BR112016027815A2

BR112016027815A2 - Sistemas e métodos para análise bioquímica incluindo um instrumento de base e um cartucho removível

Info

Publication number: BR112016027815A2
Application number: BR112016027815-1A
Authority: BR
Inventors: Alex Aravanis; Boyan Boyanov; M. Shane Bowen; Dale Buermann; Alexander Hsiao; Behnam Javanmardi; Tarun Khurana; Poorya Sabounchi; Hai Quang Tran
Original assignee: Illumina, Inc.
Priority date: 2014-05-27
Filing date: 2015-05-27
Publication date: 2021-07-20
Also published as: JP7077383B2; RU2016145904A; EP3148697A1; WO2015183871A1; KR20170012367A; KR20210032567A; CN106536055B; US20230145389A1; CA3127071A1; US20170189904A1; US11590494B2; JP2022119847A; JP6960223B2; KR102231650B1; AU2015267189A1; JP2021036242A; AU2019264546A1; AU2019261823B2; RU2016145904A3; CA2949984A1

Abstract

SISTEMAS E MÉTODOS PARA ANÁLISE BIOQUÍMICA INCLUINDO UM INSTRUMENTO DE BASE E UM CARTUCHO REMOVÍVEL. Sistemas e métodos para conduzir reações designadas utilizando um instrumento de base e um cartucho removível. O cartucho removível inclui uma rede fluídica que recebe e orienta fluidicamente uma amostra biológica para conduzir as reações designadas. O cartucho removível também inclui uma válvula de controle de fluxo que é operativamente acoplada à rede fluídica e é móvel em relação à rede fluídica para controlar fluxo da amostra biológica através da mesma. O cartucho removível é configurado para separadamente engatar um instrumento de base. O instrumento de base inclui um acionador de válvula que engata a válvula de controle de fluxo do cartucho removível. Uma montagem de detecção retida por pelo menos um entre o cartucho removível ou o instrumento de base pode ser usada para detectar as reações designadas.

Description

CESSÃO DOS INVENTORES No. Do dossiê: IP-1205-PRV Título: SYSTEMS AND METHODS FOR BIOCHEMICAL ANALYSIS

INCLUDING A BASE INSTRUMENT AND A REMOVABLE CARTRIDGE Pedido US no.: 62/003.264 Data de depósito: 27 de maio de 2014 Inventor(es): Alex Aravanis, Majid Aghababazadeh, Boyan Boyanov, M. Shane Bowen, Dale Buermann, Alexander Hsiao, Behnam Javanmardi, Tarun Khurana e Hai Quang Tran CONSIDERANDO QUE os inventores acima identificados (coletivamente “Os Cedentes”) fizeram certas novas e úteis invenções, descobertas e aperfeiçoamentos (as “invenções”), para as quais os Cedentes depositaram o(s) pedido(s) listado(s) acima e agora deseja(m) transferir todos os direitos, titularidade e interesses nas: . invenções, . pedido(s) listado(s) acima, e quaisquer outros pedidos para patente, desenho, modelo de utilidade, certificado de invenção, marca registrada, ou imagem comercial, em qualquer país ou de acordo com qualquer autoridade internacional ou regional (por exemplo, WIPO/PCT, EPO, ARIPO, EAPO, OAPI) até o ponto em que alguma ou toda sua matéria seja revelada e tenha direito ao benefício de prioridade no(s) pedido(s) listado(s) acima, incluindo pedidos provisionais, 1/7 continuação, divisão, continuação em parte, reexpedição, e pedidos de reexame (coletivamente “o(s) pedido(s)”,

. o benefício de data de depósito mais cedo e direito de reivindicar prioridade para as invenções e pedido(s) de acordo com lei e tratados aplicáveis, incluindo a Convenção de Paris para a Proteção de Propriedade industrial como revisado e emendado e 35 U.S.C. § 119, 120,

. quaisquer direitos resultantes da publicação do(s)

pedido(s), como 35 U.S.C. § 154(d), Art. 67(1) EPC,

. quaisquer Cartas Patente ou Certificados de invenção que possam ser emitidos ou concedidos a partir do(s) pedido(s),

incluindo patentes reexpedidas, certificados de reexame,

renovações e quaisquer direitos resultantes de uma prorrogação ou ajuste de termo de patente, e

