BR112020005108A2 - bactéria wood-ljungdahl de ocorrência não natural, e, método de produção de um produto - Google Patents

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Abstract

A invenção fornece microrganismos de Wood-Ljungdahl geneticamente modificados, compreendendo um ou mais genes rompidos para desviar estrategicamente o fluxo de carbono para longe de produtos não essenciais ou indesejáveis e na direção de produtos de interesse. As estratégias de expressão da invenção permitem a produção de combustíveis e produtos químicos úteis a partir de substratos gasosos, como monóxido de carbono, dióxido de carbono e/ou hidrogênio.

Description

1 / 294 BACTÉRIA WOOD-LJUNGDAHL DE OCORRÊNCIA NÃO NATURAL, E, MÉTODO DE PRODUÇÃO DE UM PRODUTO
REFERÊNCIA CRUZADA A PEDIDOS RELACIONADOS
[001] Este pedido reivindica o benefício do Pedido Provisório de Patente n° U.S. 62/565.000, depositado em 28 de setembro de 2017, cuja totalidade é aqui incorporada por referência.
ANTECEDENTES DA INVENÇÃO
[002] Há muito tempo se reconhece que processos catalíticos, como o processo Fischer-Tropsch, podem ser usados para converter gases contendo dióxido de carbono (CO2), monóxido de carbono (CO) e/ou hidrogênio (H2), como gases de resíduos industriais ou gás de síntese, em uma variedade de combustíveis e produtos químicos. Recentemente, no entanto, a fermentação a gás surgiu como uma plataforma alternativa para a fixação biológica desses gases. Em particular, os microrganismos de fixação de C1 vêm demonstrando converter os gases contendo CO2, CO e/ou H2 em produtos, como etanol e 2,3-butanodiol. A produção eficiente de tais produtos pode ser limitada, no entanto, por crescimento microbiano lento, captação limitada de gases, sensibilidade a toxinas ou desvio de substratos de carbono em subprodutos indesejados. Consequentemente, continua a haver uma necessidade de microrganismos geneticamente modificados com características melhoradas.
DESCRIÇÃO DAS FIGURAS
[003] A Figura 1 é um diagrama que mostra as principais vias de produção e os principais nós metabólicos (indicados em caixas) nos microrganismos de Wood-Ljungdahl. Melhorar o fluxo de carbono através desses nós, por exemplo, interrompendo a expressão de certos genes, melhora a produção de produtos a jusante.
DESCRIÇÃO DA INVENÇÃO
[004] A invenção fornece microrganismos de ocorrência não natural compreendendo pelo menos um gene rompido. Nos microrganismos da
2 / 294 invenção, o fluxo de carbono é desviado estrategicamente para longe de produtos não essenciais ou indesejáveis e na direção de produtos de interesse. Em certas modalidades, esses genes rompidos desviam o fluxo de carbono dos nós metabólicos não essenciais ou indesejáveis e através dos nós metabólicos- alvo para melhorar a produção de produtos a jusante desses nós metabólicos- alvo.
[005] Os microrganismos da invenção são derivados de bactérias parentais, como Acetobacterium woodii, Alkalibaculum bacchii, Blautia producta, Butyribacterium methylotrophicum, Clostridium aceticum, Clostridium autoethanogenum, Clostridium carboxidivorans, Clostridium coskatii, Clostridium drakei, Clostridium formicoaceticum, Clostridium ljungdahlii, Clostridium magnum, Clostridium ragsdalei, Clostridium scatologenes, Eubacterium limosum, Moorella thermautotrophica, Moorella thermoacetica, Oxobacter pfennigii, Sporomusa ovata, Sporomusa silvacetica, Sporomusa sphaeroides ou Thermoanaerobacter kiuvi. Em uma modalidade preferencial, a bactéria parental é Clostridium autoethanogenum, Clostridium ljungdahlii ou Clostridium ragsdalei. Em uma modalidade particularmente preferencial, a bactéria parental é Clostridium autoethanogenum.
[006] Em uma modalidade, a invenção fornece uma bactéria Wood- Ljungdahl de ocorrência não natural compreendendo uma tiolase heteróloga e uma mutação disruptiva em um ou mais genes que codificam, por exemplo, uma ou mais dentre [FeFe]-hidrogenase de bifurcação de elétrons dependente de NAD, glutamato sintase, citramalato sintase, acetolactato descarboxilase, lactato desidrogenase, acetato cinase, fosfato transacetilase e aldeído desidrogenase, em que a bactéria de ocorrência não natural aprimorou o fluxo de carbono através do acetoacetil-CoA em comparação com uma bactéria parental. Especificamente, a expressão do um ou mais genes é diminuída ou eliminada em comparação com a bactéria parental.
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[007] Em tal modalidade, a bactéria de ocorrência não natural pode produzir um produto como acetona, isopropanol, 3-hidroxi-isovaleril-CoA, 3- hidroxi-isovalerato, isobutileno, pirofosfato de isopentenila, pirofosfato de dimetilalila, isopreno, farneseno, 3-hidroxibutiril-CoA, crotonil-CoA, 3- hidroxibutirato, 3-hidroxibutirilaldeído, 1,3-butanodiol, 2-hidroxi-isobutiliril- CoA, 2-hidroxi-isobutirato, butiril-CoA, butirato, butanol, caproato, hexanol, octanoato, octanol, 1,3-butanodiol, 2-buten-1-ol, isovaleril-CoA, isovalerato ou álcool isoamílico.
[008] Por exemplo, quando a bactéria parental é Clostridium autoethanogenum, (a) a [FeFe]-hidrogenase de bifurcação de elétrons dependente de NAD pode ser selecionada do grupo que consiste em CAETHG_1576, CAETHG_1578, CAETHG_3569, CAETHG_3570 e CAETHG_3571, (b) a glutamato sintase pode ser selecionada do grupo que consiste em CAETHG_0477, CAETHG_1580, CAETHG_3850 e CAETHG_3851, (c) a citramalato sintase pode ser CAETHG_2751, (d) a acetolactato descarboxilase pode ser CAETHG_2932, (e) a lactato desidrogenase pode ser CAETHG_1147, (f) a acetato quinase pode ser CAETHG_3359, (g) a fosfato transacetilase pode ser CAETHG_3358 ou (h) a aldeído desidrogenase pode ser selecionada do grupo que consiste em CAETHG_1819, CAETHG_3287 e CAETHG_1830.
[009] Em outra modalidade, a invenção fornece uma bactéria Wood- Ljungdahl de ocorrência não natural compreendendo uma mutação disruptiva em um ou mais genes, em que a bactéria de ocorrência não natural possui um fluxo de carbono aprimorado através do corismato em comparação com uma bactéria parental.
[0010] O um ou mais genes codificam, por exemplo, um ou mais dentre purina-nucleosídeo fosforilase, permeação de lactato, cistationina gama-liase, adenina fosforibosiltransferase, 5'-nucleotidase/3'- nucleotidase/exopolifosfatase, canal mecanossensível de pequena
4 / 294 condutância, arginina desiminase, apoenzima de LL-diaminopimelato aminotransferase e fosfopentomutase. Especificamente, a expressão do um ou mais genes é diminuída ou eliminada em comparação com a bactéria parental.
[0011] Em tal modalidade, a bactéria de ocorrência não natural pode produzir um produto como corismato, ácido para-hidroxibenzoico, salicilato, 2-aminobenzoato, di-hidroxibenzoato, ácido 4-hidroxiciclo-hexano carboxílico e sais e íons dos mesmos.
[0012] Por exemplo, quando a bactéria parental é Clostridium autoethanogenum, o um ou mais genes podem codificar um ou mais dentre CAETHG_0160, CAETHG_0248, CAETHG_0498, CAETHG_1270, CAETHG_1371, CAETHG_2107, CAETHG_3021, CAETHG_3510 e CAETHG_3924; quando a bactéria parental é Clostridium ljungdahlii, os um ou mais genes podem codificar um ou mais dentre CLJU_c20750, CLJU_c21610, CLJU_c24380, CLJU_c33720, CLJU_c34740, CLJU_c42810, CLJU_c09270, CLJU_c14280, e CLJU_c18150; e quando a bactéria parental for Clostridium ragsdalei, o um ou mais genes podem codificar um ou mais dentre CLRAG_19250, CLRAG_31200, CLRAG_25120, CLRAG_24560, CLRAG_14800, CLRAG_25620, CLRAG_09600, ou CLRAG_00520.
[0013] A invenção também fornece métodos de produção de produtos através da cultura do microrganismo da invenção, na presença de um substrato, tal como um substrato gasoso compreendendo um ou mais dentre CO, CO2 e/ou H2.
[0014] O termo “ocorrência não natural”, quando usado em referência a um microrganismo, pretende significar que o microrganismo tem pelo menos uma modificação genética não encontrada em uma cepa de ocorrência natural da espécie referenciada, incluindo as cepas de tipo selvagem da espécie referenciada. Microrganismos de ocorrência não natural são tipicamente desenvolvidos em um laboratório ou em centros de pesquisas.
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[0015] Os termos “modificação genética”, “alteração genética” ou “engenharia genética” se referem amplamente à manipulação do genoma ou ácidos nucleicos de um microrganismo pela mão do homem. Da mesma forma, os termos “geneticamente modificado”, “geneticamente alterado” ou “geneticamente projetado” se referem a um microrganismo que contém essa modificação genética, alteração genética ou engenharia genética. Esses termos podem ser usados para diferenciar um microrganismo gerado em laboratório de um microrganismo de ocorrência natural. Os métodos de modificação genética de incluem, por exemplo, expressão de genes heterólogos, inserção ou exclusão ou deleção de genes ou promotores, mutação em ácidos nucleicos, expressão ou inativação de genes alterados, engenharia de enzimas, evolução direcionada, projeto baseado em conhecimento, métodos de mutagênese aleatória, embaralhamento de genes e otimização de códons.
[0016] “Recombinante” indica que um ácido nucleico, proteína ou microrganismo é o produto de modificação, engenharia ou recombinação genética. Geralmente, o termo “recombinante” refere-se a um ácido nucleico, proteína ou microrganismo que contém ou é codificado por material genético derivado de múltiplas fontes, como duas ou mais cepas ou espécies diferentes de microrganismos.
[0017] “Tipo selvagem” refere-se à forma típica de um organismo, cepa, gene ou característica que ocorre na natureza, distinta das formas mutantes ou variantes.
[0018] “Endógeno” refere-se a um ácido nucleico ou proteína que está presente ou expressa no microrganismo de tipo selvagem ou parental do qual o microrganismo da invenção é derivado. Por exemplo, um gene endógeno é um gene que está presente nativamente no microrganismo de tipo selvagem ou parental do qual o microrganismo da invenção é derivado. Em uma modalidade, a expressão de um gene endógeno pode ser controlada por um elemento regulador exógeno, como um promotor exógeno.
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[0019] “Exógeno” se refere a um ácido nucleico ou proteína que se origina fora do microrganismo da invenção. Por exemplo, uma enzima ou gene exógeno pode ser artificial ou recombinantemente criado e introduzido ou expresso no microrganismo da invenção. Uma enzima ou gene exógeno também pode ser isolado de um microrganismo heterólogo e introduzido ou expresso no microrganismo da invenção. Os ácidos nucleicos exógenos podem ser adaptados para integrar no genoma do microrganismo da invenção ou permanecer em um estado extracromossômico no microrganismo da invenção, por exemplo, em um plasmídeo. “Heterólogo” refere-se a um ácido nucleico ou proteína que é derivado de uma cepa ou espécie diferente e introduzido ou expresso no microrganismo da invenção.
[0020] Os termos “polinucleotídeo”, “nucleotídeo”, “sequência nucleotídica”, “ácido nucleico” e “oligonucleotídeo” são usados de forma intercambiável. Eles se referem a uma forma polimérica de nucleotídeos de qualquer comprimento, desoxirribonucleotídeos ou ribonucleotídeos, ou seus análogos. Os polinucleotídeos podem ter qualquer estrutura tridimensional e podem desempenhar qualquer função, conhecida ou desconhecida. A seguir, exemplos não limitativos de polinucleotídeos: regiões codificantes ou não codificadoras de um gene ou fragmento de gene, loci (locus) definidos a partir da análise de ligação, éxons, íntrons, RNA mensageiro (mRNA), RNA de transferência, RNA ribossômico, RNA de interferência curta (siRNA), RNA de grampo curto (shRNA), micro-RNA (miRNA), ribozimas, cDNA, polinucleotídeos recombinantes, polinucleotídeos ramificados, plasmídeos, vetores, DNA isolado de qualquer sequência, RNA isolado de qualquer sequência, RNA isolado de qualquer sequência, sondas de ácido nucleico e iniciadores. Um polinucleotídeo pode compreender um ou mais nucleotídeos modificados, como nucleotídeos metilados ou análogos de nucleotídeos. Se presente, modificações na estrutura nucleotídica podem ser transmitidas antes ou após a montagem do polímero. A sequência de nucleotídeos pode ser
7 / 294 interrompida por componentes não nucleotídicos. Um polinucleotídeo pode ser adicionalmente modificado após polimerização, como por conjugação com um componente de marcação.
[0021] Como usado aqui, “expressão” refere-se ao processo pelo qual um polinucleotídeo é transcrito de um modelo de DNA (como para dentro e mRNA ou outro transcrito de RNA) e/ou o processo pelo qual um mRNA transcrito é subsequentemente traduzido em peptídeos, polipeptídeos ou proteínas. Transcrições e polipeptídeos codificados podem ser coletivamente referidos como “produtos genéticos”.
[0022] Os termos “polipeptídeo”, “peptídeo” e “proteína” são usados aqui de forma intercambiável para se referir a polímeros de aminoácidos de qualquer comprimento. O polímero pode ser linear ou ramificado, pode compreender aminoácidos modificados e pode ser interrompido por não aminoácidos. Os termos também abrangem um polímero de aminoácido que foi modificado; por exemplo, formação de ligação dissulfeto, glicosilação, lipidação, acetilação, fosforilação ou qualquer outra manipulação, como conjugação com um componente de marcação. Como usado aqui, o termo “aminoácido” inclui aminoácidos naturais e/ou não naturais ou sintéticos, incluindo glicina e os isômeros ópticos D ou L, e análogos de aminoácidos e peptidomiméticos.
[0023] “Atividade enzimática” ou simplesmente “atividade” refere-se amplamente à atividade enzimática, incluindo, entre outros, à atividade de uma enzima, à quantidade de uma enzima ou à disponibilidade de uma enzima para catalisar uma reação. Por conseguinte, “aumentar” a atividade enzimática inclui aumentar a atividade de uma enzima, aumentar a quantidade de uma enzima ou aumentar a disponibilidade de uma enzima para catalisar uma reação. Da mesma forma, “diminuir” a atividade da enzima inclui diminuir a atividade de uma enzima, diminuir a quantidade de uma enzima ou diminuir a disponibilidade de uma enzima para catalisar uma reação.
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[0024] “Mutado” refere-se a um ácido nucleico ou proteína que foi modificado no microrganismo da invenção em comparação com o microrganismo do tipo selvagem ou parental do qual o microrganismo da invenção é derivado. Em uma modalidade, a mutação pode ser uma exclusão, inserção ou substituição em um gene que codifica uma enzima. Em outra modalidade, a mutação pode ser uma exclusão, inserção ou substituição de um ou mais aminoácidos em uma enzima.
[0025] “Gene rompido” refere-se a um gene que tenha sido modificado de algum modo para reduzir ou eliminar a expressão do gene, atividade reguladora do gene ou a atividade de uma proteína ou enzima codificada. O rompimento pode inativar parcialmente, inativar totalmente ou deletar o gene ou enzima. O rompimento pode ser uma mutação knockout (KO) que elimina completamente a expressão ou atividade de um gene, proteína ou enzima. O rompimento também pode ser um knockout que reduz, mas não elimina completamente, a expressão ou atividade de um gene, proteína ou enzima. O rompimento pode ser qualquer coisa que reduz, previne ou bloqueia a biossíntese de um produto produzido por uma enzima. O rompimento pode incluir, por exemplo, uma mutação em um gene que codifica uma proteína ou uma enzima, uma mutação em um elemento regulador genético envolvido na expressão de um gene que codifica uma enzima, a introdução de um ácido nucleico que produz um proteína que reduz ou inibe a atividade de uma enzima ou a introdução de um ácido nucleico (por exemplo, RNA antissenso, RNAi, TALEN, siRNA, CRISPR ou CRISPRi) ou proteína que inibe a expressão de uma proteína ou enzima. O rompimento pode ser introduzido usando qualquer método conhecido na técnica. Para os fins da presente invenção, os rompimentos são geradas em laboratório e não ocorrem naturalmente.
[0026] A “otimização de códon” refere-se à mutação de um ácido nucleico, como um gene, para tradução otimizada ou melhorada do ácido
9 / 294 nucleico em uma cepa ou espécie específica. A otimização do códon pode resultar em taxas de tradução mais rápidas ou maior precisão na tradução. Em uma modalidade preferencial, os genes da invenção são otimizados por códon para expressão em Clostridium, particularmente Clostridium autoethanogenum, Clostridium ljungdahlii ou Clostridium ragsdalei. Em uma outra modalidade preferencial, os genes da invenção são otimizados por códon para expressão em Clostridium autoethanogenum LZ1561, que é depositado sob o número de acesso DSMZ DSM23693.
[0027] “Superexpresso” refere-se a um aumento na expressão de um ácido nucleico ou proteína no microrganismo da invenção em comparação com o microrganismo do tipo selvagem ou parental do qual o microrganismo da invenção é derivado. A superexpressão pode ser alcançada por qualquer meio conhecido na técnica, incluindo a modificação do número de cópias de genes, taxa de transcrição de genes, taxa de tradução de genes ou taxa de degradação de enzimas.
[0028] O termo “variantes” inclui ácidos nucleicos e proteínas cuja sequência varia da sequência de um ácido nucleico e proteína de referência, como uma sequência de um ácido nucleico e proteína de referência divulgados na técnica anterior ou aqui exemplificados. A invenção pode ser praticada utilizando ácidos nucleicos variantes ou proteínas que desempenham substancialmente a mesma função que o ácido nucleico ou proteína de referência. Por exemplo, uma proteína variante pode desempenhar substancialmente a mesma função ou catalisar substancialmente a mesma reação que uma proteína de referência. Um gene variante pode codificar a mesma ou substancialmente a mesma proteína que um gene de referência. Um promotor de variante pode ter substancialmente a mesma capacidade de promover a expressão de um ou mais genes que um promotor de referência.
[0029] Tais ácidos nucleicos ou proteínas podem ser referidos aqui como “variantes funcionalmente equivalentes”. A título de exemplo, variantes
10 / 294 funcionalmente equivalentes de um ácido nucleico podem incluir variantes alélicas, fragmentos de um gene, genes mutados, polimorfismos e similares. Genes homólogos de outros microrganismos também são exemplos de variantes funcionalmente equivalentes. Esses incluem genes homólogos em espécies como Clostridium acetobutylicum, Clostridium beijerinckii ou Clostridium ljungdahlii, os detalhes desses estão disponíveis publicamente em sites como o Genbank ou o NCBI. Variantes funcionalmente equivalentes também incluem ácidos nucleicos cuja sequência varia como resultado da otimização de códons para um microrganismo específico. Uma variante funcionalmente equivalente de um ácido nucleico terá de preferência pelo menos aproximadamente 70%, aproximadamente 80%, aproximadamente 85%, aproximadamente 90%, aproximadamente 95%, aproximadamente98%, ou maior identidade de sequência do ácido nucleico (percentagem de homologia) com o ácido nucleico referenciado. Uma variante funcionalmente equivalente de uma proteína terá de preferência pelo menosaproximadamente 70%, aproximadamente 80%, aproximadamente 85%, aproximadamente 90%, aproximadamente 95%, aproximadamente 98%, ou maior identidade de sequência do ácido nucleico (percentagem de homologia) com a proteína referenciada. A equivalência funcional de um ácido nucleico ou proteína variante pode ser avaliada usando qualquer método conhecido na técnica.
[0030] “Complementaridade” refere-se à capacidade de um ácido nucleico para formar ligações de hidrogênio com outra sequência de ácidos nucleicos pelo Watson-Crick tradicional ou por outros tipos não tradicionais. Uma complementaridade percentual indica a porcentagem de resíduos em uma molécula de ácido nucleico que pode formar ligações de hidrogênio (por exemplo, emparelhamento de bases Watson-Crick) com uma segunda sequência de ácido nucleico (por exemplo, 5, 6, 7, 8, 9, 10 em 10 sendo 50%, 60%, 70%, 80%, 90% e 100% complementares). “Perfeitamente complementar” significa que todos os resíduos contíguos de uma sequência de
11 / 294 ácidos nucleicos se ligarão ao hidrogênio com o mesmo número de resíduos contíguos em uma segunda sequência de ácidos nucleicos. “Substancialmente complementar”, conforme usado aqui, refere-se a um grau de complementaridade que é pelo menos 60%, 65%, 70%, 75%, 80%, 85%, 90%, 95%, 97%, 98%, 99% ou 100% em uma região de 8, 9, 10, 11, 12, 13, 14, 15, 16, 17, 18, 19, 20, 21, 22, 23, 24, 25, 30, 35, 40, 45, 50 ou mais nucleotídeos, ou refere-se a dois ácidos nucleicos que hibridizam sob condições rigorosas.
[0031] “Hibridização” refere-se a uma reação na qual um ou mais polinucleotídeos reagem para formar um complexo que é estabilizado via ligação de hidrogênio entre as bases dos resíduos de nucleotídeos. A ligação de hidrogênio pode ocorrer por emparelhamento de bases Watson Crick, ligação de Hoogstein ou de qualquer outra maneira específica da sequência. O complexo pode compreender duas cadeias que formam uma estrutura dúplex, três ou mais cadeias que formam um complexo de múltiplas cadeias, uma única cadeia auto-hibridante ou qualquer combinação dos mesmos. Uma reação de hibridação pode constituir uma etapa de um processo mais extenso, como o início da PCR ou a clivagem de um polinucleotídeo por uma enzima. Uma sequência capaz de hibridizar com uma determinada sequência é referida como o “complemento” da sequência fornecida.
[0032] Os ácidos nucleicos podem ser entregues a um microrganismo da invenção usando qualquer método conhecido na técnica. Por exemplo, os ácidos nucleicos podem ser entregues como ácidos nucleicos na forma nua ou podem ser formulados com um ou mais agentes, tais como lipossomas. Os ácidos nucleicos podem ser DNA, RNA, cDNA ou combinações dos mesmos, conforme apropriado. Inibidores de restrição podem ser utilizados em certas modalidades. Os vetores adicionais podem incluir plasmídeos, vírus, bacteriófagos, cosmídeos e cromossomos artificiais. Em uma modalidade preferencial, os ácidos nucleicos são entregues ao microrganismo da invenção
12 / 294 utilizando um plasmídeo. A título de exemplo, a transformação (incluindo transdução ou transfecção) pode ser alcançada por eletroporação, ultrassonografia, transformação mediada por polietileno glicol, competência química ou natural, transformação de protoplastos, indução de profago ou conjugação. Em certas modalidades que têm sistemas de enzimas de restrição ativas, pode ser necessário metilar um ácido nucleico antes da introdução do ácido nucleico para dentro de um microrganismo.
[0033] Além disso, os ácidos nucleicos podem ser projetados para compreender um elemento regulador, como um promotor, para aumentar ou controlar a expressão de um ácido nucleico específico. O promotor pode ser um promotor constitutivo ou um promotor induzível. Idealmente, o promotor é um promotor da via Wood-Ljungdahl, um promotor de ferredoxina, um promotor de piruvato: ferredoxina oxidorredutase, um promotor de complexo de Rnf, um promotor de operão de complexo Rnf, um promotor de operão de ATP sintase ou um promotor de operão de fosfotransacetilase/acetato quinase.
[0034] Um “microrganismo” é um organismo microscópico, especialmente uma bactéria, arceia, vírus ou fungo. O microrganismo da invenção é tipicamente uma bactéria. Aqui, a recitação de “microrganismo” deve ser tomada para abranger “bactéria”.
[0035] Um “microrganismo parental” é um microrganismo usado para gerar um microrganismo da invenção. O microrganismo parental pode ser um microrganismo de ocorrência natural (ou seja, um microrganismo do tipo selvagem) ou um microrganismo que foi modificado anteriormente (ou seja, um microrganismo mutante ou recombinante). O microrganismo da invenção pode ser modificado para expressar ou superexpressar uma ou mais enzimas que não foram expressas ou superexpressas no microrganismo parental. Da mesma forma, o microrganismo da invenção pode ser modificado para conter um ou mais genes que não estavam contidos pelo microrganismo parental. O microrganismo da invenção também pode ser modificado para não expressar
13 / 294 ou expressar quantidades mais baixas de uma ou mais enzimas que foram expressas no microrganismo parental. Em uma modalidade, o microrganismo parental é Clostridium autoethanogenum, Clostridium ljungdahlii ou Clostridium ragsdalei. Em uma modalidade preferencial, o microrganismo parental é o Clostridium autoethanogenum LZ1561, que foi depositado em 7 de junho de 2010 na Deutsche Sammlung von Mikroorganismen und Zellkulturen GmbH (DSMZ), localizada na Inhoffenstraß 7B, D-38124 Braunschwieg, Alemanha, em 7 de junho de 2010 sob os termos do Tratado de Budapeste e número de acesso concedido DSM23693. Essa cepa é descrita no Pedido de Patente Internacional n° PCT/NZ2011/000144, publicado como WO 2012/015317.
[0036] O termo “derivado de” indica que um ácido nucleico, proteína ou microrganismo é modificado ou adaptado de um ácido nucleico, proteína ou microrganismo diferente (por exemplo, um parental ou do tipo selvagem), de modo a produzir um novo ácido nucleico, proteína ou microrganismo. Tais modificações ou adaptações incluem tipicamente inserção, deleção, mutação ou substituição de ácidos nucleicos ou genes. Geralmente, o microrganismo da invenção é derivado de um microrganismo parental. Em uma modalidade, o microrganismo da invenção é derivado de Clostridium autoethanogenum, Clostridium ljungdahlii ou Clostridium ragsdalei. Em uma modalidade preferencial, o microrganismo da invenção é derivado de Clostridium autoethanogenum LZ1561, que é depositado sob o número de acesso DSMZ DSM23693.
[0037] O microrganismo da invenção pode ainda ser classificado com base em características funcionais. Por exemplo, o microrganismo da invenção pode ser ou pode ser derivado de um microrganismo de fixação de C1, um anaeróbio, um acetogênio, um etanologênio, um carboxidotrófico e/ou um metanotrófico. A Tabela 1 fornece uma lista representativa de microrganismos e identifica suas características funcionais.
14 / 294 Tabela 1 Carboxidotrófico Wood-Ljungdahl Fixação de C1 Etanologênio Autotrófico Acetogênio Anaeróbio Acetobacterium woodii + + + + +/- 1 - - Alkalibaculum bacchii + + + + + + + Blautia producta + + + + - + + Butyribacterium methylotrophicum + + + + + + + Clostridium aceticum + + + + - + + Clostridium autoethanogenum + + + + + + + Clostridium carboxidivorans + + + + + + + Clostridium coskatii + + + + + + + Clostridium drakei + + + + - + + Clostridium formicoaceticum + + + + - + + Clostridium ljungdahlii + + + + + + + Clostridium magnum + + + + - + +/- 2 Clostridium ragsdalei + + + + + + + Clostridium scatologenes + + + + - + + Eubacterium limosum + + + + - + + Moorella thermautotrophica + + + + + + + Moorella thermoacetica (anteriormente + + + + -3 + + Clostridium thermoaceticum) Oxobacter pfennigii + + + + - + + Sporomusa ovata + + + + - + +/- 4 Sporomusa silvacetica + + + + - + +/- 5 Sporomusa sphaeroides + + + + - + +/- 6 Thermoanaerobacter kiuvi + + + + - + - 1 Acetobacterium woodi pode produzir etanol a partir de frutose, mas não a partir de gás. 2 Não foi investigado se o Clostridium magnum pode crescer em CO. 3 Uma cepa de Moorella thermoacetica, Moorella sp. HUC22-1, foi relatada para produzir etanol a partir de gás. 4 Não foi investigado se Sporomusa ovata pode crescer em CO. 5 Não foi investigado se Sporomusa silvacetica pode crescer em CO. 6 Não foi investigado se Sporomusa sphaeroides pode crescer em CO.
[0038] “Wood-Ljungdahl” refere-se à via de fixação de carbono de Wood-Ljungdahl, como descrito, por exemplo, por Ragsdale, Biochim Biophys Acta, 1784: 1.873 a 1.898, 2008. “Microrganismo de Wood- Ljungdahl” refere-se, previsivelmente, a um microrganismo contendo a via Wood-Ljungdahl. O microrganismo da invenção é um microrganismo de Wood-Ljungdahl, geralmente uma bactéria Wood-Ljungdahl. Geralmente, o microrganismo da invenção contém uma via nativa de Wood-Ljungdahl. Aqui, uma via de Wood-Ljungdahl pode ser uma via de Wood-Ljungdahl nativa e não modificada ou pode ser uma via de Wood-Ljungdahl com algum grau de modificação genética (por exemplo, superexpressão, expressão heteróloga,
15 / 294 knockout, etc.), enquanto ainda funciona para converter CO, CO2 e/ou H2 em acetil-CoA.
[0039] “C1” refere-se a uma molécula de um teor de carbono, por exemplo, CO, CO2, CH4 ou CH3OH. “C1-oxigenado” refere-se a uma molécula de um carbono que também compreende pelo menos um átomo de oxigênio, por exemplo, CO, CO2 ou CH3OH. “Fonte de carbono C1” refere-se a uma molécula de carbono que serve como fonte parcial ou única de carbono para o microrganismo da invenção. Por exemplo, uma fonte de carbono C1 pode compreender um ou mais de CO, CO2, CH4, CH3OH ou CH2O2. De preferência, a fonte de carbono C1 compreende um ou ambos de CO e CO2. Um “microrganismo de fixação C1” é um microrganismo capaz de produzir um ou mais produtos a partir de uma fonte de carbono C1. Tipicamente, o microrganismo da invenção é uma bactéria fixadora de C1. Em uma modalidade preferencial, o microrganismo da presente invenção é derivado de um microrganismo de fxação de C1 identificado na Tabela 1.
[0040] Um “anaeróbio” é um microrganismo que não necessita de oxigênio para o crescimento. Um anaeróbio pode reagir negativamente ou até morrer se houver oxigênio acima de um determinado limite. No entanto, alguns anaeróbios são capazes de tolerar baixos níveis de oxigênio (por exemplo, 0,000001 a 5% de oxigênio). Tipicamente, o microrganismo da invenção é um anaeróbio. Em uma modalidade preferencial, o microrganismo da presente invenção é derivado de um anaeróbio identificado na Tabela 1.
[0041] Um “acetogênio” é um microrganismo que produz ou é capaz de produzir acetato (ou ácido acético) como um produto da respiração anaeróbica. Normalmente, os acetogênios são bactérias obrigatoriamente anaeróbicas que usam a via Wood-Ljungdahl como principal mecanismo para conservação de energia e síntese de produtos derivados de acetil-CoA e acetil- CoA, como o acetato (Ragsdale, Biochim Biophys Acta, 1784: 1.873 a 1.898, 2008). Os acetogênios usam a via acetil-CoA como um mecanismo (1) para a
16 / 294 síntese redutiva de acetil-CoA a partir do CO2, (2) processo terminal de aceitação de elétrons e conservação de energia, (3) mecanismo para a fixação (assimilação) de CO2 na síntese de carbono celular (Drake, Prokaryotes Acetogenic, Em: The Prokaryotes, 3ª edição, página 354, Nova Iorque, NY, 2006). Todos os acetogênios que ocorrem naturalmente são fixadores de C1, anaeróbicos, autotróficos e não metanotróficos. Tipicamente, o microrganismo da invenção é um acetogênio. Em uma modalidade preferencial, o microrganismo da invenção é derivado de um acetogênio identificado na Tabela 1.
[0042] Um “etanologênio” é um microrganismo que produz ou é capaz de produzir etanol. Tipicamente, o microrganismo da invenção é um etanologênio. Em uma modalidade preferencial, o microrganismo da invenção é derivado a partir de um etaologênio identificado na Tabela 1.
[0043] Um “autótrofo” é um microrganismo capaz de crescer na ausência de carbono orgânico. Em vez disso, os autotróficos usam fontes inorgânicas de carbono, como CO e/ou CO2. Tipicamente, o microrganismo da invenção é um autotrófico. Em uma modalidade preferencial, o microrganismo da invenção é derivado de um autótrofo identificados na Tabela 1.
[0044] Um “carboxidotrófico” é um microrganismo capaz de utilizar o CO como única fonte de carbono e energia. Tipicamente, o microrganismo da invenção é um carboxidotrófico. Em uma modalidade preferencial, o microrganismo da invenção é derivado de um carboxidotrófico identificado na Tabela 1.
[0045] Um “metanotrófico” é um microrganismo capaz de utilizar o metano como única fonte de carbono e energia. Em certas modalidades, o microrganismo da invenção é um metanotrófico ou é derivado de um metanotrófico. Em outras modalidades, o microrganismo da invenção não é um metanotrófico ou não é derivado de um metanotrófico.
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[0046] Mais amplamente, o microrganismo da invenção pode ser derivado de qualquer gênero ou espécie identificado na Tabela 1. Por exemplo, o microrganismo pode ser um membro de um gênero selecionado do grupo que consiste em Acetobacterium, Alkalibaculum, Blautia, Butyribacterium, Clostridium, Eubacterium, Moorella, Oxobacter, Sporomusa e Thermoanaerobacter. Em particular, o microrganismo pode ser derivado de uma bactéria parental selecionada do grupo que consiste em Acetobacterium woodii, Alkalibaculum bacchii, Blautia producta, Butyribacterium methylotrophicum, Clostridium aceticum, Clostridium autoethanogenum, Clostridium carboxidivorans, Clostridium coskatii, Clostridium drakei, Clostridium formicoaceticum, Clostridium ljungdahlii, Clostridium magnum, Clostridium ragsdalei, Clostridium scatologenes, Eubacterium limosum, Moorella thermautotrophica, Moorella thermoacetica, Oxobacter pfennigii, Sporomusa ovata, Sporomusa silvacetica, Sporomusa sphaeroides, e Thermoanaerobacter kiuvi.
[0047] Em uma modalidade preferencial, o microrganismo da invenção é derivado do aglomerado de Clostridia compreendendo as espécies Clostridium autoethanogenum, Clostridium ljungdahlii e Clostridium ragsdalei. Essas espécies foram primeiramente relatadas e caracterizadas por Abrini, Arch Microbiol, 161: 345 a 351, 1994 (Clostridium autoethanogenum), Tanner, Int J System Bacteriol, 43: 232 a 236, 1993 (Clostridium ljungdahlii), e Huhnke, WO 2008/028055 (Clostridium ragsdalei).
[0048] Essas três espécies têm muitas semelhanças. Em particular, essas espécies são todos membros fixadores de C1, anaeróbios, acetogênicos, etanologênicos e carboxidotróficos do gênero Clostridium. Essas espécies têm genótipos similares e fenótipos e modos de conservação de energia e metabolismo fermentativo. Além disso, essas espécies estão agrupadas no grupo I de homologia de rRNA da clostridialidade com o DNA 16S rRNA
18 / 294 mais de 99% idêntico, têm um teor de DNA G + C de cerca de 22 a 30% em mol, são gram-positivas, têm morfologia e tamanho (células de crescimento logarítmico, entre 0,5 e 0,7 x 3 a 5 μm), são mesófilos (crescem otimamente de 30 a 37 ° C), têm gamas de pH semelhantes de cerca de 4 a 7,5 (com um pH ideal de cerca de 5,5 a 6), não possui citocromos e economiza energia por meio de um complexo Rnf. Além disso, a redução de ácidos carboxílicos nos seus álcoois correspondentes foi demonstrada nessas espécies (Perez, Biotechnol Bioeng, 110: 1.066 a 1.077, 2012). É importante ressaltar que todas essas espécies também apresentam forte crescimento autotrófico em gases contendo CO, produzem etanol e acetato (ou ácido acético) como principais produtos de fermentação e produzem pequenas quantidades de 2,3- butanodiol e ácido lático sob certas condições.
[0049] No entanto, essas três espécies também apresentam diversas diferenças. Essas espécies foram isoladas de diferentes fontes: Clostridium autoethanogenum de intestino de coelho, Clostridium ljungdahlii a partir de resíduos de galinheiro e Clostridium ragsdalei de sedimentos de água doce. Essas espécies diferem em utilização de vários açúcares (por exemplo, ramnose, arabinose), ácidos (por exemplo, o gluconato, o citrato), ácidos aminados (por exemplo, arginina, histidina), e outros substratos (por exemplo, betaína, butanol). Além disso, essas espécies diferem na auxotrofia de certas vitaminas (por exemplo, tiamina, biotina). Essas espécies têm diferenças nas sequências nucleicas e de aminoácidos dos genes e proteínas da via Wood- Ljungdahl, embora a organização geral e o número desses genes e proteínas sejam os mesmos em todas as espécies (Köpke, Curr Opin Biotechnol, 22: 320-325, 2011).
[0050] Assim, em resumo, muitas das características de Clostridium autoethanogenum, Clostridium ljungdahlii ou Clostridium ragsdalei não são específicas para essa espécie, mas são características gerais para esse agrupamento de membros defixação de C1, anaeróbicos, acetogênicos,
19 / 294 etanologênicos e carboxidotróficos do gênero Clostridium. No entanto, como essas espécies são, de fato, distintas, a modificação genética ou manipulação de uma dessas espécies pode não ter um efeito idêntico em outra dessas espécies. Por exemplo, podem ser observadas diferenças no crescimento, desempenho ou produção do produto.
[0051] O microrganismo da invenção também pode ser derivado de um isolado ou mutante de Clostridium autoethanogenum, Clostridium ljungdahlii ou Clostridium ragsdalei. Os isolados e mutantes de Clostridium autoethanogenum incluem JA1-1 (DSM10061) (Abrini, Arch Microbiol, 161: 345 a 351, 1994), LBS1560 (DSM19630) (WO 2009/064200) e LZ1561 (DSM23693) (WO 2012/015317). Os isolados e mutantes de Clostridium ljungdahlii incluem ATCC 49587 (Tanner, Int J Syst Bacteriol, 43: 232 a 236, 1993), PETCT (DSM13528, ATCC 55383), ERI‐2 (ATCC 55380) (US 5.593.886), C‐01 (ATCC 55988) (US 6.368.819), O‐52 (ATCC 55989) (US 6.368.819) e OTA‐1 (Tirado‐Acevedo, Production of bioethanol from synthesis gas using Clostridium ljungdahlii, Tese de PhD, Universidade do Estado da Carolina do Norte, 2010). Os isolados e mutantes de Clostridium ragsdalei incluem PI 1 (ATCC BAA-622, ATCC PTA-7826) (WO 2008/028055).
[0052] “Substrato” refere-se a uma fonte de carbono e/ou energia para o microrganismo da invenção. Tipicamente, o substrato é gasoso e compreende uma fonte de carbono C1, por exemplo, CO, CO2 e/ou CH4. De um modo preferencial, o substrato compreende uma fonte de carbono C1 de CO ou CO + CO2. O substrato pode ainda compreender outros componentes diferentes de carbono, tais como H2, N2 ou elétrons.
[0053] O substrato compreende geralmente, pelo menos, uma certa quantidade de CO, tal como cerca de 1, 2, 5, 10, 20, 30, 40, 50, 60, 70, 80, 90 ou 100% em mol de CO. O substrato pode compreender uma faixa de CO, como cerca de 20 a 80, 30 a 70 ou 40 a 60% em mol de CO. De preferência, o
20 / 294 substrato compreende cerca de 40 a 70% em mol de CO (por exemplo, usina siderúrgica ou gás de alto forno), cerca de 20 a 30% em mol de CO (por exemplo, gás básico no forno de oxigênio) ou cerca de 15 a 45% em mol de CO (por exemplo, gás de síntese). Em algumas modalidades, o substrato pode compreender uma quantidade relativamente baixa de CO, como cerca de 1 a 10 ou 1 a 20% em mol de CO. O microrganismo da invenção tipicamente converte pelo menos uma porção do CO no substrato em um produto. Em algumas modalidades, o substrato compreende nenhum ou substancialmente nenhum (<1% em mol) de CO.
[0054] O substrato pode compreender uma certa quantidade de H2. Por exemplo, o substrato pode compreender cerca de 1, 2, 5, 10, 15, 20, ou 30% em mol de H2. Em algumas modalidades, o substrato pode compreender uma quantidade relativamente elevada de H2, tal como cerca de 60, 70, 80, ou 90% em mol de H2. De acordo com outras modalidades, o substrato compreende nenhum ou substancialmente nenhum (<1% em mol) de H2.
[0055] O substrato pode compreender uma certa quantidade de CO2. Por exemplo, o substrato pode compreender cerca de 1 a 80 ou 1 a 30% em mol de CO2. Em algumas modalidades, o substrato pode compreender menos do que cerca de 20, 15, 10, ou 5% em mol de CO2. Em outra modalidade, o substrato compreende nenhum ou substancialmente nenhum (<1% em mol) de CO2.
[0056] Embora o substrato seja tipicamente gasoso, o substrato também pode ser fornecido em formas alternativas. Por exemplo, o substrato pode ser dissolvido em um líquido saturado com um gás contendo CO usando um gerador de dispersão de microbolhas. A título de exemplo adicional, o substrato pode ser adsorvido em um suporte sólido.
[0057] O substrato e/ou a fonte de carbono C1 pode ser um gás residual obtido como subproduto de um processo industrial ou de alguma outra fonte, como gases de escape de automóveis ou gaseificação de
21 / 294 biomassa. Em certas modalidades, o processo industrial é selecionado do grupo que consiste na fabricação de produtos de metais ferrosos, como uma fábrica de aço, fabricação de produtos não ferrosos, refino de petróleo, gaseificação de carvão, produção de energia elétrica, produção de negro de carbono, produção de negro de carbono, produção de amônia, metanol produção e fabricação de coque. Nessas modalidades, o substrato e/ou a fonte de carbono C1 podem ser capturados do processo industrial antes de serem emitidos para a atmosfera, utilizando qualquer método conveniente.
[0058] O substrato e/ou a fonte de carbono C1 podem ser gás de síntese, tais como gás de síntese obtidO por gaseificação de resíduos de carvão ou refinaria, gaseificação de biomassa ou material lignocelulósico ou reforma do gás natural. Em outra modalidade, os gases de síntese podem ser obtidos a partir da gaseificação de resíduos sólidos urbanos ou resíduos sólidos industriais.
[0059] A composição do substrato pode ter um impacto significativo na eficiência e/ou custo da reação. Por exemplo, a presença de oxigênio (O2) pode reduzir a eficiência de um processo de fermentação anaeróbica. Dependendo da composição do substrato, pode ser desejável tratar, esfregar ou filtrar o substrato para remover quaisquer impurezas indesejadas, como toxinas, componentes indesejados ou partículas de poeira e/ou aumentar a concentração de componentes desejáveis.
[0060] Em certas modalidades, a fermentação é realizada na ausência de substratos de carboidratos, como açúcar, amido, lignina, celulose ou hemicelulose.
[0061] O microrganismo da invenção pode ser cultivado para produzir um ou mais produtos. Por exemplo, o microrganismo da invenção pode produzir ou pode ser manipulado para produzir etanol (WO 2007/117157), acetato (WO 2007/117157), butanol (WO 2008/115080 e WO 2012/053905), butirato (WO 2008/115080), 2,3-butanodiol (WO 2009/151342 e WO
22 / 294 2016/094334), lactato (WO 2011/112103), buteno (WO 2012/024522), butadieno (WO 2012/024522), metiletilcetona (2-butanona) (WO 2012/024522 e WO 2013/185123), etileno (WO 2012/026833), acetona (WO 2012/115527), isopropanol (WO 2012/115527), lipídios (WO 2013/036147), 3-hidroxipropionato (3-HP) (WO 2013/180581), isopreno (WO 2013/180584), ácidos graxos (WO 2013/191567), 2-butanol (WO 2013/185123), 1,2-propanodiol (WO 2014/036152), 1-propanol (WO 2014/0369152), produtos derivados de corismato (WO 2016/191625), 3- hidroxibutirato (WO 2017/066498) e 1,3-butanodiol (WO 2017/0066498). Além de um ou mais produtos-alvo, o microrganismo da invenção também pode produzir etanol, acetato e/ou 2,3-butanodiol. Em certas modalidades, a própria biomassa microbiana pode ser considerada um produto.
[0062] Um “produto natural” é um produto produzido por um microrganismo geneticamente modificado. Por exemplo, etanol, acetato, e 2,3-butanodiol são produtos nativos de Clostridium autoethanogenum, Clostridium ljungdahlii e Clostridium ragsdalei. Um “produto não nativo” é um produto produzido por um microrganismo geneticamente modificado, mas não é produzido por um microrganismo geneticamente não modificado do qual o microrganismo geneticamente modificado é derivado.
[0063] Aqui, a referência a um ácido (por exemplo, ácido acético ou ácido 2-hidroxi-isobutírico) deve ser tomada para incluir também o sal correspondente (por exemplo, acetato ou 2-hidroxi-isobutirato).
[0064] “Seletividade” refere-se à razão entre a produção de um produto-alvo e a produção de todos os produtos de fermentação produzidos por um microrganismo. O microrganismo da invenção pode ser modificado para produzir produtos com uma certa seletividade ou com uma seletividade mínima. Em uma modalidade, um produto-alvo é responsável por pelo menos cerca de 5%, 10%, 15%, 20%, 30%, 50% ou 75% de todos os produtos de fermentação produzidos pelo microrganismo da invenção. Em uma
23 / 294 modalidade, o produto-alvo é responsável por pelo menos 10% de todos os produtos de fermentação produzidos pelo microrganismo da invenção, de modo que o microrganismo da invenção tenha uma seletividade para o produto-alvo de pelo menos 10%. Em outra modalidade, o produto-alvo é responsável por pelo menos 30% de todos os produtos de fermentação produzidos pelo microrganismo da invenção, de modo que o microrganismo da invenção tenha uma seletividade para o produto-alvo de pelo menos 30%.
[0065] “Aumentando a eficiência”, “aumento de eficiência” e similares incluem, mas não estão limitados a, aumento da taxa de crescimento, taxa ou volume de produção do produto, volume do produto por volume de substrato consumido ou seletividade do produto. A eficiência pode ser medida em relação ao desempenho do microrganismo parental a partir do qual o microrganismo da invenção é derivado.
[0066] Normalmente, a cultura é realizada em um biorreator. O termo “biorreator” inclui um dispositivo de cultura/fermentação que consiste em um ou mais vasos, torres ou arranjos de tubulação, como um reator de tanque agitado contínuo (CSTR), reator de célula imobilizada (ICR), reator de leito gotejador (TBR), bolha coluna, fermentador de elevação a gás, misturador estático ou outro recipiente ou outro dispositivo adequado para contato gás- líquido. Em algumas modalidades, o biorreator pode compreender um primeiro reator de crescimento e um segundo reator de cultura/fermentação. O substrato pode ser fornecido para um ou ambos os reatores. Como usado aqui, os termos “cultura” e “fermentação” são usados de forma intercambiável. Esses termos abrangem tanto a fase de crescimento quanto a fase de biossíntese do produto do processo de cultura/fermentação.
[0067] A cultura é geralmente mantida em um meio de cultura aquoso que contém nutrientes, vitaminas e/ou minerais suficientes para permitir o crescimento do microrganismo. Preferencialmente, o meio de cultura aquoso é um meio de crescimento microbiano anaeróbico, tal como um meio de
24 / 294 crescimento microbiano anaeróbico mínimo. Meios adequados são bem conhecidos na técnica.
[0068] A cultura/fermentação deve ser realizada, sob condições apropriadas, para a produção do produto-alvo. Tipicamente, a cultura/fermentação é realizada sob condições anaeróbicas. As condições de reação a serem consideradas incluem pressão (ou pressão parcial), temperatura, vazão de gás, vazão de líquido, pH da mídia, potencial redox da mídia, taxa de agitação (se estiver usando um reator de tanque agitado contínuo), nível de inóculo, concentrações máximas de substrato de gás para garantir esse gás na fase líquida não se torna limitante e as concentrações máximas do produto para evitar a inibição do produto. Em particular, a taxa de introdução do substrato pode ser controlada para garantir que a concentração de gás na fase líquida não se torne limitante, uma vez que os produtos podem ser consumidos pela cultura em condições limitadas a gás.
[0069] Operar um biorreator a pressões elevadas permite um aumento na taxa de transferência de massa de gás da fase gasosa para a fase líquida. Por conseguinte, é geralmente preferível realizar a cultura/fermentação a pressões superiores à pressão atmosférica. Além disso, uma vez que uma dada taxa de conversão de gás é, em parte, uma função do tempo de retenção do substrato e o tempo de retenção dita o volume necessário de um biorreator, o uso de sistemas pressurizados pode reduzir grandemente o volume do biorreactor necessária e, consequentemente, o custo de capital do equipamento de cultura/fermentação. Isso, por sua vez, significa que o tempo de retenção, definido como o volume de líquido no biorreator dividido pela taxa de fluxo de entrada de gás, pode ser reduzido quando os biorreatores são mantidos sob pressão elevada em vez de pressão atmosférica. As condições ótimas de reação dependerão parcialmente do microrganismo específico usado. No entanto, em geral, é preferível operar a fermentação a uma pressão superior à pressão atmosférica. Além disso, como uma dada taxa de conversão
25 / 294 de gás é, em parte, uma função do tempo de retenção do substrato e, por sua vez, ao atingir o tempo de retenção desejado dita o volume necessário de um biorreator, o uso de sistemas pressurizados pode reduzir bastante o volume do biorreator necessário, e, consequentemente, o custo de capital do equipamento de fermentação.
[0070] Em certas modalidades, a fermentação é realizada na ausência de luz ou na presença de uma quantidade de luz insuficiente para atender aos requisitos energéticos dos microrganismos fotossintéticos. Em certas modalidades, o microrganismo da invenção é um microrganismo não fotossintético.
[0071] Os produtos-alvo podem ser separados ou purificados a partir de um caldo de fermentação usando qualquer método ou combinação de métodos conhecidos na técnica, incluindo, por exemplo, destilação fracionada, evaporação, pervaporação, remoção de gás, separação de fases e fermentação extrativa, inclusive para, por exemplo, extração líquido-líquido. Em certas modalidades, os produtos-alvo são recuperados do caldo de fermentação removendo continuamente uma porção do caldo do biorreator, separando as células microbianas do caldo (convenientemente por filtração) e recuperando um ou mais produtos-alvo do caldo. Álcoois e/ou acetona podem ser recuperados, por exemplo, por destilação. Os ácidos podem ser recuperados, por exemplo, por adsorção em carvão ativado. As células microbianas separadas são preferencialmente devolvidas ao biorreator. O permeado sem células remanescentes após a remoção dos produtos-alvo também é de preferência devolvido ao biorreator. Nutrientes adicionais (como vitaminas do complexo B) podem ser adicionados ao permeado sem células para reabastecer o meio antes que ele retorne ao biorreator.
[0072] O microrganismo da invenção contém pelo menos um gene interrompido. Em algumas modalidades, o microrganismo da invenção contém mais de um gene interrompido, por exemplo, 2, 3, 4, 5, 6, 7, 8, 9, 10,
26 / 294 11, 12, 13, 14, 15, 16, 17, 18, 19, 20, 25, 30, 35, 40, 45, 50, 75, 100 ou 200 genes interrompidos. Por exemplo, o gene interrompido pode ser selecionado na Tabela 2. Embora números de acesso representativos sejam fornecidos para C. autoethanogenum, C. ljungdahlii e C. ragsdalei, uma pessoa versada na técnica seria capaz de identificar prontamente homólogos em outros microrganismos de Wood-Ljungdahl. Tabela 2 Clostridium ljungdahlii Clostridium ragsdalei autoethanogenum Clostridium N° Nome N° EC Gene (s) Gene (s) Gene (s) 1 Isopropilmalato/homocitrato/citramalato 2.3.1.182 CAETHG_27 CLJU_c0661 CLRAG_ sintases 51 0 18420 2 Apoproteína [NiFe]-hidrogenase I, CAETHG_08 CLJU_c2866 CLRAG_ subunidade grande 61 0 34740 3 Apoproteína [NiFe]-hidrogenase I, CAETHG_08 CLJU_c2867 CLRAG_ subunidade pequena 62 0 34750 4 N-acetiltransferase de ribossomo-proteína- CAETHG_16 CLJU_c3820 CLRAG_ alanina 76 0 20660 5 1-(5-fosforibosil)-5-[(5- 5.3.1.16 CAETHG_32 CLJU_c1171 CLRAG_1 fosforibosilamino)metilidenamino] 62 0 1830 imidazol-4-carboxamida isomerase 6 1-acil-sn-glicerol-3-fosfato aciltransferase 2.3.1.51 CAETHG_17 CLJU_c3928 CLRAG_ 73 0 21490 7 1-acil-sn-glicerol-3-fosfato aciltransferase 2.3.1.51 CAETHG_27 CLJU_c0660 CLRAG_ 50 0 18410 8 1-desoxi-D-xilulose 5-fosfato 1.1.1.267 CAETHG_33 CLJU_c1308 CLRAG_ redutoisomerase 91 0 10710 9 1-desoxi-D-xilulose-5-fosfato sintase 2.2.1.7, CAETHG_32 CLJU_c1116 CLRAG_
2.2.1.1 05 0 12300 10 1,2-diacilglicerol 3-alfa-glucosiltransferase CAETHG_00 CLJU_c1969 CLRAG_ 46 0 39450 11 Álcool desidrogenase, classe IV 1.1.1.1, CAETHG_10 CLJU_c3074 CLRAG_
1.1.1.72, 78 0 16180
1.1.1.21,
1.1.1.2 12 álcool desidrogenase 1.1.1.1, CAETHG_15 CLJU_c3593 CLRAG_
1.1.1.72, 00 0 06430
1.1.1.21,
1.1.1.2 13 Álcool desidrogenase, classe IV 1.1.1.1, CAETHG_36 CLJU_c1500 CLRAG_
1.1.1.72, 04 0 24350
1.1.1.21,
1.1.1.2 14 chaperonina GroES CAETHG_15 CLJU_c3720 CLRAG_ 73 0 36640 15 rRNA 16S (guanina527-N7)- CAETHG_21 CLJU_c4290 CLRAG_ metiltransferase 16 0 25710
27 / 294 16 Proteína da família HSP20 CAETHG_20 CLJU_c4270 CLRAG_ 94, 0, 25500 CAETHG_20 CLJU_c4269 95 0 17 2-C-metil-D-eritritol 2,4-ciclodifosfato 4.6.1.12 CAETHG_22 CLJU_c0157 CLRAG_ sintase 63 0 27230 18 2-C-metil-D-eritritol 4-fosfato 2.7.7.60 CAETHG_19 CLJU_c4128 CLRAG_ citidililtransferase 69 0 23470 19 2-isopropilmalato sintase 2.3.3.13, CAETHG_29 CLJU_c0905 CLRAG_
4.1.3.12 99 0 13980 20 2-ceto-3-desoxi-fosfogluconato aldolase 4.1.2.14, CAETHG_32 CLJU_c1163 CLRAG_
4.1.3.16, 54 0 25070
4.1.1.3 21 2-fosfossulfolactato fosfatase CAETHG_20 CLJU_c4188 CLRAG_ 17 0 04990 22 2,3,4,5-tetra-hidropiridina-2,6-dicarboxilato 2.3.1.89 CAETHG_13 CLJU_c3461 CLRAG_ N-acetiltransferase 57 0 14690 23 rRNA 23S m(2)A-2503 metiltransferase CAETHG_33 CLJU_c1260 CLRAG_1 42 0 1200 24 3-desidroquinato desidratase 4.2.1.10 CAETHG_08 CLJU_c2876 CLRAG_ 71 0 34840 25 3-desidroquinato sintase 4.2.3.4, CAETHG_09 CLJU_c2916 CLRAG_
4.6.1.3 08 0 35160 26 3-desoxi-D-arabino-heptulosonato-7- 2.5.1.54, CAETHG_09 CLJU_c2918 CLRAG_ fosfato sintase 4.1.2.15 10 0 35180 27 3-desoxi-D-arabino-heptulosonato-7- 2.5.1.54, CAETHG_35 CLJU_c1478 CLRAG_ fosfato sintase 4.1.2.15 78 0 20330 28 3-hidroxiacil-[acil-carreador-proteína] 4.2.1.61, CAETHG_20 CLJU_c4213 CLRAG_ desidratase 4.2.1.58, 43 0 05240
2.3.1.86,
4.2.1.59,
4.2.1.60,
2.3.1.85,
4.2.1.0 29 3-hidroxiacil-CoA desidrogenase 1.1.1.157 CAETHG_04 CLJU_c3730 CLRAG_ 20, 0, 17610 CAETHG_15 CLJU_c2356 86 0 30 3-isopropilmalato desidratase, subunidade 4.2.1.33 CAETHG_30 CLJU_c0906 CLRAG_ grande 00 0 13970 31 Subunidade pequena de 3- 4.2.1.33 CAETHG_30 CLJU_c0907 CLRAG_ isopropilmalato/(R)-2-metilmalato 01 0 13960 desidratase 32 3-isopropilmalato desidrogenase 1.1.1.85, CAETHG_17 CLJU_c3950 CLRAG_ 95, 0, 13950 CAETHG_30 CLJU_c0908 02 0 33 3-oxoacil-[acil-carreador-proteína] redutase 2.3.1.85, CAETHG_13 CLJU_c4216 CLRAG_
2.3.1.86, 92, 0, 26180
1.1.1.100, CAETHG_20 CLJU_c3494
1.1.1.0, 46 0 34 3-oxoacil-[acil-carreador-proteína] sintase 2.3.1.0, CAETHG_20 CLJU_c4215 CLRAG_ II 2.3.1.41, 45 0 05260
2.3.1.180,
2.3.1.86,
2.3.1.38,
2.3.1.85,
2.3.1.179
28 / 294 35 3-oxoacil-[acil-carreador-proteína] sintase-2.3.1.0, CAETHG_20 CLJU_c4219 CLRAG_ 3 2.3.1.41, 50 0 05300
2.3.1.180,
2.3.1.86,
2.3.1.38,
2.3.1.85,
2.3.1.179 36 3-fosfochiquimato 1-carboxiviniltransferase 2.5.1.19 CAETHG_09 CLJU_c2915 CLRAG_ 07 0 35150 37 5'-nucleotidase/3'- 3.1.3.5 CAETHG_13 CLJU_c3474 CLRAG_ nucleotidase/exopolifosfatase 71 0 14800 38 Proteína ribossômica SSU S10P CAETHG_19 CLJU_c4105 CLRAG_ 48 0 23240 39 Proteína ribossômica SSU S12P CAETHG_19 CLJU_c4109 CLRAG_ 52 0 23280 40 proteína ribossômica S13 da subunidade CAETHG_19 CLJU_c4080 CLRAG_ pequena 23 0 22990 41 proteína ribossômica S19 da subunidade CAETHG_19 CLJU_c4100 CLRAG_ pequena 43 0 23190 42 proteína ribossômica S3 da subunidade CAETHG_19 CLJU_c4098 CLRAG_ pequena 41 0 23170 43 proteína ribossômica S4 da subunidade CAETHG_19 CLJU_c4078 CLRAG_ pequena 21 0 22970 44 proteína ribossômica S5 da subunidade CAETHG_19 CLJU_c4087 CLRAG_ pequena 30 0 23060 45 Proteína ribossômica SSU S6P CAETHG_21 CLJU_c4279 CLRAG_ 05 0 25600 46 proteína ribossômica S7 da subunidade CAETHG_19 CLJU_c4108 CLRAG_ pequena 51 0 23270 47 proteína ribossômica S8 da subunidade CAETHG_19 CLJU_c4090 CLRAG_ pequena 33 0 23090 48 4-amino-4-desoxicorismato liase 4.1.3.38 CAETHG_15 CLJU_c3600 CLRAG_ 08 0 06500 49 4-aminobutirato aminotransferase/(S)-3- 2.6.1.19 CAETHG_01 CLJU_c2047 CLRAG_ amino-2-metilpropionato transaminase 29 0 19550 50 4-difosfocitidil-2-C-metil-D-eritritol- 2.7.1.148 CAETHG_23 CLJU_c0211 CLRAG_ quinase 16 0 27710 51 Difosfato de 4-hidroxi-3-metilbut-2-en-1- CAETHG_33 CLJU_c1310 CLRAG_ ila sintase 93 0 10690 52 Difosfato de 4-hidroxi-3-metilbut-2-enila 1.17.1.2 CAETHG_02 CLJU_c2132 CLRAG_ redutase 18 0 30880 53 4-hidroxitreonina-4-fosfato desidrogenase 1.1.1.262 CAETHG_24 CLJU_c0385 CLRAG_ 47 0 28920 54 5-(carboxiamino)imidazol ribonucleotídeo 4.1.1.21 CAETHG_29 CLJU_c0854 CLRAG_ mutase 48 0 07950 55 5-formiltetra-hidrofolato cicloligase 6.3.3.2 CAETHG_02 CLJU_c2190 CLRAG_ 86 0 31440 56 Região de ativação de metionina sintase CAETHG_29 CLJU_c0865 CLRAG_ dependente de vitamina B12 59 0 07840 57 proteína ribossômica L1 da subunidade CAETHG_19 CLJU_c4115 CLRAG_ grande 58 0 23340 58 proteína ribossômica L18 da subunidade CAETHG_19 CLJU_c4088 CLRAG_ grande 31 0 23070 59 proteína ribossômica L2 da subunidade CAETHG_19 CLJU_c4101 CLRAG_ grande 44 0 23200 60 proteína ribossômica L23 da subunidade CAETHG_19 CLJU_c4102 CLRAG_ grande 45 0 23210 61 proteína ribossômica L3 da subunidade CAETHG_19 CLJU_c4104 CLRAG_ grande 47 0 23230
29 / 294 62 proteína ribossômica L31 da subunidade CAETHG_23 CLJU_c0223 CLRAG_ grande 28 0 27830 63 proteína ribossômica L35 da subunidade CAETHG_13 CLJU_c3445 CLRAG_ grande 45 0 14530 64 proteína ribossômica L5 da subunidade CAETHG_19 CLJU_c4092 CLRAG_ grande 35 0 23110 65 proteína ribossômica L6 da subunidade CAETHG_19 CLJU_c4089 CLRAG_ grande 32 0 23080 66 proteína ribossômica L7/L12 da subunidade CAETHG_19 CLJU_c4113 CLRAG_ grande 56 0 23320 67 6-fosfofrutoquinase 2.7.1.11, CAETHG_06 CLJU_c0325 CLRAG_
2.7.1.145, 48, 0, 18670
2.7.1.144, CAETHG_24 CLJU_c2579
2.7.1.56 39 0 68 6,7-dimetil-8-ribitilumazina sintase 2.5.1.9 CAETHG_03 CLJU_c2206 CLRAG_ 04 0 31580 69 chaperonina GroEL CAETHG_15 CLJU_c3719 CLRAG_ 72 0 36630 70 Cassete de ligação ATP, subfamília B CAETHG_36 CLJU_c1517 CLRAG_ 19 0 24180 71 acetaldeído desidrogenase 1.2.1.10 CAETHG_18 CLJU_c3973 CLRAG_ 19, 0, 21980 CAETHG_32 CLJU_c1196 87 0 72 acetaldeído desidrogenase/álcool 1.1.1.1, CAETHG_37 CLJU_c1652 CLRAG_ desidrogenase 1.1.1.72, 47, 0, 33310
1.1.1.21, CAETHG_37 CLJU_c1651
1.1.1.2 48 0 73 acetato quinase 2.7.2.1, CAETHG_33 CLJU_c1278 CLRAG_1
2.7.2.15 59 0 1030 74 acetolactato sintase-1/2/3 subunidade 2.2.1.6, CAETHG_17 CLJU_c3892 CLRAG_ grande 4.1.3.18 40 0 21100 75 acetolactato sintase, subunidade grande 2.2.1.6, CAETHG_01 CLJU_c2042 CLRAG_
4.1.1.1, 24 0 25870
4.1.3.18,
1.2.4.1 76 acetolactato sintase, subunidade grande 2.2.1.6, CAETHG_04 CLJU_c2342 CLRAG_
4.1.1.1, 06 0 01330
4.1.3.18,
1.2.4.1 77 acetolactato sintase, subunidade pequena 2.2.1.6, CAETHG_01 CLJU_c2043 CLRAG_
4.1.1.1, 25 0 25860
4.1.3.18,
1.2.4.1 78 subunidade alfa da acetil-CoA carboxilase 6.4.1.2 CAETHG_20 CLJU_c4210 CLRAG_ carboxil transferase 40 0 05210 79 subunidade beta da acetil-CoA carboxilase 6.4.1.2 CAETHG_20 CLJU_c4211 CLRAG_ carboxil transferase 41 0 05220 80 acetilornitina/N-succinidiaminopimelato 2.6.1.11 CAETHG_02 CLJU_c2151 CLRAG_ aminotransferase 38 0 31070 81 aconitato hidratase CAETHG_04 CLJU_c2420 CLRAG_ 78 0 24890 82 Proteína contendo domínio ACT CAETHG_09 CLJU_c2924 CLRAG_ 17 0 35250 83 NADH-azoredutase dependente de FMN CAETHG_05 CLJU_c2515 CLRAG_ 83 0 03490 84 Adenina desaminase CAETHG_04 CLJU_c2394 CLRAG_ 60 0 17220 85 Adenina desaminase 3.5.4.2 CAETHG_06 CLJU_c2612 CLRAG_ 81 0 04200
30 / 294 86 Adenina desaminase 3.5.4.2 CAETHG_09 CLJU_c2990 CLRAG_ 89 0 35900 87 adenina fosforibosiltransferase 2.4.2.7, CAETHG_12 CLJU_c3372 CLRAG_
2.4.2.8 70 0 24560 88 adenosina desaminase 3.5.4.4 CAETHG_08 CLJU_c2828 CLRAG_ 25 0 34360 89 alfa-ribazol fosfatase CAETHG_14 CLJU_c3554 CLRAG_ 62 0 06070 90 adenosilcobinamida 2.7.7.62, CAETHG_14 CLJU_c3552 CLRAG_ quinase/adenosilcobinamida-fosfato 2.7.1.156 60 0 06050 guanililtransferase 91 ácido adenosilcobírico sintase (hidrólise da CAETHG_11 CLJU_c3202 CLRAG_ glutamina) 30 0 02650 92 S-adenosilmetionina descarboxilase 4.1.1.50 CAETHG_02 CLJU_c2131 CLRAG_ 17 0 30870 93 Adenilato quinase 2.7.4.11, CAETHG_19 CLJU_c4083 CLRAG_
2.7.4.3 26 0 23020 94 adenilossuccinato liase 4.3.2.2 CAETHG_34 CLJU_c1337 CLRAG_ 20 0 10420 95 Adenilossuccinato sintetase 6.3.4.4 CAETHG_20 CLJU_c4235 CLRAG_ 59 0 05460 96 ADP-ribose pirofosfatase 3.6.1.13 CAETHG_32 CLJU_c1124 CLRAG_ 14 0 12220 97 monóxido de carbono desidrogenase, 1.1.1.204, CAETHG_04 CLJU_c2360 CLRAG_ subunidade pequena 1.17.1.4 24 0 17570 98 monóxido de carbono desidrogenase, 1.1.1.204, CAETHG_04 CLJU_c2361 CLRAG_ subunidade média 1.17.1.4 25 0 17560 99 agmatina desiminase 3.5.3.12 CAETHG_20 CLJU_c4249 CLRAG_ 74 0 09010 100 regulador gênico acessório B CAETHG_08 CLJU_c2848 CLRAG_ 43 0, 34560 CLJU_c2753 0 101 alanina racemase 5.1.1.1 CAETHG_11 CLJU_c3212 CLRAG_ 40 0, 02750 CLJU_c1201 0, CLJU_c4039 0 102 alanil-tRNA sintetase CAETHG_32 CLJU_c1215 CLRAG_1 97 0 1650 103 Proteína contendo domínio rico em cisteína CAETHG_04 CLJU_c2412 CLRAG_ 70 0, 17130 CLJU_c2404 0 104 aldeído oxidorredutase 2.3.1.169 CAETHG_04 CLJU_c2405 CLRAG_ 71 0, 17120 CLJU_c2413 0 105 aldose 1-epimerase 5.1.3.3 CAETHG_22 CLJU_c0119 CLRAG_ 27 0 30230 106 Subunidade 1 da alofanato-hidrolase CAETHG_01 CLJU_c2048 CLRAG_ 30 0 19540 107 proteína contendo domínio não 3.5.1.54 CAETHG_01 CLJU_c2049 CLRAG_ caracterizado por carboxilase dependente 31 0 19530 de biotina 108 acetolactato descarboxilase 4.1.1.5 CAETHG_29 CLJU_c0838 CLRAG_ 32 0 08070 109 alfa-N-arabinofuranosidase 3.2.1.55 CAETHG_22 CLJU_c0124 CLRAG_ 33 0 30180
31 / 294 110 amidofosforibosiltransferase 2.4.2.14 CAETHG_29 CLJU_c0856 CLRAG_ 50 0 07930 111 sistema de transporte de aminoácidos CAETHG_27 CLJU_c0669 CLRAG_ polares proteína de ligação ao ATP 59 0 18490 112 proteína de membrana transportadora de CAETHG_12 CLJU_c0668 CLRAG_ aminoácidos ABC, família PAAT 12, 0, 15160 CAETHG_27 CLJU_c3314 58 0 113 proteína de ligação ao substrato do CAETHG_05 CLJU_c0667 CLRAG_ transportador ABC de aminoácidos, família 69, 0, 17770 PAAT CAETHG_27 CLJU_c2501 57 0 114 proteína de ligação ao substrato do CAETHG_12 CLJU_c3313 CLRAG_ transportador ABC de aminoácidos, família 11 0 15170
PAAT 115 Transportador de aminoácidos CAETHG_00 CLJU_c1932 CLRAG_ 09, 0, 33220 CAETHG_37 CLJU_c1642 36 0 116 aminoácido básico/antitérmico de CAETHG_00 CLJU_c1978 CLRAG_ poliamina, família APA 58 0 39360 117 transportador de CAETHG_01 CLJU_c2080 CLRAG_ aminoácidos/poliamina/cátions orgânicos, 65 0 19200 superfamília APC 118 transportador de CAETHG_02 CLJU_c2145 CLRAG_ aminoácidos/poliamina/cátions orgânicos, 31, 0, 31010 superfamília APC CAETHG_30 CLJU_c0926 20 0 119 aminoácido básico/antitérmico de CAETHG_04 CLJU_c2344 CLRAG_ poliamina, família APA 07, 0, 01320 CAETHG_04 CLJU_c2343 08 0 120 Transportador de aminoácidos CAETHG_04 CLJU_c0873 CLRAG_ 83, 0, 24920 CAETHG_29 CLJU_c2425 67 0 121 transportador de CAETHG_04 CLJU_c2432 CLRAG_ aminoácidos/poliamina/cátions orgânicos, 91 0 24990 superfamília APC 122 transportador de CAETHG_18 CLJU_c0712 CLRAG_ aminoácidos/poliamina/cátions orgânicos, 02, 0, 21780 superfamília APC CAETHG_28 CLJU_c3957 03 0 123 transportador de CAETHG_25 CLJU_c0476 CLRAG_ aminoácidos/poliamina/cátions orgânicos, 47, 0, 38130 superfamília APC CAETHG_25 CLJU_c0475 48 0 124 transportador de aminoácidos/poliamina/cátions CAETHG_38 CLJU_c1790 CLRAG_ orgânicos, superfamília APC 98 0 00730 125 componente 1 da para-aminobenzoato 2.6.1.85 CAETHG_15 CLJU_c3601 CLRAG_ sintetase 09 0 06510 126 aminometiltransferase CAETHG_04 CLJU_c2418 CLRAG_ 76 0 24850 127 aminopeptidase CAETHG_36 CLJU_c1576 CLRAG_ 84 0 32920 128 transportador de amônio CAETHG_24 CLJU_c0404 CLRAG_ 67 0 29120 129 subunidade A anaeróbica de sulfito redutase CAETHG_04 CLJU_c2377 CLRAG_ 42 0 17400 130 Sulfito redutase dissimilatória 1.8.7.1 CAETHG_16 CLJU_c3792 CLRAG_ (dessulfoviridina), subunidades alfa e beta 29 0 37310
32 / 294 131 sulfito anaeróbico redutase, subunidade B CAETHG_04 CLJU_c2376 CLRAG_ 41 0 17410 132 sulfito anaeróbico redutase, subunidade C CAETHG_04 CLJU_c2375 CLRAG_ 40 0 17420 133 subunidade catalítica de monóxido de 1.2.7.4 CAETHG_30 CLJU_c0911 CLRAG_ carbono desidrogenase 05 0 13910 134 subunidade de ferro-enxofre de monóxido CAETHG_30 CLJU_c0910 CLRAG_ de carbono desidrogenase 04 0 13920 135 Piridina nucleotídeo-dissulfeto CAETHG_30 CLJU_c0909 CLRAG_ oxidorredutase 03 0 13930 136 antranilato fosforibosiltransferase 2.4.2.18 CAETHG_37 CLJU_c1609 CLRAG_ 03 0 33060 137 componente antranilato sintase 1 4.1.3.27 CAETHG_37 CLJU_c1607 CLRAG_ 01 0 33040 138 componente 2 da para-aminobenzoato 2.6.1.85, CAETHG_15 CLJU_c1608 CLRAG_ sintetase 4.1.3.27 10, 0, 06520 CAETHG_37 CLJU_c3602 02 0 139 fator regulador anti-anti-sigma, SpoIIAA CAETHG_12 CLJU_c3397 CLRAG_ 95 0 14120 140 fator anti-sigma-28, família FlgM CAETHG_30 CLJU_c0949 CLRAG_ 44 0 13610 141 arginase 3.5.3.1 CAETHG_02 CLJU_c2193 CLRAG_ 90 0 31480 142 Arginina/lisina/ornitina descarboxilase 4.1.1.18, CAETHG_22 CLJU_c0138 CLRAG_
4.1.1.19 44 0 27040 143 argininossuccinato liase 4.3.2.1 CAETHG_27 CLJU_c0671 CLRAG_ 62 0 18510 144 argininossuccinato sintase 6.3.4.5 CAETHG_27 CLJU_c0670 CLRAG_ 61 0 18500 145 arginil-tRNA sintetase CAETHG_02 CLJU_c2170 CLRAG_ 57 0 31290 146 ATPase de transporte de arsenito CAETHG_36 CLJU_c1566 CLRAG_ 65 0 32720 147 asparagina sintase (hidrólise da glutamina) 6.3.5.4 CAETHG_07 CLJU_c2672 CLRAG_ 53 0 08590 148 asparagina sintase (hidrólise da glutamina) 6.3.5.4 CAETHG_38 CLJU_c1771 CLRAG_ 79 0 01020 149 asparaginil-tRNA sintetase CAETHG_20 CLJU_c4203 CLRAG_ 33 0 05140 150 aspartato aminotransferase 2.6.1.23, CAETHG_02 CLJU_c2129 CLRAG_
2.6.1.1 15 0 30850 151 aspartato aminotransferase 2.6.1.23, CAETHG_34 CLJU_c1334 CLRAG_
2.6.1.1 17 0 10450 152 aspartato amônia-liase 4.2.1.2, CAETHG_20 CLJU_c4237 CLRAG_
4.3.1.1, 62 0 05490
3.5.1.38 153 aspartato amônia-liase 4.2.1.2, CAETHG_24 CLJU_c0417 CLRAG_
4.3.1.1, 79 0 26890
3.5.1.38 154 aspartato carbamoiltransferase 2.1.3.2 CAETHG_14 CLJU_c3573 CLRAG_ 81 0 06260 155 subunidade reguladora de aspartato 2.1.3.2 CAETHG_14 CLJU_c3572 CLRAG_ carbamoiltransferase 80 0 06250 156 aspartato quinase CAETHG_11 CLJU_c3289 CLRAG_ 87 0 15440 157 aspartato quinase CAETHG_16 CLJU_c3832 CLRAG_ 90 0 20790 158 aspartato racemase CAETHG_09 CLJU_c2944 CLRAG_ 38 0 35430
33 / 294 159 aspartato semialdeído desidrogenase CAETHG_13 CLJU_c3457 CLRAG_ 53 0 14650 160 asparaginil-tRNA sintetase CAETHG_27 CLJU_c0674 CLRAG_ 65 0 18540 161 aspartil aminopeptidase CAETHG_20 CLJU_c4241 CLRAG_ 66 0 05550 162 aspartil-tRNA sintetase CAETHG_12 CLJU_c3366 CLRAG_ 64 0 24620 163 subunidade A de aspartil/glutamil-tRNA CAETHG_15 CLJU_c3692 CLRAG_ (Asn/Gln) amidotransferase 53 0 36450 164 subunidade B de aspartil/glutamil-tRNA CAETHG_15 CLJU_c3691 CLRAG_ (Asn/Gln) amidotransferase 52 0 36440 165 subunidade C de aspartil/glutamil-tRNA CAETHG_15 CLJU_c3693 CLRAG_ (Asn/Gln) amidotransferase 54 0 36460 166 ATP fosforibosiltransferase 2.4.2.17 CAETHG_32 CLJU_c1167 CLRAG_1 58 0 1870 167 Subunidade reguladora de ATP 2.4.2.17 CAETHG_32 CLJU_c1166 CLRAG_1 fosforibosiltransferase 57 0 1880 168 Subunidade a de ATPase de transporte de 3.6.3.14 CAETHG_23 CLJU_c0237 CLRAG_ H+ do tipo F 43 0 27980 169 Subunidade B do subcomplexo ATP sintase 3.6.3.14 CAETHG_23 CLJU_c0239 CLRAG_ F0 45 0 28000 170 Subunidade C do subcomplexo ATP sintase 3.6.3.14 CAETHG_23 CLJU_c0238 CLRAG_ F0 44 0 27990 171 Subunidade alfa do subcomplexo ATP 3.6.3.14 CAETHG_23 CLJU_c0241 CLRAG_ sintase F1 47 0 28020 172 Subunidade beta do subcomplexo ATP 3.6.3.14 CAETHG_23 CLJU_c0243 CLRAG_ sintase F1 49 0 28040 173 Subunidade delta do subcomplexo ATP 3.6.3.14 CAETHG_23 CLJU_c0240 CLRAG_ sintase F1 46 0 28010 174 Subunidade ClpX de ligação a ATP de CAETHG_14 CLJU_c3563 CLRAG_ protease Clp dependente de ATP 71 0 06160 175 Subunidade ClpA de ligação a ATP de CAETHG_05 CLJU_c2473 CLRAG_ protease Clp dependente de ATP 38 0 18090 176 Protease Clp dependente de ATP, CAETHG_11 CLJU_c3564 CLRAG_ subunidade protease 92, 0, 15390 CAETHG_14 CLJU_c3294 72 0 177 DNA helicase-2/DNA dependente de ATP CAETHG_15 CLJU_c3698 CLRAG_ helicase PcrA 59 0 36520 178 DNA dependente de ATP helicase RecG CAETHG_33 CLJU_c1270 CLRAG_1 51 0 1110 179 DNA dependente de ATP helicase RecQ CAETHG_05 CLJU_c2526 CLRAG_ 94 0 03610 180 protease de divisão celular FtsH CAETHG_19 CLJU_c4153 CLRAG_ 87 0 04660 181 Proteína ClpS adaptadora de Clp CAETHG_05 CLJU_c2474 CLRAG_ dependente de ATP protease 39 0 18080 182 Protease Lon dependente de ATP CAETHG_20 CLJU_c4272 CLRAG_ 97 0 25530 183 Protease prevista dependente de ATP CAETHG_31 CLJU_c1050 CLRAG_ 40 0 12870 184 Helicase DbpA de RNA dependente de ATP CAETHG_24 CLJU_c0411 CLRAG_ 74 0 26940 185 Proteína de ligação ao DNA HU-beta CAETHG_19 CLJU_c4167 CLRAG_ 96 0 04800 186 fator de liberação da cadeia peptídica 2 CAETHG_23 CLJU_c0264 CLRAG_ 65 0 28240 187 fator de iniciação de tradução IF-2 CAETHG_33 CLJU_c1315 CLRAG_ 98 0 10640
34 / 294 188 Grupo CubicO peptidase, família C da CAETHG_14 CLJU_c0884 CLRAG_ classe beta-lactamase 31, 0, 05740 CAETHG_29 CLJU_c3523 79 0 189 fosforibosilaminoimidazolcarboxamida 3.5.4.10, CAETHG_03 CLJU_c2221 CLRAG_ formiltransferase/IMP ciclo-hidrolase 2.1.2.3 19 0 31790 190 Regulador transcricional da família BirA, 6.3.4.14 CAETHG_07 CLJU_c2666 CLRAG_ repressor de operon de biotina/biotina- 47 0 08530 [acetil-CoA-carboxilase] ligase 191 riboflavina quinase/FMN 2.7.7.2, CAETHG_34 CLJU_c1319 CLRAG_ adenililtransferase 2.7.1.26 02 0 10600 192 manose-1-fosfato 2.7.7.22 CAETHG_26 CLJU_c0554 CLRAG_ guanililtransferase/manose-6-fosfato 15, 0, 38830 isomerase CAETHG_26 CLJU_c0531 37 0 193 proteína biossintética flagelar FliR/FlhB CAETHG_31 CLJU_c1036 CLRAG_ 26 0 13010 194 di-hidroneopterina aldolase/2-amino-4- 4.1.2.25, CAETHG_27 CLJU_c0637 CLRAG_ hidroxi-6-hidroximetildi-hidropteridina 2.7.6.3 32 0 30460 difosfoquinase 195 UDP-N-acetilglucosamina pirofosforilase 2.3.1.4, CAETHG_20 CLJU_c4178 CLRAG_ bifuncional/glucosamina-1-fosfato N- 2.7.7.23, 07 0 04910 acetiltransferase 2.3.1.157 196 fosforibosilaminoimidazolcarboxamida 3.5.4.10, CAETHG_29 CLJU_c0859 CLRAG_ formiltransferase/IMP ciclo-hidrolase 2.1.2.3 53 0 07900 197 RNAt nucleotidiltransferase (enzima de CAETHG_32 CLJU_c1128 CLRAG_ adição de CCA) 19 0 12170 198 Proteína contendo domínio C-terminal da CAETHG_01 CLJU_c2045 CLRAG_ biotina carboxilase 27 0 19570 199 acetil-CoA carboxilase, subunidade biotina 6.3.4.14 CAETHG_20 CLJU_c4212 CLRAG_ carboxilase 42 0 05230 200 aminoácido de cadeia ramificada: CAETHG_38 CLJU_c1774 CLRAG_ transportador de cátions, família LIVCS 82 0 00980 201 aminoácido aminotransferase de cadeia 2.6.1.67, CAETHG_30 CLJU_c0937 CLRAG_ ramificada 2.6.1.42, 32 0 13730
2.6.1.6 202 carbamato quinase 1.3.99.1, CAETHG_04 CLJU_c2380 CLRAG_
2.7.2.2 45, 0, 17370 CAETHG_30 CLJU_c0930 25 0 203 carbamato quinase 2.7.2.2 CAETHG_20 CLJU_c4255 CLRAG_ 81 0 09000 204 subunidade grande de carbamoil-fosfato 6.3.5.5 CAETHG_05 CLJU_c0441 CLRAG_ sintase 89, 0, 03560 CAETHG_25 CLJU_c2521 10 0 205 subunidade pequena de carbamoil-fosfato 6.3.5.5 CAETHG_05 CLJU_c0440 CLRAG_ sintase 90, 0, 03570 CAETHG_25 CLJU_c2522 08 0 206 proteína de ligação ao substrato do transportador ABC de CAETHG_13 CLJU_c3411 CLRAG_ carboidratos, família CUT1 09 0 14260 207 proteína de ligação ao substrato do CAETHG_14 CLJU_c3556 CLRAG_ transportador ABC de carboidratos, família 64 0 06090 CUT1 208 proteína de ligação a substratos de vários CAETHG_23 CLJU_c0198 CLRAG_ sistemas de transporte de açúcar 01 0 27580 209 subunidade catalítica de monóxido de 1.2.7.4 CAETHG_38 CLJU_c1791 CLRAG_ carbono desidrogenase 99 0 00720
35 / 294 210 proteína de alta absorção de carbono CAETHG_15 CLJU_c3735 CLRAG_ 90, 0, 36780 CAETHG_15 CLJU_c3734 91 0 211 regulador de armazenamento de carbono, CAETHG_30 CLJU_c0969 CLRAG_ CsrA 64 0 13480 212 4-carboximuconolactona descarboxilase 4.1.1.44 CAETHG_06 CLJU_c2565 CLRAG_ 34 0 03850 213 CDP-diacilglicerol-glicerol-3-fosfato 3- 2.7.8.5 CAETHG_34 CLJU_c1327 CLRAG_ fosfatidiltransferase 10 0 10520 214 proteína de divisão celular FtsA CAETHG_33 CLJU_c1229 CLRAG_1 11 0 1510 215 proteína de divisão celular FtsA CAETHG_38 CLJU_c1733 CLRAG_ 46 0 29250 216 proteína de divisão celular FtsQ CAETHG_31 CLJU_c1061 CLRAG_ 51 0 12730 217 proteína de permease de sistema de CAETHG_24 CLJU_c0308 CLRAG_ transporte de divisão celular 23 0 28690 218 proteína de divisão celular FtsZ CAETHG_33 CLJU_c1230 CLRAG_1 12 0 1500 219 Subunidade ClpB de ligação a ATP de CAETHG_27 CLJU_c0617 CLRAG_ protease dependente de ATP 17 0 07450 220 sistema de dois componentes, família de CAETHG_30 CLJU_c0943 CLRAG_ quimiotaxia, sensor quinase CheA 38 0 13670 221 proteína de quimiotaxia MotA CAETHG_22 CLJU_c0145 CLRAG_ 51 0 27110 222 proteína de quimiotaxia de ligação à purina CAETHG_30 CLJU_c0939 CLRAG_ CheW 34 0 13710 223 proteína de quimiotaxia CheD CAETHG_30 CLJU_c0940 CLRAG_ 35 0 13700 224 proteína de quimiotaxia de ligação à purina CAETHG_30 CLJU_c0946 CLRAG_ CheW 41 0 13640 225 proteína de quimiotaxia CheC CAETHG_30 CLJU_c0944 CLRAG_ 39 0 13660 226 proteína de quimiotaxia metiltransferase CAETHG_30 CLJU_c0942 CLRAG_ CheR 37 0 13680 227 sistema de dois componentes, família de CAETHG_30 CLJU_c0941 CLRAG_ quimiotaxia, regulador de resposta CheB 36 0 13690 228 cloranfenicol O-acetiltransferase tipo A CAETHG_06 CLJU_c2594 CLRAG_ 63 0 04080 229 corismato mutase 4.2.1.91, CAETHG_09 CLJU_c2913 CLRAG_
4.2.1.51 05 0 35130 230 corismato sintase 4.2.3.5 CAETHG_09 CLJU_c2914 CLRAG_ 06 0 35140 231 proteína iniciadora da replicação CAETHG_21 CLJU_c0001 CLRAG_ cromossômica DnaA 24 0 25790 232 [citrato (pro-3S)-liase] ligase 2.3.3.1 CAETHG_18 CLJU_c4055 CLRAG_ 98 0 22740 233 subunidade gama citrato liase (proteína 2.3.3.1 CAETHG_19 CLJU_c4058 CLRAG_ transportadora de acila) 01, 0 22770 CAETHG_24 81 234 subunidade alfa-citrato-liase/citrato CoA- 2.3.3.1 CAETHG_18 CLJU_c4056 CLRAG_ transferase 99, 0 22750 CAETHG_24 83 235 subunidade beta-citrato-liase/citril-CoA 2.3.3.1 CAETHG_19 CLJU_c4057 CLRAG_ liase 00, 0 22760 CAETHG_24 82
36 / 294 236 Precursor da subunidade grande da proteína 2.3.1.169 CAETHG_16 CLJU_c3757 CLRAG_ corrinoide de ferro-enxofre da acetil-CoA 10 0 36980 sintase de metilação de CO 237 Precursor da subunidade pequena da 2.3.1.169 CAETHG_16 CLJU_c3758 CLRAG_ proteína corrinoide de ferro-enxofre da 11 0 36990 acetil-CoA sintase de metilação de CO/acetil-CoA descarbonilase/subunidade delta sintase 238 Precursor da acetil-CoA sintase de 2.3.1.169 CAETHG_16 CLJU_c3755 CLRAG_ metilação de CO/acetil-CoA 08 0 36960 descarbonilase/subunidade beta sintase 239 ácido cobrínico (I) de a,c-diamida 2.5.1.17 CAETHG_111 CLJU_c3182 CLRAG_ adenosiltransferase 0 0 02450 240 adenosilcobinamida-fosfato sintase CAETHG_11 CLJU_c3201 CLRAG_ 29 0 02640 241 cobalamin-5'-fosfato sintase 2.7.8.26 CAETHG_14 CLJU_c3553 CLRAG_ 61 0 06060 242 cobalto-precorrina 3 C17-metiltransferase 2.1.1.131 CAETHG_111 CLJU_c3186 CLRAG_ 4 0 02490 243 cobalto-precorrina 4 C11-metiltransferase 2.1.1.133 CAETHG_111 CLJU_c3188 CLRAG_ 6 0 02510 244 cobalto-precorrina 5A acetaldeído-liase CAETHG_111 CLJU_c3187 CLRAG_ 5 0 02500 245 cobalto-precorrina 5B C1-metiltransferase CAETHG_11 CLJU_c3192 CLRAG_ 20 0 02550 246 cobalto-precorrina-6B (C15)- 2.1.1.132 CAETHG_111 CLJU_c3190 CLRAG_ metiltransferase 8 0 02530 247 precorrina-8X metilmutase/cobalto- 5.4.1.2 CAETHG_11 CLJU_c3193 CLRAG_ precorrina 8 metilmutase 21 0 02560 248 precorrina-6A/cobalto-precorrina-6A 1.3.1.54 CAETHG_111 CLJU_c3184 CLRAG_ redutase 2 0 02470 249 CobW/HypB/UreG, domínio de ligação a CAETHG_01 CLJU_c2064 CLRAG_ nucleotídeos 47 0 19340 250 família de proteínas de ligação a DNA de CAETHG_00 CLJU_c1958 CLRAG_ choque frio 27, 0, 39610 CAETHG_00 CLJU_c1950 35 0 251 proteína cinA induzível por CAETHG_17 CLJU_c3926 CLRAG_ competência/dano 70 0 21470 252 subunidade condensina ScpA CAETHG_32 CLJU_c1129 CLRAG_ 20 0 12160 253 proteína B de segregação e condensação CAETHG_32 CLJU_c1130 CLRAG_ 21 0 12150 254 subunidade condensina Smc CAETHG_33 CLJU_c1285 CLRAG_ 67 0 10950 255 ATPase de exportação de Cu+ CAETHG_05 CLJU_c2490 CLRAG_ 57 0 17880 256 rRNA 16S (citidina1402-2'-O)- CAETHG_22 CLJU_c0148 CLRAG_ metiltransferase 54 0 27140 257 CTP sintase 6.3.4.2 CAETHG_23 CLJU_c0220 CLRAG_ 25 0 27800 258 superóxido dismutase, família Cu-Zn 1.15.1.1 CAETHG_09 CLJU_c2978 CLRAG_ 77 0 35780 259 cianoficina sintetase CAETHG_23 CLJU_c0210 CLRAG_ 15 0 27700 260 cianoficinase CAETHG_23 CLJU_c0209 CLRAG_ 14 0 27690 261 Celobiose fosforilase CAETHG_16 CLJU_c3830 CLRAG_ 87 0 20770
37 / 294 262 ciclopropano-graxo-acil-fosfolipídio sintase CAETHG_08 CLJU_c2842 CLRAG_ 40 0 34500 263 cistationina gama-liase CAETHG_04 CLJU_c2438 CLRAG_ 98 0 25120 264 cisteína dessulfurase CAETHG_08 CLJU_c2836 CLRAG_ 33 0 34440 265 Selenocisteína liase/Cisteína dessulfurase CAETHG_12 CLJU_c3328 CLRAG_ 27 0 14980 266 proteína da família cisteína dessulfurase CAETHG_12 CLJU_c3319 CLRAG_ 18 0 15070 267 cisteína sintase A CAETHG_04 CLJU_c2437 CLRAG_ 97 0 25110 268 cisteína sintase A 2.5.1.47, CAETHG_17 CLJU_c3931 CLRAG_
2.5.1.65, 76 0 21520
4.2.99.8 269 Cisteína sintase CAETHG_29 CLJU_c0827 CLRAG_ 22 0 08120 270 cisteinil-tRNA sintetase CAETHG_01 CLJU_c2085 CLRAG_ 70 0 19150 271 cisteinil-tRNA sintetase CAETHG_19 CLJU_c4127 CLRAG_ 68 0 23460 272 dCMP desaminase 3.5.4.12 CAETHG_23 CLJU_c0233 CLRAG_ 39 0 27940 273 citidina desaminase CAETHG_39 CLJU_c1812 CLRAG_ 21 0 00540 274 citidilato quinase 2.7.4.14, CAETHG_02 CLJU_c2133 CLRAG_
2.7.1.48 19 0 30890 275 citosina desaminase 3.5.4.1 CAETHG_40 CLJU_c1923 CLRAG_ 58 0 39840 276 D-3-fosfoglicerato desidrogenase 1.1.1.95 CAETHG_22 CLJU_c0097 CLRAG_ 11 0 19610 277 D-alanina-D-alanina ligase 6.3.2.4 CAETHG_11 CLJU_c3211 CLRAG_ 39 0 02740 278 D-alanil-D-alanina carboxipeptidase CAETHG_28 CLJU_c0744 CLRAG_ 36 0 32250 279 D-alanil-D-alanina carboxipeptidase CAETHG_32 CLJU_c1127 CLRAG_ (proteína de ligação à penicilina 5/6) 18 0 12180 280 D-alanil-D-alanina carboxipeptidase CAETHG_34 CLJU_c1341 CLRAG_ 25 0 10380 281 D-alanil-D-alanina carboxipeptidase CAETHG_36 CLJU_c1572 CLRAG_ 80 0 32880 282 D-alanil-D-alanina carboxipeptidase CAETHG_32 CLJU_c1133 CLRAG_ 24 0 12120 283 D-glucarato desidratase 4.2.1.40 CAETHG_08 CLJU_c2813 CLRAG_ 17 0, 09100 CLJU_c2817 0 284 g-D-glutamil-meso-diaminopimelato CAETHG_27 CLJU_c0686 CLRAG_ peptidase 77 0 18700 285 di-hidropirimidinase CAETHG_04 CLJU_c2379 CLRAG_ 44 0 17380 286 D-serina/D-alanina/glicina: simporte de prótons, família CAETHG_29 CLJU_c0833 CLRAG_ AAT 28 0 08080 287 xilose isomerase 5.3.1.5 CAETHG_39 CLJU_c1824 CLRAG_ 32 0 00370 288 Proteína do domínio EDD, família DegV CAETHG_32 CLJU_c1165 CLRAG_1 56 0 1890 289 Regulador transcricional de ligação ao CAETHG_39 CLJU_c1797 CLRAG_ DNA, família MerR 06 0 00660
38 / 294 290 desoxirribose-fosfato aldolase CAETHG_39 CLJU_c1813 CLRAG_ 22 0 00530 291 dUTP pirofosfatase 3.6.1.19, CAETHG_31 CLJU_c1014 CLRAG_
3.6.1.23 04 0 13230 292 desfosfo-CoA quinase 2.7.1.24 CAETHG_12 CLJU_c3360 CLRAG_ 58 0 24680 293 diacilglicerol quinase (ATP) 2.7.1.107 CAETHG_29 CLJU_c0809 CLRAG_ 04 0 08260 294 diamino- 3.5.4.26, CAETHG_03 CLJU_c2209 CLRAG_ hidroxifosfororfosilaminopirimidina- 1.1.1.193 07 0 31610 desaminase/5-amino-6-(5- fosforibosilamino)uracil redutase 295 diaminopimelato descarboxilase 4.1.1.20 CAETHG_16 CLJU_c3831 CLRAG_ 88 0 20780 296 diaminopimelato epimerase 5.1.1.7 CAETHG_31 CLJU_c1076 CLRAG_ 66 0 12580 297 diaminopropionato de amônia-liase CAETHG_04 CLJU_c2386 CLRAG_ 51 0 17310 298 proteína contendo domínio de diguanilato CAETHG_12 CLJU_c3317 CLRAG_ ciclase (GGDEF) 16 0 15120 299 di-hidrodipicolinato redutase 1.3.1.26 CAETHG_13 CLJU_c3455 CLRAG_ 51 0 14630 300 di-hidrodipicolinato redutase 1.3.1.26 CAETHG_39 CLJU_c1805 CLRAG_ 14 0 00600 301 4-hidroxi-tetra-hidrodipicolinato sintase 4.2.1.52 CAETHG_08 CLJU_c2823 CLRAG_ 23 0 09180 302 4-hidroxi-tetra-hidrodipicolinato sintase 4.2.1.52 CAETHG_13 CLJU_c0430 CLRAG_ 52, 0, 14640 CAETHG_24 CLJU_c3456 98 0 303 di-hidrofolato redutase CAETHG_05 CLJU_c2449 CLRAG_ 09 0 30080 304 di-hidrolipoamida desidrogenase 1.8.1.4 CAETHG_16 CLJU_c3760 CLRAG_ 13 0 37010 305 di-hidroorotase 3.5.2.3 CAETHG_15 CLJU_c3729 CLRAG_ 85 0 36730 306 subunidade catalítica de di-hidroorotato 1.3.3.1, CAETHG_14 CLJU_c3569 CLRAG_ desidrogenase (NAD+) 1.3.99.11 77 0 06220 307 subunidade de transferência eletrônica de 1.3.3.1, CAETHG_14 CLJU_c3570 CLRAG_ di-hidroorotato desidrogenase 1.3.99.11 78 0 06230 308 di-hidropteroato sintase 2.5.1.15 CAETHG_27 CLJU_c0634 CLRAG_ 29 0 30490 309 di-hidropirimidinase 3.5.2.2 CAETHG_14 CLJU_c3589 CLRAG_ 96 0 06390 310 subunidade PreA di-hidropirimidina 1.3.1.2 CAETHG_14 CLJU_c3587 CLRAG_ desidrogenase (NAD+) 94 0 06370 311 di-hidroxi-ácido desidratase 4.2.1.9 CAETHG_01 CLJU_c2041 CLRAG_ 23 0 25880 312 rRNA 16S (adenina1518-N6/adenina1519- CAETHG_22 CLJU_c0177 CLRAG_ N6)-dimetiltransferase 79 0 27370 313 Subunidade A de DNA-girase CAETHG_21 CLJU_c0007 CLRAG_ 30 0 25850 314 subunidade A da topoisomerase-4 CAETHG_30 CLJU_c0920 CLRAG_ 14 0 13830 315 Subunidade B de DNA-girase CAETHG_21 CLJU_c0006 CLRAG_ 29 0 25840 316 DNA helicase/exodesoxirribonuclease V, CAETHG_12 CLJU_c3316 CLRAG_ subunidade A 15 0 15130 317 DNA helicase/exodesoxirribonuclease V, CAETHG_27 CLJU_c0698 CLRAG_ subunidade B 88 0 18820
39 / 294 318 DNA ligase (NAD+) CAETHG_15 CLJU_c3697 CLRAG_ 58 0 36510 319 Proteína de reparo de incompatibilidade de CAETHG_13 CLJU_c3438 CLRAG_ DNA MutS2 38 0 14460 320 Proteína de reparo de incompatibilidade de CAETHG_02 CLJU_c2123 CLRAG_ DNA MutL 09 0 30810 321 Proteína de reparo de incompatibilidade de CAETHG_02 CLJU_c2124 CLRAG_ DNA MutS 10 0 30820 322 DNA polimerase I CAETHG_12 CLJU_c3361 CLRAG_ 59 0 24670 323 Subunidade alfa do DNA polimerase-3 CAETHG_24 CLJU_c0324 CLRAG_ 38 0 28840 324 Subunidade alfa do DNA polimerase-3 CAETHG_10 CLJU_c3069 CLRAG_ 73 0 16120 325 Subunidade beta do DNA polimerase-3 CAETHG_21 CLJU_c0002 CLRAG_ 25 0 25800 326 Subunidade DNA polimerase-3 gama/tau CAETHG_21 CLJU_c0085 CLRAG_ 99 0 19730 327 DNA polimerase III, subunidade delta CAETHG_28 CLJU_c0789 CLRAG_ 82 0 25370 328 DNA polimerase-4 CAETHG_01 CLJU_c2104 CLRAG_ 89 0 18980 329 Subunidade delta' de DNA polimerase-3 CAETHG_22 CLJU_c0141 CLRAG_ 47 0 27070 330 DNA primase CAETHG_29 CLJU_c0821 CLRAG_ 16 0 08180 331 Proteína de reparo do DNA RadA/Sms CAETHG_19 CLJU_c4132 CLRAG_ 73 0 23510 332 Proteína de reparo e replicação do DNA CAETHG_28 CLJU_c0721 CLRAG_ RadC 13 0 26630 333 Proteína de reparo e replicação do DNA CAETHG_21 CLJU_c0004 CLRAG_ RecF 27 0 25820 334 Proteína de reparo e replicação do DNA CAETHG_32 CLJU_c1120 CLRAG_ RecN 09 0 12260 335 Proteína de reparo e replicação do DNA CAETHG_29 CLJU_c0811 CLRAG_ RecO 06 0 08240 336 Proteína de reparo e replicação do DNA CAETHG_22 CLJU_c0087 CLRAG_ RecR 01 0 19710 337 DNA topoisomerase-3 CAETHG_03 CLJU_c2298 CLRAG_ 60 0 01800 338 DNA topoisomerase-3 CAETHG_04 CLJU_c2347 CLRAG_ 11 0 17640 339 DNA topoisomerase-1 CAETHG_33 CLJU_c1300 CLRAG_ 83 0 10790 340 subunidade B da topoisomerase-4 CAETHG_30 CLJU_c0919 CLRAG_ 13 0 13840 341 Segregação de DNA ATPase FtsK/SpoIIIE, CAETHG_34 CLJU_c1325 CLRAG_ família S-DNA-T 08 0 10540 342 endonuclease-3 CAETHG_17 CLJU_c3927 CLRAG_ 71 0 21480 343 Subunidade alfa da RNA polimerase CAETHG_19 CLJU_c4077 CLRAG_ dirigida a DNA 20 0 22960 344 Subunidade beta da RNA polimerase CAETHG_19 CLJU_c4112 CLRAG_ dirigida a DNA 55 0 23310 345 Subunidade beta' da RNA polimerase CAETHG_19 CLJU_c4111 CLRAG_ dirigida a DNA 54 0 23300 346 Subunidade ômega da RNA polimerase CAETHG_33 CLJU_c1253 CLRAG_1 dirigida a DNA 35 0 1270
40 / 294 347 dTDP-4-desidroramnose 3,5-epimerase 5.1.3.13 CAETHG_26 CLJU_c0535 CLRAG_ 19, 0, 06720 CAETHG_26 CLJU_c0558 41 0 348 dTDP-4-desidroramnose redutase 1.1.1.133, CAETHG_26 CLJU_c0557 CLRAG_ 18, 0, 06710 CAETHG_26 CLJU_c0534 40 0 349 dTDP-glicose 4,6-desidratase 4.2.1.46 CAETHG_26 CLJU_c0555 CLRAG_ 16, 0, 06690 CAETHG_26 CLJU_c0532 38 0 350 glicose-1-fosfato timidililtransferase 2.7.7.33, CAETHG_26 CLJU_c0533 CLRAG_
