WO2022186652A1 - 눈물을 이용한 당뇨병의 진단 방법 및 키트 - Google Patents

눈물을 이용한 당뇨병의 진단 방법 및 키트 Download PDF

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정인경
김태기
김경헌
김정연
정유은
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경희대학교 산학협력단
고려대학교 산학협력단
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    • G01N2800/042Disorders of carbohydrate metabolism, e.g. diabetes, glucose metabolism

Definitions

  • the present invention is for diagnosing diabetes through analysis of metabolites in tears or monitoring the progress of diabetes after treatment.
  • Diabetes mellitus is a disease that causes chronic high blood sugar due to problems with the action or secretion of insulin, and is a common disease suffered by millions of patients worldwide. Diabetes can be caused by various genetic and environmental factors. Diabetes mellitus causes various complications such as diabetic retinopathy, nephropathy, neuropathy, stroke, myocardial infarction, and foot gangrene, which can seriously affect the patient's health and even lead to death.
  • the development of a diabetes diagnosis method can improve the patient's prognosis by enabling rapid and appropriate treatment through early diagnosis, and providing an appropriate monitoring system is very effective in preventing complications by avoiding high or low blood sugar levels and maintaining appropriate blood sugar levels. It is important.
  • Metabolomics is a study that investigates the changes in the overall metabolites according to the metabolic changes in the living body, that is, various physiological and pathological conditions. Since diabetes is caused by a complex action of genetic and environmental factors, it is very difficult to fully understand its pathology only with individual genes and diet. However, since the occurrence of diabetes is inevitably accompanied by changes in metabolites, direct physiological changes can be inferred and the etiology can be understood through a metabolomic approach.
  • Tears maintain the surface of the cornea and not only play a role in inhibiting infection, but also serve as a means of supplying nutrients and contain various metabolites, so tears may contain metabolites that can cause disease This is very high. Based on these characteristics, if a disease can be diagnosed by developing a kit to discriminate metabolites in tears, individuals can easily self-diagnose diseases non-invasively without the help of specialists. Therefore, inventing a kit for diagnosing diabetes using tears enables potential patients to self-diagnose in their daily life, increasing the possibility of early diagnosis as well as enabling proper monitoring of glucose metabolism after diagnosis. The development of therapeutic agents is also expected, which is very important.
  • An object of the present invention is to present a biomarker of a tear metabolite specific to a diabetic patient and to provide a model capable of discriminating between a normal person and a patient through the metabolite.
  • a kit for diagnosing diabetes comprising the composition of 1 above.
  • a method for providing information for diagnosing diabetes comprising comparing the level of at least one metabolite with a control.
  • the present invention discovers metabolite biomarkers that specifically increase or decrease in the tears of diabetic patients according to the onset of diabetes, and based on this, a biomarker capable of rapidly and accurately non-invasively diagnosing diabetes as well as monitoring after treatment can provide
  • the present invention can be applied to a diabetes diagnosis kit through metabolite analysis. It can also be used for various etiological studies such as glucose metabolism and diabetes complications.
  • Diabetes_Tears diabetic patients
  • Control Tears healthy controls
  • A score plot
  • B permutation tests
  • Figure 2 shows the metabolite changes in diabetic patients based on the Mann Whitney U test and MetaMapp, and each figure means the increase or decrease of each metabolite (square: metabolites with significantly higher levels in diabetic patients compared to the control group; circles; : Metabolites significantly reduced in diabetic patients; Diamond: Metabolites without statistical significance between groups).
  • each line indicates an interaction between metabolites (interactions based on biochemical relationships: mannitol-mannose, trehalose-glucose, gluconic acid lactone-glucose, galactonate-galactose, ⁇ -alanine-alanine, serine-alanine) ; interactions based on similar chemical structures: others).
  • P-value ⁇ 0.05 indicates statistical significance based on Mann whitney U test results.
  • the present invention provides at least one selected from the group consisting of 1,5-anhydroglucitol, beta-alanine, threonine, pentadecanoic acid, mannose, threose, sorbitol, serine, alanine, and squalene in tears isolated from diabetic patients It provides a composition for diagnosing diabetes, comprising a substance detecting a metabolite of:
  • the diabetes mellitus may be an absolute or relative deficiency of insulin action and may be hyperglycemia and accompanying metabolic disorders.