. quaisquer direitos que se originem da invenção de acordo com as leis e convenções que protegem direitos autorais,

marca registrada, imagem comercial ou outra propriedade industrial,

(coletivamente, “os direitos IP”), e

CONSIDERANDO QUE ILLUMINA, INC., uma sociedade comercial de

Delaware tendo local comercial em 5200 Illumina Way, San

Diego, CA 92122, Estados Unidos da América, deseja adquirir todos os direitos, titularidade e interesses para si própria,

seus sucessores, e seus nomeados (coletivamente “a

2/7

Cessionária”) nos direitos de IP por um instrumento por escrito, 35 U.S.C. § 261;

AGORA, PORTANTO, a quem interessar possa, saibam que por boa e valiosa compensação, cujo recebimento e suficiência pela presente nós reconhecemos e pela presente renunciamos ao direito de qualquer compensação adicional referente aos direitos IP;

Garantimos e declaramos para a Cessionária que temos todos os direitos de transferir nossos direitos, titularidade e interesses nos Direitos de IP sem gravame, e que não fizemos nenhuma cessão, licença, concessão ou hipoteca anterior para outro, ou fizemos qualquer acordo com outro, que afetaria nossos direitos, titularidade e interesses nos Direitos de

IP;

Por essa cessão e em virtude de quaisquer acordos anteriores em ceder, pela presente cedemos, transferimos, passamos e vendemos nossos direitos integrais, titularidade e interesse nos Direitos de IP para a Cessionária, incluindo quaisquer reivindicações ou causas de ação por danos ou outros recursos que se originem de qualquer violação anterior dos

Direitos de IP, para e ser para o benefício total da

Cessionária dos Direitos de IP totalmente como teriam sido retidos por nós caso essa Cessão não tivesse sido feita;

Autorizamos a Cessionária e seus representantes legais a:

3/7

(a) Inserir nessa Cessão qualquer informação suplementar para tornar a identificação mais completa para qualquer do(s) Pedido(s) ou Cartas patente já listadas acima,

(b) processar o(s) pedido(s), depositar novos pedidos para a(s) invenção(ões), e fazer todos os atos permitidos por lei para proteger e executar os direitos de IP,

(c) Solicitar que Cartas Patentes e Certificados de

Invenção sejam emitidos e concedidos para e no nome da Cessionária pela autoridade emissora ou de concessão, como o Comissário para Patentes dos

Estados Unidos, 37 C.F.R. § 3.81; e

Concordamos com a Cessionária de que nós e nossos representantes legais, herdeiros e testamenteiros executaremos todos os atos considerados necessários ou desejáveis pela Cessionária para permitir e auxiliar a assegurar todos os direitos, titularidade e interesses nos

Direitos de IP de modo que a Cessionária possa se beneficiar dessa Cessão, incluindo:

(a) Comunicar para a Cessionária todos os fatos conhecidos por nós que se refiram ao histórico e extensão de minha contribuição individual para os

Direitos de IP, incluindo as circunstâncias da

4/7 concepção da invenção e seus desenvolvimento e redução para prática, e fornecer documentos ou itens de suporte em meu controle, (b) Auxiliar na preparação do(s) pedido(s) e sua execução pela Cessionária, 37 C.F.R. § 3.71, e na execução dos Direitos de IP, incluindo fazer, executar, e entregar à Cessionária quaisquer outros documentos necessários, como documentos adicionais do pedido, declaração, declarações juramentadas, renúncias, petições ou cessões e (c) Auxiliar e cooperar em processos administrativos e legais, incluindo dar testemunho oral e escrito, De modo que esses sejam realizados sem compensação adicional, exceto por despesas efetivas razoáveis a serem reembolsadas pela Cessionária.

Acordamos adicionalmente com a Cessionária que não realizaremos nenhum ato futuro, firmaremos qualquer documento subsequente, ou faremos qualquer acordo subsequente com outra pessoa ou parte que esteja em conflito com essa Cessão, que pretende transferir qualquer direito, titularidade ou interesse nos Direitos de IP que são o assunto dessa Cessão, a menos que acordado por escrito pela Cessionária ou que impeça a Cessionária de receber o benefício integral do negócio de acordo com essa Cessão.

5/7

Se qualquer disposição da presente Cessão for considerada inválida ou não executável, a disposição será executada até o ponto máximo permissível para pôr em efeito a intenção dos Cedentes e da Cessionária, e o restante dessa Cessão não será afetada, porém continuará em pleno vigor e efeito.

O presente documento será executável por cada Cedente em partes, e a Cessão estará em vigor e registrável para cada Cedente a partir da data da assinatura daquele Cedente.