2.7.7.24 17, 0, 06700 CAETHG_26 CLJU_c0556 39 0 351 apoproteína da subunidade alfa de CAETHG_01 CLJU_c1389 CLRAG_ transferência de elétrons da flavoproteína 16, 0, 25950 CAETHG_34 CLJU_c2034 72 0 352 apoproteína da subunidade alfa de CAETHG_02 CLJU_c2158 CLRAG_ transferência de elétrons da flavoproteína 45 0 31170 353 apoproteína da subunidade alfa de CAETHG_17 CLJU_c3940 CLRAG_ transferência de elétrons da flavoproteína 85 0 21610 354 subunidade beta da flavoproteína de CAETHG_01 CLJU_c1388 CLRAG_ transferência de elétrons 15, 0, 25960 CAETHG_34 CLJU_c2033 71 0 355 subunidade beta da flavoproteína de CAETHG_02 CLJU_c2159 CLRAG_ transferência de elétrons 46 0 31180 356 subunidade beta da flavoproteína de CAETHG_17 CLJU_c3941 CLRAG_ transferência de elétrons 86 0 21620 357 proteína complexa de transporte de elétrons 1.18.1.3 CAETHG_32 CLJU_c1140 CLRAG_ RnfA 31 0 12050 358 proteína de complexo de transporte de 1.18.1.3 CAETHG_32 CLJU_c1137 CLRAG_ elétrons RnfD 28 0 12080 359 proteína de complexo de transporte de 1.18.1.3 CAETHG_32 CLJU_c1139 CLRAG_ elétrons RnfE 30 0 12060 360 fator de alongamento P CAETHG_31 CLJU_c1101 CLRAG_ 90 0 12450 361 fator de alongamento Ts CAETHG_33 CLJU_c1303 CLRAG_ 86 0 10760 362 fator de alongamento Tu CAETHG_19 CLJU_c4120 CLRAG_ 49, 0, 23390 CAETHG_19 CLJU_c4106 63 0 363 Endonuclease IV CAETHG_01 CLJU_c2027 CLRAG_ 08 0 26020 364 2-enoato redutase CAETHG_09 CLJU_c2984 CLRAG_ 83 0 35850 365 2,4-dienoil-CoA redutase CAETHG_10 CLJU_c3075 CLRAG_ 79 0 16190 366 2-enoato redutase CAETHG_12 CLJU_c3348 CLRAG_ 47 0 32290 367 enolase 4.2.1.11 CAETHG_17 CLJU_c3911 CLRAG_ 56 0 21260 368 enoil-[acil-proteína carreadora] redutase II CAETHG_20 CLJU_c4218 CLRAG_ 49 0 05290
41 / 294 369 Álcool desidrogenase, classe IV 1.1.1.1, CAETHG_18 CLJU_c3967 CLRAG_
1.1.1.72, 13 0 21920
1.1.1.21,
1.1.1.2 370 Álcool desidrogenase, classe IV 1.1.1.1, CAETHG_32 CLJU_c1188 CLRAG_
1.1.1.72, 79 0 03030
1.1.1.21,
1.1.1.2 371 subunidade A da excinuclease ABC CAETHG_24 CLJU_c0312 CLRAG_ 27 0 28730 372 Subunidade B da excinuclease ABC CAETHG_24 CLJU_c0311 CLRAG_ 26 0 28720 373 Subunidade C da excinuclease ABC CAETHG_24 CLJU_c0317 CLRAG_ 32 0 28780 374 Subunidade D da exodesoxirribonuclease I CAETHG_01 CLJU_c2031 CLRAG_ 12 0 25980 375 Subunidade alfa da exodesoxirribonuclease CAETHG_23 CLJU_c0259 CLRAG_ V 59 0 28190 376 Subunidade grande da CAETHG_32 CLJU_c1113 CLRAG_ exodesoxirribonuclease VII 02 0 12330 377 Subunidade pequena da CAETHG_32 CLJU_c1114 CLRAG_ exodesoxirribonuclease VII 03 0 12320 378 exonuclease específica de DNA de fita CAETHG_30 CLJU_c0924 CLRAG_ simples 18 0 13790 379 Subunidade épsilon da ATPase de 3.6.3.14 CAETHG_23 CLJU_c0244 CLRAG_ transporte de H+ do tipo F 50 0 28050 380 Subunidade gama da ATPase de transporte 3.6.3.14 CAETHG_23 CLJU_c0242 CLRAG_ de H+ do tipo F 48 0 28030 381 Proteína ATP sintase I 3.6.3.14 CAETHG_23 CLJU_c0236 CLRAG_ 42 0 27970 382 [FeFe] hidrogenase, grupo A 1.12.1.4, CAETHG_27 CLJU_c1728 CLRAG_
1.1.99.33 98, 0, 18920 CAETHG_38 CLJU_c0707 41 0 383 proteína de transporte de elétrons HydN CAETHG_00 CLJU_c2003 CLRAG_ 83, 0, 32510 CAETHG_38 CLJU_c1727 40 0 384 proteína A de transporte de ferro ferroso CAETHG_34 CLJU_c1397 CLRAG_ 80 0 09280 385 Proteína contendo domínio de di- CAETHG_22 CLJU_c0144 CLRAG_ agrupamento 4Fe-4S 50 0 27100 386 ferredoxina CAETHG_22 CLJU_c0182 CLRAG_ 85 0 27420 387 Regulador transcricional da família de CAETHG_33 CLJU_c1219 CLRAG_1 peles, regulador da captação férrica 01 0 1610 388 ferritina CAETHG_00 CLJU_c1949 CLRAG_ 26 0 39620 389 proteína B de transporte de ferro ferroso CAETHG_34 CLJU_c1398 CLRAG_ 81 0 09290 390 proteína A de transporte de ferro ferroso CAETHG_34 CLJU_c1396 CLRAG_ 79 0 09270 391 proteína de montagem flagelar FliH CAETHG_31 CLJU_c1024 CLRAG_ 14 0 13130 392 proteína flagelar da haste do corpo basal CAETHG_31 CLJU_c1019 CLRAG_ FlgB 09 0 13180 393 proteína flagelar da haste do corpo basal CAETHG_31 CLJU_c1044 CLRAG_ FlgG 34 0 12930 394 proteína flagelar da haste do corpo basal CAETHG_31 CLJU_c1045 CLRAG_ FlgG 35 0 12920
42 / 294 395 proteína flagelar da haste do corpo basal CAETHG_31 CLJU_c1020 CLRAG_ FlgC 10 0 13170 396 proteína FliJ flagelar CAETHG_31 CLJU_c1026 CLRAG_ 16 0 13110 397 proteína de biossíntese flagelar FlhA CAETHG_31 CLJU_c1037 CLRAG_ 27 0 13000 398 proteína de biossíntese flagelar FlhF CAETHG_31 CLJU_c1038 CLRAG_ 28 0 12990 399 proteína FliL flagelar CAETHG_31 CLJU_c1032 CLRAG_ 22 0 13050 400 proteína biossintética flagelar FliP CAETHG_31 CLJU_c1034 CLRAG_ 24 0 13030 401 proteína biossintética flagelar FliQ CAETHG_31 CLJU_c1035 CLRAG_ 25 0 13020 402 proteína 1 associada ao gancho flagelar CAETHG_30 CLJU_c0951 CLRAG_ FlgK 46 0 13590 403 proteína 2 associada ao gancho flagelar CAETHG_30 CLJU_c0961 CLRAG_ 56 0 13530 404 proteína do complexo do corpo basal do CAETHG_311 CLJU_c1021 CLRAG_ gancho flagelar FliE 1 0 13160 405 proteína flagelar do anel M FliF CAETHG_31 CLJU_c1022 CLRAG_ 12 0 13150 406 proteína comutadora de motor flagelar FliM CAETHG_30 CLJU_c0947 CLRAG_ 42 0 13630 407 proteína comutadora de motor flagelar FliG CAETHG_31 CLJU_c1023 CLRAG_ 13 0 13140 408 proteína flagelar FliS CAETHG_30 CLJU_c0957 CLRAG_ 52 0 13540 409 flagelina CAETHG_31 CLJU_c1018 CLRAG_ 08 0 13190 410 proteína foldase PrsA CAETHG_20 CLJU_c4171 CLRAG_ 00 0 04840 411 di-hidrofolato sintase/folilpoliglutamato 6.3.2.12, CAETHG_13 CLJU_c3468 CLRAG_ sintase 6.3.2.17 65 0 14760 412 subunidade principal de desidrogenase do 1.2.1.43, CAETHG_27 CLJU_c0893 CLRAG_ formato 1.1.99.33 90, 0, 18840 CAETHG_29 CLJU_c0699 88 0 413 Formato-tetra-hidrofolato ligase 3.5.4.9, CAETHG_16 CLJU_c3765 CLRAG_
6.3.4.3 18 0 37060 414 formiminotetra-hidrofolato ciclodesaminase 4.3.1.4 CAETHG_17 CLJU_c3880 CLRAG_ 28 0 21060 415 formiminoglutamase 3.5.3.8 CAETHG_02 CLJU_c2142 CLRAG_ 28 0 30980 416 Formiminotetra-hidrofolato de 4.3.1.4 CAETHG_02 CLJU_c2144 CLRAG_ ciclodesaminase 30 0 31000 417 subunidade E da formilmetanofurano CAETHG_29 CLJU_c3806 CLRAG_ desidrogenase 94 0, 07510 CLJU_c0900 0 418 Formiminotetra-hidrofolato de 3.5.4.9, CAETHG_16 CLJU_c3764 CLRAG_ ciclodesaminase 4.3.1.4, 17 0 37050
6.3.4.3 419 fosforibosilglicinamida formiltransferase 2.1.2.2 CAETHG_29 CLJU_c0858 CLRAG_ dependente de formiltetra-hidrofolato 52 0 07910 420 1-fosfofrutoquinase 2.7.1.11, CAETHG_01 CLJU_c2060 CLRAG_
2.7.1.145, 43 0 19380
2.7.1.144,
2.7.1.56
43 / 294 421 frutose-1,6-bisfosfatase-3 3.1.3.11 CAETHG_08 CLJU_c2905 CLRAG_ 97 0 35050 422 fosfoglicerato mutase provável CAETHG_04 CLJU_c2398 CLRAG_ 64 0 17180 423 frutose-bifosfato aldolase, classe II 4.1.2.13 CAETHG_21 CLJU_c0066 CLRAG_ 84 0 19910 424 frutose-bisfosfato aldolase 4.1.2.13 CAETHG_23 CLJU_c0281 CLRAG_ 82 0 28410 425 fumarase, subunidade alfa classe I 4.2.1.81, CAETHG_19 CLJU_c4060 CLRAG_
4.2.1.2, 03 0 22790
4.2.1.32 426 subunidade beta de fumarato hidratase 4.2.1.81, CAETHG_19 CLJU_c4059 CLRAG_
4.2.1.2, 02 0 22780
4.2.1.32 427 Ácido 2-ceto-4-pentenoato hidratase/2-oxo- CAETHG_05 CLJU_c2524 CLRAG_ hepta-3-eno-1,7-dioico hidratase (via 92 0 03590 catecol) 428 gama-glutamiltransferase 2. Treonina 2.3.2.2, CAETHG_40 CLJU_c1903 CLRAG_ peptidase. Família MEROPS T03 3.4.11.4 37 0 40010 429 difosfato de geranilgeranil sintase, tipo II 2.5.1.29, CAETHG_32 CLJU_c1115 CLRAG_
2.5.1.1, 04 0 12310
2.5.1.10 430 protease de esporos CAETHG_28 CLJU_c0791 CLRAG_ 84 0 25390 431 proteína contendo domínio de diguanilato CAETHG_08 CLJU_c2852 CLRAG_ ciclase (GGDEF) 47 0 34600 432 proteína contendo domínio de diguanilato CAETHG_06 CLJU_c2609 CLRAG_ ciclase (GGDEF) 78 0 04180 433 gluconato permease GntP CAETHG_21 CLJU_c1160 CLRAG_ 80, 0, 19960 CAETHG_32 CLJU_c0062 51 0 434 enzima de modificação do 5- CAETHG_21 CLJU_c4291 CLRAG_ carboximetilaminometil uridina tRNA 17 0 25720 435 glicose-6-fosfato isomerase 5.3.1.9, CAETHG_15 CLJU_c3713 CLRAG_
5.1.3.15 68 0 36590 436 glutamato 5-quinase 2.7.2.11 CAETHG_26 CLJU_c0599 CLRAG_ 97 0 07220 437 glutamato formiminotransferase 2.1.2.5 CAETHG_02 CLJU_c2150 CLRAG_ 37 0 31060 438 proteína hipotética conservada CAETHG_19 CLJU_c4063 CLRAG_ 06 0 22820 439 Subunidade E de glutamato mutase CAETHG_19 CLJU_c4062 CLRAG_ 05 0 22810 440 subunidade S de glutamato mutase CAETHG_19 CLJU_c4064 CLRAG_ 07 0 22830 441 glutamato N-acetiltransferase 2.3.1.1, CAETHG_02 CLJU_c2153 CLRAG_
2.3.1.35 40 0 31090 442 glutamato racemase 5.1.1.3 CAETHG_20 CLJU_c4194 CLRAG_ 23 0 05050 443 cadeia pequena de glutamato sintase 1.4.1.13, CAETHG_15 CLJU_c3724 CLRAG_ (NADPH/NADH) 1.6.99.3 80 0 36680 444 cadeia grande de glutamato sintase 1.4.1.13 CAETHG_38 CLJU_c1737 CLRAG_ (NADPH/NADH) 50 0 29210 445 subunidade pequena de glutamato sintase 1.4.1.13 CAETHG_38 CLJU_c1738 CLRAG_ (NADH) 51 0 29200 446 glutamato-1-semialdeído 2,1-aminomutase 5.4.3.8 CAETHG_25 CLJU_c0449 CLRAG_ 21 0 37850 447 glutamato-5-semialdeído desidrogenase 1.2.1.41 CAETHG_26 CLJU_c0600 CLRAG_ 98 0 07230
44 / 294 448 glutamina sintetase 6.3.1.2 CAETHG_20 CLJU_c4195 CLRAG_ 24 0 05060 449 glucosamina-frutose-6-fosfato 2.6.1.16 CAETHG_18 CLJU_c4042 CLRAG_ aminotransferase (isomerização) 85 0 22610 450 NAD + sintase (hidrólise da glutamina) 6.3.1.5, CAETHG_27 CLJU_c0692 CLRAG_
6.3.5.1 82 0 18760 451 glutaminil-tRNA sintetase CAETHG_07 CLJU_c2674 CLRAG_ 55 0 08610 452 glutamil-tRNA redutase 1.2.1.70 CAETHG_25 CLJU_c0448 CLRAG_ 20 0 37840 453 glutamil-tRNA sintetase 6.1.1.17, CAETHG_34 CLJU_c1339 CLRAG_
6.1.1.24 23 0 10400 454 Glutationilspermidina sintase CAETHG_39 CLJU_c1842 CLRAG_ 49 0 00260 455 gliceraldeído-3-fosfato desidrogenase 1.2.1.59, CAETHG_17 CLJU_c1340 CLRAG_ (NAD+) 1.2.1.12, 60, 0, 21300
1.2.1.72 CAETHG_34 CLJU_c3915 24 0 456 glicerol 3-fosfato desidrogenase 1.1.1.94, CAETHG_33 CLJU_c1248 CLRAG_1 (NAD(P)+) 1.1.1.261, 30 0 1320
1.1.1.8 457 glicerol-3-fosfato desidrogenase CAETHG_16 CLJU_c3748 CLRAG_ 00 0 36890 458 Proteína da família glicerofosforil diéster CAETHG_02 CLJU_c2180 CLRAG_ fosfodiesterase 69 0 31340 459 subunidade alfa da glicina desidrogenase CAETHG_04 CLJU_c2416 CLRAG_ (descarboxilação) 74 0 24830 460 subunidade 2 da glicina desidrogenase CAETHG_04 CLJU_c2415 CLRAG_ 73 0 24820 461 glicil-tRNA sintetase CAETHG_19 CLJU_c4146 CLRAG_ 81 0 04590 462 GMP sintase (hidrólise da glutamina) 6.3.5.2 CAETHG_15 CLJU_c3717 CLRAG_ 70 0 36610 463 GTP ciclo-hidrolase I 3.5.4.16 CAETHG_27 CLJU_c0635 CLRAG_ 30 0 30480 464 GTP pirofosfoquinase 2.7.6.5 CAETHG_12 CLJU_c3371 CLRAG_ 69 0 24570 465 guanina desaminase CAETHG_04 CLJU_c2396 CLRAG_ 62 0 17200 466 guanilato quinase 2.7.4.8, CAETHG_33 CLJU_c1252 CLRAG_1
2.7.4.12 34 0 1280 467 achaperona molecular HtpG CAETHG_00 CLJU_c1977 CLRAG_ 57 0 39370 468 repressor de transcrição induzível ao calor CAETHG_28 CLJU_c0796 CLRAG_ HrcA 89 0 25440 469 hemeritrina CAETHG_02 CLJU_c2183 CLRAG_ 73 0 31370 470 proteína do domínio de ligação a metais do CAETHG_15 CLJU_c3609 CLRAG_ tipo hemeritrina 18 0 06600 471 hemolisina III CAETHG_12 CLJU_c3364 CLRAG_ 62 0 24640 472 heptaprenil difosfato sintase 2.5.1.29, CAETHG_32 CLJU_c1142 CLRAG_
2.5.1.30, 33 0 12030
2.5.1.33 473 histidina amônia-liase 4.3.1.3 CAETHG_11 CLJU_c3284 CLRAG_ 82 0 15490 474 histidina amônia-liase 4.3.1.3 CAETHG_02 CLJU_c2146 CLRAG_ 32 0 31020 475 histidinol desidrogenase 1.1.1.23 CAETHG_32 CLJU_c1168 CLRAG_1 59 0 1860
45 / 294 476 histidinol-fosfatase (família PHP) 3.1.3.15 CAETHG_32 CLJU_c1181 CLRAG_1 72 0 1730 477 histidinol-fosfato aminotransferase 2.6.1.9, CAETHG_32 CLJU_c1172 CLRAG_1
2.6.1.58, 63 0 1820
2.6.1.57,
2.6.1.5,
2.6.1.1 478 histidil-tRNA sintetase CAETHG_12 CLJU_c3367 CLRAG_ 65 0 24610 479 Subunidade DNA helicase da junção CAETHG_12 CLJU_c3383 CLRAG_ Holliday RuvA 81 0 24450 480 Subunidade de DNA helicase da junção CAETHG_12 CLJU_c3382 CLRAG_ Holliday RuvB 80 0 24460 481 holo-[acil-carreador-proteína] sintase 2.7.8.7 CAETHG_24 CLJU_c0300 CLRAG_ 15 0 28610 482 homocitrato sintase NifV 4.1.3.21, CAETHG_25 CLJU_c0498 CLRAG_
2.3.3.14 75 0 38370 483 homocitrato sintase NifV CAETHG_25 CLJU_c0497 CLRAG_ 74 0 38360 484 cisteína dessulfurase 4.1.99.1, CAETHG_04 CLJU_c1211 CLRAG_
4.4.1.8, 03, 0, 01360
4.4.1.1 CAETHG_32 CLJU_c2339 93 0 485 homosserina desidrogenase 1.1.1.3 CAETHG_28 CLJU_c0715 CLRAG_ 07 0 26690 486 homosserina desidrogenase 1.1.1.3 CAETHG_30 CLJU_c1009 CLRAG_ 99 0 13280 487 homosserina quinase 2.7.1.39 CAETHG_28 CLJU_c0716 CLRAG_ 08 0 26680 488 homosserina O-succiniltransferase CAETHG_04 CLJU_c2433 CLRAG_ 92 0 25000 489 Hpr(Ser) quinase/fosfatase CAETHG_02 CLJU_c2191 CLRAG_ 87 0 31450 490 Proteína de maturação da hidrogenase CAETHG_03 CLJU_c2308 CLRAG_ HypC 71 0 01730 491 Proteína de maturação da hidrogenase CAETHG_03 CLJU_c2307 CLRAG_ HypD 70 0 01740 492 Proteína de maturação da hidrogenase, CAETHG_03 CLJU_c2306 CLRAG_ carbamoil desidratase HypE 69 0 01750 493 proteína de expressão/formação de 2.7.4.16 CAETHG_15 CLJU_c3687 CLRAG_ hidrogenase HypE 48 0 36400 494 Proteína de maturação de hidrogenase, CAETHG_03 CLJU_c2309 CLRAG_ carbamoil-transferase HypF 72 0 01720 495 ácido cobirínico a,c-diamida sintase 6.3.1.- CAETHG_11 CLJU_c3195 CLRAG_ 23 0 02580 496 proteína hipotética CAETHG_17 CLJU_c3882 CLRAG_ 30 0 08740 497 Proteína conservada não caracterizada CAETHG_21 CLJU_c0067 CLRAG_ YgbK, família DUF1537 85 0 19900 498 hidroxietiltiazol quinase 2.7.1.50 CAETHG_12 CLJU_c3305 CLRAG_ 03 0 15280 499 hidroxietiltiazol quinase 2.7.1.50 CAETHG_14 CLJU_c3506 CLRAG_ 15 0 26320 500 hidroximetilbilano sintase 2.5.1.61, CAETHG_11 CLJU_c3198 CLRAG_
4.3.1.8 26 0 02610 501 glicerato desidrogenase 1.1.1.95 CAETHG_00 CLJU_c1928 CLRAG_ 04, 0, 39780 CAETHG_12 CLJU_c3343 43 0
46 / 294 502 proteína de função desconhecida CAETHG_00 CLJU_c1933 CLRAG_ (DUF4163) 10 0 39760 503 FMN redutase dependente de NADPH CAETHG_00 CLJU_c1935 CLRAG_ 12 0 39740 504 proteína hipotética CAETHG_00 CLJU_c1936 CLRAG_ 13 0 39730 505 Regulador transcricional de ligação ao CAETHG_00 CLJU_c1938 CLRAG_ DNA, domínio HTH da família XRE 15 0 39710 506 proteína hipotética CAETHG_00 CLJU_c1939 CLRAG_ 16 0 39700 507 proteína rarD CAETHG_00 CLJU_c1943 CLRAG_ 20 0 39680 508 proteína de função desconhecida CAETHG_00 CLJU_c1944 CLRAG_ (DUF1848) 21 0 39670 509 proteína hipotética CAETHG_00 CLJU_c1947 CLRAG_ 24 0 39640 510 proteína hipotética CAETHG_00 CLJU_c1968 CLRAG_ 45 0 39460 511 Proteína hipotética CAETHG_00 CLJU_c1973 CLRAG_ 50 0 39410 512 Proteína conservada não caracterizada, CAETHG_00 CLJU_c1975 CLRAG_ contém domínio FIST_N 54 0 39390 513 proteína hipotética CAETHG_00 CLJU_c1980 CLRAG_ 60 0 39280 514 Ala-tRNA(Pro) desacilase CAETHG_00 CLJU_c1983 CLRAG_ 63 0 39250 515 L-cisteína dessulfidase CAETHG_00 CLJU_c1987 CLRAG_ 67 0 39210 516 proteína hipotética CAETHG_00 CLJU_c1994 CLRAG_ 74 0 39120 517 proteína hipotética CAETHG_00 CLJU_c0273 CLRAG_ 75, 0, 39090 CAETHG_23 CLJU_c1995 75 0 518 GTP pirofosfoquinase putativa 2.7.6.5 CAETHG_00 CLJU_c3062 CLRAG_ 76, 0, 39080 CAETHG_10 CLJU_c1996 66 0 519 proteína hipotética CAETHG_00 CLJU_c2001 CLRAG_ 81, 0, 29290 CAETHG_38 CLJU_c1729 42 0 520 Proteína contendo domínio MOSC CAETHG_01 CLJU_c2019 CLRAG_ 00, 0, 29730 CAETHG_05 CLJU_c2504 72 0 521 Proteína contendo domínio de ligação ao CAETHG_01 CLJU_c2025 CLRAG_ DNA, família excisionase 06 0 26040 522 proteína da família transportadora CAETHG_01 CLJU_c2026 CLRAG_ 07 0 26030 523 proteína hipotética (DUF2334) CAETHG_011 CLJU_c2030 CLRAG_ 1 0 25990 524 proteína hipotética CAETHG_01 CLJU_c2863 CLRAG_ 26, 0, 19580 CAETHG_08 CLJU_c2044 58 0 525 Proteína UPF0271 CAETHG_01 CLJU_c2051 CLRAG_ 33 0 19510 526 Proteína de função desconhecida CAETHG_01 CLJU_c2052 CLRAG_ (DUF1097) 34 0 19500
47 / 294 527 Proteína de ligação a metais prevista CAETHG_01 CLJU_c2054 CLRAG_ 36 0 19460 528 Proteína de função desconhecida CAETHG_01 CLJU_c2063 CLRAG_ (DUF1638) 46 0 19350 529 proteína hipotética CAETHG_01 CLJU_c2065 CLRAG_ 48 0 19330 530 Proteína de ligação a metais prevista CAETHG_01 CLJU_c2066 CLRAG_ 49 0 19320 531 proteína de função desconhecida CAETHG_01 CLJU_c2072 CLRAG_ (DUF4445) 56 0 19280 532 proteína hipotética CAETHG_01 CLJU_c2082 CLRAG_ 67 0 19180 533 proteína hipotética CAETHG_01 CLJU_c2083 CLRAG_ 68 0 19170 534 Canal de íons CAETHG_01 CLJU_c2086 CLRAG_ 71 0 19140 535 Proteína HutD CAETHG_01 CLJU_c2087 CLRAG_ 72 0 19130 536 Proteína de função desconhecida CAETHG_01 CLJU_c2089 CLRAG_ (DUF1657) 74 0 19120 537 Proteína de membrana não caracterizada CAETHG_01 CLJU_c2090 CLRAG_ YcaP, família DUF421 75 0 19110 538 Proteína de função desconhecida CAETHG_01 CLJU_c2095 CLRAG_ (DUF1657) 79 0 19070 539 Proteína de função desconhecida CAETHG_01 CLJU_c2097 CLRAG_ (DUF3006) 81 0 19050 540 proteína hipotética CAETHG_01 CLJU_c2102 CLRAG_ 87 0 19000 541 Cys-tRNA(Pro) desacilase CAETHG_02 CLJU_c2115 CLRAG_ 01 0 30710 542 uroporfirinogênio descarboxilase CAETHG_02 CLJU_c2118 CLRAG_ 04 0 19410 543 Proteína contendo domínio semelhante à CAETHG_02 CLJU_c2156 CLRAG_ hemeritrina 43 0 31140 544 Lactato racemase dependente de níquel CAETHG_02 CLJU_c0462 CLRAG_ 47, 0, 31190 CAETHG_25 CLJU_c2160 34 0 545 Proteína da superfamília RNase_H CAETHG_02 CLJU_c2163 CLRAG_ 50 0 31220 546 Subfamília IB hidrolase da superfamília 3.1.3.3 CAETHG_02 CLJU_c2164 CLRAG_ HAD, TIGR01490 51 0 31230 547 Proteína da família p12 da proteína de CAETHG_02 CLJU_c2167 CLRAG_ fixação a vírus 54 0 31260 548 Proteína contendo domínio CBS CAETHG_02 CLJU_c2168 CLRAG_ 55 0 31270 549 proteína hipotética CAETHG_02 CLJU_c2169 CLRAG_ 56 0 31280 550 proteína de membrana putativa CAETHG_02 CLJU_c2177 CLRAG_ 65 0 31310 551 proteína hipotética CAETHG_02 CLJU_c2178 CLRAG_ 66 0 31320 552 Proteína de membrana não caracterizada CAETHG_02 CLJU_c2184 CLRAG_ YvlD, família DUF360 74 0 31380 553 proteína hipotética CAETHG_02 CLJU_c2185 CLRAG_ 75 0 31390 554 proteína de função desconhecida (DUF896) CAETHG_02 CLJU_c2192 CLRAG_ 88 0 31460 555 proteína hipotética CAETHG_02 CLJU_c2199 CLRAG_ 97 0 31520
48 / 294 556 proteína hipotética CAETHG_02 CLJU_c2201 CLRAG_ 99 0 31540 557 proteína hipotética CAETHG_03 CLJU_c2203 CLRAG_ 01 0 31560 558 ATPase solúvel do tipo P CAETHG_03 CLJU_c2219 CLRAG_ 17 0 31770 559 proteína de transporte de cobalto/níquel CAETHG_03 CLJU_c2222 CLRAG_ 20 0 31800 560 Barril TIM tipo xilose isomerase CAETHG_03 CLJU_c2224 CLRAG_ 22 0 31820 561 Transportador de efluxo da família RND, CAETHG_03 CLJU_c0595 CLRAG_ subunidade MFP 24, 0, 31840 CAETHG_26 CLJU_c2226 92 0 562 Proteína contendo domínio hélice-giro- CAETHG_03 CLJU_c2276 CLRAG_ hélice C-terminal PucR 38 0 02030 563 Hidrolase do ácido L-2-amino-tiazolina-4- CAETHG_03 CLJU_c2281 CLRAG_ carboxílico 43 0 01980 564 succinato desidrogenase/subunidade de 1.3.99.1 CAETHG_03 CLJU_c2282 CLRAG_ ferro-enxofre fumarato redutase 44 0 01970 565 Proteína de ligação a SAM não CAETHG_03 CLJU_c2284 CLRAG_ caracterizada YcdF, família DUF218 46 0 01950 566 proteína hipotética CAETHG_03 CLJU_c2285 CLRAG_ 47 0 01940 567 3',5'-cíclico AMP fosfodiesterase CpdA CAETHG_03 CLJU_c2286 CLRAG_ 48 0 01930 568 proteína de função desconhecida (DUF326) CAETHG_03 CLJU_c2287 CLRAG_ 49 0 01920 569 Proteína associada a CRISPR Csh1 CAETHG_03 CLJU_c2297 CLRAG_ 59 0 01810 570 Componente 1 da nitrogenase tipo CAETHG_03 CLJU_c2303 CLRAG_ oxidorredutase 66 0 01780 571 Componente 1 da nitrogenase tipo CAETHG_03 CLJU_c2304 CLRAG_ oxidorredutase 67 0 01770 572 Componente 1 da nitrogenase tipo CAETHG_03 CLJU_c2310 CLRAG_ oxidorredutase 73 0 01710 573 Transportador putativo de efluxo de CAETHG_03 CLJU_c2313 CLRAG_ resistência a múltiplos fármacos 76 0 01680 574 proteína hipotética CAETHG_03 CLJU_c2317 CLRAG_ 80 0 01650 575 Proteína contendo domínio 3D (Asp-Asp- CAETHG_03 CLJU_c2320 CLRAG_ Asp) 83 0 01530 576 Proteína permease de sistema de transporte CAETHG_03 CLJU_c2326 CLRAG_ do tipo ABC-2 89 0 01470 577 Proteína da família de canais de cloreto CAETHG_03 CLJU_c2331 CLRAG_ ativado por Ca 95 0 01430 578 proteína hipotética 2.1.1.45 CAETHG_03 CLJU_c2332 CLRAG_ 96 0 01420 579 proteína hipotética CAETHG_04 CLJU_c2340 CLRAG_ 04 0 01350 580 Componente S do transportador ECF, CAETHG_04 CLJU_c2341 CLRAG_ família de folato 05 0 01340 581 Região de ativação de metionina sintase CAETHG_04 CLJU_c2345 CLRAG_ dependente de vitamina B12 09 0 17660 582 proteína hipotética CAETHG_04 CLJU_c2364 CLRAG_ 28 0 17530 583 Proteína de função desconhecida CAETHG_04 CLJU_c2366 CLRAG_ (DUF1116) 30 0 17510 584 Proteína de função desconhecida CAETHG_04 CLJU_c2368 CLRAG_ (DUF2877) 32 0 17490
49 / 294 585 Proteína não caracterizada, família CAETHG_04 CLJU_c2429 CLRAG_ piridoxamina 5'-fosfato oxidase (tipo 34, 0, 17470 PNPOx) CAETHG_04 CLJU_c2370 87 0 586 proteína redox provável da família CAETHG_04 CLJU_c2409 CLRAG_ C_GCAxxG_C_C 68 0, 30590 CLJU_c2402 0 587 proteína hipotética CAETHG_04 CLJU_c2411 CLRAG_ 69 0, 17140 CLJU_c2403 0 588 proteína hipotética 2.3.1.0, CAETHG_04 CLJU_c2430 CLRAG_
2.3.1.86, 88 0 24970
2.3.1.39,
2.3.1.3,
2.3.1.2,
2.3.1.1,
2.3.1.85 589 Regulador da atividade de protease HflC, CAETHG_04 CLJU_c2431 CLRAG_ superfamília estomatina/proibitina 90 0 24980 590 epoxiqueuosina redutase CAETHG_04 CLJU_c2435 CLRAG_ 95 0 25090 591 proteína hipotética CAETHG_05 CLJU_c2440 CLRAG_ 00 0 25130 592 proteína hipotética CAETHG_05 CLJU_c2448 CLRAG_ 08 0 30090 593 Proteína de membrana não caracterizada CAETHG_05 CLJU_c2450 CLRAG_ 10 0 30070 594 Fator anti-sigma N terminal CAETHG_05 CLJU_c2452 CLRAG_ 12 0 30050 595 Fator sigma da RNA polimerase CAETHG_05 CLJU_c2453 CLRAG_ 13 0 30040 596 Permease da superfamília do transportador CAETHG_05 CLJU_c2468 CLRAG_ de fármacos/metabólitos (DMT) 33 0 18150 597 Proteína contendo domínio de CAETHG_05 CLJU_c2470 CLRAG_ metiltransferase 35 0 35650 598 proteína hipotética CAETHG_05 CLJU_c2471 CLRAG_ 36 0 18110 599 Proteína de membrana não caracterizada CAETHG_05 CLJU_c2472 CLRAG_ 37 0 18100 600 Proteína de função desconhecida CAETHG_05 CLJU_c2481 CLRAG_ (DUF2975) 46 0 17970 601 proteína hipotética CAETHG_05 CLJU_c2483 CLRAG_ 50 0 17950 602 Regulador transcricional de ligação ao CAETHG_05 CLJU_c2491 CLRAG_ DNA, família FrmR 58 0 17870 603 proteína contendo repetição contendo WG CAETHG_05 CLJU_c2493 CLRAG_ 60 0 17850 604 proteína de membrana integral, família CAETHG_05 CLJU_c2494 CLRAG_ YjbE 61 0 17840 605 Proteína do domínio EDD, família DegV CAETHG_05 CLJU_c2496 CLRAG_ 63 0 17820 606 Proteína contendo domínio hélice-giro- CAETHG_05 CLJU_c2500 CLRAG_ hélice C-terminal PucR 68 0 17780 607 proteína hipotética CAETHG_05 CLJU_c2502 CLRAG_ 70 0 17760 608 proteína hipotética CAETHG_05 CLJU_c2507 CLRAG_ 75 0 17710
50 / 294 609 Proteína transportadora da família ABC-2 CAETHG_05 CLJU_c2511 CLRAG_ 79 0 03450 610 proteína hipotética CAETHG_05 CLJU_c2514 CLRAG_ 82 0 03480 611 proteína reguladora bla blaR1 CAETHG_05 CLJU_c2517 CLRAG_ 85 0 03510 612 Proteína putativa contendo domínio CAETHG_05 CLJU_c2518 CLRAG_ amidase 86 0 03520 613 D-alanil-D-alanina carboxipeptidase CAETHG_05 CLJU_c2519 CLRAG_ 87 0 03530 614 proteína hipotética CAETHG_05 CLJU_c2527 CLRAG_ 96 0 03620 615 proteína hipotética CAETHG_05 CLJU_c2528 CLRAG_ 97 0 03630 616 Proteína de membrana não caracterizada CAETHG_06 CLJU_c2552 CLRAG_ YczE 21 0 03730 617 proteína hipotética CAETHG_06 CLJU_c2553 CLRAG_ 22 0 03740 618 Proteína da superfamília PAP2 CAETHG_06 CLJU_c2555 CLRAG_ 25 0 03750 619 Terminal C da D-glucuronil C5-epimerase CAETHG_06 CLJU_c2559 CLRAG_ 28, 0, 03790 CAETHG_07 CLJU_c2681 62 0 620 Proteína da família alfa/beta hidrolase CAETHG_06 CLJU_c2561 CLRAG_ 30 0 03810 621 Proteína transportadora da família ABC-2 CAETHG_06 CLJU_c2569 CLRAG_ 38 0 03890 622 Proteína transportadora da família ABC-2 CAETHG_06 CLJU_c2570 CLRAG_ 39 0 03900 623 proteína hipotética CAETHG_06 CLJU_c2574 CLRAG_ 43 0 03970 624 Proteína transportadora da família ABC-2 CAETHG_06 CLJU_c2588 CLRAG_ 57 0 04020 625 Putty zinco-dedo CAETHG_06 CLJU_c2590 CLRAG_ 59 0 04040 626 Proteína conservada não caracterizada, CAETHG_06 CLJU_c2592 CLRAG_ família DUF2164 61 0 04060 627 Proteína não caracterizada YjbI, contém CAETHG_06 CLJU_c2593 CLRAG_ repetições de pentapeptídeos 62 0 04070 628 Proteína de função desconhecida CAETHG_07 CLJU_c2625 CLRAG_ (DUF4003) 02 0 04370 629 proteína hipotética CAETHG_07 CLJU_c2633 CLRAG_ 14 0 04420 630 Proteína conservada contendo um motivo CAETHG_07 CLJU_c2634 CLRAG_ semelhante à fita de Zn, possivelmente 15 0 04430 ligante ao RNA 631 Exportador de sulfito TauE/SafE CAETHG_07 CLJU_c2642 CLRAG_ 23 0 04510 632 Proteína contendo domínio de ligação 4Fe- CAETHG_07 CLJU_c2643 CLRAG_ 4S 24 0 04520 633 proteína hipotética CAETHG_07 CLJU_c2644 CLRAG_ 25 0 04530 634 proteína hipotética CAETHG_07 CLJU_c2645 CLRAG_ 26 0 04540 635 proteína hipotética CAETHG_07 CLJU_c2650 CLRAG_ 31 0 08380 636 proteína hipotética CAETHG_07 CLJU_c2656 CLRAG_ 37 0 08440
51 / 294 637 fotoproduto de esporos liase 4.1.99.- CAETHG_07 CLJU_c2659 CLRAG_ 40 0 08460 638 Nucleosídeo fosforilase 3.2.2.16, CAETHG_07 CLJU_c2660 CLRAG_
3.2.2.9 41 0 08470 639 Nuclease prevista da superfamília de CAETHG_07 CLJU_c2663 CLRAG_ restrição tipo endonuclease (RecB), família 44 0 08500 DUF1016 640 Proteína contendo domínio de di- CAETHG_07 CLJU_c2668 CLRAG_ agrupamento 4Fe-4S 49 0 08550 641 proteína hipotética CAETHG_07 CLJU_c2670 CLRAG_ 51 0 08570 642 proteína não caracterizada CAETHG_07 CLJU_c2671 CLRAG_ 52 0 08580 643 proteína de membrana insertase, família CAETHG_07 CLJU_c2675 CLRAG_ YidC/Oxa1, proteína que contém o domínio 56 0 08620 C-terminal 644 proteína hipotética CAETHG_07 CLJU_c2676 CLRAG_ 57 0 08630 645 proteína hipotética CAETHG_07 CLJU_c2680 CLRAG_ 61 0 08670 646 Proteína da família acetiltransferase CAETHG_07 CLJU_c2684 CLRAG_ (GNAT) 68 0 08720 647 Proteína de ligação a metais não CAETHG_07 CLJU_c3797 CLRAG_ caracterizada 73 0, 37360 CLJU_c2689 0 648 Família de proteína não caracterizada CAETHG_07 CLJU_c3793 CLRAG_ (UPF0051) 74, 0, 37320 CAETHG_16 CLJU_c2690 30 0 649 Permeação prevista CAETHG_07 CLJU_c2692 CLRAG_ 76 0 08770 650 Permeação prevista CAETHG_07 CLJU_c2693 CLRAG_ 77 0 08780 651 Proteína transportadora da família ABC-2 CAETHG_07 CLJU_c2706 CLRAG_ 89 0 08820 652 Protoporfirinogênio IX oxidase, dependente CAETHG_07 CLJU_c2710 CLRAG_ da menaquinona (domínio da flavodoxina) 95 0 08880 653 proteína hipotética CAETHG_08 CLJU_c2714 CLRAG_ 00 0 20090 654 Proteína transportadora da família ABC-2 CAETHG_08 CLJU_c2715 CLRAG_ 01 0 20080 655 proteína hipotética CAETHG_08 CLJU_c0083 CLRAG_ 02, 0, 20070 CAETHG_21 CLJU_c2716 98 0 656 proteína hipotética CAETHG_08 CLJU_c2725 CLRAG_ 11, 0, 16540 CAETHG_39 CLJU_c1875 94 0 657 proteína reguladora de esporulação tipo CAETHG_08 CLJU_c2827 CLRAG_ Spo0E 24 0 34350 658 Serina fosfatase RsbU, reguladora da CAETHG_08 CLJU_c2830 CLRAG_ subunidade sigma 27 0 34380 659 proteína de função desconhecida CAETHG_08 CLJU_c2831 CLRAG_ (DUF1987) 28 0 34390 660 proteína hipotética CAETHG_08 CLJU_c2832 CLRAG_ 29 0 34400 661 proteína de função desconhecida CAETHG_08 CLJU_c2833 CLRAG_ (DUF4317) 30 0 34410
52 / 294 662 Selenoproteína tipo HesB CAETHG_08 CLJU_c2834 CLRAG_ 31 0 34420 663 Proteína contendo domínio IDEAL CAETHG_08 CLJU_c2838 CLRAG_ 35 0 34460 664 Proteína da superfamília de nuclease PD- CAETHG_08 CLJU_c2839 CLRAG_ (D/E)XK 36 0 34470 665 proteína hipotética CAETHG_08 CLJU_c2841 CLRAG_ 39 0 34490 666 hemolisina putativa CAETHG_08 CLJU_c2843 CLRAG_ 41 0 34510 667 proteína reguladora de esporulação tipo CAETHG_08 CLJU_c2847 CLRAG_ Spo0E 42 0 34550 668 proteína hipotética CAETHG_08 CLJU_c2851 CLRAG_ 46 0 34590 669 Proteína de membrana não caracterizada CAETHG_08 CLJU_c2856 CLRAG_ 50, 0, 34630 CAETHG_40 CLJU_c1904 38 0 670 proteína hipotética CAETHG_08 CLJU_c2857 CLRAG_ 52 0 34640 671 proteína hipotética CAETHG_08 CLJU_c2862 CLRAG_ 57 0 34700 672 proteína hipotética CAETHG_08 CLJU_c2878 CLRAG_ 73 0 34860 673 Conjunto de pilus Flp putativo tipo TadE/G CAETHG_08 CLJU_c2884 CLRAG_ 80 0 34920 674 proteína de montagem pilus Flp/PilA CAETHG_08 CLJU_c2886 CLRAG_ 82 0 34940 675 proteína hipotética CAETHG_08 CLJU_c2890 CLRAG_ 86 0 34980 676 Transportador de triptofano TrpP CAETHG_08 CLJU_c2900 CLRAG_ 92 0 35000 677 Proteína contendo domínio CBS 1.1.1.205 CAETHG_08 CLJU_c2901 CLRAG_ 93 0 35010 678 proteína hipotética CAETHG_08 CLJU_c2902 CLRAG_ 94 0 35020 679 Endonuclease HNH CAETHG_08 CLJU_c2903 CLRAG_ 95 0 35030 680 Proteína contendo repetição da beta-hélice CAETHG_09 CLJU_c2908 CLRAG_ da família YVTN de 40 resíduos 00 0 35080 681 Domínio catalítico da L,D-transpeptidase CAETHG_09 CLJU_c2909 CLRAG_ 01 0 35090 682 Proteína conservada não caracterizada CAETHG_09 CLJU_c2910 CLRAG_ YukE 02 0 35100 683 proteína hipotética CAETHG_09 CLJU_c2919 CLRAG_ 11 0 35190 684 Proteína conservada não caracterizada 3.5.1.28 CAETHG_09 CLJU_c2920 CLRAG_ YgiM, contém domínio SH3 N-terminal, 12 0 35200 família DUF1202 685 proteína hipotética CAETHG_09 CLJU_c2925 CLRAG_ 18 0 35260 686 Domínio HD-GYP, fosfodiesterase c-di- CAETHG_09 CLJU_c2926 CLRAG_ GMP classe II (ou sua variante inativada) 19 0 35270 687 ligase de 2'-5’ RNA CAETHG_09 CLJU_c2928 CLRAG_ 21 0 35290 688 proteína hipotética CAETHG_09 CLJU_c2929 CLRAG_ 22 0 35300 689 Proteína de função desconhecida CAETHG_09 CLJU_c2932 CLRAG_ (DUF2000) 25 0 35330
53 / 294 690 proteína de função desconhecida CAETHG_09 CLJU_c2935 CLRAG_ (DUF3787) 29 0 35370 691 Proteína contendo motivo SEC-C CAETHG_09 CLJU_c2947 CLRAG_ 41 0 35460 692 proteína hipotética CAETHG_09 CLJU_c2948 CLRAG_ 42 0 35470 693 proteína redox provável da família CAETHG_09 CLJU_c2952 CLRAG_ C_GCAxxG_C_C 46 0 35510 694 proteína hipotética CAETHG_09 CLJU_c2967 CLRAG_ 65 0 35670 695 proteína hipotética CAETHG_09 CLJU_c2969 CLRAG_ 67 0 35690 696 proteína hipotética CAETHG_09 CLJU_c2974 CLRAG_ 73 0 35740 697 Lipase/Acil-hidrolase tipo GDSL CAETHG_09 CLJU_c2976 CLRAG_ 75 0 35760 698 Proteína de função desconhecida CAETHG_09 CLJU_c2977 CLRAG_ (DUF3189) 76 0 35770 699 proteína hipotética CAETHG_09 CLJU_c2980 CLRAG_ 79 0 35810 700 proteína hipotética CAETHG_09 CLJU_c2982 CLRAG_ 81 0 35830 701 PrcB C-terminal CAETHG_09 CLJU_c2986 CLRAG_ 85 0 35870 702 proteína de função desconhecida CAETHG_09 CLJU_c2987 CLRAG_ (DUF4367) 86 0 35880 703 Regulador de transcrição previsto YheO, CAETHG_10 CLJU_c3001 CLRAG_ contém os domínios HTH de ligação ao 00 0 15650 PAS e ao DNA 704 proteína do metabolismo do DNA provável CAETHG_10 CLJU_c3039 CLRAG_ 35, 0, 15920 CAETHG_10 CLJU_c3028 44 0 705 Tipo YoaP CAETHG_10 CLJU_c3059 CLRAG_ 63 0 16000 706 proteína hipotética CAETHG_10 CLJU_c3071 CLRAG_ 75 0 16150 707 proteína hipotética CAETHG_10 CLJU_c3072 CLRAG_ 76 0 16160 708 proteína hipotética CAETHG_10 CLJU_c3079 CLRAG_ 83 0 16230 709 proteína hipotética CAETHG_10 CLJU_c3080 CLRAG_ 84 0 16240 710 Proteína putativa contendo domínio CAETHG_10 CLJU_c3216 CLRAG_ amidase 91, 0, 16290 CAETHG_11 CLJU_c3088 44 0 711 Regulador transcricional de ligação ao CAETHG_11 CLJU_c3214 CLRAG_ DNA, família FrmR 42 0 02770 712 proteína hipotética CAETHG_11 CLJU_c3217 CLRAG_ 45 0 02800 713 Proteína de função desconhecida CAETHG_11 CLJU_c3220 CLRAG_ (DUF3892) 48 0 02830 714 Superfamília da Peptidase MA CAETHG_11 CLJU_c3221 CLRAG_ 49 0 02840 715 Proteína de membrana não caracterizada CAETHG_11 CLJU_c3222 CLRAG_ 50 0 03040
54 / 294 716 Proteína da família da proteína YvrJ CAETHG_11 CLJU_c3255 CLRAG_ 66, 0, 37650 CAETHG_16 CLJU_c3236 57 0 717 Proteína de função desconhecida CAETHG_11 CLJU_c3256 CLRAG_ (DUF1659) 67, 0, 29820 CAETHG_16 CLJU_c3237 56 0 718 Proteína de função desconhecida CAETHG_11 CLJU_c3238 CLRAG_ (DUF2922) 68, 0, 29830 CAETHG_16 CLJU_c3257 55 0 719 proteína de função desconhecida CAETHG_11 CLJU_c3276 CLRAG_ (DUF3786) 74, 0, 06590 CAETHG_15 CLJU_c3608 17 0 720 Proteína de função desconhecida CAETHG_11 CLJU_c3282 CLRAG_ (DUF2992) 80 0 15510 721 proteína hipotética CAETHG_11 CLJU_c3285 CLRAG_ 83 0 15480 722 proteína hipotética CAETHG_11 CLJU_c3286 CLRAG_ 84 0 15470 723 Metiltransferase fosfolipídica CAETHG_11 CLJU_c3290 CLRAG_ 88 0 15430 724 proteína de operon lia LiaG CAETHG_11 CLJU_c3291 CLRAG_ 89 0 15420 725 proteína hipotética CAETHG_11 CLJU_c3292 CLRAG_ 90 0 15410 726 Proteína doliquil-fosfato-manose CAETHG_11 CLJU_c3298 CLRAG_ manosiltransferase 96, 0, 15350 CAETHG_34 CLJU_c1332 15 0 727 proteína hipotética CAETHG_11 CLJU_c3299 CLRAG_ 97 0 15340 728 Proteína permease de sistema de transporte CAETHG_11 CLJU_c3300 CLRAG_ do tipo ABC-2 98 0 15330 729 Superfamília da haloácido desalogenase CAETHG_12 CLJU_c3307 CLRAG_ (subfamília) Classe IIA/superfamília 05 0 15260 haloácido desalogenase, subfamília IA, variante 1 com terceiro motivo com Dx(3- 4)D ou Dx(3-4)E 730 Proteína da família TIGR00659 CAETHG_12 CLJU_c3308 CLRAG_ 06 0 15250 731 proteína tipo holina CAETHG_12 CLJU_c3309 CLRAG_ 07 0 15240 732 proteína hipotética CAETHG_12 CLJU_c3323 CLRAG_ 22 0 15030 733 proteína hipotética CAETHG_12 CLJU_c3329 CLRAG_ 28 0 14970 734 Proteína de membrana não caracterizada CAETHG_12 CLJU_c3332 CLRAG_ 31 0 14940 735 Proteína de esporos não caracterizada YtfJ CAETHG_12 CLJU_c3334 CLRAG_ 34 0 14910 736 Proteína de função desconhecida CAETHG_12 CLJU_c3335 CLRAG_ (DUF2953) 35 0 14900 737 proteína hipotética CAETHG_12 CLJU_c3336 CLRAG_ 36 0 14890 738 Lecitina retinol aciltransferase CAETHG_12 CLJU_c3337 CLRAG_ 37 0 14880 739 Proteína de revestimento de esporos CotF CAETHG_12 CLJU_c3339 CLRAG_ 39 0 14860
55 / 294 740 Proteína associada ao revestimento de CAETHG_12 CLJU_c3340 CLRAG_ esporos JA (CotJA) 40 0 14850 741 proteína hipotética CAETHG_12 CLJU_c3344 CLRAG_ 44 0 32320 742 Proteína de função desconhecida CAETHG_12 CLJU_c3345 CLRAG_ (DUF3100) 45 0 32310 743 proteína hipotética CAETHG_12 CLJU_c3355 CLRAG_ 54 0 24730 744 proteína hipotética CAETHG_12 CLJU_c3362 CLRAG_ 60 0 24660 745 MEDS: MEtanogênion/metilotrófico, CAETHG_12 CLJU_c3363 CLRAG_ Domínio sensorial DcmR 61 0 24650 746 proteína hipotética CAETHG_12 CLJU_c3365 CLRAG_ 63 0 24630 747 coproporfirinogênio-3 oxidase CAETHG_12 CLJU_c3368 CLRAG_ independente de oxigênio 66 0 24600 748 peptídeo SCIFF de seis-cisteína CAETHG_12 CLJU_c3377 CLRAG_ 75 0 24510 749 proteína de membrana putativa, família CAETHG_12 CLJU_c3378 CLRAG_ TIGR04086 76 0 24500 750 subunidade de translocase pré-proteína CAETHG_12 CLJU_c3379 CLRAG_ YajC 77 0 24490 751 proteína hipotética CAETHG_12 CLJU_c3384 CLRAG_ 82 0 24440 752 Proteína UPF0755 CAETHG_12 CLJU_c3386 CLRAG_ 84 0 24420 753 Proteína reguladora de ligação ao DNA, CAETHG_12 CLJU_c3387 CLRAG_ família YebC/PmpR 85 0 14020 754 proteína não caracterizada, família YigZ CAETHG_12 CLJU_c3388 CLRAG_ 86 0 14030 755 proteína hipotética CAETHG_12 CLJU_c3390 CLRAG_ 88 0 14050 756 proteína de esporulação YunB CAETHG_12 CLJU_c3393 CLRAG_ 91 0 14080 757 O-antígeno ligase CAETHG_13 CLJU_c3406 CLRAG_ 04 0 14210 758 polimerase de unidade de repetição de CAETHG_13 CLJU_c3414 CLRAG_ oligossacarídeos 12 0 14290 759 proteína hipotética CAETHG_13 CLJU_c3432 CLRAG_ 24, 0, 14380 CAETHG_13 CLJU_c3425 32 0 760 Proteína conservada não caracterizada CAETHG_13 CLJU_c3437 CLRAG_ YbbK, família DUF523 37 0 14450 761 proteína de divisão celular ZapA CAETHG_13 CLJU_c3440 CLRAG_ 40 0 14480 762 proteína de esporulação putativa YtxC CAETHG_13 CLJU_c3448 CLRAG_ 48 0 14560 763 Proteína putativa contendo domínio de CAETHG_13 CLJU_c3453 CLRAG_ ligação a peptidoglicano 49 0 14610 764 proteína hipotética CAETHG_13 CLJU_c3463 CLRAG_ 59 0 14710 765 proteína de função desconhecida CAETHG_13 CLJU_c3465 CLRAG_ (DUF4364) 61 0 14730 766 Proteína contendo repetição da beta-hélice CAETHG_13 CLJU_c3466 CLRAG_ da família YVTN de 40 resíduos 63 0 14740 767 proteína não caracterizada TIGR03905 CAETHG_13 CLJU_c3467 CLRAG_ 64 0 14750 768 proteína hipotética CAETHG_13 CLJU_c3470 CLRAG_ 67 0 14780
56 / 294 769 Proteína de ligação ao substrato do sistema CAETHG_13 CLJU_c3471 CLRAG_ de transporte da família NitT/TauT 68 0 14790 770 Proteína de função desconhecida CAETHG_13 CLJU_c3483 CLRAG_ (DUF2812) 81 0 26070 771 proteína CcmA, família bactofilina CAETHG_13 CLJU_c3491 CLRAG_ 89 0 26150 772 Proteína de função desconhecida CAETHG_13 CLJU_c3492 CLRAG_ (DUF4004) 90 0 26160 773 Policetídeo ciclase/desidrase CAETHG_14 CLJU_c3498 CLRAG_ 07 0 26250 774 Proteína contendo domínio AAA CAETHG_14 CLJU_c3499 CLRAG_ 08 0 26260 775 Componente ThiW do transportador S de CAETHG_14 CLJU_c3505 CLRAG_ fator de acoplamento de energia 14 0 26310 776 Regulador transcricional de ligação ao CAETHG_14 CLJU_c3512 CLRAG_ DNA, família PadR 21 0 26370 777 Proteína permease de sistema de transporte CAETHG_14 CLJU_c3520 CLRAG_ do tipo ABC-2 28 0 05710 778 Proteína permease de sistema de transporte CAETHG_14 CLJU_c3521 CLRAG_ do tipo ABC-2 29 0 05720 779 Proteína conservada não caracterizada CAETHG_14 CLJU_c3522 CLRAG_ YurZ, família alquil- 30 0 05730 hidroperoxidase/carboximuconolactona descarboxilase 780 proteína de membrana putativa CAETHG_14 CLJU_c3525 CLRAG_ 33 0 05760 781 Proteína de ligação ao substrato do sistema CAETHG_14 CLJU_c3532 CLRAG_ de transporte da família NitT/TauT 41 0 05850 782 Proteína contendo repetição de CAETHG_14 CLJU_c3538 CLRAG_ tetratricopeptídeo 46 0 05920 783 Proteína YitT ancorada na membrana não CAETHG_14 CLJU_c3546 CLRAG_ caracterizada, contém os domínios DUF161 54 0 05990 e DUF2179 784 proteína contendo domínio dissulfeto redox CAETHG_14 CLJU_c3550 CLRAG_ associado a proteína de agrupamento 57, 0, 06020 híbrido CAETHG_38 CLJU_c3549 09, 0, CAETHG_14 CLJU_c1699 58 0 785 Proteína contendo domínio de repetição CAETHG_14 CLJU_c3557 CLRAG_ 65 0 06100 786 proteína hipotética CAETHG_14 CLJU_c3559 CLRAG_ 67 0 06120 787 Autoimunidade à protease CAAX CAETHG_14 CLJU_c3560 CLRAG_ 68 0 06130 788 proteína hipotética CAETHG_14 CLJU_c3567 CLRAG_ 75 0 06200 789 Proteína de função desconhecida CAETHG_14 CLJU_c3575 CLRAG_ (DUF3343) 83 0 06280 790 Proteína YitT ancorada na membrana não CAETHG_14 CLJU_c3579 CLRAG_ caracterizada, contém os domínios DUF161 87 0 06320 e DUF2179 791 Proteína provável contendo domínio da fita CAETHG_14 CLJU_c3824 CLRAG_ de zinco 88, 0, 06330 CAETHG_16 CLJU_c3580 80 0 792 Subunidade PreT de di-hidropirimidina CAETHG_14 CLJU_c3588 CLRAG_ desidrogenase (NAD+) 95 0 06380 793 proteína hipotética CAETHG_15 CLJU_c3597 CLRAG_ 05 0 06470
57 / 294 794 proteína hipotética CAETHG_15 CLJU_c3606 CLRAG_ 15 0 06550 795 Proteína da família da proteína YvrJ CAETHG_15 CLJU_c3607 CLRAG_ 16 0 06560 796 proteína hipotética CAETHG_15 CLJU_c3612 CLRAG_ 22 0 06650 797 proteína hipotética CAETHG_15 CLJU_c3618 CLRAG_ 28 0 24000 798 proteína hipotética CAETHG_15 CLJU_c3619 CLRAG_ 29 0 23990 799 proteína hipotética CAETHG_15 CLJU_c3632 CLRAG_ 40 0 23840 800 proteína hipotética CAETHG_15 CLJU_c3688 CLRAG_ 49 0 36410 801 proteína hipotética CAETHG_15 CLJU_c3690 CLRAG_ 51 0 36430 802 proteína hipotética CAETHG_15 CLJU_c3696 CLRAG_ 57 0 36500 803 proteína hipotética CAETHG_15 CLJU_c3709 CLRAG_ 64 0 36570 804 proteína hipotética CAETHG_15 CLJU_c3710 CLRAG_ 65 0 36580 805 Proteína de membrana não caracterizada CAETHG_15 CLJU_c3721 CLRAG_ YdjX, família TVP38/TMEM64, domínio 74 0 36650 associado ao SNARE 806 proteína não caracterizada, família CAETHG_15 CLJU_c3731 CLRAG_ MTH1187 87 0 36750 807 proteína de função desconhecida CAETHG_15 CLJU_c3745 CLRAG_ (DUF1836) 97 0 36860 808 Proteína contendo o motivo CxxC CAETHG_15 CLJU_c3746 CLRAG_ 98 0 36870 809 proteína de função desconhecida CAETHG_16 CLJU_c3750 CLRAG_ (DUF3786) 03 0 36910 810 proteína hipotética CAETHG_16 CLJU_c2261 CLRAG_ 04 0, 36920 CLJU_c3751 0 811 Proteína prevista de ligação a RNA CAETHG_16 CLJU_c3752 CLRAG_ 05 0 36930 812 C terminal de metileno-tetra-hidrofolato 1.5.1.20 CAETHG_16 CLJU_c3762 CLRAG_ redutase 15 0 37030 813 proteína hipotética CAETHG_16 CLJU_c3779 CLRAG_ 26 0 37210 814 Proteína de membrana integral hipotética CAETHG_16 CLJU_c3781 CLRAG_ conservada 28 0 37230 815 Proteína contendo domínio MOSC CAETHG_16 CLJU_c3801 CLRAG_ 32 0 37380 816 proteína hipotética CAETHG_16 CLJU_c3811 CLRAG_ 35 0 37480 817 proteína hipotética CAETHG_16 CLJU_c3813 CLRAG_ 39 0 37530 818 Proteína de função desconhecida CAETHG_16 CLJU_c0831 CLRAG_ (DUF1653) 44, 0 08090 CAETHG_29 26 819 Proteína contendo domínio associado ao CAETHG_16 CLJU_c3252 CLRAG_ fago e DnaD 65 0 36090 820 proteína hipotética CAETHG_16 CLJU_c3822 CLRAG_ 78 0 20680
58 / 294 821 Regulador de transcrição previsto, contém CAETHG_16 CLJU_c3823 CLRAG_ domínio HTH 79 0 20690 822 Proteína de membrana não caracterizada CAETHG_16 CLJU_c3825 CLRAG_ 81 0 20710 823 Proteína contendo motivo de sequência CAETHG_16 CLJU_c3837 CLRAG_ GxGYxY 95 0 20840 824 proteína hipotética CAETHG_16 CLJU_c3844 CLRAG_ 99 0 20880 825 proteína hipotética CAETHG_17 CLJU_c3134 CLRAG_ 51 0 21210 826 subunidade de translocase de pré-proteína CAETHG_17 CLJU_c3910 CLRAG_ SecG 55 0 21250 827 proteína hipotética CAETHG_17 CLJU_c3921 CLRAG_ 66 0 21360 828 Transportador de efluxo de CAETHG_17 CLJU_c3922 CLRAG_ treonina/homosserina RhtA 67 0 21430 829 Proteína contendo domínio semelhante a Ig CAETHG_17 CLJU_c3933 CLRAG_ 78 0 21540 830 proteína hipotética CAETHG_17 CLJU_c3938 CLRAG_ 83 0 21590 831 proteína hipotética CAETHG_17 CLJU_c3947 CLRAG_ 92 0 21680 832 proteína hipotética CAETHG_17 CLJU_c3948 CLRAG_ 93 0 21690 833 proteína hipotética CAETHG_17 CLJU_c3949 CLRAG_ 94 0 21700 834 proteína hipotética CAETHG_17 CLJU_c3953 CLRAG_ 98 0 21730 835 homosserina quinase CAETHG_18 CLJU_c3965 CLRAG_ 11 0 21900 836 Proteína da família tipo PadR do regulador CAETHG_18 CLJU_c3989 CLRAG_ transcricional 33, 0, 22120 CAETHG_18 CLJU_c3987 35 0 837 Transportador de efluxo de resistência a CAETHG_18 CLJU_c3990 CLRAG_ múltiplos fármacos 34, 0, 22130 CAETHG_18 CLJU_c3988 36 0 838 Proteína de membrana DedA, domínio CAETHG_18 CLJU_c3996 CLRAG_ associado ao SNARE 42 0 22190 839 Proteína putativa contendo domínio CAETHG_18 CLJU_c4002 CLRAG_ amidase 49 0 22250 840 Proteína da família do ativador da CAETHG_18 CLJU_c4007 CLRAG_ transcrição Mor 56 0 22330 841 fosfopantotenoilcisteína 4.1.1.36, CAETHG_18 CLJU_c4014 CLRAG_ descarboxilase/fosfopantotenato-cisteína 6.3.2.5 63 0 22370 ligase 842 proteína de função desconhecida CAETHG_18 CLJU_c4043 CLRAG_ (DUF4177) 86 0 22620 843 Proteína que contém o domínio YbbR CAETHG_18 CLJU_c4046 CLRAG_ 89 0 22650 844 diadenilato ciclase CAETHG_18 CLJU_c4047 CLRAG_ 90 0 22660 845 proteína de função desconhecida CAETHG_18 CLJU_c4052 CLRAG_ (DUF4652) 95 0 22710 846 proteína da família ribonuclease-3 CAETHG_19 CLJU_c4126 CLRAG_ 67 0 23450 847 Proteína conservada não caracterizada CAETHG_19 CLJU_c4129 CLRAG_ YacL, contém domínios PIN e TRAM 70 0 23480
59 / 294 848 proteína hipotética CAETHG_19 CLJU_c4130 CLRAG_ 71 0 23490 849 proteína hipotética CAETHG_19 CLJU_c4137 CLRAG_ 78 0 23560 850 proteína hipotética 2.6.1.11 CAETHG_19 CLJU_c4150 CLRAG_ 84 0 04630 851 proteína de divisão celular FtsL CAETHG_19 CLJU_c4163 CLRAG_ 92 0 04760 852 proteína de biossíntese de córtex de esporos CAETHG_19 CLJU_c4164 CLRAG_ YabQ 93 0 04770 853 proteína de esporulação YabP CAETHG_19 CLJU_c4165 CLRAG_ 94 0 04780 854 proteína da família tetrapirole CAETHG_19 CLJU_c4168 CLRAG_ metilase/proteína da família MazG 97 0 04810 855 proteína hipotética CAETHG_20 CLJU_c4182 CLRAG_ 11 0 04950 856 proteína hipotética CAETHG_20 CLJU_c4187 CLRAG_ 16 0 04980 857 proteína hipotética CAETHG_20 CLJU_c4190 CLRAG_ 19 0 05010 858 Proteína de membrana não caracterizada CAETHG_20 CLJU_c4191 CLRAG_ YkvI 20 0 05020 859 Proteína da superfamília da 2'-5’ RNA CAETHG_20 CLJU_c4196 CLRAG_ ligase 25 0 05070 860 proteína de função desconhecida CAETHG_20 CLJU_c4197 CLRAG_ (DUF1540) 26 0 05080 861 Proteína CxxH/CxxC, família BA_5709 CAETHG_20 CLJU_c4200 CLRAG_ 29 0 05110 862 Proteína contendo motivo SEC-C CAETHG_20 CLJU_c4201 CLRAG_ 31 0 05120 863 Proteína contendo domínio F5/8 tipo C CAETHG_20 CLJU_c4202 CLRAG_ 32 0 05130 864 regulador putativo de sistema de CAETHG_20 CLJU_c4204 CLRAG_ hidrogenase apenas com ferro 34 0 05150 865 DUTPase dimérica, superfamília all-alfa- CAETHG_20 CLJU_c4205 CLRAG_ NTP-PPase (MazG) 35 0 05160 866 proteína da família-2 transportadora CAETHG_20 CLJU_c4206 CLRAG_ 36 0 05170 867 Oxidorredutase de flavina YrpB dependente CAETHG_20 CLJU_c4221 CLRAG_ de NAD (H), família da nitropropano 52 0 05320 dioxigenase 868 Proteína de ligação a CoA prevista CAETHG_20 CLJU_c4232 CLRAG_ 56 0 05430 869 Proteína contendo domínio cupina CAETHG_20 CLJU_c4243 CLRAG_ 68 0 05570 870 Transportador putativo ABC tipo IV CAETHG_20 CLJU_c4247 CLRAG_ 72 0 05580 871 Proteína da família tipo MazG CAETHG_21 CLJU_c4276 CLRAG_ 02 0 25570 872 proteína hipotética CAETHG_21 CLJU_c4280 CLRAG_ 06 0 25610 873 Proteína de função desconhecida CAETHG_21 CLJU_c4282 CLRAG_ (DUF3343) 08 0 25630 874 proteína de membrana integral de CAETHG_21 CLJU_c4283 CLRAG_ esporulação YtvI 09 0 25640 875 proteína putativa de esporulação YyaC CAETHG_21 CLJU_c4284 CLRAG_ 10 0 25650 876 Família de proteína não caracterizada CAETHG_211 CLJU_c4285 CLRAG_ (UPF0180) 1 0 25660
60 / 294 877 Proteína de função desconhecida CAETHG_21 CLJU_c4286 CLRAG_ (DUF4446) 12 0 25670 878 proteína hipotética CAETHG_21 CLJU_c4295 CLRAG_ 21 0 25760 879 proteína associada ao ribossomo CAETHG_21 CLJU_c0003 CLRAG_ 26 0 25810 880 proteína de função desconhecida (DUF370) CAETHG_21 CLJU_c0005 CLRAG_ 28 0 25830 881 Proteína contendo domínio HDIG CAETHG_21 CLJU_c0012 CLRAG_ 31 0 20200 882 proteína hipotética CAETHG_21 CLJU_c0014 CLRAG_ 33 0 20180 883 Proteína de função desconhecida CAETHG_21 CLJU_c0016 CLRAG_ (DUF1667) 36 0 20160 884 proteína hipotética CAETHG_21 CLJU_c0055 CLRAG_ 73 0 20020 885 Manose-6-fosfato isomerase, superfamília CAETHG_21 CLJU_c0063 CLRAG_ de cupina 81 0 19950 886 Fasina do regulador de síntese de poli- CAETHG_21 CLJU_c0074 CLRAG_ hidroxialcanoato 91 0 19840 887 proteína hipotética CAETHG_22 CLJU_c0086 CLRAG_ 00 0 19720 888 Proteína de função desconhecida CAETHG_22 CLJU_c0088 CLRAG_ (DUF2508) 02 0 19700 889 inibidor da maquinaria de processamento CAETHG_22 CLJU_c0089 CLRAG_ pro-sigma K 03 0 19690 890 proteína hipotética CAETHG_22 CLJU_c0666 CLRAG_ 06, 0, 19660 CAETHG_27 CLJU_c0092 56 0 891 Proteína contendo domínio de di- CAETHG_22 CLJU_c0093 CLRAG_ agrupamento 4Fe-4S 07 0 19650 892 proteína hipotética CAETHG_22 CLJU_c0094 CLRAG_ 08 0 19640 893 proteína hipotética CAETHG_22 CLJU_c0095 CLRAG_ 09 0 19630 894 proteína hipotética CAETHG_22 CLJU_c0134 CLRAG_ 40 0 27000 895 Inibidor do sigma-G Gin CAETHG_22 CLJU_c0137 CLRAG_ 43 0 27030 896 Proteína não caracterizada YaaQ CAETHG_22 CLJU_c0140 CLRAG_ 46 0 27060 897 Chaperona de cobre CopZ CAETHG_22 CLJU_c0143 CLRAG_ 49 0 27090 898 Hidrolase associada à parede celular, CAETHG_22 CLJU_c0150 CLRAG_ família NlpC 55, 0, 27150 CAETHG_22 CLJU_c0149 56 0 899 proteína hipotética CAETHG_22 CLJU_c0153 CLRAG_ 59 0 27190 900 proteína de função desconhecida CAETHG_22 CLJU_c0156 CLRAG_ (DUF1836) 62 0 27220 901 proteína hipotética CAETHG_22 CLJU_c0158 CLRAG_ 64 0 27240 902 proteína hipotética CAETHG_22 CLJU_c0168 CLRAG_ 70 0 27280 903 proteína hipotética CAETHG_22 CLJU_c0169 CLRAG_ 71 0 27290 904 proteína de função desconhecida (DUF348) CAETHG_22 CLJU_c0175 CLRAG_ 77 0 27350
61 / 294 905 ribonuclease M5 CAETHG_22 CLJU_c0176 CLRAG_ 78 0 27360 906 proteína hipotética CAETHG_22 CLJU_c0178 CLRAG_ 81 0 27380 907 proteína hipotética CAETHG_22 CLJU_c0179 CLRAG_ 82 0 27390 908 proteína hipotética CAETHG_22 CLJU_c0180 CLRAG_ 83 0 27400 909 proteína hipotética CAETHG_22 CLJU_c0183 CLRAG_ 86 0 27430 910 Proteína de membrana DedA, domínio CAETHG_22 CLJU_c0191 CLRAG_ associado ao SNARE 94 0 27510 911 Parte da proteína que contém o domínio CAETHG_22 CLJU_c0192 CLRAG_ AAA 95 0 27520 912 endonuclease putativa CAETHG_22 CLJU_c0194 CLRAG_ 97 0 27540 913 proteína hipotética CAETHG_22 CLJU_c0196 CLRAG_ 99 0 27560 914 Proteína não caracterizada Veg CAETHG_23 CLJU_c0207 CLRAG_ 12 0 27670 915 proteína de função desconhecida CAETHG_23 CLJU_c0208 CLRAG_ (DUF3794) 13 0 27680 916 proteína hipotética CAETHG_23 CLJU_c0212 CLRAG_ 17 0 27720 917 Proteína de beta-baril não caracterizada CAETHG_23 CLJU_c0218 CLRAG_ YwiB, família DUF1934 23 0 27780 918 proteína hipotética CAETHG_23 CLJU_c0221 CLRAG_ 26 0 27810 919 Proteína conservada não caracterizada CAETHG_23 CLJU_c0224 CLRAG_ YqhQ 29 0 27840 920 proteína hipotética CAETHG_23 CLJU_c0227 CLRAG_ 32 0 27870 921 Ligação TATA-box CAETHG_23 CLJU_c0245 CLRAG_ 51 0 28060 922 proteína putativa de esporulação YyaC CAETHG_23 CLJU_c0252 CLRAG_ 57 0 28120 923 proteína hipotética CAETHG_23 CLJU_c0260 CLRAG_ 60 0 28200 924 Transportador de riboflavina FmnP CAETHG_23 CLJU_c0269 CLRAG_ 70 0 28290 925 proteína hipotética CAETHG_23 CLJU_c0270 CLRAG_ 72 0 28300 926 proteína de biossíntese flagelar CAETHG_23 CLJU_c0271 CLRAG_ 73 0 28310 927 proteína hipotética CAETHG_23 CLJU_c0277 CLRAG_ 78 0 28370 928 Proteína contendo domínio DnaJ CAETHG_23 CLJU_c0278 CLRAG_ 79 0 28380 929 proteína hipotética CAETHG_23 CLJU_c0279 CLRAG_ 80 0 28390 930 proteína de função desconhecida CAETHG_23 CLJU_c0282 CLRAG_ (DUF4363) 83 0 28420 931 Proteína de membrana não caracterizada CAETHG_23 CLJU_c0283 CLRAG_ YcaP, família DUF421 84 0 28430 932 uridina quinase 2.7.1.48 CAETHG_23 CLJU_c0284 CLRAG_ 85 0 28440 933 serina/treonina-proteína quinase RsbW CAETHG_24 CLJU_c0288 CLRAG_ 03 0 28480 934 proteína hipotética CAETHG_24 CLJU_c0290 CLRAG_ 05 0 28500
62 / 294 935 Proteína de membrana não caracterizada CAETHG_24 CLJU_c0292 CLRAG_ YdjX, família TVP38/TMEM64, domínio 07 0 28520 associado ao SNARE 936 Proteína contendo domínio CBS 1.1.1.205 CAETHG_24 CLJU_c0293 CLRAG_ 08 0 28530 937 proteína hipotética CAETHG_24 CLJU_c0295 CLRAG_ 10 0 28560 938 proteína hipotética CAETHG_24 CLJU_c0299 CLRAG_ 14 0 28600 939 Proteína de separação de lipoproteínas da CAETHG_24 CLJU_c0302 CLRAG_ membrana externa 17 0 28630 940 Proteína contendo domínio PDZ CAETHG_24 CLJU_c0310 CLRAG_ 25 0 28710 941 Domínio associado a Forkhead (FHA), liga CAETHG_24 CLJU_c0313 CLRAG_ pSer, pThr, pTyr 28 0 28740 942 proteína da membrana interna CAETHG_24 CLJU_c0316 CLRAG_ 31 0 28770 943 Proteína de ligação a nucleotídeo UPF0042 CAETHG_24 CLJU_c0319 CLRAG_ 34 0 28800 944 proteína hipotética conservada, relacionada CAETHG_24 CLJU_c0320 CLRAG_ ao cofD 35 0 28810 945 proteína hipotética CAETHG_24 CLJU_c0321 CLRAG_ 36 0 28820 946 Proteína conservada não caracterizada CAETHG_24 CLJU_c0382 CLRAG_ YgbK, família DUF1537 44 0 28890 947 Família de proteína não caracterizada CAETHG_24 CLJU_c0389 CLRAG_ (UPF0180) 51 0 29000 948 proteína de função desconhecida CAETHG_24 CLJU_c0393 CLRAG_ (DUF3870) 55 0 29040 949 Proteína de membrana contendo o domínio CAETHG_24 CLJU_c0394 CLRAG_ EamA RarD 56 0 29050 950 Proteína contendo domínio de CAETHG_24 CLJU_c0410 CLRAG_ metiltransferase 73 0 26950 951 proteína hipotética CAETHG_24 CLJU_c0421 CLRAG_ 89 0 26850 952 proteína hipotética CAETHG_24 CLJU_c0422 CLRAG_ 90 0 26840 953 proteína hipotética CAETHG_24 CLJU_c0423 CLRAG_ 91 0 26830 954 Proteína não caracterizada, contém um CAETHG_24 CLJU_c0424 CLRAG_ domínio de condensação (alongamento) de 92 0 26790
NRPS 955 proteína hipotética CAETHG_25 CLJU_c0432 CLRAG_ 00 0 26730 956 Flipase putativa GtrA (translocase CAETHG_25 CLJU_c0446 CLRAG_ transmembranar de glicose ligada a 18 0 37820 bactoprenol) 957 Proteína de função desconhecida CAETHG_25 CLJU_c0450 CLRAG_ (DUF2837) 22 0 37860 958 Subunidade PIG-U de transamidase GPI CAETHG_25 CLJU_c0452 CLRAG_ 24 0 37880 959 Propeptídeo TGF-beta CAETHG_25 CLJU_c0453 CLRAG_ 25 0 37890 960 Proteína permease de sistema de transporte CAETHG_25 CLJU_c0457 CLRAG_ do tipo ABC-2 29 0 37930 961 Proteína de membrana não caracterizada CAETHG_25 CLJU_c0464 CLRAG_ 36 0 38000 962 Proteína de função desconhecida DUF116 CAETHG_25 CLJU_c0467 CLRAG_ 39 0 38050
63 / 294 963 proteína hipotética CAETHG_25 CLJU_c0470 CLRAG_ 42 0 38080 964 proteína hipotética CAETHG_25 CLJU_c0471 CLRAG_ 43 0 38090 965 proteína hipotética CAETHG_25 CLJU_c0472 CLRAG_ 44 0 38100 966 proteína hipotética CAETHG_25 CLJU_c0480 CLRAG_ 52 0 38180 967 proteína hipotética CAETHG_25 CLJU_c0481 CLRAG_ 53 0 38190 968 Repetição putativa da ligação da parede CAETHG_25 CLJU_c0483 CLRAG_ celular 2 55 0 38210 969 proteína SafA para montagem de CAETHG_25 CLJU_c0486 CLRAG_ revestimento de esporos/proteína não 63 0 38250 caracterizada, família YkwD 970 Proteína de membrana externa TolC CAETHG_25 CLJU_c0506 CLRAG_ 83 0 38450 971 Proteína de efluxo da membrana externa CAETHG_25 CLJU_c0507 CLRAG_ 84 0 38460 972 Proteína da família ResB CAETHG_25 CLJU_c0508 CLRAG_ 85 0 38470 973 proteína contendo repetição contendo WG CAETHG_25 CLJU_c0509 CLRAG_ 86 0 38480 974 Proteína contendo domínio SLAP CAETHG_25 CLJU_c0510 CLRAG_ 87 0 38490 975 proteína hipotética (DUF2140) CAETHG_25 CLJU_c0513 CLRAG_ 90 0 38520 976 Proteína de função desconhecida CAETHG_25 CLJU_c0517 CLRAG_ (DUF1659) 94 0 38560 977 Proteína de função desconhecida CAETHG_25 CLJU_c0518 CLRAG_ (DUF2922) 95 0 38570 978 Fator sigma específico da esporulação da CAETHG_25 CLJU_c0519 CLRAG_ RNA polimerase 96 0 38580 979 O-antígeno polimerase CAETHG_26 CLJU_c0544 CLRAG_ 26 0 38900 980 Acetiltransferase (superfamília de adesivos CAETHG_26 CLJU_c0545 CLRAG_ de isoleucina) 27 0 38910 981 asparagina sintase (hidrólise da glutamina) 6.3.5.4 CAETHG_26 CLJU_c0546 CLRAG_ 28 0 38920 982 Proteína de biossíntese de polissacarídeos CAETHG_26 CLJU_c0547 CLRAG_ em cápsulas 29 0 38930 983 proteína putativa da família transportadora CAETHG_26 CLJU_c0562 CLRAG_ C de Mg2+ (MgtC) 54 0 06840 984 proteína hipotética CAETHG_26 CLJU_c0567 CLRAG_ 59 0 06900 985 proteína hipotética CAETHG_26 CLJU_c0568 CLRAG_ 60 0 06910 986 proteína hipotética CAETHG_26 CLJU_c0569 CLRAG_ 61 0 06920 987 proteína contendo domínio tipo A do fator CAETHG_26 CLJU_c0570 CLRAG_ de von Willebrand 62 0 06930 988 Tipo tubulina CAETHG_26 CLJU_c0571 CLRAG_ 63 0 06940 989 proteína hipotética CAETHG_26 CLJU_c0572 CLRAG_ 64 0 06950 990 Proteína da família de canais de cloreto CAETHG_26 CLJU_c0573 CLRAG_ ativado por Ca 66 0 06960 991 proteína hipotética CAETHG_26 CLJU_c0574 CLRAG_ 67 0 06970
64 / 294 992 Proteína GTP1/OBG CAETHG_26 CLJU_c0578 CLRAG_ 73 0 07030 993 proteína hipotética CAETHG_26 CLJU_c0579 CLRAG_ 74 0 07040 994 proteína contendo domínio fita de zinco CAETHG_26 CLJU_c0580 CLRAG_ 75 0 07050 995 Proteína de função desconhecida CAETHG_26 CLJU_c0587 CLRAG_ (DUF1861) 82 0 07110 996 proteína da família tipo VanZ CAETHG_26 CLJU_c0593 CLRAG_ 90 0 07160 997 proteína hipotética CAETHG_26 CLJU_c0601 CLRAG_ 99 0 07240 998 bomba de efluxo MntP putativa de Mn2+ CAETHG_27 CLJU_c0606 CLRAG_ 05 0 07330 999 proteína hipotética CAETHG_27 CLJU_c0608 CLRAG_ 07 0 07350 1000 Proteína de membrana não caracterizada CAETHG_27 CLJU_c0612 CLRAG_ YkvA, família DUF1232 11 0 07400 1001 proteína hipotética CAETHG_27 CLJU_c0614 CLRAG_ 13 0 07420 1002 Família Peptidase S41 CAETHG_27 CLJU_c0646 CLRAG_ 42 0 30440 1003 proteína hipotética CAETHG_27 CLJU_c0672 CLRAG_ 63 0 18520 1004 proteína hipotética CAETHG_27 CLJU_c0675 CLRAG_ 66 0 18550 1005 proteína hipotética CAETHG_27 CLJU_c0680 CLRAG_ 71 0 18600 1006 Anidrase carbônica ou acetiltransferase, CAETHG_27 CLJU_c0685 CLRAG_ superfamília de adesivos de isoleucina 76 0 18690 1007 proteína hipotética CAETHG_27 CLJU_c0687 CLRAG_ 78 0 18710 1008 Peptidoglicano/LPS O-acetilase CAETHG_27 CLJU_c0691 CLRAG_ OafA/YrhL, contém os domínios 81 0 18750 aciltransferase e SGNH-hidrolase 1009 Proteína de membrana implicada na CAETHG_27 CLJU_c0693 CLRAG_ regulação da atividade de protease de 83 0 18770 membrana 1010 proteína hipotética CAETHG_27 CLJU_c0697 CLRAG_ 87 0 18810 1011 Proteína contendo domínio acetiltransferase CAETHG_28 CLJU_c0717 CLRAG_ (GNAT) 09 0 26670 1012 proteína de função desconhecida CAETHG_28 CLJU_c0719 CLRAG_ (DUF4321) 11 0 26650 1013 proteína ligada ao radical SAM CAETHG_28 CLJU_c0734 CLRAG_ 26 0 26500 1014 proteína hipotética CAETHG_28 CLJU_c0737 CLRAG_ 29 0 26470 1015 2-iminobutanoato/2-iminopropanoato CAETHG_28 CLJU_c0742 CLRAG_ desaminase 34 0 26420 1016 proteína redox putativa CAETHG_28 CLJU_c0761 CLRAG_ 54 0 25180 1017 Proteína contendo domínio C-terminal de CAETHG_28 CLJU_c0783 CLRAG_ proteína ribossômica L7/L12 76 0 25300 1018 proteína de função desconhecida DUF4412 CAETHG_28 CLJU_c0785 CLRAG_ 78 0 25330 1019 proteína hipotética CAETHG_28 CLJU_c0786 CLRAG_ 79 0 25340 1020 proteína de competência ComEC CAETHG_28 CLJU_c0788 CLRAG_ 81 0 25360
65 / 294 1021 proteína hipotética CAETHG_28 CLJU_c0793 CLRAG_ 86 0 25410 1022 rRNA 16S (uracil1498-N3)- CAETHG_28 CLJU_c0801 CLRAG_ metiltransferase 94 0 08350 1023 proteína hipotética CAETHG_28 CLJU_c0805 CLRAG_ 99 0 08310 1024 proteína de esporulação YqfC CAETHG_29 CLJU_c0806 CLRAG_ 00 0 08300 1025 fator de maturação provável do rRNA CAETHG_29 CLJU_c0808 CLRAG_ 03 0 08270 1026 proteína de função desconhecida CAETHG_29 CLJU_c0812 CLRAG_ (DUF4342) 07 0 08230 1027 proteína hipotética CAETHG_29 CLJU_c0819 CLRAG_ 14 0 18740 1028 Proteína contendo domínio PH CAETHG_29 CLJU_c0823 CLRAG_ 18 0 08160 1029 tRNA (adenina22-N1)-metiltransferase CAETHG_29 CLJU_c0824 CLRAG_ 19 0 08150 1030 proteína hipotética CAETHG_29 CLJU_c0826 CLRAG_ 21 0 08130 1031 proteína hipotética CAETHG_29 CLJU_c0828 CLRAG_ 23 0 08100 1032 proteína hipotética CAETHG_29 CLJU_c0847 CLRAG_ 40 0 07990 1033 proteína hipotética CAETHG_29 CLJU_c0862 CLRAG_ 56 0 07870 1034 proteína hipotética CAETHG_29 CLJU_c0864 CLRAG_ 58 0 07850 1035 Subunidade F da NADH-quinona CAETHG_29 CLJU_c0868 CLRAG_ oxidorredutase 62 0 07810 1036 proteína hipotética CAETHG_29 CLJU_c0876 CLRAG_ 70 0 07730 1037 proteína hipotética CAETHG_29 CLJU_c0882 CLRAG_ 77 0 07670 1038 proteína hipotética CAETHG_29 CLJU_c0887 CLRAG_ 82 0 07610 1039 Proteína contendo domínio semelhante a Ig CAETHG_29 CLJU_c0899 CLRAG_ 93 0 07520 1040 Proteína não caracterizada YpuA, família CAETHG_29 CLJU_c0901 CLRAG_ DUF1002 95 0 14010 1041 proteína hipotética CAETHG_29 CLJU_c0902 CLRAG_ 96 0 14000 1042 Proteína de função desconhecida CAETHG_30 CLJU_c0935 CLRAG_ (DUF1292) 30 0 13750 1043 proteína hipotética CAETHG_30 CLJU_c0938 CLRAG_ 33 0 13720 1044 Proteína FlgN CAETHG_30 CLJU_c0950 CLRAG_ 45 0 13600 1045 fator de montagem flagelar FliW CAETHG_30 CLJU_c0953 CLRAG_ 48 0 13570 1046 proteína hipotética CAETHG_30 CLJU_c0956 CLRAG_ 51 0 13550 1047 proteína hipotética CAETHG_30 CLJU_c0962 CLRAG_ 57 0 13520 1048 Elemento C-terminal IS66 CAETHG_30 CLJU_c0976 CLRAG_ 69 0, 16790 CLJU_c0538 0
66 / 294 1049 proteína hipotética CAETHG_30 CLJU_c0984 CLRAG_ 77 0, 16740 CLJU_c0540 0 1050 proteína hipotética CAETHG_30 CLJU_c1004 CLRAG_ 95 0 13320 1051 Domínio bacteriano tipo Ig CAETHG_30 CLJU_c1008 CLRAG_ 98 0 13290 1052 Proteína de membrana não caracterizada, CAETHG_31 CLJU_c1010 CLRAG_ família DUF441 00 0 13270 1053 Proteína de função desconhecida CAETHG_31 CLJU_c1011 CLRAG_ (DUF3867) 01 0 13260 1054 proteína não caracterizada por fago CAETHG_31 CLJU_c1012 CLRAG_ TIGR01671 02 0 13250 1055 proteína hipotética CAETHG_31 CLJU_c1013 CLRAG_ 03 0 13240 1056 proteína hipotética CAETHG_31 CLJU_c1017 CLRAG_ 07 0 13200 1057 proteína hipotética CAETHG_31 CLJU_c1042 CLRAG_ 32 0 12950 1058 proteína hipotética CAETHG_31 CLJU_c1043 CLRAG_ 33 0 12940 1059 proteína hipotética CAETHG_31 CLJU_c1046 CLRAG_ 36 0 12910 1060 proteína hipotética CAETHG_31 CLJU_c1049 CLRAG_ 39 0 12880 1061 Proteína MraZ CAETHG_31 CLJU_c1053 CLRAG_ 43 0 12810 1062 proteína de divisão celular FtsL CAETHG_31 CLJU_c1055 CLRAG_ 45 0 12790 1063 proteína hipotética CAETHG_31 CLJU_c1065 CLRAG_ 55 0 12690 1064 inibidor de divisão celular SepF CAETHG_31 CLJU_c1066 CLRAG_ 56 0 12680 1065 Proteína da família YggT CAETHG_31 CLJU_c1067 CLRAG_ 57 0 12670 1066 proteína hipotética CAETHG_31 CLJU_c1077 CLRAG_ 67 0 12570 1067 Proteína-S-isoprenilcisteína O- CAETHG_31 CLJU_c1082 CLRAG_ metiltransferase Ste14 71 0 22440 1068 peptídeo autoindutor de lactona cíclico CAETHG_31 CLJU_c2850 CLRAG_ 76 0, 03770 CLJU_c2557 0 1069 proteína hipotética CAETHG_31 CLJU_c1088 CLRAG_ 78 0 02280 1070 proteína de montagem de pilus tipo IV PilA CAETHG_31 CLJU_c1092 CLRAG_ 81 0 12540 1071 proteína contendo domínio de CAETHG_31 CLJU_c1093 CLRAG_ clivagem/metilação do terminal N do tipo 82 0 12530 prepilina 1072 proteína contendo domínio de CAETHG_31 CLJU_c1095 CLRAG_ clivagem/metilação do terminal N do tipo 84 0 12510 prepilina 1073 proteína hipotética CAETHG_31 CLJU_c1096 CLRAG_ 85 0 12500 1074 proteína hipotética CAETHG_31 CLJU_c1097 CLRAG_ 86 0 12490 1075 proteína hipotética CAETHG_31 CLJU_c1098 CLRAG_ 87 0 12480
67 / 294 1076 proteína hipotética CAETHG_31 CLJU_c1099 CLRAG_ 88 0 12470 1077 proteína hipotética CAETHG_31 CLJU_c1102 CLRAG_ 91 0 12440 1078 proteína hipotética CAETHG_32 CLJU_c1123 CLRAG_ 13 0 12230 1079 proteína de esporulação YtfJ CAETHG_32 CLJU_c1131 CLRAG_ 22 0 12140 1080 Proteína de função desconhecida CAETHG_32 CLJU_c1132 CLRAG_ (DUF2953) 23 0 12130 1081 proteína hipotética CAETHG_32 CLJU_c1134 CLRAG_ 25 0 12110 1082 proteína hipotética CAETHG_32 CLJU_c1143 CLRAG_ 34 0 12020 1083 proteína de função desconhecida CAETHG_32 CLJU_c1144 CLRAG_ (DUF4397) 35 0 12010 1084 Domínio de função desconhecida CAETHG_32 CLJU_c1145 CLRAG_ (DUF4883) 36 0 12000 1085 Regulador transcricional de ligação ao CAETHG_32 CLJU_c1147 CLRAG_1 DNA, família FrmR 38 0 1980 1086 Proteína de membrana não caracterizada CAETHG_32 CLJU_c1148 CLRAG_1 YjjB, família DUF3815 39 0 1970 1087 Proteína de membrana não caracterizada CAETHG_32 CLJU_c1149 CLRAG_1 YjjP, família DUF1212 40 0 1960 1088 proteína hipotética CAETHG_32 CLJU_c1153 CLRAG_1 44 0 1920 1089 Proteína da superfamília PAP2 CAETHG_32 CLJU_c1176 CLRAG_1 67 0 1780 1090 proteína hipotética CAETHG_32 CLJU_c1179 CLRAG_1 70 0 1750 1091 proteína contendo domínio tipo flavina CAETHG_32 CLJU_c1182 CLRAG_1 redutase 73 0 1720 1092 Proteína não caracterizada YrrD, contém CAETHG_32 CLJU_c1213 CLRAG_1 domínio barril da PRC 95 0 1670 1093 Proteína não caracterizada, família CAETHG_32 CLJU_c1216 CLRAG_1 UPF0297 98 0 1640 1094 Proteína de função desconhecida CAETHG_33 CLJU_c1218 CLRAG_1 (DUF1292) 00 0 1620 1095 Regulador de destino celular YlbF, família CAETHG_33 CLJU_c1221 CLRAG_1 YheA/YmcA/DUF963 (controla 03 0 1590 esporulação, competência, desenvolvimento de biofilme) 1096 proteína hipotética conservada CAETHG_33 CLJU_c1236 CLRAG_1 18 0 1440 1097 proteína hipotética CAETHG_33 CLJU_c1244 CLRAG_1 26 0 1360 1098 enzima SAM radical putativa, família CAETHG_33 CLJU_c1246 CLRAG_1 TIGR03279 28 0 1340 1099 Proteína da família TIGR00255 CAETHG_33 CLJU_c1250 CLRAG_1 32 0 1300 1100 proteína hipotética CAETHG_33 CLJU_c1251 CLRAG_1 33 0 1290 1101 rRNA 16S (guanina966-N2)- CAETHG_33 CLJU_c1271 CLRAG_1 metiltransferase 52 0 1100 1102 proteína hipotética CAETHG_33 CLJU_c1273 CLRAG_1 54 0 1080 1103 Nucleotidiltransferase prevista CAETHG_33 CLJU_c1275 CLRAG_1 57 0 1050 1104 proteína não caracterizada CAETHG_33 CLJU_c1279 CLRAG_1 60 0 1020
68 / 294 1105 Histona acetiltransferase, componente do CAETHG_33 CLJU_c1284 CLRAG_ complexo alongador RNA polimerase 65 0 10970 1106 proteína hipotética CAETHG_33 CLJU_c1287 CLRAG_ 69 0 10930 1107 proteína hipotética CAETHG_33 CLJU_c1290 CLRAG_ 72 0 10900 1108 endonuclease putativa CAETHG_33 CLJU_c1297 CLRAG_ 79 0 10830 1109 fator de maturação do ribossomo RimP CAETHG_33 CLJU_c1311 CLRAG_ 94 0 10680 1110 proteína hipotética CAETHG_33 CLJU_c1313 CLRAG_ 96 0 10660 1111 proteína de esporulação, família CAETHG_34 CLJU_c1323 CLRAG_ YlmC/YmxH 06 0 10560 1112 ribonucrease Y CAETHG_34 CLJU_c1329 CLRAG_ 12 0 10500 1113 Proteína da família transportadora tipo CAETHG_34 CLJU_c1333 CLRAG_ EamA 16 0 10460 1114 proteína hipotética CAETHG_34 CLJU_c1336 CLRAG_ 19 0 10430 1115 proteína hipotética CAETHG_34 CLJU_c1338 CLRAG_ 22 0 10410 1116 Regulador transcricional da família BlaI, CAETHG_34 CLJU_c1355 CLRAG_ repressor da penicilinase 31 0, 10320 CLJU_c1347 0 1117 proteína de função desconhecida CAETHG_34 CLJU_c1358 CLRAG_ (DUF4179) 41 0 10280 1118 proteína hipotética CAETHG_34 CLJU_c1365 CLRAG_ 47 0 10220 1119 proteína não caracterizada, família CAETHG_34 CLJU_c1366 CLRAG_ PH0010/proteína A do sistema 48 0 10210 AmmeMemoRadiSam/proteína B do sistema AmmeMemoRadiSam 1120 Proteína de transporte de aminoácidos de CAETHG_34 CLJU_c1370 CLRAG_ cadeia ramificada 52 0 10170 1121 Fenilpiruvato tautomerase PptA, família de CAETHG_34 CLJU_c1373 CLRAG_ 4-oxalocrotonato tautomerase 55 0 10120 1122 Permease PerM prevista regulada por PurR CAETHG_34 CLJU_c1375 CLRAG_ 57 0 10100 1123 proteína hipotética CAETHG_34 CLJU_c1384 CLRAG_ 67 0 10000 1124 Proteína não caracterizada, família CAETHG_34 CLJU_c1385 CLRAG_ piridoxamina 5'-fosfato oxidase (tipo 68 0 09990 PNPOx) 1125 proteína hipotética CAETHG_34 CLJU_c1393 CLRAG_ 75, 0, 09230 CAETHG_34 CLJU_c1392 76 0 1126 proteína D de síntese de coenzima PQQ CAETHG_34 CLJU_c1395 CLRAG_ (PqqD) 78 0 09260 1127 Ligação ao DNA de hélice-volta-hélice CAETHG_34 CLJU_c1399 CLRAG_ alada 82 0 09320 1128 Proteína de função desconhecida CAETHG_34 CLJU_c1401 CLRAG_ (DUF3793) 85 0 09340 1129 Proteína do domínio de cupina CAETHG_35 CLJU_c1420 CLRAG_ 02 0 09530 1130 proteína hipotética CAETHG_35 CLJU_c3497 CLRAG_ 48 0 16880
69 / 294 1131 L-cisteína dessulfidase CAETHG_35 CLJU_c1464 CLRAG_ 63 0 09920 1132 proteína contendo domínio de diguanilato CAETHG_35 CLJU_c1465 CLRAG_ ciclase (GGDEF) 64 0 20550 1133 proteína contendo domínio de diguanilato CAETHG_35 CLJU_c1480 CLRAG_ ciclase (GGDEF) 80 0 20310 1134 proteína contendo domínio conservado CAETHG_35 CLJU_c1485 CLRAG_ 91 0 20270 1135 proteína contendo domínio conservado CAETHG_35 CLJU_c1486 CLRAG_ 92 0 20260 1136 Proteína de membrana não caracterizada CAETHG_35 CLJU_c1487 CLRAG_ YczE 93 0 20250 1137 proteína hipotética CAETHG_36 CLJU_c1510 CLRAG_ 12 0 24270 1138 proteína hipotética CAETHG_36 CLJU_c1511 CLRAG_ 13 0 24230 1139 Enzima de restrição B específica de 5- CAETHG_36 CLJU_c1515 CLRAG_ metilcitosina 17 0 24200 1140 proteína hipotética CAETHG_36 CLJU_c1519 CLRAG_ 21 0 24160 1141 proteína hipotética CAETHG_36 CLJU_c1520 CLRAG_ 22 0 24150 1142 Proteína permease de sistema de transporte CAETHG_36 CLJU_c1538 CLRAG_ do tipo ABC-2 40 0 24080 1143 Proteína permease de sistema de transporte CAETHG_36 CLJU_c1540 CLRAG_ do tipo ABC-2 41 0 24070 1144 Proteína de secreção da família HlyD CAETHG_36 CLJU_c1541 CLRAG_ 42 0 24060 1145 proteína hipotética CAETHG_36 CLJU_c1543 CLRAG_ 44 0 24040 1146 Proteína contendo repetição de CAETHG_36 CLJU_c1562 CLRAG_ pentapeptídeo 57 0 32630 1147 proteína redox provável da família CAETHG_36 CLJU_c1563 CLRAG_ C_GCAxxG_C_C 62 0 32680 1148 Proteína de resistência a antibióticos CAETHG_36 CLJU_c1568 CLRAG_ glicopeptídeos 75 0 32830 1149 proteína de função desconhecida CAETHG_36 CLJU_c1571 CLRAG_ (DUF4367) 79 0 32870 1150 O-metiltransferase CAETHG_36 CLJU_c1575 CLRAG_ 83 0 32910 1151 proteína de esporulação putativa YtaF CAETHG_36 CLJU_c1594 CLRAG_ 94 0 32970 1152 proteína conservada putativa UCP010219 CAETHG_37 CLJU_c1606 CLRAG_ 00 0 33030 1153 proteína de função desconhecida CAETHG_37 CLJU_c1638 CLRAG_ (DUF4363) 32 0 33180 1154 Proteína de membrana não caracterizada CAETHG_37 CLJU_c1639 CLRAG_ YcaP, família DUF421 33 0 33190 1155 proteína de função desconhecida CAETHG_37 CLJU_c1640 CLRAG_ (DUF3870) 34 0 33200 1156 proteína hipotética CAETHG_38 CLJU_c1706 CLRAG_ 18 0 33930 1157 Proteína da família Peptidase A4 CAETHG_38 CLJU_c1708 CLRAG_ 20 0 33950 1158 proteína hipotética CAETHG_38 CLJU_c1709 CLRAG_ 21 0 33960 1159 proteína hipotética CAETHG_38 CLJU_c1724 CLRAG_ 36, 0, 34210 CAETHG_38 CLJU_c1723 37 0
70 / 294 1160 Regulador transcricional de ligação ao CAETHG_38 CLJU_c1726 CLRAG_ DNA, família MerR 39 0 34230 1161 proteína de função desconhecida CAETHG_38 CLJU_c1730 CLRAG_ (DUF4342) 43 0 29280 1162 23S rRNA (pseudouridina1915-N3)- CAETHG_38 CLJU_c1740 CLRAG_ metiltransferase 53 0 01290 1163 proteína hipotética CAETHG_38 CLJU_c1745 CLRAG_ 58 0 01260 1164 proteína hipotética CAETHG_38 CLJU_c1761 CLRAG_ 69 0 01130 1165 Proteína de função desconhecida CAETHG_38 CLJU_c1765 CLRAG_ (DUF3795) 73 0 01090 1166 sistema de dois componentes, regulador de CAETHG_38 CLJU_c1773 CLRAG_ resposta YcbB 81 0 00990 1167 proteína hipotética CAETHG_38 CLJU_c1775 CLRAG_ 83 0 00970 1168 proteína hipotética CAETHG_38 CLJU_c1779 CLRAG_ 87 0 00920 1169 proteína hipotética CAETHG_38 CLJU_c1780 CLRAG_ 88 0 00910 1170 Família Peptidase M28 CAETHG_38 CLJU_c1783 CLRAG_ 91 0 00880 1171 Proteína quimiotaxia CheY ou um domínio CAETHG_38 CLJU_c1786 CLRAG_ REC (receptor) tipo CheY 94 0 00800 1172 3-metiladenina DNA glicosilase AlkD CAETHG_38 CLJU_c1788 CLRAG_ 96 0 00780 1173 Proteína de membrana contendo o domínio CAETHG_38 CLJU_c1789 CLRAG_ EamA RarD 97 0 00760 1174 fator acessório da xantina desidrogenase CAETHG_39 CLJU_c1794 CLRAG_ 03 0 00690 1175 proteína contendo domínio de diguanilato CAETHG_39 CLJU_c1796 CLRAG_ ciclase (GGDEF) 05 0 00670 1176 Proteína conservada não caracterizada YraI CAETHG_39 CLJU_c1802 CLRAG_ 11 0 00620 1177 Proteína contendo domínio Yip1 CAETHG_39 CLJU_c1807 CLRAG_ 16 0 00580 1178 Família SatD (SatD) CAETHG_39 CLJU_c1818 CLRAG_ 26 0 00500 1179 Família SatD (SatD) CAETHG_39 CLJU_c1819 CLRAG_ 27 0 00490 1180 Proteína de função desconhecida CAETHG_39 CLJU_c1820 CLRAG_ (DUF3307) 28 0 00480 1181 Proteína da família transportadora tipo CAETHG_39 CLJU_c1821 CLRAG_ EamA 29 0 00470 1182 proteína hipotética CAETHG_39 CLJU_c1822 CLRAG_ 30 0 00390 1183 Proteína de membrana não caracterizada CAETHG_39 CLJU_c1823 CLRAG_ 31 0 00380 1184 proteína hipotética CAETHG_39 CLJU_c1839 CLRAG_ 46 0 00290 1185 proteína hipotética CAETHG_39 CLJU_c1840 CLRAG_ 47 0 00280 1186 proteína hipotética CAETHG_39 CLJU_c1841 CLRAG_ 48 0 00270 1187 proteína hipotética CAETHG_39 CLJU_c1843 CLRAG_ 50 0 00250 1188 proteína hipotética CAETHG_39 CLJU_c1848 CLRAG_ 55 0 00200 1189 Proteína de divisão A inibida pela glicose CAETHG_39 CLJU_c1851 CLRAG_ 58 0 00130
71 / 294 1190 proteína de função desconhecida CAETHG_39 CLJU_c1863 CLRAG_ (DUF2935) 71 0 00020 1191 proteína hipotética 2.7.4.12, CAETHG_39 CLJU_c1864 CLRAG_
2.7.4.9 72 0 00010 1192 proteína hipotética CAETHG_39 CLJU_c3496 CLRAG_ 75 0 26220 1193 proteína hipotética CAETHG_39 CLJU_c1868 CLRAG_ 82 0 16680 1194 proteína hipotética CAETHG_39 CLJU_c1869 CLRAG_ 83 0 16670 1195 proteína hipotética CAETHG_39 CLJU_c1870 CLRAG_ 84 0 16650 1196 proteína de função desconhecida CAETHG_39 CLJU_c1873 CLRAG_ (DUF4397) 92 0 16560 1197 proteína hipotética CAETHG_40 CLJU_c1883 CLRAG_ 06 0 16420 1198 Proteína YitT ancorada na membrana não CAETHG_40 CLJU_c1915 CLRAG_ caracterizada, contém os domínios DUF161 49 0 39900 e DUF2179 1199 proteína hipotética CAETHG_40 CLJU_c1917 CLRAG_ 51 0 39880 1200 proteína hipotética CAETHG_40 CLJU_c1918 CLRAG_ 53 0 39870 1201 Proteína da imunidade 22 CAETHG_40 CLJU_c1924 CLRAG_ 59 0 39830 1202 hipoxantina fosforibosiltransferase 2.4.2.22, CAETHG_12 CLJU_c3392 CLRAG_
2.4.2.7, 90 0 14070
2.4.2.8 1203 hipoxantina fosforibosiltransferase 2.4.2.22, CAETHG_19 CLJU_c4154 CLRAG_
2.4.2.7, 88 0 04670
2.4.2.8 1204 ciclase CAETHG_32 CLJU_c1173 CLRAG_1 64 0 1810 1205 glutamina amidotransferase CAETHG_32 CLJU_c1170 CLRAG_1 61 0 1840 1206 imidazolglicerol-fosfato desidratase 4.2.1.19 CAETHG_32 CLJU_c1169 CLRAG_1 60 0 1850 1207 imidazolonapropionase 3.5.2.7 CAETHG_02 CLJU_c2147 CLRAG_ 33 0 31030 1208 indol-3-glicerol fosfato sintase 4.1.1.48 CAETHG_37 CLJU_c1610 CLRAG_ 04 0 33070 1209 IMP desidrogenase 1.1.1.205 CAETHG_15 CLJU_c3718 CLRAG_ 71 0 36620 1210 repressor dependente de ferro (metal), CAETHG_13 CLJU_c3435 CLRAG_ família DtxR 35 0 17700 1211 maturação GTPase do agrupamento H da CAETHG_20 CLJU_c4238 CLRAG_ [FeFe] hidrogenase HydF 63 0 05500 1212 epoxiqueuosina redutase CAETHG_17 CLJU_c3929 CLRAG_ 74 0 21500 1213 beta-aspartil-dipeptidase (tipo metalo) 3.4.11.1, CAETHG_07 CLJU_c2667 CLRAG_
3.4.11.2, 48 0 08540
3.4.13.3,
3.4.11.23 1214 Isoleucil-tRNA sintetase CAETHG_22 CLJU_c0189 CLRAG_ 92 0 27490 1215 cetopantoato redutase 1.1.1.169 CAETHG_01 CLJU_c0872 CLRAG_ 18, 0, 25930 CAETHG_29 CLJU_c2036 66 0
72 / 294 1216 2-desidropantoato 2-redutase CAETHG_38 CLJU_c1769 CLRAG_ 77 0 01040 1217 Isomerase de L-arabinose 5.3.1.4 CAETHG_22 CLJU_c0120 CLRAG_ 28 0 30220 1218 L-aspartato oxidase CAETHG_05 CLJU_c2442 CLRAG_ 02 0 25150 1219 L-ribulose 5-fosfato 4-epimerase CAETHG_22 CLJU_c0121 CLRAG_ 29 0 30210 1220 L-serina desidratase 4.3.1.17, CAETHG_12 CLJU_c3325 CLRAG_
4.3.1.15, 24 0 15010
4.3.1.19,
4.2.1.13 1221 L-serina desidratase 4.3.1.17, CAETHG_12 CLJU_c3326 CLRAG_
4.3.1.15, 25 0 15000
4.3.1.19,
4.2.1.13 1222 L-seril-tRNA (Sec) selênio transferase CAETHG_28 CLJU_c0747 CLRAG_ 39 0, 32220 CLJU_c2771 0 1223 L-treonina aldolase 4.1.2.5 CAETHG_06 CLJU_c2617 CLRAG_ 86 0 04250 1224 treonina-fosfato descarboxilase 4.1.1.81 CAETHG_11 CLJU_c3200 CLRAG_ 28 0 02630 1225 Proteína LemA CAETHG_00 CLJU_c1989 CLRAG_ 69 0 39190 1226 leucil-tRNA sintetase CAETHG_23 CLJU_c0275 CLRAG_ 77 0 28350 1227 repressor LexA CAETHG_01 CLJU_c2103 CLRAG_ 88 0 18990 1228 Desidrogenase prevista 1.1.1.18 CAETHG_13 CLJU_c3409 CLRAG_ 07 0 14240 1229 sintetase do ácido lipoico CAETHG_12 CLJU_c3321 CLRAG_ 20 0 15050 1230 Apoenzima LL-diaminopimelato 2.6.1.83 CAETHG_35 CLJU_c1428 CLRAG_ aminotransferase 10 0 09600 1231 proteína ribossômica de subunidade grande CAETHG_19 CLJU_c4114 CLRAG_ L10 57 0 23330 1232 Proteína ribossômica L11P da LSU CAETHG_19 CLJU_c4116 CLRAG_ 59 0 23350 1233 Proteína ribossômica L13P da LSU CAETHG_19 CLJU_c4071 CLRAG_ 14 0 22900 1234 Proteína ribossômica L14P da LSU CAETHG_19 CLJU_c4094 CLRAG_ 37 0 23130 1235 Proteína ribossômica L15P da LSU CAETHG_19 CLJU_c4085 CLRAG_ 28 0 23040 1236 Proteína ribossômica L16P da LSU CAETHG_19 CLJU_c4097 CLRAG_ 40 0 23160 1237 Proteína ribossômica L17P da LSU CAETHG_19 CLJU_c4076 CLRAG_ 19 0 22950 1238 Proteína ribossômica L20P da LSU CAETHG_13 CLJU_c3444 CLRAG_ 44 0 14520 1239 Proteína ribossômica L22P da LSU CAETHG_19 CLJU_c4099 CLRAG_ 42 0 23180 1240 Proteína ribossômica L24P da LSU CAETHG_19 CLJU_c4093 CLRAG_ 36 0 23120 1241 Proteína ribossômica L27P da LSU CAETHG_28 CLJU_c0738 CLRAG_ 30 0 26460 1242 proteína ribossômica L28 da subunidade CAETHG_33 CLJU_c1267 CLRAG_1 grande 48 0 1140
73 / 294 1243 Proteína ribossômica L29P da LSU CAETHG_19 CLJU_c4096 CLRAG_ 39 0 23150 1244 proteína ribossômica L30 da subunidade CAETHG_19 CLJU_c4086 CLRAG_ grande 29 0 23050 1245 Proteína ribossômica L32P da LSU CAETHG_33 CLJU_c1280 CLRAG_1 61 0 1010 1246 proteína ribossômica L33 da subunidade CAETHG_19 CLJU_c4119 CLRAG_ grande 62 0 23380 1247 proteína ribossômica L34 da subunidade CAETHG_21 CLJU_c4297 CLRAG_ grande 23 0 25780 1248 Proteína ribossômica L36P da LSU CAETHG_19 CLJU_c4081 CLRAG_ 24 0 23000 1249 proteína ribossômica L4 da subunidade CAETHG_19 CLJU_c4103 CLRAG_ grande 46 0 23220 1250 proteína ribossômica L9 da subunidade CAETHG_20 CLJU_c4273 CLRAG_ grande 98 0 25540 1251 lisina: simporte de prótons, família AAT CAETHG_02 CLJU_c2436 CLRAG_ 71, 0, 31350 CAETHG_04 CLJU_c2181 96 0 1252 Regulador transcricional de ligação ao CAETHG_38 CLJU_c1770 CLRAG_ DNA, família LysR 78 0 01030 1253 lisil-tRNA sintetase, classe II CAETHG_19 CLJU_c4148 CLRAG_ 82 0 04610 1254 Fosfato permease de açúcar CAETHG_35 CLJU_c1482 CLRAG_ 82 0 20290 1255 Malato/lactato/ureidoglicolato 1.1.1.37 CAETHG_26 CLJU_c0592 CLRAG_ desidrogenase, família LDH2 89 0 07150 1256 [acil-carreador-proteína] S- CAETHG_20 CLJU_c4217 CLRAG_ maloniltransferase 48 0 05280 1257 Catalase contendo Mn CAETHG_39 CLJU_c1862 CLRAG_ 70 0 00030 1258 pirofosfatase inorgânica dependente de 3.6.1.1 CAETHG_31 CLJU_c1047 CLRAG_ manganês 37 0 12900 1259 manose-1-fosfato guanililtransferase 2.7.7.22 CAETHG_22 CLJU_c0193 CLRAG_ 96 0 27530 1260 manose-6-fosfato isomerase, tipo 1 5.3.1.8 CAETHG_17 CLJU_c3945 CLRAG_ 90 0 21660 1261 Regulador transcricional de ligação ao CAETHG_06 CLJU_c2622 CLRAG_ DNA, família MerR 98 0 04300 1262 Proteína contendo domínio HDIG CAETHG_10 CLJU_c3006 CLRAG_ 05 0 15690 1263 metilenotetra-hidrofolato desidrogenase 1.5.1.5 CAETHG_16 CLJU_c3763 CLRAG_ (NADP+)/meteniltetra-hidrofolato ciclo- 16 0 37040 hidrolase 1264 metionina adenosiltransferase 2.5.1.6 CAETHG_04 CLJU_c2355 CLRAG_ 19, 0, 28180 CAETHG_23 CLJU_c0258 58 0 1265 metionil aminopeptidase 3.4.11.1, CAETHG_14 CLJU_c3578 CLRAG_
3.4.11.2, 86 0 06310
3.4.13.3,
3.4.11.23 1266 5-metiltetra-hidrofolato--homocisteína 2.1.1.13, CAETHG_27 CLJU_c0665 CLRAG_ metiltransferase 2.1.1.14 55 0 18450 1267 5-metiltetra-hidrofolato--homocisteína CAETHG_28 CLJU_c0755 CLRAG_ metiltransferase 43, 0, 34280 CAETHG_28 CLJU_c0750 48 0
74 / 294 1268 metionil-tRNA formiltransferase CAETHG_33 CLJU_c1257 CLRAG_1 39 0 1230 1269 metionil-tRNA sintetase CAETHG_22 CLJU_c0173 CLRAG_ 75 0 27330 1270 transdutor sensorial de quimiotaxia que CAETHG_03 CLJU_c2210 CLRAG_ aceita metila 08 0 31620 1271 transdutor sensorial de quimiotaxia que CAETHG_00 CLJU_c1997 CLRAG_ aceita metila com sensor de cache 77 0 39070 1272 transdutor sensorial de quimiotaxia que CAETHG_02 CLJU_c2143 CLRAG_ aceita metila com sensor de cache 29 0 30990 1273 transdutor sensorial de quimiotaxia que CAETHG_03 CLJU_c2288 CLRAG_ aceita metila com sensor de cache 50 0 01910 1274 transdutor sensorial de quimiotaxia que CAETHG_05 CLJU_c2477 CLRAG_ aceita metila com sensor de cache 42, 0, 18050 CAETHG_10 CLJU_c3043 48 0 1275 transdutor sensorial de quimiotaxia que CAETHG_24 CLJU_c0287 CLRAG_ aceita metila com sensor de cache 02 0 28470 1276 transdutor sensorial de quimiotaxia que CAETHG_29 CLJU_c0903 CLRAG_ aceita metila com sensor de cache 97 0 13990 1277 transdutor sensorial de quimiotaxia que CAETHG_31 CLJU_c1016 CLRAG_ aceita metila com sensor de cache 06 0 13210 1278 transdutor sensorial de quimiotaxia que CAETHG_34 CLJU_c1346 CLRAG_ aceita metila com sensor de cache 30 0 10330 1279 transdutor sensorial de quimiotaxia que CAETHG_34 CLJU_c1376 CLRAG_ aceita metila com sensor de cache 59 0 10080 1280 transdutor sensorial de quimiotaxia que CAETHG_34 CLJU_c1383 CLRAG_ aceita metila com sensor de cache 66 0 10010 1281 transdutor sensorial de quimiotaxia que CAETHG_40 CLJU_c1888 CLRAG_ aceita metila com sensor de cache 20 0 40120 1282 metilaspartato amônia-liase CAETHG_19 CLJU_c4061 CLRAG_ 04 0 22800 1283 S-metiltransferase de DNA-[proteína]- CAETHG_38 CLJU_c1787 CLRAG_ cisteína metilada 95 0 00790 1284 5,10-metilenotetra-hidrofolato redutase 1.5.1.20 CAETHG_16 CLJU_c3761 CLRAG_ 14 0 37020 1285 metilglioxal sintase CAETHG_28 CLJU_c0730 CLRAG_ 22 0 26540 1286 metiltetra-hidrofolato--proteína corrinoide CAETHG_16 CLJU_c3756 CLRAG_ de ferro-enxofre Co-metiltransferase 09 0 36970 1287 adenosil-homocisteína nucleosidase 3.2.2.16, CAETHG_31 CLJU_c1070 CLRAG_
3.2.2.9 60 0 12640 1288 Proteína contendo domínio de CAETHG_16 CLJU_c3805 CLRAG_ metiltransferase 33 0 37420 1289 precursor da subunidade proteica NifF de CAETHG_25 CLJU_c0493 CLRAG_ Mo-nitrogenase MoFe 70 0 38320 1290 proteína de cadeia beta de molibdênio-ferro CAETHG_25 CLJU_c0494 CLRAG_ nitrogenase 71 0 38330 1291 Proteína modular NifU para armação de CAETHG_32 CLJU_c1212 CLRAG_1 agrupamento FeS 94 0 1680 1292 proteína A de biossíntese de dinucleotídeo CAETHG_02 CLJU_c2141 CLRAG_ molibdopterina-guanina 27 0 30970 1293 molibdopterina adenililtransferase CAETHG_05 CLJU_c2506 CLRAG_ 74 0 17720 1294 proteína B de biossíntese de dinucleotídeo 1.1.99.33 CAETHG_27 CLJU_c0701 CLRAG_ molibdopterina-guanina 92 0 18860 1295 molibdopterina molibdotransferase 1.1.99.33 CAETHG_27 CLJU_c0700 CLRAG_ 91 0 18850 1296 proteína de ligação ao ATP transportadora CAETHG_13 CLJU_c3486 CLRAG_ de ABC monossacarídico, família CUT2 84 0 26100
75 / 294 1297 proteína de ligação ao ATP de sistema de CAETHG_22 CLJU_c0127 CLRAG_ transporte de ribose 36 0 30150 1298 proteína de membrana do transportador de CAETHG_13 CLJU_c3484 CLRAG_ ABC monossacarídico, família CUT2 82 0 26080 1299 proteína permease de sistema simples de CAETHG_13 CLJU_c3485 CLRAG_ transporte de açúcar 83 0 26090 1300 proteína de ligação ao substrato CAETHG_13 CLJU_c3487 CLRAG_ transportador ABC de monossacarídeo, 85 0 26110 família CUT2 1301 endonuclease específica de dsDNA/ATPase CAETHG_36 CLJU_c1505 CLRAG_ MutS2 07 0 24320 1302 N-acetil-gama-glutamil-fosfato redutase 1.2.1.38 CAETHG_02 CLJU_c2154 CLRAG_ 41 0 31100 1303 N-acetilglutamato quinase 2.7.2.8 CAETHG_02 CLJU_c2152 CLRAG_ 39 0 31080 1304 N-acetil-anidrromuramil-L-alanina amidase 3.5.1.28 CAETHG_16 CLJU_c3258 CLRAG_ AmpD 54 0 29450 1305 N-acetilmuramoil-L-alanina amidase 3.5.1.28 CAETHG_17 CLJU_c3920 CLRAG_ 65 0 21350 1306 N-acetilmuramoil-L-alanina amidase CAETHG_19 CLJU_c4069 CLRAG_ 12 0 22880 1307 N-acil-D-aminoácido desacilase CAETHG_04 CLJU_c2387 CLRAG_ 52 0 17300 1308 amido-hidrolase CAETHG_25 CLJU_c0442 CLRAG_ 11 0 37750 1309 Hidrolase de N-carbamoil-L-aminoácido 3.5.1.6 CAETHG_14 CLJU_c3591 CLRAG_ 98 0 06410 1310 N-formilglutamato amido-hidrolase CAETHG_05 CLJU_c2445 CLRAG_ 05 0 30120 1311 4-hidroxibutirato desidrogenase 1.1.1.1 CAETHG_17 CLJU_c3893 CLRAG_ 41 0 21110 1312 Desacetilase dependente de NAD CAETHG_22 CLJU_c0132 CLRAG_ 39 0 26980 1313 isocitrato desidrogenase (NAD+) 1.1.1.286, CAETHG_27 CLJU_c0663 CLRAG_
1.1.1.41 53 0 18430 1314 malato desidrogenase (descarboxilação de 1.1.1.37, CAETHG_17 CLJU_c3846 CLRAG_ oxaloacetato) 1.1.1.40, 02, 0, 26900
1.1.1.38, CAETHG_24 CLJU_c0416
4.1.1.3, 78 0
1.1.1.39 1315 Subunidade catalítica de hidrogenase CAETHG_35 CLJU_c1470 CLRAG_ apenas de ferro, dependente de NAD (P) 69 0 20490 1316 Subunidade E da NADH-quinona- CAETHG_35 CLJU_c1472 CLRAG_ oxidorredutase 71 0 20470 1317 Subunidade catalítica de nitrato redutase 1.7.7.2 CAETHG_04 CLJU_c2373 CLRAG_ dependente de NAD(P)H 37 0 17440 1318 Subunidade de nitrato redutase diaforase CAETHG_04 CLJU_c2371 CLRAG_ dependente de NAD(P)H 35 0 17460 1319 Subunidade de ferro-enxofre nitrato- CAETHG_04 CLJU_c2372 CLRAG_ redutase dependente de NAD(P)H 36 0 17450 1320 Subunidade E da NADH-quinona- 1.12.1.4, CAETHG_27 CLJU_c0703 CLRAG_ oxidorredutase 1.1.99.33 94 0 18880 1321 Subunidade F da NADH quinona 1.12.1.4, CAETHG_15 CLJU_c0704 CLRAG_ oxidorredutase 1.1.99.33 77, 0, 20480 CAETHG_35 CLJU_c1471 70, 0 CAETHG_27 95 1322 Proteína contendo domínio de di- 1.12.1.4, CAETHG_27 CLJU_c0705 CLRAG_ agrupamento 4Fe-4S 1.1.99.33 96 0 18900
76 / 294 1323 NAD+ difosfatase CAETHG_22 CLJU_c0091 CLRAG_ 05 0 19670 1324 glutamato desidrogenase (NADP+) CAETHG_23 CLJU_c0266 CLRAG_ 67 0 28260 1325 FMN redutase dependente de NADPH CAETHG_09 CLJU_c2975 CLRAG_ 74 0 35750 1326 cadeia pequena de glutamato sintase CAETHG_04 CLJU_c2419 CLRAG_ (NADPH/NADH) 77 0 24880 1327 subunidade catalítica de monóxido de CAETHG_16 CLJU_c3767 CLRAG_ carbono desidrogenase 21 0 37080 1328 nicotinamidase/pirazinamidase 3.5.1.19 CAETHG_03 CLJU_c2315 CLRAG_ 78 0 01660 1329 NAD+ quinase 2.7.1.23 CAETHG_32 CLJU_c1118 CLRAG_ 07 0 12280 1330 nicotinato fosforibosiltransferase 2.4.2.11 CAETHG_34 CLJU_c1343 CLRAG_ 27 0 10360 1331 nicotinato-nucleotídeo adenililtransferase 2.7.7.1, CAETHG_28 CLJU_c0740 CLRAG_
2.7.7.18 32 0 26440 1332 proteína de transporte de molibdênio CAETHG_16 CLJU_c3807 CLRAG_ 34 0 37440 1333 nicotinato-nucleotídeo pirofosforilase CAETHG_05 CLJU_c2441 CLRAG_ [carboxilação] 01 0 25140 1334 nicotinato-nucleotídeo-dimetilbenzimidazol 2.4.2.21 CAETHG_11 CLJU_c3194 CLRAG_ fosforibosiltransferase 22 0 02570 1335 família de proteínas reguladoras de CAETHG_20 CLJU_c0405 CLRAG_ nitrogênio P-II 91, 0, 05670 CAETHG_24 CLJU_c4265 68 0 1336 família de proteínas reguladoras de CAETHG_25 CLJU_c0491 CLRAG_ nitrogênio P-II 68 0 38300 1337 família de proteínas reguladoras de CAETHG_25 CLJU_c0492 CLRAG_ nitrogênio P-II 69 0 38310 1338 proteína NifN de molibdênio-ferro CAETHG_25 CLJU_c0496 CLRAG_ nitrogenase 73 0 38350 1339 proteína de ferro nitrogenase NifH 1.18.6.1 CAETHG_03 CLJU_c2305 CLRAG_ 68, 0, 01760 CAETHG_03 CLJU_c2312 75 0 1340 proteína de ferro nitrogenase NifH 1.18.6.1 CAETHG_04 CLJU_c2353 CLRAG_ 17, 0, 38290 CAETHG_25 CLJU_c0490 67 0 1341 proteína de síntese NifE de cofator de CAETHG_03 CLJU_c2311 CLRAG_ molibdênio nitrogenase 74 0 01700 1342 proteína de síntese NifE de cofator de CAETHG_25 CLJU_c0495 CLRAG_ molibdênio nitrogenase 72 0 38340 1343 Nitrorredutase CAETHG_09 CLJU_c2940 CLRAG_ 34 0 35400 1344 proteína de ligação ao ATP de sistema CAETHG_09 CLJU_c2999 CLRAG_ simples de transporte de açúcar 98 0 35990 1345 proteína de ligação ao ATP do transportador CAETHG_18 CLJU_c3962 CLRAG_ ABC do nucleosídeo 08 0 21810 1346 proteína permease de sistema simples de CAETHG_09 CLJU_c2997 CLRAG_ transporte de açúcar 96, 0, 35970 CAETHG_18 CLJU_c3960 06 0 1347 proteína permease de sistema simples de CAETHG_09 CLJU_c2998 CLRAG_ transporte de açúcar 97 0 35980 1348 proteína da membrana transportadora de CAETHG_18 CLJU_c3961 CLRAG_ nucleosídeo ABC 07 0 21800
