BR112015015577A2

BR112015015577A2 - método para aumentar a eficiência no uso do nitrogênio, produção, taxa de crescimento, biomassa, vigor, teor de óleo, produção de semente, produção da fibra, qualidade da fibra, comprimentoda fibra, capacidade fotossintética e/ou tolerância ao estresse abiótico de uma planta, método de produção de uma cultura, método para selecionar uma planta transformada, estrutura de ácido nucleico, método de cultivo de uma cultura, célula de planta, e planta transgênica

Info

Publication number: BR112015015577A2
Application number: BR112015015577-4A
Authority: BR
Inventors: Adi ETZIONI; Hagai Karchi
Original assignee: Evogene Ltd.
Priority date: 2012-12-26
Filing date: 2013-12-19
Publication date: 2020-09-24
Also published as: BR112015015577B1; CA2896426C; US20150376641A1; US11453888B2; US9771598B2; MX355751B; CA2896426A1; AU2013368878B2; BR122020005652B1; US20230313218A1; AU2013368878A1; BR122020005659B1; AU2021266196A1; MX2018005331A; BR122020005661B1; BR122020005664B1; US20180030469A1; AU2021266196A9; AU2019257481A1; BR122020005662B1

Abstract

MÉTODO PARA AUMENTAR A EFICIÊNCIA NO USO DO NITROGÊNIO, PRODUÇÃO, TAXA DE CRESCIMENTO, BIOMASSA, VIGOR, TEOR DE ÓLEO, PRODUÇÃO DE SEMENTE, PRODUÇÃO DA FIBRA, QUALIDADE DA FIBRA, COMPRIMENTO DA FIBRA, CAPACIDADE FOTOSSINTÉTICA E/OU TOLERÂNCIA AO ESTRESSE ABIÓTICO DE UMA PLANTA, MÉTODO DE PRODUÇÃO DE UMA CULTURA, MÉTODO PARA SELECIONAR UMA PLANTA TRANSFORMADA, ESTRUTURA DE ÁCIDO NUCLEICO, MÉTODO DE CULTIVO DE UMA CULTURA, CÉLULA DE PLANTA, E PLANTA TRANSGÊNICA, fornece polipeptídeos isolados que são, pelo menos, 80% homólogos às ID SEQ. Nº 496-794, 2898-3645 e 3647-4 855, polinucleotídeos isolados que são, pelo menos, 80% idênticos às ID SEQ. Nº 1-495 e 795-2897, estruturas de ácido nucleico compreendendo os mesmos, células transgênicas expressando os mesmos, plantas transgênicas expressando os mesmos e um método para uso dos mesmos para aumentar a eficiência no uso de fertilizantes, eficiência no uso de nitrogênio, produção, taxa de crescimento, biomassa, vigor, teor de óleo, capacidade fotossintética, produção de sementes, produção de fibra, qualidade de fibra, comprimento da fibra e/ou tolerância ao estresse abiótico de uma planta.

Description

`POLINUCLEOTÍDEOS E POLIPEPTÌDEOS ISOLADOS,

ESTRUTURAS E PLANTAS COMPREENDENDO OS MESMOS E MÉTODOS DE USO DOS MESMOS PARA AUMENTO DA EFICIÊNCIA NO USO DO NITROGÉNIO DAS PLANTAS" CAMPO DE APLICAÇÃO E HISTÓRICO

[1] O presente pedido de patente de invenção, em algumas aplicações respectivas, refere-se a polinucleotídeos e polipeptídeos isolados, estruturas de ácido nucleico compreendendo os mesmos, células transgênicas compreendendo os mesmos, plantas transgênicas expressando de forma exógena os mesmos e, mais particularmente, mas não exclusivamente, a métodos de uso dos mesmos para aumentar a eficiência no uso de fertilizantes (por exemplo, a eficiência de uso do nitrogênio), a produção (por exemplo, produção de sementes, produção do óleo), biomassa, taxa de crescimento, vigor, teor de óleo, produção de fibra, qualidade da fibra, comprimento da fibra, comprimento da fibra, capacidade fotossintética e/ou tolerância ao estresse abiótico de uma planta.

[2] Uma abordagem comum para promover o crescimento das plantas foi e continua a ser o uso de nutrientes naturais, bem como sintéticos (fertilizantes).

Assim, os fertilizantes são o combustível por trás da "revolução verde", diretamente responsáveis pelo aumento excepcional da produção das culturas durante os últimos 40 anos e são considerados a despesa geral número um na agricultura. Por exemplo, os fertilizantes nitrogenados inorgânicos, tais como o nitrato de amônio, nitrato de potássio ou ureia, normalmente são responsáveis por 40% dos custos relacionados a culturas como o milho e o trigo. Dos três macronutrientes fornecidos como fertilizantes principais [nitrogênio (N), fosfato (P) e potássio (K)], o nitrogênio é frequentemente o elemento limitante no crescimento das plantas e todas as culturas têm uma dependência fundamental em fertilizantes nitrogenados inorgânicos. 0 nitrogênio é responsável pela biossíntese de aminoácidos e ácidos nucleicos, grupos prostéticos, hormônios vegetais, defesas químicas das plantas, etc. e, geralmente, ele precisa ser reabastecido a cada ano, particularmente nos cereais, os quais compõem mais da metade das áreas cultivadas em todo o mundo.

Assim, o nitrogênio é translocado para o rebento, onde é armazenado nas folhas e no caule durante a etapa rápida do desenvolvimento da planta e até a floração. No milho, por exemplo, as plantas acumulam a maior parte de seu nitrogênio orgânico durante o período de germinação de grãos e até a floração. Uma vez que ocorre a fecundação da planta, os grãos começam a se formar e se tornam os principais coletores do nitrogênio da planta. 0 nitrogênio armazenado pode ser redistribuído em seguida a partir das folhas e do caule que serviram como compartimentos de armazenamento até a formação de grãos.

[003] Uma vez que o fertilizante se esgota rapidamente da maioria dos tipos de solo, ele deve ser fornecido para o crescimento das colheitas duas ou três vezes durante a estação de crescimento. Além disso, a baixa eficiência no uso de nitrogênio (NUE I nitrogen use efficiency) das principais culturas (por exemplo, no intervalo de apenas 30-70%) , afeta negativamente as despesas de entrada para o agricultor, devido ao excesso de fertilizantes aplicados. Além disso, o uso ineficiente ou sobreuso de fertilizantes são os principais fatores responsáveis pelos problemas ambientais, tais como a eutrofização das águas subterrâneas, lagos, rios e mares, poluição de nitratos na água potável, podendo causar a metemoglobinemia, a poluição de fosfato, a poluição atmosférica e afins. No entanto, apesar do impacto negativo dos fertilizantes no meio ambiente e os limites na utilização de fertilizantes, que foram legislados em vários países, o uso de fertilizantes deverá aumentar a fim de apoiar a produção de alimentos e fibras para um rápido crescimento populacional sobre os recursos limitados da terra. Por exemplo, estima-se que em 2050, mais de 150 milhões toneladas de fertilizantes azotados serão usadas em todo o mundo anualmente.

[004] 0 aumento da eficiência no uso de nitrogênio pelas plantas deve permitir que as culturas sejam cultivadas com baixa entrada de fertilizantes ou, alternativamente, sejam cultivadas em solos de pior qualidade e, portanto, tenha um impacto econômico significativo em sistemas agrícolas desenvolvidos e em desenvolvimento.

[005] 0 melhoramento genético da eficiência no uso de fertilizantes (FUEIfertilizer use efficiency) em plantas pode ser gerado através do cultivo tradicional ou através de engenharia genética.

[6] Tentativas de geração de plantas com FUE melhorada foram descritas na Publicação de Pedido de Patente Norte-americano N° 20020046419 (Pedido de Patente Norte- americano N° 7.262.055, de Choo, et al.); N° de Pedido de Patente Americano 20050108791, de Edgerton et al.; N° de Pedido de Patente Americano 20060179511, de Chomet et al.; Good, A, et al. 2007 (Engineering nitrogen use efficiency with alanine aminotransferase. Canadian Journal of Botany 85: 252- 262); e Good AG et al. 2004 (Trends Plant Sci. 9:597-605).

[7] Yanagisawa et al. (Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 2004 101:7833-8) descreve plantas transgênicas Doff que apresentam um crescimento melhorado sob condições de baixo nível de nitrogênio.

[8] 0 N° de Patente Americano 6.084.153, de Good et a1. divulga o uso de um promotor sensível ao estresse para controlar a expressão da Alanina Aminotransferase (A1aATI Alanine Amine Transferase) e das plantas de canola transgênica com resistência à seca e deficiência de nitrogênio melhorada quando comparadas às plantas de controle.

[9] A produção é afetada por vários fatores, tais como o número e tamanho dos órgãos da planta, arquitetura da planta (p.ex., o número de ramificações), comprimento definido dos grãos, número de grãos cheios, vigor (p.ex., a muda), taxa de crescimento, desenvolvimento da raiz, utilização de água, nutrientes (p.ex., nitrogênio) e fertilizantes e tolerância ao estresse.

[0010] Culturas, tais como as do milho, arroz, trigo, canola e soja respondem por mais da metade da ingestão calórica total humana, seja através do consumo direto das próprias sementes ou através do consumo de produtos de carne de animais criados com sementes processadas ou forragem. As sementes também são uma fonte de açucares, proteínas e óleos e metabólitos utilizados em processos industriais. A habilidade de aumentar a produção de planta, seja através do aumento da taxa de acúmulo de matéria seca, modificando a celulose ou a composição da lignina, aumento da resistência do caule, aumento do tamanho do meristema, mudança do padrão de ramificação da planta, firmeza das folhas, aumento na eficiência da fertilização, aumento da taxa de acúmulo de matéria seca, modificação do desenvolvimento da semente, melhora do enchimento da semente ou o aumento do teor de óleo, amido ou proteína nas sementes teria muitas aplicações na utilização agrícola e não-agrícola tais como na produção biotecnológica de produtos farmacêuticos, anticorpos ou vacinas.

[0011] Os óleos de semente ou vegetais são a fonte principal de energia e nutrição na dieta humana e animal. Eles também são utilizados para a produção de produtos industriais, tais como pinturas, tintas e lubrificantes. Além disso, os óleos da planta representam fontes renováveis de hidrocarbonetos de cadeia longa, os quais podem ser utilizados como combustível. Uma vez que os combustíveis fósseis utilizados atualmente são fontes limitadas e estão sendo esgotadas gradualmente, as safras de biomassa de crescimento rápido podem ser utilizadas como combustíveis alternativos ou para matérias-primas de energia e podem reduzir a dependência dos fornecimentos de energia fóssil. No entanto, o obstáculo principal para o aumento do consumo de óleos de planta como biocombustível é o preço do óleo, o qual ainda é mais alto que o combustível fóssil. Além disso, a taxa de produção do óleo da planta é limitada através da disponibilidade de território agrícola e água. Desse modo, o aumento nas produções de óleo de planta da mesma área de crescimento pode superar efetivamente a escassez no espaço de produção e pode diminuir os preços do óleo vegetal ao mesmo tempo.

[0012] Estudos que visam o aumento das produções de óleo de planta focam-se na identificação dos genes envolvidos no metabolismo do óleo, bem como em genes capazes de aumentar as produções de semente e planta nas plantas transgênicas. Genes conhecidos por estar envolvidos no aumento das produções de óleo de planta incluem aqueles que participam na síntese ou captura do ácido graxa, tal como dessaturase [p.ex., DELTA6, DELTA12 ou acil-ACP (Ssi2; Fonte de Informação de Arabidopsis (TAIR; arabidopsis (ponto) org/), TAIR N° AT2G43710)], OleosinA (TAIR N°. AT3G01570) ou FAD3 (TAIR N. AT2G29980) e vários fatores de transcrição e ativadores, tal como Led 1 [TAIR N°. AT1G21970, Lotan et al.

1998. Cell. 26;93(7) :1195-205], Lec2 [TAIR N°. AT1G28300, Santos Mendoza et a1. 2005, FEBS Lett. 579(21):4666-70], Fusa (TAIR No. AT3G26790), ABI3 [TAIR N°. AT3G24650, Lara et ai.

2003. J Biol Chem. 278(23): 21003-11] e Wril [TAIR N°.

AT3G54320, Cernac e Benning, 2004. Plant J. 40(4): 575-85].

[0013] Esforços da engenharia genética que visam o aumento no teor de óleo nas plantas (p.ex., em sementes)

incluem a regulação ascendente do retículo endoplasmático (FAD3) e plasitidal (FAD7), ácido graxo desaturase em batata (Zabrouskov V., et al., 2002; Physiol Plant. 116:172-185); superexpressando os fatores de transcrição GmDof4 e GmDofll (Wang HW et al., 2007; Plant J. 52:716-29); superexpressando glicerol-3-fosfato desidrogenase em leveduras sob o controle de um promotor específico de planta (Vigeolas H, et al. 2007, Plant Biotechnol J. 5:431-41; Pedido de Patente Norte- Americana N° 20060168684); utilizando genes FAE1 de Arabidopsis e SLC1-1 de leveduras para melhorias no ácido erúcico e teor de óleo em colza (Katavic V, et al., 2000, Biochem Soc Trans. 28:935-7).

[0014] Diversos pedidos de patente revelam genes e proteínas que podem aumentar o teor de óleo em plantas.

Estes incluem, por exemplo, o Pedido de Patente Norte- Americana N° 20080076179 (proteína de metabolismo lipídico); o Pedido de Patente Norte-Americana N° 20060206961 (polipeptídeo Yprl40w); o Pedido de Patente Norte-Americana N° 20060174373 (síntese de triacilgliceróis que reforçam a proteína (TEP)]; os Pedidos de Patente Norte-Americana N° 20070169219, 20070006345, 20070006346 e 20060195943 (que revelam plantas transgénicas com aumento da eficiência no uso de nitrogênio que podem ser utilizadas para conversão em combustível ou matérias-primas químicas) e o W02008/122980 (polinucleotídeos para aumento do teor de óleo, taxa de crescimento, biomassa, produção e/ou vigor de uma planta).

[0015] Condições de estresse abiático (ABSI Abiotic stress; também conhecido como "estresse ambiental")

tais como salinidade, seca, inundação, temperatura subaproveitada e poluição química tóxica, causam danos substanciais às plantas agrícolas. A maioria das plantas desenvolveu estratégias para se proteger contra essas condições. No entanto, se a gravidade e a duração das condições do estresse forem grandes demais, os efeitos no desenvolvimento da planta, no crescimento e na produção da maioria das espécies vegetais são profundos. Além disso, a maioria das espécies vegetais é altamente suscetível ao estresse abiótico e, portanto, exigem condições de cultivo ideal para as safras da cultura comercial. A exposição contínua ao estresse causa alterações importantes no metabolismo vegetal que em última análise, leva à morte celular e, consequentemente, gera perdas.

[0016] A seca é um fenômeno gradual, que envolve períodos de tempo anormalmente secos que duram o suficiente para produzir desequilíbrios hidrológicos sérios, como danos à cultura, falta de abastecimento de água e aumento da suscetibilidade a várias doenças. Em casos graves, a seca pode durar muitos anos e resulta em efeitos devastadores na agricultura e abastecimento de água. Além disso, a seca está associada com o aumento da suscetibilidade a várias doenças.

[0017] Para a maioria das plantas de cultivo, as regiões de plantio do mundo são muito áridas. Além disso, o uso excessivo de água disponível resulta em maior perda de terra agrícola utilizável (desertificação), e aumento da acumulação de sal em solos adiciona à perda de água disponível em solos.

[0018] A salinidade, níveis elevados de sal, afeta um em cada cinco hectares de terra irrigada. Nenhuma das cinco principais culturas alimentares, i.e. trigo, milho, arroz, batatas e soja, consegue tolerar o excesso de sal. Os efeitos prejudiciais do sal sobre as plantas resultam tanto da deficiência de água, que leva ao estresse osmótico (semelhante ao estresse causado pela seca), quanto do efeito do excesso de íons de sódio sobre processos bioquímicos importantes.

Assim como o congelamento e a seca, quantidades elevadas de sal causam déficit de água; e a presença de níveis elevados de sal torna difícil para as raízes das plantas extraírem água de seu ambiente. A salinidade do solo, portanto, é uma das variáveis mais importantes que determinam se uma planta pode prosperar. Em muitas partes do mundo, áreas de terra consideráveis são incultiváveis devido à salinidade do solo ser naturalmente alta. Assim, a salinização dos solos que são utilizados para a produção agrícola é um problema significativo e crescente nas regiões que dependem fortemente da agricultura e está a agravar-se pelo excesso de utilização, excesso de fertilização e escassez de água, geralmente causado por alterações climáticas e pelas demandas do aumento da população. A tolerância ao sal é de particular importância no início do ciclo de vida da planta, já que a evaporação da superfície do solo faz com que o movimento ascendente de água e sal se acumule na camada superior do solo, onde as sementes são colocadas. Por outro lado, a germinação normalmente ocorre em uma concentração de sal que é maior do que o nível médio de sal em todo o perfil do solo.

[0019] A transdução do sinal de estresse do sal e da seca consiste em caminhos de sinalização da homeostase iônica e osmótica. 0 aspecto iõnico do estresse do sal é sinalizado através do caminho SOS, onde um complexo de quinase de proteína SOS3-SOS2 responsiva a cálcio controla a expressão e a atividade dos transportadores de íons, como o SOS1. 0 componente osmótico do estresse de sal envolve reações complexas da planta que se sobrepõem com respostas de estresse da seca e/ou do frio.

[0020] As temperaturas subótimas afetam o crescimento e o desenvolvimento da planta durante todo o seu ciclo de vida. Dessa forma, baixas temperaturas reduzem a taxa de germinação e temperaturas elevadas resultam na necrosa da folha. Além disso, plantas maduras expostas ao excesso de calor podem experimentar o choque de calor, que pode surgir em vários órgãos, incluindo as folhas e, principalmente, os frutos, quando a transpiração é insuficiente para superar o estresse causado pelo calor. 0 calor também danifica as estruturas celulares, incluindo as organelas e o citoesqueleto e prejudica a função da membrana. 0 choque de calor pode produzir uma diminuição na síntese geral das proteínas, acompanhada pela expressão de proteínas de choque de calor, p.ex., as chaperonas, que estão envolvidas no rearranjo das proteínas desnaturadas pelo calor. 0 dano causado pela alta temperatura ao pólen quase sempre ocorre em conjunto com o estresse causado pela seca e, raramente, ocorre sob boas condições de irrigação. 0 estresse combinado pode alterar o metabolismo da planta de novas maneiras. Condições de frio excessivo, p.ex., temperaturas baixas, mas acima do ponto de congelamento, afetam as culturas de origem tropical, como a soja, o arroz, o milho e o algodão. 0 dano típico causado pelo frio inclui o emurchecimento, a necrose, a clorose ou perda de íons das membranas celulares. Os mecanismos subjacentes de sensibilidade ao frio não são completamente compreendidos ainda, mas provavelmente envolvem o nível de saturação de membrana e outras deficiências fisiológicas. Condições de luz excessiva, que ocorrem sob condições atmosféricas claras subsequentes às noites frias do final do verão/outono, podem levar à fotoiníbição da fotossíntese (interrupção da fotossíntese). Além disso, o frio pode levar a perdas de produção e à qualidade inferior do produto através do amadurecimento tardio do milho.

[0021] Aspectos comuns da seca, resposta ao estresse do frio e sal [Revisto em Xiong e Zhu (2002) Plant Cell Environ. 25:131-139] incluem: (a) alterações transitórias nos níveis de cálcio citoplasmático prévio no evento de sinalização; (b) sinal de transdução através de quinase de proteína dependente de cálcio (CDPKs 1 calcium dependent protein kinases) e/ou ativada por mitógeno e fosfatases da proteína; (c) aumentos nos níveis de ácido abscísico em resposta ao estresse, desencadeando um subconjunto das respostas; (d) fosfatos de inositol como moléculas de sinal (pelo menos para um subconjunto das alterações transitórias responsivas ao stress; (e) ativação de fosfolipases, que por sua vez, geram um leque diversificado de moléculas do segundo mensageiro, alguns dos quais podem regular a atividade das quinases responsivos ao stress; (f) a indução dos genes do tipo abundantes na embriogênese tardia (LEA I late embryogenesis abundant), incluindo os genes responsivos CR/RD CRT/DRE; (g) aumento dos níveis de antioxidantes e osmólitos compatíveis como prolina e açúcares solúveis; e (h) a acumulação de espécies reativas de oxigênio, como superóxido, peróxido de hidrogênio e radicais hidroxila.

A biossíntese do ácido abscísico é regulada por estresse osmótico em várias etapas. A sinalização do estresse osmótico, tanto dependente da ABA quanto independente, modificam primeiramente os fatores de transcrição constitutivamente expressos, levando à expressão dos ativadores transcricionais de resposta prévia, que em seguida, ativam os genes efetores de tolerância ao estresse a jusante.

[0022] Vários genes que aumentam a tolerância ao estresse do frio ou sal também podem melhorar a proteção ao estresse de seca, incluindo, por exemplo, o fator de transcrição AtCBF/DREB1, OsCDPK7 (Saijo et al. 2000, Plant J.

23: 319-327) ou AVP1 (a vacuolar pyrophosphatase-proton pump, Gaxiola et al. 2001, Proc. Natl. Acad. Sci. USA 98: 11444- 11449) .

[0023] Estudos demonstraram que adaptações da planta a condições ambientais adversas são traços genéticos complexos de natureza poligênica. Meios convencionais de cultura e melhoras de horticulturas utilizam técnicas de melhoramento seletivas para identificar plantas que apresentem características desejáveis. No entanto, o melhoramento seletivo é tedioso, consome tempo e apresenta resultado imprevisível. Além disso, recursos germoplasmáticos limitados para melhora da produção e a incompatibilidade nos cruzamentos entre espécies de plantas distantemente relacionadas representam problemas significativos encontrados no melhoramento convencional. Avanços na engenharia genética permitiram que o homem modificasse o germoplasma das plantas pela expressão de genes de interesse nas plantas. Essa tecnologia tem a capacidade de gerar culturas ou plantas com traços econômicos, agronômicos ou horticulturais melhorados.

[0024] Os esforços da engenharia genética, focados em conferir tolerância ao estresse abiótico às culturas transgênicas, foram descritos em várias publicações [Apse e Blumwald (Curr Opin Biotechnol. 13:146-150, 2002), Quesada et a1. (Plant Physiol. 130:951-963, 2002), Holmstrõm et al.

(Nature 379: 683-684, 1996), Xu et al. (Plant Physiol 110: 249~257, 1996), Pilon-Smits e Ebskamp (Plant Physiol 107: 125- 130, 1995) e Tarczynski et a1. (Science 259: 508-510, 1993)].

[0025] Várias patentes e pedidos de patente divulgam os genes e as proteínas que podem ser utilizados para aumentar a tolerância das plantas ao estresse abiótico. Estas incluem, por exemplo, as Patentes Norte-Americanas N°

5.296.462 e 5.356.816 (para aumentar a tolerância ao estresse ao frio); a Patente Norte-Americana N° 6.670.528 (para aumentar a ABST); a Patente Norte-Americana N° 6.720.477 (para aumentar a ABST); N° de Série de Pedido de Patente Norte- Americana 09/938842 e 10/342224 (para aumentar a ABST); N° de Série de Pedido de Patente Norte-Americana 10/231035 (para aumentar a ABST); W02004/104162 (para aumentar a ABST e biomassa); W02007/020638 (para aumentar a ABST, biomassa, vigor e/ou produção); W02007/049275 (para aumentar a ABST, biomassa, vigor e/ou produção); W02010/076756 (para aumentar a ABST, biomassa e/ou produção);. W02009/083958 (para aumentar a eficiência no uso da água, eficiência no uso de fertilizantes, tolerância ao estresse biótico-abiótico, produção e/ou biomassa); W02010/020941 (para aumentar a eficiência no uso do nitrogênio, tolerância ao estresse abiótico, produção e/ou biomassa); W02009/141824 (para aumentar a utilidade da planta) ; W02010/049897 (para aumentar a produção da planta).

[0026] A deficiência de nutrientes causa adaptações da arquitetura da raiz, particularmente notável, por exemplo, é a proliferação da raiz dentro de áreas ricas em nutrientes para aumentar a absorção dos nutrientes. A deficiência de nutrientes causa, também, a ativação de caminhos metabólicos da planta que maximizam os processos de absorção, assimilação e distribuição como pela ativação de mudanças da arquitetura. A engenharia da expressão dos genes desencadeados pode fazer com que a planta mostre as mudanças em sua arquitetura e o metabolismo melhorado, também, sob outras condições.

[0027] Além disso, é amplamente conhecido que as plantas geralmente respondem à deficiência de água criando um sistema de raízes mais profundas que permitem o acesso à umidade localizada em camadas mais profundas do solo. O desencadeamento desse efeito permitirá às plantas acessarem os nutrientes e a água localizados em horizontes mais profundos do solo, particularmente, aqueles prontamente dissolvidos na água, como os nitratos.

[0028] 0 algodão e subprodutos do algodão fornecem matérias-primas que são utilizadas para produzir uma grande variedade de produtos com base nos consumidores, além de têxteis, incluindo gêneros alimentícios do algodão, ração animal, fertilizante e papel. A produção, comercialização, consumo e comércio de produtos baseados em algodão geram um excesso de 100 bilhões de dólares anualmente apenas nos EUA, fazendo do algodão a cultura número um em termos de valor acrescentado.

[0029] Apesar de 90% do valor do algodão como uma cultura residir na fibra (fiapo) , a produção e qualidade da fibra diminuiu devido à erosão geral na diversidade genética de variedades de algodão e uma vulnerabilidade acrescida da cultura às condições ambientais.

[0030] Existem muitas variedades de algodoeiros, das quais fibras de algodão com uma gama de características podem ser obtidas e utilizadas para várias aplicações. As fibras de algodão podem ser caracterizadas de acordo com uma variedade de propriedades, algumas das quais são consideradas altamente desejáveis dentro da indústria têxtil para a produção de produtos de qualidade cada vez mais alta e exploração otimizada de tecnologias de fiação modernas.

Propriedades comercialmente desejáveis incluem comprimento, uniformidade do comprimento, finura, relação de maturidade, produção reduzida da fibra, micronário, resistência do feixe e resistência da fibra única. Muito esforço tem sido posto na melhoria das características das fibras de algodão, principalmente focando o comprimento da fibra e a finura da fibra. Em particular, há uma grande demanda de fibras de algodão de comprimentos específicos.

[0031] Uma fibra de algodão é composta de uma única célula que se diferenciou de uma célula epidérmica da cobertura da semente, desenvolvendo-se através de quatro estágios, ou seja, iniciação, alongamento, estágios de espessamento e maturação de parede celular secundária. Mais especificamente, o alongamento de uma fibra de algodão começa na célula epidérmica do óvulo imediatamente após o florescimento, depois do qual a fibra de algodão rapidamente se alonga por cerca de 21 dias. 0 alongamento da fibra é então finalizado, e uma parede celular secundária é formada e crescida através de maturação, tornando-se uma fibra de algodão madura.

[0032] Vários genes candidatos que estão associados ao alongamento, à formação, à qualidade e à produção das fibras de algodão foram divulgados em vários pedidos de patentes, tais como a Patente Norte-Americana N°

5.880.100 e N° de Série de Pedido de Patente Norte-Americana 08/580.545, 08/867.484 e 09/262.653 (que descrevem os genes envolvidos na fase de alongamento da fibra de algodão); W00245485 (que melhoram a qualidade da fibra, modulando a sintase de sacarose); Patentes Norte-Americanas N° 6.472.588 e W00117333 (que aumentam a qualidade da fibra por transformação com sintase de codificação de fosfato de sacarose do DNA); W09508914 (que utiliza um promotor específico da fibra e uma sequência de codificação que codifica a peroxidase de algodão); W09626639 (que utiliza uma sequência de promoção específica do ovário para expressar o cultivo da planta, modificando os hormônios no tecido do óvulo do algodão, alterando características de qualidade da fibra, tais como dimensão de fibra e força); Patente Norte-Americana N° 5.981.834, Patente Norte-Americana N° 5.597.718, Patente Norte-Americana N° 5.620.882, Patente Norte-Americana N°

5.521.708 e Patente Norte-Americana N° 5.495.070 (sequências de codificação para alterar as características das plantas que produzem fibras transgênicas); Pedido de Patente Norte- Americana N° 2002049999 e Patente Norte-Americana N° 2003074697 (que expressam um código genético para transferase endoxiloglucana, catalase ou peroxidase para melhorar as características da fibra de algodão); WO 01/40250 (que melhora a qualidade da fibra do algodão, modulando a expressão genética do fator de transcrição); WO 96/40924 (uma região reguladora da iniciação transcricional da fibra de algodão associada, a qual é expressa em fibra de algodão); EPO834566 (um gene que controla o mecanismo de formação da fibra no algodoeiro); W02005/121364 (que melhora a qualidade da fibra do algodão, modulando a expressão do gene); W02008/075364 (que melhora a tolerância de qualidade, produção/biomassa/vigor e/ou tolerância estresse abiótico da fibra das plantas).

[0033] A publicação WO N° 2004/104162 revela métodos para aumentar a tolerância ao estresse abiótico e/ou a biomassa em plantas geradas deste modo.

[0034] A publicação WO N° 2004/111183 divulga sequências de nucleotídeos para regular a expressão do gene em tricomas e estruturas de plantas e métodos utilizando os mesmos.

[0035] A publicação WO N° 2004/081173 divulga novas sequências e estruturas regulatórias derivadas da planta e métodos de utilização de tais sequências para direcionar a expressão das sequências de polinucleotídeo exógeno nas plantas.

[0036] A publicação WO N° 2005/121364 revela polinucleotídeos e polipeptídeos envolvidos no desenvolvimento de fibras vegetais e método de uso dos mesmos, a fim de aumentar a qualidade das fibras, a produção e/ou biomassa de uma planta produtora de fibras.

[0037] A publicação WO N° 2007/049275 revela polipeptídeos isolados, polinucleotídeos que codificam os mesmos, plantas transgênicas que expressam os mesmos e método de uso dos mesmos para aumentar a eficiência no uso de fertilizantes, a tolerância ao estresse abiótico da planta e biomassa.

[0038] A publicação WO N° 2007/020638 revela métodos para aumentar a tolerância ao estresse abiótico e/ou a biomassa em plantas e plantas geradas desse modo.

[0039] A publicação WO N° 2008/122980 revela estruturas de genes e métodos para aumentar o teor de óleo, taxa de crescimento e biomassa de plantas.

[0040] A publicação WO N° 2008/075364 revela polinucleotídeos envolvidos no desenvolvimento da fibra da planta e métodos de uso dos mesmos.

[0041] A publicação WO N° 2009/083958 revela métodos para aumentar a eficiência no uso de água, eficiência no uso de fertilizantes, tolerância ao estresse biótico/abiótico, produção e biomassa em plantas e em plantas geradas desse modo.

[0042] A publicação WO N° 2009/141824 revela polinucleotídeos isolados e métodos para uso dos mesmos para aumentar a utilidade da planta.

[0043] A publicação WO N° 2009/013750 revela genes, estruturas e métodos para aumentar a tolerância ao estresse abiótico, biomassa e / ou produção em plantas geradas desse modo.

[0044] A publicação WO N° 2010/020941 revela métodos para aumentar a eficiência no uso de nitrogênio, tolerância ao estresse abiótico, produção e biomassa em plantas e em plantas geradas desse modo.

[0045] A publicação WO N° 2010/076756 divulga polinucleotídeos isolados para aumentar a tolerância ao estresse abiótico, produção, biomassa, taxa de crescimento, vigor, teor de óleo, produção da fibra, qualidade da fibra e/ou eficiência no uso de nitrogênio de uma planta.

[0046] A publicação W02010/100595 divulga polinucleotídeos e polipeptídeos isolados e métodos de uso dos mesmos para aumentar a produção da planta e/ou características agrícolas.

[0047] A publicação WO N° 2010/049897 divulga polinucleotídeos e polipeptídeos isolados e métodos de uso dos mesmos para aumentar a produção da planta, biomassa, taxa de crescimento, vigor, teor de óleo, tolerância ao estresse abiótico de plantas e eficiência no uso de nitrogênio.

[0048] A publicação W02010/143138 divulga polinucleotídeos e polipeptídeos isolados e métodos de uso dos mesmos para aumentar a eficiência no uso de nitrogênio, eficiência no uso de fertilizantes, produção, taxa de crescimento, vigor, biomassa, teor de óleo, tolerância ao estresse abiático e/ou eficiência no uso da água.

[0049] A publicação WO N° 2011/080674 divulga polinucleotídeos e polipeptídeos isolados e métodos de uso dos mesmos para aumentar a produção da planta, biomassa, taxa de crescimento, vigor, teor de óleo, tolerância ao estresse abiótico de plantas e eficiência no uso de nitrogênio.

[0050] A publicação W02011/015985 divulga polinucleotídeos e polipeptídeos para aumentar as qualidades desejáveis da planta.

[0051] A publicação W02011/135527 divulga polinucleotídeos e polipeptídeos isolados para aumentar a produção da planta e/ou características agrícolas.

[0052] A publicação W02012/028993 divulga polinucleotídeos e polipeptídeos isolados e métodos de uso dos mesmos para aumentar da eficiência no uso do nitrogênio, produção, taxa de crescimento, vigor, biomassa, teor de óleo e/ou tolerância ao estresse abiótico.

[0053] A publicação W02012/085862 divulga polinucleotídeos e polipeptídeos isolados e métodos de uso dos mesmos para melhorar as propriedades da planta.

[0054] A publicação W02012/150598 divulga polinucleotídeos e polipeptídeos isolados e métodos de uso dos mesmos para aumentar a produção da planta, biomassa, taxa de crescimento, vigor, teor de óleo, tolerância ao estresse abiótico das plantas e eficiência no uso do nitrogênio.

[0055] A publicação W02013/027223 divulga polinucleotídeos e polipeptídeos isolados e métodos de uso dos mesmos para aumentar a produção da planta e/ou características agrícolas.

[0056] A publicação W02013/080203 divulga polinucleotídeos e polipeptídeos isolados e métodos de uso dos mesmos para aumentar a eficiência no uso do nitrogênio, produção, taxa de crescimento, vigor, biomassa, teor de óleo e/ou tolerância ao estresse abiótico.

[0057] A publicação W02013/098819 divulga polinucleotídeos e polipeptídeos isolados e métodos de uso dos mesmos para aumentar a produção das plantas.

[0058] A publicação W02013/128448 divulga polinucleotídeos e polipeptídeos isolados e métodos de uso dos mesmos para aumentar a produção da planta, biomassa, taxa de crescimento, vigor, teor de óleo, tolerância ao estresse abiótico das plantas e eficiência no uso do nitrogênio.

RESUMO DA INVENÇÃO

[0059] De acordo com um aspecto de algumas aplicações da presente invenção, é fornecido um método para aumentar a eficiência no uso do nitrogênio, produção, taxa de crescimento, biomassa, vigor, teor de óleo, produção de semente, produção de fibra, qualidade da fibra, comprimento da fibra, capacidade fotossintética e/ou tolerância estresse abiótico de uma planta, compreendendo expressar dentro da planta um polinucleotídeo exógeno compreendendo uma sequência de ácido nucleico que codifica um polipeptídeo, pelo menos, 80% idêntico à ID SEQ. N° [Identificação de Sequência N°]: 496-794, 2898-3645, 3647-4854 ou 4855, aumentando, desta forma, a eficiência no uso do nitrogênio, produção, taxa de crescimento, biomassa, vigor, teor de óleo, produção de semente, produção de fibra, qualidade da fibra, comprimento da fibra, capacidade fotossintética e/ou tolerância estresse abiótico da planta.

[0060] De acordo com um aspecto de algumas aplicações da presente invenção, é fornecido um método para aumentar a eficiência no uso do nitrogênio, produção, taxa de crescimento, biomassa, vigor, teor de óleo, produção de semente, produção de fibra, qualidade da fibra, comprimento da fibra, capacidade fotossintética e/ou tolerância estresse abiótico de uma planta, compreendendo expressar dentro da planta um polinucleotídeo exógeno compreendendo uma sequência de ácido nucleico que codifica um polipeptídeo selecionado de um grupo consistindo das ID SEQ. N° 496-794, 2898-4854 e 4855, aumentando, desta forma, a eficiência no uso do nitrogênio, produção, taxa de crescimento, biomassa, vigor, teor de óleo, produção de semente, produção de fibra, qualidade da fibra, comprimento da fibra, capacidade fotossintética e/ou tolerância estresse abiótico da planta.

[0061] De acordo com um aspecto de algumas aplicações da presente invenção, é fornecido um método para produzir uma colheita, compreendendo o cultivo de uma planta de colheita transformada com um polinucleotídeo exógeno compreendendo uma sequência de ácido nucleico que codifica um polipeptídeo, pelo menos, 80% homólogo à sequência de aminoácidos selecionada de um grupo consistindo das ID SEQ.

N° 496-794, 2898-3645, 3647-4854 e 4855, caracterizado pela planta de colheita ser derivada de plantas selecionadas para aumento da eficiência no uso do nitrogênio, aumento da produção, aumento da taxa de crescimento, aumento da biomassa, aumento de vigor, aumento do teor de óleo, aumento da produção de semente, aumento da produção de fibra, aumento da qualidade da fibra, aumento do comprimento da fibra, aumento da capacidade fotossintética e/ou aumento da tolerância ao estresse abiótico se comparada a uma planta do tipo selvagem da mesma espécie que foi cultivada sob as mesmas condições de cultivo, e a planta de colheita tendo aumento da eficiência no uso do nitrogênio, aumento da produção, aumento da taxa de crescimento, aumento da biomassa, aumento de vigor, aumento do teor de óleo, aumento da produção de semente, aumento da produção de fibra, aumento da qualidade da fibra, aumento do comprimento da fibra, aumento da capacidade fotossintética e/ou aumento da tolerância ao estresse abiótico, produzindo, desta forma, a colheita.

[0062] De acordo com um aspecto de algumas aplicações da presente invenção, é fornecido um método para aumentar a eficiência no uso do nitrogênio, produção, taxa de crescimento, biomassa, vigor, teor de óleo, produção de semente, produção de fibra, qualidade da fibra, comprimento da fibra, capacidade fotossintética e/ou tolerância estresse abiótico de uma planta, compreendendo expressar dentro da planta um polinucleotídeo exógeno compreendendo uma sequência de ácido nucleico, pelo menos, 80% idêntica à ID SEQ. N° 1- 495, 795-2896 ou 2897, aumentando, desta forma, a eficiência no uso do nitrogênio, produção, taxa de crescimento, biomassa, vigor, teor de óleo, produção de semente, produção de fibra, qualidade da fibra, comprimento da fibra, capacidade fotossintética e/ou tolerância estresse abiótico da planta.

[0063] De acordo com um aspecto de algumas aplicações da presente invenção, é fornecido um método para aumentar a eficiência no uso do nitrogênio, produção, taxa de crescimento, biomassa, vigor, teor de óleo, produção de semente, produção de fibra, qualidade da fibra, comprimento da fibra, capacidade fotossintética e/ou tolerância estresse abiótico de uma planta, compreendendo expressar dentro da planta um polinucleotídeo exógeno compreendendo uma sequência de ácido nucleico selecionado de um grupo consistindo das ID SEQ. N° 1-495, 795-2896 e 2897, aumentando, desta forma, a eficiência no uso do nitrogênio, produção, taxa de crescimento, biomassa, vigor, teor de óleo, produção de semente, produção de fibra, qualidade da fibra, comprimento da fibra, capacidade fotossintética e/ou tolerância estresse abiótico da planta.

[0064] De acordo com um aspecto de algumas aplicações da presente invenção, é fornecido um método para produzir uma colheita, compreendendo o cultivo de uma planta de colheita transformada com um polinucleotídeo exógeno que compreende uma sequência de ácido nucleico, a qual é, pelo menos, 80% idêntica à sequência de ácido nucleico selecionada de um grupo consistindo das ID SEQ. N° 1-495, 795-2896 e 2897, caracterizado pela planta de colheita ser derivada de plantas (plantas progenitoras) selecionadas para aumento da eficiência no uso do nitrogênio, aumento da produção, aumento da taxa de crescimento, aumento da biomassa, aumento de vigor, aumento do teor de óleo, aumento da produção de semente, aumento da produção de fibra, aumento da qualidade da fibra, aumento do comprimento da fibra, aumento da capacidade fotossintética e/ou aumento da tolerância ao estresse abiótico se comparada a uma planta do tipo selvagem da mesma espécie que foi cultivada sob as mesmas condições de cultivo, e a planta de colheita tendo aumento da eficiência no uso do nitrogênio, aumento da produção, aumento da taxa de crescimento, aumento da biomassa, aumento de vigor, aumento do teor de óleo, aumento da produção de semente, aumento da produção de fibra, aumento da qualidade da fibra, aumento do comprimento da fibra, aumento da capacidade fotossintética e/ou aumento da tolerância ao estresse abiótico, produzindo, desta forma, a colheita.

[0065] De acordo com um aspecto de algumas aplicações da presente invenção, é fornecido um polinucleotídeo isolado compreendendo uma sequência de ácido nucleico que codifica um polipeptídeo, o qual compreende uma sequência de aminoácidos, pelo menos, 80% homóloga à sequência de aminoácidos estabelecida nas ID SEQ. N° 496-794, 2898- 3645, 3647-4854 ou 4855, caracterizado pela sequência de aminoácidos ser capaz de aumentar a eficiência no uso do nitrogênio, produção, taxa de crescimento, biomassa, vigor, teor de óleo, produção de semente, produção de fibra, qualidade da fibra, comprimento da fibra, capacidade fotossintética e/ou tolerância estresse abiótico de uma planta.

[0066] De acordo com um aspecto de algumas aplicações da presente invenção, é fornecido um polinucleotídeo isolado compreendendo uma sequência de ácido nucleico que codifica um polipeptídeo, o qual compreende a sequência de aminoácidos selecionada de um grupo consistindo das ID SEQ. N° 496-794, 2898-4854 e 4855.

[0067] De acordo com um aspecto de algumas aplicações da presente invenção, é fornecido um polinucleotídeo isolado compreendendo uma sequência de ácido nucleico, pelo menos, 80% idêntica à ID SEQ. N° 1-495, 795- 2896 ou 2897, caracterizado pela sequência de ácido nucleico ser capaz de aumentar a eficiência no uso do nitrogênio, produção, taxa de crescimento, biomassa, vigor, teor de óleo, produção de semente, produção de fibra, qualidade da fibra, comprimento da fibra, capacidade fotossintética e/ou tolerância estresse abiótico de uma planta.

[0068] De acordo com um aspecto de algumas aplicações da presente invenção, é fornecido um polinucleotídeo isolado compreendendo a sequência de ácido nucleico selecionada de um grupo consistindo das ID SEQ. N° 1-495, 795-2896 e 2897.

[0069] De acordo com um aspecto de algumas aplicações da presente invenção, é fornecida uma estrutura de ácido nucleico compreendendo o polinucleotídeo isolado de algumas aplicações da invenção e um promotor para direcionar a transcrição da sequência de ácido nucleico em uma célula hospedeira.

[0070] De acordo com um aspecto de algumas aplicações da presente invenção, é fornecido um polipeptídeo isolado compreendendo uma sequência de aminoácidos, pelo menos, 80% homóloga à ID SEQ. N° 496-794, 2898-3645, 3647- 4854 ou 4855, caracterizado pela sequência de aminoácidos ser capaz de aumentar a eficiência no uso do nitrogênio, produção, taxa de crescimento, biomassa, vigor, teor de óleo, produção de semente, produção de fibra, qualidade da fibra, comprimento da fibra, capacidade fotossintética e/ou tolerância estresse abiótico de uma planta.

[0071] De acordo com um aspecto de algumas aplicações da presente invenção, é fornecido um polipeptídeo isolado compreendendo a sequência de aminoácidos selecionada de um grupo consistindo das ID SEQ. N° 496-794, 2898-4854 e

4855.

[0072] De acordo com um aspecto de algumas aplicações da presente invenção, é fornecida uma célula de planta que expressa de forma exógena o polinucleotídeo de algumas aplicações da invenção ou a estrutura de ácido nucleico de algumas aplicações da invenção.

[0073] De acordo com um aspecto de algumas aplicações da presente invenção, é fornecida uma célula de planta que expressa de forma exógena o polipeptídeo de algumas aplicações da invenção.

[0074] De acordo com um aspecto de algumas aplicações da presente invenção, é fornecido uma planta transgênica, compreendendo a estrutura de ácido nucleico de algumas aplicações da invenção, ou a célula de planta de algumas aplicações da invenção.

[0075] De acordo com um aspecto de algumas aplicações da presente invenção, é fornecido um método de cultivo de uma cultura, o método compreendendo a semeadura de sementes e/ou plantio de mudas de uma planta transformada com o polinucleotídeo isolado de algumas aplicações da invenção ou a estrutura de ácido nucleico de algumas aplicações da invenção, caracterizado pela planta ser derivada de plantas selecionadas com, pelo menos, um traço selecionado do grupo consistindo em aumento da eficiência no uso de nitrogênio, aumento da tolerância ao estresse abiótico, aumento da biomassa, aumento da taxa de crescimento, aumento do vigor, aumento da produção e aumento da produção da fibra, aumento da qualidade da fibra, aumento do comprimento da fibra, aumento da capacidade fotossintética e aumento do teor de óleo se comparada a uma planta não transformada, aumentando, desse modo, a colheita.

[0076] De acordo com um aspecto de algumas aplicações da presente invenção, é fornecido um método de seleção de uma planta transformada tendo aumento da eficiência no uso do nitrogênio, produção, taxa de crescimento, biomassa, vigor, teor de óleo, produção de semente, produção da fibra, qualidade da fibra, comprimento da fibra, capacidade fotossintética e/ou tolerância ao estresse abiótico se comparada a uma planta do tipo selvagem da mesma espécie cultivada sob as mesmas condições de cultivo, o método compreendendo: (a) fornecer plantas transformadas com um polinucleotídeo exógeno que codifica um polipeptídeo, compreendendo uma sequência de aminoácidos, pelo menos, 80% homóloga à sequência de aminoácidos selecionada do grupo consistindo nas ID SEQ.

N° 496-794, 2898-3645, 3647-4854 e 4855, (b) selecionar, a partir das plantas, uma planta tendo aumento da eficiência no uso do nitrogênio, produção, taxa de crescimento, biomassa, vigor, teor de óleo, produção de semente, produção da fibra, qualidade da fibra, comprimento da fibra, capacidade fotossintética e/ou tolerância ao estresse abiótico, selecionando, deste modo, a planta tendo aumento da eficiência no uso do nitrogênio, produção, taxa de crescimento, biomassa, vigor, teor de óleo, produção de semente, produção da fibra, qualidade da fibra, comprimento da fibra, capacidade fotossintética e/ou tolerância ao estresse abiótico se comparada a uma planta do tipo selvagem da mesma espécie que é cultivada sob as mesmas condições de cultivo.

[0077] De acordo com um aspecto de algumas aplicações da presente invenção, é fornecido um método de seleção de uma planta transformada, tendo aumento de eficiência no uso do nitrogênio, produção, taxa de crescimento, biomassa, vigor, teor de óleo, produção de semente, produção da fibra, qualidade da fibra, comprimento da fibra, capacidade fotossintética e/ou tolerância ao estresse abiótico se comparada a uma planta do tipo selvagem da mesma espécie cultivada sob as mesmas condições de cultivo, o método compreendendo: (a) fornecer plantas transformadas com um polinucleotídeo exógeno que codifica um polipeptídeo, compreendendo uma sequência de aminoácidos, pelo menos, 80% idêntica à sequência de ácido nucleico selecionada do grupo consistindo nas ID SEQ NII 1-495, 795-2896 e 2897, (b) selecionar, a partir das plantas, uma planta tendo aumento da eficiência no uso do nitrogênio, produção, taxa de crescimento, biomassa, vigor, teor de óleo, produção de semente, produção da fibra, qualidade da fibra, comprimento da fibra, capacidade fotossintética e/ou tolerância ao estresse abiótico, selecionado, deste modo, a planta tendo aumento de eficiência no uso do nitrogênio, produção, taxa de crescimento, biomassa, vigor, teor de óleo, produção de semente, produção da fibra, qualidade da fibra, comprimento da fibra, capacidade fotossintética e/ou tolerância ao estresse abiótico se comparada a uma planta do tipo selvagem da mesma espécie que é cultivada sob as mesmas condições de cultivo.

[0078] De acordo com algumas aplicações da invenção, a sequência de ácido nucleico codifica uma sequência de aminoácidos de um grupo consistindo das ID SEQ. N° 496- 794, 2898-4854 e 4855.

[0079] De acordo com algumas aplicações da invenção, a sequência de ácido nucleico é selecionada de um grupo consistindo das ID SEQ. N° 1-495, 795-2896 e 2897.

[0080] De acordo com algumas aplicações da invenção, o polinucleotídeo consiste da sequência de ácido nucleico selecionada de um grupo consistindo das ID SEQ. N° 1-495, 795-2896 e 2897.

[0081] De acordo com algumas aplicações da invenção, a sequência de ácido nucleico codifica a sequência de aminoácidos selecionada de um grupo consistindo das ID SEQ.

N° 496-794, 2898-4854 e 4855.

[0082] De acordo com algumas aplicações da invenção, a célula hospedeira é uma célula de planta.

[0083] De acordo com algumas aplicações da invenção, a célula da planta forma parte de uma planta.

[0084] De acordo com algumas aplicações da invenção, o método compreende, ainda, o cultivo da planta que expressa o polinucleotïdeo exógeno em estresse abiótico.

[0085] De acordo com algumas aplicações da invenção, o estresse abiótico é selecionado de um grupo consistindo de salinidade, seca, estresse osmótico, privação de água, inundação, etiolação, baixa temperatura, alta temperatura, toxicidade por metais pesados, anaerobiose, deficiência de nutrientes, deficiência de nitrogênio, excesso de nutrientes, poluição atmosférica e irradiação UV.

[0086] De acordo com algumas aplicações da invenção, a produção compreende a produção de semente ou produção de óleo.

[0087] De acordo com algumas aplicações da invenção, o método compreende, ainda, o cultivo da planta que expressa o polinucleotídeo exógeno sob condições limitantes de nitrogênio.

[0088] De acordo com algumas aplicações da invenção, o promotor é heterólogo ao polinucleotídeo isolado e/ou à célula hospedeira.

[0089] De acordo com algumas aplicações da invenção, o polinucleotídeo isolado é heterólogo à célula da planta.

[0090] De acordo com algumas aplicações da invenção, a planta não transformada é uma planta do tipo selvagem de base genética idêntica.

[0091] De acordo com algumas aplicações da invenção, a planta não transformada é uma planta do tipo selvagem da mesma espécie.

[0092] De acordo com algumas aplicações da invenção, a planta não transformada é cultivada sob condições de cultivo idênticas.

[0093] De acordo com algumas aplicações da invenção, o método compreende, ainda, selecionar uma planta tendo aumento de eficiência no uso do nitrogênio, produção, taxa de crescimento, biomassa, vigor, teor de óleo, produção de semente, produção da fibra, qualidade da fibra, comprimento da fibra, capacidade fotossintética e/ou tolerância ao estresse abiótico se comparada a uma planta do tipo selvagem da mesma espécie que é cultivada sob as mesmas condições de cultivo.

[0094] A menos que definido de outra forma, todos os termos técnicos e/ou científicos utilizados aqui apresentam o mesmo significado que o comumente compreendido por uma pessoa com habilidade comum na técnica à qual a invenção pertence. Embora métodos e materiais semelhantes ou equivalentes àqueles descritos aqui possam ser utilizados na prática ou no teste das aplicações da invenção, métodos e/ou materiais exemplares são descritos abaixo. Em caso de conflito, o quadro reivindicatório da patente, incluindo as definições, prevalecerá. Além disso, os materiais, métodos e exemplos são apenas ilustrativos e não pretendem ser necessariamente limitantes.

BREVE DESCRIÇÃO DOS DESENHOS

[0095] Algumas aplicações da invenção são descritas aqui, apenas como exemplos, com referência aos desenhos anexos. Agora, com referência específica aos desenhos em detalhes, enfatiza-se que as particularidades mostradas são exemplares e para os propósitos de discussão ilustrativa das aplicações da invenção. Nesse sentido, a descrição que acompanha os desenhos torna aparente àqueles com habilidade na técnica como as aplicações da invenção podem ser praticadas. Nos desenhos:

[0096] A Figura 1 é uma ilustração esquemática de um plasmídeo binário pGI modificado contendo o novo promotor At6669 (ID SEQ. N° 4880) e o GUSintron (pQYN 6669) utilizado para expressar as sequências do polinucleotídeo isolado da invenção. RB - borda direita do T-DNA; LB - borda esquerda do T-DNA; MCS - Sítio de clonagem múltipla; RE - qualquer enzima de restrição; NOS pro = promotor da nopalina sintase; NPT-II = gene da neomicina fosfotransferase; NOS ter = terminador da nopalina sintase; Sinal Poli-A (sinal de poliadenilação);

GUSintron - o gene repórter da GUS (sequência codificadora e intron). As sequências do polinucleotideo isolado da invenção foram clonadas no vetor enquanto substituíam o gene repórter GUSintron.

[0097] A Figura 2 é uma ilustração esquemática do plasmïdeo binário pGI modificado contendo o novo promotor At6669 (ID SEQ. N° 4880) (pQFN ou pQFNc) utilizado para expressar as sequências do polinucleotídeo isolado da invenção. RB [right border] - borda direita do T-DNA; LB [left border] - borda esquerda do T-DNA; MCS [multiple cloning site]- Local de clonagem múltipla; RE [restriction enzyme] - qualquer enzima de restrição; NOS pro [nopalinha synthase promoter] = promotor da nopalina sintase; NPT-II [neomycin phosphotransferase] = gene da neomicina fosfotransferase; NOS ter [nopalinha synthase terminator] = terminador da nopalina sintase; Sinal Poli-A (sinal de poliadenilação). As sequências do polinuclectídeo isolado da invenção foram clonadas no MCS do vetor.

[0098] As Figuras 3A-F são imagens que descrevem a visualização do desenvolvimento da raiz de plantas transgênicas de forma exógena expressando o polinucleotídeo de algumas aplicações da invenção quando cultivadas em placas de ágar transparentes sob condições normais (Figuras 3A-B), estresse osmótico (15% de PEG. Figs. 3C-D) ou limitação de nitrogênio (Figuras 3E~F). Os diferentes transgenes foram cultivados em placas de ágar transparente por 17 dias (7 dias de viveiro e 10 dias após a transplantação). As placas foram fotografadas a cada 3-4 dias iniciando no dia 1 após a transplantação Fig. 3A - Uma imagem de uma fotografia de plantas tiradas depois de 10 dias após a transplantação em placas de ágar quando cultivadas sob condições normais (padrão). Fig. 3B - Uma imagem da análise da raiz das plantas mostradas na Fig. 3A na qual os comprimentos das raízes medidas são representados por setas. Fig. 3C - Uma imagem de uma fotografia de plantas tiradas depois de 10 dias após a transplantação em placas de Agar, cultivadas sob condições altamente osmóticas (PEG 15%). Fig. 3D - Uma imagem da análise da raiz das plantas mostradas na Fig. 3C na qual os comprimentos das raízes medidas são representados por setas. Fig. 3E - Uma imagem de uma fotografia de plantas tiradas depois de 10 dias após a transplantação em placas de ágar, cultivadas sob condições de baixo teor de nitrogênio. Fig. 3F - Uma imagem da análise da raiz das plantas mostradas na Fig.

3E na qual os comprimentos das raízes medidas são representados por setas.

[0099] A Figura 4 é uma ilustração esquemática do plasmídeo binário pGI modificado contendo o Promotor de Raiz (pQNa RP) utilizado para expressar as sequências do polinucleotídeo isolado da invenção. RB - borda direita do T- DNA; LB - borda esquerda do T-DNA; NOS pro = promotor da nopalina sintase; NPT-II = gene da neomicina fosfotransferase; NOS ter = terminador da nopalina sintase; Sinal Poli-A (sinal de poliadenilação; as sequências do polinucleotídeo isolado, de acordo com algumas aplicações da presente invenção, foram clonadas no MCS [Local de clonagem múltipla] do vetor.

[00100] A Figura 5 é uma ilustração esquemática do plasmídeo pQYN.

[00101] A Figura 6 é uma ilustração esquemática do plasmídeo pQFN.

[00102] A Figura 7 é uma ilustração esquemática do plasmídeo pQFYN.

[00103] A Figura 8 é uma ilustração esquemática do plasmídeo binário modificado pGI (pQXNc) utilizado para expressar as sequências de polinucleotídeo isolado de algumas aplicações da invenção. RB - T-DNA borda direita; LB - T-DNA borda esquerda; NOS pro = promotor de nopalina sintase; NPT- II = gene de neomicina fosfotransferase; NOS ter = terminador de nopalina sintase; RE = qualquer enzima de restrição; sinal de Poli-A (sinal de poliadenilação); 35S - o promotor 35S (pqfnc; ID SEQ. N° 4876). As sequências de polinucleotídeo isolado de algumas aplicações da invenção foram clonadas no MCS (local de clonagem múltipla) do vetor.

[00104] As Figuras 9A-B são ilustrações esquemáticas dos plasmídeos pEBbVNi tDNA (Figura 9A) e pEBbNi tDNA (Figura 9B), utilizados nos experimentos com Brachypodium. 0 pEBbVNi tDNA (Figura 9A) foi utilizado para expressão das sequências de polinucleotídeos isolados de algumas aplicações da invenção em Brachypodium. 0 pEBbNi tDNA (Figura 9B) foi utilizado para a transformação em Brachypodium como um controle negativo. "RB fright border]" = borda direita; "2LBregion" = 2 repetições de borda esquerda; "35S" = promotor 35S (ID SEQ. N°: 4892); "NOS ter" = terminador da sintase de nopalina; "Bar ORE'" - estrutura de leitura de abertura BAR (N° de Acesso GenBank JQ293091.1; ID SEQ. N°: 5436); A sequência de polinucleotïdeo isolado das mesmas aplicações da invenção foi clonada no sítio de Clonagem Múltipla do vetor utilizando um ou mais do(s) sítio(s) de enzimas de restrição indicado(s).

DESCRIÇÃO DAS APLICAÇÕES ESPECÍFICAS DA INVENÇÃO

[00105] Os presentes inventores identificaram novos polipeptídeos e polinucleotídeos que podem ser utilizados para gerar estruturas de ácido nucleico, plantas transgênicas e aumentar a eficiência no uso do nitrogénio, eficiência no uso de fertilizantes, produção, taxa de crescimento, vigor, biomassa, teor de óleo, produção de fibra, qualidade da fibra, comprimento da fibra, capacidade fotossintética, tolerância ao estresse abiótico e/ou eficiência no uso da água de uma planta.

[001061 Dessa forma, conforme mostrado na seção Exemplos a seguir, os presentes inventores utilizam ferramentas de bioinformática para identificar polinucleotídeos que aprimoram/aumentam a eficiência no uso de fertilizantes (p.ex., eficiência no uso do nitrogênio), produção (p.ex., produção de sementes, produção de óleo, teor de óleo), taxa de crescimento, biomassa, vigor, produção de fibra, qualidade da fibra, comprimento da fibra, capacidade fotossintética e/ou tolerância ao estresse abiótico de uma planta. Os genes que afetam o traço de interesse foram identificados (ID SEQ. N° 496-794 para polipeptídeos; e ID SEQ. N° 1-495 para polinucleotídeos), com base nos perfis de expressão dos gentes de diversos ecotipos de Arabidopsis,

Cevada, Sorgo, Milho, tomate e Milho-Painço, e acessos em vários tecidos e condições de cultivo, homologia com genes conhecidos por afetarem o traço de interesse e utilizarem o perfil de expressão digital em tecidos e condições específicas (Tabelas 1 e 3-99, Exemplos 1 e 3-11 da secção de Exemplos a seguir). Polipeptídeos e polinucleotídeos homólogos (p.ex., ortólogos) com a mesma função também foram identificados [ID SEQ. N° 2898-4855 (para polipeptídeos) e ID SEQ. N° 795-2897 (para polinucleotídeos); Tabela 2, Exemplo 2 da seção de Exemplos que se segue]. Os polinucleotídeos de algumas aplicações da invenção foram clonados em vetores binários (Exemplo 12, Tabela 100) e foram, ainda, transformados em plantas Arabidopsis e Brachypodium (Exemplos 13-15).

Descobriu-se que as plantas transgênicas que superexpressam os polinucleotídeos identificados exibem um aumento da biomassa, da taxa de crescimento, do vigor e da produção em condições normais de cultivo ou em condições de cultivo limitarntes de nitrogênio (Tabelas 101-128; Exemplos 16-20) e aumento da tolerância nas condições de estresse abiótico (p.ex., deficiência de nutriente) em comparação com o crescimento controlado das plantas nas mesmas condições de cultivo. Em conjunto, esses resultados sugerem o uso dos novos polinucleotídeos e polipeptídeos da presente invenção (p.ex., ID SEQ. N° 496-794 e 2898-4855 e ID SEQ. N° 1-495 e 795-2897) para aumentar a eficiência no uso do nitrogênio, eficiência no uso de fertilizantes, produção (p.ex., produção de óleo, produção de semente e teor de óleo), taxa de crescimento, biomassa, vigor, produção de fibra, qualidade da fibra,

comprimento da fibra, capacidade fotossintética, eficiência no uso da água e/ou tolerância ao estresse abiótico, de uma planta.

[00107] Desse modo, de acordo com um aspecto de algumas aplicações da presente invenção, é fornecido um método para aumentar a eficiência no uso de fertilizantes (p.ex., eficiência no uso do nitrogênio), teor de óleo, produção, taxa de crescimento, biomassa, vigor, produção da fibra, qualidade da fibra, comprimento da fibra, capacidade fotossintética e/ou tolerância ao estresse abiótico de uma planta, compreendendo expressar dentro da planta um polinucleotídeo exógeno, compreendendo uma sequência de ácido nucleico que codifica um polipeptídeo, pelo menos cerca de 80%, pelo menos cerca de 81%, pelo menos cerca de 82%, pelo menos cerca de 83%, pelo menos cerca de 84%, pelo menos cerca de 85%, pelo menos cerca de 86%, pelo menos cerca de 87%, pelo menos cerca de 88%, pelo menos cerca de 89%, pelo menos cerca de 90%, pelo menos cerca de 91%, pelo menos cerca de 92%, pelo menos cerca de 93%, pelo menos cerca de 94%, pelo menos cerca de 95%, pelo menos cerca de 96%, pelo menos cerca de 97%, pelo menos cerca de 98%, pelo menos cerca de 99%, ou, digamos, 100% homólogo à sequência de aminoácidos selecionada do grupo consistindo nas ID SEQ. N° 496-794, 2898-3645, 3647-4854 e 4855, aumentando, dessa forma, a eficiência no uso de fertilizantes (p.ex., eficiência no uso do nitrogênio), teor de óleo, produção, taxa de crescimento, biomassa, vigor, produção de fibra, qualidade da fibra, comprimento da fibra, capacidade fotossintética e/ou tolerância ao estresse abiótico da planta.

[00108] Conforme utilizada aqui, a expressão "produção da planta" refere-se ao montante (p.ex., conforme determinado por peso ou tamanho) ou quantidade (números) de tecidos ou órgãos produzidos por plantas ou por estação de crescimento. Portanto, o aumento de produção de semente por planta pode afetar o benefício econômico que alguém pode obter da planta em uma determinada área de cultivo e/ou época de cultivo.

[00109j É importante observar que a produção da planta pode ser afetada por vários parâmetros, incluindo, mas não se limitando à biomassa da planta; vigor da planta; taxa de crescimento; produção de sementes; quantidade de sementes ou grãos; qualidade da semente ou grão; produção de óleo; teor de óleo, amido e/ou proteína em órgãos colhidos (p.ex., sementes ou partes vegetais da planta); número de flores (florezinhas) por panícula (expressado como uma proporção do número de sementes preenchidos sobre o número de panículas primárias); índice de colheita; número de plantas cultivadas por área; número e tamanho dos órgãos colhidos por planta e por área; número de plantas por área de crescimento (densidade); número de órgãos colhidos em campo; área total da folha; assimilação de carbono e particionamento de carbono (a distribuição/alocação de carbono dentro da planta); resistência à sombra; número de órgãos coletáveis (p.ex., sementes) , sementes por vagem, peso por semente; e arquitetura modificada [como aumento do diâmetro do caule, espessura ou melhoria das propriedades físicas (p.ex., elasticidade)].

[00110] Conforme utilizada aqui, a expressão "produção de semente" refere-se ao número ou ao peso das sementes por planta, sementes por vagem ou por área de cultivo ou ao peso de uma única semente, ou ao óleo extraído por semente. Portanto, a produção de semente pode ser afetada pelas dimensões da semente (p.ex., comprimento, largura, perímetro, área e/ou volume), pelo número de sementes (cheias) e pela taxa de enchimento da semente e pelo teor de óleo da semente. Portanto, o aumento de produção de semente por planta pode afetar o benefício econômico que alguém pode obter da planta em uma determinada área de cultivo e/ou época de cultivo; e o aumento da produção de semente por área de cultivo pode ser alcançado aumentando a produção de semente por planta, e/ou aumentando o número de plantas cultivadas em uma determinada área.

[00111] 0 termo "semente" (também referido como "grão" ou "núcleo"), conforme utilizado aqui, refere-se a uma planta embriônica pequena confinada em uma cobertura chamada de revestimento de semente (normalmente com algum alimento armazenado), o produto do óvulo amadurecido de plantas gimnosperma e angiosperma que ocorre após a fertilização e algum crescimento dentro da planta mãe.

[00112] A expressão "teor de óleo", conforme utilizada aqui, refere-se à quantidade de lipídeos de um determinado órgão da planta, sejam as sementes (teor de óleo da semente) ou a porção vegetal da planta (teor de óleo vegetal) e é expressa como um percentual de peso seco (10% de umidade das sementes) ou peso úmido (para a porção vegetal).

[00113] Deve-se observar que o teor de óleo é afetado pela produção intrínseca de óleo de um tecido (p.ex., semente, parte vegetal), bem como a massa ou tamanho do tecido de produção de óleo por planta ou por período de crescimento.

[00114] Em uma aplicação, o aumento do teor de óleo da planta pode ser atingido aumentando o tamanho/massa de tecido(s) de uma planta, que compreende o óleo por período de cultivo. Dessa forma, o aumento do teor de óleo de uma planta pode ser alcançado aumentando a produção, a taxa de crescimento, a biomassa e o vigor da planta.

[00115] Conforme utilizada aqui, a expressão "biomassa da planta" refere-se à quantidade (p.ex., medida em gramas de tecido secado pelo ar) de um tecido produzido a partir da planta em um período de cultivo, que também pode determinar ou afetar a produção da planta ou a produção por área de cultivo. Um aumento da biomassa da planta pode ocorrer em toda a planta ou em partes dela como partes acima do nível do solo (passível de colheita), biomassa vegetal, raízes e sementes.

[00116] Conforme utilizada aqui, a expressão "taxa de crescimento" refere-se ao aumento do tamanho do órgão/tecido da planta por período (pode ser medida em cm2 por dia ou cm/dia).

[00117] Conforme utilizada aqui, a expressão "capacidade fotossintética" (também conhecida como "Amãx") é uma medida da taxa máxima na qual as folhas são capazes de fixar o carbono durante a fotossíntese. É tipicamente medida como a quantidade de dióxido de carbono que é fixada por metro quadrado por segundo, por exemplo, como umol m-2 seg-1. As plantas são capazes de aumentar sua capacidade fotossintética por vários modos de ação, tais como por meio do aumento da área total de folhas (p.ex., por aumento da área de folhas, aumento do número de folhas e aumento do vigor da planta, p.ex., capacidade de a planta produzir novas folhas ao longo do curso de tempo) , bem como por meio do aumento da capacidade da planta de executar de maneira eficiente a fixação do carbono nas folhas. Assim, o aumento da área total de folhas pode ser utilizado como um parâmetro de medição confiável para o aumento da capacidade fotossintética.

[00118] Conforme utilizada aqui, a expressão "vigor da planta" refere-se à quantidade (medida pelo peso) ou tecido produzido pela planta em um determinado período.

Portanto o aumento do vigor pode determinar ou afetar a produção da planta ou a produção por período de cultivo ou por área de cultivo. Além disso, o vigor prematuro (semente e/ou muda) resulta em melhor posição no campo.

[00119] Melhorar o vigor precoce é um objetivo importante de modernos programas de reprodução de arroz em cultivares de arroz temperado e tropical. Raízes longas são importantes para fixação adequada do solo em arroz pré- germinado. Quando o arroz é diretamente semeado em campos alagados e onde as plantas devem emergir rapidamente através da água, brotos mais longos são associados com vigor. Onde a semeadura de perfuração é praticada, mesocótilos e coleóptilos mais longos são importantes para bom surgimento das mudas. A habilidade de projetar vigor precoce nas plantas seria de grande importância na agricultura. P.ex., baixo vigor precoce tem sido uma limitação na introdução do milho (Zea mays L.) híbrido com base no germoplasma do Cinturão do Milho na Atlântica Europeia.

[00120] Deve-se observar que uma produção de planta pode ser determinada sob estresse (p.ex., estresse abiótico, condições limitantes de nitrogênio) e/ou condições de não estresse (normal).

[00121] Conforme utilizada aqui, a expressão "condições de não estresse" refere-se às condições de cultivo (p.ex., água, temperatura, ciclos claro-escuro, umidade, concentração de sal, concentração de fertilizante no solo, fornecimento de nutriente tal como nitrogênio, fósforo e/ou potássio), que não significativamente vão além das condições climáticas diárias e outras abióticas que as plantas podem encontrar e que permitem o crescimento ideal, metabolismo, reprodução e/ou viabilidade de uma planta em qualquer estágio em seu ciclo de vida (p.ex., em uma planta de cultura da semente para uma planta madura e de volta para a semente novamente). Os técnicos no assunto estão cientes das condições normais do solo e climáticas para uma dada planta em uma dada localização geográfica. Deve ser notado que enquanto as condições de não estresse podem incluir algumas variações suaves das condições ideais (que variam de um tipo/espécie de uma planta para outra), tais variações não fazem com que a planta cesse o crescimento sem a capacidade de retomar o crescimento.

[00122] A expressão "estresse abiótico", conforme utilizada aqui, refere-se a qualquer efeito adverso sobre o metabolismo, o crescimento, a reprodução e/ou a viabilidade da planta. Consequentemente, o estresse abiótico pode ser induzido por condições de cultivo ambiental subótimas como, p.ex., salinidade, estresse osmótico, privação de água, seca, inundação, congelamento, temperatura baixa ou elevada, toxicidade por metais pesados, anaerobiose, deficiência de nutrientes (p.ex., deficiência de nitrogênio ou nitrogênio limitado), poluição atmosférica ou irradiação UV. As implicações do estresse abiótico são discutidas na seção Histórico.

[00123] A expressão "tolerância ao estresse abiótico", conforme utilizada aqui, refere-se à capacidade de uma planta em resistir a um estresse abiótico sem sofrer uma alteração substancial no metabolismo, crescimento, produtividade e/ou viabilidade.

[00124] As plantas são submetidas a uma gama de desafios ambientais. Diversos desses desafios, incluindo estresse salino, estresse osmótico geral, estresse por aridez e estresse por congelamento, têm a habilidade de impactar na planta integral e na disponibilidade de água celular. Não é de surpreender, então, que as respostas da planta a essa coleção de estresses sejam relacionadas. Zhu (2002) Ann. Rev.

Planta Biol. 53: 247-273 et al. Observe que "a maioria dos estudos na sinalização de estresse hídrico focou no estresse salino primariamente porque as respostas da planta ao sal e estiagem estão intimamente relacionadas e os mecanismos se sobrepõem". Muitos exemplos de respostas similares e caminhos para esse conjunto de estresses foram documentados. For exemplo, os fatores de transcrição de CBF demonstraram condicionamento de resistência ao sal, congelamento e estiagem (Kasuga et al. (1999) Nature Biotech. 17: 287-291). O gene Arabidopsis rd29B é induzido em resposta ao estresse de sal e desidratação, um processo que é mediado amplamente através de um processo de transdução de sinal ABA (Uno et al. (2000) Proc. Natl. Acad. Sci. EUA 97: 11632-11637), resultando em atividade alterada de fatores de transcrição que se ligam a um elemento a montante dentro do promotor rd29B. Em Mesembryanthemuma crystallinum (planta de gelo), Patharker e Cushman mostraram que uma proteína cinase dependente do cálcio (McCDPK1) é induzida pela exposição aos estresses de estiagem e sal (Patharker e Cushman (2000) Plant J. 24: 679-691). A cinase induzida por estresse também demonstraram fosforilar um fator de transcrição, provavelmente alterando sua atividade, embora os níveis transcrições do fator de transcrição alvo não sejam alterados em resposta ao estresse de sal ou estiagem. Similarmente, Saijo et al. demonstraram que uma proteína cinase dependente de calmodulina induzida por sal/estiagem de arroz (OsCDPK7) conferiu tolerância elevada ao sal e estiagem para o arroz quando superexpressa (Saijo et al. (2000) Planta J. 23: 319-327).

[00125] A exposição à desidratação evoca estratégias similares de sobrevivência em plantas, assim como o estresse de congelamento (vide, p.ex., Yelenosky (1989) Planta Physiol 89: 444-451) e o estresse de estiagem induz tolerância de congelamento (vide, p.ex., Siminovitch et al.

(1982) Planta Physiol 69: 250-255; e Guy et al. (1992) Plant 188: 265-270). Além da indução de proteínas de aclimatação fria, estratégias que permitem que as plantas sobrevivam em baixas condições de água podem incluir, p.ex., área de superfície reduzida, ou produção de óleo ou cera da superfície. Em outro exemplo, o teor de soluto elevado da planta previne a evaporação e a perda de água devido ao calor, estiagem, salinidade, asmático e similares, portanto provendo uma melhor tolerância aos estresses acima.

[00126] Será entendido que alguns caminhos envolvidos na resistência a um estresse (conforme descrito acima), também serão envolvidos em resistência a outros estresses, regulados pelos mesmos genes ou homólogos.

Certamente, os caminhos de resistência estão relacionados, não idênticos e, portanto, nem todos os genes que controlam a resistência a um estresse controlarão a resistência a outros estresses. Não obstante, se uma resistência de condições de gene a um desses estresses, estaria evidente ao especialista na técnica o teste para resistência a esses estresses relacionados. Os métodos de avaliação da resistência ao estresse também São fornecidos na seção de Exemplos a seguir.

[00127] Conforme utilizada aqui, a expressão "eficiência no uso da água (WUE l water use efficiency) " refere- se ao nível de matéria orgânica produzido por unidade de água consumida pela planta, isto é, o peso seco de uma planta em relação à utilização de água da planta, p.ex., a biomassa produzida por transpiração unitária.

[00128] Conforme utilizada aqui, a expressão

"eficiência no uso de fertilizante" refere-se ao(s) processo(s) metabólico(s) que leva(m) a um aumento na produção da planta, biomassa, vigor e taxa de crescimento por unidade de fertilizante aplicada. 0 processo metabólico pode ser a captação, propagação, absorção, acúmulo, realocação (dentro da planta) e utilização de um ou mais minerais e porções orgânicas absorvidas pela planta, tais como nitrogênio, fosfatos e/ou potássio.

[00129] Conforme utilizada aqui, a expressão "condições limitantes de fertilizante" refere-se às condições de cultivo que incluem um nível (p.ex., concentração) de um fertilizante aplicado que está abaixo do nível necessário para o metabolismo normal da planta, crescimento, reprodução e/ou viabilidade.

[00130] Conforme utilizada aqui, a expressão "eficiência no uso de nitrogênio (NUE)" refere-se ao(s) processo(s) metabólico(s) que leva(m) a um aumento na produção da planta, biomassa, vigor e taxa de crescimento por unidade de nitrogênio aplicada. O processo metabólico pode ser a captação, propagação, absorção, acúmulo, realocação (dentro da planta) e utilização de nitrogênio absorvido pela planta.

[00131] Conforme utilizada aqui, a expressão "condições limitantes de nitrogênio" refere-se às condições de cultivo que incluem um nível (p.ex., concentração) de nitrogênio (isto é, amônia ou nitrato) aplicado que está abaixo do nível necessário para o metabolismo normal da planta, crescimento, reprodução e/ou viabilidade.

[00132] A NUE e FUE melhorada da planta são traduzidas no campo em quantidades semelhantes de colheita da produção, enquanto implementam menos fertilizantes, ou produções melhoradas adquiridas pela implementação dos mesmos níveis de fertilizantes. Assim, NUE ou FUE melhorada tem um efeito direto na produção de planta no campo. Assim, os polinucleotídeos e polipeptídeos de algumas aplicações da invenção afetam positivamente a produção de planta, produção de semente e biomassa de planta. Além disso, o benefício da NUE melhorada de planta certamente melhorará a qualidade da cultura e constituintes bioquímicos da semente tais como produção de proteína e produção de óleo.

[00133] Deve-se observar que um ASST melhorado conferirá às plantas vigor melhorado também em condições de não estresse, resultando em culturas que possuem biomassa e/ou produção melhorada, p.ex., fibras alongadas para a indústria de algodão, teor de óleo mais alto.

[00134] 0 termo "fibra" é normalmente inclusivo de células de condução de parede espessa, tais como vasos e traqueídeos, e para fibrilares agregados de muitas células de fibra individual. Por isso, o termo "fibra" refere-se a (a) células de condução e não condução de parede espessa do xilema; (b) fibras de origem extraxilar, incluindo aquelas de floema, casca, tecido do solo e epiderme; e (c) fibras dos caules, folhas, raízes, sementes e flores ou inflorescências (tais como aquelas de Sorghum vulgare utilizadas na fabricação de escovas e vassouras).

[00135] Exemplos de planta que produz fibra, incluem, entre outros, culturas agrícolas tais como algodão,

árvore de seda de algodão (Paina, Ceiba pentandra), salgueiro do deserto, arbusto de creosoto, winterfat, balsa, quenafe, rosala, juta, sisal abaca, linho, milho, cana de açúcar, cânhamo, rami, paina, fibra de coco, bambu, musgo espanhol e Agave spp. (p.ex., sisal).

[00136] Conforme utilizada aqui, a expressão "qualidade da fibra" refere-se a pelo menos um parâmetro de fibra que é agricolamente desejado, ou requerido na indústria de fibra (também descrito adiante). Exemplos de tais parâmetros incluem, entre outros, comprimento da fibra, resistência da fibra, adequação da fibra, peso da fibra por comprimento da unidade, proporção de maturidade e uniformidade (também descrito adiante).

[00137] A qualidade da fibra de algodão (gaze) é tipicamente medida de acordo com o comprimento, resistência e delicadeza da fibra. Consequentemente, a qualidade da gaze é considerada mais alta quando a fibra é mais longa, mais forte e mais fina.

[00138] Conforme utilizada aqui, a expressão "produção da fibra" refere-se à quantidade ou qualidade das fibras produzidas da planta que produz fibra.

[00139] Conforme utilizado aqui, o termo "aumento" refere-se a, pelo menos cerca de 2%, pelo menos cerca de 3%, pelo menos cerca de 4%, pelo menos cerca de 5%, pelo menos cerca de 10%, pelo menos cerca de 15%, pelo menos cerca de 20%, pelo menos cerca de 30%, pelo menos cerca de 40%, pelo menos cerca de 50%, pelo menos cerca de 60%, pelo menos cerca de 70%, pelo menos cerca de 80% de aumento na eficiência no uso de fertilizante, eficiência no uso de nitrogênio, produção, produção de semente, biomassa, taxa de crescimento, vigor, teor de óleo, produção da fibra, qualidade da fibra, comprimento da fibra, capacidade fotossintética e/ou tolerância ao estresse abiótico de uma planta comparada a uma planta nativa ou planta do tipo selvagem [isto é, uma planta não modificada com as biomoléculas (polinucleotídeo ou polipeptídeos) da invenção, p.ex., um planta não transformada da mesma espécie que é cultivada sob as mesmas condições (p.ex., idênticas) de crescimento].

[00140] A expressão "expressar dentro da planta um polinucleotídeo exógeno", conforme utilizada aqui, refere-se à regulação ascendente do nível de expressão de um polinucleotídeo exógeno dentro da planta, introduzindo o polinucleotídeo exógeno em uma planta ou célula da planta e expressando-o por meios recombinantes, conforme também descrito logo abaixo.

[00141] Conforme utilizado aqui, "expressar" refere-se à expressão no mRNA e, opcionalmente, no nível de polipeptídeo.

[00142] Conforme utilizada aqui, a expressão "polinucleotídeo exógeno" refere-se a uma sequência de ácido nucleico heterólogo que pode não ser naturalmente expressa dentro da planta (p.ex., uma sequência de ácido nucleico de espécies diferentes) ou na qual a superexpressão na planta é desejada. 0 polinucleotídeo exógeno pode ser introduzido na planta em uma maneira estável ou transitória, de modo a produzir uma molécula de ácido ribonucleico (RNA I ribonucleic acid) e/ou uma molécula de polipeptídeo. Deve-se observar que o polinucleotídeo exógeno pode compreender uma sequência de ácido nucleico que é idêntica ou parcialmente homóloga a uma sequência de ácido nucleico endógena da planta.

[00143] 0 termo "endógeno", conforme utilizado aqui, refere-se a qualquer polinucleotídeo ou polipeptídeo que está presente e/ou naturalmente expresso dentro de uma planta ou uma célula da mesma.

[00144] De acordo com algumas aplicações da invenção, o polinucleotídeo exógeno da invenção compreende uma sequência de ácido nucleico que codifica um polipeptídeo tendo uma sequência de aminoácidos, pelo menos cerca de 80%, pelo menos cerca de 81%, pelo menos cerca de 82%, pelo menos cerca de 83%, pelo menos cerca de 84%, pelo menos cerca de 85%, pelo menos cerca de 86%, pelo menos cerca de 87%, pelo menos cerca de 88%, pelo menos cerca de 89%, pelo menos cerca de 90%, pelo menos cerca de 91%, pelo menos cerca de 92%, pelo menos cerca de 93%, pelo menos cerca de 94%, pelo menos cerca de 95%, pelo menos cerca de 96%, pelo menos cerca de 97%, pelo menos cerca de 98%, pelo menos cerca de 99%, ou, digamos, 100% homóloga à sequência de aminoácidos selecionada do grupo consiste das ID SEQ. N° 496-794, 2898-3645, 3647- 4854 e 4855.

[00145] As sequências homólogas incluem ambas as sequências, ortólogas e parálogas. 0 termo "parálogo" refere- se às duplicações de gene dentro do genoma de uma espécie, conduzindo aos genes parálogos. 0 termo "ortólogo" refere-se aos genes homólogos em diferentes organismos devido à relação ancestral. Assim, ortólogos são contrapartes evolucionárias derivadas de genes ancestrais únicos no último ancestral comum de duas espécies dadas (Koonin EV e Galperin MY (Sequence - Evolution - Function: Computational Approaches in Comparative Genomics. Boston: Kluwer Academic; 2003. Capítulo 2, Evolutionary Concept in Genetics e Genomics. Disponível em: ncbi (ponto) nlm (ponto) nih (ponto) gov/books/NBK20255) e, portanto, possuem grande possibilidade de terem a mesma função.

[00146] Uma opção para identificar ortólogos em espécies de plantas monocotiledônias é a realização de uma pesquisa de explosão recíproca. Isso pode ser feito através de uma primeira explosão, envolvendo explodir a sequência de interesse contra qualquer base de dados da sequência, tal como a base de dados do NCBI publicamente disponível que pode ser encontrada em: ncbi (ponto) nlm (ponto) nih (ponto) gov. Se forem procurados ortólogos no arroz, a sequência de interesse seria detonada novamente, p.ex., os 28.469 clones de cDNA de comprimento total de Oryza Sativa Nipponbare disponível em NCBI. Os resultados da explosão podem ser filtrados. As sequências de comprimento total dos resultados filtrados ou dos resultados não filtrados são então detonadas de volta (segunda explosão) contra as sequências do organismo das quais a sequência de interesse é derivada. Os resultados das primeira e segunda explosões são, então, comparados. Um ortólogo é identificado quando a sequência resultando na maior pontuação (melhor acerto) na primeira explosão identifica na segunda explosão a sequência de consulta (a sequência de interesse original) como o melhor acerto. Utilizando o mesmo racional, um parálogo (homólogo a um gene no mesmo organismo) é encontrado. No caso de grandes famílias de sequência, o programa ClustalW pode ser utilizado [ebi (ponto) ac (ponto) uk/Tools/clustalw2/index (ponto) html], seguido por uma árvore de união vizinha (wikipedia (ponto) org/wiki/Neighbor- joining) que ajuda na visualização do agrupamento.

[00147] A homologia (p.ex., homologia percentual, identidade de sequência + similaridade de sequência) pode ser determinada utilizando qualquer software para comparação de homologia que calcule o alinhamento de sequência em pares.

[00148] Conforme utilizado aqui, "identidade de sequência" ou "identidade", no contexto de duas sequências de ácidos nucleicos ou polipeptideos, inclui referência aos resíduos nas duas sequências, que são os mesmos quando alinhados. Quando a porcentagem de identidade de sequência é utilizada em referência às proteínas, reconhece-se que as posições dos resíduos que não são idênticos diferem frequentemente por substituições conservativas de aminoácidos, nas quais os resíduos de aminoácidos são substituídos por outros resíduos de aminoácidos com propriedades químicas semelhantes (p.ex., carga ou hidrofobicidade) e, portanto, não alteram as propriedades funcionais da molécula. Quando as sequências diferem em substituições conservativas, a porcentagem de identidade de sequência pode ser ajustada para cima para corrigir a natureza conservadora da substituição. As sequências que diferem por tais substituições conservativas são referidas como tendo

"similaridade de sequência" ou "similaridade". Os meios para fazer esse ajuste são bem conhecidos dos especialistas na técnica. Tipicamente, isso envolve atingir uma substituição conservativa como uma parcial em vez de uma incompatibilidade total, aumentando, desse modo, a porcentagem de identidade de sequência. Assim, por exemplo, quando for atribuída uma pontuação de 1 a um aminoácido idêntico e quando for atribuída uma pontuação de zero a uma substituição não conservativa, será atribuída uma pontuação entre zero e 1 a uma substituição conservativa. A pontuação de substituições conservativas é calculada, p.ex., de acordo com o algoritmo de Henikoff S e Henikoff JG. [Amino acid substitution matrices from protein blocks. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 1992, 89(22): 10915-9].

[00149] A identidade (p.ex., percentual de homologia) pode ser determinada utilizando qualquer software para comparação de homologia, incluindo, por exemplo, o software BlastN do National Center of Biotechnology Information [NCBI I Centro Nacional de Informação de Biotecnologia], tal como utilizando parâmetros padrões.

[00150] De acordo com algumas aplicações da invenção, a identidade é uma identidade global, ou seja, uma identidade sobre toda a sequência de aminoácidos ou de ácido nucleico da invenção e não apenas sobre partes respectivas.

[00151] De acordo com algumas aplicações da invenção, o termo "homologia" ou "homólogo" refere-se à identidade de duas ou mais sequências de ácido nucleico; ou identidade de duas ou mais sequências de aminoácidos; ou a identidade de uma sequência de aminoácidos para uma ou mais

Só/413 sequências de ácido nucleico.

[00152] De acordo com algumas aplicações da invenção, a homologia é uma homologia global, ou seja, uma homologia sobre toda a sequência de aminoácidos ou de ácido nucleico da invenção e não apenas sobre partes respectivas.

[00153] 0 grau de homologia ou de identidade entre duas ou mais sequências pode ser determinado usando várias ferramentas de comparação de sequências conhecidas. Na sequência há uma descrição não limitante de tais ferramentas, que podem ser utilizadas juntamente com algumas aplicações da invenção.

[00154] 0 alinhamento global em pares foi definido por S. B. Needleman e C. D. Wunsch, "A general method applicable to the search of similarities in the amino acid sequence of two proteins" Journal of Molecular Biology, 1970, páginas 443-53, volume 48).

[00155] Por exemplo, ao começar com uma sequência polipeptídica e comparar com outras sequências polipeptídicas, o algoritmo EMBOSS-6.0.1 de Needleman-Wunsch (disponível em emboss(dot)sourceforge(dot)net/apps/cvs/ emboss/apps/needle(dot)html) pode ser utilizado para encontrar o alinhamento ideal (incluindo as lacunas) de duas sequências juntamente com seus comprimentos totais - um "Alinhamento global". Os parâmetros padrões para o algoritmo de Needleman-Wunsch (EMBOSS-6.0.1) incluem: gapopen=10; gapextend=0.5; datafile= EBLOSUM62; brief=YES.

[00156] De acordo com algumas aplicações da invenção, os parâmetros utilizados com a ferramenta EMBOSS-

6.0.1 (para a comparação proteína-proteína) incluem: gapopen=8; gapextend=2; datafile= EBLOSUM62; brief=YES.

[00157] De acordo com algumas aplicações da invenção, o limite utilizado para determinar a homologia utilizando o algoritmo EMBOSS-6.0.1 de Needleman-Wunsch é 80%, 81%, 82%, 83%, 84%, 85%, 86%, 87%, 88%, 89%, 90%, 91%, 92%, 93%, 94%, 95%, 96%, 97%, 98%, 99% ou 100%.

[00158] Ao começar com uma sequência polipeptídica e comparar a sequências polinucleotídicas, o algoritmo OneModel FramePlus (Halperin, E., Faigler,S. e Gill-More,R. (1999) - FramePlus: aligning DNA to protein sequences. Bioinformatics, 15, 867-873) (disponível em biocceleration(ponto)com/ Products(ponto)html) pode ser utilizado com os seguintes parâmetros padrões: model=frame+ p2n.model mode=local.

[00159] De acordo com algumas aplicações da invenção, os parâmetros utilizados com o algoritmo OneModel FramePlus são model=frame+ p2n.model, mode=qglobal.

[00160] De acordo com algumas aplicações da invenção, o limite utilizado para determinar a homologia usando o algoritmo OneModel FramePlus é 80%, 81%, 82%, 83%, 84%, 85%, 86%, 87%, 88%, 89%, 90%, 91%, 92%, 93%, 94%, 95%, 96%, 97%, 98%, 99% ou 100%.

[00161] Ao começar com uma sequência polinucleotídica e comparar com outras sequências polinucleotídicas, o algoritmo EMBOSS-6.0.1 de Needleman- Wunsch (disponível em emboss(ponto)sourceforge(ponto)net/apps/cvs/emboss/apps/need le(ponto)html) pode ser utilizado com os seguintes parâmetros padrões. (EMBOSS-6.0.1) gapopen=10; gapextend=0.5; datafile= EDNAFULL; brief=YES.

[00162] De acordo com algumas aplicações da invenção, os parâmetros utilizados com o algoritmo EMBOSS-

6.0.1 de Needleman-Wunsch são gapopen=10; gapextend=0.2; datafile= EDNAFULL; brief=YES.

[00163] De acordo com algumas aplicações da invenção, o limite utilizado para determinar a homologia usando o algoritmo EMBOSS-6.0.1 de Needleman-Wunsch para a comparação de polinucleotídeos com polinucleotídeos é 80%, 81%, 82%, 83%, 84%, 85%, 86%, 87%, 88%, 89%, 90%, 91%, 92%, 93%, 94%, 95%, 96%, 97%, 98%, 99% ou 100%.

[00164] De acordo com algumas aplicações, as determinações do grau de homologia requerem adicionalmente o emprego do algoritmo de Smith-Waterman (para a comparação proteína-proteína ou comparação nucleotídeo- nucleotídeo)

[00165] Os parâmetros padrões para o algoritmo GenCore 6.0 Smith-Waterman incluem: modelo =sw.model.

[00166] De acordo com algumas aplicações da invenção, o limite utilizado para determinar a homologia usando o algoritmo de Smith-Waterman é 80%, 81%, 82%, 83%, 84%, 85%, 86%, 87%, 88%, 89%, 90%, 91%, 92%, 93%, 94%, 95%, 96%, 97%, 98%, 99% ou 100%.

[00167] De acordo com algumas aplicações da invenção, a homologia global é realizada sobre as sequências pré-selecionadas por homologia local para o polipeptídeo ou polinucleotídeo de interesse (p.ex., 60% de identidade sobre 60% do comprimento da sequência) antes da realização da homologia global para o polipeptídeo ou polinucleotídeo de interesse (p.ex., 80% de homologia global sobre toda a sequência). Por exemplo, as sequências homólogas são selecionadas usando o software BLAST com os algoritmos Blastp e tBlastn agindo como filtros para o primeiro estágio e a agulha (pacote EMBOSS) ou o alinhamento Estrutura+algorítmico para o segundo estágio. A identidade local (alinhamentos Blast) é definida com um corte bastante permissivo - 60% de Identidade em um intervalo de 60% dos comprimentos de sequências, porque é utilizada tão somente como um filtro para a fase de alinhamento global. Nesta aplicação específica (quando a identidade local é utilizada) a filtragem padrão do pacote Blast não é utilizada (estabelecendo o parâmetro "-F F").

[00168] No segundo estágio, os homólogos são definidos com base na identidade global de, pelo menos, 80% para a sequência polipeptídica principal.

[00169] De acordo com algumas aplicações da invenção, duas formas distintas para a descoberta do alinhamento global ideal para as sequências de proteína ou nucleotídica são utilizadas:

1. Entre duas proteínas (seguindo o filtro blastp): Algoritmo EMBOSS-6.0.1 de Needleman-Wunsch com os seguintes parâmetros modificados: gapopen=8 gapextend=2. 0 restante dos parâmetros permanece inalterado a partir das opções padrões listadas aqui:

Qualificadores padrões (Obrigatórios): [-asequence] sequência Nome do arquivo da sequência e formato opcional, ou referência (entrada EUA). [-bsequence] seqall Nome do arquivo da(s) sequência(s) e formato opcional, ou referência (entrada EUA) -gapopen flutuante [10,0 para qualquer sequência]. A penalidade da lacuna aberta é uma classificação tomada quando uma lacuna é criada. 0 melhor valor depende da escolha do arranjo de comparação. 0 valor padrão pressupõe que você está usando o arranjo EBLOSUM62 para as sequências de proteína e a matriz EDNAFULL para as sequências nucleotídicas (número de vírgula flutuante de 1,0 a 100,0). -gapextend flutuante [0,5 para qualquer sequência]. A penalidade pela extensão da lacuna, é adicionada à penalidade da lacuna padrão para cada base ou resíduo na lacuna.

Esta é o tempo pelo qual a lacuna é penalizada.

Normalmente espera-se poucas lacunas grandes e não muitas lacunas pequenas, assim a penalidade sobre a extensão da lacuna deveria ser menor que a penalidade da lacuna.

Uma exceção se dá quando uma ou mais sequências são lidas sozinhas com possíveis erros de sequência em cujo caso você esperaria muitas lacunas de base simples.

Pode-se obter este resultado estabelecendo a penalidade por lacuna aberta para zero (ou muito baixa) e usando a penalidade de extensão da lacuna para controlar a classificação da lacuna. (número de vírgula flutuante de 0,0 a 10,0). [-outfile] alinhamento [*.needle] Nome do arquivo de alinhamento de saída Qualificadores Adicionais (Opcional): -datafile matrixf [EBLOSUM62 para proteína, EDNAFULL para DNA]. Este é um arquivo do arranjo de classificação utilizado ao comparar as sequências.

Por padrão, este é o arquivo 'EBLOSUMS2' (para proteínas) ou o arquivo 'EDNAFULL' (para sequências nucleicas) Estes arquivos são encontrados no diretório 'data' da instalação EMBOSS.

Qualificadores Avançados (Espontâneos): -[no]brief booleano [Y] Breve identidade e similaridade.

Qualificadores Associados: "-asequence" Qualificadores Associados. -sbeginl inteiro Inicia a sequência a ser utilizada. -sendl inteiro Finaliza a sequência a ser utilizada. -sreversel booleano Reverso (se DNA). -saskl booleano Pede para iniciar/finalizar/reverter. -snucleotidel booleano A sequência é nucleotídica. -sproteínal booleano A sequência é de proteína. -slowerl booleano Faz minúsculas. -supperl booleano Faz maiúsculas. -sformatl cadeia Formato de sequência de entrada. -sdbnamel cadeia Nome da base de dados. -sidl cadeia Nome da entrada. -ufol cadeia Recursos UFO. -fformatl cadeia Formato dos Recursos. -fopenfilel cadeia Nome do arquivo dos recursos.

61/4I3 "-bsequence" Qualificadores Associados. -sbegin2 inteiro Inicia cada sequência a ser utilizada. -send2 inteiro Finaliza cada sequência a ser utilizada. -sreverse2 booleano Reverso (se DNA). -sask2 booleano Pede para iniciar/finalizar/reverter. -snucleotide2 booleano A sequência é nucleotídica. -sproteína2 booleano A sequência é de proteína. -slower2 booleano Faz minúsculas. -supper2 booleano Faz maiúsculas. -sformat2 cadeia Formato de sequência de entrada. -sdbname2 cadeia Nome da base de dados. -sid2 cadeia Nome da entrada. -ufo2 cadeia Recursos UFO. -fformat2 cadeia Formato dos Recursos. -fopenfile2 cadeia Nome do arquivo dos recursos. -outfile" Qualificadores Associados. -aformat3 cadeia Formato dos Alinhamentos. -aextension3 cadeia Extensão do nome do arquivo. -adirectory3 cadeia Diretório de Saída. -aname3 cadeia Nome do arquivo de base. -awidth3 inteiro Largura do alinhamento. -aaccshow3 booleano Mostra o número de acesso no cabeçalho. -adesshow3 booleano Mostra a descrição no cabeçalho. -ausashow3 booleano Mostra o USA completo no alinhamento. -aglobal3 booleano Mostra a sequência completa no alinhamento. Qualificadores Gerais: -auto booleano Desliga as solicitações. -stdout booleano Escreve o primeiro arquivo para a saída padrãos. -filtro booleano Lê o primeiro arquivo a partir da entrada padrão, escreve o primeiro arquivo para a saída padrão. -Opções booleano Solicita os valores padrão e adicionais.

-debug booleano Escreve a saída de depuração do programa .dbg -verbose booleano Registra algumas/todas as opções de linha de comando. -help booleano Registra as opções de linha de comando. Maiores informações sobre os qualificadores associados e gerais podem ser encontradas com - help -verbose. -warning booleano Registra as advertências. -error booleano Registra os erros. -fatal booleano Registra os erros fatais. -die booleano Registra as mensagens de expiração do programa.

2. Entre uma sequência de proteína e uma sequência nucleotídica (seguindo o filtro rblastn) Aplicação de GenCore

6.0 OneModel utilizando a estrutura+algoritmo com os seguintes parâmetros: model=frame+ p2n.model mode=qglobal - q=protein.sequence -db= nucleotide.sequence. 0 restante dos parâmetros permanece inalterado a partir das opções padrões: Uso: em -model=<model—fname> [-q=]query [-db=]database [options]. -model=<model—fname> Especifica o modelo que quer executar. Todos os modelos fornecidos pela Compugen estão localizados no diretório $CGNROOT/models/.

Parâmetros válidos de linha de comando: -dev=<dev_name> Seleciona o dispositivo a ser utilizado pela aplicação.

Os dispositivos válidos são: bic - Bioccelerator (válido para SW, XSW, FRAME N2P, e modelos FRAMEP2N). Xlg - BioXL/G (válido para todos os modelos, exceto XSW). xlp - BioXL/P (válido para SW, FRAME+_N2P, e modelos FRAME_P2N). xlh - BioXL/H (válido para SW, FRAME+ N2P, e modelos FRAME_P2N). soft - Dispositivo do software (para todos os modelos). -q=<query> Define o conjunto de consultas.

As consultas podem ser um arquivo de sequência ou uma referencia à base de dados.

Você pode especificar uma consulta pelo nome ou por número de acesso. 0 formato é detectado automaticamente.

Entretanto, pode-se especificar um formato usando o parâmetro -qfmt Se uma consulta não for especificada, o programa solicita uma.

Se o conjunto de consultas for uma referência à base de dados, um arquivo de saída é produzido para cada sequência na consulta. -db=<database Escolha o conjunto de base de dados. 0 conjunto de name> base de dados pode ser um arquivo de sequência ou uma referência à base de dados. 0 formato da base de dados é detectado automaticamente.

Entretanto, pode-se especificar um formato usando o parâmetro -dfmt. -qacc Adiciona este parâmetro à linha de comando se uma consulta for especificada usando os números de acesso. -dacc Adiciona este parâmetro à linha de comando se uma base de dados for especificada usando os números de acesso. -dfmt/- Escolhe o tipo do formato da base de dados/consulta. gfmt=<format_ty Os formatos possíveis são: pe> fasta - fasta com o tipo de sequência autodetectada. fastap - sequência de proteína fasta. fastan - sequência nucleica fasta. gcg - formato gcg, o tipo é autodetectado. gcg9seq formato gcg9, o tipo é autodetectado. gcg9seqp - sequência de proteína de formato gcg9. gcg9seqn - sequência nucleica de formato gcg9. nbrf - sequência nbrf, o tipo é autodetectado. nbrfp - sequência de proteína nbrf. nbrfn - sequência nucleica nbrf. embl - formato embl e swissprot. genbank -- formato genbank (nucleico). blast - formato blast. nbrf_gcg - sequência nbrf_gcg, o tipo é autodetectado. nbrf_gcgp - sequência de proteína nbrf-gcg.

nbrf_gcgn - sequência nucleica nbrf-gcg. raw - sequência raw ascii, o tipo é autodetectado. rawp - sequência de proteína raw ascii. rawn - sequência nucleica raw ascii.

pir -- formato pir codata, o tipo é autodetectado. Profile - perfil gcg (válido somente para - qfmt em SW, XSW, FRAME_P2N e FRAME+P2N). -out=<outfname> 0 nome do arquivo de saída. -suffix=<name> 0 sufixo do nome do arquivo de saída. -gapop=<n> Penalidade sobre a abertura de lacuna. Este parâmetro não é válido para a FRAME+. Para a FrameSearch o padrão é 12,0. Para outras pesquisas o padrão é 10,0. -gapext=<n> Penalidade por extensão de lacuna. Este parâmetro não é válido para FRAME+. Para a FrameSearch o padrão é 4,0. Para outros modelos: o padrão para as pesquisas de proteína é 0,05 e o padrão para as pesquisas nucleicas é 1,0. -qgapop=<n> A penalidade pela abertura de uma lacuna na sequência de consultas. 0 padrão é 10,0. Válido para XSW. -qgapext=<n> A penalidade para a extensão de uma lacuna na sequência de questões. 0 padrão é 0,05. Válido para XSW. -start=<n> A posição na sequência de consulta para iniciar a pesquisa. -end=<n> A posição na sequência de consulta para interromper a pesquisa. -qtrans Realiza uma pesquisa traduzida, relevante para uma consulta nucleica contra uma base de dados de proteína. A consulta nucleica é traduzida para seis estruturas de leitura e um resultado é fornecido para cada estrutura. Válido para o SW e XSW. -dtrans Realiza uma pesquisa traduzida, relevante para uma consulta proteica contra uma base de dados de DNA. Cada entrada da base de dados é traduzida para seis quadros de leitura e um resultado é dado para cada quadro. Válido para o SW e XSW. Nota: as opções "-qtrans" e "-dtrans" são mutuamente exclusivas. -matrix=<matrix file> Especifica o arranjo de comparação a ser utilizada na pesquisa. 0 arranjo deve estar em formato BLAST. Se o arquivo do arranjo não for localizado em $CGNROOT/tables/matrix, especifique o caminho completo como o valor do -matrix parameter. -trans=<transtab_name> Tabela de tradução. A localização padrão para a tabela é $CGNROOT/tables/trans. -onestrand Restringe a pesquisa para somente a vertente superior da consulta/base de dados da sequência nucleica. -list=<n> 0 tamanho máximo da lista de acertos de saída. 0 padrão é 50. -docalign=<n> 0 número das linhas de documentação precedente a cada alinhamento. 0 padrão é 10.

thr_score=<score_name> A classificação que coloca um limite à exibição dos resultados. Classificações menores que o valor mínimo de -thrmin ou maiores que o valor -thr max não são mostradas. As opções válidas são: qualidade. Escore. Escore. -thr_max=<n> 0 limite mais alto da classificação. Resultados maiores que o valor -thr max não são mostrados. -thr_min=<n> 0 menor limite da classificação. Resultados menores que o valor -thr_min não são mostrados. -align=<n> 0 número de alinhamentos registrados no arquivo de saída. -noalign Não exibe o alinhamento. Nota: os parâmetros "-align" e "-noalign" são mutuamente exclusivos. -outfmt=<format_name> Especifica o tipo de formato de saída. O formato padrão é PFS. Os valores possíveis são: PFS - Formato de texto PFS FASTA - formato de texto FASTA BLAST - formato de texto BLAST -nonorm Não realiza a normalização da classificação. -norm=<norm_name> Especifique o método de normalização. As opções válidas são: log - normalização do algoritmo. std - normalização padrão. stat - Método estatístico de Ervilharson Nota: os parâmetros "-nonorm" e "-norm" não podem ser utilizados juntos. Nota: Parâmetros -xgapop, -xgapext, -fgapop, -fgapext, -ygapop, - ygapext, -delop e -delext se aplicam somente a FRAME+. -xgapop=<n> A penalidade para a abertura de uma lacuna ao inserir um codão (triplo). 0 padrão é 12,0. -xgapext=<n> A penalidade para a extensão de uma lacuna ao inserir um codão (triplo). 0 padrão é 4,0. -ygapop=<n> A penalidade para a abertura de uma lacuna ao excluir um aminoácido. O padrão é 12,0.

-ygapext=<n> A penalidade para a extensão de uma lacuna ao excluir um aminoácido. O padrão é 4,0. -fgapop=<n> A penalidade para a abertura de uma lacuna ao inserir uma base de DNA. 0 padrão é 6,0. -fgapext=<n> A penalidade para a extensão de uma lacuna ao inserir uma base de DNA. 0 padrão é 7,0. -delop=<n> A penalidade para a abertura de uma lacuna ao excluir uma base de DNA. 0 padrão é 6,0. -delext=<n> A penalidade para a extensão de uma lacuna ao excluir uma base de DNA. 0 padrão é 7,0. -silent Nenhuma saída para a tela é produzida. -host=<host_name> 0 nome do organizador sobre o qual o servidor funciona. Por padrão, a aplicação usa um organizador específico no arquivo $CGNROOT/cgnhosts. -wait Não acesse o segundo plano quando o dispositivo estiver ocupado. Esta opção não é relevante para o pseudodispositivo Parseq ou Soft. -batch Execute o trabalho em segundo plano. Quando esta opção for específica, o arquivo "$CGNROOT/defaults/batch.defaults" é utilizado para escolher o comando batch. Se o arquivo não existir, o comando "at now" é utilizado para executar o trabalho.

Nota: Os parâmetros "-batch" e "-wait" são mutuamente exclusivos. -version Imprime o número de versão do software. -help Exibe esta mensagem de ajuda. Para ajuda mais específica digite: 'som -model=<model_fname> - help".

[00170] De acordo com algumas aplicações, a homologia é uma homologia local ou uma identidade local.

[00171] As ferramentas de algoritmo local incluem, mas não são limitadas ao software BlastP, BlastN, BlastX ou TBLASTN do Centro Nacional de Informação de Biotecnologia (NCBI), FASTA e o algoritmo de Smith-Waterman.

[00172] Uma pesquisa tblastn permite a comparação entre uma sequência de proteína e as traduções de seis estruturas de uma base de dados de nucleotídeos. Pode ser uma maneira bastante produtiva de encontrar regiões codificadas de proteína homóloga em sequências de nucleotideos não anotadas, tais como as etiquetas de sequências expressas [ESTs I expressed sequence tags] e projetos de registros do genoma [HTG I draft genome records], localizados nas bases de dados BLAST est e htgs, respectivamente.

[00173] Os parâmetros padrões para o blastp incluem: Sequências de alvo máximo: 100; Limite esperado: e- 5; Tamanho da palavra: 3: Correspondências máximas em uma faixa de consulta: 0; Parâmetros de classificação: Matriz - BLOSUM62; filtros e camuflagem: Filtro - regiões de baixa complexidade.

[00174] Ferramentas de alinhamento local que podem ser utilizadas incluem, mas não são limitadas ao algoritmo tBLASTX, que compara os produtos de tradução conceitua) de seis estruturas de uma sequência de consultas de nucleotídeos (ambas as vertentes) contra uma base de dados de sequência de proteína. Os parâmetros padrões incluem: Sequências de alvo máximo: 100; Limite esperado: 10; Tamanho da palavra: 3: Correspondências máximas em uma faixa de consulta: 0; Parâmetros de classificação: Matriz - BLOSUM62; filtros e camuflagem: Filtro - regiões de baixa complexidade.

[00175] De acordo com algumas aplicações da invenção, o polinucleotídeo exógeno da invenção codifica um polipeptídeo tendo uma sequência de aminoácidos de, pelo menos, 80%, pelo menos 81%, pelo menos 82%, pelo menos 83%, pelo menos 84%, pelo menos 85%, pelo menos 86%, pelo menos 87%, pelo menos 88%, pelo menos 89%, pelo menos 90%, pelo menos 91%, pelo menos 92%, pelo menos 93%, pelo menos 94%, pelo menos 95%, pelo menos 96%, pelo menos 97%, pelo menos 98%, pelo menos 99% ou, digamos, 100% idêntica à sequência de aminoácidos selecionada a partir do grupo consistente de ID SEQ. N° 496-794, 2898-3645, 3647-4854 e 4855.

[00176] De acordo com algumas aplicações da invenção, o polinucleotídeo exógeno da invenção codifica um polipeptídeo tendo uma sequência de aminoácidos selecionada do grupo consistindo das ID. SEQ. N° 496-794, 2898-4854 e

4855.

[00177] De acordo com algumas aplicações da invenção, o método para aumentar a eficiência no uso de fertilizante, eficiência no uso de nitrogênio, produção, biomassa, taxa de crescimento, vigor, teor de óleo, produção de fibra, qualidade da fibra, comprimento da fibra, capacidade fotossintética e/ou tolerância ao estresse abiótico de uma planta é efetuado ao expressar dentro da planta um polinucleotídeo exógeno, compreendendo uma sequência de ácido nucleico que codifica um polipeptídeo, pelo menos cerca de 80%, pelo menos cerca de 81%, pelo menos cerca de 82%, pelo menos cerca de 83%, pelo menos cerca de 84%, pelo menos cerca de 85%, pelo menos cerca de 86%, pelo menos cerca de 87%, pelo menos cerca de 88%, pelo menos cerca de 89%, pelo menos cerca de 90%, pelo menos cerca de 91%, pelo menos cerca de 92%, pelo menos cerca de 93%, pelo menos cerca de 94%, pelo menos cerca de 95%, pelo menos cerca de 96%, pelo menos cerca de 97%, pelo menos cerca de 98%, pelo menos cerca de 99%, ou, digamos, 100% idêntica à sequência de aminoácidos selecionada do grupo consistindo das ID SEQ. N° 496-794, 2898-3645, 3647- 4854 e 4855, aumentando, desta forma, a eficiência no uso de fertilizante, eficiência no uso de nitrogênio, produção, biomassa, taxa de crescimento, vigor, teor de óleo, produção de fibra, qualidade da fibra, comprimento da fibra, capacidade fotossintética e/ou tolerância ao estresse abiótico de uma planta.

[00178] De acordo com algumas aplicações da invenção, o polinucléotídeo exógeno codifica um polipeptídeo consistindo de uma sequência de aminoácidos estabelecida pelas ID SEQ. N° 496-794, 2898-4854 ou 4855.

[00179] De acordo com um aspecto de algumas aplicações da invenção, o método para aumentar a eficiência no uso de fertilizante, eficiência no uso de nitrogênio, produção, biomassa, taxa de crescimento, vigor, teor de óleo, produção de fibra, qualidade da fibra, comprimento da fibra, capacidade fotossintética e/ou tolerância ao estresse abiótico de uma planta é efetuado expressando dentro da planta de um polinucleotídeo exógeno compreendendo uma sequência de ácido nucleico que codifica um polipeptídeo compreendendo urna sequência de aminoácidos selecionada de um grupo consistindo das ID SEQ. N° 496-794, 2898-4854 e 4855, aumentando, desta forma, a eficiência no uso de fertilizante, eficiência no uso de nitrogênio, produção, biomassa, taxa de crescimento, vigor, teor de óleo, produção de fibra, qualidade da fibra, comprimento da fibra, capacidade fotossintética e/ou tolerância ao estresse abiótico da planta.

[00180] De acordo com um aspecto de algumas aplicações da invenção, é fornecido um método para aumentar a eficiência no uso de fertilizante, eficiência no uso de nitrogênio, produção, biomassa, taxa de crescimento, vigor, teor de óleo, produção de fibra, qualidade da fibra, comprimento da fibra, capacidade fotossintética e/ou tolerância ao estresse abiático de uma planta, compreendendo expressar dentro da planta um polinucleotídeo exógeno compreendendo uma sequência de ácido nucleico que codifica um polipeptídeo selecionado de um grupo consistindo das ID SEQ.

N° 496-794, 2898-4854 e 4855, aumentando, desta forma, a eficiência no uso de fertilizante, eficiência no uso de nitrogênio, produção, biomassa, taxa de crescimento, vigor, teor de óleo, produção de fibra, qualidade da fibra, comprimento da fibra, capacidade fotossintética e/ou tolerância ao estresse abiótico da planta.

[00181] De acordo com algumas aplicações da invenção, o polinucleotídeo exógeno codifica um polipeptídeo consistindo na sequência de aminoácidos estabelecida pelas ID SEQ. N° 496-794, 2898-4854 ou 4855.

[00182] De acordo com algumas aplicações da invenção, o polinucleotídeo exógeno compreende uma sequência de ácido nucleico que é, pelo menos cerca de 80%, pelo menos cerca de 81%, pelo menos cerca de 82%, pelo menos cerca de 83%, pelo menos cerca de 84%, pelo menos cerca de 85%, pelo menos cerca de 86%, pelo menos cerca de 87%, pelo menos cerca de 88%, pelo menos cerca de 89%, pelo menos cerca de 90%, pelo menos cerca de 91%, pelo menos cerca de 92%, pelo menos cerca de 93%, pelo menos cerca de 93%, pelo menos cerca de 94%, pelo menos cerca de 95%, pelo menos cerca de 96%, pelo menos cerca de 97%, pelo menos cerca de 98%, pelo menos cerca de 99%, p.ex., 100% idêntica à sequência de ácido nucleico selecionada a partir do grupo que consiste das ID SEQ. N° 1- 495, 795-2896 e 2897.

[00183] De acordo com um aspecto de algumas aplicações da invenção, é fornecido um método para aumentar a eficiência no uso de fertilizante, eficiência no uso de nitrogênio, produção, biomassa, taxa de crescimento, vigor, teor de óleo, produção de fibra, qualidade da fibra, comprimento da fibra, capacidade fotossintética e/ou tolerância ao estresse abiótico de uma planta, compreendendo expressar dentro da planta um polinucleotídeo exógeno compreendendo uma sequência de ácido nucleico, pelo menos cerca de 80%, pelo menos cerca de 81%, pelo menos cerca de 82%, pelo menos cerca de 83%, pelo menos cerca de 84%, pelo menos cerca de 85%, pelo menos cerca de 86%, pelo menos cerca de 87%, pelo menos cerca de 88%, pelo menos cerca de 89%, pelo menos cerca de 90%, pelo menos cerca de 91%, pelo menos cerca de 92%, pelo menos cerca de 93%, pelo menos cerca de 93%, pelo menos cerca de 94%, pelo menos cerca de 95%, pelo menos cerca de 96%, pelo menos cerca de 97%, pelo menos cerca de 98%, pelo menos cerca de 99%, p.ex., 100% idêntica sequência de ácido nucleico selecionado do grupo consistindo das ID SEQ. N° 1-495, 795-2896 e 2897, aumentando, desta forma, a eficiência no uso de fertilizante, eficiência no usa de nitrogênio, produção, biomassa, taxa de crescimento, vigor, teor de óleo, produção de fibra, qualidade da fibra, comprimento da fibra, capacidade fotossintética e/ou tolerância ao estresse abiótico da planta.

[00184] De acordo com algumas aplicações da invenção, o polinucleotídeo exógeno é, pelo menos cerca de 80%, pelo menos cerca de 81%, pelo menos cerca de 82%, pelo menos cerca de 83%, pelo menos cerca de 84%, pelo menos cerca de 85%, pelo menos cerca de 86%, pelo menos cerca de 87%, pelo menos cerca de 88%, pelo menos cerca de 89%, pelo menos cerca de 90%, pelo menos cerca de 91%, pelo menos cerca de 92%, pelo menos cerca de 93%, pelo menos cerca de 93%, pelo menos cerca de 94%, pelo menos cerca de 95%, pelo menos cerca de 96%, pelo menos cerca de 97%, pelo menos cerca de 98%, pelo menos cerca de 99%, p.ex., 100% idêntico ao polinucleotídeo selecionado do grupo consistindo das ID SEQ.

N° 1-495, 795-2896 e 2897.

[00185] De acordo com algumas aplicações da invenção, o polinucleotídeo exógeno é estabelecido pelas ID

SEQ. N° 1-495, 795-2896 ou 2897.

[00186] De acordo com algumas aplicações da presente invenção, o método para aumentar a eficiência no uso de fertilizantes, eficiência no uso do nitrogênio, produção, taxa de crescimento, biomassa, vigor, teor de óleo, produção de sementes, produção de fibra, qualidade da fibra, comprimento da fibra, capacidade fotossintética e/ou tolerância ao estresse abiótico de uma planta, compreende, ainda, selecionar uma planta com um aumento da eficiência no uso de fertilizantes, eficiência no uso do nitrogênio, produção, taxa de crescimento, biomassa, vigor, teor de óleo, produção de sementes, produção de fibra, qualidade da fibra, comprimento da fibra, capacidade fotossintética e/ou tolerância ao estresse abiótico se comparada a uma planta do tipo selvagem da mesma espécie que é cultivada nas mesmas condições de cultivo.

[00187] Deve-se notar que a seleção de uma planta transformada, tendo um aumento no trato se comparada a uma planta nativa (p.ex., não transformada) cultivada nas mesmas condições de cultivo, é realizada selecionando para o trato, p.ex., validando a capacidade da planta transformada em exibir um aumento do trato, ensaios bem conhecidos (p.ex., análises de plântula, ensaios de estufa), conforme será posteriormente descrito.

[00188] De acordo com um aspecto de algumas aplicações da presente invenção, é fornecido um método de seleção de uma planta transformada, tendo um aumento da eficiência no uso de fertilizantes, eficiência no uso do nitrogênio, produção, taxa de crescimento, biomassa, vigor,

teor de óleo, produção de semente, produção da fibra,

qualidade da fibra, comprimento da fibra, capacidade fotossintética e/ou tolerância ao estresse abiótico se comparada a uma planta do tipo selvagem da mesma espécie cultivada sob as mesmas condições de cultivo, o método compreendendo:

(a) fornecer plantas transformadas com um polinucleotídeo exógeno que codifica um polipeptídeo, compreendendo uma sequência de aminoácidos, pelo menos cerca de 80%, pelo menos cerca de 81%, pelo menos cerca de 82%, pelo menos cerca de 83%, pelo menos cerca de 84%, pelo menos cerca de 85%, pelo menos cerca de 860, pelo menos cerca de 87%, pelo menos cerca de 88%, pelo menos cerca de 89%, pelo menos cerca de 90%,

pelo menos cerca de 91%, pelo menos cerca de 92%, pelo menos cerca de 93%, pelo menos cerca de 93%, pelo menos cerca de

94%, pelo menos cerca de 95%, pelo menos cerca de 96%, pelo menos cerca de 97%, pelo menos cerca de 98%, pelo menos cerca de 99%, p.ex., 100% homóloga (p.ex., tendo uma similaridade de sequência ou identidade de sequência) à sequência de aminoácidos selecionada do grupo consistindo nas ID SEQ.

N° 496-794, 2898-3645, 3647-4854 e 4855,

(b) selecionar, a partir das plantas, uma planta tendo aumento de eficiência no uso de fertilizantes, eficiência no uso do nitrogênio, produção, taxa de crescimento, biomassa, vigor,

teor de óleo, produção de semente, produção da fibra,

qualidade da fibra, comprimento da fibra, capacidade fotossintética e/ou tolerância ao estresse abiótico,

selecionado, desse modo, a planta tendo aumento da eficiência no uso de fertilizantes, eficiência no uso do nitrogênio, produção, taxa de crescimento, biomassa, vigor, teor de óleo, produção de semente, produção da fibra, qualidade da fibra, comprimento da fibra, capacidade fotossintética e/ou tolerância ao estresse abiótico se comparada a uma planta do tipo selvagem da mesma espécie que ë cultivada sob as mesmas condições de cultivo.

[00189] De acordo com um aspecto de algumas aplicações da presente invenção, é fornecido um método de seleção de uma planta transformada, tendo um aumento da eficiência no uso de fertilizantes, eficiência no uso do nitrogênio, produção, taxa de crescimento, biomassa, vigor, teor de óleo, produção de semente, produção da fibra, qualidade da fibra, comprimento da fibra, capacidade fotossintética e/ou tolerância ao estresse abiótico se comparada a uma planta do tipo selvagem da mesma espécie cultivada sob as mesmas condições de cultivo, o método compreendendo: (a) fornecer plantas transformadas com um polinucleotideo exógeno que codifica um polipeptídeo, compreendendo uma sequência de aminoácidos, pelo menos cerca de 80%, pelo menos cerca de 81%, pelo menos cerca de 82%, pelo menos cerca de 83%, pelo menos cerca de 84%, pelo menos cerca de 85%, pelo menos cerca de 86%, pelo menos cerca de 87%, pelo menos cerca de 88%, pelo menos cerca de 89%, pelo menos cerca de 90%, pelo menos cerca de 91%, pelo menos cerca de 92%, pelo menos cerca de 93%, pelo menos cerca de 93%, pelo menos cerca de

94%, pelo menos cerca de 95%, pelo menos cerca de 96%, pelo menos cerca de 97%, pelo menos cerca de 98%, pelo menos cerca de 99%, p.ex., 100% idêntica à sequência de ácido nucleico selecionada do grupo consistindo nas ID SEQ. 1-495, 795-2896 e 2897, (b) selecionar, a partir das referidas plantas, uma planta tendo aumento de eficiência no uso de fertilizantes, eficiência no uso do nitrogênio, produção, taxa de crescimento, biomassa, vigor, teor de óleo, produção de semente, produção da fibra, qualidade da fibra, comprimento da fibra, capacidade fotossintética e/ou tolerância ao estresse abiótico, selecionado, desse modo, a planta tendo aumento da eficiência no uso de fertilizantes, eficiência no uso do nitrogênio, produção, taxa de crescimento, biomassa, vigor, teor de óleo, produção de semente, produção da fibra, qualidade da fibra, comprimento da fibra, capacidade fotossintética e/ou tolerância ao estresse abiótico se comparada a uma planta do tipo selvagem da mesma espécie que é cultivada sob as mesmas condições de cultivo.

[00190] Conforme utilizado aqui, o termo "polinucleotídeo" refere-se a uma sequência de ácido nucleico de fita simples ou dupla que é isolado e fornecido na forma de uma sequência de RNA, uma sequência de polinucleotídeo complementar (cDNA), uma sequência genômica de polinucleotídeo e/ou uma sequência polinucleotídeo composta (p.ex., uma combinação das sequências acima).

[00191] 0 termo "isolado(a)" refere-se a pelo menos parcialmente separado(a) do ambiente natural, p.ex., de uma célula da planta.

[00192] Conforme utilizada aqui, a expressão "sequência de polinucleotídeo complementar" refere-se a uma sequência que resulta da transcrição reversa de RNA mensageiro utilizando a transcriptase reversa ou qualquer outra polimerase de DNA dependente de RNA. Essa sequência pode ser amplificada subsequentemente in vivo ou in vitro utilizando uma polimerase de DNA dependente de DNA.

[00193] Conforme utilizada aqui, a expressão "sequência genômica de polinucleotídeo" refere-se a uma sequência derivada (isolada) de um cromossomo e, dessa forma, representa uma porção contígua de um cromossomo.

[00194] Conforme utilizada aqui, a expressão "sequência de polinucleotídeo composta" refere-se a uma sequência que seja pelo menos parcialmente complementar e pelo menos parcialmente genômica. A sequência composta pode incluir algumas sequências exonais necessárias para codificar o polipeptídeo da presente invenção, bem como algumas sequências intrônicas interpostas entre si. As sequências intrônicas podem ser de qualquer fonte, incluindo outros genes e, tipicamente, incluirão sequências de sinais entrelaçados preservadas. Essas sequências intrônicas podem incluir, ainda, elementos reguladores da expressão cis-atuantes.

[00195] As sequências de ácido nucleico que codificam os polipeptídeos da presente invenção podem ser otimizadas para expressão. Exemplos dessas modificações de sequências incluem, mas não se limitam a um teor de G/C alterado de uma abordagem mais cuidadosa do que aquela comumente encontrada nas espécies de plantas de interesse e à remoção de códons atipicamente encontrados nas espécies de plantas comumente chamada de otimização de códons.

[00196] A expressão "otimização de códons" refere- se à seleção de nucleotídeos de DNA apropriados para a utilização dentro de um gene estrutural ou fragmento dele que aborde a utilização do códon dentro da planta de interesse.

Portanto, um gene otimizado ou sequência de ácido nucleico refere-se a um gene no qual a sequência de nucleotídeo de um gene nativo ou que ocorra naturalmente tenha sido modificado a fim de utilizar códons estatisticamente preferidos ou estatisticamente favorecidos dentro da planta. Tipicamente, a sequência de nucleotídeo é examinada no nível do DNA e na região de codificação otimizada para expressão na espécie vegetal determinada utilizando qualquer procedimento adequado, p.ex., conforme descrito em Sardana et al. (1996, Plant Cell Reports 15:677-681). Nesse método, o desvio padrão de utilização do códon, uma medida da tendência de utilização do códon, pode ser calculado descobrindo primeiramente o quadrado do desvio proporcional de utilização de cada códon do gene nativo em relação àquele de genes de plantas altamente expressos, seguido por um cálculo do quadrado do desvio médio.

A fórmula utilizada é: 1 SDCU = n = 1 N [(Xn - Yn) /Yn] 2/N, onde Xn refere-se à frequência de utilização do códon n em genes de plantas altamente expressos, onde Yn refere-se à frequência de utilização do códon n no gene e interesse e N refere-se ao número total de códons no gene de interesse. Uma Tabela de utilização de códons de genes altamente expressos de dicotiledõneas está compilada utilizando os dados de Murray et al. (1989, Nuc AcIDs Res. 17:477-498).

[00197] Um método para otimizar a sequência de ácido nucleico de acordo com a utilização preferido do códon para um tipo de célula de planta particular é com base na utilização direto, sem realizar quaisquer cálculos estatísticos extras, de Tabelas de otimização de códons como aquelas disponíveis online na Base de Dados de utilização de Códons através do banco de DNA do NIAS (National Institute of Agrobiological Sciences Instituto Nacional de Ciências Agrobiológicas) no Japão (kazusa (ponto) ou (ponto) jp/codon/). A Base de Dados de utilização de Códons contém tabelas de utilização de códons para diversas espécies diferentes, com cada Tabela de utilização de códons tendo sido estatisticamente determinada com base nos dados presentes no Genbank.

[00198] Utilizando as Tabelas acima para determinar os códons mais preferidos ou mais favorecidos de cada aminoácido em uma espécie particular (p.ex., arroz), uma sequência de nucleotídeo que ocorre naturalmente e que codifica uma proteína de interesse pode ter o códon otimizado para aquela espécie de planta particular. Isso é efetuado substituindo os códons que possam ter uma incidência estatística baixa no genoma da espécie particular com códons correspondentes, em relação a um aminoácido, que sejam estatisticamente mais favorecidos. No entanto, um ou mais códons menos favorecidos podem ser selecionados para excluir sítios de restrição existentes, para criar novos em uniões potencialmente úteis (terminais 5' e 3' para adicionar o peptídeo sinal ou cassetes de terminação, sítios internos que possam ser utilizados para cortar e reunir segmentos para produzir uma sequência de comprimento total correta), ou para eliminar sequências de nucleotídeo que possam afetar negativamente a estabilidade ou a expressão do mRNA.

[00199] A sequência de nucleotídeo codificador que ocorre naturalmente já pode, antes de qualquer modificação, conter um número de códons que corresponda a um códon estatisticamente favorecido em uma espécie de planta particular. Portanto, a otimização do códon da sequência de nucleotídeo nativa pode compreender a determinação quais códons, dentro da sequência de nucleotídeo nativo, não são estatisticamente favorecidos com relação a uma planta particular e modificar esses códons de acordo com uma tabela de utilização de códons da planta particular para produzir um derivado do códon otimizado. Uma sequência de nucleotídeo modificado pode ser total ou parcialmente otimizada para a utilização do códon da planta desde que a proteína codificada pela sequência de nucleotídeo modificado seja produzida em um nível maior do que a proteína codificada pelo gene correspondente que ocorre naturalmente ou nativo. A estrutura de genes sintéticos alterando a utilização do códon é descrita, p.ex., no Pedido de Patente PCT (Patent Cooperation TreatylTratado de Cooperação em Matéria de Patentes) 93/07278.

[00200] De acordo com algumas aplicações da invenção, o polinucleotídeo exógeno é um RNA não codificador.

[00201] Conforme utilizada aqui, a expressão "RNA não codificador" refere-se a uma molécula de RNA que não codifica uma sequência de aminoácidos (um polipeptídeo).

Exemplos dessas moléculas de RNA não codificador incluem, mas não se limitam a um RNA antissentido, um pré-miRNA (precursor de um microRNA) ou um precursor de um RNA que interage com Piwi (piRNA).

[00202] Exemplos não limitantes de polinucleotídeos de RNA não codificados são fornecidos nas ID SEQ. N° 217, 218, 219, 287, 288, 495, 997, 1003, 1543 e 1703.

[00203] Dessa forma, a invenção abrange as sequências de ácido nucleico descritas acima, fragmentos delas, sequências hibridizantes encontradas nelas, sequências homólogas delas, sequências codificando polipeptideos semelhantes com diferentes utilizações de códons, sequências alteradas caracterizadas por mutações, como exclusão, introdução ou substituição de um ou mais nucleotídeos, ocorrendo naturalmente ou induzidos pelo homem, seja aleatoriamente ou da forma objetivada.

[00204] De acordo com algumas aplicações da invenção, o polinucleotídeo exógeno codifica um polipeptídeo, compreendendo uma sequência de aminoácidos, pelo menos 80%, pelo menos cerca de 81%, pelo menos cerca de 82%, pelo menos cerca de 83%, pelo menos cerca de 84%, pelo menos cerca de 85%, pelo menos cerca de 86%, pelo menos cerca de 87%, pelo menos cerca de 88%, pelo menos cerca de 89%, pelo menos cerca de 90%, pelo menos cerca de 91%, pelo menos cerca de 92%, pelo menos cerca de 93%, pelo menos cerca de 93%, pelo menos cerca de 94%, pelo menos cerca de 95%, pelo menos cerca de 96%, pelo menos cerca de 97%, pelo menos cerca de 98%, pelo menos cerca de 99%, p.ex., 100% idêntica à sequência de aminoácidos de uma planta cujo ortólogo ocorre naturalmente do polipeptídeo selecionado do grupo consistindo nas ID SEQ.

N° 496-794 e 2898-4855.

[00205] De acordo com algumas aplicações da invenção, o polipeptídeo compreende uma sequência de aminoácidos, pelo menos 80%, pelo menos cerca de 81%, pelo menos cerca de 82%, pelo menos cerca de 83%, pelo menos cerca de 84%, pelo menos cerca de 85%, pelo menos cerca de 86%, pelo menos cerca de 87%, pelo menos cerca de 88%, pelo menos cerca de 89%, pelo menos cerca de 90%, pelo menos cerca de 91%, pelo menos cerca de 92%, pelo menos cerca de 93%, pelo menos cerca de 93%, pelo menos cerca de 94%, pelo menos cerca de 95%, pelo menos cerca de 96%, pelo menos cerca de 97%, pelo menos cerca de 98%, pelo menos cerca de 99%, p.ex., 100% idêntica à sequência de aminoácidos de uma planta cujo ortólogo ocorre naturalmente do polipeptídeo selecionado do grupo consistindo nas ID SEQ. N° 496-794 e 2898-4855.

[00206] A invenção fornece um polinucleotídeo isolado, compreendendo uma sequência de ácido nucleico, pelo menos cerca de 80%, pelo menos cerca de 81%, pelo menos cerca de 82%, pelo menos cerca de 83%, pelo menos cerca de 84%, pelo menos cerca de 85%, pelo menos cerca de 86%, pelo menos cerca de 87%, pelo menos cerca de 88%, pelo menos cerca de 89%, pelo menos cerca de 90%, pelo menos cerca de 91%, pelo menos cerca de 92%, pelo menos cerca de 93%, pelo menos cerca de 93%, pelo menos cerca de 94%, pelo menos cerca de 95%, pelo menos cerca de 96%, pelo menos cerca de 97%, pelo menos cerca de 98%, pelo menos cerca de 99%, p.ex., 100% idêntica ao polinucleotídeo selecionado a partir do grupo consistindo das ID SEQ. N° 1-495, 795-2896 e 2897.

[00207] De acordo com algumas aplicações da invenção, a sequência de ácido nucleico é capaz de aumentar a eficiência no uso de nitrogênio, eficiência no uso de fertilizante, teor de óleo, produção, taxa de crescimento, vigor, biomassa, produção de fibra, qualidade da fibra, comprimento da fibra, capacidade fotossintética, tolerância ao estresse abiótico e/ou eficiência no uso da água de uma planta.

[00208] De acordo com algumas aplicações da invenção, o polinucleotideo isolado, compreendendo uma sequência de ácido nucleico, é selecionado do grupo consistindo nas ID SEQ. N° 1-495, 795-2896 e 2897.

[00209] De acordo com algumas aplicações da invenção, o polinucleotídeo isolado é estabelecido pelas ID SEQ. N° 1-495, 795-2896 ou 2897.

[00210] A invenção fornece um polinucleotídeo isolado, compreendendo uma sequência de ácido nucleico que codifica um polipeptídeo que compreende uma sequência de aminoácidos, pelo menos cerca de 80%, pelo menos cerca de 81%, pelo menos cerca de 82%, pelo menos cerca de 83%, pelo menos cerca de 84%, pelo menos cerca de 85%, pelo menos cerca de 86%, pelo menos cerca de 87%, pelo menos cerca de 88%, pelo menos cerca de 89%, pelo menos cerca de 90%, pelo menos cerca de 91%, pelo menos cerca de 92%, pelo menos cerca de 93%, pelo menos cerca de 93%, pelo menos cerca de 94%, pelo menos cerca de 95%, pelo menos cerca de 96%, pelo menos cerca de 97%, pelo menos cerca de 98%, pelo menos cerca de 99%, ou, digamos, 100% homóloga à sequência de aminoácidos selecionada do grupo que consiste das ID SEQ. N° 496-794, 2898-3645, 3647- 4854 e 4855.

[00211] De acordo com algumas aplicações da invenção, a sequência de aminoácidos é capaz de aumentar a eficiência no uso de nitrogênio, eficiência no uso de fertilizante, teor de óleo, produção, taxa de crescimento, vigor, biomassa, produção de fibra, qualidade da fibra, comprimento da fibra, capacidade fotossintética, tolerância ao estresse abiótico e/ou eficiência no uso de água de uma planta.

[00212] A invenção fornece um polinucleotídeo isolado, compreendendo uma sequência de ácido nucleico que codifica um polipeptídeo, compreendendo a sequência de aminoácidos selecionada do grupo consistindo das ID SEQ. N° 496-794, 2898-4854 e 4855.

[00213] De acordo com um aspecto de algumas aplicações da invenção, é fornecida uma estrutura de ácido nucleico, compreendendo o polinucleotídeo isolado da invenção e um promotor para direcionar a transcrição da sequência de ácido nucleico em uma célula hospedeira.

[00214] A invenção fornece um polipeptídeo isolado, compreendendo uma sequência de aminoácidos, pelo menos cerca de 80%, pelo menos cerca de 81%, pelo menos cerca de 82%, pelo menos cerca de 83%, pelo menos cerca de 84%, pelo menos cerca de 85%, pelo menos cerca de 86%, pelo menos cerca de 87%, pelo menos cerca de 88%, pelo menos cerca de 89%, pelo menos cerca de 90%, pelo menos cerca de 91%, pelo menos cerca de 92%, pelo menos cerca de 93%, pelo menos cerca de 93%, pelo menos cerca de 94%, pelo menos cerca de 95%, pelo menos cerca de 96%, pelo menos cerca de 97%, pelo menos cerca de 98%, pelo menos cerca de 99%, ou, digamos, 100% homóloga a uma sequência de aminoácidos selecionada do grupo consistindo nas ID SEQ. N° 496-794, 2898-3645, 3647-4854 e

4855.

[00215] De acordo com algumas aplicações da invenção, o polipeptídeo compreendendo uma sequência de aminoácidos é selecionado do grupo que consiste das ID SEQ.

N° 496-794, 2898-4854 e 4855.

[00216] De acordo com algumas aplicações da invenção, o polipeptídeo é estabelecido pelas ID SEQ. N° 496- 794, 2898-4854 ou 4855.

[00217] A invenção também abrange fragmentos dos polipeptídeos descritos acima e de polipeptídeos apresentando mutações, como exclusões, introduções ou substituições de um ou mais aminoácidos, ocorrendo naturalmente ou induzido pelo homem, seja aleatoriamente ou da forma objetivada.

[00218] O termo "planta", conforme utilizado aqui, abrange plantas integrais, plantas enxertadas, ancestrais e progênies de plantas e partes da planta, incluindo sementes, brotos, caules, raízes (incluindo os tubérculos) , rizomas, enxertos e células, tecidos e órgãos da planta. A planta pode estar em qualquer forma, incluindo culturas em suspensão,

embriões, regiões meristemáticas, tecido caloso, folhas,

gametófitos, esporófitos, pólen e micrósporos.

Plantas que são particularmente úteis nos métodos da invenção incluem todas as plantas que pertencem à superfamília Viridiplantae,

em particular as monocotiledôneas e as dicotiledõneas,

incluindo uma forragem ou leguminosa forrageira, planta ornamental, cultura alimentar, árvore ou arbusto selecionado da lista que compreende Acacia spp., Acer spp., Actinidia spp., Aesculus spp., Agathis australis, Albizia amara,

Alsophila tricolor, Andropogon spp., Arachis spp, Areca catechu, Astelia fragrans, Astragalus cicer, Baikiaea plurijuga, Betula spp., Brassica spp., Bruguiera gymnorrhiza,

Burkea africana, Buchá frondosa, Cadaba farinosa, Calliandra spp, Camellia sinensis, Canna indica, Capsicum spp., Cassia spp., Centroema pubescens, Chacoomeles spp., Cinnamomum cassia, Coffea arabica, Colophospermum mopane, Coronillia varia, Cotoneaster serotina, Crataegus spp., Cucumis spp.,

Cupressus spp., Cyathea dealbata, Cydonia oblonga,

Cryptomeria japonica, Cymbopogon spp., Cynthea dealbata,

Cydonia oblonga, Dalbergia monetaria, Davallia divaricata, Desmodium spp., Dicksonia squarosa, Dibeteropogon amplectens,

Dioclea spp, Dolichos spp., Dorycnium rectum, Echinochloa pyramidalis, Ehraffia spp., Eleusine coracana, Eragrestis spp., Erythrina spp., Eucalypfus spp., Euclea schimperi,

Eulalia vi/losa, Pagopyrum spp., Feijoa sellowlana, Fragaria spp., Flemingia spp, Freycinetia banksli, Geranium thunbergii, GinAgo biloba, Glycine javanica, Gliricidia spp,

Gossypium hirsutum, Grevillea spp., Guibourtia coleosperma, Hedysarum spp., Hemaffhia altissima, Heteropogon contoffus,

Hordeum vulgare, Hyparrhenia rufa, Hypericum erectum,

Hypeffhelia dissolute, Indigo incamata, Iris spp.,

Leptarrhena pyrolifolia, Lespediza spp., Lettuca spp.,

Leucaena leucocephala, Loudetia simplex, Lotonus bainesli,

Lótus spp., Macrotyloma axillare, Malus spp., Manihot esculenta, Medicago saliva, Metasequoia glyptostroboides,

Musa sapientum, Nicotianum spp., Onobrychis spp., Ornithopus spp., Oryza spp., Peltophorum africanum, Pennisetum spp.,

Persea gratissima, Petunia spp., Phaseolus spp., Phoenix canariensis, Phormium cookianum, Photinia spp., Picea glauca, Pinus spp., Pisum sativam, Podocarpus totara, Pogonarthria fleckii, Pogonaffhria squarrosa, Populus spp., Prosopis cineraria, Pseupontosuga menziesii, Pterolobium stellatum,

Pyrus communis, Quercus spp., Rhaphiolepsis umbellata,

Rhopalostylis sapida, Rhus natalensis, Ribes grossularia,

Ribes spp., Robinia pseudoacacia, Rosa spp., Rubus spp., Salix spp., Schyzachyrium sariguineum, Sciadopitys vefficillata,

Sequoia sempervirens, Sequoiadendron giganteum, Sorgo bicolor, Spinacia spp., Sporobolus fimbriatus, Stiburus alopecuroides, Stylosanthos humilis, Tadehagi spp, Taxodium distichum, Themeda triandra, Trifolium spp., Triticum spp.,

Tsuga heterophylla, Vaccinium spp., Vicia spp., Vitis vinífera, Watsonia pyramidata, Zantedeschia aethiopica, Zea mays, amaranto, alcachofra, aspargos, brócolis, couve de

Bruxelas, couve, canola, cenouras, couve-flor, aipo, couve-

manteiga, linho, couve crespa, lentilha, colza, quiabo,

cebola, batata, arroz, soja, palha, beterraba, cana de açúcar, girassol, tomate, chá de abóbora, milho, trigo, cevada, centeio, aveia, amendoim, ervilhas, lentilha e alfafa, algodão, colza, canola, pimenta, girassol, tabaco, berinjela eucalipto, uma árvore, uma planta ornamental, uma grama perene e uma cultura forrageira. Alternativamente, algas e outras não-Viridiplantae podem ser utilizadas para os métodos da presente invenção.

[00219] De acordo com algumas aplicações da invenção, a planta utilizada pelo método da invenção é uma planta de cultura como o arroz, milho, trigo, cevada, amendoim, batata, gergelim, oliveira, óleo de palma, banana, soja, girassol, canola, cana de açúcar, alfafa, painço, leguminosas (feijão, ervilha), linho, lupinus, colza, tabaco, choupo e algodão.

[00220] De acordo com algumas aplicações da invenção, a planta é uma planta dicotiledânea.

[00221] De acordo com algumas aplicações da invenção, a planta é uma planta monocotiledônia.

[00222] De acordo com algumas aplicações da invenção, apresenta-se uma célula vegetal expressando de forma exógena o polinucleotídeo de algumas aplicações da invenção, a estrutura de ácido nucleico de algumas aplicações da invenção e/ou o polipeptídeo de algumas aplicações da invenção.

[00223] De acordo com algumas aplicações da invenção, a expressão do polinucleotídeo exógeno da invenção dentro da planta é afetada pela transformação de uma ou mais células da planta com o polinucleotídeo exógeno, seguida pela geração de uma planta madura a partir das células transformadas e cultivando a planta madura sob condições adequadas para expressar o polinucleotídeo exógeno dentro da planta madura.

[00224] De acordo com algumas aplicações da invenção, a transformação é efetuada pela introdução de uma estrutura de ácido nucleico na célula da planta que inclua o polinucleotídeo exógeno de algumas aplicações da invenção e pelo menos um promotor para orientar a transcrição do polinucleotídeo exógeno em uma célula hospedeira (uma célula vegetal). Detalhes adicionais de abordagens de transformação adequadas são apresentadas abaixo.

[00225] Conforme mencionado, a estrutura de ácido nucleico, de acordo com algumas aplicações da invenção, compreende uma sequência promotora e o polinucleotídeo isolado, de acordo com algumas aplicações da invenção.

[00226] De acordo com algumas aplicações da invenção, o polinucleotídeo isolado está operacionalmente ligado à sequência promotora.

100227] Uma sequência de ácido nucleico codificadora é "operacionalmente ligada" a uma sequência reguladora (p.ex., o promotor) se a sequência reguladora for capaz de exercer um efeito regulador sobre a sequência codificadora ligada a ela.

[00228] Conforme utilizado aqui, o termo "promotor" refere-se a uma região de DNA que fica a montante do sítio da inicial transcricional de um gene ao qual a RNA polimerase se liga para iniciar a transcrição do RNA. O promotor controla onde (p.ex., qual porção de uma planta) e/ou quando (p.ex., em que estágio ou condição no tempo de vida de um organismo) o gene é expresso.

[00229] De acordo com algumas aplicações da invenção, o promotor é heterólogo ao polinucleotídeo isolado e/ou à célula hospedeira. Conforme utilizado aqui, o termo "promotor heterólogo" refere-se a um promotor de uma espécie diferente ou da mesma espécie, mas de um lócus de gene diferente, a partir da sequência de plinucleotídeo isolado.

[00230] De acordo com algumas aplicações da invenção, o polinucleotídeo isolado é heterólogo à célula da planta.

[00231] Qualquer sequência adequada de promotor pode ser utilizada pela estrutura de ácido nucleico da presente invenção. Preferencialmente, o promotor é um promotor constitutivo, um promotor específico do tecido ou induzível ao estresse abiótico.

[00232] De acordo com algumas aplicações da invenção, o promotor é um promotor de planta que é adequado para expressão do polinucleotídeo exógeno em uma célula de planta.

[00233] Promotores adequados para expressão em trigo incluem, mas não se limitam a promotor SPA de trigo (ID SEQ. N° 4856; Albanietal, Plant Cell, 9: 171- 184, 1997, que é totalmente incorporado aqui por referência), trigo LMW [ID SEQ. N° 4857 (promotor mais longo LMW) e ID SEQ. N° 4858 (promotor LMW)] e glutenina-1 HMW [ID SEQ. N° 4859 (promotor mais longo glutenina-1 trigo LMW) e ID SEQ. N° 4860 (Promotor glutenina-1 trigo HMW); Thomas e Flavell, The Plant Cell 2:1171-1180; Furtado et al., 2009 Plant Biotechnology Journal 7:240-253, cada um é completamente incorporado aqui por referência] trigo alfa, beta e gama gliadinas [p.ex., SEQ ID NO: 4861 (trigo alfa gliadina, genoma B, promotor); ID SEQ.

N° 4862 (trigo gama gliadina promotor); EMBO 3:1490-15, 1984, que é totalmente incorporado aqui por referência] trigo TdPR60 [ID SEQ. N° 4863 (trigo TdPR60 promotor mais longo) ou ID SEQ.

N° 4864 (promotor do trigo TdPR60); Kovalchuk et al., Plant Mol Biol 71:81-98, 2009, que é totalmente incorporado aqui por referência], promotor do milho Ubl [cultivares Nongda 105 (ID SEQ. N° 4865); GenBank: DQ141598.1; Taylor et a1., Plant Cell Rep 1993 12: 491-495, que é totalmente incorporado aqui por referência), e cultivares B73 (ID SEQ. N° 4866); Christensen, AH, et al. Plant Mol. Biol. 18 (4), 675-689 (1992) , que é totalmente incorporado aqui por referência), arroz actina 1 (ID SEQ. N° 4867; Mc Elroy et al. 1990, The Plant Cell, Vol. 2, 163-171, que é totalmente incorporado aqui por referência), e arroz GOS2 [ID SEQ. N° 4868 (promotor mais longo do arroz GOS2) e ID SEQ. N° 4869 (Promotor do arroz GOS2); De Pater et al. Plant J. 1992 ; 2: 837-44, que é totalmente incorporado aqui por referência), Arabidopsis Phol [ID SEQ. N° 4870 (Promotor Phol de Arabidopsis); Hamburger et al., Plant Cell. 2002 ; 14: 889-902, que é totalmente incorporado aqui por referência), promotores ExpansinB, p.ex., arroz ExpB5 [ID SEQ. N° 4871 (promotor mais longo do arroz ExpBS) e SEQ ID NO: 4872 (promotor do arroz ExpB5) e

Cevada ExpB1 [ID SEQ. N° 4873 (promotor da cevada ExpBl), Won et al. Mol Cells. 2010; 30:369-76, que é totalmente incorporado aqui por referência), cevada SS2 (sacarose síntase 2) [(ID SEQ. N° 4874), Guerin e Carbonero, Plant Physiology May 1997 vol. 114 no. 1 55-62, que é totalmente incorporado aqui por referência], e arroz PG5a [ID SEQ. N° 4875, US 7.700.835, Nakase et al., Plant Mol Biol. 32:621-30, 1996, que é totalmente incorporado aqui por referência].

[00234] Promotores constitutivos adequados incluem, por exemplo, o promotor CaMV 35S [ID SEQ. N° 4876 (Promotor CaMV 35S (QFNC)); ID SEQ. N° 4877 (PJJ 35S de Brachypodium); ID SEQ. N° 4878 (Promtor CaMV 35S (OLD)) (Odell et al., Nature 313:810-812, 1985)], promotor At6669 Arabidopsis (ID SEQ. N° 4879 (Promotor Arabidopsis At6669 (OLD)); vide Publicação PCT N°. W004081173A2 ou o novo promotor At6669 (ID SEQ. N° 4880 (Promotor At6669 Arabidopsis (NOVO)); Promotor do milho Ubl [cultivares Nonada 105 (ID SEQ.