Nome legal do inventor: Alex Aravanis Em testemunho do que, apus minha assinatura e selo aos 11 dias de fevereiro de 2015.

Assinatura ilegível Nome legal do inventor: Boyan Boyanov Em testemunho do que, apus minha assinatura e selo aos 19 dias de fevereiro de 2015.

Assinatura ilegível Nome legal do inventor: M. Shane Bowen Em testemunho do que, apus minha assinatura e selo aos 10 dias de fevereiro de 2015.

Assinatura ilegível Nome legal do inventor: Dale Buermann Em testemunho do que, apus minha assinatura e selo aos 23 dias de março de 2015.

Assinatura ilegível 6/7

Nome legal do inventor: Alexander Hsiao Em testemunho do que, apus minha assinatura e selo aos 24 dias de março de 2015.

Assinatura ilegível Nome legal do inventor: Behnam Javanmardi Em testemunho do que, apus minha assinatura e selo aos 10 dias de fevereiro de 2015.

Assinatura ilegível Nome legal do inventor: Tarun Khurana Em testemunho do que, apus minha assinatura e selo aos 2 dias de fevereiro de 2015.

Assinatura ilegível Nome legal do inventor: Hai Quang Tran Em testemunho do que, apus minha assinatura e selo aos 13 dias de fevereiro de 2015.

Assinatura ilegível 7/7

Claims

REIVINDICAÇÕES

1. Sistema, caracterizado pelo fato de compreender: um cartucho removível tendo um alojamento de cartucho e incluindo uma rede fluídica disposta no interior do alojamento de cartucho, a rede fluídica configurada para receber e orientar fluidicamente uma amostra biológica para conduzir pelo menos um entre análise de amostra ou preparação de amostra, o cartucho removível também incluindo uma válvula de controle de fluxo que é operativamente acoplada à rede fluídica e móvel em relação à rede fluídica para controlar fluxo da amostra biológica através da mesma, o alojamento de cartucho incluindo um lado de alojamento que define um exterior do cartucho removível e permite acesso operativo à válvula de controle de fluxo; um instrumento de base tendo um lado de controle configurado para engatar separadamente o lado de alojamento do cartucho removível, os lados de alojamento e controle definindo coletivamente uma interface de sistema, o instrumento de base incluindo um acionador de válvula que engata a válvula de controle de fluxo através da interface de sistema; e uma montagem de detecção retida por pelo menos um entre o cartucho removível ou o instrumento de base, a montagem de detecção incluindo um detector de imageamento e uma câmara de reação que está em comunicação de fluxo com a rede fluídica,

o detector de imageamento configurado para detectar reações designadas no interior da câmara de reação.

2. Sistema, de acordo com a reivindicação 1, caracterizado pelo fato de que o lado de controle e o lado de alojamento são genericamente planos e voltados entre si, em que a interface de sistema é uma interface de lado único na qual o instrumento de base e o cartucho removível são operativamente acoplados entre si somente através do lado de alojamento e lado de controle.

3. Sistema, de acordo com a reivindicação 2, caracterizado pelo fato de que o instrumento de base e o cartucho removível são operativamente acoplados de modo que o instrumento de base e o cartucho removível sejam fixados entre si na interface de sistema com pelo menos um entre um alojamento fluídico, um acoplamento elétrico, ou um acoplamento térmico estabelecido através da interface de sistema.

4. Sistema, de acordo com qualquer uma das reivindicações 1 a 3, caracterizado pelo fato de que o lado de controle representa um topo do instrumento de base, com relação à gravidade, de modo que o cartucho removível senta sobre e é sustentado pelo instrumento de base.

5. Sistema, de acordo com qualquer uma das reivindicações 1 a 4, caracterizado pelo fato de que o acionador de válvula inclui um corpo acionador alongado que estende através do lado de alojamento e para dentro do alojamento de cartucho.

6. Sistema, de acordo com qualquer uma das reivindicações 1 a 5, caracterizado pelo fato de que a válvula de controle de fluxo inclui um corpo de acionador alongado que estende através do lado de controle e para dentro do instrumento de base.

7. Sistema, de acordo com qualquer uma das reivindicações 1 a 6, caracterizado pelo fato de que o instrumento de base tem um lado de instrumento que está voltado em uma direção oposta com relação ao lado de controle, o instrumento de base tendo uma dimensão de instrumento estendendo entre o lado de controle e o lado de instrumento, o instrumento de base e o cartucho removível tendo uma dimensão combinada que é maior que a dimensão de instrumento.