  • 1,5-anhydroglucitol is a substance also known as 1,5-AG, may be a naturally occurring monosaccharide found in almost all foods, and is a type of glucose derivative abundantly present following glucose in the blood of healthy individuals. It can be a chemically and biochemically very stable substance in the living body, and can be excreted in the urine with little metabolization.
  • the beta-alanine may be a naturally occurring ⁇ -amino acid having an amino group bonded to the ⁇ carbon.
  • the threonine may be an essential amino acid as one of the alpha-amino acids.
  • the pentadecanoic acid is also called pentadecylic acid and may be a saturated fatty acid rarely present in nature.
  • the mannose is a monosaccharide containing 6 carbon atoms, and may be important for metabolism to aldose having an aldehyde group, particularly for glycosylation of a specific protein.
  • the threose may be a monosaccharide containing a carbon atom, and may be an aldose having an aldehyde group.
  • the sorbitol may be a type of hexahydric alcohol obtained by reducing hexoses such as glucose.
  • the serine is one of the 20 amino acids generally found in animal proteins and may be an organic compound.
  • the alanine is one of the 20 amino acids, and may be an ⁇ -amino acid.
  • the squalene is an unsaturated hydrocarbon that is abundantly contained in shark liver oil, olive, amaranth seed, rice bran, malt, and the like, and is also present in various tissues of the human body, and can be used in the biosynthesis of steroid hormones, vitamin D, bile acid, and cholesterol in the body.
  • the “diagnosis” refers to determining the susceptibility of an object to a specific disease or disorder, determining whether an object currently has a specific disease or disorder, determining the prognosis of an object suffering from a specific disease or disorder , or terametrics.
  • the present invention provides a kit for diagnosing diabetes comprising the composition for diagnosing diabetes:
  • Diabetes diagnosis kit means a kit including a composition for diagnosis of diabetes, and the kit may further include instructions for using the kit.
  • the present invention relates to 1,5-anhydroglucitol, beta-alanine, threonine, pentadecanoic acid, mannose, threose, sorbitol, serine, alanine, and squalene identified in tear samples isolated from diabetic patients. It provides an information providing method for diagnosing diabetes, comprising comparing the level of at least one selected metabolite with a control group:
  • the control group may refer to a normal person without diabetes or a tear sample isolated from a normal person.
  • the step of comparing the level of the metabolite identified in the tear sample isolated from the diabetic patient with the control group includes firstly measuring the metabolite concentration in the diabetic patient and the normal control group, and comparing the metabolite concentration It means determining whether the metabolite concentration is significantly higher or lower in the diabetic group compared to the healthy control group.
  • the step of measuring the metabolite concentration in the diabetic patient and the normal control may be quantified by a quantitative device, that is, a chromatography/mass spectrometer.
  • the quantitative device may be any chromatography for quantitative purposes commonly used in the field, and the type of the quantitative device may be, for example, gas chromatography, liquid-solid chromatography (LSC), or paper chromatography.
  • the present invention was approved by the IRB (Clinical Research Institutional Ethics Committee) of Kyunghee University Gangdong Kyunghee University Hospital, and the subjects who agreed to the study were diabetic patients and normal people without diabetes who are being treated at the Department of Endocrinology of Kyunghee University Hospital in Gangdong. The study was conducted on
  • the instrument conditions for GC/TOF MS analysis are as follows.
  • the column used for the analysis was an RTX-5Sil MS capillary column (30 m length, 0.25 mm film thickness, and 25 mm inner diameter), and the GC column temperature condition was first maintained at 50°C for 5 minutes and then raised to 330°C. It was held for 1 minute. 1 ⁇ l of the sample was injected splitless. Transfer line temperature and ion source temperature were maintained at 280°C and 250°C, respectively.
  • GC/TOF MS gas chromatography/time-of-flight mass spectrometry
  • OPLS-DA was performed to confirm the expression level of the 48 metabolites identified in Example 1 and to compare the metabolite profiling differences between diabetic patients and healthy controls.

Abstract

본 발명은 당뇨병 환자로부터 분리된 눈물 내 대사체를 검출하는 물질을 포함하는 당뇨병 진단용 조성물 또는 당뇨병 진단을 위한 정보제공방법에 관한 것이다. 본 발명은 당뇨병 환자의 눈물을 GC/TOF MS 분석하여 대조군 대비 높거나 낮은 수준을 보이는 대사체를 규명하고, 트레오닌, 펜타데칸산, 만노스, 트레오스, 솔비톨, 세린, 알라닌 또는 스쿠알렌 수준이 대조군 대비 높을 경우 또는 1,5-안하이드로글루시톨 또는 베타-알라닌 수준이 대조군 대비 낮을 경우에는 대조군 대비 당뇨병이 발병했을 가능성이 높다고 진단할 수 있다.