N° 4865); GenBank: DQ141598.1; Taylor et al., Plant Cell Rep 1993 12: 491-495, que é totalmente incorporado aqui por referência), e cultivares B73 (ID SEQ. N° 4866); Christensen, AH, et al. Plant Mol. Biol. 18 (4), 675-689 (1992), que é totalmente incorporado aqui por referência), arroz actina 1 (ID SEQ. NO 4867, McElroy et al., Plant Cell 2:163-171, 1990); pEMU (Last et al., Theor. Appl. Genet. 81:581-588, 1991); CaMV 19S (Nilsson et al., Physiol. Plant 100:456-462, 1997); arroz GOS2 [ID SEQ. N° 4868 (promotor mais longo do arroz GOS2) e ID SEQ. N° 4869 (Promotor do arroz GOS2); De Pater et al., Plant J Nov;2(6):837-44, 1992]; promotor RBCS (ID SEQ. N°

.. ~ .. ~ ~~ ~~, a.

+b'aArd.►w'.ar. ._ ~ - a.w~_ __ _ ._~. _ ....., -_ -- ,. z_-. _ ,,',►~., ey., .~~~._. ~ ~ .. _.r _ _ ~r .r_ _ ~~.!

4881); Ciclofilina do arroz (Bucholz et al, Plant Mol Biol.

25(5):837-43, 1994); histone H3 de milho (Lepetit et al, Mol.

Gen. Genet. 231: 276-285, 1992); Actina 2 (An et al, Plant J.

10(1);107-121, 1996) e Super MAS Sintético (Ni et al., The Plant Journal 7: 661-76, 1995). Outros promotores constitutivos incluem aqueles nas Patentes Americanas N°

5.659.026, 5.608.149, 5.608.144, 5.604.121, 5.569.597,

5.466.785, 5.399.680, 5.268.463 e 5.608.142.

[00235] Promotores adequados específicos de tecido incluem, mas não se limitam a promotores específicos de folha [p.ex., ATSG06690 (Thioredoxin) (expressão elevada, ID SEQ. N° 4882), AT5G61520 (AtSTP3) (expressão rebaixada, ID SEQ. N° 4883) descrito em Buttner et al 2000 Plant, Cell and Environment 23, 175-184, ou os promotores descritos em Yamamoto et al., Plant J. 12:255-265, 1997; Kwon et al., Plant Physiol. 105:357-67, 1994; Yamamoto et al., Plant Cell Physiol. 35:773-778, 1994; Gotor et al., Plant J. 3:509-18, 1993; Orozco et al., Plant Mol. Biol. 23:1129-1138, 1993; e Matsuoka et al., Proc. Natl. Acad. Sci. EUA 90:9586-9590, 1993; bem como o promotor STP3 Arabidopsis (AT5G61520) (Buttner et al., Plant, Cell and Environment 23:175-184, 2000)], promotores preferidos de semente [p.ex., Napin (originados da Brassica napus, sendo caracterizado por uma atividade promotora específica de semente; Stuitje A. R. et.

al. Plant Biotechnology Journal 1 (4): 301-309; ID SEQ. N°: 4884 (Promotor NAPIN Brassica napus) a partir dos genes específicos de semente (Simon, et al., Plant Mol. Biol. 5.

191, 1985; Scofield, et al., J. Biol. Chem. 262: 12202, 1987;

Baszczynski, et al., Plant Mol. Biol. 14: 633, 1990), arroz PG5a (ID SEQ. N° 4875; US 7.700.835), desenvolvimento precoce de sementes Arabidopsis BAN (AT1G61720) (ID SEQ. N° 4885, US 2009/0031450 Al), desenvolvimento tardio de sementes Arabidopsis ABI3 (AT3G24650) (ID SEQ. N° 4886 (Arabidopsis ABI3 (AT3G24650) Promotor mais longo) ou 4887 (Arabidopsis ABI3 (AT3G24650) Promotor)) (Ng et al., Plant Molecular Biology 54: 25-38, 2004), Albumina de castanha do Brasil (Pearson' et al., Plant Mol. Biol. 18: 235- 245, 1992), leguminosas (Ellis, et al. Plant Mol. Biol. 10: 203-214, 1988), Glutelina (arroz) (Takaiwa, et al., Mol. Gen. Genet.

208: 15-22, 1986; Takaiwa, et al., FEBS Letts. 221: 43-47, 1987), Zein (Matzke et al Plant Mol Biol, 143).323-32 1990), napA (Stalberg, et al, Planta 199: 515-519, 1996), SPA de trigo (ID SEQ. N° 4856; Albanietal, Plant Cell, 9: 171- 184, 1997), oleosina de girassol (Cummins, et al., Plant Mol. Biol.

19: 873- 876, 1992)], promotores específicos de endosperma [p.ex., trigo LMW (ID SEQ. N° 4857 (Trigo LMW Promotor mais longo), e ID SEQ. N° 4858 (promotor LMW de trigo)] e glutenina-1 HMW [ID SEQ. N° 4859 (promotor mais longo glutenina-Z LMW de trigo) e ID SEQ. N° 4860 (Promotor giutenina-1 HMW de trigo); Thomas e Flavell, The Plant Cell 2:1171-1180, 1990; Mol Gen Genet 216:81-90, 1989; NAR 17:461- 2), trigo alfa, beta e gama gliadinas (ID SEQ. N° 4861 (promotor alfa gliadina de trigo (genoma B)); ID SEQ. N° 4862 (promotor gama gliadina de trigo); EMBO 3:1409-15, 1984), promotor ltrl da cevada, cevada Bi, C, D hordeína (Theor Appl Gen 98:1253-62, 1999; Plant J 4:343-55, 1993; Mol Gen Genet

250:750- 60, 1996), cevada DOF (Mena et al, The Plant Journal, 116(1): 53- 62, 1998), Biz2 (EP99106056.7), Cevada SS2 (ID SEQ. N° 4874 (Promotor SS2 de Cevada); Guerin e Carbonero Plant Physiology 114: 1 55-62, 1997), trigo Tarp60 Kovalchuk et al., Plant Mol Biol 71:81-98, 2009, cevada D-hordeína (D- Hor) e B-hordeína (B-Hor) (Agnelo Furtado, Robert J. Henry e Alessandro Pellegrineschi (2009)], promotor sintético (Vicente-Carbajosa et al., Plant J. 13: 629-640, 1998), arroz prolamina NRP33, arroz-globulina Glb-1 (Wu et al, Plant Cell Physiology 39(8) 885- 889, 1998), arroz alfa-globulins REB/OHP-1 (Nakase et a1. Plant Moi. Biol. 33: 513-S22, 1997), ADP-glicose de arroz PP (Trans Res 6:157-68, 1997), família do gene de milho ESR (Plant J 12:235-46, 1997), gama-kafirina de sorgo (PMB 32:1029-35, 1996)], promotores específicos embrionários [p.ex., arroz OSH1 (Sato et al, Proc. Natl. Acad.

Sci. EUA, 93: 8117-8122), KNOX (Postma-Haarsma of al, Plant Mol. Biol. 39:257-71, 1999), arroz oleosina (Wu et at, J.

Biochem., 123:386, 1998)], e promotores de flor específicos [p.ex., AtPRP4, chalene sintase (chsA) (Van der Meer, et al., Plant Mol. Biol. 15, 95-109, 1990), LAT52 (Twell et al Mol.

Gen. Genet. 217:240-245; 1989), Arabidopsis apetala-3 (Tilly et al., Development. 125:1647-57, 1998), Arabidopsis APETALA 1 (AT1G69120, AP1) (ID SEQ. N°: 4888 (Arabidopsis (AT1G69120) APETALA 1)) (Hempel et al., Development 124:3845-3853,

1.997)], e promotor de raiz [p.ex., o promotor ROOTP [ID SEQ.

N°: 4889]; arroz ExpBS (ID SEQ. N° 4872 (Promotor de arroz ExpB5); ou ID SEQ. N° 4871 (Promotor mais longo de arroz ExpB5)) e promotores de cevada ExpBl (ID SEQ. N° 4873) (Won et al. Mol. Cells 30: 369-376, 2010); promotor Arabidopsis ATTPS-CIN (AT3G25820) (ID SEQ. N° 4890; Chen et al., Plant Phys 135:1956-66, 2004); promotor Arabidopsis Phol (ID SEQ.

N°: 4870, Hamburger et al., Plant Cell. 14: 889-902, 2002), que também é ligeiramente induzida por estresse].

[00236] Promotores induzíveis pelo estresse abiótico incluem, mas não se limitam a promotores induzíveis pelo sal, como o RD29A (Yamaguchi-Shinozalei et al., Mol. Gen.

Genet. 236:331-340, 1993); promotores induzíveis pela seca, como o gene promotor rabl7 (Pia et. al., Plant Mol. Biol. 21:259-266, 1993), o gene promotor rab28 do milho (Busk et.

al., Plant J. 11:1285-1295, 1997 e o gene promotor Ivr2 do milho (Pelleschi et. al., Plant Mol. Biol. 39:373-380, 1999); promotores induzíveis pelo calor como o promotor hsp80 do tomate (Patente Norte-Americana N° 5.187.267).

[00237] A estrutura de ácido nucleico de algumas aplicações da invenção pode incluir, ainda, um marcador selecionável apropriado e/ou uma origem de replicação. De acordo com algumas aplicações da invenção, a estrutura de ácido nucleico utilizada é um vetor ponte, que pode se propagar tanto em E. coli (onde a estrutura compreenda um marcador selecionável apropriado e a origem da replicação) quanto pode ser compatível com a propagação nas células. A estrutura de acordo com a presente invenção pode ser, p.ex., um plasmídeo, um bacmídeo, um fagemídeo, um cosmídeo, um fago, um vírus ou um cromossomo artificial.

[00238] A estrutura de ácido nucleico de algumas aplicações da invenção pode ser utilizado para transformar de maneira estável ou transitória as células da planta. Na transformação estável, o polinucleotídeo exógeno é integrado ao genoma da planta e, como tal, representa um traço estável e herdado. Na transformação transitória, o polinucleotideo exógeno é expresso pela célula transformada, mas não é integrado no genoma e, como tal, representa um traço transitório.

[00239] Existem vários métodos para introduzir genes estranhos, tanto em monocotiledôneas quanto em dicotiledôneas (Potrykus, I., Annu. Rev. Plant. Physiol, Plant. Moi. Biol. (1991) 42:205-225; Shimamoto et al., Nature (1989) 338:274--276)

[00240] Os métodos do princípio de causa da integração estável de DNA exógeno em DNA genômico da planta incluem duas abordagens principais: (i) A transferência genética mediada pelo Agrobacterium: Klee et al. (1987) Annu. Rev. Plant Physiol. 38:467-486; Klee e Rogers em Cell Culture e Somatic Cell Genetics of Plants, Vol. 6, Molecular Biology of Plant Nuclear Genes, eds. Schell, J. e Vasil, L. K., Academic Publishers, San Diego, Calif.

(1989) p. 2-25; Gatenby, em Plant Biotechnology, eds. Kung, S. e Arntzen, C. J., Butterworth Publishers, Boston, Mass.

(1989) p. 93-112.

(ii) Absorção direta do DNA: Paszkowski et al., em Cell Culture e Somatic Cell Genetics of Plants, Vol. 6, Molecular Biology of Plant Nuclear Genes eds. Schell, J. e Vasil, L.

K., Academic Publishers, San Diego, Calif. (1989) p. 52-68; incluindo métodos para a absorção direta de DNA nos protoplastos, Toriyama, K. et al. (1988) Bio/Technology 6:1072-1074. Absorção de DNA induzida pelo breve choque elétrico de células vegetais: Zhang et al. Plant Cell Rep.

(1988) 7:379-384. Fromm et al. Nature (1986) 319:791-793. Injeção de DNA em células ou tecidos vegetais por bombardeamento de partículas, Klein et al. Bio/Technology (1988) 6:559-563; McCabe et al. Bio/Technology (1988) 6:923- 926; Sanford, Physiol. Plant. (1990) 79:206-209; pela utilização de sistemas de micropipetas: Neuhaus et al., Theor.

Appl. Genet. (1987) 75:30-36; Neuhaus e Spangenberg, Physiol.

Plant. (1990) 79:213-217; transformação de partículas de fibras de vidro ou carboneto de silício de culturas celulares, embriões ou tecido caloso, Patente Norte-Americana N°

5.464.765 ou pela incubação direta de DNA com pólen germinante, DeWet et al. em Experimental Manipulation of Ovule Tissue, eds. Chapman, G. P. e Mantell, S. H. e Daniels, W.

Longman, London, (1985) p. 197-209; e Ohta, Proc. Natl. Acad.

Sei. EUA (1986) 83:715- 719.

[00241] 0 sistema Agrobacterium inclui a utilização de vetores plasmidiais que contenham segmentos definidos de DNA que se integram no DNA genômico da planta. Métodos de inoculação do tecido vegetal variam dependendo da espécie da planta e do sistema de entrega do Agrobacterium.

Uma abordagem amplamente utilizada é o procedimento de disco de folha que pode ser realizado com qualquer explante tecidual que oferece uma boa fonte para o início da diferenciação de toda a planta. Vide, p.ex., Horsch et al. in Plant Molecular Biology Manual A5, Kluwer Academic Publishers, Dordrecht

(1988) p. 1-9. Uma abordagem suplementar emprega o sistema de entrega do Agrobacterium em combinação com infiltração a vácuo. O sistema de Agrobacterium é especialmente viável na criação de dicotiledôneas transgênicas.

[00242] Existem vários métodos de transferência direta de DNA para células vegetais. Na eletroporação, os protoplastos são brevemente expostos a um forte campo elétrico. Na microinjeção, o DNA é injetado de forma mecânica diretamente nas células utilizando micropipetas muito pequenas. No bombardeamento de micropartículas, o DNA é absorvido em microprojéteis como os cristais de sulfato de magnésio ou partículas de tungstênio e os microprojéteis são fisicamente acelerados nas células ou tecidos vegetais.

[00243] Após a transformação estável, a propagação vegetal é realizada. O método mais comum de propagação vegetal é pela semente. A regeneração pela propagação de sementes, no entanto, apresenta a deficiência de que devido à heterozigosidade há uma falta de uniformidade na cultura, uma vez que as sementes são produzidas pelas plantas de acordo com as variâncias genéticas regidas pelas normas Mendelianas.

Basicamente, cada semente é geneticamente diferente e cada uma irá crescer com seus próprios traços específicos.

Portanto, é preferível que a planta transformada seja produzida de forma que a planta regenerada tenha traços e características idênticos da planta transgênico arranjo.

Portanto, é preferível que a planta transformada seja regenerada por micropropagação que proporciona a reprodução rápida, consistente das plantas transformadas.

[00244] A micropropagação é um processo de cultivo de plantas de nova geração a partir de um pedaço de tecido que tenha sido retirado de uma planto arranjo selecionada ou cultivar. Esse processo permite a reprodução em massa de plantas que tenham o tecido preferido expressando a proteína da fusão. As plantas da nova geração que forem produzidas são geneticamente idênticas à planta original e apresentam todas as suas características. A micropropagação permite a produção em massa de material vegetal de qualidade em um curto período de tempo e oferece uma rápida multiplicação de cultivares selecionados na preservação das características da planta transgênica ou transformada original. As vantagens da clonagem de plantas são a velocidade de multiplicação da planta e a qualidade e a uniformidade das plantas produzidas.

[00245] A micropropagação é um procedimento de múltiplos estágios que requer a alteração do meio de cultura ou das condições de cultivo entre os estágios. Dessa forma, o processo de micropropagação envolve quatro estágios básicos: Estágio um, cultura tecidual inicial; estágio dois, multiplicação da cultura tecidual; estágio três, diferenciação e formação da planta; e estágio quarto, cultura e fortalecimento em estufa. Durante o estágio um, a cultura tecidual inicial, a cultura tecidual é estabelecida e certificada como sendo livre de contaminantes. Durante o estágio dois, a cultura tecidual inicial é multiplicada até que um número suficiente de amostras de tecido seja produzido para atender aos objetivos de produção. Durante o estágio três, as amostras de tecido cultivadas no estágio dois são dividas e cultivadas em plântulas individuais. No estágio quatro, as plântulas transformadas são transferidas para uma estufa para fortalecimento, onde a tolerância das plantas à luz é gradativamente aumentada de forma que ela possa ser cultivada no ambiente natural.

[00246] De acordo com algumas aplicações da invenção, as plantas transgênicas são geradas pela transformação transitórias de células de folhas, de células meristemáticas ou de toda a planta.

[00247] A transformação transitória pode ser efetuada por quaisquer dos métodos de transferência direta de DNA descritos acima ou por infecção viral utilizando vírus modificados de plantas.

[00248] Os vírus que demonstraram ser úteis para a transformação de hospedeiros de plantas incluem o CaMV, o vírus mosaico do tabaco (TMVltabaco mosaic virus), vírus mosaico do bromo (BMVI brome mosaic virus) e o vírus mosaico comum do feijoeiro (BV ou BCMVlbeam common mosaic virus). A transformação de plantas utilizando vírus de plantas é descrita na Patente Norte-Americana N° 4.855.237 (vírus mosaico dourado do feijoeiro; BGV), EP-A 67.553 (TMV), Pedido Japonês Publicado N° 63-14693 (TMV), EPA 194.809 (BV), EPA

278.667 (BV); e Gluzman, Y. et al., Communications in Molecular Biology: Viral Vectors, Cold Spring Harbor Laboratory, New York, pp. 172-189 (1988). As partículas pseudovirais para utilização na expressão de DNA estranho em muitos hospedeiros, incluindo plantas, são descritas na WO 87/06261.

[00249] De acordo com algumas aplicações da invenção, o vírus utilizado para transformação transitória é avirulento e, dessa forma, é incapaz de causar sintomas graves como a taxa de crescimento reduzida, mosaico, manchas anelares, enrolamento da folha, amarelamento, estrias, formação de vesículas, formação de tumor e corrosão. Um vírus avirulento adequado pode ser um vírus avirulento que ocorra naturalmente ou um vírus artificialmente atenuado. A atenuação do vírus pode ser efetuada utilizando métodos bem conhecidos na técnica, incluindo, mas não se limitando ao aquecimento subletal, tratamento químico ou por técnicas de mutagênese dirigidas conforme descrito, p.ex., por Kurihara e Watanabe (Molecular Plant Pathology 4:259-269, 2003), Galon et al. (1992), Atreya et al. (1992) e Huet et al. (1994).

[00250] Cepas virais adequadas podem ser obtidas de fontes disponíveis, como, p.ex., da Coleção de Cultura Tipo Americana (ATCCIAmerican Type Culture Collection) ou pelo isolamento de plantas infectadas. 0 isolamento de vírus de tecidos vegetais infectados pode ser efetuado por técnicas bem conhecidas na técnica, conforme descrito, p.ex., por Foster e Tatlor, Eds. "Plant Virology Protocols: From Virus Isolation to Transgenic Resistance (Methods in Molecular Biology (Humana Pr), Vol 81)", Humana Press, 1998. Acredita- se que rapidamente, os tecidos de uma planta infectada contenham uma concentração elevada de um vírus adequado, preferivelmente folhas jovens e pétalas de flores, são trituradas em uma solução tampão (p.ex., solução tampão fosfato) para produzir uma seiva infectada com vírus que pode ser utilizada em inoculações subsequentes.

[00251] A estrutura de vírus de RNA da planta para a introdução e expressão de sequências de polinucleotídeo exógeno não-viral em plantas é demonstrada pelas referências acima, bem como por Dawson, W. 0. et al., Virology (1989) 172:285-292; Takamatsu et al. EMBO J. (1987) 6:307-311; French et al. Science (1986) 231:1294-1297; Takamatsu et al. FEBS Letters (1990) 269:73-76; e Patente Norte-Americana N°

5.316.931.

[00252] Quando o vírus é um vírus de DNA, modificações adequadas podem ser feitas ao vírus propriamente dito. Alternativamente, o vírus pode primeiramente ser clonado em um plasmídeo bacteriano para facilitar a estrutura do vetor viral desejado com o DNA estranho. Então, o vírus pode ser extraído do plasmídeo. Se o vírus for um vírus do DNA, uma origem bacteriana de replicação pode ser anexada ao DNA viral que é, então, replicado pela bactéria. A transcrição e a tradução desse DNA produzirão a proteína de revestimento que irá encapsular o DNA viral. Se o vírus for um vírus de RNA, o vírus é, geralmente, clonado como um cDNA e introduzido em um plasmídeo. Então, o plasmídeo é utilizado para fazer todas as estruturas. Então, o vírus de RNA é produzido pela transcrição da sequência viral do plasmídeo e tradução dos genes virais para produzir a(s) proteína(s) de revestimento que encapsula o RNA viral.

[00253] Em uma aplicação, um polinucleotídeo viral de uma planta é fornecido, no qual a proteína de revestimento nativa que codifica a sequência foi excluída de um polinucleotídeo viral, uma proteína de revestimento viral não nativa da planta codificando a sequência e um promotor não nativo, preferivelmente o promotor subgenômico da proteína de revestimento não nativa que codifica a sequência, capaz de se expressar no hospedeiro da planta, no envoltório do polinucleotídeo viral recombinante da planta e garantindo uma infecção sistêmica do hospedeiro pelo polinucleotídeo viral recombinante da planta, foi introduzido.

Alternativamente o gene da proteína de revestimento pode ser inativado pela introdução da sequência de polinucleotídeo não nativo dentro dele, de forma que uma proteína seja produzida.

0 polinucleotídeo viral recombinante da planta pode conter um ou mais promotores subgenômicos não nativos adicionais. Cada promotor subgenômico não nativo é capaz de transcrever ou de expressar genes adjacentes ou sequências de polinucleotídeos no hospedeiro da planta e incapaz de recombinar uns com ou outros e com os promotores subgenômicos nativos. Sequências de polinucleotídeo não nativas (estranhas) podem ser introduzidas adjacentes ao promotor subgenômico viral nativo da planta ou o promotor subgenômico viral nativo e o promotor subgenômico viral não nativo da planta, se houver mais de uma sequência de polinucleotídeo for incluída. As sequências de polinucleotídeo não nativas são transcritas ou expressas na planta hospedeira sob controle do promotor subgenômico para produzir os produtos desejados.

[00254] Em uma segunda aplicação, um polinucleotídeo viral recombinante da planta é fornecido, como na primeira aplicação, exceto que a proteína de revestimento nativa que codifica a sequência é colocada adjacente a um dos promotores genômicos da proteína de revestimento não nativa ao invés de uma sequência codificadora da proteína de revestimento não nativa.

[00255] Em uma terceira aplicação, um polinucleotídeo viral de planta recombinante é fornecido, no qual o gene da proteína de revestimento nativa é adjacente ao seu promotor subgenômico e um ou mais promotores subgenômicos não nativos foi(ram) inserido(s) no polinucleotídeo viral. Os promotores subgenômicos não nativos introduzidos são capazes de transcrever ou de expressar genes adjacentes em um hospedeiro da planta e são incapazes de recombinar uns com ou outros e com promotores subgenômicos nativos. As sequências de polinucleotídeo não nativas podem ser introduzidas adjacentes aos promotores subgenômicos virais não nativos da planta de forma que as sequências são transcritas ou expressas na planta hospedeira sob controle do promotor subgenômico para produzir o produto desejado.

[00256] Em uma quarta aplicação, um polinucleotídeo viral recombinante da planta é fornecido, como na terceira aplicação, de forma que a sequência codificadora da proteína de revestimento nativa seja substituída por uma sequência codificadora da proteína de revestimento não nativa.

[00257] Os vetores virais são encapsulados pelas proteínas de revestimento codificadas pelo polinucleotídeo viral recombinante da planta para produzir um vírus da planta recombinante. 0 polinucleotídeo viral recombinante da planta ou o vírus da planta recombinante é utilizado para infectar plantas hospedeiras apropriadas. O polinucleotídeo viral recombinante da planta é capaz de replicação no hospedeiro, difusão sistêmica no hospedeiro e transcrição ou expressão de gene(s) estranho(s) (polinucleotídeo exógeno) no hospedeiro para produzir a proteína desejada.

[00258] Técnicas para inoculação de vírus para plantas podem ser encontradas em Foster e Taylor, eds. "Plant Virology Protocols: From Virus Isolation to Transgenic Resistance (Methods in Molecular Biology (Humana Pr), Vol 81)", Humana Press, 1998; Maramorosh e Koprowski, eds.

"Methods in Virology" 7 vols, Academic Press, New York 1967- 1984; Hill, S.A. "Methods in Plant Virology", Blackwell, Oxford, 1984; Walkey, D.G.A. "Applied Plant Virology", Wiley, New York, 1985; e Kado e Agrawa, eds. "Principles e Techniques in Plant Virology", Van Nostrand-Reinhold, New York.

[00259] Além do exposto acima, o polinucleotídeo da presente invenção também pode ser introduzido em um genoma de cloroplasto permitindo, dessa forma, a expressão de cloroplasto.

[00260] Uma técnica para introduzir sequências de polinucleotídeo exógeno no genoma dos cloroplastos é conhecida. Essa técnica envolve os procedimentos a seguir.

Primeiro, as células das plantas são tratadas quimicamente de forma a reduzir o número de cloroplastos por célula para aproximadamente uma. Então, o polinucleotídeo exógeno é introduzido através de bombardeamento de partículas nas células com o objetivo de introduzir pelo menos uma molécula do polinucleotídeo exógeno nos cloroplastos. Os polinucleotídeos exógenos são selecionados de forma a serem integráveis no genoma do cloroplasto através de recombinação homóloga que é prontamente efetuada pelas enzimas inerentes ao cloroplasto. Com essa finalidade, o polinucleotídeo exógeno inclui, além de um gene de interesse, pelo menos uma extensão do polinucleotídeo que é derivada do genoma do cloroplasto. Além disso, o polinucleotídeo exógeno inclui um marcador selecionável que serve, pelos procedimentos de seleção sequencial, para verificar se todas ou se substancialmente todas as cópias dos genomas do cloroplasto, após essa seleção, incluirão o polinucleotídeo exógeno. Detalhes adicionais relacionados a essa técnica são encontrados nas Patentes Norte-Americanas N° 4.945.050 e

5.693.507 que são incorporadas aqui por referência. Dessa forma, um polipeptídeo pode ser produzindo pelo sistema de expressão de proteína do cloroplasto e se integra à membrana interna do cloroplasto.

[00261] De acordo com algumas aplicações, é fornecido um método para melhorar a eficiência no uso do nitrogênio, eficiência no uso de fertilizantes, produção, taxa de crescimento, biomassa, vigor, teor de óleo, produção de sementes, produção de fibra, qualidade da fibra, comprimento da fibra, capacidade fotossintética e/ou tolerância ao estresse abiótico de uma planta enxertada, o método compreendendo fornecer um enxerto que não expressa de forma transgênica um polinucleotídeo que codifica um polipeptídeo, pelo menos, 80% homólogo à sequência de aminoácidos selecionada do grupo consistindo nas ID SEQ. N° 496-794 e 2898-4855 e um rizoma de planta que expressa de forma transgênica um polinucleotídeo que codifica um polipeptídeo, pelo menos, cerca de 80%, pelo menos cerca de 81%, pelo menos cerca de 82%, pelo menos cerca de 83%, pelo menos cerca de 84%, pelo menos cerca de 85%, pelo menos cerca de 86%, pelo menos cerca de 87%, pelo menos cerca de 88%, pelo menos cerca de 89%, pelo menos cerca de 90%, pelo menos cerca de 91%, pelo menos cerca de 92%, pelo menos cerca de 93%, pelo menos cerca de 93%, pelo menos cerca de 94%, pelo menos cerca de 95%, pelo menos cerca de 96%, pelo menos cerca de 97%, pelo menos cerca de 98%, pelo menos cerca de 99%, p.ex., 100% homólogo (ou idêntico) à sequência de aminoácidos selecionada do grupo consistindo nas ID SEQ. N° 496-794, 2898- 3645, 3647-4854 e 4855 (p.ex., em uma forma constitutiva ou responsiva ao estresse abiático), melhorando, dessa forma, a eficiência no uso do nitrogênio, eficiência no uso de fertilizantes, produção, taxa de crescimento, biomassa, vigor, teor de óleo, produção de sementes, produção de fibra, qualidade da fibra, comprimento da fibra, capacidade fotossintética e/ou tolerância ao estresse abiótico da planta enxertada.

[00262] Em algumas aplicações, o enxerto da planta é não transgênico.

[00263] Diversas aplicações referem-se a uma planta enxertada, exibindo um aumento da eficiência no uso do nitrogênio, eficiência no uso de fertilizantes, produção, taxa de crescimento, biomassa, vigor, teor de óleo, produção de sementes, produção de fibra, qualidade da fibra, comprimento da fibra, capacidade fotossintética e/ou tolerância ao estresse abiótico, compreendendo um enxerto que não expressa de forma transgênica um polinucleotídeo que codifica um polipeptídeo, pelo menos 80% homólogo à sequência de aminoácidos selecionada do grupo consistindo nas ID SEQ.

N° 496-794 e 2898-4855 e um rizoma de planta que expressa de forma transgênica um polinucleotídeo que codifica um polipeptídeo, pelo menos cerca de 80%, pelo menos cerca de 81%, pelo menos cerca de 82%, pelo menos cerca de 83%, pelo menos cerca de 84%, pelo menos cerca de 85%, pelo menos cerca de 86%, pelo menos cerca de 87%, pelo menos cerca de 88%, pelo menos cerca de 89%, pelo menos cerca de 90%, pelo menos cerca de 91%, pelo menos cerca de 92%, pelo menos cerca de 93%, pelo menos cerca de 93%, pelo menos cerca de 94%, pelo menos cerca de 95%, pelo menos cerca de 96%, pelo menos cerca de 97%, pelo menos cerca de 98%, pelo menos cerca de 99%, p.ex., 100% homólogo (ou idêntico) à sequência de aminoácidos selecionada do grupo consistindo nas ID SEQ. N° 496-794, 2898- 3645, 3647-4854 e 4855.

[00264] Em algumas aplicações, o rizoma de planta expressa de forma transgênica um polinucleotídeo que codifica um polipeptídeo, pelo menos cerca de 80%, pelo menos cerca de 81%, pelo menos cerca de 82%, pelo menos cerca de 83%, pelo menos cerca de 84%, pelo menos cerca de 85%, pelo menos cerca de 86%, pelo menos cerca de 87%, pelo menos cerca de 88%, pelo menos cerca de 89%, pelo menos cerca de 90%, pelo menos cerca de 91%, pelo menos cerca de 92%, pelo menos cerca de

93%, pelo menos cerca de 93%, pelo menos cerca de 94%, pelo menos cerca de 95%, pelo menos cerca de 96%, pelo menos cerca de 97%, pelo menos cerca de 98%, pelo menos cerca de 99%, p. ex., 100% homólogo (ou idêntico) à sequência de aminoácidos selecionada do grupo consistindo nas ID SEQ. N° 496-794, 2898- 3645, 3647-4854 e 4855, de forma responsiva ao estresse.

[00265] De acordo com algumas aplicações da invenção, o rizoma de planta expressa de forma transgênica um polinucleotídeo que codifica um polipeptídeo selecionado do grupo consistindo nas ID SEQ. N° 496-794, 2898-4854 e 4855.

[00266] De acordo com algumas aplicações da invenção, o rizoma de planta expressa de forma transgênica um polinucleotídeo, compreendendo uma sequência de ácido nucleico, pelo menos cerca de 80%, pelo menos cerca de 81%, pelo menos cerca de 82%, pelo menos cerca de 83%, pelo menos cerca de 84%, pelo menos cerca de 85%, pelo menos cerca de 86%, pelo menos cerca de 87%, pelo menos cerca de 88%, pelo menos cerca de 89%, pelo menos cerca de 90%, pelo menos cerca de 91%, pelo menos cerca de 92%, pelo menos cerca de 93%, pelo menos cerca de 93%, pelo menos cerca de 94%, pelo menos cerca de 95%, pelo menos cerca de 96%, pelo menos cerca de 97%, pelo menos cerca de 98%, pelo menos cerca de 99%, p.ex., 100% idêntica ao polinucleotídeo selecionado do grupo consistindo nas ID SEQ. N°1-495 e 795-2897.

[00267] De acordo com algumas aplicações da invenção, o rizoma de planta expressa de forma transgênica um polinucleotídeo selecionado do grupo consistindo nas ID SEQ.

N°1-495 e 795-2897.

[00268] Uma vez que os processos que aumentam a eficiência no uso do nitrogênio, eficiência no uso de fertilizantes, teor de óleo, produção, produção de sementes, produção de fibra, qualidade da fibra, comprimento da fibra, capacidade fotossintética, taxa de crescimento, biomassa, vigor e/ou tolerância ao estresse abiótico de uma planta podem envolver múltiplos genes atuando de forma aditiva ou sinérgica (vide, por exemplo, Quesda et a1., Plant Physiol. 130:951- 063, 2002), a presente invenção também prevê expressar uma pluralidade de polinucleotídeos exógenos em uma única planta hospedeira para, deste modo, alcançar um efeito superior na eficiência no uso do nitrogênio, eficiência no uso de fertilizantes, teor de óleo, produção, produção de sementes, produção de fibra, qualidade da fibra, comprimento da fibra, capacidade fotossintética, taxa de crescimento, biomassa, vigor e/ou tolerância ao estresse abiótico.

[00269] A expressão de uma pluralidade de polinucleotídeos exógenos em uma única planta hospedeira pode ser efetuada cointroduzindo-se múltiplas estruturas de ácido nucleico, cada uma incluindo um polinucleotídeo exógeno diferente, em uma única célula vegetal. A célula transformada pode, então, ser regenerada em uma planta madura utilizando os métodos descritos acima.

[00270] De forma alternativa, a expressão de uma pluralidade de polinucleotídeos exógenos em uma única planta hospedeira pode ser efetuada cointroduzindo-se, em uma única célula da planta, uma única estrutura de ácido nucleico incluindo uma pluralidade de diferentes polinucleotídeos exógenos. Essa estrutura pode ser desenhada com uma única sequência promotora que pode transcrever um RNA mensageiro policistrônico incluindo todas as sequências diferentes de polinucleotídeo exógeno. A fim de permitir a cotradução dos polipeptídeos diferentes codificados pelo RNA mensageiro policistrônica, as sequências de polinucleotídeos podem ser interligadas através de uma sequência do local interno de entrada do ribossomo (IRESlinternal ribosome entry site) que facilita a tradução das sequências de polinucleotídeo posicionadas a jusante da sequência do IRES. Nesse caso, uma molécula de RNA policistrônico transcrita que codifica os diferentes polipeptídeos descritos acima será traduzida tanto no terminal 5' que tem o cap quanto nas duas sequências internas do IRES da molécula de RNA policistrônico para, assim, produzir todos os diferentes polipeptídeos na célula.

Alternativamente, a estrutura pode incluir diversas sequências promotoras, cada uma ligada a uma sequência de polinucleotídeo exógeno diferente.

[00271] A célula da planta transformada com a estrutura, incluindo uma pluralidade de polinucleotídeos exógenos diferentes, pode ser regenerada em uma planta madura utilizando os métodos descritos acima.

[00272] Alternativamente, a expressão de uma pluralidade de polinucleotídeos exógenos em uma única planta hospedeira pode ser efetuada introduzindo diferentes estruturas de ácido nucleico, incluindo polinucleotídeos exógenos diferentes, em uma pluralidade de plantas. As plantas transformadas regeneradas podem, então, ser cruzadas e a progênie resultante selecionada para obter traços superiores de tolerância ao estresse abiótico, eficiência no uso da água, eficiência no uso de fertilizante, crescimento, biomassa, produção e/ou vigor, utilizando técnicas convencionais de melhoramento de plantas.

[00273] De acordo com algumas aplicações da invenção, o método compreende, ainda, o cultivo da planta expressando o polinucleotídeo exógeno sob estresse abiótico.

[00274] Exemplos não limitantes de condições de estresse abiótico incluem salinidade, estresse osmótico, seca, privação de água, excesso de água (p.ex., inundação, encharcamento), etiolação, baixa temperatura (p.ex., estresse por frio), alta temperatura, toxicidade por metais pesados, anaerobiose, deficiência de nutrientes (p.ex., deficiência de nitrogênio ou limitação de nitrogênio), excesso de nutrientes, poluição atmosférico e irradiação UV.

[00275] De acordo com algumas aplicações da invenção, o método compreende, ainda, o cultivo da planta que expressa o polinucleotídeo exógeno em condições limitantes do fertilizante (p.ex., condições limitantes de nitrogênio). Os exemplos não limitantes incluem o cultivo da planta nos solos com baixo teor de nitrogênio (40-50% de nitrogênio do teor presente em condições normais e ideais), ou mesmo em deficiência de nitrogênio severa (0 a 10% de nitrogênio do teor presente em condições normais e ideais).

[00276] Dessa forma, a invenção abrange plantas que expressam de forma exógena o(s) polinucleotídeo(s), as estruturas de ácido nucleico e/ou o(s) polipeptídeo(s) da invenção.

[00277] Uma vez expresso dentro da célula da planta ou de toda a planta, o nível do polipeptídeo codificado pelo polinucleotídeo exógeno pode ser determinado por métodos bem conhecidos na técnica, como ensaios de atividade, Western blots utilizando anticorpos capazes de se ligarem especificamente ao polipeptídeo, Ensaio Imunoabsorvente Ligado à Enzima (ELISA 1 enzyme-linked immuno sorbent assay), radioimunoensaios (RlAlradio-immuno--assays), imunohistoquímica, imunocitoquímica, imunofluorescência e outros métodos semelhantes.

[00278] Métodos para determinar o nível do RNA transcrito do polinucleotídeo exógeno na planta são bem conhecidos na técnica e incluem, p.ex., análise de Northern blot, análise de reação em cadeia da polimerase com transcriptase reversa (RT-PCRlreverse transcription polymerase chain reaction) (incluindo RT-PCR quantitativa, semiquantitativa ou em tempo real) e hibridização in situ para

[00279] As informações e anotações da sequência não cobertas pelos presentes ensinamentos podem ser aproveitados em favor do melhoramento clássico. Assim, os dados da subsequência daqueles polinucleotídeos descritos acima podem ser utilizados como marcadores para seleção assistida pelo marcador (MAS I marker assisted selection), na qual um marcador é utilizado para seleção indireta de um determinante ou determinantes genético(s) de um traço de interesse (p.ex., biomassa, taxa de crescimento, teor de óleo,

I13/413 produção, tolerância ao estresse abiótico, eficiência no uso da água, eficiência no uso de nitrogênio e/ou eficiência no uso de fertilizantes). Os dados do ácido nucleico dos presentes ensinamentos (sequência de DNA ou RNA) podem conter ou estar ligados a sítios polimórficos ou a marcadores genéticos no genoma como o polimorfismo do comprimento do fragmento de restrição (RFLP I restriction fragment length polymorphism), microssatélites e polimorfismo de nucleotídeo único (SNPlsingle nucleotide polymorphism), impressão genética (DFP{DNA fingerprinting), polimorfismo do comprimento de fragmentos amplificados (AFLPlamplified fragment length polymorphism), polimorfismo do nível de expressão, polimorfismo do polipeptídeo codificado e qualquer outro polimorfismo na sequência de DNA ou de RNA.

[00280] Exemplos de seleções assistidas do marcador incluem, mas não se limitam à seleção de um traço morfológico (p.ex., um gene que afete a forma, a coloração, a esterilidade masculina ou a resistência como a presença ou a ausência de aresta, coloração da bainha da folha, altura, cor do grão, aroma do arroz); seleção de um traço bioquímico (p.ex., um gene que codifique uma proteína que possa ser extraída e observada; p.ex., isozimas e proteínas de reserva); seleção de um traço biológico (p.ex., (raças patogênicas ou biotipos de insetos com bases no patógeno hospedeiro ou a interação com o parasita hospedeiro pode ser utilizada como um marcador desde que a constituição genética de um organismo possa afetar sua susceptibilidade a patógenos ou parasitas).

[00281] Os polinucleotídeos e polipeptídeos descritos acima podem ser utilizados em uma ampla variedade de plantas econômicas, de forma segura e eficiente em termos de custo.

[00282] Linhagens vegetais que expressam de forma exógena o polinucleotídeo ou o polipeptídeo da invenção são triadas para identificar aquelas que mostram o maior aumento do traço desejado da planta.

[00283] Portanto, de acordo com uma aplicação adicional da presente invenção, é fornecido um método de avaliação de um traço de uma planta, o método compreendendo: (a) expressar em uma planta ou em uma parte respectiva a estrutura de ácido nucleico de algumas aplicações da invenção; e (b) avaliar um traço de uma planta em comparação a uma planta do tipo selvagem do mesmo tipo (p.ex., não transformada com as biomoléculas reivindicadas); avaliando, deste modo, o traço da planta.

[00284] De acordo com algumas aplicações da invenção, é fornecido um método de produção de uma colheita, compreendendo o cultivo de uma colheita de uma planta expressando um polinucleotídeo exógeno, compreendendo uma sequência de ácido nucleico que codifica um polipeptídeo, pelo menos cerca de 80 %, pelo menos cerca de 81 %, pelo menos cerca de 82 %, pelo menos cerca de 83 %, pelo menos cerca de 84 %, pelo menos, cerca de 85 %, pelo menos cerca de 86 %, pelo menos cerca de 87 %, pelo menos cerca de 88 %, pelo menos cerca de 89 %, pelo menos cerca de 90 %, pelo menos cerca de 91 %, pelo menos cerca de 92 %, pelo menos cerca de 93 %, pelo menos cerca de 94 %, pelo menos cerca de 95 %, pelo menos cerca de 96 %, pelo menos cerca de 97 %, pelo menos cerca de 98 %, pelo menos cerca de 99 %, ou, digamos, 100 % homólogo à sequência de aminoácidos selecionada de um grupo consistindo nas ID SEQ. N° 496-794, 2898-3645, 3647-4854 e 4855, caracterizado pela referida planta ser derivada de uma planta selecionada para aumento da eficiência no uso de fertilizante, aumento da eficiência no uso do nitrogênio, aumento da tolerância ao estresse abiótico, aumento da eficiência no uso da água, aumento da taxa de crescimento, aumento da biomassa, aumento do vigor, aumento do teor de óleo, aumento da produção, aumento da produção de semente, aumento da produção de fibra, aumento da qualidade da fibra, aumento do comprimento da fibra e/ou aumento da capacidade fotossintética se comparada a uma planta de controle, produzindo, deste modo, a colheita.

[00285] De acordo com um aspecto de algumas aplicações da presente invenção, é fornecido um método de produção de uma cultura, compreendendo o cultivo de uma cultura de planta transformada com um polinucleotídeo exógeno que codifica um polipeptídeo, pelo menos 80%, pelo menos cerca de 81%, pelo menos cerca de 82%, pelo menos cerca de 83%, pelo menos cerca de 84%, pelo menos cerca de 85%, pelo menos cerca de 86%, pelo menos cerca de 87%, pelo menos cerca de 88%, pelo menos cerca de 89%, pelo menos cerca de 90%, pelo menos cerca de 91%, pelo menos cerca de 92%, pelo menos cerca de 93%, pelo menos cerca de 94%, pelo menos cerca de 95%, pelo menos cerca de 96%, pelo menos cerca de 97%, pelo menos cerca de 98%, pelo menos cerca de 99%, ou, digamos, 100%

homólogo (p.ex., idêntico) à sequência de aminoácidos selecionada do grupo consistindo nas ID SEQ. N° 496-794, 2898- 3645, 3647-4854 e 4855, caracterizado pela planta de cultura ser derivada de plantas selecionadas para um aumento na tolerância ao estresse abiótico, aumento na eficiência no uso da água, aumento na taxa de crescimento, aumento no vigor, aumento na biomassa, aumento no teor de óleo, aumento na produção, aumento na produção de sementes, aumento na produção de fibra, aumento na qualidade da fibra, aumento no comprimento da fibra, aumento na capacidade fotossintética e/ou aumento na eficiência no uso de fertilizantes (p.ex., aumento na eficiência no uso do nitrogênio) se comparada a uma planta do tipo selvagem da mesma espécie que é cultivada nas mesmas condições de cultivo, e a planta de cultivo tendo aumento da tolerância ao estresse abiótico, aumento da eficiência no uso da água, aumento da taxa de crescimento, aumento do vigor, aumento da biomassa, aumento do teor de óleo, aumento da produção, aumento da produção de sementes, aumento da produção de fibra, aumento da qualidade da fibra, aumento do comprimento da fibra, aumento da capacidade fotossintética e/ou aumento da eficiência no uso de fertilizantes (p.ex., aumento da eficiência no uso do nitrogênio), produzindo, deste modo, a cultura.

[00286] De acordo com algumas aplicações da invenção, o polipeptídeo é selecionado do grupo consistindo nas ID SEQ. N° 496-794, 2898-4854 e 4855.

[00287] De acordo com um aspecto de algumas aplicações da invenção, é fornecido um método de produção de uma cultura, compreendendo o cultivo de uma cultura de uma planta expressando um polinucleotídeo exógeno que compreende uma sequência de ácido nucleico que é, pelo menos cerca de 80%, pelo menos cerca de 81%, pelo menos cerca de 82%, pelo menos cerca de 83%, pelo menos cerca de 84%, pelo menos cerca de 85%, pelo menos cerca de 86%, pelo menos cerca de 87%, pelo menos cerca de 88%, pelo menos cerca de 89%, pelo menos cerca de 90%, pelo menos cerca de 91%, pelo menos cerca de 92%, pelo menos cerca de 93%, pelo menos cerca de 93%, pelo menos cerca de 94%, pelo menos cerca de 95%, pelo menos cerca de 96%, pelo menos cerca de 97%, pelo menos cerca de 98%, pelo menos cerca de 99%, p.ex., 100% idêntica à sequência de ácido nucleico selecionada do grupo consistindo nas ID SEQ.

N° 1-495, 795-2896 e 2897, caracterizado pela referida planta ser derivada de uma planta (planta principal) que foi transformada para expressar o polinucleotídeo exógeno e que foi selecionada para aumento da tolerância ao estresse abiótico, aumento da eficiência no uso da água, aumento da taxa de crescimento, aumento do vigor, aumento da biomassa, aumento do teor de óleo, aumento da produção, aumento da produção de sementes, aumento da produção de fibra, aumento da qualidade da fibra, aumento do comprimento da fibra, aumento da capacidade fotossintética e/ou aumento da eficiência no uso de fertilizantes (p.ex., aumento da eficiência no uso do nitrogênio) se comparada a uma planta de controle, produzindo, deste modo, a cultura.

[00288] De acordo com um aspecto de algumas aplicações da invenção, é fornecido um método de produção de uma cultura, compreendendo o cultivo de uma cultura de planta transformada com um polinucleotídeo exógeno, pelo menos 80%,

pelo menos cerca de 81%, pelo menos cerca de 82%, pelo menos cerca de 83%, pelo menos cerca de 84%, pelo menos cerca de 85%, pelo menos cerca de 86%, pelo menos cerca de 87%, pelo menos cerca de 88%, pelo menos cerca de 89%, pelo menos cerca de 90%, pelo menos cerca de 91%, pelo menos cerca de 92%,

pelo menos cerca de 93%, pelo menos cerca de 94%, pelo menos cerca de 95%, pelo menos cerca de 96%, pelo menos cerca de

97%, pelo menos cerca de 98%, pelo menos cerca de 99%, ou digamos, 100% idêntico à sequência de ácido nucleico selecionada do grupo consistindo nas ID SEQ.

N° 1-495, 795-

2896 e 2897, caracterizado pela planta de cultura ser derivada de plantas selecionadas para aumento da tolerância ao estresse abiótico, aumento da eficiência no uso da água, aumentara taxa de crescimento, aumento do vigor, aumento da biomassa, aumento do teor de óleo, aumento da produção, aumento da produção de sementes, aumento da produção de fibra, aumento da qualidade da fibra, aumento do comprimento da fibra, aumento da capacidade fotossintética e/ou aumento da eficiência no uso de fertilizantes (p.ex., aumento da eficiência no uso do nitrogênio) se comparada a uma planta do tipo selvagem da mesma espécie que é cultivada nas mesmas condições de cultivo,

e o planta de cultura tendo um aumento na tolerância ao estresse abiótico, aumento na eficiência no uso da água,

aumento na taxa de crescimento, aumento no vigor, aumento na biomassa, aumento no teor de óleo, aumento na produção,

aumento na produção de sementes, aumento na produção de fibra,

aumento na qualidade da fibra, aumento no comprimento da fibra, aumento na capacidade fotossintética e/ou aumento na eficiência no uso de fertilizantes (p.ex., aumento na eficiência no uso do nitrogênio) produzindo, deste modo, a cultura.

[00289] De acordo com algumas aplicações da invenção, o polinucleotídeo exógeno é selecionado do grupo consistindo nas ID SEQ. N° 1-495, 795-2896 e 2897.

[00290] De acordo com um aspecto de algumas aplicações da invenção, é fornecido um método para cultivo de uma colheita, compreendendo a semeadura de sementes e/ou plantio de mudas de uma planta transformada com o polinucleotídeo exógeno da invenção, por exemplo, o polinucleotídeo que codifica o polipeptídeo de algumas aplicações da invenção, caracterizado pela planta ser derivada de plantas selecionadas com, pelo menos, um traço selecionado do grupo constituído por aumento da tolerância ao estresse abiótico, aumento da eficiência no uso da água, aumento da taxa de crescimento, aumento do vigor, aumento da biomassa, aumento do teor de óleo, aumento da produção, aumento da produção de sementes, aumento da produção de fibra, aumento da qualidade da fibra, aumento do comprimento da fibra, aumento da capacidade fotossintética e/ou aumento da eficiência no uso de fertilizantes (aumento da eficiência no uso de nitrogênio) se comparada a uma planta não transformada.

[00291] De acordo com algumas aplicações da invenção, o método de cultivo de uma colheita compreende a semeadura de sementes e/ou o plantio de mudas de uma planta transformada com um polinucleotídeo exógeno, compreendendo uma sequência de ácido nucleico que codifica um polipeptídeo, pelo menos cerca de 80%, pelo menos cerca de 81%, pelo menos cerca de 82%, pelo menos cerca de 83%, pelo menos cerca de 84%, pelo menos cerca de 85%, pelo menos cerca de 86%, pelo menos cerca de 87%, pelo menos cerca de 88%, pelo menos cerca de 89%, pelo menos cerca de 90%, pelo menos cerca de 91%, pelo menos cerca de 92%, pelo menos cerca de 93%, pelo menos cerca de 94%, pelo menos cerca de 95%, pelo menos cerca de 96%, pelo menos cerca de 97%, pelo menos cerca de 98%, pelo menos cerca de 99%, p.ex., 100% idêntico às ID SEQ. N° 496- 794, 2898-3645, 3647-4854 ou 4855, caracterizado pela planta ser derivada de plantas selecionadas com, pelo menos, um traço selecionado do grupo constituído por aumento da tolerância ao estresse abiótico, aumento da eficiência no uso da água, aumento da taxa de crescimento, aumento do vigor, aumento da biomassa, aumento do teor de óleo, aumento da produção, aumento da produção de sementes, aumento da produção de fibra, aumento da qualidade da fibra, aumento do comprimento da fibra, aumento da capacidade fotossintética e/ou aumento da eficiência no uso de fertilizantes (aumento da eficiência no uso de nitrogênio) se comparada a uma planta não transformada, aumentando, desta forma, a colheita.

[00292] De acordo com algumas aplicações da invenção, o polipeptídeo é selecionado do grupo consistindo nas ID SEQ. N° 496-794, 2898-4854 e 4855.

[00293] De acordo com algumas aplicações da invenção, o método de cultivo de uma colheita compreende a

12I/413 semeadura de sementes e/ou o plantio de mudas de uma planta transformada com um polinucleotídeo exógeno, compreendendo a sequência de ácido nucleico, pelo menos cerca de 80%, pelo menos cerca de 81%, pelo menos cerca de 82%, pelo menos cerca de 83%, pelo menos cerca de 84%, pelo menos cerca de 85%, pelo menos cerca de 86%, pelo menos cerca de 87%, pelo menos cerca de 88%, pelo menos cerca de 89%, pelo menos cerca de 90%, pelo menos cerca de 91%, pelo menos cerca de 92%, pelo menos cerca de 93%, pelo menos cerca de 94%, pelo menos cerca de 95%, pelo menos cerca de 96%, pelo menos cerca de 97%, pelo menos cerca de 98%, pelo menos cerca de 99%, p.ex., 100% idêntica às ID SEQ. N° 1-495, 795-2896 ou 2897, caracterizado pela planta ser derivada de plantas selecionadas com, pelo menos, um traço selecionado do grupo constituído por aumento da tolerância ao estresse abiótico, aumento da eficiência no uso da água, aumento da taxa de crescimento, aumento do vigor, aumento da biomassa, aumento do teor de óleo, aumento da produção, aumento da produção de sementes, aumento da produção de fibra, aumento da qualidade da fibra, aumento do comprimento da fibra, aumento da capacidade fotossintética e/ou aumento da eficiência no uso de fertilizantes (aumento da eficiência no uso de nitrogênio) se comparada a uma planta não transformada, aumentando, desta forma, a colheita.

[00294] De acordo com algumas aplicações da invenção, o polinucleotídeo exógeno é selecionado do grupo consistindo nas ID SEQ. N° 1-495, 795-2896 e 2897.

[00295] 0 efeito de transgene (o polinucleotídeo exógeno codificando o polipeptídeo) sobre a tolerância ao estresse abiótico pode ser determinado utilizando métodos conhecidos, conforme detalhado abaixo e na seção de Exemplos a seguir.

[00296] Tolerância ao estresse abiótico - Plantas transformadas (isto é, expressando o transgene) e não transformadas (tipo selvagem) são expostas a uma condição de estresse abiótico, como privação de água, temperatura subótima (baixa temperatura, temperatura elevada), deficiência de nutrientes, excesso de nutrientes, uma condição de estresse causada pelo sal, estresse osmótico, toxicidade por metais pesados, anaerobiose, poluição atmosférica e irradiação UV.

[00297] Ensaio de tolerância à salinidade - Espera-se que plantas transgênicas com tolerância a concentrações elevadas de sal apresentem melhor germinação, vigor da muda ou crescimento em condições com níveis elevados de sal. 0 estresse por sal pode ser efetuado de muitas maneiras como, p.ex., irrigando as plantas com uma solução hiperosmótica, cultivando as plantas hidroponicamente em uma solução de cultivo hiperosmótica (p.ex., solução de Hoagland), ou submetendo as plantas à cultura em meio de crescimento hiperosmótico [p.ex., meio de Murashige-Skoog (meio MS) a 50%]. Como diferentes plantas variam consideravelmente em sua tolerância à salinidade, a concentração de sal na água de irrigação, na solução de crescimento ou no meio de crescimento pode ser ajustada de acordo com as características específicas do cultivar ou variedade específica da planta, de forma a infligir um efeito leve ou moderado sobre a fisiologia e/ou morfologia das plantas (para conhecer as diretrizes com relação à concentração apropriada, consulte, Bernstein e Kafkafi, Root Growth Under Salinity Stress In: Plant Roots, The Hidden Half 3rd ed. Waisel Y, Eshel A e Kafkafi U. (editores) Marcel Dekker Inc., New York, 2002 e a referência lá contida).

[00298] Por exemplo, o teste de tolerância à salinidade pode ser realizado irrigando as plantas em diferentes estágios de desenvolvimento com concentrações crescentes de cloreto de sódio (p.ex., 50 mM, 100 mM, 200 mM, 400 mM de NaCl) aplicadas de baixo e de cima para garantir uma dispersão regular do sal. Após a exposição à condição de estresse, as plantas são, frequentemente, monitoradas até que os efeitos fisiológicos e/ou morfológicos apareçam nas plantas do tipo selvagem. Dessa forma, a aparência fenotípica externa, o grau de emurchecimento e o sucesso geral para atingir a maturidade e a progênie da produção são comparados entre as plantas de controle e as transgenicas.

[00299] Os parâmetros quantitativos de tolerância medidos incluem, mas não estão limitados ao peso úmido e seco médio, à taxa de crescimento, ao tamanho da folha, à cobertura foliar (área foliar geral), ao peso das sementes geradas, ao tamanho médio das sementes e ao número de sementes produzidas por planta. As plantas transformadas que não exibem efeitos fisiológicos e/ou morfológicos substanciais, ou que exibem maior biomassa do que as plantas do tipo selvagem, são identificadas como plantas tolerantes ao estresse abiótico.

[00300) Teste de tolerância osmótica - Os ensaios de estresse osmótico (incluindo ensaios com cloreto de sódio e manitol) são realizados para determinar se um fenótipo de estresse osmótico era específico do cloreto de sódio ou se era um fenótipo relacionado ao estresse osmótico geral. As plantas tolerantes ao estresse osmótico podem ter mais tolerância à seca e/ou congelamento. Para experimentos de germinação sob estresse salino e osmótico, o meio é suplementado, p.ex., com 50 mM, 100 mM, 200 mM de NaCl ou com 100 mM, 200 mM NaCl, 400 mM de manitol.

[00301] Ensaio de tolerância à seca/Ensaio osmótico - A tolerância à seca é realizada para identificar os genes que conferem melhor sobrevida à planta depois de privação aguda de água. Para analisar se as plantas transgênicas são mais tolerantes à seca, um estresse osmótico produzido pelo osmólito sorbitol não-iônico no meio pode ser realizado. Plantas de controle e transgênicas são germinadas e cultivadas em placas de ágar em plantas por 4 dias, depois do que elas são transferidas para placas contendo 50 mM de sorbitol. 0 tratamento causa retardamento do crescimento, então, tanto as plantas de controle quanto as transgênicas são comparadas, medindo o peso da planta (úmida e seca), a produção e pelas taxas de crescimento medidas como o tempo para a floração.

[00302] Inversamente, telas secas com base no solo são realizadas com plantas superexpressando os polinucleotídeos detalhados acima. Sementes de plantas Arabdopsis de controle, ou de outras plantas transgênicas que superexpressam o polipeptídeo da invenção, são germinadas e transferidas para vasos. 0 estresse à seca é obtido depois que a irrigação é interrompida, acompanhada pela colocação dos vasos em papel absorvente para melhorar a taxa de secagem do solo. As plantas transgênicas e de controle são comparadas umas com as outras quando a maioria das plantas de controle desenvolvem emurchecimento grave. As plantas recebem água novamente depois de obter uma fração significativa das plantas de controle exigindo emurchecimento grave. As plantas são classificadas em comparação com os controles em relação a cada um dos dois critérios: tolerância às condições de seca e recuperação (sobrevida) após a reirrigação.

[00303] Tolerância ao estresse por frio - Para analisar o estresse por frio, plantas maduras (25 dias de idade) são transferidas para câmaras a 4°C por 1 ou 2 semanas, com luz constitutiva. Posteriormente, as plantas são devolvidas à estufa. Duas semanas depois, os danos causados pelo período de resfriamento, resultando no retardamento do crescimento e em outros fenótipos, são comparados entre as plantas tanto de controle quanto transgênicas, medindo o peso da planta (úmida e seca) e comparando as taxas de crescimento medidas como o tempo para a floração, o tamanho da planta, a produção e parâmetros semelhantes.

[00304] Tolerância ao estresse por calor - A tolerância ao estresse por calor é alcançada expondo as plantas a temperaturas acima de 34°C por um determinado período. A tolerância da planta é examinada depois de transferir as plantas de volta para 22°C para recuperação e avaliação depois de 5 dias em relação aos controles internos

(plantas não-transgênicas) ou plantas não expostas nem ao estresse por frio nem ao estresse por calor.

[00305] Eficiência no uso da água - pode ser determinada como a biomassa produzida por transpiração unitária. Para analisar a WUE, o teor de água relativo da folha pode ser medido em plantas de controle e transgênicas.

0 peso fresco (FW 1 fresh weight) é registrado imediatamente; então, as folhas são colocadas por 8 horas em água destilada em temperatura ambiente no escuro e o peso túrgido (TW 1 turgid weight) é registrado. O peso seco (DW I dry weight) total é registrado depois da secagem das folhas a 60°C a um peso constante. 0 teor relativo de água (RWC 1 relative water content) é calculado de acordo com a seguinte Fórmula I: Fórmula I RWC - [ (FW - DW) / (TW - DW) ] x 100

[00306] Eficiência no uso de fertilizantes Para analisar se as plantas transgênicas são mais responsivas aos fertilizantes, as plantas foram cultivadas em placas de ágar ou vasos com uma quantidade limitada de fertilizante, conforme descrito, por exemplo, nos Exemplos 15-17 abaixo e em Yanagisawa et ai (Proc Natl Acad Sci EUA. 2004; 101:7833-8. As plantas são analisadas quanto ao seu tamanho geral, tempo para a floração, produção, teor de proteína do broto e/ou grão. Os parâmetros verificados são o tamanho geral da planta madura, seu peso úmido e seco, o peso das sementes geradas, o tamanho médio da semente e o número de sementes produzidas por planta. Outros parâmetros que podem ser testados são: o teor de clorofila das folhas (como o status do nitrogênio da planta e o grau de verdura da folha está altamente correlacionado), o teor de aminoácidos e de proteína total das sementes ou de outras partes da planta como as folhas ou os brotos, o teor de óleo, etc. Semelhantemente, ao invés de fornecer nitrogênio em quantidades limitastes, fosfato ou potássio podem ser adicionados em concentrações crescentes.

Novamente os mesmos parâmetros medidos são os mesmos listados acima. Dessa forma, a eficiência no uso de nitrogênio (NUE), a eficiência da utilização do fosfato (PUE 1 phosphate use efficiency) e a eficiência da utilização de potássio (KUE 1 potassium use efficiency) são avaliadas, verificando a capacidade das plantas transgênicas de se desenvolverem sob condições de restrição de nutrientes.

[00307] Eficiência no uso de nitrogênio - Para analisar se as plantas transgênicas (p.ex., plantas Arabidopsis) são mais responsivas ao nitrogênio, as plantas são cultivadas em 0,75-3 mM (condições de deficiência de nitrogênio) ou 6-10 mM (concentração de nitrogênio adequada).

Permite-se que as plantas cresçam por 25 dias adicionais ou até a produção de semente. Então, as plantas são analisadas quanto ao seu tamanho geral, tempo para a floração, produção, teor de proteína do broto e/ou do grão/semente. Os parâmetros verificados podem ser o tamanho geral da planta madura, seu peso úmido e seco, o peso das sementes geradas, o tamanho médio da semente e o número de sementes produzidas por planta.

Outros parâmetros que podem ser testados são: o teor de clorofila das folhas (como o status do nitrogênio da planta e o grau de verdura da folha está altamente correlacionado),

o teor de aminoácidos e de proteína total das sementes ou de outras partes da planta como as folhas ou os brotos o teor de óleo. As plantas transformadas que não exibem efeitos fisiológicos e/ou morfológicos substanciais, ou que exibem níveis maiores dos parâmetros medidos do que as plantas do tipo selvagem, são identificadas como plantas eficientes na utilização do nitrogênio.

[00308] Ensaio de eficiência no uso de nitrogênio utilizando plântulas - O ensaio é realizado de acordo com Yanagisawa-S. et al. com pequenas modificações (`Metabolic engineering with Dofl transcription factor in plants: Improved nitrogen assimilation e growth under low-nitrogen conditions" Proc. Natl. Acad. Sci. EUA 101, 7833-7838).

Brevemente, as plantas transgênicas que são cultivadas por 7- dias em 0,5 x MS [Murashige-Skoog] suplementadas com um agente de seleção são transferidas para duas condições limitantes de nitrogênio: 0 meio MS no qual a concentração de nitrogênio combinada (NH4NO3 e KNO3) era de 0,75 mM (condições de deficiência de nitrogênio) ou de 6-15 mM (concentração de nitrogênio adequada). Permitiu-se que as plantas crescessem por 30-40 dias adicionais e, então, foram fotografadas, removidas individualmente do Agar (o broto sem as raízes) e pesadas imediatamente (peso fresco) para análise estatística posterior. Estruturas para as quais somente sementes Ti estão disponíveis são semeadas em meio seletivo e pelo menos 20 mudas (cada uma representando um evento de transformação independente) são cuidadosamente transferidas para o meio limitante de nitrogênio. Para estruturas nas quais sementes

T2 estão disponíveis, eventos de transformação diferentes são analisados. Geralmente, 20 plantas selecionadas aleatoriamente de cada evento são transferidas para o meio limitante de nitrogênio e permite-se que elas cresçam por 3- 4 semanas adicionais e são pesadas individualmente no final daquele período. As plantas transgênicas são comparadas às plantas de controle cultivadas paralelamente sob as mesmas condições. Plantas transgênicas falsas expressando o gene repórter uidA (GUS) sob o mesmo promotor, ou plantas transgênicas carregando o mesmo promotor mas sem um gene repórter, são utilizadas como controle.

[00309] Determinação do nitrogênio - 0 procedimento para a determinação da concentração de N (nitrogênio) nas partes estruturais das plantas envolve o método de digestão de persulfato de potássio para converter o N orgânico em NO3- (Purcell e King 1996 Argon. J. 88:111- 113), a redução mediada de Cd- modificada de NO3- a NO2- (Vodovotz 1996 Biotechniques 20:390-394) e a medição de nitrito pelo ensaio de Griess (Vodovotz 1996, supra). Os valores de absorvência são medidos a 550 nm em relação a uma curva padrão de NaNO2. 0 procedimento é descrito em detalhes em Samonte et al. 2006 Agron. J. 98:168-176.

[00310] Testes de germinação - Os testes de germinação comparam o percentual de sementes de plantas transgênicas que poderiam completar o processo de germinação ao percentual de sementes das plantas de controle que são tratadas da mesma maneira. Condições normais são consideradas, por exemplo, incubações a 22°C sob ciclos diários de 22 horas de luz e 2 horas de escuro. A avaliação da germinação e do vigor da muda é realizada entre 4 e 14 dias após o plantio. 0 meio basal é o meio MS a 50% (Murashige e Skoog, 1962 Plant Physiology 15, 473-497).

[00311] A germinação também é verificada em condições desfavoráveis como o frio (incubação a temperaturas inferiores a 10°C ao invés de 22°C) ou utilizando soluções para inibição da semente que contenham concentrações elevadas de um osmólito como o sorbitol (em concentrações de 50 mM, 100 mM, 200 mM, 300 mM, 500 mM e até 1000 mM) ou aplicando concentrações crescentes de sal (de 50 mM, 100 mM, 200 mM, 300 mM, 500 mM de NaCl).

[00312] 0 efeito do transgene sobre o vigor, a taxa de crescimento, a biomassa, a produção e/ou o teor de óleo da planta pode ser determinado utilizando métodos conhecidos. [003131 Vigor da planta - 0 vigor da planta pode ser calculado pelo aumento dos parâmetros de crescimento como a área de folha, o comprimento das fibras, o diâmetro da roseta, o peso fresco da planta e parâmetros semelhantes por período. [003141 Taxa de crescimento - A taxa de crescimento pode ser medida utilizando a análise digital de plantas cultivadas. Por exemplo, as imagens das plantas cultivadas em estufa com base no terreno podem ser capturadas a cada 3 dias e a área da roseta pode ser calculada por análise digital. 0 crescimento da área da roseta é calculado utilizando a diferença da área da roseta entre os dias de amostragem dividida pela diferença em dias entre as amostras.

[00315] A avaliação da taxa de crescimento pode ser realizada medindo a biomassa produzida da planta, o tamanho da folha ou o comprimento da raiz por período (pode ser medido em cm2 por dia de área de folha).

[00316] A Área de Crescimento Relativo pode ser calculada utilizando a Fórmula II.

Fórmula II: Área da Taxa de Crescimento Relativo = Coeficiente de regressão da área ao longo do tempo.

[00317] Desse modo, a taxa da área de crescimento relativo está nas unidades das unidades da área (p.ex., mmz/dia ou cm2/dia) e a taxa de crescimento relativo do comprimento está nas unidades das unidades de comprimento (p.

ex., cm/dia ou mm/dia).

[00318] Por exemplo, a RGR pode ser determinada para altura da planta (Fórmula III), SPAD (Fórmula IV), Número de perfilhas (Fórmula V), comprimento da raiz (Fórmula VI), crescimento vegetal (Fórmula VII), número de folhas (Fórmula VIII), área da roseta (Fórmula IX), diâmetro da roseta (Fórmula X), cobertura de lote (Fórmula XI), área de lâmina foliar (Fórmula XII) e área da folha (Fórmula XIII). Fórmula III: Taxa de crescimento relativo da Altura da planta = Coeficiente de regressão da Altura da planta ao longo do curso de tempo (medido em cm/dia).

Fórmula IV: Taxa de crescimento relativo de SPAD = Coeficiente de regressão de medições SPAD ao longo do curso de tempo.

Fórmula V: Taxa de crescimento relativo do Números de perfilhos = Coeficiente de regressão do Número de perfilhos ao longo do curso de tempo (medido em unidades de "número de perfilhos/dia").

Fórmula VI: Taxa de crescimento relativo do comprimento da raiz = Coeficiente de regressão do comprimento da raiz ao longo do curso de tempo (medido em cm por dia).

Análise da taxa de crescimento vegetal - foi calculada de acordo com a Fórmula VII, abaixo.

Fórmula VII: Taxa de crescimento relativo do crescimento vegetal = Coeficiente de regressão do peso vegetal ao longo do curso de tempo (medido em gramas por dia).

Fórmula VIII: Taxa de crescimento relativo do número de folhas = Coeficiente de regressão do número de folhas ao longo do curso de tempo (medido em número por dia).

Fórmula IX: Taxa de crescimento relativo das áreas de roseta = Coeficiente de regressão da área de roseta ao longo do curso de tempo (medido em cm2 por dia).

Fórmula X: Taxa de crescimento relativo do diâmetro da roseta Coeficiente de regressão do diâmetro da roseta ao longo do curso de tempo (medido em cm por dia).

Fórmula XI: Taxa de crescimento relativo da cobertura de lote Coeficiente de regressão de lote ao longo do curso de tempo (medido em cm2 por dia).

Fórmula XII: Taxa de crescimento relativo da área de lâmina foliar = Coeficiente de regressão da área da folha ao longo do curso de tempo (medido em cm2 por dia).

Fórmula XIII: Taxa de crescimento relativo da área da folha = Coeficiente de regressão da área da folha ao longo do curso de tempo (medido em cm2 por dia). Fórmula XIV: Peso de 1000 Sementes = número de sementes na amostra/peso da amostra X 1000.

O Índice de Colheita pode ser calculado utilizando as Fórmulas XV, XVI, XVII, XVIII e XXXVII abaixo.

Fórmula XV: Índice de Colheita (semente) = Produção média de sementes por planta/peso seco médio.

Fórmula XVI: Índice de Colheita (Sorgo) = Peso seco médio do grão por Cabeça/ (peso seco médio vegetal por Cabeça + peso seco médio por cabeça) Fórmula XVII: Índice de Colheita (Milho) = Peso médio do grão por planta/ (peso seco médio vegetal por planta mais peso médio do grão por planta)

índice de Colheita (para cevada) - 0 índice de colheita é calculado usando a Fórmula XVIII.

Fórmula XVIII: Índice de Colheita (para cevada e trigo) = Peso seco médio da espiga por planta / (peso seco médio vegetal por planta + peso médio da espiga por planta)

[00319] A seguir encontra-se uma lista não limitada de parâmetros adicionais que podem ser detectados, a fim de mostrar o efeito da transgenia sobre os tratos das plantas desejados.

Fórmula XIX: Circularidadedo grão = 4 x 3,14 (área de grão / perímetro 2 ) Fórmula XX: volume entrenó = 3,14 x (d/2) 2 x 1.

Fórmula XXI: Peso de espigas normalizado por planta + peso seco vegetal.

Fórmula XXII: Razão Raiz/Broto = peso total da raiz na colheita / peso total da parte vegetal acima do solo no momento da colheita.

(=RBiH/BiH) Fórmula XXIII: Razão entre o número de vagens por nó na haste principal em conjunto vagens = Número total de vagens na haste principal / número total de nós na haste principal.

Fórmula XXIV: Razão do número total de sementes na haste principal para o número de sementes em ramos laterais = Número total de sementes na haste principal no conjunto de vagens / Número total de sementes em ramos laterais em conjunto de vagens. Fórmula XXV: Área Relativa do Pecíolo = (Área do pecíolo) / Área de roseta (medida em %). Fórmula XXVI: porcentagem (%) de perfilhes reprodutivos = Número de perfilhos reprodutivos / número de perfilhos) X 100. Fórmula XXVII: Ïndice de Espigas = Peso médio da espiga por planta / (peso seco médio vegetal por planta mais Peso médio da Espiga por planta) Fórmula XXVIII: Taxa de crescimento relativo da cobertura da raiz = Coeficiente de regressão da cobertura da raiz ao longo do curso de tempo.

Fórmula XXIX: Produção de óleo da Semente = Produção de sementes por planta (g.) * % de Óleo na semente. Fórmula XXX: Razão broto/raiz = peso total da parte vegetal acima do solo no momento da colheita / peso total da raiz na colheita. (=RBiH/BiH) Fórmula XXXI: Índice de Espiguetas = Peso médio da espigueta por planta / (peso seco médio vegetal por planta mais peso médio da espigueta por planta) Fórmula XXXII: % Cobertura da Copa = (1-(PAR ABAIXO/PAR ACIMA))xl00.

Fórmula XXXIII: fração de massa foliar = Área da folha / do broto.

Fórmula XXXIV: Taxa de crescimento relativo com base no peso seco = Coeficiente de regressão do peso seco ao longo do curso de tempo. Fórmula XXXV: Matéria seca total (para Milho) = Peso de espigas normalizado por planta + peso seco vegetal.

Fórmula XXXVI: NUE Apronâmico = Produção por planta (Kg.) XFertilizaç~o por Nitrogénio-Produção por planta (K.) 0% Fertilização porNitirogénio Fertilizante X Fórmula XXXVII: Índice de Colheita (Brachypodium) = Peso médio dos grãos/peso seco vegetal (vegetal + espigueta) por planta.

Fórmula XXXVIII: Índice de Colheita por Sorgo* (* quando as plantas não estão secas) = FW (fresh weightipeso fresco) das Cabeças/(FW das Cabeças + FW das Plantas) Taxa de preenchimento do grão [mg/dia] - Taxa de cúmulo de matéria seca no grão. A taxa de preenchimento do grão é calculada utilizando a Fórmula XXXIX.

Fórmula XXXIX: Taxa de preenchimento do grão [mg/dia] = [Peso do grão*espiga-I x 1000] / [Número de grão*espiga-1] x Duração do preenchimento do grão].

[00320] Concentração de proteína no grão - 0 teor de proteína no grão (g de proteína no grão m-2) é estimado como o produto da massa do grão N (g de N do m-z) multiplicado pela taxa de conversão de N/proteína de k-5,13 (Mosse 1990, supra). A concentração de proteína no grão é estimada como a relação do teor de proteína no grão por massa unitária do grão (g de proteína no grão kg-1 do grão).

[00321] Comprimento da fibra - 0 comprimento das fibras pode ser medido utilizando um fibrógrafo. 0 sistema de fibrógrafo foi utilizado para computar o comprimento em termos de comprimento "Médio da Metade Superior". A média da metade superior (UHM 1 upper half mean) é o comprimento médio da metade mais longa da distribuição das fibras. 0 fibrógrafo mede o comprimento em comprimentos de envergadura em um determinado ponto percentual (cottoninc (ponto) com/ClassificationofCotton/?Pg=4#Length).

[00322] De acordo com algumas aplicações da invenção, o aumento da produção de milho pode ser manifestado como um ou mais dos seguintes itens: aumento do número de plantas por área de cultivo, aumento do número de espigas por planta, aumento do número de fileiras por espiga, número de grãos por fileira da espiga, o peso do grão, o peso de mil grãos (peso por 1000), comprimento/diâmetro da espiga, aumento do teor de óleo por grão e aumento do teor de amido por grão.

[00323] Conforme mencionado, o aumento da produção da planta pode ser determinado por vários parâmetros. Por exemplo, o aumento da produção de arroz pode ser manifestado por um aumento de um ou mais dos seguintes itens: número de plantas por área de cultivo, número de panículas por planta, número de espiguetas por panícula, número de flores por panícula, aumento da taxa de enchimento da semente, aumento do peso por mil grãos (peso por 1000), aumento do teor de óleo por semente, aumento do teor de amido por semente, entre outros. Um aumento na produção também pode resultar na arquitetura modificada, ou pode ocorrer por causa da arquitetura modificada.

[00324] De modo semelhante, o aumento da produção da soja pode ser manifestado por um aumento de um ou mais dos seguintes itens: número de plantas por área de cultivo, número de vagens por planta, número de sementes por vagem, aumento da taxa de enchimento da semente, aumento no peso de 1000 sementes (peso por 1000), redução da dilaceração das vagens, aumento do teor de óleo por semente, aumento do teor de proteínas pro semente, entre outros. Um aumento na produção também pode resultar na arquitetura modificada, ou pode ocorrer por causa da arquitetura modificada.

[00325] 0 aumento da produção da canola pode ser manifestado por um aumento de um ou mais dos seguintes itens: número de plantas por área de cultivo, número de vagens por planta, número de sementes por vagem, aumento da taxa de enchimento da semente, aumento no peso de 1000 sementes (peso por 1000), redução da dilaceração das vagens, aumento do teor de óleo por semente, entre outros. Um aumento na produção também pode resultar na arquitetura modificada, ou pode ocorrer por causa da arquitetura modificada.

[00326] 0 aumento da produção do algodão pode ser manifestado por um aumento de um ou mais dos seguintes itens: número de plantas por área de cultivo, número de cápsulas por planta, número de sementes por cápsula, aumento da taxa de enchimento da semente, aumento no peso de mil sementes (peso por 1000), aumento do teor de óleo por semente, melhora do comprimento das fibras, resistência das fibras, entre outros.

Um aumento na produção também pode resultar na arquitetura modificada, ou pode ocorrer por causa da arquitetura modificada.

[00327] Teor de óleo - 0 teor de óleo de uma planta pode ser determinado pela extração do óleo da semente ou da porção vegetal da planta. Brevemente, os lipídeos (óleo) podem ser removidos da planta (p.ex., semente) moendo o tecido da planta na presença de solventes específicos (p.ex., hexano ou éter de petróleo) e extraindo o óleo em um extrator contínuo. A análise indireta do teor de óleo pode ser realizada utilizando vários métodos conhecidos como a Espectroscopia de Ressonância Magnética Nuclear (NMR 1 nuclear magnetic resonance), que mede a energia de ressonância absorvida pelos átomos de hidrogênio no estado líquido da amostra [Vide, p.ex., Conway TF. e Earle FR., 1963, Journal of the American Oil Chemists' Society; Springer Berlin / Heidelberg, ISSN: 0003-021X (Impresso) 1558-9331. (Online)]; a Espectroscopia no Infravermelho Próximo (NI 1 near infrared), que utiliza a absorção de energia infravermelha próxima (1100-2500 nm) pela amostra; e um método descrito no W0/200l/023884, que é com base na extração de óleo com solvente, evaporando o solvente em uma corrente gasosa que forma partículas de óleo e direcionando uma luz para a corrente de gás e nas partículas de óleo, que forma uma luz

'/ '.i - ~ 17 d~ ~ 1 ~ ~Y ~~ r~ ~, ~' q G.

H refletida detectável.

[00328] Dessa forma, a presente invenção é de alto valor agrícola para promover a produção de culturas comercialmente desejadas (p.ex., biomassa de um órgão vegetal como a madeira do choupo, ou de um órgão reprodutor como o número de sementes ou a biomassa da semente).

[00329] Quaisquer das plantas transgênicas descritas acima ou partes delas podem ser processadas para produzir um alimento, uma ração, proteína ou preparação de óleo, como para animais ruminantes.

[00330] As plantas transgênicas descritas acima, que exibem um aumento do teor de óleo, podem ser utilizadas para produzir óleo vegetal (extraindo o óleo da planta).

[00331] 0 óleo vegetal (incluindo o óleo da semente e/ou o óleo da porção vegetal) produzido de acordo com o método da invenção pode ser combinado com uma variedade de outros ingredientes. Os ingredientes específicos incluídos em um produto são determinados de acordo com a utilização pretendido. Produtos exemplares incluem ração animal, matéria-prima para modificação química, plástico biodegradável, produto alimentício misturado, óleo edível, biocombustível, óleo de cozinha, lubrificante, biodiesel, salgadinhos, cosméticos e matéria-prima para processo de fermentação. Produtos exemplares a serem incorporados no óleo vegetal incluem rações animais, produtos alimentícios humanos como salgadinhos extrudados, pães, como um agente de ligação aos alimentos, rações para aquacultura, misturas fermentáveis, suplementos alimentares, bebidas desportivas,

barras alimentícias nutricionais, suplementos multivitamínicos, bebidas dietéticas e cereais.

[00332] De acordo com algumas aplicações da invenção, o óleo compreende um óleo de semente.

[00333] De acordo com algumas aplicações da invenção, o óleo compreende um óleo da porção vegetal (o óleo da porção vegetal da planta).

[00334] De acordo com algumas aplicações da invenção, a célula de planta forma uma parte da planta.

[00335] De acordo com outra aplicação da presente invenção, é fornecido um alimento ou ração, compreendendo as plantas ou uma parte respectiva da presente invenção.

[00336] Conforme utilizado aqui, o termo "cerca de" refere-se a ± 10%.

[00337] Os termos "compreende", "compreendendo", "inclui", "incluindo", "apresentando" e suas conjugações significam "incluindo, mas não se limitando a".

[00338] O termo "consistindo de" significa "incluindo e limitado(a) a".

[00339] 0 termo "consistindo essencialmente de" significa que a composição, método ou estrutura pode incluir ingredientes, etapas e/ou partes adicionais, mas somente se os ingredientes, etapas e/ou partes adicionais não alterarem materialmente as características básicas e novas da composição, método ou estrutura reivindicado.

[00340] Conforme utilizada aqui, a forma singular "um", "uma" e "o/a" incluem referências no plural, exceto se o contexto claramente especificar o contrário. P.ex., o termo

"um composto" ou "pelo menos um composto" pode incluir uma pluralidade de compostos, incluindo misturas deles.

[00341] Ao longo do presente pedido, várias aplicações dessa invenção podem ser apresentadas em formato variado. Deve-se compreender que a descrição em formato variado é meramente para conveniência e brevidade e não deverá ser considerada como uma limitação inflexível do escopo da invenção. Portanto, a descrição de uma variedade deve ser considerada como tendo especificamente revelado todas as subvariações possíveis, bem como os valores numéricos individuais dentro daquela variação. Por exemplo, a descrição de uma variação como a de 1 a 6 deve ser considerada como tendo especificamente revelado subvariações como de 1 a 3, de 1 a 4, de 1 a 5, de 2 a 4, de 2 a 6, de 3 a 6, etc., bem como números individuais dentro daquela variação, p.ex., 1, 2, 3, 4, 5 e 6. Isso se aplica independente da amplitude da variação.

[00342] Sempre que uma variação numérica for indicada no presente documento, isso significa incluir qualquer numeral citado (fracional ou integral) dentro da variação indicada. As frases "variando/varia entre" um primeiro número indicado e um segundo número indicado e "variando/varia de" um primeiro número indicado "a" a um segundo número indicado são utilizadas aqui intercambiavelmente e significam incluir o primeiro e o segundo números indicados e todos os numerais fracionais e integrais entre eles.

[00343] Conforme utilizado aqui, o termo "método"

refere-se a maneiras, meios, técnicas e procedimentos para realizar uma determinada tarefa incluindo, mas não se limitando àquelas maneiras, meios, técnicas e procedimentos sejam conhecidas, ou prontamente desenvolvidas a partir de maneiras, meios, técnicas e procedimentos conhecidos por profissionais das técnicas química, farmacológica, biológica, bioquímica e médica.

[00344] Quando for feita referência à listagens de sequências específicas, tal referência deverá ser entendida como abrangendo também sequências que correspondem substancialmente à sua sequência complementar, como se incluindo variações de sequências menores, resultantes de, p.ex., erros de sequenciação, erros de clonagens ou outras alterações que resultem na substituição base, na eliminação base ou na adição base, desde que a frequência de tais variações seja menor que 1 em 50 nucleotídeos, de forma alternativa, menor que 1 em 100 nucleotídeos, de forma alternativa, menor que 1 em 200 nucleotídeos, de forma alternativa, menor que 1 em 500 nucleotídeos, de forma alternativa, menor que 1 em 1.000 nucleotídeos, de forma alternativa, menor que 1 em 5.000 nucleotídeos, de forma alternativa, menor que 1 em 10.000 nucleotídeos.

[00345] Deve-se observar que determinadas características da invenção, que são, para fins de esclarecimento, descritas no contexto de aplicações separadas, também podem ser apresentadas em combinação em uma única aplicação. Inversamente, várias características da invenção, que são, para propósitos de brevidade, descritas no contexto de uma única aplicação, também podem ser apresentadas separadamente ou em qualquer subcombinação adequada ou da forma apropriada em qualquer outra aplicação descrita da invenção. Determinadas características descritas no contexto de várias aplicações não devem ser consideradas características essenciais dessas aplicações, a menos que a aplicação seja inoperante sem esses elementos.

[00346] Várias aplicações e aspectos da presente invenção são delineados acima e, conforme reivindicado na seção de reivindicações abaixo, encontram suporte experimental nos exemplos a seguir.

EXEMPLOS

[00347] Referência agora é feita aos exemplos a seguir que, juntamente com as descrições acima, ilustram algumas aplicações da invenção de forma não limitante.

[00348] Geralmente, a nomenclatura utilizada no presente documento e os procedimentos laboratoriais utilizados na presente invenção incluem técnicas moleculares, bioquímicas, microbiológicas e de DNA recombinante. Essas técnicas são explicadas minuciosamente na literatura. Vide, p.ex., "Molecular Cloning: A laboratory Manual" Sambrook et al., (1989); "Current Protocols in Molecular Biology" Volumes I-III Ausubel, R. M., ed. (1994); Ausubel et al., "Current Protocols in Molecular Biology", John Wiley e Sons, Baltimore, Maryland (1989) ; Perbal, "A Practical Guide to Molecular Cloning", John Wiley & Sons, New York (1988); Watson et al., "Recombinant DNA", Scientific American Books, New York; Birren et al. (eds) "Genome Analysis: ALaboratory Manual

Series", Vols. 1-4, Cold Spring Harbor Laboratory Press, New York (1998); metodologias, conforme definidas nas Patentes Norte-Americanas NO 4.666.828; 4.683.202; 4.801.531;

5.192.659 e 5.272.057; "Cell Biology: A Laboratory Handbook", Volumes 1-III Cellis, J. E., ed. (1994); "Current Protocols in Immunology" Volumes I-III Coligan J. E., ed. (1994); Stites et al. (eds), "Basic e Clinical Immunology" (8th Edition), Appleton & Lange, Norwalk, CT (1994); Mishell e Shiigi (eds), "Selected Methods in Cellular Immunology", W. H. Freeman e Co., New York (1980); imunoensaios disponíveis são extensivamente descritos na literatura científica e de patentes, vide, p.ex., as Patentes Norte-Americanas N°

3.791.932; 3.839.153; 3.850.752; 3.850.578; 3.853.987;

3.867.517; 3.879.262; 3.901.654; 3.935.074; 3.984.533;

3.996.345; 4.034.074; 4.098.876; 4.879.219; 5.011.771 e

5.281.521; "Oligonucleotide Synthesis" Gait, M. J., ed.

(1984); "Nucleic Acid Hybridization" Hames, B. D., e Higgins S. J., eds. (1985); "Transcription e Translation" Hames, B.

D., e Higgins S. J., Eds. (1984); "Animal Cell Culture" Freshney, R. I., ed. (1986); "Immobilized Cells e Enzymes" IRL Press, (1986); "A Practical Guide to Molecular Cloning" Perbal, B., (1984) e "Methods in Enzymology" Vol. 1-317, Academic Press; "PCR Protocols: A Guide To Methods e Applications", Academic Press, San Diego, CA (1990); Marshak et al., "Strategies for Proteína Purification e Characterization - A Laboratory Course Manual" CSHL Press (1996); todos os quais são incorporados por referência como se totalmente estabelecidos no presente documento. Outras referências gerais são apresentadas ao longo do presente documento. Acredita-se que os procedimentos descritos nessas obras sejam bem conhecidos na técnica e são fornecidos para a conveniência do leitor. Todas as informações contidas nelas são incorporadas aqui por referência.

MÉTODOS EXPERIMENTAIS E DE BIOINFORMÁTICA EM GERAL.

[00349] Extração de RNA - Tecidos cultivados em diversas condições de cultivo (conforme descrito abaixo) foram amostrados e o RNA foi extraído utilizando Reagente TRIzol da Invitrogen [http://www (ponto) invitrogen (ponto) com/content (ponto)cfm?pageid=469]. Aproximadamente 30-50 mg de tecido foram coletados das amostradas. Os tecidos pesados foram triturados utilizando pilão e almofariz em nitrogênio líquido e ressuspensos em 500 µl de Reagente TRIzol. Ao usado homogeneizado, 100 gl de clorofórmio foram adicionados seguidos por precipitação utilizando isopropanol e duas lavagens com etanol a 75%. 0 RNA foi eluído em 30 gl de água livre de RNase. As amostras de RNA foram limpas utilizando o protocolo de limpeza como minikit RNeasy da Qiagen de acordo com o protocolo do fabricante (QIAGEN Inc., CA EUA). Para conveniência, cada tipo de tecido com informações de expressão de microarranjo recebeu uma Identificação do conjunto da expressão.

[00350] Análise de correlação - foi realizada para genes selecionados, de acordo com algumas aplicações da invenção, nos quais os parâmetros caracterizados (parâmetros medidos de acordo com as Identidades de correlação) foram utilizados como "eixo X" para a correlação com o transcriptoma do tecido que foi utilizado como "eixo Y". Para cada gene e parâmetro medido, foi calculado um coeficiente de correlação "R", utilizando a correlação de Ervilharson junto de um valor- p para a significáncia da correlação. Quando o coeficiente de correlação (R) entre os níveis de uma expressão de gene em um determinado tecido e um desempenho fenotípico através de ecotipos/variedade/híbrido é alto em valor absoluto (entre 0,5-1), há uma associação entre o gene (especificamente o nível de expressão desse gene) e a característica fenotípica (p.ex., aumento na produção, taxa de crescimento, eficiência no uso de nitrogênio, tolerância ao estresse abiótico e semelhantes). EXEMPLO 1

IDENTIFICAÇÃO DE GENES QUE AUMENTAM A EFICIÊNCIA NO USO DE NITROGÊNIO (NUE), EFICIÊNCIA NO USO DE FERTILIZANTE (FUE), PRODUÇÃO, TAXA DE CRESCIMENTO, VIGOR, BIOMASSA, TEOR DE ÓELO, TOLERÂNCIA AO ESTRESSE ABIÓTICO (ABST) E/OU EFICIÊNCIA NO USO DA ÁGUA (WUE) EM PLANTAS.

{00351] Os presentes inventores identificaram polinucleotídeos cuja regulação ascendente de expressão respectiva em plantas aumenta a eficiência no uso do nitrogênio (NUE), eficiência no uso de fertilizantes (FUE), produção (p.ex., produção de sementes, produção de óleo, biomassa, qualidade e/ou quantidade de grãos), taxa de crescimento, vigor, biomassa, teor de óleo, produção de fibra, qualidade da fibra, comprimento da fibra, tolerância ao estresse abiótico (ABST) e/ou eficiência no uso da água (WUE) de uma planta.

[00352] Todos os conjuntos de dados da sequência de nucleotídeos utilizados aqui foram originados a partir das bases de dados disponíveis publicamente ou de sequências obtidas utilizando a tecnologia Solexa (p.ex., Cevada e Sorgo). Os dados da sequência de 100 espécies diferentes de planta foram introduzidos em uma base de dados abrangente,

única.

Outras informações na expressão de gene, anotação de proteína, enzimas e caminhos também foram incorporadas.

As principais bases de dados utilizadas incluem: • Genomas:

o Genoma de Arabidopsis [Genoma TAIR, versão 6 (Arabidopsis

(ponto) org/)];

o Genoma de arroz [estrutura IRGSP 4.0 (rgp (ponto) dna (ponto) affrc (ponto) go (ponto) jp/IRGSP/)]; o Choupo [Populus trichocarpa, liberação 1.1 de JGI

(liberação conjunta v1.0) (genome (ponto) jgi-psf (ponto)

org/)];

o Brachypodium [conjunto 4x JGI, brachpodium (ponto) org)];

o Soja [DOE-JGI SCP, versões Glyma0 ou Glymal (phytozome

(ponto) net/)];

o Uva [Consórcio Público Franco-Italiano para Caracterização do Genoma de Videiras (genoscope (ponto) ens (ponto) fir /)]; o Mamona [TIGR/J, Instituto Craig Venter, conjunto 4x [(msc

(ponto) jevi (ponto) org/rcommunis];

o Sorgo [DOE-JGI SCP, versão Sbil [phytozome (ponto) net/)];

o Milho [milhosequence (ponto) org/];

o Pepino [cucumber (ponto) genomics (ponto) org (ponto)

cn/page/cucumber/index (ponto) jsp]

o Tomate [solgenomics (ponto) net/tomato!] o Mandioca [phytozome (ponto) net/cassava (ponto) php] • Sequências expressas de EST e mRNA foram extraídas das seguintes bases de dados: o GenBank (ncbi (ponto) nlm (ponto) nih (ponto) gov/ Genbank/); o RefSeq (ncbi (ponto) nlm (ponto) nih (ponto) gov/RefSeq/); o TAIR (Arabidopsis (ponto) org/); • Bases de dados de proteínas e caminhos: o Uniprot [uniprot (ponto) org/].

o AraCyc [Arabidopsis (ponto) org/biocyc/index (ponto) jsp]. o ENZYME [expasy (ponto) org/enzyme/].

• Os conjuntos de dados de microarranjos foram baixados de: o GEO (ncbi.nlm.nih.gov/geo/) o TAIR (Arabidopsis.org/).

o Dados de microarranjos de propriedade exclusiva (Vide W02008/122980 e Exemplos 3-13 abaixo).

• Informações de QTL e SNPs: o Gramene [gramene (ponto) org/qtl/].

o Panzea [panzea (ponto) org/index (ponto) html]. o Soja QTL: [soybeanbreederstoolbox(ponto) com/].

[00353] Conjunto da Base de Dados - foi elaborado para constituir uma base de dados ampla, rica, detalhada, confiável e fácil, compreendendo sequências genômicas de mRNA, ESTs, DNA, publicamente disponíveis, dados de várias culturas, bem como dados de expressão genética, anotação e caminho de proteínas, dados de QTLs e outras informações relevantes.

[00354] 0 conjunto de bases de dados compreende uma caixa de ferramentas de aprimoramento, estruturação, anotação genético e ferramentas de análise que permitem construir uma base de dados sob medida para cada projeto de descoberta genética. As ferramentas de aprimoramento e estruturação genético(a) permitem detectar confiavelmente variantes reunidas e transcritos antissentido, gerando a compreensão de vários resultados fenotïpicos potenciais de um único gene. As capacidades da plataforma "LEADS" da Compugen LTD de analisar o genoma humano foram confirmadas e aceitas pela comunidade científica [vide, p.ex., "Widespread Antisense Transcription", Yelin, et al. (2003) Nature Biotechnology 21, 379-85; "Splicing of Alu Sequences", Lev- Maor, et al. (2003) Science 300 (5623), 1288-91; "Computational analysis of alternative splicing using EST tissue information", Xie H et al. Genomics 2002] e comprovaram ser mais eficientes na genômica vegetal, também.

[00355] Conjunto genético e agrupamento EST - Para o agrupamento genético e o agrupamento de organismos com dados disponíveis da sequência genômica (Arabidopsis, arroz, mamona, uva, brachypodium, choupo, soja, sorgo), foi utilizada a versão genômica (GANG) do LEADS. Essa ferramenta permite o agrupamento mais preciso de sequências de ESTs e mRNA no genoma e prevê a estrutura genética, bem como, eventos alternativos de agrupamento e transcrição antissentido.

[00356] Para organismos sem dados completos de sequência genômica disponíveis, o software de agrupamento

"expressed LEADS" foi aplicado.

[00357] Anotação genética - Genes e proteínas previstos foram anotados conforme segue: A busca de comparação de sequências [blast (ponto) ncbi (ponto) nlm (ponto) nih (ponto) gov /Blast (ponto) cgi] contra todos os UniProt da planta [uniprot (ponto) org/] foi realizada. Estruturas de leitura abertas de cada transcrito putativo foram analisadas e o ORE' mais longo com o número maior de homólogos foi selecionado como a proteína prevista do transcrito. As proteínas previstas foram analisadas pelo InterPro [ebi (ponto) ac (ponto) uk/interpro/].

[00358] A comparação contra proteínas das bases de dados AraCyc e ENZYME foi utilizada para mapear os transcritos previstos com os caminhos da AraCyc.

[00359] As proteínas previstas de diferentes espécies foram comparadas utilizando o algoritmo de comparação [ncbi (ponto) nlm (ponto) nih (ponto) gov /Blast (ponto) cgi] para validar a exatidão da sequência de proteínas prevista e para a detecção eficiente de ortólogos.

[00360] Perfil da expressão genética - Diversas fontes de dados foram exploradas quanto ao perfil da expressão genética, a saber, dados de microarranjo e perfil de expressão digital (veja abaixo). De acordo com o perfil da expressão genética, uma análise de correlação foi realizada para identificar genes que são corregulados sob diferentes estágios de desenvolvimento e condições ambientais e associados com diferentes fenótipos.

[00361] Conjuntos de dados de microarranjos disponíveis publicamente foram baixados dos sites TAIR e NCBI GEO, renormalizados e integrados na base de dados. O perfil de expressão é um dos mais importantes dados de recursos para identificar genes importantes para a produção.

[00362] Um resumo digital do perfil de expressão foi compilado para cada agrupamento de acordo com todas as palavras-chave incluídas nos registros da sequência compreendendo o agrupamento. A expressão digital, também conhecida como Northern Blot eletrônico, é uma ferramenta que exibe o perfil virtual da expressão com base nas sequências EST que formam o agrupamento genético. A ferramenta apresenta o perfil da expressão de um agrupamento em termos de anatomia da planta (p.ex., o tecido/órgão no qual o gene é expresso), o estágio de desenvolvimento (os estágios de desenvolvimento nos quais um gene pode ser encontrado) e o perfil de tratamento (apresenta as condições fisiológicas sob as quais um gene é expresso, como seca, frio, infecção por patógeno, etc.). Dada a distribuição aleatória de ESTs nos diferentes agrupamentos, a expressão digital apresenta um valor de probabilidade que descreve a probabilidade de um agrupamento apresentar um total de N ESTs para conter X ESTs de uma determinada coleção de bibliotecas. Para os cálculos de probabilidade, leva-se em consideração o seguinte: a) o número de ESTs no agrupamento, b) o número de ESTs das bibliotecas envolvidas e relacionadas, c) o número geral de ESTs disponíveis representando a espécie. Desse modo, agrupamentos com baixos valores de probabilidade são altamente enriquecidos com ESTs do grupo de bibliotecas de interesse indicando uma expressão especializada.

[00363] Recentemente, a precisão desse sistema foi demonstrada por Portnoy et al., 2009 (Analysis Of The Melon Fruit Transcriptome Based On 454 Pyrosaquencing) em: XVII Conferência de Genomas Vegetais e Animais, San Diego, CA. A análise transcriptômica com base na abundância relativa de ESTs nos dados foi realizada pelo pirosequenciamento 454 de cDNA representando o mRNA do melão. Quatorze amostras de cDNA de fita dupla obtidas de dois genótipos, dois tecidos de frutas (polpa e casca) e quatro estágios de desenvolvimento foram sequenciados. 0 pirosaquenciamento por GS FIX (Roche/454 Life Sciences) de amostras de cDNA não normalizadas e purificadas renderam 1.150.657 etiquetas de sequências expressas (ESTs) que se agruparam em 67.477 unigenes (32.357 singletons e 35.120 cóntigos). A análise dos dados obtidos contra a Base de Dados Genômica de Cucurbitáceas [icugi (ponto) org/] confirmou a exatidão do sequenciamento e do agrupamento. Padrões de expressão de genes selecionados encaixaram bem seus dados de qRT-PCR (reação de cadeia de polimerase de transcrição reversa).

[00364] No geral, 215 genes foram identificados como tendo um grande impacto na eficiência no uso do nitrogênio, eficiência no uso de fertilizantes, produção (p.ex., produção de sementes, produção de óleo, qualidade e/ou quantidade de grãos), taxa de crescimento, vigor, biomassa, teor de óleo, produção de fibra, qualidade da fibra, comprimento da fibra, tolerância ao estresse abiótico e/ou eficiência no uso da água quando sua expressão respectiva é aumentada em plantas.

Os genes idênticos, seus polinucleotídeos curados e sequências de polipeptídeos, bem como suas sequências atualizadas, de acordo com a base de dados GenBank, são resumidos na Tabela 1, abaixo.

Tabela 1

Polinucleotídeos identificados para aumento da eficiência no uso de nitrogênio, eficiência no uso de fertilizantes,

produção, taxa de crescimento, vigor, biomassa, teor de óleo, produção de fibra, qualidade da fibra, comprimento da fibra,

tolerância ao estresse abiótico e/ou eficiência no uso da água de uma planta.

ID SEQ. N' ID SEQ.

N° do Nome do Gene Nome do Agrupamento Organismo do Polin: Poli LNU749 cevada10v2 AV834836 cevada 1 496 LNU749 cevada 10v2 AV834836 cevada 1 712 LNU750 cevada 10v2 BE215751 cevada 2 497 LNU750 cevada10v2 BE215751 cevada 2 497 LNU751 cevada 10v2 BE413235 cevada 3 498 LNU752 cevada10v2 BE421033 cevada 4 499 LNU753 cevada10v2 BE422116 cevada 5 500 LNU754 cevada 10v2 BE601673 cevada 6 501 LNU756 cevada10v2 BF620955 cevada 7 502 LNU757 cevada 10v2 BF624113 cevada 8 503 LNU758 cevada1Ov2 BF629458 cevada 9 504 LNU759 cevada 10v2 BM376337 cevada 10 505 LNU760 cevada 12v1 CX630466 cevada 11 506 LNU761 cevada 12v1 AJ463320 cevada 12 507 LNU762 cevada 12v1 AV834698 cevada 13 508 LNU763 cevada12v1 AV836421 cevada 14 509 LNU764 cevada 12v1 AV914625 cevada 15 510 LNU766 cevada 12v1 AW983189 cevada 16 511 LNU767 cevada 12v1 BE196490 cevada 17 512 LN U76B cevada 12v1 BE216687 cevada 18 513 LNU769 cevada 12v1 BE437319 cevada 19 514 LN U770 cevada12v1 BE602491 cevada 20 515 LNU771 cevada 12v1 BF064919 cevada 21 516 LNU772 cevada12v1 BF253521 cevada 22 517 LNU773 cevada 12v1 Bí=256991 cevada 23 518 LNU774 cevada 12v1 BF258839 cevada 24 519 LNU775 cevada12v1 BF266348 cevada 25 520 LNU776 cevada 12v1 BF266777 cevada 26 521 LNU777 cevada12v1 BF628559 cevada 27 522 LNU778 cevada 12v1 BG300262 cevada 28 523 LNU779 cevada 12v1 BG309380 cevada 29 524 LNU780 cevada 12v1 81779788 cevada 30 525 LNU781 cevada 12v1 81948718 cevada 31 526 LNU782 cevada 12v1 BI950988 cevada 32 527 LNU783 cevada 12v1 BI957813 cevada 33 528 LNU784 cevada 12v1 BQ762763 cevada 34 529 LNU785 cevada 12v1 BU966731 cevada 35 530

ID SEQ.

N° ID SEQ.

N° do Nome do Gene Nome do Agrupamento Organismo do Polin: Poli p: LNU786 cevada 12v1 EX599010 cevada 36 531 LNU787 brachypodium 1 2v1 IBRADI1G37175 brachypodium 37 532 LNU788 brachypodiuml 12v1 IBRADMG51187 brachypodium 38 533 LNU789 brash odium 12v1 BRADI1G64180 brachypodium 39 534 LNU790 brachypodiumI12v1BRADl1G64950 brachypodium 40 535 LNU791 bracypodiumI 12v1 BRADI1G69030 brachypodium 41 536 LNU792 brachypodiun12v1BRADl2G51430 brachypodium 42 537 LNU793 brash odium 12v1 8RADI2G53980 brachypodium 43 538 LNU794 brash odium 12v1 BRADI3G16630T2 brash odium 44 539 LNU795 brachypodiunl 1 2v1 BRADI4G01230 brachypodium 45 540 LNU796 brash odium 1 2v1 BRADI4G05020 brachypodium 46 541 LNU797 brachypodium12v1BRADl4G07060 brachypodium 47 542 LNU798 brachypodiun12v18RAD14G27334 brachypodium 48 543 LNU799 brachypodium12v1 BRAD14G29720 brachypodium 49 544 LNU800 brachypodiumi2v1 IBRADI5G16060 brachypodium 50 545 LNU801 milho ain o 11vá PHY7S1000598M milho ain o 51 546 LNU802 milho_painçol11v3 PHY7S1000948M milho—painço 52 547 LNU803 milho ain o 11vá PHY7S1003585M milho—painço 53 548 LNU804 rnilho_painçol11vá PHY7S1009882M milho—painço 54 549 LNU805 milho_painçol11vá PHY7S1013938M milho ain o 55 550 LNU806 milho ain o 11vá PHY7S1014253M milho—painço 56 551 LNU807 milhc_painçoj 11 v3 PHY7S1021778M milho ain o 57 552 LNU808 milho ain o 11v3 PHY7S10231 99M milho—painço 58 553 LNU809 milho ain o 11v3 PHY7S1036241 M milho ain o 59 554 LNU810 milho ain o 11v3 SICRPO86135 milho ain o 60 555 LNU811 milho 10v1 AI601011 milho 61 556 LNU813 milho 10v1 AI629666 milho 62 557 LNU814 milho 10v1 AI637029 milho 63 558 LNU815 milho 10v1 A1979480 milho 64 559 LNU816 milho 10v1 AI979737 milho 65 560 LNU817 milho 10v1 AW231541 milho 66 561 LNU818 milha 10v1 AW267199 milho 67 562 LNU819 milho 10v1 AW282410 milho 68 563 LNU820 milho 10v1 AW268911 milho 69 564 LNU821 milho 10v1 ÁW497499 milho 70 565 LNU822 milho 1Ov1 AW927651 milho 71 566 LNU823 milho 10v1 BE512590 milho 72 567 LNU824 milho 10v11BE552882 milho 73 568 LNU825 milho 10v1 1BE575202 milho 74 569 LNU828 milho 10v1 1BG458848 milho 75 570 LNU829 milho 10v1 BG549052 milho 76 571 LNU830 milho 10v1 B1679654 milho 77 572 LNU831 milho 10v1 BM269210 milho 78 573 LNU832 milho 10v1 BM895367 milho 79 574 LNU833 milho 10v1 BU036574 milho 80 575 LNU834 milho 10v1 CB816561 milho 81 576 LNU835 milho 10v1 CD986056 milho 82 577 LNU837 milha 10v1 CF064369 milho 83 578 LNU838 milho 10v1 CF634284 milho 84 579 LNUB39 milho 10v1 C0523359 milho 85 580 LNU840 milha 14v1 DN208554 milho 86 581 LNU841 milho 10v1 DN225757 milho 87 582 LNU843 milho 10v1 1EE187987 milho 88 583 LNU844 milho 10v1 T18396 milho 89 584 LNU845 milho 10v1 W21625 milho 90 585 LNU846 milho b170 AF093537 milho 91 586 LNU847 medica o 12v 1AL366283 medicago 92 587 LNU848 arroz 11v1 AFO72694 arroz 93 588 LNU849 arroz11v1 AU057716 arroz 94 589 LNU850 arroz 11v1 B1306328 arroz 95 590 LNU851 arroz 11v1 B1813446 arroz 96 591

ID SEQ.

N° ID SEQ.

N° do Nome do Gene Nome do Agrupamento Organismo do Polin: Polip.

LNU852 arroz 11 v1 1CA764428 arroz 97 592 LNU853 arroz 11 v1 CB645176 arroz 98 593 LNU854 arroz 11 v1 1GFXAF377947X27 arroz 99 594 LNU856 sor o 09v1 SB10G011070 sorgo 100 595 LNU857 soro 11v1 SB10G007600 sorgo 101 596 LNU858 soro 12v1 AW285114 sorgo 102 597 LNU861 soro 12v1 BE918914 sorgo 103 598 LNU862 soro 12v1 BG356040 sorgo 104 599 LNU864 soro 12v1 CD424245 sorgo 105 600 LNU865 soro 12v1 SB0169S002030 sorgo 106 601 LNU866 soro 12v1 SBO10003110 sorgo 107 602 LNU867 soro 12v1 SB01G004510 sorgo 108 603 LNU868 soro 12v1 SB010005240 sorgo 109 604 LNU869 sorgol 1 2v1 ISBO1G006870 sorgo 110 605 LNU870 soro 1 2v1 SBO 1 G006930 sorgo 111 606 LNU871 sorgoj 1 2v1 SBO1 G007380 sorgo 112 607 LNU872 soro 12v1 SBO1G011260 sorgo 113 608 LNU873 soro 12v1 SB01G011890 sorgo 114 609 LNU874 soro 12v1 SB01G015540 sorgo 115 610 LNU875 soro 12v1 SB01G017100 sorgo 116 611 LNU876 soro 1 2v1 SBO1 G032593P1 sorgo 117 612 LNU878 soro 12v1 ISBO1G035780 sorgo 118 613 LNU879 soro 12v1 SB01G040060 sorgo 119 614 LNU880 sor o 12v1 SB01G046630 sorgo 120 615 LNU881 soro 12v1 SB01G047345 sorgo 121 616 LNU882 sor ol2v1 SBO1G048200 sorgo 122 617 LNU883 sor o12v1 SBO1G048670 sorgo 123 618 LNU884 soro 12v1 SB01G048910 soro 124 619 LNU885 soro 12v1 SBO2G001450 sorgo 125 620 LNU886 soro 12v1 SB02G002020 soro 126 621 LNU887 soro 12v1 SB02G003980 soro 127 622 LNU888 soro 12v1 SB02G009320 soro 128 623 LNU889 soro 12v1 SB02G023760 soro 129 624 LNU890 soro 12v1 SB02G027260 sorgo 130 625 LNU892 sor º 12v1 1S802G033210 sorgo 131 626 LNU893 sor a 12v1 SBO2G036470 soro 132 627 LNU894 sor o 12v1 1SB02G039430 sorgo 133 628 LNU895 sor o 12v1 SBO2G042020 sorgo 134 629 LNU896 sor o 12v1 SBO2G043060 sorgo 135 630 LNU897 soro 12v1 SBO2G043340 sorgo 136 631 LNU898 soro 12v1 SBO30001900 soro 137 632 LNU899 soro 12v1 SB030003880 sorgo 138 633 LNU900 soro 12v1 SB03G004920 soro 139 634 LNU901 soro 12v1 SBO30006670 soro 140 635 LNU902 soro 12v1 SB03G009240 sorgo 141 636 LNU903 soro 12v1 SB03G013600 sorgo 142 637 LNU904 soro 12v1 SB03G015670 sorgo 143 638 LNU905 sor a 12v1 SB03G025980 sorgo 144 639 LNU906 soro 12v1 SB03G028220 sorgo 145 640 LNU907 soro 12v1 SBO3G029160 sorgo 146 641 LNU908 sor o 12v 1S803G030720 sorgo 147 642 LNU909 soro 12v1 SB03G032235 soro 148 643 LNU910 soro 12v1 SB03G034870 sorgo 149 644 LNU911 soro 12v1 SB03G035900 soro 150 645 LNU912 soro 12v1 SB03G037390 sorgo 151 646 LNU913 soro 12v1 SB03G039370 sorgo 152 647 LNU914 soro 12v1 SB04G000560 soro 153 648 LNU915 soro 12v1 SB04G000860 soro 154 649 LNU916 oro 12v1 SB040003110 soro 155 650 LNU917 soro 12v1 SB04G005810 sorgo 156 651 LNU916 soro 12v1 SB04G005960 sorgo 157 652

ID SEQ.

N° ID SEG.

N° do Nome do Gene Nome do Agrupamento Organismo do Polin: Polip: LNU919 soro 12v1 SB04G008660 sorgo 158 653 LNU920 soro 12v1 SBO4G019220 sorgo 159 654 LNU921 soro 12v1 SBO4G023720 sorgo 160 655 LNU922 soro 12v1 SB04G031020 soro 161 656 LNU923 soro 12v1 SB04G031630 sorgo 162 657 LNU924 soro 12v1 SBO4G031790 soro 163 658 LNU925 soro 12v1 SB04G031980 sorgo 164 659 LNU926 soro 12v1 SB04G032240 soro 165 660 LNU928 soro 12v1 SS04G035530 sorgo 166 661 LNU929 soro 12v1 SB04G036780 sorgo 167 662 LNU930 soro 12v1 SB04G037720 sorgo 168 663 LNU931 soro 12v1 SB05G000570 sorgo 169 664 LNU932 soro 12v1 SB05G001300 sorgo 170 665 LNU933 soro 12v1 SB05G0D5230 sorgo 171 666 LNU934 soro 12v1 SB05G006950 sorgo 172 667 LNU935 soro 12v1 SB05G020340 sorgo 173 668 LNU936 soro 12v1 SB05G021410 sorgo 174 669 LNU938 soro 12v1 SB05G025900 soro 175 670 LNU939 soro 12v1 SB06G015080 sorgo 176 671 LNU940 soro 12v1 SB06G016140 sorgo 177 672 LNU941 soro 12v1 SB06G018480 sorgo 178 673 LNU942 soro 12v1 SB06G019950 sorgo 179 674 LNU943 soro 12v1 SB06G020900 sorgo 180 675 LNU944 soro 12v1 SB07G000250 soro 181 676 LNU945 soro 12v1 SB07G004040 sorgo 182 677 LNU946 soro 12v1 SB07G004390 sorgo 183 678 LNU947 soro 12v1 SBO7G021870 sorgo 184 679 LNU948 soro 12v1 SB07G027790 sorgo 185 680 LNU949 soro 12v1 SBO80002580 sorgo 186 681 LNU950 soro 12v1 SBO80002740 sorgo 187 682 LNU951 soro 12v1 SB080003140 sorgo 188 683 LNU952 soro 12v1 SB08G007610 sorgo 189 684 LNU953 soro 12v1 SB08G015020 sorgo 190 685 LNU954 soro 12v1 SB08G016400 sorgo 191 686 LNU955 soro 12v1 SB08G016530 sorgo 192 687 LNU956 soro 12v1 SB08G018765 sorgo 193 688 LNU957 soro 12v1 SB08G020600 sorgo 194 689 LNU958 soro 12v1 SBO8G021920 sorgo 195 690 LNU959 soro 12v1 SB09G021265 sorgo 196 691 LNU960 sor a 12v1 SBO9G021520 sorgo 197 692 LNU961 sor a 12v1 SB09G026930 sorgo 198 693 LNU962 sor a 12v1 SB09GC26990 sorgo 199 694 LNU963 sor o 12v1 SB10G002960 sorgo 200 695 LNU964 sor a 12v1 SB10G023640 sorgo 201 696 LNU965 sor o 12v1 SB1 0G026450 sorgo 202 697 LNU966 sor o 12v1 SB10G026910 sorgo 203 698 LNU967 sor o 12v1 5B10G028680 sorgo 204 699 LNU968 soro 12v1 SB10G030200 sorgo 205 700 LNU969 soro 12v1 XM 002468645 sorgo 206 701 LNU970 soja 11v1 GLYMA13G20220 soja 207 702 LNU971 tomate 11v1 AI772930 tomate 208 703 LNU972 tomate 11v1 AI775263 tomate 209 704 LNU975 tomate 11v1 BI422101 tomate 210 705 LNU976 tri o 12vá CA596628 trigo 211 706 LNU977 tri o 12vá CK152213 trigo 212 707 LNU760_H1 brachypodium12v1 JBRADI1G02117 Brach odium 213 708 LNU832_H2 saro 12v1 SBO3G013780 sorgo 214 709 LNU834_H1 saro 12v1 SBO2G003380 sor p 215 710 LNU861_H3 milho 10v1 CF635645 milho 216 711 LNU859 soro 12v1 AW677786 sorgo 217 - LNU860 soro 12v1 BE362249 sorgo 218 -

ID SEQ.

N° ID SEQ.

N° do Nome do Gene Nome do Agrupamento Organismo do Polin: Poli p: LNUB63 soro 12v1 BG410755 sorgo 219 LNU750 cevada 10v2 BE215751 cevada 220 713 LNU760 cevada10v2 CX630466 cevada 221 714 LNU771 cevadal2v1 BF064919 cevada 222 715 LNU772 cevada12v1 BF253521 cevada 223 716 LNU783 cevada 12v1 BI957813 cevada 224 528 LNU785 cevada12v1 BU986731 cevada 225 717 LNU786 cevada 12v1 EX599010 cevada 226 718 LNU787 brachypodiumli2v1 IBR.ADI1G37175 brachypodium 227 719 LNU790 brachypodiuml 12v1 IBRADI1G64950 brachypodium 228 535 LNU792 brachypodiuml 12v1 IBRADI2G51430 brachypodium 229 537 LNU793 brachypodiumll2vl 1BRAD12G53980 brachypodium 230 538 LNU795 brachypodium 12v1 IBRADI4GO1230 brachypodium 231 720 LNU801 milho ain o 11v3 PHY7SI000598M milho—painço 232 546 LNU802 milho_ ain a 11v3 PHY7SI000948M milho—painço 233 547 LNU806 milho_painçol 11 v3 PHY7SI014253M milho ain o 234 721 LNU807 milho_painçol 11 v3 PHY7SI021778M milho ain o 235 552 LNU830 milho 10v1 BI679654 milho 236 572 LNU837 milho 10v1 CF064369 milho 237 722 LNU839 milho 10v1 00523359 milho 238 580 LNU843 milho 10v1 EE187987 milho 239 723 LNU845 milha 10v1 W21625 milho 240 724 LNU847 medica a 12v1 AL3662B3 medicago 241 725 LNU848 arroz 11v1 AFO72694 arroz 242 588 LNU851 arroz 11v1 Bí813446 arroz 243 591 LNU856 soro 09v1 S810G011070 sorgo 244 726 LNU858 sorgo 12v1 AW285114 sorgo 245 727 LNU862 sor c 12v1 BG356040 sorgo 246 728 LNU864 soro 12v1 1CD424245 soro 247 600 LNU866 sor a 12v1 SBO1G003110 soro 248 729 LNU870 sor o12v1 SB010006930 sorgo 249 730 LNU873 sor a 12v1 SBO1G011890 soro 250 609 LNU876 sargol 12v1 ISBOiG032593P1 soro 251 612 LNU886 soro 12v1 SB020002020 sorgo 252 731 LNU887 sara 12v1 SB02G003980 sorgo 253 622 LNU889 soro 12v1 SBO2G023760 sorgo 254 624 LNU892 soro 12v1 SBO2G033210 sorgo 255 732 LNU896 soro 12v1 SB02G043060 sorgo 256 733 LNU897 soro 12v1 SB02G043340 sorgo 257 631 LNU902 soro 12v1 SB03G009240 sorgo 258 636 LNU905 soro 12v1 SB03G025980 sorgo 259 639 LNU906 soro 12v1 SB03G028220 sorgo 260 734 LNU908 soro 12v1 1SB03G030720 sorgo 261 735 LNU910 soro 12v1 SB03G034870 sorgo 262 736 LNU91 1 soro 12v1 1SB03G035900 sorgo 263 737 LNU914 soro 12v1 1SB04G000560 soro 264 648 LNU919 soro 12v1 SB04G008660 soro 265 653 LNU920 soro 12v1 ISB04G019220 soro 266 654 LNU921 soro 12v1 1S804G023720 soro 267 655 LNU926 soro 12v1 1S604G032240 soro 268 660 LNU929 soro 12v1 1SB04G036780 sorgo 269 662 LNU931 soro 1 2v 1SB05G000570 sorgo 270 664 LNU932 soro 12v1 SB05G001300 sorgo 271 738 LNU935 soro 12v1 SB05G020340 sorgo 272 668 LNU936 soro 12v1 SB05G021410 sorgo 273 669 LNU938 soro 12v1 SB05G025900 soro 274 670 INU946 soro 12v1 1SB07G004390 sorgo 275 678 LNU951 soro 12v1 ISBOBGGO314O sorgo 276 739 LNU954 soro 12v1 SB08G016400 sorgo 277 740 LNU956 soro 12v1 SBOBGC18765 sorgo 278 741 LNU960 soro 12v1 SB09G021520 sorgo 279 692

ID SEQ.

N° ID SEQ.

N° do Nome do Gene Nome do Agrupamento Organismo do Polin: Poli p: LNU962 sor o 12v1 SB09G026990 sorgo 280 694 LNU967 soro 12v1 1SB10G028680 sorgo 281 699 LNU969 soro 12v1 XM 002468645 sorgo 282 742 LNU972 tomate 11v1 A1775263 tomate 283 743 LNU975 tomate llv1 B1422101 tomate 284 744 LNU977 trio 12v3 CK152213 trio 285 745 LNU861H3 milha 10v1 1CF635645 milho 286 746 LNU859 soro 12v1 AW677786 sorgo 287 LNU863 sor a 12v1 BG410755 sorgo 288 - LNU749 cevada10v2 AV834836 cevada 289 747 LNU751 cevada 10v2 BE413235 cevada 290 498 LNU752 cevada10v2 BE421033 cevada 291 748 LNU753 cevada10v2 BE422116 cevada 292 500 LNU754 cevada 10v2 BE601673 cevada 293 501 LNU756 cevada10v2 BF620955 cevada 294 502 LNU757 cevada10v2 BF624113 cevada 295 503 LNU758 cevada 10v2 BF629458 cevada 296 504 LNU759 cevada 10v2 BM376337 cevada 297 505 LNU761 cevada 12v1 AJ463320 cevada 298 507 LNU762 cevada12v1 AV834698 cevada 299 508 LNU763 cevada12v1 AV836421 cevada 300 509 LN U764 cevada12v1 AV914625 cevada 301 510 LNU766 cevada 12v1 AW983189 cevada 302 749 LN U767 cevada12v1 BE196490 cevada 303 512 LNU768 cevadal2v1 BE216887 cevada 304 513 LNU769 cevadal2v1 BE437319 cevada 305 750 LNU770 cevada12v1 BE602491 cevada 306 515 LNU771 cevada 12v1 BF064919 cevada 307 516 LNU772 cevada12v1 BF253521 cevada 308 517 LNU773 cevada12v1 BF256991 cevada 309 751 LNU774 cevada12v1 BF258839 cevada 310 519 LNU775 cevada12v1 BF266348 cevada 311 520 LNU776 cevada12v1 BF266777 cevada 312 752 LNU777 cevada 12v1 BF628559 cevada 313 522 LNU778 cevada12v1 BG300262 cevada 314 523 LNU779 cevada 12v1 BG309380 cevada 315 524 LNU780 cevada12v1 B1779788 cevada 316 753 LNU781 cevada 12v1 B1948718 cevada 317 526 LNU782 cevada 12v1 181950988 cevada 318 527 LNU783 cevada 12v1 B1957813 cevada 319 528 LNU784 cevada 12v1 BQ762763 cevada 320 754 LNU785 cevada 12v1 BU986731 cevada 321 530 LNU786 cevada12v1 EX599010 cevada 322 755 LNU787 brachypodium12v1BRADI1G37175 brachypodium 323 532 LNU788 brachypodiun12v1BRADMG51187 brachypodium 324 756 LNU789 brachypodiun12v1 jBRADI1G64180 brachypodium 325 534 LNU790 brachypodiurnl 12v1 IBRAD11G64950 brachypodium 326 535 LNU791 brachypodiumll2v1 IBRADf1G69030 brachypodium 327 536 LNU792 brachypodiurnl 12v1 IBRAD2G51430 brachypodium 328 537 LNU793 brachypodium 12v1 IBRADI2GS398O brachypodium 329 538 LNU794 brachypodium 12v1 IBRADI3G16630T2 brachypodium 330 539 LNU795 brachypodium 12v1 IBRADI4GO1230 brash odium 331 757 LNU796 brachypodiuml 12v1 IBADI4G05020 brash odium 332 541 LNU797 brachypodiumi 12v1 IBRADI4GO7O6O brash odium 333 542 LNU798 brachypodiumll2vlIBRADI4G27334 brash odium 334 543 LNU799 brachypodiuml 12v1 1BRAD14G29720 brash odium 335 544 LNU800 brachypodium12v1 IBRADI5GI6060 brash odium 336 545 LNU801 milho_ ain o 11v3 PHY7S1000598M milho—painço 337 546 LNU802 milho_ ain o 11 v3 PHY7S1000948M milho ain o 338 547 LNU803 milho_ ain o 11v3 PHY7S1003585M milho—painço 339 548 LNU804 milho ain o 11v3 PHY7S1009882M milho_ ain o 340 758

ID SEQ.

N° ID SEQ.

N° do Nome do Gene Nome do Agrupamento Organismo do Polin: Polip: LNU805 milho_ ain 11v3PHY7S1013938M milho_ ain o 341 550 LNU806 milho_ ain o 11 v3 PHY7S1014253M milho ain o 342 759 LNU807 milho_ ain o 11v3 PHY7SE021778M milho—painço 343 552 LNU808 milha ain o 11v3 PHY7S1023199M milho ain o 344 553 LNU809 milho_ ain o 11v3 PHY7S1036241 M milho_ ain o 345 760 LNU811 milho 10v1 AI601011 milho 346 556 LNU813 milho 10v1 AI629666 milho 347 557 LNU814 milha 10v1 AI637029 milho 348 558 LNU815 milho 10v1 A1979480 milho 349 559 LNU816 milho 14v1 AI979737 milho 350 761 LNU817 milho 10v1 AW231541 milho 351 762 LNU818 milho 10v1 AW267199 milho 352 763 LNU819 milho 10v1 AW282410 milho 353 563 LNU820 milho 10v1 AW288911 milho 354 564 LNU821 milho 14v1 AW497499 milho 355 764 LNU822 milho 10v1 AW927651 milho 356 566 LNU823 milha 10v1 BE512590 milho 357 567 LNU824 milho 10v1 BE552882 milho 358 765 LNU825 milho 10v1 BE575202 milho 359 766 LNU828 milha 10v1 BG458848 milho 360 570 LNU829 milho 14v1 BG549052 milho 361 767 LNU830 milha 10v1 81679654 milho 362 572 LNU831 milho 10v1 BM269210 milho 363 768 LNU833 milho 10v1 BÚ036574 milho 364 769 LNU835 milho 10v1 CD986056 milho 365 577 LNU837 milho 10v1 CFO64369 milho 366 770 LNUB38 milho 14v1 CF634284 milho 367 579 LNU839 milho 10v1 C0523359 milho 368 580 LNU840 milho 10v1 1DN208554 milho 369 581 LNU841 milho 10v1 DN225757 milho 370 582 LNU843 milho 10v1 EE187987 milho 371 583 LNU844 milho 10v1 T18396 milho 372 584 LNU845 milho 10v1 W21625 milho 373 771 LNU846 milho b170 AF093537 milho 374 586 LNU847 medica o 12v1 AL366283 medicago 375 772 LNU848 arroz 11v1 AFO72694 arroz 376 588 LNU849 arroz 11v1 AU057716 arroz 377 589 LNU850 arroz 11v1 BI306328 arroz 378 590 LNU851 arroz 11v1 81813446 arroz 379 591 LNU852 arroz 11v1 1CA764428 arroz 380 592 LNU853 arroz 11v1 08645176 arroz 381 593 LNU854 arroz 11v1 1GFXAF377947X27 arroz 382 594 LNU856 soro 09v1 SB10G011070 sorgo 383 595 LNU857 soro 11v1 SB10G007600 soro 384 773 LNU858 soro 12v1 AW285114 sorgo 385 774 LNU862 soro 12v1 BG356040 sorgo 386 599 LNU864 sor a 12v1 CD424245 sorgo 387 600 LNU865 soro 12v1 SBO169S002030 soro 388 601 LNU866 sor o12v1 SBO1G003110 sorgo 389 775 LNU867 sor o12v1 SB01G004510 sorgo 390 603 LNU868 soro 12v1 SB01G005240 sorgo 391 604 LNU869 soro 12v1 SB01G006870 sorgo 392 605 LNU870 soro 12v1 SB01G0D6930 sorgo 393 606 LNU871 soro 12v1 SB01G007380 sorgo 394 607 LNU872 soro 12v1 SB01G011260 sorgo 395 608 LNU873 soro 12v1 SB01G011890 sorgo 396 609 LNU874 soro 12v1 SB01G015540 sorgo 397 610 LNU875 soro 12v1 SB01 G017100 sorgo 398 611 LNU876 soro 12v1 SB01G032593P1 sorgo 399 612 LNU878 sorgol 12v1 SBO1G035780 sorgo 400 613 LNU879 soro 12v1 SB01G040060 sorgo 401 614

ID SEQ.

N° ID SEQ.

N° do Nome do Gene Nome do Agrupamento Organismo do Polin: Poli p: LNU880 soro 12v1 SB01 G046630 soro 402 615 LNU881 soro 12v1 SB01 G047345 sorgo 403 616 LNU882 sor o12v1 SB01G048200 sorgo 404 617 LNU884 soro 12v1 SBO1G048910 sorgo 405 619 LNU885 sor a 12v1 SB02G001450 soro 406 620 LNU886 soro 12v1 SB02G002020 sorgo 407 776 LNU887 soro 12v1 SB02G003980 sorgo 408 622 LNU888 soro 12v1 SB02G009320 sorgo 409 623 LNU889 soro 12v1 SB02G023760 sorgo 410 624 LNU890 soro 12v1 SB02G027260 sorgo 411 625 LNU892 soro 12v1 SBO2G033210 sorgo 412 626 LNU893 soro 12v1 SB02G036470 sorgo 413 627 LNU894 soro 12ví SB02G039430 sorgo 414 628 LNU895 soro 12v1 SB02G042020 soro 415 629 LNU896 soro 12v1 SB02G043060 sorgo 416 630 LNU897 soro 12v1 SBO2G043340 sorgo 417 777 LNU898 soro 12v1 SB03G001900 sorgo 418 778 LNU899 soro 12v1 SB03G003880 sorgo 419 633 LNU900 soro 12v1 SB03G004920 sorgo 420 779 LNU901 soro 12v1 SB03G006670 sorgo 421 780 LNU902 soro 12v1 SB03G009240 sorgo 422 636 LNU903 soro 12v1 SB03G013600 sorgo 423 637 LNU904 soro 12v1 SBD3G015670 sorgo 424 781 LNU905 soro i2v 1SB03G025980 soro 425 639 LNU906 soro 12v1 SB03G028220 sorgo 426 782 LNU907 soro 12v1 SB03G029160 soro 427 783 LNU908 soro 12v1 SB03G030720 soro 428 642 LNU909 soro 12v1 SB03G032235 sorgo 429 784 LNU910 sor a 12v1 SB03G034870 sorgo 430 644 LNU911 soro 12v1 SB03G035900 sorgo 431 785 LNU912 soro 12v1 SB03G037390 sorgo 432 646 LNU913 soro 12v1 SB03G039370 sorgo 433 647 LNU914 soro 12v1 SB04G000560 sorgo 434 648 LNU915 soro 12v1 SB04G000860 sorgo 435 649 LNU916 sorgol 1 2v1 SB04G0031 10 sorgo 436 650 LNU917 soro 12v1 SB04G005810 sorgo 437 651 LNU918 soro 12v1 SB04G005960 sorgo 438 652 LNU919 soro 12v1 SB04G008660 sorgo 439 653 LNU920 soro 12v1 SBO4G019220 sorgo 440 654 LNU921 soro 12v1 SB04G023720 soro 441 655 LNU922 soro 12v1 S804G031020 soro 442 656 LNU923 soro 12v1 S804G031630 soro 443 657 LNU924 soro 12v1 SB04G031790 sorgo 444 658 LNU925 soro 12v1 SBO4G031980 sorgo 445 659 LNU926 soro 12v1 SB04G032240 saro 446 660 LNU928 soro 12v1 SB04G035530 sorgo 447 661 LNU930 soro 12v1 SB04G037720 soro 448 786 LNU931 soro 12v1 SB05G000570 sorgo 449 664 LNU932 soro 12v1 SB05G001300 soro 450 787 LNU933 soro 12v1 SB05G005230 sorgo 451 666 LNU934 soro 12v1 SB05G006950 sorgo 452 667 LNU935 soro 12v1 SB05G020340 sorgo 453 788 LNU936 soro 12v1 ISBC5GO21410 sorgo 454 669 LNU938 soro 12v1 SB05G025900 sorgo 455 789 LNU940 sor o 12v1 SBO6G016140 sorgo 456 672 LNU941 soro 12v1 SB06G018480 sorgo 457 673 LNU942 soro 12v1 SBO6G019950 sorgo 458 674 LNU943 soro 12v1 SBO6G020900 sorgo 459 675 LNU944 soro 12v1 SB07G000250 sorgo 460 676 LNU945 soro 12v1 SB07G004040 sorgo 461 677 LNU946 soro 12v1 S807G004390 soro 462 678

ID SEQ. N° ID SEQ. N° do Nome do Gene Nome do Agrupamento Organismo do Polin: Poli p: LNU947 soro 12v1 SBO7G021870 sorgo 463 679 LNU948 soro 12v1 SB07G027790 soro 464 680 LNU949 sor o 12v1 1SB08G002580 sorgo 465 681 LNU950 soro 12v1 SB08G002740 sorgo 466 682 LNU951 soro 12v1 SB080003140 soro 467 790 LNU952 soro 12v1 SB08G007610 sorgo 468 684 LNU953 soro 12v1 JSBO8GO15020 sorgo 469 685 LNU954 soro 12v1 1SB08G016400 soro 470 791 LNU955 soro 12v1 SB08G016530 sorgo 471 687 LNU956 soro 12v1 SB08G018765 sorgo 472 792 LNU957 soro 12v1 SB08G020600 sorgo 473 689 LNU958 soro 12v1 158080021920 sorgo 474 690 LNU959 soro 12v1 SB09G021265 sorgo 475 691 LNU960 soro 12v1 SB09G021520 soro 476 692 LNU961 soro 12v1 SB09G026930 sorgo 477 693 LNU962 soro 12v1 1SB09G026990 sorgo 478 694 LNU963 soro 12v1 SB10G002960 sorgo 479 695 LNU964 soro 112v1ISB10G023640 sorgo 480 696 LNU965 soro 12v1 SB10G026450 sorgo 481 697 LNU966 soro 12v1 SB10G026910 sorgo 482 698 LNU967 soro 12v1 SB10G026680 sorgo 483 699 LNU968 sor a 12v1 SB100030200 sorgo 484 793 LNU970 so'a11v1GLYMA13G20220 sola 485 702 LNU971 tomate 11v1 1A1772930 tomate 486 703 LNU972 tomate 11v1 A1775263 tomate 487 704 LNU975 tomate i1v1 1B1422101 tomate 488 705 LNU976 tri o 12vá CA596628 trigo 489 706 LNU977 trio 12v3 CK152213 trigo 490 794 LNU760_Hl brachypodiJml 12v1 BRAD11GO2117 brachypodium 491 708 LNU832_H2 soro 12v1 5B03G013780 soro 492 709 LNU834_H1 soro 12v1 5B02G003380 sorgo 493 710 LNU861 H3 milho 10v9 CF635645 milho 494 711 LNU859 soro 12v1 AW677786 sorgo 495 - Tabela 1: São fornecidos os nomes dos genes, nomes dos agrupamentos, organismos a partir dos quais eles são derivados e os identificadores de sequências das sequências de poliipeptídeos e polinuclotídeos. "Polip." = polipeptídeo; "Poliu." = polinucleotideo.

EXEMPLO 2 IDENTIFICAÇÃO DE SEQUÊNCIAS HOMÓLOGAS (P.EX., ORTÓLOGAS) QUE AUMENTAM A EFICIÊNCIA NO USO DO NITROGÊNIO, EFICIÊNCIA NO USO DE FERTILIZANTES, PRODUÇÃO, TAXA DE CRESCIMENTO, VIGOR, BIOMASSA, TEOR DE ÓLEO, TOLERÂNCIA AO ESTRESSE ABIÓTICO E/OU EFICIÊNCIA NO USO DA ÁGUA EM PLANTAS.

[00365] Os conceitos de ortologia e paralogia foram recentemente aplicados às caracterizações e classificações funcionais na escala de comparações do genoma completo. Os ortólogos e parálogos constituem dois principais tipos de homólogos: 0 primeiro evoluiu de um ancestral comum por especialização e os últimos são relacionados por eventos

- - - -- .--- -- ---- -- --.- --.-, - -S •- -- -. :4 c, -

de duplicação. Supõe-se que parálogos decorrentes de eventos de duplicação antiga tendem a ter divergido na função enquanto verdadeiros ortólogos são mais propensos a reter a função idêntica ao longo do tempo evolutivo.

[00366] Para investigação e identificação adicionais de ortólogos putativos dos genes que afetam a eficiência no uso do nitrogênio, eficiência no uso de fertilizantes, produção (p.ex., produção de sementes, produção de óleo, biomassa, qualidade e/ou quantidade de grãos), taxa de crescimento, vigor, biomassa, teor de óleo, tolerância ao estresse abiótico e/ou eficiência no uso da água, todas as sequências foram alinhadas utilizando a Ferramenta de Pesquisa de Alinhamento Local Básica [BLAST I Basic Local Alignment Search Tool]. Sequências suficientemente semelhantes foram agrupadas por tentativa.

Estes ortólogos putativos foram ainda organizados sob um Filograma - um diagrama de ramificação (árvore) assumido como uma representação das relações evolutivas entre os táxons biológicos. Grupos ortólogos putativos foram analisados quanto a sua concordância com o filograma e, em casos de divergências, esses grupos ortólogos foram divididos adequadamente. Dados de expressão foram analisados e as bibliotecas EST foram classificadas utilizando um vocabulário fixo de termos personalizadas, tais como estágios de desenvolvimento (por exemplo, genes que mostram o perfil de expressão semelhante, através do desenvolvimento com regulação ascendente na fase específica, como na fase de estocagem de grãos) e/ou órgão da planta (por exemplo, genes que mostram o perfil de expressão similar em seus órgãos com regulação ascendente em órgãos específicos, como a semente).

As anotações de todos os ESTs agrupadas a um gene foram analisadas estatisticamente por comparação da sua frequência no conjunto em relação a sua abundância na base de dados, permitindo a estrutura de um perfil de expressão numérica e gráfica de tal gene, o que é denominado "digital expression".

A lógica de utilizar estes dois métodos complementares com métodos de estudos de associação fenotípica de QTLs, SNPs e expressão fenotípica baseia-se na suposição de que os verdadeiros ortólogos tendem a reter a função idêntica ao longo do tempo evolutivo. Estes métodos proporcionam diferentes conjuntos de indicações sobre as semelhanças funcionais entre dois genes homólogos, semelhanças no nível da sequência de aminoácidos - idênticos nos domínios proteicos e similaridade em perfis de expressão.

[00367] A pesquisa e identificação de genes homólogos envolve o rastreio de informação de sequência disponível, por exemplo, em bases de dados públicas que incluem, mas não se limitam à Base de Dados de DNA do Japão (DDBJ I DNA Database of Japan), Genbank e a Base de Dados de Sequência de Ácido Nucleico do Laboratório de Biologia Nuclear (EMBL I European Molecular Biology Laboratory) ou suas versões ou a base de dados MIPS. Um número de diferentes algoritmos de pesquisa tem sido desenvolvido, incluindo, mas não se limitando ao conjunto de programas referidos como programas de BLAST. Há cinco implementações de BLAST, três projetadas para consultas de sequência de nucleotídeos (BLASTN, BLASTX e TBLASTX) e duas projetadas para consultas de sequência de proteína (BLASTP e TBLASTN) (Coulson, Trends in Biotechnology: 76-80, 1994; Birren et al., Genome Analysis, I: 543, 1997). Tais métodos envolvem o alinhamento e a comparação das sequências. O algoritmo BLAST calcula a percentagem de identidade de sequência e executa uma análise estatística de similaridade entre as duas sequências. 0 software para a realização de análise BLAST está disponível ao público através do Centro Nacional de Informações sobre Biotecnologia. Outros destes tipos de software ou algoritmos são GAP, BESTFIT, FASTA e TFASTA. A GAP usa o algoritmo de Needleman and Wunsch (J. Moi. Biol. 48: 443-453, 1970) para encontrar o alinhamento de duas sequências completas que maximiza o número de correspondências e minimizam o número de lacunas.

[00368] Os genes homólogos podem pertencer à mesma família genética. A análise de uma família genética pode ser realizada utilizando a análise de similaridade de sequência. Para realizar esta análise pode-se utilizar programas padrões para alinhamentos múltiplos, por exemplo, o Clustal W. Uma árvore de Agrupamento de Vizinhos [Neighbor Joining] das proteínas homólogas dos genes de algumas aplicações da invenção pode ser utilizada para fornecer uma visão geral das relações estruturais e ancestrais. A identidade da sequência pode ser calculada usando um programa de alinhamento conforme descrito abaixo. Espera-se que outras plantas tenham um gene funcional semelhante (ortólogo) ou de uma família de genes semelhantes e tais genes fornecerão o mesmo fenôtipo preferido como os genes aqui apresentados.

Vantajosamente, estes membros da família podem ser úteis nos métodos de algumas aplicações da invenção. Exemplos de outras plantas incluem, mas não se limitando a cevada (Hordeum vulgare), Arabidopsis (Arabidopsis thaliana), Milho (Zea mays), Algodão (Gossypium), Canola (Brassica napus), Arroz (Oryza sativa), Cana-de-açúcar (Saccharum officinarum), Sorgo (Sorgo bicolor), Soja (Glycine max), Girassol (Helianthus annuus), Tomate (Lycopersicon esculentum) e Trigo (Triticum aestivum).

[00369] As análises acima mencionadas para uma homologia de sequência são preferivelmente realizadas em uma sequência de comprimento total, mas podem também basear- se em uma comparação de certas regiões, tais como os domínios conservados. A identificação de tais domínios também seria boa dentro do âmbito de conhecimento de um especialista na técnica e envolveria, por exemplo, um formato legível para computador dos ácidos nucleicos de algumas aplicações da invenção, o uso de programas de software de alinhamento e o uso de informações publicamente disponíveis sobre os domínios de proteínas, motivos conservados e caixas Esta informação está disponível na base de dados PRODOM (biochem (ponto) ucl (ponto) ac (ponto) uk/bsm/dbbrowser/protocol/prodomqry (ponto) html), PIR (pir (ponto) Georgetown (ponto) edu/) ou Pfam (sanger (ponto) ac (ponto) uk/Software/Pfam/). Programas de análise de sequências desenvolvidos para pesquisa de motivo podem ser utilizados para a identificação de fragmentos, regiões e domínios conservados conforme mencionados acima.

Programas de computador preferidos incluem, mas não estão limitados a, MEME, SIGNALSCAN e GENESCAN.

[00370] Um especialista na técnica pode utilizar as sequências homólogas fornecidas aqui para encontrar sequências similares em outras espécies e outros organismos. Os homólogos de uma proteína englobam peptídeos, oligopeptídeos, polipeptídios, proteínas e enzimas que têm substituições de aminoácidos, deleções e/ou inserções em relação à proteína não modificada em questão e que têm atividade biológica e funcional semelhante à proteína não modificada a partir da qual são derivadas. Para produzir tais homólogos, os aminoácidos da proteína podem ser substituídos por outros aminoácidos que possuem propriedades semelhantes (modificações conservadoras, tais como hidrofobicidade semelhante, hidrofilicidade, antigenicidade, propensão para formar uma estrutura ou quebrar estruturas helicoidais ou estruturas de 3 folhas). Tabelas de substituição conservativa são bem conhecidas na técnica (vide, p.ex., Creighton (1984) Proteins. W.H. Freeman and Company). Os homólogos de um aminoácido englobam ácidos nucleicos com substituição de nucleotídeo, deleções e/ou inserções em relação ao ácido nucleico não modificado em questão e que têm atividade biológica e funcional semelhante ao ácido nucleico não modificado a partir da qual são derivadas.

[00371] Os polinucleotídeos e polipeptídeos com uma homologia significativa aos genes identificados descritos na Tabela 1 (Exemplo 1, acima) foram identificados a partir das bases de dados, utilizando o software BLAST com os algoritmos Blastp e tBlastn como filtros para a primeira fase e a agulha (pacote EMBOSS) ou alinhamento FRAME+ algoritmo para a segunda fase. A identidade local (alinhamentos Blast) foi definida com um corte bastante permissivo - 60% de Identidade em um intervalo de 60% dos comprimentos de sequências porque utiliza tão somente um filtro para a fase de alinhamento global. A filtragem padrão do pacote Blast não foi usada (estabelecendo o parâmetro "-F F") .

[00372] No segundo estágio, os homólogos foram definidos com base na identidade global de, pelo menos, 80% para a sequência polipeptídica genética principal.

[00373] Duas formas distintas para encontrar o alinhamento global ideal para as sequências de proteína ou de nucleotídeos foram utilizadas neste pedido.

1. Entre duas proteínas (após o filtro blastp): Algoritmo EMBOSS-6.0.1 de Needleman-Wunsch com os seguintes parâmetros modificados: gapopen=8 gapextend=2. 0 restante dos parâmetros permaneceu inalterado a partir das opções padrões descritas acima.

2. Entre uma sequência de proteína e uma sequência nucleotídica (após o filtro rblastn): Aplicativo GenCore 6.0 OneModel, utilizando o algoritmo Frame+ com os seguintes parâmetros: model=frame+ p2n.model mode=qglobal -q=protein.sequence -db= nucleotide.sequence. 0 restante dos parâmetros permaneceu inalterado a partir das opções padrões descritas acima.

[00374] As sequências de polipeptídeos da consulta foram as ID SEQ. N° 496-794 e os polinucleotídeos da consulta foram as ID SEQ. N° 1-495 e as sequências ortólogas e homólogas identificadas tendo, pelo menos, 80% da identidade da sequência global são fornecidas na Tabela 2, abaixo.

Espera-se que estes genes homólogos aumentem a produção, produção de sementes, produção de óleo, teor de óleo, taxa de crescimento, produção de fibra, qualidade da fibra, comprimento da fibra, capacidade fotossintética, biomassa, vigor, ABST e/ou NUE de uma planta. Tabela 2 Homólogos (p.ex., ortólogos) dos genes/polipeptídeos identificados para aumento da eficiência no uso do nitrogênio, eficiência no uso de fertilizante, produção, produção de sementes, taxa de crescimento, vigor, biomassa, teor de óleo, produção da fibra, qualidade da fibra, comprimento da fibra, tolerância ao estresse abiótico e/ou eficiência no uso de água de uma planta. tD SEQ. ID SEQ Hom. à % de Hom. ao Nome Organismo 1 Nome do agrupamento N° do NO do ID SEQ Id. Algor. Polin. Polip. N°: global LNU751—H1 trigo 12vá CA652300 795 2898 498 89,1 globlastp LNU751H2 centeio12v1 DRR001012,339395 796 2899 498 88,45 glotblastn LNU752_H3 centeio 12v1 DRR001012,155230 797 2900 499 96,4 qloblastp LNU752_H4 aveia l lv1 GR316906P1 798 2901 499 90,7 globlastp LNU752_H5 brachypodiuml 12v1 BRAD12G38247_P1 799 2902 499 88,4 globlastp LNU752_H6 centeio 12v1 DRR001012,244869 800 2903 499 84,8 globlastp LNU753H1 pseudoroegneragb167FF341151 801 2904 500 96,4 globlastp LNU753_H2 tri n 12vá CA619061 802 2905 500 95,5 globlastp LNU753_H3 centeio 12v1 DRRO01013,175630 803 2906 500 93,7 oblast LNU753_H4 çypodium12v1BRADI1G76060T1 804 2907 500 90,6 gloiblastn LNU753_H5 arroz 11v1 GFXACO99399X6 805 2908 500 87 globlastp LNU753_H6 cevada 12v1 BE060847_P1 806 2909 500 80,3 globlastp LNU753H7 tri o 12vá BF474874 807 2910 500 80,3 globlastp LNU753_H8 arroz 11v1 6M037785 808 2911 500 80 globlastp LNU754_H1 tri a 12v3 BE413658 809 2912 501 95,8 globlastp LNU754_H2 le mus b166 EG390263P1 810 2913 501 95 globlastp LNU754_H3 pseudoroegneriaIgb167FF349286 811 2914 501 95 globlastp LNU754_H4 centeio 12v1 DRRO01012,101669 812 2915 501 95 gqbIastp LNU754_H5 brachypodium 12v1 BRADI2G06900_P1 813 2916 501 91,2 globlastp LNU754_H6 aveia 11v1 GR365468_P1 814 2917 501 88,7 globlastp LNU754_H7 soro 12v1 SBO3G001930 815 2918 501 85,4 globlastp LNJ754_H8 painçoil0v1 EV0454PM027276_P1 816 2919 501 84,1 lobIastp LNU754_H9 milho 10v1 AI600590_P1 817 2920 501 83,9 gobIastp

- - x . . ,r• ,.n„ s--, .... _ _ - .- - - 'n • -..-r'

ID SEQ.