8. Sistema, de acordo com qualquer uma das reivindicações 1 a 7, caracterizado pelo fato de que cada entre o cartucho removível e o instrumento de base inclui um conjunto de contatos de contatos elétricos, os conjuntos de contatos sendo eletricamente acoplados entre si na interface de sistema.

9. Sistema, de acordo com qualquer uma das reivindicações 1 a 8, caracterizado pelo fato de que o lado de alojamento é um primeiro lado de alojamento e o alojamento de cartucho compreendendo ainda um segundo lado de alojamento, os primeiro e segundo lados de alojamento voltados em direções diferentes, em que a interface de sistema é uma interface de mutilados na qual o instrumento de base e o cartucho removível são operativamente acoplados entre si ao longo de cada dos primeiro e segundo lados de alojamento.

10. Sistema, de acordo com a reivindicação 9, caracterizado pelo fato de que os primeiro e segundo lados de alojamento são genericamente perpendiculares entre si, o instrumento de base tendo um alojamento de instrumento que inclui primeiro e segundo lados de controle que estão voltados em direções perpendiculares e formam um recesso de lado aberto do instrumento de base, o cartucho removível sendo disposto no recesso de lado aberto de modo que os primeiro e segundo lados de alojamento engatam os primeiro e segundo lados de controle.

11. Sistema, de acordo com a reivindicação 10, caracterizado pelo fato de que o acionador de válvula inclui um corpo alongado que estende através da interface de sistema entre o primeiro lado de alojamento e o primeiro lado de controle, o segundo lado de alojamento e o segundo lado de controle incluindo respectivos conjuntos de contato de contatos elétricos, os conjuntos de contato sendo eletricamente acoplados entre si ao longo da interface de sistema.

12. Sistema, de acordo com a reivindicação 9, caracterizado pelo fato de que o primeiro e segundo lados de alojamento estão voltados em direções genericamente opostas, o instrumento de base tendo um lado de instrumento e uma fenda de recebimento de cartucho que abre para o lado de instrumento, o cartucho removível sendo disposto na fenda de recebimento de cartucho.

13. Sistema, de acordo com a reivindicação 12, caracterizado pelo fato de que o cartucho removível e o instrumento de base são fluidicamente acoplados ao longo do primeiro lado de alojamento e eletricamente acoplados ao longo do segundo lado de alojamento.

14. Sistema, de acordo com a reivindicação 12, caracterizado pelo fato de que o instrumento de base inclui um mecanismo de travamento que engata pelo menos um entre o primeiro lado de alojamento ou o segundo lado de alojamento para reter o cartucho removível no instrumento de base.

15. Sistema, de acordo com qualquer uma das reivindicações 1 a 14, caracterizado pelo fato de que cada do cartucho removível e instrumento de base inclui um orifício de fluxo, os orifícios de fluxo fluidicamente acoplando entre si na interface de sistema.

16. Sistema, de acordo com qualquer uma das reivindicações 1 a 15, caracterizado pelo fato de compreender ainda um mecanismo de travamento fixado a pelo menos um do cartucho removível ou instrumento de base, o mecanismo de travamento configurado para removivelmente fixar o alojamento de cartucho ao instrumento de base.

17. Sistema, de acordo com qualquer uma das reivindicações 1 a 16, caracterizado pelo fato de que o detector de imageamento é retido pelo instrumento de base e a câmara de reação é retida pelo cartucho removível.

18. Sistema, de acordo com qualquer uma das reivindicações 1 a 17, caracterizado pelo fato de que a válvula de controle de fluxo inclui uma membrana flexível que é configurada para controlar o fluxo da amostra biológica através da rede fluídica, a membrana flexível sendo flexionada entre primeira e segunda condições pelo acionador de válvula.

19. Sistema, de acordo com qualquer uma das reivindicações 1 a 18, caracterizado pelo fato de que o lado de alojamento do alojamento de cartucho inclui uma abertura de acesso através do mesmo que recebe o acionador de válvula.

20. Sistema, de acordo com qualquer uma das reivindicações 1 a 19, caracterizado pelo fato de que a válvula de controle de fluxo inclui uma válvula rotativa que é configurada para controlar o fluxo do fluido através da rede fluídica, a válvula rotativa sendo girada pelo acionador de válvula.

