WO2022186682A1 - Rank 리간드(rank ligand)에 특이적으로 결합하는 키메릭 항원 수용체 및 이의 용도 - Google Patents

Rank 리간드(rank ligand)에 특이적으로 결합하는 키메릭 항원 수용체 및 이의 용도 Download PDF

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WO2022186682A1
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chimeric antigen
rank
cell
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전태훈
양준
이창희
이나영
박인병
강석진
박시원
이현정
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주식회사 이뮤노로지컬디자이닝랩
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    • C12N—MICROORGANISMS OR ENZYMES; COMPOSITIONS THEREOF; PROPAGATING, PRESERVING, OR MAINTAINING MICROORGANISMS; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING; CULTURE MEDIA
    • C12N2510/00—Genetically modified cells

Definitions

  • the present invention relates to a chimeric antigen receptor that specifically binds to a RANK ligand; a polynucleotide encoding the chimeric antigen receptor protein; a vector comprising the polynucleotide; T cells or natural killer cells transformed with the vector; And it relates to a cell therapeutic agent or a pharmaceutical composition for the treatment of cancer comprising the cell as an active ingredient.
  • RANK ligand receptor activator of nuclear factor-kB ligand; RANK ligand; RANKL
  • TNF tumor necrosis factor
  • TRANCE TNF-related activation- induced cytokine
  • OPGL osteoprotegerin ligand
  • ODF osteooclast differentiation factor
  • mice in which the RANK ligand gene has been removed lack osteoclasts and exhibit traits such as osteopetrosis and tooth eruption disorders. arthritis and osteomyelitis) (Pettit et al., 2001; Rinotas et al., 2014).
  • RANK ligands are expressed in B lymphocyte tumors, particularly chronic lymphocytic leukemia (CLL) or multiple myeloma, and play a role in exacerbating these diseases (Croucher et al., 2001; Pearse). et al., 2001; Yaccoby et al., 2002; Sordillo et al., 2003; Secchiero et al., 2006).
  • CLL chronic lymphocytic leukemia
  • cytotoxic T lymphocytes CTL
  • NK cells natural killer cells
  • a single-chain variable fragment (scFv) portion of an antigen-recognizing antibody is grafted onto a domain grafted to CD3 zeta or the cytoplasmic signaling domain of another protein. It was attempted as a method of delivering chimeric antigen receptor (CAR).
  • CAR chimeric antigen receptor
  • the chimeric antigen receptor is grafted onto T cells or natural killer cells, it is possible to activate the anticancer action of T cells or natural killer cells only by recognizing specific antigens of scFv regardless of signal transduction by antigen presenting cells (APC).
  • APC antigen presenting cells
  • it since it is not limited to the HLA type, it can be used as a more efficient treatment method that can be used universally by many people. Indeed, these chimeric antigen receptor-expressing T cells or natural killer cells have shown efficacy in several cancers (Holzinger et al., 2016; Pettitt et al., 2018; Wang et al., 2020).
  • RANK receptor activator of nuclear factor kB
  • TRANCE receptor TNFRSF11A
  • TNFRSF11A tumor necrosis factor receptor superfamily
  • RANK.E125D+C127F was constructed, and RANK.E125D+C127F has an affinity for RANK ligand approximately 4 times higher than that of wild-type RANK (Son et al., 2015).
  • the present inventors used the fact that expression of RANK ligand in various cancer cells is confirmed or induced and that the RANK ligand and RANK are capable of binding.
  • Cancer-specific chimeric antigen receptor-expressing T cells and natural killer cells expressing RANK ligand were prepared using the extracellular domain of .E125D+C127F), and the T cells or natural killer cells were applied to cells expressing HLA class II.
  • the present invention was completed by confirming through an experiment that there is a cytotoxic ability.
  • Another object of the present invention is to provide a polynucleotide encoding the chimeric antigen receptor protein, a vector containing the polynucleotide, and T cells or natural killer cells transformed with the vector.
  • Another object of the present invention is to provide a pharmaceutical composition for preventing or treating cancer that kills cancer cells expressing a cell therapeutic agent or RANK ligand, including the transformed T cells or natural killer cells.
  • the present invention provides an antigen-binding domain; transmembrane domain; and an intracellular signaling domain, wherein the antigen binding domain comprises an extracellular domain of RANK that specifically binds to a RANK ligand.
  • the present invention provides a polynucleotide encoding the chimeric antigen receptor protein, a vector containing the polynucleotide, and T cells or natural killer cells transformed with the vector.
  • the present invention provides a pharmaceutical composition for the treatment of cancer that kills cancer cells expressing a cell therapeutic agent or RANK ligand, including the transformed T cells or natural killer cells.
  • the chimeric antigen receptor of the present invention comprises an extracellular domain of RANK that recognizes a RANK ligand. Therefore, in the case of cytotoxic T cells or natural killer cells transformed with vectors capable of overexpressing them, they have specific cytotoxicity to RANK ligand-expressing carcinomas, so they can be usefully used as immune cell therapeutics for cancer treatment. .
  • FIG. 1 is a schematic diagram showing the cDNA region of each domain expressing a chimeric antigen receptor according to an embodiment of the present invention.
  • FIG. 2A is a schematic diagram of a lentiviral vector according to an embodiment of the present invention.
  • 2B is a schematic diagram of a retroviral vector according to an embodiment of the present invention.
  • FIG. 3 is a schematic diagram of a chimeric antigen receptor expressed on the surface of cytotoxic T cells or natural killer cells according to an embodiment of the present invention.
  • RANK ligand positive cells cancer cells expressing RANK ligand (RANK ligand positive cells) and cancer cells not expressing RANK ligand (RANK ligand negative cells), which are targets of the chimeric antigen receptor provided in the present invention. It is a diagram showing the measurement result using .
  • 5a is a diagram showing the results of purification by affinity chromatography using a protein A column after making the chimeric antigen receptor provided in the present invention water-soluble and expressing it in Chinese hamster ovary (CHO) cells.
  • Figure 5b is a water-soluble chimeric antigen receptor according to an embodiment of the present invention using an antibody recognizing the constant region of a human IgG heavy chain (anti-human IgG heavy chain constant region antibody, anti-human IgG Fc region antibody) Western blotting It is a diagram showing the results confirmed by .
  • Figure 5c is a diagram showing whether the water-soluble chimeric antigen receptor according to an embodiment of the present invention recognizes cancer cells (RANK ligand positive cells) expressing the extracellular domain target RANK ligand using flow cytometry.
  • cancer cells RANK ligand positive cells
  • Figure 6a is a diagram showing the result of comparing the expression rate of GFP in cytotoxic T cells (RANK CAR-T cells) transduced with the expression vector according to an embodiment of the present invention using a lentiviral system.
  • Figure 6b is a diagram showing the result of comparing the expression ratio of RANK in natural killer cells (RANK CAR-NK cells) transduced with the expression vector according to an embodiment of the present invention using a retroviral system.
  • Figure 7a is a cytotoxic T cell (RANK CAR-T cell) or a cytotoxic T cell (Mock T cell) transduced with an empty vector according to an embodiment of the present invention as an effector cell (effector cell) RANK ligand It is a diagram showing the result of measuring the cytotoxicity to the expressing cancer cells (RANK ligand positive cells).
  • Figure 7b is a natural killer cell (RANK CAR-NK cell) or an empty vector transduced natural killer cell (Mock NK cell) according to an embodiment of the present invention as an effector cell (effector cell) expressing RANK ligand It is a diagram showing the result of measuring the cytotoxicity to cancer cells (RANK ligand positive cells).
  • the present invention provides an antigen-binding domain; transmembrane domain; and an intracellular signaling domain, wherein the antigen binding domain comprises an extracellular domain of RANK that specifically binds to a RANK ligand.
  • chimeric antigen receptor binds to a desired antigen without the mediation of antigen presenting cells (APCs) or antibodies necessary for naturally activating T cells or natural killer cells, thereby producing an antigen-antibody reaction. It may refer to a fusion protein for expression in T cells or natural killer cells in order to induce activation of T cells and attack cells expressing the corresponding antigen. In other words, when expressed in T cells or natural killer cells, it can be considered as a protein that binds to an antigen and induces activation of these cells. Through this, it may be a protein recognizing an antigen specific to a cell to cause an immune response, and the cell to cause an immune response may refer to a cell existing in a specific tissue or constituting a tissue causing a lesion.
  • APCs antigen presenting cells
  • the “RANK ligand” is an essential element for osteoclast generation, but the RANK ligand is abnormally high in expression in various carcinomas when normal cells are tumorigenic.
  • carcinomas expressing RANK ligands have been diagnosed with chronic lymphocytic leukemia (CLL), multiple myeloma, bone metastasis of cancer, osteosarcoma, prostate cancer or non-cancerous tumors. non-small cell lung cancer, but is not limited thereto.
  • Chimeric antigen receptor proteins according to the present invention include functional equivalents.
  • “Functional equivalent” means at least 70% or more, preferably 80% or more, more preferably 90% or more, more preferably the amino acid sequence of the chimeric antigen receptor as a result of addition, substitution, or deletion of amino acids. It refers to a protein having a sequence homology of 95% or more and exhibiting substantially homogeneous physiological activity. “Substantially homogenous physiological activity” means that it has an activity capable of specifically binding to a RANK ligand.
  • the present invention also includes fragments, derivatives and analogues of chimeric antigen receptors.
  • fragments, derivatives and analogues of chimeric antigen receptors As used herein, the terms 'fragment', 'derivative' and 'analog' refer to a polypeptide that retains substantially the same biological function or activity as the chimeric antigen receptor protein of the present invention.
  • Fragments, derivatives and analogs of the present invention include 1) polypeptides in which one or more conservative or non-conservative amino acid residues (preferably conservative amino acid residues) are substituted, wherein the substituted amino acid residues are encoded by the genetic code.
  • polypeptide may or may not) or 2) a polypeptide having substituent(s) at one or more amino acid residues, or 3) maturation associated with another compound (a compound capable of extending the half-life of the polypeptide, such as polyethylene glycol) a polypeptide derived from a polypeptide, or 4) the polypeptide associated with an additional amino acid sequence (eg, a leader sequence, a secretory sequence, a sequence used to purify the polypeptide, a proteinogen sequence or a fusion protein) It may be a polypeptide derived from The fragments, derivatives and analogs as defined herein are well known to those skilled in the art.
  • the antigen binding domain may be in the form of a dimer in which a pair of extracellular domains of RANK are linked to a human immunoglobulin G 1 heavy chain constant region (IgG 1 heavy chain constant region) in order to amplify signal transduction, respectively. It is not limited.
  • the extracellular domain of the RANK is characterized in that it specifically binds to a RANK ligand, which may consist of SEQ ID NO: 1 or an amino acid sequence having 95% or more homology thereto, but is not limited thereto.
  • the human immunoglobulin G 1 heavy chain constant region may consist of SEQ ID NO: 2 or an amino acid sequence showing 95% or more homology thereto, but is not limited thereto.
  • the transmembrane domain of the present invention is a site that connects the extracellular domain of RANK with the costimulatory and essential signaling domains between the cell membrane, and the intracellular signaling domain is an immune response of immune cells by binding of the antigen-binding domain. site that activates
  • the transmembrane domain is CD28, CD3 epsilon, CD45, CD4, CD5, CD8, CD9, CD16, CD22, CD33, CD37, CD64, CD80, CD86, CD134, CD137 and CD154. It may include a transmembrane domain of a protein selected from the group consisting of. Preferably, the transmembrane domain may be a transmembrane domain of CD8, which may consist of SEQ ID NO: 3 or an amino acid sequence showing 95% or more homology thereto, but is not limited thereto.
