (por exemplo, cerca de 28 a cerca de 35 dias, por exemplo, de ou de cerca de 31, 32, 33, 34 ou 35 dias) após início da administração da terapia celular. Em algumas modalidades, no mo- mento da administração de um inibidor de quinase, por exemplo, ibruti- nib, o indivíduo não exibe uma toxicidade severa após administração da terapia celular. Em algumas modalidades, a malignidade de célula é
NHL, tal como NHL ou DLBCL agressivo recorrente/refratário. Em algu- mas modalidades, administração de um inibidor de quinase, por exem- plo, ibrutinib, é encerrada ou interrompida de ou de cerca de 6 meses após início de administração da terapia de célula T se o indivíduo alcan- çou, antes até ou cerca de 6 meses, uma resposta completa (CR) após o tratamento ou o câncer, por exemplo, malignidade de célula B, pro- grediu ou recidivou após a remissão após o tratamento. Em algumas modalidades, o regime de ciclismo é continuado por todo o período, mesmo se o indivíduo alcançar uma resposta completa (CR) em um mo- mento antes do fim do período. Em algumas modalidades, a administra- ção de um inibidor de quinase, por exemplo, ibrutinib, é também conti- nuada após o fim do período, tal como é continuada durante mais que 6 meses após início de administração da terapia celular, se, de ou de cerca de seis meses, o indivíduo exibe uma resposta parcial (PR) ou doença estável (SD) após o tratamento. Em algumas modalidades, a administração de um inibidor de quinase, por exemplo, ibrutinib, é con- tinuada até o indivíduo alcançar uma resposta completa (CR) após o tratamento ou até o câncer, por exemplo, malignidade de célula B, pro- gredir ou recair após remissão após o tratamento. Em algumas modali- dades, a terapia celular, tal como células T expressando CAR, compre- ende um receptor de antígeno quimérico especificamente se ligando a um antígeno de célula B. Em algumas modalidades, o antígeno de cé- lula B é CD19.
[00262] Em alguns casos, o regime de dosagem pode ser interrom- pido a qualquer momento, e/ou por uma ou mais vezes. Em alguns ca- sos, o regime de dosagem é interrompido ou modificado se o indivíduo desenvolve um ou mais eventos adversos, toxicidade limitadora de dose (DLT), neutropenia ou neutropenia febril, trombocitopenia, síndrome de liberação de citocina (CRS) e/ou neurotoxicidade (NT), tal como aqueles descritos em Seção IV. Em algumas modalidades, a quantidade de um inibidor de quinase, por exemplo, ibrutinib, para cada administração ou por dia em certos dias de uma semana é alterada após o indivíduo de- senvolver um ou mais eventos adversos, toxicidade limitadora de dose (DLT), neutropenia ou neutropenia febril, trombocitopenia, síndrome de liberação de citocina (CRS) e/ou neurotoxicidade (NT), tal como aqueles descritos em Seção IV.
[00263] Em algumas modalidades, o inibidor de quinase, por exem- plo, ibrutinib é administrado diariamente durante um ciclo de 7, 14, 21, 28, 35, ou 42 dias. Em algumas modalidades, o inibidor de quinase, por exemplo, ibrutinib é administrado duas vezes ao dia durante um ciclo de 7, 14, 21, 28, 35, ou 42 dias. Em algumas modalidades, o inibidor de quinase, por exemplo, ibrutinib é administrado três vezes ao dia durante um ciclo de 7, 14, 21, 28, 35, ou 42 dias. Em algumas modalidades, o inibidor de quinase, por exemplo, ibrutinib é administrado a cada dois dias durante um ciclo de 7, 14, 21, 28, 35, ou 42 dias. Em algumas mo- dalidades, o inibidor de quinase, por exemplo, ibrutinib é administrado em múltiplos ciclos, por exemplo, mais que um ciclo. Em alguns aspec- tos, cada ciclo pode ter aproximadamente 7, 14, 21, 28, 35, ou 42 dias. Em algumas modalidades, o inibidor de quinase, por exemplo, ibrutinib é administrado durante 1, 2, 3, 4, 5, 6, 7, 8, 9, 10, 11, 12, 13, 14, 15, 16, 17, 18, 19, 20, 21, 22, 23, ou 24 ou mais ciclos.
[00264] Em algumas modalidades dos métodos fornecidos aqui, o inibidor de quinase, por exemplo, ibrutinib, e a terapia celular (por exem- plo, terapia de célula T, tal como terapia de célula T CAR) são adminis- trados simultaneamente ou quase simultaneamente.
[00265] Em algumas modalidades, o inibidor de quinase, por exem- plo, ibrutinib, é administrado em uma quantidade de dosagem de ou de cerca de 0,2 mg por kg de peso corporal do indivíduo (mg/kg) a 200 mg/kg, 0,2 mg/kg a 100 mg/kg, 0,2 mg/kg a 50 mg/kg, 0,2 mg/kg a 10 mg/kg, 0,2 mg/kg a 1,0 mg/kg, 1,0 mg/kg a 200 mg/kg, 1,0 mg/kg a 100 mg/kg, 1,0 mg/kg a 50 mg/kg, 1,0 mg/kg a 10 mg/kg, 10 mg/kg a 200 mg/kg, 10 mg/kg a 100 mg/kg, 10 mg/kg a 50 mg/kg, 50 mg/kg a 200 mg/kg, 50 mg/kg a 100 mg/kg ou 100 mg/kg a 200 mg/kg. Em algumas modalidades, o inibidor é administrado em uma dose de cerca de 0,2 mg por kg de peso corporal do indivíduo (mg/kg) a 50 mg/kg, 0,2 mg/kg a 25 mg/kg, 0,2 mg/kg a 10 mg/kg, 0,2 mg/kg a 5 mg/kg, 0,2 mg/kg a 1,0 mg/kg, 1,0 mg/kg a 50 mg/kg, 1,0 mg/kg a 25 mg/kg, 1,0 mg/kg a 10 mg/kg, 1,0 mg/kg a 5 mg/kg, 5 mg/kg a 50 mg/kg, 5 mg/kg a 25 mg/kg, 5 mg/kg a 10 mg/kg, ou 10 mg/kg a 25 mg/kg.
[00266] Em qualquer uma das modalidades acima mencionadas, o ibrutinib pode ser administrado oralmente.
[00267] Em algumas modalidades, dosagens, tais como dosagens diárias, são administradas em uma ou mais doses divididas, tais como 2, 3, ou 4 doses, ou em uma formulação única. O inibidor pode ser ad- ministrado sozinho, na presença de um veículo farmaceuticamente acei- tável, ou na presença de outros agentes terapêuticos.
[00268] Aquele versado na técnica irá reconhecer que dosagens mai- ores ou menores do inibidor podem ser usadas, por exemplo, depen- dendo do agente particular e da via de administração. Em algumas mo- dalidades, o inibidor pode ser administrado sozinho ou na forma de uma composição farmacêutica em que o composto está em mistura ou mis- turado com um ou mais veículos, excipientes, ou diluentes farmaceuti- camente aceitáveis. Em algumas modalidades, o inibidor pode ser ad- ministrado ou sistemicamente ou localmente ao órgão ou tecido a ser tratado. Vias exemplares de administração incluem, mas não são limi- tadas a, tópica, injeção (tal como, subcutânea, intramuscular, intradér- mica, intraperitoneal, intratumoral, e intravenosa), oral, sublingual, retal, transdérmica, intranasal, vaginal e vias inalatórias. Em algumas moda- lidades, a via de administração é via oral, parenteral, retal, nasal, topical,
ou ocular, ou por inalação. Em algumas modalidades, o inibidor é admi- nistrado oralmente. Em algumas modalidades, o inibidor é administrado oralmente em formas de dosagem sólidas, tais como cápsulas, compri- midos e pós, ou em formas de dosagem líquidas, tais como elixires, xa- ropes e suspensões.
[00269] Uma vez que a melhora da doença do paciente tenha ocor- rido, a dose pode ser ajustada para tratamento preventivo ou de manu- tenção. Por exemplo, a dosagem ou a frequência de administração, ou ambas, podem ser reduzidas como uma função dos sintomas, para um nível em que o efeito terapêutico ou profilático desejado seja mantido. Se sintomas forem aliviados para um nível apropriado, tratamento pode ser interrompido. Pacientes podem, entretanto, exigir tratamento inter- mitente em uma base de longo prazo em qualquer recorrência de sinto- mas. Pacientes podem também exigir tratamento crônico em uma base de longo prazo. A. Administração de terapia celular
[00270] Métodos para administração de células para terapia celular adotiva são conhecidos e podem ser usados em conjunto com os méto- dos, composições e artigos fornecidos de fabricação e kits. Por exem- plo, métodos de terapia de célula T adotiva são descritos, por exemplo, em Publicação de Pedido de Patente Norte-Americana No. 2003/0170238 para Gruenberg et al; Patente Norte-Americana No. 4,690,915 para Rosenberg; Rosenberg (2011) Nat Rev Clin Oncol. 8(10):577-85). Ver, por exemplo, Themeli et al. (2013) Nat Biotechnol. 31(10): 928-933; Tsukahara et al. (2013) Biochem Biophys Res Com- mun 438(1): 84-9; Davila et al. (2013) PLoS ONE 8(4): e61338.
[00271] Em algumas modalidades, as células para uso em ou admi- nistradas em conjunto com os métodos fornecidos contêm ou são pro- jetadas para conter um receptor projetado, por exemplo, um receptor de antígeno projetado, tal como um receptor de antígeno quimérico (CAR),
ou um receptor de célula T (TCR). Entre as composições estão compo- sições e formulações farmacêuticas para administração, tais como para terapia celular adotiva. São também fornecidos métodos terapêuticos para administrar as células e composições aos indivíduos, por exemplo, pacientes, de acordo com os métodos fornecidos, e/ou com os artigos fornecidos de fabricação ou composições.
[00272] As células geralmente expressam receptores recombinan- tes, tais como receptores de antígeno incluindo receptores de antígeno não TCR funcional, por exemplo, receptor de antígeno quiméricos (CARs), e outros receptores de ligação ao antígeno tais como recepto- res de célula T transgênica (TCRs). Também entre os receptores estão outros receptores quiméricos. Células projetadas exemplares para ad- ministração como a terapia celular nos métodos fornecidos são descri- tas em Seção II.
[00273] Em algumas modalidades, a terapia celular, por exemplo, te- rapia de célula T adotiva, é realizada por transferência autóloga, em que as células são isoladas e/ou de outro modo preparadas a partir indivíduo que deve receber a terapia celular, ou de uma amostra derivada de tal indivíduo. Desse modo, em alguns aspectos, as células são derivadas de um indivíduo, por exemplo, paciente, em necessidade de um trata- mento e as células, após isolamento e processamento são administra- das ao mesmo indivíduo.
[00274] Em algumas modalidades, a terapia celular, por exemplo, te- rapia de célula T adotiva, é realizada por transferência alogênica, em que as células são isoladas e/ou de outro modo preparadas a partir de um indivíduo outro que não um indivíduo que deve receber ou que final- mente recebe a terapia celular, por exemplo, um primeiro indivíduo. Em tais modalidades, as células em seguida são administradas a um indiví- duo diferente, por exemplo, um segundo indivíduo, da mesma espécie.
Em algumas modalidades, o primeiro e segundo indivíduos são geneti- camente idênticos. Em algumas modalidades, o primeiro e segundo in- divíduos são geneticamente similares. Em algumas modalidades, o se- gundo indivíduo expressa a mesma classe ou supertipo de HLA como o primeiro indivíduo.
[00275] As células da terapia de célula T podem ser administradas em uma composição formulada para administração, ou alternativa- mente, em mais que uma composição (por exemplo, duas composições) formulada para administração separada. As doses das células podem incluir um número particular ou número relativo de células ou das células projetadas e/ou uma relação definida ou composições de dois ou mais subtipos dentro da composição, tais com como células T CD4 vs.CD8.
[00276] As células podem ser administradas por quaisquer meios adequados, por exemplo, por infusão em bolus, por injeção, por exem- plo, injeções intravenosas ou subcutâneas, injeção intraocular, injeção periocular, injeção sub-retiniana, injeção intravítrea, injeção trans-sep- tal, injeção subescleral, injeção intracoroidal, injeção intracameral, inje- ção subconjuntival, injeção subtenoniana, injeção retrobulbar, injeção peribulbar, ou liberação justaescleral posterior. Em algumas modalida- des, elas são administradas por administração parenteral, intrapulmo- nar, e intranasal, e, se desejado para tratamento local, intralesional. In- fusões parenterais incluem administração intramuscular, intravenosa, intra-arterial, intraperitoneal, ou subcutânea. Em algumas modalidades, uma determinada dose é administrada por uma administração de bolus único das células. Em algumas modalidades, ela é administrada por ad- ministração de múltiplos bolus das células, por exemplo, durante um pe- ríodo de não mais que 3 dias, ou por administração de infusão contínua das células. Em algumas modalidades, administração da dose celular ou quaisquer terapias adicionais, por exemplo, a terapia de linfodeple- ção, terapia de intervenção e/ou terapia de combinação, é realizada por meio de liberação ambulatorial.
[00277] Para o tratamento de doença, a dosagem apropriada pode depender do tipo de doença a ser tratada, o tipo de células ou recepto- res recombinantes, a severidade e curso da doença, terapia anterior, a história clínica do indivíduo e resposta às células, e a discrição do mé- dico assistente. As composições e células são em algumas modalida- des adequadamente administradas ao indivíduo uma vez ou durante uma série de tratamentos.
[00278] Indivíduos de precondicionamento com terapias de imunode- pleção (por exemplo, linfodepleção) em alguns aspectos podem melho- rar os efeitos de terapia celular adotiva (ACT).
[00279] Desse modo, em algumas modalidades, os métodos incluem administrar um agente de precondicionamento, tal como um agente de linfodepleção ou quimioterapêutico, tal como ciclofosfamida, fludara- bina, ou combinações dos mesmos, a um indivíduo antes do início da terapia celular. Por exemplo, ao indivíduo pode ser administrado, um agente de precondicionamento pelo menos 2 dias antes, tal como pelo menos 3, 4, 5, 6, ou 7 dias antes do início da terapia celular. Em algumas modalidades, ao indivíduo é administrado um agente de precondiciona- mento não mais que 7 dias antes, tal como não mais que 6, 5, 4, 3, ou 2 dias antes, do início da terapia celular.
[00280] Após administração das célula, a atividade biológica das po- pulações de células projetadas em algumas modalidades é medida, por exemplo, por qualquer um de um número de métodos conhecidos. Pa- râmetros para avaliação incluem ligação específica de uma célula T na- tural ou projetada ou outra célula imune ao antígeno, in vivo, por exem- plo, por imageamento, ou ex vivo, por exemplo, por ELISA ou citometria de fluxo. Em certas modalidades, a habilidade das células projetadas para destruir células alvo pode ser medida usando qualquer um dos mé-
todos conhecidos adequados, tais como ensaios de citotoxicidade des- critos em, por exemplo, Kochenderfer et al., J. Immunotherapy, 32(7): 689-702 (2009), e Herman et al. J. Immunological Methods, 285(1): 25- 40 (2004). Em certas modalidades, a atividade biológica das células é medida ensaiando expressão e/ou secreção de uma ou mais citocinas, tais como CD107a, IFNγ, IL-2, e TNF. Em alguns aspectos a atividade biológica é medida avaliando resultados clínicos, tais como redução na sobrecarga ou carga tumoral.
1. Composições e Formulações
[00281] Em algumas modalidades, a dose de células da terapia ce- lular, tal como um terapia de célula T compreendendo células projetadas com um receptor de antígeno recombinante, por exemplo, CAR ou TCR, é fornecida como uma composição ou formulação, tal como uma com- posição ou formulação farmacêutica. Tais composições podem ser usa- das de acordo com os métodos fornecidos e/ou com os artigos de fabri- cação ou composições fornecidos, tais como no tratamento de uma ma- lignidade de célula B.
[00282] O termo “formulação farmacêutica” refere-se a uma prepara- ção que está em tal forma a permitir que a atividade biológica de um ingrediente ativo contido ali seja eficaz, e que não contenha componen- tes adicionais que sejam inaceitavelmente tóxicos a um indivíduo ao qual a formulação seria administrada.
[00283] Um “veículo farmaceuticamente aceitável” refere-se a um in- grediente na formulação farmacêutica, outro que não um ingrediente ativo, que é não tóxico para um indivíduo. Um veículo farmaceutica- mente aceitável inclui, mas não é limitado a, um tampão, excipiente, es- tabilizante, ou conservante.
[00284] Em algumas modalidades, a terapia celular, tal como células T projetadas (por exemplo, células T CAR), é formulada com um veículo farmaceuticamente aceitável. Em alguns aspectos, a escolha de veículo é determinada em parte pela célula ou agente particular e/ou pelo mé- todo de administração. Portanto, existe uma variedade de formulações adequadas. Por exemplo, a composição farmacêutica pode conter con- servantes. Conservantes adequados podem incluir, por exemplo, metil- parabeno, propilparabeno, benzoato de sódio, e cloreto de benzalcônio. Em alguns aspectos, uma mistura de dois ou mais conservantes é usada. O conservante ou misturas do mesmo estão tipicamente presen- tes em uma quantidade de cerca de 0,0001% a cerca de 2% por peso da composição total. Veículos são descritos, por exemplo, por Reming- ton's Pharmaceutical Sciences 16ª edição, Osol, A. Ed. (1980). Veículos farmaceuticamente aceitáveis são geralmente não tóxicos para recipi- entes em dosagens e concentrações usadas, e incluem, mas não são limitados a: tampões tais como fosfato, citrato, e outros ácidos orgâni- cos; antioxidantes incluindo ácido ascórbico e metionina; conservantes (tais como cloreto de octadecildimetilbenzil amônio; cloreto de hexame- tônio; cloreto de benzalcônio; cloreto de benzetônio; fenol, álcool butílico ou benzílico; alquil parabenos tais como metil ou propil parabeno; cate- col; resorcinol; ciclo-hexanol; 3-pentanol; e m-cresol); polipeptídeos de baixo peso molecular (menos que cerca de 10 resíduos); proteínas, tais como albumina sérica, gelatina, ou imunoglobulinas; polímeros hidrofíli- cos tais como polivinilpirrolidona; aminoácidos tais como glicina, gluta- mina, aspargina, histidina, arginina, ou lisina; monossacarídeos, dissa- carídeos, e outros carboidratos incluindo glicose, manose, ou dextrinas; agentes quelantes tais como EDTA; açúcares tais como sucrose, mani- tol, trealose ou sorbitol; contraíons de formação de sal tais como sódio; complexos de metal (por exemplo, complexos de proteína Zn); e/ou ten- soativos não iônicos tais como polietileno glicol (PEG).
[00285] Agentes de tamponamento em alguns aspectos estão inclu- sos nas composições. Agentes de tamponamento adequados incluem, por exemplo, ácido cítrico, citrato de sódio, ácido fosfórico, fosfato de potássio, e vários outros ácidos e sais. Em alguns aspectos, uma mis- tura de dois ou mais agentes de tamponamento é usada. O agente de tamponamento ou misturas do mesmo estão tipicamente presentes em uma quantidade de cerca de 0,001% a cerca de 4% por peso da com- posição total. Métodos para preparar composições farmacêuticas admi- nistráveis são conhecidos. Métodos exemplares são descritos em mais detalhes em, por exemplo, Remington: The Science and Practice of Pharmacy, Lippincott Williams & Wilkins; 21ª ed. (1 de maio, 2005).
[00286] As formulações podem incluir soluções aquosas. A formula- ção ou composição pode também conter mais que um ingrediente ativo útil para a indicação particular, doença, ou condição sendo tratada com as células ou agentes, onde as respectivas atividades não afetam ad- versamente a uma outra. Tais ingrediente ativos estão adequadamente presentes em combinação em quantidades que são eficazes para o pro- pósito pretendido. Assim, em algumas modalidades, a composição far- macêutica também inclui outros agentes farmaceuticamente ativos ou fármacos, tais como agentes quimioterapêuticos, por exemplo, aspara- ginase, bussulfano, carboplatina, cisplatina, daunorubicina, doxorubi- cina, fluorouracila, gencitabina, hidroxiureia, metotrexato, paclitaxel, ri- tuximabe, vinblastina, vincristina, etc.
[00287] A composição farmacêutica em algumas modalidades con- tém células em quantidades eficazes para tratar a doença ou condição, tais como uma quantidade terapeuticamente eficaz ou profilaticamente eficaz. Eficácia terapêutica em algumas modalidades é monitorada por avaliação periódica de indivíduos tratados. Para administrações repeti- das durante vários dias ou mais, dependendo da condição, o tratamento é repetido até que a supressão desejada de sintomas da doença ocorra. Entretanto, outros regimes de dosagem podem ser úteis e podem ser determinados. A dosagem desejada pode ser liberada por uma adminis- tração de único bolus da composição, por administrações de múltiplos bolus da composição, ou por administração por infusão contínua da composição.
[00288] As células podem ser administradas usando técnicas de ad- ministração padrão, formulações, e/ou dispositivos. Formulações e dis- positivos são fornecidos, tais como seringas e frascos, para armazena- mento e administração das composições. Em relação às células, admi- nistração pode ser autóloga ou heteróloga. Por exemplo, células imu- norresponsivas ou progenitoras podem ser obtidas de um indivíduo, e administradas ao mesmo indivíduo ou um indivíduo diferente, compatí- vel. Células imunorresponsivas derivadas de sangue periférico ou sua progênie (por exemplo, in vivo, ex vivo ou derivadas in vitro) podem ser administradas por meio de injeção localizada, incluindo administração por cateter, injeção sistêmica, injeção localizada, injeção intravenosa, ou administração parenteral. Quando administrando uma composição terapêutica (por exemplo, uma composição farmacêutica contendo uma célula imunorresponsiva geneticamente modificada), ela geralmente será formulada em uma forma injetável de dosagem unitária (solução, suspensão, emulsão).
[00289] Formulações incluem aquelas para administração oral, intra- venosa, intraperitoneal, subcutânea, pulmonar, transdérmica, intramus- cular, intranasal, bucal, sublingual, ou supositória. Em algumas modali- dades, o agente ou populações celulares são administrados parenteral- mente. O termo “parenteral,” como usado aqui, inclui administração in- travenosa, intramuscular, subcutânea, retal, vaginal, e intraperitoneal. Em algumas modalidades, o agente ou populações celulares são admi- nistrados a um indivíduo usando liberação sistêmica periférica por inje- ção intravenosa, intraperitoneal, ou subcutânea.
[00290] Composições em algumas modalidades são fornecidas como preparações líquidas estéreis, por exemplo, soluções aquosas isotônicas, suspensões, emulsões, dispersões, ou composições visco- sas, que podem em alguns aspectos ser tamponados para um pH sele- cionado. Preparações líquidas são normalmente mais fáceis de prepa- rar que géis, outras composições viscosas, e composições sólidas. Além disso, composições líquidas são um pouco mais convenientes de administrar, especialmente por injeção. Composições viscosas, por ou- tro lado, podem ser formuladas dentro da faixa de viscosidade apropri- ada para fornecer períodos de contato maiores com tecidos específicos. Composições viscosas ou líquidas podem compreender veículos, que podem ser um solvente ou meio de dispersão contendo, por exemplo, água, solução salina, solução salina tamponada com fosfato, poliol (por exemplo, glicerol, propileno glicol, polietileno glicol líquido) e misturas adequadas dos mesmos.
[00291] Soluções injetáveis estéreis podem ser preparadas incorpo- rando as células em um solvente, tal como em mistura com um veículo adequado, diluente, ou excipiente tal como água estéril, solução salina fisiológica, glicose, dextrose, ou similares.
[00292] As formulações a serem usadas para administração in vivo são geralmente estéreis. Esterilidade pode ser prontamente realizada, por exemplo, por filtração através de membranas de filtração estéreis.
2. Dosagem
[00293] Em algumas modalidades, a dose de células é administrada a indivíduos de acordo com os métodos fornecidos, e/ou com os artigos de fabricação fornecidos ou composições. Em algumas modalidades, o tamanho ou tempo das doses é determinado como uma função da do- ença ou condição particular (por exemplo, câncer, por exemplo, malig- nidade de célula B) no indivíduo. Em alguns casos, o tamanho ou tempo das doses para uma doença particular em vista da descrição fornecida podem ser determinados empiricamente.
[00294] Em algumas modalidades, a dose de células compreende entre de ou de cerca de 2 x 105 das células/kg e de ou de cerca de 2 x 106 das células/kg, tal como entre de ou de cerca de 4 x 105 das célu- las/kg e de ou de cerca de 1 x 106 das células/kg ou entre de ou de cerca de 6 x 105 das células/kg e de ou de cerca de 8 x 105 das células/kg. Em algumas modalidades, a dose de células compreende não mais que 2 x 105 das células (por exemplo, células expressando antígeno, tal como expressando CAR) por quilograma de peso corporal do indivíduo (células/kg), tal como não mais que de ou de cerca de 3 x 105 células/kg, não mais que de ou de cerca de 4 x 105 células/kg, não mais que de ou de cerca de 5 x 105 células/kg, não mais que de ou de cerca de 6 x 10 5 células/kg, não mais que de ou de cerca de 7 x 105 células/kg, não mais que de ou de cerca de 8 x 105 células/kg, não mais que de ou de cerca de 9 x 105 células/kg, não mais que de ou de cerca de 1 x 106 células/kg, ou não mais que de ou de cerca de 2 x 106 células/kg. Em algumas modalidades, a dose de células compreende pelo menos ou pelo menos cerca de ou de ou de cerca de 2 x 105 das células (por exemplo, células expressando antígeno, tal como expressando CAR) por quilograma de peso corporal do indivíduo (células/kg), tal como pelo menos ou pelo menos cerca de ou de ou de cerca de 3 x 105 células/kg, pelo menos ou pelo menos cerca de ou de ou de cerca de 4 x 10 5 células/kg, pelo me- nos ou pelo menos cerca de ou de ou de cerca de 5 x 105 células/kg, pelo menos ou pelo menos cerca de ou de ou de cerca de 6 x 105 célu- las/kg, pelo menos ou pelo menos cerca de ou de ou de cerca de 7 x 105 células/kg, pelo menos ou pelo menos cerca de ou de ou de cerca de 8 x 105 células/kg, pelo menos ou pelo menos cerca de ou de ou de cerca de 9 x 105 células/kg, pelo menos ou pelo menos cerca de ou de ou de cerca de 1 x 106 células/kg, ou pelo menos ou pelo menos cerca de ou de ou de cerca de 2 x 106 células/kg.
[00295] Em certas modalidades, as células, ou populações individu- ais de subtipos de células, são administradas ao indivíduo em uma faixa de ou de cerca de um milhão até ou cerca de 100 bilhões de células e/ou aquela quantidade de células por quilograma de peso corporal, tal como, por exemplo, 1 milhão até ou cerca de 50 bilhões de células (por exemplo, de ou de cerca de 5 milhões de células, de ou de cerca de 25 milhões de células, de ou de cerca de 500 milhões de células, de ou de cerca de 1 bilhão de células, de ou de cerca de 5 bilhões de células, de ou de cerca de 20 bilhões de células, de ou de cerca de 30 bilhões de células, de ou de cerca de 40 bilhões de células, ou uma faixa definida por qualquer um dos dois valores acima mencionados), de ou de cerca de 1 milhão até ou cerca de 50 bilhões de células (por exemplo, de ou de cerca de 5 milhões de células, de ou de cerca de 25 milhões de cé- lulas, de ou de cerca de 500 milhões de células, de ou de cerca de 1 bilhão de células, de ou de cerca de 5 bilhões de células, de ou de cerca de 20 bilhões de células, de ou de cerca de 30 bilhões de células, de ou de cerca de 40 bilhões de células, ou uma faixa definida por qualquer um dos dois valores acima mencionados), tal como de ou de cerca de 10 milhões até ou cerca de 100 bilhões de células (por exemplo, de ou de cerca de 20 milhões de células, de ou de cerca de 30 milhões de células, de ou de cerca de 40 milhões de células, de ou de cerca de 60 milhões de células, de ou de cerca de 70 milhões de células, de ou de cerca de 80 milhões de células, de ou de cerca de 90 milhões de células, de ou de cerca de 10 bilhões de células, de ou de cerca de 25 bilhões de células, de ou de cerca de 50 bilhões de células, de ou de cerca de 75 bilhões de células, de ou de cerca de 90 bilhões de células, ou uma faixa definida por qualquer um dos dois valores acima mencionados), e em alguns casos de ou de cerca de 100 milhões de células até ou cerca de 50 bilhões de células (por exemplo, de ou de cerca de 120 milhões de células, de ou de cerca de 250 milhões de células, de ou de cerca de 350 milhões de células, de ou de cerca de 450 milhões de células, de ou de cerca de 650 milhões de células, de ou de cerca de 800 milhões de células, de ou de cerca de 900 milhões de células, de ou de cerca de 3 bilhões de células, de ou de cerca de 30 bilhões de células, de ou de cerca de 45 bilhões de células) ou qualquer valor entre essas faixas e/ou por quilograma de peso corporal. Dosagens podem variar dependendo de atributos particulares para a doença ou distúrbio e/ou paciente e/ou outros tratamentos.
[00296] Em algumas modalidades, as doses de células compreen- dem de ou de cerca de 1 x 105 até ou cerca de 5 x 108 células T totais expressando CAR, de ou de cerca de 1 x 105 até ou cerca de 2,5 x 108 células T totais expressando CAR, de ou de cerca de 1 x 105 até ou cerca de 1 x 108 células T totais expressando CAR, de ou de cerca de 1 x 105 até ou cerca de 5 x 107 células T totais expressando CAR, de ou de cerca de 1 x 105 até ou cerca de 2,5 x 107 células T totais expres- sando CAR, de ou de cerca de 1 x 105 até ou cerca de 1 x 107 células T totais expressando CAR, de ou de cerca de 1 x 105 até ou cerca de 5 x 106 células T totais expressando CAR, de ou de cerca de 1 x 105 até ou cerca de 2,5 x 106 células T totais expressando CAR, de ou de cerca de 1 x 105 até ou cerca de 1 x 106 células T totais expressando CAR, de ou de cerca de 1 x 106 até ou cerca de 5 x 108 células T totais expressando CAR, de ou de cerca de 1 x 106 até ou cerca de 2,5 x 108 células T totais expressando CAR, de ou de cerca de 1 x 106 até ou cerca de 1 x 108 células T totais expressando CAR, de ou de cerca de 1 x 106 até ou cerca de 5 x 107 células T totais expressando CAR, de ou de cerca de 1 x 106 até ou cerca de 2,5 x 107 células T totais expressando CAR, de ou de cerca de 1 x 106 até ou cerca de 1 x 107 células T totais expres- sando CAR, de ou de cerca de 1 x 106 até ou cerca de 5 x 106 células T totais expressando CAR, de ou de cerca de 1 x 106 até ou cerca de 2,5 x 106 células T totais expressando CAR, de ou de cerca de 2,5 x 106 até ou cerca de 5 x 108 células T totais expressando CAR, de ou de cerca de 2,5 x 106 até ou cerca de 2,5 x 108 células T totais expressando CAR,
de ou de cerca de 2,5 x 106 até ou cerca de 1 x 108 células T totais expressando CAR, de ou de cerca de 2,5 x 106 até ou cerca de 5 x 107 células T totais expressando CAR, de ou de cerca de 2,5 x 106 até ou cerca de 2,5 x 107 células T totais expressando CAR, de ou de cerca de 2,5 x 106 até ou cerca de 1 x 107 células T totais expressando CAR, de ou de cerca de 2,5 x 106 até ou cerca de 5 x 106 células T totais expres- sando CAR, de ou de cerca de 5 x 106 até ou cerca de 5 x 108 células T totais expressando CAR, de ou de cerca de 5 x 106 até ou cerca de 2,5 x 108 células T totais expressando CAR, de ou de cerca de 5 x 106 até ou cerca de 1 x 108 células T totais expressando CAR, de ou de cerca de 5 x 106 até ou cerca de 5 x 107 células T totais expressando CAR, de ou de cerca de 5 x 106 até ou cerca de 2,5 x 107 células T totais expres- sando CAR, de ou de cerca de 5 x 106 até ou cerca de 1 x 107 células T totais expressando CAR, de ou de cerca de 1 x 107 até ou cerca de 5 x 108 células T totais expressando CAR, de ou de cerca de 1 x 107 até ou cerca de 2,5 x 108 células T totais expressando CAR, de ou de cerca de 1 x 107 até ou cerca de 1 x 108 células T totais expressando CAR, de ou de cerca de 1 x 107 até ou cerca de 5 x 107 células T totais expressando CAR, de ou de cerca de 1 x 107 até ou cerca de 2,5 x 107 células T totais expressando CAR, de ou de cerca de 2,5 x 107 até ou cerca de 5 x 108 células T totais expressando CAR, de ou de cerca de 2,5 x 107 até ou cerca de 2,5 x 108 células T totais expressando CAR, de ou de cerca de 2,5 x 107 até ou cerca de 1 x 108 células T totais expressando CAR, de ou de cerca de 2,5 x 107 até ou cerca de 5 x 107 células T totais expres- sando CAR, de ou de cerca de 5 x 107 até ou cerca de 5 x 108 células T totais expressando CAR, de ou de cerca de 5 x 107 até ou cerca de 2,5 x 108 células T totais expressando CAR, de ou de cerca de 5 x 10 7 até ou cerca de 1 x 108 células T totais expressando CAR, de ou de cerca de 1 x 108 até ou cerca de 5 x 108 células T totais expressando CAR, de ou de cerca de 1 x 108 até ou cerca de 2,5 x 108 células T totais expres- sando CAR, de ou de cerca de 2,5 x 108 até ou cerca de 5 x 108 células T totais expressando CAR.
[00297] Em algumas modalidades, as doses de células compreen- dem pelo menos ou pelo menos cerca de 1 x 105 de células expressando CAR, pelo menos ou pelo menos cerca de 2,5 x 105 de células expres- sando CAR, pelo menos ou pelo menos cerca de 5 x 105 de células expressando CAR, pelo menos ou pelo menos cerca de 1 x 10 6 de cé- lulas expressando CAR, pelo menos ou pelo menos cerca de 2,5 x 106 de células expressando CAR, pelo menos ou pelo menos cerca de 5 x 106 de células expressando CAR, pelo menos ou pelo menos cerca de 1 x 107 de células expressando CAR, pelo menos ou pelo menos cerca de 2,5 x 107 de células expressando CAR, pelo menos ou pelo menos cerca de 5 x 107 de células expressando CAR, pelo menos ou pelo me- nos cerca de 1 x 108 de células expressando CAR, pelo menos ou pelo menos cerca de 2,5 x 108 de células expressando CAR, ou pelo menos ou pelo menos cerca de 5 x 108 de células expressando CAR.
[00298] Em algumas modalidades, a dose de células é uma dose plana de células ou dose fixa de células de modo que a dose de células não seja presa a, ou com base na área de superfície corporal ou no peso de um indivíduo.
[00299] Em algumas modalidades, por exemplo, onde o indivíduo é um humano, a dose inclui menos que de ou de cerca de 5 x 10 8 de células expressando receptor recombinante total (por exemplo, CAR), células T, ou células mononucleares de sangue periférico (PBMCs), por exemplo, na faixa de ou de cerca de 1 x 106 até ou cerca de 5 x 108 de tais células, tal como de ou de cerca de 2 x 106, 5 x 106, 1 x 107, 5 x 107, 1 x 108 2 x 108, 3 x 108, 4 x 108 ou 5 x 108 tais células totais, ou a faixa entre qualquer um dos dois valores acima mencionados. Em algumas modalidades, onde o indivíduo é um humano, a dose inclui entre de ou de cerca de 1 x 106 e em ou 3 x 108 de células expressando receptor recombinante total (por exemplo, CAR), por exemplo, na faixa de ou de cerca de 1 x 107 até ou cerca de 2 x 108 de tais células, tal como de ou de cerca de 1 x 107, 5 x 107, 1 x 108 ou 1,5 x 108 de tais células totais, ou a faixa entre qualquer um dos dois dos valores acima mencionados. Em algumas modalidades, ao paciente são administradas múltiplas do- ses, e cada uma das doses ou a dose total pode estar dentro de qual- quer um dos valores acima mencionados. Em algumas modalidades, a dose de células compreende a administração de ou de cerca de 1 x 105 até ou cerca de 5 x 108 células T expressando receptor recombinante total (por exemplo, CAR) ou células T totais, de ou de cerca de 1 x 105 até ou cerca de 1 x 108 células T expressando receptor recombinante total (por exemplo, CAR) ou células T totais, de ou de cerca de 5 x 105 até ou cerca de 1 x 107 células T expressando receptor recombinante total (por exemplo, CAR) ou células T totais, ou partir de ou de cerca de 1 x 106 até ou cerca de 1 x 107 células T expressando receptor recom- binante total (por exemplo, CAR) ou células T totais, cada inclusive.
[00300] Em algumas modalidades, as células T da dose incluem cé- lulas T CD4+, células T CD8+ ou células T CD4+ e T CD8+.
[00301] Em algumas modalidades, por exemplo, onde o indivíduo é humano, as células T CD8+ da dose, incluindo em uma dose incluindo células T CD4+ e T CD8+, incluem entre de ou de cerca de 1 x 106 e de ou de cerca de 1 x 108 de células CD8+ expressando receptor recombi- nante total (por exemplo, CAR), por exemplo, na faixa de ou de cerca de 5 x 106 até ou cerca de 1 x 108 de tais células, tais células de ou de cerca de 1 x 107, 2,5 x 107, 5 x 107, 7,5 x 107, 1 x 108, 1,5 x 108, ou 5 x 108 de tais células totais, ou a faixa entre qualquer um dos dois dos valores acima mencionados. Em algumas modalidades, ao paciente são administradas múltiplas doses, e cada uma das doses ou a dose total pode estar dentro dos valores acima mencionados. Em algumas moda- lidades, a dose de células compreende a administração de ou de cerca de 1 x 107 até ou cerca de 0,75 x 108 de células T CD8+ expressando receptor recombinante total, de ou de cerca de 1 x 107 até ou cerca de 2,5 x 107 de células T CD8+ expressando receptor recombinante total, de ou de cerca de 1 x 107 até ou cerca de 0,75 x 108 de células T CD8+ expressando receptor recombinante total, cada inclusive. Em algumas modalidades, a dose de células compreende a administração de ou de cerca de 1 x 107, 2,5 x 107, 5 x 107, 7,5 x 107, 1 x 108, 1,5 x 108, ou 5 x 108 de células T CD8+ expressando receptor recombinante total.
[00302] Em algumas modalidades, por exemplo, onde o indivíduo é humano, as células T CD4+ da dose, incluindo em uma dose incluindo células T CD4+ e T CD8+, incluem entre de ou de cerca de 1 x 106 e de ou de cerca de 1 x 108 de células CD4+ expressando receptor recombi- nante total (por exemplo, CAR), por exemplo, na faixa de ou de cerca de 5 x 106 a 1 x 108 de tais células, de ou de cerca de 1 x 107, 2,5 x 107, 5 x 107, 7,5 x 107, 1 x 108, 1,5 x 108, ou 5 x 108 de tais células totais, ou a faixa entre qualquer um dos dois dos valores acima mencionados. Em algumas modalidades, ao paciente são administradas múltiplas doses, e cada uma das doses ou a dose total pode estar dentro de qualquer um dos valores acima mencionados. Em algumas modalidades, a dose de células compreende a administração de ou de cerca de 1 x 107 até ou cerca de 0,75 x 108 de células T CD4+ expressando receptor recom- binante total, a partir de ou de cerca de 1 x 107 até ou cerca de 2,5 x 107 de células T CD4+ expressando receptor recombinante total, a partir de ou de cerca de 1 x 107 até ou cerca de 0,75 x 108 de células T CD4+ expressando receptor recombinante total, cada inclusive. Em algumas modalidades, a dose de células compreende a administração de ou de cerca de 1 x 107, 2,5 x 107, 5 x 107 7,5 x 107, 1 x 108, 1,5 x 108, ou 5 x 108 de células T CD4+ expressando receptor recombinante total.
[00303] Em algumas modalidades, a dose de células, por exemplo, células T expressando receptor recombinante, é administrada ao indiví- duo como uma dose única ou é administrada apenas uma vez dentro de um período de duas semanas, um mês, três meses, seis meses, 1 ano ou mais.
[00304] No contexto de terapia celular adotiva, administração de uma determinada "dose" abrange administração da determinada quantidade ou número de células como uma única composição e/ou administração ininterrupta única, por exemplo, como uma injeção única ou infusão con- tínua, e também abrange administração da determinada quantidade ou número de células como uma dose dividida ou como uma pluralidade de composições, fornecida em composições individuais múltiplas ou in- fusões, durante um período específico de tempo, tal como durante não mais que 3 dias. Assim, em alguns contextos, a dose é uma administra- ção única ou contínua do número específico de células, determinada ou iniciada em um único ponto no tempo. Em alguns contextos, entretanto, a dose é administrada em múltiplas injeções ou infusões durante um período de não mais que três dias, tal como uma vez ao dia durante três dias ou durante dois dias ou por múltiplas infusões durante um período de um único dia.
[00305] Assim, em alguns aspectos, as células da dose são adminis- tradas em uma composição farmacêutica única. Em algumas modalida- des, as células da dose são administradas em uma pluralidade de com- posições, coletivamente contendo as células da dose.
[00306] Em algumas modalidades, o termo “dose dividida” refere-se a uma dose que é dividida de modo que ela é administrada durante mais que um dia. Este tipo de dosagem é englobado pelos presentes méto- dos e é considerado ser uma dose única.
[00307] Assim, a dose de células pode ser administrada como uma dose dividida, por exemplo, uma dose dividida administrada durante o tempo. Por exemplo, em algumas modalidades, a dose pode ser admi- nistrada ao indivíduo durante 2 dias ou durante 3 dias. Métodos exem- plares para dosagem dividida incluem administrar 25% da dose no pri- meiro dia e administrar os 75% restantes da dose no segundo dia. Em outras modalidades, 33% da dose podem ser administrados no primeiro dia e os 67% restantes administrados no segundo dia. Em alguns as- pectos, 10% da dose é administrado no primeiro dia, 30% da dose é administrado no segundo dia, e 60% da dose é administrado no terceiro dia. Em algumas modalidades, a dose dividida não é distribuída durante mais que 3 dias.
[00308] Em algumas modalidades, células da dose podem ser admi- nistradas pela administração de uma pluralidade de composições ou so- luções, tais como uma primeira e uma segunda, opcionalmente mais, cada uma contendo algumas células da dose. Em alguns aspectos, a pluralidade de composições, cada uma contendo uma diferente popula- ção e/ou subtipos de células, é administrada separadamente ou inde- pendentemente, opcionalmente dentro de um certo período de tempo. Por exemplo, as populações ou subtipos de células podem incluir célu- las T CD8+ e T CD4+, respectivamente, e/ou populações enriquecidas com CD8+ e CD4+, respectivamente, por exemplo, células T CD4+ e/ou T CD8+ cada um individualmente incluindo células geneticamente pro- jetadas para expressar o receptor recombinante. Em algumas modali- dades, a administração da dose compreende administração de uma pri- meira composição compreendendo uma dose de células T CD8+ ou uma dose de células T CD4+ e administração e uma segunda composi- ção compreendendo a outra de uma dose de células T CD4+ e as célu- las T CD8+.
[00309] Em algumas modalidades, a administração da composição ou dose, por exemplo, administração da composição de uma pluralidade de células, envolve administração das composições celulares separa- damente. Em alguns aspectos, as administrações separadas são reali- zadas simultaneamente, ou sequencialmente, em qualquer ordem. Em algumas modalidades, a dose compreende uma primeira composição e uma segunda composição, e a primeira composição e segunda compo- sição são administradas a partir de ou de cerca de 0 até ou cerca de 12 horas de intervalo, a partir de ou de cerca de 0 até ou cerca de 6 horas de intervalo ou a partir de ou de cerca de 0 até ou cerca de 2 horas de intervalo. Em algumas modalidades, o início de administração da pri- meira composição e o início de administração da segunda composição são realizados não mais que de ou de cerca de 2 horas, não mais que de ou de cerca de 1 hora, ou não mais que de ou de cerca de 30 minutos de intervalo, não mais que de ou de cerca de 15 minutos, não mais que de ou de cerca de 10 minutos ou não mais que de ou de cerca de 5 minutos de intervalo. Em algumas modalidades, o início e/ou conclusão de administração da primeira composição e a conclusão e/ou início de administração da segunda composição são realizados não mais que de ou de cerca de 2 horas, não mais que de ou de cerca de 1 hora, ou não mais que de ou de cerca de 30 minutos de intervalo, não mais que de ou de cerca de 15 minutos, não mais que de ou de cerca de 10 minutos ou não mais que de ou de cerca de 5 minutos de intervalo.
[00310] Em algumas modalidades, a primeira composição e a se- gunda composição são misturadas antes da administração no indivíduo. Em algumas modalidades, a primeira composição e a segunda compo- sição são misturadas abruptamente (por exemplo, dentro de ou de cerca de 6 horas, 5 horas, 4 horas, 3 horas, 2 horas, 1,5 horas, 1 hora, ou 0,5 hora) antes da administração. Em algumas modalidades, a primeira composição e a segunda composição são misturadas antes da adminis- tração.
[00311] Em algumas composições, a primeira composição, por exemplo, primeira composição da dose, compreende células T CD4+. Em algumas composições, a primeira composição, por exemplo, pri- meira composição da dose, compreende células T CD8+. Em algumas modalidades, a primeira composição é administrada antes da segunda composição.
[00312] Em algumas modalidades, a dose ou composição de células inclui uma relação definida ou alvo de células CD4+ expressando um receptor recombinante para células CD8+ expressando um receptor re- combinante e/ou de células CD4+ para células CD8+, cuja relação op- cionalmente é aproximadamente 1:1 ou está entre aproximadamente 1:3 e aproximadamente 3:1, tal como aproximadamente 1:1. Em alguns aspectos, a administração de uma composição ou dose com a relação alvo ou desejada de populações celulares diferentes (tais como relação CD4+:CD8+ ou relação CAR+CD4+:CAR+CD8+, por exemplo, 1:1) en- volve a administração de uma composição celular contendo uma das populações e em seguida administração de uma composição celular se- parada compreendendo a outra das populações, onde a administração está na ou aproximadamente na relação alvo ou desejada. Em alguns aspectos, administração de uma dose ou composição de células na re- lação definida leva a expansão melhorada, persistência e/ou atividade antitumor da terapia de célula T.
[00313] Em algumas modalidades, o indivíduo recebe múltiplas do- ses, por exemplo, duas ou mais doses ou doses consecutivas múltiplas, das células. Em algumas modalidades, duas doses são administradas a um indivíduo. Em algumas modalidades, o indivíduo recebe a dose consecutiva, por exemplo, segunda dose, aproximadamente 4, 5, 6, 7, 8, 9, 10, 11, 12, 13, 14, 15, 16, 17, 18, 19, 20 ou 21 dias após a primeira dose. Em algumas modalidades, doses consecutivas múltiplas são ad- ministradas após a primeira dose, de modo que uma dose adicional ou doses adicionais são administradas após administração da dose conse- cutiva. Em alguns aspectos, o número de células administrado ao indi- víduo na dose adicional é o mesmo ou similar à primeira dose e/ou dose consecutiva. Em algumas modalidades, a dose adicional ou doses adi- cionais são maiores que doses anteriores.
[00314] Em alguns aspectos, o tamanho da primeira dose e/ou dose consecutiva é determinado com base em um ou mais critérios tais como resposta do indivíduo a tratamento anterior, por exemplo, quimioterapia, carga de doença no indivíduo, tal como carga tumoral, volume, tama- nho, ou grau, extensão, ou tipo de metástase, estágio, e/ou probabili- dade ou incidência do indivíduo desenvolvendo resultados tóxicos, por exemplo, CRS, síndrome de ativação de macrófago, síndrome de lise tumoral, neurotoxicidade, e/ou uma resposta imune do hospedeiro con- tra as células e/ou receptores recombinantes sendo administrados.
[00315] Em alguns aspectos, o tempo entre a administração da pri- meira dose e a administração da dose consecutiva é cerca de 9 a cerca de 35 dias, cerca de 14 a cerca de 28 dias, ou 15 a 27 dias. Em algumas modalidades, a administração da dose consecutiva é em um ponto de tempo mais do que cerca de 14 dias após e menos do que cerca de 28 dias após a administração da primeira dose. Em alguns aspectos, o tempo entre a primeira e a dose consecutiva é cerca de 21 dias. Em algumas modalidades, uma dose adicional ou doses adicionais, por exemplo, doses consecutivas, são administradas após administração da dose consecutiva. Em alguns aspectos, a dose ou doses consecutivas adicionais são administradas pelo menos cerca de 14 e menos do que cerca de 28 dias após administração de uma dose anterior. Em algumas modalidades, a dose adicional é administrada menos do que cerca de 14 dias após a dose anterior, por exemplo, 4, 5, 6, 7, 8, 9, 10, 11, 12, ou 13 dias antes da primeira dose. Em algumas modalidades, nenhuma dose é administrada menos do que cerca de 14 dias após a dose ante- rior e/ou nenhuma dose é administrada mais do que cerca de 28 dias após a dose anterior.
[00316] Em algumas modalidades, a dose de células, por exemplo, células expressando receptor recombinante, compreende duas doses (por exemplo, uma dose dupla), compreendendo uma primeira dose das células T e uma dose consecutiva das células T, em que um ou ambas, a primeira dose e a segunda dose compreendem administração da dose dividida de células T.
[00317] Em algumas modalidades, a dose de células é geralmente maior o suficiente para ser eficaz em redução de carga de doença.
[00318] Em algumas modalidades, as células são administradas em uma dosagem desejada, que em alguns aspectos inclui uma dose de- sejada ou número de células ou tipos celulares e/ou uma relação dese- jada de tipos celulares. Assim, a dosagem de células em algumas mo- dalidades é com base em um número total de células (ou número por kg de peso corporal) e uma relação desejada das populações individuais ou subtipos, tal como a relação CD4+ para CD8+. Em algumas modali- dades, a dosagem de células é com base em um número total desejado (ou número por kg de peso corporal) de células nas populações indivi- duais ou de tipos celulares individuais. Em algumas modalidades, a do- sagem é com base em uma combinação de tais recursos, tal como um número desejado de células totais, relação desejada, e número total de- sejado de células nas populações individuais.
[00319] Em algumas modalidades, as populações ou subtipos de cé- lulas, tais como células T CD8+ e CD4+, são administrados em ou dentro de uma diferença tolerada de uma dose desejada de células totais, tal como uma dose desejada de células T. Em alguns aspectos, a dose desejada é um número desejado de células ou um número desejado de células por unidade de peso corporal do indivíduo a quem as células são administradas, por exemplo, células/kg. Em alguns aspectos, a dose desejada está em ou acima de um número mínimo de células ou número mínimo de células por unidade de peso corporal. Em alguns aspectos, entre as células totais, administradas na dose desejada, as populações individuais ou subtipos estão presentes em ou perto de uma relação de saída desejada (tal como relação CD4+ para CD8+), por exemplo, dentro de uma certa diferença tolerada ou erro de tal relação.
[00320] Em algumas modalidades, as células são administradas em ou dentro de uma diferença tolerada de uma dose desejada de uma ou mais das populações individuais ou subtipos de células, tal como uma dose desejada de células CD4+ e/ou uma dose desejada de células CD8+. Em alguns aspectos, a dose desejada é um número desejado de células do subtipo ou população, ou um número desejado de tais células por unidade de peso corporal do indivíduo a quem as células são admi- nistradas, por exemplo, células/kg. Em alguns aspectos, a dose dese- jada está em ou acima de um número mínimo de células da população ou subtipo, ou número mínimo de células da população ou subtipo por unidade de peso corporal.
[00321] Assim, em algumas modalidades, a dosagem é com base em uma dose fixa desejada de células totais e uma relação desejada, e/ou com base na dose fixa desejada de uma ou mais, por exemplo, cada uma, dos subtipos ou sub-populações. Assim, em algumas modalida- des, a dosagem é com base em uma dose fixa desejada ou mínima de células T e uma relação desejada de células CD4+ para CD8+, e/ou é com base em uma dose fixa desejada ou mínima de células CD4+ e/ou CD8+.
[00322] Em algumas modalidades, as células são administradas em ou dentro de uma faixa tolerada de uma relação de saída desejada de múltiplas populações celulares ou subtipos, tais como células CD4+ e CD8+ ou subtipos. Em alguns aspectos, a relação desejada pode ser uma relação específica ou pode ser uma faixa de relações. Por exemplo, em algumas modalidades, a relação desejada (por exemplo, relação de células CD4+ para CD8+) está entre de ou de cerca de 5:1 e de ou de cerca de 5:1 (ou maior do que cerca de 1:5 e menor do que cerca de 5:1), ou entre de ou de cerca de 1:3 e de ou de cerca de 3:1 (ou maior do que cerca de 1:3 e menor do que cerca de 3:1), tal como entre de ou de cerca de 2:1 e de ou de cerca de 1:5 (ou maior do que cerca de 1:5 e menor do que cerca de 2:1, tal como de ou de cerca de 5:1, 4,5:1, 4:1, 3,5:1, 3:1, 2,5:1, 2:1, 1,9:1, 1,8:1, 1,7:1, 1,6:1, 1,5:1, 1,4:1, 1,3:1, 1,2:1, 1,1:1, 1:1, 1:1,1, 1:1,2, 1:1,3, 1:1,4, 1:1,5, 1:1,6, 1:1,7, 1:1,8, 1:1,9: 1:2, 1:2,5, 1:3, 1:3,5, 1:4, 1:4.5, ou 1:5. Em alguns aspectos, a diferença to- lerada está dentro de cerca de 1%, cerca de 2%, cerca de 3%, cerca de 4% cerca de 5%, cerca de 10%, cerca de 15%, cerca de 20%, cerca de 25%, cerca de 30%, cerca de 35%, cerca de 40%, cerca de 45%, cerca de 50% da relação desejada, incluindo qualquer valor entre estas faixas.
[00323] Em modalidades particulares, os números e/ou concentra- ções de células referem-se a várias células expressando receptor re- combinante (por exemplo, CAR). Em outras modalidades, os números e/ou concentrações de células referem-se ao número ou concentração de todas as células, células T, ou células mononucleares de sangue pe- riférico (PBMCs) administradas.
[00324] Em alguns aspectos, o tamanho da dose é determinado com base em um ou mais critérios tais como resposta do indivíduo a trata- mento, por exemplo, quimioterapia, carga de doença no indivíduo, tal como carga tumoral, volume, tamanho, ou grau, extensão, ou tipo de metástase, estágio, e/ou probabilidade ou incidência do indivíduo de- senvolvendo resultados tóxicos, por exemplo, CRS, síndrome de ativa- ção de macrófago, síndrome de lise tumoral, neurotoxicidade, e/ou a resposta imune de hospedeiro contra as células e/ou receptores recom- binantes sendo administrados.
[00325] Em algumas modalidades, os métodos também incluem ad- ministrar uma ou mais doses adicionais de células expressando um re- ceptor de antígeno quimérico (CAR) e/ou terapia de linfodepleção, e/ou um ou mais etapas dos métodos são repetidos. Em algumas modalida- des, uma ou mais doses adicionais são as mesmas que a dose inicial. Em algumas modalidades, uma ou mais doses adicionais são diferentes da dose inicial, por exemplo, maiores, tal como 2 vezes, 3 vezes, 4 ve- zes, 5 vezes, 6 vezes, 7 vezes, 8 vezes, 9 vezes ou 10 vezes ou maior que a dose inicial, ou inferior, tal como por exemplo, maior, tal como 2 vezes, 3 vezes, 4 vezes, 5 vezes, 6 vezes, 7 vezes, 8 vezes, 9 vezes ou 10 vezes ou mais inferior do que a dose inicial. Em algumas modalida- des, administração de uma ou mais doses adicionais é determinada com base na resposta do indivíduo ao tratamento inicial ou qualquer trata- mento anterior, carga de doença no indivíduo, tal como carga tumoral, volume, tamanho, ou grau, extensão, ou tipo de metástase, estágio, e/ou probabilidade ou incidência do indivíduo desenvolvendo resultados tóxicos, por exemplo, CRS, síndrome de ativação de macrófago, sín- drome de lise tumoral, neurotoxicidade, e/ou a resposta imune de hos- pedeiro contra as células e/ou receptores recombinantes sendo admi- nistrados. B. Tratamento de Linfodepleção
[00326] Em alguns aspectos, os métodos fornecidos podem também incluir administrar uma ou mais terapias de linfodepleção, tais como an- tes de ou simultaneamente com início de administração da imunotera- pia, tal como uma terapia de célula T (por exemplo, células T expres- sando CAR). Em algumas modalidades, a terapia de linfodepleção com- preende administração de uma fosfamida, tal como ciclofosfamida. Em algumas modalidades, a terapia de linfodepleção pode incluir adminis- tração de fludarabina.
[00327] Em alguns aspectos, indivíduos precondicionantes com tera- pias de imunodepleção (por exemplo, linfodepleção) podem melhorar os efeitos de terapia celular adotiva (ACT). Precondicionamento com agen- tes de linfodepleção, incluindo combinações de ciclosporina e fludara- bina, foi eficaz na melhora da eficácia de células de linfócitos infiltrantes de tumor transferidas (TIL) em terapia celular, incluindo melhorar res- posta e/ou persistência das células transferidas. Ver, por exemplo, Du- dley et al., Science, 298, 850-54 (2002); Rosenberg et al., Clin Cancer Res, 17(13):4550–4557 (2011). Do mesmo modo, no contexto de célu- las T CAR+, muitos estudos têm agentes de linfodepleção incorporados, mais comumente ciclofosfamida, fludarabina, bendamustina, ou combi- nações dos mesmos, às vezes acompanhados por irradiação de baixa dose. Ver, Han et al. Journal of Hematology & Oncology, 6:47 (2013); Kochenderfer et al., Blood, 119: 2709-2720 (2012); Kalos et al., Sci Transl Med, 3(95):95ra73 (2011); Clinical Trial Study Record Nos.: NCT02315612; NCT01822652.
