WO2020195413A1 - 電流測定方法 - Google Patents

電流測定方法 Download PDF

Info

Publication number
WO2020195413A1
WO2020195413A1 PCT/JP2020/006901 JP2020006901W WO2020195413A1 WO 2020195413 A1 WO2020195413 A1 WO 2020195413A1 JP 2020006901 W JP2020006901 W JP 2020006901W WO 2020195413 A1 WO2020195413 A1 WO 2020195413A1
Authority
WO
WIPO (PCT)
Prior art keywords
current
electrodes
distance
value
measuring method
Prior art date
Application number
PCT/JP2020/006901
Other languages
English (en)
French (fr)
Inventor
正輝 谷口
敬人 大城
真田 雅和
聡 宮城
Original Assignee
株式会社Screenホールディングス
国立大学法人大阪大学
Priority date (The priority date is an assumption and is not a legal conclusion. Google has not performed a legal analysis and makes no representation as to the accuracy of the date listed.)
Filing date
Publication date
Application filed by 株式会社Screenホールディングス, 国立大学法人大阪大学 filed Critical 株式会社Screenホールディングス
Priority to JP2021508811A priority Critical patent/JP7398129B2/ja
Priority to US17/598,726 priority patent/US20220187244A1/en
Publication of WO2020195413A1 publication Critical patent/WO2020195413A1/ja

Links

Images

Classifications

    • GPHYSICS
    • G01MEASURING; TESTING
    • G01NINVESTIGATING OR ANALYSING MATERIALS BY DETERMINING THEIR CHEMICAL OR PHYSICAL PROPERTIES
    • G01N27/00Investigating or analysing materials by the use of electric, electrochemical, or magnetic means
    • G01N27/26Investigating or analysing materials by the use of electric, electrochemical, or magnetic means by investigating electrochemical variables; by using electrolysis or electrophoresis
    • G01N27/28Electrolytic cell components
    • G01N27/30Electrodes, e.g. test electrodes; Half-cells
    • G01N27/327Biochemical electrodes, e.g. electrical or mechanical details for in vitro measurements
    • G01N27/3275Sensing specific biomolecules, e.g. nucleic acid strands, based on an electrode surface reaction
    • G01N27/3278Sensing specific biomolecules, e.g. nucleic acid strands, based on an electrode surface reaction involving nanosized elements, e.g. nanogaps or nanoparticles
    • GPHYSICS
    • G01MEASURING; TESTING
    • G01NINVESTIGATING OR ANALYSING MATERIALS BY DETERMINING THEIR CHEMICAL OR PHYSICAL PROPERTIES
    • G01N27/00Investigating or analysing materials by the use of electric, electrochemical, or magnetic means
    • G01N27/26Investigating or analysing materials by the use of electric, electrochemical, or magnetic means by investigating electrochemical variables; by using electrolysis or electrophoresis
    • G01N27/416Systems
    • G01N27/49Systems involving the determination of the current at a single specific value, or small range of values, of applied voltage for producing selective measurement of one or more particular ionic species
    • GPHYSICS
    • G01MEASURING; TESTING
    • G01NINVESTIGATING OR ANALYSING MATERIALS BY DETERMINING THEIR CHEMICAL OR PHYSICAL PROPERTIES
    • G01N33/00Investigating or analysing materials by specific methods not covered by groups G01N1/00 - G01N31/00
    • G01N33/48Biological material, e.g. blood, urine; Haemocytometers
    • G01N33/483Physical analysis of biological material
    • G01N33/487Physical analysis of biological material of liquid biological material
    • G01N33/48707Physical analysis of biological material of liquid biological material by electrical means
    • G01N33/48721Investigating individual macromolecules, e.g. by translocation through nanopores