ID SEQ Hom. à % de Hom. ao Nome Organismo I Nome do agrupamento N° do N° do ID SEQ Id.

Algo.

Polin.

Poli p.

N°: global LNU754_H13 ca im_chorão 12v1 FE624722_Pl 818 2921 501 83,7 globlastp LNU754_H10 milho_ ain o 11v3PHY7SID02752M_P1 819 2922 501 83,3 globlastp LNU754_H11 arroz 11v1 BE228738 820 2923 501 82 globlastp LNU754_H12 ca im_chorão b167 FE624722 821 2924 501 82 globlastp LNU756_H1 centeio 12v1 DRRO01012,433563 822 2925 502 94,9 globlastp LNU756_H2 centeio 12v1 BE493902 823 2926 502 94,6 globlastp LNU756_H3 centeio 12v1 DRR001012,24867 824 2926 502 94,6 9loblastp LNU756_H4 tri o 12v3 BGfi06914 825 2927 502 94,6 globlastp LNU756H5 brachypodiurnl 12v1 BRADI2G24030_P1 826 2928 502 93,5 globlastp LNU756H6 aveia 11v1 GR329669_P1 827 2929 502 92,4 globlastp LNU756_H7 arroz11v1 BF475232 828 2930 502 82,61 gotbIas1n LNU756_H8 milho_ ain o 11v3 EC612148P1 829 2931 502 81,5 gobIastp LNU756H9 cana_de_a úcar 10v1 BÚ103174 830 2932 502 80,4 globlastp LNU756_H10 sorqoj12v1 SB09G021710 831 2933 502 80,1 globIasp t LNU756_H12 ca im_chorão 12v1 DN150091_P1 832 2934 502 80 oblast LNU756_Hl1 ca im_chorão b167 DN150091 833 2934 502 80 loblasi LNU757_H1 trigo 12vá CA645023 834 2935 503 98,2 globlastp LNU757_H2 centeio 12v1 DRRO01012,10473 835 2936 503 97 globlastp LNU757_H3 centeio 12v1 DRR001012,121839 836 2937 503 97 globlaslp LNU757_H4 centeio 12v1 DRRO01012,768638 837 2938 503 95,9 globlastp LNU757_H5 iri o 12vá BE426208 838 2939 503 93,5 globlaslp LNU757_H6 aveia 11v1 GR328666_P1 839 2940 503 91,8 globlastp LNU758_H1 1ri o 12v3 BG906982 840 2941 504 91,6 globlastp LNU758_H2 pseudoroegneriagbi67FF345629 841 2942 504 87,1 globlasip LNU759_H1 centeio 12v1 DRR001012,140285 842 2943 505 94 globlasip LNU759_H2 1n o 12v3 CA742547 843 2944 505 93 globlastp LNU759_H3 1ri o 12v3 SRR043326X66986D1 844 2944 505 93 globlaslp LNU759_H4 milho_ ain o 11v3 PHY7S1023760MP1 845 2945 505 90 globlastp LNU759_H5 arroz 11v1 CF293997 846 2946 505 87,4 gobIastp LNU759_H1I ca im_chorãa 12v1 IFL787656P1 847 2947 505 87 globlasip LNU759_H6 ca im_chorão b167 FL787656 848 2947 505 87 globlastp LNU759_H7 c nodon 10v1 ES299636_P1 849 2948 505 86,1 globlastp LNU759_H12 ca im_chorãa 12v1 FL779827_P1 850 2949 505 86 globlastp LNU759_H8 soro 12v1 SB09G022720 851 2950 505 83,5 globlastp LNU759_H9 brach odium 12v1 BRADI2G23060_P1 852 2951 505 82,2 globlastp LNU759_H10 milho 10v1 EE680335_P1 853 2952 505 82 globlastp LNU760_H2 seudoroe neria b167 FF358412 854 2953 506 86,75 glotblastn LNU760_H3 centeia12v1 IDRROOI014,135934 855 2954 506 81,13 glotblastn LNU760_H4 ca im_chorãa 12v1 FL773680_T1 856 2955 506 80,13 glotblastn LNU761_H1 trio 12vá 8Q170294 857 2956 507 96,1 globlastp LNU761H2 to o 12v3 BG263661 858 2957 507 95,3 .gjçblastp LNU76I_H3 centeio 12v1 BF429268 859 2958 507 95,1 globlastp LNU76I_H4 brach odium 12v1 BRADI2G61140_P1 860 2959 507 84,7 globlastp LNU761_H5 milho_painçol 11v3 PHY7SI001000M_P1 861 2960 507 84,5 globlastp LNU761H9 ca im_chorão 12v1 FE627078_P1 862 2961 507 83,8 globlastp LNU761_H6 capim_chcrãoJgb167FE605627 863 2962 507 82,8 globlastp LNU761_H7 arroz 11v1 CR278964 864 2963 507 82,6 globlastp LNU76I_H8 soro 12v1 SBO3G046200 865 2964 507 81,2 globlastp LNU762_H1 centeio 12v1 IDRROO1012,142840 866 2965 508 93,9 globlastp LNU762_H2 centeio 12v1 IDRROO1012,108084 867 2966 508 93,6 globlastp LNU762_H3 tri o 12v3 CA653618 868 2967 508 92,5 globlastp LNU762_H4 brachypothumIl2v1IBpAjJI5GQ73OOpi 869 2968 508 87,1 gpstp LNU762_H5 milho_ ain o 11v3 EC613160_P1 870 2969 508 81 globlasip LNU763 H1 tri o 12v3 BE517537 871 2970 509 93,3 globlastp LNU763_H2 peudoroegneriaIgb167IFF345576 872 2971 509 91,3 globlastp LNU763_H3 centeio í 12v1 DRR001012,538230 873 2972 509 89,7 globlastp LNU763_H4 centeio 12v1 DRR001012,104458 874 2973 509 89,1 globlastp LNU763_H5 centeio 12v1 IDRROO1012,104992 875 2974 509 89,1 globlastp LNU763_H6 centeio 12v1 DRR001012,307746 876 2975 509 89,1 glotblastn LNU763_H7 centeio 12v1 DRRO01012,403113 877 2976 509 86,58 glotblastn

ID SEQ.

ID SEQ Horn. à % de Hom. ao Nome Organismo / Nome do agrupamento N° do N° do ID SEQ Id.

Algor.

Poliu.

Poli p.

N°: global LNU764H1 tr o 12vá BE419722 878 2977 510 96 loblast LNU764_H2 centeio 12v1 JDRROO1 DRRO01 012,148705 879 2978 510 95,6 globlastpp LNU764_H3 tri o 12vá AL817877 880 2979 510 94,8 globlastp LNU764_H4 arroz 11v1 CB680462 881 2980 510 83,8 gpastp LNU764_H5 brachypodium 12v1 IBRADI3G14080_P1 882 2981 510 83.6 globlastp LNU764_H6 soro 12v1 SB07GO02140 883 2982 510 82,4 globlastp LNU764_H7 milho_ ain o 11v3 EC613412_P1 884 2983 510 81,3 globlastp LNU764H9 ca im_chorão 12v1 FE638335_Pi 885 2984 510 80,9 gioblastp LNU764_H8 capirn_charaoIgb167FE649O51 capim 886 2985 510 80,57 gIotbastn LNU764_H10 ca im_chorão 12v1 FL754424__P1 887 2986 510 80,3 globlastp LNU766_H1 trio 12v3 BF483178 888 2987 511 96,6 gastp LNU766_H2 centeio 12v1 JDRROOI012,107386 889 2988 511 96,14 glotblastn LNU766_H3 brachypodiumll2vl BRADI2G6206D_T1 890 2989 511 90,68 gIastn LNU766H5 arroz 11 v1 BM419326 891 2990 511 85,8 globlastp LNU766H6 milho_ ain o 11vá GT090868_P1 892 2991 511 85,5 globlastp LNU766_Hl1 capim chorão 12v1 DT948944_P1 893 2992 511 85,4 globlastp LNU766_H12 ca im_chorâo 12v1 FE657698_P1 894 2993 511 85,3 globlastp LNU766_H7 ain o 10v1 EV0454PM004168P1 895 2994 511 84,9 globlastp LNU766_H8 centeio 12v1 IDRROOI012,124126 896 2995 511 84,7 globlastp LNU766_H9 milho 10v1 BM259345_P1 897 2996 511 84,5 globlastp LNU766_H10 soro 12v1 SB10G025840 898 2997 511 84,4 globlastp LNU767_H1 centeio 12v1 DRR001012,555545 899 2998 512 92,3 globlastp LNU767_H2 tri o 12vá BE419870 900 2999 512 91,2 globlastp LNU767_H3 lolium 1Ov1 AU246334_P1 901 3000 512 84,6 gioblastp LNU768_H1 tri o 12vá 81479814 902 3001 513 99,1 gastp LNU768_H2 centeio 12v1 DRR001013,174965 903 3002 513 98,2 globlastp LNU768_H3 centeio 12v1 DRR001012,20806 904 3003 513 97,8 globlastp LNU768_H4 centeio 12v1 IDRROO1012,266041 905 3004 513 97,35 glotblastn LNU768_H5 brach odium 12v1 BRADI2G56682_P1 906 3005 513 93,4 gpbIastp LNU768_H6 arroz 11v1 CF294088 907 3006 513 93,4 globlastp LNU768_H15 ca im_chor5o 12v1 FL692202_Pi 908 3007 513 92,5 g!pblaslp LNU768_H7 soro 12v1 SB01G021690 909 3008 513 92,5 globlasip LNU768_H8 ca im_chorãa b167 FL692202 910 3007 513 92,5 glablasip LNU768_H9 milho 10v1 A1941829_P1 911 3009 513 92 glablastp LNU768_H16 ca im_chorão 12v1 GD014223_P1 912 3010 513 91,2 globlastp LNU768_H10 milho_ ain o 11v3 PHY7SI034560M T1 913 3011 513 90,35 gçbIastn LNU768_H11 cana_de_a úcar 10v1 1B0536826 914 3012 513 90,3 gjoblastp LNU768_H12 aveia 11v1 G0596074_Pi 915 3013 513 84,5 globlastp LNU768_H13 amborella 12v3 SRR038634,15775P1 916 3014 513 80,1 globlastp LNU768_H14 abacaxi 10v1 DT336500_P1 917 3015 513 80,1 globlasip LNU769H8 brachypodmurnli2vllBR,ADI4G21B20P1 918 3016 514 82,4 globlastp LNU769_H13 brachypodiumli2v1 IBR.ADI2G16170_PI 919 3017 514 80,8 globlastp LNU769_H14 soro 12v1 SB05G007470 920 3018 514 80,8 globlastp LNU770HI tri a 12vá BE398561 921 3019 515 96 globlastp LNU770_H2 centeiol 12v1 IDRRDO1012,712789 922 3020 515 94,8 globlastp LNU770_H3 brachypodium 12v1 IBRADI1G56870_P1 923 3021 515 82 globlastp LNU772H1 trio 12vá BM135473 924 3022 517 96 globlastp LNU772_H2 centeio 12v1 DRR001012,142915 925 3023 517 93,5g[astp LNU772_H3 centeio 12v1 DRR001012,612512 926 3024 517 93 globlastp LNU772_H4 brachypodiumi2v1 BRADI3GO8480_P1 927 3025 517 90,5 globlastp LNU772_H5 aveia 11v1 G0592678P1 928 3026 517 88,9 globlastp LNU772H8 painço 10v1 EV0454PM022643P1 929 3027 517 86,6 globlasip LNU772_H6 arroz 11v1 CB000951 930 3028 517 86,3 globlasip LNU772_H9 milho_ ain a 11 v3 PHY7SI018070M_P1 931 3029 517 86 globlasip LNU772_H15 capim chorão 12v1 DN144396P1 932 3030 517 84,3 glastp LNU772_H13 soro 12v1 SB04G008000 933 3031 517 83,9 globrastp LNU772_H10 ca im_chorão bl67 DN144396 934 3032 517 83,8 globiastp LNU772_H11 milho 10v1 AA979978P1 935 3033 517 83,7 globlastp LNU772_H14 c radon 10v1 ES292031P1 936 3034 517 82,1 qloblastp LNU773_HI centeio 12v1 DRR001012,115164 937 3035 518 94,6 globlastp

ID SEQ.

ID SEQ Hom. à % de Hom. ao Nome Organismo 1 Nome do agrupamento N° do N° do ID SEQ Id.

Algar.

Patin.

Pali . N°: global LNU773_H2 brachypodiuml 12v1 IBR..ADI1G02440_P1 938 3036 518 84,1 globlastp LNU773_H3 milho_ ain o 11v3 PHY7S1034229M_P1 939 3037 518 82,1 globlastp LNU773_H4 milho_ ain o 11v3 SICRP053164_P1 940 3037 518 82,1 globlasIp LNU773_H5 arroz 11v1 CB634493 941 3038 518 81,5 globlastp LNU774_H1 brachypodiurn 12v1 8RAD14G38810_P1 942 3039 519 82,9 globlastp LNU775_Hl centeio 12v1 DRR001012,110859 943 3040 520 93,5 gjbstp LNU775_H2 trio 12v3 CD937862 944 3041 520 82,8 globlastp LNU775H3 brash odium 12v1 BRADl2G04447_P1 945 3042 520 82,6 globlastp LNU777_H1 centeio 12v1 DRR001012,142992 946 3043 522 92,4 globlastp LNU777_H2 certeioj I2v1 IDRROO1012,313229 947 3044 522 91,8 gastp LNU777_H3 tri o 12vá BE499027 948 3045 522 81,89 glotblastn LNU778_H1 tri o 12vá 8E402486 949 3046 523 96,9 gbIastp LNU778_H2 tri o 12v3 SRRO73321X42757D1 950 3047 523 96,9 globlastp LNU778_H3 tri o 12v3 CD871315 951 3048 523 91,7 globlastp LNU778_H4 brachypodium12viBRADl2G46340P1 952 3049 523 91,6 globlastp LNU778_H5 arroz 11v1 Bí811994 953 3050 523 87,2 globlastp LNU778_H6 milho_ ain o 11v3 PHY7SI000364M_P1 954 3051 523 85,2 gpblastp LNU778_H7 soro 12v1 1SB03G030890 955 3052 523 85,1 gioblastp LNU778_H8 milho 10v1 CA399726_P1 956 3053 523 84,5 globlastp LNU778_H9 milho 10v1 A1615203_T1 957 3054 523 83,35 glotblastn LNJ779_H1 pseudoroeqnedagbi67IFF346373 958 3055 524 98,1 globlastp LNU779_H2 centeio 12v1 BE587009 959 3056 524 97,8 globlastp LNU779_H3 tri o 12vá BE402818 960 3057 524 97,5 globlastp LNU779_H4 tr9 012vá BE586120 961 3058 524 97,5 glablastp LNU779_H5 in o 12vá CV778626 962 3059 524 96,91 glotbtasin LNU779_H6 aveia 11v1 CN815634_T1 963 3060 524 94,44 glotbFastn LNU779_H7 brach odium 12v1 BRADl3G42790_P1 964 3061 524 91,7 glablastp LNU779_H8 arroz 11v1 81794901 965 3062 524 88,6 globlastp LNU779_H9 milho_ ain o 11vá PHY7SI014086MP1 966 3063 524 87,7 qloblastp LNU779_H10 ca im_chorão b167 DN144658 967 3064 524 87,7 globlastp LNU779_H11 çpLm_choràoIgbi67IFE631532 968 3065 524 87,7 globlastp LNU779H12 painçol 1 0v1 IEVO4S4PMO12215P1 969 3066 524 87,4 globlaslp LNU779H13 milho 10v1 AI649552P1 970 3067 524 86,8 loblast LNU779_H14 sor o 12v1 SBO7G024220 971 3068 524 86,8 globlaslp LNU779_H15 cana_de_a úcar 1Ov1 CA065962 972 3069 524 86,8 globlasip LNU779_H16 milho 10v1 BG354183_P1 973 3070 524 83,7 globlastp LNU779_H17 capim chorão 12v1 FE639284_P1 974 3071 524 81,8 gobIastp LNU781_H1 centeio 12v1 DRRO01012,110372 975 3072 526 98,9 globlastp LNU781_H2 centeio 12v1 IDRROOI012,15876 976 3073 526 97,11 glotblastn LNU781_H3 trio 12vá CA666142 977 3074 526 96,1 qloblastp LNU781_H4 Brach odium 12v1 IBRADI1G07870_P1 978 3075 526 91,3 globlastp LNU781_H5 milho_ ain o 11vá EC612060_P1 979 3076 526 84,2 globlastp INU781_H6 arroz11v181118736 980 3077 526 84 globlastp LNU781_H7 soro 12v1 SBO1G007340 981 3078 526 83,7 globlastp LNU781_H8 painçoli0v1 IEVO454PM114571_P1 982 3079 526 82,4 globlastp LNU781_H12 ca im_chorãa 12v1 FL756770_Pl 983 3080 526 82,2 globlastp LNU781_H9 milho 10v1 CA403670P1 984 3081 526 82,2 globlastp LNU781_H10 tri o 12vá CA593786 985 3082 526 81,84 glotblastn LNU781_H13 capim_chorãol 12v1 FE611031_P1 986 3083 526 80,8 globlastp LNU781_H11 milho 10v1 BM498386_P1 987 3084 526 80,3 globlastp LNU782_H1 tri o 12vá BQ788965 988 3085 527 97,9 globlastp LNU782_H2 centeio 12v1 DRRO01012,594129 989 3086 527 96,2 globlastp LNU783_H1 centeio 12v1 IDRRO01012,216554 990 3087 528 92,8 globlastp LNU783_H2 brachypodium12v1J8RADI2GO436Qpi 991 3088 528 81,8 globlastp LNU783_H3 arroz 11v1 BE0401B1 992 3089 528 80 globlastp LNU787_1-112 centeio 12v1 DRR001012,395832 993 3090 532 91,4 globlastp LNU787_H13 centeio 12v1 DRR001012,20638 994 3091 532 90,8 globlastp LNU7B7_H1 pseudorceqneriaJgblS7jFF3ss972 995 3092 532 90,5 globlastp LNU787_H2 tri o 12vá BG909595 996 3093 532 89,9 globlastp LNU787_H4 trigo 12vá AL821420 997 - 532 89,63 glotblasin

ID SEQ.

ID SEQ Hom. à % de Hom ao Nome Organismo 1 Nome do agrupamento N° do N° do ID SEQ Id.

Aigor.

Polin.

Poli p.

N°: global LNU787_H9 arroz 11v1 1AU092213 998 3094 532 87,7 globlastp LNU787_H6 capim_choràoJgb167GD010772 999 3095 532 86,5 globlastp LNJ787_HB milho_ ain o 11v3 PHY7S1006894MP1 1000 3096 532 86,5 globlastp LNU787_H14 ca im_chorão 12v1 GD010772_P1 1001 3097 532 86,2 globlastp LNU787_H7 cenchrus b166 EB661125_P1 1002 3098 532 86,2 globlastp LNU787_H10 ain o 10v1 EV0454PM055809_T1 1003 - 532 84,97 glotblastn LNU787_H3 le mus b166 EG384638_P1 1004 3099 532 84,7 globlastp LNU787_H11 milho 10v1 A1670300_P1 1005 3100 532 83,7 globlasip LNU788_H1 centeio 12v1 IDRROOI012,407094 1006 3101 533 91,4 globlaslp LNU788_H2 centeio 12v1 IDRROO1O12,189907 1007 3102 533 91,1 globlaslp LNU788_H3 trio 12vá BE606973 1008 3103 533 90,7 gastp LNU788H5 soro 12v1 SB10G003000 1009 3104 533 83,3 globlastp LNU789_H1 trigo 12v3 BJ312717 1010 3105 534 93,65 qlotblastn LNU789_H2 too 12vá CD898702 1011 3106 534 91,8 globlastp LNU789H3 centeio 12v1 IDRROO1O12,152256 1012 3107 534 91,7 globlastp LNU789_H4 tri o 12v3 AL821622 1013 3108 534 91,1 globlastp LNU789_H5 cevada 12v1 BG344287_P1 1014 3109 534 90,2 globlasip LNU789_H6 milho_ ain o 11v3 PHY7S1034969M_P1 1015 3110 534 89,2 globlastp LNU789_H7 capimchorão b167 FL695828 1016 3111 534 88,6 goblastp LNU789_H8 painçc10v1EVO454PM015227P1 1017 3112 534 87 globlaslp LNU789_HI3 capim_chorão 12v1 FL695828_P1 1018 3113 534 86,8 globlastp LNU789_H9 arroz 11v1 027096 1019 3114 534 86,8 globlastp LNU789_1-110 soro 12v1 SB01G037160 1020 3115 534 86,1 globlastp LNU789_1-111 milho 10v1 A1783213_P1 1021 3116 534 85,9 globlastp LNU789_H12 cana_de_a úcar 10v1 CA066166 1022 3117 534 85,6 globlastp LNU790_H1 arroz 11v1 BI804641 1023 3118 535 90,8 globlastp LNU790_H2 milho 10v1 AI461507_P1 1024 3119 535 90,4 globlastp LNU79O_H3 soro 12v1 SBO1G038000 1025 3120 535 90,4 globlastp LNU790_H10 ca im_chorão 12v1 FE603656P1 1026 3121 535 90,2 globlastp LNU790_H4 milho 10v1 BI096427_P1 1027 3122 535 90 globlastp LNU79O_H5 milha_ ain o 11v3 PHY7S1035653MP1 1028 3123 535 89,6 globlastp LNU79O_H6 centeio 12v1 DRRO01012,151815 1029 3124 535 88,6 globlastp LNU79O_H7 capim_chorãoIgb167DN142553 1030 3125 535 88,52 glotblastn LNU79O_H8 painçolOvlIEVO454PMOS3O4lPl 1031 3126 535 86,5 globlastp LNU790_H9 trio 12vá CA605241 1032 3127 535 82,3 globlastp LNU791_H1 sor o12v1 SBO1G041890 1033 3128 536 89,6 globlastp LNU791_H2 trio 12v3 ERR125558X24074D1 1034 3129 536 89,6 globlastp LNU791_H3 centeio 12v1 DRRO01012,416966 1035 3130 536 88,7 globlastp LNU791_H4 milho_ ain o 11 v31 PHY7SI038156M_P1 1036 3131 536 85,8 globlastp LNU791_H5 arroz 11v1 CA752611 1037 3132 536 85,8 globlastp LNU791_H6 capirn_choraoIgblS7IFL973644 1038 3133 536 85,8 globlastp LNU791 H7 painçoI10v1PMSLX087218OD1p1 1039 3134 536 84,9 globlastp LNU792_H1 centeio 12v1 GFXFJ374582X1 1040 3135 537 94 globlastp LNU792_H2 cevada 12v1 AV833692_P1 1041 3136 537 93,6 globlastp LNU792_H3 arroz 11v1 AU056540 1042 3137 537 89,9 gioblastp LNU792H4 milho_ ain o 11v3 PHY7SI000485M_P1 1043 3138 537 88,7 globlastp LNU792_H10 capimchorão 12v1 FE640305_P1 1044 3139 537 88,3 globlastp LNU792_H5 milho 10v1 AW600616_P1 1045 3140 537 87,7 globlastp LNU792H6 milho 10v1 CD439418P1 1046 3141 537 84,7 globlastp LNU792_H7 tri o 12vá BE412277 1047 3142 537 82,4 globlastp LNU792_H8 soro 12v1 SB03G036050 1048 3143 537 82,3 globlastp LNU792_H9 tri o 12vá CA614780 1049 3144 537 80 1obIastp LNU794H1 tri o 12vá BF201200 1050 3145 539 96,7 globlastp LNU794_H2 pseudoroegneriajgbl67lFF34448o 1051 3146 539 96,3 globlasip LNU794_H3 centeio 12v1 DRR001012,108384 1052 3147 539 96,3 globlasip LNU794_H4 aveia 11v1 G0588032P1 1053 3148 539 95,5 globlastp LNU794_H5 arroz 11v1 1AF074750 1054 3149 539 89,8 globlastp LNU794_H13 capim chorão 12v1 IFE6O1825P1 1055 3150 539 88,5 globlastp LNU794_H6 ca im_chorão b167 FE601825 1056 3150 539 88,5 globlastp LNU794_H7 ca im_chorao b167 FE644897 1057 3151 539 88,1 globlastp

ID SEQ.

ID SEQ Hom. à % de Hom. ao Nome Organismo / Nome do agrupamento N° do N° do ID SEQ Id.

Algor.

Polin.

Poli p.

Na: global LNU794_H8 cana_de_a úcar 10v1 CA102960 1058 3152 539 87,7 globlastp LNU794_H9 painçoj 10v1 EV0454PM002886_P1 1059 3153 539 87,3 globlastp LNU794_H10 milho_ ain o 11 v3 PHY7S1014266M_P1 1060 3154 539 86,5 gblast LNU794_H11 soro 12v1 SB07G003760 1061 3155 539 86,5 globlastp LNU794_H12 milho 10v1 A1944207P1 1062 3156 539 84,8 qloblastp LNU794_H14 ca im_chorão 12v1 FL968985_T1 1063 3157 539 80 glotblastn LNU797_H1 le mus b166 EG376487_P1 1064 3158 542 99,6 globlastp LNU797_H2 tri o 12vá BE400744 1065 3159 542 99,2 globlastp LNU797_H3 tri o 12vá BE406331 1066 3160 542 99,2 globlastp LNU797_H4 trio 12v3 CA730405 1067 3159 542 99,2 globlasip LNU797_H5 centeio 12v1 BF429235 1068 3161 542 98,7 globlastp LNU797_H6 (estuca b161 CK801981_P1 1069 3162 542 98,3 gaslp LNU797_H7 aveia l lv1 CN816314P1 1070 3163 542 98,3 gIobas1p LNU797_HS aveia 11v1 GO589763_P1 1071 3164 542 97,9 globIastp LNU797_H9 arroz 11v1 1BE039235 1072 3165 542 97,9 globlastp LGP52 soro 12v1 SB05G024560 1073 3166 542 97,5 globlastp brachypodiumi12v1 jBRADI4G13740T2_P LNU797_H10 1074 3167 542 97,5 globlastp LNU797_H11 milho 10v1 AI395988_P1 1075 3166 542 97,5 globlastp LNU797_H12 cana_de_a úcar 10v1 BQ536939 1076 3166 542 97,5 globlastp LNU797_H13 cenchrus b16ú BM084421_P1 1077 3168 542 97 globlastp LNU797_H14 milho_ ain a 11 v3 PHY7SIQ26806MP1 1078 3168 542 97 globlastp LNU797_H15 onion 12v1 CF439938_P1 1079 3169 542 97 gpbIastp LNU797_H16 onion 12v1 CF441222P1 1080 3170 542 97 globlastp LNU797_H17 soro 12v1 SB01G046910 1081 3171 542 97 globlastp LGP52H1 ca im_chorão 12v1 FE602145_P1 1082 3172 542 96,6 globlastp LNU797_H18 euon mus 11v1 SRR070038X135997_P1 1083 3173 542 96,6 globlasip LNU797_H19 festucalgbi6i DT675202_P1 1084 3174 542 96,6 gst LNU797_H20 milho 10v1 A1714766_P1 1085 3175 542 96,6 globlastp LNU797_H21 ain o 10v1 EV0454PM001587P1 1086 3176 542 96,6 globlastp LNU797_H22 painçoIlOvlIEVD454PMOO57OgPl 1087 3177 542 96,6 globlastp LNU797_H23 pseudoroegneriagbi67FF343O70 1088 3178 542 96,6 ploblastp LN1J797_H24 centeio 12v1 IDRROO1012,101136 1089 3178 542 96,6 globlastp LNU797_H25 centeio 12v1 DRRO01012,112514 1090 3178 542 96,6 globlastp LNU797_H26 centeio 12v1 DRR001012,193069 1091 3178 542 96,6 globlastp LNU797_H27 capim_chor5oIgb167 FE602l45 1092 3172 542 96,6 globlastp LNU797_H28 capim_chorãoIgblS7IFE6i9Og4 1093 3172 542 96,6 globlastp LNU797_H29 capim_choràoIgbl67IFE624O39 1094 3172 542 96,6g!oblastp LNU797_H30 arnica 11 v1 ISRRO99O34X109165_P1 1095 3179 542 96,2 globlastp LNU797_H31 artemisia 10v1 EY043858P1 1096 3180 542 96,2 gjastp LNU797_H32 euon mus l lv1 jSRRO70038X195269_P1 1097 3181 542 96,2 gíoblastp LNU797_H33 uva llv1 IGSVIVT01016670001_P1 1098 3182 542 96,2 globlastp LNU797H34 soja l lv1 GLYMA02G01700 1099 3183 542 96,2 globlastp LNU797_H34 soja 12v1 IGLYMAO2GO1700_P1 1100 3183 542 96,2 gobIastp LNU797_H35 girassoI 12v1 00848350 1101 3179 542 96,2 globlastp LNU797_H36 girassoll 1 2v1 DY926327 1102 3179 542 96,2 globlastp LNJ797_H37 tri o 12v3 BE398301 1103 3184 542 96,2 globlastp LNU797_H38 tri o 12v3 BE638088 1104 3185 542 96,2 globlastp LNU797_H39 tri o 12v3 CA616043 1105 3185 542 96,2 globlastp LGP52_H3 fão 12v2 CA898157P1 1106 3186 542 95,8 globlasip LNU797_H40 amsonia 11v1 ISRR098688X100584_P1 1107 3187 542 95,8 globlasip LNU797_H41 cevada 12v1 BE420554P1 1108 3188 542 95,8 gcbIastp LNU797_H42 feijão 12v1 CA898157 1109 3186 542 95,8 gpbIas1p ca stanhalgb1701SRR006295S0000440_P LNU797_H43 1110 3189 542 95,8 globlastp 1 LNU797_H44 cichoriumLgbl71 EH695394_P1 1111 3190 542 95,8 globlastp LNU797_H45 coffea l Ov1 DV681794_P1 1112 3191 542 95,$ globlastp LNU797_H46 al odão 11v1 00098301_P1 1113 3192 542 95,8 globlastp LNU797_H47 feijão_fradinho 12v1 FF391241P1 1114 3186 542 95,8 globlastp LNU797_H48 dente_de_leão 10v1 DR398974P1 1115 3190 542 95,8 globlastp LNU797_H49 eschscholzia llv1 1CK745182P1 1116 3193 542 95,8 globlastp

ID SEQ.

ID SEQ Hom. à % de Horn, ao Nome Organismo 1 Nome do agrupamento N° do N° do ID SEQ Id.

Algor.

Polin.

Poli . N°: global LNU797_H50 euon mus 11v1 SRR070038X148521_Pl 1117 3194 542 95,8 globlastp LNU797_H51 oss ium_raimondii 12v1 DR460270_P1 1118 3195 542 95,8 globlastp LNU797_H52 heritiera 10v1 lSRR005794S0001293_P1 1119 3196 542 95,8 globlastp LNU797_H53 alface í2v1 DW046332_Pl 1120 3190 542 95,8 globlastp LNU797_H54 lótus 09v1 AW720222_Pl 1121 3197 542 95,8 globlastp LNU797_H55 carvalhol 10v1 FP043285_P1 1122 3189 542 95,8 globlastp LNU797_H56 girassol112v1CD849067 1123 3198 542 95,8 gpbIastp LNU797_H57 jasmim 11 v1 1SRR098689X106530 1124 3199 542 95,8 globlastp LNU797_H58 tra a o on 10v1 SRR020205S0002302 1125 3190 542 95,8 globlastp LNU797_H59 vinca 11v1 1SRR098690X108966 1126 3200 542 95,8 globlastp LNU797_H60 vinca 11v1 SRR098690X131739 1127 3201 542 95,8 globlastp LGP52_H2 runus_mume 13v1 BU045923P1 1128 3202 542 95,4 globlastp LNU797_H61 ambrosia 11v1 SRR346935,111437P1 1129 3203 542 95,4 globlastp LNU797_H62 ambrosial11v1 15RR346943,182031_P1 1130 3203 542 95,4 qloblastp LNU797H63 arnica 11 v1 SRRO99034X103642_P1 1131 3204 542 95,4 globlastp LNU797_H64 banana 12v1 BBS104T3_P1 1132 3205 542 95,4 globlastp LNU797_H65 cacau 10v1 CU484574_Pi 1133 3206 542 95,4 globlastp catharanthusl11v1ISRR098691X100536_ LNU797_H66 1134 3207 542 95,4 loblasi P1 9 p LNU797_H67 ai odão 11v1 BE052796_P1 1135 3208 542 95,4 globlaslp LNU797_H68 al odão 11v1 BF272890P1 1136 3209 542 95,4 globlaslp LNU797_H69 gossypiurnraimondili2viiBEO52795pi 1137 3208 542 95,4 globlaslp LNU797_H70 oss ium_raimondii 12v1 BG440472_P1 1138 3209 542 95,4 globlaslp LNU797_H71 humulus 11v1 ES653444_P1 1139 3210 542 95,4 globlastp LNU797_H72 medica o 12v1 BE205283_P1 1140 3211 542 95,4 globlastp momordical10v1ISRRO71315S0000877_ LNU797_H73 1141 3212 542 95,4 lobiast P1 g p LNU797_H74 nasturtium llv1 1SRR032558,130953_P1 1142 3213 542 95,4 globlastp LNU797_H75 papouIaslilvilSRRO3O2Si,67760Pl 1143 3214 542 95,4 globlastp LNU797_H76 prunusllOvljBLO45g23 1144 3202 542 95,4 gIobastp LNU797_H77 soja 11 v1 GLYMA1 OG01760 1145 3215 542 95,4 globlastp LNU797_H77 soa 12v1 GLYMA10G01760_P1 1146 3215 542 95,4 globlastp LNU797_H78 soja 11v1 GLYMA10G42650 1147 3213 542 95,4 globlastp LNU797_H78 soja 12v1 GLYMAlOG42650P1 1148 3213 542 95,4g!pblastp LNU797_H79 soja 11v1 GLYMA20G24380 1149 3213 542 95,4 globlastp LNU797_H79 soja 12v1 GLYMA20G24380_P1 1150 3213 542 95,4 globlastp LNU797_H80 to onella 11v1 SRR066194X100358 1151 3211 542 95,4 globlastp LNU79781 trio 12vá BE516233 1152 3216 542 95,4 globlastp LNU797_H82 trevo b1ú2 BB904539_T1 1153 3217 542 95,36 glotblastn LNU797_HB3 tripygiumj1lv1 SRR098677X108743 1154 3218 542 95,36 glotblastn LNU797_H84 ambrosia 11v1 SRR346935,162287_T1 1155 3219 542 94,94 glotblastn LNU797_H85 arabido sis_f rata 09v1 JGIAL004906_P1 1156 3220 542 94,9 globlastp LNU797_H86 arabido sis 10v1 AT1G53850P1 1157 3220 542 94,9 globlastp LNU797_H87 arabido sis 10v1 AT3G14290P1 1158 3221 542 94,9 globlastp LNU797_H88 aristolochia 10v1 FD753041_P1 1159 3222 542 94,9 globlastp LNU797_H89 centaurea b166 EH720898_P1 1160 3223 542 94,9 globlastp chelidoniumlllvllSRR084752X101469_P LNU797_H90 1161 3224 542 94,9 globlastp 1 LNU797H91 rao_de_bico 11v1 GR406082 1162 3225 542 94,9 globlastp LNU797_H91 rao_de_bico 13v2 GR406082_Pl 1163 3225 542 94,9 gjpblastp LNU797_H92 cirsiumj li vi SRR346952,1003064_P1 1164 3223 542 94,9 globlastp LNU797_H93 cirsiumj iivi SRR346952,101704_P1 1165 3223 542 94,9 globlasip LNU797_H94 clementinaj 11v1 JCF418418Pi 1166 3226 542 94,9 globlastp LNU797_H95 feijão_fradinho 12v1 FF400036_P1 1167 3227 542 94,9 globlastp LNU797_H96 c rara b167 GE5867D7_P1 1168 3223 542 94,9 gbIasIp LNU797_H97 flaveria llv1 JSRR149229,124001_P1 1169 3228 542 94,9 globlastp LNU797_H98 flaveria 11v1 ISRR149229,164802_P1 1170 3228 542 94,9 globlastp LNU797_H99 flaveriaj 11v1 ISRRI49229,187551_P1 1171 3228 542 94,9 globlastp LNU797_H100 Haveria 11v1 SRR149232,124521P1 1172 3228 542 94,9 globlastp LNU797_H101 kiwi b166 FG416367_P1 1173 3229 542 94,9 globlastp LNU797_H102 óleo_de_ alma 11v1 GH636084_P1 1174 3230 542 94,9 globlastp

ID SEQ.

ID SEQ Hom. à % de Hom. ao Nome Organismo! Nome do agrupamento N° do N° do ID SEQ Id.

Algor, Polin.

Poli p.

N°: global NU797_H103 laranja 11v1 CB322089_Pl 1175 3226 542 94,9 globlastp LNU797-H104 ervilha 11v1 AM161973-P1 1176 3231 542 94,9 globlastp f ão_guandul11v1ISRR054580X103301 LNU797_H105 1177 3232 542 94,9 globlastp LNU797_H106 papoulasl li vi IFG610932 P1 1178 3233 542 94,9 globlastp LNU797_H107 safflower b162 EL375904 1179 3223 542 94,9 globlastp LNU797 H108 scablosa 11v1 SRR063723X104505 1180 3234 542 94,9 globlastp LNU797 H109 valerians 11v1 SRRO99039X102707 1181 3235 542 94,9 globlastp LNU797 H110 melancia 11v1 CK756307 1182 3236 542 94,9 globlastp LNU797_H111 antirrhinum b16ó AJ793100_T1 1183 3237 542 94,51 glotblastn LNU797_H112 sarracenia 11v1 SRR192669,135220 1184 3238 542 94,51 glotblastn LGP52_H4 feijão 12v2 CA905741_P1 1185 3239 542 94,5 globlastp LNU797_H113 arabfdo sis_I rata09v1 JGIAL009899_P1 1186 3240 542 94,5 qioblasip LNU797 H114 feijâo 12v1 CA905741 1187 3239 542 94,5 qobIastp LNU797-H115 faia 11v1 SRR006293,26585_P1 1188 3241 542 94,5 globlastp LNU797_H116 faial 11v1 SRR006293,26859_P1 1189 3241 542 94,5 qloblastp LNU797 H117 mirtllc 12v1 CV090936 P1 1190 3242 542 94,5 globlastp LNU797 H118 mirtilo 12v1 SRR353282X53162D1 P1 1191 3243 542 94,5 qloblastp LNU797-H119 cleome-s inosa iov1 GR932132_Pl 1192 3244 542 94,5 globlastp eschscholziaM11vi SRRO14116,104453_P LNU797_H120 1193 3245 542 94,5 globlastp LNU797 H121 eu horbia 11v1 IDV112478 P1 1194 3246 542 94,5 globlastp LNU797 H122 óleo de alma 11v1 EL688733_P1 1195 3247 542 94,5 globlastp LNU797_H123 amendoim 10v1 CX128176_P1 1196 3248 542 94,5 globlastp LNU797 H124 salvia 10v1 SRR014553S0016175 1197 3249 542 94,5 globlastp LNU797 H125 sesame 12v1 1SESM2V1222326 1198 3250 542 94,5 gobIastp LNU797 H126 theilun iella arvulum 11v1 BY811542 1199 3251 542 94,5 globlastp LNU797_H127 ma ã 11v1 CN544917_Pi 1200 3252 542 94,1 globlastp LNU797_H128 ,junceal b 12v1 IE6ANDIZO1A5869-P1 1201 3253 542 94,1 globlastp LNU797_H129 b 'uncea 12v1 IE6ANDIZO1AGQ24_P1 1202 3254 542 94,1 globlastp LNU797_H130 b 'uncea 12v1 IE6ANDIZOI B06M7 P1 1203 3255 542 94,1 globlastp LNU797 H131 b juncea 12v1 E6ANDiZ01BBFFF_P1 1204 3256 542 94,1 globlastp LNU797 H132 bra a 11v1 CD821133 P1 1205 3257 542 94,1 globlastp LNU797 H133 b_ra a 11v1 C0824786_P1 1206 3255 542 94,1 globlastp LNU797 H134 canola 11v1 CN734250 P1 1207 3257 542 94,1 globlasip LNU797_H135 canola 11v1 CN736323__P1 1208 3255 542 94,1 globlastp LNU797 H136 canela 11v1 EE4570ô8 P1 1209 3255 542 94,1 globlastp LNU797_H137 cleome_s inosa 10v1 IGR931830-P1 1210 3258 542 94,1 globlastp LNU797-H138 abóbora-amarela11v1 FG227107_Pl 1211 3259 542 94,1 globlastp LNU797 H139 eucali to11v2CD669666 P1 1212 3260 542 94,1 globlasip LNU797 H140 eu tlorbia l lv1 SRRO98678X123510 P1 1213 3261 542 94,1 globlastp LNU797_H141 fa o rum 11v1 SRR063703X104315-P1 1214 3262 542 94,1 globlastp LNU797_H142 flaveria 11v1 ISRR149229,113631_P1 1215 3263 542 94,1 globlastp orobanche110v11SRR023189S0023437-P LNU7971-1143 1216 3264 542 94,1 globlastp LNU797 H144 halaeno sir 11v1 CB03319fi P1 1217 3265 542 94,1 globlastp LNU797_H145 pIàtano 11v1 1SRR096786X100928_P1 1218 3266 542 94,1 gobIastp LNU797_H146 a oulas 11v1 FE964610 P1 1219 3267 542 94,1 globlasip LNU797 H147 rabanetelgb164EV528186 1220 3255 542 94,1 globlastp LNU797 H148 eufórbiolgbi6ilDVll2478 1221 3268 542 94,1 globlastp LNU797 H149 tabacolgbl62lABOOi552 1222 3269 542 94,1 globlasip LNU797 H150 tri h saris 10v1 EX999501 1223 3270 542 94,1 globlastp LNU797-H151 tri h saris 10v1 EY014414 1224 3271 542 94,1 globlastp LNU797 H216 oeal 13v1 ISRRO14463X18338D1_Pi 1225 3272 542 94,1 globlastp LNU797-H152 insen 10v1 CN645666_T1 1226 3273 542 94,09 glotblastn LNU797H153 sarracenial 11v1 ISRR192669,105817 1227 3274 542 94,09 glotblastn LGP52_H5 mamona 12v1 EE260427_P1 1228 3275 542 93,7 globlastp LGP52 H7 mimulus 12v1 DV206269 P1 1229 3276 542 93,7 globlastp LNU797 H154 b oleracea b161 DY026308_P1 1230 3277 542 93,7g}oblastp LNU797_H155 b_ra a 11v1 BG543962_P1 1231 3277 542 93,7 gobIastp LNU797_H156 canola 11v1 DY006413_P1 1232 3277 542 93,7 globlastp

ID SEQ.

Algor.

Polin.

Poli p.

N°: global LNU797_H157 canola 11v1 EE454294_P1 1233 3278 542 93,7 globlastp LNU797_H158 canola l lv1 EE454622_P1 1234 3277 542 93,7 globlastp cleome_gynandraI10v1ISRR0155325000 LNU797_H160 1235 3279 542 93,7 globlastp 2255_P1 LNU797_H161 pepino09v1 CK756307_P1 1236 3280 542 93,7 globlastp abóbora_amarelaI11viISRRO91276X151 LNU797_H162 1237 3281 542 93,7 globlastp 710_P1 LNU797_H163 hornbeam 12v1 SRR364455,122361_P1 1238 3282 542 93,7 globlastp LNU797_H164 i omoea_nil 10v1 8J559450_P1 1239 3283 542 93,7 globlasip LNU797_H165 melão 1Dv1 DV633226_P1 1240 3280 542 93,7 globlastp LNU797_H167 phyIalliv2ISRRO99O35XlO56O3.Y1 1241 3284 542 93,7 globlastp LNU797_H168 anulas 11v1 SRR030259,236762_P1 1242 3285 542 93,7 globlastp LNU797_H169 rabaneteIgbl64IEV532244 1243 3277 542 93,7 gIobIasp t LNU797_H170 rabaneteIgbl64JEV544576 1244 3286 542 93,7 globlastp LNU797_H171 rabanetelgbl64lEW7243iO 1245 3287 542 93,7 globlastp LNU797_H172 rabanete b164 EX895850 1246 3277 542 93,7 qIobastp LNU797_H173 solanum_ hure'a D9v1 SPHAJ487384 1247 3288 542 93,7 globlastp LNU797_H174 tomate 11v1 ABO01552 1248 3289 542 93,7 gIobIasp t LNU797_H175 tomate 11v1 AJ487384 1249 3288 542 93,7 gobIaslp LNU797_H188 o ulus 13v1 BU823181_P1 1250 3290 542 93,7g[oblastp mandiocaI09v1IJGICASSAVA42237VALI LNU797_H176 1251 3291 542 93,67 glotblastn DM1_T1 LNU797_H177 jpyrum11vijSRR063689X100469T1 f 1252 3292 542 93,67 glolblastn LNU797_H178 fraxinus llv1 1SRR058827,113356_T1 1253 3293 542 93,67 glotblastn LNU797_H179 fraxinus 11v1 SRR058827,100546_T1 1254 3293 542 93,25 glotblastn LN1J797_H180 plataroli1v1 SRRO96786X125700_T1 1255 3294 542 93,25 glotblastn LGP52_H6 mimulus 12v1 DV206044_P1 1256 3295 542 93,2 globlastp P1otiana_benthamianal12v1LBP748670_ LGP52_H8 1257 3296 542 93,2 globlastp

LGP52_H10 P1otiana_benthamianaI12v1 ]CN747657_ 1258 3297 542 93,2 globlastp

LNU797_H181 fraxinus 11v1 SRRD58827,105716_P1 1259 3298 542 93,2 groblasip LNU797_H182 en ibre b164 DY345083_P1 1260 3299 542 93,2 globlastp LNU797H183 'atro ha 09v1 FM889898_P1 1261 3300 542 93,2 gbIastp LNU797__H184 mimulus 1Dv1 DV206044 1262 3295 542 93,2 globlastp 1r obancheI10v1ISRR023189S0003752_P LNU797_H185 1263 3301 542 93,2 globlastp

LNU797_H186 pimenta12vi BMO67274_P1 1264 3302 542 93,2 globlastp LNU797_H187 h la 11v2 SRR099035X28578_P1 1265 3303 542 93,2 globlastp LNU797_H188 populusliúvi 1BU823I81 1266 3304 542 93,2 pbIasp LNU797_H189 populusliOvi 1BU887035 1267 3305 542 93,2 globlastp LNU797_H189 o ulus 13v1 BU887035_P1 1268 3305 542 93,2 globlastp LNU797_H190 rosa 12v1 EC589334 1269 3306 542 93,2 globlastp LNU797_H191 salvia 10v1 FE536702 1270 3307 542 93,2 qloblastp LNU797_H192 moran o 11v1 DV439642 1271 3308 542 93,2 globlasip LNU797_H193 tabacoIgbl62ICVOl8545 1272 3309 542 93,2 globlasip LNU797_H194 thellun iella_halo hiium 11v1 IBY811542 1273 3310 542 92,83 glotblasin

LNU797_H262 P1 otiana_benthamianal12v1IEB425542_ 1274 3311 542 92,8 globlastp

LGP52_H9 zostera 12v1 AM766202_P1 1275 3312 542 92,8 globlastp LNU797_H195 berin ela 10v1 FS014765_P1 1276 3313 542 92,8 globlastp LNU797_H196 nu har b166 CK746396_P1 1277 3314 542 92,8 globlastp LNU797_H197 arthenium 10v1 GW78D462_P1 1278 3315 542 92,8 globlastp LNU797_H198 halaeno sis 11v1 CB0325D4_P1 1279 3316 542 92,8 globlastp LNU797_Hl99 zostera 10v1 AM766202 1280 3312 542 92,8 globlastp LNU797_H200 banana 12v1 DN239316_P1 1281 3317 542 92,6 globlastp LNU797_H201 centeio 12v1 IDRROO1O12,220584 1282 3318 542 92,41 glotblastn LNU797_H263 oleo 13v1 SRR014464X10873D1_P1 1283 3319 542 92,4 globlastp LGP52_H11 oleo 13v1 SRR014463X25018D1_P1 1284 3320 542 92,4 gIobastp a o phophallusI11v2ISRRO89351X14736 LNU797_H202 1285 3321 542 92,4 globlastp

ID SEQ.

Algor.

Polin.

Polip.

N°: global LNU797_H203 antirrhinum b166 AJ798448_P1 1286 3322 542 92,4 globlastp LNU797_H204 silene 11v1 GH294688 1287 3323 542 92,4 globlastp LNU797_H205 c cas b166 DRO61950_P1 1288 3324 542 92 globlastp LNU797_H206 tabacoJgbl62IEB425542 1289 3325 542 92 globlastp LNU797_H207 eu horbia 11v1 1BP961521_T1 1290 3326 542 91,98 glotblasin LNU797_H208 zamaIqb166IFD77381i 1291 3327 542 91,6 qloblastp LNU797_H209 Iovegrasslgbl67 EH183763Tl 1292 3328 542 91,14 glotblastn LNU797_H210 tripterygiumjl1viSRR098677Xl01097 1293 3329 542 91,1 gIobjp ast LNU797_H211 vinca 11v1 SRR098690X109756 1294 3330 542 91,1 globlastp LNU797_H212 banana 12v1 MAGEN2012011862_P1 1295 3331 542 90,7 globlastp LNU797_H213 clementina 11v1 EY827323_T1 1296 3332 542 90,3 glotblastn LNU797_H214 laranja 11v1 CF835946_T1 1297 3333 542 90,3 glotblastn P1otiana_benthamianal12v1IFG198486_ LGP52_H 12 1298 3334 542 90,1 globlastp LNU797 H215 a uile ia 10v2 DR919315 Pi 1299 3335 542 90 globlastp LNU797_H216 olea l lv1ISRRO14463,18338 1300 3336 542 89,8 globlastp LNU797_H217 petuniab171IFN002916P1 1301 3337 542 89,8 qloblastp LNU797_H218 uizotia 10v1 GE558856_P1 1302 3338 542 89,5 globlastp LNU797_H219 partheniiirnIlOviIGW785978Pl 1303 3339 542 89,5 qloblasip LNU797_H220 liriodendron bí66 CK757590_T1 1304 3340 542 89,03 glotbiastri LNU797_H221 centeio 12v1 DRRO01012,749006 1305 3341 542 88,43 glotblastn 1eratodonl10v1ISRR074890S0022447_P LNU797_H222 1306 3342 542 88,2 globlastp T1otiana_benthamianal12v1#EH620293_ LGP52_H13 1307 3343 542 88,19 glotblasin LNU797_H223 ambrosia 11v1 SRR346943,100828_T1 1308 3344 542 87,76 glotblastn LNU797_H224 fraxinus 11v11SRR058827,l23528_T1 1309 3345 542 87,76 glotblastn LNU797_H225 h scomltre[la 10v1 AJ225438_P1 1310 3346 542 87,3 globlastp LNU797_H226 h scomitrella 10v1 AW699661_P1 1311 3347 542 87,3 globlastp LNU797_H227 sela inella]gb165 FE508399 1312 3348 542 87,3 globlastp LNU797_H228 P1 phalotaxusI11v1ISRR064395X105137_ 1313 3349 542 86,9 globlastp LNU797_H229 cryptomerialgbl66lBPl74342Pi 1314 3350 542 86,9 globlastp LNU797H230 inheiro_marítima 10v1 BX249273P1 1315 3351 542 86,9 globlastp LNU797_H231 inheiro 10v2 AW587810_P1 1316 3351 542 86,9 globlastp P1docarpus110v1ISRR065014S0007113_ LNU797_H232 1317 3352 542 86,9 globlastp LNU797_H233 batata 10v1 AJ487384_P1 1318 3353 542 86,9 globlastp LNU797_H234 se uoia 10v1 SRR065044S0017123 1319 3354 542 86,9 globlasip LNU797_H235 s ruce 11v1 ES249872 1320 3355 542 86,9 globlasip LNU797_H236 taxus 10v1 SRRO32523S0013310 1321 3349 542 86,9 globlastp LNU797_H237 flaveria 11v1 SRR149232,152816_P1 1322 3356 542 86,5 qobIastp LNU797_H238 pseudotsuga10vlSRR065l19S0007920 1323 3357 542 86,5 globlastp LNU797_H239 ptecidiurnll1v1 ISRR043594X10900 1324 3358 542 86,5 glotblastn LNU797_H240 marchantia b166 BJ844657_P1 1325 3359 542 86,1 globlastp LNU797_H241 sciado it s 10v1 SRR065035S0004334 1326 3360 542 86,1 globlastp LN1J797_H242 abies 11v2 SRR095676X104726P1 1327 3361 542 85,7 globlastp LNU797_H243 cedrus iivl SRR065007X120238_P1 1328 3362 542 85,7 globlastp LNU797_H244 rabaneteIgbl64IEV532879 1329 3363 542 85,2 globlastp LNU797H245 tea 10v1 GTO87989 1330 3364 542 85,2 globlastp LNU797_H246 nicotiana_benthamianajgbi62CN747657 1331 3365 542 84,4 globlastp LNU797_H247 gnetalesjl0vl EX949788 P1 1332 3366 542 84 globlastp LNU797_H248 cana_de_a úcar 10v1 BQ536868 1333 3367 542 83,9 globlastp LNU797_H249 li uoarroz b171 FS266885_P1 1334 3368 542 83,1 globlastp LNU797_H250 papouas li vi SRR096789,122184_P1 1335 3369 542 82,7 globlastp LNU797_H251 rabaneteIgbl64jEV529O42 1336 3370 542 82,7 globlastp LNU797_H252 rabaneteIgbl64EV539i30 1337 3370 542 82,7 globlastp LNU797_H253 rabanetelgbl64IEV542O96 1338 3371 542 82,7 globlastp LNU797_H254 c amo sís 10v1 EG989234P1 1339 3372 542 82,3 globlastp LNU797_H255 a oulas 1171 SRR030267,187266_P1 1340 3373 542 82,3 globlasip LNU797_H256 flax 11v1 JG084720_T1 1341 3374 542 82,28 glotblastn

ID SEQ.

ID SEQ Horn. à % de Horn. ao Nome Organismo 1 Nome do agrupamento N° do N° do ID SEQ Id.

Algor.

Polin.

Poli p.

N°: global LNU797_H257 erbera09v1 AJ754027_P1 1342 3375 542 81,9 globlastp LNU797_H258 disc Pium 11v1 SRRO65077X153511_P1 1343 3376 542 81,4 globlaslp LNU797_H259 love rass b167 EH185755_P1 1344 3377 542 81,4 loblast LNU797_H260 mirlilo 12v1 1SRR353285X11741D1_Ti 1345 3378 542 81,01 glotblastn LNU797_H261 a oulas 11v1 SRR096789,253826_T1 1346 3379 542 81,01 glotblastn LNU798H1 cevada 12v1 BE422159_P1 1347 3380 543 97 globlastp LNU798_H2 soro 12v1 S902G019500 1348 3381 543 93,8 globtastp LNU798H3 milho_ ain o 11v3 PHY7SI029445M_P1 1349 3382 543 93,7 gIobastp LNU798_H4 milho 10v1 AI629903_P1 1350 3383 543 93,5 globlastp LNU798_H5 to o 12v3 AL819672 1351 3384 543 91,4 gIobastp LNU798_H6 arroz 11 v1 AU174198 1352 3385 543 91,2 gIobastp LNU798 H10 ca im chorão 12v1 FE609190_P1 1353 3386 543 91 globlastp LNU798 H7 tri o 12vá BQ245545 1354 3387 543 91 globlastp LNU798_H8 ain o 10v1 EV0454PM023052_P1 1355 3388 543 87,3 globlastp LNU798_H9 trio 12v3 BG606377 1356 3389 543 85,4 glablaslp LNU799_H1 aveia 11v1 GR338611_P1 1357 3390 544 95,5 glablastp LNU799_H2 le mus b166 EG397348_P1 1358 3391 544 93,9 gobIasIp LNU799_H3 centeio 12v1 IDRROO1012,356736 1359 3391 544 93,9 globlastp LNU799_H4 centeio 12v1 DRR001012,648999 1360 3391 544 93,9 globlastp LNU799_H5 centeio 12v1 DRR001012,761725 1361 3391 544 93,9 globlastp LNU799_H6 trio 12vá BE403020 1362 3391 544 93,9 globlastp LNU799_H7 cevada 12v1 BI953338_P1 1363 3392 544 93,5 qloblastp LNU799_H8 arroz 11v1 AU085931 1364 3393 544 91,1 globlastp LNU799_H9 milho_ ain o 11vá PHY7St030913M_P1 1365 3394 544 84,4 globlastp LNU799_H10 painçoil0v1 PMSLX0021480_P1 1366 3395 544 84,1 globlastp LNU799 H11 milho 10v1 FL234904 P1 1367 3396 544 84 globlastp LNU799_H12 milho 10v1 AW076436_P1 1368 3397 544 83,3 globlastp LNU799_H13 soro 12v1 SBO2G024130 1369 3398 544 82,9 globlastp LNU799_H15 ca im_chorão 12v1 FE619626_P1 1370 3399 544 82,5 globlastp LNU799_H14 ca im_chorão b167 FE619626 1371 3400 544 81,7 globlastp LNU801_H9 capim_chorâo 12v1 FL970980_P1 1372 3401 546 93,1 loblast LNU801_H1 ain o 10v1 EVQ454PM000992_P1 1373 3402 546 92,5 globlastp LNU801_H2 soro 12v1 SB03G046360 1374 3403 546 90 globlastp LNU801_H3 arroz llv1 BM420996 1375 3404 546 88,79 glotblastn LNU801_H4 milho 10v1 A1734386_P1 1376 3405 546 87,9 globlastp LNU801H5 milho 10v1 BE552901_P1 1377 3406 546 87,2 globlastp LNU801_H6 cevada 12v1 BE412491P1 1378 3407 546 82,9 globlasip LNU801 H7 brach odium 12v1 BRAD12G61240_P1 1379 3408 546 82 gbbIpasl LNU801_H8 centeio 12v1 IDRROD1012,134722 1380 3409 546 81,6 globlastp LNU802_H1 arroz 11v1 C26804 1381 3410 547 91,3 gobIastp LNU802_H2 milho_ ain o 11v3 PHY7SI02142lM_P1 1382 3411 547 89,1 globlastp LNU802_H3 arroz 11v1 BF475211 1383 3412 547 88,9 globlastp LNU802_H20 capim_chorão 12v1 FL702067_P1 1384 3413 547 88,5 globlastp LNU802 H4 painçoliOvi EV0454PM003455P1 1385 3414 547 88 globlastp LNUB02_H5 sor o 12v1 SBO9G029750 1386 3415 547 87,8 globlastp brachypodiumI12v1IBRADI2G15300T2_P LNU802_H6 1387 3416 547 87,2 globlastp LNU802_H7 tri o 12v3 BJ257279 1388 3417 547 86,9 globlastp LNU802_H8 tri a 12vá SRR073321X559678D1 1389 3417 547 86,9 globlastp LNU802H9 cevada 12v1 AV833654_P1 1390 3418 547 86,7 globlastp LNU802_H10 centeio 12v1 DRR001012,106866 1391 3419 547 86,5 globlastp LNU802_H11 tri o 12v3 CA497108 1392 3420 547 86,5 globlastp LNU802H12 centeio 12v1 IDRROO1012,119952 1393 3421 547 86,3 globlastp LNU802_H13 centeio 12v1 IDRROO1012,141039 1394 3422 547 86,3 globlastp LNU802_H14 tri o 12v3 SRR043326X4411701 1395 3423 547 85,7gob/astp LNU802_H15 centeio 12v1 DRR001012,724073 1396 3424 547 84,84 glotblastn LNU802_H16 centeio 12v1 DRRO01012,794078 1397 3425 547 84,63 glotblastn LNU802_H17 centeio 12v1 DRR001012,762098 1398 3426 547 84,6 globíastp LNU802_H18 aveia 11v1 CN816181P1 1399 3427 547 83,7 globastp LNU802_H19 iri o 12vá SRR043323X82204D1 1400 3428 547 81,48 glotblastn

ID SEQ.

Algor.

Polia.

Poli p.

N°: global LNU803_H7 ca im_chorão 12v1 FL957205_P1 1401 3429 548 91,1 globlastp LNU803_H1 ain o í0v1 EV0454PM050490_P1 1402 3430 548 89,9 globlastp LNU803_H8 cap]mchoràol 12v1 IJG811131_P1 1403 3431 548 88,6 globlastp LNJ803_H2 brach odium 12v1 BRADI2G60317_P1 1404 3432 548 88,6 globlastp LNU803_H3 ca im_chorãv b167 FL957205 1405 3433 548 86,1 globlastp apim_chorãoI12v1 ISRR364496,92662_T LNU803_H9 1406 3434 548 83,54 glotblastn LNU803_H4 trio 12vá SRR043323X35031D1 1407 3435 548 81,2 globlastp LNU803_H5 milho 10v1 A1629617_P1 1408 3436 548 81 globlastp LNU803_H6 milho 10v1 AW288544_P1 1409 3436 548 81 globlastp LNU805_H2 ca im_chorão 12v1 DN145962_T1 1410 3437 550 80,05 glolblastn LNU805_H1 capim_chorãojqb167DN145962 1411 3438 550 80 glotblastn LNU807_H1 soro 12v1 SBO9G006610 1412 3439 552 96,1 globlastp LNU807_H12 ca im_chorão 12v1 FL935393_P1 1413 3440 552 94,6 globlasip LNU807_H2 milha 10v1 CD950739_P1 1414 3441 552 93,8 globlastp LNU807 H3 ain o 10v1 EV0454PM000715_P1 1415 3442 552 88 loblast LNU807_H4 trio 12vá BG605330 1416 3443 552 85,2 globlastp LNU807_H5 tri o 12vá CA627721 1417 3444 552 85 globlastp LNU807 H6 tri o 12vá SRR043323X42120D1 1418 3444 552 85 globlastp LNU807_H7 centeio 12v1 IDRROO1012,103250 1419 3445 552 84,9 globlastp LNU807_H8 tri o 12vá CD917464 1420 3446 552 84,7 globlastp LNU807_H9 brachypodiurn12v1 18RAD14G26810_P1 1421 3447 552 84,3 globlastp LNU807_H10 arroz 11v1 AA753940 1422 3448 552 84,3 globlastp LNUB07_H11 arroz 11v1 BI807965 1423 3449 552 84,3 globlastp LNUB08 H1 ain o 10v1 EV0454PM012822 P1 1424 3450 553 95 globlastp LNU808_H5 ca im_chorão 12v1 DN145950_P1 1425 3451 553 94,5 globlastp LNU808_H2 ca im_chorão b167 DN145950 1426 3451 553 94,5 globlastp LNU808_H6 ca im_chorão 12v1 FL698385_P1 1427 3452 553 93,1 gIobastp LNU808_H3 sor a 12v1 SB06G033120 1428 3453 553 90 globlasip LNU808_H4 milho 10v1 CF636626_P1 1429 3454 553 89 globlastp LNU809_H1 çpim_chorâojgb167JDN142820 1430 3455 554 93,9 globlastp LNU809_H2 milho 10v1 BE344743P1 1431 3456 554 87,9 globlastp LNU809_H3 soro 12v1 SBO1G001260 1432 3457 554 87,3 globlastp LNU809_H4 cana_de_a úcar 10v1 CA110374 1433 3458 554 84,7 globlastp LN1J809_H5 arroz 11v1 B1306268 1434 3459 554 82,4 gíoblastp LNU810_H1 miho_painçoI milho 11v3 SICRP020917_P1 1435 3460 555 95,8 globlastp LNU810_H2 miho_painçoI 11 v3 PHY7SI012527M_T1 1436 3461 555 94,17 gotbIastn LNU810_H3 milho_ ain o 11v3 SICRP100316_P1 1437 3462 555 89,2 globlastp LNU810_H4 painçoIi0v1EVO454PM1iO704T1 1438 3463 555 86,67 glotblastn LNU811_H1 cana_de_a úcar 10v1 BU103402 1439 3464 556 81,9 globlastp LNU811_H2 soro 12v1 SB09G001370 1440 3465 556 80,5 globlastp LNU813_H1 soro 12v1 SB01G011930 1441 3466 557 89 globlasip LNU815_H1 soro 12v1 SB03G031180 1442 3467 559 94 globlastp LNU815_H2 cana_de_a úcar 10v1 CA123143 1443 3468 559 93,4 globlastp capim_chorãoII2v1ISRRI87765,104957_ LNU815_Hl1 1444 3469 559 91 globlastp LNU815_H12 ca im_chorão 12v1 FL826760_P1 1445 3470 559 89,3 globlastp LNU815_H3 milho_ ain o 11v3 PHY7S1003141M_P1 1446 3471 559 89,2 globlastp LNU815_H4 ca im_chorão b167 FL826760 1447 3472 559 88,7 globlastp LNU815_H5 arroz 11v1 AU174360 1448 3473 559 88,6 globlastp LNU815_H6 painçoliúvl PMSLX0006943_P1 1449 3474 559 85,6 globlastp LNU815_H7 centeio 12v1 IORRUO1012,175289 1450 3475 559 85 gIobastp LNU815HB centeio 12v1 DRRO01012,458810 1451 3475 559 85 gIobastp LNU815_H9 brachypodiuml 12v1 BRAD12G46560_T1 1452 3476 559 83,23 gIotbastn LNU815_H10 trio 12v3 BE4426266 1453 3477 559 82,6 globlasip LNU816_H5 brach odium 12v1 BRAD13G53550_P1 1454 3478 560 91,5 globlastp LNU816_H6 arroz 11v1 1CA759966 1455 3479 560 91,1 globlastp LNU816_H10 centeio 12v1 DRRo01014,10485 1456 3480 560 82,1 globlasip LNU817_H1 soro 12v1 SB06G032840 1457 3481 561 91,6 globlastp LNU817_H2 milho 1úv1 AI714648_P1 1458 3482 561 88,9 gobIas1p LNU817_H3 milho_ ain o 11 v3 PHY7S1018613M_P1 1459 3483 561 85,5 globlasip

ID SEQ, ID SEQ Hom. à % de Hom. ao Nome Organismo / Nome do agrupamento N° do N° do ID SEQ id.

Algor.

Polin.

Polip.

N°; global LNU817_H7 ca im_chorão 12v1 FL735544y.P1 1460 3484 561 84,7 globlastp LNU817_H4 cenchrus b166 EB660297_P1 1461 3485 561 84,1 qloblastp LNU817_H5 capim_chorâolgblG7IFL735544 1462 3486 561 82,9 globlastp LNU817_H6 painço10v1 IEVO454PM108926_P1 1463 3487 561 80,1 globlastp P1pim_chorãoI12v1ISRR187765,390310_ LNU819_H5 1464 3488 563 86,8 globlastp LNU819_H1 milho 10v1 EU946864_P1 1465 3489 563 86,3 globlaslp LNU819 H6 ca im_chorão 12v1 FL841069_P1 1466 3490 563 85,7 globlastp LNU819_H2 ca im_chorãa b167 FL841069 1467 3491 563 84,6 globlaslp LNU819_H3 soro 12v1 CF759244 1468 3492 563 82,42 glotblastn LNU819_H4 milho_ ain o 11 v3 PHY7S1031669M_P1 1469 3493 563 80,2 globlaslp LNU820_H1 sor a 12v1 SB07G028630 1470 3494 564 91,3 globlasip LNU820_H2 painçoIlOvllEVO4S4PM458338 Pl 1471 3495 564 87 globlasip LNU820_H7 ca im_chorão 12v1 FE655496_P1 1472 3496 564 86,4 globlaslp LNUB20_H8 ca im_chorãv 12vá FE619575_P1 1473 3497 564 86,1 globlastp LNU820_H3 milho_ ain o 11vá PHY7S1014065M_P1 1474 3498 564 86,1 globlastp LNU820_H4 ca ìm_chorão b167 FE619575 1475 3499 564 86,1 goblastp LNU820_H5 capim_chorãoIgb167FE655496 1476 3500 564 81,6 globlastp LNU820_H6 brachypodiumil2v1 IBRADI3G39210_P1 1477 3501 564 80,7 globlastp LNU822_H1 milho_ ain o 11 v3 PHY7S1011544M_P1 1478 3502 566 94,3 globlastp LNUB22_H2 soro 12v1 SB06G001560 1479 3503 566 94,3 globlastp LNU822_H3 cana_de_a úcar 10v1 1CA087712 1480 3503 566 94,3 globlastp LNU822_H4 trio 12vá CA484262 1481 3503 566 94,3 globlastp LNU822_H17 capim chorào 12v1 FL830389_P1 1482 3504 566 92,9 globlastp LNU822-H5 capim chorão b167 FL830388 1483 3504 566 92,9 globlastp LNU822_H6 c nodon 10v1 ES301162_P1 1484 3505 566 91,4 globlastp LNU822_H7 ain o 10v1 EV0454PM225827_P1 1485 3506 566 91,4 globlastp LNU822 H18 ca im_chorão 12v1 FL830388 P1 1486 3507 566 90 globlastp LNU822_H8 brach odium 12v1 BRADI5GO0560_P1 1487 3508 566 90 globlastp LNU822_H9 cevada 12v1 BI949537_P1 1488 3509 566 88,6 globlastp LNU822_H10 arroz 11v1 AA750203 1489 3510 566 88,6 globlastp LNU822_H11 c nodon 10v1 ES294723_T1 1490 3511 566 87,14 glotblastn LNU822_H12 aveia 11v1 G0594699P1 1491 3512 566 85,7 globlastp LNU822_H13 trio 12vá BE490468 1492 3513 566 85,7 globlastp LNU822_H14 tri o 12v3 81751481 1493 3513 566 85,7 globlastp ólle'_de_palmaI11v1ISRR190699,168391 LNU822_H15 1494 3514 566 81,4 globlastp LNU822_H16 zostera 10v1 SRRO57351S0024697 1495 3515 566 80 globlastp LNU823H1 soro 12v1 SB10G008020 1496 3516 567 96,4 globlastp LNU823_H2 milho 10v1 A1861542_P1 1497 3517 567 92,7 globlastp LNU823H20 ca im_chorão 12v1 IFE618890_P1 1498 3518 567 90,6 globlastp LNU823_H21 ca im_chorão 12v1 FE626264_P1 1499 3518 567 90,6 globastp LNU823_H3 capim_corãojgb167jFE618890 1500 3518 567 90,6 globastp LNU823_H4 c nodon 10v1 ES300242_P1 1501 3519 567 89,6 globlastp LNU823_H5 milho_ ain o 11v3 PHY7S1007340MP1 1502 3520 567 89,1 globlastp LNU823_H6 love rass b167 EH186334_P1 1503 3521 567 87 globlastp LNU823H7 ain o 10v1 EV0454PM084286_P1 1504 3522 567 86,5 globlaslp LNU823_H8 arroz11v18E230397 1505 3523 567 86 globlastp LNU823_H9 cana_de_a úcar 10v1 1CA098201 1506 3524 567 84,9 globlastp LNU823_HlO le mus b166 CD808583_P1 1507 3525 567 83,5 globlaslp LNU823_H11 trio 12vá BE416640 1508 3526 567 83,5 globlastp LNU823_H12 pseudoroegneriagb167FF347817 1509 3527 567 83 globlastp LNJ823_H13 cenchrus b166 EB656741_P1 1510 3528 567 82,8 globlastp LNU823_H14 cevada 12v1 BE603265_P1 1511 3529 567 82,5 globlastp LNU823_H15 aveia 11v1 GO588574_P1 1512 3530 567 81,9 globlastp LNU823_H16 brachypodium12v1BRÀDI1G4524OP1 1513 3531 567 81,8 globlastp LNU823_H17 centeio 12v1 BE495527 1514 3532 567 81,6 globlastp LNU823_H18 centeio 12v1 BE587517 1515 3532 567 81,6 globlastp LNU823_H19 lolium 10v1 ES700436_P1 1516 3533 567 80,3 globlastp LNU824_H1 milho 10v1 BE575106_P1 1517 3534 568 97,8 goblastp LNU824_H5 painçoi 0v1IEVO454PM005683P1 1518 3535 568 95,2 gioblastp

ID SEQ.

Algar.

Polin. of . N°: global LNU824_H21 milha 10v1 BE056872_P1 1519 3536 568 89,4 globlasip LNU824 H27 trio 12vá BE400910 1520 3537 568 88 glablasip LNU824 H28 tri o 12v3 SRR073322X587000D1 1521 3538 568 88 globlasp t LNU824_H29 centeio 12v1 DRR001012,606957 1522 3539 568 87,96 glo1bastn LNU824_H30 trio 12v3 BQ483480 1523 3540 568 87,7 globlasip LNU824_H37 o ulus 10v1 61139016 1524 3541 568 81,3 globlasip LNU824_H37 o ulus 13v1 BI139016_P1 1525 3541 568 81,3 globlasip LNU824_H42 tnpIerygium11v1 SRR098677X102165 1526 3542 568 80,78 glotblastn LNU824_H47 banana 12v1 IMAGEN2O12015228_P1 1527 3543 568 80,5 globlasp t LNU824_H49 platanoll1v1 SRR096786X106999_T1 1528 3544 568 80,45 glotblastn LNU828_H1 soro 12v1 SBO1G037440 1529 3545 570 93,9 globlasip LNU828H2 cana_de_a úcar 10v1lCA069736 1530 3546 570 93,3 globlastp LNU828_H3 milho 10v1 BI991815P1 1531 3547 570 88,2 globlaslp LNU828H4 milho_ ain o 11v3 EC613572_P1 1532 3548 570 87,5 globlasip LNU828_H10 ca im_chorão 12v1 FE628831_P1 1533 3549 570 86,9 globlaslp LNU828_H5 capim_chorãoIgbl6TIFE62883l 1534 3549 570 86,9 globlastp LNU828_H1 1 ca im_chorão 12v1 FE635562_P1 1535 3550 570 86,6 globlastp LNU828_H6 ca im_chorão b167 FE635562 1536 3550 570 86,6 globlastp LNU828_H7 pairçoIlOvlIEVO454PMOl068OPl 1537 3551 570 84,3 globlastp LNU828_H8 arroz 11v1 1BF430629 1538 3552 570 80,9 globlastp LNU828_H9 cenchrus b166 BM084141_P1 1539 3553 570 80,8 oblast LNU829_1-11 soro 12v1 SB10G002790 1540 3554 571 94,5 globlastp LNU829_H4 milho_ ain o 11v3 PHY7SI007445M_P1 1541 3555 571 93,8 globlastp LNU700H2 ca im_chorão 12v1 FE646787_T1 1542 3556 571 92,47 glotblastn LNU829_H5 ca im_chorão b167 FL894055 1543 - 571 91,1 glotblastn LNU830_1-11 soro 12v1 SB05G022780 1544 3557 572 96,9 globlastp LNU830_H2 milho_ ain o 11v3 PHY7SI025963M_P1 1545 3558 572 96,2 globlastp LNU830_H3 milho 10v1 CD942361_P1 1546 3559 572 95,8 globlastp LNU830H13 ca im_chorãa 12v1 FL692292_T1 1547 3560 572 94,72 glotblastn LNU830_H14 ca im_chorão 12v1 FL694591_P1 1548 3561 572 94,5 globlastp LNU830_H4 arroz 11v1 BE039844 1549 3562 572 91,9 globlastp LNU830_H5 brachypodiuml12ví IBR4DI4G15130_P1 1550 3563 572 90,5 globlastp LNU830_H6 centeio 12v1 DRR001012,122402 1551 3564 572 89,7 globlastp LNU830_H7 tri o 12vá BJ292957 1552 3565 572 89,6 globlastp LNU830_H8 painço0v1 EV0454PM046481_P1 1553 3566 572 88,7 globlastp LNU830_1-19 tri o 12v3 SRR400820X1166902D1 1554 3567 572 88,31 glotblastn LNU830_H10 tri o 12v3 CA640921 1555 3568 572 86,1 globlastp LNU830_Hl1 centeio 12v1 IDRROO1 DRRO01 013,178186 1556 3569 572 85,62 glotblastn LNU830H12 trio 12v3 BJ299341 1557 3570 572 80,7 globlastp LNU832_H3 ca im_chorào 12v1 FL740797_T1 1558 3571 574 83,82 glotblastn milho 11 v3 PHY7S1005129MT1 LNU832_H1 milho_pairçol 1559 3572 574 83,82 glotblastn LNU833_H2 capin_chorãoIgblS7IFESOSS77 1560 3573 575 87,3 globlastp LNU833_H4 ca im_chorão 12v1 FL864642_P1 1561 3574 575 87,1 globlastp LNU834_H3 ca im_chorão 12v1 FE628655_Pl 1562 3575 576 88,5 gobIastp LNU834_H4 ca im_chorão 12v1 FL721897_P1 1563 3576 576 87,1 globlastp LNU834_H2 milho_ ain o 11v3 PHY7S1032419M_P1 1564 3577 576 84,2 globlastp LNU835_H1 soro 12v1 1SB03G036960 1565 3578 577 92,7 globlastp LNU835_H2 milho_ ain o 11 v3 PHY7SI001322M_P1 1566 3579 577 87,8 globtastp LNU835 H3 ca im chorão 12v1 FL816691 P1 1567 3580 577 86 globlastp LNU835_H4 ca im_chorão 12v1 DN148836_T1 1568 3581 577 82,43 gloiblastn LNU837_H1 cana_de_a úcar 10v1 CA099580 1569 3582 578 93,6 globlastp LNU837_H3 sor o12v1 SBO1G044830 1570 3583 578 89,7 globlastp LNJ837_H2 milho_ ain o 11v3 PHY7SI036841M_P1 1571 3584 578 81,3 globlastp LNU838_Hl soro 12v1 SB06G016060 1572 3585 579 81,4 globlastp LNU838_H2 milbo_painçol 11v3 PHY7SI022177M_P1 1573 3586 579 80 globlastp LNU839_H1 sor a 12v1 SBO1G035480 1574 3587 580 94,7 globlastp LNU839H6 ca im_chorão 12v1 FL711007_P1 1575 3588 580 92,7 globlastp LNU839_H2 milho_ ain o 11v3 PHY7SI034579M_P1 1576 3589 580 90,9 gpbIastp LNU839_H3 capim_choráoIgblS7IFL7liOfl7 capim 1577 3590 580 90,26 glotblastn LNU839_H7 ca im_chorãa 12v1 FL913070_P1 1578 3591 580 88,6 globlastp

ID SEQ.

ID SEQ Hom. à % de Hom. ao Name Organismo 1 Nome do agrupamento N° do N° do ID SEQ Id.

Algar.

Poliu.

Poli p.

N°: global LNU839__H4 cevada 12v1 AK365006_P1 1579 3592 580 83,1 globlastp LNU839_H5 arroz 11v1 CI197575 1580 3593 580 82,7 globlaslp LNU840_H1 milho 10v1 IGRMZM2G126856T01_T1 1581 3594 581 89,53 glotblastn LNU840H2 soro 12v1 SB01G012580 1582 3595 581 83,58 glotblastn capim_chorão¡12v1ISRR187767,717986_ LNU840_H3 1583 3596 581 82,2 globlastp LNU841_H1 soro 12v1 SB08G017100 1584 3597 582 94,3 globlastp LNU841_H2 soro 12v1 XM_002442210 1585 3597 582 94,3 globlastp LNU841_H3 milho_ ain o 11v3 PHY7S1023738M_P1 1586 3598 582 93,3 globlastp LNU641_H4 milho_ ain o 11vá PHY7S1023743M_P1 1587 3599 582 93,3 globlastp capim_chorãoM12v1ISRR187766,726682_ LNU841_H17 1588 3600 582 92,3 globlastp LNU841_H5 sor o 12v1 SBOBG017170 1589 3601 582 90,6 globlastp capim_chorãoM12v1lSRR187768,166352_ LNU841_H18 1590 3602 582 90,4 globlastp LNU841_H19 ca im_chorão 12v1 FL882657_P1 1591 3603 582 89,4 globlastp Ppim_chorãoI12v1jSRR187769,1407427 LNU841_H20 1592 3604 582 86,7 globlastp LNU841_H6 milho 10v1 GRMZM2G303536T01_P1 1593 3605 582 84,9 globlastp LNU841_H7 c nodon 10v1 ES306830_P1 1594 3606 582 84,6 globlastp LNU841_HB tri o 12v3 CA658370 1595 3607 582 83,8 globlastp LNU841_H9 cevada 12v1 HV12v1CRP170116P1 1596 3608 582 82,9 globlastp LNU841_H10 arroz 11v1 81118730 1597 3609 582 82,9 globlastp LNU841_1-111 centeiol 12v1 DRR001012,239987 1598 3608 582 82,9 globlastp LNU841H12 bracypodiumI12viIBRADl4G05620P1 1599 3610 582 81,9 globlastp LNUB41_H13 c nodon 10v1 ES298100_P1 1600 3611 582 81,7 globlastp LNU841_1-114 centeio 12v1 DRR001012,383938 1601 3612 582 81,7 globlastp cal im_chorãoI12v1ISRR187771,1169651 LNU841_H21 1602 3613 582 81,2 globlastp LNU841_H15 brachypodiumli2v1 IBRADl4G05650Pi 1603 3614 582 81 globastp P1pim_chorão~12v1~SRR187769,117822_ LNU841_H22 1604 3615 582 80,8 globlastp LNU841_HI6 .pudoroegnehaIgb167IFF355748 1605 3616 582 80,8 globlastp LNU843_H2 milho_ ain o 11v3 PHY7SI005850MP1 1606 3617 583 83,6 globlastp LNU843_1-11 soro 12v1 SB10G014220 1607 3618 583 83,4 globlastp LNU843H3 cevada 12v1 BJ449862P1 1608 3619 583 80,1 globlastp LNU844_H1 soro 12v1 SBO6G023170 1609 3620 584 86,7 globlastp LNU844_H7 ca im_chorâo 12v1 FE634672_P1 1610 3621 584 84 globlastp LNU844_H8 ca im_chcrãc 12v1 FL828767_P1 1611 3622 584 83,7 globlasip LNU844_H2 capim_chorâoIgbl67jFE634672 1612 3623 584 83,6 globlasip LNU844_H3 milho_ ain o 11v3 PHY7SI010995M_P1 1613 3624 584 81,3 globlastp LNU844_H4 ain o 10v1 EVO454PM170895_P1 1614 3625 584 81 globlastp LNU844_H5 brach odium 12v1 BRADI5G16300_T1 1615 3626 584 80,59 glotblastn LNU844_H6 milho 10v1 CF632136 P1 1616 3627 584 80 globlaslp LNU845_H1 soro 12v1 SBO2G039730 1617 3628 585 91 globlastp LNU890_H1 cana_de_a úcar 10v1 1CA092661 1618 3629 586 80,5 goblas1p LNU890_H1 cana_de_a úcar 10v1 1CA092661 1618 3629 625 88,1 globlastp LNU849_H1 arroz 11v1 AF140491 1619 3630 589 98,67 gotbIastr LNU849_H2 cevada 12v1 BM443537P1 1620 3631 589 87,5 globlastp LNU849_H3 le mus b166 EG396571_P1 1621 3632 589 87,5 globlastp LNU849_H4 milha 10v1 A1746262_P1 1622 3633 589 86,7 globlastp LNU849_H5 milho_ ain o 11 v3 PHY7SI002848M_P1 1623 3634 589 86,6 globlastp LNU849_H6 pseudoroegnerigb167IFF366817 1624 3635 589 86,6 globlastp LNU849_H7 centeio 12v1 BE587488 1625 3636 589 86,6 globlastp LNU849_H8 centeio 12v1 DRRO01012,10525 1626 3636 589 86,6 globlastp LNU849_H9 cana_de_a úcar 10v1 CA065802 1627 3637 589 86,6 globlastp LNU849_H10 tri o 12v3 BQ483162 1628 3638 589 86,6 glablastp LNU849_H17 ca im_chorão 12v1 FE636162_P1 1629 3639 589 86,2 globlastp LNU849_1-111 soro 12v1 SB03G030650 1630 3640 589 86,2 globlastp LNU849_H18 ca im_chorão 12v1 FE625302_P1 1631 3641 589 85,7 globlastp LNU849_H12 capim_chorãoIgbl67IFE62530l 1632 3642 589 85,7 globlastp

ID SEQ.

Algor.

Polin.

Poli p.

N°: global LNU849_H13 brach odium 12v1 BRAD12G46060_P1 1633 3643 589 85,3 globlastp LNU849_H14 aveia 11v1 GR357640_T1 1634 3644 589 82,59 glotblastn LNU849_H15 ain a 10v1 EV0454PM504671_P1 1635 3645 589 80,8 globlastp LNU649_H19 capim_chorão 12v1 FL757304_T1 1636 3646 589 80,36 lotblastn LNU849_H16 capirn_chorãoIgbl67IFL757304 1637 3646 589 80,36 glolblastn LNU850_H1 milho 10v1 AI677001_P1 1638 3647 590 80,2 globlastp LNU852 H1 brachypodiurrtl 2vlLBRADI5O2l58OPi 1639 3648 592 82 globlastp LNU852_H2 aveia 11v1 GR321105_P1 1640 3649 592 81,8 globlastp LNU852_H3 cevada 12v1 BF630808_P1 1641 3650 592 81,7 globlastp LNU852_H4 pseudoroegnenagb167FF354586 1642 3651 592 80,9 globlastp LNUB52_H5 tri o 12v3 BE403524 1643 3652 592 80,7 globlastp LNU854_H1 arroz 11 v1 AA752561 1644 3653 594 95,94 glotblastn LNU854_H2 milho 10v1 AW330902_P1 1645 3654 594 90,8 globlastp LNU854_H3 soro 12v1 SB01G007880 1646 3655 594 90,8 globlasip LNU854H22 ca im_chorão 12v1 FE619859_Pl 1647 3656 594 90,1 globlastp LNU854_H4 tri o 12v3 BG604569 1648 3657 594 90 globlastp LNU854_H5 centeio 12v1 DRR001012,108381 1649 3658 594 87,99 glotblasin LNU854_H6 capimchoráoIgb167 FE619859 1650 3659 594 87,8 globlastp LNU854_H7 milho_ ain o 11 v3 PHY7S1034415M_P1 1651 3660 594 86,4 globlastp INU854_H8 banana 12v1 GFXAC186756X17_P1 1652 3661 594 82,9 globlastp LNU854_H9 banana 12v1 BBS110T3_P1 1653 3662 594 82,7 globlastp LNU854_H10 banana 12v1 IMAGEN2O12031765_Ti 1654 3663 594 81,24 glotblastn LNU854_H11 carvalho 10v1 CU640269_P1 1655 3664 594 80,3 globlastp LNU854_H12 arabido sis_I rafa 09v1 JGIAL026584_P1 1656 3665 594 80,2 globIastp LNU854 H13 b 'uncea 12v1 E6ANDIZ01BGQGU_P1 1657 3666 594 80,2 glcblastp LNU854_H14 b_ra a 11v1 CD832802_P1 1658 3666 594 80,2 globlastp LNU854H15 canola 11v1 EE459921_P1 1659 3666 594 80,2 globlastp LNU854_H16 eucali to11v2SRRO01659X91383_P1 1660 3667 594 80,2 globlastp LNU854_H17 b 'uncea 12v1 AJ561120_P1 1661 3668 594 80,1 globlastp phalaenopsislllv1ISRR125771,100605_ LNU854_H18 1662 3669 594 80,1 globlastp LNU854_H19 arabido sis 10v1 AT4G16370_T1 1663 3670 594 80,05 glotblastn LNU854_H20 solanum_ hure'a 09v1 SPHAI774365 1664 3671 594 80,05 glotblastn LNJ854 H21 thellun iella arvulum llv1 IBYBO3192 1665 3672 594 80 qlotblastn LNU856_H2 ca 'im_chorão b167 FE644937 1666 3673 595 91,45 glotblastn LNUB56_H7 milho 10v1 BM896061_P1 1667 3674 595 87,9 globlastp LNU861_H1 milho_ ain o 11vá PHY751013407M_Ti 1668 3675 598 97,26 gloiblastn LNUB61_H2 milho 10v1 CD438306_T1 1669 3676 598 94,32 lotblastn LNU861_H4 arroz11v1 CK071575 1670 3677 598 89,82 glolblastn LNU861_H5 arroz11v1 SOLX00081332 1671 3677 598 89,82 glotblastn LNU861_H6 brachypodiumll2vi BRADI3G37580_T1 1672 3678 598 89,67 glotblastn LNU861_H7 centeioi 12v1 IDRROO1012,202554 1673 3679 598 89,28 glotblastn LNU861_H8 cevada 12v1 CA028638_T1 1674 3680 598 89,24 glotblastn LNU861_H9 arroz 11v1 1CA756830 1675 3681 598 82,97 glotblastn LNU861_H10 arroz 11v1 1CK008076 1676 3682 598 82,97 glotblastn LNU861 _Hi 1 milho_painçol milho 11 v3 PHY7S1031891M_T1 1677 3683 598 82,36 glotblastn LNUS61_H12 trio 12v31SRR073321X296640D1 1678 3684 598 81,5 globtastp LNU861_H13 cevada 12v1 CA008529T1 1679 3685 598 81,41 glotblastn LNU861_H14 milha 10v1 DN222557_T1 1680 3686 598 80,93 glotblastn LNU861_H15 brachypodiuml 12v1 IBRADI4G31270_T1 1681 3687 598 80,58 glotblasth LNU861_H16 sor a 12v1 SB02G025750 1682 3688 598 80,5 glotblasin LNU861_H17 milho 10v1 EE160122_T1 1683 3689 598 80,15 glotblastn LNU862_H1 soro 12v1 SB08G001030 1684 3690 599 94,5 globlastp LNU862_H3 milho_ ain o 11v3 PHY7SIQ09715MP1 1685 3691 599 93,8 globlastp LNU862__H2 ca im__chorão b167 FL705388 1686 3692 599 93,7 globlastp LNU862_H16 ca im_chorão 12v1 FE626506_P1 1687 3693 599 93,3 globlastp LNU862_H6 milha_ ain o 11vá PHY7S1026163M_P1 1688 3694 599 92,8 globlastp LNU862H7 painço 14v1 IEVO454PMO31355P1 1689 3695 599 91,9 globlastp LNU862H5 painçojiOvi EV0454PM017321_P1 1690 3696 599 90,2 globlastp LNU862_H4 milha 10v1 C0449955_P1 1691 3697 599 89,5 globlastp

ID SEQ.

Algor.

Polin, Poip.

N°: global LNU862_H8 arroz 11v1 81806647 1692 3698 599 87,7 globlastp LNU862_H9 arroz 11v1 1CK041467 1693 3699 599 86,82 glotblastn LNU862_H12 trio 12vá BE424023 1694 3700 599 82,5 gIoblaspt LNU862_H11 brach odium 12v1 BRADl4G26590_P1 1695 3701 599 82,3 globlastp LNU862_H14 centeio 12v1 DRR001012,223104 1696 3702 599 82 globlasip LNU864_H1 canade_a úcar 10v1 CA284192 1697 3703 600 88,1 globlastp LNU864_H2 milho 10v1 BG841837 P1 1698 3704 600 83,3 globlastp LNU864_H3 milho 10v1 BM074912_P1 1699 3705 600 82 globlastp LNU864_H4 ca im_chorãa b167 FL763699 1700 3706 600 82 globlastp LNU864_H7 ca im_chorão 12v1 FL763699_T1 1701 3707 600 81,97 gloiblastn LNU864_H5 milho_ ain o 11v3 PHY7SI003614M_T1 1702 3708 600 80 glotblastn LNU864H6 milho_ ain o 11v3 SOLX00021347_T1 1703 - 600 80 glolblastn LNU865_H4 ca im_chorão 12v1 FL867036_P1 1704 3709 601 90,7 globlastp LNJ865_H5 ca im_chorão 12v1 FL693600_P1 1705 3710 601 90,1 globlastp LNU865_H1 painço 11vá PHY7S1019927M_P1 milhopainçol 1706 3711 601 89,6 globlastp LNU865_H2 milho 10v1 AW056335_P1 1707 3712 601 87 globlastp LNU865_H3 brachypodium12vlBRADI3G5573OP1 1708 3713 601 80,6 globlastp LNU867_Hl milho 10v1 AI622284_P1 1709 3714 603 95,4 globlastp LNU867H2 milho_ ain o 11v3 PHY7SI034422M_P1 1710 3715 603 91,4 globlastp LNU867_H6 ca im_chorão 12v1 FE639293_P1 1711 3716 603 88,8 globlastp LNU867H3 arroz 11v1 AU065908 1712 3717 603 85,1 globlastp LNU867_H4 brash odium 12v1 BRADI1G04830_P1 1713 3718 603 84,5 globlastp LNU867_H5 centeio 12v1 DRRO01012,163223 1714 3719 603 83,4 globlasip LNU867_H7 capim_choraol 1 2v1 IDN143060T1 1715 3720 603 80,57 glotblastn LNU868_H1 cana_de_a úcar 10v1 CA093083 1716 3721 604 89,96 glotblastn LNU868_H2 milho 10v1 A1947616P1 1717 3722 604 89,2 globlastp LNU868H9 ca im_chorão 12v1 FL739389P1 1718 3723 604 88,8 last LNU868_H3 milho_ ain o 11v3 PHY7S1037194M_P1 1719 3724 604 88,8 globlastp LNU86B_H4 capim_chorãoIgbl67IFL739389 capim 1720 3723 604 88,8 globlastp LNU868_HS cenchrus b166 8M084505_P1 1721 3725 604 88 globlastp LNU868 H6 ca im chorão b167 FL693838 1722 3726 604 88 gIobastp LNU868_H10 ca im_chorão 12v1 FL693838_T1 1723 3727 604 87,95 glotblastn LNU868H7 painçoIlOvllPMSL.X0030911D1p1 1724 3728 604 86,7 globlastp LNU868_H8 arroz 11v1 0SU16747 1725 3729 604 80,6 glcblastp LNU869_H1 milha 10v1 BM266786_T1 1726 3730 605 84,71 glotblastn LNU870_H2 milho 10v1 CB616889_P1 1727 3731 606 93,7 globlastp LNU870_H5 ca im_chorão 12v1 FL933190_P1 1728 3732 606 89,8 globlasip LNU870_H6 ca im_chorão 12v1 FL689654_P1 1729 3733 606 89g{oblastp LNU870H3 milho 10v1 DR811947_P1 1730 3734 606 87,3 globlasip LNU870_H4 brachypodiurnl 12v1 IBRADI1G07390_P1 1731 3735 606 83,6 globlastp LNU870_H7 arroz 11v1 GFXAC107207X23P1 1732 3736 606 80,8 globlasip LNU871_H1 cana_de_a úcar 10v1 CA073953 1733 3737 607 97,59 glotblasin LNU871_H2 milho 10v1 H35900_P1 1734 3738 607 97 globlastp LNU871_H3 milho_ aln o 11v3 PHY7SI035239M_P1 1735 3739 607 92,2 globlastp LNU871_H4 painço10v1 IEVO454PMO12409_P1 1736 3740 607 90,8 globlastp LNU871_H5 brach odium 12v1 BRADI3G38220_P1 1737 3741 607 88,8 globlastp LNU871_H6 ca im_chorão b167 DN150454 1738 3742 607 88,2 globlastp LNU871_H10 ca im_chorão 12v1 DN150454_P1 1739 3743 607 88 globlastp LNU871H7 tri o 12v3 CA663733 1740 3744 607 84,8 globlastp LNU871_H8 tri o 12v3 BQ240433 1741 3745 607 84,6 globlastp LNU871_H9 centeio 12v1 DRRO01012,137460 1742 3746 607 84,34 glotblastn LNU872_H1 cana_de_a úcar 10v1 1CA074015 1743 3747 608 99 globlastp LNU872_H2 trs o 12vá CA486412 1744 3748 608 99 gpbIas1p LNU872_H3 milho 10v1 T70637_P1 1745 3749 608 96,7 globlasip LNU872_H4 milho 10v1 A1714486 P1 1746 3750 608 95,7 globlastp LNU872_H5 ca im_chorão b167 FL766492 1747 3751 608 94,4 globlastp LNU872_H6 cenchrus b166 BM083980P1 1748 3752 608 93,9 globlastp LNU872_H7 ain o 10v1 CD724561_P1 1749 3753 608 93,9 globlastp LNU872_H8 milho_ ain o 11v3 PHY7SI037482MP1 1750 3754 608 92,9 globlastp LNU872_H9 capim_choroIgbl67JFE6260i2 1751 3755 608 91,6 globlastp

ID SEQ.

ID SEQ Horn. à % de Hom. ao Nome Organismo 1 Nome do agrupamento N° do N° do ID SEQ Id.

Algol.

Poìin.

Polip.

N°: globar LNU872_H10 aveia 11v1 G0591754_P1 1752 3756 608 88,7 globlastp LNU872_H1 1 centeio 12v1 IDRROO1012,107218XX1 1753 3757 608 88,7 globlastp LNU872_H12 centeio 12v1 DRRO01012,112003 1754 3757 608 88,7 gobIastp LNUB72_H13 c nodon 10v1 ES292020_P1 1755 3758 608 88,6 globlastp LNU872_H14 arroz 11v1 BI806552 1756 3759 608 88,3 globlastp LNU872_H15 cevada 12v1 BE412496P1 1757 3760 608 87,8 globlaslp LNU872_H16 tri o 12v3 BE430362 1758 3761 608 87,8 globlaslp LNU872 H17 pseudoroegneriaIgb167FF346564 1759 3762 608 87,3 globlaslp LNU872_H18 brachypodium 12v1 IBR4DI1 Gil 830_P1 1760 3763 608 87,1glob!astp LNJ872_H19 love rass b167 EH183935_T1 1761 3764 608 85,51 glotblastn LNU873_Hl milho 10v1 CD969989_P1 1762 3765 609 88,7 gIobastp LNU873_H2 milho_ ain o 11v3 PHY7S1038649MP1 1763 3766 609 83,1 gIobastp LNU873_H4 ca im_chorão 12v1 FL842367_Ti 1764 3767 609 82,55 glotblastn LNU873_H5 ca im_chorão 12v1 FL842366_P1 1765 3768 609 82,1 gIobastp LNU873_H3 milho_ ain o 11v3 SIPRD087917_T1 1766 3769 609 81,03 glotblastn LNU874_Hl milho 10v1 AW308694 P1 1767 3770 610 97 globlastp LNU874H2 milho_ ain o 11vá PHY7SI033940M_P1 1768 3771 610 93,6 gIobastp LNU874_H3 brachypodiurnll2vllBR.ADI1G15377P1 1769 3772 610 88,1 globlastp LNU874_H4 tri o 12v3 BM137286 1770 3773 610 87,6 gIob1apst LNU874_H5 arroz11v1 B1797720 1771 3774 610 86,3 gIobastp LNU874_H6 1ri o 12vá SRR043326X71705D1 1772 3775 610 80,7 globlastp LNU875_H1 milho 10v1 A1600310_P1 1773 3776 611 96,3 globlastp LNU875_H2 milho_ ain 11v3PHY7S1034375M_P1 1774 3777 611 92,2 globlastp LNU875_H9 ca im_chorão 12v1 FL692975_P1 1775 3778 611 91,7 globlastp LNU875_H3 arroz11v1 GFXACO25296X19 1776 3779 611 86,9 globlastp LNU875_H4 centeio 12v1 DRR001012,181409 1777 3780 611 86,3 globlaslp LNU875_H5 tri o 12v3 CA609528 1778 3781 611 86,2 globlasip LNU875_H6 tri o 12v3 CJ953973 1779 3782 611 86,2 globlastp LNU875_H7 tri o 12v3 BE417057 1780 3783 611 85,8 globlastp LNU875_H8 brachypodiumIl2vlBRDl3G3O830Pl 1781 3784 611 84,5 globlastp LNUS78_H1 milho_painçol 11 v3 PHY7Sl038002M_P1 1782 3785 613 96,2 gobIastp LNU878_H2 milho 10v1 BE511455 P1 1783 3786 613 95,5 globlastp LNU878H16 capim_choroI 12v1 DN141295_P1 1784 3787 613 94,7 globlastp LNUB78_H3 milho 10v1 A1947516_P1 1785 3788 613 94,7 globlastp LNU878_H4 painçoliOvi EV0454PM069646_P1 1786 3789 613 94,7 globlastp LNU878_H5 capim_chorãoIgb167 DN141295 1787 3787 613 94,7 globlastp LNUB78_H6 cana_de_a úcar 10v1 CA084602 1788 3790 613 94 globlastp LNU878_H7 capim_chorâoIgbl67IFE65853l 1789 3791 613 94 globlastp LNU878_H8 cenchrus b166 EB665787_T1 1790 3792 613 90,98 glotblastn LNU878_H9 arroz 11v1 1BE040893 1791 3793 613 84,4 globlastp LNU878_H10 seudoroe neria b167 FF366886 1792 3794 613 82,2 globlastp LNU878H11 brachypodiuml 12v1 IBRADMG62860_P1 1793 3795 613 81,6 globlastp LNU878_H12 cevada 12v1 BE455249_P1 1794 3796 613 80,9 globlasip LNU878_H13 pseudoroegneriagb167IFF349713 1795 3797 613 80,9 globlastp LNU878_H14 centeio 12v1 BE636984 1796 3798 613 80,7,gbIastp LNU878_H15 trio 12vá CA655678 1797 3799 613 80,7 globlastp LNU879_H1 cara_de_a úcar 10v1 CA112170 1798 3800 614 96,8 globlastp LNU879_H2 milha 10v1 BG517175_P1 1799 3801 614 95,5 globlastp LNU879_H3 c nodon 10v1 ES301377_P1 1800 3802 614 89 globlastp LNU879_H4 trio 12vá BE426554 1801 3803 614 84 globlastp LNU879_H8 ca im_chorão 12v1 H0253185_T1 1802 3804 614 83,18 glotblastn LNU879_H5 arroz 11v1 BI306445 1803 3805 614 83 globlastp LNU879_H6 cevada 12v1 BJ454262P1 1804 3806 614 82,2g!oblastp LNU879_H7 brachypodiumi2viBRADI1G671lOp1 1805 3807 614 81,7 globlastp LNU880_H1 cana_de__a úcar 10v1 CA065186 1806 3808 615 96,5 globlastp I_NU880_H2 milho 10v1 AI600362P1 1807 3809 615 95,1 globlastp LNU880_H3 milha_ ain o 11v3 PHY7SI035863MP1 1808 3810 615 94,3 globlastp LNU880_H10 capim_chorãol 12v1 IFE6O1297_P1 1809 3811 615 93,6 globlastp LNUB80_H4 ca im_chorão b167 FE601297 1810 3812 615 92,9 globlastp LNU880_H11 capim_chorão 12v1 JFL761681P1 1811 3813 615 91,7 globlastp

187/4I3

1D SEQ.

ID SEQ Horn. á % de Hom. ao Nome Organismo! Nome do agrupamento N° do N° do ID SEQ Id.

Algor.

Polin.

Poli p.

N°: global LNU880_H5 brach dium 12v1 BRADI1G74650_P1 1812 3814 615 82,6 globlastp LNU880_H6 arroz 11v1 BMO37902 1813 3815 615 82,6 globlastp LNU880_H7 tri o 12v3 BF483896 1814 3816 615 81,9 globlastp INU880_H8 centeio 12v1 DRRO01012,109304 1815 3817 615 81,4 globlastp LNU880_1-19 centeio 12v1 LDRROO1012,101331 1816 3818 615 81,2 globlastp LNU881_H1 milho 10v1 AI622122_P1 1817 3819 616 88,2 globlastp LNU881 H2 milho_painçol 11 v3 PHY7S1034179M_P1 1818 3820 616 83 globlastp LNU881_H3 capim_chorão 12v1 FE597492_P1 1819 3821 616 80,5 globlastp LNU882_H1 milho 10v1 BM072852_P1 1820 3822 617 93,7 globlastp LNU882_H2 milho_ ain 11vá EC612475_P1 1821 3823 617 91,9 globlastp LNU882_H3 ain o 10v1 EV0454PM047888_Pi 1822 3824 617 91,5 globlastp LNU882_H4 arroz 11v1 61796737 1823 3825 617 89,4 globlastp LNU882_H5 cevada 12v1 BF064865_P1 1824 3826 617 88,1 globlastp LNU882_H6 centeio 12v1 DRR001012,119640 1825 3827 617 87,6 globlastp LNU882_H7 brachypodiurn12v11 BRADi1G76280P1 1826 3828 617 86,5 qloblastp LNU883_H1 milho ain o 11vá PHY7SI034726M_P1 1827 3829 618 95,2 globlastp LNU883_H2 milho 10v1 C0529769_P1 1828 3830 618 94,7 globlastp LNU883_H3 arroz 11v1 BI803402 1829 3831 618 91 globlastp LNU883_H4 brachypodium12v1BRADI1G75540T1 1830 3832 618 84,29 glotblastn LNU883_H5 tri o 12v3 C,j904265 1831 3833 618 82,1 globlastp LNU884_H1 milho 10v1 AI666123P1 1832 3834 619 91,8 globlastp LNU884_H4 ca im_chorão 12v1 FL810399_P1 1833 3835 619 87,6 globlastp LNU884_H2 ca im_chorão b167 FL692715 1834 3836 619 87,6 globlastp LNU884_H5 capim chorão 12v1 FL692715_P1 1835 3837 619 86,6 globlastp LNU884_H3 milha_ ain o 11v3 EC613926_Pi 1836 3838 619 85,9 globlaslp LNU885H1 milho 10v1 AA979999_P1 1837 3839 620 98,9 globlastp LNU885_H2 milho 10v1 A1932058_P1 1838 3840 620 98,3 globlastp LNU885_H3 ca im_chorão b167 FE598943 1839 3841 620 98,1 globlastp LNU885_H156 ca im_chorão 12v1 FE598943P1 1840 3842 620 97,9 Loblast LNU885H4 cenchrus b166 EB653919_P1 1841 3843 620 97,9 gobIastp LNU885_H5 soro 12v1 SB100022220 1842 3844 620 97,9 gobIastp LNU885_H6 milho_ ain 11v3PHY7SI006215M_P1 1843 3845 620 97,8g[oblastp LNU885_H157 ca im_chorão 12v1 FE604237_P1 1844 3846 620 97,6 globlastp LNU885_H7 milho_ ain a 11v3 PHY7S1029447M_P1 1845 3847 620 97,6 globlastp LNU885_HB ain o 10v1 EV0454PM002715_P1 1846 3848 620 97,6 globlastp LNU885H158 ca im_chorão 12v1 FE617027 P1 1847 3849 620 97,2 globtastp LNU885_H9 capim_chorãoIgb167FE617027 1848 3849 620 97,2 globlastp LNUB85_H10 arroz 11 v1 AÁ753506 1849 3850 620 95,7 globlastp LNUB85_H11 brachypodiurnIl2vlIBRADIlG3779QPl 1850 3851 620 94,6 globlastp LNU885_H12 brachypodiuml12v1 BRADI3G33860_P1 1851 3852 620 93,1 globlasip LNUB85_H159 ca im_chorão 12v1 FE603637_PI 1852 3853 620 92,3 globlastp LNU885_H13 morara o 11v1 C0381502 1853 3854 620 92,3 globlastp LNU885_H14 aveia 11v1 CN815217_P1 1854 3855 620 92,1 globlastp LNU885H15 batata 10v1 BG593674_Pi 1855 3856 620 92,1 globlastp LNU885_H16 tomate 11v1 BG129608 1856 3857 620 92,1 globlastp LNU885 H17 liriodendron b166 CK755344_P1 1857 3858 620 92 globlastp LNU885 H18 aveia 11v1 CN817660 P1 1858 3859 620 92 globlastp LNU885 H19 óleo de alma 11v1 EL684287_P1 1859 3860 620 92 globlastp LNU885 H2O tabaco b162 B0842866 1860 3861 620 92 globlastp LNU885 H21 melancia 11v1 X85013 1861 3862 620 92 globlastp P1otiana_benthamianal12v1JEB446376_ LNU885_H160 1862 3863 620 91,8 globlastp LNU885_H22 e ino 09v1 X85013_P1 1863 3864 620 91,8 globlastp LNU885_H23 centeio 12v1 BG264101 1864 3865 620 91,8 gobIastp LNU885_H24 centeio 12v1 4RR001012,133776 1865 3865 620 91,8 gíoblastp LNU885_H25 solanum_ hure a 09v1 SPHBG129608 1866 3866 620 91,6 gobIastp LNU885_H26 iri o 12v3 BE404507 1867 3867 620 91,6 globlastp LNU885_H27 tri o 12vá BE406710 1868 3867 620 91,6 globlasip LNU885_H161 runus_mume 13v1 BU044204_P1 1869 3868 620 91,4 gobIastp Trstolochia¡10v1ISRR039082S0002361_ LNU885_H28 1870 3869 620 91,4 gtotblasin

ID SEQ.

ID SEQ Hom. à % de Horn. ao Nome Organismo! Nome do agrupamento N° do N° do ID SEQ Id.

Algor.

Polin.

Polip.

N°: global LNU885_H29 eucali to 11v2 CD669053_Pi 1871 3870 620 91,4 globlastp LNU885_H30 óleo_de_ alma 11v1 EL681083_P1 1872 3871 620 91,4 globlastp LNJ885_H31 amendoim 10v1 EE126045_P1 1873 3872 620 91,4 globlastp LNU885_h32 pa1aenopsisIl1v1 CB032203XX1_P1 1874 3873 620 91,4 globlastp LNJ885_H162 mimulus 12v1 DV206835_P1 1875 3874 620 91,2 qloblastp a P1phophallusI11v2ISRR089351X17307 LNU8B5_H33 1876 3875 620 91,2 globlastp ca tharanthusI11v1ISRR098691X112848_ LNU885_H34 1877 3876 620 91,2 globlastp LNU885_H35 flaveria 11v1 ISRRI49229,103924_P1 1878 3877 620 91,2 globlastp LNU8B5_H36 flaveria 11v1 ISRR149229,114493_P1 1879 3877 620 91,2 globlastp LNUB85_H37 mimulus 10v1 DV206835 1880 3874 620 91,2 globlastp LNUB85_H38 carvalho 10v1 DN950673P1 1881 3878 620 91,2 globlastp LNU885_H39 tanta o í1v2 SRR066373X102202_P1 1882 3879 620 91,2 lobIastp LNUB85_H40 tri a 12vá BE403876 1883 3880 620 91,2 globlastp LNUB85_H41 banana 12v1 BBS440T3_P1 1884 3881 620 91 globlastp LNU885_H42 cacau 10v1 CA796831_P1 1885 3882 620 91 globlastp LNU885 H43 mandioca 09v1 CK643413 P1 1886 3883 620 91 globlastp castanhalgb1701SRR006295S0006601_P LNU885_H44 1887 3884 620 91 globlastp LNU885_H45 cirsium llv1 1SRR346952,128271_P1 1888 3885 620 91 globlastp LNU865_H46 alface 12v1 DW044389_P1 1889 3886 620 91 globlastp LNU885_H47 prunusIlOvlIBUO442O4 1890 3887 620 91 globlastp LNU885 H48 çpm .chorãoJgbi67JFE604237 1891 3888 620 91 globlastp LNU885_H163 mamona 12v1 T15265_P1 1892 3889 620 90,8 globlastp LNU885H49 artemisia 10v1 EY033790_P1 1893 3890 620 90,8 globlastp LNU885_H50 mandioca 09v1 CK647990_P1 1894 3891 620 90,8 globlastp LNU885_H51 mamona 11v1 1T15265 1895 3889 620 90,8 globlastp LNU885_H52 eu horbia 11v1 AW990924_Pl 1896 3892 620 90,8 globlastp LNU885H53 fiaveria 11v1 SRR149232,246685_P1 1897 3893 620 90,8 t gioblasp LNU885_H54 oss ium_raimondii 12v1 DT557120_P1 1898 3894 620 90,8 globlastp LNU885_H55 uva 11v1 BM437210_P1 1899 3895 620 90,8 globiasip LNU885_H56 soja 11v1 GLYMA11G37630 1900 3896 620 90,8 globlastp LNU885_H56 soja 12v1 GLYMA11G37630_P1 1901 3896 620 90,8 globlastp LN1J885_H164 olea 13v1 ISRRO14463X51856D1_P1 1902 3897 620 90,7 qloblastp LNU885_H57 ma ã 11v1 CN490098_P1 1903 3898 620 90,7 globlastp LNUB85H58 clementina 11v1 CF417075_P1 1904 3899 620 90,7 globlastp LNUB85_H59 al odào 11v1 AI054652_P1 1905 3900 620 90,7 Ioblast LNU885_H60 laranja 11v1 CF417075_P1 1906 3899 620 90,7 globlastp LNU885_H61 só a l l v1 GLYMA18G01580 1907 3901 620 90,7 globlastp LNU885H61 soa 12v1 GLYMA18G01580_P1 1908 3901 620 90,7 globlastp LNU885_H62 amborella 12v3 FD432979_P1 1909 3902 620 90,5 globlastp LNU885_H63 amsonia 11v1 1SRR098688X101304_P1 1910 3903 620 90,5 globlastp LNU885_H64 ma ã llv1 CN489384_P1 1911 3904 620 90,5 globlastp LNU885_H65 a uile ia 10v2 DR937313_P1 1912 3905 620 90,5 globlastp LNU885_H66 centaurea b166 EH713231_P1 1913 3906 620 90,5 globlastp LNU885_H67 cichoriumlgbi7l EH673881_Pl 1914 3907 620 90,5 globlastp LNU885_H68 cirsium 11v1 1SRR346952,1001022_P1 1915 3906 620 90,5 globlastp LNU885_H69 feijão_fradinho 12v1 FF387653_P1 1916 3908 620 90,5 globlastp LNU885_H70 eschscholzia 11v1 CD476599_P1 1917 3909 620 90,5 globlastp LNU885_H71 eschscholzia 11v1 CD478545_P1 1918 3910 620 90,5 globlastp f j o guanduI11vllSRR054580X107320 LNU885__H72 1919 3911 620 90,5 globlastp LNU885_H73 centeio 12v1 DRRO01012,135185 1920 3912 620 90,5 globlastp LNU885_H74 tri h saria 10v1 DR174094 1921 3913 620 90,5 qJoblastp LNU885_H165 mimulus 12v1 DV209559_P1 1922 3914 620 90,3 gobIastp LNU885_H75 ambrosia 11v1 SRR346935,112544_P1 1923 3915 620 90,3 globlastp LNU885_H76 ambrosial11 v1 JSRR346935,130001_P1 1924 3916 620 90,3 globlastp LNU885_H77 amica 11v1 SRRO99034X108499_P1 1925 3917 620 90,3 globlastp LNU885_H78 banana 12v1 FF558852_P1 1926 3918 620 90,3 globlastp LNU885_H79 mirtilo 12v1 CV090498_P1 1927 3919 620 90,3 globlastp

ID SEQ.

ID SEQ Hom. à % de Hom. ao Nome Organismo 1 Nome do agrupamento N° do N° do ID SEQ !d.

Algor.

Polin.

Polip.

N°: global LNU885_H80 mimulus 10v1 DV209559 1928 3914 620 90,3 globlastp LNU885_H81 tri onella 11ví SRR066194X112617 1929 3920 620 90,3 globlastp LNU885_H82 tri h sacia 10v1 1BM357149 1930 3921 620 90,3 globlastp LNU885 H83 arnica 11v1 1SRR099034X107278_T1 1931 3922 620 90,28 glotblastn LN1J885_H84 orobancheM10v1ISRR023189S0002711_T 1932 3923 620 90,28 glotblastn LNU885-H85 ambrosia 11v1 SRR346935,225484_P1 1933 3924 620 90,1 globlastp LNU885_H86 euon mus 11v1 SRR070038X106031_Pi 1934 3925 620 90,1 globlastp LNU885_H87 oss ium_raimondii 1 2v1 A1725994_P1 1935 3926 620 90,1 globlastp LNU8B5_H88 medica o 12v1 AW256519_P1 1936 3927 620 90,1 globlastp LNU885_H89 s ruce l lv1 EF678303 1937 3928 620 90,1 globlastp LNU885_H90 s ruce11v1 ES226997 1938 3929 620 90,1_gçbIastp LNU885_H91 s ruce11v1 EX358693 1939 3930 620 90,1 globlastp LNU885_H166 feïjãa 12v2 CA898352_P1 1940 3931 620 89,9 gjoblastp LNU885_H92 feijão 12v1 CA898352 1941 3931 620 89,9 globlastp LNU885_H93 faia 11v1 SRR006293,13457_P1 1942 3932 620 89,9 oblast chelidoniuml11v1ISRR084752X103249_P LNU885_H94 1943 3933 620 89,9 globlastp LNU885_H95 al odão 11v1 IAI725994Pi 1944 3934 620 89,9 globlastp LNU885H96 alface 12v1 DW066578P1 1945 3935 620 89,9 globlastp LNU885_H97 papoulaslilv1 1SRR030259,334416_P1 1946 3936 620 89,9 globlastp LNU885_H98 jperygium 11v1 LSRR098677X103558 1947 3937 620 89,9 globlastp LNU885_H167 rao_de_bico 13v2 ES560343_P1 1948 3938 620 89,7 globlastp LNU885_H99 ables 11 v2 SRR098676X100633_P1 1949 3939 620 89,7 globlastp LN1J885_H100 uva 11v1 GSVIVT01000590001_P1 1950 3940 620 89,7 _gipastp LNU885_H101 inheiro 10v2 AW011601 _P1 1951 3941 620 89,7 globlastp LNL885_H102 pseudotsugaMOviISRRO6Sli9S000SOg4 1952 3942 620 89,7 globlastp LNU885_H103 saffIowerIgbi62IEL375744 1953 3943 620 89,7 globlastp LNU885__H104 irassol 12v1 CD851729 1954 3944 620 89,7 globlastp LNU885_H105 vinca 11v1 1SRR098690X103497 1955 3945 620 89,7 globlastp LNU885_H106 solanum hure'a09v1 SPHBE920118 1956 3946 620 89,6 globlastp LNU885_H107 inheiro_marítimo 10v1 IBX251751P1 1957 3947 620 89,5 gIobastp LNU885_H108 papoulasll lv1 IFE96499i_P1 1958 3948 620 89,5 qloblastp LNU885_H109 rabanete1gbi64 EV546967 1959 3949 620 89,5 glcblastp LNU885_H110 valerians 11v1 SRR099039X104384 1960 3950 620 89,5 globlastp LN1J885_H111 cirsium 11v1 SRR346952,209008_P1 1961 3951 620 89,4 globlasip LNU885__H112 b_ra a 11v1 CD827580_P1 1962 3952 620 89,3 globlastp LNU885_Hl13 canola 11v1 CN735656_P1 1963 3953 620 89,3 globlastp LNU885_H114 canals 11v1 DY011412P1 1964 3954 620 89,3 globlastp LNU885_H115 canola 11v1 EE444048_Pl 1965 3955 620 89,3 globlastp LNUS85_Hi popuIusIiOviIAIlS2O97 1966 3956 620 89,3 gobIastp LNU885_H116 o ulus 13v1 A1162097_P1 1967 3956 620 89,3 globlastp LNU885_H117 thellun iella_halo hilum 1lv1 DN774318 1968 3957 620 89,3 obIp LNU885_H118 vinca 11v1 SRRO98690X104249 1969 3958 620 89,3 globlastp LNU885_H119 b juntes 12v1 IE6ANDIZOIAULG5_P1 1970 3959 620 89,2 globlastp LNU885_H120 b_ra a 11v1 CD815423_P1 1971 3960 620 89,2 globlastp LNU885_H121 canola 11v1 DY006806_P1 1972 3961 620 89,2 globlastp LNU885_H122 rabaneteLgbl64lEW73i499 1973 3962 620 89,2 globlastp LNU885H123 jasmim 11v1 SRRO98689X100123 1974 3963 620 89,2 globlastp LNU885_H124 tripterygium 11 v1 ISRROYB677Xi06478 1975 3964 620 89,2 globlasip LNUB85H125 ambrosia 11v1 1SRR346935,160786_T1 1976 3965 620 89,16 glotblastn LNUS85_H126 arabido sis_I rata 09v1 JGIAL002814P1 1977 3966 620 89 globlastp LNU885_H127 b_ra a 11v1 CX188616_P1 1978 3967 620 89 globlastp LNU885_H128 canals 11v1 IEE459861_Tl 1979 3968 620 88,97 glotblastn LNUJB85_H129 centaurea b166 EL934279_T1 1980 3969 620 88,97 glotblastn LNUB85_H130 zostera 10v1 AM769778 1981 3970 620 88,97 glotblastn LNUB85_H131 arabida sis 10v1 AT1G24510_P1 1982 3971 620 88,8 globlastp LNUB85H132 popuIus10vlBU83i685 1983 3972 620 88,8 globlastp LNUB85_H132 o ulus 13v1 BU824523_P1 1984 3972 620 88,8 globlastp LNU885_H133 se unia 10v1 1SRR065044S0007458 1985 3973 620 88,8 globlastp LNU885_H134 thellun iella_ arvulum iivi jDN774318 1986 3974 620 88,8 globlastp

ID SEQ.

Algor.

Polin.

Poli __ N°: global PlphalotaxuslllvllSRR064395X110135_ LNUBB5_H135 1987 3975 620 88,6 globiastp LNU885_H136 a uile ia 10v2 DR928892_P1 1988 3976 620 88,2 globlaslp podocarpus110v11SRR065014S0010290_ LNU885_H137 1989 3977 620 88,2 globlastp LNU885_H138 sciadopitysi 10v1 1SRR065035S0017103 1990 3978 620 88,2 globlastp LNU885_H139 cevada 12v1 BQ762736_T1 1991 3979 620 88,1 glotblastn LNU885_H140 peridiumJilviSRR043594Xl00385 1992 3980 620 88,04 glotblastn LNU885_H141 beterraba 12v1 B1543248_P1 1993 3981 620 88 globlastp LNU885_H142 netales 10v1 DN954800_T1 1994 3982 620 87,85 glotblastn LNU885_H143 nasturtium 11v1 JSRR032558,163106_P1 1995 3983 620 87,3 globlastp LNU885_H144 h scomitrella 10v1 AW145268_P1 1996 3984 620 87,3 globlastp LNU885_H145 onion 12v1 1SRR073446X11352201_P1 1997 3985 620 86,9 globlastp LNU885_H168 zostera 12v1 1SRR357351X10529D1_Pi 1998 3986 620 86,7 globlastp LNU885_H146 zostera 10v1 SRRO57351S0000962 1999 3986 620 86,7 globlastp LNU885_H147 seIagineIIaIgbl65FE443744 2000 3987 620 86,6 globlastp LNU885H148 silene 11v1 SRR0967S5X166572 2001 3988 620 86,5 globlastp 1eratodcnl10v1]SRR07489050022653_P LNU885_H149 2002 3989 620 86 globlastp LN1J885_H150 vinca 11v1 SRR098690X104840 2003 3990 620 85,6 globlasip LNU885_H151 disí lium l lv1 SRR065077X10363T1 2004 3991 620 85,42 glotblastn LNU885_H169 oleo 13v1 ISRRO14463X1193401_T1 2005 3992 620 85,23 glotblastn LN1J885_H152 Haveria 11v1 SRR149229,10823_P1 2006 3993 620 84,7 globlaslp LNU885_H153 taxus 10v1 SRRO32523S0062074 2007 3994 620 84,1 globlasip LNU885_H154 ca im_chorão b167 DN151949 2008 3995 620 83,9 globlastp LNU885H155 sela inella b165 FE436590 2009 3996 620 83,6 globlastp Piotiana_benthamianal12v11BP752014_ LNU885_H170 2010 3997 620 82,1 globlastp LNU887-H1 milho 10v1 BG319820_P1 2011 3998 622 90,6 globlastp LNU887_H2 milho_ ain a 11v3 EC612301_P1 2012 3999 622 84,6 globlastp INU887_H4 ca im_chorão 12v1 FL748385_P1 2013 4000 622 82,5 goblastp LNU887_H3 ca im_chorão b167 FL748385 2014 4001 622 81,4 glotblastn LNU887_H5 ca im_chorão 12v1 GD046086_P1 2015 4002 622 80,7 globlastp LNU888_H1 tri o 12v3 CD491419 2016 623 623 100 globlastp LNU888_H2 cana_de_a úcar 10v1 CA111963 2017 4003 623 92,3 globlastp P1pim_chorâol12v1ISRR187765,216058_ LNU888_H6 2018 4004 623 91,3 globlastp LNU888H3 milho_ ain o 11v3 EC613111_P1 2019 4005 623 91,3 globlastp LNU888_H4 milho_ ain o 11v3 PHY7SI032010M_P1 2020 4006 623 91,3 globlastp LNU888_H5 milho 10v1 BM379136_P1 2021 4007 623 91,3 globlastp caP1im-chorãol12v1ISRR187769,1154845 LNU888_H7 2022 4008 623 89,4 globlastp LNU888_H8 ca im_chorão 12v1 DN149585_T1 2023 4009 623 84,62 glotblastn LNU889_H1 milho 10v1 AI966901_P1 2024 4010 624 87,1 globlastp P1pim_chorãoI12v1ISRR187768,382752_ LNU889_H3 2025 4011 624 82 globlastp capim_chorãol12v1ISRR187766,665224_ LNU889_H4 2026 4012 624 80,9 globlastp LNU889_H2 capim_chorãoIqb167FE6i6994 2027 4013 624 80,9 globlastp LNU892_H1 soro 12v1 SB02G033220 2028 4014 626 95,7 globlastp LNU892_H2 milho 10v1 AI619171_Pl 2029 4015 626 92,7 globlastp LNU892113 soro 12v1 SB02G033200 2030 4016 626 90,4 globlastp LNUS92H4 milho_ ain o 11vá PHY7SI029552M_P1 2031 4017 626 86,5 globlastp 1apim_chorão112v11SRR187765,29978_P LNU892_H7 2032 4018 626 86,1 globlastp LNUB92_H8 ca im_chorão 12v1 GD022360_P1 2033 4019 626 85,5 globlastp LNU692_H5 milho_ ain o 11vá PHY7S1029584MP1 2034 4020 626 85,3 globlastp LNU892_H6 milho_ ain o 11v3 PHY7S1029578M_P1 2035 4021 626 81,8 globlastp LNU893_H13 ca im_chorão 12v1 FL793626_P1 2036 4022 627 98,6 globlastp P1pim_chorãol12v1SRR187771,339181_ LNU893_H14 2037 4022 627 98,6 globlastp

1D SEQ.

Algor.

Polin. .fop.

N°: globai LNJ893_H1 capm_choràoIgb167jFL793626 2038 4022 627 98,6 globlastp LNU893_H2 cevada 12v1 AW982181_P1 2039 4023 627 97,3 globlastp LNU893_H3 milho_ ain o 11v3 PHY7SI031280M_P1 2040 4024 627 97,3 globlastp LNU893_H4 milho 10v1 BG517269P1 2041 4025 627 97,3 globlasip LNU893_H5 ain o 10v1 EV0454PM670348_P1 2042 4024 627 97,3 globlastp LNU893_H6 centeio 12v1 1BE495982 2043 4023 627 97,3 globlasip LNU893_H7 trio 12vá CA728398 2044 4023 627 97,3 globlasip LNU893_H8 festuca b161 DT686545_P1 2045 4026 627 95,9 globlaslp LNU893_H9 lolium 10v1 AU246324_P1 2046 4026 627 95,9 globlasip LNU893_H10 arroz 11v1 CF330515 2047 4027 627 94,7 globlaslp LNU893_H11 Brach odium 12v1 BRADI1G24640_P1 2048 4028 627 90,7 globiastp ólleo _de_palmal11 v1 1SRR190701,565537 LNU893_H12 2049 4029 627 82,4 globlastp LNU8941-11 soro 12v1 1SB02G039433 2050 4030 628 93,5 globlastp LNU894_H2 tri o 12vá CA502683 2051 4030 628 93,5 globlastp LNU894_H3 cana_de_a úcar 10v1 CA147729 2052 4031 628 86,9 globlastp LNU895_H1 milho 10v1 AW244938_P1 2053 4032 629 91,2 globastp LNU895_H2 capimchorãotgb167IFE641349 2054 4033 629 85,3 gIobastp LNU895_H4 ca im_chorão 12v1 FE641349_P1 2055 4034 629 84,3 globastp LNU895_H3 milho_ ain o 11v3 PHY7SI031608M_P1 2056 4035 629 82,4 globlaslp LNU896_H1 milho 10v1 AW497539P1 2057 4036 630 81,1 blast LNU899_H1 milho 10ví AW288640_P1 2058 4037 633 91,6 globlaslp LNU899_H2 milho_ ain o 11v3 PHY7SI000435MP1 2059 4038 633 87,3 globlastp LNU899_H3 capim_chorãojgbl67JFL7O4lSl 2060 4039 633 86,64 gIotbastn LNU899_H4 ca im_chorâo 12v1 FL748364_P1 2061 4040 633 84,4 globlastp LNU899_H5 ca fm_chorão 12v1 FL704161_P1 2062 4041 633 80,8 globlasip LNU900_H1 milha 10v1 AW052900P1 2063 4042 634 93,6 globlastp LNU900_H2 milho_ ain o 11v3 PHY7SI002469MP1 2064 4043 634 90,3 obIastp LNU900_H8 ca im chorão 12v1 FL696960_P1 2065 4044 634 89,5 gobIastp LNU900_H3 centeio 12v1 DRR001012,183573 2066 4045 634 88,24 gotbIastn LNU900H4 cevada 12v1 AJ466045_Pl 2067 4046 634 87,5 globlastp LNU900_H5 tri o 12vá CA743258 2068 4047 634 87,5 globlastp LNU900_H6 brachypodiumi 12v1 BRADI2G06440_P1 2069 4048 634 86,7 globlastp LNU901_H1 milho 10v1 AI964628P1 2070 4049 635 90,1 globlastp LNU901H10 ca im_chorão 12v1 FE638167_T1 2071 4050 635 83,6 glotblastn LNU902_H1 milho 10v1 AI622490_P1 2072 4051 636 93,4 globlastp LNU902_H2 milho_ ain o 11v3 PHY7SI002453M_P1 2073 4052 636 88,6 globlastp LNU902_H3 painço10v1 1EV0454PM024444J1 2074 4053 636 86,16 glotblastn LNU902_H4 capim_chorão b167 DN140927 2075 4054 636 84,08 lotblastn LNU902_H5 capim_chorão 12v1 GD033452_T1 2076 4055 636 83,74 glotblastn LNU903_H1 milho 10v1 AI979716P1 2077 4056 637 92,3 globlastp LNU903_H2 milho 10v1 AW216295_P1 2078 4057 637 91,1 globlastp LNU903_H3 milho_ ain o 11 v3 EC612307_P1 2079 4058 637 89,9 globlastp LNU903_H5 capim_chorào 12v1 FL699073_P1 2080 4059 637 88,1 globlastp LNU903_H4 capim_chorãoIgbI67 DN150122 2081 4060 637 87,9 globlastp LNU904_H1 milho 10v1 AI947568_P1 2082 4061 638 83,1 globlastp LNU905_H1 milho 10v1 AW052874P1 2083 4062 639 88,4 globlastp LNU908_H5 ca im_chorão 12v1 H0266689_P1 2084 4063 642 88,7 globlastp LNU908_H1 milho_ ain o 11vá PHY7SI005411M P1 2085 4064 642 88,6 globlastp LNU908_H6 ca im chorão 12v1 FL973257_P1 2086 4065 642 88,1 globlastp P1Pim_chorão112v1ISRR187765,276211_ LNU908_H7 2087 4065 642 88,1 globlastp LNU908_H2 milho 10v1 DT641006_P1 2088 4066 642 87,4 globlastp LNU908H3 arroz 11v1 1CK056423 2089 4067 642 83,5 globlastp LNU908_H4 arroz 11v1 HS372695 2090 4068 642 83,46 glotblastn LNU908_H8 tri o 12vá SRR400820X635658D1T1 2091 4069 642 80,12 glotblastn LNU908H9 brachypodiumI12vlBRAD12G46i4Op1 2092 4070 642 80,1 globlastp LNU9091-11 miEho 10v1 150577951 P1 2093 4071 643 92,1 globlastp INU910_H1 milho 10v1 BG837207_P1 2094 4072 644 90,1 globlastp LNU910_H2 cana_de_a úcar 10v1 CA242307 2095 4073 644 89,8 globlastp LNU910_H8 ca im_chorão 12v1 FL945810_P1 2096 4074 644 88,9 globlastp

ID SEQ.

Algor.

Polin.

Poli . N°: global LNU91 0_H3 milho_ ain a 11 v3 PHY7S1003477MP1 2097 4075 644 88,9 globlastp LNU910_H4 capim_chorãolgbl67JFL927878 capim 2098 4076 644 87,88 glotblastn LNU910_H5 painçoil0v1 IEVO4S4PM187011_P1 2099 4077 644 84,8 globlastp LNU910_H9 brachypodiumIl2vlIBRADI2G5Ol3OPl 2100 4078 644 83 globlastp LNU910_H7 arroz 11 v1 1B1795617 2101 4079 644 82 glotblastn LNU910_H6 milho 10v1 CD946808_T1 2102 4080 644 81,63 glotblasin LNU910 H10 brash odium 12v1 BRADI2G50136_P1 2103 4081 644 80 globlastp LNU912H9 ca im_chorãa 12v1 FL792538_P1 2104 4082 646 91 globlastp LNU912_H1 milho_ ain o 11v3 PHY7SI001740M_P1 2105 4083 646 91 globlastp LNU912_H10 capim_chorãol 12v1 1FL751233_P1 2106 4084 646 90,5 globlastp LNU912_H2 ain o 10v1 EV0454PM056333P1 2107 4085 646 89,8 globlastp LNU912_H3 milho 10v1 Af948274_P1 2108 4086 646 87,7 qloblastp LNU912_H4 arroz 11v1 BM420858 2109 4087 646 84,6 globlastp LNU912_H5 brachypodbumll2vi BRADI2G52680_P1 2110 4088 646 83,1 globlastp LNU912_H6 tri o 12v3 BU099391 2111 4089 646 80,9 globlastp LNU912_H7 1n o 12vá BM136936 2112 4090 646 80,4 globlastp LNU912_H8 cevada 12v1 AK371517_P1 2113 4091 646 80,3 globlastp LNU913_H1 cana_de_a úcar 10v1 1CA082310 2114 4092 647 97,9 globlastp LNU913_H2 milhol 10v1 W59840_P1 2115 4093 647 96,7 IobIastp LNU913_H3 milho_ ain o 11 v3 EC612650_P1 2116 4094 647 93,8 globlastp LNU913_H11 ca im_chorão 12v1 FE617311_P1 2117 4095 647 92,5 globlastp LNU913_H12 capim chorão 12v1 IFE616665_P1 2118 4096 647 91,5 globlastp LNU913_H4 painçoi0v1 EV0454PM018338_P1 2119 4097 647 86,1 globlastp LNU913_H5 capim_chorão b167 FE616665 2120 4098 647 85,33 glotblastn LNU913_H6 arroz 11v1 B18ú8261 2121 4099 647 83,3 IIobIaspt LNU913_H7 brach odium 12v1 BRAD12G54580_P1 2122 4100 647 82,4 globlastp LNU913_H8 centeio 12v1 jDRROO1012,116346 2123 4101 647 82,2 globlastp LNU913_H9 tr o 12v3 BU100850 2124 4102 647 81,7 globlastp LNU913_HlC cevada 12v1 AV834883_P1 2125 4103 647 81,6 globlastp LNU914_H1 soro 12v1 SB04G000570 2126 4104 648 94,5 globlastp LNU914_H2 milho 10v1 AI665003_P1 2127 4105 648 85,6 globlastp LNJ914_H3 milho 10v1 AI372104_P1 2128 4106 648 84,4 gIobastp LNU915_H1 milho_ ain o 11vá PHY7SI016626M_P1 2129 4107 649 88,4 globlastp LNU915_H3 ca im_chorão 12v1 FL695083_P1 2130 4108 649 87,8 globlastp LNU915_H2 milho 10v1 BE453841_P1 2131 4109 649 86,3 globlasip LNU916_H1 soro 12v1 AW284247 2132 4110 650 81,8 gobIas1p LNU917_H1 cana_de_a úcar 10v1 BQ534456 2133 4111 651 96,8 globlastp LNU917_H2 milho_ ain o 11v3 PHY7SI017544M_P1 2134 4112 651 91,2 globlastp LNU917_H3 milho 10v1 AI673988_P1 2135 4113 651 90,4 globlastp LNU917_H4 capim_chorãolgbi67 DN142589 2136 4114 651 90,2 globlastp LNU917_H5 painçol 10v1 EV0454PM028850_P1 2137 4115 651 89,6 globlastp LNU917_H12 ca im_chorãa 12v1 FL813544_P1 2138 4116 651 88,1 globlastp LNU917_H6 iri o 12vá BE400183 2139 4117 651 85,1 globlastp LNU917_H7 centeio 12v1 fDRROO1012,113593 2140 4118 651 84,3 globlastp LNU917_H8 le mus b166 EG375025_P1 2141 4119 651 84 glcblastp LNU917_H9 brachypodiumi 12v1 BRADI3G06290_P1 2142 4120 651 83,8 globlastp LNU917_H10 festuca b161 DT701360_P1 2143 4121 651 82,4 globlastp LNU917_H11 milho 10v1 BQ048402_P1 2144 4122 651 82,3 globlastp LNU918_H1 milho 10v1 AJ006536_P1 2145 4123 652 85,6 qloblastp LNU918_H2 milho 10v1 EY960159_T1 2146 4124 652 83,73 glotblastn LNU918_H3 capim_chorão b167 DN149185 2147 4125 652 81,15 glotblastn LNU918_H4 ca im_chorão 12v1 1DN149185_P1 2148 4126 652 80,6 globlastp LNU920_H1 cana de a úcar 10v1 1CF576045 2149 4127 654 89,2 globlastp LNU920_H2 milho 10v1 AI677118_P1 2150 4128 654 84,2 globlastp LNU920_H5 ca im_chorão 12v1 FE646248_P1 2151 4129 654 81,5 globlastp LNU920_H3 milho_painçol 11 v3 PHY7SI018467M_ P1 2152 4130 654 80,9 globlastp LNU920_H4 capim chorão b167 FE646248 2153 4131 654 80,9gb!astp LNU921_H1 milho 10v1 CA400159 P1 2154 4132 655 82 globlastp LNU922_H16 ca im_chorão 12v1 DN143068_P1 2155 4133 656 96,2 globlastp LNU922_H1 ca im_chorão b167 FE620798 2156 4134 656 96,2 globlastp

ID SEQ.

Algor, Poliu.

Poli p.

N°: global LNU922_H2 milho_ ain 11v3 PHY7SI01746OM_P1 2157 4135 656 95,7 globlastp LNU922_H3 milho 10v1 A1901428_P1 2158 4136 656 95,7 globlastp LNU922_H4 çpim_chorãojgb167JDNi43068 2159 4137 656 95,7 globlastp LNU922_H5 painço10v1 IEV0454PM010006_P1 2160 4138 656 94,9 globlastp LNU922_H6 milhoj 10v1 IAAO11883P1 2161 4139 656 94,6 globlasip LNU922_H7 arroz 11v1 81805551 2162 4140 656 92,1 loblast brachypodiumj12v11BRADI3G52340T2_P LNU922_H8 2163 4141 656 87 globlastp LNU922_H9 aveia 11v1 CN817149_P1 2164 4142 656 86,5 globlastp LNU922_H10 tri o 12vá BQ802727 2165 4143 656 86,5 globlasip LNU922_H11 brachypodiumjl2v1 IBRADI5GO1350_P1 2166 4144 656 86,2 globlastp LNU922_H12 cevada 12v1 BE412861_P1 2167 4145 656 86 globlastp LNU922_H13 cenchrus b166 EB660552_P1 2168 4146 656 86 globlastp LNU922_H14 centeio 12v1 BE586503 2169 4147 656 85,5 globlasip LNU922_H15 centeio 12v1 DRRO01012,249546 2170 4148 656 80,7 globlastp LNU923_H1 milho 10v1 BI273413_P1 2171 4149 657 81,5 gIobIp ast LNU924_H1 cana_de_a úcar 10v1 CA070317 2172 4150 658 83,6 globlastp LNU924_H3 ca im_chorão 12v1 FL935940_P1 2173 4151 658 80,9 globlastp LNU924_H4 ca im_chorão 12v1 DN145033_P1 2174 4152 658 80,4 globlasip LNU924_H2 milho_ ain o 11v3 SOLX00022667_P1 2175 4153 658 80,4 globlastp LNU925_H1 milho 10v1 FLO10481_P1 2176 4154 659 94,2 globlastp LNU925_H2 milho_ ain a 11vá PHY7SI016794M_P1 2177 4155 659 89,5 globlastp capim_chorãoI12v1ISRR187770,1008801 LNU925_H9 2178 4156 659 86 globlastp P1pim_chorãol12v1ISRR187769,231821_ LNU925_H10 2179 4157 659 85,7 globlastp LNU925_H3 brach odium 12v1 BRADI3G51590_P1 2180 4158 659 85,4 gIobastp LNU925_H4 tri o 12vá TA12V11729457 2181 4159 659 85,31 glotblastn LNU925_H5 cevada 12v1 HV12v1CRPO55339_P1 2182 4160 659 85 globlaslp LNU925_H6 arroz11v1 CX104415 2183 4161 659 81,1 globlasip LNU925_H7 tri o 12v3 CA731766 2184 4162 659 80,2 globlasip LNU925_H8 cevada 12v1 BI777343_P1 2185 4163 659 80,1 globlastp LNU926_H1 canade_a úcar 10v1 CA088361 2186 4164 660 96,4 globlastp LNU926_H2 milho_ ain o 11 v3 PHY7S1017439M_P1 2187 4165 660 94,3 oblast LNU926_H3 milho 10v1 BI389475_P1 2188 4166 660 93,7 gobIastp LNU926_H4 milho 10v1 BM078145_P1 2189 4167 660 93,7 globlastp LNU926_H7 ca im_chorão 12v1 FL896622_P1 2190 4168 660 91,9 globlastp LNU926_H5 painçoil0v1 jEVO454PMOO1369_P1 2191 4169 660 91,9 globlastp LNU926_H6 capim_choràoIgb167FL73626S 2192 4170 660 91,3 globlastp LNU926_H8 capimchorão 12v1 FL736268_P1 2193 4171 660 91 globlastp LNU928H1 milho 10v1 AI665263_P1 2194 4172 661 96,9 globlastp LNU928_H5 ca im_chorão 12v1 FL703064_P1 2195 4173 661 90,2 globlastp LNU928_H6 capim_chorão 12v1 FL827336_P1 2196 4174 661 89,9 globlastp LNU928_H2 milha ain o 11vá PHY7S1016502M_P1 2197 4175 661 89,6 globlastp LNU928_H3 arroz 11v1 BI812770 2198 4176 661 80,26 glotblastn LNU928_H4 centeio 12v1 DRR001012,253036 2199 4177 661 80,14 glotblastn LNU929_H1 sor a 12v1 SBO4G036770 2200 4178 662 85,4 globlastp LNU929_H2 milho 10v1 BGB36023_P1 2201 4179 662 83,4 globlastp LNU929_H3 milho_ ain o 11v3 PHY7S1017734M_P1 2202 4180 662 83,1 loblast LNU929_H5 ca im_chorão 12v1 FL792661_P1 2203 4181 662 82,8 globtastp caapim_chorão112v1ISRR187772,1076529 LNU929_H6 2204 4182 662 82,2 globlastp LNU929_H4 ain o 10v1 EV0454PM007685_T1 2205 4183 662 80,76 glotblastn LNU931_H1 cana_de_a - úcar10v1 CA085385 2206 4184 664 95,3 gbIas1p LNU931_H2 milho_ ain o 11v3 PHY7SI026372MP1 2207 4185 664 91,7 globlasip LNU931_H3 milha 10v1 AW052904_P1 2208 4186 664 90,9 globlastp LNU931_H4 nilho_painçol milho 11v3 PHY7SI010145M_P1 2209 4187 664 89,7 globlastp LNU931_H5 capim_chorãoIgb167FL690712 2210 4188 664 89,51 glotblastn LNJ931_H13 capim_choràol 12v1 FL690712_P1 2211 4189 664 88,8 globlasip LNJ931_H6 soro 12v1 SB050000560 2212 4190 664 88,8 globlastp LNU931_H7 cana_de_a úcar 10v1 CA183007 2213 4191 664 87,5 QiObIaStp

ID SEQ.

ID SEQ Hom. à % de Hom. ao Nome Organismo! Nome do agrupamento NO do N° do ID SEQ Id.

Algor.

Polin.

Polip.

N°: global LNU931_H8 soro 12v1 SBO8G000580 2214 4192 664 87,1 gIobastp LNU931_H9 ain a 1Ov1 CD725261_Pl 2215 4193 664 86,9 globlastp LNU931_H10 milho_ ain o 11vá PHY7S1006320M_P1 2216 4194 664 82,6 globlastp LNU931_Hl l milho 10ví AI795587_P1 2217 4195 664 82 globlastp LNU931_H14 capim_chorão 12v1 FE652169_P1 2218 4196 664 81,2 globlastp LNU931_H12 capim_choràorgbl67 FE652169 2219 4196 664 81,2 globlastp LNU934_H1 soro 12v1 SBO50006960 2220 4197 667 97,7 globlastp LNU934_H2 milho 10v1 A1920383_P1 2221 4198 667 91,1 globlastp LNU934_H3 milho 10v1 AI601020Pl 2222 4199 667 90,1 globlastp LNU934_H4 milho_ ain o 11vá EC612232_P1 2223 4200 667 88,5 globlastp LNU934_H5 ca im_chorão b167 DN146252 2224 4201 667 88,1 globlastp LNU934_H6 capim pim_chorâoIgb167LFE626199 2225 4202 667 86,5 globlastp LNU934_H7 arroz 11v1 Bí801587 2226 4203 667 83,2 globlastp LNU936_H1 milho lOv1 AW120427_P1 2227 4204 669 81,4 globlastp LNU940_H1 sor o12v1 SBO1G006570 2228 4205 672 92,4 qloblastp LNU940_H16 ca im_chorão 12v1 GDO19934_P1 2229 4206 672 89,1 globlastp LNU940_H2 milho 10v1 BM080112_P1 2230 4207 672 89,1 globlastp LNU940_H3 ca im_chorão b167 FL987004 2231 4206 672 89,1 gIobastp LNU940 H4 milho ain o 11v3 PHY7S1039636M_P1 2232 4208 672 88 globlastp LNU940 H5 ain o 10v1 EVO454PM050387 P1 2233 4209 672 88 globlastp LNU940 H17 ca im chorão 12v1 FL987004 P1 2234 4210 672 87 globlaslp P1pim_chorãoI12v1ISRR187766,558595_ LNU940_H18 2235 4211 672 87 globlasíp LNU940 H6 brach odium 12v1 BRADl4G35010_P1 2236 4212 672 87 qloblastp LNU940_H7 arroz 11 v1 AÚ172742 2237 4213 672 85,9 globlastp LNU940_H8 cenchrus b166 EB672242_P1 2238 4214 672 84,8 globlastp LNU940H9 cevada 12v1 BG415270P1 2239 4215 672 83,7 globlastp LNU940_H10 pseudoroegneriaIgb167FF361949 2240 4216 672 83,7 globlastp LNU940_Hll festuca b161 DT690522_P1 2241 4217 672 82,6 globlastp LNU940_H12 centeio 12v1 DRRO01012,205554 2242 4218 672 82,6 globlasip LNU940_H13 centeio 12v1 DRRO01012,443974 2243 4218 672 82,6 globlastp LNU940_H14 trio 12vá BF474839 2244 4218 672 82,6 globlastp LNU940_H15 trio 12vá SRX035157S105600 2245 4219 672 80,4 globIastp LNU941_H1 cana_de_a úcar 10v1 1DV636549 2246 4220 673 82,8 globlastp LNU942 H15 ca im chorão 12v1 DN143194 P1 2247 4221 674 93 globlastp LNU942 H16 ca im chorão 12v1 FE600191 P1 2248 4222 674 93 globlastp INU942 H1 ca im chorão b167 DN143194 2249 4221 674 93 globlastp LNU942_H2 milha 10v1 AI948177_P1 2250 4223 674 92,7 globlastp LNU942_H3 cana_de_a úcar 10v1 BU103195 2251 4224 674 92,6 globlastp LNU942_H4 soro 12v1 SBO4G019760 2252 4225 674 92 globlasip LNU942_H5 milho 10v1 DV523108_P1 2253 4226 674 90,6 globlasip LNU942_H17 ca im_choráo 12v1 FE600082_P1 2254 4227 674 88,6 obIastp LNU942_H6 capm_chcrãoIgb1671FE600082 2255 4228 674 88,3 globlasip LNU942_H7 milho_ ain o 11vá PHY7S1010700M_P1 2256 4229 674 87,4 globlastp LNU942_H8 painçoilOvi PMSLX0006862D1_P1 2257 4230 674 87,3 globlastp LNU942_H9 milho_ ain o 11v3 PHY7SI020925M_P1 2258 4231 674 85,7 globlastp LNU942_H10 le mus b166 EG376656_P1 2259 4232 674 85,2 globlastp LNU942_H11 trio 12v3 BE516147 2260 4233 674 85,2 globlastp LNU942_H12 centeio 12v1 IDRROO1O12,268452 2261 4234 674 84,23 glotblastn LNU942_H13 brachypodium 12v1IBRADI5G13320_P1 2262 4235 674 84,2 globlastp LNU942_H14 arroz 11v1 B1798333 2263 4236 674 83 globlastp Tapim chorãoI12v1ISRR187765,620238_ LNU942_H18 2264 4237 674 81,76 glotblastn LNU943_H1 milha 10v1 AW165435_P1 2265 4238 675 93,5 globlastp LNU943_H2 milho 10v1 BU582245_P1 2266 4239 675 92,1 globlastp LNU943_H3 soro 12v1 SB01G018160 2267 4240 675 91,5 globlastp LNU943_H4 milho ain o 11 v3 PHY7S1022488MP1 2268 4241 675 88,4 globlastp LNU943_H5 capim chorão b1 67 FL700923 2269 4242 675 87,5 globlastp LNU943_H9 ca im_chorão 12v1 FL946368_P1 2270 4243 675 86,7 globlastp LNU943_H6 milha_ ain o 11v3 PHY7SI010535M_P1 2271 4244 675 86,4 globlastp LNU943_H7 arroz 11v1 CA762359 2272 4245 675 85 globlastp

Aw,

ID SEQ.