[00328] Tal precondicionamento pode ser realizado com o objetivo de reduzir o risco de um ou mais de vários resultados que poderiam diminuir a eficácia da terapia. Isso inclui o fenômeno conhecido como “dissipador de citocina,” pelo qual células T, células B, células NK com- petem com TILs por citocinas homeostáticas e de ativação, tais como IL-2, IL-7, e/ou IL-15; supressão de TILs por células T reguladoras, cé- lulas NK, ou outras células do sistema imune; impacto de reguladores negativos no microambiente tumoral. Muranski et al., Nat Clin Pract On- col. Dezembro; 3(12): 668–681 (2006).
[00329] Assim, em algumas modalidades, o método fornecido tam- bém envolve administrar uma terapia de linfodepleção ao indivíduo. Em algumas modalidades, o método envolve administrar a terapia de linfo- depleção ao indivíduo antes do início da administração de uma dose de células. Em algumas modalidades, a terapia de linfodepleção contém um agente terapêutico tal como fludarabina e/ou ciclofosfamida. Em al- gumas modalidades, a administração das células e/ou a terapia de lin- fodepleção é realizada por meio de liberação ambulatorial.
[00330] Em algumas modalidades, os métodos incluem administrar um agente de precondicionamento, tal como um agente de linfodeple- ção ou quimioterapêutico, tal como ciclofosfamida, fludarabina, ou com- binações dos mesmos, a um indivíduo antes do início da administração de uma dose de células. Por exemplo, ao indivíduo pode ser adminis- trado um agente de precondicionamento pelo menos 2 dias antes, tal como pelo menos 3, 4, 5, 6, ou 7 dias antes, da primeira ou dose sub- sequente. Em algumas modalidades, ao indivíduo é administrado um agente de precondicionamento não mais que 7 dias antes, tal como não mais que 6, 5, 4, 3, ou 2 dias antes, do início de administração de uma dose de células. Em algumas modalidades, ao indivíduo é administrado um agente de precondicionamento entre 2 e 7, inclusive, tal como em 2, 3, 4, 5, 6, ou 7 dias antes do início de a administração de uma dose de células.
[00331] Em algumas modalidades, o indivíduo é precondicionado com ciclofosfamida em uma dose entre ou entre cerca de 20 mg/kg e 100 mg/kg, tal como entre ou entre cerca de 40 mg/kg e 80 mg/kg. Em alguns aspectos, o indivíduo é precondicionado com ou com cerca de 60 mg/kg de ciclofosfamida. Em algumas modalidades, a ciclofosfamida pode ser administrada em uma única dose ou pode ser administrada em uma pluralidade de doses, tal como determinada diariamente, a cada dois dias ou a cada três dias. Em algumas modalidades, a ciclofosfa- mida é administrada uma vez diariamente durante um ou dois dias. Em algumas modalidades, onde o agente de linfodepleção compreende ci- clofosfamida, ao indivíduo é administrado ciclofosfamida em uma dose entre ou entre cerca de 100 mg/m2 e de ou de cerca de 500 mg/m2, tal como entre ou entre cerca de 200 mg/m2 e de ou de cerca de 400 mg/m2,
ou entre de ou de cerca de 250 mg/m2 e de ou de cerca de 350 mg/m2, inclusive. Em alguns casos, ao indivíduo é administrado cerca de 300 mg/m2 de ciclofosfamida. Em algumas modalidades, a ciclofosfamida pode ser administrada em uma única dose ou pode ser administrada em uma pluralidade de doses, tal como determinada diariamente, a cada dois dias ou a cada três dias. Em algumas modalidades, ciclofosfamida é administrada diariamente, tal como durante 1 a 5 dias, por exemplo, durante 3 a 5 dias. Em alguns casos, ao indivíduo é administrado cerca de 300 mg/m2 de ciclofosfamida, diariamente durante 3 dias, antes do início da terapia celular.
[00332] Em algumas modalidades, onde o agente de linfodepleção compreende fludarabina, ao indivíduo é administrada fludarabina em uma dose entre ou entre cerca de 1 mg/m2 e de ou de cerca de 100 mg/m2, tal como entre ou entre cerca de 10 mg/m2 e 75 mg/m2, entre de ou de cerca de 15 mg/m2 e de ou de cerca de 50 mg/m2, entre de ou de cerca de 20 mg/m2 e de ou de cerca de 40 mg/m2, entre de ou de cerca de 24 mg/m2 e de ou de cerca de 35 mg/m2, 20 mg/m2 e de ou de cerca de 30 mg/m2, ou entre de ou de cerca de 24 mg/m2 e de ou de cerca de 26 mg/m2. Em alguns casos, ao indivíduo é administrado 25 mg/m2 de fludarabina. Em alguns casos, ao indivíduo é administrado cerca de 30 mg/m2 de fludarabina. Em algumas modalidades, a fludarabina pode ser administrada em uma única dose ou pode ser administrada em uma plu- ralidade de doses, tal como determinada diariamente, a cada dois dias ou a cada três dias. Em algumas modalidades, fludarabina é adminis- trada diariamente, tal como durante 1 a 5 dias, por exemplo, durante 3 a 5 dias. Em alguns casos, ao indivíduo é administrado cerca de 30 mg/m2 de fludarabina, diariamente durante 3 dias, antes do início da terapia celular.
[00333] Em algumas modalidades, o agente de linfodepleção com- preende uma combinação de agentes, tal como uma combinação de ciclofosfamida e fludarabina. Assim, a combinação de agentes pode in- cluir ciclofosfamida em qualquer dose ou cronograma de administração, tal como aquele descrito acima, e fludarabina em qualquer dose ou cro- nograma de administração, tal como aquele descrito acima. Por exem- plo, em alguns aspectos, ao indivíduo é administrado 60 mg/kg (~2 g/m2) de ciclofosfamida e 3 a 5 doses de 25 mg/m2 de fludarabina antes de uma dose de células. Em algumas modalidades, ao indivíduo é admi- nistrado cerca de 300 mg/m2 de ciclofosfamida e cerca de 30 mg/m2 de fludarabina cada um diariamente durante 3 dias. Em algumas modalida- des, um cronograma de administração de precondicionamento termina entre 2 e 7, inclusive, tal como em 2, 3, 4, 5, 6, ou 7, dias antes do início da administração de uma dose de células.
[00334] Em um regime de dosagem exemplar, antes de receber a primeira dose, indivíduos recebem um inibidor de quinase 1 dia antes da administração de células e uma quimioterapia de precondiciona- mento de linfodepleção de ciclofosfamida e fludarabina (CY/FLU), que é administrada pelo menos dois dias antes da primeira dose de células expressando CAR e geralmente não mais que 7 dias antes da adminis- tração de células. Em alguns casos, por exemplo, ciclofosfamida é de- terminada de 24 a 27 dias após a administração do inibidor de BTK. Após tratamento de precondicionamento, aos indivíduos é administrada uma dose de células T expressando CAR como descrito acima.
[00335] Em algumas modalidades, a administração do agente de precondicionamento antes da infusão da dose de células melhora um resultado do tratamento. Por exemplo, em alguns aspectos, precondici- onamento melhora a eficácia de tratamento com a dose ou aumenta a persistência das células expressando receptor recombinante (por exem- plo, células expressando CAR, tais como células T expressando CAR) no indivíduo. Em algumas modalidades, tratamento de precondiciona- mento aumenta sobrevivência livre de doença, tal como o percentual de indivíduos que estão vivos e não exibem resíduos mínimos ou doença molecularmente detectável após um determinado período de tempo após uma dose de células. Em algumas modalidades, o tempo para so- brevivência livre de doença é aumentado.
[00336] Uma vez que as células são administradas aos indivíduos (por exemplo, humano), a atividade biológica das populações celulares projetadas em alguns aspectos é medida por qualquer um de um nú- mero de métodos conhecidos. Parâmetros para avaliar incluem ligação específica de uma célula T projetada ou natural ou outra célula imune ao antígeno, in vivo, por exemplo, por imageamento, ou ex vivo, por exemplo, por ELISA ou citometria de fluxo. Em certas modalidades, a habilidade das células projetadas para destruir células alvo pode ser medida usando qualquer método adequado conhecido na técnica, tal como ensaios de citotoxicidade descritos em, por exemplo, Kochender- fer et al., J. Immunotherapy, 32(7): 689-702 (2009), e Herman et al. J. Immunological Methods, 285(1): 25-40 (2004). Em certas modalidades, a atividade biológica das células também pode ser medida ensaiando expressão e/ou secreção de certas citocinas, tal como CD 107a, IFNγ, IL-2, e TNF. Em alguns aspectos a atividade biológica é medida avali- ando resultados clínicos, tais como redução na sobrecarga ou carga tu- moral. Em alguns aspectos, resultados tóxicos, persistência e/ou expan- são das células, e/ou presença ou ausência de uma resposta imune de hospedeiro, são avaliados.
[00337] Em algumas modalidades, a administração do agente de precondicionamento antes da infusão de uma dose de células melhora um resultado do tratamento tal como melhora a eficácia de tratamento com a dose ou aumenta a persistência das células expressando recep- tor recombinante (por exemplo, células expressando CAR, tal como cé- lulas T expressando CAR) no indivíduo. Portanto, em algumas modali- dades, uma dose de agente de precondicionamento determinada no método que é uma terapia de combinação com o inibidor de BTK e te- rapia celular é maior do que a dose determinada no método sem o ini- bidor de BTK. II. TERAPIA CELULAR E CÉLULAS PROJETADAS
[00338] Em algumas modalidades, a terapia celular (por exemplo, te- rapia de célula T) para uso de acordo com métodos terapia de combi- nação fornecida inclui administrar células projetadas expressando re- ceptores recombinantes designadas para reconhecer e/ou especifica- mente se ligar aos antígenos associados com a doença ou condição, tal como um câncer, por exemplo, malignidade de célula B. Em algumas modalidades, ligação ao antígeno resulta em uma resposta, tal como uma resposta imune contra tais antígenos. Em algumas modalidades, as células contêm ou são projetadas para conter um receptor projetado ou receptor recombinante, por exemplo, um receptor de antígeno proje- tado, tal como um receptor de antígeno quimérico (CAR). O receptor recombinante, tal como um CAR, geralmente inclui um domínio de liga- ção ao antígeno extracelular (ou ligante) ligado a um ou mais compo- nentes de sinalização intracelular, em alguns aspectos por meio de li- gantes e/ou domínios de transmembrana. Em alguns aspectos, as célu- las projetadas são fornecidas como composições farmacêuticas e for- mulações adequadas para administração a um indivíduo, tal como para terapia celular adotiva. Também são fornecidos métodos terapêuticos para administrar as células e composições a indivíduos, por exemplo, pacientes.
[00339] Em algumas modalidades, as células incluem um ou mais ácidos nucleicos introduzidos por meio de projeção genética, e desse modo, expressam produtos recombinantes ou geneticamente projeta- dos de tais ácidos nucleicos. Em algumas modalidades, transferência de gene é realizada primeiro estimulando as células, tal como combi-
nando elas com um estímulo que induz uma resposta tal como prolife- ração, sobrevivência, e/ou ativação, por exemplo, como medido pela ex- pressão de um marcador de citocina ou de ativação, seguido por trans- dução das células ativadas, e expansão em cultura para números sufi- cientes para aplicações clínicas. A. Receptores de Antígenos Quiméricos
[00340] Em algumas modalidades dos métodos fornecidos e usos, as células projetadas, tais como células T, expressam receptores qui- méricos, tais como receptores de antígeno quimérico (CAR), que con- têm um ou mais domínios que combinam um domínio de ligação a li- gante (por exemplo, anticorpo ou fragmento de anticorpo) que fornece especificidade para um antígeno desejado (por exemplo, antígeno de tumor) com domínios de sinalização intracelular. Em algumas modalida- des, o domínio de sinalização intracelular é uma porção de domínio in- tracelular de ativação, tal como um domínio de ativação de célula T, fornecendo um sinal de ativação primária. Em algumas modalidades, o domínio de sinalização intracelular contém ou adicionalmente contém um domínio de sinalização coestimulatório para facilitar funções efeto- ras. Após ligação específica à molécula, por exemplo, antígeno, o re- ceptor geralmente libera um sinal imunoestimulatório, tal como um sinal transdução por ITAM, na célula, desse modo promovendo uma resposta imune direcionada a uma doença ou condição. Em algumas modalida- des, receptores quiméricos quando geneticamente projetados em célu- las imunes podem modular atividade de célula T, e, em alguns casos, podem modular diferenciação ou homeostase de célula T, desse modo resultando em células geneticamente projetadas com longevidade maior, sobrevivência e/ou persistência in vivo, tal como para uso em métodos de terapia celular adotiva.
[00341] Receptores de antígeno exemplares, incluindo CARs, e mé- todos para projeção e introdução de tais receptores em células, incluem aqueles descritos, por exemplo, em Publicação de Pedido de Patente Internacional números WO200014257, WO2013126726, WO2012/129514, WO2014031687, WO2013/166321, WO2013/071154, WO2013/123061, Publicações de Pedido de Patente Norte-Americana números US2002131960, US2013287748, US20130149337, Patentes Norte-Americanas Nos. 6.451.995,
7.446.190, 8.252,592, 8.339.645, 8.398.282, 7.446.179, 6.410.319,
7.070.995, 7.265.209, 7.354.762, 7.446.191, 8.324.353, e 8.479.118, e pedido de patente européia número EP2537416, e/ou aqueles descritos por Sadelain et al., Cancer Discov. 2013 Abril; 3(4): 388-398; Davila et al. (2013) PLoS ONE 8(4): e61338; Turtle et al., Curr. Opin. Immunol., Outubro de 2012; 24(5): 633-39; Wu et al., Cancer, Março de 2012 18(2): 160-75. Em alguns aspectos, os receptores de antígeno incluem um CAR como descrito em Patente Norte-Americana No. 7.446.190, e aquele descrito em Pedido de Publicação de Patente Internacional No. WO/2014055668 A1. Exemplos dos CARs incluem CARs como descrito em qualquer uma das publicações acima mencionadas, tais como WO 2014031687, US 8.339.645, US 7.446.179, US 2013/0149337, Patente Norte-Americana No. 7.446.190, Patente Norte-Americana No.
8.389.282, Kochenderfer et al., 2013, Nature Reviews Clinical Oncology, 10, 267-276 (2013); Wang et al. (2012) J. Immunother. 35(9): 689-701; e Brentjens et al., Sci Transl Med. 2013 5(177). Ver também WO 2014031687, US 8.339.645, US 7.446.179, US 2013/0149337, Patente Norte-Americana No. 7.446.190, e Patente Norte-Americana No.
8.389.282.
[00342] Em algumas modalidades, as células projetadas, tais como células T, expressam um receptor recombinante tal como um receptor de antígeno quimérico (CAR) com especificidade para um antígeno par- ticular (ou marcador ou ligante), tal como um antígeno expresso na su-
perfície de um tipo celular particular. Em algumas modalidades, o antí- geno alvejado pelo receptor é um polipeptídeo. Em algumas modalida- des, ele é um carboidrato ou outra molécula. Em algumas modalidades, o antígeno é seletivamente expresso ou superexpresso em células da doença ou condição, por exemplo, o tumor ou células patogênicas, quando comparadas com células ceptonormais de células normais ou não alvejadas e/ou é expresso nas células projetadas.
[00343] Antígenos direcionados pelos receptores em algumas moda- lidades incluem antígenos associados com uma malignidade de célula B, tal como qualquer um de vários marcadores de célula B conhecidos. Em algumas modalidades, o antígeno alvejado pelo receptor é CD20, CD19, CD22, ROR1, CD45, CD21, CD5, CD33, Igkappa, Iglambda, CD79a, CD79b ou CD30. Em aspectos particulares, o antígeno é CD19. Em algumas modalidades, qualquer um de tais antígenos são antígenos expressos em células B humanas.
[00344] Os receptores quiméricos, tais como CARs, geralmente in- cluem um domínio de ligação ao antígeno extracelular que é uma porção ou porções de ligação ao antígeno de uma molécula de anticorpo. Em algumas modalidades, o domínio de ligação ao antígeno é uma porção de uma molécula de anticorpo, geralmente uma região de cadeia pe- sada variável (VH) e/ou região de cadeia leve variável (VL) do anticorpo, por exemplo, um fragmento de anticorpo scFv. Em algumas modalida- des, o domínio de ligação ao antígeno é um anticorpo de domínio único (sdAb), tal como sdFv, nanocorpo, VHH e VNAR. Em algumas modalida- des, um fragmento de ligação ao antígeno compreende regiões variá- veis de anticorpo ligadas por um ligante flexível.
[00345] Em algumas modalidades, o anticorpo ou um fragmento de ligação ao antígeno (por exemplo, scFv ou domínio VH) especificamente reconhece um antígeno, tal como CD19. Em algumas modalidades, o anticorpo ou fragmento de ligação ao antígeno é derivado de, ou é uma variante de, anticorpos ou fragmentos de ligação ao antígeno que espe- cificamente se ligam a CD19. Em algumas modalidades, o antígeno é CD19. Em algumas modalidades, o scFv contém um VH e um VL deri- vado de um anticorpo ou um fragmento de anticorpo específico para CD19. Em algumas modalidades, o anticorpo ou fragmento de anticorpo que se liga a CD19 é um anticorpo derivado de camundongo tal como FMC63 e SJ25C1. Em algumas modalidades, o anticorpo ou fragmento de anticorpo é um anticorpo humano, por exemplo, como descrito em Publicação de Patente Norte-Americana No. US 2016/0152723.
[00346] Em algumas modalidades o domínio de ligação ao antígeno inclui um VH e/ou VL derivado de FMC63, que, em alguns aspectos, pode ser um scFv. FMC63 geralmente refere-se a um anticorpo IgG1 mono- clonal de camundongo levantado contra células Nalm-1 e -16 expres- sando CD19 de origem humana (Ling, N. R., et al. (1987). Leucocyte typing III. 302). Em algumas modalidades, o anticorpo FMC63 compre- ende CDR-H1 e CDR-H2 estabelecido em SEQ ID NO: 38 e 39, respec- tivamente, e CDR-H3 estabelecido em SEQ ID NO: 40 ou 54 e CDR-L1 estabelecido em SEQ ID NO: 35 e CDR-L2 estabelecido em SEQ ID NO: 36 ou 55 e sequências de CDR-L3 estabelecidas em SEQ ID NO: 37 ou 56. Em algumas modalidades, o anticorpo FMC63 compreende a região variável de cadeia pesada (VH) compreendendo a sequência de aminoácido de SEQ ID NO: 41 e a região variável de cadeia leve (V L) compreendendo a sequência de aminoácido de SEQ ID NO: 42.
[00347] Em algumas modalidades, o scFv compreende uma cadeia leve variável contendo a sequência de CDR--L1 de SEQ ID NO:35, uma sequência de CDR-L2 de SEQ ID NO:36, e uma sequência de CDR-L3 de SEQ ID NO:37 e/ou uma cadeia pesada variável contendo uma se- quência de CDR-H1 de SEQ ID NO:38, uma sequência de CDR-H2 de SEQ ID NO:39, e uma sequência de CDR-H3 de SEQ ID NO:40, ou uma variante de qualquer um dos acima mencionados tendo pelo menos
85%, 86%, 87%, 88%, 89%, 90%, 91%, 92%, 93%, 94%, 95%, 96%, 97%, 98%, 99% ou mais de identidade de sequência. Em algumas mo- dalidades, o scFv compreende uma região de cadeia pesada variável de FMC63 estabelecida em SEQ ID NO:41 e uma região de cadeia leve variável de FMC63 estabelecida em SEQ ID NO:42, ou uma variante de qualquer um dos acima mencionados tendo pelo menos 85%, 86%, 87%, 88%, 89%, 90%, 91%, 92%, 93%, 94%, 95%, 96%, 97%, 98%, 99% ou mais de identidade de sequência. Em algumas modalidades, as cadeias pesada variável e leve variável são conectadas por um ligante. Em algumas modalidades, o ligante é estabelecido em SEQ ID NO:59. Em algumas modalidades, o scFv compreende, em ordem, um VH, um ligante, e um VL. Em algumas modalidades, o scFv compreende, em ordem, um VL, um ligante, e um VH. Em algumas modalidades, o scFv é codificado por uma sequência de nucleotídeos estabelecida em SEQ ID NO:57 ou uma sequência que exibe pelo menos 85%, 86%, 87%, 88%, 89%, 90%, 91%, 92%, 93%, 94%, 95%, 96%, 97%, 98%, ou 99% de identidade de sequência para SEQ ID NO:57. Em algumas mo- dalidades, o scFv compreende a sequência de aminoácidos estabele- cida em SEQ ID NO:43 ou uma sequência que exibe pelo menos 85%, 86%, 87%, 88%, 89%, 90%, 91%, 92%, 93%, 94%, 95%, 96%, 97%, 98%, ou 99% de identidade de sequência para SEQ ID NO:43.
[00348] Em algumas modalidades o domínio de ligação ao antígeno inclui um VH e/ou VL derivados de SJ25C1, que, em alguns aspectos, pode ser um scFv. SJ25C1 é um anticorpo IgG1 monoclonal de camun- dongo contra células Nalm-1 e -16 expressando CD19 de origem hu- mana (Ling, N. R., et al. (1987). Leucocyte typing III. 302). Em algumas modalidades, o anticorpo SJ25C1 compreende CDR-H1, CDR-H2 e CDR-H3 estabelecidos em SEQ ID NOS: 47-49, respectivamente, e se- quências CDR-L1, CDR-L2 e CDR-L3 estabelecidas em SEQ ID NOS: 44-46, respectivamente. Em algumas modalidades, o anticorpo SJ25C1 compreende a região variável de cadeia pesada (VH) compreendendo a sequência de aminoácido de SEQ ID NO: 50 e a região variável de ca- deia leve (VL) compreendendo a sequência de aminoácido de SEQ ID NO: 51. Em algumas modalidades, o svFv compreende uma cadeia leve variável contendo uma sequência de CDR-L1 de SEQ ID NO:44, uma sequência de CDR-L2 de SEQ ID NO: 45, e uma sequência de CDR-L3 de SEQ ID NO:46 e/ou uma cadeia pesada variável contendo uma se- quência de CDR-H1 de SEQ ID NO:47, uma sequência de CDR-H2 de SEQ ID NO:48, e uma sequência de CDR-H3 de SEQ ID NO:49, ou uma variante de qualquer um dos acima mencionados tendo pelo menos 85%, 86%, 87%, 88%, 89%, 90%, 91%, 92%, 93%, 94%, 95%, 96%, 97%, 98%, 99% ou mais de identidade de sequência. Em algumas mo- dalidades, o scFv compreende uma região de cadeia pesada variável de SJ25C1 estabelecida em SEQ ID NO:50 e uma região de cadeia leve variável de SJ25C1 estabelecida em SEQ ID NO:51, ou uma variante de qualquer um dos acima mencionados tendo pelo menos 85%, 86%, 87%, 88%, 89%, 90%, 91%, 92%, 93%, 94%, 95%, 96%, 97%, 98%, 99% ou mais de identidade de sequência. Em algumas modalidades, as cadeias pesada variável e leve variável são conectadas por um li- gante. Em algumas modalidades, o ligante é estabelecido em SEQ ID NO:52. Em algumas modalidades, o scFv compreende, em ordem, um VH, um ligante, e um VL. Em algumas modalidades, o scFv compreende, em ordem, um VL, um ligante, e um VH. Em algumas modalidades, o scFv compreende a sequência de aminoácidos estabelecida em SEQ ID NO:53 ou uma sequência que exibe pelo menos 85%, 86%, 87%, 88%, 89%, 90%, 91%, 92%, 93%, 94%, 95%, 96%, 97%, 98%, ou 99% de identidade de sequência para SEQ ID NO:53.
[00349] O termo “anticorpo” aqui é usado no sentido mais amplo e inclui anticorpos policlonais e monoclonais, incluindo anticorpos intactos e fragmentos de anticorpo funcional (ligação ao antígeno), incluindo fra- gmentos de ligação ao antígeno de fragmento (Fab), fragmentos de F(ab’)2, fragmentos de Fab’, fragmentos de Fv, fragmentos de IgG re- combinante (rIgG), regiões de cadeia pesada variável (VH) capazes de se ligar especificamente ao antígeno, fragmentos de anticorpo de cadeia simples, incluindo fragmentos variáveis de cadeia simples (scFv), e an- ticorpos de domínio único (por exemplo, sdAb, sdFv, nanocorpo, VHH ou VNAR) ou fragmentos. O termo abrange formas geneticamente proje- tadas e/ou de outro modo modificadas de imunoglobulinas, tais como intracorpos, pepticorpos, anticorpos quiméricos, anticorpos totalmente humanos, anticorpos humanizados, e anticorpos heteroconjugados, multiespecíficos, por exemplo, biespecíficos, anticorpos, diacorpos, tri- acorpos, e tetracorpos, di-scFv em tandem, tri-scFv em tandem. A me- nos que de outro modo indicado, o termo “anticorpo” deve ser entendido como abrangendo fragmentos de anticorpos funcionais do mesmo. O termo também abrange anticorpos intactos ou de tamanho natural, in- cluindo anticorpos de qualquer classe ou subclasse, incluindo IgG e sub- classes do mesmo, IgM, IgE, IgA, e IgD. Em alguns aspectos, o CAR é um CAR biespecífico, por exemplo, contendo dois domínios de ligação ao antígeno com especificidades diferentes.
[00350] Em algumas modalidades, as proteínas de ligação ao antí- geno, anticorpos e fragmentos de ligação ao antígeno dos mesmos es- pecificamente reconhecem um antígeno de um anticorpo de tamanho natural. Em algumas modalidades, as cadeias pesada e leve de um an- ticorpo podem ser de tamanho natural ou podem ser uma porção de ligação ao antígeno (um Fab, F(ab’)2, Fv ou um fragmento Fv de cadeia simples (scFv)). Em outras modalidades, a região constante de cadeia pesada de anticorpo é escolhida de, por exemplo, IgG1, IgG2, IgG3, IgG4, IgM, IgA1, IgA2, IgD, e IgE, particularmente escolhida de, por exemplo, IgG1, IgG2, IgG3, e IgG4, mais particularmente, IgG1 (por exemplo, IgG1 humano). Em outra modalidade, a região constante de cadeia leve de anticorpo é escolhida de, por exemplo, kappa ou lambda, particularmente kappa.
[00351] Os termos “região de determinação de complementariedade” e “CDR,” sinônimo de “região hipervariável” ou “HVR,” são conhecidos, em alguns casos, para se referir a sequências não contíguas de amino- ácidos dentro de regiões variáveis de anticorpo, que conferem especifi- cidade para antígeno e/ou afinidade de ligação. Em geral, existem três CDRs em cada região variável de cadeia pesada (CDR-H1, CDR-H2, CDR-H3) e três CDRs em cada região variável de cadeia leve (CDR-L1, CDR-L2, CDR-L3). “Regiões de estrutura” e “FR” são conhecidas, em alguns casos, para se referir às porções não CDR das regiões variáveis das cadeias pesada e leve. Em geral, existem quatro FRs em cada re- gião variável de cadeia pesada de tamanho natural (FR-H1, FR-H2, FR- H3, e FR-H4), e quatro FRs em cada região variável de cadeia leve de tamanho natural (FR-L1, FR-L2, FR-L3, e FR-L4).
[00352] Os limites de sequência de aminoácido precisos de uma de- terminada CDR ou FR podem ser prontamente determinados usando qualquer um de vários esquemas bem conhecidos, incluindo aqueles descritos por Kabat et al. (1991), “Sequences of Proteins of Immunolo- gical Interest,” 5ª Ed. Public Health Service, National Institutes of Health, Bethesda, MD (esquema de numeração “Kabat”); Al-Lazikani et al., (1997) JMB 273,927-948 (esquema de numeração “Chothia”); Mac- Callum et al., J. Mol. Biol. 262:732-745 (1996), “Antibody-antigen inter- actions: Contact analysis and binding site topography,” J. Mol. Biol. 262, 732-745.” (esquema de numeração “Contact”); Lefranc MP et al., “IMGT unique numbering for immunoglobulin and T cell receptor variable do- mains and Ig superfamily V-like domains,” Dev Comp Immunol, Janeiro de 2003; 27(1):55-77 (esquema de numeração “IMGT”); Honegger A e
Plückthun A, “Yet another numbering scheme for immunoglobulin varia- ble domains: an automatic modeling and analysis tool,” J Mol Biol, Junho de 2001 8;309(3):657-70, (esquema de numeração “Aho”); e Martin et al., “Modeling antibody hypervariable loops: a combined algorithm,” PNAS, 1989, 86(23):9268-9272, (esquema de numeração “AbM”).
[00353] Os limites de uma determinada CDR ou FR podem variar de- pendendo do esquema usado para identificação. Por exemplo, o es- quema Kabat é com base em alinhamentos estruturais, enquanto o es- quema Chothia é com base em informação estrutural. Numeração para ambos os esquemas Kabat e Chothia é com base nos comprimentos de sequência de região de anticorpo mais comuns, com inserções acomo- dadas por letras de inserção, por exemplo, “30a,” e deleções apare- cendo em alguns anticorpos. Os dois esquemas colocam certas inser- ções e deleções (“indels”) em posições diferentes, resultando em nume- ração diferencial. O esquema Contact é com base na análise de estru- turas cristalinas complexas e é similar em muitos aspectos ao esquema de numeração Chothia. O esquema AbM é um compromisso entre defi- nições Kabat e Chothia com base naqueles usados por software de mo- delagem de anticorpo AbM molecular de Oxford.
[00354] Tabela 2, abaixo, lista limites de posição exemplares de CDR-L1, CDR-L2, CDR-L3 e CDR-H1, CDR-H2, CDR-H3 como identifi- cado por esquemas Kabat, Chothia, AbM, e Contact, respectivamente. Para CDR-H1, numeração de resíduo é listada usando ambos os es- quemas de numeração Kabat e Chothia. FRs são localizadas entre CDRs, por exemplo, com FR-L1 localizada antes CDR-L1, FR-L2 loca- lizada entre CDR-L1 e CDR-L2, FR-L3 localizada entre CDR-L2 e CDR- L3 e assim por diante. Nota-se que porque o esquema de numeração Kabat mostrado coloca inserções em H35A e H35B, o fim do ciclo Chothia CDR-H1 quando numerado usando a convenção de numeração Kabat mostrada varia entre H32 e H34, dependendo do comprimento do ciclo. Tabela 2. Limites de CDRs de acordo com vários esquemas de nume- ração. CDR Kabat Chothia AbM Contact CDR-L1 L24--L34 L24--L34 L24--L34 L30--L36 CDR-L2 L50--L56 L50--L56 L50--L56 L46--L55 CDR-L3 L89--L97 L89--L97 L89--L97 L89--L96 CDR-H1 (Numeração Kabat1) H31--H35B H26--H32..34 H26--H35B H30--H35B CDR-H1 (Numeração Chothia2) H31--H35 H26--H32 H26--H35 H30--H35 CDR-H2 H50--H65 H52--H56 H50--H58 H47--H58 CDR-H3 H95--H102 H95--H102 H95--H102 H93--H101 1 - Kabat et al. (1991), “Sequences of Proteins of Immunological Inter- est,” 5ª Ed. Public Health Service, National Institutes of Health, Be- thesda, MD 2 - Al-Lazikani et al., (1997) JMB 273,927-948
[00355] Assim, a menos que de outro modo especificado, uma “CDR” ou “região de determinação de complementariedade,” ou CDRs especi- ficadas individuais (por exemplo, CDR-H1, CDR-H2, CDR-H3), de um determinado anticorpo ou região do mesmo, tal como uma região variá- vel do mesmo, deve ser entendido como abrangendo uma região de determinação de complementariedade (ou a específica) como definido por qualquer um dos esquemas acima mencionados, ou outros esque- mas conhecidos. Por exemplo, onde é indicado que uma CDR particular (por exemplo, uma CDR-H3) contém a sequência de aminoácido de uma CDR correspondente em uma determinada sequência de aminoá- cido de região VH ou VL, deve-se entender que tal CDR tem uma se- quência da CDR correspondente (por exemplo, CDR-H3) dentro da re- gião variável, como definido por qualquer um dos esquemas acima men- cionados, ou outros esquemas conhecidos. Em algumas modalidades, sequências de CDR específicas são especificadas. Sequências de CDR exemplares de anticorpos fornecidos são descritas usando vários es- quemas de numeração, embora deva-se entender que um anticorpo for- necido pode incluir CDRs como descrito de acordo com qualquer um dos esquemas de numeração acima mencionados ou outros esquemas de numeração conhecidos por um técnico versado.
[00356] Do mesmo modo, a menos que de outro modo especificado, uma FR ou uma FR(s) especificadas individuais (por exemplo, FR-H1, FR-H2, FR-H3, FR-H4), de um determinado anticorpo ou região do mesmo, tal como uma região variável do mesmo, deve-se entender abrangendo uma região de estrutura (ou a específica) como definido por qualquer um dos esquemas conhecidos. Em alguns casos, o esquema para identificação de uma CDR, FR particulares, ou FRs ou CDRs é especificado, tal como a CDR como definido pelo método Kabat, Chothia, AbM ou Contact, ou outros esquemas conhecidos. Em outros casos, a sequência de aminoácido particular de uma CDR ou FR é de- terminada.
[00357] O termo “região variável” ou “domínio variável” refere-se ao domínio de uma cadeia pesada ou leve de anticorpo que está envolvido na ligação do anticorpo ao antígeno. As regiões variáveis da cadeia pe- sada e cadeia leve (VH e VL, respectivamente) de um anticorpo nativo geralmente têm estruturas similares, cada domínio compreendendo quatro regiões de estrutura conservadas (FRs) e três CDRs. (Ver, por exemplo, Kindt et al. Kuby Immunology, 6ª ed., W.H. Freeman and Co., página 91 (2007). Um único domínio VH ou VL pode ser suficiente para conferir especificidade de ligação ao antígeno. Além disso, anticorpos que se ligam a um antígeno particular podem ser isolados usando um domínio VH ou VL de um anticorpo que se liga ao antígeno para selecio- nar uma biblioteca de domínios VL ou VH complementares, respectiva- mente. Ver, por exemplo, Portolano et al., J. Immunol. 150:880-887 (1993); Clarkson et al., Nature 352:624-628 (1991).
[00358] Entre os anticorpos fornecidos estão fragmentos de anti- corpo. Um “fragmento de anticorpo” refere-se a uma molécula outra que não um anticorpo intacto que compreende uma porção de um anticorpo intacto que se liga ao antígeno ao qual o anticorpo intacto se liga. Exem- plos de fragmentos de anticorpo incluem mas não são limitados a Fv, Fab, Fab’, Fab’-SH, F(ab’)2; diacorpos; anticorpos lineares; regiões de cadeia pesada variavél (VH), moléculas de anticorpo de cadeia única tais como scFvs e anticorpos únicos de VH de domínio único; e anticorpos multiespecíficos formados de fragmentos de anticorpo. Em modalidades particulares, os anticorpos são fragmentos de anticorpo de cadeia única compreendendo uma região de cadeia pesada variável e/ou uma região de cadeia leve variável, tal como scFvs.
[00359] O termo “região variável” ou “domínio variável” refere-se ao domínio de uma cadeia pesada ou leve de anticorpo que está envolvido na ligação do anticorpo ao antígeno. Os domínios variáveis da cadeia pesada e cadeia leve (VH e VL, respectivamente) de um anticorpo nativo geralmente têm estruturas similares, com cada domínio compreen- dendo quatro regiões de estrutura conservadas (FRs) e três CDRs. (Ver, por exemplo, Kindt et al. Kuby Immunology, 6ª ed., W.H. Freeman and Co., página 91 (2007). Um domínio único VH ou VL pode ser suficiente para conferir especificidade de ligação ao antígeno. Além disso, anticor- pos que se ligam a um antígeno particular podem ser isolados usando um domínio VH ou VL de um anticorpo que se liga ao antígeno para se- lecionar de uma biblioteca de domínios VL ou VH complementares, res- pectivamente. Ver, por exemplo, Portolano et al., J. Immunol. 150:880- 887 (1993); Clarkson et al., Nature 352:624-628 (1991).
[00360] Anticorpos de domínio único (sdAb) são fragmentos de anti- corpo compreendendo todo ou uma porção do domínio variável de ca- deia pesada ou todo ou uma porção do domínio variável de cadeia leve de um anticorpo. Em certas modalidades, um anticorpo de domínio único é um anticorpo de domínio único humano. Em algumas modalida- des, o CAR compreende um domínio de cadeia pesada de anticorpo que especificamente se liga ao antígeno, tal como um marcador de cân- cer ou antígeno de superfície celular de uma célula ou doença a ser alvejada, tal como uma célula de tumor ou uma célula de câncer, tal como qualquer um dos antígenos alvo aqui descritos ou conhecidos. Anticorpos de domínio único exemplares incluem sdFv, nanocorpo, VHH ou VNAR.
[00361] Fragmentos de anticorpo podem ser feitos por várias técni- cas, incluindo mas não limitadas a digestão proteolítica de um anticorpo intacto bem como produção por células hospedeiras recombinantes. Em algumas modalidades, os anticorpos são fragmentos recombinante- mente produzidos, tais como fragmentos compreendendo arranjos que não ocorrem naturalmente, tais como aqueles com duas ou mais regiões de anticorpo ou cadeias ligadas por ligantes sintéticos, por exemplo, li- gantes de peptídeo, e/ou que não podem ser produzidas por digestão de enzima de um anticorpo intacto de ocorrência natural. Em algumas modalidades, os fragmentos de anticorpo são scFvs.
[00362] Um anticorpo “humanizado” é um anticorpo em que todos ou substancialmente todos os resíduos de aminoácido de CDR são deriva- dos de CDRs não humanas e todos ou substancialmente todos os resí- duos de aminoácido de FR são derivados de FRs humanas. Um anti- corpo humanizado opcionalmente pode incluir pelo menos uma porção de uma região constante de anticorpo derivada de um anticorpo hu- mano. Uma “forma humanizada” de um anticorpo não humano, refere- se a uma variante do anticorpo não humano que sofre humanização, tipicamente para reduzir imunogenicidade para humanos, ao mesmo tempo em que retém a especificidade e afinidade do anticorpo não hu- mano parental. Em algumas modalidades, alguns resíduos de FR em um anticorpo humanizado são substituídos por resíduos corresponden- tes de um anticorpo não humano (por exemplo, o anticorpo do qual os resíduos de CDR são derivados), por exemplo, para restaurar ou me- lhorar a especificidade ou afinidade do anticorpo.
[00363] Em alguns aspectos, o receptor recombinante, por exemplo, um receptor de antígeno quimérico, inclui uma porção extracelular con- tendo um ou mais domínios de ligação ao ligante (por exemplo, antí- geno), tais como um anticorpo ou fragmento do mesmo, e uma ou mais região ou domínio de sinalização intracelular (também alternadamente chamada de um domínio ou região de sinalização citoplasmática). Em alguns aspectos, o receptor recombinante, por exemplo, CAR, também inclui um espaçador e/ou um domínio ou porção de transmembrana. Em alguns aspectos, o espaçador e/ou domínio de transmembrana podem ligar a porção extracelular contendo o domínio de ligação ao ligante (por exemplo, antígeno) e as regiões ou domínios de sinalização intracelular.
[00364] Em algumas modalidades, o receptor recombinante tal como o CAR, também inclui um espaçador, que pode ser ou incluir pelo menos uma porção de uma região constante de imunoglobulina ou variante ou versão modificada da mesma, tal como uma região de articulação, por exemplo, uma região de articulação de IgG4, e/ou uma CH1/CL e/ou re- gião Fc. Em algumas modalidades, o receptor recombinante também compreende um espaçador e/ou uma região de articulação. Em algu- mas modalidades, a região ou porção constante é de um IgG humano, tal como IgG4 ou IgG1. Em alguns aspectos, a porção da região cons- tante serve como uma região espaçadora entre o componente de reco- nhecimento de antígeno, por exemplo, scFv, e domínio de transmem- brana. O espaçador pode ter um comprimento que proporcione maior responsividade da célula após ligação ao antígeno, quando comparado com a ausência do espaçador. Em alguns exemplos, o espaçador tem de ou de cerca de 12 aminoácidos de comprimento ou tem não mais que 12 aminoácidos de comprimento. Espaçadores exemplares incluem aqueles tendo pelo menos cerca de 10 a 229 aminoácidos, cerca de 10 a 200 aminoácidos, cerca de 10 a 175 aminoácidos, cerca de 10 a 150 aminoácidos, cerca de 10 a 125 aminoácidos, cerca de 10 a 100 amino- ácidos, cerca de 10 a 75 aminoácidos, cerca de 10 a 50 aminoácidos, cerca de 10 a 40 aminoácidos, cerca de 10 a 30 aminoácidos, cerca de 10 a 20 aminoácidos, ou cerca de 10 a 15 aminoácidos, e incluindo in- teiro entre os pontos de extremidade de qualquer um das faixas listadas. Em algumas modalidades, uma região espaçadora tem cerca de 12 ami- noácidos ou menos, cerca de 119 aminoácidos ou menos, ou cerca de 229 aminoácidos ou menos. Espaçadores exemplares incluem articula- ção de IgG4 sozinho, articulação de IgG4 ligado a domínios CH2 e CH3, ou articulação de IgG4 ligado ao domínio CH3. Espaçadores exempla- res incluem, mas não são limitados a, aqueles descritos em Hudecek et al. (2013) Clin. Cancer Res., 19:3153, Hudecek et al. (2015) Cancer Immunol Res. 3(2): 125–135 ou Publicação de Pedido de Patente inter- nacional número WO2014031687.
[00365] Em algumas modalidades, o espaçador contém apenas a re- gião de articulação de um IgG, tal como apenas uma articulação de IgG4 ou IgG1, tal como a articulação apenas do espaçador estabelecido em SEQ ID NO: 1, e codificado pela sequência estabelecida em SEQ ID NO: 2. Em algumas modalidades, o espaçador é uma articulação de Ig, por exemplo, e articulação de IgG4, ligada a domínios CH2 e/ou CH3. Em algumas modalidades, o espaçador é uma articulação de Ig, por exemplo, uma articulação de IgG4, ligada a domínios CH2 e CH3, tal como estabelecido em SEQ ID NO: 3. Em algumas modalidades, o es- paçador é uma articulação de Ig, por exemplo, uma articulação de IgG4, ligada a um domínio CH3 apenas, tal como estabelecido em SEQ ID NO:
4. Em algumas modalidades, o espaçador é ou compreende uma se- quência rica em glicina-serina ou outro ligante flexível tal como ligantes flexíveis conhecidos. Em algumas modalidades, a região ou porção constante é de IgD. Em algumas modalidades, o espaçador tem a se- quência estabelecida em SEQ ID NO: 5. Em algumas modalidades, o espaçador tem uma sequência de aminoácidos que exibe pelo menos ou pelo menos cerca de 85%, 86%, 87%, 88%, 89%, 90%, 91%, 92%, 93%, 94%, 95%, 96%, 97%, 98%, 99% ou mais de identidade de se- quência para qualquer uma de SEQ ID NOS: 1, 3, 4 e 5.
[00366] Em alguns aspectos, o espaçador é um espaçador de poli- peptídeo que (a) compreende ou consiste em todas ou uma porção de uma articulação de imunoglobulina ou uma versão modificada da mesma ou compreende cerca de 15 aminoácidos ou menos, e não com- preende uma região extracelular CD28 ou uma região extracelular CD8, (b) compreende ou consiste em todas ou uma porção de uma articula- ção de imunoglobulina, opcionalmente uma articulação de IgG4, ou uma versão modificada da mesma e/ou compreende cerca de 15 aminoáci- dos ou menos, e não compreende uma região extracelular CD28 ou uma região extracelular CD8, ou (c) tem de ou de cerca de 12 aminoácidos de comprimento e/ou compreende ou consiste em todas ou uma porção de uma articulação de imunoglobulina, opcionalmente um IgG4, ou uma versão modificada do mesmo; ou (d) consiste em ou compreende a se- quência de aminoácidos estabelecida em SEQ ID NOS: 1, 3-5, 27-34 ou 58, ou uma variante de qualquer um dos acima mencionados tendo pelo menos 85%, 86%, 87%, 88%, 89%, 90%, 91%, 92%, 93%, 94%, 95%, 96%, 97%, 98%, 99% ou mais de identidade de sequência, ou (e) com- preende ou consiste na fórmula X1PPX2P, onde X1 é glicina, cisteína ou arginina e X2 é cisteína ou treonina.
[00367] Em algumas modalidades, o receptor de antígeno compre- ende um domínio intracelular ligado diretamente ou indiretamente ao domínio extracelular. Em algumas modalidades, o receptor de antígeno quimérico inclui um domínio de transmembrana ligando o domínio ex-
tracelular e o domínio de sinalização intracelular. Em algumas modali- dades, o domínio de sinalização intracelular compreende um ITAM. Por exemplo, em alguns aspectos, o domínio de reconhecimento de antí- geno (por exemplo, domínio extracelular) geralmente é ligado a um ou mais componentes de sinalização intracelular, tais como componentes de sinalização que mimetizam ativação por meio de um complexo de receptor de antígeno, tal como um complexo de TCR, no caso de um CAR, e/ou sinal por meio de outro receptor de superfície celular. Em algumas modalidades, o receptor quimérico compreende um domínio de transmembrana ligado ou fundido entre o domínio extracelular (por exemplo, scFv) e domínio de sinalização intracelular. Assim, em algu- mas modalidades, o componente de ligação ao antígeno (por exemplo, anticorpo) é ligado a um ou mais domínios de sinalização intracelular e de transmembrana.
[00368] Em uma modalidade, um domínio de transmembrana que naturalmente é associado com um dos domínios no receptor, por exem- plo, CAR, é usado. Em alguns casos, o domínio de transmembrana é selecionado ou modificado por substituição de aminoácido para evitar ligação de tais domínios aos domínios de transmembrana da mesma ou de diferentes proteínas de membrana de superfície para minimizar inte- rações com outros membros de complexo de receptor.
[00369] O domínio de transmembrana em algumas modalidades é derivado ou de uma fonte natural ou uma sintética. Onde a fonte é na- tural, o domínio em alguns aspectos é derivado de qualquer proteína ligada à membrana ou transmembrana. Regiões de transmembrana in- cluem aquelas derivadas da (isto é, compreendem pelo menos as regi- ões de transmembrana de) cadeia alpha, beta or zeta do receptor de célula T, CD28, CD3 epsilon, CD45, CD4, CD5, CD8, CD9, CD16, CD22, CD33, CD37, CD64, CD80, CD86, CD134, CD137 (4-1BB), ou CD154. Alternativamente o domínio de transmembrana em algumas modalidades é sintético. Em alguns aspectos, o domínio de transmem- brana sintético compreende resíduos predominantemente hidrofóbicos tais como leucina e valina. Em alguns aspectos, um tripleto de fenilala- nina, triptofano e valina serão encontrados em cada extremidade de um domínio de transmembrana sintético. Em algumas modalidades, a liga- ção é por ligantes, espaçadores, e/ou domínios de transmembrana. Em alguns aspectos, o domínio de transmembrana contém uma porção de transmembrana de CD28 ou uma variante da mesma. O domínio extra- celular e de transmembrana pode ser ligado diretamente ou indireta- mente. Em algumas modalidades, o domínio extracelular e de trans- membrana são ligados por um espaçador, tal como qualquer um des- crito aqui.
[00370] Em algumas modalidades, o domínio de transmembrana do receptor, por exemplo, o CAR é um domínio de transmembrana deCD28 humano ou variante do mesmo, por exemplo, um domínio de transmem- brana de 27 aminoácido de um CD28 humano (No de Acesso.: P10747.1), ou é um domínio de transmembrana que compreende a se- quência de aminoácidos estabelecida em SEQ ID NO: 8 ou uma se- quência de aminoácidos que exibe pelo menos ou pelo menos cerca de 85%, 86%, 87%, 88%, 89%, 90%, 91%, 92%, 93%, 94%, 95%, 96%, 97%, 98%, 99% ou mais de identidade de sequência para SEQ ID NO:8. Em algumas modalidades, o domínio de transmembrana contendo por- ção do receptor recombinante compreende a sequência de aminoácidos estabelecida em SEQ ID NO: 9 ou uma sequência de aminoácidos tendo pelo menos ou pelo menos cerca de 85%, 86%, 87%, 88%, 89%, 90%, 91%, 92%, 93%, 94%, 95%, 96%, 97%, 98%, 99% ou mais de identi- dade de sequência.
[00371] Em algumas modalidades, o receptor recombinante, por exemplo, CAR, inclui pelo menos um componente ou componentes de sinalização intracelular, tal como uma região ou domínio de sinalização intracelular. Ativação de célula T é em alguns aspectos descrita como sendo mediada por duas classes de sequências de sinalização citoplas- mática: aquela que inicia ativação primária dependente de antígeno através do TCR (sequências de sinalização citoplasmática primária), e aquela que age de uma maneira independente do antígeno para forne- cer um sinal secundário ou coestimulatório (sequências de sinalização citoplasmática secundária). Em alguns aspectos, o CAR inclui um ou ambos tais componentes de sinalização. Entre as regiões de sinalização intracelular estão aquelas que mimetizam ou aproximam um sinal atra- vés de um receptor de antígeno natural, um sinal através de tal receptor em combinação com um receptor coestimulatório, e/ou um sinal através de um receptor coestimulatório sozinho. Em algumas modalidades, um ligante de oligo ou polipeptídeo curto, por exemplo, um ligante de entre 2 e 10 aminoácidos de comprimento, tal como um contendo glicinas e serinas, por exemplo, dubleto de glicina-serina, está presente e forma uma ligação entre o domínio de transmembrana e o domínio de sinali- zação citoplasmática do CAR.
[00372] Em algumas modalidades, após ligação do CAR, o domínio citoplasmático ou região de sinalização intracelular do CAR ativa pelo menos uma das funções ou respostas efetoras normais da célula imune, por exemplo, célula T projetada para expressar o CAR. Por exemplo, em alguns contextos, o CAR induz uma função de uma célula T tal como atividade citolítica ou atividade de T-indutora, tal como secreção de ci- tocinas ou outros fatores. Em algumas modalidades, uma porção trun- cada de uma região de sinalização intracelular de um componente de receptor de antígeno ou molécula coestimulatória é usada no lugar de uma cadeia imunoestimulatória intacta, por exemplo, se ela transduz o sinal de função efetora. Em algumas modalidades, as regiões de sinali- zação intracelular, por exemplo, compreendendo domínio ou domínios intracelulares, incluem as sequências citoplasmática do receptor de cé- lula T (TCR), e em alguns aspectos também aqueles de correceptores que no contexto natural agem em conjunto com tal receptor para iniciar transdução de sinal após o envolvimento de receptor de antígeno, e/ou qualquer derivado ou variante de tais moléculas, e/ou qualquer sequên- cia sintética que tem a mesma capacidade funcional. Em algumas mo- dalidades, as regiões de sinalização intracelular, por exemplo, compre- endendo domínio ou domínios intracelulares, incluem as sequências ci- toplasmáticas de uma região ou domínio que está envolvida no forneci- mento de sinal coestimulatório.
[00373] Em alguns aspectos, o CAR inclui uma sequência de sinali- zação citoplasmática primária que regula ativação primária do complexo de TCR. Sequências de sinalização citoplasmática primárias que agem de uma maneira estimulatória podem conter motifs de sinalização que são conhecidos como motifs de ativação com base em tirosina de imu- norreceptor ou ITAMs. Exemplos de ITAM contendo sequências de si- nalização citoplasmática primária incluem aqueles derivados de cadeia CD3 zeta, FcR gamma, CD3 gamma, CD3 delta e CD3 epsilon. Em al- gumas modalidades, moléculas de sinalização citoplasmática no CAR contêm um domínio de sinalização citoplasmática, porção do mesmo, ou sequência derivada de CD3 zeta.
[00374] Em algumas modalidades, o receptor inclui um componente intracelular de um complexo de TCR, tal como uma cadeia CD3 de TCR que media ativação e citotoxicidade de célula T, por exemplo, cadeia CD3 zeta. Assim, em alguns aspectos, a porção de ligação ao antígeno é ligada a um ou mais módulos de sinalização celular. Em algumas mo- dalidades, módulos de sinalização celular incluem domínio de trans- membrana de CD3, domínios de sinalização intracelular de CD3, e/ou outros domínios de CD. Em algumas modalidades, o receptor, por exemplo, CAR, também inclui uma porção de uma ou mais moléculas adicionais tais como receptor γ Fc, CD8alpha, CD8beta, CD4, CD25, ou CD16. Por exemplo, em alguns aspectos, o CAR ou outro receptor qui- mérico inclui uma molécula quimérica entre CD3-zeta (CD3-ζ) ou recep- tor γ Fc e CD8alpha, CD8beta, CD4, CD25 ou CD16.
[00375] Em algumas modalidades, a região de sinalização intracelu- lar (ou citoplasmática) compreende uma cadeia CD3 humana, opcional- mente um domínio de sinalização estimulatória de CD3 zeta ou variante funcional do mesmo, tal como um domínio citoplasmático de 112 AA de isoforma 3 de CD3ζ humano (No. de Acesso: P20963.2) ou um domínio de sinalização de CD3 zeta como descrito em Patente Norte-Americana No.: 7,446,190 ou Patente Norte-Americana No. 8,911,993. Em algu- mas modalidades, a região de sinalização intracelular compreende a se- quência de aminoácidos estabelecida em SEQ ID NO: 13, 14 ou 15 ou uma sequência de aminoácidos que exibe pelo menos ou pelo menos cerca de 85%, 86%, 87%, 88%, 89%, 90%, 91%, 92%, 93%, 94%, 95%, 96%, 97%, 98%, 99% ou mais de identidade de sequência para SEQ ID NO: 13, 14 ou 15.
[00376] No contexto de um TCR natural, ativação completa geral- mente exige não apenas sinalização através do TCR, mas também um sinal coestimulatório. Assim, em algumas modalidades, para promover ativação completa, um componente para geração de sinal secundário ou coestimulatório é também incluso no CAR. Em outras modalidades, o CAR não inclui um componente para geração de um sinal coestimula- tório. Em alguns aspectos, um CAR adicional é expresso na mesma cé- lula e fornece o componente para geração do sinal secundário ou coes- timulatório.
[00377] Em algumas modalidades, o receptor de antígeno quimérico contém um domínio intracelular de uma molécula coestimulatória de cé- lula T. Em algumas modalidades, o CAR inclui um domínio de sinaliza- ção e/ou porção de transmembrana de um receptor coestimulatório, tal como CD28, 4-1BB, OX40 (CD134), CD27, DAP10, DAP12, ICOS e/ou outros receptores coestimulatórios. Em algumas modalidades, o CAR inclui uma região coestimulatória ou domínio de CD28 ou 4-1BB, tal como de CD28 humano ou 4-1BB humano.
[00378] Em algumas modalidades, a região ou domínio de sinaliza- ção intracelular compreende um domínio de sinalização coestimulatória intracelular de CD28 humano ou variante funcional ou porção do mesmo, tal como um domínio de 41 aminoácidos do mesmo e/ou tal domínio com uma substituição de LL por GG em posições 186-187 de uma proteína CD28 nativa. Em algumas modalidades, o domínio de si- nalização intracelular pode compreender a sequência de aminoácidos estabelecida em SEQ ID NO: 10 ou 11 ou uma sequência de aminoáci- dos que exibe pelo menos ou pelo menos cerca de 85%, 86%, 87%, 88%, 89%, 90%, 91%, 92%, 93%, 94%, 95%, 96%, 97%, 98%, 99% ou mais de identidade de sequência para SEQ ID NO: 10 ou 11. Em algu- mas modalidades, a região intracelular compreende um domínio de si- nalização coestimulatória intracelular de 4-1BB ou variante funcional ou porção do mesmo, tal como um domínio citoplasmático de 42 aminoáci- dos de um 4-1BB humano (No. de Acesso: Q07011,1) ou variante fun- cional ou porção do mesmo, tal como a sequência de aminoácidos es- tabelecida em SEQ ID NO: 12 ou uma sequência de aminoácidos que exibe pelo menos ou pelo menos cerca de 85%, 86%, 87%, 88%, 89%, 90%, 91%, 92%, 93%, 94%, 95%, 96%, 97%, 98%, 99% ou mais de identidade de sequência para SEQ ID NO: 12.
[00379] Em alguns aspectos, o mesmo CAR inclui ambas as regiões de sinalização citoplasmática primária (ou de ativação) e componentes de sinalização coestimulatória.
[00380] Em algumas modalidades, o domínio de ativação está inclu- ído dentro de um CAR, enquanto o componente é fornecido por outro CAR reconhecendo outro antígeno. Em algumas modalidades, os CARs incluem CARs de ativação ou estimulatórios, CARs coestimulatórios, ambos expressos na mesma célula (ver WO2014/055668). Em alguns aspectos, as células incluem um ou mais CAR estimulatório ou de ati- vação e/ou um CAR coestimulatório. Em algumas modalidades, as cé- lulas também incluem CARs inibitórios (iCARs, ver Fedorov et al., Sci. Transl. Medicine, 5(215) (Dezembro, 2013), tal como um CAR reconhe- cendo um antígeno outro que não aquele associado com e/ou específico para a doença ou condição pelo qual um sinal de ativação liberado atra- vés do CAR alvejando doença é diminuído ou inibido por ligação do CAR inibitório ao seu ligante, por exemplo, para reduzir efeitos fora do alvo.