Definitions

  • the present invention relates to a current measuring method for measuring a tunneling current of a biopolymer passing between a pair of electrodes.
  • Patent Document 1 describes a method for identifying a specific molecule using a fine electrode.
  • a single molecule constituting a biopolymer passing between electrodes is identified by measuring a tunnel current using an electrode pair having a short distance between electrodes.
  • Patent Document 1 does not consider such an effect on the electric current of molecules such as ions and dipoles contained in the liquid used for the liquid sample. Therefore, when a liquid containing an electrolyte is used as the liquid sample, it may cause an erroneous operation or an analysis error in the operation on the electrode or the analysis of the current value.
  • the present invention has been made in view of such circumstances, and an object of the present invention is to provide a current measuring method for more accurately measuring the tunneling current of a biopolymer contained in a liquid sample containing an electrolyte. ..
  • the first invention of the present application is a current measuring method for measuring a tunnel current of a biopolymer passing between a pair of electrodes, and a) the electrodes are arranged in a liquid containing an electrolyte.
  • the second invention of the present application is the current measuring method of the first invention.
  • B) The distance between the electrodes is fixed, and a predetermined voltage is applied from the state where the voltage between the electrodes is not applied.
  • a step of measuring the current flowing through the above step and a step of calculating the feature amount due to the electric double layer with respect to the current value measured in the step b) are included.
  • the third invention of the present application is the current measuring method of the second invention, in which the step b) and the step c) are performed before the step a), and the measurement timing in the step a) is the feature. Determined based on quantity.
  • the fourth invention of the present application is the current measuring method of the second invention, and the feature amount is a time constant of the current value measured in the step b).
  • the fifth invention of the present application is the current measuring method of the fourth invention, and a plurality of the time constants are calculated in the step c).
  • the sixth invention of the present application is the current measuring method of the fourth invention or the fifth invention, and the step b) and the step c) are performed before the step a), and the measurement timing in the step a). Is determined based on the time constant.
  • the seventh invention of the present application is the current measuring method of the fifth invention, and in the step a), an operation is performed so as to change the distance between the electrodes while applying a predetermined voltage between the electrodes.
  • the step a) is a step of waiting for a standby time calculated based on p1) the time constant and p2) a distance between the electrodes.
  • the step of acquiring the value of the operation amount used for changing the above and the current value between the electrodes, and p3) the step of changing the operation amount and changing the distance between the electrodes are repeated a plurality of times.
  • the eighth invention of the present application is the current measuring method of the seventh invention, and d) a step of calculating an approximate function that functionally approximates the relationship between the plurality of the manipulated variables and the plurality of the current values in the step a). Further have.
  • the ninth invention of the present application is the current measuring method of the seventh invention, and the waiting time in the step p1) is calculated by multiplying the time constant by a constant.
  • the tenth invention of the present application is the current measuring method of the fifth invention, in which, after the step b) and the step c), e) the distance between the electrodes where a tunnel current does not flow between the electrodes.
  • the step of measuring the value of the reference current flowing between the electrodes, f) the value of the tunnel current corresponding to the target distance between the electrodes, and the value of the reference current measured in e) are added to add up the target total. Further including a step of calculating the current value, the step e) and the step f) were performed before the step a), and the step a) was calculated based on q1) the time constant.
  • the process of manipulating the distance between the electrodes is repeated a plurality of times.
  • the eleventh invention of the present application is the current measuring method of the fifth invention, in which a tunnel current is generated between the electrodes g) after the step b) and the step c) and before the step a).
  • r2) a step of measuring the base current between the electrodes, and r3) a step of manipulating the distance between the electrodes in a direction in which the value of the base current approaches the intermediate target total current value calculated in the step h). Is repeated a plurality of times, and after the step a), i) an operation of a pre-calculated operation amount from the intermediate target electrode-to-electrode distance to the final target electrode-to-electrode distance is performed to match the final target.
  • the step of adjusting the distance between the electrodes is further included.
  • the current can be measured in consideration of the electric double layer.
  • the thickness direction of the electrode substrate is the vertical direction
  • the metal layer side is the upper side with respect to the substrate layer
  • the substrate layer side is the lower side with respect to the metal layer.
  • the orientation of the electrode substrate when used does not necessarily have to be vertically upward on the metal layer side.
  • FIG. 1 is a top view of the electrode substrate 1.
  • 2 to 4 are partial top views of the electrode substrate 1.
  • 5 and 6 are schematic views showing a state of pushing and bending of the electrode substrate 1 using the current measuring device 9.
  • 7 and 8 are schematic partial cross-sectional views showing a state of pushing and bending of the electrode substrate 1.
  • the electrode substrate 1 and the current measuring device 9 are composed of amino acids constituting proteins, which are biopolymers, nucleotides constituting nucleic acids (DNA, RNA), monosaccharides constituting sugar chains, and simple biopolymers. It is used to analyze the arrangement of molecules and each single molecule. Specifically, the biopolymer is passed between the nanoelectrodes 34 in a state where a voltage is applied between the nanoelectrodes 34 described later. Then, during this period, the tunnel current flowing between the nanoelectrode 34 and the biopolymer is detected, and the current is analyzed to analyze the single molecule constituting the biopolymer.
  • amino acids constituting proteins which are biopolymers, nucleotides constituting nucleic acids (DNA, RNA), monosaccharides constituting sugar chains, and simple biopolymers. It is used to analyze the arrangement of molecules and each single molecule. Specifically, the biopolymer is passed between the nanoelectrodes 34 in a state where a voltage
  • the electrode substrate 1 is a substantially rectangular plate-shaped substrate. As shown in FIGS. 1 to 4, 7 and 8, the electrode substrate 1 has a substrate layer 20 and a metal layer 30.
  • the longitudinal direction of the electrode substrate 1 is referred to as a first direction
  • the lateral direction of the electrode substrate 1 is referred to as a second direction.
  • the second direction is orthogonal to the first direction.
  • orthogonal includes "substantially orthogonal”.
  • the substrate layer 20 of this embodiment is formed of an insulating material.
  • the substrate layer 20 of the present embodiment has a two-layer structure in which a substrate layer formed of polyimide is superimposed on a substrate layer formed of silicon (Si).
  • the substrate layer 20 of the present embodiment has a two-layer structure, but the present invention is not limited to this.
  • the substrate layer 20 may be composed of only one layer formed of one kind of material, or may be composed of three or more layers. Further, the substrate layer 20 may be formed of a material other than silicon and polyimide, such as polyethylene terephthalate resin, ceramics, silicone rubber or alumina, as long as it is formed of an insulating material.
  • the metal layer 30 is located at the center of the two connecting electrode portions 31, the wiring portion 32 extending in the first direction between the two connecting electrode portions 31, and the wiring portion 32. It has an arranged measurement electrode unit 33.
  • the metal layer 30 is formed of, for example, a metal such as gold (Au), platinum (Pt), silver (Ag), copper (Cu), or tungsten (W), which are conductors.
  • the metal layer 30 may be formed by stacking a plurality of metal layers.
  • the structure may be such that the metal layer made of the metal such as gold, platinum, silver, and copper is superposed on the metal layer formed of chromium (Cr). Even in that case, it is preferable that the measurement electrode portion 33 is composed of only one metal layer.
  • the thickness of the metal layer 30 is, for example, 50 to 300 nm.
  • the uppermost surfaces of the substrate layer 20 and the metal layer 30 are covered with an insulating film (not shown).
  • an insulating film By covering the surface of the metal layer 30 with an insulating film, when the measurement electrode portion 33 is used in a liquid, the metal and the liquid constituting the metal layer 30 are formed in a portion of the metal layer 30 other than the measurement electrode portion 33. It is possible to suppress the exchange of electrons between them.
  • the insulating film is a TEOS oxide film, but it may be formed of another material as long as it is an insulating material. An insulating film is not formed on at least a part of the upper surface of the connecting electrode portion 31. Therefore, at least a part of the upper surface of the connection electrode portion 31 is exposed.
  • the two connecting electrode portions 31 are arranged apart from each other in the first direction.
  • the width of each of the two wiring portions 32 gradually decreases from each connection electrode portion 31 toward the measurement electrode portion 33.
  • a measurement electrode portion 33 having a width smaller in the second direction than the wiring portion 32 is arranged between the wiring portions 32 on both sides.
  • the measurement electrode portion 33 is composed of a pair of nanoelectrodes 34.
  • the pair of nanoelectrodes 34 are in a state where the tips of the nanoelectrodes 34 are in contact with each other when no load (external force) is applied to the electrode substrate 1.
  • the substrate layer 20 has a flow path 50 recessed downward from the upper surface.
  • the flow path 50 has a first flow path 51, a second flow path 52, and a measurement flow path 53.
  • the first flow path 51 and the second flow path 52 are arranged so as to face each other in the second direction with the measurement electrode portion 33 interposed therebetween.
  • the measurement flow path 53 is a groove extending in the second direction.
  • the measurement flow path 53 connects the first flow path 51 and the second flow path 52 in the second direction.
  • the first flow path 51 and the second flow path 52 are composed of a plurality of grooves connected in a grid pattern. With such a shape, when the first flow path 51 and the second flow path 52 are filled with a liquid containing a biopolymer, each biopolymer is easily arranged along the extending direction of these grooves. Therefore, clogging of the biopolymer at the boundary between the first flow path 51 and the second flow path 52 and the measurement flow path 53 is suppressed. As a result, the decrease in the fluidity of the liquid at the boundary is suppressed, and each biopolymer is arranged in the measurement flow path 53 along the extending direction of the measurement flow path 53.
  • Each groove of the first flow path 51 and the second flow path 52 has a width of about 1 ⁇ m and a depth of about 2 ⁇ m.
  • the measurement flow path 53 extends along the second direction.
  • the measurement flow path 53 is arranged at a position where it vertically overlaps with the tip of the nanoelectrode 34. As a result, biomolecules moving in the second direction in the measurement flow path 53 can easily pass between the nanoelectrodes 34.
  • the depth of the measurement flow path 53 is about 2 ⁇ m, similarly to the first flow path 51 and the second flow path 52.
  • the width of the measurement flow path 53 is narrow near the nanoelectrode 34.
  • FIGS. 5 and 6 are views showing a state of performing current measurement in the current measuring device 9.
  • FIG. 5 is a side view showing a state of the current measuring device 9 in which the electrode substrate 1 is set in an initial state.
  • FIG. 6 is a side view showing a state of the current measuring device 9 at the time of pushing and bending the electrode substrate 1. Note that FIG. 6 exaggerates the deformation of the electrode substrate 1.
  • the current measuring device 9 includes a mounting table 91, a fixture 92, a push-up tool 93, an elevating mechanism 94, a power supply 95, an ammeter 96, and a control unit 90.
  • a mounting table 91 a fixture 92, a push-up tool 93, an elevating mechanism 94, a power supply 95, an ammeter 96, and a control unit 90.
  • the mounting table 91 has a flat upper surface on which the electrode substrate 1 is mounted.
  • the fixture 92 of the present embodiment is four plate-shaped members arranged substantially perpendicular to the first direction. The fixture 92 presses and fixes the electrode substrate 1 from above and below at two locations in the first direction sandwiching the measurement electrode portion 33.
  • the push-up tool 93 is a columnar member having a hemispherical upper surface.
  • the push-up tool 93 is connected to the elevating mechanism 94.
  • the elevating mechanism 94 includes a motor 941 and a piezo actuator 942.
  • the motor 941 largely moves the push-up tool 93 up and down in millimeters.
  • the piezo actuator 942 moves the push-up tool 93 up and down in nanometer units.
  • the elevating mechanism 94 realizes both large movement and fine movement by combining the motor 941 and the piezo actuator 942.
  • the elevating mechanism 94 may be a mechanism using other power as long as it can control the push-up height.
  • the power supply 95 applies a voltage between the pair of connection electrode portions 31.
  • the ammeter 96 measures the current value of the current flowing between the nanoelectrodes 34 of the measuring electrode portion 33.
  • the control unit 90 is electrically connected to the elevating mechanism 94, the power supply 95, and the ammeter 96, and controls each unit.
  • the control unit 90 of the present embodiment is composed of a computer including an arithmetic processing unit such as a CPU, a memory such as a RAM, and a storage unit such as a hard disk drive.
  • the function of the control unit 90 is realized by operating the arithmetic processing unit based on the computer program stored in the storage unit.
  • the electrode substrate 1 When setting the electrode substrate 1 on the current measuring device 9, first, the electrode substrate 1 is placed on the mounting table 91. After that, the electrode substrate 1 is fixed by four fixtures 92 from above and below in a state where no load is applied to the vicinity of the measurement electrode portion 33 of the electrode substrate 1. At this time, the electrode substrate 1 is arranged so that the push-up tool 93 is located directly below the measurement electrode portion 33.
  • a predetermined voltage is applied between the connection electrode portions 31 by the power supply 95, and the measurement of the current value by the ammeter 96 is started. Then, the elevating mechanism 94 is driven to push up the push-up tool 93, and the distance between the tips of the nanoelectrodes 34 (distance between electrodes) is adjusted.
  • FIG. 7 is a partial cross-sectional view of the electrode substrate 1 at the initial position.
  • FIG. 8 is a partial cross-sectional view of the electrode substrate 1 when pushed up. As shown in FIGS. 4 and 7, when the electrode substrate 1 is not pressed and bent, the tips of the nanoelectrodes 34 are in contact with each other. As shown in FIG. 8, when the push-up tool 93 is pushed up, the vicinity of the measurement electrode portion 33 of the electrode substrate 1 is pushed up from the lower surface side. Then, the side walls of the substrate layer 20 constituting the measurement flow path 53 move in directions away from each other as shown by the solid line arrows in FIG.
  • the nanoelectrodes 34 move in the direction away from each other as shown by the broken line arrows in FIG. As a result, the distance between the electrodes is increased. In this way, the distance between the electrodes is adjusted by pushing up the electrode substrate 1 with the push-up tool 93.
  • FIG. 9 is a flowchart showing the flow of the tunnel current measurement process of the biopolymer in a liquid sample in which the biopolymer floats in a liquid containing an electrolyte.
  • the biopolymer contained in the liquid sample is a nucleotide.
  • the liquid containing an electrolyte contained in the liquid sample is a liquid such as an aqueous NaCl solution in which the solute is dissolved in a highly polar solvent such as water.
  • step the characteristic amount of the influence of molecules such as ions and dipoles / organic dipoles in a liquid sample on the measurement current is analyzed (step). S100).
  • the behavior of the current flowing between the nanoelectrodes 34 when a voltage is applied between the nanoelectrodes 34 in a state where the nanoelectrodes 34 are arranged in a liquid containing an electrolyte will be described.
  • FIG. 10 is a diagram schematically showing the behavior of the current flowing between the nanoelectrodes 34 when a predetermined voltage is applied between the nanoelectrodes 34 arranged in the liquid containing the electrolyte.
  • FIG. 11 is a diagram showing experimental data of initial current values when a voltage is applied between nanoelectrodes 34 arranged in a NaCl aqueous solution for a plurality of concentrations of NaCl solution.
  • the current flowing between the nanoelectrodes 34 includes a base current Ib which is a current value between the nanoelectrodes 34 in a steady state and a transient current caused by the electrolyte contained in the liquid sample.
  • the base current Ib includes a reference current Ic due to the leakage current, the device configuration of the current measuring device 9, and the environment, and a tunnel current It1 flowing between the nanoelectrodes 34. Further, the maximum value of the transient current is Io.
  • the above reference current Ic and the tunnel current It2 between the nanoelectrodes 34 flow between the nanoelectrodes 34.
  • a current as shown by the alternate long and short dash line in FIG. 10 flows between the nanoelectrodes 34.
  • the nanoelectrode 34 when the nanoelectrode 34 is arranged in a liquid containing an electrolyte, when a voltage is applied between the nanoelectrodes 34, a reference current Ic and a tunnel current It1 flow between the nanoelectrodes 34, and between the nanoelectrodes 34. In, movements and movements of ions in the liquid and molecules such as dipoles and organic dipoles occur. Due to the movement and movement of the ions and molecules, the current value between the nanoelectrodes 34 temporarily increases. This temporary increase in current value is the transient current.
  • the tunnel current It1 in the liquid containing the electrolyte is ⁇ It larger than the tunnel current It2 in the vacuum by the increase in the tunnel current due to the electric double layer.
  • FIG. 11 shows the behavior of the initial current value when a voltage is applied between the nanoelectrodes 34 for NaCl aqueous solutions having NaCl concentrations of 1 mM, 10 mM, 20 mM, 30 mM and 50 mM.
  • the NaCl concentration is 10 mM or more, the transient phenomenon of the current value appears remarkably.
  • the concentration of NaCl which is an electrolyte, increases, the number of ions and molecules constituting the solvent / solute involved in the formation of the electric double layer increases, so that the current value after the transient phenomenon has settled increases.
  • step S100 the feature amount analysis process of step S100 for each liquid sample to be measured. The specific flow of step S100 will be described later.
  • step S200 the calibration process (calibration) of the nanoelectrode 34 is subsequently performed (step S200).
  • the voltage Vp applied to the piezo actuator 942 which is an operation amount for varying the inter-electrode distance d of the nanoelectrodes 34, and the current value I between the nanoelectrodes 34 detected by the ammeter 96 Analyze the relationship.
  • the applied voltage Vp which is the amount of operation for the pair of nanoelectrodes 34, and the distance d between the electrodes is estimated.
  • the specific flow of step S200 will be described later.
  • step S300 the inter-electrode distance d of the nanoelectrode 34 is set to a desired distance.
  • step S200 The specific flow of step S200 will be described later.
  • the control unit 90 may perform feedback control so that the distance d between the electrodes is within a desired range.
  • the acquired current data is analyzed (step S500).
  • the single molecules that make up biopolymers have unique tunneling current values depending on the type. Therefore, the arrangement of a single molecule in the biopolymer can be estimated by analyzing the current data of the tunnel current of the biopolymer that floats in the liquid sample and passes between the nanoelectrodes 34.
  • FIG. 12 is a flowchart showing the flow of the feature amount analysis process.
  • the nanoelectrode 34 is placed in the liquid sample, and the nanoelectrode 34 is placed so that the distance d between the electrodes is larger than 0 (step S110).
  • a voltage is applied between the nanoelectrodes 34 and flows between the nanoelectrodes 34. It may be confirmed that the current value I of the current is smaller than the predetermined voltage value. In that case, after confirming the current value I, the application of the voltage to the nanoelectrode 34 is stopped, and the process waits for a while.
  • step S120 the current value I between the nanoelectrodes 34 is measured for a predetermined period from the start of voltage application (step S120).
  • the current value I obtained at this time has a transient response as shown in FIG.
  • the biopolymer may pass between the nanoelectrodes 34.
  • the obtained current value I sometimes includes a signal that appears when the biopolymer passes between the nanoelectrodes 34.
  • the obtained current data is analyzed and the time constant, which is a feature amount, is calculated (step S130).
  • the calculated time constant is until the transient phenomenon generated based on the change in the applied voltage between the nanoelectrodes 34 and the distance d between the electrodes converges and the amount of change caused by the transient phenomenon decreases to about 36.2%. Represents time.
  • the feature amount calculated in the present invention is not limited to the time constant. Other parameters may be calculated as features as long as they are parameters that represent the convergence state of the transient phenomenon.
  • the transient phenomenon of the current value I between the nanoelectrodes 34 as shown in FIG. 10 is described below by using the base current Ib, which is the current value between the nanoelectrodes 34 in the steady state, and the maximum value Io of the transient current component. It can be expressed as the formula (1).
  • the base current Ib is a superposition of the above-mentioned reference current Ic and the tunnel current value flowing between the nanoelectrodes 34 via the liquid containing the electrolyte contained in the liquid sample.
  • the second term on the right side of the equation (1) is the transient current component.
  • is the time constant of the transient current component. Since the current value I between the nanoelectrodes 34 can be approximated by such a mathematical formula (1), the time constant ⁇ of the transient phenomenon is calculated by approximating the current data obtained in step S110 with the mathematical formula (1). It is possible.
  • the time constant ⁇ is used as a feature quantity of the transient phenomenon in the subsequent calibration process, the distance setting process between electrodes, and the current measurement process. In each of the subsequent processes, by performing the process using the time constant ⁇ in consideration of the transient phenomenon, it is possible to suppress errors in the operation content, acquired data, analysis content, etc. caused by the transient phenomenon in each process.
  • the current value I between the nanoelectrodes 34 is approximated as in the following mathematical formula (2), assuming that five types of transient current components are superimposed.
  • the five time constants ⁇ 1 to ⁇ 5 are set to ⁇ 1, ⁇ 2, ⁇ 3, ⁇ 4, ⁇ 5 in order from the one with the smallest value of the time constant.
  • the number of time constants to be calculated is 5, but the present invention is not limited to this.
  • the number of time constants to be calculated may be 1 to 4, or 6 or more.
  • a plurality of transient current components are superimposed on the current value I between the nanoelectrodes 34. Therefore, in order to more accurately eliminate the influence of the plurality of transient current components appearing in the current value I, it is preferable to consider three or more transient current components.
  • the number of time constants to be calculated is preferably 3 to 6.
  • FIG. 13 is a flowchart showing the flow of the calibration process of the nanoelectrode 34.
  • the amount of pushing up of the electrode substrate 1 by the pusher 93 is changed to change the distance d between the electrodes, and the current value I of the current flowing between the nanoelectrodes 34 during that time is measured. Then, the relationship between the operation amount and the distance d between the electrodes is estimated from the relationship between the operation amount of the push-up tool 93 and the current value I.
  • the electrode substrate 1 is repeatedly pushed up and pulled back by the push-up tool 93 to change the distance d between the electrodes of the nanoelectrodes 34, and the value of the tunnel current flowing between the nanoelectrodes 34 between them is acquired. To do.
  • the electrode substrate 1 is placed on the current measuring device 9 and set at the initial position (step S210).
  • control unit 90 measures the reference current Ic (step S230). Specifically, the push-up tool 93 is pushed up, and the current value of the current flowing between the nanoelectrodes 34 is measured while maintaining a sufficiently large distance d between the electrodes so that the tunnel current does not flow between the nanoelectrodes 34. This makes it possible to measure the leak current and the reference current Ic caused by the device configuration of the current measuring device 9 and the environment.
  • the control unit 90 determines the reference current Ic after the predetermined initial standby time t0 elapses after the distance between the nanoelectrodes 34 reaches the distance at which the reference current Ic can be measured. Make a measurement.
  • the initial waiting time t0 is calculated based on the time constant ⁇ 5 having the largest value among the five time constants ⁇ 1 to ⁇ 5 calculated in the feature quantity analysis process in step S100.