77 / 294 1349 proteína básica de membrana A CAETHG_09 CLJU_c3000 CLRAG_ 99 0 36000 1350 proteína de ligação a nucleosídeo CAETHG_18 CLJU_c3963 CLRAG_ 09 0 21820 1351 Protease Lon dependente de ATP CAETHG_14 CLJU_c3562 CLRAG_ 70 0 06150 1352 nucleosídeo-trifosfatase CAETHG_38 CLJU_c1714 CLRAG_ 26 0 34000 1353 fator antiterminação NusA CAETHG_33 CLJU_c1312 CLRAG_ 95 0 10670 1354 Fator antiterminação NusB CAETHG_32 CLJU_c1112 CLRAG_ 01 0 12340 1355 O-acetil-homosserina sulfidrilase 2.5.1.48, CAETHG_27 CLJU_c0664 CLRAG_
2.5.1.-, 54 0 18440
4.2.99.8,
4.2.99.10,
2.5.1.49,
4.2.99.9 1356 N6-L-treonilcarbamoiladenina sintase CAETHG_15 CLJU_c3740 CLRAG_ 95 0 36840 1357 oligopeptidase F. Metalo peptidase. Família CAETHG_40 CLJU_c1905 CLRAG_ MEROPS M03B 39 0 39980 1358 transportador de oligopeptídeos putativo, CAETHG_34 CLJU_c1394 CLRAG_ família OPT 77 0 09250 1359 ornitina carbamoil-transferase 2.1.3.3 CAETHG_05 CLJU_c2523 CLRAG_ 91 0 03580 1360 orotato fosforibosiltransferase 2.4.2.10 CAETHG_14 CLJU_c3568 CLRAG_ 76 0 06210 1361 orotidina-5’-fosfato descarboxilase 4.1.1.23 CAETHG_14 CLJU_c3571 CLRAG_ 79 0 06240 1362 coproporfirinogênio-3 oxidase CAETHG_28 CLJU_c0795 CLRAG_ independente de oxigênio 88 0 25430 1363 tripeptídeo aminopeptidase CAETHG_00 CLJU_c1929 CLRAG_ 05, 0, 39770 CAETHG_00 CLJU_c1931 08 0 1364 fator 1 de liberação da cadeia peptídica CAETHG_23 CLJU_c0226 CLRAG_ 31 0 27860 1365 fator 3 de liberação da cadeia peptídica CAETHG_16 CLJU_c3828 CLRAG_ 85 0 20750 1366 peptídeo desformilase CAETHG_02 CLJU_c2196 CLRAG_ 93 0 31510 1367 peptídeo desformilase CAETHG_33 CLJU_c1364 CLRAG_1 38, 0, 1240 CAETHG_34 CLJU_c1256 46 0 1368 peptídeo desformilase CAETHG_38 CLJU_c1784 CLRAG_ 92 0 00870 1369 precursor da peptidoglicana transpeptidase, CAETHG_36 CLJU_c1573 CLRAG_ família ErfK-YbiS-YhnG 81 0 32890 1370 peptidil-prolil cis-trans isomerase B CAETHG_03 CLJU_c2289 CLRAG_ (ciclofilina B) 51 0 01900 1371 peptidil-tRNA hidrolase, família PTH1 CAETHG_20 CLJU_c4173 CLRAG_ 02 0 04860 1372 proteína da família da proteína A de choque CAETHG_22 CLJU_c0154 CLRAG_ fágico (PspA) 60 0 27200 1373 subunidade beta da fenilalanil-tRNA CAETHG_13 CLJU_c3441 CLRAG_ sintetase 41 0 14490 1374 fenilalanil-tRNA sintetase, subunidade alfa CAETHG_13 CLJU_c3442 CLRAG_ 42 0 14500
78 / 294 1375 proteína de ligação ao ATP transportadora de fosfato CAETHG_33 CLJU_c1242 CLRAG_1 ABC, família PhoT 24 0 1380 1376 proteína 1 da membrana transportadora de fosfato ABC, CAETHG_33 CLJU_c1240 CLRAG_1 família PhoT 22 0 1400 1377 proteína 2 da membrana transportadora de fosfato ABC, CAETHG_33 CLJU_c1241 CLRAG_1 família PhoT 23 0 1390 1378 Proteína de ligação ao substrato do transportador de CAETHG_33 CLJU_c1239 CLRAG_1 fosfato ABC, família PhoT 21 0 1410 1379 fosfato: acil-[proteína carreadora de acila] 2.3.1.15 CAETHG_33 CLJU_c1281 CLRAG_1 aciltransferase 62 0 1000 1380 fosfatidilserina descarboxilase 4.1.1.65 CAETHG_21 CLJU_c0071 CLRAG_ 88 0 19870 1381 CDP-diacilglicerol --- serina O- 2.7.8.8 CAETHG_24 CLJU_c0291 CLRAG_ fosfatidiltransferase 06 0 28510 1382 Fosfo-N-acetilmuramoil-pentapeptídeo- 2.7.8.13 CAETHG_31 CLJU_c1059 CLRAG_ transferase 49 0 12750 1383 fosfoenolpiruvato carboxiquinase (ATP) 4.1.1.49 CAETHG_27 CLJU_c0621 CLRAG_ 21 0 07490 1384 sistema fosfotransferase, enzima I, PtsI 2.7.1.69 CAETHG_18 CLJU_c4053 CLRAG_ 96 0 22720 1385 fosfoglucomutase 5.4.2.10, CAETHG_13 CLJU_c3421 CLRAG_
5.4.2.2 20 0 14360 1386 fosfoglucosamina mutase 5.4.2.10, CAETHG_18 CLJU_c4044 CLRAG_
5.4.2.2 87 0 22630 1387 D-3-fosfoglicerato desidrogenase 1.1.1.95 CAETHG_11 CLJU_c3278 CLRAG_ 76 0 15580 1388 fosfoglicerato quinase 2.7.2.3 CAETHG_17 CLJU_c3914 CLRAG_ 59 0 21290 1389 fosfoglicerato mutase 5.4.2.11 CAETHG_17 CLJU_c3912 CLRAG_ 57 0 21270 1390 fosfoglucomutase 5.4.2.8 CAETHG_08 CLJU_c2906 CLRAG_ 98 0 35060 1391 hidroximetilpirimidina/fosfometilpirimidin 2.7.1.49, CAETHG_12 CLJU_c3304 CLRAG_ a quinase 2.7.4.7 02 0 15290 1392 Fosfopanteteína adenililtransferase 2.7.7.3 CAETHG_33 CLJU_c1272 CLRAG_1 53 0 1090 1393 fosfopantotenoilcisteína 4.1.1.36, CAETHG_33 CLJU_c1254 CLRAG_1 descarboxilase/fosfopantotenato-cisteína 6.3.2.5 36 0 1260 ligase 1394 fosfopentomutase 5.4.2.2, CAETHG_39 CLJU_c1815 CLRAG_
5.4.2.7 24 0 00520 1395 fosforibosil-AMP ciclo-hidrolase CAETHG_32 CLJU_c1174 CLRAG_1 65 0 1800 1396 fosforibosil-ATP pirofosfatase 3.5.4.19, CAETHG_32 CLJU_c1175 CLRAG_1
3.6.1.31 66 0 1790 1397 fosforibosilamina - glicina ligase 6.3.4.13 CAETHG_29 CLJU_c0860 CLRAG_ 54 0 07890 1398 fosforibosilaminoimidazol- 6.3.2.6 CAETHG_29 CLJU_c0855 CLRAG_ succinocarboxamida sintase 49 0 07940 1399 fosforibosilantranilato isomerase 5.3.1.24 CAETHG_37 CLJU_c1611 CLRAG_ 05 0 33080 1400 fosforibosilformilglicinamidina cicloligase 6.3.3.1 CAETHG_29 CLJU_c0857 CLRAG_ 51 0 07920 1401 fosforibosilformilglicinamidina sintase 6.3.5.3 CAETHG_32 CLJU_c1154 CLRAG_1 45 0 1910 1402 Subfamília IB hidrolase da superfamília 3.1.3.3 CAETHG_30 CLJU_c0936 CLRAG_ HAD, TIGR01490 31 0 13740 1403 fosfato acetiltransferase 2.3.1.8 CAETHG_33 CLJU_c1277 CLRAG_1 58 0 1040
79 / 294 1404 Promotor responsivo à auxina GH3 CAETHG_39 CLJU_c1874 CLRAG_ 93 0 16550 1405 Poliferredoxina CAETHG_05 CLJU_c2451 CLRAG_ 11 0 30060 1406 polirribonucleotídeo nucleotidiltransferase CAETHG_34 CLJU_c1321 CLRAG_ 04 0 10580 1407 porfobilinogênio sintase 4.2.1.24 CAETHG_11 CLJU_c3196 CLRAG_ 24 0 02590 1408 regulador positivo de sigma (E), CAETHG_32 CLJU_c1135 CLRAG_ RseC/MucC 26 0 12100 1409 Cadeia A de ATPase de ATPase CAETHG_18 CLJU_c3956 CLRAG_ transportadora de K+ 01 0 21760 1410 Cadeia B de ATPase de ATPase CAETHG_18 CLJU_c3955 CLRAG_ transportadora de K+ 00 0 21750 1411 Cadeia C de ATPase de ATPase CAETHG_17 CLJU_c3954 CLRAG_ transportadora de K+ 99 0 21740 1412 precorrina-2/fator de cobalto-2 C20- 2.1.1.151, CAETHG_111 CLJU_c3189 CLRAG_ metiltransferase 2.1.1.130 7 0 02520 1413 precorrina-2 desidrogenase/siro- 2.1.1.107, CAETHG_11 CLJU_c3199 CLRAG_ hidroclorina ferrocelatase 1.3.1.76, 27 0 02620
4.99.1.4 1414 precorrina-6Y C5,15-metiltransferase 2.1.1.132 CAETHG_111 CLJU_c3191 CLRAG_ (descarboxilação) 9 0 02540 1415 pré-fenato desidrogenase 1.3.1.52, CAETHG_09 CLJU_c2917 CLRAG_
1.3.1.13, 09 0 35170
1.3.1.43,
1.3.1.12 1416 fosfatidilglicerol: prolipoproteína CAETHG_29 CLJU_c0841 CLRAG_ diacilglicerol transferase 35 0 08040 1417 prolil-tRNA sintetase CAETHG_16 CLJU_c3836 CLRAG_ 94 0 20830 1418 proteína de utilização de etanolamina EutP CAETHG_39 CLJU_c1792 CLRAG_ 00 0 00710 1419 proteína hipotética CAETHG_07 CLJU_c2661 CLRAG_ 42 0 08480 1420 proteína hipotética CAETHG_25 CLJU_c0474 CLRAG_ 46 0 38120 1421 subunidade de pré-proteína translocase CAETHG_23 CLJU_c0263 CLRAG_ SecA 64 0 28230 1422 subunidade de proteína translocase CAETHG_19 CLJU_c4084 CLRAG_ secY/sec61 alfa 27 0 23030 1423 proteína-tirosina fosfatase CAETHG_23 CLJU_c0230 CLRAG_ 35 0 27900 1424 Sistema PTS, componente IIC específico da 2.7.1.69 CAETHG_01 CLJU_c2059 CLRAG_ frutose 42 0 19390 1425 Componente IIA do sistema PTS, família 2.7.1.69 CAETHG_06 CLJU_c2607 CLRAG_ Fru 76 0 04160 1426 Sistema PTS, componente tipo IIB CAETHG_06 CLJU_c2605 CLRAG_ específico para frutose 74 0 04140 1427 Sistema PTS, componente tipo IIC 2.7.1.69 CAETHG_06 CLJU_c2606 CLRAG_ específico para frutose 75 0 04150 1428 proteína hipotética CAETHG_23 CLJU_c0285 CLRAG_ 87 0, 28450 CLJU_c1558 0 1429 purina-nucleosídeo fosforilase 2.4.2.23, CAETHG_01 CLJU_c2075 CLRAG_
2.4.2.2, 60 0 19250
2.4.2.15,
2.4.2.4,
2.4.2.1
80 / 294 1430 repressor de operon de purina, PurR CAETHG_20 CLJU_c4180 CLRAG_ 09 0 04930 1431 Enzima ativase específica do substrato CAETHG_14 CLJU_c3574 CLRAG_ CoA, putativa 82 0 06270 1432 Proteína de processamento de 16S rRNA CAETHG_33 CLJU_c1291 CLRAG_ RimM 73 0 10890 1433 Subunidade benzoil-CoA redutase/2- CAETHG_01 CLJU_c2110 CLRAG_ hidroxiglutaril-CoA desidratase, 96 0 30680 BcrC/BadD/HgdB 1434 Subunidade benzoil-CoA redutase/2- CAETHG_14 CLJU_c3576 CLRAG_ hidroxiglutaril-CoA desidratase, 84 0 06290 BcrC/BadD/HgdB 1435 DNA-3-metiladenina glicosilase CAETHG_22 CLJU_c0195 CLRAG_ 98 0 27550 1436 proteína ribossômica S1 da subunidade CAETHG_08 CLJU_c2854 CLRAG_ pequena 48 0 34610 1437 Proteína ribossômica SSU S21P CAETHG_28 CLJU_c0804 CLRAG_ 98 0 08320 1438 chaperona molecular Hsp33 CAETHG_13 CLJU_c3460 CLRAG_ 56 0 14680 1439 4-hidroxibenzoato polipreniltransferase CAETHG_34 CLJU_c1331 CLRAG_ 14 0 10480 1440 proteína de transporte de elétrons HydN 1.12.1.4, CAETHG_27 CLJU_c0706 CLRAG_
1.1.99.33 97 0 18910 1441 Proteína ribossômica L21P da LSU CAETHG_28 CLJU_c0736 CLRAG_ 28 0 26480 1442 8-oxo-dGTP difosfatase CAETHG_35 CLJU_c1432 CLRAG_ 20, 0 09720 CAETHG_35 45 1443 N-glicosilase/DNA-liase CAETHG_15 CLJU_c3723 CLRAG_ 79 0 36670 1444 proteína de ligação putativa ao substrato de CAETHG_06 CLJU_c2538 CLRAG_ sistema de transporte de 07 0 03660 hidroximetilpirimidina 1445 proteína permease de sistema liberador de CAETHG_26 CLJU_c0565 CLRAG_ lipoproteínas 57 0 06870 1446 proteína de ligação ao substrato do sistema CAETHG_38 CLJU_c1725 CLRAG_ de transporte do complexo de ferro 22, 0, 33970 CAETHG_38 CLJU_c1710 38 0 1447 proteína de ligação ao substrato do sistema CAETHG_38 CLJU_c1715 CLRAG_ de transporte do complexo de ferro 27 0 34010 1448 proteína de ligação ao substrato do sistema CAETHG_38 CLJU_c1720 CLRAG_ de transporte do complexo de ferro 33 0 34200 1449 Proteína de ligação ao ATP do sistema de CAETHG_00 CLJU_c1835 CLRAG_ transporte do tipo ABC-2 42, 0, 39490 CAETHG_39 CLJU_c1965 42 0 1450 Proteína de ligação ao ATP do sistema de CAETHG_03 CLJU_c0914 CLRAG_ transporte do tipo ABC-2 54, 0, 01870 CAETHG_30 CLJU_c3741 08 0, CLJU_c2292 0 1451 Proteína de ligação ao ATP do sistema de CAETHG_03 CLJU_c2325 CLRAG_ transporte do tipo ABC-2 88 0 01480 1452 Proteína de ligação ao ATP do sistema de CAETHG_05 CLJU_c2466 CLRAG_ transporte do tipo ABC-2 31 0 18170 1453 Proteína de ligação ao ATP do sistema de CAETHG_05 CLJU_c2512 CLRAG_ transporte do tipo ABC-2 80 0 03460
81 / 294 1454 proteína de ligação ao ATP putativa de CAETHG_06 CLJU_c2540 CLRAG_ sistema de transporte de 09 0 03680 hidroximetilpirimidina 1455 Sistema de transporte múltiplos fármacos CAETHG_06 CLJU_c2571 CLRAG_ do tipo ABC, componente ATPase 40 0 03910 1456 proteína de ligação ao ATP putativa de CAETHG_06 CLJU_c2577 CLRAG_ sistema de transporte ABC 46 0 04000 1457 Proteína de ligação ao ATP do sistema de CAETHG_06 CLJU_c2589 CLRAG_ transporte do tipo ABC-2 58 0 04030 1458 proteína de ligação ao ATP putativa de CAETHG_06 CLJU_c2614 CLRAG_ sistema de transporte de 83 0 04220 espermidina/putrescina 1459 proteína de ligação ao ATP de sistema de 3.A.1.17 CAETHG_07 CLJU_c2651 CLRAG_ transporte da família NitT/TauT 32 0 08390 1460 Proteína de ligação ao ATP de conjunto de CAETHG_07 CLJU_c3794 CLRAG_ agrupamento Fe-S 75, 0, 37330 CAETHG_16 CLJU_c2691 31 0 1461 Proteína de ligação ao ATP do sistema de CAETHG_07 CLJU_c2707 CLRAG_ transporte do tipo ABC-2 91 0 08830 1462 Sistema de transporte múltiplos fármacos CAETHG_07 CLJU_c2713 CLRAG_ do tipo ABC, componente ATPase 99 0 20100 1463 proteína de ligação ao ATP putativa de CAETHG_08 CLJU_c0107 CLRAG_ sistema de transporte ABC 04, 0, 20040 CAETHG_22 CLJU_c0768 18, 0, CAETHG_28 CLJU_c0778 70, 0, CAETHG_28 CLJU_c2719 61 0 1464 proteína de ligação ao ATP putativa de CAETHG_10 CLJU_c3016 CLRAG_ sistema de transporte ABC 16 0 39150 1465 Proteína de ligação ao ATP do sistema de CAETHG_11 CLJU_c3301 CLRAG_ transporte do tipo ABC-2 99 0 15320 1466 Proteína de ligação ao ATP do sistema de CAETHG_14 CLJU_c3519 CLRAG_ transporte do tipo ABC-2 27 0 05700 1467 Proteína de ligação ao ATP do sistema de CAETHG_14 CLJU_c3528 CLRAG_ transporte do tipo ABC-2 37 0 05810 1468 proteína de ligação ao ATP de sistema de CAETHG_14 CLJU_c3534 CLRAG_ transporte da família NitT/TauT 43 0 05870 1469 Cassete de ligação ao ATP, subfamília F, CAETHG_15 CLJU_c3726 CLRAG_ membro 3 82 0 36700 1470 Proteína de ligação ao ATP do sistema de CAETHG_15 CLJU_c3728 CLRAG_ transporte do tipo ABC-2 84 0 36720 1471 proteína de ligação ao ATP putativa de CAETHG_17 CLJU_c3863 CLRAG_ sistema de transporte ABC 13 0 20950 1472 proteína de ligação ao ATP putativa de CAETHG_18 CLJU_c4000 CLRAG_ sistema de transporte ABC 47, 0, 22240 CAETHG_35 CLJU_c1442 15 0 1473 Componentes ATPase de transportadores CAETHG_18 CLJU_c4006 CLRAG_ ABC com domínios ATPase duplicados 55 0 22320 1474 proteína de ligação ao ATP para sistema de CAETHG_21 CLJU_c0080 CLRAG_ transporte de bacitracina 95 0 19780 1475 Proteína de ligação ao ATP do sistema de CAETHG_25 CLJU_c0458 CLRAG_ transporte do tipo ABC-2 30, 0, 37940 CAETHG_28 CLJU_c0776 68 0
82 / 294 1476 Proteína de ligação ao ATP do sistema de CAETHG_25 CLJU_c0460 CLRAG_ transporte de D-metionina 32, 0, 37960 CAETHG_27 CLJU_c0628 24 0 1477 proteína de ligação ao ATP do sistema CAETHG_26 CLJU_c0566 CLRAG_ liberador de lipoproteínas 58 0 06880 1478 proteína de ligação ao ATP para sistema de CAETHG_27 CLJU_c0649 CLRAG_ transporte de bacitracina 45 0 30410 1479 Sistema de transporte de CAETHG_29 CLJU_c0881 CLRAG_ nitrato/sulfonato/bicarbonato do tipo ABC, 76 0 07680 componente ATPase 1480 Proteína de ligação ao ATP do sistema de CAETHG_34 CLJU_c1379 CLRAG_ transporte do tipo ABC-2 62 0 10050 1481 proteína de ligação ao ATP putativa de CAETHG_35 CLJU_c1424 CLRAG_ sistema de transporte ABC 06 0 09560 1482 proteína de ligação ao ATP putativa de CAETHG_35 CLJU_c1430 CLRAG_ sistema de transporte ABC 12 0 09660 1483 proteína de ligação ao ATP putativa de CAETHG_36 CLJU_c1549 CLRAG_ sistema de transporte ABC 50, 0, 00560 CAETHG_39 CLJU_c1809 18 0 1484 proteína de ligação ao ATP do sistema de CAETHG_38 CLJU_c1716 CLRAG_ transporte do complexo de ferro 28 0 34020 1485 proteína de permease/ligação ao ATP de CAETHG_40 CLJU_c1902 CLRAG_ sistema de transporte de macrólidos 36 0 40020 1486 Cassete de ligação ATP, subfamília B CAETHG_36 CLJU_c1518 CLRAG_ 20 0 24170 1487 Cassete de ligação ATP, subfamília B CAETHG_40 CLJU_c1891 CLRAG_ 25 0 40060 1488 Proteína permease de sistema de transporte CAETHG_05 CLJU_c2465 CLRAG_ do tipo ABC-2 30 0 18180 1489 proteína permease putativa de sistema de CAETHG_06 CLJU_c2539 CLRAG_ transporte de hidroximetilpirimidina 08 0 03670 1490 proteína permease putativa de sistema de CAETHG_06 CLJU_c2615 CLRAG_ transporte de espermidina/putrescina 84 0 04230 1491 proteína permease putativa de sistema de CAETHG_06 CLJU_c2616 CLRAG_ transporte de espermidina/putrescina 85 0 04240 1492 Proteína permease de sistema de transporte 3.A.1.17 CAETHG_07 CLJU_c2652 CLRAG_ da família NitT/TauT 33 0 08400 1493 Proteína permease de sistema de transporte CAETHG_14 CLJU_c3535 CLRAG_ da família NitT/TauT 44 0 05880 1494 proteína permease putativa de sistema de CAETHG_18 CLJU_c3999 CLRAG_ transporte ABC 46 0 22230 1495 proteína permease de sistema de transporte CAETHG_21 CLJU_c0079 CLRAG_ de bacitracina 94 0 19790 1496 proteína permease putativa de sistema de CAETHG_22 CLJU_c0108 CLRAG_ transporte ABC 19 0 30320 1497 proteína permease de sistema de transporte CAETHG_27 CLJU_c0648 CLRAG_ de bacitracina 44 0 30420 1498 proteína permease putativa de sistema de CAETHG_28 CLJU_c0769 CLRAG_ transporte ABC 62 0 25220 1499 proteína hipotética CAETHG_34 CLJU_c1381 CLRAG_ 64 0 10030 1500 proteína permease putativa de sistema de CAETHG_35 CLJU_c1425 CLRAG_ transporte ABC 07 0 09570 1501 proteína permease de sistema de transporte CAETHG_38 CLJU_c1713 CLRAG_ de complexo de ferro 25 0 33990 1502 proteína permease putativa de sistema de CAETHG_39 CLJU_c1810 CLRAG_ transporte ABC 19 0 00550
83 / 294 1503 Proteína permease de sistema de transporte CAETHG_39 CLJU_c1836 CLRAG_ do tipo ABC-2 43 0 00310 1504 proteína putativa de ligação ao substrato de CAETHG_06 CLJU_c2613 CLRAG_ sistema de transporte de 82 0 04210 espermidina/putrescina 1505 Cassete de ligação ATP, subfamília B CAETHG_40 CLJU_c1890 CLRAG_ 24 0 40070 1506 Proteína permease de sistema de transporte CAETHG_00 CLJU_c1966 CLRAG_ do tipo ABC-2 43 0 39480 1507 acetaldeído desidrogenase (acetilação) CAETHG_18 CLJU_c3984 CLRAG_ 30 0 22090 1508 acetil-CoA C-acetiltransferase CAETHG_04 CLJU_c2363 CLRAG_ 27 0 17540 1509 Proteína da família acetiltransferase CAETHG_02 CLJU_c2130 CLRAG_ (GNAT) 16 0 30860 1510 Proteína contendo domínio acetiltransferase CAETHG_09 CLJU_c2930 CLRAG_ (GNAT) 23, 0, 35310 CAETHG_31 CLJU_c1085 74 0 1511 fosfinotricina acetiltransferase CAETHG_10 CLJU_c3055 CLRAG_ 60 0 08730 1512 Proteína ribossômica S18 acetilase RimI CAETHG_14 CLJU_c3504 CLRAG_ 13 0 26300 1513 N-acetilglutamato sintase, família GNAT CAETHG_17 CLJU_c3901 CLRAG_ 49 0 21190 1514 Proteína ribossômica S18 acetilase RimI CAETHG_27 CLJU_c0640 CLRAG_ 35 0 30450 1515 Proteína de ligação a nucleotídeo prevista, CAETHG_01 CLJU_c2099 CLRAG_ superfamília de açúcar 83 0 19030 quinase/HSP70/actina 1516 Enzima ativase específica do substrato CAETHG_14 CLJU_c3533 CLRAG_ CoA, putativa 42 0 05860 1517 proteína carreadora de acila CAETHG_33 CLJU_c1282 CLRAG_ 63 0 10990 1518 acil-[acil-carreador-proteína] hidrolase de CAETHG_20 CLJU_c4234 CLRAG_ cadeia média 58 0 05450 1519 Acil-CoA desidrogenase 1.3.1.44, CAETHG_17 CLJU_c3942 CLRAG_
1.3.99.2 87 0 21630 1520 acil-CoA desidrogenase 1.3.1.44, CAETHG_17 CLJU_c3944 CLRAG_
1.3.99.2 89 0 21650 1521 Crotonobetainil-CoA: carnitina CoA- CAETHG_17 CLJU_c3943 CLRAG_ transferase CaiB 88 0 21640 1522 Polissacarídeo de superfície O- CAETHG_13 CLJU_c3403 CLRAG_ aciltransferase, enzima de membrana 01 0 14180 integral 1523 Fucose 4-O-acetilase CAETHG_13 CLJU_c3413 CLRAG_ 11 0 14280 1524 adenilato ciclase, classe 2 4.6.1.1 CAETHG_23 CLJU_c0280 CLRAG_ 81 0 28400 1525 ADP-ribosil-[dinitrogênio redutase] CAETHG_00 CLJU_c1998 CLRAG_ hidrolase 78 0 39060 1526 proteína hipotética CAETHG_05 CLJU_c2520 CLRAG_ 88 0 03550 1527 Aldo/ceto redutase CAETHG_08 CLJU_c2821 CLRAG_ 21 0 09160 1528 aril-álcool desidrogenase (NADP+) CAETHG_38 CLJU_c1707 CLRAG_ 19 0 33940 1529 Aldo/ceto redutase 1.1.1.21 CAETHG_38 CLJU_c1782 CLRAG_ 90 0 00890
84 / 294 1530 proteína conservada não caracterizada CAETHG_32 CLJU_c1111 CLRAG_ YloU, família da proteína de choque 00 0 12350 alcalino (Asp23) 1531 proteína conservada não caracterizada CAETHG_33 CLJU_c1268 CLRAG_1 YloU, família da proteína de choque 49 0 1130 alcalino (Asp23) 1532 D-lactato desidrogenase 1.1.1.28 CAETHG_11 CLJU_c3219 CLRAG_ 47 0 02820 1533 Éster metílico de pimoloil-ACP CAETHG_35 CLJU_c1749 CLRAG_ carboxilesterase 73, 0, 20450 CAETHG_38 CLJU_c1474 62 0 1534 Proteína da família beta-liase cistationina CAETHG_02 CLJU_c2120 CLRAG_ envolvida na resistência ao alumínio 06 0 30780 1535 proteína putativa do metabolismo do CAETHG_04 CLJU_c2382 CLRAG_ selênio SsnA 47 0 17350 1536 Citosina/adenosina desaminase CAETHG_06 CLJU_c2611 CLRAG_ 80 0 04190 1537 Citosina/adenosina desaminase 3.5.4.3 CAETHG_10 CLJU_c3053 CLRAG_ 58 0 15950 1538 amido-hidrolase CAETHG_12 CLJU_c3347 CLRAG_ 46 0 32300 1539 amido-hidrolase 3.5.1.47 CAETHG_38 CLJU_c1734 CLRAG_ 47 0 29240 1540 proteína de competência ComFC CAETHG_23 CLJU_c0261 CLRAG_ 62 0 28210 1541 Transportador de L-asparagina CAETHG_24 CLJU_c0418 CLRAG_ 86 0 26880 1542 Transportador de aminoácidos CAETHG_17 CLJU_c3896 CLRAG_ 44 0 21140 1543 Transportador de L-asparagina CAETHG_19 CLJU_c4066 CLRAG_ 09 0, 25010 CLJU_c1602 0 1544 Proteína de efluxo de lactona CAETHG_40 CLJU_c1887 CLRAG_ treonina/homosserina/homosserina 19 0 40130 1545 aminopeptidase putativa FrvX CAETHG_36 CLJU_c1506 CLRAG_ 08 0 24310 1546 Aspartil aminopeptidase CAETHG_02 CLJU_c2188 CLRAG_ 78 0 31420 1547 Aspartato/metionina/tirosina 2.6.1.23, CAETHG_09 CLJU_c2939 CLRAG_ aminotransferase 2.6.1.1 33 0 35390 1548 aminotransferase 2.6.1.- CAETHG_13 CLJU_c3454 CLRAG_ 50 0 14620 1549 taurina---2-oxoglutarato transaminase 2.6.1.62 CAETHG_14 CLJU_c3592 CLRAG_ 99 0 06420 1550 aspartato aminotransferase 2.6.1.51, CAETHG_22 CLJU_c0096 CLRAG_
2.6.1.44 10 0 19620 1551 aspartato aminotransferase 2.6.1.51, CAETHG_22 CLJU_c0113 CLRAG_
2.6.1.44 24 0 30270 1552 coenzima A ligase de fenilacetato PaaK, CAETHG_04 CLJU_c2401 CLRAG_ família de domínios formadores de 67 0 17150 adenilato 1553 acil-CoA sintetase 6.2.1.3 CAETHG_17 CLJU_c3939 CLRAG_ 84 0 21600 1554 proteína ativadora de ribonucleosídeo- CAETHG_22 CLJU_c0185 CLRAG_ trifosfato redutase anaeróbica 88 0 27450 1555 proteína de esporulação estágio II AB (fator CAETHG_12 CLJU_c3396 CLRAG_ F anti-sigma) 94 0 14110
85 / 294 1556 Proteína de ligação ao DNA do tipo AraC CAETHG_00 CLJU_c1984 CLRAG_ 64 0 39240 1557 Proteína de utilização de arginina RocB CAETHG_03 CLJU_c2321 CLRAG_ 84 0 01520 1558 arginina descarboxilase 4.1.1.18, CAETHG_13 CLJU_c3422 CLRAG_
4.1.1.19, 21 0 14370
4.1.1.17 1559 aspartato aminotransferase 2.6.1.9, CAETHG_25 CLJU_c0465 CLRAG_
2.6.1.58, 37 0 38030
2.6.1.1 ou
2.6.1.9,
2.6.1.57,
2.6.1.23,
2.6.1.78,
2.6.1.5,
2.6.1.1 1560 Repressor de ação ativa do operon de CAETHG_36 CLJU_c1565 CLRAG_ resistência ao arsênico ArsD 64 0 32710 1561 ATPase prevista CAETHG_09 CLJU_c2937 CLRAG_ 31 0 33860 1562 DNA helicase-2/DNA dependente de ATP CAETHG_16 CLJU_c3834 CLRAG_ helicase PcrA 92 0 20810 1563 DNA helicase-2/DNA dependente de ATP CAETHG_37 CLJU_c1653 CLRAG_ helicase PcrA 49 0 33340 1564 protease de divisão celular FtsH CAETHG_16 CLJU_c3835 CLRAG_ 93 0 20820 1565 Superfamília II DNA e RNA helicase CAETHG_03 CLJU_c2299 CLRAG_ 61 0 01790 1566 Superfamília II DNA e RNA helicase CAETHG_30 CLJU_c0912 CLRAG_ 06 0 13900 1567 RNA helicase dependente de ATP CAETHG_40 CLJU_c1907 CLRAG_ SUPV3L1/SUV3 41 0 39950 1568 proteína hipotética CAETHG_19 CLJU_c4134 CLRAG_ 75 0 23530 1569 proteína hipotética CAETHG_20 CLJU_c4231 CLRAG_ 55 0 05420 1570 proteína de biossíntese de tRNA CAETHG_16 CLJU_c3818 CLRAG_ treonilcarbamoiladenosina TsaE 74 0 20640 1571 Subunidade de ligação ao ATP de protease CAETHG_19 CLJU_c4133 CLRAG_ Clp dependente de ATP ClpC 74 0 23520 1572 proteína de ligação ao ATP de sistema de CAETHG_24 CLJU_c0307 CLRAG_ transporte de divisão celular 22 0 28680 1573 tRNA (Ile)-lisidina sintase TilS/MesJ CAETHG_25 CLJU_c0479 CLRAG_ 51 0 38170 1574 Cassete de ligação ao ATP, subfamília F, CAETHG_29 CLJU_c0839 CLRAG_ uup 33 0 08060 1575 proteína da família magnésio quelatase CAETHG_33 CLJU_c1298 CLRAG_ 81 0 10810 1576 proteína de ligação à penicilina CAETHG_27 CLJU_c0602 CLRAG_ 00 0 07250 1577 beta-lactamase classe A CAETHG_37 CLJU_c1643 CLRAG_ 37 0 33230 1578 proteína de ligação à penicilina 1A CAETHG_12 CLJU_c3394 CLRAG_ 92 0 14090 1579 componente específico do substrato do CAETHG_05 CLJU_c2447 CLRAG_ sistema de transporte de biotina 07 0 30100 1580 proteína carreadora de acetil-CoA 6.3.4.14 CAETHG_20 CLJU_c4214 CLRAG_ carboxilase biotina 44 0 05250 1581 biotina sintase CAETHG_16 CLJU_c3833 CLRAG_ 91 0 20800
86 / 294 1582 Enzima requerente de biotina CAETHG_01 CLJU_c2050 CLRAG_ 32 0 19520 1583 transportador provável de resistência à 4- CAETHG_34 CLJU_c1369 CLRAG_ azaleucina AzlC 51 0 10180 1584 cátion: antiportador de H+ CAETHG_24 CLJU_c0413 CLRAG_ 76 0 26920 1585 domínio de ligação ao cAMP da PCR ou CAETHG_34 CLJU_c1415 CLRAG_ uma subunidade reguladora das proteínas 96 0 09470 quinases dependentes do cAMP 1586 NDP-epimerase de açúcar, inclui 4,6- CAETHG_13 CLJU_c3418 CLRAG_ desidratase FlaA1 invertida por UDP- 17 0 14330 GlcNAc e proteína de biossíntese de polissacarídeo capsular EpsC 1587 Proteína capsular de biossíntese de CAETHG_25 CLJU_c0514 CLRAG_ polissacarídeos 91 0 38530 1588 proteína-tirosina fosfatase CAETHG_25 CLJU_c0515 CLRAG_ 92 0 38540 1589 xiluloquinase 2.7.1.17 CAETHG_35 CLJU_c1491 CLRAG_ 97 0 20240 1590 cardiolipina sintase CAETHG_08 CLJU_c2904 CLRAG_ 96 0 35040 1591 cardiolipina sintase CAETHG_29 CLJU_c0889 CLRAG_ 84 0 07590 1592 transportador de família facilitadora de CAETHG_05 CLJU_c2469 CLRAG_ difusão catiônica 34 0 18140 1593 glicosídeo/pentosídeo/hexuronida: simporte CAETHG_22 CLJU_c0125 CLRAG_ catiônico, família GPH 34 0 30170 1594 ATPase de exportação de Cd2+/Zn2+ CAETHG_08 CLJU_c2907 CLRAG_ 99 0 35070 1595 ATPase de transporte de Ca2+ CAETHG_27 CLJU_c0689 CLRAG_ 79 0 18720 1596 ATPase, tipo P (transporte), superfamília CAETHG_28 CLJU_c0787 CLRAG_ HAD, subfamília IC 80 0 25350 1597 ATPase de transporte de Ca2+ CAETHG_31 CLJU_c1048 CLRAG_ 38 0 12890 1598 exportador hidrofóbico/anfifílico-1, família CAETHG_03 CLJU_c2328 CLRAG_ HAE1 91 0 01450 1599 CDP-diacilglicerol-glicerol-3-fosfato 3- 2.7.8.5 CAETHG_13 CLJU_c3488 CLRAG_ fosfatidiltransferase 86 0 26120 1600 proteína determinante da forma da haste CAETHG_38 CLJU_c1702 CLRAG_ RodA 14 0 33900 1601 proteína de esporulação D de estágio V CAETHG_17 CLJU_c1056 CLRAG_ (proteína de ligação à penicilina específica 29, 0, 21070 da esporulação) CAETHG_31 CLJU_c3881 46 0 1602 proteína de divisão celular FtsW, lipídio II CAETHG_24 CLJU_c0314 CLRAG_ flipase 29 0 28750 1603 proteína de divisão celular FtsW CAETHG_31 CLJU_c1060 CLRAG_ 50 0 12740 1604 protease de divisão celular FtsH CAETHG_27 CLJU_c0611 CLRAG_ 10 0 07390 1605 lisozima CAETHG_10 CLJU_c3002 CLRAG_ 01 0 15660 1606 N-acetilmuramoil-L-alanina amidase CAETHG_18 CLJU_c4048 CLRAG_ 91 0 22670 1607 Beta-N-acetilglucosaminidase CAETHG_22 CLJU_c0167 CLRAG_ 67 0 27270 1608 Proteína contendo domínio LysM CAETHG_25 CLJU_c0466 CLRAG_ 38 0 38040
87 / 294 1609 N-acetilmuramoil-L-alanina amidase CAETHG_25 CLJU_c0482 CLRAG_ 54 0 38200 1610 Repetição putativa da ligação da parede CAETHG_05 CLJU_c2475 CLRAG_ celular 2 40 0 18070 1611 Repetição putativa da ligação da parede CAETHG_08 CLJU_c2861 CLRAG_ celular 2 56 0 34690 1612 proteína CpaB para montagem de pilus CAETHG_08 CLJU_c2883 CLRAG_ 79 0 34910 1613 Repetição putativa da ligação da parede CAETHG_09 CLJU_c2989 CLRAG_ celular 2 88 0 17030 1614 Proteína putativa de ligação à parede CAETHG_15 CLJU_c3635 CLRAG_ celular 43, 0, 38390 CAETHG_25 CLJU_c0500 77 0 1615 Repetição putativa da ligação da parede CAETHG_25 CLJU_c0484 CLRAG_ celular 2 57 0 38220 1616 Repetição putativa da ligação da parede CAETHG_25 CLJU_c0511 CLRAG_ celular 2 88 0 38500 1617 Repetição putativa da ligação da parede CAETHG_25 CLJU_c0512 CLRAG_ celular 2 89 0 38510 1618 Proteína putativa de ligação à parede CAETHG_26 CLJU_c1860 CLRAG_ celular 55, 0, 00090 CAETHG_39 CLJU_c0563 68 0, CLJU_c3253 0 1619 Proteína putativa de ligação à parede CAETHG_29 CLJU_c0866 CLRAG_ celular 60 0 07830 1620 Proteína putativa de ligação à parede CAETHG_39 CLJU_c1866 CLRAG_ celular 80 0 16980 1621 proteína de iniciação da divisão celular CAETHG_31 CLJU_c1069 CLRAG_ 59 0 12650 1622 chaperona molecular DnaJ CAETHG_28 CLJU_c0799 CLRAG_ 92 0 25470 1623 proteína de quimiotaxia CheX CAETHG_40 CLJU_c1886 CLRAG_ 18 0 40140 1624 sistema de dois componentes, família de CAETHG_03 CLJU_c2212 CLRAG_ quimiotaxia, sensor quinase CheA 10 0 31700 1625 proteína de quimiotaxia de ligação à purina CAETHG_03 CLJU_c2211 CLRAG_ CheW 09 0 31690 1626 sistema de dois componentes, família de CAETHG_03 CLJU_c2213 CLRAG_ quimiotaxia, regulador de resposta CheY 11, 0, 31710 CAETHG_30 CLJU_c0945 40 0 1627 Proteína contendo domínio de sinalização CAETHG_10 CLJU_c3060 CLRAG_ de proteína quimiotaxe que aceita metila 64 0 16010 (MCP) 1628 Tiamina-quinase CAETHG_18 CLJU_c3966 CLRAG_ 12 0 21910 1629 transportador de cromato CAETHG_15 CLJU_c3616 CLRAG_ 26 0 24020 1630 transportador de cromato CAETHG_38 CLJU_c1757 CLRAG_ 65 0 01170 1631 proteína de partição cromossômica CAETHG_21 CLJU_c4288 CLRAG_ 14 0 25690 1632 proteína de partição cromossômica, família CAETHG_21 CLJU_c4289 CLRAG_ ParB 15 0 25700
88 / 294 1633 2-aminoadipato transaminase CAETHG_00 CLJU_c2127 CLRAG_ 36, 0, 39530 CAETHG_02 CLJU_c1959 13 0 1634 Enzima ativase específica do substrato CAETHG_01 CLJU_c2098 CLRAG_ CoA, putativa 82 0 19040 1635 proteínas do domínio C-terminal da CAETHG_01 CLJU_c2108 CLRAG_ metilmalonil-CoA mutase/proteínas 93, 0, 30660 corrinoides cognatas metiltransferase CAETHG_40 CLJU_c1911 45 0 1636 proteína de ligação ao ATP para sistema de CAETHG_08 CLJU_c2859 CLRAG_ transporte de cobalto/níquel 54 0 34670 1637 proteína de ligação ao ATP para sistema de CAETHG_11 CLJU_c3203 CLRAG_ transporte de cobalto/níquel 31 0 02660 1638 proteína de ligação ao ATP de sistema de CAETHG_19 CLJU_c4074 CLRAG_ transporte de fator de acoplamento 17 0 22930 energético 1639 proteína de ligação ao ATP de sistema de CAETHG_19 CLJU_c4075 CLRAG_ transporte de fator de acoplamento 18 0 22940 energético 1640 proteína permease de sistema de transporte CAETHG_19 CLJU_c4073 CLRAG_ do fator de acoplamento energético 16 0 22920 1641 proteína permease de sistema de transporte CAETHG_11 CLJU_c3204 CLRAG_ de cobalto/níquel 32 0 02670 1642 proteína permease de sistema de transporte CAETHG_03 CLJU_c2223 CLRAG_ de cobalto/níquel 21 0 31810 1643 proteína permease de sistema de transporte CAETHG_12 CLJU_c3320 CLRAG_ de cobalto/níquel 19 0 15060 1644 proteína permease de sistema de transporte CAETHG_08 CLJU_c2860 CLRAG_ de cobalto/níquel 55 0 34680 1645 proteína hipotética CAETHG_27 CLJU_c0619 CLRAG_ 19 0 07470 1646 Fator de maturação de CO desidrogenase CAETHG_16 CLJU_c3759 CLRAG_ 12 0 37000 1647 Fator de maturação de CO desidrogenase CAETHG_16 CLJU_c3766 CLRAG_ 19 0 37070 1648 proteína de choque frio (fita beta, família CAETHG_12 CLJU_c3324 CLRAG_ CspA) 23 0 15020 1649 proteína de competência ComEC CAETHG_27 CLJU_c0659 CLRAG_ 49 0 18400 1650 Regulador transcricional da família CAETHG_24 CLJU_c0303 CLRAG_ CopG/antitoxina EndoAI 18 0 28640 1651 proteína contendo domínio C-terminal da CAETHG_01 CLJU_c2070 CLRAG_ metilmalonil-CoA mutase 39, 0, 30740 CAETHG_01 CLJU_c2067 54, 0, CAETHG_01 CLJU_c2056 50 0 1652 Proteína corrinoide metanogênica MtbC1 CAETHG_01 CLJU_c2074 CLRAG_ 59 0 19260 1653 uroporfirinogênio descarboxilase (URO-D) CAETHG_28 CLJU_c0757 CLRAG_ 45, 0, 32350 CAETHG_28 CLJU_c0752 50 0 1654 Proteína CrcB CAETHG_03 CLJU_c2333 CLRAG_ 97 0 01410 1655 Proteína CrcB CAETHG_03 CLJU_c2334 CLRAG_ 98 0 01400 1656 domínio de ligação ao cAMP da PCR ou CAETHG_04 CLJU_c2378 CLRAG_ uma subunidade reguladora das proteínas 43 0 17390 quinases dependentes do cAMP
89 / 294 1657 Regulador transcricional da família CAETHG_31 CLJU_c1083 CLRAG_ CRP/FNR, proteína reguladora anaeróbica 72 0 03130 1658 Transportador MFS, família CP, CAETHG_05 CLJU_c2479 CLRAG_ transportador de cianato 44 0 18000 1659 Quinurenina formamidase CAETHG_04 CLJU_c2365 CLRAG_ 29 0 17520 1660 Quinurenina formamidase CAETHG_04 CLJU_c0871 CLRAG_ 84, 0, 24930 CAETHG_29 CLJU_c2426 65 0 1661 D-3-fosfoglicerato desidrogenase 1.1.1.95 CAETHG_10 CLJU_c3061 CLRAG_ 65 0 16020 1662 D-tirosil-tRNA (Tyr) desacilase CAETHG_12 CLJU_c3370 CLRAG_ 68 0 24580 1663 metabolismo de hidrolase putativo de CAETHG_04 CLJU_c2381 CLRAG_ selênio 46 0 17360 1664 proteína de esporulação da família de CAETHG_13 CLJU_c3464 CLRAG_ polissacarídeos desacetilase PdaB 60 0 14720 1665 Proteína do domínio EDD, família DegV CAETHG_17 CLJU_c3918 CLRAG_ 63 0 21330 1666 desidratase putativa, família YjhG/YagF 4.2.1.9 CAETHG_21 CLJU_c0061 CLRAG_ 79 0 19970 1667 Desidrogenase dependente de NAD (P), 1.1.1.0, CAETHG_00 CLJU_c1999 CLRAG_ família desidrogenase de álcool de cadeia 2.3.1.86, 79, 0, 39050 curta 1.1.1.100, CAETHG_09 CLJU_c2983
1.1.1.1, 82 0
2.3.1.85 1668 Desidrogenase prevista CAETHG_06 CLJU_c2604 CLRAG_ 73 0 04130 1669 Desidrogenase dependente de NAD (P), 2.3.1.85, CAETHG_17 CLJU_c3895 CLRAG_ família desidrogenase de álcool de cadeia 2.3.1.86, 43 0 21130 curta 1.1.1.1,
1.1.1.100,
1.1.1.0 1670 proteína hipotética CAETHG_20 CLJU_c4236 CLRAG_ 60 0 05470 1671 dGTPase 3.1.5.1 CAETHG_24 CLJU_c0412 CLRAG_ 75 0 26930 1672 Proteína da família TatD DNase CAETHG_22 CLJU_c0174 CLRAG_ 76 0 27340 1673 4-hidroxi-tetra-hidrodipicolinato sintase 4.2.1.52 CAETHG_24 CLJU_c0384 CLRAG_ 46 0 28910 1674 Proteína de ligação de agrupamento Fe-Mo CAETHG_16 CLJU_c3769 CLRAG_ prevista, família NifX 23 0 37110 1675 transportador de família facilitadora de CAETHG_14 CLJU_c3548 CLRAG_ difusão catiônica 56 0 06010 1676 Transportadores de íons metálicos NRAMP (proteína CAETHG_20 CLJU_c4239 CLRAG_ natural de macrófagos associada à resistência) 64 0 05530 1677 Proteína contendo domínio CBS CAETHG_36 CLJU_c1599 CLRAG_ 96 0 32980 1678 Transportadores de íons metálicos NRAMP (proteína CAETHG_36 CLJU_c1600 CLRAG_ natural de macrófagos associada à resistência) 97 0 32990 1679 Proteína conservada não caracterizada CAETHG_31 CLJU_c1062 CLRAG_ YlxW, família UPF0749 52 0 12720 1680 Proteína conservada não caracterizada CAETHG_31 CLJU_c1064 CLRAG_ YlxW, família UPF0749 54 0 12700 1681 DNA helicase replicativo CAETHG_20 CLJU_c4271 CLRAG_ 96 0 25520
90 / 294 1682 proteína contendo domínio de CAETHG_31 CLJU_c1094 CLRAG_ clivagem/metilação do terminal N do tipo 83 0 12520 prepilina 1683 Domínio MutS III CAETHG_02 CLJU_c2182 CLRAG_ 72 0 31360 1684 Domínio MutS V CAETHG_03 CLJU_c2218 CLRAG_ 16 0 31760 1685 DNA-metiltransferase específica de CAETHG_12 CLJU_c3398 CLRAG_ adenina 96 0 14130 1686 Proteína de replicação de DNA DnaC CAETHG_20 CLJU_c4223 CLRAG_ 54 0 05340 1687 Proteína contendo domínio associado ao CAETHG_20 CLJU_c4222 CLRAG_ fago e DnaD 53 0 05330 1688 proteína de competência ComEA CAETHG_28 CLJU_c0745 CLRAG_ 37 0 32240 1689 proteína de radical SAM putativa de CAETHG_10 CLJU_c3027 CLRAG_ modificação/reparo do DNA 34 0 15910 1690 Proteína de ligação ao DNA prevista, CAETHG_16 CLJU_c3770 CLRAG_ família UPF0251 24 0 37120 1691 regulador transcricional putativo CAETHG_16 CLJU_c3250 CLRAG_ 67 0 36110 1692 diadenilato ciclase CAETHG_19 CLJU_c4131 CLRAG_ 72 0 23500 1693 complexo de transporte de elétrons, tipo 1.18.1.3 CAETHG_32 CLJU_c1141 CLRAG_ RnfABCDGE, subunidade B 32 0 12040 1694 proteína de complexo de transporte de 1.18.1.3 CAETHG_32 CLJU_c1136 CLRAG_ elétrons RnfC 27 0 12090 1695 proteína de complexo de transporte de 1.18.1.3 CAETHG_32 CLJU_c1138 CLRAG_ elétrons RnfG 29 0 12070 1696 proteína contendo domínio de proteína de CAETHG_05 CLJU_c2464 CLRAG_ ligação a GTP pequena 29 0 18260 1697 Endodesoxirribonuclease RusA CAETHG_15 CLJU_c3744 CLRAG_ 96 0 36850 1698 proteína hipotética CAETHG_28 CLJU_c0731 CLRAG_ 23 0 26530 1699 família de PhzF da proteína de biossíntese CAETHG_00 CLJU_c1942 CLRAG_ da fenazina 19 0 39690 1700 família de PhzF da proteína de biossíntese CAETHG_38 CLJU_c1777 CLRAG_ da fenazina 85 0 00940 1701 eritromicina esterase CAETHG_06 CLJU_c2568 CLRAG_ 37 0 03880 1702 Proteína da família NTE CAETHG_01 CLJU_c2084 CLRAG_ 69 0 19160 1703 proteína hipotética CAETHG_10 CLJU_c3020 CLRAG_ 27 0 15800 1704 proteína de utilização de etanolamina EutJ CAETHG_18 CLJU_c3980 CLRAG_ 26, 0, 22050 CAETHG_32 CLJU_c1191 82 0 1705 proteína de utilização de etanolamina EutQ CAETHG_18 CLJU_c3975 CLRAG_ 21, 0, 22000 CAETHG_32 CLJU_c1194 85 0 1706 subunidade A da excinuclease ABC CAETHG_35 CLJU_c1475 CLRAG_ 74 0 20400 1707 Subunidade épsilon de DNA polimerase-3 CAETHG_40 CLJU_c1914 CLRAG_ 48 0 39940 1708 Subunidade épsilon de DNA polimerase-3 CAETHG_15 CLJU_c3623 CLRAG_ 33 0 23950
91 / 294 1709 Proteína de biossíntese de CAETHG_09 CLJU_c2970 CLRAG_ exopolissacarídeos 68 0, 35700 CLJU_c1584 0 1710 família de exopolissacarídeos capsulares CAETHG_25 CLJU_c0516 CLRAG_ 93 0 38550 1711 Proteína de biossíntese de CAETHG_29 CLJU_c0861 CLRAG_ exopolissacarídeos 55 0 07880 1712 proteína hipotética CAETHG_18 CLJU_c4045 CLRAG_ 88 0 22640 1713 Desidrogenase (flavoproteína) CAETHG_08 CLJU_c2727 CLRAG_ 13 0 08970 1714 2,4-dienoil-CoA redutase dependente de CAETHG_09 CLJU_c2949 CLRAG_ NADPH, redutase de enxofre 43 0 35480 1715 glicolato oxidase 1.1.3.15 CAETHG_01 CLJU_c0591 CLRAG_ 17, 0, 25940 CAETHG_26 CLJU_c2319 88, 0, CAETHG_03 CLJU_c2035 82 0 1716 glicolato oxidase 1.1.3.15 CAETHG_02 CLJU_c2157 CLRAG_ 44 0 31160 1717 glicolato oxidase 1.1.3.15 CAETHG_34 CLJU_c1390 CLRAG_ 73 0 09940 1718 Succinil-CoA sintetase, subunidade alfa CAETHG_04 CLJU_c2367 CLRAG_ 31 0 17500 1719 proteína hipotética CAETHG_39 CLJU_c1798 CLRAG_ 07 0 00650 1720 Enzima da superfamília de radical SAM CAETHG_02 CLJU_c2200 CLRAG_ YgiQ, família UPF0313 98 0 31530 1721 Enzima da superfamília de radical SAM, CAETHG_07 CLJU_c2703 CLRAG_ família MoaA/NifB/PqqE/SkfB 86, 0, 09540 CAETHG_23 CLJU_c0197 00 0 1722 proteína não caracterizada CAETHG_12 CLJU_c3376 CLRAG_ 74 0 24520 1723 proteína hipotética CAETHG_20 CLJU_c4189 CLRAG_ 18 0 05000 1724 proteína não caracterizada de família de CAETHG_28 CLJU_c0733 CLRAG_ radical SAM 25 0 26510 1725 proteína de transporte de elétrons HydN 1.12.1.4, CAETHG_27 CLJU_c0708 CLRAG_
1.1.99.33 99 0 18930 1726 Proteína de regulação da captação de Fe2+ CAETHG_27 CLJU_c0607 CLRAG_ ou Zn2+ 06 0 07340 1727 proteína de ligação ao ATP do sistema de CAETHG_26 CLJU_c0584 CLRAG_ transporte do complexo de ferro 79 0 07080 1728 proteína de ligação ao substrato do sistema CAETHG_26 CLJU_c0582 CLRAG_ de transporte do complexo de ferro 77 0 07060 1729 proteína permease de sistema de transporte CAETHG_26 CLJU_c0583 CLRAG_ de complexo de ferro 78 0 07070 1730 Proteínas não caracterizadas que contêm CAETHG_16 CLJU_c3753 CLRAG_ agrupamentos 2Fe-2 e 4Fe-4S contêm o 06 0 36940 domínio DUF4445 1731 bacterioferritina CAETHG_00 CLJU_c1970 CLRAG_ 47 0 39440 1732 proteína B de transporte de ferro ferroso CAETHG_02 CLJU_c2166 CLRAG_ 53 0 31250 1733 proteína A de transporte de ferro ferroso CAETHG_02 CLJU_c2165 CLRAG_ 52 0 31240
92 / 294 1734 proteína flagelar FliO/FliZ CAETHG_31 CLJU_c1033 CLRAG_ 23 0 13040 1735 proteína de operon flagelar CAETHG_31 CLJU_c1029 CLRAG_ 19 0 13080 1736 proteína de modificação da haste do corpo CAETHG_31 CLJU_c1028 CLRAG_ basilar flagelar FlgD 18 0 13090 1737 proteína de gancho flagelar FlgE CAETHG_31 CLJU_c1030 CLRAG_ 20 0 13070 1738 proteína de controle de comprimento de CAETHG_31 CLJU_c1027 CLRAG_ gancho flagelar FliK 17 0 13100 1739 proteína de quimiotaxia MotB CAETHG_22 CLJU_c0146 CLRAG_ 52 0 27120 1740 proteína comutadora de motor flagelar CAETHG_30 CLJU_c0948 CLRAG_ FliN/FliY 43 0 13620 1741 proteína de freio flagelar YcgR de ligação a CAETHG_31 CLJU_c1040 CLRAG_ c-di-GMP, contém os domínios PilZNR e 30 0 12970 PilZ 1742 proteína flagelar FlbD CAETHG_31 CLJU_c1031 CLRAG_ 21 0 13060 1743 proteína de biossíntese flagelar FlhG CAETHG_31 CLJU_c1039 CLRAG_ 29 0 12980 1744 Família NADH-FMN oxidorredutase RutF, CAETHG_00 CLJU_c1948 CLRAG_ flavina redutase (DIM6/NTAB) 25 0 39630 1745 Família NADH-FMN oxidorredutase RutF, CAETHG_14 CLJU_c3543 CLRAG_ flavina redutase (DIM6/NTAB) 51 0 05970 1746 Flavodoxina CAETHG_00 CLJU_c1957 CLRAG_ 34 0 39560 1747 Flavodoxina multimérica WrbA CAETHG_05 CLJU_c2478 CLRAG_ 43 0 18010 1748 Proteína contendo domínio da flavodoxina CAETHG_13 CLJU_c3489 CLRAG_ 87 0 26130 1749 Flavodoxina CAETHG_38 CLJU_c1760 CLRAG_ 68 0 01140 1750 flavodoxina, cadeia curta CAETHG_34 CLJU_c1400 CLRAG_ 83 0 09330 1751 proteína hipotética CAETHG_02 CLJU_c2134 CLRAG_ 20 0 30900 1752 Flavorrubredoxina CAETHG_02 CLJU_c2194 CLRAG_ 91 0 31490 1753 proteína hipotética CAETHG_20 CLJU_c4233 CLRAG_ 57 0 05440 1754 Desidrogenase dependente de FMN, inclui CAETHG_13 CLJU_c3436 CLRAG_ L-lactato desidrogenase e isopentenil 36 0 14440 difosfato isomerase tipo II 1755 peptidil-prolil-cis-trans isomerase C CAETHG_22 CLJU_c0118 CLRAG_ 26 0 30240 1756 subunidade principal de desidrogenase do 1.2.1.43 CAETHG_00 CLJU_c2004 CLRAG_ formato 84 0 29330 1757 Proteína FdhD 1.1.99.33 CAETHG_27 CLJU_c0702 CLRAG_ 93 0 18870 1758 Regulador transcricional da família Fur, CAETHG_14 CLJU_c3555 CLRAG_ regulador da resposta ao estresse de 63 0 06080 peróxido 1759 proteína de montagem de pilus tipo IV PilB CAETHG_31 CLJU_c1090 CLRAG_ 79 0 12560 1760 proteína contendo domínio de diguanilato CAETHG_08 CLJU_c2829 CLRAG_ ciclase (GGDEF) 26 0 34370 1761 proteína contendo domínio de diguanilato CAETHG_17 CLJU_c3883 CLRAG_ ciclase (GGDEF) 31 0 21090
93 / 294 1762 manose-1-fosfato guanililtransferase CAETHG_07 CLJU_c2654 CLRAG_ 35 0 08420 1763 glutamina amidotransferase putativa CAETHG_15 CLJU_c3694 CLRAG_ 55 0 36470 1764 glutamina amidotransferase putativa CAETHG_19 CLJU_c4068 CLRAG_ 11 0 22870 1765 proteína não caracterizada CAETHG_00 CLJU_c1990 CLRAG_ 70 0 39180 1766 proteína H do sistema de clivagem da 1.8.1.4, CAETHG_04 CLJU_c3754 CLRAG_ glicina 2.1.2.10 75, 0, 24840 CAETHG_16 CLJU_c2417 07 0 1767 UDP: flavonoide glicosiltransferase YjiC, CAETHG_34 CLJU_c1409 CLRAG_ família YdhE 90 0 09440 1768 Glicosil hidrolase prevista, família CAETHG_26 CLJU_c0588 CLRAG_ GH43/DUF377 83 0 07120 1769 1,2-diacilglicerol-3-alfa-glicose alfa-1,2- CAETHG_00 CLJU_c1967 CLRAG_ galactosiltransferase 44 0 39470 1770 proteína hipotética CAETHG_02 CLJU_c1228 CLRAG_ 23, 0, 30930 CAETHG_33 CLJU_c2137 10 0 1771 Glicosiltransferase envolvida na bissíntese CAETHG_07 CLJU_c2655 CLRAG_ da parede celular 36 0 08430 1772 UDP: flavonoide glicosiltransferase YjiC, CAETHG_09 CLJU_c2931 CLRAG_ família YdhE 24 0 35320 1773 Família de glicosil transferase 2 CAETHG_12 CLJU_c3352 CLRAG_ 51 0 24760 1774 Glicosiltransferase envolvida na bissíntese 2.4.1.52 CAETHG_13 CLJU_c3405 CLRAG_ da parede celular 03 0 14200 1775 Glicosiltransferase, subunidade catalítica de CAETHG_13 CLJU_c3415 CLRAG_ celulose sintase e poli-beta-1,6-N- 13 0 14300 acetilglucosamina sintase 1776 Glicosiltransferase envolvida na bissíntese CAETHG_13 CLJU_c3416 CLRAG_ da parede celular 14 0 14310 1777 Glicosiltransferase envolvida na bissíntese CAETHG_13 CLJU_c3417 CLRAG_ da parede celular 15 0 14320 1778 dolicol-fosfato manosiltransferase CAETHG_17 CLJU_c3889 CLRAG_ 37, 0, 37810 CAETHG_25 CLJU_c0445 17 0 1779 Glicosiltransferase envolvida na bissíntese CAETHG_23 CLJU_c0199 CLRAG_ da parede celular 02 0 27590 1780 Glicosiltransferase envolvida na bissíntese CAETHG_23 CLJU_c0204 CLRAG_ da parede celular 09 0 27640 1781 Proteína doliquil-fosfato-manose CAETHG_25 CLJU_c0447 CLRAG_ manosiltransferase 19 0 37830 1782 Glicosiltransferase envolvida na bissíntese CAETHG_25 CLJU_c0455 CLRAG_ da parede celular 27 0 37910 1783 biossíntese de exopolissacarídeos poliprenil CAETHG_25 CLJU_c0541 CLRAG_ glicosilfosfotransferase 98, 0, 38600 CAETHG_26 CLJU_c0521 22 0 1784 ramnosiltransferase CAETHG_26 CLJU_c0542 CLRAG_ 23 0 38880 1785 Grupo 1 de glicosil transferases CAETHG_26 CLJU_c0543 CLRAG_ 25 0 38890 1786 4-amino-4-desoxi-L-arabinose transferase CAETHG_37 CLJU_c1614 CLRAG_ 09 0 33110
94 / 294 1787 Catecol 2,3-dioxigenase CAETHG_00 CLJU_c1985 CLRAG_ 65 0 39230 1788 Regulador transcricional de ligação ao CAETHG_00 CLJU_c1988 CLRAG_ DNA, família GntR 68 0 39200 1789 GTP pirofosfoquinase putativa 2.7.6.5 CAETHG_23 CLJU_c0274 CLRAG_ 76 0 28340 1790 Proteína de ligação a GTP HflX CAETHG_12 CLJU_c3391 CLRAG_ 89 0 14060 1791 Proteína de ligação ao GTP CAETHG_14 CLJU_c3561 CLRAG_ 69 0 06140 1792 proteína hipotética CAETHG_31 CLJU_c1052 CLRAG_ 42 0 12820 1793 Proteína de ligação ao GTP CAETHG_33 CLJU_c1247 CLRAG_1 29 0 1330 1794 biogênese do ribossomo GTPase A CAETHG_33 CLJU_c1295 CLRAG_ 77 0 10850 1795 Proteína de ligação a GTP LepA CAETHG_28 CLJU_c0794 CLRAG_ 87 0 25420 1796 biogênese do ribossomo GTPase CAETHG_33 CLJU_c1263 CLRAG_1 45 0 1170 1797 Proteína contendo domínio HDIG CAETHG_16 CLJU_c3812 CLRAG_ 38 0 37500 1798 Proteína contendo domínio HD CAETHG_22 CLJU_c0104 CLRAG_ 15 0 30360 1799 Domínio HD-GYP, fosfodiesterase c-di- CAETHG_27 CLJU_c0609 CLRAG_ GMP classe II (ou sua variante inativada) 08 0 07370 1800 3'-5' exoribonuclease CAETHG_17 CLJU_c3902 CLRAG_ 50 0 21200 1801 chaperona molecular GrpE CAETHG_28 CLJU_c0797 CLRAG_ 90 0 25450 1802 transportador de arsenita, família ACR3 CAETHG_36 CLJU_c1567 CLRAG_ 66 0 32730 1803 proteína de ligação de íons de cobre CAETHG_05 CLJU_c2489 CLRAG_ 56 0 17890 1804 DNA helicase-2/DNA dependente de ATP CAETHG_02 CLJU_c2195 CLRAG_ helicase PcrA 92 0 31500 1805 DNA helicase-2/DNA dependente de ATP CAETHG_08 CLJU_c2840 CLRAG_ helicase PcrA 38 0 34480 1806 Superfamília II DNA ou RNA helicase, CAETHG_35 CLJU_c1466 CLRAG_ família SNF2 65 0 20540 1807 Proteína de ligação prevista heme/esteroide CAETHG_08 CLJU_c2864 CLRAG_ 59 0 34720 1808 proteína da família de tríade histidina (HIT) 3.6.1.17 CAETHG_28 CLJU_c0803 CLRAG_ 97 0 08330 1809 junção resolvase holliday putativa 4.1.2.4 CAETHG_32 CLJU_c1217 CLRAG_1 99 0 1630 1810 hidroxilamina redutase 1.7.99.1 CAETHG_08 CLJU_c2726 CLRAG_ 12 0 08960 1811 Proteína de germinação de esporos YaaH CAETHG_00 CLJU_c1876 CLRAG_ 66, 0, 39220 CAETHG_39 CLJU_c1986 96 0 1812 Amido-hidrolase prevista CAETHG_02 CLJU_c2139 CLRAG_ 25 0 30950 1813 proteína hipotética CAETHG_05 CLJU_c2492 CLRAG_ 59 0 17860 1814 Proteína do metabolismo do L-ascorbato CAETHG_06 CLJU_c2620 CLRAG_ UlaG, superfamília beta-lactamase 96 0 04280 1815 ADP-ribose pirofosfatase 3.6.1.13 CAETHG_11 CLJU_c3205 CLRAG_ 33 0 02680
95 / 294 1816 Hidrolase dependente de metal, CAETHG_12 CLJU_c3385 CLRAG_ superfamília beta-lactamase II 83 0 24430 1817 proteína hipotética CAETHG_16 CLJU_c3827 CLRAG_ 84 0 20740 1818 superfamília haloácido desalogenase, CAETHG_20 CLJU_c4186 CLRAG_ subfamília IA, variante 3 com terceiro 15 0 04970 motivo com DD ou ED/superfamília haloácido desalogenase, subfamília IA, variante 1 com terceiro motivo tendo Dx(3- 4)D ou Dx(3-4)E 1819 proteína hipotética CAETHG_21 CLJU_c0065 CLRAG_ 83 0 19930 1820 endoglucanase CAETHG_22 CLJU_c0109 CLRAG_ 20 0 30310 1821 endoglucanase CAETHG_22 CLJU_c0110 CLRAG_ 21 0 30300 1822 endoglucanase CAETHG_22 CLJU_c0111 CLRAG_ 22 0 30290 1823 Proteína do metabolismo do L-ascorbato CAETHG_22 CLJU_c0187 CLRAG_ UlaG, superfamília beta-lactamase 90 0 27470 1824 Superfamília II da glioxilase beta-lactamase CAETHG_26 CLJU_c0564 CLRAG_ 56 0 06860 1825 suposta hidrolase de superfamília em HD CAETHG_28 CLJU_c0741 CLRAG_ do metabolismo de NAD 33 0 26430 1826 hidrolase CAETHG_29 CLJU_c0852 CLRAG_ 46 0 07970 1827 proteína hipotética CAETHG_32 CLJU_c1146 CLRAG_1 37 0 1990 1828 proteína hipotética CAETHG_32 CLJU_c1151 CLRAG_1 42 0 1940 1829 8-oxo-dGTP pirofosfatase MutT, família CAETHG_34 CLJU_c1342 CLRAG_ NUDIX 26 0 10370 1830 hidrolase putativa da superfamília HAD CAETHG_38 CLJU_c1703 CLRAG_ 15 0 33910 1831 proteína hipotética CAETHG_38 CLJU_c1781 CLRAG_ 89 0 00900 1832 Lisofosfolipase L1 CAETHG_39 CLJU_c1837 CLRAG_ 44 0 00300 1833 hidroxilamina redutase 1.7.99.1 CAETHG_28 CLJU_c0773 CLRAG_ 66 0 25270 1834 Permease da superfamília do transportador CAETHG_39 CLJU_c1859 CLRAG_ de fármacos/metabólitos (DMT) 66 0 00110 1835 Proteína da família da integrase do fago CAETHG_07 CLJU_c2702 CLRAG_ 85 0 09550 1836 integrase/recombinase XerD CAETHG_32 CLJU_c1126 CLRAG_ 17 0 12190 1837 Proteína da família DJ-1/PfpI CAETHG_38 CLJU_c1759 CLRAG_ 67 0 01150 1838 canal de potássio com tensão controlada CAETHG_26 CLJU_c0589 CLRAG_ 84 0 07130 1839 Subunidade grande de apenas hidrogenase CAETHG_01 CLJU_c2029 CLRAG_ de ferro, domínio C-terminal 10 0 26000 1840 Álcool desidrogenase, classe IV 1.1.1.1, CAETHG_24 CLJU_c0383 CLRAG_
1.1.1.72, 45 0 28900
1.1.1.21,
1.1.1.2 1841 Proteína contendo domínio de di- CAETHG_40 CLJU_c1921 CLRAG_ agrupamento 4Fe-4S 56 0 39860 1842 Flavodoxina multimérica WrbA CAETHG_10 CLJU_c3078 CLRAG_ 82 0 16220
96 / 294 1843 FMN redutase dependente de NADPH CAETHG_36 CLJU_c1605 CLRAG_ 99 0 33020 1844 2-desidro-3-desoxifosfogluconato 4.1.2.14, CAETHG_34 CLJU_c1361 CLRAG_ aldolase/(4S)-4-hidroxi-2-oxoglutarato 4.1.3.16, 43 0 10260 aldolase 4.1.1.3 1845 quinase lipídica, família CAETHG_24 CLJU_c0294 CLRAG_ YegS/Rv2252/BmrU 09 0 28540 1846 proteína hipotética CAETHG_33 CLJU_c1269 CLRAG_1 50 0 1120 1847 permease de lactato CAETHG_02 CLJU_c2161 CLRAG_ 48 0 31200 1848 carboxamptidase de muramoliltetrapeptídeo CAETHG_22 CLJU_c0135 CLRAG_ 41 0 27010 1849 acetil esterase CAETHG_12 CLJU_c3357 CLRAG_ 56 0 24710 1850 proteína hipotética CAETHG_39 CLJU_c1803 CLRAG_ 12 0 00610 1851 proteína lipoato-ligase A 2.7.7.63 CAETHG_30 CLJU_c0921 CLRAG_ 15 0 13820 1852 proteína lipoato-ligase A 2.7.7.63 CAETHG_12 CLJU_c3322 CLRAG_ 21 0 15040 1853 UDP-4-amino-4,6-didesoxi-N-acetil-beta- CAETHG_26 CLJU_c0549 CLRAG_ L-altrosamina transaminase 31 0 38950 1854 Família de exportadores de L-lisina, CAETHG_18 CLJU_c3992 CLRAG_ proteína LysE/ArgO 38 0 22170 1855 Lisofosfolipase L1 CAETHG_29 CLJU_c0853 CLRAG_ 47 0 07960 1856 proteína reguladora de hélice-volta-hélice, CAETHG_10 CLJU_c3042 CLRAG_ família lysR 47 0 15930 1857 Regulador transcricional de ligação ao CAETHG_12 CLJU_c3312 CLRAG_ DNA, família LysR 10 0 15200 1858 Regulador transcricional de ligação ao CAETHG_20 CLJU_c4207 CLRAG_ DNA, família LysR 37 0, 05180 CLJU_c2774 0 1859 Regulador transcricional de ligação ao CAETHG_20 CLJU_c4244 CLRAG_ DNA, família LysR 69, 0, 01010 CAETHG_38 CLJU_c1772 80 0 1860 Regulador transcricional de ligação ao CAETHG_20 CLJU_c4263 CLRAG_ DNA, família LysR 89 0 05650 1861 Regulador transcricional de ligação ao CAETHG_38 CLJU_c1756 CLRAG_ DNA, família LysR 64 0 01180 1862 transglicosilase solúvel de mureína lítica CAETHG_12 CLJU_c3359 CLRAG_ 57 0 24690 1863 proteína de formação de septo CAETHG_28 CLJU_c0720 CLRAG_ 12 0 26640 1864 transportador de magnésio CAETHG_02 CLJU_c2189 CLRAG_ 85 0 31430 1865 Proteína contendo domínio barril da PRC CAETHG_24 CLJU_c0297 CLRAG_ 12 0 28580 1866 o-succinilbenzoato sintase CAETHG_37 CLJU_c1641 CLRAG_ 35 0 33210 1867 proteína de transporte de manganês CAETHG_13 CLJU_c3434 CLRAG_ 34, 0, 06350 CAETHG_14 CLJU_c3585 92 0 1868 Regulador transcricional de ligação ao CAETHG_03 CLJU_c2329 CLRAG_ DNA, família MarR 93 0 01440
97 / 294 1869 Regulador transcricional de ligação ao CAETHG_06 CLJU_c2551 CLRAG_ DNA, família MarR 20 0 03720 1870 Regulador transcricional de ligação ao CAETHG_17 CLJU_c3900 CLRAG_ DNA, família MarR 48 0 21180 1871 Proteína da família MarR CAETHG_25 CLJU_c0436 CLRAG_ 04 0 37690 1872 Regulador transcricional de ligação ao CAETHG_35 CLJU_c1748 CLRAG_ DNA, família MarR 72, 0, 20460 CAETHG_38 CLJU_c1473 61 0 1873 Regulador transcricional da família MarR, CAETHG_36 CLJU_c1542 CLRAG_ 2-MHQ e repressor de regulador com 43 0 24050 resistência a catecol 1874 canal mecanossensível de pequena CAETHG_21 CLJU_c4281 CLRAG_ condutância 07 0 25620 1875 Proteína de ligação ao GTP CAETHG_33 CLJU_c1222 CLRAG_1 04 0 1580 1876 Insertase de proteínas da membrana da CAETHG_21 CLJU_c4294 CLRAG_ família YidC/Oxa1 20 0 25750 1877 Proteína contendo domínio de ligação 4Fe- CAETHG_38 CLJU_c1747 CLRAG_ 4S 60 0 01230 1878 lipoproteína da biossíntese da tiamina CAETHG_20 CLJU_c4240 CLRAG_ 65 0 05540 1879 regulador da protease sigma E CAETHG_33 CLJU_c1309 CLRAG_ 92 0 10700 1880 proteína hipotética CAETHG_29 CLJU_c0807 CLRAG_ 02 0 08280 1881 protease romboide GluP CAETHG_27 CLJU_c0610 CLRAG_ 09 0 07380 1882 Proteína de membrana não caracterizada CAETHG_30 CLJU_c1002 CLRAG_ YvbJ 93 0 13340 1883 Proteína de secreção da família HlyD CAETHG_39 CLJU_c1808 CLRAG_ 17 0 00570 1884 proteína reguladora, família luxR CAETHG_38 CLJU_c1746 CLRAG_ 59 0 01240 1885 proteína hipotética CAETHG_04 CLJU_c2427 CLRAG_ 85 0 24940 1886 Hidrolase putativa associada à membrana CAETHG_03 CLJU_c2290 CLRAG_ interna ligada à LexA 52 0 01890 1887 Proteína da superfamília do tipo CAETHG_14 CLJU_c3539 CLRAG_ transglutaminase 47 0 05930 1888 proteína contendo domínio de diguanilato CAETHG_15 CLJU_c3605 CLRAG_ ciclase (GGDEF) 14 0 06540 1889 proteína de ligação ao ATP para sistema de CAETHG_11 CLJU_c3179 CLRAG_ transporte de zinco 08 0 02420 1890 proteína de permease do sistema de CAETHG_11 CLJU_c3180 CLRAG_ transporte de zinco 09 0 02430 1891 Fosforibosil 1,2-fosfodiesterase cíclica CAETHG_20 CLJU_c4199 CLRAG_ 28 0 05100 1892 CTP: molibdopterina citidililtransferase CAETHG_04 CLJU_c2399 CLRAG_ MocA 65 0 17170 1893 Proteína contendo domínio HDIG CAETHG_16 CLJU_c3817 CLRAG_ 73 0 20630 1894 Proteína contendo domínio HDIG 3.1.3.1 CAETHG_27 CLJU_c0636 CLRAG_ 31 0 30470 1895 Proteína de ligação ao substrato do sistema CAETHG_11 CLJU_c3210 CLRAG_ de transporte de D-metionina 38 0 02730 1896 Proteína permease de sistema de transporte CAETHG_25 CLJU_c0461 CLRAG_ de D-metionina 33 0 37970
98 / 294 1897 Sistema de absorção de Zn do tipo ABC ZnuABC, CAETHG_16 CLJU_c3816 CLRAG_ componente de ligação ao Zn ZnuA 72 0 20620 1898 proteína de ligação ao substrato do sistema CAETHG_03 CLJU_c3788 CLRAG_ de transporte de zinco 18 0, 31780 CLJU_c2220 0 1899 Proteínas não caracterizadas que contêm CAETHG_28 CLJU_c0753 CLRAG_ agrupamentos 2Fe-2 e 4Fe-4S contêm o 46 0 32340 domínio DUF4445 1900 7,8-di-hidropterin-6-il-metil-4- (beta-D- CAETHG_13 CLJU_c3495 CLRAG_ ribofuranosil) aminobenzeno 5'-fosfato 93 0 26190 sintase 1901 ribonuclease J CAETHG_33 CLJU_c1220 CLRAG_1 02 0 1600 1902 proteína hipotética CAETHG_02 CLJU_c2187 CLRAG_ 77 0 31410 1903 Exonuclease de processamento de RNA, CAETHG_11 CLJU_c3215 CLRAG_ dobra de beta-lactamase, família Cft2 43 0 02780 1904 Rubreritrina CAETHG_03 CLJU_c2204 CLRAG_ 02 0 02720 1905 proteína quimiotaxia que aceita metila CAETHG_03 CLJU_c2291 CLRAG_ 53, 0, 01880 CAETHG_15 CLJU_c3620 31 0 1906 Proteína que contém o domínio do sensor CAETHG_09 CLJU_c2927 CLRAG_ de ligação ao ligante 20, 0, 35280 CAETHG_28 CLJU_c0711 02 0 1907 proteína quimiotaxia que aceita metila CAETHG_10 CLJU_c3056 CLRAG_ 62 0 15980 1908 proteína quimiotaxia que aceita metila CAETHG_12 CLJU_c3349 CLRAG_ 48 0 24790 1909 proteína quimiotaxia que aceita metila CAETHG_24 CLJU_c1481 CLRAG_ 54, 0, 29030 CAETHG_35 CLJU_c0392 81 0 1910 proteína quimiotaxia que aceita metila CAETHG_24 CLJU_c0395 CLRAG_ 57 0 29060 1911 proteína quimiotaxia que aceita metila CAETHG_25 CLJU_c0477 CLRAG_ 49 0 38150 1912 transdutor sensorial de quimiotaxia que CAETHG_27 CLJU_c0603 CLRAG_ aceita metila com sensor de cache 01 0 07260 1913 Proteína contendo domínio de sinalização CAETHG_07 CLJU_c2669 CLRAG_ de proteína quimiotaxe que aceita metila 50 0 08560 (MCP) 1914 Proteína contendo domínio de sinalização CAETHG_20 CLJU_c4264 CLRAG_ de proteína quimiotaxe que aceita metila 90 0 05660 (MCP) 1915 proteína quimiotaxia que aceita metila CAETHG_29 CLJU_c0896 CLRAG_ 90 0 07540 1916 proteína quimiotaxia que aceita metila CAETHG_04 CLJU_c2434 CLRAG_ 93 0 25020 1917 Proteína contendo domínio de sinalização CAETHG_05 CLJU_c3714 CLRAG_ de proteína quimiotaxe que aceita metila 04, 0, 30130 (MCP) CAETHG_39 CLJU_c1850 57 0, CLJU_c2444 0
99 / 294 1918 Proteína contendo domínio de sinalização CAETHG_15 CLJU_c0419 CLRAG_ de proteína quimiotaxe que aceita metila 69, 0 26870 (MCP) CAETHG_24 87 1919 proteína quimiotaxia que aceita metila CAETHG_34 CLJU_c1386 CLRAG_ 69 0 09980 1920 Proteína contendo domínio de CAETHG_05 CLJU_c2454 CLRAG_ metiltransferase 15 0 23640 1921 Proteína contendo domínio de CAETHG_05 CLJU_c2460 CLRAG_ metiltransferase 23 0 18280 1922 Biossíntese de ubiquinona/menaquinona C- CAETHG_05 CLJU_c2525 CLRAG_ metilase UbiE 93 0 03600 1923 tRNA1 (Val) A37 N6-metilase TrmN6 CAETHG_22 CLJU_c0147 CLRAG_ 53 0 27130 1924 putativa DNA metilase específica de N6- CAETHG_24 CLJU_c0406 CLRAG_ adenina 69 0 29170 1925 N-6 DNA Metilase CAETHG_29 CLJU_c0846 CLRAG_ 39 0 08000 1926 [proteína corrinoide específica do metil-Co CAETHG_01 CLJU_c2106 CLRAG_ (III) metanol]: coenzima M metiltransferase 91, 0, 30640 CAETHG_40 CLJU_c1912 46 0 1927 transportador de resistência a fármacos, CAETHG_07 CLJU_c2662 CLRAG_ subfamília EmrB/QacA 43 0 08490 1928 transportador de resistência a fármacos, CAETHG_09 CLJU_c2945 CLRAG_ subfamília EmrB/QacA 39 0 35440 1929 Efetor de secreção transmembranar CAETHG_10 CLJU_c0265 CLRAG_ 57, 0, 15940 CAETHG_23 CLJU_c3052 66 0 1930 Proteína da Superfamília do Facilitador CAETHG_10 CLJU_c3076 CLRAG_ Principal 80 0 16200 1931 Fosfato permease de açúcar CAETHG_34 CLJU_c1362 CLRAG_ 44 0 10250 1932 Proteína da família TatD DNase CAETHG_29 CLJU_c0878 CLRAG_ 72 0 07710 1933 transportador de magnésio CAETHG_22 CLJU_c0136 CLRAG_ 42 0 27020 1934 proteína de microcompartimento PduB CAETHG_03 CLJU_c2279 CLRAG_ 41, 0, 02000 CAETHG_32 CLJU_c1187 78 0 1935 Proteína contendo domínio BMC CAETHG_18 CLJU_c3970 CLRAG_ 16, 0, 21950 CAETHG_32 CLJU_c1199 90 0 1936 Proteína contendo domínio BMC CAETHG_18 CLJU_c3971 CLRAG_ 17, 0, 21960 CAETHG_32 CLJU_c1198 89 0 1937 proteína de utilização de etanolamina EutS CAETHG_39 CLJU_c1793 CLRAG_ 01 0 00700 1938 Proteína contendo domínio BMC CAETHG_18 CLJU_c3974 CLRAG_ 20, 0, 21990 CAETHG_32 CLJU_c1195 86 0 1939 Proteína de microcompartimento de CAETHG_18 CLJU_c3976 CLRAG_ utilização de casca carboxissomos e 22 0 22010 etanolamina CcmL/EutN
100 / 294 1940 Proteína contendo domínio BMC CAETHG_18 CLJU_c3979 CLRAG_ 25, 0, 22040 CAETHG_32 CLJU_c1192 83 0 1941 Proteína contendo domínio BMC CAETHG_18 CLJU_c3985 CLRAG_ 31 0 22100 1942 Proteína contendo domínio BMC CAETHG_18 CLJU_c3986 CLRAG_ 32 0 22110 1943 proteína de utilização de etanolamina EutN CAETHG_28 CLJU_c0710 CLRAG_ 01 0 18950 1944 fator de liberação glutamina CAETHG_23 CLJU_c0225 CLRAG_ metiltransferase 30 0 27850 1945 chaperona molecular DnaK CAETHG_28 CLJU_c0798 CLRAG_ 91 0 25460 1946 proteína de ligação ao ATP de sistema de CAETHG_03 CLJU_c2215 CLRAG_ transporte de molibdato 13 0 31730 1947 proteína permease de sistema de transporte CAETHG_03 CLJU_c2216 CLRAG_ de molibdato 14 0 31740 1948 proteína de ligação ao substrato de sistema CAETHG_03 CLJU_c2217 CLRAG_ de transporte de molibdato 15 0 31750 1949 proteína de biossíntese da molibdopterina CAETHG_25 CLJU_c0489 CLRAG_ 66 0 38280 1950 proteína de biossíntese da molibdopterina CAETHG_38 CLJU_c1711 CLRAG_ 23 0 33980 1951 subunidade cíclica da monofosfato sintase CAETHG_12 CLJU_c3338 CLRAG_ da piranopterina MoaA 38 0 14870 1952 piranopterina fosfato sintase cíclica CAETHG_05 CLJU_c2505 CLRAG_ 73 0 17730 1953 fator acessório da xantina desidrogenase CAETHG_04 CLJU_c2407 CLRAG_ 66 0, 17160 CLJU_c2400 0 1954 proteína contendo domínio de ligação CAETHG_03 CLJU_c2214 CLRAG_ molibdênio-pterina 12 0 31720 1955 proteína contendo domínio de síntese do CAETHG_39 CLJU_c1795 CLRAG_ cofator de molibdênio 04 0 00680 1956 Desidrogenase anaeróbica que contém CAETHG_36 CLJU_c1554 CLRAG_ selenocisteína 53 0 32620 1957 Proteína que contém o domínio repressor CAETHG_04 CLJU_c2392 CLRAG_ de transporte de molibdato ModE 58 0 17240 1958 tRNA A37 treonilcarbamoiladenosina CAETHG_02 CLJU_c2140 CLRAG_ desidratase 26 0 30960 1959 Cassete de ligação ATP, subfamília B CAETHG_29 CLJU_c0891 CLRAG_ 86 0 07570 1960 Cassete de ligação ATP, subfamília B CAETHG_29 CLJU_c0892 CLRAG_ 87 0 07560 1961 Carboxipeptidase de membrana (proteína CAETHG_36 CLJU_c1591 CLRAG_ de ligação à penicilina) 92 0 32960 1962 N-acetilmuramoil-L-alanina amidase CAETHG_22 CLJU_c0188 CLRAG_ 91 0 27480 1963 proteína de ligação ao ATP para sistema de CAETHG_36 CLJU_c1508 CLRAG_ transporte de sódio 10 0 24290 1964 proteína permease de sistema de transporte CAETHG_36 CLJU_c1507 CLRAG_ de sódio 09 0 24300 1965 proteína de efluxo putativa, família MATE CAETHG_18 CLJU_c4012 CLRAG_ 61 0 22350 1966 proteína de efluxo putativa, família MATE CAETHG_29 CLJU_c0845 CLRAG_ 38 0 08010
101 / 294 1967 proteína de efluxo putativa, família MATE CAETHG_35 CLJU_c1419 CLRAG_ 00, 0, 09520 CAETHG_37 CLJU_c1626 20 0 1968 proteína de efluxo putativa, família MATE CAETHG_36 CLJU_c1523 CLRAG_ 25 0 24120 1969 Simporte de Na+/H+-dicarboxilato CAETHG_24 CLJU_c0431 CLRAG_ 99 0 26750 1970 soluto: Simporte de Na+, família SSS CAETHG_01 CLJU_c2053 CLRAG_ 35 0 19470 1971 proteína hipotética CAETHG_04 CLJU_c2346 CLRAG_ 10 0 17650 1972 Nitrorredutase CAETHG_00 CLJU_c2000 CLRAG_ 80 0 39010 1973 Nitrorredutase CAETHG_36 CLJU_c1537 CLRAG_ 39 0 24090 1974 2,4-dienoil-CoA redutase CAETHG_04 CLJU_c2424 CLRAG_ 82 0 24910 1975 2,4-dienoil-CoA redutase CAETHG_02 CLJU_c2119 CLRAG_ 05 0 30770 1976 2,4-dienoil-CoA redutase CAETHG_36 CLJU_c1499 CLRAG_ 03 0 24360 1977 proteína hipotética , 1.1.1.2, CAETHG_05 CLJU_c3995 CLRAG_
1.1.1.1, 55, 0, 17900
1.1.1.72, CAETHG_39 CLJU_c1847
1.1.1.21, 54, 0,
1.1.1.4 CAETHG_18 CLJU_c2488 41 0 1978 FMN redutase dependente de NADPH CAETHG_07 CLJU_c2635 CLRAG_ 16 0 04440 1979 proteína do centro de metal dinuclear, CAETHG_29 CLJU_c0825 CLRAG_ família YbgI/SA1388 20 0 08140 1980 protease de maturação da hidrogenase CAETHG_08 CLJU_c2865 CLRAG_ 60 0 34730 1981 Sistema de transporte de CAETHG_29 CLJU_c0880 CLRAG_ nitrato/sulfonato/bicarbonato do tipo ABC, 75 0 07690 proteína de ligação ao substrato 1982 Nitrorredutase CAETHG_14 CLJU_c3500 CLRAG_ 09 0 26270 1983 Nitrorredutase CAETHG_14 CLJU_c3524 CLRAG_ 32 0 05750 1984 Nitrorredutase CAETHG_15 CLJU_c3621 CLRAG_ 32 0 23980 1985 Nitrorredutase CAETHG_39 CLJU_c1800 CLRAG_ 09 0 00630 1986 exonuclease SbcC CAETHG_01 CLJU_c2032 CLRAG_ 13 0 25970 1987 proteína hipotética CAETHG_04 CLJU_c2362 CLRAG_ 26 0 17550 1988 proteína hipotética CAETHG_27 CLJU_c0690 CLRAG_ 80 0 18730 1989 transportador putativo de CAETHG_40 CLJU_c1922 CLRAG_ hidroximetilpirimidina CytX 57 0 39850 1990 Epimerase de nucleosídeo-difosfato-açúcar 5.1.3.7, CAETHG_30 CLJU_c1000 CLRAG_
5.1.3.2 91 0 13350 1991 Particionamento cromossômico ATPase, CAETHG_16 CLJU_c0181 CLRAG_ família Mrp, contém agrupamento Fe-S 25, 0, 37200 CAETHG_22 CLJU_c3778 84 0
102 / 294 1992 fosfatidato citidililtransferase 2.7.7.41 CAETHG_33 CLJU_c1307 CLRAG_ 90 0 10720 1993 Família ADP-ribose pirofosfatase YjhB, CAETHG_05 CLJU_c2461 CLRAG_ NUDIX 25 0 18320 1994 dATP pirofosfo-hidrolase CAETHG_05 CLJU_c2463 CLRAG_ 27 0 29990 1995 Família ADP-ribose pirofosfatase YjhB, CAETHG_36 CLJU_c1502 CLRAG_ NUDIX 06 0 24330 1996 Proteína contendo domínio NUDIX CAETHG_38 CLJU_c1764 CLRAG_ 72 0 01100 1997 O-metiltransferase prevista YrrM CAETHG_33 CLJU_c1223 CLRAG_1 05 0 1570 1998 Proteína de ligação ao GTP CAETHG_28 CLJU_c0739 CLRAG_ 31 0 26450 1999 carbamoil-transferase atada YgeW CAETHG_04 CLJU_c2384 CLRAG_ 49 0 17330 2000 Proteína relacionada a OsmC não CAETHG_00 CLJU_c1927 CLRAG_ caracterizada 03 0 39790 2001 sistema de dois componentes, família CAETHG_17 CLJU_c3952 CLRAG_ OmpR, sensor histidina cinase KdpD 97 0 21720 2002 Oxidorredutase prevista da família CAETHG_10 CLJU_c3054 CLRAG_ aldo/ceto redutase 59 0 15970 2003 Nitrorredutase CAETHG_11 CLJU_c3218 CLRAG_ 46 0 02810 2004 Glicina/D-aminoácido oxidase CAETHG_12 CLJU_c3356 CLRAG_ (desaminação) 55 0 24720 2005 subunidade alfa da sarcosina oxidase 1.5.3.1 CAETHG_15 CLJU_c3747 CLRAG_ 99 0 36880 2006 treonilcarbamoiladenosina tRNA CAETHG_28 CLJU_c0802 CLRAG_ metiltiotransferase MtaB 96 0 08340 2007 Cadeia beta de glutamato sintase CAETHG_29 CLJU_c0869 CLRAG_ dependente de NADPH 63 0 07800 2008 NAD (P) H-flavina redutase CAETHG_39 CLJU_c1858 CLRAG_ 65 0 00120 2009 selenato redutase putativa CAETHG_04 CLJU_c2383 CLRAG_ 48 0 17340 2010 monóxido de carbono desidrogenase, 1.1.1.204, CAETHG_04 CLJU_c2993 CLRAG_ subunidade pequena 1.17.1.4 55, 0, 17270 CAETHG_09 CLJU_c2389 92 0 2011 Regulador transcricional de ligação ao CAETHG_13 CLJU_c3482 CLRAG_ DNA, família PadR 80 0 26060 2012 proteína 2 de ligação à penicilina CAETHG_01 CLJU_c0725 CLRAG_ 09, 0, 26010 CAETHG_28 CLJU_c2028 17 0 2013 Regulador transcricional da família BlaI, CAETHG_17 CLJU_c3872 CLRAG_ repressor da penicilinase 21, 0, 18580 CAETHG_27 CLJU_c0678 69 0 2014 L-aminopeptidase/D-esterase CAETHG_08 CLJU_c2855 CLRAG_ 49 0 34620 2015 Protease dependente de Zn (inclui CAETHG_09 CLJU_c2968 CLRAG_ SpoIVFB) 66 0 35680 2016 proteína hipotética CAETHG_15 CLJU_c3736 CLRAG_ 92 0 36800 2017 Regulador de destino celular YaaT, CAETHG_22 CLJU_c0142 CLRAG_ superfamília PSP1 (controla esporulação, 48 0 27080 competência, desenvolvimento de biofilme)
103 / 294 2018 proteína de montagem de esporos CAETHG_23 CLJU_c0206 CLRAG_ 11 0 27660 2019 Murein DD-endopeptidase MepM e CAETHG_23 CLJU_c0248 CLRAG_ ativador de mureína hidrolase NlpD, 54 0 28090 contêm o domínio LysM 2020 proteína hipotética CAETHG_25 CLJU_c0488 CLRAG_ 65 0 38270 2021 Família Peptidase S41 CAETHG_37 CLJU_c1624 CLRAG_ 18 0 33150 2022 Família Peptidase S51 CAETHG_10 CLJU_c3070 CLRAG_ 74 0 16130 2023 proteína de ligação a substratos do sistema de transporte CAETHG_15 CLJU_c3689 CLRAG_ de peptídeo/níquel 50 0 36420 2024 Proteína de divisão celular FtsI/proteína de CAETHG_33 CLJU_c1225 CLRAG_1 ligação à penicilina 2 07 0 1550 2025 peptidoglicano glicosiltransferase CAETHG_24 CLJU_c0315 CLRAG_ 30 0 28760 2026 proteína hipotética CAETHG_00 CLJU_c1937 CLRAG_ 14 0 39720 2027 proteína hipotética CAETHG_01 CLJU_c2038 CLRAG_ 21 0 25910 2028 Proteína permease de sistema de transporte CAETHG_03 CLJU_c2293 CLRAG_ do tipo ABC-2 55 0 01860 2029 Proteína permease de sistema de transporte CAETHG_03 CLJU_c2294 CLRAG_ do tipo ABC-2 56 0 01850 2030 Transportador MFS, família NNP, CAETHG_04 CLJU_c2374 CLRAG_ transportador de nitrato/nitrito 38 0 17430 2031 transportador putativo de MFS, família CAETHG_04 CLJU_c0848 CLRAG_ AGZA, xantina/uracil permease 61, 0, 17210 CAETHG_29 CLJU_c2395 41 0 2032 Permease PerM prevista regulada por PurR CAETHG_05 CLJU_c2503 CLRAG_ 71 0 17750 2033 proteína permease putativa de sistema de CAETHG_06 CLJU_c2578 CLRAG_ transporte ABC 47 0 04010 2034 proteína hipotética CAETHG_07 CLJU_c2648 CLRAG_ 29 0 04570 2035 proteína permease putativa de sistema de CAETHG_08 CLJU_c2720 CLRAG_ transporte ABC 05 0 20030 2036 proteína permease putativa de sistema de CAETHG_10 CLJU_c3015 CLRAG_ transporte ABC 15 0 15730 2037 Permease da superfamília do transportador CAETHG_11 CLJU_c3213 CLRAG_ de fármacos/metabólitos (DMT) 41 0 02760 2038 Permease prevista de efluxo de arabinose, CAETHG_11 CLJU_c3223 CLRAG_ família MFS 51, 0, 03050 CAETHG_29 CLJU_c0816 11 0 2039 Permease de fibrose CAETHG_11 CLJU_c3283 CLRAG_ 81 0 15500 2040 proteína hipotética CAETHG_12 CLJU_c3331 CLRAG_ 30 0 14950 2041 Proteína transportadora da família ABC-2 CAETHG_15 CLJU_c3727 CLRAG_ 83 0 36710 2042 proteína permease putativa de sistema de CAETHG_17 CLJU_c3862 CLRAG_ transporte ABC 12 0 20940 2043 Transportador MFS, família DHA2, CAETHG_25 CLJU_c0468 CLRAG_ proteína de resistência à lincomicina 40 0 38060 2044 Permease prevista de efluxo de arabinose, CAETHG_25 CLJU_c0473 CLRAG_ família MFS 45 0 38110
104 / 294 2045 Permease da superfamília do transportador CAETHG_27 CLJU_c0658 CLRAG_ de fármacos/metabólitos (DMT) 48 0 18390 2046 Proteína permease de sistema de transporte CAETHG_30 CLJU_c0915 CLRAG_ do tipo ABC-2 09 0 13880 2047 Proteína permease de sistema de transporte CAETHG_30 CLJU_c0916 CLRAG_ do tipo ABC-2 10 0 13870 2048 proteína hipotética CAETHG_32 CLJU_c1180 CLRAG_1 71 0 1740 2049 Permease PerM prevista regulada por PurR CAETHG_32 CLJU_c1214 CLRAG_1 96 0 1660 2050 proteína hipotética CAETHG_34 CLJU_c1380 CLRAG_ 63 0 10040 2051 proteína permease putativa de sistema de CAETHG_35 CLJU_c1429 CLRAG_ transporte ABC 11 0 09650 2052 proteína de membrana putativa CAETHG_11 CLJU_c3207 CLRAG_ 35 0 02700 2053 proteína de membrana putativa CAETHG_11 CLJU_c3208 CLRAG_ 36 0 02710 2054 Proteína que contém o domínio N-terminal CAETHG_12 CLJU_c3333 CLRAG_ YhgE/Pip/Proteína que contém o domínio 32 0 14930 C-terminal YhgE/Pip 2055 DNA Polimerase CAETHG_22 CLJU_c0172 CLRAG_ 74 0 27320 2056 corismato mutase CAETHG_28 CLJU_c0714 CLRAG_ 06 0 26700 2057 Hexacisfosfato de inositol CAETHG_11 CLJU_c3843 CLRAG_ 37, 0, 08920 CAETHG_16 CLJU_c3209 98 0 2058 undecaprenil-difosfatase CAETHG_11 CLJU_c3224 CLRAG_ 52, 0, 03120 CAETHG_36 CLJU_c1582 91 0 2059 Proteína da superfamília PAP2 CAETHG_16 CLJU_c3826 CLRAG_ 83 0 20730 2060 fosfoglicolato fosfatase 3.2.2.16, CAETHG_24 CLJU_c0425 CLRAG_
3.2.2.9 93 0 26780 2061 undecaprenil-difosfatase CAETHG_36 CLJU_c1596 CLRAG_ 95 0 22200 2062 fosfoglicolato fosfatase 3.2.2.16, CAETHG_38 CLJU_c1778 CLRAG_
3.2.2.9 86 0 00930 2063 transportador de fosfato inorgânico, família CAETHG_33 CLJU_c1245 CLRAG_1 PiT 27 0 1350 2064 sistema de dois componentes, família CAETHG_33 CLJU_c1238 CLRAG_1 OmpR, sensor de regulador de fosfato 20 0 1420 histidina quinase PhoR 2065 ATPase tipo PhoH CAETHG_09 CLJU_c2971 CLRAG_ 69 0 35710 2066 proteína do sistema de transporte de fosfato CAETHG_33 CLJU_c1243 CLRAG_1 25 0 1370 2067 proteína fosfocarreadora CAETHG_34 CLJU_c1335 CLRAG_ 18 0 10440 2068 proteína hipotética CAETHG_15 CLJU_c3684 CLRAG_ 45 0 36370 2069 fosfoesterase, família MJ0936 CAETHG_25 CLJU_c0487 CLRAG_ 64 0 38260 2070 proteína contendo domínio RecJ da CAETHG_34 CLJU_c1317 CLRAG_ fosfoesterase 00 0 10620 2071 hidrolase putativa CAETHG_12 CLJU_c3351 CLRAG_ 50 0 24770
105 / 294 2072 Fosfoglicerato desidrogenase 1.1.1.95 CAETHG_20 CLJU_c4209 CLRAG_ 39 0 05200 2073 fosfoglicerato mutase provável 5.4.2.11 CAETHG_07 CLJU_c2632 CLRAG_ 12 0 04410 2074 3',5'-cíclico AMP fosfodiesterase CpdA CAETHG_15 CLJU_c3611 CLRAG_ 21 0 06640 2075 proteína hipotética CAETHG_23 CLJU_c0272 CLRAG_ 74 0 28320 2076 Fosforibosiltransferase prevista CAETHG_07 CLJU_c2640 CLRAG_ 21 0 04490 2077 dTDP-4-amino-4,6-didesoxigalactose CAETHG_07 CLJU_c2679 CLRAG_ transaminase 60 0 08660 2078 O-acetil-ADP-ribose-desacetilase CAETHG_26 CLJU_c0594 CLRAG_ (regulador da RNase III), contém o domínio 91 0 07170 Macro 2079 4,6-desidratase de UDP-N- CAETHG_26 CLJU_c0548 CLRAG_ acetilglucosamina (invertida) 30 0 38940 2080 ácido pseudamínico sintase 4.1.3.19, CAETHG_26 CLJU_c0551 CLRAG_
2.5.1.56 33 0 38970 2081 UDP-2,4-diacetamido-2,4,6-tridesoxi-beta- 2.7.7.43 CAETHG_26 CLJU_c0552 CLRAG_ L-altropiranose-hidrolase 34 0 38980 2082 Proteína de membrana envolvida na CAETHG_26 CLJU_c0553 CLRAG_ exportação de antígeno O e ácido teicoico 35 0 38990 2083 proteína de biossíntese de polissacarídeo de 2.7.7.38 CAETHG_26 CLJU_c0550 CLRAG_ revestimento de esporos SpsF 32 0 38960 2084 Peptidoglicano/xilano/quitina desacetilase, CAETHG_07 CLJU_c2673 CLRAG_ família PgdA/CDA1 54 0 08600 2085 Peptidoglicano/xilano/quitina desacetilase, CAETHG_08 CLJU_c3842 CLRAG_ família PgdA/CDA1 34, 0, 34450 CAETHG_16 CLJU_c2837 97 0 2086 ácido peptidoglicano-N-acetilmurâmico CAETHG_12 CLJU_c3399 CLRAG_ desacetilase 97 0 14140 2087 Peptidoglicano/xilano/quitina desacetilase, CAETHG_18 CLJU_c4016 CLRAG_ família PgdA/CDA1 64, 0, 07460 CAETHG_27 CLJU_c0618 18 0 2088 Peptidoglicano/xilano/quitina desacetilase, CAETHG_22 CLJU_c0160 CLRAG_ família PgdA/CDA1 65 0 27250 2089 Polissacarídeo desacetilase CAETHG_22 CLJU_c0161 CLRAG_ 66 0 27260 2090 subunidade translocase de pré-proteína CAETHG_19 CLJU_c4118 CLRAG_ SecE 61 0 23370 2091 protease putativa CAETHG_13 CLJU_c3439 CLRAG_ 39 0 14470 2092 proteína de modificação do tRNA CAETHG_16 CLJU_c3819 CLRAG_ treonilcarbamoil adenosina YeaZ 75 0 20650 2093 protease de processamento do terminal CAETHG_24 CLJU_c0309 CLRAG_ carboxila 24 0 28700 2094 protease de processamento do terminal CAETHG_27 CLJU_c0604 CLRAG_ carboxila 03 0 07310 2095 proteína hipotética CAETHG_27 CLJU_c0605 CLRAG_ 04 0 07320 2096 Biossíntese de 4-metil-5 (b-hidroxietil)- CAETHG_30 CLJU_c0922 CLRAG_ tiazol monofosfato 16 0 13810 2097 protease putativa CAETHG_33 CLJU_c1224 CLRAG_1 06 0 1560 2098 Protease dependente de ATP ClpP, CAETHG_34 CLJU_c1324 CLRAG_ subunidade protease 07 0 10550
106 / 294 2099 proteína hipotética CAETHG_36 CLJU_c1496 CLRAG_ 00 0 24390 2100 serpina B CAETHG_36 CLJU_c1569 CLRAG_ 77 0 32850 2101 Família Peptidase M28 CAETHG_23 CLJU_c0267 CLRAG_ 68 0 28270 2102 proteína fosfatase CAETHG_33 CLJU_c1261 CLRAG_1 43 0 1190 2103 Proteína contendo S-box do domínio PAS CAETHG_24 CLJU_c0289 CLRAG_ 04 0 28490 2104 subunidade de translocase pré-proteína CAETHG_12 CLJU_c3374 CLRAG_ SecF 72 0 24540 2105 subunidade translDase de pré-proteína CAETHG_12 CLJU_c3375 CLRAG_ SecD 73 0 24530 2106 proteína reguladora de catabolismo de CAETHG_04 CLJU_c2369 CLRAG_ purina 33 0 17480 2107 Região de ligação ao zinco da citidina e 3.5.4.1 CAETHG_09 CLJU_c2991 CLRAG_ desoxicitidilato desaminase 90 0 35910 2108 NAD+ difosfatase CAETHG_00 CLJU_c1951 CLRAG_ 28 0 39600 2109 proteína de atenuação de operon de 2.4.2.9 CAETHG_31 CLJU_c1074 CLRAG_ pirimidina/uracil fosforibosiltransferase 64 0 12600 2110 enzima de ativação do formato de piruvato- CAETHG_34 CLJU_c1367 CLRAG_ liase 49 0 10200 2111 4-hidroxi-tetra-hidrodipicolinato sintase 4.2.1.52 CAETHG_21 CLJU_c0060 CLRAG_ 78 0 19980 2112 proteína de radical SAM não caracterizada CAETHG_24 CLJU_c0296 CLRAG_ YgiQ 11 0 28570 2113 proteína de ligação ao GTP Era CAETHG_29 CLJU_c0810 CLRAG_ 05 0 08250 2114 subunidade da flavoproteína fumarato- 1.3.99.1 CAETHG_29 CLJU_c0867 CLRAG_ redutase 61 0 07820 2115 regulador transcricional, família AbrB CAETHG_22 CLJU_c0151 CLRAG_ 57 0 27170 2116 Ativador transcricional de ligação ao DNA CAETHG_02 CLJU_c2149 CLRAG_ da família SARP 35 0 31050 2117 Proteína contendo domínio hélice-giro- CAETHG_10 CLJU_c3077 CLRAG_ hélice C-terminal PucR 81 0 16210 2118 proteína reguladora CAETHG_14 CLJU_c3540 CLRAG_ 48 0 05940 2119 proteína reguladora bla blaR1 CAETHG_34 CLJU_c1348 CLRAG_ 32 0 10310 2120 proteína reguladora bla blaR1 CAETHG_40 CLJU_c1893 CLRAG_ 27 0 40040 2121 DNA recombinase sítio-específica CAETHG_14 CLJU_c3531 CLRAG_ 40, 0, 05840 CAETHG_39 CLJU_c1852 59 0 2122 Regulador de resposta de ligação ao DNA, CAETHG_00 CLJU_c1981 CLRAG_ família OmpR, contém os domínios REC e 61 0 39270 hélice alada (wHTH) 2123 proteína contendo domínio de diguanilato CAETHG_10 CLJU_c3068 CLRAG_ ciclase (GGDEF) 72 0 16100 2124 Regulador de resposta de ligação ao DNA, CAETHG_22 CLJU_c0105 CLRAG_ família OmpR, contém os domínios REC e 16 0 30350 hélice alada (wHTH) 2125 proteína de montagem pilus CpaE CAETHG_08 CLJU_c2882 CLRAG_ 78 0 34900 2126 proteína de membrana CAETHG_17 CLJU_c3932 CLRAG_ 77 0 21530
107 / 294 2127 ribonuclease G CAETHG_28 CLJU_c0735 CLRAG_ 27 0 26490 2128 ribonuclease HI CAETHG_27 CLJU_c0613 CLRAG_ 12 0 07410 2129 ribonuclease R CAETHG_17 CLJU_c3909 CLRAG_ 54 0 21240 2130 rRNA 23S pseudouridina955/2504/2580 4.2.1.70 CAETHG_38 CLJU_c1735 CLRAG_ sintase 48 0 29230 2131 Proteína ribossômica L7Ae CAETHG_33 CLJU_c1314 CLRAG_ 97 0 10650 2132 fator de reciclagem do ribossomo CAETHG_33 CLJU_c1305 CLRAG_ 88 0 10740 2133 RNA helicase DeaD dependente de ATP CAETHG_14 CLJU_c3542 CLRAG_ 50 0 05960 2134 Fator de RNA polimerase sigma-70, CAETHG_07 CLJU_c2649 CLRAG_ subfamília ECF 30 0 08370 2135 Fator de RNA polimerase sigma, família CAETHG_25 CLJU_c0520 CLRAG_ sigma-70 97 0 38590 2136 Fator de RNA polimerase sigma-70, CAETHG_27 CLJU_c0681 CLRAG_ subfamília ECF 72 0 18610 2137 Fator de RNA polimerase sigma-70, CAETHG_34 CLJU_c1357 CLRAG_ subfamília ECF 40 0 10290 2138 Fator de RNA polimerase sigma, família CAETHG_06 CLJU_c2591 CLRAG_ sigma-70 60 0 04050 2139 proteína hipotética CAETHG_19 CLJU_c4124 CLRAG_ 65 0 23430 2140 proteína associada a spoIIIJ CAETHG_21 CLJU_c4293 CLRAG_ 19 0 25740 2141 Proteína de ligação ao RNA YlmH, contém CAETHG_31 CLJU_c1068 CLRAG_ um domínio semelhante ao S4 58 0 12660 2142 Componente previsto do complexo de CAETHG_31 CLJU_c1075 CLRAG_ controle de qualidade do ribossomo 65 0 12590 (família RQC), família YloA/Tae2, contém domínios de ligação à fibronectina (FbpA) e DUF814 2143 Proteína do domínio de ligação ao RNA S1 CAETHG_19 CLJU_c4162 CLRAG_ 91 0 04750 2144 Ferredoxina que transloca Na+: NAD+ 1.16.1.4 CAETHG_18 CLJU_c3977 CLRAG_ oxidorredutase RNF, subunidade RnfC 23 0 22020 2145 proteína determinante da forma da haste CAETHG_28 CLJU_c0724 CLRAG_ MreD 16 0 26600 2146 proteína determinante da forma da haste CAETHG_28 CLJU_c0723 CLRAG_ MreC 15 0 26610 2147 proteína determinante da forma da haste CAETHG_28 CLJU_c0729 CLRAG_ RodA 21 0 26550 2148 rRNA metilase putativa CAETHG_04 CLJU_c2349 CLRAG_ 13 0 17620 2149 RNA metiltransferase, família TrmH CAETHG_13 CLJU_c3443 CLRAG_ 43 0 14510 2150 tRNA (citidina/uridina-2'-O-)- CAETHG_17 CLJU_c3919 CLRAG_ metiltransferase 64 0 21340 2151 23S rRNA (guanosina2251-2'-O)- CAETHG_19 CLJU_c4125 CLRAG_ metiltransferase 66 0 23440 2152 23S rRNA (citidina1920-2'-O)/16S rRNA CAETHG_32 CLJU_c1117 CLRAG_ (citidina1409-2'-O)-metiltransferase 06 0 12290 2153 16S rRNA (citosina967-C5)- CAETHG_33 CLJU_c1259 CLRAG_1 metiltransferase 41 0 1210 2154 Rubreritrina CAETHG_06 CLJU_c2595 CLRAG_ 64 0 04090
108 / 294 2155 Rubreritrina CAETHG_08 CLJU_c2891 CLRAG_ 87 0 34990 2156 Rubreritrina CAETHG_17 CLJU_c3934 CLRAG_ 79 0 21550 2157 Rubreritrina CAETHG_17 CLJU_c3946 CLRAG_ 91 0 21670 2158 Rubreritrina CAETHG_38 CLJU_c1701 CLRAG_ 13 0 33880 2159 16S rRNA (citosina1402-N4)- CAETHG_31 CLJU_c1054 CLRAG_ metiltransferase 44 0 12800 2160 2-poliprenil-3-metil-5-hidroxi-6-metoxi- CAETHG_13 CLJU_c3459 CLRAG_ 1,4-benzoquinol metilase 55 0 14670 2161 Proteína de choque térmico para reciclagem CAETHG_19 CLJU_c4166 CLRAG_ de subunidade ribossômica 50S, contém 95 0 04790 domínio S4 2162 Proteína contendo domínio de CAETHG_09 CLJU_c2950 CLRAG_ metiltransferase 44 0 35490 2163 trans-aconitato metiltransferase CAETHG_31 CLJU_c1084 CLRAG_ 73 0 03140 2164 Transportador de efluxo da família RND, CAETHG_03 CLJU_c2327 CLRAG_ subunidade MFP 90 0 01460 2165 Proteína de secreção da família HlyD CAETHG_25 CLJU_c0438 CLRAG_ 06, 0, 37710 CAETHG_26 CLJU_c0596 93 0 2166 Transportador de efluxo da família RND, CAETHG_24 CLJU_c0759 CLRAG_ subunidade MFP 71, 0, 29190 CAETHG_28 CLJU_c0408 52 0 2167 Proteína contendo domínio (aceitador de CAETHG_25 CLJU_c0443 CLRAG_ fosfo) His Quinase A 15 0 37790 2168 Transdução de sinal histidina quinase CAETHG_27 CLJU_c0696 CLRAG_ 86 0 18800 2169 Proteína contendo S-box do domínio PAS CAETHG_10 CLJU_c3005 CLRAG_ 04 0 15680 2170 Transdução de sinal histidina quinase CAETHG_25 CLJU_c0478 CLRAG_ 50 0 38160 2171 Proteína contendo S-box do domínio PAS CAETHG_00 CLJU_c1976 CLRAG_ 56 0 39380 2172 Proteína contendo domínio HAMP CAETHG_05 CLJU_c2509 CLRAG_ 77 0 17680 2173 Regulador de resposta de ligação ao DNA, CAETHG_08 CLJU_c2718 CLRAG_ família OmpR, contém os domínios REC e 03 0 20050 hélice alada (wHTH) 2174 Transdução de sinal histidina quinase CAETHG_10 CLJU_c3013 CLRAG_ 13 0 15710 2175 proteína contendo domínio (aceitador de CAETHG_10 CLJU_c3064 CLRAG_ fosfo) His quinase A 68 0 16070 2176 Transdução de sinal histidina quinase CAETHG_17 CLJU_c3864 CLRAG_ 14 0 20960 2177 Transdução de sinal histidina quinase CAETHG_18 CLJU_c4026 CLRAG_ 72 0 07650 2178 Proteína contendo domínio HAMP CAETHG_20 CLJU_c4175 CLRAG_ 04 0 04880 2179 Transdução de sinal histidina quinase CAETHG_22 CLJU_c0106 CLRAG_ 17 0 30340 2180 proteína contendo domínio (aceitador de CAETHG_34 CLJU_c1377 CLRAG_ fosfo) His quinase A 60 0 10070 2181 Transdução de sinal histidina quinase CAETHG_36 CLJU_c1498 CLRAG_ 02 0 24370
109 / 294 2182 Regulador de resposta de ligação ao DNA, CAETHG_20 CLJU_c4176 CLRAG_ família OmpR, contém os domínios REC e 05 0 04890 hélice alada (wHTH) 2183 proteína contendo domínio de diguanilato CAETHG_26 CLJU_c0560 CLRAG_ ciclase (GGDEF) 42 0 06730 2184 fator de especificidade topológica da CAETHG_28 CLJU_c0728 CLRAG_ divisão celular 20 0 26560 2185 proteína sítio-determinante do septo MinD CAETHG_28 CLJU_c0727 CLRAG_ 19 0 26570 2186 serina protease CAETHG_20 CLJU_c4174 CLRAG_ 03 0 04870 2187 serina protease CAETHG_29 CLJU_c0843 CLRAG_ 36 0 08030 2188 proteína serina quinase putativa, PrkA CAETHG_25 CLJU_c0435 CLRAG_ 03 0 37680 2189 Lisofosfolipase L1 CAETHG_17 CLJU_c3870 CLRAG_ 18, 0, 08050 CAETHG_29 CLJU_c0840 34 0 2190 3-hidroxiácido desidrogenase YdfG CAETHG_34 CLJU_c1416 CLRAG_ dependente de NADP 97 0 09480 2191 proteína hipotética 2.3.1.85, CAETHG_01 CLJU_c2096 CLRAG_
2.3.1.86, 80 0 19060
1.1.1.100,
1.1.1.0 2192 3-oxoacil-[proteína carreadora de acila] 2.3.1.85, CAETHG_09 CLJU_c2922 CLRAG_ redutase 2.3.1.86, 14 0 35220
1.1.1.100,
1.1.1.0 2193 proteína hipotética 2.3.1.85, CAETHG_07 CLJU_c2658 CLRAG_
2.3.1.86, 39 0 08450
1.1.1.100,
1.1.1.0 2194 Fator de RNA polimerase sigma-70, CAETHG_36 CLJU_c1570 CLRAG_ subfamília ECF 78 0 32860 2195 Fator de RNA polimerase sigma-70, CAETHG_24 CLJU_c0420 CLRAG_ subfamília ECF 88 0 26860 2196 Regulador transcricional do metabolismo CAETHG_03 CLJU_c2323 CLRAG_ da acetoína/glicerol 86, 0 01500 CAETHG_28 00 2197 proteína contendo domínio de diguanilato CAETHG_38 CLJU_c1763 CLRAG_ ciclase (GGDEF) 71 0 01110 2198 sinal peptidase II CAETHG_31 CLJU_c1071 CLRAG_ 61 0 12630 2199 sistema de dois componentes, família de CAETHG_10 CLJU_c3004 CLRAG_ quimiotaxia, regulador de resposta CheY 03 0 15670 2200 sistema de dois componentes, família de CAETHG_34 CLJU_c1345 CLRAG_ quimiotaxia, regulador de resposta CheY 29 0 10340 2201 Transdução de sinal histidina quinase CAETHG_00 CLJU_c1946 CLRAG_ 23 0 39650 2202 Transdução de sinal histidina quinase CAETHG_00 CLJU_c1963 CLRAG_ 40 0 39510 2203 Transdução de sinal histidina quinase CAETHG_00 CLJU_c1982 CLRAG_ 62 0 39260 2204 proteína hipotética CAETHG_25 CLJU_c0456 CLRAG_ 28 0 37920 2205 proteína de transdução de sinal contendo CAETHG_00 CLJU_c1934 CLRAG_ domínio HD-GYP modificado e EAL 11 0 39750
110 / 294 2206 Proteína contendo o domínio PAS contendo CAETHG_10 CLJU_c3066 CLRAG_ proteína/diguanilato ciclase (GGDEF) 70 0 16080 2207 Proteína contendo o domínio PAS contendo CAETHG_39 CLJU_c1861 CLRAG_ proteína/diguanilato ciclase (GGDEF) 69 0 00040 2208 c-di-AMP fosfodiesterase, consiste em um CAETHG_20 CLJU_c4274 CLRAG_ domínio semelhante ao GGDEF e DHH 99 0 25550 2209 Proteína de ligação ao DNA de fita simples CAETHG_13 CLJU_c3462 CLRAG_ 58 0 14700 2210 proteína do domínio RecJ da fosfoesterase CAETHG_12 CLJU_c3373 CLRAG_ 71 0 24550 2211 proteína de metabolismo de selênio YedF CAETHG_02 CLJU_c2138 CLRAG_ 24 0 30940 2212 Recombinase sítio-específica XerD CAETHG_01 CLJU_c2101 CLRAG_ 86 0 19010 2213 proteína pequena de esporo solúvel em CAETHG_02 CLJU_c2858 CLRAG_ ácido, tipo alfa/beta 76, 0, 34650 CAETHG_08 CLJU_c2186 53 0 2214 proteína pequena de esporo solúvel em CAETHG_05 CLJU_c2476 CLRAG_ ácido, tipo alfa/beta 41 0 18060 2215 proteína pequena de esporo solúvel em CAETHG_09 CLJU_c3096 CLRAG_ ácido, tipo alfa/beta 71 0, 35720 CLJU_c2972 0 2216 proteína pequena de esporo solúvel em CAETHG_09 CLJU_c2981 CLRAG_ ácido H (menor) 80 0 35820 2217 proteína pequena de esporo solúvel em CAETHG_13 CLJU_c3458 CLRAG_ ácido, tipo alfa/beta 54 0 14660 2218 Proteína de processamento de DNA CAETHG_33 CLJU_c1299 CLRAG_ 82 0 10800 2219 pequena bomba de resistência a múltiplos CAETHG_36 CLJU_c1544 CLRAG_ fármacos 45 0 32570 2220 Superfamília II DNA ou RNA helicase, CAETHG_02 CLJU_c2155 CLRAG_ família SNF2 42 0 31110 2221 proteína de simporte de glutamato de CAETHG_01 CLJU_c2079 CLRAG_ próton 64 0 19210 2222 soluto: Simporte de Na+, família SSS CAETHG_11 CLJU_c3287 CLRAG_ 85 0 15460 2223 soluto: Simporte de Na+, família SSS CAETHG_34 CLJU_c1387 CLRAG_ 70 0 09970 2224 ânion divalente: Simporte de Na +, família CAETHG_08 CLJU_c2819 CLRAG_ DASS 19 0 09140 2225 proteína de partição cromossômica, família CAETHG_21 CLJU_c4287 CLRAG_ ParB 13 0 25680 2226 proteína de revestimento de esporos JB CAETHG_12 CLJU_c3341 CLRAG_ 41 0 14840 2227 dTDP-4-amino-4,6-didesoxigalactose CAETHG_07 CLJU_c2678 CLRAG_ transaminase 59 0 08650 2228 Proteína que contém o domínio do CAETHG_12 CLJU_c3354 CLRAG_ revestimento F 53 0 24740 2229 proteína de revestimento de esporos, CAETHG_23 CLJU_c0200 CLRAG_ família CotS 04 0 27600 2230 proteína hipotética CAETHG_23 CLJU_c0202 CLRAG_ 06 0 27620 2231 proteína de revestimento de esporos, CAETHG_23 CLJU_c0203 CLRAG_ família CotS 08 0 27630 2232 proteína S associada ao revestimento de CAETHG_23 CLJU_c0205 CLRAG_ esporos 10 0 27650 2233 proteína de revestimento de esporos, CAETHG_29 CLJU_c0820 CLRAG_ família CotS 15 0 08190