21. Sistema, de acordo com qualquer uma das reivindicações 1 a 20, caracterizado pelo fato de que o instrumento de base inclui um bloco térmico e a rede fluídica do alojamento de cartucho inclui um canal de amostra onde reações designadas com a amostra biológica ocorrem, o lado de alojamento incluindo uma abertura de acesso que estende ao longo do canal de amostra e é configurado para receber o bloco térmico para alterar uma temperatura do canal de amostra.

22. Sistema, de acordo com qualquer uma das reivindicações 1 a 21, caracterizado pelo fato de que a rede fluídica inclui uma pluralidade de canais e um módulo de armazenagem, o módulo de armazenagem incluindo uma pluralidade de reservatórios para armazenar reagentes que são usados para pelo menos uma entre preparação de amostra ou análise de amostra.

23. Sistema, de acordo com qualquer uma das reivindicações 1 a 22, caracterizado pelo fato de que o instrumento de base inclui um controlador de sistema tendo um módulo de controle de válvula configurado para controlar a operação do acionador de válvula para controlar fluxo da amostra biológica através da rede fluídica.

24. Sistema, de acordo com a reivindicação 23, caracterizado pelo fato de que o módulo de controle de válvula é configurado para controlar a operação do acionador de válvula para conduzir um protocolo de sequenciamento por síntese (SBS).

25. Método de sequenciar ácidos nucleicos, o método sendo caracterizado pelo fato de compreender: fornecer um cartucho removível tendo um alojamento de cartucho, uma rede fluídica disposta no alojamento de cartucho, e uma válvula de controle de fluxo que é operativamente acoplada à rede fluídica e móvel em relação à rede fluídica, em que o alojamento de cartucho inclui um lado de alojamento que define um exterior do cartucho removível; contatar o cartucho removível com um instrumento de base, em que o lado de alojamento do cartucho removível engata separadamente um lado de controle do instrumento de base para coletivamente definir uma interface de sistema, em que o instrumento de base compreende um acionador de válvula que operativamente engata a válvula de controle de fluxo através da interface de sistema; orientar fluidicamente uma amostra biológica para fluir através da rede fluídica do cartucho para conduzir pelo menos um entre análise de amostra ou preparação de amostra no cartucho, em que a amostra biológica é dirigida a fluir para dentro de uma câmara de reação, em que o fluxo da amostra biológica é controlado por ação do acionador de válvula na válvula de controle de fluxo; e imagear a amostra biológica na câmara de reação usando uma montagem de detecção que é retida por pelo menos um entre cartucho removível ou instrumento de base.

26. Método, de acordo com a reivindicação 25, caracterizado pelo fato de compreender ainda remover o cartucho removível a partir do instrumento de base.

27. Método, de acordo com a reivindicação 26, caracterizado pelo fato de compreender ainda contatar um segundo cartucho removível com o instrumento de base, em que o lado de alojamento do segundo cartucho removível separadamente engata o lado de controle do instrumento de base para coletivamente definir a interface de sistema.

28. Método, de acordo com a reivindicação 27, caracterizado pelo fato de que orientar fluidamente a amostra biológica e imagear a amostra biológica são repetidos múltiplas vezes em sequência.

29. Método, de acordo com qualquer uma das reivindicações 25 a 28, caracterizado pelo fato de compreender ainda vedar a amostra biológica no interior de uma região de preparação de amostra da rede fluídica e amplificar a amostra biológica enquanto a amostra biológica é vedada no interior da região de preparação de amostra.

30. Método, de acordo com qualquer uma das reivindicações 25 a 29, caracterizado pelo fato de que a válvula de controle de fluxo inclui uma válvula móvel tendo pelo menos um canal de fluxo que estende entre orifícios de válvula, o acionador de válvula configurado para mover o móvel entre posições diferentes.

31. Método, de acordo com a reivindicação 30, caracterizado pelo fato de que a válvula móvel está em uma posição de amostra quando a amostra biológica flui através do canal de fluxo e é dirigida para dentro da câmara de reação, o método compreendendo ainda mover a válvula móvel para uma posição de componente e fluir um reagente através do canal de fluxo para dentro da câmara de reação, o reagente reagindo com a amostra biológica na câmara de reação.

32. Método, de acordo com a reivindicação 31, caracterizado pelo fato de que a posição de componente inclui uma pluralidade de posições de componente, o método compreendendo ainda mover a válvula móvel entre as posições de componente de acordo com uma sequência predeterminada para fluir reagentes diferentes para dentro da câmara de reação.