  • the initial waiting time t0 is calculated, for example, by multiplying the time constant ⁇ 5 by a predetermined real number.
  • the measurement timing for measuring the reference current Ic is determined based on the time constant ⁇ 5, which is a feature quantity.
  • the control unit 90 pulls down the push-up tool 93 to a predetermined position.
  • control unit 90 After the push-up tool 93 is pulled down to a predetermined position, the control unit 90 performs a push-up step of the electrode substrate 1 by the push-up tool 93 (step S240). That is, the control unit 90 operates in the direction in which the distance d between the electrodes of the nanoelectrode 34 increases.
  • the position of the push-up tool 93 at the start of the push-up process is a position where the tips of the nanoelectrodes 34 come into contact with each other as long as the current value measured by the ammeter 96 is larger than the first threshold value described later.
  • the tips of the nanoelectrodes 34 may be separated from each other.
  • the pushing-up and lowering of the pushing tool 93 is performed by increasing or decreasing the voltage Vp applied to the piezo actuator 942. Therefore, the amount of operation for pushing up and down is the voltage value of the voltage Vp applied to the piezo actuator 942.
  • the voltage value of the applied voltage Vp becomes large
  • the amount of pushing up by the pushing tool 93 becomes large
  • the distance d between the electrodes becomes large.
  • the voltage value of the applied voltage Vp becomes small
  • the amount of pushing up by the pushing tool 93 becomes small, and the distance d between the electrodes becomes small.
  • step S240 The pushing-up step of step S240 is performed until the current value measured by the ammeter 96 becomes equal to or less than a predetermined first threshold value.
  • FIG. 14 is a flowchart showing a specific flow of the push-up process in step S240.
  • step S240 the control unit 90 first waits for a predetermined waiting time (step S241). As a result, it waits for the influence of the transient phenomenon due to the change in the inter-electrode distance d performed immediately before the standby step of step S241 to be sufficiently reduced. As a result, it is possible to prevent an error due to a transient phenomenon from occurring in the measured current value during the current measurement in step S242 thereafter.
  • the standby time in the first step S241 is, for example, the same initial standby time t0 as when measuring the reference current Ic in step S230.
  • the waiting time in the second and subsequent steps S241 is a predetermined first waiting time t1.
  • the first waiting time t1 is calculated based on the time constant ⁇ 1 having the smallest value among the five time constants ⁇ 1 to ⁇ 5 calculated in the feature amount analysis process in step S100.
  • the first waiting time t1 is calculated by multiplying the time constant ⁇ 1 by a predetermined real number, for example.
  • the first waiting time t1 may be calculated based on other time constants ⁇ 2 to ⁇ 5.
  • the waiting time in the first step S241 is preferably longer than the waiting time in the second step S241. This is because the amount of change in the inter-electrode distance d before the start of the first step S241 is larger than the amount of change in the inter-electrode distance d before the start of the second and subsequent steps S241.
  • the standby time in the first step S241 is not limited to the same initial standby time t0 as when measuring the reference current Ic in step S230, and may be the first standby time t1 or more, which is the standby time in the second step S241.
  • the waiting time calculated by another method may be used.
  • control unit 90 stores the voltage value of the voltage Vp applied to the piezo actuator 942 at that time and the current value measured by the ammeter 96 (step S242). That is, the control unit 90 acquires the value of the operation amount used for changing the distance d between the electrodes and the current value of the nanoelectrode 34.
  • control unit 90 increases the applied voltage Vp by a predetermined amount and increases the distance d between the electrodes (step S243). That is, the control unit 90 changes the inter-electrode distance d by changing the operation amount used for changing the inter-electrode distance d.
  • the control unit 90 determines whether or not the current value measured by the ammeter 96 is equal to or less than a predetermined first threshold value (step S244).
  • a predetermined first threshold value step S244: No
  • the control unit 90 returns to step S241 to perform standby, measure the current value, and increase the distance d between the electrodes. repeat.
  • the control unit 90 ends the push-up step of step S240.
  • step S50 the control unit 90 subsequently performs a pull-down step of the push-up tool 93 (step S50). That is, the control unit 90 operates in the direction in which the distance d between the electrodes of the nanoelectrode 34 becomes smaller.
  • step S250 The lowering step of step S250 is performed until the current value measured by the ammeter 96 becomes equal to or higher than a predetermined second threshold value.
  • FIG. 15 is a flowchart showing a specific flow of the lowering step of step S250.
  • step S250 the control unit 90 first waits for a predetermined first standby time t1 (step S251).
  • This first waiting time t1 is the same as the waiting time in the second and subsequent steps S241.
  • control unit 90 stores the voltage value of the voltage Vp applied to the piezo actuator 942 at that time and the current value measured by the current meter 96 (step S252). That is, the control unit 90 acquires the value of the operation amount used for changing the distance d between the electrodes and the current value I between the nanoelectrodes 34.
  • control unit 90 reduces the applied voltage Vp by a predetermined amount and reduces the distance d between the electrodes (step S253). That is, the control unit 90 changes the inter-electrode distance d by changing the operation amount used for changing the inter-electrode distance d.
  • the control unit 90 determines whether or not the current value measured by the current meter 96 is equal to or higher than a predetermined second threshold value (step S254).
  • a predetermined second threshold value step S254: No
  • the control unit 90 returns to step S251 to perform standby, measure the current value, and reduce the distance d between the electrodes. repeat.
  • the control unit 90 ends the lowering step of step S250.
  • step S260 determines whether or not the count number n has reached the predetermined number of repetitions N (step S260).
  • the control unit 90 proceeds to step S270 and increments the count number n. After that, the process returns to step S240, and the pushing-up step and the pull-down step of the push-up tool 93 are executed again.
  • step S280 determines whether or not the count number n has reached the number of repetitions N (step S260: Yes).
  • step S240 and the pulling-down step of step S250 an operation is performed so as to change the distance d between the electrodes while applying a predetermined voltage between the nanoelectrodes 34, and between the nanoelectrodes 34. Acquire the current value I.
  • step S250 by repeating the pushing-up step of step S240 and the pulling-down step of step S250 a plurality of times, the approximation function described later can be obtained more accurately.
  • FIG. 16 is a diagram showing an outline of changes over time in the voltage Vp applied to the piezo actuator 942 and the current value between the nanoelectrodes 34 in the calibration process of the nanoelectrodes 34.
  • the first stage is the voltage Vp applied to the piezo actuator 942
  • the second stage is the distance between the electrodes of the nanoelectrodes 34 d
  • the third stage is the time lapse of the current value I between the nanoelectrodes 34 detected by the current meter 96.
  • the change is shown on the proportional axis
  • the fourth stage shows the change over time of the current value between the nanoelectrodes 34 detected by the current meter 96 on the logarithmic axis. Note that FIG. 16 omits the waiting steps in steps S241 and S251 in order to make it easier to understand the relationship between the values.
  • the first threshold value is 0.01 nA and the second threshold value is 2.00 nA.
  • the first threshold value is set to a value larger than the reference current Ic.
  • the second threshold value is set to a value larger than the first threshold value and smaller than the current value flowing when the nanoelectrodes 34 come into contact with each other.
  • the operation amount for pushing up or lowering the push-up tool 93 is the voltage Vp applied to the piezo actuator 942.
  • the applied voltage Vp and the pushing amount are substantially proportional.
  • the pushing amount and the distance d between the electrodes are substantially proportional. Therefore, the amount of change in the voltage value of the applied voltage Vp is substantially proportional to the amount of change in the distance d between the electrodes.
  • the relationship between the distance between the electrodes d and the applied voltage Vp is expressed by the following mathematical formula (3), where ⁇ is the proportional coefficient.
  • step S240 as shown in FIG. 16, the applied voltage Vp is gradually increased. Specifically, each time step S243 is executed, the applied voltage Vp is increased by a predetermined amount. Therefore, the distance d between the electrodes also increases as the applied voltage Vp increases. Further, as shown in FIG. 16, in step S250, the applied voltage Vp is gradually reduced. Specifically, each time step S253 is executed, the applied voltage Vp is reduced by a predetermined amount. Therefore, in step S250, the distance d between the electrodes decreases at a substantially constant rate.
  • the distance d between the electrodes and the tunnel current It flowing between the electrodes have a relationship as shown in the following formula (4).
  • K is a constant.
  • is a known constant.
  • the current value I measured by the ammeter 96 is the sum of the reference current Ic and the tunnel current It, the current value I is represented by the following mathematical formula (5).
  • step S240 when the push-up tool 93 is gradually pushed up in step S240, the current value I becomes exponentially smaller. Then, in step S250, when the push-up tool 93 is gradually pulled back, the current value I becomes exponentially large.
  • control unit 90 approximates the relationship between the amount of operation on the push-up tool 93 in steps S240 and step S250 repeated N times and the current value I measured by the ammeter 96. Is calculated (step S280).
  • FIG. 17 is a diagram showing an example of measurement data of the applied voltage Vp and the current value I in the calibration process.
  • FIG. 18 is a diagram showing an approximate function of the measurement data of the example of FIG.
  • the horizontal axis is a real number axis and the vertical axis is a logarithmic axis.
  • the black data points indicate the measurement data in the pushing step (step S240)
  • the white data points indicate the measurement data in the pulling step (step S250).
  • the applied voltage Vp and the measured current value I are stored at predetermined time intervals (for example, 50 msec).
  • step S280 using this relationship, an approximate expression such as the following mathematical expression (6) is calculated, and the constants A, B, and C are calculated.
  • the proportional coefficient ⁇ between the distance d between the electrodes and the applied voltage Vp can be obtained as shown in the following equation (10).
  • This proportional coefficient ⁇ is an eigenvalue obtained for each electrode substrate 1.
  • an estimation function that estimates the relationship between the applied voltage Vp, which is an operation amount, and the distance d between the electrodes is calculated (step S290).
  • the current measurement process described later is performed using the proportional coefficient ⁇ and the estimation function.
  • step S200 the relationship between the operation amount (applied voltage Vp) for the pair of nanoelectrodes 34 and the inter-electrode current value (current value I) is obtained.
  • the above calibration process is performed in the liquid sample itself to be measured or in a liquid containing an electrolyte which is a liquid component of the liquid sample. Therefore, the standby steps of steps S241 and S251 are executed in consideration of the transient phenomenon of the electric double layer and the like. Thereby, the error of the current value due to the transient phenomenon can be suppressed.
  • the approximation function of the measurement data in the pushing step of step S240 and the approximation function of the measurement data in the lowering step of step S250 are calculated separately.
  • the estimation function calculation step of step S290 the estimation function when the push-up tool 93 is pushed up and the estimation function when the push-up tool 93 is lowered are calculated separately.
  • Hysteresis also appears in the relationship between the applied voltage Vp and the current value I in the pushing-up process and the lowering process due to the hysteresis of the applied voltage Vp and the movement amount of the piezo actuator 942. Therefore, it is preferable to separately calculate the approximate function and the estimation function in the push-up process and the approximate function and the estimate function in the lowering process as in the present embodiment.
  • FIG. 19 is a flowchart showing the flow of the distance setting process between electrodes in step S300.
  • FIG. 20 is a flowchart showing the flow of the electrode-to-electrode distance adjusting process in the small gap mode.
  • FIG. 21 is a flowchart showing the flow of the electrode-to-electrode distance adjusting process in the large gap mode.
  • the target electrode-to-electrode distance which is the target inter-electrode distance
  • the control unit 90 is input to the outside (step S310).
  • the distance between the target electrodes may be input in advance.
  • control unit 90 determines whether or not the distance between the target electrodes input in step S310 is equal to or less than a predetermined threshold value (step S320).
  • This threshold value is set so that the tunnel current value between the nanoelectrodes 34 when the distance between the electrodes becomes the threshold value is larger than the noise component included in the base current Ib.
  • step S320 it may be determined whether or not the target tunnel current value Iu corresponding to the target desired distance between electrodes is equal to or greater than a predetermined threshold value.
  • the target tunnel current value Iu is calculated using, for example, the above-mentioned equation (4).
  • step S320 If it is determined in step S320 that the distance between the target electrodes is equal to or less than the threshold value (step S320: Yes), the control unit 90 proceeds to the step of adjusting the distance between the electrodes in the small gap mode of step S330. On the other hand, if it is determined that the distance between the target electrodes is larger than the threshold value (step S320: No), the control unit 90 proceeds to the step of adjusting the distance between the electrodes in the large gap mode of step S340. In step S330 and step S340, a predetermined voltage is continuously applied to the nanoelectrode 34, and the current between the nanoelectrodes 34 is measured.
  • the reference current Ic is measured with the distance between the electrodes sufficiently large so that the tunnel current does not flow between the nanoelectrodes 34 (step S331).
  • the push-up tool 93 is returned to a position where the tips of the nanoelectrodes 34 come into contact with each other.
  • the reference current Ic is measured by extracting the base current Ib from the current value I measured by the ammeter 96 in step S331.
  • FIG. 22 is a diagram showing an example of the time-dependent change of the measured current value I. As shown in FIG. 22, when the current value I is measured in a liquid containing a biopolymer, the current value I is the base current Ib measured when the biopolymer is not present between the nanoelectrodes 34. And the component of the sample current Is measured when the biopolymer passes between the nanoelectrodes 34. The sample current Is is a tunnel current flowing between the biopolymer and the nanoelectrode 34.
  • the sample current Is has a current value larger than the base current Ib. Therefore, the measured current value I can be separated into a component of the base current Ib and a component of the sample current Is. Since the sample current Is in step S331 is not a measured value at the desired distance between the electrodes, it cannot be used as experimental data.
  • step S331 the control unit 90 extracts a base current Ib component from the measured current value I, and a reference current which is a current value of the base current Ib in a state where no tunnel current flows between the nanoelectrodes 34 from the component. Calculate Ic.
  • the control unit 90 calculates the target total current value Ia (step S332).
  • the target total current value Ia is the value of the tunnel current between the nanoelectrodes 34, which corresponds to the target distance d between the electrodes.
  • the target tunnel current value Iu is calculated by substituting the target inter-electrode distance d into the inter-electrode distance d in the equation (4).
  • the target tunnel current value Iu is the value of the tunnel current corresponding to the target inter-electrode distance d.
  • the target tunnel current value Iu is added to the reference current Ic to calculate the target total current value Ia.
  • control unit 90 operates the push-up tool 93 to arrange the nanoelectrode 34 at a target position where the base current Ib of the measured current value I matches the target total current value Ia, in steps S333 to S335. I do.
  • control unit 90 operates the push-up tool 93 so that the current base current Ib approaches the target total current value Ia, and changes the distance d between the electrodes (step S333).
  • the upper limit of the amount of change in the voltage Vp applied to the piezo actuator 942, which can be changed in one step S333, is determined. Therefore, the maximum amount of change in the distance d between electrodes in one step S333 is determined.
  • control unit 90 waits for a predetermined second standby time t2 (step S334).
  • the influence of the transient phenomenon accompanying the change of the distance d between the electrodes in step S333 is waited to be sufficiently reduced.
  • the second waiting time t2 which is the waiting time in step S334, is the smallest time constant ⁇ 1, the second smallest time constant ⁇ 2, and the second smallest time constant ⁇ 2 among the five time constants ⁇ 1 to ⁇ 5 calculated by the feature quantity analysis process in step S100. It is calculated based on the third smallest time constant ⁇ 3.
  • the second waiting time t2 is calculated, for example, by multiplying the average value of the time constant ⁇ 1, the time constant ⁇ 2, and the time constant ⁇ 3 by a predetermined real number.
  • control unit 90 causes the ammeter 96 to measure the current value I (step S335).
  • the control unit 90 determines whether or not the base current Ib of the current value I measured in step S335 is included in the predetermined current value range (step S336).
  • the predetermined range in which the determination is made in step S336 is set with reference to the target total current value Ia. For example, it is based on whether or not the base current Ib is within the range of ⁇ 0.0005 nA from the target total current value Ia.
  • step S336 If it is determined in step S336 that the base current Ib has not reached the predetermined range (step S336: No), the control unit 90 returns to step S333 and continuously adjusts the distance d between the electrodes.
  • step S336 determines whether the base current Ib has reached a predetermined range. If it is determined in step S336 that the base current Ib has reached a predetermined range (step S336: Yes), the control unit 90 completes the inter-electrode adjustment process in step S300.
  • the flow of the inter-electrode distance adjusting step in the large gap mode of step S340 will be described.
  • the value of the tunnel current at the distance between the electrodes is relatively small. If the value of the tunnel current is smaller than the noise component of the reference current Ic, the difference between the reference current Ic and the target total current value Ia becomes difficult to understand. Therefore, even if an attempt is made to set the electrode position by the same method as in the small gap mode, it is difficult to accurately set the electrode position at a desired distance between the electrodes. Therefore, by setting the electrode position in the large gap mode described below, the electrode position is set so as to obtain a desired distance between the electrodes.
  • FIG. 23 is a schematic view showing the state between the nanoelectrodes 34 in the step of adjusting the distance between the electrodes in the large gap mode in step S340.
  • the reference current Ic is measured with the distance between the electrodes sufficiently large so that the tunnel current does not flow between the nanoelectrodes 34 (step S341).
  • the push-up tool 93 is returned to a position where the tips of the nanoelectrodes 34 come into contact with each other.
  • the reference current Ic is measured in the same manner as in step S331 of the small gap mode.
  • the control unit 90 calculates the intermediate target total current value Id and the movement operation amount ⁇ Vp (step S342). Specifically, first, the intermediate tunnel current value Iv is calculated.
  • the intermediate tunnel current value Iv is a tunnel current value corresponding to the distance d1 between the intermediate electrodes set as the intermediate target position.
  • the distance between the intermediate electrodes d1 as the intermediate target position is a distance between the electrodes smaller than the distance d2 between the target electrodes as the final target position.
  • the intermediate tunnel current value Iv is calculated by substituting the intermediate electrode distance d1 for the inter-electrode distance d in the equation (4).
  • the intermediate tunnel current value Iv and the reference current Ic measured in step S341 are added to calculate the intermediate target total current value Id.
  • the distance d1 between the intermediate electrodes is set so that the intermediate tunnel current value Iv becomes a current value sufficiently larger than the noise component of the reference current Ic.
  • the movement operation amount ⁇ Vp is an operation amount required to move from the intermediate electrode distance d1 which is the intermediate target position to the target electrode distance d2 which is the final target position.
  • the movement operation amount ⁇ Vp is the amount of change in the voltage Vp applied to the piezo actuator 942 for moving from the intermediate electrode distance d1 to the target electrode distance d2.
  • This movement operation amount ⁇ Vp is obtained based on the estimation function obtained by the calibration process in steps S101 to S111. That is, it is obtained from the relationship of the following mathematical formula (11) by using the mathematical formula (3) and the proportional coefficient ⁇ between the inter-electrode distance d and the applied voltage Vp obtained in the calibration process.
  • control unit 90 operates the push-up tool 93 to arrange the nanoelectrode 34 at the intermediate target position where the base current Ib of the measured current value I matches the intermediate target total current value Id.
  • the distance d between the electrodes between the nanoelectrodes 34 can be set to the distance d1 between the intermediate electrodes.
  • control unit 90 operates the push-up tool 93 so that the current base current Ib approaches the intermediate target total current value Id, and changes the distance d between the electrodes (step S343).
  • Step S343 is performed in the same manner as step S243 in the small gap mode.
  • the control unit 90 waits for a predetermined second standby time t2 (step S344).
  • a predetermined second standby time t2 the influence of the transient phenomenon accompanying the change of the distance d between the electrodes in step S333 is waited to be sufficiently reduced.
  • the standby time in step S343 is, for example, a second standby time t2 which is the same as the standby time in step S333 in the small gap mode.
  • control unit 90 causes the current meter 96 to measure the current value I (step S345).
  • the control unit 90 determines whether or not the base current Ib of the current value I measured in step S345 is included in the predetermined current value range (step S346).
  • the predetermined range in which the determination is made in step S336 is set with reference to the intermediate target total current value Id. For example, it is based on whether or not the base current Ib is within the range of ⁇ 0.0005 nA from the intermediate target total current value Id.
  • step S346 If it is determined in step S346 that the base current Ib has not reached the predetermined range (step S346: No), the control unit 90 returns to step S343 and continues to adjust the distance d between the electrodes.
  • step S346 determines whether the base current Ib has reached a predetermined range. If it is determined in step S346 that the base current Ib has reached a predetermined range (step S346: Yes), the control unit 90 proceeds to step S347. Then, the electrode substrate is pushed up by the push-up tool 93 by the amount of the movement operation amount ⁇ Vp calculated in step S342 (step S347). Specifically, the control unit 90 changes the applied voltage Vp to a voltage value obtained by adding the movement operation amount ⁇ Vp to the applied voltage Vp at the distance d1 between the intermediate electrodes. As a result, the control unit 90 sets the distance d between the nanoelectrodes 34 to the distance d2 between the target electrodes at the final target position.
  • control unit 90 waits for a predetermined third standby time t3 (step S348). As a result, it waits for the influence of the transient phenomenon accompanying the change in the distance d between the electrodes in step S347 to become sufficiently small. As a result, it is possible to prevent an error due to a transient phenomenon from occurring in the measured current value during the tunnel current measurement process of the biopolymer in the subsequent step S400.
  • the control unit 90 completes the inter-electrode adjustment process in step S300.
  • the third waiting time t3, which is the waiting time in step S348, is the smallest time constant ⁇ 1 and the second smallest time constant ⁇ 2 among the five time constants ⁇ 1 to ⁇ 5 calculated in the feature analysis process of step S100. It is calculated based on.
  • the third waiting time t3 is calculated by multiplying, for example, the time constant ⁇ 1 and the average value by a predetermined real number.
  • the metal layer of the electrode substrate has only a pair of connection electrodes to which electric power is input from the outside, but the present invention is not limited to this.
  • One electrode substrate may have a plurality of pairs of electrodes to which electric power is input from the outside.
  • a voltage for electrophoresis may be applied between the first flow path and the second flow path.
  • Electrode substrate 9 Current measuring device 34 Nano electrode 50 Flow path 90 Control unit 93 Push-up tool 94 Lifting mechanism 95 Power supply 96 Current meter 942 Piezo actuator