111 / 294 2234 proteína de revestimento de esporos JC CAETHG_12 CLJU_c3342 CLRAG_ 42 0 14830 2235 Proteína de revestimento de esporos CotF CAETHG_09 CLJU_c2979 CLRAG_ 78 0 35790 2236 Proteína que contém o domínio do CAETHG_21 CLJU_c0056 CLRAG_ revestimento F 74 0 20010 2237 proteína de germinação de esporos KA CAETHG_15 CLJU_c3595 CLRAG_ 03 0 06450 2238 proteína de germinação, família Ger(x)C CAETHG_15 CLJU_c3596 CLRAG_ 04 0 06460 2239 proteína de germinação de esporos CAETHG_15 CLJU_c3598 CLRAG_ (permeação de aminoácidos) 06 0 06480 2240 proteína de germinação de esporos KB CAETHG_37 CLJU_c1644 CLRAG_ 38 0, 33240 CLJU_c1646 0 2241 proteína de germinação de esporos KC CAETHG_37 CLJU_c1648 CLRAG_ 43 0 33260 2242 proteína de germinação de esporos KA CAETHG_37 CLJU_c1649 CLRAG_ 44 0 33270 2243 proteína de germinação, família Ger(x)C CAETHG_39 CLJU_c1844 CLRAG_ 51 0 00240 2244 proteína de germinação de esporos CAETHG_39 CLJU_c1845 CLRAG_ (permeação de aminoácidos) 52 0 00230 2245 Proteína de germinação de esporos GerA CAETHG_39 CLJU_c1846 CLRAG_ 53 0 00220 2246 proteína de germinação de esporos CAETHG_23 CLJU_c0213 CLRAG_ 18 0 27730 2247 proteína de germinação de esporos CAETHG_23 CLJU_c0214 CLRAG_ (permease de aminoácidos)/proteína de 19 0 27740 germinação, família Ger(x)C 2248 proteína de maturação de esporos A CAETHG_22 CLJU_c0170 CLRAG_ 72 0 27300 2249 proteína B de maturação de esporos CAETHG_22 CLJU_c0171 CLRAG_ 73 0 27310 2250 fotoproduto de esporos liase 4.1.99.- CAETHG_12 CLJU_c3302 CLRAG_ 00 0 15310 2251 proteína de esporulação GA do estágio II CAETHG_33 CLJU_c1231 CLRAG_1 (peptidase de processamento do fator 13 0 1490 sigma-E da esporulação) 2252 proteína de membrana integral de CAETHG_33 CLJU_c1274 CLRAG_1 esporulação YlbJ 55 0 1070 2253 proteína de germinação YpeB CAETHG_23 CLJU_c0217 CLRAG_ 22 0 27770 2254 proteína de esporulação, família CAETHG_33 CLJU_c1234 CLRAG_1 YlmC/YmxH 16 0 1460 2255 Proteína de ligação a SsrA CAETHG_17 CLJU_c3908 CLRAG_ 53 0 21230 2256 proteína D de esporulação estágio II CAETHG_23 CLJU_c0247 CLRAG_ 53 0 28080 2257 proteína E de esporulação de estágio II CAETHG_19 CLJU_c4156 CLRAG_ 90 0 04690 2258 proteína M de esporulação estágio II CAETHG_32 CLJU_c1125 CLRAG_ 15 0 12210 2259 proteína P de esporulação estágio II CAETHG_28 CLJU_c0792 CLRAG_ 85 0 25400 2260 proteína R de esporulação do estágio II CAETHG_23 CLJU_c0215 CLRAG_ 20 0 27750 2261 proteína AA de esporulação do estágio III CAETHG_31 CLJU_c1103 CLRAG_ 92 0 12430
112 / 294 2262 proteína AB de esporulação estágio III CAETHG_31 CLJU_c1104 CLRAG_ 93 0 12420 2263 proteína AC de esporulação em estágio III CAETHG_31 CLJU_c1105 CLRAG_ 94 0 12410 2264 proteína AD de esporulação estágio III CAETHG_31 CLJU_c1106 CLRAG_ 95 0 12400 2265 proteína AE de esporulação de estágio III CAETHG_31 CLJU_c1107 CLRAG_ 96 0 12390 2266 proteína AF de esporulação em estágio III CAETHG_31 CLJU_c1108 CLRAG_ 97 0 12380 2267 proteína AG de esporulação em estágio III CAETHG_31 CLJU_c1109 CLRAG_ 98 0 12370 2268 proteína AH de esporulação estágio III CAETHG_31 CLJU_c1110 CLRAG_ 99 0 12360 2269 proteína B de esporulação estágio IV CAETHG_32 CLJU_c1121 CLRAG_ 11 0 12250 2270 proteína FB de esporulação em estágio IV CAETHG_28 CLJU_c0732 CLRAG_ 24 0 26520 2271 proteína AC de esporulação em estágio V CAETHG_01 CLJU_c2091 CLRAG_ 76 0 19100 2272 proteína AE de esporulação em estágio V CAETHG_01 CLJU_c2094 CLRAG_ 78 0 19080 2273 proteína B de esporulação do estágio V CAETHG_03 CLJU_c2205 CLRAG_ 03 0 31570 2274 proteína B de esporulação do estágio V CAETHG_19 CLJU_c4169 CLRAG_ 98 0 04820 2275 proteína B de esporulação do estágio V CAETHG_38 CLJU_c1736 CLRAG_ 49 0 29220 2276 proteína G de esporulação em estágio V CAETHG_20 CLJU_c4179 CLRAG_ 08 0 04920 2277 proteína R de esporulação em estágio V CAETHG_25 CLJU_c0433 CLRAG_ 01 0 37660 2278 Transportador MFS, família SP, principal CAETHG_36 CLJU_c1578 CLRAG_ transportador de inositol 86 0 32940 2279 Proteína da família subtilase CAETHG_20 CLJU_c4208 CLRAG_ 38 0 05190 2280 proteína de ligação ao substrato do sistema CAETHG_29 CLJU_c0895 CLRAG_ de transporte metil-galactosídeo 89 0 07550 2281 regulador diácido de carboidratos CAETHG_08 CLJU_c2822 CLRAG_ 22 0 09170 2282 proteína de estimulação A da fermentação CAETHG_22 CLJU_c0090 CLRAG_ do açúcar 04 0 19680 2283 NAD (P) H-hidrato epimerase CAETHG_24 CLJU_c0301 CLRAG_ 16 0 28620 2284 Fosfato de açúcar isomerase/epimerase CAETHG_14 CLJU_c3566 CLRAG_ 74 0 06190 2285 proteína transportadora de glucuronida CAETHG_01 CLJU_c2055 CLRAG_ 38 0 19440 2286 Fosfoglicerol transferase MdoB CAETHG_05 CLJU_c2508 CLRAG_ 76, 0, 17690 CAETHG_29 CLJU_c0877 71 0 2287 Repetição putativa da ligação da parede CAETHG_09 CLJU_c2973 CLRAG_ celular 2 72 0 35730 2288 Repetição putativa da ligação da parede 3.5.1.28 CAETHG_25 CLJU_c0499 CLRAG_ celular 2 58, 0 38380 CAETHG_25 76 2289 Domínio semelhante a Ig (grupo 4) CAETHG_26 CLJU_c0586 CLRAG_ 81 0 07100
113 / 294 2290 Domínio semelhante a Ig (grupo 4) CAETHG_30 CLJU_c1006 CLRAG_ 96 0 13310 2291 Domínio semelhante a Ig (grupo 4) CAETHG_30 CLJU_c1007 CLRAG_ 97 0 13300 2292 soluto: Simporte de Na+, família SSS CAETHG_03 CLJU_c2318 CLRAG_ 81 0 01550 2293 proteína de biossíntese de tiamina ThiI CAETHG_08 CLJU_c2835 CLRAG_ 32 0 34430 2294 lipoproteína da biossíntese da tiamina CAETHG_14 CLJU_c3551 CLRAG_ 59 0 06040 2295 hidrolase de tioéster de acil-CoA 3.1.2. CAETHG_15 CLJU_c3614 CLRAG_ 24 0 06660 2296 regulador de transcrição previsto YdeE, CAETHG_36 CLJU_c1522 CLRAG_ contém um domínio de ligação ao DNA do 24 0 24130 tipo AraC 2297 Inibidor da DNA girase GyrI CAETHG_38 CLJU_c1744 CLRAG_ 57 0 01270 2298 fator de alongamento da transcrição GreA CAETHG_07 CLJU_c2639 CLRAG_ 20 0 04480 2299 fator de alongamento da transcrição GreA CAETHG_14 CLJU_c3545 CLRAG_ 53 0 05980 2300 fator de alongamento da transcrição GreA CAETHG_19 CLJU_c4149 CLRAG_ 83 0 04620 2301 Subunidade grande de apenas hidrogenase CAETHG_01 CLJU_c2037 CLRAG_ de ferro, domínio C-terminal 19 0 25920 2302 Proteína contendo domínio hélice-giro- CAETHG_01 CLJU_c2046 CLRAG_ hélice C-terminal PucR 28 0 19560 2303 Regulador transcricional de ligação ao CAETHG_01 CLJU_c2073 CLRAG_ DNA, família PucR 58 0 19270 2304 Regulador transcricional da família GntR, CAETHG_02 CLJU_c2162 CLRAG_ repressor transcricional do complexo 49 0 31210 piruvato desidrogenase 2305 regulador transcricional putativo CAETHG_05 CLJU_c2480 CLRAG_ 45, 0, 17990 CAETHG_34 CLJU_c1406 87 0 2306 Regulador transcricional de ligação ao CAETHG_05 CLJU_c2495 CLRAG_ DNA, família PadR 62 0 17830 2307 Regulador transcricional de ligação ao CAETHG_05 CLJU_c2513 CLRAG_ DNA YhcF, família GntR 81 0 03470 2308 tiaminase (ativador da transcrição TenA) CAETHG_06 CLJU_c2541 CLRAG_ 10 0 03690 2309 Regulador de resposta de ligação ao DNA, CAETHG_06 CLJU_c3865 CLRAG_ família OmpR, contém os domínios REC e 44, 0, 20970 hélice alada (wHTH) CAETHG_17 CLJU_c2575 15 0 2310 Proteína que contém o domínio hélice- CAETHG_07 CLJU_c2665 CLRAG_ volta-hélice 46 0 08520 2311 proteína contendo domínio de ligação a CAETHG_07 CLJU_c2687 CLRAG_ hélice com dobradiça em loop, família 71 0 16110 AbrB 2312 Proteína contendo domínio receptor do CAETHG_09 CLJU_c2921 CLRAG_ regulador de resposta 13 0 35210 2313 Regulador de resposta de ligação ao DNA, CAETHG_10 CLJU_c1378 CLRAG_ família OmpR, contém os domínios REC e 14, 0, 15720 hélice alada (wHTH) CAETHG_34 CLJU_c3014 61 0
114 / 294 2314 regulador transcricional putativo CAETHG_11 CLJU_c1849 CLRAG_ 79, 0, 15520 CAETHG_39 CLJU_c3281 56 0 2315 Regulador transcricional de ligação ao CAETHG_11 CLJU_c3293 CLRAG_ DNA, família PadR 91 0 15400 2316 regulador transcricional de ligação ao 2.6.1.23, CAETHG_12 CLJU_c3389 CLRAG_ DNA, família MocR, contém um domínio 2.6.1.1 87 0 14040 aminotransferase 2317 Regulador transcricional de ligação ao CAETHG_14 CLJU_c3507 CLRAG_ DNA, família MerR 16 0 26330 2318 Regulador transcricional da família GntR CAETHG_14 CLJU_c3529 CLRAG_ 38 0 05820 2319 regulador transcricional de ligação ao DNA CAETHG_14 CLJU_c3558 CLRAG_ previsto YafY, contém os domínios HTH e 66 0 06110
WYL 2320 Regulador transcricional de ligação ao CAETHG_16 CLJU_c3780 CLRAG_ DNA, família LysR 27 0 37220 2321 regulador central de genes glicolíticos CAETHG_17 CLJU_c3916 CLRAG_ 61 0 21310 2322 Regulador transcricional da família GntR, 2.6.1.23, CAETHG_18 CLJU_c3991 CLRAG_ regulador para abcA e norABC 2.6.1.1 37 0 22160 2323 Hélice-giro-hélice CAETHG_20 CLJU_c4193 CLRAG_ 22 0 05040 2324 proteína hipotética CAETHG_21 CLJU_c0013 CLRAG_ 32 0 20190 2325 Regulador de resposta de ligação ao DNA, CAETHG_21 CLJU_c0082 CLRAG_ família OmpR, contém os domínios REC e 97 0 19760 hélice alada (wHTH) 2326 proteína reguladora, família Fis CAETHG_24 CLJU_c0381 CLRAG_ 43 0 28880 2327 Regulador transcricional da família GntR CAETHG_25 CLJU_c0463 CLRAG_ 35 0 37990 2328 Proteína contendo repetição de CAETHG_27 CLJU_c0615 CLRAG_ tetratricopeptídeo 14 0 07430 2329 Proteína contendo repetição de CAETHG_27 CLJU_c0616 CLRAG_ tetratricopeptídeo 16 0 07440 2330 Regulador de resposta de ligação ao DNA, CAETHG_27 CLJU_c0651 CLRAG_ família OmpR, contém os domínios REC e 47 0 30390 hélice alada (wHTH) 2331 Regulador transcricional da família CAETHG_27 CLJU_c0673 CLRAG_ Lrp/AsnC, regulador para asnA, asnC e 64 0 18530 gidA 2332 Regulador de resposta de ligação ao DNA, CAETHG_27 CLJU_c0695 CLRAG_ família OmpR, contém os domínios REC e 85 0 18790 hélice alada (wHTH) 2333 Proteína contendo domínio hélice-giro- CAETHG_28 CLJU_c0754 CLRAG_ hélice C-terminal PucR 47 0 32330 2334 Regulador de resposta de ligação ao DNA, CAETHG_28 CLJU_c0770 CLRAG_ família OmpR, contém os domínios REC e 63 0 25240 hélice alada (wHTH) 2335 domínio de ligação ao cAMP da PCR ou CAETHG_28 CLJU_c0772 CLRAG_ uma subunidade reguladora das proteínas 65 0 25260 quinases dependentes do cAMP 2336 Proteína contendo domínio CBS CAETHG_29 CLJU_c0813 CLRAG_ 08 0 08220 2337 Regulador transcricional de ligação ao CAETHG_29 CLJU_c0844 CLRAG_ DNA, família MarR 37 0 08020 2338 Regulador transcricional de ligação ao CAETHG_29 CLJU_c0870 CLRAG_ DNA, família MerR 64 0 07790
115 / 294 2339 regulador transcricional de ligação ao 2.6.1.23, CAETHG_29 CLJU_c0885 CLRAG_ DNA, família MocR, contém um domínio 2.6.1.1 80 0 07630 aminotransferase 2340 repressor transcricional NrdR CAETHG_33 CLJU_c1235 CLRAG_1 17 0 1450 2341 sistema de dois componentes, família CAETHG_33 CLJU_c1237 CLRAG_1 OmpR, regulador de resposta de síntese de 19 0 1430 fosfatase alcalina PhoP 2342 arseniato redutase CAETHG_34 CLJU_c1374 CLRAG_ 56 0 10110 2343 Regulador transcricional de ligação ao CAETHG_34 CLJU_c1412 CLRAG_ DNA, família MerR 93 0 09460 2344 proteína hipotética CAETHG_35 CLJU_c1468 CLRAG_ 68 0 20530 2345 Proteína contendo domínio hélice-giro- CAETHG_36 CLJU_c1501 CLRAG_ hélice C-terminal PucR 05 0 24340 2346 Regulador transcricional de ligação ao CAETHG_36 CLJU_c1516 CLRAG_ DNA, família MarR 18 0 24190 2347 regulador transcricional de ligação ao DNA CAETHG_36 CLJU_c1521 CLRAG_ previsto YafY, contém os domínios HTH e 23 0 24140
WYL 2348 Regulador transcricional de ligação ao CAETHG_36 CLJU_c1551 CLRAG_ DNA, família MerR 52 0 32590 2349 regulador transcricional putativo CAETHG_38 CLJU_c1762 CLRAG_ 70 0 01120 2350 Regulador transcricional da família BlaI, CAETHG_40 CLJU_c1892 CLRAG_ repressor da penicilinase 26 0 40050 2351 Regulador transcricional de ligação ao CAETHG_18 CLJU_c4011 CLRAG_ DNA, família MerR 60 0 22340 2352 Regulador transcricional contendo CAETHG_19 CLJU_c4067 CLRAG_ domínios PAS, ATPase do tipo AAA e Fis 10 0 22860 de ligação ao DNA 2353 Regulador transcricional da família AraC CAETHG_21 CLJU_c0064 CLRAG_ 82 0 19940 2354 regulador de transcrição CtsR CAETHG_19 CLJU_c4136 CLRAG_ 77 0 23550 2355 repressor pleiotrópico transcricional CAETHG_33 CLJU_c1301 CLRAG_ 84 0 10780 2356 aspartato 4-descarboxilase CAETHG_12 CLJU_c3327 CLRAG_ 26 0 14990 2357 Proteína que contém o domínio CAETHG_15 CLJU_c3701 CLRAG_ transglicosilase SLT 62 0 36550 2358 L-treonilcarbamoiladenilato sintase CAETHG_23 CLJU_c0229 CLRAG_ 34 0 27890 2359 fator de iniciação da tradução IF-3 CAETHG_01 CLJU_c3446 CLRAG_ 61, 0, 19240 CAETHG_13 CLJU_c2076 46 0 2360 proteína hipotética CAETHG_28 CLJU_c0718 CLRAG_ 10 0 26660 2361 Transportador MFS, família DHA1, CAETHG_14 CLJU_c3577 CLRAG_ proteína de resistência à 85 0 06300 biciclomicina/cloranfenicol 2362 Permease prevista de efluxo de arabinose, CAETHG_35 CLJU_c1426 CLRAG_ família MFS 08 0 09580 2363 Permease prevista de efluxo de arabinose, CAETHG_35 CLJU_c1427 CLRAG_ família MFS 09 0 09590 2364 Cassete de ligação ATP, subfamília B CAETHG_06 CLJU_c2623 CLRAG_ 99 0 04350
116 / 294 2365 Cassete de ligação ATP, subfamília B CAETHG_07 CLJU_c2624 CLRAG_ 00 0 04360 2366 Permease prevista de efluxo de arabinose, CAETHG_29 CLJU_c0886 CLRAG_ família MFS 81 0 07620 2367 Proteína de ligação ao substrato do sistema de transporte CAETHG_07 CLJU_c2653 CLRAG_ da família NitT/TauT 34 0 08410 2368 Transportador MFS, metabólito putativo: CAETHG_01 CLJU_c2112 CLRAG_ simporte de H+ 98 0 30690 2369 Transportador MFS, metabólito putativo: CAETHG_02 CLJU_c2114 CLRAG_ simporte de H+ 00 0 30700 2370 Proteína da Superfamília do Facilitador CAETHG_05 CLJU_c3610 CLRAG_ Principal 65, 0, 17800 CAETHG_15 CLJU_c2498 19 0 2371 transportador de resistência a fármacos, CAETHG_11 CLJU_c3279 CLRAG_ subfamília EmrB/QacA 77, 0, 15570 CAETHG_14 CLJU_c3503 12 0 2372 Proteína transportadora da família ABC-2 CAETHG_14 CLJU_c3527 CLRAG_ 35, 0, 05790 CAETHG_14 CLJU_c3526 36 0 2373 proteína permease de sistema de transporte CAETHG_21 CLJU_c0078 CLRAG_ de bacitracina 93 0 19800 2374 Subunidade da bomba de efluxo de CAETHG_24 CLJU_c0760 CLRAG_ múltiplos fármacos AcrB 72, 0, 26960 CAETHG_28 CLJU_c0409 53 0 2375 transportador de resistência a fármacos, CAETHG_25 CLJU_c0437 CLRAG_ subfamília EmrB/QacA 05 0 37700 2376 Permease da superfamília do transportador CAETHG_27 CLJU_c0633 CLRAG_ de fármacos/metabólitos (DMT) 28 0 30500 2377 proteína permease de sistema de transporte CAETHG_27 CLJU_c0647 CLRAG_ de bacitracina 43 0 30430 2378 Proteína YitT ancorada na membrana não CAETHG_28 CLJU_c0762 CLRAG_ caracterizada, contém os domínios DUF161 55 0 25190 e DUF2179 2379 transposase CAETHG_30 CLJU_c0983 CLRAG_ 76 0, 16750 CLJU_c0539 0 2380 Transposase InsO e derivados inativados CAETHG_40 CLJU_c1920 CLRAG_ 55 0 37620 2381 modificação de tRNA GTPase CAETHG_21 CLJU_c4292 CLRAG_ 18 0 25730 2382 tRNA (Ile)-lisidina sintase CAETHG_19 CLJU_c4155 CLRAG_ 89 0 04680 2383 proteína de motilidade contraída PilT CAETHG_33 CLJU_c1227 CLRAG_1 09 0 1530 2384 Proteína que contém o domínio Y_Y_Y CAETHG_15 CLJU_c3702 CLRAG_ 63 0 36560 2385 Transdução de sinal histidina quinase CAETHG_18 CLJU_c3997 CLRAG_ 43 0 22210 2386 Transdução de sinal histidina quinase CAETHG_34 CLJU_c1418 CLRAG_ 99 0 09510 2387 Transdução de sinal histidina quinase CAETHG_36 CLJU_c1581 CLRAG_ 90, 0, 29260 CAETHG_38 CLJU_c1732 45 0 2388 Transdução de sinal histidina quinase CAETHG_07 CLJU_c2704 CLRAG_ 87 0 08800
117 / 294 2389 Transdução de sinal histidina quinase CAETHG_27 CLJU_c0650 CLRAG_ 46 0 30400 2390 proteína hipotética CAETHG_28 CLJU_c0771 CLRAG_ 64 0 25250 2391 Regulador de resposta de ligação ao DNA, CAETHG_00 CLJU_c1945 CLRAG_ família OmpR, contém os domínios REC e 22 0 39660 hélice alada (wHTH) 2392 sistema de dois componentes, regulador de CAETHG_01 CLJU_c2077 CLRAG_ resposta YcbB 62 0 19230 2393 Regulador de resposta de ligação ao DNA, CAETHG_03 CLJU_c0917 CLRAG_ família OmpR, contém os domínios REC e 57, 0, 01840 hélice alada (wHTH) CAETHG_30 CLJU_c2295 11 0 2394 Regulador de resposta de ligação ao DNA, CAETHG_05 CLJU_c2510 CLRAG_ família OmpR, contém os domínios REC e 78 0 17670 hélice alada (wHTH) 2395 Regulador de resposta de ligação ao DNA, CAETHG_06 CLJU_c2572 CLRAG_ família OmpR, contém os domínios REC e 41 0 03920 hélice alada (wHTH) 2396 Regulador de resposta de ligação ao DNA, CAETHG_10 CLJU_c3063 CLRAG_ família OmpR, contém os domínios REC e 67 0 16060 hélice alada (wHTH) 2397 proteína reguladora da utilização de CAETHG_11 CLJU_c3288 CLRAG_ arginina 86 0 15450 2398 sistema de dois componentes, família CAETHG_17 CLJU_c3951 CLRAG_ OmpR, regulador de resposta de operon 96 0 21710 KDP KdpE 2399 Regulador de resposta de ligação ao DNA, CAETHG_18 CLJU_c3998 CLRAG_ família OmpR, contém os domínios REC e 44 0 22220 hélice alada (wHTH) 2400 Regulador de resposta de ligação ao DNA, CAETHG_18 CLJU_c4027 CLRAG_ família OmpR, contém os domínios REC e 73, 0, 07660 hélice alada (wHTH) CAETHG_29 CLJU_c0883 78 0 2401 Regulador de resposta de ligação ao DNA, CAETHG_25 CLJU_c0444 CLRAG_ família OmpR, contém os domínios REC e 16 0 37800 hélice alada (wHTH) 2402 Regulador de resposta de ligação ao DNA, CAETHG_28 CLJU_c0782 CLRAG_ família OmpR, contém os domínios REC e 75 0 25280 hélice alada (wHTH) 2403 Regulador de resposta de ligação ao DNA, CAETHG_36 CLJU_c1497 CLRAG_ família OmpR, contém os domínios REC e 01 0 24380 hélice alada (wHTH) 2404 Regulador de resposta de ligação ao DNA, CAETHG_36 CLJU_c1580 CLRAG_ família OmpR, contém os domínios REC e 89, 0, 29270 hélice alada (wHTH) CAETHG_38 CLJU_c1731 44 0 2405 regulador de resposta à ligação ao DNA, CAETHG_40 CLJU_c1885 CLRAG_ família NarL/FixJ, contém domínios REC e 17 0 40150
HTH 2406 Transdução de sinal histidina quinase CAETHG_03 CLJU_c2296 CLRAG_ 58 0 01820 2407 Transdução de sinal histidina quinase CAETHG_06 CLJU_c2567 CLRAG_ 36 0 03870 2408 Transdução de sinal histidina quinase CAETHG_06 CLJU_c2576 CLRAG_ 45 0 03990 2409 Domínio alfa-helicoidal do tipo CAETHG_08 CLJU_c1087 CLRAG_ Sensor_kinase_SpoOB 44, 0 03760 CAETHG_31 77
118 / 294 2410 sistema de dois componentes, família CAETHG_14 CLJU_c3518 CLRAG_ AgrA, sensor histidina quinase AgrC 26 0 05690 2411 sistema de dois componentes, família LytT, CAETHG_15 CLJU_c3733 CLRAG_ sensor quinase 89 0 36770 2412 Transdução de sinal histidina quinase CAETHG_21 CLJU_c0081 CLRAG_ 96 0 19770 2413 Transdução de sinal histidina quinase CAETHG_28 CLJU_c0784 CLRAG_ 77 0 25320 2414 Transdução de sinal histidina quinase CAETHG_30 CLJU_c0918 CLRAG_ 12 0 13850 2415 Transdução de sinal histidina quinase CAETHG_11 CLJU_c3296 CLRAG_ 94 0 15370 2416 ATPase do tipo histidina quinase, DNA CAETHG_18 CLJU_c3968 CLRAG_ girase B e HSP90 14 0 21930 2417 proteína de alta aderência C CAETHG_08 CLJU_c2879 CLRAG_ 74 0 34870 2418 proteína de alta aderência B CAETHG_08 CLJU_c2880 CLRAG_ 75 0 34880 2419 proteína de montagem de pilus CpaF CAETHG_08 CLJU_c2881 CLRAG_ 76 0 34890 2420 peptidase líder (peptidase prepilina)/N- CAETHG_08 CLJU_c2889 CLRAG_ metiltransferase 85 0 34970 2421 proteína de biossíntese de ubiquinona CAETHG_21 CLJU_c0073 CLRAG_ 90 0 19850 2422 proteína hipotética CAETHG_13 CLJU_c3408 CLRAG_ 06 0 14230 2423 UDP-N-acetil-D-glucosamina 1.1.1.22 CAETHG_13 CLJU_c3410 CLRAG_ desidrogenase 08 0 14250 2424 N-acetilglucosaminodifosfoundecaprenol 2.4.1.187 CAETHG_12 CLJU_c3401 CLRAG_ N-acetil-beta-D- 99 0 14160 manosaminaminiltransferase 2425 UDP-N-acetilmuramil-tripeptídeo sintase CAETHG_27 CLJU_c0620 CLRAG_ 20 0 07480 2426 UDP-GlcNAc: undecaprenil-fosfato 2.7.8.- CAETHG_23 CLJU_c0234 CLRAG_ GlcNAc-1-fosfato transferase 40 0 27950 2427 Proteína de estresse universal de ligação a CAETHG_12 CLJU_c3768 CLRAG_ nucleotídeos, família UspA 01, 0, 15300 CAETHG_16 CLJU_c3303 22 0 2428 DNA Polimerase CAETHG_22 CLJU_c0112 CLRAG_ 23 0 30280 2429 uracil permease CAETHG_04 CLJU_c2358 CLRAG_ 22 0 17590 2430 nucleobase: simporte-1 de cátion, família CAETHG_14 CLJU_c3590 CLRAG_ NCS1 97 0 06400 2431 uracil permease CAETHG_31 CLJU_c1073 CLRAG_ 63 0 12610 2432 uroporfirinogênio descarboxilase CAETHG_01 CLJU_c2107 CLRAG_ 92 0 30650 2433 uroporfirinogênio-III descarboxilase CAETHG_01 CLJU_c2058 CLRAG_ 41 0 19400 2434 uroporfirinogênio descarboxilase (URO-D) CAETHG_01 CLJU_c2068 CLRAG_ 51, 0, 19290 CAETHG_01 CLJU_c2071 55 0 2435 uroporfirinogênio descarboxilase CAETHG_05 CLJU_c2499 CLRAG_ 64, 0, 17790 CAETHG_05 CLJU_c2497 66 0
119 / 294 2436 uroporfirinogênio descarboxilase CAETHG_13 CLJU_c2756 CLRAG_ 70 0, 30730 CLJU_c3473 0 2437 Proteína ativadora de proteína-arginina- CAETHG_19 CLJU_c4135 CLRAG_ quinase McsA 76 0 23540 2438 proteína de resistência à vancomicina CAETHG_12 CLJU_c1894 CLRAG_ YoaR, contém domínios de ligação a 49, 0, 24780 peptidoglicano e VanW CAETHG_40 CLJU_c3350 28 0 2439 proteína de resistência à vancomicina CAETHG_17 CLJU_c3925 CLRAG_ YoaR, contém domínios de ligação a 69 0 21460 peptidoglicano e VanW 2440 peptidodoglicano lipídico II flipase putativa CAETHG_13 CLJU_c3412 CLRAG_ 10 0 14270 2441 Antiportador de H+/Cl ClcA CAETHG_03 CLJU_c2324 CLRAG_ 87 0 01490 2442 fator acessório da xantina desidrogenase CAETHG_27 CLJU_c0677 CLRAG_ 68 0 18570 2443 xantina desidrogenase dependente de CAETHG_04 CLJU_c2391 CLRAG_ selênio 57 0 17250 2444 Subunidade de ligação ao FAD de CO ou CAETHG_04 CLJU_c2388 CLRAG_ xantina desidrogenase 54 0 17280 2445 Subunidade de ligação ao FAD de CO ou 1.1.1.204, CAETHG_09 CLJU_c2992 CLRAG_ xantina desidrogenase 1.17.1.4 91 0 35920 2446 xantina fosforibosiltransferase 2.4.2.22, CAETHG_36 CLJU_c1512 CLRAG_
2.4.2.8 14 0 24220 2447 permeação de xantina CAETHG_04 CLJU_c2385 CLRAG_ 50 0 17320 2448 nucleobase: simporte-2 de cátion, família CAETHG_36 CLJU_c1513 CLRAG_ NCS2 15 0 24210 2449 XTP/dITP difosfo-hidrolase CAETHG_15 CLJU_c3685 CLRAG_ 46 0 36380 2450 quinase de açúcar da família NBD/HSP70 CAETHG_39 CLJU_c1829 CLRAG_ pode conter um domínio HTH do terminal 36 0 00330
N 2451 proteína hipotética CAETHG_25 CLJU_c0434 CLRAG_ 02 0 37670 2452 DNA helicase de reinício de replicação CAETHG_29 CLJU_c0890 CLRAG_ PriA 85 0 07580 2453 Peptidase dependente de Zn prevista CAETHG_30 CLJU_c0923 CLRAG_ 17 0 13800 2454 transportador de zinco, família ZIP CAETHG_23 CLJU_c0228 CLRAG_ 33 0 27880 2455 (R,R)-butanodiol desidrogenase/meso- 1.1.1.4, CAETHG_03 CLJU_c2322 CLRAG_ butanodiol desidrogenase/diacetil redutase 1.1.1.1 85 0 01510 2456 proteína hipotética CAETHG_33 CLJU_c1258 CLRAG_1 40 0 1220 2457 Peptidase dependente de Zn prevista CAETHG_14 CLJU_c3541 CLRAG_ 49 0 05950 2458 Peptidase dependente de Zn prevista CAETHG_34 CLJU_c1322 CLRAG_ 05 0 10570 2459 Superfamília II da glioxilase beta-lactamase 3.1.2.6 CAETHG_12 CLJU_c3369 CLRAG_ 67 0 24590 2460 Superfamília II da glioxilase beta-lactamase CAETHG_29 CLJU_c0863 CLRAG_ 57 0 07860 2461 proteína hipotética CAETHG_36 CLJU_c1536 CLRAG_ 38 0 24100 2462 putrescina carbamoil-transferase CAETHG_20 CLJU_c4256 CLRAG_ 82 0 09040
120 / 294 2463 fosforilase de pirimidina-nucleosídeo 2.4.2.23, CAETHG_39 CLJU_c1816 CLRAG_
2.4.2.2, 25 0 00510
2.4.2.3,
2.4.2.4,
2.4.2.1 2464 pirrolina-5-carboxilato redutase 1.5.1.2 CAETHG_15 CLJU_c3738 CLRAG_ 93 0 36820 2465 piruvato carboxilase CAETHG_15 CLJU_c3739 CLRAG_ 94 0 36830 2466 formato C-acetiltransferase 2.3.1.54 CAETHG_06 CLJU_c2598 CLRAG_ 67 0 04120 2467 formato C-acetiltransferase 2.3.1.54 CAETHG_18 CLJU_c3983 CLRAG_ 29 0 22080 2468 enzima de ativação do formato de piruvato- 2.3.1.54 CAETHG_06 CLJU_c2597 CLRAG_ liase 66 0 04110 2469 enzima de ativação do formato de piruvato- 2.3.1.54 CAETHG_18 CLJU_c3982 CLRAG_ liase 28 0 22070 2470 piruvato quinase 2.7.1.40 CAETHG_24 CLJU_c0326 CLRAG_ 41 0 28860 2471 piruvato fosfato diquinase 2.7.9.1 CAETHG_29 CLJU_c0814 CLRAG_ 09 0 08210 2472 enzima ativadora putativa de formato de CAETHG_20 CLJU_c4192 CLRAG_ piruvato liase 21 0 05030 2473 piruvato-ferredoxina/flavodoxina 1.2.7.1 CAETHG_09 CLJU_c0934 CLRAG_ oxidorredutase 28, 0, 35360 CAETHG_30 CLJU_c2934 29 0 2474 queuína tRNA-ribosiltransferase CAETHG_12 CLJU_c3380 CLRAG_ 78 0 24480 2475 quinolinato sintetase CAETHG_05 CLJU_c2443 CLRAG_ 03 0 25160 2476 biotina sintase 2.8.1.6 CAETHG_03 CLJU_c2277 CLRAG_ 39 0 02020 2477 proteína de recombinação RecA CAETHG_34 CLJU_c1328 CLRAG_ 11 0 10510 2478 DNA helicase de reinício de replicação CAETHG_33 CLJU_c1255 CLRAG_1 PriA 37 0 1250 2479 proteína contendo domínio de diguanilato CAETHG_35 CLJU_c1574 CLRAG_ ciclase (GGDEF) 90, 0, 20280 CAETHG_36 CLJU_c1484 82 0 2480 3,4-di-hidroxi 2-butanona 4-fosfato 3.5.4.25 CAETHG_03 CLJU_c2207 CLRAG_ sintase/GTP ciclo-hidrolase II 05 0 31590 2481 cadeia alfa da riboflavina sintase 2.5.1.9 CAETHG_03 CLJU_c2208 CLRAG_ 06 0 31600 2482 componente da proteína ribonuclease P CAETHG_21 CLJU_c4296 CLRAG_ 22 0 25770 2483 ribonuclease PH CAETHG_15 CLJU_c3686 CLRAG_ 47 0 36390 2484 ribonucleosídeo-difosfato redutase classe II CAETHG_27 CLJU_c0684 CLRAG_ 75 0 18680 2485 subunidade catalítica de classe III do 1.17.4.2 CAETHG_22 CLJU_c0184 CLRAG_ ribonucleosídeo-trifosfato redutase 87 0 27440 2486 proteína hipotética CAETHG_23 CLJU_c0219 CLRAG_ 24 0 27790 2487 proteína de membrana transportadora ribose CAETHG_22 CLJU_c0128 CLRAG_ ABC 37 0 30140 2488 ribose-5-fosfato isomerase 5.3.1.6 CAETHG_23 CLJU_c0231 CLRAG_ 36 0 27910
121 / 294 2489 proteína de ligação ao substrato do sistema CAETHG_22 CLJU_c0126 CLRAG_ de transporte de ribose 35 0 30160 2490 ribose-fosfato pirofosfoquinase 2.7.6.1 CAETHG_20 CLJU_c4177 CLRAG_ 06 0 04900 2491 23S rRNA pseudouridina2605 sintase 4.2.1.70 CAETHG_02 CLJU_c2136 CLRAG_ 22 0 30920 2492 23S rRNA pseudouridina1911/1915/1917 CAETHG_28 CLJU_c0743 CLRAG_ sintase 35 0 32260 2493 23S rRNA pseudouridina1911/1915/1917 4.2.1.70 CAETHG_31 CLJU_c1072 CLRAG_ sintase 62 0 12620 2494 proteína ribossômica L11 metiltransferase CAETHG_28 CLJU_c0800 CLRAG_ 93 0 08360 2495 proteína ribossômica da subunidade grande CAETHG_33 CLJU_c1293 CLRAG_ L19 75 0 10870 2496 proteína ribossômica da subunidade grande CAETHG_19 CLJU_c4110 CLRAG_ L7A 53 0 23290 2497 16S rRNA pseudouridina516 sintase 4.2.1.70 CAETHG_15 CLJU_c3700 CLRAG_ 61 0 36540 2498 fator de ligação ao ribossomo A CAETHG_33 CLJU_c1316 CLRAG_ 99 0 10630 2499 Açúcar (pentulose ou hexulose) quinase 2.7.1.47, CAETHG_22 CLJU_c0122 CLRAG_
2.7.1.16 30 0 30200 2500 ribulose-fosfato 3-epimerase 5.1.3.1 CAETHG_33 CLJU_c1264 CLRAG_1 46 0 1160 2501 Fator de RNA polimerase sigma-70, CAETHG_09 CLJU_c2988 CLRAG_ subfamília ECF 87 0 35890 2502 Fator sigma específico da esporulação da CAETHG_12 CLJU_c3395 CLRAG_ RNA polimerase 93 0 14100 2503 Fator sigma específico da esporulação da CAETHG_33 CLJU_c1226 CLRAG_1 RNA polimerase 08 0 1540 2504 RNA polimerase, subunidade sigma 28, CAETHG_31 CLJU_c1041 CLRAG_ SigD/FliA/WhiG 31 0 12960 2505 RNA polimerase, subunidade sigma 29, CAETHG_33 CLJU_c1232 CLRAG_1 SigE 14 0 1480 2506 Fator sigma específico da esporulação da CAETHG_19 CLJU_c4123 CLRAG_ RNA polimerase 64 0 23420 2507 RNA polimerase, subunidade sigma 54, CAETHG_17 CLJU_c3917 CLRAG_ RpoN/SigL 62 0 21320 2508 RNA polimerase, subunidade sigma 70, CAETHG_29 CLJU_c0822 CLRAG_ RpoD 17 0 08170 2509 Polimerase de RNA, subunidade sigma, CAETHG_33 CLJU_c1233 CLRAG_1 RpsG/SigG 15 0 1470 2510 proteína do fator I do hospedeiro CAETHG_02 CLJU_c2121 CLRAG_ 07 0 30790 2511 RNase HII CAETHG_33 CLJU_c1296 CLRAG_ 78 0 10840 2512 ribonuclease-3 CAETHG_33 CLJU_c1283 CLRAG_ 64 0 10980 2513 ribonuclease Z CAETHG_07 CLJU_c2664 CLRAG_ 45 0 08510 2514 proteína determinante da forma da haste CAETHG_23 CLJU_c0722 CLRAG_ MreB 56, 0, 28110 CAETHG_28 CLJU_c0250 14 0 2515 23S rRNA (uracil1939-C5)-metiltransferase CAETHG_24 CLJU_c0327 CLRAG_ 42 0 28870 2516 S-adenosilmetionina: tRNA CAETHG_12 CLJU_c3381 CLRAG_ ribosiltransferase-isomerase 79 0 24470
122 / 294 2517 Proteína de síntese LuxS autoindutora 2 CAETHG_04 CLJU_c2348 CLRAG_ (AI-2) com sensor S-ribosil-homocisteína- 12 0 17630 liase/quórum 2518 Transportador de efluxo da família RND, CAETHG_25 CLJU_c0439 CLRAG_ subunidade MFP 07 0 37720 2519 fator de alongamento específico da CAETHG_28 CLJU_c0748 CLRAG_ selenocisteína 40 0, 32210 CLJU_c2770 0 2520 selenofosfato sintase 2.7.9.3 CAETHG_28 CLJU_c0746 CLRAG_ 38 0, 32230 CLJU_c2772 0 2521 sistema de dois componentes, sensor CAETHG_01 CLJU_c2078 CLRAG_ histidina quinase YcbA 63 0 19220 2522 proteína sítio-determinante do septo MinC CAETHG_28 CLJU_c0726 CLRAG_ 18 0 26580 2523 serina O-acetiltransferase 2.3.1.31, CAETHG_17 CLJU_c3930 CLRAG_
2.3.1.30 75 0 21510 2524 glicina hidroximetiltransferase 2.1.2.1 CAETHG_32 CLJU_c1150 CLRAG_1 41 0 1950 2525 proteína serina/treonina quinase CAETHG_33 CLJU_c1262 CLRAG_1 44 0 1180 2526 seril-tRNA sintetase CAETHG_21 CLJU_c0017 CLRAG_ 37 0 20150 2527 chiquimato desidrogenase 1.1.1.282, CAETHG_09 CLJU_c2912 CLRAG_
1.1.1.25 04 0 35120 2528 chiquimato quinase 2.7.1.71 CAETHG_09 CLJU_c2911 CLRAG_ 03 0 35110 2529 Quinase prevista CAETHG_34 CLJU_c1363 CLRAG_ 45 0 10240 2530 Regulador transcricional contendo CAETHG_01 CLJU_c2024 CLRAG_ domínios PAS, ATPase do tipo AAA e Fis 05, 0, 17190 de ligação ao DNA CAETHG_04 CLJU_c2397 63 0 2531 sinal peptidase I CAETHG_26 CLJU_c0598 CLRAG_ 96 0 07210 2532 sinal peptidase I CAETHG_33 CLJU_c1294 CLRAG_ 76 0 10860 2533 subunidade de partículas de CAETHG_33 CLJU_c1288 CLRAG_ reconhecimento de sinal FFH/SRP54 70 0 10920 (srp54) 2534 receptor de partículas com reconhecimento CAETHG_33 CLJU_c1286 CLRAG_ de sinal fundido 68 0 10940 2535 Proteína contendo S-box do domínio PAS CAETHG_05 CLJU_c2487 CLRAG_ 52, 0, 17930 CAETHG_05 CLJU_c2485 54 0 2536 proteína de ligação de fita simples CAETHG_21 CLJU_c4278 CLRAG_ 04 0 25590 2537 proteína de ligação ao DNA de fita simples CAETHG_31 CLJU_c1015 CLRAG_ 05 0 13220 2538 siro-hidroclorina cobaltoquelatase 4.99.1.3 CAETHG_111 CLJU_c3185 CLRAG_ 3 0 02480 2539 Proteína básica pequena CAETHG_31 CLJU_c1063 CLRAG_ 53 0 12710 2540 antiportador de sódio/próton-potássio CAETHG_29 CLJU_c0897 CLRAG_ GerN, família CPA2 91 0 07530 2541 espermidina sintase 2.5.1.16 CAETHG_08 CLJU_c2820 CLRAG_ 20 0 09150
123 / 294 2542 Regulador da atividade de protease HflC, CAETHG_27 CLJU_c0694 CLRAG_ superfamília estomatina/proibitina 84 0 18780 2543 sistema de dois componentes, regulador de CAETHG_32 CLJU_c1122 CLRAG_ resposta, proteína de esporulação estágio 0 12 0 12240 2544 antagonista do fator B anti-sigma CAETHG_24 CLJU_c0286 CLRAG_ 01 0 28460 2545 proteína de esporulação estágio II D CAETHG_06 CLJU_c2549 CLRAG_ 18 0 03710 2546 N-acetilmuramoil-L-alanina amidase CAETHG_24 CLJU_c0298 CLRAG_ 13 0 28590 2547 proteína de germinação de esporos KA CAETHG_17 CLJU_c3897 CLRAG_ 45 0 21150 2548 proteína de germinação de esporos KB CAETHG_17 CLJU_c3899 CLRAG_ 47 0 21170 2549 proteína de germinação de esporos KC CAETHG_17 CLJU_c3898 CLRAG_ 46 0 21160 2550 proteína de esporulação putativa YtaF CAETHG_26 CLJU_c0585 CLRAG_ 80 0 07090 2551 Proteína ribossômica SSU S12P CAETHG_34 CLJU_c1326 CLRAG_ metiltiotransferase 09 0 10530 2552 Proteína ribossômica S14P SSU CAETHG_19 CLJU_c4091 CLRAG_ 34 0 23100 2553 Proteína ribossômica SSU S15P CAETHG_34 CLJU_c1320 CLRAG_ 03 0 10590 2554 proteína ribossômica S16 da subunidade CAETHG_33 CLJU_c1289 CLRAG_ pequena 71 0 10910 2555 Proteína ribossômica S17P SSU CAETHG_19 CLJU_c4095 CLRAG_ 38 0 23140 2556 Proteína ribossômica S18P SSU CAETHG_21 CLJU_c4277 CLRAG_ 03 0 25580 2557 proteína ribossômica pequena S20 da CAETHG_28 CLJU_c0790 CLRAG_ subunidade 83 0 25380 2558 proteína ribossômica pequena S2 da CAETHG_33 CLJU_c1302 CLRAG_ subunidade 85 0 10770 2559 proteína de modulação putativa sigma-54 CAETHG_23 CLJU_c0262 CLRAG_ 63 0 28220 2560 proteína ribossômica pequena S9 da CAETHG_19 CLJU_c4070 CLRAG_ subunidade 13 0 22890 2561 regulador transcricional da família DeoR, CAETHG_23 CLJU_c0249 CLRAG_ proteína de esporulação D do estágio III 55 0 28100 2562 proteína de esporulação estágio IV CAETHG_33 CLJU_c1249 CLRAG_1 31 0 1310 2563 proteína de esporulação estágio V CAETHG_34 CLJU_c1330 CLRAG_ 13 0 10490 2564 Serina protease, família subtilisina CAETHG_34 CLJU_c1349 CLRAG_ 33 0, 10300 CLJU_c1356 0 2565 subunidade de flavoproteína succinato 1.3.99.1 CAETHG_03 CLJU_c2280 CLRAG_ desidrogenase/fumarato redutase 42 0 01990 2566 succinil-diaminopimelato dessuccinilase CAETHG_38 CLJU_c1739 CLRAG_ 52 0 01300 2567 Transportador MFS, família de CAETHG_39 CLJU_c1828 CLRAG_ transportadores de açúcar (SP) 35 0 00340 2568 Proteína tipo TadE CAETHG_08 CLJU_c2885 CLRAG_ 81 0 34930 2569 2-hidroxi-3-oxopropionato redutase 1.1.1.60 CAETHG_21 CLJU_c2809 CLRAG_ 86 0, 19890 CLJU_c0068 0
124 / 294 2570 tiamina pirofosfoquinase 2.7.6.2 CAETHG_33 CLJU_c1265 CLRAG_1 47 0 1150 2571 tiamina-fosfato difosforilase 2.5.1.3 CAETHG_12 CLJU_c3306 CLRAG_ 04 0 15270 2572 tiamina-fosfato pirofosforilase 2.5.1.3 CAETHG_34 CLJU_c1344 CLRAG_ 28 0 10350 2573 Tioesterase prevista 3.1.2. CAETHG_17 CLJU_c3935 CLRAG_ 80 0 21560 2574 tiorredoxinaa CAETHG_18 CLJU_c4050 CLRAG_ 93 0 22690 2575 tiorredoxinaa redutase (NADPH) 1.6.4.5, CAETHG_18 CLJU_c4049 CLRAG_
1.8.1.9 92 0 22680 2576 treonina desidratase 4.3.1.19 CAETHG_36 CLJU_c1509 CLRAG_ 11 0 24280 2577 treonina quinase CAETHG_111 CLJU_c3183 CLRAG_ 1 0 02460 2578 treonina sintase 4.2.3.1, CAETHG_12 CLJU_c3318 CLRAG_
4.2.99.2 17 0 15110 2579 treonil-tRNA sintetase CAETHG_13 CLJU_c3447 CLRAG_ 47 0 14550 2580 dTMP quinase 2.7.4.12, CAETHG_22 CLJU_c0139 CLRAG_
2.7.4.9 45 0 27050 2581 Proteína contendo repetição de CAETHG_13 CLJU_c3420 CLRAG_ tetratricopeptídeo 19 0 14350 2582 Proteína contendo repetição de CAETHG_15 CLJU_c3615 CLRAG_ tetratricopeptídeo 25 0 06670 2583 Proteína contendo repetição de CAETHG_18 CLJU_c4051 CLRAG_ tetratricopeptídeo 94 0 22700 2584 Proteína contendo repetição TPR CAETHG_18 CLJU_c4054 CLRAG_ 97 0 22730 2585 frutose-6-fosfato aldolase, família 2.2.1.2 CAETHG_06 CLJU_c2596 CLRAG_ TalC/MipB 65 0 04100 2586 transaldolase 2.2.1.2 CAETHG_18 CLJU_c3964 CLRAG_ 10 0 21880 2587 proteína de transcrição antiterminação nusG CAETHG_19 CLJU_c4117 CLRAG_ 60 0 23360 2588 fator de terminação da transcrição Rho CAETHG_23 CLJU_c0222 CLRAG_ 27 0 27820 2589 fator de acoplamento da transcrição-reparo CAETHG_20 CLJU_c4172 CLRAG_ 01 0 04850 2590 proteína não caracterizada CAETHG_23 CLJU_c0268 CLRAG_ 69 0 28280 2591 Regulador transcricional de ligação ao CAETHG_04 CLJU_c2422 CLRAG_ DNA LsrR, família DeoR 80 0 24900 2592 Regulador transcricional da família BlaI, CAETHG_05 CLJU_c2516 CLRAG_ repressor da penicilinase 84 0 03500 2593 Regulador transcricional de ligação ao CAETHG_06 CLJU_c2564 CLRAG_ DNA, família MerR 33 0 03840 2594 Regulador transcricional da família CAETHG_06 CLJU_c2621 CLRAG_ Lrp/AsnC, proteína reguladora responsiva à 97 0 04290 leucina 2595 Proteína reguladora da família MerR HTH CAETHG_07 CLJU_c2677 CLRAG_ 58 0 08640 2596 Regulador transcricional de ligação ao CAETHG_07 CLJU_c2694 CLRAG_ DNA, família PadR 78 0 08790 2597 Proteína contendo domínio de interação CAETHG_15 CLJU_c3695 CLRAG_ Sigma-54 56 0 36490 2598 repressor transcricional com detecção redox CAETHG_15 CLJU_c3725 CLRAG_ 81 0 36690
125 / 294 2599 Regulador transcricional de ligação ao CAETHG_17 CLJU_c3937 CLRAG_ DNA, família LysR 82 0 21580 2600 Hélice-giro-hélice CAETHG_18 CLJU_c4013 CLRAG_ 62 0 22360 2601 interferase mRNA MazF CAETHG_24 CLJU_c0304 CLRAG_ 19 0 28650 2602 Regulador transcricional da família CAETHG_24 CLJU_c0415 CLRAG_ Lrp/AsnC, proteína reguladora responsiva à 77 0 26910 leucina 2603 Proteína de ligação ao DNA do tipo AraC CAETHG_24 CLJU_c0429 CLRAG_ 97 0 26770 2604 Regulador de resposta de ligação ao DNA, CAETHG_25 CLJU_c0459 CLRAG_ família OmpR, contém os domínios REC e 31, 0, 37950 hélice alada (wHTH) CAETHG_28 CLJU_c0775 67 0 2605 Regulador transcricional, contém domínio CAETHG_34 CLJU_c1371 CLRAG_ HTH da família XRE 53 0 10130 2606 Regulador transcricional da família AbrB, CAETHG_19 CLJU_c4170 CLRAG_ proteína de esporulação estágio V 99 0 04830 2607 Proteína de ligação ao DNA do tipo AraC CAETHG_09 CLJU_c2933 CLRAG_ 26 0 35340 2608 regulador transcricional, família AraC CAETHG_11 CLJU_c3295 CLRAG_ 93 0 15380 2609 regulador transcricional, família AraC CAETHG_14 CLJU_c3502 CLRAG_ 11 0 26280 2610 Proteína de ligação ao DNA do tipo AraC CAETHG_36 CLJU_c1524 CLRAG_ 26 0 24110 2611 regulador transcricional, família ArgR CAETHG_30 CLJU_c1119 CLRAG_ 19, 0, 13780 CAETHG_32 CLJU_c0925 08 0 2612 Regulador transcricional da família ArsR CAETHG_02 CLJU_c2179 CLRAG_ 67 0 31330 2613 regulador transcricional, família ArsR CAETHG_09 CLJU_c2953 CLRAG_ 47 0 35520 2614 Regulador transcricional de ligação ao CAETHG_22 CLJU_c0186 CLRAG_ DNA, família ArsR 89 0 27460 2615 regulador transcricional, família ArsR CAETHG_36 CLJU_c1564 CLRAG_ 63 0 32690 2616 Regulador transcricional da família CAETHG_01 CLJU_c2105 CLRAG_ Lrp/AsnC, proteína reguladora responsiva à 90 0 30630 leucina 2617 regulador de transcrição, família CAETHG_12 CLJU_c3400 CLRAG_ BadM/Rrf2 98 0 14150 2618 regulador de transcrição, família CAETHG_32 CLJU_c1210 CLRAG_1 BadM/Rrf2 92 0 1700 2619 regulador transcricional, família DeoR CAETHG_01 CLJU_c2061 CLRAG_ 44 0 19370 2620 regulador transcricional, família DeoR CAETHG_06 CLJU_c2608 CLRAG_ 77 0 04170 2621 regulador transcricional, família DeoR CAETHG_36 CLJU_c1577 CLRAG_ 85 0 32930 2622 regulador transcricional de ligação ao 2.6.1.23, CAETHG_00 CLJU_c1960 CLRAG_ DNA, família MocR, contém um domínio 2.6.1.1 37 0 39520 aminotransferase 2623 regulador transcricional de ligação ao 2.6.1.23, CAETHG_11 CLJU_c3206 CLRAG_ DNA, família MocR, contém um domínio 2.6.1.1 34 0 02690 aminotransferase 2624 Regulador transcricional de ligação ao CAETHG_19 CLJU_c4065 CLRAG_ DNA YhcF, família GntR 08 0 22840
126 / 294 2625 Regulador transcricional da família GntR, CAETHG_22 CLJU_c0123 CLRAG_ repressor transcricional da operação 31 0 30190 arabinose 2626 Regulador transcricional da família GntR CAETHG_27 CLJU_c0676 CLRAG_ 67 0 18560 2627 Regulador transcricional da família GntR, CAETHG_34 CLJU_c1391 CLRAG_ repressor transcricional do complexo 74 0 09220 piruvato desidrogenase 2628 proteína reguladora, família gntR CAETHG_39 CLJU_c1806 CLRAG_ 15 0 00590 2629 regulador transcricional, família HxlR CAETHG_04 CLJU_c3776 CLRAG_ 86 0, 24950 CLJU_c2428 0 2630 regulador transcricional, família HxlR CAETHG_38 CLJU_c1776 CLRAG_ 84 0 00950 2631 regulador transcricional, família IclR CAETHG_09 CLJU_c2938 CLRAG_ 32 0 35380 2632 regulador transcricional, família IclR CAETHG_21 CLJU_c0059 CLRAG_ 77 0 19990 2633 regulador transcricional, família IclR CAETHG_34 CLJU_c1360 CLRAG_ 42 0 10270 2634 regulador transcricional, família LacI CAETHG_22 CLJU_c0190 CLRAG_ 93 0 27500 2635 Regulador transcricional de ligação ao CAETHG_00 CLJU_c1979 CLRAG_ DNA, família LysR 59 0 39340 2636 Regulador transcricional de ligação ao CAETHG_12 CLJU_c3330 CLRAG_ DNA, família LysR 29 0 14960 2637 regulador transcricional, família LysR CAETHG_17 CLJU_c3894 CLRAG_ 42 0 21120 2638 regulador transcricional, família LytTR CAETHG_05 CLJU_c2467 CLRAG_ 32 0 18160 2639 regulador transcricional, família LytTR CAETHG_07 CLJU_c2646 CLRAG_ 27 0 04550 2640 Regulador transcricional de ligação ao CAETHG_03 CLJU_c2283 CLRAG_ DNA, família MarR 45 0 01960 2641 regulador transcricional, família MarR CAETHG_20 CLJU_c4220 CLRAG_ 51 0 05310 2642 Regulador transcricional de ligação ao CAETHG_25 CLJU_c0469 CLRAG_ DNA, família MarR 41 0 38070 2643 regulador transcricional, família MarR CAETHG_36 CLJU_c1545 CLRAG_ 46 0 32580 2644 regulador transcricional, família MarR CAETHG_40 CLJU_c1889 CLRAG_ 23 0 40080 2645 Regulador transcricional de ligação ao CAETHG_32 CLJU_c1152 CLRAG_1 DNA, família MerR 43 0 1930 2646 repressor responsivo a poli-beta- CAETHG_03 CLJU_c2278 CLRAG_ hidroxibutirato 40 0 02010 2647 Regulador transcricional de ligação ao CAETHG_05 CLJU_c2484 CLRAG_ DNA, família PadR 51 0 17940 2648 Regulador transcricional de ligação ao CAETHG_09 CLJU_c2985 CLRAG_ DNA, família PadR 84 0 35860 2649 Regulador transcricional de ligação ao CAETHG_17 CLJU_c3878 CLRAG_ DNA, família PadR 26 0 21040 2650 Regulador transcricional de ligação ao CAETHG_36 CLJU_c1604 CLRAG_ DNA, família PadR 98 0 33010 2651 regulador transcricional, família RpiR CAETHG_02 CLJU_c2135 CLRAG_ 21 0 30910 2652 regulador transcricional, família TetR CAETHG_04 CLJU_c2393 CLRAG_ 59 0 17230
127 / 294 2653 regulador transcricional, família TetR CAETHG_06 CLJU_c2562 CLRAG_ 31 0 03820 2654 regulador transcricional, família TetR CAETHG_09 CLJU_c2942 CLRAG_ 36 0 35410 2655 regulador transcricional, família TetR CAETHG_09 CLJU_c2946 CLRAG_ 40 0 35450 2656 regulador transcricional, família TetR CAETHG_13 CLJU_c3490 CLRAG_ 88 0 26140 2657 regulador transcricional, família TetR CAETHG_14 CLJU_c3586 CLRAG_ 93 0 06360 2658 regulador transcricional, família TetR CAETHG_21 CLJU_c0072 CLRAG_ 89 0 19860 2659 regulador transcricional, família TetR CAETHG_24 CLJU_c0407 CLRAG_ 70 0 29180 2660 regulador transcricional, família TetR CAETHG_31 CLJU_c1051 CLRAG_ 41 0 12830 2661 regulador transcricional, família TetR CAETHG_34 CLJU_c1410 CLRAG_ 91 0 09450 2662 regulador transcricional, família CAETHG_39 CLJU_c1799 CLRAG_ TraR/DksA 08 0 00640 2663 regulador transcricional, família XRE com CAETHG_03 CLJU_c2314 CLRAG_ sensor cupin 77 0 01670 2664 regulador transcricional, família XRE com CAETHG_34 CLJU_c1368 CLRAG_ sensor cupin 50 0 10190 2665 glucocinase 2.7.1.11 CAETHG_01 CLJU_c2081 CLRAG_ 66 0 19190 2666 transquetolase 2.2.1.1 CAETHG_24 CLJU_c0305 CLRAG_ 20 0 28660 2667 transquetolase 2.2.1.1 CAETHG_24 CLJU_c0306 CLRAG_ 21 0 28670 2668 fator de alongamento 2 da tradução (EF- CAETHG_19 CLJU_c4138 CLRAG_ 2/EF-G) 79 0 23570 2669 fator de alongamento G CAETHG_19 CLJU_c4107 CLRAG_ 50 0 23260 2670 fator de iniciação da tradução bacteriana 1 CAETHG_19 CLJU_c4082 CLRAG_ (bIF-1) 25 0 23010 2671 transportador, família NhaC CAETHG_29 CLJU_c0888 CLRAG_ 83 0 07600 2672 Antiportador Na +/H + NhaD CAETHG_07 CLJU_c2647 CLRAG_ 28 0 04560 2673 fator de gatilho CAETHG_14 CLJU_c3565 CLRAG_ 73 0 06180 2674 triosefosfato isomerase 5.3.1.1 CAETHG_17 CLJU_c3913 CLRAG_ 58 0 21280 2675 trifosforibosil-desfosfo-CoA sintase CAETHG_06 CLJU_c2537 CLRAG_ 06 0 03640 2676 2-tiouridilase específica para RNAt CAETHG_04 CLJU_c2338 CLRAG_ 02 0 01370 2677 tRNA (guanina-N(7)-)-metiltransferase CAETHG_09 CLJU_c2966 CLRAG_ 64 0 35660 2678 tRNA (guanina37-N1)-metiltransferase CAETHG_33 CLJU_c1292 CLRAG_ 74 0 10880 2679 23S rRNA (uracil-5-)-metiltransferase CAETHG_29 CLJU_c0875 CLRAG_ RumA 69 0 07740 2680 tRNA dimetilaliltransferase CAETHG_02 CLJU_c2122 CLRAG_ 08 0 30800 2681 poli(A) polimerase CAETHG_22 CLJU_c0152 CLRAG_ 58 0 27180 2682 tRNA pseudouridina38-40 sintase 4.2.1.70 CAETHG_19 CLJU_c4072 CLRAG_ 15 0 22910
128 / 294 2683 tRNA pseudouridina55 sintase 4.2.1.70 CAETHG_34 CLJU_c1318 CLRAG_ 01 0 10610 2684 RNAt-2-metiltio-N6-dimetilalladenosina CAETHG_02 CLJU_c2125 CLRAG_ sintase 11 0 30830 2685 tRNA (adenina34) desaminase CAETHG_21 CLJU_c0076 CLRAG_ 92 0 19820 2686 tRNA-U20-di-hidrouridina sintase CAETHG_19 CLJU_c4151 CLRAG_ 85 0 04640 2687 RNAt-U20a, U20b-di-hidrouridina sintase CAETHG_17 CLJU_c3879 CLRAG_ 27 0 21050 2688 Família de repressores operon Trp CAETHG_15 CLJU_c3699 CLRAG_ 60 0 36530 2689 triptofano sintase, cadeia alfa CAETHG_37 CLJU_c1613 CLRAG_ 07 0 33100 2690 cadeia beta do triptofano sintase 4.2.1.20, CAETHG_37 CLJU_c1612 CLRAG_
4.1.2.8 06 0 33090 2691 triptofanil-tRNA sintetase CAETHG_16 CLJU_c3829 CLRAG_ 86 0 20760 2692 Proteínas relacionadas a TspO e MBR CAETHG_06 CLJU_c2542 CLRAG_ 11 0 03700 2693 Proteína contendo domínio HAMP CAETHG_32 CLJU_c1178 CLRAG_1 69 0 1760 2694 regulador transcricional de dois CAETHG_18 CLJU_c3969 CLRAG_ componentes, família AraC 15 0 21940 2695 regulador transcricional de dois CAETHG_08 CLJU_c2887 CLRAG_ componentes, família LuxR 83 0 34950 2696 regulador transcricional de dois CAETHG_14 CLJU_c3517 CLRAG_ componentes, família LytTR 25 0 05680 2697 regulador transcricional de dois CAETHG_15 CLJU_c3732 CLRAG_ componentes, família LytTR 88 0 36760 2698 regulador transcricional de dois CAETHG_34 CLJU_c1382 CLRAG_ componentes, família LytTR 65 0 10020 2699 Regulador de resposta de ligação ao DNA, CAETHG_00 CLJU_c1964 CLRAG_ família OmpR, contém os domínios REC e 41 0 39500 hélice alada (wHTH) 2700 Regulador de resposta de ligação ao DNA, CAETHG_11 CLJU_c1177 CLRAG_ família OmpR, contém os domínios REC e 95, 0, 15360 hélice alada (wHTH) CAETHG_32 CLJU_c3868 68 0, CLJU_c3297 0 2701 Regulador de resposta de ligação ao DNA, CAETHG_34 CLJU_c1439 CLRAG_ família OmpR, contém os domínios REC e 98, 0, 09500 hélice alada (wHTH) CAETHG_35 CLJU_c1417 13 0 2702 sistema de dois componentes, família NarL, CAETHG_08 CLJU_c2888 CLRAG_ sensor histidina quinase DegS 84 0 34960 2703 peptidase líder (peptidase prepilina)/N- CAETHG_26 CLJU_c0561 CLRAG_ metiltransferase 43 0 06740 2704 proteína de montagem de pilus tipo IV PilC CAETHG_31 CLJU_c1091 CLRAG_ 80 0 12550 2705 pantotenato-quinase tipo III 2.7.1.33 CAETHG_19 CLJU_c4152 CLRAG_ 86 0 04650 2706 ATP sintase específica do flagelo CAETHG_31 CLJU_c1025 CLRAG_ 15 0 13120 2707 tirosil-tRNA sintetase CAETHG_16 CLJU_c3821 CLRAG_ 77 0 20670 2708 UDP-galactopiranose mutase 5.4.99.9 CAETHG_12 CLJU_c3353 CLRAG_ 52 0 24750
129 / 294 2709 UDP-glicose 4-epimerase 5.1.3.7, CAETHG_02 CLJU_c2171 CLRAG_
5.1.3.2 58 0 31300 2710 UDP-N-acetilglucosamina 1- 2.5.1.7 CAETHG_20 CLJU_c0246 CLRAG_ carboxiviniltransferase 27, 0, 05090 CAETHG_23 CLJU_c4198 52 0 2711 Epimerase UDP-GlcNAc3NAcA 5.1.3.14 CAETHG_13 CLJU_c3407 CLRAG_ 05 0 14220 2712 UDP-N-acetilglucosamina 2-epimerase 5.1.3.14 CAETHG_23 CLJU_c0235 CLRAG_ (sem hidrolisação) 41 0 27960 2713 1,2-diacilglicerol beta-glucosiltransferase CAETHG_23 CLJU_c0216 CLRAG_ processativa 21 0 27760 2714 UDP-N-acetilglucosamina-N- 2.4.1.227 CAETHG_30 CLJU_c0933 CLRAG_ acetilmuramilpentapeptídeo N- 28 0 13770 acetilglucosamina transferase 2715 UDP-N-acetilmuramato desidrogenase 1.1.1.158 CAETHG_24 CLJU_c0318 CLRAG_ 33 0 28790 2716 UDP-N-acetilmuramato--L-alanina ligase 6.3.2.8 CAETHG_20 CLJU_c4181 CLRAG_ 10 0 04940 2717 UDP-N-acetilmuramoil-tripipeptídeo--D- 6.3.2.10, CAETHG_31 CLJU_c1058 CLRAG_ alanil-D-alanina ligase 6.3.2.15 48 0 12760 2718 UDP-N-acetilmuramoilalanina--D- 6.3.2.9 CAETHG_19 CLJU_c4145 CLRAG_ glutamato ligase 80 0 04580 2719 UDP-N-acetilmuramoilalanil-D-glutamato- 6.3.2.13 CAETHG_31 CLJU_c1057 CLRAG_ -2,6-diaminopimelato ligase 47 0 12770 2720 difosfato de undecaprenil sintase CAETHG_14 CLJU_c3547 CLRAG_ 55 0 06000 2721 difosfato de undecaprenil sintase CAETHG_33 CLJU_c1306 CLRAG_ 89 0 10730 2722 undecaprenil-difosfatase 3.6.1.27 CAETHG_27 CLJU_c0622 CLRAG_ 22 0 07500 2723 biossíntese de exopolissacarídeos poliprenil CAETHG_13 CLJU_c3402 CLRAG_ glicosilfosfotransferase 00 0 14170 2724 uracil fosforibosiltransferase 2.4.2.9 CAETHG_23 CLJU_c0232 CLRAG_ 37 0 27920 2725 uridilato quinase 2.7.4.14, CAETHG_33 CLJU_c1304 CLRAG_
2.7.4.-, 87 0 10750
2.7.4.4,
2.7.4.22,
2.7.4.9 2726 urocanato-hidratase 4.2.1.49 CAETHG_02 CLJU_c2148 CLRAG_ 34 0 31040 2727 uroporfirinogênio III 2.1.1.107, CAETHG_11 CLJU_c3197 CLRAG_ metiltransferase/sintase 4.2.1.75, 25 0 02600
1.3.1.76 2728 UTP-glicose-1-fosfato uridililtransferase 2.7.7.9 CAETHG_13 CLJU_c0451 CLRAG_ 18, 0, 14340 CAETHG_25 CLJU_c3419 23 0 2729 valil-tRNA sintetase CAETHG_13 CLJU_c3469 CLRAG_ 66 0 14770 2730 Proteína de resistência a antibióticos CAETHG_31 CLJU_c1080 CLRAG_ glicopeptídeos 70 0 22450 2731 peptidodoglicano lipídico II flipase putativa CAETHG_13 CLJU_c3404 CLRAG_ 02 0 14190 2732 Xaa-Pro dipeptidase CAETHG_09 CLJU_c2964 CLRAG_ 61 0 35630
130 / 294 2733 Xaa-Pro aminopeptidase 3.4.11.1, CAETHG_31 CLJU_c1100 CLRAG_
3.4.11.2, 89 0 12460
3.4.13.3,
3.4.11.23 2734 CO ou xantina desidrogenase, subunidade 1.1.1.204, CAETHG_09 CLJU_c2994 CLRAG_ de ligação ao Mo 1.17.1.4 93 0 35940 2735 xantina desidrogenase, apoproteína da 1.1.1.204, CAETHG_04 CLJU_c2359 CLRAG_ subunidade de ligação ao molibdênio 1.17.1.4 23 0 17580 2736 CO ou xantina desidrogenase, subunidade CAETHG_04 CLJU_c2390 CLRAG_ de ligação ao Mo 56 0 17260 2737 xiluloquinase 2.7.1.17 CAETHG_39 CLJU_c1825 CLRAG_ 33 0 00350 2738 fosfolipase C CAETHG_03 CLJU_c2202 CLRAG_ 00 0 31550 2739 Treonina desidrogenase 4.2.1.20, CAETHG_05 CLJU_c2486 CLRAG_
4.1.2.8 53 0 17920 2740 Componente desidrogenase contendo CAETHG_06 CLJU_c2545 * agrupamento Fe-S 14 0 2741 1,4-di-hidroxi-2-naftoato-preniltransferase 2.5.1.- CAETHG_18 CLJU_c4028 * 74 0 2742 2-desoxi-D-gluconato 3-desidrogenase CAETHG_06 CLJU_c2585 * 54 0 2743 * CLJU_c4079 CLRAG_ 0 22980 2744 6-fosfogluconato desidrogenase 1.1.1.44 CAETHG_32 CLJU_c1159 * 50 0 2745 6-piruvoiltetra-hidropterina/6-carboxitetra- CAETHG_24 CLJU_c0402 * hidropterina sintase 65 0 2746 Proteína de ligação ao ATP do sistema de CAETHG_07 CLJU_c2686 * transporte do tipo ABC-2 70 0 2747 Proteína semelhante a Abi CAETHG_11 CLJU_c3242 * 72 0 2748 aconitase 4.2.1.3, CAETHG_10 CLJU_c3046 *
4.2.1.4 51, 0, CAETHG_27 CLJU_c0662 52 0 2749 Transportador de aminoácidos CAETHG_20 CLJU_c4250 * 75 0 2750 aldose 1-epimerase 5.1.3.3 CAETHG_39 CLJU_c1827 * 34 0 2751 alantoinase 3.5.2.5 CAETHG_36 CLJU_c1533 * 35 0 2752 proteína de ligação putativa ao ATP de CAETHG_08 CLJU_c2764 * sistema de transporte de aminoácidos 89 0, CLJU_c2894 0 2753 proteína de ligação putativa a substratos do CAETHG_08 CLJU_c2896 * sistema de transporte de aminoácidos 91 0 2754 subunidade A anaeróbica de sulfito redutase 1.8.7.1 CAETHG_06 CLJU_c2547 * 16 0 2755 sulfito anaeróbico redutase, subunidade B 1.8.7.1 CAETHG_06 CLJU_c2548 * 17 0 2756 arginina desiminase 3.5.3.6 CAETHG_30 CLJU_c0927 * 21 0 2757 arginina: antiportador de ornitina/lisina CAETHG_30 CLJU_c0929 * permease 24 0, CLJU_c2799 0 2758 subunidade catalítica de aspartato 2.1.3.2 CAETHG_36 CLJU_c1529 * carbamoil-transferase 31 0
131 / 294 2759 aminoácido aminotransferase de cadeia 2.6.1.67, CAETHG_29 CLJU_c0874 CLRAG_ ramificada 2.6.1.42, 68 0 07750
2.6.1.6 2760 * CLJU_c2357 CLRAG_ 0, 17600 CLJU_c2800 0 2761 carbamato quinase 2.7.2.2 CAETHG_04 CLJU_c1530 * 21, 0 CAETHG_36 32 2762 regulador de armazenamento de carbono, CAETHG_30 CLJU_c0954 * CsrA 49 0 2763 4-carboximuconolactona descarboxilase 4.1.1.44 CAETHG_15 CLJU_c3603 * 12 0 2764 [citrato (pro-3S)-liase] ligase CAETHG_06 CLJU_c2535 * 04 0 2765 subunidade gama citrato liase (proteína 2.3.3.1 CAETHG_06 CLJU_c3049 * transportadora de acila) 03, 0, CAETHG_10 CLJU_c2534 54 0 2766 subunidade alfa-citrato-liase/citrato CoA- 2.3.3.1 CAETHG_06 CLJU_c3047 * transferase 01, 0, CAETHG_10 CLJU_c2532 52 0 2767 subunidade beta-citrato-liase/citril-CoA 2.3.3.1 CAETHG_06 CLJU_c3048 * liase 02, 0, CAETHG_10 CLJU_c2533 53 0 2768 D-3-fosfoglicerato desidrogenase 1.1.1.95 CAETHG_32 CLJU_c1158 * 49 0 2769 regulador de desoxirribonucleosídeo CAETHG_39 CLJU_c1811 * 20 0 2770 alantoinase 3.5.2.5 CAETHG_36 CLJU_c1534 * 36 0 2771 apoproteína da subunidade alfa de CAETHG_18 CLJU_c4022 * transferência de elétrons da flavoproteína 68 0 2772 subunidade beta da flavoproteína de CAETHG_18 CLJU_c4023 * transferência de elétrons 69 0 2773 2,4-dienoil-CoA redutase CAETHG_08 CLJU_c2874 CLRAG_ 69 0 34820 2774 2,4-dienoil-CoA redutase CAETHG_37 CLJU_c1616 * 11 0, CLJU_c3859 0 2775 proteína de utilização de etanolamina EutN CAETHG_18 CLJU_c3978 CLRAG_ 24, 0, 22030 CAETHG_32 CLJU_c1193 84 0 2776 proteína de fixação de nitrogênio NifB CAETHG_04 CLJU_c2354 * 18 0 2777 Regulador transcricional da família de CAETHG_00 CLJU_c1941 * peles, regulador da captação férrica 18 0 2778 proteína tipo ferredoxina CAETHG_18 CLJU_c4020 * 66 0 2779 flagelina CAETHG_30 CLJU_c0963 * 58 0 2780 proteína contendo domínio de diguanilato CAETHG_24 CLJU_c0401 * ciclase (GGDEF) 64 0 2781 gluconocinase 2.7.1.12 CAETHG_32 CLJU_c1161 * 52 0
132 / 294 2782 Transportador de gluconato de alta CAETHG_08 CLJU_c2816 * afinidade no sistema Gnt-I 16 0 2783 * CLJU_c2811 CLRAG_ 0, 09070 CLJU_c3838 0 2784 glicerol 2-desidrogenase (NAD+) 1.1.1.6 CAETHG_07 CLJU_c2657 * 38 0 2785 glicerol desidratase, subunidade grande 2.3.1.54 CAETHG_32 CLJU_c1183 * independente da cobalamina 74 0 2786 glicerol desidratase, subunidade pequena 2.3.1.54 CAETHG_32 CLJU_c1184 * independente de cobalamina 75 0 2787 glicosiltransferase putativa, associada à CAETHG_24 CLJU_c0400 * exosortase G 63 0 2788 Flipase putativa GtrA (translocase CAETHG_17 CLJU_c3888 * transmembranar de glicose ligada a 36 0 bactoprenol) 2789 Proteína contendo domínio de ligação ao CAETHG_00 CLJU_c1926 * substrato LysR 02 0 2790 semelhante à proteína de revestimento de CAETHG_00 CLJU_c1952 * esporos 29 0 2791 proteína de amarração da vesícula CAETHG_00 CLJU_c1962 * 39 0 2792 proteína hipotética CAETHG_00 CLJU_c2002 CLRAG_ 82 0 32500 2793 Biossíntese de molibdopterina ou tiamina CAETHG_00 CLJU_c2023 CLRAG_ adenililtransferase 87, 0, 29690 CAETHG_01 CLJU_c2006 04 0 2794 proteína hipotética CAETHG_01 CLJU_c2113 * 99 0 2795 proteína de função desconhecida CAETHG_02 CLJU_c2116 * (DUF4830) 02 0 2796 proteína hipotética CAETHG_02 CLJU_c2117 * 03 0 2797 proteína hipotética CAETHG_02 CLJU_c2126 * 12 0 2798 proteína hipotética CAETHG_02 CLJU_c2128 * 14 0 2799 Proteína de função desconhecida CAETHG_02 CLJU_c2789 * (DUF1177) 81 0 2800 proteína hipotética CAETHG_02 CLJU_c2197 * 95 0 2801 proteína de função desconhecida CAETHG_03 CLJU_c2227 CLRAG_ (DUF4430) 28 0, 31880 CLJU_c2229 0 2802 Enzima prevista do barril TIM CAETHG_03 CLJU_c2300 * 62 0 2803 Regulador transcricional da família CAETHG_04 CLJU_c2336 * GntR/família MocR aminotransferase 00 0 2804 Regulador transcricional da família CAETHG_04 CLJU_c2337 * GntR/família MocR aminotransferase 01 0 2805 proteína hipotética 3.1.4.2, CAETHG_04 CLJU_c2350 *
3.1.4.46 14 0 2806 proteína hipotética CAETHG_04 CLJU_c2421 * 79 0 2807 proteína de função desconhecida CAETHG_05 CLJU_c2458 * (DUF4111) 21 0
133 / 294 2808 Região proteica do domínio beta de DNA CAETHG_05 CLJU_c2459 * polimerase 22 0 2809 Domínio GrpB, nucleotidiltransferase CAETHG_05 CLJU_c2462 CLRAG_ prevista, família UPF0157 26 0 30000 2810 proteína hipotética CAETHG_06 CLJU_c3095 * 23 0, CLJU_c2757 0, CLJU_c2554 0 2811 Proteína da família de proteínas SdpI/YhfL CAETHG_06 CLJU_c2558 * 27, 0, CAETHG_38 CLJU_c1694 04 0 2812 Quinol monooxigenase YgiN CAETHG_06 CLJU_c2560 * 29 0 2813 CDP-diacilglicerol-glicerol-3-fosfato 3- CAETHG_06 CLJU_c2573 CLRAG_ fosfatidiltransferase 42 0 03930 2814 proteína hipotética CAETHG_06 CLJU_c2599 * 68 0 2815 Proteína conservada não caracterizada CAETHG_06 CLJU_c2600 * (DUF2149) 69 0 2816 Proteína de transporte de biopolímero CAETHG_06 CLJU_c2601 * ExbB/TolQ 70 0 2817 Proteína contendo domínio da fibronectina CAETHG_06 CLJU_c2603 * tipo III 72 0 2818 proteína hipotética CAETHG_06 CLJU_c2610 * 79 0 2819 Fosfodiesterase tipo I/nucleofídeo CAETHG_07 CLJU_c2631 * pirofosfatase 11 0 2820 proteína hipotética CAETHG_07 CLJU_c2641 * 22 0 2821 Proteína transportadora da família ABC-2 CAETHG_07 CLJU_c2685 * 69 0 2822 Proteína de membrana não caracterizada CAETHG_07 CLJU_c2688 * 72 0 2823 proteína de função desconhecida CAETHG_07 CLJU_c2698 * (DUF2935) 82 0 2824 proteína hipotética CAETHG_07 CLJU_c2699 * 83 0 2825 proteína hipotética CAETHG_08 CLJU_c2722 * 07 0 2826 Acetil esterase/lipase CAETHG_08 CLJU_c2869 CLRAG_ 64 0 34770 2827 proteína hipotética CAETHG_09 CLJU_c2941 * 35 0 2828 Proteína de função desconhecida DUF2680 CAETHG_09 CLJU_c2959 CLRAG_ 55 0 35580 2829 Proteína curta contendo domínio C- CAETHG_09 CLJU_c2962 CLRAG_ terminal 58 0 35610 2830 Proteína contendo domínio de ligação 4Fe- CAETHG_09 CLJU_c2963 CLRAG_ 4S 59 0 35620 2831 uroporfirinogênio descarboxilase CAETHG_10 CLJU_c3041 * 46 0 2832 Degradante do Haem CAETHG_10 CLJU_c3067 * 71 0 2833 proteína hipotética CAETHG_10 CLJU_c3089 CLRAG_ 89 0 16270 2834 proteína de função desconhecida CAETHG_10 CLJU_c3090 CLRAG_ (DUF4829) 90 0 16280
134 / 294 2835 proteína hipotética CAETHG_10 CLJU_c3092 CLRAG_ 92 0 16300 2836 proteína de função desconhecida CAETHG_10 CLJU_c3093 CLRAG_ (DUF4829) 98 0 16310 2837 proteína hipotética CAETHG_11 CLJU_c3105 * 03 0 2838 proteína hipotética CAETHG_11 CLJU_c3227 CLRAG_ 55 0 23940 2839 Proteína contendo domínio N-terminal CAETHG_11 CLJU_c3231 CLRAG_ TfoX 61 0 08870 2840 proteína hipotética CAETHG_11 CLJU_c3235 CLRAG_ 65, 0 37640 CAETHG_16 58 2841 Proteína semelhante a Abi CAETHG_11 CLJU_c3241 * 71 0 2842 epoxiqueuosina redutase CAETHG_11 CLJU_c3275 * 73 0 2843 proteína hipotética CAETHG_11 CLJU_c3280 * 78 0 2844 proteína hipotética CAETHG_13 CLJU_c3427 * 26 0 2845 proteína hipotética CAETHG_13 CLJU_c3428 * 27 0 2846 proteína hipotética CAETHG_13 CLJU_c3481 * 79 0 2847 proteína hipotética CAETHG_13 CLJU_c3493 CLRAG_ 91 0 26170 2848 Proteína de função desconhecida CAETHG_14 CLJU_c3501 * (DUF1648) 10 0 2849 Proteína de transformação de DNA CAETHG_14 CLJU_c3510 * 19 0 2850 Protease dependente de Zn (inclui CAETHG_14 CLJU_c3514 CLRAG_ SpoIVFB) 22 0 26390 2851 proteína hipotética CAETHG_14 CLJU_c3530 * 39 0 2852 Proteína de função desconhecida CAETHG_15 CLJU_c3613 * (DUF3892) 23 0 2853 proteína hipotética CAETHG_15 CLJU_c3624 * 34 0 2854 proteína hipotética CAETHG_15 CLJU_c3633 * 41 0 2855 proteína hipotética CAETHG_15 CLJU_c3634 * 42 0 2856 proteína hipotética CAETHG_15 CLJU_c3636 * 44 0 2857 proteína de função desconhecida CAETHG_17 CLJU_c3855 * (DUF4878) 08 0 2858 Proteína de função desconhecida CAETHG_17 CLJU_c3877 * (DUF2889) 25 0 2859 proteína hipotética CAETHG_17 CLJU_c3891 * 39 0 2860 proteína hipotética CAETHG_17 CLJU_c3923 * 68 0 2861 Proteína doliquil-fosfato-manose CAETHG_18 CLJU_c4001 * manosiltransferase 48 0 2862 proteína de função desconhecida CAETHG_18 CLJU_c4004 * (DUF2935) 51 0 2863 proteína hipotética CAETHG_18 CLJU_c4008 * 57 0
135 / 294 2864 Fosfoesterase semelhante à calcineurina CAETHG_18 CLJU_c4018 * 65 0 2865 Tipo YtkA CAETHG_18 CLJU_c4032 * 78 0 2866 proteína hipotética CAETHG_20 CLJU_c4254 * 80 0 2867 proteína hipotética CAETHG_21 CLJU_c0025 * 42 0 2868 Proteína contendo domínio semelhante a CAETHG_21 CLJU_c0043 * AAA 61 0 2869 proteína hipotética CAETHG_21 CLJU_c0044 * 62 0 2870 proteína hipotética CAETHG_21 CLJU_c0045 * 63 0 2871 proteína hipotética CAETHG_21 CLJU_c0046 * 65 0 2872 Regulador transcricional de ligação ao CAETHG_21 CLJU_c0047 CLRAG_ DNA, domínio HTH da família XRE 66 0 33390 2873 Proteína da Superfamília do Facilitador CAETHG_24 CLJU_c0388 * Principal 50 0 2874 proteína hipotética CAETHG_24 CLJU_c0390 * 52 0 2875 succinil-diaminopimelato dessuccinilase CAETHG_24 CLJU_c0391 * 53 0 2876 Proteína contendo domínio Firmicu- CAETHG_24 CLJU_c0398 * CTERM 61 0 2877 proteína da família exosortase XrtG CAETHG_24 CLJU_c0399 * 62 0 2878 proteína hipotética CAETHG_24 CLJU_c0403 * 66 0 2879 proteína contendo domínio repetido CAETHG_24 CLJU_c0427 * conservado 95 0 2880 proteína hipotética CAETHG_24 CLJU_c0428 * 96 0 2881 Proteína permease de sistema de transporte CAETHG_25 CLJU_c0503 CLRAG_ do tipo ABC-2 80 0 38420 2882 proteína hipotética CAETHG_25 CLJU_c0505 CLRAG_ 82 0 38440 2883 proteína hipotética CAETHG_26 CLJU_c0575 * 69 0 2884 proteína hipotética CAETHG_26 CLJU_c0577 * 71 0 2885 Proteína de função desconhecida CAETHG_26 CLJU_c1372 * (DUF2442) 85, 0 CAETHG_34 54 2886 proteína hipotética CAETHG_26 CLJU_c0597 * 94 0 2887 proteína hipotética CAETHG_27 CLJU_c0639 * 34 0 2888 proteína do tipo CoxE contendo domínio CAETHG_27 CLJU_c0642 * VWA 38 0 2889 proteína hipotética CAETHG_27 CLJU_c0643 * 39 0 2890 proteína hipotética CAETHG_27 CLJU_c0644 * 40 0 2891 proteína hipotética CAETHG_28 CLJU_c0766 * 59 0 2892 proteína hipotética CAETHG_28 CLJU_c0767 * 60 0
136 / 294 2893 Proteína permease de sistema de transporte CAETHG_28 CLJU_c0777 * do tipo ABC-2 69 0 2894 2-enoato redutase CAETHG_29 CLJU_c0818 * 13 0 2895 proteína hipotética CAETHG_29 CLJU_c0829 * 24 0 2896 Superfamília de PD-(D/E)XK nuclease CAETHG_29 CLJU_c0830 * 25 0 2897 proteína hipotética CAETHG_29 CLJU_c0834 * 29 0 2898 proteína hipotética CAETHG_29 CLJU_c0835 * 30 0 2899 proteína hipotética CAETHG_29 CLJU_c0837 * 31 0 2900 Proteína contendo domínio de CAETHG_30 CLJU_c0965 * metiltransferase 60 0 2901 Proteína de função desconhecida CAETHG_30 CLJU_c0966 * (DUF2920) 61 0 2902 lisina-N-metilase CAETHG_30 CLJU_c0967 * 62 0 2903 proteína hipotética CAETHG_30 CLJU_c0968 * 63 0 2904 AAA-ATPase prevista CAETHG_30 CLJU_c0995 CLRAG_ 86 0, 13410 CLJU_c0989 0 2905 Nucleotidiltransferase prevista CAETHG_30 CLJU_c0996 * 87 0 2906 Proteína conservada não caracterizada CAETHG_30 CLJU_c0997 * YutE, família UPF0331/DUF86 88 0 2907 proteína hipotética CAETHG_34 CLJU_c1352 * 36 0 2908 Flavodoxina CAETHG_35 CLJU_c1422 * 04 0 2909 proteína reguladora de catabolismo de CAETHG_36 CLJU_c1525 * purina 27 0 2910 (S)-ureidoglicina amino-hidrolase CAETHG_36 CLJU_c1527 * 29 0 2911 Proteína de secreção da família HlyD CAETHG_36 CLJU_c1548 * 49 0 2912 proteína hipotética CAETHG_37 CLJU_c1622 CLRAG_ 16 0 33130 2913 proteína hipotética CAETHG_37 CLJU_c1623 CLRAG_ 17 0 33140 2914 proteína hipotética CAETHG_37 CLJU_c1635 CLRAG_ 29 0 33160 2915 proteína hipotética CAETHG_37 CLJU_c1645 * 39, 0, CAETHG_37 CLJU_c1647 42 0 2916 proteína hipotética CAETHG_37 CLJU_c1650 * 46 0 2917 proteína hipotética CAETHG_37 CLJU_c1659 CLRAG_ 63 0 33490 2918 proteína hipotética CAETHG_38 CLJU_c1695 * 05 0 2919 proteína de função desconhecida CAETHG_38 CLJU_c1696 * (DUF3784) 06 0 2920 proteína hipotética CAETHG_38 CLJU_c1698 * 08 0
137 / 294 2921 proteína hipotética CAETHG_38 CLJU_c1704 * 16 0 2922 Proteína de membrana não caracterizada CAETHG_38 CLJU_c1705 * YcaP, família DUF421 17 0 2923 Proteína de ligação a SAM não CAETHG_38 CLJU_c1741 * caracterizada YcdF, família DUF218 54 0 2924 Proteína-S-isoprenilcisteína O- CAETHG_38 CLJU_c1743 * metiltransferase Ste14 56 0 2925 transportador de cromato CAETHG_38 CLJU_c1758 * 66 0 2926 Hidrolase do ácido L-2-amino-tiazolina-4- CAETHG_38 CLJU_c1768 CLRAG_ carboxílico 76 0 01060 2927 Proteína contendo domínio HEPN CAETHG_39 CLJU_c1830 * 37 0 2928 Arilsulfotransferase (ASST) CAETHG_39 CLJU_c1834 * 41 0 2929 proteína hipotética CAETHG_39 CLJU_c1838 * 45 0 2930 proteína hipotética CAETHG_39 CLJU_c1853 * 60 0 2931 proteína hipotética CAETHG_39 CLJU_c1854 * 61 0 2932 vírus Gp157 CAETHG_39 CLJU_c1855 * 62 0 2933 proteína hipotética CAETHG_39 CLJU_c1856 * 63 0 2934 proteína semelhante a fago CAETHG_39 CLJU_c1865 * 79 0 2935 Proteína contendo domínio de CAETHG_40 CLJU_c1897 * metiltransferase 31 0 2936 Proteína contendo domínio G5 CAETHG_40 CLJU_c1901 * 35 0 2937 proteína hipotética CAETHG_40 CLJU_c1906 * 40 0 2938 Enzima dependente de PLP do metabolismo 2.5.1.-, CAETHG_40 CLJU_c1916 * Cys/Met 2.5.1.48, 50 0
2.5.1.49,
4.2.99.9 2939 * CLJU_c2748 CLRAG_ 0 08940 2940 * CLJU_c2563 CLRAG_ 0 03830 2941 * CLJU_c3622 CLRAG_ 0, 23960 CLJU_c3637 0 2942 * CLJU_c3160 CLRAG_ 0 32430 2943 * CLJU_c0098 CLRAG_ 0 19600 2944 * CLJU_c3181 CLRAG_ 0 02440 2945 * CLJU_c1445 CLRAG_ 0 09750 2946 * CLJU_c3073 CLRAG_ 0 16170 2947 * CLJU_c0781 CLRAG_ 0, 16800 CLJU_c0371 0
138 / 294 2948 * CLJU_c3154 CLRAG_ 0 16380 2949 * CLJU_c4275 CLRAG_ 0 25560 2950 * CLJU_c3082 CLRAG_ 0 16260 2951 * CLJU_c2251 CLRAG_ 0 32090 2952 Amidase relacionada à nicotinamidase CAETHG_29 CLJU_c0817 * 12 0 2953 ácido cetol redutoisomerase 1.1.1.86, CAETHG_01 CLJU_c2040 CLRAG_
1.1.1.169, 22 0, 25900
5.4.99.3 CLJU_c2039 0 2954 ácido cetol redutoisomerase 1.1.1.86, CAETHG_36 CLJU_c1531 *
1.1.1.169, 33 0
5.4.99.3 2955 L-ramnose isomerase 5.3.1.14 CAETHG_20 CLJU_c4260 * 86 0 2956 ramnuloquinase 2.7.1.5 CAETHG_20 CLJU_c4261 * 87 0 2957 * CLJU_c2682 CLRAG_ 0 08700 2958 5-metiltetra-hidrofolato--homocisteína 2.1.1.13, CAETHG_01 CLJU_c2069 CLRAG_ metiltransferase 2.1.1.14 45, 0, 19360 CAETHG_01 CLJU_c2062 53 0 2959 transdutor sensorial de quimiotaxia que CAETHG_20 CLJU_c4248 * aceita metila com sensor de cache 73 0 2960 transdutor sensorial de quimiotaxia que CAETHG_30 CLJU_c0931 * aceita metila com sensor de cache 26 0 2961 transdutor sensorial de quimiotaxia que CAETHG_34 CLJU_c1411 * aceita metila com sensor de cache 92 0 2962 * CLJU_c2923 CLRAG_ 0 35230 2963 proteína quimiotaxia que aceita metila CAETHG_12 CLJU_c3315 CLRAG_ 14 0 15140 2964 transdutor sensorial de quimiotaxia que CAETHG_39 CLJU_c1867 * aceita metila com sensor TarH/transdutor 81 0 sensorial de quimiotaxia que aceita metila com sensor Cache 2965 molibdopterina molibdocelatase CAETHG_00 CLJU_c2017 CLRAG_ 98 0 29750 2966 molibdopterina molibdocelatase CAETHG_00 CLJU_c2018 CLRAG_ 99 0 29740 2967 N-acil-D-aminoácido desacilase CAETHG_09 CLJU_c2996 CLRAG_ 95 0 35960 2968 alantoato desiminase CAETHG_36 CLJU_c1528 * 30 0 2969 malato desidrogenase (descarboxilação de CAETHG_06 CLJU_c3050 * oxaloacetato) 05, 0, CAETHG_10 CLJU_c2536 55 0 2970 proteína de ligação ao substrato do sistema CAETHG_39 CLJU_c1833 * de transporte de sulfonato 40 0 2971 cadeia alfa da proteína molibdênio-ferro CAETHG_04 CLJU_c2352 * nitrogenase 16 0 2972 proteína de cadeia beta de molibdênio-ferro CAETHG_04 CLJU_c2351 * nitrogenase 15 0
139 / 294 2973 cloroperoxidase não heme CAETHG_10 CLJU_c3081 * 85 0 2974 ornitina carbamoil-transferase 2.1.3.3 CAETHG_30 CLJU_c2801 * 22 0, CLJU_c0928 0 2975 Recombinase sítio-específica XerD CAETHG_21 CLJU_c0021 * 38 0 2976 Proteína que contém o domínio hélice- CAETHG_37 CLJU_c1655 CLRAG_ volta-hélice 51 0 33360 2977 Fosfoglicerato desidrogenase 1.1.1.95 CAETHG_10 CLJU_c3012 * 12 0 2978 pré-fenato desidratase 4.2.1.91, CAETHG_06 CLJU_c2550 *
4.2.1.51 19 0 2979 Proteína de utilização de propanodiol CAETHG_18 CLJU_c3972 CLRAG_ 18, 0, 21970 CAETHG_32 CLJU_c1197 88 0 2980 proteína de ligação ao substrato do sistema CAETHG_38 CLJU_c1712 * de transporte do complexo de ferro 24, 0, CAETHG_38 CLJU_c1718 30 0 2981 proteína de ligação ao ATP de sistema de CAETHG_00 CLJU_c2016 CLRAG_ transporte de tungstato 97 0 29760 2982 proteína de ligação ao ATP putativa de CAETHG_07 CLJU_c2627 * sistema de transporte de 07 0 espermidina/putrescina 2983 Proteína de ligação ao ATP do sistema de CAETHG_25 CLJU_c0504 CLRAG_ transporte do tipo ABC-2 81 0 38430 2984 Sistema de exportação de lipoproteínas do CAETHG_38 CLJU_c1722 * tipo ABC, componente ATPase 35 0 2985 proteína de ligação ao substrato do sistema CAETHG_00 CLJU_c2014 CLRAG_ de transporte de tungstato 95 0 29780 2986 Proteína de ligação ao substrato do sistema CAETHG_27 CLJU_c0630 * de transporte de D-metionina 26 0 2987 proteína permease de sistema de transporte CAETHG_00 CLJU_c2015 CLRAG_ de tungstato 96 0 29770 2988 proteína permease putativa de sistema de CAETHG_07 CLJU_c2628 * transporte de espermidina/putrescina 08 0 2989 proteína permease putativa de sistema de CAETHG_07 CLJU_c2629 * transporte de espermidina/putrescina 09 0 2990 Proteína permease de sistema de transporte CAETHG_27 CLJU_c0629 * de D-metionina 25 0 2991 proteína permease putativa de sistema de CAETHG_36 CLJU_c1550 * transporte ABC 51 0 2992 Proteína ElaA CAETHG_08 CLJU_c2721 * 06 0 2993 Proteína ribossômica S18 acetilase RimI CAETHG_14 CLJU_c3508 CLRAG_ 17 0 26340 2994 Proteína contendo domínio acetiltransferase CAETHG_14 CLJU_c3511 * (GNAT) 20 0 2995 * CLJU_c2100 CLRAG_ 0 19020 2996 Acil-CoA tioéster hidrolase/região N- 3.1.2. CAETHG_07 CLJU_c2637 CLRAG_ terminal BAAT 18 0 04450 2997 Imidazolonapropionase 3.5.2.3 CAETHG_10 CLJU_c3003 * 02 0 2998 proteína hipotética CAETHG_20 CLJU_c4253 * 79 0
140 / 294 2999 amido-hidrolase 3.5.1.47 CAETHG_27 CLJU_c0627 * 23 0 3000 proteína permease putativa de sistema de CAETHG_08 CLJU_c2895 * transporte de aminoácidos 90 0 3001 N-acil-D-aminoácido desacilase CAETHG_02 CLJU_c2172 * 59 0 3002 Família Peptidase M28 CAETHG_18 CLJU_c4010 * 59 0 3003 Fosfato de açúcar isomerase/epimerase CAETHG_07 CLJU_c2708 * 92 0 3004 holo-ACP sintase CAETHG_05 CLJU_c2529 * 98 0 3005 Proteína contendo domínio de ligação ao CAETHG_34 CLJU_c1354 * ligante do tipo AraC 38 0 3006 Domínio AAA (subfamília relacionada a CAETHG_27 CLJU_c0638 * dineína) 33 0 3007 receptor tripartido de soluto transportador CAETHG_32 CLJU_c1164 * independente de ATP, família DctP 55 0 3008 Repetição putativa da ligação da parede CAETHG_03 CLJU_c2235 CLRAG_ celular 2 27, 0, 31870 CAETHG_03 CLJU_c2228 35 0 3009 proteína de função desconhecida CAETHG_03 CLJU_c2233 CLRAG_ (DUF4430) 33 0 31920 3010 Proteína putativa de ligação à parede CAETHG_14 CLJU_c3516 * celular 24 0 3011 Repetição putativa da ligação da parede CAETHG_26 CLJU_c0590 * celular 2 87 0 3012 Repetição putativa da ligação da parede CAETHG_38 CLJU_c1700 * celular 2 12 0 3013 proteína quimiotaxia que aceita metila CAETHG_10 CLJU_c3040 * 45 0 3014 Proteína contendo domínio de sinalização CAETHG_38 CLJU_c1750 * de proteína quimiotaxe que aceita metila 63 0 (MCP) 3015 transportador de cromato CAETHG_15 CLJU_c3617 CLRAG_ 27 0 24010 3016 malato: Simporte de Na+ 2.3.3.1 CAETHG_17 CLJU_c3845 * 01, 0 CAETHG_24 80 3017 Proteína corrinoide metanogênica MtbC1 CAETHG_28 CLJU_c0756 * 44, 0, CAETHG_28 CLJU_c0751 49 0 3018 GTPase, família G3E CAETHG_40 CLJU_c1908 * 42 0 3019 proteína de ligação ao ATP de sistema de CAETHG_03 CLJU_c2231 CLRAG_ transporte de fator de acoplamento 30 0 31900 energético 3020 proteína permease de sistema de transporte CAETHG_03 CLJU_c2232 CLRAG_ do fator de acoplamento energético 32 0 31910 3021 proteína de transporte de nucleosídeo CAETHG_39 CLJU_c1814 * 23 0 3022 D-3-fosfoglicerato desidrogenase 1.1.1.95 CAETHG_24 CLJU_c0386 * 48 0 3023 D-3-fosfoglicerato desidrogenase 1.1.1.95 CAETHG_32 CLJU_c1162 * 53 0 3024 metabolismo de hidrolase putativo de 3.5.1.14, CAETHG_09 CLJU_c2995 CLRAG_ selênio 3.5.1.16 94 0 35950
141 / 294 3025 proteína death-on-curing CAETHG_10 CLJU_c3264 CLRAG_ 97 0 29380 3026 Domínio MutS V CAETHG_07 CLJU_c2709 * 94 0 3027 proteína reguladora bla blaR1 CAETHG_27 CLJU_c0679 CLRAG_ 70 0 18590 3028 Acetil esterase/lipase CAETHG_08 CLJU_c2868 CLRAG_ 63 0 34760 3029 proteína hipotética CAETHG_13 CLJU_c3431 * 31 0 3030 Enterocelina esterase CAETHG_14 CLJU_c3509 CLRAG_ 18 0 26350 3031 * CLJU_c3737 CLRAG_ 0 36810 3032 * CLJU_c2965 CLRAG_ 0 35640 3033 Utilização de etanolamina cobalamina CAETHG_18 CLJU_c3981 CLRAG_ adenosiltransferase 27, 0, 22060 CAETHG_32 CLJU_c1190 81 0 3034 proteína putativa de ligação ao substrato de CAETHG_07 CLJU_c2630 * sistema de transporte de 10 0 espermidina/putrescina 3035 transferência de elétrons flavoproteína- CAETHG_18 CLJU_c4021 * quinona oxidorredutase 67 0 3036 * CLJU_c0015 CLRAG_ 0 20170 3037 proteína hipotética CAETHG_07 CLJU_c2696 * 80 0 3038 proteína contendo domínio SPASM de CAETHG_15 CLJU_c3625 * ligação a 4Fe4S adicional de radical SAM 35 0 3039 Sistema de transporte Fe3+ tipo ABC, CAETHG_38 CLJU_c1717 * proteína de ligação ao substrato 29 0 3040 Proteínas não caracterizadas que contêm CAETHG_40 CLJU_c1913 * agrupamentos 2Fe-2 e 4Fe-4S contêm o 47 0 domínio DUF4445 3041 proteína associada ao gancho flagelar 3 CAETHG_30 CLJU_c0952 * FlgL 47 0 3042 proteína de quimiotaxia MotA CAETHG_00 CLJU_c1972 CLRAG_ 49 0 39420 3043 proteína de quimiotaxia MotB CAETHG_00 CLJU_c1971 CLRAG_ 48 0 39430 3044 * CLJU_c0955 CLRAG_ 0 13560 3045 * CLJU_c3749 CLRAG_ 0 36900 3046 Proteína ribossômica S18 acetilase RimI CAETHG_29 CLJU_c0898 * 92 0 3047 proteína contendo domínio de diguanilato CAETHG_01 CLJU_c2088 * ciclase (GGDEF) 73 0 3048 * CLJU_c2808 CLRAG_ 0 08980 3049 Glicosiltransferase envolvida na bissíntese CAETHG_27 CLJU_c0683 * da parede celular 74 0 3050 Proteína doliquil-fosfato-manose CAETHG_17 CLJU_c3890 * manosiltransferase 38 0 3051 dolicol-fosfato manosiltransferase CAETHG_24 CLJU_c0396 * 58 0 3052 Proteína contendo repetição de CAETHG_30 CLJU_c0964 * tetratricopeptídeo 59 0
142 / 294 3053 proteína hipotética CAETHG_30 CLJU_c0994 * 85 0 3054 Glicosiltransferase envolvida na bissíntese CAETHG_40 CLJU_c1899 * da parede celular 33 0 3055 proteína hipotética CAETHG_03 CLJU_c2316 * 79 0 3056 Flipase putativa GtrA (translocase CAETHG_20 CLJU_c4242 * transmembranar de glicose ligada a 67 0 bactoprenol) 3057 Exportador de sulfito TauE/SafE CAETHG_18 CLJU_c4024 * 70 0 3058 ATPase putativa CAETHG_32 CLJU_c1200 * 91 0 3059 Proteína da família da integrase do fago CAETHG_07 CLJU_c1479 CLRAG_ 67, 0, 08710 CAETHG_35 CLJU_c2683 79 0 3060 proteína de ligação ao ATP do sistema de CAETHG_00 CLJU_c2007 CLRAG_ transporte do complexo de ferro 88 0 29590 3061 proteína permease de sistema de transporte CAETHG_00 CLJU_c2008 CLRAG_ de complexo de ferro 89 0 29600 3062 Poliferredoxina CAETHG_18 CLJU_c4033 * 79 0 3063 proteína de ligação ao substrato do sistema CAETHG_00 CLJU_c2009 CLRAG_ de transporte do complexo de ferro 90 0 29660 3064 Proteína-S-isoprenilcisteína O- CAETHG_21 CLJU_c0057 * metiltransferase Ste14 75 0 3065 L-ramnose mutarotase CAETHG_20 CLJU_c4257 * 83 0 3066 Regulador transcricional de ligação ao CAETHG_37 CLJU_c1617 * DNA, família LysR 12 0 3067 proteína hipotética CAETHG_05 CLJU_c2455 * 17 0 3068 Efetor de secreção transmembranar CAETHG_05 CLJU_c2456 * 18 0 3069 proteína facilitadora da absorção de glicerol CAETHG_32 CLJU_c1189 * 80 0 3070 Regulador transcricional de ligação ao CAETHG_11 CLJU_c3277 * DNA, família MarR 75 0 3071 Regulador transcricional de ligação ao CAETHG_12 CLJU_c3311 CLRAG_ DNA, família MarR 09 0 15220 3072 Regulador transcricional de ligação ao CAETHG_38 CLJU_c1742 * DNA, família MarR 55 0 3073 Protease dependente de Zn (inclui CAETHG_00 CLJU_c1961 * SpoIVFB) 38 0 3074 componente específico do substrato do CAETHG_03 CLJU_c2230 CLRAG_ sistema de transporte para fator de 29 0 31890 acoplamento energético 3075 Fosfoesterase semelhante à calcineurina CAETHG_35 CLJU_c1423 * 05 0 3076 proteína quimiotaxia que aceita metila CAETHG_39 CLJU_c1804 * 13 0 3077 Biossíntese de ubiquinona/menaquinona C- CAETHG_04 CLJU_c2439 * metilase UbiE 99 0 3078 * CLJU_c2262 CLRAG_ 0 32180 3079 * CLJU_c2410 CLRAG_ 0 30580 3080 Fosfato permease de açúcar CAETHG_08 CLJU_c2870 CLRAG_ 65 0 34780
143 / 294 3081 Permease prevista de efluxo de arabinose, CAETHG_08 CLJU_c2871 CLRAG_ família MFS 66 0 34790 3082 transportador de magnésio CAETHG_30 CLJU_c0913 * 07 0 3083 Proteína transportadora de enxofre ThiS CAETHG_00 CLJU_c2022 CLRAG_ (biossíntese de tiamina) 86, 0, 34300 CAETHG_01 CLJU_c2005 03 0 3084 proteína de ligação ao substrato de sistema CAETHG_06 CLJU_c2602 * de transporte de molibdato 71 0 3085 Proteína que contém o domínio Fe4S4 da 1.7.7.2 CAETHG_06 CLJU_c2544 * molibdopterina oxidorredutase 13 0 3086 proteína contendo domínio de ligação CAETHG_00 CLJU_c1925 * molibdênio-pterina 01 0 3087 * CLJU_c1974 CLRAG_ 0 39400 3088 proteína de efluxo putativa, família MATE CAETHG_12 CLJU_c3310 CLRAG_ 08 0 15230 3089 proteína de efluxo putativa, família MATE CAETHG_07 CLJU_c2711 * 96 0 3090 * CLJU_c2252 CLRAG_ 0 32100 3091 * CLJU_c2271 CLRAG_ 0 02070 3092 2,4-dienoil-CoA redutase CAETHG_08 CLJU_c2872 CLRAG_ 67 0 34800 3093 Nitrorredutase CAETHG_36 CLJU_c1526 * 28 0 3094 GTPase de ligação ao Ni2+ envolvida na CAETHG_38 CLJU_c1721 * regulação da expressão e maturação de 34 0 urease e hidrogenase 3095 proteína de ligação ao ATP de sistema de CAETHG_39 CLJU_c1832 * transporte de sulfonato 39 0 3096 proteína permease de sistema de transporte CAETHG_39 CLJU_c1831 * de sulfonato 38 0 3097 * CLJU_c0879 CLRAG_ 0 07700 3098 nucleobase: simporte-1 de cátion, família CAETHG_36 CLJU_c1532 * NCS1 34 0 3099 nucleobase: simporte-1 de cátion, família CAETHG_36 CLJU_c1535 * NCS1 37 0 3100 Nucleotidiltransferase prevista CAETHG_30 CLJU_c0991 * 82 0 3101 proteína de ligação ao substrato CAETHG_30 CLJU_c0992 * nucleotidiltransferase, família HI0074 83 0 3102 Proteína relacionada a OsmC não CAETHG_18 CLJU_c4025 * caracterizada 71 0 3103 proteína hipotética CAETHG_31 CLJU_c1078 * 68 0 3104 Regulador transcricional de ligação ao CAETHG_37 CLJU_c1621 CLRAG_ DNA, família PadR 15 0 33120 3105 Grupo CubicO peptidase, família C da CAETHG_17 CLJU_c3866 * classe beta-lactamase 16 0 3106 Transglicosilase CAETHG_36 CLJU_c1593 * 93 0 3107 * CLJU_c1553 CLRAG_ 0 32610 3108 * CLJU_c2257 CLRAG_ 0 32130
144 / 294 3109 * CLJU_c2256 CLRAG_ 0 32120 3110 * CLJU_c2258 CLRAG_ 0, 32140 CLJU_c2254 0 3111 * CLJU_c2260 CLRAG_ 0 32160 3112 * CLJU_c2259 CLRAG_ 0 32150 3113 proteína hipotética CAETHG_09 CLJU_c2954 CLRAG_ 48 0 35530 3114 proteína rarD CAETHG_11 CLJU_c3240 * 70 0 3115 proteína hipotética CAETHG_20 CLJU_c4245 * 70 0 3116 proteína permease putativa de sistema de CAETHG_28 CLJU_c0779 * transporte ABC 71 0 3117 Transportador MFS, família DHA1, CAETHG_34 CLJU_c1414 * proteína de resistência à tetraciclina 95 0 3118 * CLJU_c3174 CLRAG_ 0 02400 3119 octaprenil-difosfato sintase 2.5.1.29, CAETHG_18 CLJU_c4031 *
2.5.1.1, 77 0
2.5.1.10 3120 proteína hipotética CAETHG_18 CLJU_c4029 * 75 0 3121 serpina B CAETHG_05 CLJU_c2446 * 06 0 3122 * CLJU_c3840 CLRAG_ 0 21860 3123 Proteína não caracterizada, família CAETHG_15 CLJU_c3711 * piridoxamina 5'-fosfato oxidase (tipo 66 0 PNPOx) 3124 proteína pequena de dissulfeto redox-ativa CAETHG_09 CLJU_c2955 CLRAG_ 2 49 0 35540 3125 Regulador transcricional da família LuxR, CAETHG_00 CLJU_c1930 * proteína reguladora positiva de maltose 07 0 regulon 3126 Proteína reguladora da família MerR HTH CAETHG_07 CLJU_c2697 * 81 0 3127 Regulador transcricional de ligação ao CAETHG_35 CLJU_c1421 * DNA, família MerR 03 0 3128 sistema de dois componentes, família CitB, CAETHG_17 CLJU_c3847 * regulador de resposta MalR 03, 0 CAETHG_24 85 3129 * CLJU_c2717 CLRAG_ 0 20060 3130 sistema de dois componentes, regulador de CAETHG_20 CLJU_c4246 * resposta YcbB 71 0 3131 sistema de dois componentes, família CAETHG_02 CLJU_c2198 * OmpR, regulador de resposta VanR 96 0, CLJU_c1438 0 3132 Fator de RNA polimerase sigma-70, CAETHG_13 CLJU_c3423 * subfamília ECF 22 0 3133 proteína de função desconhecida CAETHG_13 CLJU_c3424 * (DUF4179) 23 0
145 / 294 3134 Proteína contendo domínio de CAETHG_15 CLJU_c3626 CLRAG_ metiltransferase 36 0 23930 3135 sistema de dois componentes, família CitB, CAETHG_17 CLJU_c3848 * sensor histidina quinase MalK 04, 0 CAETHG_24 84 3136 proteína contendo domínio (aceitador de CAETHG_36 CLJU_c1547 * fosfo) His quinase A 48 0 3137 Transdução de sinal histidina quinase CAETHG_25 CLJU_c0502 CLRAG_ 79 0 38410 3138 Proteína contendo S-box do domínio PAS CAETHG_00 CLJU_c2012 CLRAG_ 93, 0, 29640 CAETHG_01 CLJU_c2020 01 0 3139 Transdução de sinal histidina quinase CAETHG_09 CLJU_c2961 CLRAG_ 57 0 35600 3140 Transdução de sinal histidina quinase CAETHG_28 CLJU_c0780 * 72 0 3141 proteína de ligação ao substrato para CAETHG_02 CLJU_c2173 * sistema de transporte de 60 0 espermidina/putrescina 3142 proteína permease de sistema de transporte CAETHG_02 CLJU_c2174 * de espermidina/putrescina 61 0 3143 proteína permease de sistema de transporte CAETHG_02 CLJU_c2175 * de espermidina/putrescina 62 0 3144 proteína de revestimento de esporos CAETHG_00 CLJU_c1955 * 32 0 3145 semelhante à proteína de revestimento de CAETHG_00 CLJU_c1956 * esporos 33 0 3146 Proteína que contém o domínio do CAETHG_00 CLJU_c1953 * revestimento F 30 0 3147 proteína de germinação de esporos CAETHG_36 CLJU_c1560 * (permeação de aminoácidos) 55 0 3148 proteína de germinação de esporos KA CAETHG_29 CLJU_c0849 * 42 0 3149 proteína de germinação de esporos KC CAETHG_29 CLJU_c0850 * 43 0 3150 proteína de germinação de esporos KA CAETHG_36 CLJU_c1559 * 54 0 3151 proteína de germinação de esporos CAETHG_36 CLJU_c1561 * 56 0 3152 Fosfato de açúcar isomerase/epimerase CAETHG_08 CLJU_c2873 CLRAG_ 68 0 34810 3153 glicosídeo/pentosídeo/hexuronida: simporte CAETHG_06 CLJU_c2580 * catiônico, família GPH 49 0 3154 glicosídeo/pentosídeo/hexuronida: simporte CAETHG_06 CLJU_c2586 * catiônico, família GPH 55 0 3155 transportador de açúcar (glicosídeo- CAETHG_34 CLJU_c1353 * pentosídeo-hexuronida) 37 0 3156 Domínio semelhante a Ig (grupo 2) CAETHG_03 CLJU_c2234 CLRAG_ 34 0 31930 3157 Domínio semelhante a Ig (grupo 2) CAETHG_03 CLJU_c2236 CLRAG_ 37 0 32000 3158 Protease/amidase intracelular putativa CAETHG_14 CLJU_c3515 * 23 0 3159 Regulador transcricional de ligação ao CAETHG_00 CLJU_c1940 * DNA, família MarR 17 0 3160 Enzima prevista do barril TIM CAETHG_03 CLJU_c2302 * 65 0
146 / 294 3161 Regulador transcricional da família LuxR, CAETHG_03 CLJU_c2330 * proteína reguladora positiva de maltose 94 0 regulon 3162 regulador transcricional de ligação ao CAETHG_09 CLJU_c2943 CLRAG_ DNA, família MocR, contém um domínio 37 0 35420 aminotransferase 3163 Regulador transcricional da família ArsR CAETHG_09 CLJU_c2956 CLRAG_ 50, 0 35550 CAETHG_36 74 3164 Regulador transcricional de ligação ao CAETHG_15 CLJU_c3604 * DNA, família MerR 13 0 3165 Regulador transcricional de ligação ao CAETHG_17 CLJU_c3854 * DNA, domínio HTH da família XRE 07 0 3166 Regulador transcricional de ligação ao CAETHG_18 CLJU_c4009 * DNA, família MerR 58 0 3167 proteína reguladora, família Fis CAETHG_20 CLJU_c4251 * 76, 0, CAETHG_20 CLJU_c4252 78 0 3168 Regulador de resposta de ligação ao DNA, CAETHG_25 CLJU_c0501 CLRAG_ família OmpR, contém os domínios REC e 78 0 38400 hélice alada (wHTH) 3169 Proteína contendo domínio FCD CAETHG_27 CLJU_c0682 CLRAG_ 73 0 18620 3170 Regulador transcricional específico para CAETHG_30 CLJU_c0932 * açúcar TrmB 27 0 3171 Regulador transcricional de ligação ao CAETHG_34 CLJU_c1413 * DNA, família MarR 94 0 3172 Regulador transcricional de ligação ao CAETHG_35 CLJU_c1488 * DNA, família MerR 94 0 3173 Regulador transcricional de ligação ao CAETHG_38 CLJU_c1766 CLRAG_ DNA, família MarR 74 0 01070 3174 Regulador transcricional da família 2.6.1.23, CAETHG_38 CLJU_c1785 * GntR/família MocR aminotransferase 2.6.1.1 93 0 3175 * CLJU_c3594 CLRAG_ 0 06440 3176 proteína de função desconhecida CAETHG_27 CLJU_c0645 * (DUF4132) 41 0 3177 Proteína de secreção da família HlyD CAETHG_03 CLJU_c2225 CLRAG_ 23 0 31830 3178 Fosfato permease de açúcar CAETHG_17 CLJU_c3936 * 81 0 3179 Permease prevista de efluxo de arabinose, CAETHG_18 CLJU_c3993 * família MFS 39 0 3180 Transportador MFS, família SP, CAETHG_20 CLJU_c4258 * transportador de inositol 84 0 3181 Transportador MFS, família ACS, CAETHG_24 CLJU_c0387 * transportador de glucarato 49 0 3182 proteína permease putativa de sistema de CAETHG_35 CLJU_c1443 * transporte ABC 16 0 3183 * CLJU_c2274 CLRAG_ 0 02050 3184 ATPase do tipo histidina quinase, DNA CAETHG_35 CLJU_c1440 * girase B e HSP90 14 0 3185 Regulador de resposta de ligação ao DNA, CAETHG_09 CLJU_c2960 CLRAG_ família OmpR, contém os domínios REC e 56 0 35590 hélice alada (wHTH)
147 / 294 3186 Regulador de resposta de ligação ao DNA, CAETHG_36 CLJU_c1546 * família OmpR, contém os domínios REC e 47 0 hélice alada (wHTH) 3187 ATPase do tipo histidina quinase, DNA CAETHG_32 CLJU_c1186 * girase B e HSP90 77 0 3188 integrase/recombinase XerD CAETHG_37 CLJU_c1654 CLRAG_ 50 0 33350 3189 desmetilmenaquinona metiltransferase/2- 2.1.1.- CAETHG_18 CLJU_c4030 * metoxi-6-poliprenil-1,4-benzoquinol 76 0 metilase 3190 * CLJU_c2275 CLRAG_ 0 02040 3191 uroporfirinogênio descarboxilase CAETHG_01 CLJU_c2111 * 97 0 3192 uroporfirinogênio descarboxilase (URO-D) CAETHG_01 CLJU_c2057 * 40 0 3193 proteína de resistência à vancomicina CAETHG_35 CLJU_c1467 * YoaR, contém domínios de ligação a 66 0 peptidoglicano e VanW 3194 aril-álcool desidrogenase 1.1.1.1 CAETHG_37 CLJU_c1615 * 10 0, CLJU_c3858 0 3195 subunidade pdxS de piridoxal 5'-fosfato CAETHG_18 CLJU_c3958 * sintase 04 0 3196 Subunidade 5'-fosfato sintase pdxT CAETHG_18 CLJU_c3959 * 05 0 3197 * CLJU_c2408 CLRAG_ 0 30600 3198 ramnulose-1-fosfato aldolase 4.1.2.19 CAETHG_20 CLJU_c4259 * 85 0 3199 * CLJU_c0099 CLRAG_ 0 19590 3200 * CLJU_c3254 CLRAG_ 0 23690 3201 chiquimato desidrogenase 1.1.1.282, CAETHG_08 CLJU_c2875 CLRAG_
1.1.1.25 70 0 34830 3202 chiquimato quinase CAETHG_16 CLJU_c3814 * 41 0 3203 proteína de germinação de esporos KB CAETHG_29 CLJU_c0851 * 45 0 3204 Chaperona de revisão Tat TorD CAETHG_06 CLJU_c2546 * 15 0 3205 Regulador transcricional de ligação ao CAETHG_06 CLJU_c2543 * DNA, família LysR 12 0, CLJU_c3856 0 3206 Regulador transcricional de ligação ao CAETHG_07 CLJU_c2712 * DNA, família MarR 97 0 3207 Regulador transcricional de ligação ao CAETHG_08 CLJU_c2877 CLRAG_ DNA, família LysR 72 0 34850 3208 proteína do tipo regulador da transcrição CAETHG_29 CLJU_c0832 * 27 0 3209 regulador transcricional, família DeoR CAETHG_07 CLJU_c2626 * 06 0 3210 regulador transcricional, família DeoR CAETHG_20 CLJU_c4262 * 88 0