Algor.

Polin.

Poli p.

N°: global LNU943_H8 centeio 12v1 DRRO01012,256371 2273 4246 675 80,45 glotblastn LNU944_H1 milha 10v1 BE519358_P1 2274 4247 676 94,5 globlastp LNU944_H2 milho_ ain o 11 v3 PHY7SI013344M_P1 2275 4248 676 90,2 ioblast LNU944_H14 ca im_chorão 12v1 FE605775_P1 2276 4249 676 89,6 globlastp LNU944_H3 ca im_chorão b167 FL691662 2277 4250 676 88,75 qotbIastn LNU944_H15 capim_chorão 12v1 FL693381_P1 2278 4251 676 87,4 globlastp LNU944_H4 arroz 11v1 AU065195 2279 4252 676 85,1 globlaslp LNU944_H5 arroz 11 v1 AA752897 2280 4253 676 84,5 globlastp LNU944_H6 brachypodiumI12v1BRADI5G26450P1 2281 4254 676 83,4 globlasip LNU944_H16 ca im_chorão 12v1 FL693806_P1 2282 4255 676 82,9 IobIas1p LNU944_H7 brach odium 12v1 BRADl3G12950_P1 2283 4256 676 82,5 globlasip LNU944_H8 milho_ ain o 11vá EC612109_P1 2284 4257 676 82,2 IobIastp LNU944_H9 soro 12v1 SBO6G033190 2285 4258 676 82,1 globlastp LNU944_H10 centeio 12v1 BE588044 2286 4259 676 81,9 globlastp LNU944_H11 cevada 12v1 BE231241P1 2287 4260 676 81,7 gIoblaspt LNU944_H12 tri o 12v3 BE416410 2288 4261 676 81,5 globlastp LNU944H13 milho 10v1 AW119989_P1 2289 4262 676 81,2 gIablaspt LNU945_H1 cana_de_a úcar 10v1 1CA102004 2290 4263 677 95,7 globlastp LNU945_H2 milho 10v1 CF630693_P1 2291 4264 677 92,4_gqlastp LNU945_H12 ca im_chorão 12v1 FE610584_P1 2292 4265 677 90,2 globlaslp LNU945_H13 ca im_chorão 12v1 FL736798_P1 2293 4266 677 90,2 globlasip LNU945_H3 milho_ ain o 11 v3 PHY7SI014236M_P1 2294 4267 677 89,6 globlaslp LNU945H4 capm_chor5oIgb167FE610584 2295 4268 677 88,21 glotblastn LNU945_H5 brachypodiumIl2vlIBRADl3Gl6.410P1 2296 4269 677 86,1 gtoblastp LNU945_H6 tri o 12v3 BE399236 2297 4270 677 84,8 globlaslp LNU945_H7 tri o 12v3 BF483870 2298 4271 677 84,8 goblastp LNU945_HB arroz 11 v1 81796904 2299 4272 677 84,3 globlastp LNU945_H9 aveia 11v1 G0589349_P1 2300 4273 677 83,3 gobIastp LNU945H10 cevada 12v1 AV835214_P1 2301 4274 677 83 globlastp LNU945_H11 centeiol 12v1 IDRROO1012,115501 2302 4275 677 81,5 globlastp LNU946_H3 ca im_chorão 12v1 FE622311_P1 2303 4276 678 88,1 globlastp LNU946_H1 milho_ ain o 11 v3 PHY7S1013314M_P1 2304 4277 678 86,8 globlastp LNU946.H4 ca im_chorão 12v1 FE631618_P1 2305 4278 678 86,3 globlastp LNU946_H2 milho 10v1 C0517747_P1 2306 4279 678 85,3 Lastp LNU947_H1 milho 10v1 AW400079_T1 2307 4280 679 80,67 glotblastn LNU948_H1 milho 10v1 CF244014T1 2308 4281 680 85,13 glotblastn LNU949_H1 cana_de_a úcar 10v1 CA070316 2309 4282 681 91,6 globlastp LNU949_H2 ain o 10v1 CD725957_P1 2310 4283 681 80,3 globlastp LNU950_H1 cana_de_a úcar 10v1 CA117340 2311 4284 682 93,5 globlastp LNU950_H2 soro 12v1 SB05G001050 2312 4285 682 88,5 globlastp LNU950_H3 milho_ ain o 11v3 PHY7SI026369M_P1 2313 4286 682 86,5 globlastp LNU950_H4 milho_ ain o 11v3 EC611923_P1 2314 4287 682 86,1 globlastp LNU950_H5 capim_choràoIgbl67IDNl42564 2315 4288 682 85,8 globlastp LNU950_H21 capim_chorão 12v1 FE601370_P1 2316 4289 682 85,6 gpbIastp LNU950H22 capim_chorSol 1 2v1 IDN142564_P1 2317 4290 682 84,9 globlastp LNU950_H6 milho 10v1 AI665950_P1 2318 4291 682 84,5 qloblastp LNU950_H7 painçoilovi EV0454PM003253 P1 2319 4292 682 84 globlasip LNU950_H8 painçoilOvi EV0454PM002572_P1 2320 4293 682 82,7 globlastp LNU950H9 arroz 11v1 1B1808891 2321 4294 682 82,7 glotblastn LNU950_H10 arroz 11v1 1AF004947 2322 4295 682 82 globlastp LNU950_1-111 trio 12v3 BE412095 2323 4296 682 81,3 globlastp LNU950_H12 trio 12v3 CA664401 2324 4297 682 81,3 globlastp LNU950_H13 trio 12vá SRR043323X26334D1 2325 4297 682 81,3 globlastp LNU950_H14 arroz 11v1 AÚ174185 2326 4298 682 81,1 gjpblastp LNU950_H15 cevada 12v1 AV910430_P1 2327 4299 682 80,9 gptp LNU950_H16 centeio 12v1 DRRO01012,134503 2328 4300 682 80,9 globlastp LNU950_H17 milho 10v1 DR804998_P1 2329 4301 682 80,7 globlastp LNU950_H18 milho 10v1 EG041994_P1 2330 4302 682 80,7 globlastp LNU950_H19 trio 12v3 CA719005 2331 4303 682 80,7 globlastp LNU95O_H20 milho 10v1 CF064453_P1 2332 4304 682 80,3 globlastp

ID SEQ.

Algor.

Polin.

Poli p.

N°: global LNU953_H1 milho_ ain o 11v3 PHY7S1021031M_P1 2333 4305 685 98,5 globtastp LNU953_H2 milho 10v1 AI947816_P1 2334 4306 685 98 globastp LNU953 H3 arroz 11v1 1B1810241 2335 4307 685 94,8 globastp LNU953H4 brach odium 12v1 BRADI4G07167_P1 2336 4308 685 93,3 globlastp LNU953_H5 centeio 12v1 18E587487 2337 4309 685 92,8 globlasip LNU953_H6 arroz 11v1 AA752560 2338 4310 685 91,8 globlastp LNU953_H7 trio 12v3 BE606922 2339 4311 685 89,93 glotblastn LNU953H8 brach odium 12v1 BRADI4G15710_P1 2340 4312 685 89,8 globlastp LNU953_H9 soro 12v1 SB05G022390 2341 4313 685 88,9 globlastp LNU953_H10 óleo_de_ alma11v1 1EY408711XX1_T1 2342 4314 685 88,62 glotblastn LNU953_H1 1 óleo_de_ alma11v1 ES323990_P1 2343 4315 685 87,5 globlastp LNU953_H12 banana 12v1 BBS995T3_P1 2344 4316 685 87,4globlastp_ LNU953_H13 milho_ ain a 11 v3 PHY7SI025878M_P1 2345 4317 685 87,4 globlastp LNU953H14 anstolochia 10v1 FD752686_P1 2346 4318 685 87,1 globlasip LNU953_H15 amborella 12v3 FD433166_P1 2347 4319 685 86,8 globlastp LNU953_H16 banana 12v1 ES434911_P1 2348 4320 685 86,3 globlastp LNU953_H18 so'a 12v1 GLYMA02G43930_P1 2349 4321 685 86,1 globlastp f ;o_guanduI11v1ISRR054580X101829 LNU953_H17 2350 4322 685 85,8 globlastp LNU953_H18 soj a l l v1 GLYMA14G04890 2351 4323 685 85,8 globlastp LNU953_H19 morango 11v1 C0379742 2352 4324 685 85,7 globlastp LNU953_H20 lótus 09v1 GFXAPO06535X8_P1 2353 4325 685 85,5 globlastp LNU953_H21 medica o 12v1 BE204582_P1 2354 4326 685 85,5 glabiastp LNU953_H22 a oulas 11v1 SRR030259,226807_TI 2355 4327 685 85,49 glotblastn LNU953_H126 mamona 12v1 XM_002514388_T1 2356 4328 685 85,47 glotblastn LNU953_H24 al odão 11v1 AI725579_P1 2357 4329 685 85,4 globlastp LNU953_H25 oss ium_raimondii 12v1 AI725579_P1 2358 4330 685 85,3 globlastp LNU953_H26 soja 11v1 IGLYMAO2G4393O 2359 4331 685 85,3 globlastp LNU953_H27 melancia 11v1 1AM738852 2360 4332 685 85,3 globlastp LNU953_H28 prunusIlIDvlIBU575i9l 2361 4333 685 85,2 globlastp LNU953H127 só a 12v1 GLYMA14G04890_P1 2362 4334 685 85,1 globlastp LNU953_H29 trgoneIIaI 11v1 SRRO66194X104042 2363 4335 685 85,1 globlastp LNU953 H128 feijão 12v2 CA899898 P1 2364 4336 685 85 globlastp LNU953 H129 feijão 12v2 CB542475 P1 2365 4337 685 85 globlastp LNU953 H13Do ulus 13v1 AI162526 PS 2366 4338 685 85 loblast LNU953 H30 feijão 12v1 CB542475 a 2367 4339 685 85 globlastp LNU953 H31 mandioca 09v1 CK650982 P1 2368 4340 685 85 globlasip LNU953 H35 populusll3vl AI162784_P1 2369 4341 685 85 globlastp LNU953_H32 trio 12v3 BE403992 2370 4342 685 84,94 glotblasin LNU953_H33 banana 12v1 ES435104_P1 2371 4343 685 84,9 globlastp LNU953_H34 eu horbia 11v1 BG467380_P1 2372 4344 685 84,9 globlastp LNU953_H35 populusilOvi IAIi62784 2373 4345 685 84,9 globtastp LNU953_H37 rao_de_bico 13v2 GR396199_P3 2374 4346 685 84,9 globlastp LNU953_H64 populusli 3 vl 1BU815471P1 2375 4347 685 84,9 globlastp LNU953H36 medica o 12v1 AW684864_P1 2376 4348 685 84,8 globlasip LNU953_H37 rao_de_bico11v1 GR396199 2377 4349 685 84,77 gIotbastn LNU953_H38 soja 11v1 GLYMA20G11300 2378 4350 685 84,7 globlastp LNU953H39 tri o 12v3 BE606346 2379 4351 685 84,7 gobIastp LNU953_H131 popuIusj13vlBU820987Pl 2380 4352 685 84,6 globlastp LNU953_H40 a uile ia 10v2 DR913332_P1 2381 4353 685 84,6 globlastp LNU953_H41 flaveria 11v1 SRR149229,10069_P1 2382 4354 685 84,6 globlastp LNU953_H42 tri onella 11v1 SRR066194X163258 2383 4355 685 84,59 glotblastn LNU953_H43 abies 11 v2 SRR098676X111217_P1 2384 4356 685 84,5 globlastp LNU953_H44 eucali tc 11 v2 CD668448_P1 2385 4357 685 84,5 glcblastp LNU953_H45 flavena 11v1 ISRR149229216232_P1 2386 4358 685 84,5 globlastp LNU953H46 uva 11v1 IGSVIVT0103460300lPi 2387 4359 685 84,5 globlastp LNU953_H47 eu horbia llv1 DV127429_T1 2388 4360 685 84,49 glotblastn LNU953_H48 girassoI12vljCX9473i7 2389 4361 685 84,4 globlastp LNU953_H49 faia 11v1 SRR006293,655_T1 2390 4362 685 84,33 glotblastn LNU953_H132 runus_mume 13v1 BU575191_P1 2391 4363 685 84,3 globlastp

ID SEQ.

ID SEQ Hom. à % de Horn. ao Nome Organismo 1 Nome do agrupamento N° do N° do ID SEQ Id.

Algor.

Polin.

Poli p.

N°; global LNU953H50 ma ã 11v1 CN444562_P1 2392 4364 685 84,3 globlastp LNU953_H51 mandioca 09v1 CK645234_P1 2393 4365 685 84,3 globlastp LNU953_H52 clementine 11v1 BQ623766_P1 2394 4366 685 84,3 gjoblastp LNU953_H53 inheiro 10v2 BF220411_P1 2395 4367 685 84,3 globlastp LNU953_H54 clementine 11v1 CB292767P1 2396 4368 685 84,2 globlastp LNU953_H55 pepinolú9vi AM731249_P1 2397 4369 685 84,2 globlastp LNU953_H56 laranja 11v1 BQ623766_P1 2398 4370 685 84,2 globlastp LNU953_H57 a uile ia 10v2 DR925985_P1 2399 4371 685 84,1 globlastp LNU953_H58 banana 12v1 ES431466_P1 2400 4372 685 84,1 globlastp LNU953_H133 mamona 12v1 XM_002524074_P1 2401 4373 685 84 globlastp LNU953_H60 moran o 11v11DY674421 2402 4374 685 84 globlastp LNU953_H61 valerìana 11v1 SRR099039X12407 2403 4375 685 84 gobIastp LNU953_H62 ambrosia l lv1 SRR346935,108676_T1 2404 4376 685 83,96 gotbIastn LNU953H63 al odão llv1 BE052039XX1_T1 2405 4377 685 83,7 glotblasin LNU953_H64 populusIlOvlIBLJ8l547l 2406 4378 685 83,7 gobIastp LNU953H65 girassolll2vl 1DY931792 2407 4379 685 83,7 globlastp LNU953_H66 vinca 11v1 SRR098690X103474 2408 4380 685 83,7 globlastp LNU953_H134 prunus_mumel13v1IBUO41590_P1 2409 4381 685 83,2 gobIastp P1phalotaxuslllvllSRR064395X106034_ LNU953_H67 2410 4382 685 83,2 gioblastp LNU953_H68 prunusIlOvljBUO4l590 2411 4383 685 83,2 gobIastp LNU953_H69 cacau 10v1 CU471848_T1 2412 4384 685 82,93 glotblastn LNU953H70 theIIun iella_haEo hiium 11v1 BY808976 2413 4385 685 82,9 globlastp LNU953_H135 runus_mume 13v1 BU573002_P1 2414 4386 685 82,7 globlastp LNU953_H71 a! odão l lv1 DT049D82_P1 2415 4387 685 82,6 Ioblastp LNU953_H72 arabido sis_I rata 09v1 JGIAL020339_Pl 2416 4388 685 82,5 globlastp LNU953_H73 b_ra a 11v1 CX189281_P1 2417 4389 685 82,5 glastp LNU953_H74 canola l lv1 EE456851T1 2418 4390 685 82,47 glotblastn LNU953_H75 eucali to11v2CU402999_P1 2419 4391 685 82,4 globlasip LNU953_H76 oss ium_raimondii 12v1 BF268450_Pl 2420 4392 685 82,4glob!astp LNU953_H77 vinca 11v1 SRR098690X106748 2421 4393 685 82,33 glotblastn LNU953_H78 b_ra a 11 v1 CD814501_P1 2422 4394 685 82,3 globlastp 1heiidoniumI11v1ISRRO84752X101848_P LNU953_H79 2423 4395 685 82,3 globlastp LNU953_H80 uva llv1 GSVIVT01022498001_71 2424 4396 685 82,27 glotblastn LNU953_H81 b_ra a 11v1 CD818738P1 2425 4397 685 82,2 globlastp LNU953_H82 canola l lv1 EE553419_P1 2426 4398 685 82,2 globlastp LNU953_H83 flaveria 11v1 SRR149229,106289_P1 2427 4399 685 82,2 globlastp LNU953_H84 amica llv1 SRR099034X101325_T1 2428 4400 685 82,17 glolblastn LNU953_H85 arabido sis 10v1 AT5G06600_P1 2429 4401 685 82,1 globlastp LNU953_H86 laranja 11v1 CB292767P1 2430 4402 685 82,1 globlastp LNU953_H87 e ino 09v1 DV737928_T1 2431 4403 685 82,05 glotblastn LNU953_H88 runus 10v1 BU573002 2432 4404 685 81,94 glotblastn a T1phophaIIusI11v2ISRRO89351X10322 LNU953_H89 2433 4405 685 81,91 glotblastn LNU953_H90 painçoIlOvlIEVO454PM00032lPl 2434 4406 685 81,9 globlastp LNU953_H91 solanum_ hureja 09v1 SPHBG123815 2435 4407 685 81,9 globlastp LNU953_H92 ma ã 11v1 CN495483_T1 2436 4408 685 81,72 glotblastn LNU953_H93 distyliurnl 11v1 ISRRO65O77X101856_T1 2437 4409 685 81,72 glotblastn LNU953_H136 mimulus 12v1 ICV519760_P1 2438 4410 685 81,7 globlastp LNU953_H94 oss ium_raimondü 12v1 AI726752_P1 2439 4411 685 81,7 globlastp LNU953_H95 mimulus 10v1 G0978886 2440 4410 685 81,7 globlastp LNU953_H96 silene l lv1 SRRO96785X10574 2441 4412 685 81,7 gobIastp LNU953_H97 tomate llv1 BG123815 2442 4413 685 81,7 globlastp LNU953_H98 silene 11v1 SRR096785X100325 2443 4414 685 81,69 gIastn LNU953H99 papoulasi 11v1 1SRR030259,101122_P1 2444 4415 685 81,6 globlastp LNU953_HIOO arabido sis_I rata 09v1 JGIAL009620_P1 2445 4416 685 81,5 globlastp LNU953_H101 solanum_ huréa09v1 ISPH8G626752 2446 4417 685 81,5 globlastp LNU953_H102 theI un ieIIa_halo hiium 11v1 IBY815359 2447 4418 685 81,5 globlastp LNU953_H103 pcpuIusi0vlBU820987 2448 4419 685 81,41 glotblastn LNU953_H104 arabidc sis 10v1 AT3G11910_P1 2449 4420 685 81,4 globlastp

ID SEQ.

Algor.

Polin.

Polip.

N°: global LNU953_H105 ambrosaI 11 v1 SRR346935,136915_T1 2450 4421 685 81,34 glotbasIn LNU953H106 tomate 11v1 ÁW030110 2451 4422 685 81,3 globlastp LNU953_H107 tomate 11v1 BG626752 2452 4423 685 81,3 globlasip LNU953H108 valerians 11v1 SRR099039X102728 2453 4424 685 81,21 glotblastn LNU953_H137 oleo 13v1 SRRO14463X11603D1_P1 2454 4425 685 81,2 globlastp LNU953_H109 thellun iella_ arvulum 11v1 1BY815359 2455 4426 685 81,2 globiasip P1 otiana_benthamianaI12v11AM816011 LNU953_H138 2456 4427 685 81,1 globlastp LNU953_H110 eucali to 11 v2SRRO01659X101826_P1 2457 4428 685 81,1 gIobastp LNU953_H111 thellun iella arvulum 11v1 BY808976 2458 4429 685 81,1 gIobastp LNU953_H112 papoulasli1v1 1SRR030259,l22982_P1 2459 4430 685 81 globlastp LNU953_H113 ambrosia 11ví 1SRR346935,109483_T1 2460 4431 685 80,99 glotblastn LNU953_H114 cacau 10v1 CU631250T1 2461 4432 685 80,94 lotblastn LNU953_H139 rao_de_bico 13v2 GR398757_P1 2462 4433 685 80,9 globlastp p1 otiana_benthamianal12v11BP749195_ LNU953_H140 2463 4434 685 80,9 globlastp LNU953_Hl15 s ruce 11v1 EX356361 2464 4435 685 80,87 glotblastn LNU953_H1 16 taxus 10v1 SRR032523S0002905 2465 4436 685 80,84 glotblastn LNU953_H117 cannabis 12v1 GR221441_P1 2466 4437 685 80,8 globlasip LNU953_H118 valerians 11v1 SRRO99039X102263 2467 4438 685 80,62 glotblastn LNU953_H119 canola 11v1 EE446069_P1 2468 4439 685 80,5 globlasip LNU953_H120 arroz 11v1 13E230378 2469 4440 685 80,5 globlasip ni otiana_benthamianaj12v1IBP748980_ LNU953_H141 2470 4441 685 80,4 globlastp P1otiana_benthamianal12v1IEG649585_ LNU953_H142 2471 4442 685 80,4 globlastp LNU953_H143 oleo 13v1 SRRO14463X13706D1P1 2472 4443 685 80,4 globlastp LNU953_H144 ca im_chorão 12v1 FE629023_P1 2473 4444 685 80,3 globlastp T1 otiana_benthamianall2v1IEB682588_ LNU953_H145 2474 4445 685 80,28 glotblastn LNU953_H121 brach odium 12v1 BRADI1G56780_P1 2475 4446 685 80,2 globlastp LNU953_H122 centeio 12v1 IDRROO1012,10357 2476 4447 685 80,2 globlastp o phophallusl11v2ISRR089351X11161 LNU953_H123 2477 4448 685 80,14 glotblastn a LNU953H124 inheiro 10v2 AW043162_P1 2478 4449 685 80,1 globlastp LNU953_H125 pseudotsugaIiOvlISRRO65li9SOO2442i 2479 4450 685 80,05 glotblastn LNU955 H12 capim chorão 12v1 DN142337_P1 2480 4451 687 92 gtoblastp LNU955_H1 milho 10v1 C0522570_P1 2481 4452 687 91,5 Ioblast LNU955_H2 mitho_ ain o 11v3 PHY7S1021896M_P1 2482 4453 687 90,5 globlastp LNU955_H3 ca im_chorão b167 FL785019 2483 4454 687 86,7 globlastp LNU955_H13 ca im_chorão 12v1 FL785019_P1 2484 4455 687 86,3 globlastp LNU955_H4 arroz 11v1 1CB665557 2485 4456 687 85,1 globlastp LNU955_H5 aveia 11v1 GR314727P1 2486 4457 687 84,3 globlastp T1pim_chorão~12v1ISRR187771,727771_ LNU955H14 2487 4458 687 83,85 glotblastn LNU955_H6 1ri o 12v3 CÁ625652 2488 4459 687 83,8 globlasip LNU955_H7 cevada 12v1 BQ659274_P1 2489 4460 687 83,2 globlastp LNU955_H8 brach odium 12v1 BRADI4G06410_P1 2490 4461 687 83 globlastp LNU9551-19 centeio 12v1 DRR001012,117807 2491 4462 687 82,8 gobIastp LNU955_H10 ain o 10v1 PMSLX0023357D2_P1 2492 4463 687 81,8 gobIastp LNU955_H15 ca im_chorãa 12v1 FL853651P1 2493 4464 687 81,7 gobIastp LNU955_H11 milho_ sino 11v3 PHY7SI021894M_P1 2494 4465 687 81,1 globlastp LNU955_H16 ca im_chorãa 12v1 FL758990_P1 2495 4466 687 80,4 globlastp LNU957_H1 milho 10v1 B1388870_P1 2496 4467 689 85,6 globlastp LNU957_H2 milho_ ain o 11vá EC613819_T1 2497 4468 689 82,08 glotblastn LNU958_H1 milho 10v1 DR801342 P1 2498 4469 690 91 glcblastp LNU958_H8 ca im_chorão 12v1 FL952819_P1 2499 4470 690 88,1 glcblastp LNU958_H2 milha_ ain o 11 v3 PHY7SI022391 M_P1 2500 4471 690 86,6 globlastp LNU958H3 cevada 12v1 BF623458_P1 2501 4472 690 82,1 glcblastp LNU958_H4 centeio 12v1 IDRROO1O12l8630 2502 4473 690 81,$ globlasip LNU958_H5 Brach odium 12v1 BRADI4G01370_P1 2503 4474 690 81,7 glcblastp

-- ----, i-.. . - ------.--- .#_$,

ID SEQ.

Algar.

Polin.

Polip.

N°: global LNU958_H6 aveia 11v1 GR331570_P1 2504 4475 690 81,7 globlastp capim_ chorão112v1ISRR187769,180209_ LNU958_H9 2505 4476 690 81,2 globlastp LNU958_H7 arroz 11v1 C73705 2506 4477 690 80,9 globlastp LNU959_H1 milho_ ain a 11v3 SOLX00016974P1 2507 4478 691 80,6 globlastp LNU959 H2 cana_de_a úcar 10v1 CA183011 2508 4479 691 80,1 globlastp LNU961_H1 milho 10v1 CF631183_P1 2509 4480 693 92,2 globlastp LNU961_H8 ca im_chorão 12v1 FE655607_T1 2510 4481 693 91,32 glotblastn LNU961_H2 milho_ ain o 11v3 PHY7SID22987M_P1 2511 4482 693 89,4 globlastp LNU961_H3 ca im_chorão b167 FE6556D7 2512 4483 693 88,1 globlastp LNU961_H4 trio 12vá CA662505 2513 4484 693 81,7 globlastp LNU961_H5 aveia 11v1 GR320475_P1 2514 4485 693 81,3 globlastp LNU961_H6 brachypodium12v1 BRADI2G18310_P1 2515 4486 593 81,1 globlastp LNU961_H7 arroz 11v1 C249C6 2516 4487 693 80,8 globlastp LNU963_H1 milho 10v1 BE238751_P1 2517 4488 695 96,4 loblast LNU963__H2 milho_ ain o 11v3 EC613777_P1 2518 4489 695 95,4 globlastp LNU963_H4 ca im_chorão 12v1 FE650575_P1 2519 4490 695 90,1 globlastp LNU963_H3 arroz 11v1 AA752580 2520 4491 695 86 globlastp LNU964_H1 milho 10v1 BE051847_P1 2521 4492 696 95 globlastp LNU964_H12 ca im_chorão 12v1 FL715928_P1 2522 4493 696 94,6 globlastp LNU964_H2 milho_ ain 11v3 PHY7SID08583M_P1 2523 4494 696 93,5 globlastp LNU964_H3 arroz 11v1 CA753376 2524 4495 696 91,9 globlastp LNU964_H4 brash odium 12v1 BRADI1G36570_P1 2525 4496 696 90,6 qloblastp LNU964_H5 trigo 12v3 CA593860 2526 4497 696 90 globlastp LNJ964_H6 capirn_chorãoIgbl67IFL7l5928 2527 4498 696 88,91 glotblastn LNU964_H7 ain a 10v1 EV0454PM024076_P1 2528 4499 696 84,1 globlastp LNU964_H8 centeio 12v1 DRR001012,11081 2529 4500 696 83,98 glotblastn LNU964H9 sor a 12v1 SB04G006930 2530 4501 696 81,2 globlastp LNU964_H10 arroz 11v1 CBD9fi675 2531 4502 696 80,87 glotblastn LNU964_H13 ca ìm_chorão 12v1 FL988009_T1 2532 4503 696 80,64 glotblastn LNU964_H11 milho_ aín o 11v3 PHY7S1017454M_P1 2533 4504 696 80,4 globlastp LNU965_H1 cana-de_a úcar 10v1 BQ533054 2534 4505 697 91,8 gIobastp LNU965_H2 milho 10v1 T12687_P1 2535 4506 697 86,8 globiastp LNU965_H5 ca im_chorão 12v1 FE648444_P1 2536 4507 697 82,3 globlastp LNU965_H3 ca im_chorão b167 FE648444 2537 4507 697 82,3 globlastp LNU965_H4 milho_ ain o 11vá EC612769_P1 2538 4508 697 81,6 globlastp INU965_H6 capim_chorão 12v1 FL899717_T1 2539 4509 697 80,07 glotblastn LNU966 H1 milho ain o 11v3 EC612437 P1 2540 4510 698 90 gIobIaspt LNU966 H7 ca im_chorão 12v1 FL704D69 P1 2541 4511 698 88 globlasip LNU966_H2 brachypodiumh12v1BRADI1G32350P1 2542 4512 698 82,4 qloblasip LNU966_H3 centeio 12v1 DRRO01012,705384 2543 4513 698 80,82 glotblastn LNU966_H4 centeio 12v1 ORRO01012,277281 2544 4514 698 80,46 glotblasin LNU966_H5 trio 12vá CD934973 2545 4515 698 80,46 qotbIas1n LNU966_H6 arroz 11v1 1B18U8003 2546 4516 698 80,4 gobIastp LNU967_H1 milho 10v1 CD001313_P1 2547 4517 699 90,5 globlastp LNU967_H2 milho_ ain o 11v3 PHY7S1005990MP1 2548 4518 699 83,3 gjbIastp LNU97Q_H1 só a 11 v1 GLYMA10G05870 2549 4519 702 98,2 globlastp LNU970_H64 soja 12v1 GLYMA10G05870_P1 2550 4520 702 95,6 gjbIastp LNU970_H2 feijão_fradinho 12v1 FF384004P1 2551 4521 702 92,3 globlastp LNU970 H3 feijão uandu 11v1 GW351178_P1 2552 4522 702 92 globlastp LNU970_H65 feijão 12v2 CA911706_P1 2553 4523 702 91,2 globlastp LNU970_H4 feijão 12v1 CA911706 2554 4523 702 91,2 globlastp LNU970_H5 amendoim 10v1 EE126306_P1 2555 4524 702 89,1 globlastp LNU97D_H6 rao_de_bico 11v1 SRR133517,113773 2556 4525 702 88,3 globlasip Pro_de_bico¡13v2ISRR133517,113773_ LNU97D_H6 2557 4525 702 88,3 globlastp LNU970_H8 soja 12v1 GLYMA19G36410 P1 2558 4526 702 88 globlastp feij o__guanduI11v1ISRR054580X124449 LNU970_H7 2559 4527 702 87,2 globlastp LNU970_H8 soja 11v1 GLYMA19G3641D 2560 4528 702 87,2 globlastp LNU970_H9 medica o 12v1 AW6926D7_P1 2561 4529 702 86,9 globlastp

ID SEQ.

Algor.

Polin.

Poli p.

N°: global LNU970_H10 tri oneIIa llv1 SRR066194X103697 2562 4530 702 86,5 globlastp LNU970_H11 soja 11v1 IGLYMAO3G3368O 2563 4531 702 85,8 globlastp LNU970_H11 so ja 12v1 GLYMA03G33680_P1 2564 4531 702 85,8 IobIastp LNU970_Hl2 látus 09v1 AW428709_P1 2565 4532 702 85,4 qloblastp LNU970_H13 o ulus 10v1 CA927561 2566 4533 702 85 gIobastp LNU970_H66 P1 otiana_benthamianaI12v1ICK284221_ 2567 4534 702 84,3 globlastp LNU970_H14 cacau 10v1 CU479946_P1 2568 4535 702 84,3 globlastp LNU970_H15 uva 11v1 GSVIVT01025656001_P1 2569 4536 702 84,3 globlastp LNU970_H16 nicotiana_benthamiana b162 CK284221 2570 4534 702 84,3 globlastp LNU970_H67 popIusl3vi CA927561_P1 2571 4537 702 83,9 globlastp LNU97O_Hl7 catharanthus l lv1 EG556643_P1 2572 4538 702 83,9 globlastp LNU970_H18 ma ã l lv1 CN580810_P1 2573 4539 702 83,6 globlastp castanhaIgb170pSRR006295S0024406_P LNU970_H19 2574 4540 702 83,6 globlastp LNU97O_H68 mamona 12v1 EG692405_P1 2575 4541 702 83,3 globlastp LNU970H21 clementina 11v1 CF504408_P1 2576 4542 702 83,2 globlastp LNU970H22 carvalho 10v1 FP025429P1 2577 4543 702 83,2 globlastp LNU970_H23 laran ja l lv1 CF504408_P1 2578 4542 702 83,2 globlastp LNU970_H24 scabiosa 11v1 SRRO63723X10102 2579 4544 702 83,2 globlastp LNU970_H25 faia l lv1 1SRR006293,l5215_T1 2580 4545 702 82,91 glotblastn LNU970_H69 runus_mume 13v1 DN553660_P1 2581 4546 702 82,9 globlastp LNU970_H70 niotiana_benthamianaI12v1IEH664749_ 2582 4547 702 82,8 globlastp LNU970_H71 olea 13v1 SRR014463X18544D1_P1 2583 4548 702 82,8 qloblastp LNU970_H26 amsonia llv1 SRRO98688X105338_P1 2584 4549 702 82,8 globlastp LNU970_H27 li uoarrcz b171 FS241348_P1 2585 4550 702 82,8 globlastp LNU970H28 populusIlOvlIAIlG3995 2586 4551 702 82,8 lobIastp LNU970_H28 o ulus 13v1 AI163995_P1 2587 4552 702 82,8 globlastp LNU970_H29 jasmim 11v1 1SRR098689X105363 2588 4553 702 82,8 globlastp LNU970_H30 moran o 11v1 1C0360524 2589 4554 702 82,6 gobIastp P}otiana_benthamianall2v1IEB425526_ LNU970_H72 2590 4555 702 82,5 globlasip LNU970H31 mirtilo12v1SRR353282X4041D1_P1 2591 4556 702 82,5 globlastp LNU97o_H32 eucali to 11v2 CT980284_P1 2592 4557 702 82,5 qloblastp LNU970_H33 lótus 09v1 DC596145_P1 2593 4558 702 82,5 globlastp LNU970_H34 prunus1l0vlCN5808l0 2594 4559 702 82,2 globlastp LNU970_H35 tabaco bí62 EB425526 2595 4560 702 82,1 globlastp LNU970_H36 tripterygium1lv1 1SRR098677X12467 2596 4561 702 82,1 globlastp rn mordica110v1ISRR071315S0003149_ LNU970_H37 2597 4562 702 81,8 globlastp LNU970_H38 nasturtium l lv1 1SRR032558,101335_P1 2598 4563 702 81,8 globlastp LNU970_H39 cleome_s inosa 10v1 GR933144_T1 2599 4564 702 81,75 glotblastn LNU970_H40 al odãn11v1AW186771_P1 2600 4565 702 81,6 globlastp LNU970H73 olea 13ví SRR014463X10063D1_P1 2601 4566 702 81,4 globlastp LNU970_H41 valerians 11v1 SRR099039X116523 2602 4567 702 81,4 globlastp LNU970_H42 melancia 11v1 AM726470 2603 4568 702 81,4 globlastp 9ossypium_raimondiiI12v1IAW186771_P LNU970_H43 2604 4569 702 81,2 globlastp LNU970_H44 euon mus l lv1 SRR070038X13639_P1 2605 4570 702 81,1 globlastp LNU970_H45 euonynusl 11v1 ISRR070038X296196_P1 2606 4571 702 81,1 globlastp LNU970_H46 tri h saris 10v1 DR170439 2607 4572 702 81,1 globlastp mandiocal09v1IJGICASSAVA23572VALI LNU970_H47 2608 4573 702 81 globlastp DM1_P1 LNU970H48 kiwi b166 FG404513_P1 2609 4574 702 81 globtastp LNU970_H49 solanum_ hureja09v1 SPHBG135560 2610 4575 702 81 globlastp LNU970_H50 al odáo llv1 CO081144P1 2611 4576 702 80,9 globlastp LNU970_H51 oss ium_raimondii 12v1 AI728093_P1 2612 4577 702 80,9 globlastp LNU970_H52 medica o 12v1 CA990040_P1 2613 4578 702 80,7 gpbIastp LNU970_H53 tomate l lv1 BG135560 2614 4579 702 80,7 globlastp LNU970_H54 vinca 11v1 SRR098690X104684 2615 4580 702 80,7 globlasp t

"'o, - — — 1 1, ~_— — .., — _ — .- . 1

1. . .. — " A

ID SEQ.

ID SEQ Hom. à % de Hom. ao Nome Organismo 1 Nome do agrupamento NO do N° do ID SEQ Id.

Algor.

Polin.

Polip.

N°: global LNU970_H55 ambrosia 11v1 1SRR346935,110771_P1 2616 4581 702 80,4 globlastp LNU970_H56 al odão 11v1 A1728093_P1 2617 4582 702 80,4 globlastp LNU970_H57 uizotia 10v1 GE557045_P1 2618 4583 702 80,4 globlastp LNU970_H5$ girassolIl2vlIDY9i23lg 2619 4584 702 80,4 globlaslp LNU970_H59 coffea 10v1 DV663991_ Pi 2620 4585 702 80,3 globlastp abóbora__amarelaIllv1ISRRO91276X125 LNU970_H60 2621 4586 702 80,3 globfastp 648_P1 LNU970_H61 e ino 09v1 AM726470_T1 2622 4587 702 80,29 glotblastn LNU970_H62 girassolll2vl CD856036 2623 4588 702 80,1 globlastp LNU970_H63 c nara b167 GE590124_P1 2624 4589 702 80 globlastp LNU971_Hl tomate 11v1 1A1487766 2625 4590 703 91,9 globlastp LNU971_H2 tomate 11v1 BG132158 2626 4591 703 91,7 globlastp LNU971_H3 tomate 11v1 BG589613 2627 4591 703 91,7 globlastp LNU971_H4 solanum_ hureia09v1 SPHA1487915 2628 4592 703 89,5 glotblastn LNU971_H5 tomate 11v1 AW218573 2629 4593 703 89,41 glotblastn LNU971_H6 solanum hureja09v1 SPHA1777070 2630 4594 703 87,66 glotblastn LNU971_H7 soianum_ Kure a 09v1 SPHDNI68697 2631 4594 703 87,66 glotblastn LNU971 H8 solanum hure a 09v1 SPHBG125614 2632 4595 703 87,5 globlastp LNU971_H9 tomate 11v1 AI777070 2633 4596 703 86,8 globlastp LNU971_H10 batata 10v1 BQ514990_T1 2634 4597 703 86,36 glotblastn LNU971_H11 solanum_ hureja 09v1 1SPHA1772789 2635 4598 703 86,31 glotblastn LNU971_H12 solanum_ hureja 09v1 ISPHBI431905 2636 4599 703 85,71 glotblastn LNU971_H13 batata 10v1 BI431905_P1 2637 4600 703 85,5 globlasip LNU971H14 batata 1Dv1 CV475926_T1 2638 4601 703 85,47 glastn LNU971_H15 solanurn_ hureja 09v1 SPHBG132158 2639 4602 703 85,4 globlasip LNU971_H16 solanurn_ hureja 09v1 1SPHA1776714 2640 4603 703 85,3 globlastp LNU971_H17 berin ela 10v1 FS009193_P1 2641 4604 703 84 globlastp LNU971_H18 batata 10v1 f3G589613_P1 2642 4605 703 83,8g!oblastp LNU971_H19 tomate l lv1 SRR027939S0232941 2643 4606 703 82,9 globlastp Tctiana_benthamianali2v1JAM836977_ LNU971_H22 2644 4607 703 82,13 glotblastn LNU971_H20 tomateilviBG125614 2645 4608 703 81,5 globlastp LNU971_H21pimenta 12v1 BM061037_P1 2646 4609 703 80,9 qloblastp LNU972_H2 P1 otiana_benthamianaI12v1IEB699638_ 2647 4610 704 91,4 globlastp LNU975_Hl solanum_ here a 09v1 SPHBi422101 2648 4611 705 85,2 glotblastn LNU975_H2 solanum_ hure'a09v1 ISPHAI896166_T1 2649 4612 705 80,17 glotblastn LNU976_H1 pseudor009neriaIgblS7IFF3474O7 2650 4613 706 93,2 globlastp LNU976_H2 centeio 12v1 IORROOI012,364991 2651 4614 706 91,47 glotblastn LNU976_H3 le mus b166 CD808542_P1 2652 4615 706 89,9 globlastp LNU977_H2 trio 12vá BM137333 2653 4616 707 86,1 globlastp LNU977_H10 arroz l lv1 C91689_P1 2654 4617 707 81,5 gobIastp LNU977_H11 sor o 12v1 SBO1 G048800_P1 2655 4618 707 80,7 globlastp LNU977_H12 milha 10v1 C0519634_T1 2656 4619 707 80,23 glotblastn LNU750_Hi trio 12vá BQ744292 2657 4620 713 89,2 loblast LNU750_H2 centeio 12v1 JDRRDO1012,14416 2658 4621 713 88,8 globlastp LNU771_H1 trio 12vá BM068568 2659 4622 715 96,7 gIobIapst LNU771_H2 centeiol 12v1 IDRROO1013,372156 2660 4623 715 87,38 glotblastn LNU771_H3 trio 12vá BE426855 2661 4624 715 84,3 globlastp LNU771_H4 (estuca b161 DT701171_P1 2662 4625 715 84 globlastp LNU771_H5 centeio 12v1 DRRO01012,320596 2663 4626 715 82,4 globlastp LNU771_H6 centeio 12v1 DRRO01017,1352396 2664 4627 715 81,6 globlastp LNU772_H7 lolium 10v1 EY457993_T1 2665 4628 716 91,41 glotblastn LNU772_H12 soro 12v1 CD209835 2666 4629 716 87,5 4astn LNU785_H1 centeiol 12v1 IDRROO1012,10208 2667 4630 717 95,63 glotblastn LNU785_H2 to o 12vá CA653207 2668 4631 717 89,2 astp LNU786_H1 tri a 12vá BJ222677 2669 4632 718 94,89 glotblastn LNU786_H2 centeio 12v1 IDRROO1012,114677 2670 4633 718 93,69 glotblastn LNU786_H4 brachypodiumli2v1 BRAD13G52470_T1 2671 4634 718 86,3 glotblastn LNU786_H5 tri a 12vá SRR400820X100908D1 2672 4635 718 84,9 glotblastn LNU786_H6 tri a 12v3 CA500094 2673 4636 718 83,88 glotblastn

ID SEQ.

ID SEQ Horn. à % de Horn, ao Nome Organismo 1 Nome do agrupamento N° do N° do ID SEQ Id.

Algor.

Polin, Polip.

N°: global LNU786_H7 arroz 11 v1 AU062764 2674 4637 718 81,85 glotblastn LNU786_H8 milho 10v1 AW076421_T1 2675 4638 718 81,29 gIotbastn LNU786_H9 milho_ ain o 11vá PHY7S1016091M_T1 2676 4639 718 81,1$ glotblastn LNU786_H10 soro 12v1 SB04G030880 2677 4640 718 80,7 glotblastn LNU786_H11 capim chcrão 12v1 FL710092_Ti 2678 4641 718 80,05 glotblastn LNU787_H5 soro 12v1 SB10G022920 2679 4642 719 85,9 globlastp LNU787_H15 ca im_chorão 12v1 GD039082_T1 2680 4643 719 83,45 lotblastn LNU806_H3 arroz 11v1 1C1312268 2681 4644 721 84,1 glotblastn LNU806H4 brachypodiuml 12v1 IBRADI3G14530_T1 2682 4645 721 83,18 glotblasin LNU806_H5 centeio 12v1 DRRO01012,245949 2683 4646 721 80,43 glotblastn LNU806_H6 tri o 12vá CA745011 2684 4647 721 80,43 gloiblastn LNU837_H8 ca im_chorão 12v1 FL706711_T1 2685 4648 722 87,5 glotblastn LNU837_H4 milho_ ain o 11v3 PHY7SI036733M_T1 2686 4649 722 83,33 glotblastn LNU837_H9 ca im_chorão 12v1 FL875810_T1 2687 4650 722 82,29 4oiblastn LNU837_H5 capirn_chorãoJgbl67IFL7O67l2 2688 4651 722 82,29 glotblastn LNU837H10 ca im_chorão 12v1 FL893419_T1 2689 4652 722 81,25 gloiblastn LNU837_H6 ca im_chorào b167 FL696926 2690 4653 722 81,25 glotblastn LNU837_H11 ca im_chorão 12v1 FL696926_T1 2691 4654 722 80,21 glotblastn LNU837_H7 ain o 10v1 EV0454PM106715_T1 2692 4655 722 80,21 glotblastn LNU856H1 milho_ ain o 11v3 PHY7SI00628QMP1 2693 4656 726 91,5 globlastp LNU856_H3 ain o 10v1 CD725559_P1 2694 4657 726 90,5 globlastp LNU856_H4 soro 12v1 1SB05G003390 2695 4658 726 90,3 globlastp LNU856_H5 milho_ ain o 11v3 PHY7SI017030M__P1 2696 4659 726 89,1 globlastp LNU856_H12 ca im_chorão 12v1 FL749250_Pl 2697 4660 726 88,9 globlastp LNU856_H6 milho 10v1 BM895627_P1 2698 4661 726 87,9 globlastp LNU856_H8 arroz 11v1 81811616 2699 4662 726 84,2 globlastp LNU856_H9 brachypodiumIl2vllBRADIiG43000Pi 2700 4663 726 82,4 globlastp LNU856_H10 Brach odium 12v1 BRADI2G09570_P1 2701 4664 726 80,7 globlastp LNU856_H11 cevada 12v1 B1949641T1 2702 4665 726 80,08 glotblastn LNU862_H10 cana_de_a úcar 10v1 CA147410 2703 4666 728 84,3 globlasip LNU862_H13 milho 10v1 BU037296_P1 2704 4667 728 81,9 gçlastp LNU862_H15 cevada 12v1 AV921382_T1 2705 4668 728 80,84 glotblastn LNU866_H1 soro 12v1 S1312V1CUFF392T1P3 2706 4669 729 95 globlasip LNU866_H2 milho 10v1 AI854982_P1 2707 4670 729 88,9 globlasip LNU866_H3 milho_ ain o 11vá PHY7S1034627M_P1 2708 4671 729 83,2 globlasip LNU866_H4 ain a 10v1 EV0454PM024441_T1 2709 4672 729 80,82 glotblastn LNU870_H1 milho_ ain o 11vá PHY7S1034640M_P1 2710 4673 730 91,1 globlastp LNU910_H11 ca im_chorão 12v1 FL927878_T1 2711 4674 736 93,48 gtotblasln LNU911_H1 milha 10v1 Á1622711P1 2712 4675 737 83,6 gobIastp LNU951_H1 milho_ ain o 11vá PHY7S1009880M_P1 2713 4676 739 82,4 gobIastp LNU951_H2 ca im_chorão 12v1 FL765313_P1 2714 4677 739 80,3 gobIastp LNU956_H1 cana_de_a úcar 10v1 BQ533901 2715 4678 741 93,94 glotblasin LNU956_H3 milho 10v1 AW191064_T1 2716 4679 741 87,59 glotblastn LNU956_H9 ca im_chorão 12v1 FL728285_T1 2717 4680 741 82,79 glotblastn LNU956_H6 pançoI10v1 EV0454PM000846_T1 2718 4681 741 82,04 glotblastn LNU956_H7 arroz 11v1 ÁA749599 2719 4682 741 81,25 glotblastn LNU956_H8 brash odium 12v1 BRAD14G04270 T1 2720 4683 741 80 glotblastn LNU972_H1 solanum_ hureja 09v1 1SPHA1775263 2721 4684 743 96,6 globlastp LNU977_HB tri o 12vá SRR400820X1185207D1 2722 4685 745 87,8 globlastp LNU749_H1 tr o 12vá BQ905774 2723 4686 747 93,4 globlastp LNJ749_H2 centeio 12v1 DRR001012,593230 2724 4687 747 90,9 globlastp LNU749_H3 brachypodiumIl2vlIBRADI4Gi011Opi 2725 4688 747 81,4 globlastp LNJ752_Hl centeio 12v1 DRRO01012,165407 2726 4689 748 96,9 globlastp LNU752_H2 trio 12v3 BE415379 2727 4690 748 96,7 globlastp LNJ766_H4 brachypodjumJi2v1BRADI1G592iOpi 2728 4691 749 90 globlastp LNJ769_H2 tri o 12vá BE427519 2729 4692 750 94,4 globlastp LNU769_H1 tri o 12vá BE402340 2730 4693 750 94,2 globlastp LNU769_H3 tri o 12vá BQ841839 2731 4694 750 93,7 globlastp LNU769_H4 centeio 12v1 BE705675 2732 4695 750 92,9 globlastp LNU769_H5 tri o 12v3 CA692455 2733 4696 750 92,5 globlastp

ID SEQ.

ID SEQ Hom. à % de Hom, ao Nome Organismo 1 Nome do agrupamento N° do N° do ID SEQ Id.

Algor.

Polin.

Poli p.

N°: global LNU769_H6 centeio 12v1 DRRO01012,119684 2734 4697 750 91,9 globlasip LNU769_H7 1ri o 12vá CD888102 2735 4698 750 86,9 gIobapst LNU769_H11 arroz 11v1 ÁU030808 2736 4699 750 82,4 globíastp LNU769_H9 soro 12v1 SBO9G026980 2737 4700 750 82,3 globlastp LNU769_H10 milho_ ain o 11v3 PHY7S1026215M_P1 2738 4701 750 82 globlastp LNU769_H12 milho 10v1 CD445089_P1 2739 4702 750 81,9 qloblastp LNU769H15 capim_choràol 12v1 IDN151230_P1 2740 4703 750 81,2 globlastp LNU769_H6 ca im_chorão 12v1 GD008102_T1 2741 4704 750 81,03 glotblastn LNU773_H6 soro 12v1 SB01G001980 2742 4705 751 80,6 globlastp LNU780_H1 tri o 12v3 BM137500 2743 4706 753 81,2 globlastp LNU784_H1 tri o 12v3 BE406457 2744 4707 754 84,1 loblast LNU784_H2 centeio 12v1 DRR001012,297633 2745 4708 754 81,7 globlastp LNU786_H3 centeio 12v1 DRR001012,109215 2746 4709 755 90,1 globlastp LNU788_H4 milho_ ain o 11v3 PHY7S1006617M_P1 2747 4710 756 83,8 globlastp LNU804_H1 painço 11v3 PHY7S1009871M_P1 milhopainçol 2748 4711 758 82,5 globlastp LNU804_H2 capim_chorãoIgbl67ÍFE6O3O29 capim 2749 4712 758 82 globlastp LNU804_H3 soro 12v1 SBO6G022510 2750 4713 758 80,2 globlastp LNU804_H4 soro 12v1 SBO6G022500_P1 2751 4714 758 80 globlastp capim_ chorão112v1ISRR187768,79981_P LNU806_H7 2752 4715 759 88,3 globlastp LNU806_H8 ca im_chorão 12v1 DN145288_P1 2753 4716 759 87,3 gIobastp LNU806_1-11 soro 12v1 SB07G002850 2754 4717 759 81,3 gIobastp LNU806_H2 milha 10v1 CD966203_P1 2755 4718 759 80,6 globlastp LNU816_H1 milho_painçol milho 11v3 GTO91139_P1 2756 4719 761 95,8 globlastp LNU816_H2 sor a 12v1 SB04G029730 2757 4720 761 95,7 globlastp LNU816_H3 milho 10v1 BQ485722_P1 2758 4721 761 95,6 globlastp LNU816_H16 ca im_chorãa 12v1 FL715086_P1 2759 4722 761 94,6 globlasip LNU816_H4 ain o 10v1 EV0454PM008535_P1 2760 4723 761 94,5 globlastp LNU816_H7 centeio 12v1 BF145541 2761 4724 761 87,6 globlastp LNU816_H8 cevada 12v1 AV909829_P1 2762 4725 761 86,6 globlastp LNU816_H17 ca im_chorão 12v1 FL746777 Pi 2763 4726 761 83,3 gobIastp LNJ816_H9 tri o 12v3 BE400688 2764 4727 761 82,5 gbIasp t LNU816_H11 tri o 12v3 TAU67717 2765 4728 761 82 gobIastp LNU816_H12 cevada 12v1 EX595315_P1 2766 4729 761 81,8 globlastp LNU816_H13 to o 12v3 SRR400820X1008111D1 2767 4730 761 80,88 glotblastn LNUB16_H14 tri o 12v3 SRR400820X10346151)1 2768 4731 761 80,88 glotblastn LNUB16_H15 brach odium 12v1 BRADI1G42750P1 2769 4732 761 80,7 globlastp LNUB21_H1 soro 12v1 SB02G033100 2770 4733 764 95,9 globlastp LNUB21_H2 milho_ ain o 11v3 PHY7SI029452M_P1 2771 4734 764 90,7 globlastp LNU821_H3 arroz 11v1 1B18O8865 2772 4735 764 82,3 globlastp brachypodiumh12v1IBRADI1G28110T2_P LNU821_H4 2773 4736 764 81,1 globlastp LNU824_H2 soro 12v1 SBO3G004750 2774 4737 765 96,9 globlastp LNU824_H3 cana_de_a úcar 10v1 CA072104 2775 4737 765 96,9 globlastp LNU824_H4 milho_ ain o 11vá PHY7SI002015M_P1 2776 4738 765 95,8 globlastp LNU824_H6 capim_chorãoIgb167FL699463 2777 4739 765 95,2 globlastp LNU824_H52 ca im_chorão 12v1 FE635824_P1 2778 4740 765 94,7 globlastp LNU824_H7 arroz 11v1 1U37978 2779 4741 765 92,7 globlastp LNU824_H8 brachypodium12v1BRADl2G0413Opl 2780 4742 765 91,6 blast LNU824_H9 cevada 12v1 BI954198 P1 2781 4743 765 91,3 aloblastp LNU824_H10 (estuca b161 DT698307P1 2782 4744 765 91,3 globlastp INU8241-111 aveia11v1 G0582430XX1P1 2783 4745 765 91,3 globlastp LNU824_H1 2 centeio 12v1 IDRROO1012,148971 2784 4743 765 91,3 globlastp LNU824_H13 centeio 12v1 DRR001012,252020 2785 4743 765 91,3 gIastp LNU824 H14 arroz 11v1 AB060277 2786 4746 765 91 globlastp LNU824_Hl5 trio 12v3 BE444676 2787 4747 765 91 globlastp LNU824_H16 centeio 12v1 DRRO01012,21112 2788 4748 765 90,73 glotblastn LNUS24_H17 soro 12v1 ISBO9GOO5O1O 2789 4749 765 89,9 globlastp LNU824_H53 ca im_chorão 12v1 DN141584_P1 2790 4750 765 89,9 globlastp LNU824_H18 milho_ ain o 11v3 PHY7SI022491M_P1 2791 4751 765 89,6 globlastp LNU824_119 milho 10v1 AI783320_P1 2792 4752 765 89,6 globlastp

ID SEQ.

Algor.

Poliu.

Poli . N°: global LNU824_H20 ca im_chorão b167 DN141584 2793 4753 765 89,6 globlastp LNU824_H54 ca im_chorão 12v1 FE599982_P1 2794 4753 765 89,6 globlastp LNU824_H22 panço10v1 CD725074_P1 2795 4754 765 89,3 globlastp LNU824_H23 cevada 12v1 BI959386_P1 2796 4755 765 88,8 globlastp LNJ824_H24 brachypodiumll2vlleR.AD12G34470P1 2797 4756 765 88,8 globlastp LNJ824_H25 aveia 11v1 CN816246_P1 2798 4757 765 88,5 globlastp LNU824_H26 centeio 12v1 DRR001012,242642 2799 4758 765 88,2 globlastp LNU824_H31 cent&cI 12v1 DRR001012,153481 2800 4759 765 85,7 globlastp LNU824_H55 ca im_chorão 12v1 DN145318_P1 2801 4760 765 83,7 gjoblastp LNU824_H32 cacau 10v1 CU505404_Pl 2802 4761 765 82,5 globlastp LNU824_H34 cana_de_a úcar 10v1 CA084205 2803 4762 765 82,3 globlastp LNU824_H33 euon mus 11v1 SRRO70038X188424P1 2804 4763 765 82,1 globlastp LNU824_H35 uva 11v1 GSVIVT01024573001_P1 2805 4764 765 81,$ globlastp LNU824_H36 karan a 11v1 CF418875_P1 2806 4765 765 81,6 goblastp LNU824_H43 tnpterygiumI1iviSRR098677Xi056i0 2807 4766 765 81,01 glotblastn LNU824_H38 eu horbia 11v1 DV129031 P1 2808 4767 765 81 goblastp LNU824_H39 mamão b1ú5 EX228132_Pl 2809 4768 765 81 globlastp LNU824H40 amborella 12vá CK763625_P1 2810 4769 765 80,8 globlastp LNU824_H48 uva 11v1 IGSVIVT01032677001_Pi 2811 4770 765 80,8 gobIastp LNU824_H56 mamona 12v1 EE260514_P1 2812 4771 765 80,8 globlastp LNU824_H46 ambrosia 11v1 SRR346935,200226_P1 2813 4772 765 80,7 globlastp LNU824_H44 al odão 11v1 C0077706_P1 2814 4773 765 80,6 globlastp LNU824_H45 oss ium__raimondii 12v1 BE054298_P1 2815 4773 765 80,6 gjbIastp LNU824H51 faia 11v1 SRR006293,9817_T1 2816 4774 765 80,39 glotblastn LNU824_H50 al odão 11v1 BE054298_P1 2817 4775 765 80,3 globlastp castanhaIgb170ISRROQ6295S0038807_P LNU824_H57 2818 4776 765 80,2 globlastp LNU824_H58 eucali ta 11v2 CB967757_P1 2819 4777 765 80,2 globlastp LNU824_H59 amsonia 11v1 SRRO98688X158094_T1 2820 4778 765 80,17 glotblastn LNU829_H2 milhol 10v1 jSRRD14550S0010991_T1 2821 4779 767 94,63 glolblastn LNU829_H3 cana_de_a úcar 10v1 CF572667 2822 4780 767 94,48 gloiblastn P1pim_chorãoI12v1ISRR187765,561639_ LNU829_H8 2823 4781 767 93,8 globlastp LNU829_H6 soro 12v1 S812V2PRD006827 2824 4782 767 90 glotblastn LNU829_H7 arroz 11v1 AF171223 2825 4783 767 81,4 globlastp LNU831_H1 soro 12v1 SB01G011000 2826 4784 768 84,92 glotblastn LNU631_H2 milho_ ain o 11v3 PHY7S1036219MP1 2827 4785 768 84,1g!oblastp LNU833_H1 soro 12v1 SB02G029650 2828 4786 769 91,9 globlastp LNU833_H3 milho_ ain o 11vá EC612621_P1 2829 4787 769 87 globlastp LNU847_H1 tri onella 11v1 SRR066194X264388 2830 4788 772 94,4 globlastp LNU847_H2 soja 12v1 GLYMA17G02680 P1 2831 4789 772 83 globlastp LNU847_H3 feijão 12v2 SRR001334,102552_P1 2832 4790 772 82 globlasip LNU847_H4 soja 12v1 GLYMAO7G38020_P1 2833 4791 772 80,4 globlastp LNU858_H3 milho 10v1 BM266633_P1 2834 4792 774 93,5 globlastp LNUS58H4 milha 10v1 AI834674_P1 2835 4793 774 90,3 globlastp LNU85B_H1 milho_ ain o 11vá PHY7S1016470M_P1 2836 4794 774 86,9 globlastp LNU858_H2 ain o 10v1 EV0454PM002436_P1 2837 4795 774 86,6 globlastp LNUB58_H5 capim_chorão 12v1 FE613408_P1 2838 4796 774 85,2 globlastp LNU858_H6 capim_chorão 12v1 FL693746_P1 2839 4797 774 81,8 globlastp LNU898_1-11 soro 12v1 SB04G003360 2840 4798 778 94,3 gIobastp LNU898_H2 milho_ ain o11v3PHY7S1017281MP1 2841 4799 778 93,7 globastp LNU898_H3 ain o 10v1 EV0454PM005287_P1 2842 4800 778 93,7 globlastp LNU898_H4 milho 10v1 AI948259_T1 2843 4801 778 93,63 glotblastn LNU898_H5 milho 10v1 BQ538526_P1 2844 4802 778 93,2 gIobastp LNU898_H9 capim_chorão 12v1 FE615026P1 2845 4803 778 92,5 gIobastp LNU898_H6 ca im_chorão b167 FL699057 2846 4804 778 91,84 glotblastn LNU898H7 arroz11v1 1BE229038 2847 4805 778 86 globlastp LNU898_H8 brachypodiuml 12v1 BRADI3G03680_P1 2848 4806 778 82,9 globlastp LNU900 H7 arroz 11v1 AU083413 2849 4807 779 83,4 globlastp LNU901__H2 milho 10v1 AW244952_P1 2850 4808 780 90,1 gjoblastp LNU901_H3 milho_painçoj 11 v3 PHY7Si001444M_P1 2851 4809 780 88,8 globlastp

ID SEQ. ID SEQ Hom. à % de Hom. ao Nome Organismo 1 Nome do agrupamento N° do N° do ID SEQ Id. Algor. Polin. Poli p. N°; global brachypodiumI12v1IBRADI2G0256OT2_P LNU901_H4 2852 4810 780 84,5 globlastp LNU901-H5 tri a 12vá BE606820 2853 4811 780 83,6 globlastp LNU901_H8 centeio 12v1 BE586835 2854 4812 780 82,47 glolblastn LNU901_H6 arroz 11v1 jB1806473 2855 4813 780 82,4 globlastp LNU901_H7 cevada 12v1 B1952377_P1 2856 4814 780 82,4 globlastp LNU901_H9 centeio 12v1 JDRR0O1012,187398 2857 4815 780 81,42 glotblastn LNU904_H2 milho ain o 11vá EC613499_PI 2858 4816 781 82,1 globlastp LNU906_H1 milho 10v1 AW055628P1 2859 4817 782 88,2 globlastp LNU906_H2 milha 10v1 8Q703950_P1 2860 4818 782 88,2 globlastp LNU906 H3 milha ain o 11v3 PHY7SI000363M P1 2861 4819 782 84 globlastp LNU909_H2 milho_ ain o 11v3 PHY7SI000744M_P1 2862 4820 784 84,6 gpastp LNU909H3 capim_thorãoIgbl67IFL723O49 2863 4821 784 82,21 glotblastn LNU909_H5 ca im_chorão 12v1 FL977640_Tl 2864 4822 784 82,1 glotblastn LNU909_H4 ain o 10v1 EV0454PM008179_P1 2865 4823 784 82,1 globlastp LNU911_H2 milha ain o 11v3 PHY7SI000115M_P1 2866 4824 785 85,1 globlastp LNU930_H1 milho10v1 AW787241_P1 2867 4825 786 91,5 globlastp LNU930_H4 ca im_chorão 12v1 FL706853_Tl 2868 4826 786 83,49 glotblastn LNU930_H2 capim_chorãolgbl67 FE618499 2869 4827 786 82,9 globlp ast LNU930_HS ca im-chorão 12v1 FE618499_P1 2870 4828 786 82,4 globlastp LNU930_H3 milho_ ain o 11v3 EC613524_P1 2871 4829 786 80,8 globlastp LNU932_H1 milho 10v1 T27560_P1 2872 4830 787 85,1 globlastp LNU938_H1 milho 10v1 DN222454_P1 2873 4831 789 87,6 qloblastp LNU938H2 milho_ ain 11v3PHY7S1027048M_P1 2874 4832 789 83,9 globlastp capim_chorão112v1ISRR187769,1104778 LNU938_H4 2875 4833 789 83,33 glotblastn LNU938_H5 ca im_chorão 12v1 FL787692_P1 2876 4834 789 82,6 globlastp LNU938_H3 soro 12v1 SB05G025910 2877 4835 789 81,1 globlastp LNU938_H6 milho ain o 11v3 PHY7SI027821M P1 2878 4836 789 80,7 globlaslp LNU954_H1 cana_de_a úcar 10v1 BQ533017_P1 2879 4837 791 94,2g!oblasjp LNU954 H2 milho ain o 11v3 PHY7SI022586M_P1 2880 4838 791 83 globlastp LNU954_H3 cenchrus b166 EB653183_P1 2881 4839 791 81 globlastp LNU956_H2 milho 10v1 AW520032_T1 2882 4840 792 89,58 glotblasin LNU956H4 ca lm_chorão b167 FL701157 2883 4841 792 85,12 glotblasin LNU956_H10 ca im_chorão 12v1 FL701157_Pl 2884 4842 792 83,3 globlastp LNU956_H5 milho_ ain o 11 v3 PHY7SI021390M_P1 2885 4843 792 82,7 globlastp LNU968_H1 milho 10v1 161233953 P1 2886 4844 793 80,7 globlastp LNU977_H4 centeio i2v IDRROO1O12,145037 2887 4845 794 97,3 globlastp LNU977_H5 centeio 12v1 DRRO01012,173329 2888 4846 794 96,7 globlastp LNU977_H6 centeio 12v1 DRRO01012,153346 2889 4847 794 96,7 globlastp LNU977_H7 cevada 12v1 BF254361_P1 2890 4848 794 96,3 globlastp LNU977_H3 centeio í2v1 DRRO01012,735828 2891 4849 794 95,89 glotblastn LNU977_H1 too 12v3 BE398977 2892 4850 794 93,7globlastp_ LNU977_H9 brachypodiuml 12v1 IBRADI1G76830_P1 2893 4851 794 88,3 globlastp LNU977_H13 ain o 10v1 EV0454PM012399_T1 2894 4852 794 81,4 glotblastn LNU977_H14 milho ain o 11vá PHY7S1035189M_P1 2895 4853 794 80,7 globlastp LNU977_H15 ca im_chorão 12v1 FL721232_P1 2896 4854 794 80,3 globlastp LNU977_H16 ca im_chorão 12v1 FL901810_T1 2897 4855 794 80,04 glotblastn Tabela 2: São fornecidos polipeptideos e polinucleotídeos homólogos (p.ex., ortólogos) dos genes identificados na Tabela 1 e seus genes clonados, os quais podem aumentar a eficiência no uso do nitrogênio, eficiência no uso de fertilizante, produção, produção de sementes, taxa de crescimento, vigor, biomassa, teor de óleo, produção da fibra, qualidade da fibra, comprimento da fibra, tolerância ao estresse abiótico elou eficiência no uso de água de uma planta. A homo'ogia foi calculada como % de identidade sobre as sequências de alinhamento. As sequências de consultas foram as sequências de polipeptídeos das ID SEQ. N° 496-794 e as sequências de polinucleotídeos das ID SEQ. ND 1-495 e as sequências em questão são sequências de polipeptídeos ou sequências de polinucleotídeos que foram dinamicamente transpostas em todos os seis quadros de leitura identificados no banco de dados com base em identidade maior que 80% com relação às sequências de polipeptídeos da consulta. "Polip." = polipeptídeo; "Polin" - polinucleotídeo; "Algor." = Algoritmo; "globlastp" - homologia global utilizando blastp; "glotblastn" - homologia global utilizando tblastn, "Ham" - homólogo, "Id." = identidade.

[00375] 0 resultado da abordagem genômica funcional descrita aqui é um conjunto de genes com estimativas elevadas de melhoria da eficiência no uso do nitrogênio, eficiência no uso de fertilizante, produção, produção de sementes, taxa de crescimento, vigor, biomassa, teor de óleo, produção da fibra, qualidade da fibra, comprimento da fibra, tolerância ao estresse abiótico e/ou eficiência no uso de água de uma planta, aumentando sua expressão.

[00376] Embora estime-se que cada gene tenha seu próprio impacto, espera-se que a modificação do modo de expressão de mais de um gene ou produto de gene (RNA, polipeptídeo) forneça um efeito aditivo ou sinérgico sobre uma característica desejada (p.ex., eficiência no uso do nitrogênio, eficiência no uso de fertilizante, produção, taxa de crescimento, vigor, biomassa, teor de óleo, tolerância ao estresse abiótico e/ou eficiência no uso de água de uma planta). Ao alterar a expressão de cada gene descrito aqui, o gene sozinho ou o conjunto de genes aumenta a produção global e/ou outros traços agrícolas importantes e, deste modo, espera-se aumentar a produtividade agrícola.

EXEMPLO 3

PRODUÇÃO DE TRANSCRIPTOMA DE CEVADA E ANÁLISE DE CORRELAÇÃO

DE ALTA PRODUTIVIDADE UTILIZANDO MICROARRANJO DE OLIGONUCLEOTÍDEO DE CEVADA 44K

[00377] A fim de produzir uma análise de correlação de alta produtividade, comparando o fenótipo da planta e o nível de expressão do gene, os presentes inventores utilizaram um microarranjo de oligonucleotídeo de cevada, produzido pela Agilent Technologies [chem (ponto) agilent

(ponto) com/Scripts/PDS (ponto) asp?lPage=50879]. C oligonucleotídeo do arranjo representa cerca de 47.500 genes e transcrições de cevada. Para definir as correlações entre os níveis de expressão de RNA e parâmetros relacionados aos componentes de produção ou vigor, várias características de plantas de 25 diferentes acessos de cevada foram analisadas.

Dentre elas, 13 acessos englobando a variação observada foram selecionados para análise de expressão de RNA. A correlação entre os níveis de RNA e os parâmetros caracterizados foi analisada utilizando o teste de correlação de Pearson [davidmlane (ponto) com/hyperstat/A34739 (ponto) html].

Procedimentos Experimentais:

[00378] Tecidos de cevada analisados - Cinco tecidos em diferentes estádios de desenvolvimento [meristema, flor, espigueta, caule e folha] que representam diferentes características da planta foram amostrados e o RNA foi extraído, conforme descrito acima. Cada tipo de tecido de informação de expressão de microarranjo recebeu um ID de Conjunto, conforme resumido na Tabela 3 abaixo.

Tabela 3 Conjuntos de expressão de transcrintoma de cevada Conjunto de Expressão ID de Conjunto Espiga em estágio inicial 1 Espiga em floração 2 Meristema 3 Caule 4 i ateia 3.

[00379] Avaliação dos parâmetros relacionados aos componentes de produção e vigor de Cevada - acessos de cevada em 4 blocos repetitivos (chamados A, B, C e D), cada um contendo 4 plantas por lote foram cultivados em estufa com rede. As plantas foram fenotipadas em uma base diária, seguindo o descritor padrão de cevada (Tabela 4, abaixo). A colheita foi conduzida enquanto 50% das espigas foram secados para evitar liberação espontânea das sementes.

As plantas foram separadas para a parte vegetativa e espigas, delas, 5 espigas foram debulhadas (grãos foram separados das glumas) para análise adicional de grão tal como medição do tamanho, contagem do grão por espigão e produção de grão por espigão. Todo o material foi secado no forno e as sementes foram debulhadas manualmente a partir das espigas antes da medição das características de semente (peso e tamanho) utilizando varredura e análise da imagem. 0 sistema de análise de imagem incluiu um computador pessoal (processador Intel P43.0 GHz) e um programa de domínio público - ImageJ 1.37 (programa de processamento de imagem com base em Java, desenvolvido no Instituto Nacional de Saúde dos Estados Unidos e livremente disponível na internet [rsbweb (ponto) nih (ponto) gov/]. Em seguida, os dados analisados foram salvos como arquivos de texto e processados utilizando o software JMP de análise estatística (Instituto SAS).

Tabela 4 Descritores padrões da cevada Traço Parâmetro Faixa Descrição Hábito de cultivo Pontuação 1-9 Prostrado (1) ou Ereto (9) P (Presença) 1 A Pilosidade das folhas basais Pontuação Ausência (1) ou Presença (2) Pigmentação do caule Pontuação 1-5 Verde (1), Basal a enas ou Metade ou mais (5) Dias para Floração Dias Dias da semeadura para surgimento de arestas Altura do nível do solo para topo dos espigas Altura da planta Centímetro (cm) mais lonas excluindo as arestas Espigas por planta Número Contagem Terminal Comprimento da espiga Centímetro (cm) Contagem Terminal de 5 espigas por planta Grãos por espiga Número Contagem Terminal de 5 espigas por planta Peso seco vegetal Grama Secado no forno por 48 horas a 70°C Peso seco das espigas Grama Secado no forno por 48 horas a 30°C I aveia w.

[00380] Grãos por espiga - No final do experimento (50% das espigas foram secados), todas as espigas dos lotes dentro dos blocos A-D foram coletadas. O número total de grãos das 5 espigas que foram manualmente debulhadas foi contado. O grão médio por espiga foi calculado dividindo o número total do grão pelo número de espigas.

[00381] Tamanho médio do grão (cm) - No final do experimento (50% das espigas foram secados), todas as espigas dos lotes dentro dos blocos A-D foram coletadas.

Os grãos totais de 5 espigas que foram manualmente debulhadas foram digitalizados e as imagens foram analisadas utilizando o sistema de formação de imagem digital. A digitalização do grão foi feita utilizando o digitalizador Brother (modelo DCP- 135), na resolução de 200 dpi e analisada com o software Imagem J. O tamanho médio do grão foi calculado dividindo o tamanho total do grão pelo número total do grão.

[00382] Peso médio do grão (mg) - No final do experimento (50% das espigas foram secados), todas as espigas dos lotes dentro dos blocos A-D foram coletadas. Os grãos totais das 5 espigas que foram manualmente debulhadas foram contados e pesados. O peso médio foi calculado dividindo o peso total pelo número total do grão.

[00383] Produção de grão por espiga (g) - No final do experimento (50% das espigas foram secados), todas as espigas dos lotes dentro dos blocos A-D foram coletadas.

Os grãos totais de 5 espigas que foram manualmente debulhadas foram pesados. A produção de grão foi calculada dividindo o peso total pelo número da espiga.

[00384] Análise do comprimento da espiga - No final do experimento (50% das espigas foram secados), todas as espigas dos lotes dentro dos blocos A-D foram coletadas. As cinco espigas escolhidas por planta foram medidas utilizando fita métrica excluindo as arestas.

[00385] Análise do número de espigas - No final do experimento (50% das espigas foram secados) , todas as espigas dos lotes dentro dos blocos A-D foram coletadas.

As espigas por planta foram contadas.

[00386] Pontuação do hábito de cultivo - No estágio de cultivo 10 (inicialização) , cada uma das plantas foi pontuada para sua natureza de hábito de cultivo. A escala que foi utilizada foi 1 para natureza prostrada até 9 para ereta.

[00387] Pilosidade de folhas basais - No estágio de cultivo 5 (revestimento da folha fortemente ereta; fim de perfilhamento), cada uma das plantas foi pontuada para sua natureza de pilosidade da folha antes da última. A escala que foi utilizada foi 1 para natureza prostrada até 9 para ereta.

[00388] Altura da planta - No estágio da colheita (50% das espigas foram secados), cada uma das plantas foi medida por sua altura utilizando fita métrica. A altura foi medida do nível do solo para o topo da espiga mais longa excluindo as arestas.

[00389] Dias para floração - Cada uma das plantas foi monitorada para data de floração. Dias de floração foram calculados a partir da data da semeadura até a data da floração.

[00390] Pigmentação do caule - No estágio de cultivo 10 (inicialização), cada uma das plantas foi pontuada por sua cor do caule. A escala que foi utilizada foi 1 para verde até 5 para roxo total.

[00391] Peso seco vegetal e produção de espiga - No final do experimento (50% das espigas foram secados), todas as espigas e material vegetal dos lotes dentro dos blocos A-D foram coletados. 0 peso da biomassa e espigas de cada lote foi separado, medido e dividido pelo número de plantas.

[00392] Peso seco = peso total da parte vegetativa acima do solo (excluindo raízes) após secar a 70 °C no forno por 48 horas.

[00393] Produção de espiga por planta = peso total da espiga por planta (g) após secar a 30°C no forno por 48 horas.

[00394] Índice de colheita (para cevada) - o índice de colheita foi calculado utilizando a Fórmula XVIII acima.

Tabela 5 Parâmetros correlacionados à Cevada (vetores) Parâmetro correlacionado com (unidades) ID de Correlação Peso do Grão [miligramas] 1 Tamanho dos Grãos [mm2] 2 Grãos Por espiga número 3 Hábito de cultivo ontua ão 1-9 4 Pilosidade de folhas basais [pontuação 1.2 5 Altura da planta [cm] 6 Produção de sementes de 5 espigas [grama] 7 Comprimento da espiga [cml 8 Espiga por planta número 9 Pi menta ão do caule [pontuação 1-51 10 Peso seco vegetal rama 11 Dias para floração [dias] 12 Tabela 5.

Resultados Experimentais:

[00395] 13 diferentes acessos de cevada foram cultivados e caracterizados com relação a 13 parâmetros, conforme descrito acima. A média para cada um dos parâmetros medidos foi calculada utilizando o software JMP e os valores foram resumidos nas Tabelas 6 e 7 abaixo. A análise de correlação subsequente entre os vários conjuntos de expressão de transcriptoma (Tabela 3) e os parâmetros médios foi conduzida. Em seguida, os resultados foram integrados à base de dados.

Tabela 6 Parâmetros medidos de IDs de correlação em acessos de cevada Acesso/Parámeiro 1 2 3 4 5 6 Linha-1 35,046 0,265 20,229 2,600 1,533 134,267 Linha-2 28,065 0,229 17,983 2,000 1,333 130,500 Linha-3 28,761 0,244 17,267 1,923 1,692 138,769 Linha- 17,869 0,166 17,733 3,167 1,083 114,583 Linha-5 41,216 0,295 14,467 4,333 1,417 127,750 Linha-6 29,734 0,275 16,783 2,692 1,692 129,385 Linha-7 25,224 0,220 12,120 3,600 1,300 103,889 Linha-8 34,994 0,278 14,067 3,500 1,188 121,625 Linha-9 20,580 0,187 21,540 3,000 1,000 126,800 Linha-10 27,501 0,224 12,100 3,667 1,167 99,833 Linha-11 37,126 0,273 13,400 2,467 1,600 121,400 Linha-12 29,564 0,271 15,283 3,500 1,083 118,417 Linha-13 19,583 0,179 17,067 3,000 1,167 117,167 I abeia b. Sao fornecidos os valores para cada um dos parametros medidos em acessos de Cevada, de acordo com as Identilicações de correlação (IDs de Correlação da Tabela 5 acima).

Tabela 7 Acesso/Parãmetro 7 8 9 10 11 12 Linha-1 3,559 12,036 48,846 1,133 78,871 62,400 Linha-2 2,538 10,932 48,273 2,500 66,141 64,083 Linha-3 2,583 11,825 37,417 1,692 68,491 65,154 Linha-4 1,574 9,900 61,917 1,750 53,389 58,917 Linha-5 3,030 11,682 33,273 2,333 68,300 63,000 Linha-6 2,517 11,532 41,692 2,308 74,173 70,538 Linha-7 1,549 8,863 40,000 1,700 35,354 52,800 Linha-8 2,624 11,216 40,625 2,188 58,334 60,875 Linha-9 2,300 11,108 62,000 2,300 62,230 58,100 Linha-10 1,678 8,583 49,333 1,833 38,322 53,000 Linha-11 2,677 10,179 50,600 3,067 68,306 60,400

Acesso/Parâmetro 7 8 9 10 11 12 Linha-12 2,353 10,505 43,091 1,583 56,148 64,583 Linha-13 1,673 9,803 51,400 2,167 42,682 56,000 I abeia I. 5ão torneados os valores para cada um dos parãmetros medidos em acessos de Cevada, de acordo com as identificações de correlação (IDs de Correlação da Tabela 5 acima).

Tabela 8 Correlação entre o nível de expressão de polinucleotídeos selecionados da invenção e seus homólogos em estágios de desenvolvimento ou tecidos específicos e o desempenho fenotípico em acessos de Cevada Conj. Nome do Con j' ID do Conj. Nome do ID do Conj. R Valor P Ex R Valor P Ex Gene de Cor. Gene de Cor. LNU750 0,80 5,15E-03 2 9 LNU756 0,70 1,59E-02 3 2 LNU756 0,73 1,05E-02 3 1 LNU756 0,74 8,57E-03 3 5 LNU757 0,75 7,80E-03 1 7 LNU757 0,74 8,71E-03 1 11 LNU761 0,74 9,03E-03 3 1 LNU761 072 1,20E-02 3 6 LNU761 0,85 9,78E-04 3 8 LNU761 0,88 4,09E-04 3 7 LNU761 0,76 6,14E-03 3 11 LNU766 0,73 1,10E-02 1 5 LNU767 0,82 2,06E-03 3 2 LNU767 0,87 5,84E-04 3 1 LNU767 0,77 6,08E-03 3 8 LNU767 0,94 1,99E-05 3 7 LNU767 0,85 9,09E-04 3 11 LNU767 0,76 6,33E-03 3 12 LNU768 0,79 3,98E-03 1 9 LNU768 0,73 1,74E-02 2 4 LNU768 0,75 7,84E-03 3 9 LNU770 0,72 1,20E-02 1 9 LNU771 0,70 2,32E-02 2 5 LNU771 0,78 4,51E-03 3 2 LNU771 0,74 9,02E-03 3 1 LNU773 0,75 7,74E-03 3 9 LNU774 0,81 2,78E-03 3 2 LNU774 0,87 4,25E-04 3 1 LNU774 0,71 1,36E-02 3 7 LNU780 0,70 1,56E-02 1 2 LNU780 0,77 6,07E-03 1 1 LNU780 0,86 1,40E-03 2 4 LNU782 0,74 8,54E-03 3 8 LNU785 0,70 1,57E-02 1 8 LNUB34 0,75 7,95E-03 3 1 LNU839 0,75 7,95E-03 3 1 Tabela 8. São fornecidas as correlações (R) e os valores-p entre os níveis de expressão de genes selecionados de algumas aplicações da invenção em vários estágios de desenvolvimento ou tecidos (Conjuntos de expressão) e o desempenho fenotípico em vários componentes de vigor, produção (produção de semente, produção de óleo, teor de óleo), biomassa elou taxa de crescimento [Correlação (Cor.), Vector (Vet.), Expressão {Exp.)] Vetor de Corr. = vetor de correlação especificado na Tabela 5; Conj. de Exp. _ conjunto de expressão especificado na Tabela 3.

EXEMPLO 4

PRODUÇÃO DE TRANSCRIPTOMA DE CEVADA E ANÁLISE DE CORRELAÇÃO

DE ALTA PRODUTIVIDADE UTILIZANDO MICROARRANJO DE OLIGONUCLEOTÍDEO DE CEVADA 60K

[00396] A fim de produzir uma análise de correlação de alta produtividade, comparando o fenótipo da planta e o nível de expressão do gene, os presentes inventores utilizaram um microarranjo de oligonucleotídeo de Cevada, produzido pela Agilent Technologies [chem. (ponto) agilent

(ponto) com/Scripts/PDS (ponto) asp?lPage=50879]. 0 oligonucleotídeo do arranjo representa cerca de 60.000 genes e transcrições de Cevada. Para definir as correlações entre os níveis da expressão de RNA e os parâmetros relacionados à produção ou vigor, várias características de planta de 15 diferentes acessos de Cevada foram analisadas. Dentre elas, acessos englobando a variação observada foram selecionados para a análise de expressão de RNA. A correlação entre os níveis de RNA e os parâmetros caracterizados foi analisando utilizando o teste de correlação Pearson [davidmlane (ponto) com/hyperstat/A34739 (ponto) html].

Procedimentos Experimentais:

[00397] Tecidos de cevada analisados - Tecidos em diferentes estágios de desenvolvimento, representando diferentes características da planta, foram amostrados e o RNA foi extraído, conforme descrito acima. Cada tipo de tecido de informação de expressão de microarranjo recebeu um ID de Conjunto, conforme resumido nas Tabelas 9- 11 abaixo.

Tabela 9 Conjuntos de expressão de transcriptoma de Cevada sob condições normais e de baixo N (no estácio vegetal) Conjunto de Expressão ID de Conjunto Raiz adventícia1T31Baixo N 1 Raiz adventícia/73/Normal 2 FoIha1T31Baixo N 3 FolhaIi3fNormal 4 Ponta da raizlT31Baixo N 5 Ponta da raiz/T31Normal 6 Tabela 9. São fornecidos os conjuntos de expressão de transcnptoma de Cevada sob condições normais e de baixo N (baixo nitrogênio) (no estágio vegetal).

Tabela 10 Conjuntos de expressão de transcriptoma de Cevada sob condições normais e de baixo N (no estágio reprodutivo) ID de Conjunto Conjunto de Expressão 1 Reprodutivo/espiga em estágio inicial/Baixo N 2 Reprodutivo/espiga em estágio inicial/Normal 3 Reprodutivo/folha/Baixo N 4 Reprodutivo/folha/Normal: 5 Reprodutivolcaule/Baixo N 6 Reprodutivolcaule/Normal 1 abela 1 U. São fornecidos os conjuntos de expressão de transcriptoma de Cevada sob condições normais e de baixo N (no estágio reprodutivo).

Tabela 11 Conjuntos de expressão de transcriptoma de Cevada sob condições de seca (no estáaio vegetal) ID de Conjunto Conjunto de Expressão 1 Seca/Espiga em estágio inicial/reprodutivo 2 Seca/folha/reprodutivo 3 Seca/ folhalvegetal 4 Secalmeristemas/vegetal 5 Seca/ponta da raiz/vegetal 6 Seca/ ponta da raizívegetal I abeia ii. Sao tomecidos os conjuntos de expressão de transcnptoma de Cevada sob condições de seca (no estágio vegetal).

[00398] Avaliação dos parâmetros relacionados aos componentes de produção e vigor de Cevada - 15 acessos de Cevada em 5 blocos repetitivos, cada um contendo plantas por lote, foram cultivadas na estufa de rede. Três tratamentos diferentes foram aplicados: as plantas foram fertilizadas e regadas regularmente durante o crescimento da planta até a colheita (conforme recomendado para o crescimento comercial, as plantas foram irrigadas de 2 a 3 vezes por semana, e a fertilização foi dada nos primeiros 1,5 meses do período de crescimento) ou com baixo Nitrogênio (80% por cento menos Nitrogénio) ou sob estresse devido à seca (ciclos de seca e re-irrigação foram conduzidos ao longo de todo o experimento, total de 40% menos de água dadas no tratamento a seco) . As plantas foram fenotipadas diariamente de acordo com parâmetros listados na Tabela 12 abaixo. A colheita foi realizada enquanto todas as espigas eram secas. Todo o material foi seco em estufa e as sementes foram debulhadas manualmente a partir das espigas antes da medição das características da semente (peso e tamanho) utilizando varredura e análise de imagem. 0 sistema de análise de imagem inclui um computador pessoal (processador Intel P4 3.0 Ghz) e um programa de domínio público - ImageJ 1.37 (Java com base no programa de processamento de imagem, que foi desenvolvido nos Institutos Nacionais de Saúde Dos Estados Unidos e livremente disponível na internet [rsbweb (ponto) nih (ponto) gov/]. Em seguida, dados de análise foram salvos para arquivos de textos e processados utilizando o software de análise estatística JMP (instituto SAS).

[00399] Produção de Grão (g.) - No final do experimento, todas as espigas dos lotes foram coletadas.

0 total de grãos a partir de todas as espigas que foram debulhadas manualmente foi pesado. A produção de grão foi calculada por lote ou por planta.

[00400] Análise do comprimento e largura da espiga - No final do experimento, o comprimento e largura das cinco espigas escolhidas por planta foram medida utilizando fita métrica, excluindo as aristas.

[00401] Análise do número de espigas - As espigas por planta foram contadas.

[00402] Altura da planta - Cada uma das plantas foi medida quando a sua altura, utilizando fita métrica. A altura foi medida a partir do nível do solo até o topo mais distante da espiga excluindo as aristas em dois pontos de tempo no crescimento Vegetal (30 dias após semeadura) e na colheita.

[00403] Peso da espiga - 0 peso da biomassa e espigas de cada unidade foi separado, medido e divido pelo número de plantas.

[00404] Peso seco = peso total da parte vegetal acima da terra (excluindo as raízes) após secagem a 70°C na estufa por 48 horas em dois pontos de tempo no crescimento Vegetal (30 dias após semeadura) e na colheita.

[00405] Espigueta por espiga = número de espiguetas por espiga foi contado.

[00406] Proporção Raiz/Broto - A proporção Raiz/Broto é calculada utilizando a Fórmula XXII acima.

[00407] N° Total de Perfilhos - todos os perfilhes foram contados por unidade em dois pontos de tempo no crescimento Vegetal (30 dias após semeadura) e na colheita.

[00408] Porcentagem de perfilhos reprodutivos - o número de perfilhes reprodutivos excluindo uma espiga na colheita foi divido pelo número total de perfilhes.

[00409] SPAD - 0 teor de clorofila foi determinado utilizando um medidor de clorofila Minolta SPAD 502 e a medição foi realizada no momento da floração. As leituras de medição de SPAD foram feitas em folha nova totalmente desenvolvida. Três medições por folha foram tiradas por lote.

[00410] FW da raiz (g.), comprimento da raiz (cm) e N° de raízes laterais - 3 plantas por unidade foram selecionadas para medição do peso da raiz, comprimento da raiz e para contagem do número de raízes laterais formadas.

[00411] FW do Broto (peso fresco) - peso de 3 plantas por vaso foi registrado em diferentes pontos de tempo.

[00412] Área Média de Grão (cm2) - No final do período de crescimento, os grãos foram separados da espiga. Uma amostra de -200 grãos foi pesada, fotografada e as imagens foram processadas utilizando o sistema de processamento de imagem descrito abaixo. A área de grão foi medida a partir daquelas imagens e foi dividida pelo número de grãos.

[00413] Comprimento e Largura Média do Grão (cm) - No final do período de crescimento, os grãos foram separados da espiga. Uma amostra de -200 grãos foi pesada, fotOgrafada e as imagens foram processadas utilizando o sistema de processamento de imagem descrito abaixo. A soma do comprimento e largura dos grãos (eixo mais longo) foi medida a partir daquelas imagens e foi dividida pelo número de grãos.

[00414] Perímetro Médio do Grão (cm) - No final do período de crescimento, os grãos foram separados da espiga. Uma amostra de -200 grãos foi pesada, fotOgrafada e as imagens foram processadas utilizando o sistema de processamento de imagem descrito abaixo. A soma do perímetro do grão foi medida a partir daquelas imagens e foi dividida pelo número de grãos.

[00415] Data de descrição - o dia no qual o estágio de inicialização foi observado foi registrado e o número de dias a partir da semeadura até a descrição foi calculado.

[00416] Teor relativo de água - o peso fresco (FWD fresh weight) de três folhas de três plantas de cada um dos diferentes IDs das sementes foi registrado de imediato; em seguida, as folhas foram embebidas por 8 horas em água destilada em temperatura ambiente no escuro e o peso túrgido (TWiturgid weight) foi registrado. O peso seco total (DWjdry weight) foi registrado após secagem das folhas a 60°C a um peso constante. 0 teor relativo da água (RWClrelative water content) foi calculado de acordo com a Fórmula I acima.

[00417] Índice de Colheita (para cevada) - 0 índice de colheita foi calculado utilizando a Fórmula XVIII acima.

[00418] Taxa de crescimento relativo: as taxas de crescimento relativo (RGR 1 relative growth rate) da Altura da Planta (Fórmula III acima), SPAD (Fórmula IV acima) e Número de perfilhos (Fórmula V acima) foram calculadas utilizando as Fórmulas indicadas.

[00419] Proporção Seca/Normal: Representa a proporção para o parâmetro específico dos resultados de condição de Seca divididos pelos resultados das condições Normais (manutenção do fenótipo sob Seca em comparação às condições normais).

Tabela 12 Parâmetros correlacionados à Cevada (vetores) sob condições normais e de baixo N (no estágio vegetal) Parâmetros correlacionados com ID de Correlação Raízes laterais por planta em TP3 [número] Normal 1

Parâmetros correlacionados com ID de Correlação Area Fali ar [cm2] 2 Número de Folhas - TP4 - Baixo N [número] 3 Comprimento máximo da folha em TP4 [mm] Normal 4 Largura máxima da folha em TP4 (mm] Normal 5 Comprimento máximo da folha em TP4 [mm] Baixo N 6 Largura máxima da folha em TP4 [mm] Baixo N 7 Raízes laterais por planta em TP3 [número] Baixo N 8 Número de Perfilhas - Baixo N -TP2 [número] 9 Número de Folhas [número] 10 Número de Sementes [número] 11 Número de Espigas [número] 12 Número de Perfilhos [número] 13 Altura da Planta (cm) - Normal 14 Altura da Planta (cm) - Baixo N 15 Altura da Planta (cm) - Baixo N - TP2 16 FW da raiz por planta no estágio vegetal [g.] Normal 17 Comprimento da raiz por planta no estágio vegetal [cm] Normal 18 FW da raiz por planta no estágio vegetal [g.] Baixo N 19 Comprimento da raiz por planta no estágio vegetal [cm] Baixo N 20 Nível de clorofila no estágio vegetal [SPAD] Normal 21 Nível de clorofila no estágio vegetal [SPAD] Baixo N 22 Produção de Sementes [g.] 23 Número de Sementes (por lote) - Baixo N [número] 24 Produção de Sementes [g.] -Baixo N 25 Produção de Sementes [g.] -Normal 26 FW do Broto por planta no estágio vegetal [g.] Normal 27 Comprimento da espiga [cm] Normal 28 Largura da espiga [mm] Normal 29 Peso total da espiga (por lote) - normal [g.] 30 Comprimento da espiga (cm) - Baixo N 31 Largura da espiga (cm) - Baixo N 32 Peso total da espiga (por lote) - Baixo N [g.] 33 Total de Perfilhas :número] 34 Area Total Foliar (mm2) - TP4 - Baixo N 35 N° Total de Espigas por lote - Baixo N [número] 36 N° Total de Perfilhas por lote - Baixo N [número{ 37 FW do Broto [g.] - Baixo N -TP2 38 Tabela 12. São fornecidos os parâmetros correlacionados à Cevada. "TP [time point]" = ponto no tempo; "DW° = peso seco; "FW peso fresco; "Baixo N" = Baixo nitrogénio.

Tabela 13 Parâmetros correlacionados à Cevada (vetores) sob condições armais e de baixo N (no estágio reprodutivo) ID de Correlação Parâmetros correlacionados com 1 Perimetro do Grão [mm]

-. *.-w-.. -i . . t.w .fl%flth.-

ID de Correlação Parâmetros correlacionados com 2 Area do Grão [mm] 3 Comprimento do Grão [mm] 4 Largura do Grão [mm] 5 DW dos Grãos 1 DW dos Brotos 6 Grãos por lote [número] 7 Peso dos grãos por planta [g.] 8 Peso dos grãos por lote [g.] 9 Altura da Planta [cm] 10 OW das Raízes [g.] 11 Número de filas [número] 12 FW das Espigas (Colheita) [g.] 13 N° de espigas [número] 14 Perfilhamento (Colheita) [número] 15 DW Vegetal (Colheita) [g.] 16 Porcentagem de perfilhos reprodutivos [porcentagem] 17 Proporção broto/raiz Tabela 13. São fornecidos os parâmetros correlacionados à Cevada sob condições normais e de baixo N (no estágio reprodutivo). "TP" = ponto no tempo; "DW" = peso seco; "FW" = peso fresco; °Baixo N" = Baixo nitrogênio; °Teor relativo de água [porcentagem], Proporção Seca/Normal — manutenção do fenótipo sob seca em comparação com as condições normais.

Tabela 14 Parâmetros correlacionados à Cevada (vetores) sob condições de seca (no estágio vegetal) ID de Correlação Parâmetros correlacionados com 1 Nivel de clorofila no estágio vegetal [SPAD] Seca 2 DW do broto na colheita [g.] 3 DW do broto na colheita por planta [g.] Seca 4 DW do broto por planta na colheita [g.] Seca 5 Grãos por planta [número] Seca 6 Produção de grãos por planta [g.] Seca 7 Índice de colheita 8 Data de florescimento [dias] Seca 9 RGR por altura da planta Seca 10 Taxa de crescimento relativo do Números de Perfilhos 11 Altura da planta por lote na colheita [cm] Seca 12 RBiH/BiH 13 Teor de água relativo vegetal {porcentagem] Seca 14 DW da raiz por planta no estágio vegetal [g.] Seca 15 FW da raiz por planta no estágio vegetal [g.] Seca 16 Comprimento da raiz por planta vegetal [cm] Seca 17 RGR por níveis de clorofila Seca 18 Comprimento da espiga Ecm] Seca 19 Espigas por planta [número] Seca 20 Produção de espigas por planta [g.] Seca 21 Largura da espiga [mm] Seca 22 Perfilhos por planta na colheita [número] Seca 23 Raízes laterais por planta vegetal [número] Seca Tabela 14. São fornecidos os parâmetros correlacionados à cevada sob condições de seca (no estágio vegetal). "RBfH/BiH" proporção raiz-broto.

Resultados experimentais:

[00420] 15 acessos diferentes de Cevada foram cultivados e caracterizados com relação à diferentes parâmetros, conforme descrito acima. As Tabelas 12-14 descrevem os parâmetros correlacionados à Cevada. A média para cada um dos parâmetros medidos foi calculada utilizando o software JMP e os valores estão resumidos nas Tabelas 15-24 abaixo. A análise de correlação subsequente entre os vários conjuntos de transcriptoma e os parâmetros médios foi conduzida. A seguir, os resultados foram integrados à base de dados.

Tabela 15 Parâmetros medidos de IDs de correlação em acessos de Cevada sob condicões de baixo N (no estágio veatal) ID de Cor,! 3 6 7 8 9 15 16 19 20 22 Linha Linha-1 8,0 102,9 5,3 5,0 0,0 41,0 16,3 0,4 24,7 24,0 Linha-2 8,0 107,8 5,2 6,0 0,0 82,0 18,8 0,2 21,7 23,3 Linha-3 7,5 111,6 5,1 4,3 0,0 61,4 17,3 0,1 22,0 26,5 Linhal 8,5 142,4 5,3 6,0 0,0 59,4 26,0 0,4 21,7 23,9 Linha-5 10,0 152,4 5,2 6,3 0,0 65,8 22,5 0,9 22,2 26,6 Linha-6 11,5 149,3 5,3 6,0 0,0 47,8 18,2 0,5 23,0 23,2 Linha-7 8,6 124,1 5,3 6,7 0,0 53,8 19,7 0,4 30,5 25,4 Linha-8 6,3 95,0 5,1 4,7 0,0 56,4 19,8 0,3 22,8 24,2 Linha-9 7,5 124,1 5,2 5,7 0,0 81,8 19,2 0,3 23,8 25,0 Linha-10 10,0 135,2 5,1 7,3 0,0 44,6 19,2 0,6 24,5 26,1 Tabela 15. São fornecidos os valores de cada um dos parâmetros (conforme descrito acima) medidos em acessos de Cevada (linha) sob condições de baixo N. As condições de cultivo são especificadas na seção de procedimento experimental.

Tabela 16 Parâmetros medidos de IDs de correlação em acessos adicionais de Cevada sob condicões de baixo N (no estágio veatal) ID de Cor.! 24 25 26 31 32 33 35 36 37 38 Linha Linha-1 230,2 9,8 46,4 15,2 8,0 13,7 39,4 12,2 16,2 0,4 Linha-2 164,6 7,3 19,8 19,6 8,1 13,4 46,3 9,0 14,6 0,4 Linha-3 88,3 3,3 10,8 16,3 9,4 9,2 51,5 11,6 16,0 0,3 Linha-4 133,6 5,1 22,6 19,3 4,9 11,6 57,1 25,0 20,8 0,6 Linha-5 106,0 6,0 30,3 90,2 9,6 11,3 67,8 7,8 12,5 0,8 Linha-6 222,6 9,7 54,1 16,4 7,2 15,1 64,2 14,5 18,8 0,5 Linha-7 219,2 7,4 37,0 20,4 7,1 12,2 52,4 15,0 21,2 0,5 Linha-8 143,5 5,8 42,0 18,8 8,5 11,0 46,2 7,0 11,0 0,4 Linha-9 201,8 7,8 35,4 18,8 10,0 12,2 68,0 5,4 6,8 0,5 Linha-10 125,0 6,3 38,3 16,6 9,4 10,6 57,9 8,4 14,0 0,6

Tabela 16. São fornecidos os valores de cada um dos parâmetros (conforme descrito acima) medidos em acessos de Cevada (linha) sob condições de baixo N. As condições de cultivo são especificadas na seção de procedimento experimental.

Tabela 17 Parâmetros medidos de IDs de correlação em acessos de Cevada sob condições normais (no estágio veatal) ID de Cori 1 2 4 5 10 11 12 13 14 14 Linha Linha-1 7,0 294,0 502,0 5,8 24,2 1090,0 41,5 2,0 64,7 64,7 Linha-2 8,7 199,0 348,0 5,5 18,2 510,0 32,0 2,0 84,0 84,0 Linha-3 8,3 273,0 499,0 5,8 22,7 242,0 36,0 1,0 67,4 67,4 Linha 4 9,7 276,0 594,0 6,0 25,5 582,0 71,4 2,3 82,0 82,0 Linha-5 10,7 313,0 535,0 4,6 23,2 621,0 34,2 2,3 72,0 72,0 Linha-6 9,7 309,0 551,0 5,3 28,3 1070,0 45,6 3,3 56,6 56,6 Linha-7 9,7 259,0 479,0 5,8 22,2 903,0 49,8 2,3 65,8 65,8 Linha-8 8,7 291,0 399,0 5,4 19,0 950,0 28,0 1,3 62,8 62,8 Linha-9 10,0 299,0 384,0 5,8 17,3 984,0 19,3 1,3 91,6 91,6 Linha-10 9,7 296,0 470,0 6,0 22,0 768,0 38,0 1,7 66,2 66,2 1 abela 11. São tornecidos os valores de cada um dos parámetros (contorne descrito acima) medidos em acessos de Cevada (linha) sob condições normais, As condições de cultivo são especificadas na seção de procedimento experimental.

Tabela 18 Parâmetros medidos de IDs de correlação em acessos adicionais de Cevada sob condicões normais (no estácrio veotal) D de Cor.! 17 18 21 23 27 28 29 30 34 Linha Linha-1 0,27 21,30 39,10 46,40 2,17 16,50 9,54 69,40 46,70 Linha-2 0,27 15,00 41,40 19,80 1,90 19,20 9,05 39,40 41,60 Linha-3 0,25 21,80 35,20 10,80 1,25 18,30 8,25 34,90 40,00 Linha-4 0,35 20,30 33,70 22,60 3,00 20,40 6,55 50,30 48,80 Linha-5 0,62 27,20 34,20 30,30 15,60 17,20 10,50 60,80 34,60 Linha-6 0,27 16,00 42,80 54,10 3,02 19,10 8,83 79,10 48,60 Linha-7 0,35 24,00 37,00 37,00 2,58 20,30 7,38 62,70 49,20 Linha-8 0,32 13,50 36,90 42,00 1,75 21,70 10,40 60,00 29,00 Linha-9 0,23 21,50 35,00 35,40 2,18 16,50 10,20 55,90 27,50 Linha-10 0,27 15,20 36,80 38,30 1,82 16,10 10,30 59,70 38,80 Tabela 18. São fornecidos os valores de cada um dos parâmetros (conforme descrito acima) medidos em acessos de Cevada (linha) sob condições normais. As condições de cultivo são especificadas na seção de procedimento experimental.

Tabela 19 Parâmetros medidos de IDs de correlação em acessos de Cevada sob condicões de baixo N (no estágio reprodutivo) lD de Cor./ 1 2 3 4 5 6 7 8 9 Linha Linha-1 2,24 0,25 0,89 0,35 0,40 683,40 6,65 33,24 76,40 Linha-2 2,24 0,24 0,87 0,35 0,16 510,50 3,96 19,81 84,00 Linha-3 2,18 0,24 0,86 0,35 1,01 1093,50 9,27 46,37 64,67 Linha-4 2,05 0,23 0,80 0,37 0,79 767,60 7,65 38,25 66,20 Linha-5 2,08 0,24 0,83 0,37 0,41 621,00 6,06 30,30 72,00 Linha-6 2,03 0,25 0,78 0,41 0,99 1069,00 10,83 54,13 56,60

ID de Cor] 1 2 3 4 5 6 7 8 9 Linha Linha-7 2,25 0,24 0,90 0,35 0,67 987,75 7,94 39,69 68,00 Linha-8 1,88 0,22 0,72 0,39 0,61 903,20 7,40 36,98 65,80 Linha-9 2,09 0,23 0,82 0,36 0,28 581,80 4,52 22,58 82,00 Linha-10 2,03 0,22 0,79 0,36 1,04 904,40 8,41 39,68 62,80 Linha-11 2,02 0,24 0,80 0,37 0,12 242,40 2,00 10,84 67,40 Linha-12 1,98 0,21 0,80 0,34 0,86 928,40 8,05 40,26 76,20 Linha-13 1,69 0,18 0,65 0,35 0,58 984,20 7,08 35,37 91,60 Linha-14 1,98 0,19 0,82 0,29 0,05 157,67 0,75 3,73 44,00 Linha-15 1,89 0,17 0,77 0,29 0,08 263,25 1,14 5,68 52,75 1 abela 19. são tomecidos os valores de cada um dos parâmetros (conforme descrito acima) medidos em acessos de Cevada (linha) sob condições de baixo N (no estágio reprodutivo). As condições de cultivo são especificadas na seção de procedimento experimental.

Tabela 20 Parâmetros medidos de IDs de correlação em acessos adicionais de Cevada sob condições de baixo N (no estágio reprodutivo) ID de Cor./ 10 11 12 13 14 15 16 17 Linha Linha-1 118,30 6,00 69,84 38,60 44,25 89,20 82,30 1,48 Linha-2 150,68 6,00 39,86 32,00 41,60 99,65 77,75 0,64 Linha-3 86,28 6,00 69,40 41,50 46,67 45,79 86,69 0,84 Linha-4 85,19 6,00 59,72 38,00 38,80 49,39 94,23 0,82 Linha-5 120,31 6,00 60,83 34,20 34,60 74,32 89,74 1,15 Linha-6 90,70 2,80 79,12 45,60 48,60 55,11 93,73 0,69 Linha-7 40,58 6,00 63,50 30,00 32,40 47,29 89,49 1,26 Linha-8 90,51 2,00 62,74 49,80 55,20 60,32 90,28 0,72 Linha-9 92,59 2,00 50,30 71,40 50,60 88,01 91,21 1,17 Linha-10 63,95 5,20 59,95 28,00 29,00 38,89 92,50 0,71 Linha-11 286,63 6,00 34,92 36,00 40,00 97,71 91,73 0,38 Linha-12 95,79 6,00 60,08 27,60 28,50 48,33 85,31 0,51 Linha-13 34,04 6,00 55,88 23,60 27,50 62,52 2,16 Linha-14 121,27 4,67 16,93 54,67 26,00 57,97 0,67 Linha-15 206,75 4,00 21,70 48,00 72,78 0,40 i meia Lu. Sao torneados os valores de cada um dos parametros (conforme descrito acima) medidos em acessos de cevada (linha) sob condições de baixo N (no estágio reprodutivo). As condições de cultivo são especificadas na seção de procedimento experimental.

Tabela 21 Parâmetros medidos de IDs de correlação em acessos de Cevada sob condições normais (no estágio reprodutivo) ID de CorJ 1 2 3 4 5 6 7 8 9 Linha Linha-1 2,29 0,25 0,90 0,35 0,39 153,20 1,34 6,68 75,20 Linha-2 2,33 0,25 0,92 0,35 0,42 164,60 1,46 7,31 82,00 Linha-3 2,28 0,26 0,93 0,35 1,25 230,20 1,95 9,76 41,00 Linha-4 2,08 0,24 0,82 0,36 0,69 125,00 1,26 6,29 44,60 Linha-5 2,13 0,25 0,86 0,37 0,43 100,00 1,13 5,67 65,80 Linha-6 1,96 0,23 0,76 0,38 0,87 222,60 1,95 9,74 47,80 Linha-7 2,09 0,23 0,83 0,35 0,77 159,40 1,28 6,40 60,60 Linha-8 1,88 0,21 0,74 0,36 0,53 219,20 1,47 7,35 53,80 Linha-9 2,19 0,24 0,86 0,35 0,34 133,60 0,98 5,06 59,40 Linha-10 1,88 0,20 0,73 0,35 0,87 134,40 1,16 5,43 56,40 Linha-11 2,03 0,22 0,81 0,35 0,15 88,25 0,92 4,62 61,40 Linha-12 2,11 0,23 0,85 0,35 0,58 174,25 1,34 6,67 65,60 Linha-13 1,77 0,19 0,68 0,36 0,76 201,80 1,57 7,83 81,80 Linha-14 2,00 0,19 0,81 0,30 0,05 86,67 0,29 1,44 69,00

1D de Cor] 1 2 3 4 5 6 7 8 9 Linha Linha-15 1,90 0,17 0,79 0,28 I 0,07 61,60 0,22 1,12 57,40 Tabela 21, São fornecidos os valores de cada um dos parâmetros (conforme descrito acima) medidos em acessos de Cevada (linha) sob condições normais (no estágio reprodutivo). As condições de cultivo são especificadas na seção de procedimento experimental.

Tabela 22 Parâmetros medidos de IDs de correlação em acessos adicionais de Cevada sob condicões normais (no estáaio reprodutivo) ID de Cor.! 10 11 12 13 14 15 16 17 Linha Linha-1 39,91 6,00 11,40 10,80 16,00 17,42 68,69 0,69 Linha-2 26,24 6,00 13,44 9,00 14,60 17,76 61,85 1,08 Linha-3 17,31 6,00 13,74 12,20 16,20 8,25 76,94 0,77 Linha-4 32,91 6,00 10,62 8,40 14,00 7,28 59,63 0,38 Linha-5 33,87 6,00 11,34 7,80 12,50 13,25 65,63 0,83 Linha-6 83,84 2,00 15,06 14,50 18,80 11,32 79,84 0,42 Linha-7 29,65 6,00 11,64 8,40 11,60 8,95 73,85 0,29 Linha-8 37,21 2,00 12,18 15,00 21,20 14,18 71,01 0,57 Linha-9 44,38 2,00 11,64 25,00 23,50 15,68 95,83 0,60 Linha-10 14,46 5,20 8,76 7,00 11,00 6,42 64,87 0,55 Linha-11 41,54 6,00 9,15 11,60 16,00 55,92 68,75 2,88 Linha-12 23,75 6,00 12,42 7,60 10,75 11,54 74,24 1,36 Linha-13 20,87 6,00 12,18 5,40 6,75 10,88 81,40 0,89 Linha-14 49,69 2,00 5,68 16,40 35,00 58,92 37,14 2,49 Linha-15 54,02 2,00 5,04 12,00 17,05 0,40 Tabela 22. São fornecidos os valores de cada um dos parâmetros (conforme descrito acima) medidos em acessos de Cevada (linha) sob condições normais (no estágio reprodutivo). As condições de cultivo são especificadas na seção de procedimento experimental.

Tabela 23 Parâmetros adicionais medidos de IDs de correlação em acessos de Cevada sob condições de Seca ID de Cor] 1 2 3 4 5 6 7 8 9 10 11 Linha Linha-1 41,33 6,15 0,22 1,90 170,00 5,55 0,47 75,00 0,27 0,07 46,00 Linha-2 33,57 5,05 0,21 1,52 267,50 9,80 0,66 71,00 0,86 0,10 52,80 Linha-3 36,57 3,20 1,17 111,00 3,55 0,53 65,00 0,73 0,06 35,00 Linha-4 40,50 3,28 1,95 205,33 7,20 0,69 0,88 0,07 38,00 Linha-5 45,07 4,76 1,90 153,60 5,28 0,53 66,75 0,40 0,16 45,20 Linha-6 39,73 3,55 0,17 1,22 252,50 7,75 0,69 90,00 0,94 0,06 48,00 Linha-7 38,33 4,52 1,75 288,40 9,92 0,69 90,00 0,70 0,10 37,67 Linha-8 36,17 3,38 1,58 274,50 10,25 0,75 0,71 0,05 41,20 Linha-9 42,13 5,67 0,25 1,88 348,50 8,50 0,60 90,00 0,77 0,10 40,80 Linha-10 31,77 3,31 1,73 358,00 14,03 0,81 0,80 0,06 49,86 Linha-11 33,47 2,65 1,00 521,39 17,52 0,87 0,92 0,06 43,00 Linha-12 42,37 5,12 0,13 0,90 71,50 2,05 0,29 90,00 0,39 0,18 47,40 Linha-13 42,27 6,86 0,19 0,90 160,13 5,38 0,44 81,60 0,88 0,15 64,80 Linha-14 36,77 3,11 0,22 1,43 376,67 11,00 0,78 90,00 -0,13 0,02 52,60 Linha-15 40,63 3,74 0,83 105,00 2,56 0,41 0,20 0,44 32,00 Tabela 23. São fornecidos os valores de cada um dos parâmetros (conforme descrito acima) medidos em acessos de Cevada (linha) sob condições de cuitivo de seca. As condições de cultivo são especificadas na seção de procedimento experimental.

Tabela 24 Parâmetros adicionais medidos de IDs de correlação em acessos adicionais de Cevada sob condições de Seca

ID de Cor.! 12 13 14 15 16 17 18 19 20 21 22 22 23 Linha Linha-1 0,01 80,60 77,52 2,07 21,67 0,09 16,70 4,20 17,72 8,64 11,68 11,68 8,33 Linha-2 0,01 53,40 60,19 1,48 20,33 -0,12 16,85 4,36 24,24 9,07 9,04 9,04 8,67 Linha-3 0,01 55,87 27,13 1,12 22,00 0,00 13,27 7,60 18,20 7,83 10,92 10,92 7,33 Linha-4 0,01 18,62 1,87 24,00 0,01 13,55 8,44 18,00 7,32 10,16 10,16 7,67 Linha-5 0,03 43,22 117,42 1,67 20,67 0,04 14,19 4,92 19,50 8,74 10,32 10,32 6,67 Linha-6 0,02 69,78 70,72 1,68 18,33 -0,07 15,64 3,43 15,00 7,62 8,78 8,78 6,67 Linha-7 0,01 45,49 37,34 1,62 21,00 0,01 15,66 6,90 23,40 6,98 13,00 13,00 7,67 Linha-8 0,01 76,51 25,56 0,85 20,33 0,00 17,49 5,80 28,16 8,05 7,44 7,44 6,67 Linha-9 0,01 87,41 66,18 1,45 21,67 -0,06 16,00 8,55 21,96 6,06 13,92 13,92 6,00 Linha-10 0,01 22,13 1,38 19,67 0,04 18,31 9,67 33,03 6,73 11,00 11,00 8,67 Linha-11 0,02 41,12 0,82 16,67 0,05 17,42 5,42 34,80 9,55 6,78 6,78 7,67 Linha-12 0,02 58,32 116,95 0,58 17,00 0,00 14,23 3,05 11,73 7,84 8,45 8,45 6,33 Linha-13 0,01 80,58 84,10 0,63 15,17 -0,07 14,81 4,07 18,78 7,81 9,15 9,15 7,00 Unha-14 0,01 73,09 37,46 1,07 27,00 0,03 16,54 3,72 21,00 8,35 5,12 5,12 7,00 Linha-15 0,03 98,86 0,70 15,00 -0,06 12,72 3,21 9,88 5,47 16,13 16,13 6,67 I anela 24. Sao fornecidos os valores de cada um dos parãmetros (conforme descrito acima) medidos em acessos de Cevada (linha) sob condições de cultivo de seca. As condições de cultivo são especificadas na seção de procedimento experimental.

Tabela 25 Correlação entre o nível de expressão de genes selecionados de algumas aplicações da invenção em vários tecidos e o desempenho fenotípico sob condições normais e de baixo nitrogênio (no estáaio veaetal) em acessos de cevada Nome do Conj. de Nome do Conj. de R Valor P Conj, de R Valor P ~onj. de Gene Exp Gene Exp. Cor. Cor. LNU749 0,76 1,75E-02 1 15 LNU750 0,73 2,45E-02 2 27 LNU750 0,77 1,54E-02 2 17 LNU750 0,87 2,60E-03 3 35 LNU751 0,89 1,30E-03 1 15 LNU751 0,98 2,69E-06 2 27 LNU751 0,93 2,74E-04 2 17 LNU751 0,76 1,73E-02 3 15 LNU752 0,72 2,74E-02 1 15 LNU752 0,92 5,34E-04 2 27 LNU752 0,86 2,91 E-03 2 17 LNU753 0,84 4,60E-03 3 31 LNU753 0,74 2,15E-02 3 19 LNU754 0,85 3,73E-03 1 19 LNU754 0,78 1,29E-02 1 38 LNU754 0,84 5,09E-03 2 21 LN1J754 0,71 3,26E-02 3 31 LNU754 0,86 3,31E-03 3 19 LNJ754 0,80 8,98E-03 3 3 LNU754 0,86 3,10E-03 3 38 LNU756 0,94 4,00E-04 4 18 LNU756 0,72 4,47E-02 4 27 LNU756 0,74 3,76E-02 4 17 LNU756 0,70 2,33E-02 5 35 LNU756 0,87 9,76E-04 5 8 LNU756 0,70 2,33E-02 5 38 LNU756 0,74 1,40E-02 5 6 LNU756 0,78 1,34E-02 3 31 LNU756 0,72 2,94E-02 3 38 LNJ757 0,70 5,28E-02 6 28 LNU757 0,77 9,44E-03 5 6 LNU757 0,88 1,66E-03 3 20 LNU758 0,79 2,06E-02 4 14 LNU758 0,86 1,27E-03 5 20 LNU758 0,77 1,60E-02 3 24 LNU759 0,80 8,91E-03 3 3 LNU759 0,72 2,87E-02 3 8 LNU760 0,73 3,85E-02 4 18 LNU760 0,74 2,15E-02 3 19 LNU760 0,79 1,07E-02 3 3 LNU760 0,85 4,06E-03 3 22 LNU760 0,73 2,57E-02 3 38 LNU760 0,70 3,50E-02 3 6 LNU761 0,73 4,00E-02 6 10 LNU761 0,81 1,47E-02 6 27 LNU761 0,90 2,64E-03 6 13 LNU761 0,74 2,34E-02 1 15 LNU761 0,83 1,07E-02 4 14 LNU761 0,83 6,15E-03 2 27 LNU761 0,76 1,68E-02 2 17 LNU761 0,86 3,06E-03 3 31 LNU761 0,73 2,49E-02 3 19 LNU762 0,71 4,71 E-02 6 27 LNU762 0,84 9,31E-03 6 13 LNU762 0,84 4,92E-03 1 7 LNU762 0,76 1,68E-02 1 37 LNU763 0,81 1,58E-02 6 5 LNU763 0,73 2,70E-02 2 18

•.%Ç ._f! - - - fl- •fl - - ------,.----t.

Nome do R Conj. de Nome do R Valor P Conj. de Valor P Conj. de Conj. de Gene Exp.

Gene Exp, Cor.

Cor.

LNJ763 0,74 2,30E-02 2 27 LNU763 0,74 2,25E-02 2 17 LNJ764 0,73 3,83E-02 4 18 LNU764 0,77 9,51E-03 5 26 LNU764 0,77 8,83E-03 5 7 LNU764 0,75 1,26E-02 5 25 LNU764 0,74 1,50E-02 5 33 LNU764 0,76 1,85E-02 3 7 LNU764 0,76 1,68E-02 3 36 LNU764 0,80 9,88E-03 3 16 LNU766 0,71 4,88E-02 6 27 LNU766 0,77 2,65E-02 6 13 LNU766 0,71 3,21E-02 1 8 LNU766 0,87 2,11E-03 1 20 LNU766 0,73 4,02E-02 4 14 LNU766 0,78 7,63E-03 5 19 LNU766 0,83 2,85E-03 5 3 LNU766 0,77 9,25E-03 5 8 LNU766 0,83 6,19E-03 2 21 LNU766 0,71 3,08E-02 3 15 LNU767 0,76 1,02E-02 5 31 LNU767 0,77 1,54E-02 3 31 LNU768 0,84 8,81E-03 6 13 LNU768 0,77 1,43E-02 1 35 LNU768 0,72 2,93E-02 1 6 LNU768 0,74 3,42E-02 4 10 LNU768 0,85 3,32E-03 3 31 LNU769 0,74 2,19E-02 1 24 LNU769 0,77 9,46E-03 5 20 LNU769 0,72 2,94E-02 2 11 LNU770 0,79 6,40E-03 5 19 LNU770 0,77 9,80E-03 5 35 LNU770 0,94 4,58E-05 5 38 LNU770 0,81 4,44E-03 5 6 LNU770 0,73 2,54E-02 3 19 LNU770 0,78 1,29E-02 3 3 LNU770 0,83 6,19E-03 3 38 LNU770 0,72 2,94E-02 3 6 LNU771 0,74 3,66E-02 4 10 LNU771 0,90 2,59E-03 4 18 LNU771 0,76 1,64E-02 2 29 LNU772 0,72 4,44E-02 6 5 LNU772 0,73 4,12E-02 4 34 LNU772 0,70 5,24E-02 4 18 LNU772 0,77 1,60E-02 2 18 LNU773 0,78 2,35E-02 6 12 LNU773 0,75 3,21E-02 6 27 LNU773 0,72 3,00E-02 1 20 LNU773 0,88 7,99E-04 5 8 LNU773 0,82 7,06E-03 3 31 LNU773 0,93 3,04E-04 3 19 LNU773 0,84 4,98E-03 3 3 LNU773 0,94 2,08E-04 3 38 LNU773 0,82 6,35E-03 3 6 LNU774 0,92 1,27E-03 6 5 LNU774 0,83 5,80E-03 1 31 LNU774 0,73 2,53E-02 1 19 LNU774 0,75 1,97E-02 1 38 LNU774 0,73 3,92E-02 4 1 LNU774 0,80 1,80E-02 4 27 LNU774 0,80 1,70E-02 4 17 LNU774 0,84 4,74E-03 2 18 LNU774 0,85 3,61E-03 2 27 LNU774 0,86 2,84E-03 2 17 LNU774 0,93 3,07E-04 3 31 LNU774 0,84 5,09E-03 3 19 LNU774 0,74 2,28E-02 3 35 LNU774 0,89 1,46E-03 3 38 LNU774 0,77 1,45E-02 3 6 LNU775 0,72 4,43E-02 6 21 LNU775 0,73 4,07E-02 6 27 LNU775 0,76 2,95E-02 6 13 LNU775 0,70 3,53E-02 1 24 LNU775 0,73 3,80E-02 4 2 LNU775 0,78 1,28E-02 3 31 LNUJ775 0,71 3,36E-02 3 38 LNU775 0,82 1,33E-02 4 28 LNU776 0,89 2,89E-03 4 13 LNU776 0,80 9,89E-03 3 31 LNU776 0,73 2,67E-02 3 19 LNU776 0,79 1,15E-02 3 35 LNU776 0,83 5,67E-03 3 38 LNU776 0,88 1,76E-03 3 6 LNU776 0,79 1,14E-02 3 16 LNU777 0,94 4,33E-04 6 17 LNU777 0,87 2,53E-03 1 19 LNU777 0,96 4,74E-05 1 38 LNU777 0,79 1,16E-02 1 6 LNU777 0,83 5,49E-03 3 31 LNU777 0,86 3,12E-03 3 19 LNU777 0,80 9,73E-03 3 38 LNU778 0,79 1,94E-02 6 13 LNU77B 0,87 4,98E-03 6 14 LNU778 0,73 1,74E-02 5 25 LNU778 0,70 2,30E-02 5 33 LNU778 0,82 7,02E-03 2 2 LNU778 0,74 2,19E-02 3 3 LNU778 0,79 1,12E-02 3 38 LNU778 0,82 7,05E-03 3 6 LNU779 0,77 1,61E-02 3 19 LNU779 0,91 7,64E-04 3 3 LNU779 0,74 2,40E-02 3 8 LNU779 0,82 7,27E-03 3 38 LNU779 0,73 2,55E-02 3 6 LNU780 0,74 3,59E-02 4 1 LNU780 0,73 1,56E-02 5 8 LNU780 0,77 8,82E-03 5 38 LNU780 0,76 1,80E-02 2 27 LNU780 0,75 2,06E-02 2 17 LNU780 0,91 6,27E-04 3 31 LNU760 0,86 2,62E-03 3 19 LNU780 0,82 7,00E-03 3 38 LNU781 0,73 4,00E-02 6 17 LNU781 0,74 2,31E-02 1 31 LNU781 0,70 2,29E-02 5 19 LNU781 0,83 3,24E-03 5 38 LNU781 0,88 1,93E-03 2 27 LNU781 0,89 1,49E-03 2 17 LNU781 0,73 2,64E-02 3 15 LNU782 0,79 2,01E-02 4 34

Nome do Conj. de Nome do Conj. de R Valor P Conj. de R Valor P Canj. de Gene Gene Cor. p Cor. LNU782 0,72 4,27E-02 4 21 LNU782 0,71 5,05E-02 4 13 LNU783 0,79 1,92E-02 6 13 LNU783 0,73 2,48E-02 3 7 LNU783 0,74 2,19E-02 3 36 LNU784 0,76 2,89E-02 6 5 LNU784 0,96 5,76E-05 2 27 LNU784 0,92 4,48E-04 2 17 LNU784 0,78 1,26E-02 3 35 LNU785 0,73 3,88E-02 6 34 LNU785 0,82 1,24E-02 6 12 LNU785 0,85 7,06E-03 6 10 LNU785 0,73 4,02E-02 6 4 LNU785 0,78 2,36E-02 6 27 LNU785 0,80 1,77E-02 6 13 LNU785 0,81 8,50E-03 1 20 LNU785 0,70 2,42E-02 5 7 LNU785 0,76 1,15E-02 5 24 LNU785 0,80 5,77E-03 5 25 LNU785 0,81 4,47E-03 5 33 LNU785 0,94 1,75E-04 2 27 LNU785 0,90 8,48E-04 2 17 I abela 25. São tornecidas as correlações (R) entre a produção dos níveis de expressão que melhoram os genes e seus homólogos em vários tecidos [Conjuntos de Expressão (Exp.)] e o desempenho fenotípico [componentes de vigor, produção, biomassa elou taxa de crescimento (Vetor de correlação (Cor.))) sob condições normais e de baixo nitrogênio em acessos de cevada. P = valor-p.

Tabela 26 Correlação entre o nível de expressão de genes selecionados de algumas aplicações da invenção em vários tecidos e o desempenho fenotípico sob condições normais e de baixo nitrogênio (no estágio reprodutivo) em acessos de cevada. Nome do Conj. de Nome do Conj. de R Valor P Conj. de R Valor P Conj. de Gene p Gene Cor. p Cor. LNU749 0,701 2,39E-02 3 4 LNU749 0,744 1,36E-02 3 10 LNU749 0,715 2,00E-02 3 12 LNU749 0,730 1,66E-02 6 15 LNU749 0,801 5,32E-03 6 10 LNU749 0,713 2,05E-02 5 14 LNU749 0,736 1,52E-02 4 9 LNU750 0,707 2,22E-02 1 9 LNU751 0,854 1,67E-03 3 13 LNU753 0,713 2,06E-02 2 6 LNU753 0,781 7,69E-03 2 7 LNU753 0,814 4,12E-03 2 8 LNU753 0,752 1,22E-02 2 12 LNU753 0,793 6,18E-03 3 17 LNU754 0,707 2,23E-02 5 2 LNU754 0,708 2,21E-02 5 1 LNU754 0,734 1,56E-02 5 3 LNU756 0,759 1,10E-02 4 17 LNU757 0,886 6,40E-04 2 14 LNU757 0,837 2,52E-03 2 13 LNU757 0,761 1,05E-02 6 10 LNU757 0,747 1,29E-02 1 13 LNU758 0,765 9,99E-03 6 15 LNU758 0,746 1,32E-02 1 9 LNU759 0,720 1,88E-02 2 5 LNU759 0,739 1,45E-02 2 7 LNU759 0,715 2,01E-02 2 8 LNU760 0,732 1,61E-02 2 13 LNU761 0,784 7,28E-03 3 17 LNU761 0,759 1,08E-02 6 6 LNU761 0,720 1,89E-02 6 5 LNU761 0,737 1,49E-02 6 7 LNU761 0,731 1,62E-02 6 8 LNU761 0,745 1,33E-02 5 17 LNU762 0,745 1,34E-02 5 13 LNU763 0,721 1,87E-02 2 13 LNU763 0,838 2,46E-03 6 15 LNU763 0,797 5,78E-03 5 14 LNU763 0,719 1,91E-02 4 15 LNU764 0,729 1,68E-02 3 13 LNU764 0,719 1,91E-02 3 16 LNU764 0,746 1,32E-02 5 4 LNU764 0,709 2,17E-02 5 10 LNU764 0,762 1,03E-02 1 9 LNU766 0,766 9,84E-03 2 9 LNU766 0,718 1,94E-02 3 9 LNU766 0,763 1,03E-02 1 17 LNU766 0,782 7,49E-03 1 9 LNU767 0,822 3,53E-03 5 17 LNU768 0,728 1,70E-02 5 14 LNU769 0,705 2,28E-02 2 1 LNU769 0,713 2,07E-02 2 3 LNU769 0,819 3,79E-03 3 4 LNU769 0,820 3,67E-03 3 10 LNU769 0,723 1,81E-02 1 16 LNU770 0,732 1,62E-02 2 13 LNU770 0,848 1,93E-03 3 13 LNU770 0,772 8,95E-03 3 16 LNU771 0,714 2,04E-02 6 11 LNU771 0,724 1,80E-02 5 4 LNU771 0,855 1,61E-03 1 5 INU772 0,718 1,93E-02 3 2 LNU772 0,789 6,71E-03 6 15 LNU773 0,801 5,36E-03 3 14

Nome do P Conj. de Nome do R Conj. de Valor P Conj. de Valor P Conj, de Gene Exp• Gene Exp.

Cor.

LNU773 0,797 5,81E-03 3 13 LNU773 0,860 1,43E-03 5 4 LNU773 0,836 2,56E-03 1 4 LNU774 0,765 9,96E-03 3 4 LNU774 0,710 3,21E-02 6 16 LNU774 0,848 1,94E-03 1 4 LNU774 0,722 1,84E-02 1 10 LNU775 0,842 2,23E-03 5 16 LNU775 0,753 1,19E-02 4 5 LNU776 0,804 5,07E-03 2 4 LNU776 0,786 7,03E-03 2 14 LNU776 0,717 1,97E-02 2 13 LNU776 0,708 2,21E-02 5 17 LNU777 0,834 2,67E-03 2 13 LNU777 0,769 9,38E-03 4 4 LNU778 0,709 2,16E-02 3 7 LNU778 0,805 4,95E-03 3 10 LNU778 0,714 2,04E-02 3 8 LNU778 0,712 2,10E-02 3 12 LNU778 0,750 1,24E-02 6 2 LNU778 0,759 1,09E-02 4 2 LNU778 0,803 5,15E-03 4 1 LNU778 0,803 5,20E-03 4 3 LNU779 0,856 1,58E-03 3 14 LNU779 0,873 9,80E-04 3 13 LNU779 0,772 8,88E-03 5 10 LNU781 0,715 2,01E-02 3 15 LNU782 0,733 1,58E-02 3 13 LNU782 0,776 8,33E-03 5 4 LNU782 0,730 1,66E-02 4 17 LNU782 0,784 7,30E-03 4 9 LNU782 0,806 4,87E-03 1 4 LNU782 0,858 1,48E-03 1 10 LNU783 0,734 1,57E-02 2 6 LNU783 0,829 3,01E-03 2 7 LNU783 0,848 1,93E-03 2 8 LNU783 0,800 5,45E-03 2 12 LNU783 0,758 1,11E-02 3 4 LNU783 0,734 1,57E-02 3 16 LNU7B3 0,724 1,79E-02 5 15 LNU783 0,885 6,72E-04 1 16 LNU784 0,801 5,32E-03 3 14 LNU784 0,763 1,03E-02 3 13 LNU784 0,846 2,03E-03 5 10 LNU784 0,744 1,37E-02 4 15 LNU784 0,713 2,07E-02 4 10 LNU784 0,779 7,88E-03 1 4 LNU784 0,832 2,86E-03 1 10 LNU785 0,740 1,43E-02 5 14 +aaeia zb. 5ao romecuaas as correiaçoes (h) entre a produção dos níveis de expressão que melhoram os genes e seus homólogos em vários tecidos [Conjuntos de Expressão (Exp.)] e o desempenho fenotípico [componentes de vigor, produção, biomassa elou taxa de crescimento (Vetor de correlação (Cor.))] sob condições normais e de baixo nitrogênio em acessos de cevada.

P = valor-p,

Tabela 27

Correlação entre o nível de expressão de genes selecionados de algumas aplicações da invenção em vários tecidos e o desempenho fenotípico sob condições de seca em acessos de cevada.

Nome do R Con¡. de Nome do Conj. de Valor P Conj. de R Valor P Conj. de Gere Exp.

Cor.

Gene Exp.

Cor.

LNU749 0,859 2,82E-02 1 18 LNU749 0,780 6,74E-02 1 11 LNU749 0,818 4,66E-02 1 20 LNU749 0,798 1,76E-02 3 10 LNU749 0,759 2,90E-02 3 16 LNU749 0,727 4,12E-02 3 11 LNU749 0,735 3,79E-02 5 22 LNU749 0,858 6,39E-03 5 4 LNU749 0,763 2,77E-02 5 15 LNU749 0,739 2,30E-02 4 19 LNU749 0,844 1,69E-02 4 13 LNU749 0,730 2,56E-02 4 12 LNU749 0,717 2,96E-02 4 14 LNU750 0,855 2,99E-02 1 12 LNU750 0,820 4,59E-02 1 2 LNU750 0,872 2,37E-02 1 14 LNU750 0,912 4,21E-03 3 13 LNU750 0,816 1,35E-02 3 14 LNU750 0,787 2,05E-02 3 1 LNU750 0,700 7,97E-02 2 6 LNU751 0,754 8,34E-02 1 2 LNU751 0,762 7,82E-02 1 14 LNU751 0,743 9,09E-02 1 1 LNU751 0,778 2,29E-02 3 10 LNU751 0,887 3,28E-03 3 11 LNU751 0,737 5,88E-02 2 1 LNU751 0,700 3,56E-02 4 12 LNU753 0,734 3,82E-02 3 21 LNU753 0,843 1,73E-02 2 21 LNU753 0,819 2,41E-02 2 12 LNU753 0,777 2,33E-02 5 10 LNU753 0,840 9,13E-03 5 11 LNU753 0,749 3,24E-02 5 2 LNU754 0,743 9,03E-02 1 21 LNU754 0,711 4,80E-02 3 12 LNU754 0,849 1,57E-02 6 13 do do Nome do Conj. de Nome do Conj. de ID de R Valor P ID de R Valor P Coi.

Gene Exp.

Gene Exp • CCor.

Cor.

LNU754 0,747 2,08E-02 6 2 LNU754 0,706 3,36E-02 6 14 LNU754 0,970 6,62E-05 5 14 LNU756 0,784 6,48E-02 1 19 LNU756 0,797 5,77E-02 1 23 LNU755 0,945 3,89E-04 3 19 LNU756 0,767 2,64E-02 3 22 LNU756 0,830 5,66E-03 6 16 LNU756 0,825 2,23E-02 2 5 LNU756 0,835 1,93E-02 2 6 LNU756 0,744 5,51E-02 2 20 LNU756 0,883 3,69E-03 5 19 LNU756 0,886 1,45E-03 4 19 LNU756 0,818 7,03E-03 4 22 LNU756 0,758 1,79E-02 4 4 LNU757 0,713 1,12E-01 1 10 LNU757 0,857 2,94E-02 1 23 LNU757 0,712 1,13E-01 1 6 LNU757 0,798 5,73E-02 1 17 LNU757 0,759 7,99E-02 1 20 LNU757 0,754 5,01E-02 2 11 LNU757 0,882 3,71E-03 5 19 LNU758 0,842 8,67E-03 3 12 LNU758 0,777 3,98E-02 2 16 LNU758 0,768 1,56E-02 4 14 LNU759 0,708 1,15E-01 1 16 LNU759 0,855 6,85E-03 3 21 LNU761 0,712 1,13E-01 1 18 LNU761 0,804 1,62E-02 3 11 LNU761 0,765 2,71E-02 5 17 LNU762 0,774 7,09E-02 1 7 LNU762 0,933 6,54E-03 1 18 LNU762 0,755 8,26E-02 1 5 LNU762 0,922 8,91E-03 1 6 LNU762 0,914 1,08E-02 1 11 LNU762 0,977 7,65E-04 1 20 LNU762 0,934 6,70E-04 3 7 LNU762 0,865 5,58E-03 3 5 LNU762 0,840 9,05E-03 3 6 LNU762 0,752 3,14E-02 5 4 LNU762 0,731 3,94E-02 5 15 LNU764 0,811 1,46E-02 3 22 LNU764 0,838 9,40E-03 3 4 LNU764 0,700 5,30E-02 3 15 LNU764 0,812 7,89E-03 6 5 LNU764 0,772 1,47E-02 6 6 LNU764 0,798 3,13E-02 6 8 LNU764 0,824 2,26E-02 2 10 LNU764 0,794 3,31E-02 2 22 LNU764 0,871 1,08E-02 2 2 LNU764 0,904 5,15E-03 2 1 LNU764 0,724 1,04E-01 5 13 LNU764 0,858 6,46E-03 5 11 LNU764 0,869 1,11E-02 4 13 LNU764 0,725 2,72E-02 4 14 LNU764 0,852 1,50E-02 4 8 LNU766 0,845 3,41E-02 1 21 LNU766 0,797 1,79E-02 3 22 LNU766 0,838 9,35E-03 3 7 LNU766 0,731 3,95E-02 3 16 LNU766 0,787 2,03E-02 3 18 LNU766 0,897 2,51E-03 3 5 LNU766 0,939 5,37E-04 3 6 LNU766 0,714 4,66E-02 3 4 LNU766 0,832 1,04E-02 3 20 LNU766 0,833 5,27E-03 4 19 LNU766 0,864 2,69E-03 4 22 LNU766 0,867 2,49E-03 4 4 LNU767 0,782 6,60E-02 1 23 LNU767 0,754 8,34E-02 1 11 LNU767 0,764 7,73E-02 1 20 LNU767 0,920 1,20E-03 3 17 LNU767 0,737 2,34E-02 6 1 LNU767 0,740 5,72E-02 2 23 LNU767 0,876 9,67E-03 2 11 LNU768 0,769 7,37E-02 1 12 LNU768 0,774 2,43E-02 3 7 LNU768 0,894 6,70E-03 2 16 LNU768 0,766 4,48E-02 2 1 LNU768 0,787 1,19E-02 4 14 LNU770 0,854 3,03E-02 1 23 LNU770 0,849 7,68E-03 3 19 LNU770 0,861 6,00E-03 3 22 LNU770 0,730 6,26E-02 6 8 LNU770 0,728 6,37E-02 2 7 LNU770 0,709 7,46E-02 2 5 LNU770 0,769 4,31E-02 2 6 LNU770 0,817 2,49E-02 2 9 LNU770 0,708 7,53E-02 2 20 LNU770 0,752 1,95E-02 4 19 LNU771 0,735 9,61E-02 1 10 LNU771 0,860 1,30E-02 3 13 LNU771 0,806 1,58E-02 3 2 LNU771 0,852 7,21E-03 3 14 LNU771 0,779 2,26E-02 3 1 LNU771 0,829 2,12E-02 3 8 LNU771 0,725 2,70E-02 6 20 LNU771 0,830 2,08E-02 2 21 LNU771 0,766 4,46E-02 2 5 LNU771 0,749 5,28E-02 2 6 LNU771 0,858 1,34E-02 2 11 LNU771 0,822 2,32E-02 2 12 LNU771 0,958 2,60E-03 5 13 LNU771 0,838 9,44E-03 5 14 LNU771 0,921 1,18E-03 5 1 LNU771 0,710 3,22E-02 4 7 LNU771 0,701 3,55E-02 4 5 LNU771 0,742 2,20E-02 4 6 LNU771 0,745 2,13E-02 4 17 LNU771 0,753 1,91E-02 4 20 LNU772 0,738 9,40E-02 1 18 LNU772 0,749 3,25E-02 3 2 LNU772 0,708 3,29E-02 6 22 LNU772 0,848 3,90E-03 6 4 LNU772 0,754 3,05E-02 5 10 LNU772 0,811 1,47E-02 5 2 LNU772 0,790 1,14E-02 4 2 LNU773 0,772 2,49E-02 3 22 LNU773 0,802 1,66E-02 3 18 LNU773 0,720 6,80E-02 3 8

Nome do Conj, de Nome do de R Valor P Conj. de R Valor P Conj. de Gene Exp. Gene Exp• Cor, Cor. LNU773 0,899 5,87E-03 6 8 LNU773 0,796 3,24E-02 2 16 LNU774 0,713 1,12E-01 1 22 LNU774 0,705 1,18E-01 1 2 LNU774 0,739 2,28E-02 6 12 LNU774 0,791 1,95E-02 5 17 LNU775 0,747 3,30E-02 3 21 LNU775 0,800 1,70E-02 3 11 LNU775 0,729 4,03E-02 3 14 LNU775 0,725 6,51E-02 6 8 LNU775 0,822 2,33E-02 2 16 LNU775 0,718 4,50E-02 5 9 LNU775 0,731 3,92E-02 5 12 LNU775 0,802 9,27E-03 4 21 LNU776 0,811 5,04E-02 1 1 LNU776 0,808 1,52E-02 3 10 LNU776 0,777 2,33E-02 3 2 LNU776 0,778 3,94E-02 2 2 LNU776 0,734 6,04E-02 2 14 LNU776 0,786 3,61E-02 2 1 LNU776 0,904 8,21E-04 4 10 LNU776 0,741 2,25E-02 4 2 LNU777 0,947 3,54E-04 3 10 LNU777 0,892 2,88E-03 3 2 LNU778 0,712 4,75E-02 3 23 LNU778 0,709 3,24E-02 6 7 LNU778 0,789 1,16E-02 6 5 LNU778 0,805 8,79E-03 6 6 LNU778 0,784 3,71E-02 2 21 LNU778 0,975 9,07E-04 5 8 LNU77B 0,703 3,45E-02 4 19 LNU778 0,748 2,04E-02 4 22 LNU780 0,778 6,87E-02 1 23 LNU780 0,785 3,65E-02 6 8 LNU781 0,807 5,20E-02 1 18 LNU781 0,917 1,00E-02 1 5 LNU781 0,837 3,79E-02 1 6 LNU781 0,880 2,06E-02 1 11 LNU781 0,765 7,63E-02 1 20 LNU781 0,910 1,68E-03 3 22 LNU782 0,818 4,67E-02 1 15 LNU782 0,889 3,18E-03 3 11 LNU782 0,715 3,04E-02 6 7 LNU782 0,886 7,89E-03 2 12 LNU782 0,908 4,65E-03 2 14 LNU782 0,721 4,37E-02 5 9 L NU782 0,856 3,21E-03 4 11 LNU782 0,747 2,06E-02 4 14 LNU783 0,762 2,81E-02 3 2 LNU783 0,735 2,40E-02 6 10 LNU783 0,820 2,39E-02 2 21 LNU784 0,782 6,61E-02 1 18 LNU784 0,897 1,54E-02 1 5 LNU7B4 0,790 6,13E-02 1 6 LNU784 0,746 8,83E-02 1 11 LNU784 0,724 1,04E-01 1 20 LNU784 0,701 5,29E-02 3 22 LNU784 0,776 4,02E-02 3 8 LNU784 0,748 2,04E-02 6 5 LNU784 0,885 8,15E-03 6 8 LNU784 0,710 3,20E-02 4 17 LNU785 0,726 1,03E-01 1 23 LNU785 0,706 1,17E-01 1 18 LNU785 0,779 6,77E-02 1 6 LNU785 0,845 3,43E-02 1 11 LNU785 0,846 3,39E-02 1 20 LNU785 0,708 4,96E-02 3 20 LNU7B5 0,708 7,53E-02 2 23 LNU785 0,738 5,81E-02 2 17 LNU785 0,769 4,31E-02 4 13 LNU785 0,813 7,74E-03 4 1 LNU834 0,826 4,28E-02 1 10 LNU834 0,866 2,56E-02 1 22 LNU834 0,767 7,48E-02 1 2 LNU834 0,765 7,64E-02 1 14 LNU834 0,824 6,35E-03 6 11 LNU834 0,782 3,78E-02 2 21 LNU834 0,810 2,71E-02 2 5 LNU834 0,792 3,36E-02 2 6 LNU834 0,838 1,87E-02 2 12 LNU834 0,708 7,50E-02 2 20 LNU839 0,826 4,28E-02 1 10 LNU839 0,866 2,56E-02 1 22 LNU839 0,767 7,48E-02 1 2 LNU839 0,765 7,64E-02 1 14 LNU839 0,824 6,35E-03 6 11 LNU839 0,782 3,76E-02 2 21 LNU839 0,810 2,71E-02 2 5 LNU839 0,792 3,36E-02 2 6 LNU839 0,838 1,87E-02 2 12 LNU839 0,708 7,50E-02 2 20 I abela Zí. ão tornecidas as correlações (R} entre a produção dos níveis de expressão que melhoram os genes e seus homólogos em vários tecidos [Conjuntos de Expressão (Exp.)[ e o desempenho fenotipico [componentes de vigor, produção, biomassa elou taxa de crescimento (Vetor de correlação (Cor.))] sob condições normais e de baixo nitrogênio em acessos de cevada. P = valor-p.

EXEMPLO 5

PRODUÇÃO DE TRANSCRIPTOMA DE SORGO E ANÁLISE DE CORRELAÇÃO DE ALTA PRODUTIVIDADE COM PARÂMETROS RELACIONADAS À PRODUÇÃO,

NUE E ABST MEDIDOS EM CAMPOS UTILIZANDO MICROARRANJOS DE OLIGONUCLEOTÌDEO DE SORGO 44K

[00421] A fim de produzir uma análise de correlação de alta produtividade entre o fenótipo de planta e o nível de expressão de gene, os presentes inventores utilizaram um microarranjo de oligonucleotídeo de sorgo, produzido pela Agilent Technologies [chem (ponto) agilent (ponto) com/Scripts/PDS (ponto) asp?lPage=50879]. 0 oligonucleotídeo do arranjo representa cerca de 44.000 genes e transcrições de sorgo. A fim de definir as correlações entre os níveis of expressão de RNA e os parâmetros relacionados ao vigor ou componentes de produção, ABST e NUE, várias características de planta de 17 diferentes híbridos de sorgo foram analisadas. Dentre elas, 10 híbridos englobando a variação observada foram selecionados para análise de expressão de RNA. A correlação entre os níveis de RNA e os parâmetros caracterizados foi analisada utilizando o teste de correlação de Pearson [davidmlane (ponto) com/hyperstat/A34739 (ponto) html].

[00422] Correlação de variedades de Sorgo em ecotipos cultivados sob condições de cultivo regular, condições graves de seca e condições de baixo nitrogênio. Procedimentos Experimentais:

[00423] 17 variedades de Sorgo foram cultivadas em 3 lotes repetitivos, em campo. Resumidamente, o protocolo de cultivo foi o seguinte:

1. Condições de cultivo regular: as plantas de sorgo foram cultivadas no campo utilizando fertilização comercial e protocolos de irrigação (370 litros por m2, fertilização de 14 unidades de 21% de ureia por período de cultivo inteiro).

2. Condições de Seca: sementes de sorgo foram semeadas no solo e cultivadas em condição normal até cerca de 35 dias a partir da semeadura, por volta do estágio V8 (oito folhas verdes são totalmente expandidas, inicialização não iniciada ainda). Nesse ponto, a irrigação foi interrompida, e estresse de seca severa foi desenvolvido.

3. Condições de fertilização de baixo nitrogênio: as plantas de sorgo foram fertilizadas com 50% menos quantidade de nitrogênio no campo do que a quantidade de nitrogênio aplicada no tratamento de cultivo regular. Todos os fertilizantes foram aplicados antes da floração.

[00424] Tecidos de Sorgo analisados -- Todos os 10 híbridos de sorgo selecionados foram amostrados para cada tratamento. Os tecidos [folha, meristema da flor e flor] das plantas cultivados em condições normais, grave estresse de seca e condições de baixo nitrogênio foram amostrados e o RNA foi extraído, conforme descrito acima. Cada tipo de tecido de informação de expressão de microarranjo recebeu um ID de Conjunto, conforme resumido na Tabela 28 abaixo. Tabela 28 Conjuntos de expressão de transcriptoma de sorgo em experimentos de campo Conjunto de Expressão ID de Conjunto Campo de sorgo! folha bandeira! Seca 1 Campo de sorgo! folha bandeira 1 Baixo N 2 Campo de sorgo 1 folha bandeira I Normal 3 Campo de sorgo 1 meristema da flor 1 Seca 4 Campo de sorgo 1 meristema da flor 1 Baixo N 5 Campo de sorgo 1 meristema da flor! Normal 6 Campo de sorgo 1 flor! Seca 7 Campo de sorgo 1 flor 1 Baixo N 8 Campo de sorgo 1 flor 1 Normal 9

Tabela 28: São fornecidos os conjuntos de expressão de transcriptoma de sorgo. Folha bandeira = a folha abaixo da flor; Meristema de flor = meristema apical após iniciação da panicula; Flor = a flor no dia da antese.