Description

눈물을 이용한 당뇨병의 진단 방법 및 키트
본 발명은 눈물의 대사물질 분석을 통해 당뇨병을 진단하거나 치료 후 당뇨병의 경과를 모니터링 하기 위한 것이다.
당뇨병은 인슐린의 작용이나 분비에 문제가 생겨서 만성적인 고혈당을 초래하는 질환으로 전 세계적으로 수백만 명의 환자가 겪는 흔한 질환이다. 당뇨병은 다양한 유전적, 환경적 요인에 의하여 유발될 수 있다. 이러한 당뇨병은 당뇨병성 망막병증, 신증, 신경병증, 뇌졸중, 심근경색, 그리고 족부 괴저 등 다양한 합병증을 유발하여 환자의 건강에 심각한 영향을 미칠 수 있으며 사망에까지 이를 수 있다.
당뇨병 진단방법의 개발은 조기 진단을 통해 빠르고 적절한 치료를 가능하게 하여 환자의 예후를 좋게 할 수 있고, 적절한 모니터링 시스템을 마련하는 것은 고혈당이나 저혈당을 피하고 적절한 혈당 수치를 유지할 수 있도록 하여 합병증 예방에 매우 중요하다.
대사체학은 생체의 대사적 변화에 따른 종합적인 대사물질의 변화, 즉 다양한 생리학적, 병리학적 상태를 규명하는 학문이다. 당뇨병은 유전적, 환경적 인자들이 복합적으로 작용하여 발생하는 것이기 때문에 그 병리학을 개별적인 유전자 및 식습관만으로 완전히 이해하기는 매우 어렵다. 그러나 당뇨병의 발생은 필연적으로 대사물질의 변화가 동반되므로, 대사체학적 접근을 통해서 직접적인 생리 변화를 추측하고 병인학을 이해할 수 있다.
눈물은 각막의 표면을 유지하며 감염을 억제하는 역할을 할 뿐만 아니라, 영양분을 공급하기 위한 수단으로 사용되며 다양한 대사물질을 포함하고 있으므로 눈물은 질병의 원인이 될 수 있는 대사물질을 포함하고 있을 가능성이 매우 높다. 이러한 특성을 바탕으로 눈물 내 대사물질을 감별하는 키트를 개발하여 질병을 진단할 수 있게 되면 개인이 전문인력의 도움 없이 비침습적으로 간편히 질병을 자가 진단할 수 있다. 따라서 눈물을 이용해서 당뇨병을 진단하는 키트를 발명하는 것은 잠재적 환자가 일상에서 자가 진단을 가능하게 하여 조기 진단의 가능성을 높일 뿐 아니라 진단 후 당대사에 대한 적절한 모니터링을 가능하게 하므로, 병리학 이해를 통한 치료제의 개발도 기대될 수 있어서 매우 중요하다.
본 발명은 당뇨병 환자에 특이적인 눈물 대사체 바이오마커를 제시하고 대사물질을 통해 정상인과 환자를 감별할 수 있는 모델을 제공하는 것을 목적으로 한다.
1. 당뇨병 환자로부터 분리된 눈물 내 1,5-안하이드로글루시톨, 베타-알라닌, 트레오닌, 펜타데칸산, 만노스, 트레오스, 솔비톨, 세린, 알라닌, 스쿠알렌으로 이루어진 군에서 선택되는 적어도 하나의 대사체를 검출하는 물질을 포함하는, 당뇨병 진단용 조성물.
2. 위 1의 조성물을 포함하는 당뇨병 진단용 키트.
3. 당뇨병 환자로부터 분리된 눈물 시료에서 확인된 1,5-안하이드로글루시톨, 베타-알라닌, 트레오닌, 펜타데칸산, 만노스, 트레오스, 솔비톨, 세린, 알라닌, 스쿠알렌으로 이루어진 군에서 선택되는 적어도 하나의 대사체의 수준을 대조군과 비교하는 단계를 포함하는 당뇨병 진단을 위한 정보제공방법.