148 / 294 3211 regulador transcricional, família HxlR CAETHG_07 CLJU_c2636 * 17, 0, CAETHG_35 CLJU_c1489 95 0 3212 regulador transcricional, família HxlR CAETHG_15 CLJU_c3712 * 67 0 3213 regulador transcricional, família HxlR CAETHG_39 CLJU_c1801 * 10 0 3214 regulador transcricional, família MarR com CAETHG_21 CLJU_c0058 * atividade da acetiltransferase 76 0 3215 Regulador transcricional de ligação ao CAETHG_13 CLJU_c3433 * DNA, família PadR 25, 0, CAETHG_13 CLJU_c3426 33 0 3216 * CLJU_c3513 CLRAG_ 0 26380 3217 regulador transcricional, família RpiR CAETHG_32 CLJU_c1155 * 46 0 3218 regulador transcricional, família TetR CAETHG_18 CLJU_c3994 * 40 0 3219 regulador transcricional, família TetR CAETHG_28 CLJU_c0758 CLRAG_ 51 0 32480 3220 regulador transcricional, família TetR CAETHG_29 CLJU_c0815 * 10 0 3221 transquetolase 2.2.1.1 CAETHG_06 CLJU_c2583 * 52 0 3222 transquetolase 2.2.1.1 CAETHG_06 CLJU_c2582 * 51 0 3223 L-treonilcarbamoiladenilato sintase CAETHG_07 CLJU_c2695 * 79 0 3224 Transportador di e tricarboxilato CAETHG_04 CLJU_c2423 * 81 0 3225 aldeído: ferredoxina oxidorredutase 1.2.7.5 CAETHG_00 CLJU_c2011 CLRAG_ 92, 0, 29650 CAETHG_01 CLJU_c2021 02 0 3226 Proteína de ligação ao DNA do tipo AraC CAETHG_06 CLJU_c2587 * 56 0 3227 Proteína que contém o domínio hélice- CAETHG_32 CLJU_c1185 * volta-hélice 76 0 3228 Regulador de resposta de ligação ao DNA, CAETHG_07 CLJU_c2705 * família OmpR, contém os domínios REC e 88 0 hélice alada (wHTH) 3229 tirosil-tRNA sintetase CAETHG_13 CLJU_c3430 * 30 0 3230 uroporfirinogênio descarboxilase CAETHG_40 CLJU_c1910 * 44 0 3231 uroporfirinogênio-III descarboxilase CAETHG_40 CLJU_c1909 * 43 0 3232 Endonuclease com dano UV CAETHG_35 CLJU_c1446 * 53 0 3233 xiluloquinase 2.7.1.17 CAETHG_32 CLJU_c1157 * 48 0 3234 S- (hidroximetil) glutationa 1.1.1.1 CAETHG_00 CLJU_c1954 * desidrogenase/álcool desidrogenase 31 0 3235 (R,R)-butanodiol desidrogenase/meso- 1.1.1.1 CAETHG_06 CLJU_c2581 * butanodiol desidrogenase/diacetil redutase 50 0 3236 (R,R)-butanodiol desidrogenase/meso- 1.1.1.4 CAETHG_06 CLJU_c2584 * butanodiol desidrogenase/diacetil redutase 53 0
149 / 294 3237 L-iditol 2-desidrogenase CAETHG_32 CLJU_c1156 * 47 0 3238 Molibdopterina oxidorredutase 1.7.7.2, CAETHG_00 * CLRAG_
1.2.1.43, 85, 18830
1.1.99.33 CAETHG_27 89 3239 proteína de esporulação em estágio V AD CAETHG_01 * CLRAG_ 77 19090 3240 proteína reguladora de esporulação tipo CAETHG_02 * CLRAG_ Spo0E 89 31470 3241 proteína hipotética CAETHG_06 * CLRAG_ 26 03780 3242 proteína hipotética CAETHG_07 * CLRAG_ 03 04380 3243 proteína hipotética CAETHG_07 * CLRAG_ 04 04390 3244 proteína hipotética CAETHG_07 * CLRAG_ 05 04400 3245 proteína hipotética CAETHG_09 * CLRAG_ 27 35350 3246 proteína hipotética CAETHG_09 * CLRAG_ 45 35500 3247 proteína hipotética CAETHG_10 * CLRAG_ 24 15770 3248 Proteína contendo domínio GHKL CAETHG_10 * CLRAG_ 25 15780 3249 regulador transcricional de dois CAETHG_10 * CLRAG_ componentes, família LytTR 26 15790 3250 proteína hipotética CAETHG_10 * CLRAG_ 77, 16250 CAETHG_10 86 3251 Proteína de função desconhecida CAETHG_10 * CLRAG_ (DUF1064) 93 32410 3252 proteína hipotética CAETHG_15 * CLRAG_ 11 06530 3253 proteína hipotética CAETHG_16 * CLRAG_ 37 37490 3254 Proteína contendo domínio de ligação ao CAETHG_16 * CLRAG_ DNA, família excisionase 66 36100 3255 proteína hipotética CAETHG_16 * CLRAG_ 68 36120 3256 regulador transcricional putativo CAETHG_16 * CLRAG_ 69 20580 3257 Regulador transcricional de ligação ao CAETHG_16 * CLRAG_ DNA, domínio HTH da família XRE 70 20590 3258 Recombinase sítio-específica XerD CAETHG_16 * CLRAG_ 71 20600 3259 proteína hipotética CAETHG_16 * CLRAG_ 82 20720 3260 proteína hipotética CAETHG_17 * CLRAG_ 00 20890 3261 Regulador transcricional da família PadR, CAETHG_17 * CLRAG_ proteína reguladora PadR 22 20990 3262 Proteína ancorada na membrana não CAETHG_17 * CLRAG_ caracterizada 23 21000 3263 proteína hipotética CAETHG_20 * CLRAG_ 61 05480 3264 regulador transcricional, família RpiR CAETHG_21 * CLRAG_ 87 19880
150 / 294 3265 proteína hipotética CAETHG_23 * CLRAG_ 38 27930 3266 Regulador transcricional previsto contendo CAETHG_24 * CLRAG_ domínios CBS 37 28830 3267 proteína hipotética CAETHG_26 * CLRAG_ 68 07000 3268 Proteína contendo domínio NUDIX CAETHG_26 * CLRAG_ 70 30010 3269 proteína hipotética CAETHG_27 * CLRAG_ 02 07270 3270 semelhante à proteína de esporulação em CAETHG_29 * CLRAG_ estágio IV 01 08290 3271 Proteína de motilidade putativa CAETHG_30 * CLRAG_ 94 13330 3272 proteína hipotética CAETHG_32 * CLRAG_ 16 12200 3273 proteína hipotética CAETHG_33 * CLRAG_ 80 10820 3274 proteína hipotética CAETHG_34 * CLRAG_ 58 10090 3275 Transdução de sinal histidina quinase CAETHG_35 * CLRAG_ 75 20390 3276 regulador de resposta de dois componentes, CAETHG_35 * CLRAG_ família SAPR, consiste nos domínios REC, 76 20380 wHTH e BTAD 3277 proteína hipotética CAETHG_39 * CLRAG_ 67 00100 3278 proteína de função desconhecida CAETHG_40 * CLRAG_ (DUF1540) 60 39820 3279 * CLJU_c0397 * 0 3280 * CLJU_c3273 CLRAG_ 0 15600 3281 * CLJU_c2762 * 0 3282 * CLJU_c2805 * 0 3283 * CLJU_c2783 * 0, CLJU_c2735 0 3284 Autoimunidade à protease CAAX CAETHG_20 CLJU_c4184 * 13 0 3285 * CLJU_c2782 * 0, CLJU_c2734 0 3286 * CLJU_c1436 * 0 3287 Amido-hidrolase prevista CAETHG_13 CLJU_c3479 * 76 0 3288 DNA-3-metiladenina glicosilase I CAETHG_15 CLJU_c3631 * 39 0 3289 2-iminobutanoato/2-iminopropanoato CAETHG_18 CLJU_c4037 * desaminase 83 0 3290 proteína 2 associada ao gancho flagelar CAETHG_30 CLJU_c0958 * 53 0 3291 subunidade da flavoproteína fumarato- CAETHG_10 CLJU_c3025 * redutase 32 0
151 / 294 3292 * CLJU_c2810 * 0 3293 * CLJU_c2784 * 0, CLJU_c2736 0 3294 * CLJU_c2777 * 0, CLJU_c2729 0 3295 * CLJU_c2778 * 0, CLJU_c2730 0 3296 * CLJU_c2779 * 0, CLJU_c2731 0 3297 * CLJU_c2749 * 0 3298 * CLJU_c2790 * 0 3299 proteína hipotética CAETHG_00 CLJU_c2010 * 91 0 3300 proteína de função desconhecida CAETHG_01 CLJU_c2109 * (DUF4445) 94 0 3301 proteína hipotética CAETHG_07 CLJU_c2700 * 84 0 3302 Transportador putativo ABC tipo IV CAETHG_08 CLJU_c2723 * 08 0 3303 proteína hipotética CAETHG_08 CLJU_c2724 * 10 0 3304 proteína hipotética CAETHG_08 CLJU_c2818 * 18 0 3305 proteína hipotética CAETHG_10 CLJU_c3010 * 09 0 3306 proteína hipotética CAETHG_10 CLJU_c3011 * 10 0 3307 Proteína contendo domínio hélice-giro- CAETHG_10 CLJU_c3021 * hélice C-terminal PucR 28 0 3308 Proteína de função desconhecida CAETHG_10 CLJU_c3023 * (DUF1097) 30 0 3309 proteína hipotética CAETHG_10 CLJU_c3029 * 36 0 3310 Proteína putativa de ligação à parede CAETHG_10 CLJU_c3032 * celular 38 0 3311 proteína hipotética CAETHG_10 CLJU_c3033 * 39 0 3312 Proteína dependente de microcistina CAETHG_10 CLJU_c3034 * 40 0 3313 Proteína contendo domínio acetiltransferase CAETHG_10 CLJU_c3035 * (GNAT) 41 0 3314 proteína hipotética CAETHG_10 CLJU_c3036 * 42 0 3315 proteína hipotética CAETHG_10 CLJU_c3037 * 43 0 3316 proteína de transporte putativa CAETHG_10 CLJU_c3044 * 49 0 3317 Região 7TM N-terminal da histidina 2.1.1.258 CAETHG_10 CLJU_c3065 * quinase 69 0
152 / 294 3318 proteína hipotética CAETHG_11 CLJU_c3228 * 56 0 3319 proteína hipotética CAETHG_11 CLJU_c3229 * 59 0 3320 Proteína contendo domínio associado ao CAETHG_11 CLJU_c3230 * fago e DnaD 60 0 3321 proteína hipotética CAETHG_11 CLJU_c3232 * 62 0 3322 zincina peptidase putativa CAETHG_11 CLJU_c3239 * 69 0 3323 proteína hipotética CAETHG_13 CLJU_c3429 * 28 0 3324 Proteína contendo domínio hélice-giro- CAETHG_13 CLJU_c3472 * hélice C-terminal PucR 69 0 3325 proteína hipotética CAETHG_13 CLJU_c3480 * 77 0 3326 proteína hipotética CAETHG_14 CLJU_c3536 * 45 0 3327 Proteína contendo domínio de edição de CAETHG_14 CLJU_c3544 * aminoacil-tRNA 52 0 3328 proteína hipotética CAETHG_14 CLJU_c3581 * 89 0 3329 Proteína contendo domínio EAL CAETHG_14 CLJU_c3583 * 90 0 3330 Proteína contendo domínio EAL CAETHG_14 CLJU_c3584 * 91 0 3331 proteína hipotética CAETHG_17 CLJU_c3884 * 32 0 3332 proteína hipotética CAETHG_18 CLJU_c4003 * 50 0 3333 Proteína contendo domínio relacionado à CAETHG_18 CLJU_c4005 * nuclease 54 0 3334 Proteína de membrana não caracterizada CAETHG_18 CLJU_c4034 * YeiH 80 0 3335 proteína reguladora de fago, família rha CAETHG_21 CLJU_c0024 * 41 0 3336 proteína hipotética CAETHG_21 CLJU_c0026 * 43 0 3337 proteína hipotética CAETHG_21 CLJU_c0027 * 44 0 3338 proteína hipotética CAETHG_21 CLJU_c0028 * 45 0 3339 proteína hipotética CAETHG_21 CLJU_c0029 * 46 0 3340 proteína hipotética CAETHG_21 CLJU_c0030 * 47 0, CLJU_c3647 0 3341 proteína hipotética CAETHG_21 CLJU_c0031 * 48 0 3342 proteína hipotética CAETHG_21 CLJU_c0033 * 50 0 3343 proteína hipotética CAETHG_21 CLJU_c0034 * 51 0 3344 proteína hipotética CAETHG_21 CLJU_c0036 * 53 0 3345 proteína hipotética CAETHG_21 CLJU_c0037 * 54 0 3346 proteína hipotética CAETHG_21 CLJU_c0038 * 56 0
153 / 294 3347 proteína hipotética CAETHG_21 CLJU_c0039 * 57 0 3348 proteína hipotética CAETHG_21 CLJU_c0041 * 59 0 3349 proteína hipotética CAETHG_21 CLJU_c0042 * 60 0 3350 transposase, família IS605 OrfB, região CAETHG_21 CLJU_c0048 * central 67 0 3351 proteína hipotética CAETHG_21 CLJU_c0050 * 68 0 3352 proteína hipotética CAETHG_21 CLJU_c0051 * 69 0 3353 proteína hipotética CAETHG_21 CLJU_c0052 * 70 0 3354 proteína hipotética CAETHG_21 CLJU_c0053 * 71 0 3355 Proteína conservada não caracterizada CAETHG_21 CLJU_c0054 * 72 0 3356 proteína hipotética CAETHG_27 CLJU_c0641 * 37 0 3357 proteína hipotética CAETHG_28 CLJU_c0713 * 05 0 3358 proteína hipotética CAETHG_28 CLJU_c0749 * 42 0 3359 proteína hipotética CAETHG_28 CLJU_c0765 * 58 0 3360 proteína FliT CAETHG_30 CLJU_c0959 * 54 0 3361 Grupo 1 de glicosil transferases CAETHG_30 CLJU_c0975 * 68 0 3362 proteína hipotética CAETHG_30 CLJU_c0990 * 81 0 3363 proteína hipotética CAETHG_30 CLJU_c0993 * 84 0 3364 subunidade grande de carbamoil-fosfato CAETHG_30 CLJU_c0998 * sintase 89 0 3365 subunidade grande de carbamoil-fosfato CAETHG_30 CLJU_c0999 * sintase 90 0 3366 proteína hipotética CAETHG_31 CLJU_c1086 * 75 0 3367 Proteína de função desconhecida CAETHG_34 CLJU_c1405 * (DUF2975) 86 0 3368 Enzima da superfamília de radical SAM CAETHG_34 CLJU_c1407 * YgiQ, família UPF0313 88 0 3369 Cassete de ligação ATP, subfamília B CAETHG_34 CLJU_c1408 * 89 0 3370 proteína de choque térmico proteína de CAETHG_35 CLJU_c1447 * domínio DnaJ 54 0 3371 Proteína contendo domínio HIRAN CAETHG_35 CLJU_c1448 * 55 0 3372 Acetil esterase/lipase CAETHG_35 CLJU_c1490 * 96 0 3373 proteína hipotética CAETHG_36 CLJU_c1514 * 16 0 3374 proteína de função desconhecida CAETHG_37 CLJU_c1620 * (DUF4179) 14 0 3375 proteína hipotética CAETHG_37 CLJU_c1631 * 25 0 3376 proteína hipotética CAETHG_37 CLJU_c1633 * 27 0
154 / 294 3377 proteína hipotética CAETHG_38 CLJU_c1719 * 31 0 3378 proteína de função desconhecida CAETHG_38 CLJU_c1767 * (DUF4386) 75 0 3379 Proteína de divisão A inibida pela glicose CAETHG_39 CLJU_c1857 * 64 0 3380 proteína hipotética CAETHG_40 CLJU_c1896 * 30 0 3381 Transportador ABC CAETHG_40 CLJU_c1900 * 34 0 3382 Transposase e derivados inativados CAETHG_40 CLJU_c1919 * 54 0 3383 * CLJU_c2797 * 0 3384 * CLJU_c2792 * 0 3385 * CLJU_c2791 * 0 3386 * CLJU_c2788 * 0 3387 * CLJU_c2776 * 0 3388 * CLJU_c2775 * 0 3389 * CLJU_c2760 * 0 3390 * CLJU_c2759 * 0 3391 * CLJU_c1690 * 0 3392 * CLJU_c2737 * 0 3393 * CLJU_c2740 * 0 3394 * CLJU_c2742 * 0 3395 * CLJU_c2743 * 0 3396 * CLJU_c2746 * 0 3397 * CLJU_c2747 * 0 3398 * CLJU_c2750 * 0 3399 * CLJU_c2754 * 0 3400 * CLJU_c1882 * 0 3401 * CLJU_c1881 * 0 3402 * CLJU_c1880 * 0, CLJU_c1878 0 3403 * CLJU_c1879 * 0 3404 * CLJU_c1877 * 0 3405 * CLJU_c1871 * 0
155 / 294 3406 * CLJU_c3098 * 0 3407 * CLJU_c3715 * 0 3408 * CLJU_c2893 * 0 3409 * CLJU_c2951 * 0 3410 * CLJU_c1579 * 0 3411 * CLJU_c1595 * 0 3412 * CLJU_c3170 * 0 3413 * CLJU_c3169 * 0 3414 * CLJU_c3168 * 0 3415 * CLJU_c3167 * 0 3416 * CLJU_c3166 * 0 3417 * CLJU_c3165 * 0 3418 * CLJU_c3136 * 0 3419 * CLJU_c3094 * 0 3420 * CLJU_c3640 * 0 3421 * CLJU_c3173 * 0 3422 * CLJU_c3176 * 0 3423 * CLJU_c3178 * 0 3424 * CLJU_c1441 * 0 3425 * CLJU_c1462 * 0 3426 * CLJU_c1556 * 0 3427 * CLJU_c0576 * 0 3428 * CLJU_c1005 * 0 3429 * CLJU_c2814 * 0 3430 * CLJU_c2798 * 0 3431 * CLJU_c4266 * 0 3432 * CLJU_c2301 * 0 3433 * CLJU_c3137 * 0 3434 * CLJU_c3132 * 0 3435 * CLJU_c3130 * 0
156 / 294 3436 * CLJU_c3129 * 0 3437 * CLJU_c3128 * 0 3438 * CLJU_c3127 * 0 3439 * CLJU_c3126 * 0 3440 * CLJU_c3125 * 0 3441 * CLJU_c3124 * 0 3442 * CLJU_c3123 * 0 3443 * CLJU_c3121 * 0 3444 * CLJU_c3120 * 0 3445 * CLJU_c3119 * 0 3446 * CLJU_c3118 * 0 3447 * CLJU_c3117 * 0 3448 * CLJU_c3116 * 0 3449 * CLJU_c3113 * 0 3450 * CLJU_c3112 * 0 3451 * CLJU_c3111 * 0 3452 * CLJU_c3109 * 0 3453 * CLJU_c3841 * 0 3454 * CLJU_c0836 * 0 3455 * CLJU_c0368 CLRAG_ 0 17070 3456 * CLJU_c0970 CLRAG_ 0 13470 3457 * CLJU_c1660 CLRAG_ 0 33500 3458 * CLJU_c1664 CLRAG_ 0 33530 3459 * CLJU_c1665 CLRAG_ 0 33540 3460 * CLJU_c1666 CLRAG_ 0 33560 3461 * CLJU_c1668 CLRAG_ 0 33580 3462 * CLJU_c1669 CLRAG_ 0 33590 3463 * CLJU_c1670 CLRAG_ 0 33600 3464 * CLJU_c1872 CLRAG_ 0 16640 3465 * CLJU_c2237 CLRAG_ 0 32010
157 / 294 3466 * CLJU_c2238 CLRAG_ 0 32020 3467 * CLJU_c2240 CLRAG_ 0, 32040 CLJU_c2243 0 3468 * CLJU_c2241 CLRAG_ 0, 32050 CLJU_c2244 0 3469 * CLJU_c2246 CLRAG_ 0 32070 3470 * CLJU_c2247 CLRAG_ 0 32080 3471 * CLJU_c2255 CLRAG_ 0 32110 3472 * CLJU_c2270 CLRAG_ 0 02150 3473 * CLJU_c2958 CLRAG_ 0 35570 3474 * CLJU_c3145 CLRAG_ 0 16350 3475 * CLJU_c3157 CLRAG_ 0 16390 3476 * CLJU_c3243 CLRAG_ 0 03340 3477 * CLJU_c3249 CLRAG_ 0 03370 3478 * CLJU_c3268 CLRAG_ 0 29350 3479 * CLJU_c3269 CLRAG_ 0 15640 3480 * CLJU_c3270 CLRAG_ 0 15630 3481 * CLJU_c3271 CLRAG_ 0 15620 3482 * CLJU_c3272 CLRAG_ 0 15610 3483 * CLJU_c3777 CLRAG_ 0 37190 3484 * CLJU_c3790 CLRAG_ 0 37290 3485 * CLJU_c3795 CLRAG_ 0 37340 3486 * CLJU_c3796 CLRAG_ 0 37350 3487 Proteína contendo domínio de di- CAETHG_29 CLJU_c0904 * agrupamento 4Fe-4S 98 0 3488 Proteína de ligação ATP do tipo IstB CAETHG_30 CLJU_c0988 * 79 0 3489 * CLJU_c2765 * 0 3490 * CLJU_c2738 * 0, CLJU_c3097 0 3491 Flavodoxina multimérica WrbA CAETHG_10 CLJU_c3022 * 29 0 3492 * CLJU_c2618 CLRAG_ 0 04260
158 / 294 3493 peptídeo desformilase CAETHG_37 CLJU_c1627 * 21 0 3494 * CLJU_c0364 * 0 3495 * CLJU_c3122 * 0 3496 Recombinase sítio-específica XerD CAETHG_30 CLJU_c0977 * 70 0 3497 Homeodomínio, tipo phBC6A51 CAETHG_21 CLJU_c0032 * 49 0 3498 proteína de medição de fita caudal de fago, CAETHG_21 CLJU_c0040 * família TP901, região central 58 0 3499 * CLJU_c3648 * 0 3500 * CLJU_c3133 * 0 3501 * CLJU_c3131 * 0 3502 * CLJU_c3107 * 0 3503 * CLJU_c1681 CLRAG_ 0 33720 3504 * CLJU_c3860 * 0 3505 * CLJU_c1434 * 0 3506 exo-poli-alfa-galacturonosidase CAETHG_09 CLJU_c2936 * 30 0 3507 proteína hipotética CAETHG_10 CLJU_c3045 * 50 0 3508 * CLJU_c3808 CLRAG_ 0 37450 3509 O-acetiltransferase de maltose CAETHG_05 CLJU_c2457 * 20 0 3510 acetiltransferase putativa CAETHG_11 CLJU_c3233 * 63 0 3511 * CLJU_c2763 * 0 3512 * CLJU_c3773 CLRAG_ 0 37150 3513 * CLJU_c3774 CLRAG_ 0 37160 3514 * CLJU_c3266 CLRAG_ 0 29360 3515 * CLJU_c2761 * 0 3516 * CLJU_c2795 * 0 3517 * CLJU_c3108 * 0 3518 * CLJU_c3031 * 0 3519 Proteína da família de transportador de 2- CAETHG_05 CLJU_c2530 * hidroxicarboxilato 99 0 3520 Transportador MFS, família CP, CAETHG_37 CLJU_c1634 * transportador de cianato 28 0 3521 Família RraA CAETHG_13 CLJU_c3477 * 74 0 3522 * CLJU_c3772 CLRAG_ 0 37140
159 / 294 3523 * CLJU_c3775 CLRAG_ 0 37170 3524 * CLJU_c1209 * 0 3525 * CLJU_c1204 * 0 3526 * CLJU_c1208 * 0 3527 * CLJU_c1207 * 0 3528 * CLJU_c1206 * 0 3529 * CLJU_c1205 * 0 3530 regulador transcricional putativo CAETHG_21 CLJU_c0023 * 40 0 3531 * CLJU_c1661 CLRAG_ 0 33510 3532 * CLJU_c3248 CLRAG_ 0 03360 3533 * CLJU_c3251 CLRAG_ 0 03390 3534 Regulador transcricional da família de CAETHG_37 CLJU_c1628 * peles, regulador da captação férrica 22 0 3535 * CLJU_c3771 CLRAG_ 0 37130 3536 região helicoidal do N-terminal da flagelina CAETHG_30 CLJU_c1001 * 92 0 3537 flagelina CAETHG_30 CLJU_c0971 * 65 0 3538 flagelina CAETHG_30 CLJU_c0960 * 55 0 3539 * CLJU_c3782 CLRAG_ 0 37240 3540 Proteína de estresse geral 26 CAETHG_11 CLJU_c3226 * 54 0 3541 * CLJU_c1557 * 0 3542 Glicosiltransferase envolvida na bissíntese CAETHG_25 CLJU_c0522 * da parede celular 99 0 3543 Grupo 1 de glicosil transferases CAETHG_26 CLJU_c0523 * 02 0 3544 proteína hipotética CAETHG_26 CLJU_c0525 * 04 0 3545 Glicosiltransferase, família GT2 CAETHG_40 CLJU_c1898 * 32 0 3546 * CLJU_c1431 * 0 3547 * CLJU_c2741 * 0 3548 Proteína da família da integrase do fago CAETHG_30 CLJU_c0979 * 72 0 3549 * CLJU_c3803 CLRAG_ 0 37400 3550 * CLJU_c3804 CLRAG_ 0 37410 3551 * CLJU_c3722 * 0 3552 Regulador transcricional de ligação ao CAETHG_06 CLJU_c2566 * DNA, família LysR 35 0
160 / 294 3553 Regulador transcricional de ligação ao CAETHG_13 CLJU_c3475 * DNA, família LysR 72 0 3554 * CLJU_c3791 CLRAG_ 0 37300 3555 Regulador transcricional de ligação ao CAETHG_37 CLJU_c1630 * DNA, família MarR 24 0 3556 Proteína contendo domínio GHKL CAETHG_37 CLJU_c1636 * 30 0 3557 proteína hipotética CAETHG_10 CLJU_c3009 * 07 0 3558 Hélice-giro-hélice CAETHG_20 CLJU_c4185 * 14 0 3559 * CLJU_c3871 * 0 3560 * CLJU_c2807 * 0 3561 * CLJU_c3786 CLRAG_ 0 37250 3562 * CLJU_c3800 CLRAG_ 0, 37370 CLJU_c3802 0 3563 * CLJU_c1603 * 0 3564 Antiportador de Na+/H+ NhaC CAETHG_15 CLJU_c3629 * 37 0 3565 proteína quimiotaxia que aceita metila CAETHG_37 CLJU_c1629 * 23 0 3566 * CLJU_c2803 * 0 3567 * CLJU_c1552 CLRAG_ 0 32600 3568 Proteína contendo domínio de CAETHG_11 CLJU_c3234 * metiltransferase 64 0 3569 * CLJU_c2269 CLRAG_ 0 02160 3570 * CLJU_c2812 CLRAG_ 0 09080 3571 * CLJU_c3810 CLRAG_ 0 37470 3572 * CLJU_c3809 CLRAG_ 0 37460 3573 * CLJU_c2793 * 0 3574 Epimerase de nucleosídeo-difosfato-açúcar CAETHG_00 CLJU_c1993 * 73 0 3575 Cadeia beta de glutamato sintase CAETHG_10 CLJU_c3026 * dependente de NADPH 33 0 3576 * CLJU_c3867 * 0 3577 * CLJU_c2263 CLRAG_ 0 02220 3578 * CLJU_c2264 CLRAG_ 0 02210 3579 * CLJU_c2267 CLRAG_ 0 02180 3580 * CLJU_c2265 CLRAG_ 0 02200 3581 * CLJU_c2266 CLRAG_ 0 02190
161 / 294 3582 * CLJU_c2786 * 0 3583 * CLJU_c3716 * 0 3584 * CLJU_c3787 CLRAG_ 0, 37260 CLJU_c3789 0 3585 Regulador transcricional, contém domínio CAETHG_21 CLJU_c0022 * HTH da família XRE 39 0 3586 * CLJU_c3138 * 0 3587 integrase tipo fago CAETHG_30 CLJU_c0978 * 71 0 3588 Proteína da família da integrase do fago CAETHG_30 CLJU_c0980 * 73 0 3589 Fago integrase, domínio semelhante ao CAETHG_30 CLJU_c0981 * SAM do terminal N 74 0 3590 * CLJU_c3247 CLRAG_ 0 03350 3591 Proteína da família da integrase do fago CAETHG_00 CLJU_c1991 * 71 0 3592 * CLJU_c0369 CLRAG_ 0 17060 3593 subunidade pequena de fago terminase CAETHG_21 CLJU_c0035 * 52 0 3594 proteína hipotética CAETHG_10 CLJU_c3024 * 31 0 3595 undecaprenil-difosfatase CAETHG_38 CLJU_c1697 * 07 0 3596 D-3-fosfoglicerato desidrogenase CAETHG_13 CLJU_c3476 * 73 0 3597 * CLJU_c3265 CLRAG_ 0 29370 3598 * CLJU_c2794 * 0 3599 * CLJU_c2796 * 0 3600 Regulador transcricional de ligação ao CAETHG_00 CLJU_c1992 * DNA, família MerR 72 0 3601 * CLJU_c2758 * 0 3602 * CLJU_c2751 * 0 3603 Proteína contendo S-box do domínio PAS CAETHG_00 CLJU_c2414 * 94, 0, CAETHG_04 CLJU_c2406 72 0, CLJU_c2013 0 3604 * CLJU_c2176 * 0 3605 proteína de germinação de esporos KC CAETHG_17 CLJU_c3887 * 35 0 3606 proteína de germinação de esporos KA CAETHG_17 CLJU_c3885 * 33 0 3607 Proteína de germinação de esporos CAETHG_17 CLJU_c3886 * 34 0 3608 * CLJU_c3839 * 0
162 / 294 3609 * CLJU_c2242 CLRAG_ 0, 32060 CLJU_c2245 0 3610 Regulador transcricional de ligação ao CAETHG_07 CLJU_c2638 * DNA, família MarR 19 0 3611 Proteína contendo S-box do domínio PAS CAETHG_18 CLJU_c4041 * 84 0 3612 Regulador transcricional de ligação ao CAETHG_37 CLJU_c1632 * DNA, família MarR 26 0 3613 * CLJU_c2739 * 0 3614 * CLJU_c1555 * 0 3615 * CLJU_c0709 CLRAG_ 0, 02170 CLJU_c2268 0 3616 Fosfato permease de açúcar CAETHG_13 CLJU_c3478 * 75 0 3617 * CLJU_c3743 * 0 3618 * CLJU_c3742 * 0 3619 Proteína contendo domínio transposase CAETHG_08 CLJU_c2892 * DDE 88 0 3620 Transposase CAETHG_30 CLJU_c0982 * 75 0 3621 proteína hipotética CAETHG_30 CLJU_c0986 * 78 0 3622 * CLJU_c3869 * 0 3623 * CLJU_c1435 * 0 3624 * CLJU_c2957 CLRAG_ 0 35560 3625 Fator de RNA polimerase sigma-70, CAETHG_37 CLJU_c1619 * subfamília ECF 13 0 3626 * CLJU_c2773 * 0 3627 * CLJU_c1437 * 0 3628 * CLJU_c2780 * 0, CLJU_c2732 0 3629 * CLJU_c2781 * 0, CLJU_c2733 0 3630 treonina sintase 4.2.3.1, CAETHG_18 CLJU_c4036 *
4.2.99.2 82 0 3631 Glicosiltransferase envolvida na bissíntese CAETHG_30 CLJU_c0974 * da parede celular 67 0 3632 regulador transcricional do transporte de CAETHG_15 CLJU_c3630 * aroF, aroG, tyrA e aminoácidos aromáticos 38 0 3633 * CLJU_c2806 * 0, CLJU_c2804 0
163 / 294 3634 Regulador transcricional de ligação ao CAETHG_10 CLJU_c3051 * DNA, família GntR 56 0 3635 regulador transcricional, família HxlR CAETHG_11 CLJU_c3225 * 53 0 3636 Regulador transcricional de ligação ao CAETHG_37 CLJU_c1625 * DNA, família MarR 19 0 3637 * CLJU_c2785 * 0 3638 * CLJU_c3861 * 0 3639 * CLJU_c1433 * 0 3640 * CLJU_c2619 CLRAG_ 0 04270 3641 * CLJU_c1202 * 0 3642 transportador, família NhaC CAETHG_18 CLJU_c4035 * 81 0 3643 Transportador di e tricarboxilato CAETHG_06 CLJU_c2531 * 00 0 3644 regulador transcricional de dois CAETHG_10 CLJU_c3008 * componentes, família LytTR 06 0 3645 regulador transcricional de dois CAETHG_37 CLJU_c1637 * componentes, família LytTR 31 0 3646 uroporfirinogênio descarboxilase CAETHG_10 CLJU_c3030 * 37 0 3647 proteína hipotética CAETHG_01 * * 37 3648 proteína hipotética CAETHG_01 * * 95 3649 proteína hipotética CAETHG_02 * * 70 3650 Proteína de ligação ao ATP do transportador CAETHG_02 * * ABC 94 3651 proteína hipotética CAETHG_04 * * 53 3652 fator de alongamento com domínio de 6.3.5.5 CAETHG_05 * * resistência à tetraciclina contendo proteína 14 3653 proteína hipotética 2.7.7.22 CAETHG_05 * * 16 3654 proteína hipotética CAETHG_05 * * 24 3655 proteína hipotética CAETHG_05 * * 28 3656 proteína hipotética CAETHG_05 * * 49 3657 Amidase relacionada à nicotinamidase 3.3.2.1 CAETHG_06 * * 95 3658 proteína hipotética CAETHG_07 * * 01 3659 proteína hipotética CAETHG_07 * * 63 3660 proteína hipotética CAETHG_07 * * 93 3661 Transposase InsO e derivados inativados CAETHG_08 * * 14, CAETHG_22 68, CAETHG_11 00
164 / 294 3662 transposase CAETHG_08 * * 15, CAETHG_22 69, CAETHG_11 01 3663 Antiportador de Na+:H+, família NhaA CAETHG_09 * CLRAG_ 53 21450 3664 Regulador transcricional da família HxlR CAETHG_09 * * 60 3665 proteína hipotética 1.3.99.1 CAETHG_10 * CLRAG_ 22 15760 3666 Proteína Cas2 associada ao CRISPR CAETHG_13 * * 94 3667 Proteína Cas1 associada ao CRISP CAETHG_13 * * 95 3668 Exonuclease associada ao CRISPR Cas4 CAETHG_13 * * 96 3669 proteína hipotética CAETHG_14 * * 34 3670 subunidade catalítica de monóxido de CAETHG_16 * * carbono desidrogenase 20 3671 proteína hipotética CAETHG_16 * * 36 3672 DNA dependente de ATP helicase RecG CAETHG_16 * CLRAG_ 48 29890 3673 Proteína contendo domínio PilZ CAETHG_16 * CLRAG_ 96 20850 3674 proteína hipotética CAETHG_22 * * 61 3675 Proteína contendo S-box do domínio PAS CAETHG_25 * CLRAG_ 12 37760 3676 2,3-dimetilmalato-liase CAETHG_25 * CLRAG_ 13 37770 3677 Fosfato permease de açúcar CAETHG_25 * CLRAG_ 14 37780 3678 Proteína contendo domínio de dedo de CAETHG_25 * * zinco do tipo YgiT 56 3679 Transposase mobilizadora de elementos CAETHG_25 * CLRAG_ REP RayT 61 38230 3680 proteína hipotética CAETHG_25 * * 62 3681 Tipo WxcM, terminal C CAETHG_26 * * 08 3682 dTDP-4-amino-4,6-didesoxigalactose CAETHG_26 * * transaminase 09 3683 manose-1-fosfato CAETHG_26 * CLRAG_ guanililtransferase/manose-6-fosfato 36 38780 isomerase 3684 proteína de montagem de pilus tipo IV PilA CAETHG_26 * CLRAG_ 44 06750 3685 proteína E do sistema de secreção tipo II CAETHG_26 * CLRAG_ (GspE) 45 06760 3686 proteína de montagem de pilus tipo IV PilC CAETHG_26 * CLRAG_ 46 06770 3687 proteína de montagem de pilus tipo IV CAETHG_26 * CLRAG_ PilM 47 06780 3688 proteína de montagem de pilus tipo IV PilO CAETHG_26 * CLRAG_ 49 06790
165 / 294 3689 proteína contendo domínio de CAETHG_26 * CLRAG_ clivagem/metilação do terminal N do tipo 50 06800 prepilina 3690 proteína hipotética CAETHG_26 * CLRAG_ 51 06810 3691 proteína contendo domínio de CAETHG_26 * CLRAG_ clivagem/metilação do terminal N do tipo 52 06820 prepilina 3692 Terminal N PilX CAETHG_26 * CLRAG_ 53 06830 3693 esterase putativa CAETHG_26 * * 72 3694 Fosfatase ácida roxa, domínio N-terminal CAETHG_26 * * 95 3695 transdutor sensorial de quimiotaxia que CAETHG_28 * * aceita metila 56 3696 proteína hipotética CAETHG_29 * * 44 3697 proteína hipotética CAETHG_34 * * 35 3698 Helicase IRC3 dependente de ATP CAETHG_35 * CLRAG_ 19 09710 3699 proteína hipotética CAETHG_35 * CLRAG_ 21 09730 3700 proteína hipotética CAETHG_35 * CLRAG_ 22 09740 3701 Domínio AAA (subfamília relacionada a CAETHG_35 * * dineína) 25 3702 proteína hipotética CAETHG_35 * * 26 3703 proteína hipotética CAETHG_35 * CLRAG_ 38 20350 3704 Exonuclease de reparo do DNA subunidade CAETHG_35 * CLRAG_ nuclease SbcCD 42 09860 3705 Proteína não caracterizada YhaN CAETHG_35 * CLRAG_ 43 09870 3706 Proteína da superfamília de nuclease PD- CAETHG_35 * CLRAG_ (D/E)XK 44 09670 3707 proteína hipotética CAETHG_35 * CLRAG_ 46 09690 3708 Helicase IRC3 dependente de ATP CAETHG_35 * * 47 3709 proteína hipotética CAETHG_35 * * 49 3710 proteína hipotética CAETHG_35 * * 98 3711 Regulador transcricional de ligação ao CAETHG_36 * CLRAG_ DNA, família MarR 58 32640 3712 Proteína contendo domínio de CAETHG_36 * CLRAG_ metiltransferase 59 32650 3713 fosfinotricina acetiltransferase CAETHG_36 * CLRAG_ 60 32660 3714 proteína redox provável da família CAETHG_36 * CLRAG_ C_GCAxxG_C_C 61 32670 3715 Proteína que contém o domínio DGC CAETHG_36 * CLRAG_ 68 32750 3716 Proteína que contém o domínio DGC CAETHG_36 * CLRAG_ 69 32760 3717 proteína H do sistema de clivagem da CAETHG_36 * CLRAG_ glicina 70 32770
166 / 294 3718 Diidropirimidina desidrogenase dependente CAETHG_36 * CLRAG_ de NAD, subunidade PreA 71 32780 3719 proteína hipotética CAETHG_36 * CLRAG_ 72 32790 3720 proteína hipotética CAETHG_36 * CLRAG_ 73 32810 3721 peptidase dependente de zinco CAETHG_36 * CLRAG_ 76 32840 3722 Regulador transcricional de ligação ao CAETHG_37 * * DNA, domínio HTH da família XRE 52 3723 proteína hipotética CAETHG_37 * CLRAG_ 53 33400 3724 proteína hipotética CAETHG_37 * CLRAG_ 54 33410 3725 Segregação de DNA ATPase FtsK/SpoIIIE, CAETHG_37 * CLRAG_ família S-DNA-T 55 33420 3726 proteína do sistema de restrição CAETHG_37 * CLRAG_ 57 33440 3727 DNA helicase-2/DNA dependente de ATP CAETHG_38 * CLRAG_ helicase PcrA 03 33820 3728 proteína hipotética CAETHG_38 * * 10 3729 proteína de membrana da bomba de CAETHG_39 * CLRAG_ arsênico 85 16620 3730 proteína de função desconhecida CAETHG_39 * CLRAG_ (DUF3794) 87 16610 3731 proteína hipotética CAETHG_39 * CLRAG_ 88 16600 3732 proteína hipotética CAETHG_39 * CLRAG_ 89, 16590 CAETHG_39 90 3733 proteína hipotética CAETHG_39 * CLRAG_ 91 16570 3734 proteína reguladora de esporulação tipo CAETHG_39 * CLRAG_ Spo0E 95 16530 3735 Proteína contendo domínio cupina 5.3.1.8 CAETHG_39 * CLRAG_ 97 16510 3736 autoindutor 2 (AI-2) quinase CAETHG_39 * CLRAG_ 98 16500 3737 Regulador transcricional de ligação ao CAETHG_39 * CLRAG_ DNA LsrR, família DeoR 99 16490 3738 Proteína de ligação ao ATP do sistema de CAETHG_40 * CLRAG_ transporte AI-2 00 16480 3739 Proteína de permease do sistema de CAETHG_40 * CLRAG_ transporte AI-2 01 16470 3740 Proteína de permease do sistema de CAETHG_40 * CLRAG_ transporte AI-2 02 16460 3741 Proteína de ligação ao substrato do sistema CAETHG_40 * CLRAG_ de transporte AI-2 03 16450 3742 autoindutor putativo-2 (AI-2) aldolase CAETHG_40 * CLRAG_ 04 16440 3743 proteína hipotética CAETHG_40 * CLRAG_ 05 16430 3744 Glicosiltransferase, família GT2 CAETHG_40 * CLRAG_ 07, 16410 CAETHG_40 12 3745 Peptidoglicano/xilano/quitina desacetilase, CAETHG_40 * CLRAG_ família PgdA/CDA1 08 40260
167 / 294 3746 UDPglicose 6-desidrogenase 1.1.1.22 CAETHG_40 * CLRAG_ 09 40250 3747 Família 2 tipo glicosiltransferase CAETHG_40 * CLRAG_ 10 40230 3748 Família de glicosil transferase 2 CAETHG_40 * CLRAG_ 11, 40210 CAETHG_40 13, CAETHG_40 14 3749 Proteína de maturação de esporos CgeB CAETHG_40 * CLRAG_ 15 40170 3750 proteína hipotética CAETHG_40 * CLRAG_ 16 40160 3751 proteína hipotética CAETHG_40 * CLRAG_ 21 40100 3752 proteína hipotética CAETHG_40 * CLRAG_ 22 40090 3753 * * CLRAG_ 38840 3754 * * CLRAG_ 39170 3755 * * CLRAG_ 39160 3756 * * CLRAG_ 39140 3757 * * CLRAG_ 39110 3758 * * CLRAG_ 39100 3759 * * CLRAG_ 29850 3760 * * CLRAG_ 33000 3761 * * CLRAG_ 33280 3762 * * CLRAG_ 33290 3763 * * CLRAG_ 40220 3764 * * CLRAG_ 17980 3765 * * CLRAG_ 03540 3766 * * CLRAG_ 06340 3767 * * CLRAG_ 06490 3768 * * CLRAG_ 09680 3769 * * CLRAG_ 32280 3770 * * CLRAG_ 32270 3771 * * CLRAG_ 32400 3772 * * CLRAG_ 32390 3773 * * CLRAG_ 32380
168 / 294 3774 * * CLRAG_ 32370 3775 * * CLRAG_ 24810 3776 * * CLRAG_ 30620 3777 * * CLRAG_ 30760 3778 * * CLRAG_ 32420 3779 * * CLRAG_ 01000 3780 * * CLRAG_ 00960 3781 * * CLRAG_ 02850 3782 * * CLRAG_ 02860 3783 * * CLRAG_ 02870 3784 * * CLRAG_ 02880 3785 * * CLRAG_ 02900 3786 * * CLRAG_ 02910 3787 * * CLRAG_ 02920 3788 * * CLRAG_ 02950 3789 * * CLRAG_ 02960 3790 * * CLRAG_ 02970 3791 * * CLRAG_ 02980 3792 * * CLRAG_ 02990 3793 * * CLRAG_ 03000 3794 * * CLRAG_ 03010 3795 * * CLRAG_ 03310 3796 * * CLRAG_ 03330 3797 * * CLRAG_ 15190 3798 * * CLRAG_ 15180 3799 * * CLRAG_ 09910 3800 * * CLRAG_ 32560 3801 * * CLRAG_ 30530 3802 * * CLRAG_ 32700 3803 * * CLRAG_ 14810
169 / 294 3804 * * CLRAG_ 25230 3805 * * CLRAG_ 25290 3806 * * CLRAG_ 20440 3807 * * CLRAG_ 37570 3808 * * CLRAG_ 26360 3809 * * CLRAG_ 37610 3810 * * CLRAG_ 36020 3811 * * CLRAG_ 36040 3812 * * CLRAG_ 36050 3813 * * CLRAG_ 36060 3814 * * CLRAG_ 09130 3815 * * CLRAG_ 05640 3816 * * CLRAG_ 16370 3817 * * CLRAG_ 23850 3818 * * CLRAG_ 13360 3819 * * CLRAG_ 13380 3820 * CLJU_c0163 * 0, CLJU_c3850 0, CLJU_c3704 0, CLJU_c3101 0, CLJU_c1754 0 3821 * CLJU_c1454 * 0 3822 * CLJU_c1587 * 0 3823 * CLJU_c0376 * 0 3824 * CLJU_c3784 * 0 3825 * CLJU_c0049 * 0 3826 * CLJU_c0155 * 0 3827 * CLJU_c0159 * 0 3828 * CLJU_c0201 * 0 3829 * CLJU_c0251 * 0
170 / 294 3830 * CLJU_c0328 * 0 3831 * CLJU_c0329 * 0 3832 * CLJU_c0330 * 0 3833 * CLJU_c0334 * 0 3834 * CLJU_c0335 * 0 3835 * CLJU_c0336 * 0 3836 * CLJU_c0341 * 0 3837 * CLJU_c0345 * 0 3838 * CLJU_c0346 * 0 3839 * CLJU_c0349 * 0 3840 * CLJU_c0350 * 0 3841 * CLJU_c0351 * 0 3842 * CLJU_c0357 * 0 3843 * CLJU_c0358 * 0 3844 * CLJU_c0359 * 0 3845 * CLJU_c0360 * 0 3846 * CLJU_c0363 * 0 3847 * CLJU_c0370 * 0 3848 * CLJU_c0373 * 0 3849 * CLJU_c0375 * 0 3850 * CLJU_c0379 * 0 3851 * CLJU_c0380 * 0 3852 * CLJU_c0414 * 0 3853 * CLJU_c0426 * 0 3854 * CLJU_c0454 * 0 3855 * CLJU_c0485 * 0 3856 * CLJU_c0526 * 0 3857 * CLJU_c0536 * 0 3858 * CLJU_c0537 * 0 3859 * CLJU_c0559 * 0
171 / 294 3860 * CLJU_c0581 * 0 3861 * CLJU_c0688 * 0 3862 * CLJU_c0774 * 0 3863 * CLJU_c0842 * 0 3864 * CLJU_c0894 * 0 3865 * CLJU_c0972 * 0 3866 * CLJU_c0985 * 0 3867 * CLJU_c1003 * 0 3868 * CLJU_c1079 * 0 3869 * CLJU_c1081 * 0 3870 * CLJU_c1089 * 0 3871 * CLJU_c1203 * 0 3872 * CLJU_c1266 * 0 3873 * CLJU_c1276 * 0 3874 * CLJU_c1350 * 0 3875 * CLJU_c1351 * 0 3876 * CLJU_c1359 * 0 3877 * CLJU_c1404 * 0 3878 * CLJU_c1444 * 0 3879 * CLJU_c1449 * 0 3880 * CLJU_c1450 * 0 3881 * CLJU_c1451 * 0 3882 * CLJU_c1452 * 0 3883 * CLJU_c1453 * 0 3884 * CLJU_c1455 * 0 3885 * CLJU_c1456 * 0 3886 * CLJU_c1457 * 0 3887 * CLJU_c1458 * 0 3888 * CLJU_c1459 * 0 3889 * CLJU_c1460 * 0
172 / 294 3890 * CLJU_c1461 * 0 3891 * CLJU_c1469 * 0 3892 * CLJU_c1476 * 0 3893 * CLJU_c1483 * 0 3894 * CLJU_c1503 * 0 3895 * CLJU_c1504 * 0 3896 * CLJU_c1539 * 0 3897 * CLJU_c1585 * 0 3898 * CLJU_c1588 * 0 3899 * CLJU_c1589 * 0 3900 * CLJU_c1590 * 0 3901 * CLJU_c1597 * 0 3902 * CLJU_c1598 * 0 3903 * CLJU_c1601 * 0 3904 * CLJU_c1618 * 0 3905 * CLJU_c1656 * 0 3906 * CLJU_c1657 * 0 3907 * CLJU_c1662 * 0 3908 * CLJU_c1663 * 0 3909 * CLJU_c1667 * 0 3910 * CLJU_c1671 * 0 3911 * CLJU_c1673 * 0 3912 * CLJU_c1674 * 0 3913 * CLJU_c1675 * 0 3914 * CLJU_c1676 * 0 3915 * CLJU_c1678 * 0 3916 * CLJU_c1679 * 0 3917 * CLJU_c1680 * 0 3918 * CLJU_c1682 * 0 3919 * CLJU_c1685 * 0
173 / 294 3920 * CLJU_c1686 * 0 3921 * CLJU_c1687 * 0 3922 * CLJU_c1688 * 0 3923 * CLJU_c1689 * 0 3924 * CLJU_c1691 * 0 3925 * CLJU_c1692 * 0 3926 * CLJU_c1817 * 0 3927 * CLJU_c1884 * 0 3928 * CLJU_c2248 * 0 3929 * CLJU_c2249 * 0 3930 * CLJU_c2335 * 0 3931 * CLJU_c2482 * 0 3932 * CLJU_c2701 * 0 3933 * CLJU_c2787 * 0 3934 * CLJU_c2815 * 0 3935 * CLJU_c3007 * 0 3936 * CLJU_c3018 * 0 3937 * CLJU_c3019 * 0 3938 * CLJU_c3038 * 0 3939 * CLJU_c3057 * 0 3940 * CLJU_c3058 * 0 3941 * CLJU_c3083 * 0 3942 * CLJU_c3084 * 0 3943 * CLJU_c3091 * 0 3944 * CLJU_c3106 * 0 3945 * CLJU_c3110 * 0 3946 * CLJU_c3114 * 0 3947 * CLJU_c3115 * 0 3948 * CLJU_c3135 * 0 3949 * CLJU_c3141 * 0
174 / 294 3950 * CLJU_c3142 * 0 3951 * CLJU_c3143 * 0 3952 * CLJU_c3144 * 0 3953 * CLJU_c3147 * 0 3954 * CLJU_c3150 * 0 3955 * CLJU_c3152 * 0 3956 * CLJU_c3153 * 0 3957 * CLJU_c3156 * 0 3958 * CLJU_c3158 * 0 3959 * CLJU_c3177 * 0 3960 * CLJU_c3244 * 0 3961 * CLJU_c3245 * 0 3962 * CLJU_c3246 * 0 3963 * CLJU_c3259 * 0 3964 * CLJU_c3260 * 0 3965 * CLJU_c3261 * 0 3966 * CLJU_c3262 * 0 3967 * CLJU_c3267 * 0 3968 * CLJU_c3346 * 0 3969 * CLJU_c3537 * 0 3970 * CLJU_c3582 * 0 3971 * CLJU_c3599 * 0 3972 * CLJU_c3627 * 0 3973 * CLJU_c3628 * 0 3974 * CLJU_c3638 * 0 3975 * CLJU_c3639 * 0 3976 * CLJU_c3642 * 0 3977 * CLJU_c3643 * 0 3978 * CLJU_c3649 * 0 3979 * CLJU_c3654 * 0
175 / 294 3980 * CLJU_c3658 * 0 3981 * CLJU_c3659 * 0 3982 * CLJU_c3660 * 0 3983 * CLJU_c3661 * 0 3984 * CLJU_c3663 * 0 3985 * CLJU_c3664 * 0 3986 * CLJU_c3798 * 0 3987 * CLJU_c3799 * 0 3988 * CLJU_c3857 * 0 3989 * CLJU_c3873 * 0 3990 * CLJU_c3875 * 0 3991 * CLJU_c3876 * 0 3992 * CLJU_c3905 * 0 3993 * CLJU_c4015 * 0 3994 * CLJU_c4017 * 0 3995 * CLJU_c4019 * 0 3996 * CLJU_c4038 * 0 3997 * CLJU_c4040 * 0 3998 * CLJU_c4267 * 0 3999 * CLJU_c1463 * 0 4000 * CLJU_c3086 * 0 4001 * CLJU_c0528 * 0 4002 * CLJU_c0524 * 0 4003 * CLJU_c1684 * 0 4004 * CLJU_c0339 * 0, CLJU_c3655 0 4005 * CLJU_c0355 * 0 4006 * CLJU_c0353 * 0 4007 * CLJU_c0337 * 0
176 / 294 4008 * CLJU_c0338 * 0, CLJU_c3656 0 4009 * CLJU_c0342 * 0 4010 * CLJU_c0343 * 0, CLJU_c3652 0 4011 * CLJU_c0356 * 0 4012 * CLJU_c0365 * 0 4013 * CLJU_c0366 * 0 4014 * CLJU_c0367 * 0 4015 * CLJU_c1672 * 0 4016 * CLJU_c1677 * 0 4017 * CLJU_c3146 * 0 4018 * CLJU_c3148 * 0 4019 * CLJU_c3159 * 0 4020 * CLJU_c3163 * 0 4021 * CLJU_c3164 * 0 4022 * CLJU_c3653 * 0 4023 * CLJU_c3657 * 0 4024 * CLJU_c2768 * 0 4025 * CLJU_c2250 * 0 4026 * CLJU_c2766 * 0 4027 * CLJU_c2897 * 0 4028 * CLJU_c2898 * 0 4029 * CLJU_c2899 * 0 4030 * CLJU_c0165 * 0, CLJU_c3852 0, CLJU_c3706 0, CLJU_c3103 0, CLJU_c1752 0 4031 * CLJU_c3017 * 0
177 / 294 4032 * CLJU_c1683 * 0 4033 * CLJU_c1477 * 0 4034 * CLJU_c3645 * 0 4035 * CLJU_c3783 * 0 4036 * CLJU_c1895 * 0 4037 * CLJU_c3099 * 0 4038 * CLJU_c3641 * 0 4039 * CLJU_c3151 * 0 4040 * CLJU_c3085 * 0 4041 * CLJU_c3785 * 0 4042 * CLJU_c0527 * 0 4043 * CLJU_c0529 * 0 4044 * CLJU_c0530 * 0 4045 * CLJU_c0973 * 0 4046 * CLJU_c3646 * 0 4047 * CLJU_c3263 * 0 4048 * CLJU_c1402 * 0 4049 * CLJU_c1403 * 0 4050 * CLJU_c2556 * 0, CLJU_c2849 0, CLJU_c2752 0 4051 * CLJU_c3874 * 0 4052 * CLJU_c2767 * 0 4053 * CLJU_c2802 * 0 4054 * CLJU_c0348 * 0 4055 * CLJU_c2253 * 0 4056 * CLJU_c2755 * 0 4057 * CLJU_c1583 * 0 4058 * CLJU_c0378 * 0 4059 * CLJU_c1586 * 0
178 / 294 4060 * CLJU_c0361 * 0 4061 * CLJU_c3668 * 0 4062 * CLJU_c0354 * 0 4063 * CLJU_c3665 * 0 4064 * CLJU_c0374 * 0 4065 * CLJU_c0344 * 0, CLJU_c3650 0 4066 * CLJU_c3161 * 0 4067 * CLJU_c0352 * 0 4068 * CLJU_c3140 * 0 4069 * CLJU_c3139 * 0 4070 * CLJU_c3162 * 0 4071 * CLJU_c0347 * 0 4072 * CLJU_c0362 * 0 4073 * CLJU_c0372 * 0 4074 * CLJU_c3149 * 0 4075 * CLJU_c3644 * 0 4076 * CLJU_c1658 * 0 4077 * CLJU_c3087 * 0 4078 * CLJU_c0340 * 0 4079 * CLJU_c0377 * 0 4080 * CLJU_c3662 * 0 4081 * CLJU_c0162 * 0, CLJU_c3849 0, CLJU_c3703 0, CLJU_c3100 0, CLJU_c1755 0 4082 * CLJU_c3904 * 0 4083 * CLJU_c2239 * 0 4084 * CLJU_c3155 * 0
179 / 294 4085 * CLJU_c3171 * 0 4086 * CLJU_c3172 * 0 4087 * CLJU_c3666 * 0 4088 * CLJU_c3667 * 0 4089 * CLJU_c0987 * 0 4090 * CLJU_c3708 * 0 4091 * CLJU_c0164 * 0, CLJU_c3851 0, CLJU_c3705 0, CLJU_c3102 0, CLJU_c1753 0 4092 * CLJU_c0331 * 0 4093 * CLJU_c2853 * 0 4094 * CLJU_c3903 * 0 4095 * CLJU_c3906 * 0, CLJU_c3907 0 4096 * CLJU_c0166 * 0, CLJU_c3853 0, CLJU_c3707 0, CLJU_c3104 0, CLJU_c1751 0 4097 * CLJU_c0333 * 0 4098 * CLJU_c0332 * 0 4099 * CLJU_c1592 * 0 4100 * CLJU_c3651 * 0 4101 tripeptídeo aminopeptidase CAETHG_00 * * 06 4102 proteína hipotética CAETHG_00 * * 53 4103 Proteína contendo domínio receptor do CAETHG_00 * * regulador de resposta 55 4104 exonuclease SbcC CAETHG_01 * * 14 4105 proteína quimiotaxia que aceita metila CAETHG_01 * * 20
180 / 294 4106 proteína hipotética CAETHG_01 * * 52 4107 Proteína contendo domínio de ligação de CAETHG_01 * * ferro-enxofre 2Fe-2S 57 4108 Proteína contendo repetição de CAETHG_02 * * tetratricopeptídeo 36 4109 Proteína da família glicerofosforil diéster CAETHG_02 * * fosfodiesterase 68 4110 Leucil aminopeptidase (aminopeptidase T) CAETHG_02 * * 79 4111 proteína AroM CAETHG_02 * * 80 4112 proteína hipotética CAETHG_02 * * 82 4113 Proteína de membrana não caracterizada, CAETHG_02 * * família transportadora de oligopeptídeos 83 (OPT) 4114 proteína reguladora de catabolismo de CAETHG_02 * * purina 84 4115 proteína hipotética CAETHG_03 * * 25 4116 proteína hipotética CAETHG_03 * * 26 4117 proteína hipotética CAETHG_03 * * 31 4118 proteína hipotética CAETHG_03 * * 36 4119 Proteína da família AcrB/AcrD/AcrF CAETHG_03 * * 92 4120 proteína hipotética CAETHG_03 * * 99 4121 Transportador MFS, família NNP, CAETHG_04 * * transportador de nitrato/nitrito 39 4122 proteína hipotética CAETHG_04 * * 89 4123 proteína hipotética CAETHG_04 * * 94 4124 proteína hipotética CAETHG_05 * * 19 4125 proteína hipotética CAETHG_05 * * 47 4126 proteína hipotética CAETHG_05 * * 48 4127 proteína hipotética CAETHG_05 * * 67 4128 DNA dependente de ATP helicase RecQ CAETHG_05 * * 95 4129 proteína hipotética CAETHG_06 * * 24 4130 proteína hipotética CAETHG_06 * * 32 4131 endoglucanase CAETHG_06 * * 87 4132 proteína hipotética CAETHG_06 * * 88 4133 proteína hipotética CAETHG_06 * * 89 4134 Proteína contendo domínio N-terminal da CAETHG_06 * * família SNF2 90
181 / 294 4135 Proteína contendo domínio N-terminal da CAETHG_06 * * família SNF2 91 4136 proteína contendo domínio SPASM de CAETHG_06 * * ligação a 4Fe4S adicional de radical SAM 92 4137 proteína hipotética CAETHG_06 * * 93 4138 proteína hipotética CAETHG_06 * * 94, CAETHG_35 28 4139 epoxiqueuosina redutase CAETHG_07 * * 13 4140 proteína hipotética CAETHG_07 * * 66 4141 proteína hipotética CAETHG_07 * * 90 4142 proteína hipotética CAETHG_07 * * 98 4143 proteína hipotética CAETHG_08 * * 09 4144 Proteína da superfamília de nuclease PD- CAETHG_08 * * (D/E)XK 37 4145 peptídeo autoindutor de lactona cíclico CAETHG_08 * * 45 4146 proteína hipotética CAETHG_08 * * 51 4147 proteína hipotética CAETHG_08 * * 77 4148 Proteína de membrana não caracterizada CAETHG_09 * * YcaP, família DUF421 51 4149 proteína hipotética CAETHG_09 * * 52 4150 transposase putativa CAETHG_09 * * 54 4151 esterase CAETHG_09 * * 62 4152 Proteína da família Lipase/Acil-hidrolase CAETHG_09 * * do tipo GDSL 63 4153 ATPase tipo PhoH CAETHG_09 * * 70 4154 Proteína contendo domínio GHKL CAETHG_10 * * 08 4155 proteína hipotética CAETHG_10 * * 11 4156 proteína hipotética CAETHG_10 * * 17 4157 proteína hipotética CAETHG_10 * * 18 4158 proteína hipotética CAETHG_10 * * 19 4159 proteína hipotética CAETHG_10 * * 20 4160 Superfamília II DNA ou RNA helicase CAETHG_10 * * 21 4161 proteína hipotética CAETHG_10 * * 23 4162 proteína quimiotaxia que aceita metila CAETHG_10 * * 61 4163 Proteína da superfamília do tipo CAETHG_10 * * transglutaminase 87
182 / 294 4164 Proteína putativa de ligação à parede CAETHG_10 * * celular 88 4165 proteína hipotética CAETHG_10 * * 94 4166 proteína de função desconhecida CAETHG_10 * * (DUF4868) 95 4167 proteína hipotética CAETHG_10 * * 96 4168 proteína hipotética CAETHG_10 * * 99 4169 Proteína secretada prevista CAETHG_11 * * 02 4170 Proteína contendo repetição de CAETHG_11 * * tetratricopeptídeo C-terminal Fis1 04 4171 proteína semelhante a fago CAETHG_11 * * 05 4172 proteína hipotética CAETHG_11 * * 06 4173 proteína hipotética CAETHG_11 * * 07 4174 proteína hipotética CAETHG_11 * * 57 4175 proteína hipotética CAETHG_11 * * 58 4176 proteína hipotética CAETHG_12 * * 13 4177 proteína hipotética CAETHG_12 * * 33 4178 capD, proteína de biossíntese de CAETHG_13 * * polissacarídeos capsulares 16 4179 tirosil-tRNA sintetase CAETHG_13 * * 29 4180 proteína hipotética CAETHG_13 * * 62 4181 proteína hipotética CAETHG_13 * * 78 4182 Endonuclease associada à CRISPR/helicase CAETHG_13 * * Cas3 97 4183 Proteína Cas5h associada ao CRISPR CAETHG_13 * * 98 4184 Proteína Csh2 associada ao CRISPR CAETHG_13 * * 99 4185 Proteína associada a CRISPR Csh1 CAETHG_14 * * 00 4186 Endoribonuclease associada ao CRISPR CAETHG_14 * * Cas6 01 4187 proteína hipotética CAETHG_14 * * 02, CAETHG_14 03 4188 proteína hipotética CAETHG_14 * * 04 4189 proteína hipotética CAETHG_14 * * 05 4190 proteína hipotética CAETHG_14 * * 06 4191 proteína hipotética CAETHG_15 * * 07 4192 proteína semelhante à descarboxilase do CAETHG_15 * * uroporfirinogênio-III 20
183 / 294 4193 Módulo sensorial de quatro feixes CAETHG_15 * * helicoidais para transdução de sinal 30 4194 hidrogenase dependente de ferro CAETHG_15 * * 75 4195 Subunidade G da NADH quinona CAETHG_15 * * oxidorredutase 76 4196 Subunidade E da NADH-quinona- CAETHG_15 * * oxidorredutase 78 4197 proteína hipotética CAETHG_16 * * 40 4198 proteína hipotética CAETHG_16 * * 42 4199 proteína hipotética CAETHG_16 * * 43 4200 proteína hipotética CAETHG_16 * * 45 4201 proteína hipotética CAETHG_16 * * 46 4202 proteína hipotética CAETHG_16 * * 47 4203 Proteína contendo domínio semelhante ao CAETHG_16 * * PLD 49 4204 DNA metilase específica da adenina, CAETHG_16 * * contém um domínio de fita de Zn 50 4205 Proteína de função desconhecida CAETHG_16 * * (DUF3780) 51 4206 Proteína contendo domínio C-terminal de CAETHG_16 * * quitobiase/beta-hexosaminidase 52 4207 proteína hipotética conservada CAETHG_16 * * 53 4208 proteína hipotética CAETHG_16 * * 59 4209 proteína hipotética CAETHG_16 * * 60 4210 proteína hipotética CAETHG_16 * * 61 4211 proteína hipotética CAETHG_16 * * 62 4212 proteína hipotética CAETHG_16 * * 63 4213 proteína hipotética CAETHG_16 * * 64 4214 aspartato quinase CAETHG_16 * * 89 4215 regulador transcricional, família TetR CAETHG_17 * * 05 4216 proteína hipotética CAETHG_17 * * 06 4217 proteína reguladora, família luxR CAETHG_17 * * 09 4218 proteína hipotética CAETHG_17 * * 10 4219 Família Peptidase M28 CAETHG_17 * * 11 4220 cloranfenicol O-acetiltransferase tipo A CAETHG_17 * * 17 4221 Hélice-giro-hélice CAETHG_17 * * 24 4222 proteína hipotética CAETHG_17 * * 52
184 / 294 4223 endonuclease-3 CAETHG_17 * * 72 4224 proteína hipotética CAETHG_18 * * 03 4225 proteína permease putativa de sistema de CAETHG_18 * * transporte ABC 45 4226 proteína hipotética CAETHG_18 * * 52 4227 proteína hipotética CAETHG_18 * * 53 4228 proteína hipotética CAETHG_19 * * 22 4229 proteína hipotética CAETHG_20 * * 12 4230 proteína hipotética CAETHG_20 * * 30 4231 [acil-carreador-proteína] S- CAETHG_20 * * maloniltransferase 47 4232 proteína reguladora, família Fis CAETHG_20 * * 77 4233 proteína hipotética CAETHG_21 * * 55 4234 proteína hipotética CAETHG_21 * * 64 4235 Proteína de função desconhecida CAETHG_22 * * (DUF1015) 12 4236 proteína hipotética CAETHG_22 * * 25, CAETHG_27 27 4237 Regulador transcricional da família GntR, CAETHG_22 * * repressor transcricional da operação 32 arabinose 4238 proteína hipotética CAETHG_22 * * 38 4239 proteína hipotética CAETHG_22 * * 80 4240 proteína de revestimento de esporos, CAETHG_23 * * família CotS 03 4241 proteína hipotética CAETHG_23 * * 05 4242 proteína de revestimento de esporos CAETHG_23 * * 07 4243 proteína hipotética CAETHG_23 * * 61 4244 proteína hipotética CAETHG_23 * * 71 4245 Transposase CAETHG_23 * * 86 4246 proteína de transporte de membrana de CAETHG_23 * * benzoato 88 4247 pirofosforilase de nicotinato-nucleotídeo 2.4.2.19 CAETHG_23 * * (carboxilação) 89 4248 proteína contendo domínio de síntese do CAETHG_23 * * cofator de molibdênio 90 4249 Hidratase de 2-ceto-4-pentenoato CAETHG_23 * * 91 4250 Proteína contendo domínio de ligação CAETHG_23 * * semelhante a BFD [2Fe-2S] 92
185 / 294 4251 proteína hipotética CAETHG_23 * * 93 4252 Proteína de função desconhecida DUF111 CAETHG_23 * * 94 4253 proteína hipotética CAETHG_23 * * 95 4254 regulador transcricional, família IclR CAETHG_23 * * 96 4255 proteína não caracterizada CAETHG_23 * * 97 4256 4-hidroxi-tetra-hidrodipicolinato sintase 4.2.1.52 CAETHG_23 * * 98 4257 Módulo sensorial de quatro feixes helicoidais para CAETHG_23 * * transdução de sinal 99 4258 proteína quimiotaxia que aceita metila CAETHG_24 * * 00 4259 Piruvato quinase, domínio barril CAETHG_24 * * 40 4260 Proteína que contém repetição de hélice CAETHG_24 * * tripla de colágeno 94 4261 subunidade pequena de carbamoil-fosfato CAETHG_25 * * sintase 09 4262 proteína hipotética CAETHG_25 * * 26 4263 proteína de ligação ao ATP putativa de CAETHG_25 * * sistema de transporte ABC 59 4264 proteína permease putativa de sistema de CAETHG_25 * * transporte ABC 60 4265 glicosiltransferase CAETHG_26 * * 00 4266 proteína hipotética CAETHG_26 * * 01 4267 proteína de membrana tipo O-antígeno CAETHG_26 * * ligase 03 4268 proteína hipotética CAETHG_26 * * 05 4269 Glicosiltransferase, família GT2 CAETHG_26 * * 06 4270 hexapeptídeo transferase (seis proteínas contendo CAETHG_26 * * repetição) 07 4271 Proteína de membrana envolvida na exportação de CAETHG_26 * * antígeno O e ácido teicoico 10 4272 Glicosiltransferase envolvida na bissíntese CAETHG_26 * * da parede celular 11 4273 proteína hipotética CAETHG_26 * * 12 4274 Glicosiltransferase envolvida na bissíntese CAETHG_26 * * da parede celular 13 4275 proteína hipotética CAETHG_26 * * 14 4276 glicosiltransferase CAETHG_26 * * 24 4277 proteína hipotética CAETHG_26 * * 48 4278 proteína hipotética CAETHG_26 * * 65 4279 proteína hipotética CAETHG_26 * * 76 4280 proteína hipotética CAETHG_26 * * 86
186 / 294 4281 Proteína que contém o domínio hélice- CAETHG_27 * * volta-hélice 15 4282 proteína hipotética CAETHG_27 * * 36 4283 argininossuccinato sintase CAETHG_27 * * 60 4284 proteína hipotética CAETHG_28 * * 04 4285 fator de alongamento específico da CAETHG_28 * * selenocisteína 41 4286 Módulo sensorial de quatro feixes helicoidais para CAETHG_28 * * transdução de sinal 57 4287 rRNA 16S (uracil1498-N3)- CAETHG_28 * * metiltransferase 95 4288 arginina: antiportador de ornitina/lisina CAETHG_30 * * permease 23 4289 flaG, proteína flagelar CAETHG_30 * * 50 4290 Família de glicosil transferase 2 CAETHG_30 * * 66 4291 Proteína contendo domínio semelhante a CAETHG_30 * * AAA 80 4292 proteína hipotética CAETHG_31 * * 69 4293 proteína hipotética CAETHG_32 * * 10 4294 proteína hipotética CAETHG_33 * * 56 4295 proteína hipotética CAETHG_33 * * 66 4296 proteína hipotética CAETHG_34 * * 21 4297 Subunidade 5'-fosfato sintase pdxT CAETHG_34 * * 34 4298 Regulador transcricional da família BlaI, repressor da CAETHG_34 * * penicilinase 39 4299 Proteína de função desconhecida DUF3793 CAETHG_34 * * 84 4300 Bomba de efluxo multifármaco acionada CAETHG_35 * * por Na+ 01 4301 Proteína conservada não caracterizada CAETHG_35 * * 17 4302 proteína hipotética CAETHG_35 * * 18 4303 proteína hipotética CAETHG_35 * * 23 4304 proteína de partição cromossômica CAETHG_35 * * 24 4305 proteína hipotética CAETHG_35 * * 27 4306 Proteína conservada não caracterizada CAETHG_35 * * 29 4307 proteína hipotética CAETHG_35 * * 30 4308 Proteína do sistema His-Xaa-Ser HxsD CAETHG_35 * * 31 4309 Proteína do sistema His-Xaa-Ser HxsD CAETHG_35 * * 32 4310 proteína hipotética CAETHG_35 * * 33
187 / 294 4311 Proteína da família peptidase líder tipo IV CAETHG_35 * * 34 4312 proteína hipotética CAETHG_35 * * 35 4313 Maturase de radical SAM do sistema His- CAETHG_35 * * Xaa-Ser HxsC 36 4314 Maturase de radical SAM do sistema His- CAETHG_35 * * Xaa-Ser HxsB 37 4315 proteína hipotética CAETHG_35 * * 39 4316 proteína hipotética CAETHG_35 * * 40 4317 proteína contendo domínio SPASM de ligação a 4Fe4S CAETHG_35 * * adicional de radical SAM 41 4318 Resolvase, domínio N-terminal CAETHG_35 * * 50 4319 Proteína relacionada a fagos CAETHG_35 * * 51 4320 Hélice-giro-hélice CAETHG_35 * * 52 4321 Tetrafosfato de diadenosina (Ap4A) CAETHG_35 * * hidrolase 56 4322 Helicase IRC3 dependente de ATP CAETHG_35 * * 57 4323 NTP pirofosfatase não-canônica para limpeza doméstica CAETHG_35 * * prevista, superfamília all-alfa-NTP-PPase (MazG) 58 4324 Domínio AAA (subfamília relacionada a CAETHG_35 * * dineína) 59 4325 proteína hipotética CAETHG_35 * * 60 4326 proteína hipotética CAETHG_35 * * 61 4327 Proteína da imunidade Imm6 CAETHG_35 * * 62 4328 Proteína que contém o domínio hélice- CAETHG_35 * * volta-hélice 67 4329 Proteína putativa de ligação à parede CAETHG_35 * * celular 77 4330 regulador transcricional, família IclR CAETHG_35 * * 83 4331 hidroximetilglutaril-CoA sintase CAETHG_35 * * 84 4332 acetil-CoA C-acetiltransferase CAETHG_35 * * 85 4333 proteína hipotética CAETHG_35 * * 86 4334 Permease prevista de efluxo de arabinose, CAETHG_35 * * família MFS 87 4335 Permease prevista de efluxo de arabinose, CAETHG_35 * * família MFS 88 4336 proteína hipotética CAETHG_35 * * 89 4337 proteína hipotética CAETHG_35 * * 99 4338 proteína hipotética CAETHG_36 * * 67 4339 proteína hipotética CAETHG_36 * * 87 4340 proteína hipotética CAETHG_36 * * 88
188 / 294 4341 triptofano sintase, cadeia alfa CAETHG_37 * * 08 4342 Proteína de germinação de esporos CAETHG_37 * * 45 4343 proteína hipotética CAETHG_37 * * 56 4344 proteína hipotética CAETHG_37 * * 58 4345 proteína hipotética CAETHG_37 * * 59 4346 Inibidor da IseA DL-endopeptidase CAETHG_37 * * 60 4347 regulador transcricional putativo CAETHG_37 * * 61 4348 proteína hipotética CAETHG_37 * * 62 4349 proteína hipotética CAETHG_37 * * 64 4350 proteína hipotética CAETHG_37 * * 65 4351 proteína hipotética CAETHG_37 * * 66 4352 RNA polimerase dependente de RNA CAETHG_37 * * 67 4353 proteína hipotética CAETHG_37 * * 68 4354 Proteína do domínio da subunidade C ABC CAETHG_37 * * da excinuclease 69 4355 proteína hipotética CAETHG_37 * * 70 4356 Proteína de função desconhecida CAETHG_37 * * (DUF4236) 71 4357 proteína hipotética CAETHG_37 * * 72 4358 proteína hipotética CAETHG_37 * * 73, CAETHG_38 01 4359 proteína hipotética CAETHG_37 * * 74 4360 proteína hipotética CAETHG_37 * * 75 4361 proteína hipotética CAETHG_37 * * 76 4362 fago terminase, subunidade pequena, CAETHG_37 * * putativa, família P27 77 4363 proteína do tipo fago terminase, subunidade grande, CAETHG_37 * * contém o domínio HTH do terminal N 78 4364 proteína hipotética CAETHG_37 * * 79 4365 proteína portal fágica, família HK97 CAETHG_37 * * 80 4366 Protease dependente de ATP ClpP, CAETHG_37 * * subunidade protease 81 4367 proteína do capsídeo principal do fago, CAETHG_37 * * família HK97 82 4368 proteína fágica não caracterizada (possível embalagem de CAETHG_37 * * DNA) 83 4369 Proteína de junção cabeça-cauda de fago CAETHG_37 * * 84
189 / 294 4370 Bacteriófago HK97-gp10, componente da CAETHG_37 * * cauda putativo 85 4371 proteína hipotética CAETHG_37 * * 86 4372 Proteína da bainha da cauda do fago CAETHG_37 * * 87 4373 Proteína do tubo da cauda do fago CAETHG_37 * * 88 4374 proteína hipotética CAETHG_37 * * 89 4375 Proteína contendo domínio SLT CAETHG_37 * * 90 4376 proteína hipotética CAETHG_37 * * 91 4377 Proteína da família NlpC/P60 CAETHG_37 * * 92 4378 Proteína de função desconhecida CAETHG_37 * * (DUF2577) 93 4379 Proteína de função desconhecida CAETHG_37 * * (DUF2634) 94 4380 Proteína de fago não caracterizada CAETHG_37 * * gp47/JayE 95 4381 proteína hipotética (DUF2313) CAETHG_37 * * 96 4382 repetição paralela da hélice beta (duas CAETHG_37 * * cópias) 97 4383 Hemolisina XhlA CAETHG_37 * * 98 4384 Lizozima M1 (1,4-beta-N-acetilmuramidase), família CAETHG_37 * * GH25 99 4385 proteína hipotética CAETHG_38 * * 00 4386 Toxina tipo PemK, tipo MazF, do sistema toxina- CAETHG_38 * * antitoxina tipo II 02 4387 proteína hipotética CAETHG_38 * * 11 4388 proteína extracelular de ligação ao soluto CAETHG_38 * * 32 4389 proteína hipotética CAETHG_39 * * 02 4390 proteína hipotética CAETHG_39 * * 73 4391 proteína hipotética CAETHG_39 * * 74 4392 NMP-quinase de especificidade ampla CAETHG_39 * * 76 4393 Proteína contendo domínio de CAETHG_39 * * metiltransferase 77 4394 proteína de função desconhecida CAETHG_39 * * (DUF4351) 78 4395 proteína hipotética CAETHG_39 * * 86 4396 Proteína que contém repetição de hélice CAETHG_40 * * tripla de colágeno 29 4397 proteína hipotética CAETHG_40 * * 52 4398 proteína hipotética * * CLRAG_ 00050 4399 proteína de resistência a múltiplos fármacos * * CLRAG_ MdtC 00060
190 / 294 4400 precursor da proteína MdtA de resistência a * * CLRAG_ múltiplos fármacos 00070 4401 proteína reguladora do metabolismo de * * CLRAG_ ácidos graxos 00080 4402 proteína de ligação à origem direita * * CLRAG_ 00140 4403 proteína hipotética * * CLRAG_ 00150 4404 proteína hipotética * * CLRAG_ 00160 4405 proteína hipotética * * CLRAG_ 00170 4406 xilulose quinase * * CLRAG_ 00360 4407 precursor da proteína periplásmica de * * CLRAG_ ligação ao níquel 00400 4408 proteína GsiA de ligação a ATP de * * CLRAG_ importação de glutationa 00410 4409 proteína OppD de ligação a ATP de * * CLRAG_ transporte de oligopeptídeos 00420 4410 proteína permease de sistema de transporte * * CLRAG_ de glutationa GsiD 00430 4411 proteína permease de sistema de transporte * * CLRAG_ de glutationa GsiC 00440 4412 proteína permease de sistema de transporte * * CLRAG_ de níquel NikB 00450 4413 metiltransferase putativa YcgJ * * CLRAG_ 00460 4414 transportador de serina/treonina SstT * * CLRAG_ 00740 4415 proteína reguladora de oxigênio NreC * * CLRAG_ 00750 4416 oxidorredutase putativa YdhV * * CLRAG_ 00770 4417 inibidor da divisão celular MinD * * CLRAG_ 00810 4418 proteína hipotética * * CLRAG_ 00820 4419 proteína hipotética * * CLRAG_ 00830 4420 proteína hipotética * * CLRAG_ 00840 4421 proteína hipotética * * CLRAG_ 00850 4422 proteína putativa YxlF de ligação ao ATP * * CLRAG_ transportadora de ABC 00860 4423 proteína hipotética * * CLRAG_ 01050 4424 desmetilrebecamicina-D-glicose O-metiltransferase * * CLRAG_ 01080 4425 proteína hipotética * * CLRAG_ 01160 4426 proteína de transporte de elétrons putativa * * CLRAG_ YccM 01220 4427 ribonuclease D * * CLRAG_ 01280 4428 GabR, proteína reguladora da transcrição * * CLRAG_ do tipo HTH 01380 4429 proteína hipotética * * CLRAG_ 01560
191 / 294 4430 Proteína Cas6 associada ao CRISPR * * CLRAG_ 01570 4431 Proteína associada ao CRISPR * * CLRAG_ (cas_TM1802) 01580 4432 proteína hipotética * * CLRAG_ 01590 4433 Proteína associada ao CRISPR (Cas_Cas5) * * CLRAG_ 01600 4434 Nuclease/helicase Cas3 associada ao * * CLRAG_ CRISPR 01610 4435 proteína hipotética * * CLRAG_ 01620 4436 Endonuclease associada ao CRISPR Cas1 * * CLRAG_ 01630 4437 Endoribonuclease associada ao CRISPR * * CLRAG_ Cas2 01640 4438 proteína hipotética * * CLRAG_ 01830 4439 uroporfirinogênio descarboxilase * * CLRAG_ 02060 4440 subunidade 38 kDa de magnésio-quelatase * * CLRAG_ 02080 4441 subunidade 38 kDa de magnésio-quelatase * * CLRAG_ 02090 4442 subunidade cobaltoquelatase aeróbica * * CLRAG_ CobN 02100 4443 Precursor do N-acetilmuramoil-L-alanina * * CLRAG_ amidase LytC 02110 4444 proteína permease de sistema de transporte * * CLRAG_ de hemina HmuU 02120 4445 proteína putativa YusV de ligação ao ATP de sistema de * * CLRAG_ transporte de sideróforos 02130 4446 precursor da proteína de ligação à vitamina * * CLRAG_ B12 02140 4447 proteína hipotética * * CLRAG_ 02230 4448 Proteína de domínio da recombinase viral * * CLRAG_ do tipo YqaJ 02240 4449 proteína hipotética * * CLRAG_ 02250 4450 Regulador transcricional do tipo HTH * * CLRAG_ ImmR 02260 4451 proteína hipotética * * CLRAG_ 02270 4452 proteína hipotética * * CLRAG_ 02300 4453 proteína hipotética * * CLRAG_ 02310 4454 GTP pirofosfoquinase YjbM * * CLRAG_ 02320 4455 proteína hipotética * * CLRAG_ 02330 4456 Proteína ribossômica 50S L22/proteína de fusão de * * CLRAG_ domínio desconhecido 02340 4457 proteína hipotética * * CLRAG_ 02350 4458 proteína hipotética * * CLRAG_ 02360 4459 proteína hipotética * * CLRAG_ 02370
192 / 294 4460 proteína hipotética * * CLRAG_ 02380 4461 proteína hipotética * * CLRAG_ 02390 4462 proteína de utilização de propanodiol PduA * * CLRAG_ 02940 4463 transportador de biotina BioY2 * * CLRAG_ 03060 4464 biotina sintase * * CLRAG_ 03070 4465 esterase de cocaína * * CLRAG_ 03080 4466 Repressor transcricional tipo HTH Bm3R1 * * CLRAG_ 03090 4467 proteína hipotética * * CLRAG_ 03100 4468 proteína hipotética * * CLRAG_ 03110 4469 proteína hipotética * * CLRAG_ 03150 4470 proteína de efluxo de lactona * * CLRAG_ homosserina/homosserina 03160 4471 GabR, proteína reguladora da transcrição * * CLRAG_ do tipo HTH 03170 4472 proteína transdutora sensorial putativa * * CLRAG_ YfmS 03180 4473 ferredoxina * * CLRAG_ 03190 4474 subunidade alfa da benzilsuccinato sintase * * CLRAG_ 03200 4475 proteína hipotética * * CLRAG_ 03210 4476 proteína hipotética * * CLRAG_ 03220 4477 proteína hipotética * * CLRAG_ 03230 4478 proteína hipotética * * CLRAG_ 03260 4479 proteína do domínio de ligação a * * CLRAG_ peptidoglicano 03270 4480 galactosídeo O-acetiltransferase * * CLRAG_ 03280 4481 N-acetiltransferase ribossômica putativa * * CLRAG_ YdaF 03290 4482 proteína reguladora SoxS * * CLRAG_ 03300 4483 proteína hipotética * * CLRAG_ 03320 4484 hélice-giro-hélice * * CLRAG_ 03380 4485 proteína hipotética * * CLRAG_ 03410 4486 proteína hipotética * * CLRAG_ 03420 4487 proteína hipotética * * CLRAG_ 03430 4488 proteína hipotética * * CLRAG_ 03440 4489 Autoimunidade à protease do terminal * * CLRAG_ amino CAAX 03800
193 / 294 4490 N-acetiltransferase ribossômica putativa * * CLRAG_ YdaF 03860 4491 proteína hipotética * * CLRAG_ 03940 4492 Repressor transcricional de ligação ao DNA * * CLRAG_ MarR 03950 4493 flavodoxina * * CLRAG_ 03960 4494 proteína quinase de sensor WalK * * CLRAG_ 04310 4495 proteína reguladora da transcrição WalR * * CLRAG_ 04320 4496 Proteína da membrana interna da família * * CLRAG_ TVP38/TMEM64 YdjZ 04330 4497 fosfatidilcolina sintase * * CLRAG_ 04340 4498 Proteína A de captação de potássio do * * CLRAG_ sistema Ktr 04460 4499 Proteína B de captação de potássio do * * CLRAG_ sistema Ktr 04470 4500 proteína transdutora sensorial putativa * * CLRAG_ YfmS 04500 4501 Precursor do N-acetilmuramoil-L-alanina * * CLRAG_ amidase LytC 05510 4502 proteína hipotética * * CLRAG_ 05520 4503 proteína McpA para quimiotaxia que aceita * * CLRAG_ metila 05560 4504 cadeia alfa da proteína molibdênio-ferro * * CLRAG_ nitrogenase 05590 4505 proteína de cadeia beta de molibdênio-ferro * * CLRAG_ nitrogenase 05600 4506 Proteína de biossíntese do cofator FeMo * * CLRAG_ NifB 05620 4507 proteína 4 de quimiotaxia que aceita metila * * CLRAG_ 05770 4508 Proteína do domínio FIST N * * CLRAG_ 05780 4509 proteína hipotética * * CLRAG_ 05830 4510 Hidrolase de 6-amino-hexanoato-dímero * * CLRAG_ 05890 4511 Proteína A do sistema UvrABC * * CLRAG_ 05900 4512 Ativador transcricional tipo HTH Btr * * CLRAG_ 05910 4513 proteína A de inanição de carbono * * CLRAG_ 06580 4514 proteína OppD de ligação a ATP de * * CLRAG_ transporte de oligopeptídeos 06890 4515 epoxiqueuosina redutase * * CLRAG_ 06980 4516 proteína hipotética * * CLRAG_ 07010 4517 Lipase/acil-hidrolase tipo GDSL * * CLRAG_ 07020 4518 Fosfodiesterase de adenosina-monofosfato 3',5'-cíclico * * CLRAG_ CpdA 07200 4519 proteína de segregação cromossômica * * CLRAG_ 07280
194 / 294 4520 precursor de internalina-A * * CLRAG_ 07290 4521 precursor de internalina-A * * CLRAG_ 07300 4522 proteína hipotética * * CLRAG_ 07360 4523 Regulador transcricional do tipo HTH * * CLRAG_ CynR 08110 4524 proteína hipotética * * CLRAG_ 08690 4525 síntese de fosfatase alcalina proteína reguladora da * * CLRAG_ transcrição PhoP 08810 4526 proteína hipotética * * CLRAG_ 08840 4527 proteína hipotética * * CLRAG_ 08850 4528 proteína hipotética * * CLRAG_ 08860 4529 proteína R da enzima de restrição tipo 1 * * CLRAG_ 08890 4530 modificação de restrição tipo I proteína do domínio de * * CLRAG_ especificidade do DNA 08900 4531 enzima de restrição putativa do tipo I * * CLRAG_ 08910 4532 glutamato racemase * * CLRAG_ 08930 4533 ferredoxina * * CLRAG_ 08950 4534 proteína McpC para quimiotaxia que aceita * * CLRAG_ metila 08990 4535 Precursor de formamida deformilase N- * * CLRAG_ substituído 09020 4536 proteína de exportação multidrogas MepA * * CLRAG_ 09030 4537 proteína de germinação de esporos GerE * * CLRAG_ 09050 4538 carboxilesterase NlhH * * CLRAG_ 09110 4539 proteína hipotética * * CLRAG_ 09120 4540 proteína hipotética * * CLRAG_ 09200 4541 proteína de resistência a múltiplos * * CLRAG_ antibióticos MarA 09210 4542 regulador de resposta de fosfodiesterase cíclica da di- * * CLRAG_ GMP RpfG 09300 4543 repressor PerR responsivo ao peróxido * * CLRAG_ 09310 4544 proteína transdutora sensorial putativa * * CLRAG_ YfmS 09350 4545 repressor transcricional com detecção de * * CLRAG_ cobre CsoR 09360 4546 putativa ATPase V de exportação de cobre * * CLRAG_ do tipo P 09370 4547 Regulador transcricional de ligação ao * * CLRAG_ DNA AraC 09380 4548 proteína da família alfa/beta hidrolase * * CLRAG_ 09390 4549 proteína de ligação à origem direita * * CLRAG_ 09400
195 / 294 4550 desmetilrebecamicina-D-glicose O-metiltransferase * * CLRAG_ 09410 4551 proteína permease/de ligação de ATP à * * CLRAG_ importação de ferro IrtA 09420 4552 proteína putativa permease/ligação de ATP para múltiplos * * CLRAG_ fármacos 09430 4553 proteína hipotética * * CLRAG_ 09490 4554 proteína hipotética * * CLRAG_ 09610 4555 proteína hipotética * * CLRAG_ 09620 4556 proteína hipotética * * CLRAG_ 09630 4557 proteína de partição cromossômica Smc * * CLRAG_ 09640 4558 proteína hipotética * * CLRAG_ 09700 4559 fosfoadenosina fosfossulfato redutase * * CLRAG_ 09760 4560 proteína hipotética * * CLRAG_ 09770 4561 proteína hipotética * * CLRAG_ 09780 4562 proteína hipotética * * CLRAG_ 09790 4563 cisteína dessulfurase SufS * * CLRAG_ 09800 4564 enzima de restrição tipo III, subunidade res * * CLRAG_ 09810 4565 proteína hipotética * * CLRAG_ 09820 4566 proteína de partição cromossômica Smc * * CLRAG_ 09830 4567 proteína hipotética * * CLRAG_ 09840 4568 Fator de sigma RNA polimerase RpoS * * CLRAG_ 09850 4569 proteína da família endonuclease/exonuclease/fosfatase * * CLRAG_ 09880 4570 proteína hipotética * * CLRAG_ 09890 4571 proteína do tipo plasmídeo pRiA4b ORF-3 * * CLRAG_ 09900 4572 proteína hipotética * * CLRAG_ 09930 4573 hidroperoxi ácido graxo redutase gpx1 * * CLRAG_ 10140 4574 regulador transcricional de resistência a hidroperóxidos * * CLRAG_ orgânicos 10150 4575 alanina - tRNA ligase * * CLRAG_ 10160 4576 proteína hipotética * * CLRAG_ 10960 4577 proteína hipotética * * CLRAG_1 1060 4578 proteína de recombinação associada à * * CLRAG_1 replicação A 1710 4579 proteína putativa de resistência a múltiplos * * CLRAG_ fármacos EmrK 12840
196 / 294 4580 proteína hipotética * * CLRAG_ 13370 4581 proteína hipotética * * CLRAG_ 13390 4582 proteína hipotética * * CLRAG_ 13400 4583 proteína hipotética * * CLRAG_ 13420 4584 glicosiltransferase SunS derivada de pró- * * CLRAG_ fago SPBc2 13430 4585 proteína hipotética * * CLRAG_ 13440 4586 proteína hipotética * * CLRAG_ 13450 4587 flagelina * * CLRAG_ 13460 4588 proteína hipotética * * CLRAG_ 13490 4589 proteína associada ao gancho flagelar FlgL * * CLRAG_ 13580 4590 Precursor do N-acetilmuramoil-L-alanina * * CLRAG_ amidase LytC 13940 4591 Proteína transportadora ABC YxdM * * CLRAG_ 14390 4592 sensor histidina quinase GraS * * CLRAG_ 14410 4593 glioxilato/hidroxipiruvato redutase A * * CLRAG_ 14820 4594 fosfatase de açúcar YidA * * CLRAG_ 14920 4595 fosfometilpirimidina sintase * * CLRAG_ 15080 4596 precursor da amidofosforibosiltransferase * * CLRAG_ 15090 4597 precursor da amidofosforibosiltransferase * * CLRAG_ 15100 4598 proteína hipotética * * CLRAG_ 15150 4599 isoprenil transferase * * CLRAG_ 15210 4600 putativa de açúcar cinase YdjH * * CLRAG_ 15530 4601 permease para citosina/purinas, uracila, tiamina, alantoína * * CLRAG_ 15540 4602 ADP-ribosilglico-hidrolase * * CLRAG_ 15550 4603 regulador transcricional putativo do tipo * * CLRAG_ HTH YurK 15560 4604 Região de ligação ao ATP * * CLRAG_ 15700 4605 proteína hipotética * * CLRAG_ 15750 4606 fator de reativação da etanolamina amônia- * * CLRAG_ liase 15830 4607 formamidase * * CLRAG_ 15860 4608 Importador de putrescina de baixa afinidade * * CLRAG_ PlaP 15870 4609 proteína hipotética * * CLRAG_ 15890
197 / 294 4610 acetoacetato descarboxilase (ADC) * * CLRAG_ 15900 4611 diguanilato ciclase putativo YedQ * * CLRAG_ 15960 4612 enzima biossintética de tiazol * * CLRAG_ 15990 4613 Proteína da superfamília AB hidrolase YdjP * * CLRAG_ 16030 4614 importador de putrescina PuuP * * CLRAG_ 16040 4615 proteína hipotética * * CLRAG_ 16090 4616 inibidor da peptidase I42 da família das * * CLRAG_ chagasinas 16320 4617 proteína hipotética * * CLRAG_ 16330 4618 proteína hipotética * * CLRAG_ 16340 4619 proteína hipotética * * CLRAG_ 16360 4620 glicosil transferase putativa * * CLRAG_ 16400 4621 proteína 4 de quimiotaxia que aceita metila * * CLRAG_ 16630 4622 fator de montagem de proteínas da * * CLRAG_ membrana externa BamE 16660 4623 proteína hipotética * * CLRAG_ 16690 4624 proteína hipotética * * CLRAG_ 16700 4625 proteína hipotética * * CLRAG_ 16710 4626 proteína hipotética * * CLRAG_ 16720 4627 proteína hipotética * * CLRAG_ 16730 4628 tirosina recombinase XerD * * CLRAG_ 16760 4629 tirosina recombinase XerC * * CLRAG_ 16770 4630 tirosina recombinase XerD * * CLRAG_ 16780 4631 proteína chaperona DnaJ * * CLRAG_ 16810 4632 proteína de repetição de tetratricopeptídeo * * CLRAG_ 16820 4633 proteína chaperona DnaK * * CLRAG_ 16830 4634 proteína GrpE * * CLRAG_ 16840 4635 proteína hipotética * * CLRAG_ 16850 4636 proteína hipotética * * CLRAG_ 16860 4637 proteína hipotética * * CLRAG_ 16870 4638 proteína hipotética * * CLRAG_ 16890 4639 proteína hipotética * * CLRAG_ 16900
198 / 294 4640 proteína hipotética * * CLRAG_ 16910 4641 GTPase Der * * CLRAG_ 16920 4642 proteína hipotética * * CLRAG_ 16930 4643 diguanilato ciclase putativa YdaM * * CLRAG_ 16940 4644 diguanilato ciclase putativa YdaM * * CLRAG_ 16950 4645 proteína de resistência a múltiplos fármacos * * CLRAG_ Stp 16960 4646 proteína de domínio relacionada à nuclease * * CLRAG_ 16970 4647 proteína hipotética * * CLRAG_ 16990 4648 proteína hipotética * * CLRAG_ 17010 4649 proteína hipotética * * CLRAG_ 17020 4650 proteína hipotética * * CLRAG_ 17040 4651 proteína hipotética * * CLRAG_ 17050 4652 Ativador transcricional tipo HTH mta * * CLRAG_ 17100 4653 proteína hipotética * * CLRAG_ 17290 4654 proteína hipotética * * CLRAG_ 17960 4655 metiltransferase putativa YcgJ * * CLRAG_ 18120 4656 subunidade putativa de xantina * * CLRAG_ desidrogenase A 18190 4657 FmdE, operon de molibdênio formilmetanofurano * * CLRAG_ desidrogenase 18200 4658 proteína hipotética * * CLRAG_ 18210 4659 proteína de ligação à vitamina B12 * * CLRAG_ 18220 4660 Proteína de ligação à S-adenosil-L- * * CLRAG_ metionina 18230 4661 molibdopterina molibdênio transferase * * CLRAG_ 18240 4662 proteína de ligação ao ATP de transportador * * CLRAG_ de molibdato 18250 4663 proteína hipotética * * CLRAG_ 18270 4664 proteína da família acetiltransferase * * CLRAG_ (GNAT) 18290 4665 proteína hipotética * * CLRAG_ 18300 4666 proteína hipotética * * CLRAG_ 18310 4667 Regulador transcricional tipo HTH GltR * * CLRAG_ 18330 4668 oxidorredutase putativa YWqN contendo FMN e * * CLRAG_ dependente de NAD(P)H 18340 4669 flavodoxina * * CLRAG_ 18350
199 / 294 4670 proteína hipotética * * CLRAG_ 18360 4671 1-desoxi-D-xilulose-5-fosfato sintase * * CLRAG_ 18640 4672 3-oxoacil-[acil-carreador-proteína] redutase * * CLRAG_ FabG 18650 4673 transportador de tartarato putativo * * CLRAG_ 18660 4674 proteína hipotética * * CLRAG_ 18970 4675 proteína hipotética * * CLRAG_ 19420 4676 metionina sintase * * CLRAG_ 19430 4677 proteína hipotética * * CLRAG_ 19450 4678 repressor da penicilinase * * CLRAG_ 19480 4679 proteína reguladora BlaR1 * * CLRAG_ 19490 4680 proteína da família isoprenilcisteína carboxil * * CLRAG_ metiltransferase (ICMT) 20000 4681 proteína hipotética * * CLRAG_ 20110 4682 proteína hipotética * * CLRAG_ 20340 4683 proteína hipotética * * CLRAG_ 20360 4684 Precursor do N-acetilmuramoil-L-alanina * * CLRAG_ amidase LytC 20370 4685 proteína hipotética * * CLRAG_ 20420 4686 proteína do transpóson Tn10 TetD * * CLRAG_ 20430 4687 repetições de anquirina (3 cópias) * * CLRAG_ 20500 4688 proteína hipotética * * CLRAG_ 20510 4689 proteína putativa de resistência a múltiplos * * CLRAG_ fármacos 20520 4690 proteína hipotética * * CLRAG_ 20910 4691 Proteína reguladora da transcrição CsgBAC * * CLRAG_ operon 20920 4692 família peptidase M28 * * CLRAG_ 20930 4693 proteína PbpX de ligação à penicilina * * CLRAG_ 20980 4694 Ativador transcricional do tipo HTH RhaR * * CLRAG_ 21010 4695 subunidade de complexo de transporte de * * CLRAG_ elétrons RsxB 21020 4696 proteína hipotética * * CLRAG_ 21030 4697 proteína hipotética * * CLRAG_ 21080 4698 proteína hipotética * * CLRAG_ 21220 4699 proteína de esporos YkvP * * CLRAG_ 21370
200 / 294 4700 precursor da desacetilase do ácido peptidoglicano-N- * * CLRAG_ acetilmurâmico 21380 4701 proteína de esporos YkvP * * CLRAG_ 21390 4702 proteína hipotética * * CLRAG_ 21410 4703 proteína hipotética * * CLRAG_ 21420 4704 transportador de sulfoacetato putativo SauU * * CLRAG_ 21570 4705 proteína hipotética * * CLRAG_ 21770 4706 triosefosfato isomerase * * CLRAG_ 21830 4707 proteína hipotética * * CLRAG_ 21840 4708 transportador de glucarato putativo * * CLRAG_ 21850 4709 fosfato isomerase de açúcar putativo YwlF * * CLRAG_ 21870 4710 Repressor transcricional tipo HTH GlcR * * CLRAG_ 21890 4711 monofosfato de piranopterina cíclica * * CLRAG_ sintase 22260 4712 Subunidade grande de 4-hidroxifenilacetato * * CLRAG_ descarboxilase 22270 4713 Enzima de ativação da 4-hidroxifenilacetato * * CLRAG_ descarboxilase 22280 4714 proteína 3 de quimiotaxia que aceita metila * * CLRAG_ 22290 4715 proteína hipotética * * CLRAG_ 22300 4716 proteína de domínio relacionada à nuclease * * CLRAG_ 22310 4717 proteína de domínio AAA divergente * * CLRAG_ 22380 4718 Regulador transcricional do tipo HTH AcrR * * CLRAG_ 22390 4719 proteína 3 de resistência a múltiplos * * CLRAG_ fármacos 22400 4720 proteína hipotética * * CLRAG_ 22410 4721 proteína hipotética * * CLRAG_ 22420 4722 ferredoxina * * CLRAG_ 22430 4723 proteína hipotética * * CLRAG_ 22460 4724 proteína hipotética * * CLRAG_ 22470 4725 proteína hipotética * * CLRAG_ 22480 4726 proteína hipotética * * CLRAG_ 22490 4727 proteína hipotética * * CLRAG_ 22500 4728 proteína hipotética * * CLRAG_ 22510 4729 metilase de modificação HaeIII * * CLRAG_ 22520
201 / 294 4730 proteína hipotética * * CLRAG_ 22530 4731 proteína hipotética * * CLRAG_ 22540 4732 proteína sensor FixL * * CLRAG_ 22550 4733 proteína hipotética * * CLRAG_ 22560 4734 proteína hipotética * * CLRAG_ 22570 4735 proteína de transposição de transpóson Tn7 * * CLRAG_ TnsC 22580 4736 proteína de transposição de transpóson Tn7 * * CLRAG_ TnsB 22590 4737 proteína de transposição de transpóson Tn7 * * CLRAG_ TnsA 22600 4738 pequena subunidade metiltransferase A do * * CLRAG_ RNA ribossômico 23630 4739 proteína hipotética * * CLRAG_ 23650 4740 proteína hipotética * * CLRAG_ 23660 4741 proteína hipotética * * CLRAG_ 23670 4742 proteína hipotética * * CLRAG_ 23680 4743 proteína hipotética * * CLRAG_ 23740 4744 regulador transcricional do catabolismo do benzoato * * CLRAG_ anaeróbico 23750 4745 proteína hipotética * * CLRAG_ 23760 4746 proteína hipotética * * CLRAG_ 23770 4747 proteína hipotética * * CLRAG_ 23780 4748 Endonuclease HNH * * CLRAG_ 23790 4749 proteína hipotética * * CLRAG_ 23800 4750 proteína hipotética * * CLRAG_ 23810 4751 Proteína de reparo e replicação do DNA * * CLRAG_ RecF 23820 4752 proteína hipotética * * CLRAG_ 23830 4753 proteína hipotética * * CLRAG_ 23860 4754 serina/treonina-proteína quinase PrkC * * CLRAG_ 23870 4755 proteína hipotética * * CLRAG_ 23880 4756 galactosídeo O-acetiltransferase * * CLRAG_ 23890 4757 proteína hipotética * * CLRAG_ 23900 4758 Ativador transcricional do operon Hca * * CLRAG_ 23910 4759 NADH oxidase * * CLRAG_ 23920
202 / 294 4760 desmetilmenaquinona metiltransferase * * CLRAG_ 23970 4761 proteína hipotética * * CLRAG_ 24030 4762 proteína hipotética * * CLRAG_ 24240 4763 proteína hipotética * * CLRAG_ 24250 4764 proteína hipotética * * CLRAG_ 24260 4765 Autoimunidade à protease do terminal * * CLRAG_ amino CAAX 24400 4766 fator de montagem das proteínas da * * CLRAG_ membrana externa BamD 24860 4767 repetição de ligação de parede celular * * CLRAG_ putativa 2 24870 4768 proteína hipotética * * CLRAG_ 25030 4769 altronato desidratase * * CLRAG_ 25040 4770 2-ceto-3-desoxigluconato permease * * CLRAG_ 25050 4771 2-desidro-3-desoxigluconoquinase * * CLRAG_ 25060 4772 regulador de transcrição KdgR * * CLRAG_ 25080 4773 proteína 4 de quimiotaxia que aceita metila * * CLRAG_ 25200 4774 transportador de amônio NrgA * * CLRAG_ 25480 4775 N-acetiltransferase de ribossomo-proteína- * * CLRAG_ S5-alanina 26200 4776 proteína da família acetiltransferase * * CLRAG_ (GNAT) 26210 4777 proteína hipotética * * CLRAG_ 26230 4778 regulador de transportador 1 de múltiplos * * CLRAG_ fármacos 26240 4779 protease putativa YdeA * * CLRAG_ 26400 4780 Precursor do N-acetilmuramoil-L-alanina * * CLRAG_ amidase LytC 26410 4781 transposase putativa * * CLRAG_ 26740 4782 proteína hipotética * * CLRAG_ 26800 4783 tirosina recombinase XerC * * CLRAG_ 26810 4784 tirosina recombinase XerD * * CLRAG_ 26820 4785 proteína hipotética * * CLRAG_ 27210 4786 proteína hipotética * * CLRAG_ 27610 4787 diacilglicerol quinase * * CLRAG_ 28550 4788 cotransportador de sódio/glicose * * CLRAG_ 28930 4789 3-oxoacil-[acil-carreador-proteína] redutase * * CLRAG_ FabG 28940
203 / 294 4790 Proteína de repetição BNR/Asp-box * * CLRAG_ 28950 4791 proteína de biofilme toxina-antitoxina TabA * * CLRAG_ 28960 4792 proteína de transporte de membrana interna * * CLRAG_ YajR 28970 4793 Precursor do N-acetilmuramoil-L-alanina * * CLRAG_ amidase LytC 28990 4794 proteína hipotética * * CLRAG_ 29010 4795 proteína verde * * CLRAG_ 29020 4796 proteína McpC para quimiotaxia que aceita * * CLRAG_ metila 29070 4797 proteína reguladora de nitrogênio P-II * * CLRAG_ 29090 4798 proteína hipotética * * CLRAG_ 29100 4799 precursor do canal de amônia * * CLRAG_ 29110 4800 proteína de quimiotaxia CheY * * CLRAG_ 29140 4801 CheY-P fosfatase CheC * * CLRAG_ 29150 4802 di-GMP fosfodiesterase cíclica * * CLRAG_ 29160 4803 proteína hipotética * * CLRAG_ 29340 4804 proteína hipotética * * CLRAG_ 29390 4805 proteína chaperona ClpB * * CLRAG_ 29400 4806 proteína hipotética * * CLRAG_ 29410 4807 proteína hipotética * * CLRAG_ 29420 4808 proteína hipotética * * CLRAG_ 29430 4809 proteína hipotética * * CLRAG_ 29440 4810 proteína reguladora da transcrição ZraR * * CLRAG_ 29480 4811 Proteína da família da proteína YvrJ * * CLRAG_ 29810 4812 proteína hipotética * * CLRAG_ 29880 4813 proteína hipotética * * CLRAG_ 29900 4814 proteína hipotética * * CLRAG_ 29910 4815 proteína hipotética * * CLRAG_ 29920 4816 proteína chaperona ClpB * * CLRAG_ 29930 4817 proteína hipotética * * CLRAG_ 29940 4818 biossíntese de ubiquinona/menaquinona C- * * CLRAG_ metiltransferase UbiE 29950 4819 regulador de resposta heme HssR * * CLRAG_ 29960
204 / 294 4820 proteína sensor de síntese de fosfatase * * CLRAG_ alcalina PhoR 29970 4821 bomba de efluxo de purina PbuE * * CLRAG_ 29980 4822 transposase * * CLRAG_ 30020 4823 N-acil-homosserina lactonase * * CLRAG_ 30030 4824 aldeído oxidorredutase * * CLRAG_ 30550 4825 subunidade F da NADH-quinona redutase de translocação * * CLRAG_ de Na(+) 30670 4826 proteína hipotética * * CLRAG_ 30720 4827 proteína de membrana interna YdgC * * CLRAG_ 30750 4828 subunidade pequena ribossômica * * CLRAG_ pseudouridina sintase A 31120 4829 proteína hipotética * * CLRAG_ 31130 4830 Proteína do domínio LysM * * CLRAG_ 31150 4831 gluconato 5-desidrogenase * * CLRAG_ 31660 4832 regulador de resposta à quimiotaxia proteína-glutamato * * CLRAG_ metilesterase 31670 4833 proteína hipotética * * CLRAG_ 31950 4834 domínio bacteriano semelhante a Ig (grupo * * CLRAG_ 2) 31970 4835 proteína hipotética * * CLRAG_ 31980 4836 domínio bacteriano semelhante a Ig (grupo * * CLRAG_ 2) 32030 4837 proteína hipotética * * CLRAG_ 32190 4838 proteína hipotética * * CLRAG_ 32360 4839 proteína hipotética * * CLRAG_ 32440 4840 proteína hipotética * * CLRAG_ 32450 4841 proteína de recombinação e reparo RecT * * CLRAG_ 32460 4842 proteína hipotética * * CLRAG_ 32490 4843 formato desidrogenase H * * CLRAG_ 32520 4844 proteína hipotética * * CLRAG_ 32740 4845 proteína hipotética * * CLRAG_ 32950 4846 proteína hipotética * * CLRAG_ 33250 4847 proteína hipotética * * CLRAG_ 33300 4848 proteína hipotética * * CLRAG_ 33320 4849 tirosina recombinase XerC * * CLRAG_ 33370
205 / 294 4850 proteína hipotética * * CLRAG_ 33380 4851 proteína hipotética * * CLRAG_ 33430 4852 proteína hipotética * * CLRAG_ 33450 4853 proteína hipotética * * CLRAG_ 33460 4854 hélice-giro-hélice * * CLRAG_ 33470 4855 proteína hipotética * * CLRAG_ 33480 4856 proteína hipotética * * CLRAG_ 33520 4857 proteína hipotética * * CLRAG_ 33550 4858 proteína hipotética * * CLRAG_ 33570 4859 proteína hipotética * * CLRAG_ 33610 4860 proteína hipotética * * CLRAG_ 33620 4861 proteína hipotética * * CLRAG_ 33630 4862 DEAD/DEAH box helicase * * CLRAG_ 33640 4863 proteína hipotética * * CLRAG_ 33650 4864 proteína hipotética * * CLRAG_ 33660 4865 proteína hipotética * * CLRAG_ 33670 4866 proteína hipotética * * CLRAG_ 33680 4867 proteína hipotética * * CLRAG_ 33690 4868 N-6 DNA metilase * * CLRAG_ 33700 4869 proteína hipotética * * CLRAG_ 33710 4870 proteína hipotética * * CLRAG_ 33730 4871 proteína hipotética * * CLRAG_ 33740 4872 proteína hipotética * * CLRAG_ 33750 4873 proteína hipotética * * CLRAG_ 33760 4874 DNA-invertase hin * * CLRAG_ 33770 4875 proteína hipotética * * CLRAG_ 33780 4876 proteína hipotética * * CLRAG_ 33790 4877 fator de montagem das proteínas da * * CLRAG_ membrana externa BamD 33800 4878 proteína de repetição de tetratricopeptídeo * * CLRAG_ 33810 4879 proteína hipotética * * CLRAG_ 33830
206 / 294 4880 proteína LtrA codificada por íntron do * * CLRAG_ grupo II 33840 4881 ptoteína tipo transposase IS200 * * CLRAG_ 33850 4882 proteína hipotética * * CLRAG_ 33920 4883 domínio bacteriano semelhante a Ig (grupo * * CLRAG_ 2) 34030 4884 proteína hipotética * * CLRAG_ 34040 4885 proteína hipotética * * CLRAG_ 34050 4886 proteína hipotética * * CLRAG_ 34060 4887 proteína hipotética * * CLRAG_ 34070 4888 proteína putativa de ligação ao ATP HMP/tiamina, YkoD * * CLRAG_ 34080 4889 proteína de ligação ao ATP de transportador de fator de * * CLRAG_ acoplamento energético EcfA2 34090 4890 proteína transmembrana de transportador de fator de * * CLRAG_ acoplamento energético EcfT 34100 4891 proteína do domínio de ligação * * CLRAG_ oxidorredutase molibdopterina 34110 4892 proteína hipotética * * CLRAG_ 34120 4893 proteína do domínio de adesão célula-célula * * CLRAG_ 34130 4894 precursor de capa-carragenase * * CLRAG_ 34140 4895 proteína hipotética * * CLRAG_ 34150 4896 Fosfodiesterase de adenosina-monofosfato 3',5'-cíclico * * CLRAG_ CpdA 34160 4897 proteína hipotética * * CLRAG_ 34170 4898 Proteína de repetição do NHL * * CLRAG_ 34180 4899 Precursor do N-acetilmuramoil-L-alanina * * CLRAG_ amidase LytC 34190 4900 Transposase IS2 TnpB * * CLRAG_ 34250 4901 transposase * * CLRAG_ 34260 4902 transposase * * CLRAG_ 34270 4903 formato desidrogenase H * * CLRAG_ 34290 4904 proteína hipotética * * CLRAG_ 34320 4905 proteína hipotética * * CLRAG_ 34330 4906 proteína hipotética * * CLRAG_ 34340 4907 proteína hipotética * * CLRAG_ 35240 4908 proteína hipotética * * CLRAG_ 35800 4909 carboxilesterase NlhH * * CLRAG_ 35840
207 / 294 4910 íntron do grupo II, domínio específico da * * CLRAG_ maturase 36010 4911 proteína de especificidade de EcoKI de * * CLRAG_ enzima de restrição tipo 1 36030 4912 proteína hipotética * * CLRAG_ 36070 4913 proteína da família acetiltransferase * * CLRAG_ (GNAT) 36080 4914 proteína hipotética * * CLRAG_ 36160 4915 proteína hipotética * * CLRAG_ 36170 4916 enzima de restrição tipo III, subunidade res * * CLRAG_ 36180 4917 Subunidade RecD de enzima RecBCD * * CLRAG_ 36190 4918 proteína da família integrase do fago * * CLRAG_ 36200 4919 Proteína do domínio FRG * * CLRAG_ 36210 4920 trocador de serina/treonina SteT * * CLRAG_ 36480 4921 proteína hipotética * * CLRAG_ 36660 4922 proteína hipotética * * CLRAG_ 37100 4923 chaperona de metal putativa YciC * * CLRAG_ 37520 4924 proteína da família acetiltransferase * * CLRAG_ (GNAT) 37540 4925 inibidor da peptidase I42 da família das * * CLRAG_ chagasinas 37550 4926 proteína hipotética * * CLRAG_ 37560 4927 proteína hipotética * * CLRAG_ 37580 4928 proteína hipotética * * CLRAG_ 37590 4929 proteína hipotética * * CLRAG_ 37600 4930 proteína hipotética * * CLRAG_ 37630 4931 proteína hipotética * * CLRAG_ 37900 4932 Precursor do N-acetilmuramoil-L-alanina * * CLRAG_ amidase LytC 38010 4933 precursor interno da B * * CLRAG_ 38020 4934 transposase putativa, semelhante a YhgA * * CLRAG_ 38240 4935 4,6-desidratase-PIB-manose * * CLRAG_ 38610 4936 PIB-L-fucose sintase * * CLRAG_ 38620 4937 N-acetilmanosaminiltransferase putativa * * CLRAG_ 38630 4938 galactosídeo O-acetiltransferase * * CLRAG_ 38640 4939 proteína de revestimento de esporos SA * * CLRAG_ 38650
208 / 294 4940 proteína hipotética * * CLRAG_ 38660 4941 proteína hipotética * * CLRAG_ 38670 4942 D-inositol 3-fosfato glicosiltransferase * * CLRAG_ 38680 4943 glicosil transferase putativa * * CLRAG_ 38690 4944 proteína hipotética * * CLRAG_ 38700 4945 proteína hipotética * * CLRAG_ 38710 4946 família de glicosil transferase 11 * * CLRAG_ 38720 4947 proteína de biossíntese de polissacarídeos * * CLRAG_ 38730 4948 UDP-glicose 6-desidrogenase YwqF * * CLRAG_ 38740 4949 UDP-glicose 4-epimerase * * CLRAG_ 38760 4950 proteína da família aciltransferase * * CLRAG_ 38770 4951 proteína hipotética * * CLRAG_ 38790 4952 acetiltransferase putativa * * CLRAG_ 38800 4953 proteína hipotética * * CLRAG_ 38810 4954 proteína da família aciltransferase * * CLRAG_ 38820 4955 proteína hipotética * * CLRAG_ 38850 4956 proteína hipotética * * CLRAG_ 38860 4957 proteína hipotética * * CLRAG_ 39020 4958 subunidade B da p-aminobenzoil-glutamato * * CLRAG_ hidrolase 39040 4959 sensor histidina quinase YycG * * CLRAG_ 39300 4960 Proteína transportadora da família ABC-2 * * CLRAG_ 39320 4961 Proteína transportadora da família ABC-2 * * CLRAG_ 39330 4962 epoxiqueuosina redutase * * CLRAG_ 39350 4963 RNA helicase RhlE dependente de ATP * * CLRAG_ 39540 4964 proteína hipotética * * CLRAG_ 39580 4965 Regulador transcricional do tipo HTH CysL * * CLRAG_ 39800 4966 proteína de ligação ao molibdênio-pterina * * CLRAG_ MopA 39810 4967 metionina gama-liase * * CLRAG_ 39890 4968 proteína do domínio de ligação ao DNA da * * CLRAG_ transposase 39910 4969 transposase putativa * * CLRAG_ 39920
209 / 294 4970 proteína de domínio hélice-volta-hélice * * CLRAG_ 39930 4971 proteína B de transporte de ferro ferroso * * CLRAG_ 39960 4972 Proteína do domínio FeoA * * CLRAG_ 39970 4973 proteína hipotética * * CLRAG_ 39990 4974 proteína hipotética * * CLRAG_ 40000 4975 proteína hipotética * * CLRAG_ 40110 4976 glicosil transferase putativa * * CLRAG_ 40180
[0073] Os inventores identificaram ainda as principais vias metabólicas e os principais nós metabólicos nos microrganismos de Wood- Ljungdahl (Figura 1). A invenção fornece ainda microrganismos com genes rompidos para desviar estrategicamente o fluxo de carbono, longe dos nós metabólicos não essenciais ou indesejáveis e através dos nós metabólicos- alvo. Tais cepas melhoraram a produção de produtos a jusante dos nós metabólicos-alvo.