[00425] Os parâmetros a seguir foram coletados utilizando um sistema de imagem digital: Área Média do Grão (cm2 ) - No final do período de cultivo, os grãos foram separados da 'Cabeça' da Planta. Uma amostra de -200 grãos foi pesada, fotografada e as imagens foram processadas utilizando o sistema de processamento de imagem descrito abaixo. A área do grão foi medida a partir daquelas imagens e foi dividida pelo número de grãos.

Comprimento Médio do Grão (cm) - No final do período de cultivo, os grãos foram separados da 'Cabeça' da Planta. Uma amostra de -200 grãos foi pesada, fotografada e as imagens foram processadas utilizando o sistema de processamento de imagem descrito abaixo. A soma dos comprimentos dos grãos (eixo mais longo) foi medida a partir daquelas imagens e foi dividida pelo número de grãos.

Área Média da Cabeça (cm2 ) - No final do período de cultivo, 'Cabeças' foram fotografadas e as imagens foram processadas utilizando o sistema de processamento de imagem descrito abaixo. A área da 'cabeça' foi medida a partir daquelas imagens e foi dividida pelo número de 'Cabeças'.

Comprimento Médio da Cabeça (cm) - No final do período de cultivo, 5 'Cabeças' foram fotografadas e as imagens foram processadas utilizando o sistema de processamento de imagem descrito abaixo. 0 comprimento da 'Cabeça' (eixo mais longo) foi medido a partir daquelas imagens e foi dividido pelo número de 'Cabeças'.

[00426] Um sistema de processamento de imagem foi utilizado, consistindo de um computador pessoal (processador Intel P4 3.0 GHz) e um programa de domínio público - ImageJ

1.37, software de processamento de imagem com base em Java, desenvolvido no Instituto Nacional de Saúde dos Estados Unidos e livremente disponível na internet em rsbweb (ponto) nih (ponto) gov/. As imagens foram capturadas em resolução de 10 Mega Pixels (3888x2592 pixels) e armazenadas em um formato JPEG (Joint Photographic Experts Group standard I padrão do Grupo Conjunto de Especialistas em Fotografia) de baixa compressão. Em seguida, os dados de saída de processamento de imagem para área de semente e comprimento de semente foram salvos para arquivos de texto e analisados utilizando o software JMP de análise estatística (Instituto SAS).

[00427] Os parâmetros adicionais foram coletados ou por amostragem de 5 plantas por lote ou pela medição do parâmetro através de todas as plantas dentro do lote.

[00428] Peso Total da Semente por Cabeça (g.) - No final do experimento (`Cabeças' da planta), as cabeças dos lotes dentro dos blocos A-C foram coletadas. 5 cabeças foram separadamente debulhadas e os grãos foram pesados, todas as cabeças adicionais foram debulhadas juntas e também pesadas.

O peso médio do grão por cabeça foi calculado dividindo o peso total do grão pelo número total de cabeças por lote (com base no lote). No caso das 5 cabeças, o peso total dos grãos de 5 cabeças foi dividido por 5.

[00429] FW da Cabeça por grama da Planta - No final do experimento (quando as cabeças foram colhidas), o total de cabeças e 5 cabeças selecionadas por lotes dentro dos blocos A-C foram coletadas separadamente. As cabeças (total e 5) foram pesadas (g.) separadamente e o peso fresco médio por planta foi calculado para o total de cabeças (FW da Cabeça /g. da Planta com base no lote) e para 5 cabeças (FW da Cabeça /g. da Planta com base em 5 plantas).

[00430] Altura da Planta - As plantas foram caracterizadas com relação à altura durante o período de cultivo em 5 pontos no tempo. Em cada medição, as plantas foram medidas com relação à sua altura utilizando uma fita de medição. A altura foi medida a partir do nível do solo até o topo da folha mais longa.

[00431] Número de folhas da planta - As plantas foram caracterizadas com relação ao número de folhas durante o período de cultivo em 5 pontos no tempo. Em cada medição, as plantas foram medidas com relação ao seu número de folhas contando todas as folhas de 03 plantas selecionadas por lote.

[00432] Taxa de Crescimento Relativo - foi calculada utilizando as Fórmulas III (acima) e VIII (acima).

[00433] SPAD - O teor de clorofila foi determinado utilizando um medidor de clorofila Minolta SPAD 502 e a medição foi realizada 64 dias após a semeadura. As leituras do medidor SPAD foram feitas em folha nova totalmente desenvolvida. Três medições por folha foram feitas por lote.

[00434] Peso seco vegetal e Cabeças - No final do experimento (quando a inflorescências estava seca), toda a inflorescência e material vegetal dos lotes dentro dos blocos

A-C foram coletados. 0 peso da biomassa e cabeças de cada lote foi separado, medido e dividido pelo número de cabeças.

[00435] Peso seco = peso total da porção vegetal acima do solo (excluindo as raízes) após secagem a 70°C em forno por 48 horas.

[00436] Índice de Colheita (HI) (Sorgo) - O índice de colheita foi calculado utilizando a Fórmulas XVI acima.

[00437] FW das Cabeças / (FW das Cabeças + FW das Plantas) - 0 peso fresco total das cabeças e suas respectivas biomassas de planta foram medidos no dia da colheita. O peso das cabeças foi dividido pela soma dos pesos das cabeças e plantas.

Resultados Experimentais:

[00438] 17 diferentes híbridos de sorgo foram cultivados e caracterizados com relação a diferentes parâmetros (Tabela 29) . A média para cada um dos parâmetros medidos foi calculada utilizando o software JMP (Tabelas 30- 35) e uma análise de correlação subsequente foi conduzida (Tabela 36). Os resultados foram, então, integrados à base de dados.

Tabela 29 Parâmetros correlacionados ao Sorao (vetores) 10 de Parâmetros correlacionados com Correlação 1 Área Média do Grão (cm2), Seca 2 Área Média do Grão (cm2), Baixo N 3 Área Média do Grão (cm2), Normal 4 FW das Cabeças 1 Planta g., (com base em lote), Seca 5 FW das Cabeças 1 Planta g., (com base em lote), Baixo N 6 FW das Cabeças !Planta g., (com base em lote), Normal 7 FW das Cabeças! Planta g., (com base em 5 plantas), Baixo N 8 FW das Cabeças! Planta g., (com base em 5 p€antas), Normal g FW das Cabeças! (FW das Cabeças + FW das Plantas)(iodos os lotes), Seca 10 FW das Cabeças 1 (FW das Cabeças + FW das Plantas)( todos os lotes), Baixo N

ID Parâmetros correlacionados com Correlação de 11 FW das Cabeças 1 (FW das Cabeças + FW das Plantas)( todos os lotes), Normal 12 FW/ Planta g., (com base em lote), Seca 13 FW/ Planta g., (com base em lote), Baixo N 14 FW1 Planta g., (com base em lote), Normal 15 Altura Final da Planta (cm), Seca 16 Altura Final da Planta (cm), Baixo N 17 Altura Final da Planta (cm), Normal 18 Área Média da Cabeça (cm2), Seca 19 Area Média da Cabeça (cm2), Baixo N 20 Área Média da Cabeça (cm2), Normal 21 Comprimento Médio da Cabeça (cm), Seca 22 Comprimento Médio da Cabeça (cm), Baixo N 23 Comprimento Médio da Cabeça (cm), Normal 24 Perímetro Médio da Cabeça (cm), Seca 25 Perímetro Médio da Cabeça (cm), Baixo N 26 Perímetro Médio da Cabeça (cm), Normal 27 Altura Média da Cabeça (cm), Seca 28 Altura Média da Cabeça (cm), Baixo N 29 Altura Média da Cabeça (cm), Normal 30 Folha SPAD 64 DPS (Dias Após Semeadura), Seca 31 Folha SPAD 64 DPS (Dias Após Semeadura), Baixo N 32 Folha SPAD 64 DPS (Dias Após Semeadura), Normal 33 Área Média do Grão de Taxa Inferior, Baixo N 34 Área Média do Grão de Taxa Inferior, Normal 35 Comprimento Médio do Grão de Taxa Inferior, Baixo N 36 Comprimento Médio do Grão de Taxa Inferior, Normal 37 Perímetro Médio do Grão de Taxa Inferior, Baixo N 38 Perímetro Médio do Grão de Taxa Inferior, Normal 39 Largura Média do Grão de Taxa Inferior, Baixo N 40 Largura Média do Grão de Taxa Inferior, Normal 41 Peso total do grão /Cabeça (com base em lote) g., Baixo N 42 Peso total do grão !Cabeça g., (com base em 5 cabeças), Baixo N 43 Peso total do grão ]Cabeça g., (com base em 5 cabeças), Normal 44 Peso total do grão /Cabeça g., (com base em lote), Normal 45 Peso total do grão /Cabeça g., (com base em lote), Seca 46 Area Média do Grão de Taxa Superior, Seca 47 Area Média do Grão de Taxa Superior, Baixo N 48 Area Média do Grão de Taxa Superior, Normal 49 [Produção de grãos + Biomassa da planta /SPAD 64 DPS], Normal 50 [Produção de grãos + Biomassa da planta ISPAD 64 DPS], Baixo N 51 [Produção de grãos ISPAD 64 DPS], Baixo N 52 [Produção de grãos ISPAD 64 DPS], Normal` 53 [Biomassa da planta (FW)ISPAD 64 DPS], Seca 54 [Biomassa da planta (FW)ISPAD 64 DPS], Baixo N 55 [Biomassa da planta (FW)JSPAD 64 DPS], Normal Tabela 29. São fornecidos os parâmetros correlacionados ao Sorgo (vetores). "g." = gramas; "SPAD° = níveis de clorofila; "FW" = Peso fresco da Planta; 'DW" = Peso seco da Planta; °normal" = condições de cultivo padrão; "DPS" = dias após a semeadura; "Baixo N' = Baixo Nitrogênio.

Cabeça - FW /Planta g. (com base em 5 plantas) = o peso fresco das cabeças colhidas foi divido peio número de cabeças que foram fenotipadas; °Baixo N" = condições de baixo nitrogênio; "Área Média do Grão de Taxa Inferior* = área do grão da fração inferior dos grãos.

Tabela 30 Parâmetros medidos em acessos de Sorao sob condicões normais ID de Semente 3 6 8 11 14 17 20 23 26 29 1 ID de Cor. Linha-1 0,11 175,15 406,50 0,51 162,56 95,25 120,14 25,58 61,22 5,97 Linha-2 0,11 223,49 518,00 0,51 212,59 79,20 167,60 26,84 67,90 7,92 Linha-3 0,13 56,40 148,00 0,12 334,83 197,85 85,14 21,02 56,26 4,87 Linha-4 0,13 111,62 423,00 0,26 313,46 234,20 157,26 26,84 65,38 7,43 Linha-5 0,14 67,34 92,00 0,12 462,28 189,40 104,00 23,14 67,46 5,59 Linha-6 0,14 66,90 101,33 0,18 318,26 194,67 102,48 21,82 67,46 5,88 Linha-7 0,11 126,18 423,50 0,46 151,14 117,25 168,54 31,33 74,35 6,78 Linha-8 0,11 107,74 386,50 0,43 137,60 92,80 109,32 23,18 56,16 5,99 Linha-9 0,10 123,86 409,50 0,43 167,98 112,65 135,13 25,70 61,64 6,62 Linha-10 0,12 102,75 328,95 0,44 128,97 97,50 169,03 28,82 71,41 7,42 Linha-11 0,121 82,33 391,00 0,46 97,62 98,00 156,10 28,13 68,57 6,99 Linha-12 0,11 77,59 435,75 0,45 99,32 100,00 112,14 22,97 56,44 6,19 Linha-13 0,12 91,17 429,50 0,45 112,24 105,60 154,74 28,09 67,79 7,02 Linha-14 0,11 150,45 441,00 0,51 157,42 151,15 171,70 30,00 71,55 7,18 Linha-15 0,11 109,10 415,75 0,46 130,55 117,10 168,51 30,54 78,94 7,00 Linha-16 0,11 107,58 429,50 0,44 135,66 124,45 162,51 27,17 67,03 7,39 Tabela 30: São fornecidos os valores de cada um dos parâmetros (conforme descrito acima) medidos em acessos de Sorgo (ID de linha) sob condições normais. As condições de cultivo são especificadas na seção de procedimento experimental.

Tabela 31 Parâmetros adicionais medidos em acessos de Sorgo sob condicões normais ID de Semente 1 32 34 36 38 40 43 44 48 49 52 55 ID de Cor. Linha-1 43,01 0,83 0,91 0,91 0,91 47,40 31,12 1,22 4,50 3,78 0,72 Linha-2 0,74 0,88 0,87 0,83 46,30 26,35 1,30 8,17 7,74 0,43 Linha-3 43,26 0,78 0,92 0,91 0,85 28,37 18,72 1,13 7,87 7,01 0,86 Linha-4 44,74 0,80 0,91 0,95 0,87 70,40 38,38 1,14 10,68 10,10 0,58 Linha-5 45,76 0,70 0,89 0,90 0,79 32,15 26,67 1,16 8,34 7,65 0,69 Linha-6 41,61 0,70 0,88 0,92 0,80 49,23 28,85 1,15 4,40 3,34 1,05 Linha-7 45,21 0,83 0,91 0,91 0,90 63,45 47,67 1,19 3,74 3,05 0,69 Linha-8 45,14 0,81 0,90 0,91 0,89 44,45 31,00 1,24 4,83 3,90 0,93 Linha-9 43,03 0,84 0,92 0,92 0,92 56,65 39,99 1,25 3,67 2,83 0,84 Linha-10 45,59 0,79 0,92 0,93 0,85 60,00 38,36 1,24 2,89 2,18 0,72 Linha-11 44,83 0,77 0,89 0,91 0,86 45,45 32,10 1,32 2,91 2,19 0,72 Linha-12 45,33 0,80 0,91 0,92 0,89 58,19 32,69 1,22 3,12 2,41 0,71 Linha-13 46,54 0,81 0,91 0,90 0,90 70,60 32,79 1,18 4,75 3,58 1,17 Linha-14 43,99 0,82 0,91 0,91 0,91 70,10 51,53 1,18 3,69 2,90 0,79 Linha-15 45,09 0,81 0,90 0,91 0,91 53,95 35,71 1,22 3,85 3,01 0,85 Linha-16 45,14 0,82 0,90 0,91 0,90 59,87 38,31 1,25 5,84 4,85 0,98 i apeia ,51: Zao rorneciaos os vaiares ae caaa um dos parametros (conforme descrito acima) medidos em acessos de Sorgo (lU de linha) sob condições normais. As condições de cultivo são especificadas na seção de procedimento experimental.

Tabela 32 Parâmetros medidos em acessos de Sorgo sob condições de baixo nitrogênio

ID de Semente 2 5 7 10 13 F 16 19 22 25 28 31 1 ID de Cor. Linha-1 ÕF 214,78 388,00 0,51 204,78 104,00 96,24 23,22 56,32 5,26 38,33 Linha-2 0,11 205,05 428,67 0,51 199,64 80,93 214,72 25,58 79,20 10,41 38,98 Linha-3 0,14 73,49 297,67 0,17 340,51 204,73 98,59 20,93 53,25 5,93 42,33 Linha-4 0,12 122,96 280,00 0,39 240,60 125,40 182,83 28,43 76,21 8,25 40,90 Linha-5 0,14 153,07 208,33 0,21 537,78 225,40 119,64 24,32 67,27 6,19 43,15 Linha-6 0,13 93,23 303,67 0,19 359,40 208,07 110,19 22,64 59,49 6,12 39,85 Linha-7 0,12 134,11 436,00 0,48 149,20 121,40 172,36 32,11 79,28 6,81 42,68 Linha-8 0,12 77,44 376,33 0,38 129,06 100,27 84,81 20,38 51,52 5,25 43,31 Linha-9 0,12 129,63 474,67 0,42 178,71 121,13 156,25 26,69 69,89 7,52 39,01 Linha-10 0,13 99,83 437,67 0,44 124,27 94,53 136,71 26,31 66,18 6,59 42,71 Linha-11 0,13 76,95 383,00 0,43 101,33 110,00 137,70 25,43 67,37 6,85 40,08 Linha-12 0,12 84,25 375,00 0,39 132,12 115,07 96,54 23,11 57,90 5,32 43,98 Linha-13 0,12 92,24 425,00 0,44 117,90 104,73 158,19 27,87 70,61 7,25 45,44 Linha-14 0,12 138,83 434,00 0,44 176,99 173,67 163,95 28,88 73,76 7,19 44,75 Linha-15 0,11 113,32 408,67 0,44 143,67 115,60 138,39 27,64 66,87 6,28 42,58 Linha-16 0,12 95,50 378,50 0,43 126,98 138,80 135,46 25,52 65,40 6,57 43,81 Tabela 32: São fornecidos os valores de cada um dos parâmetros (conforme descrito acima) medidos em acessos de Sorgo (ID de linha) sob condições de baixo nitrogénio. As condições de cultivo são especificadas na seção de procedimento experimental.

Tabela 33 Parâmetros adicionais medidos em acessos de Sorgo sob condicões de cultivo baixo nitrogênio ID de Semente 1 33 35 37 39 41 42 47 50 51 54 ID de Cor.

Linha-1 0,82 0,91 0,90 0,90 25,95 50,27 1,19 6,02 0,68 5,34 Linha-2 0,77 0,90 0,88 0,85 30,57 50,93 1,31 5,91 0,78 5,12 Linha-3 0,81 0,92 0,92 0,89 19,37 36,13 1,11 8,50 0,46 8,05 Linha-4 0,79 0,90 0,90 0,88 35,62 73,10 1,22 6,75 0,87 5,88 Linha-5 0,78 0,91 0,92 0,86 25,18 37,87 1,19 13,05 0,58 12,46 Linha-6 0,80 0,93 0,92 0,87 22,18 36,40 1,18 9,58 0,56 9,02 Linha-7 0,83 0,92 0,92 0,91 49,96 71,67 1,16 4,67 1,17 3,50 Linha-8 0,79 0,89 0,89 0,89 27,48 35,00 1,23 3,61 0,63 2,98 Linha-9 0,81 0,90 0,90 0,90 51,12 76,73 1,17 5,89 1,31 4,58 Linha-10 0,77 0,91 0,91 0,86 36,84 57,58 1,22 3,77 0,86 2,91 Linha-11 0,74 0,89 0,90 0,84 29,45 42,93 1,24 3,26 0,74 2,53 Linha-12 0,80 0,90 0,90 0,90 26,70 36,47 1,19 3,61 0,61 3,00 Linha-13 0,79 0,89 0,90 0,89 29,43 68,60 1,23 3,24 0,65 2,60 Linha-14 0,82 0,91 0,91 0,91 51,12 71,80 1,16 5,10 1,14 3,96 Linha-15 0,80 0,89 0,89 0,90 37,04 49,27 1,34 4,25 0,87 3,38 Linha-16 0,81 0,89 0,90 0,90 39,85 43,87 1,21 3,81 0,91 2,90 Linha-17 0,81 0,90 0,90 0,90 41,78 52,07 1,21 4,76 0,89 3,86 I anela 33: São tornecidos os valores de cada um dos parâmetros (conforme descrito acima) medidos em acessos de Sorgo (ID de linha) sob condições de baixo nitrogênio. As condições de cultivo são especificadas na seção de procedimento experimental.

Tabela 34 Parâmetros medidos em acessos de Sorgo sob condições de seca

ID de Semente / ID 1 4 9 12 15 18 21 24 27 30 de Cor, Linha-1 0,10 154,90 0,42 207,99 89,40 83,14 21,63 52,78 4,83 40,58 Linha-2 0,12 122,02 0,47 138,02 75,73 107,79 21,94 64,49 6,31 40,88 Linha-3 0,11 130,51 0,42 255,41 92,10 88,68 21,57 56,59 5,16 45,01 Linha-4 0,09 241,11 0,37 402,22 94,30 135,91 22,01 64,37 7,78 42,30 Linha-5 0,09 69,03 0,23 233,55 150,80 90,77 20,99 53,21 5,28 45,24 Linha-6 0,11 186,41 0,31 391,75 110,73 123,95 28,60 71,66 5,49 40,56 Linha-7 62,11 0,41 89,31 99,20 86,06 21,35 55,61 5,04 44,80 Linha-8 39,02 0,44 50,61 84,00 85,20 20,81 52,96 5,07 45,07 Linha-9 58,94 0,40 87,02 99,00 113,10 24,69 69,83 5,77 40,65 Linha-10 76,37 0,44 120,43 92,20 100,79 24,28 65,15 5,37 45,43 Linha-11 33,47 0,47 37,21 81,93 80,41 21,95 55,27 4,66 42,58 Linha-12 42,20 0,47 48,18 98,80 126,89 24,98 69,06 6,35 44,18 Linha-13 41,53 0,48 44,20 86,47 86,41 19,49 53,32 5,58 44,60 Linha-14 131,67 0,35 231,60 99,60 92,29 20,42 56,29 5,76 42,41 Linha-15 60,84 0,35 116,01 83,00 77,89 16,81 49,12 5,86 43,25 Linha-16 44,33 0,23 123,09 83,53 76,93 18,88 51,88 5,10 40,30 Linha-17 185,44 0,33 342,50 92,30 40,75 Tabela 34: São fornecidos os valores de cada um dos parãmetros (conforme descrito acima) medidos em acessos de Sorgo (ID de linha) sob condições de seca. As condições de cultivo são especificadas na seção de procedimento experimental.

Tabela 35 Parâmetros adicionais medidos em acessos de Sorgo sob condições de seca ID de Semente I ID de Correlação 45 46 53 Linha-1 22,114 1,305 5,126 Linha-2 16,770 1,190 3,376 Linha-3 9,189 1,285 5,674 Linha-4 104,444 1,459 9,509 Linha-5 3,235 1,206 5,163 Linha-6 21,997 1,214 9,658 Linha-7 9,975 1,993 Linha-8 18,579 1,123 Linha-9 29,271 2,141 Linha-10 10,453 2,651 Linha-11 14,765 0,874 Linha-12 12,861 1,091 Linha-13 18,237 0,991 Linha-14 11,602 5,461 Linha-15 18,647 2,682 Linha-16 16,356 3,054 Linha-17 8,405 i aveia so: bao rorneciaos os valores de cada um dos parâmetros (conforme descrito acima) medidos em acessos de Sorgo (ID de linha) sob condições de seca. As condições de cultivo são especificadas na seção de procedimento experimental.

Tabela 36 Correlação entre o nível de expressão de genes selecionados de algumas aplicações da invenção em vários tecidos e o desempenho fenotípico sob condições de estresse abiótico ou normal em acessos de sorgo Nome do Conj. de ID do Conj.

Nome do Conj. de ID do Conj.

R Valor P R Valor P Gene Exp. de Cor.

Gene Exp. de Cor.

LNU856 0.849 3,76E-03 1 18 LNUB56 0,827 5,96E-03 1 27 LNU856 0,830 5,57E-03 1 24 LNU857 0,748 2,04E-02 9 55 LNU858 0,841 2,31E-03 6 36 LNU858 0,781 7,71E-03 6 34 LNU858 0,741 1,41E-02 2 41 LNUB58 0,721 1,85E-02 2 51 LNU858 0,788 6,74E-03 2 16 LNUB58 0,736 1,53E-02 3 11 LNU858 0,826 3,23E-03 3 6 LNU858 0,711 2,10E-02 3 8 LNU859 0,717 1,97E-02 6 55 LNUB59 0,829 3,04E-03 9 17 LNU859 0,713 2,07E-02 9 40 LNU859 0,736 1,52E-02 9 23 LNU859 0,819 3,78E-03 9 44 LNU859 0,785 7,10E-03 9 43 LNU859 0,706 2,26E-02 9 34 LNU859 0,764 1,00E-02 2 41 LNU859 0,782 7,47E-03 2 16 LNU859 0,717 1,97E-02 8 42 LNU860 0,789 6,70E-03 6 17 LNU860 0,706 2,24E-02 6 44 LNU860 0,773 8,80E-03 2 41 LNU860 0,711 2,11 E-02 2 22 LNU860 0,891 5,43E-04 2 42 LNU860 0,757 1,13E-02 2 51 LNU860 0,760 1,07E-02 2 37 LNU860 0,877 8,51E-04 4 53 LNU860 0,854 1,65E-03 4 4 LNU860 0,878 8,41E-04 4 12 LNU860 0,728 1,69E-02 5 41 LNU860 0,845 2,10E-03 5 16 LNU860 0,713 3,09E-02 7 18 LNU860 0,723 1,81E-02 1 53 LNUB60 0,726 1,74E-02 1 12 LNU861 0,835 2,63E-03 6 17 LNUB61 0,707 2,22E-02 6 44 LNU861 0,794 6,15E-03 2 16 LNU861 0,792 6,35E-03 4 53 LNU861 0,802 5,22E-03 4 4 LNUB61 0,790 6,53E-03 4 12 LNU861 0,871 2,26E-03 3 52 LNU861 0,874 2,05E-03 3 49 LNU861 0,892 5,26E-04 1 53 LNU861 0,890 5,56E-04 1 4 LNU861 0,879 8,08E-04 1 12 LNU862 0,716 1,98E-02 6 40 LNU862 0,767 9,63E-03 4 53 LNU862 0,767 9,58E-03 4 12 LNU862 0,726 2,69E-02 3 55 LNU862 0,797 5,81E-03 3 43 LNU862 0,753 1,20E-02 1 15 LNU863 0,857 3,15E-03 9 55 LNU863 0,758 1,11E-02 2 16 LNU863 0,878 8,46E-04 5 31 LNU863 0,776 8,30E-03 7 53 LNU863 0,751 1,22E-02 7 4 LNU863 0,770 9,20E-03 7 12 LNU864 0,816 3,97E-03 2 16 LNU864 0,700 2,42E-02 3 29 LNU864 0,729 1,67E-02 3 14 LNU864 0,736 1,53E-02 7 4 LNU864 0,708 2,20E-02 7 12 LNU865 0,719 1,90E-02 6 44 LNU865 0,740 1,43E-02 9 11 LNU865 0,754 1,17E-02 2 10 LNU865 0,742 1,40E-02 5 13 LNU865 0,774 8,53E-03 3 8 LNU866 0,752 1,22E-02 2 41 LNU866 0,844 2,13E-03 2 16 LNU866 0,848 3,91 E-03 3 52 LNU866 0,746 1,32E-02 3 11 LNU866 0,868 1,13E-03 3 6 LNU866 0,805 8,85E-03 3 49 LNU866 0,734 1,56E-02 1 4 LNU867 0,719 1,92E-02 6 3 LNU867 0,704 2,31E-02 3 6 LNJ868 0,916 2,00E-04 6 48 LNU868 0,804 5,04E-03 2 16 LNU868 0,821 3,59E-03 3 17 LNU868 0,819 3,75E-03 3 44 LNU869 0,719 1,90E-02 2 2 LNU869 0,790 6,49E-03 5 2 LNU870 0,906 3,04E-04 4 53 LNU870 0,829 3,00E-03 4 4 LNUB70 0,912 2,33E-04 4 12 LNU870 0,723 1,82E-02 1 53 LNU870 0,733 1,58E-02 1 12 LNU671 0,752 1,22E-02 6 17 LNU871 0,720 1,89E-02 4 53 LNU671 0,709 2,16E-02 4 4 LNU871 0,735 1,53E-02 4 12 LNU871 0,747 1,30E-02 7 9 LNU871 0,717 2,98E-02 1 21 LNUB72 0,714 2,05E-02 4 53 LNU872 0,710 2,13E-02 4 12 LNUB72 0,735 1,55E-02 5 41 LNU872 0,743 2,19E-02 7 18 LNU873 0,732 1,61E-02 9 44 LNU873 0,848 1,95E-03 8 35 LNU873 0,768 1,56E-02 3 55 LNU874 0,715 2,02E-02 2 22 LNU874 0,855 1,60E-03 2 42 LNU874 0,727 1,72E-02 4 53 LNU874 0,710 2,15E-02 4 4 LNU874 0,736 1,53E-02 4 12 LNU874 0,724 1,79E-02 5 54 LNUB74 0,777 8,13E-03 5 13

Nome do Conj. de ID do Conj.

R Valor P R Valor P Gene Exp. de Cor.

Gene Exp. de Cor.

LNU875 0,839 2,41E-03 6 3 LNU876 0,793 6,15E-03 6 17 LNU876 0,705 3,38E-02 4 27 LNU876 0,867 1,17E-03 4 53 LNU876 0,809 4,56E-03 4 4 LNU876 0,866 1,21E-03 4 12 LNU876 0,780 7,72E-03 5 5 LNU876 0,731 1,62E-02 5 7 LNU876 0,830 2,95E-03 5 50 LNU876 0,776 8,26E-03 5 54 LNU876 0,842 2,24E-03 5 13 LNU876 0,793 1,07E-02 3 52 LNU876 0,784 1,24E-02 3 49 LNU876 0,894 4,83E-04 3 8 LNU878 0,718 1,94E-02 6 11 LNU878 0,725 1,76E-02 6 49 LNU878 0,778 8,03E-03 2 16 LNU879 0,756 1,15E-02 6 11 LNU879 0,707 2,21E-02 6 6 LNU879 0,704 2,32E-02 6 14 LNU879 0,771 9,10E-03 2 28 LNU879 0,913 2,22E-04 4 53 LNU879 0,820 3,70E-03 4 4 LNU879 0,916 1,99E-04 4 12 LNU879 0,717 1,97E-02 5 5 LNU879 0,773 8,76E-03 5 50 LNU879 0,734 1,56E-02 5 54 LNU879 0,849 1,89E-03 5 13 LNUB80 0,718 1,93E-02 2 47 LNU8B1 0,789 6,64E-03 2 41 LNU881 0,730 1,66E-02 2 51 LNU881 0,755 1,17E-02 2 37 LNU881 0,931 8,91E-05 2 16 LNU882 0,785 1,22E-02 3 52 LNU882 0,794 1,07E-02 3 49 LNU882 0,724 2,75E-02 1 45 LNU883 0,799 5,57E-03 2 47 LNU883 0,743 2,19E-02 3 52 LNUB83 0,887 6,25E-04 3 6 LNU883 0,786 7,03E-03 3 14 LNU883 0,742 2,22E-02 3 49 LNU883 0,720 1,89E-02 3 8 LNU883 0,719 1,91E-02 1 9 LNU883 0,747 2,07E-02 1 18 LNU883 0,784 1,23E-02 1 24 LNU883 0,744 2,17E-02 1 21 LNU884 0,874 9,44E-04 2 41 LNU884 0,745 1,35E-02 2 22 LNU8S4 0,767 9,63E-03 2 35 LNU884 0,872 1,02E-03 2 51 LNU884 0,743 1,38E-02 2 37 LNU884 0,779 1,33E-02 4 45 LNU884 0,809 4,58E-03 3 6 LNU885 0,845 2,08E-03 6 17 LNU885 0,879 8,12E-04 6 44 LNU885 0,712 2,10E-02 2 47 LNU885 0,891 5,48E-04 4 53 LNU885 0,788 6,83E-03 4 4 LNU885 0,897 4,40E-04 4 12 LNU885 0,721 1,87E-02 5 41 LNU885 0,711 2,13E-02 5 13 LNU885 0,724 1,78E-02 5 51 LNU885 0,843 2,18E-03 7 30 LNU885 0,705 2,28E-02 1 53 LNU885 0,716 1,99E-02 1 12 LNU886 0,862 1,35E-03 6 3 LNU887 0,710 3,23E-02 9 52 LNU887 0,714 3,07E-02 9 49 LNU887 0,725 1,76E-02 2 47 LNU888 0,858 1,50E-03 6 48 LNU888 0,742 1,41E-02 2 41 LNU888 0,732 1,62E-02 2 35 LNU888 0,811 4,39E-03 2 51 LNU888 0,716 1,99E-02 2 37 LNU888 0,706 2,26E-02 8 41 LNU888 0,741 1,42E-02 8 51 LNU888 0,787 6,95E-03 8 37 LNU888 0,855 1,64E-03 7 30 LNU889 0,971 3,19E-06 6 52 LNU889 0,851 1,80E-03 6 6 LNU889 0,884 6,87E-04 6 14 LNU889 0,948 3,02E-05 6 49 LNUB89 0,763 1,02E-02 6 8 LNU890 0,796 5,88E-03 8 2 LNUS90 0,779 7,92E-03 5 2 LNU892 0,717 1,96E-02 9 8 LNUB92 0,915 5,43E-04 4 18 LNU892 0,892 1,23E-03 4 27 LNUB92 0,864 2,70E-03 4 24 LNU892 0,733 1,59E-02 8 28 LNU892 0,734 2,43E-02 7 27 LNU893 0,818 3,85E-03 3 43 LNU894 0,850 1,84E-03 6 52 LNU894 0,815 4,08E-03 6 49 LNU894 0,802 5,22E-03 6 8 LNU894 0,840 4,64E-03 9 52 LNU894 0,855 1,61E-03 9 14 LNU894 0,808 8,35E-03 9 49 LNU894 0,871 1,04E-03 2 16 LNU894 0,711 3,16E-02 3 52 LNU894 0,862 1,33E-03 3 6 LNU894 0,829 3,05E-03 3 14 LNU894 0,733 1,59E-02 3 8 LNU894 0,718 2,93E-02 1 21 LNU895 0,716 1,97E-02 6 20 LNU895 0,720 1,88E-02 5 7 LNU895 0,716 1,97E-02 5 19 LNU895 0,868 1,13E-03 5 41 LNU895 0,792 6,32E-03 5 22 LNU895 0,797 5,75E-03 5 25 LNU895 0,817 3,91E-03 5 51 LNU895 0,748 1,28E-02 3 29 LNU895 0,727 1,72E-02 3 14 LNU897 0,746 1,32E-02 3 17 LNU897 0,790 6,56E-03 3 44 LNU899 0,701 2,39E-02 6 3 LNU899 0,717 1,96E-02 2 16 LNU900 0,894 4,83E-04 ô 17 LNU900 0,713 2,05E-02 6 44 LNU900 0,710 2,14E-02 6 43 LNU900 0,765 9,88E-03 4 53 LNU900 0,772 8,88E-03 4 12

Nome do Conj. de ID do Conj.

R V alor P R Valor P Gene Ex p. de Cor.

Gene Exp. de Cor.

LNU900 0,883 7,13E-04 5 16 LNU901 0,920 1,62E-04 4 53 LNU901 0,869 1,10E-03 4 4 LNU901 0,916 1,93E-04 4 12 LNU901 0,770 9,12E-03 5 5 LNU901 0,767 9,70E-03 5 50 LNU901 0,768 9,54E-03 5 54 LNU901 0,807 4,75E-03 5 13 LNU902 0,886 6,47E-04 6 17 LNU902 0,856 1,59E-03 6 44 LNU903 0,714 2,04E-02 6 3 LNU903 0,785 7,13E-03 2 7 LNU903 0,738 1,48E-02 2 19 LNU903 0,829 3,05E-03 2 22 LNU903 0,786 7,04E-03 2 42 LNU903 0,840 2,36E-03 2 25 LNU904 0,738 1,48E-02 6 52 LNU904 0,731 1,64E-02 6 14 LNU904 0,751 1,24E-02 6 49 LNU904 0,765 9,94E-03 4 53 LNU904 0,718 1,94E-02 4 4 LNU904 0,767 9,63E-03 4 12 LNU904 0,732 1,61E-02 5 10 LNU905 0,710 2,14E-02 2 47 LNU905 0,872 2,17E-03 4 45 LNU905 0,800 5,42E-03 4 53 LNU905 0,854 1,65E-03 4 4 LNU905 0,785 7,10E-03 4 12 LNU905 0,714 2,04E-02 8 5 LNU905 0,725 1,76E-02 5 54 LNU905 0,761 1,06E-02 5 13 LNU905 0,822 6,54E-03 7 45 LNU905 0,720 2,86E-02 1 45 LNU906 0,749 1,26E-02 6 17 LNU906 0,778 8,04E-03 6 40 LNU906 0,832 2,85E-03 6 44 LNU906 0,805 4,95E-03 6 34 LNU906 0,745 1,35E-02 2 41 LNU906 0,855 1,63E-03 2 16 LNU906 0,939 5,71E-05 4 53 LNU906 0,868 1,12E-03 4 4 LNU906 0,943 4,37E-05 4 12 LNU907 0,700 2,42E-02 6 29 LNU907 0,829 3,00E-03 6 52 LNU907 0,825 3,28E-03 6 49 LNU907 0,790 6,50E-03 6 8 LNU907 0,791 6,44E-03 8 33 LNU907 0,706 2,26E-02 8 39 LNU907 0,836 2,59E-03 8 35 LNU907 0,746 1,32E-02 8 37 LNU908 0,701 2,41E-02 2 5 LNU908 0,725 1,77E-02 1 4 LNU909 0,805 4,99E-03 2 41 LNU909 0,745 1,34E-02 2 51 LNU909 0,920 1,66E-04 2 16 LNU909 0,789 1,14E-02 4 45 LNU909 0,822 3,51E-03 3 11 LNU909 0,771 9,03E-03 3 6 LNU910 0,761 1,05E-02 6 17 LNU910 0,743 1,37E-02 6 44 LNU910 0,743 1,38E-02 5 41 LNU910 0,732 1,62E-02 5 51 LNU910 0,767 9,66E-03 5 16 LNU910 0,761 1,71E-02 3 52 LNU910 0,781 1,30E-02 3 49 LNU910 0,763 1,02E-02 1 53 LNU910 0,761 1,05E-02 1 4 LNU910 0,768 9,45E-03 1 12 LNU911 0,716 1,99E-02 6 11 LNU911 0,774 8,56E-03 8 10 LNU911 0,708 2,18E-02 5 41 LNU911 0,712 2,09E-02 5 51 LNU911 0,733 1,59E-02 3 6 LNU911 0,760 1,08E-02 7 30 LNU912 0,773 8,74E-03 9 17 LNU912 0,706 2,25E-02 9 44 LNU912 0,710 2,15E-02 9 43 LNU912 0,712 2,08E-02 2 47 LNU912 0,702 3,48E-02 4 18 LNU912 0,717 1,96E-02 7 15 LNU912 0,902 3,58E-04 1 30 LNU913 0,713 2,06E-02 2 31 LNU913 0,705 2,29E-02 2 22 LNU913 0,726 1,75E-02 2 37 LNU913 0,760 1,08E-02 3 17 LNU913 0,746 1,33E-02 3 40 LNU913 0,821 3,63E-03 3 44 LNU913 0,803 5,19E-03 3 36 LNU913 0,777 8,20E-03 3 34 LNU914 0,713 2,07E-02 6 40 LNU914 0,759 1,09E-02 6 34 LNU914 0,716 1,98E-02 9 8 LNU914 0,707 2,22E-02 5 51 LNU916 0,753 1,92E-02 1 21 LNU917 0,750 1,25E-02 6 17 LNU917 0,728 1,70E-02 6 44 LNU917 0,900 3,94E-04 4 53 LNU917 0,794 6,13E-03 4 4 LNU917 0,904 3,29E-04 4 12 LNU917 0,959 4,46E-05 3 52 LNU917 0,830 2,97E-03 3 6 LNU917 0,925 3,50E-04 3 49 LNU917 0,804 5,09E-03 3 8 LNU917 0,728 2,62E-02 1 18 LNU918 0,837 2,54E-03 9 17 LNU918 0,757 1,13E-02 8 16 LNU918 0,748 1,29E-02 3 44 LNU919 0,791 6,48E-03 9 17 LNU919 0,756 1,14E-02 9 40 LNU919 0,758 1,11E-02 9 44 LNU919 0,758 1,10E-02 9 43 LNU919 0,709 2,16E-02 9 34 LNU919 0,896 4,55E-04 2 41 LNU919 0,733 1,59E-02 2 22 LNU919 0,736 1,52E-02 2 42 LNU919 0,836 2,56E-03 2 51 LNU919 0,780 7,74E-03 2 37 LNU919 0,769 9,37E-03 2 16 LNU919 0,870 1,05E-03 8 35 LNU919 0,708 2,19E-02 3 17 LNU920 0,728 1,71E-02 6 14 LNU920 0,727 1,72E-02 6 49

Nome do Conj. de ID do Conj.

R Valor P R Valor P Gene Ex p. de Cor.

Gene Ex p. de Cor.

LNU920 0,790 1,12E-02 4 45 LNU921 0,701 2,40E-02 6 17 LNU921 0,876 8,95E-04 4 53 LNU921 0,804 5,05E-03 4 4 LNU921 0,867 1,16E-03 4 12 LNU922 0,819 3,73E-03 6 3 LNU922 0,740 1,44E-02 2 37 LNU922 0,796 5,83E-03 2 16 LNU922 0,779 7,87E-03 5 2 LNU922 0,701 2,39E-02 3 20 LNU922 0,820 6,77E-03 1 18 LNU922 0,864 2,66E-03 1 24 LNU922 0,886 1,47E-03 1 21 LNU923 0,785 7,10E-03 6 48 LNU923 0,734 1,56E-02 5 2 LNU923 0,897 4,27E-04 3 17 LNU923 0,714 2,03E-02 3 44 LNU924 0,824 3,39E-03 9 17 LNU924 0,746 1,32E-02 9 23 LNU924 0,734 1,56E-02 9 44 LNU924 0,803 5,20E-03 4 53 LNU924 0,820 3,66E-03 4 4 LNU924 0,808 4,66E-03 4 12 LNU924 0,702 2,36E-02 8 33 LNU924 0,723 1,81E-02 8 35 LNU925 0,715 2,00E-02 6 11 LNU925 0,737 1,49E-02 6 6 LNU925 0,701 2,38E-02 6 14 LNU925 0,782 7,53E-03 2 5 LNU925 0,716 1,98E-02 2 50 LNU925 0,737 1,51E-02 2 54 LNU925 0,765 9,87E-03 2 41 LNU925 0,710 2,14E-02 2 10 LNU925 0,785 7,18E-03 2 28 LNU925 0,717 1,95E-02 2 13 LNU925 0,752 1,22E-02 2 51 LNU925 0,761 1,05E-02 2 37 LNU925 0,734 1,56E-02 4 53 LNU925 0,751 1,22E-02 4 12 LNU925 0,824 3,40E-03 8 41 LNU925 0,787 6,84E-03 8 51 LNU925 0,770 9,16E-03 8 37 LNU925 0,814 4,16E-03 8 16 LNU925 0,825 6,15E-03 3 52 LNU925 0,711 2,13E-02 3 6 LNU925 0,762 1,71E-02 3 49 LNU925 0,817 3,91E-03 3 8 LNU926 0,823 3,43E-03 6 17 LNU926 0,706 2,26E-02 6 43 LNU926 0,778 8,05E-03 8 2 LNU926 0,715 2,02E-02 7 30 LNU928 0,840 4,57E-03 4 45 LNU928 0,733 2,47E-02 3 52 LNU928 0,793 1,08E-02 3 49 LNU928 0,712 3,13E-02 7 45 LNU928 0,855 1,60E-03 1 15 LNU930 0,754 1,18E-02 9 11 LNU930 0,748 1,28E-02 2 41 LNU930 0,714 2,03E-02 2 35 LNU930 0,757 1,13E-02 2 42 LNU930 0,748 1,29E-02 2 51 LNU930 0,733 1,60E-02 2 37 LNU930 0,702 2,35E-02 2 16 LNU930 0,774 1,45E-02 3 52 LNU930 0,767 1,59E-02 3 49 LNU931 0,834 2,72E-03 6 3 LNU931 0,797 5,77E-03 8 41 LNU931 0,795 5,99E-03 8 35 LNU931 0,835 2,60E-03 8 42 LNU931 0,836 2,60E-03 8 51 LNU931 0,859 1,44E-03 8 37 LNU931 0,709 2,16E-02 5 2 LNU932 0,829 5,69E-03 3 55 LNU932 0,703 3,47E-02 7 18 LNU932 0,799 9,81 E-03 7 27 LNU932 0,729 2,58E-02 7 24 LNU933 0,771 9,00E-03 5 2 LNU933 0,778 8,03E-03 1 30 LNU934 0,834 2,71 E-03 6 48 LNU934 0,868 1,13E-03 9 43 LNU934 0,711 2,10E-02 2 41 LNU934 0,755 1,16E-02 2 51 LNU934 0,757 1,12E-02 2 37 LNU934 0,716 1,98E-02 3 17 LNU934 0,897 4,31E-04 3 44 LNU935 0,739 1,46E-02 6 17 LNU935 0,781 7,62E-03 9 17 LNU935 0,765 1,62E-02 3 55 LNU935 0,927 3,22E-04 1 18 LNU935 0,815 7,47E-03 1 27 LNU935 0,871 2,21 E-03 1 24 LNU935 0,735 2,42E-02 1 21 LNU936 0,739 1,46E-02 6 36 LNU936 0,735 1,55E-02 6 34 LNU936 0,786 7,01E-03 2 42 LNU936 0,734 1,56E-02 8 16 LNU938 0,743 1,39E-02 9 17 LNU938 0,847 2,00E-03 9 44 LNU938 0,836 2,57E-03 4 30 LNU939 0,830 2,95E-03 4 53 LNU939 0,777 8,25E-03 4 4 LNU939 0,830 2,98E-03 4 12 LNU939 0,821 3,56E-03 5 5 LNU939 0,821 3,60E-03 5 50 LNU939 0,869 1,11E-03 5 54 LNU939 0,900 3,91E-04 5 13 LNU939 0,954 6,53E-05 7 18 LNU939 0,894 1,15E-03 7 27 LNU939 0,904 8,15E-04 7 24 LNU940 0,784 7,31E-03 6 6 LNU940 0,762 1,04E-02 6 40 LNU940 0,748 1,29E-02 6 14 LNU940 0,730 1,64E-02 6 34 LNU940 0,718 2,95E-02 9 52 LNU940 0,841 2,28E-03 9 6 LNU940 0,715 2,02E-02 9 14 LNJ940 0,713 2,05E-02 5 5 LNU940 0,721 1,86E-02 5 54 LNU940 0,767 9,62E-03 5 13 LNU941 0,893 5,02E-04 2 41 LNU941 0,753 1,20E-02 2 22 LNU941 0,741 1,42E-02 2 35

Nome do Conj. de IQ do Conj.

Nome do Conj. de IC do Conj.

R Valor P R Valor P Gene Exp. de Cor.

Gene Ex de Cor.

LNU941 0,721 1,87E-02 2 42 LNU941 0,891 5,44E-04 2 51 LNU941 0,824 3,37E-03 2 37 LNU941 0,857 1,52E-03 3 6 LNU942 0,716 1,99E-02 9 17 LNU942 0,786 6,97E-03 2 41 LNU942 0,737 1,50E-02 2 22 LNL942 0,740 1,43E-02 2 51 LNU942 0,839 2,43E-03 4 53 LNU942 0,829 3,01E-03 4 4 LNU942 0,846 2,01 E-03 4 12 LNU942 0,895 4,67E-04 8 31 LNU942 0,885 1,52E-03 3 52 LNU942 0,884 1,56E-03 3 49 LNU942 0,771 9,09E-03 1 53 LNU942 0,792 6,32E-03 1 4 LNU942 0,761 1,06E-02 1 12 LNU943 0,720 1,88E-02 6 17 LNU943 0,766 9,80E-03 5 19 LNU943 0,773 8,75E-03 5 28 LNU943 0,701 2,38E-02 5 13 LNU944 0,803 5,12E-03 6 26 LNU944 0,861 1,38E-03 6 20 LNU944 0,805 4,92E-03 6 23 LNU944 0,718 1,95E-02 6 44 LNU944 0,804 5,03E-03 2 28 LNU944 0,750 1,25E-02 8 47 LNU944 0,795 1,05E-02 3 52 LNU944 0,747 2,08E-02 3 49 LNU944 0,752 1,22E-02 3 8 LNU945 0,703 2,34E-02 6 14 LNU945 0,813 4,27E-03 2 47 LNU945 0,805 4,92E-03 8 35 LNU946 0,791 6,43E-03 6 17 LNU946 0,795 5,99E-03 6 44 LNU946 0,898 4,26E-04 5 16 LNU946 0,745 1,34E-02 3 23 LNU946 0,867 2,49E-03 7 18 LNU946 0,899 9,92E-04 7 27 LNU946 0,796 1,02E-02 7 24 LNU947 0,736 1,52E-02 9 40 LNU947 0,741 1,41E-02 9 34 LNU947 0,717 1,96E-02 1 53 LNU947 0,847 1,98E-03 1 4 LNU947 0,705 2,29E-02 1 12 LNU948 0,780 7,76E-03 6 48 LNU948 0,710 2,15E-02 6 3 LNU948 0,705 2,27E-02 1 30 LNU949 0,751 1,23E-02 6 52 LNU949 0,800 5,48E-03 6 11 LNU949 0,834 2,72E-03 6 6 LNU949 0,736 1,52E-02 6 14 LNU949 0,758 1,11E-02 6 49 LNU949 0,730 1,66E-02 2 47 LNU949 0,764 1,01E-02 4 53 LNU949 0,843 2,17E-03 4 4 LNU949 0,756 1,14E-02 4 12 LNU949 0,795 6,00E-03 5 5 LNU949 0,805 4,96E-03 5 50 LNU949 0,780 7,77E-03 5 54 LNU949 0,799 5,56E-03 5 13 LNU949 0,758 1,11E-02 3 8 LNU950 0,739 1,47E-02 6 3 LNU951 0,744 1,37E-02 2 13 LNU952 0,838 4,78E-03 3 52 LNU952 0,870 1,07E-03 3 6 LNU952 0,776 1,39E-02 3 49 LNU952 0,796 5,90E-03 3 8 LNU952 0,785 1,21E-02 1 45 LNU952 0,786 7,02E-03 1 53 LNU952 0,728 1,70E-02 1 4 LNU952 0,774 8,66E-03 1 12 LNU953 0,774 1,44E-02 3 52 LNU953 0,771 1,51E-02 3 49 LNU953 0,726 1,74E-02 3 • 8 LNU954 0,814 4,13E-03 6 52 LNU954 0,715 2,02E-02 6 14 LNU954 0,793 6,19E-03 6 49 LNU954 0,726 2,69E-02 4 45 LNU954 0,860 1,42E-03 8 5 LNU954 0,861 1,36E-03 8 50 LNU954 0,851 1,79E-03 8 54 LNU954 0,739 1,46E-02 8 10 LNU954 0,871 1,04E-03 8 35 LNU954 0,782 7,52E-03 8 13 LNU954 0,802 5,29E-03 5 5 LNU954 0,774 8,55E-03 5 54 LNU954 0,762 1,04E-02 5 10 LNU954 0,750 2,00E-02 7 18 LNU954 0,730 2,57E-02 7 24 LNU955 0,732 1,61E-02 9 17 LNU955 0,805 8,86E-03 4 18 LNU955 0,812 7,90E-03 4 27 LNU955 0,728 2,63E-02 4 24 LNU955 0,824 3,40E-03 8 33 LNU955 0,851 1,80E-03 8 39 LNU955 0,705 2,27E-02 5 2 LNU955 0,710 2,15E-02 1 30 LNU956 0,786 1,21E-02 4 45 LNU956 0,787 1,19E-02 1 45 LNU957 0,749 1,27E-02 6 29 LNU957 0,743 1,37E-02 6 20 LNU957 0,782 1,27E-02 3 55 LNU958 0,801 5,37E-03 9 17 LNU958 0,773 8,77E-03 4 30 LNU958 0,800 5,47E-03 8 33 LNU958 0,799 5,53E-03 8 39 LNU958 0,759 1,09E-02 8 16 LNU958 0,720 1,88E-02 5 41 LNU958 0,886 6,41 E-04 5 16 LNU959 0,827 3,13E-03 2 41 LNU959 0,747 1,29E-02 2 22 LNU959 0,757 1,13E-02 2 51 LNU959 0,778 8,02E-03 2 16 LNU959 0,727 1,72E-02 4 9 LNU959 0,928 3,02E-04 3 52 LNU959 0,871 1,03E-03 3 6 LNU959 0,701 2,39E-02 3 14 LNU959 0,893 1,17E-03 3 49 LNU959 0,771 8,97E-03 3 8 LNU960 0,865 1,23E-03 6 17 LNU960 0,886 6,43E-04 6 44

Nome do Conj. de ID do Conj. Nome do Conj. de ID do Conj. R Valor P R Valor P Gene Exp. de Cor. Gene Exp. de Cor. LNU960 0,771 9,08E-03 9 26 LNU960 0,807 4,82E-03 9 23 LNU960 0,722 1,83E-02 9 44 LNU960 0,754 1,17E-02 2 42 LNU960 0,759 1,10E-02 2 37 LNU960 0,932 8,55E-05 4 53 LNU960 0,870 1,05E-03 4 4 LNU960 0,932 8,83E-05 4 12 LNU960 0,738 1,49E-02 5 13 LNU960 0,703 2,34E-02 5 51 LNU961 0,738 1,47E-02 6 20 LNU961 0,803 5,15E-03 9 17 LNU961 0,836 2,56E-03 9 44 LNU961 0,735 1,54E-02 9 43 LNU961 0,745 1,35E-02 8 33 LNU961 0,824 3,40E-03 8 35 LNU961 0,781 7,82E-03 3 8 LNU961 0,874 2,06E-03 7 18 LNU961 0,954 6,50E-05 7 27 LNU961 0,789 1,14E-02 7 24 LNU962 0,808 4,66E-03 2 16 LNU962 0,725 1,76E-02 5 28 LNJ962 0,897 1,06E-03 3 52 LNU962 0,848 1,93E-03 3 6 LNU962 0,892 1,22E-03 3 49 LNU962 0,706 3,36E-02 1 45 LNU964 0,706 2,24E-02 2 33 LNU964 0,778 8,03E-03 2 41 LNU964 0,756 1,14E-02 2 35 LNU964 0,820 3,71E-03 2 51 LNU964 0,820 3,71E-03 2 37 LNU964 0,778 8,06E-03 3 44 LNU964 0,713 2,06E-02 1 53 LNU964 0,712 2,08E-02 1 12 LNU965 0,828 3,08E-03 6 48 LNU965 0,745 1,35E-02 6 3 LNU965 0,779 7,92E-03 2 33 LNU965 0,885 6,71E-04 2 41 LNU965 0,767 9,59E-03 2 39 LNU965 0,829 3,04E-03 2 51 LNU965 0,861 1,39E-03 2 37 LNU965 0,875 9,24E-04 2 16 LNU966 0,709 2,17E-02 6 52 LNU966 0,708 2,20E-02 6 3 LNU966 0,748 1,29E-02 3 6 LNU966 0,716 3,00E-02 7 45 LNU967 0,800 5,48E-03 6 17 LNU967 0,766 9,82E-03 4 53 LNU967 0,707 2,22E-02 4 4 LNU967 0,768 9,41E-03 4 12 LNU968 0,771 9,02E-03 6 48 LNL968 0,719 1,90E-02 2 33 LNU968 0,919 1,71E-04 2 41 LNU968 0,904 3,35E-04 2 51 LNU968 0,781 7,72E-03 2 37 LNU968 0,734 1,56E-02 2 16 LNU968 0,788 6,83E-03 3 17 LNU968 0,826 3,22E-03 3 43 LNU969 0,805 4,95E-03 2 42 Tabela 36. São fornecidas as correlações (R) entre os níveis de expressão dos genes que melhoram a produção e seus homólogos em vários tecidos [Folha bandeira, meristema da flor, caule e flor; Conjuntos de Expressão (Exp.)] e o desempenho tenotípico em vários componentes de vigor, produção, biornassa elou taxa de crescimento [Vetor de correlação (Cor.)] sob condições normais e de estresse em acessos de sorgo. P = valor-p.

EXEMPLO 6

PRODUÇÃO DE TRANSCRIPTOMA DE SORGO E ANÁLISE DE CORRELAÇÃO DE ALTA PRODUTIVIDADE COM PARÂMETROS RELACIONADOS À BIOMASSA, NUE E ABST MEDIDOS EM CONDIÇÕES SEMI-HIDROPÕNICAS UTILIZANDO MICROARRANJOS DE OLIGONUCLEOTTDEO DE SORGO 44K.

[00439] Parâmetros relacionados ao vigor do Sorgo sob condições de baixo nitrogênio, 100 mM NaCl, baixa temperatura (10 ± 2°C) e condições normais de cultivo - Dez híbridos de Sorgo foram cultivados em 3 lotes repetitivos, cada um contendo 17 plantas, em uma estufa de rede em condições semi-hidropônicas. Em suma, o protocolo de cultivo deu-se conforme segue: as sementes de Sorgo foram semeadas em tabuleiros cheios com uma mistura de vermiculite e turfa na proporção de 1:1. Após a germinação, os tabuleiros foram transferidos para a solução de alta salinidade (100 mM NaCl, além da solução Completa de Hogland) em baixa temperatura (10 ± 2°C, na presença da solução Completa de Hogland), solução de baixo nitrogênio (a quantia de nitrogênio total foi reduzida em 90% a partir da solução Completa de Hogland (ou seja, a uma concentração final de 10% a partir da solução Completa de Hogland, quantia final de 1,2 mM N) ou em solução de cultivo Normal [solução Completa de Hogland contendo 16 mM N, a 28 ± 2°C]. As plantas foram cultivadas a 28 ± 2°C.

[00440] A solução Completa de Hogland consiste de: KNO3 - 0,808 gramas/litro, MgSO4 - 0,12 gramas/litro, KH2PO4 - 0,172 gramas/litro e 0,01% (volume/volume) dos microelementos de "Super coratina" (Ferro-EDDHA [etilenodiamina-N,N'- bis(ácido 2-hidroxifenilacético)] - 40,5 gramas/litro; Mn - 20,2 gramas/litro; Zn 10,1 gramas/litro; Co 1,5 gramas/litro, e Mo 1,1 gramas/litro), o pH da solução deverá ser 6,5-6,8].

[00441] Tecidos de Sorgo analisados - Todos os 10 híbridos de Sorgo selecionados foram amostrados para cada tratamento. Três tecidos [folhas, meristemas e raízes] cultivados em 100 mM NaCl, em baixa temperatura (10 i 2°C), baixo nitrogênio (1,2 mM N) ou sob condições Normais foram amostrados e o RNA foi extraído, conforme descrito acima. Cada tipo de tecido de informação de expressão de microarranjo recebeu um ID de Conjunto, conforme resumido na Tabela 37 abaixo.

Tabela 37

Conjuntos de expressão de transcriptoma de Sorgo sob condições semi-hidropônicas ID de Conjunto Conjunto de Expressão 1 Raízes de soro sob condições de frio 2 Raízes de soro sob condições normais 3 Raízes de sorgo sob condições de baixo N 4 Raízes de sorgo sob condições de 100 mM NaCI 5 Meristemas de sorgo sob consições de frio 6 Meristemas de sorgo sob consições normais 7 Meristemas de sorgo sob consições de baixo N 8 Meristemas de sorgo sob consições de 100 mM NaCI Tabela 37: São fornecidos os conjuntos de expressão de transcriptoma do Sorgo. Condições de frio = 10 ± 2°C; NaCI =100 mM NaC1; baixo nitrogénio =1,2 mM de Nitrogénio; condições Normais = 16 mM de Nitrogênio.

Resultados Experimentais:

[00442] 10 diferentes híbridos de Sorgo foram cultivados e caracterizados com relação aos seguintes parâmetros: "Número de folhas" = número de folhas por planta (média de cinco plantas) , "Altura da Planta" = altura da planta [cm] (média de cinco plantas), "Raiz DW/Planta" - peso seco da raiz por planta (média de cinco plantas) ; "Broto DW/Planta" - peso seco do broto por planta (média de cinco plantas) (Tabela 38); A média para cada um dos parâmetros medidos foi calculada utilizando o software JMP e os valores foram resumidos na Tabelas 39-45 abaixo. Uma análise de correlação subsequente foi conduzida (Tabela 46). Os resultados foram, então, integrados à base de dados. Tabela 38 Parâmetros correlacionados ao Sorno (vetores) ID de Correla ão Parâmetros relacionados com 1 DW da Raiz/Planta -100 mM NaCI [g.] 2 DW da Raiz/Planta — Fdo [g.] 3 DW da Raiz/Planta - Baixo Nitrogénio [g.] 4 DW da Raiz/Planta - Normal [g.] 5 DW do Broto/Planta - Baixo Nitr ênio 6 DW do Broto/Planta -100 mM NaCI 7 DW do BrotolPlanta - Frio [g.] 8 DW do Broto/Planta - Normal [g.]

ID de Correlação Parâmetros relacionados com 9 Folha TP1 - 100 mM NaCI [número] 10 Folha TP1 - Frio [número] 11 Folha TP1 - Baixo Nitrogênio [número] 12 Folha TP1 - Normal [número] 13 Folha TP2 -100 mM NaCI número 14 Folha TP2 - Frio [número] [número] 15 Folha TP2 - Baixo Nitrogênio [número] 16 Folha TP2 - Normal [número] 17 Folha TP3 -100 mM NaCI número 18 Folha TP3 - Frio €número] 19 Folha TP3 - Baixo Nitrogênio [número] 20 Folha TP3 - Normal [número] 21 Baixo N - NUE por biomassa total 22 Baixo N - Broto/Raiz 23 Baixo N - NUE das raízes 24 Baixo N - NUE dos brotos 25 Baixo N - % de biomassa da raiz comparado ao normal 26 Baixo N - % de biomassa do broto comparado ao normal 27 Baixo N - % de redução de biomassa total comparado ao normal 28 Nível N/ Folha [Baixo Nitrogénio] 29 Nível N/ Folha [100 mM NaCf] 30 Nivel N/ Folha [Frio] 31 Nivel N/ Folha [Normal] 32 Normal - Broto/Raiz 33 Norma - NUE das raízes 34 Normal - NUE dos brotos 35 Normal- NUE por biomassa total 36 Altura da Planta TP1 -100 mM NaCI cm 37 Altura da Planta TP1 - Frio[cm] 38 Altura da Planta TP1 - Baixo Nitrogênio [cm] 39 Altura da Planta TP1 — Normal[cm] 40 Altura da Planta TP2 - Frio[cm] 41 Altura da Planta TP2 - Baixo Nitrogênio [cm] 42 Altura da Planta TP2 — Normal[cm] 43 Altura da Planta TP2 -100 mM NaCI [cm] 44 Altura da Planta TP3 -100 mM NaCI[cm] 45 Altura da Planta TP3 - Baixo Nitrogênio [cm] 46 Número de folhas RGR - Normal 47 Biomassa da Raiz [DW- g.]/SPAD 1100 mM NaCI 48 Biomassa da Raiz [DW- g.]/SPAD Frio 49 Biomassa da Raiz [DW- g.]/SPAD Baixo Nitrogênio] 50 Biomassa da Raiz [DW- . ISPAD[Normat] 51 SPAD - Frio 52 SPAD - Baixo Nitrogênio 53 SPAD - Normal 54 SPAD 100 - mM NaCI 55 Biomassa do Broto [DW- g.]/SPAD [100 mM NaCl] 56 Biomassa do Broto [DW- . ISPAD [Frio] 57 Biomassa do Broto [DW- g.]/SPAD [Baixo Nitrogênio] 58 Biomassa do Broto[DW-gjLSPAQ[ormal] 59 Biomassa Total - Raiz+Broto DW- g.]/SPAD L100 mM NaCI 60 Biomassa Total - Raiz+Broto DW-g.]/SPAD [Frio] 61 Biomassa Total - Raiz+Broto [DW- g.]/SPAD [Baixo Nitrogênio] 62 Biomassa Total - Raiz+Broto[DW-g]/SPAD [Normal] 1 goela 38, São tornecidos os parâmetros correlacionados ao Sorgo.

Condições de frio = 10 ± 2°C; NaCI = 100 mM NaCI; baixo nitrogênio = 1,2 mM de Nitrogênio; Condições normais = 16 mM de Nitrogénio;' TP1-2-3 referem-se aos períodos de tempos 1, 2 e

3.

Tabela 39 Acessos de Sorgo, parãmetros medidos sob condições de cultivo de baixo nitrogénio ID de Cor.! ID de 3 5 11 15 19 38 41 45 52 1 linha Linha-1 0,04 0,08 3,00 4,00 3,90 6,73 13,30 22,23 26,88 0,05 Linha-2 0,11 0,19 3,13 4,58 4,27 9,77 20,63 31,07 28,02 0,10 Linha-3 0,20 0,33 3,87 4,97 4,70 12,70 23,70 34,67 29,64 0,12 Linha-4 0,10 0,16 3,53 4,73 4,23 8,67 18,03 30,03 31,52 0,07 Linha-5 0,08 0,16 3,20 4,60 4,30 9,77 19,33 30,83 29,61 0,08 Linha-6 0,09 0,16 3,13 4,70 4,57 9,23 19,20 29,87 26,82 0,08 Linha-7 0,13 0,26 3,13 4,97 4,63 10,27 21,87 30,87 28,48 0,14 Linha-8 0,09 0,20 3,30 4,87 4,67 10,10 22,13 32,40 28,21 0,10 Linha-9 0,09 0,13 3,07 4,67 3,97 7,93 18,20 29,37 30,48 0,17 Linha-10 0,09 0,18 3,07 4,57 4,10 8,23 21,00 30,70 27,63 0,14 Tabela 39: São fornecidos os valores de cada um dos parãmetros (conforme descrito acima) medidos em acessos de Sorgo (ID de linha) sob condições de baixo nitrogênio. As condições de cultivo são especificadas na seção de procedimento experimental.

Tabela 40 Acessos adicionais de Sorgo, parâmetros medidos sob condições de cultivo de baixo nitrocênio ID de Cor.! ID 21 22 23 24 25 26 27 28 49 57 61 de linha Linha-1 27,528 1,875 9,647 17,881 84,528 81,573 82,585 6,892 0,002 0,003 0,005 Linha-2 64,124 1,707 23,538 40,586 80,954 79,164 79,812 6,568 0,004 0,007 0,011 Linha-3 115,231 1,731 43,877 71,354 117,004 104,754 109,104 6,307 0,007 0,011 0,018 Linha-4 58,017 1,568 22,580 35,436 100,519 103,497 102,317 7,446 0,003 0,005 0,008 Linha-5 52,219 2,096 16,886 35,333 72,538 83,707 79,737 6,886 0,003 0,005 0,008 Linha-6 35,103 1,815 12,440 22,663 71,777 83,215 78,767 5,873 0,003 0,006 0,009 Linha-7 84,575 2,062 28,194 56,381 93,472 107,689 102,492 6,146 0,005 0,009 0,014 Linha-8 63,728 2,097 20,528 43,200 76,051 81,386 79,588 6,046 0,003 0,007 0,010 Linha-9 47,029 1,504 18,756 28,273 86,820 70,300 76,073 7,683 0,003 0,004 0,007 Linha-10 59,998 1,999 20,086 39,912 80,511 75,859 77,355 6,740 0,003 0,007 0,010 i apeia 4u: aao iorneciaos os vaores ae cada um dos parametros (conforme descrito acima) medidos em acessos de Sorgo (ID de linha) sob condições de baixo nitrogênio. As condições de cultivo são especificadas na seção de procedimento experimental.

Tabela 41 Acessos de Sorgo, parâmetros medidos sob condições de salinidade (100 mM NaCl) ID de Car.! ID de linha 1 6 9 13 17 36 Linha-1 0,050 0,094 3,000 4,000 4,000 7,900 Linha-2 0,104 0,186 3,133 4,367 4,133 9,500 Linha-3 0,124 0,202 3,400 4,867 4,567 10,933 Linha-4 0,069 0,137 3,067 4,600 4,433 7,933 Linha-5 0,076 0,130 3,333 4,500 4,067 9,700

ID de Cor.! ID de linha 1 6 9 13 17 36 Linha-6 0,075 0,133 3,067 4,533 4,333 8,533 Linha-7 0,135 0,154 3,067 4,500 4,133 8,900 Linha-8 0,095 0,189 3,267 4,767 4,500 10,367 Linha-9 0,165 0,099 3,000 4,320 3,780 7,000 Linha-10 0,139 0,124 3,067 4,200 4,200 7,833 auew w u 'orneciaos os vaiares ae cada um aos parametros (conrorme aescnto acima) medidos em acessos de Sorgo (ID de linha) sob condições de cultivo a 100 mM NaCI, As condições de cultivo são especificadas na seção de procedimento experimental.

Tabela 42 Acessos adicionais de Sorgo, parâmetros medidos sob condições de salinidade (100 mM NaCl) ID de Cor.! ID 29 47 55 59 43 44 54 de linha Linha-1 8,183 0,002 0,003 0,004 14,200 21,800 32,733 Linha-2 8,503 0,003 0,005 0,008 16,267 23,167 35,144 Linha -3 6,124 0,004 0,007 0,012 20,367 30,367 27,967 Linha-4 6,977 0,002 0,004 0,007 13,333 22,833 30,933 Linha-5 8,492 0,002 0,004 0,006 15,900 23,700 34,533 Linha-6 6,921 0,003 0,004 0,007 16,533 23,300 29,989 Linha-7 7,763 0,004 0,005 0,009 15,467 22,467 32,089 Linha-8 7,079 0,003 0,006 0,009 18,933 26,833 31,856 Linha-9 8,601 0,005 0,003 0,008 13,680 20,280 32,513 Linha-10 8,172 0,004 0,004 0,008 15,767 23,567 34,322 aoew ,+c. oao iornecioos os vaiares ae cada um aos parametros contorme aescnto acima) medidos em acessos de Sorgo {ID de tinha) sob condições de cultivo a 100 mM NaCI. As condições de cultivo são especificadas na seção de procedimento experimental.

Tabela 43 Acessos de Sorno. tDarãmetros medidos sob condicnes cie fria ID de Cor/ ID 2 7 10 14 18 37 40 51 30 48 56 60 de linha Linha-1 0,068 0,078 3,000 3,900 4,733 6,500 11,167 28,622 6,047 0,002 0,003 0,005 Linha-2 0,108 0,154 3,000 4,133 5,333 8,767 15,867 30,311 5,683 0,004 0,005 0,009 Linha-3 0,163 0,189 3,500 4,633 5,433 10,400 18,433 27,044 4,978 0,006 0,007 0,013 Linha-4 0,093 0,112 3,167 4,167 5,500 6,800 12,200 32,278 5,869 0,003 0,003 0,006 Linha-5 0,084 0,130 3,400 4,267 5,333 9,033 16,033 28,278 5,302 0,003 0,005 0,008 Linha-6 0,114 0,165 3,200 4,233 5,067 9,000 14,633 29,889 5,899 0,004 0,006 0,009 Linha-7 0,137 0,152 •3,133 4,200 4,500 7,967 14,600 32,467 7,215 0,004 0,005 0,009 Linha-8 0,127 0,150 3,067 4,300 5,400 9,167 17,267 28,633 5,302 0,004 0,005 0,010 1-inha-9 0,108 0,112 3,067 4,167 5,367 6,500 13,433 31,711 5,909 0,003 0,004 0.007 Linha-10 0,139 0,141 3,000 4,000 5,182 7,227 13,909 29,557 5,704 0,005 0,005 0,009 aoeia'+,3: oaa rorneciaos os valores ae cada um aos parametros {contomie descrito acima) medidos em acessos de Sorgo (ID de linha) sob condições de cultivo frias. As condições de cultivo são especificadas na seção de procedimento experimental.

Tabela 44 Acessos de Sorgo, parâmetros medidos sob condições de cultivo rectular ID de CorJ JD de linha 4 8 12 16 20 39 42 46 53 Linha-1 0,053 0,101 3,000 4,167 5,333 7,467 14,967 0,155 26,700 Linha-2 0,134 0,236 3,067 4,500 5,867 9,300 18,233 0,186 29,333 Linha-3 0,173 0,313 3,800 4,800 6,200 12,867 22,100 0,159 29,856 Linha-4 0,103 0,158 3200 , 4,600 5,800 8,567 17,600 0,173 29,089 Linha-5 0,107 0,194 3,233 4,533 5,800 8,933 18,067 0,171 24,978 Linha-6 0,120 0,188 3,233 4,967 5,733 8,533 18,533 0,168 24,622

.ç - .---. "•T_ -'--..--

ID de Cor] ID de linha 4 8 12 16 20 39 42 46 53 Linha-7 0,139 0,241 3,133 4,600 5,733 10,667 22,833 0,174 30,789 Linha-8 0,124 0,244 3,433 4,933 6,000 10,267 22,033 0,171 25,500 Linha-9 0,099 0,185 3,000 4,500 5,600 7,867 20,033 0,174 32,889 Unha-10 0,115 0,242 3,000 4,567 6,067 8,767 21,800 0,204 33,544 1 dL) ld 44: Jdo iorneciaos as valores oe cada um aos parametros (contarme deserto acima) medidos em acessos de Sorgo(lu de linha) sob condições de cultivo regular. As condições de cultivo são especificadas na seção de procedimento experimental.

Tabela 45 Acessos adicionais de Sorgo, parâmetros medidos sob condições de cultivo regular ID de CorJ ID 31 32 33 34 35 50 58 62 de linha Linha-1 5,006 1,984 0,861 1,653 2,514 0,002 0,004 0,006 Linha-2 5,000 1,936 2,193 3,866 6,059 0,005 0,008 0,013 Linha-3 4,815 1,897 2,828 5,137 7,964 0,006 0,010 0,016 Linha-4 5,015 1,586 1,694 2,582 4,276 0,004 0,005 0,009 Linha-5 4,307 1,813 1,755 3,183 4,939 0,004 0,006 0,012 Linha-6 4,295 1,579 1,960 3,081 5,041 0,005 0,008 0,012 Linha-7 5,370 1,759 2,275 3,948 6,223 0,005 0,008 0,012 Linha-8 4,250 1,988 2,036 4,003 6,038 0,005 0,010 0,014 Linha-9 5,873 1,895 1,086 2,022 3,108 0,003 0,006 0,009 Linha-10 5,529 2,198 1,881 3,968 5,849 0,003 0,007 0,011 i apeia 44: Sao iorneciaos os valores de cada um dos parãmetros (conforme descrito acima) medidos em acessos de Sorgo (ID de linha) sob condições de cultivo regular. As condições de cultivo são especificadas na seção de procedimento experimental.

Tabela 46 Correlação entre o nível de expressão de genes selecionados de algumas aplicações da invenção em raízes e o desempenho fenotípico sob condições de estresse abiótico ou normal em acessos de sorgo Nome do Nome do Gene R Valor P Conj. de Exp. Conj, de Cor. Gene R Valor P Conj. de Exp. onj. de Cor. LNU856 0,862 1,26E-02 3 49 LNU856 0,860 1,31E-02 3 3 LNU856 0,933 2,14E-03 3 5 LNU856 0,812 2,67E-02 3 45 LNU856 0,851 1,52E-02 3 23 LNU856 0,896 6,34E-03 3 61 LNU856 0,928 2,59E-03 3 24 LNU856 0,921 3,24E-03 3 21 LNU856 0,877 9,56E-03 3 57 LNU856 0,855 1,42E-02 3 41 LNU856 0,801 9,50E-03 2 20 LNU856 0,840 2,37E-03 1 18 LNU857 0,716 7,05E-02 3 22 LNU857 0,812 7,87E-03 6 49 LNU857 0,777 1,37E-02 6 3 LNU857 0,778 1,36E-02 6 5 LNU857 0,777 1,37E-02 6 23 LNU857 0,811 7,92E-03 6 61 LNU857 0,778 1,36E-02 6 24 LNU857 0,787 1,19E-02 6 21 LNU857 0,727 2,65E-02 6 38 LNU857 0,795 1,04E-02 6 57 LNU857 0,703 3,47E-02 2 34 LNU857 0,757 1,82E-02 5 7 LNU857 0,744 2,15E-02 5 48 LNU857 0,701 3,52E-02 5 10 LNU857 0,858 3,08E-03 5 56 LNU857 0,827 5,94E-03 5 60 LNU857 0,847 3,99E-03 5 37 LNU857 0,871 2,26E-03 5 40 1 LNU857 0,854 3,42E-03 5 14 LNU859 0,899 3,96E-04 1 48 LNU859 0,850 1,84E-03 1 2 LNU859 0,712 2,10E-02 1 56 LNU859 0,829 3,04E-03 1 60 LNU860 0,848 1,59E-02 3 28 LNU860 0,721 2,82E-02 6 45 LNU861 0,756 1,85E-02 6 45 LNU861 0,768 1,57E-02 6 41 LNU861 0,700 3,57E-02 8 4 LNU861 0,776 1,40E-02 8 42 LNU862 0,705 7,70E-02 3 26 LNU862 0,804 8,99E-03 5 30 LNU863 0,792 1,09E-02 6 49

ID do ID do Nome do Conj.

Nome do Con]. R Valor P Conj. de R Valor P . Conj de Gene de Exp.

Gene de Exp, Cor Cor.

LNU863 0,790 1,13E-02 6 3 LNU863 0,734 2,43E-02 6 5 LNU863 0,790 1,13E-02 6 23 LNU863 0,756 1,84E-02 6 61 LNU863 0,734 2,43E-02 6 24 LNU863 0,764 1,65E-02 6 21 LNU863 0,720 2,88E-02 6 57 LNU863 0,738 2,32E-02 7 1 LNU863 0,818 7,05E-03 7 59 LNU863 0,838 4,83E-03 7 47 LNU863 0,766 1,60E-02 2 8 LNU863 0,781 1,29E-02 2 42 LNU863 0,709 3,28E-02 8 20 LNU863 0,838 4,76E-03 8 42 LNU864 0,801 3,04E-02 3 28 LNU864 0,897 1,05E-03 5 30 LNU866 0,719 6,86E-02 3 5 LNU866 0,720 6,82E-02 3 45 LNU866 0,721 6,77E-02 3 24 LNU866 0,705 7,71 E-02 3 57 LNU866 0,817 2,48E-02 3 41 LNU870 0,840 1,80E-02 3 5 LNU870 0,861 1,28E-02 3 45 LNU870 0,766 4,45E-02 3 61 LNU870 0,790 3,46E-02 3 38 LNU870 0,829 2,11E-02 3 57 LNU870 0,879 9,10E-03 3 41 LNU870 0,705 3,39E-02 6 52 LNU871 0,701 3,55E-02 5 10 LNU872 0,739 5,75E-02 3 52 LNU872 0,793 1,09E-02 6 49 LNU872 0,780 1,32E-02 6 3 LNU872 0,800 9,62E-03 6 5 LNU872 0,739 2,29E-02 6 11 LNU872 0,780 1,32E-02 6 23 LNU872 0,802 9,38E-03 6 61 LNU872 0,800 9,62E-03 6 24 LNU872 0,802 9,33E-03 6 21 LNU872 0,841 4,52E-03 6 38 LNU872 0,791 1,11E-02 6 57 LNU876 0,809 2,75E-02 3 5 LNU876 0,792 3,39E-02 3 45 LNU876 0,703 7,82E-02 3 61 LNU876 0,705 7,70E-02 3 22 LNU876 0,877 9,56E-03 3 38 LNU876 0,713 7,21E-02 3 19 LNU876 0,723 6,66E-02 3 57 LNU876 0,801 9,52E-03 6 49 LNU876 0,830 5,65E-03 6 3 LNU876 0,790 1,12E-02 6 5 LNU876 0,782 1,28E-02 6 45 LNU876 0,798 9,87E-03 6 11 LNU876 0,830 5,65E-03 6 23 LNU876 0,774 1,43E-02 6 61 LNU876 0,790 1,12E-02 6 24 LNU876 0,797 1,01E-02 6 21 LNU876 0,773 1,45E-02 6 38 LNU876 0,760 1,74E-02 6 57 LNU876 0,754 1,90E-02 6 41 LNU876 0,740 2,25E-02 2 46 LNU876 0,713 3,12E-02 2 12 LNU876 0,827 5,95E-03 2 20 LNU876 0,807 8,53E-03 5 14 LNU876 0,720 1,89E-02 1 14 LNU878 0,901 5,64E-03 3 27 LNU878 0,825 2,22E-02 3 25 LNU878 0,779 3,88E-02 3 11 LNU878 0,793 3,33E-02 3 26 LNU878 0,755 1,16E-02 1 30 LNU879 0,877 9,44E-03 3 27 LNU879 0,724 6,60E-02 3 25 LNU879 0,904 5,24E-03 3 11 LNU879 0,749 5,28E-02 3 28 LNU879 0,897 6,12E-03 3 26 LNU879 0,724 2,73E-02 7 54 LNU879 0,811 7,99E-03 2 46 LNU879 0,888 1,37E-03 2 32 LNU879 0,711 3,17E-02 5 7 LNU879 0,821 6,73E-03 5 56 LNU879 0,761 1,71 E-02 5 60 LNU879 0,832 5,38E-03 5 37 LNU879 0,785 1,23E-02 5 40 LNU879 0,820 6,79E-03 5 14 LNU879 0,741 1,43E-02 1 30 LNU881 0,731 6,19E-02 3 38 LNU883 0,744 5,51E-02 3 49 LNU883 0,750 5,21E-02 3 3 LNU883 0,901 5,61E-03 3 5 LNU883 0,794 3,30E-02 3 45 LNU883 0,708 7,50E-02 3 11 LNU883 0,828 2,14E-02 3 61 LNU883 0,781 3,82E-02 3 24 LNU883 0,747 5,34E-02 3 21 LNU883 0,701 7,93E-02 3 38 LNU883 0,753 5,08E-02 3 19 LNU883 0,839 1,83E-02 3 57 LNU883 0,768 4,35E-02 3 41 LNU8B3 0,700 3,57E-02 5 30 LNU884 0,745 5,48E-02 3 23 LNU884 0,725 6,54E-02 3 24 LNU884 0,750 5,23E-02 3 21 LNU884 0,704 7,77E-02 3 41 LNU884 0,714 3,09E-02 8 50 LNU884 0,713 3,12E-02 8 12 LNU884 0,729 1,67E-02 1 7 LNU884 0,748 1,28E-02 1 56 LNU8S4 0,787 6,95E-03 1 37 LNU885 0,851 1,51E-02 3 52 LNU885 0,709 7,44E-02 3 28 LNU885 0,736 2,37E-02 2 39 LNU885 0,821 6,72E-03 5 18 LNU888 0,835 1,93E-02 3 27 LNU888 0,844 1,70E-02 3 25 LNU888 0,762 4,66E-02 3 11 LNU889 0,794 1,06E-02 5 10 LNU889 0,740 2,27E-02 5 56 LNU889 0,710 3,22E-02 5 60 LNU889 0,713 3,11E-02 5 37 LNU889 0,847 3,95E-03 5 14 LNU892 0,799 3,12E-02 3 3

ID do ID do Nome do Nome do Conj.

R Valor P Conj.

Conj, de R Valor P Conj. de Gene de Exp.

Gene de Exp.

Cor.

Cor, LNU892 0,796 3,23E-02 3 11 LNU895 0,803 2,96E-02 3 49 LNU895 0,857 1,37E-02 3 3 LNU895 0,845 1,66E-02 3 15 LNU895 0,718 6,92E-02 3 5 LNU895 0,868 1,14E-02 3 45 LNU895 0,877 9,60E-03 3 23 LNU895 0,700 7,99E-02 3 61 LNU895 0,765 4,53E-02 3 24 LNU895 0,826 2,22E-02 3 21 LNU895 0,717 6,97E-02 3 38 LNU895 0,779 3,91E-02 3 41 LNU895 0,723 2,77E-02 6 45 LNU895 0,707 3,31E-02 6 52 LNU895 0,710 3,21E-02 2 53 LNU895 0,825 6,24E-03 8 31 LNU895 0,787 1,18E-02 8 53 LNU895 0,765 9,90E-03 1 18 LNU896 0,773 4,15E-02 3 27 LNU896 0,806 2,87E-02 3 25 LNU896 0,703 2,33E-02 1 30 LNU897 0,715 3,05E-02 7 1 LNU897 0,710 3,21E-02 8 46 LNU897 0,751 1,97E-02 8 53 LNU898 0,717 7,00E-02 3 45 LNU898 0,918 3,53E-03 3 38 LNU898 0,705 3,41E-02 6 38 LNU898 0,771 9,01E-03 1 7 LNU898 0,779 7,96E-03 1 56 LNU898 0,723 1,82E-02 1 60 LNU898 0,834 2,68E-03 1 37 LNU898 0,825 3,31E-03 1 40 LNU901 0,808 8,46E-03 8 50 LNU901 0,726 2,68E-02 8 35 LNU901 0,831 5,48E-03 8 39 LNU901 0,786 1,20E-02 8 4 LNU901 0,735 2,42E-02 8 62 LNU901 0,796 1,03E-02 8 33 LNU902 0,761 1,73E-02 6 5 LNU902 0,738 2,33E-02 6 61 LNU902 0,761 1,73E-02 6 24 LNU902 0,738 2,32E-02 6 21 LNU902 0,753 1,91E-02 6 57 LNU902 0,714 3,06E-02 6 41 LNU902 0,887 1,44E-03 7 1 LNU902 0,923 3,91E-04 7 47 LNU902 0,767 1,59E-02 5 18 LNU903 0,701 7,93E-02 3 28 LNU903 0,768 1,57E-02 6 52 LNU903 0,863 1,29E-03 1 18 LNU904 0,777 3,97E-02 3 22 LNU904 0,716 3,01E-02 7 43 LNU905 0,807 2,82E-02 3 22 LNU905 0,708 3,27E-02 2 32 LNU906 0,767 4,41E-02 3 49 LNU906 0,729 6,29E-02 3 5 LNU906 0,810 2,73E-02 3 45 LNU906 0,777 3,97E-02 3 61 LNU906 0,778 3,95E-02 3 38 LNU906 0,750 5,22E-02 3 57 LNU906 0,816 2,53E-02 3 41 .NU907 0,758 1,79E-02 8 20 LNU910 0,825 6,17E-03 6 49 LNU910 0,846 4,09E-03 6 3 LNU910 0,828 5,87E-03 6 25 LNU910 0,725 2,71E-02 6 5 LNU910 0,846 4,09E-03 6 23 LNU910 0,745 2,12E-02 6 61 LNU910 0,725 2,71E-02 6 24 LNU910 0,780 1,32E-02 6 21 LNU911 0,880 8,99E-03 3 27 LNU911 0,745 5,47E-02 3 11 LN U911 0,849 1, 56E-02 3 26 LNU913 0,720 2,88E-02 7 55 LNU913 0,762 1,71E-02 7 43 LNU913 0,709 3,25E-02 5 51 LNU914 0,778 3,95E-02 3 5 LNU914 0,709 7,45E-02 3 45 LNU914 0,807 2,83E-02 3 61 LNU914 0,794 3,30E-02 3 19 LNU914 0,840 1,81E-02 3 57 LNU914 0,774 4,12E-02 3 41 LNU914 0,787 1,19E-02 6 45 LNU914 0,808 8,36E-03 6 52 LNU914 0,726 2,67E-02 6 41 LNU915 0,841 1,77E-02 3 49 LNU915 0,887 7,78E-03 3 3 LNU915 0,837 1,87E-02 3 15 LNU915 0,710 7,36E-02 3 45 LNU915 0,702 7,90E-02 3 61 LNU915 0,701 3,53E-02 5 48 LNU915 0,759 1,76E-02 5 2 LNU917 0,840 4,56E-03 2 46 LNU917 0,737 2,36E-02 2 32 LNU917 0,888 1,38E-03 B 32 LNU918 0,824 2,27E-02 3 25 LNU918 0,859 3,03E-03 2 46 LNU918 0,714 3,06E-02 2 53 LNU918 0,748 2,04E-02 8 32 LNU919 0,907 4,82E-03 3 25 LNU920 0,743 2,18E-02 5 51 LNU922 0,717 2,98E-02 6 22 LNU922 0,803 5,12E-03 1 48 LNU922 0,749 1,26E-02 1 2 LNU922 0,769 9,35E-03 1 60 LNU924 0,759 1,78E-02 8 16 LNU926 0,705 7,68E-02 3 49 LNU926 0,713 3,12E-02 7 1 LNU926 0,792 1,10E-02 7 59 LNU926 0,726 2,67E-02 7 47 LNU926 0,802 9,37E-03 5 18 LNU929 0,811 2,68E-02 3 23 LNU929 0,726 6,46E-02 3 24 LNU929 0,773 4,16E-02 3 21 LNU929 0,834 5,24E-03 2 46 LNU930 0,734 6,01E-02 3 52 LNU930 0,757 4,87E-02 3 22 LNU931 0,729 2,59E-02 2 50 LNU931 0,769 1,54E-02 2 12

Nome do do ID do Conj.

Nome do R Valor P Conj. de R Valor P Conj.

Conj. de Gene de Exp.

Gene de Exp.

Cor.

LNU931 0,759 1,77E-02 2 58 LNU931 0,759 1,78E-02 2 62 LNU932 0,749 2,01E-02 6 22 LNU933 0,881 8,82E-03 3 49 LNU933 0,887 7,74E-03 3 3 LNU933 0,742 5,60E-02 3 15 LNU933 0,803 2,97E-02 3 23 LNU933 0,713 7,22E-02 3 61 LNU933 0,798 9,90E-03 8 12 LNU933 0,713 3,12E-02 8 58 LNU934 0,817 2,48E-02 3 27 LNU934 0,818 2,45E-02 3 25 LNU934 0,803 2,98E-02 3 11 LNU934 0,703 7,80E-02 3 52 LNU934 0,861 2,90E-03 5 51 LNU934 0,771 1,50E-02 5 30 LNU935 0,736 2,38E-02 6 41 LNU935 0,700 3,57E-02 8 8 LNU935 0,758 1,78E-02 8 39 LNU935 0,746 2,10E-02 8 4 LNU935 0,856 3,25E-03 8 42 LNU940 0,851 1,51E-02 3 11 LNU940 0,904 5,20E-03 3 52 LNU941 0,785 3,66E-02 3 25 LNU942 0,916 3,72E-03 3 49 LNU942 0,915 3,90E-03 3 3 LNU942 0,786 3,61E-02 3 23 LNU942 0,759 4,80E-02 3 61 LNU942 0,784 1,25E-02 7 44 LNU942 0,764 1,66E-02 7 55 LNU942 0,871 2,24E-03 7 9 LNU942 0,793 1,08E-02 7 13 LNU942 0,792 1,09E-02 7 36 LNU942 0,744 2,15E-02 7 59 LNU942 0,811 8,01E-03 7 43 LNU942 0,767 1,59E-02 7 6 LNU942 0,744 2,16E-02 8 4 LNU943 0,713 3,11E-02 6 49 LNU943 0,750 1,99E-02 6 3 LNU943 0,790 1,12E-02 6 25 LNU943 0,750 1,99E-02 6 23 LNU944 0,715 7,09E-02 3 49 LNU944 0,739 5,78E-02 3 3 LNU944 0,928 2,57E-03 3 15 LNU944 0,807 2,81E-02 3 45 LNU944 0,735 6,01E-02 3 41 LNU944 0,710 3,21E-02 7 6 LNU944 0,826 6,07E-03 2 12 LNU944 0,721 2,83E-02 2 35 LNU944 0,715 3,05E-02 2 34 LNU944 0,742 2,21E-02 2 8 LNU944 0,714 3,07E-02 2 20 LNU944 0,826 6,06E-03 2 39 LNU944 0,748 2,04E-02 2 4 LNU944 0,739 2,30E-02 2 58 LNU944 0,734 2,44E-02 2 62 LNU944 0,711 3,17E-02 2 33 LNU945 0,830 2,08E-02 3 22 LNU945 0,746 2,10E-02 6 22 LNU952 0,789 1,15E-02 7 29 LNU952 0,814 7,65E-03 7 54 LNU952 0,708 3,28E-02 8 32 LNU953 0,805 2,91E-02 3 27 LNU953 0,776 4,04E-02 3 11 LNU953 0,906 4,97E-03 3 26 LNU953 0,729 2,58E-02 2 35 LNU953 0,734 2,43E-02 2 39 LNU953 0,701 3,53E-02 2 4 LNU953 0,769 1,55E-02 2 33 LNU953 0,741 1,43E-02 1 37 LNU954 0,707 3,31E-02 5 10 LNU955 0,718 2,95E-02 7 44 LNU955 0,725 2,70E-02 8 33 LNU956 0,720 6,80E-02 3 22 LNU956 0,713 3,11E-02 6 22 LNU958 0,797 3,17E-02 3 22 LNU958 0,826 6,10E-03 6 15 LNU958 0,724 2,75E-02 6 5 LNU958 0,798 9,93E-03 6 45 LNU958 0,704 3,43E-02 6 52 LNU958 0,724 2,75E-02 6 24 LNU958 0,711 3,18E-02 6 57 LNU958 0,809 8,24E-03 6 41 LNU958 0,846 4,08E-03 2 32 LNU958 0,766 1,61E-02 5 37 LNU958 0,789 1,14E-02 8 16 LNU958 0,792 1,09E-02 8 42 LNU959 0,799 3,12E-02 3 19 LNU959 0,723 2,78E-02 8 50 LNU959 0,749 2,03E-02 8 33 LNU960 0,742 5,60E-02 3 11 LNU962 0,739 5,80E-02 3 25 LNU964 0,837 1,88E-02 3 49 LNU964 0,852 1,49E-02 3 3 LNU964 0,727 6,44E-02 3 15 LNU964 0,884 8,34E-03 3 5 LNU964 0,760 4,75E-02 3 45 LNU964 0,834 1,97E-02 3 11 LNU964 0,778 3,93E-02 3 23 LNU964 0,756 4,91E-02 3 52 LNU964 0,841 1,76E-02 3 61 LNU964 0,813 2,63E-02 3 24 LNU964 0,819 2,41E-02 3 21 LNU964 0,780 3,84E-02 3 38 LNU964 0,808 2,77E-02 3 57 LNU964 0,716 7,03E-02 3 41 LNU964 0,700 3,57E-02 6 45 LNU964 0,705 3,40E-02 6 38 LNU965 0,798 3,15E-02 3 27 LNU965 0,848 1,59E-02 3 26 LNU966 0,743 5,59E-02 3 61 LNU966 0,757 4,86E-02 3 57 LNU967 0,874 1,01E-02 3 49 LNU967 0,890 7,28E-03 3 3 LNU967 0,779 3,88E-02 3 23 LNU967 0,702 7,88E-02 3 61 LNU967 0,787 1,18E-02 6 41 LNU968 0,732 6,15E-02 3 27 LNU969 0,717 2,98E-02 7 9

Tabela 46. São fornecidas as correlações (R) entre a produção dos níveis de expressão que melhoram os genes e seus homólogos em vários tecidos [Conjuntos de Expressão (Exp.)] e o desempenho fenotípico [componentes de vigor, produção, biornassa alou taxa de crescimento (Vetor de correlação (Cor.))] sob condições de estresse abiótico (salinidade) ou condições normais em acessos de sorgo. Cor, — vetor de correlação, conforme descrito acima (Tabela 36). P = valor-p.

EXEMPLO 7

PRODUÇÃO DE TRANSCRIPTOMA DE MILHO E ANÁLISE DE CORRELAÇÃO DE ALTA PRODUTIVIDADE COM PARÂMETROS RELACIONADOS À PRODUÇÃO E

NUE UTILIZANDO MICROARRANJO DE OLIGONUCLEOTÍDEO DE MILHO DE 60K

[00443] A fim de produzir uma análise de correlação de alta produtividade entre o fenótipo da planta e o nível de expressão do gene, os presentes inventores utilizaram um microarranjo de oligonucleotídeo de milho, produzido pela Agilent Technologies [chem (ponto) agilent (ponto) com/Scripts/PDS (ponto) asp?lPage=50879]. O arranjo do oligonucleotídeo representa cerca de 60.000 genes e transcrições de milho.

Correlação dos híbridos de Milho em ecotipos cultivados sob condições de cultivo regular Procedimentos Experimentais:

[00444] 12 híbridos de Milho foram cultivados em 3 lotes repetitivos, em campo. As sementes de Milho foram plantadas e as plantas foram cultivadas em campo, utilizando fertilização comercial e protocolos de irrigação (485 metros cúbicos de água por dunam, 30 unidades de uran, 21% de fertilização por período de cultivo completo). A fim de definir as correlações entre os níveis de expressão do RNA e os parâmetros relacionados ao vigor ou componentes de estresse e produção, os 12 diferentes híbridos de milho foram analisados. Entre eles, 10 híbridos, englobando a variação observada, foram selecionados para análise de expressão do

RNA. A correlação entre os níveis de RNA e os parâmetros caracterizados foi analisada utilizando o teste de correlação Pearson [davidmlane (ponto) com/hyperstat/A34739 (ponto) html].

[00445] Tecidos de Milho Analisados- Todos os 10 híbridos de milho foram amostrados com relação a 3 pontos de tempo (TP2 - V6-V8, TP5 = Rl-R2, TP6=R3-R4). Quatro tipos de tecidos de planta [Espiga, folha bandeira indicada na Tabela 47 como "folha", parte distal do grão, e entrenó] cultivados sob condições normais foram amostrados e o RNA foi extraído, conforme descrito acima. Cada tipo de tecido de informação de expressão de microarranjo recebeu um ID de Conjunto, conforme resumido na Tabela 47 abaixo. Tabela 47 Conjuntos de expressão de transcrintoma de Milho Conjunto de Expressão ID de Conjunto Campo de milho/Normal/Espiga TP5 1 Campo de milho/Normal/Espiga TP6 2 Campo de milho/Normal/Grão Distal 3 Campo de milho/Normal/Entrenó TP2 4 Campo de milho/Normal/Entrenó TP5 5 Campo de milholNormal/Entrenó TP6 6 Campo de milho/Normal/Folha TP2 7 Campo de milho/Normal/Folha TP5 8 Tabela 47: São fornecidos os conjuntos de expressão de transcriptoma de milho. Folha = a folha abaixo da espiga principal Meristema da flor = meristema apical após a iniciação da folha-macho; Espiga = a flor-fêmea no dia de antese. Grão Distal = milho desenvolvendo grãos a partir da área externa do sabugo, Grão Basal - milho desenvolvendo grãos a partir da área basal do sabugo; Entrenós = Entrenós localizados acima e abaixo da espiga principal na planta. TP= ponto de tempo.

[00446] Os parâmetros a seguir foram coletados utilizando um sistema de imagem digital:

[00447] Área do Grão (cm2) - No final do período de crescimento, os grãos foram separados da espiga. Uma amostra de -200 grãos foi pesada, fotografada e as imagens foram processadas utilizando o sistema de processamento de imagem descrito abaixo. A área de grão foi medida a partir daquelas imagens e foi dividida pelo número de grãos.

[00448] Comprimento do Grão e Largura do Grão (cm) - No final do período de crescimento, os grãos foram separados da espiga. Uma amostra de -200 grãos foi pesada, fotografada e as imagens foram processadas utilizando o sistema de processamento de imagem descrito abaixo. A soma do comprimento /ou largura dos grãos (eixo mais longo) foi medida a partir daquelas imagens e foi dividida pelo número de grãos.

[00449] Área da Espiga (cm2) - No final do período de crescimento, 5 espigas foram fotografadas e as imagens foram processadas utilizando o sistema de processamento de imagem descrito abaixo. A área da espiga foi medida a partir daquelas imagens e foi dividida pelo número de Espigas.

[00450] Comprimento e Largura da Espiga (cm) - No final do período de crescimento, 5 espigas foram fotografadas e as imagens foram processadas utilizando o sistema de processamento de imagem descrito abaixo. 0 comprimento e largura da espiga (eixo mais longo) foram medidos a partir daquelas imagens e foi dividida pelo número de Espigas.

[00451] Um sistema de análise de imagem foi utilizado, consistindo de um computador pessoal (processador Intel P4 3. 0 Ghz) e um programa de domínio público - ImageJ

1.37, programa de processamento de imagem com base em Java, desenvolvido no Instituto Nacional de Saúde dos Estados Unidos e livremente disponível na internet em rsbweb (ponto) nih (ponto) gov/. As imagens foram capturadas em resolução de 10 Mega Pixels (3888x2592 pixels) e armazenadas em um formato JPEG (padrão do Grupo Conjunto de Especialistas em Fotografia) de baixa compressão. Em seguida, dados de saída de processamento de imagem para área da semente e comprimento da semente foram salvos para arquivos de textos e analisados utilizando o software de análise estatística JMP (instituto SAS).

[00452] Parâmetros adicionais foram coletados por amostragem de 6 plantas por lote ou por medição do parâmetro em todas as plantas dentro do lote.

[00453] Peso Normalizado do Grão por planta (gr.) - No final do experimento, todas as espigas dos lotes dentro dos blocos de A a C foram colhidas. Seis espigas foram separadas e os grãos foram pesados, todas as espigas adicionais foram debulhadas juntas e pesadas da mesma forma. 0 peso médio de grãos por espiga foi calculado dividindo-se o peso total dos grãos pelo número total de espigas por lote (com base no lote) . No caso de 6 espigas, o peso total dos grãos de 6 espigas foi dividido por 6.

[00454] FW da Espiga (g.) - No final do experimento (quando as espigas foram colhidas), o total e 6 espigas selecionadas por lote dentro dos blocos de A a C foram colhidos separadamente. As plantas com o total e 6 foram pesadas (g.) separadamente e a média de espigas por planta foi calculada para o total [FW da Espiga (peso fresco) por lote] e para 6 (FW da Espiga por planta).

[00455] Peso da planta e altura da espiga - As plantas foram caracterizadas com relação à altura no momento da colheita. Em cada medida, 6 plantas foram medidas com relação à altura utilizando uma fita métrica. A altura foi medida a partir do nível do solo até o topo da planta abaixo da borla. A altura das espigas foi medida do nível do chão até o local onde estava localizada a espiga principal.

[00456] Número de folhas por planta - As plantas foram caracterizadas com relação ao número de folhas durante o período de cultivo em 5 pontos de tempo. Em cada medição, as plantas foram medidas com relação ao seu número de folhas, contando todas as folhas de 3 plantas selecionadas por lote.

[00457] Taxa de Crescimento Relativo - foi calculada utilizando as Fórmulas II a XIII (descritas acima).

[00458] SPAD - 0 teor de clorofila foi determinado utilizando um medidor de clorofila do tipo Minolta SPAD 502 e a medição foi realizada 64 dias após a semeadura. Leituras do medidor SPAD foram feitas em folha jovem completamente desenvolvida. Três medidas por folha foram tomadas por espiga.

Os dados foram coletados depois de 46 e 54 dias após a semeadura (DPSIdays after sowing).

[00459] Peso seco por planta - No final do experimento (quando a inflorescência estava seca), todo o material vegetal dos lotes dentro dos blocos de A a C foi colhido.

[00460] Peso seco - peso total da parte vegetal acima do solo (excluindo raízes) após a secagem a 70°C em forno por 48 horas.

[00461] Índice de Colheita (HI) (Milho) - 0 índice de colheita foi calculado utilizando a Fórmula XVII descrita acima.

[00462] Porcentagem de Espigas Preenchidas [%] - foi calculada como a porcentagem da área da Espiga com grãos fora da espiga total.

[00463] Diâmetro do Sabugo [cm] - 0 diâmetro do sabugo sem os grãos foi medido utilizando uma régua.

[00464] Número de fileiras do núcleo por espiga - O número de fileiras em cada espiga foi contado.

Resultados Experimentais:

[00465] 12 diferentes híbridos de milho foram cultivados e caracterizados com relação a diferentes parâmetros. Os parâmetros correlacionados são descritos na Tabela 48 abaixo. A média para cada um dos parâmetros medidos foi calculada utilizando o software JMP (Tabelas 49-50) e uma análise de correlação subsequente foi realizada. Os resultados foram, então, integrados à base de dados. Tabela 48 Parâmetros correlacionados ao Milho (vetores) Parâmetros correlacionados com ID de Correlação Diâmetro do Sabugo [mm] 1 DW por Planta com base em 6 2 Area da Espiga [cm2] FW da Espiga por Planta com base em 6 4 Altura da Espiga cm 5 Comprimento da Espiga cm 6 Largura da Espiga [cm] 7 FW das Espigas por Planta com base no total 8 Preenchido Por Espiga Integral 9 Area do Grão cm 10 Comprimento do Grão [cm] 11 Largura do Grão [cm] 12 Taxa de Crescimento do Número de Folhas 13 Número de fileiras do núcleo por espiga 14 Número de folhas por planta 15 Peso do Grão Normalizado por Planta com base no total 16 Peso do Grão Normalizado por Planta com base em 6 17 Porcentagem da Espiga Preenchida 18 Altura da Planta por Lote [cm] 19 SPAD 46DPS 1P2 20 SPAD 54DPS TP5 21 aoeIa 40. arxu 4our0 e arku o4u-s: Naves ae ciororiia aepois ae 4b e 54 aias apes a semeadura (UPS). 'Fw° = peso fresco; "DW" = peso seco.

Tabela 49

Parâmetros medidos em acessos de Milho sob condicões normais ID de Cor,1ID de 21 20 1 2 3 4 5 6 7 8 9 10 11 linha Linha-1 54,28 51,67 28,96 657,50 85,06 245,83 135,17 19,69 5,58 278,19 0,92 0,75 1,17 Linha-2 57,18 56,41 25,08 491,67 85,84 208,33 122,33 19,06 5,15 217,50 0,92 0,71 1,09 Linha-3 56,01 53,55 28,05 641,11 90,51 262,22 131,97 20,52 5,67 288,28 0,93 0,76 1,18 Linha-4 59,68 55,21 25,73 580,56 95,95 263,89 114,00 21,34 5,53 247,88 0,92 0,77 1,21 Linha-5 54,77 55,30 28,72 655,56 91,62 272,22 135,28 20,92 5,73 280,11 0,91 0,81 1,23 Linha-6 59,14 59,35 25,78 569,44 72,41 177,78 94,28 18,23 5,23 175,84 0,95 0,71 1,12 Linha-7 57,99 58,48 26,43 511,11 74,03 188,89 120,94 19,02 5,22 192,47 0,87 0,71 1,14 Linha-8 60,36 55,88 25,19 544,44 76,53 197,22 107,72 18,57 5,33 204,70 0,94 0,75 1,13 Linha-9 54,77 52,98 Linha-10 51,39 53,86 26,67 574,17 55.20 141,11 60,44 16,69 4,12 142,72 0,80 0,50 0,92 Linha -11 61,14 59,75 522,22 95,36 261,11 112,50 21,70 5,58 264,24 0,96 0,76 1,18 Linha-12 53,34 49,99 1 apela 49. ão tomecidos os valores de cada um dos parâmetros (conforme descrito acima) medidos em acessos de milho (ID da linha), sob condições de cultivo regular. As condições de cultivo são especificadas na seção de procedimento experimental.

Tabela 50 Parâmetros adicionais medidos em acessos de Milho sob condições normais de cultivo 1D de Cor.1ID de 12 13 14 15 16 17 18 19 linha Linha-1 0,81 0,28 16,17 12,00 153,90 140,68 80,62 278,08 Linha-2 0,81 0,22 14,67 11,11 135,88 139,54 86,76 260,50 Linha-3 0,80 0,28 16,20 11,69 152,50 153,67 82,14 275,13 Linha-4 0,80 0,27 15,89 11,78 159,16 176,98 92,71 238,50 Linha-5 0,82 0,31 16,17 11,94 140,46 156,61 80,38 286,94 Linha-6 0,80 0,24 15,17 12,33 117,14 119,67 82,76 224,83 Linha-7 0,79 0,24 16,00 12,44 123,24 119,69 73,25 264,44 Linha-8 0,84 0,27 14,83 12,22 131,27 133,51 81,06 251,61 Linha-9 Linha-10 0,68 0,19 14,27 9,28 40,84 54,32 81,06 163,78 Linha-11 0,81 0,30 15,39 12,56 170,66 173,23 91,60 278,44 Linha-12 Tabela 50. São fornecidos os valores de cada um dos parâmetros (conforme descrito acima) medidos em acessos de milho (ID da linha), sob condições de cultivo regular. As condições de cultivo são especificadas na seção de procedimento experimental, Tabela 51 Correlação entre o nível de expressão dos genes selecionados de algumas aplicações da invenção em vários tecidos e o desempenho fenotípico sob condições normais em variedades de milho Conj. ID do ID do Name do Nome do Conj. R Valor P de Conj. R Valor P Conj. de Gene Gene de Exp. Exp. de Cor. Cor. LNU811 0,752 3,14E-02 8 13 LNU811 0,724 4,23E-02 8 11 LNU811 0,748 3,30E-02 8 10 LNU813 0,737 3,68E-02 5 12 LNU813 0,766 4,48E-02 4 15 LNU813 0,738 5,84E-02 4 19 LNU813 0,854 1,44E-02 4 5 LNU813 0,827 2,16E-02 4 8 LNU813 0,701 7,96E-02 4 4 LNU813 0,746 3,37E-02 8 11 LNU813 0,750 3,19E-02 8 6 LNU813 0,873 9,59E-04 6 20 LNU813 0,843 3,53E-02 2 15 LNU814 0,726 4,16E-02 5 11 LNU814 0,790 1,97E-02 5 6 LNU814 0,753 8,40E-02 4 1

Conj.

ID do .1D do Nome do Nome do Con, R Valor P de Conj.

R Valor P Conj. de Gene Gene de Exp.

Ex . de Cor.

Cor.

LNU814 0,900 5,74E-03 4 14 LNU814 0,748 5,34E-02 4 6 LNU814 0,867 1,15E-02 4 8 LNU814 0,825 2,22E-02 4 4 LNU814 0,770 7,34E-02 7 1 LNU814 0,746 5,40E-02 7 14 LNUB14 0,824 2,28E-02 7 13 LNU814 0,815 2,54E-02 7 6 LNU814 0,844 1,70E-02 7 8 LNU814 0,813 2,62E-02 7 4 LNU814 0,892 6,99E-03 1 14 LNU814 0,735 5,99E-02 1 8 LNU814 0,756 4,94E-02 1 4 LNU814 0,789 6,62E-03 6 6 LNU814 0,782 7,51E-03 6 8 LNU814 0,770 9,12E-03 6 4 LNU814 0,749 8,63E-02 2 3 LNU814 0,722 1,05E-01 2 16 LNU814 0,859 2,84E-02 2 6 LNU814 0,964 1,90E-03 2 9 LNU814 0,884 1,94E-02 2 18 LNU814 0,829 4,12E-02 2 17 LNU815 0,803 5,42E-02 2 9 LNU815 0,715 1,10E-01 2 18 LNU816 0,851 1,52E-02 4 19 LNU816 0,825 2,24E-02 4 5 LNU816 0,799 5,66E-02 1 1 LNU816 0,778 6,87E-02 2 12 LNU818 0,795 3,26E-02 4 12 LNU818 0,726 6,45E-02 1 14 LNU818 0,791 3,42E-02 1 15 LNU818 0,727 6,40E-02 1 11 LNU818 0,788 3,54E-02 1 9 LNU818 0,733 6,10E-02 1 10 LNU818 0,761 4,68E-02 1 7 LNU818 0,792 3,36E-02 1 12 LNU818 0,735 3,76E-02 8 13 LNU818 0,827 1,14E-02 8 11 LNU818 0,732 3,88E-02 8 10 LNU818 0,735 2,40E-02 3 15 LNU819 0,801 3,02E-02 4 18 LNU819 0,726 6,45E-02 1 3 LNU819 0,787 3,58E-02 1 6 LNU819 0,951 9,89E-04 1 18 LNU820 0,735 9,57E-02 2 12 LNU821 0,840 9,08E-03 5 3 LNU821 0,759 2,90E-02 5 16 LNU821 0,821 1,24E-02 5 11 LNU821 0,920 1,22E-03 5 6 LNU821 0,810 1,48E-02 5 4 LNU821 0,864 5,63E-03 5 17 LNU821 0,908 4,74E-03 1 14 LNU821 0,702 7,86E-02 1 13 LNU821 0,729 6,31E-02 1 6 LNU821 0,796 3,23E-02 1 8 LNU821 0,812 2,65E-02 1 4 LNU821 0,756 8,20E-02 2 9 LNU821 0,752 8,49E-02 2 18 LNU822 0,753 8,42E-02 4 1 LNJ822 0,839 1,84E-02 4 2 LNU822 0,828 1,10E-02 8 1 LNU822 0,730 3,99E-02 8 14 LNU822 0,961 1,45E-04 8 13 LNU822 0,809 1,50E-02 8 11 LNU822 0,808 1,53E-02 8 10 LNU822 0,948 3,34E-04 8 2 LNU822 0,898 2,48E-03 8 7 LNU822 0,707 5,00E-02 8 8 LNU823 0,875 9,86E-03 7 3 LNU823 0,790 3,44E-02 7 16 LNU823 0,905 5,13E-03 7 6 LNU823 0,950 1,02E-03 7 18 LNU823 0,715 7,07E-02 7 19 LNU823 0,774 4,10E-02 7 8 LNU823 0,838 1,86E-02 7 4 LNU823 0,806 2,85E-02 7 17 LNU823 0,818 1,31E-02 8 12 LNU823 0,770 7,33E-02 2 9 LNU824 0,702 5,24E-02 5 2 LNU824 0,835 9,85E-03 5 12 LNU824 0,704 7,74E-02 1 5 LNU824 0,780 2,25E-02 3 1 LNU824 0,705 3,39E-02 3 5 LNU824 0,849 3,25E-02 2 12 LNU825 0,802 5,48E-02 2 12 LNU829 0,931 7,75E-04 8 1 LNU829 0,781 2,22E-02 8 13 LNU829 0,876 4,34E-03 8 19 LNU829 0,813 1,42E-02 8 2 LNU829 0,787 2,05E-02 8 5 LNU829 0,781 2,21E-02 8 7 LNU829 0,756 3,00E-02 8 8 LNU830 0,751 8,50E-02 2 9 LNU830 0,772 7,20E-02 2 18 LNU831 0,714 4,67E-02 8 2 LNU831 0,704 5,13E-02 8 7 LNU831 0,743 1,39E-02 6 8 LNU832 0,712 7,28E-02 7 3 LNU832 0,764 4,57E-02 7 16 LNU832 0,761 4,68E-02 7 11 LNU832 0,835 1,93E-02 7 10 LNU832 0,774 4,12E-02 7 19 LNU832 0,897 6,13E-03 7 5 LNU832 0,788 3,54E-02 7 7 LNU832 0,865 1,20E-02 7 12 LNU832 0,745 5,44E-02 7 17 LNU832 0,788 3,54E-02 1 15 LNU832 0,760 4,76E-02 1 13 LNU832 0,758 4,85E-02 1 9 LNU832 0,714 7,14E-02 1 10 LNU832 0,756 4,91E-02 1 7 LNU832 0,749 3,25E-02 8 12 LNU832 0,707 2,22E-02 6 10 LNU832 0,828 3,07E-03 6 12 LNU832 0,857 3,15E-03 3 15 LNU832 0,714 3,08E-02 3 10 LNU832 0,729 2,59E-02 3 12 LNU832 0,780 6,70E-02 2 12 LNU833 0,810 5,08E-02 7 1 LNU833 0,805 1,60E-02 8 1

Conj.

ID do ID do Nome do Nome do Conj.

R Valor P de Con¡. R Valor P Conj. de Gene Gene de Exp.

Ex . de Cor.

Cor.

LNU833 0,701 5,27E-02 8 14 LNU833 0,780 2,25E-02 8 2 LNU833 0,746 8,84E-02 2 14 LNU834 0,718 6,89E-02 4 3 LNU834 0,754 5,05E-02 4 6 LNU834 0,717 6,99E-02 4 10 LNU834 0,717 6,96E-02 4 19 LNU834 0,867 1,15E-02 4 5 LNU834 0,704 7,77E-02 4 7 LNU834 0,733 6,11 E-02 4 8 LNU834 0,724 6,56E-02 4 12 LNU834 0,707 7,58E-02 4 4 LNU834 0,843 1,72E-02 7 15 LNU834 0,855 1,42E-02 7 21 LNU834 0,883 8,46E-03 7 9 LNU834 0,828 2,14E-02 7 12 LNU834 0,717 6,97E-02 1 15 LNU834 0,747 5,38E-02 1 9 LNU834 0,778 3,93E-02 1 10 LNU834 0,857 1,36E-02 1 12 LNU834 0,972 5,30E-05 8 13 1NU834 0,876 4,37E-03 8 11 LNU834 0,958 1,78E-04 8 10 LNU834 0,776 2,35E-02 8 2 LNU834 0,876 4,30E-03 8 7 LNU834 0,708 4,92E-02 8 8 LNUS34 0,729 4,01E-02 8 4 LNU834 0,747 2,09E-02 3 3 LNU834 0,828 5,89E-03 3 16 LNU834 0,859 3,03E-03 3 15 LNU834 0,840 4,61E-03 3 13 LNU834 0,915 5,41E-04 3 11 LNU834 0,723 2,77E-02 3 6 LNU834 0,720 2,88E-02 3 9 LNU834 0,943 1,39E-04 3 10 LNU834 0,874 2,06E-03 3 19 LNU834 0,778 1,35E-02 3 5 LNU834 0,883 1,63E-03 3 7 LNU834 0,906 7,68E-04 3 12 LNU834 0,708 3,28E-02 3 4 LNU834 0,835 5,12E-03 3 17 LNU834 0,765 7,62E-02 2 15 LNU834 0,703 1,20E-01 2 9 LNU834 0,775 7,00E-02 2 18 LNU834 0,860 2,81E-02 2 12 LNU835 0,716 7,01E-02 4 16 LNU835 0,734 6,03E-02 4 15 LNU835 0,807 2,83E-02 4 9 LNU835 0,791 3,43E-02 4 10 LNU835 0,846 1,64E-02 4 19 LNU835 0,777 3,98E-02 4 5 LNU835 0,917 3,64E-03 4 12 LNU835 0,766 4,45E-02 1 3 LNU835 0,805 2,89E-02 1 16 LNU835 0,707 7,55E-02 1 9 LNU835 0,753 5,07E-02 1 10 LNU835 0,960 6,02E-04 1 19 LNUB35 0,930 2,38E-03 1 5 LNU835 0,791 3,42E-02 1 7 LNUB35 0,841 1,77E-02 1 8 LNU835 0,746 5,42E-02 1 12 LNU835 0,728 6,34E-02 1 4 LNU835 0,732 6,14E-02 1 17 LNU835 0,758 8,07E-02 2 9 LNU835 0,882 2,00E-02 2 12 LNU837 0,822 2,32E-02 1 14 LNU837 0,703 7,79E-02 1 4 LNU837 0,778 2,31E-02 8 11 LNU837 0,755 3,02E-02 8 7 LNU837 0,845 3,40E-02 2 14 LNU837 0,907 1,26E-02 2 5 LNU838 0,819 1,29E-02 5 19 LNU838 0,711 4,80E-02 5 5 LNU838 0,860 2,80E-02 2 9 LNU838 0,948 4,01E-03 2 18 LNU839 0,717 6,99E-02 4 10 LNU839 0,717 6,96E-02 4 19 LNU839 0,867 1,15E-02 4 5 LNJ839 0,704 7,77E-02 4 7 LNU839 0,724 6,56E-02 4 12 LNJ839 0,972 5,30E-05 8 13 LNU839 0,876 4,37E-03 8 11 LNU839 0,958 1,78E-04 8 10 LNU839 0,776 2,35E-02 8 2 LNJ839 0,876 4,30E-03 8 7 LNU839 0,708 4,92E-02 8 8 LNU839 0,729 4,01E-02 8 4 LNU839 0,765 7,62E-02 2 15 LNU839 0,703 1,20E-01 2 9 LNU839 0,775 7,00E-02 2 18 LNU840 0,759 4,77E-02 1 19 LNU840 0,781 3,80E-02 1 8 LNU840 0,834 3,89E-02 2 18 LNU841 0,707 7,55E-02 7 16 LNU841 0,755 5,00E-02 7 10 LNU841 0,774 4,10E-02 7 19 LNU841 0,861 1,29E-02 7 5 LNU841 0,855 1,43E-02 7 12 LNU841 0,704 2,31E-02 6 3 LNU841 0,824 3,36E-03 6 8 LNU841 0,775 8,41E-03 6 4 LNU843 0,736 5,94E-02 7 3 LNU843 0,796 3,22E-02 7 16 LNU843 0,776 4,03E-02 7 21 LNUB43 0,729 6,29E 02 7 9 LNU843 0,806 2,85E-02 7 10 LNU843 0,866 1,17E-02 7 19 LNU843 0,793 3,33E-02 7 5 LNU843 0,721 6,77E-02 7 7 LNU843 0,866 1,18E-02 7 12 LNU843 0,770 4,28E-02 7 17 LNU843 0,754 5,02E-02 1 15 LNU845 0,801 3,03E-02 7 6 LNU845 0,877 9,48E-03 7 18 LNU845 0,703 7,84E-02 7 4 LNU845 0,708 7,51E-02 7 17 LNU845 0,834 3,90E-02 2 14 LNU845 0,711 1,13E-01 2 5 LNU846 0,817 2,49E-02 7 3 LNU846 0,777 4,00E-02 7 16

Conj. ID do ID do Nome do Nome do R R Valor P de Conj. Valor P Con]. Conj. de Gene Gene de Exp. Ex p. de Cor. Cor. LNU846 0,721 6,76E-02 7 13 LNU846 0,777 3,97E-02 7 11 LNU846 0,889 7,41E-03 7 6 LNU846 0,894 6,59E-03 7 18 LNU846 0,796 3,22E-02 7 4 LNU846 0,834 1,97E-02 7 17 LNU846 0,733 9,72E-02 2 9 LNU846 0,724 1,04E-01 2 12 aueia o I. oao Tomecraas as coreaçoes lK) entre os níveis ae expressao aos genes que meinoram a proouçao e seus nomologos em vários tecidos [conjuntos de Expressão (exp.)] e o desempenho fenotípico [componentes de produção, biomassa, taxa de crescimento elou vigor (Correlação vetor (con-))) sob condições normais em variedades de milho. P = Valor p.

EXEMPLO 8

NUE QUANDO CULTIVADO SOB FERTILIZAÇÃO COM NITROGÉNIO REDUZIDO UTILIZANDO MICROARRANJO DE OLIGONUCLEOTÍDEO DE 60K DE MILHO

[00466] A fim de produzir uma análise de correlação de alta produtividade entre o fenótipo da planta e o nível de expressão do gene, os presentes inventores utilizaram um microarranjo de oligonucleotídeo de milho, produzido pela Agilent Technologies [chem (ponto) agilent (ponto) com/Scripts/PDS (ponto) asp?lPage=50879]. 0 arranjo de oligonucleotídeo representa cerca de 44.000 de genes e transcrições de milho.

Correlação de híbridos de Milho em ecotipos cultivados sob condições de baixo nitrogênio.

Procedimentos experimentais:

[00467] 12 híbridos de Milho foram cultivados em 3 lotes repetitivos, em campo. As sementes de Milho foram plantadas e as plantas foram cultivadas em campo, utilizando fertilização comercial e protocolos de irrigação (485 metros cúbicos de água por dunam, 30 unidades de uran, 21% de fertilização por período de cultivo completo). A fim de definir a correlação entre os níveis de expressão do RNA com parâmetros relacionados ao vigor ou componentes de NUE e produção, 12 híbridos de milho diferentes foram analisados. Entre eles, 11 híbridos englobando a variação observada foram selecionados para análise de expressão do RNA. A correlação entre os níveis de RNA e os parâmetros caracterizados foi analisada utilizando o teste de correlação Pearson [davidmlane (ponto) com/hyperstat/A34739 (ponto) html].

[00468] Tecidos de Milho Analisados- Todos os 10 híbridos de milho foram amostrados para cada tratamento (condições de baixo N e condições normais), em três pontos de tempo: TP2 = V6-V8 (seis a oito folhas do colar são visíveis, a fase de crescimento rápido e a determinação de fileiras do núcleo são iniciadas), TP5 = Rl-R2 (acetinação - bolha), TP6 = R3-R4 (leite - pasta). Quatro tipos de tecidos de planta [Espigas, folha bandeira indicada nas Tabelas 52 a 53 como folha, parte distal do grão e entrenó] foram amostrados e o RNA foi extraído, conforme descrito acima. Cada tipo de tecido de informação de expressão de microarranjo recebeu um ID de Conjunto, conforme resumido nas Tabelas 52 a 53 abaixo. Tabela 52 Conjuntos de expressão de transcriptoma de milho sob condições de baixo N Conjunto de Expressão ID de Conjunto Campo de milho/Baixo NIEs i a1TP5 1 Campo de milho/Baixo N/Es i a/TP6 2 Campo de milho/Baixo N/EntrenólTP2 3 Campo de milho/Baixo N/EntrenólTP5 4 Campo de milho/Baixo N/Folha/TP5 5 Campo de milho/Baixo N/ FolhaITP6 6 Tabela 52: São fornecidos os conjuntos de expressão de transcriptoma de milho. Folha = a folha abaixo da espiga principal; Meristema da Flor = meristema apical após iniciação da folha-macho; Espiga = a flor-fêmea no dia de antese. Grão Distal = milho desenvolvendo grãos a partir da área externa do sabugo, Grão Basal = milho desenvolvendo grãos a partir da área basal do sabugo; Entrenó = Entrenós localizados acima e abaixo da espiga principal na planta.

Tabela 53

Conjuntos de expressão de transcriptoma de milho sob condições normais ID de Conjunto Conjunto de Expressão 1 Campo de milho/Normal/Espiga/R1-R2 2 Campo de milho/Normal/Espiga/R3-R4 3 Campo de milho Normal/ Grão Distal /R4-R5 4 Campo de milho Normal/ Entrenó /R1-R2 5 Campo de milho Normal! Entrenó /R3-R4 6 Campo de milho Normal/ Entrenó /V6-V8 Campo de milho Normal/ Folha /R1--R2 8 Campo de milho Normal/ Folha /V6-V8 Tabela 53: São fornecidos os conjuntos de expressão de transcriptoma de milho. Folha = a folha abaixo da espiga principal; Meristema da Flor = menstema apical após iniciação da folha-macho; Espiga = a flor-fêmea no dia de antese, Grão Dista[ = milho desenvolvendo grãos a partir da área externa do sabugo, Grão Basal = milho desenvolvendo grãos a partir da área basal do sabugo; Entrenó = Entrenós localizados acima e abaixo da espiga principal na planta.

[00469] Os parâmetros a seguir foram coletados ou por amostragem de 6 plantas por lote ou por medição do parâmetro através de todas as plantas dentro do lote.

[00470] Produção de Semente por planta (Kg.) - No final do experimento, todas as espigas dos lotes dentro dos blocos A-C foram coletadas. 6 espigas foram separadamente debulhadas e os grãos foram pesados, todas as espigas adicionais foram debulhadas juntas e também pesadas. 0 peso médio do grão por espiga foi calculado dividindo o peso total do grão pelo número total de espigas por lote (com base na unidade). No caso das 6 espigas, o peso total dos grãos de 6 espigas foi dividido por 6.

[00471] Peso da Espiga por lote (g.) - No final do experimento (quando as espigas foram colhidas) total e 6 espigas selecionadas por lotes dentro dos blocos A-C foram coletadas separadamente. As plantas com (total e 6) foram pesadas (g.) separadamente e a espiga média por planta foi calculada para Peso da Espiga por lote (total de 42 plantas por lote).

[00472] Altura da planta e altura da espiga - As plantas foram caracterizadas pela altura na colheita. Em cada medição, 6 plantas foram medidas por sua altura utilizando uma fita métrica. A altura foi medida a partir do nível do solo até o topo da planta abaixo do cabelo do milho. A altura da espiga foi medida a partir do nível do solo até o local onde a espiga principal está localizada.

[00473] Número de folha por planta - As plantas foram caracterizadas pelo número de folha durante o período de cultivo em 5 vezes no tempo. Em cada medição, as plantas foram medidas por seu número de folha contando todas as folhas de 3 plantas selecionadas por lote.

[00474] SPAD - 0 teor de clorofila foi determinado utilizando um medidor de clorofila Minolta SPAD 502 e a medição foi realizada 64 dias após a semeadura. As leituras de medição de SPAD foram feitas em folha nova totalmente desenvolvida. Sete medições por folha foram tiradas por lote.

Os dados foram tirados após uma vez por semanas após a semeadura.

[00475] Peso Seco por planta - No final do experimento (quando a inflorescência for seca) todo material vegetal dos lotes dentro dos blocos A-C foi coletado.

[00476] Peso seco = peso total da parte vegetal acima da terra (excluindo as raízes) após secagem a 70°C em uma câmara de secagem por 48 horas;

[00477] Comprimento da Espiga da Espiga Preenchida [cm] - foi calculado como o comprimento da Espiga com grãos fora da espiga total.

[00478] Comprimento e largura da Espiga [cm] - foi calculado como o comprimento e largura da Espiga no preenchido. A medição foi realizada em 6 plantas por cada lote.

[00479] Número de Fileira do Núcleo por Espiga - 0 número de fileiras em cada espiga foi contado.

[00480] Largura do caule [cm] - 0 diâmetro do caule foi medido no entrenó localizado abaixo da espiga principal. A medição foi realizada em 6 plantas por cada lote.

[00481] Índice de área da folha [LAI 1 folha area index] = área total de folha de todas as plantas em um lote.

A medição foi realizada utilizando um medidor da área foliar.

[00482] NUE [kg/kg]- é a proporção entre a produção total de grão por N total aplicado no solo.

[00483] NUpE [kg/kg]- é a proporção entre a biomassa de planta total por N total aplicado no solo.

[00484] Produção/largura do caule [kg/cm] - é a proporção entre as produções de grão totais e a largura do caule.

[00485] Produção/LAI [kg] - é a proporção entre as produções de grão totais e o índice da área de folha total. Resultados Experimentais:

[00486] 11 diferentes híbridos de milho foram cultivados e caracterizados com relação a diferentes parâmetros. As Tabelas 54-55 descrevem os parâmetros correlacionados ao Milho. A média para cada um dos parâmetros medidos foi calculada utilizando o software JMP (Tabelas 56-59) e uma análise de correção subsequente foi realizada (Tabelas 60- 61). Os resultados foram integrados à base de dados. Tabela 54 Parâmetros correlacionados ao Milho (vetores) sob condições de Baixo N ID de Parámetros correlacionados com Correlação 1 Baixo N - Comprimento da Espiga cm 2 Baixo N - Comprimento da Espiga da área preenchida[cm] 3 Baixo N - Largura da Espiga [mm] 4 Baixo N - Número Final de Folhas 5 Baixo N - Altura Final da Espiga Principal cm 6 Baixo N - Altura Final da Planta [cm] 7 Baixo N - N° de fileiras por espiga 8 Baixo N - SPAD R1-2 9 Baixo N - SPAD R3-R4 10 Baixo N - Largura do Caule 20/08109 prõximo ao TP5 [cm] 11 Baixo N - Peso da espiga por lote (42 plantas por lote) 0 RH] [kg] 12 Baixo N - DW Final da Planta[kg] 13 Baixo N - LAI 14 Baixo N - NUE produção k 1N aplicado em solo kg 15 Baixo N - NUE no preenchimento precoce dirão IR1-R2 rodu ão K 1N em planta SPAD 16 Baixo N - NUE no preenchimento de grão [R3-R4] produção Kg/ N em planta SPAD 17 Baixo N - NUpE (biomassa/N aplicado] 18 Baixo N - Produção de semente por dunam [kg] 19 Baixo N - Produção ILAI 20 Baixo N - Produção 1 largura do caule 21 Baixo N - Produção de semente por 1 planta — resto do lote [0- RH em K ~ aoeia 54. -cm - = cenumetros -mm = muimetros; -Kg = quilogramas ; SNAL) em K1-K2 e SPAR I J-K4; NiVel de c{orotiia depois dos estágios iniciais e tardios de preenchimento de grãos, °NUE" = eficiência no uso do nitrogênio; "NUpE" = Eficiência na captação de nitrogênio; "LAI" = Área da folha; "N" = nitrogênio; Baixo N - sob condições de baixo Nitrogênio; "Normal" = sob condições normais, `dunam" = 1000 m'.

Tabela 55 Parâmetros correlacionados ao Milho (vetores) sob condições normais ID de Parâmetros correlacionados com Correlação 1 Norma{ - DW Final da Planta [kg] 2 Normal - Comprimento da Espiga [cm] 3 Normal - Comprimento da Espiga da área preenchida[cm] 4 Normal - Largura da Espiga [mm] 5 Normal - Número Final de Folhas 6 Normal - Altura Final da Espiga Principal[cm] 7 Normal - Altura Final da Planta[Cm] 8 Normal - N° de fileiras por espiga 9 Normal - SPAD R1-2 10 Normal - SPAD R3-R4 11 Normal - Largura do Caule TP5[cm] 12 Normal - Peso da espiga por lote [0 RH [kg] 13 Normal - LAI 14 Normal - NUE produção kg/N aplicado em solo kg 15 Normal - NUE no preenchimento precoce de grão R1-R2 produção K IN em planta SPAD 16 Normal - NUE no preenchimento de grão R3-R4 rodo ão Kg/ N em planta SPAD 17 Normal - NUpE [biomassa/N aplicado]

ID de Parâmetros correlacionados com Correlação 18 Normal - Produção de semente por dunam [kg] 19 Normal - Produção 1LAI 20 Normal - Produção 1 largura do caule 21 Normal - Produção de semente poiplanta - resto do lote [0- RH em Kg] j apeia oo. -cm = cenumetros -mm- = minmetros; - Kg - = quilogramas ; SNAU em h 1-K2 e SFIAU Ft3-Fì4: Nivei de clorofila depois dos estágios iniciais e tardios de preenchimento de grãos, 'NUE" = eficiência no uso do nitrogênio; "NUpE" = Eficiência na captação de nitrogênio; "LAI" = Área da folha; 'N" = nitrogênio; Baixo N - sob condições de baixo Nitrogênio; "Normal" = sob condições normais, "dunam" = 1000 m2.

Tabela 56 Parâmetros medidos em acessos de Milho sob condicões normais ID de CorJ 1 2 3 4 5 6 7 8 9 10 11 Linha Linha-1 1,267 19,944 16,233 51,075 11,800 130,311 273,456 16,111 56,889 59,933 2,911 Linha-2 1,300 20,167 17,500 46,290 11,111 122,333 260,500 14,667 57,161 60,900 2,644 Linha-3 1,333 18,111 17,722 45,919 13,278 127,667 288,000 15,444 59,272 56,892 2,711 Linha-4 1,500 19,889 18,444 47,632 11,778 113,022 238,500 15,889 61,611 58,700 2,900 Linha-5 1,300 19,500 15,667 51,407 11,944 135,278 286,944 16,167 58,628 58,700 2,700 Linha-6 1,583 17,722 14,667 47,420 12,333 94,278 224,833 15,167 61,228 63,158 2,622 Linha-7 1,417 17,667 12,944 47,253 12,444 120,944 264,444 16,000 60,167 59,750 2,922 Linha-8 1,367 17,278 14,028 46,846 12,222 107,722 251,611 14,833 61,089 62,350 2,722 Linha-9 11,383 20,500 18,778 49,275 12,556 112,500 278,444 15,389 62,200 61,925 2,844 Linha- 1,700 17,500 12,333 48,283 11,667 139,667 279,000 17,667 57,506 57,225 2,656 10 Linha- 0,417 19,856 16,067 41,837 9,278 60,444 163,778 14,267 52,044 49,342 2,256 11 Tabela 56: São fornecidos os valores de cada um dos parâmetros (conforme descrito acima) medidos em acessos de milho (ID da linha) sob condições normais. As condições de cultivo são especificadas na seção de procedimento experimental.

Tabela 57 Parâmetros adicionais medidos em acessos de Milho sob condicões normais ID de Cor./ 12 14 15 16 17 18 20 21 13 19 Linha Linha-1 8,943 4,452 23,431 24,978 0,008 1335,625 456,707 0,167 3,208 426,086 Linha-2 7,023 3,624 19,052 17,807 0,009 1087,058 412,443 0,136 3,947 312,975 Linha-3 7,533 4,008 20,293 20,332 0,009 1202,532 443,368 0,150 3,332 307,277 Linha-4 7,991 4,237 20,719 19,957 0,010 1271,204 438,705 0,159 4,012 362,442 Linha-5 8,483 4,010 20,486 19,026 0,009 1202,966 446,659 0,150 3,864 314,138 Linha-6 5,632 3,124 15,360 13,904 0,011 937,083 356,950 0,117 4,191 224,582 Linha-7 6,100 3,286 16,383 16,234 0,009 985,893 337,486 0,123 3,969 266,437 Linha-8 6,659 3,500 17,191 17,214 0,009 1050,131 385,790 0,131 4,322 261,664 Linha-9 8,402 4,551 21,955 21,017 0,076 1365,293 481,942 0,171 2,888 482,329 Linha-10 8,215 4,087 20,994 21,529 0,004 1226,077 471,568 0,153 4,306 Linha-11 1,879 1,003 5,725 5,519 0,003 300,928 139,728 0,038 iueia or: Sao rornecieos os valores ae caaa um dos parametros tcontorme descrito acima) medidos em acessos de milho (IL) da linha) sob condições normais. As condições de cultivo são especificadas na seção de procedimento experimental.

Tabela 58

Parâmetros medidos em acessos de Milho sob condições de Baixo nitrogênio ID de Carl 1 2 3 4 5 6 7 8 9 10 11 Linha Linha-1 20,614 18,398 46,713 15,024 158,076 305,836 14,181 60,236 59,286 2,764 6,605 Linha-2 20,976 18,417 48,222 11,643 136,238 270,929 15,214 57,938 57,621 2,419 7,974 Linha-3 20,222 19,778 48,323 13,500 128,389 290,611 15,000 58,761 58,400 2,650 9,634 Linha-4 20,111 18,833 49,863 11,611 133,056 252,167 15,667 59,478 59,189 2,767 9,222 Linha-5 20,111 16,222 52,873 11,833 137,833 260,222 16,000 58,500 58,194 2,672 7,630 Linha-6 18,500 16,000 47,436 11,889 99,556 227,222 15,944 64,039 62,667 2,594 7,215 Linha-7 19,056 15,278 49,609 12,556 130,167 271,722 15,556 56,422 61,044 2,983 7,917 Linha-8 18,250 15,694 48,567 11,667 114,611 248,611 14,500 60,000 59,867 2,611 28,961 Linha-9 20,095 16,771 52,406 12,443 143,862 279,329 16,410 58,317 57,467 2,650 7,797 Linha-10 17,806 14,056 42,634 9,278 61,611 171,278 14,367 53,061 49,611 2,278 2,410 Linha-11 21,250 19,556 50,003 13,167 114,444 269,778 15,744 61,717 61,867 2,817 9,775 i apeia ou: sao rorneciaos os vaiares ae caga um dos parameiros (conforme descrito acima) medidos em acessos de milho (ID de linha) sob condições de baixo nitrogênio. As condições de cultivo são especificadas na seção de procedimento experimental.

Tabela 59 Parâmetros adicionais medidos em acessos de Milho sob condições de Baixo nitrogênio ID de Cor.! 12 14 15 16 17 18 20 21 13 19 Linha Linha-1 1,593 7,225 18,023 18,352 0,011 1083,749 416,532 0,135 2,923 341,501 Linha-2 1,429 8,411 21,787 21,919 0,010 1261,635 528,383 0,158 3,155 408,093 Linha-3 1,533 10,328 26,335 26,479 0,010 1549,245 583,458 0,194 3,330 464,768 Linha-4 1,950 9,986 25,144 25,333 0,013 1497,865 541,017 0,187 2,873 522,258 Linha-5 1,483 7,626 19,547 19,685 0,010 1143,850 428,089 0,143 2,786 439,525 Linha-6 1,600 7,728 18,049 18,541 0,011 1159,260 444,294 0,145 3,764 312,581 Linha-7 1,583 8,049 21,388 19,785 0,011 1207,424 407,200 0,151 3,499 345,901 Linha-8 1,283 8,334 20,788 20,917 0,009 1250,052 477,438 0,156 5,016 287,735 Linha-9 1,514 7,640 19,676 19,935 0,010 1146,036 445,604 0,143 Linha-10 0,433 2,555 7,213 7,722 0,003 383,219 167,902 0,048 Linha-11 1,517 10,599 25,702 25,902 0,010 1589,914 562,294 0,199 3,157 501,239 i aoeIa oy. Jso rorneciaos os valores ae caga um aos parameiros (conrorme aescnto acima] melados em acessos de milho (lu ae linha) sob condições de baixo nitrogênio. As condições de cultivo são especificadas na seção de procedimento experimental.

Tabela 60 Correlação entre o nível de expressão dos genes selecionados de algumas aplicações da invenção em vários tecidos e o desempenho fenotjpico sob condicões normais em variedades de milho Nome do Conj. ID do Conj. ID do R Nome do Valor P de Conj. de R Valor P de Conj. de Gene Exp. Cor. Gene Ex . Cor. LNU811 0,880 2,07E-02 1 13 LNU811 0,809 5,10E-02 5 13 LNU811 0,748 3,29E-02 2 12 LNU811 0,896 2,58E-03 2 4 LNU811 0,814 1,39E-02 2 8 LNU811 0,855 3,02E-02 6 13 LNU813 0,945 4,45E-03 5 5 LNU813 0,934 6,46E-03 5 10 LNU813 0,825 4,34E-02 5 9 LNU813 0,718 4,48E-02 2 17 LNU813 0,757 2,96E-02 2 11 LNU813 0,718 4,48E-02 2 1

Conj.

ID do Conj.

ID do Nome do Nome do R Valor P de Conj. de R Valor P de Conj. de Gene Gene Ex . COT.

Ex p.

Cor.

LNU813 0,747 5,37E-02 4 17 1NU813 0,747 5,37E-02 4 1 LNU813 0,849 7,73E-03 3 10 LNU813 0,809 2,74E-02 6 7 LNUB13 0,704 7,72E-02 6 10 LNU813 0,701 7,93E-02 6 16 LNU813 0,851 1,52E-02 6 6 LNU813 0,743 5,58E-02 6 9 LNU814 0,766 4,47E-02 1 8 LNUB14 0,976 8,47E-04 5 17 LNU814 0,713 1,11E-01 5 3 LNU814 0,976 8,47E-04 5 1 LNUB14 0,725 1,03E-01 5 9 LNU814 0,702 1,20E-01 5 19 LNUB14 0,745 3,41E-02 2 11 LNUB14 0,718 6,94E-02 4 3 LNUB14 0,757 4,90E-02 4 6 LNU814 0,847 1,61E-02 4 8 LNUB14 0,711 7,30E-02 6 8 LNU815 0,736 3,72E-02 2 10 LNUB15 0,845 8,22E-03 3 12 LNU815 0,833 1,02E-02 3 15 LNUB15 0,761 2,83E-02 3 14 LNU815 0,877 4,20E-03 3 4 LNU815 0,881 3,87E-03 3 16 LNU815 0,761 2,83E-02 3 18 LNU815 0,761 2,83E-02 3 21 LNUB15 0,725 4,20E-02 3 19 LNUS15 0,794 1,87E-02 7 13 LNU816 0,807 5,22E-02 1 19 LN0816 0,710 7,39E-02 1 2 LNU816 0,945 4,48E-03 5 13 LNU816 0,711 4,80E-02 2 10 LNUB16 0,866 2,58E-02 4 13 LNUB16 0,705 5,09E-02 3 5 LNUB16 0,833 2,01E-02 6 7 LNU816 0,738 5,82E-02 6 16 LNUB16 0,726 6,47E-02 6 6 LNUS16 0,816 7,34E-03 7 11 LNUB16 0,759 1,78E-02 7 9 LNU817 0,728 1,01E-01 5 11 LNU818 0,708 7,51E-02 1 12 LNUB18 0,731 6,18E-02 1 11 LNU818 0,879 9,14E-03 1 5 LNUB18 0,719 6,85E-02 1 14 LNUB18 0,907 4,80E-03 1 4 LNU818 0,937 1,84E-03 1 10 LNUB18 0,719 6,85E-02 1 18 LNUB18 0,719 6,85E-02 1 21 LNUB18 0,814 2,60E-02 1 9 LNUB18 0,721 6,75E-02 1 20 LNUB18 0,741 9,18E-02 5 11 LNU818 0,796 5,80E-02 5 10 LNU818 0,766 7,60E-02 5 8 LNU818 0,758 2,94E-02 2 4 LNUB18 0,789 2,00E-02 3 10 LNU818 0,869 2,47E-02 6 13 LNUB18 0,700 7,98E-02 6 11 LNU818 0,758 4,81E-02 6 10 LNU818 0,805 8,91E-03 7 10 LNUB18 0,801 9,46E-03 7 9 LNU819 0,772 4,19E-02 1 3 LNU819 0,770 7,32E-02 1 19 LNU819 0,773 4,15E-02 1 2 LNU819 0,813 4,92E-02 5 5 LNU819 0,722 1,83E-02 8 7 LNU819 0,769 9,28E-03 8 5 LNU819 0,709 2,18E-02 8 6 LNU819 0,742 5,64E-02 4 10 LNU819 0,713 4,73E-02 3 17 LNU819 0,713 4,73E-02 3 1 LNU819 0,727 6,44E-02 6 4 LNU820 0,714 4,66E-02 3 3 LNU820 0,749 3,25E-02 3 2 LNU821 0,702 7,87E-02 1 5 LNU821 0,753 5,08E-02 1 8 LNU822 0,824 1,18E-02 •7 13 LNU823 0,705 7,67E-02 4 11 LNU823 0,879 9,16E-03 4 3 LNU823 0,795 3,25E-02 4 8 LNU823 0,812 4,97E-02 4 19 LNU823 0,717 4,54E-02 3 9 LNU823 0,710 7,37E-02 6 17 LNU823 0,710 7,37E-02 6 1 LNU823 0,702 3,50E-02 7 9 LNU824 0,704 7,74E-02 1 6 LNU824 0,791 1,93E-02 2 11 LNU824 0,764 2,72E-02 2 9 LNU824 0,754 1,89E-02 7 6 LNU825 0,725 4,18E-02 2 4 LNU825 0,706 5,04E-02 3 2 LNU828 0,829 4,12E-02 5 5 LNU829 0,894 2,72E-03 2 7 LNU829 0,771 2,52E-02 2 6 LNU829 0,907 7,49E-04 7 17 LNU829 0,907 7,49E-04 7 1 LNU830 0,862 2,73E-02 5 9 LNU830 0,738 3,67E-02 2 11 LNU831 0,790 3,44E-02 4 3 LNU832 0,734 6,02E-02 1 7 LNU832 0,932 2,24E-03 1 5 LNU832 0,714 1,11E-01 5 10 LNU832 0,778 3,92E-02 4 7 LNU832 0,809 2,74E-02 4 12 LNU832 0,747 5,34E-02 4 11 LNU832 0,814 2,60E-02 4 15 LNU832 0,780 3,86E-02 4 14 LNU832 0,822 2,33E-02 4 16 LNU832 0,917 3,65E-03 4 6 LNU832 0,780 3,86E-02 4 18 LNU832 0,780 3,86E-02 4 21 LNU832 0,803 2,98E-02 4 20 LNU832 0,722 6,68E-02 6 5 LNU832 0,703 3,48E-02 7 11 LNU832 0,809 8,29E-03 7 5 LNU832 0,709 3,24E-02 7 10 LNU832 0,795 1,05E-02 7 9 LNUB33 0,843 3,50E-02 5 5 LNU833 0,728 1,01E-01 5 4 LNU833 0,789 1,99E-02 2 5

Conj.

ID do Conj.

ID do Nome do Nome do R R Valor P de Conj. de Valor P de Conj. de Gene Gene Exp.

Cor.

Ex p.

Cor.