Landscapes

  • Health & Medical Sciences (AREA)
  • Life Sciences & Earth Sciences (AREA)
  • Chemical & Material Sciences (AREA)
  • Physics & Mathematics (AREA)
  • Engineering & Computer Science (AREA)
  • Molecular Biology (AREA)
  • Immunology (AREA)
  • General Physics & Mathematics (AREA)
  • Analytical Chemistry (AREA)
  • Biochemistry (AREA)
  • Pathology (AREA)
  • General Health & Medical Sciences (AREA)
  • Electrochemistry (AREA)
  • Chemical Kinetics & Catalysis (AREA)
  • Biomedical Technology (AREA)
  • Nanotechnology (AREA)
  • Spectroscopy & Molecular Physics (AREA)
  • Medicinal Chemistry (AREA)
  • Biophysics (AREA)
  • Food Science & Technology (AREA)
  • Urology & Nephrology (AREA)
  • Hematology (AREA)
  • Investigating Or Analyzing Materials By The Use Of Electric Means (AREA)

Abstract

この電流測定方法は、一対の電極間を通過する生体高分子のトンネル電流を測定する電流測定方法であって、電解質を含む液体中に前記電極を配置し、前記電極間に電圧を印加しつつ、前記電極の表面に形成される電気二重層を介して前記電極間を流れる電流を測定する工程を含む。これにより、電気二重層を考慮して電流を測定することができる。その結果、電解質を含む液体試料に含まれる生体高分子のトンネル電流を、より正確に測定することができる。