[00381] Em algumas modalidades, os dois receptores induzem, res- pectivamente, um sinal de ativação e inibitório para a célula, de modo que ligação de um dos receptores ao seu antígeno ativa a célula ou induz uma resposta, mas ligação do segundo receptor inibitório ao seu antígeno induz um sinal que suprime ou diminui aquela resposta. Exem- plos são combinações de CARs de ativação e CARs inibitórios (iCARs). Tal estratégia pode ser usada, por exemplo, para reduzir a probabilidade de efeitos fora de alvo no contexto em que o CAR de ativação se liga a um antígeno expresso em uma doença ou condição, mas que também é expresso em células normais, e o receptor inibitório se liga a um antí- geno separado que é expresso nas células normais mas não células da doença ou condição.
[00382] Em alguns aspectos, o receptor quimérico é ou inclui um CAR inibitório (por exemplo, iCAR) e inclui componentes intracelulares que suprimem ou diminuem uma resposta imune, tal como resposta pro- movida por ITAM- e/ou coestimulatória na célula. Exemplos de tais com- ponentes de sinalização intracelular são aqueles encontrados em molé- culas de ponto de controle imune, incluindo receptores PD-1, CTLA4, LAG3, BTLA, OX2R, TIM-3, TIGIT, LAIR-1, PGE2, receptores de ade- nosina EP2/4 incluindo A2AR. Em alguns aspectos, a célula projetada inclui um CAR inibitório incluindo um domínio de sinalização de ou deri- vado de tal molécula inibitória, de modo que ela serve para diminuir a resposta da célula, por exemplo, que foi induzida por um CAR de ativa- ção e/ou coestimulatório.
[00383] Em alguns casos, CARs são referidos como CARs de pri- meira, segunda e/ou terceira geração. Em alguns aspectos, um CAR de primeira geração é aquele que fornece apenas um sinal induzido por cadeia CD3 após ligação ao antígeno; em alguns aspectos, CARs de segunda geração é aquele que fornece tal sinal e sinal coestimulatório, tal como um incluindo um domínio de sinalização intracelular de um re- ceptor coestimulatório tal como CD28 ou CD137; em alguns aspectos, um CAR de terceira geração em alguns aspectos é aquele que inclui múltiplos domínios coestimulatórios de receptores coestimulatórios di- ferentes.
[00384] Em algumas modalidades, o CAR abrange um ou mais, por exemplo, dois ou mais, domínios coestimulatórios e um domínio de ati- vação, por exemplo, domínio de ativação primária, na porção citoplas- mática. CARs exemplares incluem componentes intracelulares de CD3- zeta, CD28, e 4-1BB.
[00385] Em algumas modalidades, o receptor de antígeno também inclui um marcador e/ou células expressando o CAR ou outro receptor de antígeno também inclui um marcador substituto, tal como um marca- dor de superfície celular, que pode ser usado para confirmar transdução ou projeção da célula para expressar o receptor. Em alguns aspectos, o marcador inclui todo ou parte de (por exemplo, forma truncada) CD34, um NGFR, ou receptor de fator de crescimento epidérmico, tal como uma versão truncada de tal receptor de superfície celular (por exemplo, tEGFR). Em algumas modalidades, o ácido nucleico codificando o mar- cador é operacionalmente ligado a um polinucleotídeo codificando uma sequência de ligante, tal como uma sequência ligante clivável, por exemplo, T2A. Por exemplo, um marcador, e opcionalmente uma se- quência ligante, pode ser qualquer um como divulgado em pedido de patente publicado No. WO2014031687. Por exemplo, o marcador pode ser um EGFR truncado (tEGFR) que é, opcionalmente, ligado a uma sequência ligante, tal como uma sequência de ligante clivável T2A.
[00386] Um polipeptídeo exemplar para um EGFR truncado (por exemplo, tEGFR) compreende a sequência de aminoácidos estabele- cida em SEQ ID NO: 7 ou 16 ou uma sequência de aminoácidos que exibe pelo menos 85%, 86%, 87%, 88%, 89%, 90%, 91%, 92%, 93%, 94%, 95%, 96%, 97%, 98%, 99% ou mais de identidade de sequência para SEQ ID NO: 7 ou 16. Uma sequência ligante T2A exemplar com- preende a sequência de aminoácidos estabelecida em SEQ ID NO: 6 ou 17 ou uma sequência de aminoácidos que exibe pelo menos 85%, 86%, 87%, 88%, 89%, 90%, 91%, 92%, 93%, 94%, 95%, 96%, 97%, 98%, 99% ou mais de identidade de sequência para SEQ ID NO: 6 ou
17.
[00387] Em algumas modalidades, o marcador é uma molécula, por exemplo, proteína de superfície celular, não encontrada naturalmente em células T ou não encontrada naturalmente na superfície de células T, ou uma porção do mesmo. Em algumas modalidades, a molécula é uma molécula não própria, por exemplo, proteína não própria, isto é, uma que não é reconhecida como “própria” pelo sistema imune do hos- pedeiro em que as células serão transferidas adotivamente.
[00388] Em algumas modalidades, o marcador não tem função tera- pêutica e/ou não produz nenhum outro efeito além de ser usado como um marcador para projeção genética, por exemplo, para seleção de cé- lulas projetadas com sucesso. Em outras modalidades, o marcador pode ser uma molécula terapêutica ou molécula de outro modo exer- cendo algum efeito desejado, tal como um ligante para uma célula a ser encontrada in vivo, tal como uma molécula de ponto de controle imune ou coestimulatória para melhorar e/ou diminuir respostas das células após transferência adotiva e encontro com ligante.
[00389] Em algumas modalidades, o receptor de antígeno quimérico inclui uma porção extracelular contendo o anticorpo ou fragmento des- crito aqui. Em alguns aspectos, o receptor de antígeno quimérico inclui uma porção extracelular contendo o anticorpo ou fragmento descrito aqui e um domínio de sinalização intracelular. Em algumas modalida- des, o anticorpo ou fragmento inclui um scFv ou um anticorpo V H de domínio único e o domínio intracelular contém um ITAM. Em alguns as- pectos, o domínio de sinalização intracelular inclui um domínio de sina- lização de uma cadeia zeta de uma cadeia CD3-zeta (CD3ζ). Em algu- mas modalidades, a cadeia CD3-zeta é uma cadeia CD3-zeta humana. Em algumas modalidades, a região de sinalização intracelular também compreende domínios coestimulatórios de CD28 e CD137 (4-1BB, TNFRSF9), ligados a um domínio intracelular de CD3 zeta. Em algumas modalidades, o CD28 é um CD28 humano. Em algumas modalidades, o 4-1BB é um 4-1BB humano. Em algumas modalidades, o receptor de antígeno quimérico inclui um domínio de transmembrana disposto entre o domínio extracelular e a região de sinalização intracelular. Em alguns aspectos, o domínio de transmembrana contém uma porção de trans- membrana de CD28. O domínio extracelular e de transmembrana pode ser ligado diretamente ou indiretamente. Em algumas modalidades, o domínio extracelular e de transmembrana são ligados por um espaça- dor, tal como qualquer um descrito aqui.
[00390] Em algumas modalidades, o CAR contém um anticorpo, por exemplo, um fragmento de anticorpo, um domínio de transmembrana que é ou contém uma porção de transmembrana de CD28 ou uma vari- ante funcional da mesma, e um domínio de sinalização intracelular con- tendo uma porção de sinalização de CD28 ou variante funcional da mesma e uma porção de sinalização de CD3 zeta ou variante funcional da mesma. Por exemplo, em algumas modalidades, o CAR inclui um anticorpo tal como um fragmento de anticorpo, incluindo scFvs, por exemplo, específico para CD19 tal como qualquer um descrito acima, um espaçador, tal como um espaçador contendo uma porção de uma molécula de imunoglobulina, tal como um região de articulação e/ou uma ou mais regiões constantes de uma molécula de cadeia pesada, tal como uma articulação de Ig contendo espaçador, um domínio de trans- membrana contendo todas ou uma porção de um domínio de transmem- brana derivado de CD28, um domínio de sinalização intracelular deri- vado de CD28, e um domínio de sinalização de CD3 zeta.
[00391] Em algumas modalidades, o CAR contém um anticorpo, por exemplo, fragmento de anticorpo, um domínio de transmembrana que é ou contém uma porção de transmembrana de CD28 ou uma variante funcional da mesma, e um domínio de sinalização intracelular contendo uma porção de sinalização de um 4-1BB ou variante funcional da mesma e uma porção de sinalização de CD3 zeta ou variante funcional da mesma. Em algumas tais modalidades, o receptor também inclui um espaçador contendo uma porção de uma molécula de Ig, tal como uma molécula de Ig humano, tal como uma articulação de Ig, por exemplo, uma articulação de IgG4, tal como um espaçador apenas de articulação. Em algumas modalidades, o CAR inclui um anticorpo ou fragmento, tal como scFv, por exemplo, específico para CD19 tal como qualquer um descrito acima, um espaçador tal como qualquer um da articulação de Ig contendo espaçadores, um domínio de transmembrana derivado de CD28, um domínio de sinalização intracelular derivado de 4-1BB, e um domínio de sinalização derivado de CD3 zeta. B. Ácidos nucleicos, Vetores e Métodos para Projeção Ge- nética
[00392] Em algumas modalidades, as células, por exemplo, células
T, são geneticamente projetadas para expressar um receptor recombi- nante. Em algumas modalidades, a projeção é realizada introduzindo polinucleotídeos que codificam o receptor recombinante. São também fornecidos polinucleotídeos codificando um receptor. C. Ácidos nucleicos, Vetores e Métodos para Projeção Ge- nética
[00393] Em algumas modalidades, as células, por exemplo, células T, são geneticamente projetadas para expressar um receptor recombi- nante. Em algumas modalidades, a projeção é realizada introduzindo polinucleotídeos que codificam o receptor recombinante. São também fornecidos polinucleotídeos codificando um receptor recombinante, e vetores ou construções contendo tais ácidos nucleicos e/ou polinucleo- tídeos.
[00394] Em alguns casos, a sequência de ácido nucleico codificando o receptor recombinante contém uma sequência de sinal que codifica um peptídeo de sinal. Em alguns aspectos, a sequência de sinal pode codificar um peptídeo de sinal derivado de um polipeptídeo nativo. Em outros aspectos, a sequência de sinal pode codificar um peptídeo de sinal heterólogo ou não nativo, tal como o peptídeo de sinal exemplar da cadeia alpha de GMCSFR estabelecida em SEQ ID NO:25 e codifi- cada pela sequência de nucleotídeo estabelecida em SEQ ID NO:24. Em alguns casos, a sequência de ácido nucleico codificando o receptor recombinante, por exemplo, receptor de antígeno quimérico (CAR) con- tém uma sequência de sinal que codifica um peptídeo de sinal. Exem- plos não limitantes exemplares de peptídeos de sinal incluem, por exem- plo, o peptídeo de sinal de cadeia alfa de GMCSFR estabelecido em SEQ ID NO: 25 e codificado pela sequência de nucleotídeo estabelecida em SEQ ID NO:24, ou o peptídeo de sinal alfa de CD8 estabelecido em SEQ ID NO:26.
[00395] Em algumas modalidades, o polinucleotídeo codificando o receptor recombinante contém pelo menos um promotor que é operaci- onalmente ligado à expressão de controle do receptor recombinante. Em alguns exemplos, o polinucleotídeo contém dois, três, ou mais pro- motores operacionalmente ligados à expressão de controle do receptor recombinante.
[00396] Em certos casos onde moléculas de ácido nucleico codificam duas ou mais cadeias de polipeptídeos diferentes, por exemplo, um re- ceptor recombinante e um marcador, cada uma das cadeias polipeptí- deos pode ser codificada por uma molécula de ácido nucleico separada. Por exemplo, dois ácidos nucleicos separados são fornecidos, e cada um pode ser individualmente transferido ou introduzido na célula para expressão na célula. Em algumas modalidades, o ácido nucleico codifi- cando o receptor recombinante e o ácido nucleico codificando o marca- dor são operacionalmente ligados ao mesmo promotor e são opcional- mente separados por um sítio de entrada de ribossomo interna (IRES), ou um ácido nucleico codificando um peptídeo auto clivável ou um pep- tídeo que causa salto de ribossomo, que opcionalmente é um T2A, um P2A, um E2A ou um F2A. Em algumas modalidades, os ácidos nuclei- cos codificando o marcador e o ácido nucleico codificando o receptor recombinante são operacionalmente ligados a dois promotores diferen- tes. Em algumas modalidades, o ácido nucleico codificando o marcador e o ácido nucleico codificando o receptor recombinante estão presentes ou inseridos em localizações diferentes dentro do genoma da célula. Em algumas modalidades, o polinucleotídeo codificando o receptor recom- binante é introduzido em uma composição contendo células cultivadas, tal como por transdução retroviral, transfecção ou transformação.
[00397] Em algumas modalidades, tais como aquelas onde o polinu- cleotídeo contém uma primeira e segunda sequência de ácido nucleico, as sequências de codificação codificando cada uma das diferentes ca- deias de polipeptídeo pode ser operacionalmente ligada a um promotor,
que pode ser o mesmo ou diferente. Em algumas modalidades, a molé- cula de ácido nucleico pode conter um promotor que conduz a expres- são de duas ou mais cadeias de polipeptídeo. Em algumas modalida- des, tais moléculas de ácido nucleico podem ser multicistrônico (bicis- trônico ou tricistrônico, ver, por exemplo, Patente Norte-Americana No.
6.060.273). Em algumas modalidades, unidades de transcrição podem ser projetadas como uma unidade bicistrônica contendo um IRES (sítio de entrada de ribossomo interna), que permite coexpressão de produtos de gene (por exemplo, codificando o marcador e codificando o receptor recombinante) por uma mensagem de um promotor único. Alternativa- mente, em alguns casos, um promotor único pode direcionar expressão de um RNA que contém, em um único quadro de leitura aberto (ORF), dois ou três genes (por exemplo, codificando o marcador e codificando o receptor recombinante) separados um do outro por sequências codifi- cando um peptídeo autoclivável (por exemplo, sequências 2A) ou um sítio de reconhecimento de protease (por exemplo, furina). Os ORF, por- tanto, codificam um polipeptídeo único, que, durante (no caso de 2A) ou após a tradução, é processado nas proteínas individuais. Em alguns ca- sos, o peptídeo, tal como um T2A, pode fazer com que o ribossomo pule (salto do ribossomo) a síntese de uma ligação peptídica no terminal C de um elemento 2A, levando à separação entre o final da sequência 2A e o próximo peptídeo a jusante (ver, por exemplo, de Felipe, Genetic Vaccines e Ther. 2:13 (2004) e de Felipe et al. Traffic 5:616-626 (2004)). Vários elementos de 2A são conhecidos. Exemplos de sequências de 2A que podem ser usadas nos métodos e sistemas descrito aqui, sem limitação, sequências de 2A do vírus da febre aftosa (F2A, por exemplo, SEQ ID NO: 21), vírus da rinite A equina (E2A, por exemplo, SEQ ID NO: 20), vírus Thosea asigna (T2A, por exemplo, SEQ ID NO: 6 ou 17), e teschovírus-1 porcino (P2A, por exemplo, SEQ ID NO: 18 ou 19) como descritos em Publicação de Patente Norte-Americana No.
20070116690.
[00398] Qualquer um dos receptores recombinantes aqui descritos pode ser codificado por polinucleotídeos contendo uma ou mais sequên- cias de ácido nucleico codificando receptores recombinantes, em quais- quer combinações ou arranjos. Por exemplo, um, dois, três ou mais po- linucleotídeos podem codificar um, dois, três ou mais polinucleotídeos diferentes, por exemplo, receptores recombinantes. Em algumas moda- lidades, um vetor ou construção contém uma sequência de ácido nu- cleico codificando marcador, e um vetor ou construção separada contém uma sequência de ácido nucleico codificando um receptor recombi- nante, por exemplo, CAR. Em algumas modalidades, o ácido nucleico codificando o marcador e o ácido nucleico codificando o receptor recom- binante são operacionalmente ligados a dois promotores diferentes. Em algumas modalidades, o ácido nucleico codificando o receptor recombi- nante está presente a jusante do ácido nucleico codificando o marcador.
[00399] Em algumas modalidades, a estrutura de vetor contém uma sequência de ácido nucleico codificando um ou mais marcadores. Em algumas modalidades, um ou mais marcadores é um marcador de trans- dução, marcador substituto e/ou um marcador de seleção.
[00400] Em algumas modalidades, o marcador é um marcador de transdução ou um marcador substituto. Um marcador de transdução ou um marcador substituto podem ser usados para detectar células que foram introduzidas com o polinucleotídeo, por exemplo, um polinucleo- tídeo codificando um receptor recombinante. Em algumas modalidades, o marcador de transdução pode indicar ou confirmar modificação de uma célula. Em algumas modalidades, o marcador substituto é uma pro- teína que é feita para ser co-expressa na superfície celular com o re- ceptor recombinante, por exemplo, CAR. Em modalidades particulares, tal marcador substituto é uma proteína de superfície que foi modificada para ter pouca ou nenhuma atividade. Em certas modalidades, o mar- cador substituto é codificado no mesmo polinucleotídeo que codifica o receptor recombinante. Em algumas modalidades, a sequência de ácido nucleico codificando o receptor recombinante é operacionalmente li- gada a uma sequência de ácido nucleico codificando um marcador, op- cionalmente separado por um sítio de entrada de ribossomo interna (IRES), ou um ácido nucleico codificando um peptídeo autoclivável ou um peptídeo que causa salto de ribossomo, tal como uma sequência 2A, tal como um T2A, um P2A, um E2A ou um F2A. Genes de marcador extrínseco podem em alguns casos ser utilizados em conjunto com cé- lula projetada para permitir detecção ou seleção de células e, em alguns casos, também para promover suicídio celular.
[00401] Marcadores substitutos exemplares podem também incluir formas truncadas de polipeptídeos de superfície celular, tais como for- mas truncadas que são não funcionais e não transduzem ou não são capazes de transduzir um sinal ou um sinal normalmente transduzido pela forma de tamanho natural do polipeptídeo de superfície celular, e/ou do não são capazes de internalizar. Polipeptídeos de superfície ce- lular truncados exemplares incluindo formas truncadas de fatores de crescimento ou outros receptores tais como um receptor humano trun- cado de fator de crescimento epidérmico 2 (tHER2), um receptor de fator de crescimento epidérmico truncado (tEGFR, sequência de tEGFR exemplar estabelecida em SEQ ID NO:7 ou 16) ou um antígeno de membrana específico para próstata (PSMA) ou forma modificada do mesmo. tEGFR pode conter um epítopo reconhecido pelo anticorpo ce- tuximabe (Erbitux®) ou outro anticorpo anti-EGFR terapêutico ou molé- cula de ligação, que pode ser usado para identificar ou selecionar célu- las que foram projetadas com a construção de tEGFR e uma proteína exógena codificada, e/ou para eliminar ou separar células expressando a proteína exógena codificada. Ver, Patente Norte-Americana No.
8,802,374 e Liu et al., Nature Biotech. 2016 Abril; 34(4): 430–434). Em alguns aspectos, o marcador, por exemplo, marcador substituto, inclui todo ou parte de (por exemplo, forma truncada) de CD34, um NGFR, um CD19 ou um CD19 truncado, por exemplo, um CD19 não humano truncado, ou receptor de fator de crescimento epidérmico (por exemplo, tEGFR).
[00402] Em algumas modalidades, o marcador é ou compreende uma proteína fluorescente, tal como proteína fluorescente verde (GFP), proteína fluorescente verde melhorada (EGFP), tal como GFP super do- brado (sfGFP), proteína fluorescente vermelha (RFP), tal como tdTo- mato, mCherry, mStrawberry, AsRed2, DsRed ou DsRed2, proteína flu- orescente ciano (CFP), proteína fluorescente verde azul (BFP), proteína fluorescente azul melhorada (EBFP), e proteína fluorescente amarela (YFP), e variantes das mesmas, incluindo variantes de espécies, vari- antes monoméricas, e variantes otimizadas e/ou melhoradas por códon das proteínas fluorescente. Em algumas modalidades, o marcador é ou compreende uma enzima, tal como uma luciferase, o gene lacZ de E. coli, fosfatase alcalina, fosfatase alcalina embrionária secretada (SEAP), cloranfenicol acetiltransferase (CAT). Genes repórter emisso- res de luz exemplares incluem luciferase (luc), β-galactosidase, cloran- fenicol acetiltransferase (CAT), β-glucuronidase (GUS) ou variantes dos mesmos.
[00403] Em algumas modalidades, o marcador é um marcador de se- leção. Em algumas modalidades, o marcador de seleção é ou compre- ende um polipeptídeo que confere resistência a agentes exógenos ou fármacos. Em algumas modalidades, o marcador de seleção é um gene de resistência a antibiótico. Em algumas modalidades, o marcador de seleção é um gene de resistência a antibiótico que confere resistência a antibiótico para uma célula de mamífero. Em algumas modalidades, o marcador de seleção é ou compreende um gene de resistência a Puro- micina, um gene de resistência a Higromicina, um gene de resistência a Blasticidina, um gene de resistência a Neomicina, um gene de resistên- cia a Geneticina ou um gene de resistência a Zeocina ou uma forma modificada dos mesmos.
[00404] Em algumas modalidades, a molécula é uma molécula não própria, por exemplo, proteína não própria, isto é, aquela que não é re- conhecida como “própria” pelo sistema imune do hospedeiro para o qual as células serão adotivamente transferidas.
[00405] Em algumas modalidades, o marcador não tem nenhuma função terapêutica e/ou produz nenhum efeito outro que não para ser usado como um marcador para projeção genética, por exemplo, para selecionar células projetadas com sucesso. Em outras modalidades, o marcador pode ser uma molécula terapêutica ou molécula de outro modo exercendo algum efeito desejado, tal como um ligante para uma célula a ser encontrada in vivo, tal como uma molécula de ponto de con- trole coestimulatória ou imune para realçar e/ou diminuir as respostas das células após transferência adotiva e encontro com ligante.
[00406] Em algumas modalidades, o ácido nucleico codificando o marcador é operacionalmente ligado a um polinucleotídeo codificando para uma sequência ligante, tal como uma sequência de ligante clivável, por exemplo, uma T2A. Por exemplo, um marcador, e opcionalmente uma sequência ligante, podem ser qualquer um como divulgado na Pu- blicação PCT No. WO2014031687. Por exemplo, o marcador pode ser um EGFR truncado (tEGFR) que é, opcionalmente, ligado a uma se- quência ligante, tal como uma sequência T2A de ligante clivável. Um polipeptídeo exemplar para EGFR truncado (por exemplo, tEGFR) com- preende a sequência de aminoácidos estabelecida em SEQ ID NO: 7 ou 16 ou uma sequência de aminoácidos que exibe pelo menos 85%, 86%, 87%, 88%, 89%, 90%, 91%, 92%, 93%, 94%, 95%, 96%, 97%,
98%, 99% ou mais de identidade de sequência para SEQ ID NO: 7 ou
16.
[00407] Em algumas modalidades, o marcador é ou compreende uma proteína fluorescente, tal como proteína fluorescente verde (GFP), proteína fluorescente verde melhorada (EGFP), tal como GPF super do- brada (sfGFP), proteína fluorescente vermelha (RFP), tal como tdTo- mato, mCherry, mStrawberry, AsRed2, DsRed ou DsRed2, proteína flu- orescente ciano (CFP), proteína fluorescente verde azul (BFP), proteína fluorescente azul melhorada (EBFP), e proteína fluorescente amarela (YFP), e variantes das mesmas, incluindo variantes de espécies, vari- antes monoméricas, e variantes otimizadas e/ou melhoradas por códon das proteínas fluorescentes. Em algumas modalidades, o marcador é ou compreende uma enzima, tal como um luciferase, o gene lacZ de E. coli, fosfatase alcalina, fosfatase alcalina embrionária secretada (SEAP), cloranfenicol acetiltransferase (CAT). Genes repórter de emis- são de luz exemplares incluem luciferase (luc), β-galactosidase, cloran- fenicol acetiltransferase (CAT), β-glucuronidase (GUS) ou variantes dos mesmos.
[00408] Em algumas modalidades, o marcador é um marcador de se- leção. Em algumas modalidades, o marcador de seleção é ou compre- ende um polipeptídeo que confere resistência a agentes exógenos ou fármacos. Em algumas modalidades, o marcador de seleção é um gene de resistência a antibiótico. Em algumas modalidades, o marcador de seleção é um gene de resistência a antibiótico que confere resistência a antibiótico para uma célula de mamífero. Em algumas modalidades, o marcador de seleção é ou compreende um gene de resistência a Puro- micina, um gene de resistência a Higromicina, um gene de resistência a Blasticidina, um gene de resistência a Neomicina, um gene de resistên- cia a Geneticina ou um gene de resistência a Zeocina ou uma forma modificada dos mesmos.
[00409] Em algumas modalidades, ácidos nucleicos recombinantes são transferidos para células usando partículas de vírus infecciosas re- combinantes, tais como, por exemplo, vetores derivados de vírus símio 40 (SV40), adenovírus, vírus associados a adeno (AAV). Em algumas modalidades, ácidos nucleicos recombinantes são transferidos para cé- lulas T usando vetores lentivirais recombinantes ou vetores retrovirais, tais como vetores gamma-retrovirais (ver, por exemplo, Koste et al. (2014) Gene Therapy, 2014 Abr 3. doi: 10.1038/gt.2014.25; Carlens et al. (2000) Exp. Hematol., 28(10): 1137-46; Alonso-Camino et al. (2013) Mol. Ther. Nucl. Acids., 2, e93; Park et al., Trends Biotechnol., 2011 No- vembro 29(11): 550–557.
[00410] Em algumas modalidades, o vetor viral é um vírus associado a adeno (AAV).
[00411] Em algumas modalidades, o vetor retroviral tem uma se- quência repetida terminal longa (LTR), por exemplo, um vetor retroviral derivado do vírus da leucemia murina Moloney (MoMLV), vírus do sar- coma mieloproliferativo (MPSV), vírus de células-tronco embrionárias murinas (MESV), vírus de células-tronco murinas (MSCV) ou foco de baço formando vírus (SFFV). Vetores mais retrovirais são derivados de retrovírus murino. Em algumas modalidades, os retrovírus incluem aqueles derivados de qualquer fonte de células de aves ou mamíferos. Os retrovírus tipicamente são anfotrópicos, o que significa que são ca- pazes de infectar células hospedeiras de várias espécies, incluindo hu- manos. Em uma modalidade, o gene a ser expresso substitui as sequên- cias de gag retroviral, pol e/ou env. Vários sistemas retrovirais ilustrati- vos foram descritos (por exemplo, Patente Norte-Americana Nos.
5.219.740; 6.207.453; 5.219.740; Miller e Rosman (1989) BioTechni- ques 7:980-990; Miller, A. D. (1990) Human Gene Therapy 1:5-14; Scarpa et al. (1991) Virology 180:849-852; Burns et al. (1993) Proc. Natl. Acad. Sci. USA 90:8033-8037; e Boris-Lawrie e Temin (1993) Cur. Opin.
Genet. Develop. 3:102-109.
[00412] Métodos de transdução lentiviral são conhecidos. Métodos exemplares são descritos em, por exemplo, Wang et al. (2012) J. Immu- nother. 35(9): 689-701; Cooper et al. (2003) Blood. 101:1637–1644; Ve- rhoeyen et al. (2009) methods Mol Biol. 506: 97-114; e Cavalieri et al. (2003) Blood. 102(2): 497-505.
[00413] Em algumas modalidades, ácidos nucleicos recombinantes são transferidos para células T por meio de eletroporação (ver, por exemplo, Chicaybam et al, (2013) PLoS ONE 8(3): e60298 e Van Tede- loo et al. (2000) Gene Therapy 7(16): 1431-1437). Em algumas modali- dades, ácidos nucleicos recombinantes são transferidos para células T por meio de transposição (ver, por exemplo, Manuri et al. (2010) Hum Gene Ther 21(4): 427-437; Sharma et al. (2013) Molec Ther Nucl Acids 2, e74; e Huang et al. (2009) methods Mol Biol 506: 115-126). Outros métodos de introduzir e expressar material genético em células imune incluem transfecção de fosfato de cálcio (por exemplo, como descrito em Current Protocols in Molecular Biology, John Wiley & Sons, New York. N.Y.), fusão de protoplastos, transfecção catiônica mediada por lipossomos; bombardeamento de micropartículas facilitado por partícu- las de tungstênio (Johnston, Nature, 346: 776-777 (1990)); e co-precipi- tação de DNA de fosfato de estrôntio (Brash et al., Mol. Cell Biol., 7: 2031-2034 (1987)).
[00414] Outras abordagens e vetores para transferência dos ácidos nucleicos codificando os produtos recombinantes são aqueles descritos, por exemplo, na Publicação de Pedido de Patente internacional No. WO 2014055668, e na Patente Norte-Americana No. 7.446.190.
[00415] Em algumas modalidades, as células, por exemplo, células T, podem ser transferidas durante ou após expansão, por exemplo, com um receptor de célula T (TCR) ou um receptor de antígeno quimérico
(CAR). Esta transfecção para a introdução do gene do receptor dese- jado pode ser realizada com qualquer vetor retroviral adequado, por exemplo. A população celular geneticamente modificada pode em se- guida ser liberada do estímulo inicial (o estímulo anti-CD3/anti-CD28, por exemplo) e subsequentemente ser estimulada com um segundo tipo de estímulo, por exemplo, por meio de um novo receptor introduzido). Este segundo tipo de estímulo pode incluir um estímulo antigênico em forma de uma molécula de peptídeo/MHC, o ligante cognato (reticula- ção) do receptor geneticamente introduzido (por exemplo, ligante natu- ral de um CAR) ou qualquer ligante (tal como um anticorpo) que se liga diretamente dentro da estrutura do novo receptor (por exemplo, reco- nhecendo regiões constantes dentro do receptor). Ver, por exemplo, Cheadle et al, “Chimeric antigen receptors for T-cell based therapy” methods Mol Biol. 2012; 907:645-66 ou Barrett et al., Chimeric Antigen Receptor Therapy for Cancer Annual Review of Medicine Vol. 65: 333- 347 (2014).
[00416] Em alguns casos, um vetor pode ser usado que não exige que as células, por exemplo, células T, sejam ativadas. Em alguns ca- sos, as células podem ser selecionadas e/ou transduzidas antes da ati- vação. Assim, as células podem ser projetadas antes de, ou subse- quente à cultura das células, e em alguns casos ao mesmo tempo ou durante pelo menos uma porção da cultura.
[00417] Entre ácidos nucleicos adicionais, por exemplo, genes para introdução estão aqueles para melhorar a eficácia de terapia, tal como promovendo viabilidade e/ou função de células transferidas; genes para fornecer um marcador genético para seleção e/ou avaliação das células, tal como para avaliar sobrevivência ou localização in vivo; genes para melhorar segurança, por exemplo, tornando a célula suscetível à sele- ção negativa in vivo como descrito por Lupton S. D. et al., Mol. and Cell Biol., 11:6 (1991); e Riddell et al., Human Gene Therapy 3:319-338
(1992); ver também as publicações de PCT/US91/08442 e PCT/US94/05601 por Lupton et al. descrevendo o uso de genes de fu- são selecionáveis bifuncionais derivados de fusão de um marcador se- lecionável positivo dominante com um marcador selecionável negativo. Ver, por exemplo, Riddell et al., Patente Norte-Americana No.
6.040.177, nas colunas 14-17. D. Células e preparação de células para engenharia genética
[00418] Em algumas modalidades, os ácidos nucleicos são het- erólogos, isto é, normalmente não estão presentes em uma célula ou amostra obtida da célula, tal como uma obtida de outro organismo ou célula, que, por exemplo, não é normalmente encontrada na célula sendo modificada e/ou um organismo do qual tal célula é derivada. Em algumas modalidades, os ácidos nucleicos não ocorrem naturalmente, tal como um ácido nucleico não encontrado na natureza, incluindo um que compreende combinações quiméricas de ácidos nucleicos que cod- ificam vários domínios de vários tipos de células diferentes.
[00419] As células geralmente são células eucarióticas, tal como células de mamíferos, e normalmente são células humanas. Em algu- mas modalidades, as células são derivadas do sangue, medula óssea, linfa ou órgãos linfoides, são células do sistema imunológico, tais como células da imunidade inata ou adaptativa, por exemplo, células mieloides ou linfoides, incluindo linfócitos, tipicamente células T e/ou células NK. Outras células exemplares incluem células tronco, tal como células tronco multipotentes e pluripotentes, incluindo células tronco plu- ripotentes induzidas (iPSCs). As células normalmente são células primárias, tal como aquelas isoladas diretamente de um indivíduo e/ou isoladas de um indivíduo e congeladas. Em algumas modalidades, as células incluem um ou mais subconjuntos de células T ou outros tipos de células, tal como populações de células T inteiras, células CD4 +,
células CD8+ e subpopulações das mesmas, tais como aquelas defini- das por função, estado de ativação, maturidade, potencial para capaci- dades de diferenciação, expansão, recirculação, localização e/ou per- sistência, especificidade do antígeno, tipo de receptor de antígeno, presença em um órgão ou compartimento particular, perfil de secreção de marcador ou citocina e/ou grau de diferenciação. Com referência ao indivíduo a ser tratado, as células podem ser alogênicas e/ou autólogas. Entre os métodos, estão os métodos prontos para uso. Em alguns as- pectos, tal como para tecnologias prontas para uso, as células são plu- ripotentes e/ou multipotentes, como células tronco, tal como células tronco pluripotentes induzidas (iPSCs). Em algumas modalidades, os métodos incluem isolar células do indivíduo, preparar, processar, culti- var e/ou modificar as mesmas e reintroduzi-las no mesmo indivíduo, an- tes ou depois da criopreservação.
[00420] Entre os subtipos e subpopulações de células T e/ou de célu- las T CD4+ e/ou CD8+ estão células T (TN) virgens, células T efetoras (TEFF), células T de memória e seus subtipos, tais como células tronco T de memória (TSCM), T de memória central (TCM), T de memória efetora (TEM) ou células T de memória efetoras diferenciadas terminalmente, linfócitos infiltrantes de tumor (TIL), células T imaturas, células T madu- ras, células T auxiliares, células T citotóxicas, células T invariantes as- sociadas à mucosa (MAIT), células T reguladoras adaptativas e de ocor- rência natural (Treg), células T auxiliares, tal como células TH1, células TH2, células TH3, células TH17, células TH9, células TH22, células T auxiliares foliculares, células T alfa/beta e células T delta/gama.
[00421] Em algumas modalidades, as células são células assassinas naturais (NK). Em algumas modalidades, as células são monócitos ou granulócitos, por exemplo, células mieloides, macrófagos, neutrófilos, células dendríticas, mastócitos, eosinófilos e/ou basófilos.
[00422] Em algumas modalidades, as células incluem um ou mais ácidos nucleicos introduzidos por meio de engenharia genética e, assim, expressam produtos recombinantes ou geneticamente modificados de tais ácidos nucleicos. Em algumas modalidades, os ácidos nucleicos são heterólogos, isto é, normalmente não estão presentes em uma célula ou amostra obtida da célula, tal como uma obtida de outro organ- ismo ou célula, que, por exemplo, não é normalmente encontrada na célula sendo modificada e/ou um organismo do qual tal célula é derivada. Em algumas modalidades, os ácidos nucleicos não ocorrem naturalmente, tal como um ácido nucleico não encontrado na natureza, incluindo um que compreende combinações quiméricas de ácidos nu- cleicos que codificam vários domínios de vários tipos de células diferentes.
[00423] Em algumas modalidades, a preparação das células manip- uladas inclui uma ou mais etapas de cultura e/ou preparação. As células para introdução do ácido nucleico que codifica o receptor transgênico, como o CAR, podem ser isoladas de uma amostra, tal como uma amos- tra biológica, por exemplo, uma obtida ou derivada de um indivíduo. Em algumas modalidades, o indivíduo do qual a célula é isolada é aquele que tem a doença ou condição ou precisa de uma terapia celular ou ao qual a terapia celular será administrada. O indivíduo em algumas modal- idades é um humano em necessidade de uma intervenção terapêutica particular, tal como a terapia celular adotiva para a qual as células estão sendo isoladas, processadas e/ou modificadas.
[00424] Por conseguinte, as células em algumas modalidades são células primárias, por exemplo, células humanas primárias. As amostras incluem tecido, fluido e outras amostras retiradas diretamente do indi- víduo, bem como amostras resultantes de uma ou mais etapas de pro- cessamento, tal como separação, centrifugação, engenharia genética (por exemplo, transdução com vetor viral), lavagem e/ou incubação. A amostra biológica pode ser uma amostra obtida diretamente de uma fonte biológica ou uma amostra que é processada. As amostras biológi- cas incluem, mas não estão limitadas a, fluidos corporais, tais como sangue, plasma, soro, fluido cerebroespinhal, fluido sinovial, urina e suor, amostras de tecido e órgãos, incluindo amostras processadas derivadas dos mesmos.
[00425] Em alguns aspectos, a amostra da qual as células são derivadas ou isoladas é sangue ou uma amostra derivada de sangue, ou é ou é derivada de um produto de aférese ou leucaférese. Amostras exemplificativas incluem sangue total, células mononucleares de sangue periférico (PBMCs), leucócitos, medula óssea, timo, biópsia de tecido, tumor, leucemia, linfoma, nódulo linfático, tecido linfoide associ- ado ao intestino, tecido linfoide associado à mucosa, baço, outros teci- dos linfoides, fígado, pulmão, estômago, intestino, cólon, rim, pâncreas, mama, osso, próstata, colo do útero, testículos, ovários, amígdalas ou outro órgão e/ou células derivadas dos mesmos. As amostras incluem, no contexto da terapia celular, por exemplo, terapia celular adotiva, amostras de fontes autólogas e alogênicas.
[00426] Em algumas modalidades, as células são derivadas de lin- hagens celulares, por exemplo, linhagens de células T. As células em algumas modalidades são obtidas de uma fonte xenogênica, por exem- plo, de camundongo, rato, primata não humano e porco.
[00427] Em algumas modalidades, o isolamento das células inclui uma ou mais etapas de preparação e/ou separação de células com base em não afinidade. Em alguns exemplos, as células são lavadas, centrif- ugadas e/ou incubadas na presença de um ou mais reagentes, por ex- emplo, para remover componentes indesejados, enriquecer para com- ponentes desejados, lisar ou remover células sensíveis a reagentes es- pecíficos. Em alguns exemplos, as células são separadas com base em uma ou mais propriedades, tal como densidade, propriedades aderentes, tamanho, sensibilidade e/ou resistência a componentes es- pecíficos.
[00428] Em alguns exemplos, as células do sangue circulante de um indivíduo são obtidas, por exemplo, por aférese ou leucaférese. As amostras, em alguns aspectos, contêm linfócitos, incluindo células T, monócitos, granulócitos, células B, outros glóbulos brancos nucleados, glóbulos vermelhos e/ou plaquetas, e em alguns aspectos contém célu- las diferentes de glóbulos vermelhos e plaquetas.
[00429] Em algumas modalidades, as células sanguíneas coletadas do indivíduo são lavadas, por exemplo, para remover a fração de plasma e colocar as células em um tampão ou meio apropriado para as etapas de processamento subsequentes. Em algumas modalidades, as células são lavadas com solução salina tamponada com fosfato (PBS). Em al- gumas modalidades, a solução de lavagem carece de cálcio e/ou mag- nésio e/ou muitos ou todos os cátions divalentes. Em alguns aspectos, uma etapa de lavagem é realizada em uma centrífuga de "fluxo direto" semiautomática (por exemplo, o processador de células Cobe 2991, Baxter) de acordo com as instruções do fabricante. Em alguns aspectos, uma etapa de lavagem é realizada por filtração de fluxo tangencial (TFF) de acordo com as instruções do fabricante. Em algumas modalidades, as células são ressuspensas em uma variedade de tampões biocompat- íveis após a lavagem, tal como, por exemplo, PBS livre de Ca++ / Mg++. Em certas modalidades, os componentes de uma amostra de células sanguíneas são removidos e as células diretamente ressuspensas no meio de cultura.
[00430] Em algumas modalidades, os métodos incluem métodos de separação de células com base na densidade, tal como a preparação de glóbulos brancos a partir do sangue periférico por lise dos glóbulos vermelhos e centrifugação através de um gradiente de Percoll ou Ficoll.
[00431] Em algumas modalidades, os métodos de isolamento in- cluem a separação de diferentes tipos de células com base na ex- pressão ou presença na célula de uma ou mais moléculas específicas, tais como marcadores de superfície, por exemplo, proteínas de super- fície, marcadores intracelulares ou ácido nucleico. Em algumas modali- dades, qualquer método conhecido para separação com base em tais marcadores pode ser usado. Em algumas modalidades, a separação é uma separação baseada em afinidade ou imunoafinidade. Por exemplo, o isolamento em alguns aspectos inclui a separação de células e popu- lações de células com base na expressão de células ou nível de ex- pressão de um ou mais marcadores, normalmente marcadores de su- perfície celular, por exemplo, por incubação com um anticorpo ou par- ceiro de ligação que se liga especificamente a tais marcadores, segui- dos geralmente por etapas de lavagem e separação de células que se ligaram ao anticorpo ou parceiro de ligação, daquelas células que não se ligaram ao anticorpo ou parceiro de ligação.
[00432] Essas etapas de separação podem ser baseadas na seleção positiva, em que as células que se ligaram aos reagentes são retidas para uso posterior, e/ou seleção negativa, em que as células que não se ligaram ao anticorpo ou parceiro de ligação são retidas. Em alguns exemplos, ambas as frações são retidas para uso posterior. Em alguns aspectos, a seleção negativa pode ser particularmente útil onde nenhum anticorpo está disponível que identifique especificamente um tipo de célula em uma população heterogênea, de modo que a separação seja melhor realizada com base em marcadores expressos por células diferentes da população desejada.
[00433] A separação não precisa resultar em 100% de enriqueci- mento ou remoção de uma determinada população de células ou células que expressam um determinado marcador. Por exemplo, a seleção pos-
itiva ou enriquecimento de células de um tipo particular, tal como aque- las que expressam um marcador, refere-se ao aumento do número ou porcentagem de tais células, mas não precisa resultar em uma ausência completa de células que não expressam o marcador. Da mesma forma, a seleção negativa, remoção ou esgotamento de células de um tipo es- pecífico, tal como aquelas que expressam um marcador, refere-se à diminuição do número ou porcentagem de tais células, mas não precisa resultar na remoção completa de todas essas células.
[00434] Em alguns exemplos, múltiplas rodadas de etapas de sepa- ração são realizadas, onde a fração selecionada positiva ou negati- vamente de uma etapa é submetida a outra etapa de separação, tal como uma seleção positiva ou negativa subsequente. Em alguns exem- plos, uma única etapa de separação pode esgotar células que expres- sam vários marcadores simultaneamente, tal como por meio da incu- bação de células com uma pluralidade de anticorpos ou parceiros de ligação, cada um específico para um marcador direcionado para seleção negativa. Da mesma forma, vários tipos de células podem ser simul- taneamente selecionados positivamente incubando células com uma pluralidade de anticorpos ou parceiros de ligação expressos nos vários tipos de células.
[00435] Por exemplo, em alguns aspectos, subpopulações específi- cas de células T, como células positivas ou que expressam altos níveis de um ou mais marcadores de superfície, por exemplo, células T CD28+, CD62L+, CCR7+, CD27+, CD127+, CD4+, CD8+, CD45RA+, e/ou CD45RO+, são isolados por técnicas de seleção positiva ou negativa.
[00436] Por exemplo, CD3+, CD28+ T as células podem ser selecion- adas positivamente usando esferas magnéticas conjugadas com anti- CD3/anti-CD28 (por exemplo, DYNABEADS® M-450 CD3/CD28 T Cell Expander).
[00437] Em algumas modalidades, o isolamento é realizado por en- riquecimento para uma determinada população de células por seleção positiva, ou depleção de uma determinada população de células, por seleção negativa. Em algumas modalidades, a seleção positiva ou neg- ativa é realizada incubando células com um ou mais anticorpos ou outro agente de ligação que se ligam especificamente a um ou mais marca- dores de superfície expressos ou expressos (marcador +) em um nível relativamente mais alto (marcadorelevado) nas células selecionadas posi- tivas ou negativas, respectivamente.
[00438] Em algumas modalidades, as células T são separadas de uma amostra de PBMC por seleção negativa de marcadores expressos em células não T, tal como células B, monócitos ou outras células bran- cas do sangue, tal como CD14. Em alguns aspectos, uma etapa de seleção CD4+ ou CD8+ é usada para separar células T auxiliares CD4+ e CD8+ citotóxicas. Essas populações CD4+ e CD8+ podem ser ainda classificadas em subpopulações por seleção positiva ou negativa para marcadores expressos ou expressos em um grau relativamente mais alto em uma ou mais subpopulações de células T virgens de memória e/ou efetoras.
[00439] Em algumas modalidades, as células CD8+ são ainda en- riquecidas ou esgotadas de células tronco virgens, de memória central, de memória efetora e/ou de memória central, tal como por seleção pos- itiva ou negativa com base em antígenos de superfície associados à respectiva subpopulação. Em algumas modalidades, o enriquecimento para células T de memória central (TCM) é realizado para aumentar a eficácia, tal como para melhorar a sobrevivência a longo prazo, ex- pansão e/ou enxerto após a administração, o que em alguns aspectos é particularmente robusto em tais subpopulações. Ver Terakura et al. (2012) Blood,1:72–82; Wang et al. (2012) J Immunother. 35(9):689-701.
Em algumas modalidades, a combinação de células T CD8+ enrique- cidas com TCM e células T CD4+ aumenta ainda mais a eficácia.
[00440] Em modalidades, as células T de memória estão presentes em ambos os subconjuntos CD62L+ e CD62L- de linfócitos de sangue periférico CD8+. PBMC pode ser enriquecido ou esgotado de frações CD62L-CD8+ e/ou CD62L+CD8+, como o uso de anticorpos anti-CD8 e anti-CD62L.
[00441] Em algumas modalidades, o enriquecimento para células T de memória central (TCM) é baseado na expressão de superfície positiva ou elevada de CD45RO, CD62L, CCR7, CD28, CD3 e/ou CD127; em alguns aspectos, é baseada na seleção negativa para células que ex- pressam ou expressam CD45RA e/ou granzima B elevadamente. Em alguns aspectos, o isolamento de uma população CD8+ enriquecida para células TCM é realizado pela depleção de células que expressam CD4, CD14, CD45RA e seleção positiva ou enriquecimento para células que expressam CD62L. Em um aspecto, o enriquecimento para células T de memória central (TCM) é realizado começando com uma fração neg- ativa de células selecionadas com base na expressão de CD4, que é submetida a uma seleção negativa com base na expressão de CD14 e CD45RA, e uma seleção positiva com base em CD62L. Tais seleções em alguns aspectos são realizadas simultaneamente e em outros as- pectos são realizadas sequencialmente, em qualquer ordem. Em alguns aspectos, a mesma etapa de seleção baseada na expressão de CD4 usada na preparação da população ou subpopulação de células CD8+ também é usada para gerar a população ou subpopulação de células CD4+, de modo que ambas as frações positivas e negativas da sepa- ração baseada em CD4 são retidas e usadas em etapas subsequentes dos métodos, opcionalmente após uma ou mais etapas de seleção pos- itiva ou negativa.
[00442] Em um exemplo particular, uma amostra de PBMCs ou outra amostra de glóbulos brancos é submetida à seleção de células CD4 +, onde ambas as frações negativa e positiva são retidas. A fração nega- tiva é então submetida à seleção negativa com base na expressão de CD14 e CD45RA ou CD19, e seleção positiva com base em um marca- dor característico de células T de memória central, tal como CD62L ou CCR7, onde as seleções positivas e negativas são realizadas em qualquer ordem.
[00443] As células T auxiliares CD4+ são classificadas em células vir- gens, de memória central e efetoras, por meio da identificação de pop- ulações de células que possuem antígenos de superfície celular. Os linfócitos CD4+ podem ser obtidos por métodos padrão. Em algumas modalidades, os linfócitos T CD4+ virgens são células T CD45RO-, CD45RA+, CD62L+ e CD4+. Em algumas modalidades, as células CD4+ de memória central são CD62L+ e CD45RO+. Em algumas modalidades, as células efetoras CD4+ são CD62L- e CD45RO-.
[00444] Em um exemplo, para enriquecer células CD4 + por seleção negativa, um coquetel de anticorpos monoclonais tipicamente inclui an- ticorpos para CD14, CD20, CD11b, CD16, HLA-DR e CD8. Em algumas modalidades, o anticorpo ou parceiro de ligação é ligado a um suporte sólido ou matriz, como uma esfera magnética ou esfera paramagnética, para permitir a separação de células para seleção positiva e/ou nega- tiva. Por exemplo, em algumas modalidades, as células e populações de células são separadas ou isoladas usando técnicas de separação imunomagnética (ou afinidade magnética) (revisadas em Methods in Molecular Medicine, vol. 58: Metastasis Research Protocols, Vol. 2: Cell Behavior In vitro and In vivo, p 17-25 Editado por: S. A. Brooks e U. Schumacher © Humana Press Inc., Totowa, NJ).
[00445] Em alguns aspectos, a amostra ou composição de células a serem separadas é incubada com material pequeno, magnetizável ou magneticamente responsivo, como partículas magneticamente respon- sivas ou micropartículas, como grânulos paramagnéticos (por exemplo, como Dynalbeads ou grânulos MACS). O material magneticamente re- sponsivo, por exemplo, partícula, geralmente é direta ou indiretamente ligado a um parceiro de ligação, por exemplo, um anticorpo, que se liga especificamente a uma molécula, por exemplo, marcador de superfície, presente na célula, células ou população de células que se deseja sep- arar, por exemplo, que se deseja selecionar negativamente ou positiva- mente.
[00446] Em algumas modalidades, a partícula magnética ou grânulo compreende um material magneticamente responsivo ligado a um mem- bro de ligação específico, tal como um anticorpo ou outro parceiro de ligação. Existem muitos materiais responsivos magneticamente bem conhecidos usados em métodos de separação magnética. Partículas magnéticas adequadas incluem aquelas descritas em Molday, Patente Norte Americana No. 4.452.773, e na Especificação de Patente Euro- peia EP 452342 B, que são aqui incorporadas por referência. Partículas de tamanho coloidal, tais como aquelas descritas em Owen Patente Norte Americana. No. 4.795.698, e Liberti et al., Patente Norte Ameri- cana No. 5.200.084 são outros exemplos.
[00447] A incubação geralmente é realizada sob condições em que os anticorpos ou parceiros de ligação, ou moléculas, tais como anticor- pos secundários ou outros reagentes, que se ligam especificamente a tais anticorpos ou parceiros de ligação, que estão ligados à partícula magnética ou grânulo, especificamente ligam-se às moléculas da super- fície celular, se presentes nas células dentro da amostra.
[00448] Em alguns aspectos, a amostra é colocada em um campo magnético e as células com partículas magneticamente responsivas ou magnetizáveis anexadas a ela serão atraídas para o ímã e separadas das células não marcadas. Para a seleção positiva, as células que são atraídas pelo ímã são retidas; para a seleção negativa, as células que não são atraídas (células não marcadas) são retidas. Em alguns aspec- tos, uma combinação de seleção positiva e negativa é realizada durante a mesma etapa de seleção, onde as frações positivas e negativas são retidas e posteriormente processadas ou sujeitas a outras etapas de separação.
[00449] Em certas modalidades, as partículas responsivas magneti- camente são revestidas com anticorpos primários ou outros parceiros de ligação, anticorpos secundários, lectinas, enzimas ou estreptavidina. Em certas modalidades, as partículas magnéticas são fixadas às células por meio de um revestimento de anticorpos primários específicos para um ou mais marcadores. Em certas modalidades, as células, em vez dos grânulos, são marcadas com um anticorpo primário ou parceiro de ligação e, em seguida, partículas magnéticas revestidas com anticorpo secundário específico do tipo de célula ou outro parceiro de ligação (por exemplo, estreptavidina) são adicionadas. Em certas modalidades, as partículas magnéticas revestidas com estreptavidina são usadas em conjunto com anticorpos primários ou secundários biotinilados.
[00450] Em algumas modalidades, as partículas responsivas mag- neticamente são deixadas ligadas às células que serão subse- quentemente incubadas, cultivadas e/ou projetadas; em alguns aspec- tos, as partículas são deixadas presas às células para administração a um paciente. Em algumas modalidades, as partículas magnetizáveis ou magneticamente responsivas são removidas das células. Métodos para remover partículas magnetizáveis de células são conhecidos e incluem, por exemplo, o uso de anticorpos não marcados competidores e par- tículas magnetizáveis ou anticorpos conjugados a ligantes cliváveis. Em algumas modalidades, as partículas magnetizáveis são biodegradáveis.
[00451] Em algumas modalidades, a seleção baseada em afinidade é por meio de classificação de células ativadas magneticamente
(MACS) (Miltenyi Biotec, Auburn, CA). Os sistemas Magnetic Activated Cell Sorting (MACS) são capazes de seleção de alta pureza de células com partículas magnetizadas ligadas a elas. Em certas modalidades, o MACS opera em um modo em que as espécies não-alvo e alvo são se- quencialmente eluídas após a aplicação do campo magnético externo. Ou seja, as células anexadas às partículas magnetizadas são mantidas no lugar enquanto as espécies soltas são eluídas. Então, após a con- clusão dessa primeira etapa de eluição, as espécies que ficaram presas no campo magnético e foram impedidas de serem eluídas são liberadas de alguma maneira para que possam ser eluídas e recuperadas. Em certas modalidades, as células não-alvo são marcadas e esgotadas da população heterogênea de células.
[00452] Em certas modalidades, o isolamento ou separação é real- izado usando um sistema, dispositivo ou aparelho que realiza um ou mais dos passos de isolamento, preparação celular, separação, proces- samento, incubação, cultura e/ou formulação dos métodos. Em alguns aspectos, o sistema é usado para realizar cada uma dessas etapas em um ambiente fechado ou estéril, por exemplo, para minimizar o erro, manuseio do usuário e/ou contaminação. Em um exemplo, o sistema é um sistema conforme descrito em Pedido de Patente Internacional, Pub- licação Número WO 2009/072003 ou US 20110003380 A1.
[00453] Em algumas modalidades, o sistema ou aparelho realiza uma ou mais, por exemplo, todas as etapas de isolamento, proces- samento, engenharia e formulação em um sistema integrado ou autônomo e/ou em um sistema de moda automatizado ou programável. Em alguns aspectos, o sistema ou aparelho inclui um computador e/ou programa de computador em comunicação com o sistema ou aparelho, o que permite que um usuário programe, controle e avalie o resultado e/ou ajuste vários aspectos do processamento, isolamento, modificação e formulação.
[00454] Em alguns aspectos, a separação e/ou outras etapas são re- alizadas usando o sistema CliniMACS (Miltenyi Biotec), por exemplo, para separação automatizada de células em um nível de escala clínica em um sistema fechado e estéril. Os componentes podem incluir um microcomputador integrado, unidade de separação magnética, bomba peristáltica e várias válvulas de aperto. O computador integrado em al- guns aspectos controla todos os componentes do instrumento e di- reciona o sistema para realizar procedimentos repetidos em uma se- quência padronizada. A unidade de separação magnética em alguns as- pectos inclui um ímã permanente móvel e um suporte para a coluna de seleção. A bomba peristáltica controla a taxa de fluxo em todo o con- junto de tubos e, junto com as válvulas de aperto, garante o fluxo con- trolado de tampão através do sistema e suspensão contínua de células.
[00455] O sistema CliniMACS em alguns aspectos usa partículas magnetizáveis acopladas a anticorpos que são fornecidas em uma solução estéril não pirogênica. Em algumas modalidades, após a rotu- lação das células com partículas magnéticas, as células são lavadas para remover o excesso de partículas. Uma bolsa de preparação de células é então conectada ao conjunto de tubos, que por sua vez é conectado a uma bolsa contendo tampão e uma bolsa de coleta de célu- las. O conjunto de tubos consiste em tubos estéreis pré-montados, in- cluindo uma pré-coluna e uma coluna de separação, e são para uso único apenas. Após o início do programa de separação, o sistema aplica automaticamente a amostra de células na coluna de separação. As célu- las marcadas são retidas na coluna, enquanto as células não marcadas são removidas por uma série de etapas de lavagem. Em algumas modalidades, as populações de células para uso com os métodos descritos neste documento não são marcadas e não são retidas na coluna. Em algumas modalidades, as populações de células para uso com os métodos descritos neste documento são marcadas e são retidas na coluna. Em algumas modalidades, as populações de células para uso com os métodos descritos neste documento são eluídas da coluna após a remoção do campo magnético e são coletadas dentro da bolsa de coleta de células.
[00456] Em certas modalidades, a separação e/ou outras etapas são realizadas usando o sistema CliniMACS Prodigy (Miltenyi Biotec). O sistema CliniMACS Prodigy em alguns aspectos é equipado com uma unidade de processamento de células que permite a lavagem automát- ica e o fracionamento de células por centrifugação. O sistema Clin- iMACS Prodigy também pode incluir uma câmera integrada e um soft- ware de reconhecimento de imagem que determina o ponto final de fra- cionamento de célula ideal ao discernir as camadas macroscópicas do produto de célula de origem. Por exemplo, o sangue periférico é auto- maticamente separado em eritrócitos, glóbulos brancos e camadas de plasma. O sistema CliniMACS Prodigy também pode incluir uma câmara de cultivo de células integrada que realiza protocolos de cultura de célu- las, tal como, por exemplo, diferenciação e expansão de células, carga de antígeno e cultura celular a longo prazo. As portas de entrada, podem permitir a remoção estéril e a reposição do meio e as células podem ser monitoradas usando um microscópio integrado. Veja, por exemplo, Klebanoff et al. (2012) J Immunother. 35(9): 651–660, Terakura et al. (2012) Blood.1:72–82, e Wang et al. (2012) J Immunother.35(9):689-
701.