33. Método, de acordo com qualquer uma das reivindicações 25 a 32, caracterizado pelo fato de que a amostra biológica inclui ácidos nucleicos e a sequência predeterminada está de acordo com um protocolo de sequenciamento por síntese (SBS).

34. Método, de acordo com qualquer uma das reivindicações 25 a 33, caracterizado pelo fato de que uma célula de fluxo inclui a câmara de reação, a amostra biológica sendo imobilizada em uma ou mais superfícies da célula de fluxo.

35. Cartucho removível, caracterizado pelo fato de compreender: um alojamento de cartucho tendo um orifício de amostra que abre para um exterior do alojamento de cartucho e é configurado para receber uma amostra biológica, o alojamento de cartucho tendo um conjunto de contatos elétricos e uma interface mecânica que são expostos para o exterior, o alojamento de cartucho configurado para ser removivelmente acoplado a um instrumento de base; uma rede fluídica compreendendo uma pluralidade de canais, uma câmara de reação, e um módulo de armazenagem, o módulo de armazenagem incluindo uma pluralidade de reservatórios para armazenar reagentes, a rede fluídica configurada para orientar reagentes a partir dos reservatórios para a câmara de reação, em que a interface mecânica é móvel em relação à rede fluídica para controlar fluxo de fluido através da rede fluídica; e um dispositivo de imageamento disposto no interior do alojamento de cartucho e posicionado para detectar reações designadas na câmara de reação, em que o dispositivo de imageamento é eletricamente acoplado ao conjunto de contatos elétricos para comunicar com o instrumento de base, a interface mecânica configurada para ser movida por um instrumento de base quando o cartucho removível é acoplado ao instrumento de base.

36. Cartucho removível, de acordo com a reivindicação 35, caracterizado pelo fato de que a interface mecânica inclui uma válvula de canal que é configurada para controlar o fluxo do fluido através de um dos canais da rede fluídica.

37. Cartucho removível, de acordo com a reivindicação 35 ou reivindicação 36, caracterizado pelo fato de que o alojamento de cartucho inclui uma abertura de acesso que permite acesso à interface mecânica.

38. Cartucho removível, de acordo com a reivindicação 35, caracterizado pelo fato de que a interface mecânica inclui uma válvula rotativa.

39. Cartucho removível, de acordo com qualquer uma das reivindicações 35-38, caracterizado pelo fato de que o alojamento de cartucho inclui uma abertura de acesso que é exposta ao exterior e os canais incluem um canal de amostra que está em comunicação de fluxo com o orifício de amostra, a abertura de acesso estendendo ao longo do canal de amostra e configurado para receber um bloco térmico para controlar uma temperatura do canal de amostra.

40. Cartucho removível, de acordo com qualquer uma das reivindicações 35 a 39, caracterizado pelo fato de que o alojamento de cartucho inclui um orifício de acoplamento fluídico que é exposto ao exterior e está em comunicação de fluxo com a rede fluídica, o orifício de acoplamento fluídico configurado para engatar um orifício de instrumento para receber fluido através do mesmo.

41. Cartucho removível, de acordo com qualquer uma das reivindicações 35 a 40, caracterizado pelo fato de que o alojamento de cartucho inclui primeiro e segundo lados de alojamento que estão voltados em direções opostas, o primeiro lado de alojamento incluindo o conjunto de contatos elétricos, o segundo lado de alojamento incluindo a interface mecânica.

42. Cartucho removível, de acordo com qualquer uma das reivindicações 35 a 41, caracterizado pelo fato de compreender ainda um mecanismo de travamento fixado ao alojamento de cartucho, o mecanismo de travamento configurado para removivelmente fixar o alojamento de cartucho ao instrumento de base.

43. Cartucho removível, de acordo com qualquer uma das reivindicações 35 a 42, caracterizado pelo fato de que o módulo de armazenagem inclui reagentes para conduzir um protocolo de sequenciamento por síntese (SBS).