Description

電流測定方法
 本発明は、一対の電極間を通過する生体高分子のトンネル電流を測定する電流測定方法に関する。
 従来、微細な先端部を有する電極を用いて、特定の分子や原子を測定または識別する方法が知られている。微細な電極を用いて特定の分子を識別する方法については、例えば、特許文献1に記載されている。特許文献1に記載の単分子識別方法では、電極間距離の短い電極対を用いて、電極間を通過する生体高分子を構成する単分子を、トンネル電流を測定することにより識別する。
国際公開2011/108540号
 特許文献1に記載のように、生体高分子の識別を目的として電極間のトンネル電流を測定するためには、電極間の距離を精度良く調整する必要がある。このとき、一対の電極が生体高分子を含む液体試料中に配置される。
 生体高分子を遊動させるための液体が電解質を含む場合、電極間に電圧を印加すると、液体内のイオンの移動および溶媒・溶質が構成する双極子の配置などによって電極表面付近に形成される電気二重層が、電極間電流の挙動に影響を与える。しかしながら、特許文献1では、液体試料に用いられる液体に含まれるイオンや双極子等の分子が電流に与えるこのような影響については考慮されていない。このため、液体試料に電解質を含む液体を使用した場合に、電極への操作や電流値の解析において誤操作や解析誤差の原因となり得る。
 本発明は、このような事情に鑑みなされたものであり、電解質を含む液体試料に含まれる生体高分子のトンネル電流を、より正確に測定するための電流測定方法を提供することを目的とする。
 上記課題を解決するため、本願の第1発明は、一対の電極間を通過する生体高分子のトンネル電流を測定する電流測定方法であって、a)電解質を含む液体中に前記電極を配置し、前記電極間に電圧を印加しつつ、前記電極の表面に形成される電気二重層を介して前記電極間を流れる電流を測定する工程を含む。
 本願の第2発明は、第1発明の電流測定方法であって、b)前記電極間の距離を固定したまま、電極間電圧をかけていない状態から所定の電圧印加を行いつつ、前記電極間を流れる電流を測定する工程と、c)前記工程b)において測定した電流値について、前記電気二重層に起因する特徴量を算出する工程と、を含む。
 本願の第3発明は、第2発明の電流測定方法であって、前記工程b)および前記工程c)は、前記工程a)の前に行われ、前記工程a)における測定タイミングは、前記特徴量に基づいて決定される。
 本願の第4発明は、第2発明の電流測定方法であって、前記特徴量は、前記工程b)において測定した前記電流値の時定数である。
 本願の第5発明は、第4発明の電流測定方法であって、前記工程c)において、複数の前記時定数を算出する。
 本願の第6発明は、第4発明または第5発明の電流測定方法であって、前記工程b)および前記工程c)は、前記工程a)の前に行われ、前記工程a)における測定タイミングは、前記時定数に基づいて決定される。
 本願の第7発明は、第5発明の電流測定方法であって、前記工程a)は、前記電極間に所定の電圧を印加しつつ、電極間距離を変更させるように操作を行って前記電極間の電流値を取得するキャリブレーション用電流測定工程であって、前記工程a)は、p1)前記時定数に基づいて算出された待機時間の間、待機する工程と、p2)前記電極間距離の変更に用いられる操作量の値と、前記電極間の電流値とを取得する工程と、p3)前記操作量を変更して前記電極間距離を変更する工程と、を複数回繰り返す。
 本願の第8発明は、第7発明の電流測定方法であって、d)前記工程a)における、複数の前記操作量と複数の前記電流値との関係を関数近似した近似関数を算出する工程
をさらに有する。
 本願の第9発明は、第7発明の電流測定方法であって、前記工程p1)における前記待機時間は、前記時定数を定数倍して算出される。
 本願の第10発明は、第5発明の電流測定方法であって、前記工程b)および前記工程c)の後であって、e)前記電極間にトンネル電流が流れない電極間距離において、前記電極間に流れる基準電流の値を測定する工程と、f)目標とする電極間距離に対応するトンネル電流の値と、前記e)で測定した前記基準電流の値とを加算して、目標合計電流値を算出する工程と、をさらに含み、前記工程e)および前記工程f)は、前記工程a)の前に行われ、前記工程a)は、q1)前記時定数に基づいて算出された待機時間の間、待機する工程と、q2)前記電極間のベース電流を測定する工程と、q3)前記ベース電流の値が、前記工程f)で算出した前記目標合計電流値に近づく方向に前記電極間距離を操作する工程と、を複数回繰り返す。
 本願の第11発明は、第5発明の電流測定方法であって、前記工程b)および前記工程c)の後であって、前記工程a)の前に、g)前記電極間にトンネル電流が流れない電極間距離において、前記電極間に流れる基準電流の値を測定する工程と、h)中間目標とする電極間距離に対応するトンネル電流の値と、前記工程g)で測定した前記基準電流の値とを加算して、中間目標合計電流値を算出する工程と、をさらに含み、前記工程a)は、r1)前記時定数に基づいて算出された待機時間の間、待機する工程と、r2)前記電極間のベース電流を測定する工程と、r3)前記ベース電流の値が、前記工程h)で算出した前記中間目標合計電流値に近づく方向に前記電極間距離を操作する工程と、を複数回繰り返し、前記工程a)の後に、i)中間目標とする電極間距離から最終目標とする電極間距離までの予め算出された操作量の操作を行うことにより、を前記最終目標と一致するように前記電極間距離を調整する工程をさらに含む。
 本願の第1発明から第11発明によれば、電気二重層を考慮して電流を測定することができる。
 特に、本願の第2発明から第11発明によれば、電気二重層等によって生じる過渡現象に起因する誤差が生じるのを抑制できる。
電極基板の上面図である。 電極基板の部分上面図である。 電極基板の部分上面図である。 電極基板の部分上面図である。 電極基板の押し曲げの様子を示した概略図である。 電極基板の押し曲げの様子を示した概略図である。 電極基板の押し曲げ時の様子を示した概略部分断面図である。 電極基板の押し曲げ時の様子を示した概略部分断面図である。 生体高分子のトンネル電流測定処理の流れを示したフローチャートである。 電解質を含む液体中に配置されたナノ電極間を流れる電流の挙動を模式的に示した図である。 NaCl水溶液中に配置されたナノ電極間に電圧を印加した場合の初期電流値の挙動を示した図である。 特徴量解析処理の流れを示したフローチャートである。 ナノ電極の校正処理の流れを示したフローチャートである。 押し上げ工程の具体的な流れを示したフローチャートである。 引き下げ工程の具体的な流れを示したフローチャートである。 ナノ電極の校正処理における印加電圧および電流値の経時変化の概略を示した図である。 校正処理における印加電圧と電流値の測定データの一例を示した図である。 校正処理における印加電圧と電流値の測定データの近似関数を示した図である。 電極間距離設定処理の流れを示したフローチャートである。 スモールギャップモードにおける電極間距離調整工程の流れを示したフローチャートである。 ラージギャップモードにおける電極間距離調整工程の流れを示したフローチャートである。 測定された電流値の経時変化の一例を示した図である。 ラージギャップモードの電極間距離調整工程においてナノ電極間の様子を示した概略図である。
 以下、本発明の実施形態について、図面を参照しつつ説明する。なお、本願では、電極基板の厚み方向を上下方向とし、基板層に対して金属層側を上側、金属層に対して基板層側を下側として説明を行っている。しかしながら、電極基板の使用時の向きは必ずしも金属層側を鉛直上向きとしなくてもよい。
 <1.電極基板および電流測定装置の構成>
 本発明の一実施形態に係る電極基板1と、電流測定装置9とについて、図1~図8を参照しつつ説明する。図1は、電極基板1の上面図である。図2~図4は、電極基板1の部分上面図である。図5および図6は、電流測定装置9を用いた電極基板1の押し曲げの様子を示した概略図である。図7および図8は、電極基板1の押し曲げの様子を示した概略部分断面図である。
 この電極基板1および電流測定装置9は、生体高分子であるタンパク質を構成するアミノ酸、核酸(DNA,RNA)を構成するヌクレオチド、糖鎖を構成する単糖、その他の生体高分子を構成する単分子の配列や、各単分子を解析するために用いられる。具体的には、後述するナノ電極34間に電圧を印加した状態でナノ電極34間に生体高分子を通過させる。そして、この期間にナノ電極34と生体高分子との間に流れるトンネル電流を検知し、当該電流を解析することにより、生体高分子を構成する単分子の解析を行う。
 図1に示すように、電極基板1は、略長方形の板状の基板である。図1~図4、図7および図8に示すように、電極基板1は、基板層20と、金属層30とを有する。以下では、電極基板1の長手方向を第1方向と称し、電極基板1の短手方向を第2方向と称する。第2方向は、第1方向と直交する。なお、「直交する」とは、「略直交する」を含むものとする。
 本実施形態の基板層20は、絶縁材料により形成される。本実施形態の基板層20は、シリコン(Si)により形成された基板層の上にポリイミドにより形成された基板層が重なった2層構造である。なお、本実施形態の基板層20は2層構造であるが、本発明はこれに限られない。基板層20は1種類の材料により形成される1層のみから構成されてもよいし、3つ以上の層から構成されてもよい。また、基板層20は、絶縁性の材料により形成されていれば、ポリエチレンテレフタラート樹脂、セラミック、シリコーンゴムまたはアルミナなどの、シリコンおよびポリイミド以外の材料により形成されてもよい。
 金属層30は、図1~図4に示すように、2つの接続用電極部31と、2つの接続用電極部31の間において第1方向に延びる配線部32と、配線部32の中央に配置された測定電極部33とを有する。
 金属層30は、例えば、導体である金(Au)、白金(Pt)、銀(Ag)、銅(Cu)、タングステン(W)等の金属により形成される。なお、金属層30は、複数の金属層を重ねて構成されてもよい。例えば、クロム(Cr)により形成された金属層の上に、上記の金、白金、銀、銅等の金属からなる金属層が重なる構造であってもよい。なお、その場合であっても、測定電極部33は、1層の金属層のみから構成されることが好ましい。金属層30の厚みは、例えば、50~300nmである。
 基板層20および金属層30の最上面は、絶縁膜(図示せず)により覆われている。金属層30の表面を絶縁膜で覆うことにより、測定電極部33を液体中で用いる場合に、金属層30のうち測定電極部33以外の箇所において、金属層30を構成する金属と液体との間における電子のやりとりが生じるのを抑制できる。なお、本実施形態では、絶縁膜はTEOS酸化膜であるが、絶縁性の材料であれば、他の材料により形成されてもよい。なお、接続用電極部31の上面の少なくとも一部には、絶縁膜が形成されない。このため、接続用電極部31の上面の少なくとも一部は露出している。
 2つの接続用電極部31は、第1方向に離れて配置されている。2つの配線部32はそれぞれ、各接続用電極部31から測定電極部33へ向かうにつれて次第にその幅が小さくなる。両側の配線部32の間には、配線部32よりも第2方向の幅が小さい測定電極部33が配置される。図4に示すように、測定電極部33は、1対のナノ電極34により構成される。一対のナノ電極34は、電極基板1に負荷(外力)がかかっていない状態では、図4に示すように、ナノ電極34の先端部同士が接触した状態となっている。
 基板層20は、図1~図4に示すように、上面から下方へ凹む流路50を有する。流路50は、第1流路51、第2流路52および測定流路53を有する。第1流路51および第2流路52は、測定電極部33を挟んで第2方向に対向して配置される。測定流路53は、第2方向に延びる溝である。測定流路53は、第1流路51と第2流路52を第2方向に繋ぐ。
 第1流路51および第2流路52は、格子状に繋がる複数の溝により構成される。このような形状により、第1流路51および第2流路52に生体高分子を含む液体が充填されると、各生体高分子がこれらの溝の延びる方向に沿って配置されやすくなる。したがって、第1流路51および第2流路52と測定流路53との境界部で生体高分子が詰まるのが抑制される。これにより、当該境界部において液体の流動性が低下するのが抑制されるとともに、測定流路53内において各生体高分子が測定流路53の延びる方向に沿って配置される。第1流路51および第2流路52の各溝は、幅が約1μmであり、深さが約2μmである。
 測定流路53は、第2方向に沿って延びる。測定流路53は、ナノ電極34の先端部と上下に重なる位置に配置される。これにより、測定流路53内を第2方向に移動する生体分子が、ナノ電極34の間を通過しやすい。
 測定流路53の深さは、第1流路51および第2流路52と同様に、約2μmである。測定流路53はナノ電極34付近においてその幅が狭くなっている。これにより、電流値測定時に、生体高分子が、測定流路53の延びる第2方向に沿う向きで、ナノ電極34間を通過しやすい。
 次に、電流測定装置9について、図5および図6を参照しつつ説明する。図5および図6は、電流測定装置9において電流測定を行う際の様子を示した図である。図5は、電極基板1がセットされた電流測定装置9の初期状態における様子を示した側面図である。図6は、電極基板1の押し曲げ時における電流測定装置9の様子を示した側面図である。なお、図6では、電極基板1の変形を誇張して示している。
 図6に概念的に示すように、電流測定装置9は、載置台91と、固定具92と、押し上げ具93と、昇降機構94と、電源95と、電流計96と、制御部90とを有する。
 載置台91は、電極基板1を載置する平らな上面を有する。本実施形態の固定具92は、第1方向に対して略垂直に配置される4つの板状部材である。固定具92は、測定電極部33を挟んだ第1方向の2箇所において、電極基板1を上下から押えて固定する。
 押し上げ具93は、半球状の上面を有する円柱状の部材である。押し上げ具93は、昇降機構94に接続されている。昇降機構94は、モータ941とピエゾアクチュエータ942とを有する。モータ941は、押し上げ具93をミリメートル単位で大きく上下に移動させる。ピエゾアクチュエータ942は、押し上げ具93をナノメートル単位で小さく上下に移動させる。昇降機構94は、モータ941とピエゾアクチュエータ942とを組み合わせることにより、大きな動きと細かな動きとの双方を実現している。なお、昇降機構94は、押し上げ高さを制御できる機構であれば、その他の動力を用いた機構であってもよい。
 電源95は、一対の接続用電極部31間に電圧を印加する。電流計96は、測定電極部33のナノ電極34間に流れる電流の電流値を測定する。
 制御部90は、昇降機構94、電源95および電流計96とそれぞれ電気的に接続し、各部を制御する。本実施形態の制御部90は、CPU等の演算処理部、RAM等のメモリ、およびハードディスクドライブ等の記憶部を備えたコンピュータにより構成されている。制御部90の機能は、記憶部に記憶されたコンピュータプログラムに基づいて、演算処理部が動作することにより実現される。
 電極基板1を電流測定装置9にセットする際には、まず、載置台91上に電極基板1を載置する。その後、電極基板1の測定電極部33付近に負荷のかからない状態で電極基板1を上下から4つの固定具92で固定する。このとき、測定電極部33の真下に押し上げ具93が位置するように、電極基板1を配置する。
 そして、電流測定時には、まず、電源95により、接続用電極部31間に所定の電圧を印加するとともに、電流計96による電流値の測定を開始する。そして、昇降機構94を駆動させて押し上げ具93を押し上げて、ナノ電極34の先端部同士の距離(電極間距離)を調整する。
 図7は、初期位置における電極基板1の部分断面図である。図8は、押し上げ時における電極基板1の部分断面図である。図4および図7に示すように、電極基板1が押し曲げられていない状態では、ナノ電極34の先端部同士は接触している。図8に示すように、押し上げ具93を押し上げると、電極基板1の測定電極部33付近が下面側から押し上げられる。すると、測定流路53を構成する基板層20の側壁が、図8中に実線矢印で示すように、互いに離れる方向へと移動する。これにより、ナノ電極34同士が、図8中に破線矢印で示すように、互いに離れる方向へと移動する。その結果、電極間距離が拡がる。このように、押し上げ具93によって電極基板1を押し上げることにより、電極間距離の調整を行う。
 <2.生体高分子のトンネル電流測定処理>
 次に、電極基板1および電流測定装置9を用いた生体高分子のトンネル電流測定処理の流れについて、図9を参照しつつ説明する。図9は、電解質を含む液体中に生体高分子が遊動する液体試料について、当該生体高分子のトンネル電流測定処理の流れを示したフローチャートである。本実施形態において、液体試料に含まれる生体高分子は、ヌクレオチドである。また、液体試料に含まれる電解質を含む液体は、水等の極性の大きな溶媒に溶質が溶解された、NaCl水溶液等の液体である。
 図9に示すように、生体高分子のトンネル電流測定処理では、まず、液体試料中のイオンや双極子・有機双極子等の分子が測定電流に与える影響について、その特徴量を解析する(ステップS100)。ここで、ナノ電極34を電解質を含む液体中に配置した状態で、ナノ電極34間に電圧を印加した場合のナノ電極34間を流れる電流の挙動について説明する。
 図10は、電解質を含む液体中に配置されたナノ電極34間に所定の電圧を印加した場合のナノ電極34間を流れる電流の挙動を模式的に示した図である。図11は、複数の濃度のNaCl溶液について、NaCl水溶液中に配置されたナノ電極34間に電圧を印加した場合の初期電流値の実験データを示した図である。
 図10のように、ナノ電極34間に時間tにおいて電圧の印加が開始されると、ナノ電極34間には、図10中に実線で示すような電流が流れる。このとき、ナノ電極34間に流れる電流には、定常時のナノ電極34間の電流値であるベース電流Ibと、液体試料に含まれる電解質に起因する過渡電流とが含まれる。ベース電流Ibは、リーク電流や電流測定装置9の装置構成や環境に起因する基準電流Icと、ナノ電極34間を流れるトンネル電流It1とを含む。また、過渡電流の最大値をIoとする。