  • the intracellular signaling domain which is one component of the chimeric antigen receptor of the present invention, refers to a site that activates an immune response of an immune cell by binding to an antigen-binding domain.
  • the intracellular domain may be CD28, 4-1BB, CD3 zeta, or a combination thereof.
  • the chimeric antigen receptor of the present invention can exhibit a killing effect on cancer cells, particularly cancer cells expressing RANK ligand, with high activity by using CD28, 4-1BB, and CD3 zeta as intracellular signaling domains.
  • the CD28 is SEQ ID NO: 4 or 70% or more, preferably 80% or more, more preferably 90% or more, even more preferably 95% or more sequence homology thereto, and the amino acid sequence represented by SEQ ID NO: 4 and amino acid sequences exhibiting substantially equivalent functions;
  • 4-1BB (CD137) is SEQ ID NO: 5 or it has at least 70%, preferably at least 80%, more preferably at least 90%, even more preferably at least 95% sequence homology thereto, and is represented by SEQ ID NO: 5 It may consist of an amino acid sequence that exhibits a function substantially equivalent to that of the amino acid sequence;
  • CD3 zeta functions as an NK cell activation domain and has SEQ ID NO: 6 or more, preferably 80% or more, more preferably 90% or more, even more preferably 95% or more sequence homology thereto. As such, it may consist of an amino acid sequence that exhibits substantially equivalent functions to the amino acid sequence represented by SEQ ID NO: 6.
  • the antigen-binding domain may include a signal peptide, and the signal peptide may be encoded by SEQ ID NO: 7 or an amino acid sequence exhibiting 95% or more homology thereto, but is not limited thereto.
  • a polynucleotide encoding the chimeric antigen receptor protein in another aspect according to the present invention, there is provided a polynucleotide encoding the chimeric antigen receptor protein.
  • the polynucleotide encoding the antigen receptor of the present invention changes the amino acid sequence of the antigen receptor expressed from the coding region due to codon degeneracy or in consideration of the codon preferred in the organism to express the antigen receptor.
  • Various modifications may be made to the coding region within the range that does not occur, and various modifications or modifications may be made within the range that does not affect the expression of the gene in parts other than the coding region, and such modified genes are also within the scope of the present invention. It will be well understood by those skilled in the art.
  • nucleic acid bases may be mutated by substitution, deletion, insertion, or a combination thereof, and these are also included in the scope of the present invention.
  • a vector comprising the polynucleotide and a cell transformed with the vector.
  • the vector used in the present invention a variety of vectors known in the art may be used, and depending on the type of host cell to produce the antigen receptor, such as a promoter, terminator, enhancer, etc. Expression control sequences, sequences for membrane targeting or secretion, etc. can be appropriately selected and variously combined according to the purpose.
  • the vector of the present invention includes, but is not limited to, a plasmid vector, a cosmid vector, a bacteriophage vector, and a viral vector. Suitable vectors include a signal sequence or leader sequence for membrane targeting or secretion in addition to expression control elements such as promoter, operator, start codon, stop codon, polyadenylation signal and enhancer, and may be prepared in various ways depending on the purpose.
  • a vector for a lenti-virus or a vector for a retro-virus can be used.
  • pLNCX2 retro-virus vector
  • a cell can be transformed by introducing a chimeric antigen receptor that specifically binds to the RANK ligand of the present invention into the cell through the vector.
  • the cells may be T cells, tumor infiltrating lymphocytes, B cells, NK cells, or NK-T cells, preferably cytotoxic T cells and NK cells.
  • the cell may be obtained or prepared from bone marrow, peripheral blood, peripheral blood mononuclear cells or umbilical cord blood, and the cell may be a human cell, but is not limited thereto.
  • a chimeric antigen receptor that specifically binds to a RANK ligand can be transformed into cytotoxic T cells or natural killer cells (NK cells) using the vector described above.
  • the cells transformed by introducing the chimeric antigen receptor of the present invention recognize the RANK ligand as an antigen and have a characteristic of strongly binding thereto.
  • chimeric antigen receptor T cells (hereinafter abbreviated as 'CAR-T cells')" or “chimeric antigen receptor NK cells (hereinafter referred to as chimeric antigen receptor NK cells)" 'CAR-NK cells')" is a chimeric antigen receptor that specifically responds to cancer cells other than the original T cell receptor or NK cell receptor by transducing normal T cells or natural killer cells, etc. refers to T cells or NK cells expressing T cells or NK cells having the above receptor induce apoptosis of target cells, thereby exhibiting cytotoxicity.
  • CAR-T cells or CAR-NK cells may be cytotoxic T cells or cells in which the chimeric antigen receptor of the present invention is introduced into NK cells.
  • the cells have the advantage of anticancer-specific targeted therapy, which is the existing advantage of CAR-T therapeutics.
  • the cytotoxic T cells or NK cells equipped with the chimeric antigen receptor of the present invention recognize cancer cells expressing RANK ligands and effectively can destroy
  • a cell therapeutic agent comprising the cell; a pharmaceutical composition for preventing or treating cancer expressing a RANK ligand comprising the same as an active ingredient; And it provides a method for preventing or treating cancer comprising administering the cells to a subject.
  • cell therapeutic refers to cells and tissues manufactured through isolation, culture, and special manipulation from an individual, and is a drug (US FDA regulations) used for the purpose of treatment, diagnosis, and prevention, restoring the function of cells or tissues. It refers to a drug used for the purpose of treatment, diagnosis, and prevention through a series of actions such as proliferating and selecting living autologous, allogeneic, or xenogeneic cells in vitro or changing the biological properties of cells in other ways.
  • treatment refers to any action in which symptoms caused by cancer expressing RANK ligands are improved or beneficially changed by administration of the composition.
  • composition may include a pharmaceutically acceptable carrier.
  • the "pharmaceutically acceptable carrier” may mean a carrier or diluent that does not inhibit the biological activity and properties of the injected compound without irritating the organism.
  • the type of carrier usable in the present invention is not particularly limited, and any carrier commonly used in the art and pharmaceutically acceptable may be used.
  • Non-limiting examples of the carrier include saline, sterile water, Ringer's solution, buffered saline, albumin injection solution, dextrose solution, maltodextrin solution, glycerol, ethanol, and the like. These may be used alone or may be used in combination of two or more.
  • composition comprising a pharmaceutically acceptable carrier may be in various oral or parenteral formulations.
  • formulation it is prepared using diluents or excipients such as fillers, extenders, binders, wetting agents, disintegrants, and surfactants that are usually used.
  • solid preparations for oral administration include tablets, pills, powders, granules, capsules, etc., and these solid preparations include at least one excipient to the compound, for example, starch, calcium carbonate, sucrose, lactose. , gelatin, etc. may be mixed and prepared.
  • excipients for example, starch, calcium carbonate, sucrose, lactose. , gelatin, etc.
  • lubricants such as magnesium stearate and talc may also be used.
  • Liquid formulations for oral use include suspensions, solutions, emulsions, and syrups.
  • various excipients such as wetting agents, sweeteners, fragrances, and preservatives may be included. have.
  • Formulations for parenteral administration include sterile aqueous solutions, non-aqueous solutions, suspensions, emulsions, lyophilized formulations and suppositories.
  • Non-aqueous solvents and suspending agents include propylene glycol, polyethylene glycol, vegetable oils such as olive oil, and injectable esters such as ethyl oleate.
  • Witepsol, Macrogol, Tween 61, cacao butter, laurin fat, glycerogelatin, etc. may be used as the base of the suppository.
  • composition may be administered in a pharmaceutically effective amount.
  • the "pharmaceutically effective amount” means an amount sufficient to treat a disease with a reasonable benefit/risk ratio applicable to medical treatment, and the effective dose level is dependent on the subject's type and severity, age, sex, infected virus type, and drug. Activity, sensitivity to drug, time of administration, route of administration and excretion rate, duration of treatment, factors including concomitant drugs and other factors well known in the medical field.
  • Intraperitoneal administration, intravenous administration, intramuscular administration, subcutaneous administration, intradermal administration, oral administration, topical administration, may be administered intranasally, but is not limited thereto.
  • composition of the present invention may be administered daily or intermittently, and the number of administrations per day may be administered once or divided into two to three times.
  • the two active ingredients are single drugs, the number of administrations may be the same or different.
  • the composition of the present invention may be used alone or in combination with other drug treatments for the prevention or treatment of hematologic cancer. Taking all of the above factors into consideration, it is important to administer an amount that can obtain the maximum effect with a minimum amount without side effects, and can be easily determined by those skilled in the art.
  • the subject includes humans, monkeys, cows, horses, sheep, pigs, chickens, turkeys, quails, cats, dogs, mice, rats, rabbits or guinea pigs that have or can develop cancer expressing RANK ligands. means all animals. If the disease can be effectively prevented or treated by administering the pharmaceutical composition of the present invention to the subject, the type of subject is included without limitation.
  • the types of cancer expressing the RANK ligand to be treated include chronic lymphocytic leukemia (CLL), multiple myeloma, bone metastasis of cancer, and osteosarcoma. , prostate cancer, non-small cell lung cancer, and the like, but is not limited thereto.
  • CLL chronic lymphocytic leukemia
  • multiple myeloma multiple myeloma
  • bone metastasis of cancer and osteosarcoma
  • osteosarcoma adenosarcoma
  • prostate cancer non-small cell lung cancer, and the like, but is not limited thereto.
  • Example 1 By gene synthesis method chimeric antigen receptor gene cloning
  • RANK.E125D+ in which glutamic acid, the 125th amino acid of the extracellular domain of wild-tpe RANK, was substituted with aspartic acid, and cysteine, the 127th amino acid, was substituted with phenylalanine to increase the affinity of RANK for the RANK ligand
  • glutamic acid the 125th amino acid of the extracellular domain of wild-tpe RANK
  • cysteine the 127th amino acid
  • FIG. 1 A schematic diagram showing the cDNA region of each domain expressing the chimeric antigen receptor is shown in FIG. 1 .
  • the gene is expressed in pCDH-, a lentivirus-derived expression vector, CMV-MCS-EF1-copGFP (System Biosciences) or a retrovirus-derived expression vector pLNCX2 (Addgene) was cloned.
  • a primer that creates a cleavage site sequence of restriction enzyme XbaI at the 5' end was synthesized, and a restriction enzyme cleavage site was created by polymerase chain reaction, and also restricted at the 3' end. Restriction enzyme cleavage site was created by polymerase chain reaction by synthesizing a primer making the cleavage site sequence of the enzyme NotI.
  • the 5' end of the gene having a restriction enzyme cleavage site was treated with XbaI, and the 3' end was treated with NotI due to the polymerase chain reaction.
  • the multicloning site of the expression vector was treated with XbaI and NotI to allow the gene to be inserted. After mixing the restriction enzyme-treated gene with the expression vector, it was ligated by treatment with a ligase.
  • a primer that creates a cleavage site sequence of restriction enzyme Bgl II at the 5' end was synthesized to create a restriction enzyme cleavage site by polymerase chain reaction, and the cleavage site sequence of restriction enzyme NotI was also synthesized at the 3' end.
  • a restriction enzyme cleavage site was created by synthesizing the primers to be made and by polymerase chain reaction.