44. Cartucho removível, caracterizado pelo fato de compreender:

um alojamento de cartucho tendo um orifício de amostra que abre para um exterior do alojamento de cartucho e é configurado para receber uma amostra biológica;

uma válvula rotativa disposta no alojamento de cartucho,

a válvula rotativa tendo um lado fluídico e uma pluralidade de orifícios de válvula que abrem no lado fluídico, a válvula rotativa tendo pelo menos um canal de fluxo estendendo entre os orifícios de válvula, em que a válvula rotativa é giratória entre posições rotacionais diferentes;

um corpo microfluídico tendo um lado de corpo que é deslizavelmente acoplado ao lado fluídico da válvula rotativa, o corpo microfluídico pelo menos parcialmente definindo uma rede fluídica que inclui:

um canal de amostra em comunicação de fluxo com o orifício de amostra, o canal de amostra tendo um orifício de rede que abre para o lado de corpo do corpo microfluídico;

um reservatório configurado para conter um reagente, o reservatório estando em comunicação de fluxo com um orifício de reservatório que abre para o lado fluídico do corpo microfluídico; e um canal de alimentação em comunicação de fluxo com uma câmara de reação da rede fluídica, o canal de alimentação tendo um orifício de alimentação que abre para o lado de corpo do corpo microfluídico; em que a válvula rotativa é configurada para girar entre primeira e segunda posições rotacionais, o orifício de rede sendo fluidicamente acoplada ao orifício de alimentação através da válvula rotativa quando a válvula rotativa está na primeira posição rotacional, o orifício de reservatório sendo fluidicamente acoplado ao orifício de alimentação através da válvula rotativa quando a válvula rotativa está na segunda posição rotacional.

45. Cartucho removível, de acordo com a reivindicação 44, caracterizado pelo fato de que o alojamento de cartucho tem um lado exterior que é configurado para engatar um instrumento de base, a válvula rotativa incluindo uma interface mecânica que é acessível no lado exterior e configurada para engatar o instrumento de base.

46. Cartucho removível, de acordo com a reivindicação 44 ou 45, caracterizado pelo fato de que o módulo de armazenagem inclui reagentes para conduzir um protocolo de sequenciamento por síntese (SBS).

47. Cartucho removível, de acordo com qualquer uma das reivindicações 44 a 46, caracterizado pelo fato de que a válvula rotativa na primeira posição rotacional é configurada para receber um liquido de amostra quando uma força no fluido move o liquido de amostra em direção ao orifício de alimentação, em que a válvula rotativa na segunda posição rotacional é configurada para permitir que o líquido de amostra seja deslocado para dentro do reservatório quando uma força de deslocamento empurra o liquido de amostra para longe a partir do orifício de alimentação para dentro do reservatório.

48. Cartucho removível, de acordo com qualquer uma das reivindicações 44 a 47, caracterizado pelo fato de que a válvula rotativa gira em torno de um eixo, o orifício de alimentação sendo alinhado com o eixo.

49. Cartucho removível, caracterizado pelo fato de compreender: um alojamento de cartucho tendo um orifício de amostra que abre para um exterior do alojamento de cartucho e é configurado para receber uma amostra biológica, o alojamento de cartucho incluindo um lado casado configurado para estar voltado para e removivelmente acoplar-se a um instrumento de base; uma rede fluídica disposta no alojamento, a rede fluídica incluindo um canal de amostra que está em comunicação de fluxo com o orifício de amostra; uma válvula de canal incluindo um elemento de flexão configurado para mover entre primeira e segunda posições, o elemento de flexão bloqueando fluxo através do canal de amostra quando na primeira posição e permitindo fluxo através do canal de amostra quando na segunda posição, em que o lado casado do alojamento de cartucho inclui uma abertura de acesso que expõe a válvula de canal ao exterior do alojamento de cartucho, a abertura de acesso configurada para receber um acionador de válvula do instrumento de base para mover o elemento de flexão entre primeira e segunda posições.

50. Cartucho removível, de acordo com a reivindicação 49, caracterizado pelo fato de que o elemento de flexão compreende uma camada flexível que cobre uma cavidade interior da rede fluídica, a camada flexível configurada para ser empurrada para dentro da cavidade para bloquear fluxo através da mesma.

51. Cartucho removível, de acordo com a reivindicação 49 ou 50, caracterizado pelo fato de compreender ainda uma válvula rotativa disposta no interior do alojamento de cartucho, a válvula rotativa configurada para girar entre posições diferentes para alterar um percurso de fluxo da rede fluídica, a válvula rotativa incluindo uma interface mecânica que é operativamente acessível ao longo de um lado casado.

52. Cartucho removível, de acordo com qualquer uma das reivindicações 49 a 51, caracterizado pelo fato de que a rede fluídica inclui um orifício de rede em comunicação de fluxo com o canal de amostra, um orifício de alimentação em comunicação de fluxo com uma câmara de reação, e um orifício de reservatório em comunicação de fluxo com um reservatório que é configurado para armazenar um reagente, o cartucho removível compreendendo ainda uma válvula rotativa disposta no interior do alojamento de cartucho, a válvula rotativa acoplando fluidicamente o orifício de alimentação e o orifício de rede quando em uma primeira posição rotacional e acoplando fluidicamente o orifício de alimentação e o orifício de reservatório quando em uma segunda posição rotacional.