 ナノ電極34が真空中に配置されている場合、ナノ電極34間には、上記の基準電流Icと、ナノ電極34間のトンネル電流It2とが流れる。この場合、ナノ電極34間には、図10中に二点鎖線で示すような電流が流れる。
 これに対し、ナノ電極34が電解質を含む液体中に配置されている場合、ナノ電極34間に電圧を印加すると、ナノ電極34間に基準電流Icおよびトンネル電流It1が流れるとともに、ナノ電極34間において液体中のイオンや双極子・有機双極子等の分子の運動や移動が生じる。このイオンおよび分子の運動や移動により、一時的にナノ電極34間の電流値が大きくなる。この一時的な電流値の増加が過渡電流である。
また、イオンおよび分子の運動や移動が落ち着くと、液体中には、ナノ電極34の表面に沿って電気二重層が形成されている。この電気二重層を介してナノ電極34間に電流が流れる場合、電気二重層が介在しない場合と比べて、ナノ電極34間に流れるトンネル電流が大きくなる。このため、電解質を含む液体中におけるトンネル電流It1は、真空中におけるトンネル電流It2と比べて、電気二重層に起因するトンネル電流の増加分ΔIt大きくなる。
 図11には、NaCl濃度が1mM、10mM、20mM、30mMおよび50mMのNaCl水溶液について、ナノ電極34間に電圧を印加した場合の初期電流値の挙動が示されている。図11に示すように、NaCl濃度が10mM以上の場合、電流値の過渡現象が顕著に表れている。また、電解質であるNaClの濃度が高くなるにつれて、電気二重層の形成にかかわるイオンや溶媒・溶質を構成する分子が多くなるために、過渡現象が落ち着いた後の電流値が大きくなる。
 このように、ナノ電極34間に電圧を印加した際に、ナノ電極34が電解質を含む液体中に配置されていると、ナノ電極34間を流れる電流には、過渡現象が生じる。このため、ナノ電極34間に印加する電圧を変化させる場合、または、ナノ電極34の電極間距離を変化させる場合に、過渡現象を考慮せずに操作や電流値の解析を行うと、操作内容、取得データまたは解析内容等に誤差が生じる。
 また、同じ電極基板1および電流測定装置9を用いた場合であっても、ナノ電極34間に介在する液体の電解質の種類や濃度に応じて、電気二重層に起因するトンネル電流の増加量が異なる。このため、測定する液体試料ごとにステップS100の特徴量解析処理を行う必要がある。ステップS100の具体的な流れについては、後述する。
 ステップS100の特徴量解析処理が行われた後、続いて、ナノ電極34の校正処理(キャリブレーション)が行われる(ステップS200)。ステップS200の校正処理では、ナノ電極34の電極間距離dを変動させるための操作量であるピエゾアクチュエータ942への印加電圧Vpと、電流計96の検出したナノ電極34間の電流値Iとの関係を解析する。これにより、一対のナノ電極34に対する操作量である印加電圧Vpと電極間距離dとの関係が推定される。ステップS200の具体的な流れについては、後述する。
 続いて、生体高分子のトンネル電流を測定するために、ナノ電極34の電極間距離dを所望の距離にセットする(ステップS300)。ステップS200の具体的な流れについては、後述する。
 ナノ電極34の電極間距離dが所望の距離にセットされた後、ナノ電極34間を流れる電流値を測定し、生体高分子のトンネル電流を測定する(ステップS400)。このとき、必要に応じて、制御部90は、電極間距離dが所望の範囲内となるように、フィードバック制御を行ってもよい。
 ステップS400における生体高分子のトンネル電流の測定が行われた後、取得した電流データの解析を行う(ステップS500)。生体高分子を構成する単分子は、その種類によって特有のトンネル電流値をとる。このため、液体試料中を遊動しナノ電極34間を通過する生体高分子のトンネル電流の電流データを解析することにより、当該生体高分子における単分子の配列を推定することができる。
 <3.特徴量解析処理>
 次に、ステップS100の特徴量解析処理について、図12を参照しつつ説明する。図12は、特徴量解析処理の流れを示したフローチャートである。
 特徴量解析処理では、まず、ナノ電極34を液体試料中に配置し、ナノ電極34の電極間距離dが0よりも大きくなるように配置する(ステップS110)。なお、電極間距離dが0でない、すなわち、一対のナノ電極34の先端部同士が接触していないことを確認するために、ナノ電極34間に電圧を印加して、ナノ電極34間を流れる電流の電流値Iが所定の電圧値よりも小さいことを確認してもよい。その場合、電流値Iの確認後、ナノ電極34への電圧の印加を停止し、しばらく待機する。
 その後、ナノ電極34間の距離を固定したまま、ナノ電極34間に所定の電圧を印加する。そして、電圧の印加開始から所定の期間、ナノ電極34間の電流値Iを測定する(ステップS120)。このとき得られる電流値Iは、図11に示すような過渡応答性を有する。なお、ステップS120の電流測定工程中において、生体高分子がナノ電極34間を通過する場合がある。そのような場合には、得られた電流値Iには、生体高分子がナノ電極34間を通過した際に現れるシグナルが時々含まれる。
 そして、得られた電流データの解析を行い、特徴量である時定数を算出する(ステップS130)。算出される時定数は、ナノ電極34間の印加電圧や電極間距離dの変化に基づいて生じた過渡現象が収束し、過渡現象によって生じた変化量が約36.2%まで減少するまでの時間を表す。なお、本発明で算出する特徴量は時定数に限られない。過渡現象の収束状態を表すパラメータであれば、その他のパラメータが特徴量として算出されても良い。
 図10に示すようなナノ電極34間の電流値Iの過渡現象は、定常時のナノ電極34間の電流値であるベース電流Ibと、過渡電流成分の最大値Ioとを用いて、次の数式(1)のように示すことができる。なお、ベース電流Ibとは、上述の基準電流Icと、液体試料に含まれる電解質を含む液体を介してナノ電極34間を流れるトンネル電流値とが重畳したものである。
Figure JPOXMLDOC01-appb-M000001
 数式(1)の右辺の第2項が過渡電流成分となる。ここで、τは、過渡電流成分の時定数である。ナノ電極34間の電流値Iがこのような数式(1)で近似できることから、ステップS110で得られた電流データを、数式(1)で近似することによって、過渡現象の時定数τを算出することが可能である。時定数τは、過渡現象の特徴量として、以降の校正処理、電極間距離設定処理および電流測定処理において用いられる。以降の各処理において、過渡現象を考慮して時定数τを用いた処理を行うことにより、各処理において過渡現象に起因した操作内容、取得データまたは解析内容等の誤差を抑制することができる。
 ここで、現実の電流値データを解析すると、ナノ電極34間の電流値Iには、複数の過渡電流成分が重畳されていることがわかった。そこで、本実施形態では、ナノ電極34間の電流値Iについて、5種類の過渡電流成分が重畳しているものとして、次の数式(2)のように近似する。
Figure JPOXMLDOC01-appb-M000002
 数式(2)の右辺の第2項は、n=1~5の5つの過渡電流成分の和となっている。5つの過渡電流成分はそれぞれ、n=1~5について、最大電流成分がInであり、時定数がτnである。すなわち、5つの過渡電流成分は、最大電流成分がそれぞれI1,I2,I3,I4,I5であり、時定数がτ1,τ2,τ3,τ4,τ5である。ここで、以下では、5つの時定数τ1~τ5は、時定数の値が小さいものから順にτ1,τ2,τ3,τ4,τ5とする。
 なお、本実施形態では、算出する時定数の数が5つであるが、本発明はこれに限られない。算出する時定数の数は、1つ~4つであってもよいし、6つ以上であってもよい。ナノ電極34間の電流値Iには、上述の通り、複数の過渡電流成分が重畳している。このため、電流値Iに現れる複数の過渡電流成分の影響をより正確に排除するためには、3つ以上の過渡電流成分を考慮することが好ましい。また、算出する時定数の数が多すぎると、ナノ電極34間の電流値測定に影響が殆どない過渡電流成分の時定数まで算出したり、実際には生じていない過渡電流成分を算出したりすることとなりかねない。このため、算出する時定数の数は、3つ~6つであることが好ましい。
 <4.電極対の校正処理>
 次に、ステップS200のナノ電極34の校正処理について、図13を参照しつつ説明する。図13は、ナノ電極34の校正処理の流れを示したフローチャートである。
 ナノ電極34の校正処理では、押し上げ具93による電極基板1の押し上げ量を変動させて電極間距離dを変動させ、その間のナノ電極34間に流れる電流の電流値Iを測定する。そして、押し上げ具93の操作量と電流値Iの関係から、当該操作量と電極間距離dとの関係を推定する。
 本実施形態の校正処理では、押し上げ具93による電極基板1の押し上げと引き戻しとを繰り返して、ナノ電極34の電極間距離dを変動させ、その間のナノ電極34間に流れるトンネル電流の値を取得する。
 校正処理において、まず、電極基板1を電流測定装置9に載置し、初期位置にセットする(ステップS210)。次に、制御部90は、カウント数nをn=1に設定する(ステップS220)。
 そして、制御部90は、基準電流Icを測定する(ステップS230)。具体的には、押し上げ具93を押し上げて、ナノ電極34間にトンネル電流が流れない程度の十分に大きな電極間距離dを保ちつつ、ナノ電極34間を流れる電流の電流値を測定する。これにより、リーク電流や電流測定装置9の装置構成や環境に起因する基準電流Icを測定できる。
 なお、基準電流Icの測定を行う場合、制御部90は、ナノ電極34間の距離が基準電流Icを測定可能な距離まで達した後、所定の初期待機時間t0が経過した後に基準電流Icの測定を行う。この初期待機時間t0は、ステップS100の特徴量解析処理で算出された5つの時定数τ1~τ5のうち、最も値の大きな時定数τ5に基づいて算出される。初期待機時間t0は、例えば、時定数τ5に所定の実数を乗じて算出される。
 このように、基準電流Icの測定を行う測定タイミングは、特徴量である時定数τ5に基づいて決定される。これにより、基準電流Icを測定する際に、過渡現象の影響によって測定値に誤差が生じるのが抑制される。基準電流Icの測定後、制御部90は、押し上げ具93を所定の位置まで引き下げる。
 押し上げ具93が所定の位置まで引き下げられた後、制御部90は、押し上げ具93による電極基板1の押し上げ工程を行う(ステップS240)。すなわち、制御部90は、ナノ電極34の電極間距離dが大きくなる方向へ操作を行う。
 押し上げ工程の開始時における押し上げ具93の位置は、電流計96の測定した電流値が後述する第1閾値よりも大きくなる位置であれば、ナノ電極34の先端部同士が接触する位置であってもよいし、ナノ電極34の先端部同士が離間した位置であってもよい。
 なお、このステップS240における押し上げ工程と、後述するステップS250における引き下げ工程とにおいて、押し上げ具93の押し上げおよび引き下げは、ピエゾアクチュエータ942への印加電圧Vpを増減させることによって行う。このため、押し上げおよび引き下げを行うための操作量は、ピエゾアクチュエータ942への印加電圧Vpの電圧値となる。印加電圧Vpの電圧値が大きくなると、押し上げ具93による押し上げ量が大きくなり、電極間距離dが大きくなる。一方、印加電圧Vpの電圧値が小さくなると、押し上げ具93による押し上げ量が小さくなり、電極間距離dが小さくなる。
 ステップS240の押し上げ工程は、電流計96の測定した電流値が所定の第1閾値以下となるまで行われる。図14は、ステップS240の押し上げ工程の具体的な流れを示したフローチャートである。
 図14に示すように、ステップS240では、制御部90は、まず、所定の待機時間の間、待機を行う(ステップS241)。これにより、ステップS241の待機工程の直前において行われた電極間距離dの変更に伴う過渡現象の影響が十分小さくなるのを待つ。これにより、その後のステップS242における電流測定時に、測定した電流値に過渡現象に起因する誤差が生じるのを抑制できる。
 なお、1回目のステップS241における待機時間は、例えば、ステップS230の基準電流Icの測定時と同じ初期待機時間t0である。2回目以降のステップS241における待機時間は、所定の第1待機時間t1である。この第1待機時間t1は、ステップS100の特徴量解析処理で算出された5つの時定数τ1~τ5のうち、最も値の小さな時定数τ1に基づいて算出される。第1待機時間t1は、例えば、時定数τ1に所定の実数を乗じて算出される。なお、第1待機時間t1は、他の時定数τ2~τ5に基づいて算出されてもよい。
 このように、1回目のステップS241における待機時間は、2回目のステップS241における待機時間よりも長いことが好ましい。これは、1回目のステップS241開始前における電極間距離dの変更量が、2回目以降のステップS241開始前における電極間距離dの変更量よりも大きいためである。なお、1回目のステップS241における待機時間は、ステップS230の基準電流Icの測定時と同じ初期待機時間t0には限られず、2回目のステップS241における待機時間である第1待機時間t1以上であれば、他の方法により算出された待機時間であってもよい。
 次に、制御部90が、その時点でのピエゾアクチュエータ942への印加電圧Vpの電圧値と、電流計96の測定した電流値とを記憶する(ステップS242)。すなわち、制御部90が、電極間距離dの変更に用いられる操作量の値と、ナノ電極34の電流値とを取得する。
 続いて、制御部90は、印加電圧Vpを所定量増加させ、電極間距離dを増加させる(ステップS243)。すなわち、制御部90は、電極間距離dの変更に用いられる操作量を変更して電極間距離dを変更する。
 電極間距離dの変更後、制御部90は、電流計96の測定した電流値が所定の第1閾値以下となったか否かを判断する(ステップS244)。電流計96の測定した電流値が第1閾値よりも大きい場合(ステップS244:No)、制御部90は、ステップS241に戻り、待機と、電流値の測定と、電極間距離dの増加とを繰り返す。一方、電流計96の測定した電流値が第1閾値以下となった場合(ステップS244:Yes)、制御部90は、ステップS240の押し上げ工程を終了する。
 ステップS240の押し上げ工程が終了すると、続いて、制御部90は、押し上げ具93の引き下げ工程を行う(ステップS50)。すなわち、制御部90は、ナノ電極34の電極間距離dが小さくなる方向へ操作を行う。
 ステップS250の引き下げ工程は、電流計96の測定した電流値が所定の第2閾値以上となるまで行われる。図15は、ステップS250の引き下げ工程の具体的な流れを示したフローチャートである。
 図15に示すように、ステップS250では、制御部90は、まず、所定の第1待機時間t1の間、待機を行う(ステップS251)。この第1待機時間t1は、2回目以降のステップS241における待機時間と同じである。
 次に、制御部90が、その時点でのピエゾアクチュエータ942への印加電圧Vpの電圧値と、電流計96の測定した電流値とを記憶する(ステップS252)。すなわち、制御部90が、電極間距離dの変更に用いられる操作量の値と、ナノ電極34間の電流値Iとを取得する。
 続いて、制御部90は、印加電圧Vpを所定量減少させ、電極間距離dを減少させる(ステップS253)。すなわち、制御部90は、電極間距離dの変更に用いられる操作量を変更して電極間距離dを変更する。
 電極間距離dの変更後、制御部90は、電流計96の測定した電流値が所定の第2閾値以上となったか否かを判断する(ステップS254)。電流計96の測定した電流値が第2閾値未満である場合(ステップS254:No)、制御部90は、ステップS251に戻り、待機と、電流値の測定と、電極間距離dの減少とを繰り返す。一方、電流計96の測定した電流値が第2閾値以上となった場合(ステップS254:Yes)、制御部90は、ステップS250の引き下げ工程を終了する。
 続いて、制御部90は、カウント数nが所定の繰り返し回数Nに達したか否かを判断する(ステップS260)。カウント数nが繰り返し回数Nに達していない場合(ステップS260:No)、制御部90は、ステップS270へと進み、カウント数nをインクリメントする。その後、ステップS240へと戻り、再び押し上げ具93の押し上げ工程および引き下げ工程を実行する。一方、カウント数nが繰り返し回数Nに達している場合(ステップS260:Yes)、制御部90は、ステップS280へと進む。
 このように、ステップS240の押し上げ工程と、ステップS250の引き下げ工程とにおいて、ナノ電極34間に所定の電圧を印加しつつ、電極間距離dを変更させるように操作を行い、ナノ電極34間の電流値Iを取得する。このとき、ステップS240の押し上げ工程と、ステップS250の引き下げ工程とを複数回繰り返し行うことにより、後述する近似関数をより正確に求めることができる。
 ここで、図16は、ナノ電極34の校正処理におけるピエゾアクチュエータ942への印加電圧Vpおよびナノ電極34間の電流値の経時変化の概略を示した図である。図16において、1段目はピエゾアクチュエータ942への印加電圧Vp、2段目はナノ電極34の電極間距離d、3段目は電流計96の検出したナノ電極34間の電流値Iの経時変化を比例軸で示したもの、4段目は、電流計96の検出したナノ電極34間の電流値の経時変化を対数軸で示したものである。なお、図16は、各値の関係性を理解しやすくするために、ステップS241およびステップS251における待機工程を省略して示している。
 図16の3段目および4段目に示すように、本実施形態では、第1閾値は0.01nAであり、第2閾値は2.00nAである。第1閾値は、基準電流Icよりも大きい値に設定する。また、第2閾値は、第1閾値よりも大きく、かつ、ナノ電極34同士が接触した際に流れる電流値よりも小さい値に設定する。