  • the 5' end of the gene having a restriction enzyme cleavage site was treated with BglII, and the 3' end was treated with NotI due to the polymerase chain reaction.
  • the multicloning site of the expression vector was treated with BglII and NotI to allow the gene to be inserted. After mixing the restriction enzyme-treated gene with the expression vector, it was ligated by treatment with a ligase.
  • the recombinant vector RANK.E125D+C127F.CAR-T.pCDH-CMV-MCS-EF1- which recognizes the RANK ligand and expresses a protein obtained by fusion of a human immunoglobulin G 1 heavy chain constant region and a signaling protein domain.
  • copGFP and RANK.E125D+C127F.CAR-NK.pLNCX2 were completed (see FIGS. 2A and 2B ).
  • RANK ligand In order to screen human cell lines expressing RANK ligand on the cell surface, acute promyelocytic leukemia-derived cell line HL-60 (ATCC) and histiocytic lymphoma-derived cell line U937 (ATCC) cell line Expression of RANK ligand was confirmed. In order to confirm expression, cell lines were treated with an antibody (biolegend) capable of binding to RANK ligand to which a fluorescent protein was attached, and then flow cytometry (fluorescence-activated cell sorting) was used.
  • an antibody biolegend
  • flow cytometry fluorescence-activated cell sorting
  • the HL-60 cell line expressing the RANK ligand among the two cells was used as the target cell, and the U937 cell line not expressing the RANK ligand was used as a negative control.
  • Example 4 chimeric Affinity determination of human cell lines expressing antigen receptors and RANK ligands
  • each of the extracellular domains of RANK.E125D+C127F was applied to the human immunoglobulin G 1 heavy chain constant region (IgG 1 heavy chain constant region).
  • IgG 1 heavy chain constant region human immunoglobulin G 1 heavy chain constant region
  • the purified water-soluble chimeric antigen receptor was confirmed by Western blotting using an antibody recognizing the constant region of human IgG heavy chain (anti-human IgG heavy chain constant region antibody, anti-human IgG Fc region antibody, abcam) (Fig. 5b). Reference).
  • the purified water-soluble chimeric antigen receptor is treated with a cell line expressing RANK ligand (HL-60 cell line) and a cell line not expressing RANK ligand (U937 cell line) to determine whether the water-soluble chimeric antigen receptor can bind to the cell.
  • a cell line expressing RANK ligand HL-60 cell line
  • a cell line not expressing RANK ligand U937 cell line
  • the prepared chimeric antigen receptor had high affinity with the human cell line expressing the RANK ligand, and the specificity of the RANK ligand protein of the immune cell treatment prepared by HL-60 cells and U937 cells. This means that it can be used for verification of cytotoxicity.
  • cytotoxic T cells were first isolated from human peripheral blood mononuclear cells. After purchasing human peripheral blood mononuclear cells (Medilab Korea), magnetic-activated cell sorting was used to isolate cytotoxic T cells. Peripheral blood mononuclear cells were combined with an antibody capable of binding to other immune cells except for cytotoxic T cells (CD8 + T cell biotin-conjugated antibody cocktail, Miltenyi Biotec), and then these antibodies were again combined with magnetic microbeads (anti -biotin microbead) (Miltenyi Biotec).
  • the microbeads, antibodies and cells attached thereto were passed through a magnetic seperation column (Miltenyi Biotec) to obtain cytotoxic T cells not labeled with the antibody.
  • flow cytometry was performed using the cell surface factors CD8 and CD3 epsilon of cytotoxic T cells, and as a result, the purity was greater than 95%.
  • cytotoxic T cells For activation of isolated cytotoxic T cells, 1 ⁇ 10 6 pieces/ml of magnetic beads coated with human CD3 and CD28 antibodies (Thermo Fisher Scientific), and 10% calf supplemented with 100 U/ ⁇ l recombinant human IL-2 Cells were reconstituted in serum-containing RPMI (Welgene) at a density of 1.5 ⁇ 10 6 cells/ml, and cultured for 24 hours after inoculation in a 24-well cell culture dish.
  • RPMI Human fetalinogene
  • Example 2 In order to introduce the recombinant vector prepared in Example 2 into cytotoxic T cells, a lentiviral system using 293FT cells (Thermo Fisher Scientific) was used.
  • 293FT cells were inoculated to become 2.5 ⁇ 10 6 cells in a 100 ⁇ cell culture dish, and then cultured in DMEM medium containing 10% calf serum. After 24 hours of incubation, when the cells have grown to cover 60-70% of the dish, 20 ⁇ g of RANK.E125D+C127F.CAR-T.pCDH-CMV-MCS-EF1-copGFP vector DNA is added to 10 ⁇ g of psPAX2 (Addgene). and 3 ⁇ g of pMD2.G (Addgene) vector were crystallized using calcium phosphate and Hepes-buffered solution, and then introduced into 293FT cells.
  • psPAX2 Additional phosphate
  • the culture supernatant containing the lentivirus was collected at intervals of 24 hours after 48 hours of the 293FT cells introduced with the expression vector.
  • the collected supernatant was centrifuged at 21,000 rpm in an ultra-high speed centrifuge for 2 hours to concentrate the virus.
  • the concentrated virus was mixed with 4 ⁇ g/ml of polybrene and added to the culture of activated cytotoxic T cells, the transduction was performed by centrifugation at 1,800 g for 75 minutes using a centrifuge. After centrifugation, the cytotoxic T cells were further cultured for 4 hours, and then replaced with an RPMI culture medium containing 10% calf serum. After 48 hours, some of the transduced cytotoxic T cells were used to measure the transduction efficiency.
  • the transduction efficiency was measured by using flow cytometry to measure the expression level of GFP inside the cells.
  • the results of comparison with the transduction ratio of (Mock T cells) are shown in FIG. 6A .
  • Example 7 chimeric antigen receptor expression natural killer cells produce
  • 293GPG cells were dissolved in 10 ml of 10 ml of 10% calf serum-containing DMEM culture medium and inoculated in a 100 ⁇ cell culture dish and then cultured for 24 hours.
  • 20 ⁇ g of the previously prepared recombinant vector (RANK.E125D+C127F.CAR-NK.pLNCX2 vector) was crystallized using calcium phosphate and Hepes-buffered solution, and then added to the culture medium of the previously cultured 293GPG cells. Thereafter, the culture medium was changed over 72 hours at 24 hour intervals, and the culture supernatant of 293GPG cells containing retrovirus was collected and stored.
  • the collected retrovirus-containing supernatant was centrifuged at 21000 rpm for 2 hours using a high-speed centrifuge and then reconstituted in Myelocult H5100 culture solution (STEMCELL) containing 10% calf serum to be concentrated 100 times compared to before concentration.
  • NK92MI cells American type culture collection, ATCC
  • NK92MI cells were inoculated into a 24 well cell culture dish at a density of 5 ⁇ 10 5 /ml.
  • a mixed solution of 8 ug/ml of polybrene added to the concentrated retrovirus was added to the culture medium of NK92MI cells in culture and cultured for 24 hours. After 24 hours, the culture medium was replaced with a new culture medium.
  • the NK92MI cells treated with retrovirus were cultured using Myelocult H5100 culture medium supplemented with neomycin antibiotic (600 ⁇ g/ml) from 24 hours after the culture medium replacement. After 14 days of neomycin selection, NK92MI cells were transferred to fresh culture medium and proliferated for 1 week.
  • NK92MI cells After proliferation, the RANK expression level of NK92MI cells was measured using flow cytometry. NK92MI cells introduced with LAG-3.CAR-NK.pLNCX2 (RANK.E125D+C127F CAR-NK cells) and NK92MI cells introduced with empty vector pLNCX2. The results of comparing the RANK expression level of (Mock CAR-NK cell) using a flow cytometer using an anti-human RANK antibody (Novus biologicals) are shown in FIG. 6B .
  • the chimeric antigen receptor-expressing cytotoxic T cells constructed above express RANK ligands.
  • HL-60 cells and RANK which are the target cells selected in Example 3, to determine whether cells expressing RANK ligand (RANK ligand positive cells) are selectively toxic by recognizing cells specifically to confirm toxicity
  • a non-radioactive cytotoxicity assay was used to measure the degree of cytotoxicity of cytotoxic T cells to target cells by the amount of lactate dehydrogenase present in the supernatant after co-culture.
  • cytotoxic T cells (1x10 5 cells) and target cells (1x10 4 cells) into the wells of a 96-well cell culture dish, set the effector: target ratio to 10:1, and inoculate so that the volume per well becomes 100 ⁇ l Centrifuge for 4 minutes at 250 g conditions using a centrifuge to close the intercellular space. After culturing for 6 hours, 50 ⁇ l of the supernatant from each well is removed, transferred to a transparent 96-well dish for absorbance measurement, and treated with an analysis solution and 1M hydrochloric acid solution to proceed and stop the enzymatic reaction.
  • the absorbance in the 490 nm wavelength band was measured and numerically converted using a fluorescence/luminescence/absorption meter (multi-detection plate reader) to quantify the degree of cytotoxicity of cytotoxic T cells in each well.
  • the prepared chimeric antigen receptor-expressing cytotoxic T cells (RANK.E125D+C127F CAR-T cells) were treated with U937 cells or RANK ligands that do not express RANK ligands (RANK ligand negative cells).
  • RANK ligand negative cells When co-cultured with HL-60 cells, which are RANK ligand-positive cells, cytotoxicity was shown to be about 4.3% to cells not expressing RANK ligand, whereas 48% or more to the target cell line expressing MHC class II. It was confirmed that very high cytotoxicity was shown (p ⁇ 0.01).
  • HL-60 cells RANK ligand positive cells
  • U937 cells selected in Example 3 RANK ligand negative cells
  • a non-radioactive cytotoxicity assay was used to measure the degree of cytotoxicity of NK cells to target cells by the amount of lactate dehydrogenase present in the supernatant after co-culture.
  • the absorbance of the 490 nm wavelength band was measured and numerically converted using a fluorescence/luminescence/absorption meter (multi-detection plate reader) to quantify the degree of cytotoxicity of NK cells in each well.
  • the prepared chimeric antigen receptor-expressing NK cells (LAG-3 CAR-NK cells) were transformed into U937 cells that do not express RANK ligands (RANK ligand negative cells) or HL- expressing RANK ligands.
  • RANK ligand negative cells RANK ligand negative cells
  • HL- expressing RANK ligands RANK ligands
  • NK cells introduced with the empty vector as a control did not show cytotoxicity to cells not expressing MHC class II, and were measured to have no cytotoxicity regardless of the expression of RANK ligands.
  • the chimeric antigen recognition receptor-expressing NK cells containing the extracellular domain of RANK show cytotoxicity specific to the RANK ligand protein, so that it is possible to treat related cancer cells using the CAR-NK cells. there was.

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Abstract

본 발명은 RANK 리간드(RANK ligand)에 특이적으로 결합하는 키메릭 항원 수용체; 상기 키메릭 항원 수용체 단백질을 코딩하는 폴리 뉴클레오티드; 상기 폴리 뉴클레오티드를 포함하는 벡터; 상기 벡터로 형질전환된 T 세포 또는 자연살생세포; 및 상기 세포를 유효성분으로 포함하는 세포 치료제 또는 암의 치료용 약학적 조성물에 관한 것이다. 본 발명의 키메릭 항원 수용체는 RANK 리간드를 인지하는 RANK의 세포외 도메인을 포함한다. 따라서, 이를 과발현시킬 수 있는 벡터로 형질전환된 세포독성 T 세포 또는 자연살생세포의 경우 RANK 리간드를 발현하는 암종에 특이적으로 세포독성을 갖게되므로 암 치료를 위한 면역세포 치료제로서 유용하게 사용될 수 있다.