53. Cartucho removível, de acordo com qualquer uma das reivindicações 49 a 52, caracterizado pelo fato de que o lado casado é um primeiro lado casado e o cartucho removível inclui um segundo lado casado, os primeiro e segundo lados casados voltados em direções opostas, o segundo lado casado configurado para engatar o instrumento mecanicamente, fluidicamente ou termicamente.

54. Instrumento de base caracterizado pelo fato de compreender: um alojamento de sistema tendo um lado de controle configurado para engatar um cartucho removível; um motor de rotação configurado para engatar uma válvula rotativa do cartucho removível; um acionador de válvula configurado para engatar uma válvula de canal do cartucho removível; um conjunto de contatos elétricos configurado para eletricamente acoplar-se ao cartucho removível; e um controlador de sistema configurado para controlar o motor de rotação e o acionador de válvula para executar um protocolo de ensaio no interior do cartucho removível, o controlador de sistema configurado para receber dados de imageamento a partir do cartucho removível através do conjunto de contatos elétricos.

55. Instrumento de base, de acordo com a reivindicação 54, caracterizado pelo fato de compreender ainda um bloco térmico para aquecer uma porção do cartucho removível.

56. Cartucho removível caracterizado pelo fato de compreender: um alojamento de cartucho tendo um orifício de amostra que abre para um exterior do alojamento de cartucho e é configurado para receber uma amostra biológica, o alojamento de cartucho incluindo um lado casado configurado para estar voltado para e removivelmente acoplar-se a um instrumento de base; um corpo microfluídico disposto no interior do alojamento de cartucho, o corpo microfluídico tendo um lado de corpo e incluindo uma rede fluídica compreendendo uma pluralidade de canais discretos e orifícios correspondentes que abrem no lado do corpo em uma área de recebimento de válvula; e uma válvula rotativa disposta no interior do alojamento de cartucho, a válvula rotativa tendo um lado fluídico e pelo menos um canal de fluxo estendendo entre uma pluralidade de orifícios de válvula, os orifícios de válvula abrindo para o lado fluídico, o lado fluídico sendo rotativamente acoplado à área de recebimento de válvula do lado do corpo, em que a válvula rotativa é móvel entre posições rotacionais diferentes para acoplar fluidicamente os canais discretos, em que a válvula rotativa tem uma interface mecânica que é acessível ao longo do lado casado e configurada para engatar o instrumento de base de modo que a válvula rotativa seja controlada pelo instrumento de base.

57. Cartucho removível, de acordo com a reivindicação 56, caracterizado pelo fato de que a válvula rotativa gira em torno de um eixo e os orifícios de válvula incluem um orifício de alimentação, o eixo estendendo através do orifício de alimentação.

58. Cartucho removível, caracterizado pelo fato de compreender: um alojamento de cartucho tendo um orifício de amostra que abre para um exterior do alojamento de cartucho e é configurado para receber uma amostra biológica, o alojamento de cartucho tendo um lado casado que é configurado para removivelmente acoplar-se a um instrumento de base; uma estrutura microfluídica disposta no interior do alojamento de cartucho e compreendendo uma pluralidade de camadas de painel de circuito impresso empilhadas (PCB), as camadas PCB incluindo camadas fluídicas que definem canais e uma câmara de reação quando as camadas PCB são empilhadas, as camadas PCB também incluindo uma camada de fiação; um imageador configurado para ser montado na estrutura microfluídica e eletricamente acoplado à camada de fiação condutiva, o imageador orientado para detectar reações designadas no interior da câmara de reação.

59. Cartucho removível de acordo com a reivindicação 58, caracterizado pelo fato de compreender ainda conatos de entrada/saída (I/O) que são expostos a um exterior do alojamento de cartucho, os contatos I/O sendo eletricamente acoplados ao imageador.

60. Cartucho removível, de acordo com a reivindicação 58 ou 59, caracterizado pelo fato de que a estrutura microfluídica inclui uma válvula de canal na qual pelo menos uma porção da válvula de canal é definida pelas camadas PCB, a válvula de canal configurada para ser acionada para bloquear e permitir fluxo através de um dos canais.