LNU833 0,823 3,43E-03 8 10 LNU833 0,710 7,40E-02 4 3 LNU833 0,721 4,37E-02 3 10 LNU833 0,740 9,27E-02 6 13 LNU833 0,702 7,84E-02 6 10 LNU833 0,884 3,56E-03 7 13 LNU834 0,935 6,23E-03 1 13 LNU834 0,847 1,62E-02 1 10 LNU834 0,754 5,01E-02 1 9 LNU834 0,853 3,08E-02 5 4 LNU834 0,804 5,40E-02 5 10 LNU834 0,712 1,13E-01 5 19 LNU834 0,807 5,22E-02 5 2 LNU834 0,707 5,00E-02 2 8 LNU834 0,727 1,73E-02 8 15 LNU834 0,731 1,64E-02 8 16 LNU834 0,735 2,42E-02 8 19 LNJ834 0,792 3,39E-02 4 4 LNU834 0,947 1,20E-03 4 10 LNU834 0,871 1,07E-02 6 17 LNUS34 0,720 6,82E-02 6 4 LNU834 0,820 2,38E-02 6 6 LNU834 0,871 1,07E-02 6 1 LNU834 0,825 4,33E-02 6 19 LNU834 0,706 7,62E-02 6 20 LNU834 0,779 1,33E-02 7 7 LNU834 0,801 9,44E-03 7 12 LNU834 0,716 3,00E-02 7 11 LNU834 0,742 2,22E-02 7 15 LNU834 0,768 1,57E-02 7 14 LNU834 0,853 3,46E-03 7 4 LNU834 0,712 3,13E-02 7 10 LNU834 0,761 1,73E-02 7 6 LNU834 0,768 1,57E-02 7 18 LNU834 0,768 1,57E-02 7 21 LNU834 0,764 1,65E-02 7 20 LNU835 0,966 3,91E-04 1 7 LNU835 0,793 3,32E-02 1 12 LNU835 0,743 5,55E-02 1 5 LNU835 0,816 2,52E-02 1 15 LNUB35 0,778 3,92E-02 1 14 LNU835 0,836 1,91E-02 1 16 LNU835 0,915 3,86E-03 1 6 LNU835 0,778 3,92E-02 1 18 LNU835 0,778 3,92E-02 1 21 LNU835 0,822 2,34E-02 1 20 LNU835 0,753 8,37E-02 5 10 LNU835 0,772 2,48E-02 2 10 LNU835 0,881 8,80E-03 6 7 LNU835 0,811 2,69E-02 6 12 LNU835 0,711 7,35E-02 6 11 LNU835 0,724 6,57E-02 6 5 LNU835 0,809 2,76E-02 6 15 LNU835 0,801 3,06E-02 6 14 LNU835 0,759 4,77E-02 6 4 LNU835 0,821 2,36E-02 6 10 LNUB35 0,812 2,66E-02 6 16 LNU835 0,814 2,59E-02 6 6 LNU835 0,801 3,06E-02 6 18 LNU835 0,801 3,06E-02 6 21 LNU835 0,833 2,00E-02 6 20 LNU837 0,713 7,24E-02 1 11 LNU837 0,879 9,15E-03 1 8 LNU837 0,737 9,44E-02 5 7 LNU837 0,845 3,41E-02 5 6 LNU837 0,731 2,54E-02 8 19 LNU837 0,752 5,14E-02 4 2 LNU838 0,821 4,54E-02 5 17 LNU838 0,715 1,10E-01 5 3 LNU838 0,821 4,54E-02 5 1 LNUS38 0,784 2,14E-02 3 7 LNU838 0,717 4,53E-02 3 6 LNU839 0,853 3,08E-02 5 4 LNU839 0,712 1,13E-01 5 19 LNU839 0,807 5,22E-02 5 2 LNU839 0,707 5,00E-02 2 8 LNU839 0,820 2,38E-02 6 6 LNU840 0,842 1,74E-02 1 7 LNU840 0,701 7,90E-02 1 6 LNU840 0,884 1,95E-02 5 17 LNU840 0,884 1,95E-02 5 1 LNU841 0,754 5,01E-02 4 7 LNU841 0,761 4,68E-02 4 12 LNU841 0,781 3,80E-02 4 15 LNU841 0,729 6,29E-02 4 14 LNJ841 0,760 4,76E-02 4 16 LNU841 0,894 6,56E-03 4 6 LNU841 0,729 6,29E-02 4 18 LNU841 0,729 6,29E-02 4 21 LNU841 0,769 4,32E-02 4 20 LNU843 0,761 4,69E-02 1 4 LNU843 0,726 6,49E-02 1 9 LNU843 0,717 1,97E-02 8 5 LNU843 0,828 2,15E-02 4 7 LNU843 0,864 1,21E-02 4 12 LNU843 0,800 3,08E-02 4 11 LNU843 0,852 1,48E-02 4 15 LNU843 0,840 1,79E-02 4 14 LNU843 0,742 5,64E-02 4 4 LNU843 0,717 6,98E-02 4 10 LNU843 0,859 1,34E-02 4 16 LNU843 0,834 1,98E-02 4 6 LNU843 0,840 1,79E-02 4 18 LNU843 0,840 1,79E-02 4 21 LNU843 0,848 1,59E-02 4 20 LNJ844 0,894 1,63E-02 5 5 LNU845 0,761 7,91E-02 5 6 LNU845 0,800 1,71E-02 2 17 LNU845 0,800 1,71E-02 2 1 LNU845 0,825 1,17E-02 2 9 LNU845 0,710 2,14E-02 8 11 LNU845 0,874 1,01E-02 4 8 LNU846 0,809 5,14E-02 5 10 LNU846 0,787 2,06E-02 2 12 LNU846 0,865 5,50E-03 2 4 LNU846 0,707 4,99E-02 2 19 LNU846 0,735 1,55E-02 8 11 LNU846 0,706 2,26E-02 8 8 LNU846 0,746 5,39E-02 4 12 LNU846 0,819 2,41E-02 4 11

Nor

Conj. ID do Conj. ID do Nome do Nome do R Valor P de Conj. de R Valor P de Conj. de Gene Gene Ex p. Cor. Ex . Cor. LNU846 0,737 5,88E-02 4 15 LNU846 0,771 4,23E-02 4 14 LNU846 0,796 3,24E-02 4 4 LNU846 0,703 7,81E-02 4 16 LNU846 0,771 4,23E-02 4 18 LNU846 0,899 5,94E-03 4 8 LNU846 0,771 4,23E-02 4 21 LNU846 0,726 6,45E-02 4 9 LNU846 0,755 B,24E-02 4 19 LNU846 0,724 6,56E-02 4 20 LNU846 0,809 8,33E-03 7 3 LNU846 0,849 7,69E-03 7 19 LNU846 0,746 2,09E-02 7 2 i areia eu: sao romecioas as coreiaçoes (H) entre os níveis de expressão dos genes que melhoram a produção e seus homólogos em vários tecidos [conjuntos de Expressão (exp.)] e o desempenho fenotípico [componentes de produção, biomassa, taxa de crescimento elou vigor (Correlação vetor (corr))] sob condições normais em variedades de milho. P = Valor p .

Tabela 61 Correlação entre o nível de expressão dos genes selecionados de algumas aplicações da invenção em vários tecidos e o desempenho fenotípico sob condições de baixo N em variedades de milho Conj. ID do Conj. ID do Nome do Nome do R Valor P de Conj. de R Valor P de Conj. de Gene Gene Ex . Cor. Ex p. Cor. LNU811 0,836 3,80E-02 1 13 LNU811 0,782 2,18E-02 5 19 LNU813 0,876 2,22E-02 1 13 LNU813 0,762 4,66E-02 1 11 LNU813 0,835 1,93E-02 1 2 LNU813 0,731 6,18E-02 1 1 LNU813 0,766 1,61E-02 5 7 LNU813 0,705 5,09E-02 5 19 LNU813 0,730 9,98E-02 6 10 LNU813 0,842 3,53E-02 6 9 LNU813 0,879 2,10E-02 6 5 LNU813 0,941 5,07E-03 6 6 LNU813 0,708 1,16E-01 6 15 LNU813 0,708 1,15E-01 6 19 LNU813 0,733 9,77E-02 6 1 LNU813 0,727 1,73E-02 3 10 LNU813 0,766 9,82E-03 3 9 LNU813 0,843 1,72E-02 8 13 LNU813 0,726 6,48E-02 7 13 LNU813 0,702 5,21E-02 7 8 LNU813 0,746 5,42E-02 4 6 LNU814 0,832 3,97E-02 1 19 LNU814 0,923 3,02E-03 1 2 LNU814 0,752 5,12E-02 1 1 LNU814 0,713 7,21E-02 1 16 LNU814 0,873 4,67E-03 5 13 LNU814 0,786 2,07E-02 5 19 LNU814 0,777 6,88E-02 6 18 LNU814 0,850 3,20E-02 6 4 LNU814 0,776 6,94E-02 6 8 LNU814 0,777 6,88E-02 6 14 LNU814 0,703 1,20E-01 6 20 LNU814 0,897 1,54E-02 6 6 LNU814 0,881 2,04E-02 6 15 LNU814 0,808 5,18E-02 6 19 LNU814 0,777 6,88E-02 6 2 LNU814 0,777 6,88E-02 6 21 LNU814 0,833 3,95E-02 6 16 LNU814 0,785 3,64E-02 8 13 LNU814 0,752 3,14E-02 8 10 LNU814 0,727 4,08E-02 8 4 LNU814 0,873 1,03E-02 7 13 LNU814 0,799 1,73E-02 7 11 LNU814 0,826 2,21E-02 7 19 LNU814 0,766 2,67E-02 7 2 LNU814 0,774 2,43E-02 2 10 LNU814 0,802 3,02E-02 4 5 LNU814 0,729 6,26E-02 4 11 LNU814 0,742 5,61E-02 4 15 LNU814 0,839 1,83E-02 4 19 LNU814 0,703 7,78E-02 4 2 LNU814 0,709 7,47E-02 4 16 LNU815 0,775 7,03E-02 6 13 LNU815 0,903 1,37E-02 6 11 LNU816 0,830 2,08E-02 1 1 LNU816 0,934 6,40E-03 6 3 LNU816 0,815 4,09E-03 3 9 LNU816 0,911 4,27E-03 8 13 LNU816 0,753 3,10E-02 8 7 LNU816 0,883 8,36E-03 7 13 LNU816 0,910 1,71E-03 7 11 LNU817 0,748 2,04E-02 5 6 LNU817 0,737 9,47E-02 6 5 LNU817 0,708 4,94E-02 2 10 LNU817 0,792 1,92E-02 2 4 LNU817 0,916 1,41E-03 2 5 LNU817 0,893 2,82E-03 2 6 LNU817 0,775 4,09E-02 4 6 LNU818 0,878 9,37E-03 1 8 LNU818 0,844 8,44E-03 5 13 LNU818 0,705 3,40E-02 5 11 LNU818 0,910 1,19E-02 6 18 LNU818 0,760 7,98E-02 6 4 LNU818 0,709 1,15E-01 6 8

Conj.

ID do Conj.

ID do Nome do Nome do R Valor P de Con]. de R Valor P de Conj. de Gene Ex . Cor.

Geie Exp.

Cor.

LNU818 0,910 1,19E-02 6 14 LNU818 0,716 1,10E-01 6 20 LNU818 0,771 7,29E-02 6 15 LNU818 0,796 5,84E-02 6 19 LNU818 0,742 9,11E-02 6 2 LNU818 0,910 1,19E-02 6 21 LNU818 0,814 4,89E-02 6 16 LNU818 0,806 8,77E-03 3 13 LNU818 0,705 5,08E-02 8 8 LNU818 0,828 1,12E-02 7 8 LNU818 0,882 8,69E-03 2 13 LNU818 0,882 3,71E-03 2 11 LNU818 0,776 4,04E-02 4 9 LNU818 0,860 1,31E-02 4 8 LNU819 0,712 1,12E-01 6 18 LNU819 0,712 1,12E-01 6 14 LNU819 0,703 1,19E-01 6 15 LNU819 0,889 1,78E-02 6 19 LNU819 0,946 4,29E-03 6 1 LNU819 0,712 1,12E-01 6 21 LNU819 0,742 5,63E-02 4 17 LNU819 0,729 6,32E-02 4 8 LNU819 0,859 1,32E-02 4 7 LNU819 0,742 5,63E-02 4 12 LNU820 0,854 3,06E-02 6 10 LNU820 0,748 8,71E-02 6 3 LNU820 0,771 7,27E-02 6 5 LNU820 0,738 3,67E-02 8 17 LNU820 0,738 3,67E-02 8 12 LNU820 0,783 2,16E-02 2 18 LNU820 0,783 2,16E-02 2 14 LNU820 0,826 1,15E-02 2 20 LNU820 0,778 2,29E-02 2 15 LNU820 0,783 2,16E-02 2 21 LNU820 0,798 1,76E-02 2 16 LNU821 0,705 1,18E-01 1 19 LNU821 0,701 7,95E-02 1 2 LNU821 0,835 3,85E-02 6 8 LNU821 0,846 8,04E-03 2 18 LNU821 0,846 8,04E-03 2 14 LNU821 0,874 4,59E-03 2 20 LNU821 0,818 1,31E-02 2 15 LNU821 0,888 7,64E-03 2 19 LNU821 0,922 1,13E-03 2 2 LNU821 0,763 2,75E-02 2 1 LNU821 0,846 8,04E-03 2 21 LNU821 0,867 5,26E-03 2 16 LNU821 0,953 8,86E-04 4 17 LNU821 0,953 8,86E-04 4 12 LNU822 0,727 6,41E-02 8 19 LNU822 0,795 3,24E-02 4 17 LNU822 0,795 3,24E-02 4 12 LNU823 0,832 2,02E-02 1 17 LNU823 0,712 7,28E-02 1 9 LNU823 0,712 7,29E-02 1 3 LNU823 0,710 7,38E-02 1 5 LNU823 0,926 2,77E-03 1 7 LNU823 0,832 2,02E-02 1 12 LNU823 0,710 3,23E-02 5 10 LNU823 0,770 9,19E-03 3 3 LNU823 0,735 3,79E-02 2 3 LNU823 0,842 8,65E-03 2 7 LNU823 0,713 7,21E-02 4 4 LNU823 0,704 7,75E-02 4 7 LNU824 0,769 4,32E-02 1 18 LNU824 0,757 4,88E-02 1 4 LNU824 0,769 4,32E-02 1 14 LNU824 0,740 5,71E-02 1 15 LNU824 0,800 5,60E-02 1 19 LNU824 0,774 4,10E-02 1 2 LNU824 0,784 3,71 E-02 1 1 LNU824 0,769 4,32E-02 1 21 LNU824 0,746 5,40E-02 1 16 LNU824 0,791 1,12E-02 5 9 LNU824 0,714 3,07E-02 5 4 LNU824 0,758 4,85E-02 8 19 LNU824 0,703 5,17E-02 2 17 LNU824 0,835 9,93E-03 2 4 LNU824 0,877 4,25E-03 2 5 LNU824 0,889 3,12E-03 2 6 LNU824 0,703 5,17E-02 2 12 LNU824 0,786 3,60E-02 4 13 LNU824 0,846 1,65E-02 4 11 LNU825 0,800 3,06E-02 1 8 LNU825 0,916 3,70E-03 8 13 LNU825 0,885 3,45E-03 8 11 LNU825 0,729 4,03E-02 7 8 LNU825 0,908 4,75E-03 2 13 LNU825 0,804 1,62E-02 2 11 LNU825 0,740 5,74E-02 4 17 LNU825 0,740 5,74E-02 4 12 LNU828 0,990 1,44E-04 6 5 LNU828 0,823 4,40E-02 6 6 LNU828 0,721 1,06E-01 6 15 LNU829 0,805 2,91 E-02 4 8 LNU830 0,762 2,78E-02 5 19 LNU830 0,748 8,74E-02 6 7 LNU831 0,939 5,45E-03 1 13 LNU831 0,715 7,09E-02 1 11 LNU831 0,904 2,03E-03 5 13 LNU831 0,757 1,81E-02 5 11 LNU831 0,702 7,90E-02 8 13 LNU831 0,894 6,66E-03 2 13 LNU831 0,921 3,25E-03 4 13 LNU831 0,978 1,40E-04 4 11 LNU832 0,825 2,23E-02 1 5 LNU832 0,768 4,36E-02 1 20 1NU832 0,866 1,18E-02 1 6 LNU832 0,719 6,85E-02 1 15 LNU832 0,801 3,05E-02 1 1 LNU832 0,706 7,60E-02 1 16 LNU832 0,895 1,61E-02 6 5 LNU832 0,875 2,24E-02 6 6 LNU832 0,856 3,21 E-03 3 13 LNU832 0,767 9,66E-03 3 9 LNU832 0,827 3,13E-03 3 11 LNU832 0,707 4,96E-02 8 5 LNU832 0,746 3,36E-02 8 11 LNU832 0,713 4,73E-02 8 6 LNU832 0,797 1,79E-02 7 18

Conj.

ID do Conj.

ID do Nome do Nome do R Valor P de Conj. de R Valor P de Conj. de Gene Gene Ex . Cor.

Ex p.

Cor.

LNU832 0,827 1,13E-02 7 4 LNU832 0,725 4,20E-02 7 3 LNU832 0,893 2,85E-03 7 5 LNU832 0,797 1,79E-02 7 14 LNU832 0,829 1,09E-02 7 20 LNU832 0,944 4,10E-04 7 6 LNU832 0,839 9,28E-03 7 15 LNU832 0,797 1,79E-02 7 21 LNU832 0,817 1,33E-02 7 16 LNU832 0,809 1,51E-02 2 9 LNU832 0,734 3,80E-02 2 4 LNU832 0,717 4,54E-02 2 11 LNU832 0,751 3,17E-02 2 6 LNU833 0,778 3,96E-02 1 10 LNU833 0,813 2,61E-02 1 5 LNU833 0,765 4,51E-02 1 11 LNU833 0,746 5,44E-02 1 6 LNU833 0,873 1,02E-02 1 1 LNU833 0,776 6,99E-02 6 8 LNU833 0,738 9,37E-02 6 11 LNU833 0,853 1,46E-02 7 13 LNU833 0,904 2,03E-03 7 11 LNU833 0,715 4,62E-02 2 20 LNU833 0,738 3,66E-02 2 11 LNU833 0,715 4,63E-02 2 16 LNU833 0,745 5,46E-02 4 9 LNU833 0,836 1,92E-02 4 8 LNU834 0,820 2,41E-02 1 18 LNU834 0,737 5,87E-02 1 10 LNU834 0,871 1,07E-02 1 17 LNU834 0,810 2,71E-02 1 9 LNU834 0,722 6,72E-02 1 4 LNU834 0,819 2,43E-02 1 3 LNU834 0,805 2,90E-02 1 5 LNU834 0,894 6,67E-03 1 7 LNU834 0,820 2,41E-02 1 14 LNU834 0,750 5,23E-02 1 20 LNU834 0,803 2,96E-02 1 6 LNU834 0,869 1,10E-02 1 15 LNU834 0,871 1,07E-02 1 12 LNU834 0,886 1,88E-02 1 19 LNU834 0,805 2,88E-02 1 2 LNU834 0,724 6,61 E-02 1 1 LNU834 0,820 2,41E-02 1 21 LNU834 0,852 1,49E-02 1 16 LNU834 0,927 7,87E-03 6 18 LNU834 0,846 3,38E-02 6 4 LNU834 0,927 7,87E-03 6 14 LNU834 0,831 4,03E-02 6 15 LNU834 0,879 2,12E-02 6 19 LNU834 0,758 8,05E-02 6 2 LNU834 0,927 7,87E-03 6 21 LNU834 0,839 3,69E-02 6 16 LNU834 0,723 2,78E-02 3 13 LNU834 0,743 1,37E-02 3 17 LNU834 0,786 7,05E-03 3 9 LNU834 0,711 2,12E-02 3 3 LNU834 0,795 6,03E-03 3 11 LNU834 0,743 1,37E-02 3 12 LNU834 0,700 5,31E-02 8 10 LNU834 0,927 9,31E-04 8 4 LNU834 0,758 2,93E-02 8 5 LNU834 0,855 6,81E-03 8 6 LNU834 0,775 2,38E-02 7 7 LNU834 0,760 2,87E-02 7 11 LNU834 0,933 2,14E-03 2 13 LNU834 0,748 3,29E-02 2 17 LNU834 0,765 2,69E-02 2 9 LNU834 0,883 3,63E-03 2 4 LNU834 0,851 7,38E-03 2 5 LNU834 0,850 7,48E-03 2 6 LNU834 0,748 3,29E-02 2 12 LNU834 0,822 2,31E-02 4 13 LNU834 0,990 1,73E-05 4 11 LNU835 0,867 1,16E-02 1 8 LNU835 0,710 7,37E-02 1 20 LNU835 0,822 4,45E-02 6 11 LNU835 0,754 1,89E-02 3 13 LNU835 0,892 6,97E-03 8 13 LNU835 0,973 4,88E-05 8 11 LNUS35 0,739 3,61 E-02 7 5 LNU835 0,711 4,81 E-02 7 20 LNU835 0,788 2,01 E-02 2 4 LNU835 0,780 2,25E-02 2 6 LNU835 0,881 8,78E-03 4 13 LNU837 0,897 1,54E-02 1 19 LNU837 0,776 4,02E-02 1 2 LNU837 0,825 2,24E-02 1 1 LNU838 0,941 1,55E-03 4 13 LNU838 0,953 9,08E-04 4 11 LNU839 0,820 2,41 E-02 1 18 LNU839 0,739 5,77E-02 1 17 LNU839 0,722 6,72E-02 1 4 LNU839 0,740 5,73E-02 1 3 LNU839 0,805 2,90E-02 1 5 LNU839 0,820 2,41E-02 1 14 LNU839 0,750 5,23E-02 1 20 LNU839 0,803 2,96E-02 1 6 LNU839 0,869 1,10E-02 1 15 LNU839 0,739 5,77E-02 1 12 LNU839 0,886 1,88E-02 1 19 LNU839 0,805 2,88E-02 1 2 LNU839 0,724 6,61 E-02 1 1 LNU839 0,820 2,41E-02 1 21 LNU839 0,852 1,49E-02 1 16 LNU839 0,927 7,87E-03 6 18 LNU839 0,846 3,38E-02 6 4 LNU839 0,731 9,85E-02 6 8 LNU839 0,927 7,87E-03 6 14 LNU839 0,831 4,03E-02 6 15 LNU839 0,879 2,12E-02 6 19 LNU839 0,758 8,05E-02 6 2 LNU839 0,927 7,87E-03 6 21 LNU839 0,839 3,69E-02 6 16 LNU839 0,723 2,78E-02 3 13 LNU839 0,795 6,03E-03 3 11 LNU839 0,760 2,87E-02 7 11 LNU839 0,883 3,63E-03 2 4 LNU839 0,851 7,38E-03 2 5 LNU839 0,850 7,48E-03 2 6

Conj. ID do Conj. ED do Nome do Nome do R Valor P de Conj. de R Valor P de Conj. de Gene Gene Exp. Cor. Ex . Cor. LNU839 0,822 2,31E-02 4 13 LNU839 0,752 5,11E-02 4 9 LNU839 0,930 2,40E-03 4 8 LNU839 0,990 1,73E-05 4 11 LNU840 0,701 5,28E-02 7 9 LNU841 0,843 3,50E-02 6 13 LNU841 0,737 3,69E-02 8 8 LNU841 0,929 2,48E-03 7 13 LNU841 0,808 1,54E-02 7 11 LNU843 0,701 7,94E-02 1 18 LNU843 0,871 1,07E-02 1 10 LNU843 0,890 7,22E-03 1 17 LNU843 0,787 3,58E-02 1 9 LNU843 0,803 2,97E-02 1 3 LNU843 0,821 2,36E-02 1 7 LNU843 0,701 7,94E-02 1 14 LNU843 0,890 7,22E-03 1 12 LNU843 0,701 7,94E-02 1 21 LNUB43 0,722 1,84E-02 3 10 LNU844 0,745 8,95E-02 6 10 LNU844 0,865 5,60E-03 8 7 LNU844 0,765 2,69E-02 7 17 LNUB44 0,814 1,38E-02 7 7 LNU844 0,765 2,69E-02 7 12 LNU845 0,823 2,28E-02 1 18 LNU845 0,706 7,65E-02 1 17 LNU845 0,786 3,60E-02 1 9 LNU845 0,746 5,42E-02 1 3 LNUB45 0,903 5,33E-03 1 5 LNU845 0,823 2,28E-02 1 14 LNU845 0,847 1,61E-02 1 20 LNU845 0,840 1,81E-02 1 6 LNU845 0,871 1,06E-02 1 15 LNU845 0,706 7,65E-02 1 12 LNUB45 0,818 4,68E-02 1 19 LNU845 0,879 9,12E-03 1 2 LNU845 0,909 4,59E-03 1 1 LNU845 0,823 2,28E-02 1 21 LNU845 0,873 1,04E-02 1 16 LNU845 0,818 4,64E-02 6 9 LNU845 0,894 1,62E-02 6 7 LNU845 0,705 2,28E-02 3 7 LNU845 0,710 3,20E-02 3 19 LNU845 0,785 7,12E-03 3 1 LNU845 0,784 2,12E-02 8 17 LNU845 0,839 9,14E-03 8 9 LNU845 0,816 1,35E-02 8 8 LNU845 0,740 3,58E-02 8 7 LNU845 0,717 4,54E-02 8 20 LNU845 0,784 2,12E-02 8 12 LNU845 0,763 2,75E-02 7 9 LNU845 0,762 2,79E-02 7 8 LNU845 0,797 3,17E-02 4 5 LNU845 0,703 7,81E-02 4 6 LNU846 0,711 1,13E-01 6 10 LNU846 0,791 6,08E-02 6 3 LNU846 0,843 8,57E-03 8 17 LNU846 0,881 3,86E-03 B 5 LNU846 0,788 2,03E-02 8 6 LNU846 0,843 8,57E-03 B 12 LNU846 0,779 2,26E-02 7 10 LNU846 0,701 5,25E-02 2 18 LNU846 0,820 1,26E-02 2 10 LNU846 0,845 8,19E-03 2 9 LNU846 0,832 1,05E-02 2 3 LNU846 0,701 5,25E-02 2 14 LNU846 0,724 4,25E-02 2 6 LNU846 0,711 4,82E-02 2 15 LNU846 0,701 5,25E-02 2 21 i aaeia n]. sao iomeciaas as coreiaçoes trc} entre os níveis de expressão aos genes que melhoram a produção e seus Homólogos em vários tecidos [conjuntos de Expressão (exp.)] e o desempenho fenotípico {componentes de produção, biomassa, taxa de crescimento elou vigor (Correlação vetor (corr))] sob condições de baixo nitrogênio em variedades de milho. P = Valor p.

EXEMPLO 9

PRODUÇÃO DE TRANSCRIPTOMA DE TOMATE E ANÁLISE DE CORRELAÇÃO

DE ALTA PRODUTIVIDADE UTILIZANDO MICROARRANJO DE OLTGONUCLEOTÍDEO DE TOMATE DE 44K

[00487] A fim de produzir uma análise de correlação de alta produtividade entre o fenótipo relacionado à NUE e a expressão do gene, os presentes inventores utilizaram um microarranjo de oligonucleotídeo de Tomate, produzido pela Agilent Technologies [chem (ponto) agilent (ponto) com/Scripts/PDS (ponto) asp?lPage=50879]. 0 arranjo de oligonucleotídeo representa cerca de 44.000 de genes e transcrições de Tomate. A fim de definir a correlação entre os níveis de expressão do RNA e os parâmetros relacionados ao vigor ou aos componentes de produção NUE, e ABST, várias características da planta de 18 diferentes variedades de Tomate foram analisadas. Entre elas, 10 variedades englobando a variação observada foram selecionadas para análise de expressão do RNA. A correlação entre os níveis de RNA e os parâmetros caracterizados foi analisada utilizando o teste de correlação Pearson [davidmlane (ponto) com/hyperstat/A34739 (ponto) html].

Correlação das variedades de Tomate em ecotipos cultivados sob condições de baixo nitrogênio, condições de seca e condições de cultivo regular Procedimentos Experimentais:

[00488] 10 variedades de Tomates foram cultivadas em 3 blocos repetitivos, cada um contendo 6 plantas por lote, em estufa com rede. Em suma, o protocolo de cultivo se deu conforme segue:

1. Condições de cultivo regular: As variedades de Tomate foram cultivadas sob condições normais (4 a 6 Litros/m2 de água por dia e fertilizadas com NPK, conforme recomendado nos protocolos para produção comercial de tomates).

2. Condições de fertilização de Baixo Nitrogênio: As variedades de Tomate foram cultivadas sob condições normais (4 a 6 Litros/m2 por dia e fertilizadas com NPK, conforme recomendado nos protocolos para produção comercial de tomates) até o estágio de floração. Neste momento, a fertilização com Nitrogênio foi interrompida.

3. Estresse de seca: A variedade de Tomate foi cultivada sob condições normais (4 a 6 Litros/m2 por dia) até o estágio de floração. Neste momento, a irrigação foi reduzida para 50% comparado às condições normais.

[00489] As plantas foram fenotipadas diariamente, seguindo os descritores padrão do tomate (Tabela 63). A colheita foi conduzida enquanto 50% dos frutos estavam vermelhos (maduros). As plantas foram separadas em parte vegetal e frutos; destes, 2 nós foram analisados com relação aos parâmetros de inflorescência adicionais, tais como tamanho, número de flores e peso de inflorescência. O peso fresco de todo o material vegetal foi medido. Os frutos foram separados por cores (vermelhos vs. verde) e em conformidade com o tamanho do fruto (pequeno, médio e grande). Em seguida, os dados analisados foram salvos como arquivos de texto e processados utilizando o software JMP de análise estatística (instituto SAS). Os parâmetros de dados coletados são resumidos nas Tabelas 64 a 70 abaixo.

[00490] Tecidos de Tomate analisados- Dois tecidos em diferentes fases de desenvolvimento [flore folha], representando diferentes características das plantas, foram amostrados e o RNA foi extraído, conforme descrito acima. Para conveniência, cada tipo de tecido de informação de expressão de microarranjo recebeu um ID de Conjunto, conforme resumido na Tabela 62 abaixo.

Tabela 62

Conjuntos de expressão de transr_rintnma dP TnmatP ID de Conjunto Conjunto de Expressão 1 Campo de tomate/NUE/folha 2 Campo de tomate/NUE/flor 3 Campo de tomate/Seca/folha 4 Campo de tomate/Normal/folha 5 Campo de tomate/Normal/flor 6 Campo de tomate/Seca/flor 7 Campo de tomate Seca/folha 8 Campo de tomate Seca/flor 9 Campo de tomate NUE/folha 10 Campo de tomate NUE/flor 11 Campo de tomate Normalifolha 12 Campo de tomate Normaliflor i apeia óz: bao fornecidos os numeres de identificação (tU) de cada conjunto de expressão de tomate.

[00491] A Tabela 63 fornece os parâmetros correlacionados ao tomate (Vetores). A média para cada um dos parâmetros medidos foi calculada utilizando o software JMP e os valores estão resumidos nas Tabelas 64 a 70 abaixo. Uma análise de correlação subsequente foi conduzida (Tabela 71) Os resultados foram integrados à base de dados.

Tabela 63 Parâmetros correlacionados de Tomate (vetores) Parámetros correlacionados com ID de Correlação Peso de 100 frutos verdes Seca k 1 Peso de 100 frutos verdes (Baixo N) k 2 Peso de 100 frutos verdes Normal k 3 Peso de 100 frutos vermelhos (Seca) k 4 Peso de 100 frutos vermelhos (Baixo N) [kg] 5 Peso de 100 frutos vermelhos (Normal) [kg] 6 Peso do Agrupamento NUE /Normal [kg] 7 FW NUE/Normal a FW Seca/Normal 9 FW/Planta (NUE) 10 FW/Parta (Normal) 11 FWIPlanta! Seca 12 Fruta Seca/NUE 13 Fruta NUE/Normal 14 Produção de Fruto Seca /Normal 15 Produção de Fruto/Planta (NUE) 16 Produção de Fruto !Planta Seca 17 Produção de Fruto/Planta (Normal) ia HI rodu ão1 rodu ão+biomassa (Baixo N) 19 HI rodu ão1 rodu ão+biomassa (Normal) 20 Comprimento dos Folíolos [cm] (Baixo N) [cm] 21 Comprimento dos Folíolos cm (Normal) [cm] 22 Comprimento dos Folíolos cm (Seca) [cm] 23 Largura dos Folíolos (Baixo N) cm 24

Parâmetros correlacionados com ID de Correlação Largura dos Folíolos (Normal) cm 25 Lar ura dos Folíolos cm (Seca) cm 26 NUE [produção 1SPAD (Baixo N) 27 NUE [produção ISPAD (Normal) 28 NUE2 biomassa total ISPAD (Baixo N) 29 NUE2 biomassa total /SPAD (Normal) 30 NUpE biomassa/SPAD (Baixo N) 31 NUpE biomassa&SPAD (Normal) 32 Sem flores NUE 33 Sem flores (Normal) 34 N° de Flores Seca/NUE 35 N° de Flores Seca/Normal 36 N° de Flores Seca 37 N° de Flores NUElNormal 38 RWC (Normal) % 39 RWC Seca % 40 RWC Seca/Normal % 41 RWC NUE [%] 42 RWC NUE/Normal % 43 SAPD 100% RWC NUE/Normal [unidade SPAD 44 SLA área da folha/ biomassa da planta] (Baixo N) 45 SLA área da folha/ biomassa da planta] (Normal) 46 SPAD (Normal) [unidade SPA DI 47 SPAD 100% RWC (NUE) unidade SPAD] 48 SPAD 100% RWC (Normal) [unidade SPAD 49 SPAD NUE [unidade SPAD] 50 SPAD NUE/Normal [unidade SPAD] 51 Area Total da Folha cm"2 (Baixo N) 52 Área Total da Folha cm"2 Normal 53 Area Total da Folha cm"2 (Seca) 54 Peso do agrupamento de flores (Normal) 55 Peso do agrupamento flores (NUE) 56 Peso do agrupamento de flores (Seca) 57 Produção/SLA (Baixo N) 58 Produção ISLA (Normal) 59 Produ ão 1 Area Total da Folha (Baixo N) 60 Produ ão 1 Area Total da Folha (Normal) 61 Peso médio de frutos vermelhos (NUE) 62 Peso médio de frutos vermelhos (Normal) 63 Peso médio de frutos vermelhos Seca 64 Peso do agrupamento de flores Seca/NUE 65 Peso do agrupamento de flores Seca/Normal 66 Peso de frutos vermelhos Seca/Normal 67 Tabela 63. São fornecidos os parâmetros correlacionados ao tomate. "g." = gramas, "FW = peso fresco; "NUE" = eficiência no uso do nitrogênio; "RWC" = teor relativo de água; "NUpE" = eficiência na captação de nitrogénio, "SPAD' = níveis de clorofila; "HI'= índice de colheita (peso vegetal dividido na produção); °SLA" = área específica da folha (área da folha dividida por peso seco da folha).

[00492] Produção do Fruto (gramas) - No final do experimento [quando 50% dos frutos estavam maduros (vermelhos)], todos os frutos dos lotes dentro dos blocos de A a C foram colhidos. 0 total de frutos foi contado e pesado.

0 peso médio do fruto foi calculado dividindo o peso total do fruto pelo número de frutos.

[00493] Produção/SLA e Produção/Área total da folha - A produção de frutos dividida pela área específica da folha ou a área total da folha fornece uma medida de um balanço entre os processos reprodutivos e vegetais.

[00494] Peso Fresco do Fruto (gramas) - No final do experimento [quando 50% dos frutos estavam maduros (vermelhos)], todas as plantas dos lotes dentro dos blocos de A a C foram colhidas. 0 peso fresco foi medido (gramas).

[00495] Peso de inflorescência (gramas) - No final do experimento [quando 50% dos frutos estavam maduros (vermelhos)], duas inflorescências dos lotes dentro dos blocos de A a C foram colhidas. 0 peso de inflorescência (gr.) e o número de flores por inflorescência foram contados.

[00496] SPAD - 0 teor de clorofila foi determinado utilizando um medidor de clorofila do tipo Minolta SPAD 502 e a medição foi realizada no momento da floração. Leituras do medidor SPAD foram feitas em folha jovem completamente desenvolvida. Três medidas foram tomadas por folha por espiga.

[00497] Eficiência no uso da água (WUE) - pode ser determinada como a biomassa produzida por transpiração de unidade. Para analisar a WUE, o teor de água relativo à folha foi medido em plantas de controle e transgênicas. O peso fresco (FW) foi imediatamente registrado; então, as folhas foram encharcadas por 8 horas em água destilada à temperatura ambiente no escuro e o peso túrgido (TW 1 turgid weight) foi registrado. 0 peso seco total (OW) foi registrado após secar as folhas a 60°C em um peso constante. O teor de água relativo

(RWC) foi calculado, de acordo com a Fórmula I a seguir [(FW - DW/TW - DW) x 100], conforme descrito acima.

[00498] As plantas que mantiveram um teor de água relativo (RWC) alto comparado às linhas de controle foram consideradas mais tolerantes à seca do que aquelas que exibiram um teor de água relativo reduzido.

Resultados Experimentais: Tabela 64 Parâmetros medidos em acessos de Tomate sob condicões de seca ID de linha/ID 9 12 13 15 17 35 36 37 40 41 57 64 de Cor. Linha-1 1,717 2,620 1,151 0,565 0,467 0,877 2,941 16,667 72,120 0,990 0,368 0,009 Linha-2 0,344 1,092 0,732 1,415 0,483 1,219 0,336 6,500 74,510 0,974 0,407 0,195 Linha-3 0,611 1,847 1,321 1,274 0,629 1,741 2,474 15,667 65,330 1,016 0,325 0,209 Linhal 2,630 2,221 0,756 2,876 0,347 1,564 2,652 20,333 72,220 1,077 0,288 0,005 Linha-5 1,177 2,634 1,513 4,201 2,044 1,094 1,207 11,667 66,130 1,207 0,551 0,102 Linha-6 1,365 2,708 0,705 0,550 0,250 1,520 3,040 25,333 68,330 0,880 0,311 0,002 Linha-7 4,018 3,406 5,063 0,085 0,045 4,956 5,947 29,733 78,130 1,343 0,445 0,035 Linha-8 1,010 2,108 0,891 1,030 0,453 1,083 2,080 17,333 18,460 0,278 0,555 0,006 Linha-9 0,608 1,948 0,671 1,392 0,292 0,978 1,467 14,667 73,210 1,131 0,304 0,005 Linha-10 0,640 1,763 2,171 3,280 1,017 4,944 4,238 29,667 62,500 0,831 0,315 0,005 Linha-11 0,950 1,721 0,377 0,906 0,600 0,882 1,667 15,000 67,210 1,015 0,308 0,005 Unha-12 0,510 1,923 1,273 2,618 0,494 0,795 1,292 10,333 75,760 1,199 0,311 0,012 Linha-13 1,168 2,206 0,842 0,319 0,272 2,115 3,438 18,333 62,820 1,107 8,360 0,005 Linha-14 1,938 3,731 1,512 2,484 0,679 1,286 1,500 12,000 70,690 1,966 0,288 0,006 Linha-15 0,352 0,754 0,984 0,405 0,140 1,605 2,652 20,333 55,750 0,718 0,342 0,303 Unha-16 1,063 1,757 1,337 1,619 0,529 1,900 1,407 12,667 75,220 0,752 0,441 0,138 Linha-17 0,208 0,626 0,384 1,763 0,554 1,357 1,188 12,667 63,680 1,008 0,268 0,040 Linha-18 0,483 1,109 0,837 1,424 0,414 1,417 1,259 11,333 62,310 0,829 0,426 0,089 Tabela 64: São fornecidas os valores de cada um dos parâmetros (conforme descrito acima) medidos em acessos de Tomate (ID da linha), sob condições de cultivo de seca. As condições de cultivo são especificadas na seção de procedimento experimental.

Tabela 65 Parâmetros adicionais medidos em acessos de Tomate sob condicões de seca ID de linha/ID de 65 66 67 1 4 23 26 54 Cor. Linha-1 0,689 0,315 0,193 Linha-2 1,110 1,190 24,373 Linha-3 1,060 0,469 25,384 Linha-4 0,823 0,005 0,016 Linha-5 1,163 1,252 20,259 Linha-6 1,250 0,028 0,036 Linha-7 1,517 0,563 0,150 Linha-8 1,190 0,963 0,022 Linha-9 0,759 0,416 0,863

ID de linha/ID de 65 66 67 1 4 23 26 54 Cor. Linha-10 1,039 0,378 0,737 Linha-11 0,376 0,358 0,090 Linha-12 0,778 0,622 1,715 0,8 0,88667 5,1504 2,55142 337,63 Linha-13 24,115 8,196 0,171 0,28 0,34667 3,38139 2,04437 130,779 Linha-14 0,673 0,411 0,024 0,38 0,62667 7,13977 4,16522 557,927 Linha-15 0,967 0,907 10,501 0,63333 2,27 5,47615 3,08653 176,671 Linha-16 0,988 0,669 27,890 2,86 7,4 8,62307 4,69436 791,863 Linha-17 0,949 0,383 11,789 1,16 2,94 6,34602 3,86722 517,049 Linha-18 0,907 1,305 9,979 4,39667 11,6 6,77153 2,9104 832,265 Tabela 65: São fornecidos os valores de cada um dos parâmetros (conforme descrito acima) medidos em acessos de Tomate (ID da fnha), sob condições de seca. As condições de cultivo são especificadas na seção de procedimento experimental.

Tabela 66 Parâmetros medidos em acessos de Tomate sob condições de baixo nitrogênio ID de linha/ID de 7 8 10 14 16 33 38 42 43 44 48 Cor. Linha-1 0,457 2,649 4,041 0,491 0,406 19,000 3,353 74,070 1,017 0,787 28,469 Linha-2 1,072 0,382 1,213 1,932 0,660 5,333 0,276 99,080 1,296 1,372 39,039 Linha-3 0,442 0,743 2,246 0,965 0,477 9,000 1,421 69,490 1,081 0,920 33,009 Linha-4 0,006 3,008 2,540 3,802 0,458 13,000 1,696 63,240 0,943 0,753 23,418 Linha-5 1,076 0,827 1,850 2,776 1,351 10,667 1,103 77,360 1,412 1,309 34,528 Linha-6 0,022 1,544 3,063 0,780 0,354 16,667 2,000 77,910 1,004 0,965 32,513 Linha-7 0,371 3,697 3,134 0,017 0,009 6,000 1,200 80,490 1,383 1,107 27,661 Linha-8 0,809 1,218 2,542 1,157 0,509 16,000 1,920 67,400 1,013 0,949 33,676 Linha-9 0,548 0,575 1,844 2,074 0,436 15,000 1,500 67,160 1,038 0,793 30,045 Linha-10 0,364 0,551 1,517 1,511 0,468 6,000 0,857 66,070 0,878 0,924 35,502 Linha-11 0,953 1,056 1,913 2,406 1,593 17,000 1,889 69,570 1,050 0,937 24,812 Linha-12 0,800 0,492 1,856 2,056 0,388 13,000 1,625 69,300 1,096 1,356 40,771 Linha-13 0,340 1,310 2,472 0,379 0,323 8,667 1,625 100,000 1,761 1,443 47,467 Linha-14 0,611 1,361 2,621 1,642 0,449 9,333 1,167 57,660 1,603 1,502 26,064 Linha-15 0,938 0,506 1,084 0,412 0,143 12,667 1,652 90,790 1,170 1,046 35,378 Linha-16 0,677 0,705 1,166 1,211 0,396 6,667 0,741 68,000 0,680 0,562 30,600 Linha-17 0,404 0,306 0,921 4,587 1,442 9,333 0,875 59,650 0,944 1,484 38,971 Linha-18 1,439 0,474 1,088 1,700 0,495 8,000 0,889 72,170 0,961 0,643 37,456 I abela bb: São fornecidos os valores de cada um dos parâmetros (conforme descrito acima) medidos em acessos de Tomate (ID da Semente), sob condições de cultivo com baixo Nitrogênio. As condições de cultivo são especificadas na seção de procedimento experimental.

Tabela 67 Parâmetros adicionais medidos em acessos de Tomate sob condições de Baixo nitrogênio ID de linha/ID 50 51 56 62 2 19 21 24 27 29 31 de Cor. Linha-1 38,400 0,773 0,533 0,024 0,87 0,0912 6,39865 3,46688 0,01425 0,15619 0,14195 Linha-2 39,400 1,059 0,367 0,191 3,66333 0,35231 5,92027 1,97373 0,01691 0,04799 0,03108 Linha-3 47,500 0,851 0,307 0,006 0,56667 0,1751 3,68636 1,78501 0,01444 0,08247 0,06803 Linha-4 37,000 0,797 0,350 0,005 0,37 0,15286 5,42713 2,55198 0,01957 0,12803 0,10846 Linha-5 44,600 0,925 0,473 0,096 3,40333 0,42208 6,95119 3,51776 0,03913 0,09271 0,05358 Linha-6 41,700 0,961 0,249 0,004 0,68333 0,10371 3,73374 1,73101 0,0109 0,10512 0,09422 Linha-7 34,400 0,802 0,293 Q006 0,45333 0,00283 4,38515 1,87221 0,00032 0,11364 0,11332 Linha-8 50,000 0,938 0,467 0,007 0,47333 0,16679 6,72386 3,54186 0,01511 0,0906 0,07549 Linha-9 44,700 0,764 0,400 0,00fi 0,54 0,19103 6,65657 3,27815 0,0145 0,07589 0,06139 Linha-10 53,700 1,051 0,303 0,013 0,39333 0,23594 4,38654 2,5225 0,01319 0,05591 0,04272

ID de linha/ID 50 51 56 62 2 19 21 24 27 29 31 de Cor. Linha-11 35,700 0,893 0,820 0,021 0,97 0,45446 3,90107 2,60788 0,06422 0,1413 0,07709 Linha-12 58,800 1,235 0,400 0,005 0,91333 0,17306 5,29057 2,61233 0,00952 0,05504 0,04551 Linha-13 47,500 0,820 0,347 0,006 0,36333 0,11548 6,31683 3,57772 0,0068 0,05888 0,05208 Linha-14 45,200 0,936 0,428 0,047 0,34667 0,14622 5,1126 2,5642 0,01722 0,11779 0,10056 Linha-15 39,000 0,894 0,353 0,357 0,56667 0,11634 4,72494 2,48302 0,00404 0,03469 0,03065 Linha-16 45,000 0,826 0,447 0,037 4,38333 0,25338 6,83245 3,43048 0,01293 0,05102 0,03809 Linha-17 65,300 1,570 0,283 0,626 2,02 0,61025 7,09701 3,29874 0,03701 0,06064 0,02364 Linha-18 51,900 0,878 0,470 8,13 0,31274 8,21338 3,68939 0,01322 0,04226 0,02904 i apeia br: Sao rorneciaos os valores de cada um dos parametros (contorme descrito acima) medidos em acessos de Tomate (ID da Semente), sob condições de cultivo com baixo Nitrogénio. As condições de cultivo são especificadas na seção de procedimento experimental.

Tabela 68 Parâmetros adicionais medidos em acessos de Tomate sob condicões de Baixo nitrogênio ID de linha/ID de Cor. 45 52 58 60 5 Linha-1 140,044 565,932 0,0029 0,00072 1,06 Linha-2 317,118 384,77 0,00208 0,00172 6,86667 Linha-3 131,293 294,827 0,00363 0,00162 0,64667 Linha-4 148,817 377,995 0,00308 0,00121 0,53 Linha-5 257,51 476,393 0,00525 0,00284 7,17333 Linha-6 64,3367 197,085 0,00551 0,0018 0,44 Linha-7 144,599 453,236 6,1E-05 2E-05 Linha-8 246,05 625,515 0,00207 0,00081 0,55333 Linha-9 405,548 748,01 0,00107 0,00058 0,74667 Linha-10 299,316 453,962 0,00156 0,00103 0,58 Linha-11 86,1901 164,853 0,01849 0,00967 1,26667 Linha-12 182,319 338,303 0,00213 0,00115 1,34 Linha-13 160,178 395,995 0,00202 0,00082 0,52 Linha-14 90,0951 236,149 0,00498 0,0019 0,57333 Linha-15 160,99 174,585 0,00089 0,00082 0,94333 Linha-i6 379,028 441,778 0,00104 0,0009 6,17 Linha-17 531,079 489,183 0,00272 0,00295 3,67333 Linha-18 650,684 707,8 0,00076 0,0007 11,325 i aaeia nu. Sao romeciaos os valores cie cada um dos parametros (conforme descrito acima) medidos em acessos de I ornate(lu da Semente) sob condições de cultivo com baixo Nitrogênio. As condições de cultivo são especificadas na seção de procedimento experimental.

Tabela 69 Parâmetros medidos em acessos de Tomate sob condicões normais ID de linha/ID de 11 18 34 39 47 49 55 63 20 28 Cor, Linha-1 1,526 0,826 5,667 72,830 49,700 36,170 1,167 0,048 0,351 0,017 Linha-2 3,174 0,342 19,333 76,470 37,200 28,447 0,342 0,008 0,097 0,009 Linha-3 3,022 0,494 6,333 64,290 55,800 35,893 0,693 0,008 0,140 0,009 Linha-4 0,844 0,121 7,667 67,070 46,400 31,085 56,348 0,286 0,125 0,003 Linha-5 2,238 0,487 9,667 54,790 48,200 26,384 0,440 0,005 0,179 0,010 Linha-6 1,984 0,454 8,333 77,610 43,400 33,684 11,313 0,054 0,186 0,010 Linha-7 0,848 0,529 5,000 58,180 42,900 24,979 0,790 0,231 0,384 0,012 Linha-8 2,088 0,440 8,333 66,510 53,300 35,472 0,577 0,290 0,174 0,008 Linha-9 3,206 0,210 10,000 64,710 58,500 37,875 0,730 0,006 0,061 0,004 Linha-10 2,754 0,310 7,000 75,250 51,100 38,426 0,833 0,007 0,101 0,006 Linha-11 1,811 0,662 9,000 66,230 40,000 26,494 0,860 0,058 0,268 0,017 Linha-12 3,770 0,189 8,000 63,210 47,600 30,066 0,500 0,007 0,048 0,004 Linha-13 1,888 0,852 5,333 56,770 57,900 32,889 1,020 0,026 0,311 0,015 Linha-14 1,926 0,273 8,000 35,960 48,300 17,354 0,700 0,261 0,124 0,006

ID de linha/ID de 11 18 34 39 47 49 55 63 20 28 Cor. Linha-15 2,143 0,347 7,667 77,620 43,600 33,818 0,377 0,029 0,139 0,008 Linha-16 1,652 0,327 9,000 100,000 54,500 54,467 0,660 0,005 0,165 0,006 Linha-17 3,011 0,314 10,667 63,160 41,600 26,253 0,700 0,003 0,095 0,008 Linha-18 2,294 0,291 9,000 75,130 59,100 ' 44,427 0,327 0,009 0,113 0,005 aueia aa: aao rorneciaos os vaiores ae caaa um aos parametros (conforme descrito acima) medidos em acessos de Tomate (ID da linha), sob condições normais de cultivo. As condições de cultivo são especificadas na seção de procedimento experimental.

Tabela 70 Parâmetros adicionais medidos em acessos de Tomate sob condicões normais ID de linha/lD 30 32 3 6 22 25 46 53 59 61 de Cor. Linha-1 0,047 0,031 Linha-2 0,095 0,085 Linha-3 0,063 0,054 0,55667 0,82333 6,34284 3,69046 140,989 426,099 0,0035 0,00116 Linha-4 0,021 0,018 3,05333 2,45667 7,98803 4,76756 689,665 582,384 0,00017 0,00021 Linha-5 0,057 0,046 0,24 0,50333 5,59331 3,43357 130,22 291,403 0,00374 0,00167 Linha-6 0,056 0,046 2,57667 2,76 7,69722 4,56061 299,118 593,583 0,00152 0,00077 Linha-7 0,032 0,020 6,32333 5,31667 7,84568 4,43534 1117,74 947,594 0,00047 0,00056 Linha-8 0,047 0,039 5,75333 5,24 6,21698 3,15039 111,77 233,352 0,00394 0,00189 Linha-9 0,058 0,055 0,37667 0,61 6,1597 3,36888 106,294 340,731 0,00198 0,00062 Linha-10 0,060 0,054 0,29667 0,66 5,65211 3,13112 123,139 339,111 0,00252 0,00091 Linha-11 0,062 0,045 1,95333 2,70333 4,39488 2,39632 104,986 190,141 0,00631 0,00348 Linha-12 0,083 0,079 2,53333 0,7 4,44138 2,02436 111,88 421,789 0,00169 0,00045 Linha-13 0,047 0,033 1,42333 2,64 6,7696 3,8002 307,946 581,334 0,00277 0,00147 Linha-14 0,046 0,040 2,03 4,67 7,41586 3,7433 419,365 807,511 0,00065 0,00034 Linha-15 0,057 0,049 1,385 2,16667 6,70898 2,97523 365,812 784,056 0,00095 0,00044 Linha-16 0,036 0,030 2,27 0,49333 5,86525 3,21956 212,926 351,801 0,00153 0,00093 Linha-17 0,080 0,072 0,45 0,34333 4,16 2,08898 84,9441 255,776 0,0037 0,00123 Linha-18 0,044 0,039 0,41667 0,75333 10,2902 5,91228 469,874 1078,1 0,00062 0,00027 I aoea íu: aao rorneciaos os vaiores ae caaa um aos parametros (contarme descrito acima) medidos em acessos de Tomate (ID da linha), sob condições normais de cultivo. As condições de cultivo são especificadas na seção de procedimento experimental.

Tabela 71 Correlação entre o nível de expressão de genes selecionados de algumas aplicações da invenção em vários tecidos e o desempenho fenotípico sob condições normais e de estresse em ecotivos de tomate Nome do ID do Conj. deID Nome do Conj. de R Valor P Conj..do R Valor P Conj. de Gene Exp. Cor.Gene p Cor. LNU971 0,830 5,67E-03 11 32 LNU971 0,836 5,02E-03 11 30 LNU971 0,730 1,66E-02 10 52 LNU971 0,986 1,83E-07 1 55 LNU972 0,787 1,18E-02 11 20 LNU972 0,802 9,36E-03 11 28 LNU972 0,782 2,19E-02 12 59 LNU972 0,783 2,15E-02 12 61 LNU973 0,793 6,26E-03 3 43 LNU973 0,773 2,44E-02 12 3 LNU973 0,825 3,31E-03 2 49 LNU974 0,700 2,41E-02 10 52 LNU975 0,739 1,45E-02 3 51 LNU975 0,857 3,15E-03 3 62 LNU975 0,927 1,12E-04 1 55 LNU975 0,825 3,30E-03 1 63 ducIa r I. pau iurnec+uas as coreiaçoes i entre os níveis ae expressao aos genes que melhoram a produção e seus homólogos em vários tecidos [conjuntos de Expressão (exp.)] e o desempenho fenotípico [componentes de produção, biornassa, taxa de crescimento elou vigor (Correlação vetor (corr))] sob condições normais e sob condições de baixo nitrogênio em todos os ecotipos de tomate. P = Valor p.

[00499] Correlação dos traços do vigor em coletas de ecotipos de Tomate sob condições de Baixo nitrogênio, de 300 mM NaCl e condições normais de cultivo - Dez híbridos de tomate foram cultivados em 3 lotes repetitivos, cada um contendo 17 plantas, em uma estufa com rede sob condições semi-hidropônicas. Em suma, o protocolo de cultivo se deu conforme segue: As sementes de tomate foram semeadas em bandejas preenchidas com uma mistura de vermiculite e turfa em uma proporção de 1:1, Após a germinação, as bandejas foram transferidas para a solução de alta salinidade (300 mM NaCl, além da solução completa de Hoagland), solução de baixo nitrogênio ("baixo N") (a quantidade do nitrogênio total foi reduzida em 90% da solução completa de Hoagland, quantidade final de 0,8 nM N), ou em solução de cultivo Normal (Completa de Hoagland, contendo solução de 8 mM N, cultivo em 28 ± 2°C) As plantas foram cultivadas a 28 ± 2 °C.

[00500] A solução completa de Hoagland consiste em: KNO3 - 0,808 gramas/litro, MgSO4 - 0,12 gramas/litro, KH2PO4 - 0.172 gramas/litro e 0,01 (volume/volume) de microelementos de `Super coratina' (Ferro-EDDHA [etilenodiamina-N,N'-bis(ácido 2-hidroxifenilacetico)]- 40,5 gramas/Litro; Mn - 20,2 gramas/litro; Zn 10,1 gramas/litro; Co 1,5 gramas/litro; e Mo 1,1 gramas/litro), o pH da solução deve ser de 6,5 - 6,8].

[00501] Tecidos de Tomates Analisados - Todas as variedades de Tomate selecionadas foram amostradas para cada tratamento. Três tecidos [folhas, meristemas e flores] foram amostrados e o RNA foi extraído, conforme descrito abaixo. Para conveniência, cada tipo de tecido de informação de expressão de microarranjo recebeu um ID de Conjunto, conforme resumido na Tabela 72 abaixo. Tabela 72 Conjuntos experimentais de transcriptoma de Tomate ID do Conjunto Conjunto de Expresssão 1 Normal/folha 2 Normallraiz 3 Baixo Nlfolha 4 Baixo N /raiz Salinidade/folha Salinidadelraiz 7 Baixo N /raiz 8 Baixo N !folha 9 Normallraiz 10 Normal/folha 11 Salinidadelraiz 12 Salinidadelfo[ha Tabela 72. São fornecidos os conjuntos experimentais de transcriptoma de tomate.

[00502] Parâmetros relacionados ao vigor do Tomate - Após 5 semanas de cultivo, as plantas foram colhidas e analisadas com relação ao número de folhas, altura da planta, níveis de clorofila (unidades SPAD), índices diferentes de eficiência no uso do nitrogênio (NUE) e biomassa da planta.

A seguir, os dados analisados foram salvos como arquivos de texto e processados utilizando o software JMP de análise estatística (Instituto SAS). Os parâmetros de dados coletados são resumidos na Tabela 73 abaixo. Tabela 73 Parâmetros correlacionados ao Tomate (vetores) ID de Correlação Parâmetros correlacionados com 1 Folha N°. Baixo N/Normal número 2 Folha N. NaCI/Normal número] 3 Folha W. NaCI/Baixo N [número] 4 Nível de N /Folha unidade spad /folha 5 NUE das raizes Biomassa da Raiz D 1SPAD) 6 NUE dos brotos Biomassa dos Brotos D /SPAD) 7 NUE da biomassa total Biomassa Total D /SPAD) 8 Porcentagem de redução da Biomassa da Raiz comparada ao Normal 9 Porcentagem de redução da Biomassa do Broto comparada ao Normal 10 Altura da Planta Baixo N/Normal[Cm]

D de Correlação Parâmetros correlacionados com 11 Altura da Planta NaCl/Baixo N [cm] 12 Altura da Panta NaCI/Norma! [cm] 13 Biomassa da Planta NaCI [cm] 14 Altura da Planta Baixo N cm] 15 Altura da Planta NaCI [cm] 16 Altura da Planta Normal cm] 17 Biomassa da Raiz D ISPAD 18 SPAD Baixo N/Normal [unidade SPAD] 19 SPAD Baixo N [unidade SPADI 20 SPAD Normal [unidade SPAD 21 Biomassa do Broto D ISPAD 22 Broto /Raiz 23 Biomassa Total Raiz+ OW do Broto] ISPAD 24 Altura Normal 25 Folha N°. Baixo N 26 Folha W. Normal 27 Folha W. NaCI i aoeia ii. aao romeciaos os parametros correiacionaoos ao tomate. -hvv- = peso rresco; -Cm" centímetro. = "r-olrla N'.- = numero de folhas.

Resultados Experimentais: [005031 10 diferentes variedades de Tomate foram cultivadas e caracterizadas com relação aos parâmetros, conforme descrito abaixo. A média para cada um dos parâmetros medidos foi calculada utilizando o software JMP e os valores estão resumidos nas Tabelas 74 a 77 abaixo. Uma análise de correlação subsequente foi conduzida (Tabela 78). Na sequência, os resultados foram integrados à base de dados. Tabela 74 Parâmetros medidos em acessos de Tomate sob condições de baixo nitrocrênio ID 1 10 14 18 19 24 25 4 5 Cor)Linha de Linha-1 0,850 0,810 36,780 1,010 34,570 45,330 5,560 10,854 6,990 Linha-2 0,900 0,830 39,890 0,980 24,870 47,780 6,220 11,409 2,540 Linha-3 0,980 0,840 34,440 1,020 28,580 40,780 7,220 Linha-4 1,090 0,850 47,000 1,000 31,580 55,330 6,780 10,438 7,040 Linha-5 0,880 0,830 46,440 0,980 29,720 56,220 5,560 11,169 5,040 Linha-6 1,020 0,930 45,440 0,980 31,830 48,670 6,560 8,929 8,010 Linha-7 0,870 0,850 47,670 0,930 30,330 55,780 5,110 7,926 15,090 Linha-8 1,060 1,050 39,330 1,050 30,290 37,440 5,890 7,993 9,020 Linha-9 0,910 0,840 41,780 1,010 31,320 49,560 5,560 10,304 8,780 Linha-10 1,120 0,880 41,000 0,990 28,770 46,330 6,330 8,585 7,250 Linha-11 11,528 7,730 Linha-12 14,491 15,940 i apeia r4, aao rorneciaos os valores ae caaa um aos parametros (contorne descrito acima) medidos em acessos de Tomate (Linha), sob condições de cultivo de baixo nitrogênio. As condições de cultivo são especificadas na seção de procedimento experimental.

Tabela 75

Parâmetros adicionais medidos em acessos de Tomate sob condições de Baixo nitroaênio de 6 7 8 9 17 21 22 23 Cor/Linha Linha-1 35,350 58,470 62,592 75,380 0,001 0,004 5,010 0,005 Linha-2 24,090 63,750 54,158 55,112 0,000 0,003 11,393 0,003 Linha-3 Linha-4 65,020 69,290 70,547 49,726 0,001 0,007 9,494 0,008 Linha-5 46,710 71,100 59,685 63,189 0,001 0,005 11,600 0,005 Linha-6 46,670 60,540 96,129 82,667 0,001 0,005 8,200 0,006 Linha-7 120,070 73,900 106,502 66,924 0,001 0,011 10,375 0,013 Linha-8 60,090 68,810 111,905 107,983 0,001 0,007 10,523 0,008 Linha-9 66,270 66,740 81,644 55,401 0,001 0,007 8,242 0,008 Linha-10 56,460 70,820 32,214 54,433 0,001 0,007 7,967 0,008 Linha-11 38,350 69,700 143,714 62,155 0,001 0,004 6,414 0,005 Linha-12 60,320 49,720 87,471 59,746 0,001 0,006 3,909 0,007 Tabela 75. São fornecidos os valores de cada um dos parâmetros (conforme descrito acima) medidos em acessos de Tomate (Linha), sob condições de cultivo de baixo nitrogênio. As condições de cultivo são especificadas na seção de procedimento experimental.

Tabela 76 Parâmetros medidos em acessos de Tomate sob condicões normais iD de 16 20 26 4 5 6 7 17 21 22 23 Cor /Linha Linha-1 45,330 34,300 6,560 9,293 1,120 4,690 7,470 0,001 0,005 5,400 0,006 Linha-2 47,780 25,310 6,890 8,868 0,470 4,370 8,630 0,001 0,005 10,021 0,006 Linha-3 40,780 28,120 7,330 Linha-4 55,330 31,430 6,220 8,433 1,000 13,080 8,850 0,001 0,014 15,417 0,015 Linha-5 56,220 30,240 6,330 9,827 0,840 7,390 7,220 0,001 0,008 8,833 0,009 Linha-6 48,670 32,430 6,440 8,573 0,830 5,650 7,870 0,001 0,005 7,519 0,006 Linha-7 55,780 32,580 5,890 6,567 0,940 17,940 9,090 0,001 0,017 12,611 0,019 Linha-8 37,440 28,770 5,560 6,968 0,810 5,560 7,910 0,001 0,007 7,989 0,008 Linha-9 49,560 30,920 6,110 8,710 1,080 11,960 8,550 0,001 0,011 14,306 0,012 Linha-10 46,330 28,990 5,670 7,348 2,250 10,370 8,680 0,003 0,012 4,797 0,014 Linha-11 10,181 0,540 6,170 9,100 0,001 0,006 12,650 0,007 Linha-12 9,370 1,820 10,100 6,240 0,002 0,009 6,294 0,011 i apeia ia. e ao iorneciaos os valores ae caaa um aos parametros [conforme aescnto acima) medidos em acessos ae {ornate (Linha), sob condições normais de cultivo. As condições de cultivo são especificadas na seção de procedimento experimental.

Tabela 77 Parâmetros medidos em acessos de Tomate sob condições de salinidade 10 de 3 11 12 13 15 27 4 21 17 23 Cor/Unha2 Linha-1 0,540 0,640 0,150 0,120 0,360 5,600 3,560 11,400 0,001 0,000 0,001 Linha-2 0,570 0,630 0,160 0,140 0,440 6,460 3,940 11,639 0,001 0,000 0,001 Linha-3 0,680 0,690 0,250 0,210 0,260 8,470 5,000 Linha-4 0,640 0,590 0,180 0,150 0,710 8,560 4,000 10,788 0,001 0,000 0,001 Linha-5 0,560 0,640 0,190 0,160 0,460 8,870 3,560 10,776 0,002 0,000 0,002 Linha-6 0,680 0,670 0,170 0,160 0,540 7,560 4,390 6,952 0,001 0,000 0,001 Linha-7 0,540 0,620 0,180 0,150 0,660 8,640 3,170 9,213 0,001 0,000 0,001 Linha-8 0,670 0,630 0,140 0,150 0,400 5,570 3,720 8,538 0,001 0,000 0,001 Linha-9 0,650 0,720 0,140 0,120 0,520 5,820 4,000 10,370 0,001 0,000 0,001 Linha-10 0,750 0,680 0,230 0,200 0,450 9,360 4,280 8,840 0,001 Linha-11 10,434 0,001 0,000 0,001 lIDde 2 3 11 12 13 15 27 4 21 17 23 Cor.lLinha Linha-12 f I I I 12,429 I 0,001 0,000 0,001 I aoela 1. sao tomecldos os valores de cada um dos parãmetros (conforme descrito acima) medidos em acessos de Tomate (Linha), sob condições de cultivo de salinidade. As condições de cultivo são especificadas na seção de procedimento experimental.

Tabela 78 Correlação entre o nível de expressão de genes selecionados de algumas aplicações da invenção em vários tecidos e o desempenho fenotipico sob condições normais e de estresse em ecotipos de tomate Nome do R Conk. Nome do Conj. Valor P Conj. de R Valor P Conj. de Gene de Exp. Gene de Exp. Cor. Cor. LNU971 0,729 4,01E-02 4 10 LNU971 0,878 1,86E-03 4 9 LNU971 0,845 4,12E-03 6 21 LNU971 0,786 2,07E-02 6 23 LNU971 0,736 2,38E-02 3 8 LNU971 0,736 2,39E-02 8 8 LNU972 0,843 4,32E-03 6 21 LNU972 0,798 1,76E-02 6 23 LNU972 0,817 7,24E-03 3 8 LNU973 0,808 1,52E-02 3 10 LNU973 0,716 2,99E-02 3 9 LNU974 0,738 3,65E-02 1 20 LNU974 0,724 2,73E-02 4 4 LNU974 0,757 2,97E-02 4 1 LNU974 0,730 2,56E-02 3 8 LNU974 0,715 3,05E-02 7 4 LNU974 0,737 2,34E-02 8 8 LNU975 0,729 2,57E-02 9 4 LNU975 0,773 1,45E-02 4 4 LNU975 0,736 2,36E-02 3 8 LNU975 0,729 2,58E-02 2 4 LNU975 0,839 9,17E-03 2 26 LNU975 0,778 1,36E-02 7 4 Tabela 78. São fornecidas as corelações (R) entre os níveis de expressão dos genes que melhoram a produção e seus homólogos em vários tecidos [conjuntos de Expressão (exp.)] e o desempenho fenotipico [componentes de produção, biomassa, taxa de crescimento elou vigor (Correlação vetor (Corr))] sob condições normais e sob condições de baixo nitrogênio em todos os ecotipos de tomate. P = Valor p.

EXEMPLO 10

PRODUÇÃO DE TRANSCRIPTOMA DE MILHO E ANÁLISE DE CORRELAÇÃO DE ALTA PRODUTIVIDADE QUANDO CULTIVADO SOB CONDIÇÕES NORMAIS E

CONDIÇÕES DE DESFOLHAMENTO UTILIZANDO MICROARRANJO DE OLIGONUCLEOTÏDEO DE MILHO DE 60K

[00504] A fim de produzir uma análise de correlação de alta produtividade, os presentes inventores utilizaram um microarranjo de oligonucleotídeo de milho, produzido pela Agilent Technologies [chem (ponto) agilent (ponto) com/Scripts/PDS (ponto) asp?lPage=50879]. 0 arranjo de oligonucleotídeo representa cerca de 60K de genes e transcrições de Milho, projetado com base nos dados das bases de dados públicos (Exemplo 1). A fim de definir a correlação entre os níveis de expressão do RNA e os parâmetros relacionados ao vigor ou componentes de biomassa e produção, várias características da planta de 13 diferentes variedades de Milho foram analisadas sob condições normais e tratamento de desfolhamento. Algumas variedades foram sujeitas à análise de expressão de RNA. A correlação entre os níveis de RNA e os parâmetros caracterizados foi analisada utilizando o teste de correlação Pearson [davidmlane (ponto) com/hyperstat/A34739 (ponto) html].

Procedimentos Experimentais:

[00505] 13 linhas de variedades de milho foram cultivadas em 6 lotes repetitivos, em campo. As sementes de Milho foram plantadas e as plantas foram cultivadas em campo, utilizando fertilização comercial e protocolos de irrigação.

Após a acetinação, 3 lotes em todas as linhas de variedades forma submetidos ao tratamento de desfolhamento. Neste tratamento, todas as folhas acima da espiga foram removidas.

Depois do tratamento, todas as plantas foram cultivadas de acordo com os mesmos protocolos de fertilização comercial e irrigação.

[00506] Três tecidos em estágio de desenvolvimento de floração (Ri), incluindo folha (floração - R1), caule (floração - R1), e meristema de floração (floração - R1), representando diferentes características da planta, foram amostrados de plantas tratadas e não tratadas. 0 RNA foi extraído, conforme descrito em "MÉTODOS GERAIS EXPERIMENTAIS E DE BIOINFORMÁTICA". Para conveniência, cada tipo de tecido de informação de expressão de microarranjo recebeu um ID de Conjunto, conforme resumido nas Tabelas 79 a 80 abaixo. Tabela 79 Tecidos utilizados para conjuntos de expressão de transcriptoma de Milho (sob condicões normais) Conjunto de Expressão ID do Conjunto Meristema fêmea/Normal 1 Folha/Norma! 2 Caule/Normal 3 i aoera : sao rorneciaos os numeros de identiflcaçao (ID) de cada conjunto de expressão de Milho.

Tabela 80 Tecidos usados para conjuntos de expressão de transcriptoma de Milho (sob condicões de desfoihamento) Conjunto de Expressão ID do Conjunto Meristerna férrea/Desfolhamento 1 Folha/ Desfolhamento 2 Caule/ Desfolhamento 3 1 aoea ou: sao tomeciaos os numeros ae dentsticaçao (ID) de cada conjunto de expressão de Milho,

[00507] Os parâmetros a seguir foram coletados por formação de imagem.

[00508] 0 sistema de processamento de imagem utilizado consiste em um computador pessoal (processador Intel P4 3.0 Ghz) e um programa de domínio público - ImageJ

1.37 (Programa de processamento de imagem com base em Java), desenvolvido nos Institutos Nacionais de Saúde dos Estados Unidos e está livremente disponível na internet em rsbweb (ponto) nih (ponto) gov/. As imagens foram capturadas em resolução de 10 Mega Pixels (3888x2592 pixels) e armazenadas em um formato JPEG (padrão do Grupo Conjunto de 5 Especialistas em Fotografia) de baixa compressão. Em seguida, os dados analisados foram salvos em arquivos de texto e processados utilizando o software de análise estatística JMP (instituto SAS).

[00509] Peso de 1000 Grãos - No final do experimento, todas as sementes de todos os lotes foram colhidas e pesadas e o peso de 1000 foi calculado.

[00510] Área da Espiga (cm2)- No final do período de cultivo, 5 espigas foram fotografadas e as imagens foram processadas utilizando o sistema de processamento de imagem descrito abaixo. A área da Espiga foi medida a partir dessas imagens e foi dividida pelo número de espigas.

[00511] Comprimento da Espiga e Largura da Espiga (cm) ~ No final do período de cultivo, foram fotografadas 6 espigas e as imagens foram processadas utilizando o sistema de processamento de imagem descrito abaixo. 0 comprimento e a largura das espigas (eixo mais longo) foram medidos a partir dessas imagens e divididos pelo número de espigas.

[00512] Área do Grão (cm2) - No final do período de cultivo, os grãos foram separados da espiga. Uma amostra de -200 grãos foi pesada, fotografada e as imagens foram processadas utilizando o sistema de processamento de imagem descrito abaixo. A área de grão foi medida a partir dessas imagens e foi dividida pelo número de grãos.

[00513] Comprimento do Grão e Largura do Grão (cm) - No final do período de cultivo, os grãos foram separados da espiga. Uma amostra de -200 grãos foi pesada, fotografada e as imagens foram processadas utilizando o sistema de processamento de imagem descrito abaixo. A soma dos comprimentos /ou a largura dos grãos (eixo mais longo) foi medida a partir dessas imagens e foi dividida pelo número de grãos.

[00514] Perímetro do Grão (cm) - No final do período de cultivo, os grãos foram separados da espiga. Uma amostra de -200 grãos foi pesada, fotografada e as imagens foram processadas utilizando o sistema de processamento de imagem descrito abaixo. A soma do perímetro dos grãos foi medida a partir dessas imagens e foi dividida pelo número de grãos.

[00515] Área preenchida por grãos da espiga (cm2 ) -No final do período de cultivo, 5 espigas foram fotografadas e as imagens foram processadas utilizando o sistema de processamento de imagem descrito abaixo. A área da espiga preenchida com núcleos foi medida a partir dessas imagens e foi dividida pelo número de Espigas.

[00516] Preenchido por Toda a Espiga [o] - foi calculado como o comprimento da espiga com grãos fora da espiga total.

[00517] Parâmetros adicionais foram coletados por amostragem de 6 plantas por lote ou medindo o parâmetro em todas as plantas dentro do lote.

[00518] Largura do Sabugo [cm] - 0 diâmetro do sabugo sem os grãos foi medido utilizando uma régua.

[00519] Peso médio da Espiga (Kg.) - No final do experimento (quando as espigas foram colhidas), o total e 6 espigas selecionadas por lote foram colhidos. As espigas foram pesadas e a média de espigas por planta foi calculada. 0 peso médio da espiga foi normalizado utilizando a umidade relativa como sendo de 0%.

[00520] Peso da planta e altura da espiga - As plantas foram caracterizadas com relação à altura no momento da colheita. Em cada medida, 6 plantas foram medidas com relação à altura utilizando uma fita métrica. A altura foi medida a partir do nível do solo até o topo da planta abaixo da borla. A altura das espigas foi medida do nível do chão até o local onde estava localizada a espiga principal.

[00521] Num de fileiras da espiga - O número de fileiras por espiga foi contado.

[00522] Peso fresco da espiga por planta (GF) - Durante o período de preenchimento do grão (GF I grain filling), o total e 6 espigas selecionadas por lote foram colhidos. As espigas foram pesadas e o peso médio da espiga por planta foi calculado.

[00523] Peso seco da Espiga - No final do experimento (quando as espigas foram colhidas), o total e 6 espigas selecionadas por lote foram colhidos e pesados. 0 peso médio da espiga foi normalizado utilizando a umidade relativa como sendo de 0%.

[00524] Peso fresco da Espiga - No final do experimento (quando as espigas foram colhidas), o total e 6 espigas selecionadas por lote foram colhidos e pesados.

[00525] Espigas por planta - o número de espigas por planta foi contado.

[00526] Peso dos Grãos (Kg.) - No final do experimento, todas as espigas foram colhidas. Espigas de 6 plantas de cada lote foram separadamente debulhadas e os grãos foram pesados.

[00527] Peso seco dos grãos (Kg.) - No final do experimento, todas as espigas foram colhidas. Espigas de 6 plantas de cada lote foram separadamente debulhadas e os grãos foram pesados. 0 peso do grão foi normalizado utilizando a umidade relativa como sendo de 0%.

[00528] Peso do Grão por espiga (Kg.) - No final do experimento, todas as espigas foram colhidas. 5 espigas de cada lote foram debulhadas separadamente e os grãos foram pesados. 0 peso médio de grãos por espiga foi calculado dividindo-se o peso total de grãos pelo número de espigas.

[00529] Área das folhas por planta (GF) e (HD) [LAI] = Área total da folha de 6 plantas em um lote; seu parâmetro foi medido em dois pontos de tempo durante o curso do experimento; no estágio de florescimento (HD 1 heading) e durante o período de preenchimento do grão (GF). A medição foi realizada utilizando um medidor de área da folha em dois pontos de tempo no curso do experimento; durante o período de preenchimento dos grãos e no estágio de florescimento (VT).

[00530] Peso fresco das folhas (GF) e (HD) -- Este parâmetro foi medido em dois pontos de tempo durante o curso do experimento; no estágio de florescimento (HD) e durante o período de preenchimento dos grãos (GF). As folhas utilizadas para a medição do LAI foram pesadas.

[00531] Peso fresco do caule inferior (GF) (HD) e (H) - Este parâmetro foi medido em três pontos de tempo durante o curso do experimento: no estágio de florescimento (HD), durante o período de preenchimento dos grãos (GF) e na colheita (H). Os entrenós inferiores de, pelo menos, 4 plantas por lote foram separados da planta e pesados. O peso médio do entrenó por planta foi calculado dividindo-se o peso total do grão pelo número de plantas.

[00532] Comprimento do caule inferior (GF) (HD) e (H) -- Este parâmetro foi medido em três pontos de tempo durante o curso do experimento; no estágio de florescimento (HD), durante o período de preenchimento dos grãos (GF) e na colheita (H). Os entrenós inferiores de, pelo menos, 4 plantas por lote foram separados da planta e seus comprimentos foram medidos utilizando uma regra. 0 comprimento médio dos entrenós por planta foi calculado dividindo-se o peso total do grão pelo número de plantas.

[00533] Largura do caule inferior (GF) (HD) e (H)- Este parâmetro foi medido em três pontos de tempo durante o curso do experimento; no estágio de florescimento (HD), durante o período de preenchimento dos grãos (GF) e na colheita (H). Os entrenós inferiores de, pelo menos, 4 plantas por lote foram separados da planta e seus diâmetros forma medidos utilizando um calibre. A largura média dos entrenós por planta foi calculada dividindo-se o peso total do grão pelo número de plantas.

[00534] Crescimento da altura da planta: a taxa de crescimento relativa (RGR) da Altura da Planta foi calculada utilizando a Fórmula III acima.

[00535] SPAD - O teor de clorofila foi determinado utilizando um medidor de clorofila do tipo Minolta SPAD 502 e a medição foi realizada 64 dias após a semeadura. Leituras do medidor SPAD foram feitas em folha jovem completamente desenvolvida. Três medidas foram tomadas por folha por espiga.

Os dados foram coletados depois de 46 e 54 dias depois da semeadura (DPSIdias after sowing)

[00536] Peso fresco do caule (GF) e (HD) - Este parâmetro foi medido em dois pontos de tempo durante o curso do experimento; no estágio de florescimento (HD) e durante o período de preenchimento dos grãos (GF). Os caules das plantas usados para a medição do LAI foram pesados.

[00537] A matéria seca total foi calculada utilizando a Fórmula XXXV.

[00538] Peso fresco do caule superior (GF) (HD) e (H) - Este parâmetro foi medido em três pontos de tempo durante o curso do experimento; no estágio de florescimento (HD), durante o período de preenchimento dos grãos (GF) e na colheita (H). Os entrenós superiores de, pelo menos, 4 plantas por lote foram separados da planta e pesados. 0 peso médio dos entrenós por planta foi calculado dividindo-se o peso total do grão pelo número de plantas.

[00539] Altura do caule superior (GF) (HD) e (H) - Este parâmetro foi medido em três pontos de tempo durante o curso do experimento; no estágio de florescimento (HD), durante o período de preenchimento dos grãos (GF) e na colheita (H). Os entrenós superiores de pelo menos 4 plantas por lote foram separados da planta e seus comprimentos foram medidos por uma régua. 0 comprimento médio dos entrenós por planta foi calculado dividindo-se o peso total do grão pelo número de plantas.

[00540] Largura do caule superior (GF) (HD) e (H) (mm) - Este parâmetro foi medido em três pontos de tempo durante o curso do experimento; no estágio de florescimento (HD), durante o período de preenchimento dos grãos (GF) e na colheita (H). Os entrenós superiores de, pelo menos, 4 plantas por lote foram separados da planta e seus diâmetros forma medidos utilizando um calibre. A largura média dos entrenós por planta foi calculada dividindo-se o peso total do grão pelo número de plantas.

[00541] Peso seco vegetal (Kg.)- Peso total da parte vegetal acima do solo (excluindo raízes) após secagem a 70°C no forno por 48 horas; peso por número de plantas.

[00542] Peso fresco vegetal (Kg.)- Peso total da parte vegetal de 6 plantas (acima do solo, excluindo as raízes).

[00543] Número de nós - Os nós no caule foram contados no estágio de florescimento do desenvolvimento da planta.

Tabela 81 Parâmetros correlacionados ao Milho (vetores) sob condições normais e sob condicões de desfolhamentn Condições normais Desfolhamento de Parâmetros correlacionados com Parâmetros correlacionados com Carreta ão de Correta ão Peso de 1000 grãos 1 Peso de 1000 grãos 1 Largura do Sabugo [mml 2 Largura do Sabugo [mm] 2 Área da Espiga [cm2] 3 Area da Espiga [cm2] 3 Área Preenchida por Grãos da Espiga 4 Área Preenchida por Grãos da Espiga [cm1 4 Largura da Espiga cm 5 Largura da Es i a [cm] 5 Peso Médio da Espiga[g] 6 Peso Médio da Espiga 6 Altura da Espiga cm 7 Altura da Espiga cm 7 Comprimento da Espiga (de feret) [cm] 8 Comprimento da Espiga (de feret) cm 8 N° de fileiras Espiga 9 N° de fileiras Espiga 9 FW das Espigas por planta (GF) [q/planta] 10 Peso seco das Espigas (SP) !tanta 10 Peso seco das Espigas SP [kg] 11 Peso fresco das Espigas (SP) k 11 Peso fresco das Espigas SP [kg] 12 Espigas por planta (SP) !canta 12 Espigas por planta (SP) g/planta] 13 Preenchido ! Toda a Es a [valor] 13

Condições normais Desfolhamento Parâmetros correlacionados com de Parâmetros correlacionados com Correta ão de Correta ão Preenchido 1 Toda a Espiga valor 14 Perímetro do Grão [cm] 14 Perímetro do Grão cm 15 RH do Grão % 15 RH do Grão [%] 16 Area do Grão cm 16 Area do Grão cm 17 Comprimento do Grão [cm] 17 Comprimento do Grão cm 18 Largura do Grão cm 18 Largura do Grão [cml 19 Peso seco do Grão (SP) [kg] 19 Peso seco do Grão (SP) [kg] 20 Peso dos Grãos (SP) k 20 Peso dos Grãos (SP) k 21 Peso dos Grãos por Espiga (SP) k 21 Peso dos Grãos por Espiga (SP) [kg] 22 FW das Folhas hd 22 FW das Folhas (GF) 23 Área das folhas PP (hd) cm2] 23 FW das Folhas hd 24 N° de folhas (LAI) (hd) 24 Area das folhas PP (GF) cm 25 N° de folhas 1 25 Area das folhas PP hd) Lcm2] 26 Tem eratura das folhas (GF) 26 N° de folhas (LAI) hd) 27 FW do Caule inferior (h) 27 N° de folhas 1 28 FW do Caule Inferior hd) 191 28 Temperatura das folhas (GF) 29 Comprimento do Caule Inferior (h) cm 29 FW do Caule Inferior (GF) 30 Comprimento do Caule Inferior (hd) cm 30 FW do Caule Inferior h 31 Largura do Caule Inferior (h) mm 31 FW do Caule Inferior (hd) [g} 32 Largura do Caule Inferior (hd) [mm 32 Comprimento do Caule Inferior (GF) cm 33 Número de nós 33 Comprimento do Caule Inferior (h) cm 34 N° de dias até o Florescimento (campo) 34 Comprimento do Caule Inferior (hd) [cm 35 Altura da planta cm 35 Largura do Caule Inferior (GF) cm 36 Crescimento da altura da planta cm/dia 36 Largura do Caule Inferior (h) mm 37 SPAD (GF) [valor] 37 Largura do Caule Inferior (hd) [mm 38 FW do Caule (hd) [mm 38 Número de nós 39 Matéria seca total (SP) [kg] 39 N° de dias até o Florescimento (campo) 40 FW do Caule Superior (h) 40 Altura da planta [cm] 41 Comprimento do Caule Superior (h) cm 41 Crescimento da altura da planta cmldia 42 Largura do Caule Superior (h) [mm] 42 SPAD (GF) [valor] 43 DW Vegetal (SP) [kg] 43 FW do Caule (GF) 44 FW Vegetal (SP) k 44 FW do Caule hd 45 Matéria seca total SP [kg] 4ô FW do Caule Superior (GF) 47 FW do Caule Superior h 48 Comprimento do Caule Superior (GF) cm 49 Comprimento do Caule Superior (h) cm 50 Largura do Caule Superior GF mm 51 Largura de Caule Superior (h) [mm] 52 DW Vegetal SP [kg] 53 FW Vegetal (SP) k 54 abela S1. São tornecdos os parãmetros correlacionados ao milho. "NUE" = eficiência no uso do nitrogênio; "DW" = peso seco; "cm' = centímetro, "GF" = preenchimento do grão, "PP = por planta, "h"= colheita, "méd." = média, "N°" = número. "mm' = milímetro; "g" _ gramas; "kg" = quilogramas; 'cm" = centímetros.

[00544] Treze variedades de milho foram cultivadas e caracterizadas com relação aos parâmetros, conforme descrito abaixo. A média para cada um dos parâmetros foi calculada utilizando o software JMP e os valores estão resumidos nas Tabelas 82 a 85 abaixo. Uma correlação subsequente entre os vários conjuntos de transcriptoma para todos os conjuntos ou subconjuntos de linhas foi feita pela unidade de bioinformática e os resultados foram integrados à base de dados (Tabelas 86 a 87 abaixo). Tabela 82

Parâmetros medidos em variedades de Milho sob condições normais Ecoo o/Tratamento Linha-1 Linha-2 Linha-3 Linha-4 Linha-5 Linha-6 1 241,091 296,503 232,402 263,250 305,376 303,614 2 23,427 24,633 22,149 25,106 24,714 23,207 3 47,516 82,296 36,009 74,626 61,731 76,997 4 46,808 80,887 17,431 72,415 56,829 73,430 5 4,249 4,656 3,210 4,787 5,016 4,961 6 22,854 209,500 55,556 164,627 132,917 177,444 7 71,139 121,667 110,611 134,235 89,333 149,639 8 13,937 22,091 13,897 19,622 16,062 20,024 9 11,778 13,000 13,750 14,944 15,471 14,556 10 228,743 351,262 201,689 323,077 217,161 307,874 11 0,615 1,257 0,333 1,087 0,798 1,065 12 0,688 1,687 0,468 1,457 1,072 1,412 13 1,667 1,000 1,000 1,111 1,000 1,000 14 0,985 0,982 0,406 0,969 0,919 0,953 15 3,146 3,299 2,793 3,233 3,318 3,275 16 12,700 12,500 12,367 12,367 12,233 11,967 17 0,652 0,720 0,517 0,667 0,705 0,706 18 1,058 1,125 0,895 1,123 1,155 1,133 19 0,783 0,808 0,734 0,753 0,776 0,789 20 0,415 0,907 0,121 0,800 0,367 0,766 21 0,475 1,037 0,138 0,913 0,418 0,869 22 0,069 0,151 0,020 0,133 0,061 0,128 23 137,328 230,129 141,263 197,636 154,760 201,031 24 96,392 110,968 103,967 80,570 119,360 157,210 25 4186,917 7034,596 4884,333 6402,795 4297,250 6353,074 26 4341,250 3171,000 4347,500 3527,000 4517,333 3984,750 27 9,000 8,000 8,833 6,750 8,500 7,750 28 4,333 4,833 3,917 4,167 4,000 4,833 29 32,294 33,111 35,214 33,517 34,526 33,869 30 29,703 35,403 15,660 25,025 23,986 26,514 31 33,690 23,517 21,746 20,340 23,466 25,083 32 38,818 72,988 36,998 59,900 32,614 74,715 33 13,417 19,350 15,833 20,400 16,342 20,925 34 12,484 16,761 16,094 20,022 15,006 22,594 35 9,417 14,500 14,133 17,750 11,083 20,000 36 20,208 19,855 15,904 16,841 15,593 16,139 37 21,518 19,423 15,819 17,188 17,028 16,086 38 23,494 24,138 20,247 20,533 20,812 20,973 39 14,667 15,222 13,778 14,556 13,667 14,611 40 74,000 69,667 74,000 71,000 74,000 69,667 41 173,389 265,111 203,556 255,944 177,444 271,111 42 4,030 6,302 4,153 6,519 4,358 7,144 43 60,952 59,772 48,589 53,170 57,919 53,206 44 447,155 649,026 347,648 489,318 404,783 524,055 45 468,300 758,610 392,713 587,875 437,855 801,320 46 1,615 2,565 1,411 2,058 1,835 2,316 47 14,369 19,614 8,862 15,539 13,003 17,824 48 10,441 12,937 8,003 11,212 10,438 12,975 49 11,792 16,633 13,917 18,755 13,217 18,375 50 10,422 16,928 13,683 18,756 12,306 18,717 Tabela 82.

Tabela 83 Parâmetros medidos em variedades de Milho sob condições normais, linhas adicionais de milho.

Ecotipo/Tratamento Linha-14 Linha-15 Linha-16 Linha-17 Linha-18 Linha-19 Linha-20 1 290,881 202,573 250,257 275,409 306,201 256,858 187,316 2 23,184 25,919 24,876 22,751 26,468 21,662 24,046 3 78,355 51,175 93,914 57,832 96,772 64,428 55,077 4 74,411 45,927 92,312 54,139 95,429 61,811 51,437 5 4,786 4,368 5,182 4,430 5,001 4,091 4,264 6 147,490 101,917 207,111 100,476 228,444 129,889 84,805 7 118,389 117,889 145,235 99,222 133,778 81,444 125,000 8 20,313 14,750 22,601 16,653 23,837 19,849 16,955 9 16,118 15,944 15,889 13,545 14,000 12,667 17,941 10 325,083 244,997 327,145 241,060 363,704 262,126 146,149 11 1,159 0,612 1,292 0,632 1,371 0,779 0,690 12 1,800 0,704 1,595 0,865 1,739 1,213 0,861 13 1,000 1,000 1,056 1,056 1,000 1,000 0,944 14 0,930 0,889 0,982 0,934 0,986 0,955 0,934 15 3,246 2,860 3,182 3,082 3,291 2,946 2,810 16 12,600 12,033 12,233 11,200 11,967 13,133 11,667 17 0,665 0,526 0,646 0,627 0,705 0,587 0,495 18 1,142 0,992 1,118 1,041 1,151 0,969 0,962 19 0,740 0,672 0,730 0,763 0,774 0,767 0,653 20 0,820 0,362 0,921 0,419 1,017 0,516 0,408 21 0,940 0,411 1,050 0,471 1,155 0,595 0,462 22 0,137 0,064 0,154 0,073 0,169 0,086 0,073 23 212,413 137,330 181,432 133,844 199,221 155,821 140,336 24 116,750 96,150 106,945 107,158 85,973 98,842 134,450 25 7123,475 4162,750 6075,206 4339,788 6597,666 4756,583 4209,091 26 4205,500 27 7,000 8,667 7,250 7,833 7,250 9,000 9,833 28 4,250 3,833 4,833 3,333 4,083 3,833 4,167 29 33,185 34,815 33,659 36,480 33,781 34,431 34,898 30 27,606 24,589 25,264 24,006 26,178 21,142 29,925 31 20,603 15,197 16,347 19,856 18,901 22,333 31,712 32 60,358 50,068 63,067 46,065 55,885 29,802 68,184 33 18,083 17,700 20,182 15,475 19,808 16,042 23,075 34 17,072 18,267 20,694 14,622 18,478 16,206 21,117 35 15,000 12,333 18,675 14,633 20,500 11,240 18,333 36 18,105 16,705 17,094 15,435 16,868 15,521 14,653 37 17,962 15,953 18,421 16,266 17,434 15,489 16,656 38 23,473 21,292 20,973 20,593 21,458 18,966 22,008 39 14,278 13,889 14,722 14,444 15,444 12,556 13,389 40 72,000 74,000 69,667 74,000 71,000 74,000 68,333 41 244,250 215,206 273,556 229,889 273,222 194,056 260,167 42 5,603 4,686 6,960 4,424 7,017 4,298 6,424 43 55,376 56,450 56,759 54,600 55,812 52,548 61,457 44 507,783 475,345 549,336 463,157 509,738 324,976 477,917 45 660,695 468,267 724,575 435,500 618,460 339,267 592,130 46 2,233 1,347 2,727 1,503 2,331 1,560 1,615 47 15,849 12,442 14,395 16,773 17,848 13,457 20,847 48 9,723 3,074 6,981 9,759 9,396 11,344 16,205 49 17,067 14,467 17,518 17,542 18,150 15,625 20,150 50 16,417 12,094 18,339 15,622 16,628 16,572 18,494 i aoe+a ui.

Tabela 84 Parâmetros medidos Pm vari pr1ad s r]P mi l hn cnh rloafnl hamcnntr, Ecoti olTratamento Linha-2 Linha-3 Linha-4 Linha-5 Linha-6 Linha-7 1 280,025 249,808 251,859 244,024 294,292 262,463 2 19,028 21,874 22,115 19,269 16,306 21,460 3 53,600 NA 45,503 25,764 38,307 37,749 4 51,497 NA 42,952 21,912 34,591 36,008 5 4,181 NA 4,207 3,376 3,919 3,945 6 89,202 56,056 100,750 26,773 73,389 79,167 7 119,444 102,778 131,556 91,375 145,528 121,000 8 16,338 NA 13,626 10,542 12,889 12,481 9 12,706 13,909 14,357 13,600 13,000 13,167 10 0,747 0,317 0,583 0,189 0,440 0,475 11 0,973 0,464 0,833 0,250 0,629 0,637 12 1,000 0,944 0,944 0,471 1,000 1,000 13 0,954 NA 0,915 0,820 0,873 0,951 14 3,109 2,936 3,144 2,894 3,179 2,919 15 13,467 12,767 12,367 13,200 12,833 12,400 16 0,649 0,562 0,632 0,563 0,669 0,570 17 1,052 0,947 1,080 0$957 1,079 0,956 18 0,777 0,753 0,740 0,729 0,781 0,757 19 0,523 0,155 0,400 0,087 0,289 0,283 20 0,604 0,178 0,456 0$097 0,331 0,323 21 0,087 0,027 0,069 0,021 0,048 0,047 22 112,270 78,475 94,985 107,475 125,138 93,500 23 3914,000 NA 3480,000 NA 4276,500 NA 24 7,750 8,000 7,500 8,667 8,000 8,167 25 4,500 3,917 4,083 4,917 4,333 4,583 26 32,472 34,626 33,093 34,456 33,637 32,433 27 23,021 18,392 26,502 19,689 26,975 14,456 28 64,160 30,778 53,813 28,248 56,413 47,118 29 16,294 15,306 21,439 14,294 20,850 14,056 30 15,150 12,250 18,500 9,133 16,667 14,917 31 19,539 15,813 16,899 15,916 15,793 15,517 32 24,300 18,868 20,565 21,737 21,058 22,490 33 15,167 13,167 14,389 13,294 15,000 13,833 34 72,000 78,000 73,000 74,000 73,000 74,000 35 251,417 191,000 248,639 175,500 268,056 203,444 36 6,385 3,787 6,319 4,232 6,315 4,214 37 61,213 47,106 57,363 55,451 58,022 58,156 38 713,540 323,125 538,043 442,733 705,525 421,642 I ageIa 04.

Tabela 85 Parâmetros medidos em variedades de Milho sob desfolhamento, linhas adicionais de milho Ecoo o I Tratamento Linha-14 Linha-15 Unha-16 Linha-17 Linha-18 Linha-19 Linha-20 1 230,119 200,087 271,250 236,886 259,427 218,764 203,643 2 19,768 23,640 22,441 20,880 20,283 20,871 21,198 3 39,827 32,330 47,329 21,782 65,896 37,337 63,114 4 36,313 25,193 43,339 20,167 64,803 34,644 54,962 5 4,099 3,520 4,202 2,743 4,664 3,532 4,562 6 85,044 53,044 33,100 92,167 161,761 66,500 89,497 7 123,375 112,722 135,000 96,000 136,500 73,500 113,944 8 13,214 11,957 14,818 10,472 17,602 13,734 17,210 9 14,063 15,125 13,750 12,333 13,938 12,471 18,000 10 0,454 0,300 0,630 0,128 0,803 0,399 0,478 11 0,648 0,371 0,819 0,136 1,148 0,739 0,599

Ecoti o 1 Tratamento Linha-14 Linha-15 Linha-16 Linha-17 Linha-18 Linha-19 Linha-20 12 0,889 0,944 1,000 0,222 0,882 1,000 0,944 13 0,905 0,709 0,905 0,933 0,983 0,918 0,757 14 3,130 2,558 3,016 2,810 3,117 2,767 2,934 15 12,567 13,000 13,150 12,800 13,150 2967 11,700 16 0,631 0,442 0,610 0,528 0,623 0,513 0,543 17 1,066 0,826 1,024 0,932 1,084 0,927 1,020 18 0,750 0,672 0,750 0,716 0,724 0,699 0,670 19 0,302 0,143 0,439 0,044 0,667 0,255 0,359 20 0,345 0,165 0,505 0,050 0,767 0,293 0,406 21 0,056 0,025 0,073 0,026 0,124 0,043 0,076 22 113,783 93,190 93,738 94,367 89,858 91,600 122,070 23 3436,000 NA 4593,000 NA 4315,500 NA NA 24 6,750 8,800 7,500 7,833 6,250 8,500 9,400 25 4,417 4,667 4,500 4,000 4,083 4,333 4,167 26 33,433 32,831 33,424 33,020 33,981 31,871 33,320 27 27,885 17,561 17,329 17,691 20,510 23,057 34,332 28 64,188 48,835 76,233 45,857 57,850 27,597 59,030 29 18,759 17,972 20,883 13,228 17,828 14,911 20,122 30 16,100 12,917 14,833 12,917 17,500 10,667 17,200 31 18,215 17,289 17,233 16,176 17,882 15,890 18,708 32 20,955 22,352 22,470 20,057 21,230 18,472 20,590 33 14,389 13,667 14,667 14,222 15,611 12,333 13,111 34 71,000 74,000 70,667 74,000 71,000 75,333 72,000 35 254,639 210,222 261,944 215,889 268,878 181,722 251,000 36 6,482 4,912 6,282 4,450 7,044 3,711 5,808 37 59,654 58,322 59,985 54,907 56,761 50,606 60,657 38 673,238 485,700 738,368 392,267 692,225 327,840 539,167 Tabela 85,

[00545] As Tabelas 86 e 87 abaixo fornecem as corelações (R) entre os níveis de expressão dos genes que melhoram a produção e seus homólogos em vários tecidos [conjuntos de Expressão (exp.)] e o desempenho fenotípico [componentes de produção, biomassa, taxa de crescimento e/ou vigor (Correlação vetor (corr))] sob condições normais e condições de desfolhamento em variedades de milho. P = Valor p Tabela 86 Correlação entre o nível de expressão dos genes selecionados de algumas aplicações da invenção em vários tecidos e o desempenho fenotípico sob condições normais em variedades de milho Conj. ID do Conj. ID do Nome do Nome do R R Valor P de Conj. de Valor P de Conj. de Gene Cor. Gene Exp. Cor. LNU814 0,711 1,41E-02 3 26 LNU824 0,727 3,85E-05 3 50 LNU824 0,843 1,24E-07 3 12 LNU824 0,720 4,95E-05 3 6 LNU824 0,770 6,81 E-06 3 20 LNU824 0,779 4,47E-06 3 11

Nome do Conj. ID do Conj. ID do R Valor P Nome do Gene de Conj. de R Valor P de Conj. de Ex . Gene Cor. Ex p. Cor. LNU824 0,775 5,45E-06 3 21 LNJ824 0,752 1,44E-05 3 25 LNU824 0,701 9,54E-05 3 10 LNU824 0,754 1,34E-05 3 22 LNU824 0,776 1,35E-05 2 50 LNU824 0,704 1,76E-04 2 23 LNU824 0,743 4,96E-05 2 12 LNU824 0,708 1,56E-04 2 11 LNU832 0,766 1,60E-02 2 26 LNU813 0,722 1,21E-02 2 49 LNU813 0,738 6,14E-03 3 13 LNU814 0,700 1,12E-02 3 32 LNU813 0,719 1,26E-02 2 48 LNU815 0,835 7,34E-04 1 36 LNU814 0,729 1,10E-02 1 5 LNU815 0,732 6,85E-03 1 19 LNU815 0,705 1,05E-02 1 1 LNU816 0,703 1,57E-02 2 7 LNU815 0,753 4,68E-03 1 30 LNU817 0,840 1,21E-03 2 38 LNU816 0,722 7,99E-03 1 13 LNU818 0,834 7,40E-04 3 37 LNUS18 0,731 6,92E-03 3 28 LNU818 0,737 9,61E-03 2 41 LNU818 0,794 2,02E-03 3 7 LNU818 0,770 5,60E-03 2 34 LNU818 0,700 1,64E-02 2 51 LNU818 0,749 8,04E-03 1 5 LNU818 0,829 1,60E-03 2 7 LNU819 0,712 1,40E-02 2 40 LNU819 0,764 6,20E-03 3 5 LNU820 0,755 4,57E-03 3 18 LNU819 0,713 1,37E-02 1 5 LNU820 0,834 7,46E-04 3 32 LNU820 0,794 2,05E-03 3 46 LNU820 0,704 1,07E-02 3 21 LNU820 0,712 9,44E-03 3 20 LNU820 0,759 4,22E-03 1 36 LNU820 0,712 9,44E-03 3 22 LNU821 0,715 8,92E-03 3 51 LNU820 0,736 6,32E-03 1 19 LNU823 0,780 2,76E-03 3 34 LNU823 0,766 3,65E-03 3 51 LNU823 0,757 4,38E-03 3 42 LNU823 0,741 5,79E-03 3 33 LNU823 0,726 7,47E-03 3 35 LNU823 0,776 3,03E-03 3 43 LNU823 0,753 1,19E-02 2 8 LNU823 0,744 8,61E-03 2 51 LNU825 0,745 5,38E-03 3 19 LNU824 0,705 1,05E-02 3 13 LNU828 0,726 7,57E-03 3 34 LNU825 0,704 1,56E-02 2 1 LNU828 0,719 8,47E-03 1 49 LNU828 0,804 1,62E-03 3 33 LNU828 0,726 7,53E-03 1 48 LNU828 0,789 2,31E-03 1 45 LNU829 0,713 9,30E-03 3 19 LNU828 0,823 1,02E-03 1 30 LNU831 0,865 2,82E-04 1 36 LNU831 0,746 5,30E-03 3 44 LNU834 0,730 6,97E-03 1 24 LNU831 0,777 2,96E-03 1 53 LNU834 0,805 1,57E-03 1 34 LNU834 0,751 7,71E-03 1 5 LNU834 0,702 1,09E-02 1 46 LNU834 0,723 7,92E-03 1 18 LNU834 0,767 3,57E-03 1 20 LNU834 0,829 8,51E-04 1 32 LNU834 0,751 4,89E-03 1 11 LNU834 0,723 7,86E-03 1 7 LNU834 0,767 3,57E-03 1 22 LNU834 0,758 4,28E-03 1 21 LNU835 0,876 1,86E-04 1 49 LNU835 0,725 1,15E-02 2 51 LNU835 0,809 1,46E-03 1 44 LNU835 0,748 5,16E-03 1 52 LNU835 0,925 1,61E-05 1 48 LNU835 0,869 2,39E-04 1 45 LNU835 0,806 1,54E-03 1 31 LNU835 0,784 2,52E-03 1 10 LNU839 0,751 7,71E-03 1 5 LNU835 0,916 2,89E-05 1 30 LNU841 0,792 3,65E-03 2 25 LNU840 0,844 5,57E-04 1 25 LNU841 0,845 5,38E-04 1 36 LNU841 0,710 9,70E-03 1 47 LNU841 0,849 4,80E-04 1 37 LNU841 0,854 4,03E-04 1 53 LNU841 0,729 7,17E-03 1 54 LNU841 0,772 3,27E-03 1 55 LNU844 0,716 8,75E-03 3 46 LNU844 0,724 7,79E-03 3 24 LNU844 0,758 4,28E-03 3 20 LNU844 0,812 1,34E-03 3 32 LNU844 0,747 5,21E-03 3 21 LNUB44 0,717 8,64E-03 3 11 LNU844 0,835 7,31E-04 1 44 LNUB44 0,758 4,28E-03 3 22 LNU844 0,727 7,35E-03 1 55 LNUB44 0,731 6,88E-03 1 45 LNU845 0,799 1,81E-03 3 33 1 aaeia s3.

Tabela 87 Correlação entre o nível de expressão dos genes selecionados de algumas aplicações da invenção em vários tecidos e o desempenho fenotípico sob desfolhamento em variedades de milho Conj.

ID do Conj.

Exp.

Cor.

LNU814 0,761 1,01E-05 3 21 LNU819 0,765 8,32E-06 1 21 LNU824 0,720 4,95E-05 3 41 LNU824 0,715 5,85E-05 2 41 LNU824 0,719 5,18E-05 2 11 LNU829 0,725 7,62E-03 3 23 LNU829 0,753 1,41E-05 3 21 LNU832 0,703 8,91E-05 1 21 LNU835 0,720 4,98E-05 1 21 LNU813 0,721 8,15E-03 2 15 LNU813 0,740 5,93E-03 1 22 LNU814 0,701 1,11E-02 1 36 LNU814 0,701 1,11E-02 3 24 LNU815 0,766 3,70E-03 3 16 LNU815 0,710 9,74E-03 3 14 LNU815 0,773 3,20E-03 1 18 LNU815 0,769 3,49E-03 1 16 1NU816 0,714 9,14E-03 1 21 LNU816 0,751 4,86E-03 3 2 LNU817 0,718 8,54E-03 1 22 LNU817 0,732 6,79E-03 3 24 LNU819 0,754 4,59E-03 2 22 LNU819 0,716 8,80E-03 3 42 LNU819 0,767 3,57E-03 2 2 LNU819 0,792 2,16E-03 2 5 LNU819 0,730 6,98E-03 2 7 LNU819 0,733 6,71E-03 • 2 37 LNU823 0,706 1,03E-02 3 14 LNU820 0,771 3,29E-03 1 36 LNU823 0,738 6,19E-03 3 1 LNU823 0,765 3,78E-03 3 16 LNU824 0,834 7,54E-04 1 36 LNU823 0,764 3,81E-03 1 36 LNU829 0,725 7,62E-03 3 23 LNU825 0,700 1,12E-02 3 8 LNU829 0,870 2,32E-04 1 36 LNU829 0,744 5,55E-03 3 32 1NU831 0,703 1,08E-02 3 31 LNU829 0,733 6,68E-03 2 27 LNU833 0,752 4,82E-03 2 42 LNU832 0,712 9,33E-03 3 40 LNU834 0,771 3,30E-03 3 30 LNU834 0,723 7,83E-03 3 2 LNU837 0,748 5,16E-03 3 22 LNU834 0,705 1,05E-02 1 21 LNU837 0,786 2,45E-03 2 22 LNU837 0,728 7,24E-03 3 37 LNU837 0,718 8,55E-03 2 31 LNU837 0,768 3,56E-03 2 37 LNU839 0,771 3,30E-03 3 30 LNU837 0,728 7,24E-03 2 24 LNU843 0,709 9,87E-03 1 32 LNU841 0,815 1,23E-03 3 26 LNU844 0,827 9,07E-04 1 2 LNU844 0,731 6,88E-03 1 5 LNU845 0,805 1,57E-03 3 2 LNU844 0,808 1,49E-03 1 9 LNU813 0,783 2,59E-03 3 4 LNU845 0,779 2,85E-03 1 30 LNU813 0,737 6,26E-03 3 8 LNU811 0,733 4,40E-03 1 15 LNU813 0,701 7,60E-03 1 11 LNU813 0,760 4,15E-03 3 3 LNU814 0,744 3,54E-03 3 6 LNU813 0,749 3,23E-03 3 26 LNU814 0,832 4,23E-04 1 21 LNU814 0,721 5,42E-03 3 1 LNU815 0,806 8,77E-04 1 21 LNU814 0,819 6,19E-04 3 21 LNU816 0,871 1,07E-04 3 9 LNU815 0,703 7,34E-03 1 6 LNU816 0,722 5,28E-03 1 44 LNU816 0,724 5,11E-03 3 28 LNU817 0,707 6,87E-03 3 2 LNU816 0,750 3,16E-03 1 40 LNU817 0,716 5,92E-03 2 12 LNU816 0,854 2,00E-04 1 27 LNU818 0,702 7,45E-03 1 39 LNU817 0,764 2,35E-03 1 2 LNU818 0,743 3,64E-03 1 11 LNU818 0,791 1,27E-03 1 22 LNU818 0,756 2,77E-03 1 19 LNU818 0,796 1,12E-03 1 38 LNU818 0,765 2,33E-03 1 20 LNU818 0,707 6,93E-03 1 37 LNU819 0,704 1,07E-02 3 4 LNU818 0,740 3,82E-03 1 10 LNJ819 0,717 5,84E-03 3 30 LNU818 0,733 4,40E-03 1 32 LNU819 0,809 8,02E-04 1 16 LNU819 0,745 3,45E-03 3 28 LNU819 0,731 4,53E-03 1 6 LNU819 0,741 3,75E-03 1 14 LNU819 0,925 5,82E-06 1 21 LNU819 0,839 3,34E-04 1 1 LNU821 0,751 3,07E-03 1 6 LNU819 0,830 4,53E-04 1 18 LNU821 0,886 5,50E-05 1 21 LNU821 0,704 7,29E-03 1 1 LNU822 0,710 6,59E-03 2 44 LNU821 0,700 1,12E-02 1 8 LNU824 0,707 6,94E-03 1 41 LNU822 0,756 2,77E-03 2 31 LNU825 0,761 2,54E-03 3 40 LNU823 0,709 9,90E-03 1 8 LNU825 0,736 4,13E-03 2 16 LNU824 0,749 3,19E-03 1 43 LNU825 0,749 3,20E-03 2 18 LNU825 0,700 7,70E-03 3 27 LNU829 0,739 3,94E-03 3 14 LNU825 0,707 6,85E-03 2 6 LNU829 0,848 2,48E-04 3 1

Conj. ID do Conj. ID do Nome do Nome do R Valor P de Conj. de R Valor P de Conj, de Gene Gene Ex p. Cor, Ex_p:_ Cor. LNU829 0,757 4,39E-03 3 4 LNU829 0,709 9,84E-03 3 3 LNU829 0,773 1,93E-03 3 16 LNU829 0,931 3,74E-06 3 21 LNU829 0,771 2,02E-03 3 18 LNU831 0,771 2,02E-03 2 10 LNU829 0,740 5,92E-03 3 8 LNU832 0,799 1,05E-03 1 41 LNU83I 0,714 6,16E-03 2 33 LNU832 0,785 1,46E-03 1 21 LNU831 0,711 6,49E-03 2 20 LNU834 0,723 5,22E-03 3 35 LNU832 0,726 7,53E-03 1 8 LNU834 0,708 6,75E-03 1 33 LNU832 0,783 1,54E-03 2 34 LNU835 0,726 5,00E-03 1 6 LNU834 0,746 3,40E-03 3 6 LNU835 0,828 4,72E-04 1 21 LNUS35 0,715 5,98E-03 1 1 LNU835 0,756 2,80E-03 2 18 LNU835 0,704 7,26E-03 1 18 LNU838 0,744 3,57E-03 1 41 LNU835 0,718 5,69E-03 2 1 LNU838 0,746 5,33E-03 1 8 LNU835 0,841 3,17E-04 2 21 LNU839 0,746 3,40E-03 3 6 LNU838 0,750 3,16E-03 1 40 LNU841 0,719 5,61E-03 1 21 LNU839 0,723 5,22E-03 3 35 LNUB43 0,734 4,27E-03 2 27 LNU839 0,708 6,75E-03 1 33 LNU846 0,739 3,91E-03 2 36 LNU841 0,745 3,46E-03 2 2 LNU846 0,714 6,16E-03 2 29 Tabela 87.

EXEMPLO 11 PRODUÇÃO DE TRANSCRIPTOMA DE MILHO-PAINÇO E ANÁLISE DE

CORRELAÇÃO DE ALTA PRODUTIVIDADE UTILIZANDO MICROARRANJO DE OLIGONUCLEOTÍDEO DE MILHO-PAINÇO DE 60K

[00546] A fim de produzir uma análise de correlação de alta produtividade, comparando o fenótipo da planta e o nível de expressão do gene, os presentes inventores utilizaram um microarranjo de oligonucleotídeo de milho- painço, produzido pela Agilent Technologies [chem (ponto) agilent (ponto) com/Scripts/PDS (ponto) asp?lPage=50879]. 0 arranjo de oligonucleotídeo representa cerca de 60K de genes e transcrições de milho-painço. A fim de definir a correlação entre os níveis de expressão de RNA e os parâmetros relacionados à produção ou o vigor, várias características da planta de 14 diferentes acessos de milho-painço foram analisadas. Entre eles, 11 acessos englobando a variação observada foram selecionados para análise de expressão do RNA.

A correlação entre os níveis de RNA e os parâmetros caracterizados foi analisada utilizando o teste de correlação

Pearson [davidmlane (ponto) com/hyperstat/A34739 (ponto) html].

Procedimentos Experimentais:

[00547] 14 variedades de milho-painço foram cultivadas em 5 lotes repetitivos, em campo. Em suma, o protocolo de cultivo se deu conforme segue:

1. Condições de cultivo regular - As plantas de milho-painço foram cultivadas em campo, utilizando fertilização comercial e protocolos de irrigação, que incluem 283 m3 de água por dunam (100 metros quadrados) por período completo de cultivo e fertilização de 16 unidades de URAN® 32% (Solução Fertilizante de Nitrogênio; PCS Sales, Northbrook, IL, USA) (condições normais de cultivo).

2. Condições de seca: sementes de milho-painço foram semeadas em solo e cultivadas sob condições normais até o estágio de florescimento (22 dias a partir da semeadura); um tratamento de seca foi imposto por irrigação das plantas com 50% de água relativo ao tratamento normal a partir deste estágio (171 m3 por dunam (100 metros quadrados) por período completo de cultivo).

[00548] Tecidos de milho-painço Analisados - Todas as 14 linhas de milho-painço foram amostradas com relação a cada tratamento. Três tecidos [folha, flor, e caule], em 2 estágios de desenvolvimento diferentes [floração e preenchimento de grãos], representando diferentes características da planta, foram amostrados e o RNA foi extraído, conforme descrito acima. Cada tipo de tecido de informação de expressão de microarranjo recebeu um ID de Conjunto, conforme resumido nas Tabelas 88 a 89 abaixo. Tabela 88 Conjuntos de expressão de transcriptoma de milho-painço sob condições de seca Conjunto de Expressão ID do Conjunto flor:está io de flora ão:seca 1 folha: estágio de flora ão:seca 2 caule:está io de flora ão:seca 3 rão:está io de preenchimento dos rãos:seca 4 folhaestágio de preenchimento dos rãos:seca 5 caule:está io de preenchimento dos rãos:seca 6 aueia oo. oao Tomeciaos os conjuntos ae expressao oe transcnptoma de mimo-painço sob condições de seca.

Tabela 89 Conjuntos de expressão de transcriptoma de milho-painço sob condições normais Conjunto de Expressão ID do Conjunto flor: estágio de floração 1 folha:está io de floração 2 rão:está io de preenchimento dos rãos:normai 4 folha:estágio de preenchimento dos rãos:normal 5 caule:está io de preenchimento dos rãos:normal 6 i auea bu. 5ao fornecidos os conjuntos de expressão de transcriptoma de milho-painço sob condições normais

[00549] Avaliação dos parâmetros relacionados ao vigor e componentes de produção do milho-painço - As plantas foram continuamente fenotipadas durante o período de cultivo e na colheita. (Tabela 102, abaixo). O sistema de análise de imagem incluiu um computador pessoal (processador Intel 24

3.0 Ghz) e um programa de domínio público - ImageJ 1.37 (Programa de processamento de imagem com base em Java), desenvolvido nos Institutos Nacionais de Saúde dos Estados Unidos e livremente disponível na internet [http://rsbweb (ponto) nih (ponto) gov/]. Em seguida, os dados analisados foram salvos como arquivos de texto e processados utilizando o software JMP de análise estatística (instituto SAS).

[00550] Os parâmetros a seguir foram coletados utilizando o sistema de imagem digital:

[00551] No final do período de cultivo, os grãos foram separados da "Cabeça" da Planta e os seguintes parâmetros foram medidos e coletados:

[00552] Área Média do Grão (cm2) - Uma amostra de -200 grãos foi pesada, fotografada e as imagens foram processadas utilizando o sistema de processamento de imagem descrito abaixo. A área de grão foi medida a partir dessas imagens e foi dividida pelo número de grãos.

[00553] Comprimento e Largura Médios do Grão (cm) - Uma amostra de -200 grãos foi pesada, fotografada e as imagens foram processadas utilizando o sistema de processamento de imagem descrito abaixo. A soma do comprimento e largura dos grãos (eixo mais longo) foi medida a partir dessas imagens e foi dividida pelo número de grãos.

[00554] No final do período de cultivo, 14 "Cabeças" foram fotografadas e as imagens foram processadas utilizando o sistema de processamento de imagem descrito abaixo.

[00555] Perímetro Médio do Grão (cm) - No final do período de cultivo, os grãos foram separados da "Cabeça" da Planta. Uma amostra de -200 grãos foi pesada, fotografada e as imagens foram processadas utilizando o sistema de processamento de imagem descrito abaixo. A soma do perímetro dos grãos foi medida a partir dessas imagens e foi dividida pelo número de grãos.

(00556] Área Média da Cabeça (cm2) - A área da "Cabeça" foi medida a partir dessas imagens e foi dividida pelo número de "Cabeças".

[00557] Comprimento e Largura Médios da Cabeça (mm) - 0 comprimento e a largura das "Cabeças" (eixo mais longo) foram medidos a partir dessas imagens e foram divididos pelo número de "Cabeças".

[00558] 0 sistema de processamento de imagem utilizado consiste em um computador pessoal (processador Intel P4 3.0 Ghz) e um programa de domínio público - ImageJ

1.37 (Programa de processamento de imagem com base em Java), desenvolvido nos Institutos Nacionais de Saúde dos Estados Unidos e livremente disponível na internet [http://rsbweb (ponto) nih (ponto) gov/]. As imagens foram capturadas em resolução de 10 Mega Pixels (3888x2592 pixels) e armazenadas em um formato JPEG (padrão do Grupo Conjunto de 5 Especialistas em Fotografia) de baixa compressão. Em seguida, os dados analisados foram salvos em arquivos de texto e processados utilizando o software de análise estatística JMP (instituto SAS).

[00559] Parâmetros adicionais foram coletados por amostragem de 5 plantas por lote ou medindo o parâmetro em todas as plantas dentro do lote.

[00560] Peso da Cabeça (g.) e número de Cabeças (n°)- No final do experimento, as cabeças foram colhidas de cada espiga e foram contadas e pesadas.

[00561] Produção Total do Grão (g.) - No final do experimento ("Cabeças" das Plantas), as cabeças das espigas foram coletadas, debulhadas e os grãos foram pesados. Além disso, o peso médio dos grãos por cabeça foi calculado dividindo-se o peso total dos grãos pelo número total de cabeças por lote (com base no lote).

[00562] Peso de 1000 Sementes [g.] - O peso de 1000 sementes por lote.

[00563] Biomassa na Colheita - No final do experimento, a parte vegetal acima do solo (excluindo as raízes) dos lotes foi pesada.

[00564] Matéria seca total por lote - Calculada como a parte vegetal acima do solo mais todo o peso seco das cabeças por lote.

[00565] N° de dias até a antese - Calculado como o número de dias desde a semeadura até que 50% do lote chegue à antese.

[00566] Manutenção do desempenho sob condições de seca: Representa a proporção para o parâmetro especificado dos resultados de condições de Seca dividido pelo resultados de condições normais (manutenção do fenótipo sob condições de seca em comparação com as condições normais).

[00567] Os parâmetros de dados coletados são resumidos na Tabela 90, abaixo.

Tabela 90 Parâmetros correlacionados ao Milho—Painco (vetares) Parâmetros correlacionados com ID de Correlação Peso de 1000 grãos 1 Biomassa na colheita (1 M) (Kg.) 2 Perímetro do Grão (cm) 3 Area do Grão (cm2) Com emento do Grão cm 5

Parâmetros correlacionados com ID de Correlação Largura do Grão (cm) 6 Produção de Grãos r Cabe a lote 7 Area da Cabeçaa (cm2) 8 Lar ura da Cabeçaa cm 9 Comprimento da Cabeçaa (cm) 10 N° de Cabeças 11 N° de dias até a antese 12 Produção Total de Grãos 13 Matéria Seca Total (1 M) (Kg.) 14 Peso Totak das Cabeças (Kg.) 15 i apeia au. aao romeciaos os parametros correi acion aces ao milho-painço.

Resultados Experimentais:

[00568] 14 diferentes acessos de milho-painço foram cultivados e caracterizados com relação a diferentes parâmetros, conforme descrito acima (Tabela 90). A média para cada um dos parâmetros medidos foi calculada utilizando o software JMP e os valores foram resumidos nas Tabelas 91-96 abaixo. Uma análise de correlação subsequente entre os vários conjuntos de transcriptoma e os parâmetros médios (Tabelas 91-96) foi conduzida (Tabelas 97-99). Na sequência, os resultados foram integrados à base de dados. Tabela 91 Parâmetros medidos de IDs de correlação em acessos de milho- painço sob condições de seca Linhal ID 1 2 3 4 5 6 7 8 de Cor, Linha-1 2,6392 1,5284 0,6825 0,0333 0,2416 0,1755 3,0533 35,7477 Linha-2 3,3285 3,4592 0,7215 0,0373 0,2445 0,1943 8,8318 50,7137 Linha-3 2,6105 2,8720 0,6888 0,0335 0,2496 0,1707 1,3364 18,3997 Linha-4 2,2948 2,9348 0,6827 0,0319 0,2543 0,1597 1,0933 14,9379 Linha-5 2,3036 3,0224 0,6902 0,0326 0,2568 0,1618 1,3094 17,6865 Linha-6 2,6419 2,6648 0,6923 0,0334 0,2504 0,1701 0,4864 9,9107 Linha-7 2,2151 2,9750 0,6481 0,0297 0,2331 0,1626 1,6279 20,9859 Linha-8 1,8374 0,7652 0,5695 0,0238 0,1944 0,1561 3,7375 39,9290 Linha-9 2,5396 2,6616 0,6607 0,0317 0,2230 0,1807 9,9001 42,1487 Linha-10 1,6912 2,9464 0,5929 0,0252 0,2034 0,1581 4,1426 43,5237 Linha-11 3,0961 3,2304 0,7204 0,0365 0,2608 0,1782 2,9746 26,9309 Linha-12 2,5413 3,3032 0,6747 0,0321 0,2448 0,1665 1,3047 21,2295 Linha-13 3,2382 2,6316 0,7484 0,0391 0,2700 0,1842 0,3629 7,3024 Linha-14 2,2454 0,8856 0,6593 0,0301 0,2417 0,1586 1,7407 13,1262 Tabela 91: São fornecidos os valores de cada um dos parâmetros (conforme descrito acima) medidos em acessos de Milho-Painço (linha) sob condições de cultivo de seca, As condições de cultivo são especificadas na seção de procedimento experimental.

Tabela 92

Parâmetros adicionais medidos de IDs de correlação em acessos de milho-painco sob condicões de seca Linha/ID de 9 10 11 12 13 14 15 Cor.

Linha-1 1,8708 22,3630 374,4 34 1141,4938 0,5038 2,8880 Linha-2 2,6767 21,8851 127 41 1116,1782 0,7328 6,0868 Linha-3 1,3254 16,5045 737,8 51 988,2113 0,7984 5,3252 Linha-4 1,3341 13,3077 1100,8 41 1202,7733 0,6160 5,4020 Linha-5 1,5008 13,9981 1047,2 41 1360,5106 0,7079 5,5700 Linha-6 1,1661 9,1123 2050 30 995,1714 0,4700 5,2800 Linha-7 1,6655 15,0971 581,5 38 946,8482 0,6075 5,1205 Linha-8 2,1528 21,1335 311,6 30 1159,7839 0,3491 2,2884 Linha-9 2,3622 20,0249 147,2 38 1391,3882 0,4366 5,8340 Linha-10 2,3216 21,7995 95,4 NA 394,5104 0,6448 4,3164 Linha-11 1,5449 20,7968 414,4 44 1199,5016 0,7484 5,6392 Linha-12 1,5902 15,8491 667,8 51 872,4820 0,8724 5,1316 Linha-13 1,2536 6,4468 2441 31 873,9356 0,5228 5,1264 Linha-14 1,7376 9,1779 687,5 27 1187,9820 0,3605 2,3065 aoeia yc: aao Tornecioos os vaiores ae caaa um aos parametros tcontorme aescrito acima) medidos em acessos ae Mimo-Namço (linha) sob condições de cultivo de seca. As condições de cultivo são especificadas na seção de procedimento experimental.

Tabela 93 Parâmetros medidos de IDs de correlação em acessos de milho- painço para a Manutenção do desempenho sob condicões de seca Linha/ID de 1 2 3 4 5 6 7 Cor.

Linha-1 107,28492 63,80296 101,14903 103,09389 100,71910 102,26639 89,85420 Linha-2 97,44009 86,66199 100,63477 101,05865 101,13165 100,03126 121,19054 Linha-3 99,89264 90,61080 101,03545 102,80522 100,39213 102,38873 76,40597 Linha-4 97,29088 81,97765 100,28207 100,87451 100,43193 100,42313 83,95708 Linha-5 95,73134 84,03025 100,56979 101,56544 100,17700 101,33417 83,22790 Linha-6 99,52308 87,17613 99,36660 99,75367 99,50116 100,23080 70,03712 Linha-7 101,38380 73,57305 100,86771 101,13885 101,03305 100,21823 77,37223 Linha-8 102,16287 66,77138 99,64822 99,96068 99,16887 100,78369 111,74037 Linha-9 94,53807 83,21661 99,83736 98,88644 100,70881 98,15907 86,38569 Linha-10 102,69124 75,47131 101,82094 102,67156 102,00421 100,61236 57,78836 Linha-11 97,60676 90,15405 98,93543 97,94887 99,40096 98,50410 68,36558 Linha-12 97,81459 89,80968 97,98844 96,37703 97,77776 98,54474 57,64576 Linha-13 101,68636 89, 51020 100, 39095 101,18981 100, 33465 100,85848 83,16443 Linha-14 99,50250 59,88639 99,19422 99,24780 98,98318 100,25762 132,38018 aoeia tu: aao Torneemos os vaiores ae cada um cios parametros (conforme descnto acima) medidos em acessos de Milho-painço (linha) para manutenção do desempenho sob condições de seca (calculado como % de mudança sob condições de cultivo de seca vs. normais). As condições de cultivo são especificadas na seção de procedimento experimental.

Tabela 94 Parâmetros adicionais medidos de IDs de correlação em acessos de milho-painço para Manutenção de desempenho sob condições de seca Linha/ID de Cor. 8 9 10 11 12 13 14 Linha-1 94,50182 98,17799 96,68963 87,55847 78,74402 71,70254 75,80848

Linha/ID de Cor. 8 9 10 11 12 13 14 Linha-2 87,63360 98,29102 90,24976 85,12064 104,52251 85,76779 102,30604 Linha-3 93,93199 99,87804 93,97174 85,09804 64,38181 82,89037 85,90141 Linha-4 87,35732 98,42025 89,95839 91,42857 76,74662 66,68110 95,83452 Linha-5 89,50996 97,94159 91,00586 91,34682 75,80281 78,32485 88,82439 Linha-6 105,26046 98,75548 106,44273 96,15385 67,41849 98,01877 86,91644 Linha-7 91,55461 98,97568 93,88055 77,30657 59,82989 66,27755 81,03596 Linha-8 97,65054 101,33701 96,59358 79,04617 88,00374 77,03001 81,18348 Linha-9 93,05666 94,53334 98,09741 78,88532 65,27431 73,53882 80,43346 Linha-10 88,21016 95,66287 93,49773 72,38240 42,06192 64,63512 82,30493 Linha-11 97,27140 99,48243 99,65504 95,43989 63,79603 81,97152 85,75426 Linha-12 87,80382 100,35077 88,13167 103,31064 61,13590 84,96299 87,70167 Linha-13 102,45818 100,81763 101,47055 87,24712 71,85533 83,88960 91,15220 Linha-14 89,37679 95,46426 93,80683 69,12327 91,61620 77,76100 84,42533 eueIa y4: Sao rurneciaos os vaiares ae caaa um aos parametros tcontorme aescnto acima) medidos em acessos de Mizno-painço (linha) para manutenção do desempenho sob condições de seca (calculado como % de mudança sob condições de cultivo de seca vs. normais). As condições de cultivo são especificadas na seção de procedimento experimental.

Tabela 95 Parâmetros medidos de IDs de correlação em acessos de milho- painço sob condições normais Linha/ID de 1 2 3 4 5 6 7 Cor.

Linha-1 2,45995 2,39550 0,67477 0,03230 0,23989 0,17157 3,39810 Linha-2 3,41596 3,99160 0,71695 0,03689 0,24172 0,19428 7,28754 Linha-3 2,61327 3,16960 0,68170 0,03255 0,24860 0,16670 1,74902 Linha-4 2,35874 3,58000 0,68083 0,03161 0,25317 0,15900 1,30220 Linha-5 2,40635 3,59680 0,68626 0,03213 0,25634 0,15968 1,57325 Linha-6 2,65459 3,05680 0,69667 0,03353 0,25168 0,16966 0,69451 Linha-7 2,18488 4,04360 0,64249 0,02941 0,23076 0,16223 2,10395 Linha-8 1,79847 1,14600 0,57148 0,02386 0,19607 0,15493 3,34479 Linha-9 2,68629 3,19840 0,66174 0,03201 0,22145 0,18410 11,46040 Linha-10 1,64690 3,90400 0,58226 0,02458 0,19936 0,15712 7,16855 Linha-11 3,17197 3,56320 0,72818 0,03729 0,26240 0,18093 4,35102 Linha-12 2,59803 3,67800 0,68858 0,03326 0,25037 0,16901 2,26328 Linha-13 3,18446 2,94000 0,74550 0,03864 0,26910 0,18267 0,43640 Linha-14 2,25661 1,47880 0,66464 0,03032 0,24416 0,15822 1,31493 i apeia eo: sao rorneciaos os vaiares ae cada um dos parãmetros (conforme descrito acima) medidos em acessos de Milho-painço (linha) sob condições de cultivo normal. As condições de cultivo são especificadas na seção de procedimento experimental.

Tabela 96 Parâmetros adicionais medidos de IDs de correlação em acessos de milho-painco sob condicões normais Linha]ID de 8 9 10 11 12 13 14 Cor.

Linha-1 37,82752 1,90548 23,12861 427,60000 1449,62604 0,70263 3,80960 Linha-2 57,87014 2,72325 24,24950 149,20000 1067,88312 0,85440 5,94960 Linha-3 19,58832 1,32700 17,56325 867,00000 1534,92310 0,96320 6,19920 Linha-4 17,09980 1,35550 14,79317 1204,00000 1567,20040 0,92380 5,63680 Linha-5 19,75921 1,53239 15,38157 1146,40000 1794,80240 0,90380 6,27080 Linha-6 9,41542 1,18075 8,56073 2132,00000 1476,11048 0,47950 6,07480 Linha-7 22,92173 1,68275 16,08119 752,20000 1582,56728 0,91660 6,31880 Linha-8 40,88973 2,12436 21,87883 394,20000 1317,88024 0,45320 2,81880

Linha/lD de 8 9 10 11 12 13 14 Cor.

Linha-9 45,29355 2,49875 20,41332 186,60000 2131,60156 0,59370 7,25320 Linha-10 49,34091 2,42686 23,31557 131,80000 937,92760 0,99760 5,24440 Linha-11 27,68630 1,55289 20,86882 434,20000 1880,21340 0,91300 6,57600 Linha-12 24,17832 1,58464 17,98348 646,40000 1427,11884 1,02680 5,85120 Linha-13 7,12724 1,24343 6,35334 2797,80000 1216,24320 0,62320 5,62400 Linha-14 14,68632 1,82013 9,78380 994,60000 1296,69424 0,46360 2,73200 1 apeia ad: sao rorneciaos os valores de cada um dos parametros (conforme descnto acima) medidos em acessos de Milho-painço (linha) sob condições de cultivo normal. As condições de cultivo são especificadas na seção de procedimento experimental.

Tabela 97 Correlação entre o nível de expressão de genes selecionados de algumas aplicações da invenção em vários tecidos e o desempenho fenotípico sob condições de seca em variedades de milho-painco Conj. ID do Conj. ID do Nome do Nome do R Valor P de Conj. de R Valor P de Conj. de Gene Gene Ex_p:_ Cor, Exp. Cor. LNU801 0,761 1,05E-02 2 16 LNU801 0,789 6,66E-03 2 2 LNU801 0,735 1,55E-02 2 17 LNU802 0,846 3,37E-02 1 1 LNU802 0,817 4,71E-02 1 4 LNU802 0,817 4,72E-02 1 10 LNU802 0,750 8,58E-02 1 3 LNU802 0,795 5,87E-02 1 11 LNU802 0,785 6,42E-02 1 8 LNU802 0,870 2,42E-02 1 6 LNU802 0,854 3,03E-02 1 9 LNU803 0,824 4,40E-02 1 13 LNU804 0,736 9,50E-02 1 12 LNU804 0,711 1,13E-01 1 7 LNU805 0,795 5,97E-03 2 7 LNU806 0,797 5,77E-02 1 7 LNU806 0,756 1,14E-02 2 1 LNU806 0,816 3,96E-03 2 6 LNU807 0,760 7,96E-02 1 15 LNU807 0,865 2,60E-02 1 10 LNU807 0,792 6,05E-02 1 11 LNU807 0,857 2,91E-02 1 8 LNU807 0,873 2,30E-02 1 9 LNU807 0,739 1,47E-02 2 10 LNU807 0,803 5,12E-03 2 8 LNU807 0,737 1,50E-02 2 9 LNU808 0,828 3,12E-03 2 5 LNU809 0,703 1,19E-01 1 16 LNU809 0,721 1,06E-01 1 2 LNU809 0,709 2,16E-02 3 15 LNU810 0,713 2,07E-02 2 13 LNU810 0,705 2,28E-02 3 16 LNU810 0,703 2,33E-02 3 13 i anela aí. correiaçoes try entre os níveis ao expressao de genes em vasos tecidos e o desempenho tenotipico.1L) de Cor. - li] do conjunto de correlação, de acordo com os parâmetros correlacionados na Tabela acima. "Conj. de Exp." - Conjunto de expressão. = Coeficiente de correlação de Pearson; "P" = valor p.

Tabela 98 Correlação entre o nível de expressão de genes selecionados de algumas aplicações da invenção em vários tecidos e o desempenho fenotípíco da manutenção do desempenho sob condições de seca em variedades de milha-nainrn Conj. ID do Conj. ID do Nome do Nome do R Valor P de Conj. de R Valor P de Conj. de Gene Gene Exp. Cor, Exp. Cor. LNU802 0,736 1,53E-02 1 1 LNU802 0,818 3,82E-03 1 16 LNU802 0,711 2,11E-02 1 13 LNU804 0,728 2,62E-02 3 1 LNU804 0,701 3,55E-02 3 6 LNU804 0,917 7,23E-05 2 1 LNU804 0,883 3,20E-04 2 4 LNU804 0,808 2,61 E-03 2 3

Conj. ID do Conj. ID do Nome do Nome do R Valor P de Conj. de R Valor P de Conj. de Gene Gene Exp. Cor. Ex . Cor. LNU804 0,863 6,21E-04 2 6 LNU807 0,712 1,40E-02 2 11 LNU810 0,761 1,06E-02 1 16 LNU810 0,706 2,25E-02 1 13 LNU802 0,736 1,53E-02 1 1 LNU802 0,818 3,82E-03 1 16 LNU802 0,711 2,11E-02 1 13 LNU804 0,728 2,62E-02 3 1 LNU804 0,701 3,55E-02 3 6 LNU804 0,917 7,23E-05 2 1 LNU804 0,883 3,20E-04 2 4 LNU804 0,808 2,61 E-03 2 3 LNU804 0,863 6,21E-04 2 6 LNU807 0,712 1,40E-02 2 11 LNU810 0,761 1,06E-02 1 16 LNU810 0,706 2,25E-02 1 13 1 abeia m. correlações (R) entre os viveis de expressão dos genes em vários tecidos e o desempenho fenotípico. "ID de Cor.' - ID do conjunto de correlação, de acordo com os parâmetros correlacionados na Tabela acima. "Conj. de Exp.' - Conjunto de expressão. 'R" = Coeficiente de correlação de Pearson; 'P" = valor p.

Tabela 99 Correlação entre o nível de expressão de genes selecionados de algumas aplicações da invenção em vários tecidos e o desempenho fenotípico sob condições normais em variedades de milho-painço Conj. ID do Conj. ID do Nome do Nome do R Valor P de Conj. de R Valor P de Conj. de Gene Gene Ex . Cor. Ex . Cor. LNU801 0,752 1,22E-02 2 15 LNU802 0,711 1,42E-02 1 16 LNU802 0,740 9,19E-03 1 13 LNU803 0,704 2,30E-02 2 12 LNU804 0,703 1,59E-02 1 5 LNU804 0,748 8,11E-03 1 4 LNU804 0,779 4,76E-03 1 3 LNU805 0,748 1,29E-02 2 12 LNU806 0,814 4,13E-03 2 11 LNU807 0,765 6,06E-03 1 16 LNU807 0,713 1,38E-02 1 2 LNU809 0,786 4,09E-03 1 12 LNU809 0,811 4,42E-03 2 17 LNU801 0,703 5,17E-02 3 1 LNU801 0,783 7,38E-03 2 8 LNU801 0,823 1,21E-02 3 6 LNL801 0,759 2,90E-02 3 17 LNU801 0,744 9,00E-02 1 11 LNU801 0,832 4,00E-02 1 10 LNU801 0,810 5,07E-02 1 9 LNU801 0,787 6,31E-02 1 6 LNU802 0,756 1,13E-02 2 13 LNU802 0,764 1,01E-02 2 14 LNU802 0,904 2,09E-03 3 4 LNU802 0,878 4,14E-03 3 1 LNU802 0,817 4,70E-02 1 1 LNU802 0,844 8,46E-03 3 3 LNU802 0,764 7,68E-02 1 11 LNU802 0,890 1,75E-02 1 10 LNUS02 0,863 2,68E-02 1 9 LNU802 0,866 2,57E-02 1 6 LNU803 0,833 3,94E-02 1 15 LNUB03 0,800 1,72E-02 3 15 LNU804 0,886 1,88E-02 1 11 LNU804 0,837 3,77E-02 1 10 LNU804 0,834 3,91 E-02 1 6 LNU604 0,717 1,09E-01 1 8 LNU805 0,774 8,66E-03 2 5 LNU804 0,844 3,47E-02 1 9 LNU805 0,828 4,18E-02 1 10 LNU805 0,722 1,83E-02 2 7 LNUB05 0,778 6,84E-02 1 6 LNU805 0,938 5,71E-03 1 8 LNU806 0,838 2,47E-03 2 8 LNU805 0,726 1,03E-01 1 9 LNU806 0,733 1,60E-02 2 9 LNU806 0,793 6,19E-03 2 6 LNUB06 0,715 4,63E-02 3 11 LNU806 0,700 5,30E-02 3 15 LNUB06 0,741 9,19E-02 1 4 LNU806 0,818 4,65E-02 1 1 LNU806 0,985 3,40E-04 1 11 LNU806 0,854 3,02E-02 1 10 LNU806 0,936 5,93E-03 1 9 INU806 0,902 1,40E-02 1 6 LNU807 0,765 9,98E-03 2 8 LNU807 0,766 9,71E-03 2 10 LNU807 0,823 1,20E-02 3 12 LNU807 0,806 4,89E-03 2 9 LNU807 0,816 4,77E-02 1 10 LNU807 0,750 8,57E-02 1 1 LNU807 0,810 5,07E-02 1 6 LNU807 0,709 1,14E-01 1 11 LNU808 0,725 4,19E-02 3 4 LNU807 0,803 5,44E-02 1 9 LNU808 0,871 4,83E-03 3 12 LNU808 0,766 2,65E-02 3 3 LNU808 0,955 3,05E-03 1 10 LNUBOB 0,716 1,09E-01 1 1 LNU808 0,902 1,38E-02 1 6 LNU808 0,867 2,53E-02 1 8 LNU809 0,706 2,25E-02 2 2

Conj. ID do Conj. ID do Nome do Nome do R Valor P de Conj. de R Valor P de Conj. de Gene Gene Exp. Cor. Exp. Cor. LNU808 0,881 2,06E-02 1 9 LNU809 0,823 1,21E-02 3 10 LNU809 0,828 1,11E-02 3 15 LNU809 0,930 8,08E-04 3 8 LNU809 0,856 6,71E-03 3 11 LNU809 0,885 1,91E-02 1 16 LNU809 0,981 1,74E-05 3 9 LNU809 0,770 7,31E-02 1 13 LNU809 0,872 2,37E-02 1 5 LNU810 0,722 1,85E-02 2 16 LNUB09 0,792 6,03E-02 1 12 LNU810 0,724 4,22E-02 3 16 LNU810 0,785 7,20E-03 2 13 LNU810 0,707 1,16E-01 1 13 LNU810 0,722 4,31 E-02 3 14 LNU810 0,792 6,04E-02 1 12 i aoea au. correiaçoes (rt} entre os niveis de expressão dos genes em vários tecidos e o desempenho fenotípico. ID de Cor.' - ID do conjunto de correlação, de acordo com os parâmetros correlacionados na Tabela acima. "Conj. de Exp.' - Conjunto de expressão. "R" = Coeficiente de correlação de Pearson; "P" = valor p.

EXEMPLO 12

CLONAGEM DE GENE E GERAÇÃO DE VETORES BINÁRIOS PARA EXPRESSÃO DA PLANTA

[00569] Para validar seu papel no aumento da produção, os genes selecionados foram superexpressos nas plantas, conforme segue.

Estratégia de Clonagem

[00570] Os genes selecionados a partir daqueles apresentados nos Exemplos 1-13 acima foram clonados em vetores binários para a geração de plantas transgênicas. Para a clonagem, os quadros de leitura aberta de comprimento total (ORF's 1 open reading frame) foram identificados. Os grupos EST e, em alguns casos, as sequências de mRNA, foram analisados para identificar o quadro de leitura aberta total comparando os resultados de diversos algoritmos de tradução para proteínas conhecidas de outras espécies de planta.

[005711 A fim de clonar os cDNA's de comprimento total, uma transcrição reversa (RTIreverse transcription) seguida pela reação de cadeia polimerase (PCR; RT-PCR) foi realizada no RNA total extraído das folhas, raízes ou outros tecidos da planta, cultivados sob condições de estresse ou normais/limitantes. A extração total de RNA, produção de cDNA e amplificação de PCR foram realizadas utilizando protocolos padrões descritos em outro lugar (Sambrook J., E.F. Fritsch e T. Maniatis. 1989. Molecular Cloning. A Laboratory Manual, 2a Ed. Frio Spring Harbor Laboratory Press, New York.) que são bem conhecidos dos especialista na técnica. Os produtos de PCR foram purificados utilizando um kit de purificação de PCR (Qiagen).

[00572] Geralmente, 2 conjuntos de iniciadores foram preparados para a amplificação de cada gene, via PCR aninhados (se necessário). Ambos os conjuntos de iniciadores foram utilizados para amplificção no cDNA. No caso de nenhum produto ser obtido, uma reação de PCR aninhada foi realizada.

O PCR aninhado foi realizado pela amplificação do gene utilizando iniciadores externos e, em seguida, utilizando o produto de PCR produzido como um modelo para uma segunda reação de PCR, onde o conjunto interno de iniciadores foi utilizado. De modo alternativo, um ou dois dos iniciadores internos foi(ram) utilizado(s) para amplificação de 25 genes, ambos na primeira e segunda reações de PCR (significando que apenas 2-3 iniciadores foram designados para um gene). Para facilitar a clonagem adicional de cDNA's, uma extensão de 8- 12 pares de base (bp 1 base pairs) foi adicionada ao 5' de cada iniciador interno. A extensão do iniciador inclui um local de restrição de endonuclease. Os locais de restrição foram selecionados utilizando dois parâmetros: (a) o local de restrição não existe na sequência de cDNA; e (b) os locais de restrição nos iniciadores direto e reversos foram projetados de modo que o cDNA digerido seja inserido na direção do sentido no vetor binário utilizado para transformação.

[00573] Os produtos de PCR foram digeridos com endonucleases de restrição (New England BioLabs Inc.), de acordo com os locais designados nos iniciadores. Cada produto de PCR digerido/não digerido foi inserido em um vetor de cópia alta pUC19 (New England BioLabs Inc.) ou em plasmídeos originados desse vetor. Em alguns casos, o produto de PCR não digerido foi inserido no pCR-Blunt II-TOPO (Invitrogen) ou no pJET1.2 (Kit de Clonagem CloneJET PCR, Thermo Scientific) ou diretamente no vetor binário. Os produtos digeridos/não digeridos e o vetor de plasmídeo linearizado foram ligados utilizando uma enzina de ligase T4 DNA (Roche, Suíça, ou outros fabricantes). Nos casos em que o pCR-Blunt II-TOPO foi utilizado, nenhuma ligase T4 foi necessária.

[00574] 0 sequenciamento dos genes inseridos foi realizado utilizando o sequenciador ABI 377 (Applied Biosystems). Em alguns casos, após confirmar as sequências dos genes clonados, o cDNA clonado foi introduzido em um vetor binário pGI modificado contendo o promotor At6669 (p.ex., pQFNc) e o terminador NOS (ID SEQ. N°: 4891) através de digestão com endonucleases de restrição apropriados.

[00575] Nos casos de transformação de Brachypodium, após confirmar as sequências dos genes clonados, os cDNAs clonados foram introduzidos no pEBbVNi (Figura 9A), contendo o promotor 35S (ID SEQ. N°: 4892) e o terminador NOS (ID SEQ. N°: 4891) via digestão com endonucleases de restrição adequadas. Estes genes foram clonados à jusante do promotor 35S e à montante do terminador

NOS.

[00576] Diversas sequências de DNA dos genes selecionados foram sintetizadas via GeneArt (Life Technologies, Grand Island, NY, EUA). 0 DNA sintético foi projetado em sílica. Os locais de enzimas de restrição adequados foram adicionados às sequências clonadas na extremidade 5' e na extremidade 3' para permitir clonagem posterior no vetor binário desejado.

[00577] Vetores binários - 0 vetor plasmídeo pPI foi construído inserindo uma sequência de sinal poli-(A) sintético originado do vetor de plasmídeo básico pGL3 (Promega, Acesso GenBank N° U47295; nucleotídeos 4658-4811) no local de restrição HindIIl do vetor binário pBI101.3 (Clontech, Acesso GenBank N° U12640). 0 pGI é similar ao pPI, mas o gene original na coluna vertebral é o gene GUS-Intron e não o GUS.

[00578] 0 vetor pGI modificado [p.ex., pQFN, pQFNc, pQYN_6669, pQNa_RP, pQFYN 25 ou pQXNc] é uma versão modificada do vetor pGI, no qual o cassete é invertido entre as bordas esquerda e direita, de modo que o gene e seu promotor correspondente estejam próximos à borda direita e o gene NPTII esteja próximo à borda esquerda.

[00579] At6669, a nova sequência do promotor Arabidopsis thaliana (ID SEQ. N°: 4880) foi inserida no vetor binário pGI modificado, a montante dos genes clonados, seguido pela ligação do DNA e extração do plasmídeo binário das colônias E. coli positivas, conforme descrito acima. As colônias foram analisadas por PCR, utilizando os iniciadores que cobrem a inserção, que são projetados para abranger o promotor e o gene introduzido. Os plasmídeos positivos foram identificados, isolados e sequenciados.

[00580] 0 pEBbVNi (Figura 9A) é uma versão modificada do pJJ2LB, no qual o gene de resistência Higromicina foi substituído por um gene BAR que confere resistência ao herbicida BASTA [a sequência de codificação de gene BAR é fornecida no Acesso GenBank N° JQ293091.1 (ID SEQ.

N°: 5436); uma descrição adicional é fornecida em Akama K, et al. "Efficient Agrobacterium-mediated transformation of Arabidopsis thaliana using the bar gene as selectable marker", Plant Cell Rep. 1995, 14(7):450-4; Christiansen P, et al. "A rapid and efficient transformation protocol for the grass Brachypodium distachyon", Plant Cell Rep. 2005 Mar; 23(10- 11) :751-8. Epub 2004 Oct 19; e Pãcurar DI, et al. "A high- throughput Agrobacterium-mediated transformation system for the grass model species Brachypodium distachyon L", Transgenic Res. 2008 17(5):965-75; cada um dos quais é totalmente incorporado aqui por referência em sua totalidade]. A estrutura pEBbVNi contém o promotor 35S (ID SEQ. N°: 4892). 0 pJJ2LB é uma versão modificada do pCambia0305.2 (Cambia).

[00581] Nos casos em que DNA genômico foi clonado, os genes foram amplificados por POR direto no DNA genômico extraído do tecido foliar, utilizando o kit DNAeasy (Qiagen Cat. N° 69104).

[00582] Os genes selecionados clonados pelos presentes inventores são fornecidos na Tabela 100 abaixo.

Tabela 100 Nome do Plasmídeos com alto ID SEQ.

N° dos iniciadores ID SEQ.

N° do ID SEQ.