Description

RANK 리간드(RANK LIGAND)에 특이적으로 결합하는 키메릭 항원 수용체 및 이의 용도
본 발명은 RANK 리간드(RANK ligand)에 특이적으로 결합하는 키메릭 항원 수용체; 상기 키메릭 항원 수용체 단백질을 코딩하는 폴리 뉴클레오티드; 상기 폴리 뉴클레오티드를 포함하는 벡터; 상기 벡터로 형질전환된 T 세포 또는 자연살생세포; 및 상기 세포를 유효성분으로 포함하는 세포 치료제 또는 암의 치료용 약학적 조성물에 관한 것이다.
RANK 리간드(receptor activator of nuclear factor-kB ligand; RANK ligand; RANKL)는 2형 막 단백질(membrane protein)이며, 종양괴사인자(tumor necrosis factor;TNF) 계열의 한 구성원으로서 TRANCE(TNF-related activation-induced cytokine), OPGL(osteoprotegerin ligand), ODF(osteoclast differentiation factor)로도 알려져 있으며, 파골세포생성(osteoclastogenesis)에 필수적인 요소이다(Teitelbaum, 2007). 즉, RANK 리간드 유전자가 제거된 쥐는 파골세포가 결핍되어 있으며, 골화석증(osteopetrosis) 및 치아맹출(tooth eruption) 장애 등의 형질을 나타내며, RANK 리간드의 과생산은 골 질환의 다양한 퇴행성 질환(rheumatoid arthritis and osteomyelitis)과 관계가 있다(Pettit et al., 2001; Rinotas et al., 2014). 또한, RANK 리간드는 B 림프구 종양, 특히 만성림프성 백혈병(chronic lymphocytic leukemia, CLL) 또는 다발성 골수종(multiple myeloma)에서 발현하며, 이들 질환을 더 악화시키는 역할을 한다(Croucher et al., 2001; Pearse et al., 2001; Yaccoby et al., 2002; Sordillo et al., 2003; Secchiero et al., 2006). 특히, 최근 연구 결과에 의하면 만성림프성 백혈병 환자 100% 모두 RANK 리간드의 발현이 만성림프성 백혈병에서 관찰되었으며, 다발성 골수종 환자 80%가 다발성 골수종에서 RANK 리간드를 발현한다고 한다(Schmiedel et al., 2013). 이 밖에도 암의 뼈 전이(bone metastasis)(Roodman and Dougall, 2008), 골육종(osteosarcoma)(Branstetter et al., 2015), 전립선암(prostate cancer)(Brown et al., 2001), 비소형 세포 폐암(non-small cell lung cancer)(Peng et al., 2013)에서 과발현이 관찰된다.
효과적인 암 치료를 위해서 직접적으로 암 세포를 표적하는 세포독성 T 세포(cytotoxic T lymphocytes, CTL)와 자연살생세포(natural killer cell, NK cell)가 중요하다는 사실이 보고되어왔다. 지금까지 세포독성 T 세포 또는 자연살생세포를 이용한 항암 치료에 대한 연구는 환자 유래 특정 암 항원을 환자의 세포독성 T 세포에 전달하여 활성을 유발하거나, 항체 의존성 세포 독성(antibody dependent cellular cytotoxicity)을 유발하고자 하였다(Galluzzi et al., 2018; Lu et al., 2020). 하지만, 최근에는 세포독성 T 세포와 자연살생세포를 이용한 새로운 항암 치료 방법이 도입되었다. 즉, 항원을 인식하는 항체의 단일사슬 Fv 단편(single-chain variable fragment, scFv) 부분을 CD3 제타(zeta) 또는 다른 단백질의 세포질내 신호전달 도메인(cytoplasmic signaling domain)에 접목시킨 도메인에 접목시킨 키메릭 항원 수용체(chimeric antigen receptor, CAR)를 전달하는 방법으로 시도되었다. 키메릭 항원 수용체를 T 세포 또는 자연살생세포에 접목시키면 항원 제시 세포(antigen presenting cell, APC)에 의한 신호 전달과 관계없이 scFv의 특정 항원 인지만으로 T 세포 또는 자연살생세포의 항암 작용을 활성화시킬 수 있으며, 또한 HLA type에 제한적이지 않아 많은 사람들이 보편적으로 사용할 수 있는 보다 효율적인 치료 방법으로 이용할 수 있다. 실제로, 이러한 키메릭 항원 수용체 발현 T 세포나 자연살생세포는 여러 암에서 효능을 보이고 있다(Holzinger et al., 2016; Pettitt et al., 2018; Wang et al., 2020).
한편, RANK(receptor activator of nuclear factor kB)는 1형 막 단백질(membrane protein)로서, TRANCE receptor 또는 TNFRSF11A로 불리우며, 종양괴사인자 수용체족(tumor necrosis factor receptor superfamily)의 일원이다(Ono et al., 2020). RANK는 RANK 리간드와 높은 친화도 가지고 있으며, RANK 리간드와 RANK의 결합으로 전달된 신호는 파골세포생성(osteoclastogenesis)에 필수적인 요소이다(Teitelbaum, 2007; Ono et al., 2020). 최근에는 RANK 리간드에 대한 RANK의 친화도를 높이기 위해 야생형(wild-tpe) RANK의 세포외 도메인 중 125번째 아미노산인 glutamic acid를 aspartic acid로 치환하고, 127번째 아미노산인 cysteine을 phenylalanine으로 치환한 RANK mutant인 RANK.E125D+C127F가 제작되었으며, RANK.E125D+C127F는 야생형 RANK보다 RANK 리간드에 대한 친화도가 약 4배 증가한다(Son et al., 2015).
현재, RANKL-RANK 결합을 이용한 골다골증에 대한 약학 조성물(한국공개특허 제10-2020-0054698호) 또는 RANKL 억제제를 이용한 암의 화학치료 요법(한국공개특허 제10-2019-0030646호)이 공개되어 있으나, RANK의 세포외 도메인을 포함한 키메릭 항원 수용체를 이용한 면역 항암 치료제에 관한 대해서는 기재된 바 없다.
이러한 배경하에, 본 발명자들은 다양한 암세포에서의 RANK 리간드 발현이 확인 또는 유도된다는 점과, 상기 RANK 리간드와 RANK가 결합이 가능하다는 점을 이용하여 RANK 리간드에 대한 RANK의 친화도가 향상된 RANK mutant (RANK.E125D+C127F)의 세포외 도메인을 사용한 RANK 리간드를 발현하는 암 특이적 키메릭 항원 수용체 발현 T 세포와 자연살생세포를 제작하였고, 상기 T 세포 또는 자연살생세포가 HLA class II를 발현하는 세포에 특이적으로 세포독성 능력이 있음을 실험을 통해 확인함으로써 본 발명을 완성하였다.
따라서 본 발명의 목적은 RANK 리간드에 특이적으로 결합하는 키메릭 항원 수용체를 제공하는 것이다.
본 발명의 다른 목적은 상기 키메릭 항원 수용체 단백질을 코딩하는 폴리 뉴클레오티드, 상기 폴리 뉴클레오티드를 포함하는 벡터 및 상기 벡터로 형질전환된 T 세포 또는 자연살생세포를 제공하는 것이다.
본 발명의 또 다른 목적은 상기 형질전환된 T 세포 또는 자연살생세포를 포함하는, 세포 치료제 또는 RANK 리간드를 발현하는 암세포를 사멸시키는 암의 예방 또는 치료용 약학적 조성물을 제공하는 것이다.
상기와 같은 본 발명의 목적을 달성하기 위해서, 본 발명은 항원 결합 도메인; 막관통 도메인; 및 세포 내 신호전달 도메인을 포함하는 키메릭 항원 수용체(CAR)로서, 상기 항원 결합 도메인은 RANK 리간드에 특이적으로 결합하는 RANK의 세포외 도메인을 포함하는 것인, 키메릭 항원 수용체를 제공한다.
또한, 본 발명은 상기 키메릭 항원 수용체 단백질을 코딩하는 폴리 뉴클레오티드, 상기 폴리 뉴클레오티드를 포함하는 벡터 및 상기 벡터로 형질전환된 T 세포 또는 자연살생세포를 제공한다.
또한, 본 발명은 상기 형질전환된 T 세포 또는 자연살생세포를 포함하는, 세포 치료제 또는 RANK 리간드를 발현하는 암세포를 사멸시키는 암의 치료용 약학적 조성물을 제공한다.
본 발명의 키메릭 항원 수용체는 RANK 리간드를 인지하는 RANK의 세포외 도메인을 포함한다. 따라서, 이를 과발현시킬 수 있는 벡터로 형질전환된 세포독성 T 세포 또는 자연살생세포의 경우 RANK 리간드를 발현하는 암종에 특이적으로 세포독성을 갖게 되므로 암 치료를 위한 면역세포 치료제로서 유용하게 사용될 수 있다.
도 1은 본 발명의 일 실시예에 따른 키메릭 항원 수용체를 발현시키는 각 도메인의 cDNA 구역을 나타낸 모식도이다.
도 2a는 본 발명의 일 실시예에 따른 렌티바이럴 벡터의 모식도이다.
도 2b는 본 발명의 일 실시예에 따른 레트로바이럴 벡터의 모식도이다.
도 3은 본 발명의 일 실시예에 따른 세포독성 T 세포 또는 자연살생세포 표면에 발현하는 키메릭 항원 수용체의 모식도이다.
도 4는 본 발명에서 제공하는 키메릭 항원 수용체의 타겟인 RANK 리간드를 발현하는 암세포(RANK ligand positive cell)와 RANK 리간드를 발현하지 않는 암세포(RANK ligand negative cell)에서 RANK 리간드의 발현량을 유세포 분석을 이용해 측정한 결과를 나타낸 도이다.
도 5a는 본 발명에서 제공하는 키메릭 항원 수용체를 수용성으로 만들어 Chinese hamster ovary (CHO) 세포에서 발현시킨 후, protein A column을 이용하여 친화크로마토그래피(affinity chromatography)로 정제한 결과를 나타낸 도이다.
도 5b는 본 발명의 일 실시예에 따른 수용성 키메릭 항원 수용체를 인간 IgG 중쇄의 불변 영역을 인식하는 항체(항 인간 IgG 중쇄 불변영역 항체, anti-human IgG Fc region antibody)를 이용하여 웨스턴 블로팅으로 확인한 결과를 나타낸 도이다.
도 5c는 본 발명의 일 실시예에 따른 수용성 키메릭 항원 수용체를 세포외 도메인 타겟인 RANK 리간드를 발현하는 암세포(RANK ligand positive cell)를 인식하는지 여부를 유세포 분석을 이용해 나타낸 도이다.
도 6a는 본 발명의 일 실시예에 따른 발현 벡터를 렌티바이러스 시스템을 이용하여 형질도입시킨 세포독성 T 세포(RANK CAR-T cell)에서의 GFP의 발현 비율을 비교한 결과를 나타낸 도이다.
도 6b는 본 발명의 일 실시예에 따른 발현 벡터를 레트로바이러스 시스템을 이용하여 형질도입시킨 자연살생세포(RANK CAR-NK cell)에서의 RANK의 발현 비율을 비교한 결과를 나타낸 도이다.