[0074] A invenção finalmente fornece métodos de produção de produtos por cultura do microrganismo da invenção, na presença de um substrato, tal como um substrato gasoso compreendendo um ou mais de CO, CO2 e/ou H2. Possíveis combinações de genes rompidos para otimizar a produção de produtos específicos são descritas nos Exemplos 2-19.
[0075] Conforme descrito em outras partes deste pedido, esses produtos podem incluir produtos nativos ou não nativos dos microrganismos de Wood-Ljungdahl. Por exemplo, esses produtos incluem, mas não se limitam a acetil-CoA, etanol, acetato, butanol, butirato, butiril-CoA, 2,3- butanodiol, lactato, buteno, butadieno, metiletilcetona, etileno, acetona, isopropanol, lipídios, 3-hidroxipropionato (3-HP), isopreno, farneseno, ácidos graxos (ésteres etílicos de ácidos graxos, ésteres butílicos de ácidos graxos), 2-butanol, 1,2-propanodiol, 1-propanol, produtos derivados de corismato, 3-hidroxibutirato, 1,3-butanodiol, álcoois C6-C8 (hexanol, heptanol, octanol), caproato, octanoato, pirofosfato de isopentenila (IPP), pirofosfato de
210 / 294 dimetilalila (DMAPP), acetoacetil-CoA, 3-hidroxibutirato-CoA (3-HB-CoA), malonil-CoA, piruvato, desidrosshiquimato, corismato, ácido para- hidroxibenzoico, salicilato, 2-aminobenzoato, 2,3-di-hidroxibenzoato, ácido 2-hidroxiciclo-hexano carboxílico, citramalato, cetobutirato, acetolactato, acetoína, valina, leucina e isoleucina.
EXEMPLOS
[0076] Os exemplos a seguir ilustram ainda mais a invenção, mas obviamente, não devem ser interpretados para limitar seu escopo de forma alguma. EXEMPLO 1
[0077] Esse exemplo descreve a modelagem metabólica em microrganismos de Wood-Ljungdahl.
[0078] Foi utilizado um modelo metabólico em escala de genoma de Clostridium autoethanogenum como o descrito por Marcellin, Green Chem, 18: 3.020 a 3.028, 2016. Este modelo foi utilizado para simular o projeto, construção, crescimento in silico e triagem de cepas com mutações genéticas disruptivas para prever aquelas que produziriam maiores rendimentos de compostos nativos. Além disso, novos modelos em escala de genoma foram construídos para várias cepas produtoras de compostos não nativos. Para esses, genes heterólogos e reações metabólicas foram adicionados à estrutura do modelo Clostridium autoethanogenum do tipo selvagem para representar a incorporação da via de produção de compostos não nativos. Embora o modelo usado para o trabalho experimental aqui descrito seja baseado em Clostridium autoethanogenum, é razoável esperar que os resultados se apliquem a outros microrganismos de Wood-Ljungdahl, dadas as semelhanças no metabolismo.
[0079] Para cada cepa de produção química, milhões de cepas mutantes incorporando diferentes combinações de mutações genéticas disruptivas foram construídas in silico. Utilizaram-se associações booleanas gene-proteína-reação para determinar quais reações metabólicas foram
211 / 294 inativadas após a ruptura de um gene (Thiele, Nature Protocols, 5: 93 a 121, 2010). O projeto, a construção e a triagem de cepas mutantes foram realizados utilizando a versão cameo 0.11.2 (Sonnenschein, Biosustain/Cameo: 0.11.0, doi:10.5281/zenodo.835730, 2017) e algoritmos evolutivos implementados pela versão inspirada 1.0.1.
[0080] O crescimento dessas cepas mutantes foi simulado usando duas técnicas de modelagem computacional baseadas em restrições: análise de equilíbrio de fluxo (FBA) e minimização linear de ajuste metabólico (LMOMA). Essas técnicas de simulação de crescimento são usadas para capturar dois possíveis fenótipos metabólicos, após perturbações genéticas (Maia, Proceedings of the Genetic and Evolutionary Computation Conference Companion on - GECCO '17, New York, New York, ACM Press, 1.661 a
1.668, 2017). Um perfil experimental de fluxo metabólico foi construído e usado como estado de referência para simulações de LMOMA. As simulações de crescimento foram executadas usando scripts da cobrapy versão 0.8.2 (EEbrahim., COBRApy: COnstraints-Based Reconstruction and Analysis for Python, BMC Syst Biol, 7: 74, 2013), com a optlang versão 1.2.3 (Jensen, Optlang: An Algebraic Modeling Language for Mathematical Optimization,” The Journal of Open Source Software, 2, doi:10.21105/joss.00139, 2017) como a interface do solucionador e Gurobi Optimizer versão 7.0.2 como o solucionador de otimização.
[0081] As taxas de crescimento e os principais fluxos metabólicos, incluindo os de produtos de fermentação, foram registrados e usados para rastrear as cepas. Para cada simulação de cepa, foram calculados o rendimento acoplado ao produto de biomassa (BPCY) e o rendimento molar de carbono. Esses rendimentos foram utilizados para determinar o escore de condicionamento físico.
[0082] Além disso, foi realizada análise de variabilidade de fluxo (FVA) para determinar se a cepa mutante requer a produção do composto de
212 / 294 interesse para que o crescimento ocorra (desenhos de cepa acoplada ao crescimento). Se o fluxo limite mínimo do composto de interesse era maior que zero durante o crescimento, a cepa foi classificada como acoplamento de crescimento. Esses projetos de cepa acoplados ao crescimento devem permitir maior estabilidade da fermentação durante a fermentação contínua. Esse fluxo mínimo foi convertido em rendimento de carbono (rendimento mínimo de FVA) e usado para comparar o nível de acoplamento de crescimento entre as cepas. EXEMPLO 2
[0083] Esse exemplo descreve rompimentos para melhorar a produção de acetato nos microrganismos de Wood-Ljungdahl. Os experimentos de modelagem metabólica foram realizados como descrito no Exemplo 1. O acetato é um produto nativo dos microrganismos de Wood-Ljungdahl.
Pontuação de condicionamento Rendimento mínimo em FVA N° Genes rompidos Reações rompidas Genes rompidos Técnica físico N° 1 Rendime 6 CAETHG_137 Adenosina 5'-monofosfato fosfo-hidrolase (H2O + 0,327282 0,093 nto - 1, AMP <=> fosfato + H+ + adenosina), 692 LMOMA CAETHG_272 fosfoenolpiruvato carboxiquinase (PPCK) (ATP + 1, oxaloacetato + H+ --> ADP + CO2 + CAETHG_275 fosfoenolpiruvato), isocitrato desidrogenase (NADH + 3, CO2 + 2-Oxoglutarato + H+), homocisteína sintase CAETHG_275 (O-acetil-homosserina sulfidrolase) (H2S + O-Acetil- 4, L-homosserina --> Acetato + H+ + Homocisteína), CAETHG_329 dessulfidrase de cisteína (H2O + L-cisteína <=> NH3 3, + Piruvato + H2S), Pré-fenato: NAD+ oxidorredutase CAETHG_090 (descarboxilação) (NAD + Pré-fenato --> NADH + 9 CO2 + p-hidroxifenilpiruvato) 2 Rendime 5 CAETHG_137 Adenosina 5'-monofosfato fosfo-hidrolase (H2O + 0,327819 0,093 nto - 1, AMP <=> fosfato + H+ + adenosina), 362 LMOMA CAETHG_272 fosfoenolpiruvato carboxiquinase (PPCK) (ATP + 1, oxaloacetato + H+ --> ADP + CO2 + CAETHG_275 fosfoenolpiruvato), isocitrato desidrogenase (NAD + 3, isocitrato <=> NADH + CO2 + 2-Oxoglutarato + H+), CAETHG_275 homocisteína sintase (O-acetil-homosserina 4, sulfidrolase) (H2S + O-Acetil-L-homosserina --> CAETHG_329 Acetato + H+ + Homocisteína), desulfidrase de 3 cisteína (H2O + L-cisteína <=> NH3 + Piruvato + H2S)
213 / 294 3 Rendime 6 CAETHG_137 Adenosina 5'-monofosfato fosfo-hidrolase (H2O + 0,326972 0,093 nto - 1, AMP <=> fosfato + H+ + adenosina), 07 LMOMA CAETHG_272 fosfoenolpiruvato carboxiquinase (PPCK) (ATP + 1, oxaloacetato + H+ --> ADP + CO2 + CAETHG_275 fosfoenolpiruvato), Citramalato sintetase (H2O CoA 1, <=> CoA + Citramalato), Isocitrato desidrogenase CAETHG_275 (NAD + Isocitrato <=> NADH + CO2 + 2- 3, Oxoglutarato + H+), Cisteína dessulfidrase (H2O + L- CAETHG_329 cisteína <=> NH3 + Piruvato + H2S), Pré- 3, fenato:NAD+ oxidorredutase (descarboxilação) (NAD CAETHG_090 + Pré-fenolato --> NADH + CO2 + p- 9 hidroxifenilpiruvato) 4 Rendime 5 CAETHG_137 Adenosina 5'-monofosfato fosfo-hidrolase (H2O + 0,326957 0,092 nto - 1, AMP <=> fosfato + H+ + adenosina), 998 LMOMA CAETHG_272 fosfoenolpiruvato carboxiquinase (PPCK) (ATP + 1, oxaloacetato + H+ --> ADP + CO2 + CAETHG_275 fosfoenolpiruvato), isocitrato desidrogenase (NAD + 3, Isocitrato <=> NADH + CO2 + 2-Oxoglutarato + H+), CAETHG_329 cisteína dessulfidrase (H2O + L-cisteína <=> NH3 + 3, piruvato + H2S), pré-fenato:NAD+ oxidorredutase CAETHG_090 (descarboxilação) (NAD + pré-fenato --> NADH + 9 CO2 + p-hidroxifenilpiruvato) 5 Rendime 4 CAETHG_023 4-imidazolona-5-propanoato amido-hidrolase (H2O + 0,322658 0,092 nto - 3, 4-Imidazolona-5-propanoato --> N-Formimino-L- 572 LMOMA CAETHG_275 glutamato), isocitrato desidrogenase (NAD + isocitrato 3, <=> NADH + CO2 + 2-Oxoglutarato + H+), alfa- CAETHG_293 acetolactato descarboxilase (ALCTT --> CO2 + (R)- 2, Acetoína), cisteína dessulfidase (H2O + L-cisteína <=> CAETHG_329 NH3 + piruvato + H2S) 3 6 Rendime 4 CAETHG_275 Isocitrato desidrogenase (NAD + Isocitrato <=> 0,322819 0,092 nto - 3, NADH + CO2 + 2-Oxoglutarato + H+), alfa- 318 LMOMA CAETHG_293 acetolactato descarboxilase (ALCTT --> CO2 + (R)- 2, Acetoína), L-arginina imino-hidrolase (H2O + L- CAETHG_302 arginina <=> NH3 + Citrulina), cisteína dessulfidrase 1, (H2O + L-cisteína <=> NH3 + piruvato + H2S) CAETHG_329 3 7 Rendime 3 CAETHG_275 Isocitrato desidrogenase (NAD + Isocitrato <=> 0,322658 0,092 nto - 3, NADH + CO2 + 2-Oxoglutarato + H+), alfa- 31 LMOMA CAETHG_293 acetolactato descarboxilase (ALCTT --> CO2 + (R)- 2, Acetoína), cisteína dessulfidrase (H2O + L-cisteína CAETHG_329 <=> NH3 + Piruvato + H2S) 3 8 Rendime 3 CAETHG_275 Isocitrato desidrogenase (NAD + Isocitrato <=> 0,325822 0,091 nto - 3, NADH + CO2 + 2-Oxoglutarato + H+), cisteína 762 LMOMA CAETHG_329 dessulfidrase (H2O + L-cisteína <=> NH3 + Piruvato 3, + H2S), D-Ribose 1,5-fosfomutase (Ribose 1- fosfato CAETHG_392 <=> ribose-5-fosfato) 4 9 Rendime 3 CAETHG_016 N-ribosilnicotinamida:ortofosfato ribosiltransferase 0,325822 0,091 nto - 0, (fosfato + N-ribosilnicotinamida <=> nicotinamida + 762 LMOMA CAETHG_275 ribose 1-fosfato), isocitrato desidrogenase (NAD + 3, isocitrato <=> NADH + CO2 + 2-oxoglutarato + H+), CAETHG_329 desulfidrase de cisteína (H2O + L-Cisteína <=> NH3 + 3 Piruvato + H2S)
214 / 294 10 Rendime 3 CAETHG_137 Adenosina 5'-monofosfato fosfo-hidrolase (H2O + 0,325822 0,091 nto - 1, AMP <=> Fosfato + H+ + Adenosina), isocitrato 762 LMOMA CAETHG_275 desidrogenase (NAD + isocitrato <=> NADH + CO2 + 3, 2-oxoglutarato + H+), cisteína dessulfidrase (H2O + L- CAETHG_329 cisteína <=> NH3 + Piruvato + H2S) 3 11 Rendime 3 CAETHG_272 Fosfoenolpiruvato carboxiquinase (PPCK) (ATP + 0,324411 0,091 nto - 1, oxaloacetato + H+ --> ADP + CO2 + 3 LMOMA CAETHG_275 Fosfoenolpiruvato), isocitrato desidrogenase (NAD + 3, isocitrato <=> NADH + CO2 + 2-oxoglutarato + H+), CAETHG_329 desulfidrase de cisteína (H2O + L-Cisteína <=> NH3 + 3 Piruvato + H2S) 12 Rendime 3 CAETHG_272 Fosfoenolpiruvato carboxiquinase (PPCK) (ATP + 0,327495 0,090 nto - 1, oxaloacetato + H+ --> ADP + CO2 + 854 LMOMA CAETHG_329 Fosfoenolpiruvato), cisteína dessulfidrase (H2O + L- 3, cisteína <=> NH3 + piruvato + H2S), D-ribose 1,5- CAETHG_392 fosfomutase (Ribose 1-fosfato <=> ribose-5-fosfato) 4 13 Rendime 3 CAETHG_275 Citramalato sintase (H2O + Piruvato + Acetil-CoA 0,322674 0,090 nto - 1, <=> CoA + Citramalato), Isocitrato desidrogenase 674 LMOMA CAETHG_275 (NAD + Isocitrato <=> NADH + CO2 + 2- 3, Oxoglutarato + H+), Cisteína dessulfidrase (H2O + L- CAETHG_329 cisteína <=> NH3 + Piruvato + H2S) 3 14 Rendime 3 CAETHG_023 4-imidazolona-5-propanoato amido-hidrolase (H2O + 0,322658 0,090 nto - 3, 4-Imidazolona-5-propanoato --> N-Formimino-L- 27 LMOMA CAETHG_275 glutamato), isocitrato desidrogenase (NAD + isocitrato 3, <=> NADH + CO2 + 2-Oxoglutarato + H+), cisteína CAETHG_329 dessulfidrase (H2O + L-cisteína <=> NH3 + piruvato + 3 H2S) 15 Rendime 3 CAETHG_023 4,5-di-hidro-4-oxo-5-imidazolpropanoato hidroliase 0,322658 0,090 nto - 4, (4-imidazolona-5-propanoato <=> H2O + Urocanato), 27 LMOMA CAETHG_275 isocitrato desidrogenase (NAD + isocitrato <=> 3, NADH + CO2 + 2-oxoglutarato + H+), Cisteína CAETHG_329 dessulfidrase (H2O + L-cisteína <=> NH3 + piruvato + 3 H2S) 16 Rendime 3 CAETHG_275 Isocitrato desidrogenase (NAD + Isocitrato <=> 0,322819 0,090 nto - 3, NADH + CO2 + 2-Oxoglutarato + H+), L-arginina 256 LMOMA CAETHG_302 imino-hidrolase (H2O + L-arginina <=> NH3 + 1, citrulina), cisteína dessulfidrase (H2O + L-cisteína CAETHG_329 <=> NH3 + Piruvato + H2S) 3 17 Rendime 2 CAETHG_275 Isocitrato desidrogenase (NAD + Isocitrato <=> 0,322658 0,090 nto - 3, NADH + CO2 + 2-Oxoglutarato + H+), dessulfidrase 044 LMOMA CAETHG_329 de cisteína (H2O + L-cisteína <=> NH3 + piruvato + 3 H2S) 18 Rendime 2 CAETHG_293 alfa-acetolactato descarboxilase (ALCTT --> CO2 + 0,322658 0,089 nto - 2, (R)-Acetoína), cisteína dessulfidase (H2O + L-cisteína 638 LMOMA CAETHG_329 <=> NH3 + piruvato + H2S) 3 19 Rendime 2 CAETHG_016 N-Ribosilnicotinamida:ortofosfato ribosiltransferase 0,325822 0,088 nto - 0, (fosfato + N-ribosilnicotinamida <=> Nicotinamida + 5 LMOMA CAETHG_329 Ribose 1-fosfato), cisteína dessulfidrase (H2O + L- 3 cisteína <=> NH3 + piruvato + H2S) 20 Rendime 2 CAETHG_016 N-ribosilnicotinamida:ortofosfato ribosiltransferase 0,328306 0,087 nto - 0, (fosfato + N-ribosilnicotinamida <=> nicotinamida + 946 LMOMA CAETHG_090 ribose 1-fosfato), pré-fenato:NAD+ oxidorredutase 9 (descarboxilação) (NAD + pré-fenato --> NADH + CO2 + p-hidroxifenilpiruvato)
215 / 294 21 Rendime 2 CAETHG_127 AMP:pirofosfato fosforibosiltransferase (PPi + AMP 0,328306 0,087 nto - 0, <=> PRPP + adenina), pré-fenato:NAD+ 946 LMOMA CAETHG_090 oxidorredutase (descarboxilação) (NAD + pré-fenato -- 9 > NADH + CO2 + p-hidroxifenilpiruvato) 22 Rendime 2 CAETHG_016 N-Ribosilnicotinamida:ortofosfato ribosiltransferase 0,330562 0,087 nto - 0, (fosfato + N-ribosilnicotinamida <=> Nicotinamida + 44 LMOMA CAETHG_272 ribose 1-fosfato), Fosfoenolpiruvato carboxiquinase 1 (PPCK) (ATP + oxaloacetato + H+ --> ADP + CO2 + fosfatoenolpiruvato) 23 Rendime 1 CAETHG_090 Pré-fenato:NAD+ oxidorredutase (descarboxilação) 0,32509 0,087 nto - 9 (NAD + Pré-fenato --> NADH + CO2 + p- 3 LMOMA hidroxifenilpiruvato) 24 Rendime 1 CAETHG_016 N-ribosilnicotinamida:ortofosfato ribosiltransferase 0,32887 0,087 nto - 0 (fosfato + N-ribosilnicotinamida <=> nicotinamida + 246 LMOMA ribose 1-fosfato) 25 Rendime 1 CAETHG_137 Adenosina 5'-monofosfato fosfo-hidrolase (H2O + 0,32887 0,087 nto - 1 AMP <=> Fosfato + H+ + Adenosina) 246
LMOMA 26 Rendime 1 CAETHG_127 AMP:pirofosfato fosforibosiltransferase (PPi + AMP 0,32887 0,087 nto - 0 <=> PRPP + adenina) 246
LMOMA 27 Rendime 1 CAETHG_392 D-ribose 1,5-fosfomutase (ribose 1-fosfato <=> ribose- 0,32887 0,087 nto - 4 5-fosfato) 246
LMOMA 28 Rendime 1 CAETHG_272 Fosfoenolpiruvato carboxiquinase (PPCK) (ATP + 0,327443 0,087 nto - 1 oxaloacetato + H+ --> ADP + CO2 + 2 LMOMA Fosfoenolpiruvato) 29 Rendime 1 CAETHG_302 L-arginina imino-hidrolase (H2O + L-arginina <=> 0,325831 0,087 nto - 1 NH3 + citrulina) 02
LMOMA EXEMPLO 3
[0084] Este exemplo descreve interrupções para melhorar a produção de etanol nos microrganismos de Wood-Ljungdahl. Os experimentos de modelagem metabólica foram realizados como descrito no Exemplo 1. O etanol é um produto nativo dos microrganismos de Wood-Ljungdahl. Pontuação de condicionamento Rendimento mínimo em FVA N° Genes rompidos Reações rompidas Genes rompidos Técnica físico N° 1 Rendime 4 CAETHG_293 Alfa-acetolactato descarboxilase (ALCTT --> CO2 + 0,22708 0,205 nto - 2, (R)-Acetoína), ATP:acetato fosfotransferase (ATP + H+ 528 LMOM CAETHG_335 + propionato --> ADP + fosfato de propionila), 2,6- A 9, Diamino-heptanodioato:2-oxoglutarato aminotransferase CAETHG_351 (H2O + L-Glutamato + H+ + tetra-hidrodipicolinato <-- 0, 2-Oxoglutarato + LL-2,6-Diaminopimelato), L-treonina CAETHG_068 acetaldeído-liase (L-treonina --> glicina + acetaldeído) 6
216 / 294 2 Rendime 5 CAETHG_293 Alfa-acetolactato descarboxilase (ALCTT --> CO2 + 0,230473 0,205 nto - 2, (R)-Acetoína), L-arginina imino-hidrolase (H2O + L- 316 LMOM CAETHG_302 arginina <=> NH3 + citrulina), ATP:acetato A 1, fosfotransferase (ATP + H+ + propionato --> ADP + CAETHG_335 Propionil fosfato), D-ribose 1,5-fosfomutase (Ribose 1- 9, fosfato <=> ribose-5-fosfato), cistationina beta-liase CAETHG_392 (H2O + cistationina --> NH3 + piruvato + homocisteína) 4, CAETHG_049 8 3 Rendime 5 CAETHG_127 AMP:pirofosfato fosforibosiltransferase (PPi + AMP 0,230473 0,205 nto - 0, <=> PRPP + Adenina), alfa-acetolactato descarboxilase 316 LMOM CAETHG_293 (ALCTT --> CO2 + (R)-Acetoína), L-arginina imino- A 2, hidrolase (H2O + L-arginina <=> NH3 + citrulina), CAETHG_302 ATP:acetato fosfotransferase (ATP + H+ + propionato -- 1, > ADP + propionil fosfato), beta-cistationina-beta-liase CAETHG_335 (H2O + cistationina --> NH3 + piruvato + homocisteína) 9, CAETHG_049 8 4 Rendime 4 CAETHG_293 Alfa-acetolactato descarboxilase (ALCTT --> CO2 + 0,230404 0,205 nto - 2, (R)-Acetoína), ATP:acetato fosfotransferase (ATP + H+ 306 LMOM CAETHG_335 + propionato --> ADP + fosfato de propionila), D-ribose A 9, 1,5-fosfomutase (ribose 1-fosfato <=> ribose-5-fosfato), CAETHG_392 beta-liase de cistationina (H2O + cistationina --> NH3 + 4, piruvato + homocisteína) CAETHG_049 8 5 Rendime 4 CAETHG_016 N-Ribosilnicotinamida:ortofosfato ribosiltransferase 0,230404 0,205 nto - 0, (fosfato + N-ribosilnicotinamida <=> Nicotinamida + 306 LMOM CAETHG_293 ribose 1-fosfato), alfa-acetolactato descarboxilase A 2, (ALCTT --> CO2 + (R)-Acetoína), ATP:acetato CAETHG_335 fosfotransferase (ATP + H+ + Propionato --> ADP + 9, fosfato de propionila), beta-liase de cistationina (H2O + CAETHG_049 cistationina --> NH3 + piruvato + homocisteína) 8 6 Rendime 4 CAETHG_127 AMP:pirofosfato fosforibosiltransferase (PPi + AMP 0,230404 0,205 nto - 0, <=> PRPP + Adenina), alfa-acetolactato descarboxilase 306 LMOM CAETHG_293 (ALCTT --> CO2 + (R)-Acetoína), ATP:acetato A 2, fosfotransferase (ATP + H+ + propionato --> ADP + CAETHG_335 propionil fosfato), cistationina beta-liase (H2O + 9, cistationina --> NH3 + piruvato + homocisteína) CAETHG_049 8 7 Rendime 3 CAETHG_137 Adenosina 5'-monofosfato fosfo-hidrolase (H2O + AMP 0,230833 0,205 nto - 1, <=> Fosfato + H+ + Adenosina), alfa-acetolactato 248 LMOM CAETHG_293 descarboxilase (ALCTT --> CO2 + (R)-Acetoína), A 2, transacetilase fosfato (fosfato + acetil-CoA + H+ <=> CAETHG_335 CoA + acetilfosfato) 8 8 Rendime 3 CAETHG_293 Alfa-acetolactato descarboxilase (ALCTT --> CO2 + 0,230833 0,205 nto - 2, (R)-Acetoína), ATP:acetato fosfotransferase (ATP + H+ 248 LMOM CAETHG_335 + propionato --> ADP + fosfato de propionila), D-ribose A 9, 1,5-fosfomutase (ribose 1-fosfato <=> ribose-5-fosfato) CAETHG_392 4
217 / 294 9 Rendime 3 CAETHG_016 N-ribosilnicotinamida:ortofosfato ribosiltransferase 0,230833 0,205 nto - 0, (fosfato + N-ribosilnicotinamida <=> nicotinamida + 248 LMOM CAETHG_293 ribose 1-fosfato), alfa-acetolactato descarboxilase A 2, (ALCTT --> CO2 + (R)-Acetoína), fosfato transacetilase CAETHG_335 (fosfato + Acetil-CoA + H+ <=> CoA + acetilfosfato) 8 10 Rendime 3 CAETHG_127 AMP:pirofosfato fosforibosiltransferase (PPi + AMP 0,230833 0,205 nto - 0, <=> PRPP + Adenina), alfa-acetolactato descarboxilase 248 LMOM CAETHG_293 (ALCTT --> CO2 + (R)-Acetoína), fosfato transacetilase A 2, (fosfato + acetil-CoA + H+ <=> CoA + acetilfosfato) CAETHG_335 8 11 Rendime 3 CAETHG_293 Alfa-acetolactato descarboxilase (ALCTT --> CO2 + 0,230833 0,205 nto - 2, (R)-Acetoína), fosfato transacetilase (fosfato + acetil- 248 LMOM CAETHG_335 CoA + H+ <=> CoA + acetilfosfato), D-ribose 1,5- A 8, fosfomutase (ribose 1-fosfato <=> ribose-5-fosfato) CAETHG_392 4 12 Rendime 3 CAETHG_293 Alfa-acetolactato descarboxilase (ALCTT --> CO2 + 0,228988 0,205 nto - 2, (R)-Acetoína), fosfato transacetilase (fosfato + acetil- 226 LMOM CAETHG_335 CoA + H+ <=> CoA + acetilfosfato), beta-liase de A 8, cistationina (H2O + cistationina --> NH3 + piruvato + CAETHG_049 Homocisteína) 8 13 Rendime 3 CAETHG_293 Alfa-acetolactato descarboxilase (ALCTT --> CO2 + 0,229481 0,205 nto - 2, (R)-Acetoína), L-arginina imino-hidrolase (H2O + L- 172 LMOM CAETHG_302 arginina <=> NH3 + citrulina), fosfato transacetilase A 1, (fosfato + acetil-CoA + H+ <=> CoA + Acetilfosfato) CAETHG_335 8 14 Rendime 2 CAETHG_293 Alfa-acetolactato descarboxilase (ALCTT --> CO2 + 0,229408 0,205 nto - 2, (R)-Acetoína), ATP:acetato de fosfotransferase (ATP + 162 LMOM CAETHG_335 H+ + propionato --> ADP + fosfato de propionila) A 9 15 Rendime 2 CAETHG_293 Alfa-acetolactato descarboxilase (ALCTT --> CO2 + 0,229408 0,205 nto - 2, (R)-Acetoína), fosfato transacetilase (fosfato + acetil- 162 LMOM CAETHG_335 CoA + H+ <=> CoA + acetilfosfato) A 8 16 Rendime 3 CAETHG_272 Fosfoenolpiruvato carboxiquinase (PPCK) (ATP + 0,188313 0,194 nto - 1, oxaloacetato + H+ --> ADP + CO2 + 484 LMOM CAETHG_293 Fosfoenolpiruvato), alfa-acetolactato descarboxilase A 2, (ALCTT --> CO2 + (R)-Acetoína), D-ribose 1,5- CAETHG_392 fosfomutase (ribose 1-fosfato <=> ribose-5-fosfato) 4 17 Rendime 3 CAETHG_302 L-arginina imino-hidrolase (H2O + L-arginina <=> NH3 0,221462 0,188 nto - 1, + citrulina), fosfato transacetilase (fosfato + acetil-CoA 812 LMOM CAETHG_335 + H+ <=> CoA + acetilfosfato), 2,6-diamino- A 8, heptanodioato:2-oxoglutarato aminotransferase (H2O + CAETHG_351 L-Glutamato + H+ + tetra-hidrodipicolinato <-- 2- 0 Oxoglutarato + LL-2,6-Diaminopimelato) 18 Rendime 2 CAETHG_335 Fosfato transacetilase (fosfato + acetil-CoA + H+ <=> 0,221395 0,188 nto - 8, CoA + acetilfosfato), 2,6-diamino-heptanodioato:2- 806 LMOM CAETHG_351 oxoglutarato aminotransferase (H2O + L-glutamato + A 0 H+ + tetra-hidrodipicolinato <-- 2-oxoglutarato + LL- 2,6-Diaminopimelato) 19 Rendime 3 CAETHG_335 Fosfato transacetilase (fosfato + acetil-CoA + H+ <=> 0,230404 0,188 nto - 8, CoA + acetilfosfato), D-ribose 1,5-fosfomutase (1- 442 LMOM CAETHG_392 fosfato de ribose <=> ribose-5-fosfato), beta-liase de A 4, cistationina (H2O + cistationina --> NH3 + Piruvato + CAETHG_049 Homocisteína) 8
218 / 294 20 Rendime 3 CAETHG_016 N-Ribosilnicotinamida:ribosiltransferase de ortofosfato 0,230404 0,188 nto - 0, (fosfato + N-ribosilnicotinamida <=> Nicotinamida + 1- 442 LMOM CAETHG_335 fosfato de ribose), fosfato transacetilase (fosfato + A 8, acetil-CoA + H+ <=> CoA + acetilfosfato), cistationina CAETHG_049 de beta-liase (H2O + cistationina --> NH3 + Piruvato + 8 Homocisteína) 21 Rendime 3 CAETHG_137 Adenosina 5'-monofosfato fosfo-hidrolase (H2O + AMP 0,230404 0,188 nto - 1, <=> Fosfato + H+ + Adenosina), fosfato transacetilase 442 LMOM CAETHG_335 (fosfato + acetil-CoA + H+ <=> CoA + acetilfosfato), A 8, beta-liase cistationina (H2O + cistationina --> NH3 + CAETHG_049 Piruvato + homocisteína) 8 22 Rendime 2 CAETHG_335 Fosfato transacetilase (fosfato + acetil-CoA + H+ <=> 0,228988 0,188 nto - 8, CoA + acetilfosfato), beta-liase de cistationina (H2O + 404 LMOM CAETHG_049 cistationina --> NH3 + piruvato + homocisteína) A 8 23 Rendime 2 CAETHG_335 ATP:acetato fosfotransferase (ATP + H+ + propionato -- 0,228988 0,188 nto - 9, > ADP + fosfato de propionila), beta-liase de 404 LMOM CAETHG_049 cistationina (H2O + cistationina --> NH3 + piruvato + A 8 homocisteína) 24 Rendime 3 CAETHG_302 L-arginina imino-hidrolase (H2O + L-arginina <=> NH3 0,230902 0,188 nto - 1, + citrulina), fosfato transacetilase (fosfato + acetil-CoA 398 LMOM CAETHG_335 + H+ <=> CoA + acetilfosfato), D-ribose 1,5- A 8, fosfomutase (ribose 1-fosfato <=> ribose-5-fosfato) CAETHG_392 4 25 Rendime 2 CAETHG_127 AMP:pirofosfato fosforibosiltransferase (PPi + AMP 0,230833 0,188 nto - 0, <=> PRPP + adenina), ATP:acetato fosfotransferase 39 LMOM CAETHG_335 (ATP + H+ + propionato --> ADP + propionil fosfato) A 9 26 Rendime 2 CAETHG_137 Adenosina 5'-monofosfato fosfo-hidrolase (H2O + AMP 0,230833 0,188 nto - 1, <=> Fosfato + H+ + Adenosina), ATP:acetato 39 LMOM CAETHG_335 fosfotransferase (ATP + H+ + Propionato --> ADP + A 9 Propionil fosfato) 27 Rendime 2 CAETHG_335 ATP:acetato fosfotransferase (ATP + H+ + propionato -- 0,230833 0,188 nto - 9, > ADP + fosfato de propionila), D-ribose 1,5- 39 LMOM CAETHG_392 fosfomutase (ribose 1-fosfato <=> ribose-5-fosfato) A 4 28 Rendime 2 CAETHG_137 Adenosina 5'-monofosfato fosfo-hidrolase (H2O + AMP 0,230833 0,188 nto - 1, <=> fosfato + H+ + adenosina), fosfato transacetilase 39 LMOM CAETHG_335 (fosfato + acetil-CoA + H+ <=> CoA + acetilfosfato) A 8 29 Rendime 1 CAETHG_335 Fosfato transacetilase (fosfato + acetil-CoA + H+ <=> 0,229408 0,188 nto - 8 CoA + acetilfosfato) 348
LMOM
A 30 Rendime 1 CAETHG_335 ATP:acetato fosfotransferase (ATP + H+ + Propionato -- 0,229408 0,188 nto - 9 > ADP + Propionil fosfato) 348
LMOM
A 31 Rendime 2 CAETHG_016 N-Ribosilnicotinamida:ribosiltransferase de ortofosfato 0,185926 0,186 nto - 0, (fosfato + N-ribosilnicotinamida <=> Nicotinamida + 1- 556 LMOM CAETHG_293 fosfato de ribose), alfa-acetolactato descarboxilase A 2 (ALCTT --> CO2 + (R)-Acetoína) 32 Rendime 2 CAETHG_293 Alfa-acetolactato descarboxilase (ALCTT --> CO2 + 0,185926 0,186 nto - 2, (R)-Acetoína), 1,5-fosfomutase de D-ribose (1-fosfato 556 LMOM CAETHG_392 de ribose <=> ribose-5-fosfato) A 4
219 / 294 33 Rendime 2 CAETHG_293 alfa-acetolactato descarboxilase (ALCTT --> CO2 + 0,183754 0,184 nto - 2, (R)-Acetoína), cisteína dessulfidase (H2O + L-cisteína 984 LMOM CAETHG_329 <=> NH3 + piruvato + H2S) A 3 34 Rendime 2 CAETHG_293 Alfa-acetolactato descarboxilase (ALCTT --> CO2 + 0,183906 0,184 nto - 2, (R)-Acetoína), beta-liase de cistationina (H2O + 562 LMOM CAETHG_049 cistationina --> NH3 + piruvato + homocisteína) A 8 35 Rendime 2 CAETHG_279 [FeFe]-hidrogenase de bifurcação de elétrons 0,183806 0,184 nto - 6, dependente de NADP (Hyt) (NADP + ferredoxina 49 LMOM CAETHG_293 oxidada + 2,0 H2 <=> NADPH + 3,0 H+ + ferredoxina A 2 reduzida), alfa-acetolactato descarboxilase (ALCTT --> CO2 + (R)-Acetoína) 36 Rendime 2 CAETHG_279 [FeFe]-hidrogenase de bifurcação de elétrons 0,183806 0,184 nto - 8, dependente de NADP (Hyt) (NADP + ferredoxina 49 LMOM CAETHG_293 oxidada + 2,0 H2 <=> NADPH + 3,0 H+ + ferredoxina A 2 reduzida), alfa-acetolactato descarboxilase (ALCTT --> CO2 + (R)-Acetoína) 37 Rendime 2 CAETHG_279 [FeFe]-hidrogenase de bifurcação de elétrons 0,183806 0,184 nto - 9, dependente de NADP (Hyt) (NADP + ferredoxina 49 LMOM CAETHG_293 oxidada + 2,0 H2 <=> NADPH + 3,0 H+ + ferredoxina A 2 reduzida), alfa-acetolactato descarboxilase (ALCTT --> CO2 + (R)-Acetoína) 38 Rendime 2 CAETHG_279 [FeFe]-hidrogenase de bifurcação de elétrons 0,183806 0,184 nto - 5, dependente de NADP (Hyt) (NADP + ferredoxina 49 LMOM CAETHG_293 oxidada + 2,0 H2 <=> NADPH + 3,0 H+ + ferredoxina A 2 reduzida), alfa-acetolactato descarboxilase (ALCTT --> CO2 + (R)-Acetoína) 39 Rendime 2 CAETHG_279 [FeFe]-hidrogenase de bifurcação de elétrons 0,183806 0,184 nto - 7, dependente de NADP (Hyt) (NADP + ferredoxina 49 LMOM CAETHG_293 oxidada + 2,0 H2 <=> NADPH + 3,0 H+ + ferredoxina A 2 reduzida), alfa-acetolactato descarboxilase (ALCTT --> CO2 + (R)-Acetoína) 40 Rendime 2 CAETHG_024 Transporte reversível de L-lactato via simporte de 0,183806 0,184 nto - 8, prótons (H+_ext + L-Lactato_ext <=> H+ + L-lactato), 038 LMOM CAETHG_293 alfa-acetolactato descarboxilase (ALCTT --> CO2 + A 2 (R)-Acetoína) 41 Rendime 2 CAETHG_275 Citramalato sintase (H2O + Piruvato + Acetil-CoA <=> 0,183456 0,184 nto - 1, CoA + Citramalato), alfa-acetolactato descarboxilase 024 LMOM CAETHG_293 (ALCTT --> CO2 + (R)-Acetoína) A 2 42 Rendime 2 CAETHG_392 D-Ribose 1,5-fosfomutase (1-fosfato de ribose <=> 0,186014 0,183 nto - 4, ribose-5-fosfato), beta-liase de cistationina (H2O + 362 LMOM CAETHG_049 Cistationina --> NH3 + piruvato + homocisteína) A 8 43 Rendime 1 CAETHG_016 N-ribosilnicotinamida:ortofosfato ribosiltransferase 0,185926 0,182 nto - 0 (fosfato + N-ribosilnicotinamida <=> nicotinamida + 994 LMOM ribose 1-fosfato)
A 44 Rendime 1 CAETHG_127 AMP:pirofosfato fosforibosiltransferase (PPi + AMP 0,185926 0,182 nto - 0 <=> PRPP + adenina) 994
LMOM
A 45 Rendime 1 CAETHG_392 D-ribose 1,5-fosfomutase (ribose 1-fosfato <=> ribose- 0,185926 0,182 nto - 4 5-fosfato) 994
LMOM
A 46 Rendime 1 CAETHG_272 Fosfoenolpiruvato carboxiquinase (PPCK) (ATP + 0,185926 0,182 nto - 1 oxaloacetato + H+ --> ADP + CO2 + Fosfoenolpiruvato) 756
LMOM A
220 / 294 47 Rendime 1 CAETHG_302 L-arginina imino-hidrolase (H2O + L-arginina <=> NH3 0,186476 0,182 nto - 1 + citrulina) 602
LMOM
A EXEMPLO 4
[0085] Este exemplo descreve rompimentos para melhorar a produção de acetona em microrganismos de Wood-Ljungdahl. Os experimentos de modelagem metabólica foram realizados como descrito no Exemplo 1. A produção de acetona em microrganismos de Wood-Ljungdahl é descrita, por exemplo, no documento WO 2012/115527. A seguinte via foi usada para modelar a produção de acetona aqui: 2,0 Acetil-CoA --> CoA + Acetoacetil- CoA; Acetato + Acetoacetil-CoA --> Acetil-CoA + Acetoacetato; Acetoacetato --> CO2 + acetona; Acetona --> Acetona_ext.
Pontuação de condicionamento físico Rendimento mínimo em FVA N° Genes rompidos Reações rompidas Genes rompidos Técnica N° 1 Rendime 5 CAETHG_272 Acetil-CoA:dióxido de carbono ligase (formadora de ADP) 0 0,057 nto - 1, (ATP + acetil-CoA + H2CO3 --> ADP + fosfato + H+ + 267 LMOMA CAETHG_275 malonil-CoA), fosfoenolpiruvato carboxiquinase (PPCK) 3, (ATP + oxaloacetato + H+ --> ADP + CO2 + CAETHG_335 Fosfoenolpiruvato), Isocitrato desidrogenase (NAD + 8, Isocitrato <=> NADH + CO2 + 2-Oxoglutarato + H+), CAETHG_351 Fosfato transacetilase (Fosfato + Acetil-CoA + H+ <=> CoA 0, + Acetilfosfato), 2,6-Diamino-heptanato 2-oxoglutarato CAETHG_090 aminotransferase (H2O + L-glutamato + H+ + tetra- 9 hidrodipicolinato <-- 2-Oxoglutarato + LL-2,6- Diaminopimelato), pré-fenato:NAD+ oxidorredutase (descarboxilação) (NAD + pré-fenato --> NADH + CO2 + p- hidroxifenilpiruvato) 2 Rendime 4 CAETHG_272 Acetil-CoA:dióxido de carbono ligase (formadora de ADP) 0 0,057 nto - 1, (ATP + acetil-CoA + H2CO3 --> ADP + fosfato + H+ + 24 LMOMA CAETHG_335 malonil-CoA), fosfoenolpiruvato carboxiquinase (PPCK) 8, (ATP + oxaloacetato + H+ --> ADP + CO2 + CAETHG_351 Fosfoenolpiruvato), fosfato transacetilase (fosfato + acetil- 0, CoA + H+ <=> CoA + acetilfosfato), 2,6-diamino- CAETHG_090 heptanodioato:aminotransferase de 2-oxoglutarato (H2O + 9 L-glutamato + H+ + tetra-hidrodipicolinato <-- 2- Oxoglutarato + LL-2,6-Diaminopimelato), Pré-fenato:NAD+ oxidorredutase (descarboxilação) (NAD + Pré-fenato --> NADH + CO2 + p-hidroxifenilpiruvato)
221 / 294 3 Rendime 2 CAETHG_272 Acetil-CoA:dióxido de carbono ligase (formadora de ADP) 0 0,056 nto - 1, (ATP + acetil-CoA + H2CO3 --> ADP + fosfato + H+ + 697 LMOMA CAETHG_335 malonil-CoA), fosfoenolpiruvato carboxiquinase (PPCK) 9 (ATP + oxaloacetato + H+ --> ADP + CO2 + Fosfoenolpiruvato), ATP:acetato fosfotransferase (ATP + H+ + Propionato --> ADP + Propionil fosfato) 4 Rendime 3 CAETHG_272 Fosfoenolpiruvato carboxiquinase (PPCK) (ATP + 0 0,056 nto - 1, oxaloacetato + H+ --> ADP + CO2 + Fosfoenolpiruvato), 481 LMOMA CAETHG_335 ATP:acetato fosfotransferase (ATP + H+ + propionato --> 9, ADP + propionil fosfato), prefenato:NAD+ oxidorredutase CAETHG_090 (decarboxilação) (NAD + Pré-fenato --> NADH + CO2 + p- 9 hidroxifenilpiruvato) 5 Rendime 3 CAETHG_272 Fosfoenolpiruvato carboxiquinase (PPCK) (ATP + 0 0,056 nto - 1, oxaloacetato + H+ --> ADP + CO2 + Fosfoenolpiruvato), 292 LMOMA CAETHG_335 ATP:acetato fosfotransferase (ATP + H+ + propionato --> 9, ADP + fosfato de propionila), 2,6-diamino-heptanodioato:2- CAETHG_351 oxoglutarato:aminotransferase (H2O + L-glutamato + H+ + 0 tetra-hidrodipicolinato <-- 2-Oxoglutarato + LL-2,6- Diaminopimelato) 6 Rendime 3 CAETHG_272 Fosfoenolpiruvato carboxiquinase (PPCK) (ATP + 0 0,056 nto - 1, oxaloacetato + H+ --> ADP + CO2 + Fosfoenolpiruvato), 154 LMOMA CAETHG_275 isocitrato desidrogenase (NAD + isocitrato <=> NADH + 3, CO2 + 2-Oxoglutarato + H+), ATP:acetato fosfotransferase CAETHG_335 (ATP + H+ + Propionato --> ADP + Propionil fosfato) 9 7 Rendime 2 CAETHG_272 Fosfoenolpiruvato carboxiquinase (PPCK) (ATP + 0 0,056 nto - 1, oxaloacetato + H+ --> ADP + CO2 + Fosfoenolpiruvato), 112 LMOMA CAETHG_335 fosfato transacetilase (fosfato + acetil-CoA + H+ <=> CoA + 8 acetilfosfato) 8 Rendime 2 CAETHG_272 Fosfoenolpiruvato carboxiquinase (PPCK) (ATP + 0 0,056 nto - 1, oxaloacetato + H+ --> ADP + CO2 + fosfoenolpiruvato), 112 LMOMA CAETHG_335 ATP:acetato fosfotransferase (ATP + H+ + propionato --> 9 ADP + propionil fosfato) 9 Rendime 2 CAETHG_272 Fosfoenolpiruvato carboxiquinase (PPCK) (ATP + 0 0,056 nto - 1, oxaloacetato + H+ --> ADP + CO2 + fosfoenolpiruvato), 022 LMOMA CAETHG_335 ATP:acetato fosfotransferase (ATP + H+ + propionato --> 9 ADP + propionil fosfato) 10 Rendime 2 CAETHG_293 Alfa-acetolactato descarboxilase (ALCTT --> CO2 + (R)- 0 0,055 nto - 2, Acetoína), fosfato transacetilase (fosfato + acetil-CoA + H+ 245 LMOMA CAETHG_335 <=> CoA + acetilfosfato) 8 11 Rendime 2 CAETHG_293 Alfa-acetolactato descarboxilase (ALCTT --> CO2 + (R)- 0 0,055 nto - 2, Acetoína), ATP:acetato de fosfotransferase (ATP + H+ + 245 LMOMA CAETHG_335 propionato --> ADP + fosfato de propionila) 9 12 Rendime 3 CAETHG_023 4-imidazolona-5-propanoato amido-hidrolase (H2O + 4- 0 0,052 nto - 3, Imidazolona-5-propanoato --> N-Formimino-L-glutamato), 14 LMOMA CAETHG_335 ATP:acetato fosfotransferase (ATP + H+ + propionato --> 9, ADP + fosfato de propionila), 2,6-Diamino-heptanodioato:2- CAETHG_351 oxoglutarato aminotransferase (H2O + L-glutamato + H+ + 0 tetra-hidrodipicolinato <-- 2-Oxoglutarato + LL-2,6- Diaminopimelato) 13 Rendime 3 CAETHG_023 4,5-di-hidro-4-oxo-5-imidazolpropanoato hidro-lilase (4- 0 0,052 nto - 4, imidazolona-5-propanoato <=> H2O + Urocanato), 14 LMOMA CAETHG_335 ATP:acetato fosfotransferase (ATP + H+ + propionato --> 9, ADP + fosfato de propionila), 2,6-Diamino-heptanodioato:2- CAETHG_351 oxoglutarato aminotransferase (H2O + L-glutamato + H+ + 0 tetra-hidrodipicolinato <-- 2-Oxoglutarato + LL-2,6- Diaminopimelato)
222 / 294 14 Rendime 2 CAETHG_335 ATP:acetato fosfotransferase (ATP + H+ + propionato --> 0 0,052 nto - 9, ADP + fosfato de propionila), 2,6-diamino-heptanodioato:2- 041 LMOMA CAETHG_351 oxoglutarato aminotransferase (H2O + L-glutamato + H+ + 0 tetra-hidrodipicolinato <-- 2-oxoglutarato + LL-2,6- Diaminopimelato) 15 Rendime 2 CAETHG_335 Fosfato transacetilase (fosfato + acetil-CoA + H+ <=> CoA 0 0,052 nto - 8, + acetilfosfato), 2,6-diamino-heptanodioato:2-oxoglutarato 041 LMOMA CAETHG_351 aminotransferase (H2O + L-glutamato + H+ + tetra- 0 hidrodipicolinato <-- 2-oxoglutarato + LL-2,6- Diaminopimelato) 16 Rendime 3 CAETHG_016 N-ribosilnicotinamida:ribosiltransferase de ortofosfato 0 0,051 nto - 0, (fosfato + N-ribosilnicotinamida <=> nicotinamida + 1- 891 LMOMA CAETHG_335 fosfato de ribose), ATP:acetato fosfotransferase (ATP + H+ + 9, propionato --> ADP + fosfato de propionila), Pré- CAETHG_090 fenato:NAD+ oxidoredutase(descarboxilação) (NAD + Pré- 9 fenato --> NADH + CO2 + p-hidroxifenilpiruvato) 17 Rendime 3 CAETHG_016 N-Ribosilnicotinamida:ribosiltransferase de ortofosfato 0 0,051 nto - 0, (fosfato + N-ribosilnicotinamida <=> Nicotinamida + 1- 678 LMOMA CAETHG_335 fosfato de ribose), ATP:acetato fosfotransferase (ATP + H+ + 9, propionato --> ADP + fosfato de propionila), cistationina CAETHG_049 beta-liase (H2O + cistationina --> NH3 + piruvato + 8 homocisteína) 18 Rendime 3 CAETHG_137 Adenosina 5'-monofosfato fosfo-hidrolase (H2O + AMP <=> 0 0,051 nto - 1, fosfato + H+ + adenosina), isocitrato desidrogenase (NAD + 609 LMOMA CAETHG_275 isocitrato <=> NADH + CO2 + 2-oxoglutarato + H+), 3, ATP:acetato fosfotransferase (ATP + H+ + propionato --> CAETHG_335 ADP + fosfato de propionila) 9 19 Rendime 3 CAETHG_016 N-ribosilnicotinamida:ortofosfato ribosiltransferase (fosfato 0 0,051 nto - 0, + N-ribosilnicotinamida <=> nicotinamida + ribose 1- 57 LMOMA CAETHG_302 fosfato), L-arginina imino-hidrolase (H2O + L-arginina <=> 1, NH3 + citrulina), ATP:acetato fosfotransferase (ATP + CAETHG_335 acetato + fosfotransferase) Propionato --> ADP + fosfato de 9 Propionila) 20 Rendime 2 CAETHG_016 N-ribosilnicotinamida:ribosiltransferase de ortofosfato 0 0,051 nto - 0, (fosfato + N-ribosilnicotinamida <=> nicotinamida + 1- 567 LMOMA CAETHG_335 fosfato de ribose), ATP:acetato fosfotransferase (ATP + H+ + 9 propionato --> ADP + fosfato de propionila) 21 Rendime 2 CAETHG_335 Fosfato transacetilase (fosfato + acetil-CoA + H+ <=> CoA 0 0,051 nto - 8, + acetilfosfato), D-ribose 1,5-fosfomutase (ribose 1-fosfato 567 LMOMA CAETHG_392 <=> ribose-5-fosfato) 4 22 Rendime 2 CAETHG_137 Adenosina 5'-monofosfato fosfo-hidrolase (H2O + AMP <=> 0 0,051 nto - 1, Fosfato + H+ + Adenosina), ATP:acetato fosfotransferase 567 LMOMA CAETHG_335 (ATP + H+ + Propionato --> ADP + Propionil fosfato) 9 23 Rendime 2 CAETHG_335 ATP:acetato fosfotransferase (ATP + H+ + propionato --> 0 0,051 nto - 9, ADP + fosfato de propionila), D-ribose 1,5-fosfomutase 567 LMOMA CAETHG_392 (ribose 1-fosfato <=> ribose-5-fosfato) 4 24 Rendime 2 CAETHG_127 AMP:pirofosfato fosforibosiltransferase (PPi + AMP <=> 0 0,051 nto - 0, PRPP + adenina), ATP:acetato fosfotransferase (ATP + H+ + 561 LMOMA CAETHG_335 propionato --> ADP + propionil fosfato) 9 25 Rendime 2 CAETHG_335 ATP:acetato fosfotransferase (ATP + H+ + Propionato --> 0 0,048 nto - 9, ADP + fosfato de propionila), L-treonina acetaldeído-liase 294 LMOMA CAETHG_068 (L-treonina --> glicina + acetaldeído) 6
223 / 294 26 Rendime 2 CAETHG_335 ATP:acetato fosfotransferase (ATP + H+ + propionato --> 0 0,046 nto - 9, ADP + fosfato de propionila), beta-liase de cistationina 551 LMOMA CAETHG_049 (H2O + cistationina --> NH3 + piruvato + homocisteína) 8 27 Rendime 2 CAETHG_329 Cisteína dessulfidrase (H2O + L-cisteína <=> NH3 + 0 0,045 nto - 3, piruvato + H2S), ATP:acetato fosfotransferase (ATP + H+ + 591 LMOMA CAETHG_335 propionato --> ADP + fosfato de propionila) 9 28 Rendime 2 CAETHG_329 2-desoxi-D-ribose-5-fosfato acetaldeído-liase (desoxirribose- 0 0,045 nto - 9, 5-fosfato <=> acetaldeído + gliceraldeído 3-fosfato), 288 LMOMA CAETHG_335 ATP:acetato fosfotransferase (ATP + H+ + propionato --> 9 ADP + fosfato de propionila) 29 Rendime 2 CAETHG_247 dGTP trifosfo-hidrolase (H2O + dGTP --> H+ + 0 0,045 nto - 5, desoxiguanosina + trifosfato), ATP:acetato fosfotransferase 285 LMOMA CAETHG_335 (ATP + H+ + propionato --> ADP + fosfato de propionila) 9 30 Rendime 2 CAETHG_302 L-arginina imino-hidrolase (H2O + L-arginina <=> NH3 + 0 0,044 nto - 1, citrulina), ATP:acetato fosfotransferase (ATP + H+ + 994 LMOMA CAETHG_335 propionato --> ADP + fosfato de propionila) 9 31 Rendime 2 CAETHG_316 UMP: pirofosfato fosforibosiltransferase (Uracil + PRPP --> 0 0,044 nto - 4, PPi + UMP), ATP:acetato fosfotransferase (ATP + H+ + 943 LMOMA CAETHG_335 propionato --> ADP + fosfato de propionila) 9 32 Rendime 1 CAETHG_335 ATP:acetato fosfotransferase (ATP + H+ + Propionato --> 0 0,044 nto - 9 ADP + Propionil fosfato) 94
LMOMA 33 Rendime 1 CAETHG_335 Fosfato transacetilase (fosfato + acetil-CoA + H+ <=> CoA 0 0,044 nto - 8 + acetilfosfato) 94
LMOMA 34 Rendime 2 CAETHG_023 4,5-di-hidro-4-oxo-5-imidazolpropanoato hidro-liase (4- 0 0,020 nto - 4, imidazolona-5-propanoato <=> H2O + Urocanato), 286 LMOMA CAETHG_275 citramalato sintase (H2O + piruvato + acetil-CoA <=> CoA 1 + citramalato) 35 Rendime 1 CAETHG_275 Citramalato sintase (H2O + Piruvato + Acetil-CoA <=> CoA 0 0,020 nto - 1 + Citramalato) 283
LMOMA 36 Rendime 1 CAETHG_137 Adenosina 5'-monofosfato fosfo-hidrolase (H2O + AMP <=> 0 0,020 nto - 1 Fosfato + H+ + Adenosina) 094
LMOMA 37 Rendime 1 CAETHG_127 AMP:pirofosfato fosforibosiltransferase (PPi + AMP <=> 0 0,020 nto - 0 PRPP + adenina) 094
LMOMA 38 Rendime 1 CAETHG_392 D-ribose 1,5-fosfomutase (ribose 1-fosfato <=> ribose-5- 0 0,020 nto - 4 fosfato) 094
LMOMA EXEMPLO 5
[0086] Esse exemplo descreve interrupções para melhorar a produção de isopropanol nos microrganismos de Wood-Ljungdahl. Os experimentos de modelagem metabólica foram realizados como descrito no Exemplo 1. A produção de isopropanol em microrganismos de Wood-Ljungdahl é descrita, por exemplo, no documento WO 2012/115527. A seguinte via foi usada para modelar a produção de isopropanol aqui: 2.0 Acetil-CoA --> CoA +
224 / 294 Acetoacetil-CoA; Acetato + Acetoacetil-CoA --> Acetil-CoA + Acetoacetato; Acetoacetato --> CO2 + acetona; Isopropanol --> Isopropanol_ext.
Pontuação de condicionamento Rendimento mínimo em FVA N° Genes rompidos Reações rompidas Genes rompidos Técnica físico N° 1 Rendime 6 CAETHG_275 Isocitrato desidrogenase (NAD + Isocitrato <=> NADH + 0 0,043 nto - 3, CO2 + 2-Oxoglutarato + H+), alfa-acetolactato 86 LMOMA CAETHG_293 descarboxilase (ALCTT --> CO2 + (R)-Acetoína), L- 2, arginina imino-hidrolase (H2O + L-arginina <=> NH3 + CAETHG_302 Citrulina), fosfato transacetilase (fosfato + acetil-CoA + H+ 1, <=> CoA + acetilfosfato), beta-liase de cistationina (H2O + CAETHG_335 cistationina --> NH3 + piruvato + homocisteína), L-treonina 8, acetaldeído-liase (L-Treonina --> Glicina + Acetaldeído) CAETHG_049 8, CAETHG_068 6 2 Rendime 5 CAETHG_275 Isocitrato desidrogenase (NAD + Isocitrato <=> NADH + 0 0,043 nto - 3, CO2 + 2-Oxoglutarato + H+), alfa-acetolactato 854 LMOMA CAETHG_293 descarboxilase (ALCTT --> CO2 + (R)-Acetoína), fosfato 2, transacetilase (fosfato + acetil-CoA + H+ <=> CoA + CAETHG_335 acetilfosfato), beta-liase de cistationina (H2O + cistationina - 8, -> NH3 + piruvato + homocisteína), L-treonina acetaldeído- CAETHG_049 liase (L-treonina --> glicina + acetaldeído) 8, CAETHG_068 6 3 Rendime 6 CAETHG_293 Alfa-acetolactato descarboxilase (ALCTT --> CO2 + (R)- 0 0,043 nto - 2, Acetoína), L-arginina imino-hidrolase (H2O + L-arginina 791 LMOMA CAETHG_302 <=> NH3 + citrulina), fosfato transacetilase (fosfato + acetil- 1, CoA + H+ <=> CoA + Acetilfosfato), 2,6-Diamino- CAETHG_335 heptanodioato:2-oxoglutarato aminotransferase (H2O + L- 8, glutamato + H+ + tetra-hidrodipicolinato <-- 2-Oxoglutarato CAETHG_351 + LL-2,6-Diaminopimelato), beta-liase cistationina (H2O + 0, cistationina --> NH3 + piruvato + homocisteína), L-treonina CAETHG_049 acetaldeído-liase (L-treonina --> glicina + acetaldeído) 8, CAETHG_068 6 4 Rendime 5 CAETHG_293 Alfa-acetolactato descarboxilase (ALCTT --> CO2 + (R)- 0 0,043 nto - 2, Acetoína), fosfato transacetilase (fosfato + acetil-CoA + H+ 782 LMOMA CAETHG_335 <=> CoA + acetilfosfato), 2,6-diamino-heptanodioato de 2,6- 8, diamino-heptanodioato:2-oxoglutarato aminotransferase CAETHG_351 (H2O + L-Glutamato + H+ + tetra-hidrodipicolinato <-- 2- 0, Oxoglutarato + LL-2,6-Diaminopimelato), Cistationina beta- CAETHG_049 liase (H2O + Cistationina --> NH3 + Piruvato + 8, Homocisteína), L-Treonina acetaldeído-liase (L-treonina - L- CAETHG_068 treonina --> Glicina + acetaldeído) 6
225 / 294 5 Rendime 5 CAETHG_293 Alfa-acetolactato descarboxilase (ALCTT --> CO2 + (R)- 0 0,043 nto - 2, Acetoína), L-arginina imino-hidrolase (H2O + L-arginina 77 LMOMA CAETHG_302 <=> NH3 + citrulina), fosfato transacetilase (fosfato + acetil- 1, CoA + H+ <=> CoA + Acetilfosfato), Cistationina beta-liase CAETHG_335 (H2O + Cistationina --> NH3 + Piruvato + Homocisteína), 8, L-Treonina acetaldeído-liase (L-treonina --> Glicina + CAETHG_049 Acetaldeído) 8, CAETHG_068 6 6 Rendime 4 CAETHG_293 Alfa-acetolactato descarboxilase (ALCTT --> CO2 + (R)- 0 0,043 nto - 2, Acetoína), ATP:acetato fosfotransferase (ATP + H+ + 758 LMOMA CAETHG_335 propionato --> ADP + fosfato de propionila), beta-liase de 9, cistationina (H2O + cistationina --> NH3 + piruvato + CAETHG_049 Homocisteína), L-treonina acetaldeído-liase (L-treonina --> 8, glicina + acetaldeído) CAETHG_068 6 7 Rendime 4 CAETHG_293 Alfa-acetolactato descarboxilase (ALCTT --> CO2 + (R)- 0 0,043 nto - 2, Acetoína), fosfato transacetilase (fosfato + acetil-CoA + H+ 758 LMOMA CAETHG_335 <=> CoA + acetilfosfato), beta-liase de cistationina (H2O + 8, cistationina --> NH3 + piruvato + Homocisteína), L-treonina CAETHG_049 acetaldeído-liase (L-treonina --> glicina + acetaldeído) 8, CAETHG_068 6 8 Rendime 3 CAETHG_293 Alfa-acetolactato descarboxilase (ALCTT --> CO2 + (R)- 0 0,043 nto - 2, Acetoína), fosfato transacetilase (fosfato + acetil-CoA + H+ 644 LMOMA CAETHG_335 <=> CoA + acetilfosfato), L-treonina acetaldeído-liase (L- 8, treonina --> glicina + Acetaldeído) CAETHG_068 6 9 Rendime 3 CAETHG_293 Alfa-acetolactato descarboxilase (ALCTT --> CO2 + (R)- 0 0,043 nto - 2, Acetoína), ATP:acetato fosfotransferase (ATP + H+ + 644 LMOMA CAETHG_335 propionato --> ADP + fosfato de propionila), L-treonina 9, acetaldeído-liase (L-treonina --> Glicina + Acetaldeído) CAETHG_068 6 10 Rendime 4 CAETHG_293 Alfa-acetolactato descarboxilase (ALCTT --> CO2 + (R)- 0 0,043 nto - 2, Acetoína), L-arginina imino-hidrolase (H2O + L-arginina 107 LMOMA CAETHG_302 <=> NH3 + citrulina), ATP:acetato fosfotransferase (ATP + 1, H+ + propionato --> ADP + Fosfato de propionila), beta- CAETHG_335 liase de cistationina (H2O + cistationina --> NH3 + piruvato 9, + homocisteína) CAETHG_049 8 11 Rendime 3 CAETHG_293 Alfa-acetolactato descarboxilase (ALCTT --> CO2 + (R)- 0 0,043 nto - 2, Acetoína), fosfato transacetilase (fosfato + acetil-CoA + H+ 095 LMOMA CAETHG_335 <=> CoA + acetilfosfato), beta-liase de cistationina (H2O + 8, cistationina --> NH3 + piruvato + Homocisteína) CAETHG_049 8 12 Rendime 3 CAETHG_293 Alfa-acetolactato descarboxilase (ALCTT --> CO2 + (R)- 0 0,043 nto - 2, Acetoína), ATP:acetato fosfotransferase (ATP + H+ + 095 LMOMA CAETHG_335 propionato --> ADP + fosfato de propionila), beta-liase de 9, cistationina (H2O + cistationina --> NH3 + piruvato + CAETHG_049 Homocisteína) 8
226 / 294 13 Rendime 3 CAETHG_137 Adenosina 5'-monofosfato fosfo-hidrolase (H2O + AMP <=> 0 0,043 nto - 1, Fosfato + H+ + Adenosina), alfa-acetolactato descarboxilase 08 LMOMA CAETHG_293 (ALCTT --> CO2 + (R)-Acetoína), ATP:acetato 2, fosfotransferase (ATP + H+ + propionato --> ADP + fosfato CAETHG_335 de propionila) 9 14 Rendime 3 CAETHG_016 N-Ribosilnicotinamida:ortofosfato ribosiltransferase (fosfato 0 0,043 nto - 0, + N-ribosilnicotinamida <=> Nicotinamida + ribose 1- 08 LMOMA CAETHG_293 fosfato), alfa-acetolactato descarboxilase (ALCTT --> CO2 2, + (R)-Acetoína), ATP:acetato fosfotransferase (ATP + H+ + CAETHG_335 Propionato --> ADP + fosfato de propionila) 9 15 Rendime 3 CAETHG_293 Alfa-acetolactato descarboxilase (ALCTT --> CO2 + (R)- 0 0,043 nto - 2, Acetoína), L-arginina imino-hidrolase (H2O + L-arginina 029 LMOMA CAETHG_302 <=> NH3 + citrulina), ATP:acetato fosfotransferase (ATP + 1, H+ + propionato --> ADP + Fosfato de propionila) CAETHG_335 9 16 Rendime 3 0, Acetil-CoA:dióxido de carbono ligase (formadora de ADP) 0 0,043 nto - CAETHG_293 (ATP + acetil-CoA + H2CO3 --> ADP + fosfato + H+ + 023 LMOMA 2, malonil-CoA), alfa-acetolactato descarboxilase (ALCTT --> CAETHG_335 CO2 + (R)-Acetoína), ATP:acetato fosfotransferase (ATP + 9 H+ + Propionato --> ADP + fosfato de propionila) 17 Rendime 2 CAETHG_293 Alfa-acetolactato descarboxilase (ALCTT --> CO2 + (R)- 0 0,043 nto - 2, Acetoína), ATP:acetato de fosfotransferase (ATP + H+ + 017 LMOMA CAETHG_335 propionato --> ADP + fosfato de propionila) 9 18 Rendime 2 CAETHG_293 Alfa-acetolactato descarboxilase (ALCTT --> CO2 + (R)- 0 0,043 nto - 2, Acetoína), fosfato transacetilase (fosfato + acetil-CoA + H+ 017 LMOMA CAETHG_335 <=> CoA + acetilfosfato) 8 19 Rendime 3 CAETHG_335 ATP:acetato fosfotransferase (ATP + H+ + propionato --> 0 0,037 nto - 9, ADP + fosfato de propionila), beta-liase de cistationina 755 LMOMA CAETHG_049 (H2O + cistationina --> NH3 + piruvato + homocisteína), L- 8, treonina acetaldeído-liase (L-treonina --> glicina + CAETHG_068 Acetaldeído) 6 20 Rendime 3 CAETHG_302 L-arginina imino-hidrolase (H2O + L-arginina <=> NH3 + 0 0,037 nto - 1, citrulina), ATP:acetato fosfotransferase (ATP + H+ + 077 LMOMA CAETHG_335 propionato --> ADP + fosfato de propionila), L-treonina 9, acetaldeído-liase (L-treonina --> Glicina + Acetaldeído) CAETHG_068 6 21 Rendime 2 CAETHG_335 Fosfato transacetilase (fosfato + acetil-CoA + H+ <=> CoA 0 0,037 nto - 8, + acetilfosfato), L-treonina acetaldeído-liase (L-treonina --> 038 LMOMA CAETHG_068 glicina + acetaldeído) 6 22 Rendime 2 CAETHG_335 ATP:acetato fosfotransferase (ATP + H+ + Propionato --> 0 0,037 nto - 9, ADP + fosfato de propionila), L-treonina acetaldeído-liase 038 LMOMA CAETHG_068 (L-treonina --> glicina + acetaldeído) 6 23 Rendime 3 CAETHG_244 Piruvato-cinase (ADP + Fosfoenolpiruvato --> ATP + 0 0,036 nto - 1, Piruvato), cisteína dessulfidrase (H2O + L-cisteína <=> NH3 639 LMOMA CAETHG_329 + piruvato + H2S), ATP:acetato fosfotransferase (ATP + H+ 3, + propionato --> ADP + propionilfato) CAETHG_335 9
227 / 294 24 Rendime 3 CAETHG_329 Cisteína dessulfidrase (H2O + L-cisteína <=> NH3 + 0 0,036 nto - 3, piruvato + H2S), ATP:acetato fosfotransferase (ATP + H+ + 468 LMOMA CAETHG_335 propionato --> ADP + fosfato de propionila), beta-liase de 9, cistationina (H2O + cistationina --> NH3 + piruvato + CAETHG_049 Homocisteína) 8 25 Rendime 2 CAETHG_329 Cisteína dessulfidrase (H2O + L-cisteína <=> NH3 + 0 0,035 nto - 3, piruvato + H2S), ATP:acetato fosfotransferase (ATP + H+ + 355 LMOMA CAETHG_335 propionato --> ADP + fosfato de propionila) 9 26 Rendime 2 CAETHG_023 4,5-di-hidro-4-oxo-5-imidazolpropanoato hidro-lilase (4- 0 0,031 nto - 4, imidazolona-5-propanoato <=> H2O + Urocanato), 752 LMOMA CAETHG_335 ATP:acetato fosfotransferase (ATP + H+ + propionato --> 9 ADP + fosfato de propionila) 27 Rendime 2 CAETHG_023 4-imidazolona-5-propanoato amido-hidrolase (H2O + 4- 0 0,031 nto - 3, Imidazolona-5-propanoato --> N-Formimino-L-glutamato), 752 LMOMA CAETHG_335 ATP:acetato fosfotransferase (ATP + H+ + propionato --> 9 ADP + fosfato de propionila) 28 Rendime 2 CAETHG_302 L-arginina imino-hidrolase (H2O + L-arginina <=> NH3 + 0 0,031 nto - 1, citrulina), ATP:acetato fosfotransferase (ATP + H+ + 737 LMOMA CAETHG_335 propionato --> ADP + fosfato de propionila) 9 29 Rendime 2 CAETHG_247 dGTP trifosfo-hidrolase (H2O + dGTP --> H+ + 0 0,031 nto - 5, desoxiguanosina + trifosfato), ATP:acetato fosfotransferase 731 LMOMA CAETHG_335 (ATP + H+ + propionato --> ADP + fosfato de propionila) 9 30 Rendime 2 CAETHG_247 dGTP trifosfo-hidrolase (H2O + dGTP --> H+ + 0 0,031 nto - 5, desoxiguanosina + trifosfato), fosfato transacetilase (fosfato 731 LMOMA CAETHG_335 + acetil-CoA + H+ <=> CoA + acetilfosfato) 8 31 Rendime 1 CAETHG_335 Fosfato transacetilase (fosfato + acetil-CoA + H+ <=> CoA 0 0,031 nto - 8 + acetilfosfato) 707
LMOMA 32 Rendime 1 CAETHG_335 ATP:acetato fosfotransferase (ATP + H+ + Propionato --> 0 0,031 nto - 9 ADP + Propionil fosfato) 707
LMOMA EXEMPLO 6
[0087] Esse exemplo descreve rompimentos para melhorar a produção de lactato nos microrganismos de Wood-Ljungdahl. Os experimentos de modelagem metabólica foram realizados como descrito no Exemplo 1. O lactato é um produto nativo dos microrganismos de Wood-Ljungdahl. Pontuação de condicionamento físico Rendimento mínimo em FVA N° Genes rompidos Reações rompidas Genes rompidos Técnica N°
228 / 294 1 BPCY - 4 CAETHG_275 Isocitrato desidrogenase (NAD + Isocitrato <=> NADH + 0 0,011 FBA 3, CO2 + 2-Oxoglutarato + H+), ATP:piruvato, ortofosfato 882 CAETHG_290 fosfotransferase (ATP + fosfato + piruvato + H+ --> PPi + 9, AMP + fosfoenolpiruvato), cisteína dessulfidrase (H2O + L- CAETHG_329 Cisteína <=> NH3 + Piruvato + H2S), fosfato transacetilase 3, (fosfato + acetil-CoA + H+ <=> CoA + acetilfosfato) CAETHG_335 8 2 BPCY - 4 CAETHG_275 Isocitrato desidrogenase (NAD + Isocitrato <=> NADH + 0 0,011 FBA 3, CO2 + 2-Oxoglutarato + H+), ATP:piruvato, ortofosfato 882 CAETHG_290 fosfotransferase (ATP + fosfato + piruvato + H+ --> PPi + 9, AMP + fosfoenolpiruvato), cisteína dessulfidrase (H2O + L- CAETHG_329 Cisteína <=> NH3 + piruvato + H2S), ATP:acetato 3, fosfotransferase (ATP + H+ + propionato --> ADP + fosfato CAETHG_335 de propionila) 9 3 BPCY - 4 CAETHG_275 Citramalato sintase (H2O + Piruvato + Acetil-CoA <=> CoA 0 0,011 FBA 1, + Citramalato), Isocitrato desidrogenase (NAD + Isocitrato 873 CAETHG_275 <=> NADH + CO2 + 2-Oxoglutarato + H+), ATP:piruvato, 3, ortofosfato fosfotransferase (ATP + Fosfato + Piruvato + H+ CAETHG_290 --> PPi + AMP + Fosfoenolpiruvato), fosfato transacetilase 9, (fosfato + acetil-CoA + H+ <=> CoA + acetilfosfato) CAETHG_335 8 4 BPCY - 4 CAETHG_275 Isocitrato desidrogenase (NAD + Isocitrato <=> NADH + 0 0,011 FBA 3, CO2 + 2-Oxoglutarato + H+), ATP:piruvato, ortofosfato 786 CAETHG_290 fosfotransferase (ATP + fosfato + piruvato + H+ --> PPi + 9, AMP + fosfoenolpiruvato), fosfato transacetilase (fosfato + CAETHG_335 acetil-CoA + H+ <=> CoA + acetilfosfato), beta-liase de 8, cistationina (H2O + cistationina --> NH3 + piruvato + CAETHG_049 homocisteína) 8 5 BPCY - 3 CAETHG_275 Isocitrato desidrogenase (NAD + Isocitrato <=> NADH + 0 0,011 FBA 3, CO2 + 2-Oxoglutarato + H+), ATP:piruvato, ortofosfato 696 CAETHG_290 fosfotransferase (ATP + fosfato + piruvato + H+ --> PPi + 9, AMP + fosfoenolpiruvato), fosfato transacetilase (fosfato + CAETHG_335 acetil-CoA + H+ <=> CoA + acetilfosfato) 8 6 BPCY - 3 CAETHG_275 Citramalato sintase (H2O + Piruvato + Acetil-CoA <=> CoA 0 0,010 FBA 1, + Citramalato), ATP:piruvato, ortofosfato fosfotransferase 722 CAETHG_290 (ATP + Fosfato + Piruvato + H+ --> PPi + AMP + 9, Fosfenenolpiruvato), fosfato-transacetilase (fosfato + Acetil- CAETHG_335 CoA + H+ <=> CoA + Acetilfosfato) 8 7 BPCY - 2 CAETHG_290 ATP:piruvato, ortofosfato fosfotransferase (ATP + fosfato + 0 0,010 FBA 9, piruvato + H+ --> PPi + AMP + fosfoenolpiruvato), 534 CAETHG_335 ATP:acetato fosfotransferase (ATP + H+ + propionato --> 9 ADP + fosfato de propionila) 8 BPCY - 2 CAETHG_290 ATP:piruvato, ortofosfato fosfotransferase (ATP + fosfato + 0 0,010 FBA 9, piruvato + H+ --> PPi + AMP + fosfoenolpiruvato), fosfato 534 CAETHG_335 transacetilase (fosfato + acetil-CoA + H+ <=> CoA + 8 acetilfosfato) 9 BPCY - 2 CAETHG_290 ATP:piruvato, ortofosfato fosfotransferase (ATP + fosfato + 0 0,010 FBA 9, piruvato + H+ --> PPi + AMP + fosfoenolpiruvato), fosfato 387 CAETHG_335 transacetilase (fosfato + acetil-CoA + H+ <=> CoA + 8 acetilfosfato)
229 / 294 10 BPCY - 3 CAETHG_275 Isocitrato desidrogenase (NAD + isocitrato <=> NADH + 0 0,010 FBA 3, CO2 + 2-Oxoglutarato + H+), cisteína dessulfidrase (H2O + 038 CAETHG_329 L-cisteína <=> NH3 + piruvato + H2S), fosfato 3, transacetilase (fosfato + acetil-CoA + H+ <=> CoA + CAETHG_335 acetilfosfato) 8 11 BPCY - 3 CAETHG_275 Citramalato sintase (H2O + Piruvato + Acetil-CoA <=> CoA 0 0,009 FBA 1, + Citramalato), Isocitrato desidrogenase (NAD + Isocitrato 88 CAETHG_275 <=> NADH + CO2 + 2-Oxoglutarato + H+), Fosfato 3, transacetilase (Fosfato + Acetil-CoA + H+ <=> CoA + CAETHG_335 acetilfosfato) 8 12 BPCY - 2 CAETHG_275 Isocitrato desidrogenase (NAD + Isocitrato <=> NADH + 0 0,009 FBA 3, CO2 + 2-Oxoglutarato + H+), fosfato transacetilase (fosfato 678 CAETHG_335 + acetil-CoA + H+ <=> CoA + acetilfosfato) 8 13 BPCY - 2 CAETHG_275 Isocitrato desidrogenase (NAD + Isocitrato <=> NADH + 0 0,009 FBA 3, CO2 + 2-Oxoglutarato + H+), fosfato transacetilase (fosfato 586 CAETHG_335 + acetil-CoA + H+ <=> CoA + acetilfosfato) 8 14 BPCY - 2 CAETHG_275 Citramalato sintase (H2O + Piruvato + Acetil-CoA <=> CoA 0 0,008 FBA 1, + Citramalato), ATP:acetato fosfotransferase (ATP + H+ + 686 CAETHG_335 Propionato --> ADP + fosfato de propionila) 9 15 BPCY - 2 CAETHG_275 Citramalato sintase (H2O + Piruvato + Acetil-CoA <=> CoA 0 0,008 FBA 1, + Citramalato), Fosfato transacetilase (Fosfato + Acetil-CoA 686 CAETHG_335 + H+ <=> CoA + Acetilfosfato) 8 16 BPCY - 1 CAETHG_335 ATP:acetato fosfotransferase (ATP + H+ + Propionato --> 0 0,008 FBA 9 ADP + Propionil fosfato) 474 17 BPCY - 1 CAETHG_335 Fosfato transacetilase (fosfato + acetil-CoA + H+ <=> CoA 0 0,008 FBA 8 + acetilfosfato) 474 18 BPCY - 2 CAETHG_275 Isocitrato desidrogenase (NAD + Isocitrato <=> NADH + 0 0,001 FBA 3, CO2 + 2-Oxoglutarato + H+), ATP:piruvato, ortofosfato 316 CAETHG_290 fosfotransferase (ATP + fosfato + piruvato + H+ --> PPi + 9 AMP + fosfoenolpiruvato) 19 Rendime 5 CAETHG_221 [FeFe]-hidrogenase de bifurcação de elétrons dependente de 0 0,036 nto - 0, NADP (Hyt) (NADP + ferredoxina oxidada + 2,0 H2 <=> 108 LMOMA CAETHG_222 NADPH + 3,0 H+ + ferredoxina reduzida), alfa-acetolactato 4, descarboxilase (ALCTT --> CO2 + (R)-Acetoína), 2-desoxi- CAETHG_279 D-ribose-5-fosfato acetaldeído-liase (desoxirribose-5-fosfato 8, <=> acetaldeído + gliceraldeído3-fosfato) CAETHG_293 2, CAETHG_329 9 20 Rendime 5 CAETHG_221 [FeFe]-hidrogenase de bifurcação de elétrons dependente de 0 0,035 nto - 0, NADP (Hyt) (NADP + redredoxina oxidada + 2,0 H2 <=> 997 LMOMA CAETHG_222 NADPH + 3,0 H+ + redredferredoxina), alfa-acetolactato 4, descarboxilase (ALCTT --> CO2 + (R)-Acetoína), L- CAETHG_279 arginina imino-hidrolase (H2O + L-arginina <=> NH3 + 8, citrulina) CAETHG_293 2, CAETHG_302 1
230 / 294 21 Rendime 5 CAETHG_221 dGTP trifosfo-hidrolase (H2O + dGTP --> H+ + 0 0,035 nto - 0, desoxiguanosina + trifosfato), [FeFe]- hidrogenase de 826 LMOMA CAETHG_222 bifurcação de elétrons dependente de NADP (Hyt) (NADP + 4, ferredoxina oxidada + 2,0 H2 <=> NADPH + 3,0 H+ + CAETHG_247 ferredoxina reduzida), alfa-acetolactato descarboxilase 5, (ALCTT --> CO2 + (R)-Acetoína) CAETHG_279 8, CAETHG_293 2 22 Rendime 5 CAETHG_221 [FeFe]-hidrogenase de bifurcação de elétrons dependente de 0 0,035 nto - 0, NADP (Hyt) (NADP + redredoxina oxidada + 2,0 H2 <=> 799 LMOMA CAETHG_222 NADPH + 3,0 H+ + ferredoxina reduzida), alfa-acetolactato 4, descarboxilase (ALCTT --> CO2 + (R)-Acetoína), UMP: CAETHG_279 pirofosfato fosforibosiltransferase (Uracila + PRPP --> PPi + 8, UMP) CAETHG_293 2, CAETHG_316 4 23 Rendime 4 CAETHG_221 [FeFe]-hidrogenase de bifurcação de elétrons dependente de 0 0,035 nto - 0, NADP (Hyt) (NADP + ferredoxina oxidada + 2,0 H2 <=> 754 LMOMA CAETHG_222 NADPH + 3,0 H+ + ferredoxina reduzida), alfa-acetolactato 4, descarboxilase (ALCTT --> CO2 + (R)-Acetoína) CAETHG_279 9, CAETHG_293 2 24 Rendime 4 CAETHG_221 [FeFe]-hidrogenase de bifurcação de elétrons dependente de 0 0,035 nto - 0, NADP (Hyt) (NADP + ferredoxina oxidada + 2,0 H2 <=> 754 LMOMA CAETHG_222 NADPH + 3,0 H+ + ferredoxina reduzida), alfa-acetolactato 4, descarboxilase (ALCTT --> CO2 + (R)-Acetoína) CAETHG_279 5, CAETHG_293 2 25 Rendime 4 CAETHG_221 [FeFe]-hidrogenase de bifurcação de elétrons dependente de 0 0,035 nto - 0, NADP (Hyt) (NADP + ferredoxina oxidada + 2,0 H2 <=> 754 LMOMA CAETHG_222 NADPH + 3,0 H+ + ferredoxina reduzida), alfa-acetolactato 4, descarboxilase (ALCTT --> CO2 + (R)-Acetoína) CAETHG_279 4, CAETHG_293 2 26 Rendime 4 CAETHG_221 [FeFe]-hidrogenase de bifurcação de elétrons dependente de 0 0,035 nto - 0, NADP (Hyt) (NADP + ferredoxina oxidada + 2,0 H2 <=> 754 LMOMA CAETHG_222 NADPH + 3,0 H+ + ferredoxina reduzida), alfa-acetolactato 4, descarboxilase (ALCTT --> CO2 + (R)-Acetoína) CAETHG_279 8, CAETHG_293 2 27 Rendime 4 CAETHG_221 [FeFe]-hidrogenase de bifurcação de elétrons dependente de 0 0,035 nto - 0, NADP (Hyt) (NADP + ferredoxina oxidada + 2,0 H2 <=> 748 LMOMA CAETHG_222 NADPH + 3,0 H+ + ferredoxina reduzida), alfa-acetolactato 4, descarboxilase (ALCTT --> CO2 + (R)-Acetoína) CAETHG_279 8, CAETHG_293 2
231 / 294 28 Rendime 5 CAETHG_221 Alfa-acetolactato descarboxilase (ALCTT --> CO2 + (R)- 0 0,034 nto - 0, Acetoína), 2-desoxi-D-ribose-5-fosfato acetaldeído-liase 086 LMOMA CAETHG_221 (desoxirribose-5-fosfato <=> acetaldeído + gliceraldeído3- 1, fosfato) CAETHG_222 4, CAETHG_293 2, CAETHG_329 9 29 Rendime 5 CAETHG_175 Alfa-acetolactato descarboxilase (ALCTT --> CO2 + (R)- 0 0,034 nto - 7, Acetoína), 2-desoxi-D-ribose-5-fosfato acetaldeído-liase 086 LMOMA CAETHG_221 (desoxirribose-5-fosfato <=> acetaldeído + gliceraldeído3- 0, fosfato) CAETHG_222 4, CAETHG_293 2, CAETHG_329 9 30 Rendime 5 CAETHG_221 dCMP amino-hidrolase (H2O + H+ + dCMP --> NH3 + 0 0,034 nto - 0, dUMP), alfa-acetolactato descarboxilase (ALCTT --> CO2 + 086 LMOMA CAETHG_222 (R)-Acetoína), 2-desoxi-D-ribose-5-fosfato acetaldeído-liase 4, (desoxirribose -5-fosfato <=> acetaldeído + gliceraldeído3- CAETHG_233 fosfato) 9, CAETHG_293 2, CAETHG_329 9 31 Rendime 5 CAETHG_221 Alfa-acetolactato descarboxilase (ALCTT --> CO2 + (R)- 0 0,034 nto - 0, Acetoína), 2-desoxi-D-ribose-5-fosfato acetaldeído-liase 086 LMOMA CAETHG_222 (desoxirribose-5-fosfato <=> Acetaldeído + gliceraldeído 3- 4, fosfato), transportador de arsenato (Arsenato --> CAETHG_293 Arsenato_ext) 2, CAETHG_329 9, CAETHG_398 5 32 Rendime 5 CAETHG_221 N-acetilneuraminato piruvato-liase (fosforilação de piruvato) 0 0,034 nto - 0, (H2O + Fosfoenolpiruvato + N-acetil-D-manosamina --> 086 LMOMA CAETHG_222 Fosfato + H+ + Neu5Ac), alfa-acetolactato descarboxilase 4, (ALCTT --> CO2 + (R)-Acetoína), 2-Desoxi-D-ribose-5- CAETHG_263 fosfato acetaldeído-liase (desoxirribose-5-fosfato <=> 3, Acetaldeído + Gliceraldeído3-fosfato) CAETHG_293 2, CAETHG_329 9
232 / 294 33 Rendime 6 CAETHG_221 Alfa-acetolactato descarboxilase (ALCTT --> CO2 + (R)- 0 0,034 nto - 0, Acetoína), 2-desoxi-D-ribose-5-fosfato acetaldeído-liase 086 LMOMA CAETHG_222 (desoxirribose-5-fosfato <=> Acetaldeído + gliceraldeído3- 4, fosfato), fosfato de tiazol síntese (ATP + L-tirosina + L- CAETHG_254 cisteína + 1-desoxi-D-xilulose5-fosfato --> H2O + CO2 + 8, PPi + AMP + L-alanina + 4-metil-5-2-fosfoetil-tiazol + 4- CAETHG_293 Hidroxi-álcool benzílico) 2, CAETHG_329 9, CAETHG_083 2 34 Rendime 7 CAETHG_221 Alfa-acetolactato descarboxilase (ALCTT --> CO2 + (R)- 0 0,034 nto - 0, Acetoína), 2-desoxi-D-ribose-5-fosfato acetaldeído-liase 086 LMOMA CAETHG_222 (desoxirribose-5-fosfato <=> acetaldeído + gliceraldeído3- 4, fosfato) CAETHG_293 2, CAETHG_329 9, CAETHG_385 0, CAETHG_041 7, CAETHG_046 1 35 Rendime 4 CAETHG_221 Alfa-acetolactato descarboxilase (ALCTT --> CO2 + (R)- 0 0,034 nto - 0, Acetoína), 2-desoxi-D-ribose-5-fosfato acetaldeído-liase 086 LMOMA CAETHG_222 (desoxirribose-5-fosfato <=> acetaldeído + gliceraldeído3- 4, fosfato) CAETHG_293 2, CAETHG_329 9 36 Rendime 5 CAETHG_221 Alfa-acetolactato descarboxilase (ALCTT --> CO2 + (R)- 0 0,034 nto - 0, Acetoína), 2-desoxi-D-ribose-5-fosfato acetaldeído-liase 086 LMOMA CAETHG_222 (desoxirribose-5-fosfato <=> acetaldeído + gliceraldeído3- 4, fosfato) CAETHG_261 8, CAETHG_293 2, CAETHG_329 9 37 Rendime 3 CAETHG_210 Absorção de potássio (K+_ext <=> K+), alfa-acetolactato 0 0,026 nto - 7, descarboxilase (ALCTT --> CO2 + (R)-Acetoína), L- 043 LMOMA CAETHG_293 arginina imino-hidrolase (H2O + L-arginina <=> NH3 + 2, citrulina) CAETHG_302 1 38 Rendime 2 CAETHG_293 Alfa-acetolactato descarboxilase (ALCTT --> CO2 + (R)- 0 0,025 nto - 2, Acetoína), L-arginina imino-hidrolase (H2O + L-arginina 995 LMOMA CAETHG_302 <=> NH3 + citrulina) 1 39 Rendime 2 CAETHG_210 Absorção de potássio (K+_ext <=> K+), alfa-acetolactato 0 0,024 nto - 7, descarboxilase (ALCTT --> CO2 + (R)-Acetoína) 423 LMOMA CAETHG_293 2 40 Rendime 1 CAETHG_293 Alfa-acetolactato descarboxilase (ALCTT --> CO2 + (R)- 0 0,024 nto - 2 Acetoína) 375
LMOMA
233 / 294 41 Rendime 2 CAETHG_122 L-serina amônia-liase (L-serina --> NH3 + piruvato), N- 0 0,021 nto - 5, ribosilnicotinamida:ortofosfato ribosiltransferase (fosfato + 384 LMOMA CAETHG_016 N-ribosilnicotinamida <=> Nicotinamida + ribose 1-fosfato) 0 42 Rendime 1 CAETHG_016 N-ribosilnicotinamida:ortofosfato ribosiltransferase (fosfato 0 0,021 nto - 0 + N-ribosilnicotinamida <=> nicotinamida + ribose 1- 204 LMOMA fosfato) 43 Rendime 1 CAETHG_137 Adenosina 5'-monofosfato fosfo-hidrolase (H2O + AMP <=> 0 0,021 nto - 1 Fosfato + H+ + Adenosina) 204
LMOMA 44 Rendime 1 CAETHG_127 AMP:pirofosfato fosforibosiltransferase (PPi + AMP <=> 0 0,021 nto - 0 PRPP + adenina) 204
LMOMA 45 Rendime 1 CAETHG_392 D-ribose 1,5-fosfomutase (ribose 1-fosfato <=> ribose-5- 0 0,021 nto - 4 fosfato) 204
LMOMA 46 Rendime 2 CAETHG_272 Fosfoenolpiruvato carboxiquinase (PPCK) (ATP + 0 0,021 nto - 1, oxaloacetato + H+ --> ADP + CO2 + fosfoenolpiruvato), L- 012 LMOMA CAETHG_302 arginina imino-hidrolase (H2O + L-arginina <=> NH3 + 1 citrulina) 47 Rendime 2 CAETHG_210 Absorção de potássio (K+_ext <=> K+), Fosfoenolpiruvato 0 0,020 nto - 7, carboxiquinase (PPCK) (ATP + Oxaloacetato + H+ --> ADP 931 LMOMA CAETHG_272 + CO2 + Fosfoenolpiruvato) 1 48 Rendime 1 CAETHG_272 Fosfoenolpiruvato carboxiquinase (PPCK) (ATP + 0 0,020 nto - 1 oxaloacetato + H+ --> ADP + CO2 + Fosfoenolpiruvato) 928
LMOMA 49 Rendime 2 CAETHG_247 dGTP trifosfo-hidrolase (H2O + dGTP --> H+ + 0 0,020 nto - 5, desoxiguanosina + trifosfato), L-arginina imino-hidrolase 073 LMOMA CAETHG_302 (H2O + L-arginina <=> NH3 + citrulina) 1 50 Rendime 1 CAETHG_302 L-arginina imino-hidrolase (H2O + L-arginina <=> NH3 + 0 0,020 nto - 1 citrulina) 058
LMOMA EXEMPLO 7
[0088] Esse exemplo descreve rompimentos para melhorar a produção de 1,3-butanodiol em microrganismos de Wood-Ljungdahl. Os experimentos de modelagem metabólica foram realizados como descrito no Exemplo 1. A produção de 1,3-butanodiol em microrganismos de Wood-Ljungdahl é descrita, por exemplo, no documento WO 2017/0066498. A seguinte via foi usada para modelar a produção de 1,3-butanodiol aqui: 2,0 Acetil-CoA --> CoA + Acetoacetil-CoA; NADPH + H+ + Acetoacetil-CoA --> NADP + (R)- 3-Hidroxibutiril-CoA; Fosfato + (R)-3-hidroxibutiril-CoA --> CoA + (R)-3- hidroxibutiril-fosfato; ADP + (R)-3-hidroxibutiril-fosfato --> ATP + (R)-3- hidroxibutirato; (R)-3-Hidroxibutirato + ferredoxina reduzida --> ferredoxina oxidada + (R)-3-hidroxibutirraldeído; NADPH + H+ + (R)-3- hidroxibutiraldeído --> NADP + 13BDO; NADH + H+ + (R)-3-
234 / 294 hidroxibutiraldeído --> NAD + 13BDO; 13BDO --> 13BDO_ext.
Pontuação de condicionamento Rendimento mínimo em FVA N° Genes rompidos Reações rompidas Genes rompidos Técnica físico N° 1 BPCY 4 CAETHG_275 Citramalato sintase (H2O + Piruvato + Acetil-CoA <=> 0,05315 0,005 - FBA 1, CoA + Citramalato), ATP:piruvato, fosfotransferase de 908 CAETHG_290 ortofosfato (ATP + fosfato + piruvato + H+ --> PPi + AMP 9, + Fosfoenolpiruvato), cisteína dessulfidrase (H2O + L- CAETHG_329 cisteína <=> NH3 + Piruvato + H2S), fosfato 3, transacetilase (fosfato + acetil-CoA + H+ <=> CoA + CAETHG_335 acetilfosfato) 8 2 BPCY 3 CAETHG_290 ATP:piruvato, fosfotransferase de ortofosfato (ATP + 0,05193 0,005 - FBA 9, fosfato + piruvato + H+ --> PPi + AMP + 808 CAETHG_329 fosfoenolpiruvato), cisteína dessulfidrase (H2O + L- 3, cisteína <=> NH3 + piruvato + H2S), fosfato CAETHG_335 transacetilase (fosfato + acetil-CoA + H+ <=> CoA + 8 acetilfosfato) 3 BPCY 3 CAETHG_275 Citramalato sintase (H2O + Piruvato + Acetil-CoA <=> 0,05085 0,005 - FBA 1, CoA + Citramalato), ATP:piruvato, ortofosfato 774 CAETHG_290 fosfotransferase (ATP + Fosfato + Piruvato + H+ --> PPi + 9, AMP + Fosfenenolpiruvato), fosfato-transacetilase CAETHG_335 (fosfato + Acetil-CoA + H+ <=> CoA + Acetilfosfato) 8 4 BPCY 3 CAETHG_275 Citramalato sintase (H2O + Piruvato + Acetil-CoA <=> 0,05085 0,005 - FBA 1, CoA + Citramalato), ATP:piruvato, ortofosfato 774 CAETHG_290 fosfotransferase (ATP + fosfato + piruvato + H+ --> PPi + 9, AMP + fosfoenolpiruvato), ATP:acetato fosfotransferase CAETHG_335 (ATP + H+ + Propionato --> ADP + fosfato de propionila) 9 5 BPCY 3 CAETHG_290 ATP:piruvato, ortofosfato fosfotransferase (ATP + fosfato 0,05054 0,005 - FBA 9, + piruvato + H+ --> PPi + AMP + fosfoenolpiruvato), 734 CAETHG_335 fosfato transacetilase (fosfato + acetil-CoA + H+ <=> CoA 8, + acetilfosfato), cistationina beta-liase (H2O + cistationina CAETHG_049 --> NH3 + piruvato + homocisteína) 8 6 BPCY 2 CAETHG_290 ATP:piruvato, ortofosfato fosfotransferase (ATP + fosfato 0,04960 0,005 - FBA 9, + piruvato + H+ --> PPi + AMP + fosfoenolpiruvato), 672 CAETHG_335 ATP:acetato fosfotransferase (ATP + H+ + propionato --> 9 ADP + fosfato de propionila) 7 BPCY 2 CAETHG_290 ATP:piruvato, ortofosfato fosfotransferase (ATP + fosfato 0,04960 0,005 - FBA 9, + piruvato + H+ --> PPi + AMP + fosfoenolpiruvato), 672 CAETHG_335 fosfato transacetilase (fosfato + acetil-CoA + H+ <=> CoA 8 + acetilfosfato) 8 BPCY 3 CAETHG_275 Citramalato sintase (H2O + Piruvato + Acetil-CoA <=> 0,04193 0,004 - FBA 1, CoA + Citramalato), Cisteína dessulfidrase (H2O + L- 892 CAETHG_329 cisteína <=> NH3 + Piruvato + H2S), Fosfato 3, transacetilase (fosfato + acetil-CoA + H+ <=> CoA + CAETHG_335 Acetilfosfato) 8
235 / 294 9 BPCY 2 CAETHG_329 Cisteína dessulfidrase (H2O + L-cisteína <=> NH3 + 0,04068 0,004 - FBA 3, piruvato + H2S), ATP:acetato fosfotransferase (ATP + H+ 788 CAETHG_335 + propionato --> ADP + fosfato de propionila) 9 10 BPCY 2 CAETHG_329 Cisteína dessulfidrase (H2O + L-cisteína <=> NH3 + 0,04068 0,004 - FBA 3, piruvato + H2S), fosfato transacetilase (fosfato + acetil- 788 CAETHG_335 CoA + H+ <=> CoA + acetilfosfato) 8 11 BPCY 2 CAETHG_275 Citramalato sintase (H2O + Piruvato + Acetil-CoA <=> 0,03923 0,004 - FBA 1, CoA + Citramalato), ATP:acetato fosfotransferase (ATP + 684 CAETHG_335 H+ + Propionato --> ADP + fosfato de propionila) 9 12 BPCY 2 CAETHG_275 Citramalato sintase (H2O + Piruvato + Acetil-CoA <=> 0,03923 0,004 - FBA 1, CoA + Citramalato), Fosfato transacetilase (Fosfato + 684 CAETHG_335 Acetil-CoA + H+ <=> CoA + Acetilfosfato) 8 13 BPCY 2 CAETHG_335 ATP:acetato fosfotransferase (ATP + H+ + propionato --> 0,03904 0,004 - FBA 9, ADP + fosfato de propionila), beta-liase de cistationina 667 CAETHG_049 (H2O + cistationina --> NH3 + piruvato + homocisteína) 8 14 BPCY 2 CAETHG_335 Fosfato transacetilase (fosfato + acetil-CoA + H+ <=> 0,03904 0,004 - FBA 8, CoA + acetilfosfato), beta-liase de cistationina (H2O + 667 CAETHG_049 cistationina --> NH3 + piruvato + homocisteína) 8 15 BPCY 1 CAETHG_335 ATP:acetato fosfotransferase (ATP + H+ + Propionato --> 0,03795 0,004 - FBA 9 ADP + Propionil fosfato) 575 16 BPCY 1 CAETHG_335 Fosfato transacetilase (fosfato + acetil-CoA + H+ <=> 0,03795 0,004 - FBA 8 CoA + acetilfosfato) 575 EXEMPLO 8
[0089] Esse exemplo descreve rompimentos para melhorar a produção de 2,3-butanodiol em microrganismos de Wood-Ljungdahl. Os experimentos de modelagem metabólica foram realizados como descrito no Exemplo 1. O 2,3-butanodiol é um produto nativo de pelo menos alguns microrganismos de Wood-Ljungdahl. Pontuação de condicionamento Rendimento mínimo em FVA N° Genes rompidos Reações rompidas Genes rompidos Técnica físico N°
236 / 294 1 Rendime 5 CAETHG_114 Lactato desidrogenase (NAD + D-lactato <=> NADH + 0,033681 0,049 nto - 7, piruvato + H+), isocitrato desidrogenase (NAD + 774 LMOMA CAETHG_275 isocitrato <=> NADH + CO2 + 2-Oxoglutarato + H+), 3, ATP:acetato fosfotransferase (ATP + H+ + propionato - CAETHG_335 -> ADP + fosfato de propionila), 2,6-diamino- 9, heptanodioato:2-oxoglutarato aminotransferase (H2O + CAETHG_351 L-glutamato + H+ + tetra-hidrodipicolinato <-- 2- 0, oxoglutarato + LL-2,6-diaminopimelato), CAETHG_090 prefenato:NAD+ oxidorredutase (descarboxilado) 9 (NAD + Prefenato --> NADH + CO2 + p- hidroxifenilpiruvato) 2 Rendime 4 CAETHG_114 Lactato desidrogenase (NAD + D-lactato <=> NADH + 0,033681 0,049 nto - 7, piruvato + H+), isocitrato desidrogenase (NAD + 768 LMOMA CAETHG_275 isocitrato <=> NADH + CO2 + 2-Oxoglutarato + H+), 3, ATP:acetato fosfotransferase (ATP + H+ + propionato - CAETHG_335 -> ADP + fosfato de propionila), 2,6-diamino- 9, heptanodioato:2-oxoglutarato aminotransferase (H2O + CAETHG_351 L-glutamato + H+ + tetra-hidrodipicolinato <-- 2- 0 oxoglutarato + LL-2,6-Diaminopimelato) 3 Rendime 4 CAETHG_024 Transporte reversível de L-lactato via simporte de 0,033681 0,049 nto - 8, prótons (H+_ext + L-Lactato_ext <=> H+ + L-lactato), 768 LMOMA CAETHG_275 Isocitrato desidrogenase (NAD + Isocitrato <=> 3, NADH + CO2 + 2-Oxoglutarato + H+), ATP:acetato CAETHG_335 fosfotransferase (ATP + H+ + Propionato --> ADP + 9, fosfato de propionila), 2,6-Diamino-heptanodioato:2- CAETHG_351 oxoglutarato aminotransferase (H2O + L-glutamato + 0 H+ + tetra-hidrodipicolinato <-- 2-Oxoglutarato + LL- 2,6-Diaminopimelato) 4 Rendime 3 CAETHG_024 Transporte reversível de L-lactato via simporte de 0,03068 0,048 nto - 8, prótons (H+_ext + L-Lactato_ext <=> H+ + L-lactato), 84 LMOMA CAETHG_335 ATP:acetato fosfotransferase (ATP + H+ + propionato - 9, -> ADP + fosfato de propionila), 2,6-Diamino- CAETHG_351 heptanodioato:2-oxoglutarato aminotransferase (H2O + 0 L-glutamato + H+ + tetra-hidrodipicolinato <-- 2- Oxoglutarato + LL-2,6-Diaminopimelato) 5 Rendime 4 CAETHG_024 Transporte reversível de L-lactato via simporte de 0 0,026 nto - 8, prótons (H+_ext + L-Lactato_ext <=> H+ + L-lactato), 026 LMOMA CAETHG_272 Fosfoenolpiruvato carboxiquinase (PPCK) (ATP + 1, Oxaloacetato + H+ --> ADP + CO2 + CAETHG_332 Fosfoenolpiruvato), transportador de fosfato ABC 7, proteína de permease (PPi + H+ --> PPi_ext + H+ CAETHG_335 _ext), ATP:acetato fosfotransferase (ATP + H+ + 9 propionato --> ADP + fosfato de propionila) 6 Rendime 4 CAETHG_024 Transporte reversível de L-lactato via simporte de 0 0,025 nto - 8, prótons (H+_ext + L-Lactato_ext <=> H+ + L-lactato), 53 LMOMA CAETHG_335 ATP:acetato fosfotransferase (ATP + H+ + propionato - 9, -> ADP + fosfato de propionila), D-ribose 1, 5- CAETHG_392 fosfomutase (ribose 1-fosfato <=> ribose-5-fosfato), S- 4, aminometildi-hidrolipoloilproteína: (6S)-tetra- CAETHG_047 hidrofolato (tetra-hidrofolato + S-aminometildi- 6 hidrolipoilproteína <=> NH3 + 5-10-metilenotetra- hidrofolaato + di-hidrolipoilproteína) 7 Rendime 4 CAETHG_024 Transporte reversível de L-lactato via simporte de 0 0,025 nto - 8, prótons (H+_ext + L-Lactato_ext <=> H+ + L-lactato), 53 LMOMA CAETHG_335 ATP:acetato fosfotransferase (ATP + H+ + propionato - 9, -> ADP + fosfato de propionila), D-ribose 1, 5- CAETHG_392 fosfomutase (ribose 1-fosfato <=> ribose-5-fosfato), S- 4, aminometildi-hidrolipoloilproteína: (6S)-tetra- CAETHG_047 hidrofolato (tetra-hidrofolato + S-aminometildi- 5 hidrolipoilproteína <=> NH3 + 5-10-metilenotetra- hidrofolaato + di-hidrolipoilproteína)
237 / 294 8 Rendime 4 CAETHG_024 Transporte reversível de L-lactato via simporte de 0 0,025 nto - 8, prótons (H+_ext + L-Lactato_ext <=> H+ + L-lactato), 53 LMOMA CAETHG_335 ATP:acetato fosfotransferase (ATP + H+ + propionato - 9, -> ADP + fosfato de propionila), D-ribose 1, 5- CAETHG_392 fosfomutase (ribose 1-fosfato <=> ribose-5-fosfato), 4, glicina: lipoilproteína oxidorredutase (descarboxilação CAETHG_047 e aminometilação do aceitador) (glicina + H+ + 4 lipoilproteína --> CO2 + S-aminometildi- hidrolipoilproteína) 9 Rendime 4 CAETHG_127 AMP:pirofosfato fosforibosiltransferase (PPi + AMP 0 0,025 nto - 0, <=> PRPP + Adenina), transporte reversível de L- 452 LMOMA CAETHG_024 lactato via simporte de prótons (H+_ext + L-lactato_ext 8, <=> H+ + L-lactato), Isocitrato desidrogenase (NAD + CAETHG_275 Isocitrato <=> NADH + CO2 + 2-Oxoglutarato + H+), 3, ATP:acetato fosfotransferase (ATP + H+ + propionato - CAETHG_335 -> ADP + fosfato de propionila) 9 10 Rendime 4 CAETHG_024 Transporte reversível de L-lactato via simporte de 0 0,025 nto - 8, prótons (H+_ext + L-Lactato_ext <=> H+ + L-lactato), 452 LMOMA CAETHG_275 Isocitrato desidrogenase (NAD + Isocitrato <=> 3, NADH + CO2 + 2-Oxoglutarato + H+), ATP:acetato CAETHG_335 fosfotransferase (ATP + H+ + Propionato --> ADP + 9, fosfato de propionila), D-ribose 1,5-fosfomutase CAETHG_392 (ribose 1-fosfato <=> ribose-5-fosfato) 4 11 Rendime 4 CAETHG_024 Transporte reversível de L-lactato via simporte de 0 0,025 nto - 8, prótons (H+_ext + L-Lactato_ext <=> H+ + L-lactato), 422 LMOMA CAETHG_335 ATP:acetato fosfotransferase (ATP + H+ + propionato - 9, -> ADP + fosfato de propionila), D-ribose 1, 5- CAETHG_392 fosfomutase (ribose 1-fosfato <=> ribose-5-fosfato), 4, cistationina beta sintase (L-serina + homocisteína <=> CAETHG_049 H2O + cistationina) 8 12 Rendime 3 CAETHG_137 5'-nucleotidase (dUMP) (H2O + dUMP --> fosfato + 0 0,025 nto - 1, H+ + desoxiuridina), transporte reversível de L-lactato 412 LMOMA CAETHG_024 via simporte de prótons (H+_ext + L-lactato_ext <=> 8, H+ + L-lactato), ATP:acetato fosfotransferase (ATP + CAETHG_335 H+ + Propionato --> ADP + fosfato de propionila) 9 13 Rendime 3 CAETHG_114 Lactato desidrogenase (NAD + D-lactato <=> NADH + 0 0,025 nto - 7, piruvato + H+), ATP:acetato fosfotransferase (ATP + 412 LMOMA CAETHG_335 H+ + propionato --> ADP + fosfato de propionila), D- 9, ribose 1,5-fosfomutase (ribose 1-fosfato <=> ribose-5- CAETHG_392 fosfato) 4 14 Rendime 3 CAETHG_016 Transporte reversível de L-lactato via simporte de 0 0,025 nto - 0, prótons (H+_ext + L-Lactato_ext <=> H+ + L-lactato), 412 LMOMA CAETHG_024 ATP:acetato fosfotransferase (ATP + H+ + propionato - 8, -> ADP + fosfato de propionila) CAETHG_335 9 15 Rendime 3 CAETHG_024 Transporte reversível de L-lactato via simporte de 0 0,025 nto - 8, prótons (H+_ext + L-Lactato_ext <=> H+ + L-lactato), 412 LMOMA CAETHG_335 ATP:acetato fosfotransferase (ATP + H+ + propionato - 9, -> ADP + fosfato de propionila), D-ribose 1, 5- CAETHG_392 fosfomutase (ribose 1-fosfato <=> ribose-5-fosfato) 4
238 / 294 16 Rendime 3 CAETHG_024 Transporte reversível de L-lactato via simporte de 0 0,025 nto - 8, prótons (H+_ext + L-Lactato_ext <=> H+ + L-lactato), 17 LMOMA CAETHG_272 Fosfoenolpiruvato carboxiquinase (PPCK) (ATP + 1, Oxaloacetato + H+ --> ADP + CO2 + CAETHG_335 Fosfoenolpiruvato), ATP:acetato fosfotransferase (ATP 9 + H+ + Propionato --> ADP + fosfato de propionila) 17 Rendime 3 CAETHG_114 Lactato desidrogenase (NAD + D-lactato <=> NADH + 0 0,024 nto - 7, piruvato + H+), isocitrato desidrogenase (NAD + 914 LMOMA CAETHG_275 isocitrato <=> NADH + CO2 + 2-Oxoglutarato + H+), 3, ATP:acetato fosfotransferase (ATP + H+ + propionato - CAETHG_335 -> ADP + fosfato de propionila) 9 18 Rendime 3 CAETHG_024 Transporte reversível de L-lactato via simporte de 0 0,024 nto - 8, prótons (H+_ext + L-Lactato_ext <=> H+ + L-lactato), 914 LMOMA CAETHG_275 Isocitrato desidrogenase (NAD + Isocitrato <=> 3, NADH + CO2 + 2-Oxoglutarato + H+), ATP:acetato CAETHG_335 fosfotransferase (ATP + H+ + Propionato --> ADP + 9 fosfato de propionila) 19 Rendime 3 CAETHG_024 Transporte reversível de L-lactato via simporte de 0 0,024 nto - 8, prótons (H+_ext + L-Lactato_ext <=> H+ + L- 9 LMOMA CAETHG_329 Lactato), 2-Desoxi-D-ribose-5-fosfato acetaldeído-liase 9, (desoxirribose-5-fosfato <=> Acetaldeído + CAETHG_335 Gliceraldeído3-fosfato), ATP:acetato fosfotransferase 9 (ATP + H+ + Propionato --> ADP + fosfato de propionila) 20 Rendime 4 CAETHG_024 Transporte reversível de L-lactato via simporte de 0 0,024 nto - 8, prótons (H+_ext + L-Lactato_ext <=> H+ + L-lactato), 9 LMOMA CAETHG_247 dGTP trifosfo-hidrolase (H2O + dGTP --> H+ + 5, Desoxiguanosina + Trifosfato), UMP: pirofosfato CAETHG_316 fosforibosiltransferase (Uracil + PRP --> PPi + UMP), 4, ATP:acetato fosfotransferase (ATP + H+ + propionato - CAETHG_335 -> ADP + fosfato de propionila) 9 21 Rendime 3 CAETHG_024 Transporte reversível de L-lactato via simporte de 0 0,024 nto - 8, prótons (H+_ext + L-Lactato_ext <=> H+ + L-lactato), 882 LMOMA CAETHG_247 dGTP trifosfo-hidrolase (H2O + dGTP --> H+ + 5, Desoxiguanosina + Trifosfato), ATP:acetato CAETHG_335 fosfotransferase (ATP + H+ + Propionato --> ADP + 9 fosfato de propionila) 22 Rendime 3 CAETHG_160 S-aminometildi-hidrolipoliproteína: (6S)-tetra- 0 0,024 nto - 7, hidrofolato (tetra-hidrofolato + S-aminometildi- 808 LMOMA CAETHG_024 hidrolipoilproteína <=> NH3 + 5-10-metilenotetra- 8, hidrofolato + Di-hidrolipolproteína), transporte CAETHG_335 reversível de L-lactato via simporte de prótons (H+_ext 9 + L-lactato_ext <=> H+ + L-lactato), ATP:acetato fosfotransferase (ATP + H+ + propionato --> ADP + fosfato de propionila) 23 Rendime 3 CAETHG_024 Transporte reversível de L-lactato via simporte de 0 0,024 nto - 8, prótons (H+_ext + L-Lactato_ext <=> H+ + L-lactato), 808 LMOMA CAETHG_335 ATP:acetato fosfotransferase (ATP + H+ + propionato - 9, -> ADP + fosfato de propionila), S-aminometildi- CAETHG_047 hidrolipoilproteína:(6S)-tetra-hidrofolato (tetra- 5 hidrofolato + S-aminometildi-hidrolipoilproteína <=> NH3 + 5-10-metilenotetra-hidrofolato + di- hidrolipoilproteína)
239 / 294 24 Rendime 3 CAETHG_024 Transporte reversível de L-lactato via simporte de 0 0,024 nto - 8, prótons (H+_ext + L-Lactato_ext <=> H+ + L-lactato), 808 LMOMA CAETHG_335 ATP:acetato fosfotransferase (ATP + H+ + propionato - 9, -> ADP + fosfato de propionila), Glicina: lipoilproteína CAETHG_047 oxidorredutase (descarboxilação e aceitação- 4 aminometilação) (Glicina + H+ + Lipoilproteína --> CO2 + S-aminometildi-hidrolipoilproteína) 25 Rendime 3 CAETHG_024 Transporte reversível de L-lactato via simporte de 0 0,024 nto - 8, prótons (H+_ext + L-Lactato_ext <=> H+ + L-lactato), 802 LMOMA CAETHG_332 proteína de permease transportadora ABC de fosfato 7, (PPi + H+ --> PPi_ext + H+ _ext), ATP:acetato CAETHG_335 fosfotransferase (ATP + H+ + Propionato --> ADP + 9 fosfato de propionila) 26 Rendime 3 CAETHG_024 Transporte reversível de L-lactato via simporte de 0 0,024 nto - 8, prótons (H+_ext + L-Lactato_ext <=> H+ + L-lactato), 788 LMOMA CAETHG_335 ATP:acetato fosfotransferase (ATP + H+ + propionato - 9, -> ADP + fosfato de propionila), Glicina: lipoilproteína CAETHG_047 oxidorredutase (descarboxilação e aceitação- 3 aminometilação) (Glicina + H+ + Lipoilproteína --> CO2 + S-aminometildi-hidrolipoilproteína) 27 Rendime 3 CAETHG_114 Lactato desidrogenase (NAD + D-lactato <=> NADH + 0 0,024 nto - 7, piruvato + H+), ATP:acetato de fosfotransferase (ATP + 756 LMOMA CAETHG_335 H+ + propionato --> ADP + fosfato de propionila), 9, cistationina beta sintase (L-serina + homocisteína <=> CAETHG_049 H2O + Cistationina) 8 28 Rendime 3 CAETHG_024 Transporte reversível de L-lactato via simporte de 0 0,024 nto - 8, prótons (H+_ext + L-Lactato_ext <=> H+ + L-lactato), 426 LMOMA CAETHG_316 UMP: pirofosfato fosforibosiltransferase (Uracil + 4, PRPP --> PPi + UMP), ATP:acetato fosfotransferase CAETHG_335 (ATP + H+ + Propionato --> ADP + fosfato de 9 propionila) 29 Rendime 2 CAETHG_114 Lactato desidrogenase (NAD + D-lactato <=> NADH + 0 0,024 nto - 7, piruvato + H+), ATP:acetato fosfotransferase (ATP + 408 LMOMA CAETHG_335 H+ + propionato --> ADP + fosfato de propionila) 9 30 Rendime 2 CAETHG_024 Transporte reversível de L-lactato via simporte de 0 0,024 nto - 8, prótons (H+_ext + L-Lactato_ext <=> H+ + L-lactato), 408 LMOMA CAETHG_335 ATP:acetato fosfotransferase (ATP + H+ + propionato - 9 -> ADP + fosfato de propionila) 31 Rendime 4 CAETHG_016 Transporte reversível de L-lactato via simporte de 0 0,013 nto - 0, prótons (H+_ext + L-Lactato_ext <=> H+ + L-lactato), 792 LMOMA CAETHG_024 Isocitrato desidrogenase (NAD + Isocitrato <=> 8, NADH + CO2 + 2-Oxoglutarato + H+), proteína CAETHG_275 permease de transportador de fosfato ABC (PPi + H+ -- 3, > PPi_ext + H+ _ext) CAETHG_332 7 32 Rendime 4 CAETHG_024 Transporte reversível de L-lactato via simporte de 0 0,013 nto - 8, prótons (H+_ext + L-Lactato_ext <=> H+ + L-lactato), 792 LMOMA CAETHG_275 Isocitrato desidrogenase (NAD + Isocitrato <=> 3, NADH + CO2 + 2-Oxoglutarato + H+), permeação de CAETHG_332 transportador de fosfato ABC proteína (PPi + H+ --> 7, PPi_ext + H+ _ext), D-ribose 1,5-fosfomutase (ribose CAETHG_392 1-fosfato <=> ribose-5-fosfato) 4
240 / 294 33 Rendime 4 CAETHG_127 AMP:pirofosfato fosforibosiltransferase (PPi + AMP 0 0,013 nto - 0, <=> PRPP + Adenina), transporte reversível de L- 792 LMOMA CAETHG_024 lactato via simporte de prótons (H+_ext + L-lactato_ext 8, <=> H+ + L-lactato), Isocitrato desidrogenase (NAD + CAETHG_275 Isocitrato <=> NADH + CO2 + 2-Oxoglutarato + H+), 3, proteína permease de transportador de fosfato ABC CAETHG_332 (PPi + H+ --> PPi_ext + H+ _ext) 7 34 Rendime 4 CAETHG_275 Isocitrato desidrogenase (NAD + Isocitrato <=> 0 0,013 nto - 3, NADH + CO2 + 2-Oxoglutarato + H+), ATP:acetato 708 LMOMA CAETHG_335 fosfotransferase (ATP + H+ + propionato --> ADP + 9, fosfato de propionila), D-ribose 1,5-fosfomutase CAETHG_392 (ribose 1-fosfato <=> ribose-5-fosfato), cistationina 4, beta sintase (L-serina + homocisteína <=> H2O + CAETHG_049 cistationina) 8 35 Rendime 3 CAETHG_275 Isocitrato desidrogenase (NAD + Isocitrato <=> 0 0,013 nto - 3, NADH + CO2 + 2-Oxoglutarato + H+), ATP:acetato 7 LMOMA CAETHG_335 fosfotransferase (ATP + H+ + propionato --> ADP + 9, fosfato de propionila), D-ribose 1,5-fosfomutase CAETHG_392 (ribose 1-fosfato <=> ribose-5-fosfato) 4 36 Rendime 3 CAETHG_127 AMP:pirofosfato fosforibosiltransferase (PPi + AMP 0 0,013 nto - 0, <=> PRPP + Adenina), isocitrato desidrogenase (NAD 7 LMOMA CAETHG_275 + isocitrato <=> NADH + CO2 + 2-oxoglutarato + 3, H+), ATP:acetato fosfotransferase (ATP + H+ CAETHG_335 propionato --> ADP + Fosfato de propionila) 9 37 Rendime 3 0, Acetil-CoA:dióxido de carbono ligase (formadora de 0 0,013 nto - CAETHG_275 ADP) (ATP + acetil-CoA + H2CO3 --> ADP + fosfato 628 LMOMA 3, + H+ + malonil-CoA), isocitrato desidrogenase (NAD CAETHG_335 + isocitrato <=> NADH + CO2 + 2- Oxoglutarato + 9 H+), ATP:acetato fosfotransferase (ATP + H+ + Propionato --> ADP + fosfato de propionila) 38 Rendime 2 CAETHG_335 ATP:acetato fosfotransferase (ATP + H+ + propionato - 0,03068 0,013 nto - 9, -> ADP + fosfato de propionila), 2,6-diamino- 564 LMOMA CAETHG_351 heptanodioato:2-oxoglutarato aminotransferase (H2O + 0 L-glutamato + H+ + tetra-hidrodipicolinato <-- 2- oxoglutarato + LL-2,6-Diaminopimelato) 39 Rendime 2 CAETHG_272 Fosfoenolpiruvato carboxiquinase (PPCK) (ATP + 0 0,013 nto - 1, oxaloacetato + H+ --> ADP + CO2 + 53 LMOMA CAETHG_335 fosfoenolpiruvato), ATP:acetato fosfotransferase (ATP 9 + H+ + propionato --> ADP + propionil fosfato) 40 Rendime 2 CAETHG_275 Isocitrato desidrogenase (NAD + Isocitrato <=> 0 0,013 nto - 3, NADH + CO2 + 2-Oxoglutarato + H+), ATP:acetato 514 LMOMA CAETHG_335 fosfotransferase (ATP + H+ + Propionato --> ADP + 9 fosfato de propionila) 41 Rendime 2 CAETHG_024 Transporte reversível de L-lactato via simporte de 0 0,011 nto - 8, prótons (H+_ext + L-Lactato_ext <=> H+ + L-lactato), 978 LMOMA CAETHG_275 Isocitrato desidrogenase (NAD + Isocitrato <=> 3 NADH + CO2 + 2-Oxoglutarato + H+) 42 Rendime 2 CAETHG_275 Isocitrato desidrogenase (NAD + Isocitrato <=> 0 0,011 nto - 3, NADH + CO2 + 2-Oxoglutarato + H+), D-Ribose 1,5- 892 LMOMA CAETHG_392 fosfomutase (Ribose 1-fosfato <=> ribose-5-fosfato) 4 43 Rendime 2 CAETHG_016 Isocitrato desidrogenase (NAD + Isocitrato <=> 0 0,011 nto - 0, NADH + CO2 + 2-Oxoglutarato + H+) 892 LMOMA CAETHG_275 3
241 / 294 44 Rendime 2 CAETHG_275 Isocitrato desidrogenase (NAD + Isocitrato <=> 0 0,011 nto - 3, NADH + CO2 + 2-Oxoglutarato + H+), Cistationina 848 LMOMA CAETHG_049 beta sintase (L-serina + homocisteína <=> H2O + 8 Cistationina) 45 Rendime 2 CAETHG_275 Isocitrato desidrogenase (NAD + Isocitrato <=> 0 0,011 nto - 3, NADH + CO2 + 2-Oxoglutarato + H+), proteína da 84 LMOMA CAETHG_332 permease transportadora de fosfato ABC (PPi + H+ --> 7 PPi_ext + H+ _ext) 46 Rendime 2 CAETHG_272 Fosfoenolpiruvato carboxiquinase (PPCK) (ATP + 0 0,011 nto - 1, oxaloacetato + H+ --> ADP + CO2 + 832 LMOMA CAETHG_275 Fosfoenolpiruvato), isocitrato desidrogenase (NAD + 3 isocitrato <=> NADH + CO2 + 2-oxoglutarato + H+) 47 Rendime 1 CAETHG_275 Isocitrato desidrogenase (NAD + Isocitrato <=> 0 0,011 nto - 3 NADH + CO2 + 2-Oxoglutarato + H+) 772
LMOMA EXEMPLO 9
[0090] Esse exemplo descreve rompimentos para melhorar a produção de 2-butanol nos microrganismos de Wood-Ljungdahl. Os experimentos de modelagem metabólica foram realizados como descrito no Exemplo 1. A produção de 2-butanol em microrganismos de Wood-Ljungdahl é descrita, por exemplo, no documento WO 2013/185123. A seguinte via foi usada para modelar a produção de 2-butanol aqui: NADH + H+ + (R)-Acetoína --> NAD + meso-2,3-butanodiol; meso-2,3-butanodiol --> H2O + MEK; MEK + NADPH + H+ --> 2-butanol + NADP; 2-butanol --> 2-butanol_ext.