 上記の通り、本実施形態のステップS240およびステップS250において、押し上げ具93の押し上げまたは引き下げを行うための操作量は、ピエゾアクチュエータ942への印加電圧Vpである。本実施形態のピエゾアクチュエータ942は、印加電圧Vpと押し上げ量とが略比例する。さらに、押し上げ量と、電極間距離dとが略比例する。したがって、印加電圧Vpの電圧値の変化量と、電極間距離dの変化量とは略比例する。ここで、電極間距離dと印加電圧Vpとの関係は、比例係数をαとすると、以下の数式(3)で表される。
Figure JPOXMLDOC01-appb-M000003
 ステップS240では、図16に示すように、印加電圧Vpを次第に増加させる。具体的には、ステップS243を実行するごとに、印加電圧Vpを所定量増加させる。このため、電極間距離dも印加電圧Vpの増加に従って増加する。また、図16に示すように、ステップS250では、印加電圧Vpを次第に減少させる。具体的には、ステップS253を実行するごとに、印加電圧Vpを所定量減少させる。このため、ステップS250では、電極間距離dは略一定の割合で減少する。
 一方、電極間距離dと、電極間を流れるトンネル電流Itとは、以下の数式(4)のような関係を有する。なお、Kは定数である。βは、既知の定数である。
Figure JPOXMLDOC01-appb-M000004
 一方、電流計96の測定する電流値Iは、基準電流Icと、トンネル電流Itとを加算したものであるから、電流値Iは、以下の数式(5)で表される。
Figure JPOXMLDOC01-appb-M000005
 このため、図16に示すように、ステップS240において、押し上げ具93を次第に押し上げていくと、電流値Iは指数関数的に小さくなる。そして、ステップS250において、押し上げ具93を次第に引き戻していくと、電流値Iは指数関数的に大きくなる。
 ステップS260からステップS280へと進むと、制御部90は、N回繰り返し行ったステップS240およびステップS250における押し上げ具93に対する操作量と電流計96の測定した電流値Iとの関係を近似した近似関数を算出する(ステップS280)。
 図17は、校正処理における印加電圧Vpと電流値Iの測定データの一例を示した図である。図18は、図17の例の測定データの近似関数を示した図である。なお、図17および図18はいずれも、横軸が実数軸、縦軸が対数軸の片対数グラフである。図17中、黒いデータ点は、押し上げ工程(ステップS240)における測定データを示し、白いデータ点は、引き下げ工程(ステップS250)における測定データを示したものである。ステップS240~ステップS250では、所定の時間間隔(例えば50msec)ごとに、印加電圧Vpと測定した電流値Iとを記憶する。
 図17に示すように、ステップS240およびステップS250における印加電圧Vpと電流値Iとは、印加電圧Vpが大きくなるにつれて、電流値Iが指数関数的に小さくなる。ステップS280では、この関係を用いて以下の数式(6)のような近似式を算出し、定数A,B,Cを算出する。
Figure JPOXMLDOC01-appb-M000006
 このようにすれば、次の数式(7)~(9)のように各値が求まる。
Figure JPOXMLDOC01-appb-M000007
Figure JPOXMLDOC01-appb-M000008
Figure JPOXMLDOC01-appb-M000009
 以上より、電極間距離dと印加電圧Vpとの比例係数αが以下の数式(10)の通り求められる。この比例係数αが、電極基板1ごとに求められる固有値である。
Figure JPOXMLDOC01-appb-M000010
 算出された比例係数αを、数式(3)に代入して、操作量である印加電圧Vpと電極間距離dとの関係を推定した推定関数が算出される(ステップS290)。この比例係数αおよび推定関数を用いて、後述する電流測定処理を行う。
 このような校正処理(ステップS200)により、一対のナノ電極34に対する操作量(印加電圧Vp)と電極間電流値(電流値I)との関係が求められる。なお、上記の校正処理は、測定対象とする液体試料そのもの、または、当該液体試料の液体成分である電解質を含む液体内で行われる。このため、電気二重層等の過渡現象を考慮して、ステップS241およびステップS251の待機工程を実行する。これにより、過渡現象に起因する電流値の誤差を抑制することができる。
 なお、本実施形態では、ステップS280の近似関数算出工程において、ステップS240の押し上げ工程における測定データの近似関数と、ステップS250の引き下げ工程における測定データの近似関数とを別々に算出する。そして、ステップS290の推定関数算出工程においても、押し上げ具93の押し上げ時における推定関数と、押し上げ具93の引き下げ時における推定関数とを別々に算出する。
 ピエゾアクチュエータ942の印加電圧Vpと移動量とについてのヒステリシスなどに起因して、押し上げ工程と引き下げ工程とでは、印加電圧Vpと電流値Iとの関係にもヒステリシスが現れる。このため、本実施形態のように、押し上げ工程における近似関数および推定関数と、引き下げ工程における近似関数および推定関数とを別々に算出することが好ましい。
 <5.電極間距離設定処理>
 続いて、電極基板1を用いた生体高分子の電流測定処理を行うための、電極間距離dの設定処理について、図19~図21を参照しつつ説明する。図19は、ステップS300の電極間距離設定処理の流れを示したフローチャートである。図20は、スモールギャップモードにおける電極間距離調整工程の流れを示したフローチャートである。図21は、ラージギャップモードにおける電極間距離調整工程の流れを示したフローチャートである。
 生体高分子のトンネル電流を測定する場合、適切な電極間距離で測定を行うことが重要である。また、測定対象とする生体高分子ごとに、適切な電極間距離が異なる。この電流測定処理は、測定対象である生体高分子を含む液体試料中で行われる。図19に示すように、測定処理において、まず、制御部90に、外部から目標とする電極間距離である目標電極間距離が入力される(ステップS310)。なお、目標電極間距離は、予め入力されていてもよい。
 次に、制御部90は、ステップS310で入力された目標電極間距離が、所定の閾値以下であるか否かを判断する(ステップS320)。この閾値は、電極間距離が当該閾値となる場合のナノ電極34間のトンネル電流値が、ベース電流Ibに含まれる雑音成分よりも大きい値となるように設定される。
 なお、ステップS320において、目標とする所望の電極間距離に相当する目標トンネル電流値Iuが、所定の閾値以上であるか否かを判断してもよい。その場合、目標トンネル電流値Iuは、例えば、前述した数式(4)を用いて算出される。
 ステップS320において、目標電極間距離が閾値以下であると判断すると(ステップS320:Yes)、制御部90は、ステップS330のスモールギャップモードにおける電極間距離調整工程へと進む。一方、目標電極間距離が閾値よりも大きいと判断すると(ステップS320:No)、制御部90は、ステップS340のラージギャップモードにおける電極間距離調整工程へと進む。なお、ステップS330およびステップS340では、引き続きナノ電極34に所定の電圧を印加して、ナノ電極34間の電流を測定する。
 続いて、図20を参照しつつ、スモールギャップモードにおける電極間距離調整工程の流れについて説明する。まず、ナノ電極34間にトンネル電流が流れないように電極間距離を十分大きくした状態で、基準電流Icの測定を行う(ステップS331)。基準電流Icの測定後は、押し上げ具93を、ナノ電極34の先端部同士が接触する位置に戻す。
 基準電流Icは、ステップS331において電流計96の測定した電流値Iからベース電流Ibを抽出することにより測定される。図22は、測定された電流値Iの経時変化の一例を示した図である。図22に示すように、生体高分子を含む液体中で電流値Iの測定をする場合、電流値Iは、ナノ電極34間に生体高分子が存在していない場合に測定されるベース電流Ibの成分と、ナノ電極34間に生体高分子が通過した場合に測定されるサンプル電流Isの成分とを含む。サンプル電流Isは、生体高分子とナノ電極34との間に流れるトンネル電流である。
 図22に示すように、サンプル電流Isは、ベース電流Ibよりも大きな電流値を有する。このため、計測した電流値Iを、ベース電流Ibの成分とサンプル電流Isの成分とに分離することが可能である。なお、ステップS331におけるサンプル電流Isは、所望の電極間距離における測定値ではないため、実験データとして用いることはできない。
 ステップS331において、制御部90は、測定した電流値Iから、ベース電流Ib成分を抽出し、当該成分から、ナノ電極34間にトンネル電流が流れない状態におけるベース電流Ibの電流値である基準電流Icを算出する。
 次に、制御部90は、目標合計電流値Iaを算出する(ステップS332)。目標合計電流値Iaは、目標とする電極間距離dに相当する、ナノ電極34間のトンネル電流の値である。具体的には、まず、数式(4)の電極間距離dに目標電極間距離を代入して、目標トンネル電流値Iuを算出する。目標トンネル電流値Iuは、目標とする電極間距離dに相当するトンネル電流の値である。そして、基準電流Icに目標トンネル電流値Iuを加算して、目標合計電流値Iaを算出する。
 その後、制御部90は、押し上げ具93を動作させて、測定した電流値Iのベース電流Ibが目標合計電流値Iaと一致する目標位置に、ナノ電極34を配置するために、ステップS333~S335を行う。
 まず、制御部90は、現在のベース電流Ibが目標合計電流値Iaに近づくように、押し上げ具93を操作し、電極間距離dを変更する(ステップS333)。本実施形態では、1回のステップS333で変更可能なピエゾアクチュエータ942への印加電圧Vpの変化量の上限値が決められている。このため、1回のステップS333における電極間距離dの最大変更量が決められている。
 次に、制御部90は、所定の第2待機時間t2の間、待機を行う(ステップS334)。これにより、ステップS333の電極間距離dの変更に伴う過渡現象の影響が十分小さくなるのを待つ。その結果、その後のステップS335における電流測定時に、測定した電流値に過渡現象に起因する誤差が生じるのを抑制できる。
 ステップS334における待機時間である第2待機時間t2は、ステップS100の特徴量解析処理で算出された5つの時定数τ1~τ5のうち、最も小さな時定数τ1、2番目に小さな時定数τ2、および3番目に小さな時定数τ3に基づいて算出される。第2待機時間t2は、例えば、時定数τ1、時定数τ2および時定数τ3の平均値に所定の実数を乗じて算出される。
 その後、制御部90は、電流計96に電流値Iを測定させる(ステップS335)。
 そして、制御部90は、ステップS335において測定した電流値Iのベース電流Ibが、所定の電流値範囲内に含まれるか否かを判断する(ステップS336)。ステップS336において判断が行われる所定の範囲は、目標合計電流値Iaを基準として設定される。例えば、ベース電流Ibが、目標合計電流値Iaから±0.0005nAの範囲内であるか否かを基準とする。
 ステップS336において、ベース電流Ibが所定の範囲内に達していないと判断すると(ステップS336:No)、制御部90は、ステップS333へと戻り、引き続き電極間距離dの調整を行う。
 一方、ステップS336において、ベース電流Ibが所定の範囲内に達していると判断すると(ステップS336:Yes)、制御部90は、ステップS300の電極間調整処理を完了する。
 続いて、図21を参照しつつ、ステップS340のラージギャップモードにおける電極間距離調整工程の流れについて説明する。電流測定時における電極間距離が比較的大きい場合、当該電極間距離におけるトンネル電流の値は比較的小さくなる。当該トンネル電流の値が、基準電流Icのノイズ成分に比べて小さいと、基準電流Icと目標合計電流値Iaとの差がわかりにくくなる。このため、スモールギャップモードと同じ方法で電極位置を設定しようとしても、所望の電極間距離となる電極位置に正確にセットするのが困難である。そこで、以下に説明するラージギャップモードにより電極位置をセットすることにより、所望の電極間距離となるように電極位置をセットする。
 図23は、ステップS340のラージギャップモードの電極間距離調整工程において、ナノ電極34間の様子を示した概略図である。図23に示すように、まず、ナノ電極34間にトンネル電流が流れないように電極間距離を十分大きくした状態で、基準電流Icの測定を行う(ステップS341)。基準電流Icの測定後は、押し上げ具93を、ナノ電極34の先端部同士が接触する位置に戻す。基準電流Icの測定は、スモールギャップモードのステップS331と同様に行う。
 次に、制御部90は、中間目標合計電流値Idおよび移動操作量ΔVpを算出する(ステップS342)。具体的には、まず、中間トンネル電流値Ivを算出する。中間トンネル電流値Ivは、中間目標位置とする中間電極間距離d1に対応するトンネル電流値である。中間目標位置とする中間電極間距離d1は、最終目標位置とする目標電極間距離d2よりも小さい電極間距離である。中間トンネル電流値Ivは、数式(4)の電極間距離dに、中間電極間距離d1を代入することにより算出される。そして、この中間トンネル電流値Ivと、ステップS341で測定した基準電流Icとを加算して、中間目標合計電流値Idを算出する。なお、中間トンネル電流値Ivが、基準電流Icのノイズ成分よりも十分大きな電流値となるように、中間電極間距離d1を設定する。
 一方、移動操作量ΔVpは、中間目標位置である中間電極間距離d1から最終目標位置である目標電極間距離d2まで移動させるために必要な操作量である。この移動操作量ΔVpは、具体的には、中間電極間距離d1から目標電極間距離d2まで移動するためのピエゾアクチュエータ942への印加電圧Vpの変化量である。この移動操作量ΔVpは、ステップS101~S111の校正処理によって求められた推定関数に基づいて求められる。すなわち、数式(3)と、校正処理で求められた電極間距離dと印加電圧Vpとの比例係数αとを用いて、以下の数式(11)の関係から求められる。
Figure JPOXMLDOC01-appb-M000011
 続いて、制御部90は、押し上げ具93を動作させて、測定した電流値Iのベース電流Ibが中間目標合計電流値Idと一致する中間目標位置に、ナノ電極34を配置するために、ステップS343~S345を行う。これにより、ナノ電極34間の電極間距離dを、中間電極間距離d1とすることができる。
 まず、制御部90は、現在のベース電流Ibが中間目標合計電流値Idに近づくように、押し上げ具93を操作し、電極間距離dを変更する(ステップS343)。ステップS343は、スモールギャップモードのステップS243と同様に行う。
 次に、制御部90は、所定の第2待機時間t2の間、待機を行う(ステップS344)。これにより、ステップS333の電極間距離dの変更に伴う過渡現象の影響が十分小さくなるのを待つ。これにより、その後のステップS335における電流測定時に、測定した電流値に過渡現象に起因する誤差が生じるのを抑制できる。ステップS343における待機時間は、例えば、スモールギャップモードのステップS333における待機時間と同じ第2待機時間t2である。
 その後、制御部90は、電流計96に電流値Iを測定させる(ステップS345)。
 そして、制御部90は、ステップS345において測定した電流値Iのベース電流Ibが、所定の電流値範囲内に含まれるか否かを判断する(ステップS346)。ステップS336において判断が行われる所定の範囲は、中間目標合計電流値Idを基準として設定される。例えば、ベース電流Ibが、中間目標合計電流値Idから±0.0005nAの範囲内であるか否かを基準とする。
 ステップS346において、ベース電流Ibが所定の範囲内に達していないと判断すると(ステップS346:No)、制御部90は、ステップS343へと戻り、引き続き電極間距離dの調整を行う。
 一方、ステップS346において、ベース電流Ibが所定の範囲内に達していると判断すると(ステップS346:Yes)、制御部90は、ステップS347に進む。そして、ステップS342で算出した移動操作量ΔVpの分、押し上げ具93による電極基板の押し上げを行う(ステップS347)。具体的には、制御部90は、印加電圧Vpを、中間電極間距離d1における印加電圧Vpに移動操作量ΔVpを加算した電圧値に変化させる。これにより、制御部90はナノ電極34間の電極間距離dを、最終目標位置における目標電極間距離d2にセットする。
 続いて、制御部90は、所定の第3待機時間t3の間、待機を行う(ステップS348)。これにより、ステップS347における電極間距離dの変更に伴う過渡現象の影響が十分小さくなるのを待つ。その結果、この後に続くステップS400の生体高分子のトンネル電流測定処理時に、測定した電流値に過渡現象に起因する誤差が生じるのを抑制できる。制御部90は、ステップS349の後、ステップS300の電極間調整処理を完了する。
 ステップS348における待機時間である第3待機時間t3は、ステップS100の特徴量解析処理で算出された5つの時定数τ1~τ5のうち、最も小さな時定数τ1と、2番目に小さな時定数τ2とに基づいて算出される。第3待機時間t3は、例えば時定数τ1および平均値に所定の実数を乗じて算出される。
 <6.変形例>
 以上、本発明の一実施形態について説明したが、本発明は、上記の実施形態に限定されるものではない。
 上記の実施形態では、電極基板の有する金属層が外部から電力が入力される接続用電極間を一対のみ有したが、本発明はこれに限られない。1つの電極基板が、外部から電力が入力される電極を複数対有していてもよい。例えば、第1流路と第2流路との間に電気泳動用の電圧を印加してもよい。
 また、上記の実施形態や変形例に登場した各要素を、矛盾が生じない範囲で、適宜に組み合わせてもよい。
 1 電極基板
 9 電流測定装置
 34 ナノ電極
 50 流路
 90 制御部
 93 押し上げ具
 94 昇降機構
 95 電源
 96 電流計
 942 ピエゾアクチュエータ