도 7a는 본 발명의 일 실시예에 따른 세포독성 T 세포(RANK CAR-T cell) 또는 공벡터를 형질도입시킨 세포독성 T 세포(Mock T cell)를 작동 세포(effector cell)로 하여 RANK 리간드를 발현하는 암세포(RANK ligand positive cell)에 대한 세포독성을 측정한 결과를 나타낸 도이다.
도 7b는 본 발명의 일 실시예에 따른 자연살생세포(RANK CAR-NK cell) 또는 공벡터를 형질도입시킨 자연살생세포(Mock NK cell)를 작동 세포(effector cell)로 하여 RANK 리간드를 발현하는 암세포(RANK ligand positive cell)에 대한 세포독성을 측정한 결과를 나타낸 도이다.
본 발명은 하나의 양태로서, 항원 결합 도메인; 막관통 도메인; 및 세포 내 신호전달 도메인을 포함하는 키메릭 항원 수용체(CAR)로서, 상기 항원 결합 도메인은 RANK 리간드에 특이적으로 결합하는 RANK의 세포외 도메인을 포함하는 것인, 키메릭 항원 수용체를 제공한다.
본 발명에서 "키메릭 항원 수용체(Chimeric antigen receptor, CAR)"는 자연적으로 T 세포 또는 자연살생세포가 활성화하는데 필요한 항원 제시 세포(APC)나 항체의 매개 없이 원하는 항원에 결합하여 항원-항체 반응을 통해 T 세포의 활성화를 유도하고 해당 항원을 발현하는 세포를 공격할 수 있도록 하기 위해 T 세포 또는 자연살생세포에 발현시키기 위한 융합 단백질을 의미할 수 있다. 곧, T 세포 또는 자연살생세포에 발현 시 항원에 결합하여 이들 세포들의 활성화를 유도하는 단백질이라고 볼 수 있다. 이를 통해 면역 반응을 일으키고자 하는 세포에 특이적인 항원을 인식하는 단백질일 수 있으며, 상기 면역 반응을 일으키고자 하는 세포는 특정 조직에 존재하거나 병변을 일으킨 조직을 이루는 세포를 의미할 수 있다.
본 발명에서 “RANK 리간드”는 파골세포(osteoclast) 생성에 필수적인 요소이지만, RANK 리간드는 정상 세포가 종양화 되면 다양한 암종에서 비정상적으로 높은 발현을 하게 된다. 지금까지 RANK 리간드를 발현하는 암종은 만성림프성 백혈병(chronic lymphocytic leukemia, CLL), 다발성 골수종(multiple myeloma), 암의 뼈 전이(bone metastasis), 골육종(osteosarcoma), 전립선암(prostate cancer) 또는 비소형 세포 폐암(non-small cell lung cancer)이 있으나, 이에 제한되는 것은 아니다..
본 발명에 따른 키메릭 항원 수용체 단백질은 기능적 동등물을 포함한다. ‘기능적 동등물’이란 아미노산의 부가, 치환, 또는 결실의 결과, 상기 키메릭 항원 수용체의 아미노산 서열과 적어도 70% 이상, 바람직하게는 80% 이상, 더욱 바람직하게는 90% 이상, 더욱 바람직하게는 95% 이상의 서열 상동성을 갖는 것으로, 실질적으로 동질의 생리활성을 나타내는 단백질을 말한다. ‘실질적으로 동질의 생리활성’이란 RANK 리간드에 특이적으로 결합할 수 있는 활성을 가진 것을 의미한다.
본 발명은 또한 키메릭 항원 수용체의 단편, 유도체 및 유사체(analogues)를 포함한다. 본원에 사용된, 용어 ‘단편’, ‘유도체’ 및 ‘유사체’는 본 발명의 키메릭 항원 수용체 단백질과 실질적으로 같은 생물학적 기능 또는 활성을 보유하는 폴리펩티드를 말한다. 본 발명의 단편, 유도체 및 유사체는 1) 하나 이상의 보존적(conservative) 또는 비보존적 아미노산 잔기(바람직하게는 보존적 아미노산 잔기)가 치환된 폴리펩티드(상기 치환된 아미노산 잔기는 유전 암호에 의해 암호화될 수도, 되지 않을 수도 있다) 또는 2) 하나 이상의 아미노산 잔기에서 치환기(들)를 가지는 폴리펩티드, 또는 3) 또 다른 화합물(폴리펩티드의 반감기를 연장할 수 있는 화합물, 예를 들면 폴리에틸렌 글리콜)과 결합된 성숙 폴리펩티드로부터 유래된 폴리펩티드, 또는 4) 부가적인 아미노산 서열(예를 들면, 선도 서열, 분비 서열, 상기 폴리펩티드를 정제하는데 사용된 서열, 프로테이노젠(proteinogen) 서열 또는 융합 단백질)과 결합된 상기 폴리펩티드로부터 유래된 폴리펩티드일 수 있다. 본 발명에 정의된 상기 단편, 유도체 및 유사체는 당업자에 잘 알려져 있다.
상기 항원 결합 도메인은 신호전달을 증폭하기 위해 RANK의 세포외 도메인 한 쌍을 인간 이뮤노글로불린 G1 중쇄 불변 영역(IgG1 heavy chain constant region)에 각각 연결시킨 이합체(dimer) 형태일 수 있으나, 이에 제한되는 것은 아니다.
상기 RANK의 세포외 도메인은 RANK 리간드에 특이적으로 결합하는 것을 특징으로 하며, 이는 서열번호 1 또는 이와 95% 이상의 상동성을 나타내는 아미노산 서열로 이루어진 것일 수 있으나, 이에 제한되는 것은 아니다.
상기 인간 이뮤노글로불린 G1 중쇄 불변 영역(IgG1 heavy chain constant region)은 서열번호 2 또는 이와 95% 이상의 상동성을 나타내는 아미노산 서열로 이루어진 것일 수 있으나, 이에 제한되는 것은 아니다.
본 발명의 막관통 도메인 (Transmembrane domain)은 RANK의 세포외 도메인과 보조자극, 필수 신호전달 도메인을 세포막 사이로 연결하는 부위이며, 세포내 신호 전달 도메인은 항원 결합 도메인의 결합에 의해 면역 세포의 면역반응을 활성화시키는 부위를 의미한다.
본 발명의 키메릭 항원 수용체의 일 구성요소인 막관통 도메인은 CD28, CD3 엡실론, CD45, CD4, CD5, CD8, CD9, CD16, CD22, CD33, CD37, CD64, CD80, CD86, CD134, CD137 및 CD154로 이루어진 군으로부터 선택되는 단백질의 막관통 도메인을 포함하는 것일 수 있다. 바람직하게는, 상기 막관통 도메인은 CD8의 막관통 도메인일 수 있고, 이는 서열번호 3 또는 이와 95% 이상의 상동성을 나타내는 아미노산 서열로 이루어진 것일 수 있으나, 이에 제한되는 것은 아니다.
또한, 본 발명의 키메릭 항원 수용체의 일 구성요소인 세포내 신호전달 도메인은 항원 결합 도메인에 결합에 의해 면역 세포의 면역반응을 활성화시키는 부위를 의미한다. 본 발명의 일 구현예로서, 상기 세포내 도메인은 CD28, 4-1BB, CD3 제타(zeta) 또는 이들의 조합일 수 있다.
본 발명의 키메릭 항원 수용체는 세포내 신호전달 도메인으로 CD28, 4-1BB, CD3 제타(zeta)를 이용함으로써 높은 활성으로 암세포, 특히 RANK 리간드를 발현하는 암세포에 대한 사멸 효과를 나타낼 수 있다.
상기 CD28은 서열번호 4 또는 이와 70% 이상, 바람직하게는 80% 이상, 더욱 바람직하게는 90% 이상, 더더욱 바람직하게는 95% 이상의 서열 상동성을 갖는 것으로, 서열번호 4로 표시되는 아미노산 서열과 실질적으로 동등한 기능을 나타내는 아미노산 서열로 이루어질 수 있고; 4-1BB(CD137)은 서열번호 5 또는 이와 70% 이상, 바람직하게는 80% 이상, 더욱 바람직하게는 90% 이상, 더더욱 바람직하게는 95% 이상의 서열 상동성을 갖는 것으로, 서열번호 5로 표시되는 아미노산 서열과 실질적으로 동등한 기능을 나타내는 아미노산 서열로 이루어질 수 있고; CD3 제타(zeta)는 NK 세포 활성화 도메인으로 기능하며, 서열번호 6 또는 이와 70% 이상, 바람직하게는 80% 이상, 더욱 바람직하게는 90% 이상, 더더욱 바람직하게는 95% 이상의 서열 상동성을 갖는 것으로, 서열번호 6으로 표시되는 아미노산 서열과 실질적으로 동등한 기능을 나타내는 아미노산 서열로 이루어질 수 있다.
상기 항원 결합 도메인은 신호 펩타이드를 포함할 수 있으며, 상기 신호 펩타이드는 서열번호 7 또는 이와 95% 이상의 상동성을 나타내는 아미노산 서열에 의해 암호화될 수 있으나, 이에 제한되는 것은 아니다.
또한, 본 발명에 따른 다른 하나의 양태로서, 상기 키메릭 항원 수용체 단백질을 코딩하는 폴리 뉴클레오티드를 제공한다.
본 발명의 항원 수용체를 암호화하는 폴리 뉴클레오티드는 코돈의 축퇴성 (degeneracy)으로 인하여 또는 상기 항원 수용체를 발현시키고자 하는 생물에서 선호되는 코돈을 고려하여, 코딩영역으로부터 발현되는 항원 수용체의 아미노산 서열을 변화시키지 않는 범위 내에서 코딩영역에 다양한 변형이 이루어질 수 있고, 코딩영역을 제외한 부분에서도 유전자의 발현에 영향을 미치지 않는 범위 내에서 다양한 변형 또는 수식이 이루어질 수 있으며, 그러한 변형 유전자 역시 본 발명의 범위에 포함됨을 당업자는 잘 이해할 수 있을 것이다. 즉, 본 발명의 폴리 뉴클레오티드는 이와 동등한 활성을 갖는 단백질을 코딩하는 한, 하나 이상의 핵산 염기가 치환, 결실, 삽입 또는 이들의 조합에 의해 변이될 수 있으며, 이들 또한 본 발명의 범위에 포함된다.
또한, 본 발명에 따른 또 다른 하나의 양태로서, 상기 폴리 뉴클레오티드를 포함하는 벡터, 상기 벡터로 형질전환된 세포를 제공한다.
본 발명에서 사용되는 벡터는 당 분야에 공지된 벡터를 다양하게 사용할 수 있고, 상기 항원 수용체를 생산하고자 하는 숙주세포의 종류에 따라 프로모터 (promoter), 종결자(terminator), 인핸서(enhancer) 등과 같은 발현조절 서열, 막 표적화 또는 분비를 위한 서열 등을 적절히 선택하고 목적에 따라 다양하게 조합할 수 있다. 본 발명의 벡터는 플라스미드 벡터, 코즈미드 벡터, 박테리오 파아지 벡터 및 바이러스 벡터 등을 포함하나 이에 제한되지 않는다. 적합한 벡터는 프로모터, 오퍼레이터, 개시코돈, 종결코돈, 폴리아데닐화 시그널 및 인핸서 같은 발현 조절 엘리먼트 외에도 막 표적화 또는 분비를 위한 시그널 서열 또는 리더 서열을 포함하며 목적에 따라 다양하게 제조될 수 있다.