N° Organismo Gene número de cópias empregados Polin.: do Poli p.: LNU749 QFNc_LNU749 cevada 5383, 4897, 5412, 4906 289 747 LNU750 pQFNcLNU75O cevada 5182, 5357, 5182, 5245 2 497 LNU751 QFNc_LNU751 cevada 5096, 5214, 5073, 5362 290 498 LNU752 UC19c_LNU752 cevada 5087, 5232, 5087, 5232 291 748 LNU753 QFNc_LNU753 cevada 5416, 4974, 5416, 4972 292 500 LNU754 QFNc_LNU754 cevada 5067, 5338, 5067, 5338 293 501 LNU756 QFNc_LNU756 cevada 5019, 5321, 5164, 5326 294 502 LNU757 QFNc_1-NU757 cevada 5088, 5273, 5137, 5257 295 503 LNU756 MA-RQ_LNU758GA 296 504 LNU759 QFNc_LNL759 cevada 5392, 4949, 5402, 4976 297 505 LNU760_H1 QFNc_LNU760_H1 brachypodium 5043, 5359, 5043, 5359 491 708 LNU761 pUC19cLNU761 cevada 5373, 4954, 5373, 4962 298 507 LNU762 QFNc_LNU762 cevada 5371, 4898, 5391, 4912 299 508 LNU763 QFNc_LNU763 cevada 5149, 5349, 5026, 5228 300 509 LNU764 UC19c_LNU764 cevada 5396, 4899, 5396, 4913 301 510 LNU765 UC19c_LNU766 cevada 5125,4965,5125,4965 302 749 LNU767 MA_LNU767_GA 303 512 LNU768 QFNc_LNU768 cevada 5146, 5345, 5146, 5332 304 513 LNU769 pUC19c_LNU769 cevada 4929, 4987, 4929, 4989 305 750 LNU770 QFNc_LNU770 cevada 5201,5316,5061,5240 306 515 LNU771 QFNc_LNU771 cevada 5175, 5242, 5175, 5242 307 516 LNU772 To oB_LNU772 cevada 5107, 5351, 5107, 5285 308 517 LNU773 Ta oB_LNU773 cevada 5165, 4960, 5165, 4960 309 751 LNU774 pQFNcLNU774 cevada 4928, 4943, 4928, 4943 310 519 LNU775 QFNc_LNU775 cevada 5389, 5183, 5389, 5183 311 520 LNU776 UC19_LNU776 cevada 5075, 5266, 5085, 5266 312 752 LNU777 QFNc_LNU777 cevada 5174, 5205, 5174, 5205 313 522 LNU778 MK-RQ_LNU778_GA 314 523 LNU779 QFNc_LNU779 cevada 5428, 4902, 5403, 4895 315 524 LNU780 QFNc_LNU780 cevada 5098, 5354, 5098, 5354 316 753 LNU781 MA-RQ_LNU781_GA 317 526 LNU782 QFNc_LNU782 cevada 5415, 4996, 5415, 4996 318 527 LNU783 pQFNcLNU783 cevada 5103, 5212, 5160, 5238 319 528 LNU784 QFNc_LNU784 cevada 5143, 5243, 5143, 5243 320 754 LNU785 To oB LNU785 cevada 5111, 5246, 5056, 5282 321 530 LNU786 To oB_LNU786 cevada 5082, 5010, 5082, 5000 322 755 LNU787 MA-RQ_LNU787_GA 323 532 LNU788 QFNc_LNU788 brachypodium 5184, 5310, 5153, 5227 324 756 LNU789 QFNc_LNU789 brachypodium 5409, 5001, 5414, 5013 325 534 LNU790 QFNc_LNU790 brachypodium 5101, 5237, 5101, 5237 326 535 LNU791 pQFNc_LNU791 brachypodium 5080, 5203, 5080, 5203 327 536 LNU792 pQFNc_LNU792 brachypodium 5055, 5003, 5018, 5006 328 537 LNU793 pUC19cLNU793 brachypodium 5144, 5253, 5023, 5343 329 538 LNU794 MA-T_LNU794_GA 330 539 LNU795 QFNc_LNU795 brachypodium 5119, 5234, 5119, 5234 331 757 LNU796 QFNc_LNU796 brachypodium 5400, 4971, 5400, 4971 332 541 LNU797 QFNc_LNU797 brachypodium 5148, 5358, 5123, 5287 333 542 LNU798 MA-RQ_LNU798_GA 334 543 Brachypodiums LNU799 pQFNc_LNU799 5390, 5028, 5390, 5028 335 544 distachyon ND LNU800 pQFNc_LNU800 brachypodium 5063, 5337, 5069, 5236 336 545 LNU801 UC19d_LNU801 milho-painço 5002, 4923, 5002, 4930 337 546 LNU802 UC19c_LNU802 milho_ ain o 5186, 5344, 5186, 5262 338 547 LNU803 QFNc_LNU803 milho_ ain o 5092, 5218, 5052, 5356 339 548 LNU804 UC19c_LNU804 milho-painço 5062, 5215, 5131, 5292 340 758 LNU805 QFNc_LNU805 milho_ ain o 5395, 4893, 5431, 4900 341 550 1 LNU806 QFNc_LNU806 milho-painço 5401, 4940, 5376, 4975 342 759 LNU807 UC19c_LNU807 milho-painço 4926, 4907, 4927, 4911 343 552 LNU808 QFNc_LNU808 milho-painço 5124, 5366, 5099, 5221 344 553

Nome do Plasmídeos com alto ID SEQ.

N° dos iniciadores ID SEQ.

N° do ID SEQ.

N° Organismo Gene número de cópias empregados Polin.: do Poli p.: LNU809 QFNc_LNU809 milho_ ain o 5033, 5275, 5033, 5275 345 760 LNU811 UC19c_LNU811 milho 5021, 5259, 5021, 5259 346 556 LNU813 QFNc_LNU813 milho 5387, 4968, 5387, 4968 347 557 LNU814 MA-RQ LNU814_GA 348 558 LNU815 pQFNcLNU815 milho 5115, 5334, 5158, 5335 349 559 LNU816 UC19c_LNU816 milho 4916, 4937, 4918, 4932 350 761 LNU817 QFNc_1-NU817 milho 5135, 5244, 5135, 5244 351 762 LNU818 To oB LNU818 milho 5369, 5077, 5372, 5138 352 763 LNU819 pQFNcLNU819 milho 5038, 5283, 5038, 5283 353 563 LNU820 QFNc_LNU620 milho 5150, 5249, 5150, 5249 354 564 LNU821 To oB_LNU821 milho 5393, 5104, 5393, 5104 355 764 LNU822 MA-T LNU822 GA 356 566 LNU823 QFNc_LNU823 milho 5042, 5339, 5095, 5225 357 567 LNU824 QFNc_LNU824 milho 5051, 5361, 5051, 5361 358 765 LNU825 QFNc_LNU825 milho 5079, 5324, 5079, 5324 359 766 LNU828 QFNc_LNU828 milho 5426, 4981, 5426, 4981 360 570 LNU829 QFNc_LNU829 milho 5024, 5217, 5059, 5220 361 767 LNU830 To oB_LNUB30 milho 5004, 4985, 5004, 4985 362 572 LNU831 QFNc_LNU831 milho 5118, 5226, 5142, 5224 363 768 LNJ832_1-12 QFNc_LNU832_H2 soro 5418, 5083, 5418, 5083 492 709 LNU833 UC19c_LNU833 milho 5110, 5250, 5025, 5223 364 769 LNU834_H1 MA-Q_LNU834_H GA 493 710 LNU835 UC19c_LNU835 milho 5384, 5189, 5394, 5199 365 577 LNU837 To oB_LNUB37 milho 5040, 5260, 5040, 5260 366 770 LNU838 QFNc_LNU838 milho 5434, 4956, 5434, 4956 367 579 LNU839 QFNc_LNU839 milho 4931, 4966, 4931, 4966 368 580 LNU840 QFNc_LNU840 milho 5020, 5261, 5020, 5308 369 581 LNU841 QFNc_LNU841 milho 5197, 5435 370 582 LNU843 pUC19_LNU843 milho 5022, 5009, 5022, 5005 371 583 LNU844 pQFNc_LNU844 milho 4933, 4958, 4936, 4991 372 584 LNU845 To oB_LNU845 milho 5375, 4986, 5413, 4994 373 771 LNU846 UC19c_LNU846 milho 5058, 5286, 5162, 5269 374 586 LNU847 UC19c_LNU847 medicago 5430, 4905, 5419, 4910 375 772 LNU848 QFNc_LNU848 arroz 5060, 5268, 5035, 5314 376 588 LNU849 MA_LNU849_GA 377 589 LNU850 MA_LNU850_GA 378 590 LNU851 MA-RQ LNU851 GA 379 591 LNU852 MK-RQ LNU852_GA 380 592 LNU853 To oB-LNU853 arroz 4983,4909,4983,4909 381 593 LNU854 pUC19c_LNU854 arroz 4935, 4973, 4938, 4979 382 594 LNU856 UC19c_LNU856 sorgo 5198, 5241, 5198, 5241 383 595 LNU857 QFNc_LNU857 soro 5070, 5350, 5070, 5208 384 773 LNU858 UC19_LNU858 sorgo 5427.4964,5427,4964 385 774 LNU859 To oB_LNU859 sorgo 5417, 4999, 5417, 4999 495 - LNU861_H3 MA_LNU861_H3_GA 494 711 LNU862 Ta oB_LNU862 soro 5422, 4957, 5406, 4970 386 599 LNU864 QFNc_LNU864 sorgo 5140, 5336, 5017, 5309 387 600 LNU865 UC19c_LNU865 sorgo 5181, 5346, 5181, 5346 388 601 LNU866 QFNc_LNU866 sorgo 5151, 5307, 5185, 5363 389 775 LNUB67 UC19c_LNU867 sorgo 5045, 5353, 5045, 5353 390 603 LNU868 QFNc_LNU868 soro 5084, 5333, 5159, 5291 391 604 LNU869 QFNc_LNU869 sorgo 5170, 5272, 5170, 5289 392 605 LNU870 UC19c_LNU870 sorgo 5108, 5322, 5132, 5204 393 606 LNU871 UC19c_LNU871 soro 5404, 4955, 5404, 4955 394 607 LNU872 QFNc_LNU872 soro 5177, 5248, 5048, 5231 395 608 LNU873 UC19_LNU873 sorgo 4934, 4967, 4934, 4967 396 609 LNU874 To oB_LNU874 sorgo 5027, 5012, 5027, 5007 397 610 LNU875 UC19c_LNU875 sorgo 5423, 4945, 5386, 4995 398 611 LNU876 To oB_LNU876 sorgo 5178, 5263, 5136, 5213 399 612 LNU878 pQFNcLNU878 sorgo 5432, 5166, 5432, 5166 400 613 LNU879 QFNc_LNU879 sorgo 5112, 5288, 5112, 5288 401 614

Nome do Plasmídeos com alto ID SEQ.

N° dos iniciadores ID SEQ.

N° do ID SEQ.

N° Organismo Gene número de cópias empregados Polin.: do Poli p.: LNU880 UC19c_LNU880 sorgo 5109, 5303, 5157, 5296 402 615 LNU881 UC19c_LNU881 soro 4915,5105,4917,5106 403 616 LNU882 UC19c_LNU882 sorgo 4978, 4896, 4977, 4904 404 617 LNU884 MA-RQ_LNU884_GA 405 619 LNU885 MA_LNU885_GA 406 620 LNU886 QFNc_LNU886 soro 5011, 4939, 5008, 4925 407 776 LNU887 To oB_LNU887 sorgo 4924, 4982, 4924, 4982 408 622 LNU888 QFNc_LNU888 soro 5081, 5278, 5081, 5278 409 623 LNU889 UC19c_LNU889 soro 5411, 4961, 5411, 4961 410 624 LNU890 UC19c_LNU890 soro 5076, 5211, 5076, 5211 411 625 LNU892 MA-RQ LNU892_GA 412 626 LNU893 QFNc_LNU893 sorgo 5036, 5277, 5030, 5277 413 627 LNU894 UC19c_LNU894 sorgo 5155, 5219, 5155, 5313 414 628 LNU895 QFNc_LNU895 soro 5398, 5071, 5398, 5169 415 629 LNU896 UC19_LNU896 sorgo 5130, 5206, 5133, 5300 416 630 LNU897 QFNc_LNU897 sorgo 5037, 5210, 5032, 5229 417 777 LNU898 UC19_LNU898 sorgo 5176, 4950, 5128, 4992 418 778 LNU899 pUC19LNU899 sorgo 5195,5348,5113,5355 419 633 LNU900 QFNc_LNU900 sorgo 5086, 5270, 5086, 5270 420 779 LNU901 To B_LNU9D1 sorgo 5163, 5280 421 780 LNU902 QFNc_LNU902 sorgo 5129.5311,5167,5264 422 636 LNU903 MK-RQ LNU903_GA 423 637 LNU904 UC19c_LNU904 sorgo 5368, 5057, 5421, 5188 424 781 LNU905 UC19c_LNU905 soro 5029, 5235, 5091, 5319 425 639 LNU906 QFNc_LNU906 sorgo 5154,5325,5050,5274 426 782 LNU907 QFNc_LNU907 sorgo 5377, 5360, 5377, 5360 427 783 LNU908 QFNc_LNU908 soro 5397, 5065, 5382, 5041 428 642 LNU909 UC19c_1-NU909 sorgo 5424, 4998, 5407, 4941 429 784 LNU910 QFNc_LNU910 sorgo 5200, 5279, 5200, 5279 430 644 LNU911 UC19_LNU911 sorgo 5090,5202,5194,5230 431 785 LNU912 QFNc_LNU912 sorgo 5187, 5327, 5074, 5299 432 646 LNU913 UC19_LNU913 sorgo 5156, 5015, 5196, 5014 433 647 LNU914 Ta oB_LNU914 sorgo 4914, 4919, 4920, 4921 434 648 LNU915 UC19c_LNU915 sorgo 5134, 5239, 5134, 5239 435 649 LNU916 To oB_LNU916 sorgo 5180, 5276, 5190, 5290 436 650 LNU917 QFNc_LNU917 sorgo 5168, 5347, 5121, 5233 437 651 LNU918 UC19c_1-NU918 sorgo 5381,4980,5381,4980 438 652 LNU919 MA_LNU919_GA 439 653 LNU920 MA-RQ LNU920_GA 440 654 LNU921 QFNc_LNU921 sorgo 5094, 5222, 5193, 5256 441 655 LNU922 MA-T LNU922 GA 442 656 LNU923 QFNc_LNU923 sorgo 5173, 5293, 5173, 5293 443 657 LNU924 QFNc_LNU924 sorgo 5049, 5365 444 658 LNU925 UC19c_LNU925 sorgo 5410, 5097, 5405, 5066 445 659 LNU926 pQFNc_LNU926 sorgo 5145, 5301, 5145, 5320 446 660 LNU928 UC19c_LNU928 sorgo 5114, 5252, 5141, 5329 447 661 LNU930 UC19c_LNU930 sorgo 5039, 5251, 5089, 5209 448 786 LNU931 MA_LNU931_GA 449 664 LNU932 To oB_LNU932 soro 5117, 5255, 5117, 5255 450 787 LNU933 QFNc_LN1J933 sorgo 5379, 5046, 5433, 5191 451 666 LNU934 OA_LNU934_GA 452 667 LNU935 QFNc_LNU935 sorgo 5152, 5267, 5152, 5267 453 788 LNU936 MA-RQ LNU936_GA 454 669 LNU938 QFNc_LNU938 soro 5072, 5284, 5047, 5265 455 789 LNU940 QFNc_1-NU940 sorgo 5161,5254,5161,5254 456 672 LNU941 QFNc_LNU941 sorgo 5031, 5323, 5031, 5323 457 673 LNU942 QFNc_LNU942 sorgo 5054, 5258 458 674 LNU943 QFNc_LNU943 sorgo 5388, 4948, 5385, 4944 459 675 LNU944 UCI9_LNU944 sorgo 5100, 5294, 5100, 5342 460 676 LNU945 MA-RQ_LNU945_GA 461 677 LNU946 UCI9_LNU946 soro 4984, 4908, 4959, 4901 462 678

Nome do Plasmideos com alto ID SEQ. N° dos iniciadores ID SEQ. N° do ID SEQ. N° Organismo Gene número de cópias empregados Palin.: do Poli p.: LNU947 QFNc_LNU947 sorgo 5370, 4946, 5370, 4946 463 679 LNU948 UC19c_LNU948 soro 5120, 5306, 5127, 5216 464 680 LNU949 MA-RQ LNU949 GA 465 681 LNU950 UC19c_LNU950 sorgo 5116,5312,5116,5312 466 682 LNU951 QFNc_LNU951 sorgo 4922, 4951, 4922, 4951 467 790 LNU952 UC19c_LNU952 sorgo 5380, 4997, 5378, 4947 468 684 LNU953 UC19c_LNU953 sorgo 5078, 5247, 5078, 5207 469 685 LNU954 QFNc_LNU954 soro 5139, 5340, 5044, 5298 470 791 LNU955 MA_LNU955_GA 471 687 LNU956 QFNc_LNU956 sorgo 5429, 4993, 5425, 4952 472 792 LNU957 MK-RQ LNU957 GA 473 689 LNU958 QFNc_LNU958 sorgo 5122, 5295, 5122, 5295 474 690 LNU959 UC19c_LNU959 sorgo 5172, 5297 475 691 LNU960 UC19_LNU960 soro 5147, 5304, 5034, 5331 476 692 LNU961 OA_LNU961_GA 477 693 LNU962 UC19_LNU962 sorgo 4988, 4894, 4990, 4903 478 694 LNU963 UC19c_LNU963 sorgo 5420, 4942, 5408, 4963 479 695 LNU964 MA-RQ LNU964_GA 480 696 LNU965 QFNc_LNU965 sorgo 5102,5302 481 697 LNU966 To oB_LNU966 soro 5068, 5328, 5192, 5330 482 698 LNU967 UC19_LNU967 sorgo 5399, 4953, 5374, 4969 483 699 LNU968 QFNc_LNU968 soro 5093, 5315 484 793 LNU970 MA-T LNU970 GA 485 702 LNU971 MA-T LNU971_GA 486 703 LNU972 TopOBLNU972 tomate 5171, 5305, 5126, 5318 487 704 LNU975 pQFNcLNU975 tomate 5064, 5367, 5016, 5271 488 705 LNU976 QFNc_LNU976 trio 5053, 5341, 5179, 5352 489 706 LNU977 QFNc_LNU977 trio 5281, 5364, 5281, 5317 490 794 I abela 1 UU. So fornecidos os nomes dos genes clonados, os plasmideos com alto números de cópias, o organismo a partir do qual o gene foi clonado, os iniciadores utilizados para clonagem e os identificadores de sequência dos polinucleotideos e polipeptídeos dos genes clanados.

EXEMPLO 13

TRANSFORMAÇÃO DE CÉLULAS AGROBACTERIUM TUMEFACIENS COM VETORES BINÁRIOS ABRIGANDO OS POLINUCLEOTTDEOS DA INVENÇÃO

[00583] Os vetores binários descritos acima foram utilizados para transformar as células Agrobacterium. Duas estruturas binárias adicionais, tendo apenas o promotor At6669 ou o promotor 35S ou sem promotor adicional, foram utilizadas como controles negativos.

[00584] Os vetores binários foram introduzidos em células competentes Agrobacterium tumefaciens GV301 ou LB4404 (para Arabidopsis) ou AGL1 (para Brachypodium) (cerca de 109 células/mL), por eletroporação. A eletroporação foi realizada utilizando um eletroporador MicroPulser (Biorad), 0,2 cm de cadinhos (Biorad) e programa de eletroporação EC-2 (Biorad).

As células tratadas foram cultivadas em meio líquido LB a 28°C por 3 horas, então colocadas sobre ágar LB suplementado com gentamicina (para Arabidopsis; 50 mg/L; para cepas Agrobacterium GV301) ou estreptomicina (para Arabidopsis; 300 mg/L; para cepa Agrobacterium LB4404); ou com Carbenicilina (para Brachypodium; 50 mg/L) e canamicina (para Arabidopsis e Brachypodium; 50 mg/L) a 28°C por 48 horas. As colônias Abrobacterium, que são desenvolvidas nos meios seletivos, foram ainda analisadas por PCR, utilizando os iniciadores projetados para abranger a sequência inserida no plasmídeo pPI. Os produtos de PCR resultantes foram isolados e sequenciados para verificar que as sequências de polinucleotídeo corretas da invenção são devidamente introduzidas às células Agrobacterium.

EXEMPLO 14

TRANSFORMAÇÃO DE PLANTAS ARABIDOPSIS THALIANA COM OS POLINUCLEOTÏDEOS DA INVENÇÃO

[00585] Plantas Arabidopsis thaliana Columbia (plantas To) foram transformadas, utilizando o procedimento de Imersão Floral descrito por Clough e Bent, 1998 (Floral dip: a simplified method for Agrobacterium-mediated transformation of Arabidopsis thaliana. Plant J. 16(6): 735- 43) e por Desfeux et al., 2000 (Female Reproductive Tissues Are the Primary Target of Agrobacterium-Mediated Transformation by the Arabidopsis Floral-Dip Method. Plant Physiol, Julho 2000, Vol. 123, pp. 895-904), com pequenas modificações. Em resumo, as plantas To foram semeadas em vasos de 250 ml, preenchidas com mistura de cultivo com base em turfa úmida. Os vasos foram cobertos com folhas de alumínio e uma redoma de plástico, mantidos a 4°C por 3-4 dias, então, descobertos e incubados em uma câmara de cultivo a 18-24°C em 16/8 horas de ciclos claro/escuro. As plantas To estavam prontas para transformação seis dias antes da antese.

[00586] Colônias únicas de Agrobacterium carregando as estruturas binárias foram geradas, conforme descrito nos Exemplos 12-13 acima. As colônias foram cultivadas em meio LB suplementado com canamicina (50 mg/L) e gentamicina (50 mg/L) . As culturas foram incubadas a 28°C por 48 horas sob agitação vigorosa e, depois, centrifugadas a 4000 rpm por 5 minutos. Os peletes compreendendo as células Agrobacterium foram ressuspensos em um meio de transformação contendo meio de cultura de concentração média (2,15 g/L) Murashige-Skoog (Duchefa); 0,044 gM de benzilamino purina (Sigma); 112 gg/L de vitaminas B5 Gambourg (Sigma); 5% de sacarose e 0,2 ml/L de Silwet L-77 (OSI Specialists, CT) em água duplamente destilada com pH de 5,7.

[00587] A transformação de plantas To foi realizada invertendo cada planta em uma suspensão de Agrobacterium, de modo que o tecido de planta acima do solo foi submerso por 3- segundos. Cada planta To inoculada foi imediatamente colocada em uma bandeja de plástico, então coberta com redoma plástica limpa para manter umidade e foi mantida no escuro à temperatura ambiente por 18 horas para facilitar a infecção e transformação. As plantas transformadas (transgênicas) foram então cobertas e transferidas para uma estufa para recuperação e maturação. As plantas To transgênicas foram cultivadas na estufa por 3-5 semanas até as síliquas ficarem marrons e secas. As sementes foram colhidas a partir das plantas e mantidas à temperatura ambiente até a semeadura.

[00588] Para geração de plantas transgênicas Ti e T2 abrigando os genes, as sementes coletadas das plantas To transgênicas foram esterilizadas na superfície por imersão em 70% de etanol por 1 minuto, seguido por imersão em 5% de hipoclorito de sódio e 0,05% de triton por 5 minutos. As sementes esterilizadas na superfície foram totalmente lavadas em água estéril destilada e, então, colocadas nas placas de cultura contendo meio de cultura de concentração média Murashige-Skoog (Duchefa); 2% de sacarose; 0,8% de ágar de planta; 50 mM de canamicina e 200 mM de carbenicilina (Duchefa). As placas de cultura foram incubadas a 4°C por 48 horas, então, transferidas a uma sala de cultivo a 25°C por uma semana adicional de incubação. As plantas Ti Arabidopsis vitais foram transferidas para as placas de cultura fresca por outra semana de incubação. Seguindo a incubação, as plantas Ti foram removidas das placas de cultura e das placas de cultura e plantadas na mistura de cultivo contida em vasos de 250 ml. As plantas transgênicas foram deixadas crescer em uma estufa para maturidade. As sementes colhidas das plantas Ti foram cultivadas e crescidas para maturidade como as plantas T2 nas mesmas condições conforme utilizadas para cultura e crescimento das plantas Tl.

EXEMPLO 15

TRANSFORMAÇÃO DE PLANTAS BRACHYPODIUM DISTACHYON COM OS POLINUCLEOTÌDEOS DA INVENÇÃO

[00589] Semelhante ao modelo da planta Arabidopsis, o Brachypodium distachyon tem várias características que o torna recomendado como uma planta modelo para estudos de genômica funcional, especialmente nas gramíneas. Traços que o tornam um modelo ideal incluem seu genoma pequeno (-x160 Mbp por um genoma diploide e 355 Mbp por um genoma poliploide), pequena estatura física, um curto ciclo de vida e poucos requisitos de cultivo. O Brachypodium está relacionado às principais espécies de grãos de cereal, mas entende-se que esteja mais estreitamente relacionado ao Triticeae (trigo, cevada), do que aos outros cereais. O Brachypodium, com seus acessos de poliploide, pode servir como um modelo ideal para esses grãos (cujo tamanho e complexidade genômica são uma grande barreira para a melhoria da biotecnologia).

[00590] Os calos embriogênicos do Brachypodium distachyon foram transformados utilizando o procedimento descrito por Vogel e Hill (2008) [High-efficiency Agrobacterium-mediated transformation of Brachypodium distachyon inbred line Bd21-3. Plant Cell Rep 27:471-478], Vain et al (2008) [Agrobacterium-mediated transformation of the temperate grass Brachypodium distachyon (genotypeBd2l) for T--DNA insertional mutagenesis. Plant Biotechnology J 6: 236-245] e Vogel J, et al. (2006) [Agrobacterium mediated transformation and inbred line development in the model grass Brachypodium distachyon. Plant Cell Tiss Org. Cult. 85:199- 211], cada um dos quais é totalmente incorporado aqui por referência, com algumas pequenas modificações, que são brevemente resumidas abaixo.

[00591] Inicio dos calos - Espigas imaturas (cerca de 2 meses após a semeadura) foram colhidas no início do preenchimento das sementes. As espigas foram, em seguida, descascadas e esterilizadas à superfície com 3% de NaC1O contendo 0,1% de Tween 20, agitadas com um agitador rotativo a baixa velocidade, durante 20 minutos. Após três lavagens com água destilada estéril, os embriões foram extraídos sob um microscópio de dissecação em uma câmara de fluxo laminar utilizando uma pinça fina.

[00592] Os embriões extraídos (tamanho -0,3 mm, em forma de sino) foram colocados em meio de indução de calos (CIMIcallus induction medium) [sais LS (Linsmaier, EM Skoog, & F. 1965. Physiol. Plantarum 18, 100) e vitaminas mais 3% de sacarose, 6mg/L de CuSO4, 2,5mg/1 de 2,4-ácido diclorofenoxiacético, pH 5,8 e 0,25% de Phytagel (Sigma)] escutelar com o lado para baixo, 100 embriões em uma placa, e incubados a 28°C no escuro. Uma semana depois, os calos embrionários foram limpos de raízes emergentes, brotos e calos somáticos e foram subcultivados em meio CIM fresco. Durante a cultura, apareceram calos embriogênicos (EC 1 embryogenic callus) amarelados e foram, ainda, selecionados (p. ex., colhidos e transferidos) para uma incubação adicional nas mesmas condições durante mais 2 semanas. Vinte e cinco pedaços de calos subcultivados foram, então, colocados separadamente em placas de Petri de 90 X 15 mm e incubados, tal como anteriormente, por mais três semanas.

[00593] Transformação - Conforme descrito em Vogel e Hill (2008, Supra), o Agrobacterium foi raspado com placas MGL de 2 dias de idade (placas com o meio MGL que contém: Triptona 5 g/l, Extrato de Levedura 2,5 g/l, NaCl 5 g/1, D- manitol 5 g/l, MgSO4*7H20 0,204 g/l, K2HPO4 0,25 g/l, Ácido Glutâmico 1,2 g/l, Agar Planta 7,5 g) e ressuspendido em meio líquido MS suplementado com 200 gM de acetossiringona a uma densidade ótica (OD I optic density) a 600 nm (OD600) de 0, 6.

Uma vez que a densidade ótica desejada foi atingida, adicionou-se 1 ml de 10% de Synperonic PE/F68 (Sigma) por 100 mL de meio de inoculação.

[00594] Para começar a inoculação, 300 pedaços de calo foram colocados em cerca de 12 placas (25 pedaços de calo em cada placa) e cobertos com a suspensão de Agrobacterium (8-8,5 ml). 0 calo foi incubado na suspensão de Agrobacterium durante 15 minutos com agitação suave ocasional. Após a incubação, a suspensão de Agrobacterium foi removida por aspiração e os calos foram, então, transferidos para placas de cocultura, preparadas colocando um papel de filtro estéril de 7 cm de diâmetro em uma placa de Petri de 90 X 15 mm vazia.

Os pedaços de calos foram, então, suavemente distribuídos sobre o papel filtro. Uma placa de cocultura foi usada para duas placas de calos iniciais (50 pedaços de calos iniciais).

As placas de cocultura foram, então, seladas com parafilme e incubadas a 22°C, no escuro, durante 3 dias.

[00595] Os pedaços de calo foram, então, transferidos individualmente em meio de CIM, conforme descrito acima, o qual foi ainda suplementado com 200 mg/1 de ticarcilina (para matar o Agrobacterium) e Bialaphos (5 mg/L) (para seleção de uma das seções de calos embriogênicos resistentes transformados) e incubados a 28°C, no escuro, durante 14 dias.

[00596] Os pedaços de calos foram, então, transferidos para meio de indução de brotos (SIM I shoot induction media; sais LS e vitaminas mais 3% de maltose mono- hidratada) suplementados com 200 mg/1 de ticarcilina, Bialaphos (5 mg/L), ácido indol-3-acético (IAA I indol-3- acetic acid) (0,25 mg/L) e 6-benzilaminopurina (BAP I Benzylaminopurine) (1 mg/L), e foram subcultivados à luz para o mesmo meio, após 10 dias (total de 20 dias). Em cada subcultura, todas as partes de um único calo foram mantidas juntas para manter a sua independência e foram incubadas sob as seguintes condições: a um nível de iluminação de 60 1E m- 2 s-1, uma luz de 16 horas, 8 horas de fotoperíodo escuro e uma temperatura constante de 24°C. As mudas emergiram dos calos transformados.

[00597] Quando as mudas estavam grandes o suficiente para serem manuseadas sem danos, elas foram transferidas para placas contendo os meios de indução de brotações (SIM) acima indicados, sem Bialaphos. Cada plântula foi considerada como um evento diferente. As mudas brotaram perfilhas axilares e, eventualmente, tornaram-se espessas.

Cada ramo da mesma planta (ID do evento) foi, em seguida, dividido em caixas de cultura de tecidos ("Húmus") contendo sais basais de "meio de enraizamento" [sais basais MS, 3% de sacarose, 3 g/L de Phytagel, 2 mg/l de ácido acético a-

--

I •1 ir = naftaleno (NAAlnaphthalene Acetic Acid) e 1 mg/1 de IAA e Ticarcilina 200mg/L, pH 5,8). Todas as plantas em uma "caixa de Húmus" eram plantas diferentes do mesmo evento de transformação.

[00598] Quando as plantas estabeleceram raízes, elas foram transplantadas para o solo e transferidas para uma estufa. Para verificar o estado de plantas transgênicas contendo as outras estruturas, as plantas To foram sujeitas a PCR, conforme previamente descrito por Vogel et al. 2006 [Agrobacterium mediated transformation and inbred line development in the model grass Brachypodium distachyon. Plant Cell Tiss Org. Cult. 85:199-211]. EXEMPLO 16

AVALIAÇÃO DE NUE DE ARABIDOSIS TRANSGÊNICA SOB CONDIÇÕES DE BAIXO NITROGÊNIO OU NORMAL UTILIZANDO ENSAIOS DE MUDAS.

Ensaio 1: Cultivo de planta sob níveis de concentração de nitrogênio baixo e favorável

[00599] Sementes esterilizadas de superfície foram semeadas em meio basal [50% de meio Murashige-Skoog (MS) suplementado com 0,8% de ágar de planta como agente de solidificação] na presença de Canamicina (utilizada como agente de seleção). Após a semeadura, as placas foram transferidas por 2 a 3 dias para estratificação a 4°C e, então, cultivadas a 25°C em ciclos diários de 12 horas de luz e 12 horas de escuridão por 7 a 10 dias. Nesse ponto de tempo, as mudas aleatoriamente escolhidas foram cuidadosamente transferidas para placas contendo meio de MS (15 mM N) para tratamento de concentração de nitrogênio normal e 0,30 mM de

- - -'- 4-t-: - -

...-----

nitrogênio para tratamento de concentração de baixo nitrogênio. Para experimentos realizados em linhas T2, cada placa continha 5 mudas do mesmo evento transgênico e 3 a 4 placas diferentes (replicas) para cada evento. Para cada polinucleotídeo de cada invenção, pelo menos, quatro a cinco eventos de transformação independentes foram analisados a partir de cada estrutura. Para experimentos realizados em linhas Ti, cada placa continha 5 mudas do mesmo evento transgênico e 3 a 4 placas diferentes (replicas) foram plantadas. No total, para linhas Ti, 20 eventos independentes foram avaliados. As plantas que expressam polinucleotideos da invenção foram comparadas à medição média das plantas de controle (vetor vazio ou gene repórter GUS no mesmo promotor) utilizada no mesmo experimento.

[00600] Formação de Imagem Digital - Um sistema de aquisição de imagem de laboratório, consistindo de uma câmera de reflexo digital (Canon EOS 300D) anexada a uma lente de 55 mm de comprimento focal (Canon série EF-S), montada em um dispositivo de reprodução (Kaiser RS), que inclui 4 unidades de luz (lâmpada de iluminação de 4 x 150 Watts) e localizada em uma sala escura, foi utilizada para capturar imagens de mudas vistas em placas de ágar.

[00601] O processo de captura de imagem foi repetido a cada 3 a 4 dias, começando no dia 1 até o dia 10 (vide, p. ex. as imagens nas Figuras 3A-B). Um sistema de análise de imagem foi utilizado, o qual consiste em um computador pessoal (processador Intel P4 3.0 GHz) e um programa de domínio público - ImageJ 1.39 [programa de processamento de imagem com base em Java, desenvolvido nos Institutos Nacionais de Saúde dos Estados Unidos e livremente disponibilizado na internet em rsbweb (ponto) nih (ponto) gov/]. As imagens foram capturadas em resolução de 10 Mega Pixels (3888 x 2592 pixels) e armazenadas em um formato JPEG de baixa compressão. Em seguida, os dados de análise foram salvos em arquivos de textos e processados utilizando o software de análise estatística JMP (instituto SAS).

[00602] Análise de mudas - Utilizando a análise digital, os dados das mudas foram calculados, incluindo área foliar, cobertura da raiz e comprimento da raiz.

[00603] A taxa de crescimento relativo para os vários parâmetros de muda foi calculada de acordo com as seguintes fórmulas, Fórmulas XIII (taxa de crescimento relativo da área da folha) e VI (taxa de crescimento relativo do comprimento da raiz).

[00604] No final do experimento, as mudas foram removidas do meio e pesadas para a determinação do peso fresco da planta. As mudas foram então secadas por 24 horas a 60°C, e pesadas novamente para medir o peso seco da planta para análise estatística posterior. A taxa de crescimento foi determinada comparando a cobertura da área foliar, cobertura da raiz e comprimento da raiz, entre cada par de fotos sequenciais, e os resultados foram utilizados para resolver o efeito do gene introduzido no vigor da planta sob condições ideais. Semelhantemente, o efeito do gene introduzido em acúmulo de biomassa, sob condições ideais, foi determinado comparando o peso seco e fresco das plantas e daquele das plantas de controle (contendo um vetor vazio ou gene repórter GUS no mesmo promotor). A partir de cada estrutura criada, 3 a 5 eventos de transformação independentes foram examinados em replicados.

[00605] Análises estatísticas - Para identificar os genes que conferem vigor melhorado à planta ou arquitetura melhorada à raiz, os resultados obtidos das plantas transgênicas foram comparados àqueles obtidos das plantas de controle. Para identificar os genes e estruturas de alto desempenho, os resultados dos eventos de transformação independentes testados foram analisados separadamente. Para avaliar o efeito de um evento de gene sobre um controle, os dados foram analisados pelo teste t de Student e o valor-p foi calculado. Os resultados foram considerados significativos se p < 0,1. 0 pacote de software JMP estatístico foi utilizado (Versão 5.2.1, Instituto SAS Inc., Cary, NC, EUA) Resultados Experimentais:

[00606] Os genes apresentados nas Tabelas a seguir foram clonados na regulação de um promotor constitutivo (At6669). A avaliação do efeito de transformação em uma planta de cada gene foi realizada pelo teste de desempenho de número diferente de eventos de transformação. Alguns dos genes foram avaliados em mais de um ensaio de muda. Os resultados obtidos nesses segundos experimentos também foram significativamente positivos. O evento com valor p <0,1 foi considerado estatisticamente significativo.

[00607) Os genes apresentados nas Tabelas 101-104 mostraram uma melhora significativa no NU E da planta visto que produziram biomassa de planta maior (peso fresco e seco da planta; área foliar, comprimento da raiz e cobertura da raiz) em geração T2 (Tabelas 101-102) ou geração Ti (Tabelas 103-104) quando cultivadas sob condições de cultivo de nitrogênio limitastes, comparadas às plantas de controle que foram cultivadas sob condições de cultivo idênticas. As plantas que produzem biomassa de raiz maior têm melhores possibilidades de absorver maior quantidade de nitrogênio do solo.

Tabela 101 Genes mostrando o desempenho melhorado da planta sob condições deficientes de nitroaênio (aeracão T2) Peso Seco m Peso Fresco m Nome do Gene Evento # Méd. Val % Aum. Méd. Val- % Aum. LNU938 80352,1 5,65 L 46 117.0 0.24 68 LNU938 80353,1 - - - 103.8 0.04 49 LNU938 80355,5 5,40 0,18 40 90.1 0.22 29 LNU910 80350,1 5,03 0,17 30 103.2 0.09 48 LNU869 80083,3 5,75 L 49 86.0 0.21 23 LNU869 80084,4 5,35 0,10 39 - - - LNU869 80085,2 4,62 0,27 20 - - - LNUB69 80085,3 5,15 0,03 34 85.8 0.23 23 LNUB40 78676,4 - - - 84.8 0.26 22 LNU837 79574,5 4,60 0,26 19 - - - LNU837 79574,7 4,98 0,04 29 91.5 0.17 31 LNU771 80077,2 5,28 0,02 37 85.8 0.06 23 LNU771 80079,3 - - - 103.7 0.14 49 CONT. - 3,86 - - 69.7 - - LNU964 80552,4 4,77 0,04 14 94.8 0.29 19 LNU964 80552,6 5,05 0,01 20 103.2 0.06 30 LNU957 80437,1 5,95 L 42 95.0 0.14 20 LNU957 80437,6 5,28 0,29 26 99.7 0.05 26 LNU953 80428,1 5,62 0,05 34 115.3 0.15 45 LNU952 78218,3 - - - 104,1 0.14 31 LNU920 78510,1 5,40 0,08 29 105,0 L 32 LNU914 80514,5 5,50 0,02 31 86.1 0.14 8 LNU911 80420,5 - - - 98.4 0.29 24 LNU911 80424,2 5,15 0,03 23 127.8 0.09 61 LNU903 80417,6 - - - 98.2 0.01 24 LNU901 80474,5 4,62 0,28 10 - - - LNU901 80476,4 4,85 0,18 15 - - - LNU897 80448,3 5,40 0,20 29 99.0 0.03 25 LNU897 80449,1 4,70 0,10 12 - - - LNU892 80410,1 - - - 98.8 0.10 24

Peso Seco m Peso Fresco m Nome do Gene Evento # Méd.

Val % Aum.

Med.

Val- % Aum.

LNU892 80412,1 4,85 0,13 15 96.0 0.17 21 LNU884 80407,1 6,17 0,02 47 116.2 L 46 LNU884 80407,5 4,88 0,22 16 - - - LNU872 77724,7 5,15 0,13 23 99.7 L 26 LNU872 77725,4 5,10 0,11 21 90.4 0.05 14 LNU869 80084,3 5,30 L 26 93.6 0.05 18 LNU869 80084,4 5,53 0,02 32 114.5 L 44 LNU866 80443,5 5,17 0,09 23 - - - LNU866 80444,2 5,07 0,09 21 - - - LNU844 80342,1 4,55 0,17 8 - - - LNU844 80344,2 5,05 0,21 20 95.6 0.12 20 LNU834_H1 80402,7 5,38 0,17 28 112.4 0.08 42 LNU791 77893,1 5,05 0,08 20 - - - LNU749 80793,5 - - - 95.5 0.21 20 CONT - 4,20 - - 79.4 - - LNU975 80622,1 5,33 0,02 27 - - - LNU975 80624,3 5,00 0,07 19 - - - LNU819 78133,3 5,53 0,02 32 89.4 0.11 12 LNU817 80596,2 4,68 0,19 12 - - - LNU801 78584,7 4,93 0,04 18 - - - LNU800 77896,2 6,38 L 52 127.4 0.22 60 LNU794 78522,1 5,22 0,08 25 - - - LNU760_H1 80127,4 4,88 0,12 16 87.1 0.16 9 CONT. - 4,19 - - 79.9 - - LNU971 78395,1 - - - 92.1 0.13 32 LNU971 78395,5 - - - 94.8 0.21 36 LNU944 79779,3 4,07 0,27 14 - - - LNU944 79781,6 - - - 98.0 0.11 41 LNU931 79774,5 3,92 0,28 10 - - - LNU930 79770,5 4,88 0,03 36 - - - LNU930 79772,1 3,98 0,11 11 - - - LNU928 78211,4 4,50 0,16 26 94.9 0.18 36 LNU928 78215,4 4,28 0,03 19 - - - LNU917 77498,2 4,42 0,09 24 88.8 0.24 28 LNU917 77500,1 4,55 0,01 27 - - - LNU906 79219,6 - - 87.2 0.17 25 LNU904 78987,1 - - - 115.6 0.29 66 LNU904 78987,2 4,33 0,01 21 - - - LNUB74 78369,1 - - - 85.5 0.12 23 LNUB70 78501,1 4,53 0,01 26 - - - LNUB70 78505,1 4,12 0,06 15 104.9 0.11 51 LNUB70 78505,7 4,22 0,14 18 97.9 0.29 41 LNU867 79589,3 4,40 0,03 23 - - - LNU862 79757,1 4,45 0,08 24 76.6 0.22 10 LNU856 79753,3 - - 80.9 0.14 16 LNU856 79753,5 4,65 0,21 30 97.0 0.20 39 LNU829 77912,5 4,38 0,11 22 114.0 0.26 64 LNU825 77716,4 4,03 0,20 13 - - - LNU796 78235,7 4,35 0,27 22 - - - LNU792 79161,2 4,33 L 21 - - - LNU792 79215,1 4,15 0,14 16 - - - LNU763 77588,7 - - - 97.1 0.26 39 LNU758 79739,5 4,00 0,18 12 - - - LNU758 79740,3 - - - 99.3 0.29 43 CONT. - 3,58 - - 69.6 - - LNU955 80432,7 5,25 0,02 35 - - - LNU953 80428,1 - - - 84.9 0.17 25 LNU949 80557,1 - - - 83.8 0.05 24 LNU949 80557,4 - - - 77.9 0.23 15 LNU901 80474,2 4,70 0,16 21 86.9 0.20 28 LNU901 80474,3 4,70 0,09 21 98.7 0.04 46

Peso Seco m Peso Fresco m Nome do Gene Evento # Méd. Val % Aum, Méd. Val % Aum. LNU901 80476,4 4,33 0,29 11 - - - LNU892 80414,5 - - - 80.2 0.25 19 LNU866 80444,6 4,47 0,21 15 87.8 0.11 30 LNU843 78963,5 - - - 79.5 0.27 17 LNU834_H1 80402,3 - - 80.6 0.12 19 LNU834-1-11 80402,7 - - - 75.9 0,24 12 LNU798 79671,4 - - - 86.8 0.20 28 LNU798 79673,2 - - - 80.9 0.24 20 LNU787 80547,5 4,97 0,12 27 93.0 L 37 LNU766 78932,1 4,60 0,04 18 100.7 0.13 49 CONT. - 3,90 - - 67.7 - - LNUB44 80344,2 - - - 94.6 0.13 18 CONT. - - - - 80.2 - - Tabela 101: "CONT" - Controle; 'Méd." - Média; "% Aum. = % de aumento; "Val -p' — valor-p; L significa que o valor-p é menor que 0,01, p<0,1 foi considerado como significativo.

Tabela 102 Genes mostrando o desempenho melhorado da planta sob condições deficientes de nitrogênio (geração T2) Area Foliar cmz Cobertura das Raízes Fcm2I Comprimento das Raízes1cm] Nome do Evento # Gene Méd. Val- % Méd. Val- % Méd. Val-p p Aum. p Aum, p Aum. LNU954 80358,5 0,434 0,02 21 10.8 0.06 40 7.19 L 16 LNU938 80352,1 - - - 12.4 L 60 6.92 0.02 12 LNU938 80353,1 0,440 L 22 10.2 0.01 32 7.48 L 21 LNU938 80355,5 0,400 0,18 11 12.8 0.25 66 7.22 0.05 17 LNU910 80346,1 - - - - - - 6.80 0,28 10 LNU910 80348,1 0,403 0,08 12 - - - 6.82 0.04 11 LNU910 80350,1 0,461 0,02 28 11.3 0.09 47 7.18 L 16 LNU869 80083,3 - - - 13.0 0.16 69 7.16 L 16 LNU869 80084,3 0,424 0,09 18 10.3 L 33 6.55 0.23 6 LNU869 60084,4 0,404 0,28 12 9.92 0.16 28 - - - LNU869 60085,2 0,414 0,14 15 - - - - - - LNJ869 80085,3 0,477 L 33 13.9 0.02 80 7.69 L 25 LNUB40 78676,4 0,456 L 27 - - - 6.82 0.28 11 LNU840 78677,1 0,415 0,08 15 8.73 0.18 13 - - - LNU840 78763,2 - - - 9.27 0.09 20 - - - LNU840 78763,6 0,432 0,11 20 - - - - - - LNU837 79574,5 0,433 0,09 20 11.2 0.17 44 - - - LNU837 79574,7 0,434 0,02 21 10.6 0.03 38 7.16 0.02 16 LNU837 79575,2 - - - - - - 6.54 0.18 6 LNU837 79575,4 0,437 0,19 21 - - - - - - LNU771 80077,2 0,490 L 36 12.9 L 67 7.53 L 22 LNU771 80078,5 0,398 0,22 11 8.87 0.18 15 6.58 0.23 7 LNU771 80079,3 0,495 L 37 - - - 7.16 0,22 16 LNU771 80079,4 0,459 L 28 10.0 0.19 30 6.89 0,03 12 CONT. - 0,360 - - 7.72 - - 6,17 - - LNU964 80552,4 0,460 0,05 8 12.5 L 39 7.62 0.11 11 LNU964 80552,6 0,514 0,10 21 12.2 0.11 35 8.16 L 19 LNU957 80437,1 0,478 0,16 13 11.8 L 30 7.34 0.19 7 LNU957 80437,6 - - - - - - 7.61 0.05 11 LNU953 80428,1 0,467 0,26 10 10.9 0.02 20 7.32 0.15 7 LNU920 78509,5 - - - 10.8 0.05 19 7.70 0.04 12 LNU920 78510,1 - - - 10.7 0.17 18 7,66 0.02 12 LNU911 80420,5 - - - 10.8 0.26 19 7.50 0,09 9 LNU911 80424,2 0,493 0,03 16 11.8 0.19 31 7.51 0.04 10 LNU910 80350,1 - - - - - - 7.20 0.20 5 LNU903 80417,6 - - - 10.7 0.11 18 7.36 0.10 7 LNU901 80474,3 - - - 10.6 0.17 17 - - -

- '+ .-. an.: -.- .rr - ,f - -. - ...w,. -? r- --.-- f-. r --.-.-<. •-4. t

344/4I3

Área Foliar cm Cobertura das Raízes [cm2] Comprimento das Raízes [cm] Nome do o % vento Gene Méd.

Val-p Méd.

Val-p Aum.

Aum.

LNU901 80476,4 0,450 0,29 6 10.9 0.27 20 7.38 0.07 8 LNU897 80448,3 - - - 11.1 0.22 23 - - - LNU897 80449,1 - - - 10.8 0.14 20 7.50 0.05 9 LNU892 80412,1 - - - 12.5 0,07 39 7.57 0.04 10 LNU884 80407,1 0,481 0,07 13 15.0 0.05 66 7.46 0.07 9 LNU872 77724,7 - - - - - - 7.52 0.08 10 LNU872 77725,6 - - - - - - 7.24 0.20 6 LNU869 80084,4 0,481 0,27 13 15.0 L 66 8.19 L 19 LNU866 80443,5 0,464 0,07 9 - - - - - - LNU844 80341,2 - - - - - - 7.31 0.22 7 LNU844 80342,1 0,457 0,23 8 11.6 0.06 29 7.54 0.13 10 LNU844 80342,4 - - - 10.1 0.19 11 7.21 0.20 5 LNU844 80344,2 - - - 11.3 0.06 25 7.64 0.08 12 LNU834_H1 80402,7 0,499 L 18 12.9 0.09 43 7.77 0.01 13 LNU805 80784,1 - - - - - - 7.37 0.18 8 LNU773 80398,1 - - - 10.7 0.13 19 - - - LNU749 80793,5 - - 11.9 0.09 32 7.82 0.02 14 CONT. - 0,424 - - 9.05 - - 6.85 - - LNU956 80856,3 0,372 0,21 12 8.68 0.23 20 7.25 0.29 7 LNU818 80919,1 - - - - - - 7.21 0,09 6 CONT. - 0,334 - - 7.23 - - 6.79 - - LNU975 80622,1 0,400 0,16 15 - - - - - - LNU975 80624,3 0,375 0,17 7 7.86 L 18 7.03 L 14 LNU832_H2 80605,6 0,407 0,02 17 8.29 0.12 25 6.82 L 11 LNU819 78133,3 0,405 0,07 16 9.58 0.01 44 6.60 L 7 LNU817 80596,2 - - - 7.47 0.19 12 - - - LNU801 78584,7 - - - 7.34 0.04 11 - - - LNU801 78585,5 - - - 7.32 0.09 10 - - - LNU801 78585,7 0,427 0,09 22 8.56 0.07 29 6.47 0.26 5 LNU800 77896,2 0.433 L 24 10.00 0.02 51 - - - LNU799 78672,5 - - - 7.39 0.24 11 - - - LNU794 78522,1 - - - 8.83 0.21 33 6.69 0.08 9 LNU760_H1 80127,4 0,378 0,17 8 9.25 0.06 39 6.45 0.30 5 LNU760_Hl 80130,1 - - - 7.87 0.09 19 - - - LNU760_H1 80130,4 8.15 0.01 23 6.38 0.16 4 CONT. - 0,350 - - 6.64 - - 6.14 - - LNU971 78393,3 - - - - - - 7.22 0.14 7 LNU971 78395,2 - - - - - - 7.06 0,21 5 LNU971 78395,5 0,486 0,05 19 - - - 7.11 0.19 5 LNU931 79774,1 - - - - 7.25 0.07 7 LNU930 79770,5 - - - 10,3 0.30 10 7.15 0.16 6 LNU930 79772,5 - - - 11.8 0.02 26 7.10 0.24 5 LNU928 78211,4 0,442 0,15 8 11.0 0.18 17 7.40 0.01 10 LNU917 77500,1 0,497 L 22 12.7 0.01 36 7.47 0.01 11 LNU904 78987,1 0,471 0,11 15 - - - 7.38 0.17 9 LNU904 78987,2 - - - 10.7 0,26 14 - - - LNU904 78989,1 - - - - - - 7.04 0.16 4 LNU899 79765,4 - - - 10.4 0.21 11 7.57 L 12 LNU899 79765,5 - - - - - 7,26 0.03 8 LNU874 78369,1 0,460 0,08 13 - - - 7.15 0.16 6 LNU870 78501,1 0,441 0,16 8 12.1 0.14 29 7.23 0.12 7 LNU870 78505,7 0,474 0,09 16 - - - - - - LNU867 79589,3 - - - 14.0 0.05 49 7.27 0.27 8 LNU867 79590,5 - - - - - - 7.08 0.24 5 LNU862 79755,9 - - - 12.7 0.09 36 7.39 0.02 10 LNU862 79757,1 0,447 0,18 9 12.5 0.04 33 7.29 0.04 8 LNU856 79753,3 0,481 0,13 18 12.3 0.02 31 7.93 L 18 LNU829 77912,3 - - - - - - 7.16 0.27 6 LNU829 77912,5 0,455 0,24 11 10.1 0.28 8 7.44 L 10 LNU829 77914,1 - - - - - - 7.18 0.07 6

Area Foliar cm Cobertura das Raízes cm Comprimento das Raizes [cm] Nome do oba Evento# 0 Gene Méd. VaE-p Aum Méd. Val-p Méd. Val-p Aum. Aum. LNU829 77914,2 - - - - - - 7.51 L 11 LNU796 78234,5 - - - - - - 7.31 0.04 8 LNU796 78235,7 - - - - 7,44 0.10 10 LNU792 79161,2 0,499 0,03 22 11.3 0.08 21 7.29 0.03 8 LNU792 79215,3 0,469 0,21 15 - - - 7.16 0.08 6 LNU763 77588,1 - - - 10.5 0.28 11 - - - LNU763 77588,6 0,459 0,14 12 - - - - - - LNU753 77143,3 - - - - - - 7.38 0.02 9 CONT. - 0,409 - - 9.38 - - 6.75 - - LNU955 80432,7 - - - - - - 6.81 0.27 17 LNU953 80428,1 0,458 0,06 11 9.88 0.04 32 6.52 0.07 12 LNU949 80557,1 - - - 9.85 0.05 32 6.31 0.15 9 LNU949 80557,2 0,468 010 13 8.31 0.29 11 - - - LNU949 80557,4 - - - 9.07 0.10 21 - - - LNU901 80474,2 0,525 0,10 27 10.4 0.09 39 7.03 0.02 21 LNU901 80476,4 0,454 0,25 9 10.5 0.10 40 6.40 0.15 10 LNU892 80410,1 - - - 9.13 0.03 22 6.37 0.09 10 LNU892 80414,7 - - - 9.87 0.11 32 - - - LNU873 80473,6 - - - 12.1 0.17 61 6.45 0.26 11 LNU866 80444,6 0,467 0,05 13 9.26 0.18 24 6.23 0.29 7 LNU834_H1 80402,1 - - - 9.04 0.21 21 - - - LNU834_H1 80402,3 - - - 8.88 0.21 19 - - - LNU834_H1 80402,7 - - - - - - 6.38 0.16 10 LNU8341-11 80404,5 0,466 0,17 12 11.5 0.30 54 - - - LNU798 79671,4 0,465 0,09 12 9.92 0.07 32 6.56 0.04 13 LNU798 79673,2 - - - - - - 6.61 0.04 14 LNU787 80546,5 - - - 8.44 0.19 13 - - LNU787 80547,4 - - - 8.78 0.12 17 6.83 0.01 18 LNU787 80547,5 0,484 L 17 11.8 L 58 7.34 L 27 LNU766 78932,1 0,509 0,02 23 10.3 0.14 37 7.05 L 22 CONT. - 0,415 - - 7.49 - - 5.79 - - LNU884 80407,5 0,490 0,23 11 11.9 0.27 17 6.99 0.23 7 LNU844 80341,2 - - - 12.4 0.26 23 6.90 0.25 6 LNU791 77895,4 - - - 11.8 0.14 17 7.07 0.05 8 CONT. - 0,440 - - 10.1 - - 6.53 - - Tabela 102: "CONT" - Controle; 'Méd." - Média; '% Aum." = % de aumento; "Val-p" — valor-p; L significa que o valor-p é menor que 0,01, p<0,1 foi considerado como significativo.

Tabela 103 Genes mostrando o desempenho melhorado da planta sob condições deficientes de nitrogênio (geração Ti) Peso Seco m Peso Fresco m Nome do Gene Méd. Val- % Aum. Méd. Val % Aum. LNU859 5,75 0,30 19 - - - CONT. 4,84 - - - - - LNU919 5,47 0,11 21 - - - LNU886 - - - 113,1 0,13 29 LNUB59 5,65 0,07 26 - - - LNU821 - - - 100,6 0,23 14 CONT. 4,50 - - 88,0 - - LNU936 5,53 0,22 20 - - - LNU786 5,87 0,02 27 - - - CONT. 4,62 - - - - - Tabela 103: 'CONT" - Controle; "Méd." - Média; "% Aum." = % de aumento; 'Val-p" — valor-p; L significa que o valor-p é menor que 0,01, p<0,1 foi considerado como significativo.

Tabela 104

Genes mostrando o desempenho melhorado da planta sob condições deficientes de nitrogênio (aeracão Ti) Cobertura das Raízes cm Comprimento das Raízes [cm] Nome do Gene Méd. Val % Aum. Méd. Val % Aum. LNU818 - - - 6,65 0,28 11 CONT. - - - 6,00 - - LNU956 17,2 0,17 20 - - - CONT. 14,3 - - - - - LNU946 12,3 0,25 22 - - - LNU887 12,6 0,22 25 7,14 0,16 13 LNU786 13,5 0,03 34 7,03 0,19 11 CONT. 10,1 - - 6,34 - - Tabela 104: "CONT" - Conirole; "Méd." - Média; "% Aum." = % de aumento; "Val-p" - valor-p; L significa que o valor-p é menor que 0,01, p<0,1 foi considerado como significativo.

[00608] Os genes listados nas Tabelas 105-106 melhoraram a taxa de crescimento relativo da planta (taxa de crescimento relativo da área foliar, cobertura da raiz e comprimento da raiz) quando cultivados sob condições de cultivo de nitrogênio limitantes, comparados às plantas de controle (gerações T2 e Ti) que foram cultivadas sob condições de cultivo idênticas. As plantas que apresentam taxa de crescimento rápido mostram um estabelecimento melhor da planta em solo sob condições de nitrogênio deficientes. 0 crescimento mais rápido foi observado quando a taxa de crescimento da área foliar, comprimento da raiz e cobertura da raiz foi medida, Tabela 105 Genes mostrando a taxa de crescimento melhorada da planta sob condições deficientes de nitrogênio (geração T2) RGR do Comprimento das RGR da Área Foliar RGR da Cobertura da Raiz Nome do Raízes Evento # Gene Méd. Val-p % Méd. Val-p % Méd. Val-p % Aum. Aum. Aum. LNU954 80358,5 0,0422 0,08 22 1.29 0,01 42 0,649 0,03 22 LNU938 80352,1 - - - 1.48 L 63 0.640 0.03 21 LNU938 80352,2 - - - - - - 0.613 0.08 16 LNU938 80353,1 0,0418 0,09 20 1.21 0.01 33 0.666 L 26 LNU938 80354,1 - - - - - - 0.588 0.28 11 LNU938 80355,5 - - 1.55 0.01 70 0.673 0.02 27 LNU910 80346,1 - - - - - - 0.631 0.14 19 LNU910 80348,1 - - - - - - 0.615 0.09 16 LNU910 80350,1 0,0445 0,04 28 1.33 0.01 47 0.646 0.03 22 LNU869 80083,3 - - - 1.56 L 72 0.680 0.03 28 ffn. ''?:

347/4I3

RGR do Comprimento das RGR da Área Foliar RGR da Cobertura da Raiz Nome Evento # ,o Raizes Gene do Méd.

Val-p Méd.

Val-p Aum.

Aum.

LNU869 80084,3 0,0410 0,15 18 1.23 L 35 0.614 0.11 16 LNU869 80084,4 - - - 1.15 0.11 27 - - - LNU869 80085,2 - - - 1.12 0.21 23 - - - LNU869 80085,3 0,0444 0,08 28 1.66 L 82 0.673 0.05 27 LNU840 78676,4 0,0428 0,15 23 - - - - - - LNU840 78677,1 - - - 1.04 0,24 15 0.606 0.15 14 LNU840 78763,2 - - - 1.12 0.13 24 0.605 0.24 14 LNU840 78763,6 0,0405 0,23 17 - - - 0.598 0.26 13 LNU837 79574,5 - - - 1.35 0.02 49 0.622 0.13 17 LNU837 79574,7 0,0416 0,11 20 1.27 L 40 0.664 0.01 25 LNU837 79575,2 - - - - - - 0.589 0.23 11 LNU837 79575,4 0,0420 0,22 21 1.13 0.19 24 - - - LNU771 80077,2 0,0454 0,02 31 1.52 L 68 0.689 L 30 LNU771 80077,4 - - - - - - 0.594 0.22 12 LNU771 80078,5 - - - 1.06 0.21 17 0.605 0.15 14 LNU771 80079,3 0,0451 0,07 30 1.25 0.06 38 0.656 0.08 24 LNU771 80079,4 0,0454 0,02 31 1.18 0.08 30 0.613 0.12 16 CONT. - 0,0347 - - 0.908 - - 0.530 - - LNU964 80548,3 - - - - - - 0.685 0.26 12 LNU964 80552,4 0,0460 0,23 13 1,49 0.01 40 0.727 0,07 19 LNU964 80552,6 0,0475 0,17 17 1.45 0.04 37 0.734 0.04 20 LNU957 80437,1 - - - 1.38 0.06 30 - - - LNU953 80428,1 - - - 1.27 0,18 20 - - - LNU920 78509,5 - - - 1.27 0,19 19 0.703 0.14 15 LNU920 78510,1 - - - 1.26 0.22 18 - - - LNU911 80424,2 0,0463 0,23 14 1.35 0.13 27 - - - LNU903 80417,6 - - - 1.29 0.18 21 0.693 0.18 14 LNU901 80474,3 - - - 1.27 0.22 19 0.709 0.15 16 LNU901 80476,4 - - - 1.27 0.25 19 - - - LNU897 80448,3 - - 1.31 0.17 23 - - - LNU897 80449,1 - - - 1.30 0.17 22 0.696 0.17 14 LNU892 80412,1 - - 1.51 0.02 42 0.701 0.15 15 LNU884 80407,1 - - - 1.81 L 70 - - - LNU872 77724,7 - - - - - - 0.691 0.19 13 LNU872 77725,6 - - - - - - 0.704 0.13 15 LNU869 80084,3 - - 1.26 0.28 18 - - - LNU869 80084,4 0,0473 0,20 16 1.80 L 69 0.760 0.02 25 LNU844 80341,2 - - - - - - 0.701 0.16 15 LNU844 80342,1 - - 1.38 0.06 29 - - - LNU844 80344,2 - - - 1.35 0.09 27 0.698 0.18 14 LNU834_H1 80402,7 1.55 0.01 46 0.765 0.02 25 LNU773 80398,1 1.30 0.18 22 LNU749 80793,5 - - - 1.42 0.05 33 0.722 0.08 18 CONT. - 0,0407 - - 1.06 - - 0.610 - - LNU956 80854,3 - - - 1.06 0.29 21 - - - LNU956 80856,3 0,0385 0,26 12 1.06 0.19 22 0.711 0.26 8 CONT. - 0,0344 - - 0.873 - - 0.661 - - LNU975 80624,3 - - - 0.904 0.17 16 - - - LNU832_H2 80605,6 0,0371 0,14 17 0.951 0.11 22 0.610 0.02 11 LNU819 78133,3 0,0361 0,26 14 1.12 L 44 - - - LNU801 78585,7 0,0370 0,21 17 0.994 0.05 27 - - - LNU800 77896,2 0,0377 0,09 19 1.18 L 51 - - - LNU794 78522,1 - - - 1.03 0.06 31 - - - LNU760_H1 80127,2 - - - 0.896 0.27 15 - - - LNU760_H1 80127,4 - - - 1.08 L 37 - - - LNU760_H1 80130,1 - - - 0,909 0.20 16 - - - LNU760_H1 80130,4 - - - 0.964 0.05 23 0.600 0.05 10 CONT. - 0,0317 - - 0.782 - - 0.548 - - LNU971 78395,2 - - - - 0.658 0,21 10

RGR do Comprimento das RGR da Área Foliar RGR da Cobertura da Raiz Nome 7a Raizes mé do Evento # Ge Méd. Vat- % Méd. Val- % Méd. Val- ~ p Aum. p Aum. p A°um. LNU971 78395,5 0,0486 0,09 21 - - - - - - LNU930 79772,5 - - - 1.39 0.04 26 - - - LNU928 78211,4 0,0470 0,14 17 1.30 0.19 18 0.672 0.13 12 LNU917 77500,1 0,0487 0,08 21 1.49 0.01 36 - - LNU904 78987,1 0,0469 0,19 17 - - - - - - LNU904 78987,2 0,0455 0,26 13 1.26 0.27 15 - - - LNU874 78369,1 0,0481 0,09 20 - - - - - - LNU870 78501,1 - - - 1.45 0.04 32 0.659 0.25 10 LNU870 78505,7 0,0478 0,13 19 1.28 0.26 16 - - - LNU867 79589,3 - - - 1.68 L 52 0.684 0.12 14 LNU862 79755,9 - - - 1.52 0.01 38 0.702 0.03 17 LNU862 79757,1 0,0463 0,20 15 1.51 0.01 37 0.696 0.06 16 LNU856 79753,3 0,0495 0,08 23 1.47 0.01 33 0.693 0.07 16 LNU856 79753,5 0,0453 0,29 13 1.31 0.21 19 - - - LNU852 79580,2 - - - - - - 0.654 0.24 9 LNU829 77912,3 - - - - - 0.658 0.25 10 LNU796 78234,5 0,0455 0,23 13 - - - - - - LNU796 78235,7 - - - 1.45 0.08 32 0.668 0.20 11 LNU792 79161,2 0,0485 0,09 21 1.37 0.06 24 0.680 0.10 14 LNU792 79215,1 - - - - - - 0.665 0.17 11 LNU792 79215,3 - - - 1.38 0.12 26 - - - LNU763 77588,1 - - - 1.26 0.26 15 - - - LNU763 77588,8 - - - - - - 0.706 0.04 18 LNU753 77141,2 - - - 1.46 0.07 32 0.666 0.21 11 CONT. - 0,0402 - - 1.10 - - 0.599 - - LNU955 80432,7 - - - 1.61 0.01 78 0.669 0.22 19 LNU953 80428,1 - - - 1.19 0.04 31 - - - LNU949 80557,1 - - 1.18 0.05 30 - - - LNU949 80557,2 0,0476 0,13 18 - - - - - - LNU949 80557,4 - - - 1.11 0.16 22 - - - LNU914 80514,5 - - - 1,09 0.25 20 - - - LNU901 80474,2 0,0513 0,06 27 1.24 0.03 37 - - - LNU901 80474,3 - - - 1.10 0.23 21 - - - LNU901 80476,4 - - - 1.27 0.03 39 0.632 0.30 12 LNU892 80410,1 - - - 1.11 0.09 23 0.649 0.14 15 LNU892 80414,7 - - - 1.21 0.05 34 - - - LNU873 80473,6 - - - 1.44 L 59 - - - LNU866 80444,6 - - - 1.12 0.16 24 0.643 0.25 14 LNU834_H1 80402,1 - - - 1.11 0.16 22 - - - LNU834_H1 80402,3 - - 1.08 0.20 19 - - - LNU834_H1 80404,5 - - - 1.40 0.04 55 0.656 0.22 16 LNJ798 79671,4 - - - 1.18 0.06 30 - - - LNU798 79673,2 - - - 1.08 0.26 19 - - - LNU787 80546,5 - - - - - 0.648 0.20 15 LNU787 80547,4 - - - 1.06 0.21 16 - - - LNU787 80547,5 0,0478 0,11 18 1.41 L 56 0.686 0.08 22 LNU766 78932,1 0,0482 0,11 19 1.23 0.04 36 0.653 0.19 16 CONT. - 0,0404 - - 0.907 - - 0.565 - - LNU884 80407,5 - - - 1.42 0.22 21 0.633 0.04 17 LNU872 77725,4 - - - - - - 0.584 0.22 8 LNU844 80341,2 - - - 1.47 0.17 24 0.591 0.25 9 LNU791 77895,4 - - - 1.37 0.26 16 0.584 0.22 8 CONT. - - - - 1.18 - - 0,541 - - Tabela 105: "CONT" - Controle; 'Méd." - Média; "% Aum." = % de aumento; "Val-p - valor p; L significa que o valor-p é menor que 0,01, p<0,1 foi considerado como significativo.

Tabela 106

Genes mostrando a taxa de crescimento melhorada da planta sob condicões deficientes de nitroaênio (aeracão T2) RGR da Cobertura da Raiz RGR do Comprimento das Raízes Nome do Gene Méd. Val % Aum. Méd. Val % Aum. LNU818 - - - 0,691 0,11 14 CONT. - - - 0,606 - - LNU956 2,09 0,13 20 - - - CONT. 1,74 - - - - - LNU946 1,51 0,20 23 - - - LNU932 - - - 0,739 0,23 17 LNU887 1,53 0,17 25 0,722 0,18 14 LNU786 1,65 0,04 35 0,741 0,15 17 CONT. 1,22 - - 0,635 - - Tabela 106: "CONT" - Controle; 'Méd." - Média; "% Aum." = % de aumento; °Val-p" - valor p; L significa que o valor-p é menor que 0,01, p<0,1 foi considerado como significativo.

[00609] Os genes listados nas Tabelas 107-110 melhoraram a NUE da planta quando cultivadas em níveis de concentração de nitrogênio padrão. Esses genes produziram biomassa de planta maior (peso fresco e seco da planta; área foliar, cobertura da raiz e comprimento da raiz) quando cultivadas sob condições de cultivo de nitrogênio padrão, comparado àquelas plantas de controle que foram cultivadas sob condições de cultivo idênticas em geração T2 (Tabelas 107- 108) ou geração T1 (Tabelas 109-110) . A biomassa maior da planta nessas condições de cultivo indica a alta capacidade da planta de melhor metabolizar o nitrogênio presente no meio. As plantas que produzem biomassa de raiz maior têm melhores possibilidades de absorver maior quantidade de nitrogênio do solo.

Tabela 107 Genes mostrando o desempenho melhorado da planta sob condicões de cultivo de nitrogênio padrão (aeracão T2) Peso Seco m Peso Fresco m Nome do Gene Evento 4 Méd. Val % Aum, Méd. Val % Aum, LNU938 80355,5 6,80 0,27 16 140.0 0.21 43 LNU910 80348,5 - - - 129.1 0.21 32 LNU910 80350,1 7,17 0,12 23 118.7 0.18 21 LNU869 80083,3 7,10 0,09 21 142.9 0.12 46 LNUB69 80084,4 10,3 0,10 77 184.2 L 88 LN1J869 80085,3 8,25 0,01 41 158.8 0.02 63 LN11771 80077,2 - - - 170.8 L 75 LNU771 80079,3 - - - 123.8 0,26 27 CONT. - 5,85 - - 97,7 - - LNU964 80548,3 5,30 0,25 25 112.8 0.03 40 LN U964 80552,4 7,85 0,04 86 162.1 0.06 101

Peso Seco m Peso Fresco m Nome do Gene Evento # Méd. Val % Aum. Méd. Val- % Aum. LNU964 80552,6 5,70 0,01 35 103.6 0.07 28 LNU955 80432,7 6,63 0,03 57 120.4 0.03 49 LNU953 80428,1 5,40 0,15 28 - - - LNU953 80429,2 6,83 0,16 62 143.8 0.24 78 LNU949 80557,4 5,85 L 38 112.4 L 39 LNU914 80514,5 5,70 0,16 35 115.7 0.18 43 LNU901 80474,2 6,75 0,03 60 128.8 L 60 LNU901 80474,3 7,58 0,02 79 130.8 0.06 62 LNU901 80476,4 - - - 116.2 0.17 44 LNU892 80410,1 6,50 L 54 137.1 0.03 70 LNU892 80412,1 5,70 0,21 35 - - - LNU892 80414,7 6,03 0,13 43 125.5 0.19 55 LNU873 80469,3 6,42 0,10 52 119.8 0.18 49 LNU873 80473,6 4,80 0,20 14 96.2 0.24 19 LNU866 80444,6 7,20 0,03 70 150.2 0.15 86 LNU843 78963,5 4,60 0,23 9 93.2 0.21 16 LNU8341-11 80402,1 6,35 0,14 50 116.8 0.08 45 LNU834_H1 80402,3 5,88 0,04 39 97.9 0.22 21 LNU834_H1 80404,5 6,05 0,05 43 113.1 0.03 40 LNU798 79669,1 5,67 0,12 34 102.2 0,04 27 LNU798 79671,4 - - - 132.5 L 64 LNU798 79673,2 5,62 0,13 33 106.7 0.14 32 LNU787 80546,5 6,68 0,04 58 126.0 0.01 56 LNU787 80547,5 6,70 0,07 59 139.7 0.01 73 LNU766 78931,1 6,05 L 43 117.1 L 45 LNU766 78931,10 7,52 L 78 129.5 0.02 60 LNU766 78932,1 5,47 0,20 30 102.8 0.03 27 CONT. - 4,22 - - 80.7 - - LNU952 78218,3 6,10 0,25 34 - - - LNU952 78218,6 6,17 0,26 35 133.8 0.14 28 LNU905 79674,4 7,12 0,15 56 138.1 0.20 32 LNU897 80449,1 6,10 0,16 34 - - - LNU884 80407,5 8,55 0,05 87 172.8 0.16 66 LNU872 77723,2 - - - 138.9 0.15 33 LNU872 77724,7 8,20 0,02 80 154.9 0.07 48 CONT. - 4,57 - - 104.4 - - Tabela 107: "CONT" - Controle; "Méd. ° - Média; "% Aum. ° = % de aumento; "Val-p° - valor p; L significa que o valor-p é menor que 0,01, p<O,1 foi considerado como significativo.

Tabela 108 Genes mostrando o desempenho melhorado da planta sob condições de cultivo de nitrogênio padrão (geração T2) Área Foliar [cm2] Cobertura das Raizes [cm2] Comprimento das Raízes [cm] Nome do Evento # ~o Gene Méd. Val-p Méd. Val-p Méd, Val-p Aum. Aum. Aum. LNU954 80360,1 0,510 0,16 9 - - - - - - LNU938 80355,5 0,554 0,05 19 - - - - - - LNU910 80348,1 0,560 0,27 20 - - - - - - LNU910 80348,5 0,586 L 26 - - - 6.83 0.26 9 LNU910 80350,1 0,620 0,02 33 7.98 0.11 22 6.97 L 11 LNU869 80083,3 0,603 0,06 29 - - - - - - LNU869 80084,3 0,564 0,07 21 - - - - - - LNU869 80084,4 0,767 L 65 - - - - - - LNU869 80085,3 0,656 L 41 8.85 L 36 7.14 L 14 LNU840 78676,4 0,527 0,18 13 - - - 6.55 0.19 5 LNU840 78677,1 0,533 0,24 14 - - - - - - LNU840 78763,2 0,540 0,16 16 - - - - - - LNU771 80077,2 0,646 0,19 38 9.56 L 47 7.19 L 15

Área Foliar (cm2] Cobertura das Raízes [cml Comprimento das Raízes [cm] Nome do Evento # 70 Gene Méd. Val-p Aum.Méd. Val-p Á Méd. Val-p um Aum, LNU771 80079,3 0,572 0,19 23 - - - - - - LNU771 80079,4 0538 0,07 15 - - - - - - CONT. - 0,466 - - 6.52 - - 6.26 - - LNU964 80548,1 0,557 L 23 6.39 0.20 15 6.21 0.06 8 LNU964 80548,3 0,514 0,02 14 - - - - - - LNU964 80552,4 0,699 0,01 54 7.77 0.13 40 6.15 0.26 7 LNU964 80552,6 0,500 0,10 10 - - - 6.06 0.28 6 LNU955 80432,7 0,597 0,03 32 9.08 0.09 64 - - - LNU953 80428,1 0,554 0,03 22 7.46 0.07 35 6.21 0.01 8 LNU953 80429,2 0,640 0,12 41 - - - - - - LNU949 80557,4 0,612 L 35 8.01 0.02 45 6.43 L 12 LNU914 80514,5 0,598 L 32 - - - - - - LNU914 80515,6 0,543 0,09 20 - - - - - - LNU901 80474,2 0,598 0,02 32 8.49 0.02 53 6.53 0.07 14 LNU901 80474,3 0,605 L 34 6.52 0.10 18 - - - LNU901 80476,4 0,513 0,05 13 - - - 6.25 0.20 9 LNU892 80410,1 0,582 0,07 29 7.37 0.01 33 6.24 0.04 9 LNU892 80414,7 0,552 0,12 22 - - - - - - LNU873 80469,3 0,540 L 19 6.46 0.21 17 - - - LNU873 80473,6 0,502 0,16 11 6.19 0.25 12 - - - LNU866 80444,6 0,678 0,13 50 - - - - - - LNU834_H1 80402,1 0,597 0,03 32 8.21 0.09 48 6.67 L 16 LNU834_1-11 80402,3 0,519 0,03 15 6.42 0.10 16 - - - LNU834_H1 80404,5 0,588 L 30 7.17 L 30 6.30 0.21 10 LNU798 79669,1 0,517 0,02 14 - - - - - - LNU798 79671,4 0,681 L 51 9.55 0.29 73 6.63 0.26 16 LNU798 79673,2 0,573 0,13 27 7.55 0.29 36 6,66 0.14 16 LNU787 80546,5 0,568 0,01 26 7.62 0.19 38 6.31 0.24 10 LNU787 80547,4 - - - 6.11 0.29 10 6.47 0.02 13 LNU787 80547,5 0,607 0,06 34 8.87 0.03 60 6.53 0.02 14 LNU766 78931,1 0,535 0,12 18 7.02 0.09 27 - - - LNU766 78931,10 0,648 0,03 43 8.84 0.01 60 6.78 0.03 18 LNU766 78932,1 0,589 0,05 30 7.38 0.17 33 6.79 0.04 19 CONT. - 0,453 - - 5.53 - - 5.73 - - LNU952 78218,6 0,695 0,04 34 7.32 0.16 26 - - - LNU920 78507,1 - - - 7.69 0.24 33 - - - LNU920 78510,1 - - - - - - 6.53 0.29 10 LNU905 79674,4 0,663 0,16 28 8.22 0.07 42 - - - LNU905 79676,1 0,614 0,20 19 7.19 0.28 24 - - - LNU897 80449,1 0,620 0,17 20 - - - - - - LNU884 80407,5 0,791 0,03 53 9.14 0.04 57 6.76 0.19 14 LNU872 77723,2 0,689 0,15 33 - - - - - - LNU872 77724,7 0,650 0,10 26 9.50 0.05 64 6.90 0.13 17 LNU791 77895,4 - - - - - - 6.62 0.24 12 CONT. - 0,517 - - 5.81 - - 5.91 - - Tabela 108: "CONT" - Controle; "Méd." - Média; "% Aum." = % de aumento; "Val-p" - valor p; L significa que o valor-p é menor que 0,01, p<0,1 foi considerado como significativo.

Tabela 109 Genes mostrando o desempenho melhorado da planta sob condições de cultivo de nitroqênio padrão (geração TI) Peso Seco [mgi Peso Fresco[mgi Nome do Gene Méd. I Val % Aum, Méd. I Val- % Aum. LNU919 - 139,8 0,19 15 CONT. 121,4 - - LNU956 9,90 0,18 24 LNU749 10,0 I 0,20 26

Peso Seco m Peso Fresco1mg] Nome do Gene Méd. Val % Aum. Méd. Val- % Aum. CONT. 7,97 - - = de aumento; "Val-p" - valor p; L significa que o valor-p e menor que abela 1U "[:UNI - Controle; "Med." - Media; "% Aum.` % 0,01, p<O,1 foi considerado como significativo.

Tabela 110 Genes mostrando o desempenho melhorado da planta sob condições de cultivo de nitrocaênio padrão (aeracão Ti) Nome do Area Foliar cm Cobertura das Raízes cm Comprimento das Raízes[cml Gene Méd. Val- % Aum. Méd. Val % Aum, Méd, Val % Aum. LNU886 0,752 0,19 14 - - - - - - LNU821 - - - 6,89 0,27 18 5,89 0,19 7 CONT. 0,660 - - 5,83 - - 5,50 - - Tabela 110: "CONT" - Controle; "Méd." - Média; '% Aum." = % de aumento; "Val-p" - valor p; L significa que o valor-p é menor que 0,01, p<0,1 foi considerado como significativo.

[00610] Os genes listados nas Tabelas 111-112 melhoraram a taxa de crescimento relativo da planta (RGR da área foliar, comprimento da raiz e cobertura da raiz) quando cultivadas em níveis de concentração de nitrogênio padrão.

Esses genes produziram plantas que cresceram mais rápido que as plantas de controle quando cultivadas sob condições de cultivo de nitrogênio padrão. 0 crescimento mais rápido foi observado quando a taxa de crescimento da área foliar, comprimento da raiz e cobertura da raiz foi medida. Tabela 111 Genes mostrando a taxa de crescimento melhorada sob condições de cultivo de nitroaênio padrão (aeracão T2) RGR do Comprimento das RGR da Área Foliar RGR da Cobertura da Raiz Nome do Raízes Evento # Gene Méd. Val-p Méd. Val-p Méd. Val-p Aum. Aum. Aum. LNU954 80360,4 - - - - - - 0.583 0.23 10 LNU938 80354,1 - - - - - - 0,588 0.21 11 LNU938 80355,5 0,0549 0,14 18 - - - - - - LNU910 80348,1 0,0555 0,22 19 - - - - - - LNU910 80348,5 0,0588 0,11 26 - - - - - - LNU910 80350,1 0,0617 0,02 32 0.929 0.07 23 0.611 0.06 16 LNU869 80083,3 0,0584 0,12 25 - - - - - - LNU869 80084,3 0,0549 0,16 18 - - - - - - LNU869 80084,4 0,0767 L 64 0.911 0.23 20 - - - LNU869 80085,3 0,0652 L 40 1.02 L 34 0.583 0.21 10 LNU840 78677,1 0,0537 0,25 15 - - - - - - LNU840 78763,2 0,0529 0,30 13 - - - - - - LNU771 80077,2 0,0630 0,05 35 1.11 L 46 0.627 0.09 19 LNU771 80079,3 0,0537 0,30 15 0.859 0.29 13 - - -

RGR do Comprimento das RGR da Área Foliar RGR da Cobertura da Raiz Nome 7o Raízes Evento #t Gene do Méd. Val-p Aum Méd. Val-p Méd. Val-p Aum. Aum. LNU771 80079,4 0,0544 0,18 17 - - - 0.577 0.29 9 CONT. - 0,0466 - - 0.758 - - 0.528 - - LNU964 80548,1 0,0572 0,03 23 0.773 0.24 16 0.632 0.08 11 LNU964 80548,3 0,0522 0,26 12 - - - - - - LNU964 80552,4 0,0733 L 58 0.917 0.03 38 - - - LNU964 80552,6 0,0543 0,12 17 - - - - - - LNU955 80432,7 0,0607 0,02 31 1.11 L 67 - - - LNU953 80428,1 0,0561 0,04 21 0.879 0.04 32 - - LNU953 80429,2 0,0662 L 42 0.787 0.27 18 - - - LNU949 80557,4 0,0630 L 36 0.971 L 46 0.627 0.13 10 LNU914 80514,5 0,0596 0,03 28 - - - - - - LNU914 80515,6 0,0550 0,12 18 - - - - - - LNU901 80474,2 0,0592 0,01 27 1.01 L 52 - - - LNU901 80474,3 0,0623 L 34 0.792 0.16 19 - - - LNU901 80476,4 0,0534 0,15 15 - - - - - LNU892 80410,1 0,0589 0,02 27 0.890 0.02 34 0.615 0.17 8 LNU892 80414,7 0,0551 0,12 19 - - - - - - LNUB73 80469,3 0,0550 0,08 18 0.779 0.26 17 - - - LNU873 80473,6 0,0522 0,24 12 - - - - - - LNU866 80444,6 0,0664 L 43 0.901 0.08 35 - - - LNU834_H1 80402,1 0,0614 L 32 0.965 0.01 45 0.614 0.21 8 LNU834_H1 80402,3 0,0529 0,14 14 0.768 0.25 15 - - - LNU834_H1 80404,5 0,0588 0,01 27 0.859 0.03 29 - - LNU798 79671,4 0,0701 L 51 1.12 L 68 - - - LNU798 79673,2 0,0585 0,05 26 0.903 0.10 36 0.636 0.17 12 LNU7B7 80546,5 0,0572 0,03 23 0.899 0.06 35 - - - LNU787 80547,4 - - - - - - 0.609 0.25 7 LNU787 80547,5 0,0659 L 42 1.06 L 59 0.634 0.07 12 LNU766 78931,1 0,0539 0,15 16 0.830 0.09 25 - - - LNU766 78931,10 0,0668 L 44 1.02 L 54 0.639 0.10 13 LNU766 78932,1 0,0584 0,04 26 0 864 0.08 30 0.612 0.30 8 CONT. - 0,0464 - - 0.665 - - 0.568 - - LNU952 78218,6 0,0694 0,04 41 0.879 0.15 31 0.589 0.13 19 LNU920 78507,1 - - - 0.907 0.20 36 - - - LNU905 79674,4 0,0658 0,16 33 0.960 0.06 44 - - - LNU905 79676,1 0,0620 0,15 26 0.848 0.22 27 0.584 0.12 18 LNU897 80449,1 0,0618 0,17 25 - - - - - - LNU884 80407,5 0,0776 0,01 57 1.06 0.02 58 0.593 0.21 19 LNU872 77723,2 0,0681 0,07 38 0.834 0.26 25 0.582 0.26 17 LNU872 77724,7 0,0670 0,03 36 1.08 0.03 61 - - - LNU773 80399,2 - - - 0.895 0.24 34 0.583 0.28 17 CONT. - 0,0493 - - 0.669 - - 0.497 - - Tabela 111: "CONT" - Controle; "Méd." - Média; "% Aum." = % de aumento; "Val-p" - valor p; L significa que o valor-p é menor que 0,01, p<0,1 foi considerado como significativo.

Tabela 112 Genes mostrando a taxa de crescimento melhorada sob condições de cultivo de nitrogênio padrão (geração Ti) Nome do RGR da Area Foliar RGR da Cobertura da Raiz RGR do Com cimento das Raízes Gene Méd. Val % Aum. Méd. Val- % Aum. Méd. Val % Aum. LNU886 - - - 0,809 0,25 19 - - - LNU821 - - - 0,815 0,19 20 0,590 0,18 9 CONT. - - - 0,680 - - 0,540 - - LNU956 0,0900 0,29 21 - - - - - - CONT. 0,0741 - - - - - - - - Tabela 112: "CONT" - Controle; "Méd." - Média; "% Aum." = % de aumento; "Val-p" - valor p; L significa que o valor-p é menor que 0,01, p<0,1 foi considerado como significativo.

-;-r'-'-

',:-*.sw--.,.. .

EXEMPLO 17 AVALIAÇÃO DE NUE, PRODUÇÃO E TAXA DE CRESCIMENTO DE PLANTA DE

ARABIDOPSIS TRANSGÊNICA EM FERTILIZAÇÃO DE BAIXO NITROGÊNIO OU NORMAL EM ENSAIO DE ESTUFA

[00611] Ensaio 1: Eficiência no uso do nitrogênio: Produção de semente, biomassa de planta e taxa de crescimento de planta em concentração de nitrogênio ideal e limitada em condições de estufa - Esse ensaio acompanha a produção de semente, a formação de biomassa e o crescimento de área da roseta de plantas cultivadas na estufa em condições de crescimento de nitrogênio não limitantes e limitantes. As sementes de Arabidopsis Transgênica foram semeadas em meios de ágar suplementados com meio de MS e agente de seleção (Canamicina), As sementes transgênicas T2 foram, então, transplantadas para 1,7 bandejas preenchidas com turfa e perlita em uma proporção de 1:1. As bandejas foram irrigadas com uma solução contendo condições limitantes de nitrogênio, as quais foram atingidas pela irrigação das plantas com uma solução contendo 1,5 mM de nitrogênio inorgânico na forma de KNO3, suplementado com 1mM de KH2PO4, 1mM de MgSO4, 3,6 mM de KC1, 2 mM de CaCl2 e microelementos, enquanto níveis normais de nitrogênio foram alcançadas aplicando uma solução de 6 mM de nitrogênio inorgânico também na forma de KNO3, com 1mM de KH2PO4, 1mM de MgSO4, CaCl2 e microelementos. Todas as plantas foram cultivadas na estufa até as sementes ficarem maduras.

As sementes foram colhidas, extraídas e pesadas. A biomassa de planta restante (o tecido acima do solo) também foi colhida, e pesada imediatamente ou seguindo a secagem no forno a 50°C por 24 horas.

[00612] Cada estrutura foi validada em sua geração T2, As plantas transgênicas transformadas com uma estrutura conformada por um vetor vazio carregando o promotor 35S e o marcador selecionável foram utilizadas como controle.

[00613] As plantas foram analisadas por seu tamanho total, taxa de crescimento, tempo de floração, produção de semente, peso de 1.000 sementes, matéria seca e índice de colheita (HI - produção de semente/matéria seca).

0 desempenho das plantas transgênicas foi comparado às plantas de controle cultivadas em paralelo nas mesmas condições. As plantas transgênicas falsas que expressam o gene repórter uidA (GUS-Intron) ou sem nenhum gene, no mesmo promotor, foram utilizadas como controle.

[00614] 0 experimento foi planejado na distribuição de lote aleatório aninhado. Para cada gene da invenção, três a cinco eventos de transformação independentes foram analisados de cada estrutura.

[00615] Formação de imagem digital - Um sistema de aquisição de imagem de laboratório, consistindo de uma câmera de reflexo digital (Canon EOS 300D) anexada com uma lente de 55 mm de comprimento focal (Canon série EF-S), montada em um dispositivo de reprodução (Kaiser RS), que inclui 4 unidades de luz (lâmpada de 4 x 150 Watts) foi utilizada para capturar imagens das amostras de plantas.

[00616] 0 processo de captura de imagem foi repetido a cada 2 dias, começando do dia 1 após o transplante até o dia 15. A mesma câmara, colocada em uma montagem de ferro personalizada, foi usada para capturar as imagens de plantas maiores vistas em cubas brancas em uma estufa controlada pelo ambiente. As cubas são de formato quadrado e incluem bandejas de 1,7 litros. Durante o processo de captura, as cubas foram colocadas abaixo da montagem de ferro, enquanto evitavam a luz solar direta e fundição de sombras.

[00617] Um sistema de análise de imagem foi utilizado, consistindo de um computador (processador Intel 24

3.0 GHz) e um programa de domínio público - ImageJ 1.39 [programa de processamento de imagem com base em Java, desenvolvido nos Institutos Nacionais de Saúde dos Estados Unidos e livremente disponibilizados na internet em rsbweb (dot) nih (dot) gov/]. As imagens foram capturadas em resolução de 10 Mega Pixels (3888 x 2592 pixels) e armazenadas em um formato JPEG de baixa compressão (Joint Photographic Experts Group padrão). Em seguida, dados de análise foram salvos para arquivos de textos e processados utilizando o software de análise estatística JMP (instituto SAS).

[00618] Análise de folha - Utilizando a análise digital, os dados das folhas foram calculados, incluindo o número da folha, a área da roseta, o diâmetro de roseta e a área da lâmina foliar.

[00619] Taxa de crescimento vegetal: a taxa de crescimento relativo (RGR) do número da folha [Fórmula VIII (descrita acima)], área da roseta [Fórmula IX, descrita acima], cobertura do lote [Fórmula XI, descrita acima] e índice de colheita [Fórmula XV] foram calculadas conforme segue:

[00620] Peso médio das sementes - No final do experimento, todas as sementes foram coletadas. As sementes foram espalhadas em uma bandeja de vidro e uma foto foi tirada. Utilizando a análise digital, o número de sementes em cada amostra foi calculado.

[00621] Peso seco e produção de semente - Por volta do 80° dia, as plantas foram colhidas e deixadas para secar a 30°C em uma cãmara de secagem. A biomassa e o peso da semente de cada lote foram medidos e divididos pelo número de plantas em cada lote. Peso seco = peso total da parte vegetal acima da terra (excluindo as raízes) após secagem a 30°C em uma cãmara de secagem;° Produção de semente por planta = peso total da semente por planta (gr.), peso de 1000 sementes (o peso de 1000 sementes) (gr.).

[00622] 0 índice de colheita (HI) foi calculado utilizando a Fórmula XV, conforme descrito acima.

[00623] Porcentagem de óleo em sementes - No final do experimento, todas as sementes de cada lote foram coletadas. As sementes de 3 lotes foram misturadas à terra e então montadas na câmara de extração. 210 ml de n-Hexano (Cat N° 080951 Biolab Ltd.) foram utilizadas como solvente.

A extração foi realizada por 30 horas em fogo médio a 50°C.

Uma vez finalizada a extração, o n-Hexano foi evaporado utilizando o evaporador a 35°C °e condições de vácuo. O processo foi repetido duas vezes. A informação obtida do extrator Soxhlet (Soxhlet, F, Die gewichtsanalytische

Bestimmung des Milchfettes, Polytechnisches J, (Dingler's) 1879, 232, 461) foi utilizado para criar uma curva de calibração para RMN de Baixa Ressonância. 0 teor de óleo de todas as amostras foi determinado utilizando o RMN de Baixa Ressonância (MARAN Ultra - Oxford Instrument) e seu pacote de software MultiQuant.

[00624] Análise de comprimento de Síliqua - No dia 50 da semeadura, 30 síliquas de diferentes plantas em cada lote foram amostradas no bloco A. As síliquas escolhidas foram de cor verde-amarela e foram coletadas a partir das partes inferiores de um caule de planta cultivado. Uma fotografia digital foi tirada para determinar o comprimento da síliqua.

[00625] Análise estatística - Para identificar os genes que conferem tolerância significativamente melhorada aos estresses abióticos, os resultados obtidos das plantas transgênicas foram comparados àqueles obtidos das plantas de controle. Para identificar os genes e estruturas de alto desempenho, os resultados dos eventos de transformação independentes testados foram analisados separadamente. Os dados foram analisados pelo teste t de Student e os resultados foram considerados significativos se o valor-p fosse menor que 0.1. 0 pacote de software JMP estatístico foi utilizado (Versão 5.2.1, Instituto SAS Inc., Cary, NC, EUA).

[00626] As Tabelas 113-122 resumem os fenótipos observados das plantas transgênicas que expressam de forma exógena as estruturas de gene utilizando ensaios de maturação da semente na estufa (GH-SM) em condições de baixo nitrogênio (Tabelas 113-117) ou de nitrogênio normal (Tabelas 118-122).

A avaliação de cada gene foi realizada pelo teste de desempenho de diferentes números de eventos.

O evento com valor p <0,1 foi considerado estatisticamente significativo.

Tabela 113

Genes mostrando o desempenho melhorado da planta em condições de cultivo de baixo nitrogênio sob regulação do promotor

At6669 Nome do Peso Seco {mg] Floração Surgimento de inflorescência Evento # Gene Méd, Val % Aum.

Méd.

Val % Aum.

Méd.

Val % Aum.

LNU947 77448,4 458,1 0,03 17 - - - - - LNU895 77934,1 416,9 0,10 6 - - - - - LNU895 77935,3 424,4 0,05 8 - - - - - LNU878 77252,1 474,4 0,21 21 - - - - - - LNU878 77254,3 420,6 0,07 7 - - - - - - LNU820 77806,2 431,9 0,02 10 - - - - - LNU820 77807,2 423,8 0,05 8 - - - - - LNU820 77809,1 445,6 0,22 14 - - - - - - LNU815 77494,1 425,6 0,08 9 - - - - - LNU808 77678,3 456,9 0,03 17 - - - - - LNU803 77902,2 446,9 L 14 - - - - - LNU784 77612,3 480,0 L 23 - - - - - LNU784 77615,1 429,4 0,03 10 - - - - - LNU779 77887,1 428,1 0,03 9 - - - - - LNU774 77247,4 408,5 0,25 4 - - - - - CONT. - 391,6 - - - - - - - - LNU895 77934,4 616,9 0,07 8 23.0 0,04 -5 18.3 0.21 -4 LNJ895 77935,4 - - - - - - 18.9 0.30 -1 LNU890 78202,1 616,9 0,18 8 - - - - - - LNU878 77251,3 633,1 0,19 11 23,5 0.02 -3 18.0 L -6 LNU878 77254,2 606,9 0,12 6 - - - - - - LNU838 77616,2 - - - 235 0.02 -3 - - - LNU838 77616,3 593,8 0,30 4 23.6 0.04 -2 - - - LNU838 77617,2 - - - - - - 18.5 0.02 -3 LNU838 77617,5 - - - 23.7 0.19 -2 - - - LNU811 78179,1 - - - 23.2 0.26 -4 18,4 0.01 -4 LNU808 77677,2 - - - - - 18.8 0,27 -1 LNU808 77678,3 633,8 0,12 11 22.7 0.19 -6 17.4 0.21 -9 LNU808 77679,3 - - - 23.2 0.09 -4 17.4 L -9 LNU803 77901,2 - - - 23.7 0.06 -2 - - - LNU803 77902,2 676,2 L 18 - - - - - - LNU793 78169,2 - - - 22.9 L -5 - - - LNU7B4 77615,1 - - - 23.2 0.09 -4 - - - LNU784 77615,12 - - - 23.1 0.15 -4 17.5 L -8 LNU775 77592,3 819,8 0,06 43 23.1 0.01 -5 16.6 L -13 LNU774 77246,3 678,1 0,23 18 21.4 L -12 16.6 L -13 LNU774 77247,4 587,5 0,25 3 23.1 0.17 -5 18.6 0.06 -2 LNU754 77801,2 - - - 23.1 0.15 -4 18.2 0.05 -5 CONT. - 572,3 - - 24,2 - - 19.1 - - i apeia i i.i: "L LN 1 - - Uontrole; -Med.- - Metlia; '% Aum." = % de aumento; "Val-p' - valor p; L significa que o valor-p é menor que 0,01, p<0,1 foi considerado como significativo.

Os transgenes estavam sob regulação transcricional do novo promotor A16669 (ID SEQ.

N°: 4880). Deve-se observar que um aumento negativo (em porcentagem) quando encontrado na floração ou surgimento de infiorescencia indica evasão hídrica da planta.

Tabela 114 Genes mostrando o desempenho melhorado da planta em condições de cultivo de baixo nitrogênio sob regulação do promotor At6669 Area da Lâmina Foliar Icm2J Número de Folhas Cobertura do Lote cmz Nome do Evento # Gene Méd. Val-p ° Méd. Val-p Méd. Val-p Aum. Aum. Aum. LNU895 77933,2 - - - 11,8 0,15 3 - - - LNU878 77251,3 - - - - - - 107,1 0,24 19 LNU878 77252,1 2,10 0,15 40 - - - 125,2 0,21 39 LNU878 77254,3 1,58 0,04 5 - - - 94,6 0,02 5 LNU815 77492,6 - - - 11,8 0,15 3 104,9 0,24 17 LNU815 77495,1 1,62 0,19 8 - - - 99,5 0,28 11 LNU808 77678,3 1,62 0,26 8 - - - 95,9 0,04 7 LNU803 77902,2 - - - 12,2 L B - - - LNU803 77904,4 1,78 0,15 19 - - - 105,6 L 18 LNU784 77615,7 - - - - - - 101,6 0,18 13 LNU784 77615,9 1,76 0,11 17 - - - 101,2 0,04 13 LNU779 77887,1 - - - - - - 93,5 0,25 4 LNU775 77593,3 - - - - - - 93,6 0,18 4 LNU774 77246,3 - - - 11,8 0,18 4 - - - LNU774 77247,2 - - - 11,9 0,11 5 - - - LNU756 77581,3 - - - - - - 99,9 0,06 11 LNU756 77585,4 1,55 0,18 3 - - - 94,7 0,19 5 CONT. - 1,50 - - 11,4 - - 89,8 - - LNU895 77934,4 1,74 0,07 21 - - - 108,2 0,29 19 LNU878 77251,3 1,56 0,10 8 - - - - - - LNU838 77616,3 1,54 0,29 7 - - - - - LNU811 78179,1 1,63 0,02 13 - - - 98,9 0,15 9 LNU808 77677,2 1,52 0,28 5 - - - - - - LNU808 77677,3 1,54 0,28 7 - - - - - - LNU808 77678,3 1,61 0,05 12 11,9 0,09 6 104,8 0,06 15 LNU803 77902,2 - - - 12,2 0,15 8 - - - LNU803 77904,4 - - - 11,9 0,09 6 - - - LNU793 78169,2 1,57 0,11 9 - - - - - - LNU784 77615,1 1,63 0,12 13 - - - 102,1 0,05 12 LNU775 77593,1 1,55 0,22 8 - - - - - - LNU774 77246,3 1,96 0,04 36 - - - 120,5 0,03 32 LNU769 78165,2 - - - 11,8 0,14 5 - - - CONT. - 1,44 - - 11,3 - - 91,1 - - Tabela 114: "CANT" - Controle; "Méd." - Média; '% Aum." = % de aumento; "Val-p" - valor p; L significa que o valor-p é menor que 0,01, p<0,1 foi considerado como significativo. Os transgenes estavam sob regulação transcricional do novo promotor A16669 (ID SEQ. N°: 4880).

Tabela 115 Genes mostrando o desempenho melhorado da planta em condições de cultivo de baixo nitrogênio sob regulação do promotor At6669 RGR do Número de Folhas RGR da Cobertura de Lote RGR do Diâmetro da Roseta Nome do Evento # Gene Méd. Val-p % Méd. Val-p % Méd. Val-p Aum. Aum. Aum. LNU940 7781 22,1 0,886 0,08 17 - - - - - - LNU878 77251,3 - - - 13,8 0,13 19 - - - LNUB78 77252,1 - - - 16,2 L 39 0,597 0,03 17 LNU820 77807,2 0,838 0,28 11 - - - - - -

RGR do Número de Folhas RGR da Cobertura de Lote RGR do Diâmetro da Roseta Nome do Evento # Gene Méd. Val-p Méd. Val-p Méd. Val-p Aum. Aum. Aum. LNU815 77492,6 - - - 13,7 0,16 17 - - - LNU815 77495,1 - - - - - - 0,562 0,15 10 LNU803 77902,2 0,905 0,04 19 - - - - - - LNU803 77902,3 0,855 0,22 13 - - - - - - LNU803 77904,4 - - - 13,7 0,14 18 0,570 0,09 11 LNU784 77612,3 0,905 0,08 19 - - - - - - LNU784 77615,7 - - - 13,2 0,27 13 - - - LNU784 77615,9 - - - 13,1 0,30 12 - - - LNU756 77581,3 - - - - - - 0,550 0,28 7 LNU756 77584,2 0,851 0,20 12 - - - - - - LNU754 77805,2 0,863 0,17 14 - - - - - - CONT. - 0,758 - - 11,7 - - 0,513 - - LNU895 77934,4 - - - 13,3 0,20 19 0,542 0,23 13 LNU890 78204,6 0,798 0,22 14 - - - - - - LNU811 78179,1 - - - - - - 0,542 0,23 13 LNU803 77901,2 - - - - - - 0,547 0,22 14 LNU803 77902,2 0,841 0,09 20 - - - - - LNU775 77591,2 0,798 0,23 14 - - - - - - LNU775 77593,1 - - - - - - 0,544 0,23 13 LNU774 77246,3 - - - 14,9 0,03 33 0,573 0,08 19 LNU769 78165,1 0,796 0,23 13 - - - - - - CONT. - 0,703 - - 11,2 - - 0,481 - - Tabela 115: "CONT" - Controle; "Méd." - Média; "% Aum." = % de aumento; "Val-p - valor p; L significa que o valor-p é menor que 0,01, p<0,1 foi considerado como significativo. Os transgenes estavam sob regulação transcricional do novo promotor At6669 (ID SEQ. N°: 4880).

Tabela 116 Genes mostrando o desempenho melhorado da planta em condições de cultivo de baixo nitrogênio sob regulação do promotor At6669 Índice de Colheita Área da Roseta cm Diâmetro da Roseta cm Nome do Evento # Gene Méd. Val-p Méd. Val-p Méd. Val-p Aum. Áum. Aum. LNU940 77811,5 0,458 0,18 7 - - - - - - LNU878 77251,3 - - - 13.4 0.24 19 6.05 0.10 8 LNJ878 77252,1 - - - 15.7 0.21 39 6.61 0.19 18 LNU878 77254,3 - - - 11.8 0.02 5 - - - LNU838 77616,2 0,476 0,11 11 - - - - - - LNU838 77617,2 0,472 0,07 10 - - - - - LNU820 77806,6 0,471 0,08 10 - - - - - - LNU815 77492,2 0,484 0,03 13 - - - - - - LNU815 77492,6 - - - 13.1 0.24 17 5.91 0.28 5 LNU815 77495,1 - - - 12.4 0.28 11 - - - LNU806 77678,3 - - - 12.0 0.04 7 - - - LNU808 77679,3 0,466 0,11 9 - - - - - - LNU803 77901,2 0,497 0,01 16 - - - - - - LNU803 77904,4 - - - 13.2 L 18 6.22 L 11 LNU784 77615,12 0,458 0,18 7 - - - - - - LNU784 77615,7 - - - 12.7 0.18 13 5.98 0.17 6 LNU784 77615,9 - - - 12.7 0.04 13 6.05 L B LNU779 77887,1 - - - 11.7 0.25 4 5.78 0.20 3 LNU779 77890,3 0,464 0,17 8 - - - - - - LNU777 77573,3 - - - - - - 6.02 0.14 7 LNU775 77593,3 - - - 11.7 0.18 4 - - - LNU756 77581,3 0,469 0,26 10 12.5 0.06 11 - - - LNU756 77585,3 0,452 0,28 6 - - - - - - LNU756 77585,4 - - - 11.8 0,19 5 5.86 0.03 4

Índice de Colheita Área da Roseta cm Diâmetro da Roseta [cm] Nome do Evento # Gene Méd. Val-p % Méd. Val-p % Méd. Val-p % Aum. Aum. Aum. CONT. - 0,428 - - 11.2 - - 5.61 - - LNU895 77934,4 - - - 13.5 0.29 19 6.18 0.14 11 LNU878 77251,1 0,461 0,27 6 - - - - - - LNU878 77251,3 - - - - - - 5.84 0.16 5 LNU838 77620,3 0,464 0,23 6 - - - - - - LNU811 78179,1 - - - 12.4 0.15 9 6.09 0.01 9 LNU811 78180,3 0,489 0,03 12 - - - - - - LNU808 77677,5 0,494 0,06 13 - - - - - - LNU80B 77678,3 - - - 13.1 0.06 15 5.95 0.11 7 LNU797 78021,2 0,467 0,17 7 - - - - - - LNU797 78025,3 0,485 0,22 11 - - - - - - LNU793 78169,1 0,474 0,09 8 - - - - - - LNU784 77615,1 - - - 12.8 0.05 12 6.06 0.04 9 LNU775 77593,1 - - - - - - 5.84 0.19 5 LNU774 77246,3 - - - 15.1 0.03 32 6.62 0.13 19 LNU774 77247,4 0,481 0,07 10 - - - - - - LNU770 77922,1 0,499 0,15 14 - - - - - - LNU770 77925,3 0,460 0,27 5 - - - - - LNU761 78159,1 0,473 0,10 8 - - - - - - CONT, - 0,437 - - 11.4 - - 5,58 - - Tabela 116: "CONT" - Controle; "Méd." - Média; "% Aum." = % de aumento; 'Val-p" - valor p; L significa que o valor-p é menor que 0,01, p<0,1 foi considerado como significativo. Os transgenes estavam sob regulação transcricional do novo promotor A16669 (ID SEQ. N°: 4880).

Tabela 117 Genes mostrando o desempenho melhorado da planta em condições de cultivo de baixo nitrogênio sob regulação do promotor At6669 Nome do Produção de Sementem Peso de 1000 Sementes m Evento # Gene Méd. Val % Aum. Méd. Val- % Aum. LNU947 77448,4 - - - 26,4 0.09 26 LNU878 77252,1 - - - 25.9 0.08 23 LNU878 77254,3 - - - 22.6 0.19 7 LNU841 77146,1 - - - 21.7 L 3 LNU841 77148,1 - - - 21.6 0.12 3 LNU838 77616,2 187,7 0,22 12 - - - LNU820 77807,2 - - - 22.7 0.12 8 LNU820 77809,1 - - - 24.4 0.21 16 LNU815 77494,1 - - - 23.6 0.25 12 LNU808 77678,1 180,2 0,25 8 21.5 0.25 3 LNU808 77678,3 - - - 22.8 L 9 LNU808 77679,3 182,7 0,21 9 - - - LNU803 77901,2 182,5 0,22 9 - - - LNU784 77615,1 - - - 22.7 0.07 8 LNU784 77615,9 - - - 22.3 0.13 6 LNU779 77887,1 186,2 0,10 11 - - - LNU779 77890,3 187,5 0,19 12 - - - LN1J777 77573,3 - - - 22.1 L 5 LNU774 77246,3 - - - 23.1 0.23 10 LNU770 77922,1 183,6 0,14 10 - - - LNU756 77584,6 - - - 23.0 0.09 10 CONT. - 167,4 - - 21.0 - - LNU890 78202,1 - - - 22.7 0,17 13 LNU878 77254,2 273,8 0,01 10 - - - LNU878 77254,3 - - - 20.8 L 4 LNU838 77616,3 262,1 0,13 5 - - -

Nome do Produção de Sementem Peso de 1000 Sementes m E vento # Gene Méd. Val % Aum. Méd. Val- % Aum. LNU811 78180,3 266,8 0,26 7 - - - LNU808 77678,3 - - - 20.9 0.03 4 LNU803 77902,2 - - - 21.8 0.19 9 LNU797 78025,2 - - - 21.4 0.28 7 LNU797 78025,3 266,7 0,11 7 - - - LN1J793 78169,2 262,4 0,19 5 - - - LNU775 77592,3 - - - 24.0 0.01 20 LNU774 77246,3 - - - 21.0 0.01 5 LNU774 77247,4 282,3 0,02 13 - - - CONT. - 249,0 - - 20.0 - - Tabela 117: "CANT" - Controle; "Méd. - Média; "% Aum.' = % de aumento; 'Val-p' - valor p; L significa que o valor-p é menor que 0,01, p<0,1 foi considerado como significativo. Os transgenes estavam sob regulação transcricional do novo promotor At6669 (ID SEQ. N°: 4880).

Tabela 118 Genes mostrando o desempenho melhorado da planta em condições normais de cultivo sob regulação do promotor At6669 Peso Seco ]mg] Floração Surgimento de inflorescência Nome do Evento # % % % Gene Méd. Val-p Méd. Val-p Méd. Val-p Aum. Aum. Aum.

LNU947 77446,1 - - - 17.1 0.23 -4 - - - LNU947 77447,3 - - 17.0 0.15 -5 - - - LNU947 77448,3 - - 17.0 0.15 -5 - - - LNU947 77448,4 831,9 0,14 5 17.0 0.15 -5 - - - LNU895 77935,4 893,8 0,19 13 - - - - - - LNUB78 77251,3 871,2 0,06 10 17.0 0.15 -5 - - - LNUB78 77252,1 859,4 0,03 9 17.0 0.15 -5 - - - LNUB78 77254,3 884,4 L 12 - - - - - - LNU841 77148,4 - - - 17.1 0.23 -4 - - - LNU820 77807,2 833,1 0,13 5 - - - - - - LNU815 77492,2 - - - 17.0 0.15 -5 - - - LNU808 77678,3 904,3 0,30 14 - - - - - - LNU808 77679,3 - - - 17.0 0.15 -5 - - - LNU803 77902,2 879,9 0,11 11 - - - - - - LNU803 77904,4 - - - 17.0 0,15 -5 - - - LNU784 77612,3 970,6 0,21 23 - - - - - - LNU779 77889,3 836,2 0,12 6 - - - - - - LNU777 77573,3 893,1 L 13 17.0 0.15 -5 - - - LNU777 77574,4 - - - 17.1 0.23 -4 - - - LNU774 77246,3 - - - 17,0 0.15 -5 - - - LNU774 77248,2 - - - 17.0 0.15 -5 - - - LNU756 77581,3 - - - 17.0 0.15 -5 - - - LNU756 77584,2 835,7 0,11 6 - - - - - - LNU756 77584,6 887,9 L 12 - - - - - - LNU754 77801,2 - - 17.0 0.15 -5 - - -

Peso Seco [mg] Floração Surgimento de inflorescéncia Nome do Evento # % Gene Méd. Val-p Méd. Val-p Méd. Val-p Aum. Aum. Aum.

CONT. - 791,6 - - 17.9 - - - - - LNU895 77934,4 1115,6 0,09 15 - - - - - - LNU890 78202,1 1017,5 0,19 5 - - - - - - LNU878 77251,3 1237,0 0,01 28 22.8 L -6 18.1 L -5 LNU878 77252,1 - - - 23.2 0.21 -5 17.7 0.08 -7 LNU878 77254,2 1026,6 0,24 6 23.7 0.03 -3 18.6 0.28 -2 LNU878 77254,3 1068,1 0,02 10 - - - - - - LNU841 77148,1 - - - - - - 18.5 0.29 -2 LNU838 77616,2 - - - - - - 18.7 0.10 -2 LNU838 77617,5 - - - 23,5 L -4 - - - LNU811 78179,1 - - - 23.6 0.18 -3 17.9 0.25 -6 LNU808 77678,3 - - - 22.9 L -6 17.2 0.25 -9 LNU808 77679,3 - - - 23.7 0.02 -3 18.2 0.07 -4 LNU803 77902,2 1035,0 0,07 7 - - - 18.2 0.07 -4 LNU803 77904,4 - - - 23.7 0.03 -3 - - - LNU797 78025,2 1087,7 L 12 - - - - - - LNU793 78168,1 1024,6 0,24 6 - - - - - - LNU793 78169,2 - - - 22.1 0.05 -9 17.3 0.06 -9 LNU784 77615,12 - - - 23.6 0,02 -3 17.9 0.25 -6 LNU784 77615,9 - - - - - - 18.2 0.07 -4 LNU775 77592,3 1193,1 L 23 22.7 L -7 16.6 L -13 LNU775 77593,3 - - - 23.2 0.06 -5 18.7 0.10 -2 LNU774 77246,3 1090,6 L 13 22.0 L -10 16.5 L -13 LNU774 77247,2 - - - - - - 18.8 0.27 -1 LNU774 77247,4 - - - 23.2 0.06 -5 - - - LNU761 78159,1 1029,3 0,09 6 - - - - - - LNU761 78160,7 1050,0 0,23 9 - - - - - - LNU754 77801,2 - - - 23.1 0.30 -5 - - - CONT. - 967,7 - - 24.4 - - 19.0 - - Tabela 118 'CONT" - Controle; "Méd." - Média; "% Aum." = % de aumento; °Val-p' - valor p; L significa que o valor-p é menor que 0,01, p<0,1 foi considerado como significativo. Os transgenes estavam sob regulação transcricional do novo promotor At6669 (ID SEQ. N°: 4880), Deve-se observar que um aumento negativo (em porcentagem) quando encontrado na floração ou surgimento de inftorescéncia indica evasão hidrica da planta.

Tabela 119 Genes mostrando o desempenho melhorado da planta em condições normais de cultivo sob regulação do promotor At6669 Área da Lâmina Foliar 1cm2] Número de Folhas Cobertura do Lote cm Nome do Evento # Gene Méd, Val-p % Aum. Méd. Val-p % Aum. Méd. Val-p Aum. LNU947 77448,4 - - - - - - 107,3 0,29 13 LNU940 77812,1 - - - 11,6 0,19 5 - - LNU895 77935,4 1,76 0,16 7 11,7 0,11 6 106,3 0,07 11 LNU878 77251,3 1,95 0,27 19 11,8 0,05 6 - - - LNU878 77252,1 2,01 0,18 22 - - - 117,3 0,10 23 LNU841 77146,2 - - - 11,9 0,13 8 - - - LNU820 77807,2 - - - 11,7 0,07 6 - - LNU808 77677,5 - - - 12,1 0,20 9 - - LNU803 77901,2 1,75 0,23 7 - - - - - LN U803 77902,2 - - - 11,9 0,02 8 - -

Area da Lâmina Foliar Fçp1 Número de Folhas Cobertura do Lote cmz Nome do Evento # Gene Méd. Val-p % Aum. Méd. Val-p % Aum. Méd. Val-p Aum. LNU803 77904,4 - - - 12,1 0,20 9 - - - LNU777 77573,3 1,85 0,19 12 11,6 0,11 5 108,5 0,26 14 LNU777 77574,4 - - - 11,8 0,29 7 - - - LNU775 77593,3 - - - 11,6 0,19 5 - - LNU774 77247,2 - - 11,6 0,19 5 - - LNU770 77922,1 - - - 11,4 0,30 3 - - LNU770 77925,3 - - - 11,4 0,30 3 - - LNU756 77585,3 - - - 12,1 0,05 10 - - - LNU754 77801,2 - - - - - - 102,1 0,21 7 LNU754 77802,2 - - - - - - 105,1 0,25 10 CONT. - 1,64 - - 11,1 - - 95,3 - - LNU878 77251,3 1,86 0,03 21 11,8 0,10 8 115,4 0,03 23 LNU878 77252,1 1,74 0,13 13 - - - 108,2 0,13 15 LNU83S 77616,3 - - - 11,2 0,17 3 - - - LNU838 77620,3 - - - 11,4 0,07 4 - - LNU808 77679,3 - - - 11,5 0,05 5 - - LNU803 77902,3 - - - 11,3 0,24 4 - - LNU784 77615,1 - - - 12,0 0,15 10 - - - LNU775 77592,3 1,94 0,20 26 - - - 115,8 0,11 23 LNU774 77246,3 2,07 0,02 34 12,1 L 11 132,2 0,09 41 LNU774 77247,4 - - - 11,2 0,23 3 - - - CONT. - 1,54 - - 10,9 - - 94,0 - - Tabela 119: "CONT" - Controle; "Méd.' - Média; "% Aum.° = % de aumento; "Val-p" - valor p; L significa que o valor-p é menor que 0,01, p<0,1 foi considerado como significativo. Os transgenes estavam sob regulação transcricional do novo promotor At6669 (ID SEQ. N°: 4880).

Tabela 120 Genes mostrando o desempenho melhorado da planta em condições normais de cultivo sob regulação do promotor At6669 RGR da Cobertura do Lote RGR do Diâmetro da Roseta RGR do Número de Folhas Nome do cm2/dia cmldia Evento # Gene Méd. Val- % Méd. Val- ° Méd. Val- % p Aum. p Aum. p Aum. LNU947 77446,1 0,846 0,15 20 - - - - - - LNU947 77448,4 0,879 0,09 25 - - - - - - LNU940 77811,2 0,810 0,28 15 - - - - - - LNU878 77251,1 0,813 0,28 16 - - - - - LNU878 77251,3 - - - 15,5 0,11 25 - - - LNU878 77252,1 - - - 15,2 0,12 23 - - - LNU841 77146,2 0,845 0,16 20 - - - - - LNU838 77620,3 0,818 0,24 16 - - - - - - LNU820 77807,2 0,889 0,06 27 - - - - - LNU808 77677,5 0,854 0,13 22 - - - - - - LNU803 77902,2 0,913 0,03 30 - - - - - - LNU803 77903,1 0,827 0,21 18 - - - - - - LNU779 77887,3 0,817 0,25 16 - - - - - - LNU777 77574,4 0,843 0,15 20 - - - - - - LNU775 77591,2 0,818 0,26 17 - - - - - LNU774 77247,2 - - - 15,9 0,09 28 0,632 0,21 13 LNU770 77925,3 0,811 0,26 16 - - - - - LNU756 77585,3 0,859 0,12 22 - - - - - - CONT. - 0,702 - - 12,4 - - 0,558 - - LNU959 78222,8 0,790 0,23 17 - - - - - - LNU878 77251,3 - - - 14,2 0,22 21 - - - LNU878 77254,2 0,803 0,16 19 - - - - - - LNU811 78179,1 0,782 0,26 16 - - - - - - LNU803 77901,2 0,820 0,12 21 - - - - - - LNU797 78022,1 0,811 0,12 20 - - - - - -

RGR da Cobertura do Lote RGR do Diâmetro da Roseta RGR do Número de Folhas Nome do cmzldia cm/dia Evento # Gene Méd. Val- % Méd. Val- ~7° Méd. Val-p p Aum. p Aum. p Aum. LNU797 78025,3 0,822 0,13 22 - - - - - - LNU793 78168,1 0,790 0,23 17 - - - - - - LNU793 78169,2 - - - 14,3 0,28 22 - - - LNU784 77612,3 0,781 0,22 16 - - - - - - LNU784 77615,1 0,784 0,25 16 - - - - - - LNU775 77592,3 - - - 14,3 0,21 22 - - - LNU774 77246,3 - - - 16,5 0,03 40 0,588 0,20 16 LNU774 77247,2 0,812 0,13 20 - - - - - - LNU761 78159,1 0,775 0,27 15 - - - - - - LNU754 77801,2 0,799 0,19 18 CONT. - 0,675 - - 11,7 - - 0,508 - - Tabela 120: "CONT" - Controle; "Méd." - Média; "% Aum." = % de aumento; 'Val-p" - valor p; L significa que o valor-p é menor que 0,01, p<0,1 foi considerado como significativo. Os transgenes estavam sob regulação transcricional do novo promotor At6669 (ID SEQ. N°: 4880).

Tabela 121 Genes mostrando o desempenho melhorado da planta em condições normais de cultivo sob regulação do promotor At6669 Índice de Colheita Area da Roseta cm Diâmetro da Roseta cm Nome do Evento # Gene Méd. Val- % Méd. Val- % Méd, Val- % p Aum. p Aum. p Aum. LNU947 77448,4 - - - 13.4 0.29 13 - - - LNU940 77812,4 0,500 0,05 7 - - - - - - LNU895 77935,4 - - - 13.3 0.07 11 6.22 0.09 5 LNU878 77252,1 - - - 14.7 0.10 23 6.58 0.21 12 LNJ838 77616,2 0,504 0,02 8 - - - - - - LNJ815 77492,2 0,482 0,28 3 - - - - - - LNU808 77677,3 0,488 0,30 5 - - - - - - LNU808 77678,1 0,497 0,05 6 - - - - - - LNU803 77904,4 0,489 0,29 5 - - - - - - LNU784 77615,12 0,505 0,02 8 - - - - - LNU779 77887,1 0,512 0,08 10 - - - - - - LNU777 77573,3 - - - 13.6 0.26 14 6.41 0.19 9 LNU775 77591,2 0,503 0,28 8 - - - - - - LNU775 77593,3 0,503 0,03 8 - - - - - - LNU775 77595,1 0,509 0,01 9 - - - - LNU770 77922,4 0,499 0,08 7 - - - - - - LNU756 77585,4 0,491 0,19 5 - - - - - LNU754 77801,2 0,506 0,26 8 12,8 0.21 7 6.26 0.07 6 LNU754 77802,2 - - - 13.1 0.25 10 - - - CONT. - 0,467 - - 11.9 - - 5.90 - - LNU959 78224,4 0,527 0,08 22 - - - - - - LNU895 77933,2 0,483 0,07 12 - - - - - - LNU890 78204,4 0,508 0,07 18 - - - - - - LNU890 78204,8 0,519 0,12 20 - - - - - - LNU878 77251,3 - - - 14.4 0.03 23 6.46 0.03 12 LNU878 77252,1 - - - 13.5 0.13 15 6.18 0.08 7 LNU878 77254,2 0,480 0,14 11 - - - - - - LNU811 78176,8 0,481 0,04 11 - - - - - - LNU808 77677,5 0,498 0,07 15 - - - - - - LNU803 77902,3 0,471 0,08 9 - - - - - - LNU803 77903,1 0,464 0,21 7 - - - - - - LNU793 78166,4 0,483 0,03 12 - - - - - - LNU775 77592,3 - - - 14.5 0.11 23 6.46 0.27 12 LNU775 77593,1 0,500 0,19 16 - - - - - - LNU774 77246,3 - - - 16.5 0.09 41 6.75 0.03 17 LNU769 78163,4 0,467 0,19 8 - - - - - -

índice de Colheita Area da Roseta cm Diâmetro da Roseta cm Nome do Evento # Gene Méd. Val-p Méd. Val-p °7o Méd. Val-p °fio Aum. Aum. Aum. LNU769 78165,1 0,481 0,04 11 - - - - - - LNU761 78157,1 0,533 L 23 - - - - - - LNU761 78157,6 0,515 L 19 - - - - - - LNU761 78160,7 0,471 0,09 9 - - - - - - LNU754 77801,1 0,490 0,08 13 - - - - - LNU754 77802,2 0,492 0,02 14 - - - - - - LNU754 77804,1 0,491 0,20 14 - - - - - - CONT. - 0,432 - - 11.7 - - 5.75 - - Tabela 121: "CONT" - Controle; "Méd." - Média; "% Aum." = % de aumento; "Val-p - valor p; L significa que o valor-p é menor que 0,01, p<0,1 foi considerado como significativo. Os transgenes estavam sob regulação transcricional do novo promotor At6669 (ID SEC. N°: 4880).

Tabela 122 Genes mostrando o desempenho melhorado da planta em condições normais de cultivo sob regulação do promotor At6669 Nome do Produção de Sementem Peso de 1000 Sementes m E vento # Gene Méd. Val % Aum. Méd. Val- % Aum. LNU947 77447,3 409,8 0,09 11 - - - LNU947 77448,4 - - - 25.7 0.10 16 LNU895 77933,2 - - - 23.5 0.06 6 LNU895 77935,3 - - - 23.6 0.27 6 LNU878 77251,3 - - - 25.2 0.24 13 LNU878 77254,3 414,6 0,21 12 25.0 L 12 LNU820 77807,2 - - - 25.2 L 13 LNU820 77809,1 - - - 25.3 0.12 13 LNUS15 77494,1 - - 24.7 0.03 11 LNU815 77495,3 406,0 0,14 10 - - - LNU808 77678,3 - - - 24.5 0.22 10 LNU803 77901,2 395,8 0,20 7 - - - LNU803 77902,2 - - - 24.9 L 12 LNU784 77612,3 - - - 23.4 0.04 5 LNU784 77615,1 - - - 25.2 L 13 LNU784 77615,9 - - - 23.1 0.10 4 LNU779 77887,1 407,7 0,07 10 22.8 0.25 2 LNU777 77573,3 - - - 27.4 L 23 LNU775 77595,1 413,4 0,10 12 - - - LNU774 77246,3 - - - 24.0 0.02 8 LNU774 77247,2 406,2 0,08 10 - - - LNU756 77584,6 - - - 24.5 0.01 10 CONT. - 370,6 - - 22.3 - - LNU959 78224,4 471,4 0,22 13 - - - LNU895 77934,4 - - - 24.3 0.03 16 LNU895 77935,3 - - - 22.6 0.03 7 LNU890 78202,1 - - - 22.2 0.04 5 LNU890 78204,4 488,9 0,07 17 - - - LNU890 78204,8 560,4 0,05 34 - - - LNU878 77251,3 - - - 24.3 0.18 15 LNU878 77252,1 - - - 25.4 0.08 21 LNU878 77254,2 493,1 0,20 18 - - - LNU878 77254,3 - - - 23.1 0.27 10 LNU811 78176,8 478,0 0,29 14 - - - LNU797 78021,4 445,1 0,25 7 - - - LNU797 78025,2 - - - 25.2 0.06 20 LNU797 78025,3 - - - 21.6 0.23 3 LNU793 78168,1 - - - 23.3 L 11 LNU784 77615,1 - - - 22.5 0.01 7 LNU775 77592,3 - - - 26.2 L 25 LNU774 77246,3 - - - 22.4 0.22 6

Nome do Produção de Semento m Peso de 1000 Sementes m E vento # Gene Méd. Val % Aum. Méd. Val- % Aum. LNJ774 77249,1 - - - 23.1 L 10 LNU761 78157,1 495,8 0,12 19 - - - LNU761 78157,6 475,0 0,08 14 - - LNU761 78159,1 466,0 0,26 12 - - - LNU761 78160,7 493,9 0,01 18 - - - CONT, - 417,6 - - 21,0 - - i apeia i: -bUN V - Lontroie; -mea.— - media; "% Aum." = Ìo de aumento; 'Vai-p - valor p; L significa que o valor-p e menor que 0,01, p<0,1 foi considerado como significativo. Os transgenes estavam sob regulação transcricional do novo promotor At6669 (ID SEQ. N°: 4880).

EXEMPLO 18 AVALIAÇÃO DE NUE, PRODUÇÃO E TAXA DE CRESCIMENTO DA PLANTA DE

ARABIDOPSIS TRANSGÊNICA SOB FERTILIZAÇÃO NORMAL E DE BAIXO NITROGÊNIO EM ENSAIOS DE ESTUFA

[00627] Ensaio 2: Eficiência no Uso de Nitrogênio medida até o estágio de peneiração: biomassa da planta e taxa de crescimento da planta em concetração de nitrogênio ideal e limitada sob condições da estufa - Esse ensaio segue a formação da biomassa da planta e o crescimento da área de roseta de plantas cultivadas em estufa sob condições de cultivo limitantes e não limitantes de nitrogênio. As sementes transgênicas de Arabidopsis foram semeadas em meio de ágar suplementado com de meio MS e um agente de seleção (Canamicina). As mudas transgênicas T2 foram, então, transplantadas para bandejas de 1,7 litro preenchidas com turfa e perlita em uma proporção de 1:1. As bandejas foram irrigadas com um a solução contendo condições limitantes de nitrogênio que foram obtidas irrigando as plantas com uma solução contendo 1,5 mM de nitrogênio inorgânico na forma de KNO3, suplementadas com 1 mM de KH2PO4, 1 mM de MgSO4, 3,6 mM de KC1, 2 mM de CaC12 e microelementos, enquanto níveis normais de nitrogênio foram obtidos aplicando uma solução de 6 mM de nitrogênio inorgânico também na forma de KNO3 com 1 mM de

KH2PO4, 1 mM de MgSO4, 2 mM de CaC12 e microelementos. Todas as plantas foram cultivadas em estufa até o estágio de peneiração. A biomassa da planta (o tecido acima da terra) foi pesada indiretamente após colher a roseta (peso fresco da planta [FW]). Em seguida, as plantas foram secadas em um forno a 50°C por 48 horas e pesadas (peso seco da planta [DW]).

[00628] Cada estrutura foi validada em sua geração T2. As plantas transgênicas transformadas com uma estrutura conformada por um vetor vazio carregando o promotor 35S e o marcador selecionável foram utilizadas como controle.

[00629] As plantas foram analisadas com relação ao seu tamanho total, taxa de crescimento, peso fresco e matéria seca. 0 desempenho das plantas transgênicas foi comparado para controlar as plantas cultivadas em paralelo nas mesmas condições. As plantas transgênicas falsas expressando o gene repórter uidA (GUS-Intron) ou sem nenhum gene, no mesmo promotor foram utilizadas como controle.

[00630] 0 experimento foi planejado na distribuição de lote aleatório aninhado. Para cada gene da invenção, três a cinco eventos de transformação independentes foram analisados a partir de cada estrutura.

[00631] Formação de imagem digital - Um sistema de aquisição de imagem de laboratório, consistindo de um câmera de reflexo digital (Canon EOS 300D) anexada com uma lente de comprimento focal de 55 mm (Canon série EF-S), montada em um dispositivo de reprodução (Kaiser RS), o qual inclui 4 unidades de luz (lâmpadas 4 x 150 Watts) foi utilizado para capturar imagens de amostras de planta.

[00632] 0 processo de captura de imagem foi repetido a cada 2 dias, começando no dia 1 após transplante até o dia 15. A mesma câmera, colocada em uma montagem de ferro personalizada, foi utilizada para capturar imagens de plantas maiores encerradas em cubas brancas em uma estufa controlada pelo ambiente. As cubas eram de formato quadrado e incluem bandejas de 1,7 litro. Durante o processo de captura, as cubas foram colocadas abaixo da montagem de ferro, enquanto evitavam a luz solar direta e fundição das sombras.

[00633] Um sistema de análise de imagem foi utilizado, consistindo de um computador pessoal (processador Intel P4 3.0 GHz) e um programa de domínio público - ImageJ

1.39 [programa de processamento de imagem com base em Java, desenvolvido nos Institutos Nacionais de Saúde dos Estados Unidos e livremente disponibilizado na internet em rsbweb (ponto) nih (ponto) gov/]. As imagens foram capturadas em resolução de 10 Mega Pixels (3888 x 2592 pixels) e armazenadas em um formato JPEG de baixa compressão (Joint Photographic Experts Group standard). Em seguida, os dados analisados foram salvos em arquivos de texto e processados utilizando o software JMP de análise estatística (instituto SAS).

[00634] Análise da Folha - Utilizando a análise digital, os dados das folhas foram calculados, incluindo o número da folha, área de roseta, diâmetro da roseta e área da lâmina foliar.

[00635] Taxa de crescimento vegetal: a taxa de crescimento relativo (RGR) do número de folha (Fórmula VIII, descrita acima), área da roseta (Fórmula IX descrita acima)

e cobertura de lote (Fórmula XI, descrita abaixo) foram calculados utilizando as fórmulas indicadas.

[00636] Peso seco e fresco da planta - Por volta do dia 80 a partir da semeadura, as plantas foram colhidas e diretamente pesadas para determinação do peso fresco da planta (FW) e deixadas secar a 50°C em uma câmara de secagem por cerca de 48 horas antes da prensagem para determinar o peso seco da planta (DW).

[00637] Análises Estatísticas - Para identificar os genes que conferem uma significativa melhoria na tolerância ao estresse abiótico, os resultados obtidos a partir de plantas transgênicas foram comparados àqueles obtidos a partir de plantas de controle. Para identificar os genes e estruturas de alto desempenho, os resultados dos eventos testados de transformação independentes foram analisados separadamente. Os dados foram analisados utilizando teste t de Student e os resultados são considerados significativos se o valor p for menor que 0,1. 0 pacote de software LIMP estatístico foi utilizado (Versão 5.2.1, Instituto SAS Inc., Cary, NC, EUA).

[00638] Os genes listados nas Tabelas 123-124 melhoraram a NUE da planta quando cultivada em níveis de concentração limitantes de nitrogênio. Esses genes produziram plantas maiores com uma área fotossintética e biomassa maiores (peso fresco, peso seco, número de folhas, diâmetro da roseta, área de roseta e cobertura de lote) quando cultivadas sob condições limitantes de nitrogênio (estresse por deficiência de nutriente), comparado às plantas de controle cultivadas em condições de cultivo idênticas.

Tabela 123 Genes mostrando a produção de biomassa melhorada da planta em condições de cultivo limitantes de nitrogênio Peso Seco m Peso Fresco m Número de Folhas Nome do Evento # Gene Méd, Val-p Méd. Val -p Méd. Val -p Aum. Aum. Aum, LNU952 78218,1 - - - 112,5 0,05 26 - - - LNU952 78218,3 - - - 106,2 0,18 19 - - - LNU952 78218,6 - - - 100,0 0,29 12 - - - LNU952 78219,3 - - - 118,8 0,04 33 - - - LNU945 78998,2 - - - - - - 10,9 0,13 6 LNU945 78999,1 - - - 100,0 0,29 12 - - - LNU920 78507,1 - - - 106,2 0,18 19 - - - LNU920 78508,1 - - - 112,5 0,27 26 - - - LNU920 78508,2 - - - 112,5 0,05 26 - - - LNU916 78208,3 - - 106,2 0,18 19 - - - LNU914 80516,2 - - - 127,7 0,18 43 - LNU911 80420,3 - - - 106,2 0,18 19 - - - LNU911 80420,5 - - - - - - 10,4 0,22 1 LNU905 79674,3 - - - 112,5 0,05 26 - - - LNU905 79674,4 - - - 106,2 0,18 19 - - - LNU905 79675,3 - - - 118,8 0,04 33 - - - LNU844 80342,4 - - - 106,2 0,18 19 - - - LNU840 78676,1 - - - 106,2 0,18 19 - - - LNU840 78676,4 11,2 L 54 131,2 0,23 47 - - - LNU840 78763,6 9,38 0,09 29 106,2 0,18 19 - - - LNU832_H2 80602,1 - - - 106,2 0,18 19 - - - LNU832_H2 80604,2 - - - 106,2 0,18 19 - - - LNU832_H2 80605,1 - - - 107,1 0,19 20 10,6 0,05 3 LNU819 78133,3 8,75 0,06 20 - - - - - - LNU801 78585,2 - - - 100,0 0,29 12 - - - LNU791 77893,2 - - - 106,2 0,18 19 - - - LNU791 77895,2 - - - 100,0 0,29 12 - - - LNU760_H1 80127,2 - - - 131,2 0,23 47 - - - CONT, - 7,29 - - 89,6 - - 10,3 - - LNU966 78605,5 102,5 0,01 20 968,8 0,11 16 12,6 L 13 LNU966 78605,7 94,4 0,14 10 - - - 11,5 0,14 3 LNU941 78611,1 - - - - - - 11,7 0,02 5 LNU941 78613,1 105,0 L 23 1050,0 L 26 - - - LNU941 78613,5 92,5 0,13 8 937,5 0,05 12 - - - LNU941 78615,3 91,2 0,20 7 - - - 12,2 0,29 10 LNU925 78991,5 - - - - - - 12,1 0,24 8 LNU925 78992,1 - - - - - - 11,8 0,17 6 LNU925 78992,6 - - - 951,8 0,04 14 - - - LNU922 78290,1 - - - 956,2 0,29 14 - - - LNU918 78433,1 - - - - - - 11,6 0,06 4 LNU918 78433,2 99,4 0,02 16 906,2 0,22 8 11,8 0,17 6 LNU918 78433,3 98,1 0,02 15 - - - - - - LNU918 78433,8 - - - 975,0 0,01 17 12,1 L 8 LNU918 78434,2 93,1 0,19 9 925,0 0,07 11 - - - LNU915 78426,1 107,5 0,20 26 1025,0 0,03 23 - - - LNU915 78427,1 101,4 0,28 19 964,3 0,07 15 - - - LNU915 78428,1 108,1 0,03 26 1056,2 L 26 12,6 L 13 LNU915 78428,2 - - - 931,2 0,29 11 11,6 0,07 4 LNU909 78424,3 91,2 0,20 7 - - - 11,8 0,03 6

Peso Seco Im1 Peso Fresco m Número de Folhas Nome do Evento # Gene Méd, Val-p Méd, Val-p Méd.

Val-p Aum.

ÁUm Aum.

LNU909 78425,4 - - - 943,8 0,04 13 - - - LNU909 78425,5 118,1 0,07 38 1062,5 L 27 12,7 L 14 LNU909 78425,7 90,6 0,24 6 - - - - - - LNU890 78202,1 - - - - - - 12,4 L 12 LNU854 78236,1 93,1 0,19 9 - - - - - - LNU854 78236,3 - - 885,7 0,28 6 - - - LNU854 78238,1 91,9 0,16 7 - - - 11,8 0,22 6 LNU854 78240,1 - - - - - - 11,6 0,23 4 LNU849 78498,3 - - - 968,8 0,02 16 - - - LNU849 78498,4 - - - 1018,8 0,02 22 - - - LNU849 78499,1 93,8 0,08 10 - - - - - - LNU849 78500,1 - - - 893,8 0,23 7 - - - LNU849 78500,3 - - - - - - 12,2 0,29 10 LNU830 78741,1 - - - 918,8 0,16 10 - - - LNU830 78741,3 - - - 925,0 0,18 11 11,4 0,15 3 LNU830 78741,5 - - - - - - 13,2 0,27 19 LNU824 77826,1 100,0 0,02 17 956,2 0,02 14 12,6 0,28 13 LNU824 77827,2 110,2 0,12 29 974,1 0,01 17 11,6 0,07 4 LNU824 77828,4 - - - 925,0 0,07 11 11,8 0,22 6 LNU824 77829,3 103,1 0,28 21 950,0 0,11 14 11,5 0,08 3 LNU822 78623,2 108,8 0,14 27 1062,5 0,14 27 11,9 L 7 LNU822 78623,6 115,6 L 35 1056,2 0,03 26 12,1 L 8 LNJ822 78623,7 - - - - - - 12,2 0,06 10 LNU822 78625,7 91,2 0,19 7 - - - - - - LNU813 77681,3 94,4 0,14 10 918,8 0,10 10 - - - LNU813 77682,3 97,5 0,02 14 881,2 0,30 5 - - - LNU813 77685,1 - - - 918,8 0,08 10 - - - LNU813 77685,2 95,6 0,19 12 - - - - - - LNUB06 78512,7 98,1 0,20 15 918,8 0,10 10 - - - LNU806 78514,2 - - - 987,5 0,30 18 12,8 0,16 15 LNU806 78515,3 98,8 0,15 15 - - - - - - LNU806 78515,4 - - - 950,0 0,05 14 12,5 0,19 12 LNU806 78515,5 95,6 0,27 12 1037,5 0,12 24 12,5 0,25 12 LNU802 80307,3 94,4 0,08 10 - - - - - - LNU802 80309,2 - - - - - - 11,5 0,14 3 LNU802 80309,3 101,9 0,25 19 943,8 0,04 13 11,6 0,06 4 INU802 80310,1 93,1 0,12 9 975,0 0,01 17 - - - INU779 77887,2 111,2 0,30 30 975,0 0,01 17 12,2 L 10 LNU779 77889,3 90,0 0,29 5 - - - - - - LNU761 78157,1 99,1 0,23 16 983,0 0,10 18 - - - LNU761 78157,6 96,2 0,06 13 925,0 0,07 11 - - - LNU761 78160,3 104,4 0,21 22 - - - 12,6 0,07 13 CONT. - 85,5 - - 835,7 - 11,1 - - LNU970 78389,7 - - - - - - 9,88 0,02 6 LNU970 78389,8 - - - - - - 10,2 0,04 9 LNU968 77919,4 - - - - - - 9,62 0,21 3 LNU950 78913,4 - - - - - - 9,56 0,22 3 LNU934 79007,5 - - - - - - 9,69 0,08 4 LNU934 79008,3 - - - - - 9,56 0,22 3 LNU908 79736,2 - - - - - - 9,56 0,22 3 LNU908 79738,5 - - - - - - 9,56 0,22 3 LNU843 78962,4 - - - - - 9,81 0,15 5 LNU843 78963,2 - - - - - - 9,62 0,21 3 LNU790 78886,2 - - - - - - 10,8 0,30 15 LNU790 78886,3 - - - - - - 9,69 0,24 4 LNU790 78890,3 - - - - - 9,62 0,21 3 CONT. - - - - - - - 9,32 - - LNU966 78604,1 275,0 0,06 8 3195,8 0,05 12 - - - LNU966 78605,5 - - - - - - 11,8 0,26 8 LNU942 77243,2 - - - - - - 11,6 L 6

Peso Seco m Peso Fresco m Número de Folhas Nome do Evento # Gene Méd, Val Méd.

Val- 0 Méd.

Val- A -p Aum. p Aum. p Aum.

LNU941 78611,1 272,1 0,14 7 3107,1 0,13 9 - - - LNU941 78614,2 - - - - - - 11,3 0,09 4 LNU941 78615,3 280,0 0,01 10 3150,0 L 11 - - - LNU922 78287,3 276,6 0,19 8 3225,9 0,06 13 11,8 0,10 8 LNU922 78287,5 275,4 0,25 8 - - - - - - LNU922 78290,1 - - - 3121,4 L 10 - - - LNU922 78290,7 - - - 3031,2 0,28 7 - - - LNU915 78426,1 - - - 2937,5 0,23 3 - - - LNU915 78427,1 - - - - - - 11,8 0,10 8 LNU915 78428,1 - - - 3191,1 0,25 12 11,6 0,14 6 LNU915 78428,2 - - - - - - 11,6 0,01 6 LNU909 78424,3 267,1 0,23 5 - - - - - - LNU909 78425,5 266,9 0,13 5 3088,4 0,01 9 - - - LNU909 78425,7 273,1 0,02 7 3031,2 0,09 7 - - - LNU868 77621,5 - - - - - - 11,5 0,02 5 LNU854 78237,2 - - - - - - 11,8 0,26 8 LNU854 78238,1 - - - 3093,8 0,11 9 - - - LNU830 78741,3 - - - - - - 11,3 0,18 3 LNU830 78741,5 - - - - - - 11,2 0,23 2 LNU824 77826,1 266,2 0,16 4 - - - - - - LNU824 77827,3 266,2 0,11 4 3000,0 0,07 6 - - - LNU824 77829,3 - - - 2987,5 0,09 5 11,6 0,27 6 LNU822 78623,7 - - 3032,1 0,04 7 - - - LN 0822 78625,2 - - - 3012,5 0,06 6 - - - LNU813 77681,3 - - - - - - 11,6 0,02 6 LNU813 77681,4 - - - - - - 11,6 0,09 6 LNU806 78514,2 - - - - - - 12,1 0,10 10 LNU806 78515,3 - - - 3031,2 0,04 7 11,6 0,02 6 LNU806 78515,5 - - - 2992,9 0,08 5 - - - LNU759 77236,8 - - - 2950,0 0,18 4 - - - LNU751 77477,1 - - - - - - 12,0 0,25 10 LNU751 77480,1 3118,8 0,20 10 - - - CONT. - 255,1 - - 2842,4 - - 10,9 - - LNU948 78378,1 83,1 0,02 17 - - - - - - LNU948 78380,2 84,8 0,02 19 - - - - - - LNU921 79063,2 78,6 0,16 10 628,6 0,22 12 - - - LNU888 78771,1 84,4 0,06 18 - - - 12,2 L 9 LNU888 78772,7 - - - - - - 11,8 0,06 5 LNU881 78372,2 79,4 0,04 11 650,0 0,07 16 - - - LNU857 78867,1 77,2 0,11 8 627,7 0,15 12 - - - LNU816 78958,4 78,8 0,12 11 618,8 0,22 10 - - - LNU816 78958,5 91,2 L 28 693,8 0,02 23 - - - LNU816 78958,7 90,0 L 26 718,8 0,01 28 - - - LNU809 79168,2 - - - 618,8 0,19 10 - - - LNU809 79168,3 79,4 0,15 11 618,8 0,19 10 11,5 0,23 3 INU807 79248,1 - - - 625,0 0,15 11 - - - LNU788 78516,1 86,7 L 22 660,7 0,05 17 - - - LNU788 78517,2 76,2 0,14 7 637,5 0,11 13 - - - LNU788 78518,1 87,5 L 23 693,8 0,02 23 - - - LNU783 79178,2 80,0 0,03 12 650,0 0,07 16 - - - LNU778 78941,1 81,9 0,02 15 637,5 0,10 13 - - - LNU778 78944,2 - - - - - - 11,5 0,28 3 LNU762 79329,2 78,1 0,10 10 612,5 0,24 9 - - - LNU752 78153,10 92,5 0,04 30 700,0 0,03 24 11,6 0,30 4 LNU752 78155,2 82,2 0,11 15 - - - - - - CONT. - 71,2 - - 562,5 - - 11,2 - - LNU977 78032,1 162,5 0,16 11 11,6 0,08 2 LNU977 78033,1 167,5 0,29 15 - - - - - - LNU958 77687,7 165,0 0,19 13 - - - - - - LNU958 77689,2 178,8 0,02 22 1450,0 0,21 12 - - -

Peso Seco m Peso Fresco m Número de Folhas Nome do Evento # Gene Méd, Val-p °7o Méd.

Va!-p °70 Méd.

Val-p °70 Aum.

Aum.

LNU933 78897,1 168,1 0,19 15 - - - - - - LNU907 78872,8 162,1 0,17 11 - - - - - - LNU882 78973,1 - - - - - - 11,8 0,10 4 LNU880 78196,1 180,6 0,01 24 1503,6 0,13 16 - - - LNU880 78197,4 167,9 0,08 15 - - - - - - LNU880 78200,6 197,9 L 35 1456,2 0,24 13 11,6 0,19 2 LNU871 78195,4 - - - - - - 12,2 L 7 LNU848 77909,2 170,0 0,06 16 - - - - - - LNU848 77909,3 178,1 0,14 22 1450,0 0,23 12 - - - LNU847 78967,2 197,5 0,02 35 1543,8 0,09 19 12,2 0,22 8 LNU847 78967,4 - - - - - - 11,9 L 5 LNU846 78436,2 - - - - - 12,4 0,09 9 LNU846 78438,2 184,4 0,13 26 - - - 11,9 0,23 5 LNU846 78439,2 - - - - - - 11,6 0,21 2 LNU846 78439,4 - - - - - 12,1 0,08 6 LNU845 78917,3 194,2 0,10 33 1520,8 0,19 18 - - - LNU845 78917,6 173,1 0,16 18 - - - - - - LNU835 78186,2 204,4 0,27 40 1506,2 0,21 16 - - - LNU828 77598,3 193,8 0,29 33 - - - 12,2 0,11 8 LNU823 78122,2 178,1 0,02 22 - - - - - - LNU823 78136,4 166,2 0,12 14 - - - - LNU823 78139,1 174,5 0,03 19 - - - - - - LNU814 78953,2 179,4 0,02 23 1500,0 0,13 16 - - - LNU814 78953,3 177,5 0,02 21 - - - 11,9 0,05 5 LNU814 78954,1 - - - - - - 12,1 0,23 6 LNU814 78955,4 188,8 L 29 1493,8 0,14 15 - - - LNU772 78938,1 - - - - - - 12,0 0,03 6 LNU772 78940,2 - - - - - - 11,8 0,17 4 LNU757 77485,4 210,6 0,02 44 1612,5 0,06 25 - - - CONT. - 146,2 - - 1293,4 - - 11,4 - - LNU972 78907,1 - - - - - - 11,7 0,08 6 LNU972 78908,2 - - - - - - 11,9 0,05 9 LNU972 78909,3 - - - - - - 11,9 0,03 9 LNU972 78910,2 - - 3500,9 0,13 21 - - - LNU961 79143,3 350,0 0,04 16 3556,2 0,07 23 11,6 0,14 5 LNU961 79145,3 - - - 3562,5 0,02 23 11,8 0,15 8 LNU958 77687,2 - - - - - - 12,7 0,25 16 LNU958 77687,5 - - - - - - 12,1 0,02 10 LNU958 77689,1 3200,0 0,20 10 12,2 L 12 LNU958 77689,2 - - - - - - 11,6 0,28 5 LNU948 78379,4 - - - - - - 12,1 0,04 10 LNU948 78380,2 380,6 0,04 27 3618,8 0,01 25 12,3 0,05 12 LNU948 78380,3 358,1 0,24 19 3618,8 0,12 25 - - - LNU921 79061,1 - - - 3163,4 0,26 9 - - - LNU921 79063,2 - - - - - 12,0 0,14 9 LNU921 79064,3 - - - - - - 11,4 0,28 4 LNU913 78592,4 - - - - 11,9 0,20 9 LNU913 78593,1 - - - - - - 12,1 0,03 10 LNU913 78593,6 - - - - - - 12,0 0,14 9 LNU912 78403,2 - - - - - - 12,4 L 13 LNU912 78404,1 342,5 0,28 14 - - - 11,7 0,08 6 LNU888 78772,1 - - - - - - 11,9 0,05 9 LNUB8B 78772,2 - - - - - 11,8 0,07 8 LNU888 78772,7 - - - - - - 11,6 0,12 6 LNU881 78372,2 - - - - - - 12,5 0,06 14 LNU881 78373,1 344,4 0,04 15 - - - 12,0 0,14 9 LNU881 78373,2 - - - - - - 12,3 0,05 12 LNU881 78374,1 343,3 0,27 14 - - - - - - LNU823 78136,1 353,8 0,01 18 3318,8 0,09 15 - - - LNU823 78136,4 - - - - - - 12,4 0,04 13

Peso Seco m Peso Fresco m Número de Folhas Nome do Evento # Gene Méd, Val-p Méd.