4. 위 3에 있어서, 트레오닌, 펜타데칸산, 만노스, 트레오스, 솔비톨, 세린, 알라닌 또는 스쿠알렌 수준이 대조군 대비 높으면 대조군 대비 당뇨병이 발병했을 가능성이 높다고 진단하는 단계를 더 포함하는 당뇨병 진단을 위한 정보제공방법.
5. 위 3에 있어서, 1,5-안하이드로글루시톨 또는 베타-알라닌 수준이 대조군 대비 낮으면 대조군 대비 당뇨병이 발병했을 가능성이 높다고 진단하는 단계를 더 포함하는 당뇨병 진단을 위한 정보제공방법.
본 발명은 당뇨병 발병여부에 따라서 당뇨병 환자의 눈물에서 특이적으로 증감하는 대사체 바이오마커를 발굴하여, 이를 기반으로 신속하고 정확하게 비침습적으로 당뇨병을 진단할 수 있을 뿐만 아니라 치료 후 모니터링이 가능한 생체표지자를 제공할 수 있다.
또한 본 발명은 대사체 분석을 통한 당뇨병 진단 키트에 적용될 수 있다. 또한 당대사 및 당뇨병 합병증 등의 다양한 병인학 연구에 이용될 수 있다.
도 1은 OPLS-DA를 이용한 당뇨병 환자와(Diabetes_Tears) 건강한 대조군 (Control Tears) 간의 비교 분석 결과로, 눈물 대사체 프로파일을 나타낸다 (A: score plot; B: permutation tests).
도 2는 Mann Whitney U test와 MetaMapp에 기반하여 당뇨병 환자의 대사물질 변화를 나타낸 것으로, 각 도형은 각 대사물질의 증감을 의미한다 (사각형: 대조군 대비 당뇨병 환자에서 유의미하게 수준이 높은 대사물질; 원: 당뇨병 환자에서 유의미하게 감소한 대사물질; 다이아몬드: 그룹 간 통계적 유의미성이 없는 대사물질을 의미). 또한, 각 선은 대사 물질들 간 상호작용을 의미한다 (생화학적 관계에 기반한 상호작용: mannitol-mannose, trehalose-glucose, gluconic acid lactone-glucose, galactonate-galactose, β-alanine-alanine, serine-alanine; 유사한 화학 구조에 기반한 상호작용: 그 외). P-value <0.05은 Mann whitney U test 결과에 기반하여 통계적으로 유의미함을 나타낸다.
본 발명은 당뇨병 환자로부터 분리된 눈물 내 1,5-안하이드로글루시톨, 베타-알라닌, 트레오닌, 펜타데칸산, 만노스, 트레오스, 솔비톨, 세린, 알라닌, 스쿠알렌으로 이루어진 군에서 선택되는 적어도 하나의 대사체를 검출하는 물질을 포함하는, 당뇨병 진단용 조성물을 제공한다:
상기 당뇨병은 인슐린 작용의 절대적 혹은 상대적 결핍으로 고혈당과 이에 수반되는 대사 장애일 수 있다.
상기 1,5-안하이드로글루시톨은 1,5-AG로도 알려진 물질로, 거의 모든 음식에서 발견되는 자연 발생 단당류일 수 있으며, 건강한 개체의 혈중에 글루코스에 뒤이어 많이 존재하는 글루코스 유도체의 일종으로 화학적 및 생화학적으로 생체 내에서 매우 안정한 물질일 수 있고, 거의 대사되지 않고 요중에 배설될 수 있다.
상기 베타-알라닌은 β 탄소에 아미노기가 결합하고 있는 자연적으로 생성되는 β-아미노산일 수 있다.
상기 트레오닌은 알파-아미노산의 하나로 필수 아미노산일 수 있다.
상기 펜타데칸산은 펜타데실산으로도 불리며 자연계에 드물게 존재하는 포화 지방산일 수 있다
상기 만노스는 6개의 탄소원자가 포함된 단당류이고, 알데하이드기를 가지고 있는 알도스로 물질대사, 특히 특정 단백질의 글리코실화에 중요할 수 있다.
상기 트레오스는 탄소 원자가 포함된 단당류이고, 알데하이드기를 가지고 있는 알도스일 수 있다.
상기 솔비톨은 포도당과 같은 육탄당을 환원하여 얻는 6가 알코올의 일종일 수 있다.
상기 세린은 일반적으로 동물성 단백질에서 발견되는 20개의 아미노산 중 하나로 유기 화합물일 수 있다.