Pontuação de condicionamento Rendimento mínimo em FVA N° Genes rompidos Reações rompidas Genes rompidos Técnica físico N° 1 Rendime 4 CAETHG_272 Fosfoenolpiruvato carboxiquinase (PPCK) (ATP + 0 0,020 nto - 1, oxaloacetato + H+ --> ADP + CO2 + 756 LMOMA CAETHG_392 Fosfoenolpiruvato), D-ribose 1,5-fosfomutase (ribose 4, 1-fosfato <=> ribose-5-fosfato), beta-cistationina beta- CAETHG_049 liase (H2O + Cistationina --> NH3 + Piruvato + 8, Homocisteína), L-treonina acetaldeído-liase (L- CAETHG_068 treonina --> glicina + acetaldeído) 6
242 / 294 2 Rendime 4 CAETHG_137 Adenosina 5'-monofosfato fosfo-hidrolase (H2O + 0 0,020 nto - 1, AMP <=> Fosfato + H+ + Adenosina), 756 LMOMA CAETHG_272 Fosfoenolpiruvato carboxiquinase (PPCK) (ATP + 1, oxaloacetato + H+ --> ADP + CO2 + CAETHG_049 Fosfoenolpiruvato), cistationina beta liase (H2O + 8, cistationina --> NH3 + Piruvato + Homocisteína), L- CAETHG_068 treonina acetaldeído-liase (L-treonina --> glicina + 6 acetaldeído) 3 Rendime 4 CAETHG_127 AMP:pirofosfato fosforibosiltransferase (PPi + AMP 0 0,020 nto - 0, <=> PRPP + Adenina), fosfoenolpiruvato 756 LMOMA CAETHG_272 carboxiquinase (PPCK) (ATP + oxaloacetato + H+ --> 1, ADP + CO2 + fosfoenolpiruvato), cistationina beta- CAETHG_049 liase (H2O + cistationina --> NH3 + piruvato + 8, Homocisteína), L-treonina acetaldeído-liase (L- CAETHG_068 treonina --> glicina + acetaldeído) 6 4 Rendime 4 CAETHG_137 Adenosina 5'-monofosfato fosfo-hidrolase (H2O + 0 0,020 nto - 1, AMP <=> Fosfato + H+ + Adenosina), 64 LMOMA CAETHG_272 Fosfoenolpiruvato carboxiquinase (PPCK) (ATP + 1, oxaloacetato + H+ --> ADP + CO2 + CAETHG_329 Fosfoenolpiruvato), cisteína dessulfidridase (H2O + L- 3, Cisteína <=> NH3 + Piruvato + H2S), L-treonina CAETHG_068 acetaldeído-liase (L-treonina --> glicina + acetaldeído) 6 5 Rendime 4 CAETHG_127 AMP:pirofosfato fosforibosiltransferase (PPi + AMP 0 0,020 nto - 0, <=> PRPP + Adenina), Fosfoenolpiruvato 64 LMOMA CAETHG_272 carboxiquinase (PPCK) (ATP + oxaloacetato + H+ --> 1, ADP + CO2 + Fosfoenolpiruvato), cisteína CAETHG_329 dessulfidrase (H2O + L-Cisteína <=> NH3 + Piruvato 3, + H2S), L-treonina acetaldeído-liase (L-treonina --> CAETHG_068 glicina + acetaldeído) 6 6 Rendime 4 CAETHG_137 Adenosina 5'-monofosfato fosfo-hidrolase (H2O + 0 0,020 nto - 1, AMP <=> fosfato + H+ + adenosina), 476 LMOMA CAETHG_272 fosfoenolpiruvato carboxiquinase (PPCK) (ATP + 1, oxaloacetato + H+ --> ADP + CO2 + CAETHG_302 fosfoenolpiruvato), L-arginina iminoidrolase (H2O + 1, L-Arginina <=> NH3 + Citrulina), L-treonina CAETHG_068 acetaldeído-liase (L-treonina --> glicina + acetaldeído) 6 7 Rendime 4 CAETHG_272 Fosfoenolpiruvato carboxiquinase (PPCK) (ATP + 0 0,020 nto - 1, oxaloacetato + H+ --> ADP + CO2 + 476 LMOMA CAETHG_302 fosfoenolpiruvato), L-arginina imino-hidrolase (H2O + 1, L-arginina <=> NH3 + citrulina), D-ribose 1,5- CAETHG_392 fosfomutase (ribose 1-fosfato <=> ribose-5-fosfato), L- 4, treonina acetaldeído-liase (L-treonina --> glicina + CAETHG_068 acetaldeído) 6 8 Rendime 3 CAETHG_137 Adenosina 5'-monofosfato fosfo-hidrolase (H2O + 0 0,020 nto - 1, AMP <=> fosfato + H+ + adenosina), 468 LMOMA CAETHG_272 fosfoenolpiruvato carboxiquinase (PPCK) (ATP + 1, oxaloacetato + H+ --> ADP + CO2 + CAETHG_068 fosfoenolpiruvato), L-treonina acetaldeído liase (L- 6 Treonina --> Glicina + Acetaldeído) 9 Rendime 3 CAETHG_127 AMP:pirofosfato fosforibosiltransferase (PPi + AMP 0 0,020 nto - 0, <=> PRPP + Adenina), Fosfoenolpiruvato 468 LMOMA CAETHG_272 carboxiquinase (PPCK) (ATP + Oxaloacetato + H+ --> 1, ADP + CO2 + Fosfoenolpiruvato), L-Treonina- CAETHG_068 acetaldeído-liase (L-treonina-acetaldeído --> Glicina + 6 Acetaldeído)
243 / 294 10 Rendime 3 CAETHG_272 Fosfoenolpiruvato carboxiquinase (PPCK) (ATP + 0 0,020 nto - 1, oxaloacetato + H+ --> ADP + CO2 + 468 LMOMA CAETHG_392 fosfoenolpiruvato), D-ribose 1,5-fosfomutase (ribose 1- 4, fosfato <=> ribose-5-fosfato), L-treonina acetaldeído- CAETHG_068 liase (L-treonina --> glicina + acetaldeído) 6 11 Rendime 4 CAETHG_272 Fosfoenolpiruvato carboxiquinase (PPCK) (ATP + 0 0,020 nto - 1, oxaloacetato + H+ --> ADP + CO2 + 756 LMOMA CAETHG_392 Fosfoenolpiruvato), D-ribose 1,5-fosfomutase (ribose 4, 1-fosfato <=> ribose-5-fosfato), beta-cistationina beta- CAETHG_049 liase (H2O + Cistationina --> NH3 + Piruvato + 8, Homocisteína), L-treonina acetaldeído-liase (L- CAETHG_068 treonina --> glicina + acetaldeído) 6 EXEMPLO 10
[0091] Esse exemplo descreve rompimentos para melhorar a produção de ácido 2-hidroxi-isobutírico em microrganismos de Wood-Ljungdahl. Os experimentos de modelagem metabólica foram realizados como descrito no Exemplo 1. A produção de ácido 2-hidroxi-isobutírico em microrganismos de Wood-Ljungdahl é descrita, por exemplo, no documento WO 2017/0066498.
[0092] A via a seguir foi usada para modelar a produção de ácido 2- hidroxi-isobutírico nas linhas 1-40 abaixo: 2,0 Acetil-CoA --> CoA + Acetoacetil-CoA; NADH + H+ + Acetoacetil-CoA --> NAD + (S)-3- Hidroxibutiril-CoA; (S)-3-hidroxibutiril-CoA --> 2HIB-CoA; 2HIB-CoA + H2O --> 2hib + CoA; 2hib --> 2hib_ext.
[0093] A via a seguir foi usada para modelar a produção de ácido 2- hidroxi-isobutírico nas linhas 41-93 abaixo: 2,0 Acetil-CoA --> CoA + Acetoacetil-CoA; NADH + H+ + Acetoacetil-CoA --> NAD + (S)-3- Hidroxibutiril-CoA; (S)-3-hidroxibutiril-CoA --> 2HIB-CoA; 2HIB-CoA + ADP + Fosfato --> 2hib + ATP + CoA; 2hib --> 2hib_ext.
[0094] A via a seguir foi usada para modelar a produção de ácido 2- hidroxi-isobutírico nas linhas 94-103 abaixo: 2,0 Acetil-CoA --> CoA + Acetoacetil-CoA; NADH + H+ + Acetoacetil-CoA --> NAD + (S)-3- Hidroxibutiril-CoA; (S)-3-hidroxibutiril-CoA --> 2HIB-CoA; 2HIB-CoA + acetato --> 2hib + acetil-CoA; 2hib --> 2hib_ext.
244 / 294
Pontuação de condicionamento Rendimento mínimo em FVA N° Genes rompidos
Reações rompidas Genes rompidos Técnica físico N°
1 Rendime 4 CAETHG_272 Fosfoenolpiruvato carboxiquinase (PPCK) (ATP + 0 0,074 nto - 1, oxaloacetato + H+ --> ADP + CO2 + 552 LMOMA CAETHG_293 Fosfoenolpiruvato), alfa-acetolactato descarboxilase 2, (ALCTT --> CO2 + (R)-Acetoína), ATP:acetato CAETHG_335 fosfotransferase (ATP + H+ + propionato --> ADP + 9, fosfato de propionila), beta-liase de cistationina CAETHG_049 (H2O + cistationina --> NH3 + piruvato + 8 homocisteína) 2 Rendime 4 CAETHG_272 Fosfoenolpiruvato carboxiquinase (PPCK) (ATP + 0 0,074 nto - 1, oxaloacetato + H+ --> ADP + CO2 + 552 LMOMA CAETHG_293 Fosfoenolpiruvato), alfa-acetolactato descarboxilase 2, (ALCTT --> CO2 + (R)-Acetoína), fosfato CAETHG_335 transacetilase (fosfato + acetil-CoA + H+ <=> CoA 8, + acetilfosfato), beta-liase de cistationina (H2O + CAETHG_049 cistationina --> NH3 + piruvato + homocisteína) 8 3 Rendime 3 CAETHG_272 Fosfoenolpiruvato carboxiquinase (PPCK) (ATP + 0 0,071 nto - 1, oxaloacetato + H+ --> ADP + CO2 + 296 LMOMA CAETHG_293 Fosfoenolpiruvato), alfa-acetolactato descarboxilase 2, (ALCTT --> CO2 + (R)-Acetoína), fosfato CAETHG_335 transacetilase (fosfato + acetil-CoA + H+ <=> CoA 8 + acetilfosfato) 4 Rendime 4 CAETHG_016 N-ribosilnicotinamida:ortofosfato ribosiltransferase 0 0,057 nto - 0, (fosfato + N-ribosilnicotinamida <=> nicotinamida 76 LMOMA CAETHG_293 + ribose 1-fosfato), alfa-acetolactato descarboxilase 2, (ALCTT --> CO2 + (R)-Acetoína), fosfato CAETHG_335 transacetilase (fosfato + acetil-CoA + H+ <=> CoA 8, + acetilfosfato), beta-liase de cistationina (H2O + CAETHG_049 cistationina --> NH3 + piruvato + homocisteína) 8 5 Rendime 4 CAETHG_247 dGTP trifosfo-hidrolase (H2O + dGTP --> H+ + 0 0,055 nto - 5, desoxiguanosina + trifosfato), alfa-acetolactato 144 LMOMA CAETHG_293 descarboxilase (ALCTT --> CO2 + (R)-Acetoína), 2, fosfato transacetilase (fosfato + acetil-CoA + H+ CAETHG_335 <=> CoA + acetilfosfato), Beta-liase de cistationina 8, (H2O + cistationina --> NH3 + piruvato + CAETHG_049 homocisteína) 8 6 Rendime 3 CAETHG_293 Alfa-acetolactato descarboxilase (ALCTT --> CO2 0 0,055 nto - 2, + (R)-Acetoína), fosfato transacetilase (fosfato + 008 LMOMA CAETHG_335 acetil-CoA + H+ <=> CoA + acetilfosfato), L- 8, treonina acetaldeído-liase (L-treonina --> glicina + CAETHG_068 Acetaldeído) 6
245 / 294 7 Rendime 3 CAETHG_293 Alfa-acetolactato descarboxilase (ALCTT --> CO2 0 0,054 nto - 2, + (R)-Acetoína), fosfato transacetilase (fosfato + 724 LMOMA CAETHG_335 acetil-CoA + H+ <=> CoA + acetilfosfato), beta- 8, liase de cistationina (H2O + cistationina --> NH3 + CAETHG_049 piruvato + Homocisteína) 8 8 Rendime 4 CAETHG_210 Absorção de potássio (K+_ext <=> K+), alfa- 0 0,054 nto - 7, acetolactato descarboxilase (ALCTT --> CO2 + (R)- 364 LMOMA CAETHG_293 Acetoína), fosfato transacetilase (fosfato + acetil- 2, CoA + H+ <=> CoA + acetilfosfato), D- Ribose 1,5- CAETHG_335 fosfomutase (ribose 1-fosfato <=> ribose-5-fosfato) 8, CAETHG_392 4 9 Rendime 4 CAETHG_137 Adenosina 5'-monofosfato fosfo-hidrolase (H2O + 0 0,054 nto - 1, AMP <=> Fosfato + H+ + Adenosina), captação de 364 LMOMA CAETHG_210 potássio (K+_ext <=> K+), alfa-acetolactato 7, descarboxilase (ALCTT --> CO2 + (R)-Acetoína), CAETHG_293 Fosfato transacetilase (fosfato + acetil-CoA + H+ 2, <=> CoA + acetilfosfato) CAETHG_335 8 10 Rendime 3 CAETHG_293 Alfa-acetolactato descarboxilase (ALCTT --> CO2 0 0,054 nto - 2, + (R)-Acetoína), fosfato transacetilase (fosfato + 36 LMOMA CAETHG_335 acetil-CoA + H+ <=> CoA + acetilfosfato), D-ribose 8, 1,5-fosfomutase (ribose 1-fosfato <=> ribose-5- CAETHG_392 fosfato) 4 11 Rendime 3 CAETHG_127 AMP:pirofosfato fosforibosiltransferase (PPi + AMP 0 0,054 nto - 0, <=> PRPP + Adenina), alfa-acetolactato 36 LMOMA CAETHG_293 descarboxilase (ALCTT --> CO2 + (R)-Acetoína), 2, fosfato transacetilase (fosfato + acetil-CoA + H+ CAETHG_335 <=> CoA + acetilfosfato) 8 12 Rendime 3 CAETHG_137 Adenosina 5'-monofosfato fosfo-hidrolase (H2O + 0 0,054 nto - 1, AMP <=> Fosfato + H+ + Adenosina), alfa- 36 LMOMA CAETHG_293 acetolactato descarboxilase (ALCTT --> CO2 + (R)- 2, Acetoína), transacetilase fosfato (fosfato + acetil- CAETHG_335 CoA + H+ <=> CoA + acetilfosfato) 8 13 Rendime 3 CAETHG_016 N-ribosilnicotinamida:ortofosfato ribosiltransferase 0 0,054 nto - 0, (fosfato + N-ribosilnicotinamida <=> nicotinamida 36 LMOMA CAETHG_293 + ribose 1-fosfato), alfa-acetolactato descarboxilase 2, (ALCTT --> CO2 + (R)-Acetoína), fosfato CAETHG_335 transacetilase (fosfato + Acetil-CoA + H+ <=> CoA 8 + acetilfosfato) 14 Rendime 3 CAETHG_293 Alfa-acetolactato descarboxilase (ALCTT --> CO2 0 0,051 nto - 2, + (R)-Acetoína), 2-desoxi-D-ribose-5-fosfato 804 LMOMA CAETHG_329 acetaldeído-liase (desoxirribose-5-fosfato <=> 9, acetaldeído + gliceraldeído 3-fosfato), fosfato CAETHG_335 transacetilase (Fosfato + acetil-CoA + H+ <=> CoA 8 + acetilfosfato) 15 Rendime 3 CAETHG_247 dGTP trifosfo-hidrolase (H2O + dGTP --> H+ + 0 0,051 nto - 5, desoxiguanosina + trifosfato), alfa-acetolactato 796 LMOMA CAETHG_293 descarboxilase (ALCTT --> CO2 + (R)-Acetoína), 2, fosfato transacetilase (fosfato + acetil-CoA + H+ CAETHG_335 <=> CoA + acetilfosfato) 8
246 / 294 16 Rendime 3 CAETHG_293 Alfa-acetolactato descarboxilase (ALCTT --> CO2 0 0,051 nto - 2, + (R)-Acetoína), L-arginina imino-hidrolase (H2O + 492 LMOMA CAETHG_302 L-arginina <=> NH3 + citrulina), fosfato 1, transacetilase (fosfato + acetil-CoA + H+ <=> CoA CAETHG_335 + Acetilfosfato) 8 17 Rendime 4 CAETHG_210 Absorção de potássio (K+_ext <=> K+), alfa- 0 0,051 nto - 7, acetolactato descarboxilase (ALCTT --> CO2 + (R)- 376 LMOMA CAETHG_293 Acetoína), UMP: pirofosfato fosforibosiltransferase 2, (Uracil + PRPP --> PPi + UMP), fosfato CAETHG_316 transacetilase (fosfato + Acetil-CoA + H+ <=> CoA 4, + acetilfosfato) CAETHG_335 8 18 Rendime 3 CAETHG_210 Absorção de potássio (K _ext <=> K+), alfa- 0 0,051 nto - 7, acetolactato descarboxilase (ALCTT --> CO2 + (R)- 368 LMOMA CAETHG_293 Acetoína), fosfato transacetilase (fosfato + acetil- 2, CoA + H+ <=> CoA + acetilfosfato) CAETHG_335 8 19 Rendime 2 CAETHG_293 Alfa-acetolactato descarboxilase (ALCTT --> CO2 0 0,051 nto - 2, + (R)-Acetoína), fosfato transacetilase (fosfato + 364 LMOMA CAETHG_335 acetil-CoA + H+ <=> CoA + acetilfosfato) 8 20 Rendime 2 CAETHG_293 Alfa-acetolactato descarboxilase (ALCTT --> CO2 0 0,051 nto - 2, + (R)-Acetoína), ATP:acetato de fosfotransferase 364 LMOMA CAETHG_335 (ATP + H+ + propionato --> ADP + fosfato de 9 propionila) 21 Rendime 3 CAETHG_275 Citramalato sintase (H2O + Piruvato + Acetil-CoA 0 0,047 nto - 1, <=> CoA + Citramalato), Fosfato transacetilase 452 LMOMA CAETHG_335 (Fosfato + Acetil-CoA + H+ <=> CoA + 8, Acetilfosfato), Cistationina beta-liase (H2O + CAETHG_049 Cistationina --> NH3 + Piruvato + Homocisteína) 8 22 Rendime 3 CAETHG_302 L-arginina imino-hidrolase (H2O + L-arginina <=> 0 0,045 nto - 1, NH3 + citrulina), fosfato transacetilase (fosfato + 856 LMOMA CAETHG_335 acetil-CoA + H+ <=> CoA + acetilfosfato), 8, cistationina beta-liase (H2O + cistationina --> NH3 CAETHG_049 + piruvato + Homocisteína) 8 23 Rendime 3 CAETHG_247 dGTP trifosfo-hidrolase (H2O + dGTP --> H+ + 0 0,045 nto - 5, desoxiguanosina + trifosfato), fosfato transacetilase 82 LMOMA CAETHG_335 (fosfato + acetil-CoA + H+ <=> CoA + 8, acetilfosfato), cistationina beta liase (H2O + CAETHG_049 cistationina --> NH3 + piruvato + homocisteína) 8 24 Rendime 2 CAETHG_335 ATP:acetato fosfotransferase (ATP + H+ + 0 0,045 nto - 9, propionato --> ADP + fosfato de propionila), beta- 768 LMOMA CAETHG_049 liase de cistationina (H2O + cistationina --> NH3 + 8 piruvato + homocisteína) 25 Rendime 2 CAETHG_335 Fosfato transacetilase (fosfato + acetil-CoA + H+ 0 0,045 nto - 8, <=> CoA + acetilfosfato), beta-liase de cistationina 768 LMOMA CAETHG_049 (H2O + cistationina --> NH3 + piruvato + 8 homocisteína) 26 Rendime 2 CAETHG_335 ATP:acetato fosfotransferase (ATP + H+ + 0 0,044 nto - 9, propionato --> ADP + fosfato de propionila), D- 72 LMOMA CAETHG_392 ribose 1,5-fosfomutase (ribose 1-fosfato <=> ribose- 4 5-fosfato)
247 / 294 27 Rendime 2 CAETHG_137 Adenosina 5'-monofosfato fosfo-hidrolase (H2O + 0 0,044 nto - 1, AMP <=> Fosfato + H+ + Adenosina), ATP:acetato 72 LMOMA CAETHG_335 fosfotransferase (ATP + H+ + Propionato --> ADP + 9 Propionil fosfato) 28 Rendime 2 CAETHG_127 AMP:pirofosfato fosforibosiltransferase (PPi + AMP 0 0,044 nto - 0, <=> PRPP + adenina), ATP:acetato fosfotransferase 72 LMOMA CAETHG_335 (ATP + H+ + propionato --> ADP + propionil 9 fosfato) 29 Rendime 2 CAETHG_016 N-ribosilnicotinamida:ribosiltransferase de 0 0,044 nto - 0, ortofosfato (fosfato + N-ribosilnicotinamida <=> 72 LMOMA CAETHG_335 nicotinamida + 1-fosfato de ribose), ATP:acetato 9 fosfotransferase (ATP + H+ + propionato --> ADP + fosfato de propionila) 30 Rendime 2 CAETHG_335 ATP:acetato fosfotransferase (ATP + H+ + 0 0,043 nto - 9, Propionato --> ADP + fosfato de propionila), L- 66 LMOMA CAETHG_068 treonina acetaldeído-liase (L-treonina --> glicina + 6 acetaldeído) 31 Rendime 2 CAETHG_302 L-arginina imino-hidrolase (H2O + L-arginina <=> 0 0,043 nto - 1, NH3 + citrulina), ATP:acetato fosfotransferase (ATP 384 LMOMA CAETHG_335 + H+ + propionato --> ADP + fosfato de propionila) 9 32 Rendime 2 CAETHG_210 Absorção de potássio (K+_ext <=> K+), 0 0,043 nto - 7, ATP:acetato fosfotransferase (ATP + H+ + 3 LMOMA CAETHG_335 Propionato --> ADP + fosfato de propionila) 9 33 Rendime 1 CAETHG_335 Fosfato transacetilase (fosfato + acetil-CoA + H+ 0 0,043 nto - 8 <=> CoA + acetilfosfato) 296
LMOMA 34 Rendime 1 CAETHG_335 ATP:acetato fosfotransferase (ATP + H+ + 0 0,043 nto - 9 Propionato --> ADP + Propionil fosfato) 296
LMOMA 35 Rendime 1 CAETHG_137 Adenosina 5'-monofosfato fosfo-hidrolase (H2O + 0 0,020 nto - 1 AMP <=> Fosfato + H+ + Adenosina) 432
LMOMA 36 Rendime 1 CAETHG_016 N-ribosilnicotinamida:ortofosfato ribosiltransferase 0 0,020 nto - 0 (fosfato + N-ribosilnicotinamida <=> nicotinamida 432 LMOMA + ribose 1-fosfato) 37 Rendime 1 CAETHG_127 AMP:pirofosfato fosforibosiltransferase (PPi + AMP 0 0,020 nto - 0 <=> PRPP + adenina) 432
LMOMA 38 Rendime 1 CAETHG_392 D-ribose 1,5-fosfomutase (ribose 1-fosfato <=> 0 0,020 nto - 4 ribose-5-fosfato) 432
LMOMA 39 Rendime 1 CAETHG_272 Fosfoenolpiruvato carboxiquinase (PPCK) (ATP + 0 0,020 nto - 1 oxaloacetato + H+ --> ADP + CO2 + 356 LMOMA Fosfoenolpiruvato) 40 Rendime 1 CAETHG_302 L-arginina imino-hidrolase (H2O + L-arginina <=> 0 0,020 nto - 1 NH3 + citrulina) 028
LMOMA 41 BPCY - 1 CAETHG_335 Fosfato transacetilase (fosfato + acetil-CoA + H+ 0,21671 0,048 FBA 8 <=> CoA + acetilfosfato) 129 42 BPCY - 1 CAETHG_335 ATP:acetato fosfotransferase (ATP + H+ + 0,21671 0,048 FBA 9 Propionato --> ADP + Propionil fosfato) 129 43 BPCY - 1 CAETHG_290 ATP:piruvato, ortofosfato fosfotransferase (ATP + 0,21241 0,000 FBA 9 fosfato + piruvato + H+ --> PPi + AMP + 573 fosfoenolpiruvato)
248 / 294 44 Rendime 4 CAETHG_023 4,5-di-hidro-4-oxo-5-imidazolpropanoato hidro-liase 0,21241 0,112 nto - 4, (4-imidazolona-5-propanoato <=> H2O + 96 LMOMA CAETHG_275 Urocanato), citramalato sintase (H2O + piruvato + 1, acetil-CoA <=> CoA + citramalato), ATP:acetato CAETHG_335 fosfotransferase (ATP + H+ + propionato --> ADP + 9, fosfato de propionila), 2,6-diamino-heptanodioato:2- CAETHG_351 oxoglutarato aminotransferase (H2O + L-glutamato 0 + H+ + tetra-hidrodipicolinato <-- 2-oxoglutarato + LL-2,6-Diaminopimelato) 45 Rendime 4 CAETHG_023 4-imidazolona-5-propanoato amido-hidrolase (H2O 0,21058 0,112 nto - 3, + 4-Imidazolona-5-propanoato --> N-Formimino-L- 96 LMOMA CAETHG_275 glutamato), Citramalato sintase (H2O + Piruvato + 1, Acetil-CoA <=> CoA + Citramalato), ATP:acetato CAETHG_335 fosfotransferase (ATP + H+ + propionato --> ADP + 9, fosfato de propionila), 2,6-diamino-heptanodioato:2- CAETHG_351 oxoglutarato aminotransferase (H2O + L-glutamato 0 + H+ + tetra-hidrodipicolinato <-- 2-Oxoglutarato + LL-2,6- Diaminopimelato) 46 Rendime 2 CAETHG_335 Fosfato transacetilase (fosfato + acetil-CoA + H+ 0,21058 0,111 nto - 8, <=> CoA + acetilfosfato), 2,6-diamino- 576 LMOMA CAETHG_351 heptanodioato:2-oxoglutarato aminotransferase 0 (H2O + L-glutamato + H+ + tetra-hidrodipicolinato <-- 2-oxoglutarato + LL-2,6-Diaminopimelato) 47 Rendime 2 CAETHG_335 ATP:acetato fosfotransferase (ATP + H+ + 0,21544 0,111 nto - 9, propionato --> ADP + fosfato de propionila), 2,6- 576 LMOMA CAETHG_351 diamino-heptanodioato:2-oxoglutarato 0 aminotransferase (H2O + L-glutamato + H+ + tetra- hidrodipicolinato <-- 2-oxoglutarato + LL-2,6- Diaminopimelato) 48 Rendime 4 CAETHG_272 Fosfoenolpiruvato carboxiquinase (PPCK) (ATP + 0,21528 0,104 nto - 1, oxaloacetato + H+ --> ADP + CO2 + 448 LMOMA CAETHG_275 Fosfoenolpiruvato), isocitrato desidrogenase (NAD 3, + isocitrato <=> NADH + CO2 + 2-oxoglutarato + CAETHG_335 H+), fosfato transacetilase (fosfato + acetil-CoA + 8, H+ <=> CoA + acetilfosfato), beta-liase de CAETHG_049 cistationina (H2O + cistationina --> NH3 + piruvato 8 + homocisteína) 49 Rendime 3 CAETHG_272 Fosfoenolpiruvato carboxiquinase (PPCK) (ATP + 0,21528 0,104 nto - 1, Oxaloacetato + H+ --> ADP + CO2 + 424 LMOMA CAETHG_335 Fosfoenolpiruvato), fosfato transacetilase (fosfato + 8, acetil-CoA + H+ <=> CoA + acetilfosfato), CAETHG_049 cistationina beta-liase (H2O + cistationina --> NH3 8 + Piruvato + homocisteína) 50 Rendime 4 CAETHG_272 Fosfoenolpiruvato carboxiquinase (PPCK) (ATP + 0,21528 0,102 nto - 1, oxaloacetato + H+ --> ADP + CO2 + 516 LMOMA CAETHG_302 Fosfoenolpiruvato), L-Arginina imino-hidrolase 1, (H2O + L-Arginina <=> NH3 + Citrulina), Fosfato CAETHG_335 transacetilase (Fosfato + Acetil-CoA + H+ <=> CoA 8, + acetilfosfato), D-ribose 1,5-fosfomutase (ribose 1- CAETHG_392 fosfato <=> ribose-5-fosfato) 4 51 Rendime 3 CAETHG_137 Adenosina 5'-monofosfato fosfo-hidrolase (H2O + 0,21221 0,102 nto - 1, AMP <=> Fosfato + H+ + Adenosina), 476 LMOMA CAETHG_272 Fosfoenolpiruvato carboxiquinase (PPCK) (ATP + 1, oxaloacetato + H+ --> ADP + CO2 + CAETHG_335 Fosfoenolpiruvato), Fosfato transacetilase (Fosfato 8 + Acetil-CoA + H+ <=> CoA + Acetilfosfato)
249 / 294 52 Rendime 3 CAETHG_272 Fosfoenolpiruvato carboxiquinase (PPCK) (ATP + 0,21204 0,102 nto - 1, oxaloacetato + H+ --> ADP + CO2 + 476 LMOMA CAETHG_335 Fosfoenolpiruvato), fosfato transacetilase (fosfato + 8, acetil-CoA + H+ <=> CoA + acetilfosfato), D-ribose CAETHG_392 1,5-fosfomutase (ribose 1-fosfato <=> ribose-5- 4 fosfato) 53 Rendime 3 CAETHG_127 AMP:pirofosfato fosforibosiltransferase (PPi + AMP 0,21204 0,102 nto - 0, <=> PRPP + Adenina), Fosfoenolpiruvato 464 LMOMA CAETHG_272 carboxiquinase (PPCK) (ATP + Oxaloacetato + H+ - 1, -> ADP + CO2 + Fosfoenolpiruvato), Fosfato CAETHG_335 transacetilase (Fosfato + Acetil-CoA + H+ <=> CoA 8 + Acetilfosfato) 54 Rendime 3 CAETHG_272 Fosfoenolpiruvato carboxiquinase (PPCK) (ATP + 0,21204 0,102 nto - 1, oxaloacetato + H+ --> ADP + CO2 + 348 LMOMA CAETHG_302 Fosfoenolpiruvato), L-Arginina imino-hidrolase 1, (H2O + L-Arginina <=> NH3 + Citrulina), Fosfato CAETHG_335 transacetilase (Fosfato + Acetil-CoA + H+ <=> CoA 8 + acetilfosfato) 55 Rendime 3 CAETHG_272 Fosfoenolpiruvato carboxiquinase (PPCK) (ATP + 0,21204 0,102 nto - 1, oxaloacetato + H+ --> ADP + CO2 + 324 LMOMA CAETHG_275 Fosfoenolpiruvato), isocitrato desidrogenase (NAD 3, + isocitrato <=> NADH + CO2 + 2-oxoglutarato + CAETHG_335 H+), fosfato transacetilase (Fosfato + Acetil-CoA + 8 H+ <=> CoA + acetilfosfato) 56 Rendime 3 CAETHG_210 Absorção de potássio (K+_ext <=> K+), 0,21353 0,102 nto - 7, Fosfoenolpiruvato carboxiquinase (PPCK) (ATP + 304 LMOMA CAETHG_272 Oxaloacetato + H+ --> ADP + CO2 + 1, Fosfoenolpiruvato), fosfato transacetilase (fosfato + CAETHG_335 acetil-CoA + H+ <=> CoA + acetilfosfato) 8 57 Rendime 2 CAETHG_272 Fosfoenolpiruvato carboxiquinase (PPCK) (ATP + 0,21353 0,102 nto - 1, oxaloacetato + H+ --> ADP + CO2 + 3 LMOMA CAETHG_335 Fosfoenolpiruvato), fosfato transacetilase (fosfato + 8 acetil-CoA + H+ <=> CoA + acetilfosfato) 58 Rendime 2 CAETHG_272 Fosfoenolpiruvato carboxiquinase (PPCK) (ATP + 0,21241 0,102 nto - 1, oxaloacetato + H+ --> ADP + CO2 + 3 LMOMA CAETHG_335 fosfoenolpiruvato), ATP:acetato fosfotransferase 9 (ATP + H+ + propionato --> ADP + propionil fosfato) 59 Rendime 3 CAETHG_137 Adenosina 5'-monofosfato fosfo-hidrolase (H2O + 0,21241 0,090 nto - 1, AMP <=> Fosfato + H+ + Adenosina), alfa- 748 LMOMA CAETHG_293 acetolactato descarboxilase (ALCTT --> CO2 + (R)- 2, Acetoína), transacetilase fosfato (fosfato + acetil- CAETHG_335 CoA + H+ <=> CoA + acetilfosfato) 8 60 Rendime 3 CAETHG_127 AMP:pirofosfato fosforibosiltransferase (PPi + AMP 0,21171 0,090 nto - 0, <=> PRPP + Adenina), alfa-acetolactato 656 LMOMA CAETHG_293 descarboxilase (ALCTT --> CO2 + (R)-Acetoína), 2, fosfato transacetilase (fosfato + acetil-CoA + H+ CAETHG_335 <=> CoA + acetilfosfato) 8 61 Rendime 2 CAETHG_293 Alfa-acetolactato descarboxilase (ALCTT --> CO2 0,21171 0,089 nto - 2, + (R)-Acetoína), ATP:acetato de fosfotransferase 548 LMOMA CAETHG_335 (ATP + H+ + propionato --> ADP + fosfato de 9 propionila) 62 Rendime 2 CAETHG_293 Alfa-acetolactato descarboxilase (ALCTT --> CO2 0,21171 0,089 nto - 2, + (R)-Acetoína), fosfato transacetilase (fosfato + 548 LMOMA CAETHG_335 acetil-CoA + H+ <=> CoA + acetilfosfato) 8
250 / 294 63 Rendime 3 CAETHG_247 dGTP trifosfo-hidrolase (H2O + dGTP --> H+ + 0,21646 0,083 nto - 5, desoxiguanosina + trifosfato), fosfato transacetilase 936 LMOMA CAETHG_335 (fosfato + acetil-CoA + H+ <=> CoA + 8, acetilfosfato), L-treonina acetaldeído-liase (L- CAETHG_068 treonina --> glicina + acetaldeído) 6 64 Rendime 2 CAETHG_335 ATP:acetato fosfotransferase (ATP + H+ + 0,21753 0,083 nto - 9, Propionato --> ADP + fosfato de propionila), L- 768 LMOMA CAETHG_068 treonina acetaldeído-liase (L-treonina --> glicina + 6 acetaldeído) 65 Rendime 2 CAETHG_335 Fosfato transacetilase (fosfato + acetil-CoA + H+ 0,21753 0,083 nto - 8, <=> CoA + acetilfosfato), L-treonina acetaldeído- 768 LMOMA CAETHG_068 liase (L-treonina --> glicina + acetaldeído) 6 66 Rendime 3 CAETHG_016 N-Ribosilnicotinamida:ribosiltransferase de 0,21753 0,082 nto - 0, ortofosfato (fosfato + N-ribosilnicotinamida <=> 284 LMOMA CAETHG_335 Nicotinamida + 1-fosfato de ribose), fosfato 8, transacetilase (fosfato + acetil-CoA + H+ <=> CoA CAETHG_049 + acetilfosfato), cistationina beta-liase (H2O + 8 cistationina --> NH3 + Piruvato + Homocisteína) 67 Rendime 3 CAETHG_247 dGTP trifosfo-hidrolase (H2O + dGTP --> H+ + 0,21753 0,080 nto - 5, desoxiguanosina + trifosfato), fosfato transacetilase 496 LMOMA CAETHG_335 (fosfato + acetil-CoA + H+ <=> CoA + 8, acetilfosfato), cistationina beta liase (H2O + CAETHG_049 cistationina --> NH3 + piruvato + homocisteína) 8 68 Rendime 3 CAETHG_247 dGTP trifosfo-hidrolase (H2O + dGTP --> H+ + 0,21353 0,080 nto - 5, desoxiguanosina + trifosfato), ATP:acetato 496 LMOMA CAETHG_335 fosfotransferase (ATP + H+ + propionato --> ADP + 9, fosfato de propionila), cistationina beta-liase (H2O CAETHG_049 + cistationina --> NH3 + piruvato + homocisteína) 8 69 Rendime 2 CAETHG_335 ATP:acetato fosfotransferase (ATP + H+ + 0,21353 0,080 nto - 9, propionato --> ADP + fosfato de propionila), beta- 204 LMOMA CAETHG_049 liase de cistationina (H2O + cistationina --> NH3 + 8 piruvato + homocisteína) 70 Rendime 2 CAETHG_335 Fosfato transacetilase (fosfato + acetil-CoA + H+ 0,21353 0,080 nto - 8, <=> CoA + acetilfosfato), beta-liase de cistationina 204 LMOMA CAETHG_049 (H2O + cistationina --> NH3 + piruvato + 8 homocisteína) 71 Rendime 2 CAETHG_016 N-ribosilnicotinamida:ribosiltransferase de 0,21353 0,077 nto - 0, ortofosfato (fosfato + N-ribosilnicotinamida <=> 112 LMOMA CAETHG_335 nicotinamida + 1-fosfato de ribose), ATP:acetato 9 fosfotransferase (ATP + H+ + propionato --> ADP + fosfato de propionila) 72 Rendime 2 CAETHG_137 Adenosina 5'-monofosfato fosfo-hidrolase (H2O + 0,21241 0,077 nto - 1, AMP <=> Fosfato + H+ + Adenosina), ATP:acetato 112 LMOMA CAETHG_335 fosfotransferase (ATP + H+ + Propionato --> ADP + 9 Propionil fosfato) 73 Rendime 2 CAETHG_335 ATP:acetato fosfotransferase (ATP + H+ + 0,21236 0,077 nto - 9, propionato --> ADP + fosfato de propionila), D- 112 LMOMA CAETHG_392 ribose 1,5-fosfomutase (ribose 1-fosfato <=> ribose- 4 5-fosfato) 74 Rendime 2 CAETHG_127 AMP:pirofosfato fosforibosiltransferase (PPi + AMP 0,21241 0,077 nto - 0, <=> PRPP + adenina), ATP:acetato fosfotransferase 028 LMOMA CAETHG_335 (ATP + H+ + propionato --> ADP + propionil 9 fosfato)
251 / 294 75 Rendime 2 CAETHG_329 2-desoxi-D-ribose-5-fosfato acetaldeído-liase 0,21241 0,075 nto - 9, (desoxirribose-5-fosfato <=> acetaldeído + 868 LMOMA CAETHG_335 gliceraldeído 3-fosfato), ATP:acetato 9 fosfotransferase (ATP + H+ + propionato --> ADP + fosfato de propionila) 76 Rendime 2 CAETHG_302 L-arginina imino-hidrolase (H2O + L-arginina <=> 0,21241 0,075 nto - 1, NH3 + citrulina), ATP:acetato fosfotransferase (ATP 712 LMOMA CAETHG_335 + H+ + propionato --> ADP + fosfato de propionila) 9 77 Rendime 2 0, Acetil-CoA:dióxido de carbono ligase (formadora 0,21241 0,075 nto - CAETHG_335 de ADP) (ATP + acetil-CoA + H2CO3 --> ADP + 524 LMOMA 9 fosfato + H+ + malonil-CoA), ATP:acetato fosfotransferase (ATP + H+ + propionato --> ADP + Fosfato de propionila) 78 Rendime 2 CAETHG_210 Absorção de potássio (K+_ext <=> K+), 0,21241 0,075 nto - 7, ATP:acetato fosfotransferase (ATP + H+ + 492 LMOMA CAETHG_335 Propionato --> ADP + fosfato de propionila) 9 79 Rendime 2 CAETHG_210 Absorção de potássio (K+_ext <=> K+), fosfato 0,21241 0,075 nto - 7, transacetilase (fosfato + acetil-CoA + H+ <=> CoA 492 LMOMA CAETHG_335 + acetilfosfato) 8 80 Rendime 2 CAETHG_316 UMP: pirofosfato fosforibosiltransferase (Uracil + 0,21241 0,075 nto - 4, PRPP --> PPi + UMP), ATP:acetato fosfotransferase 488 LMOMA CAETHG_335 (ATP + H+ + propionato --> ADP + fosfato de 9 propionila) 81 Rendime 2 CAETHG_316 UMP: pirofosfato fosforibosiltransferase (Uracil + 0,21671 0,075 nto - 4, PRPP --> PPi + UMP), fosfato transacetilase 488 LMOMA CAETHG_335 (fosfato + acetil-CoA + H+ <=> CoA + 8 acetilfosfato) 82 Rendime 1 CAETHG_335 Fosfato transacetilase (fosfato + acetil-CoA + H+ 0,21671 0,075 nto - 8 <=> CoA + acetilfosfato) 484
LMOMA 83 Rendime 1 CAETHG_335 ATP:acetato fosfotransferase (ATP + H+ + 0,21241 0,075 nto - 9 Propionato --> ADP + Propionil fosfato) 484
LMOMA 84 Rendime 2 CAETHG_122 L-serina amônia-liase (L-serina --> NH3 + 0 0,021 nto - 4, piruvato), N-ribosilnicotinamida:ortofosfato 3 LMOMA CAETHG_016 ribosiltransferase (fosfato + N-ribosilnicotinamida 0 <=> Nicotinamida + ribose 1-fosfato) 85 Rendime 2 CAETHG_016 N-Ribosilnicotinamida:ortofosfato ribosiltransferase 0 0,021 nto - 0, (fosfato + N-ribosilnicotinamida <=> Nicotinamida 224 LMOMA CAETHG_210 + ribose 1-fosfato), absorção de potássio (K+_ext 7 <=> K+) 86 Rendime 1 CAETHG_127 AMP:pirofosfato fosforibosiltransferase (PPi + AMP 0 0,021 nto - 0 <=> PRPP + adenina) 22
LMOMA 87 Rendime 1 CAETHG_392 D-ribose 1,5-fosfomutase (ribose 1-fosfato <=> 0 0,021 nto - 4 ribose-5-fosfato) 22
LMOMA 88 Rendime 1 CAETHG_137 Adenosina 5'-monofosfato fosfo-hidrolase (H2O + 0 0,021 nto - 1 AMP <=> Fosfato + H+ + Adenosina) 22
LMOMA 89 Rendime 1 CAETHG_016 N-ribosilnicotinamida:ortofosfato ribosiltransferase 0 0,021 nto - 0 (fosfato + N-ribosilnicotinamida <=> nicotinamida 22 LMOMA + ribose 1-fosfato) 90 Rendime 2 CAETHG_024 Transporte reversível de L-lactato via simporte de 0 0,020 nto - 8, prótons (H+_ext + L-Lactato_ext <=> H+ + L- 644 LMOMA CAETHG_272 lactato), Fosfoenolpiruvato carboxiquinase (PPCK) 1 (ATP + Oxaloacetato + H+ --> ADP + CO2 + Fosfoenolpiruvato)
252 / 294 91 Rendime 2 CAETHG_210 Absorção de potássio (K+_ext <=> K+), 0 0,020 nto - 7, Fosfoenolpiruvato carboxiquinase (PPCK) (ATP + 584 LMOMA CAETHG_272 Oxaloacetato + H+ --> ADP + CO2 + 1 Fosfoenolpiruvato) 92 Rendime 1 CAETHG_272 Fosfoenolpiruvato carboxiquinase (PPCK) (ATP + 0 0,020 nto - 1 oxaloacetato + H+ --> ADP + CO2 + 58 LMOMA Fosfoenolpiruvato) 93 Rendime 1 CAETHG_302 L-arginina imino-hidrolase (H2O + L-arginina <=> 0 0,020 nto - 1 NH3 + citrulina) 06
LMOMA 94 BPCY - 4 CAETHG_275 Citramalato sintase (H2O + Piruvato + Acetil-CoA 0,05233 0,012 FBA 1, <=> CoA + Citramalato), Isocitrato desidrogenase 686 CAETHG_275 (NAD + Isocitrato <=> NADH + CO2 + 2- 3, Oxoglutarato + H+), ATP:piruvato, ortofosfato CAETHG_290 fosfotransferase (ATP + Fosfate + Piruvato + H+ --> 9, PPi + AMP + Fosfoenolpiruvato), Cisteína CAETHG_329 dessulfidrase (H2O + L-Cisteína <=> NH3 + 3 Piruvato + H2S) 95 BPCY - 3 CAETHG_275 Isocitrato desidrogenase (NAD + isocitrato <=> 0,02686 0,008 FBA 3, NADH + CO2 + 2-Oxoglutarato + H+), 55 CAETHG_290 ATP:piruvato, ortofosfato fosfotransferase (ATP + 9, fosfato + piruvato + H+ --> PPi + AMP + CAETHG_049 fosfoenolpiruvato), cistationina beta-liase (H2O + 8 Cistationina --> NH3 + Piruvato + Homocisteína) 96 BPCY - 3 CAETHG_275 Citramalato sintase (H2O + Piruvato + Acetil-CoA 0,02545 0,008 FBA 1, <=> CoA + Citramalato), Isocitrato desidrogenase 366 CAETHG_275 (NAD + Isocitrato <=> NADH + CO2 + 2- 3, Oxoglutarato + H+), ATP:piruvato, ortofosfato CAETHG_290 fosfotransferase (ATP + Fosfato + Piruvato + H+ --> 9 PPi + AMP + Fosfoenolpiruvato) 97 BPCY - 2 CAETHG_275 Isocitrato desidrogenase (NAD + Isocitrato <=> 0,01873 0,007 FBA 3, NADH + CO2 + 2-Oxoglutarato + H+), 195 CAETHG_290 ATP:piruvato, ortofosfato fosfotransferase (ATP + 9 fosfato + piruvato + H+ --> PPi + AMP + fosfoenolpiruvato) 98 BPCY - 3 CAETHG_275 Citramalato sintase (H2O + Piruvato + Acetil-CoA 0 0,002 FBA 1, <=> CoA + Citramalato), ATP:piruvato, ortofosfato 528 CAETHG_290 fosfotransferase (ATP + fosfato + piruvato + H+ --> 9, PPi + AMP + Fosfoenolpiruvato), cisteína CAETHG_329 dessulfididose (H2O + L-Cisteína <=> NH3 + 3 Piruvato + H2S) 99 BPCY - 3 CAETHG_275 Citramalato sintase (H2O + Piruvato + Acetil-CoA 0 0,002 FBA 1, <=> CoA + Citramalato), ATP:piruvato, ortofosfato 508 CAETHG_290 fosfotransferase (ATP + fosfato + piruvato + H+ --> 9, PPi + AMP + Fosfoenolpiruvato), Treonina CAETHG_361 desidratase (L-treonina --> NH3 + 2-Oxobutirato) 1 100 BPCY - 2 CAETHG_275 Citramalato sintase (H2O + Piruvato + Acetil-CoA 0 0,001 FBA 1, <=> CoA + Citramalato), ATP:piruvato, ortofosfato 842 CAETHG_290 fosfotransferase (ATP + fosfato + piruvato + H+ --> 9 PPi + AMP + fosfoenolpiruvato) 101 BPCY - 2 CAETHG_290 ATP:piruvato, ortofosfato fosfotransferase (ATP + 0 0,001 FBA 9, fosfato + piruvato + H+ --> PPi + AMP + 323 CAETHG_329 fosfoenolpiruvato), cisteína dessulfidrase (H2O + L- 3 cisteína <=> NH3 + piruvato + H2S) 102 BPCY - 2 CAETHG_275 Isocitrato desidrogenase (NAD + Isocitrato <=> 0 0,000 FBA 3, NADH + CO2 + 2-Oxoglutarato + H+), 573 CAETHG_329 dessulfidrase de cisteína (H2O + L-cisteína <=> 3 NH3 + piruvato + H2S)
253 / 294 103 BPCY - 1 CAETHG_290 ATP:piruvato, ortofosfato fosfotransferase (ATP + 0 0,000 FBA 9 fosfato + piruvato + H+ --> PPi + AMP + 573 fosfoenolpiruvato) EXEMPLO 11
[0095] Esse exemplo descreve rompimentos para melhorar a produção de 3-hidroxibutirato em microrganismos de Wood-Ljungdahl. Os experimentos de modelagem metabólica foram realizados como descrito no Exemplo 1. A produção de 3-hidroxibutirato em microrganismos de Wood- Ljungdahl é descrita, por exemplo, no documento WO 2017/066498. A seguinte via foi usada para modelar a produção de 3-hidroxibutirato aqui: 3- Hidroxibutirato --> 3-Hidroxibutirato_ext; Acetato + Acetoacetil-CoA --> Acetil-CoA + Acetoacetato; NADH + H+ + Acetoacetato --> NAD + 3- Hidroxibutirato; 2,0 Acetil-CoA --> CoA + Acetoacetil-CoA.
Pontuação de condicionamento físico Rendimento mínimo em FVA N° Genes rompidos Reações rompidas Genes rompidos Técnica N° 1 BPCY - 3 CAETHG_275 Isocitrato desidrogenase (NAD + Isocitrato <=> 0,01233 0,00 FBA 3, NADH + CO2 + 2-Oxoglutarato + H+), ATP:piruvato, 434 CAETHG_290 ortofosfato fosfotransferase (ATP + fosfato + piruvato 9, + H+ --> PPi + AMP + fosfoenolpiruvato), cisteína CAETHG_329 dessulfidrase (H2O -Cisteína <=> NH3 + Piruvato + 3 H2S) 2 BPCY - 3 CAETHG_275 Isocitrato desidrogenase (NAD + isocitrato <=> 0 0,00 FBA 3, NADH + CO2 + 2-Oxoglutarato + H+), ATP:piruvato, 258 CAETHG_290 ortofosfato fosfotransferase (ATP + fosfato + piruvato 3 9, + H+ --> PPi + AMP + fosfoenolpiruvato), CAETHG_049 cistationina beta-liase (H2O + Cistationina --> NH3 + 8 Piruvato + Homocisteína) 3 BPCY - 3 CAETHG_275 Citramalato sintase (H2O + Piruvato + Acetil-CoA 0 0,00 FBA 1, <=> CoA + Citramalato), Isocitrato desidrogenase 247 CAETHG_275 (NAD + Isocitrato <=> NADH + CO2 + 2- 7 3, Oxoglutarato + H+), ATP:piruvato, ortofosfato CAETHG_290 fosfotransferase (ATP + Fosfato + Piruvato + H+ --> 9 PPi + AMP + Fosfoenolpiruvato) 4 BPCY - 2 CAETHG_275 Isocitrato desidrogenase (NAD + Isocitrato <=> 0 0,00 FBA 3, NADH + CO2 + 2-Oxoglutarato + H+), ATP:piruvato, 178 CAETHG_290 ortofosfato fosfotransferase (ATP + fosfato + piruvato 8 9 + H+ --> PPi + AMP + fosfoenolpiruvato)
254 / 294 5 BPCY - 2 CAETHG_275 Isocitrato desidrogenase (NAD + Isocitrato <=> 0 0,00 FBA 3, NADH + CO2 + 2-Oxoglutarato + H+), ATP:piruvato, 147 CAETHG_290 ortofosfato fosfotransferase (ATP + fosfato + piruvato 5 9 + H+ --> PPi + AMP + fosfoenolpiruvato) 6 Rendime 6 CAETHG_016 N-Ribosilnicotinamida:ortofosfato ribosiltransferase 0 0,09 nto - 0, (Fosfato + N-Ribosilnicotinamida <=> Nicotinamida 007 LMOMA CAETHG_272 + Ribose 1-fosfato), Fosfoenolpiruvato 2 1, carboxiquinase (PPCK) (ATP + Oxaloacetato + H+ -- CAETHG_293 > ADP + CO2 + Fosfoenolpiruvato), Alfa-acetolactato 2, descarboxilase (ALCTT --> CO2 + (R)-Acetoína), CAETHG_335 ATP:acetato fosfotransferase (ATP + H+ + Propionato 9, --> ADP + fosfato de propionila), Cistationina beta CAETHG_047 liase (H2O + Cistationina --> NH3 + Piruvato + 5, Homocisteína) CAETHG_049 8 7 Rendime 5 CAETHG_016 N-Ribosilnicotinamida:ortofosfato ribosiltransferase 0 0,08 nto - 0, (Fosfato + N-Ribosilnicotinamida <=> Nicotinamida 891 LMOMA CAETHG_272 + Ribose 1-fosfato), Fosfoenolpiruvato 2 1, carboxiquinase (PPCK) (ATP + Oxaloacetato + H+ -- CAETHG_293 > ADP + CO2 + Fosfoenolpiruvato), Alfa-acetolactato 2, descarboxilase (ALCTT --> CO2 + (R)-Acetoína), CAETHG_335 ATP:acetato fosfotransferase (ATP + H+ + propionato 9, --> ADP + fosfato de propionila) CAETHG_047 5 8 Rendime 5 CAETHG_016 N-Ribosilnicotinamida:ortofosfato ribosiltransferase 0 0,08 nto - 0, (Fosfato + N-Ribosilnicotinamida <=> Nicotinamida 891 LMOMA CAETHG_272 + Ribose 1-fosfato), Fosfoenolpiruvato 2 1, carboxiquinase (PPCK) (ATP + Oxaloacetato + H+ -- CAETHG_293 > ADP + CO2 + Fosfoenolpiruvato), Alfa-acetolactato 2, descarboxilase (ALCTT --> CO2 + (R)-Acetoína), CAETHG_335 fosfato transacetilase (fosfato + acetil-CoA + H+ <=> 8, CoA + acetilfosfato) CAETHG_047 5 9 Rendime 4 CAETHG_272 Fosfoenolpiruvato carboxiquinase (PPCK) (ATP + 0 0,08 nto - 1, oxaloacetato + H+ --> ADP + CO2 + 852 LMOMA CAETHG_293 Fosfoenolpiruvato), alfa-acetolactato descarboxilase 2, (ALCTT --> CO2 + (R)-Acetoína), ATP:acetato CAETHG_335 fosfotransferase (ATP + H+ + propionato --> ADP + 9, fosfato de propionila), 2,6-diamino-heptanodioato:2- CAETHG_351 oxoglutarato aminotransferase (H2O + L-glutamato + 0 H+ + tetra-hidrodipicolinato <-- 2-oxoglutarato + LL- 2,6-diaminopimelato) 10 Rendime 4 CAETHG_272 Fosfoenolpiruvato carboxiquinase (PPCK) (ATP + 0 0,08 nto - 1, oxaloacetato + H+ --> ADP + CO2 + 84 LMOMA CAETHG_293 Fosfoenolpiruvato), alfa-acetolactato descarboxilase 2, (ALCTT --> CO2 + (R)-Acetoína), ATP:acetato CAETHG_335 fosfotransferase (ATP + H+ propionato --> ADP + 9, fosfato de propionila), glicina: lipoilproteína CAETHG_047 oxidorredutase (descarboxilação e aminometilação 4 aceitadora) (glicina + H+ + lipoilproteína --> CO2 + S-aminometildi-hidrolipoilproteína)
255 / 294 11 Rendime 4 CAETHG_272 Fosfoenolpiruvato carboxiquinase (PPCK) (ATP + 0 0,08 nto - 1, oxaloacetato + H+ --> ADP + CO2 + 84 LMOMA CAETHG_293 Fosfoenolpiruvato), alfa-acetolactato descarboxilase 2, (ALCTT --> CO2 + (R)-Acetoína), ATP:acetato CAETHG_335 fosfotransferase (ATP + H+ propionato --> ADP + 9, fosfato de propionila) CAETHG_047 5 12 Rendime 3 CAETHG_335 ATP:acetato fosfotransferase (ATP + H+ +Propionato 0 0,08 nto - 9, --> ADP + fosfato de propionila), 2,6-diamino- 785 LMOMA CAETHG_351 heptanodioato:2-oxoglutarato aminotransferase (H2O 2 0, + L-glutamato + H+ + tetra-hidrodipicolinato <-- 2- CAETHG_049 Oxoglutarato + LL-2,6-Diaminopimelato), 8 cistationina beta-liase (H2O + cistationina --> NH3 + piruvato + homocisteína) 13 Rendime 3 CAETHG_302 L-arginina imino-hidrolase (H2O + L-arginina <=> 0 0,08 nto - 1, NH3 + citrulina), ATP:acetato fosfotransferase (ATP + 750 LMOMA CAETHG_335 H+ + propionato --> ADP + fosfato de propionila), 4 9, 2,6-diamino-heptanodioato:2-oxoglutarato CAETHG_351 aminotransferase (H2O + L-Glutamato + H+ + tetra- 0 hidrodipicolinato <-- 2-Oxoglutarato + LL-2,6- Diaminopimelato) 14 Rendime 2 CAETHG_335 ATP:acetato fosfotransferase (ATP + H+ + propionato 0 0,08 nto - 9, --> ADP + fosfato de propionila), 2,6-diamino- 746 LMOMA CAETHG_351 heptanodioato:2-oxoglutarato aminotransferase (H2O 4 0 + L-glutamato + H+ + tetra-hidrodipicolinato <-- 2- oxoglutarato + LL-2,6-Diaminopimelato) 15 Rendime 2 CAETHG_272 Fosfoenolpiruvato carboxiquinase (PPCK) (ATP + 0 0,07 nto - 1, oxaloacetato + H+ --> ADP + CO2 + 928 LMOMA CAETHG_335 fosfoenolpiruvato), ATP:acetato fosfotransferase (ATP 4 9 + H+ + propionato --> ADP + propionil fosfato) 16 Rendime 2 CAETHG_272 Fosfoenolpiruvato carboxiquinase (PPCK) (ATP + 0 0,07 nto - 1, oxaloacetato + H+ --> ADP + CO2 + 928 LMOMA CAETHG_335 Fosfoenolpiruvato), fosfato transacetilase (fosfato + 4 8 acetil-CoA + H+ <=> CoA + acetilfosfato) 17 Rendime 2 CAETHG_293 Alfa-acetolactato descarboxilase (ALCTT --> CO2 + 0 0,07 nto - 2, (R)-Acetoína), fosfato transacetilase (fosfato + acetil- 369 LMOMA CAETHG_335 CoA + H+ <=> CoA + acetilfosfato) 2 8 18 Rendime 2 CAETHG_335 Fosfato transacetilase (fosfato + acetil-CoA + H+ <=> 0 0,05 nto - 8, CoA + acetilfosfato), L-treonina acetaldeído-liase (L- 742 LMOMA CAETHG_068 treonina --> glicina + acetaldeído) 8 6 19 Rendime 2 CAETHG_335 Fosfato transacetilase (fosfato + acetil-CoA + H+ <=> 0 0,05 nto - 8, CoA + acetilfosfato), beta-liase de cistationina (H2O 484 LMOMA CAETHG_049 + cistationina --> NH3 + piruvato + homocisteína) 4 8 20 Rendime 2 CAETHG_137 Adenosina 5'-monofosfato fosfo-hidrolase (H2O + 0 0,05 nto - 1, AMP <=> fosfato + H+ + adenosina), fosfato 466 LMOMA CAETHG_335 transacetilase (fosfato + acetil-CoA + H+ <=> CoA + 4 8 acetilfosfato) 21 Rendime 2 CAETHG_335 Fosfato transacetilase (fosfato + acetil-CoA + H+ <=> 0 0,05 nto - 8, CoA + acetilfosfato), D-ribose 1,5-fosfomutase 466 LMOMA CAETHG_392 (ribose 1-fosfato <=> ribose-5-fosfato) 4 4 22 Rendime 2 CAETHG_016 N-ribosilnicotinamida:ribosiltransferase de ortofosfato 0 0,05 nto - 0, (fosfato + N-ribosilnicotinamida <=> nicotinamida + 466 LMOMA CAETHG_335 1-fosfato de ribose), ATP:acetato fosfotransferase 4 9 (ATP + H+ + propionato --> ADP + fosfato de propionila)
256 / 294 23 Rendime 2 CAETHG_016 N-Ribosilnicotinamida:ortofosfato ribosiltransferase 0 0,05 nto - 0, (fosfato + N-ribosilnicotinamida <=> Nicotinamida + 466 LMOMA CAETHG_335 1-fosfato de ribose), fosfato transacetilase (fosfato + 4 8 Acetil-CoA + H+ <=> CoA + acetilfosfato) 24 Rendime 2 CAETHG_127 AMP:pirofosfato fosforibosiltransferase (PPi + AMP 0 0,05 nto - 0, <=> PRPP + Adenina), fosfato transacetilase (fosfato 458 LMOMA CAETHG_335 + acetil-CoA + H+ <=> Acetil-CoA + H+ <=> CoA + 8 acetilfosfato) 25 Rendime 2 CAETHG_247 dGTP trifosfo-hidrolase (H2O + dGTP --> H+ + 0 0,05 nto - 5, desoxiguanosina + trifosfato), fosfato transacetilase 300 LMOMA CAETHG_335 (fosfato + acetil-CoA + H+ <=> CoA + acetilfosfato) 4 8 26 Rendime 2 CAETHG_279 [FeFe]-hidrogenase bifurcadora de elétrons 0 0,05 nto - 9, dependente de NADP (Hyt) (NADP + ferredoxina 272 LMOMA CAETHG_335 oxidada + 2,0 H2 <=> NADPH + 3,0 H+ + 4 8 ferredoxina reduzida), fosfato transacetilase (fosfato + acetil-CoA + H+ <=> CoA + acetilfosfato) 27 Rendime 2 CAETHG_278 Formato hidrogênio-liase (também conhecida como 0 0,05 nto - 9, CO2 redutase dependente de hidrogênio) (CO2 + H2 - 272 LMOMA CAETHG_335 -> formato + H+), fosfato transacetilase (fosfato + 4 8 acetil-CoA + H+ <=> CoA + acetilfosfato) 28 Rendime 2 CAETHG_279 [FeFe]-hidrogenase bifurcadora de elétrons 0 0,05 nto - 5, dependente de NADP (Hyt) (NADP + ferredoxina 272 LMOMA CAETHG_335 oxidada + 2,0 H2 <=> NADPH + 3,0 H+ + 4 8 ferredoxina reduzida), fosfato transacetilase (fosfato + acetil-CoA + H+ <=> CoA + acetilfosfato) 29 Rendime 2 CAETHG_279 [FeFe]-hidrogenase bifurcadora de elétrons 0 0,05 nto - 4, dependente de NADP (Hyt) (NADP + ferredoxina 272 LMOMA CAETHG_335 oxidada + 2,0 H2 <=> NADPH + 3,0 H+ + 4 8 ferredoxina reduzida), fosfato transacetilase (fosfato + acetil-CoA + H+ <=> CoA + acetilfosfato) 30 Rendime 2 CAETHG_279 [FeFe]-hidrogenase bifurcadora de elétrons 0 0,05 nto - 6, dependente de NADP (Hyt) (NADP + ferredoxina 272 LMOMA CAETHG_335 oxidada + 2,0 H2 <=> NADPH + 3,0 H+ + 4 8 ferredoxina reduzida), fosfato transacetilase (fosfato + acetil-CoA + H+ <=> CoA + acetilfosfato) 31 Rendime 2 CAETHG_279 Formato hidrogênio-liase (também conhecida como 0 0,05 nto - 1, CO2 redutase dependente de hidrogênio) (CO2 + H2 - 272 LMOMA CAETHG_335 -> formato + H+), fosfato transacetilase (fosfato + 4 8 acetil-CoA + H+ <=> CoA + acetilfosfato) 32 Rendime 2 CAETHG_279 Formato hidrogênio-liase (também conhecida como 0 0,05 nto - 0, CO2 redutase dependente de hidrogênio) (CO2 + H2 - 272 LMOMA CAETHG_335 -> formato + H+), fosfato transacetilase (fosfato + 4 8 acetil-CoA + H+ <=> CoA + acetilfosfato) 33 Rendime 2 CAETHG_279 [FeFe]-hidrogenase bifurcadora de elétrons 0 0,05 nto - 8, dependente de NADP (Hyt) (NADP + ferredoxina 272 LMOMA CAETHG_335 oxidada + 2,0 H2 <=> NADPH + 3,0 H+ + 4 8 ferredoxina reduzida), fosfato transacetilase (fosfato + acetil-CoA + H+ <=> CoA + acetilfosfato) 34 Rendime 2 CAETHG_279 Formato hidrogênio-liase (também conhecida como 0 0,05 nto - 3, CO2 redutase dependente de hidrogênio) (CO2 + H2 - 272 LMOMA CAETHG_335 -> formato + H+), fosfato transacetilase (fosfato + 4 8 acetil-CoA + H+ <=> CoA + acetilfosfato) 35 Rendime 2 CAETHG_329 Cisteína dessulfidrase (H2O + L-cisteína <=> NH3 + 0 0,05 nto - 3, piruvato + H2S), fosfato transacetilase (fosfato + 271 LMOMA CAETHG_335 acetil-CoA + H+ <=> CoA + acetilfosfato) 2 8 36 Rendime 2 CAETHG_302 L-arginina imino-hidrolase (H2O + L-arginina <=> 0 0,05 nto - 1, NH3 + citrulina), fosfato transacetilase (fosfato + 265 LMOMA CAETHG_335 acetil-CoA + H+ <=> CoA + acetilfosfato) 2 8
257 / 294 37 Rendime 2 0, Acetil-CoA:dióxido de carbono ligase (formadora de 0 0,05 nto - CAETHG_335 ADP) (ATP + acetil-CoA + H2CO3 --> ADP + fosfato 261 LMOMA 8 + H+ + malonil-CoA), fosfato transacetilase (fosfato + 6 acetil-CoA + H+ <=> CoA + Acetilfosfato) 38 Rendime 2 CAETHG_023 4-imidazolona-5-propanoato amido-hidrolase (H2O + 0 0,05 nto - 3, 4-Imidazolona-5-propanoato --> N-Formimino-L- 261 LMOMA CAETHG_335 glutamato), fosfato transacetilase (fosfato + acetil- 6 8 CoA + H+ <=> CoA + acetilfosfato) 39 Rendime 2 CAETHG_023 4,5-di-hidro-4-oxo-5-imidazolpropanoato hidro-liase 0 0,05 nto - 4, (4-imidazolona-5-propanoato <=> H2O + Urocanato), 261 LMOMA CAETHG_335 fosfato transacetilase (fosfato + acetil-CoA + H+ <=> 6 8 CoA + acetilfosfato) 40 Rendime 2 CAETHG_023 4,5-di-hidro-4-oxo-5-imidazolpropanoato hidro-lilase 0 0,05 nto - 4, (4-imidazolona-5-propanoato <=> H2O + Urocanato), 261 LMOMA CAETHG_335 ATP:acetato fosfotransferase (ATP + H+ + propionato 6 9 --> ADP + fosfato de propionila) 41 Rendime 2 CAETHG_316 UMP: pirofosfato fosforibosiltransferase (Uracil + 0 0,05 nto - 4, PRPP --> PPi + UMP), fosfato transacetilase (fosfato 258 LMOMA CAETHG_335 + acetil-CoA + H+ <=> CoA + acetilfosfato) 4 8 42 Rendime 2 CAETHG_210 Absorção de potássio (K+_ext <=> K+), fosfato 0 0,05 nto - 7, transacetilase (fosfato + acetil-CoA + H+ <=> CoA + 258 LMOMA CAETHG_335 acetilfosfato) 8 43 Rendime 1 CAETHG_335 ATP:acetato fosfotransferase (ATP + H+ + Propionato 0 0,05 nto - 9 --> ADP + Propionil fosfato) 257 LMOMA 6 44 Rendime 1 CAETHG_335 Fosfato transacetilase (fosfato + acetil-CoA + H+ <=> 0 0,05 nto - 8 CoA + acetilfosfato) 257 LMOMA 6 45 Rendime 2 CAETHG_272 Fosfoenolpiruvato carboxiquinase (PPCK) (ATP + 0 0,02 nto - 1, oxaloacetato + H+ --> ADP + CO2 + 074 LMOMA CAETHG_275 Fosfoenolpiruvato), Citramalato sintase (H2O + 1 Piruvato + Acetil-CoA <=> CoA + Citramalato) 46 Rendime 2 CAETHG_272 Fosfoenolpiruvato carboxiquinase (PPCK) (ATP + 0 0,02 nto - 1, oxaloacetato + H+ --> ADP + CO2 + 07 LMOMA CAETHG_049 Fosfoenolpiruvato), cistationina beta-liase (H2O + 8 cistationina --> NH3 + piruvato + homocisteína) 47 Rendime 2 CAETHG_127 AMP:pirofosfato fosforibosiltransferase (PPi + AMP 0 0,02 nto - 0, <=> PRPP + Adenina), fosfoenolpiruvato 062 LMOMA CAETHG_272 carboxiquinase (PPCK) (ATP + oxaloacetato + H+ --> 8 1 ADP + CO2 + fosfoenolpiruvato) 48 Rendime 2 CAETHG_272 Fosfoenolpiruvato carboxiquinase (PPCK) (ATP + 0 0,02 nto - 1, oxaloacetato + H+ --> ADP + CO2 + 062 LMOMA CAETHG_392 fosfoenolpiruvato), D-ribose 1,5-fosfomutase (ribose 8 4 1-fosfato <=> ribose-5-fosfato) 49 Rendime 2 CAETHG_122 L-serina amônia-liase (L-serina --> NH3 + piruvato), 0 0,02 nto - 4, fosfoenolpiruvato carboxiquinase (PPCK) (ATP + 054 LMOMA CAETHG_272 oxaloacetato + H+ --> ADP + CO2 + 1 fosfoenolpiruvato) 50 Rendime 2 CAETHG_122 L-serina amônia-liase (L-serina --> NH3 + piruvato), 0 0,02 nto - 5, fosfoenolpiruvato carboxiquinase (PPCK) (ATP + 054 LMOMA CAETHG_272 oxaloacetato + H+ --> ADP + CO2 + 1 fosfoenolpiruvato) 51 Rendime 2 CAETHG_210 Absorção de potássio (K+_ext <=> K+), 0 0,02 nto - 7, Fosfoenolpiruvato carboxiquinase (PPCK) (ATP + 044 LMOMA CAETHG_272 Oxaloacetato + H+ --> ADP + CO2 + 8 1 Fosfoenolpiruvato) 52 Rendime 1 CAETHG_272 Fosfoenolpiruvato carboxiquinase (PPCK) (ATP + 0 0,02 nto - 1 oxaloacetato + H+ --> ADP + CO2 + 044 LMOMA Fosfoenolpiruvato) 4
258 / 294 53 Rendime 1 CAETHG_127 AMP:pirofosfato fosforibosiltransferase (PPi + AMP 0 0,02 nto - 0 <=> PRPP + adenina) 043 LMOMA 2 54 Rendime 1 CAETHG_016 N-ribosilnicotinamida:ortofosfato ribosiltransferase 0 0,02 nto - 0 (fosfato + N-ribosilnicotinamida <=> nicotinamida + 043 LMOMA ribose 1-fosfato) 2 55 Rendime 1 CAETHG_137 Adenosina 5'-monofosfato fosfo-hidrolase (H2O + 0 0,02 nto - 1 AMP <=> Fosfato + H+ + Adenosina) 043 LMOMA 2 56 Rendime 1 CAETHG_392 D-ribose 1,5-fosfomutase (ribose 1-fosfato <=> 0 0,02 nto - 4 ribose-5-fosfato) 043 LMOMA 2 57 Rendime 2 CAETHG_023 4,5-di-hidro-4-oxo-5-imidazolpropanoato hidro-liase 0 0,02 nto - 4, (4-imidazolona-5-propanoato <=> H2O + Urocanato), 003 LMOMA CAETHG_302 L-arginina imino-hidrolase (H2O + L-arginina <=> 2 1 NH3 + citrulina) EXEMPLO 12
[0096] Esse exemplo descreve rompimentos para melhorar a produção de metiletilcetona (MEK), isto é, 2-butanona, em microrganismos de Wood- Ljungdahl. Os experimentos de modelagem metabólica foram realizados como descrito no Exemplo 1. A produção de MEK em microrganismos de Wood-Ljungdahl é descrita, por exemplo, nos documentos WO 2012/024522 e WO 2013/185123. A seguinte via foi usada para modelar aqui a produção de metiletilcetona: NADH + H+ + (R)-Acetoína --> NAD + meso-2,3- butanodiol; meso-2,3-butanodiol --> H2O + MEK; H+ + MEK --> H+ _ext + MEK_ext. Pontuação de condicionamento Rendimento mínimo em FVA N° Genes rompidos Reações rompidas Genes rompidos Técnica físico N° 1 Rendime 5 0, Acetil-CoA:dióxido de carbono ligase (formadora de 0,04120 0,028 nto - CAETHG_016 ADP) (ATP + acetil-CoA + H2CO3 --> ADP + fosfato 524 LMOMA 0, + H+ + malonil-CoA), N- CAETHG_335 ribosilnicotinamida:ribosiltransferase de ortofosfato 9, (fosfato + N-ribosilnicotinamida <=> Nicotinamida + CAETHG_351 1-fosfato de ribose), ATP:acetato fosfotransferase (ATP 0, + H+ + propionato --> ADP + fosfato de propionila), CAETHG_049 2,6-diamino-heptanodioato:2-oxoglutarato 8 aminotransferase (H2O + L-glutamato + H+ + tetra- hidrodipicolinato <-- 2-Oxoglutarato + LL-2,6- Diaminopimelato), beta-liase de cistationina (H2O + cistationina --> NH3 + piruvato + homocisteína)
259 / 294 2 Rendime 5 0, Acetil-CoA:dióxido de carbono ligase (formadora de 0,04120 0,028 nto - CAETHG_137 ADP) (ATP + acetil-CoA + H2CO3 --> ADP + fosfato 524 LMOMA 1, + H+ + malonil-CoA), adenosina 5'-monofosfato fosfo- CAETHG_335 hidrolase (H2O + AMP <=> fosfato + H+ + adenosina), 9, ATP:acetato fosfotransferase (ATP + H+ + propionato - CAETHG_351 -> ADP + fosfato de propionila), 2,6-diamino- 0, heptanodioato:2-oxoglutarato aminotransferase (H2O + CAETHG_049 L-glutamato + H+ + glutamato + H+ + tetra- 8 hidrodipicolinato <-- 2-oxoglutarato + LL-2,6- Diaminopimelato), beta-liase de cistationina (H2O + Cistationina --> NH3 + piruvato + homocisteína) 3 Rendime 5 0, Acetil-CoA:dióxido de carbono ligase (formadora de 0,04120 0,028 nto - CAETHG_335 ADP) (ATP + acetil-CoA + H2CO3 --> ADP + fosfato 524 LMOMA 9, + H+ + malonil-CoA), ATP:acetato fosfotransferase CAETHG_351 (ATP + H+ + propionato --> ADP + Fosfato de 0, propionila), 2,6-diamino-heptanodioato:2-oxoglutarato CAETHG_392 aminotransferase (H2O + L-glutamato + H+ + tetra- 4, hidrodipicolinato <-- 2-oxoglutarato + LL-2,6- CAETHG_049 diaminopimelato), D-ribose 1,5-fosfomutase (ribose 1- 8 fosfato <=> ribose-5-fosfato), cistationina beta-liase (H2O + cistationina --> NH3 + piruvato + homocisteína) 4 Rendime 5 0, Acetil-CoA:dióxido de carbono ligase (formadora de 0,04120 0,028 nto - CAETHG_127 ADP) (ATP + acetil-CoA + H2CO3 --> ADP + fosfato 524 LMOMA 0, + H+ + malonil-CoA), AMP:pirofosfato CAETHG_335 fosforibosiltransferase (PPi + AMP <=> PRPP + 9, adenina), ATP:acetato fosfotransferase (ATP + H+ + CAETHG_351 propionato --> ADP + fosfato de propionila), 2,6- 0, diamino-heptanodioato:2-oxoglutarato CAETHG_049 aminotransferase (H2O + L-glutamato + H+ + tetra- 8 hidrodipicolinato <-- 2-oxoglutarato + LL-2,6- Diaminopimelato), beta-liase de cistationina (H2O + cistationina --> NH3 + piruvato + homocisteína) 5 Rendime 5 0, Acetil-CoA:dióxido de carbono ligase (formadora de 0,04120 0,028 nto - CAETHG_016 ADP) (ATP + acetil-CoA + H2CO3 --> ADP + fosfato 508 LMOMA 0, + H+ + malonil-CoA), N- CAETHG_335 ribosilnicotinamida:ribosiltransferase de ortofosfato 9, (fosfato + N-ribosilnicotinamida <=> Nicotinamida + CAETHG_351 1-fosfato de ribose), ATP:acetato fosfotransferase (ATP 0, + H+ + propionato --> ADP + fosfato de propionila), CAETHG_049 2,6-diamino-heptanodioato:2-oxoglutarato 8 aminotransferase (H2O + L-glutamato + H+ + tetra- hidrodipicolinato <-- 2-Oxoglutarato + LL-2,6- Diaminopimelato), beta-liase de cistationina (H2O + cistationina --> NH3 + piruvato + homocisteína) 6 Rendime 5 0, Acetil-CoA:dióxido de carbono ligase (formadora de 0,04120 0,028 nto - CAETHG_016 ADP) (ATP + acetil-CoA + H2CO3 --> ADP + fosfato 476 LMOMA 0, + H+ + malonil-CoA), N- CAETHG_302 ribosilnicotinamida:ribosiltransferase de ortofosfato 1, (fosfato + N-ribosilnicotinamida <=> Nicotinamida + CAETHG_335 1-fosfato de ribose), L-arginina imino-hidrolase (H2O 9, + L-arginina <=> NH3 + citrulina), ATP:acetato CAETHG_351 fosfotransferase (ATP + H+ + propionato --> ADP + 0 fosfato de propionila), 2,6-diamino-heptanodioato:2- oxoglutarato aminotransferase (H2O + L-glutamato + H+ + tetra-hidrodipicolinato <-- 2-Oxoglutarato + LL- 2,6-Diaminopimelato)
260 / 294 7 Rendime 5 CAETHG_016 N-ribosilnicotinamida:ortofosfato ribosiltransferase 0,04287 0,028 nto - 0, (fosfato + N-ribosilnicotinamida <=> Nicotinamida + 464 LMOMA CAETHG_275 ribose 1-fosfato), citramalato sintase (H2O + piruvato 1, + acetil-CoA <=> CoA + citramalato), ATP:acetato CAETHG_335 fosfotransferase (ATP + H+ + Propionato --> ADP + 9, fosfato de propionila), 2,6-diamino-heptanodioato:2- CAETHG_351 oxoglutarato aminotransferase (H2O + L-glutamato + 0, H+ + tetra-hidrodipicolinato <-- 2-oxoglutarato + LL- CAETHG_049 2,6-diaminopimelato), beta-cistationina beta (H2O + 8 Cistationina --> NH3 + Piruvato + Homocisteína) 8 Rendime 4 0, Acetil-CoA:dióxido de carbono ligase (formadora de 0,04120 0,028 nto - CAETHG_016 ADP) (ATP + acetil-CoA + H2CO3 --> ADP + fosfato 44 LMOMA 0, + H+ + malonil-CoA), N- CAETHG_335 ribosilnicotinamida:ribosiltransferase de ortofosfato 9, (fosfato + N-ribosilnicotinamida <=> Nicotinamida + CAETHG_351 1-fosfato de ribose), ATP:acetato fosfotransferase (ATP 0 + H+ + propionato --> ADP + fosfato de propionila), 2,6-diamino-heptanodioato:2-oxoglutarato aminotransferase (H2O + L-glutamato + H+ + tetra- hidrodipicolinato <-- 2-Oxoglutarato + LL-2,6- Diaminopimelato) 9 Rendime 4 0, Acetil-CoA:dióxido de carbono ligase (formadora de 0,04120 0,028 nto - CAETHG_335 ADP) (ATP + acetil-CoA + H2CO3 --> ADP + fosfato 44 LMOMA 9, + H+ + malonil-CoA), ATP:acetato fosfotransferase CAETHG_351 (ATP + H+ + propionato --> ADP + Fosfato de 0, propionila), 2,6-diamino-heptanodioato:2-oxoglutarato CAETHG_392 aminotransferase (H2O + L-glutamato + H+ + tetra- 4 hidrodipicolinato <-- 2-oxoglutarato + LL-2,6- diaminopimelato), D-ribose 1,5-fosfomutase (ribose 1- fosfato <=> ribose-5-fosfato) 10 Rendime 4 0, Acetil-CoA:dióxido de carbono ligase (formadora de 0,04120 0,028 nto - CAETHG_127 ADP) (ATP + acetil-CoA + H2CO3 --> ADP + fosfato 44 LMOMA 0, + H+ + malonil-CoA), AMP:pirofosfato CAETHG_335 fosforibosiltransferase (PPi + AMP <=> PRPP + 9, adenina), ATP:acetato fosfotransferase (ATP + H+ + CAETHG_351 propionato --> ADP + fosfato de propionila), 2,6- 0 diamino-heptanodioato:2-oxoglutarato aminotransferase (H2O + L-glutamato + H+ + tetra- hidrodipicolinato <-- 2-oxoglutarato + LL-2 6- Diaminopimelato) 11 Rendime 4 CAETHG_302 L-arginina imino-hidrolase (H2O + L-arginina <=> 0,04120 0,028 nto - 1, NH3 + citrulina), ATP:acetato fosfotransferase (ATP + 296 LMOMA CAETHG_335 H+ + propionato --> ADP + fosfato de propionila), 2,6- 9, diamino-heptanodioato:2-oxoglutarato CAETHG_351 aminotransferase (H2O + L-Glutamato + H+ + tetra- 0, hidrodipicolinato <-- 2-Oxoglutarato + LL-2,6- CAETHG_049 Diaminopimelato), beta-liase de cistationina (H2O + 8 cistationina --> NH3 + piruvato + homocisteína) 12 Rendime 3 CAETHG_335 ATP:acetato fosfotransferase (ATP + H+ + propionato - 0,04120 0,028 nto - 9, -> ADP + fosfato de propionila), 2,6-diamino- 28 LMOMA CAETHG_351 heptanodioato:2-oxoglutarato aminotransferase (H2O + 0, L-glutamato + H+ + tetra-hidrodipicolinato <-- 2- CAETHG_049 oxoglutarato + LL-2,6-Diaminopimelato), cistationina 8 beta-liase (H2O + Cistationina --> NH3 + Piruvato + Homocisteína)
261 / 294 13 Rendime 3 CAETHG_302 L-arginina imino-hidrolase (H2O + L-arginina <=> 0,04120 0,028 nto - 1, NH3 + citrulina), ATP:acetato fosfotransferase (ATP + 256 LMOMA CAETHG_335 H+ + propionato --> ADP + fosfato de propionila), 2,6- 9, diamino-heptanodioato:2-oxoglutarato CAETHG_351 aminotransferase (H2O + L-Glutamato + H+ + tetra- 0 hidrodipicolinato <-- 2-Oxoglutarato + LL-2,6- Diaminopimelato) 14 Rendime 3 CAETHG_335 ATP:acetato fosfotransferase (ATP + H+ + Propionato - 0,04120 0,028 nto - 9, -> ADP + Fosfato de propionila), 2,6-diamino- 252 LMOMA CAETHG_351 heptanodioato:2-oxoglutarato aminotransferase (H2O + 0, L-glutamato + H+ + tetra-hidrodipicolinato <-- 2- CAETHG_049 Oxoglutarato + LL-2,6-Diaminopimelato), cistationina 8 beta-liase (H2O + cistationina --> NH3 + piruvato + homocisteína) 15 Rendime 3 CAETHG_329 Cisteína dessulfidrase (H2O + L-cisteína <=> NH3 + 0,04120 0,028 nto - 3, piruvato + H2S), ATP:acetato fosfotransferase (ATP + 248 LMOMA CAETHG_335 H+ + propionato --> ADP + fosfato de propionila), 2,6- 9, diamino-heptanodioato:2-oxoglutarato CAETHG_351 aminotransferase (H2O + L-Glutamato + H+ + tetra- 0 hidrodipicolinato <-- 2-Oxoglutarato + LL-2,6- Diaminopimelato) 16 Rendime 2 CAETHG_335 ATP:acetato fosfotransferase (ATP + H+ + propionato - 0,04120 0,028 nto - 9, -> ADP + fosfato de propionila), 2,6-diamino- 24 LMOMA CAETHG_351 heptanodioato:2-oxoglutarato aminotransferase (H2O + 0 L-glutamato + H+ + tetra-hidrodipicolinato <-- 2- oxoglutarato + LL-2,6-Diaminopimelato) 17 Rendime 2 CAETHG_335 Fosfato transacetilase (fosfato + acetil-CoA + H+ <=> 0 0,028 nto - 8, CoA + acetilfosfato), 2,6-diamino-heptanodioato:2- 24 LMOMA CAETHG_351 oxoglutarato aminotransferase (H2O + L-glutamato + 0 H+ + tetra-hidrodipicolinato <-- 2-oxoglutarato + LL- 2,6-Diaminopimelato) 18 Rendime 3 CAETHG_302 L-arginina imino-hidrolase (H2O + L-arginina <=> 0 0,028 nto - 1, NH3 + citrulina), ATP:acetato fosfotransferase (ATP + 224 LMOMA CAETHG_335 H+ + propionato --> ADP + fosfato de propionila), 2,6- 9, diamino-heptanodioato:2-oxoglutarato CAETHG_351 aminotransferase (H2O + L-Glutamato + H+ + tetra- 0 hidrodipicolinato <-- 2-Oxoglutarato + LL-2,6- Diaminopimelato) 19 Rendime 2 CAETHG_335 ATP:acetato fosfotransferase (ATP + H+ + propionato - 0 0,028 nto - 9, -> ADP + fosfato de propionila), 2,6-diamino- 216 LMOMA CAETHG_351 heptanodioato:2-oxoglutarato aminotransferase (H2O + 0 L-glutamato + H+ + tetra-hidrodipicolinato <-- 2- oxoglutarato + LL-2,6-Diaminopimelato) 20 Rendime 3 CAETHG_016 N-Ribosilnicotinamida:ribosiltransferase de ortofosfato 0 0,027 nto - 0, (fosfato + N-ribosilnicotinamida <=> Nicotinamida + 74 LMOMA CAETHG_335 1-fosfato de ribose), ATP:acetato fosfotransferase (ATP 9, + H+ + propionato --> ADP + fosfato de propionila), CAETHG_049 cistationina beta-liase (H2O + cistationina --> NH3 + 8 piruvato + homocisteína) 21 Rendime 3 CAETHG_335 ATP:acetato fosfotransferase (ATP + H+ + propionato - 0 0,027 nto - 9, -> ADP + fosfato de propionila), D-ribose 1,5- 74 LMOMA CAETHG_392 fosfomutase (ribose 1-fosfato <=> ribose-5-fosfato), 4, cistationina beta-liase (H2O + cistationina --> NH3 + CAETHG_049 piruvato + homocisteína) 8 22 Rendime 3 CAETHG_127 AMP:pirofosfato fosforibosiltransferase (PPi + AMP 0 0,027 nto - 0, <=> PRPP + adenina), ATP:acetato fosfotransferase 74 LMOMA CAETHG_335 (ATP + H+ + propionato --> ADP + fosfato de 9, propionila), cistationina beta-liase (H2O + cistationina CAETHG_049 --> NH3 + piruvato + homocisteína) 8
262 / 294 23 Rendime 3 CAETHG_137 Adenosina 5'-monofosfato fosfo-hidrolase (H2O + 0 0,027 nto - 1, AMP <=> fosfato + H+ + adenosina), ATP:acetato 74 LMOMA CAETHG_335 fosfotransferase (ATP + H+ + propionato --> ADP + 9, fosfato de propionila), cistationina beta-liase (H2O + CAETHG_049 cistationina --> NH3 + Piruvato + homocisteína) 8 24 Rendime 2 CAETHG_335 ATP:acetato fosfotransferase (ATP + H+ + propionato - 0 0,027 nto - 9, -> ADP + fosfato de propionila), beta-liase de 712 LMOMA CAETHG_049 cistationina (H2O + cistationina --> NH3 + piruvato + 8 homocisteína) 25 Rendime 3 CAETHG_302 L-arginina imino-hidrolase (H2O + L-arginina <=> 0 0,027 nto - 1, NH3 + citrulina), ATP:acetato fosfotransferase (ATP + 688 LMOMA CAETHG_335 H+ + propionato --> ADP + fosfato de propionila), D- 9, ribose 1,5-fosfomutase (ribose 1-fosfato <=> ribose-5- CAETHG_392 fosfato) 4 26 Rendime 2 CAETHG_127 AMP:pirofosfato fosforibosiltransferase (PPi + AMP 0 0,027 nto - 0, <=> PRPP + adenina), ATP:acetato fosfotransferase 676 LMOMA CAETHG_335 (ATP + H+ + propionato --> ADP + propionil fosfato) 9 27 Rendime 2 CAETHG_016 N-ribosilnicotinamida:ribosiltransferase de ortofosfato 0 0,027 nto - 0, (fosfato + N-ribosilnicotinamida <=> nicotinamida + 676 LMOMA CAETHG_335 1-fosfato de ribose), ATP:acetato fosfotransferase (ATP 9 + H+ + propionato --> ADP + fosfato de propionila) 28 Rendime 2 CAETHG_137 Adenosina 5'-monofosfato fosfo-hidrolase (H2O + 0 0,027 nto - 1, AMP <=> Fosfato + H+ + Adenosina), ATP:acetato 676 LMOMA CAETHG_335 fosfotransferase (ATP + H+ + Propionato --> ADP + 9 Propionil fosfato) 29 Rendime 2 CAETHG_335 ATP:acetato fosfotransferase (ATP + H+ + propionato - 0 0,027 nto - 9, -> ADP + fosfato de propionila), D-ribose 1,5- 676 LMOMA CAETHG_392 fosfomutase (ribose 1-fosfato <=> ribose-5-fosfato) 4 30 Rendime 2 CAETHG_127 AMP:pirofosfato fosforibosiltransferase (PPi + AMP 0 0,027 nto - 0, <=> PRPP + Adenina), fosfato transacetilase (fosfato + 676 LMOMA CAETHG_335 acetil-CoA + H+ <=> Acetil-CoA + H+ <=> CoA + 8 acetilfosfato) 31 Rendime 2 CAETHG_302 L-arginina imino-hidrolase (H2O + L-arginina <=> 0 0,027 nto - 1, NH3 + citrulina), ATP:acetato fosfotransferase (ATP + 656 LMOMA CAETHG_335 H+ + propionato --> ADP + fosfato de propionila) 9 32 Rendime 1 CAETHG_335 ATP:acetato fosfotransferase (ATP + H+ + Propionato - 0 0,027 nto - 9 -> ADP + Propionil fosfato) 644
LMOMA 33 Rendime 1 CAETHG_335 Fosfato transacetilase (fosfato + acetil-CoA + H+ <=> 0 0,027 nto - 8 CoA + acetilfosfato) 644
LMOMA EXEMPLO 13
[0097] Esse exemplo descreve rompimentos para melhorar a produção de acetolactato em microrganismos de Wood-Ljungdahl. Os experimentos de modelagem metabólica foram realizados como descrito no Exemplo 1. O acetolactato é um produto nativo de pelo menos alguns microrganismos de Wood-Ljungdahl.