[00457] Em algumas modalidades, uma população de células aqui descrita é coletada e enriquecida (ou esgotada) por meio de citometria de fluxo, na qual as células manchadas para múltiplos marcadores de superfície celular são transportadas em uma corrente fluídica. Em algu- mas modalidades, uma população de células aqui descrita é coletada e enriquecida (ou esgotada) por meio de classificação de escala prepara-
tiva (classificação de células ativadas por fluorescência, FACS). Em cer- tas modalidades, uma população de células aqui descrita é coletada e enriquecida (ou esgotada) pelo uso de chips de sistemas microe- letromecânicos (MEMS) em combinação com um sistema de detecção baseado em FACS (veja, por exemplo, WO 2010/033140, Cho et al. (2010) Lab Chip 10, 1567-1573; e Godin et al. (2008) J Biophoton. 1(5):355–376. Em ambos os casos, as células podem ser marcadas com vários marcadores, permitindo o isolamento de subconjuntos de células T bem definidos em alta pureza.
[00458] Em algumas modalidades, os anticorpos ou parceiros de ligação são marcados com um ou mais marcadores detectáveis, para facilitar a separação para seleção positiva e/ou negativa. Por exemplo, a separação pode ser baseada na ligação a anticorpos marcados com fluorescência. Em alguns exemplos, a separação de células com base na ligação de anticorpos ou outros parceiros de ligação específicos para um ou mais marcadores de superfície celular são transportados em uma corrente fluídica, tal como por classificação de células ativadas por flu- orescência (FACS), incluindo escala preparativa (FACS) e/ou chips de sistemas microeletromecânicos (MEMS), por exemplo, em combinação com um sistema de detecção de citometria de fluxo. Tais métodos per- mitem a seleção positiva e negativa com base em vários marcadores simultaneamente.
[00459] Em algumas modalidades, os métodos de preparação in- cluem etapas para congelamento, por exemplo, criopreservação das células, antes ou depois do isolamento, incubação e/ou modificação. Em algumas modalidades, a etapa de congelamento e descongelamento subsequente remove granulócitos e, até certo ponto, monócitos na pop- ulação de células. Em algumas modalidades, as células são suspensas em uma solução de congelamento, por exemplo, após uma etapa de lavagem para remover o plasma e as plaquetas. Qualquer uma de uma variedade de soluções e parâmetros de congelamento conhecidos em alguns aspectos podem ser usadas. Um exemplo envolve o uso de PBS contendo 20% de DMSO e 8% de albumina de soro humano (HSA) ou outro meio de congelamento de células adequado. Este é então diluído 1:1 com meio de modo que a concentração final de DMSO e HSA sejam 10% e 4%, respectivamente. As células são geralmente congeladas a −80 °C a uma taxa de 1 °C por minuto e armazenadas na fase de vapor de um tanque de armazenamento de nitrogênio líquido.
[00460] Em algumas modalidades, as células são incubadas e/ou cultivadas antes ou em conexão com a engenharia genética. As etapas de incubação podem incluir cultura, cultivo, estimulação, ativação e/ou propagação. A incubação e/ou engenharia pode ser realizada em um recipiente de cultura, como uma unidade, câmara, poço, coluna, tubo, conjunto de tubulação, válvula, frasco, prato de cultura, bolsa ou outro recipiente para cultura ou células de cultivo. Em algumas modalidades, as composições ou células são incubadas na presença de condições estimulantes ou de um agente estimulador. Tais condições incluem aquelas concebidas para induzir a proliferação, expansão, ativação e/ou sobrevivência de células na população, para imitar a exposição ao antígeno e/ou para preparar as células para engenharia genética, tal como para a introdução de um receptor de antígeno recombinante.
[00461] As condições podem incluir um ou mais dos meios particula- res, temperatura, conteúdo de oxigênio, conteúdo de dióxido de car- bono, tempo, agentes, por exemplo, nutrientes, aminoácidos, antibióti- cos, íons e/ou fatores estimuladores, tais como citocinas, quimiocinas, antígenos, parceiros de ligação, proteínas de fusão, receptores solúveis recombinantes e quaisquer outros agentes projetados para ativar as células.
[00462] Em algumas modalidades, as condições ou agentes estimu- lantes incluem um ou mais agentes, por exemplo, ligante, que é capaz de ativar ou estimular um domínio de sinalização intracelular de um complexo de TCR. Em alguns aspectos, o agente liga ou inicia a cascata de sinalização intracelular de TCR/CD3 em uma célula T. Esses agentes podem incluir anticorpos, tais como aqueles específicos para um TCR, por exemplo, anti-CD3. Em algumas modalidades, as condições de es- timulação incluem um ou mais agentes, por exemplo, ligante, que é ca- paz de estimular um receptor coestimulador, por exemplo, anti-CD28. Em algumas modalidades, tais agentes e/ou ligantes podem ser ligados a um suporte sólido, como um grânulo, e/ou uma ou mais citocinas. Op- cionalmente, o método de expansão pode compreender ainda a etapa de adição de anticorpo anti-CD3 e/ou anti CD28 ao meio de cultura (por exemplo, a uma concentração de pelo menos cerca de 0,5 ng/mL). Em algumas modalidades, os agentes estimulantes incluem IL-2, IL-15 e ou IL-7. Em alguns aspectos, a concentração de IL-2 é de pelo menos cerca de 10 unidades/mL.
[00463] Em alguns aspectos, a incubação é realizada de acordo com técnicas tais como aquelas descritas na Patente Norte Americana No.
6.040.177 para Riddell et al., Klebanoff et al.(2012) J Immunother. 35(9): 651–660, Terakura et al. (2012) Blood.1:72–82, e/ou Wang et al. (2012) J Immunother. 35(9):689-701.
[00464] Em algumas modalidades, as células T são expandidas adi- cionando a uma composição de iniciação de cultura de células alimen- tadoras, tais como células mononucleares de sangue periférico sem di- visão (PBMC), (por exemplo, de modo que a população de células re- sultante contenha pelo menos cerca de 5, 10, 20 ou 40 ou mais células alimentadoras de PBMC para cada linfócito T na população inicial a ser expandida); e incubando a cultura (por exemplo, por um tempo sufi- ciente para expandir o número de células T). Em alguns aspectos, as células alimentadoras sem divisão podem compreender células alimen- tadoras de PBMC com radiação gama. Em algumas modalidades, os
PBMC são irradiados com raios gama na faixa de cerca de 3.000 a 3600 rads para evitar a divisão celular. Em alguns aspectos, as células ali- mentadoras são adicionadas ao meio de cultura antes da adição das populações de células T.
[00465] Em algumas modalidades, as condições de estimulação in- cluem temperatura adequada para o crescimento de linfócitos T hu- manos, por exemplo, pelo menos cerca de 25 graus Celsius, geralmente pelo menos cerca de 30 graus e geralmente a ou cerca de 37 graus Celsius. Opcionalmente, a incubação pode compreender ainda a adição de células linfoblastoides transformadas por EBV sem divisão (LCL) como células alimentadoras. LCL pode ser irradiado com raios gama na faixa de cerca de 6.000 a 10.000 rads. As células alimentadoras de LCL em alguns aspectos são fornecidas em qualquer quantidade adequada, tal como uma razão de células alimentadoras de LCL para linfócitos T iniciais de pelo menos cerca de 10:1.
[00466] Em modalidades, células T específicas do antígeno, tal como células T CD4+ e/ou CD8+ específicas do antígeno, são obtidas estimu- lando linfócitos T virgens ou específicos do antígeno com antígeno. Por exemplo, linhagens de células T específicas de antígeno ou clones po- dem ser geradas para antígenos de citomegalovírus isolando células T de indivíduos infectados e estimulando as células in vitro com o mesmo antígeno. III. RESULTADOS E MÉTODOS DO TRATAMENTO EXEMPLAR
PARA AVALIAR OS MESMOS
[00467] Em algumas modalidades dos métodos, composições, com- binações, usos, kits e artigos de fabricação fornecidos aqui, a terapia de combinação fornecida resulta em um ou mais resultados de tratamento, tal como um recurso associado a qualquer um ou mais dos parâmetros associados com a terapia ou tratamento, conforme descrito abaixo. Em algumas modalidades, o método inclui a avaliação da exposição, per- sistência e proliferação das células T, por exemplo, células T administra- das para a terapia baseada em células T. Em algumas modalidades, a exposição ou expansão prolongada e/ou persistência das células e/ou alterações nos fenótipos celulares ou atividade funcional das células, por exemplo, células administradas para imunoterapia, por exemplo, ter- apia com células T, nos métodos fornecidos aqui, pode ser medido avaliando as características das células T in vitro ou ex vivo. Em algu- mas modalidades, tais ensaios podem ser usados para determinar ou confirmar a função das células T, por exemplo, terapia com células T, antes, durante ou após a administração da terapia de combinação aqui fornecida.
[00468] Em algumas modalidades, a terapia de combinação pode in- cluir ainda uma ou mais etapas de rastreamento para identificar indi- víduos para o tratamento com a terapia de combinação e/ou contin- uação da terapia de combinação e/ou uma etapa para avaliação dos resultados do tratamento e/ou monitoramento dos resultados do trata- mento. Em algumas modalidades, a etapa de avaliação dos resultados do tratamento pode incluir etapas para avaliar e/ou monitorar o trata- mento e/ou identificar indivíduos para a administração de etapas adi- cionais ou restantes da terapia e/ou para repetir a terapia. Em algumas modalidades, a etapa de rastreamento e/ou avaliação dos resultados do tratamento podem ser usadas para determinar a dose, frequência, du- ração, tempo e/ou ordem da terapia de combinação aqui fornecida.
[00469] Em algumas modalidades, qualquer uma das etapas de rastreamento e/ou avaliação do tratamento dos resultados aqui descri- tos pode ser usada antes, durante, durante o curso de, ou subsequente à administração de uma ou mais etapas da terapia de combinação for- necida, por exemplo, a administração da terapia com células T (por ex- emplo, células T que expressam CAR) e/ou um inibidor de cinase, como um inibidor de BTK/ITK, por exemplo, Ibrutinib. Em algumas modali- dades, a avaliação é feita antes, durante, durante o curso ou após a execução de qualquer um dos métodos aqui fornecidos. Em algumas modalidades, a avaliação é feita antes de realizar os métodos aqui for- necidos. Em algumas modalidades, a avaliação é feita após a execução de uma ou mais etapas dos métodos aqui fornecidos. Em algumas modalidades, a avaliação é realizada antes da administração ou admin- istração de uma ou mais etapas da terapia de combinação fornecida, por exemplo, para rastrear e identificar pacientes adequados e/ou sus- cetíveis a receber a terapia de combinação. Em algumas modalidades, a avaliação é realizada durante, durante o curso de, ou após a admin- istração de uma ou mais etapas da terapia de combinação fornecida, por exemplo, para avaliar o resultado do tratamento intermediário ou final, por exemplo, para determinar a eficácia do tratamento e/ou para determinar se deve continuar ou repetir os tratamentos e/ou para deter- minar se devem administrar as etapas restantes da terapia de com- binação.
[00470] Em algumas modalidades, o tratamento dos resultados inclui função imunológica melhorada, por exemplo, função imunológica das células T administradas para terapia baseada em células e/ou das célu- las T endógenas no corpo. Em algumas modalidades, resultados de tratamentos exemplares incluem, mas não estão limitados a, prolifer- ação aumentada de células T, atividade funcional de células T aumen- tada, mudanças na expressão de marcador fenotípico de células imunes, tais como tais características sendo associadas às células T manipuladas, por exemplo, células CAR-T, administradas ao indivíduo. Em algumas modalidades, resultados de tratamentos exemplares in- cluem redução da carga da doença, por exemplo, carga do tumor, re- sultados clínicos melhorados e/ou eficácia aprimorada da terapia.
[00471] Em algumas modalidades, a etapa de rastreamento e/ou avaliação do tratamento de resultados inclui a avaliação da sobrevivên- cia e/ou função das células T administradas para terapia baseada em células. Em algumas modalidades, a etapa de rastreamento e/ou avaliação do tratamento dos resultados inclui a avaliação dos níveis de citocinas ou fatores de crescimento. Em algumas modalidades, a etapa de rastreamento e/ou avaliação do tratamento de resultados inclui avaliar a carga da doença e/ou melhorias, por exemplo, avaliar a carga do tumor e/ou resultados clínicos. Em algumas modalidades, qualquer uma das etapas de rastreamento e/ou avaliação do tratamento de re- sultados pode incluir qualquer um dos métodos de avaliação e/ou ensaios aqui descritos e/ou conhecidos na técnica e podem ser realiza- dos uma ou mais vezes, por exemplo, antes, durante, durante o curso de, ou subsequentemente à administração de uma ou mais etapas da terapia de combinação. Conjuntos exemplares de parâmetros associa- dos a um resultado de tratamento, que podem ser avaliados em algu- mas modalidades dos métodos fornecidos neste documento, incluem perfil de população de células imunes de sangue periférico e/ou carga tumoral.
[00472] Em algumas modalidades, os métodos afetam a eficácia da terapia celular no indivíduo. Em algumas modalidades, a persistência, expansão e/ou presença de células que expressam o receptor recom- binante, por exemplo, que expressam CAR, no indivíduo após a admin- istração da dose de células no método com um inibidor de cinase, tal como um inibidor de BTK/ITK, por exemplo, Ibrutinib, é maior em com- paração com aquele alcançado por meio de um método sem a admin- istração de um inibidor de cinase, por exemplo, Ibrutinib. Em algumas modalidades, a expansão e/ou persistência no indivíduo da terapia com células T administrada, por exemplo, células T expressando CAR são avaliadas em comparação com um método em que a terapia com célu- las T é administrada ao indivíduo na ausência de um inibidor de cinase,
por exemplo, Ibrutinib. Em algumas modalidades, os métodos resultam nas células T administradas exibindo expansão e/ou persistência au- mentada ou prolongada no indivíduo em comparação com um método em que a terapia com células T é administrada ao indivíduo na ausência de um inibidor de cinase, por exemplo, Ibrutinib.
[00473] Em algumas modalidades, a administração de um inibidor de cinase, por exemplo, Ibrutinib, diminui a carga da doença, por exemplo, a carga do tumor, no indivíduo em comparação com um método em que a dose de células que expressam o receptor recombinante é admin- istrada ao indivíduo na ausência de um inibidor de cinase, por exemplo, Ibrutinib. Em algumas modalidades, a administração de um inibidor de cinase, por exemplo, Ibrutinib, diminui a medula blástica no indivíduo em comparação com um método no qual a dose de células que expressam o receptor recombinante é administrada ao indivíduo na ausência de um inibidor de cinase, por exemplo, Ibrutinib. Em algumas modalidades, a administração de um inibidor de cinase, por exemplo, Ibrutinib, resulta em resultados clínicos melhorados, por exemplo, taxa de resposta ob- jetiva (ORR), sobrevivência sem progressão (PFS) e sobrevivência global (OS), em comparação com um método em que a dose de células que expressam o receptor recombinante é administrada ao indivíduo na ausência de um inibidor de cinase, por exemplo, Ibrutinib.
[00474] Em algumas modalidades, o indivíduo pode ser rastreado antes da administração de uma ou mais etapas da terapia de com- binação. Por exemplo, o indivíduo pode ser rastreado quanto às carac- terísticas da doença e/ou carga da doença, por exemplo, carga do tu- mor, antes da administração da terapia de combinação, para determinar a adequação, capacidade de resposta e/ou suscetibilidade à admin- istração da terapia de combinação. Em algumas modalidades, a etapa de rastreamento e/ou avaliação dos resultados do tratamento pode ser usada para determinar a dose, frequência, duração, tempo e/ou ordem da terapia de combinação aqui fornecida.
[00475] Em algumas modalidades, o indivíduo pode ser rastreado após a administração de uma das etapas da terapia de combinação, para determinar e identificar os indivíduos para receber as etapas restantes da terapia de combinação e/ou monitorar a eficácia da terapia. Em algumas modalidades, o número, nível ou quantidade de células T administradas e/ou proliferação e/ou atividade das células T administra- das é avaliada antes da administração e/ou após a administração de um inibidor de cinase, tal como um inibidor de BTK/ITK, por exemplo, Ibru- tinib.
[00476] Em algumas modalidades, uma mudança e/ou alteração, por exemplo, um aumento, uma elevação, uma diminuição ou uma redução, em níveis, valores ou medições de um parâmetro ou resultado em com- paração com os níveis, valores ou medições do mesmo parâmetro ou resultado em um ponto de tempo diferente de avaliação, uma condição diferente, um ponto de referência e/ou um assunto diferente é determi- nado ou avaliado. Por exemplo, em algumas modalidades, um mudança de vezes, por exemplo, um aumento ou diminuição, em parâmetros es- pecíficos, por exemplo, número de células T manipuladas em uma amostra, em comparação com o mesmo parâmetro em uma condição diferente, por exemplo, antes da administração de um inibidor de cinase, como um inibidor de BTK/ITK, por exemplo, Ibrutinib, pode ser determi- nado. Em algumas modalidades, os níveis, valores ou medições de dois ou mais parâmetros são determinados e os níveis relativos são compar- ados. Em algumas modalidades, os níveis, valores ou medições de parâmetros determinados são comparados aos níveis, valores ou medições de uma amostra de controle ou de uma amostra não tratada. Em algumas modalidades, os níveis, valores ou medições de parâmet- ros determinados são comparados aos níveis de uma amostra do mesmo indivíduo, mas em um ponto de tempo diferente. Os valores ob- tidos na quantificação de parâmetros individuais podem ser combinados para efeitos de avaliação da doença, por exemplo, formando uma operação aritmética ou lógica sobre os níveis, valores ou medidas dos parâmetros por meio de análise multiparamétrica. Em algumas modali- dades, uma razão de dois ou mais parâmetros específicos pode ser cal- culada.
[00477] A avaliação e a determinação dos parâmetros associados à saúde, função, atividade e/ou resultados das células T, como resultados de resposta, eficácia e/ou toxicidade, podem ser avaliados em vários pontos de tempo. Em alguns aspectos, a avaliação pode ser realizada várias vezes, por exemplo, antes da administração da terapia celular, antes, durante ou após a fabricação das células e/ou no início da ad- ministração do inibidor da cinase, por exemplo, Ibrutinib, durante a ad- ministração continuada, retomada e/ou posterior do inibidor da cinase, por exemplo, Ibrutinib, no início da administração da terapia celular e/ou antes, durante ou após o início da administração da terapia celular.
[00478] Em algumas modalidades, os atributos funcionais das célu- las administradas e/ou composições celulares incluem monitoramento de parâmetros farmacocinéticos (PK), expansão e persistência das células, ensaios funcionais celulares (por exemplo, qualquer um aqui descrito, tal como ensaio de citotoxicidade, ensaio de secreção de citocina e ensaios in vivo), avaliação de sinalização de células T de alta dimensão e avaliação de fenótipos de exaustão e/ou assinaturas das células T. Em alguns aspectos, outros atributos que podem ser avaliados ou monitorados incluem monitoramento e avaliação da doença residual mínima (MRD). Em alguns aspectos, outros atributos que podem ser avaliados ou monitorados incluem parâmetros farma- codinâmicos do inibidor da cinase, por exemplo, Ibrutinib. Em alguns aspectos, tais parâmetros podem ser avaliados usando ensaios de oc- upação de sítio ativo, por exemplo, ensaios de ocupação BTK ou ensaios de ocupação ITK. A. Exposição, persistência e proliferação de células T
[00479] Em algumas modalidades, o parâmetro associado à terapia ou um resultado de tratamento, que inclui parâmetros que podem ser avaliados para as etapas de rastreamento e/ou avaliação de tratamento de resultados e/ou monitoramento de resultados de tratamento, é ou inclui a avaliação da exposição, persistência e proliferação das células T, por exemplo, células T administradas para a terapia baseada em células T. Em algumas modalidades, o aumento da exposição ou ex- pansão prolongada e/ou persistência das células e/ou alterações nos fenótipos celulares ou na atividade funcional das células, por exemplo, células administradas para imunoterapia, por exemplo, terapia com células T, nos métodos fornecidos neste documento, podem ser me- didos avaliando as características das células T in vitro ou ex vivo. Em algumas modalidades, tais ensaios podem ser usados para determinar ou confirmar a função das células T usadas para a imunoterapia, por exemplo, terapia com células T, antes ou após a administração de uma ou mais etapas da terapia de combinação aqui fornecida.
[00480] Em algumas modalidades, a administração de um inibidor de cinase, como um inibidor de BTK/ITK, por exemplo, Ibrutinib, é projetada para promover a exposição do indivíduo às células, por exemplo, células T administradas para terapia baseada em células T, tal como para promover sua expansão e/ou persistência ao longo do tempo. Em algu- mas modalidades, a terapia com células T exibe expansão e/ou per- sistência aumentada ou prolongada no indivíduo em comparação com um método em que a terapia com células T é administrada ao indivíduo na ausência de um inibidor da cinase, por exemplo, Ibrutinib.
[00481] Em algumas modalidades, os métodos fornecidos aumentam a exposição do indivíduo às células administradas (por exemplo, au- mento do número de células ou duração ao longo do tempo) e/ou melhoram a eficácia e os resultados terapêuticos da imunoterapia, por exemplo, terapia com células T. Em alguns aspectos, os métodos são vantajosos em que um grau maior e/ou mais longo de exposição às célu- las que expressam os receptores recombinantes, por exemplo, células que expressam CAR, melhoram os resultados do tratamento em com- paração com outros métodos. Tais resultados podem incluir sobrevivên- cia e remissão do paciente, mesmo em indivíduos com carga tumoral grave.
[00482] Em algumas modalidades, a administração de um inibidor de cinase, por exemplo, Ibrutinib, pode aumentar o máximo, total e/ou a duração da exposição às células, por exemplo, células T administradas para a terapia baseada em células T, no indivíduo em comparação com a administração das células T sozinhas na ausência de um inibidor da cinase, por exemplo, Ibrutinib. Em alguns aspectos, a administração de um inibidor de cinase, por exemplo, Ibrutinib, no contexto de alta carga de doença (e, portanto, maiores quantidades de antígeno) e/ou uma ma- lignidade de células B mais agressiva ou resistente aumenta a eficácia em comparação com a administração de células T isoladas na ausência de um inibidor da cinase, por exemplo, Ibrutinib, no mesmo contexto, que pode resultar em imunossupressão, anergia e/ou exaustão que pode impedir a expansão e/ou persistência das células.
[00483] Em algumas modalidades, a presença e/ou quantidade de células que expressam o receptor recombinante (por exemplo, células que expressam CAR administradas para terapia baseada em células T) no indivíduo após a administração das células T e antes, durante e/ou após a administração de um inibidor da cinase, por exemplo, Ibrutinib, é detectado. Em alguns aspectos, PCR quantitativo (qPCR) é usado para avaliar a quantidade de células que expressam o receptor recombinante
(por exemplo, células expressando CAR administradas para terapia baseada em células T) no sangue ou soro ou órgão ou amostra de te- cido (por exemplo, local da doença, por exemplo, amostra de tumor) do indivíduo. Em alguns aspectos, a persistência é quantificada como cópias de DNA ou plasmídeo que codifica o receptor, por exemplo, CAR, por micrograma de DNA, ou como o número de células que expressam o receptor, por exemplo, que expressam CAR, por microlitro da amostra, por exemplo, de sangue ou soro, ou por número total de células mono- nucleares do sangue periférico (PBMCs) ou leucócitos ou células T por microlitro da amostra.
[00484] Em algumas modalidades, as células são detectadas no in- divíduo em ou pelo menos 4, 7, 10, 14, 18, 21, 24, 27 ou 28 dias após a administração das células T, por exemplo, CAR -expressando células T. Em alguns aspectos, as células são detectadas em ou pelo menos em 2, 4 ou 6 semanas após, ou 3, 6 ou 12, 18 ou 24, ou 30 ou 36 meses, ou 1, 2, 3, 4, 5 ou mais anos, após a administração das células T.
[00485] Em algumas modalidades, a persistência de células que ex- pressam receptores (por exemplo, células que expressam CAR) no in- divíduo pelos métodos, após a administração das células T, por exem- plo, células T que expressam CAR e/ou um inibidor de cinase, tal como um inibidor de BTK/ITK, por exemplo, Ibrutinib, é maior em comparação com o que seria alcançado por métodos alternativos, tal como aqueles envolvendo a administração da imunoterapia sozinha, por exemplo, ad- ministração de células T, por exemplo, Células T que expressam CAR, na ausência de um inibidor da cinase, por exemplo, Ibrutinib.
[00486] A exposição, por exemplo, número de células, por exemplo, células T administradas para terapia com células T, indicativa de ex- pansão e/ou persistência, pode ser declarada em termos de número máximo de células às quais o indivíduo é exposto, duração de células detectáveis ou células acima de um certo número ou porcentagem, área sob a curva para número de células ao longo do tempo e/ou com- binações das mesmas e indicadores dos mesmos. Tais resultados po- dem ser avaliados usando métodos conhecidos, como qPCR para de- tectar o número de cópias do ácido nucleico que codifica o receptor re- combinante em comparação com a quantidade total de ácido nucleico ou DNA na amostra particular, por exemplo, sangue, soro, plasma ou tecido, tal como uma amostra de tumor e/ou ensaios de citometria de fluxo que detectam células que expressam o receptor geralmente usando anticorpos específicos para os receptores. Os ensaios basea- dos em células também podem ser usados para detectar o número ou a porcentagem de células funcionais, tais como células capazes de se ligar a e/ou neutralizar e/ou induzir respostas, por exemplo, respostas citotóxicas, contra células da doença ou condição ou expressando o antígeno reconhecido pelo receptor.
[00487] Em alguns aspectos, o aumento da exposição do indivíduo às células inclui o aumento da expansão das células. Em algumas modalidades, as células que expressam o receptor, por exemplo, célu- las que expressam CAR, se expandem no indivíduo após a admin- istração das células T, por exemplo, células T que expressam CAR, e/ou após a administração de um inibidor de cinase, como um inibidor de BTK/ITK, por exemplo, Ibrutinib. Em alguns aspectos, os métodos re- sultam em uma maior expansão das células em comparação com outros métodos, tais como aqueles envolvendo a administração de células T, por exemplo, células T que expressam CAR, na ausência de admin- istração de um inibidor de cinase, por exemplo, Ibrutinib.
[00488] Em alguns aspectos, o método resulta em alta proliferação in vivo das células administradas, por exemplo, conforme medido por citometria de fluxo. Em alguns aspectos, altas proporções de pico das células são detectadas. Por exemplo, em algumas modalidades, em um pico ou nível máximo após a administração das células T, por exemplo,
células T expressando CAR e/ou um inibidor da cinase, por exemplo, Ibrutinib, no sangue ou local da doença do indivíduo ou fração de glóbu- los brancos do mesmo, por exemplo, Fração de PBMC ou fração de células T, pelo menos cerca de 10%, pelo menos cerca de 20%, pelo menos cerca de 30%, pelo menos cerca de 40%, pelo menos cerca de 50%, pelo menos cerca de 60%, pelo menos cerca de 70%, a pelo menos cerca de 80%, ou pelo menos cerca de 90% das células expres- sam o receptor recombinante, por exemplo, o CAR.
[00489] Em algumas modalidades, o método resulta em uma concen- tração máxima, no sangue ou soro ou outro fluido corporal ou órgão ou tecido do indivíduo, de pelo menos 100, 500, 1000, 1500, 2000, 5000,
10.000 ou 15.000 cópias de ou ácido nucleico que codifica o receptor, por exemplo, o CAR, por micrograma de DNA, ou pelo menos 0,1, 0,2, 0,3, 0,4, 0,5, 0,6, 0,7, 0,8 ou 0,9 expressando o receptor, por exemplo, células expressando CAR por número total de células mononucleares do sangue periférico (PBMCs), número total de células mononucleares, número total de células T ou número total de microlitros. Em algumas modalidades, as células que expressam o receptor são detectadas como pelo menos 10, 20, 30, 40, 50 ou 60% do total de PBMCs no sangue do indivíduo e/ou em tal nível por pelo menos 1, 2, 3, 4, 5, 6, 7, 8, 9, 10, 11, 12, 24, 36, 48 ou 52 semanas após as células T, por exem- plo, células T que expressam CAR e/ou o inibidor de quinase, por ex- emplo, Ibrutinib, ou por 1, 2, 3, 4 ou 5, ou mais anos após tal admin- istração.
[00490] Em alguns aspectos, o método resulta em pelo menos 2 vezes, pelo menos 4 vezes, pelo menos 10 vezes ou pelo menos um aumento de 20 vezes nas cópias do ácido nucleico que codifica o re- ceptor recombinante, por exemplo, CAR, por micrograma de DNA, por exemplo, no soro, plasma, sangue ou tecido, por exemplo, amostra de tumor, do indivíduo.
[00491] Em algumas modalidades, as células que expressam o re- ceptor são detectáveis no soro, plasma, sangue ou tecido, por exemplo, amostra de tumor, do indivíduo, por exemplo, por um método especifi- cado, tal como qPCR ou método de detecção baseada em citometria de fluxo, pelo menos 20, 21, 22, 23, 24, 25, 26, 27, 28, 29, 30, 31, 32, 33, 34, 35, 36, 37, 38, 39, 40, 41, 42, 43, 44, 45, 46, 47, 48, 49, 50, 51, 52, 53, 54, 55, 56, 57, 58, 59, ou 60 ou mais dias após a administração das células T, por exemplo, células T que expressam CAR, ou após a ad- ministração de um inibidor de quinase, como um inibidor de BTK/ITK, por exemplo, Ibrutinib, por pelo menos ou cerca de 2 , 3, 4, 5, 6, 7, 8, 9, 10, 11, 12, 13, 14, 15, 16, 17, 18, 19, 20, 21, 22, 23, ou 24 ou mais semanas após o administração das células T, por exemplo, células T que expressam CAR e/ou um inibidor de quinase, por exemplo, Ibrutinib.
[00492] Em alguns aspectos, pelo menos cerca de 1 x 102, pelo menos cerca de 1 x 103, pelo menos cerca de 1 x 104, pelo menos cerca de 1 x 105, ou pelo menos cerca de 1 x 106 ou pelo menos cerca de 5 x 106 ou pelo menos cerca de 1 x 107 ou pelo menos cerca de 5 x 107 ou pelo menos cerca de 1 x 108 células expressando o receptor recom- binante, por exemplo, células expressando CAR e/ou pelo menos 10, 25, 50, 100, 200, 300, 400 ou 500, ou 1000 células expressando recep- tor por microlitro, por exemplo, pelo menos 10 por microlitro, são de- tectáveis ou estão presentes no indivíduo ou fluido, plasma, soro, tecido ou compartimento dos mesmos, como no sangue, por exemplo, sangue periférico ou local da doença, por exemplo, tumor, do mesmo. Em algu- mas modalidades, esse número ou concentração de células é de- tectável no indivíduo para pelo menos cerca de 20 dias, pelo menos cerca de 40 dias, ou pelo menos cerca de 60 dias, ou pelo menos cerca de 3, 4, 5, 6, 7, 8, 9, 10, 11 ou 12 meses, ou pelo menos 2 ou 3 anos, após a administração das células T, por exemplo, células T que expres-
sam CAR e/ou após a administração de um inibidor de quinase, por ex- emplo, Ibrutinib. Esses números de células podem ser detectados por métodos baseados em citometria de fluxo ou baseados em PCR quan- titativo e extrapolação para o número total de células usando métodos conhecidos. Veja, por exemplo, Brentjens et al., Sci Transl Med. 2013 5(177), Park et al, Molecular Therapy 15(4):825–833 (2007), Savoldo et al., JCI 121(5):1822-1826 (2011), Davila et al., (2013) PLoS ONE 8(4):e61338, Davila et al., Oncoimmunology 1(9):1577-1583 (2012), Lamers, Blood 2011 117:72-82, Jensen et al., Biol Blood Marrow Trans- plant 2010 September; 16(9): 1245–1256, Brentjens et al., Blood 2011 118(18):4817-4828.
[00493] Em alguns aspectos, o número de cópias do ácido nucleico que codifica o receptor recombinante, por exemplo, o número de cópias do vetor, por 100 células, por exemplo, no sangue periférico ou medula óssea ou outro compartimento, conforme medido por imuno-his- toquímica, PCR e/ou citometria de fluxo, é pelo menos 0,01, pelo menos 0,1, pelo menos 1, ou pelo menos 10, em cerca de 1 semana, cerca de 2 semanas, cerca de 3 semanas, cerca de 4 semanas, cerca de 5 sema- nas, ou pelo menos cerca de 6 semanas, ou pelo menos cerca de 2, 3, 4, 5, 6, 7, 8, 9, 10, 11 ou 12 meses ou pelo menos 2 ou 3 anos após a administração das células, por exemplo, Células T que expressam CAR e/ou um inibidor de quinase, tal como um inibidor de BTK/ITK, por ex- emplo, Ibrutinib. Em algumas modalidades, o número de cópias do vetor que expressa o receptor, por exemplo, CAR, por micrograma de DNA genômico é pelo menos 100, pelo menos 1000, pelo menos 5000, ou pelo menos 10.000, ou pelo menos 15.000 ou pelo menos 20.000 em um tempo de cerca de 1 semana, cerca de 2 semanas, cerca de 3 sema- nas, ou pelo menos cerca de 4 semanas após a administração das célu- las T, por exemplo, células T que expressam CAR, ou um inibidor de quinase, por exemplo, Ibrutinib, ou pelo menos 2, 3, 4, 5, 6, 7, 8, 9, 10,
11 ou 12 meses ou pelo menos 2 ou 3 anos após tal administração.
[00494] Em alguns aspectos, o receptor, por exemplo, CAR, ex- presso pelas células, é detectável por PCR quantitativo (qPCR) ou por citometria de fluxo no indivíduo, plasma, soro, sangue, tecido e/ou sítio da doença, por exemplo, sítio de tumor, em um momento que seja pelo menos cerca de 3 meses, pelo menos cerca de 6 meses, pelo menos cerca de 12 meses, pelo menos cerca de 1 ano, pelo menos cerca de 2 anos, pelo menos cerca de 3 anos, ou mais de 3 anos, após a admin- istração das células, por exemplo, após o início da administração das células T, por exemplo, células T que expressam CAR e/ou um inibidor de quinase, por exemplo, Ibrutinib.
[00495] Em algumas modalidades, a área sob a curva (AUC) para concentração de células que expressam um receptor (por exemplo, CAR) em um fluido, plasma, soro, sangue, tecido, órgão e/ou sítio da doença, por exemplo, sítio do tumor, do indivíduo ao longo do tempo após a administração das células T, por exemplo, células T que expres- sam CAR e/ou um inibidor de quinase, por exemplo, Ibrutinib, é maior em comparação com aquele alcançado por meio de um regime de dos- agem alternativo, onde ao indivíduo é administrado as células T, por exemplo, células T que expressam CAR, na ausência de administração de um inibidor de quinase, por exemplo, Ibrutinib.
[00496] Em alguns aspectos, o método resulta em alta proliferação in vivo das células administradas, por exemplo, conforme medido por citometria de fluxo. Em alguns aspectos, altas proporções de pico das células são detectadas. Por exemplo, em algumas modalidades, em um pico ou nível máximo após as células T, por exemplo, células T que expressam CAR e/ou um inibidor de quinase, por exemplo, Ibrutinib, no sangue, plasma, soro, tecido ou local da doença do indivíduo ou fração de glóbulos brancos do mesmo, por exemplo, fração de PBMC ou fração de células T, é de pelo menos cerca de 10%, pelo menos cerca de 20%,
pelo menos cerca de 30%, pelo menos cerca de 40%, pelo menos cerca de 50%, pelo menos cerca de 60%, pelo menos cerca de 70%, pelo menos cerca de 80%, ou pelo menos cerca de 90% das células que expressam o receptor recombinante, por exemplo, o CAR.
[00497] Em alguns aspectos, a expansão e/ou persistência aumen- tada ou prolongada da dose de células no indivíduo administrado com um inibidor da quinase, por exemplo, Ibrutinib, está associada a um benefício nos resultados relacionados ao tumor no indivíduo. Em algu- mas modalidades, o resultado relacionado ao tumor inclui uma diminu- ição na carga do tumor ou uma diminuição na medula blástica no indi- víduo. Em algumas modalidades, a carga tumoral é diminuída em ou pelo menos em ou cerca de 10, 20, 30, 40, 50, 60, 70, 80, 90 ou 100 por cento após a administração do método. Em algumas modalidades, a carga da doença, o tamanho do tumor, o volume do tumor, a massa do tumor e/ou a carga ou volume do tumor são reduzidos após a dose de células em pelo menos 50%, 60%, 70%, 80%, 90% ou mais em com- paração a um indivíduo que foi tratado com um método que não envolve a administração de um inibidor de quinase, por exemplo, Ibrutinib. B. Atividade funcional das células T
[00498] Em algumas modalidades, os parâmetros associados à ter- apia ou um resultado de tratamento, que incluem parâmetros que po- dem ser avaliados para as etapas de rastreamento e/ou avaliação de tratamento de resultados e/ou monitoramento de resultados de trata- mento, incluem um ou mais de atividade, fenótipo, proliferação ou função de células T. Em algumas modalidades, qualquer um dos ensaios conhecidos na técnica para avaliar a atividade, fenótipos, pro- liferação e/ou função das células T, por exemplo, células T administra- das para terapia com células T, podem ser usados. Antes e/ou após a administração das células e/ou um inibidor de quinase, como um inibidor de BTK/ITK, por exemplo, Ibrutinib, a atividade biológica das populações de células modificadas em algumas modalidades é medida, por exem- plo, por qualquer de uma série de métodos conhecidos. Os parâmetros para avaliar incluem a ligação específica de uma célula T manipulada ou natural ou outra célula imune ao antígeno, in vivo, por exemplo, por imagem, ou ex vivo, por exemplo, por ELISA ou citometria de fluxo. Em certas modalidades, a capacidade das células manipuladas de destruir células alvo pode ser medida usando qualquer método adequado conhecido na técnica, tal como ensaios de citotoxicidade descritos em, por exemplo, Kochenderfer et al., J. Immunotherapy, 32(7): 689-702 (2009), eHerman et al., J. Immunological Methods, 285(1): 25-40 (2004). Em certas modalidades, a atividade biológica das células é medida testando a expressão e/ou secreção de uma ou mais citocinas, como CD107a, IFNγ, IL-2, GM-CSF e TNFα, e/ou avaliando a atividade citolí- tica.
[00499] Em algumas modalidades, ensaios para monitorar a saúde celular, fenótipo de atividade e/ou funções, por exemplo, funções de si- nalização, podem incluir avaliação de sinalização de células T com base em citometria de massa (CyTOF), usando espectrometria de massa de plasma indutivamente acoplado e tempo de espectrometria de massa de voo, fenotipagem de células T, imunofenotipagem, por exemplo, usando um painel de anticorpos e outros ensaios funcionais, tal como qualquer um aqui descrito.
[00500] Em algumas modalidades, os ensaios para a atividade, fenótipos, proliferação e/ou função das células T, por exemplo, células T administradas para terapia com células T incluem, mas não estão lim- itados a, ELISPOT, ELISA, proliferação celular, ensaio de linfócitos ci- totóxicos (CTL), ligação ao epítopo da célula T, antígeno ou ligante ou manchamento de citocina intracelular, ensaios de proliferação, ensaios de secreção de linfocina, ensaios de citotoxicidade direta e ensaios de diluição limitante. Em algumas modalidades, as respostas proliferativas das células T podem ser medidas, por exemplo, por incorporação de 3H- timidina, BrdU (5-Bromo-2'-desoxiuridina) ou 2'-desóxi-5-etiniluridina (EdU) em seu DNA ou ensaios de diluição de corante, usando corantes tal como diacetato de carboxifluoresceína succinimidil éster (CFSE), CellTrace Violet ou corante de membrana PKH26.
[00501] Em algumas modalidades, avaliar a atividade, fenótipos, pro- liferação e/ou função das células T, por exemplo, células T administra- das para terapia com células T, incluem medir a produção de citocinas a partir de células T e/ou medir a produção de citocinas em uma amostra biológica do indivíduo, por exemplo, amostras de plasma, soro, sangue e/ou tecido, por exemplo, amostras de tumor. Em alguns casos, essas citocinas medidas podem incluir, sem limitação, interleucina-2 (IL-2), in- terferon-gama (IFN), interleucina-4 (IL-4), TNF-alfa (TNFα), interleu- cina-6 (IL-6), interleucina-10 (IL-10) , interleucina-12 (IL-12), fator es- timulador de colônia de granulócitos-macrófagos (GM-CSF), CD107a e/ou TGF-beta (TGFβ). Os ensaios para medir citocinas são bem conhe- cidos na técnica e incluem, mas não estão limitados a, ELISA, ensaio de citocinas multiplexadas, manchamento de citocinas intracelular, matriz de grânulos citométricos, RT-PCR, ELISPOT, citometria de fluxo e bioensaios em que as células responsivas às citocinas relevantes são testadas quanto à capacidade de resposta (por exemplo, proliferação) na presença de uma amostra de teste.
[00502] Em algumas modalidades, avaliar a atividade, fenótipos, pro- liferação e/ou função das células T, por exemplo, células T administra- das para terapia com células T, inclui a avaliação de fenótipos celulares, por exemplo, a expressão de marcadores de superfície celular específi- cos. Em algumas modalidades, as células T, por exemplo, células T ad- ministradas para terapia com células T, são avaliadas quanto à ex- pressão de marcadores de ativação de células T, marcadores de ex- austão de células T e/ou marcadores de diferenciação de células T. Em algumas modalidades, o fenótipo celular é avaliado antes da admin- istração. Em algumas modalidades, o fenótipo celular é avaliado durante ou após a administração da terapia celular e/ou um inibidor de quinase, como um inibidor de BTK/ITK, por exemplo, Ibrutinib. Marcadores de ativação de células T, marcadores de exaustão de células T e/ou mar- cadores de diferenciação de células T para avaliação incluem quaisquer marcadores conhecidos na técnica para subconjuntos específicos de células T, por exemplo, CD25, CD38, antígeno de leucócito humano-DR (HLA-DR), CD69, CD44, CD137, KLRG1, CD62Lbaixo, CCR7baixo, CD71, CD2, CD54, CD58, CD244, CD160, proteína 1 de morte celular pro- gramada (PD-1), proteína do gene 3 de ativação de linfócitos (LAG-3), domínio de imunoglobulina de células T e proteína 3 de domínio de mu- cina (TIM-3), antígeno 4 de linfócito T citotóxico (CTLA-4), atenuador de linfócitos T de banda (BTLA) e/ou imunoglobulina de células T e domínio de motivo inibitório baseado em tirosina imunorreceptora (TIGIT) (veja, por exemplo, Liu et al., Cell Death and Disease (2015) 6, e1792). Em algumas modalidades, o marcador de superfície celular avaliado é CD25, PD-1 e/ou TIM-3. Em algumas modalidades, o marcador de su- perfície celular avaliado é CD25.
[00503] Em alguns aspectos, a detecção dos níveis de expressão in- clui a realização de um ensaio in vitro. Em algumas modalidades, o ensaio in vitro é um imunoensaio, um ensaio baseado em aptâmero, um ensaio histológico ou citológico ou um ensaio de nível de expressão de mRNA. Em algumas modalidades, o parâmetro ou parâmetros para um ou mais de cada um dos um ou mais fatores, efetores, enzimas e/ou marcadores de superfície são detectados por um ensaio de imunoab- sorção enzimática (ELISA), imunomanchamento, imunoprecipitação, ra- dioimunoensaio (RIA), imunocoloração, ensaio de citometria de fluxo, ressonância de plasmão de superfície (SPR), ensaio de quimiolumi- nescência, imunoensaio de fluxo lateral, ensaio de inibição ou ensaio de avidez. Em algumas modalidades, a detecção de citocinas e/ou marca- dores de superfície é determinada usando um reagente de ligação que se liga especificamente a pelo menos um biomarcador. Em alguns casos, o reagente de ligação é um anticorpo ou fragmento de ligação ao antígeno do mesmo, um aptâmero ou uma sonda de ácido nucleico.
[00504] Em algumas modalidades, a administração de um inibidor de quinase, tal como um inibidor de BTK/ITK, por exemplo, Ibrutinib, au- menta o nível de células T CAR circulantes. C. Resposta, eficácia e sobrevivência
[00505] Em algumas modalidades, os parâmetros associados à ter- apia ou um resultado de tratamento, que incluem parâmetros que po- dem ser avaliados para as etapas de rastreamento e/ou avaliação de tratamento de resultados e/ou monitoramento de resultados de trata- mento, incluem tumor ou carga de doença. A administração da imuno- terapia, tal como uma terapia de células T (por exemplo, células T que expressam CAR) e/ou um inibidor de quinase, como um inibidor de BTK/ITK, por exemplo, Ibrutinib, pode reduzir ou prevenir a expansão ou carga da doença ou condição no indivíduo. Por exemplo, onde a doença ou condição é um tumor, os métodos geralmente reduzem o tamanho do tumor, volume, metástase, porcentagem de blastos na medula óssea ou malignidade de células B detectável molecularmente e/ou melhoram o prognóstico ou sobrevivência ou outro sintoma asso- ciado à carga tumoral.
[00506] Em alguns aspectos, a administração de acordo com os métodos fornecidos e/ou com os artigos de fabricação ou composições fornecidos geralmente reduz ou evita a expansão ou carga da doença ou condição no indivíduo. Por exemplo, onde a doença ou condição é um tumor, os métodos geralmente reduzem o tamanho do tumor, vol- ume, metástase, porcentagem de blastos na medula óssea ou maligni- dade de células B detectável molecularmente e/ou melhoram o prognóstico ou sobrevivência ou outro sintoma associado à carga tu- moral.
[00507] Em algumas modalidades, os métodos fornecidos resultam em uma carga tumoral diminuída em indivíduos tratados em com- paração com métodos alternativos em que a imunoterapia, tal como uma terapia de células T (por exemplo, células T que expressam CAR) é dada sem administração de um inibidor de quinase, tal como um inibi- dor de BTK/ITK, por exemplo, Ibrutinib. Não é necessário que a carga tumoral seja realmente reduzida em todos os indivíduos que recebem a terapia combinada, mas essa carga tumoral é reduzida em média em indivíduos tratados, com base em dados clínicos, nos quais a maioria dos indivíduos tratados com tal terapia combinada exibe uma carga tu- moral reduzida, tal como pelo menos 50%, 60%, 70%, 80%, 90%, 95% ou mais dos indivíduos tratados com a terapia de combinação, exibem uma carga tumoral reduzida.
[00508] A carga da doença pode abranger um número total de célu- las da doença no indivíduo ou em um órgão, tecido ou fluido corporal do indivíduo, tal como o órgão ou tecido do tumor ou outro local, por exem- plo, o que indicaria metástase. Por exemplo, as células tumorais podem ser detectadas e/ou quantificadas no sangue, linfa ou medula óssea no contexto de certas doenças hematológicas. A carga da doença pode incluir, em algumas modalidades, a massa de um tumor, o número ou extensão das metástases e/ou a porcentagem de células blásticas presentes na medula óssea.
[00509] Em algumas modalidades, o indivíduo tem um mieloma, um linfoma ou uma leucemia. A extensão da carga da doença pode ser de- terminada pela avaliação da leucemia residual no sangue ou medula óssea. Em algumas modalidades, o indivíduo tem um linfoma não-Hodg- kin (NHL), uma leucemia linfoblástica aguda (ALL), uma leucemia lin- focítica crônica (CLL), um pequeno linfoma linfocítico (SLL) um linfoma difuso de grandes células B (DLBCL) ou um mieloma, por exemplo, um mieloma múltiplo (MM). Em algumas modalidades, o indivíduo tem um MM ou DBCBL. Em algumas modalidades, o indivíduo tem leucemia. Em algumas modalidades, a leucemia é um CLL ou um SLL.
[00510] Em alguns aspectos, as taxas de resposta em indivíduos, tal como indivíduos com NHL, são baseadas nos critérios de Lugano. (Cheson et al., (2014) JCO., 32(27):3059-3067; Johnson et al., (2015) Radiology 2:323–338; Cheson, B.D. (2015) Chin. Clin. Oncol. 4(1):5). Em alguns aspectos, a avaliação da resposta utiliza qualquer um dos métodos clínicos, hematológicos e/ou moleculares. Em alguns aspec- tos, a resposta avaliada usando os critérios de Lugano envolve o uso de tomografia por emissão de pósitrons (PET) - tomografia computador- izada (CT) e/ou CT conforme apropriado. As avaliações de PET-CT po- dem compreender ainda o uso de fluorodeoxiglucose (FDG) para linfo- mas ávidos por FDG. Em alguns aspectos, onde PET-CT será usado para avaliar a resposta em histologias ávidas por FDG, uma escala de 5 pontos pode ser usada. Em alguns aspectos, a escala de 5 pontos compreende os seguintes critérios: 1, nenhuma captação acima da base; 2, captação ≤ mediastino; 3, captação> mediastino, mas ≤ fígado; 4, captação moderada> fígado; 5, captação marcadamente maior do que no fígado e/ou novas lesões; X, novas áreas de absorção provavel- mente não relacionadas ao linfoma.
[00511] Em alguns aspectos, uma resposta completa conforme descrito usando os critérios de Lugano envolve uma resposta metabólica completa e uma resposta radiológica completa em vários lo- cais mensuráveis. Em alguns aspectos, esses locais incluem nódulos linfáticos e locais extralinfáticos, em que um CR é descrito como uma pontuação de 1, 2 ou 3 com ou sem uma massa residual na escala de 5 pontos, quando PET-CT é usado. Em alguns aspectos, no anel de Waldeyer ou locais extranodais com alta captação fisiológica ou com ativação dentro do baço ou medula (por exemplo, com quimioterapia ou fatores estimuladores de colônia mieloide), a captação pode ser maior do que o mediastino normal e/ou fígado. Nessa circunstância, a re- sposta metabólica completa pode ser inferida se a captação nos locais de envolvimento inicial não for maior do que o tecido normal circun- dante, mesmo se o tecido tiver alta captação fisiológica. Em alguns as- pectos, a resposta é avaliada nos gânglios linfáticos usando CT, em que um CR é descrito como nenhum local extralinfático da doença e nódulos alvo/massas nodais devem regredir para ≤ 1,5 cm no diâmetro transver- sal mais longo de uma lesão (LDi). Outros sítios de avaliação incluem a medula óssea, onde a avaliação baseada em PET-CT deve indicar uma falta de evidência de doença ávida por FDG na medula e uma avaliação baseada em CT deve indicar uma morfologia normal, que se indetermi- nada deve ser IHC negativa. Outros locais podem incluir avaliação do aumento do órgão, que deve regredir ao normal. Em alguns aspectos, lesões não medidas e novas lesões são avaliadas, que no caso de CR devem estar ausentes (Cheson et al., (2014) JCO., 32(27):3059-3067; Johnson et al., (2015) Radiology 2:323–338; Cheson, B.D. (2015) Chin. Clin. Oncol. 4(1):5).
[00512] Em alguns aspectos, uma resposta parcial (PR), conforme descrito usando os critérios de Lugano, envolve uma resposta metabólica e/ou radiológica parcial em vários locais mensuráveis. Em alguns aspectos, esses locais incluem linfonodos e locais extralinfáticos, em que um PR é descrito como uma pontuação de 4 ou 5 com absorção reduzida em comparação com a linha de base e massa(s) residual(is) de qualquer tamanho, quando PET-CT é usado. Nesse ínterim, essas descobertas podem indicar doença em resposta. Ao final do tratamento, esses achados podem indicar doença residual. Em alguns aspectos, a resposta é avaliada nos nódulos linfáticos usando CT, em que um PR é descrito como ≥50% de redução no SPD de até 6 nódulos mensuráveis alvo e sítios extranodais. Se uma lesão for muito pequena para medir na TC, 5 mm × 5 mm é atribuído como o valor padrão; se a lesão não é mais visível, o valor é 0 mm × 0 mm; para um nó > 5 mm × 5 mm, mas menor do que o normal, as medições reais são usadas para o cálculo. Outros sítios de avaliação incluem a medula óssea, em que a avaliação baseada em PET-CT deve indicar captação residual superior à captação na medula normal, mas reduzida em comparação com a linha de base (captação difusa compatível com alterações reativas da quimioterapia permitida). Em alguns aspectos, se houver alterações focais persis- tentes na medula no contexto de uma resposta nodal, deve-se consid- erar uma avaliação adicional com ressonância magnética ou biópsia, ou uma varredura de faixa. Em alguns aspectos, outros locais podem incluir avaliação do aumento do órgão, em que o baço deve ter regredido em > 50% em comprimento além do normal. Em alguns aspectos, são avaliadas lesões não medidas e lesões novas, que no caso da PR deve- riam estar ausentes/normais, regredidas, mas sem aumento. Nenhuma resposta/doença estável (SD) ou doença progressiva (PD) pode tam- bém ser medida usando PET-CT e/ou avaliações baseadas em CT. (Cheson et al., (2014) JCO., 32(27):3059-3067; Johnson et al., (2015) Radiology 2:323–338; Cheson, B.D. (2015) Chin. Clin. Oncol., 4(1):5).
[00513] Em alguns aspectos, a sobrevivência sem progressão (PFS) é descrita como o período de tempo durante e após o tratamento de uma doença, tal como uma malignidade de células B, em que um indi- víduo vive com a doença, mas ela não piora. Em alguns aspectos, a resposta objetiva (OR) é descrita como uma resposta mensurável. Em alguns aspectos, a taxa de resposta objetiva (ORR) é descrita como a proporção de pacientes que alcançaram CR ou PR. Em alguns aspec- tos, a sobrevivência global (OS) é descrita como o período de tempo desde a data do diagnóstico ou o início do tratamento para uma doença,
tal como uma malignidade de células B, em que os indivíduos diagnos- ticados com a doença ainda estão vivos. Em alguns aspectos, a so- brevivência sem eventos (EFS) é descrita como o período de tempo após o término do tratamento para uma malignidade de células B em que o indivíduo permanece livre de certas complicações ou eventos que o tratamento pretendia prevenir ou retardar. Esses eventos podem in- cluir o retorno da malignidade das células B ou o início de certos sintomas, como dor óssea, decorrente da malignidade das células B que se espalhou para o osso, ou morte.
[00514] Em algumas modalidades, a medida da duração da resposta (DOR) inclui o tempo desde a documentação da resposta do tumor à progressão da doença. Em algumas modalidades, o parâmetro para avaliar a resposta pode incluir resposta durável, por exemplo, resposta que persiste após um período de tempo desde o início da terapia. Em algumas modalidades, a resposta durável é indicada pela taxa de re- sposta em aproximadamente 1, 2, 3, 4, 5, 6, 7, 8, 9, 10, 11, 12, 18 ou 24 meses após o início da terapia. Em algumas modalidades, a resposta é durável por mais de 3 meses ou mais de 6 meses.
[00515] Em alguns aspectos, os critérios RECIST são usados para determinar a resposta objetiva do tumor. (Eisenhauer et al., European Journal of Cancer 45 (2009) 228-247.) Em alguns aspectos, o critério RECIST é usado para determinar a resposta objetiva do tumor para lesões alvo. Em alguns aspectos, uma resposta completa conforme de- terminado usando os critérios RECIST é descrita como o desapareci- mento de todas as lesões alvo e quaisquer nódulos linfáticos patológicos (sejam alvo ou não alvo) devem ter redução no eixo curto para <10 mm. Em outros aspectos, uma resposta parcial conforme determinado usando os critérios RECIST é descrita como pelo menos uma diminu- ição de 30% na soma dos diâmetros das lesões alvo, tomando como referência os diâmetros da soma da linha de base. Em outros aspectos,
a doença progressiva (PD) é descrita como um aumento de pelo menos 20% na soma dos diâmetros das lesões alvo, tomando como referência a menor soma do estudo (isso inclui a soma da linha de base se essa for a menor do estudo). Além do aumento relativo de 20%, a soma deve também demonstrar um aumento absoluto de pelo menos 5 mm (em alguns aspectos o aparecimento de uma ou mais novas lesões também é considerado progressão). Em outros aspectos, a doença estável (SD) é descrita como nem redução suficiente para se qualificar para PR nem aumento suficiente para se qualificar para PD, tomando como referência os menores diâmetros de soma durante o estudo.
[00516] No caso de MM, parâmetros exemplares para avaliar a ex- tensão da carga da doença incluem parâmetros como número de célu- las plasmáticas clonais (por exemplo,> 10% na biópsia da medula óssea ou em qualquer quantidade em uma biópsia de outros tecidos; plasmacitoma), presença de proteína monoclonal (paraproteína) no soro ou na urina, evidência de dano no órgão-alvo sentido relacionado ao distúrbio de células plasmáticas (por exemplo, hipercalcemia (cálcio corrigido> 2,75 mmol / l); insuficiência renal atribuível ao mieloma; ane- mia (hemoglobina <10 g/dl); e/ou lesões ósseas (lesões líticas ou oste- oporose com fraturas por compressão)).