상기 알라닌은 20개 아미노산 중 하나로, α-아미노산일 수 있다.
상기 스쿠알렌은 상어간유, 올리브, 아마란스 씨, 쌀겨, 맥아 등에 많이 함유되어 있는 불포화 탄화수소로서 인체의 여러 조직에도 존재하며, 체내에서 스테로이드 호르몬과 비타민D, 담즙산, 콜레스테롤의 생합성에도 이용될 수 있다.
상기 “진단”은 특정 질병 또는 질환에 대한 한 객체의 감수성을 판정하는 것, 한 객체가 특정 질병 또는 질환을 현재 가지고 있는지 여부를 판정하는 것, 특정 질병 또는 질환에 걸린 한 객체의 예후를 판정하는 것, 또는 테라메트릭스(therametrics)를 포함할 수 있다.
본 발명은 상기 당뇨병 진단용 조성물을 포함하는 당뇨병 진단용 키트를 제공한다:
“당뇨병 진단용 키트”는 당뇨병 진단용 조성물이 포함된 키트를 의미하며, 상기 키트는 키트를 사용하기 위한 방법이 기재된 설명서를 더 포함할 수 있다.
또한 본 발명은 당뇨병 환자로부터 분리된 눈물 시료에서 확인된 1,5-안하이드로글루시톨, 베타-알라닌, 트레오닌, 펜타데칸산, 만노스, 트레오스, 솔비톨, 세린, 알라닌, 스쿠알렌으로 이루어진 군에서 선택되는 적어도 하나의 대사체의 수준을 대조군과 비교하는 단계를 포함하는 당뇨병 진단을 위한 정보제공방법을 제공한다:
상기 대조군은 당뇨병이 없는 정상인 또는 정상인으로부터 분리된 눈물 시료를 의미하는 것일 수 있다.
상기 당뇨병 환자로부터 분리된 눈물 시료에서 확인된 대사체의 수준을 대조군과 비교하는 단계는 우선적으로 당뇨병 환자 및 정상 대조군에서의 대사체 농도를 측정하는 단계를 포함하고, 상기 대사체의 농도를 비교하여 건강한 대조군 대비 당뇨병 환자군에서 대사체 농도가 유의하게 높거나 낮은 것을 판단하는 것을 의미한다.
상기 당뇨병 환자 및 정상 대조군에서의 대사체 농도를 측정하는 단계는 정량기기, 즉 크로마토그래피/질량분석기에 의해 정량화될 수 있다. 상기 정량기기는 해당 분야에서 통상적으로 사용되는 모든 정량 목적의 크로마토그래피일 수 있고, 정량기기의 종류는 예를 들면 가스 크로마토그래피, 액체-고체 크로마토그래피(Liquid-Solid Chromatography, LSC), 종이 크로마토그래피(Paper Chromatography, PC), 박층 크로마토그래피(Thin-Layer Chromatography, TLC), 기체-고체 크로마토그래피(Gas-Solid Chromatography, GSC), 액체-액체 크로마토그래피(Liquid-Liquid Chromatography, LLC), 포말 크로마토그래피(Foam Chromatography, FC), 유화 크로마토그래피(Emulsion Chromatography, EC), 기체-액체 크로마토그래피(Gas-Liquid Chromatography, GLC), 이온 크로마토그래피(Ion Chromatography, IC), 겔 여과 크로마토그래피(Gel Filtration Chromatograhy, GFC) 또는 겔 투과 크로마토그래피(Gel Permeation Chromatography, GPC)일 수 있고, 바람직하게는 GC/TOF MS(gas chromatography/time-of-flight mass spectrometry) 분석기기일 수 있으나, 이에 제한되는 것은 아니다.
이하, 본 발명을 실시예에 의해 상세히 설명한다. 하기 실시예는 본 발명을 예시하는 것으로, 본 발명의 내용이 하기 실시예에 한정되는 것은 아니다.
실시예
1. 실험방법
(1) 당뇨병 환자 또는 정상인의 눈물 채취
본 발명은 임상연구를 위해 경희의대 강동경희대학교병원 IRB (임상연구 기관윤리위원회)의 승인을 거쳐 강동경희대학교병원의 내분비내과에 진료중인 당뇨병 환자와 당뇨병이 없는 정상인을 대상으로 연구에 동의한 대상자에 한하여 연구를 진행하였다.