본 발명에서는 바람직한 일 실시예로서, 렌티-바이러스용 벡터 또는 레트로-바이러스용 벡터를 사용할 수 있으며, 본 발명의 하기 실시예에서는 pCDH-CMV-MCS-EF1-copGFP 벡터(렌티-바이러스용 벡터)와 pLNCX2(레트로-바이러스용 벡터)를 사용하였으나, 이에 제한되는 것은 아니다.
또한, 본 발명의 RANK 리간드에 특이적으로 결합하는 키메릭 항원 수용체를 상기 벡터를 통해 세포에 도입하여 세포를 형질전환시킬 수 있다. 상기 세포는 T 세포, 종양 침윤 림프구, B 세포, NK 세포, 또는 NK-T 세포일 수 있으며, 바람직하게는, 세포독성 T 세포(cytotoxic T cell)와 NK 세포일 수 있다. 상기 세포는 골수, 말초혈액, 말초혈액단핵세포 또는 제대혈로부터 얻거나 제조될 수 있으며, 세포는 인간 세포일 수 있으나, 이에 제한되는 것은 아니다.
본 발명의 일 구현 예로서, 상기 기술한 벡터를 이용하여 RANK 리간드에 특이적으로 결합하는 키메릭 항원 수용체를 세포독성 T 세포(cytotoxic T cell) 또는 자연살생세포(NK cell)에 형질전환시킬 수 있다.
상기와 같이 본 발명의 키메릭 항원 수용체가 도입되어 형질전환된 세포는 RANK 리간드를 항원으로 인식하고 이와 강하게 결합하는 특징을 가진다.
본 발명에서, "키메릭 항원 수용체 발현 T 세포(chimeric antigen receptor T cell, 이하 간략하게 ‘CAR-T 세포’라 약칭함)" 또는 "키메릭 항원 수용체 발현 NK 세포(chimeric antigen receptor NK cell, 이하 간략하게 ‘CAR-NK 세포’라 약칭함)" 란 정상의 T 세포 또는 자연살생세포를 형질도입 등의 방법으로 본래의 T 세포 수용체 또는 NK cell 수용체가 아닌 암세포에 특이적으로 반응하는 키메라 항원 수용체를 발현하는 T 세포 또는 NK cell을 의미한다. 상기 수용체를 갖는 T 세포 또는 NK 세포는 타겟 세포의 세포자살을 유도하여 세포독성을 나타낸다.
본 발명에 있어서, 특히 CAR-T 세포나 CAR-NK 세포는 세포독성 T 세포(cytotoxic T cell) 또는 NK cell에 본 발명의 키메릭 항원 수용체가 도입된 세포일 수 있다. 상기 세포는 CAR-T 치료제의 기존 장점인 항암 특이적 표적 치료의 장점을 가지며, 특히, 본 발명의 키메라 항원 수용체를 장착시킨 세포독성 T 세포 또는 NK cell는 RANK 리간드를 발현하는 암세포를 인지하여 효과적으로 파괴할 수 있다.
따라서 본 발명의 또 다른 하나의 양태로서, 상기 세포를 포함하는 세포 치료제; 이를 유효성분으로 포함하는 RANK 리간드를 발현하는 암의 예방 또는 치료용 약학적 조성물; 및 상기 세포를 개체에 투여하는 단계를 포함하는 암을 예방 또는 치료하는 방법을 제공한다.
본 발명에서, "세포 치료제"는 개체로부터 분리, 배양 및 특수한 조작을 통해 제조된 세포 및 조직으로 치료, 진단 및 예방의 목적으로 사용되는 의약품(미국 FDA 규정)으로서, 세포 혹은 조직의 기능을 복원시키기 위하여 살아있는 자가, 동종, 또는 이종 세포를 체외에서 증식 선별하거나 다른 방법으로 세포의 생물학적 특성을 변화시키는 등의 일련의 행위를 통하여 치료, 진단 및 예방의 목적으로 사용되는 의약품을 의미한다.
본 발명의 용어, "치료"는 상기 조성물의 투여에 의해 RANK 리간드를 발현하는 암에 의한 증세가 호전되거나 이롭게 변경되는 모든 행위를 의미한다.
상기 조성물은 약학적으로 허용 가능한 담체를 포함할 수 있다.
상기 "약학적으로 허용 가능한 담체"란 생물체를 자극하지 않으면서, 주입되는 화합물의 생물학적 활성 및 특성을 저해하지 않는 담체 또는 희석제를 의미할 수 있다. 본 발명에 사용 가능한 상기 담체의 종류는 특별히 제한되지 아니하며 당해 기술 분야에서 통상적으로 사용되고 약학적으로 허용되는 담체라면 어느 것이든 사용할 수 있다. 상기 담체의 비제한적인 예로는, 식염수, 멸균수, 링거액, 완충 식염수, 알부민 주사 용액, 덱스트로즈 용액, 말토 덱스트린 용액, 글리세롤, 에탄올 등을 들 수 있다. 이들은 단독으로 사용되거나 2 종 이상을 혼합하여 사용될 수 있다.
약학적으로 허용 가능한 담체를 포함하는 상기 조성물은 경구 또는 비경구의 여러 가지 제형일 수 있다. 제제화할 경우에는 보통 사용하는 충진제, 증량제, 결합제, 습윤제, 붕해제, 계면활성제 등의 희석제 또는 부형제를 사용하여 조제된다.
상세하게는, 경구 투여를 위한 고형제제에는 정제, 환제, 산제, 과립제, 캡슐제 등이 포함되며, 이러한 고형제제는 상기 화합물에 적어도 하나 이상의 부형제, 예를 들면, 전분, 칼슘카보네이트, 수크로오스, 락토오스, 젤라틴 등을 섞어 조제될 수 있다. 또한, 단순한 부형제 이외에 마그네슘 스테아레이트, 탈크 같은 윤활제들도 사용될 수 있다. 경구를 위한 액상 제제로는 현탁제, 내용액제, 유제, 시럽제 등이 해당되는데, 흔히 사용되는 단순 희석제인 물, 액체 파라핀 이외에 여러 가지 부형제, 예를 들면 습윤제, 감미제, 방향제, 보존제 등이 포함될 수 있다. 비경구 투여를 위한 제제에는 멸균된 수용액, 비수성용제, 현탁제, 유제, 동결건조 제제 및 좌제가 포함된다. 비수성용제, 현탁제로는 프로필렌글리콜, 폴리에틸렌 글리콜, 올리브 오일과 같은 식물성 오일, 에틸올레이트와 같은 주사 가능한 에스테르 등이 사용될 수 있다. 좌제의 기제로는 위텝솔, 마크로골, 트윈 61, 카카오지, 라우린지, 글리세로젤라틴 등이 사용될 수 있다.
상기 조성물은 약학적으로 유효한 양으로 투여할 수 있다.
상기 "약학적으로 유효한 양"은 의학적 치료에 적용 가능한 합리적인 수혜/위험 비율로 질환을 치료하기에 충분한 양을 의미하며, 유효 용량 수준은 개체 종류 및 중증도, 연령, 성별, 감염된 바이러스 종류, 약물의 활성, 약물에 대한 민감도, 투여 시간, 투여 경로 및 배출 비율, 치료 기간, 동시 사용되는 약물을 포함한 요소 및 기타 의학 분야에 잘 알려진 요소에 따라 결정될 수 있다.
상기 투여는 어떠한 적절한 방법으로 환자에게 본 발명의 조성물을 도입하는 것을 의미하며, 상기 조성물의 투여 경로는 목적 조직에 도달할 수 있는 한 어떠한 일반적인 경로를 통하여 투여될 수 있다. 복강 내 투여, 정맥내 투여, 근육 내 투여, 피하 투여, 피내 투여, 경구 투여, 국소 투여, 비 내 투여될 수 있으나, 이에 제한되지는 않는다.
본 발명의 조성물을 매일 투여 또는 간헐적으로 투여해도 좋고, 1일당 투여 횟수는 1회 또는 2~3회로 나누어 투여하는 것이 가능하다. 두 유효성분이 각각 단제인 경우의 투여횟수는 같은 횟수여도 좋고, 다른 횟수로 해도 된다. 또한, 본 발명의 조성물은 혈액암의 예방 또는 치료를 위하여 단독으로, 또는 다른 약물 치료와 병용하여 사용할 수 있다. 상기 요소를 모두 고려하여 부작용 없이 최소한의 양으로 최대 효과를 얻을 수 있는 양을 투여하는 것이 중요하며, 당업자에 의해 용이하게 결정될 수 있다.
상기 개체란, RANK 리간드를 발현하는 암이 발병하였거나 발병할 수 있는 인간과, 원숭이, 소, 말, 양, 돼지, 닭, 칠면조, 메추라기, 고양이, 개, 마우스, 쥐, 토끼 또는 기니아 피그를 포함한 모든 동물을 의미한다. 본 발명의 약학적 조성물을 개체에게 투여함으로써 상기 질환을 효과적으로 예방 또는 치료할 수 있다면 개체의 종류는 제한 없이 포함된다.
본 발명에 있어 치료 대상이 되는 RANK 리간드를 발현하는 암의 종류로는 만성림프성 백혈병(chronic lymphocytic leukemia, CLL), 다발성 골수종(multiple myeloma), 암의 뼈 전이(bone metastasis), 골육종(osteosarcoma), 전립선암(prostate cancer), 비소형 세포 폐암(non-small cell lung cancer) 등을 예시할 수 있으나, 이에 한정되는 것은 아니다.
이하, 실시예를 통하여 본 발명을 더욱 상세히 설명하고자 한다. 이들 실시예는 오로지 본 발명을 보다 구체적으로 설명하기 위한 것으로서, 본 발명의 요지에 따라 본 발명의 범위가 이들 실시예에 의해 제한되지 않는다는 것은 당업계에서 통상의 지식을 가진 자에게 있어서 자명할 것이다.
실시예 1. 유전자 합성 방법에 의한 키메릭 항원 수용체 유전자의 클로닝
RANK 리간드에 대한 RANK의 친화도를 높이기 위해 야생형(wild-tpe) RANK의 세포외 도메인 중 125번째 아미노산인 glutamic acid를 aspartic acid로 치환하고, 127번째 아미노산인 cysteine을 phenylalanine으로 치환한 RANK.E125D+C127F을 이용하여 본 발명의 키메릭 항원 수용체를 제조하기 위해서, RANK.E125D+C127F의 세포외 도메인 각각을 인간 이뮤노글로불린 G1 중쇄 불변 영역(IgG1 heavy chain constant region)에 연결시킨 항원 인식 부위와 CD8α의 막관통 도메인, CD28, 4-1BB, CD3 제타(zeta) 각각의 세포내 도메인 부분의 단백질 암호화 서열을 유전자 데이터베이스(database)에서 확인하였다.
그 후 상기 도메인들을 이루는 염기서열의 종결 코돈 부분을 제외한 나머지 서열들을 하나로 이어 유전자 합성을 진행하였다. 유전자 합성의 정확도는 단백질 발현 플라스미드를 제작한 후 시퀀싱을 통하여 확인하였다. 상기 키메릭 항원 수용체를 발현시키는 각 도메인의 cDNA 구역을 나타낸 모식도를 도 1에 나타내었다.