Val-p Méd.

Val-p Aum Aum.

Aum.

LNU823 78137,3 - - - - - - 11,5 0,27 5 LNU823 78139,1 397,1 0,08 32 - - - - - - LNU816 78957,1 - - - - - - 11,6 0,12 6 LNU816 78958,4 - - - - - - 11,9 0,03 9 LNU816 78958,7 - - - - - - 12,8 0,04 16 LNU809 79168,3 - - - - - - 11,6 0,14 5 LNU809 79169,2 - - - 3212,5 0,19 11 11,6 0,14 5 LNU782 77441,1 350,0 0,17 16 - - - - - - LNU782 77444,10 - - - - - - 11,6 0,14 5 LNU782 77444,9 - - - - - - 12,1 0,08 10 LNU772 78937,4 335,6 0,13 12 3468,8 0,05 20 - - - LNU772 78938,1 433,1 L 44 3181,2 0,23 10 13,0 0,08 18 LNU772 78940,2 - - - - - - 11,8 0,15 8 LNU762 79329,2 - - - - - - 11,9 0,20 9 LNU762 79330,3 - - - 3287,5 0,12 13 - - - LNU757 77481,1 - - - - - - 11,9 0,04 8 LNU757 77483,2 - - - - - - 11,6 0,29 6 LNU757 77483,3 - - - - - 12,3 0,01 12 LNU757 77485,4 346,9 0,08 15 - - - - - - CONT. - 300,5 - - 2898,0 - - 11,0 - - LNU933 78897,1 - - - - - - 12,8 L 5 LNU882 78973,1 - - - - - 12,9 0,18 6 LNU871 78191,1 - - - 1093,8 0,19 7 - - - LNU871 78191,3 163,1 0,27 10 1112,5 0,11 8 - - LNU871 78195,4 - - - - - - 13,1 L 7 LNU865 79761,7 - - - 1162,5 0,02 13 13,1 L B LNU847 78967,4 - - - - - - 13,3 0,22 9 LNU835 78189,1 - - - - - - 13,1 0,12 8 LNU828 77597,3 165,6 0,24 11 1131,2 0,18 10 - - - LNU795 79521,6 - - - 1112,5 0,29 8 - - - LNU766 78931,2 - - - - - - 12,7 0,17 4 LNU766 78932,1 - - - 1100,0 0,20 7 - - - CONT. - 148,6 - - 1026,5 - - 12,2 - - LNU975 80622,1 - - - - - - 10,5 0,01 8 LNU975 80624,5 - - - - - - 10,7 L 10 LNU975 80625,5 - - - - - - 10,2 L 5 LNU971 78391,1 9,38 0,16 22 - - - - - - LNU971 78391,6 - - - - - 10,1 0,03 4 LNU971 78395,1 - - - 131,2 0,12 17 10,1 0,30 3 LNU971 78395,2 10,7 0,04 39 135,7 0,09 21 - - - LNU964 80552,8 - - - - - - 10,0 0,26 3 LNU960 78599,4 - - - - - - 10,1 0,11 4 LNU960 78600,3 - - - - - - 10,2 0,05 5 LNU957 80435,3 - - - - - 10,1 0,03 4 LNU957 80437,6 - - - - - - 10,3 L 6 LNU957 80437,8 10,0 0,26 30 - - - - - - LNU955 80432,1 - - - - - - 10,1 0,30 3 LNU953 80427,1 8,75 0,23 14 - - - - - - LNU953 80428,1 - - - - - 10,1 0,08 3 LNU953 80429,1 - - - - - - 10,0 0,26 3 LNU949 80553,7 - - - - - - 10,3 0,12 6 LNU949 80557,4 8,75 0,23 14 - - - - - - LNU946 80648,1 - - - - - - 10,2 0,05 5 LNU946 80648,2 10,0 0,02 30 - - - - - - LNU946 80650,2 9,29 0,21 21 - - - - - - LNU944 79781,2 - - - - - 9,94 0,27 2 LNU944 79781,6 - - - - - - 10,1 0,03 4 LNU930 79771,1 - - - - - - 10,0 0,13 3 LNU928 78213,1 - - - - - - 10,1 0,30 3 LNU917 77496,2 - - - - - - 10,2 0,05 5

Peso Seco m Peso Fresco m Número de Folhas Nome do Evenío # Gene Méd, Val- °70 Méd.

Val- ~ Méd.

Val- p p Aum.

Aum.

LNU917 77500,2 - - - 137,5 0,24 22 10,1 0,11 4 LNU917 77500,4 - - - 137,5 0,24 22 - - - LNU917 77500,6 - - - - - - 10,6 L 8 LNU906 79219,5 - - - - - - 10,2 0,18 4 LNU904 78986,5 - - - - - - 9,94 0,27 2 LNU904 78987,2 - - - - - - 10,2 0,18 4 LNU903 80417,4 10,6 0,03 38 - - - - - - LNU901 80474,1 - - - 126,8 0,13 13 - - - LNU901 80474,5 - - - - - - 10,4 0,18 6 LNU899 79765,4 9,38 0,16 22 131,2 0,12 17 - - - LNU899 79765,5 - - - - - - 10,2 0,18 4 LNU899 79766,3 - - - - - - 10,0 0,26 3 LNU897 80445,2 11,9 0,23 54 150,0 L 33 11,1 L 13 LNU897 80448,4 - - - - - - 10,1 0,08 3 LNU892 80410,1 - - - 125,0 0,17 11 - - - LNU892 80414,2 12,0 L 55 - - - - - - LNU892 80414,5 - - - - - - 10,3 L 6 LNUB84 80405,3 - - - - - - 10,5 0,26 8 LNU884 80407,1 - - - - - - 10,5 L 8 LNU884 80408,2 - - - 137,5 0,24 22 10,1 0,11 4 LNU874 78366,3 10,0 0,26 30 - - - 10,1 0,03 4 LNU874 78370,1 - - - 162,5 0,27 44 - - - LNU874 78370,3 - - - 133,9 0,17 19 - - - LNUB74 78370,7 - - - - - - 10,2 0,18 4 LNU873 80469,1 - - - 125,0 0,17 11 10,6 L 8 LNU870 78505,1 8,75 0,23 14 131,2 0,12 17 - - - LNU870 78505,5 11,2 0,14 46 - - - 10,1 0,30 3 LNU867 79590,3 - - - - - - 9,94 0,27 2 LNU866 80443,2 - - - - - - 10,3 0,12 6 LNU862 79758,5 11,2 0,14 46 156,2 L 39 11,1 L 13 LNU856 79753,3 - - - - - - 9,94 0,27 2 LNU856 79753,9 8,66 0,27 13 - - - 9,94 0,27 2 LNU852 79580,2 9,38 0,16 22 - - - - - - LNU831 79331,7 - - - 131,2 0,12 17 10,2 0,24 5 LNU831 79333,1 8,75 0,23 14 - - - - - - LNU831 79335,2 - - - - - - 10,4 L 7 LNU829 77912,3 - - - - - - 10,4 L 6 LNU829 77914,1 - - - - - - 10,6 0,11 9 LNU825 77716,4 - - - - - - 10,1 0,08 3 LNU825 77717,4 10,0 0,26 30 - - - - - - LNU817 80596,1 - - - - - - 10,3 L 6 LNU817 80596,2 9,38 0,16 22 125,0 0,17 11 - - LNU817 80598,1 - - - 125,0 0,17 11 - - - LNU817 80599,2 8,75 0,23 14 - - - 10,1 0,11 4 LNU805 80783,2 - - - - - - 10,0 0,26 3 LNU805 80784,1 - - - - - - 10,2 0,05 5 LNU800 77896,1 - - - - - - 10,0 0,26 3 LNU800 77896,4 - - - 137,5 0,24 22 10,2 0,18 4 LNU800 77900,7 8,75 0,23 14 - - - - - - LNU799 78672,5 - - - - - - 10,4 0,18 6 LNU799 78672,7 - - - 162,5 0,08 44 - - - LNU799 78674,2 9,38 0,16 22 - - - - - - LNU799 78674,5 - - - 150,0 0,13 33 10,2 0,05 5 LNU796 78235,5 - - - - - - 10,1 0,11 4 LNU794 78522,1 - - - 131,2 0,12 17 10,4 0,03 6 LNU794 78524,1 10,0 0,02 30 - - - - - - LNU794 78524,5 - - - - - - 10,2 0,24 5 LNU794 78525,2 - - - - - - 10,1 0,11 4 LNU792 79161,2 - - - - - - 10,6 L 8 LNU792 79162,2 - - - - - - 10,3 L 6

Peso Seco m Peso Fresco m Número de Folhas Nome do Evento # Gene Méd, Val 0 Méd. Val- A Méd. Val- -p Aum. p Aum. p Aum.

A LNU792 79215,1 - - - - - - 10,2 0,18 4 LNU778 78943,5 - - - - - - 10,5 0,01 8 LNU778 78944,5 11,9 L 54 137,5 0,01 22 - - - LNU773 80399,1 - - - - - - 10,4 0,08 7 LNU771 80077,2 - - - 125,0 0,17 11 - - - LNU763 77588,2 - - - - - - 10,2 0,24 5 LNU763 77588,6 10,0 0,26 30 125,0 0,17 11 10,4 0,08 7 LNU758 79739,10 10,6 0,03 38 150,0 0,13 33 11,2 0,12 15 LNU758 79739,5 - - - - - - 10,2 0,02 4 LNU758 79741,2 - - - - - - 10,1 0,11 4 LNU753 77141,2 - - - 125,0 0,17 11 - - LNU753 77143,3 - - - - - - 9,94 0,27 2 LNU753 77144,1 9,38 0,16 22 131,2 0,12 17 10,2 0,24 5 LNU753 77144,2 - - - - - - 10,0 0,26 3 LNU749 80792,2 - - - 125,0 0,17 11 10,0 0,26 3 CONT. - 7,70 - - 112,5 - - 9,75 - - LNU976 78364,1 - - - - - - 12,9 0,12 6 LNU968 77919,4 - - - 1231,2 0,03 8 - - - LNU963 78385,1 - - - - - - 12,8 0,07 6 LNU950 78911,3 - - - 1212,5 0,08 6 - - - LNU934 79007,3 - - - - - - 12,8 0,07 6 LNU934 79008,3 122,1 0,15 5 - - - - - - LNU908 79736,2 134,4 0,28 16 1312,5 0,10 15 - - - LNU893 77154,4 - - - - - - 13,4 L 10 LNU885 78416,5 125,0 0,05 8 1300,0 0,05 14 - - - LNU858 79587,2 - - - - - - 12,6 0,06 4 LNU790 78886,2 - - - - - - 12,6 0,22 4 LNU790 78890,1 134,4 0,06 16 1237,5 0,07 8 12,6 0,18 4 CONT. - 116,2 - - 1141,1 - - 12,1 - - LNU947 77448,4 - - - - - 12,7 0,03 6 LNU947 77449,1 - - - - - - 12,4 0,22 3 LNU940 77811,6 - - - - - - 12,6 0,13 5 LNU900 78851,3 - - - - - - 12,4 0,22 3 LNU898 78981,3 - - - - - 12,3 0,26 2 LNU898 78983,4 - - - - - 12,9 0,09 7 LNU898 78985,1 - - - 1393,8 0,16 14 - - - LNU894 78282,3 - - - - - - 12,4 0,22 3 LNU894 78283,7 - - - - - 12,9 0,03 8 LNU846 78436,2 - - 1368,8 0,04 12 - - - LNU846 78438,2 - - - - - - 12,4 0,22 3 LNU846 78439,4 - - - 1393,8 0,02 14 12,9 0,03 8 LNU820 77806,2 227,0 0,06 37 1410,7 0,11 15 - - - LNU820 77807,2 - - - - - - 12,5 0,11 4 LNU820 77809,1 - - - 1413,4 0,26 16 - - - LNU815 77492,2 193,1 0,05 17 1343,8 0,21 10 - - - LNU815 77492,6 - - - 1331,2 0,12 9 - - - LNU815 77494,1 - - - 1337,5 0,07 10 12,9 0,03 8 LNU814 78953,2 - - - - - - 12,3 0,26 2 LNU814 78955,4 - - - - - - 12,5 0,08 4 LNU811 78179,1 - - - 1412,5 0,03 16 12,8 0,28 7 LNU811 78180,3 - - - 1300,0 0,19 6 - - - LNU797 78022,1 - - - - - - 12,5 0,25 4 LNU793 78166,4 - - - 1325,0 0,23 8 - - - LNU759 77236,2 - - - - - - 12,3 0,26 2 LNU756 77581,3 - - - - - - 12,8 0,25 6 LNU756 77584,6 - - - 1285,7 0,28 5 - - - LNU751 77477,1 - - - 1416,1 0,09 16 - - - LNU751 77478,4 - - - - - - 12,4 0,22 3 LNU751 77480,1 - - - - - - 12,6 0,04 5 CONT. - 165,1 - - 1221,4 - - 12,0 - -

Peso Seco m Peso Fresco m Número de Folhas Nome do Evento # Gene Méd, Val-p 0 Méd. Val-p ° Méd. Val-p o Aum. Aum. Aum. LNU972 78909,3 - - - 1531,2 0,28 5 12,4 0,09 5 LNU972 78910,2 - - - 1506,2 0,28 4 - - - LNU965 78360,5 - - - - - - 12,2 0,13 4 LNU961 79143,2 - - - 1568,8 0,30 8 - - - LNU961 79145,3 - - - 1525,0 0,14 5 - - - LNU943 78407,2 - - - - - - 12,1 0,26 3 LNU943 78407,4 - - - 1581,2 0,02 9 - - - LNU926 78858,8 - - - - - - 12,1 0,26 3 LNU913 78593,1 - - - - - - 12,4 0,09 5 LNU896 78979,5 - - - 1531,2 0,11 5 - - - LNJ876 79596,2 - - 1525,0 0,18 5 - - - LNU864 79339,2 195,8 0,20 7 1617,0 0,08 11 - - - LNU833 78184,1 - - - - - - 12,1 0,26 3 LNU804 78950,4 - - - 1537,5 0,13 6 - - - LNU789 78891,6 - - - 1766,7 0,30 22 - - - LNU789 78893,3 - - - 1500,0 0,30 3 - - - LNU768 77881,3 194,4 0,26 6 1537,5 0,21 6 - - - LNU768 77883,4 198,1 0,13 8 1581,2 0,02 9 - - - LNJ764 78926,1 214,4 0,28 17 1618,8 0,07 11 12,4 0,17 5 CONT. - 183,8 - - 1453,6 - - 11,7 - - Tabela 123: "CONT" - Controle; "Méd." - Média; "% Aum,' = % de aumento; "Val-p" - valor p; L significa que o valor-p é menor que 0,01, p<0,1 foi considerado como significativo.

Tabela 124 Genes mostrando a produção de biomassa melhorada da planta em condições de cultivo limitantes de nitrogênio Cobertura do Lote 1cm2] Area da Roseta cm Diâmetro da RosetaFcm] Nome do Evento # Gene Méd. Val-p Aum Méd. Val-p Méd. Val-p Aum Aum. LNU952 78218,1 49,8 0,02 19 6,23 0,02 19 4,62 0,02 12 LNU952 78218,3 45,0 0,24 7 5,62 0,24 7 4,37 0,09 6 LNU952 78218,6 46,3 0,24 11 5,79 0,24 11 4,33 0,22 5 LNU952 78219,3 47,1 0,08 12 5,88 0,08 12 4,51 0,04 9 LNU945 78998,2 45,8 0,20 9 5,72 0,20 9 4,45 0,12 8 LNU920 78507,1 52,9 0,08 26 6,62 0,08 26 4,94 0,06 20 LNU920 78507,2 45,8 0,25 9 5,73 0,25 9 4,35 0,11 6 LNU920 78508,1 51,6 L 23 6,45 L 23 4,72 L 15 LNU920 78508,2 53,6 L 28 6,70 L 28 4,84 L 18 LNU916 78208,3 50,8 0,02 21 6,35 0,02 21 4,63 L 12 LNU914 80514,5 46,2 0,15 10 5,78 0,15 10 4,36 0,15 6 LNU914 80516,2 50,4 0,14 20 6,29 0,14 20 4,71 L 14 LNU914 80516,4 - - - - - - 4,50 0,03 9 LNU911 80420,3 46,2 0,12 10 5,77 0,12 10 4,36 0,09 6 LNU911 80424,2 46,3 0,12 10 5,78 0,12 10 4,43 0,05 7 LNU905 79674,3 47,4 0,08 13 5,92 0,08 13 4,51 0,09 9 LNU905 79674,4 - - - - - - 4,40 0,08 7 LNU905 79675,3 51,5 L 23 6,44 L 23 4,65 L 13 LNU844 80342,3 - - - - - - 4,27 0,27 4 LNU844 80342,4 - - - - - - 4,32 0,29 5 LNU840 78676,1 49,2 0,02 17 6,15 002 17 4,71 L 14 LNU840 78676,4 52,9 0,09 26 6,62 0,09 26 4,74 0,05 15 LNU840 78763,6 46,7 0,10 11 5,83 0,10 11 4,45 0,04 8 LNU834_H1 80402,7 47,6 0,21 14 5,95 0,21 14 4,47 0,23 8 LNU832_H2 80604,2 48,2 0,06 15 6,03 0,06 15 4,58 0,11 11 LNU819 78133,3 - - - - - - 4,58 0,02 11 LNU801 78585,2 45,6 0,29 9 5,70 0,29 9 4,42 0,20 7 LNU791 77893,1 54,0 0,01 29 6,74 0,01 29 4,86 L 18 LNU791 77893,2 48,8 0,03 16 6,09 0,03 16 4,52 0,04 10

Cobertura do Lote cm Area da Roseta cm2 Diâmetro da Roseta cm Nome do Evento # Gene Méd, Val-p X70 Méd.

Vai-p X70 Méd.

Val-p elo Aum.

Aum.

LNU760_H1 80127,2 51,7 0,17 23 6,47 0,17 23 4,65 0,05 13 CONT, - 41,9 - - 5,24 - - 4,12 - - LNU966 78605,5 81,2 0,03 38 10,2 0,03 38 5,22 0,05 15 LNU966 78605,7 72,2 L 22 9,03 L 22 4,94 0,01 9 LNU941 78611,1 67,9 L 15 8,48 L 15 4,67 0,22 3 LNU941 78613,1 75,3 0,03 27 9,41 0,03 27 5,10 L 13 LNU941 78615,3 75,2 L 27 9,40 L 27 5,03 L 11 LNU925 78992,1 77,2 0,26 31 9,65 0,26 31 5,18 0,21 15 LNU925 78992,6 62,1 0,26 5 7,76 0,26 5 - - - LNU918 78433,1 - - - - - - 4,73 0,23 5 LNU918 78433,2 69,7 0,21 18 8,72 0,21 18 4,90 0,23 8 LNU918 78433,3 70,2 L 19 8,78 L 19 4,85 0,02 7 LNU918 78434,2 65,6 0,02 11 8,21 0,02 11 4,82 0,03 6 LNU915 78426,1 71,3 L 21 8,91 L 21 5,05 L 12 LNU915 78427,1 69,8 0,29 18 8,73 0,29 18 - - - LNU915 78428,1 78,8 1 33 9,85 L 33 5,14 L 14 LNU915 78428,2 66,3 0,27 12 8,28 0,27 12 - - - LNU909 78424,3 69,3 0,29 17 8,66 0,29 17 - - - LNU909 78425,4 - - - - - - 5,10 0,05 13 LNU909 78425,5 81,3 0,25 38 10,2 0,25 38 5,29 0,20 17 LNU909 78425,7 67,8 0,14 15 8,48 0,14 15 4,83 0,15 7 LNU890 78202,1 74,4 L 26 9,30 L 26 4,84 0,08 7 LNU854 78236,1 62,9 0,14 6 7,86 0,14 6 4,67 0,22 3 LNU854 78238,1 68,7 L 16 8,59 L 16 4,74 0,11 5 LNU849 78498,4 72,6 L 23 9,08 L 23 4,93 0,09 9 LNU849 78499,1 69,3 0,04 17 8,66 0,04 17 4,84 0,29 7 LNU830 78741,5 79,8 0,17 35 9,98 0,17 35 5,18 0,20 15 LNU830 78742,8 63,8 0,20 8 7,97 0,20 8 - - - LNU824 77826,1 82,9 0,20 40 10,4 0,20 40 5,40 0,11 19 LNU824 77827,3 64,6 0,20 9 8,08 0,20 9 - - - LNU824 77828,4 69,4 0,04 18 8,68 0,04 18 4,73 0,11 5 LNU824 77829,3 73,8 0,05 25 9,22 0,05 25 4,97 0,10 10 LNU822 78623,2 82,2 0,27 39 10,3 0,27 39 5,29 0,22 17 LNU822 78623,6 87,8 L 49 11,0 L 49 5,56 0,04 23 LNU822 78623,7 74,0 0,21 25 9,26 0,21 25 4,96 0,14 10 LNU822 78625,2 75,9 0,29 28 9,48 0,29 28 5,12 0,25 13 LNU813 77682,3 77,3 0,16 31 9,66 0,16 31 5,20 L 15 LNU806 78514,2 87,1 0,02 47 10,9 0,02 47 5,61 L 24 LNU806 78515,3 69,3 L 17 8,66 L 17 4,75 0,10 5 LNU806 78515,4 - - - - - - 4,87 0,26 8 LNU806 78515,5 76,4 L 29 9,55 L 29 4,98 L 10 LNU802 80307,3 65,9 0,03 12 8,24 0,03 12 4,68 0,20 3 LNU802 80309,2 67,0 0,27 13 8,38 0,27 13 - - - LNU802 80309,3 67,3 0,09 14 8,41 0,09 14 4,81 0,04 6 LNU802 80310,1 67,1 0,08 14 8,39 0,08 14 4,81 0,14 6 LNU779 77887,2 77,0 0,03 30 9,63 0,03 30 5,09 0,11 13 LNU761 78157,6 67,8 0,15 15 8,48 0,15 15 4,79 0,28 6 LNU761 78159,1 66,3 0,08 12 8,29 0,08 12 4,75 0,08 5 LNU761 78160,3 84,0 0,07 42 10,5 0,07 42 5,44 0,02 20 CONT. - 59,1 - - 7,38 - - 4,52 - - LNU976 78364,1 45,6 L 47 5,71 L 47 4,19 L 25 LNU976 78364,2 34,1 0,22 10 4,27 0,22 10 - - - LNU976 78364,5 - - - - - - 3,50 0,26 4 LNU970 78388,1 36,2 0,02 17 4,52 0,02 17 3,63 0,03 8 LNU970 78389,7 33,4 0,27 8 4,18 0,27 8 3,62 0,06 8 LNU970 78389,8 44,2 0,03 42 5,52 0,03 42 4,00 L 19 LNU968 77919,4 36,5 0,01 18 4,57 0,01 18 3,66 0,02 9 LNU963 78383,4 36,6 0,07 18 4,57 0,07 18 3,65 0,27 9 LNU950 78913,4 39,1 0,12 26 4,89 0,12 26 3,74 0,18 11 LNU950 78915,2 35,7 0,03 15 4,46 0,03 15 3,66 0,04 9

Cobertura do Lote [Ám2] da Roseta cm Diâmetro da Roseta cm Nome do Evento # Gene Méd.

Val ° Méd.

Val- % Méd.

Val- % p Aum, p Aum. p Aum.

LNU949 80553,5 37,5 0,22 21 4,69 0,22 21 3,74 0,21 11 LNU949 80553,8 39,6 0,01 28 4,95 0,01 28 3,69 0,16 10 LNU934 79007,5 33,2 0,27 7 4,16 0,27 7 - - - LNU934 79008,1 33,9 0,14 9 4,24 0,14 9 3,64 0,15 8 LNU902 79606,5 38,2 0,03 23 4,77 0,03 23 3,77 0,10 12 LNU875 78413,4 36,3 0,29 17 4,54 0,29 17 3,68 0,22 9 LNU873 80473,4 - - - - - - 3,73 0,27 11 LNU843 78962,4 37,7 L 22 4,71 L 22 3,67 0,02 9 LNU843 78963,2 36,3 0,11 17 4,53 0,11 17 3,68 0,08 9 LNU790 78886,2 40,8 L 31 5,10 L 31 3,72 0,08 11 LNU790 78886,3 35,0 0,04 13 4,38 0,04 13 3,67 0,07 9 LNU790 78889,2 - - - - - - 3,59 0,07 7 LNU767 79146,1 41,6 0,09 34 5,20 0,09 34 3,85 0,15 15 LNU767 79146,2 36,5 0,01 18 4,57 0,01 18 3,72 L 11 CONT. - 31,0 - - 3,88 - - 3,36 - - LNU941 78613,1 107,3 0,04 19 13,4 0,04 19 6,23 0,02 11 LNU941 78614,2 111,8 0,01 24 14,0 0,01 24 6,25 0,02 12 LNU941 78615,3 102,4 0,13 13 12,8 0,13 13 6,03 0,15 8 LNU918 78433,3 - - - - - - 5,92 0,16 6 LNU915 78427,1 104,1 0,06 15 13,0 0,06 15 5,92 0,17 6 LNU915 78428,1 101,4 0,24 12 12,7 0,24 12 - - - LNJ909 78425,5 99,4 0,26 10 12,4 0,26 10 - - - LNU868 77621,5 - - - - - - 6,06 0,25 8 LNU854 78237,2 114,2 L 26 14,3 L 26 6,00 0,20 7 LNUB49 78498,3 - - - - - - 6,09 0,10 9 LNU849 78498,4 105,0 0,05 16 13,1 0,05 16 5,99 0,10 7 LNUS30 78741,3 - - - 12,3 0,26 9 - - - LNU830 78741,5 107,9 0,09 19 13,5 0,09 19 6,26 0,02 12 LNU813 77682,3 - - - - - - 5,88 0,28 5 LNU813 77685,1 109,6 0,02 21 13,7 0,02 21 6,28 0,12 12 LNU806 78514,2 100,4 0,28 11 12,6 0,28 11 5,86 0,29 5 LNU806 78515,3 100,7 0,13 11 12,6 0,13 11 5,93 0,15 6 LNU806 78515,5 101,9 0,15 13 12,7 0,15 13 5,96 0,11 6 LNU780 77489,4 - - - - - - 6,04 0,24 8 CONT. - 90,5 - - 11,3 - - 5,60 - - LNU948 78378,1 74,9 0,04 20 9,36 0,04 20 5,02 0,18 8 LNU948 78380,2 67,9 0,07 9 8,49 0,07 9 4,84 0,22 5 LNU921 79063,2 64,6 0,28 4 8,07 0,28 4 - - - LNU889 79601,4 67,5 0,08 B 8,44 0,08 8 4,83 0,19 4 LNU888 78771,1 75,6 0,22 21 9,45 0,22 21 5,13 0,29 11 LNU881 78372,2 71,0 0,07 14 8,87 0,07 14 4,95 0,07 7 LNU857 78867,2 69,8 0,27 12 8,72 0,27 12 4,95 0,27 7 LNU857 78870,1 - - - - - - 4,77 0,22 3 LNU816 78958,5 75,0 L 20 9,37 L 20 5,17 L 12 LNU816 78958,7 76,6 0,03 23 9,58 0,03 23 5,22 L 13 LNU809 79168,2 72,6 0,24 16 9,07 0,24 16 4,98 0,20 8 LNU809 79168,3 67,9 0,26 9 8,49 0,26 9 - - - LNU807 79248,1 66,3 0,13 6 8,28 0,13 6 4,81 0,10 4 LNU807 79250,2 65,0 0,22 4 8,13 0,22 4 - - - LNU795 79525,1 70,5 0,01 13 8,82 0,01 13 - - - LNU795 79525,5 66,0 0,15 6 8,25 0,15 6 4,80 0,11 4 LNU788 78516,1 76,3 0,07 22 9,54 0,07 22 5,11 0,30 10 LNU788 78517,2 66,7 0,07 7 8,34 0,07 7 4,86 0,06 5 LNU788 78518,1 89,3 0,11 43 11,2 0,11 43 5,59 L 21 LNU778 78941,1 72,6 0,15 16 9,07 0,15 16 4,94 0,16 7 LNU778 78944,2 70,0 0,01 12 8,75 0,01 12 4,90 0,16 6 LNU752 78153,10 75,8 0,26 22 9,48 0,26 22 5,24 0,16 13 LNU752 78155,2 64,9 0,29 4 8,11 0,29 4 4,83 0,26 4 CONT. - 62,3 - - 7,79 - - 4,63 - - LNU977 78032,1 89,1 0,28 11 - - - - - -

Cobertura do Lote cm Area da Roseta cm Diâmetro da Roseta cm Nome do Evento # Gene Med.

Val-p Méd• Val-p Méd.

Val-p Aum.

Aum.

LNU933 78897,1 - - - - - - 5,57 0,24 6 LNU880 78197,2 85,7 0,28 7 - - - - - - LNU871 78195,4 90,4 0,07 12 11,3 0,11 10 5,46 0,23 4 LNU848 77906,2 - - - - - - 5,58 0,06 6 LNU847 78967,2 87,7 0,07 9 11,0 0,14 7 5,39 0,20 2 LNU846 78438,2 - - - - - - 5,53 0,12 5 LNU846 78439,2 - - - - - - 5,52 0,22 5 LNU846 78439,4 105,8 L 32 13,2 L 29 6,04 L 15 LNU828 77598,3 96,6 0,17 20 12,1 0,20 18 5,85 0,10 11 LNU823 78122,2 90,5 0,25 13 - - - 5,62 0,30 7 LNU772 78938,1 105,8 0,14 32 13,2 0,15 29 6,10 0,26 16 LNU757 77485,4 93,2 L 16 11,7 0,01 14 5,63 0,08 7 CONT. - 80,4 - - 10,2 - - 5,26 - - LNU972 78907,1 79,1 0,15 21 9,89 0,15 21 5,43 0,24 9 LNU972 78908,2 77,3 0,06 18 9,66 0,06 18 5,40 L 8 LNU972 78909,3 88,0 0,12 35 11,0 0,12 35 5,78 0,09 16 LNU961 79143,3 78,3 0,01 20 9,79 0,01 20 5,51 L 10 LNU961 79143,4 72,6 0,13 11 9,07 0,13 11 5,42 0,05 9 LNU961 79145,3 79,1 0,01 21 9,89 0,01 21 5,38 L 8 LNU961 79145,6 70,6 0,24 8 8,83 0,24 8 5,14 0,19 3 LNU958 77687,2 87,1 L 33 10,9 L 33 5,75 L 15 LNU958 77687,5 83,6 L 28 10,5 L 28 5,72 L 15 LNU958 77689,1 84,4 L 29 10,6 L 29 5,76 L 16 LNU958 77689,2 76,8 0,15 17 9,59 0,15 17 5,37 0,22 8 LNU948 78378,1 83,1 L 27 10,4 L 27 5,66 L 13 LNU948 78379,4 77,8 0,19 19 9,73 0,19 19 - - - LNU948 78380,2 84,5 L 29 10,6 L 29 5,64 L 13 LNU948 78380,3 71,6 0,27 9 8,95 0,27 9 5,21 0,09 5 LNU921 79063,2 82,4 L 26 10,3 L 26 5,53 L 11 LNU921 79064,2 - - - - - - 5,25 0,05 5 LNU921 79064,3 74,3 0,14 14 9,28 0,14 14 5,34 0,07 7 LNU913 78592,1 79,5 L 22 9,94 L 22 5,36 0,01 7 LNU913 78592,3 77,5 0,14 18 9,69 0,14 18 5,39 0,21 8 LNU913 78592,4 86,6 L 32 10,8 L 32 5,73 0,07 15 LNU913 78593,1 86,4 L 32 10,8 L 32 5,63 L 13 LNU913 78593,6 92,6 L 42 11,6 L 42 5,96 L 20 LNU912 78401,3 - - - - - - 5,25 0,18 5 LNU912 78403,2 83,9 0,06 28 10,5 0,06 28 5,70 0,06 14 LNU912 78404,1 80,3 L 23 10,0 L 23 5,44 L 9 LNU889 79601,4 76,4 0,03 17 9,55 0,03 17 5,42 L 9 LNU889 79602,4 - - - - - - 5,27 0,21 6 LNU881 78372,2 91,4 L 40 11,4 L 40 5,88 L 18 LNU881 78373,1 73,9 0,14 13 9,24 0,14 13 - - - LNU881 78373,2 91,7 L 40 11,5 L 40 5,96 0,01 19 LNU823 78136,4 87,2 L 33 10,9 L 33 5,68 0,05 14 LNLI816 78957,1 76,3 0,04 17 9,54 0,04 17 5,42 0,02 9 LNU816 78958,4 86,4 L 32 10,8 L 32 5,60 L 12 LNU816 78958,7 96,1 0,02 47 12,0 0,02 47 6,27 0,01 26 LNU809 79168,3 77,9 0,14 19 9,74 0,14 19 5,46 0,18 9 LNU809 79169,2 78,2 0,17 20 9,77 0,17 20 5,32 0,21 7 LNU783 79176,3 74,1 0,14 13 9,26 0,14 13 - - - LNU783 79176,6 77,0 0,03 18 9,62 0,03 18 5,44 0,08 9 LNU783 79178,4 70,3 0,27 7 8,79 0,27 7 5,54 L 11 LNU782 77441,1 84,1 L 29 10,5 L 29 5,45 L 9 LNU782 77444,10 73,5 0,15 12 9,19 0,15 12 5,17 0,23 4 LNU782 77444,9 91,8 0,07 40 11,5 0,07 40 6,19 0,03 24 LNU772 78937,4 - - - - - - 5,22 0,26 5 LNU772 78938,1 96,4 L 47 12,1 L 47 6,07 L 22 LNU772 78938,2 73,9 0,12 13 9,23 0,12 13 5,29 0,02 6 LNU772 78940,2 78,9 0,04 21 9,87 0,04 21 5,43 0,12 9

Cobertura do Lote cm Area da Roseta [cm2 Diâmetro da Roseta cm Nome do Evento # Gene Méd.

Val-p Méd, Val-p Méd.

Val-p Aum.

Aum.

LNU762 79329,2 80,9 L 24 10,1 L 24 5,50 L 10 LNU757 77481,1 - - - - - 5,12 0,23 3 LNU757 77483,3 74,8 0,05 14 9,34 0,05 14 5,40 L 8 CONT. - 65,4 - - 8,18 - - 4,99 - - LNU907 78872,1 - - - - - 5,68 0,11 9 LNU907 78872,3 - - - - - - 5,32 0,21 2 LNU882 78973,1 78,8 L 10 9,85 L 10 5,48 L 5 LNU882 78973,4 85,5 0,23 20 10,7 0,23 20 5,74 0,17 10 LNU871 78195,4 77,2 L 8 9,66 L 8 5,37 0,07 3 LNU865 79761,7 80,8 L 13 10,1 L 13 5,49 0,14 5 LNU847 78968,3 - - - - - - 5,41 0,07 4 LNU845 78917,3 75,2 0,29 5 9,40 0,29 5 5,34 0,11 2 LNU835 78186,2 76,3 0,10 7 9,54 0,10 7 - - - LNU835 78189,1 73,5 0,26 3 9,19 0,26 3 5,34 0,27 2 LNU807 79250,1 81,1 0,15 13 10,1 0,15 13 5,50 L 6 LNU766 78931,1 - - - - - - 5,31 0,28 2 LNU766 78931,2 - - - - - - 5,49 0,26 5 LNU766 78932,1 88,4 0,16 24 11,1 0,16 24 5,78 0,16 11 CONT. - 71,6 - - 8,94 - - 5,21 - LNU975 80622,1 62,2 0,11 26 7,78 0,11 26 4,99 0,19 11 LNU975 80624,5 56,3 L 14 7,04 L 14 4,62 0,14 3 LNU971 78395,1 57,1 L 15 7,14 L 15 4,82 L 7 LNU971 78395,2 60,4 L 22 7,55 L 22 5,02 L 12 LNU964 80548,6 - - - - - - 4,58 0,26 2 LNU960 78600,3 60,4 0,06 22 7,55 0,06 22 4,91 0,03 9 LNU957 80437,8 52,0 0,13 5 6,50 0,13 5 4,70 0,07 5 LNU955 80432,4 53,8 0,07 9 6,72 0,07 9 4,58 0,28 2 LNU953 80427,1 - - - - - - 4,76 0,29 6 LNU949 80553,7 55,9 L 13 6,99 L 13 4,64 0,15 3 LNU949 80553,8 55,1 0,09 11 6,89 0,09 11 4,74 0,02 5 LNU949 80557,4 - - - - - 4,94 0,21 10 LNU946 80648,2 52,2 0,24 5 6,52 0,24 5 - - - LNU944 79781,6 53,2 0,03 8 6,65 0,03 8 4,68 0,02 4 LNU928 78213,1 53,7 0,28 9 6,71 0,28 9 4,67 0,05 4 LNU917 77500,4 - - - - - - 4,79 0,27 7 LNU917 77500,6 - - - - - - 4,82 0,06 7 LNU906 79219,1 - - - - - - 4,61 0,15 3 LNU906 79219,6 - - - - - - 4,69 0,08 4 LNU904 78987,3 - - - - - - 4,68 0,19 4 LNU901 80474,1 57,2 L 16 7,15 L 16 4,77 L 6 LNU901 80474,5 53,2 0,04 8 6,65 0,04 8 4,66 0,04 4 LNU901 80476,5 59,5 0,16 20 7,44 0,16 20 4,81 0,17 7 LNU899 79765,4 - - - - - - 4,75 0,13 6 LNU899 79766,2 52,3 0,17 6 6,54 0,17 6 - - - LNU899 79766,3 55,1 0,02 11 6,89 0,02 11 - - - LNU897 80445,2 69,1 L 40 8,63 L 40 5,15 L 15 LNU892 80410,1 54,1 0,17 9 6,77 0,17 9 - - - LNU892 80414,5 53,5 0,02 8 6,68 0,02 8 4,63 0,09 3 LNU884 80405,3 58,0 L 17 7,25 L 17 4,74 L 6 LNU874 78366,3 61,6 L 24 7,70 L 24 5,05 L 12 LNU874 78370,1 56,4 L 14 7,05 L 14 4,80 0,25 7 LNU874 78370,3 56,6 L 14 7,08 L 14 4,82 L 7 LNU873 80469,3 53,2 0,28 8 6,65 0,28 8 - - - LNU873 80473,3 55,1 0,09 1F 6,88 0,09 11 4,62 0,14 3 LNU873 80473,6 54,4 0,10 10 6,79 0,10 10 4,68 0,24 4 LNU870 78501,1 - - - - - - 4,70 0,03 5 LNU870 78505,5 53,7 0,15 9 6,72 0,15 9 4,64 0,12 LNU867 79590,4 61,1 0,13 23 7,63 0,13 23 4,89 L LNU867 79590,7 58,6 L 18 7,32 L 18 4,93 0,13 10 LNU866 80443,2 52,9 0,04 7 6,62 0,04 7 - - -

Cobertura do Lote cm Area da Roseta cm Diâmetro da Roseta cm Nome do Evento # Gene Méd.

Val-p °7o Méd.

Val-p Méd.

Val-p °70 Au m. um.

Aum.

LNUB62 79755,6 - - - - - - 4,69 0,28 4 LNU862 79757,1 54,9 0,16 11 6,87 0,16 11 4,82 0,27 7 LNUB62 79758,3 - - - - - - 4,69 0,09 4 LNU862 79758,5 70,4 L 42 8,80 L 42 5,41 L 20 LNU856 79753,3 55,3 L 12 6,91 L 12 4,79 L 7 LNU831 79331,7 67,1 0,08 35 8,38 0,08 35 5,18 L 15 LNU829 77912,3 58,6 0,23 18 7,33 0,23 18 4,98 0,22 11 LNU829 77914,2 55,7 0,25 13 6,96 0,25 13 4,78 L 6 LNU817 80599,2 53,0 0,03 7 6,62 0,03 7 - - - LNU800 77896,1 59,7 L 21 7,46 L 21 4,84 0,06 8 LNU800 77896,4 53,7 0,05 8 6,71 0,05 8 4,76 0,16 6 LNU799 78672,7 57,7 0,03 17 7,21 0,03 17 4,84 0,11 8 LNU799 78674,5 60,7 0,08 23 7,59 0,08 23 4,94 0,13 10 LNU794 78522,1 61,8 0,18 25 7,73 0,18 25 4,81 0,15 7 LNU794 78524,1 - - - - - - 4,95 0,30 10 LNU794 78524,5 58,6 0,24 18 7,33 0,24 18 4,93 0,20 10 LNU794 78525,2 56,8 L 15 7,10 L 15 4,72 L 5 LNU792 79161,2 51,6 0,28 4 6,45 0,28 4 - - - LNU778 78944,5 63,7 L 29 7,96 L 29 5,16 L 15 LNU773 80399,1 57,2 0,01 16 7,16 0,01 16 4,79 0,23 7 LNU763 77588,6 64,2 L 30 8,02 L 30 4,83 0,05 8 LNU758 79739,10 63,0 0,15 27 7,88 0,15 27 - - - LNU753 77141,2 56,3 L 14 7,03 L 14 4,77 L 6 LNU753 77143,3 57,6 0,02 16 7,19 0,02 16 4,79 0,07 7 LNU753 77144,1 56,0 L 13 7,00 L 13 4,80 L 7 LNU749 80792,2 - - - - - 4,76 0,17 6 LNU749 80792,3 54,1 0,09 9 6,76 0,09 9 4,66 0,07 4 CONT. - 49,5 - - 6,19 - - 4,49 - - LNU970 78390,3 101,4 0,22 8 12,7 0,22 8 - - - LNU893 77154,4 105,3 0,09 12 13,2 0,09 12 5,96 0,18 6 LNU885 78416,5 - - - - - - 6,04 0,24 7 LNU790 78890,1 121,6 L 29 15,2 L 29 6,42 0,01 14 CONT. - 94,1 - - 11,8 - - 5,64 - - LNU947 77448,4 104,8 L 33 13,1 L 31 5,95 L 12 LNU940 77811,6 90,4 0,27 15 - - - - - - LNU940 77813,1 96,4 0,01 23 12,0 L 21 5,73 0,03 8 LNU900 78851,3 94,7 0,07 20 11,8 0,09 19 5,60 0,10 6 LNU898 78983,4 96,3 0,10 23 12,0 0,13 21 5,81 0,05 10 LNU894 78283,4 85,5 0,25 9 10,7 0,28 7 5,49 0,25 4 LNU894 78283,7 102,3 L 30 12,8 L 28 5,96 L 13 LNU846 78436,2 87,5 0,26 11 10,9 0,30 10 - - - LNU846 78439,4 103,6 0,07 32 13,0 0,09 30 6,04 0,08 14 INU820 77807,2 89,2 0,22 14 11,2 0,26 12 - - - LNU820 77809,1 86,5 0,15 10 10,8 0,15 8 - - - LNU815 77492,6 85,2 0,22 8 10,7 0,23 7 - - - LNU815 77494,1 103,8 0,02 32 13,0 0,03 30 5,94 L 12 LNU814 78953,2 84,6 0,25 8 10,6 0,27 6 - - - LNU811 78176,8 86,8 0,22 10 10,9 0,24 9 - - - LNU811 78179,1 97,6 0,22 24 12,2 0,25 22 5,78 0,25 9 LNU811 78180,3 85,4 0,21 9 10,7 0,22 7 - - - LNU797 78025,3 - - - - - - 5,59 0,16 6 LNU793 78168,1 87,7 0,11 11 11,0 0,10 10 - - - LNU793 78169,1 85,3 0,21 8 10,7 0,21 7 - - - LNU769 78163,4 85,6 0,23 9 10,7 0,25 7 - - - LNU756 77581,3 90,6 0,06 15 11,3 0,05 14 5,51 0,18 4 LNU751 77478,3 90,0 0,10 14 11,3 0,12 13 - - - CONT. - 78,6 - - 9,97 - - 5,30 - - LNU965 78360,5 112,4 0,02 20 14,0 0,06 18 - - - LNU943 78407,2 110,0 0,10 17 13,8 0,15 15 - - - LNU913 78593,1 115,2 0,01 23 14,4 0,04 21 6,19 0,07 8

Cobertura do Lote cm Area da Roseta [cm2] Diametro da Roseta1cm] Nome do Evento # Gene Méd. Val % Méd. Val % Méd. Val- ~/ p Aum. p Aum. p Aum. LNU833 78184,1 101,4 0,07 8 12,7 0,09 6 5,85 0,14 2 LNU764 78926,1 103,8 t 0,01 11 13,0 L 9 5,97 0,18 4 CONT. - 93,7 - - 11,9 - - 5,75 - - i anela 1 L4: ,VIN 1 - Controle; - mea.- - Meaia; ro Aum. = Io ae aumento; -Val-p" - valor p; L significa que o valor-p é menor que 0,01, p<0,1 foi considerado como significativo.

[00639] Os genes listados na Tabela 125 melhoraram a NUE da planta quando cultivada em níveis de concentração limitantes de nitrogênio. Estes genes produziram plantas com desenvolvimento mais rápido quando cultivadas sob condições de cultivo limitantes de nitrogênio, em comparação com plantas de controle cultivadas sob condições idênticas, conforme medido pela taxa de crescimento do número de folhas, diâmetro da roseta e cobertura do lote. Tabela 125 Genes mostrando o desempenho melhorado de crescimento da roseta em condições de cultivo limitantes de nitroaênio RGR da Cobertura do Lote RGR do Diâmetro da Roseta RGR do Número de Folhas Nome do cmz/dia cmldia Evento # Gene Méd. Val-p Méd. Val-p Méd. Val-p Áum. Aum. Aum. LNU952 78218,1 - - - 5,74 0,18 17 0,354 0,12 13 LNU952 78219,3 - - - - - - 0,345 0,23 10 INU945 78998,2 - - - - - - 0,347 0,20 10 LNU920 78507,1 - - - 6,13 0,06 25 0,377 0,03 20 LNU920 78508,1 - - - 5,90 0,10 20 - - - LNU920 78508,2 - - - 6,12 0,05 25 0,372 0,02 18 LNU916 78208,3 - - - 5,84 0,15 19 0,349 0,19 11 LNU914 80516,2 - - - 5,79 0,15 18 0,356 0,09 13 LNU914 80516,4 - - - - - - 0,344 0,24 10 LNU911 80424,2 - - - - - - 0,349 0,16 11 LNU905 79674,3 - - - 5,56 0,28 13 0,349 0,21 11 LNU905 79675,3 - - - 6,01 0,08 23 0,369 0,03 17 LNU840 78676,1 - - - 5,78 0,15 18 0,368 0,04 17 LNU840 78676,4 - - - 6,08 0,06 24 0,346 0,21 10 LNU834_H1 80402,7 - - - 5,61 0,26 14 0,348 0,20 11 LNU832_H2 80605,1 - - - - - - 0,348 0,22 11 LNU819 78133,3 - - - - - - 0,342 0,26 9 LNU791 77893,1 - - - 6,26 0,04 28 0,381 0,01 21 LNU791 77893,2 - - - 5,77 0,16 18 0,357 0,09 14 LNU760_H1 80127,2 - - - 6,04 0,08 23 0,358 0,09 14 CONT. - - - - 4,90 - - 0,314 - - LNU966 78604,1 0,819 0,23 12 9,03 0,03 29 - - - LNU966 78605,5 0,839 0,15 15 9,63 L 38 0,374 0,25 11 LNU966 78605,7 - - - 8,64 0,04 24 0,375 0,23 11 LNU941 78611,1 0,833 0,13 14 8,08 0,16 16 - - - LNU941 78613,1 - - - 8,95 0,02 28 0,381 0,17 13 LNU941 78613,5 - - - 8,12 0,22 16 - - -

RGR da Cobertura do Lote RGR do Diâmetro da Roseta RGR do Número de Folhas N me /o em'/dia cm/dia do Evento # Gone Méd.

Vat-p Med.

Val-p Méd.

Val-p Aum.

Aum Aum.

LNU941 78615,3 0,812 0,28 11 8,86 0,02 27 0,376 0,22 11 LNJ925 78992,1 - - - 9,16 0,02 31 0,385 0,16 14 LNU925 78992,6 - - - - - - 0,371 0,29 10 LNU922 78290,1 0,833 0,18 14 8,73 0,05 25 - - - LNU918 78433,1 0,805 0,22 10 - - - - - - LNU918 78433,2 - - - 8,28 0,13 18 - - - LNU918 78433,3 - - - 8,35 0,08 20 - - - LNU918 78433,8 0,841 0,08 15 - - - - - - LNU918 78434,2 - - - 7,84 0,27 12 0,375 0,22 11 LNU915 78426,1 - - - 8,47 0,07 21 0,375 0,24 11 LNU915 78427,1 - - - 8,24 0,14 18 - - - LNU915 78428,1 0,880 0,03 21 9,41 L 35 - - - LNU915 78428,2 0,812 0,20 11 7,87 0,26 13 - - - LNU909 78424,3 0,832 0,12 14 8,23 0,13 18 - - - LNU909 78425,4 0,802 0,26 10 8,36 0,11 20 - - - LNU909 78425,5 0,858 0,09 18 9,77 L 40 0,390 0,15 16 LNU909 78425,7 - - - 8,12 0,16 16 - - - LNU890 78202,1 0,871 0,05 19 8,89 0,02 27 - - - LNU854 78238,1 - - - 8,07 0,18 16 - - - LNU854 78240,1 - - - 8,49 0,10 22 0,383 0,24 14 LNU849 78498,4 - - - 8,44 0,06 21 - - - LNU849 78499,1 - - - 8,31 0,10 19 - - - LNU849 78500,3 - - - 8,66 0,07 24 0,380 0,24 13 LNU830 78741,3 - - - 8,18 0,15 17 0,378 0,22 12 LNU830 78741,5 0,917 0,05 26 9,41 L 35 0,379 0,22 12 LNU824 77826,1 0,877 0,07 20 9,81 L 40 0,403 0,06 20 LNU824 77828,4 - - - 8,21 0,13 17 - - - LNU824 77829,3 - - - 8,66 0,04 24 - - - LNU822 78623,2 - - - 9,81 L 40 0,398 0,13 18 LNU822 78623,6 0,809 0,27 11 10,5 L 50 0,418 0,02 24 LNU822 78623,7 0,817 0,23 12 8,88 0,03 27 0,379 0,20 13 LNU822 78625,2 0,828 0,28 13 9,05 0,03 29 0,381 0,23 13 LNU822 78625,7 - - - 8,20 0,16 17 - - - LNU813 77682,3 - - - 9,07 0,02 30 0,399 0,07 18 LNU806 78514,2 - - - 10,4 L 48 0,428 L 27 LNU806 78515,3 - - - 8,21 0,12 18 - - - LNU806 78515,4 0,876 0,04 20 8,08 0,17 16 - - - LNU806 78515,5 0,895 0,05 23 8,97 0,02 28 - - - LNU802 80307,3 - - - 7,86 0,26 13 - - - LNU802 80309,2 - - - 7,87 0,28 13 - - - LNU802 80309,3 - - - 8,00 0,21 15 - - - LNU802 80310,1 - - - 8,08 0,17 16 - - - LNU779 77887,2 0,822 0,18 13 9,09 0,01 30 0,377 0,23 12 LNU761 78157,6 0,828 0,20 13 8,18 0,14 17 - - - LNU761 78159,1 - - - 7,91 0,25 13 - - - LNU761 78160,3 0,848 0,12 16 9,99 L 43 0,410 0,03 22 CONT. - 0,730 - - 6,99 - - 0,337 - - LNU976 78364,1 - - - 5,53 L 48 0,334 0,01 27 LNU970 78388,1 - - - 4,43 0,15 18 - - - LNU970 78389,8 0,669 0,27 14 5,28 L 41 0,299 0,20 13 LNU968 77919,4 - - - 4,44 0,15 19 - - - LNU963 78383,4 - - - 4,46 0,14 19 - - - LNU962 78635,8 0,668 0,27 13 - - - - - - LNU950 78913,4 - - - 4,81 0,03 29 0,297 0,24 13 LNU950 78915,2 - - - 4,35 0,20 16 - - - LNU949 80553,5 - - - 4,56 0,11 22 0,299 0,23 14 LNU949 80553,8 - - - 4,80 0,03 28 - - - LNU949 80557,4 - - - 4,25 0,30 14 - - - LNU934 79008,1 - - - - - - 0,297 0,22 13

RGR da Cobertura do Lote RGR do Diâmetro da Roseta RGR do Número de Folhas Nome do [cm /dia] cm/dia Evento # Gene Méd.

Val-p % Méd.

Val-p %7° Méd.

Val-p °70 Aum.

Aum.

LNU908 79738,5 0,670 0,28 14 - - - - - - LNU902 79606,5 - - - 4,51 0,12 21 - - - LNU875 78413,4 - - - 4,40 0,19 18 - - - LNU873 80473,4 - - - 4,40 0,20 18 0,300 0,21 14 LNU843 78962,4 - - 4,61 0,08 23 - - - LN 0843 78963,2 - - - 4,35 0,20 16 - - - LNU790 78886,2 0,697 0,16 18 4,94 0,02 32 - - - LNU790 78886,3 0,677 0,27 15 4,25 0,28 14 0,292 0,30 11 LNU790 78889,2 0,686 0,21 17 - - - - - - LNU787 80547,7 0,721 0,09 22 - - - - - - LNU767 79146,1 0,695 0,20 18 5,12 L 37 0,302 0,17 15 LNU767 79146,2 - - - 4,43 0,15 19 0,300 0,18 14 CONT, - 0,589 - - 3,74 - - 0,263 - - LNU966 78605,5 0,819 0,20 17 - - - - - - LNU941 78614,2 - - - 13,8 0,19 23 - - - LNU922 78287,3 0,798 0,26 14 - - - - - - LNU915 78428,2 0,807 0,26 15 - - - - - - LNU854 78237,2 - - - 14,2 0,14 27 - - - LNU830 78741,5 - - - 13,3 0,28 19 - - - LNU813 77685,1 - - - 13,6 0,21 22 - - - LNU751 77477,1 0,878 0,07 25 - - - - - - CONT. - 0,702 - - 11,2 - - - - - LNU948 78378,1 - - - 10,5 0,04 22 - - - LNU888 78771,1 - - - 10,7 0,05 25 0,481 0,05 24 LNU881 78372,2 - - - 9,74 0,19 13 - - - LNU857 78867,2 - - - 9,70 0,23 13 - - - LNU816 78958,5 - - - 10,9 0,02 26 0,481 0,02 24 LNU816 78958,7 - - - 10,4 0,05 21 0,449 0,10 16 LNU809 79168,2 - - - 10,1 0,15 17 - - - LNU809 79168,3 - - - 9,60 0,28 11 0,430 0,26 11 LNU807 79248,1 - - - - - - 0,430 0,24 11 LNU795 79525,1 - - - 9,66 0,24 12 - - - LNU795 79525,5 - - - - - - 0,429 0,23 11 LNU788 78516,1 - - - 10,8 0,02 25 0,454 0,14 17 LNU788 78518,1 - - 12,2 L 41 0,466 0,04 20 LNU783 79178,2 - - - - - - 0,446 0,19 15 LNU778 78941,1 - - - 10,0 0,15 16 - - - LNU778 78944,2 - - - 9,86 0,16 14 0,432 0,22 12 LNU752 78153,10 - - - 11,1 0,03 29 0,503 0,01 30 CONT. - - - - 8,61 - - 0,388 - - LNU933 78897,1 0,890 0,12 17 - - - - - - LNU882 78975,3 0,863 0,23 13 - - - - - - LNU880 78196,1 - - - - - - 0,490 0,30 9 LNU880 78200,6 - - - 12,0 0,15 21 0,502 0,18 11 LNU848 77906,2 - - - 11,6 0,24 17 - - - LNU848 77907,4 0,866 0,18 14 - - - - - - LNU847 78967,2 0,892 0,13 17 - - - - - - LNU847 78967,4 0,858 0,23 13 - - - - - - LNU846 78436,2 0,938 0,04 23 - - - - - LNU846 78438,2 - - - - - - 0,502 0,16 11 LNU846 78439,4 0,852 0,26 12 13,1 0,02 32 0,506 0,13 12 LNJ828 77598,3 0,876 0,16 15 12,0 0,14 21 0,512 0,11 14 LNU814 78953,3 0,885 0,15 16 - - - - - - LNU814 78955,4 0,865 0,23 13 - - - - - - LNU772 78937,4 0,849 0,29 11 - - - - - - LNU772 78938,1 - - - 13,0 0,04 31 0,500 0,21 11 LNU772 78940,2 0,861 0,26 13 - - - - - - LNU757 77485,4 - - - 11,6 0,23 17 - - - LNU750 78863,2 - - - - - - 0,493 0,23 9

RGR da Cobertura do Lote RGR do Diâmetro da Roseta RGR do Número de Folhas Nome /o cm2/dia cm/dia Evento # Gene do Méd.

Val-p Méd.

Val-p p°um Méd.

Val-p Aum Aum.

CONT. - 0,762 - - 9,91 - - 0,451 - - LNU972 78907,1 - - - 9,59 0,11 22 - - - LNU972 78908,2 0,810 0,24 14 9,30 0,17 18 0,443 0,13 13 LNU972 78909,3 0,862 0,08 22 10,8 0,01 38 0,481 0,02 23 LNU961 79143,3 - - - 9,64 0,10 23 0,455 0,07 16 LNU961 79143,4 - - - - - - 0,438 0,18 12 LNU961 79145,3 0,801 0,27 13 9,44 0,14 20 0,443 0,13 13 LNU961 79145,6 0,806 0,26 14 - - - - - - LNU958 77687,2 0,893 0,05 26 10,5 0,02 33 0,492 L 26 LNU958 77687,5 - - - 9,85 0,06 25 0,448 0,10 14 LNU958 77689,1 - - 10,2 0,03 30 0,479 0,02 22 LNU958 77689,2 - - - 9,40 0,15 20 0,440 0,17 12 LNU948 78378,1 0,810 0,26 14 10,0 0,04 28 0,472 0,02 20 LNU948 78379,4 - - - 9,34 0,17 19 0,437 0,20 12 LNU948 78380,2 0,836 0,14 18 10,1 0,04 29 0,443 0,14 13 LNU921 79063,2 0,889 0,04 25 10,1 0,04 28 0,445 0,12 14 LNU921 79064,3 0,806 0,28 14 - - - 0,433 0,23 11 LNU913 78592,1 - - - 9,58 0,11 22 - - - LNU913 78592,3 0,798 0,29 13 9,17 0,22 17 - - - LNU913 78592,4 - - - 10,4 0,02 32 0,454 0,09 16 LNU913 78593,1 0,831 0,16 17 10,4 0,02 32 0,452 0,08 16 LNU913 78593,6 - - - 11,1 L 42 0,482 0,01 23 LNU912 78401,3 - - - - - - 0,431 0,28 10 LNU912 78403,2 - - - 10,1 0,04 28 0,462 0,05 18 LNU912 78404,1 0,806 0,25 14 9,74 0,08 24 0,441 0,16 13 LNU889 79601,4 - - - 9,11 0,23 16 0,433 0,23 11 LNU889 79602,4 0,802 0,29 13 9,30 0,19 18 - - - LNU888 78772,2 0,804 0,30 13 - - - - - - LNU881 78372,2 0,833 0,15 18 10,9 L 39 0,471 0,02 20 LNU881 78373,1 0,846 0,12 19 - - - - - - LNU881 78373,2 0,831 0,20 17 10,8 0,01 37 0,466 0,04 19 LNU823 78136,4 0,856 0,10 21 10,5 0,02 34 0,466 0,04 19 LNU816 78957,1 - - - 9,02 0,27 15 - - - LNU816 78958,4 - - - 10,5 0,01 34 0,455 0,07 16 LNU816 78958,7 - - - 11,3 L 44 0,497 L 27 LNU809 79168,3 - - - 9,38 0,17 19 0,456 0,07 16 LNUB09 79169,2 - - - 9,42 0,15 20 0,444 0,13 13 LNU783 79176,3 - - - 9,01 0,27 15 - - - LNU783 79176,6 - - 9,33 0,16 19 0,445 0,13 14 LNU783 79178,4 - - - - - - 0,462 0,04 18 LNU782 77441,1 0,884 0,07 25 10,1 0,04 29 0,428 0,28 9 LNU782 77444,10 0,812 0,23 15 - - - - - - LNU782 77444,2 0,798 0,29 13 - - - - - - LNU782 77444,9 - - - 10,9 L 39 0,509 L 30 LNU772 78938,1 0,945 0,02 33 11,7 L 49 0,506 L 29 LNU772 78940,2 - - - 9,42 0,14 20 - - - LNU762 79329,2 - - - 9,70 0,09 23 0,440 0,15 12 LNU757 77481,1 0,857 0,09 21 - - - - - - LNU757 77483,2 0,820 0,21 16 - - - - - - LNU757 77483,3 0,832 0,16 17 - - - 0,447 0,12 14 CONT. - 0,708 - - 7,85 - - 0,391 - - LNU882 78973,4 - - - 10,2 0,09 18 0,449 0,25 8 LNU807 79250,1 - - - 9,82 0,18 14 - - - LNU766 78932,1 - - - 10,6 0,04 22 - - - CONT. - - - - 8,64 - - 0,416 - - LNU975 80622,1 - - - 7,90 L 28 0,416 0,05 16 LNU975 80624,5 0,743 0,20 19 7,02 0,14 14 - - - LNU971 78395,1 - - - 7,01 0,16 14 - - - LNU971 78395,2 - - - 7,28 0,06 18 0,400 0,13 12

RGR da Cobertura do Lote RGR do Diâmetro da Roseta RGR do Número de Folhas Nome do cm21dia [cm/dial Evento# o a Gene v Méd.

Vaf-p Méd.

Val-p Méd.

Val-p Aum. , um.

Aum.

LNU960 78599,4 0,725 0,28 17 - - - - - - LNU960 78600,3 - - - 7,49 0,03 22 0,400 0,13 12 LNU957 80435,3 0,723 0,30 16 - - - - - - LNU955 80432,3 0,735 0,24 18 - - - - - - LNU955 80432,4 - - - 6,83 0,25 11 - - - LNU953 80429,1 0,722 0,30 16 - - - - - - LNU949 80553,7 - - - 6,94 0,19 13 - - - LNU949 80557,4 - - - 7,12 0,12 16 0,396 0,19 11 LNJ928 78212,1 0,818 0,04 31 - - - - - - LNU928 78213,1 - - - 6,82 0,25 11 - - - LNU923 77603,3 - - - - - - 0,391 0,24 9 LNU917 77500,4 - - - 6,91 0,25 12 - - - LNU906 79219,5 0,743 0,21 19 - - - - - - LNU904 78987,2 0,775 0,11 25 - - - - - - LNU901 80476,5 - - - 7,41 0,04 20 - - - LNU899 79765,4 - - - 6,88 0,22 12 0,395 0,18 10 LNU899 79766,2 - - - - - - 0,390 0,28 9 LNU897 80445,2 - - 8,64 L 40 0,431 0,01 20 LNU892 80410,1 - - - - - - 0,393 0,23 10 LNU884 80405,3 - - - 7,35 0,04 19 - - - LNJ884 80407,1 - - - 7,09 0,13 15 - - - LNU884 80408,2 - - - 7,12 0,15 16 - - - LNU884 80408,4 - - 7,10 0,13 15 0,395 0,21 10 LNU874 78366,3 - - - 7,47 0,03 21 0,402 0,11 12 LNU874 78370,1 - - - 7,03 0,13 14 - - - LNU874 78370,3 - - - 7,05 0,12 15 0,398 0,15 11 LNU874 78370,7 0,727 0,28 17 - - - - - - LNU873 80469,1 0,771 0,12 24 - - - - - - LNU873 80473,3 - - - 6,91 0,19 12 - - - LNU873 80473,6 - - - 6,88 0,21 12 0,400 0,13 12 LNU870 78501,1 - - - - - - 0,398 0,15 11 LNU870 78505,1 - - - - - - 0,401 0,14 12 LNU867 79589,3 - - - - - - 0,389 0,27 9 LNUS67 79590,3 0,746 0,22 20 - - - - - - LNU867 79590,4 - - - 7,30 0,07 18 - - - LNU867 79590,7 - - - 7,30 0,05 19 0,405 0,10 13 LNU866 80442,2 0,734 0,25 18 - - - - - - LNU866 80443,2 0,752 0,17 21 - - - - - - LNU866 80444,6 - - - 6,87 0,24 12 - - - LNU852 79757,1 - - - - - - 0,391 0,26 9 LNU862 79758,3 - - - - - - 0,392 0,22 10 LNU862 79758,5 - - 8,82 L 43 0,459 L 28 LNU856 79753,3 - - - 6,80 0,26 10 - - - LNU856 79753,5 0,742 0,21 19 - - - - - - LNU831 79331,7 - - - 8,43 L 37 0,428 0,01 20 LNU831 79335,2 0,783 0,10 26 - - - - - - LNU829 77912,3 - - - 7,24 0,07 18 0,399 0,16 11 LNU829 77914,1 0,774 0,11 24 - - - - - - LNU829 77914,2 - - - 6,90 0,21 12 0,398 0,15 11 LNU817 80598,1 - - - 6,81 0,28 11 - - - LNU800 77896,1 - - - 7,38 0,04 20 - - - LNU799 78672,5 0,725 0,29 17 - - - - - - LNU799 78672,7 - - - 7,09 0,11 15 - - - LNU799 78674,2 - - - 7,03 0,15 14 - - - LNU799 78674,5 - - - 7,50 0,02 22 0,406 0,10 13 LNU796 78235,5 0,755 0,16 21 - - - - - - LNU794 78522,1 - - - 7,67 0,02 25 - - - LNU794 78524,1 - - - 7,85 0,01 28 0,399 0,18 11 LNU794 78524,5 - - - 7,30 0,06 19 0,392 0,24 9

- -. ' .~ __-` _- .

RGR da Cobertura do Lote RGR do Diâmetro da Roseta RGR do Número de Folhas Nome /a cm2/dia cmldia Evento # Gene do Méd. Val-p Méd. Val-p Méd. VaI-p Aum. Aum. Aum. LNU794 78525,2 - - - 7,14 0,09 16 - - - LNU792 79161,2 0,778 0,11 25 - - - - - - LNU792 79162,2 0,720 0,30 16 - - - - - - LNU778 78943,5 0,778 0,10 25 - - - - - - LNU778 78944,1 0,841 0,03 35 - - - - - LNU778 78944,5 - - - 8,11 L 32 0,432 L 21 LNU773 80399,1 - - - 6,96 0,16 13 - - - LNU771 80077,2 - - - 6,83 0,28 11 0,403 0,12 13 LNU763 77588,6 - - - 7,62 0,02 24 - - - LNU763 77589,3 0,725 0,28 16 - - - - - - LNU758 79739,10 - - - 7,84 L 27 0,400 0,17 12 LNU753 77141,2 - - - 6,90 0,20 12 - - - LNU753 77143,3 - - 7,23 0,06 17 - - - LNU753 77144,1 - - - 6,88 0,21 12 0,387 0,29 8 CONT. - 0,622 - - 6,16 - - 0,358 - - LNU790 78890,1 - - - 14,8 0,04 29 0,510 0,25 13 CONT. - - - - 11,5 - - 0,452 - - LNU947 77448,4 - - - 12,6 0,02 32 - - - LNU940 77813,1 - - - 12,1 0,06 26 0,470 0,21 13 LNU900 78851,3 - - - 11,3 0,19 18 - - - LNU898 78983,4 - - - 11,7 0,11 23 0,468 0,23 13 LNU894 78283,7 - - - 12,4 0,04 29 - - - LNU846 78439,4 - - - 12,5 0,03 31 0,468 0,23 13 LNU815 77494,1 - - - 12,7 0,02 33 - - - LNU811 78179,1 - - - 11,8 0,10 24 - - - LNU756 77581,3 - - - 11,0 0,27 15 - - LNU751 77477,4 0,941 0,11 18 - - - - - - LNU751 77478,3 - - - 11,1 0,23 16 - - - CONT. - 0,800 - - 9,56 - - 0,415 - - LNU965 78360,5 - - - 13,7 0,11 20 0,534 0,16 10 LNU943 78407,2 - - - 13,4 0,16 17 - - - LNU913 78593,1 - - - 14,0 0,07 23 - - CONT. - - - - 11,4 - - 0,487 - - i aoeia 1 zo: - L L)N V - Lontroie; - mea.` - Media; "10 Aum. = % de aumento; 'Val-p" - valor p; L significa que o valor-p e menor que 0,01, p<0,1 foi considerado como significativo.

[00640] Os genes listados nas Tabelas 126-127 melhoraram a NUE da planta quando cultivada em níveis de concentração de nitrogênio padrão. Esses genes produziram plantas maiores com uma área fotossintética maior e biomassa melhorada (peso fresco, peso seco, número de folhas, diâmetro da roseta, área de roseta e cobertura de lote) quando cultivadas sob condições de nitrogênio padrão, comparado às plantas de controle cultivadas em condições de cultivo idênticas. Tabela 126 Genes mostrando a produção de biomassa melhorada da planta em condições de cultivo de nitrogênio padrão

Peso Seco m Peso Fresco m Número de Folhas Nome do Evento # Gene Méd.

Val-p Méd.

Val-p Méd, Val-p Aum.

Aum.

LNU966 78605,5 - - - - - - 12,1 0,07 5 LNU941 78611,1 - - - 3018,8 0,07 7 - - - LNU941 78613,1 2987,5 0,15 5 11,9 0,30 2 LNU941 78614,2 - - - 3137,5 L 11 - - - LNU941 78615,3 - - - - - - 13,1 L 13 LNU925 78991,7 - - - - - - 12,6 0,03 8 LNU925 78992,1 230,6 0,28 4 3031,2 0,21 7 12,2 0,28 6 LNU925 78992,6 - - - 2957,1 0,17 4 - - - LNU922 78290,1 - - - 2943,8 0,27 4 12,9 0,11 11 LNU918 78433,3 238,6 0,23 8 - - - - - - LNU918 78433,8 - - - 3156,2 0,06 11 - - - LNU918 78434,2 - - - - - - 12,5 0,19 8 LNU915 78426,1 236,2 0,25 7 - - - 12,4 0,04 7 LNU915 78428,1 242,5 0,30 10 3131,2 0,13 11 12,3 0,06 6 LNU915 78428,2 - - - - - - 12,1 0,05 5 LNU909 78424,3 236,2 0,16 7 - - - 12,9 L 12 LNU909 78425,4 - - - - - - 12,6 L 9 LNU909 78425,7 - - - - - - 12,4 L 7 LNU890 78202,1 - - - - - - 12,3 0,01 6 LNU854 78238,1 - - - - - - 12,0 0,15 4 LNU849 78498,4 - - - - - - 12,4 0,10 7 LNU849 78499,1 - - - 2981,2 0,27 5 - - - LNU849 78500,3 234,4 0,16 6 - - - - - - LNU830 78741,3 - - - - - - 12,0 0,11 4 LNU830 78741,5 - - - - - - 12,1 0,07 5 LNU824 77826,1 235,6 0,11 6 - - - 12,6 0,16 9 LNU822 78623,2 - - 2943,8 0,22 4 12,8 0,01 11 LNU822 78623,6 - - - 2937,5 0,25 4 11,9 0,30 2 LNU822 78625,2 - - - - - - 11,9 0,17 3 LNU822 78625,7 - - - - - - 12,1 0,05 5 LNU813 77682,3 - - - - - - 12,7 0,19 9 LNU806 78515,4 - - - - - - 12,9 L 12 LNU806 78515,5 - - - - - - 12,2 0,15 6 LNU802 80310,1 239,4 0,07 8 - - - - - - LNU779 77887,2 - - - - - 12,1 0,17 4 LNU779 77887,3 - - - - - 12,6 0,12 8 LNU761 78159,1 - - - - - - 11,9 0,29 3 LNU761 78160,3 235,0 0,19 6 - - - 12,5 0,08 8 CONT. - 221,4 - - 2832,1 - - 11,6 - - LNU976 78364,1 - - - - - - 9,75 0,11 5 LNU976 78364,2 - - - - 9,75 0,11 5 LNU976 78364,5 - - - - - - 9,69 0,22 5 LNU843 78962,4 - - - - - - 9,56 0,25 3 LNU790 78890,3 - - - - - - 9,81 0,28 6 CONT. - - - - - - - 9,27 - - LNU966 78605,5 11,9 0,02 8 LNU941 78613,1 403,2 0,03 14 5655,4 0,16 19 11,5 0,15 4 LNU941 78614,2 - - - 5047,3 0,24 6 12,1 0,04 10 LNU941 78615,3 377,9 0,24 7 - - - - - - LNU915 78427,1 - - - 5133,3 0,12 8 - - - LNU915 78428,1 373,8 0,27 5 5237,5 0,21 10 - - LNU915 78428,2 - - - 5231,2 0,17 10 - - LNU854 78238,1 - - - 5087,5 0,15 7 11,9 0,02 8 LNU849 78499,1 - - - - - - 11,4 0,17 4 LNU849 78500,1 - - - - - - 11,8 0,06 7 LNU830 78741,5 - - - - - - 12,3 L 12 LNU830 78742,6 - - - - - - 11,8 0,02 7 LNU813 77681,4 - - - - - - 11,5 0,15 4 LNU806 78514,2 - - - 5231,2 0,08 10 11,4 0,26 4 LNU806 78515,3 - - - - - - 11,5 0,27 4

Peso Seco m Peso Fresco m Número de Folhas Nome do Evento # Gene Méd.

Val-p °70 Méd.

Val-p °7o Méd.

Vai-p °70 Aum.

Aum.

LNU780 77489,4 - - - - - 11,6 0,15 5 LNU751 77477,4 - - - - - - 11,4 0,23 3 LNJ751 77480,1 - - - - - - 11,6 0,18 5 CONT. - 354,5 - - 4755,4 - - 11,0 - - LNU948 78376,3 240,0 L 32 2737,5 L 49 - - - LNU948 78378,1 226,2 0,03 24 2212,5 0,13 20 11,8 0,05 5 LNU921 79063,2 - - - - - - 12,1 L 8 LNU921 79064,2 257,5 0,02 41 2868,8 L 56 - - - LNU921 79064,3 286,2 L 57 3000,0 L 63 11,8 0,23 6 LNU91 2 78402,3 231,9 0,04 27 2581,2 0,04 40 - - - LNU912 78405,2 - - - - - - 12,3 0,19 10 LNU889 79599,1 237,5 0,07 30 2681,2 0,04 46 12,1 0,18 8 LNU889 79602,4 - - - - - - 11,9 0,30 7 LNU881 78373,1 231,2 0,02 27 2643,8 L 44 - - - LNU881 78373,2 259,4 0,06 42 3143,8 0,03 71 11,9 0,13 6 LNU881 78374,1 - - - - - - 12,0 0,01 7 LNU865 79761,2 267,5 L 47 3018,8 L 64 12,0 0,10 7 LNU865 79761,4 227,5 0,06 25 2618,8 0,17 42 12,0 L 7 LNU865 79761,7 281,2 L 54 3112,5 L 69 - - - LNU857 78868,2 - - - - - - 11,6 0,12 3 LNU831 79331,2 - - - - - - 11,7 0,14 5 LNU831 79333,1 265,0 0,04 45 3087,5 L 68 - - - LNU831 79333,2 258,5 L 42 2945,8 L 60 - - - LNU816 78957,1 242,5 L 33 2956,2 L 61 - - - LNU816 78958,5 - - - - - - 11,9 0,03 6 LNU816 78958,7 - - - - - - 11,9 0,13 6 LNU809 79168,5 229,4 0,23 26 2550,0 0,02 38 - - - LNU807 79248,1 - - - - - - 11,9 0,18 7 LNU807 79250,1 - - - - - - 11,6 0,12 3 LNU795 79521,6 - - - - - - 11,4 0,27 2 LNU795 79525,1 203,1 0,21 11 - - - - - - LNU795 79525,4 265,6 L 46 2950,0 L 60 - - - LNU788 78516,1 225,6 0,03 24 2437,5 0,03 32 - - - LNU788 78517,1 - - - - - - 12,4 0,08 11 LNU788 78517,2 - - - - - - 11,9 0,03 6 LNU788 78518,1 238,8 0,17 31 2331,2 0,07 27 12,4 0,04 11 LNU788 78520,4 - - - - - - 11,9 0,01 7 LNU783 79178,4 - - - - - - 11,8 0,23 6 LNU778 78944,1 - - - - - 11,8 0,02 6 LNU77B 78944,2 - - - - - - 11,8 0,05 5 LNU762 79328,3 - - - - - - 12,2 0,11 9 LNU762 79329,2 - - - - - 11,8 0,02 6 LNU752 78153,1 264,4 L 45 3043,8 L 65 12,1 L 8 LNU752 78155,2 - - - - - - 12,0 0,10 7 CONT. - 182,3 - - 1841,3 - - 11,2 - - LNU977 77991,4 - - - 4112,5 0,14 10 - - LNU977 78033,1 365,0 0,24 19 4481,2 0,24 20 - - LNU880 78196,1 342,5 0,02 12 4043,8 0,02 9 - - - LNU860 78197,4 - - - 3981,2 0,03 7 - - - LNU871 78191,1 319,4 0,24 5 - - - - - - LNU871 78191,3 326,2 0,20 7 4243,8 L 14 - - - LNU848 77906,2 - - 4100,0 0,29 10 - - - LNU848 77909,2 - - - 3987,5 0,08 7 - - - LNUB48 77909,5 - - - 4031,2 0,09 8 - - - LNU846 78438,1 322,1 0,18 5 - - - - - - LNU845 78920,1 - - - 4000,0 0,02 7 - - - LNU828 77600,4 331,9 0,23 9 4100,0 0,07 10 - - - LNU823 78122,2 321,2 0,19 5 3918,8 0,10 5 - - - LNU823 78136,1 327,5 0,28 7 - - - - - - LNU823 78136,4 320,8 0,30 5 - - - - - -

Peso Secam Peso Fresco m Número de Folhas Nome do Evento # Gene Méd, Val-p °7° Méd.

Val-p ~7° Méd.

Val-p °70 Aum.

Aum.

LNU823 78137,3 - - - - - - 12,3 0,11 6 LNU772 78937,4 - - - - - - 11,9 0,03 3 LNU772 78938,1 331,9 0,06 9 - - - 12,8 0,01 10 LNU757 77481,1 - - - 4098,2 0,13 10 - - - LNU757 77485,2 335,6 0,19 10 4081,2 0,28 10 - - - LNU757 77485,4 338,1 0,02 11 4250,0 0,08 14 - - - LNU750 78863,2 - - - - - 11,9 0,23 2 CONT. - 305,5 - - 3722,0 - - 11,6 - - LNU972 78907,1 386,2 0,29 7 5068,8 0,04 10 11,9 0,02 6 LNU972 78909,3 - - - - - 12,5 0,29 11 LNU961 79143,3 - - - - - 11,6 0,24 2 LNU961 79145,3 396,9 0,24 9 5556,2 L 20 - - - LNU961 79145,8 - - - 5037,5 0,05 9 - - - LNU958 77687,2 - - - - - - 12,4 L 9 LNU958 77687,5 - - - - - - 12,5 0,05 11 LNU958 77689,1 - - - - - - 12,0 0,02 6 LNU958 77689,2 - - - 5093,8 0,04 10 - - - LNU948 78379,4 - - - - - - 12,1 L 7 LNU948 78380,2 - - - 5275,0 0,16 14 12,3 L 9 LNU921 79063,2 - - - - - - 12,5 L 11 LNU921 79064,3 - - - - - - 11,9 0,05 5 LNU913 78592,1 - - - - - - 12,1 L 7 LNU913 78592,3 - - - - - - 12,4 0,16 9 LNU913 78592,4 - - - - - 13,1 0,26 16 LNU913 78593,6 - - - - - 13,1 L 16 LNU912 78403,2 - - - - - - 12,0 0,02 6 LNU912 78404,1 406,9 L 12 5300,0 0,07 15 - - - LNU888 78772,7 - - - - - - 12,3 0,02 9 LNU881 78372,2 - - - 5393,8 0,19 17 - - - LNU881 78373,1 406,2 L 12 5431,2 L 18 - - - LNU8B1 78373,2 - - - - - - 12,6 0,08 11 LNU881 78374,1 398,0 L 10 5265,2 L 14 12,4 0,06 9 LNU881 78374,4 - - - 5157,1 0,03 12 - - - LNU823 78136,1 - - - 5000,0 0,06 8 - - - LNU823 78136,4 391,2 0,03 8 5093,8 0,03 10 - - - LNU823 78137,3 390,3 0,24 8 5273,2 0,01 14 - - - LNU816 78957,1 - - - 5250,0 0,12 14 12,1 0,18 7 LNU816 78958,7 - - - - - - 12,7 0,28 12 LNU809 79168,3 - - - - - - 11,9 0,24 6 LNU782 77441,1 - - - - - - 12,2 0,04 8 LNU782 77443,3 - - - 4943,8 0,12 7 - - - LNU782 77444,9 - - - - - - 12,6 0,20 12 LNU772 78937,4 - - - 4962,5 0,08 8 - - - LNU772 78938,1 387,5 0,16 7 - - - 12,4 L 9 LNU772 78940,2 - - - - - 12,6 0,04 12 LNU762 79330,3 - - - 5019,6 0,22 9 - - - LNU757 77481,1 - - - - - - 12,5 0,05 11 LNU757 77483,2 - - - - - 11,8 0,14 5 LNU757 77485,2 - - - 4937,5 0,13 7 - - - LNU757 77485,4 - - - - - - 12,2 0,04 8 CONT. - 362,5 - - 4614,3 - - 11,3 - - LNU933 78900,5 - - - 2568,8 0,23 6 - - - LNU907 78872,3 - - - 2850,0 0,08 17 - - - LNU907 78872,8 - - - 2662,5 0,04 9 - - - LNU8B2 78973,4 - - - - - - 13,8 0,11 8 LNU871 78195,4 286,2 0,13 13 2625,0 0,21 8 - - - LNU865 79761,2 271,9 0,25 7 - - - - - - LNU857 78867,2 - - - 2622,3 0,08 8 - - - LNU848 77909,3 - - - - - - 13,2 0,08 4 LNU847 78967,4 - - - 2687,5 0,30 10 - - -

Peso Seco m Peso Fresco m Número de Folhas Nome do Evento # Gene Méd, Val- °7o Méd.

Val- °70 Méd.

Val- °70 p Aum. p Aum. ~ Aum.

LNU835 78186,6 - - - 2731,2 0,29 12 - - - LNU835 78187,2 - - - 2706,2 0,12 11 - - - LNU835 78189,1 - - - 2637,5 0,06 8 - - - LNU828 77600,4 - - - 2718,8 0,05 12 - - - LNU807 79250,1 - - - - - - 13,3 0,12 4 LNU798 79671,4 - - - - - - 13,1 0,20 2 LNU795 79521,3 295,6 0,03 17 2650,0 0,05 9 - - - LNU795 79525,4 - - - 2556,2 0,24 5 - - - LNU766 78931,2 - - - - - - 13,1 0,20 2 LNU766 78932,1 291,9 0,03 15 2937,5 L 21 13,3 0,03 4 LNU752 78153,1 - - - 2662,5 0,04 9 - - - LNU750 78863,3 - - - 2650,0 0,13 9 - - - CONT. - 253,4 - - 2433,9 - - 12,8 - - LNU976 78364,1 - - 3637,5 0,27 11 - - - LNU976 78364,2 - - - - - - 12,2 0,14 3 LNU970 78389,8 276,2 0,11 12 3700,0 L 13 - - - LNU968 77917,3 - - - 3470,5 0,12 6 - - - LNU967 79001,1 - - - 3493,8 0,14 7 - - - LNU967 79002,4 258,1 0,07 5 3511,6 0,24 8 - - - LNU963 78383,4 255,0 0,22 4 3668,8 L 12 - - - LNU963 78384,2 268,8 0,02 9 3493,8 0,11 7 - - - LNU950 78915,2 263,1 0,06 7 3581,2 0,06 10 - - - LNU934 79007,5 - - - - - - 12,2 0,09 3 LNJ908 79734,4 - - - 3443,8 0,14 6 12,1 0,29 2 LNU908 79736,2 - - - 3525,0 0,18 8 - - - LNU908 79736,4 258,1 0,21 5 - - - - - - LNU902 79604,2 256,2 0,24 4 3600,0 0,11 10 - - - LNU902 79604,4 - - - - - - 12,5 0,03 5 LNU902 79606,1 - - - 3518,8 0,05 8 - - - LNU885 78416,1 - - - 3481,2 0,08 7 - - - LNU885 78416,5 - - - 3437,5 0,14 5 - - - LNU885 78419,3 261,9 0,04 6 3475,0 0,15 7 - - - LNU885 78420,1 265,6 0,01 8 3718,8 L 14 - - - LNU879 77799,2 - - - 3481,2 0,08 7 - - - LNU879 77799,3 259,4 0,24 5 - - - - - - LNU875 78413,4 - - - - - - 12,4 0,07 4 LNU875 78415,1 - - - 3562,5 0,24 9 - - - LNU858 79584,2 - - - 3625,0 0,15 11 - - - LNU858 79585,1 263,3 0,02 7 3747,3 0,05 15 - - - LNU858 79586,3 275,0 0,28 12 - - - 12,4 0,22 4 LNU790 78889,2 - - - - - - 12,5 0,16 5 LNU790 78890,1 268,1 0,11 9 3662,5 0,08 12 - - - LNU790 78890,3 - - - 3400,0 0,25 4 12,6 0,07 6 LNU767 79146,1 - - - - - - 12,3 0,06 4 LNU767 79146,2 263,1 0,02 7 3506,2 0,08 7 12,3 0,18 4 CONT. - 246,0 - - 3262,5 - - 11,9 - - LNU947 77446,1 318,8 0,02 8 3731,2 0,11 5 - - - LNU947 77447,3 318,1 0,02 8 3737,5 0,03 5 12,5 0,07 4 LNU940 77812,4 - - - 3737,5 0,03 5 - - - LNU900 78851,3 317,5 0,11 8 3800,0 0,03 7 - - - LNU900 78852,5 - - - 3678,6 0,11 3 - - - LNU900 78854,3 314,4 0,09 7 - - - - - - LNU898 78981,3 322,1 0,01 9 3873,2 0,11 9 12,4 0,14 3 LNU898 78983,4 325,6 0,01 10 3843,8 L 8 12,4 0,05 3 LNU898 78985,1 308,1 0,14 5 3750,0 0,07 5 - - - LNU898 78985,4 - - - 3656,2 0,18 3 - - - LNU894 78282,3 - - - 3750,0 0,07 5 12,6 0,20 5 LNU894 78283,4 316,2 0,13 7 3718,8 0,18 5 - - - LNU894 78283,7 322,5 0,10 9 3775,0 0,16 6 12,8 L 6 LNJ846 78436,2 323,8 L 10 3825,0 0,02 8 - - -

Peso Seco m Peso Fresco m Número de Folhas Nome do Evento # Gene Méd. Val Méd. Val- Méd. Val-p -p Aum. p ,'um A . p Aum. LNU820 77807,2 325,0 0,19 10 3737,5 0,05 5 - - - LNU815 77492,2 - - - 3712,5 0,06 4 - - - LNU815 77492,6 315,6 0,24 7 3818,8 0,10 7 12,5 0,07 4 LNU815 77494,1 - - - - - - 13,1 0,14 9 LNU815 77495,3 - - - - - - 12,5 0,02 4 LNU814 78953,2 - - - - - - 12,7 0,09 5 LNU814 78953,3 311,9 0,13 6 - - - - - - LNU814 78955,4 - - - - - - 12,6 0,14 4 LNU811 78176,1 - - 3775,0 0,02 6 - - - LNU811 78176,8 - - - - - - 12,4 0,05 3 LNU797 78025,2 - - - 3916,1 L 10 - - - LNU797 78025,3 - - - 3812,5 0,05 7 - - - LNU793 78166,4 303,8 0,29 3 - - - - - - LNU793 78167,2 - - - - - - 12,4 0,14 3 LNU793 78169,1 - - - - - - 12,5 0,27 4 LNU780 77489,4 - - 3689,6 0,28 4 - - - LNU776 79747,1 - - - 3834,5 0,28 8 - - - LNU769 78163,8 308,1 0,27 5 - - - - - - LNU769 78165,2 327,5 0,13 11 3681,2 0,13 4 - - - LNU759 77236,2 - - - 3632,1 0,30 2 - - - LNU759 77236,8 312,5 0,06 6 3825,0 0,08 8 - - - LNU751 77477,1 - - - 3806,2 L _ 7 - - - LNU751 77478,3 308,1 0,14 5 - - - - - - CONT. - 294,8 - - 3555,4 - - 12,0 - - LNU972 78907,1 - - - 4868,8 0,04 12 - - - LNU943 78407,1 - - - - - - 12,4 0,13 3 LNU943 78407,2 - - - - - 12,2 0,29 2 LNU913 78592,1 - - - - - - 12,4 0,03 3 LNU913 78592,4 432,5 0,25 17 4681,2 0,21 8 - - - LNU864 79339,2 - - - 4718,8 0,12 9 - - - LNUB50 78638,7 - - - 4837,5 0,05 11 - - - LNU76B 77883,4 - - - 4587,5 0,30 6 - - - CONT. - 368,8 - - 4341,1 - - 12,0 - - Tabela 126: "CONT" - Controle; "Méd." - Média; "% Aum." = % de aumento; "Val-p" - valor p; L significa que o valor-p é menor que 0,01, p<O,1 foi considerado como significativo.

Tabela 127 Genes mostrando a produção de biomassa melhorada da planta em condições de cultivo de nitrogênio padrão Cobertura do Lote [cm2l Area da Roseta cm Diâmetro da Roseta cm Nome do Evento # Gene Méd, Val- % Méd. Val- Méd. Val- % p Aum. p Aum. p Aum. LNU966 78604,1 87,4 0,28 11 10,9 0,28 11 5,52 0,28 7 LNU966 78605,5 87,3 0,17 11 10,9 0,17 11 - - - LNU941 78615,3 87,8 0,29 12 11,0 0,29 12 - - - LNU918 78434,2 - - - - - 5,48 0,19 6 LNJ915 78426,1 91,7 0,26 17 11,5 0,26 17 5,74 0,21 11 LNU915 78428,1 94,7 0,03 20 11,8 0,03 20 5,69 0,06 10 LNU909 78424,3 96,2 0,24 22 12,0 0,24 22 5,78 0,11 12 LNUB30 78741,5 - - - - - - 5,51 0,24 7 LNU824 77826,1 87,0 0,18 11 10,9 0,18 11 - - - LNU822 78623,7 91,8 0,28 17 11,5 0,28 17 5,61 0,29 8 LNU806 78515,4 86,7 0,19 10 10,8 0,19 10 5,49 0,17 6 LNU806 78515,5 100,9 0,19 28 12,6 0,19 28 5,96 0,27 15 CONT. - 78,6 - - 9,83 - - 5,17 - - LNU976 78364,1 42,6 L 44 5,33 L 44 4,05 L 24 LNU976 78364,5 35,5 0,01 20 4,44 0,01 20 3,64 0,02 11 LNU970 78388,1 35,7 0,02 21 4,46 0,02 21 3,70 0,15 13

Cobertura do Lote cm Area da Roseta cm Diâmetro da Roseta [cm] Nome do Evento # Gene Méd.

Val-p Méd.

Val-p °~° MÉd.

Val-p ° Aum.

Aum.

LNU970 78389,2 - - - - - - 3,39 0,16 3 LNJ970 78389,8 36,1 0,18 22 4,81 L 30 3,80 L 16 LNU970 78390,3 - - - - - - 3,41 0,10 4 LNU968 77918,3 33,3 0,15 13 4,17 0,15 13 3,46 0,26 6 LNU968 77919,4 35,9 L 21 4,49 L 21 3,64 L 11 LNU963 78383,4 32,2 0,07 9 4,03 0,07 9 3,43 0,18 5 LNU963 78385,1 34,1 0,20 15 4,26 0,20 15 3,53 0,21 8 LNU950 78913,4 - - - - - - 3,46 0,29 6 LNU949 80557,4 33,2 0,15 12 4,15 0,15 12 3,51 0,23 7 LNU934 79007,5 32,9 0,10 11 4,11 0,10 11 - - - LNU934 79008,1 32,7 0,22 10 4,09 0,22 10 3,48 0,20 6 LNU902 79606,5 - - - - - - 3,77 0,26 15 LNU843 78962,4 33,8 0,24 14 4,23 0,24 14 - - - LNU790 78886,3 31,7 0,19 7 3,96 0,19 7 3,39 0,16 4 LNU790 78890,1 35,0 L 18 4,38 L 18 3,62 L 10 LNU787 80547,3 31,4 0,21 6 3,92 0,21 6 3,43 0,07 5 LNU785 79616,8 35,5 0,01 20 4,43 0,01 20 3,49 0,02 7 LNU767 79146,1 35,0 0,27 18 4,38 0,27 18 - - - LNU767 79146,2 33,5 0,03 13 4,18 0,03 13 3,49 0,02 7 CONT, - 29,6 - - 3,70 - - 3,27 - - LNU941 78613,1 105,6 0,15 14 13,2 0,15 13 6,16 0,13 7 LNU915 78428,1 - - - - - - 6,18 0,26 7 LNU909 78425,4 - - - - - - 6,08 0,25 6 LNU830 78741,3 123,8 0,21 34 16,5 0,01 41 6,88 L 19 LNU830 78741,5 127,1 L 38 15,9 L 36 6,74 0,01 17 LNU830 78742,6 103,8 0,23 12 13,0 0,25 11 6,03 0,29 5 LNU813 77681,4 115,6 0,16 25 14,4 0,18 24 6,63 0,03 15 CONT. - 92,4 - - 11,7 - - 5,76 - - LNU948 78376,3 94,8 0,03 23 11,9 0,03 23 5,98 0,17 11 LNU948 78378,1 103,6 0,11 34 13,0 0,11 34 6,04 0,15 12 LNU921 79063,2 93,0 0,02 20 11,6 0,02 20 5,65 0,14 5 LNU921 79064,2 97,5 L 26 12,2 L 26 6,27 L 16 LNU921 79064,3 109,9 L 42 13,7 L 42 6,10 L 13 LNU889 79599,1 91,9 0,01 19 11,5 0,01 19 5,75 0,05 7 LNU889 79602,4 86,1 0,08 11 10,8 0,08 11 5,58 0,29 3 LNU888 78771,1 84,6 0,27 9 10,6 0,27 9 - - - LNU881 78372,2 94,2 L 22 11,8 L 22 5,94 L 10 LNU881 78373,1 95,7 0,03 24 12,0 0,03 24 5,81 0,04 8 LNU881 78373,2 108,9 0,08 41 13,6 0,08 41 6,31 0,14 17 LNU881 78374,1 95,8 0,03 24 12,0 0,03 24 5,93 0,01 10 LNU865 79761,2 129,8 L 68 16,2 L 68 6,89 L 28 LNU865 79761,4 111,1 L 44 13,9 L 44 6,58 0,03 22 LNU865 79761,7 95,8 0,23 24 12,0 0,23 24 5,92 0,12 10 LNU831 79333,1 93,5 0,11 21 11,7 0,11 21 5,88 0,12 9 LNU816 78957,1 101,1 0,27 31 12,6 0,27 31 6,04 0,02 12 LNU816 78958,5 100,6 0,09 30 12,6 0,09 30 5,99 0,03 11 LNU816 78958,7 95,0 1 23 11,9 L 23 5,82 0,02 8 LNU809 79168,3 84,4 0,14 9 10,5 0,14 9 5,72 0,07 6 LNU809 79169,5 87,1 0,20 13 10,9 0,20 13 5,67 0,14 5 LNU795 79525,1 92,3 0,07 19 11,5 0,07 19 5,85 0,02 8 LNU795 79525,4 92,7 0,20 20 11,6 0,20 20 - - - LNU795 79525,5 - - - - - - 5,61 0,17 4 LNU788 78516,1 110,6 0,06 43 13,8 0,06 43 6,25 L 16 LNU788 78517,1 97,7 L 26 12,2 L 26 5,88 0,01 9 LNU788 78518,1 125,2 0,06 62 15,6 0,06 62 6,62 L 23 LNU783 79178,2 85,4 0,15 10 10,7 0,15 10 5,58 0,24 3 LNU783 79178,4 84,9 0,22 10 10,6 0,22 10 5,95 0,02 10 LNU778 78944,1 109,0 0,16 41 13,6 0,16 41 6,16 0,18 14 LNU778 78944,2 87,1 0,06 13 10,9 0,06 13 5,61 0,22 4 LNU762 79328,3 86,0 0,15 11 10,7 0,15 11 - - -

Cobertura do Lote cm Area da Roseta cm2 Diâmetro da Roseta cm Nome do Gene Evento # Méd.

Val-p ~7o Méd.

Val-p X70 Méd.

Val-p X70 Aum.

Aum, Aum.

LNU762 79330,3 82,6 0,26 7 10,3 0,26 7 - - - LNU752 76153,1 - - - - - - 6,16 0,22 14 LNU752 78155,2 84,2 0,23 9 10,5 0,23 9 5,69 0,11 5 CONT. - 77,4 - - 9,67 - - 5,40 - - LNU882 78973,4 105,5 0,10 7 13,2 0,10 7 6,07 0,11 4 LNU848 77906,2 112,2 0,07 13 14,0 0,07 13 6,37 L 9 LNU846 78439,4 120,8 0,20 22 15,1 0,20 22 6,53 L 12 LNU823 78122,2 - - - - - - 6,04 0,19 3 LNU823 78137,3 109,4 0,19 10 13,7 0,19 10 - - - LNU814 78955,4 - - - - - - 5,99 0,28 2 LNU772 78938,1 122,1 L 23 15,3 L 23 6,48 0,11 11 LNU757 77485,4 103,0 0,28 4 12,9 0,28 4 - - - CONT. - 99,0 - - 12,4 - - 5,84 - - LNU972 78907,1 77,6 0,27 10 9,69 0,27 10 - - - LNU972 78909,3 87,4 L 23 10,9 L 23 5,90 0,09 13 LNU961 79143,4 - - - - - - 5,57 0,20 7 LNU961 79145,3 80,9 0,10 14 10,1 0,10 14 5,50 0,20 5 LNU958 77687,2 86,2 0,08 22 10,8 0,08 22 - - - LNU958 77687,5 88,0 0,05 24 11,0 0,05 24 6,04 0,05 16 LNU958 77689,1 81,8 L 16 10,2 L 16 5,53 0,02 6 LNU948 78378,1 84,7 0,28 20 10,6 0,28 20 5,76 0,24 10 LNU948 78379,4 75,6 0,14 7 9,45 0,14 7 - - - LNU948 78380,2 81,3 0,25 15 10,2 0,25 15 5,54 0,16 6 LNU921 79063,2 83,6 0,19 18 10,4 0,19 18 - - - LNU921 79064,3 83,6 L 18 10,5 L 18 5,65 0,02 8 LNU913 78592,1 90,3 0,03 28 11,3 0,03 28 5,91 L 13 LNU913 78592,3 83,4 0,03 18 10,4 0,03 18 5,58 0,15 7 LNU913 78592,4 90,8 L 28 11,4 L 28 5,79 0,03 11 LNU913 78593,1 85,4 L 21 10,7 L 21 5,68 L 9 LNU913 78593,6 95,2 L 35 11,9 L 35 5,88 L 13 LNU912 78403,2 81,4 L 15 10,2 L 15 5,70 L 9 LNU912 78404,1 80,8 0,17 14 10,1 0,17 14 - - - LNUB89 79599,1 74,2 0,29 5 9,28 0,29 5 - - - LNUB89 79601,4 75,9 0,16 7 9,49 0,16 7 5,46 0,14 5 LNU889 79602,4 74,8 0,21 6 9,35 0,21 6 5,43 0,14 4 LNUB81 78372,2 86,7 0,08 22 10,8 0,08 22 5,84 L 12 LNU881 78373,2 92,0 L 30 11,5 L 30 5,81 L 11 LNUB81 78374,1 79,5 0,14 12 9,94 0,14 12 - - - LNUB23 78136,4 80,5 0,01 14 10,1 0,01 14 5,50 0,03 5 LNU816 78957,1 86,7 0,03 22 10,8 0,03 22 5,78 0,11 11 LNU816 78958,7 96,7 L 37 12,1 L 37 6,13 L 17 LNUB09 79168,3 80,8 0,14 14 10,1 0,14 14 5,48 0,12 5 LNUB09 79169,2 80,4 0,01 14 10,1 0,01 14 5,48 0,04 5 LNU782 77441,1 87,6 0,04 24 10,9 0,04 24 5,72 0,02 10 LNU782 77444,2 76,2 0,26 8 9,53 0,26 8 - - - LNU782 77444,9 87,9 0,19 24 11,0 0,19 24 5,66 0,07 8 LNU772 78937,4 75,5 0,14 7 9,44 0,14 7 - - - LNU772 78938,1 99,5 L 41 12,4 L 41 6,35 0,03 22 LNU772 78940,2 85,8 L 21 10,7 L 21 5,86 L 12 LNU762 79329,2 75,6 0,24 7 9,45 0,24 7 - - - CONT. - 70,8 - - 8,85 - - 5,22 - - LNU882 78973,1 89,3 L 19 11,2 L 19 5,94 0,20 12 LNU882 78973,4 92,0 0,02 23 11,5 0,02 23 5,91 L 11 LNU871 78195,4 78,1 0,18 4 9,77 0,18 4 5,45 0,24 3 LNU865 79761,2 83,8 0,11 12 10,5 0,11 12 5,69 0,06 7 LNU865 79761,7 87,1 0,23 16 10,9 0,23 16 5,89 0,21 11 LNU857 78867,1 84,7 0,17 13 10,6 0,17 13 5,79 0,20 9 LNU835 78186,2 84,2 L 12 10,5 L 12 5,78 0,02 9 LNU807 79250,1 81,1 0,08 8 10,1 0,08 8 - - - LNU798 79671,4 88,0 0,03 17 11,0 0,03 17 5,72 0,08 8

Cobertura do Lote [cm1 Área da Roseta [cm2] Diâmetro da Roseta[cm] Nome do Evento # Gene Méd.

Val °"0 Méd.

Val- Méd.

Val- p Aum. p Aum, p Aum.

LNU795 79525,4 80,8 0,09 8 10,1 0,09 8 5,48 0,18 3 LNU766 78931,2 84,1 0,07 12 10,5 0,07 12 5,71 L 8 LNU766 78932,1 94,9 0,14 27 11,9 0,14 27 5,91 0,06 11 CONT. - 74,9 - - 9,36 - - 5,30 - - LNU976 78362,2 - - - - - - 6,38 0,08 6 LNU976 78364,2 116,5 0,10 14 14,6 0,08 12 6,57 0,02 10 LNU970 78389,8 140,6 L 38 17,6 L 36 6,84 L 14 LNU970 78390,3 119,1 0,06 16 14,9 0,05 15 6,53 0,11 9 LNU963 78383,1 - - - - - - 6,31 0,12 5 LNU963 78383,3 - - - - - - 6,28 0,22 5 LNU963 78384,2 119,9 0,05 17 15,0 0,03 16 6,38 0,07 6 LNU934 79007,5 127,0 0,17 24 15,9 0,19 23 - - - LNU902 79606,1 110,6 0,29 8 13,8 0,30 7 6,32 0,11 5 LNU885 78416,1 110,6 0,28 8 13,8 0,28 7 6,28 0,16 5 LNU885 78419,3 111,5 0,24 9 13,9 0,24 8 6,42 0,24 7 LNU879 77799,2 - - - - - - 6,25 0,29 4 LNU858 79586,3 113,6 0,22 11 14,2 0,24 10 6,41 0,06 7 LNU858 79587,2 - - - - - - 6,29 0,16 5 LNU790 78890,1 119,7 0,08 17 15,0 0,08 16 6,50 0,14 8 CONT. - 102,2 - - 12,9 - - 5,99 - - LNU947 77446,1 89,3 0,29 7 11,2 0,29 7 - - - LNU947 77447,3 96,7 0,01 16 12,1 0,01 16 5,74 0,16 6 LNU947 77448,4 125,6 L 50 15,7 L 50 6,93 0,09 28 LNU940 77812,4 95,1 0,04 14 11,9 0,04 14 5,79 0,05 7 LNL940 77813,1 106,9 L 28 13,4 L 28 6,02 L 11 LNU900 78851,3 101,5 0,03 21 12,7 0,03 21 5,85 0,07 8 LNU900 78854,3 95,3 0,05 14 11,9 0,05 14 6,01 0,07 11 LNU898 78983,4 104,6 L 25 13,1 L 25 6,00 0,02 11 LNU898 78985,1 97,5 0,30 16 12,2 0,30 16 - - - LNU898 78985,4 92,5 0,09 10 11,6 0,09 10 5,65 0,18 4 LNU894 78283,7 106,3 0,28 27 13,3 0,28 27 - - LNU846 78439,4 114,8 0,19 37 14,4 0,19 37 6,41 0,17 18 LNU820 77807,2 100,2 L 20 12,5 L 20 6,00 L li LNU815 77494,1 113,0 L 35 14,1 L 35 6,26 L 15 LNU815 77495,3 91,5 0,07 9 11,4 0,07 9 5,77 0,13 6 LNU814 78953,2 100,2 0,12 20 12,5 0,12 20 5,94 0,19 10 LNU814 78953,3 97,3 0,23 16 12,2 0,23 16 5,79 0,22 7 LNU811 78176,3 - - - - - - 5,66 0,18 4 LNU811 78176,8 95,2 0,21 14 11,9 0,21 14 - - - LNU811 78179,1 119,1 0,09 42 14,9 0,09 42 6,49 0,17 20 LNU797 78021,4 - - - - - - 5,70 0,10 5 LNU797 78025,3 100,3 0,15 20 12,5 0,15 20 5,96 0,08 10 LNU793 78166,4 - - - - - - 5,96 0,27 10 LNU793 78168,1 97,7 0,02 17 12,2 0,02 17 5,88 0,08 8 LNU793 78169,2 97,8 0,04 17 12,2 0,04 17 5,80 0,07 7 LNU769 78163,8 - - - - - - 5,78 0,08 6 LNU756 77581,3 98,6 0,26 18 12,3 0,26 18 5,89 0,20 9 LNU751 77478,3 95,4 0,02 14 11,9 0,02 14 - - - CONT. - 83,7 - - 10,5 - - 5,43 - - LNU972 78909,3 122,2 0,04 11 15,3 0,04 11 - - - LNU943 78407,2 123,5 0,23 12 15,4 0,23 12 - - - LNU913 78592,1 121,9 0,05 11 15,2 0,05 11 6,47 0,10 4 LNU913 78593,1 134,7 0,15 22 16,8 0,15 22 6,91 L 11 LNU864 79339,2 118,0 0,13 7 14,7 0,13 7 - - - LNU833 78184,1 117,7 0,11 7 14,7 0,11 7 6,52 0,18 5 LNU764 78926,1 116,1 0,16 5 14,5 0,16 5 - - - LNU764 78929,1 118,2 0,07 7 14,8 0,07 7 - - - CONT, - 110,3 - - 13,8 - - 6,21 - - Tabela 127: "CONT" - Controle; "Méd." - Média; "% Aum." = % de aumento; "Val-p" - valor p; L significa que o valor-p é menor que 0,01, p<0,1 foi considerado como significativo.

[00641] Os genes listados na Tabela 128 melhoraram a NUE da planta quando cultivada em níveis de concentração de nitrogênio padrão. Estes genes produziram plantas com desenvolvimento mais rápido quando cultivadas sob condições de cultivo limitantes de nitrogênio, em comparação com plantas de controle cultivadas sob condições idênticas, conforme medido pela taxa de crescimento do número de folhas, diâmetro da roseta e cobertura do lote.

Tabela 128 Genes mostrando o desempenho melhorado de crescimento da rnset_a em ccsndicões de cultivo de nitrogênio padrão RGR da Cobertura do Lote RGR do Diâmetro da Roseta RGR do Número de Folhas Nome do cm21dia cm/dia Evento # Gene Val-p Méd. Val-p % Méd. Val-p Méd. % A Aum. LNU941 78613,5 0,870 0,22 18 - - - - - - LNU941 78615,3 0,902 0,14 23 - - - - - LNU922 78290,1 0,916 0,11 25 - - - - - - LNU918 78433,8 0,889 0,16 21 - - - - - - LNU918 78434,2 0,864 0,27 18 - - - - - - LNU915 78426,1 - - - 11,0 0,28 18 0,454 0,29 16 LNU915 78428,1 - - - 11,4 0,19 22 - - - LNU915 78428,2 0,871 0,20 19 - - - - - - LNU909 78424,3 0,919 0,09 25 11,4 0,19 23 0,463 0,23 18 LNU909 78425,4 0,881 0,19 20 - - - - - - LNU849 78498,4 0,880 0,19 20 - - - - - - LNU830 78741,3 0,859 0,25 17 - - - - - LNU830 78741,5 0,851 0,29 16 - - - - - - LNU822 78623,2 0,859 0,28 17 - - - - - - LNU813 77682,3 0,862 0,27 17 - - - - - - LNU806 78515,4 0,921 0,10 25 - - - - - - LNU806 78515,5 - - - 12,0 0,09 30 0,460 0,27 18 LNU779 77887,3 0,887 0,16 21 - - - - - - CONT. - 0,734 - - 9,29 - - 0,391 - - LNU976 78364,1 - - - 5,11 L 43 0,312 0,02 22 LNU976 78364,5 - - - 4,32 0,07 21 0,297 0,07 17 LNU970 78388,1 - - - 4,32 0,07 21 - - LNU970 78389,8 - - - 4,21 0,12 18 0,293 0,10 15 LNU968 77918,3 - - - 4,01 0,28 13 - - - LNU968 77919,4 - - - 4,37 0,06 23 - - - LNU963 78385,1 - - - 4,07 0,22 14 - - - LNU949 80553,8 - - - 4,22 0,12 19 0,286 0,20 12 LNU949 80557,4 - - - 4,05 0,24 14 0,282 0,25 11 LNU902 79606,5 - - - 4,36 0,09 23 0,288 0,21 13 LNU843 78962,4 - - - 4,08 0,20 15 - - - LNU790 78890,1 - - - 4,16 0,14 17 0,284 0,22 11 LNU785 79616,8 - - - 4,26 0,09 20 - - - LNU767 79146,1 - - - 4,20 0,14 18 - - LNU767 79146,2 - - - 4,01 0,27 13 - - - CONT. - - - - 3,56 - - 0,255 - -

RGR da Cobertura do Lote RGR do Diâmetro da Roseta RGR do Número de Folhas Nome do cm2Idia c mldia Evento # Gene 0 0 0 Méd.

Val-p Méd.

Val-p Aum.

Aum.

LNU918 78433,1 0,818 0,28 15 - - - - - - LNU854 78238,1 0,816 0,30 15 - - - - - - LNU849 78500,1 0,819 0,29 15 - - - - - - LNU830 78741,3 - - - 15,4 0,09 35 0,615 0,12 24 LNU830 78741,5 - - 15,3 0,11 34 - - - LNU813 77681,4 - - - 14,3 0,21 25 - - - LNU780 77489,4 - - - 14,3 0,23 25 - - - CONT. - 0,712 - - 11,5 - - 0,497 - - LNU948 78376,3 - - - 13,9 0,13 26 0,579 0,29 15 LNU948 78378,1 - - - 15,2 0,04 38 - - - LNU948 78380,3 0,791 0,04 41 - - - - - - LNU921 79061,1 0,796 0,05 42 - - - - - - LNU921 79063,2 - - - 13,8 0,14 25 - - - LNU921 79064,2 - - - 14,4 0,06 31 0,632 0,06 25 LNU921 79064,3 - - - 16,4 L 49 0,597 0,16 18 LNU921 79065,1 0,781 0,05 39 - - - - - - LNU912 78401,4 - - - - - - 0,582 0,27 15 LNU912 78402,3 0,711 0,23 27 - - - - - - LNU912 76405,2 0,905 0,01 61 - - - - - - LNU889 79599,1 0,863 0,03 54 13,8 0,14 25 - - LNU889 79601,4 0,686 0,28 22 - - - - - - LNU888 78771,1 0,699 0,25 25 - - - - - - LNU881 78372,2 0,740 0,22 32 13,4 0,18 22 - - - LNU881 78373,1 0,688 0,24 23 14,6 0,06 33 0,584 0,22 16 LNU881 78373,2 - - - 16,3 0,01 48 0,639 0,06 27 LNU881 78374,1 - - - 13,9 0,13 26 - - - LNU881 78374,4 0,725 0,16 29 - - - - - - LNU865 79759,4 0,829 0,03 48 - - - - - - LNU865 79761,2 - - - 19,3 L 76 0,680 0,01 35 LNU865 79761,4 - - - 16,5 L 50 0,663 0,02 31 LNU865 79761,7 - - - 14,1 0,12 28 0,583 0,25 16 LNU857 78866,1 0,755 0,09 35 - - - - - - LNU857 78867,1 0,789 0,08 41 - - - - - - LNU857 78868,2 0,717 0,21 28 - - - - - - LNU857 78870,1 0,704 0,25 25 - - - - - LNU831 79331,2 0,720 0,21 28 - - - - - - LNU831 79331,5 0,704 0,24 25 - - - - - - LNU831 79333,1 - - - 14,1 0,11 28 0,615 0,11 22 LNU831 79333,2 - - - 13,4 0,25 21 - - - LNU816 78957,1 - - - 15,2 0,05 38 0,603 0,15 20 LNJ816 78958,2 0,692 0,25 23 - - - - - - LNU816 78958,4 0,768 0,10 37 - - - - - - LNU816 78958,5 - - - 14,8 0,05 35 0,576 0,28 14 LNUB16 78958,7 - - - 13,7 0,14 25 - - - LNUS09 79167,2 0,762 0,08 36 - - - - - - LNU809 79168,5 0,831 0,03 48 - - - - - - LNU807 79248,1 0,773 0,10 38 - - - - - - LNU807 79250,1 0,688 0,26 23 - - - - - - LNU795 79521,6 0,766 0,07 37 - - - - - - LNU795 79525,1 - - 13,3 0,21 21 - - - LNU795 79525,4 - - - 14,1 0,11 28 0,606 0,15 20 LNU788 78516,1 - - - 16,2 L 47 0,594 0,17 18 LNU788 78517,1 - - - 14,3 0,08 30 - - - LNU788 78517,2 - - - 13,3 0,25 21 - - - LNU788 78518,1 - - - 17,8 L 62 0,575 0,29 14 LNU788 78520,4 0,791 0,07 41 - - - - - - LNU783 79178,2 0,720 0,19 28 - - - - - - LNU783 79178,4 - - - - - - 0,587 0,21 16 LNU778 78944,1 - - - 16,3 0,01 48 0,593 0,21 18

RGR da Cobertura do Lote RGR do Diâmetro da Roseta RGR do Número de Folhas Nome do cm2/dia cm/dia Evento # Gene 0 0 0

Méd.

Val-p Méd, Val-p Méd.

Val-p Aum.

Aum.

LNU778 78944,2 0,719 0,23 28 - - - - - - LNU762 79326,1 0,697 0,29 24 - - - - - - LNU752 78151,2 0,686 0,26 22 - - - - - LNU752 78153,1 0,684 0,28 22 15,3 0,05 39 0,618 0,12 22 CONT. - 0,561 - - 11,0 - - 0,504 - - LNU846 78439,4 - - - 15,1 0,13 22 - - - LNU814 78955,5 0,958 0,09 17 - - - - - - LNU772 78938,1 - - - 15,1 0,13 22 - - LNU757 77483,2 0,925 0,19 13 - - - - - - CONT. - 0,818 - - 12,4 - - - - - LNU972 78907,1 0,923 0,01 20 - - - - - LNU972 78909,3 - - - 10,4 0,06 23 0,484 0,08 16 LNU961 79143,3 0,835 0,26 8 - - - - - - LNU961 79143,4 - - - - - - 0,458 0,28 10 LNU958 77687,2 - - - 10,2 0,09 21 - - - LNU958 77687,5 - - - 10,5 0,05 24 0,491 0,06 17 LNU958 77689,1 - - - 9,75 0,21 15 - - - LNU948 78378,1 - - - 9,85 0,21 17 0,469 0,19 12 LNU948 78380,2 - - - 9,66 0,26 14 - - - LNU921 79063,2 - - - 10,0 0,15 18 - - - LNU921 79064,3 - - - 9,89 0,17 17 - - - LNU913 78592,1 - - - 10,8 0,04 27 0,471 0,16 13 LNU913 78592,3 0,874 0,09 13 10,1 0,12 19 - - - LNU913 78592,4 0,887 0,14 15 10,8 0,03 27 0,462 0,24 10 LNU913 78593,1 - - - 10,2 0,09 21 - - - LNU913 78593,6 0,923 0,04 20 11,2 0,01 33 0,460 0,25 10 LNU912 78403,2 0,846 0,22 10 9,68 0,24 15 0,471 0,17 13 LNU912 78404,1 - - - 9,60 0,27 14 - - - LNU888 78772,1 0,847 0,26 10 - - - - - - LNU888 78772,7 0,877 0,14 14 - - - - - - LNU881 78372,2 - - - 10,1 0,12 20 0,467 0,19 12 LNU881 78373,2 0,856 0,21 11 11,0 0,02 31 0,466 0,19 11 LNU8B1 78374,1 0,890 0,08 16 - - - - - - LNU823 78136,4 - - - 9,63 0,26 14 - - - LNU816 78957,1 - - - 10,3 0,09 22 0,472 0,16 13 LNU816 78958,7 - - - 11,5 L 36 0,500 0,03 20 LNU809 79168,3 0,844 0,26 10 9,74 0,22 15 - - - LNU809 79169,2 - - - 9,59 0,27 13 - - - LNU782 77441,1 - - - 10,4 0,07 23 - - - LNU782 77444,9 - - - 10,4 0,08 22 - - - LNU772 78938,1 - - - 11,9 L 41 0,524 L 25 LNU772 78940,2 - - - 10,2 0,10 21 0,482 0,09 15 LNU757 77481,1 0,911 0,05 18 - - - - - - LNU757 77483,3 0,841 0,29 9 - - - - - - LNU757 77485,4 0,925 0,01 20 - - - - - - CONT. - 0,770 - - 8,45 - - 0,418 - - LNU882 78973,1 - - - 10,8 0,06 21 0,469 0,09 14 LNU882 78973,4 - - - 11,1 0,03 24 0,456 0,16 11 LNU865 79761,2 - - - 10,0 0,24 13 0,461 0,12 12 LNU865 79761,7 - - 10,4 0,13 17 0,466 0,10 14 LNU857 78867,1 - - 10,3 0,17 15 0,459 0,15 12 LNU848 77909,3 - - - 10,2 0,21 15 - - - LNU835 78186,2 - - - 10,1 0,23 13 0,461 0,12 13 LNU828 77598,3 - - - 10,3 0,18 15 - - - LNU807 79248,5 0,998 0,24 14 - - - - - - LNU798 79671,4 - - - 10,7 0,06 20 0,450 0,22 10 LNU766 78931,2 - - - 10,0 0,24 13 0,444 0,30 8 LNU766 78932,1 - - - 11,3 0,02 26 0,456 0,18 11 LNU752 78153,1 1,02 0,16 17 - - - - - -

RGR da Cobertura do Lote RGR do Diâmetro da Roseta RGR do Número de Folhas Nome do [cm /dia] cmldia Evento # Gene 0 0 0 Méd. Val-p Méd. Val-p Ácm Méd. Val-p Aum. Aum. CONT. - 0,873 - - 8,92 - - 0,410 - - LNU976 78364,2 - - - - - - 0,579 0,14 15 LNU970 78389,8 - - - 17,5 0,01 38 0,578 0,14 15 LNU970 78390,3 - - - 14,8 0,25 17 0,560 0,28 11 LNU963 78384,2 - - - 15,0 0,20 19 - - - LNU934 79007,5 - - - 15,5 0,14 23 - - - LNU924 77608,3 - - - - - - 0,558 0,30 11 LNU902 79604,4 0,894 0,11 19 - - - - - - LNU790 78890,1 - - - 14,7 0,26 16 - - - LNU790 78890,3 0,881 0,16 17 - - - - - - LNU767 79146,1 0,862 0,21 15 - - - - - CONT. - 0,750 - - 12,6 - - 0,503 - - LNU947 77447,3 - - - 11,7 0,23 15 - - - LNU947 77448,4 - - - 15,2 L 50 0,552 L 28 LNU940 77812,4 - - - 11,7 0,25 15 - - - LNU940 77813,1 - - - 13,0 0,03 28 0,482 0,18 12 LNU900 78851,3 - - - 12,2 0,11 21 - - - LNU900 78854,3 - - - 11,6 0,26 14 0,511 0,04 19 LNU898 78983,4 - - 12,7 0,05 26 0,482 0,17 12 LNU898 78985,1 - - - 12,0 0,17 18 0,480 0,21 12 LNU894 78282,3 - - - 12,0 0,20 18 - - - LNU894 78283,4 0,909 0,18 16 12,4 0,11 22 - - - LNU894 78283,7 - - - 12,8 0,07 27 0,485 0,28 13 LNU846 78438,2 - - - - - - 0,476 0,26 11 LNU846 78439,4 - - - 13,8 0,01 36 0,499 0,13 16 LNU820 77807,2 - - - 12,2 0,11 21 0,502 0,06 17 LNU815 77492,6 - - - 12,5 0,11 23 0,479 0,28 11 LNU815 77494,1 - - - 13,8 L 36 0,510 0,04 19 LNU815 77495,3 - - - - - - 0,476 0,23 11 LNU814 78953,2 - - - 12,1 0,13 20 0,490 0,13 14 LNU814 78953,3 - - - 11,8 0,23 16 - - - LNU811 78176,8 - - - 11,6 0,25 15 - - LNU811 78179,1 - - - 14,2 L 41 0,517 0,05 20 LNU797 78025,3 - - - 12,2 0,14 20 0,487 0,16 13 LNU793 78166,4 - - - 12,1 0,15 19 0,479 0,24 11 LNU793 78168,1 - - - 12,1 0,13 19 0,493 0,11 15 LNU793 78169,2 - - - 11,9 0,19 17 - - - LNU769 78163,4 - - - - - - 0,488 0,20 14 LNU769 78163,8 - - - - - - 0,480 0,22 12 LNU756 77581,3 - - - 12,1 0,14 20 0,483 0,19 12 LNU751 77477,1 0,878 0,25 12 - - - - - - LNU751 77477,4 0,914 0,19 16 - - - - - - LNU751 77478,3 - - - 11,7 0,23 15 - - - CONT. - 0,786 - - 10,1 - - 0,430 - - LNU913 78593,1 - - - 16,7 0,09 23 - - - LNU896 78978,1 0,887 0,26 14 - - - - - - CONT. - 0,777 - - 13,6 - - - - - I abeia 1lu: "CON I " - Controle; 'Méd. - Média; "% Aum." = °/o de aumento; "Val-p' - valor p; L significa que o valor-p é menor que 0,01, p<0,1 foi considerado como significativo.

EXEMPLO 19

AVALIAÇÃO DA NUE E PRODUÇÃO DE BRACHYPODIUM TRANSGÊNICA SOB FERTILIZAÇÃO NORMAL E DE BAIXO NITROGÊNIO EM ENSAIOS DE ESTUFA

[00642] Ensaio 1: Eficiência no Uso de Nitrogênio medida da biomassa e da produção da planta em concentração de nitrogênio limitada e ideal sob condições de estufa até o florescimento - Este ensaio segue a formação da biomassa e o crescimento da planta (medido por altura) das plantas que são cultivadas na estufa em condições limitantes e não limitantes (p.ex, normais) de nitrogênio. Sementes transgênicas de Brachypodium foram semeadas em plugues de turfa. As mudas transgênicas Ti foram, então, transplantadas para bandejas de 27,8 X 11,8 X 8,5 cm cheias com turfa e perlite na proporção de 1:1. As bandejas foram irrigadas com uma solução contendo condições limitantes de nitrogênio, as quais foram alcançadas irrigando as plantas com uma solução contendo 3 mM de nitrogênio inorgãnico sob a forma de NH4NOj, suplementado com 1 mM de KH2PO4, 1 mM de MgSO4, 3,6 mM de KC1, 2 mM de CaCl2 e microelementos, enquanto que os níveis normais de nitrogênio foram alcançados por meio da aplicação de uma solução de 6 mM de nitrogênio inorgãnico, também sob a forma de NHçNO3 com 1 mM de KH2PO4, 1 mM de MgSO4, 2 mM de CaC12, 3, Ede mM KC1 e microelementos. Todas as plantas foram cultivadas na estufa até brotarem. A biomassa da planta (o tecido acima do solo) foi pesada logo após a colheita dos brotos (peso fresco [FW] da planta). Em seguida, as plantas foram secadas em um forno a 70°C durante 48 horas e pesadas (peso seco [DWI da planta).

[00643] Cada estrutura foi validada em sua geração T1. As plantas transgênicas transformadas com uma estrutura formada por um vetor vazio que transporta o marcador selecionável BASTA foram utilizadas como controle (Figura 9B) .

[00644] As plantas foram analisadas quanto à sua dimensão total, ao seu peso fresco e à sua matéria seca. O desempenho das plantas transgênicas foi comparado às plantas de controle cultivadas em paralelo sob mesmas condições.

Plantas transgênicas falsas sem gene e nenhum promotor foram utilizadas como controle (Figura 9B).

[00645] O experimento foi planejado em blocos e com distribuição de lotes aninhados randomizados dentro deles. Para cada gene da invenção, cinco eventos de transformação independentes foram analisados a partir de cada estrutura.

Fenotipagem

[00646] Peso Fresco e Seco da Planta e do Broto - Em ensaios de florescimento, quando o estágio de florescimento foi concluído (cerca de 30 dias após a semeadura), as plantas foram colhidas e pesadas diretamente para a determinação do peso fresco da planta em escalas semianalíticas (0,01 g.) (FW) e deixadas secar a 70°C em uma câmara de secagem por cerca de 48 horas antes do peso para determinar o peso seco da planta (OW).

[00647] Tempo até o Florescimento - Em ambos os ensaios, Maturação de Semente e Florescimento, o florescimento foi definido como a aparência total da primeira espigueta na planta. 0 tempo até a ocorrência do florescimento é definido pela data em que o florescimento é completamente visível. 0 tempo para a data de ocorrência do florescimento foi documentado para todas as plantas e, então, o tempo a partir do plantio até o florescimento foi calculado.

[00648] Espessura da folha - Em ensaios de Florescimento, quando um mínimo de 5 plantas por lote em, pelo menos, 90% dos lotes em um experimento foi documentado no florescimento, a medição da espessura da folha foi realizada utilizando um micrômetro na segunda folha abaixo da folha bandeira.

[00649] Altura da Planta - Em ambos os ensaios, Maturação da Semente e Florescimento, uma vez que o florescimento estava completamente visível, a altura da primeira espigueta foi medida a partir do nível do solo até a parte inferior da espigueta.

[00650] Número de perfilhos - Em ensaios de Florescimento, a contagem manual de perfilhos foi realizada por planta após a colheita, antes da ponderação.

EXEMPLO 20

[00651] Ensaio 2: Eficiência no Uso de Nitrogênio medida da biomassa e da produção da planta em concentração de nitrogênio limitada e ideal sob condições de estufa até a Maturação de Sementes - Este ensaio segue a produção da biomassa e produção das plantas que foram cultivadas em estufa sob condições de cultivo limitantes e não limitantes de nitrogênio. Sementes de Brachypodium transgênicas foram semeadas em plugues de turfa. As mudas transgênicas Ti foram, então, transplantadas para bandejas de 27,8 X 11,8 X 8,5 cm cheias com turfa e perlite na proporção de 1:1. As bandejas foram irrigadas com uma solução contendo condições limitantes de nitrogênio, as quais foram alcançadas pela irrigação das plantas com uma solução contendo 3 mM de nitrogênio inorgânico sob a forma de NH4NO3, suplementado com 1 mM de KH2PO4 , 1 mM de MgSO4, 3,6 mM de KC1, 2 mM de CaCl2 e microelementos, enquanto que os níveis normais de nitrogênio foram alcançados por meio da aplicação de uma solução de 6 mM de nitrogênio inorgânico, também sob a forma de NH4NO3 com 1 mM de KH2PO4, 1 n-M de MgSO4, 2 mM de CaC12, 3,6 mM de KCl e microelementos.

Todas as plantas foram cultivadas na estufa até a maturação da semente. Cada estrutura foi validada em sua geração Ti. As plantas transgênicas transformadas com uma estrutura formada por um vetor vazio que transporta o marcador selecionável BASTA foram utilizadas como controle (Figura 9B).

[00652] As plantas foram analisadas quanto à sua biomassa total, ao seu peso fresco e à sua matéria seca, assim como a um grande número de parâmetros relacionados aos componentes de produção e produção. 0 desempenho das plantas transgênicas foi comparado para controlar plantas cultivadas em paralelo sob as mesmas condições. Plantas transgênicas falsas sem gene e nenhum promotor (Figura 9B). 0 experimento foi planejado em blocos com distribuição de lotes aninhados randomizados dentro deles. Para cada gene da invenção, cinco eventos de transformação independentes foram analisados a partir de cada estrutura.

Fenotipagem.

[00653] Peso Fresco e Seco da Planta e Vegetal - Em ensaios de Maturação de Sementes, quando o estágio de maturidade foi concluído (cerca de 80 dias após a semeadura),

as plantas foram colhidas e pesadas diretamente para a determinação do peso fresco da planta (FW) e deixadas secar a 70°C em uma câmara de secagem por cerca de 48 horas antes do peso para determinar o peso seco (OW) da planta.

[00654] Peso Seco da Espigueta (SDWISpikelets Dry weight) - Em ensaios de Maturação de Sementes, quando o estágio de maturidade foi concluído (cerca de 80 dias após semeadura), as espiguetas foram separadas da biomassa, deixadas secar a 70°C em uma câmara de secagem por cerca de 48 horas antes da ponderação para determinar o peso seco das espiguetas (SOW).

[00655] Produção de Grão por Planta - Em ensaios de Maturação de Semente, após a secagem das espiguetas para SDW, as espiguetas foram espalhadas por meio de uma máquina de produção, em seguida, por meio de uma máquina de limpeza, até que as sementes fossem produzidas por lote, em seguida, foram pesadas e a Produção de Grãos por planta foi calculada.

[00656] Número de Grãos - Em ensaios de Maturação de Sementes, depois que as sementes por lote foram produzidas e limpas, as sementes foram espalhadas por meio de uma máquina de contagem e contadas.

[00657] Peso de 1000 Sementes - Em ensaios de Maturação de Sementes, após a produção de sementes, uma fração foi colhida em cada amostra (sementes por lote; -0,5 g.), contada e fotografada. O peso de 1000 sementes foi calculado.

[00658] Índice de Colheita - Em ensaios de Maturação de Sementes, após a produção de sementes, o índice de colheita foi calculado, dividindo-se a produção de grãos e o peso seco vegetal.

[00659] Tempo até o Florescimento - Em ambos os ensaios, Maturação de Sementes e Florescimento, o florescimento foi definido como a aparição total da primeira espigueta na planta. 0 tempo para a ocorrência do florescimento é definido pela data em que o florescimento está completamente visível. 0 tempo para a data de ocorrência do florescimento foi documentado para todas as plantas e, então, o tempo a partir do plantio até o florescimento foi calculado.

[00660] Espessura da folha - Em ensaios de Florescimento, quando, no mínimo, 5 plantas por lote em, pelo menos, 90% dos lotes em um experimento foram documentadas no florescimento, a medição da espessura da folha foi realizada utilizando um micrômetro na segunda folha abaixo da folha bandeira.

[00661] Período de preenchimento do grão - Em ensaios de Maturação da Sementes, a maturação foi definida pela primeira mudança de cor da espigueta + caule na planta de verde a amarelo/marrom.

[00662] Altura da Planta - Em ambos os ensaios, Maturação de Sementes e Florescimento, uma vez que o florescimento estava completamente visível, a altura da primeira espigueta foi medida a partir do nível do solo até a parte inferior da espigueta.

[00663] Número de perfilhes - Em ensaios de Florescimento, a contagem manual dos perfilhos foi realizada por planta após a colheita, antes da pesagem.

[00664] Número de cabeças reprodutivas por planta - Em ensaios de Florescimento, a contagem manual das cabeças por planta foi realizada.

[00665] Análises estatísticas - Para identificar genes que conferem tolerância ao estresse abiótico significativamente melhorada, os resultados obtidos a partir das plantas transgênicas foram comparados com os obtidos a partir de plantas de controle. Para identificar genes e estruturas acima do desempenho, os resultados dos eventos de transformação independentes testados foram analisados separadamente. Os dados foram analisados utilizando o teste t de Student e os resultados foram considerados significativos, se o valor p foi inferior a 0,1. 0 pacote de software de estatística JMP foi utilizado (versão 5.2.1, SAS Institute Inc., Cary, NC, EUA).

[00666] Embora a invenção tenha sido descrita em conjunto com aplicações específicas respectivas, é evidente que muitas alternativas, modificações e variações serão evidentes aos especialistas na técnica. Consequentemente, ela destina-se a abranger todas essas alternativas, modificações e variações que recaiam no espírito e amplo escopo das reivindicações anexas.

[00667] Todas as publicações, patentes e pedidos de patente mencionados no presente relatório descritivo estão incorporados em sua totalidade por referência no referido relatório descritivo, na mesma extensão como se cada publicação individual, patente ou pedido de patente fosse específica e individualmente indicado como sendo incorporado aqui por referência. Além disso, a citação ou identificação de qualquer referência no presente pedido de patente não deverá ser interpretada como uma admissão de que tal referência esteja disponível como técnica anterior à presente invenção. Na medida em que os títulos da seção são utilizados, eles não deverão ser interpretados como necessariamente limitantes.

LEGENDAS DAS FIGURAS Figura 1 e 2 Ti) Borda esquerda T2) Borda direita T3) Promotor de nopalina sintase T4) Terminador da nopalina sintase T5) Gene da neomicina fosfotransferese T6) Sinal de poliadenilação A T7) Local de clonagem múltipla T8) Enzima de restrição T9) Gene repórter da GUS (sequência codificadora e intron) T10) pQYN-6669 Til) pQFNc Figura 3A T12) Condições normais Figura 3C T13) Estresse osmático (15% PEG) Figura 3E T14) Condições de limitação de nitrogênio Figura 4 Ti) Borda esquerda

T2) Borda direita

T3) Promotor de nopalina sintase

T4) Terminador da nopalina sintase

T5) Gene da neomicina fosfotransferese

T6) Sinal de poliadenilação A

T7) Local de clonagem múltipla

T8) Enzima de restrição

T15) Promotor de raiz

T16) pQNa RP

Figura 5 Ti) Borda esquerda

T2) Borda direita

T4) Terminador da nopalina sintase

T5) Gene da neomicina fosfotransferese

T6) Sinal de poliadenilação A

T9) Gene repórter da GUS (sequência codificadora e intron)

T17) tDNA invertido

T18) 2° intron (IV2) do gene ST-LS1

T19) Local invertido

T20) Promotor do NOS T21) Quadro de leitura aberto

T22) Pgyn tDNA revcomp 5714óp

Figura 6

Ti) Borda esquerda

T2) Borda direita

T4) Terminador da nopalina sintase

T5) Gene da neomicina fosfotransferese

T6) Sinal de poliadenilação A

T17) tDNA invertido

T19) Local invertido

T20) Promotor do NOS

T21) Quadro de leitura aberto

T23) Promotor do cid506 6669

T24) Inserir cassete

T25) pQFN 5967bp

Figura 7

T4) Terminador da nopalina sintase T6) Sinal de poliadenilação A

T9) Gene repórter da GUS (sequência codificadora e intron)

T17) tDNA invertido

T18) 20 intron (IV2) do gene ST-LS1

T19) Local invertido T20) Promotor do NOS

T23) Promotor do cid506 6669

T26) Inserir GUS+NOSTer

T27) pQFYN 8004bp

Figura 8

Ti) Borda esquerda

T2) Borda direita

T3) Promotor de nopalina sintase T4) Terminador da nopalina sintase

T5) Gene da neomicina fosfotransferese

T6) Sinal de poliadenilação A

T7) Local de clonagem múltipla

TB) Enzima de restrição

T28) pQXNc

Figura 9A/9B

T2) Borda direita

T4) Terminador da nopaliria sintase T29) promotor de ubiquitina

T30) Região 2LB (Borda esquerda)

T31) Barra ORF (ORF/Quadro de leitura aberta)

T32) pEBbVNi tDNA 3826bp

T33) pEBbNi tDNA 3288óp

Claims

REIVINDICAÇÕES

1. Método para aumentar taxa de crescimento, biomassa, rendimento de sementes, capacidade fotossintética e/ou tolerância ao estresse abiótico de uma planta em comparação com uma planta controle da mesma espécie que é cultivada sob as mesmas condições de crescimento, o método caracterizado pelo fato de superexpressar na planta um polipeptídeo que tem a sequência de aminoácidos estabelecida na SEQ ID NO: 524 ou um polipeptídeo ortólogo do mesmo que tem uma sequência de aminoácidos pelo menos 95% idêntica à SEQ ID NO:524, em que o referido polipeptídeo ortólogo é capaz de aumentar a taxa de crescimento, biomassa, rendimento de sementes, capacidade fotossintética e/ou tolerância ao estresse abiótico de uma planta, aumentando assim a taxa de crescimento, biomassa, rendimento de sementes, capacidade fotossintética e/ou estresse abiótico tolerância da planta.

2. Método de acordo com a reivindicação 1, caracterizado pelo fato de selecionar plantas que superexpressam o referido polipeptídeo para uma taxa de crescimento, biomassa, rendimento de sementes, capacidade fotossintética e/ou tolerância ao estresse abiótico aumentados de uma planta em comparação com uma planta controle da mesma espécie que é cultivado sob as mesmas condições de crescimento, em que o referido estresse abiótico é deficiência de nitrogênio.

3. Método de acordo com a reivindicação 1, caracterizado pelo fato de que o referido polipeptídeo é selecionado a partir do grupo que consiste nas SEQ ID NOs: 524 e 3055-3058.

4. Método de acordo com a reivindicação 1, caracterizado pelo fato de que o referido polipeptídeo é expresso a partir de um polinucleotídeo que tem a sequência de ácidos nucleicos selecionada do grupo que consiste nas SEQ ID NOs: 315, 29 e 958-961.

5. Método de acordo com a reivindicação 1, caracterizado pelo fato de que o referido polipeptídeo é expresso a partir de um polinucleotídeo que tem a sequência de ácidos nucleicos estabelecida pela SEQ ID NO: 315 ou 29.

6. Método de acordo com a reivindicação 1, caracterizada pelo fato de ainda cultivar a planta que superexpressa o referido polipeptídeo sob o estresse abiótico, em que o referido estresse abiótico é deficiência de nitrogenio.

7. Método de acordo com a reivindicação 1, caracterizado pelo fato de que o referido estresse abiótico é selecionado do grupo que consiste em salinidade, seca, estresse osmótico, privação de água, inundação, etiolação, baixa temperatura, alta temperatura, toxicidade de metais pesados, anaerobiose, deficiência de nutrientes, deficiência de nitrogênio, excesso de nutriente, poluição atmosférica e irradiação UV.

8. Método para produzir uma colheita, caracterizado pelo fato de cultivar uma planta de colheita que superexpressa um polipeptídeo que possui a sequência de aminoácidos estabelecida na SEQ ID NO: 524 ou um polipeptídeo ortólogo do mesmo que possui uma sequência de aminoácidos pelo menos 95% idêntica à sequência de aminoácidos estabelecida na SEQ ID NO: 524, em comparação com uma planta controle da mesma espécie que é cultivada sob as mesmas condições de crescimento, em que a planta de colheita é derivada de plantas selecionadas para taxa de cresciment aumentada, biomassa aumentada, rendimento de sementes aumentado, capacidade fotossintética aumentada, e/ou um tolerância ao estresse abiótico aumentado, em comparação com uma planta controle da mesma espécie que é cultivado sob as mesmas condições de crescimento, em que o referido estresse abiótico é deficiência de nitrogênio, e a planta da colheita tendo uma taxa de crescimento aumentada, biomassa aumentada, produção de sementes aumentada, capacidade fotossintética aumentada e/ou tolerância ao estresse abiótico aumentada, produzindo a colheita.

9. Método de acordo com a reivindicação 8, caracterizado pelo fato de que o referido polipeptídeo é expresso a partir de um polinucleotídeo que possui a sequência de ácidos nucleicos selecionada do grupo que consiste nas SEQ ID NOs: 315, 29 e 958-961.

10. Método de acordo com a reivindicação 8, caracterizado pelo fato de que a referida superexpressão é de um polipeptídeo que tem a sequência de aminoácidos estabelecida pela SEQ ID NO: 524.

11. Método de acordo com a reivindicação 8, caracterizado pelo fato de que o referido polipeptídeo é expresso a partir de um polinucleotídeo que possui a sequência de ácidos nucleicos selecionada do grupo que consiste nas SEQ ID NOs: 315 e 29.

12. Método para cultivar uma cultura, caracterizado pelo fato de semear sementes e/ou plantar plântulas de uma planta transformada com um construto de ácido nucleico que tem um polinucleido isolado que tem uma sequência de ácido nucleico que codifica um polipeptídeo possuindo a sequência de aminoácidos apresentada na SEQ ID NO: 524 ou um polipeptídeo ortólogo do mesmo que possua uma sequência de aminoácidos pelo menos 95% idêntica à sequência de aminoácidos estabelecida na SEQ ID NO: 524, e um promotor heterólogo para direcionar a transcrição da referida sequência de ácido nucleico em uma célula vegetal, em que a referida sequência de aminoácidos é capaz de aumentar a taxa de crescimento, biomassa, rendimento de sementes, capacidade fotossintética e/ou tolerância ao estresse abiótico de uma planta em comparação com uma planta controle da mesma espécie que é cultivada nas mesmas condições de crescimento, em que a planta é derivada de plantas selecionadas para pelo menos uma característica selecionada do grupo que consiste em: tolerância ao estresse abiótico aumentada, biomassa aumentada, taxa de crescimento aumentada, rendimento aumentado e capacidade fotossintética aumentada, em comparação com uma planta não-transformada, cultivando assim a cultura, em que o referido estresse abiótico é deficiência de nitrogênio.

13. Método para selecionar uma planta transformada tendo taxa de crescimento, biomassa, rendimento de sementes, capacidade fotossintética e/ou tolerância ao estresse abiótico aumentados em comparação com uma planta controle da mesma espécie que é cultivada nas mesmas condições de crescimento, o método caracterizado pelo fato de:

(a) fornecer as plantas transgênicas transformadas com um construto de ácido nucleico que tem um polinucleotídeo que codifica um polipeptídeo que tem uma sequências de aminoácidos apresentada pela SEQ ID NO: 524 ou um polipeptídeo ortólogo que tem uma sequência de aminoácidos pelo menos 95% idêntica a SEQ ID NO: 524 operacionalmente ligada a um promotor para direcionar a expressão em uma célula vegetal, em que a referida sequência de aminoácidos é capaz de aumentar a taxa de crescimento, biomassa, rendimento de sementes, capacidade fotossintética e/ou tolerância ao estresse abiótico de uma planta em comparação a uma planta controle da mesma espécie que é cultivada nas mesmas condições de crescimento; e (b) selecionar dentre as referidas plantas uma planta com taxa de crescimento aumentada, biomassa aumentada, rendimento de sementes aumentado, capacidade fotossintética aumentada e/ou tolerância ao estresse abiótico aumentada em comparação com uma planta controle da mesma espécie que é cultivada nas mesmas condições de crescimento, em que o referido estresse abiótico é deficiência de nitrogênio, selecionando assim a planta com rendimento, taxa de crescimento, biomassa, rendimento de sementes, capacidade fotossintética e/ou tolerância ao estresse abióticoaumentados em comparação com a planta controle da mesma espécie que é cultivada nas mesmas condições de crescimento.

14. Método de acordo com a reivindicação 1, caracterizado pelo fato de que o referido polipeptídeo ortólogo tem uma deleção, uma inserção e/ou uma substituição conservadora de aminoácido(s) em relação ao polipeptídeo estabelecido pela SEQ ID NO: 524, mantendo a capacidade de aumentar a taxa de crescimento, biomassa, o rendimento de sementes, a capacidade fotossintética, e/ou a tolerância ao stress abiótico, de uma planta, em que o referido estresse abioótico é deficiência de nitrogênio.

15. Método de acordo com a reivindicação 1, caracterizado pelo fato de que o referido polipeptídeo ortólogo é um polipeptídeo de ocorrência natural.

16. Método de acordo com a reivindicação 1, caracterizado pelo fato de que o referido polipeptídeo ortólogo é selecionado do grupo que consiste em SEQ ID NO: 3055-3058.

17. Método de acordo com a reivindicação 1, caracterizado pelo fato de que a referida superexpressão é do polipeptídeo estabelecido pela SEQ ID NO: 524.

18. Método de acordo com a reivindicação 8, caracterizado pelo fato de que o referido polipeptídeo ortólogo tem uma deleção, inserção e/ou uma substituição conservativa de aminoácido(s) com relação ao polipeptídeo apresentado pela SEQ ID NO: 524, mantendo a capacidade para aumentar a taxa de crescimento, biomassa, o rendimento de sementes, a capacidade fotossintética, e/ou a tolerância ao estresse abiótico de uma planta, em que o referido estresse abiótica é deficiência de nitrogênio.

19. Método de acordo com a reivindicação 8, caracterizado pelo fato de que o referido polipeptídeo ortólogo é um polipeptídeo de ocorrência natural.

20. Método de acordo com a reivindicação 8, caracterizado pelo fato de que o referido polipeptídeo ortólogo é selecionado a partir do grupo que consiste nas SEQ ID NOs: 3055-3058.

21. Método de acordo com a reivindicação 12, caracterizado pelo fato de que o referido polipeptídeo ortólogo tem uma deleção, uma inserção e/ou uma substituição conservativa de aminoácido(s) com respeito ao polipeptídeo estabelecido pela SEQ ID NO: 524, mantendo a capacidade para aumentar a taxa de crescimento, biomassa, rendimento de sementes, capacidade fotossintética, e/ou a tolerância ao estresse abiótico, de uma planta, em que a o referido estresse abiótico é deficiência de nitrogênio.

22. Método de acordo com a reivindicação 12, caracterizado pelo fato de que o referido polipeptídeo ortólogo é um polipeptídeo de ocorrência natural.

23. Método de acordo com a reivindicação 12, caracterizado pelo fato de que o referido polinucleotídeo isolado codifica o polipeptídeo estabelecido pela SEQ ID NO:

524.

24. Método de acordo com a reivindicação 12, caracterizado pelo fato de que o referido polipeptídeo ortólogo é selecionado a partir do grupo que consiste nas SEQ ID NO: 3055-3058.

25. Método de acordo com a reivindicação 13, caracterizado pelo fato de que o referido polipeptídeo ortólogo tem uma deleção, uma inserção e/ou uma substituição conservativa de aminoácido(s) com respeito ao polipeptídeo estabelecido pela SEQ ID NO: 524, mantendo a capacidade para aumentar a taxa de crescimento, biomassa, rendimento de sementes, a capacidade fotossintética, e/ou a tolerância ao estresse abiótico de uma planta, em que o referido estresse abiótico é deficiência de nitrogênio.

26. Método de acordo com a reivindicação 13, caracterizado pelo fato de que o referido polipeptídeo ortólogo é um polipeptídeo de ocorrência natural.

27. Método de acordo com a reivindicação 13, caracterizado pelo fato de que o referido polinucleótido codifica o polipeptídeo estabelecido pela SEQ ID NO: 524.

28. Método de acordo com a reivindicação 13, caracterizado pelo fato de o referido polipeptídeo ortólogo é selecionado a partir do grupo que consiste nas SEQ ID NO: 3055-3058.

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