당뇨병 환자 또는 정상인의 눈물 내 대사체를 동정하기 위해, 총 44명의 당뇨병 환자와 당뇨병이 없는 건강한 성인을 대조군으로 하여 양안을 포함하여 54개의 눈물 샘플을 채취하였다.
(2) GC/TOF MS 및 OPLS-DA 분석
각 눈물 샘플 10 μl에 순수 메탄올 990 μl을 섞고 강하게 혼합(vortexing)한 후에 원심분리하여 대사체를 추출하였다. 이후 추출한 대사체를 유도체화 시킨 후 GC/TOF MS 를 이용하여 분석하는데, 그 과정은 다음과 같다. 추출한 검체를 스피드 백으로 건조시킨 후에 5 μl의 40%(w/v)농도의 O-methylhydroxylamine hydrochloride in pyridine을 넣고 30℃, 200 rpm에서 90분간 반응을 시킨다. 그리고 45 μl의 N-methyl-N-(trimethylsilyl)trifluoroacetamide를 넣고 37℃, 200 rpm에서 30분간 반응을 실시한다.
GC/TOF MS 분석을 위한 기기 조건은 다음과 같다. 분석할 때 사용한 컬럼은 RTX-5Sil MS capillary column (30 m length, 0.25 mm film thickness, and 25 mm inner diameter)이며, GC 컬럼 온도 조건은 먼저 50℃에서 5분간 유지시킨 후 330℃까지 승온 시킨 후 1분간 유지하였다. 1μl의 검체를 splitless로 injection 하였다. Transfer line 온도와 Ion source 온도는 각각 280℃, 250℃로 유지시켰다.
이후, GC/TOF MS (gas chromatography/time-of-flight mass spectrometry) 분석을 수행하였다. 우선 결과 값을 통계처리 가능한 수치로 변환하고, 이를 이용하여 통계학적으로 두 생체시료군 (당뇨병 환자군 및 정상 대조군)의 차별성을 검증하기 위해 교부분 최소제곱회귀법(Orthogonal partial least squares discriminant analysis: OPLS-DA)을 수행하여, 두 생체시료군 간의 유의적인 차이를 나타내는 대사체 바이오마커를 선정하고, 해당 바이오마커들에 대해 추가적으로 분석하고 검증하였다.
2. 실험결과
(1) GC/TOF MS 분석 결과
GC/TOF MS 결과를 보유하고 있는 library에서 찾아 동정하여, 결과적으로 눈물에서 48개의 대사체를 동정하였다 (표 1). 구체적으로는 아민류, 아미노산류, 당 및 당 알코올류, 지방산류, 인산류, 유기산류 등을 포함한 총 48개의 대사체를 동정 및 상대정량하였다. 이를 기반으로 당뇨병 환자와 건강한 대조군의 대사체 차이가 있는지 살펴보기 위하여 OPLS-DA를 이용하여 구분하였다.
Category 대사체(metabolites) 규명 (눈물)
Amine Adenosine
Amino acid Alanine, Oxoproline, Serine, Threonine, β
Organic acid Azelaic acid, Citrate, DL-3-aminoisobutyrate, Fumarate, Galactonate, Gluconic acid lactone, Glycerate, Glycolate, Oxalate, Pyrrole-2-carboxylate, Succinate, Terephthalate, β
Fatty acid 1-monopalmitin, 1-monostearin, Arachidic acid, Decanoic acid, Dodecanoic acid, Heptadecanoic acid, Lignoceric acid, Myristic acid, Nonanoic acid, Oleic acid, Palmitic acid, Pentadecanoic acid, Stearic acid
Sugar and sugar alcohol 1,5-anhydroglucitol, Fucose, Galactose, Glucose, Glycerol, Mannitol, Mannose, Myo-inositol, Sorbitol, Threitol, Threose, Trehalose
Miscellaneous 1,2,4-benzenetriol, Phosphate, Salicylaldehyde, Squalene
(2) OPLS-DA를 이용한 당뇨병 환자군 및 건강한 대조군간 대사체 발현 차이 확인
실시예 1로부터 동정한 48개 대사체의 발현 수준을 확인하고 당뇨병 환자와 건강한 대조군 간의 대사체 프로파일링 차이를 비교하기 위하여 OPLS-DA를 실시하였다.