실시예 2. 키메릭 항원 수용체 단백질 발현 플라스미드 제조
RANK 리간드를 인식하고, 인간 이뮤노글로불린 G1 중쇄 불변 영역과 신호전달 단백질 도메인을 융합시킨 재조합 단백질을 세포독성 T 세포와 자연살생세포에 발현시키기 위해, 해당 유전자를 렌티바이러스 유래 발현벡터인 pCDH-CMV-MCS-EF1-copGFP(System Biosciences) 또는 레트로바이러스 유래 발현벡터인 pLNCX2(Addgene)에 클로닝하였다.
먼저, pCDH-CMV-MCS-EF1-copGFP 벡터에 클로닝하기 위해서 5′말단에 제한효소 XbaI의 절단 부위 서열을 만드는 프라이머를 합성하여 중합효소연쇄반응으로 제한효소 절단 부위를 만들고, 3′말단에도 제한효소 NotI의 절단 부위 서열을 만드는 프라이머를 합성하여 중합효소연쇄반응으로 제한효소 절단 부위를 만들었다. 그 후 중합효소연쇄반응으로 인해 제한효소 절단 부위를 가진 유전자를 5′말단은 XbaI을 처리하였으며, 3′말단은 NotI을 처리하였다. 그리고 발현 벡터의 다중클로닝 자리를 XbaI과 NotI을 처리하여 유전자가 삽입될 수 있게 만들었다. 제한효소가 처리된 유전자와 발현 벡터를 섞어 준 다음, 결합 효소(ligase)를 처리하여 연결하였다.
다음, pLNCX2 벡터에 클로닝하기 위해서 5′말단에 제한효소 Bgl II의 절단 부위 서열을 만드는 프라이머를 합성하여 중합효소연쇄반응으로 제한효소 절단 부위를 만들고, 3′말단에도 제한효소 NotI의 절단 부위 서열을 만드는 프라이머를 합성하여 중합효소연쇄반응으로 제한효소 절단 부위를 만들었다. 그 후 중합효소연쇄반응으로 인해 제한효소 절단 부위를 가진 유전자를 5′말단은 BglII를 처리하였으며, 3′말단은 NotI을 처리하였다. 그리고 발현 벡터의 다중클로닝 자리를 BglII과 NotI을 처리하여 유전자가 삽입될 수 있게 만들었다. 제한효소가 처리된 유전자와 발현 벡터를 섞어 준 다음, 결합 효소(ligase)를 처리하여 연결하였다.
그 결과, RANK 리간드를 인식하고, 인간 이뮤노글로불린 G1 중쇄 불변 영역과 신호전달 단백질 도메인을 융합시킨 단백질을 발현하는 재조합 벡터 RANK.E125D+C127F.CAR-T.pCDH-CMV-MCS-EF1-copGFP와 RANK.E125D+C127F.CAR-NK.pLNCX2를 완성하였다(도 2a 및 도 2b 참조).
실시예 3. RANK 리간드를 발현하는 사람 세포주 screening
RANK 리간드를 세포 표면에 발현하는 사람 세포주를 screening하기 위해서, 급성전골수성백혈병(acute promyelocytic leukemia) 유래 세포주인 HL-60 (ATCC) 및 조직구 림프종(histiocytic lymphoma)유래 세포주인 U937 (ATCC) 세포주에서 RANK 리간드의 발현을 확인하였다. 발현 확인을 위해 형광단백질이 부착된 RANK 리간드와 결합이 가능한 항체(biolegend)를 세포주들에 처리한 후, 유세포 분석(fluorescence-activated cell sorting)을 이용하였다.
분석결과, HL-60 세포주에서 RANK 리간드를 발현하는 것을 확인하였으며, U937 세포주에서는 RANK 리간드를 발현하지 못하는 것으로 확인하였다(도 4참조).
상기 결과를 근거로 두 세포 중 RANK 리간드를 발현하는 HL-60 세포주를 타겟 세포로 이용하였으며 RANK 리간드를 발현하지 않는 U937 세포주를 음성 대조군으로 사용하였다.
실시예 4. 키메릭 항원 수용체와 RANK 리간드를 발현하는 사람 세포주의 친화도 측정
제작한 키메릭 항원 수용체가 RANK 리간드를 발현하는 사람 세포주와 친화도가 있는지 확인하기 위하여, RANK.E125D+C127F의 세포외 도메인 각각을 인간 이뮤노글로불린 G1 중쇄 불변 영역(IgG1 heavy chain constant region)과 연결시켜, 키메릭 항원 수용체 하나당 2개의 RANK.E125D+C127F의 세포외 도메인이 항원을 인식하게 제작한 키메릭 항원 수용체를 수용성으로 만들어 Chinese hamster ovary (CHO) 세포에서 발현시킨 후, protein A column을 이용하여 친화크로마토그래피(affinity chromatography) (GE healthcare)로 정제하였다(도 5a 참조).
또한, 정제한 수용성 키메릭 항원 수용체를 인간 IgG 중쇄의 불변 영역을 인식하는 항체(항 인간 IgG 중쇄 불변영역 항체, anti-human IgG Fc region antibody, abcam)를 이용한 웨스턴 블로팅으로 확인하였다(도 5b 참조).
그 후, 정제한 수용성 키메릭 항원 수용체를 RANK 리간드를 발현하는 세포주(HL-60 세포주)와 RANK 리간드를 발현하지 않는 세포주(U937 세포주)에 처리하여 수용성 키메릭 항원 수용체가 해당 세포와 결합이 가능한지 유세포 분석을 통하여 확인한 결과를 도 5c에 나타내었다.
도 5c에 나타난 바와 같이, RANK 리간드를 발현하는 HL-60 세포는 수용성 키메릭 항원 수용체와 결합하였으나, RANK 리간드를 발현하지 않는 U937 세포에서는 수용성 키메릭 항원 수용체와 결합하지 않는 것을 확인하였다.
상기 결과에서 확인된 바와 같이, 제작한 키메릭 항원 수용체가 RANK 리간드를 발현하는 사람 세포주와 친화도가 높음을 확인하였고, HL-60 세포와 U937 세포를 제작한 면역세포 치료제의 RANK 리간드 단백질의 특이적 세포독성 검증을 위해 사용할 수 있다는 것을 의미한다.
실시예 5. 세포독성 T 세포 분리 및 활성화
본 발명의 일 실시예에 따른 키메릭 항원 수용체를 발현하는 T 세포를 제작하기 위해 먼저 세포 독성 T 세포를 사람의 말초 혈액 단핵세포에서 분리하였다. 사람의 말초 혈액 단핵세포(메디랩 코리아)를 구입한 후, 세포독성 T 세포를 분리하기 위해서 자력이용 세포 분리법(magnetic-activated cell sorting)을 이용하였다. 말초 혈액 단핵세포들을 세포독성 T 세포를 제외한 다른 면역세포들과 결합 가능한 항체(CD8+ T cell biotin-conjugated antibody cocktail, Miltenyi Biotec)와 결합시킨 다음, 상기 이 항체들을 다시 자성을 가진 마이크로비드(anti-biotin microbead)(Miltenyi Biotec)와 결합시켰다. 상기 마이크로비드와 그에 붙은 항체, 세포들을 자기장 분리 칼럼(magnetic seperation column) (Miltenyi Biotec)에 통과시켜 그 중 항체로 표지되지 않은 세포독성 T 세포를 얻었다. 분리한 세포독성 T 세포의 순도를 확인하기 위하여 세포독성 T 세포의 세포표면 인자인 CD8과 CD3 엡실론을 이용한 유세포 분석을 실시하였고 그 결과 95% 이상의 순도를 보였다.
분리한 세포독성 T 세포의 활성화를 위해 1×106개/ml의 사람 CD3와 CD28 항체가 코팅된 자석비드(Thermo Fisher Scientific), 그리고 100 U/μl recombinant human IL-2가 첨가된 10% 송아지 혈청 함유 RPMI(Welgene)에 1.5×106개/ml의 밀도로 세포를 재구성하여 24 웰(well) 세포 배양 접시에 접종 후 24시간 동안 배양하였다.
실시예 6. 키메릭 항원 수용체 발현 세포독성 T 세포 제작
상기 실시예 2를 통해 제작한 재조합 벡터를 세포독성 T 세포에 도입하기 위하여 293FT 세포(Thermo Fisher Scientific)를 사용한 렌티바이러스 시스템을 이용하였다.
먼저, 293FT 세포를 100π 세포 배양 접시에 2.5×106 세포가 되도록 접종한 후, 10% 송아지 혈청을 함유한 DMEM 배지에서 배양하였다. 배양 24시간 후, 세포가 접시의 60~70% 정도를 덮을 정도로 자라면, 20μg의 RANK.E125D+C127F.CAR-T.pCDH-CMV-MCS-EF1-copGFP 벡터 DNA를 10μg의 psPAX2(Addgene)와 3μg의 pMD2.G(Addgene) 벡터를 Calcium phosphate 및 Hepes-buffered solution을 이용하여 결정화시킨 후 293FT 세포에 도입하였다. 그 후, 상기 발현 벡터가 도입된 293FT 세포를 48시간 후 24시간 간격으로 렌티바이러스를 포함하는 배양 상층액을 모았다. 모은 상층액을 초고속 원심분리기를 21,000rpm으로 2시간 동안 원심분리하여 바이러스를 농축시켰다. 농축된 바이러스를 polybrene 4μg/ml과 혼합하여 활성화시킨 세포독성 T 세포의 배양액에 추가한 후 원심분리기를 이용해 1,800g로 75분 동안 원심분리하여 형질도입을 진행하였다. 원심 분리를 마친 세포독성 T 세포는 4시간 동안 추가 배양 후 10% 송아지 혈청 함유 RPMI 배양액으로 교체하였으며 48시간 후에는 형질도입한 세포독성 T 세포의 일부를 형질도입 효율 측정에 사용하였다.
형질도입 효율은 세포 내부의 GFP 발현량을 유세포 분석을 이용해 측정했으며 형질도입된 세포독성 T 세포(RANK.E125D+C127F CAR-T cell)를 공벡터로 제작한 바이러스를 형질도입한 세포독성 T 세포(Mock T cell)의 형질도입 비율과 비교한 결과를 도 6a에 나타내었다.
실시예 7. 키메릭 항원 수용체 발현 자연살해세포 제작
상기 실시예 2를 통해 제작한 재조합 벡터를 NK 세포에 도입하기 위하여 293GPG 세포를 사용한 레트로바이러스 시스템을 이용하였다.
먼저, 293GPG 세포 3×106개를 10ml의 10% 송아지 혈청 함유 DMEM 배양액 10ml에 풀어 100π 세포 배양 접시에 접종 후 24시간 동안 배양하였다. 앞서 제작한 재조합 벡터(RANK.E125D+C127F.CAR-NK.pLNCX2 벡터) 20μg을 Calcium phosphate 및 Hepes-buffered solution을 이용하여 결정화시킨 후 앞서 배양한 293GPG 세포의 배양액에 첨가해주었다. 이후 24시간 간격으로 72시간에 걸쳐 배양액을 교체하며 레트로바이러스를 함유한 293GPG 세포의 배양 상층액을 채취 및 보관하였다. 상기 채취한 레트로바이러스 함유 상층액은 초고속 원심분리기를 이용하여 21000rpm으로 2시간 동안 원심분리 후 농축 이전 대비 100배로 농축될 수 있도록 10% 송아지 혈청 함유 Myelocult H5100 배양액(STEMCELL)에 재구성하였다. 농축한 레트로바이러스를 NK92MI 세포(American type culture collection, ATCC)에 형질도입하기 위해 NK92MI 세포를 24 well 세포 배양 접시에 5×105/ml의 밀도로 접종하였다. 그 다음 농축된 레트로바이러스에 polybrene을 8ug/ml만큼 첨가한 혼합액을 배양 중인 NK92MI세포의 배양액에 추가한 후 24시간 동안 배양하였다. 24시간 후 새 배양액으로 교체하였으며 유전자가 도입된 세포의 선별을 위해 배양액 교체 후 24시간 후부터는 neomycin 항생제(600μg/ml)가 첨가된 Myelocult H5100 배양액을 이용하여 레트로바이러스를 처리해준 NK92MI세포를 배양하였다. 14일간의 neomycin 선별과정을 마친 NK92MI 세포는 다시 신선한 배양액에 옮겨 1주일간 증식시켰다.