[00517] No caso de DLBCL, parâmetros exemplares para avaliar a extensão da carga da doença incluem parâmetros como morfologia celular (por exemplo, células centroblásticas, imunoblásticas e ana- plásicas), expressão gênica, expressão de miRNA e expressão de proteína (por exemplo, expressão de BCL2, BCL6, MUM1, LMO2, MYC e p21).
[00518] Em alguns aspectos, as taxas de resposta em indivíduos, como indivíduos com CLL, são baseadas nos critérios de resposta do International Workshop on Chronic Lymphocytic Leukemia (IWCLL) (Hallek, et al., Blood 2008, Jun 15; 111 (12) : 5446-5456). Em alguns aspectos, esses critérios são descritos como a seguir: remissão com- pleta (CR), em que em alguns aspectos requer a ausência de linfócitos clonais de sangue periférico por imunofenotipagem, ausência de linfad- enopatia, ausência de hepatomegalia ou esplenomegalia, ausência de sintomas constitucionais e contagens sanguíneas satisfatórias; re- missão completa com recuperação incompleta da medula (CRi), que em alguns aspectos é descrita como CR acima, mas sem contagens san- guíneas normais; remissão parcial (PR), que em alguns aspectos é descrita como ≥ 50% de queda na contagem de linfócitos, ≥ 50% de redução na linfadenopatia ou ≥ 50% de redução no fígado ou baço, jun- tamente com melhora nas contagens de sangue periférico; doença pro- gressiva (PD), que em alguns aspectos é descrita como aumento ≥ 50% na contagem de linfócitos para > 5 x109/L, aumento ≥ 50% na linfade- nopatia, aumento ≥ 50% no tamanho do fígado ou baço, transformação de Richter ou novas citopenias devido à CLL; e doença estável, que em alguns aspectos é descrita como não atendendo aos critérios para CR, CRi, PR ou PD.
[00519] Em algumas modalidades, os indivíduos exibem um CR ou OR se, dentro de 1 mês da administração da dose de células, os nódu- los linfáticos no indivíduo é menor do que ou cerca de 20 mm de ta- manho, menor do que ou cerca de 10 mm de tamanho ou menor do que ou cerca de 10 mm de tamanho.
[00520] Em algumas modalidades, um clone de índice do CLL não é detectado na medula óssea do indivíduo (ou na medula óssea superior a 50%, 60%, 70%, 80%, 90% ou mais dos indivíduos tratados de acordo com os métodos). Em algumas modalidades, um clone de índice do CLL é avaliado por sequenciamento profundo de IgH. Em algumas modali- dades, o clone de índice não é detectado em um momento que é em ou cerca de ou pelo menos em ou cerca de 1, 2, 3, 4, 5, 6, 12, 18 ou 24 meses após a administração das células.
[00521] Em algumas modalidades, um indivíduo exibe doença mor- fológica se houver mais ou igual a 5% de blastos na medula óssea, por exemplo, conforme detectado por microscopia de luz, tal como maior ou igual a 10% de blastos na medula óssea, maior ou igual a 20% de blas- tos na medula óssea, maior ou igual a 30% de blastos na medula óssea, maior ou igual a 40% de blastos na medula óssea ou maior ou igual a 50% de blastos na medula óssea. Em algumas modalidades, um indi- víduo exibe remissão completa ou clínica se houver menos de 5% de blastos na medula óssea.
[00522] Em algumas modalidades, um indivíduo pode exibir re- missão completa, mas uma pequena proporção de células leucêmicas residuais morfologicamente indetectáveis (por técnicas de microscopia de luz) está presente. Diz-se que um indivíduo exibe doença residual mínima (MRD) se o indivíduo exibe menos de 5% de blastos na medula óssea e exibe malignidade de células B detectável molecularmente. Em algumas modalidades, a malignidade de células B detectável molecu- larmente pode ser avaliada usando qualquer uma de uma variedade de técnicas moleculares que permitem a detecção sensível de um pequeno número de células. Em alguns aspectos, tais técnicas incluem ensaios de PCR, que podem determinar rearranjos de genes do receptor de células Ig/T exclusivos ou transcritos de fusão produzidos por trans- locações de cromossomos. Em algumas modalidades, a citometria de fluxo pode ser usada para identificar células de malignidade de células B com base em imunofenótipos específicos de leucemia. Em algumas modalidades, a detecção molecular de malignidade de células B pode detectar apenas 1 célula de leucemia em 100.000 células normais. Em algumas modalidades, um indivíduo exibe MRD que é detectável mo- lecularmente se pelo menos ou mais de 1 célula de leucemia em
100.000 células for detectada, como por PCR ou citometria de fluxo. Em algumas modalidades, a carga de doença de um indivíduo é inde- tectável molecularmente ou MRD-, de modo que, em alguns casos, nenhuma célula de leucemia seja capaz de ser detectada no indivíduo usando técnicas de PCR ou citometria de fluxo.
[00523] No caso da leucemia, a extensão da carga da doença pode ser determinada pela avaliação da leucemia residual no sangue ou na medula óssea. Em algumas modalidades, um indivíduo apresenta doença morfológica se houver blastos maiores ou iguais a 5% na medula óssea, por exemplo, conforme detectado por microscopia de luz. Em algumas modalidades, um indivíduo exibe remissão completa ou clí- nica se houver menos de 5% de blastos na medula óssea.
[00524] Em algumas modalidades, para a leucemia, um indivíduo pode exibir remissão completa, mas uma pequena proporção de células leucêmicas residuais morfologicamente indetectáveis (por técnicas de microscopia de luz) estão presentes. Diz-se que um indivíduo exibe doença residual mínima (MRD) se o indivíduo exibe menos de 5% de blastos na medula óssea e exibe malignidade de células B detectável molecularmente. Em algumas modalidades, a malignidade de célula B detectável molecularmente pode ser avaliada usando qualquer uma de uma variedade de técnicas moleculares que permitem a detecção sensível de um pequeno número de células. Em alguns aspectos, tais técnicas incluem ensaios de PCR, que podem determinar rearranjos de genes do receptor de células Ig/T exclusivos ou transcritos de fusão produzidos por translocações de cromossomos. Em algumas modali- dades, a citometria de fluxo pode ser usada para identificar células de malignidade de células B com base em imunofenótipos específicos de leucemia. Em algumas modalidades, a detecção molecular de maligni- dade de células B pode detectar apenas 1 célula de leucemia em
100.000 células normais. Em algumas modalidades, um indivíduo exibe MRD que é detectável molecularmente se pelo menos ou mais de 1 célula de leucemia em 100.000 células for detectada, tal como por PCR ou citometria de fluxo. Em algumas modalidades, a carga de doença de um indivíduo é indetectável molecularmente ou MRD-, de modo que, em alguns casos, nenhuma célula de leucemia seja capaz de ser detectada no indivíduo usando técnicas de PCR ou citometria de fluxo.
[00525] Em algumas modalidades, os métodos e/ou administração de uma terapia celular, tal como uma terapia com células T (por exem- plo, células T expressando CAR) e/ou um inibidor de quinase, tal como um inibidor de BTK/ITK, por exemplo, Ibrutinib, diminui a carga da doença em comparação com a carga da doença em um momento ime- diatamente antes da administração da imunoterapia, por exemplo, tera- pia com células T e/ou um inibidor de quinase, por exemplo, Ibrutinib.
[00526] Em alguns aspectos, a administração da imunoterapia, por exemplo, terapia com células T e/ou um inibidor da quinase, por exem- plo, Ibrutinib, pode prevenir um aumento na carga da doença, e isso pode ser evidenciado por nenhuma mudança na carga da doença.
[00527] Em algumas modalidades, o método reduz a carga da doença ou condição, por exemplo, número de células tumorais, ta- manho do tumor, duração da sobrevivência do paciente ou sobrevivên- cia sem eventos, em um grau maior e/ou para uma maior período de tempo em comparação com a redução que seria observada com um método comparável usando uma terapia alternativa, tal como aquela em que o indivíduo recebe imunoterapia, por exemplo, terapia com célula T apenas, na ausência de administração de um inibidor de quinase, por exemplo, Ibrutinib. Em algumas modalidades, a carga da doença é re- duzida em maior extensão ou por uma maior duração após a terapia de combinação de administração da imunoterapia, por exemplo, terapia com célula T e um inibidor de quinase, por exemplo, Ibrutinib, em com- paração com a redução que seria efetuada pela administração de cada agente sozinho, por exemplo, administrando um inibidor da quinase, por exemplo, Ibrutinib, a um indivíduo que não recebeu a imunoterapia, por exemplo, terapia com célula T; ou administrar a imunoterapia, por ex- emplo, terapia com célula T, a um indivíduo que não recebeu um inibidor de quinase, por exemplo, Ibrutinib.
[00528] Em algumas modalidades, a carga de uma doença ou con- dição no indivíduo é detectada, avaliada ou medida. A carga da doença pode ser detectada em alguns aspectos através da detecção do número total de doenças ou células associadas à doença, por exemplo, células tumorais, no indivíduo, ou em um órgão, tecido ou fluido corporal do indivíduo, como sangue ou soro. Em algumas modalidades, a carga da doença, por exemplo, a carga do tumor, é avaliada medindo o número ou extensão das metástases. Em alguns aspectos, a sobrevivência do indivíduo, a sobrevivência dentro de um determinado período de tempo, a extensão da sobrevivência, a presença ou duração da sobrevivência sem eventos ou sem sintomas ou a sobrevivência sem recidiva são avaliadas. Em algumas modalidades, qualquer sintoma da doença ou condição é avaliado. Em algumas modalidades, a medida da carga da doença ou condição é especificada. Em algumas modalidades, parâmetros exemplares para determinação incluem resultados clínicos particulares indicativos de melhora ou melhora na doença ou condição, por exemplo, tumor. Tais parâmetros incluem: duração do controle da doença, incluindo resposta completa (CR), resposta parcial (PR) ou doença estável (SD) (veja, por exemplo, as diretrizes dos Critérios de Avaliação de Resposta em Tumores Sólidos (RECIST)), taxa de re- sposta objetiva (ORR ), sobrevivência sem progressão (PFS) e so- brevivência global (OS). Limiares específicos para os parâmetros po- dem ser definidos para determinar a eficácia do método de terapia de combinação aqui fornecido.
[00529] Em alguns aspectos, a carga da doença é medida ou detect- ada antes da administração da imunoterapia, por exemplo, terapia com células T, após a administração da imunoterapia, por exemplo, terapia com células T, mas antes da administração de um inibidor de quinase, por exemplo, Ibrutinib, e/ou após a administração de ambos a imunoter- apia, por exemplo, terapia com células T e um inibidor da quinase, por exemplo, Ibrutinib. No contexto da administração múltipla de uma ou mais etapas da terapia de combinação, a carga da doença em algumas modalidades pode ser medida antes ou após a administração de qualquer uma das etapas, doses e/ou ciclos de administração, ou em um momento entre a administração de qualquer uma das etapas, doses e/ou ciclos de administração. Em algumas modalidades, a admin- istração de um inibidor de quinase, por exemplo, Ibrutinib, é realizada em pelo menos dois ciclos (por exemplo, ciclo de 28 dias) e a carga da doença é medida ou detectada antes, durante e/ou após cada ciclo.
[00530] Em algumas modalidades, a carga é diminuída em ou pelo menos em ou cerca de 10, 20, 30, 40, 50, 60, 70, 80, 90 ou 100 por cento pelos métodos fornecidos em comparação com imediatamente antes da administração de um inibidor da quinase, por exemplo, Ibru- tinib, e a imunoterapia, por exemplo, terapia com célula T. Em algumas modalidades, a carga da doença, o tamanho do tumor, o volume do tu- mor, a massa do tumor e/ou a carga ou volume do tumor são reduzidos após a administração da imunoterapia, por exemplo, terapia com células T e um inibidor de quinase, por exemplo, Ibrutinib, por pelo menos ou cerca de 10, 20, 30, 40, 50, 60, 70, 80, 90% ou mais em comparação com aquele imediatamente antes da administração da imunoterapia, por exemplo, terapia com células T e/ou um inibidor de quinase, por exem- plo, Ibrutinib.
[00531] Em algumas modalidades, a redução da carga da doença pelo método compreende uma indução na remissão morfológica com- pleta, por exemplo, conforme avaliado em 1 mês, 2 meses, 3 meses, 4 meses, 5 meses, 6 meses ou mais de 6 meses, após a administração de, por exemplo, o início da terapia de combinação.
[00532] Em alguns aspectos, um ensaio para doença residual mí- nima, por exemplo, conforme medido por citometria de fluxo multipara- métrica, é negativo ou o nível de doença residual mínima é inferior a cerca de 0,3%, inferior a cerca de 0,2%, inferior a cerca de 0,1%, ou inferior a cerca de 0,05%.
[00533] Em algumas modalidades, a taxa de sobrevivência sem eventos ou a taxa de sobrevivência geral do indivíduo é melhorada pelos métodos, em comparação com outros métodos. Por exemplo, em algu- mas modalidades, a taxa de sobrevivência sem eventos ou proba- bilidade para indivíduos tratados pelos métodos em 6 meses após o método de terapia de combinação aqui fornecido é maior do que cerca de 40%, maior do que cerca de 50%, maior do que cerca de 60% , maior do que cerca de 70%, maior do que cerca de 80%, maior do que cerca de 90% ou maior do que cerca de 95%.Em alguns aspectos, a taxa de sobrevivência geral é maior que cerca de 40%, maior que cerca de 50%, maior que cerca de 60%, maior que cerca de 70%, maior que cerca de 80%, maior que cerca de 90% ou maior que cerca de 95% . Em algumas modalidades, o indivíduo tratado com os métodos exibe sobrevivência sem eventos, sobrevivência sem recidiva ou sobrevivência por pelo menos 6 meses, ou pelo menos 1, 2, 3, 4, 5, 6, 7, 8, 9, ou 10 anos. Em algumas modalidades, o tempo para progressão é melhorado, como um tempo para progressão maior que ou cerca de 6 meses, ou pelo menos 1, 2, 3, 4, 5, 6, 7, 8, 9 ou 10 anos.
[00534] Em algumas modalidades, após o tratamento pelo método, a probabilidade de recidiva é reduzida em comparação com outros méto- dos. Por exemplo, em algumas modalidades, a probabilidade de recid- iva em 6 meses após o método de terapia combinada é inferior a cerca de 80%, inferior a cerca de 70%, inferior a cerca de 60%, inferior a cerca de 50%, inferior a cerca de 40 %, inferior a cerca de 30%, inferior a cerca de 20% ou inferior a cerca de 10%.
[00535] Em alguns casos, a farmacocinética das células administra- das, por exemplo, células transferidas de forma adotiva, é determinada para avaliar a disponibilidade, por exemplo, a biodisponibilidade das células administradas. Métodos para determinar a farmacocinética de células transferidas de forma adotiva podem incluir a retirada de sangue periférico de indivíduos que foram administrados com células manipula- das e a determinação do número ou razão das células manipuladas no sangue periférico. As abordagens para selecionar e/ou isolar células po- dem incluir o uso de anticorpos específicos do receptor de antígeno qui- mérico (CAR) (por exemplo, Brentjens et al., Sci. Transl. Med. 2013 Mar; 5 (177): 177ra38) Protein L (Zheng et al., J. Transl. Med. 2012 Feb; 10:29), marcadores de epítopo, como sequências de Strep-Tag, intro- duzidos diretamente em locais específicos no CAR, em que os rea- gentes de ligação para Strep-Tag são usados para avaliar diretamente o CAR (Liu et al. (2016) Nature Biotechnology, 34:430; Publicação de pedido de patente internacional. No. WO2015095895) e anticorpos monoclonais que se ligam especificamente a um polipeptídeo CAR (veja Publicação de pedido de patente internacional No. WO2014190273). Genes marcadores extrínsecos podem, em alguns casos, ser utilizados em conexão com terapias celulares projetadas para permitir a detecção ou seleção de células e, em alguns casos, também para promover o suicídio celular. Um receptor de fator de crescimento epidérmico trun- cado (EGFRt) em alguns casos pode ser coexpresso com um transgene de interesse (por exemplo, um CAR) em células transduzidas (veja, por exemplo, Patente Norte Americana Nº 8.802.374). EGFRt pode conter um epítopo reconhecido pelo anticorpo cetuximabe (Erbitux®) ou outro anticorpo anti-EGFR terapêutico ou molécula de ligação, que pode ser usado para identificar ou selecionar células que foram projetadas com o construto EGFRt e outro receptor recombinante, tal como um receptor de antígeno quimérico (CAR) e/ou para eliminar ou separar células que expressam o receptor. Veja Patente Norte Americana No. 8,802,374 e Liu et al., Nature Biotech. 2016 April; 34(4): 430–434).
[00536] Em algumas modalidades, o número de células T CAR+ em uma amostra biológica obtida do paciente, por exemplo, sangue, pode ser determinado em um período de tempo após a administração da ter- apia celular, por exemplo, para determinar a farmacocinética das célu- las. Em algumas modalidades, o número de células T CAR+, opcional- mente células T CAR+ CD8+ e/ou células T CAR+ CD4+, detectáveis no sangue do indivíduo, ou na maioria dos indivíduos assim tratados pelo método, é maior do que 1 célula por µL, maior que 5 células por µL ou maior que por 10 células por µL. IV. TOXICIDADE E RESULTADOS ADVERSOS
[00537] Em modalidades dos métodos fornecidos, o indivíduo é mon- itorado para toxicidade ou outro resultado adverso, incluindo resultados relacionados ao tratamento, por exemplo, desenvolvimento de neutro- penia, síndrome de liberação de citocina (CRS) ou neurotoxicidade (NT), em indivíduos administrados terapia de combinação com- preendendo uma terapia celular (por exemplo, uma terapia de células T) e um inibidor de quinase, tal como um inibidor de BTK/ITK, por ex- emplo, Ibrutinib. Em algumas modalidades, os métodos fornecidos são realizados para reduzir o risco de um resultado ou sintoma tóxico, perfil, fator ou propriedade de promoção de toxicidade, tal como um sintoma ou resultado associado ou indicativo de neutropenia grave, síndrome de liberação de citocina grave (CRS) ou neurotoxicidade grave.
[00538] Em algumas modalidades, os métodos fornecidos não re- sultam em uma alta taxa ou probabilidade de toxicidade ou resultados tóxicos, ou reduzem a taxa ou probabilidade de toxicidade ou resultados tóxicos, como neurotoxicidade grave (NT) ou síndrome de liberação de citocina grave ( CRS), tal como em comparação com certas outras ter- apias celulares. Em algumas modalidades, os métodos não resultam ou não aumentam o risco de NT (sNT) grave, CRS grave (sCRS), síndrome de ativação macrofágica, síndrome de lise tumoral, febre de pelo menos 38 graus Celsius ou cerca de três ou mais dias e um nível plasmático de CRP de pelo menos ou cerca de 20 mg/dL. Em algumas modali- dades, mais do que ou mais do que cerca de 30%, 35%, 40%, 50%, 55%, 60% ou mais dos indivíduos tratados de acordo com os métodos fornecidos não exibem qualquer grau de CRS ou qualquer grau de neu- rotoxicidade. Em algumas modalidades, não mais do que 50% dos indi- víduos trataram (por exemplo, pelo menos 60%, pelo menos 70%, pelo menos 80%, pelo menos 90% ou mais dos indivíduos tratados) uma sín- drome de liberação de citocina (CRS) maior do que grau 2 e/ou uma neurotoxicidade superior ao grau 2. Em algumas modalidades, pelo menos 50% dos indivíduos tratados de acordo com o método (por ex- emplo, pelo menos 60%, pelo menos 70%, pelo menos 80%, pelo menos 90% ou mais dos indivíduos tratados) não exibem um resultado tóxico grave (por exemplo, CRS grave ou neurotoxicidade grave), como não exibem grau 3 ou neurotoxicidade superior e/ou não exibem CRS grave, ou não o fazem dentro de um determinado período de tempo após o tratamento, como dentro de uma semana, duas semanas ou um mês após a administração das células.
[00539] Em algumas modalidades, os métodos fornecidos não re- sultam em uma alta taxa ou probabilidade de toxicidade ou resultados tóxicos, ou reduzem a taxa ou probabilidade de toxicidade ou resultados tóxicos, como neurotoxicidade grave (NT) ou síndrome de liberação de citocina grave (CRS), tal como em comparação com certas outras tera- pias celulares. Em algumas modalidades, os métodos não resultam ou não aumentam o risco de NT (sNT) grave, CRS grave (sCRS), síndrome de ativação macrofágica, síndrome de lise tumoral, febre de pelo menos
38 graus Celsius ou cerca de três ou mais dias e um nível plasmático de CRP de pelo menos ou cerca de 20 mg/dL. Em algumas modali- dades, mais ou mais do que cerca de 30%, 35%, 40%, 50%, 55%, 60% ou mais dos indivíduos tratados de acordo com os métodos fornecidos não exibem qualquer grau de CRS ou qualquer grau de neurotoxicidade. Em algumas modalidades, não mais do que 50% dos indivíduos tratados (por exemplo, pelo menos 60%, pelo menos 70%, pelo menos 80%, pelo menos 90% ou mais dos indivíduos tratados) uma síndrome de liber- ação de citocina (CRS) maior do que grau 2 e/ou neurotoxicidade maior que grau 2. Em algumas modalidades, pelo menos 50% dos indivíduos tratados de acordo com o método (por exemplo, pelo menos 60%, pelo menos 70%, pelo menos 80%, pelo menos 90% ou mais dos indivíduos tratados) não apresentam um resultado de toxicidade grave (por exem- plo, CRS grave ou neurotoxicidade grave), tal como não exibe neuro- toxicidade de grau 3 ou superior e/ou não exibe CRS grave, ou não o faz dentro de um determinado período de tempo após o tratamento, como dentro de uma semana, duas semanas ou um mês da admin- istração das células. A. Síndrome de liberação de citocinas (CRS) e neurotoxicidade
[00540] Em alguns aspectos, o resultado tóxico é ou está associado ou é indicativo de síndrome de liberação de citocina (CRS) ou CRS grave (sCRS). CRS, por exemplo, sCRS, pode ocorrer em alguns casos após terapia com células T adotivas e administração a indivíduos de outros produtos biológicos. Veja Davila et al., Sci Transl Med 6, 224ra25 (2014); Brentjens et al., Sci. Transl. Med. 5, 177ra38 (2013); Grupp et al., N. Engl. J. Med. 368, 1509–1518 (2013); e Kochenderfer et al., Blood 119, 2709–2720 (2012); Xu et al., Cancer Letters 343 (2014) 172-78.
[00541] Normalmente, a CRS é causada por uma resposta imune sis- têmica exagerada mediada por, por exemplo, células T, células B, célu- las NK, monócitos e/ou macrófagos. Essas células podem liberar uma grande quantidade de mediadores inflamatórios, como citocinas e quimiocinas. As citocinas podem desencadear uma resposta inflamató- ria aguda e/ou induzir danos ao órgão endotelial, o que pode resultar em vazamento microvascular, insuficiência cardíaca ou morte. A CRS grave e com risco de vida pode causar infiltração pulmonar e lesão pul- monar, insuficiência renal ou coagulação intravascular disseminada. Outras toxicidades graves com risco de vida podem incluir toxicidade cardíaca, dificuldade respiratória, toxicidade neurológica e/ou insuficiên- cia hepática. A CRS pode ser tratada usando terapia anti-inflamatória, como uma terapia anti-IL-6, por exemplo, anticorpo anti-IL-6, por exem- plo, tocilizumabe, ou antibióticos ou outros agentes, conforme descrito.
[00542] Resultados, sinais e sintomas de CRS são conhecidos e in- cluem aqueles descritos aqui. Em algumas modalidades, onde um de- terminado regime de dosagem ou efeitos de administração ou não afetam um determinado resultado, sinal ou sintoma associado a CRS, resultados, sinais e sintomas particulares e/ou quantidades ou graus dos mesmos podem ser especificados.
[00543] No contexto da administração de células que expressam CAR, a CRS ocorre tipicamente 6 a 20 dias após a infusão de células que expressam um CAR. Ver Xu et al., Cancer Letters 343 (2014) 172-
78. Em alguns casos, a CRS ocorre menos de 6 dias ou mais de 20 dias após a infusão de células T CAR. A incidência e o momento da CRS podem estar relacionados aos níveis basais de citocinas ou à carga tu- moral no momento da infusão. Comumente, a CRS envolve níveis séri- cos elevados de interferona (IFN)-γ, fator de necrose tumoral (TNF)-α e/ou interleucina (IL)-2. Outras citocinas que podem ser rapidamente in- duzidas na RSC são IL-1β, IL-6, IL-8 e IL-10.
[00544] Resultados exemplares associados à CRS incluem febre, ar- repios, calafrios, hipotensão, dispneia, síndrome do desconforto res-
piratório agudo (ARDS), encefalopatia, elevação de ALT/AST, insu- ficiência renal, distúrbios cardíacos, hipóxia, distúrbios neurológicos e morte. As complicações neurológicas incluem delírio, atividade sem- elhante à convulsão, confusão, dificuldade em encontrar palavras, afasia e/ou ficar entorpecido. Outros resultados relacionados à CRS in- cluem fadiga, náusea, cefaleia, convulsão, taquicardia, mialgias, erup- ção cutânea, síndrome de vazamento vascular agudo, comprome- timento da função hepática e insuficiência renal. Em alguns aspectos, a CRS está associada a um aumento em um ou mais fatores, como fer- ritina sérica, dímero-d, aminotransferases, lactato desidrogenase e triglicerídeos, ou com hipofibrinogenemia ou hepatoesplenomegalia.
[00545] Em algumas modalidades, os resultados associados com CRS incluem um ou mais dos seguintes: febre persistente, por exemplo, febre de uma temperatura especificada, por exemplo, maior do que ou cerca de 38 graus Celsius, para dois ou mais, por exemplo, três ou mais, por exemplo, quatro ou mais dias ou por pelo menos três dias consecu- tivos; febre maior ou cerca de 38 graus Celsius; elevação de citocinas, tal como uma mudança máxima de vezes, por exemplo, de pelo menos, ou cerca de 75, em comparação com os níveis de pré-tratamento de pelo menos duas citocinas (por exemplo, pelo menos dois do grupo que consiste em interferon gama (IFNγ), GM-CSF, IL-6, IL-10, Flt-3L, frac- talcina e IL-5 e/ou fator de necrose tumoral alfa (TNFα)), ou uma mu- dança máxima de vezes, por exemplo, de pelo menos ou cerca de 250 de pelo menos uma dessas citocinas; e/ou pelo menos um sinal clínico de toxicidade, como hipotensão (por exemplo, medida por pelo menos um pressor vasoativo intravenoso); hipóxia (por exemplo, níveis plasmáticos de oxigênio (PO2) inferiores a ou cerca de 90%); e/ou um ou mais distúrbios neurológicos (incluindo alterações do estado mental, obtundação e convulsões).
[00546] Resultados relacionados à CRS exemplares incluem níveis séricos aumentados ou altos de um ou mais fatores, incluindo citocinas e quimiocinas e outros fatores associados à CRS. Resultados exem- plares incluem ainda aumentos na síntese ou secreção de um ou mais de tais fatores. Tal síntese ou secreção pode ser pela célula T ou uma célula que interage com a célula T, tal como uma célula imune inata ou célula B.
[00547] Em algumas modalidades, os fatores séricos associados a CRS ou resultados relacionados a CRS incluem citocinas inflamatórias e/ou quimiocinas, incluindo interferon gama (IFN-γ), TNF-a, IL-1β, IL-2, IL-6, IL-7, IL-8, IL-10, IL-12, sIL-2Ra, fator estimulador de colônia de granulócitos macrófagos (GM-CSF), proteína inflamatória de macrófagos (MIP)-1, fator de necrose tumoral alfa (TNFα), IL-6 e IL-10, IL-1β, IL-8, IL-2, MIP -1, Flt-3L, fractalcina e/ou IL-5. Em algumas modal- idades, o fator ou resultado inclui proteína C reativa (CRP). Além de ser um fator de risco precoce e facilmente mensurável para CRS, a CRP também é um marcador de expansão celular. Em algumas modalidades, os indivíduos que são medidos como tendo altos níveis de CRP, tal como ≥ 15 mg/dL, têm CRS. Em algumas modalidades, os indivíduos que são medidos como tendo altos níveis de CRP não têm CRS. Em algumas modalidades, uma medida de CRS inclui uma medida de CRP e outro fator indicativo de CRS.
[00548] Em algumas modalidades, uma ou mais citocinas ou quimiocinas inflamatórias são monitoradas antes, durante ou após o tratamento com CAR e/ou um inibidor de quinase, tal como um trata- mento com um inibidor de BTK/ITK, por exemplo, Ibrutinib. Em alguns aspectos, uma ou mais citocinas ou quimiocinas incluem IFN-γ, TNF-α, IL-2, IL-1β, IL-6, IL-7, IL-8, IL-10, IL-12, sIL-2Rα, fator estimulador de colônia de granulócitos macrófagos (GM-CSF) ou proteína inflamatória de macrófagos (MIP). Em algumas modalidades, IFN-γ, TNF-α e IL-6 são monitorados.
[00549] Os critérios de CRS que parecem se correlacionar com o início da CRS para prever quais pacientes têm maior probabilidade de desenvolver sCRS foram desenvolvidos (veja Davilla et al. Science translational medicine. 2014; 6 (224): 224ra25) . Os fatores incluem fe- bres, hipóxia, hipotensão, alterações neurológicas, níveis séricos eleva- dos de citocinas inflamatórias, tal como um conjunto de sete citocinas (IFNγ, IL-5, IL-6, IL-10, Flt-3L, fractalcina e GM-CSF), cuja elevação in- duzida pelo tratamento pode se correlacionar bem com a carga tumoral pré-tratamento e os sintomas de sCRS. Outras diretrizes sobre o di- agnóstico e tratamento de CRS são conhecidas (Veja, por exemplo, Lee et al, Blood. 2014; 124 (2): 188-95). Em algumas modalidades, os crité- rios que refletem o grau de CRS são aqueles detalhados na Tabela 3 abaixo. Tabela 3: Critérios de classificação exemplares para CRS Grau Descrição dos Sintomas 1 Não oferece risco de vida, requer apenas tratamento sintomático, tal como antipiréticos e antieméticos (por Leve exemplo, febre, náusea, fadiga, dor de cabeça, mialgias, mal-estar) 2 Requer e responde à intervenção moderada: Moderado  Necessidade de oxigênio <40%, ou  Hipotensão responsiva a fluidos ou baixa dose de um único vasopressor, ou  Toxicidade de órgão de grau 2 (por CTCAE v4.0) 3 Requer e responde à intervenção agressiva: Grave  Necessidade de oxigênio ≥ 40%, ou  Hipotensão exigindo alta dose de um único vasopressor (por exemplo, norepinefrina ≥ 20 µg/kg/min, dopamina ≥10 µg/kg/min, fenilefrina ≥ 200 µg/kg/min ou epinefrina ≥ 10 µg/kg/min), ou  Hipotensão exigindo vários vasopressores (por exemplo, vasopressina + um dos agentes acima, ou combinação de vasopressores equivalentes a ≥ 20 µg/kg/min de norepinefrina), ou  Toxicidade de órgão de grau 3 ou transaminite de grau 4 (por CTCAE v4.0) 4 Com risco de vida : Risco de vida  Requisito de suporte ventilatório, ou  Toxicidade de órgão de grau 4 (excluindo transaminite) 5 Morte Fatal
[00550] Em algumas modalidades, considera-se que um indivíduo desenvolve "CRS grave" ("sCRS") em resposta ou secundário à admin- istração de uma terapia celular ou dose de células da mesma, se, após a administração, o indivíduo apresentar: (1) febre de pelo menos 38 graus Celsius por pelo menos três dias; (2) elevação de citocinas que inclui (a) uma mudança de vezes máxima de pelo menos 75 para pelo menos dois do seguinte grupo de sete citocinas em comparação com o nível imediatamente após a administração: interferon gama (IFNγ), GM- CSF, IL -6, IL-10, Flt-3L, fractalcina e IL-5 e/ou (b) uma mudança de vezes máxima de pelo menos 250 para pelo menos um do seguinte grupo de sete citocinas em comparação com o nível imediatamente após a administração: interferon gama (IFNγ), GM-CSF, IL-6, IL-10, Flt- 3L, fractalcina, e IL-5; e (c) pelo menos um sinal clínico de toxicidade, como hipotensão (exigindo pelo menos um pressor vasoativo intrave- noso) ou hipóxia (PO2 <90%) ou um ou mais distúrbios neurológicos (incluindo alterações do estado mental, obtundação e/ou convulsões). Em algumas modalidades, CRS grave inclui CRS com um grau de 3 ou superior, tal como estabelecido na Tabela 3.
[00551] Em algumas modalidades, os resultados associados a CRS grave ou CRS de grau 3 ou superior, como grau 4 ou superior, incluem um ou mais dos seguintes: febre persistente, por exemplo, febre de uma temperatura especificada, por exemplo, maior do que em ou cerca de 38 graus Celsius, por dois ou mais, por exemplo, três ou mais, por ex- emplo, quatro ou mais dias ou por pelo menos três dias consecutivos; febre maior ou cerca de 38 graus Celsius; elevação de citocinas, tal como uma modificação de vezes máxima, por exemplo, de pelo menos ou cerca de 75, em comparação com os níveis de pré-tratamento de pelo menos duas citocinas (por exemplo, pelo menos duas do grupo que consiste em interferon gama (IFNγ) , GM-CSF, IL-6, IL-10, Flt-3L, frac- talcina e IL-5 e/ou fator de necrose tumoral alfa (TNFα)), ou uma mu- dança de vezes máxima, por exemplo, de pelo menos ou cerca de 250 de pelo menos uma dessas citocinas; e/ou pelo menos um sinal clínico de toxicidade, tal como hipotensão (por exemplo, medida por pelo menos um pressor vasoativo intravenoso); hipóxia (por exemplo, níveis plasmáticos de oxigênio (PO2) inferiores a ou cerca de 90%); e/ou um ou mais distúrbios neurológicos (incluindo alterações do estado mental, obtundação e convulsões). Em algumas modalidades, CRS grave inclui
CRS que requer gerenciamento ou cuidados na unidade de terapia in- tensiva (UTI).
[00552] Em algumas modalidades, o CRS, tal como o CRS grave, abrange uma combinação de (1) febre persistente (febre de pelo menos 38 graus Celsius por pelo menos três dias) e (2) um nível sérico de CRP de pelo menos ou cerca de 20 mg/dL. Em algumas modalidades, o CRS abrange hipotensão que requer o uso de dois ou mais vasopressores ou insuficiência respiratória que requer ventilação mecânica. Em algu- mas modalidades, a dosagem de vasopressores é aumentada em uma segunda administração ou administração subsequente.
[00553] Em algumas modalidades, CRS grave ou CRS de grau 3 engloba um aumento na alanina aminotransferase, um aumento na as- partato aminotransferase, calafrios, neutropenia febril, dor de cabeça, disfunção ventricular esquerda, encefalopatia, hidrocefalia e/ou tremor.
[00554] O método de medição ou detecção dos vários resultados pode ser especificado.
[00555] Em alguns aspectos, o resultado tóxico de uma terapia, tal como uma terapia celular, é ou está associado ou é indicativo de neuro- toxicidade ou neurotoxicidade grave. Em algumas modalidades, os sintomas associados a um risco clínico de neurotoxicidade incluem con- fusão, delírio, afasia expressiva, obtundação, mioclonia, letargia, estado mental alterado, convulsões, atividade semelhante a convulsão, con- vulsões (opcionalmente conforme confirmado por eletroencefalograma [EEG]), elevado níveis de beta amiloide (Aβ), níveis elevados de gluta- mato e níveis elevados de radicais de oxigênio. Em algumas modali- dades, a neurotoxicidade é graduada com base na gravidade (por ex- emplo, usando uma escala de Grau 1 a 5 (veja, por exemplo, Guido Cavaletti & Paola Marmiroli Nature Reviews Neurology 6, 657-666 (De- cember 2010); National Cancer Institute—Common Toxicity Criteria ver- sion 4.03 (NCI-CTCAE v4.03).
[00556] Em alguns casos, os sintomas neurológicos podem ser os primeiros sintomas de sCRS. Em algumas modalidades, os sintomas neurológicos são vistos começar 5 a 7 dias após a infusão de terapia celular. Em algumas modalidades, a duração das mudanças neurológi- cas pode variar de 3 a 19 dias. Em alguns casos, a recuperação das alterações neurológicas ocorre após a resolução de outros sintomas de sCRS. Em algumas modalidades, o tempo ou o grau de resolução das alterações neurológicas não é acelerado pelo tratamento com anti-IL-6 e/ou esteróide(s).
[00557] Em algumas modalidades, considera-se que um indivíduo desenvolve "neurotoxicidade grave" em resposta ou secundária à ad- ministração de uma terapia celular ou dose de células da mesma, se, após a administração, o indivíduo exibir sintomas que limitam o autocu- idado (por exemplo, tomar banho, vestir-se e despir-se, alimentar-se, usar o banheiro, tomar medicamentos) dentre: 1) sintomas de neuropa- tia motora periférica, incluindo inflamação ou degeneração dos nervos motores periféricos; 2) sintomas de neuropatia sensorial periférica, in- cluindo inflamação ou degeneração dos nervos sensoriais periféricos, disestesia, como distorção da percepção sensorial, resultando em uma sensação anormal e desagradável, neuralgia, como sensação de dor intensa ao longo de um nervo ou grupo de nervos e/ou parestesia, como distúrbios funcionais dos neurônios sensoriais, resultando em sen- sações cutâneas anormais de formigamento, dormência, pressão, frio e calor na ausência de estímulo. Em algumas modalidades, a neurotoxi- cidade grave inclui neurotoxicidade com um grau de 3 ou maior, tal como estabelecido na Tabela 4. Em algumas modalidades, uma neuro- toxicidade grave é considerada um grau 3 prolongado se os sintomas ou neurotoxicidade de grau 3 durarem 10 dias ou mais. Tabela 4: Critérios de Classificação Exemplares para Neurotoxicidade Grau Descrição dos Sintomas 1 Sintomas leves ou assintomáticos. Assintomático ou Leve 2 Presença de sintomas que limitam as atividades instrumentais de vida diária (ADL), tal como preparar
Tabela 4: Critérios de Classificação Exemplares para Neurotoxicidade Moderado refeições, comprar mantimentos ou roupas, usar o telefone, administrar dinheiro 3 Presença de sintomas que limitam as ADLs para o autocuidado, tal como tomar banho, vestir-se e despir- Grave se, alimentar-se, usar o banheiro, tomar medicamentos 4 Sintomas que são fatais, exigindo intervenção urgente Risco de Vida 5 Morte Fatal
[00558] Em algumas modalidades, os métodos reduzem os sintomas associados a CRS ou neurotoxicidade em comparação com outros métodos. Em alguns aspectos, os métodos fornecidos reduzem os sintomas, resultados ou fatores associados à CRS, incluindo sintomas, resultados ou fatores associados a CRS grave ou CRS de grau 3 ou superior, em comparação com outros métodos. Por exemplo, os indi- víduos tratados de acordo com os presentes métodos podem não ter sintomas, resultados ou fatores de CRS detectáveis e/ou reduzidos, por exemplo, CRS grave ou CRS de grau 3 ou superior, tal como qualquer um descrito, por exemplo, estabelecido na Tabela 3. Em algumas modalidades, os indivíduos tratados de acordo com os presentes méto- dos podem ter sintomas reduzidos de neurotoxicidade, tal como fraqueza dos membros ou dormência, perda de memória, visão e/ou in- telecto, comportamentos obsessivos e/ou compulsivos incontroláveis, delírios, dor de cabeça, cognitivos e problemas comportamentais, inclu- indo perda de controle motor, deterioração cognitiva e disfunção do sistema nervoso autônomo e disfunção sexual, em comparação com in- divíduos tratados por outros métodos. Em algumas modalidades, os in- divíduos tratados de acordo com os presentes métodos podem ter sintomas reduzidos associados à neuropatia motora periférica, neuropa- tia sensorial periférica, disetesia, neuralgia ou parestesia.
[00559] Em algumas modalidades, os métodos reduzem os resulta- dos associados à neurotoxicidade, incluindo danos ao sistema nervoso e/ou cérebro, tal como a morte de neurônios. Em alguns aspectos, os métodos reduzem o nível de fatores associados à neurotoxicidade, como beta amiloide (Aβ), glutamato e radicais de oxigênio.
[00560] Em algumas modalidades, o resultado de toxicidade é uma toxicidade limitadora de dose (DLT). Em algumas modalidades, o re- sultado tóxico é a ausência de uma toxicidade limitante da dose. Em algumas modalidades, uma toxicidade limitante de dose (DLT) é definida como qualquer grau 3 ou toxicidade superior, conforme descrito ou avaliado por quaisquer diretrizes conhecidas ou publicadas para avaliar a toxicidade específica, tal como qualquer descrito acima e in- cluindo o National Cancer Institute (NCI ) Common Terminology Criteria for Adverse Events (CTCAE) versão 4.0. Em algumas modalidades, uma toxicidade limitante de dose (DLT) é definida quando qualquer um dos eventos discutidos abaixo ocorre após a administração da terapia celular (por exemplo, terapia com célula T) e/ou um inibidor de quinase, como um inibidor de BTK/ITK, por exemplo, Ibrutinib, os eventos inclu- indo a) neutropenia febril; b) Neutropenia de grau 4 com duração de cerca ou mais de cerca de 7 dias; c) trombocitopenia de grau 3 ou 4 com sangramento clinicamente significativo; e d) trombocitopenia de grau 4 com duração de mais de 24 horas.
[00561] Em algumas modalidades, as modalidades fornecidas re- sultam em uma baixa taxa ou risco de desenvolver uma toxicidade, por exemplo, CRS ou neurotoxicidade ou CRS grave ou neurotoxicidade, por exemplo, CRS de grau 3 ou superior ou neurotoxicidade, tal como observado com a administração de uma dose de células T de acordo com a terapia de combinação fornecida e/ou com os artigos de fabri- cação ou composições fornecidos. Em alguns casos, isso permite a ad- ministração da terapia celular em regime ambulatorial. Em algumas modalidades, a administração da terapia celular, por exemplo, dose de células T (por exemplo, células CAR+ T) de acordo com os métodos fornecidos e/ou com os artigos de fabricação ou composições forneci- dos, é realizada em regime ambulatorial ou não requer admissão para o indivíduo no hospital, como admissão no hospital que exige pernoite.
[00562] Em alguns aspectos, os indivíduos aos quais foram admin- istrados a terapia celular, por exemplo, dose de células T (por exemplo, células CAR+ T) de acordo com os métodos fornecidos e/ou com os ar- tigos de fabricação ou composições fornecidos, incluindo indivíduos trat- ados em um regime ambulatorial, não são administrados uma inter- venção para o tratamento de qualquer toxicidade antes ou com a ad- ministração da dose de células, a menos ou até que o indivíduo exiba um sinal ou sintoma de uma toxicidade, tal como de uma neurotoxi- cidade ou CRS.
[00563] Em algumas modalidades, se um indivíduo administrado a terapia celular, por exemplo, dose de células T (por exemplo, células CAR + T), incluindo indivíduos tratados em regime ambulatorial, exibe uma febre o indivíduo recebe ou é instruído a receber ou administrar um tratamento para reduzir a febre. Em algumas modalidades, a febre no indivíduo é caracterizada como uma temperatura corporal do indivíduo que está (ou é medida em) igual ou acima de um determinado limite de temperatura ou nível. Em alguns aspectos, a temperatura limite é aquela associada a pelo menos febre baixa, pelo menos febre moderada e/ou pelo menos febre alta. Em algumas modalidades, a temperatura limite é uma temperatura ou faixa particular. Por exemplo, a temperatura limite pode estar em ou cerca de ou pelo menos em ou cerca de 38, 39, 40, 41 ou 42 graus Celsius e/ou pode estar em uma faixa de ou cerca de 38 graus Celsius a ou cerca de 39 graus Celsius, uma faixa de ou cerca de 39 graus Celsius a ou cerca de 40 graus Celsius, uma faixa de ou cerca de 40 graus Celsius a ou cerca de 41 graus, ou uma faixa de ou cerca de 41 graus Celsius a ou cerca de 42 graus Celsius.
[00564] Em algumas modalidades, o tratamento projetado para re- duzir a febre inclui o tratamento com um antipirético. Um antipirético pode incluir qualquer agente, composição ou ingrediente que reduza a febre, tal como um de qualquer número de agentes conhecidos por ter efeitos antipiréticos, tal como NSAIDs (tal como ibuprofeno, naproxeno, cetoprofeno e nimesulida), salicilatos, como aspirina, salicilato de colina, salicilato de magnésio e salicilato de sódio, paracetamol, aceta- minofeno, Metamizol, Nabumetona, Fenoxona, antipirina, febrífugos. Em algumas modalidades, o antipirético é acetaminofeno. Em algumas modalidades, o acetaminofeno pode ser administrado em uma dose de 12,5 mg/ kg por via oral ou intravenosa a cada quatro horas. Em algu- mas modalidades, é ou compreende ibuprofeno ou aspirina.
[00565] Em algumas modalidades, se a febre for uma febre prolon- gada, o indivíduo recebe um tratamento alternativo para tratar a tox- icidade. Para indivíduos tratados em regime ambulatorial, o indivíduo é instruído a retornar ao hospital se o indivíduo tem e/ou está determinado a ter febre prolongada. Em algumas modalidades, o indivíduo tem, e/ou é determinado ou considerado ter, febre prolongada se ele ou ela exibir febre igual ou acima da temperatura limite relevante, e onde a febre ou temperatura corporal do indivíduo não é reduzida, ou não é reduzido em ou em mais do que uma quantidade especificada (por exemplo, em mais de 1 °C, e geralmente não flutua em cerca de, ou em mais de cerca de 0,5 °C, 0,4 °C, 0,3 °C, ou 0,2 °C), após um tratamento especificado, tal como um tratamento projetado para reduzir a febre, tal como o trata- mento com um antipirético, por exemplo, AINE ou salicilatos, por exem- plo, ibuprofeno, acetaminofeno ou aspirina. Por exemplo, um indivíduo é considerado como tendo febre prolongada se ele ou ela exibe ou é determinado a exibir uma febre de pelo menos 38 ou 39 graus Celsius, que não é reduzida em ou não é reduzida em mais do que ou cerca de 0,5 °C, 0,4 °C, 0,3 °C ou 0,2 °C, ou a ou cerca de 1%, 2%, 3%, 4% ou 5%, ao longo de um período de 6 horas, ao longo de um período de 8 horas, ou ao longo de um período de 12 horas, ou ao longo de um período de 24 horas, mesmo após o tratamento com o antipirético, tal como acetaminofeno. Em algumas modalidades, a dosagem do antipi- rético é uma dosagem normalmente eficaz em tal indivíduo para reduzir a febre ou febre de um tipo particular, tal como febre associada a uma infecção bacteriana ou viral, por exemplo, uma infecção localizada ou sistêmica.
[00566] Em algumas modalidades, o indivíduo tem, e/ou é determi- nado ou considerado ter, uma febre prolongada se ele ou ela exibir febre igual ou acima da temperatura limite relevante, e onde a febre ou tem- peratura corporal do indivíduo não flutua cerca de, ou mais do que cerca de 1 °C, e geralmente não flutua cerca ou mais do que cerca de 0,5 °C, 0,4 °C, 0,3 °C ou 0,2 °C. Em tal ausência de flutuação acima ou em um determinado valor geralmente é medida ao longo de um determinado período de tempo (como por um período de 24 horas, 12 horas, 8 horas, 6 horas, 3 horas ou 1 hora de tempo, que pode ser medido a partir do primeiro sinal de febre ou a primeira temperatura acima do limite in- dicado). Por exemplo, em algumas modalidades, um indivíduo é consid- erado ou está determinado a exibir febre prolongada se ele ou ela exibe uma febre de pelo menos ou cerca de ou pelo menos cerca de 38 ou 39 graus Celsius, que não flutua na temperatura por mais de ou cerca de 0,5 °C, 0,4 °C, 0,3 °C ou 0,2 °C, ao longo de um período de 6 horas, durante um período de 8 horas, ou durante um período de 12 horas, ou durante um período de 24 horas.
[00567] Em algumas modalidades, a febre é uma febre prolongada; em alguns aspectos, o indivíduo é tratado em um momento em que um indivíduo foi determinado ter uma febre prolongada, tal como dentro de uma, duas, três, quatro, cinco, seis ou menos horas de tal determinação ou da primeira de tal determinação após a terapia inicial tendo o poten- cial de induzir a toxicidade, tal como a terapia celular, tal como a dose de células T, por exemplo, células CAR+ T.
[00568] Em algumas modalidades, uma ou mais intervenções ou agentes para tratar a toxicidade, tal como terapias de direcionamento de toxicidade, são administrados em um momento em que ou imedi- atamente após o qual o indivíduo é determinado ou confirmado (tal como é primeiro determinado ou confirmado para) exibir febre prolon- gada, por exemplo, conforme medido de acordo com qualquer uma das modalidades acima mencionadas. Em algumas modalidades, uma ou mais terapias de direcionamento de toxicidade são administradas dentro de um determinado período de tempo de tal confirmação ou determi- nação, tal como dentro de 30 minutos, 1 hora, 2 horas, 3 horas, 4 horas, 6 horas ou 8 horas disso. B. Outras Toxidades
[00569] Em alguns aspectos, o resultado tóxico é ou está associado com ou indicativo de uma ou mais toxicidade não hematológica após a administração de um inibidor de quinase, tal como um inibidor de BTK/ITK, por exemplo, Ibrutinib. Exemplos de toxicidades não hemato- lógicas incluem, mas não estão limitados a, reação tumoral exacerbada, infecções, síndrome de lise tumoral, anormalidades laboratoriais cardíacas, evento(s) tromboembólico (como trombose venosa profunda e embolia pulmonar) e/ou pneumonite.
[00570] Em alguns aspectos, a toxicidade não hematológica é a rea- ção exacerbada do tumor (TFR) (às vezes também referida como pseu- doprogressão). TFR é um aumento repentino no tamanho dos locais portadores da doença, incluindo os gânglios linfáticos, baço e/ou fígado, muitas vezes acompanhado por febre baixa, sensibilidade e inchaço, erupção cutânea difusa e, em alguns casos, um aumento na contagens de linfócitos no sangue periférico. Em algumas modalidades, o TFR é classificado de acordo com os Critérios de Terminologia Comum para Eventos Adversos (Versão 3.0; US National Cancer Institute, Bethesda, MD, EUA). Em algumas modalidades, o TFR é classificado da seguinte forma: grau 1, dor leve que não interfere com a função; grau 2, dor mod- erada, dor ou analgésicos interferindo na função, mas não interferindo nas atividades de vida diária (AVD); grau 3, dor intensa, dor ou anal- gésicos interferindo na função e interferindo nas AVD; grau 4, incapaci- tante; grau 5, morte. Em algumas modalidades, um ou mais agentes podem ser administrados ao indivíduo para tratar, melhorar ou diminuir um ou mais sintomas associados com TFR, tal como corticosteroides, NSAIDs e/ou analgésico narcótico.
[00571] Em alguns aspectos, a toxicidade não hematológica é a sín- drome de lise tumoral (TLS). Em algumas modalidades, o TLS pode ser classificado de acordo com os critérios especificados pelo sistema de classificação Cairo-Bishop (Cairo e Bishop (2004) Br J Haematol, 127: 3-11). Em algumas modalidades, os indivíduos podem receber hid- ratação intravenosa para reduzir a hiperuricemia.
[00572] Em algumas modalidades, os indivíduos podem ser monito- rados quanto à toxicidade cardíaca, tal como monitorando ECGS, LVEF e monitorando os níveis de troponina-T e BNP. Em algumas modali- dades, uma toxicidade cardíaca que potencialmente pode exigir a ma- nutenção ou suspensão de um inibidor da quinase, por exemplo, Ibru- tinib, pode ocorrer se níveis elevados de troponina-T e / ou BNP com um ou mais sintomas cardíacos forem observados.
[00573] Em algumas modalidades dos métodos fornecidos, se um in- divíduo for determinado a exibir uma toxicidade não hematológica, tal como TFR ou outra toxicidade não hematológica ou um grau particular dos mesmos, a terapia cíclica com um inibidor de quinase, por exemplo, Ibrutinib, pode ser alterada. Em alguns aspectos, a terapia cíclica é al- terada se, após a administração de um inibidor de quinase, por exemplo, Ibrutinib, o indivíduo tem um grau 3 ou toxicidade não hematológica su- perior, tal como TFR grau 3 ou superior. Em algumas modalidades, a administração de um inibidor de quinase, por exemplo, Ibrutinib, é inter- rompida permanentemente ou suspensa até que os sinais ou sintomas da toxicidade sejam resolvidos, diminuídos ou reduzidos. O monito- ramento contínuo do indivíduo pode ser realizado para avaliar um ou mais sinais ou sintomas de toxicidade. Em alguns casos, se a toxicidade for resolvida ou reduzida, a administração de um inibidor da quinase, por exemplo, Ibrutinib, pode ser reiniciada na mesma dose ou regime de dosagem antes de suspender a terapia cíclica, em uma dose menor ou reduzida e/ou em um regime de dosagem envolvendo dosagem menos frequente. Em algumas modalidades, em casos de reiniciar a terapia cíclica, a dose é reduzida ou reduzida pelo menos ou pelo menos cerca de ou cerca de 10%, 15%, 20%, 25%, 30%, 40%, 50% ou 60 %. Em algumas modalidades, se a dose antes de suspender a terapia celu- lar é de 2 mg (por exemplo, dado 5/7 dias), a dose é reduzida para 1 mg (dado 5/7 dias). Em algumas modalidades, se uma toxicidade de grau 3 ocorrer novamente, mesmo após uma redução da dose, a dose pode ser ainda mais reduzida. Em algumas modalidades, se houver recorrên- cia de toxicidade de grau 4, mesmo após uma redução da dose, a tera- pia de ciclagem pode ser descontinuada permanentemente. Em alguns aspectos, se uma toxicidade hematológica for de tal gravidade que a suspensão da terapia cíclica seja por mais de 4 semanas, a terapia cíclica pode ser descontinuada permanentemente. V. ARTIGOS DE FABRICAÇÃO E KITS
[00574] Também são fornecidos artigos de fabricação contendo um inibidor de quinase, tal como um inibidor de BTK/ITK, por exemplo, Ib- rutinib, e componentes para a imunoterapia, por exemplo, anticorpo ou fragmento de ligação de antígeno do mesmo ou terapia de células T, por exemplo, células modificadas e/ou composições das mesmas. Os artigos de manufatura podem incluir um recipiente e um rótulo ou bula no recipiente ou associado a ele. Recipientes adequados incluem, por exemplo, garrafas, frascos, seringas, bolsas de solução IV, etc. Os re- cipientes podem ser formados de uma variedade de materiais, como vi- dro ou plástico. O recipiente em algumas modalidades contém uma composição que sozinha ou combinada com outra composição eficaz para tratar, prevenir e/ou diagnosticar a condição. Em algumas modali- dades, o contêiner tem uma porta de acesso estéril. Os recipientes ex- emplares incluem bolsas de solução intravenosa, frascos, incluindo aqueles com rolhas perfuráveis por uma agulha para injeção, ou gar- rafas ou frascos para agentes administrados por via oral. O rótulo ou bula pode indicar que a composição é usada para tratar uma doença ou condição.
[00575] O artigo de fabricação pode incluir (a) um primeiro recipiente com uma composição nele contida, em que a composição inclui as célu- las manipuladas usadas para a imunoterapia, por exemplo, terapia com células T; e (b) um segundo recipiente com uma composição nele con- tida, em que a composição inclui um inibidor de quinase, tal como um inibidor de BTK/ITK, por exemplo, Ibrutinib.
[00576] Em algumas modalidades, o primeiro recipiente compreende uma primeira composição e uma segunda composição, em que a primeira composição compreende uma primeira população de células manipuladas usadas para a imunoterapia, por exemplo, terapia com células T CD4+, e a segunda composição compreende uma segunda população de células modificadas, em que a segunda população pode ser modificada separadamente da primeira população, por exemplo, ter- apia com células T CD8+. Em algumas modalidades, a primeira e a se- gunda composições de células contêm uma proporção definida das células modificadas, por exemplo, células CD4+ e CD8+ (por exemplo, proporção de 1: 1 de células T CD4+: CD8+ CAR+).
[00577] O artigo de fabricação pode incluir ainda um folheto informa- tivo indicando que as composições podem ser usadas para tratar uma condição particular. Alternativamente, ou adicionalmente, o artigo de fabricação pode incluir ainda outro ou o mesmo recipiente com- preendendo um tampão farmaceuticamente aceitável. Pode ainda in- cluir outros materiais, tal como outros tampões, diluentes, filtros, agul- has e/ou seringas. VI. DEFINIÇÕES
[00578] A menos que definido de outra forma, todos os termos da técnica, notações e outros termos técnicos e científicos ou terminologia usados neste documento se destinam a ter o mesmo significado que é comumente entendido por alguém versado na técnica ao qual o objeto reivindicado se refere. Em alguns casos, os termos com significados co- mumente compreendidos são definidos neste documento para clareza e/ou para referência pronta, e a inclusão de tais definições neste docu- mento não deve necessariamente ser interpretada como representando uma diferença substancial sobre o que é geralmente entendido na téc- nica.
[00579] Como aqui usado, um "indivíduo" é um mamífero, como um ser humano ou outro animal, e normalmente é humano. Em algumas modalidades, o indivíduo, por exemplo, paciente, a quem um inibidor de quinase, tal como um inibidor de BTK/ ITK, por exemplo, Ibrutinib, célu- las modificadas ou composições são administrados, é um mamífero, tipicamente um primata, tal como um humano. Em algumas modali- dades, o primata é um macaco ou um chimpanzé. O indivíduo pode ser homem ou mulher e pode ter qualquer idade adequada, incluindo cri- anças, jovens, adolescentes, adultos e indivíduos geriátricos. Em algu- mas modalidades, o indivíduo é um mamífero não primata, como um roedor.