그 결과, 당뇨병 환자와 건강한 대조군의 눈물 내 대사체 프로파일이 명확하게 차이가 나는 것을 확인하였다(도 1A). OPLS-DA 모델의 t[1] 축을 기준으로 건강한 대조군이 양수값을 띠며 당뇨병 환자가 음수값을 띠어서 서로 대사체 프로파일이 완전히 구분되는 것을 확인하였다(표 2). 당뇨병 환자와 건강한 대조군을 구분하는 OPLS-DA 모델이 통계적으로 유의미하게 외부 샘플에도 적용이 가능한지 살펴보기 위하여 permutation test를 진행하였고, 그 R2 값과 Q2 값이 original points보다 낮아서 모델이 통계적으로 유효함을 살펴볼 수 있었다 (도 1B).
당뇨병환자 t[1] 대조군 t[1]
당뇨병환자_1 -1.000 대조군_1 0.832
당뇨병환자_2 -0.759 대조군_2 0.618
당뇨병환자_3 -0.582 대조군_3 1.221
당뇨병환자_4 -1.548 대조군_4 0.021
당뇨병환자_5 -1.170 대조군_5 0.460
당뇨병환자_6 -1.249 대조군_6 1.173
당뇨병환자_7 -0.768 대조군_7 0.080
당뇨병환자_8 -2.158 대조군_8 -0.442
당뇨병환자_9 -0.945 대조군_9 0.456
당뇨병환자_10 -1.330 대조군_10 0.808
당뇨병환자_11 -1.369 대조군_11 2.364
당뇨병환자_12 -2.463 대조군_12 1.197
당뇨병환자_13 -2.287 대조군_13 2.392
당뇨병환자_14 -1.597 대조군_14 1.579
당뇨병환자_15 -3.568 대조군_15 2.234
당뇨병환자_16 -0.254 대조군_16 1.199
당뇨병환자_17 -1.532 대조군_17 1.801
당뇨병환자_18 -1.182 대조군_18 1.953
당뇨병환자_19 -0.677 대조군_19 1.768
당뇨병환자_20 -2.458 대조군_20 0.895
당뇨병환자_21 -1.257 대조군_21 1.862
당뇨병환자_22 -2.444 대조군_22 1.374
당뇨병환자_23 -1.158 대조군_23 0.973
당뇨병환자_24 -2.138 대조군_24 0.190
대조군_25 2.294
대조군_26 1.489
대조군_27 2.102
대조군_28 -0.330
대조군_29 1.977
대조군_30 1.351
(3) Mann Whitney U test를 이용한 당뇨병 환자-특이적으로 증감한 대사물질의 규명당뇨병의 유무에 따라 눈물에서 유의미하게 증감하는 대사물질을 확인하기 위해, 상기 48개의 대사물질에 Mann Whitney U test를 통해서 신뢰구간을 분석하였다 (표 3). 그 결과, 10 개의 대사물질이 당뇨병 환자의 눈물에서 유의미하게 증감하는 것을 확인하였다 (표 4). 구체적으로는 1,5-anhydroglucitol, β-alanine, threonine, pentadecanoic acid, mannose, threose, sorbitol, serine, alanine, squalene 10개의 대사물질이 건강한 대조군보다 당뇨병 환자의 눈물에서 유의적으로 높거나 낮은 것을 확인할 수 있었다. 10개의 대사물질 중 threonine, pentadecanoic acid, mannose, threose, sorbitol, serine, alanine, squalene은 대조군 대비 당뇨병 환자에서 발현 수준이 높았고, 반면 1,5-anhydroglucitol, β-alanine는 대조군 대비 당뇨병 환자에서 발현수준이 낮았다. 이러한 결과는 MetaMapp로 형상화하여 나타내었다 (도 2).