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Pontuação de condicionamento Rendimento mínimo em FVA N° Genes rompidos
Reações rompidas Genes rompidos Técnica físico N°
1 Rendime 5 CAETHG_275 Citramalato sintase (H2O + Piruvato + Acetil-CoA <=> 0,079303 0,195 nto - 1, CoA + Citramalato), alfa-acetolactato descarboxilase 63 LMOMA CAETHG_293 (ALCTT --> CO2 + (R)-Acetoína), ATP:acetato 2, fosfotransferase (ATP + H+ + propionato --> ADP + CAETHG_335 Fosfato de propionila), 2,6-diamino-heptanodioato:2- 9, oxoglutarato aminotransferase (H2O + L-glutamato + CAETHG_351 H+ + tetra-hidrodipicolinato <-- 2-oxoglutarato + LL- 0, 2,6-diaminopimelato), cistationina beta-liase (H2O + CAETHG_049 cistationina --> NH3 + Piruvato + Homocisteína) 8 2 Rendime 5 CAETHG_137 Adenosina 5'-monofosfato fosfo-hidrolase (H2O + AMP 0,077232 0,195 nto - 1, <=> Fosfato + H+ + Adenosina), alfa-acetolactato 495 LMOMA CAETHG_293 descarboxilase (ALCTT --> CO2 + (R)-Acetoína), 2, ATP:acetato fosfotransferase (ATP + H+ + propionato -- CAETHG_335 > ADP + fosfato de propionila), 2,6-diamino- 9, heptanodioato:2-oxoglutarato aminotransferase (H2O + CAETHG_351 L-glutamato + H+ + tetra-hidrodipicolinato <-- 2- 0, oxoglutarato + LL-2,6-diaminopimelato), cistationina CAETHG_049 beta-liase (H2O + cistationina --> NH3 + piruvato + 8 homocisteína) 3 Rendime 5 CAETHG_016 N-Ribosilnicotinamida:ortofosfato ribosiltransferase 0,077232 0,195 nto - 0, (fosfato + N-ribosilnicotinamida <=> Nicotinamida + 495 LMOMA CAETHG_293 ribose 1-fosfato), alfa-acetolactato descarboxilase 2, (ALCTT --> CO2 + (R)-Acetoína), ATP:acetato CAETHG_335 fosfotransferase (ATP + H+ + Propionato --> ADP + 9, fosfato de propionila), 2,6-diamino-heptanodioato:2- CAETHG_351 oxoglutarato aminotransferase (H2O + L-glutamato + 0, H+ + tetra-hidrodipicolinato <-- 2-oxoglutarato + LL- CAETHG_049 2,6-diaminopimelato), cistationina beta-liase (H2O + 8 Cistationina --> NH3 + Piruvato + Homocisteína) 4 Rendime 5 CAETHG_293 Alfa-acetolactato descarboxilase (ALCTT --> CO2 + 0,077232 0,195 nto - 2, (R)-Acetoína), ATP:acetato fosfotransferase (ATP + H+ 495 LMOMA CAETHG_335 + propionato --> ADP + fosfato de propionila), 2,6- 9, diamino-heptanodioato:2-oxoglutarato aminotransferase CAETHG_351 (H2O + L-Glutamato + H+ + tetra-hidrodipicolinato <-- 0, 2-Oxoglutarato + LL-2,6-Diaminopimelato), D-ribose CAETHG_392 1,5-fosfomutase (ribose 1-fosfato <=> ribose-5-fosfato), 4, cistationina beta-liase (H2O + Cistationina --> NH3 + CAETHG_049 Piruvato + Homocisteína) 8
264 / 294 5 Rendime 5 CAETHG_127 AMP:pirofosfato fosforibosiltransferase (PPi + AMP 0,077232 0,195 nto - 0, <=> PRPP + Adenina), alfa-acetolactato descarboxilase 495 LMOMA CAETHG_293 (ALCTT --> CO2 + (R)-Acetoína), ATP:acetato 2, fosfotransferase (ATP + H+ + propionato --> ADP + CAETHG_335 fosfato de propionila), 2,6-Diamino-heptanodioato:2- 9, oxoglutarato aminotransferase (H2O + L-glutamato + CAETHG_351 H+ + tetra-hidrodipicolinato <-- 2-Oxoglutarato + LL- 0, 2,6-Diaminopimelato), cistationina beta-liase (H2O + CAETHG_049 cistationina --> NH3 + Piruvato + homocisteína) 8 6 Rendime 4 CAETHG_272 Fosfoenolpiruvato carboxiquinase (PPCK) (ATP + 0 0,167 nto - 1, oxaloacetato + H+ --> ADP + CO2 + 21 LMOMA CAETHG_275 Fosfoenolpiruvato), isocitrato desidrogenase (NAD + 3, isocitrato <=> NADH + CO2 + 2-oxoglutarato + H+), CAETHG_335 fosfato transacetilase (fosfato + acetil-CoA + H+ <=> 8, CoA + acetilfosfato), L-treonina acetaldeído-liase (L- CAETHG_068 treonina --> glicina + acetaldeído) 6 7 Rendime 4 CAETHG_275 Isocitrato desidrogenase (NAD + Isocitrato <=> NADH 0 0,164 nto - 3, + CO2 + 2-Oxoglutarato + H+), cisteína dessulfidrase 56 LMOMA CAETHG_329 (H2O + L-cisteína <=> NH3 + piruvato + H2S), fosfato 3, transacetilase (fosfato + acetil-CoA + H+ <=> CoA + CAETHG_335 acetilfosfato), L-treonina acetaldeído-liase (L-treonina -- 8, > glicina + acetaldeído) CAETHG_068 6 8 Rendime 4 CAETHG_335 Fosfato transacetilase (fosfato + acetil-CoA + H+ <=> 0 0,163 nto - 8, CoA + acetilfosfato), 2,6-diamino-heptanodioato:2- 01 LMOMA CAETHG_351 oxoglutarato aminotransferase (H2O + L-glutamato + 0, H+ + tetra-hidrodipicolinato <-- 2-oxoglutarato + LL- CAETHG_392 2,6-Diaminopimelato), D-ribose 1,5-fosfomutase (ribose 4, 1-fosfato <=> ribose-5-fosfato), cistationina beta-liase CAETHG_049 (H2O + cistationina --> NH3 + piruvato + homocisteína) 8 9 Rendime 3 CAETHG_335 Fosfato transacetilase (fosfato + acetil-CoA + H+ <=> 0 0,162 nto - 8, CoA + acetilfosfato), 2,6-diamino-heptanodioato:2- 785 LMOMA CAETHG_351 oxoglutarato aminotransferase (H2O + L-glutamato + 0, H+ + tetra-hidrodipicolinato <-- 2-oxoglutarato + LL- CAETHG_049 2,6-Diaminopimelato), beta-liase de cistationina (H2O + 8 cistationina --> NH3 + piruvato + homocisteína) 10 Rendime 3 CAETHG_335 Fosfato transacetilase (fosfato + acetil-CoA + H+ <=> 0 0,161 nto - 8, CoA + acetilfosfato), 2,6-diamino-heptanodioato:2- 69 LMOMA CAETHG_351 oxoglutarato aminotransferase (H2O + L-glutamato + 0, H+ + tetra-hidrodipicolinato <-- 2-oxoglutarato + LL- CAETHG_392 2,6-Diaminopimelato), D-ribose 1,5-fosfomutase (ribose 4 1-fosfato <=> ribose-5-fosfato) 11 Rendime 3 CAETHG_137 Adenosina 5'-monofosfato fosfo-hidrolase (H2O + AMP 0 0,161 nto - 1, <=> Fosfato + H+ + Adenosina), fosfato transacetilase 69 LMOMA CAETHG_335 (fosfato + acetil-CoA + H+ <=> CoA + acetilfosfato), 8, 2,6-Diamino-heptanodioato:2-oxoglutarato CAETHG_351 aminotransferase (H2O + L-Glutamato + H+ + tetra- 0 hidrodipicolinato <-- 2-Oxoglutarato + LL-2,6- Diaminopimelato) 12 Rendime 3 CAETHG_016 N-Ribosilnicotinamida:ortofosfato ribosiltransferase 0 0,161 nto - 0, (Fosfato + N-Ribosilnicotinamida <=> Nicotinamida + 69 LMOMA CAETHG_335 Ribose 1-fosfato), fosfato transacetilase (fosfato + 8, acetil-CoA + H+ <=> CoA + acetilfosfato), 2,6-diamino- CAETHG_351 heptanodioato:2-oxoglutarato aminotransferase (H2O + 0 L-glutamato + H+ + tetra-hidrodipicolinato <-- 2- Oxoglutarato + LL-2,6-Diaminopimelato)
265 / 294 13 Rendime 3 CAETHG_293 Alfa-acetolactato descarboxilase (ALCTT --> CO2 + 0,077231 0,159 nto - 2, (R)-Acetoína), fosfato transacetilase (fosfato + acetil- 09 LMOMA CAETHG_335 CoA + H+ <=> CoA + acetilfosfato), 2,6-diamino- 8, heptanodioato:2-oxoglutarato aminotransferase (H2O + CAETHG_351 L-Glutamato + H+ + tetra-hidrodipicolinato <-- 2- 0 Oxoglutarato + LL-2,6-Diaminopimelato) 14 Rendime 3 CAETHG_329 Cisteína dessulfidrase (H2O + L-cisteína <=> NH3 + 0 0,153 nto - 3, piruvato + H2S), fosfato transacetilase (fosfato + acetil- 44 LMOMA CAETHG_335 CoA + H+ <=> CoA + acetilfosfato), 2,6-diamino- 8, heptanodioato:2,6-diamino-heptanodioato:2- CAETHG_351 oxoglutarato aminotransferase (H2O + L-Glutamato + 0 H+ + tetra-hidrodipicolinato <-- 2-Oxoglutarato + LL- 2,6-Diaminopimelato) 15 Rendime 3 CAETHG_335 Fosfato transacetilase (fosfato + acetil-CoA + H+ <=> 0 0,150 nto - 8, CoA + acetilfosfato), 2,6-diamino-heptanodioato:2- 755 LMOMA CAETHG_351 oxoglutarato aminotransferase (H2O + L-glutamato + 0, H+ + tetra-hidrodipicolinato <-- 2-oxoglutarato + LL- CAETHG_090 2,6-Diaminopimelato), pré-fenato:NAD+ oxidorredutase 9 (descarboxilação) (NAD + pré-fenato --> NADH + CO2 + p-hidroxifenilpiruvato) 16 Rendime 3 CAETHG_302 L-arginina imino-hidrolase (H2O + L-arginina <=> NH3 0 0,150 nto - 1, + citrulina), fosfato transacetilase (fosfato + acetil-CoA 38 LMOMA CAETHG_335 + H+ <=> CoA + acetilfosfato), 2,6-diamino- 8, heptanodioato:2-oxoglutarato aminotransferase (H2O + CAETHG_351 L-Glutamato + H+ + tetra-hidrodipicolinato <-- 2- 0 Oxoglutarato + LL-2,6-Diaminopimelato) 17 Rendime 2 CAETHG_335 ATP:acetato fosfotransferase (ATP + H+ + propionato -- 0 0,150 nto - 9, > ADP + fosfato de propionila), 2,6-diamino- 325 LMOMA CAETHG_351 heptanodioato:2-oxoglutarato aminotransferase (H2O + 0 L-glutamato + H+ + tetra-hidrodipicolinato <-- 2- oxoglutarato + LL-2,6-Diaminopimelato) 18 Rendime 2 CAETHG_335 Fosfato transacetilase (fosfato + acetil-CoA + H+ <=> 0 0,150 nto - 8, CoA + acetilfosfato), 2,6-diamino-heptanodioato:2- 325 LMOMA CAETHG_351 oxoglutarato aminotransferase (H2O + L-glutamato + 0 H+ + tetra-hidrodipicolinato <-- 2-oxoglutarato + LL- 2,6-Diaminopimelato) 19 Rendime 4 CAETHG_016 N-ribosilnicotinamida:ortofosfato ribosiltransferase 0 0,135 nto - 0, (fosfato + N-ribosilnicotinamida <=> nicotinamida + 79 LMOMA CAETHG_275 ribose 1-fosfato), isocitrato desidrogenase (NAD + 3, isocitrato <=> NADH + CO2 + 2-oxoglutarato + H+), CAETHG_335 fosfato transacetilase (fosfato + acetil-CoA + H+ <=> 8, CoA + acetilfosfato), L-treonina acetaldeído-liase (L- CAETHG_068 treonina --> glicina + acetaldeído) 6 20 Rendime 3 CAETHG_275 Isocitrato desidrogenase (NAD + Isocitrato <=> NADH 0 0,130 nto - 3, + CO2 + 2-Oxoglutarato + H+), fosfato transacetilase 2 LMOMA CAETHG_335 (fosfato + acetil-CoA + H+ <=> CoA + acetilfosfato), L- 8, treonina acetaldeído-liase (L-treonina --> Glicina + CAETHG_068 Acetaldeído) 6 21 Rendime 3 CAETHG_272 Fosfoenolpiruvato carboxiquinase (PPCK) (ATP + 0 0,127 nto - 1, oxaloacetato + H+ --> ADP + CO2 + 735 LMOMA CAETHG_335 Fosfoenolpiruvato), fosfato transacetilase (fosfato + 8, acetil-CoA + H+ <=> CoA + acetilfosfato), L-treonina CAETHG_068 acetaldeído liase (L-treonina --> Glicina + acetaldeído) 6 22 Rendime 2 CAETHG_272 Fosfoenolpiruvato carboxiquinase (PPCK) (ATP + 0 0,120 nto - 1, oxaloacetato + H+ --> ADP + CO2 + 09 LMOMA CAETHG_335 Fosfoenolpiruvato), fosfato transacetilase (fosfato + 8 acetil-CoA + H+ <=> CoA + acetilfosfato)
266 / 294 23 Rendime 3 CAETHG_137 Adenosina 5'-monofosfato fosfo-hidrolase (H2O + AMP 0 0,110 nto - 1, <=> Fosfato + H+ + Adenosina), fosfato transacetilase 555 LMOMA CAETHG_335 (fosfato + acetil-CoA + H+ <=> CoA + acetilfosfato), L- 8, treonina acetaldeído-liase (L-treonina --> Glicina + CAETHG_068 Acetaldeído) 6 24 Rendime 3 CAETHG_016 N-Ribosilnicotinamida:ribofiltransferase de ortofosfato 0 0,110 nto - 0, (fosfato + N-ribosilnicotinamida <=> Nicotinamida + 1- 555 LMOMA CAETHG_335 fosfato de ribose), fosfato transacetilase (fosfato + 8, acetil-CoA + H+ <=> CoA + acetilfosfato) L-treonina CAETHG_068 acetaldeído liase (L-treonina --> Glicina + Acetaldeído) 6 25 Rendime 3 CAETHG_335 Fosfato transacetilase (fosfato + acetil-CoA + H+ <=> 0 0,109 nto - 8, CoA + acetilfosfato), cistationina beta-liase (H2O + 17 LMOMA CAETHG_049 cistationina --> NH3 + piruvato + homocisteína), L- 8, treonina acetaldeído-liase (L-treonina --> glicina + CAETHG_068 Acetaldeído) 6 26 Rendime 3 CAETHG_302 L-arginina imino-hidrolase (H2O + L-arginina <=> NH3 0 0,107 nto - 1, + citrulina), fosfato transacetilase (fosfato + acetil-CoA 34 LMOMA CAETHG_335 + H+ <=> CoA + acetilfosfato), L-treonina acetaldeído- 8, liase (L-treonina --> glicina + Acetaldeído) CAETHG_068 6 27 Rendime 3 CAETHG_316 UMP: pirofosfato fosforibosiltransferase (Uracil + PRPP 0 0,107 nto - 4, --> PPi + UMP), fosfato transacetilase (fosfato + acetil- 25 LMOMA CAETHG_335 CoA + H+ <=> CoA + acetilfosfato), L-Treonina 8, acetaldeído-liase (L-Treonina --> Glicina + Acetaldeído) CAETHG_068 6 28 Rendime 2 CAETHG_335 Fosfato transacetilase (fosfato + acetil-CoA + H+ <=> 0 0,107 nto - 8, CoA + acetilfosfato), L-treonina acetaldeído-liase (L- 22 LMOMA CAETHG_068 treonina --> glicina + acetaldeído) 6 29 Rendime 2 CAETHG_335 ATP:acetato fosfotransferase (ATP + H+ + Propionato -- 0 0,107 nto - 9, > ADP + fosfato de propionila), L-treonina acetaldeído- 22 LMOMA CAETHG_068 liase (L-treonina --> glicina + acetaldeído) 6 30 Rendime 3 CAETHG_335 Fosfato transacetilase (fosfato + acetil-CoA + H+ <=> 0 0,104 nto - 8, CoA + acetilfosfato), D-ribose 1,5-fosfomutase (1- 905 LMOMA CAETHG_392 fosfato de ribose <=> ribose-5-fosfato), beta-liase de 4, cistationina (H2O + cistationina --> NH3 + Piruvato + CAETHG_049 Homocisteína) 8 31 Rendime 3 CAETHG_127 AMP:pirofosfato fosforibosiltransferase (PPi + AMP 0 0,104 nto - 0, <=> PRPP + Adenina), fosfato transacetilase (fosfato + 905 LMOMA CAETHG_335 acetil-CoA + H+ <=> CoA + acetilfosfato), cistationina 8, beta-liase (H2O + cistationina --> NH3 + piruvato + CAETHG_049 homocisteína) 8 32 Rendime 3 CAETHG_016 N-Ribosilnicotinamida:ribosiltransferase de ortofosfato 0 0,104 nto - 0, (fosfato + N-ribosilnicotinamida <=> Nicotinamida + 1- 905 LMOMA CAETHG_335 fosfato de ribose), fosfato transacetilase (fosfato + 8, acetil-CoA + H+ <=> CoA + acetilfosfato), cistationina CAETHG_049 beta-liase (H2O + Cistationina --> NH3 + Piruvato + 8 Homocisteína)
267 / 294 33 Rendime 3 CAETHG_329 2-Desoxi-D-ribose-5-fosfato acetaldeído-liase 0 0,103 nto - 9, (desoxirribose-5-fosfato <=> acetaldeído + 31 LMOMA CAETHG_335 gliceraldeído3-fosfato), fosfato transacetilase (fosfato + 8, acetil-CoA + H+ <=> CoA + acetilfosfato), cistationina CAETHG_049 beta-liase (H2O + Cistationina --> NH3 + Piruvato + 8 Homocisteína) 34 Rendime 3 CAETHG_302 L-arginina imino-hidrolase (H2O + L-arginina <=> NH3 0 0,102 nto - 1, + citrulina), fosfato transacetilase (fosfato + acetil-CoA 28 LMOMA CAETHG_335 + H+ <=> CoA + acetilfosfato), cistationina beta-liase 8, (H2O + cistationina --> NH3 + piruvato + CAETHG_049 Homocisteína) 8 35 Rendime 3 CAETHG_316 UMP: pirofosfato fosforibosiltransferase (Uracil + PRPP 0 0,102 nto - 4, --> PPi + UMP), fosfato transacetilase (fosfato + acetil- 18 LMOMA CAETHG_335 CoA + H+ <=> CoA + acetilfosfato), cistationina beta- 8, liase (H2O + cistationina --> NH3 + piruvato + CAETHG_049 homocisteína) 8 36 Rendime 2 CAETHG_335 Fosfato transacetilase (fosfato + acetil-CoA + H+ <=> 0 0,102 nto - 8, CoA + acetilfosfato), beta-liase de cistationina (H2O + 155 LMOMA CAETHG_049 cistationina --> NH3 + piruvato + homocisteína) 8 37 Rendime 2 CAETHG_137 Adenosina 5'-monofosfato fosfo-hidrolase (H2O + AMP 0 0,101 nto - 1, <=> fosfato + H+ + adenosina), fosfato transacetilase 47 LMOMA CAETHG_335 (fosfato + acetil-CoA + H+ <=> CoA + acetilfosfato) 8 38 Rendime 2 CAETHG_127 AMP:pirofosfato fosforibosiltransferase (PPi + AMP 0 0,101 nto - 0, <=> PRPP + Adenina), fosfato transacetilase (fosfato + 47 LMOMA CAETHG_335 acetil-CoA + H+ <=> Acetil-CoA + H+ <=> CoA + 8 acetilfosfato) 39 Rendime 2 CAETHG_335 Fosfato transacetilase (fosfato + acetil-CoA + H+ <=> 0 0,101 nto - 8, CoA + acetilfosfato), D-ribose 1,5-fosfomutase (ribose 47 LMOMA CAETHG_392 1-fosfato <=> ribose-5-fosfato) 4 40 Rendime 2 CAETHG_016 N-Ribosilnicotinamida:ortofosfato ribosiltransferase 0 0,101 nto - 0, (fosfato + N-ribosilnicotinamida <=> Nicotinamida + 1- 47 LMOMA CAETHG_335 fosfato de ribose), fosfato transacetilase (fosfato + 8 Acetil-CoA + H+ <=> CoA + acetilfosfato) 41 Rendime 2 CAETHG_329 2-desoxi-D-ribose-5-fosfato acetaldeído-liase 0 0,099 nto - 9, (desoxirribose-5-fosfato <=> acetaldeído + gliceraldeído 74 LMOMA CAETHG_335 3-fosfato), fosfato transacetilase (fosfato + acetil-CoA + 8 H+ <=> CoA + acetilfosfato) 42 Rendime 2 CAETHG_247 dGTP trifosfo-hidrolase (H2O + dGTP --> H+ + 0 0,099 nto - 5, desoxiguanosina + trifosfato), fosfato transacetilase 725 LMOMA CAETHG_335 (fosfato + acetil-CoA + H+ <=> CoA + acetilfosfato) 8 43 Rendime 2 CAETHG_302 L-arginina imino-hidrolase (H2O + L-arginina <=> NH3 0 0,098 nto - 1, + citrulina), fosfato transacetilase (fosfato + acetil-CoA 8 LMOMA CAETHG_335 + H+ <=> CoA + acetilfosfato) 8 44 Rendime 2 CAETHG_316 UMP: pirofosfato fosforibosiltransferase (Uracil + PRPP 0 0,098 nto - 4, --> PPi + UMP), fosfato transacetilase (fosfato + acetil- 685 LMOMA CAETHG_335 CoA + H+ <=> CoA + acetilfosfato) 8 45 Rendime 2 CAETHG_210 Absorção de potássio (K+_ext <=> K+), fosfato 0 0,098 nto - 7, transacetilase (fosfato + acetil-CoA + H+ <=> CoA + 675 LMOMA CAETHG_335 acetilfosfato) 8 46 Rendime 1 CAETHG_335 Fosfato transacetilase (fosfato + acetil-CoA + H+ <=> 0 0,098 nto - 8 CoA + acetilfosfato) 67
LMOMA
268 / 294 47 Rendime 1 CAETHG_335 ATP:acetato fosfotransferase (ATP + H+ + Propionato -- 0 0,098 nto - 9 > ADP + Propionil fosfato) 67
LMOMA 48 Rendime 2 CAETHG_293 Alfa-acetolactato descarboxilase (ALCTT --> CO2 + 0 0,048 nto - 2, (R)-Acetoína), 1,5-fosfomutase de D-ribose (1-fosfato 115 LMOMA CAETHG_392 de ribose <=> ribose-5-fosfato) 4 49 Rendime 1 CAETHG_293 Alfa-acetolactato descarboxilase (ALCTT --> CO2 + 0 0,045 nto - 2 (R)-Acetoína) 52
LMOMA 50 Rendime 2 CAETHG_272 Fosfoenolpiruvato carboxiquinase (PPCK) (ATP + 0 0,021 nto - 1, oxaloacetato + H+ --> ADP + CO2 + 365 LMOMA CAETHG_090 Fosfoenolpiruvato), prefenado:NAD+ oxidorredutase 9 (descarboxilação) (NAD + pré-fenoleno --> NADH + CO2 + p-hidroxifenilpiruvato) 51 Rendime 2 CAETHG_024 Transporte reversível de L-lactato via simporte de 0 0,021 nto - 8, prótons (H+_ext + L-Lactato_ext <=> H+ + L-lactato), 235 LMOMA CAETHG_272 Fosfoenolpiruvato carboxiquinase (PPCK) (ATP + 1 Oxaloacetato + H+ --> ADP + CO2 + Fosfoenolpiruvato) 52 Rendime 2 CAETHG_127 AMP:pirofosfato fosforibosiltransferase (PPi + AMP 0 0,021 nto - 0, <=> PRPP + Adenina), fosfoenolpiruvato 15 LMOMA CAETHG_272 carboxiquinase (PPCK) (ATP + oxaloacetato + H+ --> 1 ADP + CO2 + fosfoenolpiruvato) 53 Rendime 2 CAETHG_016 N-Ribosilnicotinamida:ortofosfato ribosiltransferase 0 0,021 nto - 0, (fosfato + N-ribosilnicotinamida <=> Nicotinamida + 15 LMOMA CAETHG_272 ribose 1-fosfato), Fosfoenolpiruvato carboxiquinase 1 (PPCK) (ATP + oxaloacetato + H+ --> ADP + CO2 + fosfatoenolpiruvato) 54 Rendime 2 CAETHG_272 Fosfoenolpiruvato carboxiquinase (PPCK) (ATP + 0 0,021 nto - 1, oxaloacetato + H+ --> ADP + CO2 + fosfoenolpiruvato), 15 LMOMA CAETHG_392 D-ribose 1,5-fosfomutase (ribose 1-fosfato <=> ribose- 4 5-fosfato) 55 Rendime 2 CAETHG_272 Fosfoenolpiruvato carboxiquinase (PPCK) (ATP + 0 0,021 nto - 1, oxaloacetato + H+ --> ADP + CO2 + 085 LMOMA CAETHG_275 Fosfoenolpiruvato), Citramalato sintase (H2O + 1 Piruvato + Acetil-CoA <=> CoA + Citramalato) 56 Rendime 1 CAETHG_016 N-ribosilnicotinamida:ortofosfato ribosiltransferase 0 0,020 nto - 0 (fosfato + N-ribosilnicotinamida <=> nicotinamida + 825 LMOMA ribose 1-fosfato) 57 Rendime 1 CAETHG_127 AMP:pirofosfato fosforibosiltransferase (PPi + AMP 0 0,020 nto - 0 <=> PRPP + adenina) 825
LMOMA 58 Rendime 1 CAETHG_137 Adenosina 5'-monofosfato fosfo-hidrolase (H2O + AMP 0 0,020 nto - 1 <=> Fosfato + H+ + Adenosina) 825
LMOMA 59 Rendime 1 CAETHG_392 D-ribose 1,5-fosfomutase (ribose 1-fosfato <=> ribose- 0 0,020 nto - 4 5-fosfato) 825
LMOMA 60 Rendime 2 CAETHG_272 Fosfoenolpiruvato carboxiquinase (PPCK) (ATP + 0 0,020 nto - 1, oxaloacetato + H+ --> ADP + CO2 + fosfoenolpiruvato), 46 LMOMA CAETHG_302 L-arginina imino-hidrolase (H2O + L-arginina <=> NH3 1 + citrulina) 61 Rendime 2 CAETHG_210 Absorção de potássio (K+_ext <=> K+), 0 0,020 nto - 7, Fosfoenolpiruvato carboxiquinase (PPCK) (ATP + 425 LMOMA CAETHG_272 Oxaloacetato + H+ --> ADP + CO2 + 1 Fosfoenolpiruvato) 62 Rendime 1 CAETHG_272 Fosfoenolpiruvato carboxiquinase (PPCK) (ATP + 0 0,020 nto - 1 oxaloacetato + H+ --> ADP + CO2 + Fosfoenolpiruvato) 42
LMOMA
269 / 294 63 Rendime 1 CAETHG_275 Citramalato sintase (H2O + Piruvato + Acetil-CoA <=> 0 0,020 nto - 1 CoA + Citramalato) 095
LMOMA 64 Rendime 1 CAETHG_302 L-arginina imino-hidrolase (H2O + L-arginina <=> NH3 0 0,020 nto - 1 + citrulina) 045
LMOMA EXEMPLO 14
[0098] Esse exemplo descreve rompimentos para melhorar a produção de isopreno nos microrganismos de Wood-Ljungdahl. Os experimentos de modelagem metabólica foram realizados como descrito no Exemplo 1. A produção de isopreno nos microrganismos de Wood-Ljungdahl é descrita, por exemplo, no documento WO 2013/180584. A seguinte via foi usado para a produção de isopreno modelo aqui: 2,0 Acetil-CoA --> CoA + acetoacetil- CoA; 2,0 NADH + 2,0 H+ + (S)-3-hidroxi-3-metilglutaril-CoA --> 2,0 NAD + CoA + (R)-mevalonato; ATP + (R)-mevalonato --> ADP + (R)-5- fosfomevalonato; ATP + (R)-5-fosfomevalonato --> ADP + (R)-5- difosfomevalonato; ATP + (R)-5-difosfomevalonato --> ADP + fosfato + CO2 + isopentenildifosfato; Isopentenildifosfato --> DMAPP; DMAPP --> PPi + isopreno; H2O + Acetil-CoA + Acetoacetil-CoA --> CoA + (S)-3-Hidroxi-3- metilglutaril-CoA; Isoprene --> Isoprene_ext. Essas interrupções também seriam úteis para melhorar a produção de IPP/DMAPP e/ou produtos a jusante de IPP/DMAPP, como farneseno e outros terpenóides. Pontuação de condicionamento físico Rendimento mínimo em FVA N° Genes rompidos Reações rompidas Genes rompidos Técnica N° 1 Rendime 5 CAETHG_206 Fosfoenolpiruvato carboxiquinase (PPCK) (ATP + 0 0,050 nto - 2, oxaloacetato + H+ --> ADP + CO2 + Fosfoenolpiruvato), 24 LMOMA CAETHG_247 alfa-acetolactato descarboxilase (ALCTT --> CO2 + (R)- 9, Acetoína), fosfato transacetilase (fosfato + acetil-CoA + H+ CAETHG_272 <=> CoA + acetilfosfato) 1, CAETHG_293 2,
270 / 294 CAETHG_335 8 2 Rendime 5 CAETHG_016 N-Ribosilnicotinamida:ortofosfato ribosiltransferase 0 0,049 nto - 0, (Fosfato + N-Ribosilnicotinamida <=> Nicotinamida + 965 LMOMA CAETHG_272 Ribose 1-fosfato), Fosfoenolpiruvato carboxiquinase (PPCK) 1, (ATP + Oxaloacetato + H+ --> ADP + CO2 + CAETHG_293 Fosfoenolpiruvato), Alfa-acetolactato descarboxilase 2, (ALCTT --> CO2 + (R)-Acetoína), fosfato transacetilase CAETHG_335 (fosfato + acetil-CoA + H+ <=> CoA + acetilfosfato), 8, cistationina beta-liase (H2O + cistationina --> NH3 + CAETHG_049 piruvato + homocisteína) 8 3 Rendime 5 CAETHG_016 N-Ribosilnicotinamida:ortofosfato ribosiltransferase 0 0,049 nto - 0, (Fosfato + N-Ribosilnicotinamida <=> Nicotinamida + 94 LMOMA CAETHG_272 Ribose 1-fosfato), Fosfoenolpiruvato carboxiquinase (PPCK) 1, (ATP + Oxaloacetato + H+ --> ADP + CO2 + CAETHG_293 Fosfoenolpiruvato), Alfa-acetolactato descarboxilase 2, (ALCTT --> CO2 + (R)-Acetoína), L-arginina imino- CAETHG_302 hidrolase (H2O + L-arginina <=> NH3 + Citrulina), fosfato 1, transacetilase (fosfato + acetil-CoA + H+ <=> CoA + CAETHG_335 acetilfosfato) 8 4 Rendime 5 CAETHG_272 Fosfoenolpiruvato carboxiquinase (PPCK) (ATP + 0 0,049 nto - 1, oxaloacetato + H+ --> ADP + CO2 + Fosfoenolpiruvato), 94 LMOMA CAETHG_293 alfa-acetolactato descarboxilase (ALCTT --> CO2 + (R)- 2, Acetoína), L-arginina imino-hidrolase (H2O + L-arginina CAETHG_302 <=> NH3 + Citrulina), fosfato transacetilase (fosfato + 1, acetil-CoA + H+ <=> CoA + acetilfosfato), D-ribose 1,5- CAETHG_335 fosfomutase (ribose 1-fosfato <=> ribose-5-fosfato) 8, CAETHG_392 4 5 Rendime 4 CAETHG_272 Fosfoenolpiruvato carboxiquinase (PPCK) (ATP + 0 0,049 nto - 1, oxaloacetato + H+ --> ADP + CO2 + Fosfoenolpiruvato), 93 LMOMA CAETHG_293 alfa-acetolactato descarboxilase (ALCTT --> CO2 + (R)- 2, Acetoína), fosfato transacetilase (fosfato + acetil-CoA + H+ CAETHG_335 <=> CoA + acetilfosfato), D-ribose 1,5-fosfomutase (ribose 8, 1-fosfato <=> ribose-5-fosfato) CAETHG_392 4 6 Rendime 4 CAETHG_016 N-Ribosilnicotinamida:ortofosfato ribosiltransferase 0 0,049 nto - 0, (Fosfato + N-Ribosilnicotinamida <=> Nicotinamida + 93 LMOMA CAETHG_272 Ribose 1-fosfato), Fosfoenolpiruvato carboxiquinase (PPCK) 1, (ATP + Oxaloacetato + H+ --> ADP + CO2 + CAETHG_293 Fosfoenolpiruvato), Alfa-acetolactato descarboxilase 2, (ALCTT --> CO2 + (R)-Acetoína), fosfato transacetilase CAETHG_335 (fosfato + acetil-CoA + H+ <=> CoA + acetilfosfato) 8 7 Rendime 4 CAETHG_016 N-Ribosilnicotinamida:ortofosfato ribosiltransferase 0 0,049 nto - 0, (Fosfato + N-Ribosilnicotinamida <=> Nicotinamida + 93 LMOMA CAETHG_272 Ribose 1-fosfato), Fosfoenolpiruvato carboxiquinase (PPCK) 1, (ATP + Oxaloacetato + H+ --> ADP + CO2 + CAETHG_293 Fosfoenolpiruvato), Alfa-acetolactato descarboxilase 2, (ALCTT --> CO2 + (R)-Acetoína), ATP:acetato CAETHG_335 fosfotransferase (ATP + H+ + propionato --> ADP + fosfato 9 de propionila) 8 Rendime 4 CAETHG_127 AMP:fosforibosiltransferase de pirofosfato (PPi + AMP <=> 0 0,049 nto - 0, PRPP + adenina), carboxiquinase de fosfoenolpiruvato 91 LMOMA CAETHG_272 (PPCK) (ATP + oxaloacetato + H+ --> ADP + CO2 + 1, fosfoenolpiruvato), alfa-acetolactato descarboxilase (ALCTT CAETHG_293 --> CO2 + (R)-Acetoína), fosfato transacetilase (fosfato +
271 / 294 2, acetil-CoA + H+ <=> CoA + acetilfosfato) CAETHG_335 8 9 Rendime 3 CAETHG_272 Fosfoenolpiruvato carboxiquinase (PPCK) (ATP + 0 0,049 nto - 1, oxaloacetato + H+ --> ADP + CO2 + Fosfoenolpiruvato), 595 LMOMA CAETHG_293 alfa-acetolactato descarboxilase (ALCTT --> CO2 + (R)- 2, Acetoína), fosfato transacetilase (fosfato + acetil-CoA + H+ CAETHG_335 <=> CoA + acetilfosfato) 8 10 Rendime 4 CAETHG_293 Alfa-acetolactato descarboxilase (ALCTT --> CO2 + (R)- 0 0,041 nto - 2, Acetoína), fosfato transacetilase (fosfato + acetil-CoA + H+ 02 LMOMA CAETHG_335 <=> CoA + acetilfosfato), 2,6-diamino-heptanodioato:2- 8, oxoglutarato aminotransferase (H2O + L-Glutamato + H+ + CAETHG_351 tetra-hidrodipicolinato <-- 2-Oxoglutarato + LL-2,6- 0, Diaminopimelato), D-ribose 1,5-fosfomutase (ribose 1- CAETHG_392 fosfato <=> ribose-5-fosfato) 4 11 Rendime 4 CAETHG_127 AMP:pirofosfato fosforibosiltransferase (PPi + AMP <=> 0 0,041 nto - 0, PRPP + Adenina), alfa-acetolactato descarboxilase (ALCTT 02 LMOMA CAETHG_293 --> CO2 + (R)-Acetoína), fosfato transacetilase (fosfato + 2, acetil-CoA + H+ <=> CoA + acetilfosfato), 2,6-Diamino- CAETHG_335 heptanodioato:2-oxoglutarato aminotransferase (H2O + L- 8, glutamato + H+ + tetra-hidrodipicolinato <-- 2-Oxoglutarato CAETHG_351 + LL-2,6-Diaminopimelato) 0 12 Rendime 4 CAETHG_293 Alfa-acetolactato descarboxilase (ALCTT --> CO2 + (R)- 0 0,040 nto - 2, Acetoína), L-arginina imino-hidrolase (H2O + L-arginina 41 LMOMA CAETHG_302 <=> NH3 + citrulina), fosfato transacetilase (fosfato + acetil- 1, CoA + H+ <=> CoA + Acetilfosfato), 2,6-diamino- CAETHG_335 heptanodioato:2-oxoglutarato aminotransferase (H2O + L- 8, glutamato + H+ + tetra-hidrodipicolinato <-- 2-Oxoglutarato CAETHG_351 + LL-2,6-Diaminopimelato) 0 13 Rendime 3 CAETHG_293 Alfa-acetolactato descarboxilase (ALCTT --> CO2 + (R)- 0 0,040 nto - 2, Acetoína), ATP:acetato fosfotransferase (ATP + H+ + 385 LMOMA CAETHG_335 propionato --> ADP + fosfato de propionila), 2,6-diamino- 9, heptanodioato:2-oxoglutarato aminotransferase (H2O + L- CAETHG_351 Glutamato + H+ + tetra-hidrodipicolinato <-- 2-Oxoglutarato 0 + LL-2,6-Diaminopimelato) 14 Rendime 3 CAETHG_293 Alfa-acetolactato descarboxilase (ALCTT --> CO2 + (R)- 0 0,040 nto - 2, Acetoína), fosfato transacetilase (fosfato + acetil-CoA + H+ 385 LMOMA CAETHG_335 <=> CoA + acetilfosfato), 2,6-diamino-heptanodioato:2- 8, oxoglutarato aminotransferase (H2O + L-Glutamato + H+ + CAETHG_351 tetra-hidrodipicolinato <-- 2-Oxoglutarato + LL-2,6- 0 Diaminopimelato) 15 Rendime 3 CAETHG_127 AMP:pirofosfato fosforibosiltransferase (PPi + AMP <=> 0 0,035 nto - 0, PRPP + Adenina), alfa-acetolactato descarboxilase (ALCTT 525 LMOMA CAETHG_293 --> CO2 + (R)-Acetoína), fosfato transacetilase (fosfato + 2, acetil-CoA + H+ <=> CoA + acetilfosfato) CAETHG_335 8 16 Rendime 3 CAETHG_016 N-ribosilnicotinamida:ortofosfato ribosiltransferase (fosfato 0 0,035 nto - 0, + N-ribosilnicotinamida <=> nicotinamida + ribose 1- 525 LMOMA CAETHG_293 fosfato), alfa-acetolactato descarboxilase (ALCTT --> CO2 2, + (R)-Acetoína), fosfato transacetilase (fosfato + Acetil-CoA CAETHG_335 + H+ <=> CoA + acetilfosfato) 8 17 Rendime 3 CAETHG_293 Alfa-acetolactato descarboxilase (ALCTT --> CO2 + (R)- 0 0,035 nto - 2, Acetoína), fosfato transacetilase (fosfato + acetil-CoA + H+ 525 LMOMA CAETHG_335 <=> CoA + acetilfosfato), D-ribose 1,5-fosfomutase (ribose 8, 1-fosfato <=> ribose-5-fosfato)
272 / 294 CAETHG_392 4 18 Rendime 3 CAETHG_247 dGTP trifosfo-hidrolase (H2O + dGTP --> H+ + 0 0,032 nto - 5, desoxiguanosina + trifosfato), alfa-acetolactato 88 LMOMA CAETHG_293 descarboxilase (ALCTT --> CO2 + (R)-Acetoína), fosfato 2, transacetilase (fosfato + acetil-CoA + H+ <=> CoA + CAETHG_335 acetilfosfato) 8 19 Rendime 3 0, Acetil-CoA:dióxido de carbono ligase (formadora de ADP) 0 0,030 nto - CAETHG_293 (ATP + acetil-CoA + H2CO3 --> ADP + fosfato + H+ + 03 LMOMA 2, malonil-CoA), alfa-acetolactato descarboxilase (ALCTT --> CAETHG_335 CO2 + (R)-Acetoína), fosfato transacetilase (fosfato + acetil- 8 CoA + H+ <=> CoA + acetilfosfato) 20 Rendime 3 CAETHG_293 Alfa-acetolactato descarboxilase (ALCTT --> CO2 + (R)- 0 0,029 nto - 2, Acetoína), fosfato transacetilase (fosfato + acetil-CoA + H+ 935 LMOMA CAETHG_335 <=> CoA + acetilfosfato), beta-liase de cistationina (H2O + 8, cistationina --> NH3 + piruvato + Homocisteína) CAETHG_049 8 21 Rendime 3 CAETHG_023 4,5-di-hidro-4-oxo-5-imidazolpropanoato hidro-liase (4- 0 0,029 nto - 4, imidazolona-5-propanoato <=> H2O + Urocanato), alfa- 835 LMOMA CAETHG_293 acetolactato descarboxilase (ALCTT --> CO2 + (R)- 2, Acetoína), Fosfato transacetilase (fosfato + acetil-CoA + H+ CAETHG_335 <=> CoA + acetilfosfato) 8 22 Rendime 3 CAETHG_023 4-imidazolona-5-propanoato amido-hidrolase (H2O + 4- 0 0,029 nto - 3, Imidazolona-5-propanoato --> N-Formimino-L-glutamato), 835 LMOMA CAETHG_293 alfa-acetolactato descarboxilase (ALCTT --> CO2 + (R)- 2, Acetoína), fosfato transacetilase (Fosfato + acetil-CoA + H+ CAETHG_335 <=> CoA + acetilfosfato) 8 23 Rendime 3 CAETHG_293 Alfa-acetolactato descarboxilase (ALCTT --> CO2 + (R)- 0 0,029 nto - 2, Acetoína), UMP: pirofosfato fosforibosiltransferase (Uracil 62 LMOMA CAETHG_316 + PRPP --> PPi + UMP), fosfato transacetilase (fosfato + 4, acetil-CoA + H+ <=> CoA + acetilfosfato) CAETHG_335 8 24 Rendime 3 CAETHG_293 Alfa-acetolactato descarboxilase (ALCTT --> CO2 + (R)- 0 0,029 nto - 2, Acetoína), fosfato transacetilase (fosfato + acetil-CoA + H+ 48 LMOMA CAETHG_335 <=> CoA + acetilfosfato), prefenato:NAD+ oxidorredutase 8, (descarboxilação) (NAD + pré-fenato --> NADH + CO2 + p- CAETHG_090 hidroxifenilpiruvato) 9 25 Rendime 2 CAETHG_293 Alfa-acetolactato descarboxilase (ALCTT --> CO2 + (R)- 0 0,029 nto - 2, Acetoína), ATP:acetato de fosfotransferase (ATP + H+ + 455 LMOMA CAETHG_335 propionato --> ADP + fosfato de propionila) 9 26 Rendime 2 CAETHG_293 Alfa-acetolactato descarboxilase (ALCTT --> CO2 + (R)- 0 0,029 nto - 2, Acetoína), fosfato transacetilase (fosfato + acetil-CoA + H+ 455 LMOMA CAETHG_335 <=> CoA + acetilfosfato) 8 27 Rendime 2 CAETHG_335 Fosfato transacetilase (fosfato + acetil-CoA + H+ <=> CoA 0 0,028 nto - 8, + acetilfosfato), 2,6-diamino-heptanodioato:2-oxoglutarato 035 LMOMA CAETHG_351 aminotransferase (H2O + L-glutamato + H+ + tetra- 0 hidrodipicolinato <-- 2-oxoglutarato + LL-2,6- Diaminopimelato) 28 Rendime 2 CAETHG_335 Fosfato transacetilase (fosfato + acetil-CoA + H+ <=> CoA 0 0,027 nto - 8, + acetilfosfato), beta-liase de cistationina (H2O + 595 LMOMA CAETHG_049 cistationina --> NH3 + piruvato + homocisteína) 8 29 Rendime 2 CAETHG_302 L-arginina imino-hidrolase (H2O + L-arginina <=> NH3 + 0 0,027
273 / 294 nto - 1, citrulina), fosfato transacetilase (fosfato + acetil-CoA + H+ 555 LMOMA CAETHG_335 <=> CoA + acetilfosfato) 8 30 Rendime 1 CAETHG_335 Fosfato transacetilase (fosfato + acetil-CoA + H+ <=> CoA 0 0,027 nto - 8 + acetilfosfato) 54
LMOMA 31 Rendime 1 CAETHG_335 ATP:acetato fosfotransferase (ATP + H+ + Propionato --> 0 0,027 nto - 9 ADP + Propionil fosfato) 54
LMOMA 32 Rendime 2 CAETHG_010 0 0,021 nto - 2, 305 LMOMA CAETHG_009 2 33 Rendime 2 CAETHG_016 N-Ribosilnicotinamida:ortofosfato ribosiltransferase (fosfato 0 0,020 nto - 0, + N-ribosilnicotinamida <=> Nicotinamida + ribose 1- 15 LMOMA CAETHG_272 fosfato), Fosfoenolpiruvato carboxiquinase (PPCK) (ATP + 1 oxaloacetato + H+ --> ADP + CO2 + fosfatoenolpiruvato) 34 Rendime 2 CAETHG_016 N-Ribosilnicotinamida:ribosiltransferase de ortofosfato 0 0,020 nto - 0, (fosfato + N-ribosilnicotinamida <=> Nicotinamida + 1- 115 LMOMA CAETHG_302 fosfato de ribose), L-arginina imino-hidrolase (H2O + L- 1 arginina <=> NH3 + citrulina) 35 Rendime 1 CAETHG_016 N-ribosilnicotinamida:ortofosfato ribosiltransferase (fosfato 0 0,020 nto - 0 + N-ribosilnicotinamida <=> nicotinamida + ribose 1- 11 LMOMA fosfato) 36 Rendime 1 CAETHG_137 Adenosina 5'-monofosfato fosfo-hidrolase (H2O + AMP <=> 0 0,020 nto - 1 Fosfato + H+ + Adenosina) 11
LMOMA 37 Rendime 1 CAETHG_127 AMP:pirofosfato fosforibosiltransferase (PPi + AMP <=> 0 0,020 nto - 0 PRPP + adenina) 11
LMOMA 38 Rendime 1 CAETHG_392 D-ribose 1,5-fosfomutase (ribose 1-fosfato <=> ribose-5- 0 0,020 nto - 4 fosfato) 11
LMOMA 39 Rendime 1 CAETHG_049 Cistationina beta-liase (H2O + Cistationina --> NH3 + 0 0,020 nto - 8 Piruvato + Homocisteína) 055
LMOMA 40 Rendime 1 CAETHG_272 Fosfoenolpiruvato carboxiquinase (PPCK) (ATP + 0 0,020 nto - 1 oxaloacetato + H+ --> ADP + CO2 + Fosfoenolpiruvato) 055
LMOMA 41 Rendime 1 CAETHG_275 Citramalato sintase (H2O + Piruvato + Acetil-CoA <=> CoA 0 0,020 nto - 1 + Citramalato) 03
LMOMA 42 Rendime 1 CAETHG_302 L-arginina imino-hidrolase (H2O + L-arginina <=> NH3 + 0 0,020 nto - 1 citrulina) 005
LMOMA EXEMPLO 15
[0099] Esse exemplo descreve rompimentos para melhorar a produção de ácido adípico em microrganismos de Wood-Ljungdahl. Os experimentos de modelagem metabólica foram realizados como descrito no Exemplo 1. A produção de ácido adípico em microrganismos de Wood-Ljungdahl é descrita, por exemplo, no documento WO 2017/0066498. A seguinte via foi usada para modelar a produção de ácido adípico aqui: ATP + CoA + Succinato --> ADP +
274 / 294 Fosfato + Succinil-CoA; NAD + CoA + 2-Oxoglutarato --> NADH + CO2 + Succinil-CoA; Acetil-CoA + Succinil-CoA --> CoA + 3-Oxo-adipil-CoA; NADH + H+ + 3-Oxo-adipil-CoA --> NAD + 3-hidroxi-adipil-CoA; 3- hidroxi-adipil-CoA --> 2,3-desidro-hidroipil-CoA; NADH + H+ + 2,3- desidro-dipipil-CoA --> NAD + adipil-CoA; Fosfato + Adipil-CoA --> CoA + Adipil-P; ADP + Adipil-P --> ATP + Adipato; Adipate --> Adipate_ext.
Pontuação de condicionamento Rendimento mínimo em FVA N° Genes rompidos Reações rompidas Genes rompidos Técnica físico N° 1 BPCY - 1 CAETHG_202 Glutamina sintetase (GOGAT) (ATP + NH3 + L- 0,02858 0,003 FBA 4 Glutamato --> ADP + Fosfato + L-Glutamina + H+) 813 2 Rendime 3 CAETHG_202 Glutamina sintetase (GOGAT) (ATP + NH3 + L- 0,09198 0,057 nto - 4, Glutamato --> ADP + Fosfato + L-Glutamina + H+) 966 LMOMA CAETHG_206 2, CAETHG_247 9 3 Rendime 5 CAETHG_202 Sintetase de glutamina (GOGAT) (ATP + NH3 + L- 0,02786 0,028 nto - 4, glutamato --> ADP + Fosfato + L-glutamina + H+), 758 LMOMA CAETHG_279 [FeFe] -hidrogenase (Hyt) bifurcadora dependente de 9, NADP (Hyt) (NADP + ferredoxina oxidada + 2,0 H2 CAETHG_290 <=> NADPH + 3,0 H+ + Redução de Redredoxina), 9, ATP:piruvato, ortofosfato fosfotransferase (ATP + CAETHG_293 Fosfato + Piruvato + H+ --> PPi + AMP + 2, Fosfoenolpiruvato), alfa-acetolactato descarboxilase CAETHG_090 (ALCTT --> CO2 + (R)-Acetoína), Pré-fenato:NAD+ 9 oxidorredutase (descarboxilação) (NAD + Pré-fenato --> NADH + CO2 + p-hidroxifenilpiruvato) 4 Rendime 4 CAETHG_202 Sintetase de glutamina (GOGAT) (ATP + NH3 + L- 0,02787 0,028 nto - 4, glutamato --> ADP + Fosfato + L-glutamina + H+), 566 LMOMA CAETHG_279 [FeFe]- hidrogenase de bifurcação de elétrons 6, dependente de NADP (Hyt) (NADP + ferredoxina CAETHG_290 oxidada + 2,0 H2 <=> NADPH + 3,0 H+ + 9, ferredoxina reduzida), ATP:piruvato, ortofosfato CAETHG_293 fosfotransferase (ATP + Fosfato + Piruvato + H+ --> 2 PPi + AMP + Fosfoenolpiruvato), alfa-acetolactato descarboxilase (ALCTT --> CO2 + (R)-Acetoína) 5 Rendime 4 CAETHG_202 Sintetase de glutamina (GOGAT) (ATP + NH3 + L- 0,02787 0,028 nto - 4, glutamato --> ADP + Fosfato + L-glutamina + H+), 566 LMOMA CAETHG_279 [FeFe]-hidrogenase de bifurcação de elétrons 5, dependente de NADP (Hyt) (NADP + ferredoxina CAETHG_290 oxidada + 2,0 H2 <=> NADPH + 3,0 H+ + 9, ferredoxina reduzida), ATP:piruvato, ortofosfato CAETHG_293 fosfotransferase (ATP + Fosfato + Piruvato + H+ --> 2 PPi + AMP + Fosfoenolpiruvato), alfa-acetolactato
275 / 294 descarboxilase (ALCTT --> CO2 + (R)-Acetoína) 6 Rendime 3 CAETHG_202 Glutamina sintetase (GOGAT) (ATP + NH3 + L- 0,02787 0,028 nto - 4, glutamato --> ADP + fosfato + L-glutamina + H+), 464 LMOMA CAETHG_290 ATP:piruvato, ortofosfato fosfotransferase (ATP + 9, fosfato + piruvato + H+ --> PPi + AMP + CAETHG_293 fosfoenolpiruvato), Alfa-acetolactato descarboxilase 2 (ALCTT --> CO2 + (R)-Acetoína) 7 Rendime 3 CAETHG_202 Glutamina sintetase (GOGAT) (ATP + NH3 + L- 0,02858 0,028 nto - 4, glutamato --> ADP + Fosfato + L-glutamina + H+), 086 LMOMA CAETHG_279 [FeFe]-hidrogenase (Hyt) bifurcadora dependente de 4, NADP (Hyt) (NADP + ferredoxina oxidada + 2,0 H2 CAETHG_293 <=> NADPH + 3,0 H+ + ferredoxina reduzida), alfa- 2 acetolactato descarboxilase (ALCTT --> CO2 + (R)- Acetoína) 8 Rendime 3 CAETHG_202 Glutamina sintetase (GOGAT) (ATP + NH3 + L- 0,02858 0,028 nto - 4, glutamato --> ADP + Fosfato + L-glutamina + H+), 086 LMOMA CAETHG_279 [FeFe]-hidrogenase (Hyt) bifurcadora dependente de 5, NADP (Hyt) (NADP + ferredoxina oxidada + 2,0 H2 CAETHG_293 <=> NADPH + 3,0 H+ + ferredoxina reduzida), alfa- 2 acetolactato descarboxilase (ALCTT --> CO2 + (R)- Acetoína) 9 Rendime 3 CAETHG_202 Glutamina sintetase (GOGAT) (ATP + NH3 + L- 0,02858 0,028 nto - 4, glutamato --> ADP + Fosfato + L-glutamina + H+), 086 LMOMA CAETHG_279 [FeFe]-hidrogenase (Hyt) bifurcadora dependente de 9, NADP (Hyt) (NADP + ferredoxina oxidada + 2,0 H2 CAETHG_293 <=> NADPH + 3,0 H+ + ferredoxina reduzida), alfa- 2 acetolactato descarboxilase (ALCTT --> CO2 + (R)- Acetoína) 10 Rendime 3 CAETHG_202 Glutamina sintetase (GOGAT) (ATP + NH3 + L- 0,02858 0,028 nto - 4, glutamato --> ADP + Fosfato + L-glutamina + H+), 086 LMOMA CAETHG_279 [FeFe]-hidrogenase (Hyt) bifurcadora dependente de 6, NADP (Hyt) (NADP + ferredoxina oxidada + 2,0 H2 CAETHG_293 <=> NADPH + 3,0 H+ + ferredoxina reduzida), alfa- 2 acetolactato descarboxilase (ALCTT --> CO2 + (R)- Acetoína) 11 Rendime 3 CAETHG_202 Glutamina sintetase (GOGAT) (ATP + NH3 + L- 0,02858 0,028 nto - 4, glutamato --> ADP + Fosfato + L-glutamina + H+), 086 LMOMA CAETHG_279 [FeFe]-hidrogenase (Hyt) bifurcadora dependente de 8, NADP (Hyt) (NADP + ferredoxina oxidada + 2,0 H2 CAETHG_293 <=> NADPH + 3,0 H+ + ferredoxina reduzida), alfa- 2 acetolactato descarboxilase (ALCTT --> CO2 + (R)- Acetoína) 12 Rendime 3 CAETHG_202 Glutamina sintetase (GOGAT) (ATP + NH3 + L- 0,02858 0,028 nto - 4, glutamato --> ADP + Fosfato + L-glutamina + H+), 086 LMOMA CAETHG_279 [FeFe]-hidrogenase (Hyt) bifurcadora dependente de 7, NADP (Hyt) (NADP + ferredoxina oxidada + 2,0 H2 CAETHG_293 <=> NADPH + 3,0 H+ + ferredoxina reduzida), alfa- 2 acetolactato descarboxilase (ALCTT --> CO2 + (R)- Acetoína) 13 Rendime 3 CAETHG_202 Glutamina sintetase (GOGAT) (ATP + NH3 + L- 0,02854 0,028 nto - 4, glutamato --> ADP + Fosfato + L-glutamina + H+), 074 LMOMA CAETHG_293 alfa-acetolactato descarboxilase (ALCTT --> CO2 + 2, (R)-Acetoína), L-arginina imino-hidrolase (H2O + L- CAETHG_302 Arginina <=> NH3 + Citrulina) 1 14 Rendime 3 0, Acetil-CoA:dióxido de carbono ligase (formadora de 0,02858 0,028 nto - CAETHG_202 ADP) (ATP + acetil-CoA + H2CO3 --> ADP + 032 LMOMA 4, fosfato + H+ + malonil-CoA), sintetase de glutamina CAETHG_293 (GOGAT) (ATP + NH3 + L-glutamato --> ADP + 2 Fosfato + L-Glutamina + H+), alfa-acetolactato descarboxilase (ALCTT --> CO2 + (R)-Acetoína)
276 / 294 15 Rendime 2 CAETHG_202 Glutamina sintetase (GOGAT) (ATP + NH3 + L- 0,02858 0,028 nto - 4, glutamato --> ADP + Fosfato + L-glutamina + H+), 002 LMOMA CAETHG_293 alfa-acetolactato descarboxilase (ALCTT --> CO2 + 2 (R)-Acetoína) 16 Rendime 2 CAETHG_202 Glutamina sintetase (GOGAT) (ATP + NH3 + L- 0,02858 0,027 nto - 4, glutamato --> ADP + Fosfato + L-glutamina + H+), 156 LMOMA CAETHG_247 dGTP trifosfo-hidrolase (H2O + dGTP --> H+ + 5 desoxiguanosina + trifosfato) 17 Rendime 2 CAETHG_202 Glutamina sintetase (GOGAT) (ATP + NH3 + L- 0,02858 0,027 nto - 4, Glutamato --> ADP + Fosfato + L-Glutamina + H+), 156 LMOMA CAETHG_329 2-Desoxi-D-ribose-5-fosfato acetaldeído-liase 9 (desoxirribose-5-fosfato <=> Acetaldeído + Gliceraldeído3-fosfato) 18 Rendime 1 CAETHG_202 Glutamina sintetase (GOGAT) (ATP + NH3 + L- 0,02858 0,027 nto - 4 Glutamato --> ADP + Fosfato + L-Glutamina + H+) 15
LMOMA 19 Rendime 2 CAETHG_202 Glutamina sintetase (GOGAT) (ATP + NH3 + L- 0,02858 0,027 nto - 4, Glutamato --> ADP + Fosfato + L-Glutamina + H+), 126 LMOMA CAETHG_351 2,6-Diamino-heptanodioato:2-oxoglutarato 0 aminotransferase (H2O + L-Glutamato + H+ + tetra- hidrodipicolinato <-- 2-Oxoglutarato + LL-2,6- Diaminopimelato) 20 Rendime 2 CAETHG_137 Adenosina 5'-monofosfato fosfo-hidrolase (H2O + 0 0,020 nto - 1, AMP <=> Fosfato + H+ + Adenosina), L-arginina 616 LMOMA CAETHG_302 imino-hidrolase (H2O + L-arginina <=> NH3 + 1 Citrulina) 21 Rendime 1 CAETHG_137 Adenosina 5'-monofosfato fosfo-hidrolase (H2O + 0 0,020 nto - 1 AMP <=> Fosfato + H+ + Adenosina) 592
LMOMA 22 Rendime 1 CAETHG_392 D-ribose 1,5-fosfomutase (ribose 1-fosfato <=> 0 0,020 nto - 4 ribose-5-fosfato) 592
LMOMA 23 Rendime 1 CAETHG_016 N-ribosilnicotinamida:ortofosfato ribosiltransferase 0 0,020 nto - 0 (fosfato + N-ribosilnicotinamida <=> nicotinamida + 592 LMOMA ribose 1-fosfato) 24 Rendime 1 CAETHG_127 AMP:pirofosfato fosforibosiltransferase (PPi + AMP 0 0,020 nto - 0 <=> PRPP + adenina) 592
LMOMA 25 Rendime 1 CAETHG_302 L-arginina imino-hidrolase (H2O + L-arginina <=> 0 0,020 nto - 1 NH3 + citrulina) 034
LMOMA EXEMPLO 16
[00100] Esse exemplo descreve rompimentos para melhorar a produção de 2-aminobenzoato em microrganismos de Wood-Ljungdahl. Os experimentos de modelagem metabólica foram realizados como descrito no Exemplo 1. A produção de 2-aminobenzoato em microrganismos de Wood- Ljungdahl é descrita, por exemplo, no documento WO 2016/191625. A seguinte via foi usada para modelar aqui a produção de 2-aminobenzoato: NH3 + Corismato => H2O + Piruvato + H+ + 2-aminobenzoato.
277 / 294
Pontuação de condicionamento físico Rendimento mínimo em FVA N° Genes rompidos
Reações rompidas Genes rompidos Técnica N°
1 Rendime 5 0, Acetil-CoA:dióxido de carbono ligase (formadora de ADP) 0 0,025 nto - CAETHG_30 (ATP + acetil-CoA + H2CO3 --> ADP + fosfato + H+ + 375 LMOMA 21, malonil-CoA), L-arginina imino-hidrolase (H2O + L- CAETHG_33 arginina <=> NH3 + Citrulina), ATP:acetato fosfotransferase 59, (ATP + H+ + propionato --> ADP + fosfato de propionila), CAETHG_35 2,6-Diamino-heptanodioato:2-oxoglutarato aminotransferase 10, (H2O + L-glutamato + H+ + tetra-hidrodipicolinato <-- 2- CAETHG_39 Oxoglutarato + LL-2,6-diaminopimelato), D-ribose 1,5- 24 fosfomutase (ribose 1-fosfato <=> ribose-5-fosfato) 2 Rendime 4 0, Acetil-CoA:dióxido de carbono ligase (formadora de ADP) 0 0,025 nto - CAETHG_33 (ATP + acetil-CoA + H2CO3 --> ADP + fosfato + H+ + 368 LMOMA 59, malonil-CoA), ATP:acetato fosfotransferase (ATP + H+ + CAETHG_35 propionato --> ADP + Fosfato de propionila), 2,6-diamino- 10, heptanodioato:2-oxoglutarato aminotransferase (H2O + L- CAETHG_39 glutamato + H+ + tetra-hidrodipicolinato <-- 2-oxoglutarato 24 + LL-2,6-diaminopimelato), D-ribose 1,5-fosfomutase (ribose 1-fosfato <=> ribose-5-fosfato) 3 Rendime 4 0, Acetil-CoA:dióxido de carbono ligase (formadora de ADP) 0 0,025 nto - CAETHG_12 (ATP + acetil-CoA + H2CO3 --> ADP + fosfato + H+ + 368 LMOMA 70, malonil-CoA), AMP:pirofosfato fosforibosiltransferase (PPi CAETHG_33 + AMP <=> PRPP + adenina), ATP:acetato fosfotransferase 59, (ATP + H+ + propionato --> ADP + fosfato de propionila), CAETHG_35 2,6-diamino-heptanodioato:2-oxoglutarato aminotransferase 10 (H2O + L-glutamato + H+ + tetra-hidrodipicolinato <-- 2- oxoglutarato + LL-2 6-Diaminopimelato) 4 Rendime 4 CAETHG_27 Isocitrato desidrogenase (NAD + isocitrato <=> NADH + 0 0,025 nto - 53, CO2 + 2-Oxoglutarato + H+), ATP:acetato fosfotransferase 361 LMOMA CAETHG_33 (ATP + H+ + propionato --> ADP + fosfato de propionila), 59, 2,6-diamino-heptanodioato:2-oxoglutarato aminotransferase CAETHG_35 (H2O + L-glutamato + H+ + tetra-hidrodipicolinato <-- 2- 10, Oxoglutarato + LL-2,6-Diaminopimelato), L-treonina CAETHG_06 acetaldeído-liase (L-treonina --> glicina + acetaldeído) 86 5 Rendime 5 0, Acetil-CoA:dióxido de carbono ligase (formadora de ADP) 0 0,025 nto - CAETHG_29 (ATP + acetil-CoA + H2CO3 --> ADP + fosfato + H+ + 305 LMOMA 32, malonil-CoA), alfa-acetolactato descarboxilase (ALCTT --> CAETHG_33 CO2 + (R)-Acetoína), ATP:acetato fosfotransferase (ATP + 59, H+ + propionato --> ADP + fosfato de propionila), 2,6- CAETHG_35 Diamino-heptanodioato:2-oxoglutarato aminotransferase 10, (H2O + L-glutamato + H+ + tetra-hidrodipicolinato <-- 2- CAETHG_04 Oxoglutarato + LL-2,6-Diaminopimelato), beta-liase de 98 cistationina (H2O + cistationina --> NH3 + piruvato + homocisteína) 6 Rendime 5 CAETHG_29 Alfa-acetolactato descarboxilase (ALCTT --> CO2 + (R)- 0 0,025 nto - 32, Acetoína), ATP:acetato fosfotransferase (ATP + H+ + 277 LMOMA CAETHG_33 propionato --> ADP + fosfato de propionila), 2,6-diamino-
278 / 294 59, heptanodioato:2-oxoglutarato aminotransferase (H2O + L- CAETHG_35 Glutamato + H+ + tetra-hidrodipicolinato <-- 2-Oxoglutarato 10, + LL-2,6-Diaminopimelato), D-ribose 1,5-fosfomutase CAETHG_39 (ribose 1-fosfato <=> ribose-5-fosfato), cistationina beta- 24, liase (H2O + Cistationina --> NH3 + Piruvato + CAETHG_04 Homocisteína) 98 7 Rendime 3 0, Acetil-CoA:dióxido de carbono ligase (formadora de ADP) 0 0,025 nto - CAETHG_33 (ATP + acetil-CoA + H2CO3 --> ADP + fosfato + H+ + 256 LMOMA 59, malonil-CoA), ATP:acetato fosfotransferase (ATP + H+ + CAETHG_35 propionato --> ADP + Fosfato de propionila), 2,6-diamino- 10 heptanodioato:2-oxoglutarato aminotransferase (H2O + L- glutamato + H+ + tetra-hidrodipicolinato <-- 2-oxoglutarato + LL-2,6-diaminopimelato) 8 Rendime 4 CAETHG_01 N-ribosilnicotinamida:ortofosfato ribosiltransferase (fosfato 0 0,025 nto - 60, + N-ribosilnicotinamida <=> nicotinamida + ribose 1- 235 LMOMA CAETHG_27 fosfato), isocitrato desidrogenase (NAD + isocitrato <=> 53, NADH + CO2 + 2-oxoglutarato + H+), transacetilase CAETHG_33 (fosfato + acetil-CoA + H+ <=> CoA + acetilfosfato), 2,6- 58, diamino-heptanodioato:2-oxoglutarato aminotransferase CAETHG_35 (H2O + L-glutamato + H+ + tetra-hidrodipicolinato <-- 2- 10 oxoglutarato + LL-2,6-diaminopimelato) 9 Rendime 3 CAETHG_33 ATP:acetato fosfotransferase (ATP + H+ + propionato --> 0 0,025 nto - 59, ADP + fosfato de propionila), 2,6-diamino-heptanodioato:2- 221 LMOMA CAETHG_35 oxoglutarato aminotransferase (H2O + L-glutamato + H+ + 10, tetra-hidrodipicolinato <-- 2-oxoglutarato + LL-2,6- CAETHG_39 Diaminopimelato), D-ribose 1,5-fosfomutase (ribose 1- 24 fosfato <=> ribose-5-fosfato) 10 Rendime 3 CAETHG_12 AMP:pirofosfato fosforibosiltransferase (PPi + AMP <=> 0 0,025 nto - 70, PRPP + adenina), ATP:acetato fosfotransferase (ATP + H+ + 221 LMOMA CAETHG_33 propionato --> ADP + fosfato de propionila), 2,6-diamino- 59, heptanodioato:2-oxoglutarato aminotransferase (H2O + L- CAETHG_35 Glutamato + H+ + tetra-hidrodipicolinato <-- 2-Oxoglutarato 10 + LL-2,6-Diaminopimelato) 11 Rendime 3 CAETHG_01 N-Ribosilnicotinamida:ortofosfato ribosiltransferase 0 0,025 nto - 60, (Fosfato + N-Ribosilnicotinamida <=> Nicotinamida + 221 LMOMA CAETHG_33 Ribose 1-fosfato), fosfato transacetilase (fosfato + acetil- 58, CoA + H+ <=> CoA + acetilfosfato), 2,6-diamino- CAETHG_35 heptanodioato:2-oxoglutarato aminotransferase (H2O + L- 10 glutamato + H+ + tetra-hidrodipicolinato <-- 2-Oxoglutarato + LL-2,6-Diaminopimelato) 12 Rendime 3 CAETHG_01 N-ribosilnicotinamida:ribosiltransferase de ortofosfato 0 0,025 nto - 60, (fosfato + N-ribosilnicotinamida <=> nicotinamida + 1- 221 LMOMA CAETHG_33 fosfato de ribose), ATP:acetato fosfotransferase (ATP + H+ + 59, propionato --> ADP + fosfato de propionila), 2,6-diamino- CAETHG_35 heptanodioato:2-oxoglutarato aminotransferase (H2O + L- 10 glutamato + H+ + tetra-hidrodipicolinato <-- 2-Oxoglutarato + LL-2,6-Diaminopimelato) 13 Rendime 4 CAETHG_30 L-arginina imino-hidrolase (H2O + L-arginina <=> NH3 + 0 0,025 nto - 21, citrulina), cisteína dessulfidrase (H2O + L-cisteína <=> NH3 088 LMOMA CAETHG_32 + piruvato + H2S), ATP:acetato fosfotransferase (ATP + H+ 93, + propionato --> ADP + Fosfato de propionila), 2,6-diamino- CAETHG_33 heptanodioato:2-oxoglutarato aminotransferase (H2O + L- 59, glutamato + H+ + tetra-hidrodipicolinato <-- 2-oxoglutarato CAETHG_35 + LL-2,6-diaminopimelato) 10 14 Rendime 3 CAETHG_32 Cisteína dessulfidrase (H2O + L-cisteína <=> NH3 + 0 0,025 nto - 93, piruvato + H2S), ATP:acetato fosfotransferase (ATP + H+ + 081 LMOMA CAETHG_33 propionato --> ADP + fosfato de propionila), 2,6-diamino- 59, heptanodioato:2-oxoglutarato aminotransferase (H2O + L- CAETHG_35 Glutamato + H+ + tetra-hidrodipicolinato <-- 2-Oxoglutarato
279 / 294 10 + LL-2,6-Diaminopimelato) 15 Rendime 3 CAETHG_30 L-arginina imino-hidrolase (H2O + L-arginina <=> NH3 + 0 0,025 nto - 21, citrulina), ATP:acetato fosfotransferase (ATP + H+ + 081 LMOMA CAETHG_33 propionato --> ADP + fosfato de propionila), 2,6-diamino- 59, heptanodioato:2-oxoglutarato aminotransferase (H2O + L- CAETHG_35 Glutamato + H+ + tetra-hidrodipicolinato <-- 2-Oxoglutarato 10 + LL-2,6-Diaminopimelato) 16 Rendime 2 CAETHG_33 ATP:acetato fosfotransferase (ATP + H+ + propionato --> 0 0,025 nto - 59, ADP + fosfato de propionila), 2,6-diamino-heptanodioato:2- 074 LMOMA CAETHG_35 oxoglutarato aminotransferase (H2O + L-glutamato + H+ + 10 tetra-hidrodipicolinato <-- 2-oxoglutarato + LL-2,6- Diaminopimelato) 17 Rendime 2 CAETHG_33 Fosfato transacetilase (fosfato + acetil-CoA + H+ <=> CoA 0 0,025 nto - 58, + acetilfosfato), 2,6-diamino-heptanodioato:2-oxoglutarato 074 LMOMA CAETHG_35 aminotransferase (H2O + L-glutamato + H+ + tetra- 10 hidrodipicolinato <-- 2-oxoglutarato + LL-2,6- Diaminopimelato) 18 Rendime 2 CAETHG_33 ATP:acetato fosfotransferase (ATP + H+ + propionato --> 0 0,025 nto - 59, ADP + fosfato de propionila), 2,6-diamino-heptanodioato:2- 067 LMOMA CAETHG_35 oxoglutarato aminotransferase (H2O + L-glutamato + H+ + 10 tetra-hidrodipicolinato <-- 2-oxoglutarato + LL-2,6- Diaminopimelato) 19 Rendime 3 CAETHG_30 L-arginina imino-hidrolase (H2O + L-arginina <=> NH3 + 0 0,024 nto - 21, citrulina), ATP:acetato fosfotransferase (ATP + H+ + 752 LMOMA CAETHG_33 propionato --> ADP + fosfato de propionila), beta-liase 59, cistationina (H2O + cistationina --> NH3 + piruvato + CAETHG_04 Homocisteína) 98 20 Rendime 2 CAETHG_33 ATP:acetato fosfotransferase (ATP + H+ + propionato --> 0 0,024 nto - 59, ADP + fosfato de propionila), beta-liase de cistationina 745 LMOMA CAETHG_04 (H2O + cistationina --> NH3 + piruvato + homocisteína) 98 21 Rendime 2 CAETHG_33 Fosfato transacetilase (fosfato + acetil-CoA + H+ <=> CoA 0 0,024 nto - 58, + acetilfosfato), beta-liase de cistationina (H2O + 738 LMOMA CAETHG_04 cistationina --> NH3 + piruvato + homocisteína) 98 22 Rendime 2 CAETHG_30 L-arginina imino-hidrolase (H2O + L-arginina <=> NH3 + 0 0,024 nto - 21, citrulina), ATP:acetato fosfotransferase (ATP + H+ + 724 LMOMA CAETHG_33 propionato --> ADP + fosfato de propionila) 59 23 Rendime 1 CAETHG_33 Fosfato transacetilase (fosfato + acetil-CoA + H+ <=> CoA 0 0,024 nto - 58 + acetilfosfato) 717
LMOMA 24 Rendime 1 CAETHG_33 ATP:acetato fosfotransferase (ATP + H+ + Propionato --> 0 0,024 nto - 59 ADP + Propionil fosfato) 717
LMOMA 25 Rendime 1 CAETHG_32 Cisteína dessulfidrase (H2O + L-cisteína <=> NH3 + 0 0,020 nto - 93 piruvato + H2S) 384
LMOMA 26 Rendime 2 CAETHG_04 Beta-liase de cistationina (H2O + cistationina --> NH3 + 0 0,020 nto - 98, piruvato + homocisteína), L-treonina acetaldeído-liase (L- 307 LMOMA CAETHG_06 treonina --> glicina + acetaldeído) 86 27 Rendime 2 CAETHG_27 Citramalato sintase (H2O + Piruvato + Acetil-CoA <=> CoA 0 0,020 nto - 51, + Citramalato), Beta-liase de cistationina (H2O + 167 LMOMA CAETHG_04 Cistationina --> NH3 + Piruvato + Homocisteína) 98 28 Rendime 2 CAETHG_30 L-arginina imino-hidrolase (H2O + L-arginina <=> NH3 + 0 0,020 nto - 21, citrulina), beta-cistationina-liase (H2O + cistationina --> 132 LMOMA CAETHG_04 NH3 + piruvato + homocisteína) 98
280 / 294 29 Rendime 1 CAETHG_04 Cistationina beta-liase (H2O + cistationina --> NH3 + 0 0,020 nto - 98 Piruvato + Homocisteína) 125
LMOMA 30 Rendime 2 CAETHG_27 Citramalato sintase (H2O + Piruvato + Acetil-CoA <=> CoA 0 0,020 nto - 51, + Citramalato), L-Arginina imino-hidrolase (H2O + L- 076 LMOMA CAETHG_30 Arginina <=> NH3 + Citrulina) 21 31 Rendime 1 CAETHG_27 Citramalato sintase (H2O + Piruvato + Acetil-CoA <=> CoA 0 0,020 nto - 51 + Citramalato) 069
LMOMA 32 Rendime 1 CAETHG_01 N-ribosilnicotinamida:ortofosfato ribosiltransferase (fosfato 0 0,020 nto - 60 + N-ribosilnicotinamida <=> nicotinamida + ribose 1- 013 LMOMA fosfato) 33 Rendime 1 CAETHG_13 Adenosina 5'-monofosfato fosfo-hidrolase (H2O + AMP 0 0,020 nto - 71 <=> Fosfato + H+ + Adenosina) 013
LMOMA 34 Rendime 1 CAETHG_12 AMP:pirofosfato fosforibosiltransferase (PPi + AMP <=> 0 0,020 nto - 70 PRPP + adenina) 013
LMOMA 35 Rendime 1 CAETHG_39 D-ribose 1,5-fosfomutase (ribose 1-fosfato <=> ribose-5- 0 0,020 nto - 24 fosfato) 013
LMOMA 36 Rendime 1 CAETHG_06 L-treonina acetaldeído-liase (L-treonina --> glicina + 0 0,020 nto - 86 acetaldeído) 006
LMOMA EXEMPLO 17
[00101] Esse exemplo descreve rompimentos para melhorar a produção de salicilato em microrganismos de Wood-Ljungdahl. Os experimentos de modelagem metabólica foram realizados como descrito no Exemplo 1. A produção de salicilato em microrganismos de Wood-Ljungdahl é descrita, por exemplo, no documento WO 2016/191625. A seguinte via foi usada para modelar a produção de salicilato aqui: Corismato --> Isocorismato; Isocorismato --> Salicilato + Piruvato. Pontuação de condicionamento físico Rendimento mínimo em FVA N° Genes rompidos Reações rompidas Genes rompidos Técnica N° 1 Rendime 3 0, Acetil-CoA:dióxido de carbono ligase (formadora de ADP) 0 0,020 nto - CAETHG_316 (ATP + acetil-CoA + H2CO3 --> ADP + fosfato + H+ + 174 LMOMA 4, malonil-CoA), UMP: pirofosfato fosforibosiltransferase CAETHG_068 (Uracil + PRPP --> PPi + UMP), L-treonina acetaldeído-
281 / 294 6 liase (L-treonina --> glicina + acetaldeído) 2 Rendime 3 CAETHG_302 L-arginina imino-hidrolase (H2O + L-arginina <=> NH3 + 0 0,020 nto - 1, citrulina), 2-desoxi-D-ribose-5-fosfato acetaldeído-liase 174 LMOMA CAETHG_329 (desoxirribose-5-fosfato <=> acetaldeído + gliceraldeído 3- 9, fosfato), L- Treonina acetaldeído-liase (L-treonina --> CAETHG_068 glicina + acetaldeído) 6 3 Rendime 1 CAETHG_068 L-treonina acetaldeído-liase (L-treonina --> glicina + 0 0,020 nto - 6 acetaldeído) 167
LMOMA EXEMPLO 18
[00102] Esse exemplo descreve rompimentos para melhorar a produção de corismato em microrganismos de Wood-Ljungdahl. Os experimentos de modelagem metabólica foram realizados como descrito no Exemplo 1. A produção de corismato em microrganismos de Wood-Ljungdahl é descrita, por exemplo, no documento WO 2016/191625. O corismato é um produto nativo de pelo menos alguns microrganismos de Wood-Ljungdahl. Espera-se que esses mesmos rompimentos aumentem de maneira semelhante o fluxo através do desidrosshiquimato, um nó metabólico logo a montante do corismato.
Pontuação de condicionamento físico Rendimento mínimo em FVA N° Genes rompidos Reações rompidas Genes rompidos Técnica N° 1 Rendime 4 CAETHG_127 AMP:pirofosfato fosforibosiltransferase (PPi + AMP <=> 0 0,021 nto - 0, PRPP + Adenina), captação de potássio (K+_ext <=> K+), 28 LMOMA CAETHG_210 L-arginina imino-hidrolase (H2O + L-arginina <=> NH3 + 7, citrulina), cistationina beta-liase (H2O + Cistationina --> CAETHG_302 NH3 + Piruvato + Homocisteína) 1, CAETHG_049 8 2 Rendime 4 CAETHG_016 N-Ribosilnicotinamida:ribosiltransferase de ortofosfato 0 0,021 nto - 0, (fosfato + N-ribosilnicotinamida <=> Nicotinamida + 1- 28 LMOMA CAETHG_302 fosfato de ribose), L-arginina imino-hidrolase (H2O + L- 1, arginina <=> NH3 + citrulina), 2,6-diamino- CAETHG_351 heptanodioato:2-oxoglutarato aminotransferase (H2O + L- 0, glutamato + H+ + tetra-hidrodipicolinato <-- 2- CAETHG_049 Oxoglutarato + LL-2,6-Diaminopimelato), cistationina 8 beta-liase (H2O + cistationina --> NH3 + piruvato + homocisteína)
282 / 294 3 Rendime 4 CAETHG_016 N-Ribosilnicotinamida:ortofosfato ribosiltransferase 0 0,021 nto - 0, (fosfato + N-ribosilnicotinamida <=> Nicotinamida + 28 LMOMA CAETHG_210 ribose 1-fosfato), captação de potássio (K+_ext <=> K+), 7, L-arginina iminoidrolase (H2O + L-arginina <=> NH3 + CAETHG_302 Citrulina), Cistationina beta-liase (H2O + Cistationina --> 1, NH3 + Piruvato + Homocisteína) CAETHG_049 8 4 Rendime 4 CAETHG_302 L-arginina imino-hidrolase (H2O + L-arginina <=> NH3 + 0 0,021 nto - 1, citrulina), 2,6-diamino-heptanodioato:2-oxoglutarato 28 LMOMA CAETHG_351 aminotransferase (H2O + L-glutamato + H+ + tetra- 0, hidrodipicolinato <-- 2-Oxoglutarato + LL-2,6- CAETHG_392 Diaminopimelato), D-ribose 1,5-fosfomutase (ribose 1- 4, fosfato <=> ribose-5-fosfato), cistationina beta-liase (H2O CAETHG_049 + cistationina --> NH3 + piruvato + homocisteína) 8 5 Rendime 3 CAETHG_127 AMP:pirofosfato fosforibosiltransferase (PPi + AMP <=> 0 0,021 nto - 0, PRPP + adenina), L-arginina imino-hidrolase (H2O + L- 27 LMOMA CAETHG_302 arginina <=> NH3 + citrulina), cistationina beta-liase (H2O 1, + cistationina --> NH3 + piruvato + homocisteína) CAETHG_049 8 6 Rendime 3 CAETHG_016 N-Ribosilnicotinamida:ribosiltransferase de ortofosfato 0 0,021 nto - 0, (fosfato + N-ribosilnicotinamida <=> Nicotinamida + 1- 27 LMOMA CAETHG_302 fosfato de ribose), L-arginina imino-hidrolase (H2O + L- 1, arginina <=> NH3 + citrulina), cistationina beta-liase (H2O CAETHG_049 + Cistationina --> NH3 + Piruvato + Homocisteína) 8 7 Rendime 3 CAETHG_137 Adenosina 5'-monofosfato fosfo-hidrolase (H2O + AMP 0 0,021 nto - 1, <=> Fosfato + H+ + Adenosina), L-arginina imino- 27 LMOMA CAETHG_302 hidrolase (H2O + L-arginina <=> NH3 + citrulina), 1, cistationina beta-liase (H2O + cistationina --> NH3 + CAETHG_049 Piruvato + homocisteína) 8 8 Rendime 3 CAETHG_302 L-arginina imino-hidrolase (H2O + L-arginina <=> NH3 + 0 0,021 nto - 1, citrulina), D-ribose 1,5-fosfomutase (ribose 1-fosfato <=> 27 LMOMA CAETHG_392 ribose-5-fosfato), cistationina beta-liase (H2O + 4, cistationina --> NH3 + Piruvato + Homocisteína) CAETHG_049 8 9 Rendime 3 CAETHG_016 N-ribosilnicotinamida:ortofosfato ribosiltransferase (fosfato 0 0,021 nto - 0, + N-ribosilnicotinamida <=> Nicotinamida + ribose 1- 1 LMOMA CAETHG_210 fosfato), captação de potássio (K+_ext <=> K+), beta-liase 7, de cistationina beta (H2O + cistationina --> NH3 + CAETHG_049 piruvato) 8 10 Rendime 3 CAETHG_127 AMP:pirofosfato fosforibosiltransferase (PPi + AMP <=> 0 0,021 nto - 0, PRPP + Adenina), 2,6-Diamino-heptanodioato:2- 1 LMOMA CAETHG_351 oxoglutarato aminotransferase (H2O + L-Glutamato + H+ + 0, tetra-hidrodipicolinato <-- 2-Oxoglutarato + LL-2,6- CAETHG_049 Diamin), Beta-liase de cistationina (H2O + cistationina --> 8 NH3 + piruvato + homocisteína) 11 Rendime 3 CAETHG_127 AMP:pirofosfato fosforibosiltransferase (PPi + AMP <=> 0 0,021 nto - 0, PRPP + Adenina), captação de potássio (K+_ext <=> K+), 1 LMOMA CAETHG_210 cistationina beta-liase de (H2O + cistationina --> NH3 + 7, piruvato + homocisteína) CAETHG_049 8
283 / 294 12 Rendime 2 CAETHG_392 D-Ribose 1,5-fosfomutase (1-fosfato de ribose <=> ribose- 0 0,021 nto - 4, 5-fosfato), beta-liase de cistationina (H2O + Cistationina -- 09 LMOMA CAETHG_049 > NH3 + piruvato + homocisteína) 8 13 Rendime 2 CAETHG_127 AMP:fosforibosiltransferase de pirofosfato (PPi + AMP 0 0,021 nto - 0, <=> PRPP + adenina), cistationina beta-liase (H2O + 09 LMOMA CAETHG_049 cistationina --> NH3 + piruvato + homocisteína) 8 14 Rendime 2 CAETHG_137 Adenosina 5'-monofosfato fosfo-hidrolase (H2O + AMP 0 0,021 nto - 1, <=> Fosfato + H+ + Adenosina), cistationina beta-liase 09 LMOMA CAETHG_049 (H2O + cistationina --> NH3 + piruvato + homocisteína) 8 15 Rendime 2 CAETHG_016 N-Ribosilnicotinamida:ribosiltransferase de ortofosfato 0 0,021 nto - 0, (fosfato + N-ribosilnicotinamida <=> Nicotinamida + 1- 09 LMOMA CAETHG_049 fosfato de ribose), cistationina beta-liase (H2O + 8 cistationina --> NH3 + piruvato + homocisteína) 16 Rendime 2 CAETHG_302 L-arginina imino-hidrolase (H2O + L-arginina <=> NH3 + 0 0,020 nto - 1, citrulina), D-ribose 1,5-fosfomutase (ribose 1-fosfato <=> 65 LMOMA CAETHG_392 ribose-5-fosfato) 4 17 Rendime 2 CAETHG_024 Transporte reversível de L-lactato via simporte de prótons 0 0,020 nto - 8, (H+_ext + L-Lactato_ext <=> H+ + L-lactato), D-Ribose 64 LMOMA CAETHG_392 1,5-fosfomutase (Ribose 1-fosfato <=> ribose-5-fosfato) 4 18 Rendime 1 CAETHG_137 Adenosina 5'-monofosfato fosfo-hidrolase (H2O + AMP 0 0,020 nto - 1 <=> Fosfato + H+ + Adenosina) 62
LMOMA 19 Rendime 1 CAETHG_392 D-ribose 1,5-fosfomutase (ribose 1-fosfato <=> ribose-5- 0 0,020 nto - 4 fosfato) 62
LMOMA 20 Rendime 1 CAETHG_016 N-ribosilnicotinamida:ortofosfato ribosiltransferase (fosfato 0 0,020 nto - 0 + N-ribosilnicotinamida <=> nicotinamida + ribose 1- 62 LMOMA fosfato) 21 Rendime 1 CAETHG_127 AMP:pirofosfato fosforibosiltransferase (PPi + AMP <=> 0 0,020 nto - 0 PRPP + adenina) 62
LMOMA 22 Rendime 1 CAETHG_302 L-arginina imino-hidrolase (H2O + L-arginina <=> NH3 + 0 0,020 nto - 1 citrulina) 03
LMOMA EXEMPLO 19
[00103] Esse exemplo descreve rompimentos para melhorar a produção de farneseno nos microrganismos de Wood-Ljungdahl. Os experimentos de modelagem metabólica foram realizados como descrito no Exemplo 1. A produção de farneseno nos microrganismos de Wood-Ljungdahl é descrita, por exemplo, no documento WO 2013/180584. A seguinte via foi usada para modelar a produção de farneseno aqui: 2,0 Acetil-CoA --> CoA + Acetoacetil- CoA; H2O + Acetil-CoA + Acetoacetil-CoA --> CoA + (S)-3-Hidroxi-3- metilglutaril-CoA; 2,0 NADH + 2,0 H+ + (S)-3-hidroxi-3-metilglutaril-CoA - -> 2,0 NAD + CoA + (R)-mevalonato; ATP + (R)-mevalonato --> ADP + (R)-
284 / 294 5-fosfomevalonato; ATP + (R)-5-difosfomevalonato --> ADP + fosfato + CO2 + isopentenildifosfato; ATP + (R)-5-difosfomevalonato --> ADP + fosfato + CO2 + isopentenildifosfato; Isopentenildifosfato --> DMAPP; 2,0 Isopentenildifosfato + DMAPP --> PPi + trans, trans-farnesil-difosfato; trans, trans-farnesil-difosfato --> farneseno + PPi; Farneseno --> Farneseno_ext.
Pontuação de condicionamento físico Rendimento mínimo em FVA N° Genes rompidos Reações rompidas Genes rompidos Técnica N° 1 Rendime 5 CAETHG_206 Cisteína dessulfidrase (H2O + L-cisteína <=> NH3 + 0 0,023 nto - 2, piruvato + H2S), ATP:acetato fosfotransferase (ATP + H+ + 775 LMOMA CAETHG_247 propionato --> ADP + fosfato de propionila), 2,6-diamino- 9, heptanodioato:2-oxoglutarato aminotransferase (H2O + L- CAETHG_329 Glutamato + H+ + tetra-hidrodipicolinato <-- 2- 3, Oxoglutarato + LL-2,6-Diaminopimelato) CAETHG_335 9, CAETHG_351 0 2 Rendime 5 CAETHG_206 ATP:acetato fosfotransferase (ATP + H+ + propionato --> 0 0,023 nto - 2, ADP + fosfato de propionila), 2,6-diamino- 76 LMOMA CAETHG_247 heptanodioato:2-oxoglutarato aminotransferase (H2O + L- 9, glutamato + H+ + tetra-hidrodipicolinato <-- 2-oxoglutarato CAETHG_335 + LL-2,6-Diaminopimelato), L-treonina acetaldeído-liase 9, (L-treonina --> glicina + acetaldeído) CAETHG_351 0, CAETHG_068 6 3 Rendime 6 CAETHG_206 Citramalato sintase (H2O + Piruvato + Acetil-CoA <=> 0 0,023 nto - 2, CoA + Citramalato), ATP:piruvato, ortofosfato 76 LMOMA CAETHG_247 fosfotransferase (ATP + fosfato + piruvato + H+ --> PPi + 9, AMP + fosfoenolpiruvato), ATP:acetato fosfotransferase CAETHG_275 (ATP H+ + Propionato --> ADP + fosfato de propionila), 1, 2,6-diamino-heptanodioato:2-oxoglutarato CAETHG_290 aminotransferase (H2O + L-glutamato + H+ + tetra- 9, hidrodipicolinato <-- 2-oxoglutarato + LL-2,6- CAETHG_335 Diaminopimelato) 9, CAETHG_351 0
285 / 294 4 Rendime 5 CAETHG_206 Alfa-acetolactato descarboxilase (ALCTT --> CO2 + (R)- 0 0,023 nto - 2, Acetoína), ATP:acetato fosfotransferase (ATP + H+ + 76 LMOMA CAETHG_247 propionato --> ADP + fosfato de propionila), 2,6-diamino- 9, heptanodioato:2-oxoglutarato aminotransferase (H2O + L- CAETHG_293 Glutamato + H+ + tetra-hidrodipicolinato <-- 2- 2, Oxoglutarato + LL-2,6-Diaminopimelato) CAETHG_335 9, CAETHG_351 0 5 Rendime 4 CAETHG_206 ATP:acetato fosfotransferase (ATP + H+ + propionato --> 0 0,023 nto - 2, ADP + fosfato de propionila), 2,6-diamino- 745 LMOMA CAETHG_247 heptanodioato:2-oxoglutarato aminotransferase (H2O + L- 9, glutamato + H+ + tetra-hidrodipicolinato <-- 2-oxoglutarato CAETHG_335 + LL-2,6-Diaminopimelato) 9, CAETHG_351 0 6 Rendime 4 CAETHG_206 ATP:acetato fosfotransferase (ATP + H+ + propionato --> 0 0,023 nto - 2, ADP + fosfato de propionila), 2,6-diamino- 73 LMOMA CAETHG_247 heptanodioato:2-oxoglutarato aminotransferase (H2O + L- 9, glutamato + H+ + tetra-hidrodipicolinato <-- 2-oxoglutarato CAETHG_335 + LL-2,6-Diaminopimelato) 9, CAETHG_351 0 7 Rendime 5 CAETHG_206 Alfa-acetolactato descarboxilase (ALCTT --> CO2 + (R)- 0 0,023 nto - 2, Acetoína), ATP:acetato fosfotransferase (ATP + H+ + 64 LMOMA CAETHG_247 propionato --> ADP + fosfato de propionila), L-treonina 9, acetaldeído-liase (L-treonina --> Glicina + Acetaldeído) CAETHG_293 2, CAETHG_335 9, CAETHG_068 6 8 Rendime 4 0, Acetil-CoA:dióxido de carbono ligase (formadora de ADP) 0 0,023 nto - CAETHG_127 (ATP + acetil-CoA + H2CO3 --> ADP + fosfato + H+ + 4 LMOMA 0, malonil-CoA), AMP:pirofosfato fosforibosiltransferase (PPi CAETHG_335 + AMP <=> PRPP + adenina), ATP:acetato fosfotransferase 9, (ATP + H+ + propionato --> ADP + fosfato de propionila), CAETHG_049 beta-liase de cistationina beta (H2O + cistationina --> NH3 8 + piruvato + homocisteína) 9 Rendime 3 0, Acetil-CoA:dióxido de carbono ligase (formadora de ADP) 0 0,023 nto - CAETHG_127 (ATP + acetil-CoA + H2CO3 --> ADP + fosfato + H+ + 385 LMOMA 0, malonil-CoA), AMP:pirofosfato fosforibosiltransferase (PPi CAETHG_335 + AMP <=> PRPP + adenina), ATP:acetato fosfotransferase 9 (ATP + H+ + Propionato --> ADP + fosfato de propionila) 10 Rendime 3 0, Acetil-CoA:dióxido de carbono ligase (formadora de ADP) 0 0,023 nto - CAETHG_335 (ATP + acetil-CoA + H2CO3 --> ADP + fosfato + H+ + 325 LMOMA 9, malonil-CoA), ATP:acetato fosfotransferase (ATP + H+ + CAETHG_049 propionato --> ADP + Fosfato de propionila), beta-liase de 8 cistationina (H2O + cistationina --> NH3 + piruvato + homocisteína) 11 Rendime 3 CAETHG_127 AMP:pirofosfato fosforibosiltransferase (PPi + AMP <=> 0 0,023 nto - 0, PRPP + adenina), ATP:acetato fosfotransferase (ATP + H+ 31 LMOMA CAETHG_335 + propionato --> ADP + fosfato de propionila), cistationina 9, beta-liase (H2O + cistationina --> NH3 + piruvato + CAETHG_049 homocisteína) 8
286 / 294 12 Rendime 2 CAETHG_137 Adenosina 5'-monofosfato fosfo-hidrolase (H2O + AMP 0 0,023 nto - 1, <=> fosfato + H+ + adenosina), fosfato transacetilase 295 LMOMA CAETHG_335 (fosfato + acetil-CoA + H+ <=> CoA + acetilfosfato) 8 13 Rendime 2 CAETHG_137 Adenosina 5'-monofosfato fosfo-hidrolase (H2O + AMP 0 0,023 nto - 1, <=> Fosfato + H+ + Adenosina), ATP:acetato 295 LMOMA CAETHG_335 fosfotransferase (ATP + H+ + Propionato --> ADP + 9 Propionil fosfato) 14 Rendime 2 CAETHG_127 AMP:pirofosfato fosforibosiltransferase (PPi + AMP <=> 0 0,023 nto - 0, PRPP + adenina), ATP:acetato fosfotransferase (ATP + H+ 295 LMOMA CAETHG_335 + propionato --> ADP + propionil fosfato) 9 15 Rendime 2 CAETHG_016 N-ribosilnicotinamida:ribosiltransferase de ortofosfato 0 0,023 nto - 0, (fosfato + N-ribosilnicotinamida <=> nicotinamida + 1- 295 LMOMA CAETHG_335 fosfato de ribose), ATP:acetato fosfotransferase (ATP + H+ 9 + propionato --> ADP + fosfato de propionila) 16 Rendime 2 CAETHG_335 ATP:acetato fosfotransferase (ATP + H+ + propionato --> 0 0,023 nto - 9, ADP + fosfato de propionila), D-ribose 1,5-fosfomutase 295 LMOMA CAETHG_392 (ribose 1-fosfato <=> ribose-5-fosfato) 4 17 Rendime 2 CAETHG_127 AMP:pirofosfato fosforibosiltransferase (PPi + AMP <=> 0 0,023 nto - 0, PRPP + Adenina), fosfato transacetilase (fosfato + acetil- 295 LMOMA CAETHG_335 CoA + H+ <=> Acetil-CoA + H+ <=> CoA + acetilfosfato) 8 18 Rendime 2 CAETHG_335 ATP:acetato fosfotransferase (ATP + H+ + propionato --> 0 0,022 nto - 9, ADP + fosfato de propionila), beta-liase de cistationina 68 LMOMA CAETHG_049 (H2O + cistationina --> NH3 + piruvato + homocisteína) 8 19 Rendime 2 CAETHG_335 Fosfato transacetilase (fosfato + acetil-CoA + H+ <=> CoA 0 0,022 nto - 8, + acetilfosfato), beta-liase de cistationina (H2O + 68 LMOMA CAETHG_049 cistationina --> NH3 + piruvato + homocisteína) 8 20 Rendime 2 0, Acetil-CoA:dióxido de carbono ligase (formadora de ADP) 0 0,022 nto - CAETHG_335 (ATP + acetil-CoA + H2CO3 --> ADP + fosfato + H+ + 665 LMOMA 9 malonil-CoA), ATP:acetato fosfotransferase (ATP + H+ + propionato --> ADP + Fosfato de propionila) 21 Rendime 2 CAETHG_335 ATP:acetato fosfotransferase (ATP + H+ + propionato --> 0 0,022 nto - 9, ADP + fosfato de propionila), prefenato:NAD+ 665 LMOMA CAETHG_090 oxidorredutase (descarboxilação) (NAD + pré-fenato --> 9 NADH + CO2 + p-hidroxifenilpiruvato) 22 Rendime 2 CAETHG_335 ATP:acetato fosfotransferase (ATP + H+ + Propionato --> 0 0,022 nto - 9, ADP + fosfato de propionila), L-treonina acetaldeído-liase 605 LMOMA CAETHG_068 (L-treonina --> glicina + acetaldeído) 6 23 Rendime 2 CAETHG_293 Alfa-acetolactato descarboxilase (ALCTT --> CO2 + (R)- 0 0,022 nto - 2, Acetoína), ATP:acetato de fosfotransferase (ATP + H+ + 35 LMOMA CAETHG_335 propionato --> ADP + fosfato de propionila) 9 24 Rendime 2 CAETHG_302 L-arginina imino-hidrolase (H2O + L-arginina <=> NH3 + 0 0,022 nto - 1, citrulina), ATP:acetato fosfotransferase (ATP + H+ + 305 LMOMA CAETHG_335 propionato --> ADP + fosfato de propionila) 9 25 Rendime 1 CAETHG_335 Fosfato transacetilase (fosfato + acetil-CoA + H+ <=> CoA 0 0,021 nto - 8 + acetilfosfato) 945
LMOMA 26 Rendime 1 CAETHG_335 ATP:acetato fosfotransferase (ATP + H+ + Propionato --> 0 0,021 nto - 9 ADP + Fosfato de propionila) 945
LMOMA
287 / 294 27 Rendime 2 CAETHG_127 AMP:pirofosfato fosforibosiltransferase (PPi + AMP <=> 0 0,020 nto - 0, PRPP + Adenina), L-treonina acetaldeído-liase (L-treonina 235 LMOMA CAETHG_068 --> glicina + acetaldeído) 6 28 Rendime 2 CAETHG_329 Cisteína dessulfidrase (H2O + L-cisteína <=> NH3 + 0 0,020 nto - 3, piruvato + H2S), L-treonina acetaldeído-liase (L-treonina -- 205 LMOMA CAETHG_068 > glicina + acetaldeído) 6 29 Rendime 2 CAETHG_137 Adenosina 5'-monofosfato fosfo-hidrolase (H2O + AMP 0 0,020 nto - 1, <=> fosfato + H+ + adenosina), fosfoenolpiruvato 16 LMOMA CAETHG_272 carboxiquinase (PPCK) (ATP + oxaloacetato + H+ --> ADP 1 + CO2 + fosfoenolpiruvato) 30 Rendime 2 CAETHG_137 Adenosina 5'-monofosfato fosfo-hidrolase (H2O + AMP 0 0,020 nto - 1, <=> Fosfato + H+ + Adenosina), cistationina beta-liase 145 LMOMA CAETHG_049 (H2O + cistationina --> NH3 + piruvato + homocisteína) 8 31 Rendime 2 CAETHG_247 dGTP trifosfo-hidrolase (H2O + dGTP --> H+ + 0 0,020 nto - 5, desoxiguanosina + trifosfato), L-treonina acetaldeído-liase 13 LMOMA CAETHG_068 (L-treonina --> glicina + acetaldeído) 6 32 Rendime 2 CAETHG_137 Adenosina 5'-monofosfato fosfo-hidrolase (H2O + AMP 0 0,020 nto - 1, <=> Fosfato + H+ + Adenosina), Citramalato sintase (H2O 115 LMOMA CAETHG_275 + Piruvato + Acetil-CoA <=> CoA + Citramalato) 1 33 Rendime 2 0, Acetil-CoA:dióxido de carbono ligase (formadora de ADP) 0 0,020 nto - CAETHG_137 (ATP + acetil-CoA + H2CO3 --> ADP + fosfato + H+ + 1 LMOMA 1 malonil-CoA), adenosina 5'-monofosfato fosfo-hidrolase (H2O + AMP <=> fosfato + H+ + adenosina) 34 Rendime 2 CAETHG_137 Adenosina 5'-monofosfato fosfo-hidrolase (H2O + AMP 0 0,020 nto - 1, <=> Fosfato + H+ + Adenosina), L-arginina imino- 1 LMOMA CAETHG_302 hidrolase (H2O + L-arginina <=> NH3 + Citrulina) 1 35 Rendime 2 CAETHG_137 Adenosina 5'-monofosfato fosfo-hidrolase (H2O + AMP 0 0,020 nto - 1, <=> Fosfato + H+ + Adenosina), transporte reversível de L- 1 LMOMA CAETHG_024 lactato via simporte de prótons (H+_ext + L-Lactato_ext 8 <=> H+ + L-Lactato) 36 Rendime 1 CAETHG_068 L-treonina acetaldeído-liase (L-treonina --> glicina + 0 0,020 nto - 6 acetaldeído) 1
LMOMA 37 Rendime 1 CAETHG_127 AMP:pirofosfato fosforibosiltransferase (PPi + AMP <=> 0 0,020 nto - 0 PRPP + adenina) 085
LMOMA 38 Rendime 1 CAETHG_137 Adenosina 5'-monofosfato fosfo-hidrolase (H2O + AMP 0 0,020 nto - 1 <=> Fosfato + H+ + Adenosina) 085
LMOMA 39 Rendime 1 CAETHG_392 D-ribose 1,5-fosfomutase (ribose 1-fosfato <=> ribose-5- 0 0,020 nto - 4 fosfato) 085
LMOMA 40 Rendime 1 CAETHG_016 N-ribosilnicotinamida:ortofosfato ribosiltransferase (fosfato 0 0,020 nto - 0 + N-ribosilnicotinamida <=> nicotinamida + ribose 1- 085 LMOMA fosfato) 41 Rendime 1 CAETHG_272 Fosfoenolpiruvato carboxiquinase (PPCK) (ATP + 0 0,020 nto - 1 oxaloacetato + H+ --> ADP + CO2 + Fosfoenolpiruvato) 07
LMOMA 42 Rendime 1 CAETHG_049 Cistationina beta-liase (H2O + cistationina --> NH3 + 0 0,020 nto - 8 piruvato + homocisteína) 055
LMOMA 43 Rendime 1 CAETHG_275 Citramalato sintase (H2O + Piruvato + Acetil-CoA <=> 0 0,020 nto - 1 CoA + Citramalato) 025
LMOMA
288 / 294 44 Rendime 2 CAETHG_290 ATP:piruvato, ortofosfato fosfotransferase (ATP + fosfato + 0 0,020 nto - 9, piruvato + H+ --> PPi + AMP + fosfoenolpiruvato), alfa- 025 LMOMA CAETHG_293 acetolactato descarboxilase (ALCTT --> CO2 + (R)- 2 Acetoína) 45 Rendime 1 CAETHG_302 L-arginina imino-hidrolase (H2O + L-arginina <=> NH3 + 0 0,020 nto - 1 citrulina) 01
LMOMA EXEMPLO 20
[00104] Esse exemplo descreve alvos de rompimentos de genes comuns em diferentes vias do produto. As otimizações foram executadas usando um algoritmo evolutivo em 444 vias. Cada projeto de cepa foi pontuado com base no rendimento obtido (projetos acoplados sem crescimento) e no rendimento associado ao produto de biomassa (projetos acoplados ao crescimento). Cada gene foi classificado com base na frequência com que apareceu nos projetos de cepas. 19 genes foram comumente identificados para rompimentos em cepas otimizadas. N° Gene Pontuação do Pontuação do acoplamento Pontuação total acoplamento de sem crescimento crescimento 1 CAETHG_3359 6,039281 14,18996 20,22924 2 CAETHG_2932 0 16,79651 16,79651 3 CAETHG_3293 2,508019 13,12476 15,63278 4 CAETHG_3510 0 12,77112 12,77112 5 CAETHG_3924 0 11,15045 11,15045 6 CAETHG_1371 0 11,03476 11,03476 7 CAETHG_2006 0 10,68385 10,68385 8 CAETHG_2909 1,515088 8,61957 10,13466 9 CAETHG_2721 0 9,82919 9,82919 10 CAETHG_2753 0,50272 9,082944 9,585664 11 CAETHG_0160 0 8,767024 8,767024 12 CAETHG_3299 0 7,876761 7,876761 13 CAETHG_2751 4,149778 3,457399 7,607177 14 CAETHG_0233 0 7,516631 7,516631 15 CAETHG_1270 0 7,501854 7,501854 16 CAETHG_0234 0 7,213378 7,213378 17 CAETHG_2790 0 6,668087 6,668087 18 CAETHG_2791 0 6,554927 6,554927 19 CAETHG_2796 0 6,324132 6,324132 EXEMPLO 21
[00105] Esse exemplo descreve alvos de rompimento de genes para aumentar a produção de compostos-alvo durante o crescimento autotrófico. Essa estratégia envolve eliminar ou diminuir a produção de outros subprodutos da fermentação, tornando o composto-alvo um subproduto de crescimento necessário. Os experimentos de modelagem metabólica foram
289 / 294 realizados como descrito no Exemplo 1.
[00106] As evidências de modelagem demonstram que essa estratégia é apropriada para compostos-alvo cuja produção impõe carga mínima de ATP. Essa estratégia não é adequada para produtos com carga significativa de ATP durante o crescimento autotrófico. Isso ocorre porque essa estratégia diminui o rendimento de ATP celular através da eliminação da fosforilação no nível do substrato catalisada pela acetato-quinase.
[00107] Em particular, a produção de produtos como acetona, isopropanol, 1,3-butanodiol, 3-hidroxibutirato, 2-hidroxi-isobutirato, 3- hidroxi-isovalerato e ácido adípico pode ser melhorada através da introdução de uma mutação disruptiva nos genes que codificam acetato cinase e/ou fosfato transacetilase e, opcionalmente, a introdução adicional de uma mutação disruptiva em um ou mais genes que codificam acetolactato descarboxilase, lactato desidrogenase, aldeído desidrogenase ou citramalato sintase.
[00108] Cada modelo foi avaliado usando análise de variabilidade de fluxo para determinar o fluxo mínimo necessário para o composto-alvo durante o crescimento normal. Em seguida, o conjunto proposto de mutações genéticas disruptivas foi aplicado a cada modelo. A análise de variabilidade do fluxo foi realizada novamente para identificar qualquer existência de acoplamento entre produção e crescimento de compostos. As simulações foram realizadas na versão cobrapy 0.13.4. Produto Rendimento mínimo Rendimento mínimo durante o durante o crescimento crescimento celular com genes-alvo celular rompidos Acetona 0,00 0,301 1,3-Butanodiol 0,00 0,323 3-Hidroxibutirato 0,00 0,395 2-Hidroxiisobutirato 0,00 0,395 3-Hidroxiisovalerato 0,00 0,368 Ácido adípico 0,00 0,428 EXEMPLO 22
[00109] Esse exemplo descreve o aumento da produção de compostos- alvo durante o crescimento autotrófico em misturas gasosas com uma baixa
290 / 294 proporção de CO, diminuindo a coprodução de acetato necessária. Os experimentos de modelagem metabólica foram realizados como descrito no Exemplo 1.
[00110] A estratégia envolve ajustar o saldo do cofator redox para que haja excesso de NADPH. Para manter a homeostase redox, a célula deve produzir produtos cuja via de produção exija NADPH. Como a produção de acetato não cumpre isso, será necessário que a célula produza outros produtos para atingir taxas máximas de crescimento.
[00111] As evidências de modelagem demonstram que essa estratégia é apropriada para compostos-alvo com carga de ATP que requer a coprodução de acetato. Essa estratégia também é apropriada para cepas que produzem etanol como produto primário. Prevê-se que esta estratégia funcione com baixos gases de CO, onde a célula pode utilizar a enzima hidrogenase para reduzir a ferredoxina e o NAD(P)+. Em alguns casos, o rendimento máximo possível do composto-alvo diminuirá, pois essa estratégia reduz a eficiência do metabolismo energético da célula.
[00112] Em particular, a produção de produtos como etanol, acetona, isopropanol, 1,3-butanodiol, 2-butanol, 2-hidroxi-isobutirato, 3-hidroxi- isovalerato, ácido adípico, metiletilcetona, isopreno, salicilato, corismato e farneseno pode ser aprimorada pela introdução de uma mutação disruptiva em um gene que codifica hydr hidrogenenase [FeFe] dependente de NAD (por exemplo, Hyd) e, opcionalmente, introduz uma mutação disruptiva em um ou mais genes que codificam glutamato sintase, citramalato sintase, acetolactato descarboxilase ou lactato desidrogenase.
[00113] Cada modelo foi avaliado usando análise de variabilidade de fluxo para determinar o fluxo mínimo necessário de acetato a altas taxas de crescimento. Em seguida, o conjunto proposto de mutações genéticas disruptivas foi aplicado a cada modelo. A hidrogenase dependente de NAD (Hyd) foi removida da matriz estequiométrica para representar o knockout
291 / 294 dessa enzima. O fluxo através da reação da glutamato sintase diminuiu em 30% para representar uma ruptura dessa enzima. A análise de variabilidade do fluxo foi realizada novamente para determinar o requisito mínimo de produção de acetato para alcançar o crescimento máximo. As simulações foram realizadas na versão cobrapy 0.13.4 Rendimento mínimo exigido de acetato na maior taxa de crescimento (produto C-mol/absorção de CO + H2 em mol) Produto Cepa [FeFe]-hidrogenase de [FeFe]-hidrogenase de bifurcação de parental bifurcação de elétrons elétrons dependente de NAD rompida dependente de NAD (Hyd) e glutamato sintase rompida rompida (Hyd) (sob expressão) Etanol 0,430 0,356 0,0002 Acetona 0,430 0,356 0,0002 Isopropanol 0,430 0,356 0,0002 1,3-Butanodiol 0,430 0,356 0,0000 2-Butanol 0,430 0,356 0,0002 2-Hidroxiisobutirato 0,430 0,356 0,0000 3-Hidroxiisovalerato 0,430 0,356 0,0000 Ácido adípico 0,430 0,356 0,0002 Metil-etil-cetona 0,430 0,356 0,0002 Isopreno 0,430 0,355 0,0000 Salicilato 0,430 0,356 0,0002 Corismato 0,430 0,356 0,0002 Farneseno 0,430 0,356 0,0002 EXEMPLO 23
[00114] Esse exemplo descreve o aumento do fluxo através do acetoacetil-CoA, um nó metabólico central. O aumento do fluxo através desse nó aumentará a produção de produtos a jusante, como acetona, isopropanol, 3- hidroxi- isovaleril -CoA, 3-hidroxi-isovalerato, isobutileno, pirofosfato de isopentenil (IPP), pirofosfato de dimetilil (DMAPP), isopreno, terpenóides como farneseno, 3-hidroxibutiril-CoA, crotonil-CoA, 3-hidroxibutirato, 3- hidroxibutirilaldeído, 1,3-butanodiol, 2-hidroxiisobutiliril-CoA, 2- hidroxiisobutirato, butiril-CoA, butirato, butanol, ocproato, hexano, 1,3- hexanodiol, 2-buten-1-ol, isovaleril-CoA, isovalerato ou álcool isoamílico. Os experimentos de modelagem metabólica foram realizados como descrito no Exemplo 1.
[00115] A maioria dos microrganismos de Wood-Ljungdahl não é nativamente capaz de converter acetil-CoA em acetoacetil-CoA, de modo que esta etapa possa exigir a introdução de uma enzima heteróloga, como uma
292 / 294 tiolase (isto é, acetil-CoA acetiltransferase) (EC 2.3.1.9). A tiolase pode ser, por exemplo, ThlA de Clostridium acetobutylicum (WP_010966157.1), PhaA de Cupriavidus necator (WP_013956452.1), BktB de Cupriavidus necator (WP_011615089.1), AtoB de Escherichia coli (NP_416728.1), ou um semelhante.
[00116] Em particular, o fluxo através de acetoacetil-CoA pode ser melhorado através da introdução de uma mutação disruptiva em um ou mais genes que codificam um ou mais, dois ou mais, três ou mais, quatro ou mais ou cinco ou mais de bifurcação eletrônica dependente de NAD [FeFe] - hidrogenase (por exemplo, Hyd), glutamato sintase, citramalato sintase, acetolactato descarboxilase, lactato desidrogenase, acetato cinase, fosfato transacetilase ou aldeído desidrogenase. Nome da enzima Número de referência em C. autothanogenum [FeFe]-hidrogenase de CAETHG_1576, CAETHG_1578, CAETHG_3569, bifurcação de elétrons CAETHG_3570, CAETHG_3571 dependente de NAD Glutamato sintase CAETHG_0477, CAETHG_1580, CAETHG_3850, CAETHG_3851 Citramalato sintase CAETHG_2751 Acetolactato descarboxilase CAETHG_2932 Lactato desidrogenase CAETHG_1147 Acetato quinase CAETHG_3359 Fosfato transacetilase CAETHG_3358 Aldeído desidrogenase CAETHG_1819, CAETHG_3287, CAETHG_1830
[00117] Todas as referências, incluindo publicações, pedidos de patentes e patentes, citadas neste documento são aqui incorporadas por referência na mesma extensão como se cada referência fosse individual e especificamente indicada para ser incorporada por referência e foi apresentada aqui na íntegra. A referência a qualquer técnica anterior neste relatório descritivo não é, e não deve ser tomada como, um reconhecimento de que essa técnica anterior faz parte do conhecimento geral comum no campo de atuação em qualquer país.
[00118] O uso dos termos “um” e “uma” e “o/a” e referentes semelhantes no contexto da descrição da invenção (especialmente no contexto das reivindicações a seguir) deve ser interpretado para abranger tanto o
293 / 294 singular quanto o plural, a menos que indicado de outra forma aqui ou claramente contradito pelo contexto. Os termos “compreendendo”, “tendo”, “incluindo” e “contendo” devem ser interpretados como termos em aberto (isto é, significando “incluindo, mas não se limitando a”), a menos que indicado de outra forma. O termo “consistindo essencialmente em” limita o escopo de uma composição, processo ou método aos materiais ou etapas especificados, ou àqueles que não afetam materialmente as características básicas e novas da composição, processo ou método. O uso da alternativa (por exemplo, “ou”) deve ser entendido como significando uma, ambas ou qualquer combinação das alternativas. Conforme usado aqui, o termo “cerca de” significa ± 20% da faixa, valor ou estrutura indicados, a menos que indicado de outra forma.
[00119] A recitação de faixas de valores neste documento visa apenas servir como um método abreviado de se referir individualmente a cada valor separado dentro do intervalo, a menos que indicado de outra forma neste documento, e cada valor separado é incorporado à especificação como se fosse aqui recitado individualmente. Por exemplo, qualquer faixa de concentração, faixa percentual, faixa de proporção, faixa inteira, faixa de tamanho ou faixa de espessura deve ser entendida como incluindo o valor de qualquer número inteiro dentro da faixa recitada e, quando apropriado, suas frações (como um décimo e centésimo de um número inteiro), salvo indicação em contrário.
[00120] Todos os métodos aqui descritos podem ser realizados em qualquer ordem adequada, a menos que indicado de outra forma aqui ou claramente contradito pelo contexto. O uso de todos e quaisquer exemplos, ou linguagem exemplar (por exemplo, “como”) aqui fornecida, visa meramente iluminar melhor a invenção e não representa uma limitação no escopo da invenção, a menos que seja reivindicado de outra forma. Nenhuma linguagem no relatório descritivo deve ser interpretada como indicando qualquer
294 / 294 elemento não reivindicado como essencial para a prática da invenção.
[00121] As modalidades preferenciais desta invenção são aqui descritas. Variações dessas modalidades preferenciais podem se tornar aparentes para os versados na técnica após a leitura da descrição anterior. Os inventores esperam que indivíduos versados empreguem tais variações conforme apropriado, e os inventores pretendem que a invenção seja praticada de outra forma que não especificamente aqui descrita. Por conseguinte, esta invenção inclui todas as modificações e equivalentes do objeto recitado nas reivindicações anexas, conforme permitido pela lei aplicável. Além disso, qualquer combinação dos elementos acima descritos em todas as suas variações possíveis é abrangida pela invenção, a menos que indicado de outra forma aqui ou claramente contradito pelo contexto.

Claims (17)

REIVINDICAÇÕES
1. Bactéria Wood-Ljungdahl de ocorrência não natural que caracterizada pelo fato de que compreende uma tiolase heteróloga e uma mutação disruptiva em um ou mais genes que codificam uma ou mais das [FeFe]-hidrogenase de bifurcação de elétrons dependente de NAD, glutamato sintase, citramalato sintase, acetolactato descarboxilase, lactato desidrogenase, acetato cinase, fosfato transacetilase e aldeído desidrogenase, em que a bactéria de ocorrência não natural aprimorou o fluxo de carbono através do acetoacetil-CoA em comparação com uma bactéria parental.
2. Bactéria de ocorrência não natural de acordo com a reivindicação 1, caracterizada pelo fato de que a expressão do um ou mais genes é diminuída ou eliminada em comparação com a bactéria parental.
3. Bactéria de ocorrência não natural de acordo com a reivindicação 1, caracterizada pelo fato de que a bactéria de ocorrência não natural produz um produto selecionado do grupo que consiste em acetona, isopropanol, 3-hidroxi-isovaleril-CoA, 3-hidroxi-isovalerato, isobutileno, pirofosfato de isopentenila, pirofosfato de dimetilalila, isopreno, farneseno, 3- hidroxibutiril-CoA, crotonil-CoA, 3-hidroxibutirato, 3-hidroxibutirilaldeído, 1,3-butanodiol, 2-hidroxi-isobutiliril-CoA, 2-hidroxi-isobutirato, butiril-CoA, butirato, butanol, caproato, hexanol, octanoato, octanol, 1,3-hexanodiol, 2- buten-1-ol, isovaleril-CoA, isovalerato ou álcool isoamílico.
4. Bactéria de ocorrência não natural de acordo com a reivindicação 1, caracterizada pelo fato de que a bactéria parental é selecionada do grupo que consiste em Acetobacterium woodii, Alkalibaculum bacchii, Blautia producta, Butyribacterium methylotrophicum, Clostridium aceticum, Clostridium autoethanogenum, Clostridium carboxidivorans, Clostridium coskatii, Clostridium drakei, Clostridium formicoaceticum, Clostridium ljungdahlii, Clostridium magnum, Clostridium ragsdalei, Clostridium scatologenes, Eubacterium limosum, Moorella thermautotrophica, Moorella thermoacetica, Oxobacter pfennigii, Sporomusa ovata, Sporomusa silvacetica, Sporomusa sphaeroides e Thermoanaerobacter kiuvi.
5. Bactéria de ocorrência não natural de acordo com a reivindicação 1, caracterizada pelo fato de que a bactéria parental é selecionada do grupo que consiste em Clostridium autoethanogenum, Clostridium ljungdahlii e Clostridium ragsdalei.
6. Bactéria de ocorrência não natural de acordo com a reivindicação 1, caracterizada pelo fato de que a bactéria parental é Clostridium autoethanogenum e: (a) a [FeFe]-hidrogenase de bifurcação de elétrons dependente de NAD é selecionada do grupo que consiste em CAETHG_1576, CAETHG_1578, CAETHG_3569, CAETHG_3570 e CAETHG_3571, (b) a glutamato sintase é selecionada do grupo que consiste em CAETHG_0477, CAETHG_1580, CAETHG_3850 e CAETHG_3851, (c) a citramalato sintase é CAETHG_2751, (d) a acetolactato descarboxilase é CAETHG_2932, (e) a lactato desidrogenase é CAETHG_1147, (f) a acetato cinase é CAETHG_3359, (g) a fosfato transacetilase é CAETHG_3358, ou (h) a aldeído desidrogenase é selecionada do grupo que consiste em CAETHG_1819, CAETHG_3287 e CAETHG_1830.
7. Método de produção de um produto caracterizado pelo fato de que é através da cultura da bactéria de ocorrência não natural de acordo com a reivindicação 1, na presença de um substrato gasoso compreendendo um ou mais de CO, CO2 e H2.
8. Bactéria de ocorrência não natural de acordo com a reivindicação 7, caracterizada pelo fato de que o produto é selecionado do grupo que consiste em acetona, isopropanol, 3-hidroxi-isovaleril-CoA, 3-
hidroxi-isovalerato, isobutileno, pirofosfato de isopentenila, pirofosfato de dimetilalila, isopreno, farneseno, 3-hidroxibutiril-CoA, crotonil-CoA, 3- hidroxibutirato, 3-hidroxibutirilaldeído, 1,3-butanodiol, 2-hidroxi-isobutiliril- CoA, 2-hidroxi-isobutirato, butiril-CoA, butirato, butanol, caproato, hexanol, octanoato, octanol, 1,3-hexanodiol, 2-buten-1-ol, isovaleril-CoA, isovalerato ou álcool isoamílico.
9. Bactéria Wood-Ljungdahl de ocorrência não natural caracterizada pelo fato de que compreende uma mutação disruptiva em um ou mais genes, em que a bactéria de ocorrência não natural aprimorou o fluxo de carbono através do corismato em comparação com uma bactéria parental.
10. Bactéria de ocorrência não natural de acordo com a reivindicação 9, caracterizada pelo fato de que o um ou mais genes codificam um ou mais de purina-nucleosídeo fosforilase, lactato permease, cistationina gama-liase, adenina fosforibosiltransferase, 5'-nucleotidase/3'- nucleotidase/exopolifosfatase, canal mecanossensível de pequena condutância, arginina desiminase, apoenzima LL-diaminopimelato aminotransferase e fosfopentomutase.
11. Bactéria de ocorrência não natural de acordo com a reivindicação 9, caracterizada pelo fato de que a expressão do um ou mais genes é diminuída ou eliminada em comparação com a bactéria parental.
12. Bactéria de ocorrência não natural de acordo com a reivindicação 9, em que a bactéria de ocorrência não natural é caracterizada pelo fato de que produz um produto selecionado do grupo que consiste em corismato, ácido para-hidroxibenzoico, salicilato, 2-aminobenzoato, di- hidroxibenzoato, ácido 4-hidroxiciclo-hexano carboxílico e sais e íons dos mesmos.
13. Bactéria de ocorrência não natural de acordo com a reivindicação 9, caracterizada pelo fato de que a bactéria parental é selecionada do grupo que consiste em Acetobacterium woodii,
Acetobacterium woodii, Alkalibaculum bacchii, Blautia producta, Butyribacterium methylotrophicum, Clostridium aceticum, Clostridium autoethanogenum, Clostridium carboxidivorans, Clostridium coskatii, Clostridium drakei, Clostridium formicoaceticum, Clostridium ljungdahlii, Clostridium magnum, Clostridium ragsdalei, Clostridium scatologenes, Eubacterium limosum, Moorella thermautotrophica, Moorella thermoacetica, Oxobacter pfennigii, Sporomusa ovata, Sporomusa silvacetica, Sporomusa sphaeroides e Thermoanaerobacter kiuvi.
14. Bactéria de ocorrência não natural de acordo com a reivindicação 9, caracterizada pelo fato de que a bactéria parental é selecionada do grupo que consiste em Clostridium autoethanogenum, Clostridium ljungdahlii e Clostridium ragsdalei.
15. Bactéria de ocorrência não natural de acordo com a reivindicação 9, caracterizada pelo fato de que: (a) a bactéria parental é Clostridium autoethanogenum e o um ou mais genes codificam um ou mais de CAETHG_0160, CAETHG_0248, CAETHG_0498, CAETHG_1270, CAETHG_1371, CAETHG_2107, CAETHG_3021, CAETHG_3510 e CAETHG_3924, (b) a bactéria parental é Clostridium ljungdahlii e o um ou mais genes codificam um ou mais de CLJU_c20750, CLJU_c21610, CLJU_c24380, CLJU_c33720, CLJU_c34740, CLJU_c42810, CLJU_c09270, CLJU_c14280 e CLJU_c18150 ou (c) a bactéria parental é Clostridium ragsdalei e o um ou mais genes codificam um ou mais de CLRAG_19250, CLRAG_31200, CLRAG_25120, CLRAG_24560, CLRAG_14800, CLRAG_25620, CLRAG_09600 ou CLRAG_00520.
16. Método de produção de um produto caracterizado pelo fato de que é através da cultura da bactéria de ocorrência não natural de acordo com a reivindicação 9, na presença de um substrato gasoso compreendendo um ou mais de CO, CO2 e H2.
17. Método de acordo com a reivindicação 16, caracterizado pelo fato de que a bactéria de ocorrência não natural produz um produto selecionado do grupo que consiste em corismato, ácido para-hidroxibenzoico, salicilato, 2-aminobenzoato, di-hidroxibenzoato, ácido 4-hidroxiciclo-hexano carboxílico e sais e íons dos mesmos.
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Families Citing this family (10)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Publication number Priority date Publication date Assignee Title
US11541105B2 (en) 2018-06-01 2023-01-03 The Research Foundation For The State University Of New York Compositions and methods for disrupting biofilm formation and maintenance
WO2020181324A1 (en) * 2019-03-08 2020-09-17 Commonwealth Scientific And Industrial Research Organisation Expression of nitrogenase polypeptides in plant cells
JP7534768B2 (ja) 2020-06-02 2024-08-15 国立大学法人広島大学 アセトンを生成する組換え好熱性細菌及びそれを用いたアセトンの製造方法
JP2023520257A (ja) * 2020-06-06 2023-05-16 ランザテク，インコーポレイテッド アセトラクテートデカルボキシラーゼ遺伝子座位でのノックインを有する微生物
CN111876396B (zh) * 2020-07-07 2022-04-01 浙江工业大学 双辅酶依赖型草铵膦脱氢酶突变体及其在催化合成l-草铵膦中的应用
KR20240021234A (ko) * 2021-06-10 2024-02-16 펠리칸 테크놀로지 홀딩스, 인크. 재조합 단백질 발현을 위한 박테리아 숙주
CN113913448B (zh) * 2021-07-23 2023-10-20 中国人民解放军军事科学院军事医学研究院 一种提高甲基营养菌吡咯喹啉醌产量的方法及应用
CN114292929B (zh) * 2021-11-30 2024-01-02 绍兴文理学院 一种用于定量耐酸乳杆菌的分子标记及一种绝对定量黄酒发酵过程中细菌群落组成的方法
WO2024192291A1 (en) 2023-03-15 2024-09-19 Renagade Therapeutics Management Inc. Delivery of gene editing systems and methods of use thereof
CN116925991B (zh) * 2023-07-28 2024-08-09 天津大学 高产甲羟戊酸的重组盐单胞菌菌株及构建方法与应用

Family Cites Families (5)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Publication number Priority date Publication date Assignee Title
EP2245137B1 (en) * 2008-01-22 2017-08-16 Genomatica, Inc. Methods and organisms for utilizing synthesis gas or other gaseous carbon sources and methanol
WO2012045022A2 (en) * 2010-10-01 2012-04-05 The Ohio State University Metabolic engineering of clostridium tyrobutyricum for butanol production
BR122023023156A2 (pt) * 2015-05-27 2024-03-05 Lanzatech Nz, Inc. Bactéria geneticamente modificada fixadora de c1 capaz de produzir pelo menos um produto derivado de corismato, e, método de fabricação de um produto de fermentação
CN108884467A (zh) * 2015-10-13 2018-11-23 朗泽科技新西兰有限公司 包含产能发酵途径的基因工程菌
US10358661B2 (en) * 2015-12-28 2019-07-23 Lanzatech New Zealand Limited Microorganism with modified hydrogenase activity

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