[00580] Como aqui usado, "tratamento" (e variações gramaticais do mesmo, como "tratar" ou "tratando") refere-se à melhoria ou redução completa ou parcial de uma doença ou condição ou distúrbio, ou um sintoma, efeito adverso ou resultado, ou fenótipo a ele associado. Os efeitos desejáveis do tratamento incluem, mas não estão limitados a, prevenção da ocorrência ou recorrência da doença, alívio dos sintomas, diminuição de quaisquer consequências patológicas diretas ou indiretas da doença, prevenção da metástase, diminuição da taxa de progressão da doença, melhoria ou paliação do estado de doença e remissão ou melhor prognóstico. Os termos não implicam na cura completa de uma doença ou na eliminação completa de qualquer sintoma ou efeito(s) em todos os sintomas ou resultados.
[00581] Como aqui usado, "atrasar o desenvolvimento de uma doença" significa adiar, impedir, diminuir, retardar, estabilizar, suprimir e/ou adiar o desenvolvimento da doença (como a malignidade das célu- las B). Esse atraso pode ser de vários períodos de tempo, dependendo da história da doença e/ou indivíduo sendo tratado. Como é evidente, um atraso suficiente ou significativo pode, com efeito, englobar a pre- venção, na medida em que o indivíduo não desenvolve a doença. Por exemplo, um linfoma de células B em estágio avançado, tal como o desenvolvimento de metástases, pode ser retardado.
[00582] "Prevenir", como aqui usado, inclui o fornecimento de pro- filaxia com relação à ocorrência ou recorrência de uma doença em um indivíduo que pode estar predisposto à doença, mas ainda não foi diag- nosticado com a doença. Em algumas modalidades, as células e com- posições fornecidas são usadas para atrasar o desenvolvimento de uma doença ou para retardar a progressão de uma doença.
[00583] Como aqui usado, “suprimir” uma função ou atividade é re- duzir a função ou atividade quando comparada às mesmas condições, exceto para uma condição ou parâmetro de interesse, ou alternati- vamente, quando comparada a outra condição. Por exemplo, as células que suprimem o crescimento do tumor reduzem a taxa de crescimento do tumor em comparação com a taxa de crescimento do tumor na ausência das células.
[00584] Uma "quantidade eficaz" de um agente, por exemplo, células manipuladas ou anti-PD-L1 ou fragmento de ligação ao antígeno, ou uma formulação farmacêutica ou composição dos mesmos, no contexto de administração, refere-se a uma quantidade eficaz, em dos- agens/quantidades e por períodos de tempo necessários, para atingir um resultado desejado, como um resultado terapêutico ou profilático.
[00585] Uma "quantidade terapeuticamente eficaz" de um agente, por exemplo, células manipuladas ou anti-PD-L1 ou fragmento de ligação ao antígeno, ou uma formulação farmacêutica ou composição dos mesmos, refere-se a uma quantidade eficaz, em dosagens e por períodos de tempo necessário, para atingir um resultado terapêutico desejado, tal como para o tratamento de uma doença, condição ou dis- túrbio e/ou efeito farmacocinético ou farmacodinâmico do tratamento. A quantidade terapeuticamente eficaz pode variar de acordo com fatores como o estado de doença, idade, sexo e peso do indivíduo e os polipep- tídeos imunomoduladores ou células manipuladas administradas. Em algumas modalidades, os métodos fornecidos envolvem a admin- istração de um inibidor de quinase, como um inibidor de BTK/ITK, por exemplo, Ibrutinib, células modificadas (por exemplo, terapia celular) ou composições em quantidades eficazes, por exemplo, quantidades tera- peuticamente eficazes.
[00586] Uma "quantidade profilaticamente eficaz" refere-se a uma quantidade eficaz, em dosagens e por períodos de tempo necessários, para atingir o resultado profilático desejado. Normalmente, mas não necessariamente, uma vez que uma dose profilática é usada em indi- víduos antes ou em um estágio inicial da doença, a quantidade pro- filaticamente eficaz será menor do que a quantidade terapeuticamente eficaz.
[00587] O termo "formulação farmacêutica" refere-se a uma preparação que está em uma forma que permite que a atividade bio- lógica de um ingrediente ativo nela contido seja eficaz, e que não con- tém componentes adicionais que são inaceitavelmente tóxicos para um indivíduo ao qual a formulação seria administrada.
[00588] Um "transportador farmaceuticamente aceitável" refere-se a um ingrediente em uma formulação farmacêutica, diferente de um ingre- diente ativo, que não é tóxico para um indivíduo. Um transportador far- maceuticamente aceitável inclui, mas não está limitado a, um tampão, excipiente, estabilizador ou conservante.
[00589] Como aqui usado, as formas singulares “um, uma, uns, umas (a)”, “um, uma, uns, umas (an)” e “o, a, os, as” incluem referentes plu- rais, a menos que o contexto indique claramente o contrário. Por exem- plo, “um” ou “uma” significa “pelo menos um” ou “um ou mais”. Entende- se que os aspectos e variações descritos neste documento incluem "consistindo" e/ou "consistindo essencialmente em" aspectos e var- iações.
[00590] Ao longo desta descrição, vários aspectos da matéria objeto reivindicados são apresentados em um formato de faixa. Deve ser en- tendido que a descrição em formato de faixa é meramente por conven- iência e brevidade e não deve ser interpretada como uma limitação in- flexível no escopo da matéria objeto reivindicada. Por conseguinte, a descrição de uma faixa deve ser considerada como tendo descrito es- pecificamente todas as subfaixas possíveis, bem como valores numéri- cos individuais dentro dessa faixa. Por exemplo, onde uma faixa de valores é fornecida, entende-se que cada valor intermediário, entre o limite superior e inferior dessa faixa e qualquer outro valor declarado ou intermediário nessa faixa declarada, está englobado dentro do objeto reivindicado. Os limites superior e inferior dessas faixas menores podem ser independentemente incluídos nas faixas menores e também são abrangidos dentro do objeto reivindicado, objeto a qualquer limite es- pecificamente excluído na faixa declarada. Quando a faixa declarada inclui um ou ambos os limites, faixas excluindo um ou ambos os limites incluídos também estão incluídas no objeto reivindicado. Isso se aplica independentemente da amplitude da faixa.
[00591] O termo “cerca de” como aqui usado refere-se à faixa de erro usual para o respectivo valor prontamente conhecido pelo especialista neste campo técnico. A referência a "cerca de" um valor ou parâmetro neste documento inclui (e descreve) modalidades que são direcionadas a esse valor ou parâmetro per se. Por exemplo, a descrição referente a "cerca de X" inclui a descrição de "X".
[00592] Como aqui usado, recitação de que nucleotídeos ou posições de aminoácidos "correspondem a" nucleotídeos ou posições de aminoácidos em uma sequência descrita, tal como estabelecido na listagem de Sequência, refere-se a nucleotídeos ou posições de ami- noácidos identificados após o alinhamento com a sequência divulgada para maximizar a identidade usando um padrão algoritmo de alin- hamento, como o algoritmo GAP. Ao alinhar as sequências, alguém ver- sado na técnica pode identificar os resíduos correspondentes, por ex- emplo, usando resíduos de aminoácidos conservados e idênticos como guias. Em geral, para identificar as posições correspondentes, as se- quências de aminoácidos são alinhadas de modo que a correspondên- cia de ordem mais alta seja obtida (veja, por exemplo : Computational Molecular Biology, Lesk, A.M., ed., Oxford University Press, New York, 1988; Biocomputing: Informatics and Genome Projects, Smith, D.W., ed., Academic Press, New York, 1993; Computer Analysis of Sequence Data, Parte I, Griffin, A.M., e Griffin, H.G., eds., Humana Press, New.Jer- sey, 1994; Sequence Analysis in Molecular Biology, von Heinje, G., Ac- ademic Press, 1987; e Sequence Analysis Primer, Gribskov, M. e Dev- ereux, J., eds., M Stockton Press, New York, 1991; Carrillo et al. (1988)
SIAM J Applied Math 48: 1073).
[00593] O termo "vetor", como aqui usado, refere-se a uma molécula de ácido nucleico capaz de propagar outro ácido nucleico ao qual está ligada. O termo inclui o vetor como uma estrutura de ácido nucleico au- torreplicante, bem como o vetor incorporado no genoma de uma célula hospedeira na qual foi introduzido. Certos vetores são capazes de di- recionar a expressão de ácidos nucleicos aos quais estão operacional- mente ligados. Esses vetores são aqui referidos como "vetores de ex- pressão". Entre os vetores estão vetores virais, como retrovirais, por ex- emplo, gamaretrovirais e vetores lentivirais.
[00594] Os termos "célula hospedeira", "linhagem celular hospedeira" e "cultura de células hospedeiras" são usados indistinta- mente e referem-se a células nas quais o ácido nucleico exógeno foi introduzido, incluindo a progênie de tais células. As células hospedeiras incluem "transformantes" e "células transformadas", que incluem a célula transformada primária e a progênie derivada dela, independente- mente do número de passagens. A progênie pode não ser completa- mente idêntica em conteúdo de ácido nucleico a uma célula-mãe, mas pode conter mutações. A progênie mutante que tem a mesma função ou atividade biológica como rastreada ou selecionada na célula original- mente transformada está incluída aqui.
[00595] Como aqui usado, uma afirmação de que uma célula ou pop- ulação de células é "positiva" para um marcador específico refere-se à presença detectável em ou na célula de um marcador específico, nor- malmente um marcador de superfície. Quando se refere a um marcador de superfície, o termo se refere à presença de expressão de superfície detectada por citometria de fluxo, por exemplo, por manchamento com um anticorpo que se liga especificamente ao marcador e detecção do referido anticorpo, em que o manchamento é detectável por citometria de fluxo em um nível substancialmente acima do manchamento detect- ado realizando o mesmo procedimento com um controle compatível com isotipo sob outras condições idênticas e/ou em um nível substancial- mente semelhante ao da célula conhecida como positiva para o marca- dor e/ou em um nível substancialmente mais alto do que para uma célula conhecida por ser negativa para o marcador.
[00596] Como aqui usado, uma afirmação de que uma célula ou pop- ulação de células é "negativa" para um marcador particular refere-se à ausência de presença detectável substancial em ou na célula de um marcador particular, tipicamente um marcador de superfície. Quando se refere a um marcador de superfície, o termo se refere à ausência de expressão de superfície detectada por citometria de fluxo, por exemplo, por manchamento com um anticorpo que se liga especificamente ao marcador e detecção do referido anticorpo, em que o manchamento não é detectada por citometria de fluxo em um nível substancialmente acima do manchamento detectado realizando o mesmo procedimento com um controle compatível com isotipo sob condições idênticas de outra forma e/ou em um nível substancialmente inferior ao da célula conhecida como positiva para o marcador e/ou em um nível substancialmente sem- elhante ao de uma célula conhecida por ser negativa para o marcador.
[00597] Como aqui usado, "Porcentagem (%) de identidade de se- quência de aminoácidos" e "porcentagem de identidade" quando usa- das em relação a uma sequência de aminoácidos (sequência de polipeptídeo de referência) é definida como a porcentagem de resíduos de aminoácidos em uma sequência candidata (por exemplo, o anticorpo em questão ou fragmento) que são idênticos aos resíduos de aminoáci- dos na sequência polipeptídica de referência, após alinhar as sequên- cias e introduzir lacunas, se necessário, para atingir a porcentagem máxima de identidade de sequência, e não considerando quaisquer sub-
stituições conservativas como parte da identidade de sequência. O alin- hamento para fins de determinação da identidade percentual da sequên- cia de aminoácidos pode ser alcançado de várias maneiras que estão dentro da habilidade na técnica, por exemplo, usando software de com- putador disponível publicamente, como software BLAST, BLAST-2, ALIGN ou Megalign (DNASTAR). Os versados na técnica podem deter- minar os parâmetros apropriados para o alinhamento de sequências, incluindo quaisquer algoritmos necessários para atingir o alinhamento máximo ao longo de todo o comprimento das sequências sendo com- paradas.
[00598] Uma substituição de aminoácido pode incluir a substituição de um aminoácido em um polipeptídeo por outro aminoácido. A substi- tuição pode ser uma substituição conservativa de aminoácido ou uma substituição não conservativa de aminoácido. As substituições de ami- noácidos podem ser introduzidas em uma molécula de ligação, por ex- emplo, anticorpo, de interesse e os produtos selecionados para uma ati- vidade desejada, por exemplo, ligação de antígeno retida/melhorada, imunogenicidade diminuída ou ADCC ou CDC melhorado.
[00599] Os aminoácidos geralmente podem ser agrupados de acordo com as seguintes propriedades comuns da cadeia lateral: (1) hidrofóbico: Norleucina, Met, Ala, Val, Leu, Ile; (2) hidrofílico neutro: Cys, Ser, Thr, Asn, Gln; (3) ácido: Asp, Glu; (4) básico: His, Lys, Arg; (5) resíduos que influenciam a orientação da cadeia : Gly, Pro; (6) aromático: Trp, Tyr, Phe.
[00600] Em algumas modalidades, as substituições conservativas podem envolver a troca de um membro de uma dessas classes por outro membro da mesma classe. Em algumas modalidades, as substituições não conservativas de aminoácidos podem envolver a troca de um mem- bro de uma dessas classes por outra classe.
[00601] Como aqui usado, uma composição refere-se a qualquer mistura de dois ou mais produtos, substâncias ou um inibidor de quinase, como um inibidor de BTK/ITK, por exemplo, Ibrutinib, incluindo células. Pode ser uma solução, uma suspensão, líquido, pó, uma pasta, aquosa, não aquosa ou qualquer combinação dos mesmos.
[00602] Como aqui usado, um "indivíduo" é um mamífero, como um ser humano ou outro animal, e normalmente é humano. VII. MODALIDADES EXEMPLARES
[00603] Entre as modallidades fornecidas estão:
1. Um método de tratamento, o método compreendendo: (1) administrar a um indivíduo tendo um câncer, uma quantidade eficaz de um inibidor de quinase que é ou compreende a estrutura , ou um sal farmaceuticamente aceitável do mesmo; e (2) administrar uma terapia de célula T autóloga ao indivíduo, a referida terapia de célula T que compreende uma dose de células T geneticamente modificadas expressando um receptor de antígeno qui- mérico (CAR) que especificamente se liga a um CD19, em que, antes de administrar a terapia de célula T, uma amostra biológica foi obtida do indivíduo e processada, o processamento compreendendo genetica- mente modificar células T da amostra, opcionalmente introduzindo uma molécula de ácido nucleico codificando o CAR nas referidas células T, em que a administração do inibidor de quinase é iniciada em pelo menos ou cerca de 3 dias antes de obter a amostra e é realizada em um regime de dosagem compreendendo administrações repetidas do inibidor de quinase em um intervalo de dosagem, durante um período de tempo que se estende pelo menos para incluir a administração em ou após o dia no qual a amostra é obtida do indivíduo.
2. Um método de tratamento, o método compreendendo: (1) administrar a um indivíduo tendo um câncer, uma quantidade eficaz de um inibidor de quinase que é ou compreende a estrutura , ou um sal farmaceuticamente aceitável do mesmo; (2) obter do indivíduo uma amostra biológica e proces- sar células T da referida amostra, desse modo gerando uma composi- ção compreendendo células T geneticamente modificadas que expres- sam um receptor de antígeno quimérico (CAR) que especificamente se liga a um CD19; e (3) administrar ao indivíduo uma terapia de célula T au- tóloga que compreende uma dose das células T geneticamente modifi- cadas, em que a administração do inibidor de quinase é reali- zada em um regime de dosagem que é iniciado em pelo menos ou cerca de 3 dias antes de obter a amostra e que compreende administrações repetidas do inibidor, em um intervalo de dosagem, durante um período de tempo e se estende pelo menos para incluir a administração do com- posto em ou após o dia no qual a amostra é obtida do indivíduo.
3. Um método de tratamento, o método compreendendo administrar a um indivíduo tendo um câncer, uma quantidade eficaz de um inibidor de quinase que possui a estrutura
, ou um sal farmaceuticamente aceitável do mesmo, em que o indivíduo é um candidato para tratamento ou deve ser tratado com uma terapia de célula T autóloga, a referida terapia de célula T que compreende uma dose de células T geneticamente modifi- cadas expressando um receptor de antígeno quimérico (CAR) que es- pecificamente se liga a um CD19, em que: antes de administrar a terapia de célula T uma amostra biológica foi obtida do indivíduo e processada, o processamento com- preendendo geneticamente modificar células T da amostra, opcional- mente introduzindo uma molécula de ácido nucleico codificando o CAR nas referidas células T; e a administração do inibidor de quinase é iniciada em pelo menos ou cerca de 3 dias antes de obter a amostra e é realizada em um regime de dosagem compreendendo administrações repetidas do inibidor em um intervalo de dosagem durante um período de tempo que se estende pelo menos para incluir a administração em ou após o dia no qual a amostra do indivíduo.
4. O método de modalidade 3, também compreendendo administrar ao indivíduo a terapia de célula T.
5. O método de qualquer uma das modalidades 1, 2 e mo- dalidade 4, em que, subsequente ao início da administração do inibidor de quinase e antes da administração da terapia de célula T, o indivíduo foi precondicionado com uma terapia de linfodepleção.
6. O método de qualquer uma das modalidades 1, 2 e mo- dalidade 4, também compreendendo, subsequente ao início da adminis- tração do inibidor de quinase e antes da administração da terapia de célula T, administrar uma terapia de linfodepleção ao indivíduo.
7. O método de modalidade 5 ou modalidade 6, em que a administração do inibidor de quinase é descontinuada ou interrompida durante a terapia de linfodepleção.
8. O método de qualquer uma das modalidades 5 a 7, em que o regime de dosagem compreende a administração do inibidor de quinase durante um período de tempo que se estende pelo menos para incluir administração até o início da terapia de linfodepleção.
9. O método de qualquer uma das modalidades 5 a 7, em que o regime de dosagem compreende a administração do inibidor de quinase durante um período de tempo que inclui a administração até o início da terapia de linfodepleção, seguida por descontinuação ou in- terrompimento da administração do inibidor de quinase durante a tera- pia de linfodepleção e em seguida nova administração do inibidor de quinase durante um período que se estende durante pelo menos 15 dias após início de administração da terapia de célula T.
10. Um método de tratamento, o método compreendendo: (1) administrar a um indivíduo tendo um câncer, uma quantidade eficaz de um inibidor de quinase que possui a estrutura , ou um sal farmaceuticamente aceitável do mesmo; (2) administrar uma terapia de linfodepleção ao indiví- duo; e (3) administrar uma terapia de célula T autóloga ao in- divíduo, a referida terapia de célula T que compreende uma dose de células T geneticamente modificadas expressando um receptor de antí- geno quimérico (CAR) que especificamente se liga a um CD19, em que, antes de administrar a terapia de célula T compreendendo amostra bio- lógica obtida do indivíduo e processada, o processamento compreende geneticamente modificar células T da amostra, opcionalmente introdu- zindo uma molécula de ácido nucleico codificando o CAR nas referidas células T, em que a administração do inibidor de quinase é inici- ada em pelo menos ou cerca de 3 dias antes da obtenção da amostra e é realizada em um regime de dosagem compreendendo administração repetida do inibidor de quinase em um intervalo de dosagem durante um período de tempo que inclui a administração até o início da terapia de linfodepleção, seguida por descontinuação ou interrompimento da ad- ministração do inibidor de quinase durante a terapia de linfodepleção, e em seguida nova administração do inibidor de quinase durante um pe- ríodo que se estende durante pelo menos 15 dias após início de admi- nistração da terapia de célula T.
11. O método de modalidade 10, em que o método também compreende obter do indivíduo a amostra biológica e processar células T da referida amostra, desse modo gerando uma composição compre- endendo as células T geneticamente modificadas que expressam o re- ceptor de antígeno quimérico (CAR) que especificamente se liga a um CD19
12. O método de qualquer uma das modalidades 1 a 11, em que a administração do inibidor de quinase é iniciada em pelo menos ou cerca de 4 dias, pelo menos em ou cerca de 5 dias, pelo menos em ou cerca de 6 dias, pelo menos em ou cerca de 7 dias, pelo menos em ou cerca de 14 dias ou mais antes da obtenção da amostra do indivíduo.
13. O método de qualquer uma das modalidades 1 a 12, em que a administração do inibidor de quinase é iniciada pelo menos ou em ou cerca de 5 dias a 7 dias antes da obtenção da amostra do indiví- duo.
14. O método de qualquer uma das modalidades 5 a 13, em que administração da terapia de linfodepleção é concluída dentro de 7 dias antes do início da administração da terapia de célula T.
15. O método de qualquer uma das modalidades 5 a 14, em que administração da terapia de linfodepeção é concluída 2 a 7 dias antes do início da administração da terapia de célula T.
16. O método de qualquer uma das modalidades 9 a 15, em que a nova administração é durante um período que se estende durante 15 dias a 29 dias após início de administração da terapia de célula T.
17. O método de qualquer uma das modalidades 9 a 16, em que a nova administração do inibidor de quinase é durante um período que se estende a, ou cerca de, ou mais que três meses após início de administração da terapia de célula T.
18. O método de qualquer uma das modalidades 1 a 17, em que a administração do inibidor de quinase é realizada uma vez por dia em cada dia que ela é administrada durante o regime de dosagem.
19. O método de qualquer uma das modalidades 1 a 18, em que a quantidade eficaz é composta de, ou de cerca de 140 mg a cerca de 840 mg ou 140 mg a cerca de 560 mg por cada dia que o inibidor de quinase é administrado.
20. Um método de tratamento, o método compreendendo: (1) administrar a um indivíduo portador de um câncer um inibidor de quinase, em que o inibidor de quinase é ou compreende a estrutura , ou é um sal farmaceuticamente aceitável do mesmo; e
(2) administrar uma terapia de célula T autóloga ao in- divíduo, a referida terapia de célula T que compreende uma dose de células T geneticamente modificadas expressando um receptor de antí- geno quimérico (CAR) que especificamente se liga a um CD19, em que, antes de administrar a terapia de célula T uma amostra biológica foi ob- tida do indivíduo e processada, o processamento compreendendo ge- neticamente modificar células T da amostra, opcionalmente introdu- zindo uma molécula de ácido nucleico codificando o CAR nas referidas células T, em que a administração do inibidor de quinase é inici- ada pelo menos a ou cerca de 5 a 7 dias antes de obter a amostra e é realizada em um regime de dosagem compreendendo repetir a adminis- tração do inibidor de quinase em um intervalo de dosagem durante um período de tempo que se estende pelo menos para incluir a administra- ção em ou após o dia no qual a amostra é obtida do indivíduo e nova administração que se estender por, ou por cerca de, ou por mais que três meses após início de administração da terapia de célula T, em que o inibidor de quinase é administrado em uma quantidade de ou de cerca de 140 mg a cerca de 560 mg uma vez por dia cada dia em que ele é administrada durante o regime de dosagem.
21. O método de modalidade 20, em que, subsequente ao início da administração do inibidor de quinase e antes da administração da terapia de célula T, o indivíduo foi precondicionado com uma terapia de linfodepleção.
22. O método de modalidade 20, também compreendendo, subsequente à administração do inibidor de quinase e antes da admi- nistração da terapia de célula T, administrar uma terapia de linfodeple- ção ao indivíduo.
23. O método de qualquer uma das modalidades 20 a 22, em que a administração da terapia de linfodepleção é concluída dentro de 7 dias antes do início da administração da terapia de célula T.
24. O método de qualquer uma das modalidades 20 a 23, em que a administração da terapia de linfodepeção é concluída 2 a 7 dias antes do início da administração da terapia de célula T.
25. O método de qualquer uma das modalidades 22 a 24, em que o regime de dosagem compreende descontinuar ou interromper a administração do inibidor de quinase durante a terapia de linfodeple- ção.
26. Um método de tratamento, o método compreendendo: (1) administrar a um indivíduo portador de um câncer um inibidor de quinase, em que o inibidor de quinase tem a estrutura , ou é um sal farmaceuticamente aceitável do mesmo; e (2) administrar uma terapia de linfodepleção ao indiví- duo; e (3) administrar uma terapia de célula T autóloga ao in- divíduo dentro de 2 a 7 dias após conclusão da terapia de linfodepleção, a referida terapia de célula T que compreende uma dose de células T geneticamente modificadas expressando um receptor de antígeno qui- mérico (CAR) que especificamente se liga a um CD19, em que, antes de administrar a terapia de célula T uma amostra biológica foi obtida do indivíduo e processada, o processamento compreendendo genetica- mente modificar células T da amostra, opcionalmente introduzindo uma molécula de ácido nucleico codificando o CAR nas referidas células T, em que a administração do inibidor de quinase é inici- ada em pelo menos ou cerca de 5 a 7 dias antes de obter a amostra e é realizada em um regime de dosagem compreendendo repetir a admi- nistração do inibidor de quinase em um intervalo de dosagem que inclui a administração até o início da terapia de linfodepleção, seguida por descontinuação ou interrompimento da administração do inibidor de qui- nase durante a terapia de linfodepleção, e em seguida nova administra- ção durante um período que se estende durante 3 meses ou mais após início de administração da terapia de célula T, em que o inibidor de qui- nase é administrado em uma quantidade de ou de cerca de 140 mg a cerca de 560 mg uma vez por dia cada dia em que é administrada du- rante o regime de dosagem.
27. O método de qualquer uma das modalidades 20 a 26, em que o método também compreende obter do indivíduo a amostra biológica e processar células T da referida amostra, desse modo ge- rando uma composição compreendendo as células T geneticamente modificadas que expressam o receptor de antígeno quimérico (CAR) que especificamente se liga a um CD19
28. O método de qualquer uma das modalidades 1 a 27, em que a administração do inibidor de quinase por dia que é administrada é de ou de cerca de 280 mg a 560 mg.
29. O método de qualquer uma das modalidades 1 a 28, em que administração do inibidor de quinase é iniciada em pelo menos ou cerca de 7 dias antes da obtenção da amostra do indivíduo.
30. O método de qualquer uma das modalidades 1 a 29, em que: a administração do inibidor de quinase é iniciada em, ou em cerca de 30 a 40 dias antes do início da administração da terapia de célula T; a amostra é obtida do indivíduo em, ou em cerca de 23 dias a 38 dias antes do início da administração da terapia de célula T; e/ou a terapia de linfodepleção é concluída 5 a 7 dias antes de iniciar a administração da terapia de célula T.
31. O método de qualquer uma das modalidades 1 a 30, em que: a administração do inibidor de quinase é iniciada 35 dias ou cerca de 35 dias antes do início da administração da terapia de célula T; a amostra é obtida do indivíduo em, ou em cerca de 28 dias a 32 dias antes do início da administração da terapia de célula T; e/ou a terapia de linfodepleção é concluída 5 a 7 dias antes de iniciar a administração da terapia de célula T.
32. O método de qualquer uma das modalidades 5-31, em que a terapia de linfodepleção compreende a administração de fludara- bina e/ou ciclofosfamida.
33. O método de qualquer uma das modalidades 5 a 32, em que a terapia de linfodepleção compreende a administração de ciclofosfamida a cerca de 200 a 400 mg/m2, opcionalmente a, ou cerca de 300 mg/m2, inclusive, e/ou fludarabina a cerca de 20 a 40 mg/m 2, opcionalmente 30 mg/m2, diariamente durante 2 a 4 dias, opcionalmente durante 3 dias, ou em que a terapia de linfodepleção compreende a ad- ministração de ciclofosfamida a cerca de 500 mg/m2.
34. Método de qualquer uma das modalidades 5 a 33, em que: a terapia de linfodepleção compreende a administração de ciclofosfa- mida em ou cerca de 300 mg/m2 e fludarabina a cerca de 30 mg/m2 diariamente durante 3 dias; e/ou a terapia de linfodepleção compreende a administração de ciclofosfamida em ou cerca de 500 mg/m2 e fludarabina a cerca de 30 mg/m2diariamente durante 3 dias.
35. O método de qualquer uma das modalidades 1 a 34, em que a administração do inibidor de quinase por dia em que é adminis- trada é de uma quantidade de, ou de cerca de 140 mg.
36. O método de qualquer uma das modalidades 1 a 34, em que a administração do inibidor de quinase por dia em que é adminis- trada é de uma quantidade de, ou de cerca de 280 mg.
37. O método de qualquer uma das modalidades 1 a 34, em que a administração do inibidor de quinase por dia em que é adminis- trada é de uma quantidade de, ou de cerca de 420 mg.
38. O método de qualquer uma das modalidades 1 a 34, em que a administração do inibidor de quinase por dia em que é adminis- trada é de uma quantidade de, ou de cerca de 560 mg.
39. O método de qualquer uma das modalidades 9 a 38, em que o período se estende durante, ou durante cerca de, ou mais que quatro meses após o início da administração da terapia de célula T ou de, ou de cerca de, ou mais que cinco meses após o início da adminis- tração da terapia de célula T.
40. O método de qualquer uma das modalidades 9 a 39, em que a nova administração é durante um período que se estende a, ou a cerca de, ou a mais que seis meses.
41. O método de qualquer uma das modalidades 9 a 40, em que: a nova administração do inibidor de quinase é interrom- pida no término do período se, no término do período, o indivíduo exibir uma completa resposta (CR) após o tratamento; ou a nova administração do inibidor de quinase é interrom- pida no término do período se, no término do período, o câncer tiver progredido ou recidivado após a remissão após o tratamento.
42. O método de qualquer uma das modalidades 9 a 41, em que o período se estende durante ou a partir detrês meses a, ou de seis meses.
43. O método de qualquer uma das modalidades 9 a 42, em que o período se estende durante ou a partir detrês meses após início de administração da terapia de célula T.
44. O método de qualquer uma das modalidades 9 a 42, em que o período se estende durante ou a partir de3 meses após início de administração da terapia de célula T se o indivíduo tiver obtido uma completa resposta (CR) em, antes de, ouem cerca de 3 meses, após o tratamento, ou o câncer tiver progredido ou tiver recidivado após a re- missão após o tratamento.
45. O método de modalidade 44, em que o período se es- tende durante ou a partir de 3 meses após início de administração da terapia de célula T se o indivíduo tiver obtido em 3 meses uma completa resposta (CR).
46. O método de qualquer uma das modalidades 9 a 42, em que o período se estende durante ou a partir deseis meses após início de administração da terapia de célula T.
47. O método de qualquer uma das modalidades 9 a 42, em que o período se estende durante ou a partir de6 meses após início de administração da terapia de célula T se o indivíduo tiver obtido em, antes de, ou em cerca de 6 meses, uma resposta completa (CR) após o trata- mento, ou o câncer tiver progredido ou recidivado após a remissão após o tratamento.
48. O método de modalidade 47, em que o período se es- tende durante ou a partir de6 meses após início de administração da terapia de célula T se o indivíduo tiver obtido em 6 meses uma resposta completa (CR).
49. O método de qualquer uma das modalidades 9 a 48, em que a nova administração é continuada durante o período mesmo se o indivíduo tiver obtido uma resposta completa (CR) em um ponto do tempo antes do término do período.
50. O método de qualquer uma das modalidades 9 a 49, em que o indivíduo obtém uma resposta completa (CR) em um tempo du- rante o período e antes do término do período.
51. O método de qualquer uma das modalidades 9 a 40, 42, 43, 44, 46 e 47, também compreendendo continuar a nova administra- ção após o término do período, se, no término do período, o indivíduo exibir uma resposta parcial (PR) ou doença estável (SD).
52. O método de qualquer uma das modalidades 9 a 40, 42, 43, 44, 46, 47 e 51, em que a nova administração é continuada durante mais de seis meses se em, ou em cerca de seis meses, o indivíduo exibir uma resposta parcial (PR) ou doença estável (SD) após o trata- mento.
53. O método de modalidade 51 ou modalidade 52, em que a nova administração é continuada até o indivíduo obter uma resposta completa (CR) após o tratamento, ou até o câncer ter progredido ou re- cidivado após a remissão após o tratamento.
54. O método de qualquer uma das modalidades 1 a 53, em que o inibidor de quinase inibe a tirosina quinase de Bruton (BTK) e/ou inibe a quinase de célula T induzível por IL2 (ITK).
55. O método de qualquer uma das modalidades 1 a 54, em que o inibidor de quinase inibe ITK e o inibidor inibe ITK ou inibe ITK com uma concentração inibitória metade da máxima (IC50) menor que ou menor que cerca de 1000 nM, 900 nM, 800 nM, 600 nM, 500 nM, 400 nM, 300 nM, 200 nM, 100 nM ou menos.
56. O método de qualquer uma das modalidades 1 a 55, em que ao indivíduo foi anteriormente administrado o inibidor de quinase antes da administração do inibidor de quinase mencionado em (1).
57. O método de qualquer uma das modalidades 1 a 55, em que ao indivíduo foi anteriormente administrado o inibidor de quinase antes da administração do inibidor de quinase mencionado em (1).
58. O método de qualquer uma das modalidades 1 a 57, em que: (i) o indivíduo e/ou o câncer (a) é resistente à inibição de tirosina quinase de Bruton (BTK) e/ou (b) compreende uma popula- ção de células que são resistentes à inibição pelo inibidor de quinase, opcionalmente em que a população de células é ou compreende uma população de células B e/ou não compreende células T; (ii) o indivíduo e/ou o câncer compreende uma mutação em um ácido nucleico codificando uma BTK, opcionalmente em que a mutação é capaz de reduzir ou prevenir a inibição da BTK pelo inibidor de quinase, opcionalmente em que a mutação é C481S; (iii) o indivíduo e/ou o câncer compreende uma mutação em um ácido nucleico codificando fosfolipase C gama 2 (PLCgama2), opcionalmente em que a mutação resulta em atividade de sinalização constitutiva, opcionalmente em que a mutação é R665W ou L845F; (iv) no momento do início da administração do inibidor de quinase mencionado em (1), e opcionalmente no momento do início da administração da terapia de célula T, o indivíduo recidivou após re- missão após um tratamento anterior com, ou foi considerado refratário a um tratamento anterior com, o inibidor de quinase e/ou com uma ter- apia inibidora de BTK; (v) no momento do início da administração do inibidor de quinase mencionado em (1), e opcionalmente no momento do início da terapia de célula T, o indivíduo progrediu após um tratamento anterior com o inibidor e/ou com uma terapia inibidora de BTK, opcionalmente em que o indivíduo exibiu doença progressiva como a melhor resposta ao tratamento anterior ou progressão após resposta anterior ao trata- mento anterior; e/ou (vi) no momento do início da administração do inibidor de quinase mencionado em (1), e opcionalmente no momento do início da terapia de célula T, o indivíduo exibiu uma resposta menor que uma re- sposta completa (CR) após um tratamento anterior durante pelo menos 6 meses com o inibidor e/ou com uma terapia inibidora de BTK.
59. Método de qualquer uma das modalidades 1 a 58, em que o câncer é uma malignidade de célula B.
60. O método de modalidade 59, em que a malignidade de célula B é um linfoma.
61. O método de modalidade 60, em que o linfoma é um linfoma não Hodgkin (NHL).
62. O método de modalidade 61, em que o NHL compre- ende NHL agressivo, linfoma de célula B grande difuso (DLBCL), DLBCL-NOS, indolente opcionalmente transformado; DLBCL-NOS po- sitivo para EBV; Linfoma de célulab grande rica em histiócito/célula T; linfoma de célula B grande mediastinal primária (PMBCL); linfoma foli- cular (FL), opcionalmentte, linfoma folicular Grau 3B (FL3B); e/ou lin- foma de célula B de grau elevado com MYC e BCL2 e/ou rearranjos BCL6 com histologia DLBCL (hit duplo/triplo).
63. Método de qualquer uma das modalidades 1 a 62, em que o indivíduo é ou foi identificado como tendo um status de desempe- nho do Eastern Cooperative Oncology Group (ECOG) menor do que ou igual a 1.
64. O método de qualquer uma das modalidades 1 a 63, em que o inibidor de quinase é administrado oralmente.
65. O método de qualquer uma das modalidades 1 a 64, em que o CD19 é um CD19 humano.
66. O método de qualquer uma das modalidades 1 a 65, em que o receptor de antígeno quimérico (CAR) compreende um domínio de reconhecimento de antígeno extracelular que especificamente se liga a CD19 e um domínio de sinalização intracelular compreendendo um
ITAM.
67. O método de modalidade 66, em que o domínio de si- nalização intracelular compreende um domínio de sinalização de uma cadeia CD3-zeta (CD3ζ), opcionalmente uma cadeia CD3-zeta humana.
68. O método de modalidade 66 ou modalidade 67, em que o receptor de antígeno quimérico (CAR) também compreende uma re- gião de sinalização coestimulatória.
69. O método de modalidade 68, em que a região de sinali- zação coestimulatória compreende um domínio de sinalização de CD28 ou 4-1BB, opcionalmente CD28 humano ou 4-1BB humano.
70. O método de modalidade 68 ou modalidade 69, em que o domínio coestimulatório é ou compreende um domínio de sinalização de 4-1BB humano.
71. O método de qualquer uma das modalidades 1 a 70, em que: o CAR compreende um scFv específico para o CD19; um domínio de transmembrana; um domínio de sinalização citoplásmico derivado de uma molécula coestimulatória, que opcionalmente é ou compreende um 4-1BB, opcionalmente 4-1BB humano; e um domínio de sinalização citoplásmico derivado de uma molécula contendo ITAM de sinalização primária, que opcionalmente é ou compreende um domí- nio de sinalização CD3zeta, opcionalmente um domínio de sinalização CD3zeta humano; e opcionalmente em que o CAR também compreende um espaçador entre o domínio de transmembrana e o scFv; o CAR compreende, em ordem, um scFv específico para o CD19; um domínio de transmembrana; um domínio de sinaliza- ção citoplásmico derivado de uma molécula coestimulatória, que op- cionalmente é ou compreende um domínio de sinalização 4-1BB, op- cionalmente um domínio de sinalização 4-1BB humano; e um domínio de sinalização citoplásmico derivado de uma molécula contendo ITAM de sinalização primária, que opcionalmente é um domínio de sinalização CD3zeta, opcionalmentedomínio de sinalização CD3zeta humano; ou o CAR compreende, em ordem, um scFv específico para o CD19; um espaçador; um domínio de transmembrana, um domí- nio de sinalização citoplásmico derivado de uma molécula coestimulató- ria, que opcionalmente é um domínio de sinalização 4-1BB, e um domí- nio de sinalização citoplásmico derivado de uma molécula contendo ITAM de sinalização primária, que opcionalmente é ou compreende um dominio de sinalização CD3zeta.
72. O método de modalidade 71, em que o CAR compreende um espaçador e o espaçador é um espaçador de polipeptídeo que (a) compreende ou consiste em toda ou uma parte de uma articulação de imunoglobulina ou uma versão modi- ficada da mesma ou compreende cerca de 15 aminoácidos ou menos, e não compreende uma região extracelular CD28 ou uma região ex- tracelular CD8, (b) compreende ou consiste em toda ou uma parte de uma articulação de imunoglobulina, opcionalmente uma articulação IgG4, ou uma versão modificada da mesma e/ou compreende cerca de 15 aminoácidos ou menos, e não compreende uma região extracelular CD28 ou uma região extracelular CD8, ou (c) é de, ou cerca de 12 ami- noácidos de comprimento e/ou compreende ou consiste em toda ou uma parte de uma articulação de imunoglobulina, opcionalmente uma IgG4, ou uma versão modificada da mesma; ou (d) tem ou consiste na sequência de SEQ ID NO: 1, uma sequência codificada por SEQ ID NO: 2, SEQ ID NO: 30, SEQ ID NO: 31, SEQ ID NO: 32, SEQ ID NO: 33, SEQ ID NO: 34, ou uma variante de qualquer das anteriores tendo pelo menos 85%, 86%, 87%, 88%, 89%, 90%, 91%, 92%, 93%, 94%, 95%, 96%, 97%, 98%, 99% ou mais identidade de sequência com as mes- mas, ou (e) compreende ou consiste na fórmula X1PPX2P (SEQ ID
NO:58), onde X1 é glicina, cisteína ou arginina e X2 é cisteína ou tre- onina; e/ou o domínio coestimulatório compreende SEQ ID NO: 12 ou uma variante da mesma tendo pelo menos 85%, 86%, 87%, 88%, 89%, 90%, 91%, 92%, 93%, 94%, 95%, 96%, 97%, 98%, 99% ou mais identidade de sequência da mesma; e/ou o domínio de sinalização primária compreende SEQ ID NO: 13 ou 14 ou 15 tendo pelo menos 85%, 86%, 87%, 88%, 89%, 90%, 91%, 92%, 93%, 94%, 95%, 96%, 97%, 98%, 99% ou mais identidade de sequência da mesma; e/ou o scFv compreende uma sequência de CDRL1 de RAS- QDISKYLN (SEQ ID NO: 35), uma sequência de CDRL2 de SRLHSGV (SEQ ID NO: 36), e/ou uma sequência de CDRL3 de GNTLPYTFG (SEQ ID NO: 37) e/ou uma sequência de CDRH1 de DYGVS (SEQ ID NO: 38), uma sequência de CDRH2 de VIWGSETTYYNSALKS (SEQ ID NO: 39), e/ou uma sequência de CDRH3 de YAMDYWG (SEQ ID NO: 40) ou em que o scFv compreende uma região de cadeia pesada variável de FMC63 e uma região de cadeia leve variável de FMC63 e/ou uma sequência de CDRL1 de FMC63, uma sequência de CDRL2 de FMC63, uma sequência de CDRL3 de FMC63, uma sequência de CDRH1 de FMC63, uma sequência de CDRH2 de FMC63, e uma se- quência de CDRH3 de FMC63 ou se liga ao mesmo epítopo que, ou compete para ligação com, qualquer dos anteriores, e opcionalmente em que o scFv compreende, em ordem, uma VH, um ligante, opcional- mente compreendendo SEQ ID NO: 41, e uma VL, e/ou o scFv compre- ende um ligante flexível e/ou compreende a sequência de aminoácido mencionada como SEQ ID NO: 42.
73. O método de qualquer uma das modalidades 1 a 72, em que a dose de células T geneticamente modificadas é composta de, ou de cerca de 1 x 105 a 5 x 108 células T expressando CAR totais, 1 x 106 a 2,5 x 108 células T expressando CAR totais, 5 x 106 a 1 x 108 células T expressando CAR totais, 1 x 107 a 2,5 x 108 células T expressando CAR totais, 5 x 107 a 1 x 108 células T expressando CAR totais, cada inclusive.
74. O método de qualquer uma das modalidades 1 a 73, em que a dose de células T geneticamente modificadas compreende pelo menos ou pelo menos cerca de 1 x 105 células expressando CAR, pelo menos ou pelo menos cerca de 2,5 x 105 células expressando CAR, pelo menos ou pelo menos cerca de 5 x 105 células expressando CAR, pelo menos ou pelo menos cerca de 1 x 106 células expressando CAR, pelo menos ou pelo menos cerca de 2,5 x 106 células expressando CAR, pelo menos ou pelo menos cerca de 5 x 106 células expressando CAR, pelo menos ou pelo menos cerca de 1 x 107 células expressando CAR, pelo menos ou pelo menos cerca de 2,5 x 107 células expressando CAR, pelo menos ou pelo menos cerca de 5 x 107 células expressando CAR, pelo menos ou pelo menos cerca de 1 x 108 células expressando CAR, pelo menos ou pelo menos cerca de 2,5 x 108 células expressando CAR, ou pelo menos ou pelo menos cerca de 5 x 108 células expressando CAR.
75. O método de qualquer uma das modalidades 1 a 74, em que a dose de células T geneticamente modificadas é composta de, ou de cerca de 5 x 107 células T expressando CAR totais.
76. O método de qualquer uma das modalidades 1 a 75, em que a dose de células T geneticamente modificadas é composta de, ou de cerca de 1 x 108 células expressando CAR.
77. O método de qualquer uma das modalidades 1 a 76, em que a dose de células T geneticamente modificadas compreende célu- las T CD4+ expressando o CAR e células T CD8+ expressando o CAR e a administração da dose compreende administrar uma pluralidade de composições separadas, a referida pluralidade de composições separa- das compreendendo uma primeira composição compreendendo uma das células T CD4+ e das células T CD8+ e a segunda composição compreendendo a outra das células T CD4+ ou das células T CD8+.
78. O método de modalidade 77, em que: a primeira composição e segunda composição são ad- ministradas 0 a 12 horas de intervalo, 0 a 6 horas de intervalo ou 0 a 2 horas de intervalo ou em que a administração da primeira composição e a administração da segunda composição são realizadas no mesmo dia, são realizadas entre cerca de 0 e cerca de 12 horas de intervalo, entre cerca de 0 e cerca de 6 horas de intervalo ou entre cerca de 0 e 2 horas de intervalo; e/ou o início de administração da primeira composição e o início de adminis- tração da segunda composição são realizados entre cerca de 1 minuto e cerca de 1 hora de intervalo ou entre cerca de 5 minutos e cerca de 30 minutos de intervalo.
79. O método de modalidade 77 ou modalidade 78, em que a primeira composição e segunda composição são administradas não mais do que 2 horas, não mais do que 1 hora, não mais do que 30 mi- nutos, não mais do que 15 minutos, não mais do que 10 minutos ou não mais do que 5 minutos de intervalo.
80. O método de qualquer uma das modalidades 77 a 79, em que a primeira composição compreende as células T CD4+.
81. O método de qualquer uma das modalidades 77 a 79, em que a primeira composição compreende as células T CD8+.
82. O método de qualquer uma das modalidades 77 a 81, em que a primeira composição é administrada antes da segunda com- posição.
83. O método de qualquer uma das modalidades 1 a 82, em que a dose de células é administrada parenteralmente, opcionalmente intravenosamente.
84. O método de qualquer uma das modalidades 1 a 83, em que as células T são células T primárias obtidas da amostra do indiví- duo.
85. O método de qualquer uma das modalidades 1 a 82, em que as células T são autólogas ao indivíduo.
86. O método de qualquer uma das modalidades 1 a 85, em que o processamento compreende: isolar células T, opcionalmente células T CD4+ e/ou CD8+, da amostra obtida do indivíduo, desse modo produzindo uma composição de entrada compreendendo células T primárias; e introduzir a molécula de ácido nucleico codificando o CAR nas células T da composição de entrada.
87. O método de modalidade 86, em que o isolamento com- preende realizar seleção com base em imunoafinidade.
88. O método de qualquer uma das modalidades 1 a 87, em que a amostra biológica é ou compreende uma amostra de sangue total, uma amostra da camada leucocitária, uma amostra de células mononu- cleares de sangue periférico (PBMC), uma amostra de célula T não fra- cionada, uma amostra de linfócito, uma amostra de glóbulos brancos, um produto de aferese, ou um produto de leucaferese.
89. O método de qualquer uma das modalidades 86 a 88, em que antes da introdução, o processamento compreende incubar a composição de entrada sob condições de estimulação, as referidas con- dições de estimulação compreendendo a presença de um reagente es- timulatório capaz de ativar um ou mais domínios de sinalização intrace- lular de um ou mais componentes de um complexo TCR e/ou um ou mais domínios de sinalização intracelular de uma ou mais moléculas coestimulatórias, desse modo gerando uma composição estimulada, em que a molécula de ácido nucleico codificando o CAR é introduzida na composição estimulada.
90. O método de modalidade 89, em que o reagente esti- mulatório compreende um agente primário que especificamente se liga a um membro de um complexo TCR, opcionalmente que especifica- mente se liga a CD3.
91. O método de modalidade 90, em que o reagente esti- mulatório também compreende um agente secundário que especifica- mente se liga a uma molécula coestimulatória de célula T, opcional- mente em que a molécula coestimulatória é selecionada de CD28, CD137 (4-1-BB), OX40, ou ICOS.
92. O método de modalidade 90 ou modalidade 91, em que os agentes primários e/ou secundários compreendem um anticorpo, op- cionalmente em que o reagente estimulatório compreende incubação com um anticorpo anti-CD3 e um anticorpo anti-CD28, ou um fragmento de ligação ao antígeno do mesmo.
93. O método de qualquer uma das modalidades 90 a 92, em que o agente primário e/ou agente secundário estão presentes sobre a superfície de um sólido.
94. O método de modalidade 93, em que o suporte sólido é ou compreende uma conta, opcionalmente em que a conta é magnética ou superparamagnética.
95. O método de modalidade 94, em que a conta compre- ende um diâmetro maior que ou maior que cerca de 3,.5 µm porém não mais que cerca de 9 µm ou não mais que cerca de 8 µm ou não mais que cerca de 7 µm ou não mais que cerca de 6 µm ou não mais que cerca de 5 µm.
96. O método de modalidade 94 ou modalidade 95, em que a conta compreende um diâmetro de ou cerca de 4,5 µm.
97. O método de qualquer uma das modalidades 1 a 96, em que a introdução compreende transduzir células da composição estimu- lada com um vetor viral compreendendo um polinucleotídeo codificando o receptor recombinante.
98. O método de modalidade 97, em que o vetor viral é um vetor retroviral.
99. O método de modalidade 97 ou modalidade 98, em que o vetor viral é umvetor lentiviral ou vetor gamarretroviral.
100. O método de qualquer uma das modalidades 86 a 99, em que o processamento também compreende após a introdução culti- var as células T, opcionalmente em que o cultivo é realizado sob condi- ções que resultem na proliferação ou expansão de células para produzir uma composição de saída compreendendo a terapia de célula T.
101. O método de modalidade 100, em que subsequente ao cultivo, o método também compreende formular células da composição de saída para criopreservação e/ou para administração da terapia de célula T ao indivíduo, opcionalmente em que a formulação é na pre- sença de um excipiente farmaceuticamente aceitável.
102. O método de qualquer uma das modalidades 1 a 101, em que o indivíduo é um ser humano.
103. O método de qualquer uma das modalidades 1 a 102, em que: pelo menos 35%, pelo menos 40 % ou pelo menos 50% de indivíduos tratados de acordo com o método que obteve uma resposta completa (CR) que é durável,ou é durável em pelo menos 60, 70, 80, 90, ou 95 % de indivíduos obtendo a CR, durante, ou durante mais que 6 meses ou durante, ou durante mais que 9 meses; e/ou em que pelo menos 60, 70, 80, 90, ou 95 % de indiví- duos obtendo uma CR por seis meses permanecem em resposta, per- manecem em CR, e/ou sobrevivem ou sobrevivem sem progressão, du- rante mais que, ou durante mais que 3 meses e/ou durante, ou durante mais que 6 meses e/ou em mais que nove meses; e/ou pelo menos 50%, pelo menos 60% ou pelo menos 70%
dos indivíduos tratados de acordo com o método obtiveram resposta objetiva (OR) opcionalmente em que a OR é durável, ou é durável em pelo menos 60, 70, 80, 90, ou 95 % de indivíduos obtendo a OR, du- rante, ou durante mais que 6 meses ou durante, ou durante mais que 9 meses; e/ou em que pelo menos 60, 70, 80, 90, ou 95 % de indiví- duos obtendo uma OR em seis meses permanecem em resposta ou sobrevivem durante mais que, ou durante mais que 3 meses e/ou du- rante, ou durante mais que 6 meses.
104. O método de qualquer uma das modalidades 60 a 103, em que, no momento, ou imediatamente antes do momento da adminis- tração da dose de células o indivíduo recidivou após a remissão após o tratamento com, ou tornou-se refratário a, uma ou mais terapias anteri- ores para o linfoma, opcionalmente o NHL, opcionalmente uma, duas ou três terapias anteriores diferente de outra dose de células expres- sando o CAR.
105. Método de acordo com qualquer uma das modalidades 60 a 104, em que, em ou antes da administração da terapia de célula T compreendendo a dose de células: o indivíduo é portador, ou foi identificado como sendo portador de um linfoma de hit duplo/triplo; o indivíduo é portador, ou foi identificado como sendo portador de um um linfoma quimiorrefratário, opcionalmente um DLBCL quimiorrefratário; e/ou o indivíduo não obteve uma resposta completa (CR) em resposta a uma terapia anterior.
106. Um kit compreendendo uma ou mais doses unitárias de um inibidor de quinase que é ou compreende a estrutura
, ou é um sal farmaceuticamente aceitável do mesmo, e instruções para a administração de uma ou mais doses uni- tárias a um indivíduo portador de um câncer que é um candidato para o tratamento com, ou que deve ser tratado com uma terapia de célula T autóloga, a referida terapia de célula T que compreende uma dose de células T geneticamente modificadas expressando um receptor de antí- geno quimérico (CAR) que especificamente se liga a um CD19, e em que, antes da administração da terapia de célula T, uma amostra bioló- gica é obtida do indivíduo e processada, o processamento compreen- dendo geneticamente modificar células T da amostra, opcionalmente in- troduzindo um ácido nucleico codificando o CAR nas células T, em que as instruções especificam o início da adminis- tração de uma dose unitária do inibidor de quinase ao indivíduo em ou pelo menos em cerca de 3 dias antes de obter a amostra e em um re- gime de dosagem compreendendo administrações repetidas de uma ou mais doses unitárias em um intervalo de dosagem durante um período de tempo que se estende pelo menos para incluir administração em, ou após o dia no qual a amostra é obtida do indivíduo.
107. O kit de modalidade 106, em que as instruções também especificam a administração de uma terapia de célula T ao indivíduo.
108. O kit de modalidade 106 ou modalidade 107, em que as instruções também especificam, subsequente ao início da administra- ção do inibidor de quinase e antes da administração da terapia de célula T, administrar uma terapia de linfodepleção ao indivíduo.
109. O kit de modalidade 108, em que as instruções especi-
ficam que a administração do inibidor de quinase deve ser descontinu- ada durante a administração da terapia de linfodepleção.
110. O kit de modalidade 108 ou modalidade 109, em que as instruções especificam que o regime de dosagem compreende a admi- nistração do inibidor de quinase durante um período de tempo que se estende pelo menos até o início da terapia de linfodepleção.
111. Kit de qualquer uma das modalidades 108 a 110, em que as instruções especificam que o regime de dosagem, compreende a administração do inibidor de quinase durante um período de tempo que inclui a administração até o início da terapia de linfodepleção, se- guida por descontinuação ou interrompimento da administração do ini- bidor de quinase durante a terapia de linfodepleção, e em seguida ad- ministração adicional do inibidor de quinase durante um período que se estende durante pelo menos 15 dias após início de administração da terapia de célula T.
112. Kit de qualquer uma das modalidades 106 a 111, em que as instruções especificam que a administração do inibidor de qui- nase é iniciada em pelo menos ou cerca de 4 dias, pelo menos em ou cerca de 5 dias, pelo menos em ou cerca de 6 dias, pelo menos em ou cerca de 7 dias, pelo menos em ou cerca de 14 dias ou mais antes da obtenção da amostra do indivíduo.
113. Kit de qualquer uma das modalidades 106 a 112, em que as instruções especificam que a administração do inibidor de qui- nase é iniciada em pelo menos ou cerca de 5 dias a 7 dias antes da obtenção da amostra do indivíduo.
114. Kit de qualquer uma das modalidades 108 a 113, em que as instruções especificam que a administração da terapia de linfo- depleção deve ser concluído dentro de 7 dias antes do início da admi- nistração da terapia de célula T.
115. Kit de qualquer uma das modalidades 108 a 114, em que as instruções especificam que a administração da terapia de linfo- depleção deve ser concluído 2 a 7 dias antes do início da administração da terapia de célula T.
116. Kit de qualquer uma das modalidades 111 a 115, em que as instruções especificam que a administração adicional do inibidor de quinase é durante um período que se estende a, ou cerca de, ou mais que três meses após início de administração da terapia de célula T.
117. Kit de qualquer uma das modalidades 106 a 116, em que as instruções especificam que a administração de cada dose unitá- ria do inibidor de quinase é realizada uma vez por dia em cada dia que ela é administrada durante o regime de dosagem.
118. Kit de qualquer uma das modalidades 106 a 117, em que as referidas uma ou mais doses unitárias cada é composta de, ou de cerca de 140 mg a cerca de 840 mg.
119. Kit de qualquer uma das modalidades 106 a 118, em que as referidas uma ou mais doses unitárias cada contém 140 mg ou cerca de 140 mg mg a cerca de 560 mg por cada dia que o inibidor de quinase é administrado. 120. Kit de qualquer uma das modalidades 106 a 119, em que as referidas uma ou mais doses unitárias cada com- preende de ou de cerca de 280 mg a 560 mg.
121. Kit de qualquer uma das modalidades 106 a 120, em que as instruções especificam que a administração do inibidor de qui- nase é iniciada em um mínimo de, ou em cerca de 7 dias antes da ob- tenção da amostra do indivíduo.
122. Kit de qualquer uma das modalidades 106 a 121, em que as instruções especificam que: a administração do inibidor de quinase é iniciada em, ou em cerca de 30 a 40 dias antes do início da administração da terapia de célula T;
a amostra é obtida do indivíduo em, ou em cerca de 23 dias a 38 dias antes do início da administração da terapia de célula T; e/ou a terapia de linfodepleção é concluída 5 a 7 dias antes de iniciar a administração da terapia de célula T.
123. Kit de qualquer uma das modalidades 106 a 122, em que as instruções especificam que: a administração do inibidor de quinase é iniciada 35 dias ou cerca de 35 dias antes do início da administração da terapia de célula T; a amostra é obtida do indivíduo em, ou em cerca de 28 dias a 32 dias antes do início da administração da terapia de célula T; e/ou a terapia de linfodepleção é concluída 5 a 7 dias antes de iniciar a administração da terapia de célula T.