증식 후 유세포 분석을 이용해 NK92MI세포의 RANK 발현량을 측정하였으며 LAG-3.CAR-NK.pLNCX2를 도입한 NK92MI 세포(RANK.E125D+C127F CAR-NK cell)와 공벡터인 pLNCX2를 도입한 NK92MI 세포(Mock CAR-NK cell)의 RANK 발현량을 항 인간 RANK 항체(anti-human RANK antibody, Novus biologicals)를 이용한 유세포분석기를 이용하여 비교한 결과를 도 6b에 나타내었다.
실시예 8. CAR-T 세포의 RANK 리간드 발현 세포 특이적 세포독성 검증
상기 제작한 키메릭 항원 수용체 발현 세포독성 T 세포가 RANK 리간드를 발현하는 세포를 특이적으로 인지하여 독성을 나타내는지 확인하기 위해 RANK 리간드를 발현하는 세포(RANK ligand positive cell)를 선택적으로 독성을 나타내는지 확인하기 위해 실시예 3에서 선정한 타겟 세포인 HL-60 세포와 RANK 리간드를 발현하지 않는(RANK ligand negative cell) 음성 대조군 세포인 U937 세포를 키메릭 항원 수용체 발현 세포독성 T 세포(RANK.E125D+C127F CAR-T cell) 혹은 공벡터를 도입한 세포독성 T 세포(Mock T cell)와 6시간 동안 공배양하였다. 공배양 후 상층액에 존재하는 젖산 탈수소 효소(lactate dehydrogenase)의 양으로 세포독성 T 세포의 표적세포에 대한 세포독성 정도를 측정하는 비방사성 세포독성 분석법(non-radioactive cytotoxicity assay)을 이용하였다.
먼저, 96 well 세포 배양 접시의 well에 세포독성 T 세포(1x105 cell)와 표적 세포(1x104 cell)를 각각 넣어 effector: target ratio를 10:1로 맞추고, well당 부피는 100μl가 되도록 접종 후 원심분리기를 이용해 250g 조건에서, 4분 동안 원심분리하여 세포 간 간격을 가깝게 만든다. 그 후 6시간 동안 배양 진행 후 각 well의 상층액을 50μl씩 걷어내어 흡광도 측정용 투명 96 well 접시에 옮긴 후 분석용액 및 1M 염산용액을 처리하여 효소 반응을 진행 및 정지시킨다. 효소 반응을 정지시키고 난 후에는 형광/발광/흡광 측정기(multi-detection plate reader)를 이용하여 490nm 파장대의 흡광도를 측정 및 수치 변환하여 각 well의 세포독성 T 세포의 세포독성 정도를 정량화하였다.
그 결과 도 7a에서 나타낸 바와 같이, 제작한 키메릭 항원 수용체 발현 세포독성 T 세포(RANK.E125D+C127F CAR-T cell)를 RANK 리간드를 발현하지 않는(RANK ligand negative cell) U937 세포 또는 RANK 리간드를 발현하는(RANK ligand positive cell) 세포인 HL-60 세포와 공배양했을 때 RANK 리간드를 발현하지 않는 세포에 대해서는 4.3% 정도의 세포독성을 보인 반면 MHC class II를 발현하는 타겟 세포주에 대해서는 48% 이상의 매우 높은 세포독성을 보임을 확인하였다(p<0.01).
반면, 대조군인 공벡터를 도입한 세포독성 T 세포의 경우 RANK 리간드 발현 유무와 상관없이 세포독성을 갖지 않는 것으로 측정되었다.
상기 결과를 통해 RANK 세포외 도메인을 포함하고 있는 키메릭 항원 인지 수용체 발현 세포독성 T 세포가 RANK 리간드 단백질에 특이적인 세포독성을 보임으로써, 상기 CAR-T T세포를 이용하여 관련된 암세포 치료가 가능함을 확인할 수 있었다.
실시예 9. CAR- NK 세포의 RANK 리간드 발현 세포 특이적 세포독성 검증
상기 제작한 키메릭 항원 수용체 발현 NK 세포가 RANK 리간드 발현 세포를 특이적으로 인지하여 독성을 나타내는지 확인하기 위해, 실시예 3에서 선정한 타겟 세포인 HL-60 세포(RANK ligand positive cell)와 U937 세포(RANK ligand negative cell)를 키메릭 항원 수용체 발현 NK 세포(RANK.E125D+C127F CAR-T cell) 혹은 공벡터를 도입한 NK 세포(Mock NK cell)와 공배양하였다.
공배양 후 상층액에 존재하는 젖산 탈수소 효소(lactate dehydrogenase)의 양으로 NK 세포의 표적세포에 대한 세포독성 정도를 측정하는 비방사성 세포독성 분석법(non-radioactive cytotoxicity assay)을 이용하였다.
먼저, 96 well 세포 배양 접시의 well에 자연살해세포(1x105 cell)와 표적 세포(1x104 cell)를 각각 넣어 effector: target ratio를 10:1로 맞추고, well당 부피는 100μl가 되도록 접종 후 원심분리기를 이용해 250g의 조건에서, 4분 동안 원심분리하여 세포 간 간격을 가깝게 만든다. 6시간 배양 진행 후 각 well의 상층액을 50μl씩 걷어내어 흡광도 측정용 투명 96 well 접시에 옮긴 후 분석용액 및 1M 염산용액을 처리하여 효소 반응을 진행 및 정지시킨다. 효소 반응을 정지시키고 난 후에는 형광/발광/흡광 측정기(multi-detection plate reader)를 이용하여 490nm 파장대의 흡광도를 측정 및 수치 변환하여 각 well의 NK 세포의 세포독성 정도를 정량화하였다.
그 결과 도 7b에서 나타낸 바와 같이, 제작한 키메릭 항원 수용체 발현 NK 세포(LAG-3 CAR-NK cell)를 RANK 리간드를 발현하지 않는 U937 세포(RANK ligand negative cell) 또는 RANK 리간드를 발현하는 HL-60 세포(RANK ligand positive cell)를 공배양했을 때, U937 세포에 대해서는 거의 세포독성을 안보인 반면, HL-60 세포에 대해서는 47% 이상의 매우 높은 세포독성을 보임을 확인하였다(p<0.01).
반면 대조군인 공벡터를 도입한 NK 세포의 경우 MHC class II를 발현하지 않는 세포에 대해서는 세포독성을 보이지 않았으며 RANK 리간드 발현 유무와 상관없이 세포독성을 갖지 않는 것으로 측정되었다.
상기 결과를 통해 RANK의 세포외 도메인을 포함하고 있는 키메릭 항원 인지 수용체 발현 NK 세포가 RANK 리간드 단백질에 특이적인 세포독성을 보임으로써, 상기 CAR-NK 세포를 이용하여 관련된 암세포 치료가 가능함을 확인할 수 있었다.
이제까지 본 발명에 대하여 그 바람직한 실시예들을 중심으로 살펴보았다. 본 발명이 속하는 기술 분야에서 통상의 지식을 가진 자는 본 발명이 본 발명의 본질적인 특성에서 벗어나지 않는 범위에서 변형된 형태로 구현될 수 있음을 이해할 수 있을 것이다. 그러므로 개시된 실시예들은 한정적인 관점이 아니라 설명적인 관점에서 고려되어야 한다. 본 발명의 범위는 전술한 설명이 아니라 특허청구범위에 나타나 있으며, 그와 동등한 범위 내에 있는 모든 차이점은 본 발명에 포함된 것으로 해석되어야 할 것이다.

Claims (15)

  1. 항원 결합 도메인;
    막관통 도메인; 및
    세포 내 신호전달 도메인을 포함하는 키메릭 항원 수용체(CAR)로서,
    상기 항원 결합 도메인은 RANK 리간드에 특이적으로 결합하는 RANK의 세포외 도메인을 포함하는 것인, 키메릭 항원 수용체.
  2. 제1항에 있어서,
    상기 항원 결합 도메인은 RANK의 세포외 도메인 한 쌍이 이합체(dimer)의 형태로 각각 인간 이뮤노글로불린 G1 중쇄 불변 영역(IgG1 heavy chain constant region)에 연결된 것을 특징으로 하는 키메릭 항원 수용체.
  3. 제1항에 있어서,
    상기 RANK의 세포외 도메인은 서열번호 1로 표시되는 아미노산 서열을 포함하는 것인, 키메릭 항원 수용체.
  4. 제2항에 있어서,
    인간 이뮤노글로불린 G1 중쇄 불변 영역(IgG1 heavy chain constant region)은 서열번호 2로 표시되는 아미노산 서열을 포함하는 것인, 키메릭 항원 수용체.
  5. 제1항에 있어서,
    상기 막관통 도메인은 CD8이며, 서열번호 3으로 표시되는 아미노산 서열을 포함하는 것인, 키메릭 항원 수용체.
  6. 제1항에 있어서,
    상기 세포 내 신호전달 도메인은 CD28, 4-1BB 및 CD3 제타(zeta)로 이루어진 것 또는 이들의 조합을 포함하는 것인, 키메릭 항원 수용체.
  7. 제6항에 있어서,
    상기 CD28은 서열번호 4; 4-1BB은 서열번호 5; 및 CD3 제타(zeta)는 서열번호 6으로 표시되는 아미노산 서열을 포함하는 것인, 키메릭 항원 수용체.
  8. 제1항에 있어서,
    상기 항원 결합 도메인은 RANK 신호 펩타이드를 포함하며, 서열번호 7로 표시되는 아미노산 서열을 포함하는 것인, 키메릭 항원 수용체.
  9. 제1항 내지 제8항 중 어느 한 항의 키메릭 항원 수용체 단백질을 코딩하는 폴리 뉴클레오티드.
  10. 제9항의 폴리 뉴클레오티드를 포함하는 벡터.
  11. 제10항의 벡터로 형질전환된 세포.
  12. 제11항에 있어서,
    상기 세포는 세포독성 T 세포 또는 NK 세포인 것을 특징으로 하는 세포.
  13. 제12항의 세포를 유효성분으로 포함하는 RANK 리간드를 발현하는 암의 치료용 약학적 조성물.
  14. 제13항에 있어서,
    상기 암은 만성림프성 백혈병(chronic lymphocytic leukemia, CLL), 다발성 골수종(multiple myeloma), 암의 뼈 전이(bone metastasis), 골육종(osteosarcoma), 전립선암(prostate cancer) 및 비소형 세포 폐암(non-small cell lung cancer)으로 이루어진 군으로부터 선택되는 것을 특징으로 하는 조성물.
  15. 제11항의 세포를 포함하는 세포 치료제.
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