Claims (11)

  1.  一対の電極間を通過する生体高分子のトンネル電流を測定する電流測定方法であって、
     a)電解質を含む液体中に前記電極を配置し、前記電極間に電圧を印加しつつ、前記電極の表面に形成される電気二重層を介して前記電極間を流れる電流を測定する工程
    を含む、電流測定方法。
  2.  請求項1に記載の電流測定方法であって、
     b)前記電極間の距離を固定したまま、電極間電圧をかけていない状態から所定の電圧印加を行いつつ、前記電極間を流れる電流を測定する工程と、
     c)前記工程b)において測定した電流値について、前記電気二重層に起因する特徴量を算出する工程と、
    を含む、電流測定方法。
  3.  請求項2に記載の電流測定方法であって、
     前記工程b)および前記工程c)は、前記工程a)の前に行われ、
     前記工程a)における測定タイミングは、前記特徴量に基づいて決定される、電流測定方法。
  4.  請求項2に記載の電流測定方法であって、
     前記特徴量は、前記工程b)において測定した前記電流値の時定数である、電流測定方法。
  5.  請求項4に記載の電流測定方法であって、
     前記工程c)において、複数の前記時定数を算出する、電流測定方法。
  6.  請求項4または請求項5に記載の電流測定方法であって、
     前記工程b)および前記工程c)は、前記工程a)の前に行われ、
     前記工程a)における測定タイミングは、前記時定数に基づいて決定される、電流測定方法。
  7.  請求項5に記載の電流測定方法であって、
     前記工程a)は、前記電極間に所定の電圧を印加しつつ、電極間距離を変更させるように操作を行って前記電極間の電流値を取得するキャリブレーション用電流測定工程であって、
     前記工程a)は、
      p1)前記時定数に基づいて算出された待機時間の間、待機する工程と、
      p2)前記電極間距離の変更に用いられる操作量の値と、前記電極間の電流値とを取得する工程と、
      p3)前記操作量を変更して前記電極間距離を変更する工程と、
    を複数回繰り返す、電流測定方法。
  8.  請求項7に記載の電流測定方法であって、
     d)前記工程a)における、複数の前記操作量と複数の前記電流値との関係を関数近似した近似関数を算出する工程
    をさらに有する、電流測定方法。
  9.  請求項7に記載の電流測定方法であって、
     前記工程p1)における前記待機時間は、前記時定数を定数倍して算出される、電流測定方法。
  10.  請求項5に記載の電流測定方法であって、
     前記工程b)および前記工程c)の後であって、
     e)前記電極間にトンネル電流が流れない電極間距離において、前記電極間に流れる基準電流の値を測定する工程と、
     f)目標とする電極間距離に対応するトンネル電流の値と、前記e)で測定した前記基準電流の値とを加算して、目標合計電流値を算出する工程と、
    をさらに含み、
     前記工程e)および前記工程f)は、前記工程a)の前に行われ、
     前記工程a)は、
      q1)前記時定数に基づいて算出された待機時間の間、待機する工程と、
      q2)前記電極間のベース電流を測定する工程と、
      q3)前記ベース電流の値が、前記工程f)で算出した前記目標合計電流値に近づく方向に前記電極間距離を操作する工程と、
    を複数回繰り返す、電流測定方法。
  11.  請求項5に記載の電流測定方法であって、
     前記工程b)および前記工程c)の後であって、前記工程a)の前に、
      g)前記電極間にトンネル電流が流れない電極間距離において、前記電極間に流れる基準電流の値を測定する工程と、
      h)中間目標とする電極間距離に対応するトンネル電流の値と、前記工程g)で測定した前記基準電流の値とを加算して、中間目標合計電流値を算出する工程と、
    をさらに含み、
     前記工程a)は、
      r1)前記時定数に基づいて算出された待機時間の間、待機する工程と、
      r2)前記電極間のベース電流を測定する工程と、
      r3)前記ベース電流の値が、前記工程h)で算出した前記中間目標合計電流値に近づく方向に前記電極間距離を操作する工程と、
    を複数回繰り返し、
     前記工程a)の後に、
      i)中間目標とする電極間距離から最終目標とする電極間距離までの予め算出された操作量の操作を行うことにより、を前記最終目標と一致するように前記電極間距離を調整する工程
    をさらに含む、電流測定方法。
     
PCT/JP2020/006901 2019-03-28 2020-02-20 電流測定方法 WO2020195413A1 (ja)

Priority Applications (2)

Application Number Priority Date Filing Date Title
JP2021508811A JP7398129B2 (ja) 2019-03-28 2020-02-20 電流測定方法
US17/598,726 US20220187244A1 (en) 2019-03-28 2020-02-20 Current measurement method

Applications Claiming Priority (2)

Application Number Priority Date Filing Date Title
JP2019-063813 2019-03-28
JP2019063813 2019-03-28

Publications (1)

Publication Number Publication Date
WO2020195413A1 true WO2020195413A1 (ja) 2020-10-01

Family

ID=72609428

Family Applications (1)

Application Number Title Priority Date Filing Date
PCT/JP2020/006901 WO2020195413A1 (ja) 2019-03-28 2020-02-20 電流測定方法

Country Status (3)

Country Link
US (1) US20220187244A1 (ja)
JP (1) JP7398129B2 (ja)
WO (1) WO2020195413A1 (ja)

Citations (2)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Publication number Priority date Publication date Assignee Title
JP2006258813A (ja) * 2005-03-15 2006-09-28 Agilent Technol Inc マイクロ流体デバイス及びマイクロ流体デバイスを用いる方法
US20180223354A1 (en) * 2017-02-01 2018-08-09 Seagate Technology Llc Nanofluidic channel opening size control using actuation

Patent Citations (2)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Publication number Priority date Publication date Assignee Title
JP2006258813A (ja) * 2005-03-15 2006-09-28 Agilent Technol Inc マイクロ流体デバイス及びマイクロ流体デバイスを用いる方法
US20180223354A1 (en) * 2017-02-01 2018-08-09 Seagate Technology Llc Nanofluidic channel opening size control using actuation

Non-Patent Citations (2)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Title
R. MORROW AND D. R. MCKENZIE: "The time-dependent development of electric double-layers in pure water at metal electrodes: the effect of an applied voltage on the local pH", PROCEEDINGS OF THE ROYAL SOCIETY A, vol. 468, no. 2137, 10 August 2011 (2011-08-10), pages 18 - 34, XP055743330, ISSN: 1364-5021, DOI: 10.1098/rspa.2011.0323 *
TAKAHITO OSHIRO: "Development of Single-molecule Electrical Analysis for a High- throughput Single-molecule Sequencer", BUNSEKI KAGAKU, vol. 66, no. 5, 5 May 2017 (2017-05-05), pages 351 - 362, XP055637919, ISSN: 0525-1931, DOI: 10.2116/bunsekikagaku.66.351 *

Also Published As

Publication number Publication date
JP7398129B2 (ja) 2023-12-14
JPWO2020195413A1 (ja) 2020-10-01
US20220187244A1 (en) 2022-06-16

Similar Documents

Publication Publication Date Title
JP6517826B2 (ja) ナノギャップ電極およびその製造方法
EP3566062B1 (en) A position correction method and a system for position correction in relation to four-point resistance measurements
JP5717634B2 (ja) 流体チャネル内の生体分子および他の分析物の電圧感知のための、長手方向に変位されるナノスケールの電極の使用
CN109791137B (zh) 用于分子识别的微流控阵列中的隧道结
WO2013115185A1 (ja) 物質の移動速度の制御方法および制御装置、並びに、これらの利用
WO2015125920A1 (ja) 生体分子シーケンシング装置用電極、生体分子シーケンシング装置、方法、及びプログラム
WO2020195413A1 (ja) 電流測定方法
US20210178384A1 (en) Improved Device For The Analysis Of Nucleic Acid Molecules
WO2019176411A1 (ja) 電極対の校正方法
WO2019176412A1 (ja) 電流測定方法
WO2019208225A1 (ja) 配列決定方法および配列決定装置
Van Megen et al. Solid state nanogaps for electrochemical detection fabricated using edge lithography
JP2021165634A (ja) 電流値データ取得方法および電流計測装置
JP2020076605A (ja) 電極調整方法および電極調整装置
JP2003121459A (ja) 電気特性測定装置及び測定方法
JP7372683B2 (ja) 電極基板および電極基板の製造方法
EP4160199A1 (en) Apparatus for biomolecule analysis with a well and a cavity below the well
JP2021038924A (ja) 電極作成方法
JP2021038923A (ja) 基板
US10656137B2 (en) Method for producing a nano-gap in a brittle film assisted by a stabilizing substrate
JP2019022522A (ja) 物質の移動速度の制御方法および制御装置、並びに、これらの利用
JP2017123838A (ja) 物質の移動速度の制御方法および制御装置、並びに、これらの利用
Kannappan et al. Applications of scanned pipettes to the localized characterization of actuating conducting polymers: an SICM design for simultaneous ion flux and topography measurements
EP1938364A1 (en) A method for fabricating nanogap and nanogap sensor

Legal Events

Date Code Title Description
121 Ep: the epo has been informed by wipo that ep was designated in this application

Ref document number: 20779682

Country of ref document: EP

Kind code of ref document: A1

ENP Entry into the national phase

Ref document number: 2021508811

Country of ref document: JP

Kind code of ref document: A

NENP Non-entry into the national phase

Ref country code: DE

122 Ep: pct application non-entry in european phase

Ref document number: 20779682

Country of ref document: EP

Kind code of ref document: A1