124. Kit de qualquer uma das modalidades 108 a 123, em que a terapia de linfodepleção compreende a administração de fludara- bina e/ou ciclofosfamida.
125. Kit de qualquer uma das modalidades 108 a 124, em que as instruções especificam que a administração da terapia de linfo- depleção compreende a administração de ciclofosfamida a cerca de 200 a 400 mg/m2, opcionalmente a, ou cerca de 300 mg/m2, inclusive, e/ou fludarabina a cerca de 20 a 40 mg/m2, opcionalmente 30 mg/m2, diaria- mente durante 2 a 4 dias, opcionalmente durante 3 dias, ou em que a terapia de linfodepleção compreende a administração de ciclofosfamida a cerca de 500 mg/m2.
126. Kit de qualquer uma das modalidades 108 a 125, em que a instrução especifica que: a terapia de linfodepleção compreende a administração de ciclofosfamida em ou cerca de 300 mg/m2 e fludarabina a cerca de
30 mg/m2 diariamente durante 3 dias; e/ou a terapia de linfodepleção compreende a administração de ciclofosfamida em ou cerca de 500 mg/m2 e fludarabina a cerca de 30 mg/m2diariamente durante 3 dias.
127. Kit de qualquer uma das modalidades 106 a 126, em que cada dose unitária do inibidor de quinase é de, ou é de cerca de 140 mg e/ou as instruções especificam que a administração do inibidor de quinase por dia em que é administrada em uma quantidade de, ou de cerca de 140 mg.
128. Kit de qualquer uma das modalidades 106 a 127, em que cada dose unitária do inibidor de quinase é de, ou é de cerca de 280 mg e/ou as instruções especificam que a administração do inibidor de quinase por dia em que é administrada é de uma quantidade de, ou de cerca de 280 mg.
129. Kit de qualquer uma das modalidades 106 a 128, em que cada dose unitária do inibidor de quinase é de, ou é de cerca de 420 mg e/ou as instruções especificam que a administração do inibidor de quinase por dia em que é administrada é de uma quantidade de, ou de cerca de 420 mg.
130. O método de qualquer uma das modalidades 106 a 129, em que cada dose unitária do inibidor de quinase é de, ou é de cerca de 560 mg e/ou as instruções especificam que a administração do inibidor de quinase por dia em que é administrada é de uma quantidade de, ou de cerca de 560 mg.
131. Kit de qualquer uma das modalidades 111 a 130, em que as instruções especificam que o período se estende durante ou a partir de, ou mais que quatro meses após o início da administração da terapia de célula T.
132. Kit de qualquer uma das modalidades 111 a 131, em que as instruções especificam que o período se estende durante ou a partir de, ou mais que cinco meses após o início da administração da terapia de célula T.
133. Kit de qualquer uma das modalidades 111 a 132, em que as instruções especificam que a administração adicional é durante um período que se estende a, ou a cerca de, ou a mais que seis meses.
134. Kit de qualquer uma das modalidades 111 a 133, em que as instruções especificam que a administração adicional do inibidor de quinase é interrompida no término do período se, no término do pe- ríodo, o indivíduo exibir uma completa resposta (CR) após o tratamento.
135. Kit de qualquer uma das modalidades 111 a 134, em que as instruções especificam que administração adicional do inibidor de quinase é interrompida no término do período se, no término do pe- ríodo, o câncer tiver progredido ou recidivado após a remissão após o tratamento.
136. Kit de qualquer uma das modalidades 111 a 135, em que as instruções especificam que o período se estende durante ou a partir de três meses a, ou de seis meses.
137. Kit de qualquer uma das modalidades 111 a 136, em que as instruções especificam que o período se estende durante ou a partir de três meses após início de administração da terapia de célula T.
138. Kit de qualquer uma das modalidades 111 a 136, em que as instruções especificam que o período se estende durante ou a partir de 3 meses após início de administração da terapia de célula T se o indivíduo tiver obtido uma completa resposta (CR) em, antes de, ouem cerca de 3 meses, após o tratamento, ou o câncer tiver progredido ou tiver recidivado após a remissão após o tratamento.
139. O kit de modalidade 138, em que as instruções especi- ficam que o período se estende durante ou a partir de 3 meses após início de administração da terapia de célula T se o indivíduo tiver obtido em 3 meses uma completa resposta (CR).
140. Kit de qualquer uma das modalidades 111 a 136, em que as instruções especificam que o período se estende durante ou a partir de seis meses após início de administração da terapia de célula T.
141. Kit de qualquer uma das modalidades 111 a 136, em que as instruções especificam que o período se estende durante ou a partir de 6 meses após início de administração da terapia de célula T se o indivíduo tiver obtido em, antes de, ou em cerca de 6 meses, uma resposta completa (CR) após o tratamento, ou o câncer tiver progredido ou recidivado após a remissão após o tratamento.
142. O kit de modalidade 141, em que as instruções especi- ficam que o período se estende durante ou a partir de 6 meses após início de administração da terapia de célula T se o indivíduo tiver obtido em 6 meses uma resposta completa (CR).
143. Kit de qualquer uma das modalidades 111 a 142, em que as instruções especificam que a administração adicional é continu- ada durante o período mesmo se o indivíduo tiver obtido uma resposta completa (CR) em um ponto do tempo antes do término do período.
144. Kit de qualquer uma das modalidades 111 a 133, 136, 137, 138, 140 e 141, em que as instruções especificam que também compreende continuar a administração adicional após o término do pe- ríodo, se, no término do período, o indivíduo exibir uma resposta parcial (PR) ou doença estável (SD).
145. Kit de qualquer uma das modalidades 111 a 133, 136, 137, 138, 140, 141 e 144, em que as instruções especificam que a ad- ministração adicional é continuada durante mais de seis meses se em, ou em cerca de seis meses, o indivíduo exibir uma resposta parcial (PR) ou doença estável (SD) após o tratamento.
146. O kit de modalidade 144 ou modalidade 144, em que as instruções especificam que a administração adicional é continuada até o indivíduo obter uma resposta completa (CR) após o tratamento, ou até o câncer ter progredido ou recidivado após a remissão após o trata- mento.
147. Kit de qualquer uma das modalidades 106 a 146, em que o inibidor de quinase inibe a tirosina quinase de Bruton (BTK) e/ou inibe a quinase de célula T induzível por IL2 (ITK).
148. Kit de qualquer uma das modalidades 106 a 147, em que o inibidor de quinase inibe ITK e o inibidor inibe ITK ou inibe ITK com uma concentração inibitória metade da máxima (IC50) menor que ou menor que cerca de 1000 nM, 900 nM, 800 nM, 600 nM, 500 nM, 400 nM, 300 nM, 200 nM, 100 nM ou menos.
149. Kit de qualquer uma das modalidades 106 a 148, em que as instruções especificam que ao indivíduo foi ou pode ter sido an- teriormente administrado o inibidor de quinase antes da administração das referidas uma ou mais doses unitárias do inibidor de quinase.
150. Kit de qualquer uma das modalidades 106 a 148, em que as instruções especificam que ao indivíduo não foi, ou pode não ter sido anteriormente administrado o inibidor de quinase antes da adminis- tração das referidas uma ou mais doses unitárias do inibidor de quinase.
151. Kit de qualquer uma das modalidades 106 a 150, em que as instruções especificam que: (i) o indivíduo e/ou o câncer (a) é resistente à inibição de tirosina quinase de Bruton (BTK) e/ou (b) compreende uma popula- ção de células que são resistentes à inibição pelo inibidor de quinase, opcionalmente em que a população de células é ou compreende uma população de células B e/ou não compreende células T; (ii) o indivíduo e/ou o câncer compreende uma mutação em um ácido nucleico codificando uma BTK, opcionalmente em que a mutação é capaz de reduzir ou prevenir a inibição da BTK pelo inibidor de quinase, opcionalmente em que a mutação é C481S;
(iii) o indivíduo e/ou o câncer compreende uma mutação em um ácido nucleico codificando fosfolipase C gama 2 (PLCgamma2), opcionalmente em que a mutação resulta em atividade de sinalização constitutiva, opcionalmente em que a mutação é R665W ou L845F; (iv) no momento do início da administração do inibidor de quinase mencionado em (1), e opcionalmente no momento do início da administração da terapia de célula T, o indivíduo recidivou após re- missão após um tratamento anterior com, ou foi considerado refratário a um tratamento anterior com, o inibidor de quinase e/ou com uma ter- apia inibidora de BTK; (v) no momento do início da administração do inibidor de quinase mencionado em (1), e opcionalmente no momento do início da terapia de célula T, o indivíduo progrediu após um tratamento anterior com o inibidor e/ou com uma terapia inibidora de BTK, opcionalmente em que o indivíduo exibiu doença progressiva como a melhor resposta ao tratamento anterior ou progressão após resposta anterior ao trata- mento anterior; e/ou (vi) no momento do início da administração do inibidor de quinase mencionado em (1), e opcionalmente no momento do início da terapia de célula T, o indivíduo exibiu uma resposta menor que uma resposta completa (CR) após um tratamento anterior durante pelo menos 6 meses com o inibidor e/ou com uma terapia inibidora de BTK.
152. Kit de qualquer uma das modalidades 106 a 151, em que o câncer é uma malignidade de célula B.
153. O kit de modalidade 152, em que a malignidade de cé- lula B é um linfoma.
154. O kit de modalidade 153, em que o linfoma é um linfoma não Hodgkin (NHL).
155. O kit de modalidade 154, em que o NHL compreende NHL agressivo, linfoma de célula B grande difuso (DLBCL), DLBCL-
NOS, indolente opcionalmente transformado; DLBCL-NOS positivo para EBV; Linfoma de célulab grande rica em histiócito/célula T; linfoma de célula B grande mediastinal primária (PMBCL); linfoma folicular (FL), opcionalmentte, linfoma folicular Grau 3B (FL3B); e/ou linfoma de célula B de grau elevado com MYC e BCL2 e/ou rearranjos BCL6 com histolo- gia DLBCL (hit duplo/triplo).
156. Kit de qualquer uma das modalidades 106 a 155, em que o indivíduo é ou foi identificado como tendo um status de desempe- nho do Eastern Cooperative Oncology Group (ECOG) menor do que ou igual a 1.
157. Kit de qualquer uma das modalidades 106 a 156, em que as referidas uma ou mais doses unitárias do inibidor de quinase são formuladas para administração oral e/ou as instruções também especi- ficam que as referidas uma ou mais doses unitárias do inibidor de são administradas oralmente.
158. Kit de qualquer uma das modalidades 106 a 157, em que o CD19 é um CD19 humano.
159. Kit de qualquer uma das modalidades 106 a 158, em que o receptor de antígeno quimérico (CAR) compreende um domínio de reconhecimento de antígeno extracelular que especificamente se liga ao CD19 e um domínio de sinalização intracelular compreendendo um ITAM.
160. O kit de modalidade 159, em que o domínio de sinaliza- ção intracelular compreende um domínio de sinalização de uma cadeia CD3-zeta (CD3ζ), opcionalmente uma cadeia CD3-zeta humana.
161. O kit de modalidade 159 ou modalidade 160, em que o receptor de antígeno quimérico (CAR) também compreende uma região de sinalização coestimulatória.
162. O kit de modalidade 161, em que a região de sinaliza- ção coestimulatória compreende um domínio de sinalização de CD28 ou 4-1BB, opcionalmente CD28 humano ou 4-1BB humano.
163. O kit de modalidade 161 ou modalidade 162, em que o domínio coestimulatório é ou compreende um domínio de sinalização de 4-1BB humano.
164. Kit de qualquer uma das modalidades 106 a 163, em que: o CAR compreende um scFv específico para o CD19; um domínio de transmembrana; um domínio de sinalização citoplásmico derivado de uma molécula coestimulatória, que opcionalmente é ou compreende um 4-1BB, opcionalmente 4-1BB humano; e um domínio de sinalização citoplásmico derivado de uma molécula contendo ITAM de sinalização primária, que opcionalmente é ou compreende um domí- nio de sinalização CD3zeta, opcionalmente um domínio de sinalização CD3zeta humano; e opcionalmente em que o CAR também compreende um espaçador entre o domínio de transmembrana e o scFv; o CAR compreende, em ordem, um scFv específico para o CD19; um domínio de transmembrana; um domínio de sinaliza- ção citoplásmico derivado de uma molécula coestimulatória, que op- cionalmente é ou compreende um domínio de sinalização 4-1BB, op- cionalmente um domínio de sinalização 4-1BB humano; e um domínio de sinalização citoplásmico derivado de uma molécula contendo ITAM de sinalização primária, que opcionalmente é um domínio de sinalização CD3zeta, opcionalmente domínio de sinalização CD3zeta humano; ou o CAR compreende, em ordem, um scFv específico para o CD19; um espaçador; um domínio de transmembrana, um domí- nio de sinalização citoplásmico derivado de uma molécula coestimulató- ria, que opcionalmente é um domínio de sinalização 4-1BB, e um domí- nio de sinalização citoplásmico derivado de uma molécula contendo ITAM de sinalização primária, que opcionalmente é ou compreende um domínio de sinalização CD3zeta.
165. O kit de modalidade 164, em que o CAR compreende um espaçador e o espaçador é um espaçador de polipeptídeo que (a) compreende ou consiste em toda ou uma parte de uma articulação de imunoglobulina ou uma versão modi- ficada da mesma ou compreende cerca de 15 aminoácidos ou menos, e não compreende uma região extracelular CD28 ou uma região ex- tracelular CD8, (b) compreende ou consiste em toda ou uma parte de uma articulação de imunoglobulina, opcionalmente uma articulação IgG4, ou uma versão modificada da mesma e/ou compreende cerca de 15 aminoácidos ou menos, e não compreende uma região extracelular CD28 ou uma região extracelular CD8, ou (c) é de, ou cerca de 12 ami- noácidos de comprimento e/ou compreende ou consiste em toda ou uma parte de uma articulação de imunoglobulina, opcionalmente uma IgG4, ou uma versão modificada da mesma; ou (d) tem ou consiste na sequência de SEQ ID NO: 1, uma sequência codificada por SEQ ID NO: 2, SEQ ID NO: 30, SEQ ID NO: 31, SEQ ID NO: 32, SEQ ID NO: 33, SEQ ID NO: 34, ou uma variante de qualquer das anteriores tendo pelo menos 85%, 86%, 87%, 88%, 89%, 90%, 91%, 92%, 93%, 94%, 95%, 96%, 97%, 98%, 99% ou mais identidade de sequência com as mes- mas, ou (e) compreende ou consiste na fórmula X1PPX2P (SEQ ID NO:58), onde X1 é glicina, cisteína ou arginina e X2 é cisteína ou tre- onina; e/ou o domínio coestimulatório compreende SEQ ID NO: 12 ou uma variante da mesma tendo pelo menos 85%, 86%, 87%, 88%, 89%, 90%, 91%, 92%, 93%, 94%, 95%, 96%, 97%, 98%, 99% ou mais identidade de sequência da mesma; e/ou o domínio de sinalização primária compreende SEQ ID NO: 13 ou 14 ou 15 tendo pelo menos 85%, 86%, 87%, 88%, 89%, 90%, 91%, 92%, 93%, 94%, 95%, 96%, 97%, 98%, 99% ou mais identidade de sequência da mesma; e/ou o scFv compreende uma sequência de CDRL1 de RAS- QDISKYLN (SEQ ID NO: 35), uma sequência de CDRL2 de SRLHSGV (SEQ ID NO: 36), e/ou uma sequência de CDRL3 de GNTLPYTFG (SEQ ID NO: 37) e/ou uma sequência de CDRH1 de DYGVS (SEQ ID NO: 38), uma sequência de CDRH2 de VIWGSETTYYNSALKS (SEQ ID NO: 39), e/ou uma sequência de CDRH3 de YAMDYWG (SEQ ID NO: 40) ou em que o scFv compreende uma região de cadeia pesada variável de FMC63 e uma região de cadeia leve variável de FMC63 e/ou uma sequência de CDRL1 de FMC63, uma sequência de CDRL2 de FMC63, uma sequência de CDRL3 de FMC63, uma sequência de CDRH1 de FMC63, uma sequência de CDRH2 de FMC63, e uma se- quência de CDRH3 de FMC63 ou se liga ao mesmo epítopo que, ou compete para ligação com, qualquer dos anteriores, e opcionalmente em que o scFv compreende, em ordem, a VH, um ligante, opcionalmente compreendendo SEQ ID NO: 41, e a VL, e/ou o scFv compreende um ligante flexível e/ou compreende a sequência de aminoácido mencio- nada como SEQ ID NO: 42.
166. Kit de qualquer uma das modalidades 106 a 165, em que a dose de células T geneticamente modificadas é composta de, ou de cerca de 1 x 105 a 5 x 108 células T expressando CAR totais, 1 x 106 a 2,5 x 108 células T expressando CAR totais, 5 x 106 a 1 x 108 células T expressando CAR totais, 1 x 107 a 2,5 x 108 células T expressando CAR totais, 5 x 107 a 1 x 108 células T expressando CAR totais, cada inclusive.
167. Kit de qualquer uma das modalidades 106 a 166, em que a dose de células T geneticamente modificadas compreende pelo menos ou pelo menos cerca de 1 x 105 células expressando CAR, pelo menos ou pelo menos cerca de 2,5 x 105 células expressando CAR, pelo menos ou pelo menos cerca de 5 x 105 células expressando CAR, pelo menos ou pelo menos cerca de 1 x 106 células expressando CAR, pelo menos ou pelo menos cerca de 2,5 x 106 células expressando CAR, pelo menos ou pelo menos cerca de 5 x 106 células expressando CAR, pelo menos ou pelo menos cerca de 1 x 107 células expressando CAR, pelo menos ou pelo menos cerca de 2,5 x 107 células expressando CAR, pelo menos ou pelo menos cerca de 5 x 107 células expressando CAR, pelo menos ou pelo menos cerca de 1 x 108 células expressando CAR, pelo menos ou pelo menos cerca de 2,5 x 108 células expressando CAR, ou pelo menos ou pelo menos cerca de 5 x 108 células expressando CAR.
168. Kit de qualquer uma das modalidades 106 a 167, em que a dose de células T geneticamente modificadas é composta de, ou de cerca de 5 x 107 células T expressando CAR totais.
169. Kit de qualquer uma das modalidades 106 a 168, em que a dose de células T geneticamente modificadas é composta de, ou de cerca de 1 x 108 células expressando CAR.
170. Kit de qualquer uma das modalidades 106 a 169, em que a dose de células T geneticamente modificadas compreende célu- las T CD4+ expressando o CAR e células T CD8+ expressando o CAR e as instruções especificam que a administração da dose compreende administrar uma pluralidade de composições separadas, a referida plu- ralidade de composições separadas compreendendo uma primeira composição compreendendo uma das células T CD4+ e das células T CD8+ e a segunda composição compreendendo a outra das células T CD4+ ou das células T CD8+.
171. O kit de modalidade 170, em que as instruções especi- ficam que: a primeira composição e segunda composição são ad- ministradas 0 a 12 horas de intervalo, 0 a 6 horas de intervalo ou 0 a 2 horas de intervalo ou em que a administração da primeira composição e a administração da segunda composição são realizadas no mesmo dia, são realizadas entre cerca de 0 e cerca de 12 horas de intervalo,
entre cerca de 0 e cerca de 6 horas de intervalo ou entre cerca de 0 e 2 horas de intervalo; e/ou o início de administração da primeira composição e o início de adminis- tração da segunda composição são realizados entre cerca de 1 minuto e cerca de 1 hora de intervalo ou entre cerca de 5 minutos e cerca de 30 minutos de intervalo.
172. O kit de modalidade 170 ou modalidade 171, em que as instruções especificam que a primeira composição e segunda com- posição são administradas não mais do que 2 horas, não mais do que 1 hora, não mais do que 30 minutos, não mais do que 15 minutos, não mais do que 10 minutos ou não mais do que 5 minutos de intervalo.
173. Kit de qualquer uma das modalidades 170 a 172, em que as instruções especificam que a primeira composição compreende as células T CD4+.
174. Kit de qualquer uma das modalidades 170 a 172, em que as instruções especificam que a primeira composição compreende as células T CD8+.
175. Kit de qualquer uma das modalidades 170 a 174, em que as instruções especificam que a primeira composição é adminis- trada antes da segunda composição.
176. Kit de qualquer uma das modalidades 106 a 175, em que as instruções especificam que a dose de células é administrada pa- renteralmente, opcionalmente intravenosamente.
177. Kit de qualquer uma das modalidades 106 a 176, em que as células T são células T primárias obtidas da amostra do indiví- duo.
178. Kit de qualquer uma das modalidades 106 a 177, em que as células T são autólogas ao indivíduo.
179. Kit de qualquer uma das modalidades 106 a 178, em que as instruções também especificam o processo para a produção da terapia de célula T.
180. Kit de qualquer uma das modalidades 106 a 179, em que o processo para a produção da terapia de célula T compreende: isolar células T, opcionalmente células T CD4+ e/ou CD8+, da amostra obtida do indivíduo, desse modo produzindo uma composição de entrada compreendendo células T primárias; e introduzir a molécula de ácido nucleico codificando o CAR na composição de entrada.
181. O kit de modalidade 180, em que o isolamento compre- ende realizar seleção com base em imunoafinidade.
182. Kit de qualquer uma das modalidades 106 a 181, em que a amostra biológica é ou compreende uma amostra de sangue total, uma amostra da camada leucocitária, uma amostra de células mononu- cleares de sangue periférico (PBMC), uma amostra de célula T não fra- cionada, uma amostra de linfócito, uma amostra de glóbulos brancos, um produto de aferese, ou um produto de leucaferese.
183. Kit de qualquer uma das modalidades 180 a 182, em que antes da introdução, o processo compreende incubar a composição de entrada sob condições de estimulação, as referidas condições de estimulação compreendendo a presença de um reagente estimulatório capaz de ativar um ou mais domínios de sinalização intracelular de um ou mais componentes de um complexo TCR e/ou um ou mais domínios de sinalização intracelular de uma ou mais moléculas coestimulatórias, desse modo gerando uma composição estimulada, em que a molécula de ácido nucleico codificando o CAR é introduzida na composição esti- mulada.
184. O kit de modalidade 183, em que o reagente estimula- tório compreende um agente primário que especificamente se liga a um membro de um complexo TCR, opcionalmente que especificamente se liga a CD3.
185. O kit de modalidade 184, em que o reagente estimula- tório também compreende um agente secundário que especificamente se liga a uma molécula coestimulatória de célula T, opcionalmente em que a molécula coestimulatória é selecionada de CD28, CD137 (4-1- BB), OX40, ou ICOS.
186. O kit de modalidade 184 ou modalidade 185, em que os agentes primários e/ou secundários compreendem um anticorpo, opci- onalmente em que o reagente estimulatório compreende incubação com um anticorpo anti-CD3 e um anticorpo anti-CD28, ou um fragmento de ligação ao antígeno do mesmo.
187. Kit de qualquer uma das modalidades 184 a 186, em que o agente primário e/ou agente secundário estão presentes sobre a superfície de um sólido.
188. O kit de modalidade 187, em que o suporte sólido é ou compreende uma conta, opcionalmente em que a conta é magnética ou superparamagnética.
189. O kit de modalidade 188, em que a conta compreende um diâmetro maior que ou maior que cerca de 3,5 µm porém não mais que cerca de 9 µm ou não mais que cerca de 8 µm ou não mais que cerca de 7 µm ou não mais que cerca de 6 µm ou não mais que cerca de 5 µm.
190. O kit de modalidade 188 ou modalidade 189, em que a conta compreende um diâmetro de ou cerca de 4,5 µm.
191. Kit de qualquer uma das modalidades 106 a 190, em que a introdução compreende transduzir células da composição estimu- lada com um vetor viral compreendendo um polinucleotídeo codificando o receptor recombinante.
192. O kit de modalidade 191, em que o vetor viral é um vetor retroviral.
193. O kit de modalidade 191 ou modalidade 192, em que o vetor viral é um vetor lentiviral ou vetor gamarretroviral.
194. Kit de qualquer uma das modalidades 180 a 193, em que o processo também compreende após a introdução cultivar as cé- lulas T, opcionalmente em que o cultivo é realizado sob condições que resultem na proliferação ou expansão de células para produzir uma composição de saída compreendendo a terapia de célula T.
195. O kit de modalidade 194, em que subsequente ao cul- tivo, o processo também compreende formular células da composição de saída para criopreservação e/ou para administração da terapia de célula T ao indivíduo, opcionalmente em que a formulação é na pre- sença de um excipiente farmaceuticamente aceitável.
196. Kit de qualquer uma das modalidades 106 a 195, em que as instruções especificam que o indivíduo é um ser humano.
197. O kit de qualquer uma das modalidades 106 a 196, em que as instruções especificam que, em ou antes da administração da terapia de célula T compreendendo a dose de células: o indivíduo é portador, ou foi identificado como sendo portador de um linfoma de hit duplo/triplo; o indivíduo é portador, ou foi identificado como sendo portador de um um linfoma quimiorrefratário, opcionalmente um DLBCL quimiorrefratário; e/ou o indivíduo não obteve uma resposta completa (CR) em resposta a uma terapia anterior.
198. Um kit compreendendo uma ou mais doses unitárias de um inibidor de quinase que é ou compreende a estrutura , ou é um sal farmaceuticamente aceitável do mesmo, e instruções para realizar os métodos de acordo com qualquer uma das reivindicações 1 a 105.
199. Um artigo de fabricação que compreende kit de qual- quer uma das modalidades 106 a 198. VIII. EXEMPLOS
[00198] Os exemplos a seguir são incluídos apenas para fins ilustra- tivos e não se destinam a limitar o escopo da invenção. Exemplo 1: Avaliação do fenótipo e função das células T que ex- pressam CAR na presença de ibrutinibe
[00604] As propriedades de células T que expressam CAR na presença de um inibidor de Btk, ibrutinibe (tendo a estrutura: ) foram avaliadas em estudos in vitro.
[00605] Para gerar células T que expressam CAR, as células T foram isoladas por enriquecimento baseado em imunoafinidade de três indi- víduos doadores humanos saudáveis, e as células de cada doador foram ativadas e transduzidas com um vetor viral que codifica um CAR anti-CD19. O CAR continha um scFv anti-CD19, um espaçador derivado de Ig, um domínio transmembranar derivado de CD28 humano, um domínio de sinalização intracelular derivado de 4-1BB humano e um domínio de sinalização derivado de CD3 zeta humano. O construto de ácido nucleico que codifica o CAR também incluiu uma sequência de EGFR truncada (tEGFR) para uso como um marcador de transdução, separada da sequência do CAR por uma sequência T2A autoclavável.
[00606] As células CD4+ e CD8+ que expressam CAR foram misturadas 1:1 para cada doador, individualmente, e as células agrupa- das para cada doador avaliadas in vitro sob várias condições. A. Atividade Citolítica
[00607] Células T de CAR geradas conforme descrito acima foram plaqueadas em triplicata em placas de Poli-D-Lisina e, em seguida, co-
cultivadas com células alvo que expressam CD19 resistentes a ibru- tinibe (células K562 transduzidas para expressar CD19, K562-CD19) em um efetor para o alvo (E:T) relação de 2,5: 1. As células alvo foram marcadas com NucLight Red (NLR), para permitir o rastreamento das células alvo por microscopia. ibrutinib foi adicionado às culturas em con- centrações de 5000, 500, 50, 5 e 0,5 nM (refletindo uma faixa de dos- agem que cobre as doses suprafisiológicas (500 nM) e Cmax (227 nM). Células T de CAR incubadas na presença das células alvo na ausência de ibrutinibe foram usadas como um controle "não tratado". A atividade citolítica foi avaliada medindo a perda de células alvo viáveis ao longo de um período de quatro dias, conforme determinado pelo sinal fluores- cente vermelho (usando o IncuCyte® Live Cell Analysis System, Essen Bioscience). A porcentagem (%) de morte do alvo foi avaliada medindo a área sob a curva (AUC) para contagem de células alvo normalizada ao longo do tempo e normalizando os valores inversos de AUC (1/AUC) definindo um valor de 0 % (células alvo sozinho) e um valor de 100 % (células T de CAR+ cocultivadas com células alvo no controle do veículo).
[00608] Conforme mostrado por microscopia, após um período inicial de crescimento de células alvo, as células T de CAR anti-CD19 de todos os doadores foram observadas para reduzir o número de células alvo ao longo de um período de quatro dias, demonstrando, assim, a morte eficaz no ensaio (FIG. 1A). Uma imagem representativa de células alvo cocultivadas com células T de CAR no início e no final do ensaio ci- totóxico é mostrada na FIG. 1B. Como mostrado na FIG. 1C, a normali- zação da morte de células alvo por células T de CAR tratadas com ibru- tinibe para controles não tratados usando cálculos de área sob a curva (AUC) mostrou que ibrutinibe, mesmo quando a concentração foi au- mentada para níveis suprafisiológicos (500 nM), não foi significa- tivamente atividade impactocitolítica das células T que expressam CAR anti-CD19 neste ensaio para dois doadores. A adição de ibrutinibe, em todas as concentrações testadas durante a cocultura, não inibiu a função citolítica das células T de CAR anti-CD19. No entanto, um au- mento modesto da morte de células alvo foi observado para um doador tratado com ibrutinibe (P < 0,0001) (FIG. 1C). B. Expressão de marcadores de superfície de células T de CAR.
[00609] Para avaliar vários marcadores fenotípicos de células T de CAR anti-CD19 cultivadas na presença de ibrutinibe, um painel de mar- cadores de ativação em células de CAR+, CD4+ e CD8+ (de três do- adores) foi rastreado durante 4 dias após a estimulação com células alvo K562 irradiadas que expressam CD19. As células T de CAR gera- das conforme descrito acima foram semeadas a 100.000 células/cavi- dade em placas revestidas com poli-D-lisina de 96 cavidades. As células alvo K562-CD19 irradiadas foram adicionadas a uma relação efetor para alvo de 2,5:1. As células foram cultivadas por até 4 dias na ausência de ibrutinibe ou na presença de ibrutinibe nas concentrações de 5000, 500, 50, 5 e 0,5 nM para a duração da cultura. As células foram colhidas em 1, 2, 3 e 4 dias e foram analisadas por citometria de fluxo para ativação de células T e marcadores de superfície de diferenciação CD69, CD107a, PD-1, CD25, CD38, CD39, CD95, CD62L, CCR7, CD45RO e para EGFR truncado (um marcador substituto para células transduzidas por CAR).
[00610] Entre os 3 diferentes doadores de células T de CAR anti- CD19, ibrutinibe nas concentrações de 5000, 500, 50, 5 e 0,5 nM não teve efeito significativo na expressão do marcador substituto de EGFR truncado, em qualquer um dos marcadores de ativação CD25, CD38, CD39, CD95 e CD62L, ou em qualquer um dos marcadores fenotípicos de células T avaliados neste estudo (CCR7, CD62L e CD45RO), con- sistente com a conclusão de que o ibrutinibe não impactou significa- tivamente o estado de ativação e/ou diferenciação/subtipo das células
T neste ensaio. A FIG. 2A representa resultados para marcadores ex- emplares. Os resultados na FIG. 2B mostram que o tratamento com ib- rutinibe não afetou o fenótipo das células como subconjuntos de memó- ria central (TCM) ou memória efetora (TEM), conforme avaliado pela expressão de CCR7 e CD45RA. Como mostrado na FIG. 2C e FIG. 2D, houve uma diminuição sutil nos níveis de expressão de CD69, CD107a ou PD-1 quando as células CD4+ ou CD8+, respectivamente, foram cul- tivadas na presença de ibrutinibe. Uma diminuição sutil na porcentagem de células T de CAR anti-CD19 que expressam tais marcadores foi ob- servada na concentração mais alta (suprafisiológica) do inibidor testado. C. Produção de Citocinas
[00611] A produção de citocinas por células T de CAR anti-CD19 cul- tivadas na presença ou ausência de ibrutinibe foi avaliada avaliando os níveis de citocinas nos sobrenadantes de coculturas de células T de CAR e células alvo K562-CD19 irradiadas. As células T de CAR geradas conforme descrito acima foram semeadas a 100.000 células/cavidade em placas revestidas com poli-D-lisina de 96 cavidades às quais as células alvo irradiadas (K562-CD19) foram adicionadas a uma relação efetor para alvo de 2,5:1. As células foram cultivadas por até 4 dias na ausência de ibrutinibe ou na presença de 0,5, 5, 50 ou 500 nM de ibru- tinibe pela duração da cultura até 4 dias. Os sobrenadantes da cultura foram colhidos a cada 24 horas nos dias 1, 2, 3 e 4, e IFNγ, IL-2, TNFa, IL-4 e IL-10 foram medidos a partir dos sobrenadantes da cultura usando kits de citocinas da Meso Scale Discovery (MSD).
[00612] A FIG. 3A representa gráficos representativos da cinética da produção de citocinas ao longo de 4 dias a partir de células T de CAR geradas a partir do doador 2. A FIG. 3B representa a mudança absoluta na produção de citocinas após estimulação por 2 dias em 2 experimen- tos independentes. Como mostrado na FIG. 3A e FIG. 3B, as concen- trações fisiológicas de ibrutinibe não diminuíram significativamente as concentrações de citocinas. Em resposta a ibrutinibe 50 nM, foi obser- vado algum aumento em IFN-γ e IL-2. ibrutinib a 50 nM aumentou mod- estamente a produção de citocinas em alguns doadores e uma diminu- ição média em IL-2 de 19,6 % ou 1200 pg/mL foi observada com ibru- tinibe 500 nM (P < 0,05) (FIG. 3B). D. Reestimulação Serial
[00613] A capacidade das células de se expandir ex vivo após estímulos repetidos em alguns aspectos pode indicar a capacidade das células T de CAR de persistir (por exemplo, após a ativação inicial) e/ou é indicativo de função e/ou aptidão in vivo (Zhao et al. (2015) Cancer Cell, 28: 415-28). Células T de CAR+ anti-CD19 geradas conforme descrito acima foram semeadas em triplicata a 100.000 células/cavi- dade em placas revestidas com poli-D-lisina de 96 cavidades e células alvo irradiadas (K562-CD19) foram adicionadas a uma relação efetor para alvo de 2,5:1 As células foram estimuladas na presença de ibru- tinibe 500 e 50 nM, colhidas a cada 3-4 dias, contadas e cultivadas para reestimulação com novas células alvo usando as mesmas condições de cultura e concentração adicionada de ibrutinibe após redefinir o número de células para a densidade de semeadura inicial para cada volta. Um total de 7 ciclos de estimulação durante um período de cultura de 25 dias foram realizadas.
[00614] Para cada ciclo de estimulação, a alteração do número de células (FIG. 4A) e o número de duplicações (FIG. 4B) foram determi- nados. Como mostrado nas FIG. 4A e FIG. 4B, a presença de ibrutinibe não impactou (por exemplo, não inibiu) o crescimento inicial de células T de CAR anti-CD19, conforme observado na alteração do número de células ou número de duplicações da população. Como mostrado na FIG. 4B, no dia 18 de estimulação, após várias ciclos de reestimulação, no entanto, observou-se que ibrutinibe em ambas as concentrações avaliadas levava a números de células aumentados e duplicações da população de células T de CAR anti-CD19 geradas por modificação de células T derivadas de dois dos três doadores avaliados.
As células derivadas desses dois doadores, geralmente, em comparação com as derivadas do outro doador, tiveram um desempenho pior no ensaio de reestimulação serial na ausência de ibrutinibe.
A FIG. 4C resume os re- sultados do número de células em cultura no dia 4 (1 ciclo ou reestimu- lação) e no dia 18 (5 ciclos de reestimulação) após a estimulação para os três doadores na presença de ibrutinibe.
Como mostrado, foi obser- vado um aumento estatisticamente significativo no número de células após 18 dias do ensaio de estimulação serial.
Em particular, após cinco ciclos de estimulação (dia 18), as células T de CAR do doador 2 tratadas com ibrutinibe nas concentrações mais altas tiveram contagens de célu- las significativamente (P < 0,05) aumentadas em relação às células de controle.
Contagens de células aumentadas não significativas também foram observadas para o doador 3 com tratamento com ibrutinibe na concentração mais alta testada.
Neste contexto, contagens de células aumentadas podem indicar capacidade proliferativa superior ou so- brevivência e não foram distinguidas.
Ao avaliar as contagens de células em condições de controle, as células derivadas dos doadores 2 e 3 ex- ibiram um desempenho menor do que às células do doador 1 neste ensaio.
Além disso, as células derivadas dos dois doadores em que es- sas diferenças foram observadas, geralmente, em comparação com as derivadas do outro doador, tiveram um desempenho menor do que no ensaio de reestimulação serial na ausência de ibrutinibe.
Notavelmente, esses doadores com desempenho menor do que se beneficiaram do tratamento com ibrutinibe neste ensaio.
Os resultados indicam que para as células T que estão prejudicadas em um ou mais fatores indicativos ou importantes para a sobrevivência e/ou capacidade proliferativa po- dem se beneficiar da combinação com um inibidor de quinase, por ex- emplo, Inibidor de quinase da família TEC ou inibidor de BTK/ITK, como ibrutinibe. Por exemplo, as combinações de tais células T com um inibi- dor da quinase, como ibrutinibe, podem melhorar a função das células T e/ou persistência após o encontro com o antígeno. E. Fenótipo TH1
[00615] Um ensaio foi realizado demonstrando a distorção de células T de CAR anti-CD19 em direção a um fenótipo TH1 quando cultivadas na presença de ibrutinibe. Foi observado que o ibrutinibe limita a ati- vação e proliferação de células T CD4 TH2 através da inibição de ITK (Honda, F., et al. (2012) Nat Immunol, 13 (4): 369-78). Um ensaio de reestimulação serial foi realizado conforme descrito acima e as células foram colhidas em vários momentos e analisadas por citometria de fluxo para avaliar a porcentagem de células T CD4+ CXCR3+ CRTH2-) ou fenótipo TH2 (avaliadas como CD4+CXCR3-CRTH2+). Os gráficos rep- resentativos para células cultivadas com e sem a concentração indicada de ibrutinibe, respectivamente, são mostrados na FIG. 5A, e a porcent- agem de células TH1 após a cultura ao longo da reestimulação serial e sob várias concentrações de ibrutinibe é mostrada nas FIG. 5B e FIG. 5C, respectivamente.
[00616] A presença de ibrutinibe neste ensaio foi observada para au- mentar a porcentagem de células T de CAR+ observadas para exibir um fenótipo TH1, após estimulação serial, e o efeito foi observado ser maior com o aumento das concentrações de ibrutinibe. Durante o período de estimulação serial de 18 dias, a porcentagem de células T de CAR TH1 aumentou a partir de células derivadas de cada um dos três doadores diferentes (FIG. 5B). ibrutinib 500 nM aumentou ainda mais a porcent- agem de células TH1 (P < 0,01) (FIG. 5C).
[00617] Nenhum efeito significativo de ibrutinibe na ativação adi- cional de T de CAR ou marcadores de memória foi observado em célu- las T de CAR isoladas do ensaio de estimulação serial (FIGS. 5D e 5E). F. Análise de expressão gênica
[00618] A expressão de vários genes foi avaliada em células T de CAR anti-CD19 cultivadas na presença ou ausência de ibrutinibe (50 nM ou 500 nM), durante a estimulação serial por 18 dias, conforme descrito acima. No dia 18 após a estimulação serial, o RNA foi isolado a partir de células T de CAR anti-CD19 e os testes do painel Nanostring Immune V2 foram executados em 594 genes. O log2 (mudança de duplicação) de cada gene foi plotado contra o –log10 (valor p bruto) derivado de testes ANOVA de gene de manutenção sem escala normalizado para contar dados para tratamento versus controle. Os resultados indicaram que o tratamento com ibrutinibe durante a reestimulação serial não al- terou significativamente a expressão gênica. Exemplo 2: Realce da Atividade Antitumoral de Células T que ex- pressam CAR na Presença de um Inibidor de Tirosina Quinase de Bruton
[00619] Um modelo de camundongo de xenoenxerto de tumor dis- seminado foi gerado pela injeção de camundongos NOD/Scid/gc-/- (NSG) com células de uma linhagem de tumor disseminada CD19+ Nalm-6, identificada como resistente à inibição de BTK.
[00620] No dia zero (0), camundongos NSG foram injetados por via intravenosa com 5 x 105 células Nalm-6 que expressam luciferase de vagalume. Começando no dia 4 e diariamente durante o estudo, os ca- mundongos foram tratados com controle de veículo ou foram tratados com ibrutinibe, em cada caso por gavagem oral diária (P.O.) a 25 mg/kg qd. Para permitir a avaliação do efeito de uma terapia de combinação com o inibidor, uma dose subideal de células T de CAR anti-CD19 de dois doadores diferentes (gerada por células de transdução derivadas de amostras de indivíduos doadores humanos essencialmente como descrito acima) foram injetados i.v. em cada camundongo a uma con- centração de 5x105 células T de CAR+ por camundongo no dia 5. Ca- mundongos nos grupos de controle foram administrados com o controle de veículo ou ibrutinibe, mas não administraram as células T de CAR. Oito (N = 8) camundongos por grupo foram monitorados.
[00621] Após o tratamento conforme descrito acima, o crescimento do tumor ao longo do tempo foi medido por imagem de bioluminescência e a radiação média (p/s/cm2/sr) foi medida. A sobrevivência dos ratos tratados também foi avaliada ao longo do tempo.
[00622] Os resultados são mostrados na FIG. 6A para o crescimento do tumor ao longo do tempo de camundongos tratados com ibrutinibe e células T de CAR. A análise dos resultados do mesmo estudo que mon- itora o crescimento do tumor em pontos de tempo maiores após a in- jeção do tumor de dois doadores diferentes é mostrada na FIG. 6B. Como mostrado, o tratamento com ibrutinibe sozinho não teve efeito so- bre a carga tumoral neste modelo resistente ao ibrutinibe em com- paração com o tratamento com veículo. Em contraste, os camundongos administrados com células T de CAR e ibrutinibe exibiram um cresci- mento tumoral significativamente diminuído em comparação com ca- mundongos tratados com células T de CAR e controle de veículo (p < 0,001, ***; p < 0,0001. ***).
[00623] A combinação de T de CAR e ibrutinibe aumentou a so- brevivência de camundongos com tumor, conforme mostrado pelas cur- vas de Kaplan Meier que mostram a sobrevivência de camundongos com tumor tratados com ibrutinbe e células T de CAR. Como mostrado na FIG. 6C, resultados representativos mostraram que camundongos tratados com células T de CAR e ibrutinibe exibiram uma sobrevida mé- dia aumentada em comparação com o grupo que recebeu a dose su- bideal de células T de CAR anti-CD19 + veículo. Efeitos semelhantes foram observados em estudos replicados usando células T de CAR anti- CD19 produzidas por transdução de células T isoladas do sangue de outros indivíduos doadores. A análise dos resultados do mesmo estudo que monitora a sobrevivência em pontos de tempo maiores após a in- jeção do tumor de dois doadores diferentes é mostrada na FIG. 6D, que mostrou que a administração combinada de T de CAR e ibrutinibe tam- bém resultou em aumento significativo da sobrevida em comparação com T de CAR e condição do veículo (p < 0,001, ***). Exemplo 3: Avaliação do Fenótipo, Função e Atividade Antitumoral de Células T que expressam CAR In Vivo na Presença de um Inibi- dor de uma Quinase da Família TEC
[00624] Camundongos NSG descritos no Exemplo 2 foram injetados por via intravenosa no dia 0 com 5 x 105 células Nalm-6 que expressam luciferase de vagalume. Começando no dia 4 e diariamente durante o estudo, os camundongos foram tratados com um controle de veículo ou foram tratados diariamente com ibrutinibe em água potável (D.W.) a 25 mg/kg/dia. Um experimento de ligação confirmou que a administração de ibrutinibe na água de beber era equivalente à administração por ga- vagem oral (dados não mostrados). Para permitir a avaliação do efeito de uma terapia de combinação com o inibidor, uma dose subideal de células T de CAR anti-CD19 foi injetada i.v. nos camundongos a 5x105/camundongo no dia 5. Como um controle, os camundongos foram administrados com o veículo de controle sem administração das células T de CAR ou inibidor.
[00625] Após o tratamento conforme descrito acima, o crescimento do tumor e a porcentagem de sobrevivência dos camundongos tratados foram determinados. Como mostrado na FIG. 7A, os camundongos trat- ados com células T de CAR anti-CD19 e ibrutinibe exibiram uma so- brevida média aumentada em comparação com o grupo que recebeu a dose subideal de células T de CAR anti-CD19 + veículo (p < 0,001). ibrutinib administrado em combinação com CAR T, também diminuiu significativamente (P < 0,001) o crescimento do tumor (FIG. 7B) em comparação com o T de CAR administrado com veículo sozinho. Os resultados foram semelhantes usando células T de CAR anti-CD19 geradas por modificação de células T derivadas de dois doadores diferentes.
[00626] A análise farmacocinética de células T de CAR+ foi analisada no sangue, medula óssea e baço de camundongos que receberam célu- las T de CAR+ anti-CD19 de uma célula derivada de um doador e que foram tratados com veículo ou ibrutinibe (3 camundongos por grupo) . As amostras foram analisadas para avaliar a presença e os níveis de células T de CAR (com base na expressão do marcador substituto usando um anticorpo anti-EGFR) e/ou células tumorais nos dias 7, 12, 19 e 26 após a transferência de células T de CAR+. Como mostrado na FIG.7C, um aumento significativo nas células T de CAR+ circulantes foi observado em camundongos tratados com ibrutinibe em comparação com aqueles tratados com células T de CAR+ e veículo, consistente com uma maior expansão de células T de T de CAR no sangue na presença de ibrutinibe. No dia 19 após a transferência de células T de CAR, um aumento significativo no número de células no sangue foi ob- servado após o tratamento com ibrutinbe (FIG. 7D: * p < 0,05). Como mostrado na FIG. 7E, significativamente menos células tumorais foram detectadas no sangue, medula óssea ou baço em camundongos nos quais o tratamento com células de CAR+ foi combinado com tratamento com ibrutinibe, em comparação com o veículo sozinho.
[00627] A imunofenotipagem ex vivo também foi realizada no sangue, medula óssea e células do baço colhidas no dia 12 após a ad- ministração de T de CAR de camundongos que receberam células T de CAR+ e que foram tratados com veículo ou ibrutinibe (n = 3 camundon- gos por grupo) As células foram avaliadas quanto aos marcadores de superfície CD44, CD45RA, CD62L, CD154, CXCR3, CXCR4 e PD-1 por citometria de fluxo e a análise dimensional de alta dimensão estocástica distribuída em T (t-SNE) foi realizada usando o software FlowJo. Como mostrado na FIG. 8A, alterações fenotípicas foram observadas em célu- las T de CAR+ isoladas da medula óssea de animais que receberam células T de CAR em combinação com ibrutinibe, em comparação com o vetor sozinho (controle). Usando citometrianálise de fluxo t-SNE mul- tivariada com base na análise agrupada de três camundongos por grupo, 4 grupos populacionais distintos foram identificados (FIG. 8B). Citometria de fluxo - histogramas mostrando os perfis de expressão in- dividuais de CD4, CD8, CD62L, CD45RA, CD44 e CXCR3 dos 4 t-SNE fechados na FIG. 8B sobreposto na expressão da população total (som- breado) é mostrado na FIG. 8C.
[00628] A porcentagem e a alteração de vezes de cada população de t-SNE em camundongos de controle ou camundongos tratados com ibrutinibe é mostrada na FIG. 8D. As diferenças estatisticamente signif- icativas são indicadas como P < 0,95 (*), P < 0,01 (**), P < 0,001 (***), P < 0,0001 (****).
[00629] Um aumento em CD8+ CD44hi CXCR3hi CD45RAlo CD62Lhi (população 2) e CD4+ CD44hi CXCR3int CD45RAhi CD62Lhi (população 4) foi observado na medula óssea de camundongos tratados com T de CAR também administrados ibrutinibe em comparação com camundon- gos de controle, no dia 12 após transferência de T de CAR (FIGS. 8A- 8C). Um maior aumento da população 4 foi observado em animais trat- ados com ibrutinibe (15,2 % em comparação com 4,4 % das células T de CAR) (FIG. 8C). Exemplo 4: Inibidor de tirosina quinase de Bruton (BTK) Realça a Função Citolítica de células T que expressam CAR fabricadas a partir de pacientes com Linfoma Difuso de Grandes Células B (DLBCL)
[00630] Células T de CAR anti-CD19 foram geradas substancial- mente como descrito no Exemplo 1, a não ser que as células T tenham sido isoladas de dois indivíduos humanos diferentes com linfoma difuso de grandes células B (DLBCL). As células foram submetidas à reestimu- lação serial, conforme descrito no Exemplo 1.D, por cocultura de células T de CAR com células alvo K562-CD19 em uma relação efetor para alvo de 2,5:1 na presença de ibrutinibe 500 e 50 nM, colhendo células a cada 3-4 dias e reestimulando nas mesmas condições após redefinir o número de células. As células foram submetidas à reestimulação serial ao longo de um período de cultura de 21 dias e monitoradas quanto à expansão celular e atividade citotóxica. Como mostrado na FIG. 9A, a expansão celular, conforme determinado pelo número de duplicações celulares, foi observada durante o período de cultura de 21 dias para células derivadas de cada indivíduo individual. ibrutinib não inibiu a pro- liferação de células T de CAR derivadas de qualquer paciente (FIG. 9A), uma observação consistente com dados anteriores de células T de CAR derivadas de doadores saudáveis. Como mostrado na FIG. 9B, as célu- las T de CAR fabricadas a partir de células derivadas de cada indivíduo individual demonstraram um aumento na função citolítica na presença de ibrutinibe 500 nM após 16 dias de estimulação serial (FIG. 9B). Em células derivadas de um paciente, um aumento na atividade citolítica após 16 dias de estimulação serial foi observado com ibrutinibe 50 nM (P < 0,01) (FIG. 9B). Este aumento na atividade citolítica é consistente com os resultados de células de doadores saudáveis (FIGS. 1C-1D). Exemplo 5: Avaliação da Assinatura Molecular por RNA-Seq de células T que expressam CAR Tratadas com ibrutinib
[00631] O RNA foi isolado de células individuais que expressam CAR, derivadas de três doadores diferentes, que foram tratados por 18 dias em um ensaio de estimulação serial na presença de ibrutinibe (50nM, 500nM) ou controle (0 nM). O isolamento do RNA foi realizado usando o RNEasy Micro Kit (Qiagen). As amostras foram sequenciadas e as leituras RNASeq foram mapeadas para o genoma humano
(GRCh38) e alinhadas com o modelo de gene de liberação 24 de GEN- CODE. As métricas de qualidade RNAseq foram geradas e avaliadas para confirmar a consistência entre as amostras. Genes expressos diferencialmente foram identificados impondo um corte de mudança de duplicação de log2 de 0,5 e um corte de taxa de descoberta falsa ajus- tada de Benjamini-Hochberg (FDR) de 0,05.
[00632] Conforme mostrado no gráfico de Volcano na FIG. 10A, ib- rutinibe 500 nM significativamente (FDR < 0,05, absLog2FC> 0,5) al- terou a expressão de 23 genes codificadores de proteínas. A FIG. 10B mostra um mapa de calor de alterações de expressão gênica para os 23 genes identificados na FIG. 10A. Embora não seja significativo, tendências semelhantes foram observadas com 50 nM (FIGS. 10C e 10D). Os gráficos de caixa de expressão gênica para genes exemplares após o tratamento das diferentes concentrações de inibidor (50 nM ou 500 nM) ou controle são mostrados nas FIGS. 11A-11E, entre os genes expressos diferencialmente, diminuições em genes, tais como granzima A (FIG. 11A) e CD38 (FIG. 11C), e aumentos em SELL/CD62L (FIG. 11A) são consistentes com um efeito de ibrutinibe para amortecer genes semelhantes a efetores terminais, ao mesmo tempo em que aumentam os genes associados ao desenvolvimento da memória. Além disso, o RNA-Seq revelou que os genes associados à promoção da diferen- ciação de TH1 foram alterados pelo ibrutinibe, incluindo a suprarregu- lação de MSC, conhecida por suprimir a programação de TH2 (Wu, C., et al. (2017) Nat Immunol, 18 (3): 344- 353), e regulação negativa de HES6, HIC1, LZTFL1, NRIP1, CD38 e RARRES3, associada com a via de sinalização ATRA/ácido retinóico identificada para inibir o desenvol- vimento de TH1 (Britschgi, C., et al. (2008) Br J Haematol, 141 (2):179- 87; Jiang, H., et al. (2016) J Immunol, 196 (3):1081-90; Heim, KC, et al. (2007) Mol Cancer, 6: 57; Nijhof, IS, et al. (2015) Leukemia, 29 (10): 2039-49; Zirn, B., et al. (2005) Oncogene, 24 (33): 5246-51) (FIGS. 11E,
11B e 11D). Em apoio aos resultados de RNA-Seq, um aumento signif- icativo na expressão de CD62L foi observado por citometria de fluxo após 18 dias de estimulação serial nos doadores 2 e 3 (FIGS. 12A e 12B). Tomados em conjunto, esses resultados apóiam que o tratamento com ibrutinibe a longo prazo pode resultar em um aumento de TH1 e fenótipo semelhante à memória na T de CAR. Exemplo 6: Administração de células que expressam CAR anti- CD19 em combinação com o Composto 1 a indivíduos com Linfoma Não-Hodgkin Recidivante e Refratário (NHL)
[00633] Composições de células T que expressam CAR anti-CD19 são produzidas substancialmente como descrito no Exemplo 1, e com- posições de células T que expressam CAR CD4+ geradas e com- posições de células T que expressam CAR CD8+ são administradas separadamente a indivíduos com linfoma não Hodgkin de células B (NHL) recidivo/refratário (R/R) em combinação com administração com ibrutinibe (tendo a estrutura: ). Os grupos de indivíduos selecionados para o tratamento incluem indivíduos com linfoma difuso de grandes células B (DLBCL); de novo ou transformado de linfoma in- dolente (NOS); linfoma de células B de alto grau, com rearranjos MYC e BCL2 e/ou BCL6 com histologia de DLBCL (linfoma de duplo/triplo hit); linfoma folicular grau 3b (FLG3B); linfoma de grandes células B rico em células T/histiócitos; DLBCL, NOS positivo para EBV; e linfoma de célu- las B grandes do mediastino primário (tímico) (PMBCL). Os indivíduos tratados também incluem aqueles que tiveram recidiva após ou são re- fratários a pelo menos duas linhas de terapia anteriores, incluindo um agente direcionado a CD20 e uma antraciclina, e têm uma pontuação do Eastern Cooperative Oncology Group (ECOG) menor ou igual a 1 na triagem.
[00634] Para gerar células T que expressam CAR, as amostras com- preendendo células do sangue circulante de um indivíduo humano são obtidas por aférese ou leucaferese, e as células T são isoladas por en- riquecimento baseado em imunoafinidade. As células são obtidas em 28 dias (± 7 dias) antes da infusão de células T de CAR+. As células isoladas são ativadas e transduzidas com um vetor viral que codifica um CAR anti-CD19.
[00635] Antes da infusão de células T de CAR+, os indivíduos rece- bem uma quimioterapia de linfodepleção com fludarabina (gripe, 30 mg/m2/dia) e ciclofosfamida (Cy, 300 mg/m2/dia) por três (3) dias.
[00636] O ibrutinibe é administrado por via oral a indivíduos começando 7 dias antes da aférese ou leucaferese (35 dias (± 7 dias) antes da infusão de células T de CAR+), diariamente, na dose de 140 mg, 280 mg, 420 mg ou 560 mg/dia, até o início da quimioterapia de linfodepleção. Durante o tempo em que o indivíduo recebe a quimioter- apia de linfodepleção, o ibrutinibe não é administrado. A administração de ibrutinibe é retomada após a conclusão da quimioterapia de linfo- depleção.
[00637] Os indivíduos recebem células T que expressam CAR de 2 a 7 dias após a linfodepleção. Os indivíduos são administrados com uma dose única de 1 x 108 células T que expressam CAR (cada dose única por meio de infusões separadas a uma proporção de 1:1 de células T que expressam CAR CD4+ e células T que expressam CAR CD8+, re- spectivamente). A administração de ibrutinibe é continuada, após a con- clusão da quimioterapia de linfodepleção e a infusão de células que ex- pressam CAR modificadas.
[00638] A resposta ao tratamento é avaliada com base na avaliação radiográfica do tumor por tomografia por emissão de pósitrons (PET) e/ou tomografia computadorizada (TC) ou ressonância magnética (MRI) na consulta inicial antes do tratamento e em vários momentos após o tratamento (por exemplo, com base sobre a classificação de Lugano, veja, por exemplo, Cheson et al., (2014) JCO 32 (27): 3059-3067). A presença ou ausência de eventos adversos emergentes do tratamento (TEAE) após o tratamento também é avaliada. Os indivíduos também são avaliados e monitorados quanto à neurotoxicidade (complicações neurológicas, incluindo sintomas de confusão, afasia, encefalopatia, ataques de mioclonia, convulsões, letargia e/ou estado mental alterado), graduada em uma escala de 1-5, de acordo com o National Cancer In- stitute - Escala de Common Toxicity Criteria (CTCAE), versão 4.03 (NCI- CTCAE v4.03). Escala de Common Toxicity Criteria (CTCAE), versão
4.03 (NCI-CTCAE v4.03). Veja, Common Terminology for Adverse Events (CTCAE) Versão 4, U.S. Department of Health and Human Ser- vices, Publicado: 28 de Maio, 2009 (v4.03: 14 de Junho, 2010); e Guido Cavaletti & Paola Marmiroli Nature Reviews Neurology 6, 657-666 (Dezembro de 2010). A síndrome de liberação de citocinas (SRC) tam- bém é determinada e monitorada, graduada com base na gravidade. Veja, Lee et al, Blood. 2014; 124 (2):188-95. Os indivíduos também são avaliados quanto à farmacocinética (PK) de células T de CAR+ anti- CD19 pré e pós-tratamento com ibrutinibe e para os parâmetros PK e farmacodinâmicos (DP) do ibrutinibe.