대사물질 당뇨병 환자 (median) 건강한 대조군 (median) Fold change (당뇨/대조군) p value
1,5-anhydroglucitol 365 2604 0.14 3.78.E-08
threonine 723 455 1.59 1.28.E-03
pentadecanoic acid 2935 2415 1.22 6.97.E-03
mannose 845 427 1.98 1.34.E-02
threose 314 210 1.50 1.34.E-02
sorbitol 281 199 1.41 2.06.E-02
serine 331 194 1.70 2.16.E-02
alanine 588 446 1.32 2.26.E-02
squalene 259 172 1.51 2.47.E-02
β-alanine 15943 21172 0.75 4.53.E-02
DL-3-aminoisobutyrate 4348 5259 0.83 5.33.E-02
trehalose 433 289 1.50 7.30.E-02
citrate 3850 8216 0.47 7.58.E-02
oxoproline 18103 11538 1.57 7.87.E-02
mannitol 502 340 1.47 8.80.E-02
fumarate 1334 1127 1.18 1.26.E-01
myristic acid 743 710 1.05 1.34.E-01
decanoic acid 930 776 1.20 1.49.E-01
palmitic acid 325987 303955 1.07 1.69.E-01
stearic acid 22754 21299 1.07 1.80.E-01
threitol 393 348 1.13 2.23.E-01
glycerol 25243 38472 0.66 2.58.E-01
glycolate 1448 1103 1.31 2.80.E-01
salicylaldehyde 696 641 1.09 2.88.E-01
adenosine 181 152 1.19 3.21.E-01
azelaic acid 138 133 1.03 3.56.E-01
succinate 908 671 1.35 3.56.E-01
phosphate 321326 345026 0.93 3.75.E-01
glycerate 373 347 1.07 4.03.E-01
lignoceric acid 1373 1283 1.07 5.08.E-01
nonanoic acid 906 864 1.05 5.08.E-01
glucose 2774 3070 0.90 5.42.E-01
arachidic acid 299 258 1.16 5.66.E-01
galactose 2239 2225 1.01 6.14.E-01
heptadecanoic acid 412 380 1.08 6.14.E-01
dodecanoic acid 502 555 0.91 7.15.E-01
gluconic acid lactone 166 169 0.98 7.15.E-01
terephthalate 367 388 0.95 7.28.E-01
oleic acid 503 527 0.95 7.94.E-01
myo-inositol 5814 4962 1.17 8.07.E-01
pyrrole-2-carboxylate 382 371 1.03 8.07.E-01
β-hydroxybutyrate 298 320 0.93 8.48.E-01
fucose 1838 1744 1.05 8.89.E-01
galactonate 238 232 1.03 9.44.E-01
oxalate 24031 23295 1.03 9.44.E-01
Category 대사물질 당뇨병 환자
(중앙값)
건강한 대조군
(중앙값)
Fold change
(당뇨/대조군)
p value
아미노산 알라닌 588 446 1.32 2.26.E-02
세린 331 194 1.70 2.16.E-02
트레오닌 723 455 1.59 1.28.E-03
베타-알라닌 15943 21172 0.75 4.53.E-02
지방산 펜타데칸산 2935 2415 1.22 6.97.E-03
당 및
당 알코올
1,5-안하이드로글루시톨 365 2604 0.14 3.78.E-08
만노스 845 427 1.98 1.34.E-02
트레오스 314 210 1.50 1.34.E-02
솔비톨 281 199 1.41 2.06.E-02
기타 스쿠알렌 259 172 1.51 2.47.E-02

Claims (5)

  1. 당뇨병 환자로부터 분리된 눈물 내 1,5-안하이드로글루시톨, 베타-알라닌, 트레오닌, 펜타데칸산, 만노스, 트레오스, 솔비톨, 세린, 알라닌, 스쿠알렌으로 이루어진 군에서 선택되는 적어도 하나의 대사체를 검출하는 물질을 포함하는, 당뇨병 진단용 조성물.
  2. 청구항 1의 조성물을 포함하는 당뇨병 진단용 키트.
  3. 당뇨병 환자로부터 분리된 눈물 시료에서 확인된 1,5-안하이드로글루시톨, 베타-알라닌, 트레오닌, 펜타데칸산, 만노스, 트레오스, 솔비톨, 세린, 알라닌, 스쿠알렌으로 이루어진 군에서 선택되는 적어도 하나의 대사체의 수준을 대조군과 비교하는 단계를 포함하는 당뇨병 진단을 위한 정보제공방법.
  4. 청구항 3에 있어서, 트레오닌, 펜타데칸산, 만노스, 트레오스, 솔비톨, 세린, 알라닌 또는 스쿠알렌 수준이 대조군 대비 높으면 대조군 대비 당뇨병이 발병했을 가능성이 높다고 진단하는 단계를 더 포함하는 당뇨병 진단을 위한 정보제공방법.
  5. 청구항 3에 있어서, 1,5-안하이드로글루시톨 또는 베타-알라닌 수준이 대조군 대비 낮으면 대조군 대비 당뇨병이 발병했을 가능성이 높다고 진단하는 단계를 더 포함하는 당뇨병 진단을 위한 정보제공방법.
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