[00639] A dosagem de ibrutinibe é interrompida após o dia 180 (6 meses após a infusão de células T de CAR+), a menos que o indivíduo atinja uma resposta parcial (RP), caso em que a administração adicional de ibrutinibe pode continuar até a progressão da doença.
[00640] A presente invenção não se destina a ser limitada em escopo às modalidades particulares descritas, que são fornecidas, por exemplo, para ilustrar vários aspectos da invenção. Várias modificações nas com- posições e métodos descritos se tornarão aparentes a partir da de- scrição e dos ensinamentos aqui. Tais variações podem ser praticadas sem se afastar do verdadeiro escopo e espírito da invenção e se des- tinam a se incluir no escopo da presente invenção. Sequências # SEQUÊNCIA ANOTAÇÃO 1 ESKYGPPCPPCP espaçador (articulação de IgG4) (aa) 2 GAATCTAAGTACGGACCGCCCTGCCCCCCTTGCCCT espaçador (articulação de IgG4) (nt) 3 ESKYGPPCPPCPGQPREPQVYTLPPSQEEMTKNQVSLTCLVKGFYPSDIAVEWESNGQPEN- Articulação-espaçador NYKTTPPVLDSDGSFFLYSRLTVDKSRWQEGNVFSCSVMHEALHNHYTQKSLSLSLGK de CH3 4 ESKYGPPCPPCPAPEFLGGPSVFLFPPKPKDTLMISRTPEVTCVVVDVSQEDPEVQFNWY- Articulação-CH2-espa- VDGVEVHNAKTKPREEQFNSTYRVVSVLTVLHQDWLNGKEYKCKVSNKGLPSSIEKTISKAKGQPRE çador de CH3 PQVYTLPPSQEEMTKNQVSLTCLVKGFYPSDIAVEWESNGQPENNYKTTPPVLDSDGS-
FFLYSRLTVDKSRWQEGNVFSCSVMHEALHNHYTQKSLSLSLGK 5 RWPESPKAQASSVPTAQPQAEGSLAKATTAPATTRNTGRGGEEKKKEKE- IgD-articulação-Fc
KEEQEERETKTPECPSHTQPLGVYLLTPAVQDLWLRDKATFTCFVVGSDLKDAHLTWEVAGKVPTG GVEEGLLERHSNGSQSQHSRLTLPRSLWNAGTSVTCT- LNHPSLPPQRLMALREPAAQAPVKLSLNLLASSDPPEAASWLLCEVSGFSPPNILLMWLEDQREVNT
SGFAPARPPPQPGSTTFWAWSVLRVPAPPSPQPATYTCVVSHEDSRTLLNASRSLEVSYVTDH 6 LEGGGEGRGSLLTCGDVEENPGPR T2A 7 MLLLVTSLLLCELPHPAFLLIPRKVCNGIGIGEFKDSLSINATNIKHFKNCTSISGDLHIL- tEGFR
PVAFRGDSFTHTPPLDPQELDILKTVKEITGFLLIQAWPENRTDLHAFENLEIIRGRTKQHGQFSLAVV SLNITSLGLRSLKEISDGDVIISGNKNLCYANTINWKKLFGTSGQKTKIISNRGENSCK- ATGQVCHALCSPEGCWGPEPRDCVSCRNVSRGRECVDKCNLLEGEPREFVENSECIQCHPECLPQ AMNITCTGRGPDNCIQCAHY- IDGPHCVKTCPAGVMGENNTLVWKYADAGHVCHLCHPNCTYGCTGPGLEGCPTNGPKIPSIATGMV
GALLLLLVVALGIGLFM 8 FWVLVVVGGVLACYSLLVTVAFIIFWV CD28 (aminoácidos 153- 179 de No. de Acesso P10747) 9 IEVMYPPPYLDNEKSNGTIIHVKGKHLCPSPLFPGPSKP FWVLVVVGGVLACYSLLVTVAFIIFWV CD28 (aminoácidos 114- 179 de No. de Acesso P10747) 10 RSKRSRLLHSDYMNMTPRRPGPTRKHYQPYAPPRDFAAYRS CD28 (aminoácidos 180- 220 de P10747) 11 RSKRSRGGHSDYMNMTPRRPGPTRKHYQPYAPPRDFAAYRS CD28 (LL a GG) 12 KRGRKKLLYIFKQPFMRPVQTTQEEDGCSCRFPEEEEGGCEL 4-1BB (aminoácidos 214-255 de Q07011.1) 13 RVKFSRSADAPAYQQGQNQLYNELNLGRREEYDVLDKRRGRDPEMGGKPRRKNPQEGLYNEL- CD3 zeta
QKDKMAEAYSEIGMKGERRRGKGHDGLYQGLSTATKDTYDALHMQALPPR 14 RVKFSRSAEPPAYQQGQNQLYNELNLGRREEYDVLDKRRGRDPEMGGKPRRKNPQEGLYNEL- CD3 zeta
QKDKMAEAYSEIGMKGERRRGKGHDGLYQGLSTATKDTYDALHMQALPPR 15 RVKFSRSADAPAYKQGQNQLYNELNLGRREEYDVLDKRRGRDPEMGGKPRRKNPQEGLYNEL- CD3 zeta
QKDKMAEAYSEIGMKGERRRGKGHDGLYQGLSTATKDTYDALHMQALPPR 16 RKVCNGIGIGEFKDSLSINATNIKHFKNCTSISGDLHILPVAFRGDSFTHTPPLDPQELD- tEGFR
ILKTVKEITGFLLIQAWPENRTDLHAFENLEIIRGRTKQHGQFSLAVVSLNITSLGLRSLKEISDGDVIISG NKNLCYANTINWKKLFGTSGQKTKIISNRGENSCK- ATGQVCHALCSPEGCWGPEPRDCVSCRNVSRGRECVDKCNLLEGEPREFVENSECIQCHPECLPQ AMNITCTGRGPDNCIQCAHY- IDGPHCVKTCPAGVMGENNTLVWKYADAGHVCHLCHPNCTYGCTGPGLEGCPTNGPKIPSIATGMV
GALLLLLVVALGIGLFM 17 EGRGSLLTCGDVEENPGP T2A 18 GSGATNFSLLKQAGDVEENPGP P2A 19 ATNFSLLKQAGDVEENPGP P2A 20 QCTNYALLKLAGDVESNPGP E2A 21 VKQTLNFDLLKLAGDVESNPGP F2A 22 -PGGG-(SGGGG)5-P- em que P é prolina, G é glicina e S é serina Ligante 23 GSADDAKKDAAKKDGKS Ligante 24 atgcttctcctggtgacaagccttctgctctgtgagttaccacacccagcattcctcctgatccca sequência de sinal de cadeia alfa GMCSFR 25 MLLLVTSLLLCELPHPAFLLIP sequência de sinal de
# SEQUÊNCIA ANOTAÇÃO cadeia alfa GMCSFR 26 MALPVTALLLPLALLLHA peptídeo de sinal de CD8 alfa 27 Glu Pro Lys Ser Cys Asp Lys Thr His Thr Cys Pro Pro Cys Pro Articulação 28 Glu Arg Lys Cys Cys Val Glu Cys Pro Pro Cys Pro Articulação 29 ELKTPLGDTHTCPRCPEPKSCDTPPPCPRCPEPKSCDTPPPCPRCPEPKSCDTPPPCPRCP Articulação 30 Glu Ser Lys Tyr Gly Pro Pro Cys Pro Ser Cys Pro Articulação 31 Glu Ser Lys Tyr Gly Pro Pro Cys Pro Pro Cys Pro Articulação 32 Tyr Gly Pro Pro Cys Pro Pro Cys Pro Articulação 33 Lys Tyr Gly Pro Pro Cys Pro Pro Cys Pro Articulação 34 Glu Val Val Val Lys Tyr Gly Pro Pro Cys Pro Pro Cys Pro Articulação 35 RASQDISKYLN CDR L1 36 SRLHSGV CDR L2 37 GNTLPYTFG CDR L3 38 DYGVS CDR H1 39 VIWGSETTYYNSALKS CDR H2 40 YAMDYWG CDR H3 41 EVKLQESGPGLVAPSQSLSVTCTVSGVSLPDYGVSWIRQPPRKGLEWLGVIWGSET- VH
TYYNSALKSRLTIIKDNSKSQVFLKMNSLQTDDTAIYYCAKHYYYGGSYAMDYWGQGTSVTVSS 42 DIQMTQTTSSLSASLGDRVTISCRASQDISKYLNWYQQKPDGTVKLLI- VL
YHTSRLHSGVPSRFSGSGSGTDYSLTISNLEQEDIATYFCQQGNTLPYTFGGGTKLEIT 43 DIQMTQTTSSLSASLGDRVTISCRASQDISKYLNWYQQKPDGTVKLLI- scFv
YHTSRLHSGVPSRFSGSGSGTDYSLTISNLEQEDIATYFCQQGNTLPYTFGGGTKLEITGSTSGSGKP GSGEGSTKGEVKLQESGPGLVAPSQSLSVTCTVSGVSLPDYGVSWIRQP- PRKGLEWLGVIWGSETTYYNSALKSRLTIIKDNSKSQVFLKMNSLQTDDTAIYYCAKHYYYGGSYAM
DYWGQGTSVTVSS 44 KASQNVGTNVA CDR L1 45 SATYRNS CDR L2 46 QQYNRYPYT CDR L3 47 SYWMN CDR H1 48 QIYPGDGDTNYNGKFKG CDR H2 49 KTISSVVDFYFDY CDR H3 50 EVKLQQSGAELVRPGSSVKISCK- VH
ASGYAFSSYWMNWVKQRPGQGLEWIGQIYPGDGDTNYNGKFKGQATLTADKSSSTAYMQLSGLTS
EDSAVYFCARKTISSVVDFYFDYWGQGTTVTVSS 51 DIELTQSPKFMSTSVGDRVSVTCKASQNVGTNVAWYQQKPGQSPKPLIYSATYRNSGVP- VL
DRFTGSGSGTDFTLTITNVQSKDLADYFCQQYNRYPYTSGGGTKLEIKR 52 GGGGSGGGGSGGGGS Ligante 53 EVKLQQSGAELVRPGSSVKISCK- scFv
ASGYAFSSYWMNWVKQRPGQGLEWIGQIYPGDGDTNYNGKFKGQATLTADKSSSTAYMQLSGLTS EDSAVYFCARKTISSVVDFYFDYWGQGTTVTVSSGGGGSGGGGSGGGGSDIELTQSPKFM- STSVGDRVSVTCKASQNVGTNVAWYQQKPGQSPKPLIYSATYRNSGVPDRFTGSGSGTDFTLTITN
VQSKDLADYFCQQYNRYPYTSGGGTKLEIKR 54 HYYYGGSYAMDY HC-CDR3 55 HTSRLHS LC-CDR2 56 QQGNTLPYT LC-CDR3 57 gacatccagatgacccagaccacctccagcctgagcgccagcctgggcgaccgggtgac- Sequência que codifica catcagctgccgggccagccaggacatcagcaagtacctgaactggtatcagcagaagcccgacggcaccgtcaagctgctgatctacca scFv caccagccggctgcacagcggcgtgcccagccggtttagcggcagcggctccggcaccgac- tacagcctgaccatctccaacctggaacaggaagatatcgccacctacttttgccagcagggcaacacactgccctacacctttggcggcgg aacaaagctggaaatcaccggcagcacctccggcagcggcaagcctggcagcggcgaggg- cagcaccaagggcgaggtgaagctgcaggaaagcggccctggcctggtggcccccagccagagcctgagcgtgacctgcaccgtgagc ggcgtgagcctgcccgactacggcgtgagctggatccggcagccccccaggaagggcctg- gaatggctgggcgtgatctggggcagcgagaccacctactacaacagcgccctgaagagccggctgaccatcatcaaggacaacagcaa gagccaggtgttcctgaagatgaacagcctgcagaccgacgacac- cgccatctactactgcgccaagcactactactacggcggcagctacgccatggactactggggccagggcaccagcgtgaccgtgagcag c 58 X1PPX2P Articulação X1 é glicina, cisteina ou arginina X2 é cisteina ou treonina 59 GSTSGSGKPGSGEGSTKG Ligante

Claims (113)

REIVINDICAÇÕES
1. Método de tratamento, caracterizado pelo fato de que compreende: (1) administrar a um indivíduo tendo um câncer, uma quantidade eficaz de um inibidor de quinase que é ou compreende a estrutura , ou um sal farmaceuticamente aceitável do mesmo; e (2) administrar uma terapia de célula T autóloga ao in- divíduo, a referida terapia de célula T que compreende uma dose de células T geneticamente modificadas expressando um receptor de antí- geno quimérico (CAR) que especificamente se liga a um CD19, em que, antes de administrar a terapia de célula T, uma amostra biológica foi obtida do indivíduo e processada, o processamento compreendendo ge- neticamente modificar células T da amostra, opcionalmente introdu- zindo uma molécula de ácido nucleico codificando o CAR nas referidas células T, em que a administração do inibidor de quinase é ini- ciada em pelo menos ou cerca de 3 dias antes de obter a amostra e é realizada em um regime de dosagem compreendendo administrações repetidas do inibidor de quinase em um intervalo de dosagem, durante um período de tempo que se estende pelo menos para incluir a admi- nistração em ou após o dia no qual a amostra é obtida do indivíduo.
2. Método de tratamento, caracterizado pelo fato de que compreende: (1) administrar a um indivíduo tendo um câncer, uma quantidade eficaz de um inibidor de quinase que é ou compreende a estrutura
, ou um sal farmaceuticamente aceitável do mesmo; (2) obter do indivíduo uma amostra biológica e proces- sar células T da referida amostra, desse modo gerando uma composi- ção compreendendo células T geneticamente modificadas que expres- sam um receptor de antígeno quimérico (CAR) que especificamente se liga a um CD19; e (3) administrar ao indivíduo uma terapia de célula T au- tóloga que compreende uma dose das células T geneticamente modifi- cadas, em que a administração do inibidor de quinase é reali- zada em um regime de dosagem que é iniciado em pelo menos ou cerca de 3 dias antes de obter a amostra e que compreende administrações repetidas do inibidor, em um intervalo de dosagem, durante um período de tempo e se estende pelo menos para incluir a administração do com- posto em ou após o dia no qual a amostra é obtida do indivíduo.
3. Método de tratamento, caracterizado pelo fato de que compreende administrar a um indivíduo tendo um câncer, uma quanti- dade eficaz de um inibidor de quinase que possui a estrutura , ou um sal farmaceuticamente aceitável do mesmo, em que o indivíduo é um candidato para tratamento ou deve ser tratado com uma terapia de célula T autóloga, a referida terapia de célula T que compreende uma dose de células T geneticamente modificadas expres- sando um receptor de antígeno quimérico (CAR) que especificamente se liga a um CD19, em que: antes de administrar a terapia de célula T uma amostra biológica foi obtida do indivíduo e processada, o processamento com- preendendo geneticamente modificar células T da amostra, opcional- mente introduzindo uma molécula de ácido nucleico codificando o CAR nas referidas células T; e a administração do inibidor de quinase é iniciada em pelo menos ou cerca de 3 dias antes de obter a amostra e é realizada em um regime de dosagem compreendendo administrações repetidas do inibidor em um intervalo de dosagem durante um período de tempo que se estende pelo menos para incluir a administração em ou após o dia no qual a amostra do indivíduo.
4. Método de acordo com a reivindicação 3, caracterizado pelo fato de que também compreende administrar ao indivíduo a terapia de célula T.
5. Método de acordo com qualquer uma das reivindicações 1, 2 e 4, caracterizado pelo fato de que, subsequente ao início da admi- nistração do inibidor de quinase e antes da administração da terapia de célula T, o indivíduo foi precondicionado com uma terapia de linfodeple- ção.
6. Método de acordo com qualquer uma das reivindicações 1, 2 e 4, caracterizado pelo fato de que também compreende, subse- quente ao início da administração do inibidor de quinase e antes da ad- ministração da terapia de célula T, administrar uma terapia de linfode- pleção ao indivíduo.
7. Método de acordo com a reivindicação 5 ou 6, caracteri- zado pelo fato de que a administração do inibidor de quinase é descon- tinuada ou interrompida durante a terapia de linfodepleção.
8. Método de acordo com qualquer uma das reivindicações 5 a 7, caracterizado pelo fato de que o regime de dosagem compreende a administração do inibidor de quinase durante um período de tempo que se estende pelo menos para incluir administração até o início da terapia de linfodepleção.
9. Método de acordo com qualquer uma das reivindicações 5 a 7, caracterizado pelo fato de que o regime de dosagem compreende a administração do inibidor de quinase durante um período de tempo que inclui a administração até o início da terapia de linfodepleção, se- guida por descontinuação ou interrompimento da administração do ini- bidor de quinase durante a terapia de linfodepleção e em seguida admi- nistração adicional do inibidor de quinase durante um período que se estende durante pelo menos 15 dias após início de administração da terapia de célula T.
10. Método de tratamento, caracterizado pelo fato de que compreende: (1) administrar a um indivíduo tendo um câncer, uma quantidade eficaz de um inibidor de quinase que possui a estrutura , ou um sal farmaceuticamente aceitável do mesmo; (2) administrar uma terapia de linfodepleção ao indiví- duo; e (3) administrar uma terapia de célula T autóloga ao in- divíduo, a referida terapia de célula T que compreende uma dose de células T geneticamente modificadas expressando um receptor de antí- geno quimérico (CAR) que especificamente se liga a um CD19, em que, antes de administrar a terapia de célula T compreendendo amostra bio- lógica obtida do indivíduo e processada, o processamento compreende geneticamente modificar células T da amostra, opcionalmente introdu- zindo uma molécula de ácido nucleico codificando o CAR nas referidas células T,
em que a administração do inibidor de quinase é inici- ada em pelo menos ou cerca de 3 dias antes da obtenção da amostra e é realizada em um regime de dosagem compreendendo administração repetida do inibidor de quinase em um intervalo de dosagem durante um período de tempo que inclui a administração até o início da terapia de linfodepleção, seguida por descontinuação ou interrompimento da ad- ministração do inibidor de quinase durante a terapia de linfodepleção, e em seguida administração adicional do inibidor de quinase durante um período que se estende durante pelo menos 15 dias após início de ad- ministração da terapia de célula T.
11. Método de acordo com a reivindicação 10, caracterizado pelo fato de que o método também compreende obter do indivíduo a amostra biológica e processar células T da referida amostra, desse modo gerando uma composição compreendendo as células T genetica- mente modificadas que expressam o receptor de antígeno quimérico (CAR) que especificamente se liga a um CD19.
12. Método de acordo com qualquer uma das reivindicações 1 a 11, caracterizado pelo fato de que a administração do inibidor de quinase é iniciada em pelo menos ou cerca de 4 dias, pelo menos em ou cerca de 5 dias, pelo menos em ou cerca de 6 dias, pelo menos em ou cerca de 7 dias, pelo menos em ou cerca de 14 dias ou mais antes da obtenção da amostra do indivíduo.
13. Método de acordo com qualquer uma das reivindicações 1 a 12, caracterizado pelo fato de que a administração do inibidor de quinase é iniciada pelo menos ou em ou cerca de 5 dias a 7 dias antes da obtenção da amostra do indivíduo.
14. Método de acordo com qualquer uma das reivindicações 5 a 13, caracterizado pelo fato de que a administração da terapia de linfodepleção é concluída dentro de 7 dias antes do início da adminis- tração da terapia de célula T.
15. Método de acordo com qualquer uma das reivindicações 5 a 14, caracterizado pelo fato de que a administração da terapia de linfodepeção é concluída 2 a 7 dias antes do início da administração da terapia de célula T.
16. Método de acordo com qualquer uma das reivindicações 9 a 15, caracterizado pelo fato de que a administração adicional é du- rante um período que se estende durante 15 dias a 29 dias após início de administração da terapia de célula T.
17. Método de acordo com qualquer uma das reivindicações 9 a 16, caracterizado pelo fato de que a administração adicional do ini- bidor de quinase é durante um período que se estende a, ou cerca de, ou mais que três meses após início de administração da terapia de cé- lula T.
18. Método de acordo com qualquer uma das reivindicações 1 a 17, caracterizado pelo fato de que a administração do inibidor de quinase é realizada uma vez por dia em cada dia que ela é administrada durante o regime de dosagem.
19. Método de acordo com qualquer uma das reivindicações 1 a 18, caracterizado pelo fato de que a quantidade eficaz é composta de, ou de cerca de 140 mg a ou a cerca de 840 mg ou de ou de cerca de 140 mg a, ou a cerca de, 560 mg por cada dia que o inibidor de quinase é administrado.
20. Método de tratamento, o método caracterizado pelo fato de que compreende: (1) administrar a um indivíduo portador de um câncer um inibidor de quinase, em que o inibidor de quinase é ou compreende a estrutura , ou é um sal farmaceuticamente aceitável do mesmo;
e (2) administrar uma terapia de célula T autóloga ao in- divíduo, a referida terapia de célula T que compreende uma dose de células T geneticamente modificadas expressando um receptor de antí- geno quimérico (CAR) que especificamente se liga a um CD19, em que, antes de administrar a terapia de célula T uma amostra biológica foi ob- tida do indivíduo e processada, o processamento compreendendo ge- neticamente modificar células T da amostra, opcionalmente introdu- zindo uma molécula de ácido nucleico codificando o CAR nas referidas células T, em que a administração do inibidor de quinase é inici- ada em pelo menos ou cerca de 5 a 7 dias antes de obter a amostra e é realizada em um regime de dosagem compreendendo repetir a admi- nistração do inibidor de quinase em um intervalo de dosagem durante um período de tempo que se estende pelo menos para incluir a admi- nistração em ou após o dia no qual a amostra é obtida do indivíduo e administração adicional que se estender por, ou por cerca de, ou por mais que três meses após início de administração da terapia de célula T, em que o inibidor de quinase é administrado em uma quantidade de ou de cerca de 140 mg a ou a cerca de 560 mg uma vez por dia cada dia em que é administrada durante o regime de dosagem.
21. Método de acordo com a reivindicação 20, caracterizado pelo fato de que, subsequente ao início da administração do inibidor de quinase e antes da administração da terapia de célula T, o indivíduo foi precondicionado com uma terapia de linfodepleção.
22. Método de acordo com a reivindicação 20, caracterizado pelo fato de que também compreende, subsequente à administração do inibidor de quinase e antes da administração da terapia de célula T, ad- ministrar uma terapia de linfodepleção ao indivíduo.
23. Método de acordo com qualquer uma das reivindicações
20 a 22, caracterizado pelo fato de que a administração da terapia de linfodepleção é concluída dentro de 7 dias antes do início da adminis- tração da terapia de célula T.
24. Método de acordo com qualquer uma das reivindicações 20 a 23, caracterizado pelo fato de que a administração da terapia de linfodepeção é concluída 2 a 7 dias antes do início da administração da terapia de célula T.
25. Método de acordo com qualquer uma das reivindicações 22 a 24, caracterizado pelo fato de que o regime de dosagem compre- ende descontinuar ou interromper a administração do inibidor de qui- nase durante a terapia de linfodepleção.
26. Método de tratamento, caracterizado pelo fato de que compreende: (1) administrar a um indivíduo portador de um câncer um inibidor de quinase, em que o inibidor de quinase tem a estrutura , ou é um sal farmaceuticamente aceitável do mesmo; e (2) administrar uma terapia de linfodepleção ao indiví- duo; e (3) administrar uma terapia de célula T autóloga ao in- divíduo dentro de 2 a 7 dias após conclusão da terapia de linfodepleção, a referida terapia de célula T que compreende uma dose de células T geneticamente modificadas expressando um receptor de antígeno qui- mérico (CAR) que especificamente se liga a um CD19, em que, antes de administrar a terapia de célula T uma amostra biológica foi obtida do indivíduo e processada, o processamento compreendendo genetica- mente modificar células T da amostra, opcionalmente introduzindo uma molécula de ácido nucleico codificando o CAR nas referidas células T, em que a administração do inibidor de quinase é inici- ada em pelo menos ou cerca de 5 a 7 dias antes de obter a amostra e é realizada em um regime de dosagem compreendendo repetir a admi- nistração do inibidor de quinase em um intervalo de dosagem que inclui a administração até o início da terapia de linfodepleção, seguida por descontinuação ou interrompimento da administração do inibidor de qui- nase durante a terapia de linfodepleção, e em seguida administração adicional durante um período que se estende durante 3 meses ou mais após início de administração da terapia de célula T, em que o inibidor de quinase é administrado em uma quantidade de ou de cerca de 140 mg a, ou a cerca de, 560 mg uma vez por dia cada dia em que é admi- nistrada durante o regime de dosagem.
27. Método de acordo com qualquer uma das reivindicações 20 a 26, caracterizado pelo fato de que o método também compreende obter do indivíduo a amostra biológica e processar células T da referida amostra, desse modo gerando uma composição compreendendo as cé- lulas T geneticamente modificadas que expressam o receptor de antí- geno quimérico (CAR) que especificamente se liga a um CD19
28. Método de acordo com qualquer uma das reivindicações 1 a 27, caracterizado pelo fato de que a administração do inibidor de quinase por dia que é administrada é de ou de cerca de 280 mg a, ou a cerca de, 560 mg.
29. Método de acordo com qualquer uma das reivindicações 1 a 28, caracterizado pelo fato de que administração do inibidor de qui- nase é iniciada em pelo menos ou cerca de 7 dias antes da obtenção da amostra do indivíduo.
30. Método de acordo com qualquer uma das reivindicações 1 a 29, caracterizado pelo fato de que: a administração do inibidor de quinase é iniciada de ou de cerca de 30 a, ou a cerca de, 40 dias antes do início da administração da terapia de célula T; a amostra é obtida do indivíduo em, ou em cerca de 23 a, ou a cerca de, 38 dias antes do início da administração da terapia de célula T; e/ou a terapia de linfodepleção é concluída em, ou cerca de 5 a 7 dias antes de iniciar a administração da terapia de célula T.
31. Método de acordo com qualquer uma das reivindicações 1 a 30, caracterizado pelo fato de que: a administração do inibidor de quinase é iniciada em ou cerca de 35 dias antes do início da administração da terapia de célula T; a amostra é obtida do indivíduo em, ou em cerca de 28 a, ou a cerca de, 32 dias antes do início da administração da terapia de célula T; e/ou a terapia de linfodepleção é concluída em ou cerca de 5 a 7 dias antes de iniciar a administração da terapia de célula T.
32. Método de acordo com qualquer uma das reivindicações 5 a 31, caracterizado pelo fato de que a terapia de linfodepleção com- preende a administração de fludarabina e/ou ciclofosfamida.
33. Método de acordo com qualquer uma das reivindicações 5 a 32, caracterizado pelo fato de que a terapia de linfodepleção com- preende a administração de ciclofosfamida em ou cerca de 200 a 400 mg/m2, opcionalmente a, ou cerca de 300 mg/m2, inclusive, e/ou fluda- rabina em ou cerca de 20 a 40 mg/m2, opcionalmente 30 mg/m2, diaria- mente durante 2 a 4 dias, opcionalmente durante 3 dias, ou em que a terapia de linfodepleção compreende a administração de ciclofosfamida em ou cerca de 500 mg/m2.
34. Método de acordo com qualquer uma das reivindicações 5 a 33, caracterizado pelo fato de que:
a terapia de linfodepleção compreende a administração de ciclofosfamida em ou cerca de 300 mg/m2 e fludarabina em ou cerca de 30 mg/m2 diariamente durante 3 dias; e/ou a terapia de linfodepleção compreende a administração de ciclofosfamida em, ou cerca de 500 mg/m2 e fludarabina em ou cerca de 30 mg/m2diariamente durante 3 dias.
35. Método de acordo com qualquer uma das reivindicações 1 a 34, caracterizado pelo fato de que a administração do inibidor de quinase por dia em que é administrada é de uma quantidade de, ou de cerca de 140 mg.
36. Método de acordo com qualquer uma das reivindicações 1 a 34, caracterizado pelo fato de que a administração do inibidor de quinase por dia em que é administrada é de uma quantidade de, ou de cerca de 280 mg.
37. Método de acordo com qualquer uma das reivindicações 1 a 34, caracterizado pelo fato de que a administração do inibidor de quinase por dia em que é administrada é de uma quantidade de, ou de cerca de 420 mg.
38. Método de acordo com qualquer uma das reivindicações 1 a 34, caracterizado pelo fato de que a administração do inibidor de quinase por dia em que é administrada é de uma quantidade de, ou de cerca de 560 mg.
39. Método de acordo com qualquer uma das reivindicações 9 a 38, caracterizado pelo fato de que o período se estende durante ou a partir de, ou mais que quatro meses após o início da administração da terapia de célula T ou de, ou de cerca de, ou mais que cinco meses após o início da administração da terapia de célula T.
40. Método de acordo com qualquer uma das reivindicações 9 a 39, caracterizado pelo fato de que a administração adicional é du- rante um período que se estende a, ou a cerca de, ou a mais que seis meses.
41. Método de acordo com qualquer uma das reivindicações 9 a 40, caracterizado pelo fato de que: a administração adicional do inibidor de quinase é in- terrompida no término do período se, no término do período, o indivíduo exibir uma completa resposta (CR) após o tratamento; ou a administração adicional do inibidor de quinase é inter- rompida no término do período se, no término do período, o câncer tiver progredido ou recidivado após a remissão após o tratamento.
42. Método de acordo com qualquer uma das reivindicações 9 a 41, caracterizado pelo fato de que o período se estende durante ou a partir de três meses a, ou de seis meses.
43. Método de acordo com qualquer uma das reivindicações 9 a 42, caracterizado pelo fato de que o período se estende durante ou a partir de três meses após início de administração da terapia de célula T.
44. Método de acordo com qualquer uma das reivindicações 9 a 42, caracterizado pelo fato de que o período se estende durante ou a partir de 3 meses após início de administração da terapia de célula T se o indivíduo tiver obtido uma completa resposta (CR) em, antes de, ou em cerca de 3 meses, após o tratamento, ou o câncer tiver progre- dido ou tiver recidivado após a remissão após o tratamento.
45. Método de acordo com a reivindicação 44, caracterizado pelo fato de que o período se estende durante ou a partir de 3 meses após início de administração da terapia de célula T se o indivíduo tiver obtido em 3 meses uma completa resposta (CR).
46. Método de acordo com qualquer uma das reivindicações 9 a 42, caracterizado pelo fato de que o período se estende durante ou a partir de seis meses após início de administração da terapia de célula T.
47. Método de acordo com qualquer uma das reivindicações 9 a 42, caracterizado pelo fato de que o período se estende durante ou a partir de 6 meses após início de administração da terapia de célula T se o indivíduo tiver obtido em, antes de, ou em cerca de 6 meses, uma resposta completa (CR) após o tratamento, ou o câncer tiver progredido ou recidivado após a remissão após o tratamento.
48. Método de acordo com a reivindicação 47, caracterizado pelo fato de que o período se estende durante ou a partir de 6 meses após início de administração da terapia de célula T se o indivíduo tiver obtido em 6 meses uma resposta completa (CR).
49. Método de acordo com qualquer uma das reivindicações 9 a 48, caracterizado pelo fato de que a administração adicional é con- tinuada durante o período mesmo se o indivíduo tiver obtido uma res- posta completa (CR) em um ponto do tempo antes do término do perí- odo.
50. Método de acordo com qualquer uma das reivindicações 9 a 49, caracterizado pelo fato de que o indivíduo obtém uma resposta completa (CR) em um tempo durante o período e antes do término do período.
51. Método de acordo com qualquer uma das reivindicações 9 a 40, 42, 43, 44, 46 e 47, caracterizado pelo fato de que também com- preende continuar a administração adicional após o término do período, se, no término do período, o indivíduo exibir uma resposta parcial (PR) ou doença estável (SD).
52. Método de acordo com qualquer uma das reivindicações 9 a 40, 42, 43, 44, 46, 47 e 51, caracterizado pelo fato de que a admi- nistração adicional é continuada durante mais de seis meses se em, ou em cerca de seis meses, o indivíduo exibir uma resposta parcial (PR) ou doença estável (SD) após o tratamento.
53. Método de acordo com a reivindicação 51 ou 52, carac- terizado pelo fato de que a administração adicional é continuada até o indivíduo obter uma resposta completa (CR) após o tratamento, ou até o câncer ter progredido ou recidivado após a remissão após o trata- mento.
54. Método de acordo com qualquer uma das reivindicações 1 a 53, caracterizado pelo fato de que o inibidor de quinase inibe a tiro- sina quinase de Bruton (BTK) e/ou inibe a quinase de célula T induzível por IL2 (ITK).
55. Método de acordo com qualquer uma das reivindicações 1 a 54, caracterizado pelo fato de que o inibidor de quinase inibe ITK e o inibidor inibe ITK ou inibe ITK com uma concentração inibitória metade da máxima (IC50) menor que ou menor que cerca de 1000 nM, 900 nM, 800 nM, 600 nM, 500 nM, 400 nM, 300 nM, 200 nM, 100 nM ou menos.
56. Método de acordo com qualquer uma das reivindicações 1 a 55, caracterizado pelo fato de que ao indivíduo foi anteriormente administrado o inibidor de quinase antes da administração do inibidor de quinase mencionado em (1).
57. Método de acordo com qualquer uma das reivindicações 1 a 55, caracterizado pelo fato de que ao indivíduo foi anteriormente administrado o inibidor de quinase antes da administração do inibidor de quinase mencionado em (1).
58. Método de acordo com qualquer uma das reivindicações 1 a 57, caracterizado pelo fato de que: (i) o indivíduo e/ou o câncer (a) é resistente à inibição de tirosina quinase de Bruton (BTK) e/ou (b) compreende uma popula- ção de células que são resistentes à inibição pelo inibidor de quinase, opcionalmente em que a população de células é ou compreende uma população de células B e/ou não compreende células T; (ii) o indivíduo e/ou o câncer compreende uma mutação em um ácido nucleico codificando uma BTK, opcionalmente em que a mutação é capaz de reduzir ou prevenir a inibição da BTK pelo inibidor de quinase, opcionalmente em que a mutação é C481S; (iii) o indivíduo e/ou o câncer compreende uma mutação em um ácido nucleico codificando fosfolipase C gama 2 (PLCgamma2), opcionalmente em que a mutação resulta em atividade de sinalização constitutiva, opcionalmente em que a mutação é R665W ou L845F; (iv) no momento do início da administração do inibidor de quinase mencionado em (1), e opcionalmente no momento do início da administração da terapia de célula T, o indivíduo recidivou após re- missão após um tratamento anterior com, ou foi considerado refratário a um tratamento anterior com, o inibidor de quinase e/ou com uma ter- apia inibidora de BTK; (v) no momento do início da administração do inibidor de quinase mencionado em (1), e opcionalmente no momento do início da terapia de célula T, o indivíduo progrediu após um tratamento anterior com o inibidor e/ou com uma terapia inibidora de BTK, opcionalmente em que o indivíduo exibiu doença progressiva como a melhor resposta ao tratamento anterior ou progressão após resposta anterior ao trata- mento anterior; e/ou (vi) no momento do início da administração do inibidor de quinase mencionado em (1), e opcionalmente no momento do início da terapia de célula T, o indivíduo exibiu uma resposta menor que uma resposta completa (CR) após um tratamento anterior durante pelo menos 6 meses com o inibidor e/ou com uma terapia inibidora de BTK.
59. Método de acordo com qualquer uma das reivindicações 1 a 58, caracterizado pelo fato de que o câncer é uma malignidade de célula B.
60. Método de acordo com a reivindicação 59, caracterizado pelo fato de que a malignidade de célula B é um linfoma.
61. Método de acordo com a reivindicação 60, caracterizado pelo fato de que o linfoma é um linfoma não Hodgkin (NHL).
62. Método de acordo com a reivindicação 61, caracterizado pelo fato de que o NHL compreende NHL agressivo, linfoma de célula B grande difuso (DLBCL), DLBCL-NOS, indolente opcionalmente trans- formado; DLBCL-NOS positivo para EBV; Linfoma de célula B grande rica em histiócito/célula T; linfoma de célula B grande mediastinal primá- ria (PMBCL); linfoma folicular (FL), opcionalmentte, linfoma folicular Grau 3B (FL3B); e/ou linfoma de célula B de grau elevado com MYC e BCL2 e/ou rearranjos BCL6 com histologia DLBCL (hit duplo/triplo).
63. Método de acordo com qualquer uma das reivindicações 1 a 62, caracterizado pelo fato de que o indivíduo é ou foi identificado como tendo um status de desempenho do Eastern Cooperative Onco- logy Group (ECOG) menor do que ou igual a 1.
64. Método de acordo com qualquer uma das reivindicações 1 a 63, caracterizado pelo fato de que o inibidor de quinase é adminis- trado oralmente.
65. Método de acordo com qualquer uma das reivindicações 1 a 64, caracterizado pelo fato de que o CD19 é um CD19 humano.
66. Método de acordo com qualquer uma das reivindicações 1 a 65, caracterizado pelo fato de que o receptor de antígeno quimérico (CAR) compreende um domínio de reconhecimento de antígeno extra- celular que especificamente se liga ao CD19 e um domínio de sinaliza- ção intracelular compreendendo um ITAM.
67. Método de acordo com a reivindicação 66, caracterizado pelo fato de que o domínio de sinalização intracelular compreende um domínio de sinalização de uma cadeia CD3-zeta (CD3ζ), opcionalmente uma cadeia CD3-zeta humana.
68. Método de acordo com a reivindicação 66 ou 67, carac-
terizado pelo fato de que o receptor de antígeno quimérico (CAR) tam- bém compreende uma região de sinalização coestimulatória.
69. Método de acordo com a reivindicação 68, caracterizado pelo fato de que a região de sinalização coestimulatória compreende um domínio de sinalização de CD28 ou 4-1BB, opcionalmente CD28 hu- mano ou 4-1BB humano.
70. Método de acordo com a reivindicação 68 ou 69, carac- terizado pelo fato de que o domínio coestimulatório é ou compreende um domínio de sinalização de 4-1BB humano.
71. Método de acordo com qualquer uma das reivindicações 1 a 70, caracterizado pelo fato de que: o CAR compreende um scFv específico para o CD19; um domínio de transmembrana; um domínio de sinalização citoplásmico derivado de uma molécula coestimulatória, que opcionalmente é ou compreende um 4-1BB, opcionalmente 4-1BB humano; e um domínio de sinalização citoplásmico derivado de uma molécula contendo ITAM de sinalização primária, que opcionalmente é ou compreende um domí- nio de sinalização CD3zeta, opcionalmente um domínio de sinalização CD3zeta humano; e opcionalmente em que o CAR também compreende um espaçador entre o domínio de transmembrana e o scFv; o CAR compreende, em ordem, um scFv específico para o CD19; um domínio de transmembrana; um domínio de sinaliza- ção citoplásmico derivado de uma molécula coestimulatória, que op- cionalmente é ou compreende um domínio de sinalização 4-1BB, op- cionalmente um domínio de sinalização 4-1BB humano; e um domínio de sinalização citoplásmico derivado de uma molécula contendo ITAM de sinalização primária, que opcionalmente é um domínio de sinalização CD3zeta, opcionalmente domínio de sinalização CD3zeta humano; ou o CAR compreende, em ordem, um scFv específico para o CD19; um espaçador; um domínio de transmembrana, um domí- nio de sinalização citoplásmico derivado de uma molécula coestimulató- ria, que opcionalmente é um domínio de sinalização 4-1BB, e um domí- nio de sinalização citoplásmico derivado de uma molécula contendo ITAM de sinalização primária, que opcionalmente é ou compreende um domínio de sinalização CD3zeta.
72. Método de acordo com a reivindicação 71, caracterizado pelo fato de que o CAR compreende um espaçador e o espaçador é um espaçador de polipeptídeo que (a) compreende ou consiste em toda ou uma parte de uma articulação de imunoglobulina ou uma versão modi- ficada da mesma ou compreende cerca de 15 aminoácidos ou menos, e não compreende uma região extracelular CD28 ou uma região ex- tracelular CD8, (b) compreende ou consiste em toda ou uma parte de uma articulação de imunoglobulina, opcionalmente uma articulação IgG4, ou uma versão modificada da mesma e/ou compreende cerca de 15 aminoácidos ou menos, e não compreende uma região extracelular CD28 ou uma região extracelular CD8, ou (c) é de, ou cerca de 12 ami- noácidos de comprimento e/ou compreende ou consiste em toda ou uma parte de uma articulação de imunoglobulina, opcionalmente uma IgG4, ou uma versão modificada da mesma; ou (d) tem ou consiste na sequência de SEQ ID NO: 1, uma sequência codificada por SEQ ID NO: 2, SEQ ID NO: 30, SEQ ID NO: 31, SEQ ID NO: 32, SEQ ID NO: 33, SEQ ID NO: 34, ou uma variante de qualquer das anteriores tendo pelo menos 85%, 86%, 87%, 88%, 89%, 90%, 91%, 92%, 93%, 94%, 95%, 96%, 97%, 98%, 99% ou mais identidade de sequência com as mes- mas, ou (e) compreende ou consiste na fórmula X 1PPX2P (SEQ ID NO:58), onde X1 é glicina, cisteína ou arginina e X2 é cisteína ou tre- onina; e/ou o domínio coestimulatório compreende SEQ ID NO: 12 ou uma variante da mesma tendo pelo menos 85%, 86%, 87%, 88%, 89%, 90%, 91%, 92%, 93%, 94%, 95%, 96%, 97%, 98%, 99% ou mais identidade de sequência da mesma; e/ou o domínio de sinalização primária compreende SEQ ID NO: 13 ou 14 ou 15 tendo pelo menos 85%, 86%, 87%, 88%, 89%, 90%, 91%, 92%, 93%, 94%, 95%, 96%, 97%, 98%, 99% ou mais identidade de sequência da mesma; e/ou o scFv compreende uma sequência de CDRL1 de RAS- QDISKYLN (SEQ ID NO: 35), uma sequência de CDRL2 de SRLHSGV (SEQ ID NO: 36), e/ou uma sequência de CDRL3 de GNTLPYTFG (SEQ ID NO: 37) e/ou uma sequência de CDRH1 de DYGVS (SEQ ID NO: 38), uma sequência de CDRH2 de VIWGSETTYYNSALKS (SEQ ID NO: 39), e/ou uma sequência de CDRH3 de YAMDYWG (SEQ ID NO: 40) ou em que o scFv compreende uma região de cadeia pesada variável de FMC63 e uma região de cadeia leve variável de FMC63 e/ou uma sequência de CDRL1 de FMC63, uma sequência de CDRL2 de FMC63, uma sequência de CDRL3 de FMC63, uma sequência de CDRH1 de FMC63, uma sequência de CDRH2 de FMC63, e uma se- quência de CDRH3 de FMC63 ou se liga ao mesmo epítopo que, ou compete para ligação com, qualquer dos anteriores, e opcionalmente em que o scFv compreende, em ordem, a VH, um ligante, opcionalmente compreendendo SEQ ID NO: 41, e a VL, e/ou o scFv compreende um ligante flexível e/ou compreende a sequência de aminoácido mencio- nada como SEQ ID NO: 42.
73. Método de acordo com qualquer uma das reivindicações 1 a 72, caracterizado pelo fato de que a dose de células T genetica- mente modificadas é composta de, ou de cerca de 1 x 105 a 5 x 108 células T expressando CAR totais, 1 x 106 a 2.5 x 108 células T expres- sando CAR totais, 5 x 106 a 1 x 108 células T expressando CAR totais, 1 x 107 a 2,5 x 108 células T expressando CAR totais, 5 x 107 a 1 x 108 células T expressando CAR totais, cada inclusive.
74. Método de acordo com qualquer uma das reivindicações 1 a 73, caracterizado pelo fato de que a dose de células T genetica- mente modificadas compreende pelo menos ou pelo menos cerca de 1 x 105 células expressando CAR, pelo menos ou pelo menos cerca de 2,5 x 105 células expressando CAR, pelo menos ou pelo menos cerca de 5 x 105 células expressando CAR, pelo menos ou pelo menos cerca de 1 x 106 células expressando CAR, pelo menos ou pelo menos cerca de 2,5 x 106 células expressando CAR, pelo menos ou pelo menos cerca de 5 x 106 células expressando CAR, pelo menos ou pelo menos cerca de 1 x 107 células expressando CAR, pelo menos ou pelo menos cerca de 2,5 x 107 células expressando CAR, pelo menos ou pelo menos cerca de 5 x 107 células expressando CAR, pelo menos ou pelo menos cerca de 1 x 108 células expressando CAR, pelo menos ou pelo menos cerca de 2,5 x 108 células expressando CAR, ou pelo menos ou pelo menos cerca de 5 x 108 células expressando CAR.
75. Método de acordo com qualquer uma das reivindicações 1 a 74, caracterizado pelo fato de que a dose de células T genetica- mente modificadas é composta de, ou de cerca de 5 x 107 células T expressando CAR totais.
76. Método de acordo com qualquer uma das reivindicações 1 a 75, caracterizado pelo fato de que a dose de células T genetica- mente modificadas é composta de, ou de cerca de 1 x 108 células ex- pressando CAR.
77. Método de acordo com qualquer uma das reivindicações 1 a 76, caracterizado pelo fato de que a dose de células T genetica- mente modificadas compreende células T CD4+ expressando o CAR e células T CD8+ expressando o CAR e a administração da dose compre- ende administrar uma pluralidade de composições separadas, a referida pluralidade de composições separadas compreendendo uma primeira composição compreendendo uma das células T CD4+ e das células T CD8+ e a segunda composição compreendendo a outra das células T CD4+ ou das células T CD8+.
78. Método de acordo com a reivindicação 77, caracterizado pelo fato de que: a primeira composição e segunda composição são ad- ministradas 0 a 12 horas de intervalo, 0 a 6 horas de intervalo ou 0 a 2 horas de intervalo ou em que a administração da primeira composição e a administração da segunda composição são realizadas no mesmo dia, são realizadas entre cerca de 0 e cerca de 12 horas de intervalo, entre cerca de 0 e cerca de 6 horas de intervalo ou entre cerca de 0 e 2 horas de intervalo; e/ou o início de administração da primeira composição e o início de administração da segunda composição são realizados entre cerca de 1 minuto e cerca de 1 hora de intervalo ou entre cerca de 5 minutos e cerca de 30 minutos de intervalo.
79. Método de acordo com a reivindicação 77 ou 78, carac- terizado pelo fato de que a primeira composição e segunda composição são administradas não mais do que 2 horas, não mais do que 1 hora, não mais do que 30 minutos, não mais do que 15 minutos, não mais do que 10 minutos ou não mais do que 5 minutos de intervalo.
80. Método de acordo com qualquer uma das reivindicações 77 a 79, caracterizado pelo fato de que a primeira composição compre- ende as células T CD4+.
81. Método de acordo com qualquer uma das reivindicações 77 a 79, caracterizado pelo fato de que a primeira composição compre- ende as células T CD8+.
82. Método de acordo com qualquer uma das reivindicações 77 a 81, caracterizado pelo fato de que a primeira composição é admi- nistrada antes da segunda composição.
83. Método de acordo com qualquer uma das reivindicações 1 a 82, caracterizado pelo fato de que a dose de células é administrada parenteralmente, opcionalmente intravenosamente.
84. Método de acordo com qualquer uma das reivindicações 1 a 83, caracterizado pelo fato de que as células T são células T primá- rias obtidas da amostra do indivíduo.
85. Método de acordo com qualquer uma das reivindicações 1 a 82, caracterizado pelo fato de que as células T são autólogas ao indivíduo.
86. Método de acordo com qualquer uma das reivindicações 1 a 85, caracterizado pelo fato de que o processamento compreende: isolar células T, opcionalmente células T CD4+ e/ou CD8+, da amostra obtida do indivíduo, desse modo produzindo uma composição de entrada compreendendo células T primárias; e introduzir a molécula de ácido nucleico codificando o CAR nas células T da composição de entrada.
87. Método de acordo com a reivindicação 86, caracterizado pelo fato de que o isolamento compreende realizar seleção com base em imunoafinidade.
88. Método de acordo com qualquer uma das reivindicações 1 a 87, caracterizado pelo fato de que a amostra biológica é ou compre- ende uma amostra de sangue total, uma amostra da camada leucocitá- ria, uma amostra de células mononucleares de sangue periférico (PBMC), uma amostra de célula T não fracionada, uma amostra de lin- fócito, uma amostra de glóbulos brancos, um produto de aferese, ou um produto de leucaferese.
89. Método de acordo com qualquer uma das reivindicações 86 a 88, caracterizado pelo fato de que antes da introdução, o proces- samento compreende incubar a composição de entrada sob condições de estimulação, as referidas condições de estimulação compreendendo a presença de um reagente estimulatório capaz de ativar um ou mais domínios de sinalização intracelular de um ou mais componentes de um complexo TCR e/ou um ou mais domínios de sinalização intracelular de uma ou mais moléculas coestimulatórias, desse modo gerando uma composição estimulada, em que a molécula de ácido nucleico codifi- cando o CAR é introduzida na composição estimulada.
90. Método de acordo com a reivindicação 89, caracterizado pelo fato de que o reagente estimulatório compreende um agente pri- mário que especificamente se liga a um membro de um complexo TCR, opcionalmente que especificamente se liga a CD3.
91. Método de acordo com a reivindicação 90, caracterizado pelo fato de que o reagente estimulatório também compreende um agente secundário que especificamente se liga a uma molécula coesti- mulatória de célula T, opcionalmente em que a molécula coestimulatória é selecionada de CD28, CD137 (4-1-BB), OX40, ou ICOS.
92. Método de acordo com a reivindicação 90 ou 91, carac- terizado pelo fato de que os agentes primários e/ou secundários com- preendem um anticorpo, opcionalmente em que o reagente estimulató- rio compreende incubação com um anticorpo anti-CD3 e um anticorpo anti-CD28, ou um fragmento de ligação ao antígeno do mesmo.
93. Método de acordo com qualquer uma das reivindicações 90 a 92, caracterizado pelo fato de que o agente primário e/ou agente secundário estão presentes sobre a superfície de um sólido.
94. Método de acordo com a reivindicação 93, caracterizado pelo fato de que o suporte sólido é ou compreende uma conta, opcio- nalmente em que a conta é magnética ou superparamagnética.
95. Método de acordo com a reivindicação 94, caracterizado pelo fato de que a conta compreende um diâmetro maior que ou maior que cerca de 3,5 µm porém não mais que cerca de 9 µm ou não mais que cerca de 8 µm ou não mais que cerca de 7 µm ou não mais que cerca de 6 µm ou não mais que cerca de 5 µm.
96. Método de acordo com a reivindicação 94 ou 95, carac- terizado pelo fato de que a conta compreende um diâmetro de ou cerca de 4,5 µm.
97. Método de acordo com qualquer uma das reivindicações 1 a 96, caracterizado pelo fato de que a introdução compreende trans- duzir células da composição estimulada com um vetor viral compreen- dendo um polinucleotídeo codificando o receptor recombinante.
98. Método de acordo com a reivindicação 97, caracterizado pelo fato de que o vetor viral é um vetor retroviral.
99. Método de acordo com a reivindicação 97 ou 98, carac- terizado pelo fato de que o vetor viral é um vetor lentiviral ou vetor ga- marretroviral.
100. Método de acordo com qualquer uma das reivindica- ções 86 a 99, caracterizado pelo fato de que o processamento também compreende após a introdução cultivar as células T, opcionalmente em que o cultivo é realizado sob condições que resultem na proliferação ou expansão de células para produzir uma composição de saída compre- endendo a terapia de célula T.
101. Método de acordo com a reivindicação 100, caracteri- zado pelo fato de que subsequente ao cultivo, o método também com- preende formular células da composição de saída para criopreservação e/ou para administração da terapia de célula T ao indivíduo, opcional- mente em que a formulação é na presença de um excipiente farmaceu- ticamente aceitável.
102. Método de acordo com qualquer uma das reivindica- ções 1 a 101, caracterizado pelo fato de que o indivíduo é um ser hu- mano.
103. Método de acordo com qualquer uma das reivindica- ções 1 a 102, caracterizado pelo fato de que:
pelo menos 35%, pelo menos 40% ou pelo menos 50% de indivíduos tratados de acordo com o método que obteve uma res- posta completa (CR) que é durável, ou é durável em pelo menos 60, 70, 80, 90, ou 95% de indivíduos obtendo a CR, durante, ou durante mais que 6 meses ou durante, ou durante mais que 9 meses; e/ou em que pelo menos 60, 70, 80, 90, ou 95% de indivíduos obtendo uma CR por seis meses permanecem em resposta, permane- cem em CR, e/ou sobrevivem ou sobrevivem sem progressão, durante mais que, ou durante mais que 3 meses e/ou durante, ou durante mais que 6 meses e/ou em mais que nove meses; e/ou pelo menos 50%, pelo menos 60% ou pelo menos 70% dos indivíduos tratados de acordo com o método obtiveram resposta objetiva (OR) opcionalmente em que a OR é durável, ou é durável em pelo menos 60, 70, 80, 90, ou 95 % de indivíduos obtendo a OR, du- rante, ou durante mais que 6 meses ou durante, ou durante mais que 9 meses; e/ou em que pelo menos 60, 70, 80, 90, ou 95% de indivíduos obtendo uma OR em seis meses permanecem em resposta ou sobrevi- vem durante mais que, ou durante mais que 3 meses e/ou durante, ou durante mais que 6 meses.
104. Método de acordo com qualquer uma das reivindica- ções 60 a 103, caracterizado pelo fato de que, no momento, ou imedia- tamente antes do momento da administração da dose de células o indi- víduo recidivou após a remissão após o tratamento com, ou tornou-se refratário a, uma ou mais terapias anteriores para o linfoma, opcional- mente o NHL, opcionalmente uma, duas ou três terapias anteriores di- ferente de outra dose de células expressando o CAR.
105. Método de acordo com qualquer uma das reivindica- ções 60 a 104, caracterizado pelo fato de que, em ou antes da adminis- tração da terapia de célula T, que compreende a dose de células:
o indivíduo é portador, ou foi identificado como sendo portador de um linfoma de hit duplo/triplo; o indivíduo é portador, ou foi identificado como sendo portador de um um linfoma quimiorrefratário, opcionalmente um DLBCL quimiorrefratário; e/ou o indivíduo não obteve uma resposta completa (CR) em resposta a uma terapia anterior.
106. Kit caracterizado pelo fato de que compreende uma ou mais doses unitárias de um inibidor de quinase que é ou compreende a estrutura , ou é um sal farmaceuticamente aceitável do mesmo, e instruções para a administração de uma ou mais doses uni- tárias a um indivíduo portador de um câncer que é um candidato para o tratamento com, ou que deve ser tratado com uma terapia de célula T autóloga, a referida terapia de célula T que compreende uma dose de células T geneticamente modificadas expressando um receptor de antí- geno quimérico (CAR) que especificamente se liga a um CD19, e em que, antes da administração da terapia de célula T, uma amostra bioló- gica é obtida do indivíduo e processada, o processamento compreen- dendo geneticamente modificar células T da amostra, opcionalmente in- troduzindo um ácido nucleico codificando o CAR nas células T, em que as instruções especificam o início da adminis- tração de uma dose unitária do inibidor de quinase ao indivíduo em ou pelo menos em cerca de 3 dias antes de obter a amostra e em um re- gime de dosagem compreendendo administrações repetidas de uma ou mais doses unitárias em um intervalo de dosagem durante um período de tempo que se estende pelo menos para incluir administração em, ou após o dia no qual a amostra é obtida do indivíduo.
107. Kit de acordo com a reivindicação 106, caracterizado pelo fato de que as instruções também especificam a administração de uma terapia de célula T ao indivíduo.
108. Kit de acordo com a reivindicação 106 ou 107, caracte- rizado pelo fato de que as instruções também especificam, subsequente ao início da administração do inibidor de quinase e antes da administra- ção da terapia de célula T, administrar uma terapia de linfodepleção ao indivíduo.
109. Kit de acordo com a reivindicação 108,caracterizado pelo fato de que as instruções especificam que a administração do ini- bidor de quinase deve ser descontinuada durante a administração da terapia de linfodepleção.
110. Kit de acordo com a reivindicação 108 ou 109, caracte- rizado pelo fato de que as instruções especificam que o regime de do- sagem compreende a administração do inibidor de quinase durante um período de tempo que se estende pelo menos até o início da terapia de linfodepleção.
111. Kit de acordo com qualquer uma das reivindicações 108 a 110, caracterizado pelo fato de que as instruções especificam que o regime de dosagem compreende a administração do inibidor de quinase durante um período de tempo que inclui a administração até o início da terapia de linfodepleção, seguida por descontinuação ou interrompi- mento da administração do inibidor de quinase durante a terapia de lin- fodepleção, e em seguida administração adicional do inibidor de quinase durante um período que se estende durante pelo menos 15 dias após início de administração da terapia de célula T.
112. Kit caracterizado pelo fato de que compreende uma ou mais doses unitárias de um inibidor de quinase que é ou compreende a estrutura
, ou é um sal farmaceuticamente aceitável do mesmo, e instruções para realização dos métodos como definidos em qualquer uma das reivindicações 1 a 105.
113. Artigo de fabricação caracterizado pelo fato de que compreende kit como definido em qualquer uma das reivindicações 106 